CHR BP REF ALT NEW TS MAF MAF_allele Prop_missing_genotypes Prop_missing_alleles Allfreq_ref Allfreq_alt Genofreq_ref Genofreq_het Genofreq_alt Allcount_ref Allcount_alt Genocount_ref Genocount_het Genocount_alt 3 3000022 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3005038 C G Y N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 3009250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3018157 A G Y Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 3 3034880 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 3034940 T C Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 3034959 C G Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 3035138 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3035487 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 3 3035581 C A Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 3 3035602 A G Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 3 3035794 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 3035830 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 3037374 C T Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 3038436 T C Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 3038458 C A Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 3038461 T G Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 3038715 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 3038777 C A Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 3038796 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3039262 G C Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 3 3039269 A G Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 3 3040402 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 3041083 T A Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 3043226 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3043319 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 3045238 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3049762 C A Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 3049775 C T Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 3050176 A C N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 3050180 C G Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 3050196 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 3 3050318 A T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 3050349 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 3050420 C A Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 3050485 C T Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 3050506 T G N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 3052822 C G Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 3 3052874 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 3053519 G C Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 3 3053529 A T Y N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 3 3053531 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3053550 A C Y N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 3 3053551 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 3 3053615 A G Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 3 3053687 G C Y N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 3053715 G A Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 3053780 C A Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 3053792 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 3 3054431 G T Y N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 3 3054513 G A Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 3054516 T G Y N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 3054547 A G Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 3055370 T C Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 3055372 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 3055381 G A Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 3055396 C A Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 3 3055648 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3055663 C T Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 3055686 A T Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 3055695 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3055926 G A Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 3 3055933 A T Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 3 3055946 T G Y N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 3055963 T G Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 3056005 T A Y N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 3 3056828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3057075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3057310 G C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 3057899 C A Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 3 3057913 G A Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 3 3057917 T C Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 3 3059751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3059838 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3060014 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 3 3061034 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 3061064 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3062017 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 3 3062025 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 3 3062050 C T Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 3062053 G A Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 3062073 T G Y N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 3063200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3063277 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 3063868 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3064273 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3065569 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3066898 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 3068208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3068885 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3069862 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3070907 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 3071174 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3071538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3071605 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3073192 T C Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 3073415 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3073586 A G Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 3074019 T C Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 3 3074023 A C Y N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 3 3074039 A G Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 3074066 C T Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 3074188 G T Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 3 3074192 T A Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 3075306 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 3075322 A G Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 3075501 T A Y N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.363636363636364 0.636363636363636 0 15 7 4 7 0 3 3075518 A G Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 3 3075520 A T Y N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 3076441 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3076886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3077114 G T Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 3077381 T C Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.0625 0.9375 0 17 15 1 15 0 3 3077608 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 3078002 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3078705 A C Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 3078713 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 3078722 T G Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 3078757 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 3078777 G T Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 3078793 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 3078885 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 3079030 A C Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 3079195 A G Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 3 3079286 A C Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 3 3079301 A T Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 3081188 T G N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 3081239 A C Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 3081556 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 3 3083719 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3090022 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3091100 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3093115 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3094320 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3094409 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 3094812 G A Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 3094840 C T Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 3098110 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 3098556 C G Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 3098557 A G Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 3098865 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3099342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3099349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3099933 T C Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 3099938 T A Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 3101907 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3106491 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3107119 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3108326 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3109786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3110089 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3111300 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3111335 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3111833 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3111903 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3111930 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3112215 T A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 3112379 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3112625 A C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 3113087 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3113090 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3115782 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 3 3124604 A G Y Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 3126926 C A Y N 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0 1 0 6 6 0 6 0 3 3127069 C T Y Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0 1 0 11 11 0 11 0 3 3127559 C T Y Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 3 3127567 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 3127571 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 3127578 A T Y N 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 3 3127697 C T Y Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0 0.545454545454545 0.454545454545455 6 16 0 6 5 3 3127984 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 6 12 0 6 3 3 3128338 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 3128856 T G Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 3128931 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 3128940 A T Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 3128945 A T Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 3128966 T A Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 3 3129508 A G Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 3 3129638 G A Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 3129979 T G Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 3 3129990 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 3 3129999 G T Y N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 3 3130002 T A Y N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 3 3130016 C G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 3 3130139 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3130147 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 3130185 A T Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 3130265 A C Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 3130268 T G Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 3131260 T A Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 3131921 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3132497 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3133719 A G Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 3133756 G T Y N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.272727272727273 0.727272727272727 0 14 8 3 8 0 3 3133776 C T Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 3 3134656 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3135121 G A Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 3135123 T C Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 3138896 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 3138900 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 3139360 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 3139509 A T Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 3140173 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3141506 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3141509 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3144980 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3147842 C G Y N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 3 3149880 T C Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 16 12 2 12 0 3 3151125 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3152948 T A Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 3 3153908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3154555 T A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 3154711 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 3154758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3156722 C T N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 3156737 A G Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 3156769 A T N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 3157455 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3157507 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 3157771 C A Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 3 3157781 T G Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 3 3158663 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 3158987 A T Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 3158990 G T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 3159038 C G Y N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 3159187 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3159262 A G Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 3159273 T G Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 3159475 A C Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 3 3159768 T C Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 3159815 C T Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 3160119 T A Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 3 3160729 A C Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 3160778 T G Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 3160928 T A Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 3161075 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 3161146 A T Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 3161161 A T Y N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 3 3161235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3161399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3161917 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3162063 A G Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 3162166 G A Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 3162545 T G Y N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 3163565 A G Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 3163885 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3164908 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 3 3166994 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 3167246 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3167874 T A Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 3 3167888 T C Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 3168144 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3169049 G C Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 3169057 T A Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 3169071 T G Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 3169103 C T Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 3169104 A G Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 3169940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3170098 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3172112 A C N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 3172121 T C Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 3172136 T A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 3172572 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 3172573 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 3172586 A C Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 3172926 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3172944 T A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 3172988 G T Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 3173255 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3175329 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3175503 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3177912 C A Y N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 3177917 C A N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 3177939 G C Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 3177949 G T Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 3177950 A G Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 3180647 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3180819 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3180923 A T Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 3181141 C T Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 3 3181143 C A Y N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 3 3181428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3182532 T A Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 3185192 G C Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 3185246 T C Y Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 3 3185599 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3185756 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3186708 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3187301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3188376 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3189345 A C Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 3189693 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3190293 T G Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 3192445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3196304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3198598 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3200061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3200631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3201039 T C Y Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 3 3201154 G A Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 16 14 1 14 0 3 3201237 G A Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 3 3201241 C T Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 3201795 T G Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 3201806 A C Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 3201847 G T Y N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 3 3202800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3202891 G C Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 3202908 G T Y N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 3 3203040 A C Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 3203181 T A Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 3 3203192 C T Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 3 3203287 C A Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 3203664 T A Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 3204365 G T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 3 3205525 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 3206283 C T Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 3206293 C A Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 3206299 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 3206338 T C Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 3206672 C A Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 3207390 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3207835 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3207966 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3208404 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 3208432 G C Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 3 3208437 A G Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 3 3208730 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 3209179 A G Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 3209190 T A Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 3 3209231 G C Y N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.25 0.75 0 15 9 3 9 0 3 3210670 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3212590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3212865 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 3212885 A C Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 3212896 T G Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 3 3212915 T G Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 3 3212930 G T Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 3214395 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3214455 A C Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 3214982 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 3 3215096 T C Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 3215103 C G Y N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 3 3215594 C G Y N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 3215605 T A Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 3215669 A T Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 3 3215904 A C Y N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 3216072 T A Y N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.230769230769231 0.769230769230769 0 16 10 3 10 0 3 3216083 A T Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 3216103 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 3 3216121 T A Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 3 3216363 A C Y N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 3216364 G A Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 3216381 T C Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 3 3217021 A G Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 3 3217144 A T Y N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 3217162 C G Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 3217245 T G Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 3217248 G A Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 3217293 C T Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 3217295 C A Y N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 3217319 C A Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 3218912 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 3218924 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 3219848 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 3219885 C G Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 3219895 G A Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 3219898 T G Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 3219911 A C Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 3 3220070 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3220251 A C Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 3220265 G C Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 3222095 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3222480 A G Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 3222529 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 3224373 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 3224390 A G Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 3224429 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 3224596 T A Y N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 3 3224600 T C Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 3 3224612 G A Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 3224639 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 3224647 A G Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 3 3225948 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3226019 C A Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 3226058 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 3226982 G A Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 3227932 G T N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 3227947 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 3227972 T G Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 3228320 C T Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 3 3228394 C T Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 3228399 T A Y N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 3228405 G A Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 3 3228509 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 3228779 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 3229247 T G Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 3 3229258 T A Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 3 3230460 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 3230742 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 3230919 T C Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 3231486 T A Y N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 3231541 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 3232672 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 3233824 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 3234778 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3235270 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3237165 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3238683 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3239591 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3239613 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 3239952 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 3241201 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3241918 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3242602 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3242689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3242745 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3242746 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3245998 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3248358 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3249788 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3267242 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3267358 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3270680 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3272065 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3272557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3272924 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 3273208 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3282338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3284406 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 3285152 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3289193 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3289500 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3289937 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3297755 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3300094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3302507 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3305547 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 3309000 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3312634 C G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 3313380 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3320248 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 3320798 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 3321695 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3321740 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3322361 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3335606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3336250 C T Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 3336502 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 3336505 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 3342070 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3342960 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3347119 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3348174 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3352267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3357334 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3359828 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3363567 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 3365189 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3369835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3370452 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3370877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3371352 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3371736 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 3376839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3378021 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3378177 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3379685 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3380083 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3381015 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3381737 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3381888 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3382204 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3383253 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 3383712 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 3384402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3384597 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 3384791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3385184 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3385414 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 3385970 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3386174 A G N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 3 3387014 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3387035 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3387109 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3387775 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 3388404 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 3390021 A T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 3390107 T A N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 3390377 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3390477 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3390514 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 3390778 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 3391183 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3391793 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3393253 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3393548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3393549 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 3393807 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3394755 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 3395198 G C Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 3395829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3395835 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 3396559 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3396940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3397477 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3397554 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 3397597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3397869 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3397885 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3397934 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 3397958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3398073 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3398263 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3398636 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3399049 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 3 3399113 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 3399157 A C N N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 3 3399815 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 3400147 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 3400259 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 3400592 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 3401026 A C Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 3401038 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 3401085 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 3401298 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3401299 A C Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 3401520 C A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 3402200 T A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 3402251 T A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 3402511 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 3402575 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3402834 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 3403048 A C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 3403335 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3403541 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3403745 A C Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 3404090 T A Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 3404702 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3404945 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 3405178 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 3405782 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3405893 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3406198 T C Y Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 3407147 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3407625 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3407641 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3408329 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3408872 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3409956 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 3410232 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 3411201 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3411233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3411273 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3411331 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3411449 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3411450 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3412020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3412743 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3412909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3412998 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3413297 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3413508 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3414396 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3414621 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3415694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3415850 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3416003 C A Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 3418578 G A Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 3418671 A C Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 3419221 G C Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 3419400 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3421428 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3421699 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3421779 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3421913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3422658 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3434071 T A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 3436685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3440702 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3440747 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3440766 A C Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 3446800 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3446989 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 3447015 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3447488 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3447611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3447941 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3448027 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3450419 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3450568 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3450669 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3451033 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3451057 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3451224 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3451986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3452736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3452812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3453338 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3453638 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3454617 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3454734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3456420 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3456908 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3457514 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3458949 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3459852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3460106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3460193 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3461930 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3462226 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3462960 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3464329 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3465365 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3466012 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3467749 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 3468431 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 3473319 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3473414 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3473510 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3474359 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3474396 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3474861 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 3474944 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3474976 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 3475509 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3476248 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3476456 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3476852 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3477027 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3477243 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3477411 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3477542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3478198 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3478682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3479494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3479868 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3479955 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3481676 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3482776 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3483638 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3484449 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3484599 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3484806 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3484838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3484936 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3486012 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3486321 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3486423 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3487002 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3487014 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3489044 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3489418 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3490521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3490644 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3491224 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3491330 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3491700 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3491938 A T Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 3492307 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3494092 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 3494465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3497746 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3498172 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 3498277 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3498297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3498343 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3498397 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3498403 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 3498724 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 3498780 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 3498906 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3498925 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3498938 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 3499063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3499073 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 3499126 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3499178 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 3499186 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3499448 G T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 3499486 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3499499 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3499933 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3499961 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 3499974 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 3499982 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 3500024 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3500490 G C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 3500511 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 3500576 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3500659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3501225 A T N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 3501445 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3501502 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3501646 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3501999 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 3502062 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3502091 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 3502193 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 3502227 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3503053 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 3503102 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3503149 A G N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.538461538461538 0.230769230769231 0.230769230769231 17 9 7 3 3 3 3503172 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 3504058 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 3504097 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3504473 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 3504505 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 3504813 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3505498 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3505582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3505679 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3505682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3505897 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 3505919 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3505953 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 3506058 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3506140 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 3506407 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 3507121 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3507530 C G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 3507531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3507562 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 3507856 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3508560 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3509308 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3509499 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3509769 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3509815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3509891 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3509949 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3510002 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3510022 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3510264 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 3510399 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3510483 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3511177 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3511207 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3512257 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3512714 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3513023 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 3513766 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3513931 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3514297 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3515140 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3515270 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3515305 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3515450 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3515731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3515791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3516229 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3516272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3516366 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3517395 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3517499 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3517667 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3517782 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3518461 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3519182 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 3519661 A G Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 3519752 A T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 3520123 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 3520353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3521013 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 3521508 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 3521609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3521732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3521794 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 3521840 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 3521898 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 3522091 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3522343 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3522373 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3522522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3522593 T G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 3522690 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3523182 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3523677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3523700 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3524347 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 3524555 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3524698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3524790 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3524884 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3525201 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3525326 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3525344 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3525443 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3526671 G T N N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 3 3526813 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 3526911 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 3526945 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 3527098 T A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 3527205 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 3527303 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3527450 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3527527 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 3527644 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3528162 G C Y N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 3528237 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 3528269 G T N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 3528490 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3528564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3528648 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3528653 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 3529147 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3529208 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3529224 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3529294 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 3529586 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3529612 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3529741 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3530311 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3530507 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3530976 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3531154 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3531270 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3531466 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3531641 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3531720 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3531802 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3531872 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3531943 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3532099 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3532157 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3532216 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3532240 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3532254 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3532257 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3532305 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3532385 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 3533399 T G N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 3533956 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 3534151 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3534839 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3535263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3535290 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3535342 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3535494 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3535750 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 3536088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3536569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3537079 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3537118 T G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 3537182 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3537627 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3537768 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 3538093 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3538162 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3538318 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3538395 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3538501 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3538516 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3538599 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3538870 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3538923 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3539111 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3539284 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3539373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3539483 G C Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 3539712 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3539768 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3539943 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3540024 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3540537 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3540604 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3540697 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3540698 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3540888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3541038 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3541051 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3541444 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3541732 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3541921 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3542452 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3542461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3542572 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3542910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3543780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3543816 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3543854 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3543889 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3544316 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3544363 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3544538 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3544851 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 3544871 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3545072 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3545730 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3545785 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3545857 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3546357 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3546433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3546470 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3546513 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3546753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3547214 A G Y Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 3547349 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3547418 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 3547616 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 3547771 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3547848 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3548106 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3548262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3548273 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3548395 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3548555 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3548926 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3549153 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3549199 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3549232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3549266 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3549459 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3549505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3549648 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3549655 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3550699 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3550766 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3550798 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3550816 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3550935 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3550977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3551061 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3551091 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3551120 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3551393 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3551436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3551474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3551491 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3551547 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 3551988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3552001 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3552016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3552024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3552130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3552268 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3552440 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3552667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3552685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3552734 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3552910 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3553070 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3553219 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3553278 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3553597 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3554072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3554148 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3554213 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3554272 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3554597 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3554605 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3554644 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3554676 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3554955 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3555059 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3555070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3555167 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3555363 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 3555367 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3555795 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3555820 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3555822 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3555844 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3555915 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3555961 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3556000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3556049 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3557014 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3557237 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3557271 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3557454 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3557479 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3557514 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3557671 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3557736 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3557780 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3558379 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3558580 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3558869 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 3558913 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3559022 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3559276 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3559814 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3559845 A T Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 3559996 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3560345 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3561225 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3562460 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3562461 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3562726 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3565278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3566727 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3566739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3567108 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3569058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3569102 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3569361 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3570580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3570742 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3570881 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 3571529 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3571852 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3572554 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3572996 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3573022 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3573443 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3574546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3574732 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3575515 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3579386 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3579446 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3579980 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3580228 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3581754 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3582005 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3582529 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3582867 A G Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 3583591 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3583741 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3585667 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3585879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3588272 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 3588286 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 3588578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3588728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3589067 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 3589221 A C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 3589303 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 3589405 G T Y N 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 9 11 2 5 3 3 3590055 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 3590439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3590482 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3590739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3591732 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3592314 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3592337 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3593057 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 3593612 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3593869 A C N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 3594219 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3594288 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3594542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3594686 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 3594964 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3595185 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3595705 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3597302 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3598139 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3599816 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3601423 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3601972 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3602350 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3604352 C G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 3604992 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3606130 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 3606736 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3607090 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3607360 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 3607493 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3607659 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3607866 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3608235 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 3608957 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3609211 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3611270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3614185 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3615135 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 3615297 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 3615620 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3615632 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3615722 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 3615821 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 3615824 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 3617270 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3617591 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 3617739 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3617745 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3618243 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3618514 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3618675 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3619420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3619514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3619533 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3619951 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3620182 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3621388 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3623344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3623572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3625703 G A Y Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.181818181818182 0.818181818181818 0 13 9 2 9 0 3 3625965 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3626149 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3626873 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3627132 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3627812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3628501 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3628823 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3631366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3631673 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3633002 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3633577 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3633753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3635854 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3636281 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 3636610 A C N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 3636650 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 3637168 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 3637564 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3637851 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3637891 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3637913 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3637918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3638001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3638791 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3639022 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3639148 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 3639799 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3639864 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3639896 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 3639922 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 3639947 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 3639970 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 3640090 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3640723 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3640730 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3641511 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3641597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3641743 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3641748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3641781 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 3641879 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 3642170 T A N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 3642286 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3642563 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3642816 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 3642980 C G Y N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 3643065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3643229 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 3644240 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 3645344 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 3645471 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3646407 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 3647752 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3647815 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3648486 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3648536 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3648546 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3648623 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3648676 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3648768 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3648805 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3649038 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3649057 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3649157 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3649188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3649442 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3649521 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3650250 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3650349 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 3650504 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3650762 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 3651226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3651245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3651648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3651858 T A N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 3652033 T G N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 3652050 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3652064 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 3653789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3653908 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3654335 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 3654412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3655294 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 3655331 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3656387 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 3656947 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 3657677 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3658023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3658776 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 3659021 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3659518 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 3659618 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 3659734 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 3659756 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 3660234 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3660249 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 3660788 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3662619 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 3663345 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 3663624 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3663684 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 3663708 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 3664486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3664547 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 3664715 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 3664940 A G N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 3 3665302 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 3665445 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 3665461 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3666075 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 3666207 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3666239 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 3666333 C G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 3666583 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 3666592 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3666718 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 3667142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3667205 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 3667256 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 3667279 G T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 3667322 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 3 3667401 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 3667536 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3667590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3667603 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 3667661 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3667763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3667769 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 3668031 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3668032 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3668042 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 3668374 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3668464 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 3668521 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 3668624 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3668929 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 3669432 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3669694 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3669848 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3669870 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 3669972 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 3670161 A C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 3670626 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 3670864 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3670911 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 3670991 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 3671049 C T Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 3671155 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 3671225 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 3671249 T C Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 3671438 A G Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 3671476 A T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 3671484 A C Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 3671801 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3671833 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 3671947 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 3672152 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 3672166 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 3672197 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 3672327 G T Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 3672554 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 3672613 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3672624 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3672764 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3672867 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 3672882 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 3672903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3672977 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 3673076 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 3673098 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 3673712 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3673818 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 3673842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3673900 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3673913 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 3674193 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3674590 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 3674632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3674730 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3674807 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 3674857 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3674905 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 3675096 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 3675350 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 3675805 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 3676144 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 3676446 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3676790 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 3676936 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 3676972 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 3677004 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 3677110 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 3677546 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3677639 G C N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 3677893 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3678002 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 3678156 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3678240 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 3678769 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 3678851 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 3679019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3679360 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 3679452 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 3679527 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 3679596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3679609 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 3679632 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 3680237 C T N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 3680259 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3680354 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 3680402 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3680632 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3680942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3681066 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3681522 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3681622 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 3682085 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3682200 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3682304 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 3682351 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3682590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3682653 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3682793 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3682907 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3684243 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3684366 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3684447 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3684659 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3684940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3685223 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3685411 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3685556 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 3685655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3685871 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3685983 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3686209 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3686308 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3686639 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3686730 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3686731 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3686771 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3686794 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3687108 T G N N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.454545454545455 0.363636363636364 0.181818181818182 14 8 5 4 2 3 3694617 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 3694699 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3695291 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3695364 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3695502 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3695594 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3695608 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3695652 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3695735 T G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 3695776 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3695992 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 3696001 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3696032 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3696057 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3696102 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3696643 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3696720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3696751 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3696767 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3697198 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3697201 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3697274 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 3697600 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3697709 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 3697850 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3697908 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3698008 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3698021 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3698047 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3698460 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3698629 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3698874 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3699032 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3699087 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3699113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3699283 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3699336 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3699349 C G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3699538 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3699665 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 3699893 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3699961 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3700091 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3700325 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3700430 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3700721 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3700740 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 3701070 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3701282 G T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3701305 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3701534 G C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 3701564 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3701687 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3701977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3701999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3702078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3702146 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3702189 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3702191 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3702275 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3702312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3702398 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3702407 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 3702966 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3702969 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3702998 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3703029 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3703059 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3703197 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3703229 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 3703251 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 3703302 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3703428 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3703501 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3703504 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3703580 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3703705 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3704316 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3704364 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3704478 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3704495 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3704518 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3704618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3704740 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3704872 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 3704882 A G Y Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 3 3705432 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 3705749 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3705823 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3705906 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3705956 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3706239 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3706445 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3706611 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3706805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3706869 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3707573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3707635 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3707749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3707965 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3708314 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 3708392 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3708560 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3708646 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3708667 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3709014 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3709376 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3709390 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3709575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3709753 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3709808 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3709928 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3709960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3709975 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3710021 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3710076 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3710131 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3710451 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3710461 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3710758 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3710779 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3711167 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3711174 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3711252 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 3711292 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3711472 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3711497 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 3711610 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3711623 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3711700 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3711726 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3711758 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3711869 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3711943 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3712095 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3712276 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3712306 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3712369 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 3712440 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3712747 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 3712830 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 3712913 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 3713151 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 3713205 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3713289 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 3713358 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3713422 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3713907 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3713933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3714032 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3714279 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3714337 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3714607 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3714665 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3714667 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 3714983 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3715383 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3715432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3715543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3715752 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3715814 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3717085 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3717552 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 3717949 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3718016 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3718687 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3718810 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3718997 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3719552 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3719647 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3719890 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3720424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3720560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3720606 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3720785 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3720828 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3721033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3721045 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3726757 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3726769 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 3726818 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3726842 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3726918 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 3727184 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3727314 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3727343 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3727752 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3727776 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3727831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3727869 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3728277 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 3728444 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3728710 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3728855 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 3728865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3729147 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 3729300 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3729387 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3729605 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3729698 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3729785 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 3730280 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3730740 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3730785 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 3731066 A C Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 3731415 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3731686 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 3731880 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 3732085 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3732285 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 3732329 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 3732964 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3733014 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3733134 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3733279 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3734037 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3734192 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3734248 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3734282 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3734313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3734485 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3734733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3734837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3735036 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 3735151 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3735433 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3736011 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3736483 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3736816 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3736872 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3737048 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3737883 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3738192 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 3738256 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3738343 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3738499 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 3738772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3738901 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 3739001 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3739216 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3739261 A C Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 3739280 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3739319 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3739336 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3739486 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3740200 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 3740217 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 3740246 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 3740312 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 3740539 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3740819 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 3740831 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3741159 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3741185 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3741690 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3742050 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3742084 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3742490 C T N Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 8 6 2 4 1 3 3742782 G A N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 3 3742892 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3743202 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 3743231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3743534 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3743840 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3744836 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 3744961 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3745032 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 3745148 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3745401 C A N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 3 3745614 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3746274 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3746306 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3746517 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3746523 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3747046 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3747706 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 3747709 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 3747813 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3748149 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3748219 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3748484 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3748537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3749011 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3749618 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3750719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3751670 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3751717 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3751723 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3751826 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3752193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3752219 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 3752242 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 3752551 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3753057 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3753211 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3753262 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3753345 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3753434 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3753743 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 3753834 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3753865 C G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 3754285 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3754757 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3754837 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3755133 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3755358 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.2 0.8 0 24 16 4 16 0 3 3756397 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 3756963 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 3757642 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 3758083 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3758447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3758505 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3758882 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 3759121 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 3759272 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3759285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3759685 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3759832 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3760248 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3760794 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3761029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3761666 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3761920 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3762019 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3762556 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3762804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3763633 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3764099 C G Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 3767177 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3768203 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 3768732 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 3769403 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3769709 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3769802 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3771389 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3771426 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3771810 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3772128 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3772223 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3772290 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 3773633 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3773657 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3774692 G T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 3774807 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3774977 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3775525 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3775552 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3775582 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3776176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3776226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3777331 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3777544 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3777986 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3778283 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3779593 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3779813 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3780611 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3781469 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3783778 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3784672 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3784728 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3784810 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3785121 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3785419 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3785889 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 3786599 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3786601 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3786858 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3787263 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 3787889 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3788542 C T N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.0769230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 9 17 1 7 5 3 3789039 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3789391 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3790466 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 3790787 G A Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 3790893 T C Y Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 3 3793290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3793305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3793406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3793499 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 3793903 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3794131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3794375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3794646 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3794655 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 3795306 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 3795387 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 3795560 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3796142 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3796807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3796924 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 3797245 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3797732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3797789 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 3798020 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3798165 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 3798207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3798647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3798805 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3799560 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3799710 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 3800069 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3800590 A G Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 3801501 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3801872 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3802057 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3804500 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3805284 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 3807655 T G Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 3808561 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3810293 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3810300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3811426 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 3811446 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3811578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3811965 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3812249 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3812743 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 3812851 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 3815394 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3815846 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 3816340 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0 0.933333333333333 0.0666666666666667 14 16 0 14 1 3 3816605 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3819594 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3820091 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3820677 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3821684 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 3822297 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3822574 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3822850 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3823309 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 3825883 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3825966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3826580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3826709 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3828105 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3828240 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3828428 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3828574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3829242 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3829347 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3829660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3829960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3830432 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3830752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3832327 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3832612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3832692 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3833388 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 3833512 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3833530 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3833576 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3834229 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3834340 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3834819 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3835533 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3835747 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3835857 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3835942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3836383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3836788 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3845244 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3845812 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3845900 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3845961 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3845985 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3846863 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3847835 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 3848385 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3848510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3848871 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3849902 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3850028 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3850831 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 3851362 G A N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 3 3852881 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3852973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3853053 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3854152 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3855066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3855211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3855674 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3856147 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3857603 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3857668 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 3857809 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 3861503 C G Y N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 3 3863089 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 3863717 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3863731 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3864981 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3870116 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3870308 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 3872122 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3872948 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3872957 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3874314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3875235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3875641 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3875806 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3875937 A C Y N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 3876259 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3877058 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3877416 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3877575 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3877843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3877930 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3878082 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3878181 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 3878417 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 3878808 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3879030 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 3879188 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3879370 G C Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3879413 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3879575 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 3879879 C T N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 3880684 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 3881210 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3881239 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3881642 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 3881990 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3882099 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3882434 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3882445 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 3882544 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3882546 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 3882662 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3882675 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3882701 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 3882811 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3883637 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3883837 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3884126 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3884160 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3884237 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3884278 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3884450 C A Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 3884569 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3884678 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3884697 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3884801 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3884817 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3885101 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3885111 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3885116 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3885294 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3885349 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3885366 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3886273 G T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3886442 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3886894 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3887234 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3887333 G C Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 3887581 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3888068 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 3888158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3888374 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3888728 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3888811 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3888907 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 3888935 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3888956 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 3889003 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3889573 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3890066 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3890096 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3890254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3890320 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3890677 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3890862 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 3891028 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 3891206 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3891267 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3891350 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3891444 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 3891556 C G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 3891652 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3891716 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3891882 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 3891988 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 3892078 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 3892246 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 3892940 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 3893140 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3893158 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3893440 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3893476 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 3893649 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 3893677 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 3893681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3893792 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3894109 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3894122 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 3894795 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3894848 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 3894851 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 3894907 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3895161 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 3895226 C G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 3895359 C A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 3895785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3895857 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3895931 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3895983 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3896095 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3896130 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 3896191 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 3896326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3896363 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3896617 A T N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 3896810 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3896901 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 3897057 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3897192 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3897492 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 3897633 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3897685 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3897769 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 3898006 A C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 3898036 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 3898098 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 3898120 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3898169 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 3898190 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3898280 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 3898435 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 3898525 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 3898727 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3898797 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3899188 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3899252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3899359 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3899362 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3899406 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 3899442 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3899522 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3899736 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3900084 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3900283 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3900357 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3901058 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 3901080 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3901125 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3901193 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3901210 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3901236 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3901260 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 3901397 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 3901568 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3901628 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3901806 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3902157 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 3902421 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3902423 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3902455 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 3903163 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3903263 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3903279 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3903622 A G Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 3903894 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3903967 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 3904487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3904524 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3904883 C A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 3904921 G T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 3905169 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3905223 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 3905389 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3905966 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 3906062 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3906221 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3906234 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3906451 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3906683 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3906872 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3908313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3908538 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3908782 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 3909012 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3909181 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3909298 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3909302 C A Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 3909727 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3909729 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3909754 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 3909790 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 3909821 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3910112 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 3912068 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 3913765 A T Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 3914946 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3914947 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3915016 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3915150 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3915404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3915453 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 3915626 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3915690 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 3915700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3916051 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3916068 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3916279 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3916321 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3916495 G A Y Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 3 3916556 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 3 3916838 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 3918238 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 3918933 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3918941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3918953 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3919016 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 3919167 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3920476 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 3921101 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 3921426 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3923610 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3924241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3924505 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3924529 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3924536 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 3924587 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3924605 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 3924754 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3924849 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3925028 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3925031 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3925081 A T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 3925104 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3925132 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 3925178 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3925355 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3925441 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 3925595 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 3925819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3926286 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3926317 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 3926491 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3926688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3927578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3927588 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3927627 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3927648 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 3927684 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3927771 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 3927815 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3928193 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3928194 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3928452 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 3928509 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 3928584 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3928653 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3928718 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3928788 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3928922 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 3935742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3935836 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 3935846 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3936007 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 3936020 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 3936268 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3936362 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3936394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3936400 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3936572 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3936690 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3936793 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3936802 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3937057 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3937061 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3937125 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3937143 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3937242 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 3937682 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3937703 A G Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 3937707 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.125 0.6875 0.1875 15 17 2 11 3 3 3937908 G A Y Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.230769230769231 0.615384615384615 0.153846153846154 14 12 3 8 2 3 3937980 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3937987 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 3938157 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3938213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3938299 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3938318 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3938363 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3938385 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3938421 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3938472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3938500 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 3939218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3939243 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3939251 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3939551 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3940352 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3940374 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3940434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3940518 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3940817 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3940826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3940900 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3941030 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3941041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3941049 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3941128 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3941455 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 3941787 A G N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 3941843 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3942089 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3942318 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 3942342 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 3942577 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 3942600 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 3942620 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 3942722 T A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 3942977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3943124 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3943190 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 3943418 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3943645 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3943689 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3943732 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3943864 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3943897 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3943906 T A N N 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 10 14 2 6 4 3 3944442 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3944711 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 3944746 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 3944899 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 3945174 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3945291 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3945779 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3945854 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3945891 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3946288 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3946306 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 3946307 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 3946399 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3946415 C T Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 3946973 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3946982 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3947088 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3947413 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3947415 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3947443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3947615 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3947686 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3947702 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3947714 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3947768 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3947794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3947831 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3948052 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3948093 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3948094 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3948167 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 3948240 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 3948370 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 3948409 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 3948542 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 3948690 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3948715 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3949424 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3950591 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3950884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3951243 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 3952581 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3952716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3952752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3952893 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 3952987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3953861 A T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 3954177 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 3954249 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 3954648 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 3954801 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 3955042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3955221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3955222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3956155 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3956807 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3957340 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3957573 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3957626 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3958347 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 3958358 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 3958577 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 3958633 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 3958831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3959400 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 3959512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3959534 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3960206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3960551 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3960966 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3960980 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3960987 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 3961326 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 3961327 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3961340 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 3961694 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3961720 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 3961778 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3961818 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 3961965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3962016 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3962140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3962502 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3962629 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 3962637 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3962771 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3962905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3963045 C T Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 3963244 C G N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 3963545 A G Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 3963571 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3963810 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3963901 A C Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 3963963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3964044 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3964096 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3964166 A T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 3964462 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3964645 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3964694 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3964929 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3964937 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3964974 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 3965455 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3965764 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3966252 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3966398 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3966542 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3966866 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 3967118 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3967161 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3967220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3967319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3967717 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3967799 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3967924 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3968226 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3968300 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3968411 G A Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 3968447 T C Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 3968549 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 3968606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3968631 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3968650 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 3968748 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3968929 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 3968987 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 3969129 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3969146 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3969325 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3969597 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3969869 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3969999 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 3970019 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3970474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3970590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3970592 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3970644 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3970724 T A Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 3970757 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3970942 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 3971020 T C Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 3 3971378 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3971518 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3971671 C G Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 3971690 A T Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 3971796 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3971925 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3971927 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3971948 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3972247 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3972270 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3972320 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 3972481 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3973176 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3973181 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3973192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3974040 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 3974277 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 3974310 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3974343 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3974602 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3974661 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3974703 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3974890 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3975058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3975410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3975738 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3976087 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3976104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3976234 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3976701 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3976727 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3977030 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3977289 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3977297 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3977458 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3977494 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3977946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3977947 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 3978011 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3978447 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3978955 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3979050 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 3979118 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3979208 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3979376 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3979409 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 3979413 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 3979598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3979656 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3979704 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 3979739 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3979865 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3980076 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3980228 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3980264 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3980281 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3980317 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3980394 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 3980401 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3980941 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3980979 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3981119 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3981481 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3981638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3981735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3981752 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3981993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3982038 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3982288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3982353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3982364 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3982971 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3983928 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 3984081 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3985438 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 3985927 C G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 3986159 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3986579 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3987934 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3988124 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3988211 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3988896 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3989801 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 3990063 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3990591 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 3991864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3992054 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 3992328 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 3992666 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3992673 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3994108 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 3994238 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3994350 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 3994381 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3995338 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3995345 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3995958 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 3996445 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 3996736 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 3996890 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3997074 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3997149 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3997208 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3998394 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 3999119 A C Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 4000612 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4000950 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 4001351 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 4001385 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4001708 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 4001762 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4001764 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4002047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4002369 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4002588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4002713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4003754 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4004407 A G Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 4004516 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 4007014 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4007030 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4007042 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4008568 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 4009092 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4009681 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4010042 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4010129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4011029 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4011490 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4011903 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4012396 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4012551 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4012939 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4015078 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 4016084 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4016189 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4016415 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4016608 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4016803 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4016939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4017242 A G Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 4017727 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4018262 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4018662 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 4018668 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 4018686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4018747 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4018993 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4019539 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4019727 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 4019960 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4020112 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 4020227 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4020467 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4021042 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4021936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4022545 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 4022662 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4023919 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4024370 G C Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 4024743 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4024771 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4025448 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 4026356 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 4026591 C A Y N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 4027118 C A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 4027252 G C Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 4027827 A T Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 4030353 T A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 4030423 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4030448 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4030638 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4031318 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 4031472 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 4032416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4034441 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 4034806 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 4035035 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4035385 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 4035389 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 4035503 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4035546 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4035788 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4036212 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 4039392 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4039510 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4039566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4039583 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 4039662 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4039988 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4040116 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4040363 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4040372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4040601 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4041583 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4042405 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4043359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4043928 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 4044128 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4044847 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4045334 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4047096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4047206 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4048610 C A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 4048989 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4049030 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 4049576 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4050738 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4051717 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4052389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4052612 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4052897 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4053432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4054255 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 4055080 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 4056045 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 4056118 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4056601 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 4057085 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4057871 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4059537 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4060507 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4060714 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4060740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4062206 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4062895 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4063286 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 4063389 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 4063663 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4063709 C G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 4063721 T A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 4064325 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 4065041 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 4065917 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4066158 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 4066361 T C Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 4066735 A C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 4067006 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 4067066 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 4068009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4069305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4070652 A G N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 3 4072695 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4072988 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4073664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4073924 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4074168 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4081464 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 4081677 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4082178 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4082845 A T Y N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 4083096 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4083295 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4083984 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4084649 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 4085037 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 4085316 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 4085402 T G Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 4085594 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 4085651 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 4090199 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 4090528 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4090925 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4091022 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4091236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4091268 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4091417 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4092321 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4093570 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4095362 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 4095449 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4095676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4095718 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4096342 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4096446 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4096672 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4097236 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4097487 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4097579 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4098291 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 4098354 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 4098555 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4098568 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4099013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4099811 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 4099998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4100211 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4101694 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4102262 G T Y N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 3 4102717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4103015 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4103837 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4104045 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4104071 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4104131 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4105463 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4105505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4106800 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4107775 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4114863 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 4115488 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4115744 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4116903 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4116932 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4117919 T A Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 3 4117923 T G Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 3 4118239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4119264 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4119653 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4119758 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4120850 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 4121166 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4122460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4122998 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4123131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4123154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4123649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4125228 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4126327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4126466 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4126501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4126719 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4126779 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4127466 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4127761 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4127980 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4128050 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4129798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4132729 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4132889 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4133725 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4133910 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 4134500 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4134786 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 4135062 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4135646 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4136244 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4137396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4137436 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4138617 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4138699 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4138971 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4139171 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4140715 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 4140957 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 4141376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4141383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4141419 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4141638 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4141815 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4143016 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4143029 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4143171 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4143188 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4143736 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4144026 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4144068 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4144084 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4144534 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4145027 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4145571 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4146200 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4146569 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4146610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4146721 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4147065 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4147082 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4147956 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4148016 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4149062 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4149333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4149620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4149634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4149873 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4150639 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 4150727 G T N N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 4151039 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4151885 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4152841 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 4154395 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 4155146 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4155149 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4163428 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 4164049 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 4171515 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4172632 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4175408 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4175757 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4175847 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4175915 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4176255 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4176843 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4177535 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4177536 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4177551 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4177742 T C Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 4177776 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4177995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4178131 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4179065 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4179069 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4179557 T A Y N 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 3 4179879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4180046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4181514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4182256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4182882 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4183722 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4184290 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4184292 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 4185061 G A N Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.2 0.8 0 6 4 1 4 0 3 4185360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4185489 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4186312 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4187450 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4188754 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4189351 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 4189385 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4189617 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4189950 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4196826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4196845 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4198189 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4198425 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4198861 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4199843 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4200362 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4201145 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4204411 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4205235 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4205535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4205738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4206519 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4207951 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4209125 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 4209472 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 4210530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4210652 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4214643 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4217628 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4218670 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4219216 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4219784 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4220171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4222827 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4229787 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4229975 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4230605 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4230995 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 4232473 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 4233034 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 4233839 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 4234234 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 4238305 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 4239676 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 4240577 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 4246236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4249781 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4253151 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4253722 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4254331 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4254510 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4254818 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4255048 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4255312 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4255732 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 4255742 T A Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 4257440 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 4258159 T A Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 4258561 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4261159 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4263639 G C Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 4264421 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 4264773 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4265340 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4266121 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4266206 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4267418 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4267621 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4267777 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4268317 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4268713 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4269653 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 4270436 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4271499 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4271816 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4271936 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4272051 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4272558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4273362 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 4274712 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4277177 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 4278436 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 4279157 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4279576 T C N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.0714285714285714 0.714285714285714 0.214285714285714 12 16 1 10 3 3 4279579 A T Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 4279608 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 4279880 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4280162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4280203 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4280891 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4281111 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4281553 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 4282195 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4282843 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 4283642 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4283845 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4285084 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4285590 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4285952 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 4286415 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 4287374 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4287555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4287632 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4287754 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4288038 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4292343 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4294514 G C Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 4296890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4298808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4299564 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4300270 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4300546 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4303187 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 4303608 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 4304108 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4306981 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4307016 A G N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 4312443 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4313141 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4313923 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4315905 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4317434 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4318133 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4319329 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 4320805 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4321299 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4321697 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4321854 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4322037 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4322597 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4323199 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4324881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4325821 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4326253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4327108 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 4327237 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4327734 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4328287 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4329025 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4329183 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4329539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4329660 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4330322 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4330442 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4332657 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 4336360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4336542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4337213 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4338206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4338313 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4339663 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 4340660 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 4342983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4343251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4343268 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4344456 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4345081 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4345572 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4346098 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4347076 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4347299 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 4347764 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4350598 G C N N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 3 4351833 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4352641 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4352855 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4353403 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4354214 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4354567 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 4355195 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4355211 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4355322 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4355685 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4355988 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4356216 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4356446 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4356500 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4356694 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4356904 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4357461 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4358087 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 4358158 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4358990 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4359239 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4360027 C A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 4360774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4361006 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4361161 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4361556 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 4361970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4362033 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4362196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4362510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4363055 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4363249 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4363536 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4363937 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4364081 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4364337 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4364966 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4365615 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4365719 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4367851 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4367920 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4367966 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4368760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4368901 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4370423 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4370659 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4371080 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4371696 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4371840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4371857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4371872 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4371971 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4372229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4372765 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4372912 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 4373086 G A N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 9 11 3 3 4 3 4373092 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 4373646 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4373895 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4374142 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4375074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4375079 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4378132 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4379752 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4383590 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4385766 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4385925 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 4395906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4396985 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4397606 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4397712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4397964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4398128 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4399340 G T Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 4402363 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 4402492 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 4402829 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4403739 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 4404406 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4405896 A G Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 4408959 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 4409510 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 4414932 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4415480 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4415599 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4416093 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4422104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4422276 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4422757 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4423857 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4424003 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4424600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4430204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4430700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4431065 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4431209 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 4431929 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4432989 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4433935 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4434471 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4435868 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 4436410 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4443702 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4444898 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4451311 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4451396 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4451764 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4452998 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4453185 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4453360 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4453465 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4453660 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4454270 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4454442 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4454501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4454514 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4454591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4455153 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4455732 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4455889 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4455949 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4456652 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 4456775 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 4457062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4457153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4457178 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4457463 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4457475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4457538 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4458056 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4458090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4458100 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4458636 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 4458765 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4459215 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4459462 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4459674 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4459814 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4460041 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4460532 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 4460661 A T N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 3 4461517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4461564 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4462164 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4462414 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 4462589 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 4462896 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4463345 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4463511 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 4463532 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 4463588 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 4463615 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4463734 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 4463800 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4463977 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 4463985 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 4464179 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4464184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4464298 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 4464357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4464415 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4464440 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4464510 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 4464512 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 4464561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4464654 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4464709 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4464878 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 4464880 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 4464943 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4464960 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 4464972 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4464974 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4465100 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 4465116 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 4465298 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4465402 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 4465443 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4465484 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 4465659 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4466045 A G Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 4466166 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 4466407 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 4466749 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4466813 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 4466824 T A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 4466912 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 4467100 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 4467288 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 4467312 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4467502 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 4467536 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4467643 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4467670 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4467785 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 4467815 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4467863 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 4467876 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 4467900 C A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 4468211 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4468225 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 4468241 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4468610 T G N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.538461538461538 0.230769230769231 0.230769230769231 17 9 7 3 3 3 4469054 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 4469179 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4469270 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4469282 A T N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 4469681 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4469756 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 4469858 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4469889 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 4470219 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 4470287 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4470397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4470535 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4470560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4470569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4470595 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4471212 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 4471217 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4471225 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 4471404 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 4471417 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 4471457 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 4471499 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 4471559 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4471571 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4471576 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4471599 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4471617 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4471626 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4471666 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4471667 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 4471714 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4471821 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4471904 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 4471960 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4471974 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 4471999 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 4472016 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 4472096 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 4472106 A G N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 4472151 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 4472163 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 4472192 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 4472214 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 4472292 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 4472440 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 3 4472569 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.583333333333333 0.166666666666667 0.25 16 8 7 2 3 3 4472744 A G N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 3 4472959 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 10 8 4 2 3 3 4472970 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 4472999 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 3 4473110 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4473120 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 4473131 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 4473156 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 4473177 T A Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 4473187 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 4473194 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 4473206 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 4473251 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4473285 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 4473568 C T Y Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 3 4473611 C A Y N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 3 4473732 A T Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 4473734 G T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 4474009 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4474057 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4474059 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4474241 A T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 4474307 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 4474418 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 4474508 C T N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 3 4474555 G C N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 4474674 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 4474721 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 4474744 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 4474755 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4474815 G T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 4474897 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 4475080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4475335 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4475354 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4475414 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4475640 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 4475675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4475780 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4475830 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4476211 A G N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 8 12 2 4 4 3 4476338 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 4476461 A G N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.545454545454545 0.272727272727273 0.181818181818182 15 7 6 3 2 3 4477121 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 4477323 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 4477566 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 4477880 C G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 4477950 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 4478160 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4478182 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4478429 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4478452 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4478704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4478813 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4478879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4479139 C T N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.454545454545455 0.272727272727273 0.272727272727273 13 9 5 3 3 3 4479156 G A N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.416666666666667 0.25 0.333333333333333 13 11 5 3 4 3 4479300 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4479529 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 4479540 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 4479757 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4479767 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4479916 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 4480231 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 4480321 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4480336 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 4480405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4480415 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 4480520 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4480590 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 4480591 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 4480601 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4480602 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4480874 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 4480906 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 4481090 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4481175 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4481420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4481532 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 4481588 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 4481630 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 4481687 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4481880 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 4482436 T C Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 4482469 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 4482477 C A Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 4482484 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 4482671 C A Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 4482682 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 4482729 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 4482758 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4482892 C T Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 4483062 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4483106 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4483117 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4483196 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4483252 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 4483270 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 4483318 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 4483561 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 11 7 4 3 2 3 4483563 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 11 7 4 3 2 3 4483683 C A N N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 3 4483793 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 4483976 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4484063 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 4484069 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4484395 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4484496 G T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 4484576 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 4484662 T C N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 3 4484815 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4484831 T A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 4484966 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 4484972 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 4485028 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4485102 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 4485127 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 4485197 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 4485274 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4485316 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4485437 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4485663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4485781 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4485917 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 4485980 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4486818 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4487855 T C N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 3 4487891 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 4488280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4488368 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4489136 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 4489236 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 4489269 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4489368 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4490888 A C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 4491713 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 4492586 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4492613 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4492747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4493151 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4493858 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4494125 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4494283 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 4494536 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 4494803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4494978 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4495192 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4495278 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4495486 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4496782 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4497111 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4498746 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4499615 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4499793 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4499918 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 4500224 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4500435 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4500819 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4501119 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4501614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4502448 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4502466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4502671 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4503083 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4503474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4503769 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 4503892 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 4504517 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4504647 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4504891 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 4505655 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4505788 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 4505942 A G Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 4506127 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4506164 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 4506495 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4507263 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4507318 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4507801 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 4507857 A C N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 4507980 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4508538 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4508605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4508963 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4509223 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4509246 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4509285 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 4509893 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4509920 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 4510032 G A N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 10 18 4 2 8 3 4510034 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 4510414 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 4510645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4510961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4512084 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4512185 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4512276 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4512438 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4512915 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 4513016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4513135 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4513445 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4514336 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4514441 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4514447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4515267 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4515332 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 4515773 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4516616 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4517732 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4517804 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4519069 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4520128 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 4520243 G A N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 4520255 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 4520632 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4521026 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4521342 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4521812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4522119 T A N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 4522740 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4524411 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4525932 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4526639 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4526667 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4528024 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4528099 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4528342 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4528449 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4529263 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4529361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4530284 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4530300 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4530369 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4530607 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 4530824 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4531537 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4531865 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4532020 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4532163 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4532461 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4532805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4533354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4533731 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4535015 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4535648 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4536502 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 4536839 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4537167 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 4538133 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4538179 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 4538319 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4538359 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4538414 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4538478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4538869 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 4539206 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4539897 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 4539949 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4541132 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 4541280 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 4541428 G A N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 3 4542170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4543017 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4543729 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 4543778 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4544408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4544793 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4545501 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4545633 C T Y Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 4545929 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 4546685 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4546805 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4546994 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4547639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4547696 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 4547712 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4547900 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4548028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4548102 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4548113 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4548715 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 4548920 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 4549022 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 4549294 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 4550454 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4550455 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4550487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4551046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4552041 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4552522 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4553163 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4554112 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 4555315 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4556299 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4556450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4557528 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4558241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4558736 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4558955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4559007 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4559171 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4560341 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 4560608 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4561018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4561396 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4561397 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4562533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4562972 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4564404 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 4564831 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4565159 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 4565908 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4566662 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4567577 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4569415 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 4569765 A C Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 4569830 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 4570332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4570820 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 4575278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4575577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4576637 T C Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 4577063 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4579484 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4579981 C A Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 4580425 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4582536 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4583495 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 4584446 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4592271 T G Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 4592379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4593441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4595789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4597576 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4597778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4599369 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4600305 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4600833 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4600963 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 4601349 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4601984 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4602919 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4604233 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 4605304 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4605402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4605513 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4605617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4606007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4606162 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4606547 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 4606748 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4607408 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4607554 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4607977 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4607995 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4608549 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4608607 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4609945 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4610880 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4612154 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 4612341 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4612556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4613342 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 4613715 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 4613728 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4614236 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4614826 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4614907 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 4615047 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 4615508 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 4615583 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 4616387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4616482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4616670 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 4616769 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 4617623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4617789 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 4617953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4618156 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4618724 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4619028 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4619818 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4620150 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 4626878 G A N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 4626971 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 4627092 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 4627376 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 4627699 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 4627867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4628061 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4628062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4628077 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4628101 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4628204 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4628222 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4628726 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4629478 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4629591 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4629819 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4629820 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4630414 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4630728 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4630981 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4631115 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4631121 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4631175 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4631235 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4631356 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4631422 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4631463 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 4632855 T A Y N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 4632890 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 4632904 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 4633116 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4633140 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 4633141 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 4633157 A T Y N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 4633372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4633373 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4633488 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4633759 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 4633959 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 4634129 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 4634405 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 4634470 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 4634508 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 4634595 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 4634794 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 4635063 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 4635297 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 4635408 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 4635768 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 4635861 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 4636657 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 4636895 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 4637152 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 4637189 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 4637814 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4637866 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4637868 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 4638106 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 4638121 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4638158 T A Y N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 4638195 G A Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 4638956 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 4639096 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 4639989 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4640059 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 4640359 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4640453 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4640540 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4640586 G C Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 4640625 A G Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 4640873 A G Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 4640875 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4641129 A G Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 4641574 G C Y N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 4642330 A G Y Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.363636363636364 0.545454545454545 0.0909090909090909 14 8 4 6 1 3 4642360 A C Y N 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 3 4642532 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 4642720 T C Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 3 4643127 A G Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 4643259 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4643370 T A Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 4643483 A C Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 4644796 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 4644903 G T Y N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 3 4645006 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4645493 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4645967 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 4646104 C A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4646670 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 4646717 T C Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 4646730 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 4646731 A G Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 4646783 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 4647214 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 4647424 A C Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 4647683 T C Y Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 4647791 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 4648008 T C Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 4648109 A G Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 4648166 A T Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 4648422 A C Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 4648638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4648693 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4648749 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4650049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4650617 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4650984 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4651069 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 4651714 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4652277 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4652564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4652621 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4653169 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4653192 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4654123 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 4654384 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4655493 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 4655812 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4655913 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4656139 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4656465 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4656759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4657339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4657443 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4657692 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 4657713 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 4657739 C G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 4657956 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 4658134 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 4658154 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 4658222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4658645 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 4658821 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 4659769 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4660106 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 4660143 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 4660382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4660569 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 4660670 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 4661767 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 4662239 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 4662568 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4663195 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 4663447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4664387 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4664450 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4664648 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4665767 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 4665962 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4666191 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 4666222 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4666247 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 4666407 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4666503 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 4666565 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4667348 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4667648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4667782 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 4668002 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4668109 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4668545 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 4668567 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4668821 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4671525 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 3 4672157 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4672544 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 4672567 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 4673008 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 4673293 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 4673478 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4673790 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4673929 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4674255 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4674542 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4674644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4675562 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4676102 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4676195 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4677413 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4677565 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 4678748 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 4679424 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4680351 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4680478 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 4680691 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4682152 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 4682548 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 4682784 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4683216 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4683559 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4683585 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4683821 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 4684132 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4684481 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4684870 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4685697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4686297 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 4686382 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4686435 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 4686504 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4686717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4687063 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4687559 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4688407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4688928 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4689328 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 4689423 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4690453 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 4690723 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4691369 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4691403 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4691555 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 4691679 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 4692301 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4692942 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4693009 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4693853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4694976 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4696588 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4696737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4697114 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 4697965 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 4698069 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4698323 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 4699184 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 4699793 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4700127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4700149 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4700280 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4700498 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4700952 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4701092 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4701438 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.0555555555555556 0.833333333333333 0.111111111111111 17 19 1 15 2 3 4701448 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 4701450 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 4702017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4703208 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4703775 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 4704932 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4706875 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4707165 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4707765 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4707944 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 4708307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4708383 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4708633 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4708844 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4709489 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4709559 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4709661 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4709775 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4709822 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4710119 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4711236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4711267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4711817 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4711903 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4711943 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4712104 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4712938 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4713596 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4714627 C A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4714792 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4714864 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4715367 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4715531 T G Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 4716156 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 4716177 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 4716451 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4716718 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4717007 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4717115 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4717160 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4717968 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 4726636 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4726862 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4727571 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4727576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4728483 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 4729180 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4729504 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 4729868 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4730008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4730480 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 4730545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4731251 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4732954 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 4733494 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4734381 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4735114 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 4735237 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4737042 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4738978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4739907 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4742906 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4743675 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 4744805 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4744914 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 4747287 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4750370 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 4750377 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4750488 G C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 4750889 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4751533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4751713 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4753344 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4757947 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 4758680 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4759366 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4759819 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4762029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4764450 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 4764883 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 4764923 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 4765020 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 4765627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4765659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4765774 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 4768080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4769447 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 4770063 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 4770073 A G Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 4770687 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 4770764 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4771034 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4771059 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4771288 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4771343 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 4771405 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 4771664 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 4771698 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 4772879 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4772924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4773561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4774182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4774912 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4775335 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4778506 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4782314 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4782953 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 4784209 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 4784227 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 4784293 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 4785354 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4785361 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 4785561 C A Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 4786147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4786369 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4787127 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4787146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4787158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4787518 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4788161 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4788347 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 4788352 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 4788783 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4789623 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4789667 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4790234 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4790260 A T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 4790506 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 4790517 C A Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 4790524 C T Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 4790970 T A Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 3 4790987 A G Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 4790990 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 4791003 T G Y N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 3 4791608 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 4791901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4793615 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4793914 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4794085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4794582 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4794791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4795859 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4797265 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4798354 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4798525 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 4799811 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 4799894 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4800371 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 4800516 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4801427 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4801833 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4802091 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4802231 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4802375 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4803769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4804034 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4804509 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4804524 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4805578 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 4806727 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 4807162 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4809757 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4810129 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4810206 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.111111111111111 0.722222222222222 0.166666666666667 17 19 2 13 3 3 4811292 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4811593 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4812459 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4813406 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4813548 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4814259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4814859 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4814893 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4816211 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4816449 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4817173 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 4817274 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 4817499 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4817841 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4825167 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4825169 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4825667 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4826008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4826231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4828875 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4829155 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4829332 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4831539 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4832492 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4832862 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4833251 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4833520 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4833524 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 4834786 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4836169 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4838624 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4839085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4840322 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4841341 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4841416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4841670 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4842866 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4843069 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4843231 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4843486 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 4843546 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4843670 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4843872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4844567 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4844607 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4844901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4844979 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4844985 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4845659 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4846185 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4847025 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4848305 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4848560 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4849009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4849094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4849291 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4849297 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4849416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4849610 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4850022 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4850032 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4851174 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4851779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4851958 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4852641 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4852700 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4855253 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4856310 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 4857476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4857843 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4858111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4859154 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4859528 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4859721 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4860429 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 4861281 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4861490 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4861536 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4861542 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 4861559 T C Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 4861818 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4863015 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4863130 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4863921 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 4866640 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4867401 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4867402 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4870146 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4870640 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4871977 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4873933 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4875496 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4876873 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4877589 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4879568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4880728 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4880763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4881787 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4881950 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4882721 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4886051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4886440 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4887682 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4889353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4889504 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.1 0.7 0.2 18 22 2 14 4 3 4890096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4890186 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4892088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4892118 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4892245 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 4893736 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4895551 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 4896170 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4897346 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4898828 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4899187 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4903711 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4906679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4907852 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4908910 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4909893 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4912388 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4914809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4915379 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4916114 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4918038 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4918364 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4920224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4920391 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4921249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4922103 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4922993 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4923834 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4924333 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4925826 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4925870 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4926438 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 4926604 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 4926661 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4927057 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 4927691 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4929227 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4929248 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4931079 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 4931916 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4932100 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4933492 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4934897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4935335 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4935954 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4936557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4936763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4937653 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 4937674 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 4937734 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 4938406 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 4938413 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4938506 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4938610 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4938653 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 4938962 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4938987 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 4939061 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 4939173 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 4939182 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 4939203 T C N Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 6 8 1 4 2 3 4939300 G C N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.0666666666666667 0.666666666666667 0.266666666666667 12 18 1 10 4 3 4939315 T G N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.0714285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 11 17 1 9 4 3 4939341 A C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 4939443 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 4939476 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4939487 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4939843 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4939857 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4940116 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 4940271 G C N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 4940315 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4940318 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 4940330 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 4940489 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4940490 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4940667 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 4940753 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 4940875 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 4940893 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 4941212 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 4941323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4941530 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4941720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4941796 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4941818 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 4941947 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4941958 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4941978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4942625 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 4942646 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 4942673 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4942791 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 4943013 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4943349 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 4943369 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 4943374 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 4943451 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4943475 A C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 4943509 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.133333333333333 0.666666666666667 0.2 14 16 2 10 3 3 4943812 G T Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 4943840 G A Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 4943859 G A Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 4943881 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4943890 C A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4943921 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 4943985 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4943986 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4944032 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4944045 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4944091 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4944092 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4944228 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 4944253 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 4944323 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4944332 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4944344 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 4944364 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4944371 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 4944452 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 4944543 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 4944554 T A N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 3 4944610 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 4944617 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 4944716 T C N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 3 4944922 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 4944974 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4945007 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4945623 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4945642 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 4945666 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 4945748 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4945759 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4946101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4946142 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4946225 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 4946259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4946306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4946318 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 4946336 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 4946495 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 4946566 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 4946625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4946785 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4946836 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 4946849 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 4946932 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4946935 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4947130 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 4947132 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4947141 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 4947191 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 4947358 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 4947366 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 4947380 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4947405 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 4947637 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 4947717 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4947750 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 4947798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4947897 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4947943 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4947944 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4948101 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 3 4948261 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 4948372 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4948389 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4948568 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 4948618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4948657 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4948662 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4948684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4948740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4948754 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4948797 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4948809 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4948949 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 4949072 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4949100 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4949374 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 4949473 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4949558 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 4949560 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 4949603 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4949729 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4949768 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 4949785 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 4949859 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 4950208 C T N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 3 4950314 A C N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 3 4950584 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4950669 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4950671 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4950734 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 4950858 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4950890 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 4950895 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 4951085 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4951177 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 4951199 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4951248 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4951354 A C N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.214285714285714 0.642857142857143 0.142857142857143 15 13 3 9 2 3 4951413 G A N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 3 4951850 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4951920 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 4951969 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4952030 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 4952031 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 4952221 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 4952286 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 4952341 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4952389 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 4952470 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4952476 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 4952553 G T N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 3 4952583 T G N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 4952657 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 4952832 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 4953072 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 3 4953121 C A N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 3 4953266 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 4953344 G C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 4953371 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 3 4953457 T G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 4953559 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 3 4953968 A C N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 3 4954353 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4954479 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 4954660 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4954763 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4954798 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 4954870 G A N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.181818181818182 0.454545454545455 0.363636363636364 9 13 2 5 4 3 4954902 G A N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 3 4955148 A G N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 3 4955433 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 4955442 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 4955682 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 4955767 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4955779 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4955801 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 4955838 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 4955896 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 4955897 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 4956268 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4956462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4956648 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 4956655 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 4956659 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4956715 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 4956848 G C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 4956989 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4957116 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4957191 A T N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 3 4957603 C G N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 3 4957903 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 4958001 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 4958210 T G N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 3 4958440 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 4958445 G T N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.2 0.666666666666667 0.133333333333333 16 14 3 10 2 3 4958466 G A N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.2 0.666666666666667 0.133333333333333 16 14 3 10 2 3 4958515 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 4958584 T A N N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.25 0.583333333333333 0.166666666666667 13 11 3 7 2 3 4958595 C T N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 3 4958627 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 4958656 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4958688 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4958715 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4958855 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4958885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4958957 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 4958965 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 4958995 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 4959137 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 4959182 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 4959250 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4959253 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4959263 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4959367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4959383 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 4959485 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 4959635 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 4959705 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 4960103 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 4960738 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 4961301 A G N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 3 4961527 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 4961603 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 4961661 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 4961893 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4961929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4961936 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4962119 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 4962313 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4962319 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 4962407 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 4962559 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 4962633 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4962666 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4962807 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 4962843 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 4963051 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 4963213 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 4963308 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 4963398 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 4963617 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4963618 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4963687 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4963760 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4963770 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4963870 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4964010 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4964208 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4964320 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 4964428 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 4964629 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4964670 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4964878 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 4964978 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 4965005 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 4965249 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 4965434 G C N N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.454545454545455 0.363636363636364 0.181818181818182 14 8 5 4 2 3 4965833 C T Y Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 12 12 2 8 2 3 4965927 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4965998 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 4966127 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4966134 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4966227 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4966229 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 4966278 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4966370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4966425 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 4966439 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4966693 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4966698 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 4966740 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 4966922 G T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 4967111 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 4967321 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4967367 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4967689 A G N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 3 4968541 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 4968627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4968707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4968956 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4969270 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 4969389 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4969800 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4969919 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 4970038 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 4972748 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4974786 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4974968 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4975354 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4975664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4979252 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4979562 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4980096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4980563 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4983690 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4986080 C T Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 3 4986947 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4988779 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4989178 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4989676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4989774 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 4991611 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 4992222 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 4993105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4993233 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 4994388 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 4994689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4994709 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 4994717 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 4996273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 4996627 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 4997094 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 4999492 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5002102 T A Y N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 3 5005855 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5006253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5006582 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5008170 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 5009909 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5011192 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5012402 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5012623 G C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 5015394 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5015498 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5016143 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5017323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5017597 G A Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 5021065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5021122 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5025125 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5026587 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5027530 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5028916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5029715 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 5030316 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 5030336 C G Y N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 5031218 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5032882 C T Y Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 5033417 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5033840 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 5034895 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 5035284 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5035541 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5036796 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 5036971 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 5037779 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5039158 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 5039942 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 5039947 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5039986 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 5040062 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 5040485 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5041326 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 5041502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5041521 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5041763 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 5042653 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5042654 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5044212 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 5044221 C T Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 5044461 T A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5044968 T G Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 5045000 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5045496 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 5047038 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5047858 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 5056499 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5056826 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5060119 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5060471 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5060532 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5061675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5062474 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5063294 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5063299 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5063619 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5063690 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5065043 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5066044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5066116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5067304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5067525 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5068259 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5068633 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5069258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5077761 G T Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 5077954 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5079472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5079580 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5080292 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5081134 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5081332 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 5081335 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 5082363 A G Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 5083228 G C N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 5084478 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5085185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5085506 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5087790 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 5088616 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5089700 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5090503 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5091569 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5092341 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 5092374 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 5093108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5093316 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5093670 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5093680 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5094025 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5094064 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5094251 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 5094252 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 5094284 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5094340 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 5094483 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 5095345 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 5095639 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 5096098 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 5096449 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5096610 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 5096867 G A N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 5097761 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 5098587 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 5098714 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 5098733 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 5098783 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 5098788 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 5098900 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5099472 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 5099653 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 5100075 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5100123 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5100265 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5100552 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 5100621 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 5100821 A T N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 3 5101070 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5101095 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5101140 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5101244 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5101486 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5101517 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5101817 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5102059 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5102079 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5102178 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 5102215 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 5102229 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5102371 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 5102558 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5102892 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 5103022 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5103073 T A N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 5103579 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 5103642 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 5103977 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5104124 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 5104323 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5104841 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5104904 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5105209 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5105331 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5105722 C A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 5106033 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 5106123 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5106296 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 5106312 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 5106362 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5106390 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5106460 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5106496 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5106518 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5106520 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5106529 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5106641 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 5106738 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5106739 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5106762 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5106828 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5106972 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5107064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5107157 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5107308 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5107362 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5107372 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5107461 C A Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 5107492 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5107529 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5107560 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5107636 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5107778 G C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 5107907 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5108077 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5108260 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 5108290 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 5108452 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5108662 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5108676 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5109023 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 5109042 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 5109100 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5109176 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 5109292 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5109308 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 5109372 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 5109482 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5109559 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5109864 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 5109936 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5109950 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5109999 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 5110155 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 5110288 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 5110376 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 5110452 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5110518 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5110924 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5111294 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 5111358 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 5111384 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 5111477 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 5111495 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 5111530 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 5111826 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 5112111 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 5112128 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5112187 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 5112243 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 5112339 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 5112534 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5112560 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 5112565 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 5112580 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 5112657 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 5112726 T A Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 5112735 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5112794 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 5112890 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5113009 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 5113032 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 5113112 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 5113183 G T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 5113335 T C Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 5113378 A G Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 5113451 T G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 5113506 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 5113680 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 5113695 T G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 5113753 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5113962 A C Y N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 5114022 C G Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 5114037 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5114088 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 5114190 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 5114483 G A Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 3 5114620 C T Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 5114625 C A Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 5114632 C A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 5114761 C A Y N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 5114831 A T Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 5114875 A T Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 5114958 G T Y N 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 10 8 3 4 2 3 5115270 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.25 0.333333333333333 0.416666666666667 10 14 3 4 5 3 5115373 C A Y N 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.272727272727273 0.272727272727273 0.454545454545455 9 13 3 3 5 3 5115636 T C Y Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 3 5115819 T C Y Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 3 5115823 C T Y Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 3 5116065 C G Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 5116229 A G Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 5116275 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 5116375 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 5116401 T G Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 5116432 A G Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 5116610 A T Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 5116685 A T Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 5116689 C T Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 5116902 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 5117137 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 5117225 C A Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 5117471 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 5117508 T A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 5117729 T G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 5117879 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 5117925 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 5117990 T A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 5118008 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 5118082 C T Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 5118113 G A Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 5118191 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 5118321 C A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 5118335 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 5118337 A T Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 5118376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5118474 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 5118523 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 5118668 C A Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 5118688 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 5118719 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 5118775 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 5118857 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 5118865 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 5118978 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5119062 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 5119112 G T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 5119113 G C Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 5119268 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 5119320 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 5119420 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5119437 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 5119640 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 5120147 G C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 5120904 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5121375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5121921 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5122028 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5122386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5122595 T G Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5124068 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5124490 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 5124684 T G Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 5124689 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 5124945 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5126324 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 5126786 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5127581 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5127829 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5127900 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5128586 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5128816 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5128893 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5130912 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5132459 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 5132784 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5133515 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5134054 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5134066 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 5134163 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5134248 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5134343 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 5134450 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 5134534 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5134629 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 5134878 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 5135023 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 5135080 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 5135244 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 5135317 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5135336 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 5135441 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 5135522 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 5135699 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 5135709 C G N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 5135870 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5135975 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5136017 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5136360 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5136543 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 5136604 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5136712 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 5136750 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5136802 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 5136856 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 5136887 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 5136990 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5137015 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 5137312 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 5137408 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 5137619 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 5137662 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 5138081 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 5138325 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5138425 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 5138456 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 5138465 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5138669 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 5138725 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 5138757 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 5138758 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 5139000 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5139023 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5139085 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 5139240 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5139302 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5139357 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5139358 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5139401 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5139562 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5139571 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 5139691 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 5139947 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 5140036 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 5140087 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 5140097 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 5140150 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5140223 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5140226 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5140246 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 5140297 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 5140408 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 5140537 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 5140615 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 5140752 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 5141344 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5141371 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 5141415 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5141453 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 5141625 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 5141694 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 5141788 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 5141813 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5141985 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5142045 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 5142533 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5142844 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5144220 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5145711 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5146156 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5147011 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 5147154 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 5147498 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5147575 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 5147770 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 5147817 A C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 5147881 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5147984 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5148008 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 5148042 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 5148043 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 5148255 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5148408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5148422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5148433 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 5148614 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5148621 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 5148982 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 5151342 T A N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 5151630 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5151908 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 5152875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5153549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5153621 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5154192 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 5154600 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5155061 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5155080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5155111 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5155677 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5156040 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5156852 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5157033 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5157110 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5157341 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5158530 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5158879 C T Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 5158896 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 5160377 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 5160733 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 5160778 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 5160932 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5161805 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 5162780 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 5163308 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5163333 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5164320 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5164327 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 5164375 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5164897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5165175 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5165722 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5167704 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 5167854 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 5168576 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 5168946 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 5169364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5169633 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5169792 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 5169915 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 5169917 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 5170195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5170529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5173793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5174588 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5175041 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5175441 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 3 5175453 G A Y Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 3 5176400 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 5177015 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 5177186 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 5177853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5178327 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 5178631 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5179289 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 5179407 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5179573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5180431 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 5180585 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 5180727 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 5181263 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 5181510 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 5182038 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 5182050 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 5182381 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 5182439 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5182600 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5182863 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5183002 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5183037 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5183295 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 5183356 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5183523 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5183536 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5183549 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 5183619 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 5183813 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5183930 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5184443 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5184520 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5184654 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5184750 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 5184927 A C Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 5185030 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 5185050 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5185113 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5185168 A T Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 5185349 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 5185368 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 5185639 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5185790 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 5185991 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5186158 T A Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 5186159 T G Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 5186933 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5187035 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5187174 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5187337 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5187628 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 5187719 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5187754 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5187951 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5188095 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5188109 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 5188539 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5188915 G A Y Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 3 5189200 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 5189217 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5189288 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 5189392 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5189991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5190061 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5190156 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 5190582 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 5190920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5190933 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5190948 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 5191061 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 5191069 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 5191359 G A N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 3 5191462 A G N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 5191663 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5191953 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 5192074 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 5192092 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 5192123 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5192162 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5192644 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 5192709 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5192787 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 5192815 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5192950 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5192988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5193245 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 5193393 C T Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 5193498 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5193509 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5193778 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5193862 A C Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 5193917 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 5194147 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5194272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5194312 G T Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 5194546 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5194576 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 5194624 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 5194704 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 5194895 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 5195009 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 5195189 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 5195211 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5195307 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5195700 C T Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 5195713 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5196653 G A Y Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 3 5197385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5198008 A C N N 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 5198473 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 5198785 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 5198904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5199071 C G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 5199130 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5199148 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5199411 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5199770 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 5199890 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5200459 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5200527 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 5200717 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 5200870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5201193 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5201231 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5201468 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 5201484 A T N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 5201950 T C N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 5202136 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 3 5202766 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 5202777 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5202966 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5202995 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5204073 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 5204140 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 5204299 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 5204966 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5204988 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5205451 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 5205616 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 3 5205800 T A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 5205945 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5206113 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5206187 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5206240 G C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 5206396 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 5206420 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5206458 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5206525 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5206528 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 5206628 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5206672 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 5206776 A T N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 5206797 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 5206801 A T N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 5206888 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 5207047 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5207118 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5207282 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 5207396 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5207959 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 5208030 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5208048 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5208258 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5208349 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 5208487 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5208538 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5208591 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 5208634 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 5208744 C T N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 5208797 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 5209420 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5210275 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5210437 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5210540 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5210787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5211137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5212165 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 5212518 A T Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 5212742 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5213085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5213219 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5215461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5215483 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5215506 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5216756 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5218034 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 5221577 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5221760 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 5224382 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5224614 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5225110 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5226269 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 5226565 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5226860 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5227284 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5227520 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5228561 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 5229988 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5230205 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 5232944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5236158 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5236847 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5238391 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 5238831 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 5238860 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5239426 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 5239550 T C Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 5239613 T C Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 5239666 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5239694 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5239774 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5239847 A C Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 5239849 G T Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 5240021 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5240064 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 5240189 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 5240626 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5240691 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5241089 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5241394 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 5241395 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 5241549 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5242258 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 5242663 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5243347 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5244215 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 5244373 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5244392 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5244520 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5244582 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 5244612 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 5244638 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 5245330 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5245420 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5246058 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5246468 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 5246981 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5247095 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 5247201 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5247401 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5247564 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 5247691 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 5248189 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5248281 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5248527 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5248531 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5248669 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5249038 T C N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 5249046 G C N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 5249054 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 5249126 T C Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 5249271 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5249363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5249417 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5249432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5249565 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5249605 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 5249607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5249644 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5249690 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5249710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5249778 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5249810 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5249817 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 5249962 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5250284 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 5250292 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 5250298 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 5250505 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5250539 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5250676 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5250972 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 5251440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5253851 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 5254084 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5255343 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 5255513 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 5255634 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 5255931 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5256113 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5256603 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 5256632 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5256815 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 5256839 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5257080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5257094 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 5257152 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5257276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5257526 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 5257590 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 5257618 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 5257812 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5257992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5258011 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 5258039 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 5258149 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 5258199 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 5258383 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5258495 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 5258780 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5259049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5259068 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5259178 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5259244 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5260639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5262011 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 5262097 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 5262143 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 5262177 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 5262180 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 5262211 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 5262219 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 5262261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5262437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5262460 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5262596 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5262703 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 5263024 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 5263026 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5263158 T G Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 5263218 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5263635 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 5263815 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5264315 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 5264834 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 5264922 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 5265007 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5265347 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 5265353 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5265523 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5265562 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5266062 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 5266063 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 5266435 A G N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 3 5267060 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 5267110 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5267126 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 5267185 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 5267233 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 5267328 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5267334 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5267451 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5267485 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 5267545 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 5267968 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5268341 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 5269051 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5269282 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 5269340 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 5269602 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 5269680 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 5269696 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 5270097 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5270477 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 5270478 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 5270542 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 5270879 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 5270940 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 5271394 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 5271530 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 5271645 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5271806 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 5271850 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5271892 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 5272480 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 5273163 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 5273174 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 5274018 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5274062 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5274075 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 5274925 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5275321 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 5275689 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 5276235 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 5276294 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5276687 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 5276705 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 5276717 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 5277255 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5277475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5277539 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 5277942 C T Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 5278312 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5278429 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5278738 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5279058 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 5279092 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 5279111 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5279113 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 5279599 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 5279837 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 5279853 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 5280020 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 5280024 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 5280213 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 5280384 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 5280726 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5280764 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 5281541 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5281582 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5281666 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 5282267 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5283189 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5283424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5283459 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5284150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5284823 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5286412 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 5286552 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5286709 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5286853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5286879 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 5286896 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 5286999 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5288921 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5289855 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5290686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5290926 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5291825 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5292061 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 5293019 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5293421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5293835 G T Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 5294438 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5295251 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5295504 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5297745 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5297813 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5299577 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 5300083 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5300579 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5300756 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5301129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5301953 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5302394 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 5302608 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 5304305 A G N Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.6 0 0.4 6 4 3 0 2 3 5304897 G C Y N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 5307085 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 5307503 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 5309033 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5309112 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5309431 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5311462 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5311488 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 3 5311503 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5312408 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5312492 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 5314502 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5314844 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5315008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5315075 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5315284 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5316362 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5316766 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5317661 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5317884 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5317953 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5317996 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5318418 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5319319 C A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 5319351 C T Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 5320766 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5322101 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 5322381 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5323201 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 5323241 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5323500 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5324063 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5325559 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5326505 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 5329161 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 5329527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5331382 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5331933 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5332072 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5332323 A C Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 5332383 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5333124 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 5335342 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5335614 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 5335711 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5335874 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 5336272 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 5336302 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 5338093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5338213 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5339007 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 5339403 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5339722 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5341157 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 5342238 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5343808 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5344410 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5344600 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 5344654 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5344668 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 5344870 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5344994 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 5345038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5345792 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5346213 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5346449 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5346933 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5347584 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5349404 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5349765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5350942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5351749 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5351937 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5353074 G T Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 5354387 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 5354388 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 5354815 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5354901 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5355468 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5355729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5355862 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5360431 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5361926 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 5361928 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 5364893 A T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 5365081 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 5365188 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5365301 G A Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 5365678 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5365848 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5366076 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5366409 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5367896 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5368054 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 5368443 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 5369035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5369134 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5369249 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5369656 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5370315 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 5370437 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 5370727 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5372045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5373082 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5373257 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5373334 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 5373466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5373940 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5374173 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5375498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5375645 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 5375971 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5377510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5379471 A T N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 5383976 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5385504 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5390866 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 5390963 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 3 5393618 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 5396049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5397719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5398704 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5399301 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5399601 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5401793 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5402655 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5403858 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5403951 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 5404806 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5404943 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 5404963 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5404979 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5405003 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 5405140 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5405304 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5405490 A G N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 5405510 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 5405651 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5405817 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5405878 G T Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 5405938 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 5405983 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 5406069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5406202 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5406228 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5406380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5406458 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5406471 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5406548 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5406932 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 5407035 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5407042 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5407049 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5407106 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5407170 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 5407237 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5407314 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5407560 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5407633 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5407693 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5407859 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 5407894 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 5407997 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 5408126 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 5408154 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 5408303 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5408329 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 5408357 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 5408424 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5408608 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5409158 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5409469 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 5409879 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5409916 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5410068 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5410807 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5410899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5411183 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5411224 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5414576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5415950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5416632 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 5416874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5417195 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5417271 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5417442 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 5417505 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 5418073 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 5418345 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 5418512 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5418580 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5418898 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5419378 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5419640 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5419866 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5422690 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 5422873 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5423031 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5423178 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5423207 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 5423250 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5423350 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5423427 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 5423507 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5423589 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 5423697 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5423738 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 5423805 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5423823 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 5423834 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 5423925 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 5423972 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 5424021 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 5424042 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 5424518 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 5424524 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 5425408 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 5425762 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 5426031 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 5426158 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 5426646 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 5426743 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 5426787 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5426995 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 5427136 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5427251 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 5427426 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 5427427 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5427506 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 5427539 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5427551 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 5427942 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5428354 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 5428460 T A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 5428749 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 5428792 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 5428798 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 5428813 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 5428850 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 5428984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5429573 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5429760 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 5429826 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 5429992 A T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 5430052 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 5430280 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5430529 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5431229 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5431241 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5431441 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 5434111 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 5434439 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5434470 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5434576 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5434659 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5442735 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 5443938 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 5444343 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 5444367 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 5444438 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5444662 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5444746 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 5444921 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 5445282 T G N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 3 5445308 C T Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 5445623 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 5445736 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 5446096 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 5446107 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 5446178 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 5446197 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 5447072 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 5448784 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 5449280 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 5449331 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 5449369 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 5449520 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 5450185 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5450234 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5450267 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5450968 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 5451156 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5451220 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5451591 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5451729 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5451743 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 5451959 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 5452112 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5452142 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5452168 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5452764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5453199 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 5453212 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 5453315 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5453327 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 3 5453328 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 3 5453388 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5453398 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 5453955 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5454121 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.0526315789473684 0.789473684210526 0.157894736842105 17 21 1 15 3 3 5454952 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5455753 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5455795 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 5455803 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 3 5456270 T A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5456548 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5456628 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 5456662 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5456938 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 5456965 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5456998 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 5457026 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 5457074 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 5457125 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 5457381 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5457453 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 5457590 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 5457682 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 5457730 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 5457865 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 5457958 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 5458002 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 5458098 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5458168 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5458189 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5458230 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 5458439 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 5458562 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5458608 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5458965 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5459125 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 5459268 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 5459397 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 5459521 C A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 5459678 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5459796 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 5459923 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 5460106 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 5460168 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 5460207 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5460289 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5460444 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5460896 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5461173 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 5461258 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5461510 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5461655 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 5461750 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5461811 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5462833 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5463085 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 5463320 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 5463321 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 5463367 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 5463403 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5463404 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5463743 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5463979 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 5465050 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 5465191 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 5465253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5465338 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 5465447 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 5465455 T C Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 5465570 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 5465761 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 5466348 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 5466390 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5466579 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5466864 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5466894 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5467031 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5467432 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 5467601 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 5467650 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 5467655 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 5467723 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 5468517 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5468518 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5468845 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 5469083 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 5469110 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 5469172 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5469188 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5469253 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 5469269 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 5469882 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5469960 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 5471865 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5472076 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5472309 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5472410 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5472607 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5472620 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5472685 G A N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.357142857142857 0.214285714285714 0.428571428571429 13 15 5 3 6 3 5473194 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 5473591 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5475700 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5475848 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5475849 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5475922 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5475985 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 5476569 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 5477268 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 5478385 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5478459 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5478646 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 5479014 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 5479905 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 5480191 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5480423 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5480436 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5480437 T G Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 5480695 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 5481366 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5482630 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5482711 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5482843 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5482852 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5482878 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5483694 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5483861 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5483898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5483918 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 5483948 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 5484212 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5484461 T A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 5484564 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 5484746 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5484762 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5484778 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5484782 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5484798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5484803 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5484834 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5484992 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5485001 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5485005 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5485035 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5485047 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5485074 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5485291 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5485411 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 5485515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5485790 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5485813 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5485916 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5486015 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5486072 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5486148 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5486150 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5486359 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 5486690 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5486758 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5486800 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5486886 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5487013 A C Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 5487061 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5487209 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5487225 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5487239 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 5487319 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 5487411 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 5487595 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5487678 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 5487805 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 5487824 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5487966 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5488072 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5488397 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5488471 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5488703 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 5488777 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5488888 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 5488976 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 5488992 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 5489006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5489083 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 5489318 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 5489738 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5490070 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 5490115 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5490125 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5490172 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 5490212 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5490328 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 5490359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5490519 G A Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 3 5491116 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5491143 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 5491171 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 5491204 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 5491348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5491372 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 5491845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5491986 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5492246 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 5492326 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 5492397 A G Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 5492399 C A Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5492681 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5492800 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 5493051 A C Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 5493063 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5493074 C A Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 5493129 T G Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 5493237 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 5493412 G T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 5493532 C G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 5493560 A G Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 5493909 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5493954 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 5494066 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5494284 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 5494335 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5494367 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5494423 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 5494472 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 5494519 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 5494556 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 5494900 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5494987 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 5495039 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5495109 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5495110 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5495201 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 5495527 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 5495804 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 5495975 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5496166 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5496188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5496365 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 5496455 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5496496 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 5496503 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 5496520 G T Y N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 5496650 T A Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 5496688 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 5497042 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 5497183 A C Y N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 10 22 4 2 10 3 5497382 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 5497386 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 5497456 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 5497515 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5497554 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 5497573 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5497768 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 5497790 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5498005 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 5498044 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 5498127 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5498128 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5498406 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 5498533 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5498574 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 5498592 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 5498729 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5499060 T A N N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 3 5500253 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 5500263 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 5500327 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5500399 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 5500425 C G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 5500497 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 5500542 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 5500631 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5500661 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5500721 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5500811 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 5500818 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5500914 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 5500915 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 5500956 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 5501045 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 5501226 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5501242 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5501376 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5501382 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5501395 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5501466 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5501521 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5501702 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 5501703 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 5501727 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 5501751 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5501781 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5501875 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 5502004 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 5502020 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5502075 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5502174 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 5502247 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 5502399 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5502441 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5502442 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 5502589 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5502595 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5502605 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5502652 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5502677 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 5502732 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5502752 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 5502874 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5502920 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 5502935 G T N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 5502973 A C N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 3 5503040 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 5503088 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5503106 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5503125 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 5503687 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5503741 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5503828 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5504033 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5504060 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 5504215 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 5504277 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 5504330 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 5504345 C G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 5504496 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 5504579 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 5504899 G C N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 5504938 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 5504959 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 5504988 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 3 5504996 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 5505006 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 5505015 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 5505040 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 5505069 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 5505093 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 5505104 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 5505143 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 5505157 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 5505375 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 5505404 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 5505424 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 5505430 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 5505449 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 5505455 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 5505743 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 5505845 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 5505866 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 5505892 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 5505896 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 5506046 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 5506077 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 5506114 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5506270 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 5506281 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 5506330 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 5506370 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 5506437 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 5506466 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 5506467 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 5506487 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 5506538 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 5506551 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 5506574 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 5506613 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5506652 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 5506705 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5506752 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 5506837 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 5506838 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 5507020 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 5507045 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 5507058 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 5507076 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 5507152 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 5507397 G C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 5507486 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 5507497 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 5507571 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 5507574 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 5507753 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 5507818 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 5507846 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 5507848 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 5507858 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5507943 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 5507993 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 5507999 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 5508048 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 5508192 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 5508263 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 5508282 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 5508292 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 5508315 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 5508690 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 5508697 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 5508720 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 5508726 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 5508748 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 5508765 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 5508799 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 5508831 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 5508851 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 5508868 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 5508906 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 5508914 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 5508932 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 5509148 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 5509270 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 5509551 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5509598 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 5509701 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5509739 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 5509767 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 5509820 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 5509828 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5509834 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 5509849 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5510025 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5510076 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 5510103 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 5510170 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 5510393 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 5510510 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 5510548 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 5510829 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5510830 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 5510923 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5511026 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 5511272 T G N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 5511552 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 5511579 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5511696 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5511786 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 5512025 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 5512294 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5512468 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 5512471 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 5512851 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5512963 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 5513316 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 5513343 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 5513425 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 5513704 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 5513955 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 5513995 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 5514176 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5514323 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5514412 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5514696 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5514857 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5515073 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5515262 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5515531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5515661 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5516049 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 5516080 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5516501 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5516824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5516876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5516933 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 5517359 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5517407 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 5517421 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 5517471 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 5517633 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5524958 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 5525074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5525139 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 5525144 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 5525202 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 5525349 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 5525352 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 5525369 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 5525394 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5525423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5525441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5525546 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5525598 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 5525771 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5525787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5526158 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 5526284 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5526322 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5526438 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5526450 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5526517 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5526550 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5526741 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5526813 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5526930 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5527023 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5527032 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5527096 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5527337 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5527461 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5527523 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5527573 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5527580 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 5527821 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 5527970 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 5528073 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5528102 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 5528187 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5528204 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5528478 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5528520 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5528681 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5528698 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 5528771 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5528892 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 5528904 C T Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 3 5529348 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5529356 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 5529483 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5529504 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5529610 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5529676 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 5529693 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 5529794 G A N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.384615384615385 0.307692307692308 0.307692307692308 14 12 5 4 4 3 5529829 T G Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 5529833 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 5529850 T G Y N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 5529858 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 5529877 C T Y Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.307692307692308 0.538461538461538 0.153846153846154 15 11 4 7 2 3 5529882 C A N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 5529941 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 5530171 G T Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 5530219 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5530252 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5530307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5530459 A T Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 5530500 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 5530674 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5530742 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5530777 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5530809 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5530958 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5531114 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5531366 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 5531552 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5531681 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 5531688 G C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5531852 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 5531864 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5531983 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5532058 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 5532119 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5532155 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5532266 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5532310 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5532465 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 5532616 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5532737 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5532939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5533027 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 5533049 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 5533151 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 5533477 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 5533556 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 5534139 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 5534198 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5534201 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5534349 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5534582 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5534711 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 5534790 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5535062 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 5535824 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5536336 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5538221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5538772 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5538825 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 5538862 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 5539008 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5539017 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 5541623 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5541708 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5543253 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5543292 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5543462 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5544052 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5544096 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5544430 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5544520 G C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5545263 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5545294 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 5545541 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5545911 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5546136 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5546189 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5546774 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 5547205 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5547475 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5547478 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 5547490 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5548505 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5548788 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5549255 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 5549833 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 5550004 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5550091 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 5550098 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 5551718 C T Y Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 3 5552827 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 5553099 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 5553465 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5554052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5554433 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5554475 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5555856 A C N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 3 5557323 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5557646 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5557874 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 5558079 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 5558179 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5559671 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5565102 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5565548 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 5565683 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5565694 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5565755 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 5565819 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 5565856 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 5566014 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5566056 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 5566138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5566370 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5566477 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 5566642 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 5566679 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5566733 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5566855 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 5566907 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5567258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5567307 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5567526 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5567915 G C N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 5570695 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 5572364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5572503 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5574295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5575793 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 5576145 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5576220 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5576818 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 5576869 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5577038 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5577138 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5577142 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 5577166 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 5577172 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 5577197 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 5577235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5577395 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 5577544 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5577602 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5577605 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5577620 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5577711 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5577725 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5577740 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5577766 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5577835 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 5578045 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 5578053 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 5578080 G A N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 3 5578194 C T N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 3 5578229 T A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 5578238 A C N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 5578317 G A N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.363636363636364 0.454545454545455 0.181818181818182 13 9 4 5 2 3 5578337 C T N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 3 5578781 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5578797 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 5578821 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 5578998 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 5579004 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 5579009 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 5579045 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5579050 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5579061 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5579157 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 5579184 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5579408 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5579537 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 5579589 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5579643 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5579704 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 5579730 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 5579777 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 5579795 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 5579818 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5579824 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 5579886 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 5579934 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 5579958 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 5579971 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5580047 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5580116 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 5580229 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5580292 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 5580295 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5580309 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 5580779 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5580865 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5580931 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5580939 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5580977 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5580980 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5581027 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5581107 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5581108 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5581384 T G N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.0769230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 9 17 1 7 5 3 5587076 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 5587133 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 5587148 T C N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.285714285714286 0.642857142857143 0.0714285714285714 17 11 4 9 1 3 5587178 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 3 5587202 G C N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 3 5587575 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5587647 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5587699 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5588016 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5588162 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 5588636 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5588701 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5588740 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 5588784 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 5588952 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 5589020 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 5589376 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5589472 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 5589726 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5589775 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5589801 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5589827 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5589828 G C Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5589868 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5589919 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5590234 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 5590532 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5590598 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 5590682 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5590750 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5590823 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5590850 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5590862 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5590896 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5590897 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 5590911 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 5590918 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 5590933 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 5590935 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 5590979 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 5591022 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5591040 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 5591053 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 5591090 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 5591153 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5591190 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5591207 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 5591348 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5591367 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5591425 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5592584 G T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 5592632 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 5592732 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5592745 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 5592756 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5592759 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5592885 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5592950 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 5593015 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5593061 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5593072 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5593183 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5593259 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 5593286 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5593329 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5593380 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 5593414 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 5593486 C T N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 9 11 2 5 3 3 5593733 A T N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 3 5593777 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 5593931 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5594016 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5594087 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5594139 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 5594301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5594336 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5594370 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5594396 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5594401 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 5594467 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5594495 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 5594651 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 5594813 G C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 5594817 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 5594848 A T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 5594872 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 5594908 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 5595015 A T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 5595074 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 5595133 C T N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 5595240 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 5595375 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 5595402 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 5595489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5595512 G T Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 5595569 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 5595641 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 5595835 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 5595853 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5596080 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5596759 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 5597290 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5597298 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5598238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5599988 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5602821 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 5602988 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 5605140 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 5607046 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5607385 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5607435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5607617 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5608483 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5609218 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5609531 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 5609541 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 5609764 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5609777 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5609924 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5610001 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 5610015 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 5610157 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 5610695 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5610698 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5610708 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 5610939 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 5611007 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5611042 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 5611055 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 5611133 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5611214 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 5611236 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 5611542 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 5611868 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 5612551 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 5612600 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5612615 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5612655 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 5612804 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5612865 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5612953 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 5613011 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5613058 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 5613331 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5613435 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 5614313 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5614569 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5614588 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 5614629 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 5614743 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5614860 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5614867 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5614885 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5615037 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 5615217 G C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5615657 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 5616003 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5616160 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 5616216 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5616371 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 5616569 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 5616577 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 5616673 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 5616868 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5616877 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 5616880 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5616897 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 5616953 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 5617008 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 5617058 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 5617085 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5617172 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 5617232 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 5617422 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5617466 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 5617549 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 5617560 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 5617647 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5617809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5617858 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 5617938 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 5617988 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 5618009 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 5618026 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 5618043 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 5618057 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 5618070 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 5618120 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 5618329 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5618511 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5618697 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5618819 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 5618820 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5619080 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 5619165 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 5619339 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5619363 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5619396 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5619421 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5619426 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5619470 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 5620172 A G Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 3 5620199 A G Y Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 3 5620443 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5620611 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5620636 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5620656 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5620700 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5620719 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5620757 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5620868 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5620901 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5620930 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5621042 T G Y N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 12 12 3 6 3 3 5621125 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 5621162 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 5621172 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 5621207 A C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 5621422 G C Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 5621457 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5621485 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5621498 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5621509 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5621545 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5621671 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 5621712 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5621866 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5621886 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5621904 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5621921 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5621969 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5622025 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5622110 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5622142 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5622234 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5622239 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5622257 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 5622259 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5622427 T A N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 5622457 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 12 6 5 2 2 3 5622465 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 5622516 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 5623072 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5623295 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5623314 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 5623350 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 5623500 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 5623509 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 5623574 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 5623614 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 5623619 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 5623743 G C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 5623747 C A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 5623925 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 5624098 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5624286 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 5624315 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 5624321 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5624366 T A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 5624465 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 5624847 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5624887 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5624994 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 5625092 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5625193 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5625339 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 5625374 T G Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 5625400 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 5625407 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5625477 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 5625517 C A N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 5625602 T A N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 3 5625612 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 5625626 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 5625654 T A N N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 3 5626500 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 3 5626562 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 3 5626634 G A Y Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 5626645 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 5626718 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5626875 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 5626879 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5626906 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 5626934 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 5626974 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 5627211 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 5627238 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5627914 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5627991 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 5627994 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 5628079 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5628095 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5628164 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 5628183 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5628266 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5628333 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5628393 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5628472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5628865 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 5629140 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5629202 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5629583 T A N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 5629799 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5629809 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5630157 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 5630214 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 5630248 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5630304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5630312 G T Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 5630774 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 5630802 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 5630865 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5630895 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5630909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5630910 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5630943 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 5630969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5630996 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5631074 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5631090 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5631200 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 5631287 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 5631385 G T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 5631432 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5631445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5631596 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5631612 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5631840 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 5631924 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5632083 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5632111 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 5632163 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5632181 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 5632209 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5632338 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5632561 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5632576 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 5632699 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5632747 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5632782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5632812 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5632935 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5632951 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5632989 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5633029 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5633058 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5633090 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 5633346 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5633977 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5634114 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 5634132 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 5634228 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 5634405 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5634419 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5634499 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5634599 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5634748 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5634891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5634913 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5634974 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 5635038 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5635104 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5635141 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5635147 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5635169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5635239 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5635298 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5635307 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5635475 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5635522 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5635530 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 5635617 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5635684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5635705 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5635786 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5635809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5635992 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5636054 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 5636148 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5636154 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 5636168 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5636206 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5636281 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5636328 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5636354 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5636379 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5636387 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5636416 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5636428 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5636473 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5636493 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 5636568 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 5636580 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5636617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5636671 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 5636842 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5636848 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 5636907 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 5636909 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 5637000 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5637123 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 5637164 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5637231 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 5637312 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5637359 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5637459 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 5637470 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 5637557 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 5637628 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 5637630 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 5637648 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5637651 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5637722 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5637763 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 5637765 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5637782 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 5637920 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 5638064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5638402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5638450 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 5638490 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5638524 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5638597 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5638707 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5638725 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5638803 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 5638946 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5638987 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 5639040 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5639076 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 5639092 T A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 5639178 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 5639350 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 5639420 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 5639447 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5639510 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5639689 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5639711 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 5639802 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5640033 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 5640166 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5640208 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 5640288 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 5640342 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5640519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5640567 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5640648 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 5640718 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5640899 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5642308 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 5642324 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 5642405 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5642434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5642471 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5642601 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5642684 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 5642731 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 5642747 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 5642883 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 5642932 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 5643249 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5643678 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 5644475 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5644541 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 5644661 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 5645033 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5645068 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 5645069 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 5645217 T A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 5645236 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 5645395 G T N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 5645513 G C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 5645536 A C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 5645726 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 5645798 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 5645842 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 5645903 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5645929 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 5645944 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 5646035 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 12 16 2 8 4 3 5646167 T G Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 5646198 A T N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 3 5646207 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 5646217 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 5646610 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 5646648 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 5647798 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 5655008 C G Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 5655377 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5655443 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 5655454 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 5655676 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5655850 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5655922 C T Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 5655972 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 5656212 A C Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 5656354 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 5656392 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 5656406 G T Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 5656518 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5656787 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 5656788 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 5656835 G C Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 5656862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5656902 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 5656923 A T Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 5656938 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5657035 C A Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 5657052 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 5657058 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 5657082 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 5657098 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5657107 G C Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 5657111 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 5657254 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5657323 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 5657341 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 5657395 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 5657398 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 5657423 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5657494 T C Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 5657536 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5657589 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5657602 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5657609 T A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5657683 T G Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 5657685 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 5657724 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5657732 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 5657838 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 5657842 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 5657850 A G Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 5657942 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 5658000 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 5658005 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 5658026 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 5658343 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 3 5658546 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 5658586 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5658669 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5658871 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.133333333333333 26 4 13 0 2 3 5658878 G A Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.133333333333333 26 4 13 0 2 3 5659036 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 3 5659143 C T Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 24 4 12 0 2 3 5659296 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 5659629 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 5659837 A T Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 5660130 G T Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 5660681 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 8 4 4 0 2 3 5660826 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 5660934 C G Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 5660981 T G Y N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.8 0 0.2 16 4 8 0 2 3 5661014 G A Y Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.8 0 0.2 16 4 8 0 2 3 5661431 G A Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 5662793 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 3 5663011 T G Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 5663030 A G Y Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 3 5663490 G C Y N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 3 5663515 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 5663529 G A Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 5663544 T C Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 5663607 A T Y N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 5663795 C T Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 3 5663911 C T Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 5664212 G A Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 3 5664288 G A Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 3 5664317 T G Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 5664520 C T Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 5664704 T G Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 5664953 C T Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 5664969 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 5665016 C T Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 3 5665111 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 5665151 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 3 5665158 G T Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 5665318 C T Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 5665533 C A Y N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 5666468 C T Y Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 3 5666482 A C Y N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 3 5666730 G A N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 5666805 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 3 5666840 G A N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 3 5666885 C A Y N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 3 5666957 G A Y Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 3 5667158 T G Y N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 5667190 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 3 5667323 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 3 5667638 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 5667911 C T Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 3 5668312 T G Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 5668491 T G Y N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 3 5668646 A T Y N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 3 5668850 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 3 5668952 G C Y N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 3 5670491 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 5670791 C T Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 5670887 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 5671041 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5671097 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5671098 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5671124 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5671458 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 5671685 C T N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 3 5671733 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 5672081 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 5672265 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 5672299 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 5672448 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 5672511 G T Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 5672584 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 5672684 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 5673130 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 5673326 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 5673806 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 5673846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5673973 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5674042 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 5674108 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5674162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5674185 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 5674309 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5674316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5674413 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 5674677 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 5674713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5674766 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 5674978 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5675126 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5675138 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5675168 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5675274 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5675725 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5676078 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 5676463 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5676942 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5677130 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5677492 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5677625 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5678390 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5678418 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 5678499 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5679278 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5679403 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5679948 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0 0.9375 0.0625 15 17 0 15 1 3 5680595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5680611 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5680651 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5680761 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5681085 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5681572 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5681995 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5682179 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5682507 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 5682678 C T Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 5682763 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5683357 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5683570 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5683931 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5683956 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 5684225 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5684246 C G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5684288 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5684324 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5684527 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5685780 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 5685936 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 5686319 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5686477 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5687067 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5687092 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 5687264 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5688004 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 5688069 T C Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 5688648 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 5689176 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5689423 C T Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 3 5689840 G A Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 5689902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5690033 A T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 5690202 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5691083 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5691189 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5691341 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5691419 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5691441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5691651 C A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 5691731 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5691855 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 5692809 G A Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 3 5693004 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 5693041 G C Y N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 7 13 3 1 6 3 5693094 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 3 5693513 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 3 5693530 C T Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 3 5693574 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 5693855 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 5694136 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 5694297 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 5694537 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 5695023 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 5695084 A T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 5695217 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5695604 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5695707 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 5695723 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 5695746 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5696289 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5696410 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5696794 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5696944 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 5696966 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5696987 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5697695 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5698256 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5698523 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5698524 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 5698559 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5699134 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 3 5699238 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 5700374 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 5700605 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 5701387 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 5701404 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 5701490 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5701669 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 5701690 G C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 5701969 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5702533 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5702831 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 5703373 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5703586 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5703688 A T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 5704467 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5704869 C G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 5707846 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 5708479 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5708484 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5708598 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5712102 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 5713663 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 5715026 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 5715574 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 5716021 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 5716036 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 5718514 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5719548 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 5720233 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 5723215 T C Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 3 5724663 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 5727103 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 5727523 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 5727677 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5739532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5742463 G A Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 5744369 G C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 5744868 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 5745676 A T Y N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 5745835 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 5746049 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 5746315 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5746324 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5746746 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5747161 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5747288 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5747596 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5748080 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 5748521 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5748828 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 5749775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5749963 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5752962 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5753179 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 5755873 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5756738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5758504 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5758672 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 5761440 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 5764440 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 5764576 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5764644 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5764678 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5764928 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5765832 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5766845 T A N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 5768874 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 5770347 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 5771995 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5772090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5772134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5772795 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5773153 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5773735 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5774303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5774483 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 5774590 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5775006 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 5775305 A C N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 5775314 G T N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 5775606 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5775713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5775792 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5777451 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 5777490 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5777972 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 5778101 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 5779579 G T N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 5780794 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 5782366 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5782899 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 5783455 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 5784161 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 5785455 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 5785470 A T N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 5787012 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 5787192 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 5787957 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 5788505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5788794 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 5789153 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 5789432 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 5789583 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 5791799 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 5792837 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5792930 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5793109 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5793745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5794150 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5794307 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5794321 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5794542 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5794634 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5794865 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5795193 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 5796419 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 5796489 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 5796694 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5796978 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 5798479 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5808175 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5809145 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5809188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5809988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5811322 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5814047 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5815602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5816942 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5817147 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 5817348 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5818469 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 5818607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5819796 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 5819845 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 5819902 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5821497 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5822864 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5823557 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5823861 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5825951 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5827582 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5828197 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5828801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5829053 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 5829139 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5829426 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 5829754 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5829882 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 5829933 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 5830681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5831930 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5832737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5833301 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 5834559 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5835401 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5835559 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5836689 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 5837061 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 5840006 T C Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 5840094 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5840130 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 5840639 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 5840640 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 5840816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5840866 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 5841015 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 5841056 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 5841080 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5841138 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5841163 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5841226 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 5841266 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 5841471 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 5841650 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5842009 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 5842148 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5842318 A T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 5842532 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 5842605 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5842718 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5842719 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5842792 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5842818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5842969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5843037 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5843076 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 5843095 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 5843168 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5843169 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5843261 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5843306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5843646 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 5843679 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 5843884 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 5844091 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5844154 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 5844202 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5844247 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5844356 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5844443 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5844494 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5844517 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5844528 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5844541 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 5845210 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5845244 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5845257 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 5845403 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5845451 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5845551 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5845591 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 5845641 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5845648 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 5845791 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5845843 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 5845893 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 5845911 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5845972 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5846153 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 5846351 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5846513 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5846629 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5846678 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 5846745 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5846747 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5846768 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5846900 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5846937 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 5846989 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5846993 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 5847037 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 5847095 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5847314 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5847392 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 5847652 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 5847718 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 5847747 G C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 5847772 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 5847819 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 5847907 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5848021 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5848033 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 5848148 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5848187 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 5848247 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5848330 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5848331 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5848360 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 5848415 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 5848429 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 5848491 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 5848884 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 5848914 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5848967 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5849270 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5849316 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5849496 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5849557 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5850046 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 5850108 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5850116 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5850286 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 5850501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5850521 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5850529 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5850640 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5850675 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5850681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5850708 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5850712 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5850741 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 5851156 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5851211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5851462 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 5851840 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5851893 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5852082 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5852114 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5852250 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 5852267 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 5852710 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 5853036 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5853260 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5853334 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5853458 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 5853552 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 5853746 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5854338 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5854399 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 5854428 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 5854723 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5854834 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5854899 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5855095 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 5855269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5855408 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 5855615 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 5855840 G A Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 5855890 A T Y N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 5856068 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5856133 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5856541 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5856572 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 5856989 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 5857351 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5857635 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 5857647 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 5857676 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5858258 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 5858368 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 5858532 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 5858607 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5858609 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5858769 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5859022 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 5859033 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 5859080 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5859143 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5859200 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 5859208 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5859221 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 5859229 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 5859232 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 5859243 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 5859280 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5859285 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5859362 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5859470 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5859494 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 5859532 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 5859558 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 5859596 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5859607 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5859625 T C N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0 0.615384615384615 0.384615384615385 8 18 0 8 5 3 5859665 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 5859697 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 5864012 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 5865670 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 5865847 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 5866154 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 5866454 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 5866602 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 5866665 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 5866759 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 5866789 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 5866831 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5866989 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5867198 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5867218 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5867359 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 5867409 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 5867435 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 5867506 A G N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 5867555 T A N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 5867611 G T N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 5867625 A T N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 5867646 A C N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 5867707 A G N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 5867766 A C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 5867905 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 5868027 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5868151 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5868154 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5868367 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5868398 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5868654 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 5868689 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 5868944 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 5869128 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5869161 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5869559 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5869915 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 5870155 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 5870211 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 5870227 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5870691 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 5870815 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 5870847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5870890 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5871063 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 5871270 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 5871680 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5871752 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 5871836 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 5872129 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5872322 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 5872398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5872418 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 5872421 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5872501 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5872982 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5873105 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 5873215 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5873378 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 5873394 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5873518 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 5873524 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 5873824 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5873926 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 5873938 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 5874274 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 5874275 G C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 5874332 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 5874667 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 5874669 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 5874976 A G N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 5875218 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 5875244 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 5875247 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 5875717 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 5875751 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5875758 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5876304 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 5876915 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 5877110 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 5877596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5877597 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5877905 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5878157 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5878435 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5878542 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 5878917 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 5879191 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 5879218 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 5879241 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 5879570 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5879780 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5879964 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 5880228 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 5880285 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5880689 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 5886516 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5886585 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 5886651 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 5886752 A C N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 5886798 G T Y N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 5887168 A T N N 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 3 5887290 A T Y N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 5887655 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 5887874 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 5888023 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5888069 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 5888088 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5888654 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 5888670 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 5888967 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 5889081 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 5889144 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 5889172 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 5889282 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5889416 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 5889940 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 5889965 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5890123 T A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 5890591 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 5890668 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5890914 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 5890934 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5891265 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5891376 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 5891469 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 5891502 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 5892357 C A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 5892387 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5892671 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 5892714 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 5892911 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5893021 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 5893332 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 5893475 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 5893537 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 5893557 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 5893572 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 5893588 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5893661 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 5894150 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5894158 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 5894228 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 5894266 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 5894445 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 5895124 A C N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 5895904 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 5895942 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5896062 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5896121 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 5896124 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 5896206 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 5896260 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 5896294 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 5896424 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5896427 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5896470 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 5896498 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 5896502 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 5896724 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5896846 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 5896858 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 5896906 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 5897098 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 5897498 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5898314 C G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 5898423 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5898668 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 5900466 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 5900956 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5901025 C T Y Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 3 5901101 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 5901426 A C Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5901697 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 5901741 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 5901790 G T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 5901831 G A Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 5901942 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 5902115 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 5902192 A C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 5903248 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 14 10 2 10 0 3 5903297 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5903356 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 5903539 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 5903553 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 5903700 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 5903894 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 5904167 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 5904179 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 5904283 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 5904343 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 5904613 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5904743 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 5904784 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5904835 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5904862 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 5904891 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 5904962 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 5905044 A T N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 5907091 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5907296 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 5907472 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 5907548 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 5907695 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 5907988 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5908049 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5908537 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 5908915 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 5909311 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 5909468 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 5909491 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 5909504 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5909547 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 5909566 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 5909598 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 5909650 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 5909845 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 5910194 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 5910211 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 5910229 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 5910231 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 5910264 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 5910283 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 5910360 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 5910363 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 5910564 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5911072 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5911933 T A N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 5913328 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 5914416 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 5914502 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 5915637 G C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 5915806 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 5918600 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5919422 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5919547 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5919611 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 5919812 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 5920123 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5921426 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5921698 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 5921871 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5921900 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5921909 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5922085 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5923055 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5923359 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 5923660 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 5923782 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 5923786 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 5924066 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 5924090 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 5924274 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 5926306 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 5926707 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5926780 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5927407 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5927848 A G Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 5927939 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 5929138 T C Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 5929141 T C Y Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 5929318 A T Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 5929635 T G Y N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 5930073 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5931483 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 5931771 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5932007 C G Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 5932313 T C Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 5932794 T G Y N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 5933109 G C Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5933339 T C Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 5933643 A G Y Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 5934957 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5935059 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5935102 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5935207 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 5935627 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5936373 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 5938124 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5938161 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5938191 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5938495 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 5938828 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5939420 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 5939518 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 5939587 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 5939707 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5939787 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 5940068 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 5940623 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 5940642 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5942000 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 5942394 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5942878 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 5943542 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 5943687 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 5950514 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 5950806 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 5950986 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5951761 A T N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 3 5951834 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 5952227 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5952304 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 5952338 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5952601 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5952677 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5952783 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5952874 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5952924 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5953071 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 5953171 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5953218 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 5953290 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5954195 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 5954293 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5954325 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5954379 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 5954414 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 5954435 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5954479 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5954493 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5954497 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5954517 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 5954559 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 5954571 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5954617 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5954645 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5954709 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5954724 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5954799 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5954813 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5954822 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 5954833 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5954876 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5954894 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5954910 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5955300 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5955365 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5955402 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5955905 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 5956179 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 5956801 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 5957097 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5957456 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5957483 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 5957909 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 5958191 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 5958341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5958353 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 5958509 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 5959491 C G N N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 3 5959550 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 5960114 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 5961945 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 5962159 A G Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 3 5962292 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 5962656 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 5962728 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 5963096 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5963141 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 5963161 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5964007 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5964411 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5965114 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 5965237 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 5965380 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 5965733 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 5965782 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 5966015 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 5966820 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5967042 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 5967397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5967607 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 5967611 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 5968054 C T N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 5968162 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 5968310 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 5968344 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 5968416 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 5968474 A T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 5968812 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 5968896 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 5969212 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 5969541 T G Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 5969667 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 5969688 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5970002 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 5970043 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 5970529 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5970628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5970851 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 5970855 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 5972842 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 5973435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5973510 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5973664 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 5973695 A C Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5974032 G C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 5974342 C A Y N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 5974604 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5974718 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5974772 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5975182 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5975307 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 5975741 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 5975817 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 5976290 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 5976766 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 5976862 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 5977458 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 5977940 C T N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 5978117 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 5979030 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5979468 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 5981283 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 5981364 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5981457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5981762 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5981902 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5982266 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 5982386 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 5982589 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 5982604 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 5982694 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 5982728 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5982863 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 5982890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5982947 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 5983189 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 5983201 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 5983263 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 5983275 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 5983348 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 5983856 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 5983928 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5984108 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 5984217 T A N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 5984309 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 5984322 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 5984331 T G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 5984442 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 5984511 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 5984561 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5984602 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 5984770 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 5984878 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 5984902 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5984909 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5985137 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 5985179 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 5986280 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 5986369 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 5986679 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 5986912 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5986979 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 5987494 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5987802 C G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 5988850 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 5988955 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 5989119 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5989227 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 5989271 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 5989929 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5990220 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5990232 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 5990313 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 5990319 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5990392 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 5990519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5990658 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 5991462 T C N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 5991502 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 5991636 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 5991803 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5991837 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5991914 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 5992006 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 5992064 A G N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 5992190 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 5992458 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 5992472 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 5992753 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 5992827 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 5993092 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 5993136 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 5993141 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 5993271 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 5993911 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5994285 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 5994381 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5994624 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5994778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5994843 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 5994926 G A Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 3 5995761 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 5995818 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 5996068 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 5996591 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 5996655 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5996709 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 5996730 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5996845 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 5997082 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5997468 A T Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 5997630 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 5997803 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 5997812 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 5997870 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 5997983 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 5998027 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 5998075 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 5998386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5998677 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5998915 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 5999666 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 5999911 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 5999915 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 6000235 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 6000389 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 6000520 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 6001324 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 6001430 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6001484 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 6001642 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 6001697 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 6002313 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6002348 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 6002719 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6003060 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 6003074 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 6003134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6003416 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 6004002 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6004577 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6004613 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 6005191 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 6006390 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 6007232 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 6007360 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 6007430 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 6007516 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 6007536 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 6007539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6007966 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 6008498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6009196 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 6009923 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 6011641 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6012069 C T N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 3 6012070 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 6012686 C A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 6013241 C A Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 6013374 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 6013392 G T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 6014062 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 6014073 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 6014130 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6014480 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 6014573 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 6014847 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 6016191 T A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 6016765 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6017323 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 6017352 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6017841 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 6018518 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 6018550 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6018604 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 6019017 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 6019035 T G Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 6019069 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 6019108 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 6019252 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 6019275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6019317 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6019454 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 6019552 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 6019854 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 6019920 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6020021 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 6020205 G C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 6020217 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 6020239 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 6020243 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 6020265 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 6020376 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 6020414 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 6020449 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 6020472 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6020574 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 6020612 A G N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 3 6020614 T C N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 3 6020660 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 6020721 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 6020811 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 6021072 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 6021082 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 6021091 G C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 6021188 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 6021280 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 6021308 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 6021352 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 6021463 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 6021971 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 6021979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6022078 C A N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 6022661 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6023365 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 6023708 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 6023735 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6023857 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6023912 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6024144 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 6024571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6024602 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 6024850 A T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 6024994 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6025169 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 6026192 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 6026195 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 6026366 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6026505 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 6026544 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 6026648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6026957 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 6027002 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6027571 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 6028298 G A N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 6028932 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 6029039 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6029171 G C N N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 3 6029618 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 6029967 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 6030137 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6030165 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6030329 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 6030453 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 6031393 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6031399 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 6031738 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 6032036 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 6032570 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 6032708 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 6032723 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 6032856 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6032941 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 6033202 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 6033205 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 6033382 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 6033443 T G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 6033455 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 6033752 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 6033763 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 6033780 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 6033860 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 6033900 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 6033906 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 6033931 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 6034024 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 6034118 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 6034194 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 6034233 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 6034244 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 6034313 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 6034350 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 6034353 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 6034373 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 6034381 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 6034587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6034745 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 6034750 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 6034855 T G N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 6034901 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 6034966 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 6034978 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 6035019 T G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 6035054 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 6035076 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 6035110 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 6035342 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 6035349 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 6035377 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 6035590 C T N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 3 6035595 A C N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 3 6035729 T A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 6035779 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.133333333333333 26 4 13 0 2 3 6035853 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.133333333333333 26 4 13 0 2 3 6036185 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 6036252 C G N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.133333333333333 26 4 13 0 2 3 6036278 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 6036407 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 6036493 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 6036568 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 6036572 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 6036724 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 6036761 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 6036912 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 6036948 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 6037152 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 6037250 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6037325 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 6037365 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 6037511 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6038540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6039527 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 6040239 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6040730 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6040732 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6041296 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 6041970 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6042499 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 6043436 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6043456 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6045965 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 6047036 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6048494 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 6049002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6049032 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6051613 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6060650 G T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 6062098 A G Y Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 3 6064728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6073951 T G N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 6075014 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 6076173 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6076264 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 6076881 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 6077827 T A Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 6078236 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 6079246 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 6082661 A C N N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 3 6083001 G A Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 6083044 A G Y Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 6083075 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 6083263 C A Y N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 3 6083331 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 6083865 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6084441 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 6084450 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 6084526 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 6084629 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 6084701 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 6084842 G A Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 6084861 A C N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 6085096 A G Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 6085112 C G N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 3 6085492 T C N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 3 6085493 G A N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 3 6085545 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 6085582 G C N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 3 6085617 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 3 6085636 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 6085719 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 6085882 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 6086140 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 6086141 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 6086191 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 6086214 T G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 6086333 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 6086491 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6086555 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 6086606 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 6086689 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 6086888 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 6087002 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 6087429 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 6087687 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 6087745 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 6088411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6088641 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 6088701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6089290 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 6091315 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 6091503 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 6091903 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 6092251 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 6092426 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 6092495 C A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 6092967 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 6093138 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 6093286 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 6093399 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 6093871 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 6094160 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 6094747 T A Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 6097081 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 6097123 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 6097236 C A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 6097344 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 6098014 G A Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 3 6098717 C T N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 6099489 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 6099503 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 6099584 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 6099625 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 6099808 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 6100007 A T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 6100407 G C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 6100422 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 6100429 C A Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 6100486 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 6100500 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 6100548 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 6100644 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 3 6100698 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 6100845 G T Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 6100870 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 6101091 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 6101108 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 6101253 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 6101801 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 6102247 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 6103507 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 6103528 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 6103768 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 6104504 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6107216 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 6107287 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6107293 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 6107543 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6107548 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6108289 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 6108618 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 6108702 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 6109202 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 6109693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6109820 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 6109881 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 6110373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6110572 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 6113597 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6113749 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6115765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6116736 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 6119298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6122192 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 6122354 A T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 6122491 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6130063 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 6131529 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 6132462 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 6134008 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 6134681 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 6134792 T A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 6136007 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 6136391 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 6137720 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 6138403 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6138432 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 6138484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6139940 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 6140135 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 6140557 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 6140571 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6140719 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 6140754 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 6140858 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 6141006 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 6141011 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 6141031 C G Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 6141076 G C Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 6141252 T C Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 6141285 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 6141359 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 6141416 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 6141506 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 6141519 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 6141554 A T Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 6141880 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 6141950 T C Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 6142001 A T Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 6142019 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 6142089 T A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 6142149 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 6142187 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 6142188 G A Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 6142269 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 6142488 A T Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 3 6142586 A G Y Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 3 6142836 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 6142980 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 6143103 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 6143417 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 6143475 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 6143492 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 6143499 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 6143802 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 6144726 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 6145009 A G Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 3 6145067 G A Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 3 6145197 G C Y N 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.181818181818182 0.636363636363636 0.181818181818182 11 11 2 7 2 3 6145200 G A Y Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.181818181818182 0.636363636363636 0.181818181818182 11 11 2 7 2 3 6145570 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 6145728 C G Y N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 6145734 A T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 6145739 T C Y Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 3 6145853 G T Y N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 6146078 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 6146091 T G Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 6147207 G C Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 6147286 A T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 6147361 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 6147365 A C Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 6147447 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 6147558 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 6147594 T C Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 6147721 A T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 6147837 A C Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 6147882 G T Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 6147974 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 6147992 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 6148579 C A Y N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 6148632 A C Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 6148981 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 6149628 C A Y N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 6149914 T A Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 6150050 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 6150327 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 6150428 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 6150432 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 6150527 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 6150627 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 6150871 T A Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 6150944 T A Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 6150974 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 6150996 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 6151026 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 6151159 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 6151292 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 6151686 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 6151893 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 6151902 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 6151993 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 6152158 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 6152281 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 6152293 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 6152299 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 6152410 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 6152413 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 6152429 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 6153546 A C Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 6153996 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 6154123 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6154383 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 6154397 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 6155036 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6156116 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 6156677 T A N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 6156680 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 6156863 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 6156944 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 6156948 T A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 6168510 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 6168577 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 6168605 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 6168791 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 6169024 G T N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 6170216 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6170286 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 6170447 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6171340 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 6172663 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 6174544 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 6174852 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6175325 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 6176305 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 3 6176787 T A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 6178030 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 3 6178421 A T N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 3 6179067 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 6179222 G A N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 6179556 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 6179644 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 6181564 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 6182950 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 6183184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6183684 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 6183714 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 6184770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6184930 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 6184995 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6184996 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6185820 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6186364 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6186905 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6187362 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6187714 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 6188224 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6188398 G T Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 6189902 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 6190808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6190824 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 6191068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6191095 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6192932 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6193038 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6193044 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6193298 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6193579 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6194746 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6195095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6195211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6195306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6196336 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 6199869 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 6200152 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 6202435 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6203850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6204237 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 6205031 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 6205116 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 6205616 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 6205964 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6206540 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 6206960 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 6208250 A G Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 6208927 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6210793 A G Y Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 3 6211587 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 6212304 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 6212441 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6212966 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6213343 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6213890 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 6214352 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 6215381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6215567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6215897 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6216753 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 6219754 T A N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 6220423 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 6220717 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6220890 T A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 6222031 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 6222173 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 6222508 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6222602 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 6222955 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 6223860 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6224107 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 6224980 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6226377 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 6227164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6227396 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6230070 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 6232116 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 6236384 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 6236685 G T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 6236960 T C Y Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 3 6237002 C T Y Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.0833333333333333 0.583333333333333 0.333333333333333 9 15 1 7 4 3 6237115 G A Y Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.0909090909090909 0.636363636363636 0.272727272727273 9 13 1 7 3 3 6237359 A G Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 6240789 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 6240947 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6241547 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6242593 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 6244009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6244144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6244835 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 6245767 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6245875 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6245926 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6246816 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6248542 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 6249232 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 6249325 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 6251061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6252498 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6253598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6254536 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6258846 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6258847 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6258885 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6262619 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6264162 C A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 6264529 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 6264897 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6268417 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 6268696 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 6273771 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 6274681 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 6278208 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6280994 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6282331 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6285719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6289959 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6291200 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6291364 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 6291436 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6291689 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 6292253 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6292445 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6292572 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 6292943 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6293221 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6294073 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6294279 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 6294446 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 6294650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6294683 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 6294773 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 6295223 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 6295375 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6295807 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6295808 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 6295990 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6296388 T A N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 3 6296601 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 6296820 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6297261 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 6297349 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6316644 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6316960 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6316972 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6317233 G C Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 6317286 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6317318 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 6317840 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 6318357 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6318906 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6318965 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 6319055 G C Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 6319554 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 6319665 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 6319739 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6320031 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6320133 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 6320310 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 6320495 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 6320788 T C Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 6320937 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 6321078 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 6321267 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 6321598 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 6321940 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 6322204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6322229 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 6322271 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6322361 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 6322394 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 6322417 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 6322763 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 6323143 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 6323214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6323705 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 6324065 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 6329893 T G Y N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 6330622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6331266 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6331826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6332013 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 6332118 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6334295 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6336147 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6336192 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6336952 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 6345028 C T Y Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 3 6346547 C G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6347156 A T Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 6349059 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 6350524 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6352049 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6352298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6353862 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 6353911 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6354618 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6355219 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 6357745 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 6362998 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6364168 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6364255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6365957 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6366364 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6366586 T A Y N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 3 6370353 A T Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 6370531 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 6374130 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 6376393 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 6377728 C T Y Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 3 6378881 C G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 6379144 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6380503 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 6380549 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 6383841 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6385380 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6387635 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 6388925 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 6391744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6391799 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 6394196 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6395622 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 6395942 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6396033 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6396903 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6398583 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6400307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6400948 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6402228 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6404635 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6406122 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6406327 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6407177 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6410648 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6412475 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6412874 C T N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 6414297 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 6414687 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6423269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6426886 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6426962 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6427191 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6428477 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6428676 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6429777 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 6430931 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6431284 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 6431352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6431360 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6432059 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 6433515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6433528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6434760 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 6434892 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 6439488 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 6440140 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6440780 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6441038 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6441809 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6441942 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6442035 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 6442452 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 6443371 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 6443879 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 6445996 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6446022 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6446520 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 6446726 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6447851 G C N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 3 6448310 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6448532 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 6448565 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6448966 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6448977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6449129 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6449333 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6450443 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6451564 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 6452743 A T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 6454597 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6454652 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6455595 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6463056 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6463485 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6463550 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6464153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6465167 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6465207 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 6465421 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 6465594 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6465797 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6467639 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 6468594 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6468859 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6468897 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6469422 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 6469465 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 6469813 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6470618 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6470781 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6471791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6471917 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6479555 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 6479954 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6480293 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6480397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6481645 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 6483104 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6485189 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6486740 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6487289 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6487651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6488043 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6488743 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6489464 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 6490138 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6490400 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6491144 G T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 6492427 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6492713 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 6493545 T C N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 6494206 G A N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 3 6494679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6495080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6495378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6495393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6496193 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 6496673 T A N N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 6496769 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 6497236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6497667 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6497907 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6498334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6499938 C G Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 6500797 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6501494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6503760 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6503784 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6504994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6505480 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 6505516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6506146 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 6506173 A T Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 6506206 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 6506217 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 3 6506237 C A Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 6506395 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 6506601 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6508179 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6508458 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6510048 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6510459 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 6510624 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 6510872 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 6510935 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 6510955 G A Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 6511195 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6511270 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6511292 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6512013 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6512014 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6512038 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 6512808 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6513045 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 6513172 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6513452 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6515607 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6515643 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6516059 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6516227 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 6517028 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6517300 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 6517521 C G Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 6518242 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 6518243 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 6518617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6518681 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6519014 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6519215 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6519841 G T Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 6519844 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 6519971 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 6521643 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 6521694 C G Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 6522646 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 6523657 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6524442 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6524680 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 6524819 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 3 6524844 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 6525013 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 6526450 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 6526500 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 6526663 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6527075 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 6527206 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6527349 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6527547 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6527674 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 6527734 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6527884 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 6528091 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6528786 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 6529684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6531056 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6532236 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6533229 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 6533624 T G N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 6533721 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 6533735 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6533824 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6534336 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6534477 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 6534576 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 6534693 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6534745 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 6534975 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6534985 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6535426 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6535514 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 6535645 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6535949 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6536920 A G Y Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0 0.7 0.3 7 13 0 7 3 3 6537062 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6537443 A C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 6537471 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6537491 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 6537618 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6537917 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 6537988 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6538326 G C Y N 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 7 7 2 3 2 3 6538363 C A Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 6538596 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6539083 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 6539533 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6541001 G A Y Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 6541075 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 6541154 A C Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 6541382 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 6541384 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6541451 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6541475 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 6541550 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 6541639 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 6541980 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6542142 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6542177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6542189 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6542473 A T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 6544603 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 6545003 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 6546644 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 6546818 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 6546819 C G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 6547299 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 6547868 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 6548241 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 6549020 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 6549466 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6549901 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6549916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6550079 G C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 6550103 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 6551083 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 6551260 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 6551432 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 6552272 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 6552380 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 6553035 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 6553039 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 6553678 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6555530 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6555633 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6558486 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6559644 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 6562231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6562853 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6563927 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6564423 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 6564590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6565149 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6567652 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 6569103 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 6569214 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6574364 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6575397 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 6575670 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 6575881 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6576146 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 6576779 A G Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 6576824 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 6577660 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6581906 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 6582592 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 6582595 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 6583143 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 6583197 G A N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 6583771 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6584054 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 6584127 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6584723 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6584783 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6585784 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6586148 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 6587120 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6587204 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6587541 C G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 6587628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6587706 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6588277 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6589146 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6589295 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6590697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6591092 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6591140 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 6591315 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 6591406 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6591637 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 6591659 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 6591985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6592049 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6592424 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6592470 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6593208 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6593340 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6593537 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 6593726 C T N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 6593975 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 6594464 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 6594858 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 6595351 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6595472 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6595747 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6597257 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 6597258 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 6597891 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6597997 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 6598068 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 6600014 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 6600105 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6600182 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6600252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6601240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6601275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6601525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6601653 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6609037 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 6609154 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6609790 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 6609799 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 6609954 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6611416 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6611832 A G N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 3 6613992 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6614513 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 6614645 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 6614912 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 6616894 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 6617050 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6617268 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6627644 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6629569 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 6630418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6630588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6631264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6631418 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 6631489 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 6631563 C G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 6631660 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 6631710 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 6631735 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 6631739 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 6631898 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 6632284 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 6632375 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 6632439 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 3 6632476 T G N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.142857142857143 0.642857142857143 0.214285714285714 13 15 2 9 3 3 6632563 T C Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 3 6632568 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 6632868 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 6632947 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 6633182 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 6633195 T A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 6633204 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 6633439 G C Y N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 3 6633632 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 6633825 G A N Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 9 7 3 3 2 3 6634067 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 6634201 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 6634608 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 6634741 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 6634870 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 6634872 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 6634906 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 6634921 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 6635112 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 6635162 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 6635205 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 6635223 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 6635239 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 6635253 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 6635568 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 6635734 G A Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 6635743 T G N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 6635779 A G N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 6635787 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 6635828 G C Y N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 6635921 C T N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 6636485 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 6637521 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 6638115 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 6638123 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 6638606 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6640098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6641475 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 6641496 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6641838 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 6641973 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 6642252 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 6642302 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6642938 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 6643570 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 6644041 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6644114 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6644150 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 6644992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6645882 A C N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 6646281 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6648374 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6649392 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 6649695 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6650252 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6650527 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6650608 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6650636 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 6651177 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6651519 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 6652692 A T Y N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.454545454545455 0.363636363636364 0.181818181818182 14 8 5 4 2 3 6653522 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 6654715 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 6655686 G C Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 6656785 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 6658640 A C Y N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 6659160 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 6659471 G T Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 6659846 T C Y Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 3 6660965 T G Y N 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 3 6661033 G T Y N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 5 7 1 3 2 3 6661302 A G Y Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 5 5 1 3 1 3 6661575 T A Y N 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 3 6661650 T C Y Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 3 6661792 C T Y Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 6662313 A T Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 6664476 T A Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 6666711 T C Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 6666842 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 6667171 A T Y N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 6667390 A G Y Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 3 6667611 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 6667674 T G Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 6667786 A G Y Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 9 9 2 5 2 3 6667797 C G Y N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 8 12 1 6 3 3 6667892 A G Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 6667973 C A Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 6668083 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 6668108 A C Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 6668399 C G Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6669429 T G Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6669888 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 6670796 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 6671568 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 6671866 G A Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 6672060 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 6672074 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 6672376 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6674135 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 6674882 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 6675392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6676599 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6677376 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6678323 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6680880 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 6681085 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6681884 C G Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 6682365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6682542 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 6683840 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6684142 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6685639 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 6685670 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 6686183 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 6688641 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6689694 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6690086 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6690920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6693433 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 6693524 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 6694192 A T N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 3 6694193 A C N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0 0.785714285714286 0.214285714285714 11 17 0 11 3 3 6696018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6696783 G A Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 6698078 C G Y N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 6702826 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 6703179 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 6703890 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 6704290 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6705033 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6706791 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6706817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6706938 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6707118 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6707157 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 6707447 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6708234 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 6708559 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6708816 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6709354 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6712072 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6712101 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 6712298 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6712356 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6712513 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6712605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6712660 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6712920 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 6713090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6713227 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 6713401 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 6713784 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6713902 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6714027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6714189 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 6714258 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6714655 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 6714848 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 6716062 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6716102 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 6716240 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6717118 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6717360 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 6717639 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 6717972 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 6719091 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6719296 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 6719552 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 6719935 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6720033 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6720435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6720606 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6721436 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6721550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6721603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6721921 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6722831 C T N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 6723110 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 6724872 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6725033 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6725300 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6725339 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6726842 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6727097 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6727397 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6727659 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 6728006 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 6728739 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6729168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6729428 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6729460 C G Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 6729719 G A N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 3 6730086 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 6730952 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6731016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6731367 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 6731847 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6731958 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 6732388 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6733016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6734107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6734165 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 6735048 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6735303 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6736199 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 6736438 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6736642 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 6737541 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 6738134 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 6738182 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6738306 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6744896 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6745295 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 6745468 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6745781 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6746305 T C Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 6746324 G A Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 6746327 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6746703 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 6747052 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6747159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6747285 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6747778 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6748443 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 6748637 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 6748700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6749171 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 6749294 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 6750037 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 6750123 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6750193 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6750820 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6752699 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6753660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6755928 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6763015 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 6763840 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6763992 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6767475 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6767846 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 6768059 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 6768090 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6768441 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 6771318 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6772291 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6772567 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6774488 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 6775313 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 6776860 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 6776913 T A N N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 3 6778124 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6778626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6779122 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 6779632 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6780617 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 6780707 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 6781271 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6782052 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6786314 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6787185 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6788030 C T N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 6789815 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6791809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6792132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6792447 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6792492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6793199 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6794003 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 6794096 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6794221 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 6794624 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6794668 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6794863 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 6795004 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 6795133 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6795281 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6795454 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6795460 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6795538 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6795804 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 6795963 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 6796731 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 6796830 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 6796885 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6797193 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6797250 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 6797585 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 6797837 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6798321 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6798359 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 6802274 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6802315 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6802674 G A Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 6804365 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6804783 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 6805529 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 6806298 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6808784 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6809760 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 6811756 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 6812260 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6812700 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6813763 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6817361 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 6818009 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6818136 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 6818472 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 6821310 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6821638 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 6822358 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 6824294 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6825114 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 6826566 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6827478 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6828217 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 6829909 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6830728 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 6830873 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 6831249 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6831598 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6831630 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6832382 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6832657 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 6832756 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 6833902 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 6834631 A G Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 6837249 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6837263 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 6837592 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6837874 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6837943 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 6838061 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 6838955 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6839263 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6841306 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6842955 A C Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 3 6842970 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 3 6843041 G A Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 3 6846397 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6847784 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6847874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6848415 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6849057 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6849066 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6849101 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 6856679 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6857116 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 6857356 C G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 6857850 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 6858514 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6858958 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 6859137 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6859453 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 6859675 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6860718 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 6861363 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 6861665 A C Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 6863551 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6863631 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6863714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6864053 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6864234 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6864819 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6865225 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 6866500 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6866739 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6866866 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6867012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6868698 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6873564 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6873998 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6874082 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6874752 T A Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 6876197 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 6876271 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 6876309 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6878586 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6878608 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6879131 C G N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 6879133 A G Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 6879521 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 6880082 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 6880158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6880871 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 6880920 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6882088 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6882159 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 6882663 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6883444 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6883929 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6885862 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6886095 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 6887639 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6887710 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6888484 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6888988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6889748 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6889919 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6889975 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 6890788 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6891198 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 6891261 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 6891395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6891593 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 6891972 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 6892384 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6894708 T C Y Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 3 6895052 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 6896971 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 6897259 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6899076 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6899108 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6906021 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 6906120 A T N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 6906869 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 6907172 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 6907878 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 6907963 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 6908687 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 6917204 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6917234 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 6917235 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 6917812 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 6919856 C T Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 6921054 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 6921523 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 6922314 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 6922815 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 6927153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6927664 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6929612 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 6930131 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6930848 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 6933299 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 6933949 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 6934364 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6937011 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6937043 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6937749 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 6938076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6938621 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6938876 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 6939197 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 6940205 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 6940434 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 6947163 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 6948012 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6949249 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 6949339 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 6950259 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 6950620 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 6953173 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6955126 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 6956997 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 6958004 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6958083 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 6958892 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 6959207 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6963560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6964991 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 6965271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6967663 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6969027 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6969623 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6969776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6972596 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6974587 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6974824 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6975641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6976076 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6978410 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6978586 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 6979684 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 6982998 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 6986494 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 6987815 A C Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 6988052 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 6988460 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 6988912 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6989902 G C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 6991174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 6993721 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 6995131 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 6995184 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 6995546 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6996750 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 6996794 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6997218 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 6998536 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 6999005 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 6999012 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 6999254 G A Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 7000587 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 7001533 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7004508 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7004973 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7005480 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7006014 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7007478 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7009327 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7010233 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 7011618 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7011621 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7012710 G C Y N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 7012811 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 7013014 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7015078 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7015390 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7015428 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7016471 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7016727 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 7018171 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7018322 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7020765 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 7021098 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 7021979 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7022164 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7023416 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7023912 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7023986 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7024479 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7024647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7025044 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7026024 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7026215 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7026832 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7027282 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7027974 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7028110 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7028348 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 7028350 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7029406 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7030719 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7030737 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7031748 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7031845 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7032635 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7034177 A G Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 7035142 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7036811 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7037017 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7037018 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7037456 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7038590 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7040857 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 7041191 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 7043213 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7044599 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7045544 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7045837 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 7048355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7048417 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7053709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7053858 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 7054526 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 7055530 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7056374 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7059057 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7060155 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 7060546 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 7060813 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7060897 T A Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 7061910 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 7063919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7064069 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7064408 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7064588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7065329 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7065787 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7067266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7068175 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7068489 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7069152 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 7069446 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 7069647 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 7070508 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 7070559 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7072124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7072920 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7072956 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7073024 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 7073540 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7073851 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 7074233 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7074741 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7074879 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7076118 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7076119 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7076639 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 3 7077007 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7078033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7080030 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7080031 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 7080238 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7081168 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 7081409 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7081485 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 7081954 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 7090057 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7090159 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7090201 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 7090277 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 7090361 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7090415 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 7090476 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 7090549 G T N N 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 6 10 1 4 3 3 7090554 G A N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 6 10 1 4 3 3 7090625 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7090665 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 7091535 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7098243 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7099018 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7099286 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7100411 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 7100484 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7100741 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 7100995 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 7101135 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7101409 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7101688 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7101870 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7102375 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7102432 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7102616 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7103197 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7103557 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7104114 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 7104155 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 7104175 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7104390 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7104490 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7104588 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7104602 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 7104733 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7104743 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7104863 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7104965 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7105007 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7105013 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7105382 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7105553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7105632 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7105635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7105906 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7106007 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7106421 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7106444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7107871 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 3 7107881 G T Y N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 3 7107977 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 7107985 C T Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 7107991 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 7108005 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 7108007 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 7109104 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7109340 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7109698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7109980 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7110082 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7110097 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7110183 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7110247 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7110339 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7110381 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 7110413 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7110522 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7110546 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7110625 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7110759 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 7110970 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 7110982 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 7111019 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7111079 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7111130 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7111311 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 7111408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7111468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7111488 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 7111954 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7111981 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7112067 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7112136 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 7112175 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7112393 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7112507 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 7112697 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 7112837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7112842 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 7112875 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 7112900 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7113144 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 7113155 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7113378 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7113390 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7113445 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 7113464 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7113581 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 7113637 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7113868 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7113909 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7114017 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7114451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7114476 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7114505 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7114544 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 7114595 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 7114676 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 7114703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7114739 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7114894 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7114897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7115093 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 7115353 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7115629 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 7115721 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 7115782 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7115909 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7115938 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7115975 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7116216 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7116399 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7116432 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7116557 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7116680 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7116696 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 7116795 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7117031 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7117200 T A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 7117731 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7117760 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7117783 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7117988 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 7118620 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7118872 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 7119101 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 7119230 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 7120293 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 7120363 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7120704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7120954 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 7121037 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7121238 A T N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 7121321 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 7121526 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 7121637 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7122342 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7122822 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 7123158 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 7123216 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7123269 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 7123379 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 7123492 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 7123514 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 7123712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7124119 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7124155 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 7124387 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 7124461 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7124462 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 7125865 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7125903 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7128288 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 4 8 2 0 4 3 7128365 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 4 8 2 0 4 3 7135400 G A N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 3 7139137 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 4 8 2 0 4 3 7141836 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7141883 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7141928 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7142072 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7143181 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7143669 C T Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 3 7143678 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 7144036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7144152 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7144453 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 7145193 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7145722 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7146054 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7146086 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7146743 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7146847 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7147021 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 7147738 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7149158 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7149170 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7149207 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7149251 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 7149336 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7149683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7150260 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 7151342 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7152079 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 7152195 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7152383 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7152866 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7153507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7153798 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 7154231 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 7154275 A C Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 7154605 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7154675 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 7154743 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7154841 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7155360 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 7155534 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7155741 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7155759 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7155769 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 7155987 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7156154 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7156341 T C Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 7156555 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 7156660 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7156717 T C Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 7156912 C A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 7157038 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7157103 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7157200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7157549 G T Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 7157651 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7157719 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7158164 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7158208 C T Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 7158278 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7158662 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7158834 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7158977 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7159172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7159294 G A Y Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0 0.7 0.3 7 13 0 7 3 3 7161312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7161364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7161400 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7161445 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7161532 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7161657 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 7161747 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7161918 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7162032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7162074 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7162361 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7162417 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7162470 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 7162684 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7162783 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 7162820 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 7163042 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7163043 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7163103 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7163132 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7163313 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 7163344 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 7163391 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 7163475 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7163868 G A N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 7163988 C T N Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0 0.8 0.2 4 6 0 4 1 3 7164070 G T Y N 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 3 7164406 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7164413 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7164435 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7164467 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7164648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7164833 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 7164906 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 7164928 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 7165415 G C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 7165499 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 7165511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7165648 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 7165899 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7165927 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 7166035 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 7166103 A T N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 7166409 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7166742 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7166787 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7166984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7167105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7167128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7167175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7167398 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7167403 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7167554 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7167690 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7168764 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 7168926 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 7169064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7169300 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7169826 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7169924 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 7170072 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 7170315 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7170489 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7170522 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7170796 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7170925 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7171061 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7171087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7171309 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7171314 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7171370 C A Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 7171403 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7171435 A G Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 7171568 A G Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 7171860 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7172081 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 7172159 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7172300 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7172309 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7172470 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7172511 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 7172525 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 7172544 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 7172647 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7172680 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7172856 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7172877 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7173288 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7173393 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7173494 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 7173579 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7173692 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 7173754 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 7174038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7174368 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7174668 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7174739 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 7174924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7174982 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 7175083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7175423 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7175556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7176873 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7184536 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 7184981 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 7185526 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7185778 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 7186533 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 7187051 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7192845 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 7200102 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 7200833 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7202663 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7203101 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7203594 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7204011 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 7204444 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7208574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7208660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7209951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7210124 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 7210778 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7211244 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7211611 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7211662 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7211863 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7212028 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 7212298 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7212528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7212541 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7212715 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7212837 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7212892 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7213081 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7213202 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7213369 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7213403 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 7213448 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 7213460 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 7213468 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7213850 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7214063 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7214101 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7214176 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7214336 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7214415 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7214422 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7214432 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7214605 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 7215033 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 7215104 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 7215131 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7215162 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7215654 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 7215709 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7215835 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7215852 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7215894 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7215923 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7215991 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7216103 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7216200 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7216355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7216498 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7216611 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 7216847 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 7216940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7216963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7217123 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 7217262 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 7224227 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 7224400 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7224458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7224547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7224593 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7224671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7224893 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7225165 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7225297 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7225332 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7225558 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 7225643 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 7225649 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7225688 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 7225708 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 7225801 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7225825 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 7225889 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7226075 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 7226146 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7226239 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 7226290 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7226700 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7227015 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7227396 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 7227839 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7228472 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7228795 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7228835 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7228932 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7229475 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7230084 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7230166 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 7230243 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7230578 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 7230579 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 7230635 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 7230706 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 7230788 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 7230801 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 7230824 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 7230837 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 7230845 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 7230888 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 7230937 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 7230976 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7231075 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7231230 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 7231454 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7231506 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 7231549 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7233626 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 7233644 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 7233789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7233843 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7233857 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7233883 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7233903 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7233926 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 7234270 A C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 7234587 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 7234778 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7234791 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7234808 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 7234873 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 7234877 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 7234902 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 7234940 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 7234973 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 7235282 C G N N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 3 7235352 G A N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 7235440 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 7235624 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 7235686 T A Y N 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0 0.8 0.2 4 6 0 4 1 3 7235922 G C N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 7236010 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 7236038 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 7236074 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7236094 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7236097 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7236146 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7236222 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7236320 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7236374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7236397 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7236424 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7236450 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7236457 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 7236590 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7236729 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 7236739 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7236823 G C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 7236928 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7236976 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7237204 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7237207 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7237410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7237456 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7237494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7237497 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7237774 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7237799 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 7237830 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 7237923 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 7237935 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 7237947 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 7238007 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 7238154 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7238183 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 7238241 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7238270 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7238279 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7238413 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7238419 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7238446 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7238586 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 7238621 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7238667 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7238758 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7238784 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 7238868 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 7238888 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7238910 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7238947 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7238962 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 7239044 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 7239074 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 7239111 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7239250 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7239260 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7239635 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7239667 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7239669 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7239728 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7239753 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 7239860 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7239914 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7239966 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7240014 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7240040 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7240222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7240327 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7240488 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 7240931 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7240969 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7241031 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7241127 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7241323 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7241353 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7241362 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7241441 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7241528 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 7241539 T A Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7241542 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 7241643 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7241680 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7241799 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 7241836 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 7242044 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7242301 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 7242420 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7242704 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7242901 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7243251 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7244136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7244223 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7244865 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7245211 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7246850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7246877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7246888 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7247748 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 7248006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7248105 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7248193 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7248288 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7248692 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7248707 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 7248722 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7248728 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7249338 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7249358 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 7249433 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 7249512 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 7249768 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 7249865 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7249978 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 7250139 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7250141 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7250489 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 7250506 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 7250528 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 7250535 T A N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 7250573 G A N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 7250715 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 7251639 G T Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 7251667 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 7251723 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7251822 A G Y Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.153846153846154 0.0769230769230769 0.769230769230769 5 21 2 1 10 3 7251827 A C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 7251834 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 7251916 G A Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 7251933 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7251950 A T Y N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 7252075 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 7252465 C A Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 7252553 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 7253765 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 7253890 T G Y N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 7254070 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 7254110 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 7254140 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 7254146 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 7254206 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7254386 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7254461 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7254514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7254520 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 7254715 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 7254840 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 7254848 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 7254895 A C N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 7254912 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 7254997 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 7255016 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7255096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7255139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7255218 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 7255277 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7255314 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7255917 C T Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 7255995 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 7256023 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7256096 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7256116 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7256249 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 7256297 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7256415 T C Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 7257182 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7257375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7257693 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7258129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7258173 C G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 7258345 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 7258740 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7258978 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7259141 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7259145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7259802 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 7259932 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 7259973 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7259986 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 7260166 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 7260347 C T Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 7260528 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7260548 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7260581 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7260597 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7260694 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7260747 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7261251 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7261258 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 7261276 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7261315 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7261491 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7261569 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7261619 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7261653 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7261680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7261764 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7261811 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7262346 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7262374 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7262522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7262569 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 7262628 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7262780 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7262797 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7262987 G C Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 7263087 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 7263135 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 7263197 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 7263508 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 7263806 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 7263973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7263976 A C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 7263992 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7264006 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7264058 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7264094 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7264255 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7264289 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7264593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7264639 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7265061 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7265143 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7265222 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 7265240 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7265474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7265482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7265590 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7265678 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 7265694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7265778 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7265795 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7265821 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7265858 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7265881 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7265897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7265918 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7266003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7266064 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7266088 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7266184 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7266271 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7266626 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 7267146 T C N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0 1 0 11 11 0 11 0 3 7267307 T A Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 7267319 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 7267569 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 7267572 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 7268167 G C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 7268268 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 7268272 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 7268431 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 7268453 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 7268455 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 7268466 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 7268522 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 7268633 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 7268680 C T Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 7268686 C T Y Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 7268963 A G Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 7269225 C T Y Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 7269246 A T Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 7269269 G T Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 7269365 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7269486 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7269487 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7269563 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7269654 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 7269717 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7269744 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 7269827 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 7269836 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7269947 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7270252 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 7270273 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7270291 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7270538 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7270669 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 7270907 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 7271047 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7271184 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 7271196 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 7271558 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7271698 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 7271828 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7271874 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7271926 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 7271934 C G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 7271987 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 7271995 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 7271999 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 7272072 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 7272130 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 7272181 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 7272294 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7272317 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7272698 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7272811 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7272943 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7273851 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7274026 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7274063 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7274154 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7274387 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7274423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7274733 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7274744 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 7274941 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7274990 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7275102 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7275124 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7275134 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7275540 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 7275796 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 7275845 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7275949 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7276095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7276267 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7276359 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7276452 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 7276540 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 7276672 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 7276833 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 7277319 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 7277496 C G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 7277622 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 7277738 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7277797 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 7277799 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 7277862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7277933 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 7277934 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7277947 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7277953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7278045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7278087 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7278156 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7278198 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7278256 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 7278329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7278352 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7278386 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 7278396 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 7278406 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7278414 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7278484 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 7278546 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 7278560 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 7278607 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7278705 T G N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 7278794 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 7278877 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 7279052 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7279109 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7279672 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7279975 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7280226 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7280331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7281131 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7281763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7283183 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7283295 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 7283424 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7283615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7284116 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7284367 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7284716 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 7285024 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7285030 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7285475 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7285847 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7286147 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 7286437 G T N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 7287482 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 7287983 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 7288729 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 7289470 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7289471 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7289483 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7289884 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7289902 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7290076 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7290690 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7291712 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 7293152 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7293294 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7293296 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7293469 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7293477 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 7293588 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 7293641 G C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 7293647 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 7294162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7294464 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 7294537 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 7295271 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7295273 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7296837 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7297199 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 7297880 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7298405 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 7298713 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7299231 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7299308 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7299311 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7299470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7300937 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 7301059 G C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 7301279 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 7301330 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7304841 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7305144 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7306161 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7306905 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 7307181 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7307288 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 7307755 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 7308398 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 7308724 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7308862 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7309001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7309062 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 7309085 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 7309843 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7309981 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7310036 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7311098 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7317922 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7318861 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 7319016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7320329 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7320539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7321175 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7322284 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7322553 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7322575 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7323381 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7324858 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7325219 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 3 7325579 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7325708 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 7326375 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 7326581 C A Y N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 7326782 T A Y N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 7327891 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 7328149 C T N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.416666666666667 0.25 0.333333333333333 13 11 5 3 4 3 7328919 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 7328985 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 3 7329093 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 7329572 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7329588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7329755 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 7331737 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 7331837 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7332069 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 7333657 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7335092 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7335493 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7335780 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7335960 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7335993 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 7336011 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 7336139 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7336321 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7336390 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 7336416 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 7336422 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7336433 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7336520 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7336556 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 7338743 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7339783 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7340964 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 7343474 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 7343915 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 7344879 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7345060 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7345335 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7345789 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7346203 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7347340 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7347348 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7348616 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7349503 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 7351002 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 7351324 A T Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 7351499 T A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 7351752 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 7352290 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 7353723 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 7353779 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 7354601 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 7354763 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7354852 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 7354874 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 7355255 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7355595 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 7355796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7355810 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 7355827 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7355859 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 7355929 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7355973 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 7355974 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 7356196 A T N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.714285714285714 0.285714285714286 10 18 0 10 4 3 7356271 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 7356285 C A N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 7356561 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7356575 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 7356691 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 7356776 C G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 7356860 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 7356870 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7356970 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 7357066 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 7357149 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 7357169 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 7357391 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 7358009 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 7358039 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 7358284 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 7358303 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 7358307 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7358540 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7358716 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 7358775 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 7358780 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 7359025 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 7359064 C A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 7359117 T C N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 3 7359132 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 7359230 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 3 7359596 C T N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 7359723 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 7359840 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 7360263 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7360374 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 7360426 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7360455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7360539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7360678 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 7360684 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7360743 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 7360877 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7360984 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7360985 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7360997 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7361092 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7361322 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 7361344 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 7361400 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 7361471 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 7361547 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7361693 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7361735 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7361810 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7361819 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 7361831 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7361902 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 7361911 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 7361981 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 7362010 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 7362093 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7362283 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 7362287 A G N Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 8 8 3 2 3 3 7362430 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 7362733 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 7362768 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 7362784 T G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 7362794 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 7362835 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7362842 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7363065 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 7363173 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7363182 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7363215 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7363237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7363279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7363420 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7363494 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7363500 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7363536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7363587 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7363606 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7363623 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7363707 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7363829 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7363874 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7364134 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7365105 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7365114 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7365154 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7365207 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7365335 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7365357 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 7365401 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 7365503 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7365542 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7365781 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7365900 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 7365988 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 7366079 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7366374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7366388 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 7366389 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 7366794 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 7367253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7367850 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 7368233 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 7368951 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7368962 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7370651 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7371150 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7371258 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7371363 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7371804 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7371907 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7372225 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 7372287 A G N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 7372288 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 7372302 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 7372306 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 7372455 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7372622 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7372770 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 7373436 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7373793 A T N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 7373960 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7374084 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7374575 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 7374725 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 7374814 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7374827 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 7376018 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7376134 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7376381 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 7376485 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7376976 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7377661 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7377803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7377987 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7378001 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7378277 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 7378656 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 7379078 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 7379081 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 7379240 G C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 7379347 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 7379817 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7379819 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7379848 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7379864 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7379978 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7379986 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 7380094 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 7380189 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7380214 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 7380281 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7380352 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7380582 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 7380871 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7381027 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 7381069 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 7381108 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7381117 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7381139 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 7381187 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 7381195 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 7381214 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 7381216 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 7381270 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7381342 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7381347 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7381357 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7381361 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7381387 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7381406 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7381411 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7381430 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7381448 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7381464 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7381479 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7381518 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7381534 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7381572 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7381592 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 7381602 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7381603 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 7381627 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7381648 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 7381718 A G N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 7381722 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 7381735 A G N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 7381844 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 7381915 C A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 7381988 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 7382001 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 7382016 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7382030 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 7382137 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7382139 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7382174 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7382208 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7382358 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7382666 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7382795 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7382798 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7382867 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7382879 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7382894 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7382914 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7382934 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7382945 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7382957 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7383001 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 7383177 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7383252 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7383264 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7383266 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7383285 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7383319 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7383389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7383429 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7383666 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7383733 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 7383801 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7383879 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7383990 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7383997 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7384034 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7384137 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 7384150 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 7384155 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7384180 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7384204 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7384206 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 7384249 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7384298 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7384336 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7384364 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 7384409 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7384487 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 7384489 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 7384518 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7384530 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 7384561 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7384562 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 7384602 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7384685 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7384703 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7384712 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7384776 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7384801 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7384821 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7384897 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7384922 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7384978 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7384985 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7385070 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7385129 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7385211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7385220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7385228 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7385255 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7385289 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7385320 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7385329 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7385333 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7385347 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7385383 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7385397 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7385443 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7385453 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7385468 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 7385536 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7385574 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7385578 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7385663 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7385667 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 7385758 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7385806 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7385816 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7385896 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 7385945 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7385973 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7385988 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7386002 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7386387 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 7386441 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 7386445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7386526 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 7386548 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7386566 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 7386578 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 7386608 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 7386614 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 7386631 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 7386662 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 7386766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7386770 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7386779 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7386814 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7386859 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7387530 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7387665 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7387758 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7388181 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 7388227 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7388242 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7388290 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7388321 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7388327 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7388412 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7388494 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7388558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7388629 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7388737 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7388757 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 7388758 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 7388854 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 7388911 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7388934 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7388941 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7389057 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7389073 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 7389074 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 7389091 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7389106 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7389135 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7389150 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7389252 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 7389266 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7389332 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7389364 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7389403 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7389445 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7389911 C A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 7389925 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7389942 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7390121 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7390176 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7390186 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7390250 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7390261 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7390292 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7390314 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7390359 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7390367 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7390415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7390429 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7390443 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7390452 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7390460 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7390467 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7390490 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7390492 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7390631 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7390671 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7390682 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7390725 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7390764 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7390890 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7390988 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7391103 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 7391134 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7391244 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 7391280 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 7391320 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 7391498 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7391516 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7391555 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7391562 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7391575 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7391645 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 7391760 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7391793 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7391895 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7391961 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7391996 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 7392025 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 7392122 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 7392672 C T N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 3 7392703 A T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 7392735 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7392905 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7392916 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7392931 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7392969 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 7392998 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7393112 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 7393191 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 7393197 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7393216 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7393261 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 7393295 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7393335 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7393350 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 7393401 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 7393413 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7393419 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7393615 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7394051 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 7394125 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 7394159 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7394205 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 7394238 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 7394262 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7394282 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7394467 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 7394513 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7394551 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 7394593 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7394608 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7394653 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 7394672 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 7394709 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 7394741 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 7394742 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7394935 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 7394943 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 7394993 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7395031 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7395032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7395049 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7395079 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 7395108 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 7395216 G A Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 7395277 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 7395323 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 7395340 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 7395456 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 7395498 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7395642 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 7395643 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7395661 A G Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 7395738 C T Y Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 3 7395739 A G Y Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 3 7395751 T G Y N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 3 7395776 G A Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 7395828 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 7395870 T C Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 7395952 A G Y Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 3 7395959 C T Y Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 7395968 A G Y Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 7395973 G T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 7396002 C T Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 7396011 C A Y N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 3 7396019 A T Y N 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 3 7396186 C T Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 7396298 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 7396364 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7396400 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 7396455 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 7396497 C G Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7396629 G A Y Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 3 7396652 G A Y Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 3 7397011 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 7397028 T G N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 3 7397184 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 7397220 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 7397273 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 7397398 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 7397429 A G Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 7397506 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 7397522 G C Y N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 7397572 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 7397689 C A Y N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 3 7397691 C G Y N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0 0.866666666666667 0.133333333333333 13 17 0 13 2 3 7397778 T G Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 7397804 G A Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 7397925 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 7397938 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7398190 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 7398199 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 7398366 C T Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 7398405 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 7398641 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 7398764 T G Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 7398791 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 7398792 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 7398806 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7398840 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7398849 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7398868 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 7399010 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7399082 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 7399120 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 7399121 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 7399206 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 7399219 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7399250 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 7399292 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 7399378 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 7399416 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 7399444 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7399446 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7399457 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 7399513 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 7399517 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 7399557 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7399560 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 7399625 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 7399670 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 7399779 G C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 7399824 A G Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 7400120 G C Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 7400148 C A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7400214 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7400245 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 7400288 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 7400352 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7400362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7400454 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 7400500 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7400580 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 7400603 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7400605 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 7400799 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 7400814 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 7400952 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 7401063 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 7401119 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 7401126 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 7401138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7401439 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 7401593 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 7401621 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 7401629 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 7401737 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 7401823 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 7401864 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 7401867 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 7401900 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 7402024 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7402048 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 7402256 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7402291 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 7402359 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 7402446 C A N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 7402549 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 7402596 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 7402693 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 7402829 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 7403093 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 7403214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7403691 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7403812 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7403850 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 7403902 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 7404092 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7404140 C A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 7404324 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 7404339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7404406 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 7404621 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7404752 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 7404952 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7405012 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 7405052 T A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 7405168 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 7405177 G C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 7405179 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 7405218 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 7405260 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7405445 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 7405994 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7406004 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7406350 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 7406500 G A Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 3 7407271 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7407282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7407329 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7407347 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7407353 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7407376 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7407384 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 7407437 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7407503 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7407561 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7407565 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7407580 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7407583 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7407596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7407676 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7408072 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7408136 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 7408170 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7408260 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7408479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7408810 C T N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.75 0 0.25 12 4 6 0 2 3 7408958 A G Y Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.75 0 0.25 12 4 6 0 2 3 7408964 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 7408969 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 3 7409843 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 7410770 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7411036 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7411317 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7412428 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7412635 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7413224 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7413843 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7414392 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7415190 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 7415706 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7416980 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7418443 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7420293 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7421099 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7423036 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 7426470 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7426806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7429140 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7429458 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 7430242 A C N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 7432729 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7433294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7435351 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 7435889 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7436187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7436696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7438322 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7439254 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7439790 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7440216 T C Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 7440287 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 7440317 A T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 7440680 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 7441138 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 7445478 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7445548 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 7446018 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7447270 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7448126 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 7449599 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7450868 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 7452107 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7452203 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7452554 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7453061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7453158 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7453159 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7453208 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7453226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7453360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7453535 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7453891 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7453921 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7454384 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 7454437 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 7454484 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 7454617 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7454709 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 7454825 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7454883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7454936 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7455043 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 7455088 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 7455355 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 7455381 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7455485 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 7455517 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7455522 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 7455538 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 7455567 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7455654 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7455673 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 7455786 A C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 7455874 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 7456022 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7456026 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7456128 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7456129 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7456139 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 7456287 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 7456319 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7456587 G C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 7456794 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7456876 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7456896 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7456934 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7457155 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7457192 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 7457212 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 7457491 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 7457569 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 7457599 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 7457832 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 7458210 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 7458486 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 7458502 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 7458504 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 7458648 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 3 7458675 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7458683 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 7459185 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 7459570 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7459908 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 7460018 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 7460034 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 7460275 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 7460296 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 7460464 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7460468 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7460482 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7460530 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7460728 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7460730 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7460831 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7461478 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 7461539 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7461678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7461897 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 7462496 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7462587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7463035 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7463589 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 7464399 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7464471 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 7464915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7465002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7465216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7465366 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7465373 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7465399 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7466070 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 7466768 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7466828 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7467663 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 7468198 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7470227 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 7470301 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 7470328 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 7470364 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7470778 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7472035 A G Y Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0 0.75 0.25 6 10 0 6 2 3 7472316 C A Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 7472531 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7474848 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7475435 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7476624 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7477249 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7483943 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 7484048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7484099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7486273 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 7486274 G T Y N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 7486717 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7487267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7487541 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7488197 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7488916 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7489004 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7489297 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7489312 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7489980 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7490182 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 7490924 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7491642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7491858 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7491951 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7493209 T A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 7493364 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 7493384 C A N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 3 7493388 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 7493542 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7493570 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7494082 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 7494190 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7494271 A G N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 7494509 T A N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 7494558 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 7494576 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 7494584 T A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 7494606 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 7494840 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 7494973 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7495079 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7496663 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7496911 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7496999 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 7497220 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7497344 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 7497551 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 7497614 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 3 7497656 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 7497709 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 7497903 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 7498199 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7498640 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7498742 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7498756 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7498848 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 7498896 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 7498919 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 7499010 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 7499073 A T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 7499161 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7499283 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 7499452 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 7499474 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 7499638 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 7499660 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 7499813 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 7499824 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 7499926 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 7500039 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 7500106 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 7500165 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 7503084 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 7503436 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 7504082 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7504146 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 7504307 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 7504489 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7504595 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 7504614 G C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 7504629 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 7504669 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 7504817 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7504826 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 7504996 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7505000 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7505227 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7505238 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7505255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7505328 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7505345 T A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7505377 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7505384 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7505396 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7505446 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 7505481 A T Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 7505500 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7505513 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7505522 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7505634 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7505678 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7505697 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7505740 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 7505787 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 7505850 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7505899 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 7505932 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 7505944 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 7505995 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7506039 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 7506129 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 7506324 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7506329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7506359 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7506373 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 7506387 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 7506389 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 7506580 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7506586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7506619 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7506669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7506677 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7506706 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7506761 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 7506805 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 7506806 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 7506894 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7506911 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7506921 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 7506971 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7507031 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7507082 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7507085 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7507491 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7507505 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7507533 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 7507551 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7507657 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 7507685 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7507708 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 7507764 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7507816 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 7507831 C T N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 7507989 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 7508059 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7508172 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 7508175 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7508269 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 7508326 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 7508656 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7508691 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7508733 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 7508745 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7508796 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7508808 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 7508837 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7508884 G T Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 7508924 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 7508961 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 7508980 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 7509052 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 7509077 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 7509135 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 7509164 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 7509295 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 7509306 G T N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 7509378 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 7509556 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 7509663 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7509738 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 7510340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7510346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7510366 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7510425 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7510512 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7510545 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7510593 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 7510612 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 7510653 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7510667 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7510718 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7510741 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 7510954 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 7510970 T C N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 3 7510990 A G N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 7511011 C T N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 7511059 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 7511209 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7511224 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7511240 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7511339 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7511349 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7511455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7511530 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 7512008 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7512161 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7512300 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7512319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7512340 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7512641 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7512735 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7512913 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7512942 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 7512943 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 7512978 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 7512987 G C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 7513033 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7513173 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 7513437 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 7513643 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 7513695 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 7513787 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7513871 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7513995 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7514228 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7514373 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7514467 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7514690 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7514697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7514704 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 7514875 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7515284 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7515386 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7515737 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7515914 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 7516170 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7516175 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 7516209 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7516316 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 7516579 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7516728 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7516809 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 7516830 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7516850 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7516975 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7517134 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7517156 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7517289 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 7517716 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 7517731 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 7517875 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7518105 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 7518942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7519348 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7519585 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 7519753 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7519929 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 7520467 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7520594 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 7520932 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7521315 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7521881 A T N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 3 7522177 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 7522214 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7522313 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7522319 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7522422 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7522757 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7522822 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7522839 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7523065 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7523066 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7523309 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7523368 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 7523430 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 7523500 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7523671 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 7523939 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7523958 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7524146 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 7524149 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 7524413 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7524526 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7524695 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 7524725 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 7524781 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 7524933 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 7524934 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 7524990 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 7525007 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 7525014 C A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 7525042 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7525072 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 7525229 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 7525307 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 7525312 T A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 7525332 C G N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 7525519 A T N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 7525529 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 7525593 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7525596 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 7525756 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 7525873 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 7525889 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 7525986 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 7526015 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 7526135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7526535 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 7526536 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7526614 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 7527002 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7527027 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 7527057 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7527180 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 7527213 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7527288 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7527439 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 7527537 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 7527541 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7527552 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7527708 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7527831 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 7527848 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7527866 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 7527886 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 7527907 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7527918 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 7527937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7528174 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 7528532 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7528664 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7529392 T A N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 7529416 C A N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 7529826 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 7530206 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 7530388 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 7530435 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7530678 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7530904 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7531452 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 7532212 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7532280 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7532438 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7532511 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7532533 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 7532635 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7532711 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7532783 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7533000 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7533271 A G N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 3 7533527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7533600 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7533672 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7533706 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7533718 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 7533781 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 7533782 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 7533948 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7534347 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 7534587 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7534755 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7534769 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7534913 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 7534927 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7534970 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7535027 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7535105 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 7535192 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7535264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7535409 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 7535529 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7535537 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7535687 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7535691 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7535704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7535746 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7535813 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7535869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7536146 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 7536159 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7536165 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 7536186 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 7536222 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 7536324 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7536363 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7536414 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7536457 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7536458 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7536542 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7536631 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7536675 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7536760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7536852 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 7536903 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 7536927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7536931 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7536943 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7536956 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7536998 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7537029 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 7537036 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7537061 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 7537112 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 7537139 G T N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 7537508 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7537619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7537669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7537689 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7537722 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7537750 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7537864 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 7537876 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7537890 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7537898 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7537903 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7537941 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7537950 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7538027 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7538067 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7538075 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7538078 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7538089 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7538091 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7538108 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7538118 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7538132 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7538142 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 7538165 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 7538189 G A N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 7538227 G T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 7538307 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7538319 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 7538355 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 7538361 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 7538426 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7538460 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7538506 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 7538509 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 7538538 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 7538884 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 7538899 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 7538944 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7538962 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 7538968 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7539028 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7539032 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7539045 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7539057 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7539287 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7539305 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7539321 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 7539330 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7539544 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7539609 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 7539628 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7539704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7539773 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7539797 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7539817 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7539868 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7539875 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7539927 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7540014 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7540097 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7540156 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7540215 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7540231 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7540337 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7540508 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 7540566 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 7540584 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 7540614 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 7540655 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 7540667 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 7540729 T A N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 7540883 G T N N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 7540977 T G N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 7541075 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 7541104 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 7541141 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 7541174 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 7541184 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 7541288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7541294 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7541413 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7541425 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7541449 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7541534 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7541551 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7541595 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 7541677 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7541678 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7541720 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 7541807 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7541808 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7541859 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7541863 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7541933 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7541951 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 7541985 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7542008 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 7542033 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7542045 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7542132 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7542237 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7542269 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7542276 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7542301 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7542345 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 7542380 G C Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 7542382 A G Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 7542426 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7542428 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 7542477 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7542493 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7542531 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7542605 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7542606 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7542654 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7542662 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 7542693 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7542713 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7542715 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7542778 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 7542866 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 7542907 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7542913 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 7542985 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 7543008 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 7543025 T G Y N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 7543094 A G Y Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 7543112 G A Y Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 7543127 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 7543130 A G Y Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 3 7543154 A C N N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 3 7543174 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 7543175 G T N N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 3 7543189 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 7543251 A G Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 7543298 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 7543321 A C Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 7543376 T A Y N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 3 7543409 G A N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 7543420 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 7543424 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 7543448 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7543456 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 7543471 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 7543526 G A Y Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0 0.6 0.4 6 14 0 6 4 3 7543584 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 7543741 A G Y Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.714285714285714 0.285714285714286 5 9 0 5 2 3 7543743 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 5 7 0 5 1 3 7543772 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 3 7543796 A C Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 7543813 G T Y N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 3 7544702 G A Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 7544777 C A Y N 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 3 7544842 A G Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 7544897 G A Y Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 6 6 2 2 2 3 7546009 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 7546024 G A N Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 7 7 2 3 2 3 7546041 A C Y N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 3 7546061 C T Y Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 3 7546213 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 3 7546243 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 5 7 1 3 2 3 7546972 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 7546980 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 7547508 G C Y N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 7547520 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 7547628 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7547652 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7547653 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7547669 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 7547676 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 7547715 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7547740 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7547764 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 7548022 A G Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 7548045 C G Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 7548053 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7549245 A G Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 7549278 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 7549292 G A Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 7549350 A G Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 7549382 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 7549391 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 7549393 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 7549460 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7549482 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 7549483 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 7549506 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 7549511 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 7549571 G T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 7549737 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7549766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7549918 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7549941 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7549960 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7549981 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7550015 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7550173 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 7550240 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 7550299 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7550373 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 7550396 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 7550550 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 7550616 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7550762 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7550883 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7550957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7551155 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 7551332 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7551616 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7551784 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7552122 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7552129 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 7552146 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 7552194 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 7552368 T A Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 7552451 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7552546 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7552572 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 7552589 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7552591 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7552841 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7552898 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7552909 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7552965 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7553000 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 7553050 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7553128 T A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7553201 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7553397 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7553418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7554519 G C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 7554679 G T Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 7554964 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7555054 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 7555109 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7555140 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 7555206 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7555303 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7555556 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7555775 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7555984 T C Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 7556011 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7556040 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7556060 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 7556120 G T Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 7556132 T A Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 7556166 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 7556221 A G Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 7556256 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 7556257 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7556472 G C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 7556493 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 7556603 G C Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 7556629 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 7556774 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7556825 G T N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 7556863 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 7558572 T C Y Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 3 7558599 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 7558691 A G Y Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 7559687 A G Y Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 7559787 C A N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 7559869 G C Y N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 7560011 G C N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 7560020 G A N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 7560063 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 7560253 G T Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 7560283 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 7560307 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 7560339 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 7560374 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 7560388 C T Y Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 7560449 T C Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 7560461 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7560514 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7560533 G C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 7561049 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 7561120 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 7561177 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 7561242 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7561245 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7561253 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 7561282 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7561340 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7561368 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 7561382 A T Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 7561453 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 7561490 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7561547 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7561548 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7561573 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7561662 C A Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 7561785 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7561796 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7561877 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 7562041 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7562095 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 7562131 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7562173 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7562199 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7562242 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7562271 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7562293 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 7562744 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7562753 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7562835 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 7562879 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 7568411 C T N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 7568648 G T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7568690 T A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7568780 T G Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7568829 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 7568831 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 7568925 T G Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 7569178 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 7569270 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7569297 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7569639 T G Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 7569652 A T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7569778 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7569842 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 7569860 C G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 7569861 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 7569978 T C Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 7570116 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7570263 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 7570631 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7570644 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7570694 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 7570705 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7571180 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 7571198 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7571463 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 7572141 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 7572234 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7572719 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7572828 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 7572909 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 7573012 C G N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 7573593 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 7573826 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 7574014 T A N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 7574283 G C N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 3 7574589 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 7574953 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 7575007 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 7575079 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 7575193 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 7575425 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 7575560 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 7578256 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7578416 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 7578878 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 7579701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7579854 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 7580616 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7580658 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 7580673 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7580711 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 7580718 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 7581127 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 7581236 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7581318 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7581327 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7581565 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7581622 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7581837 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 7582006 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 7582044 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 7582121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7582132 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 7582209 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 7582408 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7582478 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 7582670 A G N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 0.142857142857143 0.214285714285714 20 8 9 2 3 3 7582699 G T N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 3 7582738 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 7583131 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 7583578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7583698 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7583779 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7583790 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 7583914 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7583946 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7584141 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7584152 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7584346 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7584387 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7584477 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7584481 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 7584532 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7584575 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 7584604 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 7585098 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 7585266 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7585274 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7585373 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7585492 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7585607 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 7585692 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7585708 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7585759 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7585781 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7585826 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 7585872 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7585935 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7585952 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7586184 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 7586416 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 7586499 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 7586603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7586866 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 7586893 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7586914 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 7586922 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 7586972 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 7586975 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7587098 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 7587158 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 7587173 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 7587261 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 7587378 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7587385 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 7587431 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7587524 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7587525 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 7587731 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7587812 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 7587932 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7588054 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 7588126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7588127 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 7588182 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 7588323 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 7588552 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 7588767 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 7589638 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7589645 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 7589713 G A N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 7589916 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 7590207 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 7590385 G C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 7590391 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 7590430 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 7590498 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7590516 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 7590616 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7590664 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7590759 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7590936 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 7591061 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 7591090 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7591101 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7591890 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7593548 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7594902 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7595355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7596774 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7597652 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7599424 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7599444 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 7599605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7600195 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7600392 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7600486 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7600545 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7600555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7600560 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 7600613 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7600651 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7600704 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7600776 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7601897 A G Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 7602515 G A Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 7602531 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 7602630 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 7602693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7602796 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 7602819 G A Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 7602853 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7602909 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7602942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7602981 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 7603341 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 7603385 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 7603391 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 7603520 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7603561 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7603564 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 7603697 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 7603782 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7603803 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7603867 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 7603893 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 7603938 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7603970 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7604016 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7604271 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7604272 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7604355 G T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 7604588 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 7608659 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7609853 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 7611826 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7612801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7613434 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7614643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7614795 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7615949 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 7616497 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7616684 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7616960 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7617020 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7617769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7617873 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 7618342 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 7618664 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7619607 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7619920 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7619999 G T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 7620882 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7621267 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 7621779 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 7622152 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7622339 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 7622346 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 7622480 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 7622547 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 7622553 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 7622559 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7622658 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 7622710 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 7622816 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 7622890 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7622913 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 7623143 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 7623166 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 7623304 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 7623556 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 3 7623622 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 7623656 A T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 7623670 G C N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 7623686 A G N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 7623696 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 7623711 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 7623736 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 7623744 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 7624024 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 7624058 C T N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 7624071 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 7624319 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7624347 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 7624361 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 7624393 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.176470588235294 28 6 14 0 3 3 7624629 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 7624631 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 7624803 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 7624908 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 7624935 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 7624947 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 7624993 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 7625018 A C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 7625032 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 7625044 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 7625128 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7625141 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 7625206 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 7625218 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 7625484 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 7625512 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 7625549 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 7625641 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 7625797 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 7625802 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7625844 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 7625978 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7625994 C A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 7625999 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 7626242 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 7626667 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 7627727 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7627900 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7628164 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 7628410 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 7628917 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 7629142 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7630063 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7630146 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7630686 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 7630688 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 7630726 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 7631412 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 7631602 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 7632243 A T N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 7632403 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7632405 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7632469 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 7632491 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 7632509 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7632595 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7632882 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 7632932 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7633151 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 7633748 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7634257 C T N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 7634574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7634780 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 7634890 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7635718 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7635890 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 7636076 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 7636196 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 7636300 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7636603 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 7636634 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 7636646 T A Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 7636779 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7637121 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7637199 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7637350 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7637826 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 7637868 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 7638005 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7638584 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 7638653 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 7638674 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 7638770 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 7639084 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 7639296 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 7639458 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 7639512 A T Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 7639515 G A Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 7639739 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 7639914 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 7640045 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7640053 A T Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7640080 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 7640193 C G Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 7640900 G C Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 7641436 G T Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 7641509 G T Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 7641640 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7641644 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7641755 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7642025 A C Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 7642322 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 7642947 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7643045 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7643349 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7643638 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7645045 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7645367 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7645417 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7645752 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7645917 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7645918 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7648799 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 3 7650660 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 7651432 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7652495 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7654058 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 7656414 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 7657637 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 7657674 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 7657699 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 7658306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7658684 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7659044 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 7660281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7660336 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7660485 A C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 7661153 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7661520 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7661563 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7662195 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7662480 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7662950 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 7663214 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 7664490 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7665095 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7666493 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 7667173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7667188 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7667228 A C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 7667470 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7667541 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 7667557 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 7667586 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7667870 T G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 7667940 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7667973 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 7667976 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7668156 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 7668166 C A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 7668191 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7668249 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7668434 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 7668462 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 7668699 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 7668755 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7668991 T C Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 7669050 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7669173 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7669282 A T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 7669337 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 7669375 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7669385 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7669706 C A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 7669864 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 7669903 T C Y Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 3 7669913 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 7669998 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 7670041 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 7670076 A C Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 7670094 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7670095 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 7670222 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7670247 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7670250 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 7670318 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7670332 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7670372 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 7670408 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 7670635 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 7670658 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 7670817 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 7671168 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 7671225 T C Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 7671482 T C Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 7671484 T G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 7671507 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7671600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7671722 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7671881 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7672004 G A Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 7672110 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 7672246 C G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 7672259 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 7672314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7672353 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 7672370 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7672371 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7672444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7672623 T C Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 7672898 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7673769 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 7674886 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 7675103 G A Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 7675223 T G Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 7675256 T C Y Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.285714285714286 10 4 5 0 2 3 7675401 G A Y Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.375 0.125 0.5 7 9 3 1 4 3 7675881 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 7676291 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7676355 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 7676682 T G Y N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 3 7676798 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7677031 C G Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.176470588235294 0.0588235294117647 0.764705882352941 7 27 3 1 13 3 7677118 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 7677124 A C N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 3 7677174 A G N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.214285714285714 0.0714285714285714 0.714285714285714 7 21 3 1 10 3 7678215 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 7678463 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 7678543 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 7679083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7679098 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7679213 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 7679816 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7679897 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7679969 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 7680041 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7680373 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7680495 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 7681136 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 7681322 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 7681643 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7682636 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 7683832 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7683991 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 7684842 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7685768 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7685843 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7685871 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 7686374 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7686414 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7686599 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7686867 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7686868 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7687240 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 7687517 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7688175 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7688176 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 7688313 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7688321 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7688394 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 7688469 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 7688483 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 7688553 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 7688646 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 7688663 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 7689047 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 7689102 G A Y Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 7689117 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 7689141 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 7689242 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 3 7689244 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 7689448 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7689473 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 7689539 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 7689564 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 7689604 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 7689614 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7689659 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 7689780 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 7689887 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0 0.764705882352941 0.235294117647059 13 21 0 13 4 3 7689936 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 7689958 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 7690190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7690387 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 7690398 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 7690443 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 7690492 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 7690534 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 7690568 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 7690586 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 7690594 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 7690603 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 7690607 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 7690664 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 7690896 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7690953 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7691406 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 7692064 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7693961 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7694035 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7694183 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7694474 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 7694581 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7694737 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7694981 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7695015 A T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 7695485 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 7695914 A G N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 3 7697041 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 7697048 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 7697075 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 7698167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7698285 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7699215 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 7700583 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7701827 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 7704595 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 7704753 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7705542 T G Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 7705898 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7708779 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7709904 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7709951 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7712378 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7713169 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7713536 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7717188 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7719774 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7720155 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 7722488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7722817 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 7723332 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7725215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7726197 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7728126 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 7729152 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7731894 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 7739276 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 7740374 G C Y N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 7746019 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7746474 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 7746604 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7748037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7748055 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 7749891 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7750222 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7750948 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7751106 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7751455 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7751741 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7752783 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7753590 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7753738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7753955 C T Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 7755442 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 7756007 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7756224 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7756580 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7757025 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 7757169 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 7758789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7759943 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 7759995 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7760223 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7761704 C T Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 7762248 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 7764182 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7764967 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 7764994 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 7765118 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 7766566 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 7768324 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 7768917 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7769773 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7770271 T A Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 7770582 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7770688 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7770975 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 7771036 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7771048 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7771544 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7771795 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7772933 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7773170 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7773565 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7773616 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 7773764 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7773795 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 7773878 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 7773903 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7773932 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 7773947 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7774206 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 7774418 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7774457 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7774534 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 7774596 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7774604 A T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 7774611 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7775098 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7779345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7780691 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 7782000 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7783472 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7783914 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7783946 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7784656 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 7786944 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7787048 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 7787192 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7787660 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7787671 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7797454 T A N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 7798015 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7798076 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7798154 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7798212 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7799667 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 7801966 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7802341 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 7802905 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7802909 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7803004 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7803044 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 7803127 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 7803337 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7804099 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 7805365 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7807101 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7807118 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7807142 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7808987 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7812196 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7812722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7814536 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7816449 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7818679 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 7821999 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7823467 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 7824310 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 7824363 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 7824381 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 7824899 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 3 7825050 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 7825209 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7825375 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7825398 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7825415 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7825436 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7825443 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7825476 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7825528 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 7825596 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 7825651 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 7825654 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 7826315 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 7826322 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 7826540 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 7826601 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 7826637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7827070 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7827244 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7827277 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 7827303 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7827304 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7827451 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7827499 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 7827599 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 7827621 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7827670 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7827775 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7827776 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7827818 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7827838 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7827845 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7828072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7828113 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7828189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7828259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7828319 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7828430 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7828463 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7828620 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7828732 T G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7829066 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7829462 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 7829545 C G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 7829571 A T Y N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 7829705 T G Y N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 7829728 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 7829731 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 7829771 T C N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 3 7829895 C A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 7829914 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7830078 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7830125 G C Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7830159 G T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7830272 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7830527 T C Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 7830530 C A Y N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 3 7831327 T G Y N 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 3 7831624 G A Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 7831761 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 7831768 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 7831799 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 7831811 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 7831870 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 7831910 A C Y N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 7831943 A C Y N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 7831964 G A N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 7832029 G T Y N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 7832121 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 7832256 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 7832348 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 7832394 G A Y Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 3 7832493 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 7832498 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 7832661 A C Y N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 7832714 A G Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 7833134 A C Y N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 7833196 T A Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 7833372 C A Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7833472 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7833484 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7833522 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7833581 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 7833592 T A N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 7833595 G C N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 7833712 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 7833716 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 7833953 C T N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 7836795 T C Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 7836815 A C Y N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 7836851 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7836933 T A Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7837070 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7837081 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7837102 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7837397 C T Y Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 10 10 3 4 3 3 7837443 C T Y Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 7837447 C T Y Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 3 7837465 G T Y N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 3 7837603 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 4 8 2 0 4 3 7837765 G T Y N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.285714285714286 0 0.714285714285714 4 10 2 0 5 3 7837822 T G Y N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 3 7837941 G A N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 3 7838042 G A Y Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.222222222222222 0 0.777777777777778 4 14 2 0 7 3 7838057 G C Y N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.222222222222222 0 0.777777777777778 4 14 2 0 7 3 7838078 G A Y Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.25 0 0.75 4 12 2 0 6 3 7838287 C T Y Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 3 7838302 C T Y Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 3 7838342 G A Y Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 5 5 2 1 2 3 7838971 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 3 7839031 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 4 8 2 0 4 3 7839041 T C N Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.5 0 0.5 4 4 2 0 2 3 7839104 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 4 8 2 0 4 3 7839161 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.285714285714286 0 0.714285714285714 4 10 2 0 5 3 7839192 T C Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 3 7839225 T C N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.25 0 0.75 4 12 2 0 6 3 7839403 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 7839444 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 7839460 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 7839474 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 3 7839604 A G Y Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 3 7839616 G A N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 3 7839685 G T N N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.285714285714286 0 0.714285714285714 4 10 2 0 5 3 7839768 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 3 7839777 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.285714285714286 0 0.714285714285714 4 10 2 0 5 3 7839887 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 5 13 2 1 6 3 7839929 A T N N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.285714285714286 0 0.714285714285714 4 10 2 0 5 3 7840159 G A Y Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.222222222222222 0 0.777777777777778 4 14 2 0 7 3 7840282 C T Y Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.375 0.125 0.5 7 9 3 1 4 3 7840326 G T Y N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 3 7840334 C A Y N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 3 7840420 G T Y N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.25 0 0.75 4 12 2 0 6 3 7840444 T A Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 7840478 G A Y Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.25 0 0.75 4 12 2 0 6 3 7840602 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7840754 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7840827 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 7841008 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7841213 C T Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 7841271 G T Y N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 7841493 C G Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 7841545 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 7841719 G T Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7841818 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 7842132 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 7842216 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7842241 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7842267 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7842308 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 7842317 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7842362 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 7842649 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7842666 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 7843022 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7843426 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 7843434 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7843842 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 7843910 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7843911 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7844121 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 7844125 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 7844515 T C Y Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 3 7844546 G A Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 7844831 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 7844931 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7845072 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 7845506 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7845747 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 7845958 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7846232 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 7846370 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7846405 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7846471 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7846479 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 7846617 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7846753 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7846774 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7846802 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 7846852 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7846893 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7847169 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7847199 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7847204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7847260 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7848511 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 7848547 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 7848725 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 7848726 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 7848843 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7848900 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7849054 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7849060 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7849102 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 7849292 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7849426 A T Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 7849432 A C Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 7849491 T A Y N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 7849528 C T Y Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 7849728 A C N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 7849772 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 7849818 T C Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 7849914 A C Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 7849923 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 7849984 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 7850052 C A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 7850149 G C N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 7850266 C T Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 7850287 A T Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 7850475 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 7850758 A G Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 7850885 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 7850898 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7850942 A T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7851064 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 7851098 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 7851138 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7851162 C T Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 7851351 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7851358 A G Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 7851510 G A Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 7851556 C A Y N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 7851586 C A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 7851594 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7852327 T C Y Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 3 7852365 A C Y N 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 3 7852597 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 7852914 T A Y N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 7852980 A G Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 7852997 G T Y N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 7853053 A T Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 7853071 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7853109 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7853142 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7853163 T G Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 7853207 C A Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 7853227 C T Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 7853284 G T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7853289 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7853331 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 7853352 A G Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 7853533 C T Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 7853737 G T Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 7853848 C G Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 7853866 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 7853949 G T Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7854302 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7854307 C G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7854373 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 7854424 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 7854529 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7854684 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 7854775 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 7854901 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 7854906 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7854926 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7854931 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7855073 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7855090 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7855091 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7855101 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7855303 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7855358 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7855855 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7856015 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7856183 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7856441 T G N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 7856457 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 7863497 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 7863592 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7863622 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7863636 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7863660 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7863663 T G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7863756 G C Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7863802 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7863807 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7863946 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7863956 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 7864177 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7864226 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7864355 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7864361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7864538 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7864610 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7864615 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7864704 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7864780 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7864878 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7864938 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7864978 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7865145 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7865173 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7865225 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7865300 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7865555 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7865556 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 7865578 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 7865619 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7865852 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7865877 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7865952 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7866297 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7866773 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7866879 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 7866928 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7866945 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7867042 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7867060 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 7867071 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 7867133 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7867238 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7867332 G C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 7867348 A C N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 7867461 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 7867551 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 7867779 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 7867794 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 7867900 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7868039 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7868416 G C Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 7868424 C G Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 7868436 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 7868552 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7868582 A C Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7868685 A T Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7868686 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7868721 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 7868765 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7868779 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 7868804 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7868810 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7868970 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7869041 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 7869059 C A Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7869198 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 7869328 G T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 7869353 C G Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7869355 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7869394 A G Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 7869429 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 7869561 G T Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 7869660 T A Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 7869680 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 7869772 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 7869894 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 7869953 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 7870036 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7870061 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7870074 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7870076 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7870185 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7870232 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7870238 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7870380 T C Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 7870406 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 7870458 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7870495 C T Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 7870564 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 7870678 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 7870709 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7870710 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7870767 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 7870791 T G Y N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 7871066 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 7871108 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7871149 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7871150 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 7871253 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7871256 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7871300 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7871317 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7871404 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7871811 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 7871881 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 7872101 A C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7872125 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7872183 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7872277 T G Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7872315 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 7872394 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 7872520 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7872550 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 7872570 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7872678 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7872825 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7872835 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7873142 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 7873272 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7873288 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7873338 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7873505 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7873539 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7873636 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 7873831 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7873832 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7873892 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7873903 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7874045 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7874114 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7874123 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7874206 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7874330 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 7874393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7874688 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 7874898 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7875457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7875582 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7875655 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7875676 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7875687 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 7875911 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 7876209 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 7876230 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 7877822 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7877964 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7878220 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 7878234 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 7878262 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7878377 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 7878430 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 7878860 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7878952 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 7879000 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 7879138 C G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 7879248 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 7879365 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 7879405 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 7879419 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 7879568 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 7879601 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 7879629 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7879630 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7879643 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 7879661 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7879710 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 7879835 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 7879862 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7879864 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 7879940 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 7879949 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 7879952 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 7879971 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 7879980 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 7880019 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7880065 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 7880071 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7880106 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 7880130 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7880167 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 7880234 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 7880246 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 7880397 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 7880420 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 7880512 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 7880573 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 7880669 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 7880742 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 7881125 C A N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 7881154 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 7881181 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 7881270 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 7881284 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 7881354 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 7881406 C A N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 7881478 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 7881545 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 7881560 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 7881617 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 7881631 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 7881643 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 7881675 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7881685 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 7881686 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 7881750 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 7881810 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 7881835 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 7881857 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7881906 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7882039 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 7882057 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 7882107 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 7882146 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 7882169 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 7882249 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 7882384 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 7882510 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 7882598 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 7882618 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 7882711 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 7882825 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 7882874 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 7882930 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 7882963 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 7883135 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 7883178 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7883278 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 7883321 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 7883329 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 7883410 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 7883422 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7884018 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7884164 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 7884325 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 7884372 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7884760 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 7884972 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 7885043 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 7885054 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 7885075 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 7885108 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 7885165 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7885442 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7885499 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 7885538 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 7885617 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 7885639 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 7885689 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 7885778 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 7885946 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 7886007 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7886038 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 7886209 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 7886253 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 7886268 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 7886342 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 7886388 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 7886425 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 7886459 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 7886484 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 7886513 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 7886605 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 7886680 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 7886765 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 7887140 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 7887144 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 7887253 C G N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 7887452 T G N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 7887461 C A N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 3 7887583 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 7887643 A T N N 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.0909090909090909 0.636363636363636 0.272727272727273 9 13 1 7 3 3 7887653 G A N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 8 12 2 4 4 3 7887672 T G N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 7887692 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 7887926 C T N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 3 7887980 T C N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 3 7888195 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 7888339 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 7888384 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 7888449 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7888532 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 7888568 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 7888619 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7888637 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 7888690 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 7888832 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 7888955 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 7888962 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7889042 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 7889047 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 7889058 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 7889121 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 7889265 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 7889332 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 7889367 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 7889463 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 7889921 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 7890076 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 7890099 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7890150 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7890168 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 7890171 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 7890196 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 7890203 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 7890431 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 7890433 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 7890460 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 7890488 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 7890516 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 7890544 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 7890583 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 7890599 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 7890830 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7890944 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 7891077 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 7891187 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 7891298 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 7891357 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7891398 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 7891452 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 7891467 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 7891496 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7891540 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 7891651 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 7891680 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 7891684 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 7891909 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 7891965 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 7892016 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7892024 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7892069 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 7892181 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 7892354 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7892475 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 7892561 T A N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 7892609 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 7892640 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 7892675 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 7892728 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 7892817 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7892883 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 7893016 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 7893258 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7893568 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7893631 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 7893678 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 7893703 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 7893794 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 7893806 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 7893841 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7893858 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 7893936 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7893938 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7893962 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7893966 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7894022 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 7894285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7894393 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 7894871 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 7894886 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 7895033 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 7895165 C G N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 7895285 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 7895375 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7895409 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7895666 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7895717 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7895819 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7896052 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 7896060 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7896126 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7896129 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7896183 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 7896241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7896269 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7896848 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7897614 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 7898053 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 7898347 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7898437 G T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 7899063 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 7899335 G C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 7899347 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 7899901 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7900033 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7900103 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7900173 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 7900208 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 7900325 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7900459 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7900514 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7900608 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7900611 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 7900710 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7900721 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7900755 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7900812 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7901184 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7901197 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 7901538 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7901688 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7901742 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7901745 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 7901813 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7901909 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7901948 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7901970 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7901989 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 7902034 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7902118 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7902132 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7902178 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 7902318 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7902539 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7902549 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7903185 C A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 7903214 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 7903431 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7903435 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7903471 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7903505 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7903556 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7903602 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7903818 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7904188 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7904314 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 7904353 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 7904362 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7904449 A G Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 7904467 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7904475 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7905010 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7905033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7905091 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7905196 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 7905243 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 7905405 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7905497 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7905543 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7905553 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7905625 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 7905734 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 7905861 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 3 7905898 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 7905899 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 7906138 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7906295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7906321 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 7906405 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 7906423 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 7906426 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 7906466 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 7906807 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 7906821 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 7906890 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 7906924 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7906936 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 7906969 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7907021 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 7907027 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 7907079 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 7907170 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 7907558 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7907604 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7907739 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7907752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7907931 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 7907978 T G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 7908178 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7908291 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7908413 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7908422 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 7908989 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 7909232 G A N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 3 7909251 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 7909258 G A N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 15 9 6 3 3 3 7909281 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 3 7909310 T C N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 3 7909475 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 7909487 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 7910254 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7910290 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 7916621 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 7916666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7916768 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 7916887 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 7916910 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 7916911 T A N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 7917002 T A N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 7917150 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 7917255 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 7917436 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 7917607 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 7917640 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 7917857 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 7917906 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7918040 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7918158 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7918794 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7918829 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 7918984 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7919032 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 7919303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7919341 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7919347 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7919600 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7919879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7920074 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7920281 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7921263 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7921437 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7921463 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7921602 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7921756 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 7921933 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 7921960 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7922127 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 7922388 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7922588 G T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 7922626 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 7922713 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 7922883 A C N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 7922920 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 7922922 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 7923006 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 7923157 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 7923602 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7923729 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7923817 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 7923847 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 7923989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7924012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7924248 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 7924406 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 7924527 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7924854 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 7924855 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 7924889 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7925022 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7925122 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7925135 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7925499 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 7925518 C G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 7925915 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 7926205 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 7926234 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 7926262 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 7926564 A G N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 7926568 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 7926822 C A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 7926828 G T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 7926850 A C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 7927000 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 7927012 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7927243 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7927265 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7927312 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 7927388 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 7927585 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 7927669 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 7927837 A T N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 7927916 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 7927949 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 7927959 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 7928074 A C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 7928098 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 7928111 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 7928116 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 7928129 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 7928130 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 7928230 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7928301 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 7928318 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 7928367 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7928374 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7928386 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7928396 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7928398 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7928412 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7928416 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7928432 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7928461 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7928510 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 7928514 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7928529 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7928681 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7928719 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7928785 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7928991 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7929182 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7929220 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7929392 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 7929409 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 7929415 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 7929506 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 7929565 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 7929577 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 7929586 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 7929590 C G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 7929877 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 7929894 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 7929943 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 7929992 G C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 7930053 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 7930112 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 7930160 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 7930204 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 7930293 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 7930296 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 7930318 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 7930326 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 7930433 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 7930673 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7930728 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7930754 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7930770 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 7931013 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 7931046 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 7931066 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7931072 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7931415 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 7931549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7931562 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7931584 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 7931591 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7931612 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7931616 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7931708 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7931768 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7931855 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 7931917 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7932001 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 7932289 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 7932444 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 7932479 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 7932678 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 7932692 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 7932783 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7932977 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 7933029 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 7933085 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7933090 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7933155 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7933216 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7933312 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 7933356 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 7933365 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 7933473 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 7933526 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 7933901 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 7933941 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 7933982 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 7934038 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 7934560 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7934960 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 7935027 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 7935112 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 7935383 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 7935392 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 7935458 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 7935509 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 7935537 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 7935550 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 7935580 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 7935600 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 7935626 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 7935703 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 7935746 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 7935783 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 7935809 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 7935987 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 7936014 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 7936124 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 7936844 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7937184 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 7937328 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 7937393 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 7937550 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7937798 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7938028 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7938454 G C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 7938924 G A N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 7939381 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7940253 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7940593 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7941399 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7941411 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 7941948 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 7941950 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 7942302 T G N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 7942714 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7942931 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7944136 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 7944210 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7944528 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7944674 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7949218 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 7949292 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 7949349 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7949372 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7949493 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 7949725 G A Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 7949805 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 7950019 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7950116 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 7950157 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7950216 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 7950230 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7950317 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7950320 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7950444 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7950460 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7950517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7950580 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7950638 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 7950680 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7950694 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7950696 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7950739 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7950743 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7950757 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 7950763 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 7950820 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7950824 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7950860 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 7950872 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 7950911 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7950935 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7950946 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7950953 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 7950968 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7951012 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7951053 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 7951064 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7951189 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 7951284 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 7951318 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 7951323 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 7951388 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 7951448 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 7951459 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 7951521 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 7951574 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 7951601 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7951629 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 7951637 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 7951920 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 7952040 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 7952058 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 7952076 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 7952353 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7952564 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 7952582 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 7952611 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 7952883 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 7952934 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7953361 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7953528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7953529 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7953659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7953673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7953727 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7953786 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 7953807 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 7953812 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7953842 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7953896 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7953919 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 7953931 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 7953982 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 7953984 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 7954276 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7954331 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7954458 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7954558 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7954705 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 7954895 A T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 7955107 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7955170 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 7955215 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7955228 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7955261 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7955317 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7955407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7955417 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 7955489 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 7955544 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 7955804 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7955903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7955910 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7955996 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7956039 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7956138 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 7956163 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 7956200 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7956983 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 7957279 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 7957371 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7957603 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7957813 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 7958067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7958644 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 7958729 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7958784 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 7958803 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7958814 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 7958876 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7959082 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7959650 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 7959992 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 7960406 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7960576 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 7961344 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 7961967 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 7962091 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 7962201 G T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 7962619 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 7962620 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 7963138 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 7963783 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 7964249 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 7964787 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 7964856 T A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 7965193 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 7965227 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 7965414 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 7965490 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7965562 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 7965564 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 7965580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7965604 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7965630 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7965672 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7965680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7965684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7965730 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7965734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7965790 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7965799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7965847 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7965852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7965896 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7965991 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7966006 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7966051 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7966072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7966119 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7966196 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 7966391 T C N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 7966502 A G N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 7966573 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 7966670 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7966699 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7966765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7966785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7966789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7966802 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7967208 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 7967314 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 3 7967374 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 7967452 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 7967487 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7967500 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7967570 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7968294 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7969226 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7969964 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 7969970 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 7971026 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 7971144 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 3 7971724 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 7972452 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 7973001 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 7973073 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7973212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7973255 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 7973452 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7973790 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.235294117647059 0.117647058823529 0.647058823529412 10 24 4 2 11 3 7974113 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 7974127 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 7974553 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 7974889 C T Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 7976557 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7976729 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 7976763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7976815 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7976818 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7976831 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7976944 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7977222 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 7977242 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 7977732 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 7977766 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 7977861 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7977877 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 7978547 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7978752 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 7978791 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 7978803 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7979095 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 7979122 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 7979173 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 7979200 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 7979345 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7979400 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 7979526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7980350 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7980489 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7981851 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7985012 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7985305 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7985526 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7986783 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7987170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7987322 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7988016 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 3 7988810 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 7988888 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7989173 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 7989502 A T N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 7989680 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 7989685 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 7989702 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 7989775 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 7990024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7990068 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7990135 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7990236 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7990471 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7990701 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7990864 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7990879 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7990943 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7990964 T G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 7990976 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 7991261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7991288 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7991386 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7991638 T A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 7991750 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 7991927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7991973 T A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 7992075 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7992118 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7992174 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 7992196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7992350 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7992598 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 7992760 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 7993330 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 7993861 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7994014 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 7994326 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7995082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7995107 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 7995193 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7995217 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7995284 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 7995338 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7995457 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 3 7995553 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7995932 C G Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 7996275 T C Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 7997974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7998217 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 7998342 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 7998752 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 7999157 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 7999228 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 7999584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8000560 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 8000652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8000983 A C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8000990 C A Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8000996 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8001076 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 8001378 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8001727 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 8002018 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8002246 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8003393 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8003530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8003993 T A N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.0666666666666667 0.733333333333333 0.2 13 17 1 11 3 3 8004732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8005319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8005741 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 8005797 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 8005970 T A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 8005976 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 8006568 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 8006569 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 8006579 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8006879 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 8006913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8007582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8007632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8008518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8008783 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8009435 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8010274 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8010577 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8010675 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8010705 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8011360 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8011394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8011559 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8011568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8011856 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 8012288 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 8012338 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 8012477 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 8012552 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 8012662 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8013637 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 8013661 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 8013664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8013732 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 8014511 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 8015821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8016493 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8016536 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8016685 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 8016861 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.176470588235294 28 6 14 0 3 3 8016897 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8016935 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 8016970 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8017004 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8017154 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8017331 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 8017338 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 8017354 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 8017356 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 8017418 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 8017514 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 8017537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8017566 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8017648 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 8017658 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8017771 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8017851 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 8017873 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8017913 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8018028 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8018280 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8018318 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 8018481 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8018574 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 8018668 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 8018759 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8018774 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8018827 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8018925 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8018928 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 8018996 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 8019022 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 8019028 G A N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 8019166 C T N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 8019262 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 8019327 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 8019391 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 8019434 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 8019483 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 8019486 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8019604 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8019625 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 8020224 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 8020288 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 8020292 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 8020348 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 8020368 C T Y Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.285714285714286 0.0714285714285714 0.642857142857143 9 19 4 1 9 3 8020408 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 8020433 G A Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 3 8020441 G A Y Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.2 0.0666666666666667 0.733333333333333 7 23 3 1 11 3 8020472 C T Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 8020483 G T Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 8020494 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8020555 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 8020592 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8020672 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8020719 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 8020775 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8020870 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 8020979 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 8021287 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 8021288 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 8021314 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 8021328 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 8021331 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 8021355 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 8021385 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8021466 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8021476 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8021535 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 8021543 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 8021558 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8021733 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 8021751 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 8021828 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 8021928 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 8022048 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 8022062 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.166666666666667 0.777777777777778 0.0555555555555556 20 16 3 14 1 3 8022118 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 8022170 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 3 8022268 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 8022345 A C N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 3 8022377 A G N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 3 8022455 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 8022519 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 3 8022632 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 8022729 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8022814 C G N N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0.2 0 0.8 2 8 1 0 4 3 8022826 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 8022833 C T Y Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 7 7 2 3 2 3 8022917 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 8022957 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 8022963 G C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.235294117647059 25 9 12 1 4 3 8023007 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 8023012 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 8023038 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 8023066 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 8023089 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8023361 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 8023407 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 8023532 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 8023622 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8023736 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 8023921 C A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 8024034 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 8024400 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 8024420 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 8024488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8024498 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 8024549 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 8024586 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 8024652 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 8024712 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 8024752 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 8024880 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 8025017 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 8025023 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 8025050 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8025207 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 8025396 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8025864 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8025884 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 8025916 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8025959 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 8025967 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 8026088 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 8026382 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 8026506 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 8026671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8026882 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 8027004 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 8027011 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8027155 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0 0.941176470588235 0.0588235294117647 16 18 0 16 1 3 8027253 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 8027260 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 8027314 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8027332 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 8027334 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8027513 A C Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.8 0 0.2 24 6 12 0 3 3 8027622 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 8027671 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 8027846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8028149 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 8028330 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 8028386 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 8028525 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 8028560 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 8028561 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 8028583 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 8028767 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 8028793 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 8028816 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 8028924 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 8029048 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8029061 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8029094 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 8030348 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 8030951 C T N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 8031036 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 8031249 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 8031837 A G Y Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 3 8031973 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 8032057 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 14 18 0 14 2 3 8032185 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 8032407 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 8032444 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 8032487 G T N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 3 8032736 C G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 8032740 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 8032796 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 8032823 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 8032845 C A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 8032944 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 8033159 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 8033225 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 8033235 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 8033309 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 8033356 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 8033466 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8033667 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 8033693 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8033700 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 8033704 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 8034126 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 8034181 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 8034370 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 8034403 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 8034568 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 8034722 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 8034880 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 8035204 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8035269 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 8035334 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 8035352 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 8035358 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.263157894736842 0.0526315789473684 0.684210526315789 11 27 5 1 13 3 8036116 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8036345 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.294117647058824 0.0588235294117647 0.647058823529412 11 23 5 1 11 3 8036346 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8039646 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 8039765 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8040819 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 8040889 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8041209 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 8041809 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8044648 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 8048331 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8048574 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 8048952 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8049487 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 3 8049783 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8050191 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.25 0.05 0.7 11 29 5 1 14 3 8050343 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8050511 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8051613 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.25 0.05 0.7 11 29 5 1 14 3 8051755 C G Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.263157894736842 0.0526315789473684 0.684210526315789 11 27 5 1 13 3 8051768 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 3 8051810 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8052047 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8052106 C A Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 8052668 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8053208 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 8057209 C T N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 8057491 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 8057797 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8059744 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 8059826 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8060751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8061236 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8061299 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8061370 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 8062507 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8062856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8065821 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8066269 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 8066366 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8067997 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 8068001 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 8068010 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 8068022 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 8068363 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 8068678 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8068971 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 8069233 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 8069343 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 8069441 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 8069534 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 8069674 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 8069683 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 8069724 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 8069743 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 8069748 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 8069805 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 8070670 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 8071266 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8071330 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 8071361 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 8072217 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 8072219 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 8072234 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 8072313 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8072381 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 8072455 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 8072461 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 8072637 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 8072651 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 8072674 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 8072898 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 8073589 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 8073967 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 8074050 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 8074116 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 8074632 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 8074910 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 8075244 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8075312 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8075396 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8075501 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8075652 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.263157894736842 0 0.736842105263158 10 28 5 0 14 3 8075801 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8076411 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8076922 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8078071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8078497 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8079041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8080143 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8080178 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 8080189 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8082340 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8082554 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8082901 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8083346 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8083481 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8088082 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8088239 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 8088402 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8089165 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 3 8089736 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8089787 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8089893 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8089900 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8089967 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 8090066 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.176470588235294 0.0588235294117647 0.764705882352941 7 27 3 1 13 3 8090132 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 8090155 A G Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 8090163 A G Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 8090194 T C Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.176470588235294 0.0588235294117647 0.764705882352941 7 27 3 1 13 3 8090328 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8090345 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 8090386 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 8090407 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8090419 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8090445 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8090487 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 8090497 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 8090534 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8090572 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 8090582 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 8090720 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 8090876 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 8090914 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 8090958 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 8090979 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8090995 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8090998 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8091090 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8091101 T G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8091122 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8091157 T A Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 8091291 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 8091355 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 8091420 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 8091421 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 8091438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8091520 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8091566 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8091579 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8091596 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 8091599 C T Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 3 8091651 A G Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.176470588235294 0.0588235294117647 0.764705882352941 7 27 3 1 13 3 8091661 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 8091667 C T Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 8091677 A G Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 8091848 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 8091977 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 8092046 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.157894736842105 0 0.842105263157895 6 32 3 0 16 3 8092101 G T Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 8092109 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8092203 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8092265 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 8092346 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 8093791 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 8093828 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 8093841 C G N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 8093947 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 3 8094006 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 8094011 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 8094041 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 8094089 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 8094163 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 8094191 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8094220 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 8094230 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 8094310 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8094325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8094348 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8094353 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8094373 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8094378 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 8094384 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8094397 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8094444 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8094504 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8094518 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 8094581 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 8094592 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8094610 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 8094722 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 8094826 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 8094847 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 8094954 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8094963 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8094980 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 8094989 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 8095015 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8095038 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 8095094 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8095174 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8095200 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8095247 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8095313 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8095377 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8095389 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8095448 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8095607 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8095695 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8095749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8095768 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 8095807 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 8095971 A T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 8096039 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8096046 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 8096073 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 8096144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8096188 G C Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 8096211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8096400 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 8096428 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8096430 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 8096457 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 8096539 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 8096680 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 8096774 T A Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 8096832 C T Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 8097082 T A Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 8097175 G A Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 8097784 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8097857 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 8097928 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8097986 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 8098008 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 8098076 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 8098127 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8098215 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.157894736842105 0 0.842105263157895 6 32 3 0 16 3 8098329 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 8098443 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 8098467 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 8098743 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 8098770 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 8098837 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8098933 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8098999 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8099001 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8100045 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8100321 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8102096 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8102444 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8102519 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 8102596 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 8102852 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 8102885 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8102913 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8103089 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 8103117 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 8103257 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 8103315 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 8103482 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 8103704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8104024 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8104434 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8104511 C G Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 8104540 A T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 8104836 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 8104964 C A Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 8105158 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 8105178 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8105296 T G Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 8105363 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8105493 G C Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 8105584 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 8106289 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8106340 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 8106483 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8106532 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 8107755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8107843 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8108088 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 8108376 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8108852 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 8109019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8109202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8109344 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 8109486 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8110298 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8110661 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 8110670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8111269 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8111369 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8111399 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 8111450 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8111804 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8112105 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 8112150 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8112193 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8112231 C G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 8112417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8112830 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 8113152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8113176 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8113381 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8113426 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 8113533 T G N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 8113724 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 8113887 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 8114097 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 8114266 A T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 8114290 T C Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 8114301 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 8114591 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8114762 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 8114779 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8114881 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8114980 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8115064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8115084 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8115091 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8115100 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 8115126 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8115388 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8115528 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 8115561 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8115565 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8115751 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8115845 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8116063 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8116131 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8116269 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 8116334 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 8116450 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8116678 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 8116741 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8116918 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8116920 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8116954 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8117007 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8117084 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8117103 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8117116 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 8117250 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 8117270 A G Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 8117543 A T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 8117864 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8118027 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8118444 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 8118452 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 8118456 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8118555 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8118569 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 8118608 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 8118716 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 8118735 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 8118838 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 8118865 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 8119014 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8119090 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 8119154 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8119180 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8119540 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8119568 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 8119667 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 8119729 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8119885 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 8120368 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8120381 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8120633 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8120635 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8120701 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8120732 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8120793 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8120866 T A N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0 0.642857142857143 0.357142857142857 9 19 0 9 5 3 8120908 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8120923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8120930 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8120960 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8121011 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8121015 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8121060 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8121827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8121847 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8122074 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8122145 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8122160 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8122274 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8122328 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8122389 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8122585 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 8122610 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8122614 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8122734 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8123167 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8123257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8123297 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 8123341 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8123391 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8123403 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8123430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8123503 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8123515 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8123538 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8123602 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8123612 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8123646 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8123649 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8123716 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8123764 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 10 20 0 10 5 3 8123783 G A N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0 0.8 0.2 8 12 0 8 2 3 8123831 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8123884 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8123906 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8123955 G T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 8123975 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8124014 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 8124164 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8124283 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8124364 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8124388 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8124390 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8124400 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8124418 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8124421 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8124435 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8124438 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8124455 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 8124481 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8124503 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 8124532 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8124595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8124654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8124774 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8124972 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8124977 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8124986 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8125220 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8125229 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8125437 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 8125570 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 8125682 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 8125728 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 8125748 G T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 8125809 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 8125823 G A N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 8125857 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 8125861 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 8125888 A T N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 8125959 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 8126041 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 8126187 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 8126189 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 8126246 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 8126277 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8126280 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 8126295 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 8126343 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8126375 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 8126401 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8126413 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8126456 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 8126474 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 8126543 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8126598 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 8126638 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 8126759 T C N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 8126775 A T Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 8126842 T G N N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 8126922 C T N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 8126944 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 8126946 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 8127089 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 8127203 C T Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 8127228 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 8127262 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 8127263 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 8127373 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 8127385 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 8127514 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 8127667 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8127762 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8127778 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 8127955 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8128033 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8128035 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8128062 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8128075 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8128088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8128134 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8128152 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8128240 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8128298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8128454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8128465 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8128522 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8128579 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8128585 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8128769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8128797 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8128827 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8128850 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8128873 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8128903 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8129125 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8129322 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 8129332 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 8129334 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 8129394 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8129438 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8129502 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8129559 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8136516 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8136527 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8136531 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8136549 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8136626 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8136769 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 8136822 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 8136829 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 8136911 G A N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 8136969 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 8137037 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 8137045 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 8137060 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 8137108 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 8137120 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8137155 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8137227 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8137248 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 8137450 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 8137533 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8137626 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8137714 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8137764 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8137769 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8137787 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8137873 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8137884 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8138079 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8138125 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8138233 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8138290 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8138411 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8138412 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8138488 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8138541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8138694 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8138754 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8138826 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8138935 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8139633 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8139716 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8139991 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8140091 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8140227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8140441 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8140542 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 3 8141362 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 8141369 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 8141725 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8141794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8142015 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8142019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8142146 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8142197 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8142233 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8142610 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8142669 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8142693 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 8142789 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8142966 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 8143007 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8143049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8143163 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8143355 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8143388 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8143554 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 8143664 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8143793 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8143875 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 8143885 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8143886 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8143911 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8144002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8144068 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 8144266 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8144393 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8144412 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8144432 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8145074 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8145098 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 8145341 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8145415 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 8145552 A C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 8145570 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 8145620 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 8145622 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 8145637 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 8145640 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8145714 G A Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 8145754 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 8145772 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 8145787 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 8145825 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8145833 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8145848 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 8145893 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 8146033 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 8146044 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 8146212 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8146229 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8146273 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 8146277 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 8146445 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 8146465 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 8146482 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8146489 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 8146684 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 8146726 T G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 8146784 A C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 8146839 C T Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 8146851 A G Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.214285714285714 21 7 10 1 3 3 8146909 C G Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 3 8147427 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 8147475 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 8147574 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 8147671 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 8147709 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 8147907 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8147963 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 8148549 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8148567 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8149131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8149446 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 12 24 0 12 6 3 8150047 T G N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 8150099 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 8150117 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 8150158 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 8150223 C A Y N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 8150271 C A N N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 5 15 2 1 7 3 8150330 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 8150372 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 8150427 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 8150435 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8150557 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 8150725 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 8150733 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 8151350 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8151376 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 8151462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8151671 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8151707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8151741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8152234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8152614 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8153393 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8153515 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 8153709 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 8153838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8154682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8154845 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8155659 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8155969 C G Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 8156867 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8156949 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8157376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8159810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8160012 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8160112 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 8161162 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8167490 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 8170236 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8173640 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8173859 T C Y Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.125 0.6875 0.1875 15 17 2 11 3 3 8174162 G A Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 8175068 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 8175517 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8176169 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 8179015 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8181994 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8182870 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 8184557 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8191414 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 8191485 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 8194030 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 8194416 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8194419 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 8195582 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8195766 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8196736 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 8197259 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8200006 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8200295 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 8200773 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 8202650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8203146 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8203578 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 8204988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8205880 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8207317 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 8207841 A T N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 8209078 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 8209359 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 8209369 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 8210240 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.133333333333333 0 0.866666666666667 4 26 2 0 13 3 8210587 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8210912 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8212143 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8222932 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8223475 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 8223538 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8227654 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 8228226 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8229269 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8229514 G T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 8229725 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8229902 C G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8229912 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8230456 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 8230984 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8233595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8234225 T A Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 8234521 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 8234546 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 8234780 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 8234912 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 8234949 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 8235028 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 8235052 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 8235076 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 8235159 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 8235338 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 8235408 A T N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 3 8235505 G T N N 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 3 8236561 A G N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 8236565 A G N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 8237159 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 8237277 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 8237338 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 8239433 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 8239639 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8239741 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 8239810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8239816 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 8240452 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 8240490 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 8240562 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 8240623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8240707 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 8241129 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 8242181 A C Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 8242495 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 8242950 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 8244483 C A Y N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 8246845 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 8246867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8246993 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 8247094 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 8247126 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 8247292 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 8247372 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 8247387 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 8247395 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 8247429 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 8247646 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 8247758 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 8248212 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 8248382 T G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 8248610 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 8248732 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 8248803 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 8249237 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 8249423 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 8249724 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 8249942 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 8250070 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 8250291 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 8250623 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 8250659 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 3 8250785 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8251191 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 8251254 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 8251319 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 8251407 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 8251464 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8252791 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.133333333333333 26 4 13 0 2 3 8253492 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 8253536 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 8253679 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 8253696 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8254403 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8255099 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8255145 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 8256985 T G N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 8257008 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 8257036 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 8257184 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 8257513 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 8257764 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 8257853 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8258477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8258649 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8258675 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 8259113 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 8259241 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 8259266 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 8259347 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 8259737 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 8259986 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8260234 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8263019 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8263634 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8264046 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8265127 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8266647 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8266673 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 8266701 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 8266737 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8266804 C G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.176470588235294 0.0588235294117647 0.764705882352941 7 27 3 1 13 3 8267026 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8267704 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8268082 C T N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.153846153846154 0.846153846153846 0 15 11 2 11 0 3 8269493 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8269587 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8270483 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8270573 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8270706 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8270856 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 8270874 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 8270889 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 8270926 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8271159 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8271807 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 8272221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8272631 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 8272634 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8273393 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 3 8275541 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8275582 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 8275608 A G N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 8276034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8276567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8277205 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8278803 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8278975 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8279909 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 8282044 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8282369 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 8282717 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8284105 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8284385 G C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 8285771 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8287307 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8287472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8288716 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8293122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8293436 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8296615 G T Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 8297112 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8310871 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 8311729 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 8313253 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 8313316 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 8313441 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 8313899 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8314872 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8315763 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8317789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8318842 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8319093 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8319147 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8319355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8319606 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8320030 C G Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 8321654 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8322412 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 8325309 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8325799 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 8326120 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8327885 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 8330591 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8331071 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 8331155 C A Y N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 8331366 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8331988 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 4 2 2 0 1 3 8332011 T C Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 8332241 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8332717 C T Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 8332795 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 8333297 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8333393 T G Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 8333712 G A N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 3 8333755 G T Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 8335159 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8335302 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8336835 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 8336840 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8336891 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8337178 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8337243 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 8337309 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 8337404 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 8338492 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 3 8338493 G A Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 8338521 T G Y N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 8338525 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 8339478 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 8339977 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8340103 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8340210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8340558 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8340585 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8340774 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8340775 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8341721 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8343688 G C Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 8344378 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 8345031 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8346666 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8348735 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 8348921 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 8349240 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8350531 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8351061 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8352390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8352821 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8354912 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 8355051 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8355438 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 8355615 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 8356361 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8357254 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8358202 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8360349 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 8362632 A T Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 8366118 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8367803 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8368058 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 8368224 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 8368239 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 8369026 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 8369253 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8369621 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 8369786 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8371722 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 8375279 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 8377055 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 8381433 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 8381855 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 8383093 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 8383155 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8391264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8394560 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8399699 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8404277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8405163 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8405220 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8405221 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8405322 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8407320 C G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8407374 C A Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 8408053 A T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 8409557 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8410107 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 8410447 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8411630 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8411822 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 8413753 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 8413869 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 8414515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8414778 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8414822 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 8415046 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 8415948 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 8417024 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 8418394 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 8419014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8419358 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 8419672 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 8419971 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 8420187 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 8420241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8420600 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 8420702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8420843 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 8421801 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 8422445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8422518 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 8425319 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8426679 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8426951 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 8427439 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 8428322 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 8428466 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8428489 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 8433837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8434002 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 8434253 T G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8434432 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 8436744 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8436980 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 8437005 A G Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 8439318 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8439488 T G N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 8439722 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8439731 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 8440254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8440536 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8441240 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 8441555 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 8441997 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 8442437 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 8443084 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 8443437 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8444259 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 8444419 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 8452337 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8452712 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8453114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8453167 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8454043 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8455391 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 8455402 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 8455456 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8455608 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8455645 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8456544 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 8456613 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8456820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8456845 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8457283 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 8457392 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 8457424 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8457481 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8458264 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8458492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8458688 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8458775 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 8459007 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8459274 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8459554 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 8460095 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8460118 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 8460135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8460435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8460773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8460823 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8460998 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8461133 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 8461150 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 8461284 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 8461530 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 8461548 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 8461576 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8461596 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8461702 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8461739 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8461745 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8461876 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8461987 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8462056 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 8462100 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8462104 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8462126 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 8462201 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 8463042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8463074 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 8463373 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 8463560 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8463730 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 8463932 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 8464050 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8464228 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8464229 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8464645 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 8464758 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 8464763 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 8464780 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 8464881 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 8464933 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 8464963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8465116 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 8465132 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 8465651 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8465662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8466215 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 8466227 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 8466262 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8466367 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 8466453 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 8466457 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 8466540 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8467174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8469182 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 8469616 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8470153 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8470347 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 3 8470419 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 3 8470567 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 8470576 C A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 8470681 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 8470735 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 8470796 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 8470823 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 8470833 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 8470843 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 8470884 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 8471017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8471052 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 8471140 G A N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 3 8471561 A G N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.75 0.0833333333333333 0.166666666666667 19 5 9 1 2 3 8471563 T G N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.75 0.0833333333333333 0.166666666666667 19 5 9 1 2 3 8471590 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 3 8471616 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 8471628 G C N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 8471662 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 8471720 G A Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 3 8471738 C A Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 8471770 A G Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 8471834 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 8471853 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 8472167 C T N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 8472212 G A N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 8472302 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 8472429 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 8472457 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 8472513 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 8472622 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 8472647 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8472808 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 8472848 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 8472865 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 8472944 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 8473594 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 8473617 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 8473735 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 8473790 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 8473848 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8473875 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 8473892 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 8473954 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 8473967 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 8473973 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 8474066 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 8474071 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 8474165 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 8474213 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 8474230 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 8474245 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 8474293 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 8474395 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 8474464 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 8475149 C G N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 3 8475225 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 8475255 C T N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 8475335 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 8475413 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 8475486 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 8475511 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 8475515 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 8475547 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 8475578 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 8475681 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 8475762 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 8475904 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 8476040 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 8476106 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 8476132 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 8476138 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 8476152 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 8476191 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 8476269 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 8476352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8482992 T A N N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 10 10 2 6 2 3 8483432 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8483468 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 8483720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8483795 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 8483805 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 8483817 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 8483848 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 8483861 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 8483876 A G Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 8483898 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 8483912 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 8484004 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 8484052 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 8484080 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 8484232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8484326 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 8484379 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 8484444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8484481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8484535 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 8484560 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8484671 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 8484678 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 8484701 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 8484730 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 8484734 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 8484756 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 8484960 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 8485008 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 8485178 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 8485411 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 8486572 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 8486669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8486740 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 8486867 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 8487054 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8487174 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 8487176 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 8487305 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 8487424 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 8487465 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 8487506 C G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 8487679 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 8487863 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8487943 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 8487967 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 8488530 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 8488535 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 8488599 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 8488602 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 8488666 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 8488831 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 8488849 A G N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 8488926 T A Y N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 8488985 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 8489024 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 8489102 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 8489157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8489178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8489218 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 8489223 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 8489422 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 8489438 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 8489919 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 8490357 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 8490362 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 8490603 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 8490664 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 8490668 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 8490681 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8490707 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 8490721 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 8490941 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 8491001 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 8491053 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 8491201 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 8491331 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 8491728 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 8491730 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8491755 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 8491884 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 8491969 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 8491987 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 8492050 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 8492716 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 8492719 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 8492735 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 8492745 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 8492812 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 8493039 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 8493060 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 8493241 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 8493245 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 8493377 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 8493380 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 8493479 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 8493687 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 8493691 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 8493704 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 8493820 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 8494516 T G N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 8494533 T C N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 3 8494668 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 8494686 C A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 8494703 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 8494706 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8494719 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 8494764 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 8494832 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 8494848 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 8494914 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8494930 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 8495000 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 8495143 A T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 8495281 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 8495339 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 8495613 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 8495784 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8495895 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 8496075 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 8496137 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 8496518 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 8496522 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 8496575 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 8496650 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 8496767 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 8496825 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8496869 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 8496925 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 8497130 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 8497137 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 8497284 A C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 8497320 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 8497575 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 8497755 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 8497893 C A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 8498153 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8498264 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 8498278 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 8498325 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 8498405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8498450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8498472 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8498579 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 8499633 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8501037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8501940 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8502151 C A N N 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 8502162 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 8502541 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8502676 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8502741 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 8502861 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8502960 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8502980 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8503234 C A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 8503448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8503477 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 8503757 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 8503792 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 8503844 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 8503894 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 8503984 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 3 8503991 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 8503997 A C N N 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 8504139 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 8504260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8504270 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 8504332 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8504376 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 8504605 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8504651 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 8505219 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8506690 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8507196 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8507582 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8507591 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8507787 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8507842 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8508303 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8509099 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8509705 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 8509729 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 8510369 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 8510570 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8510948 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8511075 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 8512887 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8513157 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 8513370 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8519909 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 8519981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8524150 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8524160 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8527443 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 8529185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8530271 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8532357 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 8533975 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 8539586 C A N N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 3 8539881 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8540742 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8543189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8543597 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8545310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8545858 T A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 8547515 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8548016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8548017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8548120 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8548479 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 8548701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8548847 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8548961 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 8549676 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 8549699 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 8549717 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8549789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8550021 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8550203 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 8550219 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8550293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8550301 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 8550947 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8551013 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 8551019 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8551037 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 8551108 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8551123 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 8551231 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 8551261 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8551571 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 8551728 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 8551740 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 8551747 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 8551867 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8551904 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8551952 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 8552023 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 8552405 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 8552582 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8552603 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8552676 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8553101 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8553102 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8553122 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8553127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8553556 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8553732 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 8553748 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8553843 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8553854 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 8553992 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 8554488 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 8554638 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8555091 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8555142 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8555163 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 8555361 T C N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 3 8555374 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 8555413 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 8555460 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 8555699 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8555726 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8555857 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8555974 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8555999 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 8556186 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8556234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8556281 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8556283 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8556297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8556343 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8556437 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 8556530 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 8556562 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 8556592 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 8556638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8556668 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 8556681 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 8556722 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 8556821 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 8556874 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 8556943 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 8557055 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 8557073 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 8557080 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 8557131 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 8557209 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 8557268 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 8557325 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 8557339 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 8557353 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 8557367 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 8557394 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 8557575 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 8557926 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 8558173 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 8558184 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 8558234 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 8558365 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 8558399 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 3 8558426 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8558452 T G N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 8558499 T A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 8558590 G A N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 3 8558695 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8558881 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 8559046 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8559137 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 8559244 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 8559305 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 8559472 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 8559545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8559560 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 8559624 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 8559705 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 8559823 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 8559983 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 8560020 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 8560082 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 8560159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8560234 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 8561117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8562271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8563553 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 8563587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8563644 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 8563697 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 8563719 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8563749 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8563799 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 8564040 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8564098 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 8564100 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 8565457 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8565799 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8565805 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8565828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8566087 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 8566120 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 8566140 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 8566231 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 8566454 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 8566581 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 8566597 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 8566654 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8567228 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 8567317 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8568512 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 8573991 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8576784 A G N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 3 8578596 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8580795 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 8581886 G A Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 8584670 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 8584758 A C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 8585131 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 8586578 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8592347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8593675 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8594719 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8594931 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 8594937 A T N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.357142857142857 0.214285714285714 0.428571428571429 13 15 5 3 6 3 8595071 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 8595074 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 8595086 A C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 8595095 G T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 8595401 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 8596223 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 8596378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8596391 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 8596464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8596810 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 8597680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8597721 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 8597813 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 8597931 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8597967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8597999 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8598034 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 8598137 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8598146 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8598193 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8598265 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 8598311 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8598320 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 8598404 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.0625 0.9375 0 17 15 1 15 0 3 8598631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8599201 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 8599353 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 8599557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8599634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8599679 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 8599723 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 8600256 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 8600317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8600342 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 8600371 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 8600527 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 8601074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8601283 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8601420 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8601432 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 8601446 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 8601544 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 8601659 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 8601688 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 8601699 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 8601705 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 8601755 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 8601877 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 8601933 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 8602295 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 8602330 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 8602362 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8602368 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 8602499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8602523 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 8602558 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 8602612 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 8602637 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 8603172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8603661 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 8603767 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 8603785 A T N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 8603790 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 8604146 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 8604213 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 8604328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8604430 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 8604483 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 8604573 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8604747 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8604861 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8605269 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 8605567 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 8606218 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 8606319 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 8606374 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 8606389 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 8606698 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8606860 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 8607009 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 8607092 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8607357 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 8607936 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 8608211 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 8608272 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 8608291 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 8608370 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 8608518 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 8608677 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 8608765 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 8608880 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 8608882 G C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 8608993 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 8609109 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 8609159 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 8609758 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 8610132 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 8610164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8610192 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8610537 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 8610610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8610736 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 8610746 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 8610931 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 8611069 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8611393 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 8611419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8611462 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 8611598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8611775 G C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 8611783 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8611806 C G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 8611832 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 8612034 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8612047 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8612061 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8612171 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 8612274 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8612330 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8612419 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8612422 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8612451 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8612690 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8612782 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8612860 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 8612912 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 8613121 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 8613210 T G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 8613238 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 8613251 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 8613259 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 8613360 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 8613421 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 8613448 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 8613505 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 8613593 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 8617715 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8617775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8617805 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8618298 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8618356 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 8622471 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8624084 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 8624603 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8624977 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 8625554 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8625653 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 8628225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8628798 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 8629141 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 8629156 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8629265 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8629727 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 8629926 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 8629950 C T Y Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 3 8632351 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 8632465 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 8634325 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 3 8634383 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 8634558 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 8635060 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 8635072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8636205 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8636322 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 8636397 T C Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 3 8636412 T A Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 8636416 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8636472 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8636572 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 8636596 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 8636657 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 8636665 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8636694 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 8636708 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 8636863 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8636897 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 8636961 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 8637019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8637031 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 8637515 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8637748 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8637763 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 8637770 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8637923 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 8638105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8638223 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8638267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8638340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8638842 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 8639152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8639208 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 8639211 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 8639229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8639483 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 8639552 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 8639729 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 8640261 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8640262 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8640360 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8640727 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8640796 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 8640920 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8641167 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8641171 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8646270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8646271 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 8647452 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8649943 A C N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 8650135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8650377 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 8653819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8657567 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 8661670 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8663021 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8663290 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 8663933 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8664040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8678831 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8679384 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8680102 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 8681221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8681231 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8681620 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8681707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8681809 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8681822 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8682621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8683290 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8685269 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 8685874 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8686021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8686669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8687083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8687458 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 8687472 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8687893 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8688020 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8691914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8695126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8695512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8696469 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8697649 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 8700122 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 8700300 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 8702685 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 8703064 G A Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 8704522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8705213 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8707825 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8708201 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 8708484 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8711389 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 8717808 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8718276 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8720605 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 8721020 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 8722240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8724929 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 8724930 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 8725042 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 8725064 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 8725141 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 8725155 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 8725343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8725404 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 8725899 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8726135 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 8726197 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8726242 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 8726553 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8726757 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 8726765 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 8726782 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 8727045 A C N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 8727057 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 8727712 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8728197 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 8728205 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 8728343 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 8728530 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 8728698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8729512 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 8729523 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8730263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8731080 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8732986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8734217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8735264 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 8735428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8735554 T C N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 3 8735632 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 8735664 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 8735747 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 8735772 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 8735992 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 8736000 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 8736020 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 8738473 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 8738885 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 8740025 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 8741323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8741501 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8741533 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 8741693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8741807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8742718 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 8742778 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8743240 A G Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 8744866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8745600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8747113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8749323 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8749787 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8750077 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8750116 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8750144 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 8750187 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8750266 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8750286 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8750358 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8750440 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 8750623 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8750973 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 8751356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8751585 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8751608 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 8751610 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 8754011 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8754117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8754192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8758756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8759936 T C Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 8760066 T G Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 8760202 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8760232 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 8760259 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8761146 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 8761530 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 8761560 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8761612 C G Y N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 8761816 C T Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 8761853 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 8761978 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 8762309 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 8762649 C A Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 8762687 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 8762806 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 8764572 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 8765252 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 8765558 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8765571 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 8765945 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 8766057 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 8766143 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 8766161 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 8766174 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 8766227 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 8766411 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 8766462 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 8766505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8766510 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 8766630 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8767321 G T Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 8767350 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 12 16 0 12 2 3 8767371 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8767544 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 8767606 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 8767899 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8768061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8768332 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8768354 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 8768839 A T N N 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 3 8768952 A G N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 10 10 3 4 3 3 8768969 A G N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 3 8769491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8769820 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8770079 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8770462 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 8770498 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8770748 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 8770750 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 8771261 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 8771275 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 8771278 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8771391 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 8771501 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 8771566 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 8771886 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 8771894 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 8771953 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 8771967 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 8772110 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 8772316 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 8772420 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 8772448 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 8772478 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 8772634 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 8772931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8773022 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 8773132 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 8773274 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 8773660 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8773794 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 8774027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8774062 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 8774063 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 8774313 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8774490 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 8774632 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 8774745 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 8774764 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 8774777 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 8774831 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 3 8774890 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 3 8775044 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8775046 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8775217 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 8775518 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8775583 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8775764 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8775954 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8776889 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8776926 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 8777646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8778129 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 8778140 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 8778907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8779479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8781100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8783081 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8784214 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8784857 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8786057 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 8786225 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 8787176 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8788245 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8789637 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8789649 A T Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 8789700 G T Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 8790292 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8790413 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8790451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8790946 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 8791750 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8793550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8798427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8799135 T C Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 8799450 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8799740 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8806269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8807163 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 8808406 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8808999 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8810364 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8810654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8811030 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8814540 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 8814922 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8815370 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 8816381 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8816917 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8819320 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8819497 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 8819560 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 8819569 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 8820100 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 8820261 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 8820604 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8820645 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8820670 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 3 8820724 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8821130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8822129 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 8822293 A G Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 0.117647058823529 0.352941176470588 20 14 9 2 6 3 8822341 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 8822353 A G Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.555555555555556 0.0555555555555556 0.388888888888889 21 15 10 1 7 3 8822362 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 8822388 A G Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 8822603 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8823053 T C Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 8824125 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8824138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8824370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8824590 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8824638 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8825250 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8825797 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 8826028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8826044 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 8827123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8827470 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 8827531 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 8827603 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 8827641 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 8827659 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8827819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8827946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8828049 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 8828051 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 8828098 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 8828155 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 8828281 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 8828317 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 8828318 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 8828353 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8828446 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 8828730 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 8828749 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 8828924 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 8829120 C G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 8829121 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 8829163 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 8829243 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 8829321 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 8829665 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 8829666 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 8829769 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 8830102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8830715 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 8830738 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 8830903 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 8831173 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8831337 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 8831353 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 8831459 A T Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 8839062 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8839202 C G Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 8839222 G C Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 8839342 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 8839503 T G Y N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 8839532 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 8839539 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 8839548 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 3 8839633 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 8839637 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 8839699 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 8839736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8839756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8840751 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 8841349 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8841436 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 8841458 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8841547 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 8842435 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 8842472 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 8842772 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8847549 A T N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 3 8848555 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8849682 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 8850182 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8850415 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 8850523 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8851238 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8854528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8854843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8856264 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8856384 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8856618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8857574 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8858457 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8859089 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 8860563 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8864092 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8865497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8868885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8868914 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 8869050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8869060 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 8869315 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 8871213 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 8873032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8875136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8879221 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8884545 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8884794 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 8884885 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8885206 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8886163 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 8886210 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8886579 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 8886924 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 8888938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8889085 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8889834 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 8891369 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 8892735 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 8897233 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8897690 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8898058 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8898708 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8899052 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 8901319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8903964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8904766 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 8905104 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 8905564 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8912668 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 8912781 G A Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 8912785 A C Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 8913153 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 8913665 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 8913692 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 8913745 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 8913911 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 8913931 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 8914184 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 8914236 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 8914368 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 8914373 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 8914654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8914671 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 8914703 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 8914706 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8914764 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8914766 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8914968 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 8915678 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 8916133 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 8916211 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8916439 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8916447 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8916865 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8916931 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8917075 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 8917141 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8917281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8917357 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 8917495 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8917609 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 8917765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8917938 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 8917991 G A N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.384615384615385 0.230769230769231 0.384615384615385 13 13 5 3 5 3 8918066 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 8918204 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 8918222 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 8918739 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 3 8918881 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 8918943 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 8919046 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 8919063 T A Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 8919221 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 8919273 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8919351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8919389 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8919499 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8919544 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 8919585 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8919649 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 8919938 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8920075 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 8920141 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 8920214 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 8920351 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 8920359 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 8920445 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 8920461 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 8920521 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 8920551 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 8920622 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 8920764 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 8920981 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 8921175 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 8921178 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 8921360 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8921535 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.75 0.0625 0.1875 25 7 12 1 3 3 8921559 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8921733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8921849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8922128 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 3 8922140 A T N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 3 8922179 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 8922338 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8922463 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 8922499 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 8922504 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 8922880 A G N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.285714285714286 19 9 9 1 4 3 8923695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8924371 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 8924548 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 8924555 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 8924585 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 8924767 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 8924791 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 8924905 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 8924912 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 8924975 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 8925008 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 8925019 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 8925130 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 8925148 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 8925184 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 8925185 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 8925319 A G Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 8925345 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 8925375 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8925536 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8925613 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 8925629 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 8925813 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 8926026 A G Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 8926212 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 8926219 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8926383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8926477 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 8926594 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 8926634 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 8926726 A T Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 8926736 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 8926792 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 8926827 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 8926951 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 8926976 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 8927086 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 8927109 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 8927152 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 8927266 T G Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 8927276 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 8927308 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 8927316 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8927392 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 8927416 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 8927428 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 8927862 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 8927881 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 8928480 C A Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 8928857 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 8929346 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8929700 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 8930069 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 8930074 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8930187 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 8930218 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8930484 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 8930576 C T Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 8931286 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 8931328 G C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 8931399 A T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 8931448 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8931454 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 8931480 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 8931544 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 8931653 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 8931859 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 8931885 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 8932700 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8932770 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8932991 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 8933145 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 8933620 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8933736 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8935667 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8935679 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8935700 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8935936 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 8935975 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8936419 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8936779 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 8936811 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 8937147 C A N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 8937269 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8937285 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8937364 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 8937714 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8937729 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 8937732 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 8937786 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 8937792 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 8937818 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8937827 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8938750 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 8938778 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 8939023 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 8939258 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 8941431 T G Y N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 8941544 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 8942026 G C N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.5 0.214285714285714 0.285714285714286 17 11 7 3 4 3 8942055 A G N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 18 10 8 2 4 3 8942114 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8942119 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 8942133 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 8942185 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8942214 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 8942262 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8942526 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 8942600 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 8942627 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 8942830 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8942908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8943319 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 3 8943697 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8943769 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8943799 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8943901 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8943963 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 8943978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8944069 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8944700 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 8945159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8945506 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 8945636 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 8945751 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8946305 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 8946363 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 8946403 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 8946678 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 8946958 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 3 8946997 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 8947185 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 8947774 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 8947778 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 8948454 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 8948580 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 8948761 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 8949174 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 8950379 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 8950562 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8950586 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 8950729 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 8950731 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 8950791 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 8950925 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 8951006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8951018 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 8951063 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 8951208 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 8952136 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 8952302 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 8952361 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 8952647 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 8953083 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 8953930 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 8954055 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 8954059 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 8954066 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 8954490 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 8954502 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 8954823 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8954866 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 8954904 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8955012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8955029 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8955244 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8955517 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8956287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8956373 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 8956418 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 8956603 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8956697 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 8956800 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 8956938 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 8957593 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8957637 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 8957827 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 8957890 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 8957910 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 8957929 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 8958274 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8958308 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8958312 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 8958342 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 8958938 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8959091 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 8959175 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 8959656 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 8960010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8960121 C A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 8960135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8960265 G C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 8960273 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 8960852 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 8960877 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 8961249 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8961260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8961410 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 8961425 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 8961680 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 8961783 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8962062 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 8962269 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8962506 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 3 8962632 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 8962791 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 8962954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8962965 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 8962979 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8963174 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8963283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8963974 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 8964206 C G Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 8964346 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8964439 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8964536 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8964806 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 8964854 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8965110 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 8965148 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 8965166 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 8965485 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 8965594 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8965636 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 8965776 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8965920 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 8965949 T G Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 8966201 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 8966293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8966328 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 8966370 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 8966479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8966685 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 8966693 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 8966734 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 8966766 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 8966791 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 8966816 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8966818 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 8966849 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 8966868 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 8966876 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 8966920 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 8966942 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 8967196 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 8967271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8967377 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 8967395 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 8967611 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8967824 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8967994 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 8968164 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 8968173 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 8968265 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 8968412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8968417 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 8968427 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 8968447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8969116 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 8969682 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 8969851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8969852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8970040 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 8970547 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8970810 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 8970894 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8971144 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 8971341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8971583 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 8971761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8972019 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8972848 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 8973227 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8973547 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 8973816 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 8973968 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 8973984 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 8974326 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 8975079 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 8975789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8975852 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 8975865 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 8975874 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 8976025 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8976219 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 8976310 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 8976336 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 8976358 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8976374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8976637 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 8976748 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 8976772 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8976980 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 8977132 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8977361 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 8977661 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 8977692 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 8977815 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8978141 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 8978146 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 8978428 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 8978433 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 8978461 G T N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 8978504 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 8978704 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8978727 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 8979011 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8979068 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 8979070 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 8979086 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8979150 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 8979161 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 8979650 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8979762 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8979769 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 3 8979884 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 8979903 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 8980028 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 8980036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8980135 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 8980166 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 8980207 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 8980239 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 8980261 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 8980268 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 8980291 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 8980295 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 8980446 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 8980455 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 8980638 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 8980642 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 8981148 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8981208 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8981217 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 8981291 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 8981313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8981540 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 8981559 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 8981560 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 8981906 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 8981988 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 8982202 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 8982821 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 8982892 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 8983612 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 8983634 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8983667 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 8983836 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8984703 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 8984821 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 8984995 C T N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.454545454545455 0.181818181818182 0.363636363636364 12 10 5 2 4 3 8985620 C T N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 3 8986568 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 8986576 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 8986610 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 8986643 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 8986961 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 8986984 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8987024 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 8987082 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 8987154 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 8987263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8987312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8987369 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 8987426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8987565 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 8987675 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 8988026 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 8988275 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8989844 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 8989860 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 8989865 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 8989934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8990697 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 8990723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8992185 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 8993284 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 8993434 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 8993887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8994300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8994732 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 8994842 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8995024 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 8995732 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8997682 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 8997730 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 8998489 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8999040 A C N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 8999140 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 8999191 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 8999264 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 8999355 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 8999491 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 8999696 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 8999719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 8999867 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 8999933 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 8999967 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9000060 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 9000210 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 9000333 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9000375 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9000420 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9000488 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9000639 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9000828 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9000927 A T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 9001095 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 9001481 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9001764 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9001928 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 9002000 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9002838 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 9002921 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 9003035 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 9003067 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 9003228 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 9003447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9003457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9003515 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9003735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9004394 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9004703 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 9004934 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 9004940 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 9005257 A T N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 9005290 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 9005364 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 9005391 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 9005445 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9005452 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9005462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9005476 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9005617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9005799 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9005875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9005914 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9006062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9006096 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9006999 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 9007012 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9007107 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 9007165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9007487 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 9007538 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 9007671 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 9007807 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 9008474 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9008479 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9009103 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9009247 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9009930 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9009943 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 9010891 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9011197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9011333 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 9011469 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 9011527 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 9011834 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 9011875 T A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 9012014 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 9012045 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 9012304 T C Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.5 0.214285714285714 0.285714285714286 17 11 7 3 4 3 9012324 A G Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.533333333333333 0.2 0.266666666666667 19 11 8 3 4 3 9012338 C G Y N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.153846153846154 21 5 10 1 2 3 9012379 G T N N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.181818181818182 17 5 8 1 2 3 9012471 T C Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.75 0.0833333333333333 0.166666666666667 19 5 9 1 2 3 9012515 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 9012520 A G Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 3 9012645 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 9012732 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 9012906 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 9012989 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 9013050 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 9013065 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 9013139 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 9013198 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9013518 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9013652 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 9013678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9013775 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 9014715 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 9014831 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 9014962 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9014971 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9015965 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9016034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9016060 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9016073 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9016088 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9016127 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 9016156 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 9016394 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 9016601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9016977 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 9016999 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 9017054 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 9017247 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 9017366 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9017369 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9017567 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 9017580 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 9017760 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 9017847 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 9017883 T A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 9017935 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9017940 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9018107 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 9018288 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 9018575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9018739 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9018741 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9018787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9018821 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9018972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9019223 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 9019253 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9019307 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 9019372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9019626 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9019649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9019670 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9019742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9019753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9019799 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 9019811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9019869 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 9020618 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 9020660 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 9020690 T A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 9020912 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 9020930 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 9020947 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 9020998 T G N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 3 9021491 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 9021509 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 9021584 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 9021701 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 9021748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9021812 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 9021897 G T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 9022017 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9022024 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 9022260 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 9022505 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 9022715 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9022863 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 9022879 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9022987 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 9023131 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 9023190 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 9023210 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 9023450 A G N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.153846153846154 0.0769230769230769 0.769230769230769 5 21 2 1 10 3 9023472 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 5 13 2 1 6 3 9023480 T C N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 5 11 2 1 5 3 9023502 T A Y N 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.4 0 0.6 4 6 2 0 3 3 9023926 G C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 9024022 T C Y Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 8 10 3 2 4 3 9024466 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 9024570 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 9024580 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9024585 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 9024597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9024600 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9024611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9024623 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 9025111 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 9025198 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 9025314 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 9025320 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 9025411 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9025412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9025741 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9025761 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9025913 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 9025957 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 9025967 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 9026328 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 9026552 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9026701 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 6 30 3 0 15 3 9026970 T G N N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.222222222222222 0 0.777777777777778 4 14 2 0 7 3 9027165 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 9027313 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 7 11 2 3 4 3 9027506 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 9027602 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 9027604 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 9027659 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 9027669 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9027701 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 9028012 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9028601 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9029070 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9029114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9029173 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 9029220 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 9029242 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 9029265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9029351 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 9029410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9029433 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 9029463 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 9029485 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 9029501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9029561 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9029850 C A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 9029900 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 9029962 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9030003 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 9030006 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 3 9030291 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9030302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9030452 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 9030612 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 9030619 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 9030664 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9030769 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5625 0.125 0.3125 20 12 9 2 5 3 9030852 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 9030911 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 9031094 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 9031113 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 9031188 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 9031206 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 9031223 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 9031230 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 9031299 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 9031301 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 9031319 C A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 9031378 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 9031799 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 9031826 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.588235294117647 0.117647058823529 0.294117647058824 22 12 10 2 5 3 9031867 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 9031978 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.533333333333333 0.2 0.266666666666667 19 11 8 3 4 3 9032019 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9032086 A C N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.428571428571429 0.214285714285714 0.357142857142857 15 13 6 3 5 3 9032120 A T N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.428571428571429 0.214285714285714 0.357142857142857 15 13 6 3 5 3 9032157 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 9032191 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 9032221 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 9032248 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 9032371 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 9032463 G A N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 3 9032484 C T N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 9032488 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 9032539 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9032553 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 3 9032594 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9032626 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 9032634 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 9032671 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 9032703 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 9032793 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 9032800 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9032835 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 9033216 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 9033590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9033657 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9033737 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 9033874 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 9033901 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 9033985 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9034055 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9034483 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 9034531 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 9034555 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 9034660 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 9034665 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 9034823 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 9034831 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 9034848 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 9035058 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 9035787 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 9035802 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 9035947 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9035950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9036168 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 9036295 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9037391 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 9037617 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9037875 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 9037886 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 9038017 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 9038106 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9038153 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 9038211 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 9038227 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 9038236 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 9038379 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 9038383 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 9038615 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9038630 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 9038686 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 9038725 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 9038775 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 9038817 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 9038828 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 9038893 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 9038953 T G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 9038965 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 9039034 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 9039134 G A Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 9039192 C A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 9039267 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 3 9039320 A C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 9039367 C T N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 3 9039461 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 9039483 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 9039573 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 9039601 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 9039635 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 9039773 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 9039780 T A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 9039843 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9040100 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 9040325 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 9040333 C G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 9040719 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 9040774 G T Y N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 3 9041040 A C Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 9041117 G T Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 9041130 A T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 9041422 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 9041679 A G Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 9043670 A G Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 9044131 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 9044757 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 9044758 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 9044885 T C Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 9045208 C T Y Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0 0.916666666666667 0.0833333333333333 11 13 0 11 1 3 9045287 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 9045318 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 9045392 A G Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 9045673 A C Y N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 9045923 A G Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 9045942 G A Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 9045953 C T Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 9046017 G A Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 9046049 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 9046110 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 9046122 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 9046134 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9046291 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 9047065 A G Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 9047143 T C Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 9047307 C T Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 3 9047360 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 9048121 C G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 9048289 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 9048291 G A Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 9048364 T C N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 3 9048370 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 3 9048460 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 9048699 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 9049366 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9049490 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9049498 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 9049508 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 9049654 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 9049683 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 9049820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9050435 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9050488 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 9050689 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 9051163 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 9051488 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 9051618 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9051743 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 9052095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9052264 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 9052415 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 9052462 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 9052557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9052573 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 9052633 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 9052638 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 9052648 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 9052789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9052974 C A Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 9053057 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9053154 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 9053421 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 9053434 A T N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 3 9057644 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 9058485 T G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 9058888 A G Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 9058899 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 9058975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9059486 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9059546 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9059560 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9059692 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 9059709 A G Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 9059867 T C Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 9059889 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 9060155 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 9060156 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 9060176 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 9060245 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 9060270 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9060271 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9060343 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 9060390 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 9060479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9060496 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 9060529 A C Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 9060717 A T Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 9060763 C G Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 9061505 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 9061506 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 9064257 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 9064304 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 9064438 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9064483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9064555 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 9064608 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 9064714 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 9064725 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 9064817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9064837 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 9064872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9064882 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9064884 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 9064933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9064995 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 9065244 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 9065458 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 9065522 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 9065714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9065716 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 9066237 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 9066576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9066612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9066644 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9066939 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 9067024 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 9067321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9067349 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 9067356 G T Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 9067392 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9067491 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 9067603 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 9067641 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 9067704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9067840 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9067843 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9067870 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 9067992 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 9068025 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9068060 G A Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 9068112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9068216 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 9068301 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 9068438 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 9068486 T C Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 9068747 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 9068809 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 9068963 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9069221 T A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 9069322 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 9069366 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 9069391 T C Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 9069535 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 9069685 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 9069840 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 9071043 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9071257 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9071317 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 9071465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9071473 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 9071509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9071518 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 9071572 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 9071583 A T Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 9071778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9071840 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9072106 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 9072110 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 9072315 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 9072322 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 9072334 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 9072358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9072373 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 9072420 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 9072598 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9072600 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 9072652 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 9072804 A G Y Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 9073424 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9073532 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9073617 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9073655 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9073771 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 9073775 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 9073838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9074247 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 9074258 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9074489 C T Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 0.142857142857143 0.214285714285714 20 8 9 2 3 3 9075107 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9075539 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 9075658 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 9075765 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 9076673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9077402 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 9077414 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 9077985 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9078196 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 9078317 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 9078390 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 9078459 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9078463 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9078634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9078637 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9078964 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9078967 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9079064 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 9079115 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 9079559 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9080027 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9080069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9080104 T A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 9080151 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 9080222 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 9080479 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9080499 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9080575 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9080675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9080720 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 9080749 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 9080808 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 9081015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9081072 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9081332 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9081662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9081789 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 9082402 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 9082755 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 9083050 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9083058 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9083092 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 9083146 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9083382 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 9084095 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 9084317 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 9084758 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 9084866 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9085188 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 9085300 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 9085379 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9085498 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9086761 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9086909 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 9086960 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 9086988 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 9086998 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 9087117 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 9087440 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 9087610 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 9087788 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 9088168 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 9088241 G A N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 9088492 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 9088514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9088540 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9089140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9089150 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9090464 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 9097957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9098380 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9098481 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 9098514 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 9098795 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 9099709 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9099710 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9099733 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9099858 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9099863 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 9099904 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9100119 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9100158 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9100183 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9100217 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9100230 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9100339 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9100349 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 9100400 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9100411 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9100544 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9100546 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9100679 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 9103369 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9103966 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9104278 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 9104368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9104475 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9104560 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 9104674 C T Y Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 9104796 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 9104820 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 9104986 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 9105132 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 9105199 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9106237 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 9106259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9106731 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 9106914 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9107230 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 9107787 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 9107982 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9108659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9109721 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 9109751 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 9109775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9109966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9110022 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 9110046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9110057 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9113351 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 9113614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9113764 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9113803 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 9113966 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 9114185 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9114299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9114322 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9114357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9114399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9114626 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 9114673 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9114797 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 9114813 G A Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 3 9115037 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 9115094 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 9115095 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9115285 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 9115325 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9115413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9115515 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9115535 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 9115569 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9115692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9115694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9115765 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 9116187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9116400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9117221 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9117255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9117389 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9117424 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9117453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9117579 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 9117697 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9117720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9117823 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9117909 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 9117920 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9118231 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 9118295 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9118347 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 9118369 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 9118415 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9118550 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 9118561 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9118574 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 9118591 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 9118647 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9118650 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 9119019 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 9121931 C G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 9121979 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9121988 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 9122127 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9122133 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9122540 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9122593 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 9122760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9123077 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9123085 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 9123478 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9123488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9123605 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9124541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9125419 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9125456 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9125726 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9126369 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9127043 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 9127044 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9127110 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9127279 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 9127717 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9127776 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 9128443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9129060 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 9129145 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 9129286 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 9129401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9129470 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 9129471 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 9129531 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 9129577 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 9129580 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 9129793 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 9129843 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 9129867 A T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 9129935 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 9130001 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 9130074 C A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 9130418 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 9130421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9130477 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 9130678 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 9130850 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 9131128 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 9131131 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 9131293 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 9131296 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 9131304 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 9131323 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 9131378 T G N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 9131493 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 9131505 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9131692 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 9131696 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9131728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9131929 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 9132150 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9132325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9132637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9132719 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9132912 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 9133054 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9133197 G A Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 9133210 G T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 9133214 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9133233 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 9133314 C T Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 9133324 A C Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 9133364 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 9133469 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 9133471 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 9133512 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 9133638 A T Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 9133641 T A Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 9133662 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 9134230 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 9134284 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9134703 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9134982 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9134984 A G Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 9134997 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 9135038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9135206 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 9135709 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 9135729 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 9135740 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 9135743 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 9135987 A G Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 9136041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9136049 A G Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 9136060 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 9136072 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 9136206 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 9136207 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 9136223 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 9136239 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 9136554 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 9137919 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 9138010 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9138047 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 9138092 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 9138093 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 9138199 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 9138439 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9138598 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9138800 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 9138878 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 9138930 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 9138931 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 9138988 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 9139502 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9139503 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9139516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9139551 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9139583 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9139603 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9139612 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9139658 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 9139937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9140208 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9140220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9140230 T C Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 9140373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9140519 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 9140591 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 9140708 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 9140865 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9140896 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 9140904 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9140908 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 9140986 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 9141003 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 9141277 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9141386 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 9141427 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9141762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9141854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9142081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9142372 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 9142440 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 9143073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9143430 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9143667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9144062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9145886 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 9145982 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9146641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9147373 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 9147433 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9147915 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 9148227 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 9148230 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 9148439 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 9148442 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 9151005 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9151610 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9153310 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9153853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9154772 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9155382 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9155863 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9156312 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 9157289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9157307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9158029 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 9160726 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9161186 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 9161231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9161717 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 9161890 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 9161943 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9162036 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9162049 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9162163 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9162326 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9162353 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9162510 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9162631 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 9163144 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 9163155 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 9163466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9164000 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9164535 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9166204 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9166270 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9166487 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9166768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9166864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9168449 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9168982 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9168996 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 9169047 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9170360 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 9170783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9173508 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 9177304 A T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 3 9180186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9180884 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9181404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9182339 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 9182405 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9182487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9182507 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 9182508 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 9182794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9182810 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9182830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9182968 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9183466 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 9183832 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 9183869 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 9183896 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 9184356 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 9184459 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 9184681 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9186117 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 9186343 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9186677 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 9186947 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9187048 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9187111 G A N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 14 12 1 12 0 3 9187125 T A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 9187593 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 9191277 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 9192841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9192870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9192970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9193053 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9193113 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 9194608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9195508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9195648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9195671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9195851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9197534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9197718 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 9197881 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 9197966 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9197997 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9198034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9198077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9198557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9198558 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9198607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9198650 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9198789 A C Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 9198933 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 9199055 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 9199428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9200003 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 9200078 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 9200453 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 9200817 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 9200909 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 9201644 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9201840 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 9201853 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 9201879 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 9201884 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 9202094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9202100 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 9202142 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 9202151 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 9202333 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 9202344 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 9202360 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 9202449 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 9202551 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 9202608 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 9202686 G C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 9202714 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 9202748 A G N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 9202989 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 9203004 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 9203174 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 9203351 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 9203517 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 9203544 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 9203698 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 9203700 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 9203746 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 9203779 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 9203790 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 9203804 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 9203992 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 9204415 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 9204492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9204623 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 9205507 A C Y N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 9205658 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 9205702 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9205773 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 9205844 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 9205845 A C Y N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 9205932 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 9209116 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9209466 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 9209797 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 9210502 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 13 5 6 1 2 3 9210790 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 9210873 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9210980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9211014 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 9211309 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 9211610 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9211763 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 9211835 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 9211884 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 9211957 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 9212045 A T Y N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 5 5 1 3 1 3 9212186 G C Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 9212207 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 9212276 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 9212287 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 9212335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9212357 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 9212418 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 9212523 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 9212534 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 9212657 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 9212678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9212692 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 9212768 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 9212773 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 9213022 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 9213442 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 9213454 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9213694 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 9213761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9214100 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 9214135 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 9214286 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9214557 C T Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 9214612 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 9214631 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9214653 A G Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 9214660 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 9214664 A T Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 9214736 G T Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 9214777 C G N N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 3 9214778 T G N N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 3 9214830 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9214840 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 9214921 A G Y Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 9214995 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 9215107 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9215295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9215371 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 9216147 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9216528 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 9217235 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 9217244 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 9217653 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 9217880 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9217888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9218857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9218992 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 9219034 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 9219048 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9219893 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9220000 T A Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 9220044 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 9220049 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 9220064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9220067 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 9220195 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 9220511 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 9220535 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 9220545 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9220742 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9220901 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9220945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9223204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9223300 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9223318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9223334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9223593 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 9223656 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 9223768 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9224865 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 9224975 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 9225059 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 9225114 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 9225242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9227227 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 9227263 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 9227563 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9227874 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9228774 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9229443 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 9229970 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 9229972 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9230102 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9231375 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 9231494 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 9231748 A G Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 9231815 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 9232224 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 9232766 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 9233144 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 9233498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9233724 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 9233774 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 9233849 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 9234081 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 9234490 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 9234717 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 9235124 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 9235302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9235464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9235593 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 9235612 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 9235630 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 9240075 T C Y Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 3 9240575 G C Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 9241153 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 9241321 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 9241677 T C Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 9242306 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9243419 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 9243668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9243757 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 9244436 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 9244584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9245325 A C N N 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.363636363636364 0.454545454545455 0.181818181818182 13 9 4 5 2 3 9245700 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 9246595 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 9246622 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9246734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9246770 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9246797 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9246828 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 9246910 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 9246940 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.1 0.7 0.2 18 22 2 14 4 3 9247564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9247571 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 9248087 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 9248144 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 9248193 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9248433 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 3 9248570 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9248805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9248993 C G N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 9249009 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 9252032 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 9252098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9252458 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9252558 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9253358 C A N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 3 9253560 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9254785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9257907 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9258719 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9258869 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9259402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9259561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9259562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9259626 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9260290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9260299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9262121 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.176470588235294 0.705882352941177 0.117647058823529 18 16 3 12 2 3 9263036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9265559 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9266560 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 9268128 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9269521 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 9270568 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9271376 G T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 9272018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9272847 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9273339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9273373 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9273724 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9274199 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9274798 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9274849 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 9276033 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9278518 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9279023 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.157894736842105 0.736842105263158 0.105263157894737 20 18 3 14 2 3 9279060 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9285917 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9287136 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9292417 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9295880 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9295966 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9296040 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 9296857 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 3 9297070 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9297139 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9297233 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 9297461 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 9297463 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 9297593 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9297650 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9297773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9297936 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 9298310 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 9298596 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 9298813 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 9299309 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 9299706 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 9299718 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 9300027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9300093 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 9300580 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 5 7 1 3 2 3 9300599 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 7 11 1 5 3 3 9300638 C T N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.0833333333333333 0.583333333333333 0.333333333333333 9 15 1 7 4 3 9300640 T C N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.0909090909090909 0.636363636363636 0.272727272727273 9 13 1 7 3 3 9300726 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 9300761 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 9300838 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 9300898 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9300926 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 9300983 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 9301016 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9301459 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9301590 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 9302220 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 9302264 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 9302275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9302276 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9302310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9302344 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 9302370 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 9302385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9302413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9302517 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 9302562 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9302589 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 3 9302785 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9303069 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9303388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9303448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9306015 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9306016 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9306660 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9306702 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 9306905 T C Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 9307062 T G Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 9307635 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 9308280 C T Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 9308284 G T Y N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 9308480 C T Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 3 9308747 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9308756 A G Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 9308832 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9308953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9309031 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 9309704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9309779 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9309867 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 9310062 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 9317031 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9317100 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 9317113 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 9317220 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 9317516 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 9318246 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9320651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9322307 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 9322383 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 9322502 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 9322598 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 9322702 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 9322806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9322833 T A Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 9322910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9323253 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 9323433 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 9323463 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9323498 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9323789 T G Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 9323821 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9323863 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 9324094 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 9324195 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 9324906 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9324920 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 9325229 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9325238 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9325329 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 3 9326945 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 9327284 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 9327383 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 9328218 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 9328411 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 9328605 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 9328663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9328673 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9328729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9328794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9328810 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 9328812 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 9328863 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9329066 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9329325 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 9329400 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9329609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9329698 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9329708 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 9329710 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9330146 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9330579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9330835 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 3 9332023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9335479 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9335528 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9335629 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9335804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9335969 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 9336769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9336934 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 9336970 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9336996 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 3 9337072 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 9337113 T A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 3 9337332 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 9337541 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9338050 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 9338303 T C Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 3 9338340 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 3 9338355 A C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 9338459 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9338627 A T Y N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 3 9338689 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 9338913 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9339267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9339596 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9339669 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 9339942 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 9339949 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 9340113 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 9340962 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 9341070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9341074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9341427 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9341733 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9341763 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9342242 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 3 9342883 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9347046 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9347608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9347721 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 9348850 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9348910 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9349026 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9353943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9354613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9357678 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 9358102 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9358157 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 9358798 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 9359494 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9360087 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9361219 C T Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 9361279 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 9361295 A T Y N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 9361315 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 9361595 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9361663 A G Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 3 9361665 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 3 9361690 G T Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 3 9362382 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 9362814 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 9362815 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 9363230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9363580 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 9363598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9363628 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9363683 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9363686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9363735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9363736 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 9363900 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9364182 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9364350 G A Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 9364467 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 9364834 T C N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.133333333333333 0.666666666666667 0.2 14 16 2 10 3 3 9364852 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 9364869 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 9364876 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 9364881 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 9365193 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 9365207 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 9365252 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 9365258 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 9365342 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 9365366 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 9365368 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 9365618 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9365691 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9365697 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 9365745 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 9365811 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 9365819 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 9365865 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 9365872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9366130 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 9366132 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 9366265 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 9366295 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 9366414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9366500 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 9366577 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9366670 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9366812 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 9366938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9367307 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 9367379 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 9367914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9368089 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 9368289 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 9368865 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9368948 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 3 9369154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9369343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9369355 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9369397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9369545 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 9369610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9369695 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 9369807 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 9369869 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9370002 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 3 9370006 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9370062 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 9370102 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9370118 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9370295 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 9370331 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 9370356 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 9370377 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 9370422 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 9370770 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 9370961 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9371284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9371477 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 3 9371485 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9371649 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9371653 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9371721 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9371751 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9371768 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 9371807 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9371823 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 9371838 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 9372005 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 9372415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9372670 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 9372940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9372968 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9373194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9373374 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 9373495 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 9373526 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9373567 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 9373778 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 9373784 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 9373850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9373860 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 9373979 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 9374175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9374209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9374225 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 9374398 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9374408 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9374458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9374516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9374517 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 9374533 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9374564 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9374599 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 9374653 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 9374805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9374808 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 3 9374857 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 9374880 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 9374894 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 9374895 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 3 9374914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9374952 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 9375196 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9375241 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 9375270 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9375271 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9375360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9375433 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 9375436 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9375489 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9375562 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 9375565 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9375615 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 3 9375616 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 3 9376853 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9377078 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9377442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9377660 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 3 9377737 A C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0555555555555556 0.722222222222222 0.222222222222222 15 21 1 13 4 3 9378732 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 9379042 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9379089 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9379427 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 9379491 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 9379704 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 3 9379711 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 3 9379828 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 9379864 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 9379926 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 9380619 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.157894736842105 0.736842105263158 0.105263157894737 20 18 3 14 2 3 9380716 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 9380984 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 3 9381020 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 3 9381077 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9381304 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 3 9381502 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 3 9381555 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 9381634 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 3 9381659 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 9382072 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 9382172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9382344 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 9382868 T A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 9383437 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 9384262 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 9384646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9384815 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 3 9384962 A T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.0588235294117647 0.764705882352941 0.176470588235294 15 19 1 13 3 3 9385153 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 9385169 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 9385195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9385276 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9386091 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 9386412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9387694 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 9388496 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 9388923 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9389058 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9389092 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9389201 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 9389461 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 9390265 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9390936 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0 0.7 0.3 14 26 0 14 6 3 9391086 T G Y N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0 0.764705882352941 0.235294117647059 13 21 0 13 4 3 9391447 A G Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 9392523 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 9392981 G C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 9394173 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9394423 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9394875 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9395911 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9396058 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9396433 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9396668 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9398081 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9399415 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9399657 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 3 9400060 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 3 9401042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9401762 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9401767 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9402379 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9402460 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 9402542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9405950 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9406671 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9406944 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 9407000 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 9412540 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9412541 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9412620 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 9412703 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9412791 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9412832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9414507 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9414736 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9415019 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9415551 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9415827 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 9416189 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9416193 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9416246 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9416277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9416523 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9417042 A G Y Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 7 9 0 7 1 3 9417128 G A Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 9417351 A C Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 9417360 C T Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 9417400 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 9417675 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 9420540 A G Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 9421379 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 9421559 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9421693 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9421714 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9421877 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9421901 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9422006 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 9422028 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9422279 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9422356 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9422415 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 9422629 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9422754 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9422810 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 9422907 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 9422993 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 9423118 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 9423130 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9423387 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 9423401 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9423402 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 9423420 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 9423426 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 9423456 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 9425455 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9425458 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9425481 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 9425939 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9426158 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9426159 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 9426235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9426385 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9428580 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 9429115 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9429401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9429760 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 9430315 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 9430387 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 9430405 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9431074 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9431337 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9431592 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 9431669 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 9435095 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 9435823 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9437061 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9438497 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 9439049 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9439202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9439348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9439405 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9441091 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 9441494 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 9441742 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 9441772 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 9441795 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9441895 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 9442040 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 9442418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9442608 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 9442609 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 9442859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9442924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9443074 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 9443199 G A Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 9443831 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9443871 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 9444794 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9444815 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9444989 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9445495 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9445628 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9445669 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 9446803 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 9446825 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 9448158 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 9448225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9450617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9452633 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 9453104 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9453161 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9453276 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 9453369 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 9453504 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9455354 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 9455463 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 9455640 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9455641 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9455651 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9455661 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 9455673 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 9455703 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 9455867 T G N N 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 3 9456068 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9456233 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9456244 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 9456304 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 9456485 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 9456572 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 9456602 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 9456673 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 9456688 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9456711 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 9456939 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 9457258 T C N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 9457276 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 9457600 T C N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 9457822 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 9457852 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 9457972 C G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 9457994 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9458016 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 9458055 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 9458060 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 9458072 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 9458083 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 9458147 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 9458154 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 9458191 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 9458196 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 9458453 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 9458481 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 9458562 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 9458614 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 9458805 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9458818 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 9458881 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 9458882 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 9459002 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 9459034 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 9459048 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 9459210 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 9459444 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 9460551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9461295 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 9462997 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9463088 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 9463162 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 9463946 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 9463947 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 9463990 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 9464397 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 9464428 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 9464438 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 9464447 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 9464596 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 9464598 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 9464685 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 9464870 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 9464872 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9464882 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 9464891 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9465016 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 9465023 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 9465144 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 9465248 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 9465276 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 9465369 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 9465402 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 9465791 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 9465802 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 9465905 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 9466098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9466188 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 9466468 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 9466549 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 9466560 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 9466569 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 9466761 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 9466795 C G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 9466802 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 9466832 T C N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 3 9466842 T C Y Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 3 9466889 A C Y N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 9466900 G T Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 9466948 T C Y Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 3 9467368 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 9467373 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 9467391 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 9467437 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 9467555 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 9467590 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 9467596 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 9467653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9467673 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 9467676 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 9468234 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 9468277 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 9468329 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9468343 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 9468479 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 9468637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9468650 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 9468956 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 9469438 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 9469569 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 9469930 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 9470126 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 9470147 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 9470181 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 9470346 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 9470454 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 9470549 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 9470564 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 9470583 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 9470596 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 9470617 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9470661 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 9471158 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 9471500 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 9471636 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 9471752 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9472064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9472359 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 9472392 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 9472409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9472421 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 9472751 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9472836 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 9472852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9472875 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9472877 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 9473114 G C N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 9473123 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 9473402 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9473456 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 9473562 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 9473572 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 9473593 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 9474067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9474375 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 9474640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9474765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9476803 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 9476916 A C N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 9476930 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9477154 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9478576 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 9479810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9480485 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9480597 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 9480645 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 9480773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9481131 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 9482079 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 9482140 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9482486 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 9482487 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 9483409 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9483856 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9484651 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9485093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9485144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9485150 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9485294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9485498 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 9486052 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 9486291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9487381 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9487535 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9487586 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9487694 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9487699 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9487845 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9487970 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 9487971 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 9488049 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9488050 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9488148 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9488183 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9488304 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9488328 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9488655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9489776 C A N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 9489788 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 9489923 A G N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 9490975 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 9491213 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 9491280 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 9491305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9491964 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9492003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9492240 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9492410 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9492469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9492479 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9492842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9493073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9493270 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9493606 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9493639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9494006 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9494102 T C Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 9494347 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 14 10 2 10 0 3 9494582 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 9494586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9494785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9495316 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9495364 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 9495758 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9495868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9496119 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 9496361 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 9496399 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 9496405 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 9496520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9496542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9496605 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 9496697 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 9496713 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9496785 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 9497316 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 9497320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9497352 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9498636 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 9499716 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9500029 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9500968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9501546 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 9502991 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 9503489 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9503653 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9503706 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 9503708 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 9503771 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 9503799 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 9505062 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9506935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9508961 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9510025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9510387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9513711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9514540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9514817 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9515444 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 9515509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9516251 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 9516331 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 9516363 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9516571 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 9516736 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9516986 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9517014 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 9517037 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 9517137 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 9517248 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 9517249 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 9517330 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 9517651 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9517745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9517932 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9518025 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 9518047 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 9518065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9518105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9518152 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 9518191 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 9518302 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 9518329 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 9518359 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 9518369 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 9518374 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 9518410 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 9518456 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 9518469 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 9518532 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 9518603 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 3 9518614 G T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 9518660 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 9518662 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 9518673 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 9518827 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 9518849 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 9518909 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 9518937 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 9518996 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 9519018 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 9519049 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 9519054 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 9519171 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 9519218 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9519308 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 9519719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9519829 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9520109 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 9521425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9521567 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 9521899 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9521995 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9522400 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 9522415 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9522424 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9522452 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9522472 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 9522508 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9522527 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 9522577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9522870 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9523375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9525100 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 9525101 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 9525727 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 9526335 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9526967 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9527045 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 9527070 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 9527150 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 9527258 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 9527262 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 9527275 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 9527346 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 9527383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9527564 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 9527632 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9527761 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9528653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9528707 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9528744 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9528752 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 9529659 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9529800 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9531646 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 9531879 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 9531880 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9532673 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 9532815 T C Y Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 3 9533236 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 9533273 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 9533556 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9533616 G A Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 9533636 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 9534648 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9535021 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9536106 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 9536334 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9536639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9536719 G C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 9537511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9537621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9540292 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 9541864 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9542056 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 9542893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9543222 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9543366 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 9543741 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 9544324 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9546298 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 9546324 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 9546325 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9546336 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 9547005 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 9547055 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 9547078 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9547116 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9547164 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9547310 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9547384 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 9547701 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9548082 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9548327 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 9548337 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 9548366 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 9548377 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9548527 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9548933 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9548934 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9549350 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9549641 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9550583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9550635 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9551189 T A Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 9553502 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9554172 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 9556550 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9556569 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 9556958 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9557133 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9559486 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9559671 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9560007 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9560575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9561337 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 9562360 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9562522 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 9563545 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9563902 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9563907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9564580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9565053 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 9565403 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 9565483 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9565564 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9565566 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 9565575 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 9566055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9566493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9566526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9566643 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 9566825 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 9568241 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9568670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9568707 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 9568732 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 9569941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9570050 C A N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 3 9570360 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 9570879 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 9571171 T C Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 9574664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9574670 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9575415 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 9575664 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9575867 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9576983 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9577918 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 9577952 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 9577964 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9578034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9578154 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 9578157 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 9578169 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 9578347 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9578561 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 9578642 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9578747 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 9578792 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9578804 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9578823 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9578851 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 9578889 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 9578981 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9579814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9579978 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 9580688 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 9581191 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9581277 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9581547 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 9581574 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 9581625 G T Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 9581659 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 9581764 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 9581827 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 9581985 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 9581997 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 9582006 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 9582133 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 9582138 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 9582275 G C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 9582278 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 9582351 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9582426 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 9582454 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 9582852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9583074 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9583140 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9583245 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9583408 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 9583409 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 9583655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9583991 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9584013 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9584300 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9584665 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 9584849 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9584895 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 9584947 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9585324 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 9585494 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9585731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9585968 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 9586156 A G N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 3 9586314 A C Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 9586466 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9586555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9586561 A T Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 9586652 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9586692 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 9586693 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 9586732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9586738 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 9586744 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 9587731 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9588002 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9588205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9588484 C G Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 9589028 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 9589070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9589385 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 9589467 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 9589480 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 9589483 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9589606 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 9589608 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 9589664 T A Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 9589695 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 9589933 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 9589951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9589953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9589968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9590354 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9590655 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 9590676 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9590807 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 9590822 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9591540 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9591763 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 9593770 T C Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 9593796 A T Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 9594359 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9595154 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 9595850 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9598459 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9598508 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 9598702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9600294 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9601057 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 9601061 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 9601503 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9601824 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9603649 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 9604104 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9604136 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 9604308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9604341 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 9604842 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 9605061 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 9605392 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 9605473 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 9605586 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 9605746 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9606048 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9606137 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9606301 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 9606437 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 9606502 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9606735 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9606906 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 9607170 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 9607712 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9607717 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9608175 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9608516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9608649 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 9608751 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 9608975 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 9609071 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9610470 C A Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 9610516 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 9610656 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 9610749 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 9610806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9610845 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 9610887 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 9610899 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 9610958 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 9611050 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 9611080 A T Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 9611086 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 9611123 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 9611148 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 9611192 C A Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 9611211 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 9611280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9611472 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9611974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9612149 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 9613636 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9613752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9613865 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9615988 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 9616142 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 9616169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9616236 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 9616635 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9616733 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 9616789 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9617413 A G Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 9617745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9618279 G C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 9618387 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 9619522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9619535 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 9619541 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9619665 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9620079 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 9620098 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9620364 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 9620388 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 9620435 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 9620436 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 9620497 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 9620506 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 9620640 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 9620661 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 9620667 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 9620717 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 9620735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9620761 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 9620782 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 9620948 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9620993 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 9621158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9621166 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 9621206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9621216 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9621531 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 9621705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9621735 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 9621851 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 9622044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9622123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9622963 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9623127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9623131 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9623198 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 9623440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9623819 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 9623908 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9623912 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9623992 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9624200 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 9624668 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9625277 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 9625442 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9625470 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9625666 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9625756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9625939 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 9626147 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9626244 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 9626292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9626296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9626382 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9626571 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 9626572 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 9626630 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 9626691 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9626771 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9626777 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9626785 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9626792 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9626978 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 9626986 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 9627009 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 9627035 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9627192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9629951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9635648 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 9635889 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9636629 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 9636631 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 9637305 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 9637312 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 9637321 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 9637716 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 9637717 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 9637844 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 9637950 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 9637963 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 9638028 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 9638137 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 9638175 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 9638401 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 9638429 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 9638493 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 9638612 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 9638636 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 9638644 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 9638647 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 9638670 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 9638682 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 9638684 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 9638843 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 9638901 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 9639066 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 9639092 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 9639148 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 9639410 C G Y N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 9639417 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 9639430 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 9639461 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 9639503 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 9639533 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 9639550 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 9639593 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 9639647 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 9639784 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9639825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9639931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9639990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9640109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9640209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9640762 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9641204 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 9643810 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9645079 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 9645185 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 9645675 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9647584 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9647849 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 9648060 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 9648074 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9648284 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9648662 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 9648879 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 9650076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9650480 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9650657 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9650979 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9653318 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 9655223 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 9655260 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 9660881 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9661023 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 9661371 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 9661933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9664078 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 9664479 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 9664740 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9664846 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 9665382 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 9665493 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.15 0.75 0.1 21 19 3 15 2 3 9665928 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 9666071 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 9666150 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 9666728 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 9666880 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 9667186 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9667569 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 9667610 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 9667634 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 9667704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9667715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9667832 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 9667847 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9667892 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 9668006 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 9668266 T C Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 9668601 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 9668714 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 9668718 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 9669438 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9669469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9669475 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9669547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9669557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9669855 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9670133 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 9670594 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9670884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9671044 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9671094 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 9671373 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 9671507 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9671673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9672054 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 9672066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9672883 A G Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 9672902 C G Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 9673062 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 9673105 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 9673177 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 9673382 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 9673435 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9673566 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 9673701 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 9673742 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 9673871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9673947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9674132 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 9674536 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 9675399 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 9675536 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 9675596 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 9676760 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9677558 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 9678019 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 9678095 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 9678109 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 9678240 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 9679698 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 9679710 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 9679759 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 9679999 C G Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 9680284 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9680783 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9680849 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 9681181 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 9681425 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 9681515 T G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 9681673 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 3 9681677 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 9681781 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 9681788 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 9681988 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9682084 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 9682115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9682276 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9682307 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9682669 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9682762 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 3 9684146 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9684221 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9684837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9684845 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9684893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9684926 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 9684934 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 9684942 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 9684955 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 9684969 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 9684977 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 9684984 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 9685503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9685867 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9685945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9686391 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 9686487 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 9686736 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 9686781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9686822 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 9686829 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 9687016 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 9687043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9687072 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 9687487 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 9687670 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 9687718 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 9687882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9688072 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 9688169 A T Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 9688202 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 9688441 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 9688632 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 9688639 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9689048 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 9690055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9691578 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9691744 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9692523 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9693728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9693761 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9694109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9694447 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9694462 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9695096 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 9695316 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 9695737 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9695999 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9696567 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 9696859 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 9696971 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 9697018 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 9697275 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 9697340 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 9697384 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 9697509 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9697546 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 9697602 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 9697626 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 9697643 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 9697839 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 9697933 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 9697965 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 3 9698096 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9698189 C G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 3 9698312 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 9698421 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 9698649 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 9698657 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 9698765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9699127 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 9699549 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 9699603 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 9700096 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 9700183 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 9700334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9700382 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 9700498 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 9700503 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9700529 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 9700680 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9700858 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9700921 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9700954 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 9701015 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 9701040 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 9701048 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 9701383 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9701926 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 9701935 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 9702073 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 9702127 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 9702152 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9702169 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 9702235 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 9702612 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 9702691 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 9703111 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9703731 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 9703851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9703871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9704925 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9705201 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 9705390 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 9705395 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 9705654 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 9705662 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 9706457 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9706751 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 9706758 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 9706889 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 9706897 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9707215 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 9707679 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 9707774 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 9707881 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 9707938 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 9707942 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 9708180 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 9708238 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 9708272 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 9708529 C A Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 9708554 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 9708776 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 9708787 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9708835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9708873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9709385 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 9709405 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 9709481 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9709497 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9709551 T C N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.357142857142857 0.214285714285714 0.428571428571429 13 15 5 3 6 3 9709558 C G N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.333333333333333 0.2 0.466666666666667 13 17 5 3 7 3 9709587 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 9709627 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 9709684 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 9709775 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9709795 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 9709826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9709919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9709977 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9710390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9710456 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 9710503 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 9710719 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 9710760 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 9711098 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9711161 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 9711282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9711313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9711653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9711696 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 9711821 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 9712061 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 9712198 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 9712292 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 9712504 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 9712570 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 9712676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9712992 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9713205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9713231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9713274 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 9713301 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 9713674 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 9714958 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9714968 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 9715011 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 9715397 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 9715525 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9715634 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 9715741 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9715801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9715804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9715934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9716017 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 9716816 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9717828 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9717841 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9717911 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 9718289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9718659 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9718751 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9719114 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9719421 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 9720672 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9720804 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 9722080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9722160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9722547 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9723785 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 9723942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9724031 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 9724089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9724098 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 9724127 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 9724368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9724409 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9724701 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9724934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9724952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9725069 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9725186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9725192 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 9725286 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 9725307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9726656 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 9726776 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 9726802 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 9726851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9726914 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 9726930 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 9727159 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 9727178 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 9727259 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 9727331 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 9727590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9727775 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9727821 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9728202 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9728384 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 9729542 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 9730981 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9739002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9739586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9740440 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9741069 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 9741234 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9741832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9742293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9742341 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9742398 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9742611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9742721 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9742860 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9743264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9743446 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9743458 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 9743831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9743913 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 9744265 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9744276 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9744417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9744499 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9744739 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9744860 G T Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 9745293 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9746527 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9746593 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9747451 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9747537 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9747823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9747861 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 9747950 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 9747992 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 9748137 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 9748733 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9748734 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9748879 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9748886 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9749293 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 9749391 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 9749459 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 9749581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9749773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9749858 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 9749870 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 9750378 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9750394 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9750401 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9750668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9750738 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 9750869 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 9750998 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9751564 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9752742 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9753269 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9753557 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 9755236 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 9755267 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 9755486 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 9755562 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 9755681 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 9755870 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9756428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9757033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9757112 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9757140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9757175 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9757195 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 9757449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9757522 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9757526 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9757608 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 9757707 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 9757715 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9757805 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 9758631 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9758659 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9758726 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 9758779 C G Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 9758843 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9758864 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9758874 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 9760007 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 9760241 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 9760318 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9760462 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 9760966 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 9761546 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9761597 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 9761824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9762821 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9763854 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 9764004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9764019 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 9764040 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9764222 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 3 9764387 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 9764409 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9764953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9765038 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 9765060 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 9765082 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.15 0.75 0.1 21 19 3 15 2 3 9765203 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9765214 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 9765330 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 9765348 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 9765381 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 9765385 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 9765741 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9765819 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9765821 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9766098 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9766176 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9766240 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9766257 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9766347 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 9766357 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 9766371 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9766444 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9766474 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9766484 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9766741 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 9766826 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 9766873 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 9766892 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 9769302 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 9769696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9769754 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 9769854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9770382 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 9772121 T C Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 9776527 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 9776725 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9776754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9780986 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 9782579 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9783800 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9784529 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9784635 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 9784698 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9785308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9786145 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 9786451 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 3 9786553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9787781 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9787798 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9787810 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9787888 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 9788033 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 9788381 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 9789147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9789262 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9791008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9791488 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9791604 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9793973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9797152 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 9797264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9797954 C T Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 9798665 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9798957 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 3 9798977 T C N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 3 9799002 T C Y Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 3 9799116 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 9799156 C T N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 3 9799367 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 9799407 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9799500 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 9799601 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9799685 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 9800063 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9800090 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9800183 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9800265 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 9800269 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 9800290 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 9800452 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9800471 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9800565 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9800629 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9800838 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9800873 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9800944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9800980 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9801077 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9801086 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 9801826 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9801954 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9802142 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 9802198 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 9803780 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9803939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9804004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9804015 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9804084 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9804103 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9804187 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9804250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9804342 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9804365 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9804799 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9804959 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9805252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9805752 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9805983 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 9806065 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 9806567 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 9806609 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 9807693 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 9807708 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 9807757 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9808563 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 9808567 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 9808683 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 9808938 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 9808941 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 9809068 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 9809573 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 9809833 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 9809839 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 9810018 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9810262 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9812177 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9812298 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 9812313 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9813213 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9813930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9814009 A G N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 9814658 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 9814673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9814759 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 9814914 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 9815679 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 9815692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9815823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9815992 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 9816402 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 9816487 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 9816651 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 9816665 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 9816719 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 9816873 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 9816896 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 9816927 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 9817030 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 9817211 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 9817214 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 9817269 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 9817295 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 9817378 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 9817400 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 9817404 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 9817418 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 9817433 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 9817602 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 9817720 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 9817721 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 9817756 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9817929 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 9818066 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 9818075 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 3 9818128 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 9818134 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 9818219 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 9818324 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 9818355 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9818412 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9818440 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 9818508 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9818545 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9818719 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 9818923 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 9819010 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 9819121 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 9819408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9819595 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 9819631 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 9819666 G A Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 9819715 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9819729 C T Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 9819732 C T Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 9819743 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 9819758 T C Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 9819786 T C Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 9819811 A G Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 9819971 C G Y N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 9820009 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 9820228 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 9820337 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 9820449 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 9820464 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9820612 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 9820636 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 9820656 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 9820665 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 9820712 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 9820735 A T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 9820738 G C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 9820799 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 9820827 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 9820838 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 9820855 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 9821313 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9821409 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9821458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9821476 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 9821662 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9822100 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 9822135 A G Y Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 3 9822274 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 9822603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9822669 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9822670 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 9822687 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 9822757 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 9823032 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 9823151 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 9823253 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 9823371 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 9823480 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 9823553 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 9823998 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 9824002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9824210 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9824492 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9824550 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 9824755 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 9826520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9827176 A G Y Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 3 9827440 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 9827466 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 9827480 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 9827588 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 9828111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9828153 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 9828238 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 9828306 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 9828352 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 9828697 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 9829198 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9829301 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 9829303 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 9829623 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9829638 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9829927 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 9830124 G C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 9830794 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 9833080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9833236 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9833243 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9833836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9834802 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 9834919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9835184 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9835503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9835534 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0 0.75 0.25 12 20 0 12 4 3 9835546 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 9835816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9835844 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9836329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9836617 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9836661 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9837621 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 9837842 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9839653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9839712 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9841428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9843621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9844173 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 9844403 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 9844404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9844419 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 9844526 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 9844545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9844550 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 9844818 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 9844888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9844942 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 9845236 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 9845248 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 9845254 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 9845264 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 9845308 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 9845461 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 9845466 C A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 9845476 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 9845593 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 9845615 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 9845621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9846493 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 9846498 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9846620 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9846916 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 9847088 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 9847294 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9847343 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 9847375 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 9847379 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 9847387 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9847423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9847431 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 9847453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9847460 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 9847566 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 9847979 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9848417 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9848559 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9848578 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 9848585 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 9848619 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9848970 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9849887 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9850036 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9850230 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9850240 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9850363 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 9850500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9850817 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 9850923 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 9850941 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9851026 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 9851120 A C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 9851256 T G N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 3 9851465 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 9851796 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 9851839 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9851998 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 9852155 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 9852185 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 9852227 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9852504 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 9852882 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 9852940 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 9852975 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 9853568 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9853970 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 9854184 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 9854685 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 9854985 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 9855221 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 9855341 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9855629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9855836 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 9856056 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 9856067 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9856127 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 9856167 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 9856345 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9856480 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9856615 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 9856617 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 9856821 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9856952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9857004 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 9857031 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 9857113 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 9857133 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 9857143 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 9857166 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9857169 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9857259 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9857325 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 9857339 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 9857363 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 9857367 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 9857799 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9858065 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 9858697 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9858997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9859035 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9859124 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 9859135 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 9859138 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 9859146 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 9859151 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 9859169 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 9859199 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 9859702 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 9859703 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 9859885 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 9859971 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 9860033 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 9860061 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 9860253 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 9860382 C T N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 3 9860402 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 9860459 G A N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 9860470 T A N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 9860658 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 9860661 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 9860692 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9860704 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 9860711 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 9860720 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 9860732 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 9860743 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 9860840 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 9860916 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 9860982 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 9861038 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 9861048 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 9861066 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 9861175 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 9862231 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 9862252 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 9862268 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 9862287 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 9862376 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 9862408 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 9862414 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 9862450 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 9862453 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 9862881 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 9863028 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 9863128 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 9863288 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 9863290 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 9863318 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 9863407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9863683 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 9863743 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9863882 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 9863968 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 9864042 T A N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 3 9864197 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 9864257 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 9864291 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 9864317 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 9864427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9864720 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 9864782 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 9864945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9865719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9866018 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 9866096 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 9866163 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 9866218 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 9866382 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 9866648 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 9866653 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9867028 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9867201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9867223 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9867262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9867315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9867364 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 9867414 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9867449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9867451 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9867573 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9867627 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9867631 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9868066 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9868070 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9868110 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9868138 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9868220 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 9868253 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9868256 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9868276 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9868285 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9868336 C G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 9868353 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 9868390 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9868399 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9868728 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 9868766 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 9868880 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 9868915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9869012 A T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 9869040 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 9869053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9869120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9869127 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9869183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9869212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9869483 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 9869501 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9869519 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 9869568 T C Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 9869826 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 9870073 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 9870117 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 9870131 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 9870144 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 9870161 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 9870169 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 9870172 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9870190 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 9870268 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 9870319 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 9870328 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 9870332 G T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 9870342 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 9870538 A G Y Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 6 6 1 4 1 3 9870541 T C Y Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 6 6 1 4 1 3 9870549 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 9870561 A G N Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 6 6 1 4 1 3 9870575 A C N N 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 3 9870592 A G N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 3 9870639 A C N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 9870656 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 9870751 A G Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 9870772 T C Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 9870791 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 9870802 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 9870813 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 9870847 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9870898 G A Y Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 3 9870942 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 9871050 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 9871088 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 9871124 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 9871186 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 9871230 T C N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 3 9871680 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 3 9871847 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 3 9871897 T C Y Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.333333333333333 0.583333333333333 0.0833333333333333 15 9 4 7 1 3 9871960 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 9872023 A G Y Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 3 9872036 A G Y Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 3 9872104 A C Y N 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 8 10 3 2 4 3 9872134 C T Y Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 8 10 3 2 4 3 9872197 T C Y Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 9872590 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9872621 A T N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 3 9872647 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 9872677 G T N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 3 9872744 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 9872986 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 9873026 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 9873115 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 9873142 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 9873167 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9873433 C T Y Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.333333333333333 0.583333333333333 0.0833333333333333 15 9 4 7 1 3 9873511 T C Y Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0 0.777777777777778 0.222222222222222 7 11 0 7 2 3 9873658 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.25 0.666666666666667 0.0833333333333333 14 10 3 8 1 3 9873738 A G Y Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 3 9873743 T C Y Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 6 6 1 4 1 3 9873854 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 9874168 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9874202 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 9874365 G A Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 9874434 G T Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 9874465 G A Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 9874488 C T Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 9874788 C A N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 3 9874795 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 9874805 T G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 9874824 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 9874947 A G Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 9875048 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 9875149 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 9875170 A C N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 9875271 T A Y N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 3 9875276 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 9875336 T G N N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 3 9875338 T C N Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 3 9875380 C T N Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 6 6 1 4 1 3 9875387 C T N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 6 10 1 4 3 3 9875426 A C N N 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 3 9875460 A T Y N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.2 0.8 0 6 4 1 4 0 3 9875560 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 9875587 G T Y N 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 3 9875629 C T Y Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 10 10 3 4 3 3 9875886 G A Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 9875958 T C N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 3 9876030 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 9876062 T G N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 9876064 C T N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 3 9876128 C T N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 3 9876202 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 9876318 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9876405 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 9876462 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 9876510 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 9876867 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 9877111 G A N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 9877142 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 9877242 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 9877263 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 9877335 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 9877388 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 9877446 C A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 9877592 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 9878024 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9878104 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 9878140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9878231 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 9878303 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9878321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9878365 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9879385 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 9879814 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 9881062 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9881935 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 9882123 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 9882152 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9882253 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 9882394 G A N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.384615384615385 0.307692307692308 0.307692307692308 14 12 5 4 4 3 9882846 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 9882862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9883036 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 9883187 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 9883408 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 9883420 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 9883492 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 9883723 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 9883927 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9883939 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9883990 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9884089 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9884119 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 9884127 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 9884167 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9884249 C A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 9884255 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 9884753 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9885511 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 9885600 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9886104 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9886272 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9886335 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9886403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9887212 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9889808 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 9890400 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 9890409 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9890640 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9890773 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9890842 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9890854 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9890871 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9891163 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 9891196 C G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 9891404 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 9891572 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9891614 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9891780 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 9891810 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9891815 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9891830 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9891832 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9892084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9892386 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 9892454 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 9892486 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 9892502 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 9892805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9893913 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 9893914 A T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 9894273 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 9894351 C G Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 9894901 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9895360 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 9895368 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9895494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9895768 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 9895921 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 9895984 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 9896000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9896527 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 9896598 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 9896647 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 9896700 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 9896735 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 9896747 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 9896748 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 9896795 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 9896839 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9896905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9896934 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 9896972 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9897307 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9897445 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 9897450 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9897457 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 9897648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9898065 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9898068 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 9898310 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 9898483 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 9898493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9898524 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 9898937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9898941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9899232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9899266 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 9899288 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9899350 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 9899458 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9899470 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9899502 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9899561 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 9899838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9899875 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 9899886 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9899889 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9899936 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 9900136 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9900217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9900239 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9900325 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 9900385 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9900391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9900532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9900546 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 9900646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9900893 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 9900914 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9900965 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 9900985 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 9901040 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 9901085 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 9901098 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 3 9901101 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9901176 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 9901194 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9901380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9901408 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9901597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9901613 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 9901869 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 9901892 A G N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 3 9901901 A G N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 12 12 3 6 3 3 9901996 A C N N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 3 9902234 A C N N 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 3 9902238 T C N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 3 9902275 C G N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 3 9902443 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 9902529 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9902607 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9902614 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 9902642 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9902700 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 9902810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9902856 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9902966 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9902969 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9903003 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9903160 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 9903387 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 9903736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9903772 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 9912036 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 9912037 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9912166 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 9912225 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 9912375 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 9914753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9915155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9916321 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 9916386 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 9916449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9918023 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 9920476 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9923164 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9923514 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9923641 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 9923916 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 9924117 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 9924223 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 9924872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9925559 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9925725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9925906 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9926044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9926357 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 9926890 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9928183 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 9928204 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9928993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9930071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9931825 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9932593 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 9935041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9936035 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9936196 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9936871 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 9937180 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 9937784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9937837 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9937939 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 9938026 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 9938328 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 9938389 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 9938457 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9938668 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 9938711 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 9938754 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 9938908 G C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 9939201 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 9939321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9939461 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9939714 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 9939746 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 9939756 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 9939927 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 9940381 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 9940431 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 9940671 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 9941326 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 9941572 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9941641 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 9941672 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 9941785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9942035 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 9942120 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 9942137 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9942642 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 9942751 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 9942886 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 9944829 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 9945180 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9945434 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 9945475 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 9945488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9945522 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 9945597 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 9945604 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9945663 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 9945747 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 9945760 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 9945792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9945889 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 9945979 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 9945985 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 9945990 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 9946812 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 9947046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9947081 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 9947092 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 9947103 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 9948027 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 9948681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9949129 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 9949473 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 9956363 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 9957730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9957770 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9958859 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9958966 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 9958979 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 3 9959309 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 9960305 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9960340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9960421 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9960533 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 9961088 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 3 9961118 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9961209 T C N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 3 9967649 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 9967667 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9967741 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 9967815 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9967902 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 9967988 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 9968003 T G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 9968008 C G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 9968057 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 9968303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9968875 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 9968899 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 9972997 C A Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 9973431 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 9974087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9975172 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9977326 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 9978293 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9978838 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9979339 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9980699 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 9983782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9983910 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9985313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9985919 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 9985931 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 9986064 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9986240 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 9986386 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 9986594 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 9986745 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 9986841 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 9986850 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 9986977 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9987872 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 9988076 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 9996228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 9999025 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 9999027 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10000857 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10001313 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 10005772 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 10005852 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 10005879 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10006003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10006678 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 10006898 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10007120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10008309 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 10008423 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10009468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10009590 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10009645 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 10009739 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 10009872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10010374 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10010405 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10011183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10011275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10012883 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 10012958 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 10014110 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 10014300 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 10014521 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 10014530 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 10014641 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0 0.722222222222222 0.277777777777778 13 23 0 13 5 3 10014651 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 10015353 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 10015388 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 10017077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10017605 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 10018234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10018456 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 10018485 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 10018510 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 10018673 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10020698 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 10022511 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 10023287 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 10023357 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10023459 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 10023949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10024003 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 10024113 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 10024118 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 10024613 C A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 10024939 G C Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 10024997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10025151 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 10025191 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 10025207 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10025283 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10025452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10025523 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 10025812 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 10025816 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 10025930 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 10025999 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 10026064 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 10026371 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 10026571 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 10026583 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 10026610 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 10026832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10028125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10028748 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10028767 G T Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 10029616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10029849 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 10030229 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10030613 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 10030718 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10030860 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 10031321 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 10031717 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 10032151 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 10032339 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 10032487 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 10032590 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 10032754 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 10032973 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 10033073 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 10033180 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 10033396 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 10033403 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 10033564 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 10033573 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 10033664 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 10033670 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 10033691 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 10033706 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 10033741 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 10033927 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 10033951 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 10034860 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 10034882 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 10034915 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 10034982 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 10035146 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 10035359 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 10035395 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 10036115 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 10036199 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10036236 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 10036421 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 10036466 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 10036543 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 10036651 T G N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 10037305 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10037657 C T Y Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 3 10038208 A G Y Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 3 10038271 T G Y N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 10 10 2 6 2 3 10039077 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10039344 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 10039422 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10039530 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10040063 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 10040187 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10040363 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 10040689 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 10040740 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10041235 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 10041251 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 10041303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10041488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10041489 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 10041742 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 10041967 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 10041976 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 10041980 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 10042030 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 10042068 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 10042069 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 10042132 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 10042180 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 10043061 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 10043116 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10043121 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 10043148 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 10043617 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10043625 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10044023 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10044659 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10044897 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 10045062 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 10045079 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 10045201 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 10045258 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 10045318 C T N Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 9 7 2 5 1 3 10045927 T C Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 10046772 A G Y Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 3 10047276 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10048173 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 10048199 A G Y Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 10048206 A T Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 10049486 A T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 10049492 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 10049580 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 10049628 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 10049720 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 10049729 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 10049839 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 10050235 G T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 10050347 A C N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 10050402 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10050969 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 10050982 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 10051014 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 10051165 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10051172 T G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 10051503 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 10051545 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 10051607 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 10051694 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 10051714 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 10051838 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 10051844 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10051880 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 10052127 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10052165 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10052411 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 10052911 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 10053238 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10053295 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 10053325 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 10053372 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 10053416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10053454 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 10053475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10053516 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10053591 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 10053687 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 10053908 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 10054194 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10054413 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 10054423 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 10054506 C G Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 10054543 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 10054590 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10054640 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 10054658 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10054686 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 10054702 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10054904 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10054987 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 10055001 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10055020 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10055125 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10055637 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 10055682 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 10055814 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 10055817 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 10055826 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 10055894 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 10055910 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 10056056 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 10056111 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 10056148 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 10056175 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10056218 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 10056324 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10056340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10056350 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10056774 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 10056952 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10056982 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10057053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10057069 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 10057126 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10057132 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10057191 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10057202 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10057629 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10057630 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10057667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10057676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10057681 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10057695 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10057704 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10057752 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10057756 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10057807 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10057826 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10057889 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10057978 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10058010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10058011 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10058069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10058130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10058165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10058268 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10058274 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10058288 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10058310 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 10058445 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 10058499 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 10058530 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 10058549 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 10058557 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 10058676 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 10058723 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 10058743 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 10058799 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10058802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10059130 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 10059162 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10059261 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10059262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10059481 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 10059510 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 10060837 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 10060897 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 10062452 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 10062453 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 10063678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10063858 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10064376 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10064513 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 10064707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10064896 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 10064974 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 10064993 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 10065064 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 10065067 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 10065095 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 10065112 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 10065147 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 10065165 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 10065240 A C Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 3 10065271 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 10065286 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 10065289 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 10065301 A G N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 10065317 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 3 10065469 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 10065770 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 10065771 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 10065844 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 10065872 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 10065883 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 10066011 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 10066051 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 10066127 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 10066299 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10066313 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 10067286 A T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 10068041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10068277 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10071140 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 10072234 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10075098 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10076918 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 10077566 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10077757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10078053 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10078243 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10079302 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10083085 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 10083323 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 10083483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10084142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10085047 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10087982 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10091849 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10093200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10093894 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 10094254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10095746 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 10096582 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10096899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10097245 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10097565 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 10097575 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 10097581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10097672 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 10099238 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 10099505 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 3 10101910 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10104474 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 10104525 G A Y Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 3 10104643 C T Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 10104842 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 10105032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10105618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10107727 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10107805 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10109011 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 10109012 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 10109038 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 10109052 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 10109098 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 10109134 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 10109248 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 10109326 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 10109370 G T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 10109371 A T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 10109398 G A N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 10109569 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 10109619 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 10109661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10109762 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 10109818 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 10109825 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10110175 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10110271 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 10110274 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 10110290 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10110418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10110677 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 10110846 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 10111218 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 10111283 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 10111692 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 10111693 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 10111769 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 10112027 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 10112077 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 10112432 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 10112602 A T N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 10112714 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 10114077 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 3 10114568 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 10114593 A G N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 3 10115697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10116103 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 10117740 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10119564 C A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 10120325 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 3 10123167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10123352 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 10123359 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 10124443 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 10124968 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 10126891 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 10127246 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 10127366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10127488 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 10127917 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 10128116 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 10128273 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 10128386 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10128424 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 10128569 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10128573 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10128587 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 10128606 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 10128797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10129289 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 10129298 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 10129496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10129693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10130255 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 10130402 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 10130512 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 10130532 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 10130619 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 10130642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10130685 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 10130733 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 10130765 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 10130766 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 10130936 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 10131282 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10131470 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10131642 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 10131771 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 10132138 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 10132435 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 10132583 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 10132836 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 10133474 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10134861 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 10135206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10135357 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 10135433 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 10135434 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 10135477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10135534 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10135578 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 10137533 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 10137595 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10137603 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10137823 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 10138137 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10138185 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10138313 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10138339 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10138420 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 10138844 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 10138856 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 10139063 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10139197 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 10141164 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 10141649 T A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 10143474 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10143635 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10143815 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 10144137 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10144421 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 10144841 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10144896 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 10145487 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 10145546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10145597 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10145967 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 10146055 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10146166 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10146177 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 10146263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10147408 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 10147435 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 10147514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10147682 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 10147744 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10147897 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 10147943 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10148021 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 10148356 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 10148463 T C Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 10148589 C A Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 10148602 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10148667 G T Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 10148772 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 10148848 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 10148852 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 10148926 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 10148976 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10149052 C A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 10149179 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 10149379 G T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 10149431 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 10149489 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 10149491 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 10149645 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 10149937 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 10150449 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10150551 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10151294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10151689 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 10151795 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 10151878 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 10152446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10152795 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 10152857 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 10152862 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 10153064 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 10153149 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 10153255 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 10153403 T G N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 10153552 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 10153658 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 10153706 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10153707 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 10153775 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 10153908 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 10154004 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 10154043 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 10154315 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 10154431 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 10154605 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 10154891 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 10154906 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 10154923 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 10154939 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 10154976 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 10155220 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 10155289 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 10155512 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 10155547 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 10155934 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10155971 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 10156005 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 10156816 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 10157999 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 10158048 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 10158253 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 10158421 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10158494 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 10162943 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 10163054 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10163146 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10163174 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 10163195 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10163497 T C Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 10163512 G T Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 10163791 G A Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 10163848 A T Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 10164027 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10164125 T C Y Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 3 10164195 C T Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 3 10164496 G C N N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 3 10167335 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 10167366 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 10167377 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 10167401 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 10167487 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 10167540 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 10167541 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 10167551 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 10167648 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 10167722 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 10167778 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 10168192 T A N N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 3 10168193 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 5 7 1 3 2 3 10168295 A T N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 3 10168319 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 10168396 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 10168741 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 10168903 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 10168949 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 10169028 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 10169074 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 10169445 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 10169588 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 10169720 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 10170326 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 10170625 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 10170626 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 10170712 G A Y Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 3 10170723 G T Y N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 3 10170743 A C Y N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 10170748 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 10171099 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 10171351 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 10171944 G T Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 10172105 A C Y N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 10172541 T C Y Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 10172578 C T Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 10172603 C T Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 3 10172657 T C Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 10172739 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 10172743 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10172810 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 10172916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10172990 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 10173024 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 10173217 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 10173333 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10173337 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 10173580 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10173777 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 10174257 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 10174339 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 10174364 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 10174550 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10174681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10174704 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 10174742 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 10174762 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 10175272 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 10175593 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 10175977 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 10176031 C G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 10176076 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 10176077 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 10176148 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 10176178 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 10176309 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 10176369 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 10176385 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 10176386 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 10176406 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 10176430 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10176462 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 10176578 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 10176844 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 10176885 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 10179391 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10180239 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10183589 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 10183590 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 10193371 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10193828 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 10194781 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 10195459 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10195599 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10195978 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10196087 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10196126 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 10196192 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10196844 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10196856 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 10197070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10197194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10197782 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 10198322 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 10198433 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 10198507 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 10198722 C A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 10198731 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 10198735 C A N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 10198989 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 10199048 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 10199153 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 10199772 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 10199844 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10199918 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 10199945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10199960 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 10200409 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 10200652 C A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 10200935 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10202687 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 10203451 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 10203560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10203769 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 10203790 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10204025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10204068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10206746 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 10207898 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10208362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10208564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10208586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10210152 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 10212774 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10214660 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10215089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10215829 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10216867 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 10216970 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 10217173 A G Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 10217579 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10217742 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 10217944 T C Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 10218621 T C Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 10218634 G A Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 10218788 C A Y N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 3 10218970 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 10218986 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 10219005 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 10219361 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10219492 C T Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 10219756 G T Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 10219762 C T Y Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 3 10219795 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 10219894 G A Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 10219987 C G Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 10220067 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 10220619 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 10220865 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10221908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10223410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10223529 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 10223715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10224589 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10225021 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10225343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10227667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10227668 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10227727 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 10227897 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10228234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10228282 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 10228360 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 10228459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10228541 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10228796 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10228799 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 10229118 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 10229144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10229186 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 10229252 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 10229606 G A N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 10229612 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 10229795 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 10230239 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10230478 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 10230890 G A N Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 8 6 3 2 2 3 10230916 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 10230998 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10231419 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10231499 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 10231642 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 10231718 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 10231871 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 10232072 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10235148 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 10238717 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10241146 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10241298 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10243091 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10243553 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 10243657 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 10243790 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 10243800 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 10243877 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 10244334 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10244526 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 10244534 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 10244589 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 10244650 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10244741 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 10244894 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 10245146 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 10245166 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 10245373 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 10245399 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 10245522 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10245576 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 10246091 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 10246347 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 10246510 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 10246778 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10246953 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 10247014 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10247816 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 10247856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10248288 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10250739 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10251380 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10252143 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 10252196 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 10253157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10253509 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 10253751 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 10253873 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10253931 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 10253944 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 10253975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10254115 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 10254169 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 10254240 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10254430 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10254692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10254871 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10254951 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10255944 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 10255982 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 10256399 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10256522 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 10256619 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 10256726 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 10256870 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 10256926 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 10256999 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 10257014 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 10257015 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 10257154 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 10257180 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 10257327 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10257568 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 10257599 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 10257691 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 10257738 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 10257819 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 10258075 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 10258335 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 10258482 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 10258607 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 10259065 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10259111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10259517 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 10259684 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 10259971 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 10260076 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 10260172 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 10260217 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 10263673 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 10265300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10265699 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10266940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10267410 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 10267913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10269175 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 10269487 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10270315 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10271259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10272372 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 10272855 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 10273194 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 10274083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10275217 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 10275233 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 10275235 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 10276082 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10276099 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 10276635 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 10278763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10278999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10280119 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10280705 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 10280712 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 10280869 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 10281066 G C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 10281139 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10281169 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10281201 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 10281956 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10283035 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 10283622 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10284105 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10284285 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 10284558 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10284942 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10285140 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 10285159 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 10285204 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 10285228 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 10285251 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 10285555 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 10285838 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 10286000 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 10286519 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10286750 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 10287154 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 10287158 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 10288789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10289281 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 10289361 T G N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 10289365 A T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 10289476 T A N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 10289504 T G N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 10289743 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10289801 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10289891 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10289916 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 10291756 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 10293560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10295031 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 10295046 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10295172 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 10295174 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 10295217 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 10295248 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 10295259 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 10295694 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10296088 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 10296218 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 10296353 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10296430 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 10296543 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 10296565 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 10296584 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 10296843 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 10296875 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 10296987 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10296989 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 10297020 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 10297437 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10297462 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10297630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10298002 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10298288 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 10298526 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10298580 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10298594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10298630 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10298637 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 10298667 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10298675 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10298707 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10299000 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 10299430 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 10299453 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 10299459 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10299481 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 10299485 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 10299692 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 10299707 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 10299738 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 10299824 C A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 10300238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10300374 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10300468 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10300575 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 10300681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10300688 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10300716 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10300834 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10300862 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10300886 T A Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 3 10300889 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 10300907 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 10300939 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 10300958 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10300996 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10301033 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10301240 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 10301267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10301312 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 10301367 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 10301383 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10301418 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10301428 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10301657 A G Y Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 3 10301683 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 3 10301701 G A N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 10301810 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 10301829 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 10301847 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 10301871 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 10302138 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10302150 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 10302151 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 10302182 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 10302244 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 10302380 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 10302548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10302758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10302856 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 10302867 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 10302884 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 10303012 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 10303049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10303063 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 10303077 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 10303204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10303213 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 10303330 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 10303341 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 10303561 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10303573 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10303789 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 10303850 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 10303893 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10303929 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 10304028 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 10304073 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 10304712 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 10304827 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 10304932 T G Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 10305058 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 10305104 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10305217 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 10305476 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 10305488 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 10305501 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 10305505 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 10305586 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 10305634 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 10305646 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 10305662 T G Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 10305664 C G Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 10305703 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.117647058823529 0.705882352941177 0.176470588235294 16 18 2 12 3 3 10306574 A G Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 3 10306766 G A N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 3 10306776 A G N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 8 12 2 4 4 3 10306789 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 10307086 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 10307222 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 10307295 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 10307342 C G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 10307652 C G N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 10308314 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 10308400 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10308507 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 10308622 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 10308655 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 10308682 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 10308730 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 10308855 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 10309215 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 10309373 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 10309380 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 10309566 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 10309833 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 10310135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10310201 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 10310218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10310323 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10310349 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 10310382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10310404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10310556 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10310704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10310795 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 10310831 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 10310855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10310919 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 10310939 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 10310975 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 10311004 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 10311035 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 10311102 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10311132 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 10311196 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 10311266 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 10311324 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 10311395 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 10311492 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 10311524 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 10311587 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 10311596 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 10311645 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 10311655 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 10311905 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 10312148 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 10312203 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 10312405 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 10312497 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 10312908 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 10313705 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10313731 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 10313903 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10313936 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 10314001 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 10314342 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 10314423 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 10314899 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 10314911 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10315107 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 10315137 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 10315294 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 10315407 C G N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.214285714285714 0.714285714285714 0.0714285714285714 16 12 3 10 1 3 10315417 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 10315770 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 10315910 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 10317964 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 10318058 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 10318174 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 10318445 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10318446 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10318537 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 10318542 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 10318561 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 10318573 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10318630 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 10318666 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 10318671 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 10318739 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10318758 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 10319008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10319080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10319091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10319138 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 10319290 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 10319303 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 10319317 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 10319413 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 10319501 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 10319522 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 10319550 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 10319574 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 10319643 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 10319726 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 10319733 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 10319857 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 10320012 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 10320076 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 10320151 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 10320166 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 10320215 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10320320 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 10320443 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 10320480 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 10320673 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 10320719 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 10320953 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 10320976 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10321014 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 10321063 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 10321074 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 10321152 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 10321171 A C N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 10321247 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 10321695 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 10321868 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 10322159 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 10322855 C A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 10322947 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 10323807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10324847 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 10325506 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 10325524 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 10325575 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 10325594 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 10325769 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 10325913 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 10326012 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 10326265 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10326281 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 10326364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10326386 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 10326394 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 10326491 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 10326987 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 10327040 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 10327070 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 10327102 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10327138 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 10327140 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 10327381 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10327516 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10327719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10327771 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 10327796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10327912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10327933 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 10327962 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 10327970 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 10328068 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10328082 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 10328318 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 10328509 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 10328547 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 10328548 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 10328573 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10328634 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10328695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10328717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10328955 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 10329090 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 10329105 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10329136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10329185 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 10329201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10329238 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 10329466 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10329469 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10329617 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10329806 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10330176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10330230 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10330337 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 10330338 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 10330374 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 10330742 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 10330767 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10331050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10331476 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 10331522 G T N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 10331538 G T N N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 3 10331980 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10332169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10332284 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10332334 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 10332358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10332418 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 10332462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10332479 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10332523 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 10332617 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10333018 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 10333142 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 10333175 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 10333193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10333321 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 10333323 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 10333333 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 10333531 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 10333763 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 10333829 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 10333863 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 10333923 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 10334281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10334291 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 10334778 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 10334996 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 10335631 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10336070 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 10336420 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 10336435 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 10336455 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 10336598 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 10336795 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 10337355 G A N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.153846153846154 0.538461538461538 0.307692307692308 11 15 2 7 4 3 10337371 G A N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 3 10337931 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 10337933 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 10337944 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 10338236 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 10338555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10338576 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 10338898 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10339471 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 10340271 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10340771 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10340888 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 10341126 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 10341311 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 10341330 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10341347 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 10341441 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 10341462 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 10341684 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 10341713 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 10341786 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 10341791 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 10341821 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 10341832 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 3 10341878 A C N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 3 10341880 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 10341889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10341892 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 10342020 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.5 0.416666666666667 8 16 1 6 5 3 10342240 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 10342321 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 10342386 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10342458 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 10342564 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 10342578 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 10342641 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 10342711 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10342739 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10342872 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 10342938 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 10342969 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 10342992 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10343288 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 10343290 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 10343353 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10343482 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 10343584 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 10343611 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 10343748 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 10343849 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 10343960 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 10343966 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10344434 G C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 10345126 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10345186 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 10345212 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 10345269 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 10345515 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10346468 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 10346489 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10346541 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10346818 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 10346927 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 10347596 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10347678 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 10347689 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 10347835 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 10348439 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10348997 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 10349187 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10349600 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 10349751 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 10350211 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 10350485 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 10350490 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 10350573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10350940 G C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 10350982 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 10350997 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10351073 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 10351126 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 10351142 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 10351497 G C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.1875 0.0625 0.75 7 25 3 1 12 3 10351623 T C N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 3 10351662 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 10351684 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10352258 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 10352486 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 10352586 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 10352627 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 10352633 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 10352645 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 10352717 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 10352801 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 10352916 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 10352917 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 10352942 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 10353369 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 10353522 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10353673 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 10353837 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 10353976 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 10353978 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 10354205 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 10354242 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 10354252 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 10354305 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 10354306 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 10354539 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 10354842 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 10354943 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 10354984 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 10355145 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 10355168 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 10355650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10355701 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 10355725 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 10355812 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 10355975 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 10356084 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 10356240 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 10356468 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 10356893 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 10356913 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 10357578 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 10357786 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 3 10358854 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 10359221 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 10359269 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 10359324 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 10359418 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 10359621 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 10359643 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 10359658 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 10359698 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 10359709 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 10359742 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 10359750 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 10359884 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 10360216 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 10360267 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 10360425 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 10360480 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 10360495 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 10361539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10361851 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 10361900 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 3 10361903 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10361963 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 10362004 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10362051 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 10363964 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 10363993 G A N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 10364090 G A N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 3 10365785 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10366721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10367290 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10369284 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 10370145 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 10370425 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10370587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10372640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10372699 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10373055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10373741 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 3 10374047 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 10374793 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10375077 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 10375096 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 10375163 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 10375578 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 10376413 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10376641 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 10376846 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10376900 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 10377115 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 10377184 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 10377312 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 10377522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10377578 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 10377599 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 10377660 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 10377802 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 10378362 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 10378635 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 10378721 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 10378787 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 10378847 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 10378899 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 10378921 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 10378963 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 10379466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10379628 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10380405 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10380413 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 10380422 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10380427 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 10380443 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10380516 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10380728 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 10380848 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 10381169 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 10381197 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10381667 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10381692 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 10383025 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10383128 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 10383455 G A Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 10383481 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 10383485 G C Y N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 10383528 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 10383548 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 10384512 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 10384527 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10385089 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10386127 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10386344 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10386945 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10388790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10389217 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 10389332 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 10389755 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 10389886 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 10390134 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 10390768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10391040 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 10391113 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10391185 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 10391871 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 10392026 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 10392084 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 10392191 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10392223 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 10392299 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 10392434 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 10392467 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 10392489 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10392538 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10392639 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10392748 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 10392813 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 10392870 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 10392948 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 10392995 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 10393145 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 10393194 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 10393269 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10393307 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 10393312 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 10393515 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10393910 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10393935 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10393971 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10394207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10394745 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10394884 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10395151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10395726 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 10395962 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10397874 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10398432 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10399188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10400391 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10400807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10401001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10401441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10402086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10403372 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10403469 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 10403470 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 10403536 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 10403698 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10403735 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 10403864 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 10403905 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 10404009 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 10404030 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 10404048 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 10405192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10405206 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 10406508 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10406723 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 10408089 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 10409202 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10409440 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10409450 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 10409670 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 10409974 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 10410021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10410553 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 10411795 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 10412516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10413994 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 10414897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10414950 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 10415124 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 10415345 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10415353 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10415372 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10415397 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10415403 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10415669 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 10415683 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 10415685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10415783 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10415850 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 10416004 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 10416095 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 10416096 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 10416131 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 10416142 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 10416149 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 10416218 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 10416332 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 10416366 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10416537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10416551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10416585 T A Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 10416808 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10416814 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10416862 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 10416931 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10417014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10417097 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10417196 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10417201 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10417474 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 10417498 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10417733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10417746 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10417853 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10417904 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 10417982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10418319 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10418619 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10418641 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10418832 C G N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 10419616 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 10419691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10420424 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10423079 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 10423590 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10425235 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10426488 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10426617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10426952 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10427008 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 10427304 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10427386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10427461 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10427752 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 10427846 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10428229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10428870 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10430574 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10430799 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 10430822 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10430938 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10431048 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 10432003 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10433406 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 10433972 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 10434167 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 10434300 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 10434653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10434741 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10434872 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 10434911 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 10434923 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 10435075 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10435133 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10435208 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 10435263 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10435347 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 10435610 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 10435613 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 10435762 C G Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 10435818 G T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 10435865 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 10436130 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 10436457 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 10436911 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10436920 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 10437052 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 10437250 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10437500 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 10437557 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10437653 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 10437739 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 10437751 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10438159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10438341 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 10438373 A C Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 10438396 G T Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 10438449 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 10438808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10439283 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 10439426 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 10440346 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10440359 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 10440462 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10440558 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 10440619 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10440714 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10440832 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 10440852 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 10440859 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10440907 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 10441142 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 10441159 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 10441228 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10441894 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 10441970 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10442581 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 10442833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10442969 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10443213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10443443 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10443498 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10444210 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 10444217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10444242 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 10444486 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10444506 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 10444507 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 10444712 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 10444755 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 10445203 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 10446333 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 10446601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10447513 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 10448020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10448076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10448769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10449862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10451594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10451850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10458393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10458444 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10459664 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10459935 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 10469653 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10469892 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 10470035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10474795 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10475653 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10478776 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 10482407 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10482733 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10482791 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10482991 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10484932 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10484936 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10487986 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10489201 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 10502934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10507635 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10507775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10507906 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10507960 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10508334 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10509641 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 10510358 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10510941 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10510961 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10511416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10511433 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 10511778 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 10512197 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.153846153846154 0 0.846153846153846 4 22 2 0 11 3 10512418 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 10512430 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 10512575 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 10512665 C G N N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.222222222222222 14 4 7 0 2 3 10513331 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 10513345 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 10513346 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 10513653 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10513712 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10513789 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 10513939 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10513971 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 10513998 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10514031 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10514034 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 3 10514134 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.166666666666667 0.722222222222222 0.111111111111111 19 17 3 13 2 3 10514202 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10514293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10514360 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 10514428 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10514443 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10514516 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 10514769 T C Y Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 10514920 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 10514945 T G Y N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 10515270 C G Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 10515280 T C Y Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 3 10515285 T A Y N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 10515680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10515708 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10515830 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 10515917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10515920 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 10515985 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10516100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10516315 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 10516349 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 10516496 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 10516606 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 10516655 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.25 0.666666666666667 0.0833333333333333 14 10 3 8 1 3 10516673 G A N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.230769230769231 0.692307692307692 0.0769230769230769 15 11 3 9 1 3 10516703 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 10516821 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10516841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10516951 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10517047 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10517112 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10517156 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 10517205 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10517251 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10517309 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 10517415 G A N Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 11 9 4 3 3 3 10517959 A T N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.2 0.666666666666667 0.133333333333333 16 14 3 10 2 3 10518226 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10518502 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10518530 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 10518600 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10518630 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 10518673 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 10518710 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 10519041 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 10519094 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10519144 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10519302 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 10519328 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10519349 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 10519389 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 10519431 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 10519471 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 3 10519525 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 10519552 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 3 10519567 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 3 10519743 A C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 3 10519976 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 10519997 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10520226 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 10520427 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10520453 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10520457 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10520570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10520649 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10520673 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10520864 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10521345 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 10521395 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 10521451 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10521532 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10521559 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 10521872 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 10521904 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10521921 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10522062 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10522145 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10522170 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 10522253 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10522347 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 10522389 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10522510 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 10522720 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10522804 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10522826 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10522837 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10524043 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 10524444 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10524635 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10524648 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10524748 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 10524876 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 10525477 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 3 10525663 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 10525834 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10525945 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 10525969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10526033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10526108 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 10526140 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 10526180 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 10526202 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 10526210 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 10526228 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 10526237 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10526242 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 10526256 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 10526274 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 10526821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10527708 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10528197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10528307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10529643 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10529688 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10529804 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10531062 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10531393 T C Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 10531996 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 10533392 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10534858 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 10535232 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 10536176 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10539195 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 10539495 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 10541535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10542728 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10543209 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 10543808 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10544328 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10546293 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10546601 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 10546775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10546776 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10547050 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10548655 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10550057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10554386 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10554532 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10554786 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10559033 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10561980 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10562701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10566401 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10567200 C T Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.0625 0.6875 0.25 13 19 1 11 4 3 10570840 T A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 10577143 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10580128 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10581218 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10583383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10584266 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10584539 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 10587054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10588203 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10589073 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10589985 C T Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 10590176 C T Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 10590282 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 10591870 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 10595932 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 10596479 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 10601326 C T Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 10603299 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 10604336 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10605099 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10606591 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10609598 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10609952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10611430 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10612728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10613407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10613429 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10614865 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10616384 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10617005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10617616 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10619737 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10620389 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 10622293 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10624183 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10625458 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10625765 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10627537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10632754 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10632925 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 10633208 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10633297 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 10633883 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10636423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10639176 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10641099 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10641100 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 10641792 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 10642501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10642605 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10648856 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10651382 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 10651767 C A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 10654326 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10654582 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10655420 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 10655863 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10656049 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10656066 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10656563 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 10656705 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 10657864 C T Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 10658322 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10658485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10659353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10660048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10661732 T C Y Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 10661940 C T Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 3 10662181 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10662777 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10662812 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 10663164 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10663490 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 10663529 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 10663673 G C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 10663763 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 10663796 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 10663802 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10663885 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 10663966 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 10664147 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 10664155 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 10664284 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 10665788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10667139 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10668053 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10668600 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10670033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10670430 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10671548 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10671805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10674312 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10675991 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 10678609 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 10678711 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 10680074 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 10680675 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 10681665 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10682072 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 10682090 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 10682290 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10682901 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10683171 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 10683850 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10684798 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 10685798 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 10685992 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 10686559 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10687127 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 10687134 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 10687154 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 10687210 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 10687284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10687644 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 10687648 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 10687714 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 10687735 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 10688021 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 10688375 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10688458 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10688558 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 10688567 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 10688620 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 10688643 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 10688663 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 10688688 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 10688739 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 10689260 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 10689330 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 10689449 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 10689456 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 10689513 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 10689583 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 10689658 G A Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 10689659 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 10689684 A G Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 10690175 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 10690222 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 10690496 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 10691065 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 10691259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10691438 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 10692003 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10692084 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 10692167 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 10692196 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 10692285 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 10692328 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 3 10692820 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 10693167 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 10693590 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10696175 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 10696615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10696820 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 10696901 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 10697138 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 10697406 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 10697460 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10697525 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 10697759 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10697865 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 10697987 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 10698013 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 10698055 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 10698317 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10698416 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 10698463 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 10698512 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 10698548 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 10698551 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 10698626 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 10698933 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 10699016 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 10699218 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 10699386 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 10699647 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 10699677 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 10699754 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 10699788 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 10699966 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 10699986 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 10700101 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10700342 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 10701050 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 10702250 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10702860 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10703376 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10703636 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 10703649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10703680 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 10703945 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10705046 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 10705369 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 10705819 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 10706559 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10707034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10707097 A T Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 10707219 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 10707236 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 10707358 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 10707393 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 10707427 A C Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 10707630 G A Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 10707708 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 10707730 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 10707784 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 10707936 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10707963 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 10707975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10708613 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 10708641 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 10708805 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 10708823 G A N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 3 10709454 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 10709574 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10709696 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 10709913 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 10709929 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 10710352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10710472 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 10710474 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 10710487 G T Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 10710611 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 10710727 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 10710838 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 10710972 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 10711043 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 10711125 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 10711214 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 10711310 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 10711311 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 10711496 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10711510 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10711532 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10711669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10711676 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10711692 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10711814 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10711974 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10711999 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10712153 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10715622 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 10715777 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10715791 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10715930 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10715966 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10716156 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 10716393 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 10716959 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 10717095 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10717219 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 10717887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10717920 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10717950 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 10718039 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10718040 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10718290 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 10718731 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 10718799 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 10719063 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 10719315 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10719327 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 10719708 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 10720535 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 10720568 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10720614 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10720637 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 10720699 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 10720717 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 10720735 C G Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 10720776 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 10720857 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 10720878 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 10720938 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 10720982 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 10720991 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 10720994 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 10721060 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 10721079 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 10721093 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 10721166 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 10721340 T C Y Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 3 10721617 T C N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 12 8 3 6 1 3 10721709 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 10721759 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 10721764 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 10721807 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 10721815 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 10721856 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 10721890 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 10721995 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10722078 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 12 24 0 12 6 3 10722189 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 10722192 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 10722261 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 10722307 T A Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 10722330 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 10722382 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 10722457 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 10722460 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 10722470 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 10722490 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 10722518 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 10722532 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 10722545 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 10722749 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 10722762 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 10722776 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 10722829 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 10722851 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 10722914 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 10722963 T C Y Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 10723032 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 10723256 C A Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 10723321 C T Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 10723422 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10723503 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 10723509 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 10723516 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 10723523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10723580 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 10723663 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 10723740 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10723753 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10723909 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 10724101 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 10724445 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 10724484 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 10724535 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10724842 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10724910 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 10725278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10725392 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 10725424 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 10725678 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10725824 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 10725940 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 10725977 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10726029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10726031 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10726207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10726472 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 10726473 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 10726611 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10726647 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 10726882 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10727090 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 10727144 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 10727187 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10727251 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10727719 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10727749 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10727862 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 10727867 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 10728197 A T Y N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 3 10728270 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 10728291 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 10728314 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10728484 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10728531 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10728580 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 10728642 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 10728823 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 10728852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10728862 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 10728909 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 10728943 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10729136 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10729169 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 10729316 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10729432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10729464 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10729483 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 10729545 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 10729729 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 10729826 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 10729878 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10729975 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 10730005 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10730206 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10730211 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10730576 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 10730610 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10730690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10731065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10731090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10731097 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 10731147 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10731358 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10731411 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10731433 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10731488 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 10731568 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 10731570 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 10731657 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 10731697 A C Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 10731730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10731768 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10731774 A C Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 10731785 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10731834 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10732026 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 10732150 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10732179 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 10732217 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10732775 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 10732952 C A Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 10733009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10733085 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 10733094 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 10733097 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 10733169 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 10733223 A C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 10733829 T G N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 10734112 A T N N 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 3 10734115 T G N N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 3 10734232 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 10734234 A G N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 10734250 A C N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 10734313 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 10734348 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10734765 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10734943 A C Y N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 10735102 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10735265 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 10735464 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10735526 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 10735676 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 10735750 A C Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 10735835 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 3 10735982 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 10736150 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 10736182 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 10736291 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10737123 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 10737239 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 10737326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10737365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10737452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10738336 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 10738354 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10738865 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10738890 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10738965 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10739038 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10739096 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 10739217 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 10739256 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 10739336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10739410 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 10739747 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 10739917 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10740040 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10740077 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 10740292 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 10740541 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10740581 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 10740610 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 10740621 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 10740821 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10740990 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10741010 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 10741414 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 10741515 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10741903 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 10741918 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 10741936 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10742051 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10742082 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 10742151 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 10742274 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 10742462 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 10742605 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10742692 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10742735 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 10742756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10742793 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10742857 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 10743113 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 10743290 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 10743458 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 10743518 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 10743552 C G Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 10743575 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10743627 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 10743824 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10743857 A G Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 10743984 G T Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 10744489 A T Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 10744606 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 10744751 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 10744800 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10744801 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 10744958 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 10744978 C G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 10745212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10745248 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 10745301 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10745358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10745384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10745488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10745528 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 10745655 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 10745667 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 10745853 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 10745940 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 10745969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10746175 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 10746609 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10746626 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10746633 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 10746656 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10746688 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10746718 C T Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 10746827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10746923 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 10747021 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10747325 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 10747533 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10747556 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10747597 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10747661 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10747801 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10748045 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 10748242 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 10748301 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 10748433 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10748762 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10748777 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 10748802 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 10749032 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 10749393 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 10750066 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10750554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10750563 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10750575 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 10750602 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 10750658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10750912 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10751578 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 10751673 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 10751682 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 10751759 G T N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 10751982 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 10752059 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10752076 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10752082 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10752478 C G N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 3 10752544 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 10752558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10752704 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 10752888 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 10752899 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10752941 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 10753244 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10753272 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 10753376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10753400 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 10753587 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 10753727 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 10753822 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 10753960 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10754008 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10754387 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10754430 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10754437 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10755065 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 10755389 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 10755404 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10755591 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 10755944 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10756360 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 10757273 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10757324 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10757339 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 10757493 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10757954 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 10758540 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 10758588 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 10758755 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10758796 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10758984 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 10759126 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 10759380 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 10759911 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10760002 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10760455 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 10760652 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10760723 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 10760922 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 10760933 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 10761065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10761451 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 10761475 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 10761541 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 10762059 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10762671 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 10762883 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 10762960 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 10763002 T A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 10763029 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 10763085 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10763160 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 10763173 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 10763266 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 10763271 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10763291 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 10763305 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 10763365 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 10763374 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 10763464 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10763473 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 10763510 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 10763580 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 10763668 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 10763669 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 10763687 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 10763714 C T Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 3 10763715 A T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0 0.6875 0.3125 11 21 0 11 5 3 10763744 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 10763761 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 10763789 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 10763791 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 10763812 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10763883 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 10763974 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 10764229 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10765926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10766225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10766286 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 10766498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10767774 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10768137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10768235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10769561 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 10769587 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10769792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10770845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10771431 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10771537 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 10771613 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 10772282 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10772505 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 10772565 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 10773060 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 10773990 A T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 10773991 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10774182 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 10774188 A G Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 10774592 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 10774631 C T Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 10774757 C T Y Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 7 11 1 5 3 3 10775598 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 10775710 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 10776213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10776395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10777270 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 10777533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10777568 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10777579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10777622 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 10777700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10777882 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 10778664 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 10778672 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10778741 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10778757 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10778822 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 10778837 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10779025 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 10779514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10779564 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 10779770 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10779912 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 10779989 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10780047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10780059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10780311 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 10780323 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 10780644 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10780716 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 10780842 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 10780922 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10781085 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 10781097 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 10781206 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 10782011 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10782117 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 10782576 C T Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 10782648 T C Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 10782734 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 10782735 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 10782771 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10782828 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 10783429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10783460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10783467 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10783573 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 10783756 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10784031 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10784059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10784066 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10784098 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10784311 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10784351 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10784367 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10784734 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10785298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10785398 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10785443 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10785494 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10785885 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 10786147 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10786696 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10786749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10786765 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10786793 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10786863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10787228 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10787358 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 10787580 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10788161 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 10788207 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 10788316 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10788470 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10788998 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10789479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10789600 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10790346 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0 0.736842105263158 0.263157894736842 14 24 0 14 5 3 10790880 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 10790988 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10790993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10791851 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10792751 A C Y N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 10794297 T C Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 10794321 T G Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 10797068 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 10797809 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10798058 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10798108 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10798263 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10798277 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 10798306 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10798440 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10798531 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10798580 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10798606 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10798615 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10798621 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10798631 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10798642 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10798670 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10798728 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10798764 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10798777 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10798778 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10798800 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 10798816 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 10798855 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10798904 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10799010 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10799068 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10799172 G C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 10799183 T A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 10799190 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 10799202 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 10799248 G C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 10799330 G T N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 10799394 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 10799488 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 10799824 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10799991 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 10800008 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 10800063 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 10800132 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10800151 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10800409 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10800521 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 10800581 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 10800673 T A N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 10800778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10800860 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 10800868 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 10800919 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 10800922 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 10800971 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10800977 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10800986 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10801015 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10801017 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10801044 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 10801100 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 10801166 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10801199 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 10801317 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10801525 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10801536 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 10801560 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 10801699 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 10801700 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 10801733 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 10801807 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 10801823 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10801874 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10801957 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 10801972 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 10801977 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10802004 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 10802055 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10802093 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10802133 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10802332 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10802401 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10802479 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10802533 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10802535 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10802549 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10802563 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10802567 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10802579 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10802626 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10802642 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10802655 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10802673 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10802692 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10802752 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 10802805 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10802847 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10802871 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10802956 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 10803026 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 10803068 G T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 10803086 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10803173 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10803223 A T Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 3 10803303 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 10803312 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 10803331 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10803332 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 10803374 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 10803386 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10803416 T A Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 10803532 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10803562 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10803589 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10803591 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 10803605 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10803624 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10803631 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10803670 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10803684 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10803722 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 10803735 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 10803807 T A Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 10803875 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 10803879 A C Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 10803949 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 10803952 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 10803960 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10803993 C A Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 10804035 G A Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 10804051 G A Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 10804083 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10810969 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 10810973 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 10811029 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 10811095 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10811107 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 10811124 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10811136 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10811153 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10811170 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10811199 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10811203 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10811262 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10811272 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10811382 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 10811394 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 10811436 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10811486 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 10811497 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 10811562 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 10811577 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 10811609 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10811622 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 10811644 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10811703 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 10811715 A G Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 10811777 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 10811835 A C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 10811865 C G N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 10811885 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 10811936 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 10811947 A G Y Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 3 10811948 A C Y N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 10811981 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10812001 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10812015 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10812091 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 10812092 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 10812158 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 10812271 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 10812288 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 10812328 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10812359 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 10812370 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 10812417 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 10812426 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 10812446 T G N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 10812452 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 10812534 T A Y N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 3 10812551 T A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 10812556 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 10812648 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 10812676 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 10812704 T A N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 10812726 T A N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 10812729 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 10812797 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 10812834 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 10812873 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 10812910 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 10812919 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 10813223 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10813281 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10813311 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10813703 T C N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 10813745 T C N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 10813820 C T Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 10814001 T G Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 10814015 C G Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 10814158 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 10814211 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10814312 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 10814452 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10814464 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10814489 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10814577 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 10814652 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10814711 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10814830 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10814868 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10815248 C A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 10815295 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10815413 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 10815432 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 10815510 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10815537 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10815565 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10815619 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 10816075 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10816163 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 10816249 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10816469 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10816483 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10816489 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10816543 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 10816580 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10816596 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10816673 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10816718 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10816767 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10816859 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10816941 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10816979 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 10817070 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10817073 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10817229 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10817344 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10817353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10817368 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10817386 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 10817429 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10817517 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10817756 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10817952 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10817995 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10818070 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10818071 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 10818098 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 10818108 T C Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0 1 0 17 17 0 17 0 3 10818252 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10818483 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10818634 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 10818686 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 10818746 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10818749 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10819037 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10819201 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 10819373 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10819454 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10819488 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 10819797 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10820007 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 10820034 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10820083 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 10820126 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 10820130 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 10820589 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 10820610 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10820644 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10820754 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 10820858 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10820876 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 10820877 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10820915 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10820962 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10821044 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 10821268 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 10821413 C G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 10821950 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 10822091 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10822239 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 10822393 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 10822915 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 10823043 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 10823150 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10823398 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10823422 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10823557 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10823610 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10823645 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 10823666 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10823815 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10823903 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 10824057 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 10824121 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 10824133 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 10824258 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10824330 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 10824434 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10824807 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 10824823 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 10824884 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 10824967 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10825000 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10825142 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10825391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10825637 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 10825725 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 10825733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10825968 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 10825986 G A Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 3 10826114 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10826183 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 10826406 C G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 10826465 G A N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 3 10826490 A G N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 10827348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10827897 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10828147 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10828360 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 10828442 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 10828490 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10828494 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 10828621 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 10828623 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 10828692 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 10828697 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 10828722 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10828784 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 10828915 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 10828935 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 10828996 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 10829005 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 10829053 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 10829109 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10829149 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 10829274 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 10829291 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 10830118 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10830641 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 10832321 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10833190 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 10834345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10834937 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10835207 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10835858 A T N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 10836449 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 10836521 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 10838015 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10838214 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 10838400 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 10838410 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 10838625 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 10838660 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 10838698 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 10838930 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10839186 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 10839414 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 10839880 T G N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 10839893 G A N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 10839918 A G N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 10840032 G T N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 10840245 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 10840266 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10847229 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10847966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10850742 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 10852248 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10852363 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10852817 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10853933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10854190 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10854478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10854943 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10855164 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10856246 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10857491 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10857517 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10857616 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 10857701 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10858413 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10858595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10858716 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 10858834 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10859268 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10859429 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 10859748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10860219 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10860322 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10860336 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 10860805 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 10861019 C T N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 3 10861194 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10861511 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 10861906 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 10862261 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 10862269 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10862289 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 10862486 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10862617 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 10862695 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 10863049 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 10863114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10863162 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10863536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10863677 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10863913 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 10863950 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 10864136 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10864148 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 10864238 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10864456 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 10864504 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10864592 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 10864597 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 10864634 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 10864645 A C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 10864867 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10865120 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 10866130 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 10866280 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10866378 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 10866385 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 10866469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10866686 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 10866943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10867022 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 10867148 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 10867252 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 10867271 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 10867304 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 10867392 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 10867645 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 10867646 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 10867807 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 10867975 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 10868004 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 10868094 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10868226 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 10868354 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 10868367 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 10868594 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10868609 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 10868620 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 10868858 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 10868870 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 10868956 C G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 10869166 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 10869292 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10869438 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 10869479 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 10869545 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 10869603 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10869711 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 10869834 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 10869844 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 10870056 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 10870306 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 10870308 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 10870508 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 10870564 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 10871010 T C N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 3 10871101 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 10871185 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 3 10871212 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 10871225 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 10871682 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 10871756 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 10871988 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 10872027 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 10872075 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 10872700 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 10872792 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 10872838 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 10872936 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 10873078 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 10873173 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.1875 0.0625 0.75 7 25 3 1 12 3 10873210 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10873448 G C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 3 10873492 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 10873502 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 10873583 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10873594 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 10873647 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 10873689 G C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 10873727 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 10873833 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 10873897 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 10873923 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 10874227 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 10874471 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 10874496 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 10874590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10874643 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 10874665 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 10874703 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 10874776 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 10874817 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 10874836 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 10874917 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 10874958 C G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 10884118 G T Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 10884189 C A N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 3 10884298 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 10884376 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 10884394 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 10884494 G T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 10884497 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 10884524 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 10884548 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 10884599 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 10884625 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 10884721 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 10884804 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10884885 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 10884961 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 10884981 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 10885046 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 10885069 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 10885118 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 10885125 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 10885216 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10885425 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 10885439 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 10885896 T G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 10885921 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10886085 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 10886112 G T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 10886119 G T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 10886133 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 10886141 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 10886250 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 10886546 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 10886645 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 10886739 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 10886996 C G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 10887072 A T N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 10887102 T G N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 10887270 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 10887284 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 10887305 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 10887361 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 10887423 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 10887517 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 10887554 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 10887647 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10887818 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 10887880 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 10887919 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 10888084 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 10888331 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10888351 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 10888435 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 10888451 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 10888497 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 10888939 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 10889068 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 10889225 C G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 10889266 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 10889273 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 10889301 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10889653 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 10889673 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10889933 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 10889983 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10890048 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 10890228 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 10890503 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10890748 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10890810 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 10890952 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10890993 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10891137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10891335 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10891405 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10891541 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 10891546 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 10891997 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 10892051 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 10892053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10892065 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 10892350 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10892406 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10892410 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10892564 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 10892710 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10892910 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 10893029 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 10893144 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10893154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10893275 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10893299 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10893328 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10893383 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10893454 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 10893861 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10893915 C A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10894495 G T Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 10894512 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10894592 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10894628 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10895211 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10895275 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10895316 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10895479 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 10895594 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 10895819 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10895850 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10895890 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10895891 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10896008 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10896048 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10896090 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 10896129 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 10896201 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10896359 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 10896379 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 10896396 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10896400 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10896536 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 10896557 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 10896588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10896644 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 10896765 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 10896790 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 10896800 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 10896825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10897007 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 10897078 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 10897132 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 10897225 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 10897256 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 10897397 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 10897454 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 10897459 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 10897504 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10897509 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 10897570 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 10897579 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 10897662 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 10897705 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 10897893 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 10897899 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 10897968 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 10898025 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 10898047 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 10898118 T A N N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.454545454545455 0.181818181818182 0.363636363636364 12 10 5 2 4 3 10898592 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 10898658 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 10898775 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10898898 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10898935 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10899023 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 10899097 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 10899288 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10899331 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10899347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10899380 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10899392 A T Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 10899444 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10899492 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 10899510 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 10899525 T G Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 10899566 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10899600 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 10899652 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10899871 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10899927 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10899962 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10899979 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10900000 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10900008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10900036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10900058 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 10900075 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 10900114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10900130 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10900347 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10900404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10900444 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10900564 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10900649 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10900667 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 10900693 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10900734 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 10900774 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 10900855 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 10900876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10901161 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10901357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10901435 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10901493 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 10901552 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 10901625 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10901733 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 10901760 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10901763 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 10901993 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 10902004 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10902091 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 10902122 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 10902131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10902220 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 10902261 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10902283 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10902295 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 10904331 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 10904584 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10904617 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 10904620 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 10904833 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10905692 T C Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 10906205 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10907076 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10907799 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 10907847 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 10908355 C T Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 10908360 A G Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 10909259 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 10909938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10910577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10910857 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 10911392 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10911707 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 10912234 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 10912989 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10913101 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 10913800 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 10915948 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10916248 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 10916845 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10917203 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10917913 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10917940 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 10918334 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10918550 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10918761 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10918960 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 10919229 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10919427 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10919483 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10919767 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 10919892 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10920080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10920726 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10920973 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 10921152 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10921352 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10921692 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10922117 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 10922510 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 10922674 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10922816 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10923271 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10923526 C G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 10923887 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10923926 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 10923927 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 10924036 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10924202 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10924610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10924654 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10925341 A G Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 10925450 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10925531 A C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 10925992 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10926075 A T Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 10926287 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10926553 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10926928 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10927099 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10927277 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 10927311 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 10927614 G C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 10927618 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10928306 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 10928852 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 10928863 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 10928890 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10928918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10928919 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 10929064 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 10929165 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10929200 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 10929582 G T N N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 10929898 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10929939 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10930099 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10930131 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10930311 T C Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 10930366 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 10930557 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 10930634 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 10930651 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10930718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10930918 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 10930990 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 10931085 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 10931175 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10931247 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 10931629 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 10931670 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10931694 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 10931708 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 10931719 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 10932161 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 10932492 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 10932596 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 10934041 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 10934088 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 10934507 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10934837 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10934921 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10935095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10935489 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 10935580 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 10935638 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10935683 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10936146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10936303 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10937155 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10937383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10937488 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 10937813 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10937832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10938687 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10939081 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10939400 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10939528 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10939980 A T Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 10939991 A C Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 10940126 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10940244 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10940848 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 10940854 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 10941110 C T Y Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 10941161 C A Y N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 10941297 G C Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 10941799 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10941962 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10942354 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 10942437 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10942501 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 10942512 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 10942627 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10943171 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 10943205 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 10943412 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 10944026 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10944302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10944454 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10944774 C T Y Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 3 10944904 G C Y N 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 3 10946132 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10947003 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 10947004 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 10947582 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10948145 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10948410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10948521 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10949207 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10949298 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 10949803 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10949823 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10950060 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10950113 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10950277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10950310 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10950879 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10950921 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10952175 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 10952391 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10952480 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 10953581 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 10953932 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 10954089 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 10954589 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 10954706 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 10954727 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10954921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10955039 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10955091 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10955114 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10955246 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10955247 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 3 10955916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10955994 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10955998 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 10956230 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 10956335 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 10956338 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 10956937 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 10957143 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10957326 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 10957417 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 10957521 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 10957678 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 3 10958720 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 10958780 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 10958865 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 10958968 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 10958996 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 10959137 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 10959325 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 10959439 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 10960535 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 10960556 G T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 10960558 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 10960698 C G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 10960740 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 10961637 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 10968703 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 10968892 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10968941 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10969565 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10970478 T G Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 10970543 A C Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 10970901 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 10971648 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10971872 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10972348 A G N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 3 10975343 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 10975588 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 10975805 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 10975815 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 10975883 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 10975970 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 10975993 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 10976076 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 10976205 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 10976217 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 10976231 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 10976323 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 10976362 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 10976367 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 10976428 C A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 10976429 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 10976506 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 10976554 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 10976592 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 10976643 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 10976733 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 10976749 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 10976802 A G Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 10976992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10977009 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 10977165 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 10977353 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10977639 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10977817 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 10977914 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 3 10977975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10978002 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 10978376 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10978533 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 10978610 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10978730 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10978734 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10979062 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 10979159 C A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 10979222 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 10979444 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10979447 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 10979543 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 10979771 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 10980049 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 10980095 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 10980302 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 10980335 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10980410 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 10980639 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 10980736 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 10980748 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 10980795 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 10980880 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 10980938 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 10981060 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 10981124 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 10981261 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 10981269 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 10981291 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 10981296 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 10981358 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 10981446 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10981510 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 10981618 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 10981665 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 10981689 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 10981767 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 10981777 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 10982001 T A N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 10982034 G A N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 10982415 G T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 10982566 A C Y N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 10982642 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 10982691 C G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 10982705 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10982802 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 10982857 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 10982903 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 10982909 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 10982918 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10982946 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10982977 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 10983018 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10983170 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 10983369 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10983398 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10983475 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10983527 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10983547 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 10984478 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 10984615 A C N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 10984777 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 10984852 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 10985134 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 10985372 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 10985616 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 10986298 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 10987377 A G Y Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 8 12 2 4 4 3 10987699 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 10987814 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 10987828 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10988015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10988617 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 10989928 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10989986 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10990125 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 10990832 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 10990846 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 10993053 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10993265 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10993347 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 10993497 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10993546 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 10994240 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10994313 A G N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 0.142857142857143 0.214285714285714 20 8 9 2 3 3 10994402 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 10994625 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10994729 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 3 10994801 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 10995018 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 10995264 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10996050 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 10996362 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 10996923 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10998245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10998479 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10998774 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10998888 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10999034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10999073 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10999186 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 10999288 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 10999607 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 10999941 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 10999984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11000897 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11000898 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11000913 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 11000979 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11001015 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 11001301 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 11001359 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 11001422 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 11001453 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11001565 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11001653 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11001767 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 3 11001818 A T N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 3 11001848 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 3 11001884 T A N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 3 11001904 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 3 11001925 A G N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.571428571428571 0.214285714285714 0.214285714285714 19 9 8 3 3 3 11001943 A C N N 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.454545454545455 0.272727272727273 0.272727272727273 13 9 5 3 3 3 11002021 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 11002024 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 11002037 A T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 11002169 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 11002178 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 11002198 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 11002211 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 11002229 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 11002268 C A Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 11002286 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 11002307 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 11002329 T A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 11002336 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 11002455 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11002458 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 11002589 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 11002595 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 11002630 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 11002672 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11002682 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 11002733 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 11002773 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 11003200 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 11003261 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11003262 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11003330 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11003647 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 11003676 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 11003780 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 11003920 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 11003925 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 11003962 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 11003967 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 11004004 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 11004013 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11004024 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11004035 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11004111 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 11004139 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 11004170 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 11004200 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11004201 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 11004300 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 11004547 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 11004615 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 11004679 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 11004681 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 11004809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11004915 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11004970 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 11004977 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 11004999 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 11005108 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11005137 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 11005142 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 11005151 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 11005326 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11005360 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 11005481 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 11005576 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 11005750 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 11005871 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11005878 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 11005991 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 11006020 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11006211 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 11006246 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11006283 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 11006342 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 11006380 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 11006381 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 11006611 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11006902 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 11006909 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 11006922 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 11007076 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 11007190 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11007360 T A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 11007377 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 11007418 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 11007421 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 11007455 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11007468 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11007587 C A N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 11007884 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11008171 C A Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 11008172 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 11008239 C T N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 3 11008289 T C N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 10 10 3 4 3 3 11008551 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 11008710 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 11008720 A T N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.666666666666667 0.133333333333333 0.2 22 8 10 2 3 3 11008760 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 11008843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11009671 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 11009765 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11009889 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 11010007 G T N N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.444444444444444 0.111111111111111 0.444444444444444 9 9 4 1 4 3 11010146 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 11010231 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 11010319 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 11011926 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 11012028 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 11012144 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 11012194 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 11012252 C T N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.615384615384615 0.0769230769230769 0.307692307692308 17 9 8 1 4 3 11012332 C T N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.615384615384615 0.0769230769230769 0.307692307692308 17 9 8 1 4 3 11013236 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11013433 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11016697 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 11016755 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11017816 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 11017874 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 11017886 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 11017891 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 11018004 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11018044 A T Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 11018162 G T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 11018170 T G Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 11018202 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 11018205 T C Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 11018273 T G Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 11018312 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 11018325 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 11018395 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 11018421 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 11018512 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 11018547 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 11018611 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 11018628 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 11018653 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 11018763 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 11018809 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 11019086 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11019114 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11019162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11019223 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11019270 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11019369 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 11019387 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 3 11019411 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 11019543 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 11019558 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 11019571 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11019614 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 11019623 C G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 11019705 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 11019723 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 11019816 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 11019855 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 11019944 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 11020410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11021491 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11021797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11021887 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11022591 T A Y N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 3 11022689 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 11023372 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 11023427 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 11023703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11024014 G T Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 11024112 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11024323 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 11024890 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11025142 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11025665 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11025670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11025910 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 11025911 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 11026014 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 11026100 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 11026206 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 11026230 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 11026333 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 11026984 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 11027171 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11027208 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11027665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11027689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11027732 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11027800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11028058 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 11028078 A C Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 11028121 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11028254 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 3 11028623 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11028641 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11028658 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 11028677 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11028860 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11028886 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11028914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11028921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11029118 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11029142 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11029272 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 11029321 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11029354 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 11029427 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11029430 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11029438 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11029496 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11029503 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11029613 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11030040 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11030105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11030160 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 11030475 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 11030493 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11030507 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11030534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11030631 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 11030659 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 11030677 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 11030679 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 11030774 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 11030966 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.1875 0.0625 0.75 7 25 3 1 12 3 11032884 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11033274 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11036587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11038107 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11040560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11040867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11046476 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11060191 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11062598 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 11062607 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 11063173 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11063227 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11063273 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 11063291 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11063793 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11064627 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 3 11064775 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 11064946 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 11065077 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 11066038 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11072360 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 11073019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11073828 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11073978 G T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 11074350 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 11075081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11075476 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11076767 A C Y N 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 10 8 2 6 1 3 11077285 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11078217 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11078374 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11078425 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11078560 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 11078962 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11078976 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11079096 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.3125 0.625 0.0625 20 12 5 10 1 3 11079332 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11080881 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 11084777 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11086806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11087687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11088102 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11088850 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11090034 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 11090360 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11090610 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11090839 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 11091389 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11091390 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11091620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11092951 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11093734 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11096300 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11096405 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11097264 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11097587 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11099920 T C N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 11102276 C G Y N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 11102467 T G Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 11102643 G C Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 11102880 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11103370 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11104408 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11104662 C T Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.2 0.133333333333333 0.666666666666667 8 22 3 2 10 3 11105192 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 11107465 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11107555 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11108174 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11109273 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11109642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11110168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11113738 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 11114299 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11115411 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11115644 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11116688 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 11118226 T C N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 3 11119068 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 11120253 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 11120614 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11134707 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 11136411 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 11137832 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11137887 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 11151707 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 11153306 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 11154590 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 11163273 C T N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.545454545454545 0.0909090909090909 0.363636363636364 13 9 6 1 4 3 11163602 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11163614 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11166165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11167280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11172814 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11174764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11174856 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11175021 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11175774 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 11175786 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 3 11176397 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 11176435 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 11179842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11180957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11181790 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11183637 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11183661 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11183826 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11187557 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11188664 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11191052 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 11192849 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11193976 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11194702 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11195865 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11196212 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11197258 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 11198306 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 11199849 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 11200066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11200631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11201833 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 11202209 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 11202286 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11202585 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 11204763 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11208707 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 11208761 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 11208917 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11209133 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 11210972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11211662 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11213329 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 11213416 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 11214556 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 11214798 G C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 3 11220621 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11220729 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 11221566 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 11221574 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 11223990 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11224236 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 11224245 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 11224257 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 11224258 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 11224930 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 11226244 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 11226432 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 11226504 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 11227436 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 11229143 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 11230124 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11230652 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 11230807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11230851 T A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 11230873 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 11231274 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11231277 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 11231885 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 11231900 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 11231932 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 11232115 A C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 11232444 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11232700 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 11232753 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 11233205 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 11233248 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 11233253 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11233446 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 11233452 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 3 11233620 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 11233689 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 11233739 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 11233889 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 11233890 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 11233902 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 11233927 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 11234194 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 11234207 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 11234232 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 11234353 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 11234365 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 11234424 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 11234441 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 11234442 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 11234456 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 11234529 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 11234548 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 11234550 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 11234559 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 11234592 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 11234715 G T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 11234957 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 11235093 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 11235738 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 11236813 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11238365 C A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 11239713 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 11239919 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 11240618 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 11241811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11242458 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11243382 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 11243851 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 11244413 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11244871 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11244915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11246351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11246400 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11246698 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 11248259 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11248736 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 3 11249653 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11250161 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 11251329 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11252033 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 11252225 T A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 11253208 G A Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 11253250 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 11253525 A G Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 11254675 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11255166 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11255191 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11255344 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 11255705 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11255711 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 11256120 A T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 11256322 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 11256524 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11256932 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 11257008 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 11257013 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 11257038 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 11257154 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 11257173 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 11257224 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 11257456 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11257463 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 11257513 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 11257628 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11257802 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 11258593 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 11258682 C A N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 11258728 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11258810 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 11258883 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 11258938 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 11258977 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11259042 C A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 11259125 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 11259228 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11259250 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 11259330 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 11259496 C G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 11259597 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11259648 G T Y N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 11259920 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11260041 A C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11260057 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 11260116 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11260255 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 11260272 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 11260367 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 11260522 G T Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 11260529 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11260533 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 11260643 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 11260880 G A Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 11261032 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11261176 T A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 11261420 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 11261572 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 11261869 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11261877 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11262077 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11262767 T G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 11262885 C G Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 11263055 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11263473 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 11263523 A T Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 11263530 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11263690 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11263712 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11263720 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 11264175 T G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 11264345 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 11266550 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11266555 A G Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 11267327 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11267427 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 11268386 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 11268572 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 11269663 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 11269680 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 11270273 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11270672 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 11271049 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 11271308 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 11271519 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 11271681 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 11271935 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 11272015 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 11272367 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 11272558 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11273207 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11273413 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 11273421 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 11273530 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 11273610 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11273648 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 11273837 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11274207 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 11274217 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 11274251 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 11274453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11274577 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 11274825 C A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 11276481 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11276959 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 11277023 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 3 11277304 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 11277340 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 11278198 T G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 11278463 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 11278840 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11278868 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 11279160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11279247 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 11279741 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 11279953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11280357 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 11280651 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 11280966 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 11281150 A C Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 11281157 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11281565 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11282368 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 11283121 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11283515 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11284153 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 11284169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11284373 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 11285045 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 11285051 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 11285224 A T N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 11285718 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11285995 T G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 3 11286033 A C N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.411764705882353 0.0588235294117647 0.529411764705882 15 19 7 1 9 3 11286075 A T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 11286211 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 11286369 A T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 11286903 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 3 11287155 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 11287273 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 11287496 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 11287524 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 11287632 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 11287706 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 11287726 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11287734 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11287844 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11287968 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 11288117 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 11289286 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 11289660 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 11290139 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 11290492 T A N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 3 11290757 C A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 11291154 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 11291178 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 11291308 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 11291628 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 11291656 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 3 11291731 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 11291876 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 11291950 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11292247 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 11292282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11292402 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11292546 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 11292725 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 11292841 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 11293035 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 11293322 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 11294277 G A N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 11294411 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 11294430 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 11294907 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 11295161 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 11295265 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 11295467 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 11295807 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 11296065 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 11296377 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 11296538 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 11296639 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 11297063 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 11297460 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 11298782 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11299177 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 11299479 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 11299511 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 11299648 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11300674 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 11300700 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 11301856 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 11301982 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 11302143 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 11302310 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 11302668 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11302682 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 11302938 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 11302955 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 11303091 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 11303138 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 11303404 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11305203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11305330 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11305755 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 11305775 T C Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.625 0.125 0.25 11 5 5 1 2 3 11306447 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11306576 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11306650 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11306784 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11306947 C T Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 11307321 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 11308233 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 11308669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11308986 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 11309139 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11309977 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11310085 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11310279 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 11310375 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11310598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11310684 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11310786 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 11310824 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11310900 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11310996 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 11311058 C T Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 11311059 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11311101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11311310 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11311330 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11311439 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 11311545 T A N N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 11311659 G A N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 3 11311690 G A N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.333333333333333 0.6 0.0666666666666667 19 11 5 9 1 3 11311691 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 11311970 G C Y N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.285714285714286 19 9 9 1 4 3 11312216 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 11312704 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11312734 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11312788 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11312820 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11312910 G T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 11313034 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11313099 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11313503 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 11313514 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11313518 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 11313666 A C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 11313862 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11313901 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11313967 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11314142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11314256 C G Y N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.583333333333333 0.166666666666667 0.25 16 8 7 2 3 3 11314340 A G Y Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 8 8 3 2 3 3 11314769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11314781 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 11314828 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11314873 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11314888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11314928 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 11314966 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11315269 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11315482 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 11315502 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11315851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11316045 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 11316064 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 11316133 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 11316152 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 11316209 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 11316210 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11316223 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 11316254 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 11316295 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 11316309 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 11316487 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11316497 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 11316780 G T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 11316929 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11316951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11316995 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11317214 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 11317510 T G Y N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.75 0.0833333333333333 0.166666666666667 19 5 9 1 2 3 11317737 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 11317758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11317907 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11317947 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11317964 G A N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 16 12 6 4 4 3 11317972 C T Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 11318030 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 11318046 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11318075 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 11318204 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11318340 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 11318407 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11318496 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11318655 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11318667 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11318695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11318745 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11318970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11318995 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 11319160 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11319216 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11319219 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11319335 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11319347 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11319357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11319431 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11319438 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11319457 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11319491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11319533 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11319570 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11319822 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11319998 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11320653 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11320796 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 11320797 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11321542 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 11321820 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11322554 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11322712 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 11323082 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 11323133 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 11323190 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 11323348 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 11323401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11323426 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11323452 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 11323676 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11323719 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11323778 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11323808 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 11323814 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 11323857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11323928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11324082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11324135 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11324166 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11324239 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 11324275 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11324398 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11324550 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 11324673 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11324692 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 11324900 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 11325165 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 11325219 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 11325234 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11325303 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 11325512 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 11325670 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11325820 G A Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 11325917 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 11325959 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11326089 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11326530 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 11327044 C T N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 3 11327421 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 11327476 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11327527 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11327623 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11327627 G C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 11327902 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11327956 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11327982 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11327988 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11328014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11328069 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11328104 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11328119 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 11328141 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11328152 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 11328170 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11328194 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 11328254 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 11328302 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 11328367 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11329041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11329907 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11330134 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11330286 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 11330343 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 11335587 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11335687 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 11335708 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11335882 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11336296 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11336375 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11336522 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11336944 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11337311 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11337359 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11337409 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11337474 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 11337688 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11338449 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 11338614 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11339191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11339282 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 11339514 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 11340017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11340154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11340375 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 11341235 A C Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 11341568 T A Y N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 11341628 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11341666 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 11341769 C A Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 11341770 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11342310 C T Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 11342633 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 11342730 G C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 11342810 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 11343347 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 11343525 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11343778 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11343848 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11343925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11344162 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 11344450 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 11345427 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 11346015 T G Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 11346086 G A Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 11346509 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11346631 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 11346662 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11346676 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 11346797 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11347115 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 11347751 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11348563 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11349205 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11349524 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 11350059 T G Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 3 11350081 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 11350528 G C Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 11350530 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11350651 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 11350665 G A Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 11350867 C T N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 3 11350945 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 11351118 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 11351126 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 11351168 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 11351348 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11351442 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11351559 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 11351650 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11351738 G A Y Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.5 0.1 0.4 11 9 5 1 4 3 11351858 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 11351898 T A Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 11351966 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 11352129 C G Y N 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.4 0.1 0.5 9 11 4 1 5 3 11352183 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 11352209 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 11352265 G A Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 11352404 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 11352410 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 11352507 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 11352848 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 11352927 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 11352931 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 11353076 G A Y Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.5 0.1 0.4 11 9 5 1 4 3 11353117 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 11353626 T C Y Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.444444444444444 0 0.555555555555556 8 10 4 0 5 3 11353681 T G Y N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 11353746 G A Y Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.444444444444444 0.111111111111111 0.444444444444444 9 9 4 1 4 3 11353774 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 11353875 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 11354214 G C Y N 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.375 0.125 0.5 7 9 3 1 4 3 11354367 C G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 11354452 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 11355125 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 3 11355220 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 11355445 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 11355507 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.555555555555556 0.111111111111111 0.333333333333333 11 7 5 1 3 3 11355770 C A Y N 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.444444444444444 10 8 5 0 4 3 11355823 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 11355842 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 11356500 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11356534 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 11356580 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 11356883 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 11356913 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 11356940 T G Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 11357076 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 11357104 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 11357130 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 11357225 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 11357271 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11357351 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11357550 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11357760 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11357906 A G Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 11358092 C G Y N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 11358122 G C Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 11358197 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 11358392 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 11358409 C A Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 11358686 G C Y N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 3 11358731 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 11358773 T A Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 11358778 C T Y Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.214285714285714 0.142857142857143 0.642857142857143 8 20 3 2 9 3 11358969 A T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 11359084 C G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 11359168 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 11359504 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 11359734 T C N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 3 11359926 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 11359936 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 11360033 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 11360319 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11360445 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 11360827 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11360911 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11360945 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 11361002 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11361443 A T N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.214285714285714 0.0714285714285714 0.714285714285714 7 21 3 1 10 3 11361537 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11361596 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11361617 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11361640 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 11361644 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 11361654 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 11361757 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 11361777 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11362042 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 11362108 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 11362130 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 11362185 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11362257 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11362260 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 11362646 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11362705 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 11362711 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 11362873 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 11363057 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11363092 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 11363264 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11363444 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11363517 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11363766 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 11363984 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 11364017 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11364283 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 11364324 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 11364607 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11364686 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 11364703 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 11364826 T C Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 11365006 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 11365051 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11365063 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 11365130 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 11365167 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 11365291 C T Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 11365355 A G Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 11365400 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 11365557 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11365913 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 3 11365963 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 11366040 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 11366071 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 11366073 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 11366084 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 11366235 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 11366354 T G Y N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.636363636363636 0.181818181818182 0.181818181818182 16 6 7 2 2 3 11366394 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 11366503 T C N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 11366655 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 11366755 C G Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 11366770 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 11366847 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11366874 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 11366888 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 11366995 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 11367095 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 11367124 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 11367184 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 11367255 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 11367338 G A Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 3 11367367 C G N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 11367411 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 11367517 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 11367589 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 11367605 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11367613 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 11367626 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 11367764 A G Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 11367807 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 11367839 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 11367864 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 11367947 T C Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 11368111 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 11368374 G T Y N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 3 11368417 T C Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 11368513 T C Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 11368531 T C Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 11368545 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11368819 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 11368836 C A Y N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 3 11368847 T G N N 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.181818181818182 0.454545454545455 0.363636363636364 9 13 2 5 4 3 11368860 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 11368962 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 11369024 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 11369040 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 11369066 A C Y N 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 10 6 3 4 1 3 11369301 A C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 11369416 C A Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 11369427 T C Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 11369453 C G Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 11369467 G C Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 11369593 A C Y N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 11369612 A T Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 11369639 C T Y Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 3 11369922 A G Y Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 3 11370110 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11370242 G A Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 11370442 A G Y Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.181818181818182 0.454545454545455 0.363636363636364 9 13 2 5 4 3 11370466 T C Y Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.25 0.333333333333333 0.416666666666667 10 14 3 4 5 3 11370817 A C Y N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 3 11370880 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 11370921 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 11371052 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 11371095 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 11371106 G C Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 11371107 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 11371415 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 3 11371430 A G Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 3 11371742 T A Y N 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 3 11371772 C T Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 11371972 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 11372209 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 11373166 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11373212 C T Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 11373474 C T Y Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 3 11373556 T C Y Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.0909090909090909 0.545454545454545 0.363636363636364 8 14 1 6 4 3 11373578 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 11373607 T G Y N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 11373719 A G N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 11373741 T A N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 3 11373852 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 11373943 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 11374275 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 11374385 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 11374386 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 11374398 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 11374417 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11374478 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 11374673 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 11374708 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11375008 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11375254 G C Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 11375466 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 11375493 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 11375555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11375798 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 11375834 C T Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 11375841 C A N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 11375931 C T Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 11376066 A T N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 11376135 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 11376157 A C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 11376252 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 11376265 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 11376341 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 11376389 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 11376474 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 11376476 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 11376531 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11376538 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 11376624 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 11376657 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11376680 C A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 11376701 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 11376721 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 11376745 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 11376776 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 3 11376781 C T N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 3 11376799 C T Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 11376830 G T N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 11376847 A G N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 11377077 T C N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 3 11377106 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 11377146 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 11377224 G T N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 11377257 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 11377346 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 11377388 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 11377446 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11377493 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 11377649 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 11377675 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 11377716 T C Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 11377731 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 11377739 G C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 11377774 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 11377783 T A N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 11377897 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11377910 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 11377940 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 11377964 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 11378264 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11378270 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 11378353 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 11378481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11378528 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 11378589 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 11378607 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 11378615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11378630 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 11379214 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 11379229 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11379615 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 11380516 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 11380998 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11381011 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 11381015 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 11381181 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 11381590 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 11388648 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 11388665 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 11388742 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 11391574 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11392212 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11393387 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 11393595 T A N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 11393656 C A Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 3 11393840 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11394439 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 11394828 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 11395117 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 11395582 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11395830 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 11396526 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11398654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11400933 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11401247 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11403863 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 11404354 A T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 11405467 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 11407562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11408171 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11408558 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 11408883 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11411585 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 11412240 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11412553 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 11413629 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11414187 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 11415028 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 11421175 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 11421410 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 11421548 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11422147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11422304 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 11422491 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11423013 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11423913 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 11424018 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 11424121 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 11424500 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 11424664 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 11424741 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 11424768 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 11424865 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11425067 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 11425716 C T Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 11427940 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 11428005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11429371 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 11430561 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 11431202 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 11431397 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11432341 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11432511 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11433420 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 11433828 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11434341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11434462 A C N N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 9 9 3 3 3 3 11434547 T A N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 3 11434835 G A Y Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 12 12 3 6 3 3 11434846 A T Y N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 10 10 3 4 3 3 11434849 T G Y N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 3 11434875 G C Y N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 3 11435839 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11435840 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 11436246 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 11436510 G A N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.538461538461538 0.153846153846154 0.307692307692308 16 10 7 2 4 3 11437055 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11438631 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 11438893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11439329 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11439755 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 11440679 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 11441668 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 11442083 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 11442242 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 11442909 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 11443800 A C N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 3 11444021 T A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 11444918 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 11447325 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 11449076 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11449941 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11450153 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 11450179 A G Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 11450937 G C Y N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.5 0.416666666666667 8 16 1 6 5 3 11451373 A T Y N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 11452434 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11452480 G A Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 11455081 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11456289 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 11456657 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 11456667 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 11456701 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 11456706 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 11457271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11458646 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11460881 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11462068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11463028 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11464663 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 11466775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11466876 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11470589 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11471137 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11473351 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 11473679 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11474840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11479862 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11481396 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 11483115 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11483780 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 11485627 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11488551 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11489221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11489401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11493449 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 11496273 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11496281 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11497056 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 11498317 G C Y N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 11499996 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 11502080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11502846 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11504431 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 11505050 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 11505166 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11505616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11507576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11508958 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11509242 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11510123 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 11512794 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 11513484 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 11514597 C T N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 3 11524838 G A Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 11525017 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 11525447 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11526102 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11529591 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11530928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11531511 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 11531591 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 11531766 C T N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.533333333333333 0.2 0.266666666666667 19 11 8 3 4 3 11532262 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 11532550 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 3 11532697 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 11533097 T G N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 3 11533246 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 11533311 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11533379 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 11533773 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11533794 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11533830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11533836 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11533967 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11533982 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 11534337 A C Y N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 11534392 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11534423 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 11534443 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 11534493 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11534720 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11534750 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11534759 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11534779 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11534883 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11534970 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11535110 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11535830 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11535840 A T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 11535894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11535914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11536144 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 11536256 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11536430 A T Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 11536535 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 11536572 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 11536601 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 11536615 A T Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 11536649 T G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 11537020 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11537028 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11537120 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 11537763 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11538017 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 11538351 T C Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 11538722 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11538953 C G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 11539001 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 11539345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11539398 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 11539547 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11540541 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 11540752 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11542059 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11542309 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 11542460 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 11542535 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11542953 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11543369 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 11543471 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 11543663 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 11543760 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 11543767 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 11543780 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 11543815 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 11543867 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 11544054 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 11544105 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 11544178 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 3 11544475 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11544548 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11544551 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11544626 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11544656 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11544787 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.1875 0.0625 0.75 7 25 3 1 12 3 11544954 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11544996 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 11545209 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 11545289 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11545823 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.1875 0.0625 0.75 7 25 3 1 12 3 11545825 G C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 11546000 G C N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.2 0.0666666666666667 0.733333333333333 7 23 3 1 11 3 11546007 T G N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.2 0.0666666666666667 0.733333333333333 7 23 3 1 11 3 11546033 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 11546195 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 11546213 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 11546323 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 11546334 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 11546473 G C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 11546480 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 11546552 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 11546650 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 11546655 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 11551009 A G Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 11554147 T A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 11554198 A T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 11554300 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.176470588235294 0 0.823529411764706 6 28 3 0 14 3 11554304 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.176470588235294 0 0.823529411764706 6 28 3 0 14 3 11554577 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 11555096 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 11555287 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 11555324 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 11555534 A T N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 11555542 C G N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 3 11555789 A T N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 11555833 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 11555989 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 11555998 T G N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 11556075 A C N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 11556079 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 11556125 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11556152 A T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 11556196 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11556240 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11556259 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 11556312 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 11556341 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 11556434 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 11556465 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 11556481 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 11556554 A C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 11556659 A C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 11556684 C T N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 11556695 A G N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 11556772 T C N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 11556792 A G N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 11556812 T A N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 11556883 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 11556970 A C N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 3 11556971 G C N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 3 11556984 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 11557016 A C N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 3 11557152 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 11557192 G T N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 3 11557241 T G N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 11557257 C T N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 11557273 G T N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 11557313 C T N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 3 11557420 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 11557528 A C N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 11557540 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 11557570 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 11557704 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 11557737 A G N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 11557799 C T N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 11557827 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 11557850 T C Y Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 3 11557883 G T N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 11557924 C T N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 11557948 A T N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 3 11558011 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11558040 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11558173 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 11558181 T C N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 11558192 T C N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 11558407 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11558704 C A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 11559041 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 11559295 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11561418 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11562380 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 11562463 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 11562630 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 11562727 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 11562762 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11563052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11563373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11563406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11563574 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11563632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11563690 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11563790 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11563906 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11563981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11563994 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 11564039 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11564215 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 11564398 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 11564439 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 11564514 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11564627 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11564853 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 11564952 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 11565086 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11565154 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 11565771 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 11566280 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11566889 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11566894 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11566914 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11566918 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11566926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11567000 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11567071 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11567239 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11567396 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11567575 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11567668 A T N N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0 0.636363636363636 0.363636363636364 7 15 0 7 4 3 11567974 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11568102 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11568152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11568192 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11568488 T A N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 11568495 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11568674 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 11568699 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 11568854 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 3 11568883 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 11569386 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11569395 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11569571 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11569612 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 11569660 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11569705 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 11569727 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11569773 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11569782 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11569810 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11569854 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 11569882 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11570106 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11570149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11570182 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11570256 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11570315 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11570364 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11570365 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11570745 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11570845 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 11570978 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11571066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11571094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11571106 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11571539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11571638 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 11571889 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11571969 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11572136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11572204 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11572248 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11572336 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11572391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11572444 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11572557 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 11572894 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11573310 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11574027 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11574587 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 11574604 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11574989 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 11575005 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11575129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11576557 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11576605 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11577910 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 11578654 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11578970 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11579177 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11583926 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11586311 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 11587361 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11588011 T A N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0 0.846153846153846 0.153846153846154 11 15 0 11 2 3 11588398 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 11589919 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11597670 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 11597881 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11598228 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11599546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11599699 G C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 11600510 A T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 11600547 C A Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 11602929 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11603237 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 11603271 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 11603874 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 11604955 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11604976 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 11605047 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11605083 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11605100 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 11605635 A T Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 11605826 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 11606917 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 11607018 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 11607034 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11607064 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 11607171 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 11607197 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 11608187 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 11608194 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11608786 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 11608834 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 11608910 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11608975 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 11609110 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 11609115 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11609250 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11609462 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 11609682 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11609729 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 11609784 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 11609873 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11609963 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 11610078 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 11610140 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11610150 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 11610359 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 11611060 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 11611213 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 11611537 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 11611545 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 11611952 G T N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 11612033 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11612070 T A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 11612090 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 11612183 A G N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 3 11612283 G T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 11612320 C T N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.454545454545455 0.272727272727273 0.272727272727273 13 9 5 3 3 3 11613281 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 11613342 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 11613537 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11613538 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 11613641 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 11613680 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 11613753 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 11613818 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 11614077 C T N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 3 11614228 T A N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 11614298 A T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 11615179 T C N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 11616011 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11616021 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11616231 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 11616522 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 11616609 G T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 11616821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11617255 A G Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 11617820 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11617988 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11619112 G C N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 11620384 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 11621224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11625015 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11625041 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11627765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11628150 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11628532 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11628546 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11629459 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 11632356 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11632797 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11633420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11633797 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 11637751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11638000 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11638530 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 11638657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11638795 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11639850 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11643495 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11645778 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11648439 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 11648541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11648553 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11648711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11649038 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11652390 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 11653176 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11653508 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11654699 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11655628 G T N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 11655897 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 11660062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11660294 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11662580 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11663067 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 11663576 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11663996 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 11664217 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 3 11665902 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11666662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11667066 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11667283 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11668745 G C Y N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 3 11670951 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11672421 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 11672656 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 11673259 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11673401 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 11674076 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11674436 C T Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 11674530 A C Y N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 3 11674935 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11675001 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 11675288 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 11675322 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 11676096 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 11676184 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 11676191 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 11676216 G C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 11676700 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.315789473684211 0.105263157894737 0.578947368421053 14 24 6 2 11 3 11676744 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 11676748 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 11676756 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 11676783 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 11676873 A G N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.357142857142857 0.0714285714285714 0.571428571428571 11 17 5 1 8 3 11677012 G T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.294117647058824 0.117647058823529 0.588235294117647 12 22 5 2 10 3 11677036 C G N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 11677044 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.333333333333333 0.2 0.466666666666667 13 17 5 3 7 3 11677109 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 11677124 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 3 11677160 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 11677236 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 11677334 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 11677338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11677365 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 11677375 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 11677381 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 11677420 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 11677452 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 11677461 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 11677568 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 11677584 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 11677595 T A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 11677596 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 11677700 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 11677702 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 11677712 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 11677755 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 3 11678037 A C N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.333333333333333 0.0833333333333333 0.583333333333333 9 15 4 1 7 3 11678044 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.266666666666667 0.133333333333333 0.6 10 20 4 2 9 3 11678062 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 10 22 4 2 10 3 11678089 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 3 11678161 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.333333333333333 0.0555555555555556 0.611111111111111 13 23 6 1 11 3 11678169 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.315789473684211 0.105263157894737 0.578947368421053 14 24 6 2 11 3 11678237 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 11678273 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 11678290 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 11678301 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 11678317 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 11678375 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 11678399 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 11678443 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 3 11678482 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 11678530 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 11678531 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 11678572 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 3 11678603 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 11678613 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 11678648 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 11678720 T C Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.277777777777778 0.0555555555555556 0.666666666666667 11 25 5 1 12 3 11678794 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 11678806 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 11679028 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 11679080 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 11679184 C G N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.25 0.0625 0.6875 9 23 4 1 11 3 11679186 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.25 0.0625 0.6875 9 23 4 1 11 3 11679275 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 11679313 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11679382 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 11679467 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 11679484 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 11679544 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 11679892 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 3 11679940 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 3 11680029 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 3 11680364 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 11680596 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11680680 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11680713 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 11680922 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 11680991 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 11681082 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 11681210 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 3 11681360 A G Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 11681407 A C Y N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.375 0.1875 0.4375 15 17 6 3 7 3 11681464 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11681552 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.352941176470588 0.117647058823529 0.529411764705882 14 20 6 2 9 3 11681823 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 11681916 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 11681956 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 11682028 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 11682141 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 11682229 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 11682246 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 11682261 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 11682636 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11682663 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 11682712 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 11682713 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 11682758 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 11682950 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 11683032 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 11683305 T G N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.214285714285714 0.0714285714285714 0.714285714285714 7 21 3 1 10 3 11683340 A C N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.266666666666667 0.133333333333333 0.6 10 20 4 2 9 3 11683398 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.333333333333333 0.111111111111111 0.555555555555556 14 22 6 2 10 3 11683572 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.315789473684211 0.105263157894737 0.578947368421053 14 24 6 2 11 3 11683670 A T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 3 11683695 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 11683792 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 3 11683844 T G N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.2 0.0666666666666667 0.733333333333333 7 23 3 1 11 3 11683927 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.2 0.133333333333333 0.666666666666667 8 22 3 2 10 3 11684042 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 3 11684142 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 11684300 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 11684340 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 3 11684385 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11684688 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 3 11685141 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 11685164 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 11685359 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 11685782 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.333333333333333 0.111111111111111 0.555555555555556 14 22 6 2 10 3 11686027 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 11686161 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 11686407 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 11687130 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11688091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11690700 G A N Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 3 11694651 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 11694687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11694704 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 11695272 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 11697262 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11698101 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 11698703 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11698832 T C Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.294117647058824 0.117647058823529 0.588235294117647 12 22 5 2 10 3 11698837 G C Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 3 11698937 T C Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.315789473684211 0.105263157894737 0.578947368421053 14 24 6 2 11 3 11698966 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11699509 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 11700332 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11700336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11701343 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 11701393 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11701445 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11702506 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 11705491 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11705787 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11706700 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11706707 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11706886 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11707111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11707437 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11707473 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11707607 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11707883 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11707893 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 11707898 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 11708212 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 11708471 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 11709409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11709486 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 11710680 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11710690 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11710926 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 11710976 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11712164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11712574 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 11712596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11718406 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 11718687 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 11718866 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 11719214 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 11719484 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 11721636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11721738 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11722953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11724159 G A N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 11724182 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 11727001 C T N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 3 11729165 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 11729560 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11730900 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 11731083 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 11731168 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 11731264 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 11731457 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 11731590 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11731783 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11731858 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11731874 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 11731961 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11732220 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11739883 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 11740177 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 11740416 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 11740434 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11740632 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 11741020 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11741061 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 11741084 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 11741106 T C N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 11741107 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 11741365 C A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 11741575 C A Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 11741821 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11741905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11742993 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 11743290 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 11743336 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 11744249 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11744347 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 11744663 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 11744918 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 11745276 G C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 11745815 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11746317 T G Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 11746479 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11746535 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 11747012 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 11747814 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 11747924 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11749828 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11749848 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11750785 A C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 11752229 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11752486 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 11752766 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 11752816 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 11753117 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 11753133 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 11753470 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11753528 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11753769 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11754081 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11754199 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 11754299 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 11754905 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 11755111 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11758370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11758419 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11758567 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11758847 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11759170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11760157 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11761957 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11762039 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11762680 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 11763182 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11763760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11763813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11763849 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11764619 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11765476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11766152 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 11766295 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 11767199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11768058 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 11768234 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11768681 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11769438 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11769515 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11769584 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 11770117 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11770488 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 11771585 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11771937 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 11772196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11774343 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11774345 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11775208 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 11776145 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11776543 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 11777162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11777736 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11783574 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11783613 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11783893 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11784101 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11784162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11784243 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11786173 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11787265 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11789218 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11789414 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 11789685 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 11790651 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11790951 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11791348 A C N N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0 0.727272727272727 0.272727272727273 8 14 0 8 3 3 11798062 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11798519 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 11798592 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 11798723 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11799039 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11799245 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11799601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11800210 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11801273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11801726 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11801813 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11802405 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11802406 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11803262 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11806237 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11808544 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 11808982 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11809121 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11809409 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11809885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11810941 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11811025 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11812205 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11813156 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11813925 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11813976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11814519 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 11816042 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 11816554 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11817704 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 11817926 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 11817988 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11818008 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 11818454 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11818626 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11818872 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11819240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11819534 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11820264 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 11821079 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11821375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11821517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11821619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11822108 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11822238 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 11822582 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 11823188 A T N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 11824719 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 11825697 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11827170 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11828969 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11829420 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11829503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11829610 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11829870 A G N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 11830572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11830608 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 11830868 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11830938 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11830997 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11832255 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11833106 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11834248 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11837120 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11837942 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11838119 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11838177 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11839324 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11839327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11840044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11840344 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11841342 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11841368 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 11841369 G A Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 11842694 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 3 11843125 G A N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 11845080 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11846069 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11846798 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11846885 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11848495 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11850861 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11850891 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11850995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11851157 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11858499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11859727 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11860578 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11862249 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11862476 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11862802 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11863442 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11864288 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11865181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11866196 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11866234 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 11866714 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11866874 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 11867341 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11867587 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11868689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11869125 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11869389 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11871133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11873106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11874627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11875209 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11875597 G A Y Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 10 6 4 2 2 3 11876898 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11877670 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 11877776 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 11877865 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11878128 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11878324 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11880428 G A Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 11880654 C A Y N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 3 11880898 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 11880903 A T Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 11881540 G C Y N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 3 11881562 A C Y N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 11881909 T A Y N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 11882875 T G Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 11882895 A T Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 11882946 G A Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 11883186 G C Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 11883217 G A Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 11883548 C A Y N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 3 11883819 G A Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 11884838 A C Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 11885568 T G Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 11886005 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 11887839 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11888656 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11888706 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 11889515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11890742 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11890743 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11890753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11891499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11892565 A C N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 11893230 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11893612 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11893809 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11895168 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11896069 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11896668 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11897036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11897207 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11897895 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 11898979 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 11899156 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11899511 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11899545 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11899784 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11900443 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11901134 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 11901380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11901990 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 11902533 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11902596 A C N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 11903177 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11904614 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11904744 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11906397 T C Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 11906417 T C Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 11907344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11907475 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 11908357 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 11908414 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 11909489 G A N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 11910539 C A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 11910572 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 11911701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11912423 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11913228 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 11913329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11914085 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 11914668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11915523 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11915983 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 11916549 C T N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 3 11916667 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11917595 C T N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 11918125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11918277 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11918746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11919573 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11919800 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11920463 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 11921424 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11922120 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 11922240 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11922455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11922723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11923371 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 11923543 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11924427 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11925129 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11925685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11925857 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11926485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11926716 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11926882 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11927200 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11927301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11927360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11927828 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 11928614 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11929841 C A N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 3 11930639 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11930843 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 11931474 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11933434 A G Y Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 3 11939754 G T Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 11940263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11940375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11941035 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11942259 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11942447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11943476 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 11943732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11943821 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11943822 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11944461 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11944987 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11945323 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11945687 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11946195 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11946269 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11946341 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11946362 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11946398 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 11946695 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11946763 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 11947689 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11948239 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11949383 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11949962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11950458 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11951066 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11951078 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11951282 A G Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 11952208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11952591 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11952607 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11953143 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 11953383 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11953641 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11954205 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11954474 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11954853 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11955766 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 11956260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11956403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11957319 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11958621 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 11959663 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11959847 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11960009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11961119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11963369 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11964101 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11964231 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11964269 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11964500 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11965243 G A Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 11965719 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11966609 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 11966675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11966711 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11973235 T A Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 11973659 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 11973811 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 11974819 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11975933 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11976151 G C Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 11977723 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11978083 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 11979823 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 11980001 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 11980398 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 11980535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11980606 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11981608 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11982161 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 11982418 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11983216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11983329 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11984033 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11985467 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11987657 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11988086 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 11988298 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 11988782 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 11988949 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11989172 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 11990784 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11990990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11991180 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11992409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11992775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11993600 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 11993657 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 11994647 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 11995062 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 11995285 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11995360 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 11995394 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12002567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12002955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12003107 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12003910 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12004056 T A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12004214 C G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12006299 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 12006532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12008424 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12008469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12009538 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 12011443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12011559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12011890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12012217 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12012271 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12013218 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12013511 T A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 12013681 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12013706 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12013920 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12013931 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12014097 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12014160 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12014360 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12014528 C A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12014567 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12014569 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12014604 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12014619 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12014651 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12014773 A G Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 12014778 T G Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 12014818 T G Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 12014920 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 12014950 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 12014990 A T Y N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 12015017 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 12015068 A C Y N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 12015073 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 12015090 C G Y N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 12015094 C A Y N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 12015130 T A Y N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 12015158 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 12015553 C T Y Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 12015576 G A Y Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 12015648 G T Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 12015665 C G Y N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 12015790 C G Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 12015865 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12015917 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12015936 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12015943 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12016019 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12016111 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12016168 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12016174 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12016260 T G Y N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 12016475 C A Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 12016478 G T Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 12016514 G A Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 12016516 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 12016526 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 12016547 T A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 12016617 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12016767 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12016884 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12016914 T C Y Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 3 12016937 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12016969 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12016980 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12016989 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12017000 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12017007 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12017013 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12017031 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12017041 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12017062 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12017174 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12017190 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12017216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12017282 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12017339 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12017390 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12017455 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12017600 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12017724 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12017866 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12017904 T G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12018045 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12018055 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12018078 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12018085 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12018119 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12018211 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12018233 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12018236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12018256 G T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12018281 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12018286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12018315 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12018357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12018361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12018368 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12018575 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12018609 G T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12018694 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12018714 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12018756 G T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12018759 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12018830 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 12018867 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 12018886 C A Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 12018909 T A Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 12018917 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 12018928 G A Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 12018942 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 12019301 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 12019335 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12019368 A T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12019542 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12019568 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12019631 A T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12019676 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12019749 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12019832 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12019867 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12019870 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12019923 C A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12019956 A T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12019964 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12020052 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12020139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12020161 C A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12020214 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12020326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12020465 G C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12020553 G T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12020656 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12020709 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12020736 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12020830 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12020847 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12020881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12020921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12020923 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12020970 G T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12021062 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12021087 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12021110 A T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12021221 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12021227 T G Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 12021251 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12021278 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12021294 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12021387 A T Y N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 12021494 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 12021500 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 12021554 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12021618 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12021619 C T Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 12021648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12021650 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12021677 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12021682 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12021706 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12021710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12021763 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12021820 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12021837 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12021885 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12022062 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12022124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12022160 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12022264 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12022267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12022431 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12022443 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12022810 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12022902 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12023056 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12023203 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12023207 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12023293 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12023303 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12023339 A T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12023395 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12023409 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12023813 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12024389 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12025068 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12025070 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12025113 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12025171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12025179 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12025281 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12025330 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12025361 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12025440 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12025526 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12025600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12025609 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12025925 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12025970 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12026274 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12026285 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12026318 T C N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0 0.928571428571429 0.0714285714285714 13 15 0 13 1 3 12026480 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12026571 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12026899 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12027003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12027120 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 12027201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12027326 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 12027460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12027730 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12027739 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 12027761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12028073 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12028219 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 12028720 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 12028773 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 12028786 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 12028886 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 12028890 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 12029108 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 12029160 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 12029393 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 12029472 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 12029480 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12029694 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12029705 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12029830 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 12029910 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 12030062 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 12030261 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 12030419 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 12030646 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12030675 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 12030705 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 12030725 T A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 12030729 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12030816 C A Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 12030818 C A Y N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 12030924 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 12030960 A C N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 12031097 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 12031215 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 12031272 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12031282 A T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 12032116 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 12032143 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 12032188 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 12032347 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 12032371 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12032378 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12032624 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 12032731 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12032845 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 12032866 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 12032873 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12033001 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 12033018 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 12033048 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 12033070 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 12033516 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12033603 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12033695 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12033818 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12033915 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12034143 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 12034187 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 12034599 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12034775 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12035054 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12035055 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 12035300 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 12035332 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12035436 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12035476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12035577 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 12035827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12036575 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 12036768 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 12036793 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 12037021 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 12037022 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 12037296 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 12037358 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 12037361 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12037396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12037616 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12037693 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 12037715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12037975 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12038031 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12038037 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12038050 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 12038446 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12038561 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12038762 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 12038840 C G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 12038911 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12039746 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12039925 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 12040013 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 12040134 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12040245 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 12040281 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12040347 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12040605 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12041080 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 12041129 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12041549 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 12041601 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 12041652 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 12041709 C A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 12043060 A T N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 3 12043073 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 12043546 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12043695 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12043717 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 12043741 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12043970 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12043999 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 12044004 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12044035 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12044326 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12044328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12044397 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12044528 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12044692 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12044779 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12045117 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12045793 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12046639 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12049001 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12051673 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12052001 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12053298 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12053688 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 12053933 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12053956 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12054059 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12054080 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 12054095 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12054256 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12054337 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 12054660 C G Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 12054896 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12055681 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 12055683 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 12055715 T G N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 12056022 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 12056449 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 12056630 T G N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 12056782 T C Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 12057519 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12058439 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12058555 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12059742 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12061197 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12061495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12061537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12063320 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 12063528 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12067025 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12067575 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 12068388 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 12068491 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 12069258 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12069860 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12070661 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12070680 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12070999 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 12071095 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12071248 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12071364 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 12071448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12071583 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 12071650 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 12071978 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12071981 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12072010 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 12072205 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12072315 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12072609 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 12072713 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 12072842 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12073107 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12073119 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 12073258 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12073274 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 12073438 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 12073439 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12073458 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 12073523 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12073598 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 12074120 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12074419 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12074487 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12074504 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 12074566 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12074571 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12074589 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12074981 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 12075003 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 12075052 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 12075071 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 12075119 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12075155 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12075166 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12075176 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12075198 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12075236 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 12075272 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12075275 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12075287 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12075317 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12075395 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12075405 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12075656 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 12075886 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 12076022 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 12076024 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 12076109 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12076177 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 12076235 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12076243 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12076266 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12076286 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12076302 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12076311 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12076357 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12076460 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12076492 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12076800 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12076880 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12076942 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12077119 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 12077255 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12077345 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 12077361 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 12077452 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12077486 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12077621 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12077677 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12077736 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12078002 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12078088 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 12078181 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12078194 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12078484 A T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 12078561 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 12078601 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12078628 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 12078655 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 12078829 A T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 12078853 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 12078888 T C N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 12 12 3 6 3 3 12079057 A C N N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 3 12079390 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 12079404 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 12079510 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 12079669 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 12079717 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 12079735 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12079786 A T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 12079842 T A N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 12079867 A G N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 12079902 G A N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.454545454545455 0.363636363636364 0.181818181818182 14 8 5 4 2 3 12079922 G T N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 12079934 C T N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 3 12079962 A T N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 3 12079967 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 12080070 C T N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 12080080 T C N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 3 12080109 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 12080172 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 12080594 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 12080695 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12080969 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 12081164 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12081190 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12081275 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12081339 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 12081367 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12081426 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 12081468 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 12081530 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12081635 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12081636 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 12081681 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 12081751 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12081776 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 12081990 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 12082269 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12082276 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 12082381 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12082416 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 12082474 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 12082633 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12082655 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12082758 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12082787 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 12082872 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12082950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12083264 A C N N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 3 12083470 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12083620 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 12083773 C G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 12083791 A T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 12083824 A T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 12083848 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 12084084 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 12084108 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 12084140 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12084268 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 12084528 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12084542 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12084610 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 12084790 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 12084862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12084991 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12085009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12085429 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12085576 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 12085749 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 12085781 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 12086010 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 12086114 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 12086126 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 12086258 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 12086281 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 12086410 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 12086468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12086619 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 12086674 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 12086736 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12086856 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12087081 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 12087304 A T Y N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.133333333333333 0.8 0.0666666666666667 16 14 2 12 1 3 12087346 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12087465 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 12087794 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 12087816 A G Y Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 12087891 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12088079 A T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 12088377 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 12088402 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 3 12088440 G T Y N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 12088488 C A Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 12088572 A G Y Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 12088595 C T Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 12089071 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12089083 A C Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 12089215 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 12089216 C G Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 12089329 G T Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 12089398 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 12089404 A T Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 12089417 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12089725 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 12089782 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12089795 G T Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 12089796 G C Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 12089918 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12089982 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12090054 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 12090103 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 12090144 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12090306 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 12090351 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 12090967 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 12090994 C T Y Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 12091070 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12091278 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 12091321 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12091757 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 12091828 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 12091997 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12092879 T C Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 12093081 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 12093327 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12093384 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12093401 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12093436 C A Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 12093811 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12093918 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12094445 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12094961 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12095127 T G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 12095235 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12095385 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12095613 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 12095619 T A Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 12095687 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12095901 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 12095917 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 12096255 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 12096669 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12096717 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 12097001 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12097087 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12097272 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12097689 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 12097864 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12098769 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 3 12099270 A T Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 12099371 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 12099386 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 12099451 G C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12100549 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 12100734 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12100878 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12100966 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12101259 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 12101366 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12101545 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12101709 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 12101822 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12101937 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12102031 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 12102114 T C Y Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 12102165 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 12102274 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 12102277 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12102288 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12102299 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 12102345 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 12102489 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 12102526 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 12102535 T C Y Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 3 12102771 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 6 12 2 2 5 3 12102799 T A Y N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 3 12102847 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 12103081 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 12103083 A T Y N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 12103154 G C Y N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 12103394 T A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 12103546 T C Y Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 12103578 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 12103657 C A Y N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 3 12103664 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 12103668 T C Y Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 6 14 2 2 6 3 12103750 G A Y Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 12103794 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 12103933 C T Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 12103944 G T Y N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 12103969 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 12104205 T G Y N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 12104339 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 12104373 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 12104496 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 12104511 T A Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 12104517 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 12104561 T G Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 12104564 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 12104634 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12104676 T A Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 12104721 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12104797 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12104910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12104943 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12105644 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12106049 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12106149 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12106187 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12106290 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12106320 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12106433 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12106465 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12106600 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 12106805 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12106853 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12106868 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12106919 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 12106931 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12112478 T A N N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 12113320 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 12113463 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 12113682 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12113699 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12114269 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12114894 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 12114971 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12115035 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 12115111 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12115304 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12115475 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12115654 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12115902 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 12116721 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12116840 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12116943 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 12119519 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12119794 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12120214 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12120347 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12120690 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12120848 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 12121021 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 12121152 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12121229 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12121273 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12121426 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12121435 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12121640 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12121753 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12121880 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 12122217 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 12122732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12124058 T A Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 12124079 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 12124087 C T Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 12124374 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12124484 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12124795 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12124824 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12125046 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12125077 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12125120 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12125189 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12134584 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12136332 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 12137953 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12138216 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 12138386 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12138388 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 12138416 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 12138431 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12138757 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12138939 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 12139572 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12139599 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 12139608 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 12139969 T G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 12139970 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 12140034 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 12140130 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12140295 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 12140582 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 12140672 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12140908 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 12140909 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 12141040 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 12141131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12141146 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12141164 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12141333 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12141357 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12141384 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 12141396 G T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 12141668 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12141843 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12141858 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12142381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12142399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12142440 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12142589 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12142602 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12142619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12142755 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12142854 A G Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 12143138 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12143205 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12143244 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12143338 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 12143469 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12143515 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 12143551 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12143671 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12143685 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12143736 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12143777 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12144111 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12144251 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12144565 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12144578 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12144904 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12145147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12145284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12145325 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12145370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12145560 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12145887 G C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 12146350 C A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 12146529 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 12146667 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 12146678 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 12146722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12146758 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 12146978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12147079 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 12147200 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 12147287 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12147808 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 12148174 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12148418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12148449 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12148476 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12148709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12148721 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12148764 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12148942 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12149007 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12149024 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12149088 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12149194 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 12149206 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 12149304 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 12149309 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 12149333 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 12149466 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12149539 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12149634 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 12149671 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 12149674 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 12149747 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12150014 T C N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 6 10 1 4 3 3 12150198 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12150386 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12150685 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12150742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12150914 C G N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 12152450 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12153001 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12153693 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 12153733 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 12154005 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 12155025 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12156364 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12157791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12158654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12158876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12159373 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12159774 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 12160492 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12160769 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12160825 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12162102 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12162121 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12163957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12166904 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 12167373 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 12167504 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12167539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12169031 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12169907 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12172503 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12173176 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12174904 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12175944 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12176025 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12177536 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12179433 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 12179611 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12180654 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12180828 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12181694 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 12182713 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 12183332 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12185991 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 12187799 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 12188466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12190233 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 12190941 G A N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 3 12193682 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 12195014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12195074 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12196023 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12196193 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 12196406 C T Y Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 12197221 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 12199626 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12200228 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12200569 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12201049 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 12201123 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12201322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12201645 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12203055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12203821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12204080 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12206093 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12206178 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12207161 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 12207162 G C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 12207176 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 12208581 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12208757 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12209108 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 12209547 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12210616 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12211042 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12211377 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12212098 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12212220 C G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 12212564 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12213990 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12214141 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12214168 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12214915 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12216065 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 12217796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12218619 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12219089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12219170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12219529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12220258 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12220345 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12220361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12227991 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12228763 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12229073 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 12229171 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12229373 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 12229939 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12230013 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12230410 G T Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 12237197 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12237491 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 12237669 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12238853 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 12239064 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12239722 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12240850 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 12241450 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12242450 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12242906 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 12244650 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12244999 C G Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 12245941 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12246385 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 12246530 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12247051 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12247078 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 12247125 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12255314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12255367 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12255518 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12255652 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12256445 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12258717 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12259015 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12259347 T A N N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0 1 0 9 9 0 9 0 3 12262199 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 12262526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12262946 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12263217 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12263320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12263738 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12263938 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12264174 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12265140 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12265581 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 12267245 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12268423 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12269087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12269849 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12270096 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12270222 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 12270933 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12271012 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12272073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12272719 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12274298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12274683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12274943 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12275590 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 12278357 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12279235 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 12280346 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12282340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12282762 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12284006 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 12284071 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12284083 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 12284138 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12284153 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12284204 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12284446 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 12284714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12284958 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12285118 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 12285154 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 12285417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12285821 G A N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 3 12285846 C T N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 3 12286254 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12286292 T A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 12286326 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12286390 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12287061 A C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 12287083 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 12287183 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 12287214 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 12287219 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 12287327 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 12287335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12287408 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 12287485 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 12287511 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 12287709 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 12287711 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 12287819 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 12287917 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 12287954 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 12288488 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12288555 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 12288809 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 12289116 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 12289129 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12289189 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 12289236 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 12289530 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 12290021 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 12290157 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 12290216 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 12290234 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 12290456 T C N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 3 12290639 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12290807 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 12290819 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12290834 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 12290998 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 12291277 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 12291312 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 12291452 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 12291465 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 12291630 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 12291745 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12291992 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 12292015 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 12292390 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 12292425 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 12292456 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 12292619 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 12292706 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 12292893 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 12292981 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 12293158 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 12293384 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12293385 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 12293954 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 12294107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12294397 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 12294581 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12295311 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 12295715 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 12296075 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12296106 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 12296362 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 12296395 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 12296735 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 12296821 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12297300 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12297466 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 12297506 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12297547 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 12297656 A C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 12297699 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12297904 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 12297976 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 12298222 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12298381 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 12298435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12298461 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 12298510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12298764 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 12298799 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12299153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12299619 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12299669 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12300398 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12300746 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 12300867 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 12301436 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12301490 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 12301537 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 12301693 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 12302022 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 12302046 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 12302104 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12302221 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12302856 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 12303463 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 12303957 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12304204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12304951 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 12305460 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 12307887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12311676 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12311702 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12312089 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12312276 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12312817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12313140 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12313657 T C Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 12313980 T A Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 12314296 G A Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 12314669 C G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 12316860 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12317160 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12317236 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12317973 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 12318066 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 12318428 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 12318881 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12319450 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12319716 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 12319783 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12319935 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12319953 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12320607 T A N N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.454545454545455 0.454545454545455 0.0909090909090909 15 7 5 5 1 3 12320608 A G N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 3 12320757 G T N N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 3 12320816 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 12320855 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 12320987 C T N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 3 12321080 A T N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 3 12321330 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 12321734 T A N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 12321845 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 12321882 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 12321899 T G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 12322000 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 12322014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12322097 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 12322254 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 12322331 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12322333 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 12322392 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 12322464 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 12322509 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 12322671 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 12322962 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 12323025 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 12323079 C G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 12323198 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 12323301 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 12323303 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 12323374 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 12323444 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 12324004 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12324011 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 12324189 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12324257 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 12324326 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12324333 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12324404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12324436 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12324460 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12324583 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12324595 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 12324630 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 12324654 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 12324769 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12324841 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12324850 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 12324988 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12325011 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 12325022 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 12325049 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12325146 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12325188 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12325189 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12325224 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12325259 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 12325261 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 12325334 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12325434 T G N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 12325591 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 12325792 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 12325962 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 12326014 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12326307 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 12326346 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12326503 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 12326531 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12326593 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 12326615 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12326650 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12326681 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12326794 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12326838 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 12326884 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 12327190 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 12327254 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 12327366 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 12327387 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 12327435 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12327551 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12327657 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 12327674 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12327876 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12328188 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 12328189 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 12328384 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 12328495 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12328550 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12328560 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12328628 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 12328711 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 12328759 A G N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.75 0.0833333333333333 0.166666666666667 19 5 9 1 2 3 12328869 G T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 12329644 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 12329741 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 12329743 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 12329803 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 12329890 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 12329958 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12330005 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 12330515 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 12330614 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 12330684 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 12330702 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12330756 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12331205 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 12331232 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 12331392 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 12331433 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12331445 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 12331500 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 12331528 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 12331529 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 12331541 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 12331586 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 12331614 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 12331674 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 12331715 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 12331784 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12331854 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12331855 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 12331912 G C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 12332014 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 12332145 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12332256 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 12332257 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 12332269 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 12332351 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 12332462 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 12332707 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 12332722 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 12332764 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 12332996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12333139 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 12333222 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 12333294 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 12333300 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 12333359 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 12333413 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 12333496 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12333668 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12333712 A T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 12333820 T A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 12333828 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12333945 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12334031 A C N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 12334038 A T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 12334042 T A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 12334113 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 12334185 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12334617 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 12334758 T G N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 3 12334796 T C N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.615384615384615 0.0769230769230769 0.307692307692308 17 9 8 1 4 3 12334958 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12335258 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 12335334 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 12341358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12341537 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 12341934 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 12342161 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12342298 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12342574 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 12343514 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12343651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12343937 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 12344066 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 3 12344209 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 3 12344273 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 12344653 G A N Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 3 12345143 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 12345166 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 12345886 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12346193 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12346287 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 12346435 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 12346537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12346871 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 12346904 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 12347145 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12347608 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12347668 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12347796 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12347984 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 12347990 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 12348404 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 12348471 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12348772 T G N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.428571428571429 0.214285714285714 0.357142857142857 15 13 6 3 5 3 12349272 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12349596 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 12349644 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 12349697 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 12349814 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 12349933 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 12350408 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 12350516 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 12351008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12351213 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 12351376 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 12351379 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 12351992 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12352382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12352557 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12352621 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12353558 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 12353628 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 12354094 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 12354104 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12354258 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12354429 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12354634 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 12354927 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 12355291 C A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 12355846 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12356018 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 12356178 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12356183 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 12356246 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12356633 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 12356700 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12356770 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12356821 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 12356915 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 12357482 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 12357603 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 12357732 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 12357769 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12357804 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 12358668 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 12358678 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 12358801 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 12358867 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12358908 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12359053 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12359108 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 12367456 C T Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 12367569 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 12367646 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 12367908 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12368220 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 12368527 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12368572 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12370142 A G Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 3 12370176 G T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12372528 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 12372673 G T Y N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 3 12372756 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 3 12373386 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 12377206 G A Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 12377450 A C Y N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 12377503 G A Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 12378009 A C Y N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 12378138 C T Y Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.230769230769231 0.538461538461538 0.230769230769231 13 13 3 7 3 3 12378211 A G Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 3 12378276 A C N N 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0 0.9 0.1 9 11 0 9 1 3 12378314 T C N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.272727272727273 0.727272727272727 0 14 8 3 8 0 3 12378389 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12378393 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12378534 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12379786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12380323 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 12381234 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 12381599 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12382045 T G Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 12382105 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12382254 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12382591 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 12382698 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 12383013 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 12383040 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 12383378 A C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 12384569 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 12384620 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12384831 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 12385061 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12385082 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12385355 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12385417 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 12385570 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 12385787 T G Y N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 12386405 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 12386458 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12386479 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12386546 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 12386696 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 12386794 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 12388013 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 12388635 C A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 12389049 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 12389265 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12389270 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 12389295 A T Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 12389945 A T Y N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.230769230769231 0.769230769230769 0 16 10 3 10 0 3 12390008 A G Y Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.416666666666667 0.583333333333333 0 17 7 5 7 0 3 12390270 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 12390298 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12390407 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12390548 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 12390613 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 12391276 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 12391464 T A Y N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 3 12391724 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 12391901 A C Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 12391936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12392511 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 12393090 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12393619 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 12394910 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 12394983 C T Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 12395261 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 12396224 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 12396618 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 12396710 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12400260 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 12400692 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 12402450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12403025 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12403219 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 12403292 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12403641 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 12403711 T A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 12403804 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12404261 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12404496 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 12404760 G T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 12405208 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12405277 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12405326 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12406645 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12406885 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12406968 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 12407052 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 12407270 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 12407282 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 12407295 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12407674 A G N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 12407944 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 12408164 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12408401 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12408459 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 12408607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12408622 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 12408892 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 12412785 G T N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 3 12412957 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12413664 T A N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 12413750 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 12414071 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 12414367 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 12414697 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12414901 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 12414963 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 12415811 G T N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 12415986 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 12416066 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12416391 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 12416457 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 12416501 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12416666 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12416779 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 12417286 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12417476 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 12417842 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 12418048 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12418411 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 12418444 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12418472 T G Y N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 12418690 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 12418703 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 12418726 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12418824 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12418908 C A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 12418929 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12419095 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 12419182 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12419466 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 12419997 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 12420529 C T N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 3 12420557 A G N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.454545454545455 0.363636363636364 0.181818181818182 14 8 5 4 2 3 12420572 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 12421066 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 12421243 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 12421637 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12421924 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 12421963 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 12422326 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 12422528 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 12422559 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 12422613 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12422677 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 12422696 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 12422730 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12422839 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12422958 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 12423037 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 12423108 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 12423770 G A N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 3 12423853 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 12429988 C A Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 12430053 A C N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 12430538 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12430789 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12430846 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 12430896 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 12431604 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 12432435 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 12432471 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12432484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12432649 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 12432711 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12432713 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12432774 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12432811 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12432847 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 12432927 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12432982 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 12433334 G A Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 12433752 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 12433968 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 12434202 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 12434263 A C N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 12434616 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 12434914 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 12434943 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.533333333333333 0.2 0.266666666666667 19 11 8 3 4 3 12434969 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 12435121 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12435754 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 12436003 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 12436507 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12436637 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 12436944 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12436997 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12437067 T G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 12437500 C G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 12438045 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12438924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12438925 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12439750 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12442782 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12443060 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12445102 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12445316 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12445845 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12446517 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12446530 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 12446575 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12446729 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12447042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12447268 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 12447512 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12447636 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12447651 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12448460 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12448827 G C Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 12448838 T G Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 12448969 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12449785 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12450300 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 12451786 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12451876 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 12452923 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12453124 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12454127 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 12454409 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12454439 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12455384 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 12459096 C T Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 12459181 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12460216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12460829 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12460934 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12461037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12461567 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12461732 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12461916 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12462080 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 12462232 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12463170 C T Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 12463392 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12463449 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 12463532 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12464116 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12464395 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12465567 T A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 12466002 C A Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 12466623 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 12466952 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12482925 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 12483862 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12484041 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12485522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12485627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12485930 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12486703 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12487365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12487552 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12487862 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12488632 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12488745 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 12489382 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 12489783 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12490103 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12490170 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12490204 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12490238 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12490334 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12490360 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12490362 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12490522 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12490526 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12490599 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 12490727 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12490740 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 12490741 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12490752 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12490777 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 12490803 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12490822 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 12490830 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12490846 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12490871 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 12490886 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 12490976 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12491061 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 12491308 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 12491438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12491491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12491495 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 12491545 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 12491564 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 12491622 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 12491938 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 12491969 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 12492050 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 12492196 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 12492228 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12492249 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 12492291 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 12492343 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 12492352 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 12492544 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 12492645 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 12492750 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 12492776 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 12492916 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12492971 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 12492992 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12493324 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 12493345 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 12493368 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 12493587 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12493748 T G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 12493832 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 12493897 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 12494149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12494452 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12494507 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 12494880 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 12494921 A C N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 12494950 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 3 12495099 T G N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 3 12495154 G A N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 3 12495349 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 12495570 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12495655 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12495759 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12495867 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12495923 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12496011 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12496174 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 12496253 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 12496424 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12496450 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12496932 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 12496940 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12496953 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12496993 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12496999 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 12497095 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12497111 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12497225 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 12497380 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12497406 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 12497413 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12497495 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12497496 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 12498008 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12498166 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12498265 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12498388 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12498821 G T Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 12498857 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 12498858 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 12498930 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12498956 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12498979 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12499140 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12499252 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12499316 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12499454 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12499484 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12499743 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12499746 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12499939 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 12500140 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12500238 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12500339 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12500775 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12500822 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12500859 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12501517 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12501590 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12501598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12501919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12501929 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12502034 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12502079 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12502550 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12502699 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12502769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12504012 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12505309 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12505759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12505864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12506767 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 12507194 A G Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 12507263 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 12508127 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12508136 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12508423 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12508467 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12508691 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12509746 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12510643 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 12510672 T A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 12511034 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12511200 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 12511326 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 12511579 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 12511881 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12512041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12512268 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12512298 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12512835 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12513053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12513112 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12513289 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 12514075 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12514166 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12514333 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12521119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12521307 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12522806 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12523244 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12523524 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12523610 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12523723 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12524961 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12524974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12525042 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12525272 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12528325 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12529696 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12530117 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12530372 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12530924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12531372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12531843 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12533061 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12533563 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12535108 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12535719 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12535919 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12536035 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 12536228 G A N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 12536301 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 12536633 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12537236 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12537576 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12537675 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 12539344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12539680 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12539853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12539866 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 12546606 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12546751 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12547139 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12547261 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 12549720 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12549911 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12550298 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12551181 G A N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 3 12551715 T A Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 12552019 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 12552955 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12552991 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12553635 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12554281 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12556731 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12556923 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 12557609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12557669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12558078 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12560270 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12561291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12561920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12561937 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12562636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12562901 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12563340 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 12563365 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 12563561 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12564586 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12564914 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12565747 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12565836 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12566454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12566853 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12567632 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 12569201 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12570275 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12570757 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12571231 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 12571825 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12572401 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12572654 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 12573511 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12580340 G T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 12581153 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12581231 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12581368 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 12581500 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 12582245 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12582604 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12584385 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12584612 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12590033 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12590350 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12593909 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12594954 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12595193 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12595254 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12595357 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12595376 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12595586 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12596196 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12596362 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12596554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12597132 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12597208 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 12597445 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12597457 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12597482 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12597565 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12597837 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12598008 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 12598317 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12598601 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12598621 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12598667 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12598751 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12599591 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12599637 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12599657 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12599660 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12599729 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12599970 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12599982 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12600036 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12600049 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12600149 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12600231 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12600324 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12600339 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 12600375 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 12600631 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 12600705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12600762 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12600875 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12600997 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 12601000 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12601387 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 12601432 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12601473 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12601549 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 12601634 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 12601652 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 12601670 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12601855 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 12601994 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12602243 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12602262 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12602286 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12602321 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12602448 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 12602468 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 12603002 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12603042 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 12603118 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12603367 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12603417 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12603602 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 12603635 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12603658 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 12603722 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 12603780 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12603869 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12603891 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12603993 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12604139 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12604266 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12604365 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12604367 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12604401 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12604407 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12604454 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12604481 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 12604538 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12604546 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12604614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12604679 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 12605079 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12605080 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12605151 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12605171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12605189 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12605281 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12605412 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 12605553 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 12605577 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 12605617 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12605627 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 12605691 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12605712 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 12605742 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 12605755 A G N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 12605877 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 12605888 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 12605926 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12605929 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12605968 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 12606130 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 12606146 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 12606208 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 12606384 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 12606408 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 12606519 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 12606557 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 12606558 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 12607271 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 12607487 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 12607518 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12607521 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 12607612 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 12607615 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 12608094 T A N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 12608129 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 12608343 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12608646 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 12608862 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12609154 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 12609352 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 12609482 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 12609562 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12609750 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 12609765 A G N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 12609808 T A N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 12609814 T C N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 12609953 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 12610000 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 12610136 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12610164 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 12610217 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 12610239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12610354 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12610376 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12610406 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12610416 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12610451 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12610506 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12610538 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 12610646 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 12610695 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 12610733 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12610831 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 12610906 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 12610987 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12610988 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12611030 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12611036 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12611056 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12611119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12611153 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12611220 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12611322 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12611337 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12611496 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12611506 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12611552 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12611592 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 12611593 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 12611658 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12611712 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12611754 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 12611776 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12611799 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12611800 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 12611931 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12612092 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12612114 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12612192 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12612357 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 12612390 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12612434 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12612438 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12612585 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 12612596 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12612674 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12612983 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12613081 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12613316 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 12613381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12613433 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12613528 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12613585 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12613606 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12613730 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12613733 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12613812 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12613900 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12613998 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 12614259 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 12614345 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 12614395 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12614435 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 12615247 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 12615367 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12615382 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 12615484 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 12615590 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 12615686 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 12615759 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12615911 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 12615928 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12615966 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 12615973 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12616020 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12616211 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12616274 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12616318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12616386 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12616392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12616469 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12616546 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12616590 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 12616595 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 12616612 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12616670 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 12616727 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12616824 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12616858 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12616884 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12616921 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12616958 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12617118 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12617168 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12617232 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12617345 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12617444 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12617445 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12617577 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12617626 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12617731 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12617844 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 12618071 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12618085 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 12618233 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 12618356 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 12618395 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12618470 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12618530 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12618718 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12618738 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12618874 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12619122 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 12619149 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 12619184 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 12619309 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12619356 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 12619467 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12619542 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12619554 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 12619579 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12626329 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 12626360 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12626406 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12626413 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12626429 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12626457 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12626495 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 12626504 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12626510 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12626557 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12626622 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12626638 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12626644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12626654 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12626658 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12626719 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12626781 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12626788 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12626902 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12627037 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12627041 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12627109 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12627183 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 12627216 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 12627230 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 12627346 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 12627356 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12627390 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12627458 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12627476 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 12627490 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 12627499 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 12627505 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 12627560 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 12627615 T G N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 12627696 A G N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 12629658 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 12629694 T A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 12629739 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 12629759 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 12629785 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12629814 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12629929 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12629938 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 12629944 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12630114 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 12630131 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 12630153 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 12630158 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 12630207 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12630328 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 12630371 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 12630410 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 12630553 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 12630561 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 12630574 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 12630589 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 12630593 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12630686 C G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 12630702 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 12630717 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 12631038 G A N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 12631072 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12631220 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12631222 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12631348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12631362 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12631372 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12631430 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12631456 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 12631488 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 12631529 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12631539 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 12631558 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 12631786 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12631846 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12631870 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12631981 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12632002 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12632478 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 12632715 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12632779 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 12632916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12632924 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 12633010 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 12633175 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12633294 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12633852 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12633889 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12634379 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 12634441 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12634523 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 12634685 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 12634708 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 12635007 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 12635073 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 12635275 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 12635330 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 12635616 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12635737 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 12636154 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12636276 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12636430 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12637566 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12637761 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12637875 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12637984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12638301 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12638402 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12638419 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12638530 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 12638706 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12638736 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 12638763 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12638885 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12639196 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 12639655 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 12639726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12639990 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 12640394 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12640647 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 12640770 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 12640822 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 12640959 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12640997 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12641236 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 12642307 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12642310 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12642412 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 12642678 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 12642713 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12642754 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12642864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12642996 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12643097 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12643270 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12643477 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12644078 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12644400 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12644610 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12644615 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12644626 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12644887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12645057 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 12648972 C G Y N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 12650064 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12651033 G T N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 12651372 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12651564 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 12651727 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12651822 C G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 12652535 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 12653939 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 12654261 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12654884 A C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 12655146 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12655163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12655832 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12655904 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 12656014 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12656312 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12656328 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12656729 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 12656869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12657143 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12657346 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12657551 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12658190 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12658568 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 12658601 G C Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 12659048 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12659160 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 12659344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12659670 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12660299 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 12660347 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 12660500 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12660630 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 12660695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12662466 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 12662769 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 12662827 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 12663596 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12663955 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12664238 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 12664288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12665296 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 12665830 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12666668 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12666999 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12667028 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12667101 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12667678 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12669590 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 12670119 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 12671750 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 12671761 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 12671788 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 12671876 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12672515 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 12673239 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 12673405 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 12673854 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12673890 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12675624 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 12675631 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 12 6 6 0 3 3 12675812 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 12676519 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 12676549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12677193 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12677368 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12677500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12677688 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12677745 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 12677917 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 12677922 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 12678000 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 12678207 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12680454 A G N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.25 0 0.75 4 12 2 0 6 3 12681072 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 12681505 G A Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 12681523 T A Y N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 12681640 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12681657 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 12682616 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 12682631 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12682671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12683227 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 12683513 C T N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 3 12683811 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 12684231 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12684514 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 12684648 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 12684719 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12684863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12685639 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12685871 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12685887 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 12686034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12686466 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12686601 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 12687266 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12687423 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 12687681 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 12688129 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12688438 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12688632 T C Y Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 3 12689165 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12689175 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12689852 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 12689982 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 12690500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12690960 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12691060 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12691142 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12691286 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12691388 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12691618 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12691701 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12691736 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 12691748 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 12691837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12693648 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12694042 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12694105 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12694800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12695328 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12696380 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12696397 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 12696654 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 12697328 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 12697332 T A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0 0.647058823529412 0.352941176470588 11 23 0 11 6 3 12698033 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12698364 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12698671 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12698945 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12699699 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12701632 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 12702057 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12702416 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12703044 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12703720 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12703973 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12704279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12705799 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12705943 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12706995 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12707645 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 12708911 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 12708957 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12709620 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 12711499 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12712516 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 12714809 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12715140 G T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 12715864 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12716977 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12719279 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 12720453 T A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 12721643 G T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12729354 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12730157 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 12732002 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 12733265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12733994 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12738086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12738955 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12739978 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12740546 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12740699 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12740785 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12742300 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12742416 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12743286 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12745595 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12747084 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12747121 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12747246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12747308 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12747565 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12748682 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12749157 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12749260 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12749483 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 12750888 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12751266 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 12751899 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12753770 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12754678 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 12755646 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12755673 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12756248 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12756447 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12757410 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12757670 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 12758504 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12758948 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12760064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12760604 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 12760677 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12762234 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12762743 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12762890 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12763432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12764043 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 12764897 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 12765471 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12765924 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12766564 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12767030 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12767364 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12768899 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12769360 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12769362 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 12769569 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 12770118 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12770643 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12771551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12772927 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12773498 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 12773544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12774810 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12774913 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12776738 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12777257 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12777764 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 12778187 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12778227 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12778265 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12778671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12779106 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12779928 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12779954 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12780081 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12780089 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 12780106 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 12780153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12780170 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12780300 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12780301 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12780424 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12780474 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12780492 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 12780526 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 12780799 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12781191 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12781208 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12781250 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 12781338 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12781359 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12781417 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12781640 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12781718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12781798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12782003 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 12782083 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 12782342 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12782429 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12782524 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12782926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12782988 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 12783369 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 12783389 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 12783629 A T N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 12784130 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 12785080 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12785093 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12785136 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12785154 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12785537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12785559 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12785642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12785806 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 12786654 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 12787082 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12787327 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12787610 C A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 12787685 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 12787691 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 12787949 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12788005 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12788095 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12788152 T G Y N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 12794790 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 12794806 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 12794818 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12794879 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12794956 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12795037 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12795165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12795276 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12795446 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12795568 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 12795849 T C Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 3 12796173 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 12796342 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 12796351 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 12796459 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 12796472 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 12796473 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 12796747 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 12796781 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 12796806 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 12796870 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 12796871 A G N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 3 12796921 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 12796929 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 12797044 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 12797049 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 12797113 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12797116 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 12797126 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 12797223 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12797361 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 12797365 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12797381 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12797393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12797433 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12797479 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12797598 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12797673 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12797735 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12797746 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12797749 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12797761 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12797769 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12797835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12797873 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12798082 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12798097 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12798107 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12798111 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12798145 G T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12798202 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12798261 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12798304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12798357 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12798391 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12798459 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12798468 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12798516 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12798526 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12798612 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12798641 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12798652 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12798659 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 12798675 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12798692 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12798738 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 12798769 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12798777 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12798785 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12798814 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12798834 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12798846 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12798885 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12799078 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 12799126 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12799272 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 12799293 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 12799574 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12799627 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12799635 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12799647 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12799680 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12799681 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12799857 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12799858 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12799982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12799998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12800042 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12800081 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12800087 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12800109 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12800179 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12800194 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12800445 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12800454 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12800510 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12800514 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12800536 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 12800621 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12800654 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 12800658 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12800776 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12800870 C A N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 3 12800880 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12801011 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12801036 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12801052 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12801071 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12801193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12801258 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 12801427 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 12801472 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12801491 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12801498 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12801511 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12801568 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12801596 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12801645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12801659 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12801667 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12801910 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12801961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12802082 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12802090 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12802147 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12802149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12802164 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12802299 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 12802473 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 12802476 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12802666 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12802672 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12802701 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12803208 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12803297 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12803443 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12803617 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12803678 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12803702 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12803785 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12804088 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12804335 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12804453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12804648 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 12804937 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12805148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12805152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12805173 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12805209 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12805457 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12805498 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12805741 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12805849 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12805855 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 12805990 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12806463 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12807014 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12807033 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12807111 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12807454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12807826 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12808120 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12808273 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12808334 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12808389 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12809050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12809435 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 12809543 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 12809630 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12809648 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12809912 C A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 12810132 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 12810134 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 12810357 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12810397 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12810495 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12810611 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 12810659 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 12811409 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 12811619 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12812140 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 12812255 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12812314 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12812382 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12812763 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 12812868 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12813023 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 12813048 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 12813065 G A N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 12813322 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 12813384 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12813439 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12813472 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 12813491 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 12813504 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 12814380 C G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 12819781 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12819894 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 12820134 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 12820185 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12820304 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 12820401 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 12820432 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 12820575 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 12821113 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 12821319 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 12821355 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 12821579 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12821878 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 12821884 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 12822025 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12822131 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12822140 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 12822338 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 12822641 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12822867 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12823176 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 12823203 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 12823441 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 12823564 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 12823733 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 12823797 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 12823880 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 12824065 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 12824458 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12824783 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 12825934 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12827428 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 12827881 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12827991 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12828226 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12829087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12829603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12831346 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 12832415 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12832667 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12832700 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12833098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12833299 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12833366 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12835940 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12835983 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12836203 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12836789 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12840292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12841261 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12841382 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12842589 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12843094 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12843660 T G Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 12844668 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12845735 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12846400 T G N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 3 12846877 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 12847387 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12847468 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12847543 A T N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 12847629 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 12847776 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 12848411 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12848674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12848888 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 12848939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12848943 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12849118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12849128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12849191 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12849664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12849837 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12849920 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12849970 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12850147 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12850194 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 12850228 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12850299 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 12850381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12850590 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12850720 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12850744 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12850852 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12851031 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12851080 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 12851521 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12851663 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12851732 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12852045 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12852133 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 3 12852149 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12852192 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 12852227 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12852238 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12852371 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 12852390 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12852896 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12852973 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12853073 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 12853649 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 12853687 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12853813 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 12853955 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 12854220 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 12854495 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 12854520 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12854892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12854914 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12854995 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12855143 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12855171 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12855524 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12855681 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12855720 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 12855743 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 12858680 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12858877 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12859188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12860021 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12860043 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12860056 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12860309 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 12860616 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 12860811 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12860958 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12861386 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12861638 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 12861830 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12861883 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12861965 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12862378 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 12862424 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12862535 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12862683 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12862787 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 12862791 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12863451 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12863590 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 12863672 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12863737 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12863954 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12864078 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12864156 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12864233 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 12864378 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12864403 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12864423 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 12865050 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12865860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12866427 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12867638 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 12867675 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12867909 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 12867916 C A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 12867964 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 12867982 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 12868050 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 12868110 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12868155 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 12868181 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12868189 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 12868268 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 12868272 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 12868336 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12868342 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12868629 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12868676 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12869323 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12870164 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 12871362 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 12871540 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12871861 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 12872304 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12873179 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 12873732 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12873738 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 12874056 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12874202 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 12874368 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 12874377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12874383 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 12874477 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 12874485 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 12874827 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12875497 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 12875555 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 12875591 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12875756 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12876091 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12876298 C A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 12876446 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 12876571 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12877028 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 12877050 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 12877202 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 12877432 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 12877585 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 12877610 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 12877740 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 12877795 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12877860 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12877896 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 12878193 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 12878215 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12878231 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 12878571 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 12879284 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 12879308 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12879396 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 12879430 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 12879780 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12879966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12880214 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 12880236 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12880465 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 12880649 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 12880748 T A N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 3 12880774 C T Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 12880916 T A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 12880937 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 12881298 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 12881544 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 12881805 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 12881813 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 12881824 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 12881964 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 12881965 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 12882122 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12882869 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12882952 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 12882987 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 12883535 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 12883641 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 12883676 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 12883958 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 12884057 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12884209 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12884252 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 12884310 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 12884628 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 12884845 A T N N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 12885347 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12885632 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 12885691 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 12885722 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 12885725 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 12886112 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12886114 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12886128 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12886132 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12886140 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12886152 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12886188 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 12886865 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 12887186 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 12887287 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 12887474 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 12887644 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 12887801 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 12887957 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 12888154 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12888188 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 12888308 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 12888347 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 12888356 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 12888365 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 12888377 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12888404 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12888487 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 12888634 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 12888667 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12888676 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 12888736 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12888800 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12888811 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12888882 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 12888903 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 12888970 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 12888980 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 12889019 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 12889096 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12889499 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12889633 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12889652 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12889663 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12889716 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12889753 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12889764 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 12889776 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 12889903 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 12889952 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 12890102 A G N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 12890256 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 12890276 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 12890333 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12890343 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12890540 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 12890729 A C N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 12890774 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 12890780 G T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 12890787 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 12890861 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 12891027 C T N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 12891041 G A N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 12891129 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 12891130 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 12891141 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 12891188 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 12891199 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 12891204 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12891211 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 12891309 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 12891341 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12891411 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12891452 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12891552 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12891573 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12891598 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12891671 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12891681 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12891715 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 12891781 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12891794 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12891804 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12891807 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12891864 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 12891883 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 12891920 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 12891930 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 12892028 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 12892055 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 12892070 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12892474 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12892581 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 12892815 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12892853 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 12892869 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12892887 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12892951 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12892995 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12893068 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 12893183 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12893370 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12893406 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12893482 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12893527 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 12893531 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12893573 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12893575 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12893625 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12893658 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12893727 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12893763 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12893785 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12893801 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12893814 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12893820 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12893832 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12893840 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12893846 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12894044 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 12894100 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12894156 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12894165 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12894191 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12894285 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12894312 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12894349 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12894429 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12894482 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12894548 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 12894625 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12894683 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12894686 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12894763 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 12894834 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12894896 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 12894922 G T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 12894965 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 12894972 G A N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 12895225 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 12895255 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 12895346 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 12895387 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 12895395 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 12895465 G C N N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 12895466 G A N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 12895479 T G N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 12895499 G T N N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 3 12895506 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 12895516 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 12895531 C T N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 12895579 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 12895582 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 12895610 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 12895720 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 12895801 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 12895885 A C N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 12895984 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 12896039 T G N N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 3 12896057 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 12896080 A C N N 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 3 12896083 C T N Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 3 12896233 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 12896235 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 12896276 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12896284 A C N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 12896292 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 12896372 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 12896435 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 12896463 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 12896471 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 12896598 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12896624 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12896665 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12896689 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12896800 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12896811 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12896834 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12896869 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12896871 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12896892 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12897017 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12897021 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12897055 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12897066 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12897113 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12897147 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12897148 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12897166 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12897204 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 12897212 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12897308 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12897398 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12897517 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 12897575 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 12897857 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12897880 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 12897932 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12897934 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 12897995 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12898078 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 12898162 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12898211 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 12898217 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 12898242 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12898292 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12898323 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 12898353 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 12898444 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12898493 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12898498 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12898556 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 12898585 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12898612 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12898616 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 12898649 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 12898688 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 12898723 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12898766 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 12898777 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 12898818 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 12899413 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12899417 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 12899426 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 12899487 T C N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 12899517 A C N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 12899552 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 12899573 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 12899594 C A N N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 12899613 T A N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 12899752 C G N N 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 3 12899904 A C N N 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 3 12899912 T A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 12899925 T G N N 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 3 12900011 A C N N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 3 12900023 G T N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 3 12900080 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 12900104 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 12900182 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 12900374 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 12900378 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12900407 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12900507 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 12900560 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 12900577 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 12900959 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12901071 C G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 12901365 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 12901397 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 12901439 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 12901450 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 12901516 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12901572 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12901583 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12901613 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12901734 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12901834 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 12901847 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 12901875 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 12901902 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 12901922 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 12901947 G A N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 12901995 G C N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 12902021 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 12902128 T A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 12902300 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 12902401 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12909076 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 12909139 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12909178 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 12909179 T A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 12909206 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12909246 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12909407 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12909492 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12909493 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12909540 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12909652 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12909832 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 12909891 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 12909977 G A N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.0909090909090909 0.545454545454545 0.363636363636364 8 14 1 6 4 3 12909994 G C N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 12910000 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 12910344 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 12910447 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12910501 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12910516 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12910689 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 12910841 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 12910848 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 12910935 G T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 12911004 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 12911055 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 12911095 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12911111 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12911136 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12911344 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12911381 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12911469 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12911474 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12911597 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12911612 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 12911710 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12911743 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12911748 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 12911878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12911889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12911903 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12911985 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12912009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12912078 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12912089 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12912096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12912250 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12912356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12912425 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12912449 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12912509 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12912536 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12912555 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12912577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12912586 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12912651 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12912658 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 12912731 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12912741 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12912844 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12912867 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12912971 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12912978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12913026 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12913085 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12913093 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12913245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12913287 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12913306 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12913323 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12913356 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12913380 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12913421 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12913466 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12913506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12913533 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12913619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12913636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12913667 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 12913719 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12913731 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12913754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12913947 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 12914239 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12914258 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12914352 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12914561 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12914578 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12914634 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 12914637 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 12914658 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12914661 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12914736 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12914751 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12914801 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12914817 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12914837 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12914877 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12914972 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12914995 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12915000 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12915134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12915178 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12915252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12915261 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12915272 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12915354 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12915358 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12915389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12915509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12915584 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12915656 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12915694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12915744 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12915755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12915786 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12915812 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12915878 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12915907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12915932 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12915962 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 12915974 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12915992 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12915994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12916015 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12916045 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12916079 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12916186 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12916284 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12916301 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12916325 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12916370 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12916484 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 7 5 3 1 2 3 12916525 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 12916528 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 12916545 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 12916574 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 12916592 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 12916623 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 12916642 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12916670 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 12916709 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12916727 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12916966 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12916992 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12917051 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12917060 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12917109 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12917152 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12917154 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12917209 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12917217 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12917385 C A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 12917400 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 12917606 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 12917622 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 12917710 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12917800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12917914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12918020 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12918024 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12918037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12918085 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12918118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12918131 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12918181 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12918229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12918241 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12918780 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12918857 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12918935 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12919082 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12919096 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 12919350 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12919371 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12919465 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12919478 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12919568 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12919586 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 12919616 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 12919625 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 12919713 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12919750 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12919760 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12919771 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12919856 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12919977 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12919990 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 12920013 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 12920029 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 12920138 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12920145 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12920403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12920434 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12920458 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12920567 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12920580 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12920655 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 12920656 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12920775 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 12920923 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12920943 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12921096 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 12921184 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12921241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12921276 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12921316 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12921361 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12921451 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12921487 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12921507 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12921541 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12921550 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12921591 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12921701 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12921886 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12921909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12921929 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12921944 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12921970 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12922018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12922053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12922108 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12922178 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 12922267 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12922285 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 12922324 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12922345 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12922364 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12922407 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12922461 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12922503 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12922559 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12922591 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12922601 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12922719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12922746 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 12922777 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12922854 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 12922885 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 12922961 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12923038 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 12923045 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12923070 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12923077 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12923092 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12923220 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12923260 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 12923305 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12923358 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12923479 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12923501 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12923503 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 12923549 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12923564 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12923580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12923586 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 12923631 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 12923655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12923826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12923850 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12923907 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 12923917 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 12923980 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 12923995 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 12924044 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12924050 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 12924115 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12924118 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12924167 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12924178 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12924201 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12924216 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 12924243 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 12924266 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12924318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12924373 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12924412 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12924425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12924479 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12924506 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12924511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12924531 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 12924636 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12925576 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 12925613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12925622 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12925631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12925636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12925679 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12925692 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12925718 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12925777 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 12925821 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12925862 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12926008 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12926049 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12926153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12926161 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12926413 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12926422 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12926481 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 12926758 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12926916 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 12927005 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12927041 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12927094 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12927154 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 12927159 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 12927269 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12927323 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12927746 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12927802 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 12927803 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12927959 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 12927999 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12928012 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12928029 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12928151 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12928342 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 12928394 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12928612 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 12928672 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12928761 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 12928766 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 12928874 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 12928890 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 12929019 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12929072 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12930263 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 12933234 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 12936622 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 12936648 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12936656 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 12936820 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12936822 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12937178 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12937248 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 12937492 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 12937535 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 12937579 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12937642 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 12937686 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 12937702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12937782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12937809 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12937866 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 12937900 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12937925 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 12938006 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12938100 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 12938113 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12938171 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 12938212 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 12938418 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 12938464 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 12938512 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12938557 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 12938603 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 12938621 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12938678 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 12938720 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12938736 G C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 12938739 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12938782 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12938815 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12938851 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12938867 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 12938933 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12938970 G T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 12939247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12939407 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 12939471 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 12939740 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 12939877 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12940015 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 12940112 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12940149 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 12940211 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 12940222 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 12940238 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 12940240 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 12940375 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 12940442 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12940453 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12940472 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12940499 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 12940507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12940570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12940653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12940679 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12940753 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12940773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12940825 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12940846 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 12940854 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12940891 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 12940916 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 12940926 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 12941075 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 12941109 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12941254 A T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 12941263 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12941268 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12941279 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12941280 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 12941430 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12941483 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12941503 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 12941526 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 12941534 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 12941556 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 12941589 G A N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 12941636 C A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 12941651 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 12941661 C T N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 12941692 A G N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 3 12941843 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 12941853 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 12941863 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 12941865 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 12941999 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12942158 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 12942255 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12942262 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 12942295 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 12942312 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 12942315 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12942403 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 12942496 T G N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 12942507 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 12942634 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 12942653 G A N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 3 12942665 C A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 12942675 A T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 12942680 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12942710 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 12942844 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12942900 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 12942964 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 12942980 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12942994 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12943037 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12943065 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12943073 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 12943076 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 12943188 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 12943244 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12943292 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 12943627 G T N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 12943765 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 12943770 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 12943828 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 12944059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12944082 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12944191 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12944237 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 12944425 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 3 12944458 A C N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 12944473 G T N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 12944560 A G N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 12944752 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 12944796 T C Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 12944859 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 12944967 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12944971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12944982 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12945141 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12945146 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12945172 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12945390 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 12945459 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 12945473 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 12945481 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 12945562 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 12945717 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 12945738 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 12945782 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 12945903 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 12945907 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 12945928 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12945979 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 12945997 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 12946081 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 12946152 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 12946295 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 12946401 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 12946518 C G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 12946724 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 12946796 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12946910 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 12946982 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 12947117 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 12947281 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12947309 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 12947319 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 12947359 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 12947397 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 12947543 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 12947585 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 12947644 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 12947670 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 12947901 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 12947924 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 12947939 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12948006 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 12948037 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 12948062 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 12948089 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 12948118 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 12948177 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 12948203 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12948234 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12948376 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12948466 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 12948511 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 12948593 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 12948598 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 12948625 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 12948708 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 12948764 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 12948885 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 12948948 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 12948976 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 12948979 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 12949000 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 12949022 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 12949088 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 12949228 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 12949342 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 12949407 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 12949439 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 12949559 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 12949570 A G N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 3 12949635 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 12949673 G T N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 12949703 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 3 12949773 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 12949795 A C N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 12949945 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 12949950 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 12949970 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 12950122 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 12950164 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 12950169 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 12950180 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 12950203 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12950305 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 12950358 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 12950413 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 12950596 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 12950670 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 12950733 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 12950778 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12950854 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 12950868 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 12950881 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 12951012 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 12951065 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 12951188 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12951240 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 12951285 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 12951516 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 12951733 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 12951789 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 12951831 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 12951880 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 12951889 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 12952058 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 12952105 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 12952244 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 12952257 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 12952354 A T N N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 3 12952433 T C N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 12952478 G T N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 12952752 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 12952763 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 12953145 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 12953160 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 12953574 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 12953673 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 12953731 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 12953734 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 12953902 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12953952 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 12954094 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 12954222 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 12954323 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 12954505 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 12954624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12954759 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 12954925 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 12954940 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12955170 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 12955885 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 12955899 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 12955948 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 12956051 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 12956396 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 12956455 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 12956529 A C N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 12956636 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 12956653 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 12956665 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 12957105 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 12957236 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12957262 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 12957397 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12957470 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 12957613 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 12957910 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 12958241 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12958587 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12958599 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12958835 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 12959101 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12959202 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 12959340 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 12959464 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12959615 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 12959904 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12960022 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12960332 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 12960393 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12960478 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12960725 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12960756 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 12960760 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 12960770 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 12960777 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 12961074 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12961149 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 12961338 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 12961389 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 12961497 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12961667 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 12962059 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12962460 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 12962475 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12962806 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12962810 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12962837 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12963109 C T Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 12963260 A T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 12963359 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 12963418 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 12963419 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 12963439 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 12963544 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 12963567 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 12963597 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 12963638 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 12963774 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 12964077 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 12964190 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 12964251 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12964304 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 12964536 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 12964579 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 12964636 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 12964680 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 12964694 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 12964763 C G Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 12964779 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12964791 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 12964839 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 12964888 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12964902 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 12964987 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12965087 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 12965144 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12965179 C G Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 12965306 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 12965334 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12965393 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12965471 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12965610 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 12965636 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 12965654 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 12965695 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 12965723 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 12965810 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 12965861 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12965883 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12965887 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12965929 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 12966206 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 12966208 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 12966257 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 12966269 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 12966326 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 12966336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12966429 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 12966481 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 12966485 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 12966534 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12966548 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 12966608 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12966647 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 12966672 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 12966702 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 12966890 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 12966894 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 12966910 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 12966954 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 12967013 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 12967104 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12967173 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 12967330 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 12967348 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 12967664 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12967933 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 12970010 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 12970340 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 12970355 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12970669 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12971500 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 12971696 T C Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 12973504 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 12974409 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12976053 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12976176 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12976438 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 12979267 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12979543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12979578 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12979769 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 12979820 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12979880 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12980184 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12980379 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12980498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12981913 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12981966 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12982365 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12982562 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 12982654 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12982996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12983819 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12984281 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12984291 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 12984368 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12984370 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 12984521 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12986520 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 12986637 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 12992357 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 12999821 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13002168 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13002886 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13004248 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13004323 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13006836 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13007191 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 13007202 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 13007486 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13007917 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13008800 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13009615 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13011115 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13011453 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13011523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13015336 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 13015911 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13018892 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 13019578 A G Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 13020865 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13022991 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 13023752 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 13023931 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13024211 A G Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 13024219 A G Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 13024227 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 13024235 G A N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.714285714285714 0.285714285714286 10 18 0 10 4 3 13024243 G A Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 13024251 G A Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 16 20 0 16 2 3 13025926 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 13027922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13028081 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13028330 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 13029056 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13029468 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13031317 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 13032904 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13032969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13035082 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13039064 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 13039429 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13039496 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13039861 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13040529 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13041185 A C Y N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 13046104 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13046461 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13046556 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 13046851 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13048881 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13049712 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13050403 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13052149 C T Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 13053615 T A Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 13056812 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 13057205 G A Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 13057217 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 13058476 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 13068198 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 13068394 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13068572 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13069251 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 13071490 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13075187 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13075665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13075690 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13077550 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13078034 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13079025 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13079805 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 13080054 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13080219 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 13082061 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13083072 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13083260 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13085416 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13085424 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13085864 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13088299 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 13089622 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13089725 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13089966 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 13091415 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13091509 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 13093772 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13098272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13098813 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13101419 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13101587 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13101991 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13102528 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13104196 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13105841 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13107043 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13107156 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13112054 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13112824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13113554 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 13113729 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13113929 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13114190 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13114707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13115124 T G Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 13115306 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13115419 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13115618 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13116407 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 13117000 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13118084 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 13118202 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13119207 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 13121397 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13121779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13122432 T A Y N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 13122811 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13126161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13129888 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13130033 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 13131614 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13132134 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13132258 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13132614 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13133447 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13133805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13133890 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13135052 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13136260 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13136884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13137429 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 13138413 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13139872 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13140870 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13141081 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13141440 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13141472 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 13143232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13144483 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13147632 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13147710 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13148609 C G Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 13149559 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13150052 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 13150137 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13150598 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13151379 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 13152610 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13153222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13153397 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13155268 T G Y N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 3 13155294 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 13156193 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 13157845 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13159804 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13160533 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13161406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13162169 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13164495 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13164588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13166188 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13166290 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13167511 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13168350 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13171812 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13172932 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13173402 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 13174280 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 13175145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13175455 G T Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 13175676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13177047 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13178411 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 13181620 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13182048 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 13183231 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 13184293 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13184573 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13184594 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13185191 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13186723 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13187092 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 3 13187277 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13188668 G T N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 3 13188783 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13189538 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13190131 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13191132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13191932 G C Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 13193403 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13193482 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13193756 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13194334 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13194790 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13194825 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13194945 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13195569 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 13198536 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 13198910 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13199664 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13200309 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 13200622 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 13200981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13201155 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13201707 A G Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 13201720 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13202718 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 13204433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13204803 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13205112 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13205201 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13206021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13206147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13207756 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 13208017 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13208288 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13208517 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13208851 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13209936 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13210151 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13211519 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13211907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13212471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13213322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13214106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13214971 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13215393 G T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 13216430 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13216715 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13216801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13216862 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13216877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13216959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13217914 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 13218036 A C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 13218581 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13218629 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13218752 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13218830 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 13218994 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 13219203 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13219288 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 13219299 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 13226472 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 13226528 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13226637 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13226643 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13226653 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13226687 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 13226769 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 13226810 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 13226836 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 13227073 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 13227093 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 13227232 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 13227261 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 13227274 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 13227282 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 13227302 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 13227326 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 13227339 G T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 13227626 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 13227777 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 13227830 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 13227839 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 13228153 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 13228179 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 13228232 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 13228250 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 13228390 C G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 13228499 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13228531 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 13228640 C G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 13228766 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 13228813 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13229139 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 13229167 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 13229266 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 13229284 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 13229322 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 13229964 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 13230049 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13230064 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 13230158 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 13230208 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13230220 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 13230300 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 13230461 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 13230470 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 13230520 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13230665 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 13230792 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 13230829 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 13230892 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 13231356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13233079 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13234216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13235473 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13236615 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13237541 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 13237710 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13240376 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13241492 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13243656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13244577 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13244622 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13245279 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 13245419 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 13245500 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13245842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13246530 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13247431 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 13247700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13250239 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13250618 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13250882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13251837 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13252452 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13252949 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 13253648 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13256693 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13257748 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13258620 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13259058 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13260639 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13260792 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 13261728 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 13262068 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13263695 G T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 13263891 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13265472 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 13266467 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13267541 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13267602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13268474 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13270363 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13271347 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13273884 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13273945 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13274003 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 13274079 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13274089 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13274174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13274489 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13274663 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 13275435 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13277047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13277383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13278753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13281316 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 13281488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13281566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13281673 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13282585 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13282696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13283021 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 13283395 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 13284137 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13284613 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13284989 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13285300 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13286872 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 13288480 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13288695 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13288952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13289228 C A N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 0.0714285714285714 15 13 2 11 1 3 13289914 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13290002 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13290896 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 13291559 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13297173 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13297622 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13297968 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 13300478 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13302156 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13302629 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13303039 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13303248 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13303910 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13304345 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13306273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13306396 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13306641 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13307129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13307788 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 13308498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13309851 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13311576 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13313366 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13313442 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13314019 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13315396 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 13315489 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 13318768 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13319004 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13319599 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13320075 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13320146 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13320590 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13320943 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13321704 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13321783 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13322006 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13322062 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13322207 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13322224 A T N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0 0.733333333333333 0.266666666666667 11 19 0 11 4 3 13322384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13324030 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 13324090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13324393 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13324469 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13324521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13324537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13324593 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 13324666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13324706 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 13324717 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 13324793 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 13324841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13325051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13325412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13325600 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13325710 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13325723 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13325852 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13325894 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13325910 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13325995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13326016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13326136 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13326302 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13326902 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13326987 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13329224 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13329632 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13331716 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13332183 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 13332590 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13334464 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13334898 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13335350 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13336317 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 13338392 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13338920 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 13339411 G T Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 13340686 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13340747 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13341695 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 13342032 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13347175 A T N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 13347412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13348503 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 13349110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13349445 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 13350221 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13350741 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13350880 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13352047 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13352339 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13362902 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 13363053 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 13363139 A C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 13363267 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13367479 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 13368676 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 13368730 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13368977 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13369111 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13369339 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13369441 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13369964 C T N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 3 13370277 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13370327 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13370542 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13370765 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 13371440 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13372688 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13372903 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13373048 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13379885 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 13380089 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13380350 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 13380358 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13380507 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13382356 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 13382733 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13382881 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 13384361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13384726 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13385367 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 13386163 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13386287 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13386835 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 13387003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13387147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13387566 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 13388405 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 13388419 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 13388435 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 13389554 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13391316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13393131 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13393219 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13394143 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13394485 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 13394676 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13394752 G A Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 13394802 A G Y Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0 0.545454545454545 0.454545454545455 6 16 0 6 5 3 13394898 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13395135 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13395966 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 13396026 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 13396401 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 13397595 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 13397826 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 13397864 C A N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 13397982 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13398195 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13398358 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 13398827 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 13398923 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13398924 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 13399969 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 13400223 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 13400400 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 13400543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13400551 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13400733 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 13401032 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13401086 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 13401090 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13401420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13401866 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13401868 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 13401988 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13402098 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13402371 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 13402400 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13402451 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13402792 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13402889 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13403619 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13404011 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13404492 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 13404513 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 13404876 A G N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 13405004 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13405223 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 13405719 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13405752 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13405844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13405851 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 13405950 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 13405969 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 13406264 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 13406387 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 13406691 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13407074 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 13407185 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13407252 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 13407780 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13407849 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 13407881 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 13408065 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 13408146 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 13408372 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 13408387 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 13408425 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 13408464 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 13408598 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 13408682 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 13408699 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 13408867 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 13408889 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 13409011 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 13409027 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13409238 C G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 13409303 A T N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 3 13409473 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 13410160 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13414715 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13414878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13415030 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13415050 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13415930 C T Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 13420739 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 13422790 T A Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 13423035 C G Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 13423521 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13423536 G A Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 3 13423652 A C Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 13424160 C A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13424308 C G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13424587 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13424597 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13424667 C G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 13424877 G T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 13425417 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13425623 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 13425879 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13426226 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13426227 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13426332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13426890 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13427986 C A Y N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 13428189 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 13429435 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13429805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13432425 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13433342 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 13433470 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 13433474 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 13433879 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13434560 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13435088 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13435460 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13436486 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13439326 T A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 13440933 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13441530 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13441565 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13444010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13444410 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 13444516 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13445696 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13446807 A G Y Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 3 13446822 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 13446852 C T Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 13447104 C T Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 13447292 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 13447419 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13448135 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13448171 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13448428 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13448682 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13448781 G T Y N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 13448785 A T Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 13448844 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13449592 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 13451135 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 13451302 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 13451650 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 13451817 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 13452272 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 13452516 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13453168 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13453187 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13453608 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13453670 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 13455170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13455353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13455605 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13456197 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13456253 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13456401 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13457668 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13458520 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 13462185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13465475 C A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 13466031 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13467502 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 13469529 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13471954 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13472326 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13473758 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13473842 A C N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 13473927 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13476372 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13476833 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13477266 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 13477717 C G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 13478828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13479528 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13482382 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13484658 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13486274 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13486908 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13487519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13491524 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 13492261 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13494096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13496167 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 13500299 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13504374 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 13505293 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13507350 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 13508010 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13508086 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13510606 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13511738 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 13511857 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13511894 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13513232 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 3 13514081 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13514627 G A N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 3 13515124 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13517942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13519627 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13519717 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 13521035 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 13521113 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 13527248 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13527504 T G Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 13527721 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13528741 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13528816 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13528954 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 13528995 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13529285 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 13529398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13529425 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13529430 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13529654 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13529869 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 13529876 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 13530156 T A N N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.636363636363636 0 0.363636363636364 14 8 7 0 4 3 13530223 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 13530270 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 13530296 G A N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.25 17 7 8 1 3 3 13530337 G A N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.583333333333333 0.0833333333333333 0.333333333333333 15 9 7 1 4 3 13530346 G A N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.615384615384615 0.0769230769230769 0.307692307692308 17 9 8 1 4 3 13530419 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13530456 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13530469 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 13530505 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 13530518 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 13530563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13530823 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13530954 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 13531183 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 13531244 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 13531409 T A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 13531524 A C N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 13531802 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13531928 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13532000 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13532289 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 13532336 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13532484 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13532582 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 13532668 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13532836 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 13533044 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 13533142 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 13533273 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13533282 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 13533310 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 13533407 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 13533780 G T N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 13533917 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13533918 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13533931 T A N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 13533951 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 13534051 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 13534099 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 13534110 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 13534228 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 3 13534258 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 13534325 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 13534452 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 13534543 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13534647 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13535156 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13535376 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 13535454 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 13535464 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13535781 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 13535959 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 13535963 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 13536164 T C Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 13536271 A T N N 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 3 13536373 G T N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 3 13536485 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 13536494 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13536588 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13537049 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 13537372 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13537373 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13537454 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13537566 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 13537593 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13537699 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13538128 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13538265 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13538301 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13538954 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 13539055 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 13539307 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 13539375 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13539473 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 13539683 T A N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 13539811 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 13540175 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 13540215 C T N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 3 13540267 T G N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 13540324 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 13540543 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 13540653 G T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 13540978 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13541001 C G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 13541068 A T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 13541086 A C N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.153846153846154 0.538461538461538 0.307692307692308 11 15 2 7 4 3 13541110 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 3 13541309 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 13541313 C G N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 13541488 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 13541510 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 13541846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13541953 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 13544541 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13545518 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 13546147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13548212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13549111 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13552055 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13552612 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 13554600 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13556113 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13557166 T C Y Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.363636363636364 0.636363636363636 0 15 7 4 7 0 3 13557530 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13559682 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13559830 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13559832 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 13559927 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13561177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13561241 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13562181 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13568975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13569117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13569483 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13569486 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13569909 A T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 13569982 C T N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 13570216 C A N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 13570499 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13570586 C A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 13570624 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13570664 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13570761 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 13570916 T A N N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 3 13571005 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 13571117 A T N N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 12 10 1 10 0 3 13571152 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 3 13571167 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 13571224 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13571233 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13571491 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 13571498 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 13571754 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 13574136 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13575752 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 13575806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13576780 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13578024 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13578769 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13584487 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 13584549 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 13584710 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 13584751 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 13584775 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 13584899 C T N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 13585129 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 13585405 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 13585735 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 13585753 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 13585772 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 13585774 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 3 13585790 A G Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 13585843 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13585862 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 3 13586538 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13586588 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 13586738 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 13586846 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 13586874 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 13587115 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 13587219 G A N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 13587502 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 3 13587543 T G N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 13587856 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 13587891 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 13588069 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 13588322 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 13588531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13590588 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13591110 T A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 13591483 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 13592250 T C N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 3 13592396 C A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 13592621 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 13592675 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13592708 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 13593083 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13593910 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13594734 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13596204 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13596600 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 13596679 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 13596733 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13596775 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 13596893 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 13597153 G C Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 13597908 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 13597972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13598176 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 13599181 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 13599425 A G N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 3 13599509 A C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 13599665 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 13600173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13600843 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 13601483 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13601668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13601917 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 13601997 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13603016 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 13603508 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 13604603 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 13605656 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13605823 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13606756 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 13607138 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13607293 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13607316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13607586 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13608916 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13609298 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 13610677 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13610811 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13611378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13611781 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13612017 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13613404 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13613489 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13614695 C A Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 13614838 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13615167 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13615836 A G Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 13616628 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13616866 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 13617881 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13617940 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13618370 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 13618529 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13618875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13619118 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13619194 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13620681 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13620754 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13620767 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 13620888 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13621390 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13624182 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 3 13624220 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 13624490 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 13625878 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13626154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13626262 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13626533 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13627476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13628447 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13629395 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13629818 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13630213 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 13630531 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13630997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13632265 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 13632373 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 13633100 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 13633516 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 13633646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13633847 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 13634052 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13634109 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13635465 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13637535 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13638659 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13642569 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13643233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13643326 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13643380 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13643683 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13645608 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13646444 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13648204 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 13648236 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13648264 C G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 13648766 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 13648810 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13649040 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 13649045 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 13649307 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 13649417 T C N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 3 13649675 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13650802 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 13650863 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 13650866 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 13650930 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13650949 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 13651106 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 13651300 C G N N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.333333333333333 0.583333333333333 0.0833333333333333 15 9 4 7 1 3 13651301 A G N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.333333333333333 0.583333333333333 0.0833333333333333 15 9 4 7 1 3 13651361 A C N N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.111111111111111 0.777777777777778 0.111111111111111 9 9 1 7 1 3 13651739 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 13651923 C A Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 13652585 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 13652997 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 13653138 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 13653204 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 13653216 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 13653483 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 13653494 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 13653521 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13653655 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 3 13653896 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 13654021 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 13654027 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 13654471 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13654653 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 13654657 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 13654753 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 13654923 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 13654999 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 13655152 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13655781 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13655912 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13656022 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13656503 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13656622 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13656858 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 13657217 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 13657608 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 13657726 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13657735 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13657864 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13658288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13658593 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13658621 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 13658654 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 13658707 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 13658764 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 13659021 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 13659024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13659177 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 13659256 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 13659383 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 13659850 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 13660350 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13660631 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13660678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13663876 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13663924 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13664358 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 13664636 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 13664664 A G N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 3 13665004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13665232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13665991 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13666625 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13667111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13667508 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13667719 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 13667824 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 13668406 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13668546 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13668705 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 13669226 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 13669299 A T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 13669500 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 13670165 A G Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 13670517 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13670526 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13670854 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13671534 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13671862 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 13672127 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13672335 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 13672357 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 13672497 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 13672554 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 13672651 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 13672654 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 13672670 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 13672689 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 13672796 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 13672814 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 13672854 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 13672885 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 13673084 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13673116 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13673147 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13673222 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13673229 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13673270 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13673412 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 13673684 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 13673789 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 13673808 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 13673855 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13673868 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13673892 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 13673944 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13674127 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13674152 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13674168 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13674172 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13674225 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 13674235 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 13674297 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 13674577 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 13674675 T A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 13674740 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 13674758 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13674799 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 13674827 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 13674840 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 13674884 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 13675368 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 13675624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13675668 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13676012 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 13676171 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13676566 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 13676576 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 13676577 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 13676623 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 13676629 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 13676678 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13676885 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 13676892 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 13677206 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13677436 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13677442 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13677447 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13677614 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 13678310 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13678591 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 13679114 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 13679119 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 13679153 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 13679175 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 13679235 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 13679247 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 13679449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13679553 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 13679554 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 13679567 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 13679592 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 13679857 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13679991 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 13680012 C A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 13680039 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 13680079 A C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 13680089 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13680396 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 13680601 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13680900 T A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 13681316 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13681421 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 13681441 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 13681644 C G Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 13681666 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 13682053 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 13682285 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 13682477 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 13682484 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13682692 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 13682698 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13682772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13682870 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 13683255 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 13683266 T G Y N 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 6 8 1 4 2 3 13683527 G T N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 13683580 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 13683652 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 13683731 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 13683743 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13683814 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13683827 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 13684585 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13684731 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13685081 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13685793 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 13686562 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13686918 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13687061 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13687702 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 13687745 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 13687768 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 13688018 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13688637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13689206 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13689373 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 13689387 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13689441 C G Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 13689459 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 13689615 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 13689641 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 13689649 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 13689697 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13689735 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 13689746 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 13689850 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 13689871 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 13689879 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 13689908 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 13689922 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 13690124 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 13690185 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 13690250 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 13690319 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 13690380 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 13690596 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 13690799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13691018 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13691141 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 13691250 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 13691305 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 13691431 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 13691433 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 13691527 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 13691559 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13692151 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 13692180 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 13692246 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13692319 G C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 13692322 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 13692440 A G Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 13692476 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 13692568 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 13692594 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 13692922 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13693229 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 13693305 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 13693307 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 13693319 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 13693330 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 13693336 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 13693348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13693364 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 13693369 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 13693487 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 13693495 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 13693558 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 13693614 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 13695266 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13695296 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13696169 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 13696787 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 13696788 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13696801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13697037 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 13697040 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 13697063 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13697068 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13697075 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 13697255 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13697400 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 13697406 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 13697433 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13697469 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 13697489 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 13697534 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13697617 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13697730 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13697768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13697856 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13698144 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13699426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13699736 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 13699740 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 13699996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13700018 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13700053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13700070 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13700345 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13700420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13701340 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 13701484 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 13701556 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 13701699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13701732 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13702013 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 13702022 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 13702039 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13702343 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13702396 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13702502 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13702861 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 13702913 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 13702937 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 13703017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13703059 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13703099 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 13703136 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13703143 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 13703192 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 13703275 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13703285 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 13703495 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13703536 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13703596 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 13703657 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13703765 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 13703791 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13703822 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 13703988 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 13704003 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13704101 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 13704401 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 13704508 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 13704526 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13704584 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 13704719 C A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 13704799 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13704969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13705077 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13705211 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 13705230 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13705256 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13705355 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13705395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13705401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13705518 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13705519 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13705535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13705636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13705689 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13705745 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13705754 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13705850 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13705853 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13705871 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 13705935 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 13706235 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13706528 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13706578 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13706698 T A N N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 13706768 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 13707067 T A N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 13707122 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 13707203 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 13707207 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 13707327 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 13707472 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 13707742 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 13707868 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 13708027 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13708118 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13708133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13708558 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 13708786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13708921 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 13708930 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13708975 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 13709122 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13709124 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13709155 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13709268 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 13709304 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13709458 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 13709459 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 13710351 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 13710510 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13710640 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 13710716 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 13710989 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13711049 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13711056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13711064 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13711085 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13711309 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13711695 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13711914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13711991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13712077 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 13712093 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 13712967 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 13713750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13714138 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13715842 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13715930 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13716734 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 13716901 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13717778 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 13717823 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13718188 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 13718243 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 13718302 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 13718386 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13718550 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13718585 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 13718906 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13719147 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 13719215 T A N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 13719468 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 13719580 T C N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 13719638 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 13719644 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 13719863 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 13720091 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 13720128 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13720247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13720321 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13720378 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 13720432 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 13720567 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 13720669 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13720868 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13720888 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13721122 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 13721213 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13721215 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13721233 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13721390 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13721543 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13721611 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13721622 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 13721809 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13721920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13721933 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13722011 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13722031 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13722034 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 13722142 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 13722262 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 13722264 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 13722302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13722313 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 13722816 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13722964 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13723472 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 13723564 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 3 13723731 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13723741 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13723793 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 13723872 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13723906 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13724158 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 13724254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13724559 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13724747 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 13725036 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 13725181 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13725256 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13725770 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13725837 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 13725896 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 13726061 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13726282 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 13726440 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 13726518 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13726998 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13727643 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 13727672 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 13727715 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 13727733 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13727790 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 13727872 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 13728037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13728048 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 13728050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13728230 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 13728381 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 13728429 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13728492 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13728737 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 13728936 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 13729934 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 13730059 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13730539 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 13730596 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 13730671 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 13730683 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 13730895 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 13731071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13731095 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13731151 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 13732999 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13735266 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13735403 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13736867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13736874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13736929 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13737273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13737356 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 13737405 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 13737420 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13737485 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13738484 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13738726 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13741846 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13741847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13743437 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 13743546 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 13743638 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 13743701 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13743778 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 13744186 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13744366 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 13744439 T C Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 13745343 T A N N 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 2 4 1 0 2 3 13745421 A C N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 13745600 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 13745825 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 13745833 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 13745945 T A N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 13746248 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 13746333 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13746336 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13746858 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13747019 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 13747053 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 13747211 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 13747235 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 13747343 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 13747536 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 13747732 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 13747822 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13747893 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 13747970 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 13748076 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 13748092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13748824 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 13750135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13750261 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13750286 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 13750549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13750711 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 13750717 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13750749 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13750964 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 13751246 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 13751353 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 13751441 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 13751506 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 13751648 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13751974 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13752261 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 13752283 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13752307 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 13752543 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 13752632 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13752812 C T N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 3 13753388 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 13753415 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 13753508 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13753557 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 13753938 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13754029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13754046 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 13754141 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 13754345 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 13754517 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 13754829 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13754955 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 13755262 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 13755482 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13755510 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13755531 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13755625 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13755689 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13755730 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 13756027 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 13756071 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 13756078 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 13756194 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13756212 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13756757 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13757959 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13758195 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13758617 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 13758631 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13758649 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 13758693 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 13758712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13758763 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 13758923 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13759024 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13759075 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13759105 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13759156 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13759177 T G N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 13759231 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13759258 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 13759568 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 13759574 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13759687 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 13759689 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 13760015 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 13760427 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 13761017 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 13761255 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13761266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13761319 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13761660 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 13761937 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13762107 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 13762535 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 13762562 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13762712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13762715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13767760 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13768072 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 13768141 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 13768455 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13769284 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 13769832 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 13769899 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 13772255 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 13774076 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13774681 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 13775999 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13776875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13782106 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13783048 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 13786524 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 13787129 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13787338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13789645 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13790109 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 13795273 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 13795499 G C Y N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 13795515 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 13797322 G C Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 13797330 T G Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 13797899 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 13800451 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13801882 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 13801888 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 13801965 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13804404 T A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 13805081 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13806326 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13806347 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13815749 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 10 22 4 2 10 3 13817036 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 13817097 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 13817266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13817291 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13817394 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 13817941 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 13817961 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 13817995 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 13818021 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 13818049 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 13818079 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13818319 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 13818348 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 13818362 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 13818393 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 13818402 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 13818413 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 13818483 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 13818872 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 13818900 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 13819023 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13819122 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 13819171 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 13819663 A T Y N 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 6 8 0 6 1 3 13819880 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 13819916 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 13819932 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 13819960 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 13819991 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 13820028 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 13820082 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13820106 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 13820169 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 13820212 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13820226 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13820290 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 13820547 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 13820592 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 13820717 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 13820748 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 13820822 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 13820868 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 13821097 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 13821129 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 13821178 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 13821182 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13826571 T A N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 13826695 T A N N 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 5 9 2 1 4 3 13826712 G T N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 13826841 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 13826914 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 13827308 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 13827357 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 13827483 C T N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 13827716 A G N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 3 13827943 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 13828250 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 13828330 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 13828356 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 13828357 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 13828492 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 13828565 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 13828633 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13828696 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 13828789 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 13828818 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 13828902 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 13828924 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 13828927 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 13829047 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 13829052 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 13829134 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 13829148 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 13829265 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 13829275 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 13829522 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 13829559 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 13829575 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 13829609 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 13829619 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13829637 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 13829797 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 13829932 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 13830132 C T N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.545454545454545 0.181818181818182 0.272727272727273 14 8 6 2 3 3 13831153 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 13831206 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13831526 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 13832493 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13832890 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 13834083 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13836244 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13837499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13837590 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13837897 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 13838355 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 13838667 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 13838672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13839171 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13839875 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 13840073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13840428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13840440 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 13840468 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13841650 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13842495 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13843975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13844372 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 13844889 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13844891 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13845736 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13845741 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13846410 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13847083 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13848170 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 13848779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13849429 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13849439 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13849557 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13849769 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 13850154 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 13850261 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13851150 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13851263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13851379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13851841 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 13851988 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 13853065 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13853307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13853323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13853507 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 13854119 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13854781 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13854976 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 13855272 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13855931 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13857173 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13857221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13857232 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 13858340 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 13858646 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 13858801 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 13858821 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 13858926 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 13858940 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13858983 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 13858984 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 13859039 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 13859472 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 13859688 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 13860809 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13860966 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13861229 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13861270 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13863332 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13863494 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13863604 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 13863711 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13863953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13864842 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13865087 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 13866988 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13867114 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 13867371 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 13868367 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13868462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13869545 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13870558 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 13871414 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 13871565 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 13871602 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13871680 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 13871697 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13872158 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 13872311 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13872752 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 13873470 A T N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.4 0.0666666666666667 0.533333333333333 13 17 6 1 8 3 13873526 A T Y N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 13873609 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 3 13873728 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 13873806 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 13873835 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 13873839 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 13873881 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 13873887 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 13873911 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 13873919 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 13873940 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 13874024 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 13874125 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 13874152 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 13874213 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13874224 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 13874281 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 13874360 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 13874630 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 13874674 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 13874890 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 13874922 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 13875026 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 3 13875104 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 13875221 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 13875255 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 13875287 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 14 26 6 2 12 3 13875320 T A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 3 13875321 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 13875343 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 13875359 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 13875438 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 13875445 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 13875484 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 13875550 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 13875571 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 13875583 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 13875630 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13875707 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 13875715 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 13875747 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 13875748 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 13875808 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 13875933 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 13875981 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 13876046 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 13876101 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 13876167 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 13876369 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 13876459 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 13876538 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 13876615 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 13876812 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 13876819 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13876992 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 13877043 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 13877703 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 13877759 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 13877786 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 13877830 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 13878114 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 13878344 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13878616 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 13878665 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 13879098 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 13879309 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13879477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13879529 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 13879556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13879639 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 13879731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13879902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13879959 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13880061 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13880151 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 13880177 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13880371 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13880423 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 13880511 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 13880794 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 13880869 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 13880870 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 13880943 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13881282 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 13881380 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 13881413 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13881427 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 13881607 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 13881727 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 13881968 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 3 13882035 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 13882051 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13882139 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13882158 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 13882167 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13882177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13882221 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13882229 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 13882288 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 13882421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13882500 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 13882542 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 13882597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13882681 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 13882690 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 13882771 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 13883156 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13883199 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 13883246 C T N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 13883332 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 13883486 T G Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 13883502 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 13883559 T C Y Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 13883584 T C Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 13883592 A T Y N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 13883606 A C Y N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 13883643 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 13883801 A G Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 13890570 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 13890695 G A Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 13890766 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 13890906 T C Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 13891388 A C N N 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 12 4 5 2 1 3 13891470 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 13891589 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 13891654 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 13892130 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 13892144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13892173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13892280 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13892302 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13892304 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13892318 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 13892361 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13892522 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 13892538 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 13892683 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13892702 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 13892741 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13892821 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 13892878 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 13892913 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13892945 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13892952 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 13893008 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 13893040 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13893142 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 13893149 T A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 13893197 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 13893256 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 13893484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13893574 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 13893679 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13893723 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 13893757 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13893820 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 13893845 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13893958 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 13893999 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 13894161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13894205 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13894405 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 13894850 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 13895212 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 13895221 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 13895281 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13895425 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 13895505 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 13895566 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13895666 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13895686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13895709 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13895719 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 13896382 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13896570 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13896622 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 13896796 G C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 13897892 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 13898088 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13898683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13899228 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13899314 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13899438 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13899497 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 13899616 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13900514 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13901022 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13901841 T G Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 13901945 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13902124 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13902608 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13904098 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 13904160 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13904390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13904626 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 13905017 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 13905138 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13905567 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13905867 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13905995 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13906232 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13906508 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 13906533 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 13906663 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 13906721 C A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 13906810 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13906842 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13906888 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13906914 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13906919 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13907247 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 13907962 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13908311 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13908649 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13908964 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13910699 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13913321 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13914125 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 13915442 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13915459 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13915494 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 13918678 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13919477 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 13919994 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 13920009 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 13920034 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 13920143 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 13922537 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 13922586 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13922616 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13922754 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 13923532 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13923605 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13923626 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 13923851 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 13924057 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 13924068 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 13924527 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 13924542 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13924653 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 13924654 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 13924716 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 13924871 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 13924880 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 13924888 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 13925030 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 13925093 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 13925205 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 13925242 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 13925544 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 13925579 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 13925595 G T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 13925632 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 13925757 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13925795 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 13925796 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 13925860 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 13925926 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13926055 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 13926117 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 13926174 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13926179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13926227 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 13926277 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 13926324 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 13926348 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 13926384 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 13927145 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 13927264 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13927302 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13927403 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 13927405 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13927757 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 13927865 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 13927880 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 13927952 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 13928012 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 13928200 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13928610 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13928723 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 13929117 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13929180 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 13929296 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 13929331 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 13929400 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 13929508 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 13929602 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 13929675 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 13929942 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 13929973 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13930325 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13930378 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 13930668 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 13930673 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 13930710 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 13930859 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 13930892 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 13931063 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13931076 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13931144 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 13931190 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 13931246 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 13931320 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 13931407 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 13931461 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 13931776 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13931859 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 13931908 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 13931989 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 13932174 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 13932291 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 13932589 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 13932655 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 13932673 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 13933282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13933771 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13934180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13934477 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 13934689 T A Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 13934695 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 13934711 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 13934732 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13934735 G C Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 13934751 A G Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 13934767 G T Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 13934795 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 13934831 G T Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 13934845 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 13934861 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 13935189 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13935218 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13935483 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 13935522 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 13935601 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 13935670 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 13935884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13936104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13936217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13936259 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 13936315 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13937417 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13937533 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13938346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13938657 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13940116 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 13940483 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13941778 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 13943596 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13943841 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 13943948 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13944195 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13944209 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13944302 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13944583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13944707 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13945595 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 13946015 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 13946667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13947537 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 13947624 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 13947829 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13948343 C T Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 13948504 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 13949345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13949997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13950009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13954268 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13955138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13955886 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 13956953 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13956992 C T Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 13957603 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13958565 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13958721 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13960826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13961740 C A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 13962081 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 13963922 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13965564 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13972129 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 13972210 C A Y N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 13972956 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 13973882 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13974589 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13974788 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13976830 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13976883 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13977321 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13977459 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13977860 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13978629 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13979038 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13981063 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13982891 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13983403 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13984447 C G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 13984849 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13985665 T C Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 13986587 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 13988560 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13989659 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13991001 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13991039 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13991677 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13992243 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 13993203 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13995582 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13996001 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 13996033 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13996667 A G N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.181818181818182 0.454545454545455 0.363636363636364 9 13 2 5 4 3 13996962 G C N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 13997353 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 13997354 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 13997616 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13997985 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 13998041 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13998319 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 13998428 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 13998625 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 13999203 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14000981 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 14001326 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14002087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14002120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14003183 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 3 14003335 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 14003518 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 14003807 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 14004411 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 14004458 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 14004574 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 14004927 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14007201 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 14007254 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 14007255 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 14007283 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 14007301 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 14007447 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 14007500 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 14007533 T G Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 14007623 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 14007656 T C Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 14007732 T A Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 14007774 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 14007798 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 14007902 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14007921 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 14007949 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 14008032 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 14008066 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 14008140 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 14008320 G C Y N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 14008769 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 14009016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14009321 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14009322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14009578 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 14009596 T C Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 14009638 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 14009654 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 14009728 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 14009751 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 14009878 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 14009946 A C Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 14010085 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14010373 A G Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 14010475 T C N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 3 14010677 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 14010919 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 14010939 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 14011022 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 14011635 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 14011948 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14012192 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 14012313 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 14012453 C A Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 14012626 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 14012643 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 14012733 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 14012771 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 14012782 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 14012993 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 14013038 C G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 14013081 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 14013503 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14013843 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14013898 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 14013993 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 14014041 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 14014042 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 14014259 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 14014373 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 14014695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14015331 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 14015544 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 14015889 G A N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 3 14016096 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 14016156 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14016275 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 14016388 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 14016488 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 14016554 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 14016693 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14016810 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 14016864 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 14016904 G C N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 14016927 T C N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 3 14017202 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 14017237 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 14017397 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 14017416 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 14017428 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 14018154 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 14018356 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14018823 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 14019694 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14019922 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 14020203 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 14020812 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 14021005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14022491 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14022940 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 14023070 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14023450 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 14023529 T C Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 14023558 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 14023575 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 14023618 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 14023719 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 14023805 G C Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 14023840 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 14023955 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 14024012 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 14024047 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 14024121 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 14024246 A G Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 14024493 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 14024694 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 14024868 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 14024991 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 14025361 A G Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 14025578 C A Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 14025732 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14025845 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 14025947 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 14026764 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 14026927 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 14026942 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 14027335 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 14027395 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14027488 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 14027521 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 14027624 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14027672 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 14027758 G C Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 14028042 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 14028328 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 14028446 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 14028585 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14028640 G T Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 14028644 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 14028756 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 14028858 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 14029370 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14032886 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14036153 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14037090 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14039573 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14041346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14041771 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14041787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14043896 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 14044082 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14044331 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14044386 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14045744 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14045830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14045969 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14049198 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 14051475 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14053979 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 14055405 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 14056178 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 14056187 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14056657 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14056663 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 14056698 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14057852 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14059900 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14060356 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14060569 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14061022 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 14062938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14063301 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 14063398 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14063786 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14063805 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14063824 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14065087 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 14066843 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14067367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14067750 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14071161 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14072282 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14072487 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 14073470 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14074798 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14075817 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14077420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14077634 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14080662 G T Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 14081475 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 14082434 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 14082533 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14083188 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14086999 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 14087571 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 14087778 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 14088369 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14090282 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14090963 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 14091580 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14093768 A C Y N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 14093804 A G Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 14093880 G T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 14093901 A G Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 14094556 G A Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 14094771 C T N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 14094776 T G N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 14094789 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 14094793 A T N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 14094806 T A Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 14094809 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 14094854 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 14095124 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14095251 C T Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 3 14095275 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14095693 G A Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 14095823 A T N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 3 14095864 C T Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 14095868 C A Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 3 14095925 C G Y N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 3 14095971 C T Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 3 14095992 T A Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 3 14097737 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14099568 A T Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 14099573 C A Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 14100337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14100345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14100513 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 14100819 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 14101068 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 14101570 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14101708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14103610 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 14105640 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14106013 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14106202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14107550 A C Y N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 14108066 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 14108757 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14110683 T A Y N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 14112391 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14112472 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14114366 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 14115562 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14115563 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14117215 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 14117532 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 14118129 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14118468 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14119910 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 14122365 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14123028 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14126620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14128298 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 14128831 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14129342 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14129383 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14129748 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14130256 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14131308 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14131571 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14131619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14131865 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 14131979 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14132026 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 14132247 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14132961 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 14133839 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14134903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14137702 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14138366 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14140790 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14140970 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14142502 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14142870 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14142885 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 14142916 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14143602 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 14143607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14144119 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14144476 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 14144698 C A Y N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 3 14144887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14144949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14145280 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 14145576 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 14145972 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 14146018 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14146056 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 14146243 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 14146245 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 14146622 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 14146684 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 14146768 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 14146796 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 14146930 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14146938 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14147385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14147429 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 14147528 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 14147549 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14147726 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 14147787 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 14150225 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14150334 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14150486 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14151078 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 14152086 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 14153393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14154671 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14155706 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 14155717 A T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 3 14155730 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 14155888 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 14155924 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 14155925 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14156008 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 14156036 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 14156048 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 14156070 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 3 14156106 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 14156114 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 14156231 C A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 14156233 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14156244 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 14156301 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 14156901 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 14157013 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 14157209 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14157249 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14157335 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 14157376 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 14157462 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14157569 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 14157611 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 14158256 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 14158501 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14158716 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14159515 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 14159532 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 14159538 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 14159595 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14159675 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 14159699 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 14159745 T C Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 14159776 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 14159813 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 14159842 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 14159853 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 14159911 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 14159947 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 14159956 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 14159989 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 14160080 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 14160110 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 14160217 A C Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 14160284 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14160354 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14160422 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14160469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14160685 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14160736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14160838 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14160845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14160877 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14160893 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 14160919 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 14161027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14161061 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14161118 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14161201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14161221 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 14161238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14161349 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14161433 A C Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 14161436 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14161481 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 14161495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14161504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14161536 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14161576 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14161620 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14161624 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 14161778 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 14161782 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 14161811 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 14161954 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 14162083 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 14162193 A C Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 14162269 G T Y N 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.428571428571429 0.142857142857143 0.428571428571429 7 7 3 1 3 3 14162292 A C Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 14162331 T G Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 14162444 A C Y N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 3 14162466 C A Y N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 3 14162593 A G N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 14162646 T A N N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 14162933 G T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 14162984 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14163062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14163101 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14163243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14163260 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14163294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14163358 G T Y N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 3 14163382 G A Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 14163384 G A Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 14163435 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 14163436 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 14163455 G C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 14163465 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 3 14163510 A T Y N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 14163511 G T Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 14163561 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14163639 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 14164061 C A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 14164096 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 14164202 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 14164218 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 14164222 A T N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 14164240 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 14164243 T G Y N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 14164411 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 14164577 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14164630 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14164746 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14164769 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14164802 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14164856 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14165197 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 14165218 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 14165235 G T N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0 0.769230769230769 0.230769230769231 10 16 0 10 3 3 14165258 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 14165283 G A N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 3 14165338 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14165436 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14165547 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14165549 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14165575 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14165604 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14165608 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 14165650 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 14165703 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14165750 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 14165751 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 14165797 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 14165829 T C Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 14165897 G T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 14166008 T A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 14166174 C T Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 14166181 T G Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 14166222 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 14166249 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14166256 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 14166287 G C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 14166753 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 14166788 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 14167005 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14167020 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 14167138 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14167160 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14167209 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14167240 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14167415 T C Y Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 10 6 3 4 1 3 14167505 G A Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 14167506 C T Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 14167531 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 14167535 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 14167562 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 14167616 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 3 14167678 A T N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 14167774 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 14167780 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 14167800 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 14167857 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 14167860 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 14167885 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 14167904 C G N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 14168045 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 14168101 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 14168249 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14168304 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14168380 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14168407 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 14168459 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 14168501 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14171630 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 14171945 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14173220 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14175171 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 14175666 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 14176250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14176590 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14176615 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14177018 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14177519 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 14178239 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14180314 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14180376 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14180387 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14183090 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14183260 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14185543 T A N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 14186121 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14186157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14186249 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14186981 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14187045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14188108 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 14188894 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 14189416 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 14191071 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 14191246 A C N N 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.25 0.333333333333333 0.416666666666667 10 14 3 4 5 3 14191262 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 14191394 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 14191688 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 14191703 T C N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 3 14192031 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 14192258 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 14192530 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 14193809 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14194838 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14194932 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14195270 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 14196898 G A Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 14197104 T G Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 14197507 G A Y Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 14198554 A G Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 14200088 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 14201010 T C Y Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 14201180 T A Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 14201952 G A Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 14202323 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14203078 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14205229 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14205588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14205875 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 14206174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14206349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14209031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14209675 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14211598 A T Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 14211914 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 14212843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14213066 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 14213609 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14214172 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 14215030 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14215716 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14215745 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14215781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14216449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14218963 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14220669 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14221025 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14221637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14222291 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 14225931 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14226061 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 14226723 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14230014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14230069 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14230230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14231872 C A Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 14232848 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14242969 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 14244685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14244702 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14244822 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14245166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14246261 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 14246622 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 14247175 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14247390 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14247635 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 14247761 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 14247860 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 14248738 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14248964 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14249922 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14251033 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14251412 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14251631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14251886 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14252426 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14252964 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 14254575 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14255137 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 14257033 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 14258599 T G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 14258878 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14259017 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14259164 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 14259177 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14259544 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14261328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14262530 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14262897 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14265009 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14267511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14267624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14269155 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 14276236 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14276714 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14276793 G A Y Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 9 15 3 3 6 3 14278916 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 14279487 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 14279755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14279947 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 14280542 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14280807 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14280908 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14280952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14281015 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 14281036 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 14281173 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14281296 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14281315 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14281333 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14281773 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14281801 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14281846 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14281882 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14282030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14282056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14282145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14282166 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14282319 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14282401 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14282422 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14282438 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14282578 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14282640 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14282655 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14283497 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14285227 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 14285386 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14288351 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 14289881 A C Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 14290015 C A Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 14302719 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 14303198 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14310818 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 14312710 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 14312717 T G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 14312789 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 14312916 C T N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 3 14312926 T C N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.0769230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 9 17 1 7 5 3 14312981 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 14312998 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 14313009 G T N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 14313027 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 3 14313068 G A Y Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 3 14313108 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 14313123 T C N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 3 14313177 G A Y Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 3 14313185 T A Y N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 3 14313200 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 14313236 T G Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 14313250 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 14313301 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 14313933 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 14314043 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 14314080 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 14314224 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 14314245 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14314393 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 14314436 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 14314442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14314470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14314666 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 14314776 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 14314787 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 14314821 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 14314838 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14314868 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14314880 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 14314959 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 14314974 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 14315031 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 14315079 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 14315091 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 14315145 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 14315174 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 14315194 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 14315213 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14315229 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 14315343 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 14315351 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14315365 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 14315378 T C Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 14315426 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 14315451 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14315526 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14315637 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 14315676 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 14315702 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14315758 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 14315919 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 14315947 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 14316182 C T Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 14316245 C A Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 14316484 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 14316488 A G Y Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 14316554 T C Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 14316559 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 14316652 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 14316662 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 14316692 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 14316794 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 14316813 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14317086 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 14317151 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 14317166 G T Y N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 3 14317469 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14317473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14317481 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14317550 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 14317881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14317895 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14318199 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14318204 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14318317 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 14318361 C G Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 14318510 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14318667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14318802 C G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 14318848 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 14318881 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 14318949 C G Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 14319059 C G Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 14319102 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 14319158 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14319189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14319257 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14319270 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 14319284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14319525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14319558 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 14319565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14319603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14319618 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14319718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14320025 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 14320041 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 14320105 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 14320174 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 14320272 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 14320320 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 14320371 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14320372 C G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 14320613 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 14326947 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 14326956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14327083 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 14327109 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 14327114 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14327271 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14327296 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 14327332 T G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 14327357 C A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 14327398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14327421 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14327443 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 14327466 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 14327641 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 14327819 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 14327849 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 14327899 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 14327904 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14329597 T C Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 14329722 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14329859 A G Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 3 14330021 C T Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 14330067 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14330183 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 14330361 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14330377 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 14330794 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 14331128 C G Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 14331200 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 14331254 C T Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 14331331 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 14331840 C G Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 14331866 A C Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 14331878 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14331943 A G Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 14331991 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 14332054 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14332075 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 14332178 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14332197 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 14332249 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 14332301 T G Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 14332397 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 14332618 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 14332867 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14332980 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 14332985 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14333106 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 14333154 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 14333223 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 14333263 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14333395 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 14333423 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14333492 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14333545 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 14333581 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14333646 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14333698 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14333791 A G Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 14333863 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14333947 G T Y N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 14333966 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14334020 G T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 14334164 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 14336716 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 14336768 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 14336826 T A Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 14337078 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 14337099 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 14337272 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14337303 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14337329 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14337345 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14337393 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14337455 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 14337489 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 14337553 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14337617 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 14337755 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 14337785 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 14337861 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14337868 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 14337884 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 14337948 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 14339173 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 14339578 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 14339874 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14340163 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 14343441 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 14344554 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14344774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14345905 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14347827 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14348588 T G Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 14350517 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 14350820 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 14353966 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14355594 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14357558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14360144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14360389 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14360987 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 14361313 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 14361349 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 14361867 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14362084 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 14362340 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 14362456 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 14362464 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 14362511 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 14362575 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 14362692 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 14362699 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 14362738 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14363185 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 14363832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14364306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14364396 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14366468 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 14366559 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 14368655 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 14368660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14369569 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14369571 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 14369791 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 14369993 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14370311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14370748 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 14371777 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14374337 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 14374524 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 14374686 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14375044 C A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 14375442 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14376223 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 14376883 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 14376930 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14377017 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14377145 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14377770 T G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 14377908 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14377988 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 14378040 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 14378120 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 14378185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14378246 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14378259 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14378303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14378338 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 14378480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14378521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14378749 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 14380684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14380740 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14380986 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 14381058 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14381288 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 14381791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14382082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14382105 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 14382233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14382965 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 14383038 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 14383081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14383276 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14383364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14383383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14383388 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14383418 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14383472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14383581 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 14383674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14384435 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 14384900 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14385438 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 14387336 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 14387461 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 14387482 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14387785 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14388143 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14390291 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 14391816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14393494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14393644 C T Y Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 13 7 6 1 3 3 14393749 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 14394774 A G Y Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 14396807 G A Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 14396822 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 14398378 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14399167 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 14399517 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 14399711 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14399819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14405702 T A Y N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 3 14406265 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 14407682 T G Y N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 14408348 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14411144 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 14412785 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14414479 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14415697 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 14415767 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 14416384 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 14416385 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 14420936 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 14422266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14423410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14424515 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 14424848 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 14425375 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 14425782 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14426159 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14426439 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14427362 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 14429437 C T Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 14429798 C T Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 14429852 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 14430725 G A Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 14431488 C T Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 14432039 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 14432550 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14432709 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14433284 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 14433820 A C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 14439221 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14440204 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 14440534 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14440555 T C Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 14440558 A G Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 14440620 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14440637 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14440667 A C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 14441045 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14442760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14443887 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14445101 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14445596 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14446138 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 14446185 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 14446206 G A N Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.714285714285714 0.285714285714286 5 9 0 5 2 3 14446252 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 14446894 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 14446896 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 14446963 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 14454000 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 14454027 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 14456626 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 14472223 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14472390 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14472481 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14472553 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14478765 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14481652 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 14482926 T C Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 14485097 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14486265 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14486302 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14487407 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 14489510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14490541 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 14490850 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 14494342 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 14496014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14496057 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14496664 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 14496687 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 14497046 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 14501873 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14501968 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14503237 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14509314 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14509962 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14510084 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 14510614 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 14520586 C G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 14522906 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 14527659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14529679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14532250 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14532979 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14533667 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 14533678 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 14533687 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 14534181 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14534331 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 14534353 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 14534361 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 14534370 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 14534396 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14538196 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 14538204 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14538228 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 14538661 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14538887 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14539339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14539871 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 14539902 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 14540422 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 14540648 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14540749 G C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 14541597 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 14543496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14543757 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14544321 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14545637 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 14546294 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14546578 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14547691 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 14547728 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 14547856 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14547915 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14547931 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14547985 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 14548019 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 14548303 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 14548519 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 14548581 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 14548612 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14548718 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 14549152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14549517 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14549595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14549672 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14549713 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14550147 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14551250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14552245 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14555927 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14556255 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 14556267 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 14556353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14556371 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 14556454 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 14556535 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 14556896 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 14556981 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 14557184 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 14557491 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14557520 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14557648 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 14557749 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 14557842 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 14557868 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 14557876 G C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 14557909 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 14558056 A C Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 14558595 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14558960 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 14559195 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 14559452 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 14559704 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 14559709 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 14560005 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14560273 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14560320 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 14560376 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 14560383 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 14560448 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 14560482 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14560563 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 14560621 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 14560674 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 14560804 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 14560815 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 14560835 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 14560844 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 14560846 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 14560866 G C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 14561205 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 14561583 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 14562363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14562742 G T Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 14563210 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14563435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14564666 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 14565258 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 14567027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14567069 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14567623 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 14567788 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 14568013 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 14568202 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14568330 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 14568359 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 14569053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14569054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14569143 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14570276 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14570996 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 14571079 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14572190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14572225 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14574085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14576899 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14577668 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14580326 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14580789 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14580799 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14583949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14584974 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 14585209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14585448 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 14589176 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14590871 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 14590922 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 14591390 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14592025 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 14592990 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 14593787 C A Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 14597201 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 14597907 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14598534 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 14598860 C T Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 14600178 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14600201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14600390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14600997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14602123 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14602595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14605024 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14605553 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14607104 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 14607105 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14607704 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14608657 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 14609092 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14609179 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14612071 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14612348 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 14613731 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14614228 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14615957 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14616165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14616289 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14616389 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14616400 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14616523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14616690 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 14616768 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 14617312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14618692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14621314 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14621499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14622124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14622376 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14622671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14625035 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 14625093 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 14626730 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14626916 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14626929 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 14627127 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14627363 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 14627499 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14627878 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 14627895 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 14628282 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14628510 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 14628586 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14628793 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 14628839 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 14628885 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 14628990 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14628996 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14629003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14629007 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 14629027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14629239 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 14629434 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14630355 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14630477 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 14630531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14630725 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14632121 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14635811 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14636210 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14636544 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14636980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14637161 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 14638352 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 14638793 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14638939 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 14638945 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 14641398 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 14641435 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14641584 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14641990 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14642597 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14643124 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 14643715 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14645713 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14648087 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14648315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14649158 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 14649599 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14649995 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14650709 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 14650741 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 14650954 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 14651964 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 14652122 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 14652805 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 14652902 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 14652941 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 14652964 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 14653123 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 14653150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14653214 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 14653321 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 14653341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14653412 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 14653565 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14653693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14653790 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 14653841 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 14653953 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 14653963 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 14654014 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 14654021 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 14654029 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 14654172 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 14654173 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 14654266 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14654522 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 14655659 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14656307 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 14657360 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 14659707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14660484 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14660518 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 14661701 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 14661702 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14661979 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 14662137 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14662178 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14662232 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14662338 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14662455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14663273 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14663462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14663636 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14664151 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14664187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14665063 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14665294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14665714 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 14665822 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 14665925 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 14665996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14666001 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 14666243 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 14666514 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 14666691 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14666828 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 14666853 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 14667091 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 14667217 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 14667675 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14667876 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 14667905 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 14667941 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 14667950 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 14668131 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 14668172 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 14668293 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14668298 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14674023 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 14674193 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14674503 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 14674524 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14674539 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14674568 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 14674690 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14674708 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14674718 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14674737 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14675012 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 14675199 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14675335 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 14675522 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14675533 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 14675554 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 14675604 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14675819 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14675837 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14675843 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14676118 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14676201 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 14676424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14676486 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14676549 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 14676587 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14676604 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14676814 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14676951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14676990 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14677127 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 14677202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14677218 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14677252 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 14677285 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 14677385 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14677614 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 14677681 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 14677691 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 14677692 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 14677848 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 14678052 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14678061 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14678134 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14678157 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14678165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14678186 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14678239 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14678245 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 15 21 0 15 3 3 14678258 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 14678290 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14678325 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 14678749 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14678769 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14678825 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14678875 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14678908 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14678926 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14678938 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14679000 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14679095 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14679132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14679163 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14679184 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14679236 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14679646 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14680641 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14680987 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 14682872 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 14682893 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14684799 T C Y Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 14684804 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 14686643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14691062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14692511 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 14693075 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14694029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14694378 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14694593 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14694627 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14695850 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14698539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14698921 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 14699574 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 14699877 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 14700060 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14700142 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14701685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14702040 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14702195 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 14702621 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14702695 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 14703597 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14703624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14704311 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 14704693 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14706029 A G Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 14706111 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14706132 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14706266 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 14722122 G T Y N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 14722565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14722999 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14724891 T C Y Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 14727124 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14727210 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 14727658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14728290 G C Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 14728545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14728630 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14729584 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 14729590 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 14729778 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 14729896 T C Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 3 14730036 T A Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 14730194 A T Y N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 3 14730284 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 14730335 C G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 14730404 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 14730412 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 14731788 G A Y Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 3 14733317 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14733605 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14734483 A C Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 14736749 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14737414 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 14737633 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 14737680 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 14737859 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14738880 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14746522 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14747614 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14750116 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14750982 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14751003 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 14751487 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14751961 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14752751 C T Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 14753480 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14753741 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14754192 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14754275 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14754510 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14754756 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14755094 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14757354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14757713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14757897 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 14758120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14758243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14758246 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 14758937 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 14760882 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 14761263 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 14761388 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 14763374 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 14763767 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14764775 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14765690 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 14766691 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 14766944 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14767616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14768668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14768865 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14769377 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14769556 C T Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 14769658 A G Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 3 14769901 A G Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.0625 0.9375 0 17 15 1 15 0 3 14770239 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14770662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14770711 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14772218 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 14772691 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 14772835 A C Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 14773843 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14774980 T G Y N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 3 14775366 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 14775518 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 14775530 C A Y N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 14777124 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 14777618 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 14777844 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14778391 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14779321 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 14779983 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 14779996 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 14780238 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14780575 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14780972 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14781681 C T N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 14784061 A G Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 3 14784233 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 14785234 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14785248 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14785349 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 14785479 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14786463 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 14786612 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14786632 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14786693 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14786705 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14786726 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14786727 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14786995 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14787007 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14787054 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 14787129 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14787150 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14787220 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14787376 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14787384 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14787630 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14787909 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 14787962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14788302 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14788332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14788339 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14788346 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14788568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14788655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14789119 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14789142 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14789423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14789856 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 14790086 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 14790314 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14790332 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14790510 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14790521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14790963 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14791037 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 14791045 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 14791199 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14791562 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 14791645 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 14791693 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 14791787 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14791799 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 14791918 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14792042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14792226 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14792322 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14792348 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 14792360 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14792391 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 14792395 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 14792705 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14792734 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14792776 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14792813 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14792835 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14792865 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14793079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14793744 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 14794259 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14797623 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14797652 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 14798282 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 14798593 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 14798919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14799019 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14799156 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14799250 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14799281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14799468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14799643 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14799661 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14799885 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 14799909 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 14800080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14801285 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14801340 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14801549 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 14801613 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 14801819 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14802227 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 14802360 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14802422 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 14802690 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14803358 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 14803523 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14803786 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14804471 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 14804482 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 14804486 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 14804999 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14805207 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 14805717 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 14805971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14806002 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 14806332 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14806839 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14807268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14807565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14808004 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 14808024 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 14808330 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14808781 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 14808818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14808825 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14809174 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 14809444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14809918 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 14809951 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 14810111 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 14810273 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 14810328 G C N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 14810332 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 14810486 A C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 14810517 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 14810550 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14810678 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14810794 T A Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 14810988 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 14811037 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 14811080 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 14811096 A T Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 14811133 G A Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 14811152 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 14811203 G C Y N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 14811207 G A Y Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 14811295 T C Y Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0 1 0 14 14 0 14 0 3 14811296 T A Y N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 3 14811338 T A Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 3 14811341 G A Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 14811688 G C Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 14811690 A C Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 14811704 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14811804 T C Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 14811855 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 14812047 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 14812328 T C Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 14812395 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 14812519 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 14812746 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 14812787 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 14812925 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 4 2 2 0 1 3 14812948 G A Y Y 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 3 14813032 T C Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 14813147 T G Y N 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 6 8 2 2 3 3 14813150 T C Y Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 6 8 1 4 2 3 14813230 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 14813433 T C Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 14814073 C T Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 14814099 T A Y N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 14814292 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 14814318 G A Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 14814363 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 14814458 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 14814657 A G Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 14814701 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 14815180 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 14815218 G C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 14815238 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 14815251 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 14815253 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 14815331 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 14815399 G C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 14815424 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 14815435 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14815622 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 14815623 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 14815697 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 14815878 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 14815883 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 14815925 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 14816017 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 14816103 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 14816189 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 14816368 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 14816380 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 14816414 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 14816501 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14816508 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 14816690 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14816782 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 14816821 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 14816876 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 14816926 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 14816934 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 14817160 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 14817192 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 3 14817325 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 14817375 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 14817451 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 14817480 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 14817496 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 14817511 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 14817539 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 14817632 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 14817639 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 14817645 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 14817652 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 14817657 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 14817676 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 14817696 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 14817728 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14817744 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 14817771 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 14817776 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 14817796 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 14817854 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 14817976 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 14818025 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 14818271 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 14818316 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 14818348 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 14818501 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 14818518 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 14818521 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 14818567 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 14818598 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14818657 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 14818682 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14818754 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14819144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14819189 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 14819286 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 14819359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14819532 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 14819584 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 14819629 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 14819630 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 14819654 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 14819808 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 14819841 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 14819846 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14819860 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 14819879 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 14819972 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 14820209 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14820270 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14820586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14820982 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 14821170 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 14821339 T C N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 3 14821425 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 14821456 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 14821492 C A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 14821502 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 14821526 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 14821706 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 14821832 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 14821852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14822038 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 14822078 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 14822117 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14822139 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 14822146 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 14822244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14822449 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 14822465 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 14822488 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 14822566 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 14822602 A C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 14822624 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 14822640 T G N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 14822733 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 14822905 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 14822936 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 14822941 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14822953 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 14822982 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 14823004 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 14823076 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 14823275 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 14823297 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 14823338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14823367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14823414 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 14823527 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 14823706 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 14823712 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 14823850 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 14823992 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 14824107 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 14824213 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 14824313 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 14824334 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 14824341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14824423 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 14824509 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 14824513 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 14824554 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 14824566 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 14824567 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 14824602 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 14824655 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 14824662 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 14824669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14824679 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14824703 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 14824723 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 14824762 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 14824773 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 14824816 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 14824881 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 14824913 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 14824942 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 14825102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14825108 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 14825114 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 14825130 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 14825244 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 14825372 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 14825441 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 14825531 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 14825586 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 14825601 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.25 0.333333333333333 0.416666666666667 10 14 3 4 5 3 14825666 A T N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 14825668 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 14825699 T G N N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 3 14825714 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 3 14825759 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 14825783 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 14825807 A C N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 3 14825830 T A N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 3 14825848 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 14825884 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 14825917 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 14825934 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 14826158 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 14826209 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 14826228 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 14826282 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 14826330 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 14826343 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 14826424 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 14826783 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14826902 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14827020 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 14827040 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 3 14827059 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 14827122 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14827415 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14827480 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 14827542 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 14827543 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 14827684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14827690 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 14827705 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 14827950 G T N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 3 14827972 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 14828086 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 14828110 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 14828139 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 14828369 G T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 14828380 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 14828385 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 14828395 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 14828407 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 14828418 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 14828437 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 14828474 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 14828491 T A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 14828508 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 14828544 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 14828596 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 14828605 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 14828648 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 14828685 T G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 14828712 A G N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 3 14828779 T C N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 3 14828902 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 14828939 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 14829091 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 14829152 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 14829279 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14829289 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 14829512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14829625 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 14829692 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 14829753 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 14829756 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 14829815 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 14829895 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 14829903 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 14829917 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 14829975 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 14830000 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 14830068 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14830227 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14830640 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14830958 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14831072 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 14831361 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 14831773 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 14831900 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14832164 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 14832744 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 14832853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14837585 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 14837602 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 14837607 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14837972 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 14838003 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 14838189 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14838427 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14838596 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 14838603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14838648 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14838660 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 14839003 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 14839030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14839055 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14839067 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14839123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14839191 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 14839192 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 14839206 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 14839280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14839398 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14839530 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 14839791 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 14840023 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 14840174 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 14840220 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 14840332 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 14840419 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 14841022 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14841028 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 14841228 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 14841429 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 14841626 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 14841789 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 14842910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14843277 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 14843628 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14843686 G T N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 3 14844141 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 14844189 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14844293 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14844413 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14844428 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14844977 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14845110 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14845163 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 14845893 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 14845931 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 14845946 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 14846144 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14846176 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 14846259 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14846448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14846565 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 14846686 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 14846916 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 14846939 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 14847349 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 14847355 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 14847393 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 14847626 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14847655 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14847676 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14847772 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14847817 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14847895 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 14848059 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14848103 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 14848119 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 14848173 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14848190 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14848214 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14848366 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14848397 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 14848409 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 14848427 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 14849182 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 14849183 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 14849198 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 14849318 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 14849444 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14849606 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14849808 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 14850049 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14850469 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 14850544 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 14850683 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 14850713 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14850759 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 14850795 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14850825 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 14850931 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 14850956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14850985 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 14851117 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 14851134 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 14851685 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14851697 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 14851949 T G N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 14852215 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 14852382 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 14852994 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 14854224 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14854370 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 14854371 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 14854385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14854418 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 14854509 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14854723 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 14854729 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 14854871 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14855165 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14855396 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 14855496 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 14855532 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 14855689 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 14855950 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 14856424 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 14856451 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14857365 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 14857679 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14857682 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 14858215 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14858282 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 14858480 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14858502 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14858724 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 14858858 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14858936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14858949 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 14858974 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14858979 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 14859064 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 14859089 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 14859106 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 14859142 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14859143 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 14859380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14860148 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 14860261 C T N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 14861428 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 14862220 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14862712 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 14862759 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14862841 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 14862995 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14863014 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14863036 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14863404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14863458 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14863491 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14863518 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 14863725 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14863826 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14863892 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 14864086 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 14864231 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 14864235 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 14864726 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 14864788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14864831 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 14864833 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 14865040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14865041 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 14865077 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 14865146 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 14865160 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 14865327 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 14865483 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 14865496 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 14865587 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 14865669 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 14865755 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 14866148 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 14866165 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 14866488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14866637 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14866667 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14866730 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14867011 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 14867043 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 14867341 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14867546 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 14867657 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14867815 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 14868257 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14868659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14869309 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14869417 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14869502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14869966 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14870113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14870376 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 14870666 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 14870697 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 14871027 A C N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.571428571428571 0.357142857142857 10 18 1 8 5 3 14871032 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 14871074 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 3 14871086 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 3 14871302 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14871360 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14871426 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14871441 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 14871481 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 14871813 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14871859 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14871909 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14871980 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 14872071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14872137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14872157 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 14872206 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 14872228 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 14872496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14872550 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 14872571 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 14872646 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14872647 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14872724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14872768 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 14872828 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 14872889 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 14873046 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 14873231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14873650 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 14873755 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 14873804 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 14873819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14873841 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 14874002 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 14874045 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 14874054 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 14874063 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 14874079 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 14874118 C G N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 14874129 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14874153 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 14874208 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 14874261 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 14874278 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 14874366 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 14874371 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14874391 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 14874452 G T N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 14874581 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 14874583 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 14874605 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 14874608 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 14874636 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14874667 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14874820 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 14874994 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14875006 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 14875066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14876250 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 14876548 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 14876594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14876809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14876811 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14876905 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 14876907 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 14876926 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 14877010 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14877078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14877106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14877352 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14877365 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14877497 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 14877529 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 14877545 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 14877572 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 14877623 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14877665 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 14877682 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14877740 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 14877903 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14877910 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14877967 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 14877976 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 14878059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14878094 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 14878172 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14878313 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 14878487 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14878737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14878738 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 14878770 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 14878786 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14878926 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 14878934 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 14878963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14879016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14879132 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 14879258 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 14879296 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 14879407 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 14881512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14882138 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14882538 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 14883245 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 14883562 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 14883628 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 14883892 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 14883941 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 14883950 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14883968 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 14883980 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 14884023 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14884268 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 14884306 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 14884475 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14885348 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 14885789 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 14887818 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14888150 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14888460 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 14888675 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14888905 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14888929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14888952 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14888994 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14889965 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14890237 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 14891279 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 14891540 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 14891671 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14892181 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 14892393 A G N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 14892554 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 14892570 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 14892587 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 14892601 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 14892785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14892807 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14893174 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14893817 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14894290 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14894517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14894700 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14894890 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14895500 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 14895863 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14895990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14896027 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 14896052 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14896098 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 14896368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14896378 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 14896380 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 14896602 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 14896650 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 14896779 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 14896817 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 14896965 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 14897150 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 14897155 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 14897270 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 14897293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14897311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14897340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14897397 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 14897425 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 14898361 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14898407 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14898428 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14898487 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 14898555 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 14898627 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 14898732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14898819 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14898924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14898936 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 14898966 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 14899128 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14899162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14899208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14899232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14899242 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14899356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14899504 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 14899817 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14900213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14900324 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 14900338 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 14900436 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 14900657 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 14900721 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 14900809 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14900927 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 14901016 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14901085 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14901123 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 14901290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14901787 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14901879 A C N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.230769230769231 0.769230769230769 0 16 10 3 10 0 3 14902281 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14902697 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14903148 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14903236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14903525 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14903884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14904042 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14904741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14904804 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14904862 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 14904998 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14905017 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 14905252 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 14905286 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14906047 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 14906294 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 14906756 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14906836 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14907226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14907271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14907446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14907973 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 14908985 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 14909173 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 14909609 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 14909628 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 14909656 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 14909780 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 14909835 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 14909930 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 14909950 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 14909959 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 14910137 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 14910415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14910628 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14911045 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14911156 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14911243 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 14911590 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 14911735 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14911823 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14911836 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14911837 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14911854 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14911904 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14911932 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14911971 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 14911979 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 14912003 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 14912008 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 14912020 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14912129 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14912479 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 14913115 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 14913218 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 14913336 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 14913783 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 14914643 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14914788 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14915088 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 14915116 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14915520 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 14915767 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 14915776 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 14915792 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 14915795 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 14915862 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 14917276 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14917589 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 14917732 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14917784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14917836 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14918007 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 14918057 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 14918102 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14918196 T C N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 14918378 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14918485 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 14918509 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 14918820 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14919082 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 14919210 A G Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 14919415 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14919650 A G Y Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 14919697 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14919750 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14920005 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 14920032 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 14920113 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 14920158 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 14920199 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 14920284 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 14920356 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 14920366 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 14920400 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 14920493 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 14920701 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 14920794 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 14920807 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 14920880 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 14920928 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14920947 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14920982 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 14921065 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14921073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14921111 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 14921134 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14921314 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 14921333 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14921504 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 14921547 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 14921589 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 14921683 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 14921716 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 14921735 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 14921760 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 14921828 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 14922137 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14922193 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14922412 T C Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 14922435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14922583 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 14923083 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14923759 A C Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 14925461 G T Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 14926110 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 14926344 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 14926416 T C Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 14927807 A G Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 14928816 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14929192 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 14930059 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14930333 T G N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 14930565 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 14930873 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 14930935 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 14931035 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14931292 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 14931708 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 3 14931904 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 14931915 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 14932221 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 14932551 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 14932585 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 14932593 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 14932731 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 14932776 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 14932807 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 14932903 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 14932958 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 14932959 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 14932987 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 14933090 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 14933236 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 14933258 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 14933416 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 14933444 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 14933468 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 14933500 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 14933546 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 14933627 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 14933695 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 14933707 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 14933712 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 14933737 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 14933747 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 14933780 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 14933817 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 14933864 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 14933960 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 14934032 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 14934038 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 14934134 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 14934183 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 14934250 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 14934294 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 14934345 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 14934361 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 14934511 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 14934573 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 14934667 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 14934691 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 14934722 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 14934735 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 14934800 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 14935101 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 14935231 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14935605 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 14936699 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 14936820 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 14936950 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 14937165 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 14937413 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 14937473 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 14937732 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 14937937 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14938509 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 14939014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14939226 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 14939657 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 14939700 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 14939775 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14940132 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14940537 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14940591 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 14940683 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14940810 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 14940969 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 14941014 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 14941031 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 14941045 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 14941106 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 14941367 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 14941373 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 14941391 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 14941505 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14941559 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 14942009 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 14942052 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 14942072 A T N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 14942188 T A N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 14942331 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 14942396 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 14942520 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 14942586 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 14942648 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 14942850 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 14942983 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 14943011 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 14943446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14943538 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 14943587 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 14943617 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 14943637 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 14943655 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 14943656 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 14943725 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 14943736 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 14944121 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 14944230 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 14944566 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14944763 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 14946257 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 14947235 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14950177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14950412 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14953163 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14953433 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 14953919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14954015 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 14954749 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 14955011 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 14955030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14955562 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 14955870 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14956032 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14956242 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14956334 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14956881 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14957007 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 14957091 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 14957265 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14957282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14957352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14957440 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 14957503 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 14957515 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14957665 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14957852 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 14957882 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 14957989 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14958098 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14958160 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14958371 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14958402 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14958542 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 14958562 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 14958684 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 14958765 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 14958808 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14958916 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 14958949 T A Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 14958969 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14959476 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14959616 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 14959637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14959882 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 14959947 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14960003 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14960301 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14960482 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 14960579 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 14960591 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 14960662 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 14960684 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14960804 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14960813 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 14960847 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 14960855 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 14960859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14960886 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 14960955 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 14960970 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14961051 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 14961335 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 14961359 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 14961368 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 14961370 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 14961462 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14962082 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 14962290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14962373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14962936 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14963006 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14963062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14963077 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14963251 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14963614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14963642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14964144 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 14964428 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14964678 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 14964679 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 14964713 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 14964757 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 14964766 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 14964777 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14964781 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 14964809 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 14964918 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 14965003 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14965146 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14965333 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 14965363 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 14965413 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 14965422 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 14965662 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 14966266 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14966946 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 14967042 C T Y Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.714285714285714 0.285714285714286 10 18 0 10 4 3 14967490 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 14967861 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 14967887 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14967968 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 14967997 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 14968016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14968234 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 14968275 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 14968434 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 14968597 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14968620 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 14968734 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 14968870 T A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 14968898 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14968940 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 14969109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14969446 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 14969454 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 14969706 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 14969763 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 14969790 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14969804 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 14969855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14969908 G T N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0 0.692307692307692 0.307692307692308 9 17 0 9 4 3 14970356 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14970771 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14970901 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 14971288 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 14971462 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 14971861 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 14971873 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14972083 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 14972114 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 14972269 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 14972276 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 14972394 A G N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 14972902 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 14973107 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14973118 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 14973270 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 14973425 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 14973512 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 14973583 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 14973596 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 14973623 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 14973634 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 14973864 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14973999 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 14974342 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 14974663 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 14974692 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 14975107 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14975133 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14975148 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14975225 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 14975307 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14975332 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14975336 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 14975359 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 14975421 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 14975529 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 14975535 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14975601 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 14976153 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 14976478 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 14976617 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14978231 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 14978482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14978551 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14980218 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 14980386 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14980476 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 14980480 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14980555 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 14980569 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 14980604 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 14980692 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 14987690 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 14987756 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 14987779 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 14987947 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 14987969 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 14988096 A C Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 14988252 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 14988636 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14989107 G T N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 14989729 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14992328 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 14992361 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14992393 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 14994150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14996560 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 14997824 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14998391 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14998445 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 14998693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 14999701 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15002490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15003376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15004354 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15004440 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15005541 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15005591 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 15005673 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15005776 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 15005784 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 15005838 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 15006130 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 15006408 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 15006644 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 15006839 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 15006903 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15007169 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15007203 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15007234 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 15007331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15007441 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 15007595 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 15007682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15007783 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 15007827 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15009624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15010064 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 15010216 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 15010659 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15011106 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15011765 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15011873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15012943 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 15013342 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 15014896 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15018677 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15020063 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 15021706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15022518 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15024568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15025154 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 15025893 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 15026545 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 15027002 T C Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 15027149 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15027271 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 15027287 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15027290 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15027724 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 15027789 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15028044 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 15028351 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 15035006 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 15035130 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15035221 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15035304 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 15035399 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15035452 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15035504 G T N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 15035647 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15035743 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 3 15035867 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15035956 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15036515 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 15036840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15036924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15036968 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15036973 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15036995 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15037011 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15037054 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15037062 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15037104 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15037556 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15039463 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15039473 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15039508 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15040327 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 15041343 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15042074 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15042184 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 15042244 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15042263 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 15047318 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15048376 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 15048442 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15049015 G C N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 15050831 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15053421 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 15053683 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15053916 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 15054245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15054341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15054705 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15054987 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15055453 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 3 15056578 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15056741 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15057647 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 15058408 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15060076 A T Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 3 15060393 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 3 15061281 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15062792 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15063496 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 15065307 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15065667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15066161 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15066167 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15066194 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15066256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15066281 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15066353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15066479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15067129 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15067165 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 15067238 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15067604 T G Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 15067614 A G Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 15067813 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 15067862 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15067907 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15067915 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15067934 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15068161 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15068441 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15068510 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15069166 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15069187 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 15069197 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15069212 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15069706 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15070140 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15070303 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 15070407 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15070667 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15070688 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 15070905 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 15070921 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 15070983 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15071042 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 15071095 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15071202 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15071545 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 15071579 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15071617 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 15071824 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15071942 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15072003 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 15072094 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15072115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15072121 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15072782 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 15072903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15073148 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15073153 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15073160 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15073320 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15073368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15073450 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15073469 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15073470 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15073492 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15073690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15073809 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 15073878 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 15074318 C T N Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.5 0 0.5 8 8 4 0 4 3 15074567 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 15074595 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 15074679 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 15074698 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 15074730 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 15074780 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15075386 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 15075455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15075473 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 15075488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15075766 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 15075912 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 15075948 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 15076005 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 15076445 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15076539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15077020 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 15077126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15077166 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15077312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15077324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15077461 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15077512 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 15077597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15077731 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 15077755 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15077889 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15078072 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 15078372 T A N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 15078674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15078937 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15078955 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 15079198 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 15079268 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15079306 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15087368 A G Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 15087623 T C Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 15088134 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15088781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15088905 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15088909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15089054 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15089057 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15089701 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 15090236 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15090850 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 15091280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15091600 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 15093083 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15094067 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15094778 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 15095093 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15096144 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 15096475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15097873 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15098733 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15100973 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15102052 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 15102092 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15102276 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15102303 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15102435 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15102502 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 15102613 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15103244 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15103332 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15103432 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15105202 C T Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 15105213 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15105217 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15105290 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 15105305 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15105338 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15105354 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15105390 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15105504 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15105505 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15105538 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15105552 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 15105588 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 15105730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15105738 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 15105767 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15105792 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15105936 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15106163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15106170 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15106202 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15106218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15106221 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15106241 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15106254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15106269 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15106289 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15106323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15106341 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15106420 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 15106443 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15106714 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 15106863 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15106927 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 15107081 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 15107102 G A Y Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 15107261 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 15107368 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15107372 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 15107528 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15108063 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15108142 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 15108616 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 15108780 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15108838 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 15108859 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 15108924 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 15108985 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 15109039 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 15109044 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 15109081 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 15109384 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 15109444 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 15109451 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 15109555 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 15109734 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15109759 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15110311 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 15110374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15110533 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 15110573 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 15110589 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 15110600 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 15110698 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 15110775 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 15110789 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 15110835 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 15110847 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 15110880 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 15110919 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 15110949 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 15110983 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 15111100 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15111173 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 15111178 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 15111314 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 15111632 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 15111724 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 15111733 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 15111752 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 15111807 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 15111986 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 15111994 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 15112157 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 15112210 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 15112241 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 15112328 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 15112351 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15112462 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 15112697 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 15112703 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 15112756 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 15112803 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 15113023 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15113049 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15113168 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 15113178 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 15113215 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 15113274 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 15113326 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 15113412 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 15113781 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 15114328 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 15114337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15115352 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 15115771 T C Y Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0 0.727272727272727 0.272727272727273 8 14 0 8 3 3 15116543 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 15121698 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15122068 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15122843 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15124744 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 15126478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15126518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15126804 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 15127259 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15128419 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 15128463 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15128612 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15128698 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15129072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15131312 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15132205 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15135681 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 15135783 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15136160 T C Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 15136907 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15138449 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 15138592 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15138798 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15138911 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15139614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15140714 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 15140773 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15140784 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 15140894 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15141347 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 15141573 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15141593 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15141803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15141841 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 15142290 T A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15142687 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 15142807 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15142838 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 15143609 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15144065 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 15144217 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 15144732 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15144755 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 15144948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15145078 A T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 15145247 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15145306 T G N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 15145929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15146872 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 15147645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15147747 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15149403 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15150997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15152272 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15152457 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15152660 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15152878 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 15154490 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 15155005 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15155056 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15157258 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15158179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15158541 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15158862 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15158864 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 15159303 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 15160371 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 15160453 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 15160595 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 15160657 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15160667 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15160893 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 15160940 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 15161023 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15161051 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 15161123 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 15161149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15161341 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 15161429 C A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 15161623 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 15161689 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 15161731 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 15161793 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 15161873 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15161904 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15161975 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 15161979 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 15162583 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15162706 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 15162758 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 15162837 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15163030 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15163532 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 15163536 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 15163582 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 15163706 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15164034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15164285 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15164776 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 15165222 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 15165667 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 15165679 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15165790 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 15165846 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 15166404 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15167213 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15168672 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 15170564 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15171060 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15171541 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15171555 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15171564 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15172261 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15172542 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15172868 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 15173142 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15174579 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15174628 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15174706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15174715 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15174753 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15174754 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15174818 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15175165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15175167 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 15175260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15175471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15175479 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 15175483 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 15175560 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 15175607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15175626 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15175763 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15175800 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15175801 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 15175814 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15175888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15176385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15176759 T G Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 15176814 T C N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 15177034 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15177099 G A Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 3 15177822 C T N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0 0.636363636363636 0.363636363636364 7 15 0 7 4 3 15177846 T C N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 3 15177879 A T N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0 0.545454545454545 0.454545454545455 6 16 0 6 5 3 15177985 C T N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 15178016 G A N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.416666666666667 0.583333333333333 0 17 7 5 7 0 3 15178019 C T N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 15178031 C T N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 3 15178123 C T Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 3 15178192 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 15178249 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15178638 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15178785 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15178949 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15179176 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15179327 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 15179466 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15179581 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 15179597 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 15179610 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 15179826 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 15179856 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 15179870 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15180003 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 15180014 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 15180016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15180292 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 15180324 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 15180366 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 15180458 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 15180469 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 15180884 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 15181150 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15181188 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15181271 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15181388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15181405 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15181419 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15181514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15181542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15181644 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15181682 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 15181710 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15181732 G T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 15181747 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 15181802 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 15181886 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 15181906 G C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15181926 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 15181990 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 15182009 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 15182037 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 15182052 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 15182105 C G Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 15182295 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15182303 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15182327 C T Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 15182330 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 15182401 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 15182480 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15182763 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15182796 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 15182891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15182937 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 15182940 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 15183061 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15183383 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 15183418 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 15183666 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 15183855 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15183926 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 15184033 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15184342 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 15184370 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 15184395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15184461 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15184796 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 15184930 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 15184944 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15185011 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15185026 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15185137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15185196 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 15185315 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 15185372 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 15185409 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15185426 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15185439 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15185736 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15186169 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15186226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15186436 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15186450 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15186916 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15186978 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 15187017 C A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 15187126 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15187151 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 15187243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15187388 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 15187451 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 15187591 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 15187922 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 15188154 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 15188304 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15188325 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15188374 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15188515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15188537 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15188645 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15188663 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15188774 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15188874 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15189063 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15189401 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15189405 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15189459 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15189519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15189634 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15189683 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15189879 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 15190012 G T Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 15190016 G A Y Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 15190050 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 15190201 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15190277 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15190312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15190489 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15190728 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15190973 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15191257 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.2 0.733333333333333 0.0666666666666667 17 13 3 11 1 3 15191277 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 15192730 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15192803 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15192846 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 15192885 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 15192918 T A Y N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0 0.866666666666667 0.133333333333333 13 17 0 13 2 3 15192951 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15193077 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15193225 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15194543 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 15194546 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 15195119 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15195543 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15195813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15196269 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 15196355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15196537 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 15196603 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 15197050 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 15197101 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 15197342 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15197489 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 15197510 C G N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 3 15197778 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15197978 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15198085 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15198109 A C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 15198245 T G Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 15198324 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15198342 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 15198350 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 15198518 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15198597 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15198606 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15199065 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 15199066 G C Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 15199076 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 15199262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15199483 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 15199571 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 15199633 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15200201 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15200254 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15200481 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15200518 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15200634 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15200660 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 15201075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15201462 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 15201485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15201518 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 15201759 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 15201994 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15202290 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15202321 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15202357 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15202599 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15202811 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15204127 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 15204620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15205909 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15206002 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15206076 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15206590 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15206708 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15206722 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15207258 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15207365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15207897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15207921 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15208489 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 15208631 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 15208674 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 15208694 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 15208731 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 15208832 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 15208959 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 15209014 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 15209043 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 15209057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15209063 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 15209107 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 15209138 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15209146 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15209208 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15209289 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 15209388 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 15209415 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 15209418 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 15209520 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 15209521 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 15209531 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 15209570 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 15209593 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 15209608 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 15209638 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15209653 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15209663 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 15209737 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15209799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15209832 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15209873 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 15209917 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 15209993 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15210068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15210176 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15210210 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 15210291 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 15210324 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15210325 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15210520 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15210615 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 15210785 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 15210859 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 15210892 T C N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.133333333333333 0.6 0.266666666666667 13 17 2 9 4 3 15210934 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15211048 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 15211081 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15211117 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15211136 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 15211164 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 15211342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15211638 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15211661 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15211677 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15211696 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15211713 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15211807 A G Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 3 15212013 C G Y N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 15212095 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 15212325 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 15212361 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 15212657 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15212692 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15212698 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15212792 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15212836 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15212847 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15212869 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15212929 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15212934 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15212954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15212976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15213017 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15213043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15213058 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15213069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15213118 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 15213139 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 15213417 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 15213421 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 19 17 1 17 0 3 15213533 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 15213776 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 15213791 C A Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 15213875 G A Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 15213881 A G Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 15214026 T G Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 15214096 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15214105 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15214366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15214399 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15214410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15214498 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 15214748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15214824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15214919 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15215055 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15215330 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15215384 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15215623 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 15215735 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15216321 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 15216386 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 15216465 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 15216580 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15216610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15216627 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15216726 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15216889 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15216948 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15217275 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 15217312 T A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 15217355 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 15217416 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15217436 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15217861 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 15217956 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 15218421 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 15218495 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15218634 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 15218870 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 15218916 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 15219017 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15219048 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15219123 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 15219194 C T Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 15219219 C G Y N 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.2 0.8 0 12 8 2 8 0 3 15219310 T A N N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.454545454545455 0.454545454545455 0.0909090909090909 15 7 5 5 1 3 15219436 G T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 15219562 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 15219567 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15219599 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15219659 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 15219781 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 15219822 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15219892 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15220025 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15220112 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 15220185 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 15220291 A T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 15220390 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15220493 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 15220538 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 15220551 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15220579 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 15220595 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 15220612 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 15220742 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 15220777 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15220982 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 15221079 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15221098 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15221161 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15221185 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 15221262 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15221301 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15221332 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 15221382 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 15221406 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 15221510 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 15221523 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 15221614 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15221616 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 15221640 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 15221677 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 15221701 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 15221702 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 15221712 A G Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 15221744 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 15221782 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 15221833 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 15221834 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 15221930 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 15221941 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 15221973 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15222031 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15222178 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15222209 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 15222219 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 15222279 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 15222310 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 15222335 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 15222346 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 15222369 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 15222404 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 15222499 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 15222522 T G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 15222977 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 15223057 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15223184 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15223275 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15223328 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15223352 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15223375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15223481 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15223523 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15223564 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 15223568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15223629 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 15223715 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 15223754 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15224130 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 15224224 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 15224249 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15224282 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 15224328 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 15224343 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15224378 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 15224379 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 15224511 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 15224525 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 15224643 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15224679 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 15224680 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 15224724 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 15224816 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 15224858 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 15224882 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15225021 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15225055 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 15225115 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 15225187 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 15225268 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15225650 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15226064 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 15226120 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 15226720 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15226775 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 15226788 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 15226976 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15227078 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 15227151 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 15227189 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15227285 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 15227328 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 15227389 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 15227398 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 15227430 T G Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 15227583 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15227765 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15227772 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 15227792 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 15227820 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 15227828 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 15227859 A T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 15228003 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15228121 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 15228129 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 15228267 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 15228318 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 15228583 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15228600 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 15228657 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15228737 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 15228840 C T N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 3 15228959 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 15229240 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 15229278 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 15229284 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 15229301 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 15230374 G T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 15230394 T G N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 15230584 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 15230621 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15230661 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15230694 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15230757 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15230768 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15230786 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15230798 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15230805 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15230812 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15230823 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15230885 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15231063 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15231081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15231142 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15231306 G T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 15231450 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 15231485 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 15231652 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 15231658 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 15231928 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15231999 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 15232112 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15232163 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 15232224 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15232289 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 15232311 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15232315 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15232371 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 15232439 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15232441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15232476 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15232488 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 15232546 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15232553 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 15232642 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15232656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15232715 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 15232803 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15232807 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15232853 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15232883 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15232885 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 15232899 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15232900 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15233006 A G Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 15233039 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15233059 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15233091 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15233115 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 15233172 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15233177 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15233184 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15233203 A C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 15233223 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15233241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15233311 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 15233315 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 15233410 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 15233495 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 15233545 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 15233578 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 15233587 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 15233599 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 15233602 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 15233662 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15233671 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 15233689 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 15233695 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 15233832 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 15233841 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 15233905 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 15233942 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 15233976 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 15234016 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15234130 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15234147 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 15234221 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15234283 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15234543 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 3 15234694 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 15234894 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 15235168 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15235226 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 15235257 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15235277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15235346 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 15235407 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 15235475 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15235508 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15235597 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 15235782 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15236087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15236226 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 15236282 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 15236576 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15236632 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15236637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15236692 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15236777 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15236816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15236868 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15236878 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15236899 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15236974 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15237027 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15237082 T C Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 15237212 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15237470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15237735 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 15237759 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15237779 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15237784 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15237850 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15237989 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15238005 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15238148 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15238313 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15238344 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15238360 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15238398 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15238592 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15238618 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15238619 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15239176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15239214 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15239222 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 15239401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15239595 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15239598 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15239697 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15239700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15239734 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 15239854 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15240120 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 15240131 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 15240201 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 15240262 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 15240364 A C Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 15240673 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15240785 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 15241036 G C N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 15241068 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15241510 T A Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 15241587 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15241593 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 15241683 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 15241684 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 15241831 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 15243536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15243577 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15243591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15243599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15243616 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15243642 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15244199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15244771 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 15245086 C A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 15245427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15245506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15245533 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15245944 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15245975 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15246039 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15246041 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 15246090 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 15246171 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15246412 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 15246447 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 15246670 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15246813 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15246816 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15246856 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 15247048 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15247569 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15247872 A T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 15247944 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15255118 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15255138 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15255153 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15255162 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15255212 T G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 15255343 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15255365 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15255490 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15255612 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15255633 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 15255684 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 15255691 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15255709 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 15256086 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 15256144 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 15256192 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15256231 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 15256245 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15256804 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 15257256 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15257448 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15257451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15257557 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 15257569 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 15257719 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 15257782 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 15257887 T G Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 15257961 T C Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 15258111 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 15258176 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 15258345 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 15258367 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 15258396 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 15258405 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 15258460 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 15258485 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 15258831 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 15258870 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 15258892 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15259002 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15259490 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 15259540 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 15259911 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 15260043 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 15260094 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 15260168 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15260223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15260369 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 15260416 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 15260453 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 15260541 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 15260638 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 15260669 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 15260680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15260874 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15260977 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15260979 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15261006 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 15261228 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15261310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15261499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15261687 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15261715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15261760 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 15261833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15261855 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15262667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15262870 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15264492 A C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 15264793 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15264823 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 15264859 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15264954 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15265335 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 15265424 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 15265473 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 15265702 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15265740 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 15265769 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15265787 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15267747 T C Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 15267877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15269179 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15269379 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15269734 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15270125 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15270644 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 15270855 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15270923 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15272651 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 15274634 G A Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 15275149 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15276753 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15276996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15277244 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 15277468 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 15277495 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 15277563 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 15277713 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15277783 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15278367 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15278862 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 15279102 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15279333 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15279721 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 15280209 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 15280243 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 15280255 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 15280342 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 15280518 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15281314 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 15281365 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 15281573 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 15281581 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 15281597 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 15281607 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 15281833 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 15282131 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 15282141 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 15282161 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 15282196 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 15282199 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 15282223 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 15282374 T C Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 15282498 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 15282499 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 15282928 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 15283134 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15283227 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15283319 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15283946 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15284033 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15284137 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15284161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15284494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15284718 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15284807 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15284893 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 15285300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15285473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15285530 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15285551 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 15285873 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15286433 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15286610 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 15286694 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15286714 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 15286832 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15286925 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15287336 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 15287348 C A Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 15287368 T A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 15287752 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 15287813 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 15287850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15287951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15288030 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15288366 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 15288970 C T N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 15289225 A G Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 15289424 T C Y Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 15290115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15290195 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 15290413 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 15290503 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0 0.777777777777778 0.222222222222222 14 22 0 14 4 3 15290718 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 3 15290783 T C N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 3 15290799 T A N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 15290802 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 15290892 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 15290893 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 15291035 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 15291094 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15291133 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 15291198 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 15291342 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 15291377 T C Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 15291438 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15291814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15291828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15292158 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 15292340 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 15292417 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15292512 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 15292834 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15292915 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15293470 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 15293860 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 15293961 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15294108 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 15294325 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15294350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15294774 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 15294831 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15294848 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 15294972 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15295188 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 15295390 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 15295434 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15295881 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 15295985 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 15296041 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 15296073 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15296080 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 15296514 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15296623 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 15296785 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 15296982 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15297116 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 15297202 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 15297430 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15297444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15297609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15297722 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15298065 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15298166 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15298210 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 15298305 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 15298417 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15298429 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 15298543 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15298630 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 15298826 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 15298909 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 15299006 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 15299088 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15299231 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 15299265 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 15299365 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 15299390 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 15299413 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 15299453 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 15299491 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15299512 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15299549 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15299663 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15299799 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 15299832 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 15299873 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15299922 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15300028 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15300049 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 15300104 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15300122 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15300516 G T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 15300561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15300563 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15300597 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15300616 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15300675 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15300718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15300736 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15300748 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15300750 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15300805 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15300832 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15300856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15300922 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15300969 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15300971 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15301034 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 15301087 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 15301146 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 15301260 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 15301562 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15301600 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15301716 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 15301810 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 15301824 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 15301965 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15302187 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 15302217 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15302221 C A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 15302284 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 15302330 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15302427 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 15302515 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15302575 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15304257 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15304282 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 15304495 A T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 15305066 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 15305243 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15305389 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 15305427 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 15305528 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 15305548 T C Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 15305563 C G Y N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 15305693 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 15305725 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 15305815 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 15305843 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 15305883 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 15305917 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15305972 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15306005 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 15306057 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15306132 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 15306303 A C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 15306469 C T Y Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0 1 0 7 7 0 7 0 3 15306529 G A N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 15306582 C T Y Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 15313173 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 15313466 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 15313474 C A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 15313528 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15313533 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15313562 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15313565 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 15313786 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15313831 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 15313875 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 15313877 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 15313890 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 15313925 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 15313939 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 15313991 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 15314003 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 15314014 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 15314151 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 15314212 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15314296 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15314359 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 15314366 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15314387 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15314400 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15314416 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15314419 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15314433 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15314463 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15314496 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15314558 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 15314578 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15314597 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15314679 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 15314724 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 15314739 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 15314815 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 15314874 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15314885 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15314922 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15314970 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15314984 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15314994 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15315014 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15315068 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 15315071 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15315104 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15315115 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15315139 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 15315159 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 15315161 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 15315189 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15315191 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15315236 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 15315285 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 15315337 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15315338 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15315350 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15315369 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15315379 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15315452 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 15315497 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 15315498 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 15315675 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 15315848 G A Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 15315849 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 15316072 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15316310 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 15316371 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15316624 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15317265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15317367 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 15317479 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 15317561 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15317572 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15317759 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 15317892 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 3 15317975 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 15317982 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 15318058 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 15318094 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15318116 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15318251 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15318521 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 15318578 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 15318656 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 15318755 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 15318980 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15319036 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15319254 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 15319280 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 15319324 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 15319342 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 15319357 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 15319410 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 15319528 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 15319628 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 15319757 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 15319772 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 15319816 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 15319822 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 15319923 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 15319957 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 15319961 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 15320217 G T Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 15320227 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 15320245 G T Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 15320321 A G Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 15320335 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 15320347 C A Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 15320358 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 15320360 A C Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 15320476 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 15321027 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15321133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15321147 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 15321172 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15321209 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15321241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15321272 G T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 15321349 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15321350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15321403 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15321431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15321554 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15321572 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15321587 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15321635 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15321717 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15321760 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15321801 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15321810 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15321842 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15321867 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15321897 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15321915 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15321969 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15321973 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15322004 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15322088 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15322118 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15322227 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 15322241 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 15322489 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 15322585 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 15322680 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 15322784 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 15322787 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 15322811 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 15322837 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15322897 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15323213 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15323236 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15323268 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15323284 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15323312 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15323316 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15323486 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15323501 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15323515 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15323561 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15323586 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 15323607 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 15323608 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 15323635 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 15323682 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 15323701 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 15323727 C A Y N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 3 15323797 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 15323870 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15323886 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15323956 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15324005 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15324029 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15324122 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 15324179 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15324259 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15324321 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15324387 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 15324406 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 15327175 G A Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 15327191 A T Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 15327202 G A Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 15335762 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 3 15336217 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 15337176 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15338740 A C Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 15339854 T G Y N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0 1 0 15 15 0 15 0 3 15339920 C T Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 15340711 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15340851 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 15340914 G C Y N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 3 15341016 T A N N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0 0.916666666666667 0.0833333333333333 11 13 0 11 1 3 15342131 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 15342405 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 15342524 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15343225 G C Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 15343307 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 3 15345324 T C Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 15345406 G C Y N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 15345440 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 15345820 T C Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 15345840 G T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 15345846 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 15345956 T C Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 16 20 0 16 2 3 15347961 A G Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 16 12 2 12 0 3 15349313 T A Y N 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 12 6 3 6 0 3 15349402 C T Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.125 0.75 0.125 16 16 2 12 2 3 15349633 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 15349648 C T N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0 0.692307692307692 0.307692307692308 9 17 0 9 4 3 15352259 G T Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 15352281 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 15354040 C T Y Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 7 11 1 5 3 3 15354230 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 15354927 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15355002 G A Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 15355104 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 15355604 A G Y Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 15356103 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 15356199 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15356342 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 15356594 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 15356617 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15356703 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 3 15357374 A C Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 15357393 T G Y N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.117647058823529 0.705882352941177 0.176470588235294 16 18 2 12 3 3 15357846 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15357978 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15358137 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 15358713 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 15360197 C T Y Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 15360254 G C Y N 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 3 15360884 C T Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 15361137 C T Y Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 3 15361286 G A Y Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 3 15361538 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15361776 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15362745 G A Y Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.363636363636364 0.636363636363636 0 15 7 4 7 0 3 15362751 G A Y Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0 0.636363636363636 0.363636363636364 7 15 0 7 4 3 15362836 T G Y N 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0 1 0 11 11 0 11 0 3 15362843 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 15362882 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 15363463 T C Y Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0 0.769230769230769 0.230769230769231 10 16 0 10 3 3 15363666 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 15363673 A G Y Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 10 14 2 6 4 3 15363683 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 15363862 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 15363949 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15364918 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 15366313 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15366343 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 15367562 C T Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 15368966 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 3 15368982 C T Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 3 15370852 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.0588235294117647 17 17 1 15 1 3 15371061 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15371068 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15371146 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15371617 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 15373139 T A Y N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.2 0.8 0 6 4 1 4 0 3 15374970 T A Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 15375479 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 15375696 A T Y N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 15375719 A T Y N 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.1 0.9 0 11 9 1 9 0 3 15377045 A G Y Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 12 16 0 12 2 3 15377120 A G N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.333333333333333 0.583333333333333 0.0833333333333333 15 9 4 7 1 3 15377606 C G Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 15377608 A C Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 3 15377675 C T Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 15377836 C T Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 15378020 C T Y Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.25 0.75 0 10 6 2 6 0 3 15378573 A T N N 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 7 9 0 7 1 3 15378808 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 15379532 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 15379682 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 3 15379835 A G Y Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.2 0.8 0 12 8 2 8 0 3 15379861 G C Y N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 3 15380011 A C N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.181818181818182 0.0909090909090909 0.727272727272727 5 17 2 1 8 3 15380073 T G Y N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 15380086 C G Y N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0 0.846153846153846 0.153846153846154 11 15 0 11 2 3 15380124 G A Y Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 14 12 1 12 0 3 15380134 G A Y Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.0714285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 13 15 1 11 2 3 15380165 C G Y N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 9 7 2 5 1 3 15380307 T G Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 15380400 A C Y N 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 3 15380438 G A Y Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.2 0.8 0 12 8 2 8 0 3 15380573 C A Y N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.5 0 0.5 4 4 2 0 2 3 15380650 A T Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 15380670 T G Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 15380690 A C Y N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 3 15380736 G A Y Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 3 15381189 G T Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 15383093 A C Y N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 15384117 T C Y Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0 0.6875 0.3125 11 21 0 11 5 3 15385765 T C Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 15385900 C A Y N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 3 15385923 C T Y Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0 0.8 0.2 12 18 0 12 3 3 15389929 C T Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 15391043 A T Y N 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 3 15391153 C T Y Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 3 15391295 C T Y Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 13 7 6 1 3 3 15391574 G T Y N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 3 15392835 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 15393324 C T Y Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 3 15393664 A G Y Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 7 9 1 5 2 3 15394119 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 15394200 A G Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 15394666 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 3 15394747 T G Y N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 15394906 G A Y Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 5 9 2 1 4 3 15395583 C A Y N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 3 15395607 C T Y Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 11 9 3 5 2 3 15395693 T A Y N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.272727272727273 0.727272727272727 0 14 8 3 8 0 3 15396200 G A Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0 0.705882352941177 0.294117647058824 12 22 0 12 5 3 15396449 C A Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 15396568 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 12 24 0 12 6 3 15396705 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 10 20 0 10 5 3 15396758 C T Y Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0 0.8 0.2 12 18 0 12 3 3 15396766 T A Y N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0 0.8 0.2 12 18 0 12 3 3 15396770 A G Y Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0 0.785714285714286 0.214285714285714 11 17 0 11 3 3 15396965 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 15398724 G C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0 0.647058823529412 0.352941176470588 11 23 0 11 6 3 15398820 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 3 15398871 T C N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 3 15398971 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 15398985 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 15398990 C A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 15399086 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 10 20 0 10 5 3 15399113 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 15399146 C A N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 15399160 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 15399173 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0 0.75 0.25 12 20 0 12 4 3 15399248 T A Y N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 15399249 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 15399294 T A N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 12 16 0 12 2 3 15399353 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 15399384 T C N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0 0.785714285714286 0.214285714285714 11 17 0 11 3 3 15399405 G A N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0 0.769230769230769 0.230769230769231 10 16 0 10 3 3 15399441 G A N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.0769230769230769 0.769230769230769 0.153846153846154 12 14 1 10 2 3 15399501 A C Y N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 13 11 1 11 0 3 15399527 A T N N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0 1 0 12 12 0 12 0 3 15399602 C A Y N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0 0.846153846153846 0.153846153846154 11 15 0 11 2 3 15399635 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 15399713 T G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 15399741 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 15399870 T C N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0 1 0 12 12 0 12 0 3 15399889 A T Y N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 9 7 1 7 0 3 15399987 A C N N 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.3 0.7 0 13 7 3 7 0 3 15399990 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 12 6 3 6 0 3 15400434 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 15400622 C G Y N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.0714285714285714 0.714285714285714 0.214285714285714 12 16 1 10 3 3 15400635 G A Y Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 3 15400652 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.0666666666666667 0.666666666666667 0.266666666666667 12 18 1 10 4 3 15400687 T A N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.0625 0.625 0.3125 12 20 1 10 5 3 15400794 A G N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 3 15400818 A T Y N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.272727272727273 0.727272727272727 0 14 8 3 8 0 3 15400893 C T Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 15400929 A T Y N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0 0.916666666666667 0.0833333333333333 11 13 0 11 1 3 15400942 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 15400981 A T Y N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 12 10 1 10 0 3 15401072 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 10 22 0 10 6 3 15401130 C T N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0 0.916666666666667 0.0833333333333333 11 13 0 11 1 3 15401140 T A Y N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0 0.916666666666667 0.0833333333333333 11 13 0 11 1 3 15401346 T A Y N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0 0.8125 0.1875 13 19 0 13 3 3 15401397 G T Y N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0 0.75 0.25 12 20 0 12 4 3 15401485 G A Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0 0.764705882352941 0.235294117647059 13 21 0 13 4 3 15401505 A G Y Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.0666666666666667 0.733333333333333 0.2 13 17 1 11 3 3 15401532 A C Y N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 12 10 1 10 0 3 15401537 C T Y Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 12 10 1 10 0 3 15401567 T C Y Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.181818181818182 0.818181818181818 0 13 9 2 9 0 3 15401578 A T N N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.363636363636364 0.636363636363636 0 15 7 4 7 0 3 15401584 A T N N 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.3 0.7 0 13 7 3 7 0 3 15401602 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 15401618 A G N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0 1 0 10 10 0 10 0 3 15402131 G C Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 12 24 0 12 6 3 15402143 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 12 24 0 12 6 3 15402161 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 12 24 0 12 6 3 15402209 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 3 15402232 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 3 15402291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15402932 T A Y N 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0 1 0 7 7 0 7 0 3 15403023 T C Y Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.0909090909090909 0.727272727272727 0.181818181818182 10 12 1 8 2 3 15403116 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0833333333333333 0.666666666666667 0.25 10 14 1 8 3 3 15403156 A G N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.166666666666667 0.583333333333333 0.25 11 13 2 7 3 3 15403250 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0 0.8 0.2 12 18 0 12 3 3 15403412 T A Y N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0 0.75 0.25 12 20 0 12 4 3 15403579 G A Y Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0 0.928571428571429 0.0714285714285714 13 15 0 13 1 3 15403794 T A N N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 3 15403842 T C N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.25 0.75 0 15 9 3 9 0 3 15403877 G A Y Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0 0.846153846153846 0.153846153846154 11 15 0 11 2 3 15404121 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0 0.7 0.3 14 26 0 14 6 3 15404202 C T N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0 0.866666666666667 0.133333333333333 13 17 0 13 2 3 15404453 A G N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0 1 0 13 13 0 13 0 3 15404473 T C N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.181818181818182 0.818181818181818 0 13 9 2 9 0 3 15404533 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 15404547 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 15404575 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 16 14 1 14 0 3 15404741 G A Y Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0 1 0 13 13 0 13 0 3 15404810 T G Y N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0 0.866666666666667 0.133333333333333 13 17 0 13 2 3 15404884 G A Y Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0 1 0 10 10 0 10 0 3 15404907 G C Y N 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.181818181818182 0.818181818181818 0 13 9 2 9 0 3 15405009 T A Y N 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0 1 0 7 7 0 7 0 3 15405211 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.3 0.7 0 26 14 6 14 0 3 15405308 C G Y N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0 0.823529411764706 0.176470588235294 14 20 0 14 3 3 15405334 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0 0.933333333333333 0.0666666666666667 14 16 0 14 1 3 15405362 G A N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.0769230769230769 13 13 1 11 1 3 15405527 T C N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 15405529 G A N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 15405713 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 7 5 1 5 0 3 15405745 G C Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 15406345 A T Y N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 16 12 2 12 0 3 15406705 A G N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.1 0.8 0.1 10 10 1 8 1 3 15407209 T A Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0 0.722222222222222 0.277777777777778 13 23 0 13 5 3 15407439 T G Y N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0 0.8 0.2 12 18 0 12 3 3 15407712 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 15408097 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 15408994 A G Y Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.0833333333333333 12 12 1 10 1 3 15409262 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 15409361 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 3 15409563 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 15409574 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 15409970 T C Y Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.0666666666666667 15 15 1 13 1 3 15410274 C A Y N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0 1 0 9 9 0 9 0 3 15410293 T A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 15410438 G C Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 15410667 G A Y Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.307692307692308 0.615384615384615 0.0769230769230769 16 10 4 8 1 3 15411775 C T Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0 0.8125 0.1875 13 19 0 13 3 3 15413413 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 15413973 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 15414040 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 15414291 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 15414828 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 15414861 G T N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 15415709 T C Y Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 3 15415769 A G N Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 3 15415783 T A N N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 3 15415822 G C N N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 3 15415962 C T Y Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0 0.909090909090909 0.0909090909090909 10 12 0 10 1 3 15416059 G C Y N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 3 15416093 C G Y N 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 12 6 3 6 0 3 15416229 A C N N 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.444444444444444 0 0.555555555555556 8 10 4 0 5 3 15416232 T G N N 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.444444444444444 0 0.555555555555556 8 10 4 0 5 3 15416279 T C N Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.5 0 0.5 4 4 2 0 2 3 15416300 A G Y Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 15416442 T A N N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 15416550 G A Y Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 3 15416560 G A Y Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 15416637 T C Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 15416643 C T Y Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 3 15417069 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 15417117 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 15417171 T C Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 15417185 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 15417232 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 15417724 C T Y Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.363636363636364 0.636363636363636 0 15 7 4 7 0 3 15418113 C G Y N 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 3 15418888 A T Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 15418916 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 15419060 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 15419228 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15419294 G A Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 15419317 A T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 15419332 A G Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 15419377 G C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 15419442 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15419464 A G Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 3 15419485 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15419516 A T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 15419675 T A Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 15419718 G T Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 15419728 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 15419879 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 15419945 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 15419974 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 15420173 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 15420635 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15420652 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 15422193 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15422276 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15422366 A C Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 15422450 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 15422483 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 15422616 C T Y Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 15422658 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15424709 C A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 15425516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15425810 C T N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 9 11 3 3 4 3 15425815 T C N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 3 15425893 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 15426635 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 15426815 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 3 15427190 A T N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 15427209 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 15427257 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 15427701 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 15427917 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 15428404 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15428417 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 15428693 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15429084 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 15429290 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15434584 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15434744 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15435349 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15436605 A C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 15436620 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 15436808 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 15436820 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 15437074 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 15437103 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 3 15437191 A G Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 15437607 G T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 15437773 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 15437840 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15439227 C G Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 15439316 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 15439937 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 15440899 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15441560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15441565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15441941 T A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 15443003 T C Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 3 15443077 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 15443151 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 15443325 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 15443361 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 15443414 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 15443424 A T N N 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.25 0.75 0 10 6 2 6 0 3 15443507 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 12 6 3 6 0 3 15443532 G T N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 15443545 T A N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0 0.769230769230769 0.230769230769231 10 16 0 10 3 3 15444176 A T Y N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.5 0 0.5 4 4 2 0 2 3 15444282 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 15444308 A G Y Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0 0.75 0.25 6 10 0 6 2 3 15444396 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 15444490 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 15444964 A G Y Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 15445044 C A Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 15445095 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 15445199 C G Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 3 15445284 G A Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0 0.722222222222222 0.277777777777778 13 23 0 13 5 3 15445539 A G Y Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0 0.636363636363636 0.363636363636364 7 15 0 7 4 3 15445743 T A Y N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0 0.7 0.3 7 13 0 7 3 3 15445779 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 15445787 A G Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 15445796 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15446918 G T Y N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 3 15447065 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 3 15447227 T C Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 15447296 C A Y N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 3 15447344 T G N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 3 15447415 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 8 16 0 8 4 3 15447462 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 15447505 C T Y Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0 0.615384615384615 0.384615384615385 8 18 0 8 5 3 15447603 G C Y N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.0769230769230769 0.769230769230769 0.153846153846154 12 14 1 10 2 3 15447608 G A Y Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.0769230769230769 0.769230769230769 0.153846153846154 12 14 1 10 2 3 15447678 C G Y N 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0833333333333333 0.666666666666667 0.25 10 14 1 8 3 3 15447685 A G Y Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0 0.7 0.3 7 13 0 7 3 3 15448529 T C Y Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.230769230769231 0.769230769230769 0 16 10 3 10 0 3 15448955 A T Y N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.111111111111111 0.777777777777778 0.111111111111111 9 9 1 7 1 3 15449104 G A Y Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 3 15449319 T C Y Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0 0.692307692307692 0.307692307692308 9 17 0 9 4 3 15449649 T C Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 15449667 A T Y N 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 8 6 2 4 1 3 15449694 A G Y Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 3 15449842 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 15449850 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15450114 G C Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 15450320 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 15450364 G T Y N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 15450626 G A Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 3 15450661 G A Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 15450710 C T Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 3 15450744 C G Y N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.0833333333333333 0.583333333333333 0.333333333333333 9 15 1 7 4 3 15450753 G T Y N 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.0909090909090909 0.636363636363636 0.272727272727273 9 13 1 7 3 3 15450821 G A Y Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.0833333333333333 12 12 1 10 1 3 15450822 G T Y N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.0769230769230769 13 13 1 11 1 3 15450964 G A Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.0555555555555556 18 18 1 16 1 3 15451271 G C Y N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 3 15453224 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 15453251 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0 0.8 0.2 12 18 0 12 3 3 15453353 T A N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 15453659 A T Y N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 15453890 A T N N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 3 15453892 C T N Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 3 15453964 C T Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 15453984 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 15454901 A T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 15455064 A C Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 3 15455098 A C Y N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 3 15455124 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 15455285 A C Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 15455594 T A Y N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 3 15456015 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 15456652 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 15456673 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 15456698 G A Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 15456955 G A Y Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 15456970 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 15457011 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 15457038 C T Y Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 7 9 0 7 1 3 15457428 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 15458208 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 15458220 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 15458958 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 15458970 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15458982 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 15459027 C T Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 15459475 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 15459772 C G N N 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 3 15459783 G T N N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 3 15459914 C A N N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 3 15461073 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 5 7 1 3 2 3 15461154 A G N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 3 15461159 G C Y N 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.444444444444444 0 0.555555555555556 8 10 4 0 5 3 15461168 A T N N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 3 15461172 C A Y N 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 3 15461194 T A N N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 5 5 2 1 2 3 15461207 A G N Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 3 15461254 A G N Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 3 15461291 C T N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 3 15461364 A G N Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 3 15462046 T C Y Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.5 0 0.5 8 8 4 0 4 3 15465421 C T Y Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 3 15465435 G C Y N 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 3 15470872 A G Y Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 8 6 1 6 0 3 15471063 T C Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 15471435 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 3 15471957 T A Y N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 15474262 A G Y Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 3 15475396 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 15477223 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 15478812 T A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 15479365 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 15479703 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 15479949 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 15480236 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 3 15480266 G A Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 15480414 T G Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 15481029 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15481221 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 15481690 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 15481810 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 15483392 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 15483732 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 15483956 A C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 15484066 T C Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 15484081 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 15484082 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 15484160 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 15485868 A C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 15485906 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 15486236 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 3 15488155 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 15490228 A G Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 15490916 C T Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 15494255 T C Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 3 15494256 G A Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 15494316 A C Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 15494397 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 15494601 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 15497139 T A Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 15497399 G C Y N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 5 11 0 5 3 3 15499058 C T Y Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 3 15499913 G A Y Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.2 0.8 0 6 4 1 4 0 3 15501287 T C Y Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 3 15501416 A C Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 15502398 T C Y Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 3 15502414 C A Y N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 3 15502431 G A Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 15502601 G T Y N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 3 15504536 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15505707 A G Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 15505847 C T Y Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.25 0.75 0 15 9 3 9 0 3 15507213 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15507302 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 3 15507327 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 15507405 A G Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 15507445 T A Y N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 15507476 T G Y N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 12 16 0 12 2 3 15507492 G T Y N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 15507603 G A Y Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 3 15507751 C T N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 15507802 T G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 15508325 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 15508734 G C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 3 15508744 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15508770 T G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 15508877 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 15 21 0 15 3 3 15508959 T C N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 3 15508977 G A N Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 3 15509172 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 15509185 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 15509235 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 15510188 C T Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 15510424 G T Y N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 15510493 A C N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 15510704 A G Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 15510798 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15511550 G A Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 15511581 G A Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 15512250 A C Y N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 3 15512251 A C Y N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 15522643 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 15522720 T G Y N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.0625 0.875 0.0625 16 16 1 14 1 3 15522905 A T Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 15522973 A C Y N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 15522989 A C Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 15522996 T G Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 15523202 A G Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 15523726 T C Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 15523744 A G Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 15523823 T A Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 15523846 T C Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 15523934 G C Y N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 15523970 C T Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 15524140 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 15524158 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 15524338 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15524346 T C Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 15524365 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 15524586 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15524589 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 15524814 A G Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 15524831 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 15525035 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 15525059 C T N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 15525092 G A Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 15528522 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 15528579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15529073 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 15529261 A G Y Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 3 15529349 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 3 15529386 A T Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 15529411 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 15529435 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 3 15529547 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 15529582 C A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 15529675 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 15529714 G T N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 15529727 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 15529739 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 15529789 T A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 15529850 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 15529884 T A Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 15529922 T C Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 15529988 A G Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 3 15530033 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 15530040 A T N N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 15530055 A G N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 3 15530066 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 15530494 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 15530497 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 15533820 T A Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 15534034 A G Y Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 11 7 3 5 1 3 15534188 G A Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 3 15534231 T A Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 15534259 A T Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 15534332 T A N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 15534445 G A Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.1875 0.75 0.0625 18 14 3 12 1 3 15534480 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.105263157894737 0.842105263157895 0.0526315789473684 20 18 2 16 1 3 15534743 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0 0.894736842105263 0.105263157894737 17 21 0 17 2 3 15535150 T C Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 14 18 0 14 2 3 15535252 G T Y N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.0588235294117647 0.823529411764706 0.117647058823529 16 18 1 14 2 3 15535323 G C N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.0769230769230769 0.769230769230769 0.153846153846154 12 14 1 10 2 3 15535783 A G Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 15535825 G C Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 15535880 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15536138 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15536170 G T N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 15536198 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 15536214 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 15537132 T C N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.0666666666666667 15 15 1 13 1 3 15537402 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.222222222222222 0.722222222222222 0.0555555555555556 21 15 4 13 1 3 15538306 G T Y N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0 0.928571428571429 0.0714285714285714 13 15 0 13 1 3 15539197 T C N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 15539575 T A Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.105263157894737 0.842105263157895 0.0526315789473684 20 18 2 16 1 3 15539741 A T Y N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 15539752 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 15539757 C T Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 15540373 G A Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 15540778 G A Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.1875 0.75 0.0625 18 14 3 12 1 3 15540835 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 15541398 T G Y N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.0588235294117647 17 17 1 15 1 3 15543460 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 15544132 G T Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 15547051 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15547196 A G Y Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0 1 0 15 15 0 15 0 3 15547463 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.105263157894737 0.842105263157895 0.0526315789473684 20 18 2 16 1 3 15548170 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15548242 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 15548260 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 15548262 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 15548594 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 15548673 A G N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 3 15548740 G T Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 3 15548953 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 15549258 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15549266 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 3 15549960 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 3 15550060 T A Y N 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 6 8 0 6 1 3 15550080 T C Y Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.166666666666667 0.75 0.0833333333333333 13 11 2 9 1 3 15550115 C T Y Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 15 13 1 13 0 3 15550956 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15551196 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 15551200 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 15552533 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 15552553 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 15552580 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 3 15552637 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 15552676 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 15552690 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 15552760 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 3 15553042 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 15553068 A C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 3 15553696 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 15553706 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 15553749 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 15553814 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 15554180 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 15554220 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 15554900 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15554904 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15555043 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15555107 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 3 15555189 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 15555273 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 15555287 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 15555299 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 15555376 A C Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 15555385 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15555487 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 15555508 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15556149 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 15556360 A T N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 3 15556659 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15557914 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 15557951 A C Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 15559189 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15559832 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 15559950 T G Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 15560142 T A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 15560154 A T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 15560168 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 15560178 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 3 15561264 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 15561287 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 15561359 T G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 15561388 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 15561401 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 3 15561411 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 15561466 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 15561521 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 15561568 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 15561589 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 15561601 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15561614 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 15561627 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 15561646 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 15561745 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 15561809 C A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 15561864 C G N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 3 15561995 A G Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 15562093 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 15562151 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 3 15562502 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 15562574 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 15562578 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 3 15563626 T A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 15563711 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 3 15563915 G T Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 15563935 A C Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 15564109 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 15564123 C A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 15564126 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 15564877 T A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 15566949 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 15566956 T G Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 15568022 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 3 15568025 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 15568396 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 15568481 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 15568927 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 3 15568946 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 3 15568986 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 3 15569228 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 15569398 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 15569412 T G Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 15569455 G T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 15569516 T G Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 15569865 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15569889 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 15572249 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15572301 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 15573539 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 15574095 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15574831 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15575293 G C N N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.1 0.8 0.1 10 10 1 8 1 3 15575353 A C N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.3125 0.625 0.0625 20 12 5 10 1 3 15575359 G T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 15576272 C G Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 3 15577872 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 15577993 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15578244 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 15578288 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 15578354 C G Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 15578386 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15578439 G C Y N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.25 0.6875 0.0625 19 13 4 11 1 3 15578463 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.25 0.6875 0.0625 19 13 4 11 1 3 15578476 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15578489 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.222222222222222 0.722222222222222 0.0555555555555556 21 15 4 13 1 3 15578679 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 15579379 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 15579462 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 3 15580534 T A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 15581338 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 15581396 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 15581397 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 15581548 A T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 3 15581594 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 15581609 T G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 15581614 T A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 15581790 T G Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 15581839 T C Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 15582425 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 15582536 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 15582622 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15582750 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 15582759 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 15583104 C T N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.153846153846154 0.769230769230769 0.0769230769230769 14 12 2 10 1 3 15583412 G C Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 15583520 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15583537 T G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 15583538 T A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 15583841 A G Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 15584026 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 15584073 T A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 15584145 A G Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 15584152 G T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 15584320 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 15584460 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 15584474 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15584813 T A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 15584999 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 15585205 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 3 15585350 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 15585362 A T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 3 15585572 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 15585718 A T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 15585838 T C Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 15586188 G A Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 15586209 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 15586443 T C Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 15586491 T C Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 15586582 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 15586791 G T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 15586869 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 15586882 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 15587462 T G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 15587828 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 15588064 G T Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 15588073 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 15588152 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15588395 T G Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 15588482 T C Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 15588589 G T Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 15588636 A C Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 15588729 G T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 15588744 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 15588890 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15589912 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 15589945 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 15590145 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15591862 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 15592033 C A Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 15592058 G T Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 15592092 G A Y Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 15592113 A C Y N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0 0.583333333333333 0.416666666666667 7 17 0 7 5 3 15592350 T C Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 15592355 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15592363 C T Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 15592368 C A Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 15592375 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15592564 A T Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.3125 0.625 0.0625 20 12 5 10 1 3 15592595 A G Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 15592637 A T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 15592971 G A Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 15593421 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 15593424 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 15593464 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15593817 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 15594311 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 15594409 G C Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 15594414 G A Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 15594465 T C Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 15594988 C G Y N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 15595126 T C Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 15595367 A G Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 15595649 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15596152 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 15596288 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 15597698 T C Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 3 15598123 A G N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 15598658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15598809 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 15598951 G T Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 15599184 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15599330 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 15599460 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 15599476 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 15599519 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 3 15599553 A G Y Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 7 9 2 3 3 3 15599691 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 15600047 G T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 15600164 A C N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 15600313 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 15600316 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 15600797 T C Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 15600822 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 15600899 A C Y N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 15600994 T G N N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 3 15601800 G T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 15602217 A G Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 16 20 0 16 2 3 15602544 C T Y Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 3 15603338 A G Y Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0 0.846153846153846 0.153846153846154 11 15 0 11 2 3 15603349 T C Y Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.1 0.9 0 11 9 1 9 0 3 15603369 C T Y Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 3 15603405 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 3 15603417 T C Y Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 5 7 1 3 2 3 15603420 T C Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 15603443 G T Y N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.0769230769230769 13 13 1 11 1 3 15603455 T A Y N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 3 15603825 C T Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 15603996 T A Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 15604018 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 15604085 G T Y N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0 0.6875 0.3125 11 21 0 11 5 3 15604242 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 15604262 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 15604267 T C Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 15604304 A C Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0 0.842105263157895 0.157894736842105 16 22 0 16 3 3 15604316 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 3 15604832 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 15604846 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 15606633 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 15607678 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 15607719 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 15607902 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 15607998 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 15608838 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 15608854 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15608918 C G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 15609021 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 15610515 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 15610533 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 15663101 A G N Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.25 0.75 0 10 6 2 6 0 3 15672953 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 15673160 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 15675660 G C Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 15678243 A G Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 15678404 C T Y Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.2 0.8 0 6 4 1 4 0 3 15678504 G A Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 15678925 A G Y Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 3 15690544 T C N Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 3 15691034 T C Y Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 3 15691082 T G Y N 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 4 2 2 0 1 3 15691178 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 3 15691408 T C Y Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0 0.642857142857143 0.357142857142857 9 19 0 9 5 3 15691528 G C Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 15691629 T C Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 15692224 C A Y N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 8 12 1 6 3 3 15692700 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15692733 G T N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.230769230769231 0.769230769230769 0 16 10 3 10 0 3 15694821 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 15694822 T A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 15697148 C T Y Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0 1 0 11 11 0 11 0 3 15698924 C A Y N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 15698971 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 15699031 G T Y N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 3 15699477 T G Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 15700700 A T Y N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 15702321 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 15702376 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 15705023 T A Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 15706449 C T Y Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 3 15708923 C A Y N 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 10 8 1 8 0 3 15710029 A G Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 3 15714148 T A Y N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 9 7 1 7 0 3 15715518 G A Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 15716715 C T Y Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0 0.909090909090909 0.0909090909090909 10 12 0 10 1 3 15716965 T G Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 15717052 C A Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 15724226 G A Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.133333333333333 0.8 0.0666666666666667 16 14 2 12 1 3 15724269 T A Y N 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0 0.818181818181818 0.181818181818182 9 13 0 9 2 3 15725838 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 15726467 C T Y Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0 0.928571428571429 0.0714285714285714 13 15 0 13 1 3 15727217 A T Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 15728521 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15728534 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 3 15728607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15728707 A T Y N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0 0.615384615384615 0.384615384615385 8 18 0 8 5 3 15730649 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 15730798 G A Y Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0 0.8 0.2 8 12 0 8 2 3 15731598 A T Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 15733859 C A Y N 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 8 6 1 6 0 3 15733872 T G Y N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 3 15734466 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0 0.733333333333333 0.266666666666667 11 19 0 11 4 3 15734474 T C Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 15734638 G C N N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0 0.8 0.2 8 12 0 8 2 3 15734647 T G N N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0 0.8 0.2 8 12 0 8 2 3 15736064 G A Y Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 15736090 T C Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 15736280 G C Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 15736325 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 15736367 T A Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 15736599 G A Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 15736756 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 15736803 T C Y Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.307692307692308 0.615384615384615 0.0769230769230769 16 10 4 8 1 3 15736831 C T Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 15736890 G A Y Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.25 0.75 0 15 9 3 9 0 3 15738042 A G N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 15738168 A T Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 15738173 G A Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 15738310 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 15738513 G A Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 15738666 G A Y Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 3 15738671 C T Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 15738700 C G Y N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 15738744 G T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 15738749 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 15738971 A G Y Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 5 9 1 3 3 3 15739115 G A Y Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 3 15739250 T C Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 3 15739367 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 15739387 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15739605 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 15739752 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 15740057 A G Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 15740071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15740997 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 3 15741020 A T Y N 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 3 15741022 A C Y N 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0 0.8 0.2 4 6 0 4 1 3 15741035 A G Y Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 3 15741080 G C N N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 3 15741111 T C N Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 3 15741167 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 3 15741389 C T N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.363636363636364 0.636363636363636 0 15 7 4 7 0 3 15741569 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 15741580 G A N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 3 15742017 T A Y N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 3 15742221 G A Y Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 3 15742442 C T Y Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 3 15742532 G A Y Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 15742537 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 15742798 T C Y Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.416666666666667 0.583333333333333 0 17 7 5 7 0 3 15742861 A G Y Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 3 15742885 A G Y Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.416666666666667 0.583333333333333 0 17 7 5 7 0 3 15742900 C A Y N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.416666666666667 0.583333333333333 0 17 7 5 7 0 3 15742931 T A Y N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 13 11 1 11 0 3 15743152 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 15743198 A C Y N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 15743244 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 15743265 C T Y Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 15743267 T C Y Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 3 15743375 T C Y Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.416666666666667 0.583333333333333 0 17 7 5 7 0 3 15743508 G T Y N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 15743592 G T Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 15744171 G C Y N 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 15744333 A C Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 15744464 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 15744605 G A Y Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0 1 0 12 12 0 12 0 3 15744677 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 15744908 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 15745235 T A N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 3 15745443 C T N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 3 15745453 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 15745492 T C N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 3 15745576 A G Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 15745592 C G N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 15745767 T C N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 15745903 A C N N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 13 11 1 11 0 3 15745995 C T Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 15746036 A G N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0 1 0 12 12 0 12 0 3 15746219 A G N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0 0.916666666666667 0.0833333333333333 11 13 0 11 1 3 15746609 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 15746631 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 15746730 A T Y N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 15746801 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 15746845 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 15746901 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 15747089 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 3 15747160 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 15747558 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 15747755 T C N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 3 15747789 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 15748018 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 15748049 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 15748158 A T N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 15748583 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 15748604 A T Y N 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.3 0.7 0 13 7 3 7 0 3 15748633 A C Y N 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 3 15748795 T C Y Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 3 15748935 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 15749001 A T Y N 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 8 10 0 8 1 3 15749049 A C Y N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 15749167 A T Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 15749192 A T Y N 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 12 6 3 6 0 3 15749529 C A Y N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 3 15749824 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 3 15750036 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 3 15750048 C T Y Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 3 15750351 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 15751042 G T Y N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 3 15751053 G C N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 3 15751178 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 3 15751313 G A Y Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 3 15751349 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 15751376 A C Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 15751779 G A Y Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 3 15752000 A G Y Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 3 15752135 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 3 15752180 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 3 15752483 G C Y N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 3 15752516 C T Y Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 3 15752730 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 3 15753112 A T Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 15753511 G C Y N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 3 15753950 A T Y N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 15754065 A G Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 15754445 A T Y N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 3 15754488 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 15754678 C T Y Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 3 15754832 A C Y N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 15755105 T A Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 3 15755117 C T Y Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0 1 0 11 11 0 11 0 3 15755153 T A Y N 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.181818181818182 0.818181818181818 0 13 9 2 9 0 3 15755196 C T Y Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.363636363636364 0.636363636363636 0 15 7 4 7 0 3 15755216 C G Y N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 13 11 1 11 0 3 15755306 C A Y N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0 1 0 12 12 0 12 0 3 15755637 A T Y N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 3 15756448 A C Y N 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 8 6 1 6 0 3 15756922 T C Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 15757158 G T Y N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 3 15757584 T A Y N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 12 10 1 10 0 3 15757591 C A Y N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 12 10 1 10 0 3 15758608 A G Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 3 15758667 G A N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 3 15758770 C T Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 15758808 T A N N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 12 10 1 10 0 3 15758836 T C N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0 0.923076923076923 0.0769230769230769 12 14 0 12 1 3 15758990 T C Y Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 13 11 1 11 0 3 15759100 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 15759140 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 15759165 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 15759392 T A Y N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 9 7 1 7 0 3 15759567 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 3 15760299 G A Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 15760334 G A Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 15760356 G C Y N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 15760723 T C Y Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 15760977 G A Y Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.25 0.75 0 15 9 3 9 0 3 15761063 G C Y N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 13 11 1 11 0 3 15761245 G A Y Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 13 11 1 11 0 3 15761555 A G Y Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 15762817 T A Y N 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 3 15765187 C A Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 15765257 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 15765266 A G Y Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 15765446 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15765604 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 15765619 T C N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 15765638 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 15765643 G C N N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 13 11 1 11 0 3 15765740 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 15766047 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 15766961 A C Y N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 10 20 0 10 5 3 15766984 G A Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 3 15766989 C T Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.266666666666667 0.666666666666667 0.0666666666666667 18 12 4 10 1 3 15767303 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 15767654 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 15767659 A C Y N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 15767709 G A Y Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 3 15767725 A T Y N 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 3 15774858 G A Y Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 8 10 2 4 3 3 15774877 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 15774980 G A N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 15774994 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 15775138 C T Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 15775199 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 15775307 C G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 15775489 T C Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.0588235294117647 17 17 1 15 1 3 15775526 A C Y N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0 0.923076923076923 0.0769230769230769 12 14 0 12 1 3 15775538 A G N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 13 11 1 11 0 3 15775633 C T Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0 0.933333333333333 0.0666666666666667 14 16 0 14 1 3 15775714 C G Y N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 3 15775734 C T N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0 1 0 14 14 0 14 0 3 15775900 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 15776060 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 15776077 A G Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 15776307 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 15776308 T G Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 15776339 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 15776382 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 15776462 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 15776480 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 15776663 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15776732 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 15776853 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 15776886 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15776910 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15777126 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 15777148 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 15777199 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 15777294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15777351 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 15777513 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15777618 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 15778138 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 15778187 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 15778401 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15778409 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15778484 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15778597 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 15778650 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 15778690 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 15778803 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15779092 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15779115 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15779150 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15779244 C A Y N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 3 15779646 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 6 8 1 4 2 3 15779802 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 15779896 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15779927 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15779934 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15780045 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 15780047 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15780256 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15780333 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 15780366 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15780483 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 3 15780589 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15781016 T C Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 15781152 A G Y Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 3 15781194 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 15781213 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 15781246 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 15781269 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 15781719 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 15781927 A G Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.105263157894737 0.736842105263158 0.157894736842105 18 20 2 14 3 3 15782142 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15782438 C G N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 3 15782478 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 15782706 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15782988 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 15783030 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15783231 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15783302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15783346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15783375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15783807 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 15784011 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15784044 G A Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 15784106 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 15784124 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 15784125 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 15784392 T A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 3 15784528 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 3 15785345 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15785388 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15785520 A C Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 15785551 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 15785562 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 15785578 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15785594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15785644 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 15785663 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 15785708 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15785771 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 15785794 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15785831 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 15785904 A T Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 3 15785914 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 15785968 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 15786023 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15786038 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15786086 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 15786114 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 15786145 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 15786213 T A Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 15786224 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 15786236 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15786290 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 15786300 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15786345 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 15786403 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 15786636 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15786780 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.3 0.7 0 26 14 6 14 0 3 15787320 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15787383 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.0526315789473684 19 19 1 17 1 3 15787418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15787421 A C Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.0526315789473684 0.842105263157895 0.105263157894737 18 20 1 16 2 3 15787582 C G Y N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 15787968 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 15787985 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15788035 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 15788052 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 15788095 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 15788137 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15788179 T C Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 15788185 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 15788196 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 15788197 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 15788282 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 15788401 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15788444 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 15788491 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 15788540 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 15788554 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15788628 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 15788649 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 15788790 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 15788927 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15788937 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 15788943 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 15789018 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 15789062 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 15789338 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 15789426 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 15789460 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15789559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15789564 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 15789622 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 15789688 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 15789701 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 15789856 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 15789857 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 15789911 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 15789922 T C N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0 0.928571428571429 0.0714285714285714 13 15 0 13 1 3 15790069 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 15790129 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 15790193 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 15790322 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15790380 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 15790481 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 15790543 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 15790569 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 15790730 G A Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 3 15790829 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 15790883 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 15790969 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 15791071 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 15791144 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 15791216 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 15791233 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15791277 G A Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 15791541 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 15791587 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 15791689 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15791723 T A Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 15791819 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15792059 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 15792483 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 15793005 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 3 15793727 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 15793757 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 15795442 A G N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 15795831 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 15796488 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 3 15796737 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 15797733 C T N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.25 0 0.75 4 12 2 0 6 3 15797743 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 15798325 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 15798388 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 15798477 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15798577 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 15798585 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15798614 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15798637 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 15798670 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 15798702 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 15798806 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 15799180 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 15799626 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 15799676 C G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 15799682 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15799834 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 15799867 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 15800017 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 15800039 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 15800071 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15800099 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 15800386 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15800591 A G Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 15800626 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 15800857 T A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 15800892 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 15801004 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15801049 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 15801050 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 15801117 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 15801132 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 15801133 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 15801763 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 15801811 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15801830 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15802030 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 15802445 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 15802568 A G Y Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 15802672 T C Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 15802694 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 15802731 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 15802784 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 15802797 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 15802885 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15802900 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 15802981 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 15802982 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 15803113 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 15803269 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15803703 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 15803938 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 15803960 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 15803964 G A Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 15803983 G A Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 15803991 G A Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 15804073 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 15804201 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15804336 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 15804519 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 15805086 A T N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 15805094 G A N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 15805107 T C N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 15805119 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 15805171 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 15805197 A G Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 15805572 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 15805582 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 15805754 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 15805797 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 15805887 G T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 15805892 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 15805915 C A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 15806361 A G Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 15806433 C G Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 15806523 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 15806529 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 15806780 A T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 15806811 C A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 15806813 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 15807022 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 15807071 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 15807072 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 15807264 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 15807275 A C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 15807386 C A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 15807578 C G Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 15807995 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 15808058 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15808085 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 15808099 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 15808238 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 15808240 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 15808313 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15808404 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 15808418 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 15809651 A G N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 15809753 T C N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 3 15810133 G A N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 15810176 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 15811007 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15811217 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 15811371 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 15811884 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 15812286 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 3 15812327 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 15812408 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 15813353 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 3 15813432 G A N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 3 15813567 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 3 15813985 G C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 15814119 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 15814136 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 15814181 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 15814596 G A Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 3 15814776 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 15815036 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 15815186 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 15815211 C A Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 15815563 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 15815720 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 15815829 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 15815866 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 15815952 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 15816028 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 15816063 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 15816357 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 15816481 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 15816620 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 15816743 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 15816947 C A Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 15817084 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 15817137 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 15817179 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15817185 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 15817235 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 15817264 C A N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 15817473 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 15817520 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15817618 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 15817993 T C Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 15818001 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 15818060 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 15818273 C G Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 15818306 G A Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 15818315 A C Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 15818863 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 15818971 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 15819585 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 15820253 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 15820328 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15820404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15820923 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15821009 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 15821109 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 15821412 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 15821489 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 15821922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15821942 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 15821950 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 15822155 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15822360 G T N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 15829096 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 15829360 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 15829370 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 15829374 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15829387 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15829489 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 15829824 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15829825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15829888 A G Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 15829948 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 15830050 T C Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 15830094 G A Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 3 15830213 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15830229 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15830364 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 15830456 A G Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 15830474 T C Y Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 15830504 T A Y N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 15830513 T A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 15830657 G A Y Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 3 15830776 G T Y N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 3 15830824 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15830896 T C Y Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 15831195 T C Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 15831289 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 15831313 T A Y N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 15831359 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 15831624 G C Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 15831640 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 15831779 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 15831790 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15831916 T G Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 15832076 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15832156 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 15832365 G T Y N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 15832788 T C Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 15832909 T C Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 3 15832920 G C Y N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 15833122 A T Y N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 3 15833190 T G Y N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 15833318 A G Y Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 3 15833357 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 3 15833621 C T Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 15833696 G C Y N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 3 15833755 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 15833756 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 7 5 3 1 2 3 15833770 T C Y Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 8 8 3 2 3 3 15833786 A T Y N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 8 12 2 4 4 3 15833836 G A Y Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 15833885 C T Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 15834269 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 15834632 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15834807 G C Y N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 3 15834908 T A Y N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 15834971 C T Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 15835115 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 15835479 C G Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 15835498 C A Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 15835512 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 15835534 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15835627 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 15835640 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 15836369 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 15836784 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 15837382 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 15837411 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 15837425 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 15837441 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 15837456 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 15837577 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 15837672 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 15838004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15838139 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 15838140 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 15838254 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 15838565 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 15839283 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15839351 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 15839357 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15839367 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15839416 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15839426 T A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15839502 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15839565 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15839666 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 15839739 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15839774 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 15839807 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 15839815 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 15840069 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15840159 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 15840185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15840192 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 15840208 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 15840296 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 15840491 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 15840532 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15840628 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 15840910 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15841335 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15841518 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 15841531 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 15841608 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 15841643 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15841656 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15841779 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 15841977 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 15842095 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 15842130 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 15842135 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15842254 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 15842360 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 15842416 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 15842423 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 15842471 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15842502 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 15842607 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 15842672 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15842838 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 15842881 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 15843192 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 15843228 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 15843258 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 15843319 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 15843360 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 15843405 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 15843647 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15843864 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 15843935 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 15843974 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 15844215 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 15844328 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 15844408 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 15844472 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 3 15844588 A C N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 3 15844627 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 15844709 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 15844721 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 15844838 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 15844840 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 15844903 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15844924 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 15845081 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 15845235 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 15845435 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 15845453 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 15845608 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 15845658 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 15845724 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 15845812 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 15845883 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 15846054 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 15846058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15846224 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 15846529 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 15846593 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 15846623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15846638 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 15846702 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 15846850 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 15846916 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 15846994 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15847234 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 15847327 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15847363 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15847529 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15847567 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 15847662 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 15847677 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15847698 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 15847740 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 15847897 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 15848061 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 15848320 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 15848479 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 15848489 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15848589 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 15848659 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15848839 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 15848881 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 15848933 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 15849101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15849219 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 15849534 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 15849559 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 15849777 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 15849778 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 15849935 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15850207 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15850660 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15850774 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 15850822 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 15851161 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 15851188 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 15851392 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15851423 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 15851436 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15851467 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 15851495 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 15851613 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 15851723 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 15851738 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 15851750 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15851937 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 15852232 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15852314 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 15852519 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15852644 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 15852665 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 15852786 G A N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 15852788 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 15853101 T A N N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.454545454545455 0.363636363636364 0.181818181818182 14 8 5 4 2 3 15853178 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 15853186 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 15853190 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 15853201 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 15853203 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15853328 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 15853345 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 15853385 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 15853413 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15853548 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 15853566 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 15853644 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 15853733 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 15853757 T G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 15853864 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 15853881 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 15853906 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 15854070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15854587 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15854905 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15854919 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 15854960 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15855005 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 15855018 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15855240 G C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 15855433 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 15855645 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 15855713 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 15855714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15855760 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 15855996 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 15856161 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 15856223 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 15856249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15856300 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15856762 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 15856866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15857160 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15857165 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 15857224 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15857310 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15857489 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 15857902 C T N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 15857904 C G Y N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 15857921 C G N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 3 15857933 C T N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 3 15857942 C A N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 15857993 A G N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 3 15858008 T G Y N 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 10 14 4 2 6 3 15858070 G T Y N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 3 15858074 C T Y Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 3 15858138 A T Y N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 15858142 G C Y N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 15858149 C T Y Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 15858160 T C Y Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 3 15858329 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 16 8 4 8 0 3 15858399 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 15858438 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 15858445 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 15858540 G T Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 15858582 A G N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 15858585 T A Y N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 15858603 A C Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 15858642 C A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 15858678 C G Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 15858972 A G N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 15859024 G A Y Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 10 6 3 4 1 3 15859141 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 15859233 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 15859242 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 15859249 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 15859253 C T Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 15859357 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 15859399 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 15859730 T C Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 15859749 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 15859781 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 15859786 G A N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.166666666666667 0.583333333333333 0.25 11 13 2 7 3 3 15859866 T A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 15859892 T C Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 3 15859916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15859973 C G Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 15860018 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 15860061 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 15860108 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 15860113 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 15860119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15860137 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 15860213 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 15860272 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 15860277 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 15860313 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 15860341 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 15860344 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 15860394 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 15860453 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 15860639 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15860658 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15860704 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 15860761 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15860767 T G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 15860880 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 15861083 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15861150 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 15861189 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15861209 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15861216 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 15861276 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 15861283 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 15861949 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 15861955 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 15861968 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 15862005 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 15862133 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 15862152 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 15862215 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15862242 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15862354 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15862374 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 15862389 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15862480 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 15862596 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 15862601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15862715 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 15862763 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15862812 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15862860 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15862967 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15863071 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15863113 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15863290 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 15863328 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 15863360 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 15863430 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 16 20 0 16 2 3 15867481 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 15867569 T G Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 15867681 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 15867721 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 15867795 T A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 15867915 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 15867920 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 15867929 T A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 15868078 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15868157 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 15868160 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 15868235 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15868254 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 15868291 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 15868298 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 15868309 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15868466 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 15868496 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15868607 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 15868610 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15868660 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 15868689 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 15868755 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 15868968 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 15868990 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 15869010 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15869234 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 15869262 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 15869402 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 15869424 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 15869493 A T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 15869510 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 15869538 A C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 15869619 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15869621 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 15869670 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 15869703 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 15869762 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 15869792 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 15869839 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 15869851 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 15869880 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 15870003 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 15870034 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 15870104 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 15870127 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 15870206 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 15870264 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 15870273 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 15870314 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 15870346 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15870392 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 15870618 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 15870665 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 15870720 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 15870795 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 15870824 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 15870840 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 15870882 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 15870916 G C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 15870929 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 15870972 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 15870992 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 15871011 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 15871052 T G N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 15871152 C T N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 15871862 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 15872091 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15872237 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 15872354 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 15872364 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 15872386 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 15872446 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 15872469 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 15872474 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 15872523 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 15872757 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 15872774 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 15872792 G C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 15872882 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 15872897 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 15873133 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 15873171 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 15873235 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 15873240 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 15873283 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15873299 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 15873306 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 15873506 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 15873660 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15873726 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 15873727 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 15873755 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 15873822 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 15873937 A G Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 15873973 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 15874001 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 15874012 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 15874016 A C Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 15874104 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 15874154 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 15874186 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 15874228 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 15874238 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 15874253 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 15874282 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 15874390 C G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 15874440 A C Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 15874923 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 15874937 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15875055 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 15875113 A T Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 15875187 T C N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 3 15875234 A G N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 15875262 T C N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.363636363636364 0.545454545454545 0.0909090909090909 14 8 4 6 1 3 15875278 T C N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 3 15875331 C T N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 15875354 C A N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 15875388 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 15875455 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 15875460 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 15875588 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 15875628 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 15875789 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 15875828 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 15875846 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 15875856 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 15875874 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 15875891 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 15875982 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 15876021 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 15876108 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15876149 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 15876226 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 15876242 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 15876367 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15876502 T A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 15876547 T C Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 15876607 G T Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 15876764 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 15876778 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 15876827 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15876887 T C Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 15877062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15877066 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15877160 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 15877195 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 15877323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15877374 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15877376 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15877417 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 15877521 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 15877526 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 15877589 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 15877601 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 15877616 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15877638 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 15877677 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 15877694 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 15877702 A G N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 15877735 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 15877765 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 15877780 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 15877887 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 15877894 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 15878037 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15878060 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 15878105 A C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 15878118 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 15878131 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 15878341 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 3 15878353 C G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 3 15878390 G A N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 3 15879413 T G Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 15880284 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 15880310 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15880395 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15880528 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 15880548 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 15880611 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 15880647 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 15880732 A T N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 3 15880784 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 14 10 2 10 0 3 15880837 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 15880848 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15880857 T G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 15880971 C G N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.0625 0.9375 0 17 15 1 15 0 3 15880977 A G N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 3 15880982 A G N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 15881039 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 12 6 3 6 0 3 15881114 A T N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 15881368 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 15881438 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 15881726 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 15881880 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 15881891 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 15881996 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 15882284 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 15882307 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 15882546 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 15882576 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15882604 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 15882614 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 15882755 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 15882762 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 15882777 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15882819 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 15882827 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 15883310 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 15883390 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 15883485 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15883496 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 15883525 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 15883543 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 15883566 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 15883608 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 15883686 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 15883865 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 15883967 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15884004 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15884057 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 15888215 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 15889298 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 15889324 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 15889561 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 15889576 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 15889712 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 15889780 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 15889795 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 15889803 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 15889812 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 15889862 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 15889931 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 15890068 C G N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 15890098 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 15890228 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 15890400 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 15890430 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 15890483 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 15890527 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15890530 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15890545 G T Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 15890547 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 15890637 A T Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.0555555555555556 18 18 1 16 1 3 15890639 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 15890652 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15890671 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 15890709 A G N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 15890750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15891080 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15891161 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 15892260 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15893937 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 15894018 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 15895096 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 15895231 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 15895271 T A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 15895284 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 15895379 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 15895392 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15895538 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 15895584 C T Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 3 15895585 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 15895646 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 15895785 T G Y N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 15895871 C T Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 15896064 T G N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 3 15896438 G A N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 3 15896467 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 15896653 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 15896704 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15896748 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 15896755 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 15896918 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 15897083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15897229 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 15897231 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15897275 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 15897734 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15897788 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15897816 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 15897957 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 15898020 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 15898025 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15898215 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 15898239 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15898250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15898293 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15898421 A G Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 15898476 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 15898561 G A Y Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 3 15898620 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 15898667 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 15898825 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 15898859 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15898874 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15898889 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 15898900 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15898920 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15898928 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15898965 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 15899005 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15899006 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15899106 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 15899231 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 15899250 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15899292 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 15899293 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 15899305 G C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 15899341 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 15899382 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 15899468 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15899499 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 15899673 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 15899905 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15899917 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 15899950 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 15900037 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 15900121 T G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 15900285 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 15900311 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15900317 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 15900358 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 15900387 T A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 15900402 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15900445 T G Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 15900661 G A Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 3 15900710 T C N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 3 15900815 T C Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 15900838 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 15900853 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 15900862 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 3 15900965 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 15901026 G T N N 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.363636363636364 0.454545454545455 0.181818181818182 13 9 4 5 2 3 15901159 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 15901166 A T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 15901173 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 15901250 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15901359 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 15901377 T C Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 15901381 T G Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 15901456 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 15901603 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 15903148 A G Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 15903262 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 15903275 T G N N 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 6 6 1 4 1 3 15903279 G A N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 3 15903407 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15903409 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 15903443 T C N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 15903477 C T N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 15903557 T C Y Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 3 15903633 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 15903656 G C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 15903682 T G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 15903689 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 15903728 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 15903739 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 15903749 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 15903862 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 15903902 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 15903937 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 15903978 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 15903983 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 15904079 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 15904093 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15904106 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 15904130 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15904276 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 15904343 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 15904391 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 15904399 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 15904493 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15904508 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 15904527 A T Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 15904542 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 15904565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15904585 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 15904587 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 15904644 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15904675 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 15904684 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 15904702 G C Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 15904707 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 15904717 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 15905267 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 15905320 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 15905471 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 15905510 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15905623 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 15905761 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 15905860 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 15906034 T A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 15906078 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 15906153 G C N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 3 15906188 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 15906197 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 15906202 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 15906291 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 15906406 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 15906412 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 15906610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15906855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15906865 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 15907147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15907300 T G Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 15907342 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 15907379 A C Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 15907390 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 15907403 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 15907538 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 15907569 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 15907581 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 15907699 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 15907963 C G Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 15908211 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 15908261 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15908304 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 15908362 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 15909191 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 15909226 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15909254 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15909313 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 15909317 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 15909397 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 15909417 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 15909536 C A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 15913218 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 15913283 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 15913551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15913652 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15913727 G A Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 15914091 A G Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 3 15914173 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15914221 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15914249 T G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 15914261 A G Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 15914320 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15914322 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15914336 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15914338 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15914348 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15914415 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15914436 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 15914781 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 15915275 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 15915324 A G Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 15915422 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15915458 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15915563 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15915710 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15915812 T G Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 15915833 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 15916256 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 15916302 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15916577 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 15916598 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 15916661 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15916717 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 15916743 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 15916771 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 15916795 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 15916900 A T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15916946 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 15917050 A C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15917168 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 15917188 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 15917376 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 15917411 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15917425 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 15917456 A G Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 15917480 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 15917602 C G Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 15917662 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 15917725 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 15917738 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 15917812 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 15917879 T A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15917953 C T Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 15917984 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15918075 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 15918211 T G Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 15918524 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 15918599 T A Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 15918673 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 15918758 C T Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 15918821 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 15918847 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 15918849 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 15918879 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 15918997 A G Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 15919051 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 15919108 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 15919192 G A Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 15919198 A T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 15919318 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 15919337 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15919452 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15919615 G C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15919654 G T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 15919757 G C Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 15919796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15919898 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 15919924 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 15920173 A T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 15920231 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 15920236 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 15920549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15920652 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 15920776 T A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 15920906 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15921074 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15921176 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 15921247 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 15921401 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15921431 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15921468 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15921568 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 15921857 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15921957 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15921993 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15921998 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15922142 T A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15922157 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15922176 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 15922192 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 15922260 A G Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 15922275 T C Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 15922285 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 15922288 C A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 15922380 C G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 15922540 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15922583 G C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15922597 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 15922608 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 15922701 C G Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 15922778 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 15922793 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 14 10 4 6 2 3 15922869 T C Y Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.153846153846154 0.538461538461538 0.307692307692308 11 15 2 7 4 3 15922898 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 15922954 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 15923097 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 15923138 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 15923202 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 15923657 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 15924455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15925086 C A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 15925568 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15925664 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 15926610 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 15926681 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 15926716 T A Y N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 15926758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15926811 G A Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 3 15927113 T G Y N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 15927270 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 15927491 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 15927589 A G Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 15927643 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 15928180 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 15928345 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 15928549 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15928568 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 15929066 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 15929112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15929281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15929352 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15929562 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 15930231 A T Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 15930454 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 15930465 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 15930551 G T Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 15930711 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15930778 G A Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 3 15930791 A C Y N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.454545454545455 0 0.545454545454545 10 12 5 0 6 3 15930891 G T Y N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 15930892 T C Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 15931081 A G Y Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 11 7 3 5 1 3 15931093 G A Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 15931113 A T Y N 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 12 8 4 4 2 3 15931742 T C Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 15931829 G C Y N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.571428571428571 0.357142857142857 10 18 1 8 5 3 15932305 T G Y N 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 3 15932505 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 3 15932569 A G Y Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.363636363636364 0.636363636363636 0 15 7 4 7 0 3 15932603 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.416666666666667 0.5 0.0833333333333333 16 8 5 6 1 3 15933161 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 15933317 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 15933503 T G Y N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 3 15934384 T C Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 15934747 A G Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 15934770 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 15934880 T C Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 15934972 A G Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 15935084 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15935377 T C Y Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 3 15935391 T A Y N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 3 15935408 T A Y N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 3 15935477 G T Y N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 3 15935568 C T Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 15935633 T A Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 15935755 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 15935885 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 15935964 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15936022 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15936083 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15936581 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 15936651 A C Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 15936865 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15936966 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 15937026 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 15937109 A C Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 15937335 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15937357 A G Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 15937460 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 15937758 C A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 15937841 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 15938060 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 15938124 G A Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 15938166 T A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 15938221 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 15939602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15939753 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 15939943 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 15939993 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 15940247 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 15940282 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 15940490 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 15940976 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 15941070 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 15941198 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 15941362 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 15941434 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15941453 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 15941596 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15941627 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15941694 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15941703 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 15941835 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 15941839 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 15941896 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 15941923 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15941933 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15942161 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 15942248 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 15942386 G C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 15942395 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 15942422 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 15942423 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15942457 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 15942549 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15942565 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15942595 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15942649 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15942729 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15942751 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 15942936 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15943044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15943048 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15943057 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 15943442 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 15943460 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 15943568 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15943590 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 15943632 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 15943643 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 15943747 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 15943782 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15943831 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 15943859 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 15943931 A T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 3 15944004 T G Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 3 15944219 G A Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 3 15944230 C T Y Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0 0.75 0.25 9 15 0 9 3 3 15944295 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 15944542 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 15944570 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 15944571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15944687 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 15944773 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 15944805 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 15944897 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 15944957 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 15944971 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 15945000 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 15945012 A C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 15945025 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 15945120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15945213 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 15945253 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15945275 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 15945341 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 15945413 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 15945441 A C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 15945469 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 15945486 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15945709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15945713 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 15945876 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15945919 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 15946545 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 15946596 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 15946794 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 15947040 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 15947254 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15947415 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 15947583 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 15947669 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 15947691 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 15947888 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 15947904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15947926 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 15948006 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 15948190 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 15948233 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 15948336 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 15948645 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 15948752 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 15948776 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 15948814 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 15949013 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 15949023 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 15949047 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 15949199 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 15949243 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 15949352 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 15949512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15949592 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15949603 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15949610 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15949614 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 15949671 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 15950139 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 15950293 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 15950385 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 15950510 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15950618 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15950743 T A Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 15950761 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 15951072 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 15951150 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 15951189 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 15951527 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 15951566 A C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 15951590 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 15956389 T G Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 15956477 C T Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 15962383 C G Y N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 15963363 T G Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 15963437 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 15963475 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 15963606 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 15963650 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 15963699 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 15963700 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 15963710 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 15963878 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 15963947 G T Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 15964025 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 15964035 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 15964209 T C Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 15964219 T A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 15964232 A G Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 15964294 G T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 15964414 G A Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 15964473 T A Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 15964593 T A N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 15964719 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 15965051 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 15965152 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 15965194 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 15965242 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 15965246 A G Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 15965289 C T Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 15965393 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 10 8 3 4 2 3 15965440 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 15965472 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 15965533 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15965600 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 15965613 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 15965643 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 15965644 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 15965691 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 15965753 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 15965829 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 15965996 A C N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 15966020 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 15966038 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 15966053 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15966093 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 15966169 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 15966300 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 15966352 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15966372 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 15966428 G T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 15966532 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15966658 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 15966691 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 15966713 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 15966743 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 15966761 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15966888 T C N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 3 15967169 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 15967646 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15967663 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 15967772 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 15967964 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 15967984 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 15968049 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 15968059 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 15968078 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 15968090 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 15968131 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 15968229 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 3 15968273 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15968286 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 15968372 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15968468 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 15968754 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15968815 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 15969258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15969503 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 15969559 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 15969707 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 15969730 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 15969857 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15970047 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 15970424 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 15970530 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 15970990 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 15971103 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 15971167 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 15971185 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 15971267 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 15971414 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 15971425 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 15971553 A T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 15971564 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15971692 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 15971698 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 15971821 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 15972316 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15972372 A C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 15972484 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 15972537 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 15972751 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 15972791 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 15972820 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 15972982 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15973001 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 15973067 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 15973109 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 15973264 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 15973275 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15973631 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15973732 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15973809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15974019 G T Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 15974161 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15974234 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15974240 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 15974385 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15974695 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 15975145 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 15975148 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 15975162 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15975194 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15975208 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15975245 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15975257 T C Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 15975287 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15975335 A T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 15975388 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 15975403 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15975657 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15975662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15975821 C G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 15975937 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 15976263 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15976268 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15976373 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15976384 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15976399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15976494 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15976610 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 15976634 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 15976678 G A Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 15976701 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15976860 G C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 15976891 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 15977039 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15977104 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15977230 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15977244 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15977247 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15977276 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15977344 C A Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 15977356 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15977571 G A Y Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 15977744 T C Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 15977859 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15977860 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 15977892 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15977907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15978127 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15978461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15978572 T A Y N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 15978672 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 15978687 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 15978711 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15978760 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 15978958 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 15979043 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 15979052 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 15979064 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15979086 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 15979154 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15979274 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15979286 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15979333 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15979350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15979398 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 15979488 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15979541 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15979593 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15979770 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15979780 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15979807 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15979808 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15979833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15979970 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15979984 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15980142 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15980149 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15980153 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15980165 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15980213 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15980260 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 15980267 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 15980293 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 15980301 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 15980343 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 15980360 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 15980428 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 15980476 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15980512 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15980548 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15980563 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15980674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15980690 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15980695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15980738 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15980811 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15980879 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15981012 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15981013 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15981070 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 15981085 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 15981115 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15981213 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15981362 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15981401 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15981487 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15981721 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 15981735 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15981776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15981859 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15982070 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15982237 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15982267 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 15982348 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 15982378 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15982394 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15982484 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 15982511 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 15982521 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 15982567 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15982802 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 15983033 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15983068 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 15983138 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15983163 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 15983239 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15983246 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 15983256 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15983446 T G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 15983461 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15983486 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15983529 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 15983563 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 15983602 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 15984233 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 15984259 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 15984300 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 15984333 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 15984339 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 15984433 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15984626 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15984632 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15984660 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 15984671 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15984690 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 15984760 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15984802 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 15984818 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 15985044 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15985103 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15985116 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 15985301 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 15985399 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15985501 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 15985548 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15985556 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15985565 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15985595 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15985632 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15985681 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15985820 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15985880 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15985902 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15986018 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 15986076 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 15986174 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 15986280 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 15986295 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15986324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15986381 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 15986400 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15986439 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 15986462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15986665 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 15986878 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 15987222 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 15987229 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 15987751 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 15987812 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 15988012 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 15988433 A C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 15988507 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 15994915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15994946 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15995120 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 15995161 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 15995761 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 15996181 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15996952 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 15996990 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 15997072 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15997162 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15997195 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15997751 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 15998093 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 3 15998114 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15998131 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 15998377 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 15998495 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 15998505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15998626 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15998886 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.666666666666667 0.133333333333333 0.2 22 8 10 2 3 3 15999057 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 15999270 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15999356 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 15999381 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15999534 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 15999596 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 15999646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 15999723 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 15999728 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 15999764 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 15999777 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 15999861 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 16000056 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16000093 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 16000111 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 16000147 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 16000331 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 16000400 C G Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 16000490 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 16000552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16000622 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 16000666 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 16000723 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 16000731 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 16000759 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 16000772 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 16000774 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 16000784 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 16000850 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 16000894 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 16000981 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16001079 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 16001104 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 16001501 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 16001533 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 16001543 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 16001569 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 16001581 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 16001610 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 16001766 C G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 16001778 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 16001804 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 16001826 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 16001854 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 16001972 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 16001982 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 16002102 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16002187 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 16002202 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 16002371 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 16002502 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 16002580 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 16002631 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 16002661 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 16002673 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 16002768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16002820 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 16002828 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 16002873 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 16002884 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 16003020 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 16003214 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 16003514 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 16003841 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 16003864 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 16003868 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 16004179 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 16004187 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 16004250 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 3 16004389 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 16004520 A T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 16004695 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 16004740 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 16004812 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 16005204 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 16005206 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 16005224 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 16005766 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 16005883 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 16006024 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 16006262 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 16006294 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 16006422 G A Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 16006427 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 16006738 T C N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 16006810 G T N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 16006921 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 16007099 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16007419 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16007539 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 16007576 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16007750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16007779 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16007828 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 16007829 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 16008129 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 16008395 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 16011100 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 16011287 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 16012625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16015040 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16015108 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16015154 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 16015174 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16015190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16015261 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16015346 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 16015498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16015719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16015726 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 16015885 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16015999 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 16016059 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 16016083 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16016261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16016285 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 16016338 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16016403 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 16016583 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 16016614 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 16016732 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 16016733 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 16016746 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 16016800 C A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 16016825 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16016870 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 16016895 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 16016924 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 16017000 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 16017251 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 16017256 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 16017278 T C Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 16017296 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 16017685 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 16017763 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 16017764 A T Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 16017942 T C Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 16018692 C A Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 16018708 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16019049 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 16019073 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 16019103 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 16019127 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 16019141 C T N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 3 16019670 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 16019988 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 16020150 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 16020155 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 16020238 C T Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.2 0.733333333333333 0.0666666666666667 17 13 3 11 1 3 16020252 A G Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 16020345 A G Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 3 16020428 C T Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 16020539 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16020557 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16020599 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 16020729 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 16021254 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 16021314 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16021567 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 16021678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16021746 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 16021887 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 16021900 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 16021910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16021915 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 16022056 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 16022277 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 16022281 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 16022327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16022607 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16022657 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16022920 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 16023018 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16023168 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 16023227 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 16023236 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 16023285 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 16023448 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16023818 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 16023897 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 16023940 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 16023955 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 16024011 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 16024231 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16024363 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 16024407 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 16024483 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 16024553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16024618 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 16024802 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 16024938 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16024980 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 16025078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16025357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16025508 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 16025522 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 16025703 C T N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.545454545454545 0.181818181818182 0.272727272727273 14 8 6 2 3 3 16025739 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 16025750 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 16026092 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 16026338 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 16026339 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 16027418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16027950 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 16028150 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 16028191 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 16028249 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16028324 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 16028526 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16028535 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 16028708 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 16028723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16028742 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 16029277 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 16029415 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 16029699 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 16029765 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 16030523 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 16030809 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 16030856 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 16030916 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 16030926 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 16030960 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 16030982 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 16031108 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 16031261 C T Y Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.6 0 0.4 6 4 3 0 2 3 16031371 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 16031385 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 16031608 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 16031721 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 16031834 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 16031849 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 16031900 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 16031932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16031953 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 16031954 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16031972 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 16031986 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 16032094 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 16032109 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 16032191 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16032235 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16032966 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16033954 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16035567 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16036057 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16036189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16036539 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16036550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16036629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16036940 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16037458 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16038033 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16038502 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 16038664 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 16038943 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 16038984 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 16039099 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 16039165 C G N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 3 16039766 T A Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 16039830 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 16039874 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 16040574 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 16040636 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 16040720 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 16040877 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 16042232 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 16042792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16042827 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 16043066 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 16043332 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16046551 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 3 16047540 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16048041 C A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 16050440 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16050749 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16051453 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 16051546 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 16051627 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16051880 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 16052242 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 16052330 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 16052331 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 16052522 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 16052636 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 16052675 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 16052726 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16052861 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16052904 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16052926 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 16053026 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 16053031 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 3 16053043 T G N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 16053056 C T N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 3 16053346 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16054216 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 16054219 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16054230 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 16054244 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 16054321 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 16054462 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16054833 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 16054885 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 16054946 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 16055002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16055134 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16055147 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 16055278 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 16055290 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 16055459 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 16055733 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 16055812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16055867 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 16055879 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16055921 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 16056188 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 16056374 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 16056436 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 16056441 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 16056865 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16056876 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16056932 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 16057044 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16057153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16057467 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16058322 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 16058332 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 16058385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16058429 A T Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 16058487 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16058985 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16059187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16059829 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 16059995 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16060109 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16060275 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16060462 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16060586 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16060731 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16060916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16061484 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16061675 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 16061676 T A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 16061717 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 16061718 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 3 16061764 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 16061985 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16062071 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16062219 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16062237 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 16062315 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 16062360 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16062423 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16062432 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16062484 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16062532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16062559 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 16062638 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16063074 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 16063087 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16063291 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 16063341 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16063391 T G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 16063469 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 16063498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16063527 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16063602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16063788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16063856 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 16063989 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 16063990 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 16064229 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 16066797 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16067718 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16068683 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16068998 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16069149 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16069552 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16069624 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16069674 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16070035 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16070366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16070598 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16072172 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 16072929 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16076181 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16076577 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16077583 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16077629 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 16079578 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16080164 G T Y N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 3 16080174 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 16084039 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16084074 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16084391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16088276 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16089642 G C N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 16090038 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16090042 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16090185 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16090252 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 16090372 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16090382 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16090385 G T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 16090483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16090612 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16090709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16090843 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 16090924 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16090962 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 16091048 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 16091090 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16091196 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16091210 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 16091241 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16091411 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16091582 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16091651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16091692 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16091764 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 16091819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16091857 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16092043 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 16092205 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16092239 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16092244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16092253 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 16092438 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16092478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16092485 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 16092519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16092587 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16092602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16092619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16092687 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 16092689 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 16092710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16092767 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16092846 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16092981 C G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 16093675 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16093680 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16093708 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16096513 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 16098258 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 16099728 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16099771 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16101263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16101603 T G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 16102736 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16106515 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 16106588 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16111371 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 16111515 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 16112243 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16112488 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16113599 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16115840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16118172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16118975 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16118983 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 16120182 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16121723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16123129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16123261 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16124267 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16126012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16129107 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16130547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16130638 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16131246 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16131496 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 16142999 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16143684 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16143881 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16144059 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16145554 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16147204 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16147216 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16147217 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16148785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16149626 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16149941 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16150135 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16150594 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16150940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16153040 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16154081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16154434 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16154984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16155337 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16156071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16156174 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16160231 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16160658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16161111 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16161173 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16161327 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16161351 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16161368 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16161609 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16162194 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16162791 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16162918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16162940 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 16162977 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 16163064 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 16163526 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 16163538 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 16164037 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16164059 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16164146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16164239 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16164369 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16164459 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16164705 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 16164796 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 16164852 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 16164946 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16164970 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16165192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16165299 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16166206 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16166260 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 16166288 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16166364 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16166409 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16167187 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 16167283 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16167305 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 16167854 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 16167932 A C N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 3 16168216 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16168430 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16168445 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 16168966 T G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 16169102 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16169159 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16169295 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 16169372 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 16169391 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16169448 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 16169558 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 16169560 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 16169584 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 16169693 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16169707 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 16169719 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 16169975 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 16170045 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 16170162 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 16170188 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 16170374 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16170460 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16170475 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16170531 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 16170545 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 16170595 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 16170597 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 16170631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16170728 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 16170911 T C Y Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 3 16170952 C G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 16171090 G A Y Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 3 16171103 T C Y Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 3 16171108 C A Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 16171184 A T Y N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 3 16171185 C T Y Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 3 16171217 C A Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 16171638 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 16171667 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16171696 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 16171943 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16171960 G T Y N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 16172007 T C Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 16172127 A G Y Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 16172172 G A Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 16172271 C T Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 16172273 C A Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 16172290 G A Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 16172335 A G Y Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0.5 0 0.5 2 2 1 0 1 3 16172447 C T N Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0.5 0 0.5 2 2 1 0 1 3 16172737 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 16172802 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 16172825 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 16172886 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 16172989 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16173077 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16173080 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16173118 A T Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 16173151 A C Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 16173162 T A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 16173331 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 16173365 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 16173491 T G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 16175350 T G Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 16175370 C G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 16175525 A T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 16175561 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 16175635 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 16176288 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 16176408 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 16176501 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 16176511 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 16176590 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 16176619 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 16176626 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 16176632 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 16176679 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 16176940 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 16177106 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 16177145 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 16177183 G C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 16177724 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 16177892 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 16178092 C G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 16178149 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 16178254 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 16178292 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16178668 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 16178735 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 16178759 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 16178843 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 16178849 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 16178873 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 16179233 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 16179284 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 16179348 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 16179476 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 16179610 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 16179656 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 16179684 T A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 16179709 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 16179919 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 16180074 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 16180162 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16180258 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 16180360 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 16180365 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 16180422 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 16180571 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 16180698 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 3 16180846 C G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 16180870 C G Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 16180934 A T Y N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 3 16180943 T A Y N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 3 16181118 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 16181534 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16181653 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 16181674 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 16181707 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 16181725 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 16181851 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 16181955 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 16182226 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 16182486 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 16182502 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16182540 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 16182579 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 16182882 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 16183017 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 16183051 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16183076 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 16183264 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 16183470 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16183529 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 16183537 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16183865 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16183975 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 16184002 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 16184074 G T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 16184076 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 16184152 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 16184170 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 16184204 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 16184310 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 16184341 C A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 16184434 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 16184493 G A Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 16184506 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 3 16184615 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 16184671 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 16184715 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 16184864 G C Y N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 16188130 T C Y Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 3 16189445 G A Y Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 3 16191036 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 16191085 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 16191101 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 16191135 G C N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 16191312 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16191357 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 16191372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16191378 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 16191422 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 16191507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16191531 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 16191597 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 16191606 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 16191642 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 16191676 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 16191699 C A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 16191711 G A Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 3 16191762 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 16191800 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 16191818 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 16191863 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 16191930 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16192099 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 16192128 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 16192245 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16192375 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 16192390 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 16192455 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 16192641 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 16192655 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16192702 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16192747 T G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 16192828 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16192872 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16192937 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 16193236 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 16193237 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 16193249 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16193251 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16193344 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 16193488 T G Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 16193707 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16193753 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 16193967 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 16193993 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 16194104 A G N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 16194136 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16194233 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16194321 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16194390 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 16194472 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 16194500 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 16194810 T G N N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 3 16195330 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 16195484 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 16195493 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 16195648 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 16195742 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 16195802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16195803 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16195863 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16195868 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 16195888 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16195914 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16196025 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16196055 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16196255 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16196355 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16196425 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16196518 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16196567 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 16196633 A T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 16196889 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 16196914 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 3 16196973 A T Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 3 16197097 A G Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 19 17 1 17 0 3 16197270 A C Y N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0 1 0 14 14 0 14 0 3 16197624 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 16197759 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16197927 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 16198012 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 16198059 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 16198064 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 16198265 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16198298 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16198305 G C Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 16198315 T C Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16198348 T C Y Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 16198391 G T Y N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 16198573 A G Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 16198582 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16198651 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 16198682 G T Y N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 16198711 C T Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 16198815 C G Y N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 16198940 A G Y Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 16198986 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 16199054 T C Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 16199291 C T Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 16199310 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 16199339 G A Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 16199384 A G Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 16199435 G T Y N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 16199560 T C Y Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 16199582 A G Y Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 3 16199651 G C Y N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 3 16199665 G A Y Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 3 16199939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16199956 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 16199990 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 16200015 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 16200048 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 16200161 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 16200270 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 16200379 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 16200419 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16200518 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 16200563 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 16200576 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16200589 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 16200659 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16200766 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16200786 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16200816 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16200849 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16200855 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16200985 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 16201077 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16201318 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16201321 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16201334 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16201411 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16201510 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16201561 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 16201751 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16201779 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16201827 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16202003 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 16202080 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 16202308 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16202315 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 16202322 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 16202345 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 16202385 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 16202435 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16202495 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16202507 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16202584 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16202658 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 16202690 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16202714 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16202766 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 16202784 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16202930 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16202952 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16202978 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16203296 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16203401 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16203452 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16203598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16203636 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16203704 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16203798 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16203837 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16203926 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16204062 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16204156 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 16204157 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 16204171 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 16204278 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 16204345 G A N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 16204477 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.25 0.666666666666667 0.0833333333333333 14 10 3 8 1 3 16204617 A C N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 3 16204849 T C N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 7 9 0 7 1 3 16204921 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 16204933 A T N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 16205033 A G N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.166666666666667 0.75 0.0833333333333333 13 11 2 9 1 3 16205052 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 3 16205132 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 16205157 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 16205202 A G N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 3 16205249 T G N N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 3 16205320 G A N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 16205393 T C N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 3 16205538 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 16205596 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 16205642 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16205777 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 16205792 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16205856 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 16206098 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 16206134 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 16206252 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 16206373 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 16206419 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 16206438 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 16206468 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16206479 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 16206502 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 16206729 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16206745 T A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 16206973 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 16206984 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 16207131 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 16207228 T A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 16207259 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 16207317 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 16207338 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 16207439 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 16207626 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16207679 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 16207740 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16207772 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 16207884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16207914 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16207921 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16207931 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 16208038 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 16208087 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 16208215 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 16208310 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 16208327 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 16208408 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 16208485 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 16208493 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 16208526 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16208625 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 16208654 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 16208720 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 16209155 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16209704 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16209756 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 16209770 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16209774 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16209788 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16209806 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16209826 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16209927 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16210001 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 16210071 A C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 16210174 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 16210467 A T N N 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 7 11 2 3 4 3 16210469 T C N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 3 16210544 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 16210594 G T N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 3 16210798 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 16210844 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 16210966 T G N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 16211097 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 16211262 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 16211314 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16211541 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 16211586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16211622 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 16212072 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 16212170 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 16212778 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16213281 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16213507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16213536 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16213650 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 16214160 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 16214250 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16214641 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 16214798 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16215954 C T Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 16215986 C G Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 16217047 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16217084 A T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 16218138 T C Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 16218149 T G Y N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 16218271 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 16218454 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16218643 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16218668 T G Y N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 16218897 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 16219098 T C Y Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 3 16219138 G T Y N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 16219140 T C Y Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 3 16219444 A C Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 16220116 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 16220188 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 16220445 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16220507 G C Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16220550 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16220596 G T Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 16220738 T C Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 16220805 T C Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 16220944 T C Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16220996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16221058 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 16221306 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 3 16221379 C G Y N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 3 16221587 T C Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 3 16221648 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 3 16222183 T G Y N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 3 16222665 T C Y Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 8 6 3 2 2 3 16222714 T C Y Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 3 16223210 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 16223439 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.285714285714286 10 4 5 0 2 3 16223997 A T Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 16224272 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16224446 T C Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 16224486 T A N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 16224605 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 16225170 A C Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16225782 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 16226196 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16226290 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16226309 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16226412 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16226487 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16226665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16226825 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 16226850 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 16226859 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16226865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16226912 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16226972 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16227492 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 16227930 A C N N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 3 16228564 T A Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 16228571 A G Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 16228745 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 16228776 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16229305 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 16229321 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16229379 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 16229469 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 16229656 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16229887 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 16229929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16230018 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16230094 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16230229 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 16230512 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16230640 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16230759 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16230792 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16230897 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16231180 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16231286 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16231442 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16231450 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16231465 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16231534 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16231628 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16231664 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 16231712 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16232257 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 16232509 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 16232593 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16233098 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 16233144 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 16233425 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 16233442 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 16233567 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 16233584 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 16233593 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 16233600 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 16233621 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 16233623 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 16233638 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 16233647 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 16233670 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 16233725 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 16233741 T A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 16233764 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 16233777 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 16233788 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 16233817 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 16233828 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 16233837 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 16233920 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 16233922 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 16233959 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 16234054 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16234075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16234231 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16234251 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 16234267 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 16234400 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 16234496 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 16234497 T A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 16234563 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 16234612 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 16234648 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 16234668 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 16234678 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 16234692 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 16234707 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 16234717 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 16234721 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 16234768 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 16235040 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 16235130 G T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 16235369 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16235482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16235807 C T Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 16235981 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16236259 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16236496 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 16236565 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 16236568 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 16236577 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 16236597 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 16236619 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 16236630 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 16236650 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 16236691 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 16236832 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 16236846 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 16236869 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 16236888 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 16236974 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 16236988 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 16237001 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 16237017 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 16237067 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 16237088 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 16237094 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 16237172 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 16237179 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 16237200 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 16237209 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 16237223 G C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 16237284 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 16237316 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 16237318 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 16240544 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 16240590 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 16240737 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 16240739 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 16240762 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 16240778 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 16240813 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16240905 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 16241170 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 16241187 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 16241189 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 16242499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16242555 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 16242568 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 16242592 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 16242608 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 16242744 C G N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 16242752 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 16242798 T G N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 16242877 T C N Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 3 16242879 T G N N 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 3 16243081 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 16243371 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 16243484 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 16243489 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 16243516 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16243540 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 16243657 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 16243788 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16244112 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 16244128 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 16244157 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 16244177 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 16244890 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16244965 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16245035 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 16245701 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16245720 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16246510 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 16246872 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16246957 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16247352 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16247475 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16247495 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16247529 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16247784 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16247790 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16247882 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16248714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16248886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16248910 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16249743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16249761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16249848 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 16249859 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16249924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16249947 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16250405 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16250450 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16250475 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 16250525 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 16250783 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16250941 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16250957 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16251014 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16251062 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16251225 C G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 16251334 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16258155 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 16258315 T C Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 16258470 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16258789 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16258966 G T Y N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 16259406 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 16259892 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 16260035 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 16260194 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16260195 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16260215 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16260366 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16260396 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 16260507 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16260597 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 16260714 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 16261252 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 16261777 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16262123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16262196 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 16262290 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16262399 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 16262473 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16262508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16262672 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16263089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16263325 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16263554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16263556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16263764 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16263904 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16264419 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16264600 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 16264691 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16264692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16264937 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 16265157 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 16265590 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16265676 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 16265742 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16265767 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16265789 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16265865 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16265868 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16265911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16265955 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16265986 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16266030 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16266237 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16266314 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16266470 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16266478 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16266495 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16266569 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16266700 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16266829 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 16266859 A G Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 16266861 T G Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 16266952 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16266986 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16267016 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16267059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16267270 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 16267289 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16267308 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16267328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16267346 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16267402 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16267435 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16267503 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 16267527 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16267879 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16267890 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16267903 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16268084 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16268201 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 16268252 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16268255 G A Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 16268273 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16268602 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16268618 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16268628 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16268677 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16268687 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16268705 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16268727 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16268745 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16269755 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16269933 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16269935 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16269983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16270147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16270386 G T N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 3 16270459 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16270530 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16270634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16270654 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16270696 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16270709 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16270840 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16270959 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16271137 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 16271168 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 16271350 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16271384 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16271393 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16271398 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 16271485 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16271637 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16271700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16271790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16271837 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16271851 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16271871 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16271917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16272018 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16272021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16272183 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16272267 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16272355 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16272484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16272520 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16272631 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16272659 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16272703 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16272846 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16272902 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16273166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16273434 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16273548 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 16273699 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 16273808 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16273849 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 16273871 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 16273936 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16273993 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16273999 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16274255 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16274273 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16274353 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 16274502 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 16274559 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 16274626 T G N N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.25 0.75 0 15 9 3 9 0 3 16274646 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 16274695 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16274750 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16274882 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16274917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16274931 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16275028 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16275198 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16275229 G T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16275251 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16275335 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16275382 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16275399 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 16275537 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16275589 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16275635 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16275774 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16275837 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 16275941 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16275948 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16275969 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16275976 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16276078 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16276200 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16276201 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16276266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16276285 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16276309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16276374 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16276387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16276540 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16276605 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16276679 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 16276984 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16277040 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16277105 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16277178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16277213 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16277260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16277287 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16277696 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16278039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16278188 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16278203 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16278587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16278598 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16278764 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16278804 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16278875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16278995 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16279200 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16279490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16279525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16279582 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16279673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16279771 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 16279855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16280134 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16280197 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16280225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16280277 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16283256 T C Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 16283370 A C Y N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 16283561 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 16283799 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 16283806 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 16283920 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 16284144 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16284261 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16284431 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16284479 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16284550 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16284630 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16284882 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16285155 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16285417 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16285438 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16285482 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16285494 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16285645 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 16285653 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16285678 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16285748 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16285945 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 16285995 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 16286249 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16286315 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16286331 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 16286427 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16286497 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16286510 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16286717 C A N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 16287824 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16288275 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16288301 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 16289540 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16289541 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 16289678 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16289752 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16289768 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16289841 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16289872 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16289914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16289918 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16290063 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16290125 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16290218 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16290246 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16290280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16290297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16290323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16290357 G A Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 16290497 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16290509 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16290530 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16290535 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16290665 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16290879 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16290893 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16290903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16290977 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16290990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16291076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16291205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16291221 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16291447 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16291529 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 16291660 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16291909 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16292219 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16292271 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 16292327 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16292560 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 16292688 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16292801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16292845 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16293037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16293236 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 16294104 A G Y Y 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 3 16294251 T G Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 16294503 C T Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 16299564 C T Y Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 7 11 1 5 3 3 16299714 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16299780 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 16300071 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16300289 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16300320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16300703 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16301537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16304477 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 16304711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16305679 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16305862 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 16307077 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16308977 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16310375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16310588 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16310996 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16312085 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16312375 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16312658 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 16312836 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16314770 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16315434 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16316055 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 16316399 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 16316961 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16317057 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16318696 G T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 16319108 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 16320805 T C Y Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 16328476 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16328598 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16329286 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16329964 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16330175 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16331351 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16332717 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16333365 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 16334055 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16335053 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16335070 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 16335114 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 16335920 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 16338209 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 16340161 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16340214 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16340786 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16340971 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16341058 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16341103 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 16341758 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16341920 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 16342437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16342923 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16343944 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 3 16344819 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 16345049 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 16346177 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16346193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16347342 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 16348853 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16349435 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 16349512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16349538 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 16349926 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 16350265 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16352559 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16352810 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 16354145 T G Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 16354535 C G Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 16355586 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 3 16356302 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 16356368 C T Y Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.545454545454545 0.272727272727273 0.181818181818182 15 7 6 3 2 3 16356537 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16356562 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 16357256 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16357351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16358315 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16362098 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16362977 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16363468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16364172 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 16364560 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 16365846 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 3 16366062 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 16368725 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 16368816 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 16369915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16370476 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 16371839 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 16372169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16372925 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16380120 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 16380345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16380546 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16380806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16382034 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16383065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16383853 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16383967 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 16385468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16386662 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16386875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16387094 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16389374 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 16390111 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 16390179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16390603 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16398048 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16398049 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16398169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16398519 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16399241 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16399394 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 16399815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16399922 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 16400094 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16400988 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 16401115 C A Y N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 16401730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16401936 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16402033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16402051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16402244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16402778 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16402880 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16403093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16403236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16403846 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16404031 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16404768 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16404820 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16405289 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 16406708 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 16406767 C A Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 16407110 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16407370 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16408381 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 16408642 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16408855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16409230 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16409548 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 16410127 G A Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 16410141 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 16410337 T C N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 3 16410357 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 16410995 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 16412242 G A Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 16412300 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 16412640 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 16412902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16413135 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16413356 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16413551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16413836 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 16414369 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 16414405 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16414600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16414916 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16415144 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16416036 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16416114 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 16416440 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 16416540 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 16416551 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16417038 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 16417162 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 16417771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16417906 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16418259 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16419492 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 16419504 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16420965 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 16421028 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 16421163 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16422047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16422362 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16422418 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16422752 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16422818 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16423530 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16423713 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16424097 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16424130 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16424226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16424745 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16424819 C T N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 16424969 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16425466 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 16427963 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 16428826 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 16428946 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 16428948 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 16429868 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16429948 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16430222 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16430551 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16430590 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 16430752 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16431776 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16432491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16432864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16432968 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16433027 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16433728 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16433743 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16433792 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16433963 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16434010 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16434059 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16434207 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 16434282 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 16434469 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 16434514 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 16434689 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16435428 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16435762 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 16435953 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16436126 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16436191 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16436217 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16436786 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16437104 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16438441 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 16439136 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16439564 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16439634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16439699 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 16439700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16439878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16440134 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16440209 T A Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 16440433 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16440478 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16440536 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 16440745 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16440864 G C Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 16440870 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16441031 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16441593 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16442234 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16442344 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16442361 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 16442394 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16442433 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16442456 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16442596 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16442616 C T Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 16442660 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16442712 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16443824 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16443939 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16444776 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16444840 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16444888 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16445101 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 16445204 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 16445530 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16445738 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16445865 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 16446438 G T Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 16446552 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 16446743 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 16446814 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16446852 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16446872 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16447246 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16447251 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16447270 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16447868 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 16447980 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16448026 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16448927 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16449142 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16449436 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16449892 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16450085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16450504 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16450561 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16450659 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 16450849 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16451628 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16451919 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 16452341 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16452463 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16452548 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16452747 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16453073 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16453077 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16453837 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 16454262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16454301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16454411 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16454512 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16454780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16455036 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16455089 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16455099 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16455123 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16455206 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 16455268 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16455369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16455626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16455722 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 16455868 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16455890 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16455909 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16457788 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16458405 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16459310 T C N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 3 16459840 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 16459941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16461546 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16462616 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16463386 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16463426 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16463796 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16463993 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 16465001 A C Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 16465657 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16465816 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 16467173 T G Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 16467350 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 16467396 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 16467448 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 16467622 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 16467710 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 16467794 G A Y Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 16468149 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 16468363 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 16469738 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 16470311 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 16470470 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 16471139 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 3 16471438 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 16472126 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 16472256 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 16473350 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16473376 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16473430 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 16474356 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16474707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16474791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16474797 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16475001 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16475249 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 16475259 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 16475625 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16477373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16485489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16485515 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16485516 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16485543 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 16485926 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 16486450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16486948 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16487136 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16488797 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16488957 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16489436 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16489777 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16489898 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16490279 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16490349 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16490413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16490553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16492488 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16493024 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16493067 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16494158 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16494364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16495148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16496961 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16497007 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16497014 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 16497205 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16497444 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16497816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16498162 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16498853 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16499073 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16499845 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16499868 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16500004 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16500176 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16500177 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16501014 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16501086 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 16501390 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 16501953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16502310 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16504808 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16505400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16505704 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16506856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16506932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16507305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16508448 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16509020 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16510288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16510763 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16513468 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16513491 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16514230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16514434 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 16515354 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16517152 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16518364 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16518415 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 16520211 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16520329 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16520524 G A Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 16521301 T G Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 16521978 G C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 16521992 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 16522421 T G Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 16523431 T G Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 16523513 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 16523874 C A Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 16524269 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 16524691 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16524800 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16536194 C T Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 16536259 A G Y Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 3 16537104 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16537918 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16538293 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16538691 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16539690 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16540282 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 16540711 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 16541481 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16541925 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16542773 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16542806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16544419 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16544634 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16545035 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16546822 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16547537 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16550477 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16551643 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16552434 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16553472 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16553559 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16555693 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16560238 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16560984 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16566954 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16566967 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16567124 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16568394 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16568468 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 16569259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16569409 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16569612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16569852 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16571198 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16572727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16572782 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 16573919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16574251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16575353 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16578154 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16582627 G C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 16583030 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16588177 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16588244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16588365 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16589231 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16590525 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16592022 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16594575 C T N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 16596742 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16599962 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16600328 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16600851 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16602592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16603706 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 16603776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16605313 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16606894 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16607413 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16609061 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 16609998 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16610239 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16610455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16611258 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16612385 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16612601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16613479 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 16614768 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16614926 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16615540 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 16616968 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 16617157 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 16617225 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 16618354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16619187 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16621384 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16622284 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16622444 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16624406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16625008 C A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 16625158 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 16626676 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16628920 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16630090 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16632572 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16633553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16634446 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 16634738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16634914 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 16634988 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 16635792 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16635918 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16635945 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 16636065 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16636280 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16636321 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16636468 A T Y N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 3 16636496 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 16636516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16636530 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16637022 T A N N 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.142857142857143 0.714285714285714 0.142857142857143 7 7 1 5 1 3 16637286 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16637369 A T N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0 0.75 0.25 9 15 0 9 3 3 16637432 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16637464 A C N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 16637741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16637833 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 16637925 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 16638120 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16638207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16638253 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 16638361 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 16638526 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 16638663 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16639320 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 16639405 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 16639963 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 16640128 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16640983 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16641055 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16641138 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 16641271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16641331 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 16641627 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16641803 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 16641838 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 16641886 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 16642027 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 16642057 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 16642114 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 16642303 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16642376 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 16642761 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 16642990 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 16643130 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16643174 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16643260 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16643420 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16643452 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16643524 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16643538 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16643680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16643860 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 16644209 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16644369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16644442 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 16644568 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16644633 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16644679 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 16644760 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16644904 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 16644908 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 16644952 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 16644959 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 16645004 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 16645179 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 16645230 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16645234 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 16645428 G C Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 16645453 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 16645467 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16645469 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 16645478 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16645488 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 16645540 C T Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 16645702 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 16646223 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16646229 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16647054 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 16647280 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 16647285 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 16647298 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 16647598 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 16647618 A G N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 16647632 T C Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 16647665 A G N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 16647767 G C N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 16647798 A C N N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 3 16647820 A T N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 16648197 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 16648239 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 16648241 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 16648610 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16648658 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 16648697 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 16648820 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 16648837 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 16648844 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 16648861 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16648862 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 16648912 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 16648922 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 16648949 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16649028 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 16649193 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 16649226 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 16649270 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 16649311 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 16649395 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16649846 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 16649946 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 16650128 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 16650267 A C Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 16650680 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16650924 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16650954 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16651008 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16651036 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 16651156 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 16651426 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 16651512 T A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 16651671 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 16651812 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 16651898 A G Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 16651938 A G Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 16652025 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 16652055 A C N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 3 16652066 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 16652146 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 16652157 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 16652342 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 16652382 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16652407 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16652420 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16652459 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16652604 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 16652676 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 16652800 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 16652805 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16653593 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16653600 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 16653648 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 16653774 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 16654046 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 16654295 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16654392 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 16654412 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 16654692 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 16654734 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 16654758 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 16654778 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 16654844 C A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 16655022 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16655228 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16655646 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 16655845 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16655848 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16655884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16655896 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16655898 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16656007 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16656040 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16656054 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16656421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16656547 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 16656686 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16656712 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16656798 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 16656931 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 16657146 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16657730 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16657758 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 16657809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16658048 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16658289 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 16658421 C T Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 16658473 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 16658512 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16658754 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16658804 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 16659488 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 16659491 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 16659518 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 16659601 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16659604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16660208 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16660418 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 16660419 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 16660618 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16660627 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16660751 T C Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 16660860 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 16660922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16660923 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 16661038 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16661082 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 16661196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16661316 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 16661702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16662216 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 16662256 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16662277 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16662346 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 16662359 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 16662481 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16662687 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16662711 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16662817 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 16662915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16662932 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16662995 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16662999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16663101 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16663106 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16663146 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16663151 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16663167 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16663588 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16663757 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 16663760 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 16664052 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16664172 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16664454 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 16664700 T C N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 16665007 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 16665324 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16665432 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 16665575 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 16665642 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 16665666 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16665904 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 16666009 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16666019 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16666026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16666041 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16666085 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16666123 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16666162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16666297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16666378 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16666427 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 16666500 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 16666540 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 16666804 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16667716 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 16667721 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 16668026 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16668202 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16668379 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16668403 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 16668446 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16670550 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16670582 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16671408 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16671499 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 16671519 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16671545 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16671777 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16672713 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 16673454 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16674388 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16674519 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 16674658 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16674708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16675120 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 16675437 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16675501 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16675812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16676679 A C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 16677667 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16677789 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 16678739 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16679620 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16679637 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16679779 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 16679970 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16680047 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 16680177 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16680799 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 16681265 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16683478 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16684818 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16685050 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16685756 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 16685904 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16686022 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16686315 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16686456 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16687034 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16688100 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16688220 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16688656 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16689313 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 16689332 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 16690641 T G Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 16690841 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 16691657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16692113 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16701058 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16701826 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 16702515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16702764 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16702933 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16703066 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 16703529 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16704332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16705546 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16706498 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16709826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16711549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16713853 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 16717756 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16718456 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16718688 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 16718795 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16719929 T G Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 16719971 T G N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 16720826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16722787 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16724330 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 16725877 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 16728819 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16728944 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16730640 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16730942 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16732298 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16732344 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16732423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16732471 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16735909 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 16736067 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16736343 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16737270 A C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 16738987 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16739373 A C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 16739405 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16739462 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 16739551 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 16740076 A T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 16741522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16741888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16742163 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16743264 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16743613 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 16744050 C G Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 16744488 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16744668 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 16746402 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16747967 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16748055 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16752186 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16752199 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16752231 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 16752261 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16752323 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16752630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16752830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16752969 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16752993 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16753093 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16753374 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16753440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16754427 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16754498 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16754571 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16755096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16759583 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16760429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16760569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16760653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16762147 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 16764813 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16765539 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 16768975 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16771705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16776662 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 16777212 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 16778570 G A Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 16779289 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16783463 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16783469 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16784074 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16784715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16785629 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16788309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16788949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16789389 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16789831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16792884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16794296 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16794871 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 16797418 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 16799867 A G Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 16807983 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16814566 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16819051 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16820265 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16821280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16821544 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16823163 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16825849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16827413 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16828429 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16829668 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16831838 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16831904 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16832309 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16834573 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 16834922 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16835171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16836676 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16836743 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16837712 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16838786 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16839234 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16840620 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 3 16840862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16842831 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16843830 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16845838 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16846231 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 16847076 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16847444 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16847804 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16848229 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16848377 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16848383 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16848664 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16848967 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16849472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16849589 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 16849721 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 16851239 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16851868 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16851967 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16855416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16856110 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 16856389 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16856647 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16857208 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16857836 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16857958 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 16858463 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 16862273 C T Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 16862580 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 16862591 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 16863981 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16864053 C T Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 16864527 C T Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 16864632 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16864972 T A Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 16865248 C G Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 16865406 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 16865659 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16865820 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16866089 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16866877 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 16866952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16867032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16867080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16867202 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16867520 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16868675 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16869856 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 16870094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16870189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16871238 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16872011 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 16873833 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16873877 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16874254 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 16875007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16876209 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 16876366 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 16876974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16878177 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16878854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16878948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16878955 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16879393 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16880379 C G Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 16882533 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16883170 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16884307 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16884601 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 16886265 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16886678 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16887864 C G Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 16888071 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 16888620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16889110 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16889355 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16889668 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16893667 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16900999 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16901227 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16901228 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16901923 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16902457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16903783 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 16904512 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16905436 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16905519 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16905805 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16906449 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16906650 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16906901 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16906928 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16907617 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16907686 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 16907762 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16908851 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 16909344 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16910558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16911235 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16912405 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16913550 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16915867 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 16917470 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16918264 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16918536 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16921567 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16922465 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16922581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16922727 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16923264 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16923288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16923980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16924177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16924430 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16925059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16928737 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 16929461 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16929919 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16934057 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16934235 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16935129 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 16935236 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16935665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16936445 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16939454 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16939846 C G Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 16943962 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16944053 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16946533 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16946674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16949107 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16949530 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16952694 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16955529 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16955591 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16958855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16959237 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16959477 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16959787 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16960517 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16960542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16960800 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 16962106 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16962119 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16962867 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16963539 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16963756 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16964397 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16964469 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16968013 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16968533 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 16968772 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16969017 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16970039 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16970103 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16972849 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 16972860 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16973020 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16973052 G T Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 16973293 G A Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 3 16973728 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16973871 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16974118 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16974511 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16975298 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16975334 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16975548 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16976192 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16976385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16978499 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16978525 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16979897 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 16980277 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16980849 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16980957 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16981111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16981578 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16982392 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16984176 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16984271 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16984712 A C Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 16985529 T C Y Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 16985737 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 16985738 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 16986106 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16986227 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16986439 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16987426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16987755 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16987935 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16988911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16988927 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16988967 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 16989843 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16990219 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16991062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16991270 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16994880 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16995018 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 16996361 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 16996946 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 16997500 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16998048 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 16998131 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 16998219 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 16999520 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 16999936 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 17001714 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17002509 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17003398 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17003509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17003819 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17007491 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17007746 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 17007988 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 17009685 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17009955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17010301 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17011030 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17011145 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17011599 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17011911 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17012249 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17012312 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17012905 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17013270 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17013948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17014268 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17014350 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17016206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17016473 C G Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 17016495 G C Y N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 17017710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17018893 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17019962 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17021256 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17022171 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17022184 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17022787 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17023394 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 17028110 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 17028117 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17029927 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 17030361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17031531 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17031946 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17032817 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17032938 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17033004 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17033132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17033751 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17033982 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17035171 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17037859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17038557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17038903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17041802 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17044169 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17044631 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17046553 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 17047414 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 17048759 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 17049136 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17049312 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17049383 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17049698 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17050384 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17050489 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17050753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17050821 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17051702 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17051707 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 17052011 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17052012 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17053106 A C Y N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 17054490 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17055637 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17057227 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17060028 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17060733 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17060923 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 17061111 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 17061392 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17061778 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 17061790 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 17061844 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 17062269 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 17062299 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 17062311 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17062590 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17062743 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17062770 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17062825 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 17063105 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17063399 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17063705 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17063735 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17063749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17063850 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17063873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17064277 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17064364 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17064367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17064447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17065345 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 17065349 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 17065357 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 17065366 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17065372 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17065400 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17065463 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17065636 A T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 17065701 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17065749 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17065766 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 17065799 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 17065800 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 17065863 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17068418 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17068583 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17068874 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17068982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17069446 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 17069447 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17069697 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 17069962 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17069996 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17070040 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17070149 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17070200 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17070791 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17070819 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17071508 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17071650 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17071790 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17073759 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 17074138 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17078176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17079063 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17080059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17081829 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17098955 C T Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 17100897 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 17103768 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17104453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17104924 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17105893 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17109721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17110119 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17110283 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 17110493 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17111065 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 17111384 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17112352 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 17112486 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 17112552 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17112781 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17112910 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17112940 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17113122 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17113163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17113694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17113810 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17113949 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17114758 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17114904 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 17114916 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17114983 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17115060 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17115222 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17115232 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17115261 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17115355 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17115996 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17117432 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17119614 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17120055 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17127379 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17127972 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 17128710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17128960 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17129481 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17130088 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17130305 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17130377 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17130907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17131693 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17132782 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17133705 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17133849 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17134938 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17135429 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17135992 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17138150 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17138151 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17138451 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 17139441 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17140003 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17140019 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 17140501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17140638 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17141039 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17141118 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 17141406 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17141831 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 17142029 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17143462 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 17144600 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17144861 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17145206 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 17145404 G T N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 17145409 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 17145418 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 17146475 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17147243 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17148123 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 17148351 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17149370 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17149533 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17149684 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17149702 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17149807 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17150908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17151032 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 17152097 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 17152214 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 17152325 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17152358 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 17152441 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17152638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17152928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17153468 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17155330 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17155421 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17155422 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 17155440 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17155479 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17155519 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 17155524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17155586 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17155667 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 17155711 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 17156037 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 17156139 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17156184 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17156212 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17156213 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17156299 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17156300 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17156330 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17156347 T A Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 17156441 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17156453 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17156520 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17156558 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17156609 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17156618 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17156620 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17156645 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17156667 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17156833 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17156865 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17157166 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 17157287 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17157323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17157334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17157348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17157416 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17157533 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17157551 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17157566 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17157577 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17157638 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 17157666 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17157720 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17157739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17157742 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 17157759 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17157897 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17157914 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17157976 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17157978 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17158056 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17158112 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17158157 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17158181 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17158194 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17158228 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17158231 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17158241 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17158259 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17158351 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17158369 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17158382 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17158463 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17158485 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17158496 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 17158500 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 17158591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17158604 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17158607 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17158736 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 17158794 C G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 17158803 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 17158816 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 17158844 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 17159163 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 17159203 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17159572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17159628 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17159661 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17159694 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17159775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17159815 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 17159833 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17159869 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17159900 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17160090 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17160207 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17160231 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 17160469 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 17160493 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17160517 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 17160627 G T Y N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 17160751 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17160754 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17160793 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17160810 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 17160857 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 17160867 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 17160897 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17162363 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 17162379 A G Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 17162849 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17163256 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 17163390 G A Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 17163666 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 17163684 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17163783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17163939 T C Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 17164546 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17164714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17164910 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 17164911 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 17165064 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17165147 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17165443 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17166334 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17166339 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17166350 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17166448 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17167166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17167176 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17167574 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17167619 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 17167739 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 17167896 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17167987 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17168261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17168614 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17168648 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17168943 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17169082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17169107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17169281 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17169419 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17169463 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17170575 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17170719 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 17171034 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17171994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17172593 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17172729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17173196 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17173571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17174093 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17175290 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 17175376 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17176074 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17176387 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17179997 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17181014 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 17181920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17182313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17183199 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 17183222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17183839 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17183857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17187026 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 17188175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17188177 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 17188241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17189509 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17189611 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17189638 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17189977 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17190029 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17190043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17190090 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 17190538 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17190758 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17191031 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17191137 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 17191415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17191554 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17192224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17192280 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17192566 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 17200595 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 17200943 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17201136 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17201429 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17201595 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17201988 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 17202003 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 17202020 G T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 17202252 T A Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 17202358 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17202478 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17202529 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 17202649 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17202692 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17202853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17202929 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17203010 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17203046 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17203116 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17203458 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 17204012 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17204029 C G Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 17204172 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17204190 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 17204330 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 17204512 C T Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 17204574 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17204687 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17204754 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17204824 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 17204875 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17205120 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17205186 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 17205284 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 17205310 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17205311 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17205340 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17205396 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17205570 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17205669 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 17206279 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 17206347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17206358 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 17206500 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17206725 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17206742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17206824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17206961 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 17206962 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 17207391 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17207507 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17207598 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17207928 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17207929 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17207967 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17208048 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17208152 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17208213 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17208285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17208309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17208474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17208630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17208649 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17208794 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17209085 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17209154 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17209232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17209256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17209418 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 17209517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17209527 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17209713 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17209863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17209869 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17210191 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17210320 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17210499 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17210593 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 17210605 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 17210743 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17210792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17210973 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 17211151 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 17211163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17211269 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 17211343 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17211394 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 17211592 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 17213088 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17213277 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17213615 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17213742 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 17213782 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17214592 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 17214611 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 17214772 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17214803 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17214874 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 17215024 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 17215339 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17215618 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17215751 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 17216163 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 17216226 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 17216540 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17216770 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 17217363 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 17218327 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17218584 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17219271 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17221132 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17221308 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 17221405 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17221911 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17222148 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17222158 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17223438 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17223798 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17224306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17224601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17224787 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17225330 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17225809 T G N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 3 17225989 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 17226913 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17228743 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17231747 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17231871 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17232073 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17232115 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 17233295 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17233714 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 17234032 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17235276 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17238431 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17239492 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17239925 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 17241177 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 17241553 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17242431 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17243380 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17244425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17245185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17246000 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17246560 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17247226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17250783 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 17251435 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17252874 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 17255266 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 17256754 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17256980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17257476 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17257918 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17260407 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17260427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17260780 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 17261757 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17262502 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17262950 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 17264099 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 17264538 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17265458 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17267518 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17267621 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17268003 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17268489 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17268852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17269540 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 17269704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17270010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17270358 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17270811 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 17273229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17274023 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17274058 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17274299 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 17274878 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 17277349 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 17277701 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17277933 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 17278226 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 17278347 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 17278476 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 17278743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17279218 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17279272 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 17279442 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 17279466 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17280883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17280964 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17290084 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17291837 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 17291879 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17293768 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17294078 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17295360 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 17295967 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17296018 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17296092 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 17296177 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17296562 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17298021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17298639 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 17299406 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17299622 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17301023 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17301493 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17303209 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 17303306 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 17303742 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 17304980 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17306435 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17307127 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17308292 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 17308402 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17308549 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17308661 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17308859 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17308932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17309481 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 17310526 A T Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 17311309 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17311448 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 17312383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17312605 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17312720 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17313338 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17314089 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17314327 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17314678 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17315914 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 17316301 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 17316717 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 17316856 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17316889 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17317174 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 17317548 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17318025 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17318395 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 17319177 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17319201 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17325939 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17328450 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 17328658 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17329543 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17329603 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17330057 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 17330143 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 17330210 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 17330486 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17332250 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17338589 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17341007 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17347895 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17347911 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 17348153 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17348268 A G N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 17349139 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17349297 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17352657 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17355469 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 17355471 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 17355522 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 17356056 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17358019 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17358077 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17358197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17358568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17358586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17358606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17358829 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17359203 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17359225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17359340 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17359495 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17359674 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 17359977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17360005 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 17360067 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17360196 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 17360227 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 17360289 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17360342 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17360404 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17360520 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17360754 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17360850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17361349 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 17361356 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 17361369 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 17361600 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 17361661 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 17361731 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17361802 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 17361895 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17361945 G C N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 17361952 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 17361966 T G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 17361984 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 17362095 C G N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 17362096 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 17362192 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 17362301 G A N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 17362308 T C N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 17362388 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 17362471 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 17362573 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 17362611 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 17362696 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 17362735 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 17362987 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 17363029 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 17363051 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 17363137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17363167 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 17363184 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17363197 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 17363243 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 17363397 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 17363517 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17363641 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 17363798 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 17363838 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 17363867 C A N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 17363939 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 17363972 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 17364151 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 17365042 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17365162 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17365730 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17368619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17368653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17369697 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17370301 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17372149 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 17374728 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 17375758 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17376095 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 17377248 A T Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 17377553 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17377670 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17377774 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17377805 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17378597 T C Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 17379528 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 17379929 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 17380235 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17380275 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17380495 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 17380664 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17380951 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17381748 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 17382174 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17382343 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17382616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17384841 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17384842 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17384993 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17385225 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17385636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17385752 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17385797 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17386184 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17386271 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17386444 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17387769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17387840 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17388050 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17389046 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17389110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17395750 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17396112 C A Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 3 17396795 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17398535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17398562 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17401280 G C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 17401617 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 17404794 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17405080 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17405326 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17407077 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 17407450 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 17407723 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17409235 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17409595 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17411414 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17411669 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 17414186 A C Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 17414233 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17414540 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17415970 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17416266 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17416370 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17416385 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17416679 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17417316 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 17417333 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 17418023 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 17418393 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17420360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17424122 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17424601 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 17426240 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 17426333 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17427662 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17428917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17429135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17429622 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 17429631 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 17429984 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 17430000 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17430197 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17430608 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17430791 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17432216 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17432445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17433682 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 17435050 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17435065 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17435194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17435338 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17435455 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17435788 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17435925 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17436367 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 17437040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17437043 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17437172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17437423 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17437457 C T N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 3 17437550 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17437656 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17437792 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17437819 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17437869 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 17437886 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17437971 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17437994 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17438332 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 17438562 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 17439293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17439306 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17439345 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17439773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17440234 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17440400 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17441257 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17442164 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 17443412 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17443534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17443556 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17443840 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17445045 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17446670 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 17448454 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17449807 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17449955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17452053 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 17453582 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17456395 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 17457346 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17457575 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17459617 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17465253 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17466208 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17469309 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 17469788 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17469885 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 17469889 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17469985 C A N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 17471016 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 17471381 A T N N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 17471465 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17471851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17471930 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17471998 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17472422 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17472503 A G N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 17472535 T C N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 17472655 T A N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 17473001 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 17473399 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 17473630 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 17474290 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 17474523 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 17474567 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 17475273 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 17475710 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17477487 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17478512 C G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 17478945 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17479008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17479011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17479344 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 17480638 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17481789 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17483253 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17484669 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17486462 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17487090 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17487842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17488786 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 17489027 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17489296 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17489336 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17489436 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17490959 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17491148 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17491159 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17491283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17491827 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17492659 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17493521 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17494404 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 17494827 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17494863 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 17494896 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 17494944 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17495221 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17495559 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 17495628 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 17495649 T G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 17495662 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 17495830 T G N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 17495845 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 17495858 T G N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 17495941 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17495976 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17495977 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17495995 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17496136 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17496139 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17496189 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17496231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17496280 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17496408 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 17496653 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 17496731 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 17496776 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 17496816 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17496903 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 17497091 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 17497139 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 17497148 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 17497775 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 17497813 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 17497932 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 17497938 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 17498155 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 17498365 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 17498430 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 17498444 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 17498450 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 17498711 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 17498760 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17499808 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 17500817 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17501135 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17502546 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 17502547 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 17503643 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 17503919 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17503957 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17504028 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17504113 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17504157 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17504229 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 17504272 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 17504298 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 17504303 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17504347 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 17504625 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 17504666 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 17504685 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17504702 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17504829 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17505160 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17505188 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17505208 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17505210 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17505228 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17505251 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17505283 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17505308 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17505531 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17505587 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17505669 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17505831 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17505907 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17505909 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17505918 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17505956 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17505989 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17506811 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17506824 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 17506971 C G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 17507026 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 17507098 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 17507193 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17507464 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17508150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17508615 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17508628 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17508881 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17509692 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17509747 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17509920 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 17510386 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17510512 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 17511238 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17511860 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17514917 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17515231 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17515257 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17515895 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 17516009 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17518856 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17524085 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 17526073 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 17526601 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17527059 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17528276 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 17528865 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17532194 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17532464 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 17532667 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17533100 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 17533477 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17533737 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17534547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17534739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17535540 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17539355 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17540735 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17541101 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17543691 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17543794 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17543955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17544599 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17544896 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17545728 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 17545892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17547717 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17547728 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 17547979 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17548042 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 17548881 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17556440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17557727 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17559578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17560678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17563489 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 17563628 A C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 17564360 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17565433 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17565447 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17566633 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17566698 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17569065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17572033 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17577247 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17586929 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17589206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17589554 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17589964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17590992 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17591019 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17591499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17591766 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 17592336 C T N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 17592794 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17592931 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17593122 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17593606 C T Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 17593777 C G Y N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 17594056 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 17594980 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 17595371 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 17595372 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 17595388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17595405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17595439 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17595455 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17595510 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17595530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17595618 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17595750 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17595796 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 17595868 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17595872 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17595902 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17596130 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17596244 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 17596747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17596993 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17597065 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17597097 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17597220 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17597226 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17597261 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17597267 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17597364 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17597446 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17597721 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 17597727 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17597866 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17597916 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17597941 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17598484 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 17598757 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 17599339 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 17599340 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 17599379 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 17599395 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17599518 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 17599536 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 17599559 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 17599591 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17599602 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 17599618 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 17599666 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17600143 T A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 17600301 T G N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 17600751 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 17600777 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17601107 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17601326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17601493 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17601536 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17601660 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17601703 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 17601831 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17601888 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 17601931 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 17601951 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 17601977 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 17602118 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17602145 G T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 17602177 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 17602186 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 17602216 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 17602327 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17602360 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 17602384 T A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 17602392 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 17602415 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 17602529 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 17602553 C T Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 17602711 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 17602730 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 17602890 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17602902 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17602962 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 17603060 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17603073 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17603076 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17603085 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17603151 T A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 17603152 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 17603172 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 17603196 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 17603338 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 17603361 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 17603392 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17603422 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17603506 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 17603509 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 17603558 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17603577 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17603629 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17603739 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17603824 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17603825 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17603871 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 17603945 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17604118 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17604151 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17604208 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17604211 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17604512 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17604616 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 17604706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17604843 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 17605096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17605118 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17605460 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17605484 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17605507 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17605562 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17605707 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17605766 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17605778 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17605812 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17605905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17606308 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17606354 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 17606358 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 17606366 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 17606371 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 17606380 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17606528 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 17606578 T G Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 17606613 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17606619 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17606664 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17606666 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17606756 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 17606788 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17606796 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17606875 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17606876 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17606888 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17606931 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17606959 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17607009 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17607188 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 17607193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17607495 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17607551 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 17608168 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17609016 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 17611763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17611789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17612075 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17612081 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17612091 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17612098 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17612133 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17612154 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17612187 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17612195 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17612208 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 17612247 G T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 17612298 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 17612707 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 17612900 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17613026 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 17613091 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17613185 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17613847 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 17613852 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 17613884 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 17613969 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 17614039 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 17614050 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 17614062 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 17614102 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 17614106 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 17614166 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 17614217 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 17614245 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 17614304 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17614309 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 17614319 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 17614323 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 17614416 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 17614430 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17614431 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17614636 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 17614693 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 17614766 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17614803 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17614853 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17614882 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17614929 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17615080 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17615178 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17615228 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 17615452 C A Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 17616241 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17616385 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17616529 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 17616537 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 17616656 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 17616685 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 17617553 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17617592 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17618149 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 17618371 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17618548 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17618627 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17618659 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17618889 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 17619417 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 17619433 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 17619602 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17619625 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 17619651 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 17619713 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 17619728 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17619910 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17620169 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17621248 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 17621496 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17621598 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 17621758 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 17622465 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17622523 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17622575 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17622586 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17622592 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17622658 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17622750 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 17622802 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17622866 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17622939 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17622961 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17622986 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17622993 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17622999 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17623014 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17623080 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17623381 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17623421 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17623446 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17623474 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17623516 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17623520 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17623536 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17623653 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17623661 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17623688 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 17623788 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17623791 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17623859 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17623876 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17623973 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17623984 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17624020 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17624043 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 17624077 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17624090 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17624102 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17624104 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17624114 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 17624125 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 17624134 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 17624144 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17624165 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17624244 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17624285 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17624348 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17624404 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17624427 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17624514 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 17624532 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17624594 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17624708 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17624729 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17624806 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17624870 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17624885 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17624903 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17624913 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17625057 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17625167 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17625294 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17625355 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17625910 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 17625990 A G N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 17626317 T C N Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 3 17626553 A G N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 17626646 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 17627010 C G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 17627077 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 17627090 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17635356 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 17635493 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17636636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17636792 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17637001 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17640162 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17640452 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17642275 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17642846 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 17643563 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 17644535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17645880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17646137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17648841 G A Y Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 3 17650237 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 17650361 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17650518 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17651396 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 17657492 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17658339 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 17659070 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17661456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17662141 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 17662976 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 17663022 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 17663184 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17663464 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 17663505 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 17664334 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17664454 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17664525 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17664638 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 17664680 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17664703 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17664800 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 17664869 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 17664907 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 17664916 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17664938 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 17665216 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 17665694 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 17665701 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17665848 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 17666113 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17666177 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17666217 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17666316 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17666448 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17666464 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 17666575 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17666615 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 17666667 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 17666703 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17666747 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 17666803 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 17666823 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 17667023 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 17667040 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17667057 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17667143 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17667207 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17667312 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17667318 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17667367 T G Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 17667619 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17667671 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17667916 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 17667982 T G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 17667989 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 17668009 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 17668027 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 17668090 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17668192 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 17668268 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17668272 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17668327 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17668387 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17668423 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 17668465 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17668472 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17668476 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 17668489 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17668491 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 17668512 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 17668671 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 17669178 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17669209 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17669269 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17669272 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17669284 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17669288 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17669355 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 17669380 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 17669413 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17669606 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17669661 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17669724 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17669828 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 17669880 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 17670125 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 17670448 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 17670909 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 17670949 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 17671014 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17671179 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 17671190 A G N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 17671264 A C N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 17671273 C T N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 17671674 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17671964 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 17671982 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17672023 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 17672063 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 17672070 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 17672814 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17672975 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17673366 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17673594 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 17673833 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17673926 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17673952 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17674449 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17674468 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17674716 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 17674745 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 17674832 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 17674839 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 17674870 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 17674876 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 17674929 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 17674999 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 17675037 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17675177 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17675256 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 17678052 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17678683 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17679414 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17680708 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17686062 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17686215 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17686544 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17686734 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17689405 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17692221 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17693488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17694365 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17695191 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17695758 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 17696518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17697319 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17699434 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17700722 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17700922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17702889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17703089 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17703143 A T Y N 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 3 17706000 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17707851 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 17709948 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17711413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17711931 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17712365 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 17712655 A G Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 17712668 C G N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 17713469 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17714363 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17716790 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 17717341 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17718558 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 17719309 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17719854 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17719873 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 17720414 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 17720622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17720624 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17723144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17723466 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 17723620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17724225 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17724402 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 17725584 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17725921 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17726149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17726234 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17726272 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 17726363 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 17726699 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 17726703 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 17726770 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17729492 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17729521 G C N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 17729967 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17731042 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 17731260 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17731710 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17733612 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17733622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17734174 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17734297 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17734535 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17736021 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17736350 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17737802 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 17738157 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 17741630 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17741865 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17743713 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17743971 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 17746568 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17746962 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 17747126 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 17748095 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 17748144 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17748157 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 17748170 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17748189 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17748229 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17748243 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17748271 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17748405 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 17748409 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 17748533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17748706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17748920 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17748931 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17748942 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 17749106 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17750360 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17750391 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17750777 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17750778 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17752914 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17753901 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 17754182 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 17754265 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 17754651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17754961 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 17755075 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17755156 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 17755413 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17755454 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17755455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17755616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17755631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17755729 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17755737 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17755849 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17756344 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17756485 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17756786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17756826 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17757216 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17757247 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17757528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17757711 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17757743 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17757747 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17757791 A G Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 17757911 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17757956 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17757967 C T Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 17757968 A G Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 17757979 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 17757998 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 3 17758057 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17758058 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 17758076 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 17758089 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 17758117 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 17758195 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17758266 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17758421 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 17758507 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 17758646 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 17758706 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17758837 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17758859 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17758926 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 17759049 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 17759067 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 17759094 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17759425 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 17759494 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 17759775 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 17759980 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 17760229 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 17760289 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 17760420 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 17760652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17760690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17760957 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17760959 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17761337 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 17763204 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17764251 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17766332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17766541 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17767038 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17767127 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17767864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17768595 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 17768607 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 17771620 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 17772359 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 17772412 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 17772746 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 17772919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17773208 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17773488 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 17773642 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17773704 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17773991 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 17774009 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 17774063 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17774096 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 17774196 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 17774639 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17774641 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 17774660 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 17774797 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 17774863 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 17775097 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 17775345 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 17775387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17775620 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 17775721 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17776314 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17776326 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17776424 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 17776531 T A Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 17776754 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 17777265 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 17777268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17777278 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 17777285 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 17777574 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 17777598 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17777603 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17777781 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 17777904 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 17778228 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 17778523 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 17778546 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 17778773 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17778884 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17779230 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 17779395 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 17779398 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 17779448 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17779551 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 17779650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17779654 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17779705 A T Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 17779718 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 17779806 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 17779868 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17779881 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17779939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17780289 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17780323 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17780450 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 17780470 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17780478 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17780494 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17780509 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17780568 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17780698 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 17780711 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 17780746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17780763 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17780815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17780824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17780884 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17780890 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17780895 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17780906 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17781032 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17781043 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17781052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17781259 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17781371 A C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 17781663 C A Y N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 17781971 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17782006 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 17782012 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 17782252 A G N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 17782393 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 17782403 A T N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 17782407 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 17782465 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17782494 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 17782586 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 17782757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17783018 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17783034 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17783056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17783058 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17783235 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17783448 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17783467 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17783535 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17783541 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17783614 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17783736 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17783739 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17783770 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17783993 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 17784066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17784112 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17784146 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17784321 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17784382 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17784422 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17784432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17784519 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17784616 A G Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 17784653 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17784745 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17784748 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 17784802 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 17784836 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17784855 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17785094 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17785138 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17785140 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17785149 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17785154 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17785168 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17785545 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17785874 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 17785952 C T Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 17786181 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 17786724 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17786737 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17786799 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 17786875 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17786995 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 17787000 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 17787183 T C N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 17787292 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17787449 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 17787548 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 17787566 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17787657 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 17787690 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 17787745 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 17787927 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 17787947 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 17788028 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17788244 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 17788289 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 17788315 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 17788447 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 17788497 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 17788529 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 17788682 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 17788882 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 17788895 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17788974 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 17789303 G T Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 17789414 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 17789839 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 17790037 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 17790368 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17790483 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17791076 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 17791254 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 17791273 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 17791490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17791702 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17791828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17791917 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17792120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17792163 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17792202 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17792226 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17792417 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 17792473 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17792629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17792634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17792758 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17792847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17792893 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17792903 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17793030 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17793097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17793586 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17793702 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17793755 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17793775 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17793954 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 17793962 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 17794022 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 17794035 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17794039 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 17794060 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 17794122 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 17794146 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 17794221 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 17794257 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 17794317 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17794340 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 17794384 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 17794423 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 17794455 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 17794523 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17794533 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 17794591 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17794650 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17794666 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 17794733 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 17794756 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17794877 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 17794893 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17794941 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17795282 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 17796181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17797918 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17798314 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17798457 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 17798489 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17798514 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17799301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17799527 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17811984 G A Y Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 17812801 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17812999 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17813091 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 17813392 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17813465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17813681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17813702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17814007 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17814039 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17814304 A C Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 17814713 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17815069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17815078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17815167 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 17815288 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17815352 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17815500 G C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 17815679 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 17816256 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 17816271 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17816389 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 17816498 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17816579 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 17816669 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 17816681 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 17816733 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 17817031 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 17817067 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 17817205 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 17817305 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17817339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17817361 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17817428 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 17817602 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17817716 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17817824 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17817894 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17817951 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 17817973 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17818111 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17818203 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17818261 G A Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 17818359 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17818417 C G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 17818499 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 17818649 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 17818734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17818794 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 17818907 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 17819724 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17819866 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 17819931 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17820144 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 17820151 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 17820203 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 17820308 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17820439 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17820458 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17820509 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17820520 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17820571 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 17820766 A C Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 17821011 T C Y Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 3 17821140 G A Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 17821205 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17821213 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17821333 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17821448 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 17821582 G A Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 17821683 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 17821694 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 17821712 T C Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 17821728 G A Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 17821851 T C Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 17821852 A T Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 17822031 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17822119 C G Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 17822261 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17822282 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 17822425 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17822685 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17822748 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17822846 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17822923 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 17822989 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 17822991 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17823024 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17823074 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17823082 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 17823097 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 17823208 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 17823218 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 17823257 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17823260 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17823277 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 17823291 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 17823328 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 17823370 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 17823425 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 17823476 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17823639 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 17823675 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17823722 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 17823774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17823802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17823822 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17823845 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17824165 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 17824222 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17824288 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 17824307 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 17824322 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 17824453 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 17824502 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 17824651 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 17824691 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17824736 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17824890 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 3 17824904 G A N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 3 17824960 C A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 17825003 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 17825035 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 17825066 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17825178 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17825185 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17825234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17825244 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17825261 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 17825348 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17825363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17825419 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17825461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17825494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17825605 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17825624 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17825630 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17825645 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17825646 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17825661 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 17825670 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 17825694 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17825705 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17825816 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 17825842 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17825889 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17825892 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17825962 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 17826174 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 17826249 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17826262 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17826306 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17826375 A T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17826378 A T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17826437 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 17826776 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17826863 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 17826878 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 17826935 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 17826966 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 17827158 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17827282 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 17827905 T C Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 17828285 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17828619 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17828695 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17828818 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 17828824 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 17828829 G A Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 17828881 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 17828901 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 17828920 A C N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 17829059 C T Y Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 3 17829063 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 17829092 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 17829133 G T Y N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 17829143 A G Y Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 17829165 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 17829175 G C Y N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 17829228 G C Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17829574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17830845 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 17830996 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 17831058 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17831062 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17831103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17831299 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17831364 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17831474 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17831556 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17831567 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17831581 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17831650 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17831702 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 17831780 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 17831872 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 17832574 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 17832593 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 17832665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17832766 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17832800 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17832889 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17833020 T A Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 17833078 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17833079 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17833160 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 17833193 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17833202 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 17833347 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17833385 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 17833464 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 17833483 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17833532 T G N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 17833533 T G Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 3 17833604 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 17833625 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17833638 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 17833653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17833663 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 17833839 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 17833934 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 17833936 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17833962 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 17833996 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17834051 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 17834121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17834216 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17834257 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17834285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17834303 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17834357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17834364 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17834371 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17834402 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17834403 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17834448 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17834461 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17834470 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17834479 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17834482 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17834522 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17834616 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 17834619 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 17834692 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17834710 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17834737 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17834915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17834977 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 17834978 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17835045 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17835175 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17835196 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 17835220 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17835384 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17835410 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17835440 C T Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 17835487 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17835497 T G Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 17835500 G A Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 17835563 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17835619 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 17835668 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 17835671 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 17835695 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 17835744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17835757 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17835759 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17835771 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17835851 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 17835874 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17835895 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17835899 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 17835926 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 17836115 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 17836162 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 17836175 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 17836182 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 17836208 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17836211 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17836275 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 17836328 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 17836384 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 17836553 G C Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 17836575 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 17836676 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 17836793 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 17836862 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 17836867 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 17836990 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 17837109 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 17837120 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17837130 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17837169 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17837255 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 17837273 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17837287 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17837342 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17837562 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17837617 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17837709 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 17837849 T A N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 17837981 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 17838019 A G N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 3 17838208 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 17838247 A G N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 17838255 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 17838283 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 17838352 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 17838576 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 17838613 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 17838630 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17838683 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17838691 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17838827 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17838856 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17838858 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 17838868 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 17838914 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17838940 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 17838967 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 17839030 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 17839034 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 17839061 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17839063 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 17839155 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17839172 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17839223 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17839254 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17839255 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17839273 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17839369 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 17839638 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 17839648 A T N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 17839678 A G N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 17839778 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 17839869 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 17840004 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 17840476 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17840682 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 17840842 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17840980 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 17840994 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 17841088 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 17841222 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17841327 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17841553 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17841561 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17841628 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17841773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17841777 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17841910 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 17842088 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17842146 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 17842225 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 17842246 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 17842361 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 17842363 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 17842414 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17842426 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 17842437 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 17842469 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17842484 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17842528 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 17842706 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 17842920 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17842924 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17843679 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17843706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17843728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17843755 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17843775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17843843 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17843853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17843917 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17843953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17844129 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17844268 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17847433 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 17847456 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17847510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17847768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17847876 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17847897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17848005 A C Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 17849044 T A Y N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 17849050 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 17849265 C G N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 17849345 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 17849387 T C Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 17849489 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17849555 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 17849596 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17849666 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 17849763 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17850113 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 17850117 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 17850162 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17850216 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17850231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17850324 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 17850349 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 17850354 T A Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 17850388 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 17850395 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 17850427 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 17850448 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 17850479 A G Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 17850512 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 17850793 A G Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 17850805 T C Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 17851349 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 17852494 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17852772 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17861777 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17863265 G A Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 17864450 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17867376 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17869919 T C Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 17870382 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 17871147 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17872301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17872533 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17873107 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17881976 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17883125 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17885121 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17885645 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17885675 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17886308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17887052 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17888569 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17889182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17889308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17898654 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 17899622 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17901265 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17902935 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17903335 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 17908286 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17908645 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17911995 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17912807 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17913699 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17916740 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17917973 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 17921230 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 17922574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17927134 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17928644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17928986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17929683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17930137 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17931020 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17931122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17931138 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17931257 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17931317 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17931326 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17931374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17931379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17931530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17931598 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17931633 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17931717 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17931776 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17931812 C G Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 17931827 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17931834 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17932019 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 17932089 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 17938324 A T N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 17938488 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 17938541 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 17938812 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17938846 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17938881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17939065 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17939184 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17939951 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17940358 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 17940555 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17940577 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17940647 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17940705 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17940715 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17940746 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 17940758 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17940913 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17941069 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 17941085 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17941111 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17941141 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17941166 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17941243 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17941267 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 17941379 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17941409 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17941419 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 17941509 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 17941535 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 17941859 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17942924 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 17944065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17944813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17945059 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 17945225 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17945303 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17945337 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17945367 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17945400 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 17946101 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17946339 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 17947094 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17947267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17947426 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17948271 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 17949660 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17950060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17950070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17950074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17950106 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17950125 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17950287 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17950551 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17951764 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17952978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17954793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17957198 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17957522 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17957969 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17958381 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17958781 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 17960929 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17961447 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 17962371 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 17963370 C A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 17963445 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17964898 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17966690 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17967130 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17968689 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 17969409 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17970640 C G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 17972606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17973259 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17973894 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17976311 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17976360 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17977648 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17979637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17980521 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17981630 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17985336 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17986135 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17986470 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 17986873 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 17986894 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 17987036 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 17987046 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 17987048 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 17987226 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 17987233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17987338 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17987390 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17987454 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 17987530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17987572 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 17987650 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 17987749 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 17987809 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 17988054 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 17988091 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 17988215 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 17988239 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 17988307 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 17988424 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 17988569 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17988610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17989031 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 17989135 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 17989187 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 17989222 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 17989289 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 17989319 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 17990189 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17992218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17992232 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17992492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17992571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17992594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17993103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17993274 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17993376 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17993448 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 17993537 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 17993930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17994251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17994444 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17995689 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17995810 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 17995936 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 17997931 T G N N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 17998128 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 17998708 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 17998782 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 17998994 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 17999038 C G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 17999314 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 17999315 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 17999646 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 18000079 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18000346 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 18000745 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 18000759 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18002414 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18003881 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18004567 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18005787 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18007612 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18008692 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 18009290 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18009826 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18010511 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 18010535 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18010622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18011029 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18011098 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18011520 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18011561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18011908 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18011940 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18011967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18011977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18012087 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18012439 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18012565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18012596 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18012903 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 18013073 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18013222 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 18013281 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 18013511 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 18013529 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18013585 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 18013609 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 18013725 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 18013852 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 18014025 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 18014270 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 18014348 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 18014390 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 18014529 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 18014603 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 18014627 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 18014672 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18014675 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 18014734 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 18014752 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 18014781 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 18014807 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 18014818 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18014821 G T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 18014939 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 18014959 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 18014980 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 18015062 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 18015070 C G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 18015245 T C Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 18015312 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 18015368 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 18015374 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 18015412 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 18015517 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 18015612 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 18015655 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 18015666 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 18015669 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 18015677 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 18015725 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 18015740 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 18015762 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 18015768 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 18015979 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 18015999 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 18016220 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18016240 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 18016311 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 18016411 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 18016946 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 18016991 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 18017166 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 18017325 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 18017380 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 18017489 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 18018063 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 18018206 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18018349 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 18018399 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 18018497 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 18018562 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 18018588 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 18018603 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 18018607 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 18018629 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18018659 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 18018709 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 18018759 T A N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 3 18020528 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18021105 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 18022011 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18022284 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18023022 A C N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 18026947 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 18027178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18027244 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 18027286 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 18027307 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 18027372 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18027383 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 18028281 G C Y N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0 1 0 16 16 0 16 0 3 18028291 C G Y N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 3 18029394 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18029526 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18029530 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 18029539 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 18029593 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 18029754 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 18029771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18029869 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18030035 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 18030118 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18030162 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18030740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18031326 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 18031611 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 18031668 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18031865 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18032162 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 18032903 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18033150 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 18033592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18033636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18033667 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18033797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18033829 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 18033950 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18033999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18034094 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18034162 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 18034398 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 18034414 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 18034579 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 18034620 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 18034696 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 18034719 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 18034751 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 18034801 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 18034904 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 18034935 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 18035007 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 18035110 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 18035179 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 18035329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18035360 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 18035400 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 18035451 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 18035524 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 18036248 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 18036280 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 18036325 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 18036364 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 18036378 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 18036398 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 18036422 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 18036429 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 18036524 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 18036536 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 18036593 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 18036734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18036850 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 18036913 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18036931 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 18036956 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18037047 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18037073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18037081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18037317 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18037369 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18037519 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 18037540 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 18037555 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 18037686 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 18037723 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 18037999 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 18038488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18041019 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18041025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18042260 T G Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 3 18042388 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18043037 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18043850 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18043992 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 18044283 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18044903 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18046912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18047611 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18048267 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 18050919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18051375 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18051414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18051469 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 18051580 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 18052260 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 18052402 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18052589 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18052603 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18053315 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18054413 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18054879 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 18055808 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18056031 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18056190 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 18056267 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18057015 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18057861 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18059528 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 18059834 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18060106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18061013 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 18062667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18065728 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18066182 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18066330 C G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 18066362 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 18067797 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18068087 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18068898 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 18069005 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 18069260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18069450 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18070432 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18070433 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 18070791 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18070896 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18070927 T A Y N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 18070931 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18071026 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18071049 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18071055 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18071087 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18071345 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18071367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18071411 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18071431 C A Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 18071495 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 18071507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18071542 C A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 18071685 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 18073081 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 18073195 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18073236 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 18073378 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18073447 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18073490 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18073690 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 18073725 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18073901 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 18073950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18074078 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18074113 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18074139 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18074297 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 18074380 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18074421 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18074423 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18074570 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18074660 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18074687 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18074808 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18074870 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18074936 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18074942 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18075047 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18075062 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18075303 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18075308 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18075507 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 18075587 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 18077480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18077534 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 18077691 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18079513 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18079555 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18079773 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18079849 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 18079927 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 18081146 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18081541 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18082262 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 18082391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18083253 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18083279 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18084212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18084876 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18085313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18085333 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 18085337 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 18085349 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18085647 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 18085714 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18085823 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18085952 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18086095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18086116 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18087467 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18087614 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18088085 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18088717 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 18089466 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 18089501 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 18089642 C A N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 18089646 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 18089685 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18089732 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 18089907 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 18090518 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18090754 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18090812 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18091198 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 18092361 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18092516 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18092696 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18093540 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 18093551 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 18093583 C T Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 18093725 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18093752 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 18094144 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 18094193 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 18094314 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 18094367 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 18094394 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18094397 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18094419 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18094436 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18094443 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18094512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18094627 G C Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 18094714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18094755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18094794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18095059 T G Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 18095295 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18095301 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18095315 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18095330 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 18095395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18095416 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18095423 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18095462 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18095510 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 18095533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18095538 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18095559 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18095593 C A Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 18095601 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18095700 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18095738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18095774 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18095859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18095866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18095932 G A Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 3 18095951 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18096063 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18096151 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 18096202 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 18096216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18096233 T C Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 18096314 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 18096443 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 18096571 G T Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 18096587 T G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 18096600 C G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 18096650 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18096715 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18096761 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18096865 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18096932 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18097012 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18097076 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 18097109 A G Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 18097131 G T Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 18097562 C T Y Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 18097871 G C Y N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 18097961 T C Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 18098760 T C Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 18098877 C A Y N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 18098897 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18099001 C T Y Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 18099185 T C Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 18099224 G A Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 18099267 G A Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 18099454 G A Y Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 3 18099493 T A Y N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 18099506 T C Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 18099513 C A Y N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 18099566 A T Y N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 18099606 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18099742 A C Y N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.0833333333333333 0.75 0.166666666666667 11 13 1 9 2 3 18099833 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18099916 C T Y Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 12 16 2 8 4 3 18100031 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 18100044 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 18100082 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 18100102 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 18100399 A G Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 18100412 T C Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 18100470 T G Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 18100541 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 18100566 G C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 18100570 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 18100631 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 18100759 G A Y Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.571428571428571 0.357142857142857 10 18 1 8 5 3 18100769 T A Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 18100787 C T Y Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 18100805 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 18100821 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 18100844 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18100846 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18100909 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 18101067 C G Y N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 18101387 G T Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 18101393 G A Y Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 3 18101419 A C Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 18101462 G A Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 18101650 G A Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 18101684 C T Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 18101753 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 18101981 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 18102050 G A Y Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 18102153 A G Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 18102195 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18102216 C G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 18102247 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18102354 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 18102383 G A Y Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 18102386 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 18102420 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 18102493 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 18102575 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18102685 T C Y Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 18102885 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18102978 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 18103015 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18103102 A G Y Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 5 7 1 3 2 3 18103260 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 18103312 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 18103674 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18103861 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18103943 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18104180 G C Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 18104411 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18104974 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 18104997 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 18105020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18105197 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 18106420 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 18106443 T C Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 18106591 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 18106672 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 18106962 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 18106967 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 18107075 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18107107 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 18107142 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 18107179 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 18107233 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 18107254 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 18107555 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 18107757 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18107967 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18107979 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 18108090 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18108185 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 18108831 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18108858 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 18109048 C T Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 18109406 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18109544 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 18110355 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18110395 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18110447 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18110466 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18110680 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 18110681 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 18110693 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 18110881 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 18110892 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 18110939 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 18111092 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 18111127 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 18111144 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 18111163 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 18111233 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18111256 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18111381 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 18111607 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 18112065 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18112186 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 18112213 A C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 18112536 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 18112651 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18112780 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 18112849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18112896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18113359 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 18113372 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18113649 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18113892 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 18113965 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18114029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18114053 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18114353 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18114360 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18114396 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18114567 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18114569 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18114656 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18114664 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18114671 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 18114740 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18114938 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18114966 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 18115247 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 18115428 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18116251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18116423 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 18116431 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 18116692 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18117006 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18117145 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18117955 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18118829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18119017 C A N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 18121324 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 18121325 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18125009 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 18126850 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 18129865 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 18130001 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18130825 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18132156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18132565 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18133821 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18140641 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 18141422 A T Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 18143989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18144059 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18144065 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18144175 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18144196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18146023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18146431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18148108 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18148664 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18149644 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 18151944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18152620 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18152832 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18153609 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 18155407 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18156674 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18158459 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18159124 T C Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 18160219 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18161354 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18161396 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18161436 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 18161502 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 18161516 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 18161794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18162058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18162773 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18163043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18165601 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18166066 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18166111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18166695 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18166816 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18167124 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18167528 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18167624 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18167973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18168485 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18168587 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18170096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18170613 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18170625 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18171341 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18171359 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 18171393 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18171925 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 18172101 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18173791 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18174020 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 18174555 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18174658 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18174959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18175533 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18176300 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18176726 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18177929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18177996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18178301 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18179114 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18179630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18179799 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18181038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18182035 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 18182999 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 18183245 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 18183246 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 18183659 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18183831 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18185036 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 18185196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18185539 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18185541 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18186018 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18186108 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18188170 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 18189235 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 18192783 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18196245 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 18198899 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18201768 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18202765 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18203817 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18205546 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 18205922 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18206034 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18206616 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18207808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18221031 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 18221076 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18221276 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18221375 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18221885 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 18221904 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18222120 G T Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 18222200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18222240 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 18222323 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18222423 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18222452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18222453 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18222629 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18223361 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18223362 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18223412 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18223416 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18223656 G T Y N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 3 18223820 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 18223947 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18224084 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18224438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18224994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18225026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18229935 C A N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 3 18229972 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18229977 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18230796 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18230945 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18232118 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18234956 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18236596 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 18236637 G T Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 18236889 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18237131 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18240134 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 18241754 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 18243316 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18244674 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18246498 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 18247984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18256990 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 18258220 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18259602 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18260182 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 18260346 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 18260352 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 18260359 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 18260428 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 18260808 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 18260819 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 18260859 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 18260884 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18260920 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 18261096 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 18261431 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 18261690 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 18262067 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18262314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18262931 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18263042 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18263266 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 18263315 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 18263391 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 18263474 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 18263505 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 18263532 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 18263556 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18263571 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 18263575 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 18263770 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 18264081 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 18264102 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 18264206 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 18264232 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 18264498 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 18264745 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18264837 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 18264857 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18264984 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 18265002 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 18265052 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 18265072 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18265082 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18265258 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 18265271 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 18265315 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 18265440 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 18265470 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 18265564 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 18265775 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 18265787 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18265801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18265832 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18265982 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18266074 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18266219 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 18266274 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18266556 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 18266581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18266684 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18266968 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 18266978 G C Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 18267005 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 18267084 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18267234 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 18268666 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18268690 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 18268722 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 18268728 A T N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 18268733 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 18268739 C G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 18268778 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 18268792 C A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 18268839 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 18268840 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 18268897 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 18269035 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 18269259 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 18269282 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 18269543 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 18269622 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 18269719 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 18269840 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 18270743 T A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 18270844 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 18270845 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 18270992 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 18271022 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 18271114 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 18271142 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 18271574 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 18271584 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 18272255 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 18272305 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 18272334 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 18272845 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18272976 T A N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 18273946 A C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 18274510 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 18275047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18275336 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 18275372 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 18276184 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 18276188 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 18276636 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18277002 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 18277014 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 18277677 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 18278032 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18278332 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 18279142 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 18279296 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 18279377 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 18279492 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 18283513 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18283740 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18283794 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 18283822 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18283926 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 18283935 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 18283951 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18284132 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 18284266 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18285287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18285661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18287303 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18288122 G A Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 18290009 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 18295151 C A Y N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 18295231 T A Y N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 3 18296895 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18297345 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18297408 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18300316 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18301091 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18302275 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18303828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18303849 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 18305636 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18307664 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18310259 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 18310770 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18311467 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 18313515 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18314011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18316256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18317450 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18317592 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 18317849 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 18317850 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 18318215 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 18318691 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18320107 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 18320207 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 18320436 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 18320938 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 18321085 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 18321097 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 18321134 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 18321135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18321211 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 18321340 A C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 18321504 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 18321528 T C Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 18321585 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 18321594 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 18321618 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 18321691 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18321961 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18322366 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18322464 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18322508 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18322509 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 18322676 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18322950 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18323060 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18323125 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18323256 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 18323281 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18323328 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 18323342 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18323379 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 18323532 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 18323612 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 18323631 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 18323649 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 18323650 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 18323797 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 18323842 T C Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 18323878 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 18324029 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18324057 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 18324102 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 18324584 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 18324606 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 18324629 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 18324878 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 18325220 C T N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 18325301 C A N N 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 3 18325630 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 18325720 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 18325726 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 18325867 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 18325880 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 18325882 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 18325894 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18325953 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 18325977 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 18326316 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18326523 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 18326600 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 18326671 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 18326811 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 18326820 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 18326910 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18326960 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 18327038 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 18327148 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 18327386 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 18327402 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 18327612 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 18327629 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 18327682 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18328674 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 18329338 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 18329517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18330524 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 18330650 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 18330872 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 18330928 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18331096 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18337549 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18337777 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 18337817 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 18337829 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 18338045 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 18338184 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18338217 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18338269 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 18338438 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 18338513 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18338530 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 18338570 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 18338590 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 18338945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18339757 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18339948 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18340070 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 18340087 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18340234 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18340452 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 18340862 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18341625 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18342780 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18343256 T G Y N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 18343363 C T Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 18344128 C T Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 18344336 T G Y N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 18344456 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 18344607 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18344883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18344969 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18345894 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 18347670 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18347767 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18348145 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18348530 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 18348571 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18348948 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 18349199 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18349241 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 18349386 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18349425 T A Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 3 18349617 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18349689 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 18349767 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18350023 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18350288 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18350511 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 18350618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18350918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18351395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18351509 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18352301 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18352528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18353254 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18353390 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18353798 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18354176 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18354863 G C Y N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 18356215 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18356968 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18357154 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 18357227 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 18357462 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 3 18357481 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 18358404 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18359144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18363063 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18363342 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 18363475 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 18363478 C T Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 18363486 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 18363563 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 18363573 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 18363668 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 18363694 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 18363749 T G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 18364988 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 18365029 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 18365245 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18365380 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 18366007 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 18366092 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18366220 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18366609 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18366805 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 18367621 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18367691 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 18368030 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 18368042 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 18368049 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 18368187 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18369957 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18370125 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18371268 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18371976 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18373407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18374326 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18376392 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 18376456 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 18377133 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18377134 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18377155 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18377954 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 18378262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18378528 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 18379910 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18379950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18379962 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 18379990 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18380129 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 18380144 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 18380205 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 18380404 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 18380522 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18380576 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18380801 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18381057 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 18381818 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18382989 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 18383090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18383153 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18383453 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 18383525 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18383648 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18383656 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18384033 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 18384136 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 18384149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18384179 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 18384373 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18384395 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 18384745 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 18384828 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18384884 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 18384890 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 18385051 T G N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 3 18385336 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 18385351 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 18385481 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 18385529 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 18385661 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 18385803 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18387030 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18387239 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 18387511 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 18387733 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 18387738 C G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 18387873 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 18388254 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18388277 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 18388285 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 18388409 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18388457 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 18388737 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 18388739 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 18388847 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18388884 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18388946 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18389712 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 18389878 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 18389911 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18390040 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18390223 G C N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 18390567 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 18390576 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 18391225 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 18391779 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 18391849 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 18392682 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 18392748 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 18393301 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 18393466 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 18393771 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18394711 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 18395051 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 18395082 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 3 18395166 A G N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.384615384615385 0.307692307692308 0.307692307692308 14 12 5 4 4 3 18395177 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 3 18395224 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 10 8 3 4 2 3 18395457 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 18395597 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18395606 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 18395610 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 18395621 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 18395691 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 18395856 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 18396057 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 18396500 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 18396749 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 18396832 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 18396876 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 18397181 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 18397276 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 18397471 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 18397507 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 18397756 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 18397761 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 18398302 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 18398361 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 18398489 C G N N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 14 10 6 2 4 3 18398567 A C N N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 3 18398578 C T N Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 3 18398889 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 18398930 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 18399036 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 18399093 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 18399139 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 18399184 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18399209 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 18399257 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 18399266 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 18399318 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 18399409 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 18399503 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 18399538 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 18399547 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 18399550 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 18399595 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 18399693 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 18399711 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 18399746 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 18399914 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 18399976 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 18400078 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 18400174 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 18400215 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 18400359 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 18400374 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 18400380 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 18400403 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 18400423 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 18400477 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 18400533 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 18400556 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18400607 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 18400628 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18400630 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 18400639 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 18400653 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 18400654 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18400720 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 18400781 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 18400786 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 18400814 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 18400907 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 18400991 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 18401058 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 18401218 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 18401265 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 18401380 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 18401583 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18401607 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 18401836 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 18401896 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18401930 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 18401945 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 18401965 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18402009 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 18402235 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18402289 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 18402355 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 18402433 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 18402458 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 18402594 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 18402723 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18402738 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 18402885 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 18402887 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 18403029 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 18403082 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 18403319 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 18403376 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 18403589 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 18403662 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 18403842 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 18403957 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18403971 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 18403988 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 18404149 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 18404272 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18404944 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 18404992 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 18405152 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 18405271 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 18405313 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 18405376 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 18405395 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18405550 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 18405551 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 18405739 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 18405754 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 18406034 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 18406238 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 18406318 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 18406380 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 18406432 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 18406579 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 18407169 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18407473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18408382 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18409065 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 18409153 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 18409445 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 18409655 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 18409667 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 18409678 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 18410062 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18410867 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 18410935 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 18410941 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 18410987 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.4375 0.1875 0.375 17 15 7 3 6 3 18411195 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 18411234 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 18411454 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 18411634 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 18411663 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 18411712 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 18411790 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 18411838 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 18411977 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 18412265 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18412385 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 18412399 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 18412700 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 18413123 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 18413174 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 18413281 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 18413289 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 18413415 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 18413653 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 18413752 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 18413867 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 18413879 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 18413937 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 18413969 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 18413997 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 18414020 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 18414036 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 18414167 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 18414407 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 18414467 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 18414519 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18414569 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 18414584 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 18414657 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 18414711 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 18414741 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 18414763 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 18414788 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 18414797 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 18414883 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 18415061 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 18415160 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 18415257 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 18415299 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 18415335 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 18415402 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 18415518 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 18415526 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 18415549 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 18415574 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 18415639 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 18415640 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 18415674 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 18415699 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 18415735 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 18415744 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 18415768 C A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 18415789 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 18415891 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 18415901 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 18415956 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 18415981 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 18415987 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 18416011 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 18416057 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 18416072 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 18416091 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 18416102 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 18416164 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 18416257 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 18416294 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 18416507 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 18416513 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 18416520 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 18416526 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 18416589 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 18416610 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 18416630 A G Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 18416642 A G Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 18416651 A T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 18416664 G A Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 3 18416667 C T Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 18416748 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 18416753 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 18416760 C A Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 18416901 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 18416902 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 18416957 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 18416969 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 18417075 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 18417082 G A Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 18417139 T G Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 18417155 T C Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 18417162 A C Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 18417221 A T Y N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 18417274 G A Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 18417513 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 3 18417911 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 18417958 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 18418124 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 18418136 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 18418258 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 18418281 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 18418335 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 18418518 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 18418535 G A N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 3 18418618 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 3 18418645 G C N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 18418661 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 18418678 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 18418794 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 18418828 A T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 18418867 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 18418999 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 18419042 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 18419282 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 18419328 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 18419480 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18419492 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18419779 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18419981 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 18419990 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 18420078 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18420238 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18420335 T A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 18420512 T C N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.272727272727273 0.545454545454545 0.181818181818182 12 10 3 6 2 3 18420555 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 18421004 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 18421021 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 18421197 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 18421244 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18421434 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18421488 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18421503 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 18421515 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 18421533 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 18421558 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18421682 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 18421753 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 18421793 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18421867 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 18421910 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 18421930 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18422042 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 18422053 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 18422123 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 18422138 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 18423025 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 18423279 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 18423378 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18423492 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18423584 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 18423598 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 18423622 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18423665 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18423848 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 18423993 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 18424046 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 18424284 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 18424285 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 18424396 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 18424452 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 18424477 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18424543 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 18425127 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 18425285 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 18425419 G C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 18425569 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 18425570 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 18425757 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18425860 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 18426161 T G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 18426180 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 18426248 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18426402 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 18426793 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 18426799 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 18426847 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 18426850 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 18426940 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 18426944 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18426977 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 18426986 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 18427032 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18427176 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 18428025 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18428633 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 18429122 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 18429307 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 18429358 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 18429436 A C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 18429464 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 18429564 G T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 18429567 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 18429592 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 18429609 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 18429666 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18429727 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 18429869 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18429936 T G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 18429941 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18430001 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 18430002 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 18430069 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 18430078 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 18430081 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18430109 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 18430160 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18430176 T A N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 3 18430205 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 3 18430207 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 18430254 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18430279 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18430315 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 18430399 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 3 18430421 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 18430779 C A N N 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 5 9 1 3 3 3 18430809 A T N N 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 9 11 3 3 4 3 18430823 T C N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 3 18430834 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 3 18430841 A G N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 3 18430872 A G N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 3 18430878 A T N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 3 18430891 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 18430929 G A N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.454545454545455 0.363636363636364 0.181818181818182 14 8 5 4 2 3 18430991 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 18430994 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 18431016 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 18431024 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 18431033 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 18431124 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 18431144 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 18431307 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 18431317 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 18431326 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 18431406 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 18431475 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 18431615 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18431795 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18432061 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 18432086 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 18432098 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 18432171 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 18432172 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 18432230 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 18432304 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 18432382 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 18432493 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 3 18432547 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18432557 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 18432629 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 18432633 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 18432677 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 18432720 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 18432814 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18432858 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 18432876 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 18432951 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 18432962 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18432975 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 18432981 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 18433002 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 18433010 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18433027 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 18433048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18433068 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 18433090 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 18433161 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 18433162 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 18433185 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 18433239 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18433315 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18433414 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 18433576 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 18433627 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 18433665 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 18433719 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 18433741 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18434018 C G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 18434061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18434541 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 18434563 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 18434589 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 18434638 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 18434774 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 18434863 C A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 18434969 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 18435091 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 18435242 T G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 18435286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18435487 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 18435513 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18435608 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 18435627 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 18435660 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 18435944 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18435981 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 18435994 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 18436067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18436173 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 18436359 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 18436558 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 18436675 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 18437351 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18437520 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 18437577 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 18437658 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 18437727 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 18437729 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 18437743 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 18437749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18437769 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 18437900 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 18437972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18438010 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 18438114 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 18438199 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 18438214 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 18438224 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 18438347 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 18438387 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 18439329 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 18439481 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 18439498 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 18439765 G T N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 18439841 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 24 4 12 0 2 3 18440032 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 18440084 A T N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 18440202 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 18440294 T G N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.25 0.0833333333333333 0.666666666666667 7 17 3 1 8 3 18440295 C A N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.25 0.0833333333333333 0.666666666666667 7 17 3 1 8 3 18440351 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 18440359 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 18440389 A T N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 18440443 T C N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 3 18440521 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 18440829 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.222222222222222 14 4 7 0 2 3 18440969 T G N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.214285714285714 0.142857142857143 0.642857142857143 8 20 3 2 9 3 18441146 G A N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.153846153846154 22 4 11 0 2 3 18441216 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 18441286 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.133333333333333 26 4 13 0 2 3 18441344 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 18441376 G T N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 24 4 12 0 2 3 18441402 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.153846153846154 22 4 11 0 2 3 18441450 C T N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.230769230769231 0.153846153846154 0.615384615384615 8 18 3 2 8 3 18441529 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 18441590 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 18441597 G A N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 3 18441681 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 18441743 A T N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.214285714285714 0.142857142857143 0.642857142857143 8 20 3 2 9 3 18441830 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 18441831 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 3 18441846 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 18442488 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 3 18442634 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 18442696 G A N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 3 18442769 G T N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.307692307692308 0.153846153846154 0.538461538461538 10 16 4 2 7 3 18442864 A T N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 18442885 A C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 3 18442915 A T N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 18442975 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.214285714285714 0.142857142857143 0.642857142857143 8 20 3 2 9 3 18443099 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 3 18443114 G A N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 3 18443291 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 18443292 T C N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.181818181818182 18 4 9 0 2 3 18443389 T G N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 18443546 A G N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 3 18443578 C G N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 3 18443707 T C N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 18443746 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 18443826 T C N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 18443855 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 3 18443971 C T N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.214285714285714 0.142857142857143 0.642857142857143 8 20 3 2 9 3 18444590 C A N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 3 18444908 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 18444925 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 18444985 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 18445100 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 18445147 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 18445217 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 18445230 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 18445347 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 18445396 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 18445487 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 18445644 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 18445689 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 18445837 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 18445870 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 18445977 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 18446004 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 18446017 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 18446077 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 18446196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18446230 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 18446344 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 18446399 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 18446511 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 18446548 C G N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 3 18446646 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 18446673 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 18446685 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 18446695 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 18446792 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 18446830 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 18446873 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18446911 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 18447080 C T N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 3 18447280 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 18447283 C A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 18447293 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 18447380 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 18447449 G C N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 18447514 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 18447515 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 18447557 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 18447678 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 18447804 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 18447862 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 18447941 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 18447952 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 18447964 C G N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 3 18448222 A G N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 18448287 T A N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 3 18448415 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 18448606 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 18448621 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 18448637 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 18448651 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 18448681 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 18448703 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 18448719 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 18448766 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 18448774 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 18448819 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 18448985 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 18449047 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 18449067 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 18449136 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 18449172 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 18449184 T G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 18449238 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 18449239 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 18449411 C T Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 18457191 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 18457231 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18457250 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 18457277 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 18457293 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 18457345 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 18457378 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 18457379 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 18457431 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 18457507 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 18457650 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 18457701 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 18457794 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 18457881 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 18457883 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 18457905 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 18457934 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 18458101 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18458122 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 18458372 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 18458434 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 18458438 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 18458635 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 18458639 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 18458847 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 18458924 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 18459023 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18459850 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 18459905 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 18460166 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 18460266 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18460295 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18460334 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 18460436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18460539 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 18460572 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 18460640 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 18460650 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 18460682 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 18460695 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 18460921 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 18460957 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 18461084 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18461355 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 18462054 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 18462681 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 18464426 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18464670 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18464869 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18464999 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 18466142 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 18466325 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18466397 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 18467943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18469654 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18469754 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18470583 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 18471169 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18471503 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 18472945 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18473577 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 18473786 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 18474196 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 18474345 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 18474811 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 18475397 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 18476416 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 18477461 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 18477479 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 18478745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18479125 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18479891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18479994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18481493 G A Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 18482769 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 18482777 A C N N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 9 5 4 1 2 3 18482947 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 18483337 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18484151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18484789 A G Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 18484993 G T Y N 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.428571428571429 0.142857142857143 0.428571428571429 7 7 3 1 3 3 18489130 A C N N 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.75 0 0.25 6 2 3 0 1 3 18493933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18493948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18494010 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18494088 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18496333 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 18497217 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 18497681 A G Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 16 14 1 14 0 3 18497714 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 18498285 T C Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 18498389 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18498745 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18498910 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18498954 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18498957 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 18499011 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18499149 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18500048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18500171 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 18500208 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 18500412 A C N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 18500433 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 18500732 C A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 18500929 T G N N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 3 18500950 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 11 7 4 3 2 3 18501289 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18501637 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 18501656 C G Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 18501687 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 18501799 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18501996 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18502077 A G Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 18502697 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 18503078 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 18503789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18503970 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18504056 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 18504103 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 18504625 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18504992 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18505119 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18505390 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18505599 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 18505757 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18507266 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 18507317 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18507557 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18507736 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 18508354 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18508604 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 18509802 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 18510016 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 18510948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18511532 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 18511591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18511693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18511769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18512046 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18512263 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18512310 A G Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 18512324 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18512375 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18512806 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 18512821 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 18512852 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 18512902 A C Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 18513074 T A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 18513145 T A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 18514096 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18514500 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18514783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18515106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18515361 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 18515447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18515465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18515756 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18515854 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 18516841 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 18517235 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18518266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18518294 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18518303 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18518340 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18518614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18519839 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 18519944 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 18519993 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 18520872 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18521288 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18521691 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18523048 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18523584 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 18523869 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 18524198 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 18524245 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18524539 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 18525065 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18525281 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18526215 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 18526336 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 18526407 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 18526887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18527436 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18527873 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18527887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18527990 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 18528086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18528127 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 18528198 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 18528272 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 18528321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18528407 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18528551 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18528580 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 18528597 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 18528620 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18528730 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18528755 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 18528927 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 18529024 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 18529155 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 18529176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18529201 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 18529256 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18529504 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 18529646 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 18530154 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18530311 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 18530323 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 18530587 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18531197 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18531498 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18532608 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 18533413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18533442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18533688 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 18533837 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18534462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18534714 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18535163 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18535355 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18535431 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18535892 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18536454 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18536601 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 18537554 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 18538190 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 18538278 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18538407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18538481 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18538625 G C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 18538710 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18538937 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18538977 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 18538978 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18539026 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18539069 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18539093 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18539213 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 18539274 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18539336 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18539350 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 18539719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18539738 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 18540024 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 18540227 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 18540876 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 18540887 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 18540905 G C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 18540974 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 18541204 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18541327 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 18541332 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 18541368 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 18541440 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 18541472 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 18541507 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 18541584 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 18541669 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18541743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18541804 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18541820 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18541902 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 18541943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18542008 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 18542149 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 18542234 A C N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 3 18542441 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18542700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18542721 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 18542765 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 18542802 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18542896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18542990 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18543278 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 18543311 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 18543382 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 18543435 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 18543528 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18543535 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18544016 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18544067 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 18544110 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 18544131 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 18544201 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 18544236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18544307 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 18544403 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 18544493 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 18544623 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 18544643 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 18544681 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 18544868 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 18544877 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 18544972 T A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 18545149 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 18545221 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18545329 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18545363 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 18545385 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 18546892 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18546946 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18547366 C T N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 18548728 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 18548859 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 18548951 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 18549382 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 18549496 C T N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.538461538461538 0.230769230769231 0.230769230769231 17 9 7 3 3 3 18549504 A T N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 3 18549508 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 18549519 T C N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.636363636363636 0.181818181818182 0.181818181818182 16 6 7 2 2 3 18549530 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18549589 G A N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 3 18549748 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 18549843 A T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 18549849 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 18549901 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 18550006 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 18550644 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 18550649 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18550879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18550968 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 18551376 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 18551401 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 18551414 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18551455 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 18551613 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 18551675 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 18551702 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 18551712 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 18551743 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 18551901 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 18551960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18551968 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 18552147 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18552258 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18552629 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18552797 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18552804 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18552811 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18552875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18552883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18553113 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18553145 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 18553383 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 18553446 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18553463 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18553482 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 18553516 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 18553679 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18553964 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 18554022 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18554023 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18554381 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18554455 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 18554580 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18554621 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 18554696 T G N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 18555434 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18555603 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18555615 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18555923 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18555985 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18556236 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 18556320 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 18556580 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 18556768 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 18556909 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18556962 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 18557147 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18557344 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 18557430 A T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 18557557 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 18558149 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 18558320 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18558517 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 18558624 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 18558632 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 18558954 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 18558994 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 18559068 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 18559090 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 18559113 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 18559691 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 18559795 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 18559903 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 18560089 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 18560694 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 18560990 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18562804 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 18563090 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18563310 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 18563404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18563481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18563572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18563751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18563757 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18563918 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18564285 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18564472 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18564927 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 18565099 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 18565168 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 18565327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18566008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18566371 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 18566558 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 18566706 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 18567334 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 18567364 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 18567371 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 18567518 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18567636 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 18568061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18568234 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 18568401 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 18568440 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 18568453 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 18568473 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 18568634 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18568652 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18568718 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18569849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18569850 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18570974 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18571509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18571577 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 18572495 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18573111 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18573487 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18574002 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 18574638 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18576189 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18576600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18578108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18579492 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 18579596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18580420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18582393 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18584789 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 18585146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18585806 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18587159 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 18587205 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18587591 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18587599 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18587671 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 18587731 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 18587916 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18588064 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18588303 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 18588405 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18588463 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18588477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18588868 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18588873 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18588884 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 18588887 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 18588969 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 18589539 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18589647 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18589742 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 18589915 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 18589967 T G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 18590116 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 18590428 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 18590608 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18590993 C G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 18591196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18591355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18591377 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18591379 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18591430 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18591440 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 18591442 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 18591474 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18591520 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18591651 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 18592184 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 18592270 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 18592542 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 18593096 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 18593112 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 18593561 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 18593584 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18593585 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 18593641 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 18593660 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 18593786 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 18593938 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 18594332 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 18594715 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 18595765 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18595959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18595986 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18596451 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 18597355 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 18597546 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 18597627 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18597798 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 18597799 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 18597956 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 18598111 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18598171 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 18598235 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18598422 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18599138 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 18599187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18599309 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 18599312 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 18599333 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 18599354 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 18599386 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 18599397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18599595 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 18599613 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 18599721 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 18599873 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 18599943 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 18600098 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 18600147 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 18600162 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 18600236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18600277 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 18600423 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 18600447 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18600457 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 18600468 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 18600479 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 18600510 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 18600585 T C N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 16 14 1 14 0 3 18600843 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18601050 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 18601576 A C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 18601619 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 18601744 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 18601752 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 18601776 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 18601836 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18601947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18602321 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 18602508 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 18602597 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 18602625 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 18602643 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 18602722 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 18602757 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 18602772 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 18602827 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 18602845 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 18602847 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 18602997 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 18603035 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18603049 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 18603153 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 18603250 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 18603327 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18603517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18604220 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18604668 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18605895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18605972 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 18606784 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 18606834 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18607052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18607056 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 18607288 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 18607396 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18607806 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 18607825 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18608052 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18608202 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 18608240 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 18608300 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 18608435 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 18608500 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 18608528 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18608652 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 18608722 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 18608963 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 18609217 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 18609288 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 18609528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18609535 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 18609550 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18609760 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 18609789 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18609910 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 18609949 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 18609995 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 18610067 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18610518 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 18610823 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18611611 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 18611648 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18611680 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 18611896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18611964 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18611999 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18612021 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18612221 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18612248 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18612496 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18612505 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18612520 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 18612524 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 18612533 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 18612663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18612781 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 18612955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18613107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18613225 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18613349 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18613624 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 18616901 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 18623401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18623523 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18625391 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18628158 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18628739 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 18628795 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18629144 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18629259 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 18629432 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18629806 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18630094 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18630165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18630753 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18631388 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18631737 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 18631890 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 18632021 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18633090 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18633174 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 18633962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18634391 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18634671 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18634822 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18637792 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18640245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18641122 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18641425 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18642769 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18643330 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 18645592 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18647447 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 18647747 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18648538 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18650859 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18650938 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 18653557 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18653902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18654822 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18654894 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18655237 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18655484 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18655849 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18655945 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 18655954 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18655979 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 18656137 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 18656284 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 18656324 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 18657994 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18658549 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18658710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18658712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18658981 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 18659433 A C Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 18659460 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 18659643 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 18659807 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 18660096 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 18660108 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 18660124 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18660191 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 18660253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18660280 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 18660335 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 18660865 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18660893 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18661168 T G Y N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 18661204 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18661285 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 18661693 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18661825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18661923 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 18661985 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18662053 T C Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 18662130 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18662196 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 18662246 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18662290 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 18662392 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18662407 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 18662730 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18662789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18662859 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18662863 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 18662969 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 18663129 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18663213 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18664005 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 18664044 A T N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 3 18664045 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 18664079 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18664134 T A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 18664170 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 18664177 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 18664366 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 18664550 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 18664993 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 18665332 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 18666273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18666343 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 18666399 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 18666498 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 18666546 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 18666585 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 18666588 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 18666601 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 18666606 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 18666683 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18666871 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 18666889 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18666916 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 18666935 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 18666945 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18666974 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 18667021 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18667059 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18667175 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18667182 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 18667223 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 18667279 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18667315 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 18667460 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18667473 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 18667479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18667523 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18667544 C A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 18667591 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 18667618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18667703 A C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 18667800 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 18667876 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18668094 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 18668099 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 18668133 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18668718 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18668803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18668829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18668849 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 18668886 C G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 18668950 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 18669185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18669228 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 18669236 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 18669454 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 18669796 G T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 18669917 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18671137 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 18671408 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 18671542 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 18671564 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 18671759 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 18671804 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18671833 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18671887 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18671962 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 18672155 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 18672455 T C N Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 3 18673030 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 18673070 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 18673099 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 18673105 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 18673628 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 18674016 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18674172 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 18674216 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 18674360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18674547 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 18675149 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 18675223 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 18675425 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18675450 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18675524 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18675641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18675689 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 18677420 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 18677874 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18677915 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 18678188 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 18678218 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 18678234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18678238 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 18678316 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18678327 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 18678387 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 18678394 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 18678555 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 18680131 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18681836 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18682955 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 18683877 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18686733 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18688728 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18688739 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18690101 A C Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 18690102 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 18690750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18690976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18691572 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18691942 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18692414 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 18694585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18695578 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18695766 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18696219 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.05 0.85 0.1 19 21 1 17 2 3 18697105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18698351 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18698447 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18699006 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18701595 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 18701641 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 18702755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18703496 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 18703994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18704715 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18705853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18706093 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18706455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18706840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18706869 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18706987 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18707449 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 18707618 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 18707943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18708430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18709217 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18710232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18710563 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18710816 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 18710874 T C Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 18712741 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18713452 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18713940 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18713985 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18716536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18718169 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18718467 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18719666 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 18719794 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18719824 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18719841 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18719908 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18719927 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18720220 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18720480 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18720493 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18720606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18720624 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 18720625 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 18720795 C A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 18720816 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 18721000 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18721093 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18721199 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18721358 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18721413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18721939 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18722142 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18723687 G C Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 18723729 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 18723847 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 18723913 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 18723923 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18724029 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 18724099 T G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 18724190 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 18724194 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 18724790 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 18724811 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 18724898 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 18724906 C T N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 18724928 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 18724956 C G N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 18724974 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 18724985 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 18725012 A C N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 18725046 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 18725081 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 18725094 T A N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 18725121 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 18725188 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 18725193 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 18725245 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 18725316 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 18725317 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 18725342 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 18725406 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 18725428 T G N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 18725429 A T N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 18725465 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 18725531 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 18725573 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 18725574 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 18725634 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 18725653 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 18725693 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 18725826 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 18726014 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 18726053 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 18726130 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18726200 G C Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 18726258 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 18726392 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 18726437 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 18726506 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 18726528 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 18726573 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 18728899 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18729155 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18729830 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18730125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18731353 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18733776 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18735262 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 18735838 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18736086 A T Y N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 3 18736095 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 18736236 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 18736294 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 18736570 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 18736703 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 18737227 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 18737443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18737671 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 18737673 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18737688 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18737712 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18737801 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 18737837 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 18737838 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 18737889 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 18737891 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 18738012 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 18738031 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 18738139 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 18738173 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 18738196 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 18738256 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 18738267 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 18738278 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 18738336 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 18738378 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 18738521 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 18738539 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 18738654 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 18738701 A T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 18738731 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 18738752 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 18738790 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 18738875 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18738876 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 18738925 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 18738993 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 18739062 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 18739223 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 18739258 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 18739263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18739293 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 18739314 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 18739331 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 18739343 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 18739491 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.555555555555556 0.111111111111111 0.333333333333333 22 14 10 2 6 3 18739549 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 18739654 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 18739692 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 18739833 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 18739851 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 18740190 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 18740883 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 18742073 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18743422 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18744511 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 18745989 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18746039 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18746171 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18746378 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 18746692 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 18747071 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 18747187 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 18747234 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 18747249 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 18747314 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 18747361 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 18747803 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 18747806 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 18747817 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 18747981 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 18748133 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 18748162 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 18748323 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 18748404 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 18748499 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 18748666 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 18749011 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 18749102 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 18749627 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 18749632 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 18749704 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 18749753 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 18749869 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 18750199 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 18750297 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 18750440 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 18750545 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 18750953 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 18751027 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 18751113 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 18751249 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 18751296 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 18751341 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 18751385 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 18751418 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 18752063 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 18760444 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 18760502 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 18761798 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18763105 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18764082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18764166 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18765006 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 18765506 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 18765764 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 18765880 A T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 18765895 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.578947368421053 0.105263157894737 0.315789473684211 24 14 11 2 6 3 18765931 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18765973 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 18766149 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18766358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18767217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18767708 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 18767752 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 18767809 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 18767818 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 18767828 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 18768204 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 18768490 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 18768793 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 18769705 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18769713 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18769840 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18770319 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 18770842 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 18770870 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18771390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18771606 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 18771802 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 18771883 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 18771980 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 18772139 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18772158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18772328 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 18772703 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18772876 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18772956 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18773117 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 18773290 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18773578 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 18774069 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 18774391 A C Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 18774530 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 18774745 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18774775 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18774988 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 18775142 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 18775337 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 18775477 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 18775547 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 18776502 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18776971 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18777012 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 18777029 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 18777414 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 18777551 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 18777712 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 18778136 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 18778327 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18778346 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 18778490 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 18778534 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 18778548 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 18778745 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 18779345 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 18779347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18779376 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 18779417 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 18779474 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18779613 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 18779725 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 18779881 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 18779943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18779994 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 18780026 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 18780068 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 18780100 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 18780107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18780194 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 18780209 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 18780234 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 18780320 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 18780349 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 18780420 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 18780499 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 18780542 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 18780567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18781010 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 18781012 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 18781150 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 18781206 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 18781282 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 18781535 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18781537 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 18781548 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 18781551 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 18782084 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 18782428 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 18782429 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 18782715 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18782775 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18783367 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 18783499 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 18783516 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 18783643 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 18783667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18783734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18783969 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 18784011 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 18784025 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18784300 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18784592 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 18784785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18784854 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 18784998 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 18785186 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 18785268 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18785291 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 18786295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18786330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18786356 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18786986 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 18787658 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 18788047 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18788249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18788263 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 18788271 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18788274 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 18788342 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 18788356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18788488 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18788558 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18788624 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 18788672 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 18788697 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 18788704 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 18788757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18788854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18788955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18789001 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 18789060 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18789245 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18789477 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 18789488 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 18789604 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 18789640 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 18789910 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 18789976 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 18790102 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18790876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18790999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18791111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18791244 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18791355 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18791719 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 18791853 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 18791994 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 18792034 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 18793296 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 18793375 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18793522 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 18793646 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18793774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18793786 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 18793893 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18793940 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 18793999 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 18794020 G C N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 3 18794053 A T N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.125 0.75 0.125 16 16 2 12 2 3 18794054 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 18794071 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 18794164 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0 0.8125 0.1875 13 19 0 13 3 3 18794178 A T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0 0.647058823529412 0.352941176470588 11 23 0 11 6 3 18794186 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 18794328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18794416 C A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 3 18794533 G A Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 18794548 G A Y Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 18794599 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18794697 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 18794883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18794992 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 18795005 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 18795047 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18795048 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18795425 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 18795457 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 18795725 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 18795730 A C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 18795752 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 18795839 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18795891 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18796113 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 18796114 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 18796139 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18796167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18796170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18796480 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18797211 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18797221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18797317 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18797328 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18797425 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18797633 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18797695 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18797723 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 18797745 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18798262 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18798368 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18798402 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18798525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18799087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18799217 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18799390 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18799708 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18799742 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18799804 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18799881 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18800100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18800117 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 18800231 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18800237 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 18800276 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18800339 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18800367 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18800678 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 18800686 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18800995 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18801058 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18801119 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18801208 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18801309 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18801310 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18801403 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18801404 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 18801429 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 18801707 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18801785 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18801966 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18802010 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 18802027 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 18802239 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18802381 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18802622 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18802857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18803064 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 18803133 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18803310 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18803438 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18803535 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18803536 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 18803553 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18803556 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18803581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18803641 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18803656 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18803807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18804221 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 18804222 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 18804279 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 18804316 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 18804614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18804798 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18805107 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 18805184 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 18805795 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18806036 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18806861 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 18807039 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 18807069 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18807100 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 18807223 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18807526 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18807754 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18807796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18808239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18808315 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 18808493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18808499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18808587 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 18808678 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 18808789 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 18808815 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 18808903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18809506 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 18809716 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 18809731 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 18810007 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18810525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18810580 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 18811022 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18811214 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18811738 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18812410 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 18812488 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18812781 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18812944 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18812977 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18813041 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18813051 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 18813620 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18815685 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18820076 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18822073 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 18822712 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18823906 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 18825952 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18826835 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 18830456 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 18831357 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 18831964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18832635 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 18834504 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18834557 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 18834752 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 18837843 C A Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 18838128 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 18838143 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 18838159 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 18838498 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 18838842 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 18838997 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 18839309 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 18839544 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 18839546 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 18839571 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 18840273 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18842235 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18843294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18845449 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18849893 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18849975 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18850207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18851275 G A Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 18851280 A G Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 18851306 A G Y Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 3 18851346 G A Y Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 3 18851348 G A Y Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 3 18853266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18853390 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18853666 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18854073 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18854685 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18854871 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18855082 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18855441 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18855809 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18856419 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18856788 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18856845 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18857032 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18857203 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 18857746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18857885 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 18859067 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18859417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18862425 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18862711 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18864835 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 18866448 G C Y N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0 0.8 0.2 12 18 0 12 3 3 18872945 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18873839 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 18874776 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18875792 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18876568 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18876924 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 18877554 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 18877635 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18878056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18878663 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 18878884 A G Y Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 18880866 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 18880888 A T Y N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 18880890 C A Y N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 18880929 T C Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 18880933 G A Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 18881169 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18884703 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18884889 G T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 18885355 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 18886122 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 18886147 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 18886558 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18887349 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 18887374 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 18887377 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18887731 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 18887743 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18887807 G A Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 18887926 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 18887990 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 18888000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18888049 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18888062 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18889248 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 18889317 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 18889394 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18889412 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18889445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18889449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18889892 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18889916 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 18890555 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 18890589 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 18890671 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18890688 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18890703 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 18890919 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18891850 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 18895193 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18895711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18896930 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18897259 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18898379 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18899805 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18901290 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18901375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18904326 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 18905321 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18906421 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18907187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18907209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18907795 G A N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 3 18907933 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18908220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18910438 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 18910803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18910988 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18912317 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 18913000 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18913268 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 18914042 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 18914747 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18923556 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18923669 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18923871 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 18924513 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18924778 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18925135 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18925689 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18926751 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 18927446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18927911 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 18928778 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18929784 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18931316 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18932146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18932880 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18933528 C T Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 18934767 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 18935983 G C N N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 18936846 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18937647 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18938833 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 18938844 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18939020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18942801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18943061 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18943699 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18947530 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 18948494 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18949615 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 18950046 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 18950578 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18950868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18950939 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 18951051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18951190 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18951419 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 18951751 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18951893 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 18952024 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 18953428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18953690 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 18953709 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18953748 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 18954491 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18954992 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 18955078 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 18955172 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18955220 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18955225 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18955371 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 18955985 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 18956200 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18956462 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 18956826 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18956910 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 18956921 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 18956993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18957129 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 18957136 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 18957207 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 18957240 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 18957331 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 18957364 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 18957475 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 18957487 G A Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 18957521 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 18957615 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 18957853 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18958139 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18958264 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18958352 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18958476 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 18958714 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 18958902 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 18958923 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 18960182 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 18960266 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 18960469 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 18962041 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18965991 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18966188 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18967256 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18967644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18968359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18968915 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18968916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18969270 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18970781 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18972315 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18973841 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 18973950 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18974268 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18976928 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18977521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18979265 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 18981714 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 18983622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18984383 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18986324 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18988862 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18988973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18990066 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 18990072 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18993894 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 18994069 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19002506 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19003134 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19005156 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19006681 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19006922 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19007522 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19007952 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19008186 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19008609 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19009747 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19009904 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 19010286 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 19010998 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19012244 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19012605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19012750 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19012859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19013503 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19013833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19013898 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19014214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19014301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19014348 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19014651 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 19014691 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 19014753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19014951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19015261 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19016095 A G Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 19017210 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19017417 C T Y Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 3 19017459 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 19017731 A G Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 3 19019784 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19019890 T C Y Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 3 19019894 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19020432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19020638 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 19020666 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 19020813 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19020823 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 19020882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19021235 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 19021254 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 19021532 C T N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 3 19022116 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 19022300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19022330 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 19022505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19022656 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19022671 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19022686 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19022694 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19022970 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19023272 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19023763 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19024640 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19025833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19025874 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19026081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19026223 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19026604 T G N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 3 19027464 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19027863 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 19027969 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19028065 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19028792 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19029012 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19029099 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19029106 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19029111 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19029341 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19029481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19029680 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19029799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19029923 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 19029954 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 19029972 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 19030047 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 19030157 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 19030264 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 19030279 A T N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 3 19030283 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 3 19030291 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 6 8 1 4 2 3 19030297 A T N N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 9 7 3 3 2 3 19030319 G A N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 19030322 G A N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 19030341 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 19030382 T A N N 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 6 6 1 4 1 3 19030405 T G N N 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 6 8 1 4 2 3 19030789 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19030961 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 19031031 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 19031069 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 19031088 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 19031109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19031126 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 19031319 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 19031409 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 19031474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19031564 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 19031690 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 19031838 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19031912 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19032240 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 19032300 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19032442 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19032452 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19032660 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 19032661 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 19033001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19033055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19034632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19034965 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19035515 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 19035703 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19035965 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 19036035 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19036058 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 19036132 G C N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 19036201 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19036239 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19036328 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19036394 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19036423 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19036497 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19036591 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19036601 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19036809 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19036850 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19036922 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 19036995 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19037163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19037381 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19037446 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19037450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19037490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19038256 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19038428 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19039457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19039811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19041489 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 19042798 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19043828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19045488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19046983 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 19048599 G A Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 3 19048831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19048914 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19049160 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19050282 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19052724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19053290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19053634 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 19054672 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19054919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19056492 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19058560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19059258 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19059710 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 19060774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19060869 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19062119 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19062384 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19062414 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19062984 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19063139 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 19063214 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19063405 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19063429 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 19063434 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19063448 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19063460 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 19063466 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19063488 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19063503 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 19065603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19067529 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19067830 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19070832 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19070837 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19071494 A G Y Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 3 19072369 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19072371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19072590 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19073000 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19073275 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19073308 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19073337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19073517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19073526 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19073531 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19073584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19073667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19073710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19073727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19073816 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19073882 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19073906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19073936 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19074010 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19074077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19074101 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19074601 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19074603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19074637 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19074745 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 19074803 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19074884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19074930 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19075157 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19075223 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19075428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19075429 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19075923 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19076301 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19076329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19076344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19076767 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19076916 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19078136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19078500 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19078590 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19078599 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19078675 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19078847 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19078881 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19078917 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19078955 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19079015 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19079017 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19079049 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19079065 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19079074 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19079098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19079122 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19079131 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19079200 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19079331 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19079350 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19079391 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19079426 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19079485 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19079509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19079664 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 19079859 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19079865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19080690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19080701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19080897 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19081129 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 19081724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19081787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19082576 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19082632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19082658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19082938 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19082993 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19083118 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19083191 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 19083269 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19083452 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 19083665 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19083691 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19083878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19084371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19084491 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 19084515 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 19084871 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 19084898 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 19085046 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 19085897 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 19086108 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19086280 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 19086282 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19086351 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 19088136 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 19088160 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19088864 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19090079 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19090177 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 19090848 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19091320 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19091600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19095009 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19095525 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 19096710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19099038 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 19099681 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19101182 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19101396 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 19101509 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 19101612 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 19101623 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19101828 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19101979 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19102074 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 19102086 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19102180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19102380 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 19102417 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19102475 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19102543 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19102664 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19103304 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19103343 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19103447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19103740 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 19104059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19104146 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19104738 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19105905 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19107494 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 19109898 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19111498 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 19111662 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19111727 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19115374 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19115383 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19121666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19123015 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19123229 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19126145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19126212 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19127261 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19129374 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19130532 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19130620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19131973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19132592 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19133351 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19133564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19135013 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19135089 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 19135143 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19136262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19138550 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19139635 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19140178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19141339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19142073 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19142127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19142182 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 19144288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19144831 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19145469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19146825 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 19150524 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 19152516 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19152669 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 19152850 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19154767 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 19155016 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19155072 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19155371 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 19155385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19156563 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19162932 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 19163174 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 19163311 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19165887 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19169935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19170002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19171461 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19171482 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19171943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19173191 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 19173564 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19174898 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 19185362 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19186011 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 19186150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19186587 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19188310 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19190619 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19190625 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19192958 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19193624 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 19193990 T C Y Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.714285714285714 0.285714285714286 5 9 0 5 2 3 19195880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19196059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19197163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19200441 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19201508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19202950 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 19202977 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 19202989 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 19203173 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19203664 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19203678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19203727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19204140 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19204324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19204666 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 19204966 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19204989 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 19205065 A T Y N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 3 19205147 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 19205612 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19205635 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19205858 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 19206255 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 19206998 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19207155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19207250 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19207370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19207429 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19207453 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19207458 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19207505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19207541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19207553 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19207635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19207645 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19207695 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19207706 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19207861 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19207894 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19207990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19208403 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19208597 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 19208688 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 19208707 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19208736 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19208758 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19208829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19208907 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19209206 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19210613 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 19211732 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 19211845 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 19212977 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 19213001 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 19213019 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 19213060 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 19213275 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 19213300 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 19213770 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19214074 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19214243 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19214357 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19214411 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 19214445 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19214732 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19214895 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19214917 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19215095 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19215107 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19215124 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19216218 G C N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 19216383 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 19216602 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 19216647 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19216705 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 19216866 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19216920 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19216946 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 19217069 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19217341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19217385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19217441 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19217448 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19218013 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 19218031 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19218057 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19218122 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19218171 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 19218274 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19218277 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19218288 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 19218467 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 19218992 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19219018 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19219044 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 19219053 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19219099 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19219176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19219194 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19219425 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19219475 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19219590 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19219679 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19219723 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 19219769 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19219804 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 19219908 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19219947 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19219958 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19219960 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19220140 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19220307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19220451 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 19220579 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 19220971 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 19221614 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19221740 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 19221741 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19222190 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19222226 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 19223287 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19223437 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 19223461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19223558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19223583 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19223590 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19223645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19223818 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19223819 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19223856 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 19224076 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19224361 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19225634 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19228122 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19229254 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 19229587 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 19229913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19230039 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19230498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19231641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19231731 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 19231772 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19232885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19232912 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19233238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19233388 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 19234300 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19234306 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19234315 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19234339 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19234436 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19234465 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19234558 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19234563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19234584 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19234732 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19235131 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19235143 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 19235171 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 19235333 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19236269 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 19236359 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 19236510 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 19236679 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 19236716 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 19236806 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 19236968 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 19237216 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 19237238 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 19237382 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 19237524 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19237530 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19237540 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19237768 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19237780 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19237860 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19237952 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19237961 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19237980 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19237996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19238012 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19238021 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19238060 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19238062 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19238182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19238186 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19238232 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19238243 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19238269 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19238392 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 19238449 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19238488 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 19238708 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19238735 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19238745 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19238791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19238824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19238888 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19239962 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 19240008 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 19240019 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 19240215 C T Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 19240238 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 19240337 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19240342 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19240641 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19240710 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19240759 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19240873 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 19241058 T A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 19241221 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19241703 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19241790 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19241803 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19241810 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19241899 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19242949 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19243177 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 19243234 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 19243282 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19243352 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 19243514 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 19243674 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19243690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19243692 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 19243781 C G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 19243900 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 19243901 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 19243941 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19243955 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19243991 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19244076 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19244132 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19244442 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19244641 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19244706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19244893 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19244949 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 19245030 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19245605 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 19245630 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19245659 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19245704 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19245723 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 19245725 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 19246184 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 19246199 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 19246617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19247143 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19247176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19247472 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 19247512 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19247592 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19247750 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 19247764 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19247796 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 19247900 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 19247976 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 19247981 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 19248053 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 19248080 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19248192 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 19248194 G T N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 19248360 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 19248362 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19248628 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 19248692 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19248808 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 19248945 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19249002 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19249040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19249048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19249053 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19249106 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 19249465 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19249519 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19249638 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19249690 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19249713 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19249812 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 19250019 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19250199 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19250265 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19250524 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19250540 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19250779 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19250822 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19250879 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 19251054 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19251090 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19251182 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 19251599 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19251663 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 19251695 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 19251768 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19252053 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19252438 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 19252517 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 19252552 C A N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.0666666666666667 15 15 1 13 1 3 19252729 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19252747 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19252751 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19253061 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19253068 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19253327 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19253357 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19253435 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19253451 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19253459 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19253476 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19253513 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19253514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19253569 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19253669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19253948 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19253975 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19254283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19254290 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19254296 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19254328 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19254343 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19254359 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19254440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19254446 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19254538 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19254603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19254652 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19254722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19254806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19254828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19255149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19255174 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19255266 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19255292 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19255448 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19255518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19255521 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19255538 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19255542 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19255592 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19255668 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19255818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19255831 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19259536 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19259571 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 19259591 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 19259846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19260141 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 19260390 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19260410 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 19260427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19260472 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19260482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19260543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19260795 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 19260806 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 19260882 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 19260938 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 19261070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19261153 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 19261654 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19261680 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19262093 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 19262223 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19262299 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19262304 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19262674 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19262733 A C Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 19262748 C G Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 19262843 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 19262878 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 19263586 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19263833 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19264309 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19264427 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 19264456 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 19264679 T A Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 19265011 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19265043 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19265091 G C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 19265183 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 19265256 T G Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 19265525 G T Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 19265783 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 19265915 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19266523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19266654 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19266681 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19266747 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19266984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19267004 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19267063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19267547 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 19267581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19267660 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19267936 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19267937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19267989 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19268111 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19268880 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19269041 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19269210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19269425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19270299 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 19270367 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19271232 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 19271911 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 19273346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19273846 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19274968 G A Y Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 3 19277327 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19277991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19279676 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19280033 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19280534 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19282286 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19282735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19283193 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19283678 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19284454 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19286363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19290034 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19290035 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19291089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19291562 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 19291652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19297552 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19298552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19300541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19301200 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19302659 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19305185 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19305267 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19305780 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19305994 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19307293 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19307810 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19307854 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19310162 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19310778 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19312322 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19313075 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19314052 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19314238 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19316677 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19321628 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19321737 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19321866 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19322258 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19322559 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19325101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19325763 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 19326036 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 19326040 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 19326048 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 19326071 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 19326120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19326124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19326143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19326192 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 19327631 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19327836 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 19328149 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 19328170 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 19328491 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 19329790 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19329795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19330269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19330622 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 19330650 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 19330718 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 19330723 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 19330763 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 19331059 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 19331088 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 19331156 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 19331316 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 19331386 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 19331407 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 19331452 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 19331475 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 19331486 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 19331628 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 19331989 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 19332284 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 19332556 A T N N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 19333246 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 19333518 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 19333816 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19334018 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19334840 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 19336043 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 19336655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19336949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19337544 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 19338345 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19339141 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19339421 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19339726 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19339778 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19340939 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19341168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19347530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19347642 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19347754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19347844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19355924 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19357263 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 19357548 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19359663 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 19359872 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 19359906 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 19359917 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 19361947 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19369054 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19369660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19369891 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 3 19369995 C T N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.230769230769231 0.153846153846154 0.615384615384615 8 18 3 2 8 3 19370469 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19370588 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19370932 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 19371039 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19371284 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19371515 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19372635 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 19372811 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 19373361 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19373625 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 19374109 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 19374281 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 19374695 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19374698 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 19374845 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 19375077 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 19375255 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 19375347 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 19375627 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19375680 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 19376483 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 19376608 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 19376661 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 19376793 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 19377176 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19377252 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 19377701 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19378142 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 19378224 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 19378387 T C Y Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 12 4 5 2 1 3 19378408 G T Y N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 3 19379159 T A Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 19379222 T C Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 19379246 A C Y N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 19379610 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 19379771 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 19379967 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 19380050 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 19380291 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19380534 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 3 19380968 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 19381308 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 19381605 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 19381709 A C N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 10 22 0 10 6 3 19381728 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19381740 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 19382630 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 19383910 A T N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 3 19383922 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 19383938 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 19384963 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 19385418 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 19385423 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 19385436 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 19385724 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 19386084 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 19386104 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 19386223 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 19386224 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 19386697 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 19386727 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 19386728 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 19386872 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 19387143 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19387158 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 19387220 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 19387882 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 19387999 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 19388014 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 19388038 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 19388042 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 19388121 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 19388185 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 19388229 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 19388237 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 19388261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19388278 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 19388292 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 19390653 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 19390671 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 19390672 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 19390773 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 19390803 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 19390847 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 19390852 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19390861 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19390871 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 19390889 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 19390890 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 19390913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19390922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19390946 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 19391055 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 19391063 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 19391097 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 19391117 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 19391164 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 19391178 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 19391209 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 19391389 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 19391448 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19391498 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 19391508 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 19391558 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 19391583 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 19391600 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 19391713 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 19391848 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 19391903 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 19391957 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 19391991 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 19391992 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 19392091 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 19392216 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 19392540 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 19393219 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 19393250 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 19393306 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 19393781 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 19394744 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 19394761 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 19394767 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 19394778 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 19395173 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 19395186 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 19395216 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19395284 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 19395288 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 19395383 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 19395480 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 19395518 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 19395602 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 19395653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19396023 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19396094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19396113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19396200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19396243 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19396360 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19396538 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19396702 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19396776 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19396925 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 19396927 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 19397001 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 19397114 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 19397565 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 19397587 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 19397592 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 19397599 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 19397625 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 19397674 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 19397682 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 19397688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19397728 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 19397854 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 19398226 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 19398239 G T N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 19398309 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 19398360 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 19398486 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 19398854 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 19399169 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 19399313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19399585 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 19399643 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19399748 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 19400621 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 19400646 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 19400672 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 19400680 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 19400881 C T Y Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 3 19400984 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 19401962 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19402274 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 19402344 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 19402401 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 19402498 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 19402618 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 19402624 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 19402642 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 19402659 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 19402803 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 19402865 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 19402931 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 19402944 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 19402979 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 19402995 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 19403044 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 19403072 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 19403225 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19403240 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 19403241 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 19403267 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 19406579 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 19406773 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 19407008 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 19407304 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 19407316 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 19407334 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 19407380 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 19407443 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 19407460 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 19407477 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 19407576 G T Y N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 19407608 G T Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 19407972 C T Y Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.166666666666667 0.583333333333333 0.25 11 13 2 7 3 3 19407983 T C Y Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.181818181818182 0.727272727272727 0.0909090909090909 12 10 2 8 1 3 19408293 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 19408308 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 19408646 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 19408840 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 19408894 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 19408979 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 19409322 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19409342 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 19410070 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 19410151 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 19410161 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 19410184 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 19410405 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 19410761 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 19411222 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 19411911 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 19411960 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 19412019 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 19413052 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19413698 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 19414924 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19415070 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 19415321 G T Y N 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 3 19415473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19416599 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19416722 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 19419071 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 19419115 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 19419118 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 19419216 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 19419615 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 19419616 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19419630 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 19419640 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 19421242 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 19421409 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 19422482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19422816 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19422921 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19423013 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19426011 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19426080 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19426704 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 19426736 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 19426752 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 19426760 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 19426770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19426814 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19426873 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 19426906 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 19426994 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19428562 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 19428569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19428589 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 19429359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19434293 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19434407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19434530 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19434701 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19436883 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 19437159 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 19437476 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19437711 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19437848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19438839 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19438914 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 19439127 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 19439474 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19439595 T C Y Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.416666666666667 0.583333333333333 0 17 7 5 7 0 3 19440569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19441016 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19441410 C A Y N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 3 19441579 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 19443187 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19444909 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19445688 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19445935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19446363 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19446988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19447595 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19449524 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19450563 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19450613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19450943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19452147 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19453174 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 19453209 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19453217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19453253 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 19453961 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 19453969 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 19454565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19454651 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19454757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19454998 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 19455419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19455442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19455520 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19455911 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19456015 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 19456519 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19456601 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19456618 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 19456627 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 19457000 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19459892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19460378 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19460443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19460495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19460566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19460805 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 19460825 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19461044 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19461331 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 19461524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19461668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19461728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19461964 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 19461968 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 19461983 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19461997 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19461998 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19462013 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19462063 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19462123 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19462142 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19462201 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19462310 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19462314 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19462463 G A N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.285714285714286 10 4 5 0 2 3 19462731 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 19462943 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 19463067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19463504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19463697 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19463735 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19463748 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19463799 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 19464236 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19464490 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19464509 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19464541 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19464590 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19464777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19465445 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19465498 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 3 19465499 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 3 19466425 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 19466655 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 19466695 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 19466891 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19467466 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 19467729 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 19467834 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 19467863 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 19468288 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 19468336 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 19468453 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 19468463 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19468503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19468850 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 19469627 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19470419 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 19470579 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 19470589 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 19470791 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 19470806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19471220 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19471510 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 19471526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19471555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19471913 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19471922 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 19472416 G T N N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 19472533 T A N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 19472622 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 19472757 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 19472996 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19473034 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19473090 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 19473136 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19473222 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19473440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19473509 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 19473632 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19473986 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 19474064 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 19474288 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19474296 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19474365 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19474374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19474478 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 19474504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19474565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19474573 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19474591 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19475583 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19475689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19475862 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19476682 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19476734 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19476819 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19476913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19477690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19478148 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19479315 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 19479330 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19479353 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 19479390 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 19479479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19479578 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 19479620 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 19480052 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19480199 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 19480258 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 19480334 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 19480358 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 19480655 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19480741 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 19480749 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 19480762 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 19480796 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 19480809 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 19480913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19481001 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 19481016 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19481187 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19481194 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19481252 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 19481460 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 19481543 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 19481631 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 19481632 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 19481770 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 19481773 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 19481849 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 19481909 T G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 3 19481986 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 19482114 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 19482242 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19483545 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 19483610 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 19483622 T C Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 19483624 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 19483659 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 19483719 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.235294117647059 0.117647058823529 0.647058823529412 10 24 4 2 11 3 19483940 T A N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 19484025 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 19484030 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 19484088 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 19484416 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19484430 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 19484817 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19485007 T C Y Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 3 19485079 C T N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 3 19485212 C G N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 19485525 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 19486048 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19486338 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 19486353 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 19486757 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 19486952 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 19486954 T G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 19487068 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19487110 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 19487162 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 19487165 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 19487202 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 19487449 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 19487500 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 19487641 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 19487920 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 19488147 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 19488537 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 19488607 T C Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 19488847 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 19489037 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 19489270 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 19489301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19489660 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 19489718 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 19489819 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19491121 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 19491305 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19491433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19492021 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19492133 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 19492470 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19492858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19492900 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 19493296 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19493608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19494153 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 19502063 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 19503308 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19503523 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 19503811 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19504843 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19504846 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19505566 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19506315 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19506316 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19507090 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19507777 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19507796 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 19508312 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19508605 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19508768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19509264 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 19509488 T A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 19509507 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19509677 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19509691 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 19509730 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 19509832 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19510051 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19510206 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 19510208 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19510391 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19512119 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19512205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19512651 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 19512682 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 19512699 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19512717 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19513038 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19513384 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 19513437 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 19513883 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 19514011 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19514133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19514151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19514714 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 19514887 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19514982 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 19514997 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 19515013 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 19515032 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 19515098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19515260 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 19515367 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 19515399 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 19515453 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 19515609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19515718 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 19515755 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19515799 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19515861 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19515908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19515935 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19515950 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 19515988 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 19516120 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19516235 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 19516258 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 19516362 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 19516395 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 19516403 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 19516456 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19516459 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 19516560 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19516686 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 19516749 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 19516993 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 19517760 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 19518309 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 19518393 T G N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 19518413 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19518644 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 19519085 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 19519287 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19519369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19519620 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 19519689 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19519694 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19519700 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19519712 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19519736 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 19519834 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19519882 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19519924 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 19519999 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19520117 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 19520151 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 19520239 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 19520261 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 19520267 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 19520602 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 19520699 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19521060 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19521141 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 19521184 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19521256 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 19521380 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19521409 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19521477 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19521533 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19521717 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 19521726 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19521728 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19521737 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 19521767 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 19521860 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19521874 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19521905 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19521946 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19521964 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19522003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19522160 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19522493 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19522597 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19522878 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19522959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19523263 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19524355 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19524382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19524620 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19524629 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19524650 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19524763 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19524853 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 19524867 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19525083 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19525084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19525341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19525467 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19525741 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19525824 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 19526032 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19526176 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19526194 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19526268 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19526479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19526610 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19526691 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19526779 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19526857 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19527151 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19527169 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19527504 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19527521 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19527546 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19527590 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19527600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19527781 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19528342 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19528407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19528922 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19528934 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19528991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19529120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19529167 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19529196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19529322 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 19529378 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19529433 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19529624 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19529692 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19529765 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19529848 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19529991 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 19530075 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19530118 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19530317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19530363 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19530414 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19530451 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 19530571 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 19530588 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19530707 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 19530834 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19531386 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 19531481 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19531508 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19531753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19531918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19532065 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 19532329 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 19532795 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 19532962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19533257 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 19534083 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 19534820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19534841 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19535066 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19535173 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 19535179 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 19535458 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19535592 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19536075 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 19536093 A T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 19536104 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 19536165 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 19536315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19536396 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 19537040 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 19537153 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 19537252 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 19537399 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19538170 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 19538201 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19538232 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19538332 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19538342 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19538345 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19538355 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 19538393 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 19538419 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 19538462 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 19538501 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 19538580 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19538619 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 19538827 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19538916 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19538933 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 19539047 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19539100 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 19539253 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 19539294 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19539395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19539527 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 19539535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19539631 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 19539673 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 19539689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19539896 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19539973 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 19539985 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 19540059 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 19540284 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 19540573 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 19540615 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19540649 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19540995 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 19541114 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19541128 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19541129 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 19541217 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 19541375 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19541388 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 19541437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19541530 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19541630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19541758 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19541831 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 19541837 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19541927 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 19541968 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 19542270 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 19542416 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19542469 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 19542575 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 19542664 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 19542985 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 19543025 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 19543115 T A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 19543269 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19543339 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 19543711 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19543958 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19544420 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19544483 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19544603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19545023 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19545378 G C Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 19545751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19545817 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 19546032 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19546081 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19546285 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19546330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19546352 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19546353 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19546550 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 19546651 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 19546845 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19546871 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 19547100 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 19547384 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19547394 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19547438 G C Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 19547618 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19547720 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 19548131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19548272 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19548315 C A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 19548337 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19548467 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 19548741 G T Y N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 19548959 A G N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 3 19549005 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 19549028 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19549034 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 19549051 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19549146 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19549191 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 19549225 C T N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 19549453 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 19549798 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19549873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19549915 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19549928 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 19549993 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 19550007 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19550056 G C Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 19550091 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 19550151 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19550374 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 19550463 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19550635 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 19550656 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 19550670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19550713 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 19550781 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 19550985 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 19551005 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 19551211 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 19551358 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 19551375 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 19551779 T C Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 19551891 T C Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 19552334 G A Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 19552421 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 19553236 A G Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 19553242 C T Y Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 19553835 A G Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 19553910 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 19554125 T C Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 19554173 A T Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 19554194 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 19554201 G A Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 19554292 A G Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 19554815 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19554845 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 19555400 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 19555556 C T Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 19555658 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 19555662 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 19556286 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 19556626 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 19557194 G A Y Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.307692307692308 0.230769230769231 0.461538461538462 11 15 4 3 6 3 19557613 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19557833 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 19558156 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 19558192 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19558878 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 19559191 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 19559650 A G Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 19559755 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 19559794 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 19560297 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 19560349 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 19560470 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19560604 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19560736 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 19561038 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19562860 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 19562957 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 19563065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19563315 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 19563579 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19563909 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19564071 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 3 19564114 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19564144 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 19564426 C G Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 19564437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19565434 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19565595 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19565994 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19566020 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19566474 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19566480 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 19569944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19570658 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19570662 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19570693 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 19571076 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 19571551 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19572640 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19573185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19573469 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19573635 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 19574052 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 19576584 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19576585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19576599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19576630 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 19577128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19577357 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19577589 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 19578783 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19580240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19585709 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19586245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19586366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19587401 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 19587404 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19587833 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 19588380 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19588753 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19588817 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 19588829 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 19588926 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 19588939 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 19589195 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 19589213 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 19589381 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 19589595 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 19589684 A C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 19589920 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 19590102 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 19590597 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 19590671 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 19590914 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19590954 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 19591059 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 19591330 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 19591415 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 19591443 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 19591557 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 19591608 C T N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 19591651 A T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 19591762 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 19591961 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 19592125 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 19592127 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 19592140 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19592284 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 19592285 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 19592599 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 19592611 C T N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 19592701 A T N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 19592793 A G N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 19592795 C G N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 19592812 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 19592837 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 19592863 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 19592908 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 19592944 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 19593003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19593033 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 19593065 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 19593172 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 19593196 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 19593283 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 19593830 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 19593999 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 19594625 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 19594719 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 19594846 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 19595580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19595610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19596088 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 19596710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19597311 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 19597429 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 19597491 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19597640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19598939 T C N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 3 19599120 A G N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 19599150 C G Y N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 19599269 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 19599344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19599515 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 19599782 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 19599814 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 19599818 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 19599865 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 19600074 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 19600122 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19600213 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 19600675 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19600825 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19601022 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 19601441 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19601994 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 19602644 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19602666 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19602736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19602899 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19606719 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19606755 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19606756 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19606770 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19607558 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19607678 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19608122 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19609275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19609587 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19611682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19611857 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19613335 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19614465 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19616795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19617998 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19619895 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19621926 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 19622253 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 19622725 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19623393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19624725 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19626957 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 19627733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19628398 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19628770 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19629641 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 19629714 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 19630299 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 19630370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19630674 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19630775 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 19630909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19631115 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19631266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19631307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19631793 T C Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 19631854 G T Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 19631870 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19631873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19631891 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 19631939 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 19632019 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 19632269 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19632417 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 19632432 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 19632469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19632510 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19632664 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 19632687 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19632796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19632809 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19632810 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19632820 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 19633399 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 19633402 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 19633449 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 19633576 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 19633613 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 19633618 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 19633624 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 19633739 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 19633740 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 19633753 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19633946 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 19633953 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 19634073 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 19634074 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 19634244 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19635263 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19635265 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19635397 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 19636210 C A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 3 19636342 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 19636361 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19636937 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 19637044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19637109 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19637369 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 19638833 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19639484 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 19639675 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19639719 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 19640003 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19641178 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 19641998 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19642999 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 19643011 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 19643012 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 19643076 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 19643077 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 19643169 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 19643173 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 19643301 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 19643308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19643657 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 19643720 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 19644181 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 19644804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19644916 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 19644970 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 19644976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19645011 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 19645046 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19645057 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19645090 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19645649 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19645943 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 19646152 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 19646830 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19647009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19647166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19647186 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19647340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19648507 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19649029 T A Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 19649060 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19649095 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 19649221 A G Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 19649505 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 19649527 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 19649544 A T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 19649778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19649789 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 19649822 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19649848 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19649973 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 19650042 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19650324 G A Y Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 19650628 C T Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 19650642 T C Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 19650670 C A Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 19650704 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 19650731 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 19650807 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19650812 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 19650828 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 19650869 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 19650949 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 19651167 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 19651198 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 19651228 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 19651250 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 19651781 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19652342 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 19652352 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 19652382 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 19652395 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 19652402 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 19652820 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19652857 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19653206 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 19653314 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19654389 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19654632 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 19654689 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19655708 A C Y N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 19656123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19657082 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 19657588 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 19657732 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 19657885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19657908 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 19658204 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19658246 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 19659319 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19659471 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 19659536 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19660140 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19660452 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19660559 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19660624 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 19660706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19660731 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19660743 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19660782 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 19660795 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19660823 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 19660834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19660852 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19660869 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19660931 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 19661000 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19661002 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19661091 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19661149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19661294 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19661489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19661602 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19661720 T A Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 19661895 A G Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 19661993 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 19662344 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19662477 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 19665508 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 19665737 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19666189 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 19666389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19666605 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 19666655 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 19666659 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 19666762 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 19666919 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 19667029 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 19667131 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 19667254 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 19668015 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19668844 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 19668979 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 19669015 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 19669055 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 19669073 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 19669093 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 19669115 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 19669138 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 19669256 T A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 19669423 T A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 19669570 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 19669805 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 19669813 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 19670047 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19670304 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 19670383 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 19670620 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19670731 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 19670847 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 19671087 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 19671175 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 19671366 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 19671415 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 19671416 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 19671438 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 19671502 G C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 19671516 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 19671620 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 19671765 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 19671905 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 19672988 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 19673127 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 19673222 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 19673303 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 19673386 T A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 19673434 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 19673491 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 19673764 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 19673768 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 19673949 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 19674253 A C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 19674355 G A Y Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 19674357 A G N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 19674375 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 19674401 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 19674452 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 19674653 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 19675093 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 19675172 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19676091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19676102 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 19676313 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 19676457 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19676458 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19676811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19676900 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 19676927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19677085 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 19677209 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 19677237 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 19677444 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 19677535 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19677665 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 19677700 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19677774 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 19679091 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 19680827 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 19681058 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 19681148 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 19681169 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 19681273 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19681341 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19681464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19681712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19681915 A C Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 19681974 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19681988 C A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 19682392 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 19682404 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 19682428 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 19682440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19682605 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 19682613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19682632 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 19682719 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 19682761 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19682830 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 19682893 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 19683809 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 19683937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19684054 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19686184 T A N N 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 7 7 2 3 2 3 19686838 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 19687163 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 19687201 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 19687574 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19688124 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19688247 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 19688261 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19688358 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19688400 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 19688412 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19688424 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 19688457 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19689145 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19689237 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19689426 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19689570 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19689857 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19689991 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19690222 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19690241 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 19690274 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 19690324 T A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0 0.705882352941177 0.294117647058824 12 22 0 12 5 3 19691779 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 19691928 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19692526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19692534 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19692785 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19693218 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 19694113 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19694163 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19694431 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19695443 T C N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 19696642 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19699346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19699756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19701363 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 19701373 A C N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 19701461 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 19701496 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19701799 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 19701829 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 19701935 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19701982 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19701985 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 19702232 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 19702297 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 19702333 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 19702769 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 19702796 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 19702816 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 19703097 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 19703108 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 19703285 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 19704104 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 19704126 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 19704367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19704541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19705314 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 19706688 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19706752 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19706871 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 19706883 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 19707059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19707078 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 19707082 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 19707125 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 19707139 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 19707203 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 19707204 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 19707240 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 19707243 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 19707284 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 19707399 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19707453 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 19707515 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 19707542 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 19707652 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 19707750 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 19707763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19707793 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 19707794 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 19707830 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 19707924 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 19708029 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 19708051 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 19708098 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 19708244 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 19708350 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 19708442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19708558 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 19708608 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 19708629 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 19708692 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 19708780 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 19708830 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 19708884 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 19709091 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 19709192 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 19709302 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 19709311 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 19709458 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 19709513 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 19709600 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 19709707 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 19709793 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 19709860 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 19710604 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 19710889 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 19710926 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 19711369 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 19711826 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19711827 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19711842 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 19711971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19711978 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19712246 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 19712275 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19712282 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 19712320 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 19712337 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 19712340 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 19712415 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 19712440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19712543 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19712790 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 19712907 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 19713169 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 19713489 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 19721429 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 19721767 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 19722060 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 19722935 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 19723308 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19724299 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19727022 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19727204 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19728547 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 19728780 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 19729301 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19729475 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 19729944 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19730389 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 19731453 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19732122 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19732608 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19733411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19734183 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19734840 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19735809 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19736245 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 19736913 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 19737423 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 19737728 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19738047 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19740397 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 19740408 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19740514 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19740820 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19740857 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19741952 T C N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 3 19742095 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 3 19742159 A C N N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 3 19746053 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 19746326 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19746354 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19746523 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 19746768 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 19747481 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19747566 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19747797 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19748129 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 19748172 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 19748430 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 19748872 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 19748975 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 19749353 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 19754802 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19754833 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19754976 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 19755237 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 19755325 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19755425 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 19755465 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 19755535 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 19755651 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 19755704 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19755895 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 19756197 G A Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 19756637 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 19756812 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 19757074 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 19757153 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 19757159 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 19757210 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 19757394 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19757436 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19757485 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 19757497 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19757498 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19757523 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19757565 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 19758198 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 19758222 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 19759090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19759471 T A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 19764224 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19764515 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19764840 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 19764916 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 19764978 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 19765229 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 19765304 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 19765394 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 19765436 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19766287 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 19766341 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 19767130 A T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 19767514 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 19767910 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19767912 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19767990 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19768074 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 19768156 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 19768418 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 19768436 A T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 19768443 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 19768482 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 19768639 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 19769164 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 19769264 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 19769333 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 19769790 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 19769869 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19769967 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 19770144 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 19770227 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 19770348 A G Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 19770478 T A Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 19770644 A G Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 19770940 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 19771485 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 10 8 4 2 3 3 19772119 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 19772164 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 19772282 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 19772689 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19772766 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 19772775 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 19772786 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19773080 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 19773217 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 19773271 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 19774189 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19774854 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19777027 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 19777317 G T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 19777485 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19777611 C T N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 3 19780186 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19782079 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19782106 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19782143 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19783859 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 19785077 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19787372 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 19787544 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19787688 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19787746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19788343 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19789716 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 19791487 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 19792006 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 19794107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19795815 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19796046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19797747 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19798088 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 19798495 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 19798587 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19798905 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 19800482 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19800727 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19801102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19801883 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 19802636 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 19802638 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 19802656 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 19802659 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19802915 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 19802991 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 19803027 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19803520 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19803668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19804077 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 19804172 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 19804176 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 19804326 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19804337 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19804923 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 19805947 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 19806769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19807567 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 19807794 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19813897 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19814202 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 19814255 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19814829 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19814995 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 19822577 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19822664 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 19829309 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19829880 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19830635 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19831878 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19832124 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 19832314 T C Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 19832315 G A N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.2 0.733333333333333 0.0666666666666667 17 13 3 11 1 3 19832349 C A Y N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 19833195 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19833210 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 19834003 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 19834525 T C Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 19834541 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 3 19834667 G A Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 3 19835145 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 19835510 T C N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 3 19836575 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19836892 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19837286 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 19840579 C A Y N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 19840907 A G Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 19842324 G A Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 19843198 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 19843574 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 19844357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19844716 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 19844993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19845311 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 19845842 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19846143 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19846255 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 19846565 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 19846688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19848006 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 19848378 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 19848388 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 19848511 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19848645 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 19848802 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 19848815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19848829 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 19848886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19849173 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 19849597 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 19849619 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19849651 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 19849659 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 19849739 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 19849801 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19849982 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 19850113 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 19850174 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 19850506 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 19850541 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 19850610 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 19850737 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19850958 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 19851004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19851008 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 19851113 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 19851388 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 19851432 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19851433 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19851461 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 19851601 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 19851624 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 19851666 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 19851685 C A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 19851698 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 19851771 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 19851871 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 19851877 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 19851933 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 19851996 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 19852000 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 19852017 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 19852043 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 19852135 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 19852154 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 19852212 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 19852229 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19852266 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 19852329 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19852350 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 19852431 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19852537 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 19852763 A G Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 19852892 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 19855869 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 19855875 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19857361 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19857523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19857671 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 19858505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19858824 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19859519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19859570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19859841 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19859979 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 19860027 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 19860066 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 19860569 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19860687 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19860694 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19860731 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19860760 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19860824 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 19860839 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 19860997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19861027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19861028 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19861039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19861370 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 19861373 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 19861381 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 19861420 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19861571 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 19861590 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 19861990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19862035 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19862048 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 19862121 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 19862133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19862143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19862146 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19862184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19862652 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 19862719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19862754 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 19862765 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 19862781 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 19862820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19862902 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 19862909 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 19863068 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19863129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19863206 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 19863229 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 19863232 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 19863294 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19865098 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 19865307 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19868759 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19868846 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 19868947 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19869107 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 19869141 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 19869572 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 19870141 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 19870358 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 19870407 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 19870542 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19870565 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 19870617 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 19870643 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 19870648 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19870685 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 19871066 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 19871431 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 19871555 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 19871556 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 19871786 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19871814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19871878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19871931 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19872226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19872255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19872388 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19872900 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19872939 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 19872978 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19873172 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 19873237 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19873838 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 19873839 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 19874570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19874685 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 19874816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19874923 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 19875046 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19875090 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19875175 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 19875246 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19875269 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19875291 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 19875426 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19875434 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19875551 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19875603 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19875772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19875908 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 19875953 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 19875966 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 19875992 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 19876006 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 19876017 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 19876205 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19876228 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 19876278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19876491 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19876708 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 19876876 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19876911 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 19876970 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 19876998 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19877008 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 19877048 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19877065 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19877110 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19877288 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19877588 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19877612 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 19877800 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 19877806 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 19877899 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 19877927 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 19877945 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 19877996 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 19878087 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 19878164 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 19878167 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 19878337 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19878841 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 19878870 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 19878921 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 19879149 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19879264 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19880355 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19880836 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19880841 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 19880903 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 19880954 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19880960 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 19881328 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 19881359 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 19881395 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 19881790 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19882150 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 19882374 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 19882544 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 19882593 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 19882796 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19884210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19884280 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 19884295 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 19884877 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19884945 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 19884966 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 19884981 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19886695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19886728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19886946 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19887423 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19887726 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19887819 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19888778 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19888997 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19889110 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19889461 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 19889544 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 19889570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19889647 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19889792 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19889934 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 19889938 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19890150 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19890508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19890910 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19890974 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 19891015 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 19891313 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19891603 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19891653 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19891698 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19891699 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19891748 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19891752 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19891762 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19891774 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19892170 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19892184 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19892290 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19892292 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19892485 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 19892630 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19892929 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19893032 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19893189 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19893523 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19893692 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 19893776 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 19894424 A G Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 19894504 C T Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 19894658 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 19894732 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 19895073 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19895076 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19895087 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19895111 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19895181 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19895233 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19895240 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19895356 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19895361 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19895433 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19895514 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19895595 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19895611 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19895685 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19895694 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19895716 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19895812 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 19895822 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 19896127 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 19896195 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 19896437 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19897050 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19897118 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19897238 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19897726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19897800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19897932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19898137 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 19898519 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 19898522 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19898541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19898573 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19898647 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19898699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19898718 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 19899032 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19899189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19899316 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19899412 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19899740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19900436 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 19900769 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19901252 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19901861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19902684 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 19902726 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19902761 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19902762 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19902835 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 19902925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19902953 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 19903344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19903399 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19903587 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 19903917 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19903925 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19903955 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 19904153 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19904201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19904616 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19904632 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 19904634 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19904771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19905003 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 19905467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19905562 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19905636 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19906930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19907078 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19907257 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 19907360 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 19907458 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 19907466 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19907509 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 19907511 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19907676 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 19907766 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19907832 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 19908299 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19908731 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19908769 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19908803 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19908964 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19909006 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 19909456 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19909469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19909527 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19909550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19909597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19909620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19910235 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19910315 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19910361 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 19910453 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19910637 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19910772 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19911008 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 19911329 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19911662 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19912092 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19912432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19912897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19915457 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19915609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19915709 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 19915713 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 19915879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19916104 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19916132 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19916305 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19916923 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19916949 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19916973 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19917259 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19917591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19917728 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 19917969 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19921070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19921276 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19921793 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19921918 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19922135 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19922227 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19922321 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 19922401 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19922639 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 19923545 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 19923555 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19923881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19925070 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19925117 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19925226 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19925528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19925534 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19925606 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19926045 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19926174 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19926180 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19926316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19926437 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19926461 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 19926530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19926689 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19926836 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19926911 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19926964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19926965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19927941 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19929269 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19930148 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 19930908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19930941 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19931183 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19933536 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 19933548 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 19933850 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19933996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19934133 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19934714 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19935702 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 19935723 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 19935727 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19935743 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 19935803 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19936021 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19936244 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19936287 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19936295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19936325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19936484 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 19936561 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 19936707 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19936758 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19936863 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19936880 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 19936900 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19936998 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19937050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19937065 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19937121 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19937176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19937294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19937351 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19937353 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19937402 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19937414 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19937418 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19937430 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19937443 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19937640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19938009 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19938051 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19938756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19939031 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19939875 T G Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 3 19939877 A G Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 3 19940006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19941858 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19941878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19941887 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19942940 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19943821 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19945679 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 19948030 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 19948400 A G Y Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 19949032 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19949359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19950901 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19953610 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19954633 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19954651 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 19954809 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19958379 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 19958612 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19958632 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 19958646 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 19958826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19958944 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 19959114 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 19959384 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19959857 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19960352 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 19960430 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 19960514 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 19960516 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 19960584 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 19960961 A C N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 19961056 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 19961066 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 19961154 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 19961232 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19961257 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19961288 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19961451 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 19961464 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 19961500 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 19961505 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 19961521 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 19961522 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19961567 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19961615 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19961665 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19961667 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19961690 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19961738 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19961761 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19961819 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19961836 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19961892 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19961896 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19961922 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19961929 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19962095 C A N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 19962156 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 19962175 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 19962217 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 19962298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19962389 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19962434 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19962452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19962532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19962708 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19962849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19962871 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19962891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19963168 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19963292 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19963396 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19963532 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19963609 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19963668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19964040 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19964054 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19964092 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19964100 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19964108 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 19964134 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19964248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19964309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19964392 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19964497 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19964644 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 19965481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19965583 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19965584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19965801 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19965807 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19965944 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19965957 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19966181 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19966391 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19966833 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19966936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19967028 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19967158 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19967202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19967734 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 19967866 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19968421 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19968536 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 19968695 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 19968707 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 19968713 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19968915 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19968919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19968998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19969034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19969259 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 19969342 G T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 19969343 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 19969365 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 19969384 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 19969406 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 19969409 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 19969437 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 19969442 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 19969467 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 19969503 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 19969578 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 19969585 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 19969614 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 19969764 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 19969774 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 19969899 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 19970707 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19970796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19970997 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19971059 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19971210 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19971422 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19971431 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19971468 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 19971507 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 19971815 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 19973161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19973276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19973404 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19973554 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19973723 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 19973793 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19974168 T A Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 19974281 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19974318 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 19974533 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19974600 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19974683 T A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 19974869 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19975040 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 19975054 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19975055 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 19975223 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19975226 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 19975377 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19975402 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19975482 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19975807 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 19975940 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 19976026 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 19976235 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 19976283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19976381 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 19976406 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 19976570 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 19976782 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19976827 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19976855 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 19976888 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 19976889 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 19977272 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 19977389 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 19977482 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 19977596 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19977615 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19977695 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 19977798 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19978105 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 19978391 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19978484 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19978560 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19978762 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19978766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19978903 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19978922 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19979028 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 19979119 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19979154 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 19979155 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 19979224 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 19979262 T A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 19979271 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19979306 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 19979695 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19979758 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19979873 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19980399 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19980660 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19980743 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 19980744 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19980816 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19980944 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19980976 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19981029 G A Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 19981100 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19981106 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19981158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19981256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19981276 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 19981484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19981539 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19981592 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19981604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19981873 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19981892 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19981924 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19982014 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19982026 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19982088 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19982100 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19982108 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19982253 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19982609 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 19982767 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 19982926 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19983060 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 19983132 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 19983179 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 19983268 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 19983325 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 19983354 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19983456 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19983500 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19983838 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 19983857 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 19984040 G T N N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 3 19984170 T C Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 19984183 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 19984242 C T Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 19984291 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19984332 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19984368 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 19984531 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 19984638 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19984718 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 19984744 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19984840 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 19984903 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19984924 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19984951 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19985216 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19985403 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19985429 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19985440 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19985465 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 19985587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19985711 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 19985722 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19985726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19985955 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19986226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19986254 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19986318 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19986345 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19986497 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19986541 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 19986542 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 19986610 T C N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 19986688 A G N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 19986699 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 19986788 G A Y Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 19986889 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 19987021 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19987613 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19987677 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19988096 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19988140 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 19988519 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19988637 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 19988726 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19988797 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 19988834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19988913 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 19989064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19989122 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19989157 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19989195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19989251 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19989269 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19989333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19989347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19989900 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19989958 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19990039 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 19990075 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19990302 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19990362 C T Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 19990371 A G Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 19990475 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19990508 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 19990531 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 19990572 A T Y N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 19990770 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19990889 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 19990936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19991021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19991871 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 19993074 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 19995852 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19996341 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 19996415 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 19998237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19998413 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 19998425 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19998447 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19998524 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19998684 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 19998750 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19998781 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 19998841 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19998861 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 19998893 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 19998962 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 19998973 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 19998989 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19999195 T C N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 19999355 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 19999369 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 19999421 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 19999426 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 19999492 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19999508 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19999543 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 19999577 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 19999582 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 19999595 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 19999612 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 19999636 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 19999640 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 19999695 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 19999718 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 19999726 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 19999992 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20000021 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20000034 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20000059 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20000072 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 20000394 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 20000479 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 20000505 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 20001562 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 20001995 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 20002097 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 20002133 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 20002156 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 20002292 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20002327 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20004246 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20004247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20004325 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 20004454 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20004504 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20004528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20004733 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20004738 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20004752 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20004805 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20005026 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20005200 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 20005201 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 20005229 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20005376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20005502 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20005508 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20005585 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20005593 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 20005885 T G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 3 20006228 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 20006240 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20006523 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 20006861 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 20007010 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 20007305 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20007630 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20007650 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20007659 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20007877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20007887 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20007919 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20007944 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20007976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20007996 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20008179 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20008202 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20008358 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20008439 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20008495 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 20008988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20009091 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20009668 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20009697 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 20009709 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20009719 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 20009780 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20009784 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20009801 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20009945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20010239 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 20010442 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 20010477 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 20010493 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 20010705 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20010713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20010842 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20010896 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20010897 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20010913 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 20011356 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 20011465 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20013093 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20013356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20014004 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20014658 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20018831 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20020361 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 20023702 C A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 20024194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20024590 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20024635 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20024792 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20026065 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 20026221 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20028849 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20029898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20029930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20030226 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20031925 T G N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 3 20032789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20033802 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20034021 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20034477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20034530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20034848 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 20034927 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20034977 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20035165 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 20035235 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20035356 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20035371 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20035387 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20035392 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20035663 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20035685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20035697 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20035904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20035917 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20036391 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20036599 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20036638 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20036923 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20036961 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20037351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20037672 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 20037721 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20037767 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20038039 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 20038106 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20038123 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20038205 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 20038242 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20038415 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20038615 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20040794 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20043534 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20044977 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20045264 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20046611 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20047069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20047268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20047521 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20047726 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 20047746 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20047795 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20047919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20047970 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 20047996 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20048070 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20048195 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20048276 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20048342 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 20048343 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20048353 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20048402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20048466 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 20048547 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20048611 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20048856 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20049015 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 20049037 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 20049041 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 20049050 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 20049055 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 20049069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20049278 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20049293 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20049410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20049415 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20049437 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20049465 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20049513 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20049539 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20049577 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20049635 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20049662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20049663 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20050041 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20050078 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20050102 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20050415 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20050426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20050450 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20050643 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20050752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20051140 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20051155 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20051176 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20051190 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20051215 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20051430 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20051501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20051515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20051677 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 20051721 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20051794 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20051942 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 20052215 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 20052240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20052313 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20052895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20052981 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20053042 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20053081 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20053361 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20053383 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20053438 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 20053511 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20053600 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20053605 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20053716 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20053731 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20053767 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 20053787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20053799 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20053808 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 20054122 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20054502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20054608 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20054651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20054714 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20054765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20055149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20055227 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20055230 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20055437 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 20055465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20055503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20055636 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20055659 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20055818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20056658 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20056952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20056965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20058493 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20058661 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20058975 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20059149 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20059233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20059234 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20059495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20060112 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20060233 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20060313 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20060510 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20060513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20060824 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20061033 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20061046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20061174 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20061409 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20061431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20061603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20061932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20061953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20062738 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20062830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20062994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20063004 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20063099 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20063225 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20063321 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20063432 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20064257 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20064320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20064330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20064366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20064389 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20064395 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20064510 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20064698 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20064710 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20064716 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20064790 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 20064803 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 20064839 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20064900 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20064945 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20064947 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20064985 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20065005 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20065031 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20065119 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20065130 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20065161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20065234 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20065269 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20065575 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20065915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20066196 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20066921 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20067716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20068426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20068440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20068556 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20068653 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20068750 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20068855 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 20069124 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20069268 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20070573 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20070633 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20070708 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20070759 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20070840 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 20070900 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20071015 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20071510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20073953 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20075791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20077698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20080187 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20081769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20082508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20082917 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20083385 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20083933 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20086222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20087093 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 20087101 T C Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 20087323 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 20087442 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20087700 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20087771 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20087966 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 20088260 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 20088650 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 20088737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20088807 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20089037 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 20089079 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20089404 C A Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 20089461 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 20089500 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20089875 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 20090363 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20090394 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20090453 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 20090471 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 20090485 T A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 20090547 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 20090600 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20090631 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 20090682 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20090909 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 20090927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20090943 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20090979 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 20091038 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20091106 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 20091131 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 20091137 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 20091149 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 20091171 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20091177 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 20091192 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20091210 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20091300 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 20091305 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 20091381 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 20091386 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 20091449 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 20091516 G A N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 20091703 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 20091773 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 20092033 G A Y Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 11 9 2 7 1 3 20092284 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 20092393 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 20092404 G T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 20092620 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 20092689 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20092746 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20092864 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 20092909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20093064 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20093194 G T Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 20093385 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20093652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20093667 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20094096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20094553 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 20094587 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 20094597 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 20094616 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 20094642 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 20094652 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 20094659 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 20094876 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 20094992 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20095002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20095038 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 20095064 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20095066 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 20095077 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 20095337 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20095569 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 20095619 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20095631 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20095657 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 20095767 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 20095887 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 20095909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20096223 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20096348 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20096485 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 3 20096741 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 20096769 G T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 20096775 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 20096781 C G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 20097000 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 20097361 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20097367 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 20097519 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 20097566 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 20097905 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 20098305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20098547 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20098604 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20098838 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20098952 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 20099038 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 20099237 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20099920 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 20100014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20100275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20100452 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 20101239 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20101244 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20101307 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 20101492 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 20101493 G C N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 20101511 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 20101526 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 20102260 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20102430 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20102820 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 20102878 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 20102928 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20103103 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 20103148 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 20103198 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 20103215 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20103410 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 20103544 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20103662 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20103729 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20103783 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 20103798 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20103799 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20103836 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20103844 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20103909 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20104401 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 20104888 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20105059 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20105103 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 20105123 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20105279 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20105334 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20105369 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20105378 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20105423 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20105560 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20105671 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20105878 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20105890 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 20105912 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20105945 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 20106064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20106122 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20106215 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 20106237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20106260 A T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 20106306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20106312 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 20106375 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20106385 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20106456 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20108026 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 20108187 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 20108249 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20108299 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 20112932 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 20113195 A C Y N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 20113246 T G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 20113296 T C Y Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.25 0.333333333333333 0.416666666666667 10 14 3 4 5 3 20113331 C T Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 20113339 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 20113351 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20113954 G A Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 20114086 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 20114191 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20114336 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20114392 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20114414 C A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 20114430 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20114668 T A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20114731 T A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 20114780 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 20114799 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20114849 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20114863 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20114890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20114992 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20115155 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 20115243 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 20115285 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20115344 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20115357 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20115389 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20115516 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 20115572 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 20115606 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 20115632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20115637 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20115797 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20115956 A G Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 20115995 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 20116023 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 20116156 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20116216 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 20116278 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20116299 A G N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 20116346 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 20116359 G T Y N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 3 20116495 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 20116607 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20116712 T C Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 20116756 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 20116801 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20116938 T A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 20116966 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 20116976 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 20117061 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 20117162 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 20117188 C G Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 20117266 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20117348 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20117423 A G Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 20117468 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20117702 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 20117715 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 20117735 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 20118455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20118488 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 20119032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20119105 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20119128 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 20119229 G T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 20119302 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20119703 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20120012 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 20120043 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20120144 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20120182 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20120531 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20120911 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20120947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20121684 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20121986 T C N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 9 11 3 3 4 3 20122106 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 20122248 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 20122373 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20122564 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 20122739 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20122752 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20122916 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 20123008 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20123031 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20123281 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 20123483 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 20123535 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 20123613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20123719 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 20123720 A C Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 20123859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20123891 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20124531 G C Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 20124541 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 20125381 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 20125384 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 20126064 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20126296 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 20126907 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20127099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20127603 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20127701 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 20127949 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20127953 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 20128069 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20128070 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20128104 A T N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 20128160 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 20128164 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20128215 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 20128369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20128433 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20128485 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 20128773 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 20129056 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20129223 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20129232 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 20129358 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 20129363 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20129411 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20129679 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20130147 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 20130177 G A N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 20130178 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 20130203 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 20130231 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 20130252 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 20130277 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 20130342 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 20130381 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 20130406 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 20130417 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 20130733 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 20131133 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20131487 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20131506 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 20131564 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20131977 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20132389 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20132674 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20132791 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 20132960 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20133360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20133672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20133673 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20133997 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20134063 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20134178 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 20134216 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20134230 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 20134252 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20134352 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 20134502 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20134668 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 20134976 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20135072 T A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 20135080 G T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 20135190 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20135405 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20135431 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 20135639 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20135726 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20135814 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 20136124 C G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 20136758 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20137036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20137104 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 20137267 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 20137311 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20137344 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 20137628 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20137639 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20137657 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20137828 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20138851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20139482 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 20139652 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20139776 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 20139910 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 20140049 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20140202 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 20140576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20140665 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20140723 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 20140758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20140802 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20140816 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20141203 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20141587 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20141626 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 20141661 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 20141689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20141730 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 20141732 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 20141741 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 20141744 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 20142859 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20144185 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20144308 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 20145916 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20146118 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20146758 C T Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 20147595 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 20147607 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 20148024 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20148408 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20149536 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20150563 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20150750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20151241 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20151773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20152728 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20152759 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20153266 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20153331 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20154196 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20154624 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20154716 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20155152 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 20155214 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20155227 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20155243 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20155295 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20155412 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20155429 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 20155497 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20155509 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 20155570 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20155571 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 20156947 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20156955 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20157090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20157493 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20157769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20157802 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20158192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20158346 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20160450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20160491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20160872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20160873 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20162370 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20162534 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20163029 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20163262 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 20163350 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 20163406 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 20163432 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 20163555 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 20163556 T A N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 3 20163571 T G N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 3 20163649 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 20163750 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 3 20164154 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 3 20164174 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 20164220 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 20164224 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 20164334 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 20164411 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20164813 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 20165092 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 20165420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20165483 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 20165490 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 20165724 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 20166128 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 20167882 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 20168886 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 20170474 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20170496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20170648 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 20171842 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20173705 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20174301 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 20174625 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 20174759 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 20175262 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20175280 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20175493 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20175611 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20175682 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 20176228 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20177313 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20178469 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20178553 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20178718 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 20179314 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 20179589 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 20179633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20179777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20179937 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20179967 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20180078 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20180097 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20180331 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20180374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20180388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20180564 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20180584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20180692 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20180937 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 20180946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20180987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20181002 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20181026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20181041 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20181052 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 20181186 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 20181245 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20181453 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20181504 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20181519 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20181542 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 20181546 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 20181585 G T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 20181785 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20181910 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20182266 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 20182739 T C Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 20182743 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20183280 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 20183345 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20183382 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 20183423 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 20183560 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20183639 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20183702 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20183721 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20183782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20183806 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20183838 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20183887 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20183931 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20183960 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20184316 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20184341 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20184656 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20184689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20184707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20184724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20184737 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20184777 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20184798 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20184823 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20184875 T C Y Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 20184883 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20184892 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20184915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20184937 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 20184981 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20184999 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20185101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20185179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20185255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20185322 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20185352 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20185402 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20185502 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20185513 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20185546 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20185629 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20185642 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20185757 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20185765 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20185919 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20185923 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20185930 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20185981 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20185982 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20186319 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20186381 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 20186435 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 20186436 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 20186512 G T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 20186578 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 20186591 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20186650 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20186702 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20186942 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20186946 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20186957 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20187169 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20187182 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 3 20187394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20187647 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 20187829 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 20187845 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 20187887 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 20187899 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 20187975 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20188035 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20188299 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20188753 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 20188802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20188883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20190077 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 20190251 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20190324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20190492 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20190651 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 20190934 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20191565 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 20191606 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 20191676 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 20192248 T C N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 3 20192686 C G N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 3 20192794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20192838 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 20192923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20193272 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20193428 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 20194309 A T N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 20194534 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20194544 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20194809 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 20194843 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20195155 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 20195351 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20195496 A C Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 20195806 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 20195921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20197718 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20197951 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20198657 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 20200458 A G Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 20202329 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20202543 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20202839 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20203523 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20203984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20205799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20206007 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20206098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20206883 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20207112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20207220 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 20207492 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20208948 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20209055 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 20211470 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20212108 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 20212181 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 20212599 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 20213231 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 20213624 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 20213626 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 20214177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20214223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20214526 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20214548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20215539 A C N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 20215811 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20216076 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20216090 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20216268 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20216902 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20217069 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20217407 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20217450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20217484 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20217490 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20217522 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20217654 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20217857 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20217968 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20218598 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20218674 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20218850 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20218905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20219311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20219509 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20219530 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20219807 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20219877 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20219896 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20219903 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20220318 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20220392 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20220752 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20220788 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20221365 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20221370 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20221607 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20221625 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 20222090 T C N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 20222094 T C N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 20222150 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 20222611 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 20222741 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 20222770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20222874 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 20223085 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20223184 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20223192 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20223263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20223290 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20223351 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20223442 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20223472 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20223626 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20223665 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20223728 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20223853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20223867 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20223966 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20223972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20223984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20223992 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20223998 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20224060 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20224074 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20224171 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 20224301 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 20224466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20224471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20224558 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20224600 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20224759 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 20225569 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 20225572 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 20225658 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20225716 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20227204 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 20227229 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 3 20227309 G T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 20227979 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20228205 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 20228367 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 20228379 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 20228464 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20228466 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 20228570 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20228637 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20228903 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20229571 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 20229607 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 20229632 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20229887 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 20229919 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 20229950 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20229999 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20230832 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20231247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20231366 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 20231605 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20231889 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20232056 A C Y N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 3 20232595 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20232696 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 20232890 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20232903 C A N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 20232938 T C N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 3 20232939 G A N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 3 20233033 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 20233046 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 20233097 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 20233101 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 20233145 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 20233197 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 20233290 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 20233342 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 20233677 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20233720 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20233944 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20234056 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 20234561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20234757 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 20234772 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 20234835 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 20234836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20235187 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 20235189 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20235264 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20235601 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 20235602 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 20235670 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 20235708 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 20235736 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20235817 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 20235944 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 20236048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20236173 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20236332 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20236463 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 20236531 C T N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 3 20236544 A G N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 20236794 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 20236935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20236943 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20237101 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20237225 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 20237331 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 20237354 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20237573 A T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 20237764 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20237819 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20238012 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20238022 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20238057 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20238234 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 20238445 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 20238520 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 20238538 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 20238840 G C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 20238859 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 20238878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20238917 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 20239087 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20239106 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 20239154 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 20239263 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 20239359 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20239366 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 20239624 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20239626 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20239724 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20239748 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20239749 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 20239802 G T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 20239828 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20239831 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 20240170 C A N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 3 20240181 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20240242 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 20240253 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20240265 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 20240306 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 3 20240309 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 3 20240322 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 20240380 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 20240453 G A N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 0.0909090909090909 13 9 3 7 1 3 20240458 G A N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 0.0909090909090909 13 9 3 7 1 3 20240549 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 20240569 G A N Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 3 20240895 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 20240914 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 20240949 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 20240988 T G N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 20240991 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 20241059 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 20241073 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 20241142 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20241191 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20241202 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20241242 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 20241249 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 20241267 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 20241331 C T Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 20241334 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20241379 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 20241397 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 20241485 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20241486 C A N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 20241504 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20241521 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 20241535 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 20241546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20241744 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20241804 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 20241820 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20241850 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 20241921 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 20242082 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 20242083 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 20242137 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 20242271 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 20242290 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 20242334 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 20242356 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 20242388 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 20242460 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20242541 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20242565 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 20242598 G A Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 20242735 T C N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 3 20242736 C T N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 3 20242749 G A N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 3 20242803 C T Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 20242904 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 20243034 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20243120 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 20243122 A T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 20243377 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 20243546 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 20243745 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20243836 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20243888 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 20244055 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 20244145 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20244513 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20244551 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 20244968 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20245051 G C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 20245137 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 20245400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20245422 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20246546 C G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 20246568 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20246591 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20246638 C G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 20246665 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 20247306 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20247319 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20247582 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20247844 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20248756 C G Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 20249409 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 20249484 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20249662 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20250421 C A Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 20250422 A G Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 20250719 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20251145 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20251163 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20251202 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20251456 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20251490 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20251928 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20251990 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20252448 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20252496 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20252801 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 20252954 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 20253228 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 20253255 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20253261 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 20253368 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 20253588 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 20253915 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20254627 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20254791 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20254895 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20254899 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20254919 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20255065 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20255150 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20255187 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 20255290 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 20255316 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20255543 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 20255706 C A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 20255817 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20255837 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20255902 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 20255975 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 20256110 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20256175 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 20256190 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 20256471 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 20256481 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 20256751 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20256812 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 20256830 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20256867 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 20256889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20256953 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 20257018 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20257305 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 20257341 G C N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 3 20257465 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 20257486 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 20257509 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20257607 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 20257654 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20257695 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20257737 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20257752 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20257816 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20257824 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20257839 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20257856 C T Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 20258053 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 20258074 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20258143 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20258154 T A Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 20258226 G A Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 20258511 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20258569 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 20258647 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20258857 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20258868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20258927 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20259021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20259030 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20259056 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 20259057 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20259087 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20259431 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 20259449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20259474 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20259627 C T Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 3 20260351 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 20260392 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 20260433 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 20260448 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 20260556 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 20260599 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20260635 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 20260738 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 20260784 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 20260787 T G N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 20260909 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20260945 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20260952 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20261026 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 20261063 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20261072 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20261082 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20261083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20261103 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20261109 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 20261114 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 20261136 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 20261157 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 20261172 A C N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 20261185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20261251 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 20261273 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 20261278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20261343 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20261383 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 20261408 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 20261424 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 20261497 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 20261531 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 20261571 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 20261586 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 20261617 T G Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 20261768 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20262051 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 20262072 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 20262086 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 20262129 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 20262450 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20262493 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 20262548 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 20262685 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 20262718 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 20262743 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20262857 C A Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 20262858 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 20262933 G C N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 20263242 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 20263348 T G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 20263512 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20263647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20263885 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 20263893 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20263923 T G Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 20263932 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 20264229 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20264271 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 20264390 C A Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 20264457 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 20264562 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 20264563 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 20264739 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 20264807 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 20264847 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 20264880 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 20265026 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20265204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20265214 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 20265569 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 20265615 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20265625 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20265712 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 20265825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20266017 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 20268436 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20270951 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20271993 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20274090 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20276932 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20277556 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20279574 C G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20280988 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20281560 T G Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 20286907 G T Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 20289746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20289889 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20291407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20291494 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20291505 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20291551 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20291563 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 20292249 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 20293168 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 20293194 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20293352 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20294657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20294702 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 20295060 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20297786 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20298412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20298670 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 20298934 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20301533 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 20302057 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 20302063 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 20302568 C G Y N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.181818181818182 0.727272727272727 0.0909090909090909 12 10 2 8 1 3 20302586 G T Y N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.181818181818182 0.727272727272727 0.0909090909090909 12 10 2 8 1 3 20302834 T C Y Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 3 20302871 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 20303588 C T N Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 3 20303943 C T N Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 3 20304014 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 20304117 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 20304199 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 3 20304220 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 3 20304396 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 3 20304402 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 20304588 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20304605 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20304627 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 20304674 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 20304683 C T N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 3 20304773 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20305052 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 20305145 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20305164 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 20305205 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 20305346 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 20305422 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 20305490 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 20305491 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 20305692 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20305763 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20305893 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 20306131 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20306177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20306346 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 20306364 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 20306394 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20306564 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 20306698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20306739 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20306761 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 20306923 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 20306943 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 20307011 C G Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 20307112 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20307142 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 20307152 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 20307186 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 20307452 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 20307600 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 3 20307705 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 20307748 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 20307807 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20307865 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 20307901 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 20308007 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20308063 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20308074 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 20308101 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 20308209 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 20308303 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 20308321 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 20308428 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 20308466 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 20308524 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 20308635 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20308651 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 20308724 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20308893 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20308925 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20309002 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20309067 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 20309111 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 20309138 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 20309156 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 20309180 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 20309392 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 20309437 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 20309671 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 20309835 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 20310178 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20310611 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20310628 A T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 20310716 T G N N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 3 20311361 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20311730 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 20311859 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20311961 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20312514 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 20312597 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 20312612 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 20312675 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 3 20312693 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 3 20313030 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 20313097 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 20313098 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 20313181 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 20313256 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20313266 G T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 20313291 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 20313395 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 20313396 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 20313435 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 20313495 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 20313526 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20313537 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20313610 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20313765 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20313813 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20313830 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 20313898 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20313932 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 20314947 A G Y Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.363636363636364 0.636363636363636 0 15 7 4 7 0 3 20314948 A T Y N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.363636363636364 0.636363636363636 0 15 7 4 7 0 3 20317865 C T Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 20317914 T G Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 20318333 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 20318402 A T N N 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.363636363636364 0.454545454545455 0.181818181818182 13 9 4 5 2 3 20318441 T C N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 3 20318452 C A Y N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 3 20318457 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 3 20318484 T C Y Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 3 20318515 T A Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 20318533 T A Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 20318599 G T Y N 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 9 11 3 3 4 3 20318737 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 20318742 T C Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 20318772 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20318814 G A Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 20318830 G T Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 20318877 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 20318930 G T Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 20319016 G A Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 20319030 G C Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 20319109 C T Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 20319162 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 20319176 G C Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 20319191 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 20319225 C T Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 3 20319239 G A Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 20319245 T G Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 20319305 C G Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 20319339 T C Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 20319391 G A Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 20319417 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 20319491 C A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 20319826 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20320325 C T Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 20320458 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20320554 T A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 20320626 C G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 20320662 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 20320674 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 20320825 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 20320839 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 20320877 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 20320986 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 20321069 A T N N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 3 20321132 T C N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.363636363636364 0.363636363636364 0.272727272727273 12 10 4 4 3 3 20321301 A G N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 3 20321316 G A N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 3 20321343 T A N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 20321349 T G N N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.25 0.583333333333333 0.166666666666667 13 11 3 7 2 3 20321365 A T N N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.272727272727273 0.545454545454545 0.181818181818182 12 10 3 6 2 3 20321438 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 20321496 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20321503 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 20321559 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 20321606 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 20321652 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 20321730 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20321835 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 20321896 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20321952 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20322187 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20322254 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 20322272 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 20322291 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 20322303 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20322326 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 20322333 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 20322348 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20322377 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 20322396 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 20322440 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 20322459 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 20322477 G T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 3 20322507 C T Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 20322516 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 20322563 A G Y Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 3 20322674 C T Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 20322699 G A Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 20323676 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 20323686 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 20323703 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20323838 T G N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 3 20323854 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 3 20323880 C T Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 20323956 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 20323985 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 20324051 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 20324088 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 20324095 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 20324421 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 3 20324430 C A N N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 3 20324434 T A N N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 3 20324450 T G Y N 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 3 20324461 T A N N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 20324796 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20324986 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 20325165 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 20325216 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20325229 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20325268 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20325288 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20325367 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 20325411 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 20325518 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20325565 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 20325810 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 3 20326060 A T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 20326080 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 20326210 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 20326216 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 20326243 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 20326256 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20326285 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 20326468 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20326703 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 20326946 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20326954 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20327257 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 20327260 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 20327337 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 20327392 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 20327450 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20327538 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 20327539 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20327573 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20327646 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 20327759 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 20327834 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 20327857 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 20327987 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20328294 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0 0.823529411764706 0.176470588235294 14 20 0 14 3 3 20328382 C G Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 3 20328463 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 20328623 A G Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 20328880 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 20328927 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20328944 G A Y Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 20328949 A C Y N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.133333333333333 0.6 0.266666666666667 13 17 2 9 4 3 20328966 T G Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 20328979 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 20329037 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20329046 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20329126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20329222 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20329234 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 20329244 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 20329299 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20329423 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 20329745 C A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 3 20329786 G C Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.2 0.8 0 24 16 4 16 0 3 20329788 G T Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.2 0.8 0 24 16 4 16 0 3 20329845 T G Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 3 20329976 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 20329987 C G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 20330178 T A Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 3 20330243 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 20330251 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 20330384 A T Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 20330482 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 3 20330490 T A Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 20330549 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20331084 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 20331137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20331151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20331190 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 20331272 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20331380 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20331456 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20331457 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20331523 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20331609 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 20331636 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 20331652 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20331676 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20331718 T G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 20331732 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 3 20331914 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20331941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20332014 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 20332224 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 20332236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20332325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20332338 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20332423 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 20332443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20332530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20332588 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 20332605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20332631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20332721 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 3 20332783 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20332788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20332818 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20332836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20332870 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20332884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20332924 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20333092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20333170 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 20333290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20333297 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20333306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20333332 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20333437 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20333482 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 20333509 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20333673 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 20333714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20333719 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20333728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20333739 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20333757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20333792 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20333846 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20333851 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 20333868 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20333887 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 20333888 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 20333917 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20333986 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20334026 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20334036 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20334110 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20334163 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20334172 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20334216 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20334234 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20334304 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20334363 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 20334409 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 20334441 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 20334459 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20334522 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20334537 G C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 20334713 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20334993 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 20335069 A T Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 20335168 G T N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 20335211 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20335250 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20335328 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 20335414 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 20335416 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 20335661 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20335672 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 20335702 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20335747 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20335761 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 20335847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20335869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20335907 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20335924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20335994 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 20335999 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 20336088 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20336175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20336233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20336274 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20336317 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 20336357 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 20336416 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20336430 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20336466 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20336702 T A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 20336706 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20336787 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20336793 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20336897 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 20337150 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 20337266 G A Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 18 14 4 10 2 3 20337447 C T Y Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.153846153846154 0.538461538461538 0.307692307692308 11 15 2 7 4 3 20337455 T A Y N 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 10 14 2 6 4 3 20337510 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20337571 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20337589 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 20337622 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 20337672 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20337876 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 20338492 A C Y N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 7 13 1 5 4 3 20338547 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20338551 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 20339363 T A Y N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 20339380 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20339414 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 20339475 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 20339493 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20339504 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20339549 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20339656 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20339684 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 20339868 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20340015 C A Y N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 20340033 A T Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 20340043 C A Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 20340099 C T Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 20340147 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20340200 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20340318 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20340394 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 20340398 G C Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 20340462 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20340543 T C Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 20341223 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20341252 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20341350 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20341499 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 20341507 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 20341554 T A N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 20341558 T C N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 20341760 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20341901 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20341991 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20342132 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 20342400 A T N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 3 20342736 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20342745 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 20342854 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20342880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20342960 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 20342967 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 20343237 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 20343427 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 20343655 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20343680 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 20343701 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20343743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20343763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20343831 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 20343854 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20343896 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 20343933 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20343977 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 20344073 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20344082 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 20344150 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20344155 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20344185 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 20344267 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 20344305 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 20344323 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20344443 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 20345133 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20345527 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20345528 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20345589 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20345651 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20345788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20345851 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20346245 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 20352648 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20352675 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 20352719 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20352730 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 20352882 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 20353145 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20353198 C A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 20353214 C T N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 3 20353378 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20355096 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20355118 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20355123 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20355181 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20355233 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20355244 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 20355287 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 20355301 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20355310 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20355366 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20355473 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20355510 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20355596 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20355774 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20356106 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20356222 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20356548 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20356606 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20356819 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 20356882 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20356990 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 20357186 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20357290 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20357359 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20358205 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20358296 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20358326 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 20358633 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20359277 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20359314 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20360967 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20361034 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20361611 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20361897 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20362415 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20362627 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 20362722 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 20364079 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20364425 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 20364641 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20365209 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20365990 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20366611 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20367323 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20367411 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 20367450 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20367799 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20367844 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 20368916 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20370446 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20371158 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20371505 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20371732 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 20372054 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 20372146 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20372195 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20372378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20372601 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 20373454 G A N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 3 20373678 G C N N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 9 9 2 5 2 3 20374725 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 20375514 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20375737 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20375847 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20376424 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 20376812 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 20377204 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 20377481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20378186 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20378566 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20380249 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20380900 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 20381148 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 20381300 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20381486 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20382020 A G N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 3 20382189 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20382767 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 20382815 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20382904 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20382988 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 20383054 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20383111 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 20383114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20383164 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20383309 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20383341 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20383451 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 20383591 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20383692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20383747 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20383844 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 20383845 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 20385621 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 20386864 C G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 20386961 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20386968 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20386980 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20387284 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 20387346 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20387865 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 20387924 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 20388009 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 20388018 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 20388167 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20388199 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20388298 G T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 20388365 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 20388424 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 20388466 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 20388505 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20388570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20388633 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 20388835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20388840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20388907 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 20388970 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 20388973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20389036 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 20389060 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 20389079 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20389122 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 20389165 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 20389205 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 20389228 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20389256 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 20389286 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20389296 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 20389348 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 20389574 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 20389575 A T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 20389592 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 20390256 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 20390408 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 20391144 T A N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 20391151 T A N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 3 20391205 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 20391258 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 20391385 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 20391440 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 20391640 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20391678 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 20391679 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20391692 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20391747 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 20391769 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 20391824 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 20391835 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 20391965 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 20392088 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 20392128 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20392151 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20392188 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20392226 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 20392557 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20392694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20392784 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20393062 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20393146 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20393147 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20393179 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 20393188 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20393327 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20393372 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20393380 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20393413 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20393465 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 20393591 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20393810 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20393829 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20393841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20394002 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20394199 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20394320 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20394338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20394432 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20394433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20394466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20394532 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 20394617 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 20394632 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 20394643 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 20394845 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 20394863 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 20394978 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 20395027 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20395089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20395095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20395101 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 20395224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20395243 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20395244 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20395420 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20395710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20395737 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 20395748 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 20395768 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20395787 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 20395823 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20395893 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20396112 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20398031 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 20398092 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20398396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20398771 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20398795 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20399230 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20402282 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 20403075 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20403152 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20403257 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20403380 T C Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.1875 0.6875 0.125 17 15 3 11 2 3 20403429 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20403461 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20403475 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 20403484 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20403493 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20403637 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20403648 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20403654 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20403765 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20403774 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20403780 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20403788 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20403793 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20403828 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20403851 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20405469 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 20405632 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20405917 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20405942 G T Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 20406099 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20406162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20406178 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20406210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20406239 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20406325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20406366 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20406394 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20406408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20406457 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20406473 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20406532 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20406613 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20406674 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20406679 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20406832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20407030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20407046 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20407163 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20407707 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20407788 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20407799 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20408308 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20408378 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20408428 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 20408509 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20408513 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 20408705 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 20408722 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20408727 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20408756 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20408891 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20408906 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 20408937 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20408944 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20408971 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 20408990 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20408993 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 20409063 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20409099 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20409148 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20409601 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20409640 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20409660 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20409693 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20410026 T C N Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 6 8 1 4 2 3 20410181 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20410236 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20410241 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 20410256 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20410289 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 20410459 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 20410530 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20410625 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 20410656 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 20410686 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 20410739 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20410750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20410821 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20410924 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 20411017 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 20411035 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20411143 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 20411147 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 20411403 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20411501 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20411567 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 20411610 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20411661 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20411825 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20411836 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20411846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20411875 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20411970 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 20411989 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20412047 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 20412122 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 20412126 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 20414425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20414455 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20415138 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20415590 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20417523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20417609 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20417756 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20417806 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20417839 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20418373 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20418499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20418827 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20418887 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 20419102 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20419205 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20419324 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20419373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20419402 A T Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 20419575 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 20419604 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20419624 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20419641 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 20419690 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20419723 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20419761 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20419799 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20419812 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20419831 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20420121 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 20420148 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 20420233 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 20420263 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20420306 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20420522 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20420557 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 20420632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20420633 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20420673 A T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20420903 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20420915 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20421000 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 20421072 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20421096 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 20421119 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 20421158 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 20421233 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20421289 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 20421365 G A N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 3 20421428 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20421441 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 20421507 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20421602 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 20421786 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 20421912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20422085 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 20422148 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20422166 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20422191 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20422616 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20422646 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 20422698 A G N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 3 20422821 T G N N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 3 20422895 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 3 20423014 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 20423044 T G N N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 3 20423053 A C N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 3 20423111 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 20423208 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 20423459 A G N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.272727272727273 0.0909090909090909 0.636363636363636 7 15 3 1 7 3 20423495 G A N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.181818181818182 0.0909090909090909 0.727272727272727 5 17 2 1 8 3 20423549 C T N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.25 0.0833333333333333 0.666666666666667 7 17 3 1 8 3 20423591 G A N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.181818181818182 0.0909090909090909 0.727272727272727 5 17 2 1 8 3 20423784 G A N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 3 20423859 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 20424587 G T Y N 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.428571428571429 8 6 4 0 3 3 20424691 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 20424821 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 20424968 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 20425003 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 20425041 A T Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 20425091 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 20425131 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 20425211 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20425358 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20425525 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 20425604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20425618 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20425663 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 20425729 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20425982 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 20426006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20426058 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20426077 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20426217 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 20426227 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 20426255 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 20426292 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 20426493 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 20426542 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20426544 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20426585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20426597 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20426647 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20426670 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 20426725 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20426727 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20426808 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 20426862 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 20426874 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20427034 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 20427045 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 20427052 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20427189 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20427353 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20427557 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20427656 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20427680 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20427738 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20427820 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 20427863 T A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 20427958 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20428157 A G Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 20428223 T C Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 20428240 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 20428346 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 20428394 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20428447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20428451 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20428498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20429001 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20429112 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20429170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20429422 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20429565 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20429789 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20429869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20429883 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20429903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20430080 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 20430317 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20430450 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20430454 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20430465 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20430466 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20430513 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20430567 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20430685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20431433 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20431495 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20431798 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 20431872 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 20431885 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 20432022 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 20432121 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20432148 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20432186 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20432192 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20432200 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20432295 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20432536 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20432609 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20432705 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20432789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20432885 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20432897 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20432898 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20432962 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 20432983 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20432993 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20433092 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20433102 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20433220 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 20433364 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20433553 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20433573 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20433770 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20434412 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20434466 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20434611 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20434730 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20434744 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20434966 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20435286 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20435371 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20435522 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20435874 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20436008 C A Y N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 20436328 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 20436736 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 20437033 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20437066 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 20437088 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 20437104 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20437106 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20437196 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 20437223 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20437240 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 20437288 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 20437468 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20437475 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20437543 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20437574 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20437585 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20437704 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20437705 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20437734 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 20437844 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20437957 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 20438180 A C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 20438205 T G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 20438307 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20438315 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 20438358 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 20438432 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 20438437 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 20438449 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20438487 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 20438610 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 20438651 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20438675 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20438712 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 20438717 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 20438981 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 20439066 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 20439078 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 20439232 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20439279 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20439286 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20439450 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20439794 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20439809 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20439900 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20441514 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 20441974 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20442024 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20442071 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20442348 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20442634 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20442662 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20442852 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20442900 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20443308 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20443599 T G Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20443615 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20443657 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20443679 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20443818 C A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20443832 T C Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20443887 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20443954 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20444245 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 20444478 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 20444584 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20444772 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20445133 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 20445532 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 20445683 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 20445687 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 20445773 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20445908 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 20446219 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20447055 A T Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 20447072 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 20447275 G A Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 20447305 C G Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 20447358 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20447405 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20447594 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20448053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20448263 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20448289 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20448538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20448776 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20448790 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20448874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20448907 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20449335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20449665 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20449772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20449800 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 20449829 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20449869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20449931 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20449990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20450058 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20450169 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20450176 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20450357 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20450466 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20450545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20450551 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20450594 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20450684 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20450690 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20450701 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20450939 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20450959 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20451017 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20451136 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 20451227 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20451259 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20451270 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20451287 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20451317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20451524 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20451534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20451621 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20451644 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20451652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20452661 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 20452720 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20452892 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20453077 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20453091 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20453276 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20453282 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20453938 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20454010 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20454220 A C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 20454446 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20454659 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20454740 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20454741 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20454911 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20455132 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20455209 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20455435 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20455460 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20455691 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20455692 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20455804 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20455828 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20456114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20456203 G C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20456275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20456296 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20456656 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 20456680 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20456875 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20456893 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20456900 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20457041 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20457065 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20457097 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20457681 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20457999 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20458130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20458378 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20459350 C A N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 3 20460258 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20460894 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 20461197 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 20461333 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 20461448 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 20461488 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 20461746 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20461855 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20461922 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20462181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20463282 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 20463822 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 20463877 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20463882 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20463929 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 20463990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20463997 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20464057 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20464117 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 20464283 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 20464396 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 20464637 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 20464663 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 20464715 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 20464827 C A Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 20464857 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 20464858 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 20465119 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 20465284 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20465540 C G N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 20465702 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 20465768 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 20465839 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20466119 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 20466125 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 20466210 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 20466222 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20466236 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 20466245 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20466340 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20466623 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 20466722 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20466725 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20466758 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20466854 G A Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 20467018 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20467129 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 20467354 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 20467396 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 20467572 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 20467604 A T N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 20467691 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 20467798 C G Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 20468703 G A N Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 7 7 2 3 2 3 20468722 A C N N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 9 5 3 3 1 3 20468734 T C N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 3 20468795 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 20468830 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 20468831 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 20468890 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 20468923 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 20468935 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 20468941 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 20469160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20469172 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20469173 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20469200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20469226 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20469233 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20469312 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 20469372 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20469404 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20469429 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20469450 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 20469497 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 20469509 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20469512 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20469567 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 20469629 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 20469947 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 20469966 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 20469968 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 20469994 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 20470106 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 20470121 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 20470181 T G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 20470342 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 20470421 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 20470464 T A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 20470467 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 20470478 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 20470558 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20470559 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20470740 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20470903 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 20470935 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 20470953 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 20470960 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 20471023 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 20471076 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20471277 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20471295 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 20471298 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 20471401 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20471593 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20471656 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20471659 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20471950 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 20472096 T A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 20472123 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 20472160 T C Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 20473006 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20475006 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20475100 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 20475109 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 20475116 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20475120 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20475338 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20475421 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 20475431 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 20475485 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20475575 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20475602 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20475613 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20475640 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 20475660 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20475665 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20475703 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20475710 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20475753 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 20475885 G T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 20475902 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 20475909 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 20475937 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 20476292 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 20476316 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 20476320 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 20476407 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20476456 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 20476483 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 20476500 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 20476519 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20476527 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20476535 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20476551 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20476564 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 20476671 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 20476757 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20476802 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 20476806 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 20476885 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20476906 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 20476957 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20476965 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 20477032 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20477035 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20477106 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20477200 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20477217 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20477239 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20477262 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 20477558 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 20477569 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 20477586 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 20477640 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 20477682 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20477686 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20477709 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 20477794 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 20477849 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20477877 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20477893 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20477904 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20477995 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20478067 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 20478148 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 20478153 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 20478244 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 20478290 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 20478334 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 20478369 A T Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 20478584 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 20478724 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 20478826 A C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 20478916 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20478924 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20479042 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 20479050 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20479402 G T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 20479526 T A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 20479609 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 20479653 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20479798 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 20479821 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20480003 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 20480073 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 20480223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20480312 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 20480431 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 20480459 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20480753 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 20480772 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 20480803 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20481022 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 20481159 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20481342 A T N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 20481467 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 20481513 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 20481791 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 20482070 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 20482171 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 20482340 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20482356 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 20482368 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 20483198 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20483289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20483947 C T N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.538461538461538 0.230769230769231 0.230769230769231 17 9 7 3 3 3 20484561 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 20484649 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20484805 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20486362 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 20486377 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20486389 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20486537 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 20486553 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20486799 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 20486809 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 20486815 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 20486930 T A Y N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 3 20487119 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 20487613 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 20487646 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 20487648 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 20487680 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 20487705 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 20487758 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20487793 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 20487845 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20487866 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 20488031 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20488208 T C N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 3 20488280 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 20488295 G A N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 20488322 C T Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 20488373 A C N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 20488398 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20488790 A G Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 20488818 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 20488821 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 20489079 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20489121 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20489122 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20489248 C G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 20489447 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20489478 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20489540 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 20489545 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 20489563 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 20489626 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 20489639 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 20489710 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 20489949 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 20490147 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 20490175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20490235 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20490239 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 20490291 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 20490511 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20490591 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20490592 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20490709 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 20490865 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20490992 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 20490997 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20491067 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 20491181 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 20491235 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 20491279 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20491323 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20491381 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 20491393 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 20491481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20491539 T A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 20492489 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20496068 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20496280 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20496617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20498498 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20498505 G C Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 20498895 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20499100 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20499546 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20499924 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20500988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20502400 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20502829 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20503422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20504563 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20505380 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20505642 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 20505674 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 20505817 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 20505886 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 20506029 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20506619 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20506902 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20507021 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20507205 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 20507369 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20507577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20508470 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 20508572 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 20508620 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 20508673 A T N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 20508835 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 20508989 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 20509155 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 20509295 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 20509337 G C Y N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 20509338 C T Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 20509861 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 20510257 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20510604 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20510692 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20510890 C T N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 15 13 1 13 0 3 20511364 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20511842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20512225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20512246 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20512540 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 20512575 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20512753 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20512820 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 20513126 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 20513406 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 20513487 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20513793 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20514108 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20514118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20514321 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20515524 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20515543 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 20515829 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20523102 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20523517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20523930 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 20524099 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 20524208 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 20524424 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20524867 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20525438 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20525599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20525627 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 20525725 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20525769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20525889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20526106 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 20526195 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20526396 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 20526406 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20526447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20526502 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20527140 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20527216 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20527549 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20528642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20529941 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20530234 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20530659 A G Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 20538490 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20538570 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20539671 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20539702 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20540069 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20540419 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20540679 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20540906 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20542400 A G Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 20542805 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 20545646 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20545751 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20546316 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20547985 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20548464 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20548585 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20550205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20550544 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20550959 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20550975 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20552576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20552933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20557148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20557602 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 20557771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20560553 C A Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20560607 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20560773 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20561333 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20561368 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20561708 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20561785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20561840 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 20562136 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 20562229 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20562285 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 20562348 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20562375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20562433 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 20562822 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 20562847 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 20562898 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 20563114 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20563217 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 20563569 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20563573 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20563625 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20563651 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20563746 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20563818 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20563998 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20564147 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20564219 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20564228 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20564312 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 20564394 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20564557 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20564591 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20564757 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20564781 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20564903 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20565037 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20565083 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 20565258 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20565306 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20565333 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20565353 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20565374 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20565401 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20565428 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20565429 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 20565450 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20565477 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20565534 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 20565554 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 20565613 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 20565767 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20566289 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 20566322 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20566342 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20566445 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20566459 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20566473 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20566510 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20566564 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20566721 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 20566742 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 20566762 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 20566795 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 20566875 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 20566880 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20567023 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20567128 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 20567149 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20567169 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20567238 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20567246 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20567249 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20567370 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20567476 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 20567477 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 20567533 G C N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 20567539 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 20567623 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 20567630 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 20568697 G T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 20568745 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 20568759 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20568834 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20568902 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 20569034 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20569048 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20569198 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20569354 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 20569405 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 20569669 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20569741 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 20569766 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20569771 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20569778 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 20569909 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20569998 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20570025 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20570071 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20570075 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20570125 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20570126 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20570408 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20570434 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20570628 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20570632 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20570667 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20570705 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20570728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20570753 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20570992 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20571043 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 20571074 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20571091 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20571165 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20571182 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20571213 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20571227 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20571397 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20571420 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20571615 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20571829 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20571836 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 20571878 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 20571904 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 20571913 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 20572030 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20572044 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20572058 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20572131 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 20572150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20572331 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20572382 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 20572403 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20572632 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 20572661 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20572772 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20572793 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20572961 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20573005 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20573021 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20573027 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20573131 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20573137 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20573204 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20573409 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20573581 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20573627 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20574297 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 20574448 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20575372 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20575431 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 20575533 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20575727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20575800 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20575814 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20575856 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20575860 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20576121 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20576156 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20576231 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 20576486 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 20576499 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20576557 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20576759 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20576800 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 20576846 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 20576885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20576996 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20577004 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20577061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20577184 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 20577271 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20577345 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20577443 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20577454 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20577540 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 20577567 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20577577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20577650 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 20577703 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20577719 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20577737 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20577830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20577837 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20577895 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 20577987 C T N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 3 20578102 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 20578126 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 20578338 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20578414 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 20578520 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20578613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20578615 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20578706 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20578850 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20578860 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20578886 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 20579191 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20579254 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20579589 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20580166 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20580529 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20583059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20585797 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20586096 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20586206 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20586267 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20586867 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 20594346 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20594416 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20594668 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20594712 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20595187 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20595314 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20595399 T C N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 20595409 A G N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 20595427 T G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 20595458 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20595525 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20595562 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20595575 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20595743 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20595853 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20595874 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20595908 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20595962 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 20596076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20596176 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20596613 A C N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 20596668 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20597004 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 20597761 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 20597785 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20598006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20598086 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 20598091 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 20598154 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20598213 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 20598373 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 20598439 T A Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 20598507 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20598658 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20598686 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20598698 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 20598700 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 20598726 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 20598739 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 20598751 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 20598811 G T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 20598844 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 20598849 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 20598905 A T Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 20598935 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 20598970 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20599100 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 20599156 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 20599180 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20599192 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 20599204 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20599275 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20599292 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20599332 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20599368 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20599373 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20599473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20599485 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20599611 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20599660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20599880 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20599970 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 20600021 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 20600048 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20600075 G C Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 20600099 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20600135 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 20600176 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 20600229 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20600247 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20600324 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 20600349 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 20600450 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20600454 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 20600495 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 20600553 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 20600572 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 20600655 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20600673 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20600848 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20601037 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20601072 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 20601192 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20601199 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20601204 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20601293 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20601371 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 20601386 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 20601428 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20601440 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20601458 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20601512 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20601567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20601586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20601591 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 20601618 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 20601700 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20601711 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20601720 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20601769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20601851 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20601925 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20602033 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20602057 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20602094 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20602132 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 20602141 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20602174 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20602279 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20602314 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20602356 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20602455 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20602489 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 20602510 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20602562 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 20602656 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 20602821 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20603279 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20603461 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 20603557 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20603567 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 20603648 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20603965 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 20604235 T G Y N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 20604254 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 20604274 G A Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 3 20604514 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 20604541 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20604720 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20604849 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20604960 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 20605138 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20605139 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20605278 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20605393 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 20605499 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 20605505 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 20605513 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20605606 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 20605663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20605820 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 20605877 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20605893 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 20606318 A T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 20606409 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 20607485 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 20607715 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20607750 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20607802 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 20607807 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20607827 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20607902 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 20608002 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20608014 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20608210 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 20608258 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20608435 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 20608448 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 20608887 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20608995 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 20609090 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 20609147 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20609165 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 20609273 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 20609539 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20609769 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 20609833 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 20610665 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 20610691 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20610722 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 20610733 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 20610849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20610876 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20611033 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 20611223 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 20611294 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 20611309 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 20611357 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 20611386 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 20611588 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 20611603 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 20611937 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 20611958 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 20611983 C G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 20612046 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 20612061 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 20612069 G T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 20612082 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 20612103 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 20612124 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 20612309 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 20612501 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 20612509 G A N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 20612531 G C N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 20612607 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 20612612 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 20612634 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 20612653 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 20612705 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 20612889 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 20612937 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 20613003 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 20613155 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20613199 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 20613213 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 20613238 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 20613340 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 20613370 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 20613436 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 20613575 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 20613639 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 20613989 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 20614004 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 20614039 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 20614071 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 20614078 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 20614122 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 20614420 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20614425 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20614491 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 20614494 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 20614502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20614563 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 20614693 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 20614822 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20614847 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 20614854 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 20614998 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20615324 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20615694 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20615857 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20616095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20616204 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20616444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20616950 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20617043 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20617072 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20617146 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20617159 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20617883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20618136 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 20618596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20618795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20618878 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20618926 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20619027 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20619040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20619174 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20619840 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 20619862 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20619954 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 20620071 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 20620248 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 20620251 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 20620270 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 20620307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20620371 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 20620396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20620506 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20621264 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 20621428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20622280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20622332 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 20622394 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 20622549 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 20622642 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20622683 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20622686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20622761 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 20622994 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 20623354 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 20623408 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 20623525 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 20623542 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 20623721 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 20623791 G T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 20623981 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20624027 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20624031 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20624119 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20624138 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 20624181 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 20624265 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 20624342 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 20624363 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 20625374 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20626285 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20627031 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 20627139 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20627152 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20627169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20627342 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20627450 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20627639 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20627711 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20627757 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20627841 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20627902 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20628052 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 20628054 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 20628126 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 20628216 T A N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 20628238 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 20628370 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20628406 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20628424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20628640 T A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 20628679 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20628690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20628758 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20628772 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 20628789 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20628959 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20629320 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20629380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20629577 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 20629613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20629769 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20629823 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20630034 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20630080 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20630187 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20630251 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20630284 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20630610 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 20630975 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20631012 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20631313 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 20631421 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20631575 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20631588 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 20631919 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20632023 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20632182 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 20632214 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 20632257 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 20632303 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 20632306 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20632324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20632338 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 20632462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20632622 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 20632823 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 20632971 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20633041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20633605 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20633625 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 20634872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20635342 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 20635364 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20635678 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20635797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20635882 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20636048 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20636072 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20636076 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20636445 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 20636899 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20637108 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20637163 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20637214 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20637770 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20638148 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 20638219 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20638404 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20638416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20638682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20638803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20638937 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20647779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20648039 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20648075 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 20648362 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20648444 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20649054 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20649083 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 20649276 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 20649421 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20649524 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 20649545 T G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 20649714 T C Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 20649842 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20649994 A C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 20650033 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20650592 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20650623 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20650632 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20650722 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20650872 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20651112 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20651250 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20651258 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20651305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20651379 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20651790 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20651978 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20652414 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 20652436 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20652452 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20653034 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20653058 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 20653067 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20653121 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20653280 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20653355 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20653448 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 20653732 A T Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 20653793 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20653951 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 20654059 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20654176 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20654291 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 20654455 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20654532 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20655117 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20655130 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20655783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20655831 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 20655942 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20656278 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20656309 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20656431 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 20656556 T C N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 20656685 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20656786 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 20657111 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20657173 A G N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 3 20657188 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 20657328 T C N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 3 20657461 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20657575 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20657725 G T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 20657991 C G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20658099 G T Y N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 3 20658310 T C Y Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 3 20658484 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 20658492 T C Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20658599 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20658743 A C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 20658744 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 20658778 A G Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 20658784 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20658958 T C Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 20658987 T G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 20659080 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 20659224 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20659261 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20659348 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 20659402 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 20659408 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 20659490 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20659559 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20659570 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20659641 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20659750 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 20659819 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20659848 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20659887 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 20659914 G C Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 20659921 G A Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 20659991 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20660302 G A Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 20660382 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20660430 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20660471 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20660535 A C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 20660767 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 20660897 C T Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 20661135 T G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 20661137 G T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 20661260 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20661429 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 20661697 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20661919 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 20662139 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 20662322 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20662346 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20662592 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20662593 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 20662777 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20662859 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 20662887 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20662983 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20663056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20663473 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20663536 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20663568 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20663569 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20663648 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20663700 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20664034 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20664296 C A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 20664814 A C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 20664939 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20664960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20665214 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 20665412 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20665488 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20665713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20665986 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20666081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20666102 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20666360 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20666367 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20666575 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 20666762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20667049 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20667183 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20667220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20667277 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20667345 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20667551 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20667778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20667851 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 20667948 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20668018 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20668057 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20668248 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 20668408 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 20668775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20668786 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20668804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20668806 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 20669123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20669197 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 20669244 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20669300 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 20669486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20669621 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20669723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20669856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20669867 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 20669908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20670196 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 20670348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20670395 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20670575 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 20671457 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20671906 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20672026 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20672109 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20672413 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 20672621 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 20672622 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20672632 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 20672645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20672681 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20672732 A G N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 3 20672925 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 20673069 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 20673123 A T N N 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.285714285714286 10 4 5 0 2 3 20673202 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20673209 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 20673345 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20673401 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20673420 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 20673530 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 20673718 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20673765 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20673778 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20673832 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20673853 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20673869 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20673874 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20673899 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20673956 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20674063 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20674131 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 20674148 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20674243 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 20674274 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20674314 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20674317 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 20674335 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20674339 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20674417 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20674479 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20674545 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20674714 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20674764 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 20674923 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20675122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20675314 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20675390 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 20676490 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20676588 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20676594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20676732 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20676883 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20677013 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20677082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20677602 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 20677647 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 20678003 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 20678479 C T N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 3 20678692 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20678779 G T Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 20678834 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20678909 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20678980 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20679128 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20679184 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20679220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20679306 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20679406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20688734 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 20689464 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20693423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20694694 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20695760 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20695854 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20696778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20696826 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20696873 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20696986 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 20697150 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 20697203 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20697258 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20697304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20698217 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20698330 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 20698541 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20698708 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20698752 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 20709119 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20709813 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20711121 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20711467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20711764 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20712092 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 20712388 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20712392 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20712938 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20713067 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20713733 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20713756 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 20713779 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20713901 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20713918 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20713958 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 20713973 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20714018 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 20714178 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 20714543 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20715132 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 20715178 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20715512 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20716839 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20717721 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20717764 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 20717792 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 20717942 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 20717983 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 20718091 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 20718228 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 20718409 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20718977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20719240 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 20719736 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 20720436 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20720657 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20720978 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20720988 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 20721253 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20721257 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 20721316 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20721411 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20721974 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 20722023 A C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 20722065 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20722499 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20722538 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 20722634 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 20722759 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 20723064 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 20723136 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 20723396 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 20725344 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 20725553 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20725559 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 20725583 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20725626 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20725961 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 20726088 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20726103 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 20726295 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 20726340 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20726550 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 20726608 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 20726733 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20726765 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20726870 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20726935 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20726950 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20727043 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 20727047 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 20727208 G T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 20727334 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20727398 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20727447 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 20727538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20727635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20727672 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20727710 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20727740 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20727899 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20727909 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 20727950 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20727967 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20728086 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 20728153 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20728176 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 20728200 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 20728201 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 20728290 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 20728292 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 20728434 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20728702 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20728988 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 20729067 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 20729114 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 20729170 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 20729375 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20729543 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20729598 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 20729818 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20729828 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 20729953 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 20729956 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 20729968 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 20730230 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 20730486 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 20730531 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 20730609 C T N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 3 20730611 C T N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 3 20730630 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 20730649 C G N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 20730697 T G N N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 5 7 1 3 2 3 20730906 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 20731024 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 20731143 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 20731185 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 20731223 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 20731242 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20731277 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 20731387 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 20731492 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 20731494 A C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 20731503 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 20731515 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 20731577 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 20731578 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 20731610 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 20731633 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20731752 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20731908 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 20731979 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 20739277 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20739302 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20739745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20739872 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 20739913 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 20740034 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20740116 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 20740144 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20740260 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20741452 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20741852 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20741958 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20742188 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 20742212 G C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 20742218 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 20742233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20742300 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20742402 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 20742418 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 20742514 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 20742560 A G N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 20742587 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 20742666 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20752619 A G Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 20753092 T C Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 20753297 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 20753432 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 20753477 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 20753532 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20753682 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20753691 G C N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 20753841 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 20753877 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 20753915 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 20754579 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 20754756 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 20754930 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 20755136 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 20755417 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 20755578 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 20755724 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20755821 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20755833 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20755925 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 20755989 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 20756028 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 20756193 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 20756222 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 20756557 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20757464 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 20757566 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 20757621 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20757623 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20757636 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20757664 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20757700 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20757778 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 20757889 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 20758247 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20758534 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20758689 T A Y N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 20758737 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20758773 A C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 20758789 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20758842 C G Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 20758905 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20759044 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20759131 T G Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 20759250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20759256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20759480 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20759496 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 20759599 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 20759742 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 20759886 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20759916 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20759996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20760077 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20760124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20760497 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20760525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20760680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20760881 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20761017 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20761059 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 20761165 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 20761234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20761265 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20761271 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20761494 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 20761523 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20761649 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20762164 C G Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 20762664 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 20762919 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 20763051 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 20763252 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20763496 C A Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 20763551 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 20764077 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 20764365 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 20764671 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20764717 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20764882 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 20765121 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20765258 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20765325 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 20765490 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 20765527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20765549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20766420 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 20766733 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 20766785 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20767175 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 20768186 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20769372 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20770237 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20770640 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 20770781 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 20770849 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 20770987 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 20771055 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20771149 A G Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 3 20771197 A C N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 20771268 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 20771324 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 20771498 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 20771554 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20771559 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 20771781 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 20771864 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20771962 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 20772020 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 20772129 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 20772298 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 20772452 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20772584 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 20772706 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 20772837 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 20773089 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 20773140 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 20773500 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 20773638 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 20773655 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 20773798 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 20774076 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 20774078 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 20774315 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 20774752 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 20774859 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20775031 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 20775178 A C N N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.363636363636364 0.636363636363636 0 15 7 4 7 0 3 20775276 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 20775314 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 20775396 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 20775398 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 20775450 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 20775453 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 20775669 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 20776417 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20776442 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 20776573 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 20776714 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 20776751 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20776916 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 20777080 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 20777089 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 20777120 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 20777515 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 20777523 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 20778857 T G N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 3 20778935 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20779000 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 20779040 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20779097 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 20779197 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 20779262 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20779280 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 20779385 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 20779513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20779575 C G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20779696 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 20779793 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20779852 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 20779874 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 20779956 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20779961 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20780186 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20780253 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 20780310 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 20780318 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 20780620 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 20780843 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 20780903 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20780930 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 20780949 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20781077 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 20781296 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 20781330 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20781372 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 20781501 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 20781739 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 20782275 C T Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 20782370 C T Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 20782423 G A Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 20782439 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20782443 T C Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 20782467 G T Y N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 3 20782558 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 20782606 A G Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 20782690 G C Y N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 20782743 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20782755 A G Y Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 3 20782942 C T Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 20782954 T G Y N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 20783079 T C Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 20783109 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 20783114 C A Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 20783154 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20783233 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 20783246 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 20783277 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 20783313 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 20783396 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 20783487 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 20783545 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 20783610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20783657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20783749 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 20784903 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 20784906 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 20785589 A C N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 3 20785883 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20786599 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20787009 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20787594 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20787623 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20788103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20789357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20789734 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20790493 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 20790870 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20791689 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 20791790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20792285 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 3 20792295 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 20792324 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 20792384 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20792430 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20792433 C A Y N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 20792442 T C Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 20792566 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 20792589 G A Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 20792720 T A Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 20792848 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20792921 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20793178 T C Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 20793249 C G Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 20793698 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20794390 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20794497 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 20794595 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 20794625 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20794663 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 20794719 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 20794740 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 20794764 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 20795339 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 20795476 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 20795540 T G Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 20795691 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 20795809 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20795952 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20796012 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20796107 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20796131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20802406 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 20802633 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20802754 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20802838 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20802931 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20803003 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 20803069 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 20803091 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 20803215 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20803218 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 20803318 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 20803341 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 20803373 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20803413 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 20803670 T C Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 20803739 C A Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 20803802 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20803814 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 20803830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20803957 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20803966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20803977 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 20804032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20804045 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 20804075 G T Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 20804183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20804227 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20804273 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 20804329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20804341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20804362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20804443 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20804489 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 20804568 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20804709 G T Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 20804841 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 20804858 T G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 20804861 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20804886 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 20804959 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20804999 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 20805136 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 20805153 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20805166 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20805395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20805431 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20805476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20805564 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20805574 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 20806100 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 20806148 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20806352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20806473 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20806541 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20806561 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 20806665 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20807384 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20807566 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 20807658 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 20807932 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20807964 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20808051 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20808180 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20808289 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 20808407 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20808570 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20808792 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 20808811 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20809128 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20809325 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 20809457 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20809563 C A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 20809683 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 20809789 T A N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 20809834 C A Y N 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.363636363636364 0.454545454545455 0.181818181818182 13 9 4 5 2 3 20809883 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 20809968 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 20809997 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 20810012 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 20810870 A G Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 20811272 T C Y Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 3 20811511 C T Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 20812689 A G Y Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 20812781 C G Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 20812814 A C Y N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 20812865 A G Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 20812904 C G Y N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 20812906 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 20814098 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 20814261 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 20814275 G T Y N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 3 20814292 G T N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 20814304 T C N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 20814352 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 20814354 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 20814379 T C Y Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 3 20814446 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 20814467 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 20814487 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 20814498 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 20814516 A G N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 20814524 G A Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 20814558 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 20814613 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 20814819 A G N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 3 20815085 G T Y N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 3 20815086 G T Y N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 20815148 C A Y N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 3 20815362 G T Y N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 20815564 A T Y N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 20815580 A G Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 20815613 A T Y N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 20815666 G A Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 20815734 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 20815768 C T N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 20815769 A G N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 20815840 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 20815890 G A Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 20815955 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 20815983 T C N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 20816228 C T Y Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 20816367 T C N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 3 20816433 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 20816766 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 20816868 C A N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 20816900 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 20816929 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 20817035 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 20817036 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 20817049 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 20817066 A C Y N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 20817145 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 20817162 A G N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 20817163 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 20817213 G T Y N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 20817225 G T Y N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 20817252 G T N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 20817259 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 20817273 G T N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 20817320 G T N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 20817357 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 20817463 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 20817492 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 20817624 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 20817680 T C N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 20818149 C T Y Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 20818294 G A Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 20818338 C T N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 20818470 G A N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 20818696 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20818933 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 20818961 T A Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 20819404 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 20819512 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 20819626 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20819681 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20819822 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20819868 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20819891 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 20819913 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 20819966 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 20819993 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20820016 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 20820088 G T Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 20820120 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20820219 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 3 20820509 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 20820660 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 20820739 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20820788 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 20820892 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 20820968 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 20821016 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 20821041 G T Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 20821217 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 20821222 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 20821266 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20821366 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20821411 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 20821419 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20821501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20821607 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 20821650 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20821679 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20821773 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20821798 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 20822018 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 20822105 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 20822546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20822579 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 20822906 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20822948 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 20822967 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 20823029 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20823033 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 20823076 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 20823078 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 20823193 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 20823199 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 20823207 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20823259 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20823273 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 20823476 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20823500 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 20823531 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20823684 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 20823712 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20823714 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20823833 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 20823884 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20823901 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20824031 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20824060 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 20824173 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 20824192 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20824202 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 20824313 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20824459 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 20824472 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20824482 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20824525 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 20824763 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20824960 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20825009 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20825035 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20825175 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 20825198 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 20825257 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 20825259 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 20825364 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 20825466 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20825513 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 20825580 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20825633 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 20825665 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 20825693 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20825720 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20825764 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 20825790 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20825846 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20825910 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20825914 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 20825927 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 20825973 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20825995 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20826055 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20826087 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 20826138 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 20826178 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 20826364 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 20826436 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20826542 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 20826576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20826767 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 20826784 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20826822 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 20826963 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 20827145 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 20827196 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20827284 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 20827369 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20827418 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 20827542 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 20827562 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 20827871 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 20827922 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 20827946 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 20828067 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 20828102 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20828243 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 20828296 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 20828312 A T Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 20828331 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 20828332 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 20828482 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20828496 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20828557 G T Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 20828803 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 20828823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20828865 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 20828974 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20829213 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 20829362 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 20829373 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20829419 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 20829513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20829544 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 20829557 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 20829649 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 20829663 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 20829798 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 20829850 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 20829927 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 20829932 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 20830016 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 20830035 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 20830191 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 20830207 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 20830332 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 20830451 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 20830520 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 20830627 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 20830772 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 20830934 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 20830957 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 20831118 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 20831177 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 20831533 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 20831534 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 20832244 A C Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 20832500 C G Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 20832517 C T Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 20832545 T C Y Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 20832856 G C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 20833102 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 20833480 T A Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 20834139 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 20834950 C T Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 20835023 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 20835026 T A N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 20835432 C T Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 20835480 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 20835522 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 20835530 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 20836017 G T Y N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 20836136 G T Y N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 3 20836960 T A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 20837195 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20837736 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 20837888 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 20837928 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20838063 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 20838165 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 20838793 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 20838871 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 20838916 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 20838961 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 20838965 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 20839072 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 20839315 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 20839362 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 20839378 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 20839672 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 20839713 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 20839741 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20839762 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20839789 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 20840036 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 20840274 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 20840540 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 20841505 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20841649 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 20842002 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 20842362 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 20842738 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20842866 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 20842898 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 20843000 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20843055 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 20843230 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 20843239 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 20843303 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 20843333 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 20843369 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20843665 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20843673 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 20843805 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 20843837 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 20843847 A T Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20843907 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20843929 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20844051 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20844065 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20844202 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20844234 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 20844353 T G N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 20844414 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20844441 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 20844519 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 20844561 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 20844578 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 20844635 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 20844670 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 20844674 G T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 20844704 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 20844865 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 20844874 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 20844889 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20844890 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20845045 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20845088 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20845102 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20845217 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 20845259 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20845260 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20845273 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 20845276 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20845335 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20845358 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 20845374 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 20845408 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 20845473 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 20845491 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 20845533 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 20845555 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 20845687 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20845696 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20845732 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 20845849 C G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 20846263 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20846272 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 20846401 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 20846495 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 20846519 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20846538 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20846738 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 20846845 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 20846893 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20846938 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 20847335 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 20847350 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 20847356 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 20847434 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 20847514 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 20847564 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 20847645 A T N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 20847711 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 20847737 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 20847845 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 20848256 A C Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 20848385 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 20848631 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20848766 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 20848936 C A Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 20849019 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 20849024 A T N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 20849108 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 20849163 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20849270 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20849303 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20849340 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 20849414 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 20849705 C G N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 20849767 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 20849905 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 20849906 C G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 20849971 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 20849978 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 20850009 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 20850049 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20850073 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 20850258 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 20850269 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 20850290 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 20850310 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 20850478 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20850606 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20850638 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20850675 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20850746 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20850747 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20850790 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20850851 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20850891 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20850902 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20850949 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20851077 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 20851079 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20851141 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 20851156 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 20851222 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 20851267 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 20851268 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 20851351 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 20851463 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 20851686 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 20851757 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 20851766 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 20851874 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 20851877 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 20851938 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 20851973 C T N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 20851996 C T N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 20852028 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 20852445 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 20852497 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 20852616 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 20852653 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 20852675 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 20852742 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20852764 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 20852789 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20852809 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20852811 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20852825 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20852880 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20852891 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20852957 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 20852971 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 20853076 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20853130 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 20853144 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20853207 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20853230 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 20853291 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 20853318 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20853324 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20853376 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 20853415 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 20853605 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 20853606 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 20853651 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 20853721 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20853763 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 20854058 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 20854351 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20854427 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 20854494 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20854681 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 20854752 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 20854770 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 20854807 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 20854821 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 20854930 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 20855074 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 20855111 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 20855131 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20855200 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20855217 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20855237 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 20855243 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 20855256 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 20855343 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 20855358 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 20855369 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 20855412 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 20855458 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 20855471 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 20855474 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 20855483 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 20855493 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 20855509 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 20855550 G C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 20855703 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 20855782 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20855800 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20855816 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20855826 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 20855866 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20855873 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20855994 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20856153 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20856213 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20856404 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 20856418 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 20856546 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 20856573 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 20856627 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 20856807 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20856824 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 20856855 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 20856909 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20856933 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 20856946 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 20856995 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 20857011 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 20857096 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 20857129 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20857508 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 20857646 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 20857679 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 20857773 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 20857786 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 20857849 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 20858045 G T Y N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 20858174 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 20858227 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 20858299 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 20858370 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 20858507 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 20858540 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 20858577 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 20858614 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 20858749 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20858760 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 20858771 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20858981 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 20858982 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 20859052 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20859137 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 20859207 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 20859240 A T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 20859503 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 20859514 G A N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 3 20859525 C A N N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.166666666666667 0.583333333333333 0.25 11 13 2 7 3 3 20859536 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 20859538 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 20859861 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 20859947 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 20860046 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 20860083 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 20860085 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 20860196 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 20860343 C A Y N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 20860440 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 20860451 G T N N 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 6 6 1 4 1 3 20860561 C T Y Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 3 20860592 T C Y Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 20860660 A C Y N 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 10 6 4 2 2 3 20860688 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 20860939 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20861014 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 20861027 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20861044 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 20861098 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 20861194 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20861202 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20861305 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 20861329 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20861437 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 20861448 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20861464 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 20861571 T G N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 20861620 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 20861787 C G N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 20861791 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 20861890 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 20862082 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20862095 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20862111 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 20862147 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 20862177 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20862247 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 20862402 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20862433 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 20862557 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 20862561 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20862720 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 20862876 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 20862963 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 20863049 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20863270 G C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 20863333 A T N N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.25 0.583333333333333 0.166666666666667 13 11 3 7 2 3 20863343 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 20863571 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20863596 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 20863597 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 20863631 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 20863723 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 20863852 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 20864008 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 20864044 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 20864063 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 20864120 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 20864153 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 20864273 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 20864302 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 20864378 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 20864479 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 20864552 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 20864622 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 20864635 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 20864674 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 20864740 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 20864781 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 20864798 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 20864807 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 20864958 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 20864990 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 20865042 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 20865059 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 20865151 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 20865164 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 20865260 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 3 20865283 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 20865416 A G Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 20865432 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 20865457 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 20865479 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20865492 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 20865529 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 20865560 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 20865573 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 20865616 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 20865634 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 20865648 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.0526315789473684 0.736842105263158 0.210526315789474 16 22 1 14 4 3 20865651 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 20865674 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 20865738 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 20865774 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 20865790 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 20865807 C T Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 20865837 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 20865841 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 20865937 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 20865994 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 20866044 T G N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 20866058 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 20866091 T A N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 20866168 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 20866201 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20866209 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 20866259 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20866432 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 20866770 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 20867188 C G Y N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 20867343 A G Y Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 6 6 1 4 1 3 20867419 T C Y Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 7 9 1 5 2 3 20867632 A T Y N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 20867953 G T Y N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.2 0.8 0 6 4 1 4 0 3 20868428 T C Y Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 3 20868512 T G Y N 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.4 0 0.6 4 6 2 0 3 3 20868573 G A Y Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 3 20868715 G A Y Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 3 20868795 T G Y N 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 5 9 2 1 4 3 20868897 T A N N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 20869338 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 20869377 A G Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 20869468 T C Y Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 5 15 2 1 7 3 20869541 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 20869609 G A N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 20869629 C A N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 20869651 T C N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 20869711 T C Y Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 20869861 C A Y N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 3 20869896 G A Y Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 3 20869998 T C Y Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 5 11 2 1 5 3 20869999 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 20870717 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 20870754 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 20871104 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 20871105 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 20871186 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 20871212 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 20871314 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 20871392 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 20871731 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 20871932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20871979 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 20872130 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 20872145 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 20872288 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 20872439 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 20872513 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 20872605 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 20872618 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 20872630 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 20872666 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 20872668 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 20872822 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 20873034 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 20873037 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20873048 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 20873208 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 3 20873580 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 20873877 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 20873897 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 20874043 C A N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 3 20874052 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 20874401 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 20874403 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 20874544 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 20874564 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 20874570 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 20874662 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 20874698 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 20874944 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 20874948 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 20875441 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 20875456 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 20875467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20875473 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 20875497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20875511 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 20875616 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 20876001 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 20876120 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20876128 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 20876166 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20876253 G C N N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 3 20876740 C T Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 20876914 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 20878466 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 20878974 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 20878984 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20879003 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 20879012 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 20879015 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 20879043 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 20879120 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 20879329 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 20879404 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 20879414 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 20879567 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 20879646 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 20879723 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 20879966 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 20879971 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 20880003 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 20880111 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 20880126 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 20880265 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 20880294 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 20880308 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 20880341 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 20880361 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 20880479 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 20880519 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 20880552 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 20880626 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 20880663 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 20880710 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 20880727 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 20880743 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 20880776 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 20880801 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 20880813 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20880832 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 20880862 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 20880932 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 20880933 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 20880996 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 20881037 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 20881201 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 20881273 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 20881297 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 20881314 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 20881413 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 20881429 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 20881436 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 20881466 C G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 20881503 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 20881518 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 20881604 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 20882412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20882768 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20883029 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20883250 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 20883454 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20883525 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 20883573 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20883580 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 20883992 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 20883994 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 20884059 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 20884068 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 20884096 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 20884164 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 20884360 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 20884445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20884465 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20884676 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20884875 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20885213 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20885553 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20886115 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20886676 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 20886924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20888719 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 20889413 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20891770 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20892468 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 20893161 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 20893788 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20895495 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 20896142 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20896699 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 20896891 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 20896963 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 20897449 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 20897590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20898113 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 20898201 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 20898596 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 20900360 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 20906770 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 20906800 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 20906825 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 20906866 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 20906964 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 20907279 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20907603 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20907990 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 20908454 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 20909508 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20909551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20910385 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 20910560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20910995 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 20911285 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 20911346 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 20911722 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20911872 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20912276 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 20917544 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 20918538 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20920871 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 20921240 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20921548 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20922012 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20922067 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20922615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20924292 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20925227 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20925489 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20926341 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20927129 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20927162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20927549 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20927650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20928460 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20928952 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20929598 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20929933 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20930996 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 20931184 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 20931197 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20931504 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20931520 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20932244 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20933979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20934057 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 20934125 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20934158 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20934168 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20934204 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20934241 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20934257 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 20934328 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20934376 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20934377 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20934397 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20934537 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20934570 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20934655 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20934660 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20934685 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20934702 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20934734 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20934787 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20934838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20934909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20934972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20935049 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20935189 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20935306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20935373 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 20935390 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20935420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20935427 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20935524 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20935638 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20935851 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 20935892 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 20935997 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20936070 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20936191 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 20936235 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 20936298 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 20936322 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 20936326 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 20936335 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 20936398 G C Y N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 20936770 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 20936805 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 20936885 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20936962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20937016 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20937031 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20937148 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20937157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20937166 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20937229 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20937271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20937312 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20937338 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20937368 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20937383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20937392 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20937493 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20937497 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20937504 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20937600 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20937604 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20937623 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20937686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20937791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20937825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20937839 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20938164 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 20938197 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20938308 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 20938316 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 20938366 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 20938394 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 20938428 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20938454 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20938465 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20938467 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20938547 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20938569 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20938668 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20938678 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20938696 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20938713 T A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 20938734 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20938743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20938801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20938873 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20939112 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 20939230 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20940458 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 20940499 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20940807 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 20940841 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 20940951 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 20940995 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 20941059 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 20941085 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 20941173 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 20941215 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 20941230 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 20941270 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 20941292 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 20941294 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 20941360 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 20941523 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 20941879 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 20941963 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20942093 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 20942153 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20942169 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20942240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20942263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20942405 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20942468 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20942482 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20942488 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20942521 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20942618 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20942635 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 20942697 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20942698 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20942749 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20942750 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20942778 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20942779 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20942822 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 20942886 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20942903 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20942959 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20943004 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20943098 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20943282 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20943390 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20943413 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20943438 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20943496 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20943511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20943554 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20943566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20943672 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20943772 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20944329 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 20944431 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 20945335 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 20945336 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 20945369 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 20945489 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20945523 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20945584 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20945690 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 20945784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20945980 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20946122 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20946174 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20946232 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20946245 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20946472 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20946492 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 20946511 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20946555 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20946556 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20946595 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20946655 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20946656 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20946670 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20946733 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20946967 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20947007 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20947122 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20947130 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 20947149 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20947160 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20947167 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20947223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20947264 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 20947317 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20947358 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20947429 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20947468 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20947524 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20947989 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20947997 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20948011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20948052 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20948146 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20948168 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20948206 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20948216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20948278 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20948355 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 20953398 A T N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 20953418 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20953467 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20953555 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20953651 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20953736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20953846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20953855 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20953868 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20953993 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20954008 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20954015 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20954047 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20954143 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 20954253 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20954270 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 20954385 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20954491 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20954515 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20954791 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 20954815 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 20954876 A T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 20954946 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 20954964 G A Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 20954986 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 20955024 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 20955116 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 20955117 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20955207 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20955229 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20955245 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 20955265 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20955266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20955295 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20955318 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 20955356 C G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 20961385 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 20961418 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 20961928 C T N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 20961957 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 20961969 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 20962030 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 20962048 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 20962053 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20965790 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 20965824 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20965881 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 20965980 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20966008 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 20966040 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20966178 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 20966193 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20966263 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 20966376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20966465 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 20966544 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 20966553 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20966749 T A N N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 20967198 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 20967251 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 20967273 T A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 20967536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20967665 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20968429 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 20969011 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20969905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20969911 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 20969943 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 20970086 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20970676 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 20970699 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20971096 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20971199 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20971200 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 20971466 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20971536 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20971848 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20971956 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20972490 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20973065 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20973324 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20973421 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20973497 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 20973731 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20973854 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20973888 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20973945 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 20973946 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 20974101 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20974129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20974336 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 20974510 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 20974552 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 20974553 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 20974703 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20974845 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20975345 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20975418 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20975616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20975668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20975741 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20975845 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20975932 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20975997 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 20976233 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 20976287 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 20976694 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 20976869 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 20976886 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 20976949 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 20976955 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 20977088 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 20977184 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 20977208 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 20977213 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20977258 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 20977277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20977279 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 20977356 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20977490 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 20977493 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 20977717 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 20977728 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 20977811 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20977937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20978000 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20978182 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 20978309 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 20978351 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20978427 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20978561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20978590 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 20978601 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20978681 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20978686 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20978695 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 20978765 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20978930 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20978940 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20979008 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20979085 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 20979481 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20979729 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20979804 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20980188 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20980392 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20980484 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 20980500 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20980549 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 20980876 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20980923 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20980962 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 20981014 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20981025 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20981069 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20981093 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 20981104 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 20981184 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 20981190 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 20981255 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 20981315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20981476 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20981490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20981530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20981662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20981742 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 20981901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20981961 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 20982063 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 20982112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20982254 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20982284 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 20982303 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 20982470 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20982476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20982487 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 20982517 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 20982521 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 20982618 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 20982668 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20982833 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 20982892 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20982933 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 20982942 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20983030 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 20983075 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20983094 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20983097 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 20983184 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 20983185 A C N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 20983203 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 20983413 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 20983494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20983578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20983713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20983838 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 20983842 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 20983890 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20984195 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 20984247 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 20984417 G T N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 20984642 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20984683 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20984730 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20984931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20985110 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20985144 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20985156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20985258 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 20985429 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 20985455 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20985535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20985589 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 20985846 A T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 20985992 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 20986041 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20986052 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 20986085 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 20986458 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 20986469 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 20986891 A C Y N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 20986975 T C Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 3 20987041 G A Y Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.454545454545455 0.181818181818182 0.363636363636364 12 10 5 2 4 3 20987083 A C Y N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 20987159 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 20987260 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 20987281 C T N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 3 20987339 T A Y N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 3 20987467 C A Y N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 20987620 C G Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 20987628 T C Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 20987691 G C Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 20987743 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 20987946 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 20988063 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 20988067 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 20988244 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 20988272 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 20988578 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20988667 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 20988742 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20989483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20989613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20989766 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 20990794 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 20990836 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20990986 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 20991045 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 20991190 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 20991202 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 20991211 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 20991300 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 20991330 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 20991378 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 20991405 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20991414 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 20991532 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 20991722 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 20991743 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 20991799 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 20991813 T A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 20992154 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20992253 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20992765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20993656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20993912 C T N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 3 20994202 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20994259 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 20994633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20994962 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20995077 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20995211 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20995328 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20995371 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20995417 G T Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 20995499 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20995810 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20995897 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20995945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20996258 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 20996590 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 20996871 A G Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 20997002 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 20997138 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 20997285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20997334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20997404 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20997406 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20997644 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 20997760 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20997863 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 20998014 G T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 20998054 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20998062 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20998250 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 20998345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20998444 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 20998550 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20998677 A C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 20998802 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20998853 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 20998954 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20999163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20999293 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20999540 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 20999777 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 20999800 G A N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 3 21000343 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21000443 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21000450 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21000467 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21000571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21000624 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21000692 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21000864 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 21001171 A C N N 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.714285714285714 0.285714285714286 5 9 0 5 2 3 21001402 A C N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 21001519 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21001571 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 21001651 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21001679 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 21002013 T A N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 3 21002057 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 21002318 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 21002599 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 21002995 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 21003182 A G N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.181818181818182 0.727272727272727 0.0909090909090909 12 10 2 8 1 3 21003448 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 21003618 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 21003636 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 21003689 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 21004038 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21004135 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 21004223 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 21004232 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 21004332 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 21004400 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 21004409 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 21004438 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 21004577 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 21004589 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 21004622 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21004658 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 3 21004878 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 21004919 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 21004958 G A N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 21004964 C G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 21005090 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 21005194 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 21005208 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21005276 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 21005409 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21005422 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 21005435 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 21005445 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 21005586 A C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 21005632 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 21005809 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 21005822 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 21005862 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 21005894 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 21005912 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 21005974 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 21005978 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21006049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21006054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21006084 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 21006105 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 21006147 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 21006202 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 21006326 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 21006335 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21006364 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 21006401 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21006518 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 21006613 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 21006739 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 21006779 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 21006892 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 21006965 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 21006968 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 21007098 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 21007347 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 21007372 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 21007426 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 21007570 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 21007645 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 21007680 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 21007950 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 21008078 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 21008186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21008409 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 21008466 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 21008562 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 21008584 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 21008712 C T Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 21008901 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 21009128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21009163 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 21009263 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21009322 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21009445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21009458 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 21009459 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 21009582 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 21009755 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21009776 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21009813 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 21009893 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 21009920 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 21009964 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 21009978 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 21009991 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 21010030 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 21010158 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 21010179 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21010680 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 21010723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21010733 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 21010743 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21010746 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 21010859 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21010906 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 21010998 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 21011083 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 21011126 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 21011232 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 21011240 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 21011327 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 21011365 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 21011371 T A Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 21011425 T C N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 3 21011483 A G N Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 3 21011635 C G N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 3 21011667 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 21011684 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 21011700 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 21011702 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 21011764 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21011804 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 21011849 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 21012041 C A Y N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 21012107 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 21012147 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 21012427 C G Y N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 3 21012456 A G N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 3 21012484 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 3 21012487 T C Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 3 21012535 T G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 21012544 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 21012641 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 21012681 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 21012818 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 21012911 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.588235294117647 0.117647058823529 0.294117647058824 22 12 10 2 5 3 21012956 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5625 0.125 0.3125 20 12 9 2 5 3 21013039 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 3 21013079 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 21013127 G T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 21013164 G T N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 21013322 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 21013484 C T N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 21013488 G A N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 21013509 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 18 10 8 2 4 3 21013542 C T N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.153846153846154 0.0769230769230769 0.769230769230769 5 21 2 1 10 3 21013545 G A N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 21013709 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 21013772 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 21013978 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 21014014 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 21014327 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 21014340 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 21014524 A C N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 21015028 A T N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 3 21015249 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 21015515 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21015858 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 21016122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21016872 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21017082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21017133 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 21017228 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 21017250 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 21017382 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 21017582 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 21017796 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 21017826 G C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 21017928 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 21018051 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21018063 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 21018107 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21018123 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 21018186 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 21018212 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 21018264 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 21018291 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21018313 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 21018504 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21018529 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 21018530 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 21018608 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 21018652 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21018738 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21018753 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21018760 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21018787 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 21018892 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21018895 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21018933 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21018964 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 21018974 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 21019006 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21019039 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 21019052 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21019107 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 21019128 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 21019197 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 21019214 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 21019219 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 21019227 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21019290 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 21019326 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 21019394 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 21019462 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21019512 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 21019516 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 21019561 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21019593 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21019622 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21019638 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 21019682 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21019801 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 21019854 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 21019872 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 21019877 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 21020013 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21020028 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 21020052 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21020063 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21020076 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21020206 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21020390 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21020422 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 21020486 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 21020533 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 21020628 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21020705 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 21020710 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 21020720 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21020735 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21020813 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21021107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21021117 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21021142 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21021235 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 21021305 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 21021326 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 21021331 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21021346 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21021371 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 21023064 C A N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 21023071 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 3 21023203 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 21023210 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21023311 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21023316 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21023339 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21023450 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 21023456 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 21023543 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21023557 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21023563 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21023618 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 21023678 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 21023812 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 21023827 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21023930 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 21024015 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 21024040 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21024048 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 21024071 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 21024078 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21024096 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21024112 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 21024122 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21024124 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21024252 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21024253 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21024270 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21024278 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21024476 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 21024512 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 21024517 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 21024576 C A N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0 0.75 0.25 9 15 0 9 3 3 21024637 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 21024701 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 21024725 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21024729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21024736 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21024752 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21024802 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 21024835 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21024863 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21024885 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 21024922 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 21024958 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 21024997 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21025020 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21025029 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21025050 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 21025073 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21025170 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 21025236 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 21025277 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21025404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21025418 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21025475 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21025972 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 21026001 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 21026219 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21026742 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 21026843 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 21026844 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 21026919 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21026925 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21026971 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 21027062 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21027066 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 21027082 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 21027414 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 21027687 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 21027697 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 21028171 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 21028326 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 21028331 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 21028349 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21028613 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21028916 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 21029260 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 21029341 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21029347 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 21029398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21029438 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21029520 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 21031242 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 21033207 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 21035590 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 21035959 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21039070 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21040416 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21040456 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 21040886 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21041123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21046497 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21048782 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 21050492 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21051459 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 21054576 A G N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 21054711 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 21055852 A C N N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 21058996 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 21059989 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21062049 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 21062656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21065086 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 21065103 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 21067200 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 21068723 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 21068860 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 21071708 A G Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 21073088 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21073429 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 21074081 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21077302 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21078000 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21078144 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21079102 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 21079528 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 21080015 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 21080075 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21081179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21082557 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21082719 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 21087502 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21088028 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 21088683 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 21098974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21100636 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21101503 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21101964 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 21104283 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21104762 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21104780 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 21106867 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21107204 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21107703 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 21108494 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 21110010 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21111073 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 21111786 G T Y N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 21111827 C A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 21111850 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21112395 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 21113577 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 21113732 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 21113759 A C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 21114114 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21114992 T G Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 21115716 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21115941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21116298 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 21119201 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 21119429 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21119679 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21120104 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 21120210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21120842 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 21121633 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21125770 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21130466 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21132576 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 21133978 T A Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 21134856 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21135892 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 21138801 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21139132 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21139395 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 21140184 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 21140198 T G N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 21140791 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21141104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21143819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21144312 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 21150735 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 21150975 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21151620 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21153299 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21156593 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21157654 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 21159722 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 21159901 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21163295 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 21165710 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21165857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21165885 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 21166608 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 21167385 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21170382 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21172157 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21172570 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 21172914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21173364 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 21173982 C T N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 21174918 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21175288 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 21176564 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21176591 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21177534 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 21177744 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21177832 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 21178777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21179947 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 21180400 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 21180797 C A Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 21181054 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 21181449 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 21182696 G A N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.307692307692308 0.615384615384615 0.0769230769230769 16 10 4 8 1 3 21183337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21183515 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 21183584 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 21183689 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21184692 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21184942 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 21185162 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 21185164 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 21186200 A T N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 21186235 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 21187170 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 21190538 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21191103 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 21191115 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 21191135 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 21191224 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 21191232 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 21191249 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 21191335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21191408 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 21191667 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 21191902 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 21193103 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 21193358 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 21193404 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 21193931 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21194243 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 21194798 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21194994 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21195554 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21195903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21195949 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 21196966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21197872 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21198575 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21199521 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21199913 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21200137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21200232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21200251 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21201094 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21202868 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21203798 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21204177 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21205287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21205485 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21206926 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21206927 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21207424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21207542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21207979 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21208683 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21209406 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 21209802 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21211369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21212800 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21213342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21213343 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21213426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21215899 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21216042 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 21223719 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 21223788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21223852 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 21223896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21224899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21225718 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21226616 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21226905 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21227152 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 21227513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21229090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21229663 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 21230331 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21232189 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21232383 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21232757 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21233006 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 21234353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21235051 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21235069 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 21235074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21235138 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21235206 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21235634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21236207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21236289 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 21236720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21237172 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21237432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21237512 A G Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 21240958 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21241301 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21243535 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21243919 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 21244268 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 21244552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21244665 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21245643 T C Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 21246532 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 21246898 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21247550 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21250280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21250776 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 21251379 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21251451 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 21252567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21256095 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 21256842 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21257154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21257748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21258293 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21258452 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 21258697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21258747 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21258952 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21259462 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21259537 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21259541 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21259672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21259675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21259866 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21259873 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21259989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21260221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21260225 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21260291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21260302 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 21260400 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21260647 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 21260662 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 21261078 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21261102 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21261260 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21261404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21261418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21261595 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21261703 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21262242 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 21262338 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21262533 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21262549 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 21262898 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21265511 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 21265808 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21267063 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21267301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21268310 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 21269101 G C Y N 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 8 6 1 6 0 3 21269129 C T Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 21269157 A G Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 21270150 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21272315 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21272483 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 21272581 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21272769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21272861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21272927 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 21272938 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 21273060 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 21273132 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 21273169 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 21273183 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 21273214 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 21273286 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 21273327 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 21273463 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 21273700 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 21273780 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 21273849 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 21273858 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 21274082 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21274112 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 21274135 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 21274147 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 21274254 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 21274269 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 21274312 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 21274379 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 21274547 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 21274586 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 21274602 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 21274603 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 21274781 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21275045 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21275252 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21275265 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21275278 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21275407 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21275520 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 21275651 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21275724 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21275778 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21275793 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 21275803 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21276229 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21276412 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 21276421 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21276499 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21276550 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21276618 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21276635 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21276724 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21276994 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21277078 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21277135 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21277194 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21277482 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 21277557 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 21277765 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21277773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21277806 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 21277898 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21278129 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21278153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21278184 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21278221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21278250 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 21278359 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21278365 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21278396 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 21278650 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21278654 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21279075 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 21279129 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21279230 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21279315 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21279420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21279428 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 21279473 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21279529 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21279546 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 21279614 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21279691 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21279693 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 21280146 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 21280587 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 21280644 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 21280720 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 21280877 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 21281550 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 21281581 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 21281917 A G Y Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 21288575 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 21288661 C A Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 21288725 C T Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 21291738 C T Y Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 21291974 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 21292096 G T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 21292231 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 21292422 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 21292678 G C Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 21292709 C T Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 21292921 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 21292974 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 21293269 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 21293736 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21293815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21294777 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 21295848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21295909 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21295970 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 21296123 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21296174 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21297369 A G N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 21297686 G T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 21297780 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 21297787 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 21297791 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 21297875 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 21297907 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 21298285 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 21298290 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 21298479 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 21298494 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21298501 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 21298507 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 21298615 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 21298650 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 21298679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21298722 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21298725 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 21298847 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 21299034 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 21299066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21299070 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21299094 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 21299101 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 21299133 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21299154 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 21299161 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21299191 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 21299274 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 21299476 C T Y Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 6 6 1 4 1 3 21299499 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 7 11 1 5 3 3 21299614 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 21299731 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 21299735 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 21299798 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 21299885 A T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 21299987 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 21300023 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 21300097 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 3 21300127 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 21300260 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 21300283 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 21300301 A G Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.8125 0 0.1875 26 6 13 0 3 3 21300347 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 21300559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21300604 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 21300650 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 21300700 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 21300835 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 21301254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21302056 A G Y Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 21302097 G A Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 21302217 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 21302454 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 21302464 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 21302504 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 21302724 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 21303457 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21303729 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21303843 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 21303844 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 21303955 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 21304403 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21304791 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 21304823 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 21304980 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21305203 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21306561 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21307249 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 21307578 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 21307603 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 21307988 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 21308037 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 21308060 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 21308153 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 21308261 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 21308383 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 21308452 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 21308507 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 21308790 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 21308855 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 21309229 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 21309810 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 21309934 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 21309964 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21310025 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 21310154 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 21310165 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 21310322 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 21310395 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21310402 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21310439 T G Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 21310465 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 21310471 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 21310671 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 21310741 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21310819 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21311179 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 21311313 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 21311381 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 21311485 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 21311617 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 21311843 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21312410 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21312648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21313218 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21313406 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21313445 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 21313559 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 21313584 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 21314319 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 21315497 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21315819 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 21315894 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 21316335 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 21316688 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 21317146 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21317646 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21317988 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 21318981 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 21319026 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 21319050 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 21319189 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 21319274 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21319496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21319752 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 21320104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21320748 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 21320962 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 21321382 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 21321446 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 21321594 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 21321693 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21321749 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 21322277 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 21322341 C A Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 21322481 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 21323498 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 21323527 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 21323608 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21323618 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 21323699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21323766 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21323904 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 21324125 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 21324219 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 21324231 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 21324238 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 21324407 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 21324460 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 21324506 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21324508 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 21324561 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 21324570 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21324583 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 21324700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21324849 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21325153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21325207 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21325254 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 21325276 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21325384 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21325564 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21326242 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21326341 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 21326433 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 21326925 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21326987 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21327008 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21327058 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21327121 A C Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 21327252 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 21327287 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21327426 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 21327460 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21327461 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21327474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21327511 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 21327523 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 21327591 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21327791 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 21327810 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 21327883 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 21327946 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 21328165 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 21328191 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21328205 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 21328272 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 3 21328284 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 21328345 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 21328482 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 21328640 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21328659 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 21328722 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21328766 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21329311 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 21331426 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21331585 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21332188 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21333464 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21333482 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21333953 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21334455 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21335405 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 21335467 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 21335566 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 21335967 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21336075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21336123 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 21336213 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 21336276 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 21336312 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 21336363 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 21336517 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 21336555 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 21336647 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 21336684 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 21336703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21336717 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 21337082 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21337101 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 21337154 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 21337240 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21337377 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 21337402 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 21337462 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 21337645 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 21337688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21337751 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 21337808 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21337843 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 21337920 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 21338063 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21338074 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21338075 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21338191 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 21338210 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 21338293 C G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 21338322 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 21338668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21338732 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 21338786 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 21339034 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21339201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21339484 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 21339487 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 21340960 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 21341306 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 21341389 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 21341441 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 21341726 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 21341813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21344647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21345056 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 21345920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21345927 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21346156 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21348418 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21349150 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 21350812 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 21357395 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 21357409 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 21358651 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21358816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21359179 T A Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 21359184 A G Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 21359468 A G Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 21359762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21360064 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21361666 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 21362318 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21364116 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21367547 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 21367626 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 21367762 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21367891 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21368102 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 21368336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21368813 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 21369342 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 21369837 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 21369838 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 21369848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21370351 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21370368 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 21370392 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21370975 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21370998 G A Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 21371312 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21371450 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 21372317 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 21372529 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 21372646 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 21372741 T C Y Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 9 7 3 3 2 3 21372803 G T Y N 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 3 21372895 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 21373416 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 21373475 G A N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 21373922 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 21374733 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21374927 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21375055 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 21375613 G C N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 3 21375693 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 21376268 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 21376351 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 21376361 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 21376390 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 21376391 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 21376403 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 21376425 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 21376440 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 21376506 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 21376637 T C N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 3 21376855 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 21376916 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21376977 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 21376984 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 21377009 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 21377197 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 21377298 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 3 21377646 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 21378319 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21378349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21378412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21378451 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 21378472 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 21378511 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 21378541 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 21378620 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21378871 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 21379037 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 21379204 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 21379271 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21379276 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21379329 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21379331 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21379414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21379436 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21379583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21379723 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21379729 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21379902 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21379991 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21380029 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 21380125 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 21380209 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21380293 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 21380303 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 21380362 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21380421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21380740 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 21380815 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 21380944 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 21381003 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 21381101 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 21381243 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 21381403 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21381762 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21381767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21381797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21381876 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 21382152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21382180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21382234 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 21382250 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21382281 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 21382318 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 21382383 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 21382470 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 21382478 A C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 21382485 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21382503 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21382517 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21382607 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 21382634 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 21382727 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21382884 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21382901 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21383012 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 21383414 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21384098 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 21384180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21384279 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 21384428 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 21384440 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 21384497 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 21384568 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 21384700 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21384848 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 21384850 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 21385540 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 21385562 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 21385657 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 21385703 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21385711 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 21385827 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21385843 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 21385866 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 21385881 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 21386013 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 21386142 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 21386158 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 21386167 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 3 21386277 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 21386499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21386542 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 21386776 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 21386826 G A N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 3 21386827 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 14 10 4 6 2 3 21386846 G A N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 3 21386904 G T N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.153846153846154 0.538461538461538 0.307692307692308 11 15 2 7 4 3 21386922 G A N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.363636363636364 0.545454545454545 0.0909090909090909 14 8 4 6 1 3 21387039 A G Y Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 21387394 G A N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 21387428 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 21387452 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 21387506 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 21387975 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 21388301 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 21388379 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 21388423 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 21388438 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 21388439 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21388460 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 21388499 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 21388542 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 21388546 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 21388588 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 21388617 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 21389357 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21389438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21390529 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 21390562 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 21390658 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 21390664 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 21390675 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 21391185 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 21391217 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 21391226 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 21391299 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 21391419 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 21391530 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 21391631 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 21391636 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 21391710 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 21391876 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21391933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21392136 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 21393066 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 21393304 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 21393388 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 21393442 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21393519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21393870 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 21394380 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21394663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21394904 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21394973 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21395239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21395248 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 21395484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21395632 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21395641 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21395718 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21395904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21395936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21396171 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 21396197 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21396348 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21396349 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21396792 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21397039 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 21397159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21397171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21397180 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 21397405 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21399061 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 21399334 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 21399348 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 21399494 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 21399638 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 21399679 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 21399687 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 21399716 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 21399986 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 21400237 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21400377 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 21400679 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 21401336 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 21401355 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 21401357 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 21401423 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 21401431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21401812 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 21402835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21403046 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21403433 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21403876 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 21403903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21403929 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 21404072 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 21405168 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 21405180 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 21405207 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 21405242 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 21407627 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21407924 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21408903 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 21409005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21409019 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 21409024 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 21409678 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21410064 T G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 21410396 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21410779 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21411130 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21411138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21411431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21411585 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 21412139 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 21412403 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21412418 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21418979 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21419904 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 21419938 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 21421328 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 21421532 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 21421679 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21421770 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21421773 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21421781 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21422300 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 21422364 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 21424779 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21425839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21426307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21426387 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21426451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21426630 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 21427030 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21428184 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 21428306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21428970 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 21429060 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21429790 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21429916 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21430021 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21430092 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 21430131 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21430379 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21430784 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21430814 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21431669 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 21431724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21432277 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 21432354 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21433015 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 21433135 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 21433166 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 21433167 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 21433180 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21433854 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 21433865 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 21434530 T A N N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 9 9 2 5 2 3 21434615 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 21435181 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 21435440 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 21435558 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 21435574 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 21435813 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 21435827 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 21436048 G C Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 3 21436081 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 21436122 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 21436142 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 21436209 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 21436213 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 21436226 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 21436239 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 21436259 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 21436319 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 21436490 C T Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 21436564 A C N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 21436584 T A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 21436612 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 21436615 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 21436662 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 21436671 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 21436690 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21436727 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 21436741 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 21436826 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 21436840 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 21436905 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 21436978 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21437371 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 21437530 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21438302 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21438600 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21438835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21438943 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21439495 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 21440414 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 21440521 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21440695 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 21440869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21441401 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21441513 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 21441514 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 21441679 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 21442021 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 21442525 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21442618 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 21442623 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 21442654 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 21442732 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 21442825 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 21442863 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 21443037 T C N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 12 8 4 4 2 3 21443043 G A N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 3 21443059 C T N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 21443402 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 21443440 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21443900 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 21444132 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21444164 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 21444298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21444359 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 21444372 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 21444383 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 21444473 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21444645 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 21444775 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21444953 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21444968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21445516 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21445599 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21445624 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 21445646 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21445647 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 21445800 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21446533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21446675 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 21447288 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 21447433 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 21447582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21447842 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 21447947 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 21447988 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 21448455 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 21448509 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 21449068 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21449081 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 21449259 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21449379 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21449652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21449704 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21449858 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 21450714 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21451354 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21452561 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21453114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21453255 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21453708 T C Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 21453716 T C Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.4 0.133333333333333 0.466666666666667 14 16 6 2 7 3 21454380 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 21455693 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 21455930 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 21456485 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21457319 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21458506 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 21458972 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 21459368 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21459752 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21459898 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 21461561 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21461572 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21461694 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 21461714 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 21461750 T A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 21461944 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21464096 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 21464318 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21464756 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21464815 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21464827 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21464848 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21464892 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21464932 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 21465216 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21465677 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 21465685 G C N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 21465707 T G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 21465953 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21465954 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21466009 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 21466028 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21466274 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21466423 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 21466532 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 21466561 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 21467019 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21467028 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21467070 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 21467188 A G Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 21467227 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21467372 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21467881 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 21468104 C G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 21468219 T G Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 21468311 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21468321 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21468644 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21468645 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 21468999 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 21469011 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 21469027 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 21469128 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 21469253 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 21469374 G C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 21469389 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 21469555 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 21469793 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21469807 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 21469844 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21470128 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 21470164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21470180 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 21471019 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21471374 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 21471406 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 21471484 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 21471519 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 21472099 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 21473070 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 21473348 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21473525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21473619 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21473626 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 21473792 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21473922 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 21474105 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 21475035 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 21475174 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21475212 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 21475617 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 21475846 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 21477302 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21477307 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 21477401 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 21477505 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 21477713 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 21477739 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 21477893 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 21477914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21477997 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 21478008 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 21478052 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21478078 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21478159 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21478162 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21478462 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 21478523 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 21478552 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 21478643 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 21478676 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 21478772 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 21478783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21478825 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 21478848 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 21478886 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 21478907 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 21478991 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 21479028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21479103 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 21479125 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 21479146 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 21479172 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 21479183 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 21479209 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 21479251 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 21479275 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 21479313 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 21479361 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 21479400 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 21479405 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 21479443 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 21479454 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 21479457 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 21479490 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 21479509 G C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 21479557 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21479636 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 21479935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21479966 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 21479983 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 21480029 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21480162 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21480179 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 21480345 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 21480738 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 21480829 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 21480880 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21482634 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 21482666 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 21482877 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 21482886 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 21482952 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 21483463 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 21483588 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21483608 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21483738 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 21483852 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 21483872 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 21484122 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 21484435 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 21484436 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 21484451 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21484631 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21484655 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 21484662 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21484719 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 21484734 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21484777 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21484820 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 21484866 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 21484899 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 21484913 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 21484921 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 21484945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21484959 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 21485042 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 21485140 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 21485191 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21485238 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 21485248 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 21485377 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21485421 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 21485497 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 21485508 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 21485537 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 21485719 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 21485740 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 21485743 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 21485792 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 21485799 C A N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 21485827 T A Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 21485873 G T Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 21485932 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21486002 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 21486014 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 21486035 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 21486041 A C Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 21486053 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 21486077 T C Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 21486229 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 21486353 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 21486386 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 21486397 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 21486558 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 21486673 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21486919 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 21486943 A G Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 21487042 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21487117 C G Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 21487181 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 21487240 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 21487253 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21487280 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21487348 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21487367 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21487471 G T Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 21487500 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 21487508 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21487627 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21487640 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 21487698 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 21487916 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 21488017 G T Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 21488095 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 21488180 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 21488388 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21488407 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 21488414 T C Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 21488510 C T N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 3 21488729 G A Y Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 3 21489037 A T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 21489053 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 21489066 T G Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 3 21489086 G T Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 3 21489096 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 21489345 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 21489363 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 21489384 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 21489388 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 21489522 G T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 21489624 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 21489688 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 21489721 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 21489775 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 21489787 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 21489808 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 21489824 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 21489859 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 21489901 C T Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 21490009 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 21490028 T C Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 21490049 C A Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 21490090 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 21490132 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 21490376 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 21490396 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 21490398 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 21490612 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 21490685 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 21490740 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 21490820 A C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 21490882 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21490933 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 21490953 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 21490985 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 21491025 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 21491055 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 21491211 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21491267 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 21491354 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 21491373 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 21491409 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 21491470 C A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 21491638 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21491660 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 21491672 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 21491808 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 21491818 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 21491941 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 21492033 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 21492069 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 21492474 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 21492478 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 21492532 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 21492586 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21492605 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21492699 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21492736 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21492905 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 21492906 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 21492930 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 21492938 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 21493000 G C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 21493098 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 21493329 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 21493396 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 21493430 C A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 21493814 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 3 21494019 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 21494216 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 21494564 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 21495009 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 21495027 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 21495346 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 3 21495610 C A Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 3 21495717 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 21495746 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 21495822 C A Y N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 21495837 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 21495882 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 21495968 T G N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 3 21496043 G T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 21496184 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 21496198 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 21496225 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 3 21496269 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 21496307 G A Y Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 3 21496410 G A Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 21496463 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 21496479 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 3 21496493 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 21496541 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 21496562 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 21496649 A T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 21496653 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 21496682 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 21496683 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 21496746 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 21496759 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 21496885 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 21496912 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 21496952 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 21496955 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 21496990 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 21497010 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 21497066 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 21497072 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 21497125 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 21497234 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 21497586 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21497616 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 21497732 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 21497747 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21497855 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21498079 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 21498135 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21498147 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 21498166 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21498259 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 21498342 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 21498343 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 21498374 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 21498399 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 21498405 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 21498452 C A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 21498459 T A Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 21498505 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 21498521 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 21498685 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 21498755 A G Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 3 21498784 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 21498824 A C Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 21498837 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 21498849 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 21498950 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 21498978 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 21499043 G T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 21499218 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 21499310 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 21499366 A T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 21499501 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 21499559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21499619 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 21499859 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 21499902 G T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 21499927 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 21500070 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21500736 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 21500753 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21500818 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 21501025 T G Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 21501388 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 21501846 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 21501964 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 21502075 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 21502188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21502495 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21502515 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21502997 C G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 21503173 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 21503390 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21503447 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 21503451 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 21503461 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 21503671 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 21503687 T A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 21503724 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 21503769 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21503787 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 21503837 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 21503838 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 21503911 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 21503931 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 21503977 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 21504230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21504346 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 21504491 A T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 21504511 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 21504775 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 21504804 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 21504889 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 21504925 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21504956 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 21505038 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 21505083 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 21505086 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 21505139 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 21505305 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 21505391 G T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 21505648 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 21505653 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 21505661 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 21505833 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 21505880 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 21505886 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 21505891 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 21505919 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 21505953 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 21506044 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21506175 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 21506290 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21506291 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 21506442 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 21506447 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 21506456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21506473 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 21506531 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 21506535 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 21506624 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 21506630 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 21506752 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 21506838 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 21506894 C G Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 21506912 A T Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 21506967 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 21507185 A G Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 21507208 A T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21507332 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 21507366 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 21507389 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 21507437 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 21507485 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 21507536 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 21507565 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 21507582 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 21507654 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 21507731 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21507804 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 21507945 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 21508019 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 21508100 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 21508102 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21508174 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 21508224 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 21508440 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 21508660 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 21508759 T G N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 15 15 6 3 6 3 21508810 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 21509000 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 3 21509049 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 21509137 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 21509154 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 21509271 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 21509364 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 21509494 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 21509558 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 21509627 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 21509655 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 21509679 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 21509745 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 21509755 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21509774 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 21509779 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 21509987 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 21509991 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 21510004 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 21510016 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 3 21510018 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 21510109 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 21510164 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 21510225 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 21510334 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 21510639 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 21510644 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 21510679 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 21510727 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 21510813 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 21510867 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 21510977 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 21511128 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 21511186 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 21511382 C T N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 3 21511482 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 21511486 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 21511584 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21511609 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 3 21511628 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 21511670 T G Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 21511739 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 21511927 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21511958 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 21511970 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 21511998 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 21512034 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 21512080 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 21512084 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 21512151 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 21512194 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 21512214 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 21512358 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 21512372 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 21512396 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 21512414 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 21512791 C A N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 21513103 G C Y N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.0666666666666667 0.733333333333333 0.2 13 17 1 11 3 3 21513118 T G Y N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.0714285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 13 15 1 11 2 3 21513303 T G N N 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.363636363636364 0.272727272727273 0.363636363636364 11 11 4 3 4 3 21513356 G A Y Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.357142857142857 0.214285714285714 0.428571428571429 13 15 5 3 6 3 21513365 G A Y Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 3 21513611 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 21513660 C A Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 21513676 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 21513797 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 21513865 G A Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 3 21513926 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 21514056 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 21514087 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 21514429 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 21514468 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 21514626 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 21514903 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 21515244 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 21515320 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 21515356 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 21515364 G T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 21515496 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 21515664 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 21516051 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.375 0.1875 0.4375 15 17 6 3 7 3 21516102 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 21516248 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 21516489 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 21516640 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 21516644 C T Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 3 21516821 A G Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 21516895 A C Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 21516999 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 21517226 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 21517248 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 21517292 G T Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 21517605 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 21518138 G C Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 21518149 A G N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 21518359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21518559 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 21518611 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21518615 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 21518668 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 21518688 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21518690 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21518700 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 21518813 C A Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 21518940 T A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 3 21518957 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21519040 A T Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 21519082 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 21519404 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21519444 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21519465 C A Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 21519467 G T Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 21519483 A C Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 21519490 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21519500 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21519508 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 21519591 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21519613 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21519666 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 21519707 T C Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 21519751 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21519896 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 21519923 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 21519928 A T Y N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 21519940 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 21519941 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 21519951 C T Y Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 3 21519973 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 21520022 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 21520042 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 21520274 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 21520594 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21520679 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21520999 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21521003 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 21521417 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21521425 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 21521647 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 21522348 C A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 21522381 A T Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 21522469 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21523014 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21523135 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 21523332 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21523369 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 21523493 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 21523773 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 21523778 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 21524199 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21524392 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 21524643 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 21524824 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 21525426 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21526124 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 21526287 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 21526350 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 21526384 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 21526390 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 21526489 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 21526507 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 21526508 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 21526608 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 21526665 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 21526672 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 21526702 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 21526736 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 21526740 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 21526804 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 21526808 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 21527100 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21527313 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21527415 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21527459 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 21527537 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 21527544 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21527715 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21527841 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 21528109 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 3 21528149 C T N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 3 21528229 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 21528231 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 21528249 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 21528834 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 21528857 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 21528968 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 21529055 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 21529467 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 21529634 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 21529683 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 21530165 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 21530177 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 21530207 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 21530246 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 21530317 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 21530360 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 21530389 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 21530874 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 21531862 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 3 21531913 T A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 21531954 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 21532091 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 21532101 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 21532245 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 3 21532530 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 21532615 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 21532741 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 21533365 T C N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 3 21533442 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 3 21533456 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 21533659 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 21533793 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 21533804 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 21533919 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 21534065 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 21534138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21534139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21534199 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 21534211 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 21534433 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21534439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21534507 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 21534862 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 21534916 T A N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 3 21535065 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 21535141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21535153 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 21535501 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 21535752 A C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 21535823 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 21535897 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 21535960 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 21535984 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21536000 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21536001 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 21536084 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21536257 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 21536472 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 21536489 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 21536514 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 21536555 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 21536594 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21536668 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 21536702 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 21537026 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21537046 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 21537116 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 21537125 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 21537336 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 21539029 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21539070 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 21539083 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21539175 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21539324 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21539520 A C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 21539786 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21539967 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21540231 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 21540325 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21540668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21540748 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 21540950 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 21540969 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 21541019 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 21541026 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 21541044 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 21541091 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 21541980 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 21542077 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 21542139 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 21542140 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 21542169 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 21542201 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 21542228 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 21542256 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 21542257 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 21542427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21542505 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 21542552 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 21542562 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 21542573 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 21542584 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 21542585 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 21542595 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 21542687 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 21542696 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 21542710 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 21542759 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 21542777 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 21542808 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 21542832 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 21542878 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 21542929 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 21542942 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 21542954 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 21543014 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 21543022 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 21543035 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 21543090 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 21543397 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 21543404 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 21543430 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 21543433 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 21543524 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 21543566 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21543759 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 21543765 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21544682 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 21544803 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21545638 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 21545856 G T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 21545955 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 21545983 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 21546294 G T N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 3 21546390 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 21546514 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 21546758 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 21546839 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21547175 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 21547345 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 21547375 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21547424 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21547476 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21547524 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21547678 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21547690 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21547746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21547802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21547823 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 21547904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21547923 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 21548039 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21548114 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21548116 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 21548651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21548691 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 21548831 T G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 21548892 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 21548978 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 21549369 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 21550957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21556985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21557730 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21563014 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 21563263 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21568435 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 21569286 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 21570174 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 21570289 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21570325 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21570559 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21570568 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 21570574 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 21570789 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 21570811 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 21571035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21571447 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 21571621 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21571872 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 21571994 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 21572237 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21572366 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 21572452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21572510 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 21572664 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 21572708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21572755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21573349 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 21573431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21573501 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 21573553 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 21573617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21573705 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21573744 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 21573842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21573932 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 21574194 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21574326 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21574354 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 21574355 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 21574377 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21574394 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21574446 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21574474 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21574571 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21574573 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21574689 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 21574754 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 21574830 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 21574853 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21575398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21575498 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21576979 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21577451 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 21577581 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 21577686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21577769 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 21577937 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 21578243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21578526 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 21578672 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21579455 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 21579822 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 21579865 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21579926 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 21579927 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 21579944 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 21580071 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 21580102 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.235294117647059 0.117647058823529 0.647058823529412 10 24 4 2 11 3 21580189 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 21580236 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21580361 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21580457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21580601 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 21580815 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 21580910 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21580947 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21581142 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21581345 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21581445 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21581519 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21581733 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 21581915 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 21581972 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 21582537 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 21582708 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21582713 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21582774 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21582783 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 21582915 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21582961 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 21583542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21583708 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21583768 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21583777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21583841 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21583843 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21583976 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21584206 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21591077 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 21591081 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 21591165 A C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 21591169 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 21591236 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21591247 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 21591391 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 21591395 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21591534 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 21591535 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 21591709 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21591757 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21591790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21591797 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 21591858 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.388888888888889 0.111111111111111 0.5 16 20 7 2 9 3 21591867 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.388888888888889 0.111111111111111 0.5 16 20 7 2 9 3 21591876 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 3 21591880 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.5 0.1875 0.3125 19 13 8 3 5 3 21592156 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 21592339 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21592437 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21592620 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 21593035 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 21593868 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21594409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21594908 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21595385 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 21595398 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 21595412 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 21595734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21596015 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21596419 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21598095 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21598251 A C Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 21600116 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21600181 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 21600249 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 21601474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21601578 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 21602085 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21604389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21605339 C T Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 21605897 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 21612057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21612740 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21613690 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 21613706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21614218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21614372 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21619376 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21619565 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21621642 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21621802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21623059 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21623947 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 21624938 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21625073 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21625217 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 21625931 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 21626447 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21626620 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 21626927 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 21627281 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 21629450 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 21630525 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21631240 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 21631547 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 11 7 3 5 1 3 21631767 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 21633120 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 21633262 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21633279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21633660 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 21633719 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 21633731 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21634808 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21635063 C G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 21635141 C A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 21636187 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21636640 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21636671 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 21636956 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21638162 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21638887 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 21641494 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21642124 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 21642794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21643567 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 21643688 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21644769 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 21645216 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21647977 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21649237 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21649301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21649987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21650789 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 21652833 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 21652962 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21653290 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 21653563 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 21654355 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21655151 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21655222 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 21657243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21658025 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 21658275 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21658679 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 21658802 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 21659492 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 21660589 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 21660851 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 21660919 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 21663213 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 21663318 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 21663470 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 21663490 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 21663726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21664863 A T Y N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 3 21665081 A T Y N 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 10 8 3 4 2 3 21665141 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21665142 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21665258 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 21665377 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 21665536 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21665596 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 21665656 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 21665926 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 21665981 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 21666010 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 21666218 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 21666347 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21666387 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 21666554 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 21666928 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21667032 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 3 21667064 C A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 21667145 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 21667263 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21667328 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 21667347 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 21667381 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 21667508 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 3 21667800 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 21667842 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 3 21667882 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 21667902 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 21667914 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 21667930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21667958 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 21668092 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 3 21668244 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 21668622 C A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 21669629 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 21669708 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 21669801 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 21670221 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 21670690 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 21670940 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 21671020 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 21671022 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 21671070 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 21671091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21671118 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 21671122 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 21671192 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 21671252 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 21671279 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 21671391 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 21671750 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 21671767 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 21671958 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21672246 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21672356 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 21672662 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 21672856 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 21673143 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 21673965 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21674688 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 21675240 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 21676417 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 21676695 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 21677216 A C N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 21677699 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 21677817 C T Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 21677855 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 21677860 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 21677925 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 21678010 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 21679196 G A Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 21679419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21679446 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21680498 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 21681008 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21683353 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 21684466 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21685106 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 21685167 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 21685393 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 21685407 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 21685503 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 21685576 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21685875 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21685915 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21685980 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21685987 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21686015 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21686020 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21686041 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 21686087 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21686102 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 21686138 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21686204 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 21686205 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21686229 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21686304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21686305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21686322 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 21686369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21686375 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 21686450 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 21686522 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21686647 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21686732 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21686771 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 21686777 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21686986 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21687013 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21687052 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21687078 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21687094 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 21687153 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21687473 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21687481 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 21687611 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 21688068 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 21688127 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21688147 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 21688319 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21688344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21688565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21688580 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21688905 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21689134 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 21689346 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 21689380 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 21689412 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 21690523 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21691813 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 21692120 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 21692533 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 21694127 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 21696499 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21698145 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 21698254 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 21699255 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 21700280 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21705115 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 21709584 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 21714155 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 21714769 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21715255 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21715680 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 21716500 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 21717386 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21717406 T G Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 21717940 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 21719922 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21719924 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21720714 T A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 21720998 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 21721048 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 3 21721349 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 3 21721493 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 21721494 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21721571 T A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 21721639 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 21721853 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 21721862 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 21722018 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 21722044 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 21722203 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 21722426 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 21722900 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21723057 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 21723123 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21723124 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 21723449 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 21723630 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 21723750 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 21723775 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 21723776 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 21723788 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 21723798 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 21723933 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 3 21724001 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 21724170 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 21724427 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21724500 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 21724600 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 21724608 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 21724625 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 21724661 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 21724685 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 21724696 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 21724921 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 21724938 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 21724940 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 21725082 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 21725147 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 21725148 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 21725269 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 21725316 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 21725325 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 21725430 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 21725433 T A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 21725477 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 21725486 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 21725544 T C Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 21725680 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 21725686 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 21725734 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 21726014 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 21726178 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 21726182 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 21726225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21726235 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 21726266 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 21726289 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 21726308 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 21726367 A G Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 21726441 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 21726463 C T Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 21726695 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 21726696 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 21726709 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 21726980 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 21727022 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 21727090 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 21727253 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 21727315 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 21727384 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 21727916 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 21728418 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 21729265 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 21729362 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 21729378 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 21729418 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 21729420 A C N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 21729492 G C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 21729608 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 21729701 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 21729881 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 21729920 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 21730004 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 21730101 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 21730146 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 21730189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21730281 G T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 21730312 T G Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 21730379 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21730435 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 21730508 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21730790 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 21730791 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 21730812 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 21731211 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 21731450 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 21731454 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 21731577 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21731882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21731930 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 21732150 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21732163 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 21732318 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 21732400 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 21732419 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 21733126 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 21733198 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 21733258 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 21733591 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 21734261 G A N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.5 0.214285714285714 0.285714285714286 17 11 7 3 4 3 21734341 T A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 21734393 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 21734411 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 21734702 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 21735043 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 21735052 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 21735058 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 21735067 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 21735276 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21735339 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 21735364 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 21735397 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 21735421 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 21735485 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 21735532 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 21735549 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 21735679 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 21735750 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21735791 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 21735800 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 21735821 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 21736050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21736061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21736109 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21736195 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 21736286 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 21736405 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 21736539 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 21736730 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 21736964 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 21736981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21736987 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 21737111 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 21737677 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 21737775 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21737795 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 21737833 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 21737847 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 21737985 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 21737987 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 21737998 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 21738015 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 21738021 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 21738077 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 21738118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21738340 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 21738415 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 21738418 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 21738469 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 21738742 A G N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 3 21738927 C G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 21738957 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 21739594 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 21739802 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 21740342 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 21740435 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 21740588 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 21741313 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 21741435 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 21741929 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 21741950 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 21742173 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 21742877 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 21743178 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 21743287 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 21743311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21743349 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 21743510 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 21743664 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 21744044 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 21744126 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 21744185 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 21744248 T C Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 21744256 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 21744262 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 21744277 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 21744554 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 21744607 T A Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 21744777 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 21744791 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 21744804 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 21744822 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 21744840 G T Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 21744843 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 21744852 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 21744920 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 21744952 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 21745009 T G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 21745088 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 21745089 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 21745112 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 21745242 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 21745518 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 21746109 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 21746801 G C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 21747335 C A N N 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 21748894 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21750366 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 21750374 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 21750411 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 21750425 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 21750432 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 21750455 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21750466 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 21750544 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 21750597 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 21750648 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21750661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21750915 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 21751179 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 21751380 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 21752561 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21752577 C T Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 21752599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21752669 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21752746 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 21753645 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 21754601 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21755707 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 21755843 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 21756026 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 21756131 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21756219 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 21756969 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 21757089 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 21757499 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 21757648 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 21757919 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 21757958 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 21758010 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 21758053 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21758065 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 21758196 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 21758361 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 21758711 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 21758770 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 21758966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21759119 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 21759124 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 21759188 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 21759234 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 21759240 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 21759328 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 21759375 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 21759544 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 21759558 C A Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 21759565 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 21759573 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 21759644 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 21759691 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 21759718 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 21759745 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 21759790 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 21759812 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 21759826 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 21759856 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 21759859 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 21759951 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 21759976 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 21759981 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 21759987 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 21759992 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 21760014 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 21760211 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 21760221 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 3 21760864 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 21760880 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 21760913 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 21761055 T G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 21761377 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 21761463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21761482 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 21761541 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 21761691 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 21761811 A C N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.214285714285714 0.714285714285714 0.0714285714285714 16 12 3 10 1 3 21762760 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 21763113 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 21763432 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 21763647 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21763763 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21764224 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 21764254 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 21764404 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 21764572 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 21764785 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 21764793 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 21764882 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 21765162 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 21765184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21765265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21765338 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 21765467 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21765939 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 21766004 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 21766229 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 21766481 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 21766529 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 21766579 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21766611 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21766648 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21766727 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 21766729 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 21766747 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 21766810 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 21766852 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 21766860 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 21766877 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 21766915 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 21766963 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 21767027 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 21767084 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 21767098 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 21767122 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 21767132 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 21767292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21767424 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 21767453 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 21767472 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 21767530 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 21767612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21767614 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 21767682 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21767819 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 21767933 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 21768000 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 21768111 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 21768144 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 21768183 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 21768192 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 21768212 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 21768382 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 21768493 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 21768545 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21768721 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 21768727 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 21768859 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 21769051 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21769146 C G Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 21769410 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 21769500 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 21769772 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 21770106 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 21770174 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 21770242 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 21770333 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 21770345 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 21770369 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 21770657 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 21770703 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 21770763 A C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 21770911 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 21771121 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 21771258 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 21771285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21771455 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 21771698 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 21771936 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 21772515 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21773559 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 21774017 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 21774077 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21774110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21774134 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21774146 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 21774239 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 21774410 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 21774464 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 21774934 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 21775129 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 21775307 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 21775346 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 21775477 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21775537 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 21775918 G T N N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.545454545454545 0.181818181818182 0.272727272727273 14 8 6 2 3 3 21775919 C A N N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 15 9 6 3 3 3 21775979 G C N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 3 21776025 G C N N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.416666666666667 0.25 0.333333333333333 13 11 5 3 4 3 21776351 G A N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.615384615384615 0.153846153846154 0.230769230769231 18 8 8 2 3 3 21776369 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 21776751 A G N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.272727272727273 0.181818181818182 0.545454545454545 8 14 3 2 6 3 21776797 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 21777408 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 21777491 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 21777734 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 21777790 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 21777814 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 21777928 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 21777972 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 21778915 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21779288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21779706 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21779718 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21779943 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 21780226 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 21780282 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 21780299 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21780344 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 21780973 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 21781377 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 21781466 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 21781534 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21781593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21781970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21782062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21782300 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 21782526 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 21783053 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 21783095 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 21783178 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 21783185 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 21783218 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 21783309 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21783337 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 21783363 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 21783443 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 21783449 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 21783454 G T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 21783514 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 21783715 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 21783779 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 21783789 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 21783801 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 21783845 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 21785402 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21785927 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 21787164 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 21787280 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 21787363 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 21787493 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 21787509 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 21787560 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 21787579 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 21787866 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 21787930 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 21788051 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 21788336 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 21788829 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21789105 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 21789131 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 21789969 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21790320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21791160 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21791683 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21793003 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 21793824 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 21794782 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21796456 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 21797048 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 21797555 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 21797663 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 21797972 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 21798190 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 21798204 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 21798288 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 21798314 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 21798547 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 21798552 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 21798616 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 21798654 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 21798666 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 21798756 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 21798847 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 21798884 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 21798888 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 21798900 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 21799023 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 21799067 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 21799136 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 21799183 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 21799214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21799337 G C Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 21799386 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 21799835 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21800178 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 21800891 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 21800906 G A Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 21801165 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 21801607 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 21801620 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 21801707 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 21802618 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 21802695 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 21803884 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21804212 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 21804516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21805764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21807204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21807433 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21809171 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 21810756 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21812161 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 21815250 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21815504 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21816937 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 21819860 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 21820070 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 21820447 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21820836 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 21823130 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 21823282 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 21823305 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 21823408 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 21823798 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 21824050 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 21824281 T A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 21824365 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 21824600 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 3 21824694 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 21824877 G T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 21824992 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 21825021 C G Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 21825159 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 21825196 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 21825280 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 21825424 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 21825679 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21825750 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 21825777 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 21825781 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 21825990 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 21826352 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 21826398 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21826430 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 21826681 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 21826692 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 21826731 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 21826778 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 21826918 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 21826936 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 21826977 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 21827146 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21827241 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 21827639 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 21827819 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 21827910 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 21827964 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 21828065 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21828143 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 21828169 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 21828197 C A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 21828502 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 21828550 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 21828553 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 21828573 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 21828605 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 21828656 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 21828900 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 3 21828916 T G N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 21829000 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 21829022 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 21829198 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 21829305 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 3 21829576 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 21829954 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 21830119 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 21830129 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 21830551 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 21830558 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 21830594 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 21830924 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 21830953 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 21832008 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 21832176 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 21834328 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 21835236 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 21835265 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 21835326 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21835454 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 21835732 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 21835788 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 21835814 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 21835838 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 21835887 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 21835905 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 21835914 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 21835920 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 21836055 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 21836272 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 21836274 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 21836474 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 21836871 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 21836994 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 21837059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21837520 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 21838111 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 21838122 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 21838295 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 21838368 A C Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 21838386 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 21839185 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21840274 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21841621 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21841684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21843672 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21845422 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21847006 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21849448 C T Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 21849692 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 21851673 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21851988 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 21853193 A C Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 21855141 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 21855471 A C Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 21856198 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21856977 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 21857002 T G Y N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 21858636 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21858905 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21859461 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 21861654 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 21865146 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 21869185 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21872489 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 21872543 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21872972 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 21873009 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 21874271 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 21874727 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 21874839 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 21874947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21875578 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21875888 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 21875916 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 21877063 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 21879112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21879331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21879394 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 21879424 A G Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 21879712 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 21879781 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 21880096 A G Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 21880445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21881151 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 3 21882427 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 21882581 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 21882600 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 21882860 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 21883033 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 21883072 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 21883263 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 21883289 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 21883338 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 21883431 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 21883632 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 21883832 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 21883878 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 21884062 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 21884176 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 21884185 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 21884197 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 21884215 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 21884327 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 21884425 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 21884458 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 21884619 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21884656 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21884728 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21884752 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 21884769 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 21884842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21884852 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21884892 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21884894 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 21885525 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21885888 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 21886188 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 21886267 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 21886521 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 21886628 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 21886640 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 21886876 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 21886994 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 21887680 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 21888069 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 21888353 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 21888469 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21888510 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 21888538 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 21888622 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 21888648 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 21888701 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 21888874 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 21888982 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 21889142 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 21889293 C A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.117647058823529 0.705882352941177 0.176470588235294 16 18 2 12 3 3 21889365 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 21889494 G T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 3 21889595 A G N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.133333333333333 0.733333333333333 0.133333333333333 15 15 2 11 2 3 21889709 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 3 21889756 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 21889764 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 21889981 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 21890195 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 21890208 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 21890228 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 21890427 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 21891012 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 21891039 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 21891075 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 21891085 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 21891257 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 21891267 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 3 21891319 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 3 21891434 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 21891676 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 21891680 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 21891693 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 21891694 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 21891727 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 21891777 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 21891914 C T N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0 0.928571428571429 0.0714285714285714 13 15 0 13 1 3 21891922 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 21892025 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 21892103 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 21892194 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 21892249 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 21892312 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 21892330 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 21892774 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 21892786 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 21892998 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 21893011 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 21893264 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 21893298 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 21893309 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 21893310 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 21893438 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 21893506 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 21893552 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 21893659 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 21893696 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 21893957 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 21893976 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 21894126 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 21894133 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 21894139 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 21894169 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 21894174 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 21894188 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21894235 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 21894320 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 21894363 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 21894681 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 21894719 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 21894727 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 21894747 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 21894875 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 21894998 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 21895127 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 21895298 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 21895737 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 21895769 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 21896007 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 21896009 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 21896062 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 21896068 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 21896166 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 21896373 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 21896550 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 21896558 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 21896748 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 21896759 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 21896921 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 21897012 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 21897027 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 21897121 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 21897269 T C N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.466666666666667 0.2 0.333333333333333 17 13 7 3 5 3 21897876 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 21897931 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 21897960 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 21897975 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 21898131 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 21898143 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 21898184 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 21898203 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 21898209 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 21898311 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 21898646 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 21898697 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 21898742 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 21898775 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 21898807 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 21898818 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 21898831 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 21898867 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 21898932 A T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 21900863 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 21900963 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 21901101 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 21901198 C G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 21901199 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 21902807 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 21903188 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 21903440 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 21904013 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 21904419 T A Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 21904489 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 21905048 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 21905355 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21906217 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 21907981 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 21908612 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21909480 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 21911733 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 21911941 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 21912058 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 21912202 C T N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 3 21912205 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 21912230 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 21912254 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 21912413 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 21912482 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 21912493 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21912582 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21912590 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21912767 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 21912833 G T Y N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 21912837 A G Y Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 21912961 T G N N 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 3 21913047 G T N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 21913093 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 21913126 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 21913230 A C N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 8 16 0 8 4 3 21913296 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 21913322 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 21913339 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 21913441 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 21913475 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 21913554 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 21913608 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 21913795 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 21913868 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 21913940 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 21913997 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 21914056 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21914251 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 21914299 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 21914363 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 21914388 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 21914427 T A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 21914481 G A N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 21914503 T C N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 21914576 C G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 21914594 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21914634 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 21914641 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 21914655 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 21914878 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 21915282 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 21915349 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 21915372 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21915388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21915400 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 21915489 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 21915631 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 21915798 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 21916360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21917415 A T Y N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 3 21917714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21917805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21920098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21920845 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21921124 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 21921160 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 21921649 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21922081 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 21922197 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 21922615 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21922900 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 21923101 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 21923114 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 21923205 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21923278 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 21923323 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 21923414 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 21923469 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 21923485 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 21923567 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 21923615 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21923641 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 21923813 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 21924132 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 21924144 T G N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 21924186 C A N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 21924327 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 21924637 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 21924639 A T N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 21924679 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 21925023 T C Y Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.461538461538462 0.230769230769231 0.307692307692308 15 11 6 3 4 3 21925285 A G Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.230769230769231 19 7 9 1 3 3 21925418 T C Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 21925676 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 21925696 G A Y Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.428571428571429 0.0714285714285714 0.5 13 15 6 1 7 3 21927330 T A Y N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 3 21927363 C G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 21927685 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 21928361 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 21928424 G C N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 21928561 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 21928885 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 21929379 T A N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 3 21930472 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 21930555 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 21930805 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 21931314 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 21931586 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 21931644 G C N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.230769230769231 19 7 9 1 3 3 21931894 T G N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 3 21931979 T G N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 3 21931992 T C N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.25 0.0833333333333333 0.666666666666667 7 17 3 1 8 3 21931993 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 21932110 C T N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.25 0.0833333333333333 0.666666666666667 7 17 3 1 8 3 21932126 T C N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.25 0.0833333333333333 0.666666666666667 7 17 3 1 8 3 21932381 G A N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 3 21932387 A T N N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 3 21932477 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 21932483 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 21932496 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 21933351 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 21933514 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21933524 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 21933557 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 21933643 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 21933880 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21934171 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21934249 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 21935046 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 21935272 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 21936273 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 21936589 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 21936617 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 21936903 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21937107 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21937848 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 21937951 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 21938648 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 21938755 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21938922 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 21938951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21939524 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 21940786 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21941075 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 21942190 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 21942332 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 21942626 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 21943220 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 21945070 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 21945791 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 21946801 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 21947290 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 21948077 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 21949353 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 21949489 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 21949743 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 21949744 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 21949755 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 21949795 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21949921 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 21950296 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 21950431 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 21950443 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21950444 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 21950485 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 21950564 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21950883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21950927 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 21951090 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21952106 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 21952575 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 21952671 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21952729 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 21952833 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 21952948 A G N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 3 21953079 G T N N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 21953540 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 21953548 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 21953563 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 21954086 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 21954286 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 21954477 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 21954931 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 21955294 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21955511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21956058 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 21956151 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 21956359 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 21956498 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 21957268 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21957520 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21957845 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 21957881 A C N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 21957892 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 21957893 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 21958246 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 21958303 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 21958973 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 21959326 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 21959344 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 21959358 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 21959435 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21959436 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21959697 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 21959712 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 21959757 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 21959799 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 21959906 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 21959999 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 21960007 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 21960021 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 21960273 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 21960304 A C Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 21960718 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0 0.789473684210526 0.210526315789474 15 23 0 15 4 3 21961252 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 21961843 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 21963491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21964228 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 21964826 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 21965210 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 21965223 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 21965283 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 21965310 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 21965656 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 21965732 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21965794 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 21965945 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 21967045 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 21967860 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 21967899 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 21967951 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 21968308 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 21969492 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 21970030 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 21970906 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 21971043 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 21973904 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 21974370 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 21980134 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 21980240 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 21981420 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 21984937 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 21985896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21986032 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 21987299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21988376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21988604 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 21995706 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 21996467 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 21996490 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 21996503 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 21996509 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 21996544 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 21997330 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 21997608 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 21998818 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 21999086 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 21999528 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 22000867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22002419 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 22002529 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 22004284 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22005134 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22006164 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22010714 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22011028 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 22012611 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 22012638 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22012656 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22012830 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 22013719 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 22014002 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22015186 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 22015765 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 22024019 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 22024481 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 22025214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22025551 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 22025665 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 22026838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22027248 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22028116 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 22028754 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 22030404 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 22032200 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 22032942 A C Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 22034712 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 22035266 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 22036558 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 22039873 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 22040841 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 22041100 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22042637 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 22042871 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22042947 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 22044227 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 22044276 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 22047607 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 22048374 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 22049192 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 22050203 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 22050334 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 22050875 A C Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 22051350 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 22051351 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 22051386 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 22053470 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 22053654 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 22055137 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 22055477 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 22056420 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22056732 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22056816 A C Y N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 12 12 3 6 3 3 22058029 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 22058987 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 22059815 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 22062755 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 22064066 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 22064087 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 22064926 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 22065470 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 22065621 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22068963 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 22069392 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 22070932 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 22071410 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 22072037 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 22072044 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 22072055 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22072776 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 22072814 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 22072840 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 22073120 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 22073164 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 22073321 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 22073866 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 22074569 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22076127 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 22076215 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 22076701 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 22076720 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 22078634 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 22079288 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 22082429 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 22083526 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22084191 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22084280 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 22085019 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 22085365 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22085478 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22086416 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 22086441 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22086830 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 22086870 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22088102 C T N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 3 22088675 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22089100 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 22089175 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 22089190 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 22089302 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22089320 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 22090479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22091521 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22092321 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22092327 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22093429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22093849 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22095059 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 22095677 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 22096361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22096658 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 22097264 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 22097869 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 22098002 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22098030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22098658 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 22099048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22099385 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 22099395 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22099689 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 22100015 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22101213 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 22101504 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22101686 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 22101800 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 22102177 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 22102190 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 22102372 C T Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 22103608 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 22103694 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 22103718 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 22103824 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22104485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22105336 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 22105510 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 22105756 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 22106086 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 22108173 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 22108230 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 22108546 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22108588 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22108625 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 22109196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22110369 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 22112266 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22113477 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 22115689 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 22117424 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 22118521 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 22118895 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22119061 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 22119486 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 22119811 A G Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 22120414 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22121883 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 22122477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22124750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22124754 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 22125288 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 22125581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22125723 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22125944 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 22125995 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 22126052 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 22126167 T C N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 3 22126188 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 22126318 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 22126484 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 22126518 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22126648 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 22126680 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 22126688 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 22126957 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 22126977 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 22127039 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 22127132 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 22127320 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22127574 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22127618 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 22127676 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22127731 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22127932 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22127975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22128164 A G Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 22128423 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 22128533 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22128627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22128636 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 22128645 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22128674 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22128854 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 22128895 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 22128918 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 22128986 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22129048 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22129049 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22129077 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 22129103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22129322 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 22129367 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 22129426 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 22129471 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 22129472 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 22129571 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22129585 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 22129635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22129692 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 22129963 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 22129986 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22129998 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22130070 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22130080 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 22130129 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22130187 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 22130197 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 22130261 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 22130535 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22130720 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22130834 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 22130913 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 22130914 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 22131236 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 22131338 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 22131407 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 22131433 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22131446 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22131463 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22131663 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 22131694 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 22131791 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22131819 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 22131859 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 22131955 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 22132004 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22132115 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 22132184 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 22132568 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 22132622 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 22132767 C T N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 22132893 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 22132923 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 22132963 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 22132992 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 22133082 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22133089 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22133112 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 22133125 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 22133175 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22133216 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22133217 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 22133276 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22133311 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 22133374 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 22133404 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22133417 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22133712 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22133743 T C Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 22133915 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22134043 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 22134149 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22134156 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22134179 G T Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22134235 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22134237 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 22134324 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 22134376 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 22134411 A C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 22134526 C A Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 22134610 A C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 22134858 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 22134904 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 22134906 A T N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 22134942 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 22135176 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 22135358 A T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 22135387 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22135421 C G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 22135634 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 22135678 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 22135688 G A Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 22135742 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22135862 A T Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 22136068 G T Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 22136180 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 22136182 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 22136213 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 22136446 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 22136456 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 22136551 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 22136562 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 22136624 A C Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 22136659 G C Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 22136684 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 22136697 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 22136723 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 22136793 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22136799 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 22136835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22136954 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 22136956 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 22137163 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 22137255 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 22137272 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 22137443 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22137520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22137576 T C Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 22137609 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 22137682 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 22137745 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22137842 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 22137864 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 22137885 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 22137886 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 22137896 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 22138237 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 22138265 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22138423 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 22138507 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22138652 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 22138700 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 22138735 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 22138793 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 22138821 G A Y Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 22138857 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 22138951 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 22138964 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 22139004 C T Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 22139017 T G N N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 3 22139027 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 3 22139096 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 22139252 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 22139354 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 22139359 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 22139375 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 22139395 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 22139407 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 22139423 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 22146110 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22146155 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22146217 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 22146325 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22146367 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22146406 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 22146526 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22146531 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22146565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22146696 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22146698 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 22146713 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22146866 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 22146892 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22146950 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 22147039 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 22147057 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22147569 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 22147640 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22147670 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 22147750 A G Y Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.6 0 0.4 12 8 6 0 4 3 22147755 T C N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.6 0 0.4 12 8 6 0 4 3 22147886 G A Y Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.625 0 0.375 10 6 5 0 3 3 22147932 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.555555555555556 0.111111111111111 0.333333333333333 11 7 5 1 3 3 22147966 T A Y N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 22148048 T C Y Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 3 22150030 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 3 22150062 G A Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 22150143 C T Y Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 3 22150232 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 22150247 C A Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 22150273 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22150299 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 22150315 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 22150336 G C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 22150357 C A Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 22150359 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 22150381 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 22150406 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22150408 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22150439 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 22150503 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22150526 C T Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 22150537 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 22150731 T G Y N 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 8 10 1 6 2 3 22151096 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 3 22151682 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 22151763 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22151800 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 22151866 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0555555555555556 0.722222222222222 0.222222222222222 15 21 1 13 4 3 22151914 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 22151976 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 22151981 T C N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.625 0.125 0.25 11 5 5 1 2 3 22152000 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 10 8 2 6 1 3 22152044 A G Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 22152067 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 22152124 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22152720 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 22152786 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22152828 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22152866 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22152896 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22152935 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 22153128 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22153178 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22153226 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22153227 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22153294 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 22153340 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 22153392 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 22153413 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 22153500 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22153529 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22153552 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22153615 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 22153709 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 22153733 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22153790 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22153802 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 22153860 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 22154108 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 22154139 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 22154167 T C Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 22154244 T C Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 22154349 A G Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 22154514 A G Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 22154559 A T Y N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 22154570 T A Y N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 3 22154624 C T Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 22154653 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22154666 T C Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 22154732 T G Y N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 3 22154820 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 22154889 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22155005 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22155097 G A Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0 0.8125 0.1875 13 19 0 13 3 3 22155167 A T Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 22155335 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 22155374 T A Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 22155510 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 22155514 T A Y N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 22155540 G A Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 3 22155720 G T Y N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 22155731 G A Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 22155802 C A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 22155817 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 22155891 T G Y N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 22155896 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 22156118 G A Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 22156225 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 22156230 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 22156580 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 22156791 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22156839 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22156883 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22156906 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 22160016 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 22160059 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22160078 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22160098 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22160115 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 22160183 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22160191 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22160210 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22160298 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22160312 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 22160429 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 22160458 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22160471 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22160472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22160553 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22160589 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22160608 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22160609 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22160629 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22160678 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22160696 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 22160854 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22160858 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22160880 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22160914 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 22160920 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22160956 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 22160976 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22161043 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22161063 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22161125 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22161343 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22161442 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 22161457 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22161508 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 22161571 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 22161582 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22161594 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 22161649 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22161650 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 22161697 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 22161849 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 22161896 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 22161966 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 22162035 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 22162113 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 22162149 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22162209 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22162238 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0555555555555556 0.722222222222222 0.222222222222222 15 21 1 13 4 3 22162267 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 22162337 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 22162338 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 22162390 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22162431 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22162440 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 22162456 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22162511 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22162599 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22162673 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 22162713 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22162715 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22162801 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 22162814 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 22165519 C T Y Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 6 8 0 6 1 3 22166693 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 22166704 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 22166708 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 22166747 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 22166755 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 22166770 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 22166800 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 22166818 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 22166876 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 22166906 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22166916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22166929 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22166997 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22167006 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22167104 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22167113 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22167155 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22167215 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 22167249 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22167397 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 22167434 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 22167435 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22167453 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22167538 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22167543 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22167552 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 22167579 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 22167614 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22167625 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22167682 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 22167694 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 22167704 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22167748 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 22167802 A C Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 22167854 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 22167864 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22168036 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22168052 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22168064 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 22168078 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22168159 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22168180 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22168555 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 22168592 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 22168968 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 22169156 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 22169244 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 22169297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22169317 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 22169318 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 22169511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22169570 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 22169581 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 22169588 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 22176248 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 22176317 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22176333 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22176351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22176453 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 22176501 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 22176532 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22176843 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22176877 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22177063 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22177422 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 22177475 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 22177560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22177710 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22177719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22177730 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 22177816 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22177840 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22184032 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 22184064 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22184105 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 22184196 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22184600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22184681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22184695 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22184726 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22184749 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22184763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22185195 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 22185221 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22185343 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22185462 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 22185520 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22185567 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 22185607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22185715 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22185727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22185896 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22185935 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22186062 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 22186112 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22186120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22186162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22186310 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 22186332 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 22186393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22186707 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22186860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22186969 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 22186971 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 22187046 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 22187049 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 22187902 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 22187922 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 22187932 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22188025 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 22188357 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 22188383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22188459 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22188612 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22188774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22188809 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 22188824 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22189086 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 22189244 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 22189331 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22189370 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 22189373 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 22189418 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22189563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22189577 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 22189668 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22189738 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 22189897 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 22189976 C T N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.214285714285714 0.0714285714285714 0.714285714285714 7 21 3 1 10 3 22190063 G C N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 22190113 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22190129 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22190137 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22190169 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22190184 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22190357 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22190414 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 22190497 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 22190500 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 22190524 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 22190632 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22190787 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 22190795 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 22191055 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 22191109 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 22191149 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 22191170 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22191286 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22191452 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 22191550 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22192005 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 22192124 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 22192275 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22192282 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 22192462 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 22192603 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 22193365 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 22193559 C G Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 22193656 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22193787 T C Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 22193811 G C Y N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 22197077 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 22197142 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 22197209 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 22197324 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22197352 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 22197447 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22197720 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22197822 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22197828 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22197865 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 22197909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22197960 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 22197968 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22198018 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22198053 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 22198069 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22198091 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 22198094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22198144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22198340 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 22198468 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 22198481 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 22198601 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22198610 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 22198643 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 22198803 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22198811 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22198866 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 22198988 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 22199200 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 22199279 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 22199290 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 22205580 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 22205846 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22205917 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22205922 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22205974 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 22206670 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22206671 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22207042 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22207079 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 22207140 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 22207235 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 22207938 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22208255 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 22208556 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 22208894 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 22209127 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 22209246 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 22209257 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 22209277 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 22209302 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 22209473 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 22209484 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 22209556 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22209664 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 22209720 C T Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 22209731 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 22209811 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 22209995 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 22210032 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 22210045 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 22210219 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 22210267 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 22210284 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 22210349 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 22210400 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 22210432 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 22210443 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 22210483 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 22210504 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 22210584 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 22210646 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 22210759 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 22210968 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 22211014 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 22211170 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 22211625 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 22211661 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 22211758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22212112 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 22212195 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22212352 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22212432 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 22212614 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 22212638 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 22212806 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 22213224 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 22213244 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 22213371 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 22213618 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 22213647 T C Y Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 3 22213653 T C Y Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 3 22213665 G C Y N 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 3 22213803 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 3 22213916 C T N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 3 22213918 C A N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 22213976 T G N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 3 22214113 G C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 22214239 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 22214244 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 22214508 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 22214512 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 22215080 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 22215429 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 22215451 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 22217362 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 22217840 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22217856 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 22218397 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 22218702 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22218879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22224781 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22224945 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 22225112 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 22225614 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 22226031 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 22227252 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 22229855 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 22231062 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 22231232 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 22232125 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 22232900 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22233748 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 22234307 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22234326 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22234542 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22234581 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22234648 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22234691 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22234725 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22234839 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22234868 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22234961 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 22235037 A G Y Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 3 22235339 C A Y N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.6 0 0.4 6 4 3 0 2 3 22235342 C T Y Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.6 0 0.4 6 4 3 0 2 3 22241425 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 22241477 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 22241508 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 22241529 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22241631 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 22241709 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 22241713 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 22241821 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 22241975 A G Y Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 3 22241976 T G Y N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 3 22242104 G A Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 22242173 T G Y N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 22242187 T G Y N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 22242201 T G Y N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 3 22242471 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22242496 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 22242527 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22242660 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 22242663 T A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 22242673 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 22242704 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 22242955 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 22243129 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 22243351 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 22243367 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 22243410 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 22243424 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 22243508 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22243600 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 22243657 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 22243747 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 22243774 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 22243992 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 22244308 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22244589 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22244662 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22245051 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 22245092 T G N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 22245229 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 22245254 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 22245571 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 22245612 A C N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 22245662 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22245676 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22245770 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22246009 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 22246128 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 22246211 G T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 22246254 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 22246264 T C Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 22246267 A T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 22246411 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 22246430 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 22246440 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22246446 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 22246483 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22246689 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 22246705 C T Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 22246762 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 22246773 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22246811 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22246855 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 22247158 A G Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 22247174 A G N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 22247180 G A Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 22247192 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 22247194 T C N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 22247257 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 22247264 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 22247270 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 22247341 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 3 22247400 T C N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.454545454545455 0.454545454545455 0.0909090909090909 15 7 5 5 1 3 22247413 G T N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 3 22247449 G T N N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 3 22247582 T C N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 12 8 4 4 2 3 22247606 G C N N 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 10 6 3 4 1 3 22247658 T C N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 3 22247718 C T N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 13 7 4 5 1 3 22247802 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 22247820 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 22248001 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22248009 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 22248230 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 22248491 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 22248580 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22248629 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22248647 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 22248781 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 22248931 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22248977 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22248988 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22249055 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22249149 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22249152 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22249195 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22249198 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22249224 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22249360 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22249477 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22249506 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 22249523 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 22249543 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 22249572 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 22249594 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 22249661 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 22250097 A T N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 22250115 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 22250305 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 22250509 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22250594 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22250655 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 22250739 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 22251402 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22251513 C G Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 22251609 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 22251844 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22251940 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 22252350 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 22252366 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 22252373 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 22252385 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 22252397 C G Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 22252425 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 22252720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22252739 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 22252853 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 22252878 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 22252952 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 22253386 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22253396 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 22253540 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 22253571 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 22254320 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 22254326 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 22254380 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 22254503 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 22254730 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 22254933 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22255043 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22255074 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 22255328 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 22255502 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 22256141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22256355 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 22256427 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 22256479 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 22256580 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 22256615 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 22256633 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22256758 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 22256820 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 22256848 A T Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 22256889 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 22256976 G T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 22257046 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22257401 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 22257673 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 22257740 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 22257995 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 22258018 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 22258120 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 22258355 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 22258427 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 22258583 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 22258661 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 22258716 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 22258816 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 22258864 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 22258989 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 22259013 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 22259115 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 22259122 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 22259219 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 22259231 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22259258 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 22259262 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 22259298 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 22259332 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 22259366 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 22259375 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 22259462 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 22259476 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 22259491 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 22259512 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 22259520 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 22259612 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 22259701 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 22259854 C G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 22259924 C T Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 22260092 G A Y Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 3 22260098 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 22260115 G A Y Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 3 22260126 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 22260159 T C Y Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 10 14 4 2 6 3 22285690 A G Y Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 3 22285785 T C Y Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 22285851 G A Y Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 5 9 1 3 3 3 22285858 G A Y Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 7 9 2 3 3 3 22286305 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 22286480 T A Y N 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 3 22286481 A T Y N 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 3 22286495 C T Y Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 3 22286503 C G Y N 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 3 22286509 T C Y Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 3 22286541 C T Y Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 3 22286619 G T Y N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 3 22286657 C G Y N 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 3 22286994 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 22287029 A G Y Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 3 22287095 G C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 22287139 G T Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 22287225 G A Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 22287320 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 22287324 G C Y N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 22287449 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 22287450 A G Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 22287490 T C Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 22287596 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 22287665 C T Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 22287685 T G Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 22287800 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 11 7 2 7 0 3 22288037 A C Y N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 3 22288040 T G N N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 3 22288084 A C N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 3 22288129 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 22288252 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 22288376 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 22288619 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 22288726 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 22289142 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 22289168 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22289306 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 22289453 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 22289777 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 22290054 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 22290072 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 22290232 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 22290311 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 22290478 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22290562 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 22290582 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22290650 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 22290710 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 22290799 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 22290859 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 22290864 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 22290958 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22291342 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22291491 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 22291616 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 22291643 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 22291729 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 22291734 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 22291762 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 22291855 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 22291882 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 22291952 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 22291953 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 22291977 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 22292002 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 22292032 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 22292130 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 22292137 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 22292181 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 22292217 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 22292222 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 22292283 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 22292328 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 22292426 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 22292438 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22292838 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 22293308 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 22293418 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 22293491 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 22293532 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 22293997 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 22294567 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22294588 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 22295215 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 22295269 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22295297 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 22295328 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 22295364 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 22295440 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 22295445 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 22295604 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 22296388 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 22296463 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22296539 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 22296571 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 22296595 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 22296626 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 22297060 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22297072 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22297174 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 22297199 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 22297342 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 22297352 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 22297684 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22297725 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 22297768 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 22298316 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 22298363 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 22298454 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 22298526 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22298534 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 22298619 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 22298755 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22299407 T A Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 22299638 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22299670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22299933 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 22299963 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22300197 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22300251 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22300472 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 22300595 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 22300761 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 22301175 G T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 22301185 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 22301186 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 22301216 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 22301577 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 22301591 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 22301616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22301649 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 22301762 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 22301788 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 22301815 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22301895 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 22301900 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 22302048 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 22302232 T A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 22302366 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 22302386 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22302733 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 22302743 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 22302848 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 22302869 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 22302894 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22303078 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 22303251 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 22303257 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 22303335 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22303377 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 22303400 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 22303436 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22303449 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 22303521 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 22303615 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 22303751 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22303771 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22303778 A C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 22303907 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 22304092 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 22304508 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22304607 G T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 22304612 C T Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 22304653 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 22304678 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 22304679 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 22304722 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 22304739 T C Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 22304829 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 22304901 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22304955 A T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 22304992 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 22305067 A C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 22305117 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 22305118 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 22305132 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 22305179 G C Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 22305247 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 22305255 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22305269 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 22305281 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 22305317 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 22305470 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 22305538 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 22305627 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 22305628 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 22305682 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 22305721 G C Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 22305763 C A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 22305787 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 22305889 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 22305946 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 22305961 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 22305983 G C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 22306026 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 22306046 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 22306954 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22306962 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 22306967 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22307197 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22307202 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 22307256 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22307342 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 22308211 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 22308311 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 22308366 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22308418 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22308495 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 22308591 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 22308600 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 22308940 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 22309051 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22309105 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 22309165 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 22309464 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22309598 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 22309623 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 22309782 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 22309853 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 22309951 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 22309962 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22310447 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 3 22310472 A G Y Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 10 8 2 6 1 3 22310661 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 22310704 C T N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 3 22310752 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 22310780 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 22310846 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 22310864 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 22310932 C A Y N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 22310971 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 22310992 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 22311034 G A Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 22311083 T C Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 22311105 G T Y N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 22311114 C G Y N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 22311123 T C Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 22311161 G C Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 22311216 G C Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 22311230 A G Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 22311256 T G Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 22311267 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 22311341 G T N N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 3 22312061 C T N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 22312112 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 22312153 G T Y N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 3 22312181 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 3 22312197 A T Y N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 22312198 A T Y N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 22312221 T C N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 3 22321713 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 22321803 T A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 22321814 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 22321824 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 22322022 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 22322028 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 22322038 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 22322103 A G N Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 5 5 2 1 2 3 22323310 C G N N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 22323351 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 22323376 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 22323399 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 22323413 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 22323444 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22323453 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 22323464 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 22323510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22323514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22323524 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 22323610 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 22323666 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 22323683 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22323686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22323703 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 22323719 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 22323730 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22323777 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 22323779 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 22324005 T G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 22324017 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 22324094 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 22325117 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 22325127 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 22325166 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 22325228 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 22325234 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 22325255 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 22325293 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 22325299 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 22325594 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 22325693 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 22325890 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 22325891 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 22326000 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 22326073 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 22326216 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 22326693 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 22326757 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 22326779 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22326887 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 22327129 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22327242 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 22328634 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 22330074 C G Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 22330354 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 22330411 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 22330635 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22330674 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22330966 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 22331340 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22332215 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22332311 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22332470 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22332510 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22332717 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 22332831 T C Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 22333244 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 22333250 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22333461 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 22333765 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22334496 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22334590 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22334620 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22334939 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22335810 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 22336125 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 22336275 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 22336615 C A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 22336702 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22336746 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 22336759 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 22336822 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22336837 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22336902 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 22336988 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22337114 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 22337121 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22337195 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 22337303 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 22337575 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22339989 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22340051 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 22340250 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 22341343 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22341575 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 22341655 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22342337 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 22343952 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 22344548 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 22344628 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22345832 C T Y Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 3 22345983 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 22346152 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22359779 G T Y N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.285714285714286 0 0.714285714285714 4 10 2 0 5 3 22360076 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 22360100 A C Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 22360292 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 22360805 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22362322 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 22362705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22362747 T C Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 22363378 A C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 22363870 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 22366009 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 22366396 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 22367700 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22368900 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22369175 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22369267 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22372491 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22373276 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 22374069 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22374503 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 22375429 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 22375848 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 22375947 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 22376546 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 22376996 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 22378157 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 22378336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22378673 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22380272 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 22381122 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 22382008 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 22382135 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 22382281 C G N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 22382729 T G Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 22383308 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 22383491 G T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 22383499 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 22383816 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22383948 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 22384959 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 22385057 T A Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 22385615 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 22386570 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 22386998 A T Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 22387144 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22387505 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 22387640 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22388180 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 22388225 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22388341 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 22388364 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 22390237 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22390841 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 22393786 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22393944 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22394098 A G N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0 0.785714285714286 0.214285714285714 11 17 0 11 3 3 22395067 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 22395830 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22395884 C G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 22396161 A G Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 22396786 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 22397025 A C Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 22397120 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22397684 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 22397807 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 22397905 C A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 22398116 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 22398477 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 22398926 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22399119 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 22400609 G A Y Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 22400666 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 22400697 G A Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 22400715 G T Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 22400961 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 22401725 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 22403368 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 22403408 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 22404648 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22405378 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22406129 T C Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 22407436 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 22407957 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 22408295 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22409785 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 22410484 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 22411018 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 22411160 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22411589 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 22411658 A C Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 22412127 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 22412183 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 22412780 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 22413211 T A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 22413570 T A Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 22413686 A C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 22419938 T G Y N 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 3 22420308 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 22420869 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22420889 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 22422201 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 22422285 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22423296 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22423728 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22423900 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 22424619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22424659 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 22425625 T A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 22426124 C T Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 22426287 T C Y Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 22426288 G T Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 22426359 T C Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 22426493 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22426692 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 22427487 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 22427858 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 22428165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22430831 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 22430978 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22431281 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22431525 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22431568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22431732 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22431741 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 22431895 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22432781 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 22434562 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22435309 C A Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 22436338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22436365 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22437088 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22437427 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22437674 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 22438100 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 22438643 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22439616 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22440365 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22440443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22441901 T G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 22444166 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22444245 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22444678 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 22444699 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 22445805 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 22447613 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 22447856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22448152 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22448174 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22448234 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 22448610 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 22449207 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22449471 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22449601 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22449724 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 22450066 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22450910 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 22452762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22455091 G C N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 22455214 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22458566 C A N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 3 22459087 A C Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 22459475 A G Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 22459746 G A Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 22460685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22461768 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22462107 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22462683 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22464235 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 22465225 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22465742 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 22468575 T A Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 22468885 C T Y Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 3 22469137 T C Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 22469334 A G Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 22469353 G T Y N 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 3 22471244 C G Y N 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 3 22471344 G A Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 22474877 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22475671 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22475824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22477115 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22477616 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 22478073 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22478535 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22480762 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22480957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22482811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22483196 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 22485213 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 22485535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22487783 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22487934 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22488437 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22490084 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22490168 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22492918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22493463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22493943 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 22495005 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 22495348 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22496754 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22497442 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 22498502 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22499484 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 22499921 G T Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 22500379 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22500464 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22501109 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22501636 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22502214 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22503054 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 22503167 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22504337 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22505270 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22506626 T G Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 22506662 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 22506727 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22506947 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22507002 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22507529 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22507624 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22507883 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22507901 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 22510870 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22517257 T G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 22517406 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 22517530 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 22517843 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 22518600 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22518788 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22519299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22527312 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 22527913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22528520 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22528755 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22528989 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22530135 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 22531029 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 22531104 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22531923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22532367 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22533789 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 22534487 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 22535233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22535915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22536524 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 22536801 C G Y N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 22536905 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 22537343 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 22537506 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 22539609 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22539761 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 22540727 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 22540987 T A Y N 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 3 22541003 C A Y N 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 22541497 G A Y Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 6 6 1 4 1 3 22541728 C T Y Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 6 8 1 4 2 3 22541790 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 22546550 T C Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 22549967 G A Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 22550230 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22550421 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22550903 G A Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 22551064 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 22551280 A T Y N 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 7 7 2 3 2 3 22558505 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22561166 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22561303 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22561598 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22562491 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 22562768 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22564614 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 22566385 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22566477 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22566983 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 22567379 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22567510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22567637 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22567735 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22567818 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 22567881 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 22567913 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 22567969 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 22567997 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22568008 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 22568017 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 22568134 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 22568187 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22568325 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 22568400 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 22568461 A T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 22568486 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 22568492 G C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 22575137 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 22575166 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22575207 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22575226 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 22575252 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22575312 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 22575371 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 22575741 C T N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 22575843 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 22575913 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 22576006 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22576112 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22576160 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22576321 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 22576443 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22576481 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22576503 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 22576520 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 22576543 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 22576585 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 22576602 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 22576692 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22576705 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 22576710 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22576767 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22576865 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22576888 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22576989 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22577068 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22577072 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22577345 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 22577506 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 22577519 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 22577629 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22577635 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22577649 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 22578134 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22578339 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 22578525 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22578685 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 22578825 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 22579453 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22579498 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22580080 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22580112 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22580522 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22580547 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22580642 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22581547 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22581613 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22581872 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 22582011 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22582032 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22582070 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 22582149 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22582215 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 22582308 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 22582482 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 22582648 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 22582693 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 22582857 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22583552 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 22583631 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22583678 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22583705 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22583781 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 22583804 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 22583834 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22583978 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 22584016 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22584020 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 22584084 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22584085 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22584143 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 22584150 C G N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 22584154 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 22584256 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22584332 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 22584432 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 22584705 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 22584725 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22585006 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22585009 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 22585023 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22585056 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22585062 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22585235 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 22585307 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22585593 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22585596 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22585669 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22586157 T C N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 3 22586233 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22586271 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 22586313 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22586343 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22586354 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 22586371 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22586526 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22586587 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 22586597 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 22586624 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22586642 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 22586676 C A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 22586845 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 22586898 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 22586907 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 22586924 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 22586925 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 22586957 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 22587090 G C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 22587174 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 22587199 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22587239 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 22587242 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 22587285 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22587409 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22587582 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22587647 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22587793 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 22587811 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 22587989 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 22588162 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 22588319 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 22588329 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 22588376 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 22588380 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 22588433 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 22588582 G T N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 22595046 G C N N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 8 8 3 2 3 3 22595181 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 22595199 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 22595352 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 22595358 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 22595364 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 22595427 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 22595440 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 22595477 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22595611 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 22595762 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22595807 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 22595821 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 22595856 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22595879 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 22596061 T A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 22596126 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 22596141 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 22596340 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22596424 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 22596660 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 22596815 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22596891 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 22596907 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 22596995 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 22597081 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22597083 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 22597228 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 22597305 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 22597369 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22597389 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 22597452 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 22597502 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22597634 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 22597651 T A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 22597742 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 22597754 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22597825 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22598649 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22598849 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22599279 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 22599284 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 22599362 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 22599548 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 22599663 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22599672 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 22599722 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 22599858 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22599918 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 22599997 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 22600021 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 22600069 T G Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 22600080 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 22600087 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 22600098 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 22600147 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 22600152 T G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 22600161 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 22600240 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 22600253 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 22600258 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 22600274 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 22600441 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 22600556 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 22600966 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 22604631 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 22604653 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22604767 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 22605260 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 22606527 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22606650 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 22606850 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22608086 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 22609060 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 22609392 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 22609933 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22610033 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22610464 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 22610579 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 22610597 T G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 22610616 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 22610874 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 22610882 C A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 22610886 A C N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 22611000 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22611007 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22611011 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 22611024 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 22611124 T G Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 22611141 A C Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 22611318 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 22611347 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 22611422 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 22611447 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 22611465 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22611485 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 22611486 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 22611549 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 22611663 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 22611676 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 22611720 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 22611794 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 22611812 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 22611834 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 22611894 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 22611969 G C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 22612026 A C Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 22612105 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 22612385 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 22612868 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 22612907 C G Y N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 22612935 T C Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 22613273 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 22613645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22613950 T G Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 22621382 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 22621954 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 22634327 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 22634393 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 22634749 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22634799 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22634853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22635692 C A Y N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 3 22635721 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 22636235 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22638418 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 22638704 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22638886 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 22638903 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 22639158 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 22640483 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 22640891 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22640955 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22642820 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22643102 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22644683 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 22645117 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 22645245 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 22645531 G A Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 22645611 A C Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 22646093 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22646221 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22646254 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22646264 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22646329 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 22646330 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 22646553 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 22646705 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22646837 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22646885 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22646985 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22647052 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22647372 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22647394 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 22647428 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 22647733 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22647939 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22648040 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 22648070 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 22648459 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22648570 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22648766 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22648803 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22648927 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22649077 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 22649199 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 22649260 C G Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 22649744 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22649768 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22649822 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22649846 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 22650021 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22650130 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22650271 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22652094 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22652403 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 22652412 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22652470 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22658880 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22658906 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 22658972 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22659152 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22659241 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22659415 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22659471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22659629 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22659762 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22659804 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 22660001 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 22660209 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 22660364 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 22660514 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 22660530 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 22660704 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22660917 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 22661283 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22661404 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22661623 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 22661783 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22661922 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 22662033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22662176 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 22662284 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22662320 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 22662328 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 22662474 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22662574 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22662840 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 22663037 G A Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 22663775 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 22664371 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 22664372 T G Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 22664600 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 22664619 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 22664669 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 22664775 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22664877 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 22665021 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 22665168 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 22665405 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 22665431 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 22665528 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22665610 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 22665696 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22665740 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 22665903 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22665915 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22666026 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 22666053 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 22666132 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22666276 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 22666387 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 22666457 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 22666573 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 22666655 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 22666772 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 22666842 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22667024 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 22667042 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 22667912 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22668331 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22668947 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22668976 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22669090 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22669592 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 22670285 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22670995 C A Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 22671334 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22671534 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 22672060 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 22672134 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22672313 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 22672327 C A Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 22672568 T C Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 22672577 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 22672614 T C Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 3 22672907 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22672945 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22672990 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 22673823 G T Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 22673856 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 22673861 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 22673971 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 22674019 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22674158 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22674331 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22674346 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 22674944 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 22675590 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 22675688 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 22675907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22675918 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22675936 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22675957 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22676215 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 22676476 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22676533 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22676540 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22677024 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22677613 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 22677750 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 22678094 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 22678193 C A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 22678204 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 22678300 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 22678688 G T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 22678804 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 22679676 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 22679716 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22679928 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22679964 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22680013 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22680217 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22680251 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22680301 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22680489 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22680538 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 22680851 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 22680925 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 22681134 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22681413 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22681785 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22682353 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22684423 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 22684585 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22684655 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22684668 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22684855 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22685001 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22685173 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22685211 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22685219 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22685401 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 22685932 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 22686010 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22686299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22687018 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 22687114 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 22687194 C T N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 22687531 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 22687705 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 22687763 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 22687956 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22687980 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 22687981 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 22688029 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 22688121 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22688142 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 22688236 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 22688501 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 22688705 A G N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 10 10 4 2 4 3 22688750 G A N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 3 22688880 C T Y Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 9 11 3 3 4 3 22688883 T C Y Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 9 11 3 3 4 3 22688930 G A Y Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.272727272727273 0.272727272727273 0.454545454545455 9 13 3 3 5 3 22689779 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22689807 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22690094 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22690149 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 22690781 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22690833 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22690899 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 22690949 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 22690990 G C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 22691204 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 22691536 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22692109 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 22692195 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 22692239 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 22692769 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 22692917 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22693069 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 22694127 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 22694223 T G N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 3 22694446 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22694574 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 22695247 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 22695858 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 22696160 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22696222 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22696243 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 22696284 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22697282 T C Y Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 12 4 5 2 1 3 22697319 A G Y Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 3 22697540 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 3 22697583 C G Y N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 22697706 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22697858 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22698585 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 22699301 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 22699502 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22699792 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 22699859 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 22699913 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 22700764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22701001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22701719 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22701722 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 22702412 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22702698 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 22703210 C A N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 22703749 A T Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 22703957 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22704107 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22704249 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 22704334 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 22704726 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 22705004 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22705099 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 22705150 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 22705252 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 22705389 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 22705572 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 22705763 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 22706025 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22707598 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 22708508 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22709218 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22709630 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 22709899 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 22709954 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 22710025 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 22710077 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 22710080 A C N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 22710573 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 22710610 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 22711950 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 22712210 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22712453 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22712536 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22712688 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22712868 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22713038 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 22713455 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22713485 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22713498 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22713902 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 22713929 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22713982 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22714492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22715599 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22716478 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 22716493 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 22717264 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22717442 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 22717636 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 22717761 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22717881 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 22717910 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 22718154 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22719116 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 22719321 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 22719794 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 22719874 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 22719992 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 22720064 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 22720179 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 22720213 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 22721017 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 22721098 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 22721121 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22722097 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22722350 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 22722590 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 22722654 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 22723192 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22723884 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 22723969 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22724016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22724234 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22724253 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 22724699 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 22724716 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 22725247 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 22725357 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22725417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22725543 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 22725611 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22726093 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 22726342 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 22726359 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 22726433 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22727037 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22727151 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 22727414 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22727630 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22727698 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 22727750 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22727814 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22727845 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22728009 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 22728055 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22728141 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22728242 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22728804 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 22729081 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 22729195 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 22729692 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 22730262 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22731892 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 22732359 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 22733022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22733023 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22733661 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22734443 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 22734547 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 22735333 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 22735448 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 22735534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22736368 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22736794 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 22736822 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22736829 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22737368 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 22737378 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 22738587 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 22738949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22738973 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 22739425 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22740282 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 22740471 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 22741116 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 22741882 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 22742131 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22742733 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22743355 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 22743464 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 22744420 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22745243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22745557 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22745611 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 22745749 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22746423 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22746505 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 22746599 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 22746962 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 22747032 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22747130 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22747765 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 22748273 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22748830 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 22748950 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22749481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22749816 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22749906 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22750888 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22750999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22751985 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 22752282 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 22752930 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22753583 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22754108 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 22754212 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 22755105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22755117 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 22755481 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 22756365 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22757256 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 22757486 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 22757602 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 22757715 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22758047 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 22758186 T A N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 22758301 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 22758358 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 22758616 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 22758713 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 22758852 C A N N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 22758888 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 22758919 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22759019 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22759056 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 22759187 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22759628 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22759828 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 22760233 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 22760372 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22760501 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 22760577 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 22760745 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22761460 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 22761486 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 22761509 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22761552 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22761571 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22761914 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 22762916 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22763984 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22764482 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22765373 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22769050 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22770693 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 22771592 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22771933 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22772103 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22772246 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22772555 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22772646 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22773604 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 22774529 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 22774738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22775808 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22776719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22778057 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22778333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22778460 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22778698 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22779567 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22780139 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 3 22780311 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 22781661 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22781882 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22781896 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 22781920 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 22781942 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 22782000 G T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 22782283 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 22782794 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 22783364 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 22783431 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 3 22783940 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 22783957 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 22784074 A C N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 3 22784630 T A N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 22784709 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 22784832 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 22784878 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 22785177 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22785298 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 22785448 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 22785531 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 22785671 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 22785798 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22786343 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22786387 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22786446 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22786515 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 22786542 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22786550 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 22786618 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 22786755 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22786827 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 22786972 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 22786973 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 22787086 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22788108 G C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 22788563 A T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 22789169 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 22789233 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 22790036 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22790039 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 22790062 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 22790260 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22790364 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 22790454 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22790535 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 22790596 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22790684 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 22790689 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 22790722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22790860 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 22790879 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22790958 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 22791098 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 22791155 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 22791263 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 22791702 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22791756 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 22791781 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22791881 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 22791913 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 22792577 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 22792587 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 22792722 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 22792823 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 22792906 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 22793315 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 22793496 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 22793559 A C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 22793613 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 22793697 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22793926 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 22794074 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 22794212 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 22794229 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 22794473 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22794901 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22795387 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 22795427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22795441 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 22795466 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22796120 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22796223 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 22796243 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22796396 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 22796455 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 22796555 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 22799024 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 22813244 T C Y Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 3 22814189 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 6 12 2 2 5 3 22814208 T G Y N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 3 22814341 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 22814365 T G Y N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 22814380 T C Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 22814381 G C Y N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 22814392 A G Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 22814399 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 22814425 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 22814625 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 22814725 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 22814737 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 22814776 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 22814842 C T Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 22814843 A G Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 22814906 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 22814911 A C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 22814922 G T Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 22814939 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 22815040 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 22815085 C T Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 22815165 C A Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 22815175 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 22816270 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 22816292 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 22816406 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 22816784 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 22816802 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 22816951 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 22816994 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 22817014 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 22817079 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 22817187 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 22817277 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 22817353 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 22817613 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 22817642 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 22817981 T A N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 22817991 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 22818095 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22818099 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 22818473 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 22818598 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 22818877 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 22818915 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 22818947 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22819163 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22819192 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 22819536 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 22819626 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 22819862 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 22820157 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 22820216 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22820531 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 22820695 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 22820766 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22820791 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 22820936 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22820948 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22820972 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22821170 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 22821248 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 22821304 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 22821329 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 22821368 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 22821376 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 22821398 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 22821414 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 22821442 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 22821485 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 22821524 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 22821589 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 22821598 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 22821819 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 22821825 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 22821864 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 22822133 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 22822152 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22822177 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 22822290 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 22822313 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 22822325 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 22822389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22822390 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 22822541 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 22822560 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 22822636 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 22823152 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22823291 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 22823352 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22823528 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 22823699 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 22823709 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 22823829 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 22824500 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 22824671 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22824792 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 22824865 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 22824998 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 22825064 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 22825083 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 22825131 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 22825146 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 22825156 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 22825308 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 22825576 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 22825683 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 22825748 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 22826116 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22826385 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22826476 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22828137 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22828149 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22828331 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22828722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22830065 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 22830095 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 22830586 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 22831248 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22831898 A G Y Y 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 3 22838109 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 22838154 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22838869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22839240 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22839266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22840264 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22840377 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22840450 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22840549 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 22840618 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 22840921 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 22841067 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 22841169 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22841186 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22841743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22841915 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22842220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22842758 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22843537 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22843548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22843697 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22844031 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 22844371 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22845231 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22845499 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 22845744 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 22845803 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 22845846 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 22845894 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22845900 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 22846225 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 22846468 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 22846812 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 22847359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22847393 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 22847422 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22847485 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 22847492 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 22854393 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 22854478 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 22854501 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 22854688 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 22854711 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 22854736 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 22854764 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 22854880 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22854881 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 22854954 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 22854981 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 22855004 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 22855146 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 22855207 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 22855227 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22855295 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 22855326 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 22855358 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 22855401 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 22855615 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 22855784 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 22855790 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 22855893 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 22855900 C G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 22855981 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 22856139 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 22856246 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 22856592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22856751 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 22856824 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 22857297 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 22857304 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 22857325 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 22857641 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 22857665 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 22857749 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 22857767 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 22857851 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 22857893 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 22857940 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 22858011 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 22858081 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 22858171 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 22858248 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22858304 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 22858345 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 22858401 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 22858425 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 22858553 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 22858674 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 22859018 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22859125 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 22859196 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 22859309 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 22859437 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 22859459 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 22859501 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 22859703 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 22859819 A C N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 22859890 C G N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 22859903 G A N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 22859953 C T N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 3 22860040 C A N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 22860065 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 22860072 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 22860183 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 22860199 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 22860217 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 22860226 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 22860381 A T N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 22866772 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 22866806 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 22866854 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 22866911 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 22866965 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22867039 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 22867372 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 22867406 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 22867541 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 22867803 A C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 22867815 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 22868004 A T N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 22868107 T G N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 3 22868163 C T N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 3 22868197 G C N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 3 22868491 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22868733 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 22868842 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22868896 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 22869152 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 22869414 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22869435 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 22869608 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22869648 G T Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 3 22869771 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 22870159 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 22870175 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22870254 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 22870299 T G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 22870339 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 22870387 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 22870404 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22870464 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 22870541 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 22870745 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22871115 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22871126 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 22871294 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22871325 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 22871404 C G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 22871405 G C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 22871534 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 22871697 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22871735 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 22871771 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22871822 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 22871862 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 22872340 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 22872437 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 22872469 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 22872787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22873000 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 22873125 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 22873375 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22873441 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 22873450 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22873491 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22873696 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22873976 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 22874020 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 22874114 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 22874158 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 22874297 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 22874471 A T Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 22874705 G T Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 22874713 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 22874717 A G Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 22874858 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 22874990 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 22875023 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 22875035 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 22875056 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 22875207 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 22875317 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 22875809 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 22875879 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22875918 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 22875922 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 22875972 G A N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 3 22876021 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 22876054 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 22876069 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 22876104 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 22876234 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22876272 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22876275 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 22876342 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 22876490 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 22876574 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 22876581 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 22876718 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 22876737 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 22876927 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22876976 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 22876996 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 22877072 A G Y Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.181818181818182 18 4 9 0 2 3 22877566 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22877806 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 22877887 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 22878248 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 22878393 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 22878772 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 22879414 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22879620 G T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 22880427 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22880486 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 22880551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22880580 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22881037 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 22882162 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 22882414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22884565 T G Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 22884621 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 22885804 T G Y N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.6 0 0.4 6 4 3 0 2 3 22886192 G C Y N 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.5 0 0.5 6 6 3 0 3 3 22886327 A G Y Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 3 22886954 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 3 22887305 C G N N 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.444444444444444 0 0.555555555555556 8 10 4 0 5 3 22887484 T C N Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 9 5 4 1 2 3 22888501 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 22889155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22890096 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 22890573 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 22890623 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 22890628 A C Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 22890665 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 22890899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22891126 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 22891369 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 22891517 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22891619 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 22893137 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 22893436 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 22894278 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22894388 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 22894572 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22894692 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 22894774 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22894805 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22894824 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 22895632 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 22895692 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22895775 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22895847 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22895894 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 22896036 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 22896438 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 22896473 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 22897215 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 22897315 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 22897487 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 22897551 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 22897862 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 22898317 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 22898380 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22898391 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22898418 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 22898597 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 22898631 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 22898788 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 22898971 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 22899089 T C Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 22899147 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 22899158 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 22899570 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 22899613 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 22899893 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 22900332 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 22900435 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22900483 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22900496 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 22900551 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 22900846 T G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 22900980 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 22901104 A C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 22901351 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 22901615 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 22901643 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 22901734 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 22901765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22901836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22901943 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 22901960 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 22902058 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 22902921 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22903150 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 22903176 T C N Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 10 6 3 4 1 3 22903456 G A Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 22903477 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 22903501 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 22905906 G A N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 22905973 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 22906005 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 22906983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22914323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22914654 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 22915107 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22916430 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22916487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22917634 A C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 22917743 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 22917960 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22918133 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 22918932 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 22919018 C T Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 22921072 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 22921083 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 22921108 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 22923203 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 22923334 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 22923437 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 22923639 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 22923829 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 22923969 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22926138 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 22927660 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22927947 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 22928385 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 22930492 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22931253 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22931403 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22931492 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22931879 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 22932463 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 22932497 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 22933530 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22933755 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22933880 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22934255 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22934566 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 22935746 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22935965 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 22936565 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 22936629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22937161 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 22937310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22937373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22937393 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22937526 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 22937969 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 22939245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22939488 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 22939684 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 22940321 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22940333 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 22941171 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 22941189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22941622 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 22942017 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22943320 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22944071 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 22944141 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 22944541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22944580 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 22944758 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 22945767 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 22946466 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22946689 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 22946780 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 22947248 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 22947604 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22947692 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22947728 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22948498 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 22950671 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 22951656 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 22952593 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22952644 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22955247 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 22955955 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 22957368 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 22959402 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 22960614 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22961096 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 22961774 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 22964528 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22964802 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22964981 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 22965049 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 22965073 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 22965314 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 22965425 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 22965445 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 22965456 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22965515 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 22965542 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 22965591 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 22965621 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 22965855 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 22965863 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 22966094 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 22966138 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22966263 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22966308 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22966334 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 22966433 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 22966461 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 22966476 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 22966547 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 3 22966576 A G Y Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.153846153846154 0.0769230769230769 0.769230769230769 5 21 2 1 10 3 22966582 G T Y N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 3 22966701 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 22966752 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 22966790 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 22966845 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 22966939 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 22967316 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 22967417 C G N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 22967618 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 22967624 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 22967725 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 22967801 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 22967915 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 22968118 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 22968773 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 22969107 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 22969108 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 22969230 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 22969718 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 22970149 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 22970409 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 22970488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22970574 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 22970735 A T Y N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 3 22970826 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 22970946 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 22971022 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 22971093 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 22971460 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 22971732 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 22972095 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 22972241 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 22972281 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 22972524 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22973030 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 22973121 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 22973190 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 22973373 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 22973389 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 22973442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22973458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22973468 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 22973469 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 22973480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22973563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22973720 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 22973799 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 22973820 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 22973835 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 22974029 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 22974043 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 22974811 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 22975171 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 22983658 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 22983659 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 22983779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22983847 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 22985292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22985402 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 22985612 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 22986001 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 22986011 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 22986012 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 22987054 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 22987185 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 22987261 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 22987425 C G Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 22987489 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 22987524 A G Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 22987636 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 22987749 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 22987836 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 22987972 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 22988142 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 22988379 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 22988905 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 22989312 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 22989520 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 22989540 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 22989613 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 22989641 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 22990060 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 22990122 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 22990465 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 22990481 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 22990713 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 22991524 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 22991579 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 22991664 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 22992594 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 22993197 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 22993329 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 22993360 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 22993455 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 22993634 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 22993804 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 22994538 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 22994803 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 22994833 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 22995141 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 22996433 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 22996459 G C N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 22996598 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 22996823 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 22996959 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 22997022 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22997055 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22997084 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 22997136 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22997175 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22997177 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22997188 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22997235 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 22997319 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 22997448 G A N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 3 22998344 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 22998401 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 22998726 T A N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 3 22998885 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 22998918 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 22998969 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 22999347 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 22999428 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 22999477 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 22999761 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 22999912 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 23000062 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23000155 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23000207 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23000226 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23000322 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23000477 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 23000674 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23000702 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 23000769 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 23000784 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 23000908 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 23001044 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 23001086 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 23001149 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 23001193 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 23001240 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 23001278 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 23001394 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 23001516 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 23001552 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 23001553 G C Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 23001711 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 23001716 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 23002145 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 23002606 A T N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 3 23003675 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 23003703 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 23003898 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 23004163 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 23004392 T G Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 3 23004397 G T N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 23004720 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 23004896 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 23005196 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 23005217 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 23005404 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 23006178 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 23006523 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 23006874 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 23007212 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 23007606 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 23007632 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 23008141 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23008645 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 23009091 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23010990 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23011022 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 23011557 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 23011858 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 23011961 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 23012188 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 23013320 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23013344 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23013399 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 23013415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23013513 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23013557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23013563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23013958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23013970 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23014204 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23014597 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23014642 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 23015015 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23015696 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23016285 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23017837 A G Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 23018282 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 23018688 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23020208 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 23020952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23021120 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 23021268 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 23021554 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23021806 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23021948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23022712 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23022893 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23023258 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23024894 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23025073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23025403 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23025732 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 23025745 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23026135 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 23026792 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 23026851 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 23026943 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 23027116 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23027158 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 23027337 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 23027515 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 23027522 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23027638 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 23027696 C T N Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 9 5 4 1 2 3 23027898 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 23027991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23028309 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 23028314 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 23028381 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 23028768 T A Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 23028915 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 23028936 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 23028989 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23029016 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23029146 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 23029261 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23029488 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23029660 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23029723 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23029786 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23029925 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 23029972 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0 0.722222222222222 0.277777777777778 13 23 0 13 5 3 23030352 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 23030408 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23030421 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23030759 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 23031145 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 23031155 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23031168 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 23031283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23031569 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23031682 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23031733 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 23031802 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 23031885 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23031959 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23031974 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23032034 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23032080 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23032123 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23032167 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23032189 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23032196 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23032205 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23032272 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23032324 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23032493 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 23032919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23033141 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23033231 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23033692 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23033884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23034228 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23034244 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23034359 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23034460 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23034622 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23034627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23034665 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23035446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23036321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23036661 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23037496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23037890 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23039439 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23039704 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23039748 A T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 23039833 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 23040135 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23040206 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 23040234 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23040237 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23040279 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 23040349 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 23040584 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23040608 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 23040716 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 23040851 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23040866 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23040872 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23042368 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23042400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23044281 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23044390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23044459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23044839 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23046280 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23046304 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23046864 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 23047006 T G Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 23047290 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 23049392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23049520 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23050001 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 23050119 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23052872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23053056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23054173 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23054645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23055052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23055551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23056463 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 23056549 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 23056789 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 23059398 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 23059449 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 23059994 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23060033 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23060147 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23060322 A T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 23060484 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23060886 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 23060982 T G N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 23061334 G A Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 23061335 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 23061370 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 23061379 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 23061597 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 23061722 T C N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 3 23061859 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 23061972 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 23061974 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 23062067 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 23062165 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23062358 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 3 23062415 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23062449 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 23062504 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 23062620 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 23062633 G A N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 3 23062843 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 23062870 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 23062939 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23062994 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 23063042 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23063436 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23063461 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 23063582 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 23063912 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 23063990 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23064128 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23064309 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 23064373 G T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 23064383 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 23064961 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 23065307 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23065601 A C N N 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.181818181818182 0.636363636363636 0.181818181818182 11 11 2 7 2 3 23065876 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 23065884 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 23065901 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 23065963 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 23065985 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 23066002 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 23066036 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 23066132 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 23066195 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 23066205 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 23066320 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 23066334 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23066387 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23066505 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 23066630 A C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 23066655 A T N N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 3 23066701 A T N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 3 23066836 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 23066941 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23067038 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23067363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23067375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23067544 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.176470588235294 0.705882352941177 0.117647058823529 18 16 3 12 2 3 23067982 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 23067985 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 23068035 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 23068142 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 23068163 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 23068221 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 23068267 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23068332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23068350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23068395 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23068406 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23068773 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 23069259 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23072359 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 23072447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23081870 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23082344 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 23083086 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23083205 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23083559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23084270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23084591 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 23085590 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23085815 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23086123 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23086138 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23086172 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23086347 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23086895 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23087379 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23087546 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23087642 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 23087675 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 23087761 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 23087798 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23087871 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23088024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23088050 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 23088119 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23088455 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23088688 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23088746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23088956 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23089010 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23089076 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23089284 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23089336 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23089401 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 23089402 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23089414 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23089417 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23089436 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23089492 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23089507 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23089532 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23089652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23089700 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23089708 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 23089966 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23089989 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23090082 C G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 23090117 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 23090214 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 23090292 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23090367 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 23090394 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 23090531 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 3 23090576 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 23090660 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 23090771 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23090812 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23091058 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 23091144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23091171 G T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 23091207 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 23091216 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 23091533 C T Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 3 23091553 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 23091682 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 23091834 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0555555555555556 0.722222222222222 0.222222222222222 15 21 1 13 4 3 23091835 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 3 23091927 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 3 23092273 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23092295 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23092378 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23092416 G T Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 23092542 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23092615 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 23092643 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 23092663 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23092772 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 23092803 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 23092886 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 23092994 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23093018 C T Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 23093132 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23093185 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23093198 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 23093209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23093248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23093814 G C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 23093819 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 23093951 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23094265 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23094372 T A Y N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 23094870 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 23094895 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23095581 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 23095590 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 23095731 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23096240 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 23096338 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 23096368 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 23096391 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 23096403 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 23096414 T C Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 23096569 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23096692 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 23096709 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 23096743 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 23096821 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 23096882 A G N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 23096889 G T N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 23097046 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23097049 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 23097209 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23097325 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 23097543 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 23097624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23097742 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23097754 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 23098240 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 23098430 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 23098964 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23099004 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23099371 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 23099375 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 23099532 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 23100371 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 23101031 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23101072 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23101228 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 23101749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23101808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23101829 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23101873 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 23101986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23102160 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23102327 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 23102499 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23102604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23102731 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23102963 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 23103238 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23103410 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23103462 A T N N 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.181818181818182 0.636363636363636 0.181818181818182 11 11 2 7 2 3 23103492 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 23104742 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 23104832 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23105539 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23105872 C A Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 23105966 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 23106183 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23106635 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 23106646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23106650 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 23106724 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 3 23106808 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 23107128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23107274 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23107537 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23107715 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23107932 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23108094 T A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 23108589 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 23108694 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23108780 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 23108833 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 23108905 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 23109165 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23109228 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23109396 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 23109505 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23110518 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 23110543 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23111141 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 23111227 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 23111264 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 23111285 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23111365 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23111375 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 23111560 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 23111751 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 23111917 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23112667 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 23112965 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 23113055 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 23113288 A T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 23113459 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 23113508 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23113618 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 23113652 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23113676 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 23113688 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 23113784 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 23113795 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23113854 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 23113899 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 23113942 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23113968 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 23114040 G T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 23114056 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 23114085 C T Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 23114157 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 23114191 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 23114433 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 23114484 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 23114505 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 23114595 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 23114654 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 23114789 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 23114919 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23115277 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 23115408 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 23115673 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 23115695 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 23115720 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 23115891 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 23116274 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23116285 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23116392 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 23116533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23116543 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 23116601 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 23117236 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23117307 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 23117983 T G N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.571428571428571 0.357142857142857 10 18 1 8 5 3 23118079 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 23118144 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23118166 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 23118239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23118459 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23118586 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 23118601 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23118632 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 23119238 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 23119410 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 23119518 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 23119741 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 23119893 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 23119929 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 23120790 T A N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 23120915 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 23121026 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23121112 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 23121167 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 23121184 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 3 23121233 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 23121241 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 23121267 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 23121347 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 3 23121384 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 23121456 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 23121462 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 23121487 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 23121499 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 23121533 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 23121547 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 23121639 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 23121651 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 3 23121724 G C Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 23121726 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.105263157894737 0.736842105263158 0.157894736842105 18 20 2 14 3 3 23121779 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 23121814 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 3 23121822 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 3 23121842 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.1 0.7 0.2 18 22 2 14 4 3 23121931 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 23122028 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 23122060 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 23122073 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 23122205 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 23122279 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 23122338 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 23122392 G C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 23122454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23122500 A C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 23122504 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 23122546 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 23122552 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 23122593 C G Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 23122604 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 3 23122617 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 3 23122874 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 23123232 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23123240 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 23123255 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23123300 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 23123310 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 23123394 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 23123426 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23123451 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23123497 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 23123506 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 23123534 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 23123561 T G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 23123631 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 23123690 T A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 23123701 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23123864 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 23123884 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23123901 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 23124019 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 23124082 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 23124175 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 23124194 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 23124338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23124465 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23124481 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23130206 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 23130215 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 23130217 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 23130227 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 23130234 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 23130295 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 23130317 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 23130320 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23130484 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23130509 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 23130557 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 23130574 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 23130597 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23130683 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 23130701 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 23130758 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 23130770 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 3 23130778 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 3 23130903 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 23131042 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23131267 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 23131364 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 23131492 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 23131495 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 23131598 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23131670 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23131693 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23131721 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23131768 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23131772 T A N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.266666666666667 0.666666666666667 0.0666666666666667 18 12 4 10 1 3 23131804 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 3 23131982 G A N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.25 0.583333333333333 0.166666666666667 13 11 3 7 2 3 23132055 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 23132100 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 23132154 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 23132157 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 23132195 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 23132559 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 3 23132589 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.157894736842105 0.736842105263158 0.105263157894737 20 18 3 14 2 3 23132795 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 23132839 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 23133052 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 23133068 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 23133095 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 23133157 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 23133434 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 23133505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23133604 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23133804 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 23133841 T C Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 23134020 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 23134135 G C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 3 23134138 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 3 23134190 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 3 23134644 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 23134649 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23134788 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 3 23134929 A C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 3 23134968 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 3 23135078 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23135190 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 23135329 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23135353 C T N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.266666666666667 0.666666666666667 0.0666666666666667 18 12 4 10 1 3 23135511 C A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 23135555 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 23135649 T G N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 23135665 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 23135674 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 23135688 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23135709 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 3 23135734 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 23135890 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 23135934 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 23135981 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 3 23136024 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 23136210 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23136277 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23136502 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 23136703 A T N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 23136718 C A N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.125 0.75 0.125 16 16 2 12 2 3 23136908 T C N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 3 23137064 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 23137090 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 3 23137312 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 23137330 A G N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 23137526 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 23137599 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 23137662 T A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 23137781 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 23137881 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 23137940 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 23138038 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 23138252 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 23138275 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 23138364 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 23138519 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 23138799 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 23138896 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 23139497 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 3 23139572 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 23139703 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 3 23139850 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 23139861 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 23139928 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 23139940 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 23139983 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 3 23140007 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 23140116 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 23140120 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 23140444 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23140487 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 23140504 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23140626 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 23140881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23140882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23140988 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 23141029 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23141039 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23141047 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 3 23141107 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 23141111 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 23141167 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 23141204 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23141445 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23141498 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23141555 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23141630 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23141704 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23141840 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23141894 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 23141926 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 23142004 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 23142171 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23142222 G T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.176470588235294 0.705882352941177 0.117647058823529 18 16 3 12 2 3 23142394 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 23142726 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 23142808 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23142828 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 23142885 A G N Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 9 7 3 3 2 3 23142972 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 23143050 A T Y N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 23143583 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 23143610 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 23143646 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 23143871 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 23144184 C A Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.176470588235294 0.705882352941177 0.117647058823529 18 16 3 12 2 3 23144263 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 23144271 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23144425 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23144472 G T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 23144549 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 3 23144559 T C Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 23144572 T C Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 23144591 T C Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 23144616 G A Y Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 3 23144681 A G Y Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 3 23144913 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23144920 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 23145183 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 23145192 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 23145335 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 23145617 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23145624 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23145784 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23145953 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23146189 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 3 23146423 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 23146625 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 23147010 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 23148227 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23148274 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 23148472 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 23148477 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 23148508 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 23148560 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 23148673 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23148706 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 23149063 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 23149309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23149342 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 23149360 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 23149495 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 23149553 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23149667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23149772 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 23149800 G T Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 3 23149849 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 23149875 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 23150003 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 23150307 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23150344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23150374 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23151048 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23151076 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 23151086 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23151106 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 23151118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23151390 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23151453 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 23151483 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23151673 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 23151783 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 23152233 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23152525 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 23152845 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 23152986 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 3 23153065 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 23153112 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23153147 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 23153197 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23153199 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23153211 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 23153673 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23153733 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23153822 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 23154397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23154476 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 23154616 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.105263157894737 0.736842105263158 0.157894736842105 18 20 2 14 3 3 23154681 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.111111111111111 0.722222222222222 0.166666666666667 17 19 2 13 3 3 23154705 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23154777 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 3 23154810 G T N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.0625 0.625 0.3125 12 20 1 10 5 3 23154819 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 23154904 C T Y Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 3 23154956 C G Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 23154958 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 5 7 1 3 2 3 23155088 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 23155142 T G N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 23155150 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 23155298 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 3 23155399 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 23155427 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.125 0.6875 0.1875 15 17 2 11 3 3 23155561 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 23155565 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 23155582 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 23155727 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 23155798 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 23155928 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23155967 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 23156125 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23156138 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23156486 G A N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 23156601 T C N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 23156735 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 3 23163190 A T N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.153846153846154 0.538461538461538 0.307692307692308 11 15 2 7 4 3 23163221 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 23163278 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23163291 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23163336 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 23163753 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23163824 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23163876 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23163898 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23163926 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 23163933 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 23163954 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 23164137 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23164200 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23164221 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 23164603 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23164684 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 23164723 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 23164726 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 23164737 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 23164755 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23164788 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 23164818 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 23164844 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23164873 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23165218 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23165297 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23165525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23165795 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23165893 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 23165905 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 23165922 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23165936 C T N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 23165980 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 23166004 C G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 23166045 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23166467 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23166481 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23166521 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 23166531 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 23166555 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 23166619 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 23166827 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 23166835 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 23166863 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 23166904 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 23166953 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 23166963 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 23166982 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23167066 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23167067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23167109 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23167210 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23167290 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23167314 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23167324 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23167383 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23167427 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 3 23167459 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23167504 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 23167519 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23167591 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23167608 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23167854 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23169198 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23169424 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23170914 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.0526315789473684 0.736842105263158 0.210526315789474 16 22 1 14 4 3 23171206 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 23172225 A G Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 23173314 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23174074 T G Y N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 23174289 T C Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 23175117 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23175234 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 23175625 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23176185 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 23178909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23179459 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 23179526 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 23179534 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 23182216 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 23183816 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23184525 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23184551 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23184662 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23186526 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 23187703 G T Y N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 23189229 C T N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 3 23189773 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23190291 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23190473 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 23191594 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23191784 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 23192538 T C Y Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 3 23192597 T C Y Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 3 23192847 C T Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 23193020 C T Y Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.333333333333333 0.2 0.466666666666667 13 17 5 3 7 3 23193988 C T Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 3 23194518 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 23194691 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 3 23194738 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 23195003 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 23195194 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23195225 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23195258 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23195803 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 23196109 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23196759 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23196870 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23197257 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23197322 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 23198695 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23199116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23199390 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23199592 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23199618 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23200608 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23200851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23200886 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23214555 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23215391 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 23215945 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23216136 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23216759 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 23217372 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23220255 C G Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 23223164 C G Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 23223208 A G Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 23223221 A G Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 23223514 C A Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 23224110 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 23224746 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23225024 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 23225305 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 23225554 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23225581 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23226246 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23226372 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 23227061 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23227556 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23227645 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 23228271 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23228376 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 23229763 A T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 23229785 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23232751 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 23233902 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23234988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23235044 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23235534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23235558 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 23238798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23239569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23241505 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 23241556 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23242430 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 23242634 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 23243302 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23243589 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23243888 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23244579 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23245906 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23246095 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 23246998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23247239 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23247474 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 23247620 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23250626 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23250746 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23250822 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23251510 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 23252273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23260007 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 23262908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23265177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23265808 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23266116 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23267213 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 23268148 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 23268250 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23268638 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23271194 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23271202 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 23271647 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23271785 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23272994 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23274313 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23274945 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23275785 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 23276334 C A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23276971 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23277018 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 23278873 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23279502 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23279577 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23280488 C T Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 23282586 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23282787 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23284371 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23285257 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 23285563 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 23286078 G A N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 23286236 T A N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 23286382 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 3 23286386 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 3 23286481 G C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 23286494 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 23286548 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 23286587 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 23286609 G A N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 23286629 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 23286659 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 23286936 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 23287047 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 23287094 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 23287193 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 23287218 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 23287282 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 23287348 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23287662 T A N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 3 23287853 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 23287874 G C N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 23287949 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23288059 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 23288906 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 23288935 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 23289021 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23289052 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23289088 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 23289289 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 23289366 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 23289686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23289779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23289898 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23291309 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 23291345 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 23291471 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23291685 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 23292429 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 23292459 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 23292767 G A N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 3 23293076 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 23293324 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 23293426 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 23293460 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 23293714 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 23293743 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 3 23293744 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 23293772 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 23293820 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 23293849 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 23293853 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 23293908 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 23293920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23293986 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 23293994 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 23294011 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 23294039 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 23294082 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 23294142 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 23294158 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 23294166 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 23294189 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 23294277 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 23294290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23294388 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 23294439 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 23294630 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23294739 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 23294799 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 23294860 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 23294862 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 23294957 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 23294977 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 23295145 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 23295192 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23295502 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 23295520 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 23296497 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23296532 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23297171 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23297265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23297603 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23297751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23297829 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23297889 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23298057 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23298532 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 23298590 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23298901 A T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 23298913 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23299014 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23299036 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 23299255 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23299275 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 23299499 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 23299523 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 23299575 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23299632 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 23299641 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 23299647 A T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 23299886 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 23299913 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 23299922 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 23299943 A C N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 23300079 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 23300087 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 23300105 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 23300117 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 23300118 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 23300170 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 23300254 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 23300301 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 23300408 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 23300461 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 23300495 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 23300508 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 23300647 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 23300665 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 23300679 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 23300725 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 23300786 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 23300817 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23300819 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23300957 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 23301124 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 23301134 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 23301232 C A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 23301301 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 23301312 T C N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 23301334 G T N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 23301400 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 23301416 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 23301495 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23301512 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 3 23301635 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 23301816 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 23301830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23302089 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23303118 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23303288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23303410 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23303596 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23303824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23304209 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23304700 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 23304801 C G N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 23304916 T A N N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 3 23304933 T C N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 3 23305058 A C N N 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 3 23305129 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 23305201 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 23305468 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 23305551 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 23306632 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23306655 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23307721 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 23308500 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23308635 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23309038 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 23309194 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23309236 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 23309348 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 23309391 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 23309439 A G N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 23309464 T A N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 23309598 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 23309604 T C N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 23309639 A C N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 23309679 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 23309681 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 23309701 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 23309783 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 23309812 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 23309822 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 23309836 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 23309892 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 23309905 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 23309920 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 23309945 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 23309980 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 23310060 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 23310103 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 23310218 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 23310295 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 23310317 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23310364 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 23310514 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 23310725 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 23310851 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 23310882 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 23310905 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 23311362 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 23311599 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 23311641 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 23311761 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 23311992 T G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 3 23312226 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 23312236 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 23312270 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 23312271 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 23312592 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 23312773 C T N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 23312811 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 23312981 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 23313112 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 23313365 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 23313617 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 23313804 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 23313818 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 23313917 C T N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 3 23314432 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 23314497 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 23314512 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 23314597 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 23314711 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 23314899 A T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 23314900 C A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 23315055 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 23315374 A G N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0 0.545454545454545 0.454545454545455 6 16 0 6 5 3 23315481 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 23315549 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23315586 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23315640 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 23315657 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23315717 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 23315813 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 23315988 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23316245 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23316412 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 23316468 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 23316510 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 23316525 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 23316665 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 23316833 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 23316974 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23316991 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 23317067 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 23317135 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 23317287 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23317447 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 23317665 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 23317848 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 23317978 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23318083 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23318130 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 23318244 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23318277 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 23318382 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 23318394 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 23318432 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 23318531 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 23318579 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 23318654 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 23318765 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 23318770 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 23318783 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 23318908 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 23318933 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23319187 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23319375 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23319414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23319419 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23319811 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23320272 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23320365 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23320915 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23321099 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 23321292 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 23321301 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 23321351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23321549 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23321581 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23321644 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 23321744 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 23321780 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 23321878 G A N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 3 23322022 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 23322133 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 23322355 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 23322411 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 23322633 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 23322776 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 23322807 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 23322888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23322927 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 23323027 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 23323050 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 23323132 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 23323208 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 23323226 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 23323375 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 23323397 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 23323442 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 23323484 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 23323532 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 23323578 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 23323689 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 23323717 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 23323839 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 23323880 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 23324085 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23324149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23324342 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 23324451 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 23324460 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 23324516 G T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 23324670 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23324710 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 23325337 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 23325708 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23325799 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23325965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23325977 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 3 23326105 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23326340 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 23326549 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23326775 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23326811 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 23326944 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 23327151 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 23327348 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 23327362 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 23327539 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 23327815 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 23327858 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 23328750 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 23329029 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 23329092 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 23330098 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 23330377 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 23330502 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 23330630 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 23330801 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 23331395 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23331812 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23332148 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23332208 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23332230 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23332308 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23332316 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23332611 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23332627 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23332731 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 23332835 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 23332848 T A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 23332993 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23333107 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 23333414 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 23333623 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 23335982 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23336857 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23339000 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 23339218 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23340272 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 23340895 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 23340985 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23340987 A G Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 23341116 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23341260 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 23341606 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 23341681 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 23341801 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 23342625 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23343177 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 23345391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23345943 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23346472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23346645 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 23347387 T G Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 23347591 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 23347717 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23348083 A G Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 23348579 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23348669 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23348951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23349135 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23349686 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23349722 T G N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 23349850 T G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 23350253 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23351310 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23351532 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 23351540 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 23351834 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 23351964 G A N Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 9 9 2 5 2 3 23352036 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 23352449 A C Y N 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 3 23352605 A G N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 3 23352632 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 23352724 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 23352726 G C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 23352744 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 23352752 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 23352762 G T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 23352822 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 23352881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23353008 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23353119 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 23353227 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23353241 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 23353288 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 23353338 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23353351 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 23353360 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 23353470 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23353611 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 23353673 T G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 23353794 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23354046 C T N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 23354050 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 23354229 C T Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 23354299 T C Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 23354875 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 23354892 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 23354934 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 23354937 C A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 23355162 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 23355188 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 23355213 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 23355283 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23355528 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 23355534 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 23355647 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 23355731 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 23355783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23356349 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 23356445 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23358270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23359779 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23365261 C G Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 23368094 A G Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 23368309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23368704 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23369803 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0833333333333333 0.666666666666667 0.25 10 14 1 8 3 3 23370275 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23372029 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23374312 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 23374812 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23374881 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23374893 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23375200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23376208 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23376569 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 23377336 T G Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 23378261 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 23378518 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 23378550 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 23378581 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 23378680 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 23378690 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 23378736 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 23378737 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 23378770 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 23378771 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 23378963 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 23379010 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23379036 T G N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 23379052 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 23379214 C T N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 23379223 T C N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 3 23379248 T C N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 23379386 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 3 23379475 A G N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 3 23379483 G T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 23379502 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 23379518 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 23379522 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 23379772 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23379988 A C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 3 23379989 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 23380086 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 23380088 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 23380162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23380173 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23380186 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 23380196 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 23380224 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 23380656 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 23380688 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23380982 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 23381052 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 23381058 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 23381200 A G N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 3 23381211 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 23381279 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 23381306 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 23381369 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23381448 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23381468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23381538 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 23381568 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23381579 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 23381594 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 23381705 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 23381763 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23381794 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23381826 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 23381836 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23381914 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 23382054 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23382161 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23382246 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23382312 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23382487 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 23382512 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 23382535 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23382887 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23383292 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23384795 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 23384893 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 23385110 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 23385547 G C N N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 3 23385569 A T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 23385640 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 23385678 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 23385810 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 23386004 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 23386244 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 23386282 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 23386286 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 23386308 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 23386624 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 23386634 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 23386655 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 23386680 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 23386780 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 23386790 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 23386800 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 23386852 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 23386881 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 23387026 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 23387135 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 23387225 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 23387272 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 23387564 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23387958 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23388189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23388839 A G Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 23389185 A G Y Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 3 23389322 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 23389323 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 23390678 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23390712 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 23390863 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 23391240 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 23391315 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 23391575 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 3 23392407 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 23392515 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 23392540 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 23392555 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 23392724 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 23392829 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 23393173 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 23393198 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 23393213 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23393220 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 23393385 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23393443 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23393952 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23393994 C G Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 23394038 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 23394057 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23394209 G A Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 23394870 C G Y N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 3 23394995 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23395476 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23395579 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 23395747 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23395836 G C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 23396027 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 23396034 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 23396157 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 23396202 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23396215 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 23396390 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 23396406 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 23396532 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23396891 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23396964 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23397052 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 23397098 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 23397395 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 23397435 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 23397444 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 23397454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23397509 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 23397536 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 23397638 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 23397724 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 23397729 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 23397744 T A N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 23398009 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 23398066 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 23398570 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 23398615 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 23398944 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 23398956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23399056 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 23399184 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 3 23399236 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 23399281 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23399507 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 23399518 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 23399640 C T N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 3 23399648 T A N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 3 23399657 C T N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 23399752 A T N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 23399754 G T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 23399769 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 23400088 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23400308 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 23400365 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 23400514 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23400694 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 23400737 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 23400747 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 23400816 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 23400858 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 23400893 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 23400932 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23400971 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 23401036 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 23401042 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 23401067 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 23401098 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 23401122 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 23401135 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 23401185 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 23401264 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 23401277 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 23401327 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 23401348 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23401353 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 23402274 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 23402508 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 23402583 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23402601 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23402614 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 23402631 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 23402717 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 23402869 G T Y N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 3 23402881 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 3 23403294 T C Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.384615384615385 0.538461538461538 0.0769230769230769 17 9 5 7 1 3 23403315 G A Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 23403343 T G Y N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 23408706 A G N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 23408787 T C N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 23408807 T C N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 3 23408980 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 23409098 A G N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.5 0.214285714285714 0.285714285714286 17 11 7 3 4 3 23409118 A G N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.416666666666667 0.166666666666667 0.416666666666667 12 12 5 2 5 3 23409157 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 23409953 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 23410017 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 23410053 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 23410086 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 23410107 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23410297 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 23410736 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23410850 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23410907 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 23410994 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 23412001 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 23412274 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 23412391 T G N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 23412623 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 23412636 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 23412868 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23413205 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 23413441 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23413646 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23414065 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23414378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23414422 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 23414690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23414919 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 23414927 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 23415004 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 23415078 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23415545 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23415566 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23415882 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 23416019 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23416127 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23416893 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 23416917 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 23417143 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23417204 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23417358 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 23417385 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23419059 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 23419914 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 23422598 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23422625 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23422708 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 23423335 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 23424013 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 23424014 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 23426202 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23428285 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 23428332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23429226 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 23429458 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23429743 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23430072 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23431480 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 23432164 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23432548 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23432673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23433421 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23433778 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23434718 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23434938 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23434951 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 23435504 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 23435862 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23436252 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23436328 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23438844 C T Y Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.230769230769231 0.615384615384615 0.153846153846154 14 12 3 8 2 3 23440808 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23440844 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 23441402 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23441432 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 23441738 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 23441817 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23443015 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23443467 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 23443619 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 23443663 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23443791 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23444008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23444147 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 23444242 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 23444464 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 23444639 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23444731 T G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 23445116 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 23445272 C G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 23445609 A G Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 23446182 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23446730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23446820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23447017 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23447955 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 23448077 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 23448100 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 23448200 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23448219 T C N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 23448757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23449409 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 23449491 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23449693 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23450077 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23450609 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23451823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23451850 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23452153 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23452514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23453085 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23454050 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23454281 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23454728 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23454942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23455316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23455338 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23456579 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 23456757 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23457007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23457067 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 23457108 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 23457164 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 23457670 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23458139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23458184 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 23458397 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 23459022 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23459647 C A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 23459980 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23460101 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23460166 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 23460819 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23461921 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23461941 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23462065 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23462333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23462479 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23463117 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 3 23464017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23465297 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23465539 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23465856 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23465916 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23466683 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 23466756 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 23467223 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 23467512 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23469645 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 23470351 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23471725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23472112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23472294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23473364 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23473522 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23473571 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23474137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23474755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23474971 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 23477511 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23477909 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23478108 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 23478454 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 23480335 G T Y N 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 12 8 3 6 1 3 23484841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23485923 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23486146 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23486576 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23487296 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23487416 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23487554 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 23488314 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 23489658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23492139 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 23492144 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 23492807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23492956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23493839 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23494701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23495086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23495145 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23495455 G C Y N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 23495540 A C Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 23495641 G A Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 23496666 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 23497103 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23499838 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23500319 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23500883 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 23501668 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23502311 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23502394 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23503059 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23504849 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 23507049 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.111111111111111 0.722222222222222 0.166666666666667 17 19 2 13 3 3 23507633 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 23507852 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23507914 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23507998 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23508491 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23508839 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 23508860 A G Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 3 23509071 C G Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 3 23509184 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 3 23509450 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 23510900 A T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 23510993 C G Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 3 23511948 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23512049 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23512230 A T Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.210526315789474 0.736842105263158 0.0526315789473684 22 16 4 14 1 3 23512261 A G Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.1875 0.75 0.0625 18 14 3 12 1 3 23512262 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23512374 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23512756 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23513010 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 23513700 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23513720 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23514073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23514093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23514705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23514835 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23515050 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 23515207 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23515642 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23515906 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 3 23516401 G T Y N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 23516667 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 3 23517371 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 23517561 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 23517691 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23517855 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23517874 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 23517998 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23517999 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23518152 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23518192 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23518209 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23518332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23518339 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23518400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23518426 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23518428 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23518474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23518529 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 23518747 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23519145 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23519202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23519302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23519351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23519824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23520349 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23520355 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23520741 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 23520809 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 23520909 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 23521863 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23522050 C A N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 16 12 2 12 0 3 23522331 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 23522462 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23523582 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 23523610 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 23524971 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23526188 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23527545 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 23529755 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23531488 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23532507 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23533290 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23533434 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23533568 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23533756 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23537356 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23537502 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23537928 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23539950 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23540167 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23541202 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23541247 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.0588235294117647 0.764705882352941 0.176470588235294 15 19 1 13 3 3 23542102 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23542273 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23542527 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 23542596 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 23543690 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23544097 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.15 0.8 0.05 22 18 3 16 1 3 23546506 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 23547497 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23548153 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23548874 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23549885 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23550220 A G N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 3 23550619 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 23552098 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 23552122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23552791 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23553317 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23553639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23555069 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23555689 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 23555714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23555799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23555861 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23556056 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23556269 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23558145 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 23558579 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23558771 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23559272 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23559391 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23559725 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23561361 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23561484 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23561963 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 23562680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23563018 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23563327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23565026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23566501 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23566670 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 23566706 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 23566769 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 23566800 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 3 23566801 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 3 23566822 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 23566828 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 23566844 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 23567019 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23567023 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23567999 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 23568112 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 3 23568257 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 23568258 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 23568293 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23568398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23568413 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23568622 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23569039 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.15 0.75 0.1 21 19 3 15 2 3 23569501 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.176470588235294 0.705882352941177 0.117647058823529 18 16 3 12 2 3 23569752 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 23569931 G C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 3 23569943 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 23569964 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 23570062 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 23570091 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 23570103 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 23570226 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 3 23570280 T A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 3 23570376 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 3 23570390 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 23570401 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 5 7 1 3 2 3 23570674 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 3 23570828 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 23570934 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23570941 C A N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 3 23570978 G T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 23571108 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 23571120 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 23571234 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 3 23571352 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 3 23571404 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 23571563 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23571709 C G N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 3 23571945 A G Y Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.0625 0.625 0.3125 12 20 1 10 5 3 23572010 A C Y N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 23572054 G A Y Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 3 23572068 G A Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 23572162 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 3 23572217 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 23572475 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 23572599 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 23572758 C A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 3 23572788 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 3 23572792 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 3 23572876 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 23572926 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 23572965 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 23572983 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 3 23572997 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 23573018 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 23573054 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 23573080 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 23573108 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 23573171 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 23573202 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 3 23573287 G T N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 3 23573326 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 23573328 G T N N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 5 11 0 5 3 3 23573514 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 10 22 0 10 6 3 23573531 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 23573592 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 23573607 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 23573611 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 23573618 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 23573659 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 23573660 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 23573735 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23573802 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 23573809 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 23573982 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 23573983 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 23574016 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 3 23574222 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 23574251 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 23574303 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 23574344 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 3 23574541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23574817 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23574852 C T Y Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.0714285714285714 0.714285714285714 0.214285714285714 12 16 1 10 3 3 23574910 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23575002 T A Y N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 23575078 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 23575119 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 3 23575128 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 3 23575188 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 23575234 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 23575272 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 23575396 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 3 23575418 G T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 3 23575500 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 3 23575512 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 23575562 T A N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.5 0.416666666666667 8 16 1 6 5 3 23575576 A G N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 3 23575634 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 23575714 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 23575748 G C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 3 23575825 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 23575826 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 23575850 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 23575930 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 23575936 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 23576103 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 23576136 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 23576145 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 23576181 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23576191 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 23576482 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.0666666666666667 0.666666666666667 0.266666666666667 12 18 1 10 4 3 23576550 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 3 23576731 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23576769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23577194 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 23577293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23577444 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23577825 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 23578415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23578650 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 23578674 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23578721 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 23579006 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23579040 C T N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.454545454545455 0.454545454545455 0.0909090909090909 15 7 5 5 1 3 23579107 A C N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 3 23579326 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 23579727 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23579746 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23580066 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 3 23580067 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23580137 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23580439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23580569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23580714 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 23580805 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 23580806 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 23580909 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23581049 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23581142 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 23581539 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23581984 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23582061 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23582280 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 23582335 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 23582462 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23582838 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23582845 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23592315 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23592498 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23592612 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23592830 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 23592833 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23592875 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 23592894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23593212 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 3 23593258 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23593283 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23593499 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23593540 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23593596 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23593807 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23593845 C G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0 0.647058823529412 0.352941176470588 11 23 0 11 6 3 23593909 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23594162 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23594483 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 23594652 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23595451 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23595472 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 23595544 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 23595693 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23595718 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 23595746 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 23595749 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23595759 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 23595803 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 23595843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23595887 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 23595909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23595979 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.1 0.75 0.15 19 21 2 15 3 3 23595985 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23596006 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23596012 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 23596059 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 23596089 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 3 23596126 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 3 23596249 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 3 23596287 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 23596423 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 23596588 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23596692 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23596855 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 23596912 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23596925 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23597178 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23597258 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 23597350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23597373 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23597561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23598281 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 23598708 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23598711 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23598860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23599315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23599420 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23599567 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23599577 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23599578 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23600045 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23600205 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 23600216 G A N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 12 4 5 2 1 3 23600277 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 23600385 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 23600391 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 23600594 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 23600784 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 23600992 C G Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 23601037 T A Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 23601340 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 23601769 C T N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 23601791 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 23601982 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23602065 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23602173 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23602179 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23602262 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23602366 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23602420 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23602493 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23602555 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23602566 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23602591 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23602627 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 23602646 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 23602779 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 23602782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23602951 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23602969 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23603427 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 23603443 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 23603854 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23603968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23604288 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23605090 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23605175 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23605274 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23605439 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23605472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23605745 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 23605863 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23605902 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 23605918 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23605966 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23606014 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23606070 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23606072 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23606152 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23606164 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 23606234 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 23606347 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 23606421 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23606482 C A Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 23607196 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23607279 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 23607362 C A N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 3 23607630 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23607709 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23607763 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23607872 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 23608650 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23608711 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 23608726 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 23609088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23609267 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23609327 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 23609524 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23609594 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 23609603 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23609741 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23609753 C A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 23609793 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23610018 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23610211 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23610313 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23610976 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23611344 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23611539 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23611861 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23611988 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23612476 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 23612600 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 23612655 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 23612756 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 23612811 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23612827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23612862 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23612977 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 23613052 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 23613192 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 23613206 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 23613263 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23613268 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 23613285 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 23613394 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 23613408 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 23613462 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23613568 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 23613622 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 23613777 C T N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 23613863 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 23613866 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 23613882 C G N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 23614076 C T N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 3 23614145 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 23614265 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 23614280 T G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 23614409 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 23614476 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 23614520 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 23614537 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 23614548 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 23614612 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 3 23614646 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 23614887 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23615036 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 23615072 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 23615142 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 23615170 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 23615253 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23615283 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 23615391 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 23615465 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 23615490 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 23615541 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 23615626 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 23615640 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 23615709 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 23615759 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23615812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23615912 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23616045 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23616157 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23616295 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23616808 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23616809 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23616864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23617043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23617368 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 23617518 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23617946 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23618109 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 23618360 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 23618418 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23618450 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 23618675 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23618763 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23619257 T G Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 23619378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23619529 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23619692 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23620298 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 23620300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23620621 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23620694 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 23620970 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23621250 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23621677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23621798 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23621830 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23621864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23622009 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23622033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23622265 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 23622954 C G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 23622973 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 23623205 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23624097 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23624123 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 23624207 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23624290 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 23624320 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 23624334 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 23625236 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 23625289 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23626125 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 23626335 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23626344 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23626365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23626520 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23626670 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23627389 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23627563 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 23627582 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23627704 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23627892 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 23627913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23628005 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23628118 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23628219 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23628256 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 23628318 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 23628324 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 23628495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23628870 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23628893 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23629026 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23629056 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23629132 C T Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 23629793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23629868 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23630011 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23630118 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 23631451 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23631766 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23631978 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23632571 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 23632744 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23633552 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23633671 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 23633685 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 23633757 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 23633839 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23633843 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23634089 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23634128 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 23634414 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 23634701 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23634763 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23634873 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23634885 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23634974 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 23634989 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 23635162 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23635261 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23635390 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23635481 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 23635681 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23635701 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23635754 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23635778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23635830 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 23635996 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23636065 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23636117 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23636401 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23636948 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 23637502 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 23638242 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 23638565 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 3 23638593 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 23638805 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 23638877 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 23639364 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23639476 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 23639487 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 23640203 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 23640269 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 23640441 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 23640451 C A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 23640590 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 23640929 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 23640991 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23641065 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 23641249 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 23641270 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 23641423 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 23641569 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23641713 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23641718 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23641792 C A N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 3 23642158 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 23642227 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 23642623 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 23642697 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 23642854 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 23643198 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 23643274 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 23643413 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23643430 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23643648 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23643781 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 23643783 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23643921 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23643981 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 23644101 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23644330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23644333 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 23644425 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 23644578 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 23644618 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 23644696 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 23644843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23645018 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 23645099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23645262 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 23645448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23645473 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 23646109 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23646148 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 23646170 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23646328 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 23646371 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 23646533 C G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 23646541 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 23646592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23646603 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23646756 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23647134 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 23647245 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23647329 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 23647459 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 23647542 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 23647597 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 23647648 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 23647779 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 23647963 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 23647985 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 23648017 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 23648059 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 23648060 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 23648339 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 23648460 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 23648560 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 23648675 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 23648747 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 23648748 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 23648779 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 23649033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23649106 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23649122 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23649640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23649813 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23649817 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23649826 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23650141 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 23650203 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 23650239 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23650250 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23650635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23650639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23650893 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 23651515 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 23651766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23652738 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23652820 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23653822 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23654747 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23655211 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 23655503 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23656598 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 23656629 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23656889 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 23656893 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 23656931 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 23657058 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 23658359 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23660904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23661353 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 23663665 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23664238 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23665213 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23666771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23668840 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23672831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23673047 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 23673765 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23673857 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23675355 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23675388 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23675616 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23675803 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23676494 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23676512 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23676521 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23676591 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 23676657 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23676683 A C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 23676743 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23677151 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 23677212 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23677228 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 23677366 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 23677465 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 23677601 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 23677747 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 23677755 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23678350 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23678576 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 23678577 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23678597 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 23678632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23678793 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 23678867 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23679052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23679076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23679104 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23679454 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23679686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23679731 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 23679735 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23679790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23679926 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 23680053 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 23680073 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 23680118 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 23680290 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23680344 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23680442 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 23680499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23680648 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23680687 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23680842 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 23680860 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23681097 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23681212 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23681219 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23681864 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23681928 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23682244 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23683041 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23683232 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23683297 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 23683501 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23683552 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 23683588 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23683595 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23683609 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 23683911 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23685700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23685818 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23685936 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23686524 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 23686638 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 23686646 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 23686841 T A Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 23686926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23687013 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23687092 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23687107 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 23687324 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23687349 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23687388 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 23687414 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 23687422 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23687446 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 23687453 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23687467 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23687487 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23687539 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23687619 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 23687621 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 23687730 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 23687733 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 23687776 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 23687801 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 23687824 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 23687839 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 23687874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23687904 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23687966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23687970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23688090 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23688123 C G Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 23688188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23688251 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 23688271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23688618 C A Y N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 12 12 3 6 3 3 23688771 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23688782 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 23688856 T G N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.230769230769231 0.538461538461538 0.230769230769231 13 13 3 7 3 3 23689124 G C Y N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 23689209 G T Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 23689244 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 23689383 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 23689422 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 23689470 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 23689621 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 23689633 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 23689682 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23689745 T C N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.0714285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 11 17 1 9 4 3 23689748 G T N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 3 23689794 G T Y N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 3 23689950 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 23690156 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 23690193 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23690461 A G Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 23690525 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23690673 C G Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 23690943 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23690954 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 23690976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23691039 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23691262 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 23691330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23691414 A T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 3 23691417 A G Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 3 23691565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23691593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23691703 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 23691732 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 23691846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23691895 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 23692333 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 23692411 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 23692456 A G N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 3 23692496 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 3 23692760 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23692794 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 23692836 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23692844 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23692908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23693439 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23693553 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23693743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23693778 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 23693797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23693830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23693960 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 23693961 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 23694100 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23694149 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 23694697 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23694765 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23694827 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23695044 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 23695121 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23695170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23695296 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23695638 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23696074 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 23696296 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23696327 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23696420 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 3 23696494 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0 0.789473684210526 0.210526315789474 15 23 0 15 4 3 23696604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23696614 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23696650 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23696701 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23696743 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23696826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23696996 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23697091 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23697232 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 3 23697282 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 23697328 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23697395 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23697442 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23697470 G C N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 23697520 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 23697559 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 23697654 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 23697840 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 23697885 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23698060 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23698407 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23698530 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23698532 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 23698557 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23698733 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23699088 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23699207 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 3 23699375 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23699413 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23699442 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 3 23699535 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23699687 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23699739 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23699810 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 23699843 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 23699923 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 23700048 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23700102 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23700315 G A N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 23700372 T G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 23700390 G C N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 23700709 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 3 23700755 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 3 23701271 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 23701338 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 23701417 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23701455 T C Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 23701594 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23702017 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23702187 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 23702529 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 23702740 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23703059 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 23703279 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 23703295 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 23703430 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 23703451 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 23703455 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23703663 T C Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 23703791 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 23704063 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23704471 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 23704543 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 23704921 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23704951 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23705662 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23705719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23705872 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23706183 G A N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.454545454545455 0.454545454545455 0.0909090909090909 15 7 5 5 1 3 23706386 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 23706403 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23706568 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23706750 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 23706872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23706908 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 23706919 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 23706980 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 23707055 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23707139 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 23707152 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23707485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23708055 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23708238 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23708493 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23708733 G C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 23708926 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 23709014 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 23709037 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23709189 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23709190 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23709305 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23709442 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23709589 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23709615 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23710021 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 23710097 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 23710183 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23710401 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23711098 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23711203 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23711393 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23711423 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23711468 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23711546 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23711793 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 23711930 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 23712274 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 23712393 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23712509 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 23712639 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 23712832 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 23712875 A C N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 3 23712897 A T N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 3 23713019 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 23713217 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 23713376 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 23713444 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23713543 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 23713558 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 23713589 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 23713756 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 23713795 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 23713888 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 23713964 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 23714002 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 23714044 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 23714049 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 23714107 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23714155 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 23714306 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23714328 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 23714372 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 23714544 A T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 23714572 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 23714580 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 23714656 G C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 3 23714718 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23714736 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 23714819 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 23714823 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 23714927 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 23714961 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 23714994 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 23715035 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 23715054 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 23715061 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 23715126 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 23715224 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 23715237 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 23715329 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 23715396 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 23715442 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 23715462 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 23715465 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 23715488 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 23715508 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 23715527 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 23715607 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 23715608 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 23715648 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 23715669 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 23715673 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 23715748 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 23715756 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 23715781 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23715832 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 23715941 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0833333333333333 0.666666666666667 0.25 10 14 1 8 3 3 23716367 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 23716411 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 23716421 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 23716487 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 23716490 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 23716529 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 23716543 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 23716564 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 23716599 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 23716655 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 23716872 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 23717198 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 23717257 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23717271 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 23717376 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 23717467 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 23717514 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 23717633 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 23717779 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 23717934 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 23717980 A C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 23718039 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23718506 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 23718507 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 23718520 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 23718604 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23719106 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 23719778 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 23719833 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23720072 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23720089 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 23720388 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23720417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23720419 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23720652 A C N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 3 23720823 T A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 23720890 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 23721355 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 23721394 G C N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 23721413 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 23721477 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 23721635 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23721657 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23721704 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23721917 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23721951 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23722025 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 23722162 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23722179 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23722207 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 23723842 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23723953 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23724005 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 23724216 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23724505 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 23725854 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23726583 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23726736 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23728189 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23729933 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23731115 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23731126 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23732533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23733140 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23734182 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 23734475 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23734624 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23734757 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23735472 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23735564 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23736060 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23736063 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23736145 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23736472 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23736515 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23736612 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23736651 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23736802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23736957 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23737436 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23737490 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23738202 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 23738211 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 23738282 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 23738488 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 23738502 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 23738766 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 23738913 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23739034 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23739707 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 23739791 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23742410 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23743447 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23743764 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23745300 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23745305 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23746670 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 23746904 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23746973 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23747188 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23747236 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23747369 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 23747421 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 23747673 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 23747849 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23748045 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 23748182 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 23748218 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23748411 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23748514 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23748908 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23749014 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23749029 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23749136 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23749157 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23749248 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23749346 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 23749574 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 23749681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23749787 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 23749964 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23750601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23750732 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23750935 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23751889 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23752041 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23753248 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23753480 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23754605 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23755305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23756561 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23757257 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23757755 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 23760409 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23760495 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23760546 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23760797 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23761372 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23762636 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23762981 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 23763875 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23764399 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 23764680 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23765870 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23765901 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23766490 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23766676 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 23767168 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23767806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23767982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23770506 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 23770813 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23770862 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23771408 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 23772791 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23774162 G A Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 23774598 T A Y N 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0.5 0 0.5 2 2 1 0 1 3 23775356 C T Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 23776194 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23776351 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 23776492 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 10 20 0 10 5 3 23776558 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23776777 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 23776817 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 23776823 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 23776837 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 23776920 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23776965 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 23777226 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23778091 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23778107 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23778117 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 23778223 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23778297 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23778318 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23778540 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23778549 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23778616 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23778631 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23778648 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23778660 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23778680 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23778718 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23778772 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23778779 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23778819 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23778905 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 23779059 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23779069 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23779115 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23779143 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23779167 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23779179 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23779246 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23779273 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23779279 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23779323 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23779413 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23779420 G T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23779453 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23779568 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23779595 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 23779605 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 23779743 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23779788 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23779820 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23779862 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23779876 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23779981 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23780005 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 23780011 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23780120 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 23780192 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23780222 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23780469 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23780570 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23780697 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23780722 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23780793 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23780814 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 23780823 G C Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 23780936 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23780996 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23781062 C T N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.2 0.666666666666667 0.133333333333333 16 14 3 10 2 3 23781241 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23781267 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23781300 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23781384 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23781432 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23781486 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23781701 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23781756 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23781803 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23781860 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23781870 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23781926 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23781981 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23782159 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23782182 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23782263 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23782374 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23782534 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23782552 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23782577 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23782636 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23782671 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 23783060 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 23783066 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 23783117 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 23783227 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 23783297 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 23783320 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 23783327 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 23783373 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 23783945 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 23783946 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 23783962 G C Y N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 3 23784077 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 23784134 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23784198 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 23784239 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23784320 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23784412 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23784451 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23784477 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23784497 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23784520 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23784588 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 23784613 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 23784653 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 23784681 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23784802 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23784860 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23784896 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23784967 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 23785028 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 23785294 C A N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 23785322 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 23785345 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23785422 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 23785516 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23785661 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23785941 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23786084 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23786183 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23786385 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23786410 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23786500 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23786517 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23786550 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23786808 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23786866 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23786878 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23786976 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23786994 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23786995 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23787011 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23787048 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23787053 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23787081 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23787127 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23787224 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 23787232 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 23787593 C A Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 23787598 T A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 23787649 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 23787732 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 23787804 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23787852 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23787903 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23787928 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23787955 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23788093 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23788108 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23788132 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23788165 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23788205 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23788233 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23788293 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23788332 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 23788348 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 23788418 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 23788463 T A Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 23788468 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 23788545 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 23788582 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 23788622 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 23788642 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 23788645 C G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 23788657 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 23788824 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23788910 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23788939 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23788951 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23788955 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23788986 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23789110 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23789186 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23789206 A C Y N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 23789216 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 23789246 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23789264 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23789272 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23789323 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23789333 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 23789428 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23789477 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23789498 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23789588 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 23789596 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 23789791 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23789812 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 23789849 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 23789868 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 23789878 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 23789925 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23790042 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23790143 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23790146 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23790170 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 23790181 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23790229 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23790239 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23790263 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 23790333 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23790431 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23790446 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23790462 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23790472 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23790473 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23790501 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 23790502 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23790562 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23790623 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23790767 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23790818 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23790899 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23790913 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23790921 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23790948 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 23791110 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23791235 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23791299 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23791334 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23791340 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23791351 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23791355 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23791375 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23791404 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23791421 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23791479 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23791489 G C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23791584 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23791599 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23791622 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23791628 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23791765 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23791804 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23791836 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23791844 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23791862 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23791893 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23791910 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23791978 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 23792144 C A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 23792154 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 23792185 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 23792220 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23792240 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 23792254 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 23792322 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23792360 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23792496 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23792562 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23792762 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23792764 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23792836 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23792847 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23792868 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23792880 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23793000 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23793007 A C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23793013 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23793023 T G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23793045 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23793062 C G Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 23795908 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 23795957 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23796045 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23796059 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23796094 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23796139 T A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23796166 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23796183 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23796300 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23796332 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 23796333 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 23796404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23796449 C G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23796455 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23796562 T A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23796618 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23796671 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23796715 T A Y N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 23796795 T G Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 23796870 A T Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 23796921 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23797150 A T Y N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 23797705 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 23799194 C T N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 23799271 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 23799451 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23799498 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 23799510 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 23799513 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 23799521 C G N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 23799534 A T N N 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 3 23799579 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 23800797 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 23800805 G A Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 23801062 A C N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 23801124 T G N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 23801392 A G Y Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 3 23801819 C T Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 23801821 A C Y N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 23802351 A T Y N 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.2 0.8 0 12 8 2 8 0 3 23802413 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 23802482 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 23802507 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 23802511 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 23802521 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 23802549 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23802556 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23802573 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23802598 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23802617 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23802672 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 23802683 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23802709 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23802756 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23802836 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23802859 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23802874 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23802974 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 23802975 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23803031 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23803154 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23803155 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23803373 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23803432 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23803457 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23803642 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23803674 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23803699 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23803748 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23803922 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 23803937 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23803973 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23804018 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23804141 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23804172 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23804214 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 23804222 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23804245 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23804376 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23804391 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23804536 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23804574 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23804603 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 23804614 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23804709 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23804794 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23804827 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23804848 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23804893 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23804921 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23804967 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23805003 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23805110 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23805122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23805127 G C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23805187 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23805273 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23805567 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 3 23805578 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 23805602 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 23805608 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 23805620 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 3 23805637 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 23806094 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 23806108 A T Y N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 23806153 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 23806168 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 23806240 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 23806407 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23806549 C A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 23806552 G C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 23806615 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 23806638 C A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 23806654 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 23806665 T G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 23806796 G A Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 23806927 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23806948 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23807107 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 23807135 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23807173 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 23808188 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23808466 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23808523 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 23808579 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23808626 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23808781 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23808841 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23809011 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23809089 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 23809126 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 23809218 C A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 23809266 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 23809562 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 23809871 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 23810053 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 23810087 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 23815596 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 23815658 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 23815719 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 23815799 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23815861 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23815909 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23815937 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23816003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23816047 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23816208 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23816528 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23816556 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23816624 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 23816655 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23816656 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 23816692 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23816699 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23816950 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23817171 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23817209 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 23817288 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 23817369 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 23817587 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 23817691 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 23817854 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 23818086 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23818320 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 23818394 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23818549 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23818640 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 23818796 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 23818926 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23820169 C A Y N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 3 23820649 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23820758 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 3 23820880 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 23821152 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23821519 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23821530 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23821641 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 23821715 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 23821724 T G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 23821749 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 23821967 A C N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 23821974 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 23822223 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23822301 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 23822308 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 23822352 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 23822402 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 23822441 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 23822815 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 23823046 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 23823143 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 23823314 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 3 23823332 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23823676 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 23824009 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23824079 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 23824126 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 23824280 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 23824385 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23824629 A T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 23824882 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 23825141 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 23825162 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23825342 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 23825386 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 23825674 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23825689 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 23826179 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 23826225 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 23826247 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 23826248 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 23826381 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 23826470 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 23826493 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 23826500 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 23826522 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 23826674 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 23826680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23826694 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 23826857 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23826899 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23826970 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23827293 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23828187 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23828442 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23828511 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23828687 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 23828713 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23829185 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 23829276 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 23829427 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23829436 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23829542 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23829561 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23829651 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23829665 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23829693 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 23829769 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23829954 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23830120 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 23830226 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 23830256 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 23830269 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 23830402 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 23830463 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 23830486 C A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 23830519 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 23830576 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 23830636 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 23830645 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 3 23830688 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 23830850 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 23830852 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 23830883 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 23830950 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 23830993 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 23831006 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 23831029 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 23831039 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 23831057 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 23831091 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 23831156 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 23831160 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 23831175 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 23831237 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 23831570 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 23831579 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 23831637 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 23831714 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 23831762 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23831871 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 23831926 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 23831932 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 23832201 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 23832284 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 23832301 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 23832358 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 23832471 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23832538 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 23832577 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23832969 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 23833093 G C N N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 8 12 2 4 4 3 23833124 C G N N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 8 8 3 2 3 3 23833327 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 10 14 2 6 4 3 23833401 G A N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.230769230769231 0.615384615384615 0.153846153846154 14 12 3 8 2 3 23833468 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 23833532 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 23833672 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 23833835 T G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 23833887 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 23833893 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23833904 C G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 23833907 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23834016 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 23834031 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 23834084 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 23834173 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 23834247 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 23834279 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23834366 T A N N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.166666666666667 0.583333333333333 0.25 11 13 2 7 3 3 23834616 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 23834716 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 23834900 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23834955 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 23834992 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 23835002 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 23835072 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 23835155 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23835200 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 23835202 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 23835289 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 23835290 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 23835313 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23835322 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 23835335 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 23835489 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 23835842 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 23835973 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 23836767 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23836931 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23836940 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23836992 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23837037 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23837247 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23837258 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23837421 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23837456 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23837559 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23837696 C T N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.571428571428571 0.357142857142857 10 18 1 8 5 3 23837722 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23837750 C A N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.0625 0.875 0.0625 16 16 1 14 1 3 23837769 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 23837778 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 3 23838939 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23839267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23839475 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23839545 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 23841905 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23842598 G C Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 23842656 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23843109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23843737 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23844110 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 23844305 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 23844346 G A Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 23844466 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23844612 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 23844656 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 23844942 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23845230 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 23845549 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 23845619 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23845903 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 23846050 A C Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 23846100 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 23846237 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 23846251 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 23846261 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23846336 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23849524 A C Y N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 23849900 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23850315 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 23850331 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 23851072 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 23851352 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 23851985 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 23852014 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23852151 A T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 23852278 C T N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 3 23852285 C A N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 3 23852359 T G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 23852362 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 23852448 C G Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 23852493 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 23852632 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 23852641 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 23852710 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 23852732 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 23852780 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 23852811 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 23853006 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 23853018 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 23853400 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23853444 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23853448 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 23853481 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 23853506 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 23853517 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23853544 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 23853562 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 23853582 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23853698 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23853854 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 23853876 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23853881 T C Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 23853979 C G Y N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 23854229 T C Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 3 23854256 T C N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 23854275 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 23854284 G A N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 23854358 A G Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 23854605 A G Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 23854728 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 23854890 C A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 23854914 T C Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 23854942 A T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 23854953 A G Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 23854975 A G Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 23854999 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 23855190 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23855623 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 23855745 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23855775 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23855883 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23856153 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 23856461 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 23856483 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 23856518 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23856651 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23856776 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 23856986 A C Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 23857222 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23857353 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 23857360 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 23857578 C T Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 23857899 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 23858301 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23858533 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 23858590 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23858614 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23858906 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 23858917 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23859019 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 23859118 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23859152 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 23859206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23859224 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 23859271 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 23859372 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 23859444 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23859507 T G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 23859531 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 23859556 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23859578 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 3 23859723 A C Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 23859733 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 23859781 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 23859980 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23860101 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23860106 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 23860321 C G N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 23860487 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 23860499 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 23860509 A T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 23860523 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 23860597 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 23860663 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23860704 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23860717 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 23860753 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 23861256 A T Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 23861447 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23861474 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 23861489 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 23861891 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23861893 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23861918 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23862034 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 23862374 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23862392 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23862479 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 23862488 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23862561 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23862688 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23862715 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 23862796 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23862865 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23862872 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23863021 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 23863025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23863137 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23863238 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23863428 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 23863800 T G Y N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 23864230 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 3 23864277 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23864348 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23864362 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23864434 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 23864470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23864493 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 23864687 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 23864695 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 23864714 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 23864757 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23864772 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23865001 A T N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.153846153846154 0.615384615384615 0.230769230769231 12 14 2 8 3 3 23865065 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 23865307 C A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 23865410 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 23865411 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 23865468 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 23865713 G T N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 23865728 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23865761 T G Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 23865784 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 23865863 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 23865942 C G Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 23865959 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 23866025 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 23866035 A T Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 23866086 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 23866115 T C Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 23866119 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 23866276 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 23866293 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 23866296 A C Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 23866341 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 23866343 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 23866443 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 23866475 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 23866600 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 23866697 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 23866739 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 23866823 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 23866847 C A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 23866868 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 23866887 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 23866913 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 23866954 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 23867085 C T Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 3 23867092 C G Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 23867280 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23867567 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23867713 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23867917 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23868075 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23868113 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23868238 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23868305 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23868353 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23868508 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 23868621 G C Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 23868710 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23868807 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23868889 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 23868912 A C Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 23868920 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 23868932 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 23868940 T A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 23868972 G T Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 3 23868999 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23869061 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23869128 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23869135 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23870569 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23870575 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23870720 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 23870756 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23870806 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23870909 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23871052 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23871085 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23871231 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 23871554 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23871746 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23871801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23871809 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23871827 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23871918 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 23872095 A T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 23872127 A C Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 23872236 C A Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 23872289 A C Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 23872520 C T Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 23872593 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 23872620 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23872684 T C Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 23872689 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 3 23872704 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 23872708 T C Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 23872747 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 3 23873204 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 23873476 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 23873615 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23873633 A C Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 23873865 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23873897 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23874010 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 23874175 G T Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 23874354 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 23874452 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 23874989 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 23875066 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23875167 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23875477 C A N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 23875578 T A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 23876061 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 23876085 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 23876138 A C Y N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 23876179 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 23876192 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23876198 G C Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 23876292 T C Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 23876452 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23876684 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23876701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23876746 G T Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 23876843 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23876942 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23877003 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 23877086 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23877094 C G Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 23877123 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 23877133 A T Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 23877303 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 23877406 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 23877407 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 23877564 G T Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 23877571 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23877613 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 23877628 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23877699 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 23877898 G C Y N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 23877900 T C Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 23877962 G A Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 3 23877979 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 23878059 G T Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 23878111 T G Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 23878156 A T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 23878162 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23878175 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 23878274 T C Y Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 3 23878539 G A Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 23878629 A G Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 23878679 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 23878686 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 23878697 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23878739 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 23878818 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23879119 C G Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 23879302 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 23879395 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23879419 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23879451 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 23879472 T A Y N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 23879492 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23879592 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23879810 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23879983 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23880166 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 23880462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23880602 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23880708 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 23880725 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23880795 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23880909 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23881089 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 23881246 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23881421 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 23881541 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 23881634 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23883482 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23884416 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23885819 T A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 23888497 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23891277 G A Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 23891635 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 23891931 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 23892437 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23893993 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23895624 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 23895845 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23896027 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 23896292 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 23896830 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 23897002 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23897454 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23897942 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 23898472 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 23898561 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23900163 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 23900680 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23903831 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23904602 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23904758 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23905057 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23905670 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23906094 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23906326 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23906781 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23907191 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23907856 A C Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 23908895 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23912867 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23913894 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 23915677 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23916475 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23923852 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23924358 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23925089 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23928701 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23929236 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 23929352 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23929731 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 23929797 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 23929855 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 23929862 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 23929868 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 23929887 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 23929929 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 23929940 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 23929968 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 23930020 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 23930030 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 23930034 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 23930098 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 23930442 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23930586 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 23930598 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 23930705 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23930925 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 23931040 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23931074 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23931398 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 23931399 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 23931509 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23931656 G T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 23931704 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23931719 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23931722 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 23931730 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 23931804 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 23931837 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 23931982 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23932369 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23932388 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 23932590 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23932929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23932987 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23932992 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 23933061 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23933364 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 23933385 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 23933618 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 23933701 T C Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 23934251 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 23934613 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23934993 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23935439 C A Y N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 3 23935671 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23935989 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23936453 G T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 23936683 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 23936828 T G Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 23937946 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23938097 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23938255 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23938345 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 23938555 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 23938573 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 23938625 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23938749 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23939177 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23939215 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23939558 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23939906 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23939991 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23940008 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 23940273 T C Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 23940276 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 23940370 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23940530 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23940545 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23940560 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 23940562 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 23940582 C A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 23941700 T C Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 23941713 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 23941753 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 23941785 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23941870 C G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 23941926 A C Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 23941933 A G Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 23942007 T G Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 23942013 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23942064 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 23942182 C G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 23942250 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23942286 A G Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 3 23942305 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 23942394 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 23942447 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 23942482 T A Y N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 23942675 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 23942720 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23942905 A T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 23942906 A T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 23942919 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 23942953 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23943013 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 23943053 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 23943158 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23943507 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23943513 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23943547 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 23943589 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 23943792 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 23943872 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23943885 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 23943970 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23943985 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23944147 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23944265 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 23944279 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 23944410 G C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 23944530 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23944573 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23944615 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 23944651 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 23944825 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 23945315 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 23945334 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 23945360 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23945807 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23945861 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 23946026 T C Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 23946043 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 23946162 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 23946283 A C Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 23946325 T C Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 23946351 G A N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 3 23946554 T G N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 23946632 G C Y N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 3 23946695 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 23947119 G C Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 23947251 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 23948296 A G Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 23948340 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 23948366 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 23948556 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 23948751 A C N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 3 23948824 A G N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 9 11 3 3 4 3 23949251 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 23949443 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 23949579 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23949793 A C Y N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 23949945 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23950054 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 23950175 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23950364 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23950394 C A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 23950425 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 23950427 T G Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 23950482 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 23950585 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 23950644 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23950721 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23950861 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 23951083 G A Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 23951242 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 23951435 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23951552 A C Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 23951626 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23951772 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 23951883 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 23951945 A G Y Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 3 23951978 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 23952353 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23952642 T C Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 23952692 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 23953104 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23953286 T A Y N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 23953415 T G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23953486 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23953517 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 23953580 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23953671 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 23953700 G C Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 23953772 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23953867 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23953912 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23953992 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 23954174 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 23954194 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 23954200 G T Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 23954339 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23954392 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23954403 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23954561 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23954597 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23954606 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23954661 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23954831 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 23954834 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23954852 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 23955011 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23955171 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 23955451 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23955569 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23955596 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23956764 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23956890 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23957233 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23960759 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23960871 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23961346 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 23961485 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23961522 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23961742 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23962058 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 23962124 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 23962159 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 23962182 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23962220 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 23962309 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23963147 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23964792 C A N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 23964897 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23965227 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23965696 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23966377 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 23966439 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 23966461 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23967514 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23968397 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 23968423 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 23968682 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23970567 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23970837 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 23970922 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23971134 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23971144 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23971151 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23971184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23971210 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 23972327 C A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23972341 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23972702 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23972815 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23972828 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23972843 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23972856 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 23972866 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 23972937 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23972943 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23972974 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23973092 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23973129 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 23973167 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23973201 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23973342 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23973354 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23973466 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 23973498 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 23973707 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23973739 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 23973783 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 23973805 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 23973870 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23973945 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 3 23973959 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 23974038 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 23974046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23974198 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 23974272 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 23974436 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 23974586 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23974628 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 23974694 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23974760 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23974953 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 23974976 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 23975088 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 23975183 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23975184 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23975287 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23975458 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 23975631 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 23975642 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23975649 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23975681 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23975705 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 23975807 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 23976075 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23976119 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 23976128 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 23976166 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23976250 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 23976264 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23976522 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 23976684 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23976789 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 23976808 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23976839 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23976848 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 23976863 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 23977006 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 23977057 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 23977078 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 23977349 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 23977403 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23977495 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23977586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23977811 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23977901 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 23978824 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23978837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23979013 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 23979038 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23979065 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 23979088 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23979135 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23979591 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23979693 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23979719 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 23979764 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 23979923 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23980309 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 23980369 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23980495 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23980498 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23980529 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23980540 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23980736 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23980828 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23980864 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23980968 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23981097 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 23981128 C A Y N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 23981159 A G Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 23981161 A G Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 23981612 G C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23981801 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23981819 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 23981821 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23981850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23981878 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 23982108 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23982117 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23982138 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 23982274 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23982330 G A Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 23982532 G A Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 23982604 A C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23982763 A T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23982976 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23983036 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23983059 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23983245 G T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23983513 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23983527 C T Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 23983651 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23983754 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23984125 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23984132 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 23984151 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23984168 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23984243 C T Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 23984405 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23984692 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 23984759 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 23984803 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23984813 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23984839 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23984866 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23984935 C A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 23984951 T A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 23985075 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23985321 C G Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 23985357 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23985434 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23985541 G A Y Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 3 23985546 G A Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 23985571 A C Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 23985761 A T Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 23985780 T G Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 23985790 G A Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 23985843 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 23985953 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23985992 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23986039 A T Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 23986051 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23986116 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23986187 T A Y N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 23986271 G T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 23986329 A C Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 23986569 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23986609 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23986639 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23986792 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23986876 G C Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 23986898 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 23986944 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23986969 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23986982 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 23987054 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23987378 G A Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 23987675 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 23993909 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 23993942 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 23993971 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 23993972 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 23993991 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23993999 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23994046 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 23994084 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 23994121 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23994174 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23994188 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 23994268 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23994402 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23994436 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 23994535 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 23994561 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 23994603 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23994617 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 23994640 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23994701 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 23994753 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 23994771 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 23994834 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 23994900 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23994941 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 23995012 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 23995037 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23995120 C A N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 23995317 C T Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 23995485 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 12 6 3 6 0 3 23995506 A G N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 13 7 4 5 1 3 23995657 C G N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 3 23995853 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 23996013 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 23996267 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 23996320 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23996327 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 23996338 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 23996343 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 23996427 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 23996429 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 23996459 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 23996481 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 23996542 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23996553 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 23996580 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23996643 T A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 23996664 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23996698 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 23996720 G A N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 3 23996900 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 23996929 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23996949 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23996991 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 23997012 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23997019 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23997061 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23997083 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23997120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23997184 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23997385 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23997412 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 23997426 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 23997504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23997510 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 23997536 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 23997636 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23997655 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 23997761 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23997861 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23997892 T A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 23997894 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23997913 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23997925 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23997962 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23998085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23998093 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23998166 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23998167 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 23998196 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23998237 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23998404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23998419 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23998541 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 23998609 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 23998610 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 23998671 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 23998730 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 23998780 A T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 23999144 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23999253 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23999387 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23999563 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 23999578 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 23999653 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 23999698 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 23999758 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 23999759 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 23999937 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 23999965 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 23999966 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 24000025 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 24000064 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 24000124 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24000176 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24000255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24000271 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24000296 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24000310 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24000356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24000547 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24000557 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24000636 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 24000716 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 24000718 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 24000788 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24000841 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24000857 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24000885 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24000913 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24000983 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24001027 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24001031 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24001188 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 24001226 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24001240 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24001293 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 24001297 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 24001372 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 24001519 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 24001530 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 24001566 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24001576 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24001712 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 24001809 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 24001836 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 24001953 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 24001995 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 24002007 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 24002076 T G N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 24002167 C T N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 24002258 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 24002312 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 24002436 A C N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 24002468 T G N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 24002491 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 24002523 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 24002526 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 24002552 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 24002631 C T N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 3 24002665 A C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 24002895 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 24002969 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 24003060 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 24003154 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24003166 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24003373 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 24003407 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24003413 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24003582 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 24003583 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 24003611 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24003652 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 24003722 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24003836 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24003905 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24003921 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 24003947 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 24003978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24003981 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24004014 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 24004118 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24004141 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24004152 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24004169 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24004268 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 24004277 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24004291 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24004443 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24004532 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24004536 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24004748 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0 0.777777777777778 0.222222222222222 14 22 0 14 4 3 24004805 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 24004854 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24005137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24005204 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 24005240 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 24005249 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24005255 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 24005326 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24005368 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24005467 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24005485 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24005499 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 24005554 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24005561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24005702 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24005720 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24005727 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24005798 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24006047 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 24006270 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 24006334 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 24006341 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24006365 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 24006381 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24006580 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24006743 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24006763 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24006834 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24006919 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24008053 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 24008064 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 24008786 A G Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 24010109 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24010666 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24010746 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24010939 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24011109 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24011120 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24011330 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24011455 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24013416 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24013445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24014147 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24014351 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 24015244 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24015480 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24016533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24016664 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 24017079 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24017887 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24018274 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24021667 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24021732 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 24023334 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24024998 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24026515 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24027450 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 24027552 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 24028285 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 24028367 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 24028653 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 24028657 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 24028780 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 24028852 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 24029088 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24029207 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 24029354 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 24029461 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24029555 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24029759 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24030309 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24030342 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 24030502 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24030553 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24030579 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 24030588 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 24030819 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24030854 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 24030964 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24031538 G C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 24031857 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24032343 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 24033306 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24033558 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 24034152 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24035883 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 3 24036246 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 3 24036589 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 24038757 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 24039404 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 24040863 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 24041544 C A N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 3 24041763 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24042582 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24044097 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 24044530 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24046492 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24048044 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 24050416 C T Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0 0.8125 0.1875 13 19 0 13 3 3 24051614 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 24051615 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24051881 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 24052831 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 24053065 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24053171 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24053302 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24054125 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24054963 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24055493 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 24055656 T A N N 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0 1 0 7 7 0 7 0 3 24055699 T C Y Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 3 24057602 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 24057639 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24057807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24058666 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24059363 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24061855 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24062402 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24062627 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24064074 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24064339 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24065267 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24068681 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24070564 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24071394 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 24071916 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24071917 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24072282 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24073194 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 24075119 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 24075539 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24076715 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24077044 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 24078405 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24079510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24079869 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24080536 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24083634 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24083659 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 24083683 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 24083872 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24083901 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24084215 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 24084275 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 24084351 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24084377 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24084390 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 24084460 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 24084610 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24084674 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 24084735 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24084930 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 24084945 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 24085395 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24085464 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24085928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24085970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24086043 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24092616 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 24092860 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24092879 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24092938 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24092973 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24092983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24093000 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24093093 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24093116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24093131 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24093165 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24093179 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24093201 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24093291 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24093303 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24093506 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 24093540 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 24093556 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24093587 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 24093597 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24093709 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 24093799 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 24093808 T G Y N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 24093858 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 24094009 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 24094183 C T N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 24094328 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 24094416 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 24094430 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 24094486 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24094494 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24094520 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 24094549 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 24094869 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 24094957 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 24094967 T A Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 24095033 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 24095045 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 24095060 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24095133 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24095251 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 24095328 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24095403 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 24095468 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 24095678 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24095683 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24095728 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 24095785 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 24095805 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24095943 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24096356 A C Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 24096564 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 24096830 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 24097155 G T Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 24097159 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 24097209 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 24097306 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24097358 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24097380 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 24097549 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24097704 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24097724 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24097737 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24097834 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 24097887 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 24098016 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 24098033 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 24098431 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24098653 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 24099787 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24100171 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24100849 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24101286 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 24102582 A C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 24102699 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24102867 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24103079 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24104195 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 24104225 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 24104269 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24104304 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24104425 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24104471 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24104814 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24104988 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 24105316 C A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 24105728 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24105885 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24106491 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24106719 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 24106760 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24106951 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 24106987 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 24107728 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24107762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24108201 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24108488 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24108892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24109518 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24109751 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 24109841 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 24109891 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 24110310 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24110321 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24110429 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24110696 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24110835 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24111246 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24112752 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24113224 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 24113639 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 24114277 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 24114860 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 24115056 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 24115108 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24115245 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 24115260 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 24115266 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 24115293 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 24115541 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 24115709 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 24115733 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 24115769 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 24115827 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 24116048 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 24116312 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 24116388 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24116781 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 24116928 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 24117250 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 24117694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24117834 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 24118060 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24118097 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24118165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24118224 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24118280 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24118282 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24118307 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24118328 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24118391 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24118628 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24118674 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24118689 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24118711 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24118838 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24118955 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24119131 C A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24119179 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24119219 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24119223 G T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24119269 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24119306 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24119443 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24119474 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24119536 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24119551 C G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24119558 C A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24119568 T A Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 24119575 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 24119747 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24119798 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 24119833 T A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24119841 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24119868 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24119944 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24119995 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 24120035 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24120106 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24120143 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24120229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24120237 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24120244 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 24120279 T A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24120313 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24120389 A T Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 24120418 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24120447 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24120456 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24120541 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24120581 G T Y N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 24120655 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24120716 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24120761 C G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 24120762 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 24120930 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24120933 A C Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24121024 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24121055 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24121056 C G Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24121068 C G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24121193 C A Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24121291 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24121405 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24121418 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24121452 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24121484 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24121511 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24121641 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24122495 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24122589 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24122642 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24122711 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24123016 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24123649 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 24123791 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 24124044 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24124086 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 24124133 G C Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 24124275 A C Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 24124305 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24124365 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 24124381 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24124632 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24124838 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 24124995 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 24125036 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 24125053 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 24125162 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24125252 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 24125262 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 24125356 C T Y Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 3 24125446 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 24125452 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 24125481 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 24125494 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 24125511 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 24125579 C A Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 24125610 C A Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 24125772 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24125783 G T Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 24125903 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 24125910 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 24125933 C A Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 24126002 T A Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 24126029 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 24127849 T G Y N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 24128491 A C Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 24128531 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 24128569 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 24128648 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 24128716 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 24128776 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 24128796 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24128826 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 24128909 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24129113 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 24129147 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 24129335 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 24129441 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 24129506 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 24129619 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 24129632 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24129669 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 24129852 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 24130424 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24130496 A C Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 24130498 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24130582 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24130600 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24130651 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 24130902 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24130941 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24130960 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24131030 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24131095 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24131113 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24145265 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 24145286 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24145318 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 24145334 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 24145383 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24145442 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24145469 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24145489 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24145538 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24145602 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24145610 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24145653 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24145656 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24145683 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24145855 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24146087 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 24146089 T G N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 3 24146128 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 24146151 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 24146181 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 24146184 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24146612 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24146638 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24146645 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24146682 A T N N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 14 12 1 12 0 3 24146730 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24146813 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24147074 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24147185 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 24147212 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24147215 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 24147248 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24147263 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 24147322 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 24147328 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 24147650 C A N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 3 24147668 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 24147710 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24148046 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24148050 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24148114 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 24148216 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 24148415 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 24148455 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24148505 G T Y N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 3 24148521 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 10 20 0 10 5 3 24148530 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 3 24148726 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 24148741 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 24148850 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24148914 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 24148962 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24149072 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24149076 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24149130 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 24149170 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24149188 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24149223 C A N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 24149629 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 5 9 1 3 3 3 24150111 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 24150114 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24150166 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 24150250 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24150467 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 24151068 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24152647 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24153675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24155251 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24156589 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24156761 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24158151 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24158375 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24158867 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24160019 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24161072 G T Y N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 3 24161338 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24162115 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24163354 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 24163968 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24164069 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24164395 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 24167034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24168139 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24169160 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24169234 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24169239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24170461 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24171999 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 24173153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24173965 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24174460 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24175712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24175894 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24176790 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24177028 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24177079 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24177919 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24178628 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 24179315 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 24180466 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24180943 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24180965 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24181188 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 24181799 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 24182105 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 24182169 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 24182208 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 24182422 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 24182693 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 24182782 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24182792 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24182915 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24182928 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 24183133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24183137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24185278 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24185317 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 24185626 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24186153 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24186263 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24186328 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24186706 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 24186754 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 24186755 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24187344 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24187826 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24187834 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24187893 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24188089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24188483 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24188889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24188892 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24189022 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24189096 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24189114 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24189159 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24189572 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24190167 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24190347 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24190500 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24190643 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24190725 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24190947 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24190975 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24190980 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24191171 C A Y N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 24191379 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 24191416 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24191611 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24191652 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24191921 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24191948 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24191968 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24191985 A T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24192157 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24192384 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 24192410 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24192656 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24192691 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24192802 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24192821 A C Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24192854 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24192859 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24192868 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24192924 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24193123 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24193151 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24193201 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24193305 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24193349 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24193395 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24193518 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24193521 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24193613 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24193883 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 24195092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24195255 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24195336 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24195409 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24195466 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24195964 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24196063 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24196110 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24196481 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24196503 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24196565 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24196566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24196625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24196776 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24196818 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24196928 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24196930 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24196976 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24196987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24197020 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24197040 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24197048 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24197089 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24197188 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24197207 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24197239 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24197321 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24197324 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24197337 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24197389 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24197400 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24197557 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24197602 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24197637 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24197638 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24197731 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24197737 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24198186 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24198247 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24198651 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24199106 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 24199205 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24199516 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24199591 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24199602 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24199778 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24199802 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24199914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24199923 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24199984 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24199991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24200073 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24200275 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24200318 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24200371 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24200418 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24200477 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24200482 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 24200542 A G Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 24200546 A G Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 24200613 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 24200688 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 24200732 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 24200866 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 24200882 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 24200906 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 24200921 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 24200954 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 24200958 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 24200974 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24200995 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24201003 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24201013 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24201017 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 24201047 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 24201055 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 24201123 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 24201263 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24201351 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24201450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24201478 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24201499 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24201515 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24201537 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24201569 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 24201679 A T Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 24201702 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 24201725 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 24201752 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 24201778 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 24201847 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 24201852 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 24201982 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 24202123 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24202383 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24202451 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24202572 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24203108 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24203539 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24203776 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24203777 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24204264 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24204357 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24204568 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24204787 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24204860 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 24204893 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24205309 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24205575 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24205767 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24205942 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24205999 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24206106 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24206354 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 24206399 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24206463 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 24206472 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24206638 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 24206668 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 24206704 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 24206768 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24206828 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24207102 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24207312 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 24207414 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 24207486 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24207637 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24207638 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24207682 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24207829 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 24207834 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24207840 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24208051 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24208084 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24208100 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24208132 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24208145 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 24208177 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24208188 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 24208242 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24208249 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 24208255 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 24208298 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 3 24208445 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24208566 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24208594 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24208675 T G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 24209363 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24209534 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24209865 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 24210147 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 24210843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24211323 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 24211687 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24213117 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24213233 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 24213287 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 24213572 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 24213763 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24213994 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24214492 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24215813 C A Y N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 3 24216220 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 24216283 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 24216315 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24216343 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 24216444 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 24216451 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24216482 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 24216579 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24216602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24216614 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24216783 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 24216837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24216883 C G Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 24216906 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 24216934 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24216997 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24217018 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24217022 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24217131 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 24217184 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24217214 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 24217369 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24217456 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24218219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24218227 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24218563 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24218770 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 24218774 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24219333 G A N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 24219386 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 24219566 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24219900 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 24219936 T A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 24219951 T G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 24220004 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24220031 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 24220077 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 24220158 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 24220210 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24220317 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 24220390 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24220573 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 24220691 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24221029 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24221164 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24221229 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 24221392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24221487 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24221624 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 24221694 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 24222120 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24222283 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 24222404 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24222426 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 24222427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24222437 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24222573 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 24222585 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24222618 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 24222909 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24224314 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24224719 A G Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 24226876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24227284 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 24229423 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 24231037 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24231216 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24231502 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 24231696 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 24231721 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24231807 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24231849 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24232583 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24232622 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24232633 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24232650 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24232673 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24232681 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24232712 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24232794 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24232946 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24232973 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24232974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24232993 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24233057 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24233109 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24233203 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24233225 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24233271 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24233537 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24233550 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24233565 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24233592 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24233603 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24233679 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24233752 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24233759 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24233765 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24233789 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24233799 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24233979 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24233988 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24234034 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24234170 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24234203 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24234272 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24234410 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 24234439 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24234474 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24234786 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24234855 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24235227 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24235265 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 24235567 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24235590 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24235601 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24235859 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24235966 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 24236024 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 24236055 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24236110 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24236135 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 24236160 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 24236230 A T N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 24236289 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 24236292 G C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 24236304 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 24236307 C T N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 24236349 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 24236395 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 24236414 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 24236527 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 24236529 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 24236551 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24236567 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24236654 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24236671 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24236675 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24236820 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24236844 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24236851 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 24236932 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24236944 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 24236970 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 24237017 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24237060 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24237177 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24237196 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 24237257 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24237303 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24237370 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 24237443 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24237537 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24237653 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 24237720 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24237747 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24237766 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24237937 C A Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 24238038 T A Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 24238248 A C Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 24238264 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24238684 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 24238839 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24238852 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 24239052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24239125 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24239261 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 24239318 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24239544 T A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 24239564 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 24239609 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24239654 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 24239772 C G N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 24239817 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24240014 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 24240071 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24240082 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 24240248 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 24240250 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 24240302 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24240315 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 24240330 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 24240419 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 24240630 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 24240704 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 24240785 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 24240806 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 24240854 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24240908 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24240925 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 24240985 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 24241030 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 24241034 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 24241057 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24241109 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24241173 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24241177 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 24241195 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 24241243 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 24241342 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 24241355 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24241509 A C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 24241565 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 24241649 T C Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 24241719 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 24241722 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24241740 C A Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 24241868 A G N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 24241931 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 3 24241969 C G N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 24242082 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 24242101 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 24242348 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24242422 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 24242430 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24242607 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 24242739 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 24242758 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 24242759 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 24242792 A T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 24242802 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 24242820 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24242825 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 24242840 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 24242895 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 24242897 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 24242962 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 24243043 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 24243056 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 24243101 A T Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 24243576 G A Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 24243677 T C Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 24243806 A G Y Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 24243826 C A Y N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 24243913 C G N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 24244019 T A Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 24244037 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24244344 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 24244358 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24244376 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 24244468 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 24244481 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24244599 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24244618 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 24244634 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 24244700 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 24244718 G T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 24244763 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24244844 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 24245057 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24245082 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 24245172 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24245244 A C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 24245246 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 24245257 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 24245298 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24245321 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24245587 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 24245640 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 24245654 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 24245803 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24245855 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24245880 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24245887 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24245925 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 24245941 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 24245988 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24246055 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24246149 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24246165 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24246169 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24246307 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 24246312 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24246322 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 24246345 C G Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 24246365 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24246383 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 24246422 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 24246588 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24246597 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24246601 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24246656 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24246698 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24246717 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24246849 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24246852 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24246904 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24246947 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24247114 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24247247 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24247373 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 24247413 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 24247696 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 24247917 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24248083 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24248198 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24248305 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24248326 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24248579 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24248632 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24249305 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 24250610 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24250855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24251009 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24251486 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24251712 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24251755 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24252103 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24253573 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 24254045 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24254217 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24254516 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24254584 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24254813 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24255136 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24255164 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 24255178 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 24255221 A C N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 24255941 A G Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 24255983 G A Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 24256032 T A Y N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 24256271 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 24256273 T C Y Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 24256288 G A Y Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 3 24256351 T C Y Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 24256431 C G Y N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 24256493 T C Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 24256539 T C Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 24256649 A T Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 24257046 C G Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24257092 C G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24257145 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24257501 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24257574 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24257597 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24257728 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24257735 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24257743 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24257781 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 24257782 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24257880 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 24257896 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 24257922 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 24257996 A T N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 24258022 T A N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 24258077 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 24258083 G T Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 24258186 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24258252 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24258310 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24258455 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24258838 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 24258876 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24259098 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24259137 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 24259227 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 24259278 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 24259445 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 24259462 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 24259662 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 24259680 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24259856 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24259925 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 24260015 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 24260084 A G Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 24260264 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 24260273 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 24260617 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 24260696 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 24261095 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24261247 G C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24261303 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 24261469 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 24261550 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 24262194 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24262196 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24262296 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24262396 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 24262531 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 24262577 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24262595 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24262656 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 24262671 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24262761 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24262921 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24263075 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 24263250 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 24263639 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24263728 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 24263902 G T Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 24264366 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 24264390 A G Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 24265110 C T N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 6 14 2 2 6 3 24265186 C T N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 24265197 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 24265297 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 24265309 A G Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 24265317 G A Y Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 24266214 C T N Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 3 24266329 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 24266345 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 24266426 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 24266716 T A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 24267139 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 24267155 T C Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 24267198 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 24267232 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 24267265 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 24267299 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 24267378 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 24267397 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 24267440 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 24267460 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 24267777 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 24267792 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 24267815 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 24267852 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 24267894 G A Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 24268004 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 24268094 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 24268267 T G Y N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 24268555 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 24268556 A G Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 24268877 A T Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 24269173 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 24269174 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 24269203 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 24269568 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24269647 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24269679 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 24269775 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24269904 A T Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 24270202 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24270209 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 24270371 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 24270742 T C Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 24270813 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 24270940 G T Y N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 24270980 A G Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 24271025 G A Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 24271056 G C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24271084 C A Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 24271124 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 24271414 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 24271415 A G Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 24271436 T C Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 24271625 A T Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 24271626 G T Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 24271669 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 24271747 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24271939 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 24272007 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 24272190 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24272419 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 24272688 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24272742 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24272780 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 24272824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24272846 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 24272853 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24272883 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 24273087 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 24273116 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 24273125 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24273255 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24273300 G C N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 24273407 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24273428 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24273431 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24273442 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24273450 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 24273475 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24273493 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 24273512 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 24273528 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24273592 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 24273805 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24273888 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24273993 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 24274012 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 24274028 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24274124 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 24274162 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24274166 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 24274213 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24274238 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24274313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24274489 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24274657 T A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 24274778 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24275169 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 24275489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24275587 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24275691 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24275692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24275757 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 24275885 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24275889 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24275910 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24276169 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 24276258 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 24276563 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24276650 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24276728 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 24276769 G C N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 24276773 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 24276846 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 24276873 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 24276976 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 24277127 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24277482 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24277512 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 24277590 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24277894 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24278237 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24278268 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24278321 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24278583 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 24278589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24278596 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24278607 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24278635 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24278638 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24278653 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 24278677 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 24279047 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 24279264 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24279288 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24279356 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24279364 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24279460 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24279497 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24279671 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24279692 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24279849 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24279997 G C N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 24280147 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 24280296 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 24280708 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 24280798 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24280848 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24280896 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24280904 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24281020 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 24281209 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 24281257 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24281260 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 24281270 C G N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 24281286 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 24281371 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24281456 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 24281471 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 24281481 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 24281511 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24281568 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24281640 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24281657 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 24281760 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24281797 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24281925 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 24281942 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 24281946 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 24281971 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 24281974 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24281987 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 24282022 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24282162 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24282270 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24282281 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24282434 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24282455 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24282538 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24282545 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24282913 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24283108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24283141 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 24283206 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24283377 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24283667 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24283741 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24284551 A G Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 24284885 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 24284981 A G Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 24285027 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 24285212 A C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 24285222 C A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24285224 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24285255 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24285287 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24285709 T C Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 24285930 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 24286637 A C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 24286684 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 24286710 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 24286998 T G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 24287062 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24287168 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 24287238 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24287633 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24287779 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 24288566 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 24288760 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 24288786 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24289883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24290025 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24290599 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24290722 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24290731 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24290938 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24291219 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24291285 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24291305 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24291359 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 24291435 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24291470 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24291501 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24291528 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 24291534 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 24291615 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 24291628 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24291645 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 24291647 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 24291675 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24291686 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24291793 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24291795 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24291834 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24291916 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 24292041 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 24292119 G T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 24292164 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24292209 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24292258 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24292390 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24292431 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24292509 G C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 24292874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24292964 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 24292995 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 24293690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24294013 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24294616 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 24296770 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24297075 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24297403 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24304799 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24305406 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24305448 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24306232 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24307044 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24307343 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24307414 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24307498 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24307515 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24307527 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24308035 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24308879 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24309627 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24309779 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24311242 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24311511 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24311803 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24312265 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24312862 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24313858 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 24314291 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24314538 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 24315069 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24315189 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24315343 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 24315994 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24316090 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24316318 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24316403 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24316528 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 24316529 T G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 24316569 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24316872 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24317240 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24317461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24317512 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24318240 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24318260 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24318431 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24318871 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 24319509 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24320612 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24320659 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24320677 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24320694 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24320917 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24321006 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24321134 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24321270 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24321433 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24321496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24321518 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24321662 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24321909 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24321997 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24322119 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24322345 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 24322579 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24322599 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24322750 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24322757 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24322783 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24322829 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 24322859 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 24323272 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24323327 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24323391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24323524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24326176 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24326277 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24326599 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24327036 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24327684 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24328238 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24329209 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 24329220 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 24329262 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24329362 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 24329420 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 24329583 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 24329804 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 24329931 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24330196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24330287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24330380 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24330532 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24330666 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24330752 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 24330799 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24330870 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24330898 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24330920 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24330931 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24330977 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24331049 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24331548 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24331655 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 24332006 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24332059 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24332204 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 24332282 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 24332359 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24332505 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24333002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24333008 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24333090 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24333098 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24333261 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24333356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24333466 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24333519 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24333706 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24333735 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24333781 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24333789 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24333857 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24333873 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24333926 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 24333980 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24334183 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 24334249 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24334251 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24335316 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24335408 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24335471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24335483 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24335706 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 24335792 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 24335888 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24335916 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 24336045 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 24336073 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 24336129 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24336136 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24336148 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24336342 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24336382 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24336418 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24336440 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24336464 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24336490 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24336511 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24336559 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24336658 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24336707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24336724 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24337014 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24337292 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 24337358 G T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 24337377 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 24337384 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24337629 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24337876 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 24338148 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 24338208 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 24338436 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24338445 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24338455 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24341194 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24341362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24341577 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24342053 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24342140 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24342837 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 24343327 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 24343468 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 24343687 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24344934 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24346163 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24346195 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24346409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24346524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24346547 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24346560 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24346586 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24346726 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24346878 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24347091 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24347150 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24347710 C T Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 24347743 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 24348025 T A N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 3 24348090 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24348137 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24348844 G A Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 24348897 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24348921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24348992 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24349035 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24349102 G T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24349324 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24349905 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24349924 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24349990 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24350321 T C Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 24350678 A T Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 24350679 C T Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 24350948 T C Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 24351018 A G Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 24351073 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24351084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24351106 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24351142 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24351557 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24351591 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24351630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24351640 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24351768 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24351931 G T Y N 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 3 24352060 C T Y Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 3 24352240 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 24352564 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 24352590 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24352740 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24353352 G A Y Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.363636363636364 0.636363636363636 0 15 7 4 7 0 3 24353441 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24353480 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24353522 A T Y N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 24353635 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24353679 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24353730 C A N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 24353895 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24353935 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24354162 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24354212 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24354337 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24354343 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24354445 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24354753 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24354860 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24354972 A C Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 24354985 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24355166 G T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24355362 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24355584 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24355621 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24355863 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24356205 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24356398 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24356414 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24356738 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24356905 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24356914 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24356958 T G Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24356982 G C Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24357008 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24357201 C A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24357334 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24357381 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24357400 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24357411 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24357514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24357637 T A Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24357649 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24357652 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24357833 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24357907 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24358141 T C Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 24358418 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24358591 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24358620 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24358742 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24358821 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24358992 A C Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 24359016 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24359503 A G Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 24359605 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24359841 G T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 24359878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24360482 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24360576 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24360601 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24360718 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 24361033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24361198 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24361387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24361458 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24361643 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24361978 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24362087 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24362332 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24362433 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 24362667 C A Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24363370 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 24363442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24363448 A C Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24363479 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24363953 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24363975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24364003 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24364077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24364156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24364200 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24364253 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24364355 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24364555 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24364560 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24364593 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24364604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24364616 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24364624 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24364674 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24364678 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24364711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24364740 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24364743 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24364753 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24364764 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24364831 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24364841 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24364847 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24364863 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24364903 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24364951 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 24365260 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 24365402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24365664 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24365777 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24365855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24365902 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24365937 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24366150 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24366419 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 24366489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24366586 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24366597 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24366646 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24366676 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 24366700 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24367021 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24367261 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24367464 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24367509 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24367510 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24367718 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24367809 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24367914 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24367915 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24367928 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24368048 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 24368058 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 24368064 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24368075 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 24368107 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24368213 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 24368222 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 24368230 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24368248 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24368340 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24368360 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24368381 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24368480 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24368521 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24368568 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24368626 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24368636 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24368645 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24368652 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24368709 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24368759 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24368849 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24368864 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 24368902 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24368934 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24369056 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24369073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24369113 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24369198 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 24369218 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24369242 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 24369352 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24369360 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24369376 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24371081 T G N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 24371136 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 24371154 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 12 6 3 6 0 3 24371155 A G Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 3 24371190 A T N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 24371192 A G N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 24371212 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 24371220 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 24371264 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 24371290 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 24371296 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24371309 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24371460 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 24371512 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24371579 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 24371613 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24371691 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24371790 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 24371825 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24371866 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24371877 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24372030 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24372041 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24372387 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24372445 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24372477 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24372502 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 24372534 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 24372537 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 24372643 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 24372648 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 24372682 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24372698 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 24372789 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 24372840 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 24372850 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 24372855 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 24372884 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24372893 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24372923 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24373043 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24373089 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24373109 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 24373186 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 24373225 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24373229 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 24373371 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 24373396 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 24373472 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 24373570 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 24373590 T C N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 24373597 A G N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 24373692 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 24374051 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24374082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24374106 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24374214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24374225 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24374278 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24374289 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24374339 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24374463 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24374492 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24374535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24374594 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 24374678 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24374791 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24374867 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 24374986 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24375319 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 24375320 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 24376090 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24377269 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24377308 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 24377901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24378966 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24378972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24379124 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24379476 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24379563 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24379651 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 24379678 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 24379989 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24380011 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24380061 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 24380116 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24380273 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24380428 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24380496 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 24380589 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 24380608 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24380742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24380777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24380826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24380834 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24380925 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24380930 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24380959 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24381115 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24381116 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24381193 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24381212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24381239 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24381265 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24381291 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24381307 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24381318 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24381328 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24381467 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24381482 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24381485 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24381523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24381532 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24381561 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24381622 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24381626 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24381711 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24381755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24381762 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24381773 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24381791 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24381824 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24381916 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24381923 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24381964 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24382048 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24382291 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24382326 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24382342 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24382352 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24382423 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24382440 G T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 24382548 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 24382586 G T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 24382587 G T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 24382607 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 24382617 C A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 24382735 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0 0.733333333333333 0.266666666666667 11 19 0 11 4 3 24382768 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 24382796 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24382861 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24382920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24382965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24383000 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24383144 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24383359 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24383412 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24383614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24383677 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24383774 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 24383784 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 24383883 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24384345 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24385803 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 24386121 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24386359 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24386435 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24386486 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24386646 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24386719 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24387230 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24387392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24387834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24388431 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24388485 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24388672 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24388701 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24391835 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24392267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24392414 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24393054 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 24393756 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24395514 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24395752 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 24396702 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24396971 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 24397193 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 24397325 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 24397564 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 24397770 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24397820 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24397915 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24397937 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24398082 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 24398269 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24398307 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 24398349 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24398363 C G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 24398372 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24398479 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24398503 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24398561 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 24398598 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 24398639 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 24398938 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24398957 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24398995 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24399005 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24399039 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24399066 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 24399238 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24399312 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24399409 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24399479 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24399529 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24399604 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24399610 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24399693 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 24399725 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24399734 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24399925 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 24400152 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 24400182 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24400245 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 24400308 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 24400397 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24400413 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24400432 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24400455 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 24400584 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 24400648 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 24400694 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 24400810 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 24401273 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24401451 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 24401458 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 24401477 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24401491 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24401516 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 24401545 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24401556 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 24401878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24402133 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 24402409 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 24402464 T C Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 24402757 G A N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 24403137 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 24403360 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24403488 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24403566 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24403588 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24403618 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24403619 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 24403636 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24403651 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24403657 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 24403678 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24403703 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24403714 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24403727 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24403740 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24403764 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24403768 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24403805 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24403817 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 24403892 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24403901 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24403923 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24403972 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24403992 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 24404022 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 24404041 G C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 24404136 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 24404155 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 24404230 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 24404240 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 24404274 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 3 24404346 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 24404378 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24404459 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24404505 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 24404566 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24404596 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 24404663 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24404672 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24404704 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 24404799 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24404902 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 24404935 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 24404953 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 24404979 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 24405132 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 24405153 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24405297 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 24405444 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 24405790 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 24405905 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 24405943 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 24406475 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 24406546 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 24406621 C A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 24406650 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 24406688 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 24406899 G A N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 3 24407255 C G N N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 5 11 0 5 3 3 24407257 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 24407369 A C N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 24407374 C G N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 24407492 C G N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 24407496 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 24407550 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 24407580 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 24407666 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 24407716 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24407722 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24407732 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 24407759 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 24407843 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 24407910 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24407975 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 24407999 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 24408011 G C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 24408018 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 24408123 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 24408141 C G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 24408177 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 24408181 C A N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 24408237 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24408345 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 24408866 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 24409303 G C Y N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 3 24409514 A T N N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 3 24409668 A T N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 3 24409742 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 24409952 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24409954 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24410065 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 24410069 G C Y N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 24410392 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24410541 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24410563 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24410651 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24411192 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24411450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24411465 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 24411512 G C Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24411900 C A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24411952 T C Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 24412062 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 24412259 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 24412381 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24412388 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 24412414 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 24412514 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 24412553 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 24412592 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 24412642 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 24412739 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24412764 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24413657 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24413693 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 24413751 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24413834 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 24413918 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24414587 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24414997 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24415203 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 24415373 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 24415387 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 24415548 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 24416619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24416821 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 24417073 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24417284 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24417973 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 24418555 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24419190 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24419555 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24419629 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24420870 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24421274 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24421563 C T Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 24421965 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24421987 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24422005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24422861 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24423376 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 24423419 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24423479 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24423962 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 24425281 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24425575 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24426212 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24426300 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24426999 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24427093 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24427188 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 24427312 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 24429632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24430046 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24432246 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24432656 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24432733 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24436174 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24438554 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 24439805 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24440079 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24441531 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24443288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24445254 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24445939 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24446024 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 24447696 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 24447976 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24448243 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 24448343 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24449214 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 24451142 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24451908 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24452517 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24453124 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24453390 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24453495 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24453589 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24454578 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24462004 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24462273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24462280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24463023 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24463044 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24463427 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24465260 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 24466782 G C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 24470134 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 24470135 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 24470505 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 24470605 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24470723 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24470920 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24470923 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24470996 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24471128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24471157 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24471289 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24471498 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24471639 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24471806 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24471927 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24471983 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24472119 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24472209 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24472210 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24472475 C G Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 24472849 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24473524 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24473773 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24473820 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24473880 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24474455 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 24474540 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24475229 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24475239 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24475359 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24475639 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24477043 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24477354 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24477897 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24478034 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24478089 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24478112 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24478244 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24478651 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24478788 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24479065 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24479205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24479237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24479967 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24480290 C A N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 3 24480389 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24480436 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24480483 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24480587 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 24480590 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24480879 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24480913 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24480931 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24481270 T A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 24481327 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24481615 T A Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 24481778 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24481819 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24482071 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24482092 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24482185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24482261 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24482309 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24482701 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 24483064 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24483090 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24483302 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 24483642 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 24483760 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 24484103 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 24484276 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 24484347 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24484430 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 24484514 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 24484549 C T N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 24484551 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 24484607 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 24484822 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 24484845 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24484961 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24484993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24485006 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24485088 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24485119 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24485217 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24485227 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24485251 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24485284 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24485581 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24485631 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24485760 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24486247 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24487039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24487812 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24487983 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24488028 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24488617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24488767 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24489137 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24489201 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24489257 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24489285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24489414 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 24489489 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24489837 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24490061 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24490188 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24490688 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24490721 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24490749 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24490809 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24490810 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24490948 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24491024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24491084 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24491099 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24491112 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24491213 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24491234 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24491496 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24491777 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24491873 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24491928 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24492026 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24492686 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24492704 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24493163 C T N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 24493182 A T N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 24493239 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 5 13 2 1 6 3 24493256 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 24493458 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24493472 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 24493754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24493935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24493952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24494059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24494201 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24494207 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24494253 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 24494298 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24494333 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24494861 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24495240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24495333 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24495619 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24495654 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24495667 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24495948 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24495965 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24495977 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24496009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24496043 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24496057 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24496066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24496092 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24496223 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24496273 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24496278 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24496312 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24496345 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24496398 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24496580 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24496594 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24496598 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24496693 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24496777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24496839 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24497037 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 24497241 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24498589 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24498793 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24498826 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24498874 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24499236 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24499560 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24500215 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 24500784 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 24503041 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24503379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24505804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24506707 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 24507776 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 24508744 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24510226 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24510902 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24513881 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24514073 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24514099 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24514255 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24514506 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24517453 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 24517960 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24518212 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24518213 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24519011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24519136 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24519619 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24519924 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 24520004 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 24520707 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24520905 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24521089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24521194 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24527921 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 24528315 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24528715 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24528921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24528950 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24529488 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 24529595 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24530191 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24530910 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24530924 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24531000 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24531305 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 24531528 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24531604 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 24535528 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24537156 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24537694 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24537763 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24537933 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24538164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24538656 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24539862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24540363 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24541713 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24542221 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24543447 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24544870 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24547180 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24547527 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24548209 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24548999 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24549030 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24551644 A C N N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 24552207 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24552275 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24562821 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24562912 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24563289 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24564734 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24565286 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24565309 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 24565340 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24565448 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24565538 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24565997 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24566959 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24567031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24567676 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24567766 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 24568820 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 24569316 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24569503 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24569518 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24569751 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24570268 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24570620 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24570766 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 24570888 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24572232 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 24573440 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 24573636 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 24573698 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 24574397 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 24574576 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 24574630 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24574644 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 24574659 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24574675 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 24574809 A T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24574823 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24574828 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24574839 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 24574857 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24574887 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 24574940 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24575145 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 24575186 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 24575413 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 24575446 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24575465 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24575511 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24575607 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24575671 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24575724 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24575873 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24575904 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24576177 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24576191 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 24576231 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 24576601 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24576854 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24576858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24576883 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24577010 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24577803 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24577817 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 24577962 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24578032 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24578190 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 24578200 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24578221 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24578265 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24578307 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24578313 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24578349 C T Y Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0 1 0 10 10 0 10 0 3 24578586 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24578740 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 24578864 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24578920 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 24578923 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 24578964 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 24579013 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 24579116 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24579276 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 24579279 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 24579302 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 24579311 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24579314 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 24579630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24580065 G A N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 24580122 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 24580124 C T Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 24580303 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24580316 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 24580467 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24580523 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 24580637 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 24580643 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24580716 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 24580743 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 24580773 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 24580878 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 24580913 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 24580997 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 24581090 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 24581120 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 24581314 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24581407 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24581476 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24581799 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 24582066 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24582766 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24582777 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24582879 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24583627 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24584033 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24584245 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24584676 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 24584696 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 24584830 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24584857 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 24584976 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24585136 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 24585176 A G Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 24585226 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 24585227 A C N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 24585415 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 24585443 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 24585512 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 24585614 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 24587952 A G N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 24588790 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24589125 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24589494 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24590043 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24590762 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24591433 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24591625 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 24591868 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24591885 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24591907 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24591935 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24591938 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24591974 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24592036 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24592241 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24592342 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24593129 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24594156 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24594222 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24595212 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24596381 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 24596803 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 24596832 T G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24597777 T C N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 24598017 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24598875 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24599352 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24599379 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24599417 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24599593 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 24599594 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24599624 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24599647 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24599820 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24599968 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24600011 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 24600020 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 24600277 T A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 24600438 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24600573 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 24600743 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24600808 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 24600914 A C Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 24601028 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 24601098 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24601140 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24601195 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24601213 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24601248 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24601438 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24601480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24601523 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24601683 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24601830 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 24601831 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 24601957 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24601975 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24602705 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24602795 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24602847 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24603382 T A Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 24603815 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24603874 G T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 24604111 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24604143 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24604159 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24604162 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24604457 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24604556 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24604646 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24605007 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24605059 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24605186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24605268 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24605616 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24605622 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24606002 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24606132 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24606190 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 24606332 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24606413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24606474 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 24606542 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 24606614 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24606642 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 24606651 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 24606675 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 24607214 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24607219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24607332 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24607362 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24607525 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24607540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24607582 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24607777 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24608100 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24608165 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24608166 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24608202 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24608248 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24608300 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 24608459 C T N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 24608476 C A N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 24608493 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 24608520 A T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 24608530 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 24608568 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 24608669 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 24608802 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24608814 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24609425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24609571 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 24610239 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 24610984 T A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 24611685 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24611695 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24611709 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24611711 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24611745 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24611781 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24611792 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 24611826 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24611857 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24611917 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24611931 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24611958 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24611982 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24612055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24612259 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24612352 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24612868 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24612935 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24613025 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24613043 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24613305 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24613384 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24613889 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 24614536 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24614627 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24614703 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24614798 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24614977 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 24615077 C A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 24615243 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 24616091 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24616135 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24616204 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24616256 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24616320 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24616324 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24616561 A G Y Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 24617144 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 24617343 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 24617469 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 24617501 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 24617600 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24617683 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 24617704 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24618114 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24618197 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24618276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24619515 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24620544 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24620858 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24621106 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24621441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24623423 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24623446 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24623691 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24623725 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24624697 G T Y N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 24625774 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 24625842 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24625857 C A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24626217 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24626219 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24627032 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 24627872 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 24629316 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24629383 A C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 24629446 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24630978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24631670 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24632096 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24632637 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24632798 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24634758 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24636345 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 24637230 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 24637966 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24638227 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24638392 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24638579 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24638623 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24638652 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 24638773 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24638788 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24638891 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24638956 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24639161 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24639174 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24639312 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24639464 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24639545 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24639579 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24639811 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24640634 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 24641444 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24641760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24641991 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24642036 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24642110 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24642115 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24642266 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24642320 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24642360 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24642554 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24642569 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24645088 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 24645264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24645912 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24646127 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24646902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24647137 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24647720 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24647749 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24647792 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24648926 A C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24650252 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 24650869 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24650875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24651722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24652252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24652670 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24654563 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24654607 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24655116 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24655748 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 24659423 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 24659676 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 24662755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24664502 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24664741 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24665423 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24665502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24666266 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 24666976 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24667995 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24668158 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 24668228 C A Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 24669140 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24669369 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24671570 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24671919 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24672461 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24672572 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24673319 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24676120 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 24677210 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24677221 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24677247 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24677413 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24677460 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 24677461 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 24677676 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24677811 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24677865 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 24677871 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 24678235 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24678595 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24681110 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24683150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24683442 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24683947 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24685538 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24685615 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24685705 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24685751 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24686410 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24686468 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24686555 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24686582 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24686909 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24686920 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24686921 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24687092 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 24687872 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24687897 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24688069 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24688093 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24689002 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24689128 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24689145 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24689251 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24689909 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24690729 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24690972 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24690990 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 24691540 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24692030 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24692058 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 24692499 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24692762 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 24692851 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 24693471 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24693483 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24693607 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24694317 T G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 24694394 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 24694531 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24694586 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24695137 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 24695152 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 24695214 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24695250 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 24695473 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 24695536 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24695592 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24695618 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 24696013 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 24696015 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 24696253 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 24696285 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 24696338 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 24696503 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24696677 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 24696743 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24696864 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24696866 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24697185 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 24697193 G C N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 24697264 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24697307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24697420 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24697611 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24697653 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24697658 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24697667 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 24697737 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24697747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24697819 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24697823 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24698073 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24698101 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24698112 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 24698257 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24698340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24698344 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24698610 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24698671 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24698692 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24698772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24698834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24698838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24698901 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24699047 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24699109 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 24699161 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24699380 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 24699845 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24699857 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24699887 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24699924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24699980 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24700160 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24700165 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24700210 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24700257 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24700328 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 24700409 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24700492 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 24701339 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24701345 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24701361 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24701435 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24701473 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24701476 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24701494 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24701497 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24701545 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24701717 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24701765 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24701782 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24701804 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24701819 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24701855 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24701916 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24701920 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24701971 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24701974 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24701988 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24702092 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24703307 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 24703666 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 24703884 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 24703917 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0 0.823529411764706 0.176470588235294 14 20 0 14 3 3 24704034 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 24704117 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 24705519 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24705601 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 24705999 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 24706189 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24706229 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24706322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24706418 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24706508 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24706556 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24706617 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24706811 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24706841 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24706888 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24707237 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 24707300 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 24707474 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24707487 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24707488 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24707528 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 24707571 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24707592 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24707601 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24707794 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24707827 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24707974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24707984 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 24708004 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24708023 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24708041 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24708070 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 24708108 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 24708117 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24708140 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24708203 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24708216 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24708317 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24708321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24708384 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24708425 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24708461 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 24708567 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24708581 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24708608 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 24708646 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24708662 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24708674 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24708689 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24708758 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24708901 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 24708976 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24709582 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24709926 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 24710345 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24710584 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24710625 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24710685 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24710835 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 24711131 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 24711268 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24711316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24711329 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24711587 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24711632 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24711817 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24711866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24712511 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24712682 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24712696 A T Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 24712943 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24713071 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24713093 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24713115 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24713828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24715142 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24715246 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24715320 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24715501 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24715574 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 24715888 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 24715969 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 24716001 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24716285 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 24716290 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24716302 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24716589 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24716674 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24716689 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24716690 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24716708 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 24716869 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24717471 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 24717550 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24718251 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24718365 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24718591 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24718723 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24719160 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24719161 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24719208 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24720263 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 24720718 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24720974 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24721073 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24721396 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 24722053 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24722664 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24723083 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 24723973 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24724391 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 24725638 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24726023 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24726232 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24726355 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24726714 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24726785 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24726893 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24727811 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24728044 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24728380 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24729245 A T N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 3 24729288 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 24729313 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 24729376 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 24729579 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24729710 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24729738 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 24729774 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 24729827 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 24730086 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 24730292 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24730321 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 24730521 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 24730565 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24730776 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24730861 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24730897 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24730910 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24730935 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24730980 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24731129 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24731159 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24731160 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24731176 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24731409 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24731938 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 24732253 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 24732529 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24734276 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 24734489 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 24734732 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24735050 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24735219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24735715 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24736280 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24736936 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24738568 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24740476 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24740634 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 24740670 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 24741374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24741609 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24741992 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24742085 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24742590 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24743078 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24743155 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24743954 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24743956 T G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24743982 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24744201 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 24744291 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24744669 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24744888 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24745096 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 24745407 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 24745431 C A N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 24745658 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 24745913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24745945 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 24746033 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24746101 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 24746105 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24746248 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24746252 A T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 24746383 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24746385 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24746451 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24746511 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24746547 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 24746567 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24746654 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24746706 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24746974 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24747141 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 24747301 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24747400 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24747431 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24747432 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24747466 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24747666 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24747717 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24747918 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24747923 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24748017 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24748025 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24748055 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24748069 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24748137 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24748270 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24748363 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 24748448 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 24748541 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24748621 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24748736 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24748988 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24749012 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24749098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24749121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24749308 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24749388 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24749582 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 24749882 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24749935 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24752012 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24752403 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24753618 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24753764 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24754636 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24755121 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24755305 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24755810 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24755923 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 24756159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24756357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24756521 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24756577 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24757061 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24757739 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 24759163 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24759790 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24760427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24760580 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24761286 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24761290 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24761505 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24761593 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24762909 T G Y N 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 3 24763052 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24763474 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24763577 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24764121 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24764278 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24764944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24765022 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24765085 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 24765199 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24765212 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24765283 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 24765300 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24765526 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24765936 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24766014 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24766193 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 24766382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24766515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24766828 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 24767048 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24767051 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24769159 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 24769181 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24769187 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 24769192 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24769297 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 24769305 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 24769334 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 24769408 A G N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 3 24769495 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 24769532 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24769705 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24770293 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24770610 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24771634 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24771880 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24772132 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 24773677 T A Y N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 24775691 G C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 24775994 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24776350 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24776510 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24776564 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24777242 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 24777606 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24777614 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 24777795 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24778219 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24778271 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 24778281 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24778932 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24779105 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 24779261 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24779263 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24779380 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24779389 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24779541 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24780034 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24780080 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24780138 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24780355 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24780457 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24780698 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24780713 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 24780734 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24780735 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24780746 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24780855 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24781035 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 24781047 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 24781067 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 24781069 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 24781352 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 24781450 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24781457 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24781569 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24781597 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24781772 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24781874 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24781901 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24781925 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24782002 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24782027 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24782030 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24782064 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24782128 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 24782160 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 24782576 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24782720 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24782736 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24782756 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24782770 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24782892 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24783079 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 24783102 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 24783172 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 24783228 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 24783241 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24783467 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24783562 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24783585 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24783589 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24783598 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24783682 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24783933 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24783967 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24784148 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24784183 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24784447 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24784612 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24784674 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24784722 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24784827 A C N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0 0.75 0.25 9 15 0 9 3 3 24784884 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 24784932 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 3 24785201 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24785246 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24785269 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24785581 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 24785582 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24785636 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24785707 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24785879 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24785926 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 24785965 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 24786211 A T Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 24786250 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 24786911 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24787028 T A Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 24788654 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24788797 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24789038 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24789090 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 24789577 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24789627 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24789698 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24789901 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24789961 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24790587 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 24790644 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 24791094 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24791106 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 24791222 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24791318 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24791362 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24791395 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24791806 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24791867 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24791922 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 24792189 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24792362 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 24792430 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24792530 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 24793077 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24793118 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24793162 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24793317 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24794171 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 24794190 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24794209 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24794228 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24794402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24794542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24794578 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24794676 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24794682 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24796297 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 24796664 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 24796699 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 24797004 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 24797261 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 24797549 T G N N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.2 0.8 0 6 4 1 4 0 3 24798156 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24798321 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24798358 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 24798686 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 24799730 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 24799850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24800107 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 24800717 C T N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 3 24800895 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 24801189 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 24801232 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 24801311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24801341 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 24801409 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24801494 G T Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 24801579 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 24801611 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 24801685 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 24801744 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 24801832 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 24802023 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 24802119 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 24802137 C G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 24802142 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 24803483 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 24803885 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 24803898 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 24804479 G A N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 3 24804548 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 24805556 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24805606 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 24806302 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24806941 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 24807174 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 24807200 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 24807436 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 24808016 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 3 24808120 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 24808151 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 24808582 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 24808607 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 24809069 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24809111 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 24809571 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 24810192 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24810259 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 24810260 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 24810428 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 24810719 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 24810725 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 24810788 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 24810800 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 24810827 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 24810867 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 24810916 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24810939 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24811509 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 24811798 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24812374 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24812502 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24812514 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 24812572 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24812585 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24812613 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 24812640 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 24812665 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 24812687 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24812897 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24813655 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 24813788 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 24813791 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 24813817 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 24813911 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 10 20 0 10 5 3 24814021 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24814196 C A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 24814240 C A N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 24814258 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 24814509 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 24814558 T A Y N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.153846153846154 0.846153846153846 0 15 11 2 11 0 3 24814678 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 24814737 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 24814801 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24814814 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 24814819 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24814952 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24815003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24815012 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 24815047 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24815068 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24815093 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24815110 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24815270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24815298 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24815332 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24815481 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 24815500 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 24815517 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24815719 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 24815734 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24815866 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24815920 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24816011 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24816241 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24816257 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24816394 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24816426 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24816446 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24816611 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24816618 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 24816880 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24817416 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24817443 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24817511 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 24817590 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24818444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24818461 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 24818462 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24818491 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24818559 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24818725 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24819366 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 24819854 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24820994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24821570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24821945 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 24822085 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24822086 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24822723 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 24824036 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 24824493 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 24825860 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 24826185 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24826915 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 24828261 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24828410 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 24828502 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 24828651 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 24829586 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 24830808 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24831786 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 24831800 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 24832221 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 24832944 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 24833358 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 24836278 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 24836579 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 24838047 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24839014 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24839547 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24839612 A G Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 24840199 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24840314 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24840540 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 24841184 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24841219 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24841276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24843041 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24843578 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 24843600 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 24843667 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 24844368 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 24844409 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 24844451 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24844900 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 24844945 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 24845110 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 24845290 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 24845489 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24845692 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 24845785 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24845840 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24846010 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24846019 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24846394 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24846491 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24846549 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 24846561 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24846855 T C Y Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 24853444 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24853560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24853850 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 24853965 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24853992 A T Y N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 24854174 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24854192 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 24854193 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 24854203 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 24854253 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 24854293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24854373 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24854434 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 24854645 T C N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 3 24854673 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 3 24854748 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 24854774 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 24854913 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 24855080 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 24855120 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 24855127 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 24855307 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 24855326 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 24855386 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 24855633 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 24855785 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 24855885 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 24855922 G T Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 24855958 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 24856002 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 24856011 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 24856017 C A Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 24856149 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 24856315 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 24856382 T C Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 24856745 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 24857131 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 24857266 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 24857272 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 24857341 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 24857424 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 24857469 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 24857515 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 24857638 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 24858057 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 24858146 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24858267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24858299 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 24858428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24858588 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 24858788 A G Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 3 24858927 T G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 24859109 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24859232 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24859328 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24859370 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24859372 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24859563 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24859788 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24859837 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 24860089 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 24860231 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 24860329 C G Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 24860391 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 24860404 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24860800 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24860953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24868459 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24868523 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24868524 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24868682 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24868701 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 24868825 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24868829 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24868844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24868945 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24868969 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24869091 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24869094 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24869219 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24869676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24869734 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24869988 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24870180 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 24870355 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24870378 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24870398 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24870454 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24870473 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24870540 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24870616 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24870785 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24870902 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24871317 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24871565 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24871566 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24871634 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24871646 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24871782 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24871808 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24872172 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24872173 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24872282 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24872323 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24872405 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24872476 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24872809 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24872861 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24873091 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24873366 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 24873426 A T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 24873457 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 24873514 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24873703 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24873791 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24874117 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24874412 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24874469 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24874725 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24875077 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24875523 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24875725 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24875737 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24875743 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24875781 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24875787 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24875796 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24875819 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24875922 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24875985 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24876023 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24876063 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24876100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24876115 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24876320 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24876405 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24876406 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24876535 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24876601 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24876679 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24876827 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24876876 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24876908 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24877040 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24877230 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24877323 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24877389 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24877479 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 24877599 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24877662 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 24877871 T G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 24877886 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 24878231 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24878232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24878248 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24878255 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24878259 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24878423 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24878428 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24878457 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24878497 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24878541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24878609 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 24878773 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24878843 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24878844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24879118 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24879119 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24879182 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24879255 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24879265 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24879270 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24879514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24880213 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24880228 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24880344 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24882849 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 24882904 T C N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0 0.636363636363636 0.363636363636364 7 15 0 7 4 3 24883224 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24890227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24892900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24893191 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 24893612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24894032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24894165 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24894175 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 24894412 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24894592 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24895822 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24896810 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24898385 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24900388 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24901288 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 24902572 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24902632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24903273 C A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24903312 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24904833 C T Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 24905082 T A Y N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 24906339 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24907580 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24907719 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24908600 C T N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 24910640 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24913835 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24914190 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24914455 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24915505 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24915974 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24917645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24918139 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24918260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24919582 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 24922967 C T Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 24923301 T A Y N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 24923318 C T Y Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 3 24923713 C T Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 24923730 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 24924030 G A Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 24924906 C A Y N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 24924958 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24924976 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 24925050 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24925300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24926854 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24926958 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24928794 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24930854 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24931402 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 24932610 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24932713 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24932756 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 24932766 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 24932815 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24939537 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 24939629 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24939679 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24940013 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24940168 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24940330 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 24940419 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24940704 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24940861 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24940982 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24941319 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24941405 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24941500 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 24941688 A C Y N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 24943033 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24943050 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24943078 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24943208 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24943655 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24943710 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24943787 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24943909 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 24943993 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24944046 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24944147 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24944191 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 24944260 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24944409 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24944433 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24944443 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24944464 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24944600 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24944687 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24944987 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24945091 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24945227 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24945303 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24945304 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24945420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24945546 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24946200 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 24946316 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24946328 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24946394 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24946399 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24946486 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24946653 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24947441 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24947565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24947744 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24948268 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24948548 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24948723 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24949545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24949559 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24949718 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24949855 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24950079 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 24950152 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24950511 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24950587 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24951072 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24952227 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24952312 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24952435 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24953529 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24953928 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24957825 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24958082 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24958090 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24958149 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24958252 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24958475 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24958573 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24958686 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24958708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24958714 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24958781 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24958807 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24958808 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24958910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24958940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24958977 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24958988 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24959006 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24959077 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24959106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24959122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24959469 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24959551 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24959722 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24959738 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24959765 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24960016 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24960209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24960247 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24960274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24960371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24960407 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24960487 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24960501 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24960511 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24960580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24960584 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24960800 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24960804 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24960852 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 24960902 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24960947 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24960948 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24961132 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 24961217 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 24961265 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 24961310 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24961329 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24961396 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 24961420 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24961509 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24961556 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24961582 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24961591 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24961665 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24961739 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 24961741 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24961830 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24961844 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24961853 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24961963 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24961976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24962015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24962016 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24962084 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24962179 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24962383 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24962400 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24962417 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24962509 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24962588 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24962981 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24962989 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24963020 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24963042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24963152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24963168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24963205 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24963206 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24963249 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24963266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24963273 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24963298 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24963308 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24963313 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 24963399 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 24963468 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 24963497 T C Y Y 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 3 24963607 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 24963629 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24963701 A T Y N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 24963744 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 24963788 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24963797 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 24963821 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24963845 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24963851 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24963892 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24963899 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24963924 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24963984 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24963999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24964019 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24964027 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24964070 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24964090 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24964166 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24964244 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24964365 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24964366 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24964423 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24964820 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24964937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24964941 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24965142 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24965184 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 24965313 T G N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 24965759 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 24965821 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 24965876 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24965917 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24965993 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24966191 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 24966213 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 24966221 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24966285 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24966327 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24966450 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24966682 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24966937 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24967186 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24967342 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24967381 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24967625 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24967727 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24967926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24968052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24968141 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24968220 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24968262 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24968291 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24968487 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24968652 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24968750 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24969105 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24969246 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24969334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24969511 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24969583 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24969593 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 24969837 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 24969894 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 24969902 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 24969943 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 24970082 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 24970108 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 24970599 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 24970624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24970687 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24970903 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24971472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24971510 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24972589 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24973971 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 24974088 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 24974112 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 24974376 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 24974636 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24975027 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 24975113 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 24975211 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 24975212 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 24975427 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 24975569 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 24975590 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 24975675 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 24976673 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 24976707 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24977623 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 24977635 A G N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 24977640 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 24977673 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24977779 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24978424 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24982948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24983115 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 24986000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24986286 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24987083 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 24987477 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24987809 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 24988101 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 24988600 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 24988653 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 24988676 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 24988746 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 24988782 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 24988870 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 24989467 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 24989538 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 24989543 G A N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 3 24989655 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 24989687 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 24989971 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 24990092 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 24990104 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24990136 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24990445 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 24990490 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 24990633 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 24990648 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 24990703 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 24990828 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24990852 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24990892 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24990901 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24990918 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24991052 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 24991100 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 24991116 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 24991125 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 24991181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24991314 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 24991478 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 24991570 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 24991608 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 24991695 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 24991794 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 24991795 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 24991821 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 24991924 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 24991958 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 24991982 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 24991988 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 24992017 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 24992158 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24992333 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 24992375 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24992559 G T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 24992720 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 3 24992817 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 24992846 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 24992898 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 24993171 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 24993231 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 24993288 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 24993423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24993437 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24993742 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24994020 C G Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 24994062 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 24994181 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 24994247 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 24994271 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 24994297 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 24994571 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 24994634 C A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 24994741 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 24994781 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 24994947 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24995276 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 24995316 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 24995478 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 24995619 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 24995716 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 24996074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24996118 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 24996501 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 24996537 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 24996717 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 24996718 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 24996855 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24996893 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 24996997 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24997022 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24997064 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24997275 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 24997358 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 24997416 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 24997591 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 3 24997809 A G N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.181818181818182 0 0.818181818181818 4 18 2 0 9 3 24998090 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24998113 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 24998374 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 24998458 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 24998484 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 24998846 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 24999081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24999115 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24999135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24999157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 24999529 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 24999736 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 25006412 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25006450 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25006645 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 25006670 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 25006743 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 25007256 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25007466 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 25007526 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 25007560 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 25007880 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25008041 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 25008466 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 25008487 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25008563 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25009085 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25009110 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 25009188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25009242 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25009887 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25010070 T G N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 25010168 T C N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0 0.769230769230769 0.230769230769231 10 16 0 10 3 3 25010370 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 25010416 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 25010593 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25010798 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 25011442 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25011476 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 25011488 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 25011790 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25011836 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25011884 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 25011939 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 25011955 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25012011 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25012081 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 25012098 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25012145 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25012265 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 25012280 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 25012500 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 25012791 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25012810 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 25012915 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 25013179 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25013264 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 25013525 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25013579 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25013593 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25013630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25013722 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25013793 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25013905 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 25014054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25014094 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25014249 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25014261 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25014322 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25014323 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25014409 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25014425 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 25014439 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 25014475 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25014603 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25014652 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25014666 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 25014758 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25014934 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25014952 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 25015099 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25015175 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 25015238 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 25015271 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25015353 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25015474 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 25015604 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25015728 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25015865 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25015873 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 25015964 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25016278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25016533 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 25016765 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25016923 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25016942 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25017127 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25017175 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 25017292 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25017404 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 25017510 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 25018046 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 25024211 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 25024243 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25024265 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25024298 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25024468 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 25024640 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25024659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25024763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25024840 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25024865 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25025938 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25025952 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25026147 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25026157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25026158 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25026173 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25026177 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25026189 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25026217 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25026978 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 25027456 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 25028477 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25028919 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 25029023 C A Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25029795 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 25030365 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25031175 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25031515 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 25032444 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25032462 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25033013 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 25033158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25033367 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25034059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25034259 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25034355 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25034392 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 25034666 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25036156 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 25040280 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25040340 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25040557 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 25040610 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25042764 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 25042768 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25043148 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 25043151 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 25043427 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 25043441 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25043569 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25043656 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25043673 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 25043675 A T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 25043852 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 25044121 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 25044263 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 25044324 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25045168 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 25045288 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25045326 T A Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 25045712 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 25045761 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 25046049 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 25046164 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 25046531 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 25046585 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 25046601 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 25046607 A C Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 25046617 T G Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 25046656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25046678 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25046866 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 25046918 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 25046984 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 25047021 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 25047047 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 25047072 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 25047296 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25047305 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25048044 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25048715 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25048763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25048765 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25049058 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25049524 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 25049845 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 25050053 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25050383 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 25050437 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25050467 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25051091 G T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 25051266 G A Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 25051273 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25051302 T A Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 25051999 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25052090 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25052466 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25052785 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 25052838 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25052910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25053039 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25053214 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 25053220 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25053228 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25053460 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25053711 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 25059384 A T Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 25061336 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25061462 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25061552 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 25061564 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 25061664 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 25061704 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 25061776 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 25061804 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 25061983 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 25062152 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25062322 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25062368 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25062446 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25062592 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25062606 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25062888 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 25062946 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 25063228 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 25063260 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 25063362 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25063463 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 25063626 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 25063733 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25063825 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25063957 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 25064054 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 25064143 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 25064153 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 25064200 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 25064271 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25064406 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 25064542 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 25064636 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25064640 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 25064713 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 25064880 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 25064925 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 25064957 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 25065189 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 25065234 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 25065293 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 25065331 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 25065440 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 25065454 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 25065471 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25065533 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 25065648 A G N Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 3 25065669 G T N N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 3 25065690 C G N N 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 25066065 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 25066093 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 25066205 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 25066213 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 25066395 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 25066442 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 25066520 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 25066557 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 25066725 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 25066779 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 25066780 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25066959 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 25067202 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 25067412 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 25067435 G C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 25067472 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 25067502 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 25067555 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 25067579 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25067769 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 25067858 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25067950 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25068019 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 25068167 T C Y Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 3 25068598 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 25068690 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 25068954 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25068963 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25069063 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25069142 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 25069171 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 25069221 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 25069436 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 25069462 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 25069475 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 25069644 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 25069650 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 25069705 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25069716 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25069726 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25069744 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25069757 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 25069758 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 25069860 A T N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 3 25069900 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 25069934 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 25069953 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 25069978 G A N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 3 25070106 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 25070111 C G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 25070170 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 3 25070384 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 25070461 G T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 25070476 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 25070563 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25070576 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 25070593 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25070687 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25070980 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25071091 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25071101 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25071195 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 25071224 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 25071341 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 25071388 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 25071401 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 25071445 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25071448 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25071481 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25071495 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25071530 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25071558 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25071610 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25071699 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25071921 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 25072035 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25072117 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 25072149 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 25072421 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25072826 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 25075304 A T Y N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 25075383 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 25075456 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 25075794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25076201 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 25076541 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25076617 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25076834 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 25076879 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25076924 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 25077161 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25078156 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 25078221 T G Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 25079417 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 25079515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25079757 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25079819 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 25079895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25083768 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25083883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25084061 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 25084115 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 25084575 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 25084700 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25084752 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25085172 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 25085253 T G Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 25085287 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 25085549 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25085595 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25085779 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25085797 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25085879 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 25085896 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 25086281 C A Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 25086303 C A Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 25086358 T A Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 25086365 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25086666 A T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25086777 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25086928 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 25087008 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25087044 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 25087124 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25087401 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25087783 G C Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 25087855 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 25087955 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25087979 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25088159 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25088470 T C Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 3 25088475 C T Y Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 25088633 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25088781 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 25088785 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25088831 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 25088979 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 25089253 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 25089281 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 25089437 T C Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 25089445 G T Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 25089452 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25089476 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25089508 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25089697 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 25089858 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25089910 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25090102 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25090183 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 25090316 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25090570 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25090577 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25090699 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 25090735 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25090942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25090961 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25090971 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25090973 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 25091087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25091191 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25091231 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25091262 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25091264 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25091522 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 25091647 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 25091800 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25091839 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25091906 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25092096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25092209 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 25092340 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25092605 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 25092725 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 25092740 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 25092755 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25092936 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25093778 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25093971 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 25094581 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 25094819 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25094886 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25095168 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 25095297 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25096253 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 25096502 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25096872 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25096945 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25097012 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25097813 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 25098251 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25099808 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25100324 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25100847 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25101012 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25101860 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25101976 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 25102048 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 25102169 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 25102214 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 25102592 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25103289 G T N N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 25103404 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 25103419 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 25103435 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25103663 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25103664 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25103796 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25103868 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25103874 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 25103897 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25103923 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 25104006 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25104026 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25104161 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25104181 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25104196 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25104197 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25104216 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25104243 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25104289 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25104303 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25104399 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25104401 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25104412 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25104418 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25104430 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25104431 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25104452 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 25104458 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 25104470 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25104578 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25104594 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 25104652 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 25104671 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 25104675 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 25104731 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25105012 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 25105058 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25105131 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25105191 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 25105203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25105354 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 25106181 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 25108368 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25108781 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 25109006 G T Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 25109292 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 25109300 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 25116020 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25116206 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25116320 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25116423 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 25117048 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 25117453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25117549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25117847 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25118194 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 25118623 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 25118699 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 25118842 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25118901 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 25118933 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 25118958 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 25119564 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25119747 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 25120113 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 25120423 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 25120735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25120770 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 25128109 A T Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 25128631 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25128925 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25129333 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 25130287 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 25130909 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 25131038 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25131362 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25131881 G A Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 25132520 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25133283 A T Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 25133509 C T Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 3 25134274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25134976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25135376 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25136319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25136499 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 25136840 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25136960 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25137093 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25137121 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25137234 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25138166 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25138446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25140541 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25142384 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25142438 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25142764 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 25142950 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 25143173 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 25143338 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 25143435 C A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 25143835 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25144960 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25145678 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25145917 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25145996 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25146542 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 25147323 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25147684 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25147702 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 25147882 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25148137 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 25148410 G T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 25149671 A C Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 25149762 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25156966 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 25158339 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 25159072 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25159945 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25160117 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 25161722 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25162455 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 25163950 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25164093 G A Y Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 3 25164901 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25165444 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 25166422 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25166713 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25166951 G T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 25167087 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25167391 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25167609 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25167939 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25168821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25168899 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25171235 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25172166 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 25174851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25176602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25177160 T G Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 25177218 A G Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 25177969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25178052 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25178422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25180613 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25181351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25185348 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 25186125 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25186281 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 25195282 G T Y N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 25195424 C A Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 25196826 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 25197135 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 25197549 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25197827 C A N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 3 25198005 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 25198466 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 25198695 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 25199306 A C N N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 3 25199557 G T Y N 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.75 0 0.25 6 2 3 0 1 3 25200271 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25202158 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25202415 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25202581 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 25203049 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25203345 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25204722 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 25211946 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25214649 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25215347 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 25215566 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 25216590 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 25216988 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 25217433 G C Y N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 25217578 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 25217956 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 25218624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25218680 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25218752 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25219064 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 25219350 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 25219363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25219375 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 25219422 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 25219439 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 25219458 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 25219468 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 25219473 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 25219540 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 25219543 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 25219621 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 25219641 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 25219655 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 25219683 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 25219690 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 25219741 T A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 25219802 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 25219830 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 25219870 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 25219875 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 25219922 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 25219937 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 25219943 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 25219998 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 25219999 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 25220017 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 25220083 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 25220099 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 25220218 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 25220310 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 25220368 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 25220375 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 25220420 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 25220469 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 25220550 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25220634 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 25220715 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 25220822 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 25220848 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 25220909 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 25220948 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 25220996 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 25220998 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 25221045 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 25221070 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 25221072 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 25221090 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 25221118 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 25221121 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25221289 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25221309 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 25221995 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25222149 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25222212 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25222653 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25223529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25223686 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 25223707 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25223727 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25223901 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 25223974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25224265 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25224497 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25224603 G T N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 25224604 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 25224709 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 25224973 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 25225358 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 25225466 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25225485 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 25225997 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25226033 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 25226071 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 25226084 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25226170 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25226214 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25226223 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25226247 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25226327 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25226343 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25226396 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 25226453 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 25226528 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25226546 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25226571 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 25226573 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25226635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25226705 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 25226844 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25226863 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25226892 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25226897 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25227047 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25227083 C G N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 25227084 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 25227201 T A N N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.5 0 0.5 4 4 2 0 2 3 25227254 C T N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 25227427 C T Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 25227727 A G Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 25227728 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 25227799 T A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 25227823 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 25227838 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25227946 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25227965 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25228045 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25228051 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25228056 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25228068 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25228161 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25228471 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25228590 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 25228601 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25228620 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25228643 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25228648 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25228661 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25228961 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 25229028 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25229043 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25229069 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25229082 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25229121 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 25229215 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 25229254 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 25229276 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 25229389 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 25229395 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 25229447 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25229465 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25229466 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25229485 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25229553 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 25229600 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25229640 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 25229676 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25229688 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 25229690 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25229728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25229828 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25229867 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 25229887 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 25230018 G T N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 25230336 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 25230353 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25230375 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 25230447 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25230538 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 25230540 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25230722 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 25230748 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25230770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25230802 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 25230823 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25230881 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25230894 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25230933 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 25230962 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25230963 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25231033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25231110 A T Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 25231157 G T Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 25231191 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25231248 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 25231265 A T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 25231670 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 25231812 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 25231950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25232065 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 25232116 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25232133 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 25232152 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25232191 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25232205 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 25232232 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25232240 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 25232409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25232636 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25232655 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 25232666 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25232707 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 25232895 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25232929 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25233137 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 25233332 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 25233376 A T N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.75 0.0833333333333333 0.166666666666667 19 5 9 1 2 3 25233389 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 3 25233477 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 25233515 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 25233662 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 25233935 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25234168 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 25234285 A C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 25234302 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 25234613 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 25234807 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 25235282 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25235421 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 25235472 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 25235550 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25235737 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25235842 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25235906 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 25236195 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 3 25236290 T C Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 25236314 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 25236391 T G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 25236398 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25236443 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25236454 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 25236542 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25236599 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 25236732 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25236769 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 25236813 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25236999 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 25237019 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 25237036 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25237303 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 25237335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25237746 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 25237986 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 25238445 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25238763 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25238957 A C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 25239048 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 25239134 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25239188 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25239192 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 25239300 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 25239349 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25239411 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25240262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25241560 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25246776 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25246886 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 25246937 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 25247354 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 25247507 T A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 25248673 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25248739 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25249189 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25250154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25250193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25251067 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 25251984 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25252215 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25252681 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25252949 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 25252989 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 25253143 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25254656 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25255305 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25255447 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25256103 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25258617 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 25259127 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25259209 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 25259439 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25259697 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 25259698 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25260473 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 25261262 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 25263020 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25263715 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25266422 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 25266634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25267439 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 25267624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25268106 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25268186 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25269773 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 25271076 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25271444 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25271621 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25271667 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25272671 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25272910 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25273317 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25274065 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25274149 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25275023 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25275444 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 25278624 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 25280115 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 25282020 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25282355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25282538 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 25282596 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25282680 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25283172 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 25283788 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25285301 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 25285473 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 25286313 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 25287774 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 25287983 T G Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 25288852 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 25289630 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25290214 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25291193 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25292114 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 25292426 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 25292437 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 25292453 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 25292531 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 25292588 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 25292604 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 25292607 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 25292735 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25292755 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 25292764 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 25292779 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25292913 C G N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 25293043 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 25293049 G A N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 25293067 G C N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 25293075 T A N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 25293160 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25293177 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 25293414 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25293451 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25293517 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25293667 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25294284 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 25294308 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 25294320 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 25294741 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 25295246 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 25295269 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25295573 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25295604 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25295622 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25296622 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 25296777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25296800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25297449 T C Y Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 25297642 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25297696 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25297810 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25297814 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25297845 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25297855 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25297921 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25297978 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25298070 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25298173 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 25298271 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 3 25298289 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 25298315 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 25298322 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 25298463 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 25298477 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 25298575 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 25298605 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 25298635 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 25298672 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 25298687 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 25298709 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 25298761 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 25299083 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 25299692 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 3 25299740 A T N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 3 25299816 A C N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 25299938 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 25299960 T A Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 25299984 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 25300107 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 25300161 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 25300357 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 25300560 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 25300643 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 25300737 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 25300860 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25300902 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25300913 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 25301005 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 25301123 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 25301315 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25301348 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25301432 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 25301504 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25301520 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25301583 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25301588 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25301607 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25301634 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25301674 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25301724 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25301781 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25301840 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25302032 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25302068 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 25302119 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 25302212 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 25302511 A G N Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 3 25302577 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 25302626 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 25302830 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 25302913 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25302916 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 25303047 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 25303048 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25303164 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25303231 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 25303344 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 25303404 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 25303441 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25303513 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 25303591 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25303680 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25303746 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 25303779 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25303912 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25304033 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 25304078 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25304102 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25304126 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 25305749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25306198 A T N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.0769230769230769 13 13 1 11 1 3 25307020 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25308078 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25308413 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25308617 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25309240 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25309349 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25310484 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25312183 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 25312757 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 25312792 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 25312935 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 25313005 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25313130 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 25313141 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 25313385 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25313448 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25313747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25314983 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25315032 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25315036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25320568 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25320744 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25321703 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25322146 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25322393 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 25323025 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 25323149 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25323150 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25323462 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25323846 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25324017 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25324097 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25324117 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 25324155 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 25324259 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 25324382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25324420 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 25324498 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25324831 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25324877 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 25324954 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 25325305 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25325323 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 25325519 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 25325662 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 25325708 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 25325725 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 25325908 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 25325946 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 25326104 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 25326251 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 25326283 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 25326332 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 25326343 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 25326540 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 25326690 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 25326700 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 25326716 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 25326877 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 25327358 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 25327580 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25327844 A G Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 25327931 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 25327956 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 25328680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25328898 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25328914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25329030 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25333404 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25333985 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25333996 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25334131 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 25334265 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25334269 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25334409 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25334728 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 25335338 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 25335488 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 25335977 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 25336318 C G Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 25336416 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25336631 C T Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 25337260 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25337351 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25338045 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 25339309 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25339727 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 3 25340743 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 25340984 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25341010 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25341235 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25341776 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 25341794 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 25341893 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 25341951 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 25341986 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 25342056 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25342136 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 25342193 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25342343 C A Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 25342531 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 25342646 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 25342880 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 25342955 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25342969 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25342970 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25343413 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25343500 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25343727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25344453 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 25344457 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 25344568 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 25344660 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 25344731 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 25344733 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 25345511 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 25345518 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 25345531 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 25345567 G C Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 25345706 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 25345741 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25345757 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25345770 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25346132 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25348091 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25349265 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25349434 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25349582 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25349585 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25349660 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25349987 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 25350134 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 25350524 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25351915 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 25353271 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 25354033 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25356001 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 25356666 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25357439 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 25357975 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25358041 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25358210 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25358550 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 25358614 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 25358708 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 25359279 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 25359908 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 25360100 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25360472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25361429 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25362107 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25362898 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 25363861 T C Y Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 25363862 T C Y Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 25365087 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 25365474 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 25366464 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25367521 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 25367665 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 25367677 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 25367813 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25367837 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 25368884 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25368992 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25369389 T A N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 25369417 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 25369734 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 25369848 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 25369872 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 25369964 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25370475 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 25370603 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25370980 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 25371270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25371289 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25371304 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25371394 C A Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 25371583 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 25378109 A G Y Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 3 25378363 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25378506 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 25378740 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 25378754 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 25378842 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25379019 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 25379568 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25379812 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 25379816 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25379861 T C Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 25379976 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 25379982 C A Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 25379997 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 25380292 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 25380664 A G Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 25380797 T C Y Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 25380799 G T Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 25380825 T G Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 25380872 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 25380927 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 25380968 T C Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 25380999 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25381105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25381494 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25381813 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25382157 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25382281 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25383110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25383619 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25384775 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 25384785 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 25385649 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 25385981 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 25386566 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 25386958 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25386963 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25387246 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 25387464 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25387495 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25387561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25387605 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 25387634 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 25388492 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25388513 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25388532 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25390074 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25390469 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 25390577 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25394372 C G N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 25394574 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 25397213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25397847 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 25399229 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25402667 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 25403433 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25404647 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 25405131 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 25405564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25405598 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25406308 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25407455 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 25409062 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25409640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25410440 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25410527 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 25410858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25410908 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25411253 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 25412284 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 25412394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25413033 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25414305 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 25414895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25415272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25416566 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 25418588 A C Y N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 25421481 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 3 25426504 C A Y N 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 5 9 2 1 4 3 25427452 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 25428415 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 25429387 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 25429502 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 25430580 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 25430882 C T Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 25431032 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 3 25431279 C T Y Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 3 25433867 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 25433879 T A Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 25433906 A T Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 25433914 A C Y N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 25433986 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 25434055 A G Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 25434070 G A Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 25434148 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 25434330 T C Y Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.333333333333333 0.111111111111111 0.555555555555556 7 11 3 1 5 3 25434457 G C Y N 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 7 5 3 1 2 3 25434471 G T Y N 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 3 25435350 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 25435388 G A Y Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 25440623 T C Y Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 25441235 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 25442866 G C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 25442958 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 25447049 A G Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 25447152 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 25454919 T G Y N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 5 7 1 3 2 3 25455529 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 25455612 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 25455744 C G Y N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 3 25455766 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25455818 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25455853 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 25455865 G C Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 25456623 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 25456841 C G N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 25457160 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 25457254 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 25457325 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 25457683 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25457861 A T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 3 25458026 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.416666666666667 0.5 0.0833333333333333 16 8 5 6 1 3 25458219 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 25458289 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 25458296 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25458384 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25458593 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25458623 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 25458644 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25459777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25461778 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 25462065 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25463445 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25466006 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25467932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25469070 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25469474 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 25469867 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 25470448 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25470926 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25471172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25472790 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25473028 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25473066 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 25473957 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25475265 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25476636 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25477477 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 25478012 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 25478097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25479129 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25480267 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25480311 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25480317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25480431 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 25480724 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 25481358 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25482307 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 25482499 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25482869 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 25482998 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25483168 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.166666666666667 0.722222222222222 0.111111111111111 19 17 3 13 2 3 25483213 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25483237 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 25483336 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25483382 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 25483430 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 25483611 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 25483707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25483989 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 25484281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25484356 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25484418 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 25484442 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 3 25484557 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 25484637 G C N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 3 25484753 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 25484804 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 25484905 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 25484962 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 25485025 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 25485069 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 25485438 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 25485564 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 25485643 G A N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.214285714285714 0.714285714285714 0.0714285714285714 16 12 3 10 1 3 25485875 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 25486193 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25486231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25486284 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25486424 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25487888 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 25488425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25489560 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25489702 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 3 25489813 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 25489842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25489863 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25490045 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25490921 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25491243 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25491254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25491329 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25491360 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25491394 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25491404 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25491639 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 25491932 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25492276 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25492354 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25492480 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25492509 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 25492793 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25493724 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 25493774 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 25494313 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25494390 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 25494641 A C N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.5 0.416666666666667 8 16 1 6 5 3 25494860 A G N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 3 25495113 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 25495172 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 25495268 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 25495283 G A Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 25495322 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 25495373 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 25495565 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25495954 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25496111 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 25496176 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 25496193 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 25496207 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 25496236 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 25496420 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 25496439 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 25496801 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25496944 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25497011 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25497035 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25497420 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 25497431 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25497781 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25497810 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25497849 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 25498056 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25498069 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25498200 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25498281 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25498285 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25498361 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25498444 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25498463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25498467 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25498529 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25498557 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25498605 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25498631 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25498648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25498659 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25498840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25498858 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25498915 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25498949 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 25498977 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 25498980 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 25499233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25499376 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25499428 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 25499696 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 25499860 C A Y N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 25500022 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 25500178 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 25500203 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 25500326 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 25500445 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 25500526 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 25500564 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 25500854 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25501198 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 25501793 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 25501800 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25501837 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25501894 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25502069 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 25502186 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 25502188 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 25502368 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 25502381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25502666 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 25502775 C G Y N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 25502834 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25502880 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 25502885 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 25503042 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25503165 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 25503196 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25503318 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25503465 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25503617 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 25503774 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 25504140 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25504283 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 25504316 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 25504353 C A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 25505779 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 25505959 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 25505972 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 25506058 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25506126 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 25506217 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 25506312 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25507147 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 25507195 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 25507444 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25507450 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 25507486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25507489 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 25507984 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25508182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25508282 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 25508322 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25508830 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 25508929 C G N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 3 25509008 C T N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 3 25509142 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 25509145 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 25509179 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 25509185 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 25509227 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 25509281 A T N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 3 25509368 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 25509431 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25509606 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 19 17 1 17 0 3 25509607 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 3 25510096 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 25510172 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 25510187 G C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 25510190 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 25510427 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 25510610 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 25510636 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 25510866 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 25510920 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 25510951 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 25511092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25511251 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 25511494 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 25511536 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 25511543 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 25511577 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 25512464 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 25512806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25513928 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25514208 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25514334 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25514371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25514437 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25514859 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25514925 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25514936 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25514940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25514955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25515054 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 25515066 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25515114 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25515161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25515188 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 25515320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25515883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25516050 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25516356 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25516357 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25516837 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 25517024 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 25517072 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 25517087 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 25517125 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25517337 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 25517735 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25517945 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25518725 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 25519577 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 25519590 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 25522737 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25523217 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 25523595 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 25523689 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 25524067 G C N N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 25524083 A T N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 25524702 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25524885 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 25525020 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 25525287 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 25525728 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 25527178 G C Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 25527759 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 25527874 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25527933 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 25528439 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 25529248 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 25531925 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25532115 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25532128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25532734 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 25532838 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25536822 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25538980 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25542415 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25543115 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 25543132 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 25543597 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25543680 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 25544579 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 25546600 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 25546939 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 25547038 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 25547044 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 25547078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25547109 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 25547150 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 25547153 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 25547903 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25547972 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25549408 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25549923 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25550904 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 25551911 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25552064 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25552701 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25552961 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25554388 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25554668 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25555770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25558826 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 25559026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25559154 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25559855 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 25559856 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 25560163 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 25560759 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 25561399 A G Y Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 25561564 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 25562146 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25563133 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25563156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25563520 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 25563743 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25563866 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25563894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25563916 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 25563930 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 25564023 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25564095 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25564097 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25564195 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 25564395 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 25564589 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 25564632 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25564749 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 25564758 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 25564826 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 25564873 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 25564981 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 25565058 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25565102 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25565171 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 25565227 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 25565285 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25565319 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 25565334 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 25565339 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 25565465 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 25565538 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25565614 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 25565794 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 25565873 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 25566010 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 25566036 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 25566090 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 25566134 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 25566231 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25566235 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 25566598 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25566613 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 25566673 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 25566850 A G N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 3 25566878 T G N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 3 25566973 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 25567125 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 25567144 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 25567219 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 25567321 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 25567355 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 25567364 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 25567389 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 25567477 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 25567487 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25567644 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 25567909 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 25567994 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25568079 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 25568161 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25568460 G A Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 3 25568639 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25568732 C A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 25568837 A G Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 25568847 A T Y N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 25568874 C T Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 25568940 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 25568981 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 25569018 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 25569046 A C N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 25569102 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 25569106 T A N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 25569376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25569532 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 25569636 A C Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 25569668 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 25569705 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 25569707 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 25569716 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 25569762 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 25569765 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 25569855 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 25569943 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 25569976 A C Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 25570014 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 25570240 T A Y N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 25570247 A T N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 3 25570270 G C Y N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 25570273 A T Y N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 3 25570306 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 25570335 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 25570393 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 25570470 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 25570490 C G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 25570710 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 25570739 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 25570775 C A N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 25570865 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 25570907 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 25570993 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 25571057 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 25571115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25571123 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 25571128 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 25571180 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 25571209 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 25571251 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 25571287 C G Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 25571297 A C Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 25571366 C A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 25571401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25571428 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 25571457 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 25571661 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25571678 C A Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 25571814 G A Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 25571861 A T Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 25571865 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 25571914 G A Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 25571919 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 25572237 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 25572243 T C Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 25572253 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 25572264 G T Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 25572284 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 25572472 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 25572541 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25573002 T G Y N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 25573027 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 25573233 T G Y N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 25573278 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 25573347 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 25573684 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25573833 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25573867 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25573970 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25574333 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 25574505 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 25574651 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25574673 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 25574723 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 25574748 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 25574772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25575485 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25575489 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 25575677 C G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25575689 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 25575690 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 25575713 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 25575736 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25575870 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 25575940 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25575941 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 25576056 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25576079 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 25576090 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 25576230 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25576250 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25576321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25576387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25576471 G C Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 25576526 C A Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 25576721 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 25576780 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25576892 T G Y N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 25577243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25577261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25577445 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25577476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25578133 T G Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 25578274 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 25578286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25578667 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25578732 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 25578758 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25578770 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 25578841 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 25578842 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 25578857 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 25578938 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 25578956 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 25579029 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25579125 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 25579199 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 25579313 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 25579654 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 25579730 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 25579786 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 25579850 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 25579923 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25579977 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 25580378 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 25580456 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 25580572 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 25580670 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 25581060 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 25581344 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 25581463 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 25581615 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 25581747 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 25581837 T G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 25581920 G C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 25581950 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 25582043 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 25582103 T A N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 25582149 A C Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 25582227 T G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 25582370 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 25583245 T A N N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 3 25583297 C A Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 25583541 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25583796 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25583991 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25584092 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25584360 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25584387 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 25584407 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 25584412 C G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 25584524 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 25584586 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 25584620 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 25584632 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25584689 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25584788 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25584881 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25584953 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25585124 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25585140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25585336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25585420 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 25585826 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25586175 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25586935 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 25587015 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 25587161 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 25587173 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25587296 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 25587405 T G Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 25588209 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 25588295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25588726 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 25588761 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 25588826 C T Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 25588945 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25589150 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 25589178 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 25589379 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 3 25589392 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25589927 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 25589941 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25590604 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 25590891 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 25590994 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 25591264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25591543 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 25591556 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 25591742 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 25591749 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25591872 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 25591968 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 25592005 A G Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 25592143 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 25592172 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 25592292 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 25592294 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 25592705 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 25593713 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 25594534 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 25594638 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 25595337 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25595358 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25595452 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25595479 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25595879 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25595934 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 25596024 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 25596424 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25596523 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 25596943 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 25597025 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 25597059 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 25597064 C G Y N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 25597231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25597413 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25597433 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 25597444 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25597462 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 25597470 A C Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 25597487 G A Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 25597488 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 25597521 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25597564 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 25597670 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25597681 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 25597703 C T Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 25597745 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 25597796 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 25597831 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 25597889 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 25597909 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25598063 G C Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 25598107 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 25598112 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 25598119 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 25598154 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25598179 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 25598219 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 25598304 G A Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 25598406 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 25598589 T G N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 25598597 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 25598656 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 25598664 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 25598695 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 25598747 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 25598751 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25598814 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 25598924 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 25598989 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 25598993 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 25599058 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 25599089 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 25599199 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 25599255 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 25599262 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 25599325 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 25599357 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 25599405 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 25599410 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 25599477 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25599507 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 25599728 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 25599834 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 25600148 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 25600165 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 25600265 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 25600280 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 25600328 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25600360 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 25600476 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 25600492 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 25600531 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 25600582 T G Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 25600646 A T Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 25600661 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 25600750 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 25600799 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 25600920 C T N Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 3 25601112 C A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 25601143 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 25601193 A G Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 25601289 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 25601334 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 25601433 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 25601620 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 25601658 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 25601958 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 25602087 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 25602282 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 25602486 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 25602561 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25602657 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 25602661 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 25602829 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 25602924 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 25603166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25603271 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 25603282 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 25603284 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 25603447 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25603499 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 25603504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25603522 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 25603553 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 25603788 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 25603973 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25604020 T G Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 25604092 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 25604256 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 3 25604506 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 25604820 C G Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 25604890 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25605322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25605349 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25605454 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 25605996 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 25606364 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 25606398 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 25606463 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 25606484 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 25606497 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 25606620 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 25607674 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 25607868 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25608280 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 25608361 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 25608758 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25608841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25609297 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 25612859 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 25613122 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25613157 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 25613174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25613275 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25613303 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 25613315 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 25613588 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25613599 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25613670 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25613731 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 25613817 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25613867 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 25614234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25614473 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 25614512 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 25614616 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 25615595 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 25615815 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 25616199 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25616209 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 25616345 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25616430 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 25616458 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 25616786 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 25616824 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 25616829 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25616936 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 25616974 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 25617064 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 25617172 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 25617217 C A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 25618239 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 25618307 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 25618361 G T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 25618384 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 25618545 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25618769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25619113 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 25620029 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25621003 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25621145 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25621269 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25622991 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 25623021 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 25624445 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 25626444 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25626571 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25626988 C A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 25627584 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 25627702 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25628220 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25628568 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25628953 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25628978 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25629125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25629480 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25629524 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25630628 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 25630682 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 25633100 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 25635794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25637545 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25638533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25638709 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25641063 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25642579 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 25643343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25643761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25644472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25645283 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 25646751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25647512 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25647570 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25650798 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25651155 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 25652003 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25652475 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 25653190 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 25656420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25656878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25660283 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25662616 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 25662703 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 25663187 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 25663308 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25663396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25663528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25664506 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 25665017 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25665491 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 25665583 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 25665610 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 25665663 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 25665673 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 25665687 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 25665731 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 25665742 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 25665756 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 25665768 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 25665769 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 25665834 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 25665837 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 25666177 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25666180 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25666201 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25666224 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25666286 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 25666325 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 25666342 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25666410 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25666716 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25666750 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25666764 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25666829 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25666833 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25666876 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25666933 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25666994 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25667029 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25667181 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 25667337 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25667650 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25667675 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25667701 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 25667730 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 25667776 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 25668112 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 25668356 T C Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 25668385 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 25668406 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 25668476 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 25668497 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 25668631 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 25668705 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 25668742 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25668925 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25668950 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 25668978 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25669009 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 25669059 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25669068 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25669076 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25669111 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25669134 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 25669223 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25669238 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25669260 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25669299 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 25669328 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 25669352 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 25669353 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 25669441 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25669471 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25669505 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25669567 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25669641 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25669683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25669901 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25670000 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25670576 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 25670795 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 25670815 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 25670900 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25670902 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 25670941 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 25671732 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25672128 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 25672347 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25672376 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25672378 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25673869 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25679538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25682773 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25683419 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25685424 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 25686533 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 25686802 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25687409 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25687446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25689189 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 25689321 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 25690168 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 25690878 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25691401 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25691954 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25692044 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 25692798 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 25692827 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 25693351 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25693607 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25693719 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25693951 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 25693995 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25694104 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 25694219 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 25694313 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 25694332 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 25694432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25694483 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25694645 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 25694748 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 25695869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25697339 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25701038 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 25702227 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25703047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25704236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25705521 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25706767 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25710528 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25714200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25718071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25719969 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25720005 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 25720211 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 25721361 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25721417 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 25721453 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25721494 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25721539 G T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 25721769 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25721878 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25722096 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25722178 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 25722393 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 25723900 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25723959 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25724200 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 25724356 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 25724480 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25724855 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25724999 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25725079 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25725351 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25726165 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25726938 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 25728140 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25728399 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25729407 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 25731407 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 25732200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25732396 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25733288 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 25733535 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25734642 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25739304 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 25739476 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 25739549 A T N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 25741054 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 25741407 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 25741862 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 3 25741932 G A N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 25741962 G T Y N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 25742168 C A N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 3 25742261 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 25742471 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 25742507 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 25742542 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 25742582 A T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 25742662 G T N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 25742695 T A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 25743685 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 25743699 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 25743944 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 25743947 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 25743985 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 25743986 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 25744042 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 25744100 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 25744139 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 25744161 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 25744234 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 25744316 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 25744458 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 25744585 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 25744609 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 25744693 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 25744720 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 25744757 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 25744912 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 25744968 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 25744981 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 25745212 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 25745282 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 25745469 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 25745491 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 25745525 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 25745596 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 25746322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25746355 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 25746438 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 25746629 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 25746788 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 25747085 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 25747123 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 25747306 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 25747379 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 25747449 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 25747547 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 25747559 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 25747591 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 25747946 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 25748209 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 25748216 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 25748225 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 25748313 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 25748337 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 25748378 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 25748807 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25748823 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 25748950 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 25748961 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 25748986 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 25749037 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 25749145 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 25749171 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 25749208 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 25749355 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 25749515 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 25749883 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 25751440 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25751997 G A Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 25753153 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 25753363 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25753478 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25753720 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 25754160 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25754436 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25754528 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25755580 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25756509 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 25756524 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 25756541 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25756595 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 25756613 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 25756833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25756882 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 25756971 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25757237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25757306 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25757310 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25757339 T A Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 25757418 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25757457 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25757475 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25757505 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25757792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25757794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25757805 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 25757808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25757831 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25758026 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25758028 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25758237 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25758297 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25758480 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25758532 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25758534 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25758548 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25758730 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 25758738 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 25758823 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 25759106 T C Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 25759169 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 25759669 A C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 25759729 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 25760272 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25760453 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25760476 C A Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 25760478 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25760545 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 25760615 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 25760680 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 25760782 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25761052 A T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 25761123 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 25761164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25761201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25761211 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25761340 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25761571 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 25761630 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 25761683 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 25761705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25761714 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 25761779 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 25761786 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25761986 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 25762233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25762244 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 25762286 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 25762443 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25762446 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 25762558 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25762611 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 25763246 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 25763317 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25763670 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 25763710 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25763849 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25765288 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 25765912 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25766067 A T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 25766458 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 25766612 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 25767240 T G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 25768829 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25768964 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25769136 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25770500 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25770851 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25772311 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 25772354 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 25773105 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 25774552 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 25774553 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25775443 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 25776227 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25776441 G T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 25776688 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 25776747 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 25777974 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 25779181 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 25779609 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 25779757 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 25780517 G T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 25781442 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25781460 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 25781964 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25782443 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 25783720 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25784823 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 25785826 A T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 25786241 G A Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 25786528 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 25787305 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25787315 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 25787977 G C Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 25789318 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25792462 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 25792925 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 25794085 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 25794416 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 25794447 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 25794653 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 25794774 A T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 25794777 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 25795114 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 25795115 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 25795230 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 25795295 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 25795405 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 25795902 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 25795929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25796105 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 25796177 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25797228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25798079 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25799030 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 25800149 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 25801012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25802682 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25803287 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25803689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25805977 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25806351 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25807194 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25807317 C A Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 25808650 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 25808917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25810133 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25811356 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 25811542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25812358 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25813394 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25814365 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25815958 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25817228 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25818109 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 25818165 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25820229 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25820238 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25821547 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25821623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25823182 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 25823755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25823808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25824709 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 25824715 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 25824842 C T Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 25825086 A G Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 25825159 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 25825911 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 25826184 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 25826291 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25826419 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 25826688 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 25827486 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 25827526 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 25827566 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 25827702 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 25828687 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25829135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25829254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25829992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25830114 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25831756 T A Y N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 25832546 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 25833052 C A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 25833352 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 25833742 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25836988 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 25839631 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25839724 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 25839795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25841094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25841486 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 25843424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25843653 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 25843859 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 25844017 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 25844020 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 25844120 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 25844267 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 25844385 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 25844477 A G Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 25844606 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 25844796 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 25844983 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25845018 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 25845031 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 25845097 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 25845115 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 25845116 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 25845209 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 25845240 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 25845321 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 25845338 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 25845440 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 25845444 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 25845583 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 25845663 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 25845665 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 25845708 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 25845733 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 25845734 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 25845754 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 25845862 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 25846832 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 25846936 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 25846942 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 25847127 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 25847216 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 25847220 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 25847228 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 25847249 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 25847313 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 25847328 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 25847399 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 25847424 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 25847434 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25847463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25847468 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25847474 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25847517 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 25847591 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 25847602 T G Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 25847664 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 25847909 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 25848048 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 25848089 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 25848098 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 25848138 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 25848154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25848264 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 25848282 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 25848334 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 25848476 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 25848577 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 25848599 A C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 25848637 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 25848746 C A Y N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.416666666666667 0.583333333333333 0 17 7 5 7 0 3 25848844 A G N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 3 25848933 C T N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 3 25848942 G A N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 3 25849570 T G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 25849587 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 25849609 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25849734 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 25849736 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 25849800 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 25849843 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 25849871 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 25850129 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 25850200 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 25850272 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 25850281 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 25850381 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 25850425 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 25850498 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 25850581 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 25850594 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 25850625 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 25850674 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 25850691 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 25850788 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 25850956 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 25851139 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 25851243 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 25851258 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 25851315 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 25851317 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 25851328 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 25851355 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 25851411 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 25851420 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 25851527 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 25851607 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25851609 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 25851688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25852507 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25854286 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25854924 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 25855257 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 25855365 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 25855442 C G Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 25855603 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 25855678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25856077 T A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 25856513 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 25857273 A C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 25857404 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25858213 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25858435 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 25858468 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 25860487 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 25860599 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25861083 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 25861512 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 25861992 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 25862026 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 25862423 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25862580 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 25862808 C T N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 16 12 2 12 0 3 25862850 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 25863126 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 25863181 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 25863301 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25863402 T C Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 25863582 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 25863639 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 25863707 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 25863720 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 25863737 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 25863921 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 25863931 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 25864039 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 25864059 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 25864068 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 25864428 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 25864583 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 25864827 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 25864874 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 25864887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25864988 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 25865991 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25866035 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25866089 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 25866136 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 25866240 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 25866749 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 25867405 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 25867686 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 25867693 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 25867741 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 25867782 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 25867847 G A Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 25867894 A G Y Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 3 25868108 C T Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 25868279 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25868798 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25868930 A T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 25869161 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 25869407 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25869488 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 25869929 G C Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 25870054 G A N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 25870641 C T Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 25870697 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 25870810 A G Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 25871041 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 25871166 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 25871240 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 25871294 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25871651 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 25872383 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 25872539 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 25872937 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 25873152 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 25873438 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 25873698 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 25873972 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 25874085 G C Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 25874400 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25874654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25875634 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25875866 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 25876112 C T Y Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 3 25876166 A T Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 25876276 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 25877442 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 25878268 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 25878752 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 25879123 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25882375 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 25882880 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 25883790 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 25883821 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 25885576 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 25885832 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 25885867 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 25885951 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 25886016 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25886092 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25886255 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 25886317 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 25886637 G A Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 25886992 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 25887031 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25888056 A G Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 25890501 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 25894479 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25895754 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 25896045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25896769 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25896980 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25897573 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 25898814 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25899448 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 25899451 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25900598 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 25900939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25901572 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25902314 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25903179 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 25905343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25906035 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25906771 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 25906984 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25907152 A G Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 25907165 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 25907171 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 25907177 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 25907280 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 25907323 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 25907333 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 25907351 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 25907464 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 25907563 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 25907643 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 25907933 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 25907937 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 25907989 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 25908246 T A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 25908279 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 25908334 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 25908341 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 25908454 A T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 25908562 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 25908628 A C N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.307692307692308 0.615384615384615 0.0769230769230769 16 10 4 8 1 3 25908676 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 25908844 T C N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 7 9 1 5 2 3 25908871 A T N N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 8 8 2 4 2 3 25909108 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 25909126 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 25909128 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 25909174 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 25909246 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 25909363 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 25909401 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25909531 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 25909542 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 25909577 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 25909974 C T N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 3 25910137 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 25910217 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25910233 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 25910261 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 25910358 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 25910429 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 25910514 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 25910558 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 25910772 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25911178 C T N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 3 25911203 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 25911280 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 25911287 T A N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 3 25911521 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 25911523 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 25911534 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 25911963 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 25912083 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 25912304 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25912377 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 25912392 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 25912410 C G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 25912454 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 25912684 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 25912761 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 25912937 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 25913301 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 25913326 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 25913335 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 25913377 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 25913472 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25913528 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25913805 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 25913830 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 25913918 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 25913946 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 25913981 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25914097 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 25914194 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 25914232 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 25914251 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 25914292 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 25914341 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25914381 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 25914407 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 25914652 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 25914732 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 25914819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25914998 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25915014 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25915130 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25915770 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 25915908 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 25916008 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 25916024 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 25916132 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 25916156 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 25916242 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25916376 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25916409 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25916482 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 25916500 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25916577 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25916744 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 25916762 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 25916768 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25916813 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 25917006 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 25917049 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 25917066 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 25917278 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25917380 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 25917432 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25917448 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 25917523 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25917603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25917604 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25917615 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25917620 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25917638 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25917706 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25917837 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25917871 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25917949 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 25917957 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 25918046 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25918061 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25918088 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25918122 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 25918150 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 25918197 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 25918264 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 25918268 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 25918333 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 25918382 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 25918587 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 25918618 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25918629 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25918645 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25918750 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 25918774 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25918779 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25918840 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 25918861 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25918916 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 25918940 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 25918954 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 25919002 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 25919020 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25919047 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25919168 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 25919291 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 25919319 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 25919359 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 25919390 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 25919504 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 25919632 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25919757 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 25919787 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 25919893 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 25919957 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 25919959 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 25920010 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 25920060 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 25920321 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 25920335 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 25920402 A C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 25920415 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 25920422 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 25920614 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 25920673 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 25921297 T G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 25921360 T C N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 25921384 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 25921429 T G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 25921505 C T N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 3 25921689 T G N N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 3 25921867 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 25922034 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 25922250 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 25922306 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 25922332 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 25922371 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 25922453 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 25922461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25922585 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25922588 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 25922863 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 25922880 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 25922937 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 25923163 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 25923294 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 25923343 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 25923392 G T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 25923613 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 25923695 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 25923747 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 25923860 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 25923906 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 25923971 G T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 25924122 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 25924131 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 25924159 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 25924263 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25924391 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 25924474 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 25924502 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 25924515 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 25924516 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 25924592 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25924682 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 25924813 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 25924833 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 25924907 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25924908 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25924967 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 25924974 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 25926499 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 25927186 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 25927874 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 25928221 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 25931351 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 25931628 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25935165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25935526 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 25935785 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25938958 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 25940035 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 25941073 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25943294 C G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 25945259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25948038 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25948654 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25948708 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25949026 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25950572 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25950620 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25950975 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25951095 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 25951109 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 25951164 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 25951551 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 25952046 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 25952112 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 25952514 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 25952742 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 25952753 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25953211 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 25953422 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 25953767 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25953981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25954118 T G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 25954719 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 25954791 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 25954946 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25955179 T C Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 3 25955208 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 25955311 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 25955493 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 25955568 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 25955695 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 25955964 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 25956035 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 25956088 C G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 25956617 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 25956651 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 25957182 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 25957214 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 25958302 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25958532 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 25958810 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 25959536 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 25959632 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 25959861 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 25959880 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 25960234 A G Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 25961138 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 25961269 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 25961314 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 25961350 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 25961555 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25961558 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 25961668 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 25961693 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 25961749 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25962055 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 25969986 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25971407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25973435 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 25977141 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 25977616 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25977699 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25977701 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25977793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25977795 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 25978115 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 25978365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25979740 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 25980201 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25980710 G A N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 25981021 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 25981118 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25981533 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 25982060 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25982295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25982588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25984279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25984484 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 25985294 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25985317 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 25985994 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 25986534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25986545 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 25986921 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 25988019 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 25990906 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 9 5 4 1 2 3 25992124 C T N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 13 7 6 1 3 3 25992207 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 25992713 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 25992844 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 25993321 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 25993460 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 25994144 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 25994368 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 25994644 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 25995461 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 25999447 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26001042 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 26001114 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 26001462 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26001666 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26001809 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 26002178 T C Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 26002323 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26002439 G C Y N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 26002767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26003029 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26003132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26003477 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 26003590 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26003775 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 26005178 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 26012380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26012498 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 26012618 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 26012721 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 26013557 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 26013568 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 26013602 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 26013620 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 26013677 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 26013720 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 26013756 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 26013891 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 26014320 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 26014385 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 26014418 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 26014491 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 26014529 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26015307 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 26015788 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 26016681 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 26016712 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 26016748 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 26016754 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26016843 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26016885 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 26016918 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 26016969 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 26016997 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 26017024 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 26017129 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 26017143 C G N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 3 26017235 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 26018033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26018128 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26018136 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 26018142 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 26018147 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 26018266 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 26018391 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26018530 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 26018690 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 26018698 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 26018882 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 26018893 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 26018926 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 26019026 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 26019111 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 26019604 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 26019605 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 26019657 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26019750 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 26019856 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26019988 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26020131 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 26020194 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 26020241 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 26020374 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 26020387 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 3 26020442 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 26020516 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 26020531 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 26021455 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 26022156 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 26024410 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 26024532 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 26024600 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 26024654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26027897 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26029468 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26030119 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 26030321 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 26031194 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 26032956 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26036074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26036143 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 26036283 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26036634 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 26036959 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 26037048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26037607 T A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 26037784 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26037910 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 26038899 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 26038904 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 26038995 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26039323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26039405 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 26039893 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 26040044 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26040113 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 26040173 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26040298 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26040554 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 26040897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26041071 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 26041113 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 26041138 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26041292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26041357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26041648 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 26041799 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 26041827 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 26041851 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 26041903 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 26042411 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 26042728 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26042820 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26042848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26043534 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 26043659 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26043675 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 26043680 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 26043776 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26043965 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 26044296 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 26044404 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26044405 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 26044630 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 26044984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26045070 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26045216 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26045682 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26046020 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26046298 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 26046888 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 26046909 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26046953 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 26047204 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26047360 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 26047535 G A Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 26047859 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 26048247 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26048496 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 26048597 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26049050 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26049485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26049710 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26050505 A T Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 26050625 G T Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 26050770 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 26050863 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 26051020 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 26053162 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26053706 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26055344 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26057180 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 26057421 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26060254 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 26063355 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26063838 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26063963 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 26065441 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26065976 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 26068375 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26072969 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 26073433 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26073465 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26073633 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 26073651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26073973 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26074004 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26074200 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 26074229 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26074365 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26074385 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26074391 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26074475 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 26074584 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 26074600 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 26074604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26074654 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 26074671 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 26074786 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 26074831 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 26075025 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 26075033 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 26075179 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26075293 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 26075422 T A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 26075491 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 26075493 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 26075605 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 26075829 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26075917 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26075931 G C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 26075994 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 26076090 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 26076196 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 26076221 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 26076310 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 26076395 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26076419 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 26076513 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 26076693 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 26076845 T A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 26076919 A G N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 26077121 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26077492 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26077773 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 26078037 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 26078516 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26078545 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26078950 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26078971 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26079441 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 26079508 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26079596 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 26081841 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26082389 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26082423 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26082773 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 26082911 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 26083397 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26083583 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26083751 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 26083882 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 26084353 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26084410 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 26084444 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26084497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26084532 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26084544 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 26085123 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26085162 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26085330 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 26085535 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 26085599 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26085611 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 26085625 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 26085776 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 26085915 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 26085939 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 26085971 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 26086026 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 26086076 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 26086113 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26086116 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26086230 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 26086294 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 26086358 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26086403 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26086505 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26086527 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26086540 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26086610 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26086730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26086828 A T Y N 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 3 26086905 C T N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 3 26086968 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 26086999 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 26087019 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26087132 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 26087144 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 26087539 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 26087683 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 26087693 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 26087725 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26088047 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 26088301 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 26088421 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 26088468 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 26088479 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 26088595 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 26088828 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 26089201 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 26089230 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 26089423 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 26089437 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 26089574 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 26089620 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 26089797 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 26089886 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 26089929 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 26090191 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 26090209 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 26090403 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 3 26091286 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26091502 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26091544 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 26091791 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 26091955 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 26092177 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 26093101 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 26093918 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26094255 T G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 26094320 T C Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 26094325 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 26094348 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 26094565 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 26094601 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 26094618 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 26094687 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 26095573 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 26095658 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 26095809 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 26096069 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 26096191 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 26096204 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26096393 A C Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 26096593 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 26096956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26097021 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 26097250 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 26097980 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 26098099 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 26098235 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 26098271 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 26098750 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26099684 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26101315 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26101475 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 26105969 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26106019 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 26106031 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 26106032 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 26106069 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26106094 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 26106728 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 26106748 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26106750 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26107286 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 26107972 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26108281 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 26108282 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 26108406 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26109483 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26110492 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 26110527 G A Y Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 3 26110578 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 26111694 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 26114430 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26114552 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 26115190 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 26116844 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26118042 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 26119490 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26120330 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26120407 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 26120829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26121913 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 26122150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26122171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26122972 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 26123596 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 26124249 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 26124735 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 3 26125154 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26125580 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26125978 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26126547 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26129257 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26129752 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26129790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26130805 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 26131979 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26132125 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 26132741 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26133721 A C Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 26133953 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26135331 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 26137002 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 26137726 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 26138525 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26138864 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26139048 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26139992 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26140276 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26140578 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 26141856 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26141887 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 26141950 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 26142511 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26142895 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26143273 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26143992 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 26144225 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 26144963 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26145720 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26146044 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26147994 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 26148113 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 26148538 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 26149332 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 26149336 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 26149402 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 26149560 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 26149596 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 26149664 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 26149671 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 26149681 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 26149775 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 26149875 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 26149888 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 26149903 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 26150027 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 26150123 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 26150193 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 26150285 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 26150462 T C N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 3 26150471 T A N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 3 26150707 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 26150735 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 26150757 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 26151431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26151569 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 26151723 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 26151748 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 26151773 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 26151787 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 26151817 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 26151843 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 26151883 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 26151910 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 26152014 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 26152033 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 26152062 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 26152063 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 26152121 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26152146 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26152240 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 26152248 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 26152297 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 26152462 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 26152495 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 26152510 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 26152768 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 26152804 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 26153451 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 26153469 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 26153510 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 26153657 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 26153704 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 26153765 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 26153808 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 26154119 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 26154182 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 26154305 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 26154385 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 26154395 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 26154435 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 26154474 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 26154540 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 26154542 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 26154676 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 26154805 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 26154814 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 26155106 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 26157502 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26157611 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26158444 C A Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 26158776 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 26159152 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26159825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26160001 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 26160794 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 26161095 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 26161108 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 26161517 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 26161548 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 26161678 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 26161764 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 26161777 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 26161793 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 26161886 A C N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 3 26162246 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 26162363 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 26162503 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 26162588 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 26162602 G C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 26162657 C G Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 26162724 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 26162944 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 26162987 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 26163191 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 26163214 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26163229 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 26163285 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 26163465 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 26163482 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 26163536 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26163631 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 26163648 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 26163649 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 26163661 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 26163795 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 26164166 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 26164360 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 26164447 A G Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 26165176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26165187 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 26165610 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 26165958 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 26167159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26168292 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 26169129 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26170523 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26170542 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26170763 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 26175611 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 26178263 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26178786 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 26179344 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26179768 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 26180183 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26180403 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 26181228 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 26181591 A C Y N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 26181961 A G Y Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 3 26182069 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 26182496 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 26184334 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 26184456 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26184911 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 26185090 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26185102 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26185179 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 26185345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26185362 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 26185453 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 26185554 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 26185835 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 26186143 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 26186313 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 26186476 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 26186609 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 26186870 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26186888 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26186889 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 26186920 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26186921 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 26186952 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26187011 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26187059 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26187414 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26189304 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 26189398 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26189440 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 26189478 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26189581 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26189635 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 26189766 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 26189950 C G Y N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 3 26190037 A T Y N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 3 26190054 A G Y Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 3 26190343 T G Y N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 3 26190421 T A Y N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 26190446 G A Y Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 26190466 T G Y N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 26190521 C T Y Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 26190645 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 26190907 T G Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 26191496 T G Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 26191499 C A Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 26191519 A C Y N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 26191555 G A Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 26191769 A T Y N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 26191873 C G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 26191902 T A Y N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 3 26191913 C T Y Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 8 12 1 6 3 3 26191914 A G Y Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 3 26192095 T C Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 26192141 G T Y N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 26192144 A C Y N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 26192278 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26192287 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 26192568 A G N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 3 26192582 T A Y N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 3 26192818 C T Y Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 26193099 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 26193108 A G N Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 6 8 1 4 2 3 26193298 C T Y Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 6 10 2 2 4 3 26193358 G A N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0 0.6 0.4 6 14 0 6 4 3 26193465 A G Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 26194170 G C N N 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 26194173 G A N Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 26194276 G A Y Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 3 26194327 A G Y Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 3 26194511 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 26194529 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 26194558 G T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 26194763 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26194831 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26195000 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26195005 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26195096 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26195097 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26195143 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26195337 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26195366 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26195390 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26195421 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26195475 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26195489 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 26195501 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 26195528 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 26195643 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 26195705 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 26195862 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 26195876 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 26196019 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26196055 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26196308 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 26196619 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 26196765 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26196867 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26197207 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 26197329 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26197479 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26197547 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 26197627 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26197631 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26197642 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26197651 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26197695 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26197903 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 26198041 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 26198099 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 26198112 T A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 26198142 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 26198224 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 26198242 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 26198273 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 26198299 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 26198312 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 26198376 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 26198377 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 26198622 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 26198722 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 26198723 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 26199122 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 26199289 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26199413 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 26199421 G T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 26199474 G A N Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 26199612 T G N N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 26200007 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 26200116 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26200175 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 26200285 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 26200405 C A N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 26200601 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 26200642 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 26200671 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 26200902 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26201097 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26201106 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26201125 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 26201306 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 26201888 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 26202002 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 26202034 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 26202036 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 26202096 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 3 26202207 C A N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 26202270 C A N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 3 26202300 T A Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 26202419 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 26202542 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26202552 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 26202579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26202649 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 26202687 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 26202713 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 26202733 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26202747 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26202755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26202791 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26202950 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 26202986 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26203007 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 26203117 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26203127 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26203145 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26203335 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 26203415 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 26203531 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26203694 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 26203997 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 26204039 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 26204208 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26204216 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26204273 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 26204366 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26204372 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 26204437 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26204792 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 26204843 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 26204921 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 26204926 G T N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 26204993 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 26205045 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26205221 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26205285 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26205302 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26205396 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 26205466 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26205540 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26205555 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26205573 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 26205657 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26205659 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26205670 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 26205919 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26205951 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 26205973 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 26205985 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26205997 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26206022 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26206041 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26206064 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 26206077 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 26206103 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26206164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26206175 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26206200 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26206284 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26206297 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 26206312 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26206387 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 26206511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26206549 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26206609 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26207000 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26207006 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 26207034 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26207066 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 26207077 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 26207105 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26207114 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26207132 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 26207244 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 26207324 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 26207401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26207458 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 26207639 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 26207780 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 26207869 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 26207967 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 26208084 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 26208116 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 26208127 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26208131 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26208151 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 26208173 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26208842 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 26208905 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 26209195 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26209219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26209377 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26209934 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26210176 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26210825 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 26210845 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26211040 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 26211063 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 26212829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26212968 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26214114 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 26214184 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26214620 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26214975 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26215334 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 26215833 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 26215890 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26215928 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26215975 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 26215984 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 26215996 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 26216139 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 26216279 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 26216427 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26217535 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 26217545 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26217733 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26217756 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 26217781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26218040 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26218166 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 26218188 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26218254 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26218269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26218273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26218390 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 26218397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26218520 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 26218571 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 26218573 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 26218584 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26218597 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 26218628 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26218655 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 26218864 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 26218916 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 26218986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26219005 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 26219025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26219395 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26219455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26219603 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 26219687 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 26219715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26219770 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26219873 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26219978 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 26220108 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26220148 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 26220150 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 26220312 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26220318 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 26220352 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 26220471 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 26220679 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 26220866 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 26221023 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 26221252 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 26221357 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 26221951 T C Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 26222147 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26222279 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26222283 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26222391 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26222456 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 26222536 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26222707 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 26222823 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26223000 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26223012 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26223090 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 26223142 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 26223399 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 26223935 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26224062 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 26224081 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26224140 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 26224146 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 26224182 T C Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 26224224 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 26224540 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 26224599 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26224884 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 26225139 G A N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 26225194 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 26225630 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 26225704 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26225783 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 26225992 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 26226081 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 26226099 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 26226282 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 26226424 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 26226856 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 26227089 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 26227420 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26228705 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 26229607 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 26229738 A G N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 3 26229891 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 26229966 G T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 26230107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26230335 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 26230424 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 26230527 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26231484 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26231610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26232569 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 26233228 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26233321 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26233348 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26233357 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26233614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26233695 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 26233739 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 26234032 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26234079 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26234109 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 26234212 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 26234298 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 26234365 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26234823 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26234859 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 3 26235826 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26236056 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 26236248 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 26236513 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26236566 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26236758 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 26236923 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26237443 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 26237893 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26239271 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26239502 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 26240199 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26240368 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 26240403 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 26240526 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26240661 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 26241054 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 26241662 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26241719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26241963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26242276 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 26242648 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 26242788 C G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 26242995 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26243146 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26243218 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 26244142 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 26244422 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26244626 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 26245708 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 26253486 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 26253527 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 26253585 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26253677 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26253733 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26253803 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 26253878 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26253949 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 26253950 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26254088 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 26254162 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 26254268 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26254324 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26254408 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 26254848 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 26254962 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 26255032 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 26255398 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26255404 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26255438 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 26255466 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26255485 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26255503 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 26255580 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 26255586 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 26255657 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26255664 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26255695 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26255741 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26255786 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 26255933 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 26255983 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 26256150 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26256474 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26257112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26257763 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26257871 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 26257931 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 26258030 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 26258050 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 26258149 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26258244 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 26258443 C A Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 26258890 A C Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 26259361 A T Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 26259613 A T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 26259895 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26259947 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 26259974 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 26260070 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 26260105 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26260162 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26260222 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26260333 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 26260536 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 26261091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26261325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26261939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26262010 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26262101 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26262349 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 26262350 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 26262929 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 26263599 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26263615 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 26264193 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 26265422 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26265436 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 26265477 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26265481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26266436 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26268748 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 26269064 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26269252 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 26269829 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 26270053 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 26270440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26270875 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 26270894 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26271052 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26271331 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26271823 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 26271975 T A N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 26272568 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26273090 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 26273341 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26273393 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26273526 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 26273686 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26274321 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 26274346 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26274369 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 26274489 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 26274578 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 26274901 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26275067 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 26275229 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 26275263 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26275302 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26275635 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26275802 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 26276110 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26276140 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 15 21 0 15 3 3 26276737 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 26276836 C G N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 26276837 A G N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 26277160 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 26277296 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 26277305 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26277390 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26277524 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26277718 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26278316 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 26278359 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26278419 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 26278451 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 26278538 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26278729 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 26279429 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 26279439 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 26279696 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 26280568 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 26280586 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26280601 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 26280638 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26280897 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 26281336 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 26281460 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 26281497 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 26281502 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26281547 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 26281593 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 26281615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26281648 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 26281725 A T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 26281784 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 26281883 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26282081 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 26282203 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 26282307 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 26282373 A C Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 26282401 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 26282447 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 26282513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26282541 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 26282643 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26282774 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 26282845 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 26282872 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 26282927 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 26282980 T G Y N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.181818181818182 0.727272727272727 0.0909090909090909 12 10 2 8 1 3 26283057 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 26283126 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 26283223 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 26283323 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 26283328 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 26283622 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 26283763 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26283965 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26284049 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 26284052 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 26284111 G T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 26284256 C A Y N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.0625 0.6875 0.25 13 19 1 11 4 3 26284679 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 26285024 C T Y Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 26285145 T C N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 26285200 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26285368 T A Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 26285482 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 26285501 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 26286854 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26287204 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26287985 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26288224 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26290135 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 26296826 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 26297136 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26298098 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26299513 T A N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.0769230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 9 17 1 7 5 3 26300474 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26301109 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26302517 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26304992 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26305276 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26305923 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 26306262 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26306567 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26312573 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 26314618 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 26318083 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26318384 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26319282 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26319713 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26320354 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 26320414 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 26321121 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 26321333 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 26321787 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26321951 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26322664 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 26323888 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26324656 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26325411 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 26325473 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26326037 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26326049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26326149 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26326332 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 26326501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26326741 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 26326810 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 26328033 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 26328090 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26328891 A T N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 26329154 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 26329900 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 26329960 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26329961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26330024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26330537 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 26330538 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 26330576 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26330635 A C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 26330657 T G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 26330997 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26331271 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 26331391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26331461 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26331781 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26332177 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 26332311 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26332444 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26332496 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 26332846 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26332957 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 26333520 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 26333947 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 26333993 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26334084 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 26334108 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26334149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26334349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26334502 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26334517 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 26334972 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26335137 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26335234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26335307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26335421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26335673 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26335700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26336058 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 26336141 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26336264 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 26336388 A T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 26336486 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 26337025 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 26337050 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 26337158 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 26337356 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26337422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26337578 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 26337695 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 26337999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26338025 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26338026 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26338200 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 26338244 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 26338252 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 26338276 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 26338468 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 26339321 G A N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 3 26339370 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 26339548 C A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 26339552 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26339893 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26339934 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26340374 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26340469 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26340810 A C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 26341044 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26342492 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26342683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26342752 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26349941 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 26349960 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26349968 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26350021 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26350090 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 26350177 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 26350244 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 26350265 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26350340 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26351903 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26352111 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 26352255 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26352340 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 26352791 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 26353617 T A N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 26353975 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 26354178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26354510 C G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 26354575 C A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 26354658 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 26354667 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 26354698 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 26354822 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26354930 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26355076 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26355178 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26355785 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26356060 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 26356091 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 26356096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26358891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26359036 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 26359094 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 26359129 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 26359209 C G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 26359526 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 26359695 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 26360014 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 26360136 T G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 3 26360192 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 26360639 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26360658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26361019 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 26361074 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26363020 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26363066 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26363556 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26363563 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 26364214 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 26364749 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26365023 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26365123 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26365124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26365189 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 26365314 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26365339 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 26365412 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26365436 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26365533 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 26365721 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 26365913 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 26365953 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 26366252 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26366278 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26366579 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 26366596 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 26366606 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 26366630 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 26366650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26366695 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 26366748 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26366963 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 26367042 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 26367131 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26367167 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26367303 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26367483 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 26367504 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26367508 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 26367826 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 26368334 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26368547 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 26369084 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 26369178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26369220 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 26369439 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 26369570 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26369719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26369833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26369862 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 26370415 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 26370449 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26370506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26370638 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 26370745 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 26370783 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 26370844 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 26370861 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26370909 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 26370927 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 26371133 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 26371237 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26371333 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26371438 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26371441 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26371461 A C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 26371535 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26371539 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26371558 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26371580 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26371602 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26371671 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26371770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26371863 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26371881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26372044 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 26372181 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26372555 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26373028 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 26373058 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 26373068 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 26373118 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 26373123 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 26373147 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 26373164 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 26373173 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 26373184 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 26373228 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 26373233 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 26373302 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 26373362 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 26373415 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 26373652 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 26373812 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26374028 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 26374054 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 26374231 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 26374245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26374277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26374675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26374801 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 26374815 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26374853 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 26374938 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 26375011 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26375023 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26375293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26375570 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 26375695 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 26375924 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 26376881 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 26376989 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 26377104 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 26377173 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26377501 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 26377621 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 26377663 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26377687 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 26377783 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 26377819 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 26377892 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 26378011 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26378192 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26378222 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26378587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26379605 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 26380794 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26381000 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 26382788 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26384575 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 26385322 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26385418 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26387263 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26388398 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26388891 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26390938 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 26391625 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 26392073 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 26392178 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 26392216 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 26392259 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 26392328 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 26392381 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 26392398 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 26392532 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 26392784 T G Y N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 26393141 T G Y N 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 3 26394016 G C Y N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 26396516 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 26396563 G C N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 3 26397899 A C Y N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 26398127 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 26398158 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 26398263 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 26398332 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26398471 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26398630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26398643 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 26398915 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26399078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26399174 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 26399292 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26399498 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26399507 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26400010 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 26400085 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 26400128 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 26400216 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26400559 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26400832 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26401096 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 26401224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26401712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26401891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26402136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26404224 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 26404243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26404502 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26404534 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26405026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26405072 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 26405081 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 26405091 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 26405301 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 26405504 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 26405528 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 26405707 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 26405832 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 26405840 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26406031 C A Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 26406041 A G Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 26406223 C G Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 26406401 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26406789 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26406875 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 26407108 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 26407124 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 26407146 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 26407286 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26407311 A C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 26407326 T A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 26407337 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26407358 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26407379 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 26407398 G C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 26407435 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 26407488 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 26407521 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26407570 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 26407602 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 26407734 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 26407753 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 26407843 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 26407977 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26408065 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26408105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26408283 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 26408331 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 26408348 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 26408560 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26408573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26408637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26408663 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 26408707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26408745 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 26408944 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26408945 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 26409469 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 26409988 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 26410471 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26410939 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26411686 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26412277 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 26412436 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 26412530 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 26412559 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 26412798 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 26413697 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 26414315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26414844 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 26415107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26416266 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 26416330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26416394 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 26416588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26417085 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 26417248 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 26418197 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 26418447 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 26418457 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26418987 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26419788 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26419934 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26420339 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 26420545 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 26420557 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 26420642 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 26420735 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 26420861 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 26420862 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 26420890 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 26421018 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 26421126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26422304 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26422385 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26422676 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26423881 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26425580 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26426366 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26426861 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26427484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26428397 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26428526 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26428919 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 26429186 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 26429406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26429612 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26429726 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 26429833 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 26429952 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 26430142 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 26430170 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26430289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26430357 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26430643 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 26430721 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 26430811 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 26430994 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 26431438 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26431600 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26431748 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 26431850 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 26432138 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 26432572 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 26432705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26432733 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26432914 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26433065 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26433413 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26433793 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26435160 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 26435285 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 26435289 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 26436393 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26436517 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26436927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26438631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26439526 C G Y N 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 3 26439547 T C Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 26439940 T C Y Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0 0.8 0.2 4 6 0 4 1 3 26440546 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26440975 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26441048 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26441764 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26443287 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26445662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26446969 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26448099 C A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 26449337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26450841 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26451636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26453252 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26453258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26455677 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26456363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26456522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26456687 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 26456807 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 26456919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26459596 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 26459657 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 26459758 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 26459887 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26459988 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 26460220 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26460236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26460258 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26460262 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26460275 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 26460335 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26460336 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26460575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26460622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26462673 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26462805 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 26464213 G A Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 26464768 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26465010 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26465431 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 26466016 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 26466194 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26466546 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26466714 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26466797 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26467616 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26468589 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26468633 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26469376 C A Y N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 26470132 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26470138 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26470181 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26470207 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26470290 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26470301 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26470351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26470545 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 26470678 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 26477977 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26478054 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26478120 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26478162 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26478187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26478240 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26478272 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26478285 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26478430 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26478762 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26478766 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26478825 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 26478868 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 26479052 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 26479178 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 26479220 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26479322 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26479345 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 26479389 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 26479425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26479438 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26479738 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26480192 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26480194 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 26480590 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 26480609 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 26480766 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 26480960 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 26481251 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 26481252 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 26481390 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 26481585 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 26481618 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 26481620 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 26482411 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26482797 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26483954 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 26484179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26484276 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 26484451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26484782 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26485418 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 26485561 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 26485636 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 26485864 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26485956 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26486683 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26486768 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 26487016 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 26487506 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 26487642 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 26487712 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26488058 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 26488096 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 26488629 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 26488826 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 26488960 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26489392 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26490353 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26490356 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26490390 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 26490648 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 26490674 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 26490705 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 26490808 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 26490879 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26490915 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26491007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26491063 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 26492677 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26493321 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26493998 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 26494034 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 26494108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26494211 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26494218 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26494254 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26494532 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26494600 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26494615 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26495363 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26496039 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26496248 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 26497387 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26497403 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26497659 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 26497722 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 26497819 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 26497830 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 26498178 A G N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 3 26498942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26499321 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26500014 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26500571 A G Y Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0 0.928571428571429 0.0714285714285714 13 15 0 13 1 3 26500578 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 26500589 T C Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 3 26500713 A C Y N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 26502367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26502452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26504263 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 26504314 G A Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 3 26504564 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26504833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26506166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26507328 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26507549 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 26507989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26508480 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 26508828 A G Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 26508854 T G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 26509434 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26509531 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26510274 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26512635 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26512715 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26513198 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26513809 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 26517015 A C N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 26517775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26517857 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26518606 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26518720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26521042 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26521192 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26521383 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26522280 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26522281 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 26524154 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26524181 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 26524548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26524622 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 26524792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26525058 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26525150 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 26525246 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 26525295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26525338 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 26525366 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26525377 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26525573 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 26525677 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 26525728 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 26525991 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26526156 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26526219 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 26526276 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26526281 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26526298 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26526505 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26527189 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26528072 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26528088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26529612 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26529995 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26530583 A G Y Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 3 26530792 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 26531018 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 26531280 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26531334 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 26531396 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 26531595 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 26531805 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26532033 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 26532415 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 26533123 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26533325 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26533408 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 26533681 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26533989 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 26534260 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26536245 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26536676 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 26536767 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26537620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26537785 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26537880 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 26538099 T G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 26538462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26538664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26538860 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 26539068 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 26539077 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 26539084 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 26539107 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 26539123 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 26539657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26539721 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 26539881 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26539987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26540148 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 26540665 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26540706 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 26540927 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 26541054 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26541136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26541272 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26541466 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 26541508 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 26541512 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 26541646 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26542354 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26542632 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26542707 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26543101 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26545867 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26546356 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 26546367 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26546470 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 26547173 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 26547275 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26547301 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 26547338 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 26548735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26548889 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26549716 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 26549739 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26550170 T G N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 26551410 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 26553714 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26554139 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26554582 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 26555107 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26557126 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 26557672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26558085 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 26558117 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.526315789473684 0.105263157894737 0.368421052631579 22 16 10 2 7 3 26558242 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 26558669 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 26559074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26559097 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 26559133 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 26559232 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 26559405 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 26559699 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 26559738 A T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 26559804 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 26559848 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 26559849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26559880 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 26559882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26559948 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 26559994 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 26560001 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 26560012 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 26560071 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 26560107 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 26560119 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 26560430 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 3 26560585 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26560603 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26560660 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26561673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26561738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26561788 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26563949 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26564509 A C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 26565207 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 26565329 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26565658 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 0.105263157894737 0.421052631578947 20 18 9 2 8 3 26565851 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 26566158 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 26566355 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 26566921 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 26567055 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 26567066 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 26567080 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 26567144 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 26567214 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 26567370 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 26567411 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.526315789473684 0.105263157894737 0.368421052631579 22 16 10 2 7 3 26567460 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 26567499 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 3 26567524 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26567549 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.466666666666667 0.2 0.333333333333333 17 13 7 3 5 3 26567586 G A N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 15 15 6 3 6 3 26567961 A C Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 26567968 C A Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 26569806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26570254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26570397 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 26571530 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26572297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26573725 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 26573879 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26575270 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 26575400 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 26575444 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26575452 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 26576315 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26577344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26578494 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26578678 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 3 26579246 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 26579698 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 26581189 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26581273 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26581319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26581333 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26581361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26581374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26581396 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26582093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26582138 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26582274 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 3 26582406 T G Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 3 26582833 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26582834 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26584134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26585205 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26585690 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 26585805 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26585884 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 26585943 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26585971 T A Y N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 3 26585975 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 26586057 T A Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 3 26586128 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 26586133 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26586223 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26586232 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26586239 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26586268 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26586465 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 26586472 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 26586864 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26586894 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26587051 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 26587100 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 26587123 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26587129 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 26587144 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26587160 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26587166 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26587239 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26587256 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 26587421 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 26587472 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26587519 C G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26587542 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 26587592 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 26587677 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 26587764 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 26588083 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 26588515 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 26588659 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 26588876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26588973 A C Y N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 26589073 A T Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 26589085 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 26589205 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 26589259 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 26589266 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 26589307 C T Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 26589445 G C Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 26589657 C T Y Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 15 15 6 3 6 3 26589686 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 26589734 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 26589787 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 26589817 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 26589898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26590239 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 26590350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26590419 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 26590425 T C Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 26590574 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 26590586 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 3 26590589 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26590625 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26590710 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26590789 G T Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 26590848 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26590946 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 26591333 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26591514 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 26591608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26592060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26592148 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 26592304 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 3 26592323 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26592339 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 26592716 C G N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 3 26592884 T A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 26593411 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 26593577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26593782 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 26593839 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26594132 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26594142 G T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26594145 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26594162 C A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26594317 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26594622 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26594627 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26594936 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26595106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26595214 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26595632 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 26595700 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 26596153 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26596167 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26596253 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26596360 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 26596427 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26596436 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 26596629 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26596816 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 26596909 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26596913 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26596925 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 26597037 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26597215 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26597477 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 3 26597482 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26598200 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 26598630 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26599323 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26599677 G A Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 26600283 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26600352 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26601472 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 26602088 T A Y N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 3 26602223 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26602275 C G Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 26602416 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 26603657 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 26603826 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26604013 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 26604112 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 26604924 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 26605072 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 26605642 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26606321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26607626 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 26607807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26607843 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26608065 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26608174 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26608750 A G N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0 0.818181818181818 0.181818181818182 9 13 0 9 2 3 26609636 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 26609908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26610035 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26610076 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 26610077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26610299 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 26610339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26610443 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26610453 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 26611603 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26611614 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26612007 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26612090 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 26612116 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26612155 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26612159 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26612206 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 26612208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26612284 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26612532 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26612539 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26612599 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 26612742 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26612856 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26612924 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26612938 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26612946 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26613027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26613071 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26613219 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 26613327 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26613369 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26613396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26613411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26613462 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26614351 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26616119 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26616396 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 26616558 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26616632 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 26616679 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 26616724 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 26616727 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 26617453 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 26617562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26617588 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 26617649 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26618491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26618972 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26619731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26619789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26620176 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 26620463 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 26620563 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 26620572 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26620784 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26620860 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26620894 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26620929 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26620980 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26621149 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26621180 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26621244 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 26621282 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26621328 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26621691 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26621898 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26621965 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26622041 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26622121 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26622340 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26622676 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 26624959 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 26625077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26625721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26625827 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26625834 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 26626131 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 26626545 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26627349 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 26627465 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26627510 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26627881 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 26627966 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 26628149 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 26628198 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 26628306 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26629019 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26629178 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26629275 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 26629465 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 26629473 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 26629498 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 26629899 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26629906 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 26629916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26629967 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26630082 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 26630127 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 26630217 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 26630347 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 26630382 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26630638 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26630759 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 26630986 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26631196 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26631701 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 26631801 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26632014 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26632661 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 26632704 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 26632738 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 26632746 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 26632982 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26633016 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26633132 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 26633235 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 26633246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26633321 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26633362 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 26633410 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 26633425 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 26633433 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 26633530 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 26633601 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 26633716 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 26636059 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26636060 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26636180 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26636231 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26636252 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26636338 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 26636341 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 26636371 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 26636402 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 26636526 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 26636606 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26636609 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 26636841 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26636858 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 26636859 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 26636871 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 26636879 T A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 26636965 T A N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 26637037 A T N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 26637056 A G N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 26637063 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26637121 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 26637198 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 26637208 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26637228 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 26637356 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 26637389 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 26637466 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 26637701 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26637709 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 26637793 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26637854 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 26637951 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26637982 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 26638034 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26638126 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26638169 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 26638365 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 26638479 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26638488 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 26638568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26638588 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 26638598 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 26638774 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 26639275 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26639295 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26639304 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 26639354 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 26639512 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26640264 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 26640287 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26640512 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 26640523 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 26640562 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 26640568 C T N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 26640678 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 26640891 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26640977 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26641042 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 26641411 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26641459 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26641472 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26641484 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26641534 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 26641608 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26641660 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26641684 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26641788 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26641801 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26641879 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 26642138 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 26642155 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 26642167 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26642201 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 26642444 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 26642664 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 26642919 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 26643039 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 26643072 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 26643078 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 26643083 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 26643129 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 26643402 A C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 26643419 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26643569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26643699 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 26643839 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 26644042 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26644086 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 26644152 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26644381 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26644427 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26644480 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26644531 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 26644618 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 26644902 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 26644969 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 26645662 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 26646143 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 26646426 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 26646620 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26646702 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 26646756 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26646799 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 26646966 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 26647824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26648043 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 26648579 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 26648729 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26649059 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26649307 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26649906 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26651165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26651579 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 26652476 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26652558 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 26652844 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 26653744 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26655194 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 26655292 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 26656655 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26658408 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 26658654 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26658777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26660559 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26667468 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26671242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26675873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26678544 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26679795 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26679886 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 26679973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26680098 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26681497 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26682641 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26689458 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26690519 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26692333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26692853 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26693589 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 26694051 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26694304 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 26694320 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 26694588 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 26694707 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26695364 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 26695681 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26695698 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26695833 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 26696439 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 26696568 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 26696569 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 26696983 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26697088 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 26697114 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 26697190 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26697477 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 26697586 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26697731 T A N N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 3 26697904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26697941 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 26698140 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26698538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26698587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26698613 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26698734 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26698862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26698974 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26699637 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26699643 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26699650 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26699763 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26699773 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26699998 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26700006 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26700155 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26700172 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26700219 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26700255 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26700399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26700455 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26700469 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26700526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26700696 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26700708 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26700716 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26700729 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 26700757 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 26700769 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26700843 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26700899 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26701010 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 26701015 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 26701082 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26701242 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 26701286 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 26701410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26701557 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 26701558 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 26701574 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26701951 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 26701976 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 26702008 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 26702012 T A N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 26702272 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 26702341 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 26702413 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 26702597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26702885 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 26703225 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26703266 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26703487 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 26703515 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26703660 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26703691 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26703906 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26704033 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26704191 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26704196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26704313 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26704370 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26704465 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26704589 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26704737 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26704965 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26705009 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 26705382 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26705944 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26706059 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26706077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26706145 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 26706500 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26706761 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 26706823 A G N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 3 26706890 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 26706997 C A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 26707043 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26707527 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 26709270 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26709534 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26710239 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26710250 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26710402 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26710940 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26712274 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26712473 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 26713391 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 26714369 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26717050 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26717086 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26717159 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26717644 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26718666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26718759 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 26719030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26721351 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26723499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26724282 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26724317 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26724343 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 26724416 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 26724545 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 26724731 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 26724900 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 26725176 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26725216 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26725256 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26725427 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26725636 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26725692 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 26725959 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 26725973 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 26726077 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26726899 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 26726902 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 26727203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26727209 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26727282 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 26727359 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 26727454 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26727613 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26728003 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26728042 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 26728158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26728409 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 26728419 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 26729979 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 26730239 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26730488 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 26730788 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 26731003 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26731024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26731051 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 26731061 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 26731257 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26731467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26732090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26732128 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 26732287 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26733043 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 26733318 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 26739271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26739397 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 26739668 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26739675 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 26739729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26741142 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 26742509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26746893 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 26746897 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 26747129 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 26747370 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26747452 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 26747679 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 26747962 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26748154 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26748155 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26748205 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26748467 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 26748496 G C Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 26748531 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 26748642 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 26748734 C T Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 26748758 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26748775 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 26748792 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 26748809 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 26748827 C T Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 26748832 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 26748878 G T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 26748892 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26749018 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26749119 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26749131 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26749197 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 26749200 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26749303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26749307 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 26749318 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26749334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26749359 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26749457 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26749948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26750185 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26750233 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26750519 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26751097 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26752513 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26753592 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 26753855 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 26754746 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26754780 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 26754800 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 26755330 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 26755339 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 26755353 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 26755463 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 26755657 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26756949 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26763886 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 26763934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26763953 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26764017 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 26764018 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26764634 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26765130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26765703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26765987 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26766245 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 26766270 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26766331 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 26766343 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 26766345 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 26766394 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 26766458 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 26766591 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 26766674 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 26766751 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 26766888 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26766944 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 26766988 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26766992 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26767136 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26767210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26767237 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26767272 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 26767339 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26767428 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 26767441 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 26767461 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 26767478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26767537 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 26767582 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26767588 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 26767599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26767654 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 26767738 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 26767761 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 26767776 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 26767790 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 26767840 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26767847 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 26768085 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 26768134 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 26768194 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 26768249 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 26768326 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 26768354 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26768491 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 26768516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26768565 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 26768808 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 26768912 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 26768949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26768966 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26768984 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 26769118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26769231 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 26769460 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 26769509 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 26769589 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26769680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26769818 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26769865 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26770104 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 26770106 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26770201 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26770355 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26770395 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26770665 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26771238 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 26771370 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26771778 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26772469 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 26772543 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26772921 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26773663 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 26773719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26774229 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 26774459 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 26775208 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26775228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26775229 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 26775240 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 3 26775322 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 26775343 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26775516 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 26775567 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 26775601 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 26775754 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 26776060 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 26776282 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26776310 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 26776399 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 26776545 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 26776625 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 26777033 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 26777511 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 26778015 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26779220 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26780498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26780989 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 26782291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26784383 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26784946 T G Y N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 26790972 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26791674 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26796000 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 26797534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26797890 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 26798772 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26806007 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 26806800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26808306 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26809546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26809720 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26809845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26810604 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26813882 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26814410 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26822952 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26823457 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26826064 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 26826504 G T N N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 10 10 3 4 3 3 26828806 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 26829075 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26830573 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26833229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26833248 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26834267 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 26834614 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26834697 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26834847 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 26834989 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26835224 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26835241 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26835457 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 26835479 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 26835724 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26835727 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26836089 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 26836231 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26836255 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 26836304 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26837189 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 26837457 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 26837463 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 26838774 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26839035 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 26839269 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26840520 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26841627 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 26841690 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 26842734 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 26852527 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 26853189 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 26855862 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26855904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26856183 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 26856189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26856502 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26858028 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 26858700 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26858940 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 26860842 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26860950 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 26861929 G A Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 26862090 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 26862554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26863139 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26863156 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26864014 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26865401 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26866023 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26866531 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 26866629 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 26867086 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 26867504 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26867945 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26868227 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26868738 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 26870528 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26871713 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 26871719 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 26871779 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 26872930 A G Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 3 26875819 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 26875898 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26875959 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 26876186 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26876640 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26877235 G C N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 26877307 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26877508 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 26877589 G C Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 26877978 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 26878046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26878113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26878548 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26879413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26879611 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 26879648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26879877 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 26879915 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 26880032 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 26880100 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 26880124 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26880138 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 26880221 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 26880297 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26880298 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 26880445 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 26880479 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 26880482 T G Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 26880497 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 26880588 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 26880662 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 26880815 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 26881032 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 26881070 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 26881450 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26881467 T G Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 26881503 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 26881739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26882111 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 26882117 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 26882161 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 26882170 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 26882196 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 26882268 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26882902 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 26882918 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26883091 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 26883133 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.15 0.85 0 23 17 3 17 0 3 26884258 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26884276 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 26884659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26885929 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 26885978 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26887956 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26888461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26889090 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26893053 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 26894333 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26894494 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26894815 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 26894829 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26895705 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 26895779 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 26897939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26898112 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 26899467 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26899487 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26900201 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 26900497 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26900687 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 26901353 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26901571 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 26901915 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26903491 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26905425 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 26905441 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26905615 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26906173 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26906319 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26906633 T G Y N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 26906725 T A Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 26906729 T C Y Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 26906777 G C Y N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 3 26906812 G A Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 26906814 G A Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 26907083 G C Y N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 3 26907184 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26907198 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 26907441 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 26907461 G C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26907823 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 26908050 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 26908167 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 26908404 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26908529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26908873 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 26909522 G A Y Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 3 26909530 C T Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 3 26909617 A G Y Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 26909809 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26909960 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 26910099 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 26910200 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26910234 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 26910289 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 26910498 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26910690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26910840 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 26910904 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 26910908 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 26911804 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26911881 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26911898 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26911911 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26912032 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26912117 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 26912150 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 3 26912180 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 26912181 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26912196 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 26912218 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 26912231 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 26912655 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 26912753 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 26912812 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 26912978 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26913001 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 26913218 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 26913459 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 26914021 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26923368 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26925011 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 26925107 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 26925773 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 26926031 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 26926072 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 26926248 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 26926270 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 26926460 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 26926473 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26926488 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26926492 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 26926531 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 26926578 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 26926618 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26927013 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 26927070 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26927205 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 26927213 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 26927233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26927274 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 26927376 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 26927571 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 26927591 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 26927640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26927681 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26927699 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 26927778 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 26928031 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 26928161 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 26928434 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 26928482 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 26928500 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 26928531 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 26928544 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 26928550 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 26928558 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.222222222222222 0.722222222222222 0.0555555555555556 21 15 4 13 1 3 26928571 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 26928572 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 26928592 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 26928601 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 26928738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26928772 G C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 26928815 A C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 26928820 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 26928827 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 26928838 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 26928869 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 26928893 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26928909 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 26928933 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 26928940 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 26928949 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 26929447 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26929574 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 26930149 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 26930525 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26931990 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26932040 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 26932072 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26932145 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26932198 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 26932224 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26932297 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26932398 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26932612 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26932637 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26932689 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26933540 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 26933553 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 26933938 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 26933968 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 26934031 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 26934048 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 26934056 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 26934217 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 26934422 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 26934443 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 26934533 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 26934548 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26934661 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 26934681 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 26934700 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 26934721 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 26934725 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 26934876 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 26934959 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 26934982 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 26935139 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 26935140 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 26935179 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 26935295 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 26935484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26935499 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 26935513 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 26935519 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26935691 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26935692 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 26935801 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26935809 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26935958 A G Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 26935974 A C Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 26936040 C A Y N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 26936065 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26936079 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 26936144 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26936399 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 26936406 A T Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 26936418 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 26936421 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26936470 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 26936619 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26936634 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 26936700 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26937349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26938450 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 26940229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26941075 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26941160 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 26942114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26942123 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 26945102 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 26946908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26947129 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 26947176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26947234 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26948865 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26949081 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26949343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26949375 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 26949416 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 26949457 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 26950100 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 26950200 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 26950914 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26950915 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26951272 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 26951575 A T Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 26952002 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26952040 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26952084 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26952169 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26952202 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26952350 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26952425 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 26952695 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26952757 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26952766 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26952940 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26953028 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26953104 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26953193 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26953249 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26953254 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26953273 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26953352 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 26953445 A G N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 16 12 2 12 0 3 26953459 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26953536 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26953728 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 26953814 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26953844 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26953855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26953923 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 26954016 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26954084 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26954091 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26954135 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 26954189 T G N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 26954465 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26954474 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26954534 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 26954542 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 26954600 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26954641 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26954689 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26954823 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26954952 G T Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 26955216 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 3 26955295 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26955370 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26955384 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26955397 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26955530 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 26955625 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26955776 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 26955889 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26956414 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26956670 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26956684 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26956799 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26957018 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26957080 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26957102 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26957167 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26957238 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26957367 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26957419 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26957679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26957682 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 26957718 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26957783 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26957906 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 26958305 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 26958579 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26958923 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26960083 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26960160 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26960379 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 3 26960423 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 26960453 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.5 0.1 0.4 22 18 10 2 8 3 26960535 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26960539 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 3 26961260 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26961263 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26961306 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26961357 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26961373 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26961400 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26961571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26961992 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 26962417 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26962783 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 3 26962792 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 3 26962865 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26962883 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 26964166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26964510 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 3 26964571 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26964627 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26964815 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26965821 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 26965993 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 26966442 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26966536 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26966820 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26966881 G C Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 26966908 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26967029 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26967319 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 3 26967424 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 26967608 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 26967935 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 26967968 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26968084 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 26968246 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 3 26968457 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 26968586 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 3 26968773 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 3 26968777 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 3 26968947 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26968959 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.388888888888889 0.111111111111111 0.5 16 20 7 2 9 3 26968960 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.388888888888889 0.111111111111111 0.5 16 20 7 2 9 3 26968990 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26969334 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26969789 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26969932 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26969943 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26970032 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26970160 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 26971031 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26971054 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 26971301 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26971454 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 3 26971904 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 3 26971910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26971948 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26972120 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 26972322 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 3 26972388 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 26972407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26972583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26972620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26973095 C A Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.45 0.1 0.45 20 20 9 2 9 3 26973107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26973211 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26973293 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26973303 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 26973453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26973531 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26973922 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 26973945 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 26974171 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26974221 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 26974254 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26974373 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26974426 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26974585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26976077 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26976127 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26977708 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 26978434 C A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 26978451 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 26978895 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26981170 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 26981218 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 26981445 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 26981842 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26982172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26982981 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26983204 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 26983218 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 26983230 A C N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 26983287 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 26983529 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26983568 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 26983764 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 26983765 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 26983799 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 26984043 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26984133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26984256 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 26984444 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 26984451 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 26984599 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 26984611 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 26985313 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 26985478 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 26985493 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26986133 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 26986155 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 26987077 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 26990034 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 26990045 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26990474 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 26994749 A G Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 26995116 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 26995143 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 26995266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26995376 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 26996230 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 26996793 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 26997441 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26997627 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26997876 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 26998559 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 26998665 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 26998779 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 26998873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26999217 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 26999332 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 26999408 T A Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 26999561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 26999651 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 26999730 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 26999737 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 26999956 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27000167 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27001103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27001109 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 27001123 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 27002445 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 27002511 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27002528 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 27002556 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27002715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27002780 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27002852 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 27002961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27002971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27002973 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27002985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27003176 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27003253 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27003801 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27004813 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 27004902 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27006352 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 27007171 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27008457 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27009269 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27009644 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27010515 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27010662 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 27012158 C T Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 27012201 A T Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 27012231 C G Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 27012241 G A Y Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 27012278 G T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 27012305 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 27012316 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 27015046 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 27015457 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27015780 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27015825 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 27015915 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 27016073 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 27016275 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27016515 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27017086 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27017219 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 27018622 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27018896 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27019019 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27019215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27019425 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27020022 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27020114 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27020919 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 27021132 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27021606 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27023515 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 27023608 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27023819 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 27024038 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 27024081 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 27024937 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27025539 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 27026302 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27026439 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 27026810 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27027258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27027365 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27027557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27027776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27028289 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27028788 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27028833 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27029763 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27031208 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 27033381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27033887 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27033989 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27035614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27038192 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 27038203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27038729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27038806 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27038985 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27039720 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 27041283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27041683 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27042466 A G N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 27044838 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 27045199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27045651 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27048825 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27049050 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 27049439 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27049582 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 27049815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27049837 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27050929 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 27051293 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27052595 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 27052984 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27053216 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27053464 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27053498 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27053701 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27053842 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 27053852 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27053949 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 27053952 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 27053975 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27053977 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 27053997 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 27055165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27058485 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 27059381 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 27060026 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 27060151 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 27060287 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 27060690 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 27060853 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 27060878 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27060879 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27061029 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27061083 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27061296 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27061493 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27061498 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 27061545 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27061580 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 27061669 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 27061739 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 27061756 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 27061835 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 27061891 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 27062113 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 27062152 A G N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 27062489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27062746 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 27062913 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 27062914 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 27062946 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 27063002 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 27063031 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 27063107 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 27063115 T A N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 3 27063177 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 27063405 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27063745 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 27063752 T C Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 27063805 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 27064351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27064446 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 27064569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27064584 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 27064652 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27064686 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27064895 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27064968 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27065104 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27065209 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27065678 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27065739 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 27066031 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 27066093 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 27066114 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27066178 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27066512 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 27067178 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27067906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27067953 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 27070461 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 27070464 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 27070632 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27071110 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 27071176 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27071208 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27071212 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 27071236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27071241 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 27071259 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27071406 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 27071407 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 27071449 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 27071530 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 27071601 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 27071622 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 27073231 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 27073582 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 27075033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27075913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27076429 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 27076834 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27078816 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 27080192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27080677 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27080736 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27080752 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 27082578 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 27082604 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 27082711 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 27082999 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27083510 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 27084046 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 27084158 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27084410 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 27084875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27084954 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27085073 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 27085206 A C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 27085209 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 27085302 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 27085340 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 27085435 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 27085484 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27085501 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 27086003 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27086176 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 27086321 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 27086397 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 27086428 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 27086790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27086791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27086874 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 27086937 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27086971 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 27087045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27087058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27087184 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27087223 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 27087421 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 27087463 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27087839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27087895 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27088064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27088077 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27088159 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 27088542 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 27089685 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 27090090 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 27090261 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 27090386 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 27090766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27091266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27093005 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27094345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27098278 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27098454 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 27098688 T G Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 27098823 T A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 27098958 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 27099090 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 27099175 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 27099260 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 27099409 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 27099992 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27100038 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 27100289 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 27100293 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 27100630 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 27100679 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 27100884 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27101170 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 27101181 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 27101268 T A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 27101912 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 27102025 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 27103016 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27103071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27103084 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 27103392 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 27104286 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27105581 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 27106011 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 27106077 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 27106170 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 27106174 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 27106376 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 27107022 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 27107043 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 27107050 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 27107368 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27107626 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 27107705 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 27108084 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27109989 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 27111009 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 27111220 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 27111465 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 27111717 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27111775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27111828 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 27111852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27111969 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 27112409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27112436 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 27112472 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 27112575 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 27112717 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 27112838 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 27112843 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 27112856 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 27112910 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 27112922 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 27113037 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27113381 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27113392 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 27113797 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 27113799 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 27113809 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 27113990 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 27114007 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 27114014 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 27114022 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 27114033 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 27114637 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27115609 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27116283 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 27116291 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 27116729 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 27116817 A C Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 27116838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27116891 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 27116928 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 27116941 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 27117126 T C Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 27117147 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 27117156 A C Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 27117180 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 27117186 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 27117285 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 27117346 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 27117369 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27117442 A T Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 27117608 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 27117642 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 27117765 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27117947 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 27117988 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 27118135 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 27118279 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 27118280 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27118293 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 27118394 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27118519 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 27118753 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 27118763 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 27119157 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 27119286 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27119459 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 27119533 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 27119543 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 27119919 T G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 27119934 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 27121182 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 27121184 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 27121700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27122547 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 27122679 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 27122724 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 27122735 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 27122810 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 27123391 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 27123421 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 27123663 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 27123996 G A Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 27124051 A C Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 27124141 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 27124169 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 27124180 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 27124213 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 27124340 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 27124347 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 27124492 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 27124621 G T Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 27124761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27124802 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 27124874 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 27124943 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 27125261 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27125336 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27125374 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27125494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27125567 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 27125866 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 27125947 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 27126002 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 27126502 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 27126555 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 27126589 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27126697 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 27126740 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 27126753 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27127156 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 27127376 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 27127377 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 27127574 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 27127582 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 27127594 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 27127672 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 27128104 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 27128333 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27128719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27128933 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27129577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27129616 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 27130140 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 27130210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27130265 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 27130686 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27130691 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27130705 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27130708 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 27130716 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27130726 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27130729 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 27130758 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 27130762 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 27130800 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 27130883 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27130928 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 27131398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27131572 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27131894 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 27132051 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 27132473 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27132503 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 27132506 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27132530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27132543 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 27132580 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 27133053 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 27133310 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 27133589 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 27133638 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27134699 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 27134748 T A Y N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 3 27134760 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 10 20 0 10 5 3 27134834 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27134908 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27134976 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27135097 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27135116 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27135240 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27135321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27135361 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27135369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27135389 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27135451 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 27135671 T G Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 27135849 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27136168 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 27136980 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 27138052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27138229 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 27138336 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27138413 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 27138475 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 27138616 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 27138645 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27138799 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 27138826 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 27138829 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 27138854 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27138859 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 27138877 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27138978 G A N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0 0.7 0.3 7 13 0 7 3 3 27139077 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27139085 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27139090 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27139127 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27139155 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27139207 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27139357 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 27139380 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 27139600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27139667 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 27139698 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27139721 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27139751 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27139798 C T N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 27139852 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 27139855 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 27139893 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27139924 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27139940 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27139974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27140015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27140107 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27140203 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27140647 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 27140760 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 27140763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27141025 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27141201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27141257 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27141405 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 27141489 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27141648 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 27141961 A T Y N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 27142466 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27142809 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27142857 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 27142905 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27142987 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27143439 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27143457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27143612 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27143814 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27143939 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27144310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27145401 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27145621 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27145757 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27145897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27146080 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 27146221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27146376 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27146499 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 27146864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27147644 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 27147732 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 27147820 C T N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 6 14 2 2 6 3 27147867 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 27148312 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27148337 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 27148375 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27148649 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 27148716 A T Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 27148737 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 27149085 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27149262 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 27149335 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 27149397 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 27149491 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 27149668 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 27149678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27149787 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 27150239 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27150513 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27150566 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 27150609 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27150693 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 27150698 T A Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 27150725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27150736 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 27150767 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27150883 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 27150885 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 27151121 G A Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 27151201 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 27151229 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 27151523 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 27151549 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27151677 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 27151761 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27151786 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27151812 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27151817 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27152067 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27152083 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27152157 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27152222 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 27152326 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 27152333 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 27152351 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 27152436 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 27152593 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27152610 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27152665 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 27152762 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27153321 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 27153359 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 27153508 G A Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 27154229 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27154477 C G Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 27155567 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 27155730 T G Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 27156626 G A Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 3 27156743 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 27156884 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 27157012 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 27157187 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27158718 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27159023 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27159076 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27159242 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27159593 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27160628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27160995 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27161114 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 27161677 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27161680 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27161713 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27161740 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27162115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27162748 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 27162845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27163373 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27164336 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 27164987 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 27165161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27165361 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 27165536 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27165619 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27166019 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27166273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27167126 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27168001 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27168204 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 27168750 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 27168975 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 27169047 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 27169276 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 27169454 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27169469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27169474 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27169626 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27169782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27170639 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27170662 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27170717 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27170726 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 27170810 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27170818 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27171400 G C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27171725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27172185 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 27172208 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 27172234 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 27172391 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27172525 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 27172846 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27173098 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 27173189 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 27173303 C A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 27173336 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 27173421 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 27173441 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27173654 G A N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 3 27173709 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 27173747 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 27173802 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 27173848 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 27173933 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 27173948 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 27173992 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 27174147 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27174264 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27174421 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 27174444 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 27174462 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 27174534 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 27174544 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 27174802 T G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 27174906 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 27175152 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27175185 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27175321 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 27175362 G T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 27175414 A T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 27175519 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 27175529 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 27175533 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 27176894 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 27177264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27177301 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 27177382 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 27178134 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27178221 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27178741 T C Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 27178752 T C Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 27178755 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 27178776 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 27179037 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 27179268 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27180083 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 27180168 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 27180230 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 27180592 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27181245 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27182538 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27182675 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 27182796 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27182800 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 27182994 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 27183025 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 27183276 C T N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 27183302 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 27183322 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 27183734 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 27183751 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 27183768 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27183813 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27183877 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27183959 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 27184083 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 27184216 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 27184328 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 27184331 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 27184415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27184751 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 27184981 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 27185889 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27186102 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27186132 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27186149 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 27186352 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 27186385 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27186389 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27186429 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 27186692 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27186950 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 27190296 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27190669 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 27191944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27192082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27194179 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 27194338 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27194458 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27194664 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27195284 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27195300 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27196250 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27196666 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27197315 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27198715 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 27199603 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 27199820 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27201191 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 27201296 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 27201412 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 27201432 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 27201455 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27201591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27201853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27201878 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27201965 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 27202087 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27202115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27202188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27202220 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27202268 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27202702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27202704 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27202722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27202797 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27203290 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 27205326 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 27205345 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 27205479 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27205592 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 27205606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27205622 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27205720 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27205745 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27205751 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 27205809 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27205837 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27205862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27205867 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27205971 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 27206057 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27206099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27206257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27206368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27207687 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 27207806 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 27207835 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27209794 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27209917 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 27209929 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 27210993 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27213489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27213618 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 27213875 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 27213984 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 27219518 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 27220230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27221380 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27221444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27221706 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27221730 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27221731 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27222277 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27222330 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27222412 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27222589 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27222610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27222723 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 27222729 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 27222770 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27222784 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 27222823 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 27223136 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 27224159 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27224839 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 27225311 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 27225718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27226612 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27226971 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 27227000 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 27227012 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 27227244 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 27227259 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 27227347 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 27227441 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 27228067 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 27228165 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 27228441 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 27228482 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 27228758 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 27228810 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 27230273 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27230417 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 27231398 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 27231704 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 27232608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27235704 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27237033 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27238168 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 27238189 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27238205 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 27238447 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 3 27239482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27240534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27240622 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27241741 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 27246717 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27246731 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27248054 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 27248562 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 27249216 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 27252277 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 27252326 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27252386 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 27252566 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27252972 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 27253019 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 27253078 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 27253097 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 27253175 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 27253204 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 27253210 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 27253231 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 27253241 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 27253260 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27253274 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 27253295 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 27253311 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 27253354 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 27253366 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 27253406 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 27253416 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 27253618 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 27253664 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 27253676 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 27255666 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27255693 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27255773 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27255849 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27255854 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 27255939 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 27255944 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27256016 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27256021 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27256052 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 27256089 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27256100 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 27256299 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 27256397 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 27256485 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27256858 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 27256880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27257200 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 27257202 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 27257211 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 27257574 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27257795 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 27258176 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27258180 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 27258378 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 27258994 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27259022 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27259073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27259926 G C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 27260106 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27260109 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27260188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27260315 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 27260437 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27260468 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 27260539 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 27260555 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27260689 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27260734 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 27260781 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 27260829 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27260831 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27261121 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27261173 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27261187 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 27261282 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 27261387 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 27261436 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 27261446 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27261589 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 27261649 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 27261952 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 27263160 G A Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 27263540 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 27263773 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 27264168 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27264347 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 27264543 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27264602 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27264901 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 27264913 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 27264925 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 27265136 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 27265189 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27265224 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27265305 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27265677 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27265808 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27265869 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27266359 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 27266368 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27266530 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 27266587 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 27266979 T C Y Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 3 27267010 C T Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 16 14 1 14 0 3 27267110 G T Y N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 3 27267121 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 27267123 A C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 27267300 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 27267374 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 27267585 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27267813 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 27267925 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 27268005 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 27268015 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 27269240 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27271678 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27272024 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27275922 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 27276646 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 27279238 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27279315 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 27279356 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27279800 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27280556 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 27280558 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27280705 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 27280787 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27280857 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27280868 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 27281011 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 27281107 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27281173 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27281209 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27281245 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 27281317 G A Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 27281376 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 27281440 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 27281441 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 27281499 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 27281876 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 27282210 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27282267 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27282418 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27283232 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 27283537 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 27283550 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 27283568 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 27283606 C G Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 27283694 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 27284291 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 27284329 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 27284334 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 27285182 G C N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 27285769 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27285897 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27285966 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27286009 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 27286453 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 27286506 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 27286607 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 27286622 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27286895 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27286905 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 27286997 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27288205 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27288444 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 27288451 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 27288851 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27288893 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27288922 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 27289036 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27289151 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27289582 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 27289670 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27289684 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 27289689 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27290373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27290472 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 27290694 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27290699 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27290963 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 27291238 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 27291292 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27292723 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 27292844 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27292882 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 27293035 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 27293089 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 27293227 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 27293258 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27293730 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 27293766 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 27293818 G T Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 27293876 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 27293951 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27293973 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 27294054 C T Y Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 27294556 T C Y Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 27294644 C T Y Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0 0.75 0.25 6 10 0 6 2 3 27294680 C G Y N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 3 27294841 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 7 5 1 5 0 3 27294967 T C Y Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 3 27295011 A G Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 27295076 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 27295195 C T Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 27295294 A C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 27295313 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 27295318 T C Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 27295429 T A Y N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.0769230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 9 17 1 7 5 3 27295501 G A Y Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 3 27295502 T C Y Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 3 27295585 A G Y Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 3 27295587 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 27296209 T C Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 3 27296246 C T Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 27296444 A G Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 27296463 A G Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 27296530 A T Y N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 27296567 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 27296626 C T Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 27296721 T C Y Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 7 11 1 5 3 3 27296803 A T Y N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 27297224 G T Y N 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 8 6 2 4 1 3 27297256 T G Y N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 3 27297415 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 3 27297427 T C Y Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 27297552 T C Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 27297563 C T Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 27297632 A C Y N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.230769230769231 0.615384615384615 0.153846153846154 14 12 3 8 2 3 27297655 T C Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 27297703 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 27297951 A T Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 27297961 T A Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 27298016 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 27298267 A G Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 27298446 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 27298961 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 27299075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27299108 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 27299152 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 27299261 T G Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 27299303 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 27299425 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27299440 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 27299560 G A Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 27299844 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 27300113 G T Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 27300594 C A Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 27300782 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 27300888 A T N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 27300898 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 27300915 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 27301146 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 27301335 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 27301870 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 27301880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27301883 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 27301891 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 27301961 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 27301970 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 27301973 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 27302195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27302371 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27302387 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27302426 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 27302848 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27303000 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27303026 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 27303148 C A Y N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 27303208 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 27303217 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 27303233 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 27303299 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 27303444 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 27303883 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 27303887 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 27304022 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 27304116 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 27304129 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 27304136 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 27304174 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 27304226 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 27304269 C G Y N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 27304427 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 3 27304480 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 27304683 C G Y N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 3 27306048 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 27307269 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27307328 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27307340 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 27307402 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 27307419 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27307444 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 27307591 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 27307651 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 27307901 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 27307957 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 27307958 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 27308519 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 27308675 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 27308698 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27309050 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27309054 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 27309096 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 27309415 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 27309482 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 27309640 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 27309664 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 27309766 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27309833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27309850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27310107 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 27310158 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 27310162 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 27310182 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 27310199 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 27310211 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 27310309 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27310739 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27310986 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 27311019 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 27311302 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 27311362 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 27311376 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 27311431 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27311455 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 27311736 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 27312361 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 27312712 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27313035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27314089 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 27314472 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27314515 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 27314807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27314842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27314936 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 27316356 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27317440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27317914 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27319189 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 27319726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27320176 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 27320364 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27320711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27321121 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 27321410 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 27321447 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27321989 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27322296 G T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 27323202 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27323819 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 27323944 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 27324020 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 27324133 A C Y N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 27324142 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 27324359 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27324478 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27324804 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27327213 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27328543 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27330656 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27331591 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27331594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27331829 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27332334 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 27332348 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 27332671 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 27332994 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27333601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27333622 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27333717 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 27333761 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 27333818 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 27333986 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 27334120 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 27334291 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27334402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27334821 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27335257 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 27335696 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 27336381 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27338352 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27340495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27341897 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27342083 A C Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 27343297 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 27343505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27344278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27344498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27345585 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27346093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27346750 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27347053 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 27347200 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 27348650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27349198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27349560 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27349561 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27351635 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27351756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27352575 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27354665 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27354720 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27357066 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27362142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27363353 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27364872 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 27365632 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27365996 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27368087 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 27368318 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27368361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27368473 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 27368525 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 27368611 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 27368692 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 27368806 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 27369016 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27369042 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27369084 A C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27369117 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27369350 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27369416 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27369597 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27369627 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27369689 A T Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 27369892 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 27369979 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27370332 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27370373 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 27370441 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27370516 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27370533 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27370555 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27370654 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27370673 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27370709 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 27370722 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27370731 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 27370791 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27371060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27371235 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 27371852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27373480 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27374409 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27374563 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27374690 C T Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 27376144 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 27377120 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 27377177 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27377217 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 27377247 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27377535 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 27378520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27378582 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27378765 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27378824 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27378883 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 27379108 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 27379133 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 27379323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27379495 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 27379577 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 27379627 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 27379980 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27380168 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27380178 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27380766 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27380833 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 27381190 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 27381209 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 27381332 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27381780 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 27381810 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27381821 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27381978 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27382071 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27382073 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27382197 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27382218 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27382286 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27382504 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 27382615 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 27382669 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 27382688 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 27382695 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 27383200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27383817 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27384020 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27384075 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 27384120 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 27384335 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27386446 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 27386671 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27386947 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 27387608 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27387726 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 27388092 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 27388094 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27388112 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27388162 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27388379 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27388457 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 27388662 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 27388710 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 27388760 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27389012 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27389597 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27389769 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 27389870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27392449 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27392642 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27393070 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27393276 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27393551 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 27393911 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27394561 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27395276 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27395311 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27395955 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 27396673 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 27396808 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 27396997 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 27397055 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 27397086 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 27397325 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 27397647 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 27397940 A T N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 27398066 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 27398067 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 27398086 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 27398157 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 27398267 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27398577 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 27399264 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27399289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27399398 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27399793 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 27400170 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 27400248 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 27400300 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 27400606 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 27400647 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 27400668 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27400819 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 27400831 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 27400945 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 27400957 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27401041 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 27401427 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27402089 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27402110 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 27402209 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27402806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27403772 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27404338 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 27404577 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27405186 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27405914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27406277 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27407020 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 27408754 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 27408957 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27409278 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27409298 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27409456 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 27409496 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27409564 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 27409585 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 27409667 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 27409678 T C Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 27409737 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 27409759 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 27409814 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 27409817 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 27410040 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 27410123 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27410125 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27410149 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27410321 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 27410335 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27410355 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 27410441 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 27410480 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 27410554 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 27410560 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 27410572 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 27410620 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 27410640 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 27410668 G T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 27410677 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 27410727 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 27410735 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 27410751 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 27410763 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 27410779 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 27410949 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 27410975 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 27410976 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 27410997 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27411131 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 27411147 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 27411244 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 27411267 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 27411301 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 27411315 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27411459 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 27411537 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 27411582 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 27411635 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 27411656 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 27411657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27411668 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 27411910 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 27411961 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 27411994 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 27411998 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27412090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27412096 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 27412261 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27412296 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 27412308 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27412336 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27412355 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 27412426 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 27412443 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 27412520 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 27412554 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 27412565 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27412667 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 27412735 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 27412768 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 27412917 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 27412934 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 27413545 C T Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 27413553 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 27413650 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 27413710 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 27413795 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27413890 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27413914 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27413926 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27413927 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27413938 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27413953 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27413989 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27414021 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27414111 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27414144 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 27414248 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27414492 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 27414524 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27414525 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27414613 G T Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 27414690 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27414866 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 27414870 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 27414893 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 27414931 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27414987 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27415047 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 27415056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27415061 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27415101 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27415108 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27415265 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 27415269 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27415407 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27415438 T A Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 27415588 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 27415621 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 27415798 C T N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 3 27416868 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27417055 T G N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 27417186 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 27417316 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27417490 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27417561 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27418181 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 27418318 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 27418430 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 27418443 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 27418719 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 27419306 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27419371 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 27419385 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27419444 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27419449 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 27419509 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27419622 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 27419935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27420036 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 27420263 A G N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 27420387 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 27420421 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 27420526 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 27420708 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 27420819 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 27420939 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 27421431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27421462 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 27421576 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 27422209 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27422432 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27423034 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 27423680 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 27424018 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27424034 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 27424969 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27425684 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 27426293 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 27426522 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27426788 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27427526 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27427565 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 27428090 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27428388 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 27428401 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 27428489 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27428604 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27428616 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 27428660 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 27429074 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27429075 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27429094 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 27429160 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27429232 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27429442 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 27429539 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 27429980 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27430148 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 27430411 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 27430606 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27430890 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27430917 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27430929 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27430941 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27430969 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 27431024 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 27431071 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27431073 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 27431105 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27431323 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27431423 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 27431444 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 27431596 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 27432007 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 27432176 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 27432307 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 27432385 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 27433752 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27434134 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27434290 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27435086 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27436855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27436860 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27437309 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 27437430 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 27437490 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 27437571 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27437591 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 27437658 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27438532 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27438537 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27438573 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 27438991 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27439343 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27442087 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 27442893 T A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 27442981 G A N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 3 27443018 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27443383 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 27443908 C A N N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.333333333333333 0.583333333333333 0.0833333333333333 15 9 4 7 1 3 27444440 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 27444757 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 27444817 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27444968 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 27445001 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27445128 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27447694 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27448597 G T Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 27450182 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27450402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27453058 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 27453906 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 27454493 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 27454973 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27456869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27458490 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27460696 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27460976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27462362 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 27462387 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27462406 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 27463274 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 27463293 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 27463597 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27463608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27463757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27464186 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 27464254 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 27464257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27464667 A T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 27464753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27464998 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 27465110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27465421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27465530 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 27465828 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 27465957 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 27466042 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 27466057 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 27466265 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 27466274 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 27466323 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 27466518 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 27466650 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27466847 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 27466860 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 27466896 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 27467016 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 27467057 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 27467374 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 27467486 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 27467616 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 27467640 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 27468763 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27469016 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 27469394 T C N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 3 27470261 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 27470275 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 27470330 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 27470358 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 27470379 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 27470406 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 27470872 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 27470998 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 27471065 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 27471151 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 27471486 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27471848 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27471999 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27472161 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27472983 G T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 27473077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27473481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27473701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27473825 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 27473969 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27474262 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27474414 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 27475200 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 27475696 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27475856 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27476032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27476191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27476299 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 27476438 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27476627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27476677 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 27476777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27476788 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 27476805 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 27477016 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 27477026 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27477782 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 27477862 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27477958 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 27477969 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 27478414 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 27478586 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 27478670 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 27478714 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27478778 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27478780 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27478859 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27478927 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 27478958 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27478985 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 27479011 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 27479022 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 27479099 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27479143 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 27479393 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27479554 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 27479611 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27479621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27479881 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27480018 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 27480077 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 27480082 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 27480329 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 27480334 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 27480427 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 27480685 G A N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.272727272727273 0.545454545454545 0.181818181818182 12 10 3 6 2 3 27480686 G A N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.272727272727273 0.545454545454545 0.181818181818182 12 10 3 6 2 3 27480924 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 27480942 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 27481261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27481295 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 27481343 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 27481586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27481766 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 27481767 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27481916 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 27481922 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 27481941 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 27482022 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 27482136 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27482228 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 27482253 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27482275 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 27482291 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 27482303 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 27482445 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27482607 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 27482707 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 27482736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27482759 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 27482787 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27482863 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 27482878 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 27482925 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 27483051 A G N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 27483152 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 27483155 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 27483249 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 27483258 T G N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 27483276 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 27483281 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 27483324 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 27483594 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27483756 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27484022 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 27484043 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 27484652 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27484841 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27484934 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 27485031 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 27485440 G C Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 27485580 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27485594 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27485599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27485611 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 27485803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27485817 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27485853 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 27485887 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 27486117 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27486172 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 3 27486227 G T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 27486229 G C N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 27487367 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27487422 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27488107 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 27490959 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27493329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27493444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27493989 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27494096 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27495278 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 27495626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27497447 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27497509 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27498033 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 27499075 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27499809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27500908 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 27501117 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27501254 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 27501296 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 27501315 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 27501822 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27502013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27502804 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 27502813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27504154 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 27504997 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27505385 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27506149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27509428 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27509559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27510555 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27511990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27512753 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 27513395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27513721 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 27513731 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 27513948 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 27513968 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 27514114 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27514140 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 27514141 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27514271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27514301 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 27516366 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27519094 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27519112 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27519256 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 27519736 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 27520240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27520470 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27520855 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 27520941 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 27521061 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 27521545 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 27521680 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 27521696 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 27522365 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 27525207 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27525548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27525567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27525575 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27525579 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 27526056 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27526992 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 27527161 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 27527220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27527226 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 27527274 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 27527284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27527296 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 27527298 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 27527391 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 27527499 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 27527550 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 27527757 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27528102 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27528156 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 27528304 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27528536 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 27528582 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 27528602 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 27528627 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 27528665 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 27528698 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 27528764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27528800 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 27528880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27528945 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27528990 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27529040 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 27529057 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 27529067 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27529076 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 27529090 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27529175 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 27529202 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27529203 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27529225 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 27529339 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 27529437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27529517 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 27529540 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27529567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27529587 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 27529748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27530644 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27531281 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 27531307 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 27531516 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 27531553 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 27531740 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 27531798 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 27531829 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27531932 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 27531996 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 27532180 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 27532233 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 27532645 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 27532702 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 27532722 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 27532758 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 27533185 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 27533240 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 27533404 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 27534048 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 27534320 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 27534963 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 27535058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27536472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27537817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27537845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27539234 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 27539356 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 27539487 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 27539513 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27540098 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27540769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27540790 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27541086 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27541182 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27541348 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27541354 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27541454 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 27541529 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 27541674 T C Y Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 3 27542316 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27542533 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 27543132 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27543760 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27543810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27543917 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27547038 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 27547182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27547513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27547707 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27548051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27548502 A C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 27548737 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 27551163 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27551903 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27553236 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27553761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27554706 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 27555262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27556230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27556238 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 27557409 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 27557470 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27557475 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27557515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27557795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27557932 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27557993 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27558004 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27558086 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27558156 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27558310 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27558425 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27558485 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27558568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27558601 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27558628 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27558659 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27559016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27559486 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 27559730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27560239 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27560657 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27560800 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27561734 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27561964 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 27562104 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27563749 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27563893 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27565152 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 27567078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27568500 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 27568550 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27569183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27570670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27570760 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 27571282 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27571568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27572071 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27572329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27573276 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 27574001 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27574189 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 27574340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27574426 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 27574623 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 27574889 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 27575046 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 27575048 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 27575064 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 27575105 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27575277 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 27575530 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 27575765 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 27575998 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 27576107 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27576133 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 27576459 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 27576571 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 27576833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27577031 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27577396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27577827 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 27577934 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 27578357 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27578977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27579653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27579671 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27580152 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 27580916 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27581027 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 27581138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27581303 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27581411 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27581440 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 27581616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27581792 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 27581957 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 27581984 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 27582169 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27582188 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27582225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27582297 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 27582346 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27582531 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27582539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27582580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27582633 A C Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 27582741 T G Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 27582792 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 27582840 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 27582853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27582994 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27583162 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 27583568 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27583717 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 27584333 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27587409 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27587833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27595373 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27595596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27595709 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27595720 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27595854 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27596182 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 27597274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27597858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27600469 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27602268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27609585 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27609804 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27609825 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27610551 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 27613410 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27614544 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27615224 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27615777 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 27615796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27615852 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27615961 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 27616004 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 27616053 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27616570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27616888 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27617033 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27617765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27617778 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 27617796 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 27617809 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 27617814 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 27617949 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 27618119 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 27618459 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27618670 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 27618825 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 27618836 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27619279 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27619671 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27619784 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 27620407 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27620935 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27621563 T A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 27622570 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27623310 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27623560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27623839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27623918 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27624054 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27624235 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27624332 C T Y Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0 0.733333333333333 0.266666666666667 11 19 0 11 4 3 27624420 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27624459 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27624475 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27624516 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27624540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27624589 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27624805 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27624936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27625174 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 27625523 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 27625524 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 27625556 C G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 27625604 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 27625988 A T Y N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 27627035 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27627366 C A Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 27627441 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 27627609 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27627716 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27627795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27627859 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 27628519 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27628673 C T Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 27629097 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 27629106 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27629257 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 27629546 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 27629699 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 27629706 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27629747 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27629778 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27629795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27629904 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 27630137 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27630580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27630583 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 27630647 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 27630750 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 27630765 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 27630772 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27630906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27631046 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 27631074 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 27631244 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 27631252 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 27631312 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 27631353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27631387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27631390 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 27631408 A C Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 27631429 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 27631726 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27632011 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27632049 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27632211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27632310 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27634215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27634911 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27635676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27636384 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 27636502 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 27636556 C G Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 27636654 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27636884 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 27637063 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 27637133 A T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 27637860 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 27638007 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27638221 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27638671 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27638824 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27639527 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 27639576 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27639633 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27639652 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 27640711 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 27640927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27640968 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 27641008 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 27641023 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 27641133 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 27641276 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 27641455 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27641545 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 27641632 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27641708 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 27641711 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 27641857 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27642200 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 27642358 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 27642378 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 27642439 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 27642746 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27642814 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 27642966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27643053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27643165 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 27643272 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 27643364 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 27644011 T C Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 27644468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27644507 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 27644942 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 27645231 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27646655 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27646739 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 27646753 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 27646764 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 27647274 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 27649109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27650571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27650665 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 27650716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27650726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27650811 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 27650850 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 27650851 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 27651042 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 27651155 C G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 27651161 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 27651203 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27651252 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 27651487 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 27651529 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 27651772 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 27654497 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 27654503 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 27654580 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 27654599 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 27654617 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 27654638 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 27654652 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 27654691 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 27654793 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 27654918 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 27654994 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27655037 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 27655157 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 27655183 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 27655235 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 27655367 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 27655376 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 27655405 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 27655433 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 27656337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27656837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27656870 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 27656977 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27657196 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 27657213 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 27657238 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 27657257 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 27657349 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 27657368 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 27657537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27657605 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 27657699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27657712 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27657729 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 27657835 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 27659329 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 27659370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27659371 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 27659613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27659745 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27659837 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27660030 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 27661143 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 27661259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27661443 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 27661511 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27662185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27662559 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 27662634 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 27662711 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27662789 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 27662883 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27662994 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 27663073 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 27663108 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 27663125 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 27663167 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 27663185 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 27663642 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27663732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27663766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27663889 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27664149 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27664257 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27665456 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 27665946 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27666395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27666459 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 27667791 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27668002 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 27668063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27668071 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 27668583 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 27668732 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 27669118 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 27669238 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 27669749 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27669831 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27669902 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 27670400 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 27670490 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27670532 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27670572 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 27671134 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27671171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27671580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27672303 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 27672358 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 27672411 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 27672526 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 27672540 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 27672736 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 27672750 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27672988 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27673121 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27673230 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 27673258 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 27673349 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27673639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27674235 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 27674270 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 27674302 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 27674734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27674740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27674745 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27674804 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27674863 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 27674907 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27674959 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27674998 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 27675005 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 27675021 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 27675133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27675234 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 27675308 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27675548 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 27675578 T A Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 27675659 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 27675791 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 27675848 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 27676193 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27676211 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 27676322 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27676674 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 27676743 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 27676988 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 27677406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27677568 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27678726 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 27679630 T A N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 27679632 T A N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 3 27681539 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27682228 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27682513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27682655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27682893 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27682918 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 27683093 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 27683210 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 27683309 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 27683402 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27683531 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27684272 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 27684577 A G N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 27685095 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 27685184 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27685349 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 27685446 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27685609 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 27686083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27686127 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27686218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27686386 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27686638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27686787 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 27686897 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27688178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27688210 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27688336 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27689793 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 27689865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27690518 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.3 0.7 0 26 14 6 14 0 3 27691173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27691333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27691964 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27692166 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27692252 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27692302 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27692691 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27692999 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27693005 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27693159 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27693162 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 27693320 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 27693486 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27693487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27693764 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 27693854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27694426 A C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 27694449 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27694564 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 27694566 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 27694576 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 27694608 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 27694723 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27694902 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 27695091 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 27695107 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27695158 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 27695597 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 27695769 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 27695834 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 27695946 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 27695994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27696145 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27696293 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27696326 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27696362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27696365 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27696660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27696662 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27697690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27697766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27698195 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 27698231 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 27698370 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 27698447 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27698465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27698950 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27698975 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27699092 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27699353 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 27700151 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27700346 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 27700482 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27700975 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27701002 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27701207 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 27701213 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27701267 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27701410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27701619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27702284 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27702833 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27703245 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 27703483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27703726 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27703783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27703826 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27704009 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 27704084 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 27704161 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 27704241 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27705386 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27705592 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27705609 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27705690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27705737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27706112 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 27706176 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 27706304 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 27706415 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27706490 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 27711268 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27713090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27713159 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 27713560 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27713715 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27713794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27716854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27720189 A T Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 27720909 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27722090 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27725082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27727084 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 27727301 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27727353 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27727708 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27727972 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27729302 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 27729329 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 27729343 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 27729380 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 27729395 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 27729640 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27729808 A C Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 27730090 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 27730453 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 27730634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27731248 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 27731336 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 27731382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27731513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27731576 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27731718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27733433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27733696 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27733962 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 27734157 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27734206 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 27735509 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27735888 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27736328 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27736798 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27737036 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27737057 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27737062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27737080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27737271 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27737293 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27737447 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27737497 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27738079 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27738087 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27738264 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27738400 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27738513 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27738555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27739079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27739173 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27739279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27739316 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27739527 C G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27739531 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27739723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27739855 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27739858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27740762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27741020 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27741096 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27741247 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27741342 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27741353 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27741362 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27741441 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27741496 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27741556 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27741588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27741709 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27741721 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27741836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27741936 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 27741937 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 27742001 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27742005 G T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27742078 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27742097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27742147 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27742429 A T N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 27742432 G A N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 27742454 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 27742457 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 27742466 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27742760 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27742784 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 27742789 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 27742869 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27742883 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27742889 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27742898 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27742909 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27742949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27742982 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27742989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27743016 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27743036 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27743516 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27744382 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27744514 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27744583 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27744623 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27744633 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27744657 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27744798 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27744821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27744824 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27744835 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27744856 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27744862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27744876 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27745048 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27745056 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27745310 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27745360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27745415 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27745434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27745501 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27745709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27746029 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27746071 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27746135 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27746196 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27746206 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27746350 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27746375 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27746772 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27746925 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27746976 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27747022 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27747092 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27747243 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27747352 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27747599 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27747918 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27748455 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27748472 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27749649 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27750226 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27750245 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 27750519 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 27750627 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27750701 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 27750865 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 27750960 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27751718 A T N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 27752685 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27752713 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27752879 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27753089 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27753444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27753651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27754460 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27754962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27754970 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27755074 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27755434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27755552 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27755832 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 27756202 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27756244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27756301 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27756304 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27756321 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27756374 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27756546 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27756842 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27756868 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27756882 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27756958 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 27756995 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 27757551 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27757562 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27757582 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27757666 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27758003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27758323 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27758459 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27759074 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27759180 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27759344 G T N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 27759355 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27759360 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27759465 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27759491 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27760102 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27762192 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27762198 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27762423 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27762791 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27762848 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27762878 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27763023 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27763683 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27764011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27764165 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27764166 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27764233 A T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 3 27764525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27764618 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27764657 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27765107 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27765129 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27765226 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27765908 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 3 27765909 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 3 27766969 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27767110 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27767320 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27767555 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27767688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27767692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27768078 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 27768087 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27768715 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27768945 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27769015 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27769077 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27769147 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27769304 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27769405 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27769420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27769672 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27769764 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27769806 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27769840 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 27769851 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27769922 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27769938 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27770046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27770107 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27770119 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27770142 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 27770157 A T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 27770298 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27770360 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27770361 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27770392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27770418 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27770454 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27770513 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27770522 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27770690 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27770703 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27770846 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27770861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27770895 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27770903 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27770906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27771004 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27771319 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 27771511 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27771952 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27772061 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27772328 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27772410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27772452 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27772497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27772505 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27772537 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27772556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27772586 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27772588 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27772604 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27772621 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27772749 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27772842 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27772875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27772914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27773007 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27773076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27773126 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27773190 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27773213 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27773216 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27773258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27773293 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27773316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27773471 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27773485 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27773761 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27773870 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27773898 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27774078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27774084 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27774174 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27774276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27774290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27774343 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27775225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27775275 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27775661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27775971 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27776034 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27776260 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 27777002 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27777763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27777792 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27777825 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27777916 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27778251 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27778296 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27778580 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27778748 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27778752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27778820 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27779178 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 27779214 T C N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 3 27779366 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27779617 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27779627 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27780035 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27780076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27780228 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27780239 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27780300 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27780646 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27780735 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27781008 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27781030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27782209 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27783333 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27784285 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27784510 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27785240 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 27785516 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27785906 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 27787162 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27787613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27788223 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27788892 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27788893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27788932 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27788948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27789100 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27789349 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27789357 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27789472 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27789570 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27789581 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27789604 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27789709 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27789800 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27789806 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27789945 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27790009 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27790095 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27790589 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27790706 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27791412 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27791455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27791497 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27791510 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27791619 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27791679 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27791762 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27791869 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 27792290 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27792341 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27792443 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 27792444 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 27792785 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27792797 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27793103 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 27793243 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 27793247 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 27793382 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27793419 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27793420 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27793436 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27793479 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27793644 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27793754 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27794013 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27794121 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27794708 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27794736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27795193 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 27795197 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 27795409 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27795418 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27795490 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27795850 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 27795912 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 27795917 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 27796131 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27796137 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27796172 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27796192 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 27796347 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27796384 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27796442 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27796525 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27796546 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27796565 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 27796686 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27796838 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 27797111 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 27797172 T A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 27797345 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27797561 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27797644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27797717 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27797719 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27797749 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27797767 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27797833 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27797883 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27798257 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27798613 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27799063 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27800033 C A Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 27800349 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 27800921 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 27801030 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 27801123 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27801209 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 27801220 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27802168 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 27802173 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27802253 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27802357 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27802425 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 27802453 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27802538 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 27802567 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 27802613 G C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 27802634 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 27802889 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27802934 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 27803034 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27803481 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 3 27803938 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27804499 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27804903 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27805171 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 27805564 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 27805627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27806648 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 27806781 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 27806787 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27806841 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27807111 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 27807135 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 27807149 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 27808050 G A Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 27808940 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27809836 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 27810135 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27810329 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 27810388 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 27810565 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 27810589 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 27810715 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 27810746 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 27810845 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 27810888 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 27813165 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27814670 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 27815473 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 27815534 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 27815576 C G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 27815643 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 27815709 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27815776 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27816269 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27816366 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27816369 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27816399 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 27816624 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27816647 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27816658 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 27816774 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27816957 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27817442 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27817535 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 27817684 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 27819002 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27819125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27820845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27821626 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 27824234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27824661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27826659 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 27826664 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27827456 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 27827637 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27829907 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27831274 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27834695 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27834976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27835248 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27836164 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 27836390 A C Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 27836607 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 27836734 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27837396 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27838259 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27840208 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27840262 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27840653 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 27842838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27843176 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 27843193 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 27843204 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 27843428 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 27843435 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27843493 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27843528 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27843599 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 27844411 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 27844585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27844685 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 27844856 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 27845143 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 27845145 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 27845184 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 27845259 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 27845291 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 27845294 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 27845412 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 27845528 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 27845547 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 27845589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27845854 A G Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 27845881 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 27845887 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 27845952 A C N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 10 20 0 10 5 3 27845958 T C Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 27846215 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 3 27846217 G T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 27846552 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 27846726 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27846761 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27847418 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27848886 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27849316 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 27849347 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27849482 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27849625 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27849776 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27850026 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 27850105 C A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 27850179 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 27850243 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 27850289 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 27850352 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27850474 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27851462 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 27851532 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27851566 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 27851663 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 27851716 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 27851736 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27851810 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 3 27851904 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 3 27851905 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 27851968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27852083 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 27852225 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 27852230 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 27852449 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27852462 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 27852493 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 27852525 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 27852888 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27852969 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27853369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27853395 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27853484 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27853543 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 27853637 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 27853775 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 27854733 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 27854880 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 27854900 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27854906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27854948 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27855144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27855408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27855814 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27856753 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27856896 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 27856963 A G N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 27857232 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27857280 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27857301 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27857310 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27857827 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27858526 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27859289 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 27860051 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 27860062 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 27860071 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 27860110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27860158 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27860168 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27860204 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27860316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27860359 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27860411 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 27860810 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 27861329 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 27861368 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 27861623 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27861682 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 27861908 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 27861959 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27862090 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27862106 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 27862411 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27862872 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 27863120 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 27864376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27865531 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27865604 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27865654 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 27866123 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27866207 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27866214 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27866280 T G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 27866418 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 27866422 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 27866684 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27866839 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27866866 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27866869 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 27867026 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27867152 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 27867379 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27867418 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27867624 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27867852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27867873 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27867896 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27868176 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 27868536 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27868755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27868759 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27868768 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 27870914 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27871705 A G Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 3 27871826 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 27873329 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 27873346 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27873380 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 27873783 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 27874494 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 27874680 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 27874892 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 27875108 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 27875134 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 27875345 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 27875626 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 27875642 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 27875657 T G Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 27875665 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 27875689 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 27875745 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 27875778 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27875787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27875864 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27876346 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 27876428 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 27876449 C T Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 27876733 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27876759 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27876935 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27876955 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27876978 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27877061 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27877832 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27878094 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27878135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27878157 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27878218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27878424 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 27878469 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 27878557 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27878760 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27878772 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 27878783 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27878803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27878853 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27879423 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27879447 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27879537 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27879565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27879689 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 27879713 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27880164 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 27880461 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 27880482 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 27880487 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 27880504 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 27880510 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 27880560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27880564 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 27880673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27880787 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27880892 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27880923 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27880948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27881011 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27881127 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 27881343 T A Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 27881652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27881737 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27881833 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27882154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27882190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27883899 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27884005 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27884202 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27885408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27885451 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27886536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27886676 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27886829 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27886933 A C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27886968 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 27887030 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27887161 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27887255 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 27887359 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27887679 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27887902 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27888135 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27888449 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27888452 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27888523 G C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 27888696 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27889027 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27889046 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27889068 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27889070 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27889081 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27889139 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27889254 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27889446 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 27889540 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27889909 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27889958 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27890036 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27890037 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27890301 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27890414 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27890492 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27890520 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27890666 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27890834 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27890867 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27890890 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27890911 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27890987 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 27891033 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27891065 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27891121 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27891126 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27891244 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 27891280 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 27891287 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 27891365 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27891480 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27891536 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27891557 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27891707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27891946 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27892048 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27892095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27892176 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27892177 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27892200 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27892219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27892292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27892448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27893130 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27893733 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27893774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27894431 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 27894450 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 27895011 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27895358 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27895366 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27895432 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27895576 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27895942 A G Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 27896042 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27896073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27896092 A C Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 27896795 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 27899974 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27900123 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27900872 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27900909 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27901798 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27901818 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27901848 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27901911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27902365 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27902385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27902443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27902574 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27902815 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27903136 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27903187 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27903306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27903347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27903406 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27903541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27903755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27903774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27904044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27904216 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27904253 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27904552 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27904642 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27904798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27904996 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 27905194 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 27905310 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 27905399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27906061 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 27906084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27906256 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 27906295 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27908078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27908911 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 27908980 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 27909468 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27909485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27909554 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27909836 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27909934 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27909972 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 27910857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27910908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27910975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27911062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27911093 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27911208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27911266 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27911300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27911319 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27911332 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27911432 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27911624 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27912189 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27912326 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27912339 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27914022 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27914998 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27914999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27916097 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27916477 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27917281 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27917305 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27917726 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27917742 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27918491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27918846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27918852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27919002 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27919003 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27919141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27919258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27919301 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27919572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27921370 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27921947 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 27922676 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 27923587 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27923870 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 27926928 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27930766 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 27931359 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27931418 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 27932199 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27932373 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 27932487 T G N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 3 27932555 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 27932560 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 27936072 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 27937133 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 27937161 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27937176 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 3 27937521 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 27938428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27938438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27938448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27938467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27938503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27938528 C T N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 3 27938628 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 27938813 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 27938849 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 27939293 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 27939336 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 27939481 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 27939527 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 27939590 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 27939765 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 27939775 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 27939779 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 27939817 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 27940240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27940248 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27940327 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 27940668 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27941413 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 27941474 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 27943672 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27944085 A C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.1875 0.0625 0.75 7 25 3 1 12 3 27944090 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 27944262 C A N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.357142857142857 0.214285714285714 0.428571428571429 13 15 5 3 6 3 27944345 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 27944888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27945594 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27945675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27945724 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27945825 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27946003 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27946009 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27946181 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27946375 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27946388 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27946476 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 27946546 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 27946630 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 27947734 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 3 27947862 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 27947883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27948649 G A Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 27948661 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 27948799 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27948843 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27948859 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27948925 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27948968 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27949001 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27949387 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 3 27949414 C T Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 27949490 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 27949971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27950049 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 27950188 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 27950771 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27950773 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27950841 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 27950892 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 27951448 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 27951599 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27951632 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 27951652 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27951659 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27951706 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27951711 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27952317 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 27955276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27955552 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27957194 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27957244 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27958104 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 27958124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27958330 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 27958497 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27958748 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27958814 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 27958831 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 27958894 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 27958911 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 27959026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27959034 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27959051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27959088 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27959236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27959703 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 27959869 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27959903 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 27959909 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27959989 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 27960052 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27960105 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 27960221 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 27960265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27960267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27960337 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 27960382 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27960438 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27960481 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27960506 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27960530 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27960723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27960754 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 27960796 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27960815 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27960881 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 27961282 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 27961306 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 27969130 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 27969134 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 27969144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27969194 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 27969210 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 27969383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27969388 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27969405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27969584 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27969594 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27969620 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 27969632 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27969652 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27969733 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27969757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27969763 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27969776 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27969867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27969886 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27970111 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 27970263 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27970338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27970502 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 3 27970533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27970563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27970621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27970676 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 27970737 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27970806 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 27971026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27971077 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27971368 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 27971425 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27971515 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 27971524 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 27971539 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 27971619 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27971677 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 27971779 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 27971836 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 27971861 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 27971916 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 27972253 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27972300 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27972425 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27972896 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 27972966 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 27973022 T C Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 27973332 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27973761 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 27973971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27973973 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 27974091 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 27974192 T C N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.363636363636364 0 0.636363636363636 8 14 4 0 7 3 27974595 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 27974834 C T Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 27974853 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 27974896 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27974909 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27975161 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27975209 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27975580 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 27975663 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27975730 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 27975783 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 27975893 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 27975951 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 27976096 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27976168 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27976251 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 27976328 C G Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 27976380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27976546 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 27976564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27976736 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 27976760 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 27976767 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27976853 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 27976859 G A Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 27976878 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 27977570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27978044 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 27978334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27978673 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27978781 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 27978801 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27978826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27978830 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27978916 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 27978986 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 27979054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27979299 T G N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 3 27980551 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27981658 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27982427 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27982503 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27982682 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 27982710 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.176470588235294 0.0588235294117647 0.764705882352941 7 27 3 1 13 3 27982787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27982814 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 27982976 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 27982988 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 27983070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27983235 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 27983394 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 27983401 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 27983517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27983522 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 27983707 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 27983716 A C Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 27983800 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 27984126 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 27984358 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 27984418 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 27984500 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27984508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27984585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27984892 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 27985175 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 27985197 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 27985217 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 27985261 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 27985317 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27985383 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 27985404 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 27985423 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 3 27985453 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27985473 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 27985482 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 27985500 C T N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 3 27985697 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27985712 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 27985892 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27985910 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27986030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27986457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27986534 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 27986621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27986683 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27986719 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 27986764 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27987191 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 27987209 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 27987232 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 27987239 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27987265 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27987398 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27987536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27987630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27987633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27987645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27987818 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 27987821 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 27987857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27987900 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27987913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27987933 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27987986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27988136 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 27988165 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 27988215 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 27988232 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 27988234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27988248 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 27988261 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 27988279 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27988366 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 27988419 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 27988603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27988651 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27988875 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 27989276 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27989359 A C Y N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0 0.769230769230769 0.230769230769231 10 16 0 10 3 3 27989370 T C Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 27989452 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 27989593 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27989667 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 27989868 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 27989902 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27989937 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 27989983 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27989998 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 27991426 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27992070 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 27992495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27992534 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27992547 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27993802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27996099 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 27996672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27999013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27999923 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 27999963 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28000068 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28000075 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28000680 G C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 28001036 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 28001289 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 28001398 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 28001908 G T Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 28002004 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 28002033 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 28002088 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28002298 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 3 28002385 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 28002405 A T N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 28002456 A C N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 28002476 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 28002489 C T N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 28002524 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 28002595 A C N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 28002664 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 28002765 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 28002837 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 28002842 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 28002997 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 28003093 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28003097 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28003137 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 28003282 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 28003290 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 28003329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28003333 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 28003446 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 28003519 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28003541 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 28003554 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 28003570 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 28003586 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 28003618 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28003634 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 28003682 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 28003700 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 28003812 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 28003912 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 28003947 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 28004040 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 28004128 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 28004212 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 28004738 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 28004761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28004998 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 28005000 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 28005215 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28005321 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 28005583 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 28005885 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28005922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28006309 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 28006883 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28006964 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 28007648 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 28007751 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 28007765 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 28007773 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 28007785 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 28007804 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 28007827 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 28007881 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 28008131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28008303 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28008539 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28008563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28008575 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28008594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28008782 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 28009018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28009124 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28009701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28009750 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28009755 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 28009762 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 28009908 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28009986 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 28010100 T A Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 28010104 T A Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 28010148 T A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 28010465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28012099 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 28012905 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 28014845 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28017585 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28018338 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 28018445 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28019938 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 28022306 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28022774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28023167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28023684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28024849 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 28025231 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28025240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28025264 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28025412 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 28025413 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28025423 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 28025444 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 28025504 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 28025522 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 28025600 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 28026033 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 28026277 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 28026347 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 28026488 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28026556 A G Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 28026810 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 28026846 T A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 28026955 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 28027002 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 28027136 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 28027138 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28027252 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 28027380 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 28027392 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 28027440 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 28027479 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28027511 T A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 28027525 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 28027698 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 28027740 A T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 28027744 G C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 28027759 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 28027789 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 28027795 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 28027800 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 28027807 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 28027894 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 28027989 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 28028074 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 28028403 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28028590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28028624 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 28028666 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 28028695 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 28028746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28028761 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 28028769 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 28028874 A G Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 28028909 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 28028973 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 28029001 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 28029141 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28029208 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28029367 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28029372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28029420 C A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 28029431 A G Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 28029465 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 28029486 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 28029507 G A Y Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 28029518 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 28029524 T C Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 28029544 A G Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 28029629 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 28029657 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 28029769 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28029825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28029910 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 28029931 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 28029957 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 28030040 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28030409 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28030600 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28030710 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 28030763 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28030793 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28030909 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28031185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28031204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28031229 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28031262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28031294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28031584 G C Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 28031708 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28031750 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28031770 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28032045 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28032068 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28032244 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 28032402 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28032414 A C N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 28032456 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28032693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28032785 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28032844 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28032859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28032999 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 28033008 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 28033024 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 28033050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28033060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28033099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28033106 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 28033127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28033140 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 28033179 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 28033193 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 28033357 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28033393 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 28033412 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 28033443 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 28033569 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28033602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28033623 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 28033702 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 28033766 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 28033767 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 28033877 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28033997 T A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 28034051 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 28034056 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 28034146 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 28034306 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 28034391 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28034691 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28034780 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 28035002 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 28035145 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 28035395 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28035485 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28035738 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 28035829 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28035867 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 28035884 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28035903 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28036056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28036058 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 28036345 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 28036424 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 28036449 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 28036477 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28036513 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 28036572 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 28036575 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 28036760 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28036882 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28037222 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28037417 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28037826 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28037830 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28038017 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 28038193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28038342 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28038383 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28038418 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 28038428 T G N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 28039940 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28039977 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28040064 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 28040507 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28040642 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28040662 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 28040986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28041352 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28041366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28041490 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28041498 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28041564 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28041673 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 28041998 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28042023 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28042850 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 28042963 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28043374 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28043376 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28043394 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28043395 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28043547 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28043626 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28043664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28043687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28043773 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28043782 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28043818 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28043837 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28043892 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28043915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28043938 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28043948 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28044068 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28044072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28044112 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28044143 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28044164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28044212 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28044214 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28044332 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28044428 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28044443 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28044550 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28044575 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28044681 T A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28044698 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28044733 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28044778 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28044843 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28044861 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28044870 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28044996 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28045200 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28045379 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28045380 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28045823 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 28045913 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 28046338 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 28046445 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 28046580 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28046724 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28046816 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28047078 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28047150 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28047373 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28047630 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28047773 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28047864 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28047869 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 28047910 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28047919 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28048002 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 28048035 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28048127 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28048195 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28048221 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28048246 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28048271 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28048388 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 28049057 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28049075 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28049088 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28049645 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28049960 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28050207 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28050212 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28050248 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28050383 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28051376 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 28051635 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 28051955 C T Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 28051958 T G Y N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 28054523 A G Y Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 3 28055081 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 28055350 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28055404 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 28055629 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28058051 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28058158 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28058234 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 28058565 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28058739 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28058810 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28058922 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 28058970 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 28059392 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 28059447 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 28059476 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 28059577 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 28059785 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28059965 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28060038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28060069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28060201 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28060322 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28060427 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 28060609 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 28062023 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 28062028 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28062968 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28063525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28064714 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28065899 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28066177 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 28066619 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28067118 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28067361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28068700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28068925 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 28068945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28069003 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28069093 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 28069219 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28069259 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28069309 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28069312 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 28069516 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28069536 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28069564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28069596 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 28069947 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 28070195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28070491 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28070727 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28070814 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28070910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28070968 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28071121 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 28071476 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28072915 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28075000 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28075529 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28076625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28076821 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28077378 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 28077566 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 28077658 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 28077951 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.166666666666667 0.777777777777778 0.0555555555555556 20 16 3 14 1 3 28077952 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.166666666666667 0.777777777777778 0.0555555555555556 20 16 3 14 1 3 28078028 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 28078096 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28078137 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28078147 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28078159 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 28078218 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28078227 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28078420 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28078633 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28078778 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28078933 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28078959 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28078978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28079179 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28079336 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28079350 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28079373 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28079395 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28079497 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28079554 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 28079712 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28079920 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 28080027 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 28080186 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28080288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28080420 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28080441 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 28080457 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28080618 T A Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 28080670 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28081040 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 28081299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28081949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28082081 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28082240 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28082371 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 28082545 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28084220 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28085025 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28085041 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28085529 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28085533 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 28086338 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28087396 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28087605 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28087832 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28088581 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 28089079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28089099 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28090292 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 28090717 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 28093159 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28093860 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 28093927 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28094064 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 28094867 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28095369 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28095578 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 28095685 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28095803 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28095944 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 28100408 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28101086 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28102276 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 28102906 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28103775 T G N N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 5 11 2 1 5 3 28103895 T A N N 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.333333333333333 0.111111111111111 0.555555555555556 7 11 3 1 5 3 28106316 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28106876 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28107709 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 28108144 A T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 28108817 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 28108922 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 28109109 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 28109169 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 28109188 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28109201 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28109431 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28109698 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 28110392 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 28110400 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28110406 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28110674 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 28110706 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 28110847 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28110859 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 28110885 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28111074 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28111359 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28111407 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28111786 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 28112453 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28112720 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28112872 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28112880 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 28112887 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 28112927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28112991 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28113139 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 28113335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28114057 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28114111 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 28114131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28114267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28114602 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 28114846 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 28115765 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28115896 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 28116053 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28116067 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28116534 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28116803 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28117262 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28117663 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 28117826 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28117889 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28118562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28118777 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28118853 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28118858 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 28118933 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28118961 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28119339 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28119753 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28119793 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28119907 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28120009 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 28120010 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 28120048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28120274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28120332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28120565 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 28120754 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28120845 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28121417 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28121563 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 28121603 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 28122320 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 28124750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28125106 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28125610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28127253 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28128109 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28129733 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28129838 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28130385 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28131820 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28131856 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28132579 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 28132742 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 28132807 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 28132854 C A N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 28133166 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 28133582 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28133637 C G Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 28133642 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28133735 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28134122 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28134178 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 28134255 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28134353 A T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28134579 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 28134620 G T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28134666 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28134777 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 28134779 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 28134789 G C Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 28134886 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 28134906 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 28135218 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28135255 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28135317 G C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 28135323 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 28135342 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 28135415 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28135577 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 28135637 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28135710 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 28135942 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28136093 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28136765 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28138752 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 28139711 A C Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 28140332 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28140455 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28142090 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 28142242 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28142632 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 28142672 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 28143408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28145541 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28145588 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28145590 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 28145885 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 28147608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28147710 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28148218 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 28148291 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 28148609 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28148740 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28148755 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28149127 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 28149333 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28150034 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28150107 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28150333 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 28150368 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 28151846 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28152237 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28152277 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28152357 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 28152470 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28152555 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28152602 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28152654 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28152744 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 28153037 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 28153054 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28153056 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28153217 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 28153264 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28153282 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 28153410 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 28153866 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 28153893 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 28153894 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 28153943 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 28153982 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 28154045 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28154046 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28154058 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 28154063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28154087 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28154101 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28154107 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28154121 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28154130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28154170 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 28154197 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28154330 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 28154359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28154508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28154646 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28155619 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28155856 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28155882 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28155932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28156187 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28156203 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28156215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28156376 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 28156596 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 28156848 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28156857 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28156921 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 28156984 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28157030 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28157034 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28157048 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 28157068 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 28157150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28157214 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 28157418 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28157425 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28157633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28157660 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28157915 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28158809 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28158833 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28159099 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28159129 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28159238 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 28159476 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 28159514 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28161982 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28162464 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 28162647 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28163166 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28163300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28163463 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28164053 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 28164278 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28164319 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28164350 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 28164539 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28164681 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28164690 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28164905 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28165151 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28165492 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 28166427 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 28166541 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 28166693 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 28166776 G C Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 28166815 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28166961 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 28167030 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28167263 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 28167483 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28168949 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 28169836 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28169973 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28170256 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28171727 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28171850 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 28173221 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28173699 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28174106 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28174585 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28174643 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28174775 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 28174896 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28175785 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28175897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28176295 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28176393 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28176838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28177100 T A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 28177157 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28177224 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 28177461 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28178009 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28178655 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 28178978 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 28179193 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28179264 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28179810 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28180572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28181359 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28181497 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28181720 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 28183313 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 28183440 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 28183516 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 28183550 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 28183766 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 28183887 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28184196 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28184238 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 28184258 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 28184375 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 28184967 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 28184978 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 28184986 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 28185024 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 28185126 C A N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 3 28185178 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 28185260 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 28185412 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28185529 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28185870 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 28185972 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28185997 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 28186037 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 28187888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28188094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28188489 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 28188527 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28188798 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28189076 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 28189469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28189579 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28189793 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 28189835 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28189887 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 28190014 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28190047 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 28190178 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 28190499 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 28190546 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 28190625 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28190930 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 28190951 T G Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 28191058 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 28191073 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 28191123 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28191225 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 28191398 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 28191404 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 28191443 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 28191455 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28191460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28191479 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28191532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28191585 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28191605 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28191612 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28191632 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28191838 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28191960 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28192195 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 28192268 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 28192378 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 28192397 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 28192535 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 28192566 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 28193205 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 28193237 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28193448 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 28193501 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28197143 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 28201358 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28201677 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 28202152 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 28202588 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28203033 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28203051 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28203478 T C Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 28203495 C A N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 28203534 T C Y Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 3 28204208 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 28204220 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 28204302 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 28204325 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 28204516 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 28204555 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 28204635 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 28204652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28204659 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 28204694 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 28204848 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 28204981 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28205416 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28205932 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28206275 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28206334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28206941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28207760 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28207995 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28208300 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28209042 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 28209111 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 28209187 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28209704 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 28210450 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 28210843 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 28210867 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 28211007 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 28211054 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 28212335 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28212604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28212876 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28213495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28213726 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 28213833 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 28214029 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28214165 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28214468 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 28214526 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 28214653 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 28214699 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28214712 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28214967 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 28216568 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28217199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28217464 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 28217525 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 28217535 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28217670 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28217810 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28218014 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28218091 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28218094 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 28218274 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28218304 G T N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 28218381 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28218562 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 28218573 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 28218763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28218830 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 28219027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28219168 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 28219225 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28219259 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28219354 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 28219529 C A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 28219764 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28220092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28220499 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28221473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28221480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28222489 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 28223216 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 28224640 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28226053 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28226331 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28226445 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28227240 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 28227467 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28228405 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 28229476 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28229571 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28230767 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28230809 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28231412 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28233473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28233493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28233500 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28234436 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 28235388 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28235683 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28235739 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28235820 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28237195 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28237197 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28238786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28241144 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28241438 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 28241795 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28241883 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 28242306 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28243688 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28245732 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28245772 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28246178 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28246308 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28246500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28246712 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28246868 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 28246971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28247031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28247155 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28247160 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 28247192 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 28247196 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28247337 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 28247593 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28247638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28247667 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28247670 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28247710 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28247985 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28248057 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 28248192 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28248571 C T N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0 0.9 0.1 9 11 0 9 1 3 28248717 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 28248926 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 28249598 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 28249697 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 28249761 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28249819 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28249826 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28249837 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28249852 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28249983 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 28251923 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28253385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28254783 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28254850 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28254944 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 28254981 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28254992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28255011 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28255167 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28255264 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28255585 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28255625 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 28255772 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28255778 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 28256003 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 28256280 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28256302 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28256372 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28256439 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 28256674 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28256694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28256755 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 28256756 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 28256778 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28256782 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28256794 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28256806 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28256874 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28256927 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 28256941 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 28256958 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28256962 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 28257191 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 28257212 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28257439 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28257650 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28257671 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28257728 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28257783 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28257786 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28257834 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28257871 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28257999 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28258010 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28258269 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28258713 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28258823 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 28258861 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 28258884 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 28258899 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28258979 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28258996 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28259018 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28259071 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 28259231 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28259277 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 28259306 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 28259369 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 28259378 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28259426 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 28259428 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28259520 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28259543 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28259555 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28259576 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 28259677 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28259704 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28259794 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 28259835 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 28259882 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 28260115 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 28260269 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28260293 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 28260317 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28260512 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28261054 G A Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 28261371 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 28261396 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 28261429 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 28261433 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 28261535 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28261683 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 28261925 G T Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 28262087 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 28262104 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 3 28262112 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 28262195 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28262531 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28262546 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 28262665 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 28263426 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28263763 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 28263844 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 28264343 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 28264388 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 28264513 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 28264596 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 28264801 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 28265021 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28265040 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 28265271 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28265615 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 28265735 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 28265814 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 28265871 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28265879 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 28265894 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 28266004 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28266061 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 28266263 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 28266290 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 28266481 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28266548 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28266612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28266623 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 28266630 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28266902 C G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 28267170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28267369 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 28267380 A C N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 28267601 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28267656 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 28267676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28268084 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 28268148 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 28268164 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 28268268 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28268289 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 28268620 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 28268727 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 28269033 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 28269154 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 28269258 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 28269746 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 28269804 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28269807 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 28269891 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 28270236 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 28270608 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 28270677 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 28270694 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 28270792 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 28271000 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 28271080 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 28271123 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28271250 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 28271258 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 28271293 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 28271310 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 28271396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28271397 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 28271414 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 28271493 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 28271564 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28271819 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 28271837 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 28271861 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 28272059 C G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 28272102 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 28272188 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28272238 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28272239 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28272309 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 28272383 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28272737 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 28272741 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 28272874 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 28273502 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 28273640 A C Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 28273652 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 28273692 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 28273703 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 28273747 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 28273817 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 28274022 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 28274056 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 28274061 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 28274110 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 28274507 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 28274613 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28274635 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28274642 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28274851 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28275002 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28275020 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28275416 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 28275456 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 28275567 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 28275584 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 28275604 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 28275676 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 28275747 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 28275784 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28275818 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 28275932 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28276048 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 28276060 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 28276206 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 28276348 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 28276470 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 28276593 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 28276798 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 28276954 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 28276990 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 28277021 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 28277100 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28277163 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 28277177 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 28277225 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 28277584 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28277698 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 28277710 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 28278358 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28278462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28278493 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 28278494 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 28279720 T C N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 28279745 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 28279776 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28279843 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 28279847 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 28279897 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 28279935 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 28280165 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 28280422 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 28280450 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 28280726 C G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 28280734 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 28281334 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 28281413 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 28281599 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 28281781 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 28281787 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 28281993 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28282041 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 28282061 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 28282141 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28282152 C G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 28282242 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28282243 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28282406 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28282892 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 28282906 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 28282955 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 28282978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28283038 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 28283199 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 28283368 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28283380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28283459 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 28283471 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 28283475 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 28283702 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 28283755 C G Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 28283845 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 28284057 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 28284058 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 28284072 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 28284147 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28284174 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 28284318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28284399 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28284452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28284494 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 28284741 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28284767 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 28284794 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 28284838 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 28284878 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 28284994 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 28285041 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 28285101 C T N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 28285132 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 28285135 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 28285162 T G N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.538461538461538 0.153846153846154 0.307692307692308 16 10 7 2 4 3 28285554 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 28285580 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 28285637 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 28285652 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 28285693 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 28285730 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 28285740 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 28285963 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28286065 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 28286124 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 28286154 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 28286197 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 28286243 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 28286837 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 28287031 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 5 13 2 1 6 3 28287040 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 28287305 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 28287342 T A N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.166666666666667 0.0833333333333333 0.75 5 19 2 1 9 3 28287347 G T N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.166666666666667 0.0833333333333333 0.75 5 19 2 1 9 3 28287384 A C N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.181818181818182 0.0909090909090909 0.727272727272727 5 17 2 1 8 3 28287516 G A N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.181818181818182 0.0909090909090909 0.727272727272727 5 17 2 1 8 3 28287547 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 28287550 T C N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 5 11 2 1 5 3 28287584 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 28287591 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 28287611 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 28287613 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 28287630 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 28287643 C T N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 5 11 2 1 5 3 28288104 T C N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.181818181818182 17 5 8 1 2 3 28288125 C T N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 5 15 2 1 7 3 28288221 C T N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 28288274 A T N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.75 0.0833333333333333 0.166666666666667 19 5 9 1 2 3 28288276 G T N N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.181818181818182 17 5 8 1 2 3 28288531 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 28289092 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 14 10 6 2 4 3 28289812 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28290160 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28290213 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28290403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28290454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28290640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28290643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28290685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28290828 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 28290890 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 28291003 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 28291035 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28291100 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28291156 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28291165 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 28291249 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 28291263 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 28291296 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 28291305 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 28291512 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 28291637 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 28291756 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 28292138 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 28292187 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 28292200 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 28292370 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 28292437 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 28292654 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 28292827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28292840 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28292885 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28292941 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28292985 C T N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 3 28293002 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 28293016 G T N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 3 28293019 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 28293071 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28293096 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 28293163 C A N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 28293256 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 28293291 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 28293304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28293415 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28293440 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 28293448 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28293503 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28293571 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 28293579 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 28293647 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 28293744 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 28293765 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 28293770 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28293797 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 28293833 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 28293855 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28293897 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 28293904 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 28293968 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28294264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28294340 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28294404 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28294416 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28294516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28294764 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 28294776 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 28294814 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28294825 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 28295005 A G Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 28295053 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28295119 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 28295203 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 28295233 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 28295269 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 28295282 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 28295300 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28295321 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 28295441 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 28295610 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28295636 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28295716 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 28295796 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 28295988 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 28296019 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 28296030 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 28296102 T G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 28296387 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 28296410 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 28296561 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 28296660 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 28296728 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 28297138 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 28298303 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28298367 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 28298424 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28298527 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 28298839 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 28298851 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 28298915 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28298951 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 28298964 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 28298971 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 28298977 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28299164 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 28299204 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 28299277 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 28299279 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 28299486 C A Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 28299493 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 28299522 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 28299563 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 28299662 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28299745 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 28299801 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28299869 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28299900 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 28299930 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 28300191 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 28300234 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28300245 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28300346 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 28300435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28300587 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28300707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28300951 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28301015 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 28301039 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28301063 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 28301081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28301097 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 28301105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28301149 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 28301339 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28301342 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 28301385 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28301850 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28302184 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28302410 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28302430 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 28302439 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 28302499 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 28302503 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 28302510 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 28302830 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 28302994 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 28303246 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28304230 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 28305341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28305823 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28306866 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 28307033 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 28307061 C A Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 28307089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28307219 T G N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 3 28307450 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 28308066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28308203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28309591 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 28311111 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 28311172 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28311448 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28311465 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 28311951 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28314607 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28314956 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 28315508 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 28315740 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 28317905 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28318913 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 28318914 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 28319367 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28319796 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28319852 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28321550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28321876 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28322001 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28322383 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28322564 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 28322862 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 28323086 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28323102 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28323163 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 28323194 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 28323645 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28323707 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28323787 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28323920 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28323927 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 28324247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28324255 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 28324365 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28324373 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28324389 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28324495 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 28324600 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28324808 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28325528 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 28325529 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 28325750 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28326697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28326714 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 28326949 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 28327407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28327436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28327437 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28328041 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28328130 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 28328244 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28328383 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 28328450 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28328632 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28328797 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 28328911 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 28329097 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 28329297 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 28329318 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 28329350 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 28329716 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 28329881 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 28329938 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 28330076 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 28330306 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28330332 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 28330374 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28330384 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 28330402 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28330418 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 28330473 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 28330487 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 28330512 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28330554 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28330593 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28330594 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28330637 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28330700 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 28330810 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28331016 A T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 28331381 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 28331565 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28331621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28331815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28331875 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28332176 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 28332400 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28332729 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28332766 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28332774 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 28332947 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28333243 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28333253 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28333316 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 28333374 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28333437 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 28333473 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 28333485 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 28333506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28333582 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 28333654 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 28333731 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 28333781 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28333797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28333840 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 28333893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28333904 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28333954 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 28333995 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 28334261 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28334657 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28334737 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28334740 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 28334749 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 28334772 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 28334909 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 28335004 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28335026 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 28335092 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28335103 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28335213 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28335553 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28335736 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 28335886 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28335932 G T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 28336016 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 28336444 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28336695 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28336741 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28336751 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 28337515 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 28337525 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 28337597 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 28337723 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 28337811 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 28337818 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 28337936 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 28338123 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 28338353 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 28338354 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28338651 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 28338700 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28338714 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 28338733 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28338942 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28338962 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 28338974 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28338994 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 28339037 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28339229 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28339298 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 28339314 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 28339329 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28339449 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 28339888 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 28340111 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28340117 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 28340150 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28340210 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 28340250 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 28340379 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28340677 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28340797 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28340861 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 28341130 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 28341204 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 28342159 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28342160 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 28342187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28342341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28342381 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 28342555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28342606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28342755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28342768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28342778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28342916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28344149 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28344205 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28344425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28344510 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28344547 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28345649 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 28345696 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 28345759 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 28345832 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 28345873 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 28347365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28349311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28349329 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 28351383 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 28352169 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28352397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28352648 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28352909 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28352941 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28352982 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28352996 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28353019 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28353087 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28353440 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 28353534 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28353664 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28353728 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 28354002 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 28354102 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 28354179 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28354328 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28354335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28354452 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28354539 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28354550 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28354551 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28354575 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28354654 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28354834 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28354909 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28354986 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28355020 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28355168 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28355243 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 28355378 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28355406 G A N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 28355430 C T N Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 3 28355660 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28355674 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28355871 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28355957 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 28355961 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 28356138 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 28356202 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 28356396 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 28356416 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 28356456 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 28356525 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28356740 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28356990 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28357110 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28357111 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28357165 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 28357307 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28357785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28357970 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 28358008 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28358027 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 28358100 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28358175 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28358198 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 28358261 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28358314 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28358320 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28358336 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28358351 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28358534 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28358586 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28358647 T A Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 28358690 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28358787 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28358917 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28359047 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 28359169 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28359242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28359342 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 28359563 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28359758 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28359791 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 28359810 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 28360139 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 28360314 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28360364 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 28360389 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28360467 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28360795 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 28360921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28360946 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 28360954 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 28361037 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28361066 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28361076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28361117 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28361125 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28361143 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28361181 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28361216 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28361222 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28361230 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28361255 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28361306 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28361320 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28361374 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28361392 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28361431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28361432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28361647 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 28361677 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 28361782 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 28361787 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 28361807 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28361912 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 28361920 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28362036 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28362076 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28362137 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 28362190 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 28362206 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28362259 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 28362274 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 28362286 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 28362311 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28362490 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28362533 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28362696 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28362724 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28362832 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 28363387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28363426 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28363466 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28363551 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28363666 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 28363866 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28363908 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 28363945 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 28364062 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 28364298 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28364348 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28364349 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28364438 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 28364463 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 28364464 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 28364777 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28366834 A G Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 28367345 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28367789 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 28367812 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 28367887 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 28367941 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 28367950 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 28368041 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 28368072 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 28368472 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 28368558 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 28368594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28368613 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 28368679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28368748 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28369731 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 28369779 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 28370103 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 28370128 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28370210 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 28374014 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28374056 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 28374499 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 28374565 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 28375503 T C N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 3 28375938 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 3 28376330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28376482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28376879 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 28376953 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 28377004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28377063 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 28377087 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 28377109 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 28377400 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 28377539 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 28377566 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 28377921 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 28378311 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 28378321 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28378323 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28378384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28378506 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28378530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28378680 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 28378733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28378791 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28379165 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28379404 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28379432 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28379440 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 28379789 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 28379837 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 28379900 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28379906 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28379912 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28379924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28379927 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28379940 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28380016 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 28380033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28380083 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 28380105 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28380246 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28380262 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 28380805 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 3 28381137 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 28381444 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28384587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28384643 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 28384966 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 28385639 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 28385779 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 28385805 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 28385833 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 28385848 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 28385866 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 28385874 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 28385888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28386061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28386062 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 28386182 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28386232 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 28386888 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 28386898 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 28387476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28387751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28388054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28388359 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 28388367 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28388519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28388813 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 28389073 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28389107 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 28389220 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 28389236 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 28389620 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 28390024 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28390321 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28390817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28390861 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28392774 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28393110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28396172 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28396585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28396629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28397361 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 28397403 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 28398144 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 28399109 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 28399162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28399944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28402230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28402718 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28402852 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 28402901 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28403279 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28403480 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28403795 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 28403877 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 28407600 G A Y Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 3 28408178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28408226 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28408343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28408596 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28409316 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 28409356 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28409457 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28409489 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28409509 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28409536 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28409565 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28409679 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28409847 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 28410202 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28411562 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28411734 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 28411942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28411959 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 28412016 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28412404 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 28412572 T G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 28412620 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 28412721 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 28421006 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 28421168 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 28421210 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 28421672 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28421826 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28421856 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28422009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28422225 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28422697 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28422805 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28422873 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 28423796 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28424031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28425002 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 28425093 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 28425106 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 28425199 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 28425253 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 28425255 G C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 28425308 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 28425317 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 28425365 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 28425424 A C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 28425533 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28425559 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 28425567 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 28425729 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 28425922 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28425958 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28426031 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28426723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28426779 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28426798 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 28427126 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28427219 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28427543 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28427896 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28427904 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28428664 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28428995 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28429918 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28430141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28430216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28432092 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28432113 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28432134 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28432250 G A Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 3 28432388 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 28432403 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28432454 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28432589 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 28432636 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28432695 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28432770 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28432872 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28432880 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28432922 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28433038 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28433051 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28434725 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 28434936 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 28434965 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28434966 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28435017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28435040 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28435079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28435080 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28435091 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 28435182 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28435221 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28435241 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28435314 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28435348 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28435378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28435486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28435565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28435602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28435683 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 28435721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28435771 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 28435812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28435911 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28435949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28436051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28436120 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28436129 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28436228 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28436571 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28436583 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28436602 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28436605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28436633 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28436662 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28436760 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28436775 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28436918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28437883 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28438305 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28438515 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28438546 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28438749 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28438920 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28439020 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28439053 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28439088 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28439130 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28439215 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28439437 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 28439466 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28439550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28439560 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28439705 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28439777 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28439820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28439854 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 28440065 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 28440220 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28440375 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 28440381 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 28440718 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28440719 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28441055 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 28441477 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 28441519 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28441554 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28441705 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28441706 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28441785 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28441843 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 28441994 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 28442020 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 28442062 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28442185 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 28442635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28442711 A C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 28442898 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 28442932 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 28442949 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 28443020 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 28443035 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 28443042 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 28443052 T A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 28443093 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 28443127 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 28443129 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28443144 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28443157 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 28443263 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 28443328 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 28443333 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 28443348 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28443685 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28444033 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28444352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28444790 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28445056 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 28446942 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28447200 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 28447773 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28453218 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28454027 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28454203 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 28454318 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28454547 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 28454575 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28454599 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 28454608 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 28454701 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 28455067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28455182 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 28455898 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28456001 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28456058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28456060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28456646 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 28456771 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 28456813 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 28457143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28457823 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28457971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28458247 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 28458296 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 28458307 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28458693 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 28458715 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28458718 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28458804 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 28458854 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28459064 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28459065 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 28459260 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 28459344 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 28459345 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 28459393 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 28459493 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28459502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28459618 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 28459662 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28459756 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 28459873 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28460053 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28460246 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28460275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28460290 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28460295 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28460351 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28460364 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28460504 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 28460587 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28460882 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28460903 T G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 28461015 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28461022 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28461043 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28461374 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 28461433 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28461557 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 28461592 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 28461975 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 28462059 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 28462310 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28462397 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 28462402 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 28462821 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28462914 T A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 28463183 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28463283 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28463472 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 28463633 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 28463668 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 28464005 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 28464456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28464502 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28464554 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 28464698 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 28464706 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 28464788 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28464989 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 28465120 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 28465141 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 28465172 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 28465201 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 28465214 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 28466971 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28466985 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 28467081 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28467095 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 28467598 A G Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 28467990 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28468713 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28468747 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 28468755 G T Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 28468829 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28469054 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 28469071 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 28469105 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 28469672 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 28469731 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 28469770 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 28469867 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 28470155 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 28470217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28470361 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 28470484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28470923 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 28470935 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 28470961 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 28470975 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 28471012 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 28471115 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 28471243 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 28471338 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 28471845 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 28471883 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 28472071 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28472148 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28472158 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 28472175 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 28472317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28472405 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 28472441 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 28472541 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 28472553 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 28472652 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 28472682 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 28472699 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 28472749 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 28472881 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28473272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28473276 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 28473294 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 28473312 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 28473390 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 28473509 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 28473521 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 28473567 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 28473573 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 28473593 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 28473614 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 28473722 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 28473723 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 28473795 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28473834 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 28473842 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 28473928 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 28473931 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 28473956 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 28473976 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 28474069 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28474079 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 28474235 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 28474273 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 28474420 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 28474448 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 28474465 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28474577 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 28474682 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 28474697 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 28474883 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 28474915 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 28474980 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 28475235 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 28475321 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 28475341 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 28476152 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 28476477 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 28476600 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 28477422 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 28477945 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28478021 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28478471 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28478473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28478522 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 28478608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28478949 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 28479084 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 28479567 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 28479744 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 28479838 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 28479843 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 28479905 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 28479939 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 28479963 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 28479964 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 28479978 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28480015 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 28480163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28480267 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 28480287 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 28480345 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 28480508 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 28480711 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 28480712 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 28480734 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28480796 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28480831 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 28480873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28480922 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 28481024 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 28481025 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 28481210 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 28481229 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 28481333 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28481572 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28481831 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 28481837 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 28482147 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 28482478 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28482536 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 28482715 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28482760 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28482798 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28482842 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28483167 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28483251 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28483264 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 28483428 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28483840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28484388 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 28484848 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 28485200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28485327 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28485547 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 28485647 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 28485654 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 28485997 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28486276 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28486523 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28486721 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28486729 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28486893 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28486937 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 28486955 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 28487099 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28487200 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28487209 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 28487213 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 28487269 A G Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 28487432 C G Y N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 28487509 G A Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 28487658 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 3 28487922 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 28487990 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28488075 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 28488176 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28488185 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28488218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28488385 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28488429 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 28488448 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 28488454 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 28488636 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28488715 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28488753 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28488758 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28488818 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 28489132 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28490092 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28490342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28490525 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28490993 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28492078 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 28492169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28494143 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28494458 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28494474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28496923 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28498458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28499681 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28505288 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28505727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28506240 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28506570 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28509235 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28511806 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28514275 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 28514818 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 28517013 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28517659 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 28517663 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 28517798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28517810 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 28517819 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28517829 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28517837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28517911 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 28518327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28518358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28518465 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28518691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28519162 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28519651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28519747 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28519770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28519771 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 28519813 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28519911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28520473 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28521170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28521208 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28523158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28524713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28525270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28525357 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 28525459 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28525685 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28525690 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28527196 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 28527894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28528054 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28528920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28530353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28531617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28533657 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28537677 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 28537738 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28539944 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 28540834 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28542846 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28543886 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28544069 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 28544078 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 28544099 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 28544327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28545369 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 28545396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28545569 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 28545644 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 28545689 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 28545706 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 28545807 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 28545835 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28545889 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 28545892 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 28545974 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28546093 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 28546116 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28546167 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28546204 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 28546445 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 28546551 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 28546675 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28546812 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 28546974 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 28546975 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 28546994 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 28547121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28547345 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 28547615 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 28547881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28547911 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 28548363 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 28548369 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28548395 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28548654 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 28548729 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 28548874 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 28548907 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 28548912 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 28549013 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 28552259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28552937 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28552992 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 28555382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28555915 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 28556038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28556765 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28558409 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28561214 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 28561688 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28562236 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28562275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28562873 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 28563015 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 28563205 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 28563237 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 28563425 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 28563951 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 28564094 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 28566400 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28566444 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 28567519 C T Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 28567568 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 28567712 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28569704 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28569713 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 28569901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28570326 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 28570523 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 28570646 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 28570857 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 28571113 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 28573471 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28573510 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 28573835 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28574898 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 28575401 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28576018 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28576071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28576220 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 28576989 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 28577791 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28578310 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 28578357 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28578672 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 28578710 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 28579494 A C Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 28579602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28579725 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 28579754 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 28579800 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 28580924 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 28582544 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 28583139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28584553 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 28585999 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28586834 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28586854 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 28586944 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 28587060 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 28587090 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28587190 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 28587202 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 28587209 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28587232 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 28587806 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28588362 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28588577 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 28588670 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28588729 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28588795 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28588989 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28589566 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28589607 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28589631 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28589658 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28589766 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28589809 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 28589945 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 28590213 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 28590215 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28590365 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28590883 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 28590924 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 28591157 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 28591247 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 28591328 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28591499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28591622 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28591636 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 28591649 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 28591671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28591722 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28591847 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28591879 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 28591900 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28592256 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28592289 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28592365 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 28592456 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28592506 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 3 28592596 G A N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 3 28592817 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 28592998 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28593158 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28593203 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 28593726 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 28593923 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 28593980 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 28593984 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 28594030 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 28597964 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 28599047 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 28599973 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 28600139 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 28600441 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 28600490 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 28600561 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 28600571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28600648 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 28600655 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 28600670 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 28600728 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 28600850 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28600898 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 28600918 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 28601042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28601107 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28601357 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28602582 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 28602726 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28604195 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 28604292 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28605526 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28606478 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 28606644 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 28606681 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 28606695 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 28606752 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 28606820 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 28607146 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28607158 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28607170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28609345 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 28609479 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 28609538 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28609548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28609583 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 28609683 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 28609689 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28609921 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 28610012 G T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 28610324 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28610341 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28610416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28610606 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28610678 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28610681 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28610703 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 28610859 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 28611668 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28611823 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28611902 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 28612504 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 28613082 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 28613387 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 28613561 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 28613576 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 28613595 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28613717 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 28613769 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 28614192 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28614391 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 28614408 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 28614512 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28614753 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 28615509 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 28615800 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28615829 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 28615856 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 28616671 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 28616714 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28616984 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 28620006 T G N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 28620172 T G N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 28620204 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 28620319 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28621026 G C Y N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 28621088 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 28621163 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28621263 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28621279 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 28621341 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 28621458 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 28621761 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 28621791 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28621973 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28622008 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 28622017 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 28622292 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 28622451 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 28622683 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28622756 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 28622778 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28622798 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 28623278 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 28623286 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28623299 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 28623320 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28623324 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 28623391 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 28623446 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28623599 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 28623601 G C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 28623660 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28623783 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28623826 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 28623910 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28624015 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 28624039 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28624126 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28624215 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 28624316 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28624513 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28624552 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 28624555 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28624586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28624770 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 28624813 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 28625322 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28625330 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 28625688 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28625744 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28626206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28626209 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 28626877 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28628224 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28628377 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28629113 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 28629412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28629485 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28629542 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 28629574 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 28630147 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 28630384 C A Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 28630617 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 28631726 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 28632746 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 28632764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28632974 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28633016 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 28633047 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28633169 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 28633367 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 28634192 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28634229 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 28634387 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 28634404 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 28634542 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 28634654 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 28634699 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28634724 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28634853 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28634884 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 28634890 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28635102 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28635128 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28635231 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28635239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28635372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28635575 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 28635607 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 28635860 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28635870 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28635872 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28636205 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 28638924 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28638961 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 28638978 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 28639190 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 28639391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28639393 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28639543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28639703 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28639778 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 28640509 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 28640864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28641072 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28641096 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 28641679 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 28642188 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 28642910 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 28643194 A T N N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 3 28643456 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28643596 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28643749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28643817 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28643921 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28643970 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28643987 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 28644015 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28644112 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 28644151 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28644267 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28644352 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28644434 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28644657 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28645022 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28645328 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28645816 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28646716 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 28647333 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 28649397 C T N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 28649587 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 28651797 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28652571 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 28654375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28655788 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 28655833 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 28656308 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 28656431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28657438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28660089 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28660252 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28660350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28669212 A G Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 28673117 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28675947 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28680916 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 28682630 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28683596 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28683780 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28685339 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 28685818 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28685858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28685896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28685935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28686044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28686079 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 28686484 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28686539 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 28686631 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28687219 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28687332 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28687443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28687555 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 28687581 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28687592 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28687793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28687827 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 28687848 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28687872 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28688023 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 28688285 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 28688401 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28688551 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 28688694 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 28688787 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28688881 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 3 28688904 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 28689177 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28689481 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28689613 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28689738 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 28689741 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 28690081 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28690082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28690398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28690424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28690437 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28690788 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28690996 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28691003 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28691330 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28691430 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 28691846 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 28692843 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 28693058 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28693098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28693216 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 28693277 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 28693289 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 28693616 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 28694065 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 28694564 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 28694579 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 28694584 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 28694608 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 28694644 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 28694877 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28694888 T A Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 28695107 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28695701 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28696475 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 28696672 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 28696742 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28697134 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28697516 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 28697678 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28697769 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 28697969 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 28698081 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28698308 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 28698449 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28698455 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 28698473 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 28698860 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28698902 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 28698924 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 28699013 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 28699271 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 28699321 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 28699487 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 28699513 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28699659 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 28699665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28699677 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 28699735 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28699799 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28699813 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28699836 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28699874 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 28699966 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28700101 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28700175 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 28700286 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 28700504 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 28700516 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28700575 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 28700577 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28701036 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 28701614 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 28702135 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28702383 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 28702486 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 28702566 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 3 28702848 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 28703296 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28703605 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28703996 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 28704180 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 28704686 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 28704696 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28704715 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 28704728 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28704825 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28705070 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 28705111 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 28705282 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28705346 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28705934 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28706029 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28706606 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 28707176 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28707518 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28707521 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28707857 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28708006 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28708066 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 28708385 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28708453 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28708570 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28708777 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 28708785 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28708887 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 28708925 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28708983 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 28709034 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 28709057 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28709077 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 28709259 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28709338 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 28709368 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28709577 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28709680 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28709698 A T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 28709746 C G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 28709759 C A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 28709869 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 28709889 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 28709977 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 28710014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28710088 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 28710110 A C Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 28710146 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 28710266 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28710399 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 28710419 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.210526315789474 0.736842105263158 0.0526315789473684 22 16 4 14 1 3 28710422 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 28710595 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 28710704 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 28710792 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 28711079 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 28711138 T C Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 28711593 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28711901 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 28711938 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28712022 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 28712068 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 28712508 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 28712757 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 28712824 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 28713120 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 28713162 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 28713211 G T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 28713225 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 28713360 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 28713415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28713435 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28713469 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28713700 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 28713703 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28713834 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28713867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28713896 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28714055 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 28714077 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28714164 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 28714254 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 28714347 T A Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 28714470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28714775 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 28715630 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 28716168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28716172 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 28716233 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 28716469 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28716477 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28716533 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 28716583 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 28716987 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 28716997 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 28717033 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 28717111 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 28717353 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 28717386 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 28717495 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 28717514 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28717515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28717554 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28717612 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28717623 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28717708 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 28717726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28717809 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 28718227 C T Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 28718293 A G Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 28718429 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 28718454 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 28718472 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 28718505 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28718574 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28718579 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28718602 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28718684 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28718798 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28718882 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28718886 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 28718931 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 28718955 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 28718957 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 28719004 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 28719142 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28719544 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 28719577 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 28720238 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 28720512 A C N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 28720533 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 28721359 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 28721365 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 28721425 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 28721517 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28722851 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 28722872 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 28723113 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 28724009 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28724045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28724088 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28724149 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28724344 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 28724362 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 28724363 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 28724385 A T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 28724394 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 28724418 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 28724507 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 28724686 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 28724746 C G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 28724826 A T Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 28724832 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 28724857 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 28725058 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 28725473 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 28725953 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 28726066 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 28726095 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28726394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28726910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28727015 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 28727024 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28727202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28727287 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 28727533 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 28727802 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28727911 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 28727987 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 28727997 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 28729006 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 28729677 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 28729915 C A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 28729959 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 28731632 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 28732495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28732644 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28734203 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 28734835 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 28735568 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28736175 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28737394 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 28737475 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 28737591 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 3 28737764 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 28738131 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28738373 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28738502 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 28738823 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28738893 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28739077 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28739107 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28739117 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28739327 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 28739394 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 28739403 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 28739418 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 28739483 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 28739503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28739541 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 28739551 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 28739578 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 28739582 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 28739592 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 28739629 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28739702 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 28739704 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 28739773 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28739823 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 28739843 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 28739845 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 28739859 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 28740063 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 28740091 T A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 28740534 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 28740702 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 28740722 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 28740756 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 28740826 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 28740914 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 28740973 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 28741033 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 28741055 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 28741123 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 28741204 C A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 28741281 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 28741302 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 28741339 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 28741681 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 28741729 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 28742418 G T N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 28742424 T G N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 28742440 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 28742447 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 28742499 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 28742519 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28742524 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 28742543 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 28742589 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28742670 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28742797 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 28742889 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28742903 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 28743067 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 28743097 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 28743126 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 28743274 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 28743289 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 28743356 A T N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 28743357 A C N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 28743409 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 28743421 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 28743507 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 28743558 G T N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 28743572 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 28743720 A C N N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 3 28743843 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28743861 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 28743902 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 28744023 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 28744146 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28744176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28744236 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 28744237 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 28744320 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 28744344 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28744470 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28744485 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28744488 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28744542 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28744549 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 28744572 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28744617 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28744630 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 28744636 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28744649 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 28744679 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28744753 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28744762 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28744816 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28744879 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28744910 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28744911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28744966 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28744969 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 28745002 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28745086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28745125 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28745196 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28745243 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 28745289 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 28745317 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 28745330 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 28745381 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28745767 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28745801 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 28745954 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 28745980 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 28745988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28746133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28746446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28748358 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28748392 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28748401 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28748541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28748766 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28748811 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28749891 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28750680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28750969 A C Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 28750986 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 10 14 0 10 2 3 28751026 G A Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 28751078 C A Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 28751599 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28751968 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 28752333 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28752718 A C Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 28752737 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 28752771 A C Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 28753320 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28753484 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 28753618 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28753629 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 28753955 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28754775 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 28754819 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 28754846 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28755210 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28755449 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 28755693 G T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 28755896 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 28756309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28756377 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28756562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28756785 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 28757089 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 28757831 C T Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 3 28758006 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 28758194 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 28758227 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.0526315789473684 0.842105263157895 0.105263157894737 18 20 1 16 2 3 28758279 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.15 0.75 0.1 21 19 3 15 2 3 28758865 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 28758890 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 3 28759080 A C Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 28759106 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28759223 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 28759828 G C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 28760049 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28760148 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 28760489 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28760502 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28760548 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 3 28760999 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0 0.894736842105263 0.105263157894737 17 21 0 17 2 3 28761061 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.0555555555555556 0.777777777777778 0.166666666666667 16 20 1 14 3 3 28761237 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 28761292 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28761340 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 28761696 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 28761864 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 28762000 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 28762410 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 28762494 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 28762585 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 3 28762652 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 14 10 4 6 2 3 28763336 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28763742 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 28763822 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 28763868 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 3 28765281 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28772267 C A Y N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.230769230769231 0.615384615384615 0.153846153846154 14 12 3 8 2 3 28772282 G A Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 28772405 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 28772427 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 28772431 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 28772446 A G Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 3 28772453 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28773910 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28774303 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 28774402 A G Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 28774444 C G Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 28775182 T A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 28775301 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 28775620 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 28776372 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 28777332 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 28777509 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28777883 T G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 28777893 G T Y N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 3 28778817 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 28778849 T G Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 28778984 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28779141 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28780321 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 28780374 T C Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 28780375 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 28780490 A G Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 28780698 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 28780709 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 28781494 T C Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 28781678 T C Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 28781861 A G Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 3 28781893 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28781894 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 28782276 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 3 28782424 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 28784866 G A Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 28785039 G A Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 28786326 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 28786446 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28787161 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 28787224 T C N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 3 28789233 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 28789377 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 28789801 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 28790052 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.05 0.8 0.15 18 22 1 16 3 3 28790092 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 28790095 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 28790160 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28790480 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 3 28790481 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 3 28790506 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 28790529 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 28790542 C A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 3 28790570 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 28790616 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28790819 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28791364 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 28791490 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 28791608 T A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 3 28791635 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 28791724 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28791753 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 28792047 T G Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 3 28792455 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 28792973 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28793106 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 28793221 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 28793500 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28793603 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 28794073 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.1875 0.6875 0.125 17 15 3 11 2 3 28794103 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 28794263 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28794407 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28794654 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 28794807 T C Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.117647058823529 0.705882352941177 0.176470588235294 16 18 2 12 3 3 28794812 A T Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 28795142 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 28795230 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 28795509 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28795533 G C Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 28795543 G T Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 28795676 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 28795947 T C Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 28795964 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 28795973 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28797319 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 28797331 G T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0 0.647058823529412 0.352941176470588 11 23 0 11 6 3 28797350 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 10 20 0 10 5 3 28797389 T C Y Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0 0.928571428571429 0.0714285714285714 13 15 0 13 1 3 28797447 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 28798471 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28799243 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28799391 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 28799427 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28799470 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28799497 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 28799565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28799648 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 28800336 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 28800483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28800773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28800885 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 28800930 C A Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.105263157894737 0.736842105263158 0.157894736842105 18 20 2 14 3 3 28801119 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28803357 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 28805054 T C N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 3 28805864 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28807246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28809003 T G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 28809092 A C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 28809337 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 10 8 4 2 3 3 28810499 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 28811168 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 28812075 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28812274 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28812795 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 28812961 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28812975 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 28813428 T A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 28815197 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 28817297 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0 0.684210526315789 0.315789473684211 13 25 0 13 6 3 28817542 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 28817572 T C Y Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 3 28817615 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 28817874 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 28818422 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28818625 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 28820733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28821844 A C N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 3 28824746 C T Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 28825715 T C Y Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 12 12 2 8 2 3 28825833 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 28825849 C A Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 28825911 G A Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 28826095 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 28826916 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 28827174 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 28827274 C A Y N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 3 28827275 A G N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 3 28827814 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 28828698 G T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 28829864 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 28830912 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28830952 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28831008 A G Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 28831957 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 28832006 G A Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 28832220 A G Y Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 28834161 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28834996 G A Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.117647058823529 0.705882352941177 0.176470588235294 16 18 2 12 3 3 28837575 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 28839122 A T Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 28840592 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 28842891 C T Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 28843089 A T N N 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 28848309 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 28849565 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28852118 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28853274 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 28854265 T A Y N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 28854433 C T N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 28854486 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 28856947 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28857320 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28858773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28859501 C T N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0 0.583333333333333 0.416666666666667 7 17 0 7 5 3 28860729 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 28862360 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28863375 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 28865909 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 28866070 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28866226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28867440 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 28867491 A T N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 28867529 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 28867852 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 28867920 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28867923 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 28867966 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 28867967 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 28868009 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 28868039 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28868065 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 28868367 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 28868414 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 28868556 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 28869076 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 28869141 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 28869145 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 28869167 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 28869335 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 28869598 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 28869615 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 28869801 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 28869856 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 28869863 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 28869870 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 28870059 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 28870080 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 28870090 C G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 28870127 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 28870138 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 28870249 T C Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 28870295 A C N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 28870348 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 28870390 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 28870566 G T Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 28870599 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 28870610 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 28870621 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28870630 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 28870690 G A Y Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.5 0 0.5 4 4 2 0 2 3 28870796 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 28870899 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28870907 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 28870917 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 28870958 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 28871049 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 28871058 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 28871131 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 28871177 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28871186 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 28871194 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 28871214 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 28871235 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 28871236 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 28871326 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 28871333 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 28871445 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 28871454 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 28871770 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 28871827 A T N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 28871831 C G N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 28872245 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 28872298 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 28872308 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 28872334 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 28872381 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 28872487 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 28872553 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 28872587 G T Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 28872744 T C Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 28872883 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 28872967 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 28873063 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28873074 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 28873251 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 28873331 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28873366 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 28873470 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28873496 C G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28873516 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 28873525 G C Y N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 28873545 A G Y Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 28873568 C G Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 28873598 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 28873640 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28873647 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28873772 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 28873897 A C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 28873944 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 28873986 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 28874041 C A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 28874229 T C Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 28874316 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 28874407 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 28874408 C A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 28874447 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 28874689 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28874704 C G N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 28874714 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 28874779 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 28874933 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28874993 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 28875020 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 28875087 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 28875101 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 28875119 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 28875155 T G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 28875175 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 28875278 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 28875513 T A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 28875515 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 28875697 C T N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 3 28875726 A C N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 28875754 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 28875801 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 28875836 T G N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 28875890 T A N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 28875911 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 28875928 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 28875957 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 28876082 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 28876131 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 28876188 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 28876253 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28876340 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28876518 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28876563 G T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 28876603 T A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 28876654 A T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 28876693 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 28876704 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 28876831 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 28876852 T G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 28876914 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 28877054 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 28877286 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 28877579 C A N N 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 3 28877619 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 28877666 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 28877680 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 28877758 G T N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 28877909 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 28878106 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 28878123 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 28878235 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 28878240 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 28878482 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 28878528 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 28878570 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 28878586 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 28883461 G A N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 28883563 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 28883580 T A N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 28883581 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 28883613 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 28883616 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 28883630 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 28883652 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 28883676 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 28883753 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 28883862 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 28883891 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 28884622 C T N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 28884695 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 28884706 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 28884847 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 28885078 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 28885087 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 28885399 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 28885443 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 28885493 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 28885495 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 28885521 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 28885533 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 28885571 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 28885612 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 28885654 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 28885773 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 28885787 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 28885841 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 28885916 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 28886284 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28886307 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 28886330 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 28886359 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 28886449 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 28886569 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 28886600 C T N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 3 28886743 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 28886895 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 28887067 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 28887116 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 28887273 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 28887285 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 28887330 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28887388 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28887504 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 28887646 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 28887708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28887710 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28887776 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28887800 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28887872 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28887889 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 28888005 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28888025 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28888139 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 28888163 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 28888173 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 28888205 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 28888220 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 28888224 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28888253 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 28888266 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28888288 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28888294 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28888461 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 28888539 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 28888597 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 28888874 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 28888888 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 28888918 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28888965 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 28889079 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 28889141 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28889157 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 28889273 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28889287 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 28889316 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28889343 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 28889492 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28889504 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 28889624 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 28896435 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28896542 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28896663 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 28896674 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 28896704 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 28896766 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28896786 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 28896801 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28896837 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28896915 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28897006 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28897058 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 28897083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28897232 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 28897239 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28897257 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 28897304 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 28897305 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 28897345 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 28897450 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 28897583 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 28897765 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 28897807 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 28898013 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28898014 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28898080 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28898137 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28898177 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28898196 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 28898418 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 28898496 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 28898531 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 28898679 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 28898710 C A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 28898976 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 28899018 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28899020 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 28899219 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 28899235 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 28899595 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 28899797 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 28900435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28900609 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 28901087 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28901241 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 28901260 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28901386 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 28901402 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 28901445 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 28901584 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 28901720 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 28901787 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 28902002 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 28902038 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 28902065 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 28902218 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 28902322 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28902346 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 28902381 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 28902428 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 28902432 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 28902450 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 28902466 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 28902491 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 28902515 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 28902588 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 28902652 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 28902722 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 28902824 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 28902874 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 28902925 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28903247 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 28903320 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 28903337 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 28903375 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 28903402 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28903426 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28903561 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28903684 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28903720 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 28903832 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 28903948 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 28904035 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 28904062 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28904103 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28904157 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 28904192 C T N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 0.153846153846154 0.153846153846154 20 6 9 2 2 3 28904294 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 28904434 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 28904506 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 28904622 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 3 28904623 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 3 28904771 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.176470588235294 27 7 13 1 3 3 28904777 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.176470588235294 27 7 13 1 3 3 28904965 C T N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 28905098 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 28905351 G T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 28905430 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 28905535 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 28905788 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 28905811 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28905844 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 28905876 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 28905890 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28905958 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 28906018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28906219 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 28906266 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28906302 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 28906534 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 28906557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28906787 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28913347 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 28913367 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28913370 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28913404 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28913420 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 28913516 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 28913517 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 28913547 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 28913599 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 28913673 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 28913685 T G N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 28913701 G A Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 28913708 T C Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 28913715 A G Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 28913724 T A Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 3 28913749 A G N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 3 28913754 A C Y N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.25 0.75 0 15 9 3 9 0 3 28913854 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 28913882 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 3 28913884 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 28913924 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 28913932 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 28914004 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28914095 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 28914128 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 28914183 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 28914194 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 28914252 G A Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 28914266 G T Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 3 28914267 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 28914284 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28914320 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 28914615 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 28914638 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 28914695 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 28914729 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 28914804 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 28914814 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 28914819 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 28914979 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 28915004 A C N N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 3 28915008 A G N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 3 28915085 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 28915100 G C N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 3 28915191 C G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 28915228 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 28915251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28915264 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28915315 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 28915332 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 28915447 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 28915523 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28915629 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28915659 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 28915715 A T Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 28915786 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 28916014 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 28916154 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 28916222 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28916231 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 28916238 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 28916294 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 28916334 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 28916458 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 28916483 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 28916559 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 28916905 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 28917013 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 28917032 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 28917071 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 28917075 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 28917138 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 28917149 G A Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 28917177 A C Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 28917179 A G Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 28917190 G T Y N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 28917251 C G Y N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 28917288 G A Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 3 28917321 C T Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.133333333333333 26 4 13 0 2 3 28917336 T G Y N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 28917337 T G Y N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 28917374 G A Y Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 28917398 T C Y Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 28917437 A C Y N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 3 28917512 A G Y Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 3 28917544 C T Y Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 5 5 2 1 2 3 28918001 A T N N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 28918179 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 28918235 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 28918319 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 28918345 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 28918357 A T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 28918365 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 28918383 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 28918390 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 3 28918399 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 28918519 T C Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 28918528 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28918540 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 28918605 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 28918635 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 28919064 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 28919195 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 28919230 G A Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 28919241 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 28919362 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28919608 C T Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 28919612 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 28919626 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 28919818 T C Y Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 3 28919852 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 28919874 A T Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 28919888 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 28920173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28920260 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28920321 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 28920352 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 28920393 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 28920569 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 28920599 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 28920614 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 28920656 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 28920841 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 28920953 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 28921029 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 28921064 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 28921117 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 28921143 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 28921300 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 28921349 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 28921398 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 28921442 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 28921804 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 28921892 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 28921952 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 28922072 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 28922303 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28922375 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 28922399 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 28922457 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 28922472 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 28922524 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28922552 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 28922638 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 28923122 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28923461 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 28923482 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28923546 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28923609 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28923705 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 28924059 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28924105 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28924129 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 28924245 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 28924703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28924810 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 28924888 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 28924907 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 28924923 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28925017 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 28925040 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 28925062 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 28925141 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 28925146 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 28925180 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 28925339 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 28925372 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 28925459 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 28925469 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 28925504 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 28925565 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 28925603 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 28925639 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 28925719 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 28925743 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 28925750 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 28925815 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28925950 T G N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 3 28926044 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28926051 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 28926134 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28926278 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 28926346 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 28926379 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 28926437 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 28926486 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28926605 T A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 28926720 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 28926786 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 28926791 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 28926811 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 28926860 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 28926919 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 28926932 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 28926957 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 28927048 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 28927061 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 28927085 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28927112 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 28927118 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28927132 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 28927159 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 28927226 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 28927234 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 28927260 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 28927275 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 28927311 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 28927392 T A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 28927432 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 28927530 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 28927598 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 28927608 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 28927618 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 28927640 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 28927751 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 28927942 G A N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 28928044 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 28928069 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 28928086 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 28928136 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 28928179 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 28928243 T G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 28928589 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 28928657 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28928753 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28928841 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 28928890 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28929009 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28929083 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28929106 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 28929245 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28929279 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28929354 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 28929531 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 28929982 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28930423 G C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 28930458 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28930566 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28930591 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28931101 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28931149 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28931156 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28931245 A G N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0 0.692307692307692 0.307692307692308 9 17 0 9 4 3 28931368 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28931478 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28931513 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28931714 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28933666 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28934772 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28935115 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28935315 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 28935316 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28935745 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 28935859 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 28937387 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 28938255 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 28938484 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28938500 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 28938539 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28938629 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28939097 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28939415 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 28939525 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28939559 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 28939582 A T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 28939721 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 28940085 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 28940183 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 28940450 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28940498 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 28940555 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 28940629 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 28940735 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 28940757 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 28940820 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 28940860 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 28941422 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 28941546 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 28941565 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 28941693 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 28941730 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28941733 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28941817 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 28941991 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 28942013 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 28942290 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 28942309 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 28942421 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 28942474 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 28942505 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 28942543 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 28942544 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 28942830 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 28942893 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28942907 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 28942937 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 28942951 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 28943021 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 28943109 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 28943240 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 28943405 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 28943470 A C N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 3 28943519 C A N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 28943566 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28943628 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28943638 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 28943891 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 28943892 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 28944148 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 28944186 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 28944328 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 28944378 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 28944404 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 28944483 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 28944757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28944927 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 28944944 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28945193 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 28945211 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28945247 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28945304 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 28945331 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 28945348 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 28945463 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28946073 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 28946150 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 28946400 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 28946532 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 28946612 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 28946667 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 28946736 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 28947411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28948109 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28948214 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 28948405 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 28948529 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28948536 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28948544 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 28948577 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 28948707 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 28948715 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 28948759 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 28948892 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 28949037 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 28949046 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 28949369 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 28949492 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 28949565 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 28949782 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 28949849 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28949901 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 28949909 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28949917 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 28949927 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 28949931 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 28949977 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.1 0.85 0.05 21 19 2 17 1 3 28950209 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28950270 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28950379 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28950390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28950444 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 28950579 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28950807 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 28952862 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 28953218 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 28953375 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28953389 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 28953482 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 28953497 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 28953500 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 28953558 G C N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 3 28953650 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 28953685 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 28953689 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 28953715 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 28953744 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28953832 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28953999 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 28954109 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 28954133 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 28954168 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 28954193 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 28954511 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28954513 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28954625 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28954865 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28955070 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 28955093 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 28957395 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28958709 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28960571 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28960901 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28962032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28962725 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 28966929 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28967782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28967926 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28968201 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28968220 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28968807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28971353 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28971929 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28972945 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28973934 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28976452 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28977258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28977338 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28977352 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28978273 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 28978440 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28978828 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28979285 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28980250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28980799 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28981032 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28982074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28982538 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28982990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28983208 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28983225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28984006 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28984476 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28984722 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28984748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28985014 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28986778 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28993443 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28993683 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28993749 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28993767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28993969 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28994029 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28994034 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28994086 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28994141 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28994203 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28994370 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28994477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28994487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28994557 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28994705 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28994780 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28994848 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28994852 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28994960 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28995939 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28996040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28996373 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 28996864 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28996906 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28997033 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28997096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28997755 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28997759 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28997791 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28997800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28997845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28997877 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28997990 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 28998019 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 28998066 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 28998620 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 28998858 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28998859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28998869 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28999019 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28999033 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28999056 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28999069 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28999100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28999198 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28999201 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28999274 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 28999378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28999535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28999587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28999704 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 28999799 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 28999909 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 28999951 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29000195 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29000244 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29000281 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 29000282 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 29000441 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29000530 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29000630 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 29001528 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29001745 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29002062 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 29002087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29002095 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 29002207 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 29002302 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29002790 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29002906 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29002947 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29002951 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29003019 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29003077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29003240 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29003322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29003335 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 29003512 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 29003624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29003626 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29003964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29003965 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29004233 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 29004492 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29004733 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29004947 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29005103 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29005161 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29005187 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29005206 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29005215 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29005247 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29005757 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29006128 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 29006274 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 29006275 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 29006297 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 29006330 G C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 29006362 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29006464 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 29006497 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 29006572 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 29006805 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 29006854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29006871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29006952 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 29007099 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29007227 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29007287 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29007327 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29007490 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29007593 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 29007655 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29007688 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29007735 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29007800 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29007842 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29008013 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29008281 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29008360 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29008439 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29008586 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 29008774 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 29008817 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 29008854 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 29008950 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 29008980 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 29009266 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29009349 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 29009679 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29009752 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29009840 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29009864 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 29010209 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29010210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29010358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29011033 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29011384 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 29011534 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 29011645 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 29011798 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29011830 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 29011863 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29012115 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29012142 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29012244 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29012341 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29012428 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29012441 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29012471 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29012578 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 29012776 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29012860 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 29012968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29012972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29013023 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 29013168 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 29013452 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29013850 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29013970 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29014118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29014209 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 29014213 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 29014224 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 29014226 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 29014265 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 29014332 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29014367 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29014388 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29014481 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 29014866 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 29016778 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29017082 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 29017310 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29017651 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 29017809 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 29018684 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 29018711 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 29018885 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 29018958 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 29019252 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 29019278 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 29019317 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 29019350 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 29019453 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 29019534 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 29019539 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 29019551 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 29019563 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 29019618 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29019640 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29019754 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29019780 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29020040 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 29020161 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29020169 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29020347 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 29020379 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29021774 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29023535 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29026537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29026565 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29029061 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 29029075 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 29029086 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 29029133 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 29029264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29029734 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29032117 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29032618 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29033006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29033767 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29034202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29035204 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29035710 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29035750 A G N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 29035884 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 29036165 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 29036249 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 29036280 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29036282 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29036294 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29036334 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 29036337 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29036346 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29036377 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 29036621 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 29036658 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29037049 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 29037055 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29037495 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29039291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29039663 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29042909 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29042943 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 29042988 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 29043189 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29043196 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29043515 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29043751 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29043774 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29043794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29043926 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29044070 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29044117 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 29044121 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29044285 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29044521 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 29044839 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 29044950 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29045117 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 29045503 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 29045618 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 29045683 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 29045772 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29045797 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29045853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29046197 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29046289 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 29050104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29050427 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29051479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29051986 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 29053312 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 29054891 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29056046 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29056061 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29056313 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29056710 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29060098 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29063044 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29063131 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29063754 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 29064014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29066446 G C Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 29067283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29067535 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29068302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29068388 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29068583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29068831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29068849 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29070505 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29071851 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29071976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29072034 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29072829 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29074032 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29074101 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29074230 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29074293 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29074865 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29074895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29074931 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29075076 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29075457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29075567 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29075614 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29075755 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29075853 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29076725 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29076827 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29076829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29077047 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29077105 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29077108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29077132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29077715 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29077829 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29077924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29078000 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29078021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29078109 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29078132 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29078503 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29078515 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29078518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29078543 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29078592 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29078648 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29078652 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29078687 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29078777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29078806 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29078848 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29078877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29079070 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29080151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29080272 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29080412 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29080464 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29080582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29081885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29082830 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29082908 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29083591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29084494 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29084800 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29085124 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29085429 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29085438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29085453 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29086447 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29086622 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 29087001 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29087221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29087230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29087468 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29087756 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29088024 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29088641 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29089318 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29089385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29089479 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29089797 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29090257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29091055 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29091058 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29091201 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 29091303 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29091692 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29092350 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29092406 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 29092474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29092624 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29092636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29092673 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29092890 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29092985 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 29093057 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 29093118 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 29093193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29093290 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 29093330 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 29093380 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29093407 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 29093421 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 29093467 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 29093499 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 29093541 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 29094031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29094049 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29095096 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29095354 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29095363 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29095366 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29095464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29095506 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29095571 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 29095740 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 29095790 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 29095855 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 29096120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29096298 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29096436 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29096459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29096463 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29096579 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29096662 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29096665 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29096681 G A Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 29096757 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29096780 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29096783 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29096791 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29096923 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29097325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29097355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29097406 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29097935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29098234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29098373 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29098421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29100122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29100514 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29100531 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29103027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29103587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29105244 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29105312 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29105682 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29105724 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 29106330 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29106355 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29106531 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29106550 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29106581 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 29106583 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29106601 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29106740 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29106786 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29107084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29107091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29107223 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29107328 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29107371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29108200 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29108207 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29108322 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29108323 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29108429 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29108447 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29108502 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29108561 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29108624 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29108673 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29109050 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29109060 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29109108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29109142 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29109551 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29109574 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29109629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29109745 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 29109841 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29109885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29110026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29110101 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29110320 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29110403 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29110677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29110734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29110871 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29111316 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29111387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29111458 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29111563 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29111800 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29111888 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29111915 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29112493 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29112494 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29112604 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 29112625 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29113011 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29113072 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29113091 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29113146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29113242 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29113277 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29113536 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 29113858 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29114037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29114416 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29114442 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29114496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29114615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29114628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29114697 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29114866 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29114868 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29114883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29114943 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29114945 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29114954 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29115118 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29115198 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29115472 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29115574 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29115671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29116101 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29116109 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29116328 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29116446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29116499 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29116866 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29116908 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29116990 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29117397 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29117605 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29117796 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29117811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29118102 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29118647 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29118803 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29118887 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 29119286 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29119550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29119662 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29119726 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29119742 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29119784 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29120498 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29120690 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29120847 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29120918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29120922 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29120990 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29121090 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29121129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29121299 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29123264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29124729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29127173 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29127235 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29128889 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29128890 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29129195 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29129214 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29129226 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29129352 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29129471 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29129478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29129646 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29129782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29129822 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29129959 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 29130112 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 29130212 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 29130284 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29130313 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29130336 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29130408 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29130414 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29130422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29130580 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29130621 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 29130622 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 29130646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29130729 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29130761 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29130762 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29130807 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 29130822 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29130849 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29130882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29130919 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29131005 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29131011 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29131114 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 29131154 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29131375 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29131423 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29131434 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 29131531 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 29131795 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 29132093 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 29132176 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29132244 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 29132270 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 29132276 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29132281 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29132292 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 29132355 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 29132847 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 29132953 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29132994 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 29133121 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29134133 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29134225 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29134408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29135250 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29135659 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29135934 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29136024 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29136066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29136117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29136149 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29136765 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29137019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29137030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29137068 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29137187 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29137239 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29137297 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29137494 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 29137812 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 29137881 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 29137882 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 29137999 A T Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 29138055 G A Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 29138058 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 29138077 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 29138142 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 29138235 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 29138240 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29138248 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29138353 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29138384 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29138497 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29138599 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 29138665 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29138722 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29138742 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29138853 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29138936 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29138937 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29138969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29139001 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29140696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29140795 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29141030 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29141157 A G Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 3 29141482 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29141562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29142291 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29142532 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29142682 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29143237 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29143378 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 29144063 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29144088 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 29144125 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29144668 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29144794 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29145432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29145731 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 29145887 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29145945 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29145970 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 29146004 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 29146018 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 29146041 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 29146239 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 29146279 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 29146438 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29146497 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 29146670 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29146704 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 29146736 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 29146929 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29146990 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29147059 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29147102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29147109 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29147159 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29147164 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29147210 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29147333 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29147357 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29147369 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29147381 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29147384 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29147427 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 29147462 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29147484 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29147553 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29147642 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 29147649 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29147659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29147920 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 29148038 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29148162 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29148239 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29148292 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29148301 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29148370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29148413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29148471 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29148485 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29148529 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29148741 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29149277 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29149367 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 29149779 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29150612 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29150878 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29151012 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29151416 A G N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 29151452 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 29151489 T C N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 29152606 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29154775 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29155272 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 29156220 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29156842 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29158586 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29158904 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29159534 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29159633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29160122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29160547 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 29161158 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29161481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29161775 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29161876 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29162498 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29163374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29164130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29164783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29164793 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29165027 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29165182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29165245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29165979 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29166344 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29166604 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29166674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29166679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29166791 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 29166822 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 29166887 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29167145 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29167250 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 29167261 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29167272 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29167309 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29167428 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29167457 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29167673 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29167707 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29167944 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29168092 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29168224 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29168373 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29168847 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29168899 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29168991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29169749 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29170090 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29170126 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29170140 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29170173 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29170312 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29170325 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 29170337 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29170343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29170436 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 29170437 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29170539 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29170550 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 29170653 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 29170727 A T N N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 3 29170815 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 29170864 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 29171017 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 29171120 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29171217 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29171249 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29171298 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29171352 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29171667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29171917 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29171941 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29172012 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 29172016 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 29172675 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29172693 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29172702 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29173070 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29173084 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29173134 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29173220 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29173407 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29174000 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29174281 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 29174287 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 3 29174299 C T Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 29174305 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 29174326 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 29174373 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 29174648 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 29174703 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29175088 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29175278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29175322 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29175349 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29175416 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 29175801 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29175847 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29175848 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29176313 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29176487 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29176488 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 29176508 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 29176546 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29176837 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29176862 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 29177033 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29177617 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 29177790 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 29177838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29177995 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29178042 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29178393 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 29178394 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 29178405 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29178427 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 29178450 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 29178498 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 29178516 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29178527 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29178627 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 29178811 A T N N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 29178828 G A N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 29180038 G A Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 29180069 G T Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 29180141 C A Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 29181084 C T Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 29181091 C A Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 29181150 G A Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 29181163 C T Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 29181301 C G Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 29181313 T A Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 29181346 T A Y N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 29181350 A G Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 29181727 G A Y Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 3 29181819 T A Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 29183910 T C Y Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 10 22 0 10 6 3 29183918 T G Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0 0.684210526315789 0.315789473684211 13 25 0 13 6 3 29184123 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 29184157 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29184199 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29184218 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29184226 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29184234 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29184273 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29184279 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29184288 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29184340 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 29184357 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29184361 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29184386 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29184503 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29184509 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29184522 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 29184701 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29184706 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29184766 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29184789 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29184825 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29184829 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29184899 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29184932 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29184980 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29185002 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29185003 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 29185027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29185050 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29185109 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29185149 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29185173 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 29185180 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29185215 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29185230 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29185290 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29185314 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29185317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29185391 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29185495 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29185498 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29186435 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29186456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29186486 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29186559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29186636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29187105 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29187272 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29187411 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29187824 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29188023 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29188124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29188147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29188531 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29189233 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29189961 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29189962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29190209 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29190232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29190716 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29190791 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29191372 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29191927 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29192008 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29192023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29192184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29192223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29192310 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29192314 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29192477 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29192877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29192967 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29192971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29192982 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29192983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29193273 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29193279 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29194167 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29194231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29194258 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29194360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29194365 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29194412 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29194501 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29194566 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29194958 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 29195071 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 29195113 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29195597 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 29195832 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 29195868 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 29195884 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29195899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29196076 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29196336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29196395 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29196479 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29196604 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29196890 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29196964 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 29197121 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29197315 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 29197472 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 29199170 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29199193 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29199194 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 29199223 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29199596 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29200051 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29200070 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29200214 T G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 29200680 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29200942 A G N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 29201677 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 29201856 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 29201982 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 29202026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29202169 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 29202364 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 29202388 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 29202399 A T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 29202417 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 29202419 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 29202435 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 29202678 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29203672 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29204581 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29206038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29206880 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29207049 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29209069 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29210255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29210709 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29210874 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 29211039 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 29211767 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29212091 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29212242 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29212270 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29212316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29212447 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29212448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29212486 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29212547 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29213017 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 29213085 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 29213309 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29214209 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29220675 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29220702 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29221004 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29221530 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29221948 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29222164 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29222490 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29222904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29223653 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29223911 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29223920 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29224107 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29224157 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29224175 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29224239 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29224547 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29225648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29226127 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29227682 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 29228308 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 29228311 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 29228319 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 29229348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29229546 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29229611 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29229913 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29229956 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29230531 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 29230532 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29230598 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 29230599 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 29230820 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29231124 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29231189 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29231374 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29231382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29231414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29231461 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 29231526 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29231552 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 29231721 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29231975 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 29232039 G T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 29232335 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29232432 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29232548 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29232626 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29233159 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29233490 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29233802 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29234267 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29234413 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29234479 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29234523 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29234564 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29235501 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29235813 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 29235883 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29235885 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 29235944 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29235966 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29236125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29236291 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29236330 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29236631 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29237020 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29237259 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 29237306 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29237697 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29237882 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29238226 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29238610 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29238764 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29239050 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29239108 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29239132 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29239185 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29239223 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 29239314 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29239399 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29240168 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29241487 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29241632 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29242107 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29242310 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29242419 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29242432 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 29242527 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29242587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29242841 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29242855 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 29243525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29244766 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29245218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29245287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29246594 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29246743 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29246748 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29246795 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29246800 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29246994 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29247303 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29247675 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29247678 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29247820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29248271 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29248653 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29248821 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29249010 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29249768 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29249870 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29250060 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 29253224 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29253881 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29254024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29255953 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29259212 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29261062 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29264600 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29264799 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29264843 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29265146 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29270310 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29271093 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29271839 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 29272127 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 29272128 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29272152 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 29272415 T G Y N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 29272423 T C Y Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 3 29272433 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 3 29273220 G A Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 29274898 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 29275298 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29275318 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29275481 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29275524 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29275556 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29275606 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29275684 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 29276568 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29276806 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29276855 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29277161 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29277639 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29277810 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29277897 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29277938 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29277953 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29277979 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29278123 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29278216 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29278539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29278567 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29278955 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29279086 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29279147 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29279224 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29279524 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29280129 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 29280679 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29280740 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29280745 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 29280917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29280955 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 29280968 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 29280984 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29281106 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 29281119 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29281259 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29281340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29281494 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29281513 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 29281514 G C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 29281601 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 29281609 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 29281722 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29281896 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 29281959 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 29282079 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 29282135 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 29282237 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29282280 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 29282314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29282481 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 29282505 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 29282572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29282575 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 29282616 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29282620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29282836 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29282999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29283006 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29283293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29283299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29283344 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29283385 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29283402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29283480 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29283538 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29283559 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29283587 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29283603 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29283628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29283639 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29283675 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29283750 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29283804 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 29283838 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29283971 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 29284001 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29284066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29284177 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 29284188 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 29284222 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 29284249 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29284294 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29284381 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29284549 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 29284569 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29285172 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29289059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29289507 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29290074 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29290982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29291355 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 29291719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29291730 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29291879 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 29292039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29292890 T G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 29293809 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 29294064 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 29294100 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 29294111 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 29294118 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 29294196 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 29294393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29296233 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 29296549 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29296988 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 29297296 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 29297306 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 29297457 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 29297484 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 29297863 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 29297869 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 29298718 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29298797 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 29299833 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29300332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29300458 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 29300470 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 29300571 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29300729 A G Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 29300792 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 29300879 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29301120 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29301195 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29301326 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29302293 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29302855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29304273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29305301 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29305908 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29307156 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29307553 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 29308556 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29308568 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 29308610 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 29308683 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 29308761 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29309111 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29309137 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29309146 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29309480 A G N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 15 13 1 13 0 3 29309526 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 29310947 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 29312445 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29312994 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 29314798 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 29314800 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 29315242 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29315618 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 29315735 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 29315894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29316080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29316179 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 29316185 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 29316227 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 29316659 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29316944 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 29317192 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29317276 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 29317840 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 29317898 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 29317971 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 29318181 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29319438 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 29319602 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29319742 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29320294 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29320371 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29320386 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 29323538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29323594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29324544 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 29324560 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 29324581 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29324648 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 29324736 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 29324825 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29324852 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29325409 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 29328031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29328045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29328090 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29328125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29328278 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29328444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29328473 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29328552 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29328710 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29328792 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29329228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29329237 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29329274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29329283 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29329336 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29329577 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29329614 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29329664 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29329738 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29329762 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29329780 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29329913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29329976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29329991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29330168 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 29330268 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 29330270 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 29330397 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29331053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29331302 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29331377 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29331796 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 29332104 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 29332359 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29333630 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 29333768 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 29333845 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 29334160 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 29334174 A G Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 29334210 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 29334220 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 29334255 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 29334446 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 29334633 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 29335140 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 29335148 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 29335159 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29335186 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29335354 C T N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 29335497 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29337010 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29337402 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 29337661 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 29338534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29339976 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29340021 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29340777 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 29342098 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29343087 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 29344080 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 29344163 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 29344164 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 29344345 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 29344481 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 29344491 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 29344527 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 29344552 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 29344567 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 29344575 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 29344752 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 29344789 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 29345147 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 29345284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29345596 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29345766 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29346563 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29346572 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29346576 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29346596 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29346621 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 29346678 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29346737 A G N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 12 10 1 10 0 3 29346780 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29346809 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29346849 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29347571 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 29347721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29347757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29348227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29349504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29349574 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29350288 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29350308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29350315 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29351380 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29351649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29352817 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 29353412 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29353474 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 29353500 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 29353501 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 29353520 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29353640 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 29353959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29354012 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29354017 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29354029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29354056 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 29354063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29354115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29354118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29354356 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29354457 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29354504 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29354953 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29354996 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29355285 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 29355609 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29355753 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29355775 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29355906 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 29356062 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29356125 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29356287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29356462 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29356523 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29356890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29357024 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29357362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29357522 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 29357556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29357623 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29357698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29357784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29358639 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29358661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29358664 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29360322 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29360391 T A N N 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.181818181818182 0.818181818181818 0 13 9 2 9 0 3 29367546 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 29367662 G T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 29367774 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 29367778 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 29367799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29367871 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29367919 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29367931 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29367933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29368081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29368119 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29368146 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29368152 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29368204 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29368224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29368256 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29369104 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29369815 A T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 29369816 A T N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 29371100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29371585 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 29371960 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29371999 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29372699 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29373193 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29373205 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29373226 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29373241 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29373279 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29373296 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29373336 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29373357 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29373369 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29373370 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29373563 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 29373715 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 29373750 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 29373807 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 29373954 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29373985 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29374117 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29374118 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29374260 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29374279 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 29374410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29374434 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29374556 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29375072 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29375113 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29375161 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 29375414 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29375455 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29375539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29375549 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29375568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29375680 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 29375855 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 29375874 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 29375888 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 29376105 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 29376123 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 29376275 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 29376289 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 29376296 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 29376331 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29376618 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29376817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29377238 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29380460 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29381214 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 29381872 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29383032 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29383067 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29383150 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29383232 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29384380 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29385548 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29393336 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29394124 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29395365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29396695 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 29397570 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 29397799 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29398653 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29398901 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29399033 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29399149 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29399294 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29399704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29400008 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 29400314 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29400630 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29400777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29400840 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29402015 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29403468 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 29403657 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 29404111 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 29404319 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29404345 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29404374 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29405513 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29405616 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29405697 G A Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 29405709 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29405811 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29405893 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 29405896 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 29405984 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29406049 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29406235 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 29406381 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29406434 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29406644 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29406862 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29407679 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 29407897 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 29407987 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29408042 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29408387 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 29409005 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29409074 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29409423 G T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 29410113 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 29410138 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 29410278 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 29410343 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 29411125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29411276 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29411427 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 29411860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29411871 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29411886 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29411909 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 29411911 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29412006 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29412245 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29412311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29412440 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29412492 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29412536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29414206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29415010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29415086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29415102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29415211 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29415247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29415359 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29415443 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29415461 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29415463 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29415534 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29415663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29415674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29415681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29415728 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29415754 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29415828 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29416464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29416722 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29416776 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29417287 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 29425270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29425353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29425429 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29425474 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29425636 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29425672 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29425816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29426112 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29426293 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29426478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29426519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29427192 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29427417 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29427713 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 29427834 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 29428075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29428333 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29428578 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29428641 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29428790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29428800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29428828 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29428974 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29429041 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29429398 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29429438 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29429525 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29429588 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29429824 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29430402 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29430651 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29431257 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 29431699 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29432395 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29433139 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 29433777 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29437866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29438683 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29438767 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29439019 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29439024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29439187 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29439480 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29439501 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29439549 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29439654 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29439729 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29439733 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29439763 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29439812 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29440105 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29440269 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29440406 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 29440597 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29440651 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 29440652 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 29440736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29440790 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29440932 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 29441016 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 29441094 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 29441174 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 29441188 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 29441191 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 29441211 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29441310 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29441348 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29443056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29443386 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29443544 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29443557 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29443558 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29443570 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29443848 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29443914 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29443926 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29444024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29444138 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29444374 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29444531 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29444993 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29445064 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29445124 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 29445347 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29445390 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29445460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29445529 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29445568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29445569 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29445619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29445625 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29445662 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29445815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29445833 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29445838 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29445846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29445875 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29445918 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29445951 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29445961 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29446190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29447251 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29447363 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29450697 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29452039 C A Y N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 29452311 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29453772 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29454073 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29454084 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29454277 T G Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 29454283 G A Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 29455318 G C Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 29456350 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29457632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29458904 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29459885 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29461792 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29462523 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29462671 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29463968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29464064 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29465602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29466339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29468041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29468630 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29469078 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29469734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29469922 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29470192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29470691 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29471259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29471400 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29471474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29471535 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29471665 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29471675 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29471684 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29471737 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29471779 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29471926 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29472128 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29472164 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29472195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29472298 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29472403 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29472454 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29472486 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29472564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29472620 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29472623 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29472808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29472810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29472822 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 29473027 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29473033 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29473067 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29473138 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29473178 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29473239 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29473266 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29473284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29473367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29475215 T A Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 29475358 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29475469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29475596 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29475932 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29476011 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29476639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29476730 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29476787 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29477068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29478152 T G Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 29478299 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29478653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29479156 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29479980 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 29480409 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29481302 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29481303 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29482253 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 29483929 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29484134 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29484896 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29485063 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29485068 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29485114 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29485140 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 29485191 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29485471 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29485511 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29485681 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29485915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29485918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29486030 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29486237 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 29486831 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 29487313 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29487354 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 29487753 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29487779 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29489763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29489818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29490081 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29490161 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29490263 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29490496 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29490577 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29491053 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 29491293 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29491547 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29492611 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29492711 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 29492876 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29493138 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29493333 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29493372 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29493409 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 29493422 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29493521 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 29493664 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29493775 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29493976 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29493999 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29494083 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29494290 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29494386 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29494445 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29494795 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 29495083 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 29495258 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29495265 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 29495322 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29495326 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29495366 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29495397 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 29495461 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29495548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29495595 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29495674 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29495700 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29495776 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29495788 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29495887 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29495936 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29496508 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29496657 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29497101 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 29497222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29497405 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29498131 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29498194 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29498337 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29498790 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 12 6 3 6 0 3 29499171 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29499657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29499810 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29500015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29500209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29500768 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29501447 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29501578 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29501814 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29502283 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29502803 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29503569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29503610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29503666 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29503716 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29504307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29504390 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29506984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29507474 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29507559 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29507655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29508065 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29509148 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29509664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29510568 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29512573 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29512665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29515196 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29516281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29516558 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29519908 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 29523016 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29524068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29524934 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29528135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29528881 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29531482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29534257 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29538111 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29538197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29538383 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29538385 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29538415 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29538699 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29539860 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29540384 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29540960 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29542566 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29543298 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 29544234 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29544648 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29545152 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 29546153 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29546628 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29547008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29547187 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29547886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29548618 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29548710 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29548760 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29548795 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29548843 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29550139 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29550789 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29551399 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29551622 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29552133 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29552285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29552733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29553101 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29553102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29553146 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29553171 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29553577 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 29554843 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29556330 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29557023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29560154 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29560773 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29561742 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29561907 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29562133 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29562214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29562538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29562550 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29562570 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29562761 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29562969 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29563059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29563388 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29563944 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29564086 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29565800 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29567129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29567367 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29567554 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29568609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29571038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29571327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29572620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29572934 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29573281 A G Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 29573284 T A Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 29573329 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 29573350 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 29573384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29574576 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29576072 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29576271 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29576305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29576443 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29577343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29577440 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29581130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29582109 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29582499 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29582548 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29583366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29583900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29585496 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 29585650 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29585754 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29585931 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29586009 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29586174 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29586288 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29586289 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29586566 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29586583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29586818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29586823 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29586901 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29586949 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29587012 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29587083 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29587181 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29587244 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29587280 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29587290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29587344 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29587345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29587533 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29588196 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29588371 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29588754 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29589201 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29589452 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29589724 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29589909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29590008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29590203 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29590245 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 29590258 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 29590360 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29590388 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29590486 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29592186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29592232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29592255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29592281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29592414 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29592461 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29592464 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 29592517 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29592696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29592758 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29592769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29592806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29593252 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 29593323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29593386 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29593473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29593775 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29593872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29594031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29595605 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29596306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29596465 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29596727 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29597966 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29598053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29598331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29600349 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29601797 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29601983 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29602341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29604709 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29605343 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 29605640 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29605766 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29606105 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29606255 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29606351 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29606417 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29606692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29606801 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29606875 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 29606893 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 29606910 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 29606966 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 29607015 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 29607657 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29607667 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29607832 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29607923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29608089 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29608217 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 29608300 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 29608312 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29608348 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29608371 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29608409 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29608414 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29608501 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29608511 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29608548 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29608944 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29609233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29609248 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29609271 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29609387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29609452 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29609454 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 29609470 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29609677 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29609747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29609773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29609837 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29610068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29610118 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29610148 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29610167 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29610264 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29610376 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29610447 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29610615 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29611162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29611247 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29611261 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29611313 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29611327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29611392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29611598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29611897 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29612039 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29612057 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29612193 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29612312 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29612741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29612827 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29612957 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29613084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29613268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29614987 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29615288 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 29615538 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29615575 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29615726 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29615833 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29615844 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29615886 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29615889 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 29615903 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29615998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29616006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29616253 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29616419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29616422 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29616485 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29616859 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29617550 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29617598 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29617823 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29617836 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29617842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29624824 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29624830 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29624918 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0 0.823529411764706 0.176470588235294 14 20 0 14 3 3 29625041 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29625044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29625082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29625182 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29625219 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29625251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29625274 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29625277 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29625312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29625339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29625435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29625915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29626116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29626298 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29626577 A C Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 29627557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29627733 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29627762 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29627825 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 29629318 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29629426 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29629465 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29629657 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29629685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29629727 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 29629738 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29629855 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29629993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29630029 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29630085 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29630098 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29630740 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29630888 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29631078 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29632119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29632390 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29632487 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29632550 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29634009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29634269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29634382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29634607 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29634630 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29634683 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29635139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29638274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29638335 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29638628 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29638901 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29638917 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29640046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29641109 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29644012 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29644529 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29645246 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29645372 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 29645796 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29647370 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29648030 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29649034 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 29649082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29649360 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29649460 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29649606 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29650256 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29650533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29650650 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29650877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29651614 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29652082 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29652211 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29652249 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29652296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29652349 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29652742 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29652752 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29652791 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29652921 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 29653284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29653294 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29653301 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29653348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29653644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29653835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29654255 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29654948 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29656037 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29656148 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29656338 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29656477 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29656505 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29657283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29657569 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29657593 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29657646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29659169 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29659206 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29659500 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29659684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29659768 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29659792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29659960 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29660276 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29661913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29662023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29662305 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29662431 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29662790 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29663055 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29663126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29663204 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29663215 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29663323 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29663492 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29663599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29663633 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29663652 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29663769 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29663896 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29663917 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29663949 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29663975 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29664086 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29664107 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29664110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29664300 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29664341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29664375 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29664945 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 29665146 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29665327 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29665384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29665682 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29665785 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29665821 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29666042 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 29666093 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 29666225 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29666383 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29666649 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 29666772 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29666795 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29667239 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29667244 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29667299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29667524 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29667853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29667888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29667909 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29668040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29670129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29670225 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 29672862 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29673257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29674176 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29674691 T A N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 3 29675912 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29676171 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29676426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29676432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29676611 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29676791 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29677195 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 29677972 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 29678375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29679381 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 29680256 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 29680779 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29681862 T C Y Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 3 29682798 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29684480 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29685770 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29685821 C A N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 29685951 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29686602 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29686633 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 29686879 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 29686894 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 29686978 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 29687084 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 29687146 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 29687510 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 29687645 A C N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 3 29687720 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 29687730 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 29687766 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 29687787 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 29687916 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 29687936 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 29689836 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 29690301 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29690668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29690867 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29691006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29691024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29691118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29691288 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29691295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29691697 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29691698 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29692231 A T N N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0 0.6 0.4 6 14 0 6 4 3 29694325 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29694737 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29695918 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29696554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29696973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29696994 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29697057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29697115 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 29697233 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29697289 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29697329 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29697397 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29697460 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29697886 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29698011 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29698075 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29698844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29698951 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29698983 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29699292 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29699345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29700430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29702470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29702953 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29703750 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 29703913 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 29704112 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 29704221 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29704437 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 29704474 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 29704530 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 29704546 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 29704577 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29704623 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 29704635 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 29704654 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29704681 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29704742 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29704745 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29704753 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29704771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29704915 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 29705103 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 29705188 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 29705207 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 29705222 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 29705293 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 29705320 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 29705569 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 29705650 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 29706018 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29706055 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 29706108 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 29706111 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 29706138 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 29706171 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 29706174 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 29706319 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29706355 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 29706376 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 29706509 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 29706692 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 29706764 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 29706791 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 29706953 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 29707386 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 29707510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29707771 C T N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 29708043 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 29708053 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 29708229 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29708270 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29708314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29708525 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 29709141 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29709435 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29709840 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29709882 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 29710262 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29711220 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29712524 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 29714245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29714328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29714404 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29714470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29714492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29714600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29714616 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29714999 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 29715042 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 29715266 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29715278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29715294 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29715346 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29715356 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29715454 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29715486 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29715493 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29715512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29715755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29715935 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 29715942 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 29716234 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 29716433 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 29716517 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 29716603 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 29716928 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 29717025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29717063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29717137 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29717173 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29717288 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29717292 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29717340 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 29717536 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29717595 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 29717631 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 29717691 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 29719120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29719351 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29719405 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 29719569 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 29719670 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 29720511 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 29720722 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 29720815 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 29721332 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 29721529 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29721670 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 29722500 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29722954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29723746 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 29723938 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 29724126 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29724328 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29724337 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 29724517 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29725207 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29725244 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 29725266 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29725539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29725991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29726085 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29727016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29727611 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29728230 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 8 10 3 2 4 3 29728802 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29729318 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29730069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29730469 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29730637 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 29732091 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29733318 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29736240 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29736338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29736442 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 29736508 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29736702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29736915 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29738229 A G Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 29738270 A G Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 29738973 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29739601 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29744140 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 29744371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29744465 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29744478 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29744498 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29744666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29744711 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29745223 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 29745225 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 29745241 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 29745315 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 29746237 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29747090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29747121 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29747896 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29747951 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29749720 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29750113 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29750749 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29750875 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29750997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29751049 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29751119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29751237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29751467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29751997 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29752183 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29752249 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29752618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29753476 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29755150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29756374 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29756645 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29756785 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29756961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29757031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29757287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29757288 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29757343 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 29757410 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29757431 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29757682 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29757742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29757755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29757819 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29757893 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29757906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29757949 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 29757986 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 29758002 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29758178 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29758664 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29758699 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 29758794 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 29758796 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29758869 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29759081 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29759160 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29759231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29759414 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29759570 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29759632 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29759635 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29759671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29759729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29760090 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29760123 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 29760196 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 29760235 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29760593 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 29760724 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 29760760 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 29761124 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 29762042 C G N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 3 29762328 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 29762578 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 29762858 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29762937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29762975 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29763145 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 29763157 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 29763413 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29763730 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 29763800 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 29763801 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 29763841 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 29763850 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 29764063 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29764117 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29764203 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 29764288 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29764320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29764328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29764380 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 29764381 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 29764396 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29764426 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29764434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29764472 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29764566 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29764569 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29764654 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29764684 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29764698 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29771861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29771890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29771895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29772155 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29772359 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29773018 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29774751 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29779188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29779384 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 29779927 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29780024 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29780111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29780138 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29780554 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29782493 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 29782927 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29782986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29785066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29785067 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 29785115 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 29785316 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29785561 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 29785709 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29785977 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29786142 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29786461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29786534 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 29787243 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 29788703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29793838 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29795832 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29800137 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29801149 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29801367 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29803037 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29804020 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 29804393 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 29805359 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29805931 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29806372 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29807514 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29809586 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29817336 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 29819218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29820424 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29823272 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 29823370 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29823623 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 29825826 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29825827 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29826984 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29828015 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 29828070 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 29828102 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29828244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29828284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29828351 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29828466 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 29828486 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 29828515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29828591 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29828763 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 29828776 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 29828937 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29828969 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29828980 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 29829333 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 29829507 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29830093 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 29830205 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 29830290 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 29830318 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29830653 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 29830812 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 29830863 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29831088 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 29831111 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 29831157 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 29831191 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 29831405 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 29831426 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 29831650 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29831989 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 29832002 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 29832040 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 29832236 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29832330 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 29832409 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 29832601 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 29832782 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29832792 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29832908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29832915 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 29833149 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29833162 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29833172 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 29833195 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 29833213 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 29833327 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29833451 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29833481 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29833746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29833824 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29833917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29833943 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29834023 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29834145 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 29834663 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29834685 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29834704 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29834885 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29835056 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29835091 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29835121 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29835212 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29835254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29835317 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29835340 A G N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.0714285714285714 14 14 1 12 1 3 29835436 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 29835444 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29835463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29835483 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29835536 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 29835539 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 29835565 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 29835599 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 29835639 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 29836213 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 29836638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29837372 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 29837444 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 29837452 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29837553 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29837682 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29837683 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29837736 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 29837738 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 29837749 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 29837764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29837844 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29837961 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 29837969 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 29838021 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29838039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29838051 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29838498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29838657 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 29838763 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29838795 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29838807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29838934 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29838983 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29839036 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29839082 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29839161 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29839212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29839319 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29839608 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29839649 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29839682 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29839738 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 29839882 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 29839885 G C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 29839914 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 29839926 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 29840185 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29840214 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29840432 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29840645 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 29840798 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 29840967 C T N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 7 9 0 7 1 3 29840979 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 3 29841393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29841508 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29841534 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29841548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29841623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29841639 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 29841821 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29841826 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29841923 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29841932 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29842075 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29842143 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29842389 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29842603 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29842832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29842890 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29842906 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29843294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29843318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29843424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29843461 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29843474 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29843518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29843633 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29843808 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29843929 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 29844088 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 29844262 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29844394 G A N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 29844696 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 29844952 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29844963 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 29844982 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 29845032 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29845117 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29845139 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29845242 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29845263 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 29845330 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29845704 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29845706 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29846003 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 29846077 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29846174 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29846992 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 29847824 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29848207 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 29851496 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29851952 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 29852394 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29852591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29852923 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29853144 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 29853146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29853385 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29854036 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 29854283 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 29854409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29854588 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 29854706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29854904 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29855486 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29855620 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29855651 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 29855816 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29855826 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 29855861 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 29856647 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29857734 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29857763 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 29857948 T A N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0 0.866666666666667 0.133333333333333 13 17 0 13 2 3 29858020 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29858027 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29858349 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29858473 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29858624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29859128 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 29859785 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29860459 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29860492 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29860528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29860536 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29860558 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29860721 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29860727 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29860737 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29860752 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29860944 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29861288 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29861437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29861569 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29861648 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29861651 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29861727 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29861773 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29861836 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29861944 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29861956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29862397 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29862450 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29862493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29862584 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29862602 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29862636 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29862709 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29862871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29862977 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 29863068 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29863113 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 29863121 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 29863405 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 29863766 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29863842 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29864641 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29865854 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29866083 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 29866231 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 29866260 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 29866267 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 29866406 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 29866472 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 29866573 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 29866604 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 29866728 T A Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 3 29866772 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 29867097 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 29867237 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29867812 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29868295 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29868477 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29869042 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29869049 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29869392 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 29869401 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 29869549 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 29869600 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29870349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29870354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29870637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29870956 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 29871197 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29871273 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29871401 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29871429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29871455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29872012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29872126 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29872143 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 29872321 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29872409 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 29872443 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29872491 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29872507 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 29872519 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29872631 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29872677 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29872844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29872895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29873470 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29874046 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29874121 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29874163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29874207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29874317 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29874467 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29874766 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 29875071 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29875115 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29875965 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29875985 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 29876019 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29876458 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29876513 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29876597 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29876933 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29877000 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29877342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29877772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29877923 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29882155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29882556 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29883693 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29883717 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29883746 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29883793 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29883845 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29884725 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29887052 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29888364 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29888401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29888848 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29889012 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29889632 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29889765 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29889857 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29890077 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29890542 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29891091 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 29891221 A C N N 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 3 29891712 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 29892112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29892536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29893569 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 29893619 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 29893675 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29894351 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29894837 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 29894904 T A Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 29894921 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29895038 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 29895420 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 29895623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29895647 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29895798 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 29895871 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29895927 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29895944 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 29895969 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 29896059 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 29896087 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 29896110 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 29896151 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 29896172 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29896292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29896435 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 29896952 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29900286 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29900378 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 29900670 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 29900705 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29900898 C T N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 29901580 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 29901603 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29901652 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 29901905 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29902043 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 29906923 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29912646 G A N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 3 29912705 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 29913552 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29913586 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29913722 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29914312 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29914665 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29915159 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29915186 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 29917026 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29918765 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29919843 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29920318 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 29920327 A G N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 3 29920391 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 29920503 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 29921285 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29921521 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 3 29921636 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 29921759 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 29921913 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 29921929 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29921941 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 29921954 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 29922273 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 29922306 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 29922337 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29922516 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 29922536 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29922599 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 29922774 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29930675 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29930845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29930989 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 29931013 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 29931063 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29931195 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29931200 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 29931267 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 29931377 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 29931409 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29931561 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 29931568 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29931609 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 29931666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29931718 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 29931733 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 29931820 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29931844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29931901 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 29932161 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 29932162 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29932221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29932425 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 29932457 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 29932584 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 29932615 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 29932824 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 29933537 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 29933697 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 29933757 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 29933827 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 29933899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29934074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29934116 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29935113 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29936750 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29939110 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29946263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29946604 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29948600 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29948814 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29949250 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 29949569 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 29950603 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 29950652 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29950984 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 29951571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29951794 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29951970 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 29952114 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.125 0.75 0.125 16 16 2 12 2 3 29952278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29952354 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29952358 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29952365 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29952396 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29952488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29952494 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 29952581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29952781 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 29952791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29952852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29952989 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29953019 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29953039 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29953119 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29953184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29953198 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 29953344 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 29953360 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 29953398 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 29953426 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 29953462 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 29953507 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 29953572 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 29953631 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 29953733 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 29953804 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29953887 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29954103 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 29954129 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 29954139 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 29954152 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29954222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29954250 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 29954311 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 29954375 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29954530 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 29954533 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 29954547 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 29954561 A C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 3 29954565 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 29954614 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29954636 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29954967 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 29954980 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29955281 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29955342 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29955354 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29955564 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29955598 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29956169 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 29956238 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 29956442 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 29956482 C G Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 29956813 G T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 29957105 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29957189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29957338 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 29957455 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29957457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29957936 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 29958606 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29958658 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29959340 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29959531 A G N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 16 12 6 4 4 3 29959753 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 29959897 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 29960138 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 29960351 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 29960784 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 29960871 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29960929 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29960939 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29961125 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29961369 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29961756 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29961918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29961967 T G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 29962895 T C Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 29963222 T G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 29963396 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 29963515 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 29963523 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29963597 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 29963600 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 29963621 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29963666 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29963678 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 29963688 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 29963763 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 29963773 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 29963778 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 29963819 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 29963935 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29963959 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 29963985 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29964055 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 29964917 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 29964927 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 29964934 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 29965109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29965777 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 29965949 T G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 29965968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29966036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29966061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29966070 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29966182 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 29966196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29966315 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 29966483 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 29966485 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29966603 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 29966693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29966800 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29966818 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 29966835 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 29966910 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 29966935 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 29966937 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 29967592 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29967778 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29967940 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29968398 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29968666 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29968975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29969155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29969292 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29971452 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29975104 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 29975234 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29975300 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29976319 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29976352 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 29976500 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 29976533 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 29976535 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 29976544 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 29976581 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 29976601 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29976705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29976778 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 29977430 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 29977448 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 29977638 T G N N 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 11 9 3 5 2 3 29977691 T C N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 29977692 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 29977705 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 29978146 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 29978746 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29979551 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 29980352 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29982835 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29982882 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29983090 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29984226 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29985378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29986428 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 29986922 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29986926 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29987335 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29988517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29988786 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 29988859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29990418 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 29990424 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 29990544 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 29990679 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 29990694 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 29990902 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 29991145 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 29991196 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 29991358 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 29991406 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 29991634 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 29991760 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 29991799 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29991887 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 29991929 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 29991960 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 29992260 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 29992279 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 29992307 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 29992310 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 29992335 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 29992372 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29992375 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29992493 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 29992598 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 29992628 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 29992754 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 29993350 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 29993643 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 29993835 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 29993908 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 29993943 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 29994065 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 29994117 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 29994247 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 29994455 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 29994630 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 29994671 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 29994672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29994695 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 29994706 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 29994837 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29994859 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 29994878 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29994937 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 29995085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29995126 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 29995195 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 29995341 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 29995354 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 29995380 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 29995441 C A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 29995828 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 29995854 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 29996245 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 29997464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 29997591 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 29997810 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 29997941 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 29999229 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 29999694 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30000467 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 30001920 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 30003253 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 30003319 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30005124 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30006050 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 30006075 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30006827 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30007724 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 30007759 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 30007843 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30008196 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 30008311 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30008344 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 30008542 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 30008580 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 30009068 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 30009705 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30010089 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 30010107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30010147 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 30010229 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30011058 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30011644 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 30014500 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 30014669 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 30014881 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30015132 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30015169 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30015453 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30015511 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30015988 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30016209 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 30016289 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30016482 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30016583 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30016748 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30016975 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30017194 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30017598 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 30017663 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 30017728 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 30017759 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 30017779 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 30018000 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 30018146 G C N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 30018203 C T N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 3 30018466 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 30018625 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 30018742 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30019016 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 30019363 T C N Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 9 9 2 5 2 3 30019839 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 30020242 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30022057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30022086 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 30022221 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 30022671 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30023003 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 30023348 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 30023812 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 30024009 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30024060 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30024173 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 30024224 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30024246 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30024282 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 30024318 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30024339 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30024505 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30024782 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 30024786 T G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 30024846 C A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 30024932 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30024952 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30024994 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 30025054 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 30025200 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 30025241 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30025303 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30025340 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30025343 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 30025362 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30025406 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30025595 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30025641 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 30025768 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 30025772 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 30025785 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 30025800 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 30025811 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 30025829 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30025859 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30025897 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 30025949 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30025996 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 30026095 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 30026361 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 30026481 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30026512 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 30026522 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 30026619 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 30026817 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 30026851 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 30026858 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 30026899 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30026947 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 30027092 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30027102 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 30027147 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 30027227 C A N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 3 30027269 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 30027275 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30027308 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 30027350 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30027496 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30027638 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30027688 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 30027784 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30027960 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 30028248 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30028269 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30028287 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30028402 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 30028525 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30028541 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 30028642 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 30028812 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30029059 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 30029077 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 30029405 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 30029929 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 30030055 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30030298 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 30030932 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 30031696 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30031748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30031828 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 30032257 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30032721 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30032993 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30032997 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 30033523 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30034195 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30034833 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30035393 A G Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 30035972 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 30036008 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30036074 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 30036165 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 30036905 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 30036940 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30036941 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 30037025 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30037341 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30038099 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30038145 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 30038447 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 30038468 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 30038528 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 30038704 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 30038941 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30039567 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 30039619 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30039692 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 30039710 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 30039726 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 30039860 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30040082 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30040382 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 30040384 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 30040400 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 30040402 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 30040456 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30040542 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 30040553 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 30040641 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30040983 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30041172 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 30041338 G C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 30041393 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30041498 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 30041562 G C Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 30041901 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 30041969 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30042079 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 30042328 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 30042709 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30042723 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30042761 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30043015 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30043319 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30043553 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30043892 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30044171 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30044266 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30044355 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 30044755 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 30045146 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 30045375 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 30046103 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30046106 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30046498 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30046645 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30047899 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30048137 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30048991 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30049810 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 30049866 C G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 30050527 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30051353 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30051647 G T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.117647058823529 0.705882352941177 0.176470588235294 16 18 2 12 3 3 30051649 G T N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 30052074 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30052378 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30053155 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30053222 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30053475 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30053528 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30054352 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 30054705 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 30054806 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 30054985 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 30055007 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 30055103 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30056090 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30056418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30056472 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30056580 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30056733 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 30056958 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 30056959 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 30057008 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 30057295 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 30057311 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 30057591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30057672 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 30057711 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 30057734 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30057735 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30058132 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 30058338 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 30058437 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30058497 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30058498 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30058809 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30058863 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30059200 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30060330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30060606 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 3 30061847 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 10 20 0 10 5 3 30063306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30064264 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30064771 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30067482 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 30067680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30067791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30068219 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 30068256 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 30068391 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30068487 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 30068517 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 30068586 T G Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 30068625 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30068635 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 30069089 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30073827 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 30074053 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 30074061 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 30074077 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 30074086 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 30074453 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30075156 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 30076086 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 30076111 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 30076293 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 30076539 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 30077212 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 30077213 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 30077850 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 30077869 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 30078190 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 30078217 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 30078248 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 30078329 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 30078349 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 30078398 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 30078399 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 30078747 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 30078758 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 30078772 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 30078847 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30079059 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 30079362 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 30079364 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 30079446 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 30079526 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 30079598 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 30082079 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 30082130 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30083305 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 30083492 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30084514 C T Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.125 0.8125 0.0625 17 15 2 13 1 3 30084682 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30085171 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 30085390 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 30085413 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 30085535 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30085536 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 30085594 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30085627 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 30085721 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 30085993 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 30086112 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 30086149 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30086368 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 30086370 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30086536 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 30087454 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 30087783 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 30087898 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 30089264 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30089427 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30089494 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30090682 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 30092630 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30094487 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 30094543 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30094565 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 30094627 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 30094809 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30094937 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30095395 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 30095484 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 30095854 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 30096007 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30096147 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 30096389 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 30096482 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 30096508 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 30096547 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30096743 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30096870 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30097318 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 30097877 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30098226 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30098227 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30098327 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 30098507 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 30099765 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30099854 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30099977 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 30100469 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 30100587 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 30100768 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 30100859 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 30100935 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 30103678 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30103816 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30105222 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30106539 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 30106765 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30107067 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 30107090 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 30107321 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30107734 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 30108251 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 30111525 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30111602 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 30111724 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 30111992 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 30112153 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30112215 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30112322 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 30115061 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 30115281 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 30115826 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30117592 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 30117662 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30117664 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 30117744 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 30118951 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 30119674 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30119783 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30120337 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 30123697 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 30123859 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30125122 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 30125631 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30126955 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30129451 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 30129759 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 30131266 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 30132727 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 30133613 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30134591 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30135762 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 30136090 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 30136315 G A N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 3 30136385 C A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 30136601 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 30136823 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30136853 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 30137162 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30137315 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 30137330 T A N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 30137368 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 30137379 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 30137445 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 30137451 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 30137743 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 30137752 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 30137756 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30137789 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30137797 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 30137823 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 30137893 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30138104 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30138281 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30138304 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30139114 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30139523 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 30140115 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30140208 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30142296 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 30142578 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 30142878 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30145803 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 30146089 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 30146128 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30146462 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 30146467 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30146601 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 30146639 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 30146726 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 3 30146738 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 30146903 G T N N 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 3 30146971 G A N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 30147760 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 30147913 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 30148004 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30148564 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30148590 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 30148597 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 30148969 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 30149862 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 30149940 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 30149973 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 30150023 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 30150043 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 30150216 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 30150664 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 30151164 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 30151171 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 30151267 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 30151286 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 30152521 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 30152746 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30153747 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 30154222 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 30154873 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 30155553 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 30155718 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30156050 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 30156782 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 30157259 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 30157507 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 30157663 C G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 30160379 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30160905 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 30161984 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 30162975 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 30163303 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30163451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30163489 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 30163927 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30167588 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 30168079 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30169426 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30170959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30171801 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 30172483 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30172825 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30173740 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30176452 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30176605 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 30176939 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30177726 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30178914 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30178936 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30179622 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 30179751 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 30180049 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 30180971 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30181986 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30182034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30182166 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30182678 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 30182709 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30182741 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 30183095 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 30183223 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30183639 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 30183690 G C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 30183850 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 30183869 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 30183969 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 30183980 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 30183999 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 30184256 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 30184362 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 30184654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30185022 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 30185807 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30185964 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 30186791 T A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 30186793 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 30187523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30187790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30189064 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 30189473 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 30189530 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 30190004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30190796 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 30192180 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 30192212 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 30192264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30192295 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 30193409 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 30193569 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 30193638 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 30194761 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 30194901 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 30195412 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30195971 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 30196375 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30197304 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30198371 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30199310 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30199456 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 30200629 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30201722 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 30201757 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 30201771 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 30202198 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 30202441 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 30202498 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30202532 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30202556 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30202666 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 30202701 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 30202808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30202897 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 30202908 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 30203009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30203035 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 30203947 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30204110 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 30204450 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30204486 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30204603 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 30204690 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 30204802 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 3 30204883 G A N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 3 30204898 A T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 30204931 C G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 30204945 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 30204985 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 30205230 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30205308 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 30205429 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30205441 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30205545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30205563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30205603 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 30205619 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30205679 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 30206072 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30206092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30206147 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30206150 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 30206181 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 30206388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30206454 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30206461 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30206479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30206515 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 30206665 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 30206764 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 30207030 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 30207266 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 30207271 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30208028 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 30208042 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 30208160 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 30208275 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 30208813 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 30210609 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30211374 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 30212532 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 30215551 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 30216528 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30216881 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 30217057 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 30218334 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30218488 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30218508 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30221569 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 30221582 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 30221591 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 30221665 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30221690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30221764 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 30221774 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 30221859 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30222728 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 30223430 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 30223552 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 30223667 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 30223691 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 30223776 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30223787 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 30223919 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 30223937 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 30224050 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 30224288 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 30224319 C A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 30224337 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 30224395 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 30224488 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 30225872 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30226107 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 30226384 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 30226715 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30228643 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 30229634 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 30229890 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30229905 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30231885 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30232003 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 30232012 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 30232179 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 30232218 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30232237 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30232272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30232307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30232402 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 30232403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30232434 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 30232435 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30232458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30232547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30232595 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30232602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30232679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30232700 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 30232930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30232949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30232986 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30233285 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 30233465 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30233528 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 30233529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30233650 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 30233660 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 30233700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30233829 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30233873 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30233989 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30233991 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 30234172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30234188 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 30234313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30234346 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 30234360 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 30234399 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 30234715 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30234788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30234852 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30234897 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30235016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30235810 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30235952 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30235971 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 30237107 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 30237625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30237962 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 30238057 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 30238472 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 30238860 C G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 30239023 G T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 30239582 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 30239848 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 30240081 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30240097 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30240254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30240467 C T N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 30240710 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30240886 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 30240918 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 30240920 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 30241003 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 30241248 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 30241352 A G N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 3 30241354 C T N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 3 30241483 A G N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 30241498 A G N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 3 30241654 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 30241752 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 30241790 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 30241997 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 30242184 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 30242189 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 30242284 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30242321 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30242360 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30242469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30242635 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 30242639 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 30242750 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 30242875 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30244648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30245001 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 30245746 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30246242 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 30248322 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 30249729 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 30249860 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30249890 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 30250224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30250707 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 30251617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30252061 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30252144 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30252368 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 30252483 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30252617 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 30252663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30252835 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 30253560 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 30253871 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30253973 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30254031 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 30254682 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30254966 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30256789 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30257114 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30257397 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 30257689 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 30257885 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 30257976 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30258676 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30258720 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 30258748 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 30258752 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 30258784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30258889 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 30259277 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30259355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30259401 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30259632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30260216 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 30261103 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30262999 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30263423 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30264082 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 30265109 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 30265206 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 30265316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30265424 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30265916 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30265944 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30266324 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 30266327 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 30266736 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 30267376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30268247 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30268379 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 30268731 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 30268844 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30269264 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 30269432 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 30269605 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 30270069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30271751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30271765 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30273323 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 30273684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30273686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30274031 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 30274078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30274149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30274292 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30274439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30274482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30275207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30276150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30276506 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 30276619 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30277703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30277859 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30277874 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 30278621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30279572 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30279589 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30280398 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30280404 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 30280440 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 30280471 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30280639 T A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 30280802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30280899 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 30281076 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 30281506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30281731 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 30281748 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 30281807 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 30281911 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30282115 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 30282336 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 30282440 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 30282583 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 30282591 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 30282820 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 30282866 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30283013 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 30283416 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 30283435 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 30283559 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 30283682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30283693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30283718 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 30283749 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 30284028 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 30284038 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 30284054 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 30284455 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 30284554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30284759 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 30284798 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 30284802 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 30284815 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30284831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30285135 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 30285197 G C Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 30285311 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30285325 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 30285353 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 30285407 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 30285453 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 30285460 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 3 30285479 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 3 30285533 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 3 30285616 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 30285643 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 30285664 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 3 30285677 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 3 30285723 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 30285764 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 30286016 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 30286064 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 30286085 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 30286139 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 30286158 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 30286174 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 30286186 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 30286242 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 30286268 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 30286302 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 30286391 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 30286414 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 30286459 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 30286529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30286602 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 30286637 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 30286711 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 30286761 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 30286781 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 30286859 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 30286877 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 30286908 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30286925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30287108 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 30287120 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 30287215 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 30287218 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 30287281 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 30287302 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30287376 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 30287379 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 30287439 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 30287575 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 30287632 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30287981 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30288007 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30288008 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30288102 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 30288325 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 30288348 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 30288482 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30288615 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 30288621 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 30288716 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 30288761 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 30288993 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 30289111 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 30289331 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 30289385 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 30289556 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 30289598 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 30289615 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 30289623 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 30289636 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 30289768 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 30289797 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 30291548 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 30292091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30293145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30293202 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 30293329 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 30293367 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 30293491 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 30293582 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 30293636 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30293829 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 30294124 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30294126 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30294327 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 30294418 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 30294985 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 30295023 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 30295238 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 30295328 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 30295731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30296383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30296687 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30296799 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 30296983 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 30297162 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 30297190 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 30297195 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 30297227 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 30297410 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 30297459 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 30297498 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 30297650 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 30297711 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 30297725 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30299409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30299707 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30300458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30300470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30301051 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30301309 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30301555 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30302460 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30302601 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30302623 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 30302666 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 30302675 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 30302782 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 30302796 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 30302818 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 30302955 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 30302961 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 30303041 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 30303131 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 30303301 G A Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 30303533 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 30303718 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 30303725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30303752 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30303911 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 30303964 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 30303993 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 30304031 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 30304223 A C Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 30304241 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30304304 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30304676 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 30304950 A C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 30305342 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30305618 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 30305829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30306069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30306299 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30306319 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30307765 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 30307886 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30308026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30308219 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 30308980 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 30309021 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30309119 A T Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.117647058823529 0.823529411764706 0.0588235294117647 18 16 2 14 1 3 30309978 A G N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 30310383 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30311550 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 30314966 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30316002 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30316054 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 30318008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30318910 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 30320963 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30321443 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30322223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30324975 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30325000 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30325458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30325492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30325538 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 30325634 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30325727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30325867 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 30326367 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30326415 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30326438 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30326547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30326711 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 30326719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30326730 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 30326868 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30326871 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30327004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30327086 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30327133 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30327398 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30327481 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30327505 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30327534 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30327624 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30327690 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30327839 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 30327854 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 30327875 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 30327880 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 30327893 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 30328081 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 30328311 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 30328741 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 30328776 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30328793 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30328817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30328859 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30329125 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30329400 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30329446 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 30329496 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30329501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30330188 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 30330696 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30330734 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30330908 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30330918 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30331205 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 30332064 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 30332282 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30332464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30332481 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30332776 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 30 6 15 0 3 3 30332859 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30333059 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30333403 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30334134 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30334153 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 30334154 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 30335127 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 30335823 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 30335858 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 30335904 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 30336376 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30336412 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 30336518 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 30337017 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30337250 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 30337273 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 30337374 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30338356 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30338648 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30338767 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 30338771 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 30338906 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 30338947 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 30339060 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30339083 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30339126 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30339149 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 30339204 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30339245 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30339268 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30339281 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30339312 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30339379 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30339429 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30339452 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30339612 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30339639 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 30339836 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 30339905 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 30340049 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30340058 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30340088 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30340329 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30340339 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30340491 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 30340581 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 30340770 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30340811 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 30340862 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 30341201 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 30341236 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30341280 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 30341397 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30341426 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 30341595 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 30341751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30341915 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 30342151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30342319 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 30342365 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 30342395 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 30342446 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 30342517 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30342552 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30342672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30342688 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 30342767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30343390 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 30344322 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 30345452 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 30345829 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 30346506 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30346972 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 30346991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30347365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30347866 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30348421 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30348552 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 30348633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30350914 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 30352212 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 30352228 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30352537 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 30352792 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 30352875 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 30353498 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30353686 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 30353914 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30353917 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30354174 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 30354677 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 30354679 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 30354691 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 30354699 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 30354739 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 30354989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30355228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30355276 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 30355432 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 30355614 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30355715 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30355754 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 30355777 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 30355941 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30355946 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30357715 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 30358421 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30360335 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 30360339 A T Y N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 30361477 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 30362070 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 30362913 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30363324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30363358 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 30364254 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30364280 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30364590 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 30364675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30364937 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 30365446 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 30365672 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30366116 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 30366129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30366188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30366354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30366419 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30366802 T A Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 3 30367205 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 30367472 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 30367628 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 30367657 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30367745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30367778 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 30367816 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 30367819 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 30369351 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 30370400 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 30370405 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30370476 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 30370799 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 30371999 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30372333 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 30372593 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 30373795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30374505 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30375462 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30378920 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30379571 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30379968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30380854 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30382946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30384889 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 30385555 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 30386756 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 30386899 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 3 30387344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30387393 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 30388399 C A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 30389869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30390768 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30391377 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 30391548 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 30392640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30394263 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30394843 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30395067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30395136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30395584 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30395607 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30395621 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30395716 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30395938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30395966 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30396183 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 30397611 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30397689 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30397690 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30397960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30397970 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30398199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30398240 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30398458 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30398474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30398691 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30398734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30399385 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30401417 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 30403105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30403474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30405538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30407273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30410850 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30412408 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30412822 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30413507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30413603 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30413604 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30414344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30414649 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 30414713 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 30414740 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30414806 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 30414811 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30414868 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 30415161 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30416487 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30421909 T G Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 30422217 A G Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 30422459 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 30422498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30422655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30422816 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30423180 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 30423474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30423665 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 30423681 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 30423756 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 30424181 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30424288 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30424369 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30424481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30424488 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 30424668 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 30424683 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30424715 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 30424734 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 30424844 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30424858 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30424909 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 30424935 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 30425294 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 30425595 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 30425835 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30425849 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 30426121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30426136 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30426313 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30426314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30426502 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 30426686 G T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 30426695 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 3 30426735 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 30426779 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 30426941 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 30427135 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 30427268 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 30427376 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 30427520 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 30427561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30427635 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30427643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30427698 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 30427854 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30428037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30428093 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30428111 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30428209 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 30428311 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 30428314 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 30428389 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 30428412 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 30428701 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30428738 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30428867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30429200 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 30429563 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 30429602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30429833 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30429952 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 30430642 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 30430964 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 30430989 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 30430991 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 30431263 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 30431304 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 30431321 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 30431531 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30431550 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30431707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30431748 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30431754 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30431832 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30431837 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 30432163 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 30432329 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 30432347 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 30432790 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 30432837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30432883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30432950 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30433186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30433213 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30433247 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 30433578 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30433619 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 30433648 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30433684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30433759 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30433776 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30433908 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30433993 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 30434630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30435012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30435405 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30435525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30435545 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30435548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30435872 A C N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 3 30435908 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30435977 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30436413 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30436451 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30436614 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 30436660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30436683 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30436716 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 30436836 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 30436889 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 30437107 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 30437187 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 30437199 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 30437367 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30437579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30438566 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30438621 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 30438910 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 30439531 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 30439805 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30439835 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 30440287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30440400 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 30440784 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 30441394 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 30441475 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30441621 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 30441632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30441657 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 30441690 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 30442773 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 30442785 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 30442830 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 30442840 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 30443858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30444076 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 30444260 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 30444461 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 30444584 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 30444724 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 30444866 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 30444936 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 30445004 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 30445213 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 30445261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30445349 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 30445405 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 30445768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30446269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30446277 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30446358 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 30446366 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30446596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30446896 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 30447094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30447155 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30447166 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 30447194 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30447302 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30447411 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 30447612 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 30447744 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30447826 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30447860 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30447864 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30447895 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 30447925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30448185 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30448192 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30448219 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30448311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30448350 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30448369 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30448896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30448921 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30449418 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30449903 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30449919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30449932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30449994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30451096 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30451160 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30451267 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30451288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30451313 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30451477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30451737 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30451913 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30451944 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30451955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30452247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30452608 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30453345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30453371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30453380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30453446 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30453554 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30453594 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30453604 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30454541 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 30456038 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30456428 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30456856 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30456909 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30457008 T C N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 30457033 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30457743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30458068 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30458272 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 30458509 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30458580 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30458583 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30458987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30460654 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 30460673 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 30460985 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30461189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30461710 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30461727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30461872 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30461906 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30461908 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30461926 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30461931 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30462123 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30462334 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30462775 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 30466579 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 30467076 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30467345 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30467550 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30467614 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30467879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30467921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30468165 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30468368 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 30468597 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30468729 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30469124 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 30469660 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30470935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30471931 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30472072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30472160 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30472171 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30472177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30472242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30472334 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30472458 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30472521 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30472610 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30472636 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30473368 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30473753 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.0625 0.9375 0 17 15 1 15 0 3 30474100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30474196 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30474416 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30475805 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30476051 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 30477051 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 30477409 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30477639 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30477728 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30477799 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30478451 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 30478498 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30478521 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30478562 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30478598 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30478808 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30478851 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30478976 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30479049 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30479130 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30479388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30479616 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30479800 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30479848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30479905 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30479917 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30480052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30480210 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30480214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30480266 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30480480 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30480867 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 30481200 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30481489 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30481684 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30481947 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30482098 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30484070 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 30484626 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 30484992 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30485858 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30486916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30487494 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30487944 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30488012 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30488097 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30488657 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30488830 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30490175 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 30490257 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30490316 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30490328 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30490437 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30490468 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30490597 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30492146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30492359 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30492362 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30492585 T C N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 12 16 0 12 2 3 30492847 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30493124 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30494230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30494456 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30494691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30494829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30494850 C T Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 30494869 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30494970 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 30495173 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30496068 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30496110 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 30496207 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 30497443 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30497542 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30498862 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30499399 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 30499892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30499961 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30501958 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30502817 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30503155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30504153 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30504166 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30504847 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 30504985 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30506256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30514039 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30518755 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 30518758 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 30518786 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 30519470 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30519503 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30519528 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30519744 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 30519820 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30520065 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30520250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30520280 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30520312 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30520490 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30520496 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30521206 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30521223 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 30521859 C T Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 30522051 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 30522198 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 30522226 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 30522323 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 30522333 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30522414 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30522717 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 30523047 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 30523177 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 30523219 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30523252 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 30523896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30524547 C T Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 30525014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30525595 C T Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 30525853 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30526599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30527763 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30528300 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 30528316 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 30528682 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 30528982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30529040 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30529131 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 30529161 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30529190 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30529445 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 30529521 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30529532 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 30529537 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 30529625 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30529695 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30529699 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30529796 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30529797 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 30530030 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 30530038 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 30530060 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 30530099 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 30530103 A T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 30530195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30531257 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 30531401 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 30531796 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30532070 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 30532251 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 30534314 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 30536046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30536066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30536205 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30538020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30538989 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30538997 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30539017 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30539467 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30540018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30540061 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30541320 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30541785 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 30541793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30542705 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 30543860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30543890 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30544026 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 30544400 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 30544585 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 30544615 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30544624 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30544691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30544731 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 30546585 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30548075 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 30548611 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 30550553 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 30551087 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30551436 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30552269 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 30553753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30553912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30554702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30554761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30554812 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30555127 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30555356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30555559 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30556072 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 30556194 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 30556410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30556976 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 30557532 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30558869 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 30559901 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30560181 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30564115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30564312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30566347 A T Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 30566379 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30566659 G A Y Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 8 6 1 6 0 3 30567575 G A Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 30567600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30567622 C T Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 30567646 T G Y N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 30567734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30571039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30572394 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 30572630 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30573219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30574023 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30574204 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 30574550 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30574871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30574907 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30575408 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30575551 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30575829 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30576010 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30576409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30576567 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30577989 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30578980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30581156 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 30581716 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30581846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30581863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30582058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30582060 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30582079 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30582530 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30582560 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30582695 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 30582842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30583074 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 30583138 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30583636 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30583851 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 30584149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30584150 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30584451 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30584534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30584663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30584863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30585153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30585163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30585230 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 30585862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30586785 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 30586818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30587305 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 30587613 A G N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0 0.6 0.4 6 14 0 6 4 3 30587616 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 3 30587805 T A N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 30587853 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 30587912 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 30588014 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30588101 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 30588173 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 30588324 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 30588382 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 30588388 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 30588477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30588486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30588577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30588586 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30588619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30588673 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30588707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30588793 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30588956 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 30588963 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 30588969 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 30589065 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 30589094 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 30589103 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 30589126 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 30589211 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30589239 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30589316 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 30589409 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30589462 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 30589495 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 30589509 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 30589553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30589759 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 30589871 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 30589923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30590224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30590678 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30591021 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30591093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30591105 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 30591178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30591645 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 30591829 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 30592157 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30592311 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 30592364 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 30592448 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 30592456 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 30592484 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 30592485 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 30592566 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 30592652 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30592790 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 30593310 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 30593456 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 30593505 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 30593511 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 30593546 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 30593613 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 30593614 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 30593691 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 30593715 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30593962 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 30594162 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 30594204 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 30594239 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 30594252 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 30594661 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 30594902 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30594903 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30596580 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30596744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30596940 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30597079 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30597136 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 30597717 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30597813 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 30597835 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 30597929 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30598094 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30598177 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30598233 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 30598341 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30598430 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30598459 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 30598553 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30598678 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30598794 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30598900 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30598913 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30599102 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30599270 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 30599666 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30599777 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30599799 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30599977 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30599984 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30600527 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30600619 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30600642 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30600648 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30600710 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30600717 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30600768 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30600883 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30600890 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30600944 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30601045 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30601071 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30601099 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30601226 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30601258 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 30601268 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30601372 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30601473 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 30601529 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30601776 G T N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 30604079 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 30604097 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30604203 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 30604250 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30604434 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30604473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30604570 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30604575 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30604775 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 30604882 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 30604885 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 30605450 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30605933 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30606036 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30606153 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 30606377 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30606392 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30606610 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30606941 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30607130 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30608870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30609753 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 30610111 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30611269 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30611329 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30611391 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30611454 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30611493 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30611545 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30611590 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30611615 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30611827 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 30611847 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 30611849 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 30611940 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 30611944 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 30612007 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 30612053 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 30612101 C G N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 30612151 C A N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 30612154 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 30612181 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 30612366 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 30612370 C A N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 30612465 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 30612475 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 30612528 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 30612550 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 30612588 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 30612645 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 30612699 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30613204 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 30613285 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 30613649 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 30613819 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 30613899 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 30614225 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 30614283 G A N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 30614455 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 30614605 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 30614635 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 30614636 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 30614649 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 30614938 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 30615030 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 30615331 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30615363 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 30615369 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 30615393 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 30615412 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 30615464 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 30615503 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 30615529 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 30615559 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 30616007 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 30616229 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 30616234 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 30616275 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 30616492 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 30616642 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 30616828 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 30617618 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30617739 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30617840 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30617898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30617922 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 30617926 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 30617934 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30617979 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30617980 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30618063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30618152 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30618166 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30618489 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30618609 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30618694 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30618732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30618845 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30618857 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30619008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30619191 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30619308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30619535 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 30619593 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 30619692 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30619746 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 30619986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30620081 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30620089 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30620136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30621629 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30621689 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 30622016 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 30622248 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 30622371 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30622425 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30622482 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 30622606 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30622964 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 30623078 T C N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0 0.583333333333333 0.416666666666667 7 17 0 7 5 3 30623139 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 30623143 A G N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 3 30623161 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 30623222 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 30623256 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 30623268 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30623334 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30623405 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30623641 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 30623645 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30623681 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30623761 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30623792 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 30623835 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30624128 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 30624276 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 30624306 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30624308 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 30624379 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30624452 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30624496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30624986 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 30625148 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 30625154 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 30625170 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 30625300 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30625341 C A N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 30625412 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30625422 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30625449 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30625854 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30625995 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 30626282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30626289 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30626364 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 30626900 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 30626957 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 30626995 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30627065 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 30627220 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 30627483 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 30627511 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30627651 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 30627657 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 30628398 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 30629493 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30629895 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 30630196 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30630922 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30631441 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30631651 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30634187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30634233 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30635244 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30635762 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30636293 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30636335 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30636359 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30636736 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30637167 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30637177 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30637243 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 30637437 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 30637491 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 30637793 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 30637885 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30638249 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30638272 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30638286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30638332 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 30638354 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 30638359 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 30638399 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 30638404 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 30638432 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 30638636 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 30639086 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30639843 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30640419 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30640465 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30641056 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30642042 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30642344 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 30642655 T G N N 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0 0.9 0.1 9 11 0 9 1 3 30642685 G A Y Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 3 30642711 C G N N 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 3 30642902 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 30642934 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 30643075 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 30643113 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30643308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30643335 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30643358 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 30644668 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 30645487 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30646618 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30646938 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30647039 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30647837 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30649050 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30649280 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30649754 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30649851 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 30650542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30651531 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30651831 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 30651880 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30652040 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30652094 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 30652238 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 30652407 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 30652423 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 30652441 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 30652472 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30652668 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30652717 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30652790 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 30652864 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 30652876 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 30652900 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 30653341 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 30653699 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 30653712 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 30653763 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30653827 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 30654039 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30654088 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30654103 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30654194 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30654278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30654326 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 30655127 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 30655409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30655441 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 30655504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30655869 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 30655877 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 30655894 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 30655956 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 30656080 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 30656154 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 30656317 C A N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 30656427 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30656493 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 30656630 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 30656639 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30657434 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 30658006 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30658017 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30658798 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 30659240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30659677 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30659712 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30659826 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30662161 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30662383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30663939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30664503 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30664842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30665312 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 30665385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30665438 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 30665612 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 30665631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30665762 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30665866 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30666078 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 30666477 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30666502 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30666804 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 30666859 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30667237 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 30667278 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 30667287 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 30667451 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30667499 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 30667695 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30667860 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30668130 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 30668159 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 30668182 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 30668195 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 30668297 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30668326 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30668404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30668592 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30668849 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 30668938 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 30669027 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30669042 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30669247 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30669297 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30669299 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30669458 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 30669484 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 30669576 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 30669605 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 30669628 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 30669642 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 30669760 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 30669824 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 30670144 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 30670169 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 30670215 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30670251 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 30670382 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 30670397 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 30670404 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 30670417 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 30670427 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 30670627 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30670630 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30671871 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 30672065 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 30672143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30672358 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30673101 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30673698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30674179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30676268 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 30678975 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.235294117647059 0.705882352941177 0.0588235294117647 20 14 4 12 1 3 30679533 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 30680188 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30682626 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30682714 A G N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 12 8 3 6 1 3 30683046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30683129 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30683215 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30683264 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30683267 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30683286 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30683319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30683357 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30683625 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 30683633 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30683640 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 30683761 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 30684064 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30684128 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 30684143 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30684673 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 30685325 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30685438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30685498 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30685501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30685518 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30685597 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30686272 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30686298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30686306 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30686340 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30686367 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 30686538 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 30687002 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 30688057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30688442 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 30688630 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30689137 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30690481 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30691064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30691708 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30691842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30692430 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 30692485 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 30694649 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30696924 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 30697176 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30700642 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 30702412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30703408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30706634 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30707924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30710445 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 30712082 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30712870 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 30713708 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 30713710 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 30715405 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30719351 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30719577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30720189 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 30720236 C T Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 30720264 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 30720784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30720819 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30721139 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30721191 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 30721315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30721327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30721333 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 30721556 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 30721641 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30721701 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30721731 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 30721759 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 30721760 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 30721899 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 30721991 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30722035 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30722313 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 30722501 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30722806 G C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 30722839 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 30722878 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 30723615 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30723991 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30724039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30724924 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30725915 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 30727056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30727270 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 30727309 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30727545 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30727668 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 30729506 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 30730627 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 30731063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30731319 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 30731361 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 30731392 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 30731402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30731696 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30732083 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 30732126 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30732591 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30732651 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 30733094 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 30733275 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 30733284 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30733300 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30733358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30733410 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 30733480 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30733644 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30734021 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 30734371 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 30734602 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 30734931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30739041 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 30739159 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 30739404 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30739907 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30740634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30740878 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30741982 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 30744117 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30745089 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30746672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30746972 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30747256 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30747555 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30747752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30748218 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30748657 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30748724 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30750550 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30751922 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30751929 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30752022 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30752127 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 30752337 G A Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 30752644 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30752711 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30753501 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30753844 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30754500 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30754960 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 30756027 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30756246 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 30756430 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 30756712 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30756723 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30757486 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 30758162 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 30760116 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 30760665 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30762725 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30763533 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30763694 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30763866 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30763898 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30763985 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30764048 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 30764135 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30764173 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30764180 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 30764224 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30764253 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 30764265 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30764355 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 30764371 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 30764429 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 30764524 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30764541 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30764570 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 30764611 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 30764653 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 30764907 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 30765117 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 30765155 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 30765156 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 30765176 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 30765192 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 30765198 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 30765234 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 30765288 G A Y Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 30765391 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 30765437 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 30765619 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30765625 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 30765701 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30765716 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30765721 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30765738 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30765777 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 30765840 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30765970 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30765979 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 30766024 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30766215 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 30766559 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30766567 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30766781 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 30766786 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 30766799 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 30766860 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 30766943 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30767025 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 30774323 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30775041 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 30775781 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 30775852 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 30777995 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30778508 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 30778775 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 30779790 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30779892 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 30779900 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30779940 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 30780061 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 30780074 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 30780236 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 30780274 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 30780515 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 30780547 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 30780576 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 30780701 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30780832 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 30780993 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 30781009 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 30781209 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 30781471 C G N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 30782068 C A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 30782226 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 30783680 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 30784107 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30784123 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30784481 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 30784734 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30784934 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30784960 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30784970 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 30785731 C T Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 30785942 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 30786296 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 30786395 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30786712 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30786771 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 30787419 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 30787430 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 30787630 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 30787803 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 30787817 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30788274 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 30788353 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 30788387 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 30788491 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 30788492 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 30788582 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 30788627 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 30788842 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 30788850 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 30789194 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 30789331 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 30789336 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 30789401 A G N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 3 30789451 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 30789645 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 30789961 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30790894 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 30791065 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 30791146 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30791517 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30791661 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 30792313 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 30792486 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 30792584 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30792744 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 30793027 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 30793045 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 30793262 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30793342 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 30793401 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30793491 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 30793606 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 30793701 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 30793973 T A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 30794460 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 30795849 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30796278 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 30796377 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30796588 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 30796702 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30796757 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 30797409 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30797443 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30797531 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 30798005 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30798058 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 30798604 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 30799299 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30799821 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 30800328 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 30800394 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30801327 G T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 30801941 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 30802356 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 30802385 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30804049 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30805137 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30805723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30806519 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30807117 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30807118 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 30807261 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30807308 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 30808041 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 30808474 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30808495 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 30808589 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 30808593 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 30809081 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30810184 G A N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.2 0 0.8 4 16 2 0 8 3 30810189 T C N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.2 0 0.8 4 16 2 0 8 3 30810998 A T Y N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.25 0.583333333333333 0.166666666666667 13 11 3 7 2 3 30811015 G C Y N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.153846153846154 0.615384615384615 0.230769230769231 12 14 2 8 3 3 30811035 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 30811061 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 30811164 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 30811287 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 30811442 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 30811641 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 30811783 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 30811953 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 30812227 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 30812276 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 30813413 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 30813651 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 30814060 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 30814136 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 30814251 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 30814420 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 30814443 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 30814647 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 30814675 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 30814807 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30814950 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 30815212 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 30815409 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30816159 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 30816808 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30816840 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30816845 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30816851 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 30816858 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 30816879 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30816929 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 30816958 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 30816995 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 30817019 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30817113 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30817620 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 30817635 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 30817728 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 30817782 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 30818065 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30818319 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 30818337 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30818436 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30820034 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 30820491 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30821088 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30822401 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 30825644 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 30826465 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30826872 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30827174 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30827227 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30827240 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30827640 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30827898 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 30828331 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30828343 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 30828366 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30828418 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30828692 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 30829113 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 30829466 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 30829506 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 30829918 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30832115 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 30832323 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30832337 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30833951 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 30836170 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 30836203 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 30836211 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 30836242 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 30836254 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 30836275 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 30836516 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30836584 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 30836939 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 30837139 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 30837449 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 30837495 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 30837696 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 30837733 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 30837814 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 30837819 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 30837832 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 30838053 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 30838226 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 30838259 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 30838299 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30838368 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30838517 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30838718 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 30838986 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 30839031 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 30839109 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 30839167 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 30839317 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 30839413 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 30839506 T C N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 3 30839517 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 3 30839744 A T N N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 30839754 G T N N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 30839764 A G N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 30839879 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 30839888 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 30839924 A C N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 30839987 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 30840120 A T Y N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 30840231 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 30840327 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30840358 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30840613 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 30840622 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 30840760 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 30841004 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 30841012 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 30841221 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 30841234 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 30841623 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 30842562 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 30842604 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 30842627 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 30842632 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 30842725 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 30842739 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 30842772 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 30842797 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 30842834 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 30843026 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 30843090 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 30843187 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 30843330 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 30843418 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 30843422 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 30843475 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 30843617 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 30843641 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 30843642 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 30843705 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 30843731 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 30843866 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 30843982 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 30844056 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 30844153 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 30844165 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 30844258 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 30844307 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 30844309 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 30844406 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 30844454 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 30844458 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 30844495 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 30844509 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 30844510 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 30844528 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 30844609 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 30844776 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 30844979 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30845255 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30845976 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30846305 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 30846677 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 30846876 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 30846916 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 30846965 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 30846999 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 30847054 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 30847077 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 30847149 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 30847247 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 30847297 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 30847428 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 30847496 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30848081 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 30848137 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 30848309 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 30848321 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 30848351 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 30848486 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 30848904 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 30848937 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30849106 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30849525 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 30849834 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30849962 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30849972 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 30849973 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30850608 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30850880 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30850888 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30850941 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 30851294 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 30851997 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 30852241 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30852272 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 30852352 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30852463 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30852477 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30852693 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 30853183 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30853807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30856184 G A Y Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0 0.9 0.1 9 11 0 9 1 3 30857433 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30858277 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30858307 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30858949 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30859559 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 30859606 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 30859889 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 30860044 C T N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 30860525 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 30860551 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 30862002 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30863208 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 30863831 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30864615 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30864618 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30864809 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30865542 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 30867547 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 30871312 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 30872304 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30872328 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30872338 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30872357 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30872364 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30872404 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30872446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30872498 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 30872532 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 30872536 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 30873140 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 30873533 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 30873661 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30874302 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 30875283 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 30880598 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30881652 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30881869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30882102 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 30882231 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30882665 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 30882729 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30882799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30882808 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30882899 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30882922 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 30883073 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30883368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30883537 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30883547 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30883997 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30884027 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30884112 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 30884271 T C Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 3 30884538 A T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 30884634 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 30884914 A G Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 30885003 A G Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 3 30885114 A G Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 30885238 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 30885347 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 30885476 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.0526315789473684 0.842105263157895 0.105263157894737 18 20 1 16 2 3 30885910 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 30885926 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 30885940 C G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 30885951 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30886009 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 30886024 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 30886025 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 30886042 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 30886264 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 30886283 T G N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 3 30886659 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 30886889 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30887118 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 30887140 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30887318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30887473 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 30887475 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 30887635 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 30887666 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 30887759 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 30888012 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 30888101 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 30888123 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30888151 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30888249 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30888264 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30888328 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30888451 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30888581 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 30888617 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 30888688 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30888693 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30888813 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 30888934 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 30888937 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 30888960 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 30888961 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 30889089 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 30889183 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 30889217 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30889269 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30889287 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 30889315 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30889354 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30889458 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30889479 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30889542 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30889561 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30889817 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 30889842 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 30889897 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 30890020 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 30890048 C T Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 30890158 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 30890174 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30890291 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30890318 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30890380 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 30890397 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30890508 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 30890510 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 30890541 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 30890606 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 30890670 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 30890711 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 30890761 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30890780 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30890792 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 30890810 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 30890942 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30890949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30890986 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 30891050 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 30891183 C G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 30891256 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30891259 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30891464 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30891472 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30891508 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30891598 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30891703 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30891770 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30891788 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30891955 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30892492 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 30892524 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 30893355 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 30893412 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 30893488 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 30893538 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 30893614 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30893624 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 30893625 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 30893641 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 30893797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30893806 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 30893843 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 30893964 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30894037 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 30894144 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 30894185 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 30894197 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 30894235 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30894254 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30894257 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30894309 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30894414 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 30894515 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 30895019 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30895106 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 30895189 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30896498 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30896684 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30896734 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30896815 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30898530 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30898617 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30899248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30899377 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30900876 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30900959 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30901508 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 30901518 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30903078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30904040 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30904055 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30904942 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30904990 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30905633 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30905935 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 30906432 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 30906489 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30906589 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 30906624 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30908535 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30910124 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30910131 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 30910322 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 30910327 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 30910408 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30910606 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 30911653 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 30911753 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 30911905 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 30911961 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 30911999 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 30912122 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 30912798 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 30912870 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30913079 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 30913275 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 30913285 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 30913443 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 30913542 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 30913621 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 30914354 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 30914364 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30914426 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 30914505 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 30914510 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 30914663 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 30914778 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 30915237 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30915253 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 30915314 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 30915367 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30915388 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30915470 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30915475 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30915565 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30915622 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 30915665 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30915751 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 30915851 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 30916046 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30916078 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 30916188 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30916189 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30916234 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 30916461 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 30916556 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30916616 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 30916617 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30916643 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30916753 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 30916766 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30916808 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30916816 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30916889 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30916895 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 30917123 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 30917887 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30918599 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 30918707 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 30918861 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 30918925 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30918989 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 30919116 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 30919211 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30919254 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30919316 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 30919487 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 30919494 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 30919635 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 30919850 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30920152 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30920290 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 30921005 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30921022 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 30921326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30921558 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 30922408 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30922423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30922794 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 30922822 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30923180 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 30923217 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30923370 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30923393 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30923451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30923492 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30924107 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 30924256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30924307 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30924329 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 30924452 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30924703 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 30924714 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 30924777 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 30924835 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 30925061 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30925253 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 30925551 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 30925578 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 30925593 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 30925601 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 30925611 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 30925620 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30925759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30925789 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30925843 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 30925931 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 30926069 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 30926100 C G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 30926123 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 30926225 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30926513 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 30926668 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30926705 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 30926731 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 30926792 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 30926913 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 30926924 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 30926936 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30927001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30927125 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30927181 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 30927294 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 30927362 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30927559 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 30927624 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 30927806 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 30927822 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30927891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30927925 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30928502 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 30928619 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30928630 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30928643 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 30928653 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30928676 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30928729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30928740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30928797 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 30928858 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 30928870 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 30929167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30929201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30929344 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 30929517 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 30929567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30929614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30929655 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30929786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30929815 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 30929843 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30929882 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30929930 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30930857 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 30930886 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30931013 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 30931538 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30931541 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30931831 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30932010 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30932415 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 30932714 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 30932740 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 30933007 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30933086 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 30933899 T C N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 30934085 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 30934117 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30934310 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30934428 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 30934540 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30934737 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 30934833 A C N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 30934948 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 30935686 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30935708 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 30935821 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 30935866 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30935884 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30936812 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 30936896 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 30937031 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 30937146 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30937292 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30937377 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30937476 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30937693 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 30937840 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30937917 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30937928 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30937938 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30938240 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 30938380 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 30938741 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 30938951 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 30939026 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 30939196 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 30939359 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 30939368 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 30939440 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 30939640 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 30939700 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 30939718 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 30939730 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 30939733 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 30939742 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 30939926 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 30940299 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 30940618 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 30940627 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 30940740 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 30940937 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 30940960 A T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 30941119 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 30941177 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 30941185 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 30941202 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 30941215 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 30941411 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 30941636 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30941905 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 30942302 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 30942566 G T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 30943092 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30943094 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 30943242 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30943324 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 30943333 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 30944895 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30945334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30945704 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30946189 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30946435 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 30946725 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 30946761 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 30947071 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 30949059 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 30949236 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30952000 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 30952004 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 30953280 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30953424 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30953567 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30953604 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 30953608 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 30954343 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30954940 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 30955040 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30955050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30955054 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 30955764 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30955924 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 30956021 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30956154 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 30956165 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 30956350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30956571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30956572 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30956589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30956748 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 30956849 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 30957142 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30957164 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30957216 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 30957362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30957471 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 30957529 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30957583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30957668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30957678 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30957703 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30957948 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30957955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30957999 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 30958019 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30958157 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30958175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30958186 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30958237 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30958418 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 30958446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30958548 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 30958904 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30959107 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 30959149 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 30959208 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 30959242 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 30959494 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 30959551 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 30959560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30959656 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30959669 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 30959717 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30959790 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30959816 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 30959850 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30959881 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30959895 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 30959902 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30959990 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30960011 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 30960330 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 30960418 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30961072 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 30961305 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30961395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30961664 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 30961679 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30961939 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 30962011 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 30962094 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 30962099 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 30962120 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30962321 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 30962670 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30962740 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 30962810 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30962938 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30963049 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 30963107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30963318 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 30963331 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30963342 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 30963348 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 30963365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30963426 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30963564 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 30963752 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 30964026 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30964273 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 30964305 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 30964524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30964591 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 30964989 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30965130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30965164 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 30965378 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 30965424 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 30965706 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 30965798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30966827 C T Y Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 8 8 2 4 2 3 30966831 G A Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 30967806 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 30968523 A C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 30968713 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 30968747 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30969841 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 30969986 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 30969995 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30970010 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 30970503 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 30970564 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30970716 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30971158 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 30971214 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 30971222 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 30971283 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 30971321 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30971880 C T N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 30971881 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 30971925 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 30972064 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 30972258 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 30972483 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 30972544 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 30972835 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 30974509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30974610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30974679 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 30974718 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30975069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30975213 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30975265 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30975816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30975894 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30976760 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30977153 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30977632 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30978774 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30979423 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 30979483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30979747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30980121 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30980233 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30980642 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30981671 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30982634 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 30984051 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30984414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30984463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30991032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30996864 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 30997408 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30997767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 30997796 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30997806 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30997808 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 30997929 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30997934 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30997968 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30997987 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30998048 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30998084 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 30998304 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 30998350 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 30998404 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 30998432 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 30998795 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 30998952 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 30999273 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 30999694 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 30999721 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31000181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31000707 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31000898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31002096 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31002436 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31002580 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31002639 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31002918 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31002944 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31002989 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31003108 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31003295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31003326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31003423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31003566 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31003577 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31003588 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31003645 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 31003654 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 31003663 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 31003741 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31004149 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31004252 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31004469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31004620 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31004713 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 31004902 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 31004921 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 31005285 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 31005311 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31005320 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31005350 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31005398 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 31006004 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31006102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31006682 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31006778 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31007793 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31008045 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 31008275 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 31009114 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 31009484 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31009553 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31009648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31009652 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31009939 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31010041 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31010899 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31011806 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31012685 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 31015099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31018492 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 31020159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31020288 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 31020556 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 31020672 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 31022986 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31023488 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31023700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31023770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31024749 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31025351 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31025754 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31026527 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 31027251 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31028112 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 31028298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31028584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31029600 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 31029607 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31029796 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 31032219 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31034055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31034835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31035180 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 31035896 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31036091 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 31036135 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 31036140 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 31036180 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 31036288 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 31036391 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31036395 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 31037553 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31038279 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31042841 A G Y Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 31042863 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 31043745 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 31043788 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 31044583 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 31044682 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 31044854 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 31045842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31046266 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31046549 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 31046581 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 31046617 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 31046691 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 31046732 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31046940 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31046993 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 31047623 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31048926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31049706 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31050204 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31050356 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31050366 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31051066 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31052184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31052260 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31052464 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31052945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31053082 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31053172 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31053192 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31053352 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31053516 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31053932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31054974 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 31055266 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31055289 A C N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 31055290 T A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 31055334 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31055415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31056944 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31057226 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31057592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31058028 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 31058282 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 31058379 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31058404 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 31058433 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 31058452 G A Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 31058505 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 31058818 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 31058820 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 31058940 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31060282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31060459 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 31060484 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 31060500 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 31060701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31060703 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31061159 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 31061247 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31061424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31061438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31061444 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31061488 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 31061600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31063189 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31063416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31063548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31065852 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 31065853 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 31065912 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31066025 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 31066110 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 31066158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31066449 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 31066521 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 31066534 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 31066580 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 31066629 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31066755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31066790 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31067001 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31067004 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31067051 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 31067203 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 31067258 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 31067595 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 31067783 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 31068028 A T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 31068102 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 31068213 G C Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 31068235 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31068314 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31068401 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31068448 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31068646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31068681 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31068692 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 31068846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31069352 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31069446 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31069452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31069517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31069669 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31069698 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 31069861 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31070175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31070194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31070589 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31071427 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 31072864 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31073245 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31075068 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31078439 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 31078473 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31078607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31078722 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31078734 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31078973 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31078982 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31079094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31079130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31079159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31079190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31079237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31079275 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31079909 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 31087972 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 31088411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31089390 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31089766 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31090006 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 31090114 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 31090118 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 31090376 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31090421 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31090438 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 31090710 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 31091184 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31091769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31091795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31092016 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31092138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31092155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31092651 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 31092705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31092850 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31092999 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 31093030 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31093629 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31093766 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 31093827 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 31094886 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31095322 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 31095821 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31095986 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31096296 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31096425 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 31096472 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31096538 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31096694 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31097036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31097109 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31097136 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31097168 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 31097194 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 31097244 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 31097251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31097318 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 31097454 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 31097523 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 31097541 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31097548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31097569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31097615 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 31097759 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 31097881 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 31097968 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 31097989 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 31098007 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 31098057 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 31098091 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 31098114 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31098197 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 31098262 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 31098282 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 31098348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31098367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31098394 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 31099079 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 31099502 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 31099675 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 31099677 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 31099707 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 31099796 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 31099847 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 31099849 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31099883 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 31099927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31099965 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31101375 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 31101430 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31101590 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 31101612 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 31101623 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 31101625 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 31102022 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 31102373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31102921 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 31103121 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31103441 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31103820 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31104140 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31104237 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 31104264 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 31104304 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 31104327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31104667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31105060 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31105074 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 31105117 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 31105426 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 31105433 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 31105546 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 31105570 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 31105687 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 31105710 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 31105767 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 31105797 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 31105802 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 31106152 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 31106500 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31106770 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31107364 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31107518 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 31107573 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 31107603 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 31107838 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31107894 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31108366 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 31108433 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 31108462 C T Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 31108519 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 31108605 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 31108762 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 31109022 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31109137 T G Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 31109143 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 31109422 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 31109423 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 31110010 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 31110116 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31110262 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 31110338 T A Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 31110339 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 31110556 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31111480 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 31111507 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 31111696 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 31111808 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 31111848 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 31111901 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 31111947 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31111955 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 31112270 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 31112674 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 31114310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31114431 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31114522 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 31114854 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31114871 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 31115012 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 31115066 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 31115122 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31115256 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 31115353 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31115470 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31115779 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 31115781 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 31115813 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 31116017 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31116205 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31116294 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31116429 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 31116438 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31116768 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 31116826 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31116855 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31117008 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 31117014 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 31117102 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 31117108 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31118313 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 31118565 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 31118701 A G Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 31118823 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 31118885 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 31119221 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 31119340 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 31119783 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 31119904 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 31119940 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 31120009 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 31120309 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 31120402 C T Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 31120411 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 31120631 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31120637 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31120684 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 31120693 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 31120705 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31121564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31123517 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 31123611 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.4375 0.1875 0.375 17 15 7 3 6 3 31124183 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31124272 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31124599 C A N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.357142857142857 0.214285714285714 0.428571428571429 13 15 5 3 6 3 31124876 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31125029 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31125043 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31125129 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 31125714 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31126460 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31126506 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31126765 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31127057 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 31127692 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 31127730 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 31127990 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 31128818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31128956 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 31128978 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31129062 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 31129501 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 31129668 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 31129805 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 31130578 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 31133289 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31133625 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 31134288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31135337 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31135492 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 31135496 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 31135744 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31135841 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31135971 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31136270 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31136462 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31136922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31137166 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 31137216 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 31137407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31137438 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31137460 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 31137488 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31137504 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 31137507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31137613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31137776 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 31137793 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31137821 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31137838 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 31137858 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 31137862 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 31137871 T G Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 31137889 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 31137895 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 31137944 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 31137955 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31137986 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 31137996 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 31138002 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 31138530 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 31138576 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 31138926 G C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 31139125 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 31139211 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 31139250 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 31139290 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 31139308 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 31139314 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 31139343 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 31139351 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 31139603 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 31139639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31139645 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 31139675 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 31139811 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 31140083 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31140178 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 31140462 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 31140492 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 31140550 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 31140608 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 31140949 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 31141408 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 31141437 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 31141560 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31141586 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 31141660 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 31141665 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31141711 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 31141776 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 31141779 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31141833 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 31141839 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 31142001 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 31142204 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 31142434 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 31142544 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 31142557 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 31142594 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 31142606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31142696 C A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 31142796 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 31142808 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 31142818 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 31142833 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 31142911 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 31142961 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 31143064 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 31143446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31143578 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 31143812 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 31143835 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31144035 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 31144050 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31144399 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 31144602 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31144779 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31144878 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 31144927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31144984 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 31145155 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31145261 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 31145269 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31145283 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31145449 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31145452 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 31145482 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 31145769 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31146260 T C Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 31146552 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 31146937 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 31147040 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 31147662 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31147912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31147935 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31147957 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31148034 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31148143 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31148156 A T N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 31148587 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31148735 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31148746 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31148822 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31148941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31148977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31149083 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 31149283 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31149370 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 31149426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31149699 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31149762 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31149792 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31149819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31149901 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 31149990 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 31150073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31150712 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 31151436 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31151909 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 31151965 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 31152813 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31152960 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 31153310 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 31153584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31153813 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 31154055 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 31154249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31154315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31154671 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 31154674 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 31154841 T C N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 3 31155458 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 31155540 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 31155565 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 31155713 C A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 31155771 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 31155777 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 31155789 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 31156195 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 31156211 A G N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 31156221 A G N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 31156254 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 31156268 A G N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 31156281 A G N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 31156293 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 31156306 A G N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 3 31156317 T C N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 31156439 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 31156636 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 31156744 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 31157124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31157128 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 31157481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31157849 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31157907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31158271 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31158413 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 31159126 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 31159186 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 31159232 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 31159256 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 31159497 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 31159575 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 31159710 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 31159743 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 31160076 G C Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 31160188 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 31160233 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 31160297 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 31160334 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31160383 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 31161159 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 31161170 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 31161534 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 31161945 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 31162838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31163441 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 31164548 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 31164584 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 31165221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31165269 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 31165615 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 31166177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31166229 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 31166515 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 31166637 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 31166937 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 31166967 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 31167049 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 31167569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31167759 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 31167839 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 31168146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31168490 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 31168495 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 31168806 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 31168870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31168875 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 31169022 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 31169068 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31169183 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31169280 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 31169320 C T N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 31169382 T C N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 10 10 3 4 3 3 31169447 A T N N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 9 9 3 3 3 3 31169518 A T Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 31169697 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31169878 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 31169894 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31169969 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 31170092 C T N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 31170345 C A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 31170557 T G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 31170623 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31170689 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31170702 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31170798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31170985 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 31171114 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 31171305 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31171365 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31171467 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 31171867 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 31172044 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 31172065 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 31172081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31172510 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 31172727 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 31173132 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 31173159 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 31173208 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 31173336 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 31173411 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 31173459 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31173783 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 31174250 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 31175082 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 31175162 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 31175198 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31175269 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31175498 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 31175592 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 31175639 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 31175741 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 31175821 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 31175899 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 31176007 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 31176159 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 31176314 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 31176319 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 31176332 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 31176444 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 31176530 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 31176655 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 31176659 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31176876 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31177198 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 31177431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31178031 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 31178066 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31178078 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31178098 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31178110 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31178227 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 31178252 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31179353 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31179488 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31179771 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 31179772 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 31179949 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 31180071 C T Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 31180094 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31180111 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31180129 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 31180187 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 31180194 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 31180472 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 31180643 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31180673 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31180821 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 31180922 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 31180956 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31181019 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 31181030 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 31181088 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 31181130 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 31181663 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31181737 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31181861 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 31181869 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 31181906 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 31182207 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 31182315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31183354 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 31183722 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 31183741 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 31183797 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 31183847 A T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 31183866 A G Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 31183875 T C Y Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 31183970 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31184219 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 31184220 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 31184240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31184616 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 31184618 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31184630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31184656 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 31184720 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 31185101 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 31185102 T G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 31185560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31185595 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 31185612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31185613 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 31185652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31185726 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 31185727 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 31185753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31185923 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31185973 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31185982 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 31186123 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 31186176 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31186221 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 31186446 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31186461 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 31186482 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 31186703 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 31186945 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31186971 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31186990 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31187092 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31187273 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31187379 G T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 31187384 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 31187466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31187467 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 31187534 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31188271 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 31188337 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 31188362 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 31188748 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 31189337 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31189840 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 31189898 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 31189984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31190117 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 31190191 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 31190209 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 31190359 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31190412 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 31190413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31190549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31190647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31190755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31191398 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 31191599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31191706 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31191932 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 31192044 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 31192135 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 31192644 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 31194780 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 31195158 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 31195372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31195380 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31195522 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 31195550 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31195645 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 31195719 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31195759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31195867 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31195892 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31195998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31196139 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 31196204 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31196213 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31196268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31196301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31196310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31196336 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31196709 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31196716 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 31196979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31197052 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 31197272 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31197376 T G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 31197477 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 31197613 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 31198124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31198591 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 31198628 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 31198660 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 31199027 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 31199386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31199425 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 31199436 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 31199486 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 31199604 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 31199679 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 31199750 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 31199839 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 31199855 A C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 31199873 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 31200020 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 31200084 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 31200154 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 31200204 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 31200454 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 31200486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31200711 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 31200874 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 31200875 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 31200914 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 31201037 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 31201094 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 31201134 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 31201161 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 31201164 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 31201182 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 31201205 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 31201251 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 31201305 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 31201514 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 31201608 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 31201665 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 31201815 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 31202039 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 31202433 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 31202557 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 31202630 T C Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 31203310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31203329 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 31203379 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 31203430 A T Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 31203739 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 31204119 A C Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.235294117647059 0.705882352941177 0.0588235294117647 20 14 4 12 1 3 31204120 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 3 31204172 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 31204229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31204270 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31204343 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31204386 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 31204596 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 31204900 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31204993 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 31205050 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31205077 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31205518 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 31205534 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31205792 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 31205913 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 31205948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31206050 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 31206161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31207712 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31208120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31209194 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31209204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31209630 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31210429 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31210494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31212338 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31212474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31213142 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31214741 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 31214755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31214772 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 31215034 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 31215079 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31215100 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.375 0.125 0.5 14 18 6 2 8 3 31215379 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 31215546 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 3 31215622 T G Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 31215933 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 31216016 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 31216281 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 31216426 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31216761 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 31216845 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31217038 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 31217114 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31217162 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 31217199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31217200 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31217801 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 31217838 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31217867 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31217982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31218147 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 31218182 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 31218425 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 31218505 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 31218607 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31218885 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 31219216 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 31219265 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 31219278 T A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 31219459 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 31219515 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 31219594 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 31219645 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 31219677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31219723 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 31219854 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 31219868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31219894 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 31219903 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 31219923 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 31219970 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 31220393 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 31220504 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 31220616 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 31220663 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 31220738 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 31220793 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 31220906 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 31220922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31220950 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 31221307 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 31221584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31221767 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31222481 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 31222506 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 31222744 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 31223145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31223245 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31224859 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31225234 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31225338 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31226317 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 3 31226998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31227117 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31227728 A G Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 31227798 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 31227843 T C Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 31227902 T C Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 31228167 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 31228357 T A Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 31228488 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 31229332 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 31229517 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31229859 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31230687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31230958 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 31231984 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31232203 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 31232327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31232360 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31233122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31233861 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31233870 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31233984 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31235057 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31235384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31235783 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31235967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31236631 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31238075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31238696 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 31238889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31239177 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31239349 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 31239364 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 31239511 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 31242115 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31242206 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31242244 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31242350 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 31242366 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 31242384 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31242397 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 31242601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31244329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31245754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31248435 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31248575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31257516 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 31260157 A T Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 31260510 C G Y N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 3 31260720 A G Y Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 3 31261193 C A Y N 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.375 0 0.625 6 10 3 0 5 3 31262910 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 31263834 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31263850 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31264907 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31265451 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 31265717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31267065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31267343 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31267386 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 31270600 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31270959 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 31271113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31271115 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 31272167 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31274412 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 31274552 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 31274746 A G N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.428571428571429 0.0714285714285714 0.5 13 15 6 1 7 3 31274891 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 31274934 G A N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.214285714285714 21 7 10 1 3 3 31275263 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 31275345 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 31282615 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 31282701 C A Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 31282727 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 31282818 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.25 0.333333333333333 0.416666666666667 10 14 3 4 5 3 31282889 T A Y N 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.4 0 0.6 4 6 2 0 3 3 31283356 T A Y N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 31283512 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 31283575 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31283745 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 31283807 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31283895 C A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 31284100 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 31284155 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 31284171 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31284204 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 31284205 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31284230 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 31284252 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 31284264 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 31284445 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31284520 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31284527 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31284720 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31284754 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 31284927 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 31285045 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31285052 T A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 31285064 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 31285152 G A Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 31285169 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 31285221 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 31285269 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 31285340 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31285376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31285377 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 31285517 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 31285638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31285641 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 31285706 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31285835 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31285949 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 31285952 G C Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 31285981 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 31286117 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 31286124 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 31286148 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 31286240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31286344 A T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 31286517 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 31286543 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31286618 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 31286633 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31286964 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 3 31287365 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 31287384 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 31287456 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31287525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31287637 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 31288043 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 31288053 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31288408 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31288483 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 31288565 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 31288868 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31288978 C G Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 31289185 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 31289229 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 31289432 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 31289484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31289603 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 31289691 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31289711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31290024 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 31290077 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 31290446 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 31290638 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31290699 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 31290774 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 31290777 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 31290846 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 31290861 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 31291053 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 31291060 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 31291078 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 31291125 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 31291204 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 31291256 G T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 31291348 A G Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 3 31291420 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 3 31291423 A G Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.571428571428571 0.214285714285714 0.214285714285714 19 9 8 3 3 3 31291441 T G N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 3 31291475 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 31291709 G T Y N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.363636363636364 0.181818181818182 0.454545454545455 10 12 4 2 5 3 31291910 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 31291918 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 31291958 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 31292043 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 31292080 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 31292365 G T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 31292394 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 31292423 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 31292437 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 31292449 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31292511 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 31292525 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 31292627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31292718 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 31292813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31292872 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 31292949 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 31292998 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 31293194 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 31293196 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 31293252 C G Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 31293300 G A Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 31293312 T A Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 31293542 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 31293562 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 31293627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31293859 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31294080 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 31294316 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 31294342 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 31294593 T A Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.2 23 7 11 1 3 3 31294676 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 31294877 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 31294929 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.294117647058824 0.117647058823529 0.588235294117647 12 22 5 2 10 3 31295313 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31295372 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 31295481 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 31295859 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 31296807 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31299707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31301676 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31301942 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31302136 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31302630 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 31302980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31303199 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31303641 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 31304435 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 31304681 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 31304709 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 31305111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31305391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31305921 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 31305955 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 31307850 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31309112 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31309192 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 31309287 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31309728 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31310096 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31311016 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 31311192 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 31311297 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 31311375 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31311500 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 31311611 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 31311669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31311709 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 31311794 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 31311796 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 31311834 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 31311868 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 31311997 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 31312047 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 31312100 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 31312102 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31312157 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31312169 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 31312499 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 31312550 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 31312552 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 31312833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31313060 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 31313305 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31313829 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31314005 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31314033 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 31314200 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31314208 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 31314234 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 31314252 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 31314432 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31314441 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 31314494 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 31314603 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31314770 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31314869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31315135 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 31315144 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31315216 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 31315241 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 31315245 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 31315401 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31315472 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31315503 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31315535 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31315617 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 31315788 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31315871 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31315992 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 31315994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31316064 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31316286 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 31316399 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 31316415 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 31316456 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 31316543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31316896 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 31316939 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31316964 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31317283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31317284 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31317477 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31317528 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31317666 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31317767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31317780 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31317805 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31317824 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31317829 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31317855 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31317884 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 31317961 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 31317992 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31318077 T A N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 31318089 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 31318128 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31318295 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31318320 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31318412 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 31318542 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31318595 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31318668 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31318746 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 31318843 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31319063 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31319126 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 31319158 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 31319207 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31319322 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 31319450 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 31319496 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31319572 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 31319604 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31319638 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31319654 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 31319709 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 31319713 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31319735 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 31319788 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31319790 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31319804 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31319805 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31319848 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31319899 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 31319900 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31319910 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 31319961 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 31319973 A T N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 31319999 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 31320005 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 31320065 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31320155 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31320340 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 31320345 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31320387 C T Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 3 31320773 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 31320836 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 31320874 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 31321036 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 31322953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31322980 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31323143 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 31323245 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31323303 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31323347 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31323540 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31323561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31323821 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 31323853 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 31323907 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 31323922 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 31324020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31324079 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 31324084 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31324112 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 31324151 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31324164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31324172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31324196 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 31324272 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 31324489 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 31324614 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31324647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31324914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31324925 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 31324952 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 31324978 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31325017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31325052 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31325078 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 31325141 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 31325149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31325241 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 31325294 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 31325352 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 31325452 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 31325490 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31325645 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 31325732 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31325758 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 31325780 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 31325813 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 31325987 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 31325995 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31326186 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 31326215 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31326257 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 31326396 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 31326581 G C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 31326626 T C N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.307692307692308 0.230769230769231 0.461538461538462 11 15 4 3 6 3 31326632 T C N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 3 31327206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31327216 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31327249 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 31327287 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31327356 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 31327486 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 31327589 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 31327672 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 31327720 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 31327909 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 31327942 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 31328056 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31328148 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 31328155 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 31328218 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31328236 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31328426 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 31328575 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 31328619 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31328933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31329001 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31329046 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 31329054 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 31329145 C T Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 31329151 T G Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 31329366 G A Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 31329556 C A Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 31329602 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 31329695 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 31329768 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31329788 C A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 31329851 A G Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 31329868 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 31330250 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 31330277 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 31330333 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 31330580 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 31330595 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31330887 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 31330942 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 31330981 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31331001 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31331043 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31331143 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 31331214 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 31331277 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31331360 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 31331667 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 31331736 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31331844 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 31331897 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 31332114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31332121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31332132 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31332166 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 31332196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31332248 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31332300 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 31332319 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31332409 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31332881 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 31332900 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 31332941 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 31332960 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31332984 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 31332992 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31333056 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31333169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31333215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31333264 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31333489 G A Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 31333509 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31333536 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 31333867 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 31333965 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 31334039 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31334053 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 31334729 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 31334757 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 31334832 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31334926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31335008 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 31337344 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 31337524 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 31337564 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 31337582 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 31337830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31338128 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 31338203 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 31339364 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 31340914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31342494 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31344190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31345078 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31345157 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 31348713 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31349847 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31351393 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31351801 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31352592 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31352717 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31353087 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 31353159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31353465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31353886 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31354070 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31354286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31354442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31354548 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31354608 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31354648 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31354695 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 31355032 T G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 31355174 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 31355200 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 31355555 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 31355578 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 31355881 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31355909 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31355948 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 31356021 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 31356067 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31356200 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 31356273 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 31356466 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 31356587 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 31356597 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 31356626 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 31356641 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31356965 G C N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 31357216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31357302 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31357460 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31357468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31357592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31357806 C A Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 31358073 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 31358237 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 31362763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31364431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31366399 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 31366417 A T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 31366800 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31376695 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31379059 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31379500 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31382004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31383342 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 31383392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31383863 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31387865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31388067 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31388566 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31390304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31391329 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31391605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31392072 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31395235 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31395491 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31396815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31397605 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31398449 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31398488 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31399534 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31399571 T G Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 31399581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31399599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31399636 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 31399795 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31399800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31399875 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 31399994 A T Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 31400043 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31400085 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 31400214 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31400309 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 31400361 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 31400429 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 31400443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31400552 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31400623 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 31400680 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 31400753 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 31400856 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 31401131 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 31401156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31401335 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31401523 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31401824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31401870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31401916 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 31401984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31402036 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31402100 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31402127 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31402229 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 31402271 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31402303 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31402416 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 31402694 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 31405567 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 31407355 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31407507 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31407511 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 31407622 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 31407693 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31407769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31410097 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 31410347 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 31410348 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31410390 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 31410397 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 31410422 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 31410794 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 31410806 T A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 31410939 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 31410978 A C N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.75 0.0833333333333333 0.166666666666667 19 5 9 1 2 3 31410992 A G N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 3 31411007 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31411091 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31411221 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 31411483 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 31411597 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 31411614 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 31411672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31411695 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 31411702 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 31411813 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 31411847 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 31411998 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 31412077 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 31412104 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31412120 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31412234 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 31412303 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 31412533 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31412558 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 31413316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31413428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31414082 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 31414153 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 31414707 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 31415426 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 31415746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31415762 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 31415825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31416111 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31416160 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31416300 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31416415 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31416524 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 31416799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31416834 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 31416995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31417149 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 31417171 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 31417186 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31417248 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 31417287 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 31417470 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31417502 C G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 31417530 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 31417729 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 31417791 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 31417955 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 31417957 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31418451 C A N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 31418475 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 31418520 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 31418877 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 31418898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31418960 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31419037 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 31419501 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31419537 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31419561 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 31419574 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31419601 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 31419687 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31419818 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31420589 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 31420672 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 31421001 C T Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 31421369 T C Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 31421604 T G N N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 31421607 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 31421615 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 3 31421625 A T N N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 3 31421901 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 31422591 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 31423734 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31423808 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31423939 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31424032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31424118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31424837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31425012 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 31425031 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 31425046 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 31425106 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 31425107 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 31425122 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 31425191 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31425257 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 31425262 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 31425376 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31425377 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 31425407 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 31425425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31425672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31426301 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31426338 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 31426378 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 31426388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31426482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31426580 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 31426614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31426736 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31426942 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 31426991 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 31427023 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 31427073 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 31427083 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 31427252 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 31427378 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31427430 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 31427459 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 31427600 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 31427609 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 31427677 G T Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 31427776 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 31427795 G T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 31427904 T A N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 31427906 A T N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 31428011 T A N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 31428128 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31428135 A T Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 31428164 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 31428177 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 31428225 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 31428265 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 31428269 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31428378 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 31428608 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 31428610 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 31428640 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 31428649 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 31428671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31429212 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 31429239 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 31429317 A G N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 3 31429548 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31429767 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 31430045 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 31430094 C T N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 3 31430316 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 31430317 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31430360 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 31430376 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 31430424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31430622 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31430665 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31430727 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31430804 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 31430867 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31430945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31431050 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31431112 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31431116 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31431140 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31431177 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31431225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31431247 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 31431439 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31431687 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 31431710 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31432261 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 31432577 T C Y Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 3 31432595 A T Y N 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 10 14 0 10 2 3 31432602 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 31432742 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31432751 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31432764 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 31432972 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31433074 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31433108 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 31433477 C T Y Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 3 31433737 G A N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 31440342 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 31440452 A G N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 3 31440853 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31441039 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31441071 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31441223 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31441373 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 31441375 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 31441387 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 31441710 C T Y Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 3 31441913 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31442052 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 31442248 A T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 31442272 A G Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 31442332 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 31442355 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 31442396 G A Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 31443119 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31443148 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 31443186 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31443197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31443212 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31443252 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31443279 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31443286 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31443368 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31443431 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 31443440 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31443454 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31443579 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31443593 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 31443601 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 31452652 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 3 31452697 T A Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 31452704 A T Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 31462125 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 31462137 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 31462268 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 31462279 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 31462392 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 31462405 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 31462435 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 31462466 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 31462468 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 31463492 C A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 31464292 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 31464307 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 31464376 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 31464396 C T N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 3 31464427 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 31464499 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 31464502 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 31464536 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 31464572 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 31464576 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 31464588 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 31464589 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 31464761 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 31464771 A G N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 31464785 T G N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 31464799 A T N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 31465564 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 31465574 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31466089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31466166 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31466183 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31466244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31466346 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31467792 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31468172 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 31468219 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 31468227 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 3 31468268 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 31468356 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31468526 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31468615 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31468638 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 31468658 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31468985 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31468992 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31469049 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 31469064 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31469073 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31469092 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31469101 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31469164 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 31469177 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31469427 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 31469526 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31469682 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31469714 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31469724 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31469741 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31469871 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31469893 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31469974 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 31469984 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31470052 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31470065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31470091 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31470113 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 31470139 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31470144 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31470162 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 31470179 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 31470228 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 31470244 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 31470283 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31470291 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31470396 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 31470403 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 31470525 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31470562 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 31470599 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31470620 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31470651 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31470854 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 31471178 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 31471492 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 31471538 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31472055 C A Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 31472289 G A Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 31472328 A T Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 31472355 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 31472388 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 31472525 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31472551 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31472582 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 31472820 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 31472846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31472865 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31473045 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31473050 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31473079 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31473113 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31473956 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 31473963 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 31473980 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 31474023 C T Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 31474725 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 31474753 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 31474921 A G N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 31475029 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 31475454 A T N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 3 31475493 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 31475539 C T N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 31476242 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 31476268 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 31476326 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 8 4 4 0 2 3 31476562 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 31476921 T C N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 3 31477059 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 8 4 4 0 2 3 31477120 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 31477144 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 31478587 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 7 5 3 1 2 3 31478588 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 31479378 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 31479380 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 31479408 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 31479553 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 31479635 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 31479682 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 31479718 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 31484961 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 31485691 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 31485767 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 31485788 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 31485834 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 31485868 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 31486883 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31486989 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31487036 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 31487110 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31487167 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31488022 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 3 31488033 T A Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 3 31488114 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 3 31488227 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31490383 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 31490638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31492975 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 31493583 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 31493753 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 31497842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31498952 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31498969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31501290 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31502938 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 31503250 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 31506356 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 31511668 C T Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 31511794 C T Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 31511862 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31511897 C T Y Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.230769230769231 0.769230769230769 0 16 10 3 10 0 3 31517210 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 31519505 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 31519977 G A Y Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 31526049 T C Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 31526302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31527827 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 31529839 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31530385 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31536328 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 31538400 C G Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 31540579 G C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 31540948 C A Y N 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 3 31542617 A G Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 31542667 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 3 31542784 A T Y N 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 8 10 0 8 1 3 31546288 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.0526315789473684 0.736842105263158 0.210526315789474 16 22 1 14 4 3 31547390 T A Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 31547724 T C Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 31559818 G T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 31562251 C T Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 31562542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31563261 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 31563348 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31563466 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31563468 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 31565623 C A Y N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 14 10 2 10 0 3 31570286 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 31571153 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31572333 C G N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 31574350 A C N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 31581649 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31582964 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 31583628 A G Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 3 31583632 T G Y N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 12 16 0 12 2 3 31583760 C A Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 31585437 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 31585467 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 31585476 T C Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.0588235294117647 0.705882352941177 0.235294117647059 14 20 1 12 4 3 31585912 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 31585931 C A Y N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.0625 0.875 0.0625 16 16 1 14 1 3 31586473 T A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 31586494 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31589562 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31590069 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 16 8 4 8 0 3 31590077 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 14 10 2 10 0 3 31590435 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 3 31591172 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31591300 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31592579 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31593195 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 31593607 A C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 31593716 C T Y Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 31594096 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 31594100 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 31594141 T G Y N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 3 31594153 A C Y N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 3 31594245 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 31594260 G T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 31594353 T C Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 16 12 2 12 0 3 31598864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31608566 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 31608817 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 31610573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31611671 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31611986 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31613929 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31614492 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 31617280 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 31617285 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 31617373 G A Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 31617401 A C Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 31617733 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 31617757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31618096 A G N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 31618669 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31619528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31619919 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31620017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31620297 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 31621704 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31622020 G T Y N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.714285714285714 0.285714285714286 10 18 0 10 4 3 31622329 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31624712 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 31624860 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 31628277 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 31628487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31629266 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31629622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31629831 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 31629843 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 31630012 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 31630013 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 31630062 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 31630222 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 31630286 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 31630543 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31630682 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31630708 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31630870 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31631024 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31631076 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31631090 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31631303 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 31631380 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 31631433 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 31631685 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31631774 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 31632191 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31632852 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 31632870 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31633056 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 31633062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31633090 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31633123 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31633198 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 31633227 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 31633337 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31633403 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 31633443 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 31633466 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31633720 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31633776 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31633944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31633996 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31634126 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31634210 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31634227 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 31634277 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31634393 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 31634414 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 31634501 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31634733 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31634745 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31634988 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31635133 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 31635347 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31635382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31635422 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31635444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31635585 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31635651 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31635757 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31635796 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31635880 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31636174 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 31636201 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31636308 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 31636342 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31636386 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 31636423 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31636502 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31636536 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31636710 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31636719 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31636767 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31636842 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31636859 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31636896 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31637104 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31637139 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31637144 T C Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 31637242 A C Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31637281 G A N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 3 31637286 T C Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 31637298 T C Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 31637335 C A Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31637404 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31637413 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31637508 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31637647 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 31637951 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31638321 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31638680 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31638716 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31638758 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 31639165 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31639261 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 31639289 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 31639341 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31639358 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 31639571 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 31639668 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 31639781 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 31639843 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31639977 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 31639983 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 31640134 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31640920 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31643234 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31644440 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 31645537 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31646813 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31651780 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31651806 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31652065 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31652135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31652255 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31652736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31652880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31652942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31653120 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31653297 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 31653329 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 31653558 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 31653658 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31653715 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 31653816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31653881 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 31653906 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 31653910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31653930 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 31654071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31654077 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31654331 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31654514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31655005 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31655038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31655104 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31655143 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31655346 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31655355 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31655613 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31655786 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31655948 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31656027 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31656118 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31656280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31656286 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31656308 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31656459 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31656519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31656624 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31656713 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 31656771 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31656819 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31656821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31657092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31657114 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31657152 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31657269 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31657475 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31657602 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31657618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31657641 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 31658217 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31658248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31658283 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31658545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31658576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31658609 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31658653 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31658729 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31658749 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31659171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31659176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31659242 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 31659279 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31659311 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31659327 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31659646 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31659648 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31659956 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31659993 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31660003 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31660528 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 31660816 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31664414 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31664574 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31664893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31665805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31665824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31666699 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31667732 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31667929 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31667985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31668142 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 31668167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31668311 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31668406 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31668690 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 31668734 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 31668866 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31668872 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31669269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31669285 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31669315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31669390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31669429 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31669679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31669778 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31669829 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 31670264 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31670346 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 31670385 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31670415 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31670456 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31670500 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31670525 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31670604 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 31670605 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 31670646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31670668 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31670876 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31670936 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31671027 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31671037 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31671042 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31671056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31671082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31671136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31671153 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31671167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31671213 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31671337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31671405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31671622 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31671674 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31671727 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31671749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31671985 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31678218 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31678404 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31678539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31678753 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31678810 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31679348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31679388 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31680099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31680269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31680286 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31680516 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31682112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31683234 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31683593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31683984 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31684443 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31684478 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31685557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31686162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31686742 G A N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.0769230769230769 13 13 1 11 1 3 31686772 G T N N 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 3 31687450 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 31687474 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 31693820 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31694880 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 31695463 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31695541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31696034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31696281 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31696676 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31696869 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 31696906 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 31697612 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31698109 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31698512 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 31698588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31698633 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31698684 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31698873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31698953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31699399 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 31701192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31701265 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31701269 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31701352 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 31701383 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 31701384 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 31701468 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 31701487 C G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 3 31701661 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 31701751 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 31701789 A C N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 31701873 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 31701913 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 31702019 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31702025 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31702355 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31702721 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31702729 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31703489 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31703515 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 31703707 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 31703770 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 31705634 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31705936 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31706534 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31706555 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 31706669 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31707217 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31707246 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31707303 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31707348 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31707349 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 31707399 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31707432 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31707443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31707555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31707565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31711932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31712126 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31718014 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 31728932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31729836 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31730181 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31730629 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31730687 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31730725 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 31731258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31731310 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31731324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31731873 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31731983 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31732066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31732355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31732557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31733027 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 31733040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31733109 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31733188 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31733483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31733580 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 31733740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31734229 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31734278 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31734657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31734761 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31737976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31738420 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 31739847 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 31740690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31740818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31741301 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31743607 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31743716 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31744584 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31744813 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31745309 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31750653 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31750859 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31750887 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31752412 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31753648 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31757403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31757804 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31757855 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 31757934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31757939 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31758124 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 31758253 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31758259 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31758688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31758880 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31759406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31759671 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 31759818 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31759987 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 31760010 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 31760079 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 31760957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31762158 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31764294 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31764313 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 31764316 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 31765163 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 31765222 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 31765450 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 31767726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31767850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31767930 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31768541 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31768768 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31768801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31770612 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31776316 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31776317 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31778006 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31779905 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 31784446 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 31784690 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 31784956 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31784961 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 31785028 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31785065 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31785066 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 31785134 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 31785231 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31785354 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31785406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31785448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31785450 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31785546 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31785608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31785638 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31785751 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 31785812 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 31785828 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 31785894 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 31785948 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 31786031 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 31786334 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 31786355 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 31786404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31786433 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 31786451 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31786503 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 31786585 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 31786590 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 31786712 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 31786739 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 31787142 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31787234 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 31787242 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 31787573 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 31787849 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31787862 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31787933 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31787951 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31788110 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 31788120 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31788125 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 31788169 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 31788212 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31788267 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31788278 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 31788617 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 31788746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31789000 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 31789450 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31789693 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 31790203 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31790977 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31791208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31791526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31791648 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31792289 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 31792867 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31793662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31794151 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31795329 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31796430 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31797486 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31798876 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31801794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31802379 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31802583 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31802801 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31804078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31804578 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31805060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31807583 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31807709 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31808047 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31808159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31808332 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31808789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31808792 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31808946 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31809148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31809989 T A N N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 3 31810028 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 31810099 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31810102 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 31810160 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31810505 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31810558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31812161 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31812402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31812446 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31812858 C T N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 7 9 0 7 1 3 31813011 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 31813711 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31813813 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31813914 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31814020 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31814390 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31814878 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31814946 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 31814981 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 31815303 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31815427 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31815528 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31815770 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31815857 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 31815901 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31815902 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31815929 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31816037 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31816230 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 31817580 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31817851 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31817854 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31818139 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31818148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31818474 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 31818608 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31820275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31820331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31820332 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31822160 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31822326 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31822409 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31823409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31823913 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31824094 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 31824775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31824917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31826024 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31826734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31828806 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31829062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31829131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31830348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31830567 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31830793 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31831468 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 31831720 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31832561 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31832719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31832765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31832858 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31832868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31832878 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31833709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31835858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31836012 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31836733 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31837746 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31841032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31841548 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31841651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31841997 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31842078 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31843057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31851127 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31853092 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 31853103 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 31855007 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31855087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31862642 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31864317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31864401 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31864422 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31864559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31864598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31864782 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31864834 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31866536 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31866621 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31866676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31867210 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31867251 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31867437 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31867481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31867550 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31867565 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31867792 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31867886 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31867922 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31867937 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31868036 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31868065 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31868067 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31868089 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31868093 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31868203 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31868252 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31868542 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31868708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31868837 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31868905 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31869416 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31869634 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31870158 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31870588 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31870724 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31871066 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31871082 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31871301 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31871742 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 31873908 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31874367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31875614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31878780 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 31879043 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 31879351 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 31879573 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 31879610 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 31879860 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 31879967 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 31880086 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 31880087 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 31880466 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 31880812 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 31880929 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 31880954 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31881018 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 31881030 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 31881102 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 31881353 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31881369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31884022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31888545 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 31889431 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 31889554 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 31889789 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31889837 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31890137 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31890153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31890915 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31891034 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 31891115 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 31891143 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 31891364 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 31891391 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 31891400 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 31891467 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 31891508 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31891875 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31891889 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31891994 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31892043 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 31892174 G C Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 31892222 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 31892297 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31892370 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31892429 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 31892559 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31892669 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31892679 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31892723 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31892819 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31892841 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31892915 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31895319 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31895857 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 31896302 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 31896535 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31896605 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 31896659 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 31898387 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31898679 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31898844 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31898881 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31899077 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 31899132 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 31899409 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31899622 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 31900327 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 31900817 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 31901018 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 31901518 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 31901532 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 31901828 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 31902184 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 31902200 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 31902250 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 31902355 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 31902443 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 31902533 T C N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0.2 0 0.8 2 8 1 0 4 3 31902614 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 31903145 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 31903394 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 31903501 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31903548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31903685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31904153 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 31904188 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 31904329 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 31904334 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 31904386 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 31904765 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 31904857 A C Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 3 31904858 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.25 0.7 0.05 24 16 5 14 1 3 31904870 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31904921 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31904935 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31904966 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 31905053 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31905162 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 31905177 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 31905212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31905227 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 31905319 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 31905333 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31905360 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 31905394 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 31905406 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 31905426 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 31905548 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 31905607 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 31905699 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 31906121 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 31906189 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31906785 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31907081 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 31907105 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 31907113 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 31907166 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 31907273 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31907324 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 31907325 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 31907359 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 31907377 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 31907445 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 31907568 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 31907587 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 31907605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31907625 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 31907764 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 31907767 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31908056 C T N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 3 31908134 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 31908230 G A N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 31908231 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 31908278 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 31908317 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 31908379 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 31908420 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 31908437 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 31908568 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 31908569 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 31908588 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 31908628 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 31908935 A G N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 6 14 2 2 6 3 31908943 G A N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.272727272727273 0.181818181818182 0.545454545454545 8 14 3 2 6 3 31908960 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 31909028 A G N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.272727272727273 0.272727272727273 0.454545454545455 9 13 3 3 5 3 31909281 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 31909310 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 31909362 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 31909465 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 31909609 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 31909636 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 31909708 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 31910370 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 31910561 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31910698 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 31910872 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 31911016 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 31911032 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 31911047 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 31911064 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 31912168 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 31912263 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31912274 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 31912294 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 31912306 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 31912372 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 31912467 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 31912569 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 31912575 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 31912615 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 31912681 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 31912731 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 31912779 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31913482 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 31913533 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 31913615 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 31913653 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 31913719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31913916 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31913943 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 31913964 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 31913974 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 31914162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31914400 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 31914696 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31914813 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 31914893 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 31915249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31915272 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 31915640 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 31915865 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 31915890 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 31916019 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 31916496 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31917083 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31917811 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 31917975 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31917999 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31918240 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31918244 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31918432 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31918507 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 31918533 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 31918572 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 31918576 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 31918592 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31918612 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31918614 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31918665 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 31918777 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31918778 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 31918790 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 31918860 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 31918863 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 31919047 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 31919075 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 31919133 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 31919210 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 31919419 G A N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 31919422 A G N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 31919688 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 31920062 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 31920260 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 31920313 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 31920369 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31920423 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 31920461 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 31920652 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 31921092 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 31922018 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 31922025 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 31922047 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 31922076 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 31922261 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31922379 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 31922705 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 31922931 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31923035 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 31924505 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 31924794 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31925701 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31926206 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31926463 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 31927075 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31929077 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31929079 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31930852 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31931949 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31934065 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 31934076 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31934160 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 31934288 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 31934305 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31934356 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 31934404 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 31934572 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 31934960 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31934970 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 31935105 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31935198 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31935237 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31936179 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 31936266 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31936276 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31936677 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31936848 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 31937152 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31937268 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31937389 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 31937416 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 31937537 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 31937610 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 31937621 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 31937738 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 31937759 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 31937762 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 31937947 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31938608 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31938707 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31938761 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 31938785 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31938819 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31938922 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31939542 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 31939666 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 31939704 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 31939767 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 31939816 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31939870 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 31940052 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 31940680 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31941366 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 31941669 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 31941746 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 31941766 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 31941772 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 31941796 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 31941807 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 31942062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31942231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31942821 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31943509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31943595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31943668 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 31943727 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 31943755 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31944569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31944686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31945835 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 31945903 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31946762 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31947776 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31948433 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31948585 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 31948702 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31948797 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 31948870 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 31948876 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 31948943 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 31949015 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 31949054 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31949214 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 31949310 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 31949402 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31949403 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 31949482 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 31949699 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31950098 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31950374 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 31950575 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 31950944 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 31951096 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31951249 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 31951555 A T N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 31951673 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 31951812 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31951825 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 31952343 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 31953271 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31953416 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31953518 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 31954420 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31954577 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31954787 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31954824 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31954933 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 31954958 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 31955167 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31955364 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 31955366 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31955696 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 31955708 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 31955710 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 31955773 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 31955779 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 31955875 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31956297 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31956511 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31956887 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31957317 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31957402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31957411 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31957585 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31957607 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 31957628 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 31957702 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 31958029 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31959770 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31960045 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 31960363 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31960433 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 31960466 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 31962291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31964644 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 31964937 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 31966542 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31966558 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31966739 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31966768 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31966814 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31966987 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 31967177 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31967299 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31967532 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 31967542 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 31967631 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 31967717 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31967897 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31968133 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 31968338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31968520 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 31968588 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31968663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31968711 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31968740 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31968847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31968950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31969055 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 31969096 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 31969137 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 31969149 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31969321 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 31969384 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 31969396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31969440 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31969474 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31969635 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31969833 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31970006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31970036 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31970050 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 31970087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31970173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31970189 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31970259 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31970325 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31970389 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31970397 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 31970457 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31971323 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 31971681 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31971889 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 31971942 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 31971962 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 31971965 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 31972024 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 31972072 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31972206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31972235 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31972268 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31972532 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31972556 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31972638 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 31972651 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31972682 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31972712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31972720 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 31972964 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 31973655 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 31973673 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 31973802 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31973809 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31973935 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 31974133 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31974143 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 31974149 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 31974263 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31974265 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 31974299 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 31974314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31974322 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31974389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31974437 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 31974443 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31974448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31974480 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 3 31981647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31981775 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31981852 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 31982019 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31982054 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 31982065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31982127 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 31982152 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 31982165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31982203 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31982262 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31982273 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31982279 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31982290 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 31982308 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 31982459 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 31982465 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 31982597 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31982619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31982631 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31982688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31982711 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 31982724 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31982804 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31982805 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31983014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31983095 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 31983107 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31983244 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31983251 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31983347 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31983365 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31983565 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31983589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31983639 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31984044 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31984256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31984261 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31984274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31984592 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31984612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31984695 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31984873 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 31984932 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31986496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31986563 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31987247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31987412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31987896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31988425 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 31989787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31990124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31991556 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 31993443 G A Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 31994892 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 31994971 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 31995090 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 31995251 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31995411 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 31996291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31997572 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 31998295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32000602 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 32000657 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 32000887 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32001360 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32001537 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32001561 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 32001626 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32001754 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 32001806 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 32001991 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32002003 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32002253 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32002413 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32002608 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32002752 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32002874 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32002877 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32002965 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 32002990 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 32003135 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32003819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32005226 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32005296 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32005297 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32005311 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32005354 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 32005386 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 32005395 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32005400 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32005419 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32005426 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32005499 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32005577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32005629 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32005815 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32006453 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 32006727 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32006826 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32006992 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32007271 G T N N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 14 12 1 12 0 3 32007535 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32007849 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32007967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32008238 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32008438 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32008637 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32008722 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32008751 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32009788 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32009985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32009990 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32010054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32010098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32010321 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32010416 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32011390 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32011423 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32011579 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32011760 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32012116 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 32012732 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32013638 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32013655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32013685 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32013829 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 32013989 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32014022 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32014033 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32014242 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 32014291 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32014331 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32014426 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32014452 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32014453 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32014552 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32014688 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 32014699 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 32014724 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32014913 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32014979 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32014995 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 32015001 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32015207 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32015236 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32015249 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32015411 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 32015948 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 32015954 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 32016467 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32016714 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32017067 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32017100 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32017136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32017157 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32017263 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32017482 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32017530 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32018499 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32019339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32019919 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32020344 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 32021247 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32022802 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32022864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32023133 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32023828 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32025671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32025745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32026766 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32029986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32030037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32030380 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32030479 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 32031425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32031566 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32032297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32032665 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32032687 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32033017 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32033071 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32034122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32034314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32034485 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32034708 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32034904 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32035193 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32036439 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 32037581 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32037657 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32038394 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32041021 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32043321 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 32044224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32044346 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 32044555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32045047 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 32045308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32045446 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32045489 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 32045896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32046061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32046298 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 32046438 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 32046734 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32047003 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 32047045 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 32047148 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 32047215 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 32047263 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 32047273 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 32047401 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 32047416 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 32047615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32047620 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 32047670 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 32047756 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 32047833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32047929 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 32048113 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 32048348 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 32048794 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32049449 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32051346 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32051673 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 32051689 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32051816 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 32051853 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32051969 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 32052053 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 32052071 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 32052088 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 32052112 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 32052151 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32052442 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 32052714 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 32053282 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32053538 A T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 32054109 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32054277 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 32054420 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32054566 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 32054869 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32054940 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32055080 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32055416 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32055743 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32056266 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32056300 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32056464 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32056632 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32057353 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32057355 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32058565 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32058573 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32059001 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32059819 A G Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 32060017 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 32060334 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 32060528 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32067574 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 32067605 T C N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 32068023 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32068059 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 32068613 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 32068648 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 32068799 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32069034 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32069045 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 32069256 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32070493 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32071022 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32072402 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32072922 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32073514 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32074696 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32076946 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32079462 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32080117 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32080284 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32080343 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32080385 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32080440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32080588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32081009 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32081078 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32081095 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32081157 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 32081168 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32081173 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 32081216 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32081218 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32081345 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32081348 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32081384 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32081385 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32081475 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32081540 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32081703 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32081785 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32082035 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32082110 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32082216 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32082302 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32082332 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32082380 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32082602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32083116 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32083420 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32083647 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32083778 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32083803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32084528 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32084566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32084942 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32085483 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32086003 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32086414 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32086445 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32086498 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 32086527 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32086548 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32086549 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 32086725 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32086730 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32086757 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32086783 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32086792 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32086852 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32087053 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32087353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32087384 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32087411 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32087473 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32087558 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32087560 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32087755 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32088141 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32088169 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32088241 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32088257 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32088313 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32088361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32089035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32089836 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32090182 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 32090230 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32090236 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32090250 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32090256 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32090287 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32090394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32090450 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32090547 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32090849 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32091028 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32091033 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32091068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32091339 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32091416 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32091696 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32092260 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32092486 T C N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 3 32092621 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 32093088 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32093107 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32093200 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32093214 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32093881 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32093941 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32093948 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32093959 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32094214 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32094369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32094689 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32094750 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32094780 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32094805 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32094843 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32094932 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32094947 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32095053 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 32095109 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32095173 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 32095200 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 32095300 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32095374 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32096113 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32096257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32096515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32096709 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32096885 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32096986 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32097047 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32097528 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32097588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32097607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32097623 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32097691 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32098198 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 32098790 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 32098934 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32099042 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32099065 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32099083 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32099253 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32099274 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32099351 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32099353 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32099501 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32099771 C A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 32099843 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 32105297 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32105320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32105337 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32105439 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 32105483 T C Y Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 3 32105574 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 32105592 C T Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 16 12 2 12 0 3 32105646 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 32105723 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32105753 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32106016 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32106061 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32106117 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32106464 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32106901 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32107012 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32107053 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32107129 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32107158 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32107506 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32107778 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32107814 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32108405 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32108625 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32108746 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32108805 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32108943 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32109151 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32109260 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32109282 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32109365 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32109399 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32109825 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32110027 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32110044 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 32110070 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 32110211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32110560 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 32110608 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32110629 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32110766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32110870 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32110873 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32110908 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32110920 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32110990 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32111086 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32111373 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32111388 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32111979 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32112133 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32112214 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32112278 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32112411 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32112443 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32112563 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32112648 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32112655 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32112692 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32112823 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32113060 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32113198 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32113323 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32113329 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32113390 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32113456 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32113472 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32113536 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32113681 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32113703 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32113721 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32113739 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32113792 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32113812 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32114128 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32114137 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32114177 G T Y N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 32114406 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32114541 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32114757 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32114926 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32114951 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32114958 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32114991 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32115055 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32115081 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32115203 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32115238 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32115373 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32115579 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32115645 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32115738 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32115972 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32115979 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32116022 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32116429 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 32116455 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32116694 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 32117130 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32117141 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32117142 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 32117197 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32117237 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32117281 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32117300 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32117337 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32117356 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32117381 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32117569 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32118638 A G Y Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 9 7 1 7 0 3 32119986 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 32120019 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 32120038 A G N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 32120045 C G Y N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 32120071 A G Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 32120122 G T Y N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 32120226 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 32120337 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 32120345 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32120358 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32120423 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32120574 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32120621 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32120790 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32120817 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32120896 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32121055 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32121322 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 32121339 C G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 32121353 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 32121383 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 32121476 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 32121500 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32121621 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32121826 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32121841 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32121988 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32122132 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32122193 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32122219 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32122250 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32122432 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32122557 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32122636 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32123407 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32124287 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32124311 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32124366 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32124499 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32124708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32124927 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32124986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32125102 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32125323 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32125421 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32125551 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32125812 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32125883 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32125899 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32125917 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32126327 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32126504 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32126835 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32127270 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32127464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32127505 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32127515 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32127522 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32127833 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32127884 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32128256 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32128263 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32128306 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32128310 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32128349 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32128470 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32128664 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32129289 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32129314 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32129315 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32129418 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32129557 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32129749 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32129753 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32129775 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32129866 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32129872 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32130857 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32130888 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32130934 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32131440 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32131474 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32131777 G A Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 32131824 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 32131907 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32131983 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32131987 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32132035 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32132050 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32132577 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32132992 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32133112 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32133124 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32133193 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 32133316 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32133384 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32133442 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32133496 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32133554 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32133556 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32133567 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32133597 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32133620 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32133622 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32133718 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32133721 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32133899 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32133903 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32133916 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32133922 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32134020 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32134039 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32134061 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32134145 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32134180 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32134220 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32134241 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32134263 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32134383 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32134506 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32134779 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32135115 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32135200 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32135280 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32135281 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32135296 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32135321 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32135373 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32135491 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32135492 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32135512 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32135687 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32135778 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32135939 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32135946 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32135975 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32136001 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32136185 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32136253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32136917 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32136926 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32137026 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32137049 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32137473 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32137567 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32137591 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32137679 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32137698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32137766 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32137882 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32137926 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32137932 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32137954 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32137962 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32138667 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32138691 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32138945 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32138978 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32139124 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32139194 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32139231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32139312 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32145940 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32145952 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32146018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32146035 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32146094 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32146451 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32148534 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32148914 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32149052 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32149082 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32149300 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32149476 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32149508 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32149658 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32149944 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32150024 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32150103 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32150474 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32150479 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32150592 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32151191 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 32151198 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 32151502 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32151511 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32151570 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32151619 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32151987 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32152191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32152800 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32152898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32153053 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32153054 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32153131 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32153144 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32153234 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32153456 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32153499 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32153620 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32153666 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32153710 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32153762 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32153965 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32153988 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32154081 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32154164 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32154220 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32154295 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32154337 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32154423 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32154513 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32154529 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32154674 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32154774 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32155366 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32155388 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32155393 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32155676 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32155698 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32155703 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32155848 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32156054 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32156074 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32156224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32158207 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32158374 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32158385 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32158659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32158999 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32159042 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32159096 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32159103 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32159134 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32159227 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32159463 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32159485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32159666 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32159667 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32159854 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32159913 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32159971 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32159987 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32159996 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32160098 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32160241 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32160341 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32160450 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32160492 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32160552 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32160872 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32160883 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32161061 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32161106 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32161152 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32161171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32161254 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32161399 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32161416 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32161430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32161463 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32161482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32161518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32161577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32161631 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32161656 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32161860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32161889 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32161900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32163077 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32163111 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32163149 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32163168 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32163192 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32163516 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 32163534 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 32163587 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32163710 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 32163745 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32164350 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32164607 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32164786 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 32164963 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 32165022 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32165123 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32165522 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 32165545 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32165566 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32165581 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32165589 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32165596 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32165643 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32166185 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32166188 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32166215 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32166271 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32166306 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32166320 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32166327 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32166342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32166353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32166363 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32166372 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32166418 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32166530 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32166646 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32166836 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 32167066 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 32167737 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32168336 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32168533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32169244 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32169480 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32169707 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32169722 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32169901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32169944 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32170070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32170223 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32170378 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32170716 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32170879 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32170886 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32170893 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32171072 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32171102 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32171110 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32171129 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32171312 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 32171327 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 32171572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32171735 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32171807 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32171906 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 32172037 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32172067 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32172302 A T Y N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 32172450 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 32172780 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32173172 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32173229 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32173650 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32173666 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32174286 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32174325 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32174438 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32174481 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 32174715 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 3 32174947 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32175106 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 32175711 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32175743 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32175852 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32175859 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32176031 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32176213 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32176283 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32176287 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32176304 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32176314 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32176371 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32176374 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32176606 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32176651 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32176656 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32177044 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32177193 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32177299 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 32177635 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32177661 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32177881 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32179449 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32179905 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32179964 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32181015 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32181652 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32181780 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32182744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32182876 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32183767 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32183938 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32183995 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32184016 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32184918 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32185840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32185946 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32185948 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32186379 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32189583 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32190770 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32190821 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32191175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32191736 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32192767 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32192889 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32194078 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32194935 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32195961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32196229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32196574 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32196707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32197502 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32198546 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32199261 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32200084 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32200308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32200487 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32200508 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32200895 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32201006 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32201057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32201628 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32201826 C T Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 3 32201936 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32202155 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32202855 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32202870 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32203345 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 32203592 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32204922 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32204947 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32205570 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32205617 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32205852 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32206098 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32206176 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32206263 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32206273 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32206306 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32206408 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32206413 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32206608 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 32206628 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 32206669 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32206727 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32206778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32206971 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 32213232 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32213327 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32213401 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32213435 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32213541 C G Y N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 32213574 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 32213596 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 32213692 G A N Y 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 3 32213908 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 32214276 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32214459 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32214552 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 32214691 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32215212 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32215291 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32215319 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32215365 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32215384 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32215705 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32215733 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32215780 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32215865 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 32215998 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32216321 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32216696 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 32216709 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 32216748 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 32216786 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32216991 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32217371 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32217497 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32217641 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32217761 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32217826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32217914 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32218329 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32218424 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32218532 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0 0.941176470588235 0.0588235294117647 16 18 0 16 1 3 32218557 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 32218646 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 32218648 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 32218920 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32219307 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32219347 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32219354 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32219451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32219472 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32219562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32219589 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32219655 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32219692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32219708 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32219960 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32219973 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32219981 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32220094 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32220223 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32220310 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32220517 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32220539 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32220558 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32220775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32220790 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32220858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32220864 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32220878 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32220908 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32220915 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32220936 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32221037 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32221102 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32221144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32221192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32221274 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32221322 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32221531 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32221866 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32222110 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32222267 A G N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 32222398 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 32222408 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 32222530 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 32222731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32222847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32222867 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32223001 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32223040 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32223398 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32223509 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32223637 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32223647 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32223749 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32223777 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32223793 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32223842 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32223912 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32223914 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32224037 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32224059 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32224252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32224395 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32224567 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 32224609 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 32224618 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 32224623 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 32224802 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32224868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32224919 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32225190 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32225294 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32225325 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 32225378 A T N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 32225746 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32225759 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32225766 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32225870 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32225893 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32226029 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 32226139 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32226146 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32226167 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32226227 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32226469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32226472 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32226586 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 32226594 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32226768 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32226824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32226842 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32226861 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32226865 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32226995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32227095 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32227298 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32227300 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32227530 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32227575 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32227616 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32227617 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32227633 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32227657 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 32227660 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 32227801 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 32227839 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32227887 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32227984 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32227985 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32228039 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32228040 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32228188 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32228191 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32228332 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32228343 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32229602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32229907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32231049 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 32231362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32231425 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32231855 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32231914 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32231996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32232427 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32232713 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32233165 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32233176 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32233590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32233675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32234069 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32234088 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32234095 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32234321 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32235702 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32236640 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32237725 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 32237866 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32238337 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 32238717 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 32238796 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32238903 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32238926 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 32239265 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 32239782 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 32239783 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 32240175 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32240736 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32240909 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32240971 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 32241074 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 32241240 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32241593 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32241744 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32242206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32242675 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32242949 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 32243074 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 32243223 A T N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 32243263 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 32243268 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 32243276 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32243354 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 32245119 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32245123 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32245608 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32246137 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32246332 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32246397 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 32246521 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 32246750 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32246755 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32247163 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32247185 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32247372 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32247444 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 32247544 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32247625 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 32247779 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32248001 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32248024 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32248099 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 32248309 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32248366 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32248444 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32248542 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 32248693 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 32248840 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32248901 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32248953 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32248994 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32249105 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32249276 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 32249348 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32249372 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32249554 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 32249704 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 32249841 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 32250008 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 32250122 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 32250156 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 32250212 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 32250213 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 32250232 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 32250357 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 32250511 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 32250626 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 32250841 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 32250922 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 32251152 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32251395 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32251502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32251595 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32251629 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32251633 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32251726 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 32252037 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 32252078 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 32252103 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 32252104 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 32252148 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 32252171 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 32252402 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 32252455 G A N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 32252540 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 32252546 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 32252551 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 32252558 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 32252632 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 32252691 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32252734 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32252754 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32252776 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 32252794 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32252822 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 32252940 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 32252999 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 32253048 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32253102 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 32253172 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 32253232 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 32253469 A G N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 3 32253525 G T N N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 3 32253532 T G N N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 3 32253554 T C N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 3 32253590 C A N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 32253610 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 32253790 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 32253921 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 32253941 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 32253943 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 3 32254014 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32254036 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 32254066 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 32254085 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32254189 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32254341 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 32254386 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 32254488 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 32254490 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32254540 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 32254571 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 32254640 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 32254708 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 32254735 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 32254771 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 32254879 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 32254890 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 32254933 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 32255682 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32255683 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32255736 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32255841 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 32255849 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32255899 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32256015 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32256052 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 32256080 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32256081 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32256094 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32256213 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32256308 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32256526 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32256630 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32256714 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32256758 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32256785 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 32256823 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 32256927 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 32257217 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 32257396 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 32257626 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 32257732 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 32257923 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 32258159 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32258219 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32258451 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32258553 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 32258741 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 32258793 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 32258807 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 32258828 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 32258844 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 32258861 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 32258862 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 32259069 A G N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 32259281 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 32259639 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32260483 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 32260765 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32261123 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 32261510 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32261651 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32261671 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32261705 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 32261795 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32262022 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 32262534 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 32262792 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32262961 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32266728 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 32266927 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 32267080 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 32267388 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32267945 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 32268022 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 32268130 C A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 32268315 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 32268333 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 32268400 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 32269174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32269192 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 32269280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32269337 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 32269763 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 32269863 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 32269896 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 32269907 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 32269972 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 32269977 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32270388 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 32270944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32271333 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 32271369 A C Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 32271649 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32271679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32271759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32271810 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 3 32271811 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32272766 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32272775 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 32272947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32273113 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32273304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32273322 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32273348 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32273401 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32273407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32273456 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32273565 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32273581 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32273708 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32273939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32273961 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32274020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32274033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32274055 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32274122 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 32274258 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32274786 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32274804 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32274932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32275014 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32275145 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32275317 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32275646 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32275651 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32275662 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32275675 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32275679 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32275783 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32275944 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 32275945 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 32276003 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32276049 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32276084 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32276351 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32276405 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 32276436 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 32276510 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32276630 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32276756 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32276772 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 32276802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32277029 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 32277053 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32277262 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32277264 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32277437 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 32277480 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32277595 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32277697 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32277746 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32277856 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32278079 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 32278206 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 32278270 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 32278340 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32278722 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 32279295 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 32279450 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 32279585 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 32279702 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 32280276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32280521 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32280831 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 32281182 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32281259 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32281519 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32281676 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 32281752 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 32281769 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32281940 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 32281973 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 32282033 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 32282252 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32282458 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 32282461 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32282585 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32282665 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 32282697 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 32282717 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32282827 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 32282836 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32282848 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32282878 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32282900 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32282977 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32283126 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32283341 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32283683 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32283808 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32283818 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32283947 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 32283974 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32284071 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32284110 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32284122 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 32284179 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 32284183 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32284194 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 32284200 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32284429 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 32284547 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 32285220 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32285257 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 32285665 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32285698 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 32285891 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32286503 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32287227 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 32289718 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 32289737 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 32289782 C T N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 32290199 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 32290229 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 32291001 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32291850 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 32291942 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32292127 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 32292254 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32292305 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32292569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32292724 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 32292727 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32292796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32292853 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32293003 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32293725 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 32294267 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 32294935 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32295153 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 32295188 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32295402 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32295585 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32295683 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32295958 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 32296929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32296971 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32297139 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32297958 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32297964 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 32298186 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32298687 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32299503 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32299547 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32299553 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32299579 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 32299905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32300470 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32301144 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 32301444 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32301822 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32301940 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32302251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32303081 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32303084 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32303098 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32303153 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32303451 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32304475 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32304693 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32304780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32306054 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 32306335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32306426 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32306653 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32306795 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32306844 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32306986 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32307398 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32307734 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32307883 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32307919 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32308276 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 32308393 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32308804 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32308814 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32308898 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32309027 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32309174 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32309464 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32309481 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32310537 T C Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 32310837 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 32311172 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32311208 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32311247 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32311359 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 32311597 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32311630 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32311949 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32312075 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32312103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32312129 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32312170 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 32312743 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 32312761 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 32313080 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 32313127 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 32313190 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32313466 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 32313514 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 32313654 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 32313873 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 32314816 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32315150 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 32316099 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 32316541 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32316819 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32317338 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32317699 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 32317738 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 32318103 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32318251 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 32318252 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 32318290 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32318389 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 32318434 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32318468 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32318696 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32318906 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32318994 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32319161 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 32319244 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 32319449 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 32319655 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32319933 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32319960 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32319977 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 32319978 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 32320012 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32320014 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32320132 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 32320309 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 32320718 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32320729 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32321068 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 32321769 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 32321946 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 32321978 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32322134 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32322445 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32322512 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32322531 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32322558 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32323015 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 32323168 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32323244 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 32323250 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 32323325 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32323612 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32323652 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32323834 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32323870 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32324226 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 32324598 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32324911 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 32325024 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32325030 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32325038 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32325170 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32325332 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32325535 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32325570 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32325631 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32326025 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32326029 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32326108 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32326231 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32326571 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32326613 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32326963 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32327659 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 32327748 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32328291 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32328548 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32328549 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32328854 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 32328879 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 32328897 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32328930 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32329264 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32329314 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32329336 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32329468 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32330019 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32330751 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32330872 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 32331425 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32331753 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32331762 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32332210 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32332351 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32332919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32333027 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32333272 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32333517 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32333888 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32334111 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32334227 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 32334293 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32334328 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 32334448 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32334463 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32334658 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32334691 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32334990 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32334993 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32335010 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 32335391 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32336260 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32336396 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32336460 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32336600 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32336617 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32336632 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32337108 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 32337453 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32337966 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32338093 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 32338102 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 32338160 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 32338184 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32338422 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 32338943 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32339524 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32339770 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32339906 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32340247 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32340294 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32340720 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32341326 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32341568 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 32342014 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32342024 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 32342037 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32342059 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 32342087 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 32342135 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32342221 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32342342 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32342614 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32342660 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32342702 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32343463 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32343534 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32343851 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32344033 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32344040 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32344150 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32344179 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32344905 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 32345366 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32345435 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32345723 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32345985 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32346399 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32346489 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32346498 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32346756 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32347019 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32347410 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32348347 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32348804 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 32349024 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32350645 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32351255 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32351598 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32352323 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32352335 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32352349 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32352380 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 32352411 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32352424 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32352617 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32352743 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32353064 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 32353111 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 32353112 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 32353561 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32353568 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32353576 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32353670 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32354054 G C N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 3 32354062 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32354479 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32354556 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32355166 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32355991 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32356232 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32356286 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32356983 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32357256 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32357739 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32358686 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32358692 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32360077 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32362498 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32363154 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32363205 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32364027 A G N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.153846153846154 0.846153846153846 0 15 11 2 11 0 3 32364420 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32364629 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 32365220 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32365310 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32365363 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32365407 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32366221 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 32366575 T G Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 32366673 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 32366737 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32366865 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 32366915 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 32366959 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32366960 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32366992 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32367122 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32367540 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32367573 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32367655 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32367772 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32367811 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32368118 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32368165 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32368565 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32368779 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32368790 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32368886 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32368937 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32368979 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32369846 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32370162 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32370234 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32370418 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32370682 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32370768 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32370841 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32370861 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32370982 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32371051 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32372148 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32372247 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32373060 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32373186 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32373217 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32373261 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32373347 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32373599 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32373618 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32374271 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32374303 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32374401 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32374404 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32374637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32374748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32374807 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32374958 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32375050 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32375105 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32375379 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32375515 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32375628 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32375649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32375661 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32375852 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32375928 C G Y N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 32375939 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32376113 T C Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 32376166 C T Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 32376250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32376281 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32376371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32376374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32376484 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32376491 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32376505 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32376555 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32376585 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32376658 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32376701 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32376851 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32376873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32376875 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32377718 A T Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 32378853 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32378913 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32378938 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32378941 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32379624 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32380446 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32380569 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 32380745 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 32380804 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 32380912 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32380976 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32382315 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32382658 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32384173 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32384234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32385102 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32385463 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32385569 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32385655 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32385843 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 32386934 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32387310 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32388194 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32389252 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32389376 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32392639 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32394162 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32394222 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32394373 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32394613 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32394712 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 32396011 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32396222 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32396306 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32396550 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 32396612 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32397492 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32397855 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32398350 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32398961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32399393 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32399409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32399477 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32399649 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32399690 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32399691 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32399828 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32399941 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32399949 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32400030 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32400036 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32400045 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32400112 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32401063 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32401133 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32401526 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 32401570 G C Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 32401581 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 32401743 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32401774 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32401829 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32401845 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32401874 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32401921 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32401946 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32402033 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32402041 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32402117 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32402121 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32402131 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32402232 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32402343 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32402658 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 32402659 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32402705 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 32402810 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32402835 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32403543 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32403562 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32403820 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32404116 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32404136 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32404179 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32404490 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32404565 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 32404611 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32404839 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32404853 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32404953 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32405064 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32405431 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32405436 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32405613 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32405637 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32405685 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32405821 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32406429 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 32406470 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32406523 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32406648 G T N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 32407221 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 32407239 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 32407333 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32407381 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 32407434 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32407524 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32407698 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32407704 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 32407870 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32408029 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32408088 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 32408231 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32408349 A G Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 32408355 G C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 32408392 A T N N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 3 32408522 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32408658 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32408782 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32408849 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32408990 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32409418 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32409420 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32409830 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 32410349 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32410366 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32414316 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 32415698 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32416380 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32416815 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32418195 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32418650 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32418755 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32420077 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32420477 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32421042 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32421916 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32423306 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32423394 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32424078 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 32424919 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32425051 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 32425271 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32425428 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32426222 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32426542 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32427272 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32427333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32428824 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 32429027 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 32429901 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32430096 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32430279 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 32430429 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32431532 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32431536 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32431728 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32431952 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 32431992 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32432067 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32432104 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32432109 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32432533 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32433170 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32434040 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32434949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32435085 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32435325 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 32436172 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 32436418 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32438135 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 32438324 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32438483 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32438753 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32439224 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 32439562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32439963 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32440760 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32440771 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 32440891 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32440929 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32442101 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32442410 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32442964 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32443260 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32443449 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32443739 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 32443769 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32444477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32444504 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32444588 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32445254 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32445283 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32445657 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32445695 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32445820 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32445918 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32446118 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32446220 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32446302 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32446346 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32446569 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 32446616 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32446788 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32446799 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32447455 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32448262 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32448263 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32449191 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32449192 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32449214 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32449591 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 32449656 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32449781 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32449849 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32450368 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 32450583 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 32450789 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32450922 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 32451021 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32451129 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32451306 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32451521 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 32451571 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32451629 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 32451680 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 32451772 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 32451836 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 32451896 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 32452011 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32452033 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32452267 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32452515 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32452731 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32453245 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32453695 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32454145 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32454941 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32455123 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32455734 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 32456004 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32456770 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 32458229 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32458246 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 32458247 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32458465 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 32458641 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 32459083 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 32459934 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 32460088 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32460174 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32460719 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32460876 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32460880 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32460916 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32461025 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32461038 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32461087 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 32461110 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32461290 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32461384 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 32461393 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32461524 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32461551 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32463729 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32463911 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 32464485 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32465571 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 32467860 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 32468074 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32468153 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 32468168 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32468247 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 32469122 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 32469155 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 32470046 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 32470059 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32470569 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32470604 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 32470795 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32471067 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32473603 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 32473768 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32473953 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 32475323 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 32475328 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 32475818 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 32476137 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32477438 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32478140 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32478234 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 32478308 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32478325 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 32478335 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32478366 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 32478692 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32478697 G C Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 32478973 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32479181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32479360 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32480041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32480533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32482762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32483278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32483371 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32483423 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32483504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32483547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32484467 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32484958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32485024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32486407 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32487311 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32487446 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32487588 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32487743 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32487746 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32487949 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32489305 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32489982 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32491023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32491109 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32491314 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32491356 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32491431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32491518 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 32491589 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32492380 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32492461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32492658 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32492723 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32492794 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 32492891 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 32493090 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32493096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32493144 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32493203 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32493247 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32493252 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32493315 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32493401 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32493600 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32493812 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32493835 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32493851 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32493919 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32493953 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32494003 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 32494004 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32494100 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32494121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32494164 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32494214 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32494276 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32494377 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32494448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32494518 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32494520 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32494529 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32494540 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32494552 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32494605 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32494687 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 32494706 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32494838 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 32494982 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32495070 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32495167 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32495183 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32495473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32495545 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32495876 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32495946 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32495988 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32495996 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32496049 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32496406 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32496439 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32496500 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32496507 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32496929 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32496957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32497295 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32497406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32497510 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32497538 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32498167 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32498635 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32498696 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32498702 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32498775 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32498801 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32498940 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32498946 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32499026 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32499076 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32499111 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32499148 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32499149 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32499174 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32499242 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32499356 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32499410 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32499487 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32499529 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32499643 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32499672 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 32499761 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32499805 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32502362 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32502663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32502699 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32503028 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32503095 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32503163 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32503342 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32503443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32503501 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32503546 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32503572 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32503590 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32504176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32504360 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32504421 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32504447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32504516 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32504713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32504787 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32504819 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32504859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32504877 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32504881 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32504916 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32504923 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32504927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32505173 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32505258 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32505272 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32505343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32505746 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32505759 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32506010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32506211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32506414 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32506531 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32506542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32506566 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 32506577 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32506941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32507123 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32507203 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32507419 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32507587 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32507620 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32507675 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32508176 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32508183 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32508191 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0 0.882352941176471 0.117647058823529 15 19 0 15 2 3 32508560 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32509018 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32509029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32509061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32509121 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32509145 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32509451 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32509513 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32509586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32509689 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32509707 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32510055 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 32510058 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 32510195 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32510202 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32510227 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32510242 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32510531 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32511417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32511801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32512624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32513604 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32516976 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32518323 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32518353 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32518640 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32518923 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32518934 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32518941 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32518948 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32519081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32519361 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32519370 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32519426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32519449 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32519450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32519478 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32519508 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32519606 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32519722 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32519837 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32520253 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 32520309 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 14 18 0 14 2 3 32520526 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32520534 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32520576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32520639 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32526309 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32526378 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32528132 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32528650 A G Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 32529533 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 32530006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32530299 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32530300 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 32530329 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32530339 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32530347 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32530405 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32530546 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32530563 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32530573 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32530582 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32530646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32530672 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32530681 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32530684 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32531240 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32531302 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32531376 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32531394 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32531523 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32531527 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32531657 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32533238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32534086 C G Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 32534875 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 32534956 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32535258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32535898 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 32536108 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32536947 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32537387 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32537455 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32538048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32538924 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32539015 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32539051 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32539263 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32539606 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32539669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32539767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32539891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32539910 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32539928 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32539945 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32539993 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32539997 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32540606 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32541062 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32541196 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32541216 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32541259 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32541560 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 3 32541617 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32541618 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32541832 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32541835 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32541912 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32541987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32542398 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32542415 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32542455 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32542456 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32542485 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 32542778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32542859 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32543015 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32543119 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 32543168 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 32544162 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32544441 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32546144 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32546219 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 32546765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32547134 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32547207 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32547218 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32547415 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32548086 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32548226 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 32548236 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 32548263 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 32548340 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 32548347 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 32548366 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 32548369 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 32548438 C G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 32548526 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 32548628 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 32548727 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 32548823 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 32549051 G C N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 32549506 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32549839 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 32549845 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32549854 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32549898 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32549973 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32550149 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 32550186 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 32550319 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32550353 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32550409 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 32550466 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 32551495 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 32552061 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 32552288 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32552483 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32552703 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32552719 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 32553153 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32553643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32554373 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32555487 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 32557964 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32559224 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32559808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32559823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32560062 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32560158 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32560249 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32560420 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32560468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32560532 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32560543 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32560558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32560609 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32560787 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32560960 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32561138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32561560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32561603 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32561684 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32562339 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 32562372 G C N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 32562446 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 32562818 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 32562819 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 32562857 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 32562863 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 32562920 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 32563090 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32563093 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 32564113 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 32564310 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 32564423 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 32564514 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 32564583 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 32564731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32564751 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32565024 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 32565025 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32565071 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32565383 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32565458 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32565480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32565521 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32565540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32566537 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32566694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32566808 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32567080 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32567448 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32568050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32568433 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32568523 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32568835 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32569076 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32569084 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32569091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32569113 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32569178 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32569414 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32569448 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32569461 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32569587 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 32569600 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 32569709 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32569871 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 32569882 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 32569909 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 32570085 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32570094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32570218 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 32570245 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 32570373 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32570480 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 32570585 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32570663 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 32570976 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32571615 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32576282 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 32576307 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 32576345 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 32576390 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 32576536 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 32576571 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 32576572 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 32576807 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 32577031 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 32577946 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 32578108 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 32578256 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32578627 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32578874 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32578932 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 32579207 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32579216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32579227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32579260 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32579307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32579346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32580097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32581085 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 32582935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32584774 A T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 32586915 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32588659 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32588724 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32590764 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32591771 G T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 32592048 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32592332 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32594019 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32594208 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32595189 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32595433 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32595849 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 32596540 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32596803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32596889 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32598554 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32598793 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32598955 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32598956 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 32598991 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32599594 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32599595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32599616 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 32600031 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 32600392 T A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32600398 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32600487 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32600845 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32600951 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32601029 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32601380 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32601387 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32601614 T A Y N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 3 32601621 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 32601629 T G Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 32601648 A T Y N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 32601656 A G Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 32601739 T C Y Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 3 32602372 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 32602388 A T N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 32602459 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 32602522 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 32603291 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 32603478 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32604150 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 8 10 0 8 1 3 32604772 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32604773 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 32604783 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 32604903 A C N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 3 32604904 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 3 32605532 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 32607369 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32608084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32608243 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32610511 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32610547 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32611447 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32613880 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 32614064 G T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 32614103 G T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 32615192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32615223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32616541 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32616758 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32617149 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32617506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32618186 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32618187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32618944 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32619044 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32619064 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 32619150 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 32619162 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 32619213 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32619247 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32619567 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32619584 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 32619591 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32619678 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32619761 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 32620437 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32620467 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 32620486 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 32621667 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32622181 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32622354 C T N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 32622929 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32624240 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 32624535 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 32624542 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 32625291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32626719 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32626780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32627162 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32628059 G A Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 32628085 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 32628431 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32628448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32628459 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32628596 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32629183 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32630216 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 32630238 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32630246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32630261 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 32630761 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32630767 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32630777 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32630810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32630831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32630866 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32630878 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32630883 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32630932 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32631015 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32631304 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 32631331 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32631389 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32631494 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 32631573 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 32631646 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 32631694 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 32631708 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 32631709 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 32631755 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32631792 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32631829 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32631842 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32631943 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32632118 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32632163 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32632197 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32632255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32632258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32632979 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 32632980 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 32632993 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32634265 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32634298 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32634488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32635093 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32635299 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32635510 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32635867 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32636825 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32637029 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32637066 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32637079 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32637397 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32637443 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32637655 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32637674 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32637927 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32638023 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 32638072 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32638258 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32638267 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32638300 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 32638335 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32638338 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32638367 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32638567 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32638586 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32639040 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32639233 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32639238 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32639331 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32639335 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32639364 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32639424 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32639436 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32639533 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32639783 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32639805 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32640363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32640409 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32640547 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32640676 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32640681 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32640769 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32640859 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32641082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32641597 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32641711 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32642975 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32643360 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32643467 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 32643493 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32643579 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32643695 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 32643900 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32643957 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 32643965 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32643984 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32643990 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32644207 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32644234 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32644566 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32644583 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32644635 T C Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 32644840 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 32644845 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 32644855 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 32645287 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 32645307 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 32645452 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32645503 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32645658 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32645772 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32645825 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32645925 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 32645963 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32646252 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 32646280 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32646298 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32646335 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32646580 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32646742 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32647058 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32647077 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32647088 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32647172 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32647295 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 32647627 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32648309 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32648548 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32648618 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32648642 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32648645 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32648655 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32648710 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32648780 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32648891 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32648893 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32648902 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 32648940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32648948 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32649075 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32649128 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32649137 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32649146 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32649184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32650252 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32650883 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32650890 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32650937 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32650944 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32651066 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32651110 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32651122 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32651127 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32651251 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32651255 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32651273 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32651318 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32651334 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32651558 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32651638 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32652116 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32652189 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32652213 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32652578 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32652704 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32652820 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32652837 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32653131 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32653549 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32653564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32653741 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32653900 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32654008 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32654251 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32654283 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32654783 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32657200 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32657473 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32657709 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32659401 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 32659637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32660236 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32660641 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32660693 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32660833 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32661451 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32661702 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32661716 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32661821 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 32661863 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32662233 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32664599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32665398 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 32668346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32670427 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32675466 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 32677035 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 32678172 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32679597 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32680251 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32683116 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32683154 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32690564 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32691074 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 32691579 T G Y N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 32692632 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32692705 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32693240 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 32693343 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32693351 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 32693372 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32693513 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 32693611 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 32693614 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 32693632 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 32693900 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 32693912 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 32694197 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 32694560 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 32694760 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32694979 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32695032 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 32695060 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32695096 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32695166 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32695434 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 32695436 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 32695541 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 32695648 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 32695702 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 32695709 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 32695771 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 32695782 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 32695848 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 32695875 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 32695923 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 32695950 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 32696114 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 32696165 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 32696260 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32696281 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 32696367 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 32696389 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32696635 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 32696654 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32696669 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 32696671 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 32696808 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 32696896 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 32696946 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 32697179 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 32697430 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 32697630 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 32697663 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 32697797 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32697809 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 32698287 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32698573 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32698627 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32698761 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 32699076 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 32699236 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 32699639 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 32700022 C T N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.181818181818182 18 4 9 0 2 3 32700076 G A Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 32700174 A G Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 32700216 T G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32700289 A G Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 3 32700490 C T Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.75 0.0833333333333333 0.166666666666667 19 5 9 1 2 3 32700497 A G N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 3 32700564 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 2 4 1 0 2 3 32700658 A G Y Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 3 32700748 A C Y N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 3 32700757 G A Y Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 32700893 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 32701017 G A Y Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 32702769 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 32702842 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 32702867 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32702906 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 32702959 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 32702974 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 32702975 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 32702999 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 32703010 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 32704080 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 32704132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32704136 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 32704223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32704224 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32704235 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32704292 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 32704359 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 32704409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32704469 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32704483 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 32704484 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 32704543 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 32704577 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 32704685 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 32704733 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32704757 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32704905 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 32704923 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32704995 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 32704996 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 32705092 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32705110 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 32705125 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 32705192 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32705209 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 32705233 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 32705330 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 32705488 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 32705601 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 32705663 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 32705844 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 32706192 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 32706204 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32706273 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 32706564 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32706608 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 32706719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32707236 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 32707402 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 32707696 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32707697 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32707845 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32707980 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32708115 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32708217 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32708327 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32708500 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32708517 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32708601 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 32708617 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32708623 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32708635 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32708844 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32709031 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 32709167 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 32709405 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32709470 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32709500 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 32709537 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32709879 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 32709918 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 32710073 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 32710137 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 32710257 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32710283 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 32710394 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 32710472 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 32710549 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32711077 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32711093 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32711250 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 32711484 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 32711564 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32711715 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 32711817 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 32711968 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 32712130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32712164 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 32712165 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 32712236 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 32712424 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32712512 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 32712642 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 32713488 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 32713494 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 32713579 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 32713684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32713976 T G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 32713977 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 32714533 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32715587 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32716000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32716544 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32716749 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32716859 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32716955 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32718525 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32719881 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 32720309 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32721169 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 32721205 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32721333 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32721359 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 32721360 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 32721417 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 32721456 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 32721478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32721521 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 32721639 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 32721771 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32721772 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32721909 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 32722028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32722126 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 32722336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32722489 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 32722714 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 32722736 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 32722785 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32722880 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 32722887 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 32723094 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 32723146 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32723748 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32723775 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32723874 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32723894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32723917 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32723918 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32724036 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32724070 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32724088 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32724181 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32724251 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32724871 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 32724872 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 32724908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32725256 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 32725260 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 32725328 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 32725453 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32725465 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32725488 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 32725512 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32725971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32726154 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32726540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32726858 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 32726911 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 32727399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32727408 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32727697 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32728893 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 32729044 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32729516 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32729706 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 32729882 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 32730457 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 32730485 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 32730498 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 32730573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32730598 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 32730762 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 32731075 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 32732032 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32732033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32732081 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 32732178 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32732182 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32732358 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32732437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32732958 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32733263 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 32733305 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 32733356 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 32733420 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32733491 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 32733711 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 32733716 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 32733727 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 32733870 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 32733884 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 32733901 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 32733930 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 32734314 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 32734473 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32734890 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 32735169 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 32735294 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32735405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32735462 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32735598 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 32735643 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32735695 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 32735715 T C N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 3 32735752 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 8 6 1 6 0 3 32735962 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 32736081 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 32736244 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32736275 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32736629 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 32736643 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 32736678 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 32736710 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 32736713 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 32736724 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 32736737 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 32736743 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 32737132 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 32737142 A G N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 32737608 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 32737717 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32737727 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32737907 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32737910 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32738149 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 32738216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32738291 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 32738407 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 32738554 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32738668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32738669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32738814 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 32738826 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32738953 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32738962 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32738977 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32738978 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32738988 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32739333 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32739416 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32739472 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32739479 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32739593 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 32739594 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 32739673 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32739690 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32739767 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 32739840 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 32740795 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 32740797 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32741011 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 32741185 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 32741288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32741350 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32741351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32741399 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32741603 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32741608 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32741616 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32741621 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 32742135 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 32742173 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32742264 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 32742271 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32742393 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 32742626 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32742627 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32742641 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 32742646 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 32742660 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 32742674 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32742773 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32742888 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 32742905 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32743147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32743272 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32743325 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32743656 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32743669 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32743780 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32743928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32743948 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 32743966 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32744118 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32744209 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32744231 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32744245 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32744266 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 32744286 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32744564 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32745394 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 32745402 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 32745490 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32745510 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32745516 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32745545 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32745595 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32745702 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32745733 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32745999 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32746099 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32746188 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32746266 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32746336 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 32746396 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32746477 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32746613 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 32746667 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 32746746 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32746811 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 32746829 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 32746860 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32746991 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32747122 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 32747220 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 32747323 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 32747447 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 32747881 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 32748000 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 32748147 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 32748398 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32748450 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32748707 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 32748710 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 32748898 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32748940 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32748962 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32748970 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32748987 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32749150 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32749180 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 32749493 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 32749512 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32750105 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 32750106 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 32750144 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 32750164 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 32750408 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 32750494 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 32750666 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 32750848 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32751193 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 32751361 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 32751367 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 32752142 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 32754055 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32754377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32755255 C G N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.571428571428571 0.357142857142857 10 18 1 8 5 3 32755278 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32755556 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32755899 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 32755960 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 32757817 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 32758073 T A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 32759114 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32759291 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32760186 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32760657 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32760884 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 32761504 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32761747 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 32761821 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32762073 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 32762711 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32762917 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32763244 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32763483 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 32765046 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32766669 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32767424 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32767669 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32769266 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32769314 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32770798 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 32775379 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32775453 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32781080 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32781526 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32782372 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 32782650 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32784154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32784414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32784508 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32784574 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 32784632 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32784647 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32784811 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 32784869 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32784879 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32784968 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32785099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32785147 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32785525 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32785597 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32785827 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 32785840 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 32785908 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 3 32785972 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 32785974 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 32786198 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 32786211 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 32786242 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 32786307 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32786336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32786372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32786407 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 32786411 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 32786620 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32786649 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 32786653 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 32786693 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32786705 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 32786714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32786788 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 32786833 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 32786840 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 32786851 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 32787099 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 32787312 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32787347 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32787458 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 32787466 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 32787647 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32787771 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32787779 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32787815 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32787913 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 32787944 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32787958 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32788014 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32788136 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 32788148 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32788240 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 32788288 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 32788323 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32788460 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32788475 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 32788668 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 32788790 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 32789264 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 32789421 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32789513 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 32789804 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 32789901 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 32789931 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 32792342 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 32792807 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 32796766 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32797617 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32797624 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 32798310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32799001 A G Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 32799522 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32799542 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32801960 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 32802492 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 32802493 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 32805035 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 32806290 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 32806812 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32807025 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32807117 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32809585 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32809915 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32810606 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 32811212 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 32811696 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 32811865 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 32811871 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32811893 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32811989 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32812087 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32812101 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 32812103 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 32812388 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32812413 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32812418 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32812991 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32813003 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32813004 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32813088 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32813150 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 32813181 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32813204 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32813771 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32813831 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32813850 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32814019 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32814335 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 32814375 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 32814516 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 32814676 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32814685 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32814742 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 32814756 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 32814794 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32814853 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32815073 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32815083 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32815106 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32815251 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32815252 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32815290 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 32816014 T G N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 32816252 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 32816670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32818323 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 32821470 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 32821471 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 32823412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32823438 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 32823670 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32823821 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 32824109 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 32824276 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 32826255 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32826959 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32826960 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 32827074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32827215 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32828102 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 4 8 2 0 4 3 32828281 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 32829626 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32830123 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32831304 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 32831407 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32831682 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 32831815 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 32832021 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 32832297 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32832350 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 32832989 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 32833055 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 32833114 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 32833125 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 32833194 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32833214 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 32833491 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32833524 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32833674 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 32834137 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 32834228 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 32834753 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32835059 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32835768 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32835785 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32835814 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32835951 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 32836684 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 32838469 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 32838656 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32839015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32839615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32839709 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 32839854 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 32840251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32842043 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32842750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32843479 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 32843643 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 32843700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32843701 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32845774 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32846694 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 32846695 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 32846744 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32846904 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32847036 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32847114 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 32847506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32848165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32849556 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32849979 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 32850372 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 32851227 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32851814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32852354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32852389 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 32852907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32853849 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32854512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32855181 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32855248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32855372 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 32855481 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 32856141 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 32856142 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 32857103 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 32857166 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32857211 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32857402 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 32857428 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 32857590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32857595 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32857891 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 32857966 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 32858032 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32858045 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 32858067 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 32858213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32858254 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32858324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32858430 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32858442 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32858483 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 32858646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32858804 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32858807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32858859 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32858861 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32858950 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32859057 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 32859068 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32859148 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 32859359 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 32859374 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 32859376 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 32859402 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32859539 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32859775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32859907 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32860012 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32860228 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 32860337 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32860415 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 32860509 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 32860553 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 32860843 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 32861148 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32862089 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 32862118 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 32862248 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 32865036 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32865523 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 32865539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32865570 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 32865719 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 32866053 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 32866420 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 32866426 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 32866563 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32866810 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 32866993 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 32867047 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32868143 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32868333 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 32868369 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 32868445 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 32868446 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 32868669 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 32869594 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 32869598 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 32870510 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32870771 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32870786 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32870887 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 32870944 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32870994 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32871003 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32871036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32871040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32871134 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32871150 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32871151 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32871250 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32871253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32871326 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32871364 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 32871381 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 32871393 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 32871583 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 32871752 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32871906 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32871959 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 32871979 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 32872131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32873035 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32873158 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 32874573 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 32875514 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 32876573 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 32877158 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32877306 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32877479 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32877779 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 3 32878049 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32878148 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 32878401 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32878504 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32878700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32879131 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32879621 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32879929 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 32881183 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32881468 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32881469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32882482 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 32883010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32883904 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 32885243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32885282 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32886442 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32886654 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32887050 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 32887257 A T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 32887562 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32887686 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32887701 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32887948 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 32888201 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 32888233 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 32888237 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 32888288 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 32888350 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 32888469 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32888497 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32888594 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 32888721 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 32888855 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 32888858 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 32888920 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 32888923 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32888955 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 32888986 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 32889009 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 32889017 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 32889297 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32889516 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 32889519 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 32889622 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32889623 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32889643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32889667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32889803 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 32889826 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 32889869 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32890397 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 32891353 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32892479 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32892522 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32892679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32892756 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 32892801 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 32892808 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 32892857 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 32893018 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 32893267 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 32893272 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 32893286 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 32893322 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 32893415 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 32893491 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 32893587 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 32893617 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 32893644 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32893735 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 32893776 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 32893834 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 32893901 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 32893947 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 32893968 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32894086 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 32894848 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 32894858 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 32894870 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 32894913 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 32894963 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 32895165 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 32895413 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32895556 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32895557 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32895797 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32896439 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32897410 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 32897662 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 32897786 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 32897968 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32898204 T A Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 32898305 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 32898346 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 32898530 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 32898536 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 32899129 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32899138 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 32899338 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32899624 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 32899909 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 32899992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32900457 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32901315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32902674 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32903520 G C N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 32903922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32904279 G C Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 32905546 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32906575 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 32906698 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 32907135 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 32907142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32907207 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 32907305 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 32907941 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32908149 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32908200 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 32908205 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 32908305 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 32908426 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 32908464 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 32908484 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32908680 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32909347 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 32909479 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32910003 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 32910156 T A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 32910157 T A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 32910291 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 32910299 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 32910453 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32910461 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32910546 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 32910779 G T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 32910792 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 32910824 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 32910887 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 32910927 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 32911012 G A Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.5 0.214285714285714 0.285714285714286 17 11 7 3 4 3 32911053 C A N N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.636363636363636 0.0909090909090909 0.272727272727273 15 7 7 1 3 3 32911152 G A N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 32911429 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 32911633 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 32911896 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 32911936 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32912066 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32912592 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 32913088 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32913118 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32913215 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32913250 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32913575 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 32913592 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 32913690 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 32913789 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 32914415 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 32914491 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 32914570 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 32914870 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 32914879 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 32915029 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32915058 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32915110 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 32915116 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32915416 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 32916185 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32916376 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 32916427 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32916665 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32916710 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32916831 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32916875 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32916883 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32916968 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32916995 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32917070 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32917203 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32917234 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 32917400 A G Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 32917634 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32917880 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 32917905 T G Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 32918039 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 32918044 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 32918083 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32918208 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 32918223 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 32918284 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 32918384 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 32918399 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 32918568 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32919280 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32919444 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 32919801 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 32919945 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 32920016 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 32920212 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 32920238 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 32920290 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 32920299 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 32920414 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 32920483 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 32920532 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32920588 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 32920663 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 32920699 A C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 32920711 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 32920893 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 32922002 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32922096 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32922197 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32922214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32922255 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32922355 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 32922430 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 32922614 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32923558 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32924171 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 32924276 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 32926973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32928322 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32928361 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 32928529 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32928822 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32928848 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32928868 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 32929054 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 32929306 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 32929355 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32929428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32929539 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 32929933 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 3 32930388 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 32930413 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 32930868 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 32930869 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32930889 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32930972 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 32931082 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32931157 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 32931524 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 32931569 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 32931592 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 32931989 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32932215 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 32932239 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32932273 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 32932324 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32932418 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 32932466 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32932496 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 32932755 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32932924 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 32932957 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 32932970 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 32933049 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 32933074 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 32933117 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 32934011 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 32934151 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 32934168 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32934184 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 32934543 A T N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.428571428571429 0.142857142857143 0.428571428571429 14 14 6 2 6 3 32934565 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 32934593 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 32934607 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 32934662 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32934756 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 32934798 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 32934947 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 32934957 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 32934961 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 32935007 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 32935074 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 32935075 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 32935091 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 32935103 G C Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 32935108 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 32935126 T C Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 32935242 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32935398 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 32935786 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 32935910 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 32935957 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32936677 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32936729 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 32936801 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 32936805 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 32936854 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32936866 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32937091 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 32937213 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32937473 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 3 32937486 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 3 32937547 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 32937558 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 32937656 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 32937659 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32937672 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 32937685 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 32937805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32937846 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32937920 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32937938 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32938011 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32938414 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32938647 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32938739 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 32938868 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 32938933 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32938984 G A Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 32940415 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32940494 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32940694 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32940695 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32940836 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 32941008 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32941024 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 32941719 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32941768 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32943326 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 32943416 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32943455 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32945112 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32945416 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 32945427 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 32945454 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 32945778 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32946098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32946720 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 32947327 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32947332 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32947906 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32947947 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 32948107 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32948186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32948321 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 32948432 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 32948632 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 32948905 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 32949111 A G Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 32949183 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 32949308 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 32949462 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 32949585 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 32949608 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 3 32949966 T A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 32950009 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 32950057 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 32950081 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 32950133 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 32950293 G A N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.466666666666667 0.0666666666666667 0.466666666666667 15 15 7 1 7 3 32950479 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 32950485 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 32950533 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 32950556 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32950604 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 32950741 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32950824 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32950984 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32951132 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 32951136 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 32951149 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 32951193 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 32951278 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 32951399 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32951587 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32951770 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32952052 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32952100 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32952119 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32952715 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32952750 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 32952814 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32954375 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32954485 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32954757 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32954875 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 32955383 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32955567 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32957767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32958768 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 32958879 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 32959867 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32960051 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 32960508 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32960641 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32960657 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32962136 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 32962467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32962861 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32962911 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 32963390 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 32963405 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 32963448 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32963493 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32963556 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32963784 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32963785 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 32963809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32963850 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 32964100 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32964138 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32964155 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32964241 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32964370 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32964430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32964486 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32964499 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32964526 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32964612 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32964674 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 32964720 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32964851 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 32964905 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 32965160 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 32965364 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 32965613 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32965876 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 32965950 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 32966023 C A Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 32966103 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 32966124 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32966134 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 32966183 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 32966305 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 32966331 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 32966449 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 32966454 G T N N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 3 32966595 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 32966662 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 32966669 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 32966746 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32966747 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32966909 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 32966911 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 32966980 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 32967342 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32967387 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32967443 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 32967473 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 32967530 A T Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 32967544 T A Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 32967671 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 32967895 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32968027 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 32968162 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32968177 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32968242 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 32968406 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32968448 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 32968485 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 32968494 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 32968541 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 32968935 C G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 32969017 G T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 32969046 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 32969055 T G Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 32969182 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 32969416 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 32969516 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32969639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32969771 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32969826 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 32970134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32970170 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 32970226 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 32970319 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32970345 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32970376 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 32970398 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32970469 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 32970498 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 32970568 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32970582 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 32970625 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 32970743 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 32970763 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 32970937 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 32970938 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 32971013 T C Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 32971060 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 32971061 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 32971113 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32971552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32971811 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 32972289 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32972627 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32972991 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 32973104 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 32973314 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 32973328 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32973769 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 32973882 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32975070 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32975103 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32975680 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32975867 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 32976010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32976545 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 32977408 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 32980417 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 32980536 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 32981180 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32982854 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 32984864 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32984930 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32985829 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32985911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32985967 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32986038 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 32986122 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 32986142 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 32986168 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 32986383 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32986440 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 32986623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32987101 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32987128 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 32987286 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 32987296 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 32987515 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 32987547 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32987589 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32987856 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 32987892 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 32987940 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32988811 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32988863 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 32989100 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 32989126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32989238 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 32989413 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32989553 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32989729 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 32989795 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.2 0.133333333333333 0.666666666666667 8 22 3 2 10 3 32990011 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 32990081 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32990394 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 32990445 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32990534 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 32990592 C G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 32990683 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 32990685 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 32990870 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32990884 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32990903 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32990916 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32991006 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 32991074 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32991134 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 32991142 G A N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 3 32991201 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 32991236 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 32991530 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32991747 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32991828 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32991829 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 32991859 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32991909 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 32991940 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32992001 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32992095 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 32992175 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32992275 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32992501 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32992763 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 32992781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32992959 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 32992989 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32993153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32993234 A G Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 32993344 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32993382 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32993425 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 32993466 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 32994591 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 32994949 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32995060 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 32995195 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32995232 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32995733 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 32996640 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 32996883 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 32997292 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32997306 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32997317 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 32997460 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 32997539 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 32998341 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 32998394 C A Y N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 32998437 A G Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 32998843 A C Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 32998954 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 32999292 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 32999430 C A Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 32999651 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 32999709 A C Y N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 32999856 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 32999867 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 32999919 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 33000406 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 33000440 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 33000602 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 33000676 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 33001229 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 33001250 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 33001290 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33001322 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 33001414 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 33001640 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 33001731 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 33001771 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 33002097 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 33002149 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 33002170 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 33002184 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 33002196 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 33002337 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 33002425 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 33002543 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 33002571 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 33002624 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 33002635 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 33002645 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 33002652 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 33002671 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 33002692 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 33002712 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 33002741 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 33002752 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 33002764 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 33002787 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 33002907 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 33002937 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 33002972 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 33002973 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 33003030 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 33003053 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 33003361 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 33003701 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 33003778 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 33003795 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 33003812 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 33003976 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 33004051 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 33004085 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 33004199 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 33004428 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 33004461 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 33004471 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 33004528 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 33005651 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 33006632 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 33007892 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 33007978 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 33007987 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 33008028 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 33008179 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 6 12 2 2 5 3 33008207 A T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 33008668 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 33008675 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 33008688 G A N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 33008701 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 33008718 A G N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 33009014 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 33009076 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 33009125 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33009213 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33009303 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 33009330 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33009372 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 33009391 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 33009443 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 33009681 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33010428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33010843 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33011368 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33011822 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 33012066 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33012463 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 33012561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33012635 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33012812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33012881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33012902 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 33013132 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 33013284 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 33013379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33013521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33013594 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 33013842 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 33015747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33016035 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33016118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33016858 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 33017471 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33017573 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 33018275 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33019636 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 33019662 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 33019976 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33021495 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 33022268 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 33022466 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33023086 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 33023112 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 33023747 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33024054 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33024059 T A N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 33024406 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 33024430 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 33024716 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 33024739 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33025006 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 33025160 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 33025346 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 33025385 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 33025628 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 33026062 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 33026213 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 33029963 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 33030682 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 33030785 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 33032324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33033789 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 33034492 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 33036353 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 33036847 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 33036927 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33041538 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33041921 C A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 33042550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33043690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33043857 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33044348 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 33044562 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 33044794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33045551 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 33045566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33045574 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 33045706 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 3 33045716 T G N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 33045759 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 33045782 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33046294 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 33046301 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 33046376 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 33047251 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33047619 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 33048333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33048524 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 33048824 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33049161 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 33049358 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 33049997 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 33049999 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 33050327 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 33050333 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 33050355 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 33050362 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 33050382 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 33050386 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 33050401 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 33050466 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33050468 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 33050477 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 33050487 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 33051301 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33051395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33051883 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 33052542 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 33052589 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 33052894 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 33052951 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 33052954 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 33053054 A T Y N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 33053085 T G Y N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 33053303 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33053430 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 33053434 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 33053487 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 33053494 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 33053548 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 33053569 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 33053624 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 33053696 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 33053762 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 33053835 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 33053846 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 33053877 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 33053915 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 33053942 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 33054146 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 33055084 G A Y Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 3 33055139 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 33055359 C T Y Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 33055481 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 33055565 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33055568 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 33055874 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33055932 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33055970 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33056110 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 33056261 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33056466 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 33056469 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33056754 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 33056814 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 33056840 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 33056846 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 33056923 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 33056948 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 33056967 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 33056982 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 33057019 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 33057150 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 33057486 T C Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 33057488 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33057499 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33057824 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33058038 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33058045 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33058123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33058145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33058182 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33058214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33058234 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 33058341 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 33058438 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33058440 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 33058462 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 33058481 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33058623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33058791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33058843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33058864 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 33059001 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 33059078 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 33059199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33059216 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 33059264 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 33059459 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 33059514 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 33059515 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 33059622 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 33059635 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 33059751 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 33059864 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 33059932 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 33059998 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 33060024 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 33060071 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 33060110 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 33060226 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 33060241 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 33060296 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33060409 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 33060531 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 33060575 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 33060622 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 33060666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33060725 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 33060843 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 33060853 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 33060964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33061192 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33061252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33061502 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 33061515 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 33061762 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33061834 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33061882 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33061907 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 33061927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33062058 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 33062134 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 33062231 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33062318 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 33062463 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 33062581 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 33062632 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 33062649 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 33062712 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 33063024 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33063070 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 33063114 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33063203 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 33063219 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 33063243 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 33063253 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 33063402 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 33063608 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 33063633 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33063673 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 33063732 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 33063736 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 33063772 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 33064132 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 33064156 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 33064166 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 33064242 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 33064255 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33064368 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33064397 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 33064416 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 33064447 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 33064524 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 33064556 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 33064597 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 33064600 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 33064658 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 33064712 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 33064815 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 33064943 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33065099 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 33065108 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 33065120 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33065134 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 33065157 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 33065177 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 33065182 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 33065201 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33065238 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 33065250 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 33065266 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 33065304 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 33065334 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 33065342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33065360 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 33065373 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 33065419 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 33065454 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 33065546 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 33065848 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 33065854 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33065886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33065938 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 33066004 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 33066019 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 33066083 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 33066151 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 33066207 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 33066262 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 33072633 G T N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 3 33072656 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 33072704 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33072839 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33073000 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 33073133 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 33073216 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 33073289 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33073394 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 33073412 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33073709 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 33073806 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33073856 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33073898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33074035 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33074117 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33074193 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33074228 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33074276 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33074299 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33074320 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33074388 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33074544 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 33074548 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33074589 G A N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 33074655 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 33074675 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 33074749 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33074799 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33074903 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33074904 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 33074936 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 33074937 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 33074979 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33075311 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 33075339 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 33075614 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33075699 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 33075732 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33075792 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33076223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33076528 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 33076676 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33077417 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 33077506 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 33077578 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 3 33077816 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 33077958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33078009 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 33078022 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 33078184 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 33078191 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 33078201 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 33078203 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 33078234 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 33078269 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 33078307 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 33078308 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 33078336 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 33078357 A C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 33078426 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 33078474 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 33078500 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 33078518 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 33078532 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 33078576 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 33078611 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 33078641 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 33078661 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 33078701 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 33078757 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 33078848 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 33079016 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33079335 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 33079349 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 33079399 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 33079441 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 33079502 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 33079514 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33079538 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33079549 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 33079581 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 33079665 T G N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 33079687 T C Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 3 33079726 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 33080117 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 33080412 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33080508 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 33080575 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 33080619 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33080676 A G Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 33080934 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 33080935 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 33080962 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 33081016 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 33081033 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33081061 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 33081102 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 33081136 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33081244 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 33081649 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 33081700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33082008 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 33082147 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 33082191 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 33082236 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 33082261 C G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 33082350 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 33082365 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33082366 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33082399 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 33082435 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 33082876 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 33083164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33083277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33083293 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33083306 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 33083332 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 33083470 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 33083496 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 33084149 T C Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 33084300 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33084348 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33084395 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 33084588 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33084949 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33085023 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33085173 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 33085251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33085260 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 33085542 A G Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 33085911 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 33086037 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 33089569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33089958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33090237 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33090635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33092230 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 33092326 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 33092683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33093345 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 33093825 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 33094643 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 33095763 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 33096667 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 33097231 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33097692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33097979 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33098032 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 33098057 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 33098111 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 33098245 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 33098470 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 33098531 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 33098611 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 33098690 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 33098830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33098831 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 33098944 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 33098952 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 33098979 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 33099015 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 33099098 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 33099234 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33106560 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 33106641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33106895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33107074 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 33107228 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 33107416 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 33108354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33108402 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33109387 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 33109518 A C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 33109552 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 33109604 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 33109971 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 33110067 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 33110942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33110948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33111357 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33113444 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 33113563 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 33116269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33118275 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 3 33118311 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33118349 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33118424 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33118493 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33118543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33118560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33118675 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33118823 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33118903 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33119012 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33119018 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33119032 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33119122 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33119139 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33119140 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33119150 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33119258 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33119275 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33119290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33119337 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 33119380 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33119431 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 33119584 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33119667 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 33119842 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33119907 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33120245 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 33120653 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33120674 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 33120856 T A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 33120895 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 33122080 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33122690 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 33123160 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33123567 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 33123598 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 33123664 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 33123735 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 33123895 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 33123992 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 33124012 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 33124052 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 33124154 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 33124228 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 33124242 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 33124577 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 33124893 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 33124933 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 33125807 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 33125820 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 33125889 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 33125921 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 33125973 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 33125995 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 33126090 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 33126141 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33126565 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 33126844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33127144 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 33127254 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 33127464 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 33128339 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 33128344 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 33128547 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33128598 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 33128599 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 33128950 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 33129949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33129977 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33130200 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 33130234 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33130235 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33130810 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33132160 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33132242 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33134772 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 33134792 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 33134932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33134938 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 33135020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33135115 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 33135169 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 33135171 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 33135183 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 33135242 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 33135418 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 33135578 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 33135733 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33135734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33135761 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 33135801 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 33135865 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 33135884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33135920 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 33136046 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33136281 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 33136310 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 33136405 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 33136415 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 33136447 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33136648 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 33140963 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 33141102 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 33141208 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 33141592 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33141680 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 33151322 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 33151703 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 33151796 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 33152038 C A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 33152098 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 33152341 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 33152373 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33152421 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 33152638 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 33152679 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 33152714 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 33152748 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 33152755 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 33152909 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 33153046 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33153048 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 33153157 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 33153562 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 33153620 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 33153639 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 33153653 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 33153715 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 33153716 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 33153888 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 33153890 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 33154085 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 33154358 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 33154642 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33154915 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33155071 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33155121 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 33155164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33155333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33155978 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33156029 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33156059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33156212 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33156431 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33156474 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33156614 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33156683 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33156728 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 33156742 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33156746 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 33156775 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 33156841 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33157255 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 33157412 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 33158151 C T N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 3 33158484 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 33158489 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 33158509 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33158637 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 33158972 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 33158989 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33158999 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 33159151 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 33159178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33159295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33159735 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 33159777 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 33160730 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 33160836 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 33161424 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 33161472 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 33161549 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 33161615 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 33161970 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33162280 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33162300 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 33162303 C T N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 33162329 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 33162341 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 33162677 A T N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 33162743 G T N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.5 0.214285714285714 0.285714285714286 17 11 7 3 4 3 33163150 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 33163207 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 33163262 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 33163385 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 33163496 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 33163503 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 33163577 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 33163584 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 33163593 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 33163652 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 33163717 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 33163730 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 33163750 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 33163836 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 33163839 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33163889 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 33163930 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 33164030 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 33164045 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 33164103 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 33164130 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 33164160 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 33164196 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 33164200 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 33164221 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 33164331 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 33164339 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 33164536 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 33164640 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 33164648 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 33164699 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 33164744 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 33164763 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 33164827 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 33164887 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 33164915 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 33164919 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 33165068 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 33165198 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 33165258 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 33165271 G C N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 33165319 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 33165345 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 33165355 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 33165382 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 33165411 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 33165417 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 33165681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33165717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33165730 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 33165816 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 33166058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33166234 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 33166297 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 33166670 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 33166854 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 33166899 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 33167236 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 33167263 C T Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 3 33167264 C G N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 33167372 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 33167508 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 33167656 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 33167853 G T N N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 3 33168116 A T N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 3 33168937 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 33169015 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 33169063 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 33169121 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 33169133 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 33169315 A T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 33169352 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 33169426 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 33170005 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 33170192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33170308 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 33170397 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 33170489 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 33170549 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 33170607 A T Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 33170645 G C N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 33170659 A G Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 33170689 A T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 33170708 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 33171516 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 33171768 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33171836 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 33172177 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 33172290 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33172397 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33172639 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 33172705 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 33172724 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 33172861 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 33173332 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 33173486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33173506 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33173745 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 33174027 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 33174267 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 33174343 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 33174387 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 33174639 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 33174756 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33174886 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33175717 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 33175873 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 33175936 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33175983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33175990 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33176012 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33176435 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 33176524 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33176532 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33176718 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 33176902 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 33177327 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 33177395 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 33177472 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33177754 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 33177794 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 33178168 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 33178335 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33179434 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33179844 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33180351 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 33180608 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 33181639 G C N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.3125 0.625 0.0625 20 12 5 10 1 3 33181808 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 33181980 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 33182058 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 33182387 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 33182395 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 33182424 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 33182675 G C Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 33183554 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 33183939 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33184389 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 33184477 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33184518 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33184755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33184840 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33185549 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 33185560 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 33185674 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 33185961 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 33185977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33187069 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 33187166 A T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 33187417 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33187457 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 33188196 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 33188267 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 33188370 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 33188442 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 33188616 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 33188676 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 33188687 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 33188779 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 33188787 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 33188836 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 33188970 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33188986 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 33189023 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 33189129 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 33189145 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 33189155 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 33189240 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 33189518 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33189583 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 33189738 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 33189956 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33190077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33190146 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 33190160 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33190643 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 33190740 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33190908 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33191102 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 33191305 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 33191620 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33191813 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33191954 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33192109 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 33192297 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 33192349 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33192479 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 33192527 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 33192655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33192700 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 33192715 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33193051 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 33193309 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 33193639 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 33193702 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 33193879 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 33194017 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 33194055 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 33194181 A C N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 33194256 T C N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 3 33194525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33194607 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 33194655 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 33194705 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 33195098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33195170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33195396 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 33195656 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 33195779 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33195871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33195993 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 33196192 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 33196334 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 33196437 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 33196512 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 33196516 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 33197630 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 33197736 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33197756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33197820 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 33197974 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33198012 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 33198023 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 33198284 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 33198505 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 33198539 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 33198806 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 33199326 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 33199475 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 33199502 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 33199796 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 33199887 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 33199922 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 33199932 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 33199953 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 33200015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33200327 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 33200387 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 33201032 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 33201222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33201295 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 33201316 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 33201364 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 33201405 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 33201534 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 33201536 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 33201707 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 33201780 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 33201850 G T Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 33201893 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 33201904 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 33202034 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 33202081 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33202313 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 33202326 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 33202443 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 33202448 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 33203064 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33203185 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33203195 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33203267 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 33203278 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33203296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33203328 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33203348 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33203352 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33203361 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 33203373 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33203482 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33203495 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 33203521 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 33203573 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 33203707 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33203887 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 33203889 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33203949 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 33204113 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33204293 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33204367 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 33204430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33204559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33204870 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 33205146 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 33205699 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33205747 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 33205906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33205911 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 33206269 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 33206413 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 33206449 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 33206450 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 33206463 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 33206540 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 33206550 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 33206603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33206907 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 33207364 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 33207372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33207401 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 33207481 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 33207653 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 33207680 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 33207762 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 33207783 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 33207790 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 33207815 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33207865 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33208124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33208157 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33208169 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 33208297 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 33208606 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 33208697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33208710 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33209049 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 33209146 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 33209214 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33209308 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 33209328 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33209355 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 33209417 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33209613 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 33209905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33210675 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 33210904 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33211782 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33212039 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33212498 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33212533 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 33212549 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33212737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33212800 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33213039 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 33213237 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 33213314 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 33213521 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33214318 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33214366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33214631 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 33214647 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33214668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33214719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33214756 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33214822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33214979 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33215837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33215847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33216053 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33216211 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33216235 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33216532 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33216733 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33216824 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33217469 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33217791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33217984 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 33218063 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33218100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33218170 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 33218271 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 33218479 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 33218697 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 33218849 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 33218969 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 33219337 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 33219384 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33219715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33219937 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 33219962 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33220236 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 33220250 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 33224475 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 33224670 T C Y Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 33224859 A G Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 33224872 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 33225053 T C Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 33227991 A C Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 33228022 A G Y Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 3 33228271 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 33229054 G C Y N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.166666666666667 0.583333333333333 0.25 11 13 2 7 3 3 33229470 C T Y Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 3 33230106 A G N Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 3 33230118 A G N Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 3 33230166 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 33230301 G A Y Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 6 6 1 4 1 3 33231185 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33231222 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 33231580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33231905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33232086 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33234325 G T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 33234414 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 33234434 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 33234444 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 33234527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33234647 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33237588 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 33238362 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 33239852 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 33239889 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 33240354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33241152 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33241210 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33241700 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 33241834 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 33242143 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33245141 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33245632 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 33253377 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 33253551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33254110 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33254181 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33255856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33256781 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33257187 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 33258955 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33259216 A C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 33260194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33260879 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33261248 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 33261362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33261657 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33262212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33263400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33263502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33263646 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33266477 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33266661 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 33267346 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33267790 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33268458 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33269677 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 33270989 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 33271260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33271320 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 33271588 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33271724 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33271744 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33271762 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33272058 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33272073 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33272146 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33272162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33272171 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33272190 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33272249 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33272386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33272480 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 33272498 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 33272736 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 33272769 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 33272773 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 33272824 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 33272830 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33272876 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 33272938 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 33272962 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 33273101 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33273376 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33273534 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33273743 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33274665 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33277135 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33277442 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33277733 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 33278846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33278850 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 33280379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33281692 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33282894 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 33284324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33287407 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 33288071 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33288112 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33288813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33289604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33292437 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 33296612 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33297103 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33298195 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 33300863 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 33300897 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33301563 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 33301684 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 33301851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33302104 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 33302168 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 33302171 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 33302257 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 33305279 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33305503 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 33307459 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33308420 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33309165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33316776 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33317037 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 33320731 G T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 33321131 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 33321154 C T Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 33321158 A T Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 33321170 G T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 33321813 T A Y N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.461538461538462 0.153846153846154 0.384615384615385 14 12 6 2 5 3 33322069 T G Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 33322187 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 33324157 A G Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 33325033 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 33328489 C A Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 33328506 A G Y Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 33328777 G A Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 33329204 T A Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 33329330 G A Y Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 11 9 3 5 2 3 33329531 A G Y Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 7 11 1 5 3 3 33329653 T A Y N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 33330117 C G Y N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 33330422 C T Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 16 12 6 4 4 3 33331697 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 33331723 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33331842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33332079 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 33332229 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33332466 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 33333222 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33333269 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33333532 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33333631 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33333694 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33333718 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33333740 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33334157 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33334186 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 33334255 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 33334264 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 33334390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33334733 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 33335249 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 33335368 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 33335464 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 33335508 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 33335704 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 33335741 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33335742 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 33335792 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 33335864 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 33335922 T A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 33335940 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 33335973 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 33335987 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 33335996 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33336004 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 33336024 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 33336078 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33336122 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 33336153 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 33336244 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 33336263 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33336854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33336873 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 33336886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33337104 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 33337191 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 3 33337211 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 33337684 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33339093 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33339360 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 33339715 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 33339925 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 33339958 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33339997 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33340034 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 33340171 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33340476 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33340614 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 33340842 A C Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 33340907 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33340943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33340960 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 33341048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33341590 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33341643 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 33341696 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33341718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33341749 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 33341760 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33341970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33341982 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33342037 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33342065 G T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 33342082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33342112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33342129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33342264 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33342323 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33342369 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 33342384 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33342673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33342691 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 33342718 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33342826 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33342871 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 33342917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33342945 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 33342990 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 33343037 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33343183 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 33343273 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 33343314 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33343523 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33343760 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 33343785 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 33344059 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 33344161 T A Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 33344450 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33344703 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33344850 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33344864 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33344877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33345008 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33345079 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 33346794 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33346927 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33347161 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33348136 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33350379 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33353672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33354035 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33354691 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33354834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33355878 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33355911 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33355944 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 33356168 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33356513 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 33356515 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 33356547 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 33356827 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33356829 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33356907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33357242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33358467 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33358487 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 33358521 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33358531 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33358552 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33359286 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33359530 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33359767 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 33359838 C T Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 33359844 T G Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 33359945 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 33360102 C A Y N 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 3 33360115 T A Y N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 33360519 C A Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 33360622 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33361122 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33361531 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 33362574 G T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 33362827 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 33363075 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33364073 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33364401 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 33364969 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33365438 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33371208 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33371338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33371637 G T Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 33371759 C A Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 33371919 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 33372263 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 33372281 G T N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.357142857142857 0.214285714285714 0.428571428571429 13 15 5 3 6 3 33372282 G A N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.357142857142857 0.214285714285714 0.428571428571429 13 15 5 3 6 3 33372292 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 33372606 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 33373010 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33373518 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 33374402 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 33374520 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 33374608 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 33374849 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 33375392 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 33375842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33375883 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33375887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33376816 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33377015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33377064 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33377153 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33377470 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33377716 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 33377736 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 33377741 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 33377784 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 33377962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33377984 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33377989 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33378081 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33378099 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33378243 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33378249 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 33378344 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 33378368 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33378406 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 33378446 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 33378513 C T Y Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 3 33378673 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 33378741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33378762 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 33378777 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 33378899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33378975 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 33379126 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 33380345 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 33380844 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 33380861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33380862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33380939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33380961 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 33381042 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 33381142 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 33381156 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 33381299 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 33381619 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 33381620 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 33381665 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 33381726 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 33381728 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 33381810 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 33381963 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 33381964 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 33382052 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 33382076 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 33382131 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33382178 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 33382235 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 33382344 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 33382415 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 33382609 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 33382682 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33382708 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 33382720 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 33382840 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 33382846 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 33382953 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 33382975 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 33383042 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 33383061 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 33383100 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 33383105 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 33383225 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 33383269 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 33383347 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 33383466 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 33383540 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 33383545 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 33383555 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 33383556 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 33383883 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 33384055 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 33384079 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 33384097 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 33384293 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 33384518 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 33384553 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 33384599 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 33384687 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 33384704 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 33384732 G T Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 3 33384928 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 33385044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33385201 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 33385334 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 33385434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33385882 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 33385919 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 33385930 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 33386933 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 33387021 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 33387869 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 33388153 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33389121 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 33389563 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 33389889 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 33390013 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33390791 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 33390938 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 33390952 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 33392292 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 33392307 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 33392768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33393271 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 33393422 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 3 33393699 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 33393819 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 33393866 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 33394014 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 33394047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33394063 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 33394107 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 33394174 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 33394339 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 33394549 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 33394560 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 33394605 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 33394631 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 33394850 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 33394900 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 33395224 C G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 33395622 A G Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 33395626 T C Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 33395657 T A Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 33395787 A G Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 33395940 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33396279 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 33396619 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 33396704 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 33396714 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 33396732 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 33396752 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 33396864 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 33396919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33396944 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 33397053 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 33397090 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 33397104 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 33397254 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 33397285 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 33397314 C G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 33397336 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 33397385 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 33397408 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 33397422 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 33397499 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 33397749 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 33397893 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33397993 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 33398034 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 33398103 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 33398128 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 33398180 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 33398344 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33399024 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 33399344 A G Y Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 3 33399775 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 33400453 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 33400531 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 33400583 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 33400683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33400991 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 33401011 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 33401133 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 33401540 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 33402426 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 33402671 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 33402740 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 33402811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33403435 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 33403723 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33403755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33403766 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33403793 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 33403865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33403866 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 33403966 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 33404889 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33404965 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33404995 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33405055 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33405113 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33405340 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33405625 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33405749 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 33405857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33405877 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 33405908 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33405940 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33405969 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33405998 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33406013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33406019 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 33406045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33406280 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33406391 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33406410 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33406430 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33406460 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33406689 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33406719 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33407096 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33407152 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33407216 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33407234 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 33407366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33407380 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 33407387 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33407467 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 33407517 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33407527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33407537 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33407545 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33407661 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 33407711 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33407765 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33407819 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33408042 A G Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 33408101 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 33408153 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 33408231 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33408264 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 33409907 T A Y N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 33409937 T A Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 33409967 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 33410009 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 33410048 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33410071 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33410138 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33410177 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33410217 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 33410444 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 33410509 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 33410599 A G Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 33410661 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 33410708 T G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 33410743 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 33410799 C G Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 33410986 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 33410991 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 33411023 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 33411057 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 33411078 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 33411166 A C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 33411207 G A N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 33411523 A C Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 33411530 T C Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 33411722 T C Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 33412717 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 33412727 G T Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 33412747 C G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 33412841 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 33412867 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33413083 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 33413663 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33413837 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33413862 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33413871 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33413885 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33413919 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33414068 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 33414144 T G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 33414202 T G Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 33414241 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 33414251 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33414353 G T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 33414373 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 33414637 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33414696 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33414756 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33414784 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 33414808 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 33415024 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33415026 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33415430 T G Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 33415444 T A Y N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 33415517 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 33415565 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33415632 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33415688 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33415701 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33415747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33415785 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33415863 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33415898 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 33415939 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33415985 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33416015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33416028 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33416168 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33416341 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33416662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33416729 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33416923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33416937 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33416974 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33417099 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33417153 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33417199 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 33417212 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 33417236 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33417240 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33417325 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 33417355 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 33417379 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 33417631 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 33417749 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 33417750 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 33417794 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 33417847 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33417855 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 33418191 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33418288 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33418417 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33418429 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33418492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33418501 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33418531 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 33418728 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33418771 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33418856 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 33418890 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 33418922 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 33418933 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 33419298 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 33419425 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33419710 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 33419737 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33419785 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33419808 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33419953 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 33419978 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 33420092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33420222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33420266 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33420314 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 33420490 T A N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 33420509 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 33420948 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33421019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33421086 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33421100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33421117 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33421235 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33421237 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33421439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33421531 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 33422110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33423245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33425376 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33426254 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33427002 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33437766 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 33439258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33440407 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 33442176 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33442798 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33443551 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33444937 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 33445193 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33448357 C A Y N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 3 33450183 A G Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 33456671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33456685 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33457051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33457411 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 33457715 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33460804 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33461130 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 33461389 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33461689 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33466035 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 33466640 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33468696 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33470641 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33472953 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33474210 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 33474746 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33474992 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33476741 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33476815 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33477208 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 33477391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33477744 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33477937 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 33479551 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33479833 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33480149 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33480334 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 33482243 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33482725 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33484332 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 33485598 T A N N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 3 33487164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33487634 A T N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 3 33487894 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 33488018 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 33488031 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 33488041 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 33488242 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33488410 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 33488606 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 33489332 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33489401 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33489667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33489692 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33489693 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33489867 C T Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 33489920 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 33490310 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 33490700 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 33491047 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 33491061 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 33491425 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33491466 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 33492124 A G Y Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 3 33493055 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33493082 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 33493100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33493289 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 33493320 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 33493350 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 33493388 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 33493391 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 33493413 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 33493508 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 33493632 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33493791 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 33493794 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33493802 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33493899 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 33495420 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33495582 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33508487 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33508496 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33508686 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33508707 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33510201 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33510639 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33511773 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33511991 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33514120 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33514296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33516574 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 33516734 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 33517981 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 33524729 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 33528398 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 33530005 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 33531172 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 33532398 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33535471 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33536698 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 33537866 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 33538017 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 33538157 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 33538286 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 33539377 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 33539717 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 33540132 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 33540352 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 33541097 A G Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 33541970 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33543106 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 33543750 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 33544193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33544200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33544480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33544586 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33547034 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33550439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33551348 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 33553670 C T N Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 3 33558244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33559377 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 33559516 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33560348 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33560562 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33561746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33565248 C A N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 3 33565657 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33565760 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 33565958 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 33566763 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 33568724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33568736 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33568778 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33569877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33571399 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33572348 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 33574285 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33574601 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33574717 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33576678 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33578339 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33578572 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33579009 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33579756 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33579814 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33581370 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33582015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33582339 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 33582595 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33582773 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33583150 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33583229 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 33583698 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 33584198 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33584327 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 33585030 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 33585230 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 33585286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33585419 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 33585928 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 33586389 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 33586506 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33586819 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 33587059 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 33587165 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 33587197 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 33587261 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33587348 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 33587414 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 33587632 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 33587712 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 33587788 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 33587942 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 33588124 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 33588563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33588624 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 33588713 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 33588772 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 33588801 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 33588884 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 33588923 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 33588961 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 33589055 G T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 33589233 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 33589236 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 33589437 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 33589440 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 33589476 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 33589481 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 33589623 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 33589672 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 33589678 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 33589729 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 33589805 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33589977 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 33590041 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 33590046 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 33590224 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 33590287 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 33590337 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 33590413 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 33590414 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 33590458 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 33590634 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 3 33590746 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33590939 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 33591019 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 33591058 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 33591089 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 33591147 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 33591242 C T N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 33591300 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 33591335 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 33591367 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 33591404 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 33591423 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 33591442 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 33591510 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 33591566 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33591572 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 33591627 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 33591634 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 33591776 C A N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 33591785 T G N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 33591802 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 33591832 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 33591871 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 33591880 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 33591948 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 33592034 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 33592050 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 33592106 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 33592472 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 33592598 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 33592628 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 33592631 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 33592697 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 33592732 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 33592760 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 33592864 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 33592873 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 33592883 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 33592914 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 33592926 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 33592986 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 33593013 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 33593051 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 33593069 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 33593100 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 33593209 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 33593342 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 33593415 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 33593419 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 33593543 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 33593657 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 33593733 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 33593814 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 33593914 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 33593945 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 33593977 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 33594048 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 33594228 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 33594237 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 33594295 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33594472 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 33594695 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33594886 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33594892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33595011 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33595116 C A N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 3 33595307 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33601413 G A Y Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 3 33601453 T C Y Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 3 33601488 G A Y Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.125 0.75 0.125 8 8 1 6 1 3 33601540 C T Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.176470588235294 0.764705882352941 0.0588235294117647 19 15 3 13 1 3 33601610 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 33601794 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33601928 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33601941 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 33602195 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 33602423 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33603085 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33603319 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33603669 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33604009 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33604363 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 33604410 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33604520 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33604548 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33605061 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 33605139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33605143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33605370 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33605517 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33605531 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33605540 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33605550 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33605741 T G Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 33606387 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 33606721 C A Y N 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 3 33606840 G A Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 33607593 C G Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 33608341 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 33608388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33608803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33608854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33608913 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33609234 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33609589 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33609607 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33609750 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33610232 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33610301 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33610724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33610736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33610844 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 33611139 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33611485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33611552 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 33611574 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33611646 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33611689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33611825 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33612101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33612148 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33612382 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33612387 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33613004 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 33613479 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 3 33613493 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 33613684 C A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 33613823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33614410 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33614445 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33614815 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33614894 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33614949 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33615050 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 33615060 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33615067 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33615092 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33615196 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33615258 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33615298 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33615299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33615318 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33615344 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33615382 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33615649 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33615769 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33616047 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 33616049 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 33616109 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33616138 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33616274 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33616287 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33616318 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33616495 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33616515 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33616547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33616563 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 33616596 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33616850 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 33617203 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 3 33617446 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33617791 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 33618097 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33618507 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 33619326 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33621117 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33621146 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33621148 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 33621624 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33621731 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33621755 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33621816 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33621914 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33622101 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33622112 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33622118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33622132 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33622171 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33622219 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33622251 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33622406 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33622468 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33622490 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33622520 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33622616 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33622645 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33622716 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33622765 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 33622784 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 33622819 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 33622920 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33623133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33623236 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33623251 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33623307 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 33623451 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33623662 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33624201 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33624227 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33624344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33624553 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33624645 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33625066 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33625179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33625214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33625998 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33626129 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33626218 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33626376 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33626467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33626577 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33626638 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 33626701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33626795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33626809 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 33626875 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 33626970 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33627042 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 33627107 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 33627221 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 33627487 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33628051 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 33628209 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 33628308 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 33628339 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 33628884 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 33628892 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 33628905 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33629004 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 33629019 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 33629038 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 33629096 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 33629194 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 33629243 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 33629447 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33629633 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 33629650 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 33629662 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 33629703 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 33629717 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 33629826 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 33629848 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 33629871 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 33629892 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 33629896 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 33629910 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 33629911 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33629973 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 33630001 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 33630193 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 33630220 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 33630224 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 33630307 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 33630398 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 33630466 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 33630499 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 33630564 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 33630575 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 33630830 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33630868 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 33630905 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33631201 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 33631234 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 33631243 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33631280 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 33631543 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 33631928 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 33631943 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 33631965 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 33632431 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 33632551 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 33632663 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 33632700 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 33632710 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 33632782 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 33633002 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 33633068 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 33635938 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 33637450 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 33638497 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 33638774 C G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 33638836 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 33638837 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 33638892 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 33638983 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 33639161 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 33640608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33640931 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 33641035 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 33643113 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33643732 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33644382 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 33644866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33647724 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33647756 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33647856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33649289 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 33649310 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 33649322 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33649856 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 33649974 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33650159 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 33650435 G A N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 3 33650574 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 33650755 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 33650795 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 33651454 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33651887 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 33652031 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 33652764 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 33653277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33653323 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 3 33653416 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33653439 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 33653601 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 33653834 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 33653921 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33654228 G T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.3125 0.625 0.0625 20 12 5 10 1 3 33654457 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 33654696 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 33654822 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 33654825 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 33655367 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33655617 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 3 33655683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33655813 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 33655972 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 33656007 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 33656326 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 33656592 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 33656601 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 33656969 T A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 33658448 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 33658940 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33658998 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33659249 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33659631 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33662887 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33663393 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33663597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33664011 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33665750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33666698 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 33674391 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33675914 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 33675951 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 33677801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33678230 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 33685792 C A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 3 33686526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33686532 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 33686915 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 33687100 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 33687341 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33687553 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.176470588235294 0.705882352941177 0.117647058823529 18 16 3 12 2 3 33687633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33687702 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 3 33687980 G A Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 33688005 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 3 33688031 A T N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 18 14 4 10 2 3 33688055 T A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 33688233 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 3 33688323 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33688520 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 33689279 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 33689465 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33689671 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 33689863 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 33690428 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 33690517 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33690810 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.25 0.666666666666667 0.0833333333333333 14 10 3 8 1 3 33691053 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 33691163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33691369 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 33691375 T G Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 33691729 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 33691740 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 33692089 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 33692157 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33692839 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 33693221 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33693737 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 33694147 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 33694439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33694965 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 33695305 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 33695459 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33695661 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 33695851 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 33696093 A G Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 33696930 A T Y N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 33697815 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 33697853 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33698122 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 33698233 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 33698327 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 33699044 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 33699108 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33699457 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 33699746 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 3 33700585 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 33700746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33700866 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 33701319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33701487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33701674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33702231 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33702310 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 33703876 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 33704055 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33704546 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 33704644 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 3 33704934 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33705573 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33705681 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 33707006 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33707106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33707253 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33707292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33709262 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33709572 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 33709709 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 33710172 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33710175 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 33710297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33710522 G T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 33710885 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33710896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33712154 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33712295 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 33712370 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 33712470 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 33712766 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 33713071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33713892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33714265 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33714291 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 33714309 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 33714586 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 33714778 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33714886 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33715009 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33715012 T G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 33715167 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33715217 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33715376 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33715936 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 33716046 C G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 33716857 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33717264 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 33717664 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33718007 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 33719831 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33719857 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33719957 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 33719993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33720046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33720347 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33720586 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 33720857 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 33720877 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33720922 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33721789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33723027 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33723496 G A Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 33723511 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 33723592 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 33723711 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33723728 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 33723814 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33723822 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33723840 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 33723850 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33723851 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 33723912 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33724274 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 33724294 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33724466 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33724475 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33724513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33724528 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33724556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33724562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33724720 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 33724777 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 33724815 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 33725071 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33725083 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33725264 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33725298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33725641 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 33725663 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 33725997 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 33726911 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 33728859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33728887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33729937 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33730626 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33732466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33736164 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33736994 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33737497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33737877 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33738791 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33741870 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33743190 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33744516 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 33745841 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33745947 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 33746056 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33746681 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 33746919 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 33747048 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 33747261 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 33747268 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33747297 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33747336 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33747343 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 33747357 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 33747362 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 33747414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33747573 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 33747897 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33747915 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33748431 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33748443 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33748595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33748649 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33748683 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33748716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33748726 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33748788 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33748805 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 33748835 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33748958 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 33748968 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 33749059 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33749189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33749301 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 33749534 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33749541 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33749545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33749664 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 33749738 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 33749900 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 33749904 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 33749954 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 33749955 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 33750172 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33750409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33750681 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 33750737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33750957 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 33750997 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 33754958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33755650 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 33756193 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33756194 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33757950 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 33759227 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33759634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33759649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33759689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33760336 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33760405 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33760454 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33760524 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33760610 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 33760621 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 33760775 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33762077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33762284 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 33762398 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 33762554 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 33762931 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33763051 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 33763104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33763150 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 33763218 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 33763264 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 33763317 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 33763543 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 33763636 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 33764846 T C N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 3 33765128 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 3 33765969 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 33766128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33766286 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 33766390 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 33766398 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 33766444 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 33766602 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 33766616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33766635 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 33766656 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 33766771 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 33766772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33766846 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 33766863 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 33767082 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 33767497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33767554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33767592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33767869 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33768315 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 33768320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33768388 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 33768578 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 33768645 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 33768875 C A N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 33768905 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 33768982 C G N N 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 10 14 2 6 4 3 33769049 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 3 33769052 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 33769081 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 33769236 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 33769259 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 33769328 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 33769412 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 33769527 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33769594 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 33770478 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 33770840 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 33771298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33771584 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33772383 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 33772838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33773021 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 33773380 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 33773487 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 33773642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33773793 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 33775264 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33775682 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 33775790 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33775803 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 33775808 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 33775985 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 33776565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33776632 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33776845 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 3 33777047 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 33777071 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 33777077 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 33777150 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33777480 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.0526315789473684 0.736842105263158 0.210526315789474 16 22 1 14 4 3 33777486 T A Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.0526315789473684 0.842105263157895 0.105263157894737 18 20 1 16 2 3 33777826 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 33777850 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 33777868 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 33777894 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 33777975 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 33778045 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 33778287 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 33778379 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 33778403 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 33778610 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 33778620 T G Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 33778695 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 33778721 A G N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 3 33778722 T C N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 12 12 3 6 3 3 33778781 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 33778787 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 3 33778845 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 33778861 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 33778870 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 33778879 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 33778964 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 33778996 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 33779021 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 33779073 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 33779078 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 33779471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33779503 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 33779602 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33779632 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 33779934 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 33780475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33780501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33780642 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 33780807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33780848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33780968 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 33783135 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33783405 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33783808 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33785331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33785928 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 33788558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33789332 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 33790545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33792219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33792499 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 33792938 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 33793035 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 33793086 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33793131 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33793291 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 33793307 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 33793357 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 33793386 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33793397 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33793551 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 33793555 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 33793569 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33793677 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 33793682 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 33793688 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 33793762 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 33793770 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 33793792 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 33793795 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 33793939 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33794003 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33794012 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 33794083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33794170 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 33794185 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33794188 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 33794235 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 33794545 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 33795030 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33795081 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33795097 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33795148 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33795196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33795249 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33795545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33795640 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33795766 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33795982 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33796498 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33796530 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 33796550 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33796722 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 33796767 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 33796850 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 33796860 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 33796863 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 33796900 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 33796929 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 33796950 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 33797170 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 33797278 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 33797341 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 33797654 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 33797704 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33797897 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 33798013 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 33798110 T G N N 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 3 33798112 C A N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 33798432 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33798499 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 33798602 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 33798841 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33799546 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 33800079 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33800145 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33800240 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33800274 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 33800290 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 33800324 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33800399 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 33800586 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 33800645 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 33800740 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 33800741 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 33800920 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 33800988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33801104 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 33801174 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 33801193 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 33801245 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 33801303 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 33801638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33801804 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 33801844 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33801985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33802031 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33802255 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33802524 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 33802555 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33803101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33803281 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 33803529 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 33803546 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 33803570 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33803826 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 33803836 G T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 33803840 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 33803953 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 33804010 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 33804038 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 33804793 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33805313 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 33805335 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 3 33805885 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 33806524 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 33807041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33807487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33807937 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 33808060 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 33808438 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 33808601 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 33809310 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 33809385 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 33809401 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 33809889 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 33810166 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 33810222 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 33810227 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 33811665 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 33811807 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 33812252 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 33812316 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 33812522 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 33812870 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 33813113 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 33813538 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 33813836 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33813873 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33814061 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33814218 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33814465 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 33814502 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 33814537 G A N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 33814557 T A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 33814817 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 33814845 T A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 33814850 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 33814915 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 33814939 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 33815114 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33815249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33815722 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 33815749 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 33816036 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33816185 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 33816280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33816285 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33816653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33816711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33816757 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 33816799 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33816892 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33817044 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 33817058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33817452 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33817966 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 33817990 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 33819541 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33819994 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33820015 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 33822402 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 33822440 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33822843 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 33822950 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 33823074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33823553 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 33823651 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 33823672 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 33823719 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 33823894 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 33823902 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 33823991 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 33824047 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 33824264 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 33824271 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 33824326 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 33824343 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 33824513 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 33824547 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 33824560 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 33825030 A G N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 33825341 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 33826395 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 33834845 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 3 33836341 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33836897 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33837484 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33837826 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 33839601 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33839983 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 33840101 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33840178 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 33840218 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33840312 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 33840319 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 33840353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33840859 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 33840954 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 33840969 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 33841186 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 33841196 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 33841212 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 33847875 G T N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 33847955 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 33847978 A C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 33848095 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33848201 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 33848301 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 33848378 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 33848501 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 33848775 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 33848969 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 33848981 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33849012 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 33849101 G A N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.454545454545455 0.0909090909090909 0.454545454545455 11 11 5 1 5 3 33849134 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 33849578 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 33849585 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 33849615 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 33849631 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 33849961 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 33850393 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 33850395 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 33850458 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 33850537 C G Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 33850577 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 33850626 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 33850647 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 33850851 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 33850857 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 33851163 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 33851463 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 33851515 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33852149 C A N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 3 33852377 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33852414 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33852415 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33852428 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 33852910 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33854184 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33855881 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33856911 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 33859284 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33862042 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33862103 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33862322 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33862887 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 33864103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33864397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33864598 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33865820 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33866622 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 33866808 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 33867157 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 33867175 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33867218 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 33867249 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 33867250 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 33867284 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 33867387 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 33867889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33868032 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 33868308 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 33868545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33868704 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 33868754 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 33868777 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 33869062 C T N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 3 33869441 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 33869533 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 33870952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33871607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33872213 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 33872323 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33872477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33872714 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 33872746 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 33873062 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 33873138 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 33873190 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33873315 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 33873350 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 33873360 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 33873423 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 33873446 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 33873449 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 33873648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33873841 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 33873923 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 33874046 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 33874246 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 33874386 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 33874479 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33874480 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33874520 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 33874767 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 33874825 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 33875147 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33875253 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 33875442 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33875460 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 33875531 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33875536 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 33875788 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 33876502 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33877367 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 33877591 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 33877714 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33877745 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 33877987 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 33878464 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33878515 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 33878640 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 33878843 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 33878871 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33878891 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 33879219 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 33879332 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33879725 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33879979 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33880167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33880857 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33881153 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 33881666 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33882061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33882620 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 33883623 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33884914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33885354 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 33886642 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 33886908 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 33886938 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33887235 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 33887367 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33887413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33887534 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 33887618 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33887638 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 33887651 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33888605 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 33889637 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 33889670 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 33890014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33891101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33891675 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 33892252 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33892617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33894438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33895090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33895681 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 33895765 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 33895899 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33897747 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 33897756 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 33897770 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 33899770 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0 0.8125 0.1875 13 19 0 13 3 3 33899829 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33901523 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 33901919 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 33902308 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33902453 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 33903350 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 33904609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33905050 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33905477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33907155 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 33907412 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 33907616 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33907681 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33909972 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33910388 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 33910593 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 33910701 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33911640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33911759 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33912140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33913113 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 33914414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33916342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33917454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33917584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33918635 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 33920464 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33920565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33920602 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33923718 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 33923748 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 33923757 G T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 33924676 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33927971 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33928942 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33929001 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 33929202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33931711 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33932754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33934815 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33935513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33939029 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33939483 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 33939941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33942020 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33946073 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 33946188 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33946277 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33947640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33948406 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 33949292 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33949709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33950194 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 33950381 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33951091 G T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 33953291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33953431 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 33953528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33954566 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 33954567 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 33954978 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 3 33954985 G C N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 15 15 6 3 6 3 33955908 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33955919 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 33956451 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33957348 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33958221 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33960564 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 33960965 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 33961347 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 33961487 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33961766 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33961988 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 33962950 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 33963422 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33963576 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 33964444 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33964650 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33965331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33965544 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33966570 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33966685 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 33967223 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 33970528 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33970761 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 33972302 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 33975256 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 33975479 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 33975612 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33975826 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33977856 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33983112 A G Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 33983207 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 33983353 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33983583 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 33983671 T A N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 33983921 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33984170 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33984695 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33984770 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33985206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33985582 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 33985826 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33986270 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 33986874 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 33987801 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 33988033 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 33988193 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 33988245 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 33988349 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 33988476 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 33988543 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 33988581 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 33988598 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 33988612 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 33988639 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 33988680 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 33988728 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33988968 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 33989006 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 33989325 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 33989329 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 33989352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33989426 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 33989561 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 33989704 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33990194 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33992477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33992929 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 33992957 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 33992964 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 33992970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33993331 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 33995648 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 33995779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33995795 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33996058 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 33996281 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 33996338 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 33996672 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 33996835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33996846 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 33996867 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33997146 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 33997198 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 33997256 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 33997268 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 33997269 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 33997282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33997300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33997303 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 33997334 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 33997336 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 33997376 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 33997379 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 33997660 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33997715 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33997727 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33997743 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 33997932 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 33997938 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33997992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33998145 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 33998200 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 33998280 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 33998314 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 33998320 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 33998464 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 33998465 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 33998558 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 33998682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33998719 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 33998760 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 33998944 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 33999208 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 33999869 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 34000566 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 34000593 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 34001207 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34001775 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 34001828 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34002282 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 34002297 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 34002370 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 34003902 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34004954 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34005106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34005221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34005365 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 34005575 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34005988 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 34006017 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 34006199 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 34006366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34006635 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 34006654 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 34006704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34006705 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 34006763 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 34006832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34007409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34007715 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34007762 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34007977 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 34008135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34008211 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 34008357 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34008365 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34008389 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 34008402 G T N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 3 34008403 G T N N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 3 34008562 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34008664 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 34008859 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 34008883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34008899 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 34008940 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 34009833 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34010016 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 34010867 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 34011474 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 34011678 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 34011920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34013026 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 34013110 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 34013148 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34013203 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 34013291 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34013311 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34013432 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34013444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34013541 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 34013610 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 34013626 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 34013647 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34013659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34013765 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34013792 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 34013822 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 34013881 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 34014318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34014369 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 34014539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34014772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34014826 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 34014850 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 34015221 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34015342 C T N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0 0.75 0.25 9 15 0 9 3 3 34015405 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 34015550 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 34016052 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 34016100 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 34016180 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 34016213 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 34016304 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 34016401 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 34016510 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 34016535 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34016670 T A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 34016738 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 34016754 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34016916 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 34017023 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34017067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34017152 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34017178 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34017250 T C Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 34017326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34017344 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 34017384 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34017697 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 34017825 A C Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 34017827 A T Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 34018027 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 34018125 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 34018128 C A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 34018310 T G Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 34018318 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 34018375 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 34018422 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 34018464 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 34018626 A G Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 34018766 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 34018801 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34018851 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34018880 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 34019153 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 34019266 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 34019503 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 34019541 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34019953 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 34020346 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 34020427 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 34020542 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 34020795 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 34020802 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 34021398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34021551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34021765 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 34022020 C G N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 34024007 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34024389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34024437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34024482 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 34024499 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34024821 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 34024889 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 34024991 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 34025056 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 34025095 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34025173 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 34025221 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 34025291 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34025911 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 34028781 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34029871 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34033358 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 34033940 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34034360 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34034447 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 34034567 C T Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 34034653 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 34036379 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 34037597 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 34039256 C A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 34039469 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34039530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34039563 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 34039945 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34040080 G T Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 34040416 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34040430 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 34040456 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 34040460 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 34040485 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 34040497 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 34040510 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 34040530 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 34040656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34040679 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 34040811 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 34040856 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34040869 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 34040870 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 34040900 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 34040918 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34040923 G C Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 34041137 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 34041452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34041476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34041626 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34041691 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 34041819 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 34041949 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 34042416 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 34042437 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 34042467 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 34042519 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 34042525 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 34042597 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 34042626 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 34042822 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 34042852 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 34042874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34043369 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 34043542 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 34044072 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 34044078 A T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 34044606 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 34044641 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34044729 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 34045266 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 34045447 T C N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.454545454545455 0.272727272727273 0.272727272727273 13 9 5 3 3 3 34045498 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 34045538 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 34045577 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 34045939 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 34046072 C T N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 3 34046320 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 34046374 T C N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 34046423 T C N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.5 0.214285714285714 0.285714285714286 17 11 7 3 4 3 34046758 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 34046913 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 34047281 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 34047297 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 34047315 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34047530 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34047623 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 34047627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34047634 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34047658 A T Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 34047928 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 34048136 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 34048279 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 34048793 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 34048858 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 34048963 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 34049427 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 34049445 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 34049475 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 34049564 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 34049841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34049944 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 34050019 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34050077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34050903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34050951 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34051943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34052244 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 34052298 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 34052495 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 34052734 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34052747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34052779 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 34052895 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 34052952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34053240 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 34053260 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 34053330 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 34053418 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 34053426 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 34053463 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 34053949 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 34054032 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 34054056 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 34054058 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34054408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34054432 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 34054858 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 34055019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34055196 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 34055332 C G Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 34055441 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 34055499 C G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 34055596 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 34055613 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34055707 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 34055742 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 34055763 C G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 34055998 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 34056048 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 34056077 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 34056092 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 34056394 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34056415 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34056432 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 34057014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34058650 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34059904 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 34059933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34060763 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 34061025 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34061172 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 34061481 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34061685 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34061696 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34061698 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 34061768 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34061841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34061949 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34061994 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34062031 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 34062143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34062205 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34062218 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34062356 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 34062395 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34062425 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34062440 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 34062538 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34062872 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 34062897 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34062932 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34063042 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 34063130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34063334 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34063402 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34063418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34063497 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34063525 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 34063596 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34063753 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 34063894 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34063994 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34064003 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34064013 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 34064034 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 34064305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34064382 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34064425 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34064448 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34064468 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34064490 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 34064559 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34065043 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 34065073 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34065179 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34065216 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34065250 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34065257 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34065290 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34065340 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 34065395 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34065430 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34065439 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 34065446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34065450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34065527 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 34065667 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 34065705 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34065706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34065767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34065779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34065843 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34065852 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34065911 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34065970 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34066145 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34066936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34066977 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34066992 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34067013 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34067028 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34067030 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34067151 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34067262 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34067378 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34067447 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34067558 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34067623 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34067917 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 34067925 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 34067989 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 34068049 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 34068183 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34068254 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 34068712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34068784 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34068881 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 34068905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34069026 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34069160 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34069233 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34069383 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34069405 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34069432 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34069592 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34069730 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 34069768 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34069776 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34069849 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34069876 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 34069877 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 34069993 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34070005 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34070687 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34070730 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34070822 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34070897 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34070911 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34070928 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34070958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34071037 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 34071038 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 34071162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34071481 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 34071617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34071706 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 34071723 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 34071816 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 34071837 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 34071854 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 34071879 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 34071964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34072146 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 34072623 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 34073315 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 34073455 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34073456 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34073611 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 34073783 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 34073795 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 34074146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34074153 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 34074307 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 34074350 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 34074415 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 34074438 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 34074618 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 34074763 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 34074881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34074896 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 34074925 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 34075310 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 34075511 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 34075735 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34076219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34076239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34076742 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34076821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34076909 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34076979 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34077441 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34077469 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 34077490 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34077510 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 34077616 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 34077669 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 34077692 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 34077696 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 34077707 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 34077739 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 34077743 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 34077763 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 34077766 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 34077778 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 34077863 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 34077882 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 34077905 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 34078051 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 34078513 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 34078544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34079607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34079780 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 34080511 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 34080580 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 34080887 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34080906 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34081057 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 34082255 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 34082551 A G Y Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 8 10 2 4 3 3 34082777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34083303 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 34083319 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 34083436 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 34083658 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 34083741 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 34083743 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 34083817 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 34084475 A G Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 34085041 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34085149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34085333 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 34086023 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 34086302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34086775 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 34089790 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 34090154 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 34090211 A T Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 34090255 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 34090376 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 34090889 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34090909 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34091027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34091652 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 34091767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34091812 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 34091879 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 34091955 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 34091956 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 34092006 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 34092094 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 34092401 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 34092430 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 34093105 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 34093874 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 34094000 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34094291 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34094292 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34097822 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 34097924 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34097938 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34097991 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34098085 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 34098135 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 34098138 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 34098909 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 34099705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34100615 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34100926 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 34101140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34101553 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 34101853 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34102457 G C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 34103319 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 34103417 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 34103545 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 34103615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34103683 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 34103700 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 34103772 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 34103816 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 34103864 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 34103938 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34104034 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34104066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34104460 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34104552 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34104571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34104608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34104635 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34105183 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 34105185 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34105194 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34105302 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 34105350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34105561 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34105609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34105737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34105783 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 34106486 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34106519 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34106649 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 34106837 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34106889 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34106927 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34106935 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34106956 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34107019 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34107023 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34107076 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34107130 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34107194 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34107300 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34107425 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34107533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34107558 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34107562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34108197 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34108296 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34108353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34109444 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34109468 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34109645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34110308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34110488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34110529 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 34110833 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 34110968 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34110998 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 34111054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34111055 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34111080 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34111097 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34111160 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34111170 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34112029 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 34112090 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 34112117 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 34112265 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 34112275 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 34112303 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 34112355 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 34112431 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34112464 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 34113103 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 34113123 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34113422 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 34113869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34114465 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 34114980 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 34115023 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 34115037 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 34115130 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 34115360 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 34115994 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 34117244 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34117246 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 34117302 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 34117326 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34117415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34117787 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 34117809 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34117996 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 34118381 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 34120905 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34121035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34121443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34122032 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 34122297 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 34122332 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34122408 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 34122484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34122553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34122884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34122890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34123480 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34125660 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34127947 G T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 34128066 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34128162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34128450 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 34128552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34128983 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34130064 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34130071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34130671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34130889 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34132154 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 34132575 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34132692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34132837 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34132943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34133288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34133371 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 34133622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34136751 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34137429 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34137798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34139592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34141878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34142563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34142670 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34142672 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34143185 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34147034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34147963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34148240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34148390 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34148551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34148849 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34148876 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34149328 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34149504 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 34149702 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 34149703 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 34150059 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34151242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34151308 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34151701 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34152413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34153378 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 14 26 6 2 12 3 34153641 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 26 14 12 2 6 3 34156012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34156155 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34156405 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 14 26 6 2 12 3 34157268 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 34157631 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 34157632 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 34158222 G T Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 34160722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34160873 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 26 14 12 2 6 3 34160885 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 26 14 12 2 6 3 34160911 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 26 14 12 2 6 3 34161003 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 14 26 6 2 12 3 34161090 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 26 14 12 2 6 3 34161449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34161498 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34161811 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 34166215 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 34166320 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34166401 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.294117647058824 0.0588235294117647 0.647058823529412 11 23 5 1 11 3 34166457 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 34166544 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 3 34166705 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34166707 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34166780 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34168206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34168376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34168394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34168678 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34169418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34170347 C A Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 34171541 C T N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 34171611 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 34171644 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34171832 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 34172167 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34172961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34177326 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34177610 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34178117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34178319 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34178838 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34179033 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 34179444 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34179768 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34179804 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34179836 T G N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.3125 0.0625 0.625 11 21 5 1 10 3 34179894 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 14 26 6 2 12 3 34179922 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 14 26 6 2 12 3 34179929 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 34179946 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 14 26 6 2 12 3 34180008 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 14 26 6 2 12 3 34180457 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 26 14 12 2 6 3 34180822 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34180925 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34180928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34181318 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34181320 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34181677 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34181697 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34181766 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34181819 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34181831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34181976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34182061 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34182091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34182188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34182273 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34182292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34182363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34182726 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34182770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34182813 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34182837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34182996 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34183047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34183076 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34183226 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.611111111111111 0.111111111111111 0.277777777777778 24 12 11 2 5 3 34183259 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34183263 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34183332 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34183353 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34183404 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34183521 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 26 14 12 2 6 3 34183961 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34184038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34184228 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 26 14 12 2 6 3 34184315 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.578947368421053 0.105263157894737 0.315789473684211 24 14 11 2 6 3 34184761 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34184851 A C Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 34184879 G A Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 34184884 A G Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 34184899 A G Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 34184903 T C Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 34184917 T C Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 34184988 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34185000 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 34185149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34185179 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34185303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34186156 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34188485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34189332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34189681 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34189783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34189794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34190049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34190141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34190431 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34193492 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34194544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34194675 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34195257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34197613 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.333333333333333 0.111111111111111 0.555555555555556 14 22 6 2 10 3 34199381 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.315789473684211 25 13 12 1 6 3 34200312 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34200361 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 34200800 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 14 26 6 2 12 3 34200984 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 26 14 12 2 6 3 34201395 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34205580 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34206051 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 34206165 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 3 34206731 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34206876 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 34207019 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.5 0.1 0.4 22 18 10 2 8 3 34207103 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34207297 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34207522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34207576 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34207579 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34207621 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.368421052631579 0.105263157894737 0.526315789473684 16 22 7 2 10 3 34207632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34207703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34207739 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34207747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34207760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34207785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34207789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34207804 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34207838 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34207856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34207889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34208413 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34209618 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 34210448 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34211726 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34212157 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 34216072 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34218590 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.5 0.0555555555555556 0.444444444444444 19 17 9 1 8 3 34218790 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.5 0.1 0.4 22 18 10 2 8 3 34219153 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34219566 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34219933 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34220458 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34222925 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34230407 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34230851 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34239993 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34244995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34257062 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 34271633 G T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.263157894736842 27 11 13 1 5 3 34278060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34278879 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 34278943 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34281035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34283767 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34283810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34283835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34283886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34283942 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34284074 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34284112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34284182 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34284407 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 34284424 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34285769 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 34285854 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34286337 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34286757 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34287771 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 34287911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34287925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34287980 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34288054 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34288233 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 34288477 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 34289291 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 34290624 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34290740 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34290920 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 34290949 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34291054 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 34291291 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34291375 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.421052631578947 0.105263157894737 0.473684210526316 18 20 8 2 9 3 34291496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34297011 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 34298510 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 14 26 6 2 12 3 34300208 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 34303069 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 34305531 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 34306656 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 34316665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34332228 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 34333983 A T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 34339489 A C Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 34341253 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34341945 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 34346148 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 34346156 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 34346455 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34347274 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 34347318 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 34347325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34347346 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 34347358 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 34347362 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 34347392 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 34347407 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 34347527 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 34347569 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 34347570 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 34347580 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 34347596 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 34347613 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 34347716 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34347807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34347969 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 34348162 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34348213 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34348368 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34348471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34348516 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34348607 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34348608 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34348636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34348679 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34348836 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 34348846 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 34348847 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 34349528 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 34349597 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34349672 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34349723 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 34349797 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 34349875 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 34350072 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 34353552 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 34353808 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 34354000 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34354603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34354964 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 34356084 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34356231 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34357140 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 34358323 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34358933 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 34361518 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34361762 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 34362096 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 34362458 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 34362576 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 34362707 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 34363247 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34364108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34364793 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34364866 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34365618 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34365637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34365779 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34365955 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34365968 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34366000 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34366072 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34366098 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34366116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34366175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34366513 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 34366697 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34366840 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34366988 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34367092 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34367126 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34367140 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 34367164 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 34367217 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34367318 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34368236 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34368283 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34368284 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34368316 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34368480 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34368542 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34368554 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34368917 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34368979 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34368998 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 34369014 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 34369372 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 34369384 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 34369389 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 34369559 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 34369566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34369662 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34369718 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 34369765 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 34369773 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 34369806 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 34369987 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 34370067 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34370139 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34370481 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 3 34370741 T G N N 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 6 6 1 4 1 3 34370893 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 34370944 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 34371025 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34371082 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34371083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34371263 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34371356 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 34371372 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34371526 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 34371581 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 34371658 C T Y Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 3 34371785 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 34372052 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 34372081 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 34372093 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34372315 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 34372341 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 34372351 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 34372658 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 34373021 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34373195 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 34373575 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 34373576 C G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 34373934 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 34374399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34375169 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 34375261 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 34375340 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 34375364 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 34375407 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 34375418 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 34375523 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34375557 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 34376067 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34376097 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 34376112 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 34376130 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 34376254 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34376281 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 34376322 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34376331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34376343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34376448 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 34376878 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34378322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34378495 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 34378778 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34378856 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 34378951 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 34379215 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34379224 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 34379297 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 34379817 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 34380053 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 34380347 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 34380632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34381668 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 34381678 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34381753 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 34381764 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 34382004 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 3 34382036 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 34382128 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 34382130 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 34382338 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 34382488 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 34382540 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 34382550 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34382580 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 34382655 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 34382741 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 34382869 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 34382905 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 34382912 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 34382936 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 34382972 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 34382993 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34383283 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 34383349 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 34383439 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 34383597 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 34383598 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 34383684 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 34383727 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 34383825 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 34384144 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 34384187 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 34384209 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 34384235 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34384370 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 34384372 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34384411 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 34384461 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 34384549 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34384573 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34384575 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34384745 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34384875 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34384884 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 34384928 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 34384929 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34385040 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 34385251 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 34385416 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 34385433 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34385449 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 34385548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34385834 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 34385849 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 34385882 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 34385888 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 34385964 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 34385983 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 34385985 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 34386032 T A Y N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 34386064 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 34386103 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 34386125 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 34386134 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 34386142 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 34386193 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 34386205 C G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 34386280 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 34386352 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 34386422 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 34386461 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 34386594 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34386725 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 34386862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34386943 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 34387059 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34387071 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 34387097 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 34387235 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 34387251 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 34387325 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 34387422 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 34387588 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 34387651 T A N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 3 34387707 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 34387727 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 34387743 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 34387753 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 34387881 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 34387965 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 34388006 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 34388024 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 34388089 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34388174 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 34388363 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 34388826 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.222222222222222 14 4 7 0 2 3 34388891 A G N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.181818181818182 18 4 9 0 2 3 34388926 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 24 4 12 0 2 3 34388955 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 24 4 12 0 2 3 34388996 A C N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 24 4 12 0 2 3 34389073 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.133333333333333 26 4 13 0 2 3 34389079 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.133333333333333 26 4 13 0 2 3 34389150 G A N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.307692307692308 0.0769230769230769 0.615384615384615 9 17 4 1 8 3 34389247 G A Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 34389249 G A Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 34389529 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 34389705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34389737 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 34389800 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 34389843 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34389865 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34389868 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34389882 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34389998 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34390014 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 34390173 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34390194 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 34390252 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34390267 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34390270 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34390336 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34390406 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 34390430 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 34390481 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 34390541 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 34390550 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 34390567 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 34390681 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 34390695 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 34390835 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 34391032 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34391050 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 34391113 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 34391127 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 34391268 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 34391309 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 34391388 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 34391643 T G N N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 8 8 3 2 3 3 34391861 C G N N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 34391926 T G Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 34391972 T C N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 3 34392004 G C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 34392027 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34392112 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34392172 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34392203 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 34392219 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34392253 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34392299 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 34392350 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34392358 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 34392396 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 34392411 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34392433 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 34392871 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 34393407 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 34394047 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34394161 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34394292 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34394310 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34394591 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 34394807 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 34394824 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34395011 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 34395165 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 34395183 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 34395234 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 34395457 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34395534 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 34395587 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34396129 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34396207 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34396406 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 34396407 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 34396435 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34397210 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34397331 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 34397406 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34398153 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34398280 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34400541 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 34401177 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34401771 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34401842 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34402761 G A Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 3 34403733 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 34404126 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34404433 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 34404552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34406857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34407645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34407777 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 34408120 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 34408198 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34408230 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34408355 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34409035 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 34409082 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34409086 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34409778 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34410534 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 34410712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34410781 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34410846 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 34411066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34411267 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 34411270 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 34411305 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 34411312 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 34411326 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 34411377 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 34411490 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 34411495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34411873 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34411893 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34411894 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 34412012 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 34412049 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 34412068 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 34412380 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 34412710 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34413138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34413403 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34413975 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34414416 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 34414643 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34414908 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34414928 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34414996 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 34415245 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 34415275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34417350 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 34417381 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 34417424 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 34417451 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 34417495 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34417559 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 34417634 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34418319 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 34418722 G T Y N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.6 0 0.4 6 4 3 0 2 3 34419326 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34420113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34420826 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34420888 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34421405 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 34421459 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34421538 T G Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 34421601 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 34421660 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34421688 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 34421700 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 34421704 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34421933 G T N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 3 34421960 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 34422020 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 34422177 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 34422194 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 34422214 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 34422307 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 34422309 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 34422345 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34422385 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 34422540 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 34422608 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34422982 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34423052 G C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 34423681 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34423704 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34423747 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34423782 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 34423982 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34424051 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 34424071 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 34424401 T G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 34424477 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 34424516 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 34424585 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 34424597 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34425138 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34425284 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34425368 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 34426489 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34426681 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 34426775 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 34426796 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 34426832 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 34426894 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 34426918 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 34426982 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 34427007 C G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 34427134 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34427142 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 34427194 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 34427320 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34427441 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 34427448 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 34427460 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 34427894 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 34427938 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 34428012 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34428075 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34428078 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34428196 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 34428229 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 34428302 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 34428403 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 34428643 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34428673 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 34428718 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 34428763 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 34429089 A G Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 34429156 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 34429259 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 34429291 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 34429354 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 34429360 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 34429409 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 34429554 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 34429568 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 34429649 C A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 34429693 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 34429696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34429755 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 34429817 C G Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 34430047 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 34430055 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 34430092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34430254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34430382 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 34430512 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 34430643 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 34430692 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34430751 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34431026 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 34431287 T C Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 34431403 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 34432001 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 34432148 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 34432152 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 34432162 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 34432233 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 34432563 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34432576 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 34432583 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34432690 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 34432707 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 34432719 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34432726 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34432749 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34433070 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 34433659 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34433767 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 34433824 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 34434496 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34434634 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34434881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34437646 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34438251 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34439064 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 34439530 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34440303 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 34443622 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34444258 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 34444355 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34446865 C T Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 34447076 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34447507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34447541 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34448494 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 34448794 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 3 34449818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34451252 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34451253 G T Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 34451717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34451736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34452488 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34453098 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 34453212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34453242 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34453325 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 34453498 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34453859 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34453975 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34453991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34454398 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 34454640 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34454643 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 34454683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34454895 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34454930 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34454931 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34454983 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34454995 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 34455146 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 34455552 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 34455911 C A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 34455956 A T Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 34455965 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 34456042 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 34456071 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 34456378 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 34456405 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 34456486 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 34456546 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 34456673 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 34456770 G A Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 34456941 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34457311 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 34457324 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34457356 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 34457362 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 34457432 T A N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 34457443 T C Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 34457489 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 34457560 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 34457634 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 34458760 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 34458781 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 34458884 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 34459641 A T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 34459799 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34460337 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 34460594 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34462995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34464790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34464870 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34464879 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34467751 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 34467860 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 34468298 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 34468575 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 34468983 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34469014 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34469763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34469798 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34469843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34470063 A G Y Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 34471474 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 34471577 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34472680 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 34472745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34472792 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34472920 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 34472952 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 34473152 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 34473155 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 34473219 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 34473825 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34473938 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 34473965 C A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 34473966 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34474112 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34474180 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 34474204 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 34474377 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 34474431 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34474454 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34474563 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 34474598 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 34474641 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 34474974 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 34475037 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 34475158 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 34475257 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 34475319 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34475379 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34476449 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34476689 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34478195 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34478334 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34478425 G A Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 34480277 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 34480672 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34481408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34481957 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 34484008 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34484111 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 34484939 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34485000 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34486028 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 34486428 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34486429 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34486587 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34487331 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34488954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34489201 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34491011 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 34491919 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 34492121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34495464 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 34495479 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34495607 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 34495731 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 34496061 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34496257 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 34496280 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 34496342 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 34496499 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 34497623 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 34497645 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 34497949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34497969 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34498097 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 34499745 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 34499916 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 34500240 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34500292 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 34500312 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 34500341 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34500774 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 34501276 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34501332 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 34501784 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34502049 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34502149 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 34502157 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 34502208 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 34502273 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 34502322 C G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 34502455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34502591 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 34502802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34502905 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 34503077 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 34503110 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 34503119 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 34503158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34503168 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34503204 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 34503255 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 34503547 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 34503574 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 34503685 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 34503945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34504129 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 34504210 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 34504883 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 34504899 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 34504936 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 34504965 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 34505011 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34505169 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 34505295 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34505297 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 34505379 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34505505 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34505614 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34505640 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 34505643 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 34505912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34506162 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 34506627 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34506795 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 34506911 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 34507894 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34508402 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34508706 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34509745 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34509828 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34511859 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34513076 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34513301 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34514236 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34514351 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 34514764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34514887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34515062 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34516500 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 34516556 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 34516711 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34516889 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34516905 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34516923 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34516944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34516964 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 34517116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34517233 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34517241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34517318 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34517389 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34517423 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34517426 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34517494 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34517515 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34517869 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34517900 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34517989 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34517994 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34518061 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34518133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34518398 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34518414 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34518439 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34518960 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34518985 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34519222 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34519342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34519393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34519395 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34519444 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 34519460 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 34519482 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 34519517 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 34520781 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34520919 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34520925 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34520935 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34520990 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 34521000 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 34521011 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34521045 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34521117 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 34521214 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34521248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34521460 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34521681 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34521743 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34522122 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34522263 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34522638 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34523918 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34524365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34524500 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 34524787 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34524805 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34524837 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34525957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34525994 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34526416 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34527422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34529058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34533020 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34534546 T C Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 34536844 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 34537328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34537379 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34548510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34555811 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34556788 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 34564477 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 34564998 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 34565915 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 34567120 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 34567722 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34568021 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34569533 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 34569949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34571434 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 34573807 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34574171 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34574259 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 34574788 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34575819 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34575832 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 34576473 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34576577 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 34576590 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 34576625 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 34576637 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 34576708 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 34576709 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 34577379 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34577449 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34577874 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 34578553 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34579653 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34579737 G C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 34580106 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34580107 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34581401 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 34582867 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34582884 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34584607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34587462 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34589300 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 34589453 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 34589499 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 34589861 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 34589886 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34591096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34591786 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34592256 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34592600 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 34592810 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 34593495 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34593521 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 34593613 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34593837 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 34594155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34594453 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 34594837 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 34595204 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34595473 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 34595613 C G Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 34595614 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 34595977 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34596720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34598134 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34598339 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 34598346 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34598441 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34598475 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 34598528 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34598539 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34598595 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 34598598 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 34598690 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34598694 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 34598725 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34598740 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34599046 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34599593 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34599823 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34600229 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 34600236 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 34600384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34600410 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34600858 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34601465 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34602113 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34602526 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 34604053 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34604676 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34604997 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34605690 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 34605776 T A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 34606196 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 34606324 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34606718 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 34607060 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34607197 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34607270 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34607384 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34607729 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34607731 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34607828 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34607922 A C N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 10 20 0 10 5 3 34607937 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34607966 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34608039 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34608049 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34608062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34608066 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34608076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34608202 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34608314 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34608343 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34608463 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 34608487 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 34608512 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34608531 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34608562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34608605 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34608624 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34608647 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34608666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34608681 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 34608689 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34608780 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34608800 T A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 34608881 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 34608939 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 34609097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34609138 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 34609224 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 34609230 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 34609269 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34609520 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 34609592 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 34609701 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 34609723 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34609881 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 34609896 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 34610073 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 34610490 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34610549 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 34610653 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 34610933 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 34612398 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 34612576 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34612669 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34612674 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34612797 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34612842 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34612867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34612946 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34613061 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34613106 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 34613122 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 34613289 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 34613447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34613543 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 34613590 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 34613604 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 34613810 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 34613902 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 34613909 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 34613934 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 34613940 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 34614314 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34614468 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34616173 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 34616240 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 34616486 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 34616510 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 34616568 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 34616753 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 34616874 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34616942 A T Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 34616971 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 34616972 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 34617137 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 34617544 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 34617545 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 34617754 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 34618014 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 34618088 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 34618213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34618331 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34618454 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 34618474 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 34618710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34620299 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34620584 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 34620595 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34623419 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34623498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34623509 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34625766 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34626935 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34628029 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 34629234 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 34629331 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 34630016 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34630551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34630995 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 34630996 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 34631141 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 34631304 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34631377 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 34631408 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34631675 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34631713 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34631788 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34631828 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34631840 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34632322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34632531 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34632663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34632716 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 34632855 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 34632967 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34633286 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34633536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34633726 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34633744 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 34633793 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34633808 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34633909 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 34634102 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34634235 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34634547 G A N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 34634738 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 34634983 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 34635311 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34637065 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34638440 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34638797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34639058 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34639993 G A N Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.6 0 0.4 6 4 3 0 2 3 34642642 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34643173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34643207 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 34643527 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34646106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34648136 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34648715 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34649400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34649764 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34650933 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34651669 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34651812 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34653187 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 34655349 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 34655372 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34655418 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 34655706 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 34655958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34656032 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 34656937 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34657189 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 34658874 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34660482 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 34660935 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 34661615 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34662251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34662912 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 34663659 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34663735 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 34663771 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34664223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34665450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34665873 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34666137 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34667448 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34669590 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 34670687 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 34672610 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 34674123 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34675481 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 3 34676611 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34676948 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 34677112 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 34677662 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 34677683 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 34677743 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 34678161 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 34678330 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34678520 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34678884 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34679693 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 34679787 T G Y N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 34680570 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34680716 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 34680753 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 34680782 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 34680870 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 34680907 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 34681408 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34683668 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34684116 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 34684492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34684739 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34685299 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 34685474 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34686837 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34687416 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 34687969 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 34688222 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 34688282 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 34688700 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 34688735 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 34689307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34689499 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 34689904 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 34690504 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 34690658 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 34690797 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 34690827 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 34690854 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 34691278 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 34691379 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 34691907 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 34693062 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 34694832 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 34695292 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34696857 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 34697328 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 34697887 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34698414 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34698474 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 34698482 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 34698525 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34698610 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 34698626 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34698782 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 34698862 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 34698868 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 34698998 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 34699005 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 34699076 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 34700150 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34700258 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34700598 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 34700600 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 34700669 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 34700887 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34701227 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 34701466 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 34703182 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 34703287 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34703918 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 34703938 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34703952 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 34704244 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.105263157894737 0.842105263157895 0.0526315789473684 20 18 2 16 1 3 34705334 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 34705426 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 34706056 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 34706299 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34706327 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 34706749 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 34707608 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 34707703 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 34707731 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34707772 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 34707833 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34708323 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34708403 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 34708468 C A Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 34708469 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 34708490 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 34708572 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 34708596 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 34708787 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 34708977 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34709007 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 34709157 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34709344 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 34709480 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 34709618 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 34709678 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34709954 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 34709964 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34709998 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34710003 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 34710012 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 34710670 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 34710673 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 34710835 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 34711018 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 34711020 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 34711901 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 34711910 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 34711945 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 34712037 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 34712210 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 34712508 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34712592 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34712626 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34712714 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 34712835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34712995 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34713282 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34713362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34713378 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34713448 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34713471 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 34713646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34713657 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 34713839 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34713870 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 34713873 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34713884 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 34713885 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34713906 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34713919 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34714091 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34714100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34714189 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 34714251 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 34714488 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 34714530 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34714553 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 34714556 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 34714567 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 34714701 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 34715051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34715074 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34715076 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34715158 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34715172 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34715216 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34715230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34715263 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34715347 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 34715406 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34715895 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34715915 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34715978 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 34716051 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 34716490 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 34716572 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34716741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34716856 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 34716948 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34717008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34717232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34717382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34717769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34718142 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34718197 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 34718315 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 34718330 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 34718357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34718502 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34718597 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34718643 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34718844 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34718859 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 34718892 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 34719132 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34719202 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 34719288 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 34719353 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34719362 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34719425 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 34719495 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 34719496 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 34719516 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 34719924 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 34719926 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 34719941 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 34720502 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 34720996 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 34721321 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34721800 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 34721860 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34721871 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 34721922 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 34721997 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 34722168 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34722223 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34722359 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 34722384 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 34722416 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 34722448 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 34722459 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 34722505 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 34722629 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 34722639 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 34722653 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 34722659 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 34722695 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34722766 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 34722832 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 34722887 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 34723072 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 34723107 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 34723297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34723323 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 34723426 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 34723453 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 34723476 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34723516 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34723566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34723635 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 34723868 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34723873 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 34723886 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 34723914 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34724301 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 34724350 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 34724479 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 34724654 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 34724720 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34725221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34725234 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 34725262 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 34725263 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 34725279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34725348 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 34725365 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 34725855 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34725959 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34726002 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 34726242 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 34726433 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34726619 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 34726625 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 34726631 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 34726640 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 34726769 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34726851 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 34726873 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34727007 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34727195 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34727332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34727718 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 34727790 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 34727843 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 34727855 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 34727883 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 34727904 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 34728167 T G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 34728184 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 34728287 C G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 34728496 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34728517 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34728619 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34728657 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34728674 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 34728692 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34728725 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 34728731 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 34728820 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 34728896 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34728935 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 34728936 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 34728946 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 34728973 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 34728998 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 34729126 G A Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.153846153846154 21 5 10 1 2 3 34729134 G A N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 3 34729210 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 34729213 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 34729313 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 34729467 G T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 34729512 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 34729571 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 34729579 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 34729682 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 34729687 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34729704 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 34729728 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 34729755 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 34729766 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 34729808 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 34729870 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 34729898 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 34730049 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 34730064 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 34730096 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 34730097 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 34730145 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 34730177 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 34730188 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34730235 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 34730294 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 34730296 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 34730487 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 34730501 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 34730513 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 34730550 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 34730583 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 34730611 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 34730659 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 34730671 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 34730709 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 34730781 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 34731047 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34731054 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 34731224 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 34731317 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 34732024 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 34733367 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 34733637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34733886 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34734746 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34735613 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34736966 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34738045 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34738293 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34738572 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 34738618 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34738749 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 34738761 G C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 34738795 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34739468 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 34739721 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34739838 C T Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 34740060 G C Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 34740085 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34740141 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 34740428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34740575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34741735 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 34741828 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 34741879 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 34741931 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34741978 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34742275 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 34742543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34742548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34742580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34742598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34742601 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34742719 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 34742820 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 34742946 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34742957 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 34742959 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 34743149 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 34743154 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 34743562 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34744044 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 34744059 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 34744121 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 34744191 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 34745295 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 34745306 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 34752496 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 34753116 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 34753123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34753162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34753186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34753200 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34753340 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 34753554 T C Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 34753670 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 34753851 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 34753866 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 34754212 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 34754296 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 34754405 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 34754810 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 34755525 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 34755649 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 34755681 C G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 34755699 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34755710 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 34755784 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 34756480 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 34756481 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 34757161 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34757512 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 34757521 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34757644 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34757707 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 34758208 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 34758215 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 34758245 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34758306 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 34758426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34758438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34758547 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 34758691 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34758693 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34758708 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 34758737 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 34758746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34758887 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 34758945 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 34758977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34759249 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34759313 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 34759383 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 34759421 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34759582 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34760090 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34760117 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 34760143 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34760498 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 34760963 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 34761241 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 34761583 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 34761990 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34762308 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 34762371 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34762372 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34762432 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 34762516 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 34762691 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 34762902 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 34763394 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 34763425 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 34763582 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34763586 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34763626 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 34763629 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 34763639 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 34763641 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 34763671 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34763822 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 34763826 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 34763840 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 34763990 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34764191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34764193 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 34764407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34764438 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34765033 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 34765167 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 34766245 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 34766539 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34766673 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34766763 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 34766769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34766870 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34766948 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34767444 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34767786 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 34768488 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34769090 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34769405 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34769437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34771184 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 34771829 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34773175 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34775684 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 34776636 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 34776685 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 34776874 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 34777920 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34778504 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 34778785 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34778844 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34779021 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 34780436 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34781777 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34784428 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34786454 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34786786 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34788457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34789791 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34790265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34790536 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34792405 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34792411 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34793476 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 34793498 A G Y Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 8 6 3 2 2 3 34793718 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 34795991 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34796323 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 34796629 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34796678 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34796848 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 34797702 A G Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 34797941 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 34797944 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 3 34797967 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 34798026 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 34798075 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34798145 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 34798267 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 34798359 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 34798544 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 34798623 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 34798897 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.176470588235294 27 7 13 1 3 3 34798923 A C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.176470588235294 27 7 13 1 3 3 34799128 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 34799509 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34799513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34799857 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 34800708 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 34800853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34800917 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34801174 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34801223 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 34801697 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 34801741 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34801835 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 34801870 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34801913 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 34801948 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34802048 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34802522 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34802574 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34802751 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34802816 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 34803009 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 34803551 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34803590 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 34803613 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34803992 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34804047 G C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 34804115 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34804313 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 34804351 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 34804494 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 34804642 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 34804682 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34805039 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 34805730 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34806009 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 34806229 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 34806319 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34806339 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 34807977 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34807979 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 34808018 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 34808156 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 34808180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34808222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34808255 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34808672 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 34808796 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 34808804 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 34808861 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.25 0.333333333333333 0.416666666666667 10 14 3 4 5 3 34808983 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 34809079 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 34809257 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 34809406 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 34809422 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 34809478 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 34809482 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 34809655 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34809723 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 34809734 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 34809843 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 34809933 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 34809991 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 34810003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34810091 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 34810093 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 34810192 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 34810230 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 34810267 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 34810278 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 34810332 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 34810494 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 34810586 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 34810636 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34810781 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 34811271 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34811743 T A Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 34811748 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34811797 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34811812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34811835 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34812236 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34812393 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 34812582 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 34812583 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 34813117 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 34813232 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34814564 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 34814585 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 34814595 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 34814699 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 34814702 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 34814863 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 34814943 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 34815032 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34815093 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 34815100 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 34815198 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 34815219 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34815408 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 3 34815596 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34815889 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34816061 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 34816136 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 34816178 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34816228 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 34816239 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 34816293 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 34816299 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34816308 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 34816484 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 34816511 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 34816617 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 34816804 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 34816812 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 34816975 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34817315 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 34817799 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 34817940 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 34818009 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34818012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34818024 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 34818061 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 34818248 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 34818592 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 34818610 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 34818799 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 34819165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34819549 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34820001 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34820018 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 34820197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34820396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34820431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34820639 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 34820836 C T Y Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 3 34821104 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34821256 A C Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 34821265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34821285 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 34821357 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34821408 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 34821464 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 34822110 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 34822716 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34823060 A G Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 34823895 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 34825220 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 34825227 G C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 34825417 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 34825449 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 34829258 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34829284 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34829364 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 34829906 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 34830028 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 34830053 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 34830568 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34831259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34831956 C T N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 15 9 6 3 3 3 34831998 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 34832501 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 34832618 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 34832672 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 34832856 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 34833277 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 34833571 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34833666 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34834433 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 34834620 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 34835095 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 34835106 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 34835611 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 34835640 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 34835649 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 34835671 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34835735 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34835795 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 34835825 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 34835852 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 34835974 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 34836641 T C Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 34836718 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 34837190 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34838896 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 34840145 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 34840164 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 34840178 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 34840310 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 34840546 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 34840654 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34840713 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34840725 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 34840750 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 34840918 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34840999 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 34841199 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 34841275 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 34841316 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34843263 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34843590 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 34845030 G A Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 24 4 12 0 2 3 34845234 C T Y Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 3 34846068 A T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 34846165 G A Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 34846214 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 34846375 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34846381 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34846525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34846703 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34847329 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34847448 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 34847522 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 34847534 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 34847591 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 34847783 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34847996 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34848135 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 3 34848241 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 34848288 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 34848345 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 34848501 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34848726 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 34848767 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34848890 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34849072 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 34849233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34849314 T G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 34849323 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34849563 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 34849648 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 34849933 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 34850157 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 34850229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34850352 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34850390 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 34850407 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 34850430 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 34850445 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 34850480 A G N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 34850497 G T N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 34850501 G A N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 34850609 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34850734 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 34850769 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 34850906 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34851368 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34851429 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 34851471 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34851504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34851509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34851632 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34851644 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34851656 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 34851671 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 34851698 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 34851829 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 34851884 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 34852030 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 34852065 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 34852105 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34852113 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 34852124 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34852228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34852581 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34852645 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 34852738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34852926 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34852931 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 34852988 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34853008 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 34853021 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34853022 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 34853070 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34853103 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 34853112 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 34853356 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 34853391 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 34853404 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 34853499 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34853530 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 34853624 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 34853742 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 34853871 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34854052 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 34854138 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 34854173 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 34854196 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 34854254 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 34854266 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 34854473 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34854551 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34854559 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 34854601 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 34854609 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 34854617 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 34854754 A G Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 34854797 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34854903 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 34854941 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 34855301 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 34855567 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34856035 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34857275 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 34857500 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 34857560 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34857909 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 34858508 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 34858713 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 34859639 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 34859806 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 34860269 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34860270 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 34860422 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 34860569 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 34860608 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 34860622 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 34860624 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34860645 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 34860723 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 34860742 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 34860748 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 34860753 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 34860808 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34860856 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 34860860 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 34860920 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 34860960 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 34860975 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 34860984 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 34861121 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 34861376 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 3 34861535 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 34861537 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 34861984 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34861986 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34862494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34862520 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 34862545 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34862710 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 34863446 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34863480 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 34863632 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 34863690 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 34864019 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 34864108 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 34864330 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 34864384 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 34864429 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 34864486 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 34864489 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 34864499 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 34864519 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 34864566 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 34864633 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 34864674 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 34864753 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 34864777 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 34864787 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 34864861 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 34864912 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 34864940 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 34865064 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 34865106 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34865356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34865438 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 34865532 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 34865543 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 34865555 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 34865966 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 34865973 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 34866497 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 34866778 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34867063 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34867496 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34867797 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34868279 C A Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 34868596 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34868633 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34868970 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34869362 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 34869391 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 34869568 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 34869772 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 34869798 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 34870085 T G Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 34870174 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34870570 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34870873 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 34871115 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34871459 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34871810 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 34872461 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 34873167 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 34873182 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 34873593 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34873669 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34873995 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 34874007 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 34874028 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 34874321 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 34874417 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34874650 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34874655 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34874855 T A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 34874896 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 34874903 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 34874950 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 34874977 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 34875352 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 34875496 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 34875517 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34875792 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 34875816 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 34876525 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34876963 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34877272 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 34877338 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 34877401 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34877942 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34879284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34880623 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 34882350 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 34882721 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 34883542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34883854 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34884312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34884513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34884591 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34885884 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 34886637 C G Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 34887002 G T Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 34887019 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34887104 C A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 34887164 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 34887240 A C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 34887406 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 34887967 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 34888271 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34888410 A C Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 34888556 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 34889203 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34889568 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 34890209 C A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 34891107 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34891224 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34891428 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34891545 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 34892101 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 34892145 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34892179 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34892284 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 34892454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34892986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34893206 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 34893609 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 34893949 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 34893976 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 34894013 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 34894245 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34894752 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34894779 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 34894910 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 34894960 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34895510 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 34895558 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34895724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34896414 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34897024 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 34897042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34898062 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 34898066 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 34898189 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 34898235 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 34898277 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34898388 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 34899120 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 34899812 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 34900031 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 34900158 C G Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 34900167 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 34900187 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 34900316 G C Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 34900562 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34902447 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34903841 T A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 34905935 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34905937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34907066 A G Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 34907103 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34907134 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34907603 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 34907820 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34907821 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 34908595 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 34908699 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 34908899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34908900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34908915 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 34909044 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 34909067 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34909088 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 34909099 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 34909501 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 34909575 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 34909679 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 34909832 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 34910009 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 34910050 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 34910225 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 34910242 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 34910245 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 34910296 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34910301 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 34910366 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 34910452 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 34910513 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 34910577 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 34910644 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 34910727 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 34910846 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 34910893 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34911043 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 34911090 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 34911111 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 34911146 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 34911174 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 34911182 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 34911212 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 34911313 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 34911450 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 34911510 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34911543 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 34911565 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 34911572 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 34911600 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 34911858 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 34911985 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 34912278 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 34912354 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 34912388 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 34912401 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34912583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34912773 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 34912797 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 34912799 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 34912936 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34913019 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 34913108 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 34913374 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 34913450 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34913688 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34914059 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 34914197 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 34914344 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 34914455 A C N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.153846153846154 0.0769230769230769 0.769230769230769 5 21 2 1 10 3 34914532 G T N N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 3 34914553 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 34915676 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 34916182 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 34916337 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34916436 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 34916569 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 34916582 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 34916673 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 34916797 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 34917605 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 34917801 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 34917838 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 34917940 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 34917951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34918088 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 34918214 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 34918381 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34918557 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34918594 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34918627 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 34918963 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 34919023 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 34919208 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 34919675 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34919751 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 34919809 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 34919830 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 34919972 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 34919987 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 34920265 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 34920336 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 34920360 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 34920401 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 34920447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34920542 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 34920626 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 34920687 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 34920804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34920830 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 34920889 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 34920992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34920993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34921203 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 34921302 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34921365 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 34921376 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34921391 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34921422 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 34921589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34921653 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 34921665 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34921801 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 34921887 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 34921917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34921976 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 34922038 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 34922077 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 34922350 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 34923014 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 34923441 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 34924120 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 34924128 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 34924167 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 34924374 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 34924476 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 34924498 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 34924688 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 34924935 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 34924985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34924990 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 34925130 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 34925380 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 34925785 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 34925830 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 34925967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34925999 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 34926037 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 34926369 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 34926371 C G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 34926490 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 34926693 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 34926751 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.235294117647059 0.0588235294117647 0.705882352941177 9 25 4 1 12 3 34926768 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34927090 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 34927187 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34927290 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34927329 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 34927449 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 3 34927485 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34927558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34927719 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 26 14 12 2 6 3 34927724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34928274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34928801 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34929204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34931258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34931339 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34931437 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34932191 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 34932684 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 34933620 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34933634 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.578947368421053 0.105263157894737 0.315789473684211 24 14 11 2 6 3 34933969 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 34933970 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.210526315789474 0.0526315789473684 0.736842105263158 9 29 4 1 14 3 34934231 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34935077 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 34935092 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 34935127 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 34935681 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34935946 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 34936028 C A Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 34936775 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 34936835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34936842 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 34937165 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 34937564 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 34937719 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 3 34938126 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 34938144 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 34938484 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 34938523 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 34938576 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 34938615 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 34938780 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 34939096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34939350 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34939405 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34939500 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 34939736 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34939892 C A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 3 34939949 G T Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 3 34939993 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 34940028 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 3 34940056 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 3 34940061 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 34940168 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 34940209 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 34940221 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 34940269 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.368421052631579 0.105263157894737 0.526315789473684 16 22 7 2 10 3 34940367 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 3 34940371 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 3 34940396 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 3 34940700 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.368421052631579 0.105263157894737 0.526315789473684 16 22 7 2 10 3 34940790 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 34940829 A T Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 34940922 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 34941016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34941017 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 3 34941095 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 34941096 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 34941307 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 3 34941310 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 34941350 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34941506 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 34941612 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 34941728 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 34941742 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 34942288 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 34942446 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 34942483 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 34942498 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 34942623 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34942659 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 34942843 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 34943223 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 34943310 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 34943317 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 34943378 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 34943448 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 34943594 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 34943653 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 34943757 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 34943774 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 34943918 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 34943920 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 34943991 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34944016 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 34944028 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 34944048 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 34944057 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 34944243 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 3 34944405 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 34944685 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 34944709 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 34944722 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 34944851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34944860 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 34944962 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 34944977 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 34944982 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 34944990 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34945194 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 34945466 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34945650 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 34945703 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 34945959 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 34945999 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 34946041 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 34946184 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 34946217 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 34946238 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 34946278 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 34946293 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 34946308 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 34946636 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34946784 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 34946798 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 34946818 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 34946924 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 34946986 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 34947169 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 34947284 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34947285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34947318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34947629 A G Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 34947668 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34947843 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34948950 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 3 34949037 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 34949060 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 34949615 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 34949778 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 34950101 C A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 3 34950115 T A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.1875 0.0625 0.75 7 25 3 1 12 3 34950120 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.1875 0.0625 0.75 7 25 3 1 12 3 34950387 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 34950987 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34951117 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 34951810 T A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 34952027 T G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 3 34952691 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.6 0.133333333333333 0.266666666666667 20 10 9 2 4 3 34952714 C A N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 15 15 6 3 6 3 34952895 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34953029 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 34953272 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 34953652 T G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 34953654 A G Y Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 34955974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34959861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34960250 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34961517 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34961677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34961794 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34962270 A C N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 3 34962663 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34962669 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 34962727 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 34964795 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 34965262 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 34966854 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34966855 C G Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 34968644 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34969475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34970438 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34970907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34971914 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34974640 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 34978477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34978907 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34978913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34978966 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34979289 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 34979567 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34980051 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34980323 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34980361 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34980584 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 34981928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34982208 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 34982429 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 34982599 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34982705 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 34982771 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34982778 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34982905 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 34983950 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34984020 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34984029 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34984073 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34984480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34984655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34985091 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 34985198 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 34985226 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 34985375 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 34985646 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34985668 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34985847 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 34986285 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 34986731 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 34988058 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34988316 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34988393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34988396 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 34988481 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 34988602 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 34988676 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 34988815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34988826 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 34988837 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 34988850 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 34988857 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 34989191 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 34989196 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 34989524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34989855 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 34990201 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34990969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34991438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34991474 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.263157894736842 28 10 14 0 5 3 34991509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34991754 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 34992918 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34993021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34993335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34993369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34994224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34994534 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 34995366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34995840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34996263 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 34996474 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34996713 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34999147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 34999629 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 34999825 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 35000473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35000482 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 35000491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35000599 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35001124 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35001217 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 35001531 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35003210 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 35003340 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35003390 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35003499 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35003561 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 35003717 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 35004977 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35005144 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 35005145 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 35005323 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 35005337 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 35005406 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 35005494 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 35005553 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 35005602 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 35005655 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 35005656 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 35006102 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 35006340 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35006352 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 35006460 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 35006659 C T Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 35006724 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 35006738 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 35006754 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 35006765 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 35006800 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 35006842 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 35006868 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 35006935 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35008157 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35008166 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 35008172 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 35008348 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35008353 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 35008409 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 35008464 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35008597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35008669 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 35008682 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 35008691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35008794 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 35008889 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 35009003 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 35009157 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 35009224 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 35009234 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35009275 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 35009385 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 35009537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35011528 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 35012553 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 35012585 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 35012603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35012815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35013036 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 35013094 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 35013121 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 35013135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35013306 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35013364 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 35013419 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 35013438 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35013499 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35013549 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 35013664 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35013665 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 35013726 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 35013801 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 35013832 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 35013844 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35013852 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 35013909 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35013912 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35013949 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35013995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35014025 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35014387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35014394 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35014455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35014775 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 35014841 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35015127 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 35015580 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35015688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35015717 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35015806 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35015816 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 35015907 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35015962 C A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 35016035 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 35016065 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 35016165 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 35016192 A C Y N 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 3 35016203 T A Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 35016272 C T Y Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 35016276 G T Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 35016327 A G Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 35016338 T C Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 35016450 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 35016466 C T Y Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 3 35016707 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 35016804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35016999 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35017106 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35017140 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35017190 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35017306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35017329 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 35017382 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 35017413 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 35017789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35017812 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35017875 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 35017896 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 35017944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35017956 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35018006 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 35018008 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 35018070 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35018126 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 35018153 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 35018227 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 35018292 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35018342 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35018445 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35018528 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 35018639 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 35018711 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35018865 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35018885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35019005 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 35019006 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 35019120 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 35019196 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 35019208 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 35019218 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 35019364 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35019404 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 35019438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35019441 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 35019455 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 35019491 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35019535 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35019607 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35019615 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35019625 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35019653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35019679 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 35019970 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 35020082 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 35020248 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 35020273 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35020306 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35020356 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35020376 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35020401 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 35020485 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35020499 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 35020516 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 35020588 A G N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 35020641 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35020661 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35020734 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35020745 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35020815 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35020821 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35020845 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35020915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35020987 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 35021059 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 35021166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35021290 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35021366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35021653 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 35021706 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 35021915 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 35021948 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 35021954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35021983 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 35023124 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35023133 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35023166 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35030754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35030941 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 35031166 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35031215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35031406 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 35031564 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35031828 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 35032447 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35032549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35032683 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35032818 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35032933 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 35033048 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 35033211 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35033393 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 35033443 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35033499 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 35033501 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35033587 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 35033663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35034452 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35034454 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 35034500 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 35034507 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35035433 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 35035501 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35035522 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35035525 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35036127 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 35036156 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 35036219 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 35036492 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35036547 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 35036603 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35036636 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35036643 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35036831 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 35037060 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 35037309 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 35037360 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 35037438 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35037751 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35037789 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35037809 A C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 35037851 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 3 35037946 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35038058 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 35038460 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35039747 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 35040288 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35040396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35041007 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35041228 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35041545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35041643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35041710 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35045528 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35045586 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35045590 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35045792 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 35046019 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 35046058 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 35046166 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35046267 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35046298 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 35046576 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35046594 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35046631 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35046650 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35046721 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35046880 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 35048909 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35049896 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35050560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35051937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35052289 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 35053633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35054012 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35054088 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35054834 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35055142 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 35055265 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 35055326 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 35055420 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 35055928 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 35056035 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 35056094 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 35056254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35056369 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35056487 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 35056766 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35056786 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35057631 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 35057961 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35058001 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 35058046 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 35058098 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 35058349 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 35058465 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 35058660 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 35058661 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 35059660 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35059702 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35059737 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35059738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35060016 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35060139 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 35060211 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 35060222 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35060545 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 35060570 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 35061116 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 35061130 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 35061199 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 35061212 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 35061221 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 35061237 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 35061272 G A Y Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0 1 0 15 15 0 15 0 3 35061320 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 35061354 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 35061378 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 35061459 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 35061557 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 35061566 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 35061593 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 35061628 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 35061775 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 35061779 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 35061870 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 35061875 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 35061884 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 35061886 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 35061900 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 35061956 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 35062028 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 35062113 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 35062141 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 35062192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35062415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35062455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35063178 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 35063393 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 35063548 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35064345 A C N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 3 35067628 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 35067709 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35067796 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 35067830 T A Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 35068099 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35068150 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35068360 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 35068886 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 35069623 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 35069639 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 35069667 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 35069692 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 35069725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35069783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35070195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35071198 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35071299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35071496 A G Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 35072013 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 35072056 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35072119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35072228 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 35072261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35072331 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35072373 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 35072432 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35072443 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35072539 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35072630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35072649 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35072660 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35072869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35072940 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 35073116 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 35073315 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 35073547 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35074020 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35074072 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 35074281 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35074491 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 35074523 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35074576 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 35075173 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35075203 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35075413 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35076032 A C N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 35076197 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 35076264 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35076318 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 35076325 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 35076334 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35076363 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35076369 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35076421 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35076476 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35076724 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 35076835 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 35076851 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35077145 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35077154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35077335 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35077807 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 35078022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35078124 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35078293 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35078454 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35078573 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35078637 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35078677 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35078926 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35078932 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35079013 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 35079237 T A N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 3 35079312 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 35079471 A T Y N 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 3 35079493 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 35079566 C T Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 3 35079624 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 35079633 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 35079642 A T Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 35079653 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35079675 A G Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 3 35079685 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 35079715 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35079799 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35079843 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 35079846 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 35079902 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 35079903 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 35079952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35079966 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35080102 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 35080125 T A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 35080142 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35080185 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35080313 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 35080325 A C Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 35080424 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35080490 C T Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 3 35080565 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35080568 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 3 35080592 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 35080636 G A Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 35080710 T C Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 35080964 A C Y N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 35080978 A C Y N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 3 35081045 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 35081155 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 35081170 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 35081255 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 35081269 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 35081375 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 35081419 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 35081431 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35081449 G T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 35081485 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 35081500 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 35081529 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 35081586 C A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 35081593 G T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 35081600 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 35081617 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 35081655 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 35081857 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 35081879 A C Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 35081911 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 35081938 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 35082132 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 35082187 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 35082210 A G Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 35082250 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 35082401 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 35082419 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 35082428 T G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 35082431 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 35082491 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 35082515 A T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 35082535 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 35082557 A C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 35082562 G C Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 35082624 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 35082697 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 35082827 T G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 35082881 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 35082923 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 35082993 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 35083038 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35083055 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 35083064 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 35083099 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 35083116 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 35083154 C A Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 35083167 C A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 35083194 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 35083241 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35083253 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 35083294 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 35083328 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 35083366 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 35083454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35083473 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 35083514 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 35083737 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 35083788 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 35083809 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 35083818 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 35083862 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35084037 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35084317 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35084381 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 35084400 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 35084447 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35084487 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35084718 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 35084742 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 35085082 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35085343 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35085452 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 35086208 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 35086213 G C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 35086634 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35086644 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 35087022 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 35087325 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 35087331 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 35087542 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35087713 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 35087965 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35088152 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35088272 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35088300 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 35088527 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35089061 A T Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 35089381 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 35089510 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 35089524 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35089741 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35089875 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 35089897 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35089999 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35090033 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35090368 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35090408 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 35090435 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35090483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35090721 C T Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 35091615 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35091644 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35091684 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35091706 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35091748 A G Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 35091963 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 35092098 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 35092256 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35092417 A G Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 35092446 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 35092953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35092977 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 35092999 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35093127 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35093271 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35093838 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35093989 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 35094099 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 35094538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35094829 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 35095075 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 35095099 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 35095235 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 35095584 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 35095754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35095833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35095961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35096690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35096691 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 35102047 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35102210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35102224 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35102753 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35103170 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35103780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35103930 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35104030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35104621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35104761 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 35104819 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 35104878 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 35104933 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 35105030 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 35105085 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35105203 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 35105499 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35105520 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35105623 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 35105668 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35105849 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 35105970 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 35106166 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.0555555555555556 0.833333333333333 0.111111111111111 17 19 1 15 2 3 35106422 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35106504 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35106839 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 35106878 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35106965 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 35107011 A C N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 35107211 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 35107318 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35107446 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 35107704 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35107797 A T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 35108102 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35108229 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35108341 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 35108473 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 35108492 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35108590 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35108654 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35109300 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35109513 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 35110869 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 35111136 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35111143 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 35111186 T G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 35111341 T A Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 35111499 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35111504 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 35111620 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 35111632 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35112398 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 35112412 A T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 3 35113234 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 35114217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35114549 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 35114589 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 35114649 T A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 35114835 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 35115356 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 35115712 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 35115774 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 35115785 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 35115887 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 35115971 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 35116083 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35116084 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35116127 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35116154 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 35116330 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 35116660 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 35116984 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35116992 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35117008 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35117017 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35117054 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35117239 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35117284 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 35117600 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35117601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35117946 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 35119153 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35119731 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 35119778 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 35119865 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35119938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35119946 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35119949 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35120037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35120123 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35120127 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 35120227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35120731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35120812 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 35120903 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35121014 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35121179 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35121364 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 35122177 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35122208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35122465 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35122725 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35122748 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 35123013 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 35123585 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35124313 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35124666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35124894 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35124910 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 35124951 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35125216 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 35125387 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35125415 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 35125463 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 35125488 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35125532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35125605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35126184 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35126213 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 35126330 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35126475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35126560 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35126586 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35126595 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 35126724 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35127210 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 35127801 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 35127852 C A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 35127907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35127974 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35128019 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35128101 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 35128156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35128194 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 35128222 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 35128302 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 35128402 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 35128844 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35128873 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35129251 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35129383 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 35129416 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35129430 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35129441 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35129448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35129485 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35129625 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 35129661 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35129728 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35129750 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 35129832 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 35129879 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 35129949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35129954 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 35130082 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35130246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35130742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35130850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35131504 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 35131945 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35131978 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35132171 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 35132305 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 35132337 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 35132347 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 35132487 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35133511 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 35133512 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 35133655 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35133764 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35133818 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35133940 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35133985 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35134167 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35134298 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 35134472 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 35134496 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 35134565 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35134606 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35134634 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35134992 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35135297 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35135680 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35135844 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35136016 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35136075 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 35136119 G T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 35136138 A C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 35136207 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 35136279 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 35136583 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35136701 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 35136807 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 35136981 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 35137060 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 35137281 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 35137571 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 35137836 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35138115 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35138782 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35138870 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35139323 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35139647 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35139707 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 35140354 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35140442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35140586 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35140597 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35141610 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 35141642 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 35142907 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 35143188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35143319 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35143389 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35143399 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35143552 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 35144805 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35144997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35145016 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35145096 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35145112 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35145327 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35145533 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35145930 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 35145966 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35145967 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35146578 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35146587 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35146600 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 35146936 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 35147209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35148445 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 35148500 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 35148563 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 35148600 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 35149489 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 35149784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35149910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35150004 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35150041 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35150500 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35150645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35150684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35151512 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 35151607 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 35151689 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 35152104 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35152330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35152332 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35152496 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 35152539 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 35152608 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 35152650 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 35153944 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 35154217 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 35154564 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 35154714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35154726 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 35154819 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35159527 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35159552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35160147 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35160215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35160261 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 35160339 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35160463 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 35160522 T G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 35160597 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 35160607 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 35160614 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 35160667 G C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 35160678 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 35160716 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 35162312 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35162330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35162359 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 35162480 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 35162680 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35162709 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 35162787 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35162828 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 35162860 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 35162878 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 35163415 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35163454 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35163550 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 35163554 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35163744 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35163752 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35163812 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 35163874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35163875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35163940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35163951 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35164062 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35164187 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 35164258 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35164289 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 35164327 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35164412 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 35164663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35164781 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 35164838 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 35165066 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 35165289 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35165336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35165495 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 35165551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35165575 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 35165627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35165671 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 35165837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35165887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35166535 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 35166575 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 35166585 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 35166967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35166983 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 35167060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35167136 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35167170 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35167355 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35167570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35167804 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35167881 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35167947 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35168134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35168245 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35168500 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 35168821 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35169297 T A Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 35169298 T A Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 35169726 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35169738 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 35170505 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35170623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35170919 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 35170923 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 35171140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35172022 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35173234 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 35173519 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35173714 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35173965 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 35174156 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35174208 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35174756 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 35174763 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 35175321 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 35175353 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35175394 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 35175420 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 35175431 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 35175526 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 35175823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35176362 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 35176398 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 35176420 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 35176461 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 35176469 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 35176565 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 35176608 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 35176653 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 35176673 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 35176797 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 35176883 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 35177164 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 35177184 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 35177207 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 35177279 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35177461 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35177490 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35177560 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35177592 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35177653 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 35177676 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 35177746 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35177761 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35177781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35177844 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 35177945 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 35177977 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35178123 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35178140 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35178168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35178192 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35178206 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 35178253 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 35178324 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 35178559 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 35178692 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35178731 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35179549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35179703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35179972 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35181299 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 35181482 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35181644 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 35181655 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 35181668 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 35181908 A G N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 35181938 C G N N 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 35182438 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 35182702 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35183214 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 35192752 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35193131 G T N N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 9 9 3 3 3 3 35193469 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35193471 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35194277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35194746 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35194997 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35195745 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35197921 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35199353 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35200378 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35200464 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 35203187 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35204781 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35205213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35207152 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 35207313 C G Y N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 35207667 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35207888 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35208976 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35209361 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 35209578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35209620 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35209683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35209786 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35210904 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 35211245 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 35211274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35211972 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 35212236 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 35212380 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 35213818 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 35213861 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35213873 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 35214149 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 35214331 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35214469 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35214481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35214716 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35214988 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 35215210 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35215685 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 35215724 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 35216190 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 3 35216254 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35216797 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35216880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35217047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35217173 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35217496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35217870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35218676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35218680 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 35219975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35220270 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 35220377 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 35220408 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 35220479 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 35220961 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 35220980 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 35221006 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 35221088 A T Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 35221520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35221652 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 35222743 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35223489 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 35224664 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35225686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35226057 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35226088 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 35226133 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 35226146 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 35226197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35227365 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35228036 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 35228117 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 35228125 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35228812 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 35228873 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35229076 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 35229218 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35229283 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35231944 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35231945 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35232913 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35233084 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35233413 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35233657 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 35233741 G T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 35233749 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35233808 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 35233809 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 35234013 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 35234183 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 35234402 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35234469 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35234544 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35234582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35234626 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35234650 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35235374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35235605 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 35235615 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35235726 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35235878 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 35235928 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 35236011 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 35236012 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 35236068 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 35236077 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 35236095 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35236150 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35236157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35236218 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 35236221 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 35236802 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 35237621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35238796 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35238812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35238903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35239732 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35241096 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35242053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35242884 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 35243286 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35243589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35245738 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35247304 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 35248612 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 35248686 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 35248706 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 35248736 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 35248821 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 35248924 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 35249146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35249197 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 35249232 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 35249265 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35249553 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35249703 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 35249820 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 35249940 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 35250603 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35250715 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 35250746 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 35250759 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 35250768 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 35250776 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 35250814 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 35250839 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 35250960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35251212 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 35251281 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 35251323 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 35251365 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 35253795 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35254475 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35254658 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 35254880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35255377 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35256500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35256768 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35256789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35256876 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35256950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35256966 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35257269 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 35257287 T C Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 35257303 C G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 35257461 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 35257463 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 35257812 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 35258466 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 35258528 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 35258537 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35258813 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 35259053 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 35259141 G A Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 35259185 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35259267 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35260343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35260459 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 35263473 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 35263563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35264711 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35264712 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35264725 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35266347 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35267083 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 35267192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35267478 C A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 35268825 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35269549 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 35270685 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 35271419 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 35271763 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35272818 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 35274371 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 35274937 C G Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 35275015 T C Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 35275124 C A Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 35275161 C A Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 35275235 T C Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 35275466 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 35275477 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 35275478 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 35275548 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 35275605 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 35275608 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 35275629 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 35275651 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 35275688 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 35275760 C G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 35275782 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 35275824 C G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 35275935 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 35275982 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 35275994 G C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 35276141 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35276191 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 35276546 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 35276618 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 35276642 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 35276651 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 35276700 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 35276744 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 35276764 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 35276776 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 35276838 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 35276922 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 35276923 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 35276976 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 35277067 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35277150 T G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 35277179 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 35277352 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 35277353 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35277601 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 35277820 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 35277839 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 35277882 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 35278047 T G Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 35278057 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 35278061 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 35278082 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 35278124 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 35278180 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35278387 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 35278523 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 35278560 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 35278717 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35278817 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35278912 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 35285016 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35285023 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 35285071 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 35285090 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35285098 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35285112 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 35285187 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35285277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35285348 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 35285661 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 35285682 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35285835 G A N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 3 35285903 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 3 35286071 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 14 10 6 2 4 3 35286072 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 14 10 6 2 4 3 35286084 C T N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.533333333333333 0.2 0.266666666666667 19 11 8 3 4 3 35286250 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 35286284 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35286355 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 35286865 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 35286991 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 35287230 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 35287235 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 35287337 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 35287920 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35288305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35288498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35288523 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 35288564 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 35288570 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35288715 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35288719 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35288744 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 35288794 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 35288953 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 35289612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35289628 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 35289629 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35289955 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 35290004 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 35290170 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 35290269 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35290598 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 35290645 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 35291000 G C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 35291117 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 35291312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35291513 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 35292517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35292531 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35294474 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35294859 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35297117 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35300007 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 35300166 G T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 35301684 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 35301776 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 35302024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35302350 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35302400 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35302567 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35302763 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35302909 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 35303501 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 35303629 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35303673 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35303850 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35304679 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 35304967 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35305077 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35305112 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35305328 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35305532 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 35305603 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35305735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35305741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35305759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35305995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35306047 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35306074 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 35306538 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35306591 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35306860 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35306881 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35306894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35306918 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35306978 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35307052 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35307060 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35307166 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35307207 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35307226 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35307284 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35307373 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35307699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35308197 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35308234 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35308364 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 35308373 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 35308399 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35308595 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35308650 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35308674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35308703 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35308718 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35308847 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 35308914 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35308926 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35308935 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35309026 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35309094 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35309103 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35309194 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35309294 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 35309481 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35309489 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35309744 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35309761 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 35309860 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35310273 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35310404 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35310411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35310432 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35310442 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35310479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35310526 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35310530 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35310631 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35310873 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35310892 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 35310999 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 35311010 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 35311034 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35311122 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 35311287 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 35311630 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 35311864 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 35312096 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35312097 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35318148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35318496 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35319146 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35319911 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35320085 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35320459 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 35320703 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 35320867 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 35320949 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35320971 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35321024 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35321075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35321077 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 35321634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35322082 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35323155 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 3 35323294 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 35324138 T G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 35324822 C T N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 35331525 G C Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 35334060 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 35334216 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 35334462 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35334685 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 35337307 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35337360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35337378 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35339261 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 35339935 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35341203 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35341969 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35342172 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35343610 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 35344675 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 35345237 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 35345880 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 35346591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35349694 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 35350405 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 35351457 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35352434 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35352536 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 35353062 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35354819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35357331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35358424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35358737 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35358750 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 35359196 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35359284 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35361382 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35361632 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 35361640 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35362218 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35362319 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35362392 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35362429 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35362583 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35362611 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35362831 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35362878 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 35363428 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 35363489 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 35363493 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 35364041 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 35364096 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35364749 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35364815 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35365187 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35365529 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35365903 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 35365913 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35366237 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35366326 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35366618 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35367098 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35367173 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35367338 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 35367537 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35367626 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 35367792 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35367911 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 35367916 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 35368086 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35368087 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 35368155 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35368160 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35368242 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35368258 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35368297 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35368364 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35368403 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35368443 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35368497 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35368537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35368545 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35368698 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35368752 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35368890 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 35368952 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 35369063 T C Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 35369221 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35369331 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35369435 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 35369564 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35369622 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 35369653 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35369693 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 35369947 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35370394 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 35370448 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35370539 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 35370551 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 35370606 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35370635 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35370636 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35371234 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 35371311 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35371870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35371922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35371988 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35372471 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35372772 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 35373165 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35373655 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 35373975 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35374520 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35374656 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35374843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35376186 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 35376817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35377652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35377666 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35378905 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 35379319 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35379324 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 35379405 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 35379488 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 35380244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35380303 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35381263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35381506 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 35381550 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 35381552 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 35382569 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 35384941 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35384977 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35386045 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35386393 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35386411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35386471 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35388051 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 35388483 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 35388750 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35388752 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35389074 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35389093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35390022 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 35390923 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35391710 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 35391853 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 35396325 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35396782 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35401323 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 35402640 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35402696 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 35402713 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 35404802 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 35405668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35407820 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35407830 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35407928 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 35408205 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 35408206 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 35408273 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 35410128 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35410878 C A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 35411217 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 35412752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35412949 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 35413412 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35413540 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35414090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35414451 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 35414488 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 35414522 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35415025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35415272 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 35416099 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35416225 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35416226 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35416449 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 35416502 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35416575 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 35416767 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 35417031 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35417430 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 35417844 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35417847 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35417884 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35417957 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35418005 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35418017 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35418121 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35418227 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35418655 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 35418828 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 35419075 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 35419200 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 35419260 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35419421 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35419477 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35419590 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 35419637 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35419638 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35419662 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35419870 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 35419964 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 35420072 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35420084 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35420168 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 35420482 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 35420537 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 35420558 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 35420583 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 35420949 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 35421063 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 35421189 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 35421229 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 35421259 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 35421271 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 35421302 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35421667 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35421674 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35421747 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35421768 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35421780 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 35421795 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 35421809 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 35421829 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 35421904 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 35421943 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35421944 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35421975 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35422103 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35422118 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 35422251 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 35422296 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 35422364 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35422506 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 35422561 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 35422627 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 35422745 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35422893 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 35422922 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35422945 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 35423003 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 35423058 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 35423268 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 35423684 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 35423713 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 35424217 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 35424535 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35424536 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35424577 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35424584 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35424912 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 35424928 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 35424993 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 35425860 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 35426203 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35426204 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35426282 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35426352 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35426386 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35426435 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 35426616 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35426632 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35426783 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35426902 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35426965 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35427015 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35427119 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 35427259 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 35427274 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 35427297 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35427317 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35427384 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35427469 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35427591 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 35427592 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 35427621 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 35427678 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35427692 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35427880 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 35428036 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 35428230 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35428334 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35429981 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 35430028 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35430078 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 35430132 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 35430141 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 35430212 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 35430231 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 35430258 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 35430322 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 35430481 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 35430506 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 35430582 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 35430630 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 35430647 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 35431019 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 35431108 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35431124 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35431238 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35431977 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35432096 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 35432126 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35432177 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35432236 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35432332 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35432348 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 35432458 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 35432663 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35432749 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 35433013 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 35433042 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 35433093 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35433137 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35433152 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35433166 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 35433201 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 35433437 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35433588 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35433620 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 35433705 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 35433937 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 35434251 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 35434272 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 35434432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35434566 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 35434599 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 35434609 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35434810 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 35434849 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 35434897 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35434939 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 35434941 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 35435022 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 35435070 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 35435131 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 35435133 G C N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 35435148 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 35435303 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35435310 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35435353 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 35435389 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 35435418 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 35435439 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35435458 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35435602 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 35435686 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35435780 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 35435783 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 35435817 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 35435840 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 35435875 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 35436035 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35436086 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35436087 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35436101 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35436167 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 35436383 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 35436404 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 35436626 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 35437121 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35437138 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35437221 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 35437263 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 35437330 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 35437346 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 35439010 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 35439486 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35439537 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 35440321 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35440474 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 35440506 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 35440550 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 35441529 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 35441641 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35441654 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35441706 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35441751 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 35442155 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 35442424 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35442467 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35442617 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 35442685 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 35442871 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35442956 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 35443101 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 35443172 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35443337 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35443376 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 35443424 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35443537 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 35443553 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35443570 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35443573 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35443687 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35443727 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35443800 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 35443808 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 35443845 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 35443953 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 35444033 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 35444067 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 35444219 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 35444240 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35444241 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35444264 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35444301 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35444361 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35444754 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 35445397 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 35445559 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 35445573 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 35445900 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 35445959 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 35445961 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 35445996 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 35446069 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35446229 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 35446252 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35446706 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 35447092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35447319 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 35447378 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35447387 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 35447607 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 35447625 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 35447689 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 35447738 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 35447876 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 35447935 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 35447936 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 35448097 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 35448207 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 35448365 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 35448425 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 35448462 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 35448698 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35448949 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 35448976 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35449050 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 35449068 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35449349 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35449378 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35450169 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35450346 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35450377 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35451461 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35451631 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 35451943 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35451965 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35452545 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 35454397 G A N Y 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 3 35454577 G A Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 35455055 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35455691 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 35455923 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 35456189 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 35456998 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35457111 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 35457298 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35457885 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35458147 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35458367 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35458398 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35458615 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35458680 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35459549 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35459886 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35459909 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35460072 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35460159 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35460181 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35460195 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35460453 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35461568 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35461730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35462288 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35465208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35467239 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 35467666 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35467801 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35467937 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 35467959 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 35468058 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35468075 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 35468129 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35468149 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35468158 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35469271 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 35469573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35469915 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35470126 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 35470294 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35470361 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35470648 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35470653 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 35471767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35471878 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35472431 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 35474086 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 35475372 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35475548 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35475617 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35475716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35476037 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 35476109 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 35476192 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 35476306 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 35476462 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 35476543 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35476602 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35476762 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35476872 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35476925 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35476991 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 35477156 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35477377 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35477383 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35477633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35477647 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35477660 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35477717 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35477932 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 35478107 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35478195 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35478241 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35478463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35478466 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35478484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35478625 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35478783 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35478789 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 35478800 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 35478811 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35479024 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35479063 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35479468 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35479651 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 3 35479756 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35479830 G T Y N 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 3 35479922 T C Y Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 3 35479936 G A Y Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 3 35480896 C T Y Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.75 0 0.25 6 2 3 0 1 3 35481084 A G Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 35482194 A G N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 35482198 C A N N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 35482217 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 35482221 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 35482299 C A Y N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.0588235294117647 17 17 1 15 1 3 35482303 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 35482330 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 35482547 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35482618 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35482723 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35482732 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35483273 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35483323 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35483437 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35483506 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35483566 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 35483620 G A N Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 3 35483822 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 35483898 C G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 35484113 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 35484540 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 35485090 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 35485167 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35485250 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 35485626 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 35485778 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35485913 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35486029 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35486164 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 35486232 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35486280 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35486340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35486379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35486633 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35486692 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35486949 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35487097 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 35487218 G C N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 35487226 A C N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 35487833 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35488076 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 35488171 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 35488322 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35488568 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 35488632 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 35488721 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35488915 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35488929 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35489039 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 35489097 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35489193 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35489539 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 35489561 A G Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 35489815 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35490027 C T Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 35490320 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35490384 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35490623 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 35490669 T G Y N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 35490691 C T Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 35490879 A C N N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 3 35490884 G A Y Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.0769230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 9 17 1 7 5 3 35491003 A T Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 35491452 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35491683 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35491849 A G Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 35491973 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35493101 T A Y N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 35493326 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35493377 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35493410 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35493555 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 35493846 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35494388 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 35494659 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35494667 C G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 35495049 C A Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 35495082 T G Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 35495132 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 35495170 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35495458 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 35495671 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 3 35495758 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 35495841 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 35495950 C T N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 3 35496145 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 35496249 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 35496608 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 35497131 A G Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 35497153 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 35497157 T A Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 35497321 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35497353 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35497702 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35497912 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 35497936 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 35497940 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35498138 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35498328 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 35498446 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 35498629 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 35498708 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35498720 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35498903 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35499002 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35499071 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 35499072 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35499114 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 35499389 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 35499718 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35499810 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35499833 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 35499862 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 35499871 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 35499909 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35500002 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35500015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35500026 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 35500042 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35500097 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35500137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35500207 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35500412 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35500472 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 35500587 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 35500635 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35500656 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 35500705 C A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 35500750 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 35500921 C T N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 3 35500940 C T N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 35500955 C T N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 35501039 T G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 35501168 C A N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 35501188 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 35501193 G C N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 35501272 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 35501290 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 35501310 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 35501341 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 35501388 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 35501390 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 35501489 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 35501612 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35501667 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 35501679 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 35501800 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 35501807 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 35501861 G C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 35501904 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 35501929 C A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 35502026 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 35502177 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 35502224 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35502516 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 35502617 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 35502697 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35502702 A T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 35502741 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 35502755 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 35502758 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 35504378 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 35504555 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 3 35504601 A G N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 3 35504651 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 35504743 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 35504760 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 35504773 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 35504777 T C Y Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 3 35504809 A G Y Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 3 35504898 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 3 35504903 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 3 35505065 T G Y N 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 8 6 3 2 2 3 35505082 C T Y Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 6 8 1 4 2 3 35505087 G T Y N 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 7 11 1 5 3 3 35505093 A G Y Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 3 35505210 A G Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 35505230 T C Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 35505270 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 35505322 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35505356 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 35505490 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 35505498 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 35505563 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 35505596 G T Y N 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 8 10 2 4 3 3 35505664 G T Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 35505789 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.5 0.416666666666667 8 16 1 6 5 3 35505798 A G Y Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 35505831 C T Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 35505881 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 35505888 G A Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 35505902 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 35505930 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 35505945 A C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 35506005 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35506022 A C Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 35506109 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35506153 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 35512535 A G Y Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 35512595 A G Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 35512617 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 35512632 C G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 35512660 A G Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 35512735 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 35512764 G T Y N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 35512833 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 35512895 G T Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 35512900 C A Y N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 3 35512991 C A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 35513023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35513058 T G Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 35513129 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 35513148 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 35513157 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35513389 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 35513411 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 35513456 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35513580 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 35513744 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35513794 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 35514070 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 35514440 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35514488 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35514638 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 35514914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35515018 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35515207 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 35515217 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 35515498 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35515520 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 35515688 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 35515701 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 35515704 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 35515746 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 35515784 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 35515908 G A Y Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 3 35516065 C A N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 35516116 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 35516127 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 35516135 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 35516192 T G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 35516378 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35516402 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35516409 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35516435 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35516470 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35516606 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 35516750 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35516800 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 35516920 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 35516981 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 35517011 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 35517022 A G N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 3 35517438 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 35517484 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35517565 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 35517577 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35517838 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 35517923 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 10 22 0 10 6 3 35517948 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0 0.642857142857143 0.357142857142857 9 19 0 9 5 3 35518343 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.25 0.6875 0.0625 19 13 4 11 1 3 35518622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35518645 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35518794 T A Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35518824 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 3 35518958 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 35519054 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35519178 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 3 35519219 T C Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 35519860 T A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 35519963 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 35520019 G A Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 35520039 T A Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 35520438 T A Y N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 3 35520442 T C Y Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 35520490 C A Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 35520526 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 35520571 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 35520654 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 3 35520795 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 35520887 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 3 35520961 T C Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 35522152 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 35522182 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35522258 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 35523973 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 35524100 A T Y N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 35524171 C A Y N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 35524185 T C Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 35524223 A C Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 35524235 T A Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 3 35524246 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 35524454 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 35524476 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 35524541 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35526433 G C Y N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 35526537 C T N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 35526548 G A Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 35526900 G T Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 35530012 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35530685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35531372 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 35532532 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 35532722 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35534162 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35534178 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35534560 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35534588 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35535259 T C N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 3 35535335 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 35535501 A G Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 35535568 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0 0.777777777777778 0.222222222222222 14 22 0 14 4 3 35536122 C A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 35536185 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35536195 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 35536294 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 35536386 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 35536439 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 35536488 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 35537139 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 35537148 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 35537150 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 35537193 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 3 35537253 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 35537264 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.0625 0.625 0.3125 12 20 1 10 5 3 35537276 T A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 3 35537287 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 3 35537580 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 35537605 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 35537689 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 35537756 C T Y Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 5 15 2 1 7 3 35537983 A G Y Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 3 35538069 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 35538588 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 35538670 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 35538760 G C Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 35538762 G T Y N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 35538971 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 35539026 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 35539114 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 35539260 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 35539291 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 35539543 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35539656 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 35540512 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 35540545 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 35541029 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35542218 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 35545715 C T Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 35545718 A T Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 35545731 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35545750 A T Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 35545838 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35545867 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35546034 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35546217 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 35546251 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 35546262 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 35546264 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 35546334 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 35546509 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 35546543 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 35546626 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35546638 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35546789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35546812 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 35546967 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 35546998 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 35547010 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 35547375 T C Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 35547446 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35547493 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 35547497 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 35547549 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 35547648 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 35547675 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35547760 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35547811 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 35547822 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 35547853 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35547933 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35548045 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 35548046 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 35548059 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 35548140 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 35548146 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 35548268 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35548343 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35548386 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 35548450 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 35548627 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 4 2 2 0 1 3 35548638 A T Y N 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 3 35548700 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35548896 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 35549319 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 35549345 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 35549378 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 35549441 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35549484 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 35549496 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 35549514 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 35549527 G T Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 35549561 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 35549812 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 35549942 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35550105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35550258 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35550453 A T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 35550703 T G Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 3 35550912 T G Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 35550916 A C Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 35551001 T C Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 35551004 C T Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 35551185 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 35551268 A G Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 3 35551276 G A Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 3 35551498 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 35551666 C T Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 35551713 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 35553339 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 35553621 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35553627 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 35553834 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 35553837 C T Y Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 3 35553886 A T Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 35553892 G A Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 35554005 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 35554097 A G N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 35554242 A G Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 35554246 T A Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 35554286 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35554296 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 35554320 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35554366 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 35554381 A G Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 35554434 T A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 35554581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35554598 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35554631 C G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 35554669 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 35554740 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35554818 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35554820 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 35555050 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 35555202 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35555233 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35555285 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 35555505 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 35555509 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 35555681 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35555697 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35555701 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 35555815 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35555849 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35555969 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35555978 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35556107 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35556177 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35556238 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35556310 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 35556322 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35556334 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35556375 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35556387 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35556392 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35556404 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35556417 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 35556428 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 35556435 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 35556520 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35556553 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 35556609 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 35556689 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 35556743 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35556768 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 35556814 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35556854 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 35556871 G T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 35556939 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 35556956 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35557006 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 35557013 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 35557035 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 35557052 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 35557402 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35557422 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 35557711 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35557995 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35557999 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35558205 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35558552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35558555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35558631 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35559003 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35559052 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35559200 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35559244 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 35559270 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35559391 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35559408 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 35559464 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35559470 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 35559482 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 35559507 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35559560 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35559633 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 35559739 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 35560054 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 35560190 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 35560577 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 35561228 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 35561278 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 35561291 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 35561529 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 35561556 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35561617 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35561716 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 35561747 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35562166 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35562224 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35562569 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35562745 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35563784 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35563926 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35563967 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35564157 A G Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 35565264 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 35565352 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 35566611 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35566756 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 35566984 C A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 35566987 G C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 35567273 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 35567464 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 35567633 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35567674 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35567905 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35567911 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 35568067 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 35568139 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35568402 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 35568426 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35568443 A G Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 35568508 A G Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 35568603 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 35568671 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 35568800 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35568976 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35569084 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35569214 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35569224 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35569504 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35569921 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35569963 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 35570182 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35570204 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35570256 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35570268 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35570274 C G Y N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.214285714285714 0.642857142857143 0.142857142857143 15 13 3 9 2 3 35570374 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 35570392 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35570476 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 35570592 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35570675 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35570772 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35571030 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35571081 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35572155 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 35572503 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35573175 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 35573333 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35573972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35574214 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35574297 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35574367 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35574406 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35574532 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35574546 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35574609 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35574942 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0 0.894736842105263 0.105263157894737 17 21 0 17 2 3 35575037 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35575163 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35575170 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35575182 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35575338 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 35575589 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 35575637 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 35575674 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 35575690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35575693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35575733 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35575782 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35575784 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 35575807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35576141 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35576244 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35576305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35576322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35576398 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35576469 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35576511 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 35576516 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 35576556 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35576653 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35576885 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35576988 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 35577028 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35577072 G C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 35577201 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35577714 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 35578113 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35578304 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35578450 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35578539 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35578657 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35578703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35578899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35578981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35579105 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 35579119 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 35579140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35579201 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35580272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35580309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35580391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35581147 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35581251 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 35581278 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35581448 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35581533 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 35581616 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 35581917 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35582271 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35582301 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35582615 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 35582684 T A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 35583144 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35583216 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35583442 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35584978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35585490 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35585840 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35585934 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35585961 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 35586077 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35586097 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 35586115 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 35586213 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35586242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35586263 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35586281 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 35586318 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35586561 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35586620 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 35586696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35586785 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 35586862 C G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 35587083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35587357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35587562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35587605 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35587659 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35587689 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35587702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35587728 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35587942 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35587966 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35588041 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35588098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35588160 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35588238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35588416 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35588452 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 35588683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35588695 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35588811 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35589117 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 35589193 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 35589335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35589347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35589374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35589385 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35589411 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35589511 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 35589544 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 35589556 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 35589559 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35589612 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35589732 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 35589819 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35589834 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 35589917 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35589950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35589983 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35589989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35590000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35590264 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35590330 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35590332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35590378 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35590522 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 35590540 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 35590556 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35590595 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 35590802 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 35590820 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 35590847 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35590864 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35590869 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35590883 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35590898 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35590986 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35591032 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 35591034 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 35591229 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 35591303 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 35591304 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 35591351 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35591688 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 35591696 C A Y N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 35591713 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 35591815 A C Y N 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 3 35591817 G T Y N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 35591946 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35591952 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35592027 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35592034 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 35592058 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 35592077 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 35592140 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35592290 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35592530 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 35592648 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35592661 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35592735 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35592767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35592780 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35592791 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35592937 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35592964 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 35593025 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 35593128 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35593152 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 35593263 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 35593420 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35593562 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 35593580 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 35593642 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 35593733 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35593884 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35593990 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 35594027 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35594127 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35594326 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 35594841 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 35595468 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35595691 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 35595713 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 35595718 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 35595792 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 35596487 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 35596704 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 35596937 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 35597286 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 35597303 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 35597561 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35597567 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35597600 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 35597605 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35597698 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 35597861 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35598453 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 35598599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35598956 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 35599191 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 35599225 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 35599962 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 35599994 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 35601347 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35601415 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 35603070 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 35603590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35604244 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35604295 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35604379 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35604407 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35604455 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35604656 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35604682 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35604757 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 35605125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35605161 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35605451 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35605847 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 35605871 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35612767 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 35612786 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35612808 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35613038 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35613385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35613818 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35613845 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35613851 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35613949 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35614042 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35614100 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35614126 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35614459 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0 0.882352941176471 0.117647058823529 15 19 0 15 2 3 35614460 G T N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 14 18 0 14 2 3 35614582 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35614600 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35614713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35614755 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35614770 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35614794 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35614798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35614887 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 35614888 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 35614968 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35615009 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35615026 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35615085 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35615196 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 35615233 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35615705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35615974 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35616114 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35616333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35616865 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35616958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35616984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35617190 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35617447 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 35617494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35617650 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35617705 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 35617869 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35617999 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 35618366 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35618384 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35618467 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35618664 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35618869 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35619139 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 35619400 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35619496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35619947 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35621884 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35622679 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35623320 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35624009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35624328 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35624423 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35624959 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 35625035 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35625069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35625076 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35625101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35625241 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35625293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35625298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35625397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35625706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35625812 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 35626477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35627014 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35627045 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35627067 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35627163 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35627933 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35628035 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35629316 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35629337 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35629363 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35629443 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 35629555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35629560 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35629705 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35630346 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35630727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35630838 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35631329 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 35631454 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 35631455 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 35631672 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 35632038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35632068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35632152 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 35632529 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35632558 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35632575 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35632673 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35632728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35632802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35632826 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35632866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35632939 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35633006 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35633053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35633080 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35633219 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35633248 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35633282 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 35633298 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35633323 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35633328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35633878 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35633897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35633902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35634088 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 35634130 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35634313 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 35634315 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 35634395 T A N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 35634735 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35634864 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35635010 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35635145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35635151 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35635390 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 35635594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35635683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35635719 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35635728 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 35635810 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35635853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35635879 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35636337 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35636441 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35636445 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35636559 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35636569 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35636621 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35636736 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35636843 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 35637080 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35637102 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35637289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35637307 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35637369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35637681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35637978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35638573 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 35638673 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35638702 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 35638869 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35639223 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35639693 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35639720 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35639759 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35639779 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 35639792 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 35639866 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35639951 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 35640298 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35641139 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35641282 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35641508 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35641834 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35642034 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35643397 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35643478 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35643573 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35643955 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35645598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35648093 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35648245 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35648515 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35648574 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35648592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35648657 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35649082 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35649197 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35649214 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35649232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35652540 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 35653770 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35654373 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35654705 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35655103 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35655655 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35657446 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 35657570 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35662036 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35667576 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35669501 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35671749 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35675416 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35678445 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35680725 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35681922 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35681983 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35685918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35688669 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 35689302 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35689939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35692451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35692959 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35693262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35693847 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35693935 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35693989 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35696064 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35696120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35697319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35702314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35703141 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35703161 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35703439 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35704409 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 35704892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35707809 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35708460 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 35709108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35709721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35709760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35712168 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35713192 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35713961 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35714615 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 35714658 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 35717922 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35720906 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35722351 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35722423 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35724901 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 35725573 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 35726176 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35727285 A T N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 35729593 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 7 5 1 5 0 3 35730040 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35731099 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35732849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35735133 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 35735644 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 35735655 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 35735662 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 35735684 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35737575 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35737625 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 35738834 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35742055 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35742059 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35742382 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35745325 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35747400 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35748726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35749045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35753046 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35753222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35753532 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35754125 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35754683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35756939 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35757719 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35757868 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35759307 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35759550 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35762174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35764625 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35768117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35768435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35768657 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35768787 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35768826 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35769021 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35769106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35769311 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35769329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35774444 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35774538 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35774750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35777022 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35778016 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35779009 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35779869 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35780043 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35780446 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35781284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35781519 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35782385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35783086 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35784507 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35787346 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35787554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35787572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35790063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35791331 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35792281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35794720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35794966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35795168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35796051 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35796146 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35797291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35797383 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35798563 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35798700 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35798820 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 35798957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35803340 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35806994 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35807321 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 35811082 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35811475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35812972 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35813411 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35817396 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35818357 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35818628 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 35818953 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35819831 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35820664 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35821133 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35821163 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 35821222 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35822011 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35822518 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35822720 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 35822799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35823828 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35825096 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35825853 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35826222 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35827337 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35830207 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35830732 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35830786 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35832549 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35832666 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35833215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35833592 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 35833617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35833999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35834367 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 35834794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35835158 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 35836078 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 35836612 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35836888 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35837086 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35837095 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35837240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35837285 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35837473 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35837476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35837591 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35837875 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35837898 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35838032 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35838151 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35838220 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35838229 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35838439 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35838478 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35838516 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35838748 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35838799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35838803 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35838821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35838920 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35838928 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35839018 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35839028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35839109 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35839157 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35839837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35839867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35843528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35845639 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 35846061 A G N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 3 35849507 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 35849548 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 35849689 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 35849701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35849848 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 35849891 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 35850256 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 35850444 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35851080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35851584 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35851629 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 35851891 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 35851914 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 35852272 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 35852351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35852429 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 35852843 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 35852844 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 35854328 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 35854369 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 35856631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35856830 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35857638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35861194 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35861226 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35864913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35865466 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35865482 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 35872790 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 35873237 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35874637 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35879105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35880916 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 35880961 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35881298 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 35881357 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 35881692 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 35881706 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 35881928 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 35881931 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 35881954 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 35882049 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 35882055 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 35882458 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 35883063 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35883065 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 35883170 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 35883212 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 35883244 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 35883308 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 35883312 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 35883338 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 35883346 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 35883379 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 35883423 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 35883481 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 35883592 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 35883635 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 35883671 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 35883761 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 35884051 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35884141 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 35884300 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 35884332 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35884384 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35884395 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 35884483 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35884644 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 35884668 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 35884720 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 35885233 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 35885311 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 35885425 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 35885478 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 35885670 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 35885757 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 35885770 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 35886099 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35886642 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 35886710 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35887927 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 35887939 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 35888033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35888125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35888629 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 35889167 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35889230 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35889241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35889349 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35889569 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 35889973 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 35890188 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35890197 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 35890207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35890208 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 35890321 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 35890445 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 35890540 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 35890588 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 35890783 G A N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.384615384615385 0.230769230769231 0.384615384615385 13 13 5 3 5 3 35890789 C A N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.384615384615385 0.230769230769231 0.384615384615385 13 13 5 3 5 3 35890801 T A N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.357142857142857 0.214285714285714 0.428571428571429 13 15 5 3 6 3 35890942 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 35891034 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 35891130 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 35891224 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 35891225 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 35891240 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 35891291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35891392 G C Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 35891422 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 35891430 G C Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 35891560 G C Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 35891561 A T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 35891576 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 35891669 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 35891759 G A Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 35891879 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 35891896 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 35891987 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 35891988 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 35892230 T A N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 35892385 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35892401 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35892438 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35892503 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 35892514 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35892525 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 35892534 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 35892725 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 35892764 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 35892922 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 35893035 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35893128 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 35893284 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 35893326 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 35893750 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 35893844 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 35893899 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35894054 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35894055 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35894082 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35894111 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 35894299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35894317 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 35894832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35894875 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 35894961 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35895447 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 35895746 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35895926 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35896177 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35896351 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35896577 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 35896658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35897483 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35897951 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 35898034 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35898201 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 35898321 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35898938 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35898996 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35899722 T A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 3 35899956 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 35900261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35902281 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35902818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35903308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35904510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35906009 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35906579 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 35907130 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 35907562 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 35907602 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35908382 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 35908419 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35909014 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 35909019 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 35909032 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 35909672 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35910222 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 35910561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35910926 A C N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 3 35911096 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 35911137 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 35911209 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35911268 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35911562 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35911609 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 35912352 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35912459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35912589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35912769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35912781 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 35913308 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 35913693 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35915079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35915119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35915135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35915479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35916868 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 35916907 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 35916993 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 35917089 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35917288 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 35917381 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 35917388 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 35917395 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 35917507 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 35917676 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 35917995 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35918061 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 35918149 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 35918436 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 35918529 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 35918700 A C N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 35918732 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 35919169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35919221 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 35919225 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 35919235 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 35919251 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 35919488 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35919508 G T N N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.461538461538462 0.153846153846154 0.384615384615385 14 12 6 2 5 3 35920207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35920264 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 35920289 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 35920479 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 35920554 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 35920713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35920965 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 35921299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35921795 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 35921799 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35922133 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 35922775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35922819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35922893 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35922958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35923005 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35923013 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35923193 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35923398 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 35923689 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35923690 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35923805 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35923870 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 35924110 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35924123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35924234 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 35924240 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 35924259 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35924261 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 35924913 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 35924963 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35925090 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 35925753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35925910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35925941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35926025 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 35926032 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35926192 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35926219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35926238 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35926269 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35926305 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35926306 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 35926334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35926352 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35926364 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35926477 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35926515 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35926559 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35926583 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35926627 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35926631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35927051 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35927077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35927082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35927106 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35927115 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35927121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35927181 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35927213 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35927236 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35927247 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35927281 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35927352 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 35927708 T G Y N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 35927720 T C Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 35927774 C T Y Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 35927842 C T Y Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 35927933 C T Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 35928001 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 35928059 A G Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 35928334 A G Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 35928502 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 35928547 T A Y N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 3 35928556 T G Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 35928584 A C Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 35928637 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35928680 A C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 35928700 A T Y N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0 0.545454545454545 0.454545454545455 6 16 0 6 5 3 35928768 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 35928844 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 35928990 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35929007 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35929059 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35929184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35929350 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35929353 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35929384 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35929451 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35929497 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35929536 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35929646 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 35929683 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35929725 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35929726 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35929783 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 35929899 C A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 35930022 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35930091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35930307 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 35930311 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 35930448 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 35930479 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35930518 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 35930522 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 35930531 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35930612 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 35930624 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 35930626 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 35930641 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35930644 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35930760 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35930783 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35931085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35931115 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35931118 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35931151 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35931166 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35931174 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35931206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35931243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35931403 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35931504 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 35931524 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 35931546 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 35931661 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 35931686 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 35931829 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35931916 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35931926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35932019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35932114 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35932216 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35932319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35932490 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 35932501 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35932528 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35932629 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35932638 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35932708 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35932903 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35932940 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35932963 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35933086 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35933206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35933265 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35933273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35933291 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35933319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35933639 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 35933657 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 35933722 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35933728 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35933785 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35933797 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 35933798 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35933882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35933892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35933919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35933950 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35933982 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35934051 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35934075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35934095 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35934108 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 35934121 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35934122 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35934141 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35934148 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35934222 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35934583 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 35934725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35934746 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 35934846 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 35934947 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35934964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35934965 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 35935028 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 35935037 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35935054 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 35935089 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 35935190 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 35935206 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35935417 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35935474 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 35935594 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 35935652 C A Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 35935669 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 35935766 T C Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 35935790 C T Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 35935797 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35935840 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 35935863 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 35935940 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 35935995 T C Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 35936030 T C Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 3 35936070 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 35936550 T G N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 35936637 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35936783 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35936849 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35936894 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 35936953 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35936956 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 35936979 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35937009 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35937074 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35937171 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 35937260 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35937287 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 35937295 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 35937430 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 35937441 G A N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 35937611 C T N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 35937759 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35937762 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 35937770 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 35937893 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 35937920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35937969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35937984 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35938006 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35938018 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 35938193 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 35938213 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35938225 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35938281 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 35938288 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 35938332 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 35938361 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35938363 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35938452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35938506 C A N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 3 35938519 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35938522 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 35938544 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 35938632 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 35938744 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35938772 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35938777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35938827 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35938900 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 35939119 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 35939176 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35939209 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35939242 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35939256 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35939322 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 35939371 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 35939375 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 35939445 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 35939492 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35939574 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 35939636 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35939700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35939720 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 35939734 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35939751 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35939771 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 35939776 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35939804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35939939 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 35939973 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 35940073 C T N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 3 35940084 T A N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 35940108 G A N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 3 35940212 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 35940280 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 35940360 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 35940535 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 35940577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35940586 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 35940757 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 35940774 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 35940789 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35940798 A G N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 35940838 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35940860 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 35940901 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35940931 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35940948 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 35940953 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 35940964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35940993 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35941148 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 35941151 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35941171 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 35941190 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 35941240 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 35941257 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 35941381 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35941402 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 35941440 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 35941459 A G Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 35941521 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35941555 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35941604 A C N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 35941628 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 35941829 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35941919 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 35942149 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 35942352 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 35942353 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 35942404 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 35942515 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 35942617 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35942765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35942912 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 35943083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35943228 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 35943270 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 35943308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35943426 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 35945235 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 35945321 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35945366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35945370 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35945399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35945412 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35945525 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35945555 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 35945601 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35945623 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35945672 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35945741 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35945896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35945908 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35946036 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35946055 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35946780 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35946794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35946948 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35947012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35947145 A T N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 35947146 G C N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 3 35947581 C T N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0 0.769230769230769 0.230769230769231 10 16 0 10 3 3 35947742 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35947746 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35947918 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35947952 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 35947992 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35948086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35948118 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35948238 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35948316 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35948412 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35948650 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35948669 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 35948794 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35948877 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35948901 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35948934 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35949022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35949055 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35949213 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35949544 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35949726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35949893 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35949915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35950034 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35950044 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35950112 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35950156 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35950157 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35950195 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35950376 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35950396 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35951181 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 35952217 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 35952438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35954122 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35954586 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 35954639 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35954850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35956051 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35958678 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35958789 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35959456 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 35961611 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35962019 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 35962045 T A N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 35963548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35963762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35963981 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35964177 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35964338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35966684 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35969074 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35969736 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 35973026 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35973652 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35974686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35977498 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35977862 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 35977871 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 35978112 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 35978229 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 35978546 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35980433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35981665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35982654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35983627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35984854 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35985079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35989217 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 35989276 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 35989293 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 35989296 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 35989392 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 35989411 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 35989459 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 35989464 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 35989551 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 35989724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35989731 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 35989911 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 35991863 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35991904 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 35991987 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35992649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35992812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35992837 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 35992997 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35993168 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 35993178 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 35993187 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 35993195 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 35993369 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35993515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35993549 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35993641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35993719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35993740 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35993751 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 35993777 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35993948 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35994060 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 35994073 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 35994219 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35994308 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35994580 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35994748 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 35995903 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35996049 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35996304 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35996386 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 35996467 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35996543 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35996596 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 35996752 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35997040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35997041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35998361 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35998469 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35998498 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 35998536 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 35998969 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 35998994 G A Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 35999002 G C Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 35999065 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 35999087 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35999092 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35999102 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 35999253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35999254 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35999283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35999349 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 35999481 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 35999779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35999990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 35999997 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 36000004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36000012 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 36000141 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 36000321 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36000478 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 36000555 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 36000603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36000666 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36000805 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36001085 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 36001180 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36001279 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 36001379 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 36001431 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 36001585 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 36002017 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 36003169 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 36003647 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 36004313 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36004319 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 36004588 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 36004600 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36004652 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 36004763 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36004972 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36005069 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36005112 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 36005127 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 36005164 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 36005245 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 36005254 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36005324 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 36005325 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 36008195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36008212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36008249 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36008253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36008276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36008353 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36008361 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36008420 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 36008504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36009183 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 36009333 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 36009337 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 36009377 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36009557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36009615 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36009853 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 36009919 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36010097 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 36010433 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 36010488 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 36010659 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 36010705 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36010870 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36010927 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 36010928 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 36011002 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36011040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36011137 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 36011172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36011224 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 36011274 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36011301 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36011459 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36011471 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36011528 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36011672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36011675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36011693 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 36011705 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 36011820 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 36011844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36012015 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 36012043 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36012051 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36012073 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36012207 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36012219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36012228 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36012492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36012537 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 36012654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36012685 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36012701 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36012707 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36012747 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 36012801 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36012872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36012971 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36012985 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36013191 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36013420 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36013535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36013540 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36013717 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 36013863 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36013984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36014239 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 36014355 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 36014360 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 36014382 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36014655 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 36014767 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 36014986 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 36015020 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 36015277 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 36015630 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 36015651 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 36015703 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 36015728 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 36015736 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36015893 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 36015948 G A N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 3 36016301 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 36016452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36017202 G C Y N 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0 1 0 7 7 0 7 0 3 36017377 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 36017801 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36018034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36018745 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36019389 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 36019559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36019602 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36020213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36020384 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 36020418 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 36020486 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36020853 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36020866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36020933 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 36020990 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36021494 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36021555 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36021744 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36022544 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 36024221 G A Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 36024806 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36025074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36025186 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36025234 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 36025576 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 36025673 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36025939 C G Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 36026140 T C Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 36026197 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36027128 T C Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 36027670 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36027681 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 36027853 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36028987 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.416666666666667 0.5 0.0833333333333333 16 8 5 6 1 3 36029080 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 36029942 T C Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.333333333333333 0.6 0.0666666666666667 19 11 5 9 1 3 36030173 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36030543 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 36030939 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36031992 C G Y N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 3 36033729 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 36034749 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 36035279 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36035393 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 36035827 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 36036082 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 36036143 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 36036251 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36037222 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 36037391 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36037423 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 36037761 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 36037827 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 36039048 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 36039092 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 36039652 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 36040350 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36041587 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 36042510 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36042644 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36042766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36042778 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 36042828 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 36043390 T A Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 36044539 T G Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 36045417 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36046377 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 36046649 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.583333333333333 0.166666666666667 0.25 16 8 7 2 3 3 36047292 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36047419 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36047574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36047716 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36049681 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36049918 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36050062 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36050207 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36050217 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36050530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36051333 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36051502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36051547 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36051607 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 36052334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36053282 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36053357 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36054446 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 36054552 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36055018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36055066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36055794 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36056687 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 36056803 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 36057374 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 36057387 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 36057607 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36058026 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 36059153 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36059275 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36059454 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36060321 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36060323 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36060343 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 36061205 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36061529 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36062689 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36062818 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 36062837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36063339 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36063678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36064674 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 36065049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36065148 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 36065177 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 36065619 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 36065697 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36065890 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 36066051 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 36066086 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 36066464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36066492 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36066493 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 36066515 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 36066672 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36066798 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 36066848 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36066879 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 36067078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36067144 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 36067192 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 36067205 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36067226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36067271 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36067279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36067425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36068044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36068259 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36068432 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36068491 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36068497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36069314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36070824 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36071190 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36071600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36073210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36075062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36075092 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36075172 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36075323 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36075513 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 36076467 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 36077100 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 36077159 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36077280 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36077470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36077943 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36078025 A T N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 36078089 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36078096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36078158 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36078250 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36078982 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36079000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36079055 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36079165 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36079313 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36079611 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 36079617 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 36079690 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36079743 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36080261 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36080383 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36080516 A G N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.461538461538462 0.153846153846154 0.384615384615385 14 12 6 2 5 3 36080744 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 36080792 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 36080861 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 36080989 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36081696 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36081798 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36082016 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 36082020 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 36082037 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 36082269 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36082392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36082409 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 36082410 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36082430 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 36082504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36082564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36082753 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36082800 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36082840 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36082899 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36083066 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36083096 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36083172 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36083192 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36083444 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 36083493 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36083518 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 36083715 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36083719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36083750 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36083779 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 36083802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36083880 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36083941 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36083979 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 36084043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36084376 G C N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 3 36084525 T G N N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 15 9 6 3 3 3 36084586 T A N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 3 36084607 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 36084833 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 36084925 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 36085030 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 36085397 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36085429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36085509 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36085613 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36085685 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36085966 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36085989 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36086075 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36086263 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36086694 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 36088016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36088643 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36088815 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36088903 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36089401 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36089585 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 36090237 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36090242 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36090402 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36090452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36090463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36090520 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36090625 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36090684 G C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 36090780 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36090782 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36091027 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36091052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36091300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36091332 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36091436 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36091479 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 36091913 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36092069 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36092075 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36092369 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36092414 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36092700 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36093136 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36093162 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36093226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36093516 C T N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.538461538461538 0.230769230769231 0.230769230769231 17 9 7 3 3 3 36094571 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36094657 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36094795 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 36094818 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36094958 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36095011 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36095021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36095103 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36095150 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36095155 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36095201 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36095486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36095490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36095594 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36095685 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 36095750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36095802 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36095836 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 36095837 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 3 36095905 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36095914 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 36096015 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36096096 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 36096116 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36096131 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36096139 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36096264 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36096266 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 36096320 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36096501 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36096503 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 36096562 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 36096759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36096967 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36096981 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36097081 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36097216 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36097410 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36097642 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 36097733 A T N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 3 36098355 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36098469 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 36098522 A G Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 36098606 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 36098619 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36098631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36098654 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36098661 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36098799 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36098815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36098914 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36099277 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36099410 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 36099429 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 36099488 A C Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 36099678 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36099711 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36099719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36099845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36099852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36099944 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36099997 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36100415 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36100424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36100686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36100763 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36100799 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 36100800 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36100913 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36101015 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36101069 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36101332 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36101352 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36101399 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36101443 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36102253 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 36102604 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36102641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36102785 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36102912 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36103542 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36103627 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36104102 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36104137 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36105215 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 36105842 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36106007 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36106042 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 36106309 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36106379 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36106630 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36106635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36106736 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36106756 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 36106916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36106976 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36107112 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 36107208 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36107359 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36107401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36107403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36107442 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36107450 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36107523 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 36107601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36107644 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36107773 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36107788 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 36107907 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36107913 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36107947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36108030 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36108137 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36108182 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36108195 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36108200 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36108236 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36108261 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36108325 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 36108326 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 36108340 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36108402 G A N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 36108407 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 36108458 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 36108477 C T N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 3 36108592 C A N N 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 7 7 2 3 2 3 36108658 G T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 36108718 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 36108791 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36108806 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36109066 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36109167 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 36109248 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36109349 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 36109363 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36109445 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 36109590 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36109607 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36109650 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36109707 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36109789 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36109817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36109840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36109880 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36109927 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36109952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36109956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36110092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36110826 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36110828 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36111088 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 36111140 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 36111143 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36111164 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36111168 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 36111212 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36111239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36111552 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36111814 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 36111893 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 36112078 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36112152 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 36112390 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36112784 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36113011 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36113032 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36113205 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36113280 T G N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 3 36113554 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 36113801 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36113833 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36113850 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36113856 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36114002 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36114034 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 36114046 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 36114055 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 36114075 A T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 36114093 T G N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 9 15 3 3 6 3 36114161 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 36114269 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 36114365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36114413 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36114507 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36114688 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36114692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36114728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36114968 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 36115120 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36115210 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36115329 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36115400 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36116503 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 36116591 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 36116805 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36116872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36116958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36117021 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 36117087 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36117177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36117264 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36117300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36117897 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0 0.75 0.25 12 20 0 12 4 3 36118927 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 36118969 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 36119046 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 36119222 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36119294 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36119433 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36119620 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36120135 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36120180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36120302 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36121567 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36122277 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 36122416 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36122721 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36122793 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 36122991 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 36123013 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36124089 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 36124274 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36124391 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36124416 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36124529 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36125006 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36125234 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 36125288 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36125302 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36127103 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36127229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36127441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36127520 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36128042 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36128047 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36128060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36128607 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36128609 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36128785 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36128881 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36128898 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36129109 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36129289 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36129332 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36129683 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36129694 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36129805 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36129863 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36130201 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36130366 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36130555 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36130597 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36130762 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36131022 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36131090 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36131165 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36131429 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36131848 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36131982 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36132098 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36132151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36132170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36132227 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36132486 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36132626 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36132656 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36132811 T A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36132933 C A Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 36134364 G C Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 36134371 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 36134758 G C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 36134913 G T Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 36134978 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 36135126 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 36135209 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36135354 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36135551 A G N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0 0.9 0.1 9 11 0 9 1 3 36136199 A G Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 36136328 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36137025 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 36138158 C T Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 36138376 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 36138699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36138812 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36138862 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36139208 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36139252 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36139303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36139500 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36139556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36139602 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36139780 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36140231 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36140311 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36140747 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36140942 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 3 36140973 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 36141011 T C N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 3 36141357 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36141369 A G Y Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.153846153846154 0.538461538461538 0.307692307692308 11 15 2 7 4 3 36141588 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 36141637 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36141773 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36141858 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36142022 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 36142276 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 36142389 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 36144828 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36145020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36145129 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 36145252 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36145351 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36145391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36146219 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36146362 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 36147245 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 36147534 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36148031 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 36148762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36149543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36150238 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36151986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36152132 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36154542 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 36158251 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36159322 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36159323 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 36162444 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36162697 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36162834 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36166327 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 36168254 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36170190 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36170463 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36173006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36175999 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36176851 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36179059 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36179722 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 36179909 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36181482 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36183045 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36183138 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36183324 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36183731 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36183991 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 36190814 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36190852 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36191040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36191704 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36192482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36193854 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36195202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36195443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36196191 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36196194 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36196288 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36196795 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36199136 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36199670 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36199691 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36201973 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 36202278 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 36207993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36208029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36208872 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36209135 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 36215542 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36216150 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36216494 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36216621 C A Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 36216628 G C Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 36216642 G C Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 36216655 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 36216687 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 3 36217143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36217450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36219637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36221784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36222312 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 36223859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36224431 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36225090 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36225100 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36225780 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 36226061 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 36226686 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 36226737 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 36228547 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36228997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36230890 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36231245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36232017 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36232852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36233833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36234225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36234236 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36234804 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36235057 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36236319 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 36239187 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36239427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36240056 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36240229 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36240329 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36240333 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36240732 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36240982 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36241226 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36241565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36241629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36241867 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 36242150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36242154 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36242164 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 36242274 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 36242293 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36242508 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 36242808 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36242817 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 36242983 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36243133 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36243270 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36243288 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36243672 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36243718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36243765 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36244201 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 36244340 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36244557 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36244601 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36244637 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36244733 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36244911 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36245043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36245084 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 36245165 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36245209 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 36245267 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36245365 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36245555 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36245721 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36246237 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36246390 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 36246628 G T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 36246829 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36246839 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36246995 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 36247149 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 36247179 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 36247209 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 36247509 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36248434 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36249169 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36249617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36249632 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36249654 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 36249766 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36249841 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36249904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36249911 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36250202 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36250628 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36250642 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 36251443 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36251700 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36251762 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36251780 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36252035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36252093 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36252188 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 16 12 6 4 4 3 36252207 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 36253343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36254092 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36256273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36256304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36256395 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36256517 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36256586 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 36256644 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36257797 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36259993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36260095 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36260181 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36260187 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36260238 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 36260268 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 36260339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36260362 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36260418 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36260546 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 36260569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36260602 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 36261304 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36261343 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36261360 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 36261509 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 36261544 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 36261913 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 36262055 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36262301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36262382 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36262855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36263383 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 36263422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36264046 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 36264161 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 36264162 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 36264180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36264331 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36264354 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 36264948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36265173 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36265202 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 36265481 C T Y Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 6 8 0 6 1 3 36266223 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36266258 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36266439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36266502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36266933 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 36267248 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36267322 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36267556 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 36267569 A C N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 36267588 A C N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 36267840 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36267917 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36267931 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36268032 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36268070 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36268144 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36268169 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 36268170 G T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 36268184 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36268227 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 36268281 C T Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 36268282 A C Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 36268523 A G N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 7 13 1 5 4 3 36268801 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36268805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36268846 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 36268861 C T N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.266666666666667 0.666666666666667 0.0666666666666667 18 12 4 10 1 3 36269210 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 36269228 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 36269243 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36269256 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36269267 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36269434 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36269490 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 36269795 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36269889 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 36269893 C G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 36269990 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 36270476 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 36272911 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36275199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36276103 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36276480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36279016 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 36279615 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36279813 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36280004 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 36280060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36280422 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36280484 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36281041 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36281381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36281691 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 36281710 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 36281981 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36282240 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 36282356 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 36282446 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36282451 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 36282459 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36282499 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36282563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36282747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36282868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36283079 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 36283372 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36283547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36284666 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36287142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36287408 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36287983 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 36288529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36289418 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36290476 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 36291114 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 36292346 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36292804 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36297579 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 36299341 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 36299464 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36299673 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 36299730 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36300100 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 36300182 G C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 36301148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36303391 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36304513 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 36307583 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 36307690 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 36307798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36307881 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36307914 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 36307932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36308179 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36308190 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36308250 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36308334 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36308362 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 36308527 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36308801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36309042 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36309346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36309369 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36309824 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36310001 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36310076 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36310387 T C Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 36310559 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36310785 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36310956 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36310975 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36311289 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36311366 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 36311438 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36311476 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36311576 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36311675 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36311832 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36311849 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36311946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36311964 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 36312116 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 36313527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36314732 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 36318798 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 36318956 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36323280 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 36323490 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36323761 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 36324163 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36324480 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36324562 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 36324797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36324815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36324824 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 36325091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36325138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36325155 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36325314 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 36325344 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 36325379 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 36325401 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 36325723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36325785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36325952 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 36326027 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36326074 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36326092 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36326470 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36326514 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36326521 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36326542 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36326752 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36326768 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36326831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36326942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36327003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36327341 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36327346 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36327438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36327493 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36327516 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36329203 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36329565 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36329625 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36329812 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36329814 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36330039 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 36330405 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36332716 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 36332743 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36333541 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 36334221 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 36334232 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 36334249 A T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 36334286 T G N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 3 36334333 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 36334695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36334765 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36334793 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36334865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36335159 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36335205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36335229 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36335269 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36335273 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36335345 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36335353 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36335406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36335422 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36335449 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36335486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36335506 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36335517 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36335529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36335578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36335808 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36335831 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36335897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36336166 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36336275 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36336663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36337011 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36337085 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36337132 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36337160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36337259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36337304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36337367 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 36339211 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 36339318 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 36339356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36339386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36340397 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36340406 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 36340536 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36340602 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 36340648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36340658 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36340764 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 36340788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36340840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36340881 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 36341016 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36341167 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 36341190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36341209 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36341312 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 36341324 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 36341334 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 36341438 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36341490 T A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 36341518 C T N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 3 36341598 A T N N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 12 12 3 6 3 3 36341713 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36341947 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 36342031 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 36342300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36342407 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36343531 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36343595 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 36343689 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36343823 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36344783 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 36345858 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36347396 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36347966 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36348414 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36348532 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36348573 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36348590 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36348672 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36348710 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36348779 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 36349032 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 36349065 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 36349079 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36349730 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 36350070 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 36350071 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 36350090 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36350184 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 36350249 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 36350340 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 36350454 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 36350459 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 36350723 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36350739 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36350835 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 36350913 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 36350923 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 36350996 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 36351124 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 36351556 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 36352501 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 36353141 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 36353501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36353652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36353833 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 36354043 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36354252 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 36354325 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 36354409 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 36354847 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36354966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36354996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36355052 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36355167 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36355188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36355623 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 36355970 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 36356041 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 36356052 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 36356292 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 36356498 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 36356901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36357016 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36357065 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 36357314 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 36357344 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 36357659 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 36357714 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 36357832 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 36357851 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 36357863 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.1 0.8 0.1 20 20 2 16 2 3 36358148 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36358182 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36358241 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36358281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36358689 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36358836 C A Y N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 36358840 C A Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 36358916 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36358941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36358943 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36358973 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36358978 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36358985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36359071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36359142 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 36359165 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 36359166 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 36359441 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 36359771 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36359846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36359941 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36360087 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36360136 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36360267 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36360327 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36360393 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36360512 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36360566 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36360580 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36360598 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36360648 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36360695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36360713 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36360721 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36360747 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36360797 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36360972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36360994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36361048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36361106 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36361107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36361354 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36361555 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36361968 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36362236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36362772 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 36363134 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 36364278 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36364491 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 36364529 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 36364593 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 36364658 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36364672 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 36364704 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36364751 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 36364769 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 36364781 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 36364867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36365108 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 36365720 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 36365792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36365811 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 36365812 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 36365902 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36365920 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36365932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36365958 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 36366106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36366131 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 36366217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36366247 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36366284 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 36366299 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 36366373 G T Y N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 36366910 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 36366941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36366970 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 36366979 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 36367023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36367149 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36367173 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 36367210 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36367271 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 36367858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36367879 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 36368175 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36368426 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 36368539 A C N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 36368545 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 36368558 G A N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 3 36368608 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 36368624 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 36368709 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36368946 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 36369257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36369499 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 36369543 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 36370570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36371331 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36371801 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36373991 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 36375572 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36375855 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 36376237 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 36376329 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 36376627 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36377632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36378023 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36378115 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36378320 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36378677 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36379331 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36379332 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36379583 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36379589 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 36379658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36379938 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 36380261 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 36380660 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 36380978 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 36381363 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36381922 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 36381945 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 36381947 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 36382109 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 36382123 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 36382131 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 36382147 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 36382420 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 36382579 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36383038 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 36383124 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 36383169 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 36383205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36383259 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 36383414 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36383827 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36383849 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36384193 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 36384207 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 36384669 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36384683 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36385071 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 36385345 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36385375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36385388 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 36385429 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 36385466 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36385515 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 36385533 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 36385558 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36385561 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 36385571 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 36385808 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 36386740 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 36386903 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36387178 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 36387189 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36387751 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 36387785 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 36387926 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 36387977 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36388154 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 36388226 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 36388350 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 36388362 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 36388625 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36388674 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36388711 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36388747 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36389079 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36389664 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 36390172 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 36390192 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 36390334 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 36390362 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36390435 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 36390466 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 36390481 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36390482 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36390503 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 36390509 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 36390522 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 36390523 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36390760 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 36390772 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36390881 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 36390961 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36390973 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36391028 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 36391128 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36391165 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36391437 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36391465 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36391533 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36391568 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36391578 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 36391613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36391620 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36391644 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 36391738 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36391770 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 36391800 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 36391886 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36392261 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36392308 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36392325 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36392331 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36392463 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36392469 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36392518 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36392543 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36392557 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36392791 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 36393528 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36393539 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 36393563 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 36393600 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 36393641 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 36393690 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 36393780 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36393863 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 36393927 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 36394052 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 36394077 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36394132 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 36394201 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 36394207 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 36394248 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 36394301 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 36394322 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 36394337 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 36394439 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 36394626 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 36394669 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 36394777 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 36394781 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 36394870 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 36394895 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 36394920 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 36395303 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 36395311 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 36395697 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 36396168 G T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 36396250 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 36396364 G C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 36396379 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 36397328 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 36397690 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 36397854 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 36397935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36397997 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36398116 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 36398228 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 36398233 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 36398320 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 36398737 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 36398743 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 36398844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36398855 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36398865 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36399329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36399335 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 36399481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36399632 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36399722 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 36399892 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 36400778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36400783 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 36401116 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 36401172 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36401272 C T N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.636363636363636 0.181818181818182 0.181818181818182 16 6 7 2 2 3 36401521 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 36401554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36401677 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 36402092 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 36402485 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 36403158 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36403292 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36403577 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 36403608 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 36403689 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 36403698 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 36403825 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 36403829 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 36406763 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36410271 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 36410425 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 36413912 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 36413913 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 36413991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36414030 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 36414253 T A N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 36414258 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 36414341 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 36414432 A G N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 36414449 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 36414680 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36414695 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 36415984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36416577 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36417018 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36417611 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36417736 G C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 36418381 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 36418692 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 36418782 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 36419452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36420551 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 36420596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36421118 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 36421226 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36421265 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36421271 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 36421283 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 36421314 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 36421394 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36421596 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36421625 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36421649 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 36421708 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36422110 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 36422512 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36422639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36422644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36422790 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 36423735 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 36423830 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 36424300 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 36424597 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36424745 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 36424799 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 36425174 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36425217 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36425245 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 36425290 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36425310 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36425396 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36425410 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 36425443 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36425453 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36425468 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 36425532 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36425541 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36425549 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 36425566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36425584 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36425599 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36425662 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 36425762 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36425859 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 36425871 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 36425872 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 36425889 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 36425914 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36425973 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36425989 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36426001 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36426175 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 36426177 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 36426356 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36426382 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 36426422 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 36426494 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 36426541 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 36426554 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 36426574 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 36426584 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 36426614 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 36426657 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 36426698 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 36426812 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36426835 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 36426846 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 36426857 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 36426904 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 36426929 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36426939 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36426956 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36427005 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 36427418 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 36427477 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 36427489 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 36427664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36427668 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 36427904 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36427996 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 36428026 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36428038 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36428184 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 36428189 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 36428234 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 36428333 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 36428359 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 36428445 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 36428536 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36428705 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 36428731 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 36428750 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 36429008 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 36429019 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 36429036 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 36429050 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 36429068 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 36429074 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 36429114 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 36429184 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 36429246 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 36429618 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36429834 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36430228 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 36430588 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 36430999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36431188 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36431394 A G N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.153846153846154 21 5 10 1 2 3 36431947 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36432134 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 36432192 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 36432255 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 36432340 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 36432420 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 36432465 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 36432481 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 36432497 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 36432498 C A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 36433220 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 36433562 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 36433587 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36433704 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 36433811 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 36434247 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 36434568 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 36435196 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 36435437 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36435447 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36435582 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 36436003 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 36436046 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 36436136 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 36436299 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 36436323 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 36436436 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 36436627 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 36436778 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 36436786 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 36436900 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 36437654 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 36437766 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 36437834 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 36437841 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 36438081 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 36438191 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 36438199 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 36438427 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 36439295 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 36439340 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 36439391 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 36439419 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 36439438 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 36439710 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 36439941 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 36440072 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 36440449 A G N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.461538461538462 0.230769230769231 0.307692307692308 15 11 6 3 4 3 36440614 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 3 36441471 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 36442251 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 36442264 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 36442284 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 3 36443098 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 36444934 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 36445015 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 36445450 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 36445669 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 36445892 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 36445935 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 36446006 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 36446394 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 36446509 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36447345 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36447516 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 36447578 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 36447815 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36448074 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 36448104 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 36448331 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36448579 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 36448644 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36448985 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 36449184 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 36449307 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 36449333 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 36449449 A G N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 3 36449817 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 36449891 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 36449903 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 36449926 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 36450141 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 36450216 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 36450883 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 36452034 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36452531 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 36452571 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 36452839 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 36452930 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36453136 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 36453424 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36454665 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36455058 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36455091 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36455154 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36455695 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36455993 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 36457976 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36458027 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 36458066 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36458163 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 36458223 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 36458275 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 36458345 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 36458391 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 36458457 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 36458568 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36458591 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36458634 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36458768 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36458927 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36459039 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36459210 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 36459453 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 36459566 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 36459644 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 36459668 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 36459988 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 36460211 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 36460291 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 36460328 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 36460658 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36460715 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36460866 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36461439 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 36461585 A C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 36461728 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 36461918 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 36462313 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 36462371 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 36462570 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 36462577 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 36462657 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36462776 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 36462949 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36462993 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36463113 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 36463253 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36463303 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36463509 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 36463510 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 36463561 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 36463757 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 36463910 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 36463947 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 36464492 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 36464511 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 36464611 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36464653 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 36464725 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 36464857 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 3 36464877 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 3 36465366 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36465414 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36465774 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 36466043 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36466161 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 36466191 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 36466235 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 36466401 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36466487 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36466609 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36467019 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36467051 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36467439 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 36467468 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36467668 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 36467695 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 36467797 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36468266 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 36468401 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 36468506 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 36468563 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 36468678 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36468815 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 36468829 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 36469030 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 36469051 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36469087 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 36469104 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36469122 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36469153 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 36470459 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 36471206 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36471316 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36471338 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 36471433 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36471820 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36472232 A T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 3 36472264 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 36472280 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 36472351 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 36472367 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36472368 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36472378 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36472498 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36472525 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 36472662 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36472667 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36472773 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 36472789 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 36472859 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 36472864 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 36472933 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 36473035 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 36473070 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 36473224 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 36473362 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 36473497 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 36473721 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36473732 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 36473762 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36473788 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 36473889 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 36473951 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 36474459 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 3 36474639 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 36474832 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 36474966 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 36475005 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 3 36475078 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 36475283 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 36475328 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36475490 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 36475510 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 3 36475741 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 36475975 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36476033 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 36476248 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 36476284 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 36476310 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 36476387 A T N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.133333333333333 0.733333333333333 0.133333333333333 15 15 2 11 2 3 36476785 T A N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 3 36477038 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 3 36477137 G C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 3 36477215 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 36477252 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 36477676 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 36478309 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36478335 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 36478407 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 36478419 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 3 36478443 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 36478473 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 3 36478502 C A N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 36478520 C T N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 36479780 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 36479941 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36480108 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 36480229 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 3 36480413 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 36480652 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 3 36480710 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 36480836 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36480917 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36481325 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 36481454 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36481646 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 36481844 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 36481914 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 36482317 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 36482337 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 36482353 G T N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.181818181818182 0.0909090909090909 0.727272727272727 5 17 2 1 8 3 36482628 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 36482680 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36482720 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36482998 G A N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 36483105 C T N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 36483139 G A N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 3 36483157 C T N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 36483249 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 36483257 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 36483275 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 36483276 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 36483327 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 36483331 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 36483433 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36483481 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36483494 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36483753 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36483777 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 36483914 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36484009 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36484019 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36484082 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36484083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36484186 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 36484240 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36484275 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 36484279 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 36484302 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 36484327 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36484420 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36484426 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 36484481 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36484508 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 36484883 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 36484893 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 36484896 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 36485124 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 36485512 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 36485557 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 36485606 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 36485699 C A N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 36486323 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 36486399 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36486422 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36486834 G T Y N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 36488234 G A Y Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 36488284 C G Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 36488464 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 36488473 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36488648 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 36489122 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 36489131 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36489216 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.444444444444444 0.111111111111111 0.444444444444444 18 18 8 2 8 3 36489225 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 36489250 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36489527 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 36489759 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 36489803 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 36489837 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 36489838 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 36489871 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36489892 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36489906 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36489979 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36490014 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36490156 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36490203 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36490234 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 36490238 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36490248 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 36490264 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 36490271 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 36490294 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 36490342 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 36490553 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 36490584 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.421052631578947 0.105263157894737 0.473684210526316 18 20 8 2 9 3 36490629 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36490640 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36490666 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 36490669 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 36490689 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 36490698 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 36490961 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 36491053 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 36491195 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36491226 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36491234 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.4 0.1 0.5 18 22 8 2 10 3 36491388 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36491419 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 36491426 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36491450 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 36491522 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36491533 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36491601 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36491646 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 3 36491659 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36491696 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 36491699 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 36491850 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36491948 G C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 3 36492063 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 3 36492210 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 36492228 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 36492269 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 36492481 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 36492617 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 36492636 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36492641 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36492703 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36492797 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36493214 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 36493571 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 36493611 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 36493719 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 36493742 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 36493821 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 36493884 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36493955 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 36494005 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36494106 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 36494174 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36494239 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 36494256 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 36494287 G T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 36494745 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 36494968 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 36495097 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36495164 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.555555555555556 0.111111111111111 0.333333333333333 22 14 10 2 6 3 36495367 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 36495421 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 36495424 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36495470 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36495475 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 36495546 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 36495558 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 36495593 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.375 0.125 0.5 14 18 6 2 8 3 36495598 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 36495663 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 0.117647058823529 0.352941176470588 20 14 9 2 6 3 36495711 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 36495727 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 36495760 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 36495847 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 36495848 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 36495862 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36496055 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 36496293 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.388888888888889 0.111111111111111 0.5 16 20 7 2 9 3 36496368 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 36496510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36496562 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36496600 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 36496922 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 36497064 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 3 36497089 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 36497253 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 36497375 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 36497626 A T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.470588235294118 0.117647058823529 0.411764705882353 18 16 8 2 7 3 36497924 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 36498212 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 36498280 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 36498525 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.266666666666667 0.133333333333333 0.6 10 20 4 2 9 3 36498812 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 36498972 T C N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.571428571428571 0.214285714285714 0.214285714285714 19 9 8 3 3 3 36498991 C T N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 3 36499009 A G Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 3 36499060 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.5 0.1875 0.3125 19 13 8 3 5 3 36499069 C T Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 3 36499190 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 36499275 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.4 0.1 0.5 18 22 8 2 10 3 36499654 A G N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.181818181818182 0.0909090909090909 0.727272727272727 5 17 2 1 8 3 36500192 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 36500335 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 36500457 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.555555555555556 0.111111111111111 0.333333333333333 22 14 10 2 6 3 36500568 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.375 0.1875 0.4375 15 17 6 3 7 3 36500596 T G N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.466666666666667 0.133333333333333 0.4 16 14 7 2 6 3 36500696 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.466666666666667 0.133333333333333 0.4 16 14 7 2 6 3 36500771 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.6 0.133333333333333 0.266666666666667 20 10 9 2 4 3 36500790 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 3 36500859 C A N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 36501388 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 36501501 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 36501546 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36501930 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 36502566 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 36502823 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36502924 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36503121 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.421052631578947 0.105263157894737 0.473684210526316 18 20 8 2 9 3 36503299 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 36503321 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 36503386 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36503395 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36503428 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 36503492 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 36503503 G C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 36503507 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 36503533 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 36503552 T A N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 36503580 G A N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 36503694 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 3 36503829 C T Y Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 3 36503835 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 3 36503869 A G N Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 9 5 3 3 1 3 36503878 G A Y Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 9 5 4 1 2 3 36503882 C T Y Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 9 5 4 1 2 3 36503889 A C N N 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 3 36504057 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 36504098 A T N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 36504110 T A N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 36504255 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36504306 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.368421052631579 0.105263157894737 0.526315789473684 16 22 7 2 10 3 36504710 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.368421052631579 0.105263157894737 0.526315789473684 16 22 7 2 10 3 36504721 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.368421052631579 0.105263157894737 0.526315789473684 16 22 7 2 10 3 36504857 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.411764705882353 0.117647058823529 0.470588235294118 16 18 7 2 8 3 36504980 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.375 0.125 0.5 14 18 6 2 8 3 36505038 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 3 36505199 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.368421052631579 0.105263157894737 0.526315789473684 16 22 7 2 10 3 36505201 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 36505457 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.368421052631579 0.105263157894737 0.526315789473684 16 22 7 2 10 3 36505513 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 36505562 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 36505869 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 36505917 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 36505967 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 36505972 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 36506007 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 36506008 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 36506019 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 36506134 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 36506136 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 36506180 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 36506209 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 36506226 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 36506250 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 36506259 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 36506321 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 36506436 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36506490 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36506695 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 36506795 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.4 0.1 0.5 18 22 8 2 10 3 36506910 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.388888888888889 0.111111111111111 0.5 16 20 7 2 9 3 36506911 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36506940 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 36506996 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.4 0.1 0.5 18 22 8 2 10 3 36507000 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.4 0.1 0.5 18 22 8 2 10 3 36507118 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 36507143 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 36507170 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.421052631578947 0.105263157894737 0.473684210526316 18 20 8 2 9 3 36507172 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.421052631578947 0.105263157894737 0.473684210526316 18 20 8 2 9 3 36507237 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.421052631578947 0.105263157894737 0.473684210526316 18 20 8 2 9 3 36507269 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.4 0.1 0.5 18 22 8 2 10 3 36507380 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.4 0.1 0.5 18 22 8 2 10 3 36507397 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.421052631578947 0.105263157894737 0.473684210526316 18 20 8 2 9 3 36507437 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.411764705882353 0.117647058823529 0.470588235294118 16 18 7 2 8 3 36507563 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.4 0.1 0.5 18 22 8 2 10 3 36507578 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.421052631578947 0.105263157894737 0.473684210526316 18 20 8 2 9 3 36507589 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.4 0.1 0.5 18 22 8 2 10 3 36507735 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 36507812 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.444444444444444 0.111111111111111 0.444444444444444 18 18 8 2 8 3 36507822 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.421052631578947 0.105263157894737 0.473684210526316 18 20 8 2 9 3 36507993 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.421052631578947 0.105263157894737 0.473684210526316 18 20 8 2 9 3 36508016 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 3 36508099 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.421052631578947 0.105263157894737 0.473684210526316 18 20 8 2 9 3 36508115 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 36508212 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.4 0.1 0.5 18 22 8 2 10 3 36508223 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.4 0.1 0.5 18 22 8 2 10 3 36508335 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 36508495 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 3 36508577 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 36508603 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.4 0.1 0.5 18 22 8 2 10 3 36508749 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.4 0.133333333333333 0.466666666666667 14 16 6 2 7 3 36508769 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.388888888888889 0.111111111111111 0.5 16 20 7 2 9 3 36508827 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 36508924 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 36508966 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36508989 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.4 0.1 0.5 18 22 8 2 10 3 36509014 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.4 0.1 0.5 18 22 8 2 10 3 36509036 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.4 0.1 0.5 18 22 8 2 10 3 36509064 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36509095 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36509221 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 36509440 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36509475 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36509494 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 36509508 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 36509628 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36509651 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 36509666 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 36509789 A G N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.384615384615385 0.153846153846154 0.461538461538462 12 14 5 2 6 3 36509897 C T N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 3 36509926 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 3 36509990 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 36510240 T A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 36510251 A T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 36510403 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 36510610 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.388888888888889 0.111111111111111 0.5 16 20 7 2 9 3 36510635 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36510712 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36510723 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 36510736 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36510778 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 36510979 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36511071 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 36511265 T A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 3 36511383 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 36511484 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 36511516 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36511521 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 36511561 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 36511576 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36511736 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 36511775 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36511999 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.368421052631579 0.105263157894737 0.526315789473684 16 22 7 2 10 3 36512113 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 36512127 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 36512129 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 36512190 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 36512272 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 36512314 G C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 3 36512379 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 3 36512441 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36512447 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 36512474 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.368421052631579 0.105263157894737 0.526315789473684 16 22 7 2 10 3 36512524 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36512680 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 36512729 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 36512765 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 36512929 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 3 36513063 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 36513218 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 36513256 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 36513374 A G N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.333333333333333 0.2 0.466666666666667 13 17 5 3 7 3 36513612 C T N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 3 36513657 G T N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 3 36513818 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 36513880 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 36513913 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 36514068 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36514219 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36514246 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 3 36514257 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 36514541 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 36514705 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 36514759 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 36514782 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36514795 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 36514874 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 36514927 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 36515055 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 36515195 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 36515196 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 36515243 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 36515246 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36515287 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 36515308 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 36515401 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 36515434 C T N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 3 36515441 G A N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 13 7 4 5 1 3 36515447 T A N N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 3 36515531 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 3 36515726 A G N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 36515817 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36515865 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36516044 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 36516128 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 36516262 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36516277 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 36516338 G C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 3 36516376 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 36516408 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 36516421 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 36516427 A T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 36516458 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 36516564 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 36516634 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 36516759 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 36517143 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 36517311 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 36517330 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 36517332 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 36517372 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 36517517 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36517564 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36517595 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36517600 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36517708 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36517794 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36517816 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36517929 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 36517952 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 36518300 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 36518353 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 36518420 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 36518438 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 36518539 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36518695 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36518832 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36518852 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36518935 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36518980 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36518996 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36519266 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36519761 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 36519871 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36520518 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36520520 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36520535 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 36520536 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36520560 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36520671 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.421052631578947 0.105263157894737 0.473684210526316 18 20 8 2 9 3 36520679 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.4 0.1 0.5 18 22 8 2 10 3 36520684 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.421052631578947 0.105263157894737 0.473684210526316 18 20 8 2 9 3 36520697 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36520729 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 36520741 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36520987 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36521185 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 36521222 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 36521525 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 36521597 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.333333333333333 0.111111111111111 0.555555555555556 14 22 6 2 10 3 36522272 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 36522703 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 36522736 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 36523226 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36523358 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 36523769 T C N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 36524066 C T N Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 9 5 4 1 2 3 36524081 A T N N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.25 0 0.75 4 12 2 0 6 3 36524345 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 36524469 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 36524526 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 36524758 A T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 36524836 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 36524841 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 36524907 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 36525129 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 36525292 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36525386 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36525426 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36525438 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 36525469 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36525713 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36525737 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 36525749 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36525911 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 36525940 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 36526937 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36526953 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36526981 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 36526982 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36527027 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36527059 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 36527133 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36527141 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 36527147 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 36527211 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 36527302 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 36527399 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36527409 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36527456 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 36527493 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 36527521 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 36527614 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36527654 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 36527677 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 36527704 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 36527741 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 36527955 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 36527966 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 36528085 T G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 3 36528086 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 3 36528129 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 36528233 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 36528236 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 36528251 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 36528252 T A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 36528402 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36528769 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36529276 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 36530468 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36530664 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 3 36530868 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 36530889 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36531044 T C N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.333333333333333 0.25 0.416666666666667 11 13 4 3 5 3 36531183 T C N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 3 36531191 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 36531204 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 36531416 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 36531725 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 36531823 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 36531972 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 36532064 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36532099 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36532106 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 36532134 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 36532137 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 36532293 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36532310 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 36532359 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 36532388 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36532416 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 36532424 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 36532448 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 36532509 G A N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 3 36532526 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 36532869 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 36533132 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 36533225 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 36533447 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 36533464 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 36533475 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 36533494 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36533587 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 36533639 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36533667 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 36533695 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 36533702 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 36533831 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 36533887 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 36533890 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 36533920 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 36533987 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 36534016 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 36534233 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 36534240 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 36534245 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 36534271 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 36534297 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 36534304 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 36534318 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 36534644 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 36534662 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 36534748 C A Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 36534780 A C Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 36534970 C A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 36535017 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 36535041 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 36535160 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 36535183 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 36535449 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 36535531 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 36535608 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 36535670 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 36535699 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36535764 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 36535817 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36535822 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36535994 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36536188 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 36536473 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 36536635 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 36536636 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 36536657 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 36536715 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 36536755 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 36536768 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 36536849 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 36536923 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 36537113 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 36537121 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 36537162 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 36537436 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 36537929 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 36537989 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 36538022 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 36538233 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 36538439 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.388888888888889 0.111111111111111 0.5 16 20 7 2 9 3 36538877 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36539043 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 36539046 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 36539122 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 36539453 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 36539717 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36539873 C G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 3 36539941 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 36540099 A T N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 3 36540147 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 36540286 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36540313 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 3 36540399 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 36540472 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 36540571 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 36540676 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.368421052631579 0.105263157894737 0.526315789473684 16 22 7 2 10 3 36540805 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 36541079 A C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 36541088 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 36541169 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 36541233 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 36541245 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 36541291 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 36541298 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 36541321 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 36541356 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 36541622 G T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.470588235294118 0.117647058823529 0.411764705882353 18 16 8 2 7 3 36541736 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 36541740 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 36541762 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 36541771 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 36541781 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 0.105263157894737 0.421052631578947 20 18 9 2 8 3 36541812 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 36541821 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 36541955 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 3 36541983 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 36541999 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 36542436 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 36542496 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 36542514 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 36542552 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 36542580 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 36542612 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 36542770 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 36542777 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 36542809 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 36542920 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 36543295 G A N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 3 36543487 C G N N 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.4 0.1 0.5 9 11 4 1 5 3 36543872 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 36543898 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 36543945 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 0.105263157894737 0.421052631578947 20 18 9 2 8 3 36544059 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 36544071 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 36544126 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 36544214 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 0.105263157894737 0.421052631578947 20 18 9 2 8 3 36544442 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 36544820 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 36545605 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 3 36545815 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 36546067 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36547202 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 36547494 A T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 36547729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36547782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36548360 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 36548362 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 36548470 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 36548586 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 36548639 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 36549353 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 36549392 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 36549651 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 36549687 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36549764 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36549826 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36549859 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 36549894 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 36550035 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36550127 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 36550167 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 36550187 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 36550269 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 36550293 A T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 36550329 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 36550353 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 36550430 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 36550476 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36550560 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 36550581 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36550623 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 36550735 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 36550741 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 36550777 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 36550793 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 36550805 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 36550822 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 36550832 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 36550932 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 36550939 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 36550951 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 36551037 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 36551063 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 36551078 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 36551092 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 36551315 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36551424 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 36551549 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36551565 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36551835 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36551863 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36551882 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36552060 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36552130 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 36552154 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36552157 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36552199 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36552278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36552319 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36552320 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36552399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36552537 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36552635 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 36552651 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36552714 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36552729 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 36552802 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36552814 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36552877 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 36552998 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 36553077 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 36553095 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 36553225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36553283 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36553481 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36553549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36553569 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36554372 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36554386 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36554427 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36554440 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36554465 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 36554536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36554582 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36554644 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36554645 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36554723 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 36554751 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36554777 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 36554791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36554833 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 36554854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36554896 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36554915 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36554922 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36554963 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36555010 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 36555195 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36555325 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36555350 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36555447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36555505 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36555523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36555678 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36555744 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36555791 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36556034 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36556035 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36556119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36556208 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36556294 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36556379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36556468 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36556516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36556594 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36556834 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36556840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36556935 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36557144 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36557365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36557861 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36558005 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36558083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36558135 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36558155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36558156 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36558236 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36558249 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36558405 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 36558444 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36558491 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36558872 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 36558911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36558920 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 36559124 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 36559906 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 36560209 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36560316 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36560790 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 36560816 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36560821 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36560866 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 36560919 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 36560975 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 36561022 T G Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 36561130 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 36561144 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36561196 G T N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 36561208 A G N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 12 4 5 2 1 3 36561275 G A N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 3 36561313 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36561395 G C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 36561485 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 36561498 A C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 36561613 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 36561682 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 36562036 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 36562091 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 36562188 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 36562286 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36562438 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36562461 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36562464 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36562640 G T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 36562679 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36562840 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 36562859 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36562914 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36562930 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36562969 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 36563267 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36563300 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36563387 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36563570 C T Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 3 36563857 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36564089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36564131 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 36564815 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36564895 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36564931 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 36565066 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36565261 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 36565576 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 36565631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36565759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36565816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36566028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36566194 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36566315 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36566345 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36566406 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36566521 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 36566553 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 36566727 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36566822 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36566896 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36566904 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36567009 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36567010 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36567035 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 36567154 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36567310 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36567314 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36567785 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36567795 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36567974 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 36567980 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36567995 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 36568070 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 36568260 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 36568275 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36568323 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 36568376 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36568381 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 36568394 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 36568455 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 36568643 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36568648 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36568745 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36568777 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36568918 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36569007 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36569160 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36569222 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36569237 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36569285 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36569726 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36570608 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36570681 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36570692 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36570694 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36570711 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36571052 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36571074 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 36571077 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36571143 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36571199 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36571293 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 36571320 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36571385 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 36571422 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36571569 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 36571680 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 36571694 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 36571703 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 36571812 T C N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 3 36571953 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 36571964 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 36572063 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36572136 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 36572464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36572523 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36572609 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36572789 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36572846 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36572853 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36572897 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36573045 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36573110 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36573125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36573153 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36573241 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36573245 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36573366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36573396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36573454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36573688 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 36573813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36574008 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36574032 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 36574183 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36574302 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 36574477 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36574548 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36574611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36574745 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 36574746 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 36574780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36574826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36574846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36574967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36575137 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 36575249 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36575250 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 36575322 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36575353 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 36575457 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36575519 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36575594 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36575623 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 36575685 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36575691 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36575718 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36575780 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36575821 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36575859 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36575870 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36575879 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 36575892 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 36575906 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36576044 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 36576212 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36576297 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 36576555 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 36576601 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36576714 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 36576776 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36576797 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 36576798 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36576828 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36576886 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 36576903 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 36576913 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 36576926 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 36577382 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36577644 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 36578438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36578557 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 36578829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36578875 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 36578944 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36579696 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36579723 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36579870 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36580163 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36580246 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 36580303 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 36580757 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 36580847 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36580950 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36581496 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36581580 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36582006 G T Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 36582007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36582377 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 36582442 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 36582475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36582608 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 36582757 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 36582776 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36582842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36582879 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36582969 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36583244 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36583289 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36583292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36583466 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 36583994 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36584064 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36584079 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36584273 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36584844 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36584868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36584968 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 36585056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36585086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36585229 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 36585487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36585561 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36585870 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 36585923 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36585927 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36585985 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 36586167 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36586173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36586193 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36586224 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 36586241 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 36586258 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 36586308 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 36586435 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 36586715 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 36587432 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36587717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36587732 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36587761 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36588012 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36589369 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 36589621 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36589787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36591170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36591507 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 36591569 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 36591587 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 36591588 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 36591687 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 36591714 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 36591747 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 36591801 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 36592022 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 36592398 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 36592999 G C N N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 5 15 2 1 7 3 36593093 G C N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 36593117 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 36593158 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 36593216 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 36593481 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 36593612 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 36593636 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 36593666 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 36593704 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 36593721 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 36593744 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 36593745 C G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 36593763 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 36594077 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 36594206 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 36594210 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 36595481 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 36596783 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 36597159 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36597621 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 36597754 T C N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 3 36597859 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 36598223 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36598522 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 36598882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36602711 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 36605501 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 36605750 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36606204 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36606821 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36606998 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36607542 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 36608369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36608508 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36608509 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36608565 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 36608642 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36608645 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 36608679 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 36608772 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 36609399 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 36609518 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 36609791 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 36610086 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 36610696 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36611287 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 36611426 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 36611439 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36611601 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 36611887 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 36612040 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 36612398 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36612834 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 36612917 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 36613041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36613043 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 36613055 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 36613065 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36613487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36613541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36613689 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36613704 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36613722 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36613751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36613824 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36613849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36613870 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36613915 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36613937 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36613938 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36614019 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 36614070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36614094 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 36614182 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 36614201 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 36614396 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 36614453 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 36614497 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 36614622 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36614644 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36614680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36614754 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 36614949 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 36615040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36615054 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36615088 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36615514 C T N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.181818181818182 0.0909090909090909 0.727272727272727 5 17 2 1 8 3 36615519 G A N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.153846153846154 0.0769230769230769 0.769230769230769 5 21 2 1 10 3 36615546 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 36615552 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 36615573 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 36615590 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 36615679 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 36615683 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 36615749 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36615805 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 36615817 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 36615904 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 36616149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36616177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36616483 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36616836 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36617059 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36617286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36617305 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36617522 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36617744 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36618090 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 36618377 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 36618859 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36618966 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 36618977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36619096 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 36620396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36620498 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36620574 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 36620629 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36620883 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 36621013 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 36621220 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 36621404 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 36621552 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 36621839 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 36622919 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 36623044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36623548 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36623773 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36623812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36624289 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 36624383 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 36624540 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 36624592 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 36624757 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36624771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36625718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36626221 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36626324 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36626331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36626344 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36626478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36626483 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36626707 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36626722 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36626859 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 36626865 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36626997 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36627010 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 36627063 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36627104 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 36627156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36627221 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 36627434 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36627682 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 36627866 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 36627876 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 36628102 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 36628227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36628245 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 36628251 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 36628423 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 36628443 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 36628452 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 36628786 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 36628798 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 36628862 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 36629114 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36629141 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36629153 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 36629233 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 36629441 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 36629532 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36630108 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36630606 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 36630993 T A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 36631044 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36631580 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 36631583 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 36631642 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 36631752 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 36631764 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 36631792 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 36631825 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 36631845 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 36631878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36632015 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 36632320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36632816 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 36632933 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 36633449 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 36634037 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 36634245 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36634289 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 36634348 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 36635211 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 36635399 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 36635530 T C N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 3 36635547 T G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 36636114 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36636256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36636550 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36636582 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36640233 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36640379 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36640467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36640746 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36642033 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36642050 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36642173 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36642229 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36642403 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36642499 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36642511 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36642558 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36642560 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36642672 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36642699 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36642737 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36642953 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36643035 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 36643880 G A Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 36644165 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36644172 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 36644212 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36644238 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36644249 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 36644251 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 36644411 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36644839 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36645416 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36645476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36645486 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36645640 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36645678 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36645695 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36645734 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36645889 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36645980 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36646164 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36646200 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36646370 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36646517 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36646710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36646771 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36646900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36646906 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36646911 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36646919 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36646933 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36646958 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36646965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36647016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36648459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36649196 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36650530 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36650811 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36651166 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36651938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36651970 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36653738 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36653938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36654319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36654327 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36654433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36654441 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 36654464 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36654833 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36654877 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36655085 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36655108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36655163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36655764 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36655936 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36656027 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36656254 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36656735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36658749 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36658947 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36659130 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36659140 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36659411 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36659428 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36659532 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36659651 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36660273 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 36661880 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36662086 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36662458 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36663460 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36663697 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36664617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36664830 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36664850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36664864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36664865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36665119 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36665498 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36665844 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36666243 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36666600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36666612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36666746 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36666747 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 36666818 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36667050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36667076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36667392 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36667393 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36667596 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36667646 A T N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 36667723 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36667776 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36667819 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36667891 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36668038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36668523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36668530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36668710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36668755 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36668888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36668895 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36669074 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36669859 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36670027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36670032 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36670149 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36670170 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36670279 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36670490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36670608 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36670843 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36671702 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36671756 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36671867 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36671980 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36672007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36672433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36672526 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36672671 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36672692 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36672696 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36672736 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36672872 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36672940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36673356 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36673399 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 36673789 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36673791 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36673909 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36673925 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36673974 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36674009 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36674190 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36674282 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36674307 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36674345 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36674490 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36674611 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36674651 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36674717 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36674805 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36675450 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36675686 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36676371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36676457 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36676532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36676581 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36676653 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36676665 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36677040 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36677317 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36677968 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36677971 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36678185 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36678599 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36678731 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36678747 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36678980 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36679101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36679611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36679673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36680160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36680373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36680415 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36680447 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36680592 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36680596 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36680704 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36680743 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36680862 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36680900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36680970 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36681101 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36681209 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36681232 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36681376 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36681387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36681411 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36681420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36681427 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36681457 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36682181 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36682258 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36682276 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36682281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36682351 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36682470 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36682862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36682877 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36682954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36683188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36683222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36683230 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36683247 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36683258 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36683751 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 36684560 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36684998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36685745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36685923 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36686356 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36687232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36687824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36687964 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36688066 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36689128 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36689931 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36690226 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36690977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36691899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36692458 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36692642 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 36692644 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 36692766 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36692829 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36693591 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36693784 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36694105 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36694683 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36695859 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 36696231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36696377 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36696644 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36696769 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 36696791 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 36696829 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36699643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36701062 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36701220 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36701269 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36701340 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36701455 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36701464 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36701510 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36701523 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36701572 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36701649 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36701732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36705710 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 36705768 A T Y N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 36705831 T C Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 36705840 T C Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 36705963 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36706071 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36706425 C T Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 36706666 T C Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 36706771 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36706821 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36707161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36707186 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36707318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36707630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36708851 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36709410 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36709688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36709852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36709992 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36710203 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36710338 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36710621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36711335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36711714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36712051 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36713408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36713611 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36713697 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36713722 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36713798 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36713910 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36713979 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36714038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36714524 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36714540 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36714627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36714635 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36714833 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36715037 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36715051 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36715079 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36715199 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36715207 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36715263 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36715523 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36715572 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36715618 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36715675 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36715848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36715992 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36716031 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36716146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36716208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36716383 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36717043 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36717058 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36717265 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36717477 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36717723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36718236 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36718437 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36718562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36718614 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36718671 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36718677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36718744 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36718849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36719124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36719204 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36719251 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36719258 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36719808 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36720341 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36720399 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36720406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36720557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36720650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36721054 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36721079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36721211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36721405 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36721541 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36721548 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36721781 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36721882 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36722212 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36722435 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36722617 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36722874 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36723087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36723111 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36723211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36723239 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36723328 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36723377 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36723424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36724009 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36724699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36725211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36725274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36725935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36726706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36727160 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36727437 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36727658 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36727750 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36728187 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36728266 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36728308 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36728372 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36728718 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36728924 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36729127 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36729408 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36729963 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36730444 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36730559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36730597 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36730598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36730686 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36733723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36733792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36733828 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36733876 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 36734045 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36734506 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36736288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36736894 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36736972 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36737508 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36737650 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36738693 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36739264 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36739612 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36739851 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 36740337 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36740704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36740742 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36740767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36740998 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36741042 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36741052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36741088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36741413 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36741486 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 36741502 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36741798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36741802 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36741897 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36742558 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 36742591 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36742608 C T N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 36742778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36742792 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36743033 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36743057 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36743093 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36743114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36743372 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36743817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36744234 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36745104 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36745158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36745239 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36745349 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36745376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36745432 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36745461 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36745640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36745718 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36745722 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36745729 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36745758 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36745786 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 36745787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36745815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36745847 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36745851 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36746029 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36746074 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36752727 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36752765 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36753090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36753097 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 36753118 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36753266 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36753423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36753483 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36753641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36753665 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36753709 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36753832 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36753851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36753987 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36754180 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36754340 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36754375 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36754631 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36754646 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36754787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36754831 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36754838 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36754900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36754952 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36755050 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 36755066 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 36755195 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 36755268 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 36755272 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36755401 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36755420 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36755473 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36755550 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 36755588 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36755612 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 36755782 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36756177 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36756242 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36756251 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36756274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36756317 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36756497 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36756561 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36756576 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36756801 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36757022 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36757183 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36757372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36757391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36757402 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36757438 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36757468 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36757472 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36757506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36757554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36757703 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36757746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36758688 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36759600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36759721 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 36759795 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36759838 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 36759886 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36759903 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36759980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36760127 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 36761122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36761560 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36761702 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 36762011 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36762046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36762077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36762201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36762692 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 36762702 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 36762886 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 36763013 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36763017 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36763043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36763075 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36763115 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36763116 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 36763130 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 36763246 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 36763380 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 36763644 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36763946 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 36763975 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36764109 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36764480 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36764563 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36765171 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36766548 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36767000 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36767310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36768574 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36768668 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36769142 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 36769205 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36769209 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36769628 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36769656 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36769671 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 36769864 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36769873 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36769891 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36769943 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36769979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36770161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36770170 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36770257 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36770410 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36770544 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36770992 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36771045 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36771325 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36771359 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36771463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36771478 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36771484 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36771503 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36771657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36771763 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36771814 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36771919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36771967 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36771973 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36772100 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36772241 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 36772247 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36772303 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36772327 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36772434 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36772438 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36772512 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36772797 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 36772808 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 36772910 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36773331 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 36773516 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 36773603 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36773830 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36773847 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 36774039 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 36774080 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36774225 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36774348 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36774458 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36774460 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36775176 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 36775198 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 36775423 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36776938 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 36777251 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36777396 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36777592 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36777628 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36777632 G T Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 36777876 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36778417 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36778462 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 36778488 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 36778570 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36778664 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36778976 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 36779072 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36779077 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36779096 C T N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 3 36779157 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36779185 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36779429 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36779682 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36779698 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36779767 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 36779837 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36779992 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 36780065 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36780169 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36780258 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36780279 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36780486 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 36780558 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36780614 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36780692 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36780729 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36780834 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36780847 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36780960 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36780970 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36780983 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36781290 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36781327 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36781358 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36781444 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36781514 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 36781708 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36781863 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 36781889 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 36782014 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 36782030 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 36782052 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 36782330 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 36782343 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 36782347 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36782389 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36782405 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36782453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36782641 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36782703 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36782742 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36782744 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36782870 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36783117 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36783616 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 36783744 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 36784041 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 36784490 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 36784825 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 3 36784833 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 36784938 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36784946 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 36785033 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 36785036 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 36785061 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 36785457 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 36785602 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36785694 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36785736 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36786243 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36786274 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36786397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36786785 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36786874 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36787912 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36788194 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36788459 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36788658 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36788706 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36788741 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36788800 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36788876 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36789224 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36789295 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36789302 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 36789427 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36789535 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36789711 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36789748 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36789757 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36789927 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36790186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36790191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36790411 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36790416 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 36790506 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36790680 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36790796 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36791518 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36791525 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36791743 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 36791744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36791809 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36791854 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36791896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36791993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36792294 G A N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 3 36792339 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36792443 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36792888 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36792890 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36793062 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36793237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36793903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36794299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36794410 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36794480 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 36794537 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36794992 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36794996 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36795009 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36795125 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36795126 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 36795205 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36795214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36795257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36795403 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36795597 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36795633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36795834 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36795867 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36796006 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36796029 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36796056 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36796079 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36796123 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36796213 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36796242 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36796270 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36796383 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36796487 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36796555 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36796693 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36796786 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36796829 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36796889 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36796953 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36797020 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36797021 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 36797069 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 36797189 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36797343 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36797397 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36797488 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36797492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36797613 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36797708 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36797766 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36797788 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36797954 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36797978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36798016 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36798170 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36804537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36805377 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36805519 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 36805851 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36805890 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36805911 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36805959 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36805963 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36806250 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36806255 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36806353 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 36806432 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36806642 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36806739 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36806775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36806797 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36807119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36807122 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36807378 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 36807416 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 36807508 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36807585 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36807673 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36808004 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36808021 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36808044 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36808267 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36808350 C T N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 36808386 G C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 36808595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36808604 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36808606 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36808665 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36808743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36808783 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36808956 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36809171 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36809473 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 36809492 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 36809604 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 36809819 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36810174 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36810276 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36810704 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 36810905 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 36810916 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 36810937 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36810941 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36811017 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36811090 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 36811214 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 36811245 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 36812641 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36812684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36812688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36812752 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36812758 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36813347 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36813392 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36813460 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36813566 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 36813650 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 36813661 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36813697 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36813847 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36814340 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36814481 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36814595 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 36814622 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36815095 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36815191 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36815324 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36815346 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36816015 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 36816108 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 36816381 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36816830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36816954 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36817187 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36817282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36817298 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36817604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36817748 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36817851 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36817853 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36818009 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36818021 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36818032 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36818035 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36818116 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36818137 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36818247 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36818261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36818272 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36818366 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36818475 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36818549 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 36818674 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36818675 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36818739 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36819029 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36819042 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36819056 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36819081 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36819091 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 36819093 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36819250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36819269 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 36819294 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 36819295 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 36819306 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 36819348 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36819371 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36819791 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36819801 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36820222 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36820372 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36820393 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36820789 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 36821161 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 36821876 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 36821985 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 36822079 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36822538 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 36822653 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36822807 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36822828 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36822891 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36823343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36823416 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 36823723 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 36823739 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36824655 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36824755 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 36824756 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 36824921 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 36825003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36825150 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 36825258 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36825463 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36825984 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36826045 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36826059 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36826455 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 36826476 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36826657 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36826901 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 36827035 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 36827624 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36828495 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36828788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36829120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36829188 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36829596 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36829610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36830019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36830242 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36830750 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 36830841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36831010 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36831213 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36831277 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36831303 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36831482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36831522 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36831548 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36831668 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36831746 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36832578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36832601 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36832950 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36833000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36833056 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36833647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36834119 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36834405 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36834732 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36834776 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36835096 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36835264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36835445 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36836496 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36836604 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36836798 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36836854 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36838177 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36838319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36838470 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36838499 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36839030 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36839070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36839085 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36839601 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36839741 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36839817 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36840113 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36840114 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36840218 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36840290 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 36840740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36840773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36840784 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36840797 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36840837 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36840848 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36840860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36841264 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36841290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36841610 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 36841834 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36841999 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36842866 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36842891 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 36843006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36843181 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36843277 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36843528 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 36844275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36844306 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36844876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36844918 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36846120 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 36846330 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36846352 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 36846358 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36847227 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36847264 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36847289 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36847306 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36847341 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36849230 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36849987 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36850645 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36850774 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36850777 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 36852620 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 36852664 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 36852666 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 36852680 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36853413 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36853448 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 36853548 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 36853605 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36853666 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 36853697 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 36853898 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36853955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36854036 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36854226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36854309 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36854403 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36854404 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 36854683 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 36854756 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 36855004 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 36855144 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 36855166 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 36855218 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36855498 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 36856150 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36856248 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 36856272 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36856314 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 36856407 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36856910 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 36857088 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 36857169 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 36857183 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36857250 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 36857331 G T N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 36857350 G A N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 36857581 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 36857683 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 36858269 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 36858656 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 36858684 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 36858690 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 36858754 G C N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 36858810 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 36858813 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 3 36858923 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 36858943 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 36859004 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 36859071 T G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 36859096 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 36859166 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 36859278 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36859428 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 36859514 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 36859729 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36859759 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36859863 T A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 36859968 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 36860153 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36860226 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 36860244 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 36860289 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 36860297 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 36860423 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 36860444 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 36860662 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 36860665 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 36860776 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 36860807 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36860983 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 36861047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36861087 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 36861234 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 36861793 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 36861981 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 36862343 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36862364 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 36862372 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 36862379 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 36862581 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 36862588 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36862610 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 36862800 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36862923 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 36863100 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 36863152 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 36863276 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 36863343 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36863517 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 36863564 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 36863566 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36863603 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36863636 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36864101 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 36864203 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 36864311 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36864581 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 36864640 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 36864865 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 36865223 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 36865314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36865335 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 36865592 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 36865636 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 36865647 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 36865654 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 36865676 C G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 36865790 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36866008 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36866336 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 36866400 C G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 36866430 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 36866497 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36866539 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 36866599 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 36866605 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 36866740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36866780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36867167 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 36867189 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 36867274 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36867563 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 36867696 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36867697 G C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 36867790 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36867847 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 36867875 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36867953 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 36868018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36868027 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 36868786 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 36869015 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 36869396 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 36869545 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36869798 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 36870297 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36871133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36871689 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36871783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36874223 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36874305 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36874763 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36874774 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36875700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36876895 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36877039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36877898 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36878152 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36878177 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36878256 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 36878260 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 36878277 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 36879114 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36879382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36880727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36881239 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36881514 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36882801 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36883287 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36883949 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 3 36885327 A T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 36885550 T A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 36885602 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 36886914 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 36887343 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 36887541 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36887699 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 36888133 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 36888299 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36888426 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 36888960 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 36889003 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36889069 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36889423 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 36889605 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36889645 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36890348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36890678 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 36890817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36891222 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36892730 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 36892920 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36893151 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 36893156 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 36893221 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36894160 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36896164 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 36896264 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36896354 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36896472 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 36896862 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36897556 C G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 36898104 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36898116 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36898520 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36898532 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36899414 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 36899532 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36899916 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 36900243 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 36900270 G T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 36900288 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36900534 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36900546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36900645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36900782 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36901087 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36901148 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 36901176 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36902644 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 36902652 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36902679 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36902682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36903740 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36904752 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36904896 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36905277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36905294 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 36905331 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36905422 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 36905436 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36905443 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36905461 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36906317 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36906518 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36906657 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36907657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36908230 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36908486 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36909035 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36909095 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 36909262 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36909505 A G N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 36910298 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36911452 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36911748 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36911754 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36911945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36911957 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36912005 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 36912114 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36912201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36912276 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 36912363 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36912432 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 36913457 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 36913931 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36914008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36916420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36918211 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36918747 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36919381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36920301 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36920306 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36921733 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36922996 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36923093 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36923861 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 36924128 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36925065 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36925937 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 36925964 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 36925984 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 36925989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36928322 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36928488 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36928654 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36928988 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36929268 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36929307 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 36929314 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 36929804 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36930561 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 36930596 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 36930916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36930956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36930980 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36931604 C G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 36931659 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 36931691 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 36931745 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 36932140 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 36932682 G A N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 36934108 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 36934572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36934655 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36935056 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36935087 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36935177 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36935208 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 36935262 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 36935445 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36935463 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36935503 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36935997 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36936054 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36936278 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36936583 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36936863 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36936996 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36937047 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36937260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36937831 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36938215 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36938380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36938562 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36938731 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36938832 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36938922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36939498 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36939590 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36939684 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36939747 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36939863 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36940107 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36940173 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36940340 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36940604 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36940731 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36940810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36941074 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36941209 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36941631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36941639 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36941815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36941927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36941977 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36942037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36942375 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36942407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36942582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36942614 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36942639 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36943138 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36943311 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36943479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36943764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36944146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36944200 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36944352 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36944392 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36944623 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36944650 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 36944661 A C N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 36944682 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36944750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36945077 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36945379 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36945588 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 36946263 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36946405 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36946410 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 36946483 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 36946486 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 36946697 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36946873 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36947113 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36947347 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36947756 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36947833 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36948325 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36948449 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36948503 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36948812 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36948827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36948853 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36948875 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36949120 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36949195 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36949218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36949307 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36949591 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36949695 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36949920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36950152 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36950241 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36950298 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36950352 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36950440 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36950454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36950460 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36950490 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36950738 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36950903 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36950956 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36951125 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36951144 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36952035 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 36952147 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36952220 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36952297 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36952534 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 36952672 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36952733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36952787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36952875 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36952883 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36952891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36954932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36955236 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36955647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36956245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36956304 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36956720 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36956795 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36956870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36956978 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36957048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36957234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36957347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36957384 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36957577 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36957765 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36957800 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36957898 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36957932 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36957964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36958187 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 36958347 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 36958349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36958483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36958573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36958693 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36958777 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36958786 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36958876 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36958898 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36959001 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36959023 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 36959124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36959254 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36959482 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36959528 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36959713 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36959921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36960005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36960052 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36960067 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36960100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36960206 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36960343 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36961311 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36961312 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36961397 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 36961547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36962137 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 36962220 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 36962227 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36962443 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36962455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36963340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36963678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36965057 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36965203 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36965739 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36966315 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36967130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36967985 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36968883 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36970459 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36971819 A C Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 36972073 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36972357 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 36974103 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36974182 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36974369 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36975672 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36975886 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 36976212 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36977073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36977361 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36977426 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36977504 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36977618 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36978359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36978481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36978528 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36978545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36978675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36978851 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36979208 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 36980736 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36980851 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36981022 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36981024 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36984709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36984983 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36985293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36985854 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36986059 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36986660 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 36987071 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36987429 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36987891 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36988621 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36988778 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36988794 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36989492 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36989682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36989694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36990106 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36990177 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36991378 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 36991828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36991939 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36992496 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36992723 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 36994916 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36996349 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 36997412 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 36998179 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36998620 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 36998939 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 36999208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 36999366 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37000091 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37000393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37000842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37002644 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37002687 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37003012 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 37003638 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37003778 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37005768 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37006415 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37007027 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37007527 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37007851 G A Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 37008179 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37009266 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37010731 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 37010791 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 37010854 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 37010925 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 37011054 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37011369 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37011899 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37012560 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37012876 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37013367 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37013554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37013667 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37014462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37014479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37014712 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37016137 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37016212 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37016589 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37017270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37017331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37017800 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37018645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37018905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37019116 A C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0 0.823529411764706 0.176470588235294 14 20 0 14 3 3 37019676 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37020259 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37020260 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37020293 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37020315 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37020473 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37020505 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37020513 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37021622 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 37022210 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37022237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37022480 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 37022501 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 37022746 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37022941 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37023332 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37023548 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37023654 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37023657 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37024047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37024143 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37024358 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37024462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37024584 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37027689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37027979 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37028089 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37028116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37028558 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37028696 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37028706 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37028798 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37028972 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37028997 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 37029196 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37029404 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 37029495 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 37029656 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 37029685 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 37030007 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37030056 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37030167 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 37030187 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37030321 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37030443 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37031066 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 37031151 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37031187 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37031299 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 37031638 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 37032075 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 37032078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37032395 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37032597 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37033633 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 37033901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37033963 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37034100 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37034271 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37034730 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37034820 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37034877 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 37034952 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37035117 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 37035240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37035272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37035285 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 37035348 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 37035400 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37035452 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 37035469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37035488 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 37035534 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 37035596 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 37035611 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 37035763 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 37035807 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 37035813 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 37036433 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 37036515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37036885 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37037680 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37037783 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37037897 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37037901 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37037932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37037945 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37037968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37038061 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37038082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37038384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37038413 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 37038613 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37039011 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37040407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37040425 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37040503 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37040598 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37041097 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 37041295 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37041424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37041785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37041887 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37042024 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37042168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37042189 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37042402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37042479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37042536 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 37042712 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37042906 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37042940 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37043293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37043408 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37043847 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37043877 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37043888 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37043896 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37044512 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 37044637 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 37045082 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 37045128 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37045169 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 37045186 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 37045408 G T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 37045515 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 8 10 2 4 3 3 37045535 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 37045556 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 37045670 A T N N 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 3 37045720 A G N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 3 37045754 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 3 37045780 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 37045935 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37045983 G T N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 3 37045984 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 37046010 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37046017 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37046021 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 37046033 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37046087 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37046128 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37046133 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37046182 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37046280 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 37046317 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37046452 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 37046525 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 37046555 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 37046606 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 37046639 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 37046684 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 37046720 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 37046767 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 37046913 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 37046958 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 37047009 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 37047021 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 37047092 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 37047144 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37047320 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 37047380 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 37047589 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37047759 T G N N 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.25 0.333333333333333 0.416666666666667 10 14 3 4 5 3 37047918 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 3 37047989 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37048045 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 37048345 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 37048602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37049823 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37049843 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37049862 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 37049863 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37049888 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37049963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37049977 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37050098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37050393 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 37050972 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 37051017 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 37051885 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 37052004 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 37052510 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 37052523 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 37052828 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37053080 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 37053153 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37053629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37053660 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 37053929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37054022 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37054037 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37054064 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 37054135 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37054352 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37054854 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 37054886 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 37054890 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 37054977 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 37055077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37055120 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 37055132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37055230 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37055318 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 37055341 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 37055789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37056700 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 37056754 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 37056829 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 37056847 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 37056862 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 37056892 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 37056949 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 37057014 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 37057015 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 37057025 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 37057037 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37057083 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 37057194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37057478 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 37057507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37057908 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37057949 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37058246 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 37058684 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 37058934 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37059072 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37059086 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 37059109 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 37059114 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 37059138 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 37059191 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37059253 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 37059292 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 37059319 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 37059355 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 37059358 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 37059374 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 37059612 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 37059691 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37059802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37060008 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 37060115 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 37060212 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 37060270 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37060288 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 37060451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37060530 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 37060672 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 37060698 G C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 37060701 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 37060722 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 37060726 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 37060757 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 37060801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37060870 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 37061196 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 37061228 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 37061339 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37061381 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 37061417 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 37061442 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37061453 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37061656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37061766 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 37061784 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 37062056 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 37062140 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 37062198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37062285 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 37062567 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 37062573 T G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 37062787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37062794 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 37062890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37063017 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 37063086 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37063199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37063392 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 37063616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37063632 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37063636 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37063650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37063704 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37063719 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37063723 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37063803 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 37063865 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 37063907 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 37063985 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 37064422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37064595 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37064969 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 37065094 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37065246 T G Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 37065394 C G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 37065576 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37065583 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 37065853 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37066838 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 37067126 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37067172 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37067224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37067271 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 37067418 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37067420 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37067695 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 37067809 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37067853 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37067952 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37067957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37068055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37068410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37068580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37068685 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37068898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37069059 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37069090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37069117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37069138 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37069139 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37069233 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37069318 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37069353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37069396 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37069406 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37069614 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37069653 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37069654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37070168 C T Y Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0 1 0 15 15 0 15 0 3 37070939 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 37070969 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 37071016 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 37071125 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 37071162 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 37071255 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 37071284 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 37071366 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 37071429 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 37071551 A T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 3 37071647 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37071677 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37071840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37071900 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37072270 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37072271 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37072300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37072427 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37072520 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37072526 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37072869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37072906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37073242 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37073274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37073315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37074315 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 37074658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37074687 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37074730 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 37074774 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 37074841 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37075014 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37075056 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37075337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37075403 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 37076109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37076547 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37076792 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 37076896 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 37076913 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 37076986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37077032 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37077085 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 37077111 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37077562 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37077851 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37077999 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37078073 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 37078149 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37078372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37078393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37078452 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37078491 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37078950 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37079046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37079410 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37080013 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 37080122 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37080402 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 37080439 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37080456 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 37080467 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 37080512 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 37081769 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 37081903 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 37082012 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 37082028 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 37082126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37082192 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 37082350 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37082436 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37082886 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37083044 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37083699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37083880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37083970 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37085783 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37085830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37086140 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37086237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37086550 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 37086634 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37086757 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37086776 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37086782 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 37086980 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 37087051 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 37087295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37087444 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37088196 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37088222 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37088453 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 37088481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37088502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37088717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37088742 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37089254 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37089480 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37089610 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37089655 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37089683 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 37089729 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 37089764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37089802 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37089934 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37089950 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 37089994 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 37090051 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37090293 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37090304 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37090317 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37090343 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37090379 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37090396 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37090443 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37090596 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37090717 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 37092307 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37092573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37092725 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 37092768 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 37092784 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 37092903 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 37093004 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 37093027 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 37093032 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 37093444 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 37093708 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37093970 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 37094136 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37094279 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 37094870 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37094897 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37095029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37095123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37095155 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37095739 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 37095904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37096758 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 37096773 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 37096865 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 37096899 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 37096936 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 37096978 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 37097148 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 37097281 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 37097297 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37097301 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37097900 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 37098004 G A N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 37098021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37098323 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 37098387 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 37098526 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37098872 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37098977 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37099139 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37099397 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37099603 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37099705 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 37099875 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37100003 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37100843 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37101011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37101051 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37101103 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37101140 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37101213 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37101564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37101835 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37101836 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37101984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37101985 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37102008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37102021 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37102166 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37102274 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37102301 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37102393 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 37102435 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37102440 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 37102460 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 37102529 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 37102585 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37102656 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37102687 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37102698 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37102792 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37103049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37103058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37103230 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37103567 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37103626 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 37104307 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 37104372 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37104481 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37104599 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37104660 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37104749 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37104833 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37104995 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37105073 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37105117 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 37105126 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37105184 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 37105473 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 37105803 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 37105839 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 37105955 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 37106186 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 37106307 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 37106309 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 37106323 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 37106497 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 37106501 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37106686 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37106689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37106806 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37106882 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 37106927 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37106932 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37107203 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37107271 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37107331 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37107715 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37107726 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37108086 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 37108113 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 37108132 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 37108213 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37108230 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37108368 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 37108420 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 37108438 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37108586 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37109406 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 37109409 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 37109650 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37109694 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 37109713 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37109743 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37110155 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37110279 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37110283 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37110332 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37110381 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37110536 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37110612 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37110641 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37110744 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37110974 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37111019 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37111051 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37111115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37111139 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37111295 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37111325 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 37111351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37111668 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 37111754 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 37111776 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 37111813 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 37112109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37112367 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 37112462 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 37112533 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 37112602 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 37112823 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 37112897 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 37112918 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 37113028 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 37113134 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 37113307 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 37113352 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 37113361 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 37117044 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 37117208 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 37117488 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 37118079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37118970 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 37119172 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 37119189 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37119244 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 37119307 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 37119650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37120235 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 37120355 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 37120597 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37120694 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 37120804 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 37120821 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37120849 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 37120854 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 37120868 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 37121548 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 37121638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37122449 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37122917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37123454 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37123660 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37123693 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37123861 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37124078 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 37124125 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 37124143 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 37124208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37124227 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37124416 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 37124456 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 3 37124580 T C N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 3 37124614 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 5 7 1 3 2 3 37124948 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 5 9 1 3 3 3 37125089 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 37125153 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 37125157 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37125366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37125391 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37125449 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 37125783 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 37125885 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37126049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37126088 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37126123 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 37126156 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37126250 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 37126327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37126378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37126388 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 37126646 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 37126787 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37126812 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37126854 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 37127845 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37128170 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37128387 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 37128580 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37128647 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37128980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37129694 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37129707 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 37130050 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 37130094 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 37130106 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 37130684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37131974 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37132028 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37132075 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37132077 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37132139 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37132400 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 37132486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37132819 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37132969 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 37133012 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 37133157 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37133563 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 37133581 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 37133790 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37133855 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37133889 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37133904 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37133908 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37133945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37133956 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37134170 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 37134299 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37134309 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37134350 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37134389 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37134420 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37134554 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37134674 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37134718 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37134737 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 37134794 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37135152 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37135178 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37135261 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 37135360 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37135532 C T Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 37135585 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37135701 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 37135778 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 37135944 G A Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 37135951 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37136029 G T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37136135 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37136257 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 37136777 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37136781 A T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37137027 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 37137386 T G Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 37137670 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37137698 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37137729 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 37137789 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37137806 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37138030 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37138112 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37138331 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37138436 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37138440 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37138739 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37138747 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 37138836 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 37138878 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37138956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37138963 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37139455 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37139717 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37139846 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37139871 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37140071 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37140227 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37140373 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37140487 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37140758 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 37140885 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37141006 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37141200 T C Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 37142511 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37142595 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 37142646 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 37142661 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 37142746 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 37143114 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37143247 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 37143636 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 37143700 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 37143708 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 37143794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37143868 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37147339 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37147664 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37147680 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37147751 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 37147795 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37147815 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37147963 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37147982 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37147987 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37148012 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37148026 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37148032 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37148114 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37148232 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37148549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37148645 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37148662 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37148903 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37148960 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37149284 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 37149381 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 37149461 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37149527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37149532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37149560 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37150014 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37150122 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37150149 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37150359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37150685 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 37150835 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 37150905 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 37151049 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 37151059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37151096 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 37151141 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37151176 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 37151221 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 37151306 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 37151393 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 37151394 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 37151429 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 37151502 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 37151581 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 37151604 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 37151617 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 37152009 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37152054 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37152089 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 37152132 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 37152156 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37152403 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37152433 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 37152481 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 37152508 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 37152572 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 37152577 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 37152595 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 37152623 A T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 37152694 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 37152756 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 37153567 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 37154141 T A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 37154189 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 37154516 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37154647 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37154744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37155127 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37155327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37156075 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37156095 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 37156580 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 37157480 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 37157495 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37157578 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37158166 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 37158888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37159152 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37159173 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37159221 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37159232 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 37159312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37159347 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 37159418 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 37159493 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37159645 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 37159669 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37159878 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 37159907 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37160014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37160045 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 37160064 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37160087 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 37160096 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 37160163 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 37160186 A C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 37160254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37160493 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 37160687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37160724 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37160762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37160818 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 37160914 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 37160991 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37161027 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 37161490 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37161562 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37161631 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37161645 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37161730 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37161775 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37161993 C A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 37162116 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 37162119 T G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 37162147 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 37162536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37162572 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 37162620 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37162995 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37163086 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 37163710 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 37163967 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37163995 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37164053 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 37164302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37164445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37164998 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37165095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37165230 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 37165310 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37166291 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 37166381 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 37166461 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 37166624 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 37166987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37167019 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37167129 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37167167 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37167885 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37167966 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37168150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37168676 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37168905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37168962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37169367 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 37170006 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37170046 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 37170096 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 37170195 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 37170283 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37170368 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37170372 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37170978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37171000 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37171012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37171023 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37171141 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37171213 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37171230 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37171250 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37171260 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37171359 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37171429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37172078 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37172355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37172807 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37172816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37172898 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37173040 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37173091 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37173277 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37173477 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37173584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37173812 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37173850 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37173897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37174387 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37174447 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37174638 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37174848 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37174851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37175283 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37175330 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37175348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37175373 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37175382 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37175455 A T Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 37175545 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 37175663 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 37175704 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 37175760 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 37175904 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37176025 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 37176048 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37176207 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 37176215 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37176234 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 37176356 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 37176372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37176523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37176786 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37176971 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 37177109 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 37177359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37177573 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37177615 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 37178281 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 37178380 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 37178584 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37178629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37179045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37179495 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37179629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37179840 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37180097 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37180425 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37180760 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37180843 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37180981 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37181012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37181220 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37181242 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 37181432 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 37182306 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 37182431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37182671 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 37182996 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37183627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37183673 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37183974 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37184284 A C N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 37185607 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37185683 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37185954 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37186103 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37186160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37186781 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37186868 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37186897 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37186938 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37187049 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37187111 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37187123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37187361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37187831 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37188050 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37188321 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37188435 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37188447 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37188732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37188786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37188802 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 37189150 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37189521 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37189558 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37189578 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37189680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37190648 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37190770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37190856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37190878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37190956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37191031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37191349 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37191419 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 37191652 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37191783 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37192757 G T N N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 3 37193158 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37193218 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37193361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37194757 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 37194872 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37195390 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37195579 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37195851 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37196709 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37197033 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 37197075 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37197173 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37197541 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37198077 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37198102 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37198502 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 37198552 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37198662 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37199152 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37199298 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37199362 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37199420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37199470 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37199679 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 37199704 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37199730 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37199782 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 37199878 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37200090 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37200106 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 37200130 A G N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 37200228 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37200521 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37200586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37200602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37200703 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37200817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37200818 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37202516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37202897 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37202918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37203087 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37203127 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 37203132 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 37203437 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37203507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37203530 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37203573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37203861 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37204169 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37204219 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 37204488 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37204816 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37205474 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37205478 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37205712 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37205886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37205908 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37205910 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37205929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37206193 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37206219 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37206224 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37206252 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37206322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37206363 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37206664 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37206759 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37206874 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37206983 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37207396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37207652 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 37208502 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37208557 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37208652 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37208733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37208800 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37208826 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37209519 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37209833 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37210324 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37210389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37210903 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37211091 T C N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 3 37211145 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37211354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37211416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37211461 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37211462 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37211529 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 37211535 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 37212169 G C N N 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 3 37212619 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37212620 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37212911 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37213136 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 37213626 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 37213882 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37213932 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37215243 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37215770 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37217096 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37217097 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37217233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37217597 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37218368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37218765 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37219145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37220628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37220685 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37220731 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37220735 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37220782 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37220812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37221154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37221745 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 37221799 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37222150 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37222164 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37222378 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 37223219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37224824 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37224944 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37225105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37225148 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37225279 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37225292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37225308 A T N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0 0.75 0.25 12 20 0 12 4 3 37225323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37225379 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37225467 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37225690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37225870 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37225949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37225950 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37225975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37225978 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37226117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37226160 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37226498 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37227066 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37227528 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37227645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37227892 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37227939 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37227941 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37228124 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37228338 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37228525 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37228557 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37228603 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37228833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37229010 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37229094 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 37229405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37229414 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37229429 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37229524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37229877 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37230056 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37230294 T A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 37230716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37230738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37230863 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37230925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37230959 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37231016 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37231203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37231429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37231504 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37231514 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 37231551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37231568 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37231714 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37231716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37231742 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37231756 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37232295 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 37232398 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 37232438 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37232457 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37232463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37232739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37232845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37233010 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37233056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37233102 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37233134 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37233138 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37233145 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37233200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37233337 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37233368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37233478 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37233491 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37233502 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37233688 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37233893 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37233933 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37234194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37234489 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37234505 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37235013 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37235704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37235768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37236090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37236448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37236449 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37237094 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 37237372 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37237615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37237620 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37237849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37237921 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37238223 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37238295 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37238324 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 37238374 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37238471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37238477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37238495 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37238702 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37238868 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37238880 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37238995 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37239026 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37239414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37239575 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37239938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37239939 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37240762 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37240885 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37241134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37241518 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37241531 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37241592 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37241760 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 37241848 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37241852 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37241941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37242424 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37242644 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37242850 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37242954 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37243020 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37243034 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37243041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37243163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37243185 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37243772 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37243803 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37243812 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37244002 A T N N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.25 0.75 0 15 9 3 9 0 3 37244195 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37244207 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37244246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37244321 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37244396 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37244486 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37244754 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37244799 T A Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 37244801 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 3 37244843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37245115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37245158 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37245319 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37245561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37245568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37245639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37245642 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37245835 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37245892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37246038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37246135 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37246247 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37246446 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37246448 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37246486 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37246569 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37246586 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37246887 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 37247352 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 37247467 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 37248079 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37248296 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37248377 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 37248414 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37248486 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 37248702 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 37249104 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37249119 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 37249285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37249622 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37249756 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 37249892 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37251305 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37251425 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37251576 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37251635 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 37251662 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 37251732 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37251956 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 37251996 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 37252035 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 37252049 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 37252162 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 37252203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37252480 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 37252599 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37252643 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 37252759 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 37253110 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 37253127 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37253222 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37254181 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 37254497 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 37254674 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 37254700 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 37254869 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 37255630 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37255684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37255685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37255763 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 37255849 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37255914 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 37255956 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37256012 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37256092 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37256132 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 37256142 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37256156 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 37256205 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 37256545 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37256569 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 37256785 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37256862 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37256868 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 37257119 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 37257505 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37257607 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 37257746 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 37257759 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 37257810 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 3 37257818 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 37258713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37258758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37259203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37259371 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 37259454 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 37259964 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 37260113 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 37260199 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 37260339 A T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 37260640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37260644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37260849 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 37260965 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 37261271 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 37261477 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37261573 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37262008 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37262071 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 37262198 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37262381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37262433 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 37263436 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37263447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37263647 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37264299 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37264472 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37264506 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37264816 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 37265085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37265141 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37265231 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37265351 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37265633 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37265735 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37266182 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37266216 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 37266230 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37266820 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 37267850 T C Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 37267894 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 37267994 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 37268012 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 37268145 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 37268339 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 37268430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37268555 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 37268640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37268682 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 37268742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37268835 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 37268889 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 37269536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37269541 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37270019 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 37270397 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 37270494 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 37270532 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37270576 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 37270593 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 37270611 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 37270639 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 37270717 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 37270727 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37270754 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37270969 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37271069 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37271152 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37271286 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 37271684 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 37271940 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 37272656 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 37272787 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 37272801 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 37272824 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 37273232 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 37273368 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37273387 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37273416 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 37273419 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 37273456 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37273908 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 37274105 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37274132 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 37274146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37274147 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 37274236 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 37274251 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 37274464 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 37274481 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 37274579 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 37274605 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 37274870 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 37275089 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 37275167 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37275170 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 37275192 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37275287 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 37275323 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 37276784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37276878 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37276907 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37276923 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 37277119 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 37277177 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 37277228 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37278228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37278244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37278250 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 37278283 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 37278342 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 37278541 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37279207 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 37279314 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 37279512 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 37279537 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37279800 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 37280475 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 37280496 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 37280577 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37280808 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37280868 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 37281107 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 37281170 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37281344 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37281350 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 37281360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37281383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37281406 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 37281485 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37281655 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 37282155 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 37282210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37282328 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 37282423 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 37282617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37282761 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 37282817 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 37282885 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 37283043 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 37283154 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37283220 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 37283714 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 37283873 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 37283899 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 37284020 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 37284024 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 37284304 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 37284338 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 37284355 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 37284367 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 37284376 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 37284383 G C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 37285182 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37285262 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 37285285 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37285701 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 37285745 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 37285993 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37286033 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 37286142 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 37286630 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 37286708 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 37286829 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37286838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37286890 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37287182 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 37287210 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 37287282 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37287375 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37287421 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 37287527 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 37287554 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 37287809 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 37288942 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37289376 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37289527 G C Y N 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 3 37295329 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37295359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37295636 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 37295881 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 37295895 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37296030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37296221 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37296224 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37296256 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37296599 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37296652 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37296660 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37297202 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 37297775 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 37297793 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 37297895 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 37297924 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 37297937 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 37297961 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 37297974 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 37299272 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37299418 T A N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 3 37299633 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37299661 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 37299685 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37299697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37299745 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37299822 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37299832 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37299853 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37299902 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37300188 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37300221 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 37300222 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 37300253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37300292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37300564 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37300584 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37300748 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 37300768 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37301007 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 37301376 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37301524 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 37301667 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 37302009 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37302310 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37302537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37302614 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 37302634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37303182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37303267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37303728 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 37304032 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 37304530 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37304556 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37304613 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37304734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37304855 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37304856 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37305132 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37305258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37305300 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37305312 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37305367 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 37305368 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 37305491 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37305561 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37305618 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37305640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37307030 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 37307267 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 37307285 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37307474 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 37307707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37307783 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 37307799 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37308288 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 37308422 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37308577 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 37308615 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 37308650 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37308876 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 37309102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37309273 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 37309356 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 37309399 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 37309496 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 37309593 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 37310371 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37310531 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37310838 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37310882 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37311194 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37311689 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37311832 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 37312197 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37312566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37312896 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37312924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37312937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37313054 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 37313138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37313178 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 37313284 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 37313439 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 37313503 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 37314073 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37314083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37314229 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37314492 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 37314571 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 37314628 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 37314629 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37314655 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37314690 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 37314746 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 37314819 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37314896 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37314963 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 37315077 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37315182 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37315316 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37315399 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37315467 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37315880 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37315996 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 37316028 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37316045 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37316060 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 37316158 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 37316323 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 37318480 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 37318483 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37318607 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 37318876 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37318999 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37319042 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37319079 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37319564 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37319579 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37321126 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 37321391 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 37321413 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37321721 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37321767 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37321972 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37322016 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37322737 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37323854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37323913 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 37324029 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37324038 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37324160 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37324186 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37324377 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37324457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37324839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37324930 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37325226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37325251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37325305 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37325367 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37325552 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37325853 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 37325934 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37326061 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37326200 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 37326758 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 37326797 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37327025 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37327582 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37327825 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37327934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37327956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37327972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37327989 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37328064 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37328212 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 37328283 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37328585 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 37328801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37329116 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 37329182 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37329418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37329496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37329593 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37330102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37330234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37330342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37330666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37332239 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37333048 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37333162 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 37333219 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37333260 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37333398 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37333671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37333762 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37333802 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 37334215 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37334312 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37334336 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 37334471 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37334506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37334669 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 37334697 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37334957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37335164 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 37335224 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 37335335 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 37335451 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 37335501 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37335942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37336156 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37336175 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 37336204 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37336468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37336788 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 37336843 G T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 37336912 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 37337129 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37337371 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 37337444 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 37337486 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37337600 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37337906 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 37338567 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 37339047 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37339118 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37339138 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37339254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37339380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37340134 T G N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 37340338 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37340442 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 37340638 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 37341196 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 37341486 A G N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 37341792 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 37342052 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37342072 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37342211 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 37343121 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 37343256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37343307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37343890 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37344182 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 37344712 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 37344783 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37344924 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37345353 G A Y Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.272727272727273 0.727272727272727 0 14 8 3 8 0 3 37346060 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37346340 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37346416 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37346417 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 37346610 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 37346811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37347229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37347635 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37347758 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37347826 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37348074 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 37348258 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 37348369 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37349577 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37349812 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 37349870 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 37350318 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 37350394 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37350501 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 37350523 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37351341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37351362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37351554 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37352197 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37352747 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37353404 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 37353778 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 37353920 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 37353942 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 3 37354074 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 37354075 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37354195 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 37354330 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37354345 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 37354475 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 37354846 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 37355478 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37355778 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37355943 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37355950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37356087 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 37356139 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37356182 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 37356208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37356917 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37357021 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37357348 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37357469 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 37357472 A C N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 37358173 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 37358219 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37358302 C A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 37358487 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 37358676 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 37358849 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 37359016 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 37359089 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 37359391 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 37359455 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 37359478 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 37359489 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 37359573 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 37359782 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 37359908 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 37360099 T A N N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 3 37360402 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 37360572 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 37360919 T G N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 37360984 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 37361115 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37361168 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37361298 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 37362252 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 37362497 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37362825 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 37363691 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37364088 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 37364278 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37364572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37364634 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37364731 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37364747 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37364890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37365159 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37365451 A C N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 37365534 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37365547 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37365801 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 37365810 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37366331 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37366341 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37366463 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37366891 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 37366920 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 37367092 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 37368231 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 37368606 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37368959 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37369021 C G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 37369257 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 37369343 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 37369735 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37370226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37370568 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37370674 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 37372435 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37372451 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37372499 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37372929 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 37373035 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37373108 A T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 37373234 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 37373636 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37374737 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 37374802 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 37374900 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37375216 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37376169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37376279 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37376328 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37376401 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37376674 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 37376907 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 37377308 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 37377696 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 37378068 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 37378265 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37378330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37378409 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 37378735 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37379202 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 37379430 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37379480 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37379488 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37379575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37379659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37379674 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 37380387 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37380427 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37380544 G C Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 37381411 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37381515 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 37381745 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37383032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37383451 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37383565 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 37384295 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37385340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37385651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37385741 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37385952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37386337 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37386409 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37386533 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37386724 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37387243 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37388951 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37389393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37389432 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37389684 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37389734 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37391005 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 37391395 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37391961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37392685 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37393356 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37393389 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37393885 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37393940 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37393954 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 37394226 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 37394515 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37394549 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 37395751 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37395770 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 37396207 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37396377 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 37396710 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37397393 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 37398436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37398847 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37399337 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 37399415 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 37399469 T G Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 37400954 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37401101 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37401112 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37401557 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37401700 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 37401703 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37402333 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37402719 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 37403109 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37403292 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37403646 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37405102 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37405350 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37405870 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37406550 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37407487 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37407830 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37408322 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37408497 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 37410149 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 37410153 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37410724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37412339 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37412895 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37412900 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37413111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37413133 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37413319 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37413419 A C N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 37413441 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37413978 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37414337 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37415099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37415186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37415484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37415515 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37415982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37416196 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37416233 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37417187 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 37417307 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37417591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37417624 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37418049 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 37418743 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37418835 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 37422231 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37422398 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37423970 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 37424328 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37424434 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 37424590 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37425665 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37426658 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37426720 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 37426863 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 37427028 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37427133 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 37427591 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37427974 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 37428193 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37428631 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 37428652 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37428760 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37429315 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37429347 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37429420 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37429606 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37429891 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37430915 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37431015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37431140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37431213 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37431613 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37432161 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 37433072 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 37433244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37433719 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 37433736 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37433919 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 37434516 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37434538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37434988 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37435139 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37435756 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37435929 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37436155 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37436463 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37436731 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37437243 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37437517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37437575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37437614 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37437799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37437838 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37438150 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37438908 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37439164 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37439356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37439413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37440013 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37440091 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37440486 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37440588 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37441732 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37443002 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37443015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37443108 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37443660 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37444631 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37444911 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37445186 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37445408 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37446753 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37447473 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 37447838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37447971 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37448209 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37448788 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 37449294 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 37449653 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 37449670 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 37450386 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37450471 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 37451448 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 37451531 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37451880 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37453053 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 37454031 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 37454345 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37454413 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 37454779 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37455309 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37455426 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37456097 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37456168 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37456208 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 37456297 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37457132 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37457167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37457562 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 37457625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37457987 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37458749 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37458917 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37459513 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37459854 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37460954 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37461373 G C N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 3 37461441 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 37461464 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 37462102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37462181 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 37462329 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37462336 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 37462497 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37462578 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37463329 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 37463571 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37463823 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 37464206 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 37464308 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 37464558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37465442 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37465699 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0 0.894736842105263 0.105263157894737 17 21 0 17 2 3 37466225 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37466450 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 37466703 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37467482 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37467845 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37468052 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37468417 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37468710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37468902 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37470067 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 37470682 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37470695 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37470703 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37470750 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37470824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37471303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37471305 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37471512 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 37472000 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37472112 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37472179 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37472256 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 37472580 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37473336 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 37473447 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37473604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37474050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37474373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37474505 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37474769 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 37474798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37474836 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37474842 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37474959 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37475134 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37475189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37475339 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 37475622 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37475706 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37475708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37475959 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 37475960 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 37476493 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37477221 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37478086 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 37478123 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37478151 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37478186 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 37478460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37479941 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 37480534 A T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 37480627 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37480744 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37480947 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 37481029 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 37481052 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 37481978 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37482524 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37482987 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 37483026 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 37483576 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 37483882 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 37484109 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 37484152 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37484156 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37484175 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37484302 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 37484887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37485042 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37486459 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37486520 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 37486532 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 37486633 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37486899 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 37486900 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 37486980 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37487030 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 37487051 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 37487160 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 37487202 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 37487279 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 37487286 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 37487294 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 37487328 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 37487337 T A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 37487353 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 37487735 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 37487737 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 37487987 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37488005 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37488078 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37488123 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 37488177 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37488178 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37488264 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37488537 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 37488576 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 37488580 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 37488659 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 37488918 C T Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 37490105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37490154 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 37490587 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 37490861 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 37490899 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 37491229 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37491804 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 37491978 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 37492215 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 37492847 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 37493194 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 37493296 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 37493302 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 37493341 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 37493418 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 37493685 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 37493935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37494000 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 37494086 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37494099 A C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 37494417 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 37495355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37495960 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37496401 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37496598 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 37496761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37496981 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 37496993 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 37497386 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 37497398 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 37497510 C A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 37497564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37497905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37497926 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 37498462 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 37500606 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37500914 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 37501091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37501616 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 37501768 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37501806 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 37501808 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 37501841 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37501871 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37501906 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37502748 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37503003 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 37503011 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 37503016 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 37503160 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 37503985 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37504352 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37505760 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 37506435 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 37506514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37506660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37506771 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 37507016 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37507607 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37507681 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37508276 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37508303 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37508342 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37508510 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37508626 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37508681 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37508870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37509142 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37509205 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37509290 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37509440 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37509466 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37509596 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37509854 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37510112 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 37510167 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 37510217 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 37510234 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 37510350 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 37510381 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 37510576 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 37511276 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 37511564 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 37511658 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37511899 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 37511940 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37512095 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 37512363 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37512365 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37512391 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 37512726 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 37512853 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 37512999 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37513006 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37513382 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 37513453 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 37513471 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 37513472 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 37513487 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 37513532 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37513762 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 37513770 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 37513839 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 37513938 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 37514102 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 37514765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37515109 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37515516 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37516380 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 37516462 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 37516478 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37516496 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 37516550 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37516907 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37517284 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 37517300 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 37517438 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37517532 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 37517870 A G N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 3 37518015 T C N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 37518208 T A N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 37518268 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 37518431 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37518466 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37519517 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 37519537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37519612 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 37519658 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 37519705 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 37519952 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 37519955 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 37520192 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 37520212 C A N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 3 37520336 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 37520604 A T N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 37520645 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 37520692 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 37520693 T A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 37520716 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 37520735 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 37520836 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 37520848 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 37520916 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 37520936 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 37521074 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 37521203 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 37521208 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 37521220 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37521240 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 37521287 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 37521411 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 37521419 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 37521434 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 37521435 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 37521496 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 37521509 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 37521546 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 37521563 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 37521570 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 37521612 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 37521621 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 37521651 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 37521670 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 37521811 T C Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 37521871 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 37521893 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 37521921 C A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 37521922 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 37521942 T C Y Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 37521957 C A Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 37521978 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 37522038 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37522073 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 37522102 T G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 37522110 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 37522220 T G N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 37522418 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 37522623 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 37522648 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 37522688 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 37522789 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 37522980 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 37523042 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 37523146 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 37523723 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 37523777 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 37523852 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 37523872 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 37523907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37524008 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 37524028 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 37524685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37527093 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 37527128 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 37527338 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 37527339 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 37528591 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37528875 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37530293 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 37530322 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37530426 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37530448 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37530482 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37530812 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37530982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37531215 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 37531742 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 37532045 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 37532469 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 37532819 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 37532883 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 37533033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37533147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37533571 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37533617 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 37535293 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 37535515 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 37536142 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 37536891 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 37536950 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 37536970 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 37537016 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 37537210 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 37537237 C A N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 37537245 T C N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 37537263 A G N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 37537608 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 37537642 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37537731 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 37537753 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 37538054 T A N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 37538105 A C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 37538191 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 37538627 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 37538773 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 37540037 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37540445 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 37540451 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 37540462 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 37540656 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37540926 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 37541114 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 37542464 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 37542749 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37543701 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 37544019 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37544154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37544890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37544921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37544925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37544968 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 37545281 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 37545392 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37545472 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 37545473 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 37545486 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 37545495 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 37545501 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 37545528 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 37545699 G A N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 37545723 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 37545730 A T N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 37546099 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 37546648 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 37546721 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 37546819 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 3 37547062 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 37547401 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 37547501 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 37547520 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 37547650 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 37547909 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37548049 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37548465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37548515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37548560 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 37548826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37549024 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 37549467 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 37549538 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37549549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37549816 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 37549951 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 37550039 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 37550040 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 37550529 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 37550665 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 37550712 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37551054 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 37551087 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 37551314 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37551427 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37551607 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37551637 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37551723 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37551878 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 37552019 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 37552074 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37552098 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 37552429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37552486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37552751 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37552815 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37553585 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37553783 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37553790 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37554397 T C Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 37554526 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 37554769 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 37554982 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37555393 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37555397 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 37555514 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 37555638 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 37556813 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 37556869 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 37557365 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37557809 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 37558453 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 37559295 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 37559313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37560229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37560742 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 37560799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37561003 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 37561406 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37561966 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 37562160 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37562597 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37563419 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37564104 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37564242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37564842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37565164 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37567018 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37567729 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37568250 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37568448 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 37568449 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37568464 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 37569090 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37570648 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37571210 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 37571341 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37571448 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37571622 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37571795 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37572068 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 37573121 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37575075 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37575736 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37575768 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 37575929 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 37575963 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37576040 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 37576042 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37576217 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37576304 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37576388 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 37576464 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 37576722 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 37576966 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 37577147 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 37577448 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37577476 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37577552 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37577746 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37577806 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37578457 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37578622 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37578679 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37578707 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 37578730 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 37578807 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 37579062 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 37579076 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37579164 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37579952 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 37579986 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37580402 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37580618 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 37580868 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37581095 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37581109 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37581110 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37581120 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37581123 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37581231 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37581249 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37581335 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37581846 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 37581982 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 37581987 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 37582004 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37582079 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37582210 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 37582213 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37582523 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37582558 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 37582591 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37582722 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37583376 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37583397 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 37583438 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37583466 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37583916 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37584071 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37584513 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37584583 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37584771 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37584853 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37584876 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37584912 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37585037 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37585076 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37585121 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37585319 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37585627 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 37585713 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 37585956 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37586773 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37586829 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37586887 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37586943 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37587009 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 37587026 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 37587041 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37587116 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37587168 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37588494 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 37588495 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 37588517 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37588622 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37588645 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37588830 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 37588859 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37588930 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37588961 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 37588982 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37589214 T C N Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 3 37589235 T C N Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 9 9 2 5 2 3 37589259 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 3 37589383 A C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 37589467 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 37589475 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 37589545 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 3 37589602 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37589655 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37589678 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37590523 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37590578 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37590608 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37590689 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37590744 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37590748 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37590825 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37590983 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37591029 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37591056 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37591146 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37591232 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37591304 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 37591386 G C N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 3 37591466 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37591592 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37591755 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 37591913 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37592011 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37592014 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 37592111 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37592188 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37592259 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37592263 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37592282 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37592397 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37592401 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37592418 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37592421 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37592447 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37592462 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37592497 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37592512 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37592587 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 37592617 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37593106 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 37593175 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 37593507 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37593572 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37593616 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37593741 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 37593832 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37593945 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37594043 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37594269 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37594271 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37594493 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37594609 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37594626 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37594643 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37594679 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37594766 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37594805 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37594869 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37594871 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37595487 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 37595579 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 3 37595660 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37595844 T G N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 3 37596015 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 37596125 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37596160 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37596252 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37596269 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37596280 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37596319 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37596786 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37596853 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37597647 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 37597785 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37597836 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37597955 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37597961 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37598012 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37598044 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37598264 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37598369 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37598497 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37598624 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37598638 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37598676 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37598680 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37599526 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 37599533 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 37599553 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 37599571 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37599696 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37599759 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37599841 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37600065 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 37600448 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 37600451 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37600586 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 37600638 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37600716 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37600756 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37600949 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37600964 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 37601157 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 37601549 G A N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 37601920 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37602179 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37602191 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 37602200 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37602259 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 37602392 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 37602422 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 37602446 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 37602475 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 37602491 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 37602526 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 37602818 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 37602885 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 37603030 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37603132 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37603367 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 3 37603399 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 37603579 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37603599 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 37603666 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37603787 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 37603824 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 37603867 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 37604046 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37604082 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 37604239 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 37604456 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37604609 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37604673 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 37605102 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37605407 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37605410 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37605475 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37605625 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37605894 A T N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 37606002 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37606081 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37606158 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37606166 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37606180 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37606198 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37606224 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37606243 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37606271 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37606285 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 37606310 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37606343 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37606344 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37606378 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37606447 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37606540 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37606575 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37606579 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37606601 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 37606627 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37606685 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 37606791 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37606818 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37607541 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 37607639 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 37607654 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37607784 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 37607797 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 37607820 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 37607823 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 37607858 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 37607994 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 37608644 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37608767 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 37609639 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 37609805 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 37610311 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37610653 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37610855 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37611582 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37611976 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37612235 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 37612774 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37613436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37614286 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 37614524 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 37615017 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 37615251 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 37615254 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37615314 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 37615384 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 37615563 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 37615564 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 37615834 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 37615841 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 37616044 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 37616451 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 37616463 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37616476 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37616493 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 37616507 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37616657 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 37616694 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37616794 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 37616838 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 37616912 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 37616936 C G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 37616950 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 37617174 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 37617218 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.0555555555555556 0.777777777777778 0.166666666666667 16 20 1 14 3 3 37617328 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37617512 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 37617830 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 37618097 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 37618615 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 37618659 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 37618902 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 37619008 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37619014 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 37619133 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37619204 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 37619287 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 37619767 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 37619799 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37620063 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37620495 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37620554 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37620692 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37620752 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37621413 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 37621878 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37622065 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37622427 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37622509 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 37622660 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 37623121 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 37623142 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37623150 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37623483 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37623767 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37623772 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37624036 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37624328 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37624818 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37624968 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37625221 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37625222 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37625369 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37625675 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37625676 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 37625700 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37625804 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37625818 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37625840 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37626006 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37626271 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37626497 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37626846 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37626892 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37626916 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37626922 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 37626980 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37627013 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37627105 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37627106 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37627146 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 37627184 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37627220 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37627441 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37627457 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37627806 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37627961 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37628007 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 37628562 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37628567 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37628617 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37628645 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37628646 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37628666 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37628725 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37628859 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37628912 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37628935 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37629008 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37629014 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37629030 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37629139 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37629174 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37629252 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37629306 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 37629485 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37629733 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 37629981 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37629991 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37630037 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37630066 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37630081 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37630402 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37630462 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 37630538 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 37630722 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37630858 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37630859 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37630941 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37630944 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37631016 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37631123 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37631207 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37631248 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37631266 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37631336 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37631356 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37631457 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37631582 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37631977 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37631983 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37632338 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 37632516 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37632517 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37632692 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37632914 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37633009 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37633028 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 37633183 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37633212 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 37633272 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37633309 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37633613 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37633660 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 37633902 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37633908 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37634106 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37634209 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37634270 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37634304 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37634319 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37634381 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37634476 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37635004 A C N N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.181818181818182 0.545454545454545 0.272727272727273 10 12 2 6 3 3 37635116 G C N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 3 37635165 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 37635232 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 37635288 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 37635332 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 37635406 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 3 37635890 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37636046 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 37636089 A G N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.0833333333333333 0.583333333333333 0.333333333333333 9 15 1 7 4 3 37636165 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37636172 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37636286 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37636309 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37636418 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37636636 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37636747 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 37636845 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37636876 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37637025 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37637174 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37637376 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37637501 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37637696 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 37637777 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 37637936 G T N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 3 37637999 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 37638384 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37638432 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37638587 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37638672 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37638681 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 37638780 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 37638852 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 37638920 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 37639515 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37639534 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37639575 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37639631 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 37639756 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 37639779 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 37639842 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 37639884 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37639925 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 37639993 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 37640233 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 37640278 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 37640323 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 37640347 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37640686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37640733 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 37640786 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37640821 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 37640825 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 37640843 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 37640886 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 37640968 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 37641017 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 37641189 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37641190 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37641597 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37641604 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37641729 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37641781 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37641825 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 37641828 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 37641900 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37641924 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37641945 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37641998 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37642184 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37642211 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37642473 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37642707 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 37642922 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 37643035 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37643212 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 37643234 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 37643304 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37643386 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 37643432 C T N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 37643479 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 37643752 A T N N 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 3 37643827 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 37643912 A C N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.153846153846154 0.846153846153846 0 15 11 2 11 0 3 37643922 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 37643925 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 37643933 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 37643967 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 37644033 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 37644484 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37644527 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37644638 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37644820 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37644834 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37645185 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37645210 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 37645258 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 37645313 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 37645347 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37645570 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37645614 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 37645698 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37645804 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 37645954 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37646113 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37646280 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37646329 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37646432 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37646478 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37646509 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 37646729 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 37646874 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37646953 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37646988 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37647468 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37647638 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37647682 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37647729 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37647847 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37647864 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37647869 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 37647892 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37648318 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 37648327 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 37648362 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37648511 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37648522 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 37648532 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37648582 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37648706 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37648798 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 37648805 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 37648810 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 37649001 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37649020 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37649206 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 37649218 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 37649292 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37649303 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37649481 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 37649514 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 37649526 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 37649795 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 37649883 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 37649968 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37650056 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 37650070 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 37650198 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 37650220 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37650251 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37650258 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37650370 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 37650386 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37650451 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37650706 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37650729 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37650866 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37650945 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37651009 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37651363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37651442 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37651600 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37651654 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37652058 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37652091 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 37652104 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37652163 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37652164 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37652572 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37652978 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37653063 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37653083 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37653406 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37653415 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37653544 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37653628 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37653634 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37654075 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 37654300 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 37654348 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37654437 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 37654448 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 37654552 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 37654589 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 37654596 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37655073 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37655200 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 37655294 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37655366 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37655384 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37655433 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 37655524 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37655540 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37655592 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 37655701 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37655714 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.105263157894737 0.894736842105263 0 21 17 2 17 0 3 37655736 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37655739 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37655767 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37655875 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37655883 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37655946 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 37656024 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37656109 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 37656652 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 37656669 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 37656750 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 37656783 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37656858 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37656974 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 37656981 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 37657012 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 37657017 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37657104 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 37657328 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 37657340 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 37657556 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37657564 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 37657569 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37657715 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 37657728 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 37657787 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37658149 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 37658211 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37658349 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 37658735 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 37659181 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 37659754 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37660122 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37660488 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 37660623 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 37660640 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 37660664 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 37660674 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 37660685 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 37660795 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 37661580 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 37661869 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 37661896 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 37661924 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37662007 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 37662539 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 37662836 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 37663216 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 37663217 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 37663257 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 37663334 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37663389 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 37663736 T G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 37663908 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 37664289 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37664316 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37664371 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 37664565 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 37664566 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 37664580 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 37664690 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 37664854 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37665265 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37665387 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 37665490 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37665505 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 37665568 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 37665569 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 37665600 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37665704 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37665863 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 37665921 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37666022 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 37666272 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37666365 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37666528 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 37666562 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 37666645 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37666877 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37666915 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37667142 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37667317 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 37667498 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37667972 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 37668527 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 37668715 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37668753 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37668881 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 37668988 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 37669072 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 37669383 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 37669423 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37669439 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 37669725 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 37669808 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 37670041 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 37670338 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 37670375 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 37670524 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 37670529 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 37670584 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 37670625 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 37670669 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37670778 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 37670984 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 37671054 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 37671162 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 37671296 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 37672093 C T N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 3 37672315 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 37672347 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37672363 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 37672729 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 37672777 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37672858 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37672884 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37673211 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 37673417 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37673462 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 37673484 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 37673809 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 37673973 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 37674170 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37674872 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 37676134 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 37676162 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 37676212 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 37676293 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37676458 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 37676596 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 37677513 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 37677693 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37677783 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 37677787 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 37677934 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 37677950 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 37678119 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37678243 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 37678269 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 37678324 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 37678330 C G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 37678438 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 37678773 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 37678809 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 37678828 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 37678934 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 37679019 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 37679109 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37679316 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 37679332 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37679340 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37679354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37679846 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37680097 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 37680556 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 37680640 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 37680950 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37681020 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 37681642 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 37681727 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 37681752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37681853 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37682436 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 37682517 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 37682710 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 37682738 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37683094 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 37683120 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 37683144 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 37683157 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 37684117 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37684123 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 37684211 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 37684247 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37684300 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 37684401 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 37684473 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 37684484 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 37684563 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 37684689 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37684705 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37684972 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37685246 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37685936 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 37686272 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 37687165 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37687194 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 37687205 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37687254 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 37687452 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 37687607 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 37687679 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37687686 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37687836 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 37688019 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 37688180 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37688204 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37688208 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37688220 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 37688245 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37688246 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 37688257 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37688315 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37688457 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37688519 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 37688583 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 37688693 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 37688721 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37688753 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 37688793 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 37688863 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 37688947 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37689143 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37689581 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37689887 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 37689893 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 37689932 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 37690086 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 37690088 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37690266 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37690319 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 37690344 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 37690802 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 37690812 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 37691471 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 37691478 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 37691497 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 37691515 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 37691546 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 37691847 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 37691848 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 37691998 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 37692081 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 37692177 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 37692209 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 37692576 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 37692790 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 37692876 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 37692897 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 37692941 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 37693049 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 37693101 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 37693215 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37693511 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 37694062 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 37695189 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37695392 G T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 37695498 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 37695564 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 37695622 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 37695687 G A N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 3 37696091 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 37696115 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 37696117 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 37696144 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 37696217 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 37696418 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 37696678 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 37696773 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 37697085 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 37697278 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 37697321 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 37697410 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 37697483 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 37698017 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 37698087 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 37698804 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 37698890 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37698944 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37699019 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 37699325 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 37699453 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37699650 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 37699798 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 37701080 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 37701092 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37701103 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 37701212 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 37701288 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37701493 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37701517 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37701789 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 37701840 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 37702049 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 37702097 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 37702345 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 37702376 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 37702449 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 37702529 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 37702596 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 37702617 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 37702661 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 3 37702762 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 37703188 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 37704488 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 37705387 A T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 37705522 T A N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 12 16 2 8 4 3 37706468 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 37707454 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 37707856 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37708102 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 37708331 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37708993 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37709169 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37709392 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 37709509 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 37709850 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37709955 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 37710239 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 37710982 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37711035 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 37711160 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 37711459 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 37711593 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 37711685 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 37712715 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37712863 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37713973 G C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 37714033 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37714153 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37714653 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 37714888 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 37715021 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37715078 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 37715193 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37715442 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 37716227 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 37716482 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 37716731 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 37716926 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37717070 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37717117 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 37717232 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37717296 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37717308 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 37717447 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 3 37717982 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37718000 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 37718001 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 37718090 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 37718119 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 37718132 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37718289 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37718528 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37718563 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37718621 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 37718821 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37719135 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 37719234 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37719617 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 37719787 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 37720007 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37720278 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 37720394 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 37720569 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 37720608 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 37720698 T G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 37720774 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 37720799 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37720829 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 37720833 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 37720894 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37720902 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37721107 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 37721139 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 37721182 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 37721220 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 37721222 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 37721244 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 37721291 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 37721311 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 37721362 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 37721379 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 37721467 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37721468 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37721687 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 37721869 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 37722013 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 37722072 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 37722113 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 37722162 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37722165 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37722264 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 37722313 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 37722481 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37722731 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 37722792 G A N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.333333333333333 0.25 0.416666666666667 11 13 4 3 5 3 37722800 C G N N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.454545454545455 0.181818181818182 0.363636363636364 12 10 5 2 4 3 37722994 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 37723232 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 37723244 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 37723261 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37723471 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 37723515 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37723553 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37723554 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 37723573 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 37723583 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37723620 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37723702 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37723721 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37723768 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37723769 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 37723916 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37723955 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37724141 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37724165 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37724207 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37724430 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37724484 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 37724768 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37724770 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37724780 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37724849 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37724922 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37725100 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 37725201 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 37725243 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37725246 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37725289 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37725313 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37725417 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37725441 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37725467 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37725530 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 37726030 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37726059 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37726162 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37726191 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 37726274 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37726387 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 37726512 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 37726650 A G N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 37726708 T C N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.0833333333333333 0.583333333333333 0.333333333333333 9 15 1 7 4 3 37726877 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 37726919 T A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 37727060 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 37727160 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37727165 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37727199 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37727824 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37727900 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37727901 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37727912 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37728181 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37728326 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37728334 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 37728359 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37728412 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37728423 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37728561 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37728562 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37728628 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37728636 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37728657 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37728665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37728691 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37728717 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37728763 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37728915 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37728923 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37728946 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37728978 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37728985 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37729032 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37729129 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37729151 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37729206 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37729209 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37729264 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37729301 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37729342 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37729350 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37729408 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37729473 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37729510 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 37729511 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 37729527 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 37729548 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37729583 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37729593 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37729609 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 37729711 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 37729763 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 37729791 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 37729825 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 37729840 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 37730011 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37730027 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37730254 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37730881 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37731031 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 37731164 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 37731473 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37731871 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 37731876 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 37731893 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 37731918 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 37732405 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 37732622 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 37732850 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 37733167 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37733209 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37733273 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37733280 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37733531 T C Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 37733615 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 37733790 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 37733897 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 37734058 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37734065 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 37734272 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37734769 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 37734775 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 37734794 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37734798 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37734854 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 37734863 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 37734999 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37735001 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37735044 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37735077 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37735258 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37735441 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 37735466 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 37735471 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37735621 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37735629 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 37735675 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 37735815 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 37735906 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37736048 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 37736055 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 37736067 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 37736313 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 37736530 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 37736601 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 37736617 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 37736899 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 37736938 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 37737031 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 37737042 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 37737055 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 37737298 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 37737412 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 37737632 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 37737794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37737923 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 37738371 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 37738595 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 37738978 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 37739475 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 37739526 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 37739623 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37739674 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 37739953 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37740427 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37740431 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37740456 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 37740518 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37740637 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37740725 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37740772 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37740821 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37740924 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37740975 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37741040 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 37741071 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 37741282 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 37741533 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 37741762 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 37741773 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 37741807 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 37741836 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 37741925 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37741961 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 37742165 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37742166 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37742292 T G N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 3 37742306 T G N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 37742310 G T N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 3 37742373 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 37742628 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 37742804 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 37743060 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 37743089 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 37743325 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 37743399 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 37743511 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 37743589 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 37743897 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37744053 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 37744752 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37745965 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37745977 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37746025 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 37747134 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 37747467 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37747772 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 37747784 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 37747865 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 37748069 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37748136 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37748237 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37748268 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 37748290 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37748343 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37748352 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37748503 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37748582 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 37748807 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 37748871 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37749236 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 37749436 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 37749588 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37749927 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 37750173 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 37750207 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 37750216 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 37750234 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 37750343 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37750349 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 37750377 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 37750402 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 37750446 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 37750492 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37750622 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37750635 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 37750658 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 37750779 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37750842 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37751063 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37751133 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37751212 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 37751219 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 37751247 A C N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 37751267 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37751283 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37751284 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37751346 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37751884 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37751997 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 37752104 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 37752108 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 37752321 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 37752445 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 37752655 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37752656 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 37752698 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 37752707 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 37752817 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 37752923 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 37753052 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 37753085 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 37753110 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 37753138 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37753150 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 37753159 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37753187 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 37753249 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 37753362 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 37753455 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 37753488 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37753626 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37753730 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 37753806 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 37753933 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 3 37754092 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 37754186 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 37754430 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 37754478 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 37754512 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 37754560 T A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 37754648 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 37754697 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37754730 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37754811 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37754814 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 37754873 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37754980 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37755057 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37755063 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 37755242 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37755273 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 37755274 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 37755284 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 37755288 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 37755352 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 37755374 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 37755375 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 37755413 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 37755429 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37755937 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37755991 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 37756225 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37756293 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37756297 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 37756352 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 37756367 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 37756536 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37756569 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 37756727 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37756761 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37756800 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37757023 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 37757113 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37757341 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 37757423 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 37757454 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 37757646 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37757989 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37758133 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37758364 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 37758387 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 37758634 A G N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 3 37758803 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 37759408 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 37759448 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 3 37759468 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 37759546 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37759626 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 37759822 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 37759826 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37759970 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 37760229 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37760259 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37760432 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 37760548 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 37760643 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 37760902 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 37761201 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 37761229 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 37761242 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 37761426 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 37761435 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37761519 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 37761681 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 37761877 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 37761936 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 37761938 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 37762062 C T N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 37762129 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 37762279 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 37762351 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37762376 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37762525 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37762534 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37762537 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37762776 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37762812 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 37763012 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 37763038 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 37763435 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 37763548 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 37763650 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 37763792 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 37763937 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 37763980 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 37764174 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37764266 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 37764306 G T Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 37764403 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37764423 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37764485 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37764515 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37764571 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37764578 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37764635 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 37764703 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37765061 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 37765243 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 37765274 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 37765656 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37765686 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 37765755 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37765818 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 37765831 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37765859 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 37765922 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 37765974 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37765988 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37766008 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 37766053 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37766065 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 37766121 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37766169 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 37766228 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37766251 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37766325 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37766386 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 37766387 G A Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 37766401 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37766411 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 37766496 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37766743 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37766871 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37766934 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37767299 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37767306 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37767622 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 37767664 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 37767713 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37767725 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 37767760 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 37767877 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37768455 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 37768549 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37768992 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 3 37769216 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 37769248 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.125 0.8125 0.0625 17 15 2 13 1 3 37769795 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37769903 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 37770175 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37770412 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37770436 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37770448 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 37770453 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37770618 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37770807 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37771005 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37771027 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 37771168 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 37771225 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 37771258 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 37771697 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 37771731 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 37771750 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 37771770 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 37771810 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37771899 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37771923 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 37772037 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37772181 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37772191 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37772279 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 37772973 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37773032 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 37773058 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 3 37773222 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 3 37773239 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 37773283 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 37773535 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 37773571 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 37773589 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 37773763 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37773782 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 37773870 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37773930 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 37773996 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 37774035 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37774053 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 37775147 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 37775381 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 37775499 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37775557 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37775857 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 37775858 A G N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.153846153846154 0.538461538461538 0.307692307692308 11 15 2 7 4 3 37775963 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 37776204 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 37776258 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 37776297 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 37776322 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 37776527 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37776746 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 37776875 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37776885 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 37776889 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 37776913 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 37776938 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 37776985 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 37777128 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 37777160 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37777571 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 37777576 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37777591 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 37777663 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 37779309 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 37779491 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37779654 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37779682 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 37779690 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 37779810 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37779941 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37779962 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 37780064 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37780289 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37780349 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37780354 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37780385 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 37780447 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37780533 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 37780552 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37780568 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37780641 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37780703 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 37780751 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37780761 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 37780805 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 37780821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37780855 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37780902 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 37780932 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37781057 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37781061 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 37781086 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 37781120 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 37781129 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 37781163 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 37781252 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 37781345 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 37781427 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37781575 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 37781612 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 37781623 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 37782259 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37782834 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37782835 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37782896 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37782920 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 37782943 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 37782948 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 37783184 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 37784012 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 37784828 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37785095 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37785185 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37785313 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 37785391 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37785883 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 37786350 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37786542 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 37786566 A T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 37786598 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 37786784 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 37786800 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 37786821 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 37786918 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 37787060 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 37787088 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 37787090 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 37787099 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 37787174 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 37787324 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 37787347 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 37787390 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 37787409 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 37787439 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 37787627 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 37787733 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 37788091 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 37788176 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 37788226 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 37788279 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37788442 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 37788453 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 37788617 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 37788646 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 37788647 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37788758 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 37788816 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 37788918 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 37789167 A C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 37789191 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 37789201 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 37789281 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 37789787 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 37790421 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 37790497 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 37790523 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 37790538 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 37790647 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37790888 A T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 37791264 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 37791621 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37793873 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37794313 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 37794797 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 37795143 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 37795193 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 37795365 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 37795866 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37796639 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 37797014 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 37797198 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 37797379 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 37797768 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37797813 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37798304 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 37798342 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 37798356 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 37798365 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 37798731 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 37798893 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 37799343 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 37799796 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 37799841 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37799881 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37799972 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 37799985 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.105263157894737 0.842105263157895 0.0526315789473684 20 18 2 16 1 3 37800013 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 37800099 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37800278 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37800279 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 37800548 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 37800724 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 37800773 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 37801019 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 37801256 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 37801318 A T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 3 37801398 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 37801457 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 37801490 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 37801786 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 37801843 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 37802136 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37802148 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37802163 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37802173 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 37802271 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 37802280 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 37802398 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37802744 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37802842 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37803187 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37803243 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 37803295 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 37803356 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 37803377 G T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 37803382 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 37803489 C T N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 3 37804281 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 37804382 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37805027 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 37805056 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 37805107 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 37805542 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 37805640 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 37805727 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37806502 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 37806649 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37807520 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 37807560 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 37809740 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37810165 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37810602 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37810715 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 37811212 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37811390 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37811918 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37812063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37812587 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37812596 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 37812695 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37812961 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37813012 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37813466 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37814069 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37814539 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37814567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37814648 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37814650 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 37814659 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37814681 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37814811 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37814957 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37815121 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 37815146 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37815204 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 37815262 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 37815343 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37816688 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 37817001 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37817005 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37817551 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37817640 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37817842 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 37817904 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37817934 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37818021 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37818197 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37818316 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37818572 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37818623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37819040 A C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 37819132 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 37819140 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 37819773 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37819874 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37819918 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37820064 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37820160 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37820284 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37820327 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37820470 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37820529 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37820602 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37820794 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 37820837 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 37820844 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 37820919 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 37820950 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 37821123 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 37821139 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37821625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37821816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37821817 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 37821984 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 37822059 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 37822169 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 37822219 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 37822260 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37822279 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 37822312 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 37822346 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 37822737 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 37822856 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 37823117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37823193 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 37823297 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37823493 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 37823541 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37824204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37824283 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37825021 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 37825142 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 37825266 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37825320 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37825343 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37825359 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37825568 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37825647 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37825653 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37825771 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37825882 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37826126 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37826147 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37826362 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37826603 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37826942 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37827065 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37827136 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 37827139 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 37827216 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37827267 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37827278 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37827300 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 37827423 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37827458 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37827461 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37827926 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37828150 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37828170 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37828836 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 37828899 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37828973 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37828996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37829127 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37829145 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37829213 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37829250 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37829319 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37829353 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37830509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37830528 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37831459 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 37831941 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 37832147 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 37832390 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37833146 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37833200 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37833244 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37833334 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 37833384 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37833465 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37834251 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37834347 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37834967 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37835016 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37835121 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37835168 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37835815 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37836277 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 37836693 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37836718 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 37836785 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37836966 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37836990 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 37837639 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 37837682 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 37837872 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37837903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37837905 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37838000 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 37838247 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37838268 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37838283 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 37838409 C G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 37838539 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 37838674 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 3 37838694 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 37838949 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37838972 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 37839022 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37839053 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37839157 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37839244 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37839353 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37839376 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 37839429 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37839636 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37839750 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 37839780 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 37839921 A T Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 37840114 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 37840193 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 37840195 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 37840415 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 3 37840582 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 3 37840616 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 3 37840779 T C Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 37841036 T C N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 3 37841211 C T Y Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 3 37841263 C T Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 3 37841323 G A Y Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 3 37841333 G A Y Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 3 37841383 A G Y Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 3 37841531 A C N N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 3 37841570 T C N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 3 37841591 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 3 37841781 A G N Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 3 37841882 A C N N 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 37842924 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 37843163 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 3 37843204 C T Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 37843352 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 3 37843393 C A N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 3 37843397 A C N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 3 37843540 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 37843600 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 3 37843987 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37844046 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 37844080 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 37844092 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 37844149 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 37844181 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37844183 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37844461 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37844669 A T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 37845091 G A Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 37845394 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 37845975 T A Y N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 3 37846361 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 37846419 A C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 37846451 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 37846486 G T Y N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 37846498 G A Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 37846511 A G Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 37847321 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 37847845 C T Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 37848177 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 37848435 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 37848720 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 37849455 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37849457 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37849493 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 37849501 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 37849689 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37849815 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 37849875 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37849879 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37850044 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 37850076 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37850475 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37850588 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37850684 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 37850916 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37850940 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37851227 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 37851301 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37851466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37851938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37852139 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37852403 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37852530 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37852686 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37852767 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 37852770 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 37852813 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 37852930 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37853032 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37853199 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 37854123 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37854421 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37854636 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37854849 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37855011 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37855374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37855481 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37855615 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37855980 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37856155 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 37856163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37856328 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37856346 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37856352 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 37856385 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37856390 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37856403 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 37856527 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37856585 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37856687 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37856772 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 37856872 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37857361 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37857504 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37857684 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37858355 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37858804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37859300 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37859499 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37860109 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 37860425 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 37861193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37861552 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37861556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37861631 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37861727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37861787 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37861974 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37862113 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37862178 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37862210 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37862227 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37862358 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37862604 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37862691 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37863497 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37863670 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37863725 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37863855 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37863870 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37863988 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37864008 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37864191 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37864253 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37864267 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37864324 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 37864492 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37864551 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37864563 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37864617 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37864664 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 37864685 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 37864885 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37864907 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37864969 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37865085 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37866298 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37867281 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37867379 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 37867665 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37867790 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 37868427 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37868479 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37868515 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 37868560 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 37868598 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 37868740 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 37868787 T G Y N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 37868991 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37869035 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 37869046 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 37869147 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37869166 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 37869180 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37869208 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 37869215 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 37869223 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 37869257 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 37869269 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 37869441 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37869497 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 37869582 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37869622 A T Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 37869662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37869702 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37869797 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37869799 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37869838 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37869881 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37869889 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 37870057 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 37870064 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 37870077 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 37870098 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 37870207 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 37870241 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 37870548 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 37870642 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37870645 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37870759 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37870953 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 37870987 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 37871260 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 37871299 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 37871425 G A N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 3 37871574 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 37871842 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 37872098 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 37873659 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 37873797 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 37873808 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 37873817 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37873888 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 37873895 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37874649 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 37874983 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37875002 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 37875096 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37875110 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 37875316 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37875325 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37875371 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 37875447 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37875597 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 37875742 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 37875876 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 37876034 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 37876113 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 37876159 A T N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.0769230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 9 17 1 7 5 3 37876171 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 37876246 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 37876385 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37876456 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 37876710 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37876807 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37876810 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37876864 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 37876909 C A N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.133333333333333 0.8 0.0666666666666667 16 14 2 12 1 3 37877155 G C N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 3 37877172 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 37877176 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 37877247 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 37877293 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 37877811 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37878252 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 37878263 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 37878617 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 37878648 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37878654 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 37878676 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37878905 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 37878928 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 37879023 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 37879083 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37879134 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 37879397 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37879398 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 37879423 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 37879479 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 37879634 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 37879704 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 37879748 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 37879823 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 37879863 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 37879959 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 37879991 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 37880004 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 37880031 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37880319 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 37880352 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 37880447 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 37880461 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 37880506 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 37881041 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37881504 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 37881529 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 37881910 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37881957 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37882045 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 37882075 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37882229 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 37882239 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 37882362 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37882379 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 37882746 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37883917 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37884207 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 37884209 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37884296 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 37884419 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37884568 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 37884622 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37884778 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 37884779 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 37884813 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 37884985 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 37885197 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37885527 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 37885666 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37885703 A G Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 37885704 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 37885747 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37885777 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 37885809 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 37885828 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37885855 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37885870 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37886167 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37886699 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37886761 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37886782 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37887012 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37887018 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 37887042 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 37887813 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 37887875 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 37889061 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37889232 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 37890555 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 37890568 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37890828 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 37891000 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 3 37891055 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 37891420 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 37891467 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37891838 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 37891852 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 37892010 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 37892130 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 37892139 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 37892252 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 37892305 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 37892534 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37892537 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 37892574 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 37892575 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 37892683 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 37892714 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 37892798 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 37894030 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 37894110 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 37894402 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37894769 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 37894868 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37894985 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 37895378 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 37895425 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37896244 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37896407 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37896428 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 37896437 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 37896503 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37896528 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37896753 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37896888 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 37897128 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37897278 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 37897416 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 37897561 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 37897815 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 37898161 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37898227 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37898230 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37898684 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37898716 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37898730 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37899757 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37899790 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37899889 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 37899904 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 37899906 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 37899993 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37900004 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37900077 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 37900098 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37900130 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37900323 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 37900330 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 37901083 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37901282 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37901284 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 37901345 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 37901481 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37901539 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37901557 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37901578 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37901582 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37901597 A T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 37901628 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37901660 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37901774 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37901972 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37901982 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37902029 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37902104 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 37902580 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 37902639 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 37902787 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37902791 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37902850 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37902954 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37903170 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37903281 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37903284 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37904376 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37904500 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37905156 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 37905161 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 37905530 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37905723 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 37906235 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37907540 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 37908476 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37908612 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 37908681 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 37909520 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 37909587 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37909694 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 37910306 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37910372 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37910838 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37910844 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37910937 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37911034 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37911177 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37911178 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 37911253 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37911314 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37911457 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37911497 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37911508 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37911558 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 37911829 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 37911841 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37912884 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37912886 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37913322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37913970 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37914734 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37915486 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37915518 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37915744 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 3 37916271 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37916379 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37916668 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37917547 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 37919059 A C N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 3 37923009 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 2 4 1 0 2 3 37924001 T G Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 37924512 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37928600 T C Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 37929232 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 37929312 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37929350 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37929442 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37929452 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37929854 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37930082 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37930383 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37930780 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 37931049 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37931221 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 37931684 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 37932790 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37933187 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37933552 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37933625 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 37934755 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37935121 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37935128 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 37935631 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 37936273 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37936295 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37936499 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37936632 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 37936647 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 37936790 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 37936800 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 37936851 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 37936918 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 37936947 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 37936984 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 37936997 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 37937003 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 37937026 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 37937100 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 37937164 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 37938870 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 37938917 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 37938921 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 37938966 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 37939065 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 37939138 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 37939204 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 37939372 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 37939608 C T N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 3 37939924 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 37939964 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 37940415 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37940455 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37940771 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 37940929 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37940930 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 37940948 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 37940956 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37940972 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 37940993 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 37941083 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 37941112 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 37941204 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37941220 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37941298 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 37941312 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 37941581 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 37941626 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 37942020 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 37942168 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 37942265 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 37942289 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 37942416 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 37942417 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 37942503 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 37942696 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 37942801 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 37942836 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 37942877 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 37942995 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 37943073 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 37943107 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 37943267 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 37943332 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 37943641 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 37943844 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 37944013 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 37944149 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 37944265 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37944984 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 37945023 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 37945289 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 37945454 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 37945534 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 37946744 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 37946758 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 37946776 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 37946852 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37946879 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 37946880 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 37947025 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37947045 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 37947046 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 37947090 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37947094 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37947478 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 37947545 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 37947635 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 37947773 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 37947796 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37947817 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 37947846 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 37947958 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 37948027 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37948053 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 37948308 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 37948350 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 37948735 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37948846 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37948938 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37949110 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37949223 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37949463 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37949865 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 37950228 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 37950254 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 37950292 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 37950458 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37950615 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 37950676 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 37950697 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 37950698 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 37950765 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 37950931 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 37950972 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 37951444 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 37951486 G A Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 37951492 C A Y N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 37951514 G A Y Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 37951560 A G N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 37951608 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 37951619 C T N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 37951626 C G N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 37951773 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 37951775 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 37952045 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37952071 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37952134 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 37952877 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37952910 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 37953138 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 37953297 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37953325 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37953349 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37953377 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37953442 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37953530 T C Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37953564 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37953580 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37953606 G T Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37953632 A C Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37953895 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37954040 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37954078 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37954160 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 37954179 C T Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 37954197 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 37954229 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37954698 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 37954728 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 37954844 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37954884 C A Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37955153 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37955509 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 37955727 A G Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37955735 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37955794 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37955851 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37955892 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37955903 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37955910 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37955953 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37956126 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37956429 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37956559 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 37956567 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 37956676 G A Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 37956735 G T N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 3 37957065 A G Y Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 7 13 1 5 4 3 37957100 C A Y N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0 0.545454545454545 0.454545454545455 6 16 0 6 5 3 37957106 A G Y Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 3 37957127 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 3 37957220 T C Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 37957256 T A Y N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 37957351 A T Y N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 3 37957513 C T Y Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 3 37957558 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 37957697 G A Y Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 3 37957800 G A Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 37957867 C T Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 37957878 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 37957917 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 37958007 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 37958072 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37958189 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 37958327 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 37958360 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37958427 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37958621 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37958721 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37958737 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37958769 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 37959848 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37960086 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 37960115 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37960353 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37960363 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 37960408 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 37960484 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 37960517 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 37960581 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37960618 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37960689 A G Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37960754 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37960764 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37960810 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37960815 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37960906 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37961135 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37961203 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 37961223 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37961229 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37961239 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37961260 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37961444 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37961451 A T Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 37961483 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 37961489 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 37961535 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 37961557 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37961571 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 37962142 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 37962160 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 37962168 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37962238 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 37962264 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 37962274 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 37962306 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 37962380 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 37962401 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 37962441 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 37962643 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37962735 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37962855 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 37962879 T A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 37962902 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 37962974 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 37963229 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 37963289 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37963332 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 37963376 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 37963418 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 37963434 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 37963445 T G N N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 3 37963446 T G N N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 3 37963583 A T N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 37963594 G A N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 37963609 G T N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 37963787 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 37963843 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 37963856 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 37963880 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 37963901 G C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 37964008 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 37964032 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 37964111 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 37964121 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37964176 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37964220 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37964260 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37964293 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 37964377 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 37964449 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 37964464 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 37964506 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 37964543 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37964600 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 37964624 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 37964654 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37964667 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 37964840 T A N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 37965514 C A N N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 37965525 A T N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 37965552 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 37965646 G C N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 37965667 C G N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 37965685 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 37965761 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 37965779 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 37965783 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 37965808 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 37965824 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 37965874 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37965922 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 37966009 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 37966061 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 37966102 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37966103 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 37966131 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 37966187 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37966323 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37966405 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 37966427 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 37966508 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37966568 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37966669 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 37966681 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37966749 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37966761 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37966762 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37966788 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37966793 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37966824 A C Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37966880 A C Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37966933 A T Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37966967 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37967049 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37967053 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37967103 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 37967176 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37967273 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 37967287 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 37967345 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37967400 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 37967445 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37967596 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37967651 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37967691 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37967834 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37967858 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37967859 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37967921 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37967946 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37968198 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 37968260 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 37968277 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37968313 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37968432 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37968694 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37968864 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 37969031 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37969178 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37969233 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37969270 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37969304 C T Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 37969338 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37969359 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 37969411 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37969506 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 37969734 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 37969735 G A Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 37969762 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37969822 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37969833 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37969835 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37969876 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37969889 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37969992 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37970061 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37970101 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37970165 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37970264 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37970342 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37970359 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37970387 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37970728 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37970921 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37971019 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37971020 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 37971177 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 37971190 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37971241 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37971367 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37971412 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37971429 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37971576 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 37971591 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37971647 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37971685 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37971703 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37971767 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 37971817 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37971856 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37971894 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37971905 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37971973 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37971992 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37972037 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37972043 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37972222 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 37972244 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37972276 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37972286 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37972305 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37972418 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37972801 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37972992 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37973163 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37973610 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37973884 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37973983 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37974027 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37974036 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37974182 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37974525 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37974627 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 37974646 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 37974660 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 37974779 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37974801 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 37974814 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37974835 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37974898 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37974911 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37974916 C A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37974979 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37975025 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37975080 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37975167 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37975199 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37975204 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37975234 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37975292 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 37975395 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37975516 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37975716 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37975783 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37975808 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37975992 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37976229 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 37976234 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 37976347 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 37976440 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 37976640 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 37977144 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 37977203 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 37977208 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37977394 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37977694 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 37977758 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 37977885 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 37977910 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 37977940 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 37978199 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37978337 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37978343 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37978493 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37978587 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37978856 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37978945 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37978957 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37979252 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37979275 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 37979363 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37979706 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37979783 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 37980100 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37980138 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37980173 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37980302 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37980391 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37980772 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37980941 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 37980970 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 37980997 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 37980998 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 37981170 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37981788 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37981824 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37981842 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37981878 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 37982054 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37982145 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 37982147 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 37982171 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 37982248 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37982274 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37982460 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 37982493 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37982557 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37982583 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37982612 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 37982627 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37982654 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37982935 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 37982940 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 37983079 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37983133 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37983409 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37983455 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37983487 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 37983505 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 37983506 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37983560 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37983861 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37983959 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37983996 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37984022 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37984029 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 37984206 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37984236 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 37984369 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 37984422 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 37984528 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37984540 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37984986 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37985045 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37985053 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37986589 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37986721 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 37986733 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 37986936 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37987197 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37987204 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37987289 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37987917 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 37988490 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 37988581 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37988611 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37988620 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37988769 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 37988943 G A N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 3 37988977 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 37988978 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 37988995 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 37989074 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37989092 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37989113 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37989192 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37989239 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 37989790 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37989946 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37990743 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37990932 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37991487 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37991618 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37991638 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37991726 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 37991762 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 37991801 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 37991814 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 37992290 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 37992301 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 37992334 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37992502 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 37992690 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37992715 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37992816 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37992968 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37993113 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37993809 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37994013 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37994052 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 37994093 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 37994106 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 37994203 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 37994288 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 37994495 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 37994498 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 37994648 T A Y N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.166666666666667 0.0833333333333333 0.75 5 19 2 1 9 3 37994732 A C Y N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 6 14 2 2 6 3 37994863 A C Y N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 37994945 A G Y Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 37995059 G C Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 37995360 A G Y Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 7 9 2 3 3 3 37996033 C A Y N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 37996605 G T Y N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 3 37996796 T G Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 37996932 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37996952 C G Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 37997008 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37997018 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 37997034 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37997245 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 37997312 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 37997323 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 37997390 T C Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 37997576 T C Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 37997846 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 37997878 T C N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 37998118 A G Y Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 6 6 1 4 1 3 37998208 T G Y N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.166666666666667 0.0833333333333333 0.75 5 19 2 1 9 3 37998474 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37998499 A G Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 37998655 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 37998705 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 37998760 T G Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 37998802 G T Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 37998938 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 38000114 T C N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 6 10 1 4 3 3 38000162 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 38000168 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 38000201 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 38000214 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 38000256 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38000310 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38000396 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38000597 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38000626 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38000666 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 38000759 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38000789 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38000796 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38000874 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 38000984 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38001062 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38001074 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38001134 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38001406 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38001552 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38001701 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 38001800 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 38001807 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 38001839 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 38001847 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 38001964 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 38001995 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 38002176 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38002371 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38002495 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 38002514 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38002580 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38003016 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38003247 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 38003313 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38003413 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 38003691 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38004477 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38004487 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38004569 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38004604 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38004710 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38004828 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38005196 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38005219 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 38005294 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38005310 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38005734 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 38005736 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 38006029 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 38006221 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 38006388 T G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 38006563 A C N N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 3 38006783 A T N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 38006824 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 38006849 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38006874 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38006883 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 38007166 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 38007334 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38007345 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38007355 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38007496 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 38007587 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38007625 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 38007627 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38007747 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38008134 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 38008181 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38008630 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38008815 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 38008860 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 38009115 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 38009166 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38009340 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 38009446 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 38009591 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 38009894 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 38010020 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 38010044 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38010461 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38010478 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 38010546 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 38010575 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 38010724 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38010965 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 38011047 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38011078 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38011085 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38011186 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38011799 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 38012079 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 38012125 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38012659 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 38012861 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 38013086 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38013202 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 38013831 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 38013929 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 38013967 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38013999 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 38014059 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38014318 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38014704 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 38014925 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 38014966 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 38015033 T C N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 38015123 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 38015445 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 38015466 G C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 38015703 A T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 38015790 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38015857 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38015886 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 38015935 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 38016056 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38016269 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38017063 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38017069 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38017128 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38017424 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38017441 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38017485 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38017486 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38017541 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 38017619 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38024587 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 38024638 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38024836 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 38024927 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38025703 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 38026067 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38026104 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38026207 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38026682 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38026702 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 38026709 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 38027004 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 38027173 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 38027256 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38027317 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 38027338 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 38027481 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38027757 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38027765 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 38028108 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 38028714 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 38028772 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 38028958 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 38028966 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 38029012 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 38029046 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 38029181 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 38029517 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 38029568 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 38029606 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 38029629 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 38029642 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 38029650 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 38029655 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 38029664 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 38029683 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 38029708 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 38029762 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38029870 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 38030238 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 38031319 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 38031400 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38031427 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38031509 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38031708 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38032245 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 38033719 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38034464 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 38035152 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 38035245 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 38035715 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 38035760 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 38035791 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 38035856 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 38035872 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 38035905 C A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 38035964 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 38036035 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38036051 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 38036057 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 38036119 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 38036163 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38036222 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38036241 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38036261 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 38036277 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 38036373 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 38036382 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38036555 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 38036731 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 38036734 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 38036820 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 38037038 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 38037273 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 38037461 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38037935 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 38037987 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 38038002 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 38038714 G C Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 38039079 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 38039120 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 38039419 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 38039433 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 38039450 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 38039635 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 38040041 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 38040107 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 38040267 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 38040736 C T Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 38040761 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 38041005 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 38041248 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 38041452 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 38041501 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 38042095 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38043332 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 38044371 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 38044859 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 38044886 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38045003 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 38045146 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 38045573 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 38045684 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 38045687 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 38045879 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 38045986 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 38045994 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 38046140 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 38046143 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38046220 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 38046482 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38046683 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38046820 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 38046868 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38047033 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38047137 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38047151 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38047185 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 38047204 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38047314 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 38047329 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 38047332 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 38047354 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38047447 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 38047530 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 38047705 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 38047724 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 38048100 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 38048528 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 38049168 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 38049257 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38049437 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38049440 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 38049510 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38049511 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38049558 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38049903 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38049942 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38050069 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 38050404 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 38050834 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 38051191 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 38051253 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 38051716 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 38051858 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 38052073 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38052429 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38052551 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38052675 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38052677 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38052772 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38052915 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38052926 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 38052982 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 38053093 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38053141 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 38053207 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38053277 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38053278 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38053319 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38053527 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38053585 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 38053704 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38053782 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 38053805 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 38053867 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38053931 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 38054028 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38054332 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38054391 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38054407 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38054628 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38055012 T G N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 38055119 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38055268 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38055324 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38055329 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38055467 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 38055501 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38055620 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38055812 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 38055998 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 38056167 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38056219 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38056366 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38056445 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 38056566 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38056570 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38056791 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 38056841 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38056953 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38056978 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 38056990 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 38057039 A C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 38057121 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 38057221 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 38057281 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 38057434 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 38057459 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38057742 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 38057768 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 38057803 T G Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38060127 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 38060596 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 38060764 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38060952 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38061048 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38061198 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38061244 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38061288 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38061871 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38061897 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 38062170 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38062608 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 38063262 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38063567 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 38063628 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 38063645 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 38063658 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 38063682 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 38063721 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 38063754 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 38064014 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 38064067 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 38064144 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 38064237 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 38064283 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 38064315 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 38064342 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 38064425 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38064454 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38064472 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 38064575 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 38064796 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 3 38064799 C T Y Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 3 38065045 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 38065116 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 38065268 T G Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 38065277 A C Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 38065311 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 38065312 T G Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 38065428 T A Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 38065528 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 38065551 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 38065599 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 38065650 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 38065657 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 38065685 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 38065699 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 38065903 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 38065907 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 38066135 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 38066150 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 38066184 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 38066196 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 38066214 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 38066273 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 38066424 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 38066516 T C N Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 3 38068592 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38068604 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 38068809 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 38068828 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38069332 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 38069744 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 38069836 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38070119 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38070135 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 38070204 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38070287 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38070460 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 38070470 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 38070483 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 38070950 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 38071093 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 38071231 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38071498 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38071534 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38071551 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38071620 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 38071625 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 38071712 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 38071728 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 38071807 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 38071812 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 38071848 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38071861 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 38072034 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 38072210 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 38072500 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 38072667 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38073025 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 38073810 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38073863 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 38073940 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38074037 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 38074207 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 38074783 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38074848 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38075031 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38075418 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 38075478 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38075616 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38075869 G T N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 3 38075917 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 38076000 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 38076009 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 38076012 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38076125 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 38076175 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38076268 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 38076320 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 38076360 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 38076525 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38076544 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 38076605 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38076611 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38076616 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38076640 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38077407 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38077520 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38077541 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 38077705 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 38077736 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 38077926 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38078051 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38078087 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 38078106 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 38078111 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 38078121 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38078139 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 38078376 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 38078385 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 38078406 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 38078579 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 38078584 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 38078594 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38078667 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38078714 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38078769 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38078799 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 38078832 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 38080626 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38080653 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38080684 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 38080813 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38080920 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38081271 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38081386 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38081544 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 38081553 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 38081575 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 38081605 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38081649 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 38081825 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 38081859 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 38081865 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 38081921 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38082129 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38082184 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38082197 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38082226 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38082233 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38082245 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38082280 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38082289 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38082311 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38082414 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 38082422 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 38082616 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38082713 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38082743 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38082804 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38082833 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38082866 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38082908 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38082910 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38082928 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38082960 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38082965 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38083126 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38083141 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 38083160 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38083192 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38083194 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38083317 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38083340 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38083350 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38083462 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 38083483 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 38083552 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 38083573 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 38083575 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 38083623 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 38083853 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38083858 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38083955 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38083975 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38083984 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 38084067 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38084160 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38084186 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38084283 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38084383 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 38084477 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 38084520 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38084532 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38084562 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38084570 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38084663 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38084731 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38084784 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38084908 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 38085016 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38085082 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 38085096 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 38085112 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 38085160 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38085208 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38085382 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 38085388 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38085424 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 38085446 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 38085667 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38085734 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38086011 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38086112 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38086141 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38086183 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38086648 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38086888 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 38087508 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 38087510 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 38087558 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 38087584 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 38087658 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38087706 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 38087777 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 38087944 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38087967 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38088033 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 38089025 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 38089478 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 38089500 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 38089571 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 38089704 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 38089746 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 38089786 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 38089836 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 38089871 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 38090092 A G Y Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 15 13 1 13 0 3 38090533 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 38091001 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38091026 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38091251 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 38091553 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 38091850 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 38092180 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 38092200 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 38092217 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 38092440 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38093302 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38093365 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 38093427 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38093524 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38093528 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 38093844 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 38093924 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 38093967 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38094061 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38094163 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 38094247 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 38094525 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38094531 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38094693 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 38094782 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38094809 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38094905 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38095108 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 38095141 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38095373 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38095392 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38095421 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 38095857 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38096079 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38096203 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 38096260 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 38096913 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 38097033 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38097035 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38097056 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38097334 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 38097461 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 38098040 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38099206 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 38099225 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38099542 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38100027 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38100062 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38100126 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 38100236 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 38100334 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38100780 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 38100949 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38101010 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38101025 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38101345 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38101786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38101826 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38101981 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38102453 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 38102646 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38102780 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38103139 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38103319 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 38103321 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 38103821 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38104115 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38104323 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 38104329 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38104377 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 38105047 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38105302 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38105510 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 38105526 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 38105840 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 38106127 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 38106447 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 38106515 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38106527 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 38106536 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38106706 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0555555555555556 0.722222222222222 0.222222222222222 15 21 1 13 4 3 38106757 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 38106803 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 38107068 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 38107098 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 38107231 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38107303 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 38107542 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 38107912 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 38107970 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 38108061 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 38108106 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 38109292 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38109425 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 38109429 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 38109505 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38109510 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38109557 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 38109563 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 38109568 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 38109666 T A N N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0 1 0 8 8 0 8 0 3 38117882 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38117893 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38118171 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38118222 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 38118339 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38118353 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38118369 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 38118446 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 38118828 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38119081 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38119286 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38119290 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38119521 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38120217 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38120359 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38121364 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 38121514 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 38122171 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 38122185 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 38122308 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38122345 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38122347 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 38122712 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 38122820 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38123269 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38123349 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 38123423 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 38123465 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38123571 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38123648 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38123857 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 38124019 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 38124660 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 38124720 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38124737 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 38124744 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 38124785 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 38125508 G C Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 38125519 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 38125535 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 38125544 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 38125608 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 38125785 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38126746 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 38126757 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 38127287 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 38127459 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38127611 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38127644 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 38128283 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38128706 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 38128720 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 38128917 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38129031 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38129463 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38129674 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 38129704 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 38129818 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 38129857 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38130085 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 38130653 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 38130761 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 38130794 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 38130800 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 38130822 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 38130942 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 38130951 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38131146 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38131166 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38131475 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 38131543 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38131693 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 38131703 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 38131710 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 38131720 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 38131760 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38132002 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 38132346 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 38133133 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38134211 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 38134537 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38134564 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 38134596 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 38134633 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 38134706 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 38134707 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 38134782 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 38135139 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 38135162 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 38135254 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38135283 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 38135285 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 38135368 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38135557 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 38135565 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 38135644 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38135742 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 38135820 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 4 24 2 0 12 3 38135892 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.2 0.133333333333333 0.666666666666667 8 22 3 2 10 3 38136109 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38136126 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38136131 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 38136141 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 38136147 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38136197 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 38136366 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38136388 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 38136398 C A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.133333333333333 0 0.866666666666667 4 26 2 0 13 3 38136458 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 38136539 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38136548 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 38136584 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 38136585 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 38136601 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 38136798 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 38136827 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.235294117647059 25 9 12 1 4 3 38136852 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 38136866 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 38136871 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 38136883 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 38136889 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 38136918 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 38137052 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 38137095 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38137140 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38137163 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38137263 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 38137271 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 38137474 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 38137782 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 38137791 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 38137811 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 38137822 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 38137930 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 38137945 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 38137969 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 38137997 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 38138026 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 38138167 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 3 38138171 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 3 38138204 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.3125 0.0625 0.625 11 21 5 1 10 3 38138263 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 38138405 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.235294117647059 0.117647058823529 0.647058823529412 10 24 4 2 11 3 38138409 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 38139038 A G N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.272727272727273 0.0909090909090909 0.636363636363636 7 15 3 1 7 3 38139074 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 38139097 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 38139122 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 3 38139297 G C N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.2 0.133333333333333 0.666666666666667 8 22 3 2 10 3 38139339 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.263157894736842 0.0526315789473684 0.684210526315789 11 27 5 1 13 3 38139356 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.277777777777778 0.0555555555555556 0.666666666666667 11 25 5 1 12 3 38139400 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.333333333333333 0.0666666666666667 0.6 11 19 5 1 9 3 38139515 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.285714285714286 0.0714285714285714 0.642857142857143 9 19 4 1 9 3 38139639 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 38139781 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 38139813 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 38140029 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 38140152 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 3 38140220 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 38140253 G T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.294117647058824 0.117647058823529 0.588235294117647 12 22 5 2 10 3 38140289 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 3 38140319 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 3 38140609 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 38140640 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 38140662 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 38140712 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 3 38141050 A T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.294117647058824 0.117647058823529 0.588235294117647 12 22 5 2 10 3 38141312 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 38141354 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 3 38141458 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 38141485 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 38141746 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 38141747 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 38142138 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 38142204 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 38142205 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 38142225 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 38142236 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 38142243 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 38142261 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 38142296 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 38142302 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 38142318 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 38142319 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 38142334 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 38142348 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 38142366 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 38142397 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 38142456 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 38142467 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 38142493 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 38142507 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 38142634 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 3 38142678 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 38142696 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 38142728 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 38142759 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 38142868 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 38142885 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38143080 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 38143125 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 38143196 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38143206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38143265 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 38143268 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 3 38143329 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 38143377 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 38143435 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 38143447 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 38143537 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 38143544 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 38143571 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 38143598 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 38143672 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.294117647058824 0.0588235294117647 0.647058823529412 11 23 5 1 11 3 38143738 C T N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.214285714285714 0.142857142857143 0.642857142857143 8 20 3 2 9 3 38144013 C T N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.272727272727273 0.0909090909090909 0.636363636363636 7 15 3 1 7 3 38144045 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 8 16 4 0 8 3 38144069 A G N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.230769230769231 0.0769230769230769 0.692307692307692 7 19 3 1 9 3 38144102 T A N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 3 38144184 C A N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 3 38144247 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 3 38144259 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 3 38144264 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 3 38144280 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.235294117647059 0.117647058823529 0.647058823529412 10 24 4 2 11 3 38144305 T G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.294117647058824 0.117647058823529 0.588235294117647 12 22 5 2 10 3 38144391 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 38144407 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 38144481 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38144510 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 38144535 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 38144629 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 38144635 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 38144656 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 3 38144725 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 3 38144771 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 3 38144809 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 38144841 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 38144910 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 3 38144988 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 38144996 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38145114 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 3 38145142 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 38146323 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38146414 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38146538 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38146837 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 3 38147080 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 38147408 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38147409 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 38147448 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38147515 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 38147544 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38147583 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 38148147 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38148310 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 38148315 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38148626 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 38148915 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 38149562 C A Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 38149621 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38150094 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 38150189 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38150234 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38150268 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 38150273 T C Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 38150293 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38150304 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 38150316 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38150332 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 38150409 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 38150443 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 38150447 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38150551 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38150561 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38150568 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 38150576 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38150590 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38150867 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 38150894 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38151350 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38151492 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 38151599 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38151624 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 38151835 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 38151856 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38151909 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 38151989 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 38152086 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 38152115 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 38152155 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38152179 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 38152353 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38152359 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 38152391 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38152434 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38152508 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38152548 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38152751 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 38152835 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 38152841 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 38152867 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 38153196 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38153228 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38153282 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 38153385 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38153395 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 38153482 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 38153504 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 38153652 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38153668 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38153671 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38153711 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 38153771 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 38153936 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38154447 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38154603 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38154623 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 38154640 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 38154785 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 38154797 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 38154833 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 38154875 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 38154994 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 38155102 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 38155119 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 38155187 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 38155196 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 38155217 C G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 38155248 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 38155268 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 38155480 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 38155515 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 38155618 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 38155795 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38155829 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 38155841 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38155870 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 38155950 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 38156012 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 38156319 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 38156509 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 38156567 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 38156681 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38156779 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38156797 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 38156956 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38156987 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 38157005 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 38157014 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 38157038 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38157060 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 38157169 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 38157237 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38157248 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38157272 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 3 38157630 A G N Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 8 8 3 2 3 3 38157868 T A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 38157886 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 38158047 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38158067 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 38158072 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 38158204 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38158272 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38158485 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38158486 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 38158527 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38158550 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38158570 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 38158618 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 38159129 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 38159157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38159164 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38159205 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38159368 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 38159376 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38159422 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38159506 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 38159507 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 38159565 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 38159587 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 38159812 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 38159863 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.555555555555556 0.111111111111111 0.333333333333333 11 7 5 1 3 3 38159887 A T Y N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.545454545454545 0.181818181818182 0.272727272727273 14 8 6 2 3 3 38159892 A T Y N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.583333333333333 0.166666666666667 0.25 16 8 7 2 3 3 38159950 A G Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.666666666666667 0.133333333333333 0.2 22 8 10 2 3 3 38159992 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 38160032 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 38160194 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38160204 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 38160223 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 38160275 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38160437 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38160440 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38160667 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38161061 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 38161062 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38161095 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 38161119 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 38161128 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38161186 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38161236 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38161592 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 38161885 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38162088 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 38162597 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 38162655 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38162761 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38162821 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 38162847 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 38162869 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 38162871 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 38162882 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 38162891 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38162913 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 38162969 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 38163193 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38163196 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38163252 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 38163349 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 38163436 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 38163533 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 38163811 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 38163957 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38163961 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 38164219 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38164314 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 38164399 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 38164411 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 38164547 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 38164588 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 38164618 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 38164622 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 38164658 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 38164697 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 38164715 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 38164767 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 38164789 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 38164806 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 38164814 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 38164841 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 38164891 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 38164916 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 38165187 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 38165414 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 38165590 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 38165591 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 38165697 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 38165711 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38165767 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 38165823 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 38165886 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 38165913 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38166118 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38166585 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 38166842 T A N N 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 3 38167117 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 38167172 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 38167185 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 38167284 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 38167577 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 38167803 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 38168578 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 38170696 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38172194 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 38172204 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38172251 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38172325 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38172336 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38172440 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38172494 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38172940 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 38172951 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 38172974 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38173017 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 38173607 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 38173649 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 38173711 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38173753 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 38173754 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38173897 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38173943 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 38173961 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 38173972 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 38174004 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 38174147 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 38174234 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38174238 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 38174252 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 38175504 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38175533 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38175613 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 38175646 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38175769 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38176000 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 38176072 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38176177 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38176468 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 38176551 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 38176623 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38176769 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 38176837 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38176970 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 38177248 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 38177552 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38177580 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38177595 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38177613 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38177640 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38177647 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38178018 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38178274 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38178423 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 38178424 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38178559 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 38178883 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38178946 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 3 38179797 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 38179826 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 38180019 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38180025 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 38180269 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 38180389 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 38180520 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 38180526 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 38180540 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 38180715 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 38180778 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 38180824 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 38180871 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38180872 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38180962 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38180994 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38181016 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 38181076 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 38181389 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 38181413 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38181438 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38181464 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38181699 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38181907 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38181913 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38181933 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38181971 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38181983 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38182234 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38182408 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 38182478 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 38182729 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38182947 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38182956 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38183090 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 38184336 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38184396 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 38184963 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 38185017 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 38185097 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 38185199 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 38185253 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 38185286 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38185536 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 38185617 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38185956 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38186544 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38186566 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38186601 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38186685 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 38186689 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38186708 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38186880 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38186902 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38186907 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38186980 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 38186997 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 38187052 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 38187069 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 38187331 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38187364 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38187491 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38187700 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38187882 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 38187921 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 38188332 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 38188560 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 38188790 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38188825 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38189053 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 38189163 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 38189378 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38189541 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38189898 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 38190226 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38190518 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 38190612 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38190634 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38191195 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38191263 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38191341 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38191354 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38191764 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38191928 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38191955 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38192100 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38192104 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 38192131 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 38192251 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38192257 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38192331 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 38192541 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 38192790 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 38192821 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 38193128 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 38193287 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 38193432 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38193566 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38193718 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38193953 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38194294 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 38194315 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 38194356 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 38194411 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38194413 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 38194486 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 38194517 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 38194567 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 38194622 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 38194631 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 38194659 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38194723 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 38194797 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 38194824 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 38194869 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38194916 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 38194976 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38194989 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 38195018 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 38195042 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 38195095 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 38195142 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38195206 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 38195221 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 38195239 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 38195420 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 38195444 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 38195475 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38195551 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 38195830 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38195849 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 38195931 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38196243 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38197894 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38197938 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 38198033 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38198080 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38198280 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 38199385 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 38199598 A T Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 38199622 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 38199715 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 38199909 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38200760 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 38200818 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 38200970 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38201145 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 38201737 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38201844 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 38202226 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 38202260 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 38202361 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38202362 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 38202555 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 38202571 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 38202796 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38202808 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38202849 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38203206 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38203551 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38203571 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38203603 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 38203677 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 38204023 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 38204024 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 38204451 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38204474 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38204773 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 38204806 G C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 38204843 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 38204883 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38205320 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38206026 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38206097 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38206099 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38206196 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38206229 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38206465 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 38206767 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38206827 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38206857 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38207086 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 38207174 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38207374 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38207882 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38208311 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 38208673 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 38208686 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 38208760 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38208933 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38208935 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38210055 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 38210616 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38211556 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 38211770 C A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 38212101 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 38212271 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 38212392 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 38213143 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 38213445 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38213558 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38213762 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 38213827 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38213939 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38213988 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38214950 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38215005 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38215090 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 38215264 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 38215429 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38215432 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38215527 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38215570 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38215619 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38215698 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38215772 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38215852 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38215896 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38216546 G C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 38216563 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 38216620 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 38216854 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 38217683 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38218681 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38218790 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38218840 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38219086 A T Y N 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 7 5 1 5 0 3 38219404 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38219536 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 38219552 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38219700 T A Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 38220066 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38220091 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 38220223 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38220406 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38220701 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38220716 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38221317 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38221443 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 38221786 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38221881 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 38222268 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38222320 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 38222521 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38222599 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38222990 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38223358 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 38223502 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 38223565 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 38223994 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 38224038 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38224384 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38224441 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38224587 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 38224680 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38224833 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 38225173 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 38225230 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 38226566 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 38226661 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 38226843 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38226859 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38227071 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 38227572 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38227648 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 38227692 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38227853 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38227961 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38227980 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 38228031 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 38228257 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 38228263 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38228276 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38228322 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38228384 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38228408 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38228539 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 38229091 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 38229206 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38229315 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 38229361 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 38229373 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 38229489 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 38229565 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38229616 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 38229788 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 38230719 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38230727 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38230934 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38231015 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 38231049 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38231096 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38231101 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 38231125 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 38231145 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38231234 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38231446 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38231529 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 38231637 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 38231652 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 38231709 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 38231807 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 38231986 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 38232070 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 38232114 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 38232315 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 38232347 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 38232583 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38232877 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38232903 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 38232971 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38232989 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38233082 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38233716 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38233910 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 38234035 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 38234109 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 38234123 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38234252 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38234513 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38234610 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38234888 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 38234952 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38234985 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38235073 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38235141 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 38235306 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38235317 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38235465 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38235512 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38235555 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38235922 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38236035 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38236110 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 38236220 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 38236313 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 38236451 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 38236557 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38236592 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 38236747 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38236849 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 38236856 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38236991 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38237045 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38237307 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 38238211 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38238823 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 38238878 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 38238989 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 38239139 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38239178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38239473 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 38239718 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 38239732 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38239777 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 38239805 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 38239809 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 38239831 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 38239950 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 38239954 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 38240039 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 38240051 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 38240058 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 38240065 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 38240085 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 38240097 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 38240271 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 38240612 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38240613 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 38240664 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38240902 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 38240982 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 38241021 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 38241058 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 38241150 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 38241256 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 38241732 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38241774 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38241826 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 38241873 G A N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 38241891 G A N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 3 38241943 C T N Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 8 8 2 4 2 3 38241963 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 38241996 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 3 38242069 G A Y Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 3 38242156 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 3 38242362 G A N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 38242477 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 38242484 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 38242496 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 38242590 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 38242698 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38242791 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 38242846 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38242862 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38242989 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38243034 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38243071 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38243095 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38243129 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38243172 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38243431 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38243538 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38243547 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38243760 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38243766 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38243946 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38244052 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38244060 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38244218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38244428 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38244471 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38244606 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38244625 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 38244630 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38244666 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38244672 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38245460 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 38245486 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38245549 C G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 38245705 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38245808 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38245843 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 38246140 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38246531 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 38246728 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 38246753 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38246761 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38246787 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38246799 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38246923 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38247145 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38247169 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38247309 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38247315 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38247331 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 38247553 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38247664 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38247957 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38248043 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38248050 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 38248108 A T N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 38248244 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 38248374 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38248467 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 38248542 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38248768 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38248935 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38248965 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38248967 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38248995 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38249049 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38249085 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38249159 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 38249261 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 38249320 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 38249408 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38249443 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38249457 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38249542 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 38249680 T G N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 38249698 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 38249825 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38249896 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38249912 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38249943 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38249944 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38249969 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38250056 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38250107 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38250127 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38250131 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38250199 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38250245 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 38250301 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 38250335 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38250364 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38250374 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38250403 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38250487 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 38250523 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38250532 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38250555 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 38250581 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 38250593 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 38250672 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 38250687 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38250697 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38250707 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38250772 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38250795 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38250875 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 38250910 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 38250924 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 38251010 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38251037 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38251160 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38251167 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38251175 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38251181 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38251215 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38251262 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38252099 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38252102 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38252111 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 38252118 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 38252206 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 38252415 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38252559 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38252739 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 38252764 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 38253044 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 38253233 G C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 38253384 T A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 38253527 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 38253650 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38253803 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38254078 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 38254333 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 38254545 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 38254675 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 38254711 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 38254733 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 38254810 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 38254849 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38254852 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 38254997 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 38255038 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38255588 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38255601 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38255613 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38255634 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38255746 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38255760 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 38255831 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38255864 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 38255911 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 38255915 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 38255929 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 38255955 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 38255967 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 38255972 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 38255978 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 38255992 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 38256032 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 38256051 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 38256215 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38256221 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38256226 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38256446 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38256833 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38257102 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38257164 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38257199 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 38257225 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 38257341 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 38257452 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 38257560 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 38257609 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 38257649 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 38257682 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 38257800 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 38257946 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38257949 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 38257974 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38258013 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38258029 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38258855 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38258860 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38258895 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 38258914 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38259002 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38259012 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 38259050 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38259061 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 38259130 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38259218 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 38259251 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 38259269 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38259357 G A Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 3 38259358 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 14 18 0 14 2 3 38259478 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 38259566 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 38259682 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38259793 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 38259825 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 38259876 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38260004 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38260055 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38260069 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38260221 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38260369 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38260414 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38260746 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38260761 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38260940 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 38260991 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38261021 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38261022 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38261142 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 38261152 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 38261176 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 38261685 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 38261755 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 38262055 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38262164 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38262174 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38262217 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 38262238 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38262255 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38262375 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38262464 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 38262592 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38262601 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38262657 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 38262664 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 38262987 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 38263171 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38263227 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38263238 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38263376 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38263560 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38263608 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 38263814 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 38263860 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 38263891 A G Y Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0 0.769230769230769 0.230769230769231 10 16 0 10 3 3 38263892 A G N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.416666666666667 0.583333333333333 0 17 7 5 7 0 3 38264102 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 38264140 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38264278 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38264677 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38264716 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38264739 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38264765 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38264767 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38264882 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 38264909 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 38265094 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38265376 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38265488 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38265506 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38265600 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38265728 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 38266339 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38266369 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38266425 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38266458 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38266518 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38266519 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 38266540 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0 0.777777777777778 0.222222222222222 14 22 0 14 4 3 38266541 T G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 3 38266662 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 38266706 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38266815 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38266964 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 38266994 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38267092 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38267206 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 38267336 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38267687 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 38267743 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38267795 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38267856 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38267891 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 38267908 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 38267912 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 38267926 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38267960 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38268098 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38268283 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38268311 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 38268425 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38268475 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 38268577 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 38268617 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38268728 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38268839 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 38269104 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38269161 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38269288 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 38269447 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38269749 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38270040 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38270124 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38270226 G C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 38270608 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 38271198 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38271454 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 38271508 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38271629 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38271739 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38271909 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38271956 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38272043 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38272754 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38272924 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38272976 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 38273001 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38273405 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38273504 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38273626 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38274134 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38274137 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38274227 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38274334 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38274350 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 38274592 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38274605 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38275275 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38275412 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38275989 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38276129 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 38276391 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 38276568 G A N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 38276605 C T N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 3 38276769 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 38276775 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 38276872 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 38276894 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 38276943 C G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 38277083 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38277087 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38277267 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38277306 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38277312 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38277383 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38277467 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 38277503 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 38277615 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 38277674 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 38277733 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 38277739 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 38277841 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38277844 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38277870 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 38278205 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38278426 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38278511 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 38278528 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 38278814 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38278842 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38278943 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38279047 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38279075 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38279139 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38279172 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 38279174 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 38279191 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38279239 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38279261 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38279265 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38279292 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38279330 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38279407 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38279434 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38279518 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38279783 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38279816 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38279878 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 38280149 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 38280279 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38280402 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38280437 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38280468 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38280606 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 38280774 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38280812 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38281150 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38281483 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38281900 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38281950 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38281961 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38282033 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38282051 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38282089 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38282238 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 38282256 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38282280 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38282414 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 38282461 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 38282475 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 38282506 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 38282609 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38282610 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38282699 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38282711 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38282734 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38282762 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38282774 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38282840 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38282901 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38283049 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 38283134 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 38283135 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 38283245 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38283265 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38283271 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38283339 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 38283454 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 38283458 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 38283477 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38283547 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 38283548 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38283584 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 38283623 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 38283658 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38283695 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38283744 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38283764 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38283770 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38283777 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38283833 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38283936 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38284036 C T Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 3 38284146 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 38284148 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 38284176 T A Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 38284180 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 38284218 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 38284245 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 38284268 G A N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 38284356 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 38284410 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 38284774 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 38285175 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 38286019 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 38286189 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38286214 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 38286224 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 38286322 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38286625 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38286735 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 38286847 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 38286954 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 38287099 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 38287155 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 38287158 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 38287682 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 38287739 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 38288377 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 38288599 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38288621 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38288884 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38288988 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38288998 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38289021 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38289053 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38289362 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38289649 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38289654 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38289721 G A N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 38291350 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38292006 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 38292118 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 38292213 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 38292284 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 38292287 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 38292323 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 38292558 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 38292575 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 38292704 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 38292898 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 38292984 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38293035 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 38293116 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 38293159 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 38293187 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 38293359 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38293372 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38293402 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 38293453 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 38293455 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 38293489 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 38293695 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 38293723 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 38293893 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38294171 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 38294219 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38294284 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38294361 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 38294678 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 38294722 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 38295141 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38295159 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38295211 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 38295398 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38295446 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 38295540 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 38295618 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 38295672 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 38296403 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 38296824 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 38296853 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38297249 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38297351 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38297352 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 38297551 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 38297723 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 38298282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38298835 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 38299025 A T N N 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 3 38299239 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 38299283 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38299358 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38299400 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38299416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38299428 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38299430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38299984 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38300060 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38300086 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38300114 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38300123 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38300185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38300477 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 38300674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38301092 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38301590 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38301701 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 38301703 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 38302126 C A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 38302127 A C N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 38302166 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 38302239 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 38302685 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 38302879 G A Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 38302889 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 38302901 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 38302929 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 38303328 A G Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 38303427 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38303885 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 38304150 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38304151 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38304286 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38304348 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38304350 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 38304378 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38304441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38304490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38304848 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38304949 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38305132 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 38305315 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38305398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38305870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38305871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38305917 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38306161 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38306734 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38306761 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38306816 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38306995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38307041 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38307833 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38310860 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38310887 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38311021 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38311770 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38312197 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 38312722 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 38313151 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38313466 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38313469 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38313702 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38313757 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38313816 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38313831 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38314087 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38314517 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38314584 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38314963 A C N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 38315060 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 38315157 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38315371 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38315406 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38315410 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38315712 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 38316093 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38316177 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38316419 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 38316435 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 38316757 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38316846 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38317128 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38317746 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38317771 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 38318076 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 38318260 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38318405 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38318472 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38319373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38319714 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38319772 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38319871 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38320259 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38320324 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38320403 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38320506 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38320574 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38320626 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38320712 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38320852 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38321627 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 38321761 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38321900 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38321903 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38321929 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38322256 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38322964 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38323248 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38323956 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38324038 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38324178 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38324506 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38324508 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38324625 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38324710 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38325419 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38327007 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38327059 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38327064 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38327182 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38327277 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 38327421 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 38327452 T G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 38327473 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 38327545 A T N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 38327556 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 38327697 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 38327747 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38328048 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38328136 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38328393 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38328677 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38328774 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38329863 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38329884 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38330138 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 38330154 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38330460 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38331175 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 38331186 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 38331528 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 38331801 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 38331854 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 38331895 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 38331927 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 38332032 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38332065 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38332512 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38332569 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38332678 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38332686 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38332703 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38332881 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 38332898 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 38333001 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38333075 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38333076 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38333146 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38333325 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 38333443 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38333491 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 38333712 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38333740 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38333767 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38333829 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38334072 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38334181 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38334271 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38334291 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38334295 A C Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38334512 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38334513 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 38334865 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38335223 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38335938 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38336058 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38336498 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38336813 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38336841 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38336844 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38336895 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38337055 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38337104 A T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38337114 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38337246 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 38337505 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 38337527 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38337688 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 38337724 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38337767 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38337969 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 38338115 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 38338128 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38338729 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38339076 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38339769 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 38339872 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 38340615 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38340687 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38340820 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38340826 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38340942 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38341003 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38341006 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38341075 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 38341242 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 38341579 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38341588 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38341893 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 38342023 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38342035 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38342066 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38342075 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38342211 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38342598 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38343309 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38343925 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38344028 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38344092 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38344135 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38344784 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38345307 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38345961 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38346662 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 38347774 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 38348510 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 38348939 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 38349363 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 38349704 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38350048 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 38350795 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38350876 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38351390 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 38351551 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 38351739 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 38351762 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38352319 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38352402 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38352563 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38352861 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38352952 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 38356299 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 38356347 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 38356574 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 38357022 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 38357201 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 38357265 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 38358517 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38358670 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 38359510 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38360181 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38360228 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 38360393 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38360902 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38361003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38361234 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38361643 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.388888888888889 0.111111111111111 0.5 16 20 7 2 9 3 38361693 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38361783 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 38362090 C G Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 38363225 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 38363354 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 38363543 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 38363571 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 38363612 A C Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 38363620 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 38363755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38363786 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 38363827 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 38364001 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38364059 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 38364128 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 38364129 T G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 38364221 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 38364266 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 38364593 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38364611 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38364640 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38364858 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38365035 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 38365545 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 38365778 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 38365908 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38366042 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 38366067 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 38366209 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 38366409 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38366496 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 38366616 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38366632 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38366942 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 38366964 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 38366970 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 38366982 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 38367437 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 38367629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38368599 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 38368638 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 38368983 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 38369129 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 38369299 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 38369900 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 38370043 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 38370285 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 38370489 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 38371362 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 38371443 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 38371702 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 38372473 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 38372747 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 38372835 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 38373004 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 38373120 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 38373401 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 38374928 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 38375080 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 38375139 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 38375149 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 38375466 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 38375674 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 38375682 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 38375726 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 38376136 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 38376315 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 38376380 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 38376589 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 38376632 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 38376658 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 38376695 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 38376706 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 38376835 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 38376837 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 38377400 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 38377558 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 38377648 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 38377656 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 38378073 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 38378432 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38378468 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 38378535 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 38378607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38378679 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 38378858 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 38379060 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 38379154 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 38379257 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 38379269 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 38379321 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 38379576 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 38379596 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 38379641 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 38379667 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 38379684 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 38379746 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 38379864 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 38379891 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 38379977 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 38380001 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 38380147 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 38380312 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 38380460 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 38380462 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 38380738 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 38381036 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 38381237 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 38381241 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 38381250 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 38381469 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38381498 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 38382047 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 38382144 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 38382728 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 38383996 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 38384363 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 38384428 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 38384438 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 38384562 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 38384665 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 38384676 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 38384786 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 38384839 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 38385151 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 38385172 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 38385175 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 38385430 T C N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.153846153846154 0.538461538461538 0.307692307692308 11 15 2 7 4 3 38385435 C A N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.153846153846154 0.538461538461538 0.307692307692308 11 15 2 7 4 3 38385560 C T N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 3 38385624 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 38385771 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 38385929 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 38386432 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 38386649 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 38386657 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 38386718 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 38386763 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 38386876 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 38387104 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38387335 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 38387789 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 38388109 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 38388163 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 38388182 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 38389266 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 38389269 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 38390029 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 38390235 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38390371 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38391067 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38391191 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 38391447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38391518 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 38392307 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 38392419 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 38392440 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 38393538 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 38393588 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 38393600 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 38393642 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 38393919 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 38394036 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 38394044 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 38394064 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 38394148 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 38394161 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 38394239 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 38394291 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 38394398 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 38394430 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38394660 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 38395027 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38395065 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38395119 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 38395246 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 38395290 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 38395308 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 38395393 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 38395410 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 38395749 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 38396319 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38396367 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38396636 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38397656 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 38399522 C G Y N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 3 38399685 C T Y Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.363636363636364 0.636363636363636 0 15 7 4 7 0 3 38399702 T C Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 3 38400627 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38401040 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 38401144 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 38401154 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 38401282 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 38401512 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 38403475 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 38403591 A G N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.5 0.214285714285714 0.285714285714286 17 11 7 3 4 3 38409066 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 38409323 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 38411167 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38411400 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38411913 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 38412318 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 38413321 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 38414010 G C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 38414274 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 38414393 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 38414412 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 38414494 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 38414547 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 38414721 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 38414777 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 38414909 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 38414950 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 38414960 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 38415072 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 38415081 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 38415107 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 38415152 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 38415257 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 38416665 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 38416712 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 38416722 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 38416754 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 38417028 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38417080 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 38417947 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38418058 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38418394 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38418508 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38419230 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38419358 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38419588 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38419705 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38419828 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 38420564 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38422244 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38422465 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38423017 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 38423490 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38423556 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38423624 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38423706 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 38424025 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38424175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38425354 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38426084 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 38426979 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 38427139 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38427376 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38428613 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38429624 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38429670 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38430192 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38430968 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38431556 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 38431816 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38432471 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38432654 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 38432778 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38432790 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38432927 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38433025 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 38433175 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 38433213 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 38433626 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38433652 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38433653 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38433719 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38433790 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38434108 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 38435030 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38435067 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38435611 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38435656 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 38435780 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38435876 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 38435973 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38436076 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38436077 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 38436153 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 38436158 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 38436199 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 38436326 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 38436364 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38436423 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 38436488 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38436530 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38436596 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38436672 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 38436735 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38436771 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38436860 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38436941 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38437006 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38437366 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38437384 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38437587 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38437798 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 38438215 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 38438216 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 38438257 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38438293 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 38438718 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38438747 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38439078 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 38439376 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 38439516 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38440008 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 38440141 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 38440169 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 38440433 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38440565 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38440665 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38440721 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38440730 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38440768 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38440833 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 38440894 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38440911 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38440921 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38440922 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 38440944 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38440946 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38440990 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38441064 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38441156 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38441237 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 38441259 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38441260 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38441330 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38441341 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38441394 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38441420 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 38441434 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38441440 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38441736 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38441803 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38442355 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 38442421 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38442470 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38442473 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 38442589 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 38442600 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 38442722 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 38443242 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38443299 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38443598 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38444382 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 38444832 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 38445947 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38445967 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38446008 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 38448387 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 38448407 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 38448461 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 38448467 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 38448484 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 38448614 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 38448617 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 38448635 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 38448721 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 38448825 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 38448841 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 38448969 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 38449061 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 38449128 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 38449192 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 38449196 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 38449315 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 38449333 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 38449442 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 38449446 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 38449933 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38450083 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 38450097 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 38450111 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 38450312 G T N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 38450414 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 38450645 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 38451042 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 38451259 A G Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 38451271 A G Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 38451337 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 38451427 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 38451477 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 38451619 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 38451636 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 38452005 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 38452253 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 38452923 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 38452981 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 38453040 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 38453056 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 38453539 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 38453548 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 38453583 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 38453666 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 38453985 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 38454192 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 38454219 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38454539 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38454676 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38454880 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38454933 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 38454946 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 38454968 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 38455317 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38455581 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 38455727 A T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 38456385 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38456947 T C N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.636363636363636 0.181818181818182 0.181818181818182 16 6 7 2 2 3 38457041 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 38457229 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 38457304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38457706 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 38457729 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 38457975 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 38457981 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 38458002 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 38458102 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 38458139 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 38458260 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 38458598 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 38458609 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 38458664 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 38458668 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 38458685 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 38458697 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 38458826 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 38458848 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 38458853 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 38458873 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 38458874 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 38459322 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 38459523 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 38459530 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 38459579 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 38460764 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38460857 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 38461068 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38461214 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38461483 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 38461632 C A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 38461696 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 38461790 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 38461872 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 38463050 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 38463062 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 38463129 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 38463320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38463357 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 38463379 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 38463400 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 38463586 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 38463954 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38463993 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 38464451 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 38464511 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38464800 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 38464846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38464861 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38464903 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38465020 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38465438 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 38465621 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 38465732 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 38465813 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38465970 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 38465992 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 38466120 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 38466255 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 38466287 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 38466316 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 38466321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38466485 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 38466743 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 38466764 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 38467336 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 38467519 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 38467575 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38467867 T G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 38467899 T G N N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.181818181818182 17 5 8 1 2 3 38467900 T C N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 3 38467913 G A N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.615384615384615 0.153846153846154 0.230769230769231 18 8 8 2 3 3 38467957 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 38467992 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 3 38468065 C A N N 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.625 0 0.375 10 6 5 0 3 3 38468308 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 38468315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38468383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38468387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38468444 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38468466 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38468490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38468544 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38468552 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38468578 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38469874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38470132 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 38470821 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 38471102 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 38471313 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 38471583 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 38471711 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38472230 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 38472731 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38473156 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38473770 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 38474251 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 38474258 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 38474263 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 38474346 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 38474370 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 38474731 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 38474769 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 38475231 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 38475325 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 38475367 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38475399 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38475445 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 38476358 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 38477217 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38477547 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 3 38477757 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38477845 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 38478900 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38479057 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 38479136 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 38479854 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 38480081 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38480562 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 38480603 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 38480833 G A N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 3 38481301 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38481355 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38481548 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38481638 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38481769 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38481933 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38482243 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 38482264 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 38482352 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38482459 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38482627 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38482825 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38482974 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38483359 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38483394 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 38484442 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38484625 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 3 38484841 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38484925 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38484951 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 38484974 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38484986 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 38485095 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38485157 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38485207 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 38485234 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 38485257 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 38485326 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 38485334 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 38485459 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 38485493 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 38485495 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 38485505 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 38485541 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 38485615 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 38485706 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 38485733 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 38485798 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 38486047 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 38486084 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 38486087 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 38486175 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 38486193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38486251 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38486310 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38486355 T A N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 38486633 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 38486673 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 38486751 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38486941 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 38487048 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38487063 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 38487090 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38487226 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 38487283 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38487294 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38487386 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38487469 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38487472 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38487538 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38487773 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 38487839 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38487927 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 38488039 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38488078 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38488212 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38488238 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38488421 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38488498 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38488592 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38488780 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 38488798 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38488837 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38488857 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38488899 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38488929 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38489044 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 38489046 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 38489109 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38489151 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38489177 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 38489273 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 38489309 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 38489489 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38489490 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38489534 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 38489693 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38489739 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38489767 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38489792 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38489813 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38489843 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38489903 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38489904 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38489945 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 38489981 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 38489983 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 38490005 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38490070 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38490332 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38490334 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38490344 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38490444 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38490457 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38490614 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38490848 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 38490925 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38490946 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38490969 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 38490974 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 38491009 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 38491120 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 38491147 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38491210 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 38491258 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38491305 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 38491312 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38491316 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38491331 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 38491368 G T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.176470588235294 27 7 13 1 3 3 38491453 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 38491673 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38491802 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 38493007 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 38493294 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38494393 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 38494401 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 38494480 C G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 38494558 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38494734 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38495115 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38495228 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 38495389 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38495719 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38495824 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38496188 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 38496225 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38496253 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38496293 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38496357 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38496366 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38496673 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38496743 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38496792 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 38496886 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38496967 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38497069 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 38497099 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 38497119 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 38497132 A C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 38497140 G C N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 38497162 T G N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.571428571428571 0.214285714285714 0.214285714285714 19 9 8 3 3 3 38497219 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 8 10 3 2 4 3 38497299 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 38497331 C A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 38497340 T A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 3 38497351 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 38497445 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 38497645 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 38497660 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 38497743 C A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 38497758 G A N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 38497812 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 38497897 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 38497944 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 38498044 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 38498077 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38498079 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38498203 A C N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 3 38498318 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 38498379 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 38498469 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38498852 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 38499029 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38499096 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38499326 C A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 3 38499415 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 38499440 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38499478 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 38499747 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 38499909 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 38500005 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 38500043 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38500115 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 38500309 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38500358 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38500461 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38500550 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38500627 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 38500821 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38500822 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38500982 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 38501149 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 38501197 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 38501235 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38501262 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 38501268 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 38501274 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38501368 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 38501369 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 38501435 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 38501470 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 38501577 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 38506620 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38506712 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38506734 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38506860 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 38506861 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38506890 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38506969 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 38506970 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38506982 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38507073 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38507105 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 38507129 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38507462 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38507639 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38507652 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38507689 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38507891 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38507973 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38507983 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38508109 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38508189 C G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 38508195 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 38508427 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38508491 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38508570 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 38508685 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38508751 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 38508771 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 38508804 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 38508807 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 38508957 A C N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 38509339 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38509784 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 38510708 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38510812 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38510832 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38510846 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38510882 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38510968 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38510998 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38511052 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38511058 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38511101 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38511166 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38511205 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 38511206 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 38511303 G C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 38511312 A T N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 38511351 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 38511462 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38511576 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38511688 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 38511694 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 38511711 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 38511775 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38511801 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38511823 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 38511907 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 38511991 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38512145 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38512183 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 38512278 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38512331 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38512470 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 38512522 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 38512615 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 38512657 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 38512667 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38512714 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38512745 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 38512770 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38512844 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38512899 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 38512902 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 38512920 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 38512943 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38512977 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 38513116 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 38513231 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 38513264 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 38513266 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 38513723 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 38514263 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38515838 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38515946 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38516000 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38516545 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38517583 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38517835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38517997 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 38518230 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 38518833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38519475 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38519826 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 38520469 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 38520479 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 38520583 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38520603 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38520639 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 38520681 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 38521207 G C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 38521265 C G Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.176470588235294 27 7 13 1 3 3 38521280 T A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38521455 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 38521808 A T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 38522036 T A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 38522319 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 38522367 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 38522381 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 38522403 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 38522704 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38522811 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 38522917 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38523342 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 38523554 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38523731 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 38523902 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 38523940 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 38524036 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38524050 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38524051 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38524152 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 38524186 G C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 38524252 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 38524313 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38524478 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38524894 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38524895 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38524966 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38525031 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 38525126 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38525431 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 38525519 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38525521 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 38525564 A G N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 38525565 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 38525578 A G N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 3 38525714 T C N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 3 38531980 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 38531987 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 38532010 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 38532063 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38532115 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38532136 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38532211 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38532216 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38532432 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 38532565 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 38532711 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 38532748 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 38532844 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 38532959 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38533126 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38533230 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38533322 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 38535319 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 38535832 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 38536085 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 38538190 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 38538380 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 38538404 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38538441 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 38538447 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 38538551 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38538691 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 38538797 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38538901 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38538947 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38539163 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38539175 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 38539370 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 38539484 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38539510 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38539752 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38540067 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38540282 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38540392 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38541002 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38541214 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38541321 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38541510 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38541994 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38542023 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38542272 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38542308 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38542347 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38542415 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38542474 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38542564 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38542634 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38543181 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 38543228 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38543916 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38543967 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38544065 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38544224 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 38544308 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38544374 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38544427 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 38544649 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38544681 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38544754 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38544987 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 38545109 C T N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.363636363636364 0.272727272727273 0.363636363636364 11 11 4 3 4 3 38545120 A T N N 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 9 11 3 3 4 3 38545145 A T N N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 8 12 3 2 5 3 38545217 G A N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 3 38545290 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 38545647 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38546039 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38546565 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 3 38546656 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 38546687 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 38546838 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38546925 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 38547203 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38547248 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 38547285 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38547413 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38547439 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 38547530 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38547595 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38547764 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38547963 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38548398 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38548424 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38548474 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38548531 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38548737 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 38549022 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38549028 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38549158 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38549221 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38549233 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38549301 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38549362 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38549416 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38549944 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38549963 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38550380 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38550389 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38550396 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 38550483 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 38550484 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 38550673 G C N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 3 38550692 C T Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 38551108 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38551194 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 38551289 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 38551914 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 38552205 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 38552443 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 38552458 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 38552561 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38552580 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38552617 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38552646 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38552662 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38553111 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 38553233 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38553745 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38553806 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38554099 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 38554716 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38554756 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 38554761 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 38554827 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 38554911 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 38554919 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 38554977 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 38555234 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38556416 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38556486 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38556500 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 38556629 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 38556693 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38556718 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38557086 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38557179 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38557484 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38557522 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38557913 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38559568 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38559581 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38559656 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38559848 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38559973 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38559985 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38559997 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38560017 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38560996 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38561164 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38562075 T G N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 38562096 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 38562103 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 38562370 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38562594 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 38563382 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38564146 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 38564233 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38564244 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38564266 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38564336 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38564478 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38564566 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38564708 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 38564711 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38565019 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 38565056 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38565124 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 38565129 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 38565145 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 38565149 T G N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 38565157 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 38565195 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 38565217 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 38565267 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38565296 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 38565314 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 38565346 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 38565449 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 38565462 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 38565518 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38565541 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38565554 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38565593 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38565703 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38565715 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38565757 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38565773 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 38565788 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38565813 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38565830 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38565973 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38565992 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 38565999 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38566022 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38566041 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 38566043 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 38566115 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38566126 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38566133 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38566199 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38566238 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38566344 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38566421 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38566498 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38566541 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38566544 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38566571 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38566597 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38566617 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38566629 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38566748 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38566750 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38566775 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 38566792 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 38566796 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38566965 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38567130 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 38567189 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38567205 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38567264 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38567307 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38567319 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38567358 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38567371 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38567400 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38567562 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38567589 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38567621 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38568024 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 38568042 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38568063 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38568084 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38568098 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38568177 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38568366 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38568437 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38568569 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38568690 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38568953 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38569174 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38569480 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 38569519 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 38569520 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 38569531 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 38569578 G A N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 3 38569616 T A N N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 3 38569658 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 38569684 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 38569797 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 38570281 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38570290 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38570362 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38570408 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 38570477 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38570808 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38570837 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38570850 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38571644 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 38571662 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 38571688 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38571925 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 38571975 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38572176 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 38572218 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 38572266 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 38572267 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 38572325 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 38572384 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 38572397 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 38572483 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 38572490 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 38572557 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38572569 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38572581 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38572659 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 38572711 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 38572826 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 38572917 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 38572925 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38573146 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 38573212 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 38573259 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38573386 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38573425 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 38573451 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 38573478 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38573662 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38573792 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38574053 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 38574079 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 38574845 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 38574956 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38575207 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 38575470 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 38575579 A T N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 3 38575591 T C N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 38575609 A T N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 38575615 T G N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 3 38575747 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 38575791 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 38575850 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 38575881 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 38575916 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 38576027 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 38576136 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 38576172 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38576384 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 38576536 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38576661 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38576908 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38576978 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38577380 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38577387 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38577443 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38577462 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38577534 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38577702 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 38577891 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 38577913 A T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 38577929 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38578594 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38578732 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38578779 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 38578781 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 38578928 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 38579210 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 38579249 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 38579259 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38579505 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 38579517 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 38580517 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38580576 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38581047 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38581139 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38581277 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38581307 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38581334 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38581589 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38581865 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38581890 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38581905 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38582138 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38582218 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38582343 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 38582351 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38582416 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38582445 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38582460 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38582513 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 38582547 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38582784 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 38582807 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 38582833 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 38582885 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38583048 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 38583217 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 38583237 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 38583333 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 38583480 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38583609 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38583629 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38583665 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38583770 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38583777 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38583837 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 38583850 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 38583942 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38583964 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38584090 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38584233 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 38584235 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 38584277 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 38584298 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 38584309 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38584412 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38584463 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38584612 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 38584617 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38584625 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38584681 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 38584689 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 38584934 A C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 38584951 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38585030 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 38585120 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38585158 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38585179 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38585223 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38585276 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38585359 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38585403 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38585414 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 38585517 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38585598 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38585606 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38585647 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38585757 C T N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 3 38585799 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 38585875 G A N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 0.142857142857143 0.214285714285714 20 8 9 2 3 3 38585896 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 3 38585913 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 38585923 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 38585974 T A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 38586020 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 38586230 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 38586269 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 38586311 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 38586348 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 38586377 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 38586431 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 38586541 A T N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 3 38586553 C T N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 3 38586561 A G N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 3 38586695 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 3 38586762 T C N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 3 38586834 A T N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 0.142857142857143 0.214285714285714 20 8 9 2 3 3 38586917 T C N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 3 38587219 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38587306 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 38587339 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38587542 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38587552 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38587626 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38587672 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38587673 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38587741 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 38587818 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 38588067 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38588084 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 38588086 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 38588205 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38588248 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38588257 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 38588953 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38589412 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38589414 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38589445 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 38590120 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 38590234 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38590483 A C N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 38590630 G A N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.545454545454545 0.181818181818182 0.272727272727273 14 8 6 2 3 3 38590681 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 38590853 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 38591164 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38591442 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38591577 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 38591611 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38591675 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 38591770 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38592193 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38592334 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 38592733 T A N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.533333333333333 0.2 0.266666666666667 19 11 8 3 4 3 38592744 T A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 38592747 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 38592756 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 3 38592765 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38592859 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 38592882 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 38593045 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38593163 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 38593399 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38593695 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 38594362 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 38594637 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 38595430 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38595523 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38595535 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38595836 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38595875 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38596017 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38596248 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38596256 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38596285 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 38596340 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 38596452 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 38596876 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38596950 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38597495 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 38597568 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38597574 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38597595 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 38597596 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 38597619 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 38597620 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 38597679 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38597767 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38597812 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38597840 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 38597855 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 38597884 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 38597975 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 38598078 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 38598121 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 38598586 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38598617 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38598708 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 38598728 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38598748 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38598850 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 38599024 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 38599175 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38599200 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38599255 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38599258 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38599280 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38599344 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38599436 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38599505 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 38599528 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 38599616 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38599682 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38599731 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38600241 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38600410 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 38600464 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38600472 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38600506 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38600571 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 38600614 C A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 38600693 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 3 38600791 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38600891 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 38600893 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 38601154 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38601186 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 38601453 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38601586 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 38601772 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38601867 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38601902 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 38601909 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 38601916 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 38601958 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 38602071 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38602305 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38602312 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38603103 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 38603483 A C N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 38603799 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 38603987 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38604438 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 38604704 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 38604814 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 38605543 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38605634 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38605639 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38605719 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38605732 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38605973 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38606268 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38606353 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38606545 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38606575 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38606590 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38606609 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38606622 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38606624 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38607037 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38607462 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38607738 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38607938 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38608485 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 38608808 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38608861 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38608916 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38609237 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38609466 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38609478 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38609487 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38609700 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 38609807 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38609824 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 38609912 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 38610043 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 38610059 A T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 38610180 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 38610337 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38610769 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 38610774 T C N Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 9 5 3 3 1 3 38610852 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 38610880 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 38610934 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 38610951 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 38611024 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38611038 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 38611043 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 38611051 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38611109 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38611123 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 38611187 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 38611280 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 38611447 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38611463 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 38611466 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 38611524 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 38611727 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38611817 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 38611860 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38611953 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38611999 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 38612110 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38612436 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38612464 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38612505 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 38612546 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38612573 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 38612611 G C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 38612647 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 38612814 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38612984 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 38613115 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 38613349 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38613402 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38613573 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38613610 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 38614030 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 38614149 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38615578 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 38615969 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38615988 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38616081 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38616225 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38616227 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38616307 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 38616512 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38616893 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38616924 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 38616952 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38616958 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38617679 A G N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 12 8 4 4 2 3 38618424 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 38618709 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 38618752 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38619014 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38619071 T A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 38619522 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 38620044 C G N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 3 38620046 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 3 38620368 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 38620387 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 38620500 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38620627 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38620637 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38620712 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 3 38620723 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38620890 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 38621016 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38621029 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38621466 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38621820 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38621926 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38622249 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 38622825 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38623115 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38623169 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38623280 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 38623371 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38623661 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38624166 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38624725 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 3 38625183 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 3 38625322 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 38625543 C G N N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0 0.916666666666667 0.0833333333333333 11 13 0 11 1 3 38625555 T C N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.363636363636364 0.545454545454545 0.0909090909090909 14 8 4 6 1 3 38625706 C A N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.466666666666667 0.2 0.333333333333333 17 13 7 3 5 3 38626374 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38626450 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 38626590 T C Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38626684 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 38626720 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38626859 T G N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.5 0.142857142857143 0.357142857142857 16 12 7 2 5 3 38629560 T G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 3 38629631 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 38629954 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38630115 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 38630247 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38630336 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38630381 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38630398 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38630403 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38630427 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38630428 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38630565 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 38630931 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38632169 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38632468 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 38632566 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 38632631 T G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 38632790 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38632819 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 38632821 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 38632853 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 38632990 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38633047 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38633108 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38633255 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38633268 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38633293 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 3 38634411 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38634460 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 3 38634607 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38634680 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38634939 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 3 38634971 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38635039 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38635130 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38635278 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38635613 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38635646 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38635692 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38635744 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 38635746 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 38635779 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38635793 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38635855 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38635869 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38635888 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38635959 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38636052 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38636507 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38636519 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38636537 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38636577 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38636598 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38636693 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38636839 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38636855 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38636898 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 38637034 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 38637081 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 38637095 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 38637115 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 38637260 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 38637275 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38637309 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 38637319 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 38637390 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38637394 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38637415 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38637436 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38637461 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 38637475 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 38637508 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38637591 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38637636 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38637646 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38637662 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38637723 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38637731 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38637807 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38637821 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 38637827 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38637846 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38637911 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38637993 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 38638101 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 38638118 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 38638127 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38638238 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38638249 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38638275 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38638295 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38638333 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38638345 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38638384 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 38638408 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38638595 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38638623 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38638990 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38639053 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38639269 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38639513 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38639597 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38639655 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38639793 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38639814 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38639842 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38640689 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 38641280 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38641698 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38643125 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 38643862 T A N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 38645753 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 38648594 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38650847 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 38650858 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 38650869 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38650970 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38651068 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 38651105 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 38651147 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 38651192 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 38651204 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 38651383 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38651475 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38651492 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38651511 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 38651527 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 38651531 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 38651557 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 38651585 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38651587 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38651701 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 38651956 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 38652054 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 38652307 T A Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 38652378 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38652402 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38652501 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 38652504 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 38652598 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38652614 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38652636 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38652685 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 38652700 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38652763 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38652807 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 38652844 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 38652849 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 38652855 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 38652872 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 3 38652891 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 38652912 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 38653016 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38653029 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 38653073 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38653088 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38653103 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38653246 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 38653651 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38654193 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38654392 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38654430 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38654931 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 38655141 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38655155 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38655322 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 3 38655372 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 38655477 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38655478 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38655513 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38655553 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 38655563 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 38655575 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38655638 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38655660 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 38655661 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 38655695 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 38655710 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 38655798 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38655825 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 38655924 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38655935 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38656029 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38656063 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38656077 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38656150 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38656192 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38656257 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38656314 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38656456 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38656712 A C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 38656738 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38656774 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 38656821 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 38656838 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 38656875 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38656876 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 38656951 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38656955 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38657266 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38657447 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38657616 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38657773 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38657787 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38657802 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38657834 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38658030 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 38658767 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 38658780 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 38659113 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38659290 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38659301 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38659451 C A N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 38659642 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 38660054 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38660257 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38660357 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 38660378 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38660432 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38660501 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38660556 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38660827 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 38660842 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 38668345 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38668370 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38668371 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38668507 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38668520 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38668657 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38668667 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38668707 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38668798 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 38668812 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 38668923 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38669159 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 3 38669330 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 38669360 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 38669416 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 38669422 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 38669559 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38669626 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38669790 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 3 38669866 C T N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.5 0.142857142857143 0.357142857142857 16 12 7 2 5 3 38670039 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 38670388 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38670685 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38670865 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38670908 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 38670932 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38671057 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38671971 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 38673393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38673511 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38673526 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 38673627 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38673649 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 38673689 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38674587 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 38675000 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38675472 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38676410 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38677907 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38678054 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 38678067 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38678091 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38678124 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 38678165 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 38678179 A G Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 38678183 A T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 38678198 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38678530 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 38678802 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38678803 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38678847 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38678850 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38679057 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 38679072 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 38679199 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 38679235 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38679354 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38679361 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38679529 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38679534 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38679609 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38679637 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38679669 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38679719 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38679769 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38679785 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38679799 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 38679990 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38680032 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38680057 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38680158 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38680225 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38680258 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38680327 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38680354 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 38680623 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 38681023 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38681090 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38681168 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38681271 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38681283 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38681475 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38681514 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 38681548 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38681568 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 38681574 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 38681672 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38681711 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38682010 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38682283 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 38682359 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 38682415 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38682526 C A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 38682532 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 38682595 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 38682808 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 3 38683055 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38683103 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38683184 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38683631 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 3 38683788 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38683826 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38683873 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38683904 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38683973 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38684030 T A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 38684240 A G N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 38684260 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 38684332 T G N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.333333333333333 0.2 0.466666666666667 13 17 5 3 7 3 38684336 G T N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.375 0.1875 0.4375 15 17 6 3 7 3 38684464 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 38684597 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38684841 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 38684928 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 38685135 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 38685174 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 38685255 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38685319 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38685719 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38685816 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38685952 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38685967 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38685973 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38686235 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 38686682 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38686696 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 38686791 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38686839 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 38686840 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 38686879 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 38686911 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38686926 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38686935 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38686973 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38687103 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38687176 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38687290 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38687313 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38687354 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38687513 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38687679 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38687696 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38687728 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38687769 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 38688081 C A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 38688348 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 38690531 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38690732 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38691579 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 38691657 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 38691993 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38692149 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38692724 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38692725 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38692746 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38692881 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38692903 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 38692950 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 38693093 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 38693095 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 38693213 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 38693675 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38693770 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 38693774 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38693828 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38693892 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38694199 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38694210 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38694214 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38694240 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38694307 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38694325 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38694353 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38694394 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38694584 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38694643 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38695494 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38695531 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38695623 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 38695640 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 38695682 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 38695688 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38695877 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 38695894 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 38695954 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38695982 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38696033 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38696061 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38696133 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 38696544 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38696770 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 38696928 C T N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 3 38697121 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38697266 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38697273 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38697374 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38697403 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38697424 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38697429 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38697455 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38697763 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38698249 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 38698342 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 38698438 A C N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 38698479 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.4375 0.1875 0.375 17 15 7 3 6 3 38698726 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38698767 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38698838 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 38698882 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38699006 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38699093 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 38699169 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38699262 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 38699344 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38699592 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38699621 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38699767 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38699778 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38699884 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38700137 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38700275 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38700285 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38700516 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 38700627 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38700789 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38700797 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38700949 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38701047 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 38701611 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 38702019 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38702291 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38702381 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 38702473 G C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 38702564 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 38702808 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38702874 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38702912 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38703997 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38705095 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38705305 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 38705732 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38705755 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38705900 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38706566 T C N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.545454545454545 0.181818181818182 0.272727272727273 14 8 6 2 3 3 38707013 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 38707037 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38707053 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38707070 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38707101 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 38707109 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38707155 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38707220 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38707236 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38707238 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38707321 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 38707581 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 38707698 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38707950 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38708665 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38709833 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38710196 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38710510 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 38710676 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 38710686 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38710709 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 38710910 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 38711198 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38711397 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38711402 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 38711525 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 38711562 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 38711597 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 38711774 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 38711864 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38711888 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38712002 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 38712026 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 38712039 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 38712106 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 38712367 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38712375 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38712589 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38712591 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38712631 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 38712718 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38712730 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38712760 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 38712810 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38712938 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38713042 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 38713175 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38713213 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 38713239 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 38713251 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 38713274 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 38713303 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 38713322 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 38713323 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 38713343 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 38713398 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38713507 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 38713523 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38713875 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 3 38713886 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38714110 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 38714125 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 38714192 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38714273 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 38714471 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 38714498 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 38714543 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38714555 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38714585 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38714625 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38714634 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38714729 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 38714820 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38714847 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 38714910 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 38714930 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 38714952 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 38715077 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38715274 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 38715356 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38715400 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38715449 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 38715922 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38715956 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38716237 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 38716614 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 38716984 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38717045 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38717579 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38717611 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 38717839 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38717966 G C Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 3 38717973 C G Y N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.125 0.75 0.125 16 16 2 12 2 3 38717980 C G Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 3 38717987 C G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 38717994 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38718093 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 38718113 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 38718129 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 38718132 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 38718302 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 38718303 G C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 38718347 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38718373 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38718453 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 38718884 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38718893 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 38719073 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 38719165 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 38719335 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 38719348 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 38719772 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 38720256 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 38720374 A G N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 3 38720677 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 3 38720736 C A N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 3 38720794 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 38720836 C A N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 38720847 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 38721102 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 38721166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38721712 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 38721726 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 38721808 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38722091 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 38722133 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 38722184 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 38722188 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 38722258 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 38722591 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 38722835 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 3 38722849 T C N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 3 38722867 G C N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.5 0.416666666666667 8 16 1 6 5 3 38722935 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 38723105 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 38723280 T A N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 3 38723400 G T N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 3 38723481 A C N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 3 38723547 C G N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 3 38723675 A G N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 3 38723835 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 38723896 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 38723937 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38724229 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 38724247 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 38724251 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 38724277 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38724451 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 38724938 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 38725403 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38725481 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38725498 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38725568 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38725638 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38725662 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 38725732 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 38725745 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38725979 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38726226 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 38726284 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 38726371 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 38726804 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 38726812 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 38726890 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 38727426 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 38727692 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 38728058 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 38729299 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 38729300 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 38729593 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 38729618 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38729732 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 38730229 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 38730591 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 38730615 C G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 38731761 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 38731775 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 38731849 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 38732452 A T N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 38732617 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 38732767 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 38732902 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 38733476 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 38733915 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38734032 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38734136 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 38734153 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38734244 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 38734285 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 38734604 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38734668 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38734708 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38735092 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 38735803 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 38736048 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38736049 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38736073 A G Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 38736132 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 38736155 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38736639 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 38736677 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 38736749 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 38736791 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 38736808 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 38736843 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 38736895 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 3 38737051 A C N N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 6 12 2 2 5 3 38737054 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 6 12 2 2 5 3 38737087 C G N N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 8 8 3 2 3 3 38737111 G A N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 3 38737116 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 3 38737178 G T N N 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 8 10 3 2 4 3 38737182 A G N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 8 12 3 2 5 3 38737227 T C N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.230769230769231 0.153846153846154 0.615384615384615 8 18 3 2 8 3 38737310 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 38737344 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 38737361 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 38737386 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 38737404 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 38737436 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 38737488 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 38737503 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 38737599 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 38737724 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 38737763 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38737852 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 38738054 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 38738433 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 38738759 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 38738976 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 38739022 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38739045 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 38739062 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 38739223 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 38739530 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 38739598 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 38739725 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 38739822 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 38739894 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 38739949 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 38739971 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 38740355 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38740388 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38740390 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38740416 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38740757 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 38740821 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 38740835 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 38741136 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 38741293 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 38741466 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38741595 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 38741608 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 38741687 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 38741801 T A N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 3 38742100 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 38742182 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 38742280 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 38742314 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 38742326 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 38742647 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 38742761 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 38742811 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 38742874 C A Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 38743161 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 38743368 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 38743384 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 38743423 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 38743454 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 38743557 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 38743665 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 38743699 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 38743935 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 38743963 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 38744010 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 38744022 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 38744036 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 38744046 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 38744171 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 38744306 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 38744316 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 38744342 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 38744399 C A Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 38744402 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 38744445 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 38744647 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 38744705 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38744832 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 38744985 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 38745065 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 38745146 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 38745176 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 38745359 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 38745685 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 38745695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38745742 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 38745838 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 38745926 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 38746760 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38746871 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 38747020 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38747141 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38747226 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 38747455 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 38747684 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 38747832 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 38750155 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 38750165 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 38750176 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 38750232 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 38750278 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 38750318 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 38750329 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 38750410 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38750476 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 38750555 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 3 38751131 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 38751587 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38751705 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 38752045 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 38752303 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38752337 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38752380 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38752486 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38752497 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38752504 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38752525 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 38752533 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38752672 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 38752697 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 38752779 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38752894 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38752897 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38752912 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38753049 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38753141 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 38753195 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38753207 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38753261 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38753704 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 38753810 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 38753857 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38753867 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38753974 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38754139 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38754844 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 38754989 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 38754990 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 38755011 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 38755154 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 38755631 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38756005 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38757154 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38757989 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 38758080 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38759257 C T N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 3 38759492 T C N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 3 38760497 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 38760665 T G N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 38760791 C T N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 38761136 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38761233 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 38762152 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 38762523 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38762583 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38762721 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 38762770 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38762956 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38763113 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 38763331 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38763352 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 38763363 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 38763630 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38767339 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38767399 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 38767513 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38767527 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38767551 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 38767657 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 38768047 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38768227 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38768243 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 38768300 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 38768304 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 38768320 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 38768328 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 38768477 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 38768501 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 38768553 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 38768577 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 38768627 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 38768634 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 38768645 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38768669 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 38768699 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38768715 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38768749 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38768999 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38769146 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38769468 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38769482 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38769666 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38769715 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38769939 G T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 38769940 T G N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 3 38769985 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 38770732 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 38770858 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38771474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38771746 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 38771779 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38771907 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 38771944 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 38772023 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 38772537 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38772651 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 38772860 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38772893 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 38773003 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 38773132 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 38774262 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38774888 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 38775136 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38775199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38775422 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38775428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38775480 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38775726 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 38775826 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 38775842 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38775896 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38776044 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38776112 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38776191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38776249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38776582 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38776675 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 38776715 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 38776717 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38776753 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38776760 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38776923 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 38776963 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 38776985 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 38776992 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38777018 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 38777061 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 38777086 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38777223 T C Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 3 38777356 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38777376 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38777393 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38777402 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38777416 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38777458 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38777492 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 38777530 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38777571 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 38777588 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 38777595 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38777626 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 38777677 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 38777706 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38777755 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 38777760 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 38777779 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 38777781 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38777796 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 38777842 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 38777847 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 38777861 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 38777887 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 38777913 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 38778207 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38778235 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38778346 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 38778388 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 38778493 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38778530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38778615 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38778632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38778659 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38778660 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38778722 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38778740 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38778752 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38779424 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38779696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38779738 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38779804 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38780256 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 38780270 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 38780280 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 38780281 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38780333 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 38780451 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 38780460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38780888 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38781018 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38781033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38781097 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 38781103 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 38781108 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 38781117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38781143 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 38781194 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 38781209 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 38781271 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 38781860 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38782062 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 38782427 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.5 0.142857142857143 0.357142857142857 16 12 7 2 5 3 38782531 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 38782561 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 38782648 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 38782678 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38782741 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 38783148 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38783669 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 38783671 C G N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 3 38783718 A T N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 3 38783902 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 38783981 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38783994 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38784247 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 38784516 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 38784902 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 38785132 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38785350 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 38785632 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38785701 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38785728 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 38788807 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 38791083 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 38791153 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38791282 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 38791321 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38791798 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38792338 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 38792569 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38792981 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38793277 C T N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 3 38793667 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 38793970 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 38794036 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 38794205 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38794410 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38794469 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 38794494 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38794721 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 38794820 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 38795238 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 38795473 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 38795972 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 38796011 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 38796651 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38796730 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 38796836 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 38796978 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38797024 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 38797028 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 38797038 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 38797051 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38797089 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 38797095 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 38797132 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 38797173 T C N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 3 38797188 T A N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 3 38797192 C G N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 3 38797225 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 38797237 T G N N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.181818181818182 0.545454545454545 0.272727272727273 10 12 2 6 3 3 38797425 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 38797523 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38797591 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38797607 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 38797617 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38797848 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 38798003 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 38798052 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38798058 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 38798126 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38798159 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38798191 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 38798211 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38798233 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38798264 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 38798306 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38798585 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38798625 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38798649 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38798698 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38798715 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38798732 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38798756 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38798778 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38798780 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38798796 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38798826 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38798939 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 38798967 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 38799082 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 38799119 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38799155 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38799218 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 38799267 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 38799506 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38799609 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 38800637 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 38802424 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38802748 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38804217 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38804522 C G Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 38804636 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 38804807 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 38804934 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38805068 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 38805091 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 38805137 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 38805202 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38805422 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 38805562 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 38806541 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38807032 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38807035 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38807131 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 38807188 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 38807193 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 38807260 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 38807631 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 38808235 C T N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 3 38808311 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 38808979 T C N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 3 38809128 C T N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 3 38809237 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 38809300 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 38809346 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 38809475 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 38809535 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 38810020 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 38810027 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 38810097 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 38810498 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 38810512 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 38810523 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 38810539 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 38810620 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 38810649 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 38810675 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 38810822 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 38810876 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38811008 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 38811258 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 38811346 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 38811447 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 38811463 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 38811686 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 38811866 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 38812358 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38812962 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38813360 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38813691 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 38813707 C G N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 38813922 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 38813937 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 38813947 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 38813967 C G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 38814026 G C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 38814070 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 38814085 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 38814119 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 38814120 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 38814135 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 38814151 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 38814189 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 38814204 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 38814241 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 38814333 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 38814342 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 38814420 T G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 38814568 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 38814596 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 38815099 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 38815110 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 38815248 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38815366 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 38815408 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38815435 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 38815454 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 38815489 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 38815711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38815740 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38815768 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 38816109 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 38816149 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38816329 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 38816399 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 38816432 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 38816554 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 38816558 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 38816571 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 38816875 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38816925 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38816931 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 38817831 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 38818455 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38818796 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 38818977 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 38819011 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 38819512 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 38820272 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 38821228 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 38821375 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 38821413 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 38821475 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 38821827 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 38822684 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38822718 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 38822893 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 38822930 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 38822933 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 38823275 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 38823501 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 38823687 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 38823722 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 38823850 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 38823878 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 38824065 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 38824071 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 38824417 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38824504 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 38824802 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 38824810 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 38824826 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38824883 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 38824971 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38825163 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 38825656 T C N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.384615384615385 0.230769230769231 0.384615384615385 13 13 5 3 5 3 38825835 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 38825960 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 38826086 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 38826109 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 38826122 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 38826145 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 38826159 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 38826221 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38826267 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 38826283 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 38826574 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 38826939 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 38826982 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 38826983 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 38826993 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 38827099 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 38827295 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 38827858 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 38828098 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 38828314 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 38828525 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 38828756 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 38828998 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 38829049 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 38829616 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 38829826 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 38830571 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 38830769 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 38831963 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 38832065 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 38832453 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 38832521 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 38832780 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 38833162 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 38833259 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 38833461 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 38833846 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 38834226 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 38834239 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 38834264 G C N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.4375 0.1875 0.375 17 15 7 3 6 3 38834424 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 38834551 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 38834630 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.5 0.1875 0.3125 19 13 8 3 5 3 38834672 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 38834681 T A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 38834731 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 38834737 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 38834759 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 38834778 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 38834796 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 38834803 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38834839 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38834896 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 38835163 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 38835310 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 38835322 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 38835469 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 38835819 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 38835916 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38836180 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 38836414 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 38837493 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 38837674 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 38837730 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 38837755 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 38838094 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 38838161 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 38838184 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 38838206 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 38838214 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 38838496 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 38838565 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38838643 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 38838679 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 38838847 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 38838936 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 38839686 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 38839732 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38839821 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38840146 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 38840241 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 38840531 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 38840568 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 38840703 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 38841022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38841229 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 38841471 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 38841975 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 38842105 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.526315789473684 0.105263157894737 0.368421052631579 22 16 10 2 7 3 38842281 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 38842572 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 3 38842588 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 38845249 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 38845785 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 38846598 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 38846694 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38846875 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 38847148 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 38847246 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 38847499 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 38847675 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 38847818 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 38847877 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 38847990 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 38848030 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5625 0.125 0.3125 20 12 9 2 5 3 38848040 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 38848142 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 38848258 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 38848290 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 38848599 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 38848632 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 38848706 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 38848760 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 38848782 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 38848869 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 38848959 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 38849017 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 38849184 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 38849329 G A N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 3 38849389 C G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 3 38849401 A T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 3 38849424 G C N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 15 15 6 3 6 3 38849486 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 3 38849551 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 38849615 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 38849752 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 38849780 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 38849781 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 38849819 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 38849831 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 38850356 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 38850793 T A N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.333333333333333 0.2 0.466666666666667 13 17 5 3 7 3 38851153 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 3 38851205 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 38851552 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38851594 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 38851680 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38851948 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 38851958 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 38852094 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 38852369 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 38852462 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 38852489 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 38852660 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 38852776 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 38853732 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 38854315 T C N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 14 6 6 2 2 3 38855845 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 38856451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38856506 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38857198 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38857552 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38858900 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 38859015 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38859089 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38859364 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 38859674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38860096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38860121 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 38860273 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 38860367 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 38860422 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 38860718 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 38862259 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38862565 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38864215 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38864739 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 38865506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38866785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38867446 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 38867556 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.166666666666667 0.777777777777778 0.0555555555555556 20 16 3 14 1 3 38868600 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 38869251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38869260 G C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 38869413 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38869524 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 38869948 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 38870029 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 38870059 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38870092 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38870134 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38870239 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38870246 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38870279 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38870435 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 38870705 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 38870762 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 38870798 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 38870808 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 38870861 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 38870947 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 38870977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38871038 A T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 38871044 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 38871112 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 38871118 C A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 38871453 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38871645 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38871736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38872188 C T Y Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 38872201 C A N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0 0.9375 0.0625 15 17 0 15 1 3 38872386 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 38872676 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 38872678 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 38872692 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 38872745 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 38872793 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 38872801 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 38872862 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38872956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38873049 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 38873082 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38873102 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 38873174 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38873441 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38873930 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 38873984 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 38874145 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 38874456 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38874619 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 38874650 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 38874731 T A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 38874835 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 38874846 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 38874911 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 38874991 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 3 38875043 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38875426 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 38875611 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38875680 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38875817 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38877110 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38877731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38879084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38879288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38880868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38880983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38881617 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38881811 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 38881872 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 3 38881925 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 38883742 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 3 38883828 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 38884074 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 38884149 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 38884160 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 38884240 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 38884268 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 38884283 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 38884383 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 38884415 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 38884416 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 38884453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38884459 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 38884767 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 38884972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38885033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38885086 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38885117 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 38885128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38885192 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38885331 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38885374 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 38885379 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 38886205 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 38887776 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38887837 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38888485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38888959 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38889110 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 38889398 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38889799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38890117 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 38890596 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 38890766 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38890982 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 38891416 C A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 38891443 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 38891579 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 38892246 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 38892334 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 38892805 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 38892834 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 38893101 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 38893129 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 38893169 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38893363 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 38893391 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38893514 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38893881 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38893999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38894172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38894252 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 38895131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38895406 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38895806 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38896292 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 38896970 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 38897067 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38897122 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 38897135 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38897201 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38897269 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 38897460 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 38897776 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 38897844 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38897879 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 38898556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38898572 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 38898603 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38898707 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38898826 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 38898912 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 38898928 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 38898951 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 38899041 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 38899448 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38899529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38899543 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38899720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38900187 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 38900372 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38901032 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 38901036 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 38903445 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38904852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38905110 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38906678 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38906936 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 38907055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38910329 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 38910510 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 38910656 C T N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.214285714285714 0.142857142857143 0.642857142857143 8 20 3 2 9 3 38910919 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 38910954 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 38910991 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 38911115 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 38911130 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 38911491 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 38911527 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 38911538 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 38911784 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 38912178 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 38912238 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 38912247 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 38912343 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 38912641 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 38912647 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 38912655 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38912722 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.263157894736842 0.0526315789473684 0.684210526315789 11 27 5 1 13 3 38912820 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 38912841 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 38913021 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 38913233 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 38913302 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 38913339 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 38913462 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 38913544 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 38913761 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 38914031 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 38914032 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 38914439 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38914665 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38914725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38914755 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38914763 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 38915110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38915998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38916141 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38917053 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 38918271 C T N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0 0.866666666666667 0.133333333333333 13 17 0 13 2 3 38918979 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38920666 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 38920864 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38921010 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38921145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38921774 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 3 38922557 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38923150 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38923472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38923697 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 38923839 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38923884 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38924048 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 38924473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38924608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38924609 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38924844 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 38924879 C T Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 38931159 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 38931160 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 38931279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38931309 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 38931654 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38932319 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 38932399 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38932566 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 38933154 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 38935689 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 38936621 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38937071 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 38938794 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 38938799 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 38938928 A G N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 38942996 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38943522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38943651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38943659 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38944111 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38944812 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38946268 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38946369 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38947439 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 38948862 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 38949992 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38951098 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 38952813 G A N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 38952900 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38953249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38954694 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38954886 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38955326 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 38955613 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38955742 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 38956116 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 38956170 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 38956191 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38956290 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 38956480 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 38956526 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38956667 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 38956724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38956847 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38956883 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38956963 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38956986 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38957001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38957266 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38957322 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 38957363 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 38957387 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 38957463 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38957484 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38957556 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38957576 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38957741 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 38957822 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 38957828 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 38957839 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38957896 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38957907 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38957945 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38957976 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 38958064 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38958139 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 38958210 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 38958231 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38958245 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38958511 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 38958517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38958546 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38958574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38958601 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 38958650 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 38958654 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38958768 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38958782 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38958798 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 38958821 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38958838 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38958873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38958943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38958997 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38959018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38959079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38959122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38959174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38959188 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38959192 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38959201 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38959218 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38959308 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38959473 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 38959486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38959676 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 38959715 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 38959817 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 38959851 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 38959913 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 38959953 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 38960029 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 38960205 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 38960300 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 38960301 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 38960335 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 38960353 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 38960761 A C N N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 3 38960804 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 38960843 A C N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 38960969 C T N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 15 13 1 13 0 3 38960989 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 38961073 A G N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.0714285714285714 0.714285714285714 0.214285714285714 12 16 1 10 3 3 38961117 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 38961203 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 38961282 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 38961387 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 38961517 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 38961627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38961646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38961750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38961771 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38961854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38961879 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38961887 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38961913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38962161 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38962240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38962306 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 38962473 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 38962672 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 38962964 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 38963169 G C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 38963321 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 38963338 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 38963368 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 38963656 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 38963829 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38963919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38964442 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 38964535 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38964920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38965144 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 38965449 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38966288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38966480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38966815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38967036 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38967110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38967215 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38967597 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 38967721 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 38967821 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38967920 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38967972 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 38968014 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 38968507 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 38969652 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 38971557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38971683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38971704 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38973588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38974512 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38975666 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 38977310 C G Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 38977341 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38977356 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 38977610 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38979749 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 38979966 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 38981136 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 38981172 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 38981271 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 38981939 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38981940 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38982060 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 38982066 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38982128 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38982159 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38982270 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 38982291 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 38982348 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38982829 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 38983048 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38983053 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 38983458 C G N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 38983609 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 38983662 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 38983751 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 38983782 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 38983798 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 38983804 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38983875 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38983880 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 38984508 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 38984681 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 38984698 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 38984702 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 38984813 A C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 38984952 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 38985005 A G N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 38985270 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 38985645 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 38985718 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 38986898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38987596 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 38987631 A T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 38988047 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38988494 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38990213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38990957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38991029 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38992057 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38992430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38993382 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38994428 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38994435 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 38994506 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 38994669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38994773 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 38996067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38996119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38996975 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 38998338 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 38998399 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 38998507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38998541 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 38998684 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 38999233 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38999467 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38999500 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38999505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38999536 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38999556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38999626 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 38999692 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 38999795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39000135 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39001892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39003163 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39004165 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39004557 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39004570 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39005060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39006392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39007070 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39007476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39007495 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39007634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39007719 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39007831 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 39008410 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39008496 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39008717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39008804 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39008819 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39010004 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39010022 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39010307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39010751 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39010866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39011004 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39011940 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39012466 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39013116 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39013219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39013748 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39013942 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39014381 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39014545 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39015626 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39016434 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39016447 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39016479 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39016838 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 39017480 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 39018408 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39020944 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39023583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39024762 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39024806 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39025327 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39025682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39027982 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39028254 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39028275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39028446 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39029616 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39029741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39030344 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39031049 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39031094 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 39031243 C T N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 39031322 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 39031339 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 39031526 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39031589 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 39031662 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 39031755 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39031782 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 39031810 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 39031872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39031874 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 39031903 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 39031968 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 39032018 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39032135 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39032333 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39032638 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 39032946 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39032972 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 39033110 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 39033155 T A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 39033516 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 39033615 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 39033765 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 39035091 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 39035154 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 39035167 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 39035230 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 39035380 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 39035381 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 39035412 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39035762 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 39035941 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 39036156 C T N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 8 12 2 4 4 3 39036539 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 39036605 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 39036664 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 39036909 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 39036949 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 39036951 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 39036983 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 39037024 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 39037032 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 39037049 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 39037344 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 39037443 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 39037511 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 39037523 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 39037607 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39037765 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 39038306 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 39038474 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 39038625 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 39038691 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 39038731 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 39038857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39038903 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 39038994 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 39039002 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 39039473 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 39040597 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 39043957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39044533 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 39044573 G T N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0 0.846153846153846 0.153846153846154 11 15 0 11 2 3 39046105 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39046418 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39046439 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 39046453 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39046482 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39046505 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 39046632 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39046726 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39047087 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 39047150 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 39047847 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 39047856 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 39047905 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 39047971 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 39048030 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 39048073 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 39048077 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 39048169 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 39048171 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 39048180 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 39048203 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 39048209 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 39048615 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39048988 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 39048998 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 39049014 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 39049063 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39049093 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 39049202 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 39049238 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 39049371 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 39049394 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 39049650 A T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 39049663 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 39049683 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 39049738 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 39049757 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 39049975 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 39050248 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 39050273 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 39050289 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 39050296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39050376 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 39050534 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 39050591 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 39050636 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 39050847 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 39050875 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 39050876 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 39051010 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 39051159 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 39051301 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 39051450 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 39051501 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 39051676 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 39051704 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 39051724 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 39051748 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 39052035 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 39052036 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 39052168 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 39052207 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 39052760 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39052949 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39053303 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39053369 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 39053528 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39053539 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 39053777 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39053908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39054034 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 39054136 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39054230 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 39054512 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 39054578 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 39054635 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 39054748 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 39055871 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39056176 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39056353 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39056623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39057912 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39057980 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39058187 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39058315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39058358 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39058379 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39058449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39058848 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 39059147 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39059252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39059622 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 39059708 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39059785 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39059838 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39059840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39059904 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39060129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39060151 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39060251 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39060479 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39060628 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 39060638 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 39061308 G A Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 39062114 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39062274 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 39062394 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39062440 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 39062684 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39062685 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39062753 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39063136 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39063494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39063750 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39063985 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39064987 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 39065188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39065863 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39066528 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39067107 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39067430 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39068687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39068894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39069124 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39069473 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39069601 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39069841 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39070625 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39070692 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39070797 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39071417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39071537 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39071913 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39072337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39073170 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39073358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39074160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39075323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39078242 A T Y N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 39078979 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39079183 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39081009 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39089478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39089638 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39089910 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 39090375 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 39091167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39093034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39093045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39093427 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 39093674 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39093683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39093700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39093753 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39093756 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39093801 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39093833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39093852 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39093954 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39094163 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39094494 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39094524 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39094543 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39094585 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39094618 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39094808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39094815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39094901 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39094920 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39094965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39094993 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39095038 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39095290 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39095320 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39095329 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39095332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39095345 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39095346 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39095474 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39095487 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39095535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39095581 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39095629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39095726 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39095734 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39095803 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 39095815 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39095844 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39095947 A C Y N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 3 39095982 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39096091 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39096109 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39096159 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39096223 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 39096471 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39096608 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 39096807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39097005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39097395 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39097541 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 39097618 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39097715 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 39097778 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39097790 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 39097814 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 39098210 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39098490 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39098621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39098667 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 39098682 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39098769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39098783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39098867 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39098886 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 39098973 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39098984 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39099017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39099081 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 39099111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39099244 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39099444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39099508 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39099638 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39099872 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39100223 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 39100338 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39100891 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 39101023 C T N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 6 10 2 2 4 3 39101038 A G N Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 3 39101141 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 39101248 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 39101397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39101586 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 39101597 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39101651 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39101802 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39101904 C G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 39102103 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 39102158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39103394 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 39103531 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 39103907 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 39104322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39104976 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 39105061 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 39105100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39105570 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 39105606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39105747 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39105748 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39105766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39105813 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39106076 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39106179 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39106485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39106560 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 39106625 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39106633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39106723 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 39106724 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 39106845 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39106955 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 39107226 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 39107485 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 39107920 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 39107959 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 39108000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39108001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39108030 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 39108052 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39108063 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 39108093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39108150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39108180 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 39108210 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 39108298 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 39108331 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39108423 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39108517 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 39109602 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39109623 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39109637 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39110219 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 39111906 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 39112846 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 39112889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39112916 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39113259 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39113322 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 39113865 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39116364 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 39116540 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39116646 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39116676 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39116770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39116824 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39116838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39116923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39118694 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 39118857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39119661 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39119810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39119866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39119880 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39119888 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39119909 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39120065 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39120145 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39120168 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39120634 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39120916 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39121785 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39121812 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39122075 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39122146 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39122201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39122804 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39122945 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39122998 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39123148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39123186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39123865 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39124390 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39124500 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39124534 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39124780 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39124825 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39124897 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39125127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39125299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39125564 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 39125729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39125739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39125859 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39125881 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 39125940 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39126035 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 39126133 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 39126165 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 39126273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39126342 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 39126369 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 39126378 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 39126395 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 39126412 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 39126529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39126548 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 39126575 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 39126633 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39127016 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 39127639 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39128042 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39128660 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39128695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39129169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39129649 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39129781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39130374 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39131179 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 39131483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39131564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39131611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39132099 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39132138 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39132277 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39132377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39133031 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39133129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39133140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39133205 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 39133845 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 39134066 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 39134118 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 39134246 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 39134301 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 39134327 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 39134372 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 39134386 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 39134402 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 39134465 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 39134477 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 39134480 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 39134568 T A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 39134647 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 39134705 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 39134894 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39135405 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 39135438 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 39135770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39136129 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39136456 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39136560 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39143157 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39143208 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39143288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39143323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39143389 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39143477 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39143640 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 3 39143712 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39143814 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39143822 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39143911 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39144149 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39144202 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39144449 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39144450 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39146081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39147332 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 39147454 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39148862 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39149555 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39149663 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39150486 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39150850 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39150946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39151138 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 39151183 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39151258 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39151631 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 39151915 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 39152192 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39152511 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39152590 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 39152702 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 39152744 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39152838 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 39152854 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 39152908 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 39153269 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 39154783 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39155171 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39155406 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39156180 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39157849 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 39158156 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39160403 A T N N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0 0.636363636363636 0.363636363636364 7 15 0 7 4 3 39160493 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39160980 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39161305 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 39162004 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39162628 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39162931 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 39163137 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 39163704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39165074 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39165471 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39165685 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39165878 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39165959 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 39166074 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39166545 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39166971 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 39166984 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39167168 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39167388 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39167517 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 39167552 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 39167588 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 39167623 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 39167719 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 39167812 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 39167837 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 39168438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39169346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39170652 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 39170653 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 39170663 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39170687 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 39170934 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 39171489 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 39171504 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 39171528 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 39171621 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 39171700 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39171736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39171877 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39171912 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39171945 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39172015 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 39172046 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 39172818 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39172821 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39172965 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39173106 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39173392 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39173606 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39173750 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39173838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39174063 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39174187 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39174241 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 39174292 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39174385 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39174445 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39174459 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 39174525 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39174535 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39174576 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 39174626 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39174731 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 39174768 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 39174858 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39174896 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39175264 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 39175320 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 39175597 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39175676 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39175682 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 39175698 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39175842 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39175845 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39175858 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39175866 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39175965 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39176297 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39176360 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39176378 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39176392 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 39176441 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39176446 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39177588 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 39177589 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39177641 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 39177835 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39177880 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39177899 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39177968 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39178225 G T N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 39178263 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 39178434 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 39178465 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39178468 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39178884 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39179398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39179421 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 39179489 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39179545 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39179565 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 39179576 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39179589 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39179612 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 39179656 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 39179722 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 39179863 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 39179864 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 39179944 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 39180022 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 39180048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39180101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39180304 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 39180358 G T N N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 3 39180387 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 39180499 T A N N 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 3 39180505 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 39180620 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 39180692 A C Y N 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 39182015 A G N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 39182113 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 39182261 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39182722 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39182826 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 39182848 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39182895 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39182897 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39183062 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 39183073 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39183095 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39183188 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 39183226 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39183263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39183285 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39183318 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 39183449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39183478 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39183487 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 39183527 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 39183576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39183771 T G N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 39184023 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 39184042 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 39184106 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 39184150 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39184242 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39184339 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39184356 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 39184424 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39184446 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39184514 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 39184717 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 39184751 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 39184876 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39184889 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39184904 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39185482 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39185514 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39185559 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39185609 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39185744 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39185903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39186054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39186162 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 39186174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39186176 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39186195 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39186256 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39186301 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39186327 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39186442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39186486 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 39186491 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 39186501 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 39186539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39186541 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39186568 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39186639 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 39186655 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39186658 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39186777 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 39186786 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 39186801 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 39186838 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 39186873 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 39186879 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 39186886 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39186927 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39186982 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39187007 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 39187076 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39187105 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39187238 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 39187335 T A Y N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 3 39187365 C T Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 39187398 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39187466 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 39187484 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 39187490 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 39187533 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 39187534 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 39187638 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 39187654 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39187660 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 39187764 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 39187786 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39187792 C G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 39187801 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 39187803 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 39188071 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39188129 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 39188174 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 39188234 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 39188267 C A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39188331 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 39188407 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 39188408 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 39188622 T G Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 39188625 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 39188671 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39188744 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 39188822 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 39188840 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 39188848 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 39188856 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 39188956 C G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 39188975 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 39189105 T A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 39189176 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39189206 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 39189345 C A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 39189350 C A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 39189357 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 39189374 C G Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 39189501 G C Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 39189557 A G Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 39189588 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 39189592 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39189699 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 39189764 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 39189780 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 39189787 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 39189847 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 39189919 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 39189957 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 39189965 T A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 39190046 C G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 39190111 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 39190176 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 39190309 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39190334 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 39190393 A T Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 39190395 T C Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 39190505 T C Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 39190588 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 39190661 G A Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 39190684 A T Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 39190718 A C Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 39190737 G C Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 39190744 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39190807 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39190833 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 39190843 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39190861 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 39190902 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 39190904 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 39190926 A G Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 39190945 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 39191027 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 39191146 G A Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 39191362 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 39191486 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 39191606 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 39191619 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 39191648 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 39191763 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 39191771 T G Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 39191798 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 39191889 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 39191955 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 39191987 C G Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 39192012 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 39192047 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 39192067 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39192089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39192092 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39192107 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39192158 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 39192166 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39192198 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 39192204 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 39192214 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39192257 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 39192308 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 39192315 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 39192320 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 39192334 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 39192417 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 39192586 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 39192651 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39192696 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39192749 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39192800 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39192903 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39192946 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39193028 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39193097 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39193113 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39193342 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 39193387 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 39193397 T C N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 39193415 A G N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 3 39193574 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 39193599 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 39193611 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 39193661 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 39193662 G T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 39193687 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39193701 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 39193716 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 39193725 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 39194192 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39194310 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39194317 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39194424 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39194437 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39194457 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39194518 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39194654 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39194932 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39195029 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 39195424 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39195432 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39195440 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39195494 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 39195538 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 39195729 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39195755 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39195770 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39195784 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39195896 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39195993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39196003 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39196011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39196051 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39196167 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39196271 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39196300 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39196457 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39196492 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39196512 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39196580 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39196671 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39196788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39196890 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39196910 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39196927 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39196935 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39196940 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39196974 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 39196998 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39197023 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39197098 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39197129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39197176 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39197209 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39197322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39197343 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 39197374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39197377 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39197403 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39197415 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39197425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39197487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39197531 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39197641 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 39200516 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39200538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39200614 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39200632 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39200720 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 39200726 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39200745 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39200782 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39200867 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39200923 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39200965 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39201055 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39201141 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39201516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39201540 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39201592 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 39201643 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 39201645 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39201664 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39201674 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 39201679 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39201841 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39202155 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39202179 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 39202203 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 39202337 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 39202435 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39202579 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 39203033 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39203179 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 39203282 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39203325 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39203337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39203428 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 39203524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39203540 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39203692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39203860 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39204008 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39204059 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39204076 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39204181 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39204369 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39204677 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39204771 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39204828 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39204936 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39204939 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 39204955 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 39205083 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 39205676 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39205747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39205983 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 39206472 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 39206975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39207056 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39207057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39207069 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39207166 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39207191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39207317 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 39208426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39210113 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39210367 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39211711 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39212182 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39213436 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 39213846 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 39213943 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39213994 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39214921 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 39215279 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39216629 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39218163 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39219575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39220825 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39221781 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39223970 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 39224487 T G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 39226274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39229160 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 39229242 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39229807 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39231370 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 39232754 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39233614 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39234387 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 39236357 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 39236397 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39236960 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39237156 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 39237277 G T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 39238885 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39239621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39242905 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 39245264 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 39246937 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39248044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39248995 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39249024 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 39250256 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39250290 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39251347 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39252875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39253246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39253858 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39254382 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 39263672 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 39263718 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 39264029 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39265099 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39268551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39269924 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39269963 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 39270704 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 39270944 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 39271398 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39273801 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39274824 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39277675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39278662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39279850 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39280757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39286136 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39294733 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39296871 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 39303424 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39303554 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 39303568 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 39304198 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39305359 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39306520 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39308486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39308656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39309123 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39310000 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 39311811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39312813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39313016 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39314031 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39314121 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39314493 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 39315467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39316229 A G Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 39316472 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39316836 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39318971 T G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 39320012 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 39320267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39320865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39321306 C T Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 39321423 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 39321583 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 39321814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39322176 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39322245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39322368 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39322795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39323400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39323518 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39324537 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39325717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39326926 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39328238 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39329286 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39331779 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39332029 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39332387 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 39332850 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 39332891 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 39332980 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39333103 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 39333137 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 39333153 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39333292 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39333411 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 39333419 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39333426 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39333443 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 39333520 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39333654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39334013 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 39334033 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39334401 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39334454 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 39334808 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39335977 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39336304 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 39336340 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 39336369 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39336677 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39337335 A G N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0 0.545454545454545 0.454545454545455 6 16 0 6 5 3 39337435 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39337893 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39338223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39338421 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 39339153 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 39339158 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 39339182 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 39339217 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 39339364 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 39339368 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39339382 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 39339636 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39340286 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 39340293 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 39340297 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39340405 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39340637 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 39340830 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39340906 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39340935 A T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 39341036 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 39341171 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39341196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39341210 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 39341248 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 39341272 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 39341305 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 39341543 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 39341613 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39341632 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 39341784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39342535 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 39342572 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 39342807 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 39342838 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 39342965 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 39342981 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39343014 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39343625 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 39343884 T C N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 3 39343964 A C N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 39344072 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 39344132 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 39344138 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 39344280 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 39344389 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 39344414 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 39344449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39344467 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 39344547 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 39344589 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 39344605 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39344832 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39344883 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 39345252 T C Y Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.6 0 0.4 6 4 3 0 2 3 39348049 T A Y N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 39348697 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 39348747 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39348885 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 39349039 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39349100 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39349131 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 39349166 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39349192 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 39349247 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 39349494 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 39349495 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 39349615 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 39349893 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39349907 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 39350052 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 39350106 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39350125 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39350144 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39350149 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39350264 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 39350297 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39350456 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 39350504 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39350525 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 39350549 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 39350550 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 39350677 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 39350786 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 39350909 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 39350954 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 39350955 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 39351039 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 39351044 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 39351410 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39351438 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 39351508 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39351570 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39351669 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39351729 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 39351870 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 39351956 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39352467 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39352684 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39352800 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39352861 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 39352872 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39352926 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39352991 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39353165 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 39353179 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39353215 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39353240 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 39353551 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 39353696 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39354092 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39355417 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39355425 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 39355446 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 39355693 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39355779 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 39355896 G A N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 16 14 1 14 0 3 39356230 A T Y N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 39356262 A C N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 39356266 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 39356277 T C N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 3 39356400 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39356439 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 39356694 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 39356762 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 39356959 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39357196 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39357272 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 39357289 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 39357294 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 39357305 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 39357538 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 39357548 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 39357650 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 39357681 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 39357723 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 39357775 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 39357839 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 39357898 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 39357968 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39358020 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 39358240 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 39358267 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39358287 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 39358908 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 39359131 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 39359226 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 39360268 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39360412 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39360844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39361133 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39361815 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39361915 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39362311 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39363386 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39363507 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39363580 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39363658 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39363667 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39363709 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39363710 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39363772 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39364027 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39364183 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39364213 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39364231 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 39364370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39364456 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39364656 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39364709 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39364737 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39364747 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39365133 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39365272 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39365312 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 39365318 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39365345 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39365394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39365458 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 39365646 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39365715 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39365869 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39365998 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 39366336 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39366411 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39366527 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39366586 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 39366960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39366984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39367063 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39367109 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39367273 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39367314 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 39367495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39367675 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39367679 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39367742 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39367785 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39368233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39368708 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39368828 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39369007 C T Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 39369037 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 39369054 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39369472 G C Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 39369612 C A Y N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 39369652 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 39369696 G A Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 39369707 C A Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 39369733 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39369814 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39369817 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39369941 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 39369994 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39370046 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39370056 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39370097 T C Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 39370098 T C Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 39370140 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 39370254 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39370280 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 39370299 A T Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 39370300 C T Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 39370381 C A Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 39370402 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 39370417 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 39370440 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 39370452 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 39370855 A G Y Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 3 39371218 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39371306 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 39371790 C T Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 39371943 T A Y N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 39371959 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39371980 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 39371997 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39372164 C T Y Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 39372384 A T Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 39372454 C A Y N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 39372455 C A Y N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 39372603 G T Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 39372620 G A Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 39372647 A G Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 39373079 A C Y N 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 3 39373086 C T N Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 3 39373093 T G Y N 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 3 39373627 A G Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 39373662 T A Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 39373700 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 39373971 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 39374215 A T Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 39374333 T G Y N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0 0.764705882352941 0.235294117647059 13 21 0 13 4 3 39374492 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 39374517 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39374518 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39374679 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39374682 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39374759 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39374801 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39374892 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39374905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39374915 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39374936 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39374977 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39375054 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39377133 A G Y Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.363636363636364 0.636363636363636 0 15 7 4 7 0 3 39377352 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 39378208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39379494 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39379889 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39379940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39379946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39379973 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39380203 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39380782 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 39380890 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 39381856 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 39382185 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39382619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39383438 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 39383793 G C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 39384031 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39384269 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39384277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39384488 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39384982 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39385049 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39385220 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 39386547 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39387249 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 39387358 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39387399 G A Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 39387691 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 39387759 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 39388034 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 39388122 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39388245 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39388372 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39390546 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 39390564 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 39390921 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39391301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39391400 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39391434 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39391579 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39391736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39391742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39391834 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 39391912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39391959 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39392080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39392236 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39392377 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39392393 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39392446 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39392475 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39392503 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39392567 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39392583 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39393137 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39393410 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39393596 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 39393607 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 39393613 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39393675 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 39393717 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39393801 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39393862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39393990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39394018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39394049 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39394074 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39394158 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39394195 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39394224 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39394261 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39394294 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39394335 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39394371 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39394387 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 39394454 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39394457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39394492 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39394574 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39394659 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39394719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39394827 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39394894 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39394953 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39395087 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39395187 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39395189 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39395561 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39395631 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39395978 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 39396045 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39396061 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39396087 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 39396207 C T N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 39396236 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39396245 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39396275 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39396276 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39396501 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 39396578 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39396665 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39396682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39396790 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39396820 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 39397205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39397217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39397274 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39397291 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39397323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39397344 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39397348 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39397364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39397369 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39397419 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39397464 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39397615 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 39397668 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39397678 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 39397749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39397803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39397880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39397907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39397979 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39398036 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39398051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39398161 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 39398165 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39398187 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 39398266 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 39398371 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 39398579 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 39398663 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 39398671 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 39398679 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 39398707 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 39398870 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39398877 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39398899 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39398901 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39398989 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39399007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39399678 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39399824 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39400146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39400573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39400815 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 39401030 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39401231 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39401514 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39402394 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39402491 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 39402789 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 39402967 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39402986 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 39403027 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39403038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39403222 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39403248 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39403469 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39403832 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 39403930 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39404029 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39404155 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 39404334 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39404639 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39404640 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39404740 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39404767 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39404827 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39405340 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39405491 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 39405969 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39405983 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 39406928 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39406963 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39407219 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 39407767 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39410386 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39410477 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39410796 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 39411366 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 39411501 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39411539 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39411635 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39411716 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39411720 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39411865 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 39411923 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39412480 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39412669 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39412762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39412763 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39412806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39412825 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39413026 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39413062 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 39413092 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39413132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39413174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39413210 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39413212 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39413256 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39413360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39413373 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39413415 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39413561 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39413661 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39413668 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39413682 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39413882 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39413982 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39414004 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39414021 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 39414060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39414077 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 39414184 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 39414486 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 39414526 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 39414552 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 39414568 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 39414767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39415113 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39415341 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39415447 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 39415622 G A N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0 0.7 0.3 7 13 0 7 3 3 39415653 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 39415942 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39416258 A G Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 39417204 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 39417244 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 39417329 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 39417892 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39417912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39418105 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39418715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39420723 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39421573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39422172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39422311 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39422376 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39423044 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 39423552 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39424068 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 39424714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39424962 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39424980 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 39425157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39425161 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39425195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39425202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39425314 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39426081 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39426455 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 39426546 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 39426710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39426829 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39426861 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39427312 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39427318 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 39427382 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 39427479 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 39427820 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 39427900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39427915 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39429570 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39430915 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39431719 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 39432224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39433195 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39433455 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 39433604 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39435994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39439355 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39440246 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 39440316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39440337 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 39441522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39441542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39443274 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 39443323 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 39443380 A C Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 39443489 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39452494 A C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 39452791 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 39456599 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39457544 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 39457635 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39457661 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 39457681 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 39457717 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 39457832 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 39457843 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 39457856 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 39457870 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 39457886 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 39457917 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 39458273 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 39458876 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39458928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39459192 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39459314 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39459665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39460063 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 39460603 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39462193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39462425 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39462549 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39463297 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39463369 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 39463375 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 39463384 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 39463789 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 39465995 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39466891 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 39469092 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39470514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39471944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39472885 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39473751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39474270 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39475061 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39476122 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39477260 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 3 39478131 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 39480659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39481546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39482381 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39482406 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39482829 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39484861 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39485214 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39485428 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39487772 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39490042 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39491861 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39498798 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 39499292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39499312 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39499403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39500767 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 39511476 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39511835 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 39512029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39512923 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39513025 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 39513100 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 39513226 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 39513348 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 39513352 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 39513370 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 39513384 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 39513415 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39513423 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39513431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39513555 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 39513602 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 39513608 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39513659 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 39513957 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 39514023 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 3 39514148 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39514432 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 39514902 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39514908 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 39515225 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 39515319 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39515329 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39515425 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 39515446 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 39515522 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 39515576 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 39515590 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 39515627 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 39515719 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 39515737 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 39516043 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 39516140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39516183 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39516232 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 39516312 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 39516313 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39516463 G T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 39516810 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39516845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39517302 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 39517348 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 39517621 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 39517668 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 39517682 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 39517792 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 39517908 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 39518105 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 39518108 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 39518171 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 39518192 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39518247 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 39518312 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 39518337 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 39518350 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 39518359 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 39518434 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 39518472 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 39518579 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 39518675 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39518687 A T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 10 22 4 2 10 3 39518766 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 39518858 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 39518886 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39518900 T G Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 39519110 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.235294117647059 0.117647058823529 0.647058823529412 10 24 4 2 11 3 39519150 T C Y Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 39519240 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39519367 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.25 0.166666666666667 0.583333333333333 8 16 3 2 7 3 39519377 G T N N 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 6 8 1 4 2 3 39519609 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 2 4 1 0 2 3 39519635 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 4 8 2 0 4 3 39519973 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 39519974 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 39520034 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39520053 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 39520071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39520079 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 39520241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39520316 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 39520551 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 39520598 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 39520666 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 39520695 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 39520697 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 39520868 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 39520923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39520931 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 39520953 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 39520956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39520987 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 39520995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39521019 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 39521070 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 39521084 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 39521133 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 39521134 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 39521232 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39521239 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 39521269 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 39521321 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 39521431 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39521432 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 39521483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39521759 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 39521913 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 39521993 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39522133 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 39522163 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39522428 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 39522488 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 39522513 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39522514 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39522550 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39522557 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39522602 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39522807 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39522859 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39522966 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39522970 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39523015 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39523054 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39523113 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39523118 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39523640 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39523687 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39523696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39523863 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39525743 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 39526084 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 39526467 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39526739 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39526893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39527323 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 39527566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39527592 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 39527764 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 39527772 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 39527966 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 39528181 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 39528220 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 39528274 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 39528286 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 39528298 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 39528345 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 39528618 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 39528654 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 39528706 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 39528758 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 39528944 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 39528981 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 39529128 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39529237 T A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 3 39529252 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 3 39529282 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39529512 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 39529532 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 39529629 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 39529679 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 39529721 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 3 39529793 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 39529827 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 39529891 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 39529893 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 39529982 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 39530014 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 39530092 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 39530230 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 39530251 G C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 39530266 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 39530321 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 39530439 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 39530605 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 39530840 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 39530906 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39530951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39531126 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 39531175 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39531806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39533740 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39533741 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 39534006 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 39534017 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 39534158 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 39534163 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 39534765 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39534915 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 39534953 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39535105 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 39535244 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39535329 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 39535930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39536124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39536199 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39536234 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 39536853 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39536962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39537410 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39537524 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 39537626 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 39537938 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39537955 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 39537963 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 39537975 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 39538017 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 39538302 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 39538944 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 3 39539030 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 39539041 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 39539236 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 39539561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39539760 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 39540532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39541100 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39541228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39541250 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 39541736 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 39541832 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39541835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39541961 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39542139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39542288 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39542493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39542501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39542640 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39542670 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 39542706 A T N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 39542795 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39542814 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 39542997 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 39543140 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 39543202 C G N N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 15 9 6 3 3 3 39543264 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39543545 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 39544284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39545178 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39545523 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 39546254 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 39547116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39547203 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39548905 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39550124 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39552523 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39552534 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39552967 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 39554375 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39555363 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39558633 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39559134 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39559239 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39559487 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39560903 G T Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 39561613 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39561822 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39561896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39562077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39562186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39562988 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39563094 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39563275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39564448 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39564471 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39564671 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39566158 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39566561 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39566721 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39568885 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 39570241 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39570499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39570598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39570669 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39572661 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 39574358 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39575728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39577876 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.588235294117647 0.117647058823529 0.294117647058824 22 12 10 2 5 3 39578114 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39578210 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 39578732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39578744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39578969 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39579403 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 39579412 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 39579431 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39579432 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 39579564 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 39579712 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.235294117647059 0.117647058823529 0.647058823529412 10 24 4 2 11 3 39579726 A T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 39579729 A T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 39579774 A C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 39579804 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 39579845 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 39579889 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.294117647058824 0.117647058823529 0.588235294117647 12 22 5 2 10 3 39579896 T G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.294117647058824 0.117647058823529 0.588235294117647 12 22 5 2 10 3 39579914 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 39579960 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 39580115 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 39580156 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 39580172 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 39580201 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 39580242 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 39580303 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 39580489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39580532 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 39580634 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.294117647058824 0.117647058823529 0.588235294117647 12 22 5 2 10 3 39580720 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 39580816 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 39580853 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 39580885 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 39580968 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 39581126 G T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 3 39581261 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 39581510 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 39581560 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 39581592 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 39581678 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 39581783 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39581856 C G N N 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 3 39581984 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39582348 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 39582384 C T N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.357142857142857 0.0714285714285714 0.571428571428571 11 17 5 1 8 3 39582464 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 3 39582497 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.3125 0.125 0.5625 12 20 5 2 9 3 39582608 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 39582632 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 39582647 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 39582650 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 39582774 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 39583112 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 39583135 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39583182 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 39583183 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 39583383 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 39583693 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39583806 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 39584033 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 39584060 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 39584143 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 39584264 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39584280 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 39584286 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 3 39584344 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 39584461 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 39584635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39584659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39584868 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 39584930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39585447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39586169 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 39586370 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39586410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39586509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39586567 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39586660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39586669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39586830 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 39587056 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 39587320 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39587440 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39587691 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39587772 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39587958 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 39588245 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 39588918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39589057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39589180 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39589876 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39589969 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 39590548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39590918 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39591172 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39591315 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 39591500 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39592080 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39592340 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39592629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39592646 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39592984 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 39592987 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 39593092 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39593203 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 39593319 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 39593871 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 39594460 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 39594755 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 39594871 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 39594899 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 39595005 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39595194 T G N N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 3 39595241 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 39595257 G A N Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.5 0 0.5 6 6 3 0 3 3 39595381 C G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 3 39595585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39595600 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39596722 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 39596836 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39597163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39597201 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39597205 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39597327 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39597346 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39597460 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39597472 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39597655 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 39597666 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 39597677 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 39597698 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 39597723 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 39597739 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 39597749 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 39597831 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 39597841 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 39597858 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 39597878 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39598045 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 39598336 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39598394 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39598482 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39598520 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39598618 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 39598694 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 39598699 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 39598728 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39598853 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 39598892 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 39598977 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 39598981 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 39598993 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 39599020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39599706 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 39599821 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 39599852 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39599964 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39600000 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 39600028 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 39600039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39600046 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 39600084 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39600086 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39600204 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 39600280 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 39600317 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 39600363 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39600612 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 39600725 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 39600780 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 39600892 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 39601028 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 39601052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39601064 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 39601086 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39601142 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39601282 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 39601354 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 39601382 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 39601516 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 39602550 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 39602825 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39602986 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 39602989 G A N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 39603245 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 39604008 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 39604460 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39605499 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39606444 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39606805 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39606854 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 39607046 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39607083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39609071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39609089 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39609152 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39609273 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39609575 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39610137 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39610872 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39611219 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 39611222 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 39611267 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39611367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39611398 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 39611435 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 39612042 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39612058 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39612389 A C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39612402 T G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39612452 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39612515 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39612589 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39612643 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 39612644 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39612951 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39612953 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 39613628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39613835 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39613842 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39613872 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39613889 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39614312 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39614401 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39614535 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 39614576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39614617 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 39614688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39614711 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 39614754 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39614756 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 39614796 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 39615034 A G N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 39615101 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 39615129 G T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 39615159 G T N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 39615755 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39615793 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 39615858 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39615861 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39615906 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39615992 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39616019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39616342 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39616475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39616633 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39616646 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39616683 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 39616772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39616879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39617003 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39617311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39617391 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39617417 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39617754 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39618362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39619215 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39619233 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39619332 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39619387 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39619428 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39619480 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 39619557 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39620798 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 39620836 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 39620986 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39621090 C G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 39621185 G C N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 39621229 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 39621314 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 39621347 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 39621381 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 39621397 G C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 39621399 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 39621424 A G N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 39621470 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 39621635 G C N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 39621683 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 39621701 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 39621702 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 39621736 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 39621779 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 39621794 C A N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 39621832 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 39621908 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 39621975 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39622164 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 39622198 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39622256 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 39622390 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 39622392 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39622460 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39622586 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39622689 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39622774 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 39622835 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 39623399 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39623544 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39623605 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39624117 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39624149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39624204 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39625030 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39625320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39625368 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39625390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39625497 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39625525 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39625526 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39625719 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39626660 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39626723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39626872 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39627004 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 39627899 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 39628051 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 39628199 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 39628468 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 39628863 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39629066 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 39629307 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39629331 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39629389 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39629415 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 39629455 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39629512 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 39629698 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 39629942 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39630005 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39630066 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39630170 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39630204 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39630253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39630261 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39630327 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39630438 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 39630515 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39630532 C G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39630648 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39630660 C A Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39630694 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39630724 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39631111 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39631158 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39631180 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39631197 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39631306 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39631436 C G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39631452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39631510 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39631605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39631723 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39632140 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39632148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39632374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39632682 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39632909 T G N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 39632980 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 39633121 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39633185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39633655 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39633920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39634037 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39634158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39634434 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39635691 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39635737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39635820 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 39635898 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 39636338 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 39636432 A C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39636527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39636598 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39636981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39637037 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39637324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39637354 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39637395 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 39637415 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39637678 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 39637868 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39638141 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39638467 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39638729 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39638911 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39639006 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39639025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39639086 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39639181 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39639183 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 39639398 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39639560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39639572 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39639616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39639628 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39639879 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39640196 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39640340 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39640342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39640391 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39640517 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39640640 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 39640740 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39641623 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39642837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39642943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39643002 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 39643231 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 39643512 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 39643846 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 39643864 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39643899 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39643941 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39644111 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39644180 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39644216 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39644232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39644295 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39644304 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39644627 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39644628 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39644733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39644756 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39644897 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39644931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39645251 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 39645276 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 39645358 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39645540 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39645725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39645779 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 39645908 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39646407 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39646457 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 39646538 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 39646694 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 39646926 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 39646939 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 39647407 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 39647434 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39647443 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39647604 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 39647733 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 39647830 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 39647836 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 39647860 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 39648011 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 39648165 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39648186 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 39649006 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39649310 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 39649322 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 39649388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39649469 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 39649683 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 39649709 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 39650063 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 39650095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39650142 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 39650399 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39650477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39650551 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39650713 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 39650933 A C Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 39651025 A G Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 39651410 C T Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 39651909 C G N N 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 7 7 2 3 2 3 39651917 T G N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 39652331 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39652346 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39652401 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39652402 T G Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39652640 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 39652931 C G Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 39653034 A T Y N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 39653244 C G Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 39653305 A C Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 39653377 A C Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 39653941 C G Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 39653947 G T Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 39654045 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39654070 C A Y N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 3 39655165 C T Y Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 3 39655458 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 4 8 2 0 4 3 39656031 C T Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 39656316 A G Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 39656502 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39656700 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 39656750 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 39656955 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 39656991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39657294 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 39657456 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 39657701 T A Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 39657704 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 39657824 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 39657919 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 39658171 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 39658716 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 39658746 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 39659750 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 39660011 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 39660060 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 39660370 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39660553 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 39660690 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 39660691 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 39660948 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 39661090 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 39661094 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 39661121 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 39661178 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 39661219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39661291 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 39661342 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 39661365 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 39661633 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 39661850 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39661866 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39662001 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 39662021 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39662265 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 39662275 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 39662290 A T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 39662310 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39662368 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39662480 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39662833 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39663209 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39663221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39663268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39663430 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39663477 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39663535 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39663594 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39666055 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 39666405 C G Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 39667158 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39667269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39667344 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 39667602 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39670111 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 39671226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39671336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39671807 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39673891 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39674170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39674196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39674299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39674302 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 39674372 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 39674408 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 39674435 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 39674447 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 39674489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39674490 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 39674587 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 39674589 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 39675235 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39675416 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39675433 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39675648 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 39675686 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 39675754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39675931 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 39676444 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39676480 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39676515 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 39676539 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 39676542 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 39676741 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 39676744 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 39676779 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 39676784 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 39676796 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 39676798 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39676827 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 39676859 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39676911 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 39676932 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 39677116 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 39677123 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39677156 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39677174 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 39677188 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39677211 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39677230 G T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 39677267 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 39677292 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 39677310 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 39677344 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 39677533 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39677565 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39677615 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 39677640 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 39677723 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 39677726 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 39677759 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 39677764 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 39677987 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 39678009 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 39678018 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 39678066 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39678339 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 39678482 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 39678503 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 39678558 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 39678648 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39679261 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39679406 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39679599 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 39679623 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 39679679 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 39679681 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39679770 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 39679926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39680002 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39680043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39680053 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 39680119 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 39680150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39680219 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 39680282 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39680304 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 39680340 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 39680341 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 39680464 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 39680480 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 39680705 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39680815 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 39680912 G C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 39681027 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39681059 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 39681099 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 39681138 A T Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 39681189 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 39681423 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 39681442 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 39681445 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 39681492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39681598 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 39682200 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 39682589 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 39682735 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 39682861 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 39683128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39683167 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 39683392 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39683534 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 39685781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39686486 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39686626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39686951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39688238 T C Y Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 12 10 1 10 0 3 39688517 C G Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 3 39688653 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 39688778 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 39689324 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 39689372 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 39689449 A G Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 3 39689461 G T Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.611111111111111 0.111111111111111 0.277777777777778 24 12 11 2 5 3 39689759 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 39689918 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 39689980 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 39690044 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39690163 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 39690292 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 39690403 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39690500 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39690635 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 39691516 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 39691645 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 39691868 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 39691987 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 39692171 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 39692211 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39692253 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 39692312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39692366 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39692395 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 39692495 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39692565 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39692765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39692916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39692967 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 39693126 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 39693230 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 39693605 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 3 39694192 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 39694454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39694756 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39694775 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39695081 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39695204 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 39695343 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39695516 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39696071 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39696923 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39697100 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 39697461 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 39697608 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39697644 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39698160 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39698351 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 39698544 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 39698849 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39699234 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 39699274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39699887 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 39699938 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 39699993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39700073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39700225 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 39700621 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 39700842 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 39701364 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 39701680 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 39702485 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 39702608 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 39702642 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39702824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39703254 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39703600 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 39703666 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 39703809 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 39703917 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39703947 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 39704204 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39704315 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 39704398 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 39704492 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 39704544 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 39704599 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 39705484 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39705489 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39706707 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39707318 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 39707413 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 39708065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39708752 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39708889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39709030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39709178 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39709361 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 39709383 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 39709427 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 39709477 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 39709478 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 39709679 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39709695 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39709701 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39709707 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 39709713 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 39709719 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 39709771 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 39709786 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 39709886 T G Y N 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 8 6 1 6 0 3 39709966 C T Y Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 3 39710013 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 39710190 A T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 39710274 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 39710292 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 39710335 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 39710351 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 39710418 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 39710433 C T N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 3 39710475 C G N N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 5 15 2 1 7 3 39710480 T C N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 5 11 2 1 5 3 39710518 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 4 2 2 0 1 3 39710651 C T Y Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 3 39710728 A G N Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 3 39710758 T C Y Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 6 6 1 4 1 3 39710830 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 39710843 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 39710861 G T N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 39710879 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 39710890 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 39710911 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 39711180 G C N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 3 39711192 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 39711590 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 39711636 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 39711699 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39711792 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39711799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39711850 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39711855 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 39711862 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39711875 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39711904 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39711923 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39711937 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39711938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39712024 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39712026 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 39712101 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39712113 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39712375 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39712414 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 39712467 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 39712470 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39712521 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39712524 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39712622 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39712690 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39712732 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 39712742 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 39712761 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 39712848 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 39712859 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39712928 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39712930 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39712957 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 39713030 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 39713046 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 39713110 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 39713131 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39713163 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 39713271 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 39713327 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39713353 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39713476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39713530 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39713648 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39713690 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 39713980 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 39713990 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39714069 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39714290 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39714293 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39714425 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 39714494 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 39714572 A C Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 39714741 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39714964 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 39715002 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 39715041 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39715404 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 39716997 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39717778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39718765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39726268 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 39727151 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 39727299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39727832 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39729643 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 39730460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39730566 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39730646 C T N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 39731275 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39731331 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 39732420 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39732481 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39732559 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39733732 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39734121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39734984 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 39736133 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39736152 G T Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 39740486 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 39740542 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 39740593 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 39740957 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 39741009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39741158 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 39741193 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39741300 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 39741320 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 39741414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39741440 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 39741512 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39741659 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 39742014 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 39742364 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 39742654 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39742660 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39742699 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 39743054 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 39743344 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 39743582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39743960 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 39744055 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39744551 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 39744684 A G N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 39745210 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 39745268 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39745463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39745614 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39745783 G T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 3 39746126 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 39746181 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 39746249 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 39746322 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 39746366 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 39746561 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 39746928 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39747222 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 39747383 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 39747612 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 39747954 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 39748269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39748479 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39748583 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39748634 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39749002 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39749038 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39749080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39749095 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39749352 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 39749648 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39750258 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 39750332 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 39750345 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39750737 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39750802 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 39750826 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 39750946 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39750963 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 39750992 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 39752436 C G Y N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.416666666666667 0.5 0.0833333333333333 16 8 5 6 1 3 39753910 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 39754143 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39754603 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 39754696 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 39754852 G C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 39755000 G A N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 3 39755315 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39755466 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39755490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39755621 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39755957 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39756049 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39763402 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39763641 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39763726 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39763767 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39763882 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39763999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39764046 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 39764434 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39764557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39764738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39764927 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 39765079 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39765343 A C Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 39765404 C T N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 3 39765609 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 39765805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39765973 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 39766838 G T Y N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 39768168 G A Y Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 39768855 C A Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 39768920 G A N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.384615384615385 0.230769230769231 0.384615384615385 13 13 5 3 5 3 39769011 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39769665 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 39771613 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 39772173 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 39772365 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 39772366 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 39772401 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 3 39772481 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 39772482 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39772541 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39772545 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 39772560 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39772568 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 39772803 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 39773020 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 39773257 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 39773444 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.5 0.111111111111111 0.388888888888889 20 16 9 2 7 3 39773717 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39773803 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39774010 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39774074 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39774142 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 39774189 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39774200 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 39774245 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39774311 T G N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 39774488 A T N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 39774552 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 39774582 T C Y Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.153846153846154 0.846153846153846 0 15 11 2 11 0 3 39774583 T C N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.230769230769231 0.769230769230769 0 16 10 3 10 0 3 39774607 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 39774625 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39774681 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39774720 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 39774834 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 39774835 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 39774920 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 39775004 G T N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 39775012 G T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 39775034 A T N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 39775061 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 39775122 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39775311 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39775330 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 39775467 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 39775648 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 39775691 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 39775702 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39775709 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 39775861 T C Y Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.153846153846154 0.769230769230769 0.0769230769230769 14 12 2 10 1 3 39782616 T C Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 39782635 C A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 39782647 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 39782732 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 39782790 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0555555555555556 0.722222222222222 0.222222222222222 15 21 1 13 4 3 39782882 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 39782883 G T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.0588235294117647 17 17 1 15 1 3 39782958 C G N N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 3 39782980 A C N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 39783156 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 39783185 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 39783247 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 39783273 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 39783436 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39783501 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 39783637 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 39783826 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 39783920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39783993 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 39784057 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 39784070 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 39784082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39784176 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 39784388 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 39784627 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 39784720 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 39784762 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 39784976 A T N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 3 39785019 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39785051 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 3 39785083 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 39785133 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 39785163 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 39785460 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 39785492 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 39785542 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 39785630 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 39785804 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 39785853 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 39785903 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 39785921 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 39785926 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 39786134 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 39786138 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 39786146 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 39786150 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39786161 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39786327 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 39786333 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 39786663 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 39786706 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 39786723 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 39786972 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 39787381 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 39788768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39788904 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39789114 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39789784 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39792480 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 39792842 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39793056 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39793862 T G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 39794123 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 39794136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39794334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39794469 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 39794709 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 39794788 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 39794977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39795055 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 39795189 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 39795218 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39795283 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 39795377 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39795435 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 39795483 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39795484 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39795496 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 39795660 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 39795715 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39795990 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39796044 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39796098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39796138 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 39796186 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 39796196 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 39796317 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 39796332 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 39796366 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 39796405 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39796413 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 39796556 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 39796805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39796819 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39796881 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 39796885 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39796986 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39797212 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39797242 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39797337 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39797353 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39797435 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 39797512 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 39797531 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39797738 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 39797757 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 39798041 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39798819 T G Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 39799803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39799825 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 39800448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39800486 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 39800766 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39800773 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 39800806 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39800824 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 39800838 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 39801002 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39801096 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 39801170 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39801244 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 39801261 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39801292 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39801307 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39801344 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 39801362 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 39801539 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39801583 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 39801632 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 39801652 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 39801859 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39803015 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39803637 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39804505 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39804659 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 39805544 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 39806131 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39806640 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 39808041 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39808060 G C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 39809135 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39809349 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 39809670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39809986 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 39810795 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 39812096 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39812123 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39815011 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39815743 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39816252 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39817001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39817834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39818150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39818197 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39818208 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39818804 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39821258 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39822373 T G Y N 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.363636363636364 0.272727272727273 0.363636363636364 11 11 4 3 4 3 39827814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39828410 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39828978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39829196 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 39830420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39833468 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39834269 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39834453 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39837342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39837508 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 39837663 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 39837775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39838056 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39838229 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39838266 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39839232 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.1875 0.75 0.0625 18 14 3 12 1 3 39839626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39841585 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 39842037 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39842243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39842323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39843170 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39844616 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39844699 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 39845307 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39848045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39848050 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39848276 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39848384 T C Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 39848716 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39848739 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39848843 G A N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 3 39849704 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 39850166 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39850345 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39850412 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39855088 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 39855209 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39856110 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 39856151 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 39856197 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39856244 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 39856392 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 39856403 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 39856474 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 39856672 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39856693 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39856718 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39856751 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39856812 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39856900 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39856911 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39856920 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39857005 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 39857042 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 39857080 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39857153 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39857211 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39857287 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39857408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39857730 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 39857773 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 39857802 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 39857890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39857950 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 39857957 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39858433 A G Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 39858456 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39858464 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 39858740 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 39858847 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39858891 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 39859064 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39859077 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39859188 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39859210 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39859460 T G Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 3 39860103 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39860213 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39861102 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39862192 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39862998 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39863650 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39863905 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39863978 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39864018 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 39864031 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39864048 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39864150 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 39864176 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39864188 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39864232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39864321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39864330 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 39864420 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 39864930 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 39864935 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39865095 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 39865149 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39865206 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 39865295 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 39865352 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 39865417 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39865437 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39865455 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 39865688 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 39866146 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 39866321 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39866351 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 39866630 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 39866674 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 39866788 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 39866870 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39867015 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 39867065 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39867168 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39867565 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39868516 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 39868652 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 39868740 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 39868771 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 39868978 G C Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 39869041 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39870060 G C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 39870375 C G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 39870392 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39870920 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 39871230 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 39871372 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 39871422 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 39871496 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39872812 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 39874468 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 39874569 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 39874805 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39874901 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39876458 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39876873 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 39877115 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39877404 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 39877455 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39878060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39878869 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 39879100 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 39879661 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39879697 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 39879933 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 39879949 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 39880776 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 39880973 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 39881046 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39881153 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 39881214 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 39881224 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39881387 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 39881442 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 39881470 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 39881515 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 39881561 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 39881568 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 39881874 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39882308 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 39882545 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39883072 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 39883403 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 39884208 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39884256 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39884659 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39884838 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 39884871 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39885446 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39885955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39886003 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39887200 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 39887765 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 39888006 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39888194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39888244 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 39888564 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 39889188 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 39890094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39890371 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 39890455 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 39890494 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 39890500 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 39890734 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 39890928 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 39891232 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 39891254 T G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 39891264 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 39891673 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39891681 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 39891700 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39891851 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39891974 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39892058 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 39892074 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39892078 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39892100 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39892158 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 39892188 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39892234 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39892454 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39892486 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39892861 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 39892992 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 39892994 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 39893027 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 39893055 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 39893260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39893292 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 39893295 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 39893323 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 39893554 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 39894133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39894438 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 39894581 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 39894740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39894965 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39894970 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39894998 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39895026 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39895081 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39895122 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39895180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39895231 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39895412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39895469 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 39895471 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 39895508 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 39895674 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39895746 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39895757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39895802 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 39895830 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 39895843 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 39895877 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39896204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39896275 A T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 39896313 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39896524 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39896537 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39896552 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39896563 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39897246 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39897313 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39897463 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39897485 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39897547 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39897555 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39897569 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 39897727 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39897828 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39897869 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39897926 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 39897931 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39897971 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 39898230 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 39898256 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 39898284 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 39898302 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 39898450 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39898482 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39898534 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 39898793 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 39898950 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39899157 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 39899236 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39899295 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39899801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39900299 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39900329 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39900376 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39900399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39900517 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 39900552 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39900603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39900732 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39901090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39901797 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39902009 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39902424 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39902880 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39903347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39903626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39903648 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39903838 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 39904567 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 39904623 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 39904627 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 39904673 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 39904741 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 39905238 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 39905475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39905586 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 39905671 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 39905791 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 39905808 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 39906217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39907080 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39907932 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39908297 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39910754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39910823 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39912937 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39913435 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39913437 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39913466 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 39914239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39914460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39915997 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39916187 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39917834 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 39918879 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 39920481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39920589 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 39920813 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 39920814 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 39920838 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39921072 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39921096 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 39921212 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 39921375 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 39921505 A T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 39921506 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 3 39921798 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39921895 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 39921976 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 39922019 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39922083 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39922856 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39922869 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 39922923 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39923102 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39923120 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 39923156 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39923181 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39923660 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 39924536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39924624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39925199 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 39926699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39927796 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39928288 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39930340 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39930896 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39931081 G C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 39931324 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 39931401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39932821 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 39932866 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 39933092 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 39933168 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 39933172 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 39933306 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 39933323 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39933372 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 39933592 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 39933824 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 39933993 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 39934342 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 39934614 G C N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 39934623 C T N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 39934741 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 39934820 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 39934841 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 39935057 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 39935061 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 39935373 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 39935412 G T N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 39935511 G T N N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 3 39935594 C A N N 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 3 39935635 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 39935640 A C N N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 3 39935905 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 39936050 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 39936096 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39936125 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 39936135 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 39936153 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 39936226 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 39936233 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 39936263 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 39936426 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 39936435 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 39936514 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39936556 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 39936798 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 39937043 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 39937049 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 39937061 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 39937070 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 39937140 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39937619 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.214285714285714 0.714285714285714 0.0714285714285714 16 12 3 10 1 3 39938277 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 39938337 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 39938558 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 39938570 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 39938578 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 39938605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39938618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39938625 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 39938657 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 39938751 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 39938803 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 39938943 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 39939023 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39939165 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 39939416 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 39939442 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 39939481 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 39939487 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 39939534 G A N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 3 39939696 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 39939717 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 39939748 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 39939753 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 39939823 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 39939866 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 39939882 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 39939919 C A N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 39940117 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 39940148 A G Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 39940159 A G Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 39940425 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39940432 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 39940459 T A Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 39940484 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39940488 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 39940561 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 39940592 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 39940594 C A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 39940626 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 39940653 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 39940692 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 39940875 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 39940928 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39940970 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 39941004 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 39941009 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 39941104 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39941188 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 39941255 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 39941256 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 39941285 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 39941313 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 39941490 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 39941521 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 39941543 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 39941609 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 39941647 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39941656 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 39941689 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 39941887 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 39941897 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 39942126 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 39942169 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39942245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39942301 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 39942336 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39942347 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39942365 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 39942512 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39942571 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39942794 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39942906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39943121 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39943202 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39943272 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39943301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39943321 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39943494 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39943564 A T Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 39943589 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39943599 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 39943655 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39944609 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39944964 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 39945627 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39949127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39949252 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39949385 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 39949924 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39950325 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 39950432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39951013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39951284 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 39951327 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 39951551 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39951556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39952078 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 3 39952281 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 39952367 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 39952503 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 39952615 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 39952637 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 39952881 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 39953062 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39953141 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 39953193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39953537 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 39953554 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 39953634 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 39953836 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 39954013 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 39954045 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39954112 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39954165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39954758 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39954791 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 39954987 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39955002 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39955150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39955175 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39955191 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39955322 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39955344 T G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 39955443 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 39955448 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39955668 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 39955761 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 39955967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39956140 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39956268 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 39956322 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39956557 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39956799 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39956962 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39957840 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 39958253 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 39958283 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39958373 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 39958416 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 39958593 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39958911 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 39959025 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 39959098 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39959499 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39959693 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 39959726 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39959919 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 39960089 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 39960247 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 39960418 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 39960423 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39960723 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 39960760 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 39960801 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 39961043 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 39961146 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 39961159 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 39961375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39961863 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 39962150 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 39962292 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 39962541 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 39963224 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 39963325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39963459 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 39963609 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 39963676 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 3 39963687 C T N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 39963774 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 39963796 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 39963832 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 39964203 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 39964227 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 39964277 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 39964289 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 39964354 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 39964376 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 39964422 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 39964497 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 39964560 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 39964838 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39964905 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 39964915 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 39964982 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 39964989 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39965177 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 39965188 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 39965202 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 39965278 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 39965393 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 39965415 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 39965476 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 39965518 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 39965579 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 39965603 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 39965931 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 39966120 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39966224 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39966278 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39966526 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39967167 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 39967333 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39968486 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39968568 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 39968586 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39968704 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39969170 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 39969499 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 39970322 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39970427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39973656 A G N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 3 39973683 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 39973780 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39973903 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 39974121 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39974855 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39974982 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39975013 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39975024 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39975027 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39975281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39975632 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39976846 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39977083 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39977775 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 39978260 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 39978271 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 39978297 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 39978306 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 39978323 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 39978879 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 39979118 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39979988 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39980638 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 39982459 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39982782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39983353 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39986111 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39986365 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39986388 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 39987457 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 39988013 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39988026 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 39988188 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 39988465 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 39988481 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 39988521 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 39988522 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 39988540 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 39988604 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 39988673 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 39988800 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39988848 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39989096 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39989473 A C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 39990771 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 39992949 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 39994093 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 39994177 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 39995598 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 39995650 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39997261 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 39997781 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 39998140 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.315789473684211 0.105263157894737 0.578947368421053 14 24 6 2 11 3 39999074 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 39999904 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40000620 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 40002281 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40002796 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40004092 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40004329 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40009852 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40012572 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40014064 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 40018197 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40020722 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40021509 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 40021640 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40021909 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40022284 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 40022429 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 40022911 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.55 0.1 0.35 24 16 11 2 7 3 40023034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40023674 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 40024078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40025465 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40026616 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 40027505 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40027677 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40028469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40030123 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40031429 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40034644 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 40038447 T G Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 40038952 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40039649 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40039822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40040050 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 40040065 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 40040095 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40040101 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 40040542 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 40040552 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 40040598 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 40040701 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 40040719 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 40040767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40040774 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 40040859 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 40041125 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40041128 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 40041167 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40041199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40041472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40041482 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40041643 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40041785 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40041853 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 40042474 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 40042527 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 40042646 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 40042735 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 40042916 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40042940 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 40043011 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40043013 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 40043051 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 40043122 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 40043225 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 40043226 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 40043264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40043402 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40043440 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40043566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40043583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40043712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40043721 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40043740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40043758 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40043985 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 40044160 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40044171 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40044886 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 40044887 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 40044912 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 40044926 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40044948 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40045030 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40045034 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40045047 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40045075 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 40045089 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40045091 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40045129 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40045177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40045270 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40045319 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40045358 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40045413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40045454 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40045505 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 40045633 A C N N 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 5 13 2 1 6 3 40045740 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 40045803 A G N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.230769230769231 0.153846153846154 0.615384615384615 8 18 3 2 8 3 40045964 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40046048 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 40046111 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 40046199 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 40046227 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 40046321 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 40046351 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 40046390 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.214285714285714 0.142857142857143 0.642857142857143 8 20 3 2 9 3 40046520 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 3 40046579 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 40046835 C A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 40046887 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40046922 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40046942 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 40046989 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 40046995 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 40047029 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 40047104 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40047125 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 40047191 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40047271 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 40047285 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 40047526 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 40047637 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 40047649 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 40047691 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40047913 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 40047943 A G N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 3 40047992 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40048042 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 40048125 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 40048137 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 40048285 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 40048294 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 40048396 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 40048510 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 40048639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40048758 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 40048854 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 40048892 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 40048984 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 40049006 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 40049024 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 40049085 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 40049097 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 40049646 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.333333333333333 0.111111111111111 0.555555555555556 14 22 6 2 10 3 40049652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40049906 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 40049954 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40050020 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 40057252 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 40057460 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 40057514 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 40058005 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 40058103 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 40058888 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 40059139 C A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 40059224 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 40059387 C A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 40059443 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 40059445 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 40059490 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 40059497 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 40060725 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 40064086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40065493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40065737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40065750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40067601 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40067635 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40067649 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40068223 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40069783 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40070088 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40070717 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40072531 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40073484 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40073492 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40074390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40076481 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40076602 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40077109 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 40077840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40077978 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 40079864 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40079910 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40080544 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 40082306 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40082542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40082945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40084346 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 40084383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40085689 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40086198 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40086229 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 40086725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40086859 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 40087732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40087815 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 40088086 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40088225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40088442 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 40088501 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 40088608 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 40088626 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 40088636 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 40088665 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 40088770 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 40088863 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 40088876 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 40089441 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40089488 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 40089544 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40089748 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 40090234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40091268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40091423 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40091477 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 40091932 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 40092270 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40092793 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40092817 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 40093082 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40093085 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 40093096 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40093151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40093192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40093203 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40093207 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40093222 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 40093789 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 40094060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40094122 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40095162 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40095275 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40095291 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40095294 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 40095419 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40095450 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40095715 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 40095757 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40096032 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40096150 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 40096243 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 40096259 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 40096324 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 40096349 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 40096373 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 40097039 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 40097045 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 40097093 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 40097375 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 40097417 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40097496 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 40097640 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 40097670 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40097723 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 40097764 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40097809 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 40098104 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40098161 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40098170 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40098231 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40098335 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 40098451 G C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 3 40098459 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40098525 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40098595 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 40098655 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40098676 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 40098692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40098975 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 40099016 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 40099372 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40099435 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40099441 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40099489 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40099518 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 40099597 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40099647 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 40099679 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40099833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40099926 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 40099985 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 40100212 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40100278 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40100317 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 40100323 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 40100471 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 40100529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40100605 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 40100695 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 40100821 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 40100892 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 40100905 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 40100929 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 40100940 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 40101017 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 40101028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40101073 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 40101124 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 40101183 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 40101227 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 40101347 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 40101397 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 40101411 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 40101414 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 40101507 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 40101795 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 40101812 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 40101828 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 40101844 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40101899 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 40102069 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40102150 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 40103080 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40103171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40103172 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 40103304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40103350 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 40103367 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 40103393 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40103414 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40103460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40103463 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40103512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40103827 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 40103873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40105660 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40107518 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40108435 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40108514 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 40108547 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 40108652 T A N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 40108887 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40109530 A C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 40109587 G T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 40109608 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 40109880 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 40109915 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 40109958 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 40110163 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 40110169 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40110293 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 40110306 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40110314 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 40110321 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40110326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40110427 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 40110628 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40110813 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40111693 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40111819 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 40111839 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 40112083 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 40112410 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 40112482 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 40112545 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 40112718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40112782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40112877 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40112994 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 40113226 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 40113231 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 40113452 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 40113455 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 40113545 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 40114043 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40115475 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40115640 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 40115663 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 40115720 A G Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 40115856 A G Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 40115977 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40116207 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40116231 A G Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 40116357 G T Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 40116402 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40116457 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40116713 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 40116896 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 40117005 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 40117162 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 40117782 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 40117795 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 40117854 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 40117889 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 40118288 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 40118684 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 40118772 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40118816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40118893 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 40118958 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 40119014 G A Y Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 9 7 3 3 2 3 40119057 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 40119525 G C N N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 3 40120091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40120239 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40120317 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40120582 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 40120712 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 40120753 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 40120956 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 40121068 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 40121092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40121106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40121305 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 40121404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40121412 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 40121559 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 40121617 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 40122275 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 40122300 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 40122386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40122609 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 40122694 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 40122756 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40122758 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 40122849 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 40123269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40123338 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40123523 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 40123748 G C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 40123875 G T Y N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 40123981 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 40124016 G A N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 9 11 3 3 4 3 40124017 G A N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 9 11 3 3 4 3 40124115 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 40124137 T G N N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 3 40124178 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 40124471 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40124489 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40124770 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40124850 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40124889 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 40124921 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 40125212 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 40125272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40125348 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40125360 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 40125608 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 40125731 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 40125889 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 40126140 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40126475 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40126911 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40127557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40127574 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 40127944 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40128073 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 40128101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40128114 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 40128191 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40128408 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 40128470 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 40128549 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 40128869 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 40128924 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 40129943 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40130229 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 40130359 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 40130538 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 40130712 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 40132025 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 40132087 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 40132377 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40136267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40136622 C A N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0 0.75 0.25 12 20 0 12 4 3 40138205 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 40138316 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40139787 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 40140123 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40140723 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 40141158 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 40143534 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 40143658 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40144039 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 3 40144252 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 40144922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40145182 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40145209 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 40145237 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 40145293 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 40145346 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 40145347 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 40145385 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40145395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40145496 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40145505 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40145519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40145652 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40145769 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 40145917 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40145957 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 40146033 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 40146034 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40146112 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 40146169 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40146381 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 40146390 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40146420 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40146462 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40146485 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40146502 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 40146510 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40146797 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40146798 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40146914 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40146921 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40146925 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 40147049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40147106 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40147126 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40147142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40147174 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 40147215 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 40147282 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 40147302 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 40147335 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 40147355 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40147570 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 40147658 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 40147870 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 40147925 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 40148108 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 40148123 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 40148130 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40148147 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40148171 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 40148220 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 40148313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40148324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40148329 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 40148398 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40148464 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 40148509 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 40148518 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 40148550 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 40148554 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40148574 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 40148580 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 40148745 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40148800 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40148805 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 40148877 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 40148950 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40148983 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40148988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40149036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40149073 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 40149081 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40149090 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40149258 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40149348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40149356 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40149419 A C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 3 40149532 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 40149562 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40149656 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40149667 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 40149748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40149889 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40150022 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40150108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40150122 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 40150184 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40150252 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 40150270 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 40150509 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40150617 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40150619 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40150669 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40150703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40150737 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 40150870 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40150960 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 40150980 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40150996 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40151143 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40151222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40151235 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40151243 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40151283 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40151372 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40151502 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40151506 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40151648 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 40152071 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 40152201 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 40152238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40152261 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40152312 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 40152402 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 40152416 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40152554 T A Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.111111111111111 0.833333333333333 0.0555555555555556 19 17 2 15 1 3 40152557 A T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0 0.882352941176471 0.117647058823529 15 19 0 15 2 3 40152607 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40152636 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40152791 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 40152860 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40152901 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40153509 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40153513 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40153562 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40153779 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 40153901 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 40153902 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 40154111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40154395 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 3 40154497 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 40154504 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 40154553 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 40154615 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 40154635 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 40154639 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 40154712 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 40154741 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 40154849 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 40154872 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 40154903 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 40155050 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 40155152 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 40155195 A C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 40155248 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 40155255 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 40155592 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 40155663 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 40155727 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40155917 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 40155970 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40156480 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 40156691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40156838 C G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 40156905 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 40156990 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 40157040 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40157151 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 40157226 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 40157375 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 40158696 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40160121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40160999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40161897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40162447 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40162827 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40162890 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40165213 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40167007 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40167070 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40173896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40173971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40175723 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 40175946 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40176463 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40176464 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40176569 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40178027 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40182052 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40182446 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 40183852 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40184126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40184202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40185943 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40186250 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40186690 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40187850 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40187920 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 40188450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40189139 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 40189250 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40189280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40192265 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 40193165 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 40193638 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 40193749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40193958 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40193984 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40194717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40196022 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 40196518 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 40196543 C G N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 3 40196678 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 40196698 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 40196876 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40196955 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 40197016 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 40197049 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 40197274 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 40197279 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 40199110 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 40199321 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 40199497 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 40199536 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40199708 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 40200730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40200869 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 40200899 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 40200950 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40200985 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 40201008 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 40201123 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40201180 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 40201181 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 40201240 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.235294117647059 0.117647058823529 0.647058823529412 10 24 4 2 11 3 40201246 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40201417 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 40201712 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 40201810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40201904 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 40201913 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 40201935 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 40202060 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 40202317 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 40202382 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 40202429 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 40202449 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 40202569 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 40202617 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40202859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40203120 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40203782 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 40203899 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 40204256 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40204278 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40204282 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40204299 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40204302 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40204320 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40204801 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 40204855 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40204885 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 40205371 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 40205491 A C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 40206277 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 40206289 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 40206353 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 40206580 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40206659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40206668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40206755 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 40207010 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 40209795 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40209870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40210001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40210182 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 40210227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40210245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40210897 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40210907 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 40210942 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 40211444 C T Y Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 40211479 A G Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 3 40211751 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 11 7 4 3 2 3 40213639 G A Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 40213671 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40214033 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40215062 C G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 40216106 T C Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 40216806 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 40216807 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 40216895 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40216947 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 40217043 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 40217062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40217072 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 40217146 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 40217633 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40218016 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40218058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40218333 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 40218431 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40218456 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40218495 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40218612 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40218824 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40218999 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40219028 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 40219101 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40219193 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40219304 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 40219420 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40219675 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40219770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40219848 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 40219977 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 40220142 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40220173 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 40220175 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 40220328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40220428 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40220541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40220569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40220891 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40220935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40222277 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 40222515 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40222691 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 40222857 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40222904 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 40223042 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 40223074 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 40223104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40223283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40223512 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40224258 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40224995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40225140 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40226553 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 40226583 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 40228269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40228566 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40228610 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 40228777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40229153 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40229170 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40229279 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40229291 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40229361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40229368 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40229375 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40229986 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40230297 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40230311 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40234141 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40234951 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40234992 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40235189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40236168 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 40236866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40236975 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40237679 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 40238515 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40239904 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40239951 C T Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 40240876 C G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 40241427 G A Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 40241860 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 40241861 T G N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 40242103 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40242258 C G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 40242260 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 40242295 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40242324 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40242425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40242426 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 40242470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40242489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40242538 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40242759 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40242804 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40242816 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40243044 C G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 40243109 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 40243226 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 40243240 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 40243344 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 40243764 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 40244569 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40244626 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 40244737 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 40244751 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 40245041 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 40245063 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 40245089 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 40245158 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 40251741 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40251934 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40252095 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 40252178 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 40252343 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 40252624 T G Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 40252636 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 40252655 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40252721 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 40253615 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 40253652 A C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 40253715 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 40253726 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 40253743 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 40253853 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40254284 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40255265 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40255964 A G Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 40256284 A G Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 40256315 T C Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 40257631 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40257801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40259091 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 40259333 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 40259365 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 40259458 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 40259750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40259767 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40259773 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 40259779 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 40262140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40262168 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40265580 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40265748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40265752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40265766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40265789 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 40269220 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40269595 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 40269597 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40269631 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 40269755 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40270058 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 40270298 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 40270436 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 40270459 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 40270484 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 40270567 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40270580 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 40270653 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40271149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40271178 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 40271619 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40271640 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40271656 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 40272378 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 40272564 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 40272960 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40273382 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 40273578 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40273670 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 40273738 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 40273920 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 40274067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40274188 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40274201 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 40274291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40274367 G C Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 40274419 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40274822 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40274841 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 40274895 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40275047 G A Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 40275447 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40275474 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 40275480 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 40275613 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40275684 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40275766 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 40276006 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 40276033 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 40276097 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 40276110 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 40276413 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40277128 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 40277388 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40277840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40278788 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40279101 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 40280080 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40281318 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 40281490 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 40282118 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 40282175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40282263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40282354 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 40286222 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 40286629 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40287340 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 40287506 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40287685 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 40287698 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 40287782 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 40287845 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 40288013 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 40288119 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 40288247 T C N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 3 40288612 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40288695 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 40288704 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 40288766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40289049 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40289283 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40289351 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40292422 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40292598 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40293863 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40294124 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40294258 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40294667 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 40294733 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40294771 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40295190 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 40295621 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 40295999 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 40296485 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 40296503 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 40296515 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 40296555 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 40296623 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 40296695 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 40296714 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 40296747 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 40298007 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40298448 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40298687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40299462 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40300636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40301821 A C Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 40302104 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 40302304 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40302757 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 40302840 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40303223 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40303282 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 40303453 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40303457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40303555 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40303571 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 40304774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40305172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40305966 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 40306307 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 40306312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40306402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40306634 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40306682 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 40306685 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 40306702 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 40306707 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 40306837 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40306900 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40307075 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 40307475 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 40307593 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 40307731 A C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 40307759 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 40308725 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 40308763 G A N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 3 40308910 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 40309634 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40309800 T G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 40309812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40310194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40310279 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 40310293 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40310570 G A Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 40310808 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40310813 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40310826 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 40310908 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 40310932 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40311007 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 40311158 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40311170 C A Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 40311214 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40311465 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40311515 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40311650 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 40311705 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40312161 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 40312208 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 40312250 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 40312380 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40312455 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 40312466 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40312630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40312654 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40312763 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 40313328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40313329 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 40313387 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 40313402 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 40313419 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 40313430 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 40313608 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 40313647 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 40313651 A T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 40313740 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 40313975 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 40314273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40314498 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 40314595 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 40314630 A C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 40315037 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40315291 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40315384 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 40315591 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 40315647 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40315847 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 40316046 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40316160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40316180 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 40316339 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 40316358 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40316360 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 40316400 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 40316547 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40316701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40316727 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40316759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40316997 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 40317101 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 40317150 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 40317229 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 40317366 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 40317769 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 40317925 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 40318088 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 40318217 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 40318480 G C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 40318673 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 40318683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40318717 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 40319077 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40319097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40319138 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 40319161 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 40319162 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 40319181 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40319440 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40319505 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 40319513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40319935 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 40319983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40320132 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 40320212 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 40320277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40320368 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 40320459 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 40320549 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40320802 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 40320870 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 40321076 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 40321122 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 40321279 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 40321288 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40321307 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 40321370 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 40321397 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 40321398 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 40321410 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 40321676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40322048 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 40322058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40322796 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 40323058 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40325115 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40325892 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40329934 C G Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 40330934 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40331068 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 40332579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40332931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40333264 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40336992 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 40337067 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 40337283 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 40337333 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40337564 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40337643 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40337666 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40337748 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40337820 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40337824 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40337846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40337943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40337964 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40338647 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40338668 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40338671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40338925 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 40339216 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40339385 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40339570 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 40339667 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 40339918 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 40340434 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 40340582 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 40340844 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 40340931 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 40340934 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 40341011 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 40341117 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 40341262 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 40341290 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 40341309 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 40341314 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 40341325 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 40341331 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 40341394 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 40341422 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 40341423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40341458 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 40341494 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 40341654 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 40342664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40343744 G C Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 40343773 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 40343801 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 40343816 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 40343874 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 40343875 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 40344001 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 40344057 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 40344153 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 40344158 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 40344181 T A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 40344188 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 40344275 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40344623 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 40344678 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 40344718 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40344902 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 40344956 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 40345024 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40345041 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 40345094 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 40345109 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 40345250 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40345432 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 40345526 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 40345645 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 40345654 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 40345841 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 40346171 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 40346248 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 40346264 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 40346299 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 40346360 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 40346388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40346437 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40346477 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 40346647 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 40346694 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40346776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40347160 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40347321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40347552 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 40347564 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 40347642 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 40347666 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 40347778 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40347861 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 40348212 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40348540 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 40348913 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40348985 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 40349336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40349755 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 40349774 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 40349787 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 40350395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40350516 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 40350638 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 40350723 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 40350871 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 40351045 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 40351904 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 40352447 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 40352821 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 40352854 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40353036 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40353095 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 40353445 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 40353771 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 40353783 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 40353788 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40354128 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 40354358 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 40354455 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 40354575 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 40354615 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 40354796 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 40354966 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 40355019 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 40355264 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 40355271 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 40355366 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 40355507 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 40355536 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 40355580 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 40355641 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 40355705 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40355893 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 40355981 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 40355988 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 40356179 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 40356201 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 40356673 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40357102 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40357691 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40358009 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 40358066 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40358359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40358478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40358504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40358946 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 40359057 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40359155 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40361937 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40362043 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 40362697 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40362746 C A Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 40363480 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 40363497 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 40363555 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40363578 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 40363618 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 40363636 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 40363822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40363843 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 40363914 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40364950 C T Y Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0 0.818181818181818 0.181818181818182 9 13 0 9 2 3 40365363 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 40366588 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40366625 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40366680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40366690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40366732 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40366842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40366907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40366936 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 40366970 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 40367221 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40367273 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40367523 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 40367531 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 40367559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40369102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40369380 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40369482 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 40369686 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40369958 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 40370154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40370386 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 40371299 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 40371309 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 40372117 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40373447 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 40373753 A T Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 40373912 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 40374155 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 40374866 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40374885 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 40375338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40375367 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40375455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40375512 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 40376032 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40380321 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40380907 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40381373 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 40383106 G C Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 40383942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40384233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40384426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40386855 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 40386930 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 40387007 A C Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 40387091 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 3 40387178 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40387216 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40387221 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 40387297 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 40387305 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 40387308 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 40387319 A C Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 40387321 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 40387420 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40387544 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 40387576 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 40387581 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 40387614 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40387656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40387750 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 40388042 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40388303 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40389618 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40389919 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 40390234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40390717 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 40390837 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 40390958 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40391209 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 40391241 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 40391547 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 40391639 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 40391708 C G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 40391720 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40391852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40392012 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 40392340 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40392444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40392510 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 40392601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40392659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40392723 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40392813 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40392938 G T Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 40393010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40393258 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 40393686 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 40393841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40393849 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 40393948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40394233 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 40394348 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40394597 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 40394746 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 40394866 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 40394939 A T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 40394963 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 40395042 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 40395094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40395108 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40395150 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 40395157 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 40395746 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 40395754 G A Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 40395827 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 40395833 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 40395838 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 40395847 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 40396048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40396060 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 40396228 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 40396610 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40396732 A G Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 40397473 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 40397894 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40398302 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 40398315 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 40398472 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 40398727 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 40399145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40399157 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 40399195 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 40399211 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 40399264 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40399316 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 40399394 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 40399508 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 40399532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40399834 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 40400191 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 40400259 T G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 40400266 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 40400285 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 40400307 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 40400438 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 40400555 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 40400561 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 40400872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40400886 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 40400913 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 40400916 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 40400969 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 40401023 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 40401072 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 40401100 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 40401126 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 40401216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40401225 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 40401245 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 40401412 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 40401464 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 40401534 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 40401626 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 40401698 A T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 40401702 C A N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 40401734 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 40401999 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 40402090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40402226 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 40402571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40402663 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 40402843 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 40403207 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 40403229 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 40403259 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 40403449 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40403478 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40403493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40403738 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 40403848 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40403877 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 40403949 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 40403953 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40404103 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 40404146 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 40404220 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 40404230 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 40404281 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 40404416 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 40404476 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 40405262 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 40405479 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 40405856 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40406818 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40406983 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 40407122 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40407124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40407163 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40407209 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40407229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40407259 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40407342 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 40407373 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 40407425 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 40407489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40407532 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 40407663 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40407729 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40409003 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 40409108 G T Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 40409187 G C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 40409299 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40409352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40409371 C A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 40409505 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40409573 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40410146 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 40410270 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 40410465 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40410576 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40410714 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40410880 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40410969 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 40411100 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 40411105 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40411322 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40411330 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 40411351 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40411356 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40411407 G C Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 40411445 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40411446 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 40411481 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 40411511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40411558 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40412067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40412154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40412538 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40412627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40412645 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40412667 A C N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 40412669 A G N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 3 40413427 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40413449 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 40413451 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40413496 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 40413533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40413645 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40413788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40413866 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40413893 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 40414084 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40414087 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40414190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40414210 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 40414342 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 40414525 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 40414580 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 40414655 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 40414776 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 40414852 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 40414857 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 40415173 A G Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 40415481 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 40415488 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 40415492 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 40416258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40416540 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40416636 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 40416698 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 40416708 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 40416766 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 40417004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40417079 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 40417102 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 40417104 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 40417122 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 40417183 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 40417294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40417633 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 40417939 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 40417989 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40418128 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 40418335 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40418567 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40418744 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 40418758 G C N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 40418789 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 40418907 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40418941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40419042 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40419208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40419451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40420547 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 40420900 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 40421673 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40423428 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 40423594 A C Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 40423624 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 40424441 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40424624 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 40425425 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40426505 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40426692 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40426811 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 40427100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40427425 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40428362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40429230 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 40429394 T C Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 40429773 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 40430113 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 40430206 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40430270 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 40430475 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40430584 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40430811 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40431072 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40431147 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40431243 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40431377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40431433 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 40431746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40431999 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 40432178 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 40432356 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40432695 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 40433159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40433257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40433428 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40433733 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 40433758 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40434050 A G Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.0625 0.9375 0 17 15 1 15 0 3 40434373 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 40434407 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 40434440 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 40434690 A G N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 3 40436089 A C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 40436659 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40436982 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40437080 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40437605 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 40437982 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40438320 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 40438366 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40438408 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 40438524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40438549 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40438981 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40439050 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 40439480 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 40440227 G A Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 40440233 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40440280 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40440491 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 40440506 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40440579 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40440587 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 40440699 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 40440706 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 40440783 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 40440902 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 40440945 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 40440983 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40441191 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40441560 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40441602 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40441722 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 40441748 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40442431 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 40442672 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40442888 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 40443022 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 40443175 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40443190 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40443218 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40443251 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 40443932 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 40443957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40444774 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40445051 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40445639 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40445806 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 40446084 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 40446284 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 40446501 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 40446598 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 40446671 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 40446692 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 40447199 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 40447212 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 40447410 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 40447552 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 40447566 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 40447573 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40447647 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 40447758 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.157894736842105 0.789473684210526 0.0526315789473684 21 17 3 15 1 3 40447856 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40448095 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 40448166 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40448170 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40448194 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 40448340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40448476 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 40448546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40448598 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40448625 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40448669 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40448759 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 40448806 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 40455538 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 40455717 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 40455740 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 40455744 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 40456040 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 40456787 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 40456812 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 40456867 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40457201 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 40457254 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 40458494 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 40459289 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40459970 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40460280 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 40460304 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 40460488 C G Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 40460881 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 40460939 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 40461132 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 40461145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40461803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40462247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40464968 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 40465286 G T N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 40465467 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 40465695 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 40465714 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 40465716 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 40465745 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 40465771 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 40465788 A C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 40466100 G A N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.454545454545455 0.0909090909090909 0.454545454545455 11 11 5 1 5 3 40466314 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 40466618 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 40466630 T C Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 40466660 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 40466696 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 40466832 C A Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 40466939 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 40466974 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40466995 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40467120 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 40467271 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 40467288 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 40467432 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 40467705 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40467863 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 40467978 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 40468138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40468456 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 40468488 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 40468515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40468543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40468655 C A Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 40468775 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 40468897 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 40468991 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 40469005 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 40469059 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 40469447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40469501 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 40469536 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 40469618 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40470408 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40470551 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 40470578 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40470874 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 40471427 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 40471580 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 40475931 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40476529 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 40477338 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 40478422 G A Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 3 40481659 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40483208 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 40483621 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 40483686 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 40484981 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 40485138 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 40485140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40485181 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 40485195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40485205 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 40485217 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 40485244 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 40485258 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 40485436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40485441 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40485451 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 40485533 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40486021 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40486124 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 40486434 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 40486553 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 40486714 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 40486811 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 40486963 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 40487086 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 40488718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40489239 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 40490256 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 40490656 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40491324 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 40491654 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40491763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40492025 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 40492099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40492138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40492793 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40492938 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 40493432 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 40493614 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 40493640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40494041 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 40494219 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 40494399 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 3 40494466 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.222222222222222 27 9 13 1 4 3 40494629 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40494718 G T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 40495050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40495095 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40495193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40495239 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 40495274 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 40495289 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 40496087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40496165 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 40496168 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 40496181 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40496215 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40496223 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40496262 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 40496670 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 40497822 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 40498027 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 40498322 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 40498486 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 40498584 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 40498667 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 40498744 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 40499511 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 40499560 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 40499633 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 40499735 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 40499803 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 40499973 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 40500418 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 40500514 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 40500612 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 40500620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40500730 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 40500876 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40500877 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40501062 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.157894736842105 0.789473684210526 0.0526315789473684 21 17 3 15 1 3 40501126 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 40502028 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 40502576 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40502689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40502846 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40502939 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 40502984 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40503143 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40503149 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 40503226 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 40503512 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 40503516 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 40503530 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 40503597 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 40503600 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 40503704 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 40503713 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 40503752 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 40503800 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 40503801 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 40503927 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40503938 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 40503982 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40504018 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 40504050 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 40504529 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40504533 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 40504567 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 40504574 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 40504599 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40504638 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 40504684 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40504742 T G N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 40504797 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 40504851 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 40504855 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40504882 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 40505034 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40505283 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 40505396 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 40506539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40506689 A G Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 40506828 C A Y N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 3 40506881 T G Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 40507513 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 40507807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40508191 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 40508527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40508597 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40509501 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40509747 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 40509809 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40509922 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40510313 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40510696 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40511628 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 40512116 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 40512252 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 40512420 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 40515655 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 40515722 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40517021 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40517880 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40521102 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40523329 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 40523470 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 40523929 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40523984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40524960 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40527093 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40528662 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40529327 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40529506 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40530532 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 40531095 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40532277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40532401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40538202 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40540606 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40540835 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 40541369 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 40541719 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40541934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40542360 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40542988 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40543501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40546719 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40546737 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40547258 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 40551227 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40552280 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40556459 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40559823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40562329 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 40562706 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40563474 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 40563827 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40564520 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 40564683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40565011 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40568009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40568856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40569329 A C N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 40569357 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 40569715 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 40569837 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 40569888 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 40570014 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 40570597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40571112 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 40571444 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 40571460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40571503 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 40571724 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 40572513 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 40572558 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40572733 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40572818 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 40573343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40573651 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40573735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40573989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40574110 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40574209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40574227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40576115 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40576367 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40580206 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 40581131 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40582023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40582931 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40583526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40584110 G C Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 40585973 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40587084 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40587085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40587394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40587555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40588494 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 40588914 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40590845 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 40591060 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40591458 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40591459 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40591715 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40591915 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 40595972 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40596295 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 40598231 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40598232 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40598902 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40601481 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40601653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40602837 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40603266 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40603902 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 40604527 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40606385 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40606663 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 40607318 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 40608856 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40609762 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 40609977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40611046 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40611233 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40612771 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 40613495 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40614432 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 40614891 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40614893 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40614992 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40615053 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40615087 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40616207 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40616300 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40616364 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40616692 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40616707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40616761 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 40616815 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40617071 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40617303 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40617747 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40619660 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 40620946 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40621663 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 40622248 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40622643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40623417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40623553 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 40623875 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40624670 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40625090 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 40625644 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 40625967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40627394 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40627662 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40627899 G A N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 40629097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40631468 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40631646 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40632509 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40632518 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40632584 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40632603 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40632616 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 40632617 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40632688 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40633346 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 40633649 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 40635859 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 40636278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40638250 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40638339 G T Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 3 40638364 T C Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 40638935 G A Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 40640262 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40642086 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40643522 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40644396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40645999 G C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 40646237 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40646929 G C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 40647732 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40649300 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40650408 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40650414 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40650422 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40651291 G A Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 40651685 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 40651767 C G Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 40652115 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 40652249 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40652304 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 40653173 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40653512 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 40654828 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 40656746 C G Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 40657342 C A Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 40662296 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40668323 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40668431 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40670479 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40671268 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40671363 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 40671460 C T Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 40673413 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40673468 A C Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 40674241 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40674306 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40676222 G C Y N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 40676252 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 40676961 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40677233 G A Y Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 40678875 T G Y N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.307692307692308 0.538461538461538 0.153846153846154 15 11 4 7 2 3 40678954 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 40679006 A T Y N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 40679588 T G N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 3 40680078 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40680162 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40680185 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40680482 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 40682678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40682829 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40682846 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 40683244 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40684065 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40685836 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40685906 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40689906 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40690061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40691762 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 40692596 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40693191 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40694177 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40694316 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40695878 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.1875 0.75 0.0625 18 14 3 12 1 3 40696128 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 40696132 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 40696752 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 40696862 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40696883 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40697335 C A Y N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 0.153846153846154 0.153846153846154 20 6 9 2 2 3 40698551 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40698652 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 40698661 C A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 40698667 C A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 40699030 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40700480 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40700676 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40700817 C G Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 40702145 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40702147 C A Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 40704369 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 40704721 T G N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 3 40706818 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40707491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40707522 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40707561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40707959 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 40710170 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40712288 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40714269 T A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 40716484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40716606 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 40716779 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40716908 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 40716940 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 40716996 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40717002 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 40717320 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 40717324 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 40717431 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 40717607 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40717626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40718432 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 40718556 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40718919 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 40718966 G T N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 3 40718984 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 40719353 C G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 40719861 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 40719948 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 40720013 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 40720077 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 40720415 T G N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 40720549 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 40720568 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 40720726 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40720903 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.05 0.85 0.1 19 21 1 17 2 3 40721104 C G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40721146 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 40721382 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 3 40721780 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 40722011 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 40722095 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 40722101 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 40722234 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 40722275 G A Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 40722306 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 8 16 0 8 4 3 40722424 A T Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 40722451 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 40722490 C G Y N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 40722513 T A Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 40722654 A C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 40722780 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 40722789 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 40722889 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40723054 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40723082 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 40723112 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 40723123 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 40723352 C T Y Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 10 6 4 2 2 3 40723565 G C Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 40723715 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40723860 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 40724344 A G Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 40724365 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40724618 T A Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 3 40724669 G A N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 40724851 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40724879 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40724904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40725892 G T Y N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 40725928 T A Y N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.416666666666667 0.5 0.0833333333333333 16 8 5 6 1 3 40726058 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 40726152 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 40726470 C G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 40726506 C G Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 40726533 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40726619 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40726746 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40726986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40727054 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0 0.75 0.25 15 25 0 15 5 3 40727112 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 40727120 C T N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.0769230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 9 17 1 7 5 3 40727172 A T N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.0625 0.875 0.0625 16 16 1 14 1 3 40727530 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 40727563 C G Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 40727569 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 40727601 A T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 40727603 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 40727623 C G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 40727765 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 40727770 T C Y Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 3 40727920 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 40727937 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 40728084 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 40729228 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40729738 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40729978 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40730080 A T Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 40730105 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 40730285 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40730299 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40731272 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 40731888 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 40731987 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40732050 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40732072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40732223 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 40732249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40732376 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 40732415 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 40732596 C T Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 40732829 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 40732910 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40733268 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 40733554 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40733804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40733911 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 40734013 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40734197 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40734498 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40734573 C G Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 40737581 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 40737875 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 40738265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40738326 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 40738448 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 40738581 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 40738612 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 40738750 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40739180 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 40739212 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 40739352 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 40739362 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 40739461 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 40739771 T A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 40739772 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 40739924 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 40740025 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 40740648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40740730 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 40740762 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 40740825 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 40740839 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 40740963 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 40740966 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40741054 A C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 40741097 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 40741107 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 40741118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40741156 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40741230 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 40741366 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40741451 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 40743067 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40743222 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 40743305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40743504 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 40744717 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40744949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40745291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40746970 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 40747373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40747484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40748630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40748965 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 40749675 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 40750265 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40750277 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40751234 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40753290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40755234 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40755794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40761954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40762056 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40764120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40767981 A G Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.0625 0.9375 0 17 15 1 15 0 3 40767982 A T Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 3 40769974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40771321 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 3 40772551 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40772642 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40772966 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40774203 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40776233 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40776435 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40776909 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 40777860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40782078 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40782678 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 40782799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40783226 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 40785299 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 40786390 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40786476 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40786793 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40786798 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40786827 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40786872 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40786903 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40786930 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40787053 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40787197 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40787219 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40787376 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40787517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40787582 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40787585 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40787593 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40787872 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 3 40788023 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 40788169 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 40788271 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 40788434 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 40788480 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40788550 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40788749 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40788765 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40788864 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40788933 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40788937 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 40789185 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40789226 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 40789324 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40789367 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40789478 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40789554 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40789811 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40790246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40791147 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40791407 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 40791522 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 40791769 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40791912 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40792002 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 40792493 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40792579 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 40792860 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 40792991 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 40793315 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 40793440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40793460 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 40793490 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40793508 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 40793812 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40793942 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40794049 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40794308 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 40794331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40794551 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 40794710 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 40795021 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40795827 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40796070 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 40796271 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40796342 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 40796618 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 40796879 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 40797421 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 40797466 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 40797573 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40797575 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 40797588 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 40797669 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40797744 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 40797907 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 40798069 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 40798263 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 40798594 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 40798911 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 40798977 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 40799095 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 40799098 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 40799185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40799427 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 40799456 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40799530 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 40799787 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40799793 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 40799852 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 40799867 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 40799940 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 40799944 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 40800035 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 40800112 C G Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 40800302 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 40800465 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 40800540 G C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 40800783 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 40800825 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 40800842 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 40800878 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 40800880 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 40801005 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40801011 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 40801061 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 40801109 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 40801179 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 40801211 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 40801397 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 40801501 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 40801747 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 40801752 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 40801769 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 40801819 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 40801882 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 40801926 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40801982 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 40802232 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 40802321 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 40802345 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 40802638 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 40802640 G C N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 40802979 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 40803097 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 40803216 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 40803227 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 40803269 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 40803482 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 40803546 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 40803547 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 40803634 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 40803660 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 40803881 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 40803941 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 40803957 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 40804098 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 40804225 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 40804341 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 40804398 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 40804442 C G Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 40804517 T A Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 40804966 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 40805004 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 40805378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40805562 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 40805901 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40805904 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40806028 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40806179 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 40806414 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 40806852 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40807096 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40807861 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40808578 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40808796 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40808846 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40808851 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40808862 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40809082 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40809553 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40811063 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40811081 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 40811273 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 40811335 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 40812565 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 40813094 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 40813545 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40814548 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40815280 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 40815394 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40815409 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 40815458 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40815552 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40815938 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 40815994 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 40816256 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 40816264 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 40816415 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 40816623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40816667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40817014 C G N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 40817197 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 40817331 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 40817419 C T N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 3 40818447 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 40818480 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40819131 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40820619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40822333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40823202 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 40825648 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 40829347 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 40831003 A T N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.0625 0.8125 0.125 15 17 1 13 2 3 40832387 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 40833533 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40834093 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 40834819 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 40835310 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 40835335 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 40835601 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 40835786 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 40835835 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 40836121 A T Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 40836286 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 40836301 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 40836489 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40836979 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 40837573 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 40837747 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 40838087 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 40838167 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 40838355 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40838356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40838584 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40838600 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 40838716 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40838829 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 40838991 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 40839001 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 40839179 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40839228 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 40839230 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40839241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40839446 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40839463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40839484 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40839746 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 40839893 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40839900 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 40839935 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 40839993 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40840197 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 40840399 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40840520 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 40840870 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40841022 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40841287 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 40841420 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40841445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40841559 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 40841881 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40841916 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40841967 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40841992 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40842216 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40842247 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40842268 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40842559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40842600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40842713 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40842803 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40843255 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40843272 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 40843349 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 40843487 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40844480 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40844901 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40845741 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40845978 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40846195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40846629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40846725 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40846966 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 40847004 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40847006 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 40847029 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40847306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40847323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40847341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40847430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40847435 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40847624 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40847654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40847690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40847709 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40847723 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40847743 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 40847789 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40847900 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 40847919 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 40848316 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 40848523 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 40848640 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 40848947 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40849138 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40849815 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 40850780 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40851060 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40851629 G C N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 40852863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40853023 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 40854088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40854561 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40855419 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 40855996 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 40856036 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 40856070 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 40856186 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 40856188 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 40856877 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 40856940 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 40856961 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 40856993 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 40857265 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 40857424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40857815 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 40857859 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 40858018 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 40858036 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 40858056 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40858103 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 40858147 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 40858165 A C N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 40858591 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 40858729 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 40858789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40858826 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 40859159 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40859164 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40859171 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 40859178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40859194 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40859330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40859340 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40859345 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40859479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40859501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40859531 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40859591 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40859660 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 40859766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40859774 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40859860 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40859904 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 40859937 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 40860050 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 40860064 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 40860078 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 40860105 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 40860137 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 40860172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40860175 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 40860268 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 40860340 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40860390 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40860442 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40860627 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40860683 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40861334 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 40861511 G C Y N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 40861548 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 40861555 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 40861573 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 40861815 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40862038 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40862268 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40862275 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 40862695 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 40862918 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40863801 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40864799 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40868859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40869055 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 40869417 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 40869724 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 40870125 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 40870238 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 40870534 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 40870678 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 40870695 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40870708 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 40870990 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40871029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40871059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40871090 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40871113 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40871284 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40871360 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 40871453 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 40871994 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40872473 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40872517 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 40872693 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40872798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40872852 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 40873289 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40873419 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 40873521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40873571 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 40874350 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40874353 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 40874411 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 40874431 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 40874493 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 40874515 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 40874840 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40874874 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 40874938 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 40874950 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 40875030 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 40875046 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 40875149 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 40875214 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 40875289 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 40875423 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 40875434 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 40875483 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 40875497 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40875550 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 40875778 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 40875926 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40875931 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 40876202 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 40876293 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40876370 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 40876496 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 40876524 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40876672 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40876698 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40876845 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 40876916 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40876920 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40876950 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40876974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40877025 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40877073 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 40877219 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40877450 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 40877566 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 40878130 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40878207 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40878223 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40878249 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 40878422 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 40878948 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 40878980 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 40879160 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40879828 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 40879911 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40879989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40880211 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40880225 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 40880447 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 40880743 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40880784 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40881784 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 40882315 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40883386 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 40883823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40885361 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40885748 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40885822 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 40886133 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 40886333 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 40888868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40888998 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 40890526 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 40890766 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 40891023 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 40891451 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 40891556 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 40891998 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40893051 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 40893390 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 40893672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40894197 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 40894308 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 40895939 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 40896212 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 40896802 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 40897046 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 40897340 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 40897344 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 40897367 C A Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 40897380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40897400 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 40897510 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40897512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40898208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40898269 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 40899046 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40899203 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 40899461 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40899474 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40899495 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40899566 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 40899628 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 40900424 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 40900560 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 40901044 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40901088 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 40901247 T G Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 40901269 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 40901324 A G Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 40901711 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 40902766 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40903181 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 40903497 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40903537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40904363 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40906140 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 40907314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40908069 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 40908310 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 40908970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40909997 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 40910001 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40910714 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 40910745 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 40910883 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40911045 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 40912036 G C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 40913748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40914323 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40915077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40915397 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 40917028 A C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 40917197 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 40917983 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 40918089 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 40918341 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40918373 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 40918441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40918803 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 40918907 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40919300 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 40920170 T G Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 40920862 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 40920897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40920926 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 40921005 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 40921238 C T Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 40921274 C T Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 40921441 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 40921474 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 40921519 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 40921580 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 40921906 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 40921952 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 40921982 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 40921987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40922049 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 40922350 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40922436 G T Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 40922492 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40922531 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 40922637 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 40922686 C G Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 40922689 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 40922747 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 40922750 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 40922934 T A Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 40923238 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 40923340 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40923788 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40923901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40923922 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40924127 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40924181 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 40924240 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40924249 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40924447 A C Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 40924658 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 40924933 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40925112 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 40925138 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 40925168 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 40925253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40925921 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 40926138 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40926360 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40926432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40926605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40926703 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 40926754 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40926837 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40926947 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 40927118 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 40927165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40927191 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40927220 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 40927253 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 40927994 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 40928108 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 40928342 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 40928358 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 40928371 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 40928603 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 40928701 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 40928814 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 40929112 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 40929160 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 40929391 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 40929403 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 40929594 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 40929622 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 40929742 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 40929769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40929773 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40930162 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 40930195 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 40930216 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 40930272 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 40930677 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 40930808 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 40930933 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 40930947 G C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 40931320 C T N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.454545454545455 0.181818181818182 0.363636363636364 12 10 5 2 4 3 40931661 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 40932326 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 40932567 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 40932731 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 40933372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40933477 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40933483 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 40933501 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40933508 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 40933618 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 40933638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40933658 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 40933681 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 40933873 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 40933886 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40933911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40933923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40934003 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 40934036 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 40934064 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 40934416 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40934522 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 40934607 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40934609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40934649 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 40934659 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 40934691 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 40934746 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 40934757 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 40934802 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40934984 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40935163 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 40935388 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 40935415 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40935566 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40935685 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 40935686 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 40935788 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40935864 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40936011 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 40936132 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 40936754 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 40936820 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 40936987 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40937118 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 40937126 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 40937255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40937294 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40937766 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 40937832 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 40937855 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 40937881 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 40938046 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40938497 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 40938639 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40938662 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 40938685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40938836 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40938964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40939040 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40939106 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40939186 C T Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 40939308 A G Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 40939405 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 40939427 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 3 40939434 C T N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 3 40939511 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 40939721 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 40940048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40940160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40940351 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40940376 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 40942111 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40942305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40942348 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 40942607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40943150 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40943441 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40943590 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 40944160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40944467 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 40944526 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40944648 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 40944733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40944862 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 40944886 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 40944914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40945000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40945075 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40945082 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40945133 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40945160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40945188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40945225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40945257 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 40945349 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 40945486 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 40945512 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 40945533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40945849 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 40945909 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 40946011 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 40946180 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 40946308 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40946649 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 40946821 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 40947262 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 40947429 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 40947436 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 40947729 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 40948016 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 40948048 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 40948387 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 40948512 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 40948664 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 40948668 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 40948679 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 40948998 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 40949027 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 40949050 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 40949059 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 40949295 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40950498 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 40950517 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 40951625 A C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 40952475 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 40952558 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 40952561 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 40952781 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 40952815 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 40952827 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40953610 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 40954423 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 40954674 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 40954718 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 40954724 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40955645 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 40955871 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 40956006 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40957031 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 40957064 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 40957108 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 40957287 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 40957339 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 40957714 T A N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 3 40957799 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 40957800 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 40957852 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 40958129 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 40958187 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40958569 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 40958644 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 40958669 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 40958936 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 40958945 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 40958950 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 40958959 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 40959110 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 40959506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40959563 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40959751 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 40960032 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 40960086 G A N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 40960252 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 40960559 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 40961059 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 40961083 C A Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 40961145 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40961343 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40961410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40961550 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 40961698 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 40961706 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40961973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40962171 C G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 40962183 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40962286 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40962431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40963103 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40963229 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 40963261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40964212 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40964428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 40964625 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 40964897 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 40965476 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 40965504 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40965543 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40965608 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 40965844 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 40965955 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40966071 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40966178 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40966235 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40966509 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40966553 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40966571 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 40966637 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 40966697 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 40966710 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 40966764 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 40967049 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40967210 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40967517 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40967567 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 40967664 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 40970049 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40971866 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40972119 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 40972201 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 40972307 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 40972357 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 40972403 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 40972546 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 40972677 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40972680 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40973316 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 40973338 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 40973625 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 40973630 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 40973752 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 40973788 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40973866 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 40973867 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40973889 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40973928 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40973959 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 40973962 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 40974004 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 40974062 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 40974178 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 40974436 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 40974946 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 40975445 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40975451 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 40975490 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 40975599 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 40975662 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40975923 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 40976432 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40976481 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 40976528 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 40977045 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 40977415 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40977561 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 40977870 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 40978342 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40979120 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 40979366 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40979719 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40979938 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 40980050 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40980108 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 40980297 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 40982062 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40982073 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 40982718 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40982813 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 40982900 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40983062 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40983431 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 40984174 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 40984764 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40987057 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40988437 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 40988685 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40988694 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40988865 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 40989022 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 40989152 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 40989228 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 40989616 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 40989773 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 40989812 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40989826 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40990415 A G N Y 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 3 40990509 A C Y N 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 3 40990560 G A Y Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 7 11 1 5 3 3 40990755 A G Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0 0.764705882352941 0.235294117647059 13 21 0 13 4 3 40991152 A G Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 40991554 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 40991625 T G Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 40991740 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 40991989 G T Y N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 40992100 T C Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 40992150 C T Y Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 40993097 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 40993115 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 40993149 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 40993531 G T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 40993676 C A Y N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 40993761 C T Y Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 11 9 3 5 2 3 40993827 A G Y Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 3 40993910 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 2 4 1 0 2 3 40994348 C T Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 3 40994574 A T Y N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.142857142857143 0.714285714285714 0.142857142857143 14 14 2 10 2 3 40994834 C T Y Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 40995154 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 40995302 G T Y N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 40995387 T A Y N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 40995390 G A Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 40995583 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 40996289 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 40996368 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 40996381 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 40996522 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 40996829 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40996972 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 40997013 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 40997043 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 40997061 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 40997323 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 40997429 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 40997446 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 40998524 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 40998975 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 40999495 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 41000007 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41000335 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41000439 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41000485 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41000514 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41000644 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41000925 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41001047 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 41001309 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 41001378 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41001476 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 41001999 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41002075 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 41002530 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41002569 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 41003400 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 41003405 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 41003663 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 41003746 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41004171 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 41004467 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 41004528 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 41004762 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 41004927 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 41006309 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41006452 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 41006661 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 41007074 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 41007258 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 41007448 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41007690 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41007795 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41007802 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 41008141 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 41008153 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 41008162 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41008273 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 41008330 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 41008331 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 41008567 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 41008904 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 41008985 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 41009352 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 41009364 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41009439 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41009472 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 41010397 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41010463 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41013415 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41015440 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 41015598 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41018013 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41018376 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 41020483 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41020563 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 41020607 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41020763 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41020829 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41021199 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41021290 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 41023367 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41023420 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 41023613 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41025558 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41025882 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 41027756 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41028931 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 41028955 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41029925 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41030026 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41030642 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41031661 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 41032427 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 41033004 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41033062 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41034272 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41034488 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 41035293 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 41035424 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41035459 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41035550 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41035640 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 41035671 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41035732 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41035744 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41035835 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41036303 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41036445 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41036590 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41036890 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 41036895 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41036905 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 41036906 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41037066 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41038572 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41038803 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41039110 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 41039284 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41039389 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41039965 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 41040079 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41040231 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41041136 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 41042145 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41042259 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41042308 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41042333 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41042378 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41042387 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41043588 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41043848 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41044034 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41045314 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 41045685 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 41045704 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 41046066 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 41046301 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41046861 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 41046943 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 41047849 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 41047900 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 41048213 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41048562 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 41048631 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 41048660 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 41049621 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41049671 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41049904 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41050055 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 41050063 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 41050076 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 41050213 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 41050282 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 41050342 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41050440 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 41050455 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 41050622 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 41050758 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41050800 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 41050870 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 41051658 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 41051659 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 41051695 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 41051770 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41051949 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41051959 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 41052160 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 41052227 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 41052292 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 41054203 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 41054345 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 41056265 A G Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 41056986 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41059574 C T Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 41060412 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 41060636 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 41060922 T G N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 41061118 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 41061119 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 41061321 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 41062496 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 41063233 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41063440 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41063537 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 41063565 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41064083 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41064502 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 41064670 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 41064736 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 41064762 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 41064770 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 41064810 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 41064978 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41065000 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41065008 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 41065854 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41066132 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41066170 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41067423 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41067852 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 41068075 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41068156 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 41068214 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 41068232 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 41068252 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41068277 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 41068304 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41068336 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 41069947 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41070605 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 41070614 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 41070678 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 41070730 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 41070810 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 41071014 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 41071068 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 41071349 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 41071573 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 41071629 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 41071775 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 41071785 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 41071809 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 41071873 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 41071891 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 41071950 A T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 41071968 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 41072001 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 41072029 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 41072102 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 41072206 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 41072214 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 41072483 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 41072485 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 41072538 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 41072854 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41072864 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 41072945 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 41073231 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 41073281 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 41073506 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 41073707 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 41073720 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 41073755 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 41073777 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 41073792 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 41073832 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 41073928 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 41073953 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 41074626 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 41074694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41076520 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 41076790 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 41077373 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41077591 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41077648 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41077677 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41077970 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41078167 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41078345 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 41078760 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41079134 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41079564 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 41080106 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 41080336 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41080366 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 41080904 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 41081084 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41081699 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 41081804 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 41081837 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 41081842 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41081978 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 41082045 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 41082081 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 41082123 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 41082142 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41082410 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 41083107 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41083157 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41083218 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 41083370 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41083381 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 41083574 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41083960 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 41084056 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 41084483 C A Y N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 3 41084778 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 41084950 A T Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 41085046 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 41086316 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 41086869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41086895 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 41087008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41087129 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 41087156 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41087160 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 41087168 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41087524 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 41087748 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 41088144 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 41088154 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 41088235 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 41088473 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 41088511 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41088771 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 41089348 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41089368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41089369 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41089763 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 41090387 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 41090398 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41090426 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41090522 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41090528 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41090602 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 41090631 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 41090769 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 41090833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41090861 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 41090886 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 41091673 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 41091674 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41091693 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 41091757 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41091771 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41092054 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41092087 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41092500 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41092592 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41092813 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41092883 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 41093000 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 41093224 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41093287 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41093601 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 41093933 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 41094181 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41094261 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41094290 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41095318 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41095323 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41095391 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 41095422 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41095608 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41095712 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 41095827 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41096059 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 41096198 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41096411 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 41096487 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 41096576 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41096603 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41096910 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 41097348 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 41098175 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41098291 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 41098732 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41099218 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 41099612 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41099615 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41099754 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41099804 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41099831 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 41099937 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41100029 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41100063 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41100122 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41100516 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41101517 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41101776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41102323 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 41102338 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 41102340 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 41102435 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41102436 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41103142 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 41103148 A C N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 3 41103465 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41104269 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41105303 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41105359 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41105615 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 41105761 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 41105997 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 41106207 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41106251 T C Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 41106475 T G Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 41107481 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41108101 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41110063 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41110473 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41112090 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41112192 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41112358 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41112822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41113001 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 41113541 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 41114002 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 41114008 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 41114083 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 41114581 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 41114760 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 41115159 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 41115231 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41115242 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 41115286 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 41115361 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 41115413 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41115666 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41116062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41117237 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41118075 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 41118739 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41118813 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41118820 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41118877 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41118907 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41119037 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 41119247 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41119348 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 41119402 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 41119436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41119858 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41119924 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41119925 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41120136 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 41120345 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41120790 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 41120864 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 41121018 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41121061 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 41123720 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 41123899 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41124030 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41125575 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 41126129 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 41126186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41126344 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41126866 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 41127300 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 41127321 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 41127368 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 41127719 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 41127763 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41127775 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 41127879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41129509 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 41129582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41129876 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41133387 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41133415 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41134311 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 41134333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41134334 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 41135064 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41135659 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41135822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41136081 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41136148 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 41136712 C G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 41137434 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 41138156 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 41138613 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 41138689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41139000 T A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 41139491 C T Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 41139735 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 41139956 T C Y Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 12 8 3 6 1 3 41139962 C T Y Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 3 41140018 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 41140148 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41140218 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 41147617 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 41148499 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41149363 C T N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 14 6 6 2 2 3 41149841 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41150053 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 41150695 G A Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 41151862 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41151879 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 41152015 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41152062 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41152201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41152305 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41152678 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 41152739 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 41152756 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 41153297 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41153410 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41153443 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41153467 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41153485 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41153500 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41153513 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41153525 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41153595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41153617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41153801 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41153918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41153949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41153956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41154038 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 41154276 G T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 41154416 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 41154484 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41154485 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41154865 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 41154961 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 41155219 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41156188 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 41156262 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 41156415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41157876 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 41159277 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 41160190 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 41160850 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 41161483 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41163245 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 41164767 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41166206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41166267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41166774 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 41166824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41166841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41166865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41166897 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41167054 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41167123 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41167169 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41167181 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41167207 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41167305 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41167372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41167400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41167412 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41167502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41167569 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41167634 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41167647 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41167776 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41167819 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 41167897 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41167911 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41167949 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41168092 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 41168224 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 41168336 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 41168348 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 41168410 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 41168428 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 41168514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41168987 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41169078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41169464 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41169468 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41169506 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 41169865 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41169991 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 41170007 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41170063 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41170603 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 41170686 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 41171608 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41172278 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41172423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41172572 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 41172764 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 41172942 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 41173066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41173073 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 41173929 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 41174446 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 41174588 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 41174971 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41175333 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41175764 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41176084 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 41176717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41177478 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41177514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41178292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41179246 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41179619 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41180460 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41181816 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 41182047 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 41182190 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 41182255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41182466 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41182551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41182761 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41182766 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41182778 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41182779 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 41183228 G A Y Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.363636363636364 0.181818181818182 0.454545454545455 10 12 4 2 5 3 41183334 C T Y Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.416666666666667 0.166666666666667 0.416666666666667 12 12 5 2 5 3 41183342 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 41183371 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 41183374 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 41183451 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 41183468 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 41183560 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41183611 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41183668 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 41184251 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 41185924 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 41188345 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 41188442 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 41188525 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 41188579 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 41188663 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 41188687 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 41188992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41188999 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 41189059 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 41190145 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 41192085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41193107 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 41194607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41194686 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 41194705 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 41194796 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 41195075 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 41195199 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 41195833 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 41196019 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 41196473 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41197793 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 41198667 C T Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 41198907 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 41199606 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.222222222222222 27 9 13 1 4 3 41199702 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41199714 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 41199860 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 41199922 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 41200114 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 41200302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41200341 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 41201173 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 41201277 G A Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 41201288 G T Y N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.230769230769231 0.769230769230769 0 16 10 3 10 0 3 41201311 C T Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 41201313 C T Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 3 41202811 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 41203012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41203248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41203323 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 41203562 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 41203707 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41204078 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 3 41204104 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 41204288 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 41204515 A G N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 41204573 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 3 41204766 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 41204972 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 41205054 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 41205100 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 41205127 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 41205200 G C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 41205240 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 41205382 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 41205474 T C N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 3 41205684 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 41205784 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 41205924 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 41207540 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 41207542 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 41207669 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 41207678 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 41207803 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 41207878 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41207969 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 41207997 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 41209554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41209638 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41209947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41210121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41210277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41214032 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 41214101 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41215268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41216315 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 41216477 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41216484 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41216671 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 41217077 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41217552 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41219075 G T Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 41219113 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 41219114 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 41223688 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41223863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41224006 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41224365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41225062 A C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 41225117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41225529 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 41226005 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41226751 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41226889 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41226915 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41227074 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 41227295 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41229291 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41231892 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41233158 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41233432 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 41233442 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41233526 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41233597 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 41233610 C G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 41233636 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41233637 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41233672 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41234857 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 41234874 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41234938 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41235007 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41235023 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41235124 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 41235922 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 41236002 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41236056 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 41236227 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 41236328 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 41236399 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 41236670 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 41236827 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 41237059 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 41237090 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 41237137 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 41237421 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 41237497 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 41237597 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 41237679 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 41237680 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 41237858 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 41237901 G T N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 41237958 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 41237960 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 41237991 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 41238066 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 41238150 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 41238202 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 41238418 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41238485 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41238512 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41238515 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41238541 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41238564 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 41238595 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41238613 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41238624 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41238801 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41238952 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41238955 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41239031 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41239036 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41239547 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 41239824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41240147 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 41240151 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 41240555 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 3 41240584 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 3 41240625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41240959 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 41241115 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 41241537 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 41242061 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 41242132 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 41242335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41242394 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 41243239 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 41243898 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 41243910 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 41244033 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 41244056 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 41244174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41244355 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 41244753 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 41244800 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 41244833 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 41245213 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 41245351 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41246184 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 41246352 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 3 41246437 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 3 41246450 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 3 41246539 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 3 41246595 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.5 0.1 0.4 22 18 10 2 8 3 41247097 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 41247376 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 3 41247670 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 41248158 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 3 41248627 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.421052631578947 0.105263157894737 0.473684210526316 18 20 8 2 9 3 41249098 C A Y N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 41249110 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 3 41249588 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 41249693 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 41250591 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.5 0.1 0.4 22 18 10 2 8 3 41250742 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 41250743 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 41250842 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 3 41250889 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 41251043 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 41251077 C T Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.470588235294118 0.117647058823529 0.411764705882353 18 16 8 2 7 3 41251118 C T Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 0.117647058823529 0.352941176470588 20 14 9 2 6 3 41251467 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 41251511 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 41251539 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 41251789 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 41252117 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41252451 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 41252594 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41255306 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 41255854 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 41256229 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 41256273 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 41256475 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 41257002 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 41259206 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.5 0.1 0.4 22 18 10 2 8 3 41259352 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.526315789473684 0.105263157894737 0.368421052631579 22 16 10 2 7 3 41259840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41260343 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 41260910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41262743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41262915 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 41264028 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41264151 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 41264307 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 41264814 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 41265559 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 41265849 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 41265894 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 41265922 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 41266310 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 41266518 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 3 41266754 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 41266878 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 3 41266995 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 41267417 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 41269620 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41269633 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 41269648 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 41269684 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 41269704 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 41270833 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 41271650 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 41271737 C A Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 41271947 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 41272113 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 41272148 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 41272163 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 41272184 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 41272186 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 41272414 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41272451 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 41272490 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 41272966 C G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 41273417 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 41273550 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41273796 G T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 41273841 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 41273846 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 41273859 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 41273938 T C Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.5 0.125 0.375 18 14 8 2 6 3 41274014 T C Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.533333333333333 0.133333333333333 0.333333333333333 18 12 8 2 5 3 41274033 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 41274066 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 41274142 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 41274199 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 41274234 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 41274242 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 41274293 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 41274320 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 41274348 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 41274436 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 41274453 G T Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 41274521 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 41274538 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 41274649 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 41274851 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 41274988 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 41274991 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 41275029 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 41275097 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 41275637 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 41275905 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 41276090 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.444444444444444 0.111111111111111 0.444444444444444 18 18 8 2 8 3 41276211 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 41276423 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 41276428 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 41276451 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 41276475 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 41276501 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 41276726 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 41278944 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41279008 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 41279112 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 41279139 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 41279247 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 41279463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41279591 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 41279905 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 41281288 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 41281451 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 41281453 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 41281479 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 41281626 A T N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.133333333333333 0.6 0.266666666666667 13 17 2 9 4 3 41281681 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 41282407 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 41282700 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 41283704 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41284219 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 41284473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41285521 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41285672 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41285880 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41286814 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 41286830 A T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 41287155 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41287218 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 41287667 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 41287707 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41287747 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 41287806 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41287888 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 41287910 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 41288204 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 41288275 C A Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 41288346 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41288414 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 41288422 G A Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 41288545 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 41288574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41288703 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 41288789 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 41288865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41289628 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 41289647 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 41289684 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 41289831 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 41289833 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 41289871 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 41289877 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 41289890 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 41289913 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 41289950 G T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 41289972 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 41290008 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 41290348 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 41290642 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 41290649 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 41290834 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41290966 C G Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 41290974 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 41291127 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 41291290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41291312 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 41291313 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 41291796 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 41293268 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 41293507 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 41294607 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41294803 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41294837 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 41294873 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41295053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41295182 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41295987 T A Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 41296005 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 41296227 C T Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 41296255 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 41297603 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 41298212 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 41298443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41302979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41304271 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41307614 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 41308271 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41308301 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 41309045 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41309527 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41319431 A G N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 41321770 C T Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 41322243 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 41322351 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 41322372 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 41322482 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41322591 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 41322690 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 41322773 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 41322824 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 41322858 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 41323275 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 41323422 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 41323426 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 41323447 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 41323639 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 41323722 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 41323727 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 41326280 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 41326838 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 41327455 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 41327707 T C Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 41329583 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 41331159 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 41331516 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 41332763 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 41332841 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41332902 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41333062 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41334594 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41334814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41334975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41335498 C T N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 3 41335510 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 41336285 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 41336535 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41336568 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 41336713 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41338111 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41339508 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41339769 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41340052 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 41340516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41341126 C G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 41341726 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 41341741 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41341784 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 41342006 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 41342077 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 41342214 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 41342215 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 41342388 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41342688 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 41342744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41342888 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41343117 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41343497 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 41343684 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41343789 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 41344102 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 41344466 G C Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 41344734 T C Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 41344736 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 41344775 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 41345016 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41345118 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 41345845 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 41346518 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 41346575 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 41346855 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 41346890 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 41346985 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 41347003 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 41347150 A T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 41347173 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 41347221 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 3 41347306 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41347390 A T N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 41347814 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 41348099 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41348738 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 41349491 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 41351240 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41352760 C G Y N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.25 0.6875 0.0625 19 13 4 11 1 3 41353182 A T Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 41354028 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41354083 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41355246 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 41356690 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41356820 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 41357044 A G Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 41357100 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 41357419 T G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 41357473 A G Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 41357679 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 41357693 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 41358117 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 41358200 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 41358286 G A Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 3 41358694 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 41359040 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41359100 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 41359464 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 41359975 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 41360138 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 41360907 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 41360930 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 41360956 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 41361682 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41362008 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41362185 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 41362951 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 41363323 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 41363797 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 41363880 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 41363891 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 41363900 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 41363967 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 41364304 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 41365200 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 41365382 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 41365399 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 41365434 T G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 41365564 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 41368147 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 41370770 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 41371001 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 41371016 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 41373520 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41374117 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 41374137 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 41374319 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 41374501 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 41374594 C T Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 41374887 A C Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 41375048 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 41375270 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 41376344 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 41376597 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41376926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41377063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41377149 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 41379678 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 41379726 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 41380984 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 41381867 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 41382899 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 41382912 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41382985 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 41383143 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41383935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41384467 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 41384497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41385075 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 41385259 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 41386841 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 41387090 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 41387522 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 41388062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41388367 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 41388595 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41388600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41388865 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 41389141 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 41389214 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 41389272 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 41389281 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 41389470 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 41389786 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 41389816 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 41389902 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 41389911 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 41389920 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 41389934 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 41390475 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 41390491 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 41390905 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 41391631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41392101 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 41393435 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 41393545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41396803 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41399461 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41399614 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 41401688 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 41403038 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 41404139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41405240 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 41406736 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 41407808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41409124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41409348 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 41409938 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 41413075 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 41414541 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41414655 G C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 41415993 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41416340 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41417069 C A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 41417253 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 41417366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41417376 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 41417987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41419311 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41422180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41422436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41422445 C A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 41422811 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 41422903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41422946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41423052 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 41423199 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41423892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41424851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41425161 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41425774 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 41425841 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 41425930 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 41426129 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 41426172 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41426255 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41426359 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41426519 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41426683 C T Y Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.2 0.0666666666666667 0.733333333333333 7 23 3 1 11 3 41426687 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 41426714 C A Y N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 41426906 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41426926 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 41426982 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 41427115 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41427123 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 41427150 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41427307 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41427373 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 41427374 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 41428063 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 41428290 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 41428347 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41428505 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 41428506 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 41428539 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 41428581 A C Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 41428753 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 41428788 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 41428828 G A N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.2 0.133333333333333 0.666666666666667 8 22 3 2 10 3 41428854 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 41429031 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 41429302 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 41429450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41429934 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 41429958 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41430257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41430318 A T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 41430594 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 41430652 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 41431015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41431192 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41431215 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41431235 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41431400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41431528 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41431570 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41431659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41431812 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41431849 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 41432096 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 41432213 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41432370 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41433436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41433563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41433861 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41433942 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 41433973 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 41434074 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 41434645 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 41434914 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 41434921 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 41435028 G C N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 41435072 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 41435246 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 41435421 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 41435451 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41435477 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 41435517 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41435545 A G Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 41435862 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 41436166 G T Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 41436327 G A Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 41436380 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 41436431 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 41436543 A C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 41436734 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41437056 T A N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 41437511 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 41437555 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41437778 T C Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 41437780 G A Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 41437840 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41437947 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41438027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41438126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41438391 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 41438412 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 41438643 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 41438762 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 41440013 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 41440042 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41440637 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 41440675 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41440949 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 41441104 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 41441698 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 41441774 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 41441825 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41441909 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41442311 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 41442423 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 41442688 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 41442942 G A N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 3 41442977 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 41442980 G A N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 41443092 C T N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.571428571428571 0.214285714285714 0.214285714285714 19 9 8 3 3 3 41443134 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 3 41443277 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 41443325 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 41443348 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 41443583 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41443610 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 41443630 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 41443790 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 41443826 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 41443866 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 41443907 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 41444068 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 41444101 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 41444102 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 41444147 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 41444193 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 41444273 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 41444324 T A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 41444422 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 41444496 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 41444498 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 41444543 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 41444546 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 41444611 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 41444612 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 41444648 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 41445030 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 41445086 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41445213 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 41445376 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 41445454 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41445669 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 41445979 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 41445982 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 41446116 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 41446350 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 41446523 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 41446852 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 41446871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41447034 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41447051 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 41447211 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 41447289 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 41447390 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41447442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41447464 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.157894736842105 0 0.842105263157895 6 32 3 0 16 3 41447478 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 41447719 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 41447769 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 41447793 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 41447859 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 41447874 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 41447981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41447990 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41448113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41448115 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41448366 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41448372 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 41448384 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 41448393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41448625 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 41449013 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41449137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41449194 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 41449290 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 41449527 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 41449796 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41449935 G A N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 10 10 3 4 3 3 41450102 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 41450151 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 41450290 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 41450429 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 41450444 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 41450508 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 41450864 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41450947 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41451079 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 41451230 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41451534 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41451651 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 41451663 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 41451831 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 41451881 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41452031 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 41452442 C T N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 3 41452516 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.157894736842105 0 0.842105263157895 6 32 3 0 16 3 41452550 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41452560 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41452728 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 41452739 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 41452751 T A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 41452763 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41452846 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41453346 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 41453642 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 41454151 T G Y N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 41454167 G T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 41454273 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41454953 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 41455021 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 41455108 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 41456037 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 41456135 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41456282 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 41456704 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 41457312 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 41458275 A C Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 41458301 A T Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 41458384 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 41458869 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 41458871 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 41458898 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41458995 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 41459109 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41459190 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41459422 G T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 41460222 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41461093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41461107 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41461198 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 41461255 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 41461630 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 41461851 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.157894736842105 32 6 16 0 3 3 41461901 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 41461985 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 41462609 C G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 41463061 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41463082 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 3 41463467 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41463570 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 41463576 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41463640 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.157894736842105 32 6 16 0 3 3 41463751 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41464104 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 41464286 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 41464425 G T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 3 41464573 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41464647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41465234 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41465402 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41465442 A C Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 41465485 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 41465801 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41466002 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41466137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41466277 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 41466296 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41466398 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41467039 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41467053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41467120 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41467136 A G Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 41467332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41467393 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41467395 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41467459 C A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 41467647 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 41467895 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41468012 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41468549 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 41468643 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41468675 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41468788 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 41468983 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 41469330 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 41469460 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41469582 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41469763 T A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41469916 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41470002 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 3 41470153 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41470358 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41470372 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41470514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41470568 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41470648 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41470682 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41470838 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41470970 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41470981 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41471036 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41471044 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41471084 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 41471146 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41471322 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41471749 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 41471921 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41471927 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41471964 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41472027 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 41472037 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 41472154 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 41472155 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 41472715 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41472792 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 41472793 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41473121 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41473178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41473188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41473306 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 41473395 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 41473458 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 41473560 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 41473589 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41473646 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 41473805 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41473859 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 41473871 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41473968 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41474006 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41474207 T C Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 41474290 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41474503 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 41474526 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41474577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41474869 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41474874 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41474960 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 41475154 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 41475291 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41475434 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 41475606 C A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 41475731 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41475778 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41475840 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 41475856 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41475876 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41475887 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 41475893 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 41475921 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 41476030 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 41476133 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41476214 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41476218 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41476265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41476284 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41476759 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41476795 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.157894736842105 0 0.842105263157895 6 32 3 0 16 3 41476889 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 41476935 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 41477041 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41477087 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 41477201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41477336 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 41477543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41477609 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41477767 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41477838 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 41478256 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41478294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41478329 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41478332 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 41478537 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41478614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41478817 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.157894736842105 0 0.842105263157895 6 32 3 0 16 3 41479074 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41479217 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41479381 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41479573 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41479596 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 41479769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41479823 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41479961 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41479990 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 41480131 C A Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 41480188 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41480881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41480956 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 41481011 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 41481168 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 30 6 15 0 3 3 41481188 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 30 6 15 0 3 3 41481283 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 41481513 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 41481563 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 41481740 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.157894736842105 32 6 16 0 3 3 41481747 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 41481949 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41482297 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 41482527 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 41482589 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.157894736842105 32 6 16 0 3 3 41482740 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 41482766 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 41483618 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 41483647 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 41483650 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 41483996 C T Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 41484002 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 3 41484111 C A Y N 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.454545454545455 0.272727272727273 0.272727272727273 13 9 5 3 3 3 41484132 C T N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 3 41484183 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 41484444 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41484612 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 41484775 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 41484924 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.157894736842105 32 6 16 0 3 3 41485276 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 41485424 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41485607 A C Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 41485820 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 41485946 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41485999 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 41486173 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41486682 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41486759 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 41486899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41487030 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 41487374 A G N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 41487950 T A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 41488038 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 41488436 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 41488483 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41488905 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41489106 C T N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.153846153846154 0.0769230769230769 0.769230769230769 5 21 2 1 10 3 41489638 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 41489852 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41490180 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 41490338 G A Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 3 41490410 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 41490668 T C Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.176470588235294 0 0.823529411764706 6 28 3 0 14 3 41491032 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 41491684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41491779 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 41491800 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 41491827 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 41491851 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 41491852 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 41491966 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.157894736842105 32 6 16 0 3 3 41492038 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 41492048 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 41492120 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 41492253 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 41492285 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 41492413 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 41492542 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 41492591 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 41493146 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 41493300 G A Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.625 0.125 0.25 11 5 5 1 2 3 41493395 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 41493768 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.176470588235294 28 6 14 0 3 3 41494066 A C Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 3 41494314 G T N N 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.75 0 0.25 12 4 6 0 2 3 41494792 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 41495140 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 41495939 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41496172 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 41497287 G C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 41497913 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.157894736842105 32 6 16 0 3 3 41498020 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 41498130 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 41498981 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 41499230 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 41499237 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.157894736842105 0 0.842105263157895 6 32 3 0 16 3 41499540 G C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 41499847 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41500472 A C Y N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 41501243 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41501507 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 41501719 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41501955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41502995 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 41503122 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 41503382 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 41503416 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 41504144 T C Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 3 41504159 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41504376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41504478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41504607 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 41504787 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 41506047 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 41506562 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.157894736842105 0 0.842105263157895 6 32 3 0 16 3 41507059 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 41507083 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 41507181 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 41507199 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 41507295 G A Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.133333333333333 0 0.866666666666667 4 26 2 0 13 3 41507416 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41507447 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 41507448 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 41507521 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 41507570 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.157894736842105 32 6 16 0 3 3 41507800 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 41507828 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.176470588235294 0 0.823529411764706 6 28 3 0 14 3 41508068 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.1875 0.0625 0.75 7 25 3 1 12 3 41508104 A T Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 3 41508129 G C N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.2 0 0.8 6 24 3 0 12 3 41508288 G C N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.2 0 0.8 6 24 3 0 12 3 41508588 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 41508611 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41508629 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 3 41509090 G C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 41509122 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41509228 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 41509241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41509309 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 41509703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41509888 T A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 10 22 4 2 10 3 41510577 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 41510806 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 41510826 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 41511040 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 41511132 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 41511702 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 41511816 C G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 41512037 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 41512047 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41512192 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 3 41512363 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 41512549 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41512584 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41512675 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 41512692 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 41512935 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 41513018 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 41513270 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 41513276 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 41513541 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 41513690 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 41513915 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 3 41513921 C G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 41514201 T A N N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 3 41514274 T G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 3 41514334 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 41514366 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 30 6 15 0 3 3 41514406 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 41514450 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 30 6 15 0 3 3 41514548 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 41514619 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 41514847 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 41514922 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 41514973 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.133333333333333 26 4 13 0 2 3 41515167 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 41515220 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 41515271 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 30 6 15 0 3 3 41515296 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 30 6 15 0 3 3 41515428 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 41515471 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 30 6 15 0 3 3 41515541 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 41515577 T G N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.8 0 0.2 24 6 12 0 3 3 41515648 A T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 41515658 G C N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.153846153846154 21 5 10 1 2 3 41515704 T G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.176470588235294 28 6 14 0 3 3 41515787 G T N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.153846153846154 22 4 11 0 2 3 41515811 C G N N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.181818181818182 17 5 8 1 2 3 41515838 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 20 4 10 0 2 3 41515853 T C N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.8 0 0.2 16 4 8 0 2 3 41515912 T C N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.8 0 0.2 16 4 8 0 2 3 41515925 C A N N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.8 0 0.2 16 4 8 0 2 3 41515939 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 20 4 10 0 2 3 41516040 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 24 4 12 0 2 3 41516048 A C N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 41516053 A T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 3 41516078 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 3 41516282 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 41516419 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 41516510 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 41516742 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 30 6 15 0 3 3 41516818 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 41516837 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 41516876 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 41517023 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 41517086 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 41517087 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 41517165 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 41517506 C G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 41517700 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 41517956 A G Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 41517981 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 41518073 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 41518104 A C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 41518231 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 41518242 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 41518243 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 41518378 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 41518544 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 41518588 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 41519331 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 41520254 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 41520945 A G N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 3 41521602 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 41521898 A T N N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 3 41522093 C T N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.384615384615385 0.307692307692308 0.307692307692308 14 12 5 4 4 3 41522451 C A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 41523051 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 41523583 T C Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 41525075 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 41525107 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 41526304 C T Y Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 3 41526480 T C Y Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.307692307692308 0.230769230769231 0.461538461538462 11 15 4 3 6 3 41526562 A G Y Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 3 41527030 A C N N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 8 8 3 2 3 3 41527161 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41527209 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41527569 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 41527737 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 41528434 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 41528969 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 41529366 A C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 41529444 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 41529691 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41529857 G T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 41531807 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 41531903 A G Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 41532055 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 41533682 A G Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 41534636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41537031 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 41537346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41539337 T G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 41540392 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 41541595 G A Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 41541723 A G Y Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 12 8 4 4 2 3 41542646 C T N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 41542829 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 41543038 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 41543059 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41546333 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 41546546 G T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 41546659 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 41546802 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 41548676 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41549499 C G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 41550455 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41550915 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41551843 A C Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 41551902 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41552175 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41553057 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 41554046 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 41556129 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 41557058 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41557963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41560633 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41562621 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 41562652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41563085 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 41563096 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41563118 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 41563145 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 41563148 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 41563506 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 3 41563581 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41564501 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 11 7 3 5 1 3 41564504 C T Y Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 12 8 3 6 1 3 41564519 G A Y Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 3 41566375 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 41567717 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41571354 A C Y N 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 13 7 4 5 1 3 41571362 C T Y Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 3 41574189 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 41574956 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 41576295 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 41576392 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 41576693 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41576920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41577161 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 41577433 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 41578069 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 41578498 G A Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 3 41581620 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 41581980 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 41584004 T A Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 41584098 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41584407 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 41584714 A G Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 41585460 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 41585582 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41585801 C A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 41586014 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41586407 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41586446 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41587317 C A Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 41587398 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 41587940 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 41590987 G A Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 41591360 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 41593700 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41593722 C A Y N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 41594062 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41594773 T A Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 41594783 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 41594888 C A Y N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.181818181818182 17 5 8 1 2 3 41594911 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 41601167 A T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 41601419 C G Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 41601465 T C Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 41601521 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 41601718 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 41601747 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41602561 T G Y N 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 12 6 5 2 2 3 41605081 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 41605222 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41607278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41607451 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 41608186 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41608840 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41609451 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41610605 G A Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 41612513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41613155 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 41613227 A C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 41614309 T G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 41614387 G T Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 41616799 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 41616830 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 41616904 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 41616966 C T N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 41617114 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 41617598 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 41617852 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 41617917 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 41618075 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41618083 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41618858 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 3 41618875 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 41619123 G C N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 41619217 A C N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 3 41619269 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 41619373 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 41621547 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 41621828 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 41622057 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 41622129 T G N N 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.6 0 0.4 12 8 6 0 4 3 41622383 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 16 8 8 0 4 3 41622874 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 41622915 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41622916 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41623012 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 41623202 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 41623807 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 3 41623941 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 41624601 A T Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41624661 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41624969 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41625300 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 41625430 T C Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 41625797 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 41626588 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41626600 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41626650 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 41627652 C G Y N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 41628503 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 41628520 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 41628592 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 41628620 G T Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 41628762 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41629124 C G N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 3 41629168 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 41629540 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 41630231 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41630322 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 41630393 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41630638 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41630691 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41630769 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41631189 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 41631211 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 41631576 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.375 0.1875 0.4375 15 17 6 3 7 3 41631861 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 41632484 T A Y N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 41632487 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 41633873 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 41634459 A T N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.25 0.166666666666667 0.583333333333333 8 16 3 2 7 3 41634773 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 30 6 15 0 3 3 41634813 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41635418 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 41635685 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41635718 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 41636393 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41637198 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41637233 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41637301 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41637554 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 41637708 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 41638153 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 41638207 A G Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 41640547 C T Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 41640853 G C Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 41641209 T C Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 41642001 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41642447 T G Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41642689 C T Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 41642727 C T Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 41642837 A G Y Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 41643371 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41643376 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 41643410 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 41643427 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41643462 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41643556 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 41643656 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 41643673 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.266666666666667 0.133333333333333 0.6 10 20 4 2 9 3 41643690 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41643767 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 41644026 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 41644084 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 41644631 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 41644819 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 41645097 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41645251 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41645396 G A N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 41645829 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 41645947 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41646002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41646192 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41646260 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 41646313 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41646476 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41646813 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 41646958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41646985 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 41647131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41647351 G C Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 41647493 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 41647592 G A Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 41647621 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 41647857 A C Y N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 3 41648182 C G Y N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 41648199 C A Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 41648289 T G Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41648787 G T Y N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 41649507 C T Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 41649821 T C Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 41649834 T G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 41650064 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 41650125 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41650152 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41650303 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 41650304 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41650386 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41650679 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 41651012 T C Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41651465 C A Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 41651647 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 41651648 T G Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 41651830 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 41651900 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 41652394 A C Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 41652425 T C Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41652604 C T Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 41652606 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41653208 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41653636 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 41653999 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41654695 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 41654869 A C Y N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 41655111 C T Y Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.307692307692308 0.153846153846154 0.538461538461538 10 16 4 2 7 3 41656350 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 41657117 T A N N 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.428571428571429 8 6 4 0 3 3 41657143 T G N N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 7 13 3 1 6 3 41657508 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41657563 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 41657617 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41658467 G C Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41658571 T G Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41658660 C G Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 41659077 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 41659315 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41659371 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41659395 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41659532 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41659987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41660002 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 41660011 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 41660145 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 41660520 C G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 41660584 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41660733 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41660767 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 41660846 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41660862 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 41661058 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41661845 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41662012 T A Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 41662020 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 41662089 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 3 41662159 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 3 41662160 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 41662533 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41663160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41663298 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 41663774 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 41663846 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41664590 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41664700 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 41665301 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41665316 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 41665440 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 41665645 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 41666001 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 41666477 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41666892 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 41667175 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41667452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41668759 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 41669449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41669561 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41671051 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41671069 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41671136 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 41671719 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41672076 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41673459 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 41675170 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41675232 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41675497 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41675720 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 41684571 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41685087 A G Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 41685183 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41685743 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 41685834 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41686134 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41687304 A G N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.583333333333333 0.0833333333333333 0.333333333333333 15 9 7 1 4 3 41687460 G A Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 41687608 T C Y Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.6 0 0.4 12 8 6 0 4 3 41688339 C T Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 41688676 C G Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 41689202 T G Y N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 3 41689266 A T Y N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 3 41689351 A G Y Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 3 41689352 T G Y N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 3 41689367 T G Y N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 41689691 A T Y N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 41689746 T A Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 41689981 C A Y N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 3 41690774 C T Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 41692000 T G Y N 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.555555555555556 0.111111111111111 0.333333333333333 11 7 5 1 3 3 41692126 T C Y Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.545454545454545 0.0909090909090909 0.363636363636364 13 9 6 1 4 3 41692463 C A N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 41692708 C G Y N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.363636363636364 0.181818181818182 0.454545454545455 10 12 4 2 5 3 41693799 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 41693836 T C Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 41694109 A G Y Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.363636363636364 0.181818181818182 0.454545454545455 10 12 4 2 5 3 41694201 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 41695432 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 41695636 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 41695891 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 41696078 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 41696170 G C Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 41697281 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 41698638 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 20 4 10 0 2 3 41698640 T A N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 3 41698826 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 41699005 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41699229 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 41699470 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41699869 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 41700099 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41700202 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 41700944 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 41701417 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41702013 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 41702023 C A N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.4375 0.125 0.4375 16 16 7 2 7 3 41702048 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 41702058 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 41702059 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 41702348 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41702574 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 41702684 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 41702773 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 41702878 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 41703244 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 41703260 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 41703267 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 41703315 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41703371 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 41703420 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41703448 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41703477 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41703568 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41703577 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41703684 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 41703790 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 41704001 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 41704005 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 41704018 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 41704158 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 41704367 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 41704371 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41704407 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 41704524 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 41704700 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 41704752 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41704840 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41705015 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 41705404 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 41706085 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 41706300 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41706388 G A Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 41706412 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 41706444 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 41706497 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 41706500 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 41707235 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 41707283 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41707295 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 41707387 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41707491 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 41707595 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41707820 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 41707924 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 41707933 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 41707963 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 41708011 C T N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 41708016 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 41709028 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41709031 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 41709043 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 41709078 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 41709159 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 41709238 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41709395 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41709685 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 41709707 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41709910 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41710143 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 41710155 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 41710218 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41710260 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 41710557 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 41710660 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 41711039 A T N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 41711046 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 41711565 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 41711699 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41711739 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 3 41711848 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41711849 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41711959 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41712491 T G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 41712943 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 41713034 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41713375 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 41713880 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 41714470 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 41717363 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 41717629 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41718305 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41718539 T A Y N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 3 41718833 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 41718841 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 41720149 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41721381 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 41722057 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 41722253 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 41723112 A T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.75 0.0625 0.1875 25 7 12 1 3 3 41723175 C T Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 41723829 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 41724259 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 41724374 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 41725034 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41725443 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41725598 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41725767 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 41726432 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41728074 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 41728724 A T N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.230769230769231 0.0769230769230769 0.692307692307692 7 19 3 1 9 3 41728803 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 41728936 C A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 10 22 4 2 10 3 41729226 C T N Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 3 41729767 A G Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 41729799 A C Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 41729818 T A Y N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 41729936 T A N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 41729957 A C Y N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 41730111 G T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 41730237 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41730307 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 41730313 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 41730362 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 41730539 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 41730575 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 41730625 T C Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 41730799 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 3 41730808 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 3 41730812 A G N Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 11 9 4 3 3 3 41730837 C T N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 3 41730838 C G N N 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 3 41730856 A G N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 3 41730858 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.416666666666667 0.5 0.0833333333333333 16 8 5 6 1 3 41730870 A G N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 3 41730884 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 41730995 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41731071 C G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 41731216 G T N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 41731224 G T N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 3 41731418 G T N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.266666666666667 0.133333333333333 0.6 10 20 4 2 9 3 41731534 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 41731551 A C N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 3 41731638 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 41731678 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 41731726 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 41731942 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41732333 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 41732385 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41732501 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41732511 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41732534 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41732678 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41732894 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41732986 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 41733154 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 41733164 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 41733217 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 41733311 C G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 41733521 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41733595 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 41733619 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 41733894 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 41734031 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 41734093 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41734143 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41734240 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41734259 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41734415 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 41735114 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41735135 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41735277 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41735352 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41735409 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41735436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41735662 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 41735678 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 41735683 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41735814 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41735825 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 41735928 C G Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41735930 C T Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 41735972 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 41735997 A G Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 41736572 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 41736578 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 41736643 T C Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41736673 A T Y N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 3 41736887 T C Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41736899 C T Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 41736930 C G Y N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 3 41736953 G T Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 41736997 A T Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 41737003 T C Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.8 0 0.2 24 6 12 0 3 3 41737037 C T Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 41737038 T A Y N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 41737148 C A Y N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.5 0.125 0.375 9 7 4 1 3 3 41737330 G C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 41737356 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 41737436 T C Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41737518 T A Y N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.375 0.0625 0.5625 13 19 6 1 9 3 41737537 C G Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5625 0.125 0.3125 20 12 9 2 5 3 41737630 G A Y Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.357142857142857 0.142857142857143 0.5 12 16 5 2 7 3 41737650 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 41737810 A C Y N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 41737937 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 41737947 C T Y Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.3125 0.125 0.5625 12 20 5 2 9 3 41738033 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41738099 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41738179 T C Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 41738216 A T Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 41738324 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41738638 T C Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 41738698 C T Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 41738744 G A Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 41738815 G T Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41738818 G C Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41739147 A G Y Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 10 14 4 2 6 3 41739150 T C Y Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 10 14 4 2 6 3 41739314 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 41739338 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 3 41739342 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 41739515 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41739564 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41739697 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 41739700 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 41739721 A C Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41739858 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 41739867 T G Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41739890 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 41739930 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 41740108 T C Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 41740234 C T Y Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 3 41740354 G C Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 41740357 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 41740398 T A Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 41740399 G T Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 41740453 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 41740556 A G Y Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.333333333333333 0.0666666666666667 0.6 11 19 5 1 9 3 41740598 G A Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.4375 0.125 0.4375 16 16 7 2 7 3 41740645 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 41740789 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 41740850 A C Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 41740862 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41740868 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41740901 T G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 41740914 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 41740943 C T Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 41740969 A T Y N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.25 0.166666666666667 0.583333333333333 8 16 3 2 7 3 41741017 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 41741038 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41741444 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 41741477 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 41741644 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 3 41741867 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41741871 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41741955 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41742003 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41742196 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 41742295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41742461 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 41742548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41742622 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41742624 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 41742670 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41742679 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41742852 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41742874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41742931 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41742976 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41743146 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41743175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41743214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41743226 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41743240 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 41743266 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41743304 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41743432 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 41743489 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41743628 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 41743796 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 41744073 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41744164 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41744401 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41744655 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41744709 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 41744840 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 41744920 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.6 0.133333333333333 0.266666666666667 20 10 9 2 4 3 41745003 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 41745074 C A N N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 3 41745125 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 41745413 G T N N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 41745428 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 41745509 T C Y Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.307692307692308 0.230769230769231 0.461538461538462 11 15 4 3 6 3 41745566 A C Y N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 41745604 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.176470588235294 0.0588235294117647 0.764705882352941 7 27 3 1 13 3 41745612 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 41745658 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41745672 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 41745821 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 41745855 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 41745925 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 41745974 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41746006 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 41746027 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41746168 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 41746195 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41746210 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 41746423 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 41746524 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41746552 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41747329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41747495 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41747533 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 41747552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41747561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41747658 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41747695 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41747739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41747766 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 41747781 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41747892 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41747930 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41747956 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41748027 A T N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 41748064 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41748167 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 41748209 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41748233 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41748342 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 41748408 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41748436 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41748576 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41748729 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41748779 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 41748840 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41748963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41749928 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41749929 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41750016 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41750200 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 41750277 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41750394 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 41750430 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41750554 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.666666666666667 0.133333333333333 0.2 22 8 10 2 3 3 41750577 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 3 41750683 A T N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 41750703 C T N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 3 41750769 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 41750896 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 41750909 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 41751520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41751557 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 41751643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41751664 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41754476 G T Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 41754484 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41754708 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41754736 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41754972 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 41754989 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 3 41755091 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 41756582 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41758269 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41759392 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 41760120 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 41760183 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41760576 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41760815 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41761338 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 41761725 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 41761901 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 41762026 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41762202 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 41762221 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 41762289 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 41762296 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 41762361 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 41762483 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 41762491 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 41762568 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 41762831 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 41762918 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41762981 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41763685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41764237 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41764836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41765165 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 41765312 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41765338 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41765508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41765799 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41765822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41765951 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41766154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41766163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41766452 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41766489 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 41766700 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 41766880 T A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 41767340 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 41767549 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41767589 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41767612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41767652 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41767754 C A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41767912 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41767914 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41768029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41768039 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41768182 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 41768418 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41768515 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 41768656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41768681 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41768800 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41768877 A C N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 41769336 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 41769445 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41769463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41769820 G T Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 41770260 T G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41770322 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41770329 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 41770647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41770718 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 41771285 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41771286 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41771321 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 41771973 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41773218 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41773387 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41775044 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 41775089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41775134 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41775465 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41777605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41778148 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 41778467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41778895 T G N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.461538461538462 0.230769230769231 0.307692307692308 15 11 6 3 4 3 41779193 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41780058 C T Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 3 41780165 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41781190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41781236 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41782811 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 41783959 C A N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 3 41785110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41786243 A C Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 41787649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41787756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41787931 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 41788052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41788310 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41789635 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 41789671 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 41789778 A C Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 41789864 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41789865 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41791250 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41791789 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41792051 C T Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.2 23 7 11 1 3 3 41792420 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 41792492 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 41793586 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 41793677 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41793995 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41794341 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 41794455 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41794470 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 41794590 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41794938 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 41794948 G T Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 3 41794990 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 41795076 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41796477 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41797315 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41797338 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 41798458 T C Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 41798555 A T Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 41801080 T C Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 41803268 A G Y Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 5 7 1 3 2 3 41803648 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41804581 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 41804786 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41804807 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 41805092 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 41805796 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41806179 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41806494 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 41807268 G C Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 41809154 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 3 41810555 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41810688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41811467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41811494 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 41811623 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41811793 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41812134 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41812264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41812546 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 41812684 T G N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 3 41812694 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 41812728 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.2 23 7 11 1 3 3 41812748 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 41812831 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 41812860 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 41812861 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 41812898 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 41813036 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41813091 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 41813153 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 41813172 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 41813184 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 41813198 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 41813199 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 41813225 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 41813412 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 41813507 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 41813782 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41813818 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41813875 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41813985 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41814028 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41814033 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 41814129 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 41814161 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 41814252 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 41814258 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41814269 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 3 41814275 T C Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 41814581 A T Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.75 0.0625 0.1875 25 7 12 1 3 3 41814659 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 41814708 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 41814709 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 41814943 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41815002 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41815486 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 41815499 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 41815712 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41816014 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 41816054 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41816168 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 41816195 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 41816216 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41816254 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 41816265 A T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 41816277 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 41816280 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 41816341 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 41816372 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 41816380 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 41816405 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 41816419 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 41816429 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 41816447 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41816486 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41816514 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 41817402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41817618 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 41818959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41821460 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41821702 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41821710 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41822147 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41823964 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41824167 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41824190 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41824236 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41824253 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41824290 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 41824292 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 41824669 G T N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 3 41824768 A G N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 41825580 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 3 41825617 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 41825866 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41825876 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41825895 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41825969 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41825977 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41825994 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41825995 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41826075 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41826142 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41826296 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 41826314 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41826370 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 41826873 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41827260 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41827631 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 41827654 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41827836 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 41827893 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 41827923 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41827960 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41827975 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 3 41828063 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 41828163 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 41828168 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 41828201 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 41828231 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 3 41828430 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 41834809 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 41834825 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 41834827 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41834913 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 41834921 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 41834931 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 41835040 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 41835154 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 41835345 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 41835413 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 41835496 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 41835613 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 41835620 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 41835712 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 41835717 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 41835749 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41835805 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 41835810 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 41835823 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41835831 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41835838 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41835884 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 41835909 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 41835921 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 41835958 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 41835998 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 41836002 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 41836051 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41836106 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41836204 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 41836253 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 41836338 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41836382 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 41836530 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 41836541 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 41836625 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41836850 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41837152 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41837246 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41837273 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41837332 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41837411 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41837559 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41837704 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 41837720 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41837723 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 41838076 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 41838424 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 3 41838538 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41838586 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 41838802 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41838860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41838929 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41838949 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41839075 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 41839131 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 41839157 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 41839162 T A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 41839199 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41839329 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 41839436 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 41839505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41839784 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 41839851 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 41839886 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 41839959 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 41840389 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.333333333333333 0.111111111111111 0.555555555555556 14 22 6 2 10 3 41840566 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 41840580 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 41840588 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 41840642 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 41840887 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 41840932 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 41841009 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 41841070 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 41841181 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 41841191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41841216 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 41841320 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 41841420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41841435 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 41841661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41841805 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41841871 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 41841916 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 41841918 A T Y N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 41841939 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 41842056 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 41842086 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 41842190 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 41842281 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 41842435 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41842446 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41842546 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41842863 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41843103 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 41843131 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 41843236 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41843647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41843673 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41843788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41843828 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41843848 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41843849 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41843891 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41843930 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41844271 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41844563 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41844579 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41844940 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41844984 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41845104 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 41845263 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.3125 0.0625 0.625 11 21 5 1 10 3 41845270 A C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.294117647058824 0.117647058823529 0.588235294117647 12 22 5 2 10 3 41845336 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41845404 G C N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 3 41845585 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41845595 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41845610 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41845828 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 41845854 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41845967 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41846077 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41846281 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 41846379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41846432 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41846492 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 41846748 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41846750 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41847072 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41847315 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41847629 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41847935 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 41848044 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 41848259 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41848557 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 41848866 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 41848896 G C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 41849138 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41849206 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41849758 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 41849973 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41850383 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 41850424 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 41850988 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 41852535 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 41853513 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 41854212 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 41854679 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 41855187 C A Y N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.307692307692308 0.153846153846154 0.538461538461538 10 16 4 2 7 3 41855220 A G Y Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.333333333333333 0.133333333333333 0.533333333333333 12 18 5 2 8 3 41855356 A G N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.307692307692308 0.0769230769230769 0.615384615384615 9 17 4 1 8 3 41855723 G C N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 3 41856002 C A Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 3 41856170 G C N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.3125 0.125 0.5625 12 20 5 2 9 3 41856553 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41856588 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41857186 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 41857219 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41857556 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 41857581 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 41857808 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 41857891 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41857954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41858159 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41858175 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 41858184 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 41858194 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41858278 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 41858309 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41858314 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 41858327 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 41858392 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41858485 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 41858557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41858798 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41858815 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 41859055 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41859102 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41859211 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 41859212 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 41859303 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 41859307 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41859425 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41859443 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41859462 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41859502 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 41859549 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 41859684 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 41859718 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 41859840 C T Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 41859841 A G Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 41859867 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 41859908 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 41860012 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 41860403 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 41860637 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41862232 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 41862521 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 41862550 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 41862683 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41862724 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 41862748 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 41862995 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 41863149 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 41863190 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41863367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41863728 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41863730 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 41863739 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 41863968 T A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 41864035 T G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 41864179 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41864234 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41864256 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41864344 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41864363 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41864387 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 41864410 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 3 41864440 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41864456 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41864555 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 41864713 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 41864746 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 41864802 C G Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 41865200 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 41865282 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41865308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41865664 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 41865942 G T Y N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 41866075 A G Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 41867474 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 41867503 T C Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 41867581 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41867716 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 41868105 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 41869852 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 41869902 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41869903 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 41870019 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 41870020 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 41870030 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 41870154 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 41870446 G C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 41870511 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 41870643 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 41871313 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 41871418 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41871532 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 41871569 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 41871700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41871718 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 41871762 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41872043 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 41872075 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 41872089 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 41872492 C A N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.2 0.133333333333333 0.666666666666667 8 22 3 2 10 3 41872644 A T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 41872844 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41872932 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 41873018 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 41873132 A T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 41873165 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41873169 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41873203 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 41873204 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 41873234 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41873243 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41873272 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41873331 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 41873367 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 41873398 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 41873451 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 41873836 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41873856 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 41874526 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 3 41874648 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41874677 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 41874845 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 41874867 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 41874904 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 41874958 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 41874975 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 3 41874978 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 3 41874993 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 41875033 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 41875054 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41875072 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 41875099 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 41875147 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 41875166 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41875287 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 3 41875300 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 41875452 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 41875510 C T N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.333333333333333 0.2 0.466666666666667 13 17 5 3 7 3 41875562 G A N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 0.142857142857143 0.214285714285714 20 8 9 2 3 3 41875580 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.333333333333333 0.133333333333333 0.533333333333333 12 18 5 2 8 3 41875594 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.352941176470588 0.117647058823529 0.529411764705882 14 20 6 2 9 3 41875609 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 41875694 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41875733 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41875821 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 41875858 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 41875961 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 41876048 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 41876118 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 41876245 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 41876252 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 41876300 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41876750 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41877174 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 41877181 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41878083 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41878159 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 41878204 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 41878355 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 41878384 C G N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.428571428571429 0.142857142857143 0.428571428571429 14 14 6 2 6 3 41878408 T A N N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.416666666666667 0.25 0.333333333333333 13 11 5 3 4 3 41878456 G A N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.307692307692308 0.153846153846154 0.538461538461538 10 16 4 2 7 3 41878461 T A N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 3 41878492 C T N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.384615384615385 0.0769230769230769 0.538461538461538 11 15 5 1 7 3 41878561 T A N N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 15 9 6 3 3 3 41878587 C G N N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.545454545454545 0.272727272727273 0.181818181818182 15 7 6 3 2 3 41878599 T A N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 41878612 G A N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.5 0.214285714285714 0.285714285714286 17 11 7 3 4 3 41878617 T A N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 41878896 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41878981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41879018 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 41879259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41879329 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 41879387 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 41879515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41879627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41879632 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 41879678 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 41881134 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 41881453 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41881537 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41881622 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41881729 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41881925 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41881996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41882017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41882182 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 41882843 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41883357 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41884197 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41885748 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41885819 A T N N 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0 1 0 7 7 0 7 0 3 41887598 C A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 41888359 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 41888673 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41889784 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41891928 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 41891964 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 41892332 A G N Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 9 9 3 3 3 3 41892608 A T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 41892772 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41892829 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41892849 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 41893375 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 41894318 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 41895223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41896343 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41896789 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 41897028 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 41897075 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 41897303 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41898121 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 41898670 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 41898689 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 41898842 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41898994 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 41899714 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41900875 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41901743 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 41902074 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41902821 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 41903201 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41903756 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41905129 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41905332 T G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 3 41905338 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 41906821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41907956 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41907972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41908056 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41908233 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41908733 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41909251 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41909670 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41909836 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41909954 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41910094 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 41910096 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41910131 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41910305 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 41910480 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41910504 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41910764 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41911054 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41911094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41911153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41911703 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41911815 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41911984 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41912707 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 41913123 G T N N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.545454545454545 0.272727272727273 0.181818181818182 15 7 6 3 2 3 41914105 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 41914377 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41914794 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 3 41914815 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 41915135 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41915770 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 41916602 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41916716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41916990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41917371 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41917845 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41918377 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41918668 A T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 41919110 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 41919350 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41919358 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41919389 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41919549 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41927323 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41927766 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 41927992 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41928567 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 41928600 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 41929485 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 41931252 T G Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 41931394 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41932055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41932381 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41932678 T G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41932684 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41932757 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 41932913 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 41933585 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41933601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41933837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41934161 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 41934253 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41935051 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 41935210 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 41935361 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 41935628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41936165 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 41936610 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 41936882 A T Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 3 41937860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41938759 A C Y N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 3 41938884 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41938997 C G Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 3 41939737 A G Y Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 14 6 6 2 2 3 41939763 G T N N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 8 12 3 2 5 3 41939764 T G N N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 8 12 3 2 5 3 41939833 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 41939904 G T Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 3 41939987 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 41939997 C T N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 41940015 G A Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 41940468 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41940518 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41940663 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 41941082 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 41941086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41941493 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41941908 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 41943790 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41943806 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41943833 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41944232 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41944392 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41944652 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 41944744 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 41944759 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 41944889 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 41944975 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 41944977 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41945013 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41945046 A T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 3 41945355 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 41945407 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 41945473 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 41946591 C G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 41948219 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 41948355 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41948660 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 41948675 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 41951341 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 41952129 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41952363 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 41952614 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41953446 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41955200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41955686 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41955983 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41956130 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 41956286 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 41959234 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41959287 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41959969 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41960398 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 41961090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41963029 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41963784 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41964136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41964826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41964882 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41964962 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 41965357 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 41966239 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 41966343 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 41966387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41966460 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 41967879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41968309 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41969341 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 41970014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41970672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41971126 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 41971986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41972484 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41974286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41974480 A T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 41974619 A C Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 41974888 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 41979551 C A Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 41981551 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 41981652 G A Y Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 41981686 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 41982263 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 41982976 A T Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 41983240 C T Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 41983682 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 41983738 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41984730 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41985118 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 41991736 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 41992032 T C Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 3 41992261 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 41992466 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 41994291 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 41998000 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42000887 T A Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 42000893 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 42001852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42002658 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42003320 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42005145 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42006426 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42013446 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 42014066 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42019082 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42019249 G C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 42019329 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 42019485 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42019785 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42019836 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 42019888 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 42020053 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 42020080 C T N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.416666666666667 0.25 0.333333333333333 13 11 5 3 4 3 42020270 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 42020395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42020436 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42020704 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 42020982 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42021142 A T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 42021530 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42022303 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42022368 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 42022506 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42022990 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42023091 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42023124 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42023378 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 42023394 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 42023437 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42023614 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42023719 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 42024116 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42024463 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42024484 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42024584 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42024585 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42024643 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 42024650 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42024671 C G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 3 42024820 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 42024936 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 42025153 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 42025672 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42025942 G C N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 3 42025968 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42026127 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 42026366 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42026451 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 42026465 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 3 42026480 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42026578 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 42026761 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 3 42026906 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42026907 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42027006 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 42027062 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42027210 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 42027223 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 42027547 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 42027604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42027638 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42027941 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42028319 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42028325 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42028357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42028424 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42028426 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42028477 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42028665 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42028679 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42028716 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 42029205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42029353 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42029430 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 42029679 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42029864 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42030221 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 42030506 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42030530 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42030660 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 42031270 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42031341 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 42032034 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 42032398 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42032518 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 42032729 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42032960 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 42033185 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42035549 A G Y Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 42035634 G A Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 42035715 A G Y Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 3 42035750 T G N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.0714285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 13 15 1 11 2 3 42036028 C T N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.181818181818182 0.727272727272727 0.0909090909090909 12 10 2 8 1 3 42036664 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42036737 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42037009 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 42037043 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42037093 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42037254 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42037354 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42037410 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42038085 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42038466 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42038508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42039128 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 42039132 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 42039238 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 42039813 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 42040065 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 42040066 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 42040100 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42040118 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42040131 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 42040152 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42040183 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42040252 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 42040698 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 42040803 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42040880 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42041008 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42041130 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42041223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42041344 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42041445 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42041540 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 42041679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42041688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42041775 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42041789 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42041887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42041921 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42041928 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42042013 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42042083 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42042646 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42042657 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42042772 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42042793 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42042844 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42042852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42042907 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42042991 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.6 0.133333333333333 0.266666666666667 20 10 9 2 4 3 42043067 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 42043145 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42043193 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42043196 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 42043317 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42043330 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42043345 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42043549 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42043558 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42043620 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 42043660 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42043731 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 42043880 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42044150 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42044191 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42044192 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 42044272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42044343 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42044346 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42044514 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42044600 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 42044640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42044646 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42044659 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42044702 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42044904 T A N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 42044970 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 42045110 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 42045161 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42045365 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 42045427 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42045479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42045536 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42045562 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42045592 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42045596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42045691 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42045698 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42045727 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42045743 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42045755 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42045794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42045831 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42045891 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42046401 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 42046413 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 42046539 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 42046558 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42046674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42046769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42046772 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42046786 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42046810 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42046856 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42046861 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 42046951 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 42046998 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 3 42047006 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 42047011 C A N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 42047064 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 42047163 T C N Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 3 42047175 C G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 42047420 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 42047458 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 42047605 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42047752 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42047988 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 42048011 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 42048077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42048109 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42048129 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42048221 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42048232 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 42048233 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 42048263 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42048390 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 42048471 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 3 42048492 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42048780 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 42048846 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 42049136 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 42049138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42049150 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42049191 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42049586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42049643 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42049651 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 42049701 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 42049806 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42049995 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 42050003 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42050125 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42050213 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42050229 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 42050230 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 42050274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42050390 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42050476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42050507 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42050739 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42052434 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 42052502 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 42052690 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42052699 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42052773 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 42053061 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 3 42053198 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42053218 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 42053569 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42053601 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42053671 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42053791 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42054126 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42054162 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42054540 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42054712 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42054933 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42055039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42055120 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42055220 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 42055751 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 42055953 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42055973 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 42056043 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42056051 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 42056102 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42056193 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42056646 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42057188 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42057339 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42057457 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42057543 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42057771 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42058308 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42058382 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42058496 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42058560 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42058628 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 42058729 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 42058730 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42058816 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 42058830 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 42059209 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42059403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42059462 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 42059567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42059568 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42060146 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42060729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42060817 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42061439 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42061493 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42061666 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42061669 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42061866 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42062157 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42062469 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42062749 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 42062876 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42063251 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42063329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42063434 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 42063435 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 42063525 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42063670 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42063700 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42064112 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42064183 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 3 42064685 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42065085 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42065348 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42065489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42065534 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42065568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42065614 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42065637 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42065657 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42065659 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 42065760 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 42065892 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 42065895 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42065916 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 42065932 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 42065947 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42065994 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 42066031 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 42066193 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42066276 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 42066289 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 42066443 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 42066539 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42066580 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 42066586 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 3 42066720 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 42066959 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 42067018 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 42067059 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 42067152 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 42067186 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 42067208 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42067444 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 42067489 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 42067758 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42067780 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 42067817 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 42068062 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42068301 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42068373 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42068390 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 42068416 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42068442 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42068505 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 42068550 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 42068575 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 42068593 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42068597 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 42068708 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42068743 G T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 42068912 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 42069191 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42069212 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42069213 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42069257 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42069364 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 42069547 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42069649 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42069676 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 42069976 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42069997 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42070206 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42070330 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 42070522 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42070531 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42070551 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 42070587 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42070616 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42071043 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 42071344 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42071401 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 42071567 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42071631 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42071645 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42071698 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42071762 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 42071879 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42071938 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42072241 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42072296 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42072298 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42072342 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42072438 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42072489 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 42072651 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42072689 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42072815 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42072934 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 42072956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42073017 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42073083 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42073136 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 42073236 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42073254 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42073303 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42073327 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42073415 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42073422 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 42073426 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42073441 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42073446 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 42073484 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42073542 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 42073677 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42074170 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 42074200 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 42074392 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 42074412 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 42074416 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 42074434 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 42074449 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 42074620 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 42074755 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 42074789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42074845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42075773 C T N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 42075931 C A N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.3125 0.125 0.5625 12 20 5 2 9 3 42076460 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 42076463 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42076522 C T N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.181818181818182 0.0909090909090909 0.727272727272727 5 17 2 1 8 3 42076570 A C N N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 3 42080162 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 3 42080259 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.235294117647059 0.117647058823529 0.647058823529412 10 24 4 2 11 3 42081001 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 42081241 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 42081359 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42081449 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 42081514 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 42081896 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 42081912 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42081917 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42082289 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 42082467 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42082866 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 3 42083001 C T Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 42083267 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 42083398 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 42083559 T C Y Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 3 42083577 C G N N 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 3 42083712 T C Y Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 42083855 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42084257 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 42084262 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 42085045 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 42085068 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 42085174 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 42085760 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42085826 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 42086164 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 42086681 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 42086854 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 42087035 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 42087105 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 42087129 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 42087165 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 42087175 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 42087255 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 42087274 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 42087679 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 42088206 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 42088218 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 42088245 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 42088304 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.315789473684211 0.105263157894737 0.578947368421053 14 24 6 2 11 3 42088551 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 42088616 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 42088759 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 42088823 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42089696 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 42089723 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 42089750 G C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 42089782 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42089816 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 42089857 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 42089865 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42089924 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 42090280 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 42090383 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 42090994 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 12 6 5 2 2 3 42091399 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 42091847 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 3 42092773 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42093115 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 42094105 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 42094654 T C N Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.5 0 0.5 6 6 3 0 3 3 42095888 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42096083 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42097757 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42100495 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 42100615 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 42105334 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42105580 C A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 42105881 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42106854 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42108288 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 42110394 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42111948 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 42112206 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42113118 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42114754 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42115326 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 42115516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42118261 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 42118377 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 42119029 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 42119409 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42119800 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42129213 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 42129430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42129699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42130336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42130512 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 42130518 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42130534 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42130554 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 3 42130705 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 42132128 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 42132515 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42132800 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 42132810 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 42133148 T G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 42133281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42133318 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 42133678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42133763 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42133841 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 42133887 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42133952 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42133985 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42134005 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42134007 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42134092 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42134108 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42134112 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42134139 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42134313 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42134349 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42134393 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42134457 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42134473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42134497 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42134520 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42134555 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42134558 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42134609 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42134676 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 42134707 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 42134725 G C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 42134769 T A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 42134939 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42135073 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42135078 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42135231 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 42135633 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 42135746 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 42136227 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42136256 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42136268 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42136295 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42136327 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42136435 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 42136464 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42136489 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42136585 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42136890 A T N N 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 3 42136993 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42137003 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42137044 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42137045 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42137138 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42137155 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42137200 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42137247 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42137288 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42137290 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42137486 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 42137617 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42137637 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 42137836 G C N N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 3 42138026 T A N N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 9 9 3 3 3 3 42138029 C A N N 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 7 9 2 3 3 3 42138040 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 42138054 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 42138077 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 42138138 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 42138267 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42138437 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42138576 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42138628 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42138853 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42138879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42139045 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 42139132 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 42139176 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42139189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42139251 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42139252 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42139278 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42139372 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42139614 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42139631 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42139792 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42139810 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42139860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42140160 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 42140239 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42140392 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 42140466 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.578947368421053 0.105263157894737 0.315789473684211 24 14 11 2 6 3 42142000 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 42142155 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 42143086 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 42143520 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 42143615 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 42143824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42143966 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42144004 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42144204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42144261 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 42144262 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 42144311 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 42144425 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 42144432 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.466666666666667 0.2 0.333333333333333 17 13 7 3 5 3 42144544 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 42144555 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 42144616 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 42144671 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 42144721 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.555555555555556 0.111111111111111 0.333333333333333 22 14 10 2 6 3 42144855 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 42144889 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 42144923 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 42144990 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 42145044 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 42145085 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 3 42145098 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 42145245 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42145343 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42145469 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 42145874 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 42145884 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 42145908 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 42145956 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42146003 C A N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 42146038 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 42146071 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42146081 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42146165 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 42146308 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42146311 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.4 0.1 0.5 18 22 8 2 10 3 42146434 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.333333333333333 0.111111111111111 0.555555555555556 14 22 6 2 10 3 42146464 A T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.352941176470588 0.117647058823529 0.529411764705882 14 20 6 2 9 3 42146658 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42146725 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 3 42146806 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 42146866 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 42146873 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 42146970 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 42147074 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 42147228 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 42147308 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 42147367 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 42147557 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42147599 T A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 42147707 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42147821 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 42147921 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42147934 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 42148061 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 42148127 C A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 42148175 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42148275 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42148351 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 42148529 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42148538 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42148762 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 42148826 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 42148828 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 42148856 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 42148888 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42148973 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 42149192 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 42149538 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 42149564 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42149642 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 42149827 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42149853 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42149950 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42150065 T G N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 42150077 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 42150105 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 42150179 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 42150502 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 42150513 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 42150526 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 42150674 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42150715 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 42150740 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 42150744 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 42150860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42150881 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42151054 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 42151772 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 42151780 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 42151798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42151856 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 42151939 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 42152392 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42152499 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42152640 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42152669 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42152829 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42152889 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 42152968 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 42153184 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42153191 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42153247 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 42153350 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42153359 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 42153418 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42153419 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42153433 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42153959 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 42154110 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 42154148 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 42154293 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 42154406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42154765 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42154870 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42154905 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42154985 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 42155137 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 42155408 T A N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.666666666666667 0.133333333333333 0.2 22 8 10 2 3 3 42155670 T G N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 42155798 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 42155830 C G N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 3 42156258 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 42156273 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 42156533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42156743 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 42156845 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 42157102 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42157506 G T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 42157514 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 42157673 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42157796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42157798 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42158275 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42158319 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 42158345 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 42158389 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 42158429 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 42158543 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 42158588 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42158669 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 42158814 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 42158828 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 42158858 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 42159025 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 42159041 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 42159069 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 42159072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42159202 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 42159282 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 42159396 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 42159482 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 42159607 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 42159674 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 42159753 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 42159756 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42159781 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42159843 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 42159868 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 42159938 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 42159955 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 42159966 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 42160116 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 42160131 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42160160 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 42160199 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 42160304 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 3 42160337 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.5 0.1875 0.3125 19 13 8 3 5 3 42160447 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 42160462 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42160705 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 42160808 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 42160912 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 42161171 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 42161227 G T N N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.7 0 0.3 14 6 7 0 3 3 42161514 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 42161610 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 42162483 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 42162623 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 42162716 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 42162831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42162851 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 42162949 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 30 6 15 0 3 3 42162992 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 42163022 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 42163103 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 42163113 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 42163141 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 42163802 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42164213 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42164294 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 42164328 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 42164336 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 42164430 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 42164695 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42164799 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 42165026 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 42165174 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 42165516 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 42165967 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 42165979 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 42166017 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 42166030 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 42167384 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 42168141 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 42168286 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 42168694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42169134 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42169197 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42169658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42169940 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 42170071 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 42170074 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 42171037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42171695 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 42172410 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 42172538 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 42174246 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 42174259 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 42174332 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 42175262 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 42178969 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 42181155 T G N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 42182606 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 42182799 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42184004 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 42184340 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 42186514 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 42187392 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42187701 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 42187830 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 42187975 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 42188731 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 42188912 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 42189216 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 42190125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42190819 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 42191180 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42191198 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 42191744 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42194267 T C Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 42194337 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42195416 A C Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 42196062 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42197547 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42197556 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 42198821 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42199965 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42200078 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42204580 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 42204895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42208388 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42209743 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42210399 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 42213855 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42216300 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 42216406 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42216554 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42216760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42217269 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 42220928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42220956 T C Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 42221006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42221063 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42221591 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42222050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42222947 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42223465 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42223637 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42225642 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42226376 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 42226649 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42227193 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 42227215 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 42227280 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 42229495 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42229985 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42234699 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42235283 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 42236034 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42236236 C T N Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 7 7 2 3 2 3 42236981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42237386 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42238470 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42238582 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 42238850 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42239970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42240420 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42241167 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42241579 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 42242092 G T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 42242914 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 42242920 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42243348 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 42243882 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 42244185 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 42244643 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42245414 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 42245697 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42245864 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 42245942 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42246502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42246758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42246787 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42246834 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42247178 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 42248738 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42249084 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42249849 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42251782 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42251795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42252285 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42253111 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 42253147 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 42253158 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42253669 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 42253844 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 42254126 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 42254333 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 42254379 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 42254396 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42254620 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 42255179 G T N N 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.454545454545455 0.272727272727273 0.272727272727273 13 9 5 3 3 3 42255223 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 42255376 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 42256155 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 42256430 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42256688 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42256830 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42257178 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 42257272 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 42257624 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42258013 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 42258299 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42258396 T A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 42258421 T A N N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 5 5 2 1 2 3 42258858 A G Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 42258925 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42258933 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 42259033 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 42259034 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 42259101 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 42259126 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42259328 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42259558 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 42259802 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 42259954 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 42260670 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 42260837 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 42261351 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 42261464 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 42261620 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 42261762 T G N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 3 42264138 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 3 42265771 C T N Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 11 9 4 3 3 3 42265820 T C N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 3 42266492 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 42266821 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 42267458 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 42267523 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 42267631 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 42267742 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 42268180 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 42269372 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 42270166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42270486 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42272948 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 42273073 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42273395 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 42273413 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 42273708 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 42273885 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 42274215 A G N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 3 42274245 T C N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 3 42274255 T C N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 3 42274256 G A N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 3 42274272 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 42274378 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 42274686 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 42275057 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 3 42275169 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42275170 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42275186 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 42278333 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 42278814 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42278826 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 42278846 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42279079 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42280051 T C Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.176470588235294 27 7 13 1 3 3 42282033 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 42282095 G T Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 42282325 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 42282444 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42282502 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 42282937 T A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 42283078 T G Y N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 42283528 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42283640 C A Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 42284900 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42285382 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42285912 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42286411 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 42286459 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42286464 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42287290 T C N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.214285714285714 0.0714285714285714 0.714285714285714 7 21 3 1 10 3 42287302 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42288612 A C Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 42288690 G T Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 42288741 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 42288855 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42290010 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42290295 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42291155 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42291302 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42291342 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 42292001 G C Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 42292153 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 42292440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42293050 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 30 6 15 0 3 3 42293879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42296428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42296639 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42297387 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42301354 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42303541 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 42304881 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42305423 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 42305440 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42311782 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 42311879 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 42312313 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 42313628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42313833 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42313842 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42314250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42314704 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42314812 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42315658 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 42317163 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42317236 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 42317628 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42319474 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42320999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42321141 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42321997 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42323891 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42324809 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 3 42325512 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42325629 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42325888 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 42326300 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42327028 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42327134 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42327607 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 42328788 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42329333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42330286 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42331282 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 42331488 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42332498 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 42332919 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42335566 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 42336516 C A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 42337010 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42337174 T G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 3 42337520 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 42337867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42338346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42338857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42339241 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 42339919 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 42340375 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 42341868 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 42341898 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 42341988 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 42342022 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 42342157 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 42342222 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 42342450 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42342990 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 42343473 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 42343492 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 42344095 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 42344096 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 42344149 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 42344298 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 42344439 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 42344581 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 42345089 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 42345244 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 42345406 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 42345639 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 42345747 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 42345835 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 42346024 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 42346039 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 42346357 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42346978 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.444444444444444 0.111111111111111 0.444444444444444 18 18 8 2 8 3 42347469 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 3 42347519 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 3 42347573 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.444444444444444 0.111111111111111 0.444444444444444 18 18 8 2 8 3 42347704 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42347846 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 42347993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42348056 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 3 42348317 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.444444444444444 0.0555555555555556 0.5 17 19 8 1 9 3 42348809 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 42349504 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42349599 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 42349721 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 42349840 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 42350428 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 3 42350537 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.411764705882353 0.117647058823529 0.470588235294118 16 18 7 2 8 3 42351813 T G N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.466666666666667 0.133333333333333 0.4 16 14 7 2 6 3 42351990 T G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 3 42351991 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 3 42352020 C A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 3 42352397 T G N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.266666666666667 0.0666666666666667 0.666666666666667 9 21 4 1 10 3 42352407 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.6 0.133333333333333 0.266666666666667 20 10 9 2 4 3 42352435 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 42352657 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42352721 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42352753 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42352856 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42352949 C A Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 42353319 A T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 42353386 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42353408 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 42353563 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42353618 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 42353625 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 42353774 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 42353893 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 42353903 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 42354171 T G Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 3 42354280 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 42354301 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 42354425 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42354509 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 42354572 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42354888 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 42354952 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 42355080 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 42355137 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 42355171 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 42355490 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 42355556 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 42355640 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 42355755 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42355857 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 42355868 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 42355877 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42356117 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42356625 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 42356690 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42356810 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 42356847 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42357112 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 42357142 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42357199 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42357371 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42357416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42357507 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 42357543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42357714 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 42358094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42358476 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 42358578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42358588 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42358894 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42359075 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 42359197 C A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 42359327 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 42359789 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 42360312 C T Y Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.5 0.125 0.375 9 7 4 1 3 3 42360483 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42361096 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 42361274 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 42361742 A T N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.333333333333333 0.2 0.466666666666667 13 17 5 3 7 3 42362622 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 42363175 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42364476 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 42364861 C A N N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.454545454545455 0.181818181818182 0.363636363636364 12 10 5 2 4 3 42365129 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 42367886 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42367907 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 42371078 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 42371333 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 42372855 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 42374849 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 42375850 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 42375890 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 42376894 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 42377207 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 42377551 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 42379815 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 42379914 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 42380436 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 42388616 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 42389108 C G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 42389821 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 42390052 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 42390634 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 42392338 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42392879 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42393030 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 42393649 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 42395135 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 42395423 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 42395457 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 42395483 G C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 42397936 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 42398281 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 42398711 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 3 42401134 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42402885 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42403185 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 42404490 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42404837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42405122 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42405505 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42406050 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 42407364 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42407903 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 42408918 G A N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.533333333333333 0.2 0.266666666666667 19 11 8 3 4 3 42408954 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 42410283 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 42410900 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 42412711 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 42412930 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 42413048 G T N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.307692307692308 0.153846153846154 0.538461538461538 10 16 4 2 7 3 42413121 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 3 42413239 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 42413777 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 42413897 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42414052 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 42414213 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 42414550 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 42414559 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42414568 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42415756 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 42415874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42416065 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 42416351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42416436 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42416523 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42417635 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 42417794 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42417875 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 42418427 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 42418777 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42419017 A C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 42419817 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42420936 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 11 7 4 3 2 3 42421856 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42421857 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42422231 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 42423068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42423232 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 42423602 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 42424330 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42424734 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 3 42426059 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42427480 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42427905 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 42428587 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42429684 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 42430050 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 42430371 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 42431132 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 42431144 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 42433182 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 42434377 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 42434607 C A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 42434765 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 3 42434824 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 42435079 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 42435257 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 42436197 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 42436601 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 42437438 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 42437466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42437626 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 42437717 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 42437835 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 42437921 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 42437945 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 42437948 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 42438034 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 42438093 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 42438118 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 42438143 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 42438299 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 42438527 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 3 42438590 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 42438696 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 42439050 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 42439102 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 42439277 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 3 42439913 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 3 42443305 G A Y Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.272727272727273 0 0.727272727272727 6 16 3 0 8 3 42444750 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42444921 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42447455 T G N N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.384615384615385 0.307692307692308 0.307692307692308 14 12 5 4 4 3 42448241 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42448958 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 42451501 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 42452490 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42452546 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 42454725 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 42455722 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 42458182 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42459294 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 42460713 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42461155 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 42461760 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 42461777 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 42462128 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 3 42462169 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 42462458 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 42462638 A C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 42464502 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42464858 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 42466776 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42466800 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 42468656 T C Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 3 42471026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42471158 T A Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 42471159 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 42472333 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 42474345 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.2 0.133333333333333 0.666666666666667 8 22 3 2 10 3 42476522 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 42478176 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 42478307 A G Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 42480357 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42481231 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42481239 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 42482600 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42482889 A G N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.333333333333333 0.2 0.466666666666667 13 17 5 3 7 3 42483500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42484126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42485897 A C N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 42487907 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 42491411 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 42493440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42493911 C G Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 42495788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42496475 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 42497291 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42504321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42504499 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 42505477 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42511717 T A Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 42511834 C T Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 42513269 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42513428 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 42513671 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 42513987 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42515224 G C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 42516393 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42517236 G C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 3 42517721 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 42518094 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 42519339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42519669 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42527128 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42527879 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 42528583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42528774 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42530070 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42530108 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 42530958 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 42532202 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 42533651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42535612 A C Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 42535779 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42535847 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 42537077 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42538195 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42538946 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42539167 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 42541094 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 42541095 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42541304 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42541315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42541532 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42543130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42546560 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 42548479 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42548557 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42549838 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42549890 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42551676 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42551786 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42552119 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42552166 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 42552335 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42552407 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42553608 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 42554218 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42554347 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 42554445 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 42554867 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42555170 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42555209 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42556666 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42556834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42557378 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42557570 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42558018 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 42558166 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 42558301 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42558406 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 42558701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42558963 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42560220 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 42560236 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42560237 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 42560372 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 42560636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42561069 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 42561612 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42561891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42561921 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42562126 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42562387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42563097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42563464 T G N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 42563833 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 8 10 3 2 4 3 42564005 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 42564512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42565000 T C Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.470588235294118 0.117647058823529 0.411764705882353 18 16 8 2 7 3 42565153 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42565193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42565194 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42565290 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42565829 A C N N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 3 42566491 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 42566650 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 42566682 G A Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 3 42566943 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42567564 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42567668 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 42567777 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 42568184 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42568399 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42568530 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42569008 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 3 42569462 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 3 42569522 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 42569755 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 42569790 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 42570166 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42570325 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 3 42570405 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42570527 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 42570931 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 42571575 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42571665 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42571972 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 42572126 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 42572786 A C Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.388888888888889 0.111111111111111 0.5 16 20 7 2 9 3 42573096 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42573239 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42573498 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 42573512 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 42574135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42574736 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42578334 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 42578388 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42579537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42579674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42580442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42580505 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42580861 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 42580933 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 3 42581162 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42581695 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42581954 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 3 42582102 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 42582140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42582354 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 42582528 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.470588235294118 0.117647058823529 0.411764705882353 18 16 8 2 7 3 42582607 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 3 42582659 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 42582673 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 42582991 G A N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 10 18 4 2 8 3 42583004 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.3125 0.125 0.5625 12 20 5 2 9 3 42583060 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 3 42583172 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42583281 G C N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.4375 0.125 0.4375 16 16 7 2 7 3 42583557 C G N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.538461538461538 0.153846153846154 0.307692307692308 16 10 7 2 4 3 42583935 C G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 3 42583949 A C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.470588235294118 0.117647058823529 0.411764705882353 18 16 8 2 7 3 42583987 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.4375 0.1875 0.375 17 15 7 3 6 3 42584046 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.411764705882353 0.117647058823529 0.470588235294118 16 18 7 2 8 3 42584217 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42584310 C A Y N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 3 42584357 T C Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 3 42584731 A G Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 42585199 C A Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.6 0.133333333333333 0.266666666666667 20 10 9 2 4 3 42585248 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 42585280 A G Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 42585398 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 42585528 C A Y N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 3 42586294 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 42586460 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42586691 C G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.411764705882353 0.117647058823529 0.470588235294118 16 18 7 2 8 3 42587219 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 42587901 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 42588085 G T Y N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.357142857142857 0.142857142857143 0.5 12 16 5 2 7 3 42588485 C T N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.214285714285714 0.142857142857143 0.642857142857143 8 20 3 2 9 3 42589325 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 42589387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42589635 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 42589648 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 42589705 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 42589788 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 42589809 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 42589859 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 42589869 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 42589910 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 3 42590267 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42590336 C T Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 3 42590687 A T Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 42590869 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 42590925 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42590936 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 3 42590967 C G Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 42590995 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 42591034 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 42591103 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42591209 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 3 42591417 G T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 42591433 T C Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 3 42591457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42591469 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 42591602 C A Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 3 42591674 C A Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 42591696 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42591872 T A N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 42591908 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 42591921 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 42592141 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 42592161 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 42592168 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 42592361 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 42592458 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 42592546 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 42592770 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 42592921 A C Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 42592922 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 0.105263157894737 0.421052631578947 20 18 9 2 8 3 42592944 G T Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 0.105263157894737 0.421052631578947 20 18 9 2 8 3 42592975 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 42593089 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 42593264 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 42593350 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 42593400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42593481 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 42593482 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 42593533 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 42593569 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 42593736 C A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 42593834 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42593846 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 42594040 G C Y N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.272727272727273 0.181818181818182 0.545454545454545 8 14 3 2 6 3 42594222 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 42594260 T A N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.5 0.125 0.375 18 14 8 2 6 3 42594271 T C Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.588235294117647 0.0588235294117647 0.352941176470588 21 13 10 1 6 3 42594296 T A Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.555555555555556 0.111111111111111 0.333333333333333 22 14 10 2 6 3 42594315 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 42594391 G A Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 3 42594490 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 42594510 T A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 42594712 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.4375 0.1875 0.375 17 15 7 3 6 3 42594766 A G Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 3 42594787 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42594791 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.5 0.111111111111111 0.388888888888889 20 16 9 2 7 3 42594803 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42594813 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 42595097 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 42595112 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42595224 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 42595230 T C N Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.5 0.1 0.4 11 9 5 1 4 3 42596646 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42596961 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42597003 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.4375 0.1875 0.375 17 15 7 3 6 3 42597329 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42597348 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42597375 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 42597541 T G N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.4375 0.1875 0.375 17 15 7 3 6 3 42597596 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 42597627 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42597810 T A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.352941176470588 0.117647058823529 0.529411764705882 14 20 6 2 9 3 42598228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42598384 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 3 42598648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42598756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42598770 G C Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 42598876 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42599331 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42599638 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42599649 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42599830 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42599868 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42600841 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42600933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42601484 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42601616 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 3 42601742 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42601773 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42602167 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42602625 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 42602730 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 42602791 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42602794 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 3 42602836 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42603807 A T Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 42607977 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42608001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42609367 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42610159 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 42612246 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42612765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42613886 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 42614098 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42614231 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 42614716 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42614776 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42614888 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42615075 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42615405 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42617048 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 42617960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42618430 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42619237 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 42620426 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42620606 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42620734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42621573 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42621666 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42622388 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42622473 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42623031 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 3 42623158 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42623320 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42624010 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42631850 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42632181 A T N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 3 42632372 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.555555555555556 0.111111111111111 0.333333333333333 22 14 10 2 6 3 42632393 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 42632436 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 42632682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42632788 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 42632856 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 42632879 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42632889 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 42632954 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 0.105263157894737 0.421052631578947 20 18 9 2 8 3 42632979 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.526315789473684 0.105263157894737 0.368421052631579 22 16 10 2 7 3 42634302 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 42634503 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 42634649 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 42634711 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 42634763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42634871 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 42635375 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42635433 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 42635905 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 0.105263157894737 0.421052631578947 20 18 9 2 8 3 42636100 T G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 3 42636301 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 42636598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42636673 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42637556 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.388888888888889 0.111111111111111 0.5 16 20 7 2 9 3 42637666 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42638049 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 42639180 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 42639364 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.5 0.111111111111111 0.388888888888889 20 16 9 2 7 3 42639437 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42639890 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 42639971 G C N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.538461538461538 0.0769230769230769 0.384615384615385 15 11 7 1 5 3 42640031 C A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 42640965 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42641051 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 42641092 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 3 42641116 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42641367 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 42641379 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 42641446 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 42641477 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 42641497 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 42641505 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 42641690 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42641726 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 42641732 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42641801 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 42641898 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42641940 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42642182 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 42642193 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42642262 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 42642435 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42642582 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42642602 T A N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.5 0.125 0.375 18 14 8 2 6 3 42642714 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.526315789473684 0.105263157894737 0.368421052631579 22 16 10 2 7 3 42642720 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42642940 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42643063 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42643085 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 42643242 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42643302 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 42643307 G C Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 42643328 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 3 42643350 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 42643398 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42643455 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42643554 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42643571 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42643696 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 42643707 A G Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 42643800 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42643950 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 42643953 G T Y N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 14 10 6 2 4 3 42644068 A T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 42644195 T A N N 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 13 7 6 1 3 3 42644205 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 42644249 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 42644403 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42644477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42644634 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 3 42644676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42644852 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 42644929 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 42644963 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42644994 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 42645038 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 0.117647058823529 0.352941176470588 20 14 9 2 6 3 42645203 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42645418 T A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.5 0.1 0.4 22 18 10 2 8 3 42645987 T G Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 3 42646021 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 3 42646557 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42646687 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 3 42647657 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42647903 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42648389 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42649297 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.421052631578947 0.105263157894737 0.473684210526316 18 20 8 2 9 3 42651173 A C Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 42651242 G T Y N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 42652063 T G Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 42652281 C T Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 42652301 A C Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 42652673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42653627 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 42654058 C A Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 42654242 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 42654272 G C Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 42654372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42654572 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42654756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42654969 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42655161 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42655205 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42655544 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 3 42656893 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 42657243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42657276 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42657340 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42657836 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42658014 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 42658342 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42658857 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 42659018 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 42659019 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 42659998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42660008 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 42661147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42661418 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42662243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42662947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42663078 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42663106 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42664390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42665226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42665914 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42665950 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42666071 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42666167 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42666497 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 42667988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42668206 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 42668426 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42668567 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42668569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42668685 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42668723 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42668770 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42668945 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42668949 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 42669319 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 42670044 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42670083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42670086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42670514 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42670616 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.526315789473684 0.105263157894737 0.368421052631579 22 16 10 2 7 3 42670641 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42671061 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42671538 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42671617 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42671630 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 42671686 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42671840 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 42672160 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42672352 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42672392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42672509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42672703 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42673144 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42673252 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42673263 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42673527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42673536 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42673584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42673654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42673783 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42674207 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42674262 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42674393 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42674500 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42674749 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 42674797 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.368421052631579 0.105263157894737 0.526315789473684 16 22 7 2 10 3 42674860 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 42675066 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42675082 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 42675182 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42675428 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 3 42675561 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 42675627 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42675690 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 42675964 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 42676066 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 42676134 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 3 42676290 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 42676433 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42676540 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 42676562 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 42676564 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 42676755 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 42676851 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42676943 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.388888888888889 0.111111111111111 0.5 16 20 7 2 9 3 42677029 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42677099 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42677329 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42677468 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.411764705882353 0.0588235294117647 0.529411764705882 15 19 7 1 9 3 42677562 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.388888888888889 0.111111111111111 0.5 16 20 7 2 9 3 42677794 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 42677935 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42678249 C A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 42678381 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 42678632 C G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 42678906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42678937 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 42679024 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 42679200 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 42679551 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42679687 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42681114 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 42681195 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 42681313 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 42681583 G A N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 3 42682032 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 42682055 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42682149 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 42682304 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 42682305 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 42682339 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.526315789473684 0.105263157894737 0.368421052631579 22 16 10 2 7 3 42682521 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42682595 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42683212 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 42683332 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 42683398 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 42683451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42683568 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 42684100 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42684101 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 42684127 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42684445 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42684466 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 42684485 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 42684614 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 42684615 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 42684875 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 3 42685144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42685295 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42685359 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.5 0.125 0.375 18 14 8 2 6 3 42685360 G T N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.4375 0.125 0.4375 16 16 7 2 7 3 42685560 C T Y Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 3 42685566 T A Y N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 42685581 G C Y N 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 3 42685647 A G Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 42686309 C G N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 42686371 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 42686449 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42686700 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42686719 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42686901 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 42687146 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42687534 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42687562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42687693 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42687840 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 42687845 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 42687959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42687982 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 42688213 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42688361 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42688640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42689145 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42689289 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 42689378 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42689473 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 42689674 C A N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 42689874 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42689978 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.555555555555556 0.111111111111111 0.333333333333333 22 14 10 2 6 3 42690208 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 42690284 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42690559 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 42690803 G T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 42690809 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42691510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42691551 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 42691695 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 42691703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42691725 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 42691738 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 42691797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42691951 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 42692194 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42692206 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42692230 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 42692395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42692732 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 42692848 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 42692874 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42692914 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 42693169 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 42693237 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42693912 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 42693951 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 42693955 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 42694038 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 42694046 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 42694169 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 42694216 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 42694249 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 42694473 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42694481 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 42694767 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 42694875 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 3 42694899 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42695050 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 42695066 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 42695086 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 42695099 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 42695246 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 42695321 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 42695453 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 42695676 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 42695851 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42695858 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 42695941 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 42695946 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 42695992 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 42696290 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 42697032 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 42697080 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 42697115 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 42697119 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 42697189 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42697212 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 42697369 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 42697399 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 42697431 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 42697437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42697513 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42697910 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42697919 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 42697969 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 42697984 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42698021 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 42698099 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 42698398 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 42698477 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 42699156 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42699357 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42699366 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42699498 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42699919 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42702754 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 42703577 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42703986 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42704867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42705018 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42706351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42706381 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42707810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42713936 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42714031 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 42714052 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 42714954 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42715034 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42716979 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42718205 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42719442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42719950 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42720417 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 42720620 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42721734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42721984 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42722598 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 42722874 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 42724269 C G Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 3 42724924 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 42725014 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 42725027 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42725196 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42725373 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 42725493 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 42725644 T A N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 3 42725714 G C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 42725805 C A N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 15 15 6 3 6 3 42725905 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 42726560 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 42726852 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 42727124 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 42727688 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 42728125 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 42729268 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42730795 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 42731291 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 42731692 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42731965 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 42732251 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 42732386 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 42732447 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 42733111 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 42733429 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 42734315 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 42734345 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 42734430 A G N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 3 42734450 G C N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 3 42734744 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 42734813 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 3 42734957 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 42735930 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 42736885 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42737787 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42738320 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 42738624 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 42738745 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42739125 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42739528 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42739894 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42740149 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 42740251 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42740885 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42741637 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 42743176 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42743569 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42744387 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42744832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42745174 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42745559 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 42745596 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42745836 C G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 42745908 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 42746196 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 42746471 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 42746679 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.4 0.133333333333333 0.466666666666667 14 16 6 2 7 3 42746713 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 42747480 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42747583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42747749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42748192 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 42748193 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42748301 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.4375 0.1875 0.375 17 15 7 3 6 3 42748319 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42748434 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 3 42748633 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42748874 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42748994 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 42749181 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42749237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42750452 C A Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 42753405 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 42754214 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42754629 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42755147 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42755821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42756636 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42756882 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42757035 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42757165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42757670 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42759668 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42760096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42761371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42761529 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42761545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42762113 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 42764016 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42765951 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42765979 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 42766101 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42766544 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42766975 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42768712 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42769785 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42770519 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 42770915 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42772020 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42773344 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.470588235294118 0.117647058823529 0.411764705882353 18 16 8 2 7 3 42774837 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42775663 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42776168 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42776173 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42776421 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42776562 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42776773 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42776903 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42777393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42778052 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 42778217 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42778463 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42779331 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42779928 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 42780331 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 42780543 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 42780556 C G N N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 42780997 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42781800 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42782693 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42785035 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42786956 T G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 42787839 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42788728 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 42789357 C T Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 3 42790620 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42791022 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 42792249 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42792780 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 42792914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42793899 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42794469 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42794495 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42795662 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 42795697 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42796845 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42797541 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 42798183 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 42798222 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 42798433 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 42798651 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 42802691 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42802733 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42803097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42803290 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42803540 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42803720 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42803732 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42805898 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42806109 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 42806230 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 42806610 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42807170 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42807204 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42809473 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42809929 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42810166 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42817876 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42818852 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42820121 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 42820592 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42822939 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 42824019 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42824299 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42824395 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42826618 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 42827150 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 42827605 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 42827940 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42833085 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42834522 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42835485 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42835940 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42836512 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42837585 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 42837959 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42838622 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42839565 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 42841964 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42842150 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42842212 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42842222 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42842680 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 42843927 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42844226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42844472 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42844612 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42844639 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42845539 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42845668 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42846149 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42846544 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42846892 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 42847684 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 42847740 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 42847843 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 42848738 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 42848742 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 42849039 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 42849198 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 42849243 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 42849547 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 42849585 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42849612 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 42849949 A G N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.166666666666667 0.0833333333333333 0.75 5 19 2 1 9 3 42849965 G C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 42849980 G C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 42849990 A C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 42850014 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 42850024 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 3 42850068 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42850226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42850289 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 42850334 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 42850430 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 42850451 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 42850654 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 42850682 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 42850913 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 42850939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42851033 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 42851085 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 42851106 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 42851119 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 42851444 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 42851846 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 42851894 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 42851903 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 42852009 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 42852350 T C N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 42852449 T A N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.25 0 0.75 6 18 3 0 9 3 42852553 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 42852558 T A N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 42852564 C A N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 42852599 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 42852699 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 42852885 C A N N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 3 42852925 A G N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 3 42852956 G A N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 42852988 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 6 12 2 2 5 3 42853207 A T N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 3 42853257 G A N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 3 42853575 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 42853577 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 42853601 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 42853604 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 42854013 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 42854055 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 42854420 A T Y N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 42854545 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 42854615 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 42854658 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42854973 C T N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 5 15 2 1 7 3 42854987 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 42855373 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 42855383 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 42855569 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42855809 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42855908 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 42856327 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42857358 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42857428 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42857491 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42857590 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42857680 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42857747 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42858337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42858492 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42858538 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42858920 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42859769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42859853 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 42859932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42860244 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42860510 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42860832 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 42860955 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42861197 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 42861446 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42862313 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42862709 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42862756 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42862781 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42865185 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42865457 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42865730 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42866636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42867008 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42867952 G A Y Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 8 8 3 2 3 3 42868025 A T Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 42868294 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42868299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42869167 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 42869193 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42869523 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42869682 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42870977 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42871019 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 42871286 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42871541 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 42871774 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42872552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42872894 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 42874011 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 42874497 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42875303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42876582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42878518 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42878756 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42879267 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 42879722 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42880258 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42881569 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42881773 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42882308 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42882859 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 42883046 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42883584 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42885136 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 42885920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42886496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42887006 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 42887879 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42888533 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42888633 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 42890156 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42890470 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42890620 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42890791 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 42890936 C A Y N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 42891957 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 42893433 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42893576 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42894808 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42894975 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 42895148 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42896632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42896789 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42896851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42897782 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42898323 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42898420 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42898445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42899049 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 42899282 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 42899324 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42900054 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42900962 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 42901194 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 42901714 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42902210 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 42902872 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42903025 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42903282 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42903491 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 42903920 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 42904041 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42904110 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 42904141 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42904860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42904919 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 42905780 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42905812 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42905894 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42906026 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42907128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42907756 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42908110 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 42908196 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42908451 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42909489 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42909950 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42910079 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42910305 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 42910953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42911055 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 42911351 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 42911406 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 42911730 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 42911870 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42915333 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 42915414 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 42915861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42916017 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 42916018 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 42917006 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42917007 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42917106 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42917219 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 42917538 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 42917562 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 42917584 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42917602 A T N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 42917603 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 42917792 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 42917873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42917986 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42918700 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 42918937 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42919751 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42920393 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 42920542 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42920701 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 42921789 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42921808 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42921928 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42921954 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 42922536 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42923107 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 42923332 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 42923798 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 42923990 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 42924601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42924665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42924826 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 42924918 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 42925146 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42925689 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 42925871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42926223 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42926321 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 42926332 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 42927148 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42927231 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 42927259 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42927770 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42928103 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42928111 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42928168 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42928366 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 42928641 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 42928737 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42929297 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 42929440 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42929532 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 42929636 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 42929648 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 42929676 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42929714 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42929844 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 42930102 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 42930161 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42930199 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 42930288 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 42930369 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 42930410 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42930423 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42930767 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 42930924 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 42930955 T C Y Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 3 42931120 A G Y Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 3 42933258 A T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 42933423 A T Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 42933608 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 42933675 G C N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 42933713 C A Y N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 42933955 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42934026 G T Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 42934135 T A Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 42934154 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42934227 T C Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 42935295 C A Y N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 42935324 C T Y Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 42935346 G A Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 42935480 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 42935492 A C N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 42935546 T A N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 42935762 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 42935851 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 42935935 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 42936212 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 42936353 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 42936427 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 42936485 G T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 42936663 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 42936937 G A Y Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.153846153846154 0.0769230769230769 0.769230769230769 5 21 2 1 10 3 42937165 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42937218 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 42937303 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 42937335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42937364 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 42937374 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 42937422 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42937500 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 42937771 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 42937901 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 42938137 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 42938264 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 42938377 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42938405 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 42938676 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 42938729 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 42938873 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 42938932 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 42938975 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 42939081 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 42939107 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 42939255 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 42939393 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 42939404 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 42939555 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 42939610 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 42939625 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 42939704 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 42939850 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 42939998 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 42940369 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 42940491 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 42940542 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 42940554 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 42940561 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 42940574 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 42940680 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42940695 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 42940706 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 42940710 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 42940748 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 42940759 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 42940774 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 42940803 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42940838 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 42940905 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 42940944 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42941048 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 42941077 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 42941159 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 42941234 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 42941240 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42941259 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42941294 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 42941331 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 42941354 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 42941368 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 42941399 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 42941405 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 42941490 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 42941683 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 42941867 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42941917 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 42942168 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42942276 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 42942373 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42942487 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42942509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42942768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42943020 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42943025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42943037 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42943131 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42943135 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42943152 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 42943185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42943727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42943773 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42943850 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42943907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42943976 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42944003 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42944127 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 42944298 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 42944373 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42944442 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42944536 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42944609 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42944736 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 42944916 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 42945129 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 42945686 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 42945969 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42945998 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42946158 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42946170 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42946206 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 42946351 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42946443 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42946489 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42946951 A G Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 42947042 G T Y N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 42947061 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 42947093 C T Y Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 3 42947649 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 42947764 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 42947847 G C Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 42947883 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42948060 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42948126 G A Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 42948334 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42948357 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42948364 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42948588 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42948592 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42949526 C T Y Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 42949545 C T Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 42950157 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 42950167 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 42950540 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42950597 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42950806 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42954024 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 42954913 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 42955042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42955371 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42955951 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42956469 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 42956792 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42956820 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42957150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42957318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42957336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42957408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42958402 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42958479 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42958691 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 42959255 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42959465 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 42959828 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 42959988 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42960249 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 42960868 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 42961058 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 42961132 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 42961198 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 42961277 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 42961642 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 42962432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42962775 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42963139 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 42964184 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42965073 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42965362 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42965593 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42966802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42967104 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 42967117 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42967158 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 42967423 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42967972 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 42968684 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42968700 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42969769 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42970337 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 42970519 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42970877 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42971450 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 42971710 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42971739 A T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 42972986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42973397 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42973820 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42974074 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42974091 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42974441 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 42975783 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42976898 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42976945 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42977414 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42978433 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42978497 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42978970 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42979371 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 42980213 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42980422 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 42980598 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42980654 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42980823 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42980917 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42981533 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42981616 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42982343 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 42982392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42983050 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42983559 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 42984746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42984951 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 42987573 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 42987619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42988144 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 42988230 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 42988556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43001143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43001156 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43001883 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43001927 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43002280 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 43002866 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43003681 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43006532 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43007042 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 43007134 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43007670 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43007857 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43008062 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 43008396 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 43008531 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 43008606 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 43008668 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 43008688 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 43008795 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 43008852 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 43008958 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 43009362 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 43009389 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 43009486 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 43009687 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 43009745 G T N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 43010000 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43010107 G A N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 3 43010137 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43010154 G T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 43010363 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 43010449 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43010559 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 43010598 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 43010601 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 43010864 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43010984 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 43010992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43011051 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 43011213 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43011471 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43011525 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 43012581 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 43012681 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 43012766 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 43012930 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43012960 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43013065 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 43013111 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43013508 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43013539 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 43013596 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 43013692 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43013727 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 43014410 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 43014476 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 43014496 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 43014524 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 43015019 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 43015351 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43015391 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 43015455 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43015600 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43016030 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 43016096 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 43016198 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43016282 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43016326 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 43016399 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 43016444 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43016497 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43016590 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 43016757 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43016777 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43016804 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43016844 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43016980 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 43017008 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43017183 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43017247 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 43017417 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43017456 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43017516 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 43017571 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43017732 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43017745 G T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 43017804 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 43017818 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43017938 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 43017944 C G N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 43017999 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 43018183 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43018189 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43018303 A C N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 3 43018316 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43018397 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43018422 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43018530 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43018551 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43018716 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43019006 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 43020002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43020238 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43020784 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43021088 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 43021248 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 43021500 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43022131 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43022329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43022603 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 43022908 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 43023310 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 43023677 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43024067 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 43024854 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43025596 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43026245 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 43026737 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43026821 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43027025 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43027348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43027491 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43027563 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43027589 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43027812 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43027962 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43028161 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43028412 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 43028856 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43029051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43029509 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43029584 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 43030095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43030589 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 43030937 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 43031289 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43031818 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 43032060 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 43032161 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43032460 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 43032653 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43033235 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43033371 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 43033530 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43034724 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 43035868 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43035973 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 43036219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43037788 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43037882 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 43038337 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43038457 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43038506 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 43038665 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43040781 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 43041054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43041308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43043179 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43043985 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43044472 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 43045561 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43045941 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 43046136 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 43046151 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43046299 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 43046379 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43046413 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43046647 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 43046890 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 43046965 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43047071 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43047116 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 43047118 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43047192 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43047238 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43047241 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43047402 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43047445 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43047491 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43047551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43047832 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43047869 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43047887 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43047923 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43047969 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43048063 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43048111 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43048137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43048245 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43048724 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43048735 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43048790 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43049099 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43049308 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43049513 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43049790 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43049806 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43049856 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43049995 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43050235 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43050288 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43050341 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43050367 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 43050453 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43050803 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43050821 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43050919 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43050954 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43051156 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43051597 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43051621 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43051780 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 43052174 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 43052385 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 43052427 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 43052525 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43052552 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 43052627 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43052712 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 43052968 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 43052990 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43052993 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 43053197 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43053279 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 43053317 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 43053403 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43053472 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43053489 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43053515 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43053685 T G N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 43053884 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43054256 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43054551 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 43054825 A G Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 43055207 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 43056073 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 43056309 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43056514 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 43056552 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43056617 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43057187 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 43057260 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 43057482 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43057511 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43057560 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43057709 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43057831 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43057916 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 43058035 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 43058191 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 43058329 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43058342 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43058385 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43058934 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43059179 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43059180 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43059330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43059360 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43059423 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43059815 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43059954 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43060577 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43060820 A T Y N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 3 43061361 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43061448 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43061555 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 43061587 T G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 43061588 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43061639 T C Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 43061677 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43061690 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 43061713 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 43061728 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 43061729 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43061841 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43062056 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43062061 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43062111 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43062113 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43062176 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43062212 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43062213 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43062230 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43062956 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 43062987 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 43063029 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 43063399 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43063589 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43064186 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43064209 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43064288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43064296 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43064359 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43064361 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43064593 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43064699 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43064808 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43064889 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 43064968 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43065275 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43065554 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43065617 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43065777 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43066051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43066180 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43066412 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43066469 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 43066528 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43066542 T C Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 43066725 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 43066883 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43066990 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 43067211 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43067291 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43067936 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43067946 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43068213 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43068429 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43068507 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43068886 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43069272 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43069345 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 43069412 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43069800 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43070002 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43070051 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43070094 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43070571 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43070918 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43071022 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 43071033 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 43071346 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43071456 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 43071664 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 3 43071718 T G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 43071730 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 43071779 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43071925 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43072103 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 43072114 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43072266 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 43072455 G A Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 43072634 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43072868 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43072944 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43072963 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43072986 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43073053 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43073165 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 43073399 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43073416 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 43073424 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 43073579 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43073776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43073831 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43073867 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43074068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43074154 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 43074697 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43074878 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43074961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43074997 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43075208 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43075579 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43075995 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43076306 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43076642 A C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 43079113 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43079197 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43079840 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43080400 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43081241 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43081458 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43081813 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43081944 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43082781 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43082916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43083246 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43083299 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43083569 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43083985 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 43084587 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43084840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43084876 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43084977 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43085434 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43085494 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43085540 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43086662 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 43086672 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43087158 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43087565 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43087684 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43088001 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43088675 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43088858 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43089005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43089653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43090044 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43090269 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43091844 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 43092763 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43092847 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43092942 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43095506 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43095509 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43095597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43095598 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43103140 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43103204 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43103413 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43103539 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43103545 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43103645 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43103816 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 43110493 A C N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 43110516 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 43110528 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 43111407 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43111544 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 43111742 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43111759 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43111933 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 43112107 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43112315 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43113041 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43113057 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43113581 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43113613 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43113782 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43113948 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 43115123 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43115256 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43115557 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43115952 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43117663 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43118402 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43119739 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43119910 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43121241 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 43122486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43122518 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43123247 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43123797 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43124063 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43124275 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43124575 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43124733 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43125213 T G Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 43125268 A T Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 43125439 A C Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 43125806 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43126192 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43127527 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43127713 A T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 43128333 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43128777 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43129102 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43129319 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43129441 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43129661 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43131047 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43131119 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43133055 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43133280 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43133839 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43133840 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43134455 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43134484 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43136539 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 43136805 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43137292 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43137443 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43138281 A C Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 43138368 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43139042 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43139213 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43139421 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43139522 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43140532 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43140819 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43141465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43141565 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43141677 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43142148 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43142188 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43144408 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43144561 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43145241 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43145311 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43145468 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43145826 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43146245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43146620 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43146779 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43147208 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43147334 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43147744 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43147746 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43147797 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43147807 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43148652 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43149561 G T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 43149659 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43150570 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43150933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43151190 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43151591 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43151882 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43151913 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43152728 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 43153454 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43153701 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43153781 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 43154078 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 43154579 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 43154832 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43155539 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 3 43155784 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43155836 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 43156166 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43157107 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43157184 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43157477 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43157653 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43158494 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 3 43158566 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43158675 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 43159635 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43160395 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43162517 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 43163406 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43163556 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43163773 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43164723 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43165102 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43165695 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 43168794 C A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 43169540 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 43169903 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 43170175 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 43170272 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43170286 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 43170579 A T N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 43170977 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 43171129 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 43171138 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 43171353 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43171709 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43171732 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43171760 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43171795 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43171840 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43171928 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 43171993 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43172145 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 43172226 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43172598 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 43172643 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 43172915 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43173954 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 3 43173970 A G N Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 3 43174218 G C N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 3 43174324 A T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 43174325 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 43174403 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43174423 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 43174442 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43174624 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43174639 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43174675 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 43174703 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43174794 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43174815 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43174817 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 43174847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43174864 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43175005 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43175220 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43175284 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 43175293 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43175460 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 43175607 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 43175681 T G Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 43175693 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 43175845 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 43175865 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43175893 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43175962 A C Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 43175983 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43176035 A C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43176052 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43176116 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43176145 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43176296 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43176349 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43176466 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43176477 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 43176535 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 43176673 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43176781 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 43176962 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43176987 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43177075 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 43177212 C A Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43177214 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43177297 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43177543 T C Y Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 3 43180576 C T N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 43180621 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43180847 T G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 43181016 A C N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 3 43181032 G A N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 3 43181055 T G Y N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 3 43181105 T G Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 43181158 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 3 43181331 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43181801 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 43181824 A T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43183608 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 43183700 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 43184334 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 43184484 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43184540 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 43184562 G T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 43184609 T G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 43184655 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 43184698 A T N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 43184742 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 43184862 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 43185269 A T N N 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 43185371 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43185381 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 43185634 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 43185732 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 43185901 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43185957 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43186282 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43186335 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43186376 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 43186972 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43188246 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43188633 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 43188713 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43189720 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43189914 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43190922 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 43190974 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 43191005 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 43191267 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43191578 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 43192002 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 43192474 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 43192980 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 43193271 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43194084 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.0625 0.875 0.0625 16 16 1 14 1 3 43194411 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43194708 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43194766 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43194864 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43194929 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43195231 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43195282 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43195376 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43195491 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 43195572 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43195651 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43195726 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43195738 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43195818 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43195819 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43195871 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 43195900 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 43195982 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43196040 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 43196087 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43196088 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 43196102 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43196305 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43196361 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43196409 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43196540 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43196561 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 43196566 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43196619 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43196635 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43196645 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43196695 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 43196766 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43196769 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43196855 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 43196862 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43197103 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43197126 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43197129 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43197229 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43197242 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43197292 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43197304 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43197308 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43197329 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 43197330 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 43197353 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43197441 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 43197443 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 43197489 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 43197542 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 43197578 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 43197595 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 43198113 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 43198188 C G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 43198505 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 43198564 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 43198654 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 43198655 A T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 43198682 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 43198752 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 43198756 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 43198875 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43199022 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 43199248 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 43199267 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 43199363 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43199381 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 43199394 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43199654 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 43200610 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43202316 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43202785 T G Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 43203157 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 43203697 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43206701 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 43206939 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43208201 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 43208499 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 43208646 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43208668 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 43208783 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 43208922 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43209105 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43210431 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 43210877 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43212495 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43212876 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43212930 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43213040 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43213670 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43213750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43215268 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43215676 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43216999 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43218513 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43219628 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43220998 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43221210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43221405 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43222607 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 43222610 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 43223697 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43224328 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43224781 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43225339 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43225425 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43225565 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43228265 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43228573 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43229571 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 43230308 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 43230335 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43230574 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43230597 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43230653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43231025 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 43232341 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43232994 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43233042 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43233150 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43233538 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43233949 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43234799 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43235066 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 43235405 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43236004 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43236026 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 43236487 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43236551 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43237090 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43237200 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43238480 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43238695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43238770 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43238804 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43239357 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43239372 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43240299 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43241077 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43241459 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43241595 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43241756 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43242052 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 43242178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43242232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43242391 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43242589 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43242777 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43243350 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43243509 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43243558 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43243761 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43244586 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43244800 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43245162 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43245631 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43245842 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43247059 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43247318 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 43247357 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 43247399 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 43247744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43248682 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43249109 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 43249149 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43250107 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 43250262 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43250345 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43250370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43250500 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 43250954 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 43250958 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 43251145 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 43251252 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43251272 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 43251471 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43251529 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43251939 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43252043 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43252059 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43252322 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43252424 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43252637 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43252843 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43253307 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 43253474 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43254008 G T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 43254253 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 43254533 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43255116 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43255358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43255454 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43255688 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43257391 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43257984 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 43258401 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43258431 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43258662 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43258721 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43258895 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43259233 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43259247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43259445 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43259446 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43259948 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43260569 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43260933 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43262661 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 43262870 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43264237 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 3 43265457 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43265941 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43266568 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43267011 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43267260 A C N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 43268146 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43268523 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43268748 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43268867 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43268920 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43269183 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43269407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43269943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43270362 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 43275303 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43275541 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43275670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43275746 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43275817 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43275871 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43275915 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43275969 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43276039 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43276111 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 43276229 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43276332 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43276344 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43276393 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43276589 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43276910 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43277451 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43277539 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 43277659 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 43277820 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 43277929 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 43278046 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 43278050 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43278116 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43278274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43278455 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 43278486 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43278579 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43278583 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43278657 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43278671 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43278860 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 43278955 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 43279356 A G Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 43279381 C A Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 43279415 G A Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 43279441 G A Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 43279446 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 43279453 A C Y N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 43279467 A G Y Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 43279499 G C Y N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 43280005 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 43280085 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43280150 G T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 43280501 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43280505 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43280695 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43280730 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43280798 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43281161 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43281393 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43281504 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43281740 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43281777 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 43282007 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43282291 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43282407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43282503 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43282716 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43282741 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 43282776 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43282886 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 43282937 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 43282955 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43283215 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 43283438 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 43283457 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43283462 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43283692 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43283926 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43283940 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 43284192 T C N Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 3 43284193 T C N Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 3 43284206 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 3 43284246 C T N Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 3 43284283 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 43284882 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43285159 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43285335 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 43285433 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43285654 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43285853 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43285946 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43286339 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43287308 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 43287858 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43288112 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43288159 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43288372 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43288508 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43288689 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43288913 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43288941 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43288951 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43289056 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43289098 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43289293 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 43289350 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43289386 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43289427 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43289653 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43296145 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43296324 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43296402 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43296542 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43296573 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43296630 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43296753 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43297064 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43297273 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43297520 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43297594 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 43297780 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 43297888 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43299217 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 43299230 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 43299320 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43299371 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43299391 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43299529 T C Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 43299610 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 43299812 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43299828 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43300246 T A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43300519 T G Y N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 43300924 A T Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 43301102 G C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43301140 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 43301228 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43301294 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 43301342 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43301665 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43301814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43301858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43301860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43302021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43302762 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43302774 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43302934 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43303405 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43303443 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 43303581 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43303652 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43303765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43303806 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43303813 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 43303963 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43304089 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43304406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43304449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43304812 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43304931 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43305008 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43305218 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43305247 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43305546 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43305777 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43305816 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43306077 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 43306160 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43306249 G T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 43306293 T A N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 43307170 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 43307347 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43307505 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43308213 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43308306 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43308351 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 43308533 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43308546 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43308820 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43308904 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43308931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43309049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43309065 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43309226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43309494 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43309604 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43309704 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43309791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43309847 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43310550 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43310847 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 43311111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43311368 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43311431 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43311455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43311960 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43312322 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43312635 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43312670 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43312770 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43313013 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43313046 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43313051 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43313198 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43313407 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43313431 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43313498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43313966 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43314095 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 43314303 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 43314895 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 43314900 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 43314935 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 43314959 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 43315315 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43315622 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43315887 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43316120 G A N Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 3 43317077 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43317106 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43317467 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43317493 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43317615 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43317698 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43318274 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43318424 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43318804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43319233 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43319321 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43319424 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43319584 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 43319839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43319984 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43320020 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 43320182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43320227 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43320228 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 43320351 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43320380 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43320494 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43320951 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43320986 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43321118 T C Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 43321211 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43321226 A G Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 43321402 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 43321423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43321717 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43321732 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43321837 C G Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 43321912 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 43322231 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43322249 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43322567 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 43322612 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43322853 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43322949 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43323268 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 43323426 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43323624 A G Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 43323695 T G Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 43323881 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43323894 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 43324032 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43324112 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43324330 T G Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 43324539 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43324631 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 43324681 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43324682 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43324781 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43324980 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 43324990 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43325373 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43325418 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43325443 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43325454 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43325526 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43325579 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43325823 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43325844 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43326140 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43326247 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43326456 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43326589 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43326698 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43326851 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43327213 G T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 43327558 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43327751 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 43328598 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 43329559 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43329632 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43329760 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43329789 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43330018 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43330080 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43330192 T A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 43330269 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 43330655 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43330728 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 43330865 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43331147 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 43331188 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43331635 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 43331737 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43331807 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43332972 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 43333610 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43333697 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43333750 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43333878 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43333922 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43333948 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43334228 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 43334366 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 43334637 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43334854 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43334935 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43334984 C A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 43335500 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43335543 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43335624 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43335968 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43336041 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43336055 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43336068 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43336131 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43336162 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43336255 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43336702 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43337367 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43337509 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43337510 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43337665 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43337679 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43337763 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43337865 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43337891 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43338489 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 43338788 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43338814 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43338873 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43338898 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43338994 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43339310 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43339323 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43339728 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43340028 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43340039 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43340083 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43340190 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43340191 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43340275 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43340505 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43340543 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43340576 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43340685 C T Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 43340900 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43341026 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43341532 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43341894 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43342039 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 43345977 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43346037 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43346186 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 43346221 T A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 43346239 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 43346556 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43348828 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43348847 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43349345 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 6 12 0 6 3 3 43349731 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 43349946 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43350159 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43350190 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 43350223 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43350225 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43353046 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43353094 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43354198 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.157894736842105 32 6 16 0 3 3 43354256 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43354535 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 43354898 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 43354929 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 43354968 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 43354971 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 43354982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43354985 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43355100 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43355271 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43355383 T G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 3 43355470 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 3 43355682 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 43355915 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 43356129 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 43356342 G C Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43356628 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 43356715 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43357065 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 43357288 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 43357304 G C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 43357445 G T N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 43362549 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 43362629 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 43362810 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43362888 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 43363194 A C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 43363274 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 43363363 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43363381 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 43363643 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 43363841 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 43363852 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 43364266 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 43364540 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 43364691 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43364766 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43364782 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43365293 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 43365372 T A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 43365394 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 43366040 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43366088 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 43366517 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 3 43366718 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43366850 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 43366902 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 43367119 G T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 43367178 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43367229 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43367506 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43367953 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 43368216 C A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 43369015 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43369468 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43369842 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43370216 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43370309 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43370342 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43370427 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 43370974 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43371050 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43372743 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 43373092 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43373570 G T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 43374174 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 43374780 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 43374808 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 43374871 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 43374937 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 43375053 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 43375891 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 43376199 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43376502 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43376520 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43376525 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 43377167 G C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43377489 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43377617 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 43377910 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43378146 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 43378200 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 43378321 A T Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 43378893 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 43379225 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 43379247 C G N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 43379697 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43381387 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43381446 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 43381548 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43381752 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43381939 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43383334 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 43383367 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 43383529 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43383599 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43383981 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 43384432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43384712 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43385544 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43385801 T C N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 3 43386038 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 43386077 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43386764 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 43386880 T G N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 3 43387620 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43387977 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43388109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43388135 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43388307 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43388858 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 43389518 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43389586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43390945 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 43392047 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43392196 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43392631 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 43392874 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43393323 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 43394324 A C Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 43394432 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43394808 T C Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 43394901 A T Y N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 43394911 C T Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 43395035 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43395053 C A N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 43395113 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 43395129 C T Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 43395151 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43395230 G C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 43395315 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43395395 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43395667 T C Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 43395684 A T Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 43395769 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 43395799 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43395836 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 43395870 A G Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 43395953 T C Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 43396056 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43396097 T A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 43396103 A T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 43396549 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43396592 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 43397195 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43397361 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43398004 A T Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 43398174 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43398218 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43398329 T A Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 43398330 T A Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 43398577 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43398854 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43399422 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43399505 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 43399705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43399811 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43399816 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43399868 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43399894 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43400010 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43400067 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43400194 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 43400695 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 43400708 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43400848 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43400978 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43400999 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43401277 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43401336 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43401344 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 43401461 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43401542 C A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43401552 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43401605 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43401698 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43402691 T A Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 43402745 G A Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 43402916 G A Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 43402968 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43403590 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43403814 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 43404700 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 43404742 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43404895 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 43405220 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43405323 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43405330 C A Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 43405427 A T Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 43406026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43406182 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43406504 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43407221 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43407265 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43407907 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43408070 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43408304 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43408927 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 43409567 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 43409967 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43410097 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 43410463 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43410836 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 43410839 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43411409 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43411665 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43411671 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43411996 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43413048 A G Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 43413915 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43414873 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43414888 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43415605 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43415772 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43415914 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43416583 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43416702 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43417110 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43417325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43417423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43417621 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43418554 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43418997 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43419509 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43419668 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 43419938 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43420165 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43420314 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43421921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43422489 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43422592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43422870 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43423604 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43424723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43424998 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 43425068 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43426468 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 43427062 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43427241 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43427987 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43428430 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43428434 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43428844 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 43429048 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 43429060 A G Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 43429150 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 43430549 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43431581 A C Y N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 3 43431835 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43431950 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43433189 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43433814 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 43433868 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43434268 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43434536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43435644 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 43436475 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43437158 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43437532 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43437934 G T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 43438162 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 43438993 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43438994 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43439043 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43440066 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43440358 C A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 43440550 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43441186 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43441364 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43441385 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 43441614 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43441636 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43441818 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43442186 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43442523 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43442994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43443059 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 43443312 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43443675 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43443914 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 43444032 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43444049 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43445684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43446426 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 43447389 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43447690 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43447867 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 43448182 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43448197 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43448207 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43448249 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43448554 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 43448633 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 43448681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43448691 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 43448754 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 43448843 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 43448875 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43448876 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43448975 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 43448993 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43449083 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43449088 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 43449167 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43449273 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 43449292 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 43449531 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43449543 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43449583 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 43449734 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 43449873 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43450047 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43450068 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43450206 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 43450243 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 43450248 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 43450592 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 43450798 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43450830 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43451139 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43451176 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43451318 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 43451581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43451711 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43451810 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43452127 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43452164 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43452198 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43452435 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43452727 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43452951 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43453070 G A Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 24 4 12 0 2 3 43453245 A T Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 43453288 A G Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 43453337 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 43453796 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43453871 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43453957 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43454063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43454537 T C Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 3 43455116 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43455172 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43455395 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43455594 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43455805 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43455892 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43456116 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 43456212 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43456292 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43456651 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43457077 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 43457498 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43457723 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43457871 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43458587 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43458653 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43458741 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43458787 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43458829 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 43459135 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 43459716 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43459848 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43459944 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43460063 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 43460464 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43460769 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 43460840 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43461016 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43461056 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43461062 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43461372 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43461716 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43462995 A G N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 3 43463585 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 43464071 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 43464576 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 43464745 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43464990 A G N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 43465691 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 43466432 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43466709 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 43466919 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 43467246 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43467274 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43467867 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43468289 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43468962 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 43469426 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43469487 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43469624 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43469862 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43470230 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 43470826 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43470972 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43471284 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 43471947 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43472293 T G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 43472479 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 43472712 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43472715 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 43473302 G A N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 3 43473644 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 3 43473772 A C Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 43474630 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43474655 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43474731 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43474782 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 43474826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43475017 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43475187 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43476559 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 43476734 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 43476797 T G N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 43477094 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43477605 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43477712 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43477817 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 43478848 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 43478978 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43479035 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 43479343 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43479391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43479600 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43479715 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43479858 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 43479868 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 43479871 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 43480938 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43480966 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 43481785 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43481862 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 43481942 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43482235 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 43482237 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 43482278 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 43482895 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43483146 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43483191 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 43483403 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43483486 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 43484004 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43484006 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 43484464 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43484536 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43484600 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43484691 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43484916 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43485001 G T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43485048 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 43485226 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 43485462 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43485612 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 43485650 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43486055 G T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43486113 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 43486291 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43486442 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43486447 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43486519 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43486532 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43487033 A C Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43487249 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43487543 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43487595 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43487817 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43487894 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43487943 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43487956 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 43488118 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 43488364 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 43488575 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 43488617 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43488785 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43488794 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43488848 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43489244 C A Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43489404 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 43490215 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 43490539 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 43490675 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43490704 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43490736 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43490815 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43490887 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43491488 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43491516 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43492084 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43492768 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43492885 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43492974 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43492984 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43493226 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 43493250 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 43493801 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43494083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43494265 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43494608 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43495007 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 43495108 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43495137 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 43495752 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43496700 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43497605 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43498388 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43498549 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 43498620 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43499156 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43499591 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 43499714 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43499715 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43500421 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43500852 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 43500914 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 43501333 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43501390 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43504311 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43504636 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 43504999 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43505536 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43505775 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43505792 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43505879 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43506220 C G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 43506562 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43506566 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43506890 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43507195 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 43507424 T A Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 43508597 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 43508742 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43509112 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43509636 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 43509983 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43510679 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43510986 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43511098 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43512120 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 43512736 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43512839 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 43513747 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43514125 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43514134 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43514210 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43514363 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 43514514 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43514791 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43515234 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43515622 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 43515769 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 43516253 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43516273 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43516309 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43516492 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 43516504 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43516505 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 43516639 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43516747 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43517042 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 43517093 C T Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 43517357 G C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 3 43517385 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 43517488 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 43517601 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 43517756 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43517835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43517905 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43518085 T G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43518438 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43518700 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43518781 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43518935 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43519567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43519569 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43519585 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43519892 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43520087 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43520118 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 43520284 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 43520399 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 43520578 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 43520630 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43520650 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 43520745 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 43520746 G C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 43521179 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43521423 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43521697 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43521846 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43521917 T A N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 43522086 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 43522141 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43522212 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43522233 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 43522364 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 43522452 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43522658 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43522681 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 43522719 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 43522987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43523340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43523441 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43523577 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43523757 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43523842 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43524432 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43524798 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43524824 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43524825 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43524913 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43524932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43524944 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43525122 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 43525189 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43525380 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 43525435 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 43525441 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 43525556 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43525564 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43525577 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 43525625 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43525700 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43525736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43525844 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43525880 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43525981 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43526023 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 43526024 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43526064 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43526109 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43526207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43526861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43526934 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 43527001 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43527305 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43527328 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43527348 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43527479 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43527507 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43527559 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43527693 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43527705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43527972 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43528009 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43528099 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 43528248 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43528349 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43528471 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43528572 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43528663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43529014 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43529614 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43529626 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43529688 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43529690 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43529819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43530125 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43530289 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43530423 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43530983 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43531022 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43531386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43531534 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43532014 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43532163 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 43532271 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43532315 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43532446 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 43532941 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43532993 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43533216 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43533243 G C Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 43533441 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 43533539 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 43533884 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43537818 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 43537896 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43538248 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43538421 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43538526 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43539121 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43539122 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43539615 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43539632 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43539772 C T N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 43540133 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 43540134 C G Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 43540189 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43540370 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43540666 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43540836 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43540857 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43541222 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 43541285 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 43541347 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 43541513 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43541606 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43541716 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43542083 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43542383 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43542804 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 43542823 T G N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 3 43543426 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43543968 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43544175 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43544190 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43545037 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43545456 C T Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.375 0.125 0.5 14 18 6 2 8 3 43545702 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 43546416 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 43546482 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43546980 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43547230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43547750 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 43547871 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43548183 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43548389 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 43548515 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 43549272 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43549766 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43550845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43550990 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43553269 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43553937 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43553996 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43555321 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 43555524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43555594 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43556231 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43556289 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43556460 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43556801 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43556975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43557059 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 43557331 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43557566 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43558440 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43558605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43558998 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43559161 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43559647 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43560312 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43561036 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43561370 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43562048 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43562067 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43562299 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43562574 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43562593 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43562594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43562661 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 43562686 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43562897 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43563006 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43563175 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43563569 A T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 43563759 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 43563856 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 43563961 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 43564009 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 43564182 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 43564210 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 43564392 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 43564485 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 43564798 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43564808 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43564915 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43565272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43565284 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 43565311 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43565321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43565389 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43566951 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 43567417 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43567638 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 43568671 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43568823 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43568863 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43569165 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43569895 T A Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 43570217 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43570366 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 43570742 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 43571093 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 43571361 T A N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 43571514 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 43572151 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 43572424 A C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 43573079 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43573240 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 43573765 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 43573806 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 43574022 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 43574026 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43574261 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 43574294 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 43574497 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43574951 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 43574991 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43577044 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 43577194 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 43577217 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 43577655 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 43577669 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 43577785 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 43578561 C A Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 43578715 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43578834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43578903 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43578985 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 43579011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43579196 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43579289 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43579621 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 43579689 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 43579844 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 43580085 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 43580102 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 43580180 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 43580197 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43580318 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 43580630 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 43580653 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 43581089 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 43581516 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 43582172 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 43582464 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43582540 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 43583197 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 43583656 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 43583669 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 43583876 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43584378 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 43584522 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 43584626 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 43584751 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 43585184 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43585202 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 43585659 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 43585850 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 43585992 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43586282 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43586318 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43586417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43586511 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43586531 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 43586571 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43587257 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 43587379 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43587579 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43587641 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 43587731 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43587797 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43587821 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 43587891 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 43587988 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43588137 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 43588336 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 43588708 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 43588727 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43589330 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43589331 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43589492 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43589581 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 43589892 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43590057 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43590117 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 43590498 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 43590877 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43591541 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43591674 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 43591839 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43591930 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43591973 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 43592246 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43592346 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 43592511 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 43593110 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 43593266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43593285 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43593352 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43593427 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 43593510 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43593886 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 43593957 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 43594033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43594267 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 43594327 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 43594377 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 43594468 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43594486 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 43594817 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 43595017 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 43595103 G C N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.538461538461538 0.230769230769231 0.230769230769231 17 9 7 3 3 3 43595443 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 43595813 C T Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 43595818 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43595844 G T Y N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 43595919 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 43595953 A G Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 43595990 T G Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 43596212 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43596368 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 43596465 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43596705 G T Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 43596726 C A Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 43596753 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43596906 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43596995 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 43597097 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 43597160 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 43597227 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 43597425 A G Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 43597638 T G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 43597729 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 43597822 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 43597987 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 43598084 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 43598228 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 43598314 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 43598665 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43598839 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43599048 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43599141 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43599315 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 43599996 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 43600604 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 43601149 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43601465 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43601478 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 43601553 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43601716 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43601728 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 43601871 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 43602129 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 43602220 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 43602291 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 43602540 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43603162 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 43603473 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 43603781 A C Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 43603932 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 43604062 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43604374 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43604470 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 43604512 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43604516 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43604642 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 43604722 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 43604937 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 43605204 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43605328 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43605965 C T N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 3 43606279 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43606534 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43606576 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 43606626 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 43606723 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 43606742 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 43606840 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 43606906 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43606907 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 43607081 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43607107 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 43607215 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 43607628 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 43607640 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 43607932 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 43608284 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 43608588 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 43608671 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 43608756 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43609818 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43609930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43610082 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43610298 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 43610428 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 43611016 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43611271 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43611535 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 43611635 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 43611744 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 43611956 A T N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 43612007 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 43612242 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43612261 T G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 43612635 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 43612722 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 43612799 T A Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 43612958 G T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 43613036 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 43613401 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 43613412 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43613464 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43613472 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 43613544 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 43613613 C A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 43613720 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43613871 A G Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 43613939 A T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 43613955 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 43613956 G T Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 43614034 G C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 43614078 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 43614120 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 43614381 T G Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 43614591 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 43614908 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 43614916 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 43615250 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 43615483 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 43615956 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 43616110 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43616344 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 43616386 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 43616387 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 43616477 T G Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 43616667 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43616743 A C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 43616845 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 43617091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43617139 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 43617349 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43617364 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 43617455 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 43617551 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 43617865 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 43617866 A C Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 43618020 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 43618053 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43618171 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 43618392 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 43618624 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 43618676 C G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 43618677 C G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 43618765 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43618798 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 43619015 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 43619128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43619263 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 43619332 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 43619485 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 43619582 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 43619749 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43620139 A T Y N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.583333333333333 0.0833333333333333 0.333333333333333 15 9 7 1 4 3 43620733 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43620779 T A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 43620898 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43621088 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 43621140 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 43621405 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 43621475 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43621520 T A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 43621873 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 43622098 C A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 43622116 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 43622267 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43622369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43622417 C A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 43622514 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43622546 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 43623068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43623164 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43623317 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 43623339 T A Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 43623488 T G N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 43623637 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 43623902 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 43624129 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 43624436 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 43624725 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 43625001 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 43625072 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43625350 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 43625363 C T Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 43625503 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 43625675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43625821 T A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 43625824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43626010 T A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 43626311 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 43626322 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 43626392 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43626405 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 43626565 C A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 43627059 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 43627152 T A Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 43627182 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 43627436 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43627600 G C Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 43627646 A G Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 43628187 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43628194 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43628556 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 43628557 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 43628579 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 43628836 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 43628897 A C N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.5 0.214285714285714 0.285714285714286 17 11 7 3 4 3 43629163 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 43629220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43629345 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 43629348 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43629595 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 43629813 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 43629984 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 43629985 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 43630089 T C N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 43630118 T A Y N 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 10 6 4 2 2 3 43631459 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 43631464 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 43631495 C T Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 43631696 A C Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 43632356 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43633134 A T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 43633211 T C Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 43635535 A G Y Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 13 11 1 11 0 3 43635809 A T N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 43636048 G A N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 43636053 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 43636508 C T N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 43636569 A G N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 43636732 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43636971 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43637187 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 43637188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43637227 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 43637394 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43637987 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 43637993 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 43638273 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43638731 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 43638814 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 43639169 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 43639774 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 43639818 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 43639886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43639981 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 43640036 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 43640090 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 43640272 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 43640513 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43640628 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43640693 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43641017 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 43641106 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43641830 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43641997 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 43642533 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 43642646 A T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 43642879 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 43643042 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 43643192 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 43643234 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 43643275 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43643377 T C N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 43643679 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 43643778 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 43644578 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 43644621 C G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 43645175 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43645274 C A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 43645395 A T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 43645533 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43645559 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 43646179 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43646330 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 43646501 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 43646518 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 43646981 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 43647235 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 43647243 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43647253 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 43647305 G C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 3 43647519 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43647644 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 43647767 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43648064 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 43648290 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 43648549 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43648625 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43648648 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 43648700 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43648837 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 43648885 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43648967 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 43649011 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 43649280 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43649839 C T N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.333333333333333 0.2 0.466666666666667 13 17 5 3 7 3 43650058 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 43650094 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 43650729 A T N N 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.454545454545455 0.272727272727273 0.272727272727273 13 9 5 3 3 3 43651080 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43651220 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 43651344 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 43651706 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43651714 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 43651935 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 43652087 A C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 43652370 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 43652467 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43652657 T G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 43652677 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 43653301 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 43653508 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 43653787 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 43654001 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 43654315 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43654473 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43654897 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 43654972 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 43655023 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43655492 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43655615 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 43655663 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 43655718 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 43655805 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 43655849 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 43655980 A G Y Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 7 9 0 7 1 3 43656180 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 43656181 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 43656485 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 43656497 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 43656529 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 43656530 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 43656652 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 43656863 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 43656941 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 43657421 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 43657643 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 43658028 T A Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 43658178 C A Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 43665436 G C Y N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 43665576 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 3 43665685 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 43665724 G T Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 43665745 T G Y N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 43665781 T C Y Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 3 43666170 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 43666347 G A Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 43666421 A C Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 43666501 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 43666841 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 43666898 G C Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 43666982 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 43667006 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 43667170 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 43667558 T A Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 43667646 A T Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 43667861 A G Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 43667972 C G Y N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 43667995 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 43668074 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 43668284 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 43668312 G A Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 43668627 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 43668844 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 43668927 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 43668983 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 43668986 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 43669015 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 43669104 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 43669123 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 43669217 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43669250 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43669302 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 43669322 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 43669358 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43669378 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 43669384 A C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43669507 G T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 43669668 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 43669759 G C Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 43669856 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 43669888 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 43670153 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43670157 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43670227 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 43670233 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 43670301 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43670356 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43670550 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 43670616 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43670620 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 43670705 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 43670783 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 43670821 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 43671108 G A N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 43671207 T G N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 43671437 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 43671474 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 43671657 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43671755 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 43671778 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43672151 G T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 43672527 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43672611 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43672626 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43672724 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 43672784 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43672850 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43673084 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43673153 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43673176 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 43673225 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 43673240 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 43673253 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43673291 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 43673344 T G Y N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 3 43673395 G C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43673421 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 43673512 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43673551 C G Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 43673707 T A Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 43673767 A G Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 43673782 T C Y Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 3 43673918 G T Y N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 43673939 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 43673981 G A Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 43674169 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43674535 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 43674554 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 43674691 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 43674736 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43674781 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 43674903 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43674946 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 43675017 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 3 43675178 A T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 3 43675225 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 43675321 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 43675335 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 43675420 A T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 3 43675440 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 43675710 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 43675725 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43675738 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 43675758 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 43676067 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43676084 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43676211 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 43676367 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 43676557 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 43676806 A T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 43676850 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 43677228 T G N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.230769230769231 0.0769230769230769 0.692307692307692 7 19 3 1 9 3 43677493 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43677514 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 43677627 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43677647 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 43677692 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 43677865 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43677882 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43678305 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.5 0.1875 0.3125 19 13 8 3 5 3 43678348 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 43678545 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43678741 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 43679110 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 43679138 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 43679488 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43679646 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 43679827 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43680103 A G N Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 3 43680425 C A N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 3 43680698 A T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 43680741 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43680948 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43681086 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 43681192 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43681230 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43681420 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 43681596 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 43681610 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 43681655 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43681701 C T Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 43681868 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 43681926 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 43681971 G A N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 14 6 6 2 2 3 43682035 T A Y N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 3 43682036 C T Y Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 3 43682099 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 43688835 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43688901 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 43689005 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43689132 G T Y N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 43689485 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43689531 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43689633 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43689641 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43689654 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 43689813 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43689816 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43689895 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 43689940 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 43689947 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43690187 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 43690294 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 43690334 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43690546 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43690817 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 43690959 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 43690988 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 43691204 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 43691249 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 43691383 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 43691602 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43691724 A C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43691990 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 43692000 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 43692050 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43692068 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43692223 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 43692282 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43692455 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43692554 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 43692614 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 43692731 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43692805 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43692820 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43692821 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43693272 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43693335 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43693356 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43693437 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43693745 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43694021 C A Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 43694043 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 3 43694111 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43694144 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43694384 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43694442 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 43695057 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43695165 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43695426 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43695563 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43695590 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 43696126 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 3 43696574 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 3 43697044 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 43697312 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 43697365 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43697865 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43698204 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 43698221 A C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 43698250 G C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 43698367 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 14 10 6 2 4 3 43698666 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43698670 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43699041 G T N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 43699478 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 43699850 A G N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.5 0.214285714285714 0.285714285714286 17 11 7 3 4 3 43699916 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 43700152 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43700389 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 43700624 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43700957 G T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 0.117647058823529 0.352941176470588 20 14 9 2 6 3 43701074 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43701119 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43701187 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43701371 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 43701746 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 43701774 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 43701821 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43702470 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 43702609 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43702659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43702769 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 43702819 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43702886 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43702966 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43702975 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 43703098 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43703330 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43703610 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43703615 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43703751 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43703789 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43703815 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43703884 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43703909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43703929 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43703969 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43704368 A C N N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 3 43704380 T C N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 3 43704435 T C N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 3 43704470 C A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 43704586 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 43704644 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 43704742 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43704776 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43704793 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 43704800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43704804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43704826 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 43704829 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43704922 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 43704972 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 43704990 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43705016 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 43705090 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43705131 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43705186 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43705269 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 43705334 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 43705380 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43705428 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43705439 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43705440 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43708443 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43708503 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43708559 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43708636 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 43708672 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43708697 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 43708705 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43708906 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43708992 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43709012 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43709024 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43709039 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43709051 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43709136 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43709154 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43709159 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43709178 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43709191 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43709255 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 43709273 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43709274 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43709321 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43709598 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43709623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43709940 A T Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 43710053 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43710105 G T Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 43710252 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 43710265 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43710285 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 43710321 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 43710363 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43710375 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43710379 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43710406 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43710436 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43710456 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 43710563 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43710659 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 43710930 A C Y N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 3 43710957 G A N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 3 43711019 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 43711038 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43711113 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43711151 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43711155 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43711214 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43711392 T A Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 43711406 A G N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 43711541 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 43711557 C T N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 3 43711690 A C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 43711701 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43711718 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43711803 C G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 43711837 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 43711874 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 43711932 T G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 43712003 C A N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 43712104 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43712154 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43712263 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43712303 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43712352 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43712430 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43712454 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43712534 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43712547 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43712585 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43712647 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43712670 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43712771 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 43712774 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43712808 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43712827 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43713070 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 43713084 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43713100 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43713163 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43713187 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 43713200 A T N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 43713429 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 43713440 A C N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 3 43713457 C T N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 3 43713563 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43713739 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43713776 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43713913 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43713968 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43714012 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43714094 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43714095 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43714169 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43714176 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43714193 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43714227 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43714232 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43714264 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43714414 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43714471 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43714493 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43714521 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43714618 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43714687 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43714736 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43714749 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43714801 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43714839 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43714843 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43714855 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43714875 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43714900 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 43714919 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 43714946 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 43714985 A C N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 43715018 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43715087 G C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 43715109 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 43715115 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 43715162 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43715212 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43715228 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43715354 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43715401 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43715426 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43715430 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 43715439 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43715443 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43715563 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43715566 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43715578 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43715631 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43715648 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43715731 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43715783 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43715813 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43715835 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43715948 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43715969 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43716103 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43716296 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43716374 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43716386 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43716428 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43716484 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43716546 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43716585 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43716742 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43716768 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 43716854 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43716865 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43716894 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43716929 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43716960 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43716987 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43717137 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43717168 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43717228 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 43717281 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43717285 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43717294 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43717300 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43717340 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43717384 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43717528 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43717534 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43717577 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 43717578 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 43717691 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43717790 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43717908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43717989 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43718000 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43718019 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43718025 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43718033 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43718036 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43718050 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43718062 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43718079 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43718108 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 43718118 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43718163 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43718244 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43718255 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43718407 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43718413 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43718617 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43718677 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 43718700 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43718703 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 43718762 C G N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.533333333333333 0.2 0.266666666666667 19 11 8 3 4 3 43718802 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43718855 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43718895 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 43718940 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 43718945 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43718990 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43719145 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 43719152 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43719168 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43719271 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43719291 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43719292 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43719322 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43719359 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43719412 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43719589 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43719592 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43719665 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 43719757 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 43719836 A G N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 43720186 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43720233 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 43720238 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43720319 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43720366 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43720402 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43720432 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43720485 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43720587 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43720685 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43720804 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43720860 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43720876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43720981 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43720987 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43721127 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43721161 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43721269 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43721327 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 43721354 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43721403 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43721563 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43721747 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43721780 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43721864 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 43722142 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 43722249 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 43722268 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 43722441 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43722617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43722674 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43722757 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43722850 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43722959 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43723008 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43723122 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43723230 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43723238 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43723250 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43723286 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 43723374 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 43723420 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 43723498 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 43723747 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 3 43723801 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 43723937 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 43723948 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43723954 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 43724150 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 43724190 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 43724192 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 43724332 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 43724375 A T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 43724376 C G N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 3 43724396 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 43724406 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43724476 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 43724490 A T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 43724535 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 43724618 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43724703 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 43724735 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43724777 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 43724967 A C Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 43725094 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 43725125 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 43725200 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 43725217 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 43725240 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 43725250 A T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 43725354 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 43725575 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 43725700 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 43725706 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 43725892 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43725972 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43726060 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 43726082 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43726289 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 43726645 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 43726674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43726696 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43726738 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 43726917 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43726970 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 43727250 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43727266 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 43727519 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43727546 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 43727693 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43727728 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43727869 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 43727948 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43728322 G C N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 3 43728353 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 43728616 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43729017 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 43729021 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 43729246 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 43729315 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 43729437 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 43729519 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 43729582 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 43729625 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 43729668 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 43729721 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43729747 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43729797 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43729806 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43729817 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 43729881 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 43729968 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 3 43729982 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43729986 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43730131 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 43730350 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 43730424 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43730677 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 43730690 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 43730732 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43730756 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 43730806 T G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 43730808 C A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 43730963 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43730965 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43731023 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43731064 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43731074 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43731098 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 43731122 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 43731131 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 43731141 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43731159 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 43731178 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43731227 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43731294 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43731457 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 43731718 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43731795 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 43731854 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 43731907 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 43731915 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 43731974 C T N Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 6 8 2 2 3 3 43732169 T C N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 3 43732196 A G N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 43732213 A T N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 3 43732249 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 43732286 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 43732480 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43732535 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 43732547 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 43732557 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43732780 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43732823 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43732848 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43732916 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 43732986 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43733010 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43733041 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 43733124 T A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 43733127 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 43733135 G A N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.5 0.214285714285714 0.285714285714286 17 11 7 3 4 3 43733264 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43733293 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43733349 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43733356 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43733480 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43733492 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43733540 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 43733572 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43733691 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 43733693 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 43733703 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 43733782 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 43734061 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 43734066 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 43734226 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43734284 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 43734316 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43734376 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 43734412 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 43734446 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 43734766 A C N N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 3 43734791 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 43734879 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 43734885 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 43734904 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 43734974 T G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 43734975 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 43735020 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 43735048 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 43735074 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 43735088 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 43735169 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 43735270 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43735302 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 43735371 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43735430 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43735509 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 43735524 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 43735586 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 43735703 G T N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 43735861 G T N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 3 43735897 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 43735958 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 43736036 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43736041 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43736054 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 43736064 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43736098 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 43736147 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43736217 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 43736250 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43736261 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 43736323 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 43736324 G T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 43736350 T A N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 43736430 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 43736470 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 43736538 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 43736659 G T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 43736673 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 43736723 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43736730 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 43736769 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43736792 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43736872 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43736921 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43736940 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43736958 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43736970 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43737050 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43737055 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43737075 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43737080 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43737088 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43737101 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43737118 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43737131 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43737160 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 43737161 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43737252 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43737361 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 43737455 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43737481 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43737534 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43737550 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43737624 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43737653 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 43737808 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 43737829 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43737851 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43737870 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43737883 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 43737894 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 43738100 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 43738149 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 43738248 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43738276 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43738384 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.0588235294117647 0.764705882352941 0.176470588235294 15 19 1 13 3 3 43738389 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 43738441 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43738446 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43738462 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43738474 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43738501 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43738524 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 43738558 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 43738622 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43738633 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43738641 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 43738645 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43738737 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43738790 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 43738825 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 43738912 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 43738952 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 43739103 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 43739212 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 43739214 T G N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 43739313 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 43739324 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43739336 A T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 43739415 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 43739453 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 43739466 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 43739630 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43739736 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43739756 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43739797 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43739798 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43739871 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43739879 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 43739901 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43739903 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43739935 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43739964 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43739966 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 43739985 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43740004 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43740011 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43740061 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 43740066 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43740180 G T N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 43740250 C T N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 43740264 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 43740271 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 43740312 C T N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 43740332 A C N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 43740359 C A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 43740375 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 43740429 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 43740544 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43740549 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 43740605 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43740622 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 43740646 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43740647 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 43740699 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43740755 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43740860 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43740867 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43740906 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43740917 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43740932 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 43741006 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43741009 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43741027 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 43741051 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43741064 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43741102 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43741111 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43741138 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43741153 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 43741155 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 43741172 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 43741228 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43741236 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43741303 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43741595 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 43741632 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 43741637 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43741985 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43742122 G A Y Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 3 43742599 G A Y Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 0.0714285714285714 15 13 2 11 1 3 43749394 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 43749708 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43749738 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43749789 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43749813 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43750006 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43750036 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43750094 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43750097 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43750127 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43750148 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43750253 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 43750255 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 43750372 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 43750384 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 43750409 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 43750411 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 43750533 T G N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 43750601 A C N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 43750614 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 43750622 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 43750693 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 43750766 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 43750775 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 43750788 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43750811 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 43752048 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 43752057 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 43752069 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 43752073 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 43752183 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43752191 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43752216 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43752224 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43752246 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 43752324 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43752355 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43752379 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43752402 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43752432 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43752472 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43752532 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43752551 T G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 43752579 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 43752618 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43752646 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43752704 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 43752706 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43752784 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 43752839 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43752910 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 43752923 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 43752963 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 43752996 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 43753032 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43753083 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 43753088 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 43753104 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 43753153 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 43753179 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43753188 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43753265 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 43753287 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 43753331 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 43753405 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43753416 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 43753434 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 43753472 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 43753510 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 43753528 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 43753576 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 43753613 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43753661 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 43753702 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 43753706 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 43753732 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 43753853 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43753868 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43753869 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 43754054 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43754085 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43754127 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 43754129 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 43754147 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 43754156 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43754161 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43754176 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43754264 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43754333 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43754344 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 43754348 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43754355 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43754362 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43754381 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43754404 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43754410 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43754429 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 43754455 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43754492 C A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 43754505 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 43754516 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 43754534 G T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 43754547 A T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 43754560 A T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 43754566 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 43754632 T A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 43754735 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 43754746 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 43754828 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43755021 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 43755037 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43755057 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43755091 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43755116 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43755183 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43755206 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43755257 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43755293 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43755345 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 43755554 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 43755622 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43755765 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43755786 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43755888 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43755897 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 43756025 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 43756101 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 43756117 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 43756132 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 43756166 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43756171 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43756306 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 43756416 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 43756461 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 43756488 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 43756551 T A N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 43756554 C T N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 43756882 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 43756944 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43756991 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 43756997 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 43757022 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43757098 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43757157 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43757172 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 43757216 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43757220 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43757347 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43757377 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43757379 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43757510 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43757533 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43757592 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43757696 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43757861 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43757884 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43757896 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43757932 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43757947 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43757967 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43758039 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 43758046 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43758089 G A Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 43764439 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 43764449 A G Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 43764466 A T Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 43764544 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43764582 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 43764629 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43764709 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43764741 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 43764765 A T N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 8 16 0 8 4 3 43764802 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 43764839 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43764862 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43764962 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43764963 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43764986 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43765022 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 3 43765094 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 43765198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43765223 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43765260 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 43765261 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 43765300 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 43765342 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 43765373 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43765414 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43765685 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 43765743 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 43765785 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43765825 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43765905 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 43765907 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 43765951 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43765973 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43765984 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 43766047 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43766119 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 43766179 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 43766197 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 43766317 C G N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 43766319 G A Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 43766387 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 3 43766556 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 43766656 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 3 43766683 G A N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 15 15 6 3 6 3 43766698 A G N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 15 15 6 3 6 3 43766766 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43766782 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 43766815 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 43766847 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 43766896 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 43766995 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43767064 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43767282 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.611111111111111 0.111111111111111 0.277777777777778 24 12 11 2 5 3 43767286 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 43767361 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 43767515 C T Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 43767576 A C Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 3 43767655 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 43767708 A G N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 3 43767748 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 43767756 T G N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 3 43767762 A C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 43767791 T A Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43767807 T C Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 43768041 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43768042 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43768121 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43768211 G C Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 43768228 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43768260 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 43768266 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 43768277 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 43768354 G C Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 43768477 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43768495 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43768554 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43768588 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43768646 T G Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43768662 A T Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43768688 C G Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 43768793 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43768910 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 43768965 C A Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 43769123 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 43769181 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 43769266 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 43769316 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 43769473 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43769486 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 43769590 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43769661 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43769907 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 43769926 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 43769966 T A N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 3 43769972 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 3 43770096 C A N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 43770224 A G Y Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 3 43770466 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43770628 A T Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43770661 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43770804 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 43770920 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43771041 T C Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 43771143 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 43771208 G A Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 43771256 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 43771278 G A Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 43771338 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 43771348 T C Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 43771603 A C Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 43771621 G T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 43771634 G T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 43771706 C G Y N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 43771717 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 3 43771739 C G N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 43771792 A C Y N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 3 43771852 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43771879 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43771948 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43771979 A T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43772033 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43772070 T G Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 43772088 T G Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 43772123 T G Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 43772242 C T Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 43772277 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 43772288 C T Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 43772309 G T Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 43772313 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43772324 A C Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 43772372 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43772399 T G Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43772438 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43772506 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43772646 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 43772678 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43772714 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 43772818 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 43772858 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 43772961 G T N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 43772974 T A N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 3 43772994 A G N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 43773005 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 43773063 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43773283 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 43773289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43773315 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 43773360 T G N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 43773431 A C N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 43773440 A C N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 43773459 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 43773505 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 43773514 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 43773664 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43773680 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 43773698 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 43773702 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43773733 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 43773990 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 43774031 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43774108 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43774112 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43774129 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 43774143 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 43774182 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43774203 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43774277 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43774320 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43774468 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43774585 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 43774779 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43774793 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43774816 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43774820 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43775126 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 7 5 3 1 2 3 43775219 A C N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 3 43775221 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 43775242 C T N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.5 0.214285714285714 0.285714285714286 17 11 7 3 4 3 43775316 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43775334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43775416 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43775422 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43775433 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43775453 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 43775505 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 43775512 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 43775632 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 43775670 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43775723 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43775741 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 43775783 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43775836 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43775847 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43775976 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43776020 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43776033 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 43776227 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43776237 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 43776438 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43776550 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43776553 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43776674 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 43776720 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43776910 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43777026 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 43777053 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43777079 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 43777105 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43777147 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43777204 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 43777222 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 43777385 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 43777445 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43777506 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 43777654 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43777680 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43777683 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43777761 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43777831 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43777918 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 43777955 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 43778065 C T N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 43778118 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 7 11 1 5 3 3 43778312 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 16 12 6 4 4 3 43778503 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43778530 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43778578 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43778596 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43778648 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43778673 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43778708 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43778710 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43778753 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43778806 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43778845 C A N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.466666666666667 0.2 0.333333333333333 17 13 7 3 5 3 43778858 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 43779263 G T N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 3 43779299 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 43779308 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 43779380 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 3 43779416 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 43779435 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 43779446 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 43779474 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43779528 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 43779561 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43779617 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 43779667 G C N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 3 43779708 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43779792 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 43779922 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43779957 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 43779990 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 43779993 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43780053 C G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 43780139 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43780229 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43780321 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 43780376 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 43780643 G C N N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.416666666666667 0.25 0.333333333333333 13 11 5 3 4 3 43780658 T G N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.428571428571429 0.214285714285714 0.357142857142857 15 13 6 3 5 3 43780838 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43780932 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 43780991 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 43781007 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43781610 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43781848 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 43781900 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43781979 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 43782042 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 43782191 A T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 43782240 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 43782487 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 43782538 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 10 14 4 2 6 3 43782586 G A N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.466666666666667 0.2 0.333333333333333 17 13 7 3 5 3 43782737 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 43782841 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 43782862 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43782939 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43782978 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43782981 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43783067 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43783182 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 43783230 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 43783625 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.4375 0.1875 0.375 17 15 7 3 6 3 43783701 A G N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.533333333333333 0.2 0.266666666666667 19 11 8 3 4 3 43783777 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 43783818 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 43783839 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 43783937 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43783993 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43784030 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43784058 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43784133 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43784173 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43784197 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 43784216 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 43784295 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 3 43784296 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 43784353 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43784354 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43784403 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 43784516 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 43784559 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 43784595 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 43784672 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 43784705 G C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 43784713 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 43784716 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 43784734 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 43784842 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43784896 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43784907 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 43784985 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 43785063 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43785162 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 43785224 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 43785238 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 43785320 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 43785331 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 43785361 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43785380 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 43785394 T G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 43785742 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43785913 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43785988 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43785996 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43786018 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43786072 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43786076 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43786204 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43786230 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43786245 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43786269 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 43786295 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 43786301 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43786363 G T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 43786398 C A N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 3 43786558 A T N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 43786605 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43786640 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 43786957 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43787253 C G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 43787483 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43787713 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 43787933 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43787991 A T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 43788178 G C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 43788272 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 43788306 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43788395 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 43788408 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 43788600 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 43788657 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43788722 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43788733 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43788796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43788920 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43789133 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43789276 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43789306 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43789331 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43789355 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43789389 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43789406 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43789414 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 43789464 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43789471 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 43790095 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 43790471 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 43790769 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 43790856 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43790903 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43791146 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43791613 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43791633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43791808 G A N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.428571428571429 0.214285714285714 0.357142857142857 15 13 6 3 5 3 43791930 G T N N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 10 10 4 2 4 3 43792219 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43792340 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 43792390 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 43792690 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43792757 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43792903 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43792984 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 43793296 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43793354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43793488 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43793499 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43793612 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43793753 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 43793792 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 43793934 G C Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 43794087 C A N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.533333333333333 0.2 0.266666666666667 19 11 8 3 4 3 43794103 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43794580 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 43794635 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 43795009 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43795055 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43795358 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43795451 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 43795478 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43795486 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 3 43795592 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 43795776 A T N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.153846153846154 0.615384615384615 0.230769230769231 12 14 2 8 3 3 43795876 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 43795972 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43796030 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43796072 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 43796182 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 43796591 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43796834 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43796877 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43797031 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43797032 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43797102 A T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 43797114 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43797152 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43797173 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 43797202 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43797405 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43797544 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43797644 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43797779 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43797793 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43797839 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43797848 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43797853 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43797873 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 43798250 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43798320 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43798342 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43798417 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 43798434 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43798506 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43798680 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43798907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43798922 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43799086 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43799198 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 43799241 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 43799326 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43799335 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43799344 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43799416 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43799487 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 43799593 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 43799711 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43799883 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43800172 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 10 14 2 6 4 3 43800240 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 43800349 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 43800478 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 43800506 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 43800676 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 43800810 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43800922 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43801101 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 43801237 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43801254 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43801394 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43801503 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 43801723 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 43801724 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 43801749 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 43801957 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43801981 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43802006 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 43802154 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43802235 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43802403 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 43802491 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43802524 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 43802993 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43803389 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43803632 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 43803634 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 43803736 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43803802 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 43803949 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 43804076 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43804494 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43804495 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43805129 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 43807032 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43807709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43807809 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43807900 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43808279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43815030 G A N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 43815060 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 43816798 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43816910 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43817010 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 43818504 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 43818631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43818736 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43819047 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 43819085 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 43819175 G T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 43819177 A T Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 43820682 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43820709 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43821032 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 43821535 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 43821895 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 43821920 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 43822029 T A Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 43822084 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 43822772 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43823117 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 43823342 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 43823655 T A N N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 3 43827635 T G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 43827798 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43827869 C A Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 43828209 G T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 43828343 A C Y N 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.75 0 0.25 6 2 3 0 1 3 43832323 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 43832345 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 43833275 C G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 43833288 C T N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 43833761 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 43834127 A T N N 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 43834370 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 43834494 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 43834562 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43835100 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 43836400 C T N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 14 6 6 2 2 3 43836909 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43837186 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43838151 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 43838573 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 43838587 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 43838751 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 43838869 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 43838874 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 43839285 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43839489 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 43839923 C A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 43840073 G A N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 43840652 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43840712 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 43840717 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 43841210 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 43841327 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 43841480 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43841540 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 43841691 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43841799 T G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 43842229 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 43842268 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 43842839 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 43842926 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 43843023 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43843041 G T N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 43843720 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 43843789 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43843876 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 43844176 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43844423 T A N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 43844838 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43844992 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43846179 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 43846371 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 3 43846603 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 3 43846605 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 3 43846722 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 43847030 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43847122 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 43847156 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 43847595 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 43847640 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43847669 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 43847740 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43847894 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 43847944 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43848035 T C Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 43848058 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 43848563 G A Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 43848570 G T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 43848603 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43848676 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43849078 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43849150 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 43849222 G T Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 43849729 G A Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 43849915 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 3 43850493 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 43850815 C A N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 43851943 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43851948 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 43852791 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 43853417 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 43853559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43854045 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43854099 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43854757 T A N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 3 43855110 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 43855201 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 43855546 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 43855552 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 43855736 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 43856255 A C Y N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 43856371 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43856785 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 43856947 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 43857211 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43857331 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43857437 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43857800 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43857813 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43858022 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 43858106 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 43858181 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43858330 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 43858383 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 43858595 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43858650 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43858771 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 43859664 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 43859745 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 43859782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43859818 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 43859897 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 43860019 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 43860137 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 43860197 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 43860236 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 43860254 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 43860363 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 43860368 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 43860473 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 43860645 G A Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 43860828 C T Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 3 43860848 A C Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 43860912 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 43860922 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 43860941 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 43861003 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 43861016 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 43861134 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 43861197 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43861227 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 43861233 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 43861320 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 43861343 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 43861362 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 43861434 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43861473 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 43861523 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 43861603 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 43861643 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 43861732 A C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 0.117647058823529 0.352941176470588 20 14 9 2 6 3 43861738 C A N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.533333333333333 0.133333333333333 0.333333333333333 18 12 8 2 5 3 43862487 T C N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 18 10 8 2 4 3 43862507 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.588235294117647 0.117647058823529 0.294117647058824 22 12 10 2 5 3 43862970 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 43862973 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 43863017 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.5 0.111111111111111 0.388888888888889 20 16 9 2 7 3 43863035 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43863040 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.5 0.111111111111111 0.388888888888889 20 16 9 2 7 3 43863047 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.5 0.111111111111111 0.388888888888889 20 16 9 2 7 3 43863091 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 43863210 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 43863258 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43863264 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 43863343 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 43863360 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 43863388 C A Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 3 43863401 C T Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.470588235294118 0.117647058823529 0.411764705882353 18 16 8 2 7 3 43863443 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 43863608 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 43863804 G C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 43863841 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 43863845 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 43863892 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 43863941 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43863992 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 43864018 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 43864140 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 43864165 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43864299 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 43864338 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 43864343 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 43864506 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 43864604 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 43864621 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43865282 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 43865506 A C N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.466666666666667 0.2 0.333333333333333 17 13 7 3 5 3 43865800 A C N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 9 15 3 3 6 3 43865928 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 3 43866781 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 43866883 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 43866927 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43867281 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 43867405 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43867432 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43867571 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43867634 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43869034 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43869203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43869292 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43869374 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 43869415 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 43870133 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 43870397 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 43870422 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43870575 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43870613 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43870641 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 43870689 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 43870920 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43871064 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 43871349 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 43871358 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 43871395 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 43871551 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 43871566 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 43871568 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 43871729 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43871752 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43871833 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 43872003 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43872041 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43872056 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 43872081 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 43872097 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 43872363 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 43872528 C A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 43872543 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 43872586 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 43872686 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43872740 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 43872772 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43872791 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43872893 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43872913 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43872932 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43872961 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43872994 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43873042 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 43873177 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43873351 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 43873355 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 43873378 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 43873390 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 43873597 C T N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 43873600 T A N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 43873611 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 43873639 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 43873656 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 43873707 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 43873795 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 43873961 T A N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 43874087 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 43874089 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 43874434 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43874548 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43874623 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43874631 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43874660 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43874701 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 43874710 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43874774 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43874804 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43874913 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43874943 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43875013 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43875055 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43875097 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43875114 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43875120 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43875212 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43875223 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43875267 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43875327 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43875437 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 43875449 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43875478 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43875505 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43875541 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43875581 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43875618 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43875714 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43875913 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43876023 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 43876079 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43876454 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 43876506 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 43876649 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 43876738 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 43876826 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 43876892 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 43876931 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 43877109 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 43877208 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43877324 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43877458 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43877525 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43877560 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43877588 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43877607 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43877872 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43878046 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43878070 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43878122 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43878139 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 43878321 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43878487 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43878523 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43878605 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43878779 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43878825 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43879071 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43879417 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 43880516 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43880663 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 43881085 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 43881112 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43881324 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 43881478 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43881632 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 43882162 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 43882240 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43882277 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 43882441 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 43882490 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43882997 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 43883577 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 43883857 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43884032 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43891235 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 43891302 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 43891337 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 43891370 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 43891414 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 43891503 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 43891544 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 43891559 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 43891659 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 43891706 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 43891894 A T N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.5 0.125 0.375 18 14 8 2 6 3 43892683 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 43892760 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 3 43892922 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 43892968 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 43893163 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 43893297 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43893429 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 43893491 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43893733 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 43893752 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.4375 0.1875 0.375 17 15 7 3 6 3 43893753 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 3 43893863 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 43894211 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 43894585 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 43894601 A T N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.466666666666667 0.2 0.333333333333333 17 13 7 3 5 3 43894679 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 43895244 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43895378 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43895428 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 43895519 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 43895643 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43896215 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 43896285 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43896483 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43896511 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43896567 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 43897081 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 43897149 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 43897529 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43897837 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 43898030 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 43898295 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43898315 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43898824 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43898850 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43899290 G T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 43899350 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43899592 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43899710 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43900007 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43900019 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43900143 T G N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 43900615 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 43900744 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 43900967 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43901042 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43901362 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 43901487 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43901516 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43901597 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43901665 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43901683 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43901689 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 43901855 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43901865 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43901909 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43902111 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 43902156 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43902239 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43902264 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43902277 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43902279 G T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 3 43902299 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43902312 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43902313 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43902333 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43902379 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43902453 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43902454 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43902490 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 43902500 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 43902521 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 43902736 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 43902746 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 43902781 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 43902812 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 43902825 G T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 43902886 G T Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 3 43902889 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 43902915 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 43902918 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 43902950 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 43902959 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 43902963 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 14 10 6 2 4 3 43903012 G A N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 43903044 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 43903084 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 43910816 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 43910927 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 43911017 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43911074 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 43911089 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43911152 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43911165 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43911181 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43911193 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43911196 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43911258 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43911262 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43911295 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 43911332 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 43911342 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 43911353 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 43911355 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 43911427 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 43911494 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 43911550 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 43911601 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 43911652 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43911665 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43911706 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43911739 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43911740 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 43911774 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43911784 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 43911804 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43911823 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 43911867 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43911942 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43911979 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43912010 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43912026 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43912038 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43912071 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43912082 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43912098 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43912262 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 43912265 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 43912368 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 43912390 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 43912413 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 43912662 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43912719 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 43912731 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43912751 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43912769 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43912781 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43912789 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43912798 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43912906 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43912911 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43912963 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 43912964 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43912980 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43913029 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43913036 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 43913180 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43913245 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43913297 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 43913309 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 43913320 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43913356 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 43913453 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 43913485 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43913524 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43913545 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43913602 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43913634 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43913677 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 43913718 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43913753 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43913757 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43913830 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43913831 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43913846 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43913875 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43913980 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43913984 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43914000 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43914006 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43914023 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43914045 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43914046 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43914056 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43914078 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43914148 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43914213 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43914223 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43914237 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43914289 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43914312 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43914338 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43914384 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 43914393 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 43914418 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43914492 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43914559 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 43914571 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43914634 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43914648 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43914686 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43914745 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43914948 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43915001 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43915003 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43915098 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43915116 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 43915198 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43915212 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 43915232 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 43915307 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 43915389 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 43915397 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 43915412 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 43915495 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 43915506 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 43915510 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 43915544 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 43915583 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 43915631 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 43915655 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 43915707 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 43915736 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 43915773 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 43915853 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 43915885 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 43915938 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 43915944 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 43916033 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 43916161 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 43916330 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 43916339 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 43916366 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43916402 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43916430 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 43916730 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 43916804 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 43916865 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 43917058 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43917059 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 43917121 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43917141 C A Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 43917218 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 43917219 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 43917230 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 43917244 G T N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 43917380 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 43917417 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 43917427 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 43918067 A T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 43918138 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43918185 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43918234 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 43918251 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 43918273 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 43918308 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 43918347 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 43918406 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 43918440 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 43918446 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 43918599 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43918668 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 3 43918678 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 43918679 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 43918699 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 43918710 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 43918748 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 43918754 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43918828 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 43918936 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 43918964 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 43918994 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 43919004 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 43919012 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 43919027 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 43919088 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 43919170 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 43919179 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 43919356 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 43919705 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 43919931 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43920060 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43920463 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 43921152 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43921361 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43921798 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 43921958 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43922858 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43923149 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43923192 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43924333 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43924507 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43924749 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43925114 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43925562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43925747 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43925938 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43926665 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 43926994 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43927399 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43929207 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43929925 G A Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 3 43930540 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 43930550 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43930790 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 43930947 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43931020 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43931083 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 43931229 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 43931247 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.588235294117647 0.117647058823529 0.294117647058824 22 12 10 2 5 3 43931378 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 43931391 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 43931402 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 43931450 T A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 43931784 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 43931810 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 43931880 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43931885 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 43931905 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 43931908 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 43931922 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43932002 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 43932037 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 43932050 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 43932107 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43932123 C T N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 15 15 6 3 6 3 43932182 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43932280 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43932312 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43932321 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 43932418 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 43932497 C T N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 43932515 A C N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 43932540 G T N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 43932572 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 43932573 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 43932868 A T N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 43932896 A T N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 43932908 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 43932951 G T N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 43932965 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 43932988 A T N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 43932990 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 43933170 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 43933233 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 43933250 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43933320 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43933330 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43933347 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 43933448 T A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 43933450 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 43933473 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 43933549 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 43933608 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 43933885 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 43933897 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 43934027 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 43934045 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43934115 T G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 43934127 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 43934346 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 43934433 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 43934440 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 43935029 T G N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 43935191 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 43935284 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 43935354 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 43935376 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43935517 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43935579 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 43935717 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 43935734 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43935789 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43935874 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 43935879 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43936021 T C N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 43936038 C A N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 43936070 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 43936165 G A N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 43936183 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 43936236 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 43936243 G A Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 43936274 T G Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 43936280 T G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 43936290 G T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 43936298 C G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 43936398 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 43936571 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 43936575 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43936610 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43936616 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43936700 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 43936779 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 43936787 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 43936797 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43936844 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43936908 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43936934 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43936979 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43937004 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43937056 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43937233 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43937262 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43937317 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43937476 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43937825 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 43937866 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 43937961 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 43938026 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43938029 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 43938141 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43938218 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43938463 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43938600 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 43938692 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 43938733 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 43938769 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43938937 G T N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 43938958 T C N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 43938979 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 43938980 A G N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 43939001 G A N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 43939139 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 43939224 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 43939347 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 43939447 A G Y Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0 1 0 6 6 0 6 0 3 43939629 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 43939714 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43939838 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 43939886 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 43939976 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 43939987 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 43940340 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43940497 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 43940528 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43941119 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 43941303 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43941310 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 43941505 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43941565 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 43941789 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43941799 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43941986 A C N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 43942008 T C Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 43942160 G A Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 43942271 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 43942383 T G Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 43942432 C T Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 43942442 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 43942481 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43942506 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 43942579 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43942580 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43942645 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 43942741 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43942759 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43942827 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43942914 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 43942960 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 43943321 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 43943470 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43943700 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43943927 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43943932 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43943973 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43943990 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43944018 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 43944019 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 43944255 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 43944264 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43944496 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 43944554 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 43944620 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 43944745 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 43944755 T A N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 43944974 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 43945276 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 43945295 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 43945326 C T N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 43945328 A C N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 43945341 A C N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 43945369 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 43945405 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 43945577 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43945651 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 43946001 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43946043 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43946066 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43946081 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43946174 A C Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43947196 G A Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 43947237 G T Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 43947406 A C Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 43947465 G C Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 43947514 G T Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 43947517 G T Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 43947537 G A Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 43947590 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 43947688 T C Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 43947758 T C Y Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 43947810 G T Y N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 43947886 C T Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 43948358 A T Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 43948550 T C Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 43948592 T A Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 43948640 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 43948658 G T Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 43948747 A C Y N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 43948764 C G Y N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 3 43948814 T G Y N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 43948887 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 3 43948935 T C Y Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 43948975 C T Y Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 43949076 A C Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 43949144 A G Y Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 3 43949145 A C Y N 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 3 43949239 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 43949490 T G Y N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 43949771 A G Y Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 3 43949910 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 43949998 C T Y Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 43950015 A C Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 43950223 T G Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43950307 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43950364 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 43950445 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 43950455 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 43950593 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 43951087 G T Y N 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 8 6 1 6 0 3 43951351 G A Y Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 43951446 G C Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 43951535 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 43951639 A T Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43951763 A C Y N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 43951764 T C Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 43952216 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 43952379 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43952380 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43952889 T A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 43953289 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 43953465 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 43953502 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43953710 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 43953721 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 43953759 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 43953939 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43954117 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 43954282 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43954290 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43954317 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 43954403 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 43954429 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43954446 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43954501 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 43954526 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 43955139 C A Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 43955190 C A N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0 0.583333333333333 0.416666666666667 7 17 0 7 5 3 43955412 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43955527 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 43955621 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 43955655 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 43955697 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43955874 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 43956023 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 43956133 C G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 43956278 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 43956451 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 43956586 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 43956587 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 43956922 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 43957184 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43957260 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 43957281 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 43957423 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 43957431 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 43957702 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43957730 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43958074 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 43958346 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 43958374 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 43958542 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 43958624 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 43958757 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 43958990 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 43959075 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 43959090 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 43959101 G T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 43959155 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 43959198 T C Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 43959365 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 43959615 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 43959952 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 43959961 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 43959964 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 43959988 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43960076 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 43960086 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 43960122 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 43960335 G T N N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 43960338 A G N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 43960602 G A Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 43960707 G T Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 43960714 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43960920 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43960937 G A Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 43961086 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 43961235 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43961279 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 43961366 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 43961424 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43961570 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 43961596 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 43961934 G T N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 43961939 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43961979 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 43962188 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 43962207 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 43962237 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 43962288 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 43962528 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43962542 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 43962554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43962703 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43962807 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 43962871 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 43962923 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43963224 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 43963667 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 43963727 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 43964072 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 43964189 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 43964373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43964468 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 43964506 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 43964686 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 43964736 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43965213 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43965239 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 43965332 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 43966074 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 43966254 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43966359 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 43966397 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43966548 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43966752 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 43966946 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43966964 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43967356 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43967497 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43967571 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43967580 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43967687 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 43967690 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 43967699 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 43967711 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43967790 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43968301 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 43968409 C T Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 43968470 C T Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 43968597 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 43969417 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43969423 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 43969501 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 43969692 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43969695 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43969704 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 43969756 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 43969912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43969947 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43969958 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 43969981 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43970023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43970061 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43970159 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43970215 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43970358 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 43970377 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 43970542 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43970576 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43970603 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43970735 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43970778 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43970862 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43971037 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43971059 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 43971080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43971084 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43971107 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43971129 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43971172 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43971242 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43971293 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 43971442 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43971632 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43971690 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43971786 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43971840 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 43971872 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 43971897 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 43971930 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43971987 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43972019 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43972197 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43972204 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 43972405 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43972519 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43972557 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43972616 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43972621 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43972697 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 43972788 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 43972839 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43972936 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43973005 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43973097 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43973181 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43973256 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43973418 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43973420 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 43973440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43973445 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43973475 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43973488 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43973683 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43973808 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43973878 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 43973920 C G Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 43973940 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43973992 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43974067 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43974090 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 43974119 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 43974365 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43974428 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 43974508 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43974691 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 43974695 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43974740 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43974983 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43974993 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 43975085 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43975099 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 43975191 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43975206 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 43975249 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43975374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43975417 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 43975450 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43975527 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 3 43975571 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43975635 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 43975685 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43975712 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 43975758 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43975856 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43976369 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43976552 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43976582 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 43976643 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 43977073 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43977148 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43977244 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 43977385 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 43979347 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 43979476 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43979778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43979917 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43980124 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43980905 G A Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 43981626 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 43983415 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43983428 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43983696 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43983719 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43984327 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43984498 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 43985262 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43985635 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 43985720 T C Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 43986084 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43986158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43986311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43986740 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 43987206 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 43987320 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 43987656 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 43988174 G C N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 43988266 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 43988633 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 43989467 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43989473 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 43989544 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43989681 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 43989693 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 43996994 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 43997090 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 43998598 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 43998779 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 43999613 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 44001150 G A Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 44001438 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 44001489 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 44001561 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44001598 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44001604 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44002281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44002356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44002500 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 44003013 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44003120 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44003164 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 44004008 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 44004041 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44004347 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44004407 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44004683 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44005125 T G Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44005636 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44006272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44006502 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44006814 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44007886 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44008086 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44008498 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 44008765 G T N N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 44008805 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 44009664 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 44010119 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44010195 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44010280 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44010453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44011209 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44011400 T C N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 44011858 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 44013295 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44014746 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44014883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44015014 T A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 44015086 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44015537 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44015631 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44015903 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44016702 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44016922 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44016950 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 44017157 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44017638 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44017971 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44018660 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 44019248 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44020174 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44020437 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44020606 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44020932 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44022081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44022913 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44022987 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44023498 C T N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 44024070 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44026818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44027171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44027355 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44030931 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44031646 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44031805 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44032475 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44033639 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44033699 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44034947 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44035536 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44038339 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44039601 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44039673 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44041363 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44042815 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44043950 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44052525 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44052532 G A Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.4375 0.1875 0.375 17 15 7 3 6 3 44053005 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44053418 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44053739 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 44057459 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 44058474 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44058691 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 44059460 A C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 44059501 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.444444444444444 0.111111111111111 0.444444444444444 18 18 8 2 8 3 44059609 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 44059824 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44059922 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44060199 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44060237 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44060512 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 44060685 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44060859 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.4375 0.125 0.4375 16 16 7 2 7 3 44061103 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 44061580 C T Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 44061668 G A Y Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 44061747 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 44063287 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 44063373 T A Y N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 44064147 T C Y Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 44064561 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 3 44065362 C T Y Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 3 44065521 G C Y N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 44065664 A G Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 3 44066066 G T Y N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 44066279 G C Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 44067780 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 44069437 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44069602 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44070312 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44070433 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44071310 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44071671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44071685 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 3 44071700 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44071926 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44072825 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44072888 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44073937 G A Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 44075603 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44075746 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44077714 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44078137 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 44078842 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44079568 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44080341 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44080743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44080930 T A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 44081171 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.411764705882353 0.117647058823529 0.470588235294118 16 18 7 2 8 3 44081370 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44081427 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44082008 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44082030 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44082510 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 44083153 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 44083338 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44083806 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 44084307 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44084407 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44084455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44084612 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44084732 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 44084760 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 3 44084837 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 3 44084874 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44085546 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44085668 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44086747 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44086791 G C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 44087211 A T Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 3 44087367 C T Y Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 3 44087636 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44087637 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44088590 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44089018 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44089646 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44090565 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44090660 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44090806 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44090985 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 44091007 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44091020 G C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44091405 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44091480 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44091861 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 44092255 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 44092380 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 44092893 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44093351 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44093675 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44094833 C T Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 0.117647058823529 0.352941176470588 20 14 9 2 6 3 44094844 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44095423 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44095598 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44096052 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44097136 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 44097728 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44097849 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44097980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44098030 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44098254 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 44098478 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 44098795 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 44099299 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44099620 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44099702 G C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 44100102 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44100113 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44100353 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44100556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44100679 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44101348 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44101678 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44102045 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44102050 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44102687 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44102826 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44103773 G A N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 44103845 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 44104037 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 44105464 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 44105710 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 44105890 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.411764705882353 0.117647058823529 0.470588235294118 16 18 7 2 8 3 44106385 C A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 3 44106623 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 44107045 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 3 44107077 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 44107407 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44107513 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44107516 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 3 44107898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44107972 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44108096 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 44108193 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 44108239 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 44108590 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 44108817 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44109097 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 3 44109154 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 44109299 C A N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 3 44109325 C T N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 44109520 C A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 44109674 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44109811 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44110015 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44110030 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44110156 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44110317 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 44110425 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44110585 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44110632 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44110638 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44110643 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44110710 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44110733 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44110737 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44111406 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 44111490 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 44112127 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44112224 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44112343 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44112559 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44112664 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44112748 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 44112990 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44113341 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44113439 T A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 44113453 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 44113635 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 44113710 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 44113741 T A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 44114094 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 44114240 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44114307 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 44114368 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44114466 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44114495 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44114500 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44114520 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44114689 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 44114699 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44114835 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44115079 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44115081 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44115132 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44115251 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44115439 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 44115473 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44115649 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 44115720 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44115821 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44115874 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44116128 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44116270 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44116307 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44116318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44116327 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 44116919 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44116947 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 44117041 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44117058 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44117070 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44117198 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44117210 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44117254 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44117543 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44117562 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44117762 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 44117803 C A N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 44117822 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 44117911 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 44118070 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44118173 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44118223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44118239 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44118255 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44118259 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44118284 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44118362 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44118642 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44118672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44118890 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44118906 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44118940 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44119076 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44119125 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44119274 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44119294 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44119422 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 44119440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44119600 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44119822 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 44119925 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44120088 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 44120548 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 44120855 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 44120942 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 44121044 G T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 44121680 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44121791 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44122436 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44122566 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44122647 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 44122709 G T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 44122794 G A N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 44123061 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44123090 G T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 44123113 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44123304 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 44123399 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44123687 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44123776 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44123906 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 44123930 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 44123939 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 44124177 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44124239 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 44124485 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44124514 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 44124624 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 44124635 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 44124641 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 44124729 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 44124746 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 44124748 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44124812 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44124816 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 44124847 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 44124877 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 44125244 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44125288 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 44125338 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 44125351 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44125535 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 44125646 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44125649 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44125710 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44125759 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44125812 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44125883 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44126101 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44126218 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44126232 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44126403 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44126438 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44126601 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44126676 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44126692 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 44127125 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44127240 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44127547 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44127654 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44127695 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44127796 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44127818 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44127853 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 44127974 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44128000 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 44128030 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.4375 0.125 0.4375 16 16 7 2 7 3 44128098 G T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 44128146 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 44128165 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44128356 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 44128413 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44128444 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 44128518 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 44128589 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 10 14 4 2 6 3 44128721 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.333333333333333 0.133333333333333 0.533333333333333 12 18 5 2 8 3 44128937 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 44129092 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 44129125 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44129247 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44129249 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44129268 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44129279 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 44129444 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 44129498 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 44129524 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 44129634 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44129797 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44129888 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 44129973 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44129976 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 44130031 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 44130078 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44130360 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44130369 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 44130456 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 44130517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44130810 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 44130829 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 44131004 G T N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.538461538461538 0.230769230769231 0.230769230769231 17 9 7 3 3 3 44131045 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 3 44131214 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44131280 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 44131629 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 44131642 G T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 44131649 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44131691 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44131700 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44131710 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44131788 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44131908 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44131952 G A N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 3 44132049 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44132205 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 44132214 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 44132216 G C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 44132235 T A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 44132408 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 44132416 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 44132458 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44132463 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44132625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44132672 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44132673 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 44132826 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 44132853 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44132880 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44132888 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44132923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44133138 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 3 44133207 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 44133209 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44133237 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 44133265 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 44133369 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44133388 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44133395 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 44133829 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44133891 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 44133974 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 44134118 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44134195 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 44134222 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44134398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44134485 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44134759 G A N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 3 44134777 G A N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 3 44135009 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44135032 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44135052 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 44135104 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44135137 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44135191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44135346 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 44135396 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 44135425 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44135443 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 44135471 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 44135526 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44135713 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 44135722 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 3 44135727 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 3 44135749 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44135783 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44135810 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44135875 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 44135881 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44136055 G T N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 44136175 A T N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 3 44136204 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 44136273 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 44136337 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 44136539 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 44136551 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 44136555 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 44136589 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 44136631 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 44136668 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44136703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44136743 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44136786 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44136855 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44136963 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44136990 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 44136996 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44137205 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44137214 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44138052 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 44138352 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 44139320 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44139379 A G N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 44139401 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44140363 A G Y Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.2 0.8 0 12 8 2 8 0 3 44140787 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 44141942 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44142125 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44142212 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44142250 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 44142859 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44143065 T G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 44143565 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44143580 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44143825 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 44143884 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44143948 T C Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 44143986 A C Y N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0 1 0 14 14 0 14 0 3 44144496 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 44144653 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 44145161 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 44145224 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 44146046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44146089 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44146221 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 44146380 G C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 44146447 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 44146806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44147364 G C N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 44147470 A G N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 3 44147764 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 44147800 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44147964 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44149543 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44152679 C G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 44153412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44154090 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 44154512 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44157309 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44158579 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44159506 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44162183 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44162515 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44162988 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44164159 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 44164175 A T Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 44165794 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 44165862 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44166236 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44167854 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44168288 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44170942 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44171159 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44171839 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 44173593 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44173734 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44173782 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44173998 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44174928 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44175258 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44175461 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44176572 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.333333333333333 0.111111111111111 0.555555555555556 7 11 3 1 5 3 44176960 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44177553 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44181073 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 44182181 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44183765 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44184587 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44185299 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44185617 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44185646 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44185758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44186867 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44186888 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44186889 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44188508 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 44189520 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44189904 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44191774 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44192033 C A Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 44192416 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44192749 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44192775 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44193213 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44193311 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44193616 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 44194075 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44194232 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44194251 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44195153 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44195392 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44196274 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44197802 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44200468 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44202703 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 44211789 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44212518 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44213332 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44216487 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44216517 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44217528 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44219548 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 44219684 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44220586 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44222297 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44223375 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44225804 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44226567 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44227386 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44227524 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5625 0.125 0.3125 20 12 9 2 5 3 44227570 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 44227606 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44227804 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44227925 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44228634 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44228702 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44228969 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 44229062 A T Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 44229381 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44229944 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 44230211 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 44230212 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44230358 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 44230482 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 44230529 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 44230553 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 44230558 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 44230611 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44230728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44230819 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44230928 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44231016 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 44231056 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 44231101 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 44231186 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44231201 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44231235 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 44231255 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44231286 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 44231400 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44231786 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 44231788 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 44231847 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44232207 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44232574 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44232620 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 44232648 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 44232737 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44232808 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44232887 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44232952 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44233019 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44233045 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 44233047 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44233196 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 44233350 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44233490 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 44233521 C A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 44233526 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 44233650 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 44233810 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 44233822 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 44233898 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44234067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44234271 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44234287 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44234747 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44234824 A T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 44234898 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44235449 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44235471 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44235485 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44235629 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 44235696 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 44236005 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44236049 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 44236068 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44236185 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 44236193 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44236395 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 44236431 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 44236476 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 44236486 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 44236489 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 44236578 G C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 44236677 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 44236680 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 44236697 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 44236710 G A N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 3 44236714 A G N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 3 44236782 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 44236810 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 44236915 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 44236941 A C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 44236995 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44237020 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 44237129 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 44237153 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44237214 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 44237256 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 44237308 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 44237314 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 44237326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44237371 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44237788 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44237790 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 44238131 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44238507 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 44238676 A T N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 44238682 C A N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 44238707 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44238863 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44238961 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44239058 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 44239123 T A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 44239424 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 44239651 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 44239652 T A N N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 3 44239873 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 44239908 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 44239990 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 44240034 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 44240053 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 44240119 C T N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 44240140 A T Y N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 44240170 T A N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 44240180 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 44240201 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44240524 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44240969 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44241118 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 44241847 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 44241895 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 44241995 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 44242303 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 44242983 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.3125 0.125 0.5625 12 20 5 2 9 3 44243408 G T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 44243895 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 44244006 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44244136 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 44244253 C A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 44244387 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 44244533 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44244608 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44244687 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 44244763 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 44244792 A C N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 3 44244799 T G N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 3 44244807 G A N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 5 15 2 1 7 3 44244853 A T N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 44244910 G A N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 0.153846153846154 0.153846153846154 20 6 9 2 2 3 44244973 C G N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.357142857142857 0.142857142857143 0.5 12 16 5 2 7 3 44245010 C T N Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.428571428571429 0.142857142857143 0.428571428571429 7 7 3 1 3 3 44245030 A T N N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 3 44245076 C T N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.375 0.125 0.5 7 9 3 1 4 3 44245141 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 44245306 C G N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.266666666666667 0.0666666666666667 0.666666666666667 9 21 4 1 10 3 44245391 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.214285714285714 0.142857142857143 0.642857142857143 8 20 3 2 9 3 44245546 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 44245556 C T N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 44245666 T A N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 44245739 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 44245894 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 44245936 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 44246082 G A N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 12 8 5 2 3 3 44246095 G C N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 3 44246183 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44246185 T G N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 3 44246289 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 44246333 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 44246359 G C N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 3 44246439 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 44246638 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.333333333333333 0.111111111111111 0.555555555555556 14 22 6 2 10 3 44246692 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.333333333333333 0.111111111111111 0.555555555555556 14 22 6 2 10 3 44246777 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 3 44246948 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 44247117 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 44247455 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.315789473684211 0.105263157894737 0.578947368421053 14 24 6 2 11 3 44247465 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.315789473684211 0.105263157894737 0.578947368421053 14 24 6 2 11 3 44247646 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.352941176470588 0.117647058823529 0.529411764705882 14 20 6 2 9 3 44247704 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44247713 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.352941176470588 0.0588235294117647 0.588235294117647 13 21 6 1 10 3 44247735 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 44247752 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 44247765 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 44247795 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44247816 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44247842 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 3 44247868 T A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 3 44247877 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.375 0.1875 0.4375 15 17 6 3 7 3 44248041 A C N N 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.4 0 0.6 4 6 2 0 3 3 44248458 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 44248583 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 44248655 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 44248803 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 44248835 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 44248986 G T N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 9 15 3 3 6 3 44249047 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 3 44249254 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 44249527 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 44250064 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44250711 A C N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 44251633 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 44251832 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44251837 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44251854 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44252153 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 44252722 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44254238 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44254429 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 44254580 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 44254602 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 44254900 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 44255119 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 3 44255687 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 44255888 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 3 44256052 A C N N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.333333333333333 0.25 0.416666666666667 11 13 4 3 5 3 44256421 C G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 44256526 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 44256847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44256908 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 44257505 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 44257771 A C N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.375 0.125 0.5 14 18 6 2 8 3 44258124 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 3 44258584 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 44258985 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 44259214 A T N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.357142857142857 0.142857142857143 0.5 12 16 5 2 7 3 44259518 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 44259708 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 3 44259952 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 44259980 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 44260119 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44260590 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 44260604 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44260905 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 44266345 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 44267361 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44267473 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 44267656 C A Y N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 44267890 T A N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.357142857142857 0.214285714285714 0.428571428571429 13 15 5 3 6 3 44268408 C A N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.3125 0.125 0.5625 12 20 5 2 9 3 44269595 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 44270033 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.352941176470588 0.0588235294117647 0.588235294117647 13 21 6 1 10 3 44270232 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 44270622 A G N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 3 44271397 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 44271718 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 44272216 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 44272309 A T N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 44272361 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 3 44272556 A C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 44272639 A T Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 3 44273541 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44275607 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44276440 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 44277162 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 44277517 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44279451 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 44280256 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 44280955 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 44281933 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44282597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44284314 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44285010 T G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 44285530 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 44286875 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44286974 T G Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 3 44288569 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 44289068 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44290211 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 44290314 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44290869 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44291668 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 44292231 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 44296732 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 44298285 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 44298411 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44298743 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44298778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44298795 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44299787 G T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44300538 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44300860 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44300894 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44301091 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44301727 C A Y N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 3 44301913 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 44302265 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 44302747 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44302982 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44303198 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44303216 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44303254 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44303909 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44304272 A T N N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 44304744 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 44304815 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 44306064 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44306344 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 44306541 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 44306761 T A N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 44306802 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44307012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44307026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44307121 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 44307695 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 44307769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44308228 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44308965 G A Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 3 44309087 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 44309484 C T Y Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 3 44309647 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44309834 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44309844 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44310084 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44310152 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44310155 C G Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 44310274 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 44310414 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44310424 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44310775 G A Y Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 44311122 C A Y N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 44311246 T A Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 44311368 A C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 44311393 G A Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 3 44311397 G T Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 44311622 A G Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 44311813 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 44311899 T G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 44311907 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 44312926 G C Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44313270 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44313472 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 44313684 A C Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 44314703 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44314716 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44314822 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44314985 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44315132 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44316536 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44316619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44316733 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44316782 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 44317016 G A Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 44317150 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44317748 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44318019 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44318180 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44319300 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 44319342 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44319846 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44320321 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44320533 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44321477 C G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44321650 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44321876 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44322171 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44322488 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44323014 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44323658 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44323725 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44324360 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44324409 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44324458 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44324837 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 44324847 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 44324848 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 44325809 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 44325945 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44326594 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44327660 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 44327669 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 44327723 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 44329623 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44330842 G A Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 44331580 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 44331716 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44331866 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 44333993 C T N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 44334055 G A Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 44334097 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 44334417 T C Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 44334537 G C Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 44334701 C A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 44334900 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44334990 A T Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 44335422 G T Y N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 44335443 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 44335468 T C Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 3 44335552 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 44335583 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 44335951 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44335976 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44335996 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44335997 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44336046 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 44336317 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 44336514 G T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44336539 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 44336605 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 44336618 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 44336775 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 44337166 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44337182 G A Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 44337258 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 44337342 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44337514 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 44337644 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 44337744 T A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44337890 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44337900 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44337930 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44337952 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44338556 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 44338600 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44338620 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44338622 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 44338775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44338781 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44338857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44338866 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44338882 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44338926 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44339006 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 44339420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44339665 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 44339757 T A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44339779 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44339828 T G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 44339891 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 44340496 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 44340559 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44340615 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44340633 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 44340705 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44340830 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 44340894 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44340896 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 44342329 A G Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 44342340 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 44342425 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44342637 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44342857 T G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 44343017 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44343038 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44343133 T G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 44343235 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44343239 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 44343248 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 44343356 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44343382 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44343671 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44343678 T A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 44343763 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44343798 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44343859 C A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 44343935 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44343998 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 44344067 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 44344077 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 44344146 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 44344152 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 44344228 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44344467 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44344543 G T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44344546 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44344847 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44344865 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44344899 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44345101 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44345121 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44345281 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44345374 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 44345380 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44345461 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44345477 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44345503 T G Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 44345609 T A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 44345615 G C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44345732 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 44345827 G T Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 44345893 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44345941 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 44346029 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44346099 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44346299 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44346308 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44346328 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44346647 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 44346755 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44347118 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44347192 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44347217 A C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 44347263 T G Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 44347329 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44347337 C G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 44347740 C A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 44347769 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44347904 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 44347987 T A Y N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 44348262 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44348466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44348579 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44348676 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 44348900 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44348924 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44349087 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 44349145 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44349175 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44349182 G C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 44350191 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44350343 A G Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 44350602 A G Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 44350870 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44350874 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44350913 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 44351135 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44351170 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44352078 T C Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 44352185 A C Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 44352678 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44353083 T G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 44353319 C T Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 44353693 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 3 44353755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44354437 A T N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 44354710 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 44354809 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 44355035 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 44356356 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 44356357 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 44356974 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 44357371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44357810 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 44357843 G C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 44357960 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 44358081 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44358088 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 44358308 G T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 44358330 G T Y N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.357142857142857 0.142857142857143 0.5 12 16 5 2 7 3 44358509 G T N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 44358515 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 44358713 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44358741 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 44358756 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 44358782 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 44358799 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 44358815 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 44358853 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 44359043 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 44359044 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 44359131 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44359146 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 44359398 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 44359674 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 44359695 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 44360005 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 44360010 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 44360088 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 44360149 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 44361163 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.333333333333333 0.2 0.466666666666667 13 17 5 3 7 3 44361539 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 44361615 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 44361931 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 44362060 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 44362069 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 44362128 A G Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 44362142 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 44362145 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 44362201 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 44362205 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 44362261 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 44362278 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 44362619 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 44370615 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 44370649 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 44370791 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 44370810 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44371016 A G N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.615384615384615 0.153846153846154 0.230769230769231 18 8 8 2 3 3 44371125 A G Y Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.714285714285714 0.285714285714286 5 9 0 5 2 3 44371557 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 44371587 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 44371840 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 44371891 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44372211 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 44372325 T G Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 44372392 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 44372754 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44372814 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44372834 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44372843 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44372925 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44373070 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44373095 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 44373116 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44373152 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44373163 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44373203 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44373211 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44373248 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44373302 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 44373338 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44373470 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44373580 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44373590 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 44373693 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 44373822 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 44373901 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44373992 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44374047 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 44374048 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 44374070 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44374084 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 44374131 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 44374174 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44374186 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 44374216 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44374240 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 44374356 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 44374370 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44374411 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 44374475 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44374494 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44374523 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44374677 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44374696 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 44374714 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.210526315789474 0.736842105263158 0.0526315789473684 22 16 4 14 1 3 44374746 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 44374754 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 44374846 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44374892 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 44374955 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 44374985 C T N Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 3 44375004 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 44375088 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 44375103 G C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 44375188 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 44375233 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 44375240 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 44375344 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44375505 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 44375524 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44375540 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44375572 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44375608 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 44375644 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 44375682 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44375707 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44375716 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44375751 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 44375786 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 44375796 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44375843 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 44375899 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 44375933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44376016 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 44376056 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44376075 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44376077 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44376101 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44376124 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 44376364 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44376455 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 44376461 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 44376493 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 44376519 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 44376563 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44376597 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44376633 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44376657 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44376667 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 44376707 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 44376873 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44376879 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44376896 A C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 44376922 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 44377025 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44377061 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 44377110 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44377111 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44377157 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 44377201 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 44377440 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 44377495 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 44377508 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44377525 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44377624 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 44377676 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44377715 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44377716 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 44377826 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 44377984 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 44378048 G A Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 44378097 G A Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 44378156 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 13 5 6 1 2 3 44378440 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 44378520 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 44378572 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 44378735 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 44379042 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44379112 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 44379136 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44379232 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44379288 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44379339 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 44379384 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 44379407 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 44379527 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44379566 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44379606 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 44379642 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 44379689 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 44379744 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 44379773 C A N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.666666666666667 0.133333333333333 0.2 22 8 10 2 3 3 44379787 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44379821 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 44379975 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44379982 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44380160 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44380237 T A N N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 3 44380265 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 44380272 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44380315 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 44380480 A T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 3 44380506 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 44380629 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 44380676 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 44380752 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 44380757 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 44380784 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 44380802 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 44380818 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 44381017 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 44381151 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 44381552 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 44381692 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44381700 T G Y N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 44382214 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 44382275 T G Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 44382624 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 44382696 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 44383050 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 44383083 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44383569 C T Y Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.3125 0.125 0.5625 12 20 5 2 9 3 44383606 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44383612 C G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 44383665 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44383771 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 44383810 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44383883 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44384062 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44384065 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 44384402 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44384439 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.533333333333333 0.2 0.266666666666667 19 11 8 3 4 3 44384501 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44384746 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44384847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44384876 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44384933 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44385050 A C Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44385108 A C Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 44385193 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 3 44385239 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44385638 T G Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 44385792 C T Y Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 5 15 2 1 7 3 44385800 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 44385996 A T Y N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.25 0.75 0 15 9 3 9 0 3 44386060 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44386106 T C Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 44386181 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 44386223 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44386239 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 44386323 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44386537 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 44386729 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44386744 C A Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 44386903 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 44386926 A G Y Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 3 44386955 T G Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 44387021 G A Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 44387040 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44387062 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44387335 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44387474 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 44387837 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 44387945 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 44388037 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44388159 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 44388514 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 44388540 G T N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.333333333333333 0.133333333333333 0.533333333333333 12 18 5 2 8 3 44388833 G A N Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 8 6 3 2 2 3 44388834 T A N N 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 8 6 3 2 2 3 44388868 T G N N 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 11 9 4 3 3 3 44388879 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 44388917 G A Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 44389080 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 44389138 A T Y N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 44389194 A C Y N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 44389377 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 44389392 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 44389420 T A N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 44389607 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 44389694 T C Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 44390178 C T Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.153846153846154 21 5 10 1 2 3 44390287 C T Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 3 44390444 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44392450 T A Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 44393491 C A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 44394598 G A N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 3 44394703 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 44396393 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 44396491 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 44396503 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44396867 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 44397324 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44397379 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44397913 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 44398262 A T N N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 3 44398371 C A Y N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 44398567 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 44398963 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 44399043 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 44399052 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 44399196 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 3 44399313 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44399432 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44399445 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44399479 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44399511 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44399515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44399567 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44399642 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 44399661 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44399678 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 44399685 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 3 44399777 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44399786 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 44399858 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 44399870 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 44400018 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44400044 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44400104 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44400289 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44400360 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44400367 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.263157894736842 0.0526315789473684 0.684210526315789 11 27 5 1 13 3 44400659 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44400719 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44400752 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44400763 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44400837 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44400886 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44400985 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 44400986 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44401024 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44401032 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44401448 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 44401468 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 44401474 A C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 44401483 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 44401558 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 44401589 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.222222222222222 0.0555555555555556 0.722222222222222 9 27 4 1 13 3 44401609 T G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.235294117647059 0 0.764705882352941 8 26 4 0 13 3 44401761 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 44401830 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 44401867 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 44401963 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 44402122 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44402290 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 44402312 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44402438 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44402486 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 44402487 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 44402528 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.294117647058824 0.117647058823529 0.588235294117647 12 22 5 2 10 3 44402532 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 44402568 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44402663 T G N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.307692307692308 0.0769230769230769 0.615384615384615 9 17 4 1 8 3 44402733 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 44402797 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44402826 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44402857 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 44402866 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 44402934 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44402942 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44403005 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44403100 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44403121 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44403174 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44403202 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44403214 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44403226 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44403269 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44403316 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44403493 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 44403628 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44403650 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 44403777 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44404090 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 44404136 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 44404146 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44404157 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 44404201 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44404259 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44404266 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44404393 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44404442 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 44404461 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 44404503 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 44404506 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 44404524 T G N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.466666666666667 0.133333333333333 0.4 16 14 7 2 6 3 44404550 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 44404584 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 44404622 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 44404654 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44404661 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44404674 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 44404711 G C Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 44404739 G T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 44404752 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 44404766 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 44404777 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 44404810 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44404818 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44404823 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44404831 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44404863 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44404894 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44404922 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44404932 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44404933 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44405014 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 44405076 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44405095 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44405206 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44405219 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 44405247 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 44405274 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 44405359 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44405371 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44405375 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44405425 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44405432 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44405510 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44405557 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44405588 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44405615 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44405682 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44405722 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44405776 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44405794 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44405821 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44405839 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44405843 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44405851 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44405876 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44405883 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44405938 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44405954 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44406239 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44406279 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44406305 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44406401 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 44406422 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44406506 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44406549 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44406572 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44406580 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44406776 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44406777 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44406787 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44406794 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 44406836 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44406889 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 44406893 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44406920 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44406931 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44406971 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44407289 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 44407383 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 44407459 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 44407515 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 44407619 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44407794 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44408592 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 44408597 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 3 44408834 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 44408835 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 44408919 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 44408964 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 44409071 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 44409205 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 44409226 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 44409315 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 44409328 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 44409336 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 44409366 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 44409586 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 44409617 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44409620 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 44409640 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 44409649 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44409666 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 44409728 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 44409784 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 44409863 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 44409894 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 44409900 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 44409907 C A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 44409935 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 44409941 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 44409979 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 44410009 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 44410072 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 44410079 T A Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 44410293 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44410297 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 44410358 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44410399 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 44410407 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 44410563 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44410599 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44410606 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 44410611 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 44410765 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 44410793 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44410794 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 44410832 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44410833 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44410906 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44410911 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 44410942 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44411025 T C Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 44411049 C A Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 44411073 G T N N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.636363636363636 0 0.363636363636364 14 8 7 0 4 3 44411118 T A N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 44411202 C T N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 3 44411429 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 44411491 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 3 44411792 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 44411878 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 44412050 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 44412116 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44412117 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44412160 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 44412185 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 44412229 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 44412309 C T Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 44412314 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 44412584 G A N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 44412644 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 44412772 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44412789 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44412818 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44412854 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44412857 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44413043 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 44413094 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 44413152 T G N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 44413221 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 44413243 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 44413369 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44413405 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 44413416 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 44413422 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44413660 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 44413681 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 44413699 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 44413710 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44413757 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44413759 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44413783 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44413785 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44413821 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44413891 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 44413940 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44413999 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44414002 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44414031 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 44414105 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 44414154 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44414174 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44414180 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44414203 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 44414291 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44414302 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 44414431 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 44414554 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44414566 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44414610 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44414618 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44414875 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 44415196 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44415243 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44415248 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44415298 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44415327 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44415330 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44415343 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 44415383 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44415410 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44415450 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44415487 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44415494 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 44415538 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 44415657 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 44415749 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44416145 T C N Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 3 44416201 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 44416262 T G N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 44416279 G T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 44416292 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 44416388 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44416445 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 44416493 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44416494 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44416572 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44416644 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44416692 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 44416710 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44416739 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 44416745 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44416914 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44416944 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44417098 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 44417206 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44417242 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 44417271 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44417310 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44417365 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 44417391 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44417410 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44417411 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44417466 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44417489 A G Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 44417717 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44417786 A C Y N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 44417909 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 44419843 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44420133 C G Y N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 44420271 T A Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 44420391 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 44420575 T A Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 44420713 A T Y N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 44420787 G A N Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.5 0 0.5 4 4 2 0 2 3 44420940 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 44420945 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 44420953 T G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 44420978 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 44421004 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44421014 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 44421200 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 44421244 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44421327 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44421345 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 44421347 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44421366 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44421523 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 44421583 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 44421722 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44421791 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 44421831 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44421841 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 44421843 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44421930 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44421968 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44421981 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44422015 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44422065 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44422121 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44422153 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44422203 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 44422220 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44422344 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44422452 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44422488 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44422507 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44422511 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44422518 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44422547 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44422836 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44422894 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44422896 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44422938 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44422980 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44422982 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 44423106 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 44423130 A C N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 44423134 A C N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 44423145 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 44423147 C G N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 44423281 C G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 44423302 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44423308 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 44423323 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44423395 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 44423424 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44423453 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44423478 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44423559 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44423587 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 44423605 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44423647 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44423676 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44423742 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44423786 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 44423821 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44423826 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44423867 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44423881 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44423886 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44423897 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44423901 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 44424015 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 44424037 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44424066 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44424087 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44424143 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44424298 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 44424358 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 44424401 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44424523 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44424713 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 44424754 T A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 44424757 C T N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 44424823 C G N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 44424887 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 44424899 T C N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 44424914 A T N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 44425089 C A N N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 3 44425119 A G N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 3 44425246 A G N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 44425257 T C N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 44425272 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 44425346 T G N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 44425358 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 44425388 G C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 44425433 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44425457 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44425472 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44425523 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 44425546 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44425556 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 44425621 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 44425628 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 44425712 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44425729 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44425781 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 44425782 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 44425809 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44425879 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44425883 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44425927 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44425935 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44425975 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44425986 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44425998 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 44426017 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 44426041 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 44426117 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44426124 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44426133 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44426153 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 44426161 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44426190 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 44426203 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 44426216 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 44426221 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 44426255 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44426319 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 44426325 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 44426381 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 44426389 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44426417 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44432993 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 44432998 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 44433033 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 44433631 G A N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 44433641 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 44433646 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 44433657 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 44433703 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 44433756 G T N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 44433806 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 44433812 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 44433837 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 44433856 A T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 44433906 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44433917 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44433971 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 44433973 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 44434022 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44434034 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 44434104 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 44434105 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 44434154 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 44434164 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44434278 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44434287 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 44434293 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 44434303 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44434313 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 44434319 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 44434437 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 44434461 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 44434519 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44434577 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 44434599 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 44435040 A G Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 44435208 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 44435215 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 44435392 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44435457 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 44435494 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 44435612 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 44435804 G T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 44435852 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 44435864 T G N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 44435866 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 44435983 G C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 44436079 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 44436130 A T N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 3 44436171 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 44436204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44436218 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 44436283 T G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44436398 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 44436408 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 44436477 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 44436556 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 44436579 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 44436744 G T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 44436771 C G Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 44436800 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 44436825 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 44436957 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44437220 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 44437407 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 44437569 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 44437617 G T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.25 0.0625 0.6875 9 23 4 1 11 3 44437648 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44437721 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 44437823 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 44437857 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 44437859 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 44438096 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44438209 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 44438299 G T N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 3 44438421 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 44438440 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 44438459 G T N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 44438507 A T N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 3 44438629 G C N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.285714285714286 19 9 9 1 4 3 44438630 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 44438911 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 3 44438972 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 3 44439016 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 44439255 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 44439313 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 44439320 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44439351 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 44439353 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 44439405 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 44439414 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 44439430 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44439507 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 26 14 12 2 6 3 44439589 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 44439614 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 44439764 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 44439967 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44440133 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 44440200 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44440222 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 44440319 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 44440337 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 44440487 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 44440574 T C N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.538461538461538 0.153846153846154 0.307692307692308 16 10 7 2 4 3 44441065 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 44441074 C T N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.571428571428571 0.0714285714285714 0.357142857142857 17 11 8 1 5 3 44441306 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.277777777777778 25 11 12 1 5 3 44441453 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 44441515 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 44441581 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 44441596 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 44441638 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 44441783 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 44441830 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.235294117647059 0.117647058823529 0.647058823529412 10 24 4 2 11 3 44441926 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44442051 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44442052 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 44442199 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 44442231 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44442442 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 44443510 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44443548 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44443670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44443813 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44443911 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44444047 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 44444377 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 3 44444582 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44444703 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 44446181 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44446269 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44446353 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44447892 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44447915 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44447954 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 44448114 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44448148 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 44448215 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 44448308 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 44448309 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 44448429 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 44448512 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44448791 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 44449546 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 44457294 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44457337 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 44457519 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 44457610 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 44457747 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 44457759 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 44457990 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44458022 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44458039 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44458065 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44458136 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44458148 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44458343 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44458344 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 44458532 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44458575 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44458616 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44458794 G C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44458816 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 44458835 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44458980 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44459100 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 44459115 C T Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 44459121 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 44459369 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44459411 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44459475 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44459521 C G Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 44459527 A C Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 44459695 G A Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 44460314 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44460407 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44460434 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44460528 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44460701 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 44460743 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 44460880 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44460917 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 44461554 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44461731 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44461851 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44462820 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44462879 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44462997 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44463020 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44463151 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44463307 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 44463322 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44463408 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 44463443 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 44463537 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44463553 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44463997 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 44464084 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 44464151 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44464206 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44464574 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44464827 T G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 44465041 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44465093 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 44465152 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44465179 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44465288 G T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 44465330 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44465473 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44465532 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 44465572 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44465625 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44465715 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44465742 G C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44466253 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44466342 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44466356 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 44466375 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44466430 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44466471 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 44466709 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 44467020 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 44467224 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44467259 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 44467402 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44467555 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44467679 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 44467699 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44467839 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44467891 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 44467913 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44468040 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44468248 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 44468277 T G Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 44468544 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44468552 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44468558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44468669 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44468682 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44468746 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44468767 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44469074 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44469277 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44469326 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44469329 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 44469594 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44476420 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44476499 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44476573 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44476689 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44476727 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44476752 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 44476790 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44476927 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44476951 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44477024 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44477380 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 44477437 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44477446 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44477489 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 44477532 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44477601 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44477708 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 44477742 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44477757 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 44477761 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44477879 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44477927 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44477964 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44477965 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44477983 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44477985 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 44478019 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44478076 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44478178 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44478250 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44478276 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44478290 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44478299 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44478309 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44478321 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 44478329 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44478333 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44478414 G A Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 44478419 C A Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 44478429 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 44478535 T A Y N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 44478750 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44478774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44478838 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44478854 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44478864 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44478910 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44478941 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44478953 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44478968 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44478975 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44478980 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44478988 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44479054 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44479082 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44479096 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44479187 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44479212 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44479214 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44479242 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 44479267 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 44479298 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44479396 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 44479422 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 44479437 C T Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 44479438 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 44479459 T G N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 44479514 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 44479579 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 44479650 C G Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 44479671 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 44479680 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44479686 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44479692 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 44479755 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44479829 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 44479832 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 44479851 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44479863 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44479870 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 44479875 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44479888 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 44479921 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 44479974 G T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 44479980 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 44480006 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44480014 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44480054 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 44480083 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 44480087 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44480118 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 44480186 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 44480218 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44480227 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44480229 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44480240 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44480263 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44480313 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44480338 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44480364 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44480379 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44480386 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44480425 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44480483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44480515 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44480521 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44480604 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44480648 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44480671 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44480704 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 44480789 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44480846 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 44480925 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 44480927 T G N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 44480955 A G N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 44481049 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 44481068 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 44481189 C A Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 44481205 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 44481231 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 44481250 A C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 44481258 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 44481338 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44481387 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44481447 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44481481 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44481532 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44481563 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44481564 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44481679 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44481749 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44481768 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44481779 C G Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 44481803 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 44481859 T G N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 44481913 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 44481939 T G Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 44482134 T G N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 44482144 T C N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 44482151 A G Y Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 44482249 T G Y N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 44482353 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 44482434 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 44483850 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 44484040 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44484057 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 44484401 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 44484863 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44484890 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44484977 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44485102 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44485128 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44485188 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44485190 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44485272 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44485279 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44485317 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 44485362 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 44485424 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 44485479 T A N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 44485547 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 44485548 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 44485562 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 44485622 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 44485686 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44485700 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44485773 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44485864 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 44485911 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44485933 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 44485954 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44485966 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44486037 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44486053 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44486078 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44486140 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44486184 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44486254 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44486272 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44486328 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44486374 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44486421 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 44486429 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44486456 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44486491 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44486493 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44486505 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44486509 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44486558 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44486639 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 44486650 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 44486678 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44486699 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44486711 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44486720 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44486755 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44486759 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44486826 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 44486894 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 44487356 A C Y N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 3 44487383 G A Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 44487802 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 44487847 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44487919 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44487924 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44487949 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44488026 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44488089 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44488149 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44488251 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44488258 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44488270 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 44488378 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44488411 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44488415 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44488434 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44488465 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44488511 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44488597 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44488701 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44488702 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44488731 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44488752 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44488818 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44488823 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 44488842 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 44488861 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44488882 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44488905 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 44488914 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44488955 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44488992 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44489050 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44489106 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44489193 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44489210 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44489251 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44489304 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 44489305 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 44489452 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44489459 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44489529 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44489549 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 44489619 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 44489841 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44489876 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44489936 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44489946 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44489996 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44490186 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44490237 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44490238 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44490311 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44490434 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44490456 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44490533 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 44490554 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44490557 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44490631 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 44490659 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 44490865 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44490978 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44491009 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 44491077 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 44491111 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 44491113 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 44491226 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 44491263 T G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 44491337 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 44491398 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44491404 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 44491469 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44491530 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44491541 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 44492029 G T Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 44492075 T A Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 44492143 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 44492187 A C Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 44492241 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44492277 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44492513 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44492623 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 44492830 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44492963 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 44493006 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 44493438 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 44493537 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 44493601 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44494069 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 44494124 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44494690 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 44494767 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 44494877 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44495431 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44495679 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44496278 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44496358 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 44496817 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44496889 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44496927 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 44497526 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44497625 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 44497973 G A N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.545454545454545 0.272727272727273 0.181818181818182 15 7 6 3 2 3 44497994 A G N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.636363636363636 0.181818181818182 0.181818181818182 16 6 7 2 2 3 44498039 T C N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 44498131 A T N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 44498279 G A N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 44498304 C T N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 3 44498368 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 44498451 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 44499025 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 44499064 G T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 44499066 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 44499106 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 44499154 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 44499170 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44499181 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 44499211 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 44499220 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 44499259 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 44499284 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 44499296 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 44499297 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 44499329 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 44499479 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 44499480 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 44499537 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 44499538 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44499582 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 44499710 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 44499825 C T N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 44499996 G A N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 44500079 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 44500082 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 44500160 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 44500174 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 44500191 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 44500256 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 44500273 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 44500314 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 44500349 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 44500362 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 44500377 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 44500469 T A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 44500485 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 44500490 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 44500514 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44500527 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44500562 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 44500583 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 44500593 C A N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 44500973 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44501030 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44501125 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 44501157 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44501198 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44501578 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44501635 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 44501787 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 44501798 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 44501865 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44501973 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44502048 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 44502067 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44502104 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 44502117 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 44502127 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 44502254 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 44502301 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 44502321 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 44502322 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 44502347 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44502420 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44502431 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 44502444 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 44502456 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 44502457 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 44502504 C T N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 44502593 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 44502922 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 44502938 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 44502983 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44503011 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 44503013 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 44503043 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44503235 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 44503251 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 44503260 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 44503370 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 44503476 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44503507 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 44503520 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 44503599 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44503694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44503711 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44503817 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 44503859 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 44503923 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44503961 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44504075 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44504081 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44504168 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44504306 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44504531 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44504678 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 44504853 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 44504971 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44504977 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 44504994 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 44505144 A T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 44505202 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44505343 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44505350 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 44505368 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44505409 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44505460 C A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 44505470 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 44505491 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 44505534 T G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 44505566 A C N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 44505577 G A N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 44505613 A T N N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 44505681 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 44505705 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 44505721 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 44505826 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 44505833 T G N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 44505913 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 44505944 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 44506200 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 44506265 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44506498 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44506605 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44507011 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 44507402 A T N N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 44507689 G C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 44507733 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 44507740 G T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 44507912 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44508479 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 44508611 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 44508663 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44508677 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 44509134 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44509177 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 44509246 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 44509599 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 44509865 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44509913 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44510657 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44511032 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 44511074 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44511121 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44511308 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 44511523 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 44511949 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 44512669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44512723 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44512776 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44513303 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 44513477 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44513645 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 44514152 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 44514489 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44514802 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 44514855 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44514923 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 44515348 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44515460 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44515627 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 44515769 A C Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 44516399 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44516728 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 44517160 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44517222 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 44517393 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 44517566 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44517975 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44518458 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 44518559 T A N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 44519105 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 44519317 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44519809 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44519993 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 44520155 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 44520191 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44520195 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44520222 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44520243 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44520533 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 44520659 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44520686 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44521082 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44521285 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44521462 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44521564 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44521712 T A N N 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.1 0.9 0 11 9 1 9 0 3 44521858 A C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 44521860 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 44521905 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44521968 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 44522031 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44522092 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 44522142 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44522460 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 44522610 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44522780 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44524103 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44524497 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44524513 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44524573 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44524598 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44524619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44524666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44524667 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44524772 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44524815 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44524857 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44524917 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44525146 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44525320 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44525476 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 44525778 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 44525804 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44525897 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44525990 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44526055 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 44526191 G C Y N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 44526320 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 44526469 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 44526821 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 44526830 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 44526859 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 44527177 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44527209 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44527538 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44527626 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 44528224 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44528288 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44528331 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44528361 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44528390 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 44528738 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 44528810 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 44528849 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44528970 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 44528992 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 44529623 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44529807 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 44529968 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 44530008 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44530246 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44530411 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 44530470 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44530533 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44530562 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44531111 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44531264 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44531270 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 44531394 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44531649 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44531773 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44531821 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 44531856 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44531962 G A N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 44531981 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 44532011 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 44532324 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 44532735 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44532786 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44533445 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44533493 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 44533675 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44533753 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44534280 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44534467 C T N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 44534529 T G N N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 44534713 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 44534990 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44535050 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 44535468 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44535663 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 44535886 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 44536221 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 44536254 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44536771 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44536836 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44536892 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44537036 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44537074 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 44537185 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44537202 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44537301 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44537412 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44537791 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44537835 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44537849 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44537907 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 44538051 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 44538058 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44538299 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44538410 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 44538575 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44538631 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44539016 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44539207 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 44539609 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 44539962 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44540410 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 44542294 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44542465 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44542606 G T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 44543786 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44546868 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44547065 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 44547079 G A Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 44549395 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44549448 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44549961 A T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 44550205 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44550947 T C Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 44552790 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44553813 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44554064 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44554083 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 44554864 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 44554935 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44555362 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44555575 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44556448 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44557053 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 44557738 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44557912 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44559441 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44560338 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 44560962 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44561690 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44562256 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 44562494 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44562612 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 44563420 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44563637 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44563694 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44563751 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44564839 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 44565080 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44565492 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44567516 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44567738 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 44570293 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 44570652 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44570880 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44571002 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44572702 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44572843 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44575327 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44575542 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 44575652 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44575949 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44577602 G T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 44577682 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44577779 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 44578984 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44578998 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44579064 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44579420 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44580043 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44580323 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44580855 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44581335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44581815 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44582203 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44583565 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 44584395 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44584684 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44584970 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44585291 A T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 44586546 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 44586738 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 44587341 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 44587662 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44588243 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44588283 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44588306 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44588446 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44588660 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44589323 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44589420 G T Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 44590235 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44591043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44591091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44592340 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44592735 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 44593010 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44593027 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44593055 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44593682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44594754 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44594836 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44595118 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 44595206 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 44595691 A G Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 44595723 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 44596033 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44596478 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 44596879 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 44596997 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44598219 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44598255 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44598359 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 44598456 A G Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 44598954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44600162 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44600229 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44602251 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 44603287 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44603610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44604561 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44604677 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44605104 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 44605721 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 44606570 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44607329 G A Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 44607518 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 44607799 G T Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 44608118 T C Y Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 3 44608147 C G Y N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 3 44608162 G C Y N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 3 44609424 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 44609553 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44610097 G T Y N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 3 44610207 T C Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 44610242 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 44610505 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44611185 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 44611878 G T Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 44612495 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44613191 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44613863 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 44614555 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44614830 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44615352 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44615796 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44615934 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44616810 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 44617143 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 44617595 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 44617711 T C N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 3 44619156 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 44619697 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44619996 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 44620331 C T N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 44621501 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 44622633 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44623412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44623655 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44623721 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44623882 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44624165 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44624244 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44624712 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44625385 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44625408 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 44625754 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44627478 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44628362 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44628669 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 44629619 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44629750 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44630325 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44630418 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44630445 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44630511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44631980 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44632166 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44632560 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44633410 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44633419 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44634103 A G N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 3 44634152 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44635227 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44635643 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44636210 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 44636540 C A N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 44636617 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 44636667 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 44636732 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 44637291 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44637444 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44637815 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 44638501 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44638776 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44639537 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 44639806 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 44640928 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 44641242 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44641411 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44641950 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44643248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44643771 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44643777 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44643899 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 44643985 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44645134 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44645195 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 44645415 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44645428 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44645944 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 44646484 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 44646719 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44646966 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44647190 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44648248 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44648277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44648956 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 44649063 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44649205 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44650007 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44650033 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44650434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44650732 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44650941 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44651371 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44651496 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 44651735 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44652001 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44652326 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44652392 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 44652664 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 44652808 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44652888 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44654092 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44654463 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44654969 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44655107 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44655618 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44655831 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44656766 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44657023 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44657287 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44657294 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44657496 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44657506 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 44658232 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44658834 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44658957 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44659099 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44659956 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44661174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44661290 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 44661372 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 44668137 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44668397 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 44668557 C T N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 44668592 A T N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 44668875 G T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 44669076 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 44669765 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 44670344 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44670404 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 44670805 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44671246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44671784 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44672364 T C N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 44674152 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 44674222 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44674369 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44674371 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44674774 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 44675218 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44675232 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 44675504 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44675534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44675673 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 44675717 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 44675733 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 44676064 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44676128 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 44676156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44677241 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 44677249 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44678333 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44678416 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44678688 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 44678926 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44678976 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44680126 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 44680883 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44681551 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 44681568 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 44681653 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44682207 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44682239 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44682430 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44683419 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44683543 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44683947 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 44684594 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44684668 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44684926 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44685196 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 44686177 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44686230 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44686696 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 44687459 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44687460 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44687731 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44694890 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 44695005 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 44695025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44695376 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 44695429 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44695497 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 44696105 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44696401 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 44696484 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 44696925 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 44697150 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44697405 T G N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 44697525 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 44697559 T C N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 44697812 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 44697982 A G N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 44698152 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44698172 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44698323 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44698333 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44698347 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44698374 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44698409 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44698453 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44698521 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44698586 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44698675 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44698767 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 44698787 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 44698791 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44698805 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 44698831 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44698926 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44699017 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44699035 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44699114 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44699139 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44699264 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44699375 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44699389 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 44706022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44706092 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44706123 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44706125 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44706154 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44706188 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44706198 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 44706351 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44706516 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44706553 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 44706582 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 44706589 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 44706623 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44706645 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 44706651 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44706697 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44706711 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44706762 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44706875 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 44707070 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44707101 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44707128 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 44707141 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44707153 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44707156 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 44707226 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44707239 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44707292 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44707500 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44707541 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44707656 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44707672 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44707682 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44707694 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44707702 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44707730 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44707761 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44707833 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 44707899 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44707909 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44707924 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44707930 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44707950 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44707988 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44708004 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 44708043 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44708200 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 44708217 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44708253 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44708319 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44708363 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44708395 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44708586 C A N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 44708603 T C N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 44708639 T C N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 44708758 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 44708836 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44708913 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44708914 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44708945 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44708982 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44709023 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 44709040 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44709133 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 44709172 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44709385 A G N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 44709557 T G N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 3 44709603 A C N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 44709714 T C N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 44709797 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 44709826 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 44709832 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 44709852 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 44709946 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 44709969 A G N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 44710041 A C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 44710177 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44710308 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 44710404 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44710469 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44710473 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44710541 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44710746 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44710800 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44711435 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44711701 T A Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 44712171 G T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 44712259 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44712298 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44712303 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44712365 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44712373 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44712407 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44712423 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44712439 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44712441 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44712460 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44712929 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44713019 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44713063 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44713064 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44713095 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 44713100 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44713319 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 44713337 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44713421 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 44713449 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44713464 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44713549 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44713561 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44713733 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44713773 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44713889 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 44714003 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 44714017 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 44714066 A C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 44714078 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 44714128 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44714216 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 44714275 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 44714349 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44714388 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 44714424 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 44714646 T C N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 44714747 G A N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 44715014 T C N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 3 44715071 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 44715200 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44715230 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44715300 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 44715481 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 44715482 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44715961 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44715997 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 44716001 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 44716067 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44716082 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44716375 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 44716478 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 44716485 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 44716514 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44716593 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 44716835 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 44716862 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 44716923 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44716982 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44716994 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 44717223 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44717263 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 44717337 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44717543 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 44717544 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 44717949 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 44718003 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44718450 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 44718612 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 44719656 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 44719763 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 44719808 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 44719809 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 44719882 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 44720005 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 44720060 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 44720066 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 44720086 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44720376 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44720385 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44720397 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44720823 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44720837 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44721064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44721259 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44721269 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44721285 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44721365 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 44721367 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44721381 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 44721388 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44721407 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 44721408 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 44721420 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 44721421 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 44721434 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 44721462 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 44721539 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44721549 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44721563 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 44721569 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 44721652 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44721834 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44722270 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 44722305 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 44722336 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 44722373 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 44724016 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44724966 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44725040 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 44725677 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44725789 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44725873 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44726418 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 44728176 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44728640 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 44729427 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44729492 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44729652 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 44729712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44729782 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 44729990 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 44730144 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 44730382 C A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 44730749 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44731168 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44731389 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44731391 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44731666 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 44732082 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 44732119 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 44732211 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44732309 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 44732509 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44732833 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 44732964 T G Y N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 44732976 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44733412 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44733702 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44733705 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44733852 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44734015 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44734153 T A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 44734378 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 44734439 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44734962 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44735313 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44735332 T A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44735626 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 44735631 A G Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 44735639 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44735651 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44735955 G C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44736476 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44738316 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44738486 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44739005 C T Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 44739210 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 44739327 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 44740200 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 44740218 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 44740255 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 44740468 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 44740839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44741083 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 44741174 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 44741423 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 44741761 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44741825 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44743417 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 44744094 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44744663 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44745539 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 44745863 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 44745948 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44746075 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 44746527 G T Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 44746621 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44746637 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 44746731 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44746797 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44746867 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44747315 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44747453 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44747462 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44747465 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44747883 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 44747983 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 44748027 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 44748118 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44748238 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 44748447 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44748490 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44748491 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44748558 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44748623 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44748666 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 44748698 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44748710 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44748807 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44749006 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44749018 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 44749070 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44749223 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 44749306 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44749312 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44749381 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 44749418 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 44749677 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 44749753 A T N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 44749788 G A N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 44749913 C G N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 44749969 C G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 44749990 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 44750038 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44750143 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44750205 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 44750297 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44750319 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44750489 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44750623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44750646 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44750853 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44751590 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 44751846 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 44751894 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 44752330 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44752350 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44752394 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44752410 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 44752436 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 44752720 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44752965 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44753079 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44753128 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44753482 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 44753500 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44753730 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44753854 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44753855 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44754025 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44754035 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44754064 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 44754274 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 44754310 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 44754386 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44754773 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 44754789 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 44754801 T A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 44754889 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 44755704 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44756823 G A Y Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 44757524 T A Y N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 44757644 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44757761 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44758361 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44758416 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44759611 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 44760469 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 44760543 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 44761464 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44761554 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 44761858 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44762202 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 44762339 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44762473 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44762816 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44762966 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 44763039 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 44763105 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44763424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44763647 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44763838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44763969 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44764010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44764195 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44764923 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44765078 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44765257 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44765417 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 44765500 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 44765525 C G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 44765662 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 44765904 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 44765975 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44766021 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 44766921 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 44767254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44767418 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 44767634 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44768015 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44768300 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44768608 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 44768685 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44768694 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44768822 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44769155 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 44770512 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 44770989 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 44771176 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44771693 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 44771784 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 44771826 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 44772062 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44772106 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 44772160 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 44772197 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 44772563 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44772823 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 44772973 A T Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 44772998 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 44773045 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 44773102 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 44773203 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 44773238 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 44773289 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 44773336 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 44773402 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44773505 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 44773701 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 44773703 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 44773810 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 44773964 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 44773987 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 44774036 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 44774261 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 44774334 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 44774448 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 44774485 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 44774614 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 44774697 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44774821 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 44775337 A T N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 44775554 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44775564 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44775929 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44776078 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44776700 A T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 44777362 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44777708 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44777735 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 44777762 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44777773 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 44777823 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44778012 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 44778054 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 44778388 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 44778530 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44778931 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44779153 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44779286 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44779373 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44779535 A T N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 44779675 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 44779925 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 44780248 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44780526 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 44780830 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44780851 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 44780946 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 44781284 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44781310 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 44781311 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 44781327 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44781346 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44781375 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44781454 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44781484 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44781494 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44781495 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 44781534 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44781621 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 44781746 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 44781747 T G N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 44781772 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 44781847 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 44782006 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44782098 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 44782141 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 44782142 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 44782152 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 44782271 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 44782316 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 44782341 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 44782381 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 44782392 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 44782469 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 44782503 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 44782525 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 44782540 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 44782619 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 44782636 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44782720 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 44782769 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 44782790 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44782814 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44782842 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 44782908 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44782968 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44783044 G C N N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 3 44783133 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 44783189 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44783193 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44783288 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44783343 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44783411 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44783447 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44783452 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44783618 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 44783646 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 44783667 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 44783837 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44784002 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44784056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44784335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44784348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44784474 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44784484 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44784548 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44784586 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44784633 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44784665 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44784782 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 44784822 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 44784866 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 44785055 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44785128 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 44785137 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 44785337 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 44785426 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 44785461 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44785607 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44785631 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 44785700 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44785750 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 44785886 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 44785920 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 44785987 T A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 44786084 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44786184 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44786410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44786480 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44786517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44786558 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44786584 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44786670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44786686 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44786729 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44786750 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44786844 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 44786982 C G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 44787183 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 44787259 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44787277 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 44787328 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44787333 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44787517 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44787565 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44787572 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 44787584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44787597 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 44787646 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44787691 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44787733 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44787734 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44787833 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 44787852 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44788039 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44788240 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44788345 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44788501 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44788540 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44788607 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44788622 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44788629 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44788678 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44788829 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44788931 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44788942 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44788980 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44789020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44789021 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44789055 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44789094 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44789120 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44789137 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44789160 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44789164 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44789180 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44789185 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44789222 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44789252 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44789296 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44789304 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44789355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44789371 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44789475 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44789500 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44789507 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44789592 C A N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 44789653 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 44789689 G A N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 3 44790330 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44790433 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44790452 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44790547 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44790577 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 44790586 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44790592 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44790713 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44790748 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44790995 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44791002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44791193 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44791253 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44791375 C A N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 44791484 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 44791581 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44791643 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 44791908 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 44791981 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 44792107 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44792206 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44792291 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 44792362 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 44792365 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 44792577 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 44792651 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 44792657 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 44792719 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 44792740 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44792755 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 44792756 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 44792769 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 44792770 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 44792788 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 44792791 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44792811 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 44792997 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44793190 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 44793215 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 44793242 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 44793308 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 44793316 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44793355 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 44793360 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44793385 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44793447 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 44793553 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 44793587 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 44793670 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44793739 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44793755 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44793907 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 44793921 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 44793935 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 44793955 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 44794072 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44794210 C G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 44794352 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 44794358 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 44794365 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 44794403 G T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 44794429 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 44794450 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44794470 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44794506 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 44794541 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 44794575 T A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 44794629 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 44794630 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44794655 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 44794748 A C N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 44794784 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 44794905 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 44796166 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44796256 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44796266 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 44796344 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44796494 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44796623 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44796830 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 44796883 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44796919 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44796986 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44797020 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44797141 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 44797231 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44797240 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44797279 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44797334 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44797340 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44797352 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 44797378 G T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 44797433 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 44797436 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 44797478 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 44797525 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44797538 G C N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 44797595 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 44797681 T C Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 44797874 C T N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 3 44797878 T G N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 16 12 2 12 0 3 44797887 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44797949 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44797991 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44797995 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44798015 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44798093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44798118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44798130 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44798164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44798188 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44798297 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44798394 T C N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 3 44798409 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 44798493 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 3 44798505 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 44798528 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 44798553 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44798581 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 44798711 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44798788 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44798906 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44798966 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44799090 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44799110 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44799183 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44799197 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44799254 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44799312 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44799344 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44799485 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44799506 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44799523 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44799533 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44799554 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44799598 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 44799604 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 44799845 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44799914 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 44799918 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 44799935 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44799941 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44800109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44800112 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44800155 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44800255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44800298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44800346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44800382 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44800429 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44800710 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44800770 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44800789 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 44801558 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44801613 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 44801623 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 44801651 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 44801770 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44801775 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44801826 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 44801960 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44801980 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44801981 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 44802028 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 44802063 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 44802121 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 44802128 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 44802143 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 44802183 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 44802208 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44802218 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 44802223 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 44802232 C G Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 44802234 T A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44802243 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 44802315 G C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 44802334 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 44802493 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44802509 A T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 44803004 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44803013 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44804374 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 44804495 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 44804555 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44804618 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44804659 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44804694 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44804721 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44804854 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44804863 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44804903 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44804954 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44805008 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44805381 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44805396 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44805525 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44805539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44805641 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44805665 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44805778 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44805804 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44805843 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44805898 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44806166 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 44806272 G T Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 44806340 G T Y N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 44806440 A G N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 44806486 G T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 44806629 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44806656 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44806660 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 44806672 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44806747 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44806764 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44806923 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44807083 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44807123 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44807170 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44807290 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44807375 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 44807387 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44807437 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44807490 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44807501 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 44807671 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44807676 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44808022 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44808049 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 44808087 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44808174 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44808235 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44808270 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 44808305 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 44808374 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44808392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44808556 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44808571 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44808614 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 44808643 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 44808737 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44809145 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44809195 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44809218 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 44809712 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44809743 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44809979 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44810868 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44810872 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 44810916 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44811139 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44811857 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 44811994 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44812272 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44812379 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 44812559 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44812709 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44813294 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 44813410 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 44813457 A G Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 3 44813610 A G Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 3 44813616 A G Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 44813672 G A Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 44813965 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44814198 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44814207 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44814317 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44814850 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44815047 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 44815145 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44815266 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44815463 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44815529 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44815535 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44815695 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44815699 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44815801 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44815870 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44815963 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44816245 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44816246 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44816352 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44816486 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44816506 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44816595 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 44816806 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44817020 T G Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 44817021 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44817178 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44817244 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44817353 T G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44817386 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44817592 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 44817608 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44817668 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44817866 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44817928 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44817989 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44818158 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44818439 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 44818578 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44818660 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44818916 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44819056 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44819150 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44819251 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44819483 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44819521 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44819540 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44820184 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44820221 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44820372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44820561 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44820583 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44820617 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44820715 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 44820936 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44821490 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44821706 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44821724 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44822199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44822335 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44822401 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 44822441 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 44822490 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 44822597 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 44822853 G A N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 15 13 1 13 0 3 44826330 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 44826415 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44826562 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44826653 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44827179 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 44827257 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44827712 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44827814 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44830093 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44830094 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 44830348 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 44830652 G T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 44830734 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 44830740 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44830811 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44831366 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 44831938 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 44832389 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 44832409 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 44833069 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 44833538 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44833944 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44833987 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 44834051 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 3 44834196 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44834235 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 44834255 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 44834576 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 44834577 G T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 44834592 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 44834630 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 44834713 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 44835342 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44835604 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 44835755 A G N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 44836037 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44836299 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 44836333 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 44836461 T A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 44836489 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44836521 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 44836733 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 44836753 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44836944 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44837001 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44837047 T A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 44837199 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 44837377 T A Y N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 3 44837526 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44838015 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44838099 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44838183 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 44838360 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 44838411 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 44838762 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 44838927 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 44839332 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44839397 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44839652 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44839820 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44839914 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44839948 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44840030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44840115 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44840126 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44840137 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44840365 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44840478 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44840545 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44840686 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 44840823 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 44841019 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44841382 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44841551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44842464 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44842480 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44842562 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44842605 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44842664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44842795 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44842906 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44842941 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44843032 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44843055 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44843109 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44843309 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 44843322 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 44843333 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 44843636 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44843931 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 44844186 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44844221 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44844299 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44844542 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44844665 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44845082 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 44846716 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 44847013 A T N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 44847410 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 44847474 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44847557 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44847646 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44847667 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 44848011 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44848243 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44848813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44848929 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 44849162 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44849199 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44849428 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44849679 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44849701 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44849777 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44849860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44849948 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44850169 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 44850274 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44850413 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44850454 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44850566 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44850895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44851470 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 44851620 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44851797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44851896 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44852121 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44852148 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44852256 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44852618 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 44852670 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 44852763 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44852894 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44852926 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44853004 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44853018 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 44853381 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44853401 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44853474 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 44853800 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44853818 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44853831 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 44853894 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44853909 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44853950 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44853956 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44854053 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44854172 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44854204 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 44854285 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44854401 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 44854406 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 44854464 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 44854557 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44854589 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 44854807 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 44854854 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44854878 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 44855080 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 44855570 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 44855890 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44855961 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44856022 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 44856249 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 44856649 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44856880 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44856928 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44857106 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 44857144 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 44857628 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44857840 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44858020 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 44858369 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44858899 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44858915 A T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 44859161 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44860082 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 44860449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44860467 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44860539 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 44860690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44861462 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44862024 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44862412 C A N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 44863733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44863797 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44869285 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44871251 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 44871538 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44871840 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44873303 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44873982 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44875555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44875646 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44876962 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44877349 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44878016 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44881767 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 44882168 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44882593 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44883002 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 44883017 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 44885007 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44885137 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 44885469 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44885867 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44886561 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 44887826 G C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0 0.722222222222222 0.277777777777778 13 23 0 13 5 3 44887975 T A Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 44889332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44890120 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44890255 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 44891029 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44891828 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 44891979 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 44892328 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44892516 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 44892906 T C N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 44893106 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 44896881 C A Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 44896946 T A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 44897430 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44897803 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 44898291 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44898688 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 44899753 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 44902462 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44902679 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 44903479 T G Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44903744 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44903782 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44904545 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44904810 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 44905662 G T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44905816 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44906284 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 44906348 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44906873 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44906879 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44906920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44908317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44908318 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44909079 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44910474 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44911074 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44911855 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44912167 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44912225 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44912254 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44912461 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44912582 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44912837 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44913034 C A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44913258 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 44913310 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44913621 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44914639 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44914870 T G Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 44915168 A G Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 44916099 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44916128 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 44916745 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44916838 T A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44916859 A T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44916925 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44917275 T C Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 44917739 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44917845 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44918033 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44918180 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 44918181 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44918418 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44918679 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 44918914 A C Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 44919116 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44920540 G T Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 44921380 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 44922175 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44923755 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44923804 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44924326 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44925588 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44927647 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44928190 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44928353 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 44928631 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44929868 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44930801 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44933150 G C Y N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 3 44933160 G C Y N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 3 44933579 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44938630 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 44938687 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 44938947 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44938957 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 44939139 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 44939314 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44939363 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 44939586 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 44940361 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 44940555 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44940690 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44940739 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 44941891 G A N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 44941906 A G N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 44942060 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 44942469 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44942663 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44943284 G C Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 44943841 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 44943898 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 44944037 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44944089 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44944092 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 44944148 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44944738 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44944778 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44945062 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44945240 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44945279 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 44945589 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 44946054 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 44947215 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 44947380 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 44947421 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 44947694 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 44947800 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 44947875 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44948687 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 44948737 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44948983 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 44949044 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 44949213 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44949231 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44949301 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44949327 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44949527 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44949640 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 44949748 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 44951703 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 44951833 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44952051 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 44952097 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 44952293 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44952851 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 44952857 C A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 44953448 C T Y Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 44953519 C T N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 44953617 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 44953782 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 44953971 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 44954566 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 44954670 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 44954730 C A Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 44955170 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 44955206 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44955376 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 44955474 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44955623 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 44955743 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44955975 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 44956233 A C N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 44956801 C G N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 44957357 G C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 44957641 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44957649 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44957660 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44957755 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44957765 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44957825 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 44957845 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44957875 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 44957893 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44958014 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 44958186 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 44965450 A G Y Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.166666666666667 0.0833333333333333 0.75 5 19 2 1 9 3 44965515 G T Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 44965690 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44965713 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 44965766 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 44965886 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 44965923 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44965974 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44966043 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 44966642 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44966758 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 44966804 G A N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 44973142 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 44973615 C A Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 44973860 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44974125 C G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 44974290 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 44974506 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44974664 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44974731 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44974751 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44975135 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44975247 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 44975792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44975872 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44975888 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44976205 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44977364 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44977374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44977572 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44978095 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44978853 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44978905 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44980040 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 44980687 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 44981019 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44981182 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44981399 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44981556 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44981573 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44981776 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 44981952 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 44982257 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 44982341 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 44982583 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44982722 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44982804 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 44982910 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 44982978 T G N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 44983014 G C Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 44983177 T C N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 44983261 C A N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 44983546 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44983569 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 44983646 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 44983723 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44983776 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44983811 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 44983840 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44983973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44984050 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44984172 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44984690 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 44984792 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 44984992 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44985357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44985609 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44985739 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44985813 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 44985869 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44986201 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 44986338 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 44986595 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44987003 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 44987096 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44987124 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44987280 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44987673 G T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 44988042 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44988211 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 44989658 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44989834 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 44989927 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 44990819 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 44991093 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 44991237 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 44991615 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 44991774 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 44991826 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 44992137 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44992406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44992661 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 44992875 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 44993059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44993089 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44993318 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44993378 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44993387 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 44993596 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44993713 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44993765 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 44993792 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 44993818 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44993831 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 44993964 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44993987 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44994019 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 44994032 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44994048 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44994165 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44994247 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44994496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44994562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44994606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44994622 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44994840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44995103 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 44995224 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44995564 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44995699 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44995713 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 44995731 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 44995748 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44995869 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 44996158 T A Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 44996303 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44996314 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 44996492 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44996590 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44996616 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44996681 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44996724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44996741 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44996778 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44996781 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44996858 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44996937 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44996957 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 44996990 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 44997070 G C Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 44997209 T A Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 44997324 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 44997374 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44997516 T G Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 44997586 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 44997847 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 44998007 T A Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 44998020 G T Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 44998080 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44998396 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 44998445 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 44998584 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44998710 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 44998715 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 44998790 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44998810 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44998832 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 44998912 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 44999082 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 44999249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 44999368 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 45000097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45000106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45000168 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 45000233 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45000234 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45000282 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 45000789 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45001338 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45001432 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45001482 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 45001619 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45001944 C G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 45002090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45002691 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 45003142 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45003209 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 45003359 C G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 45003407 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45003913 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45004258 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45004262 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 45004271 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 45004431 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45004629 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45004955 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 45005051 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45005344 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 45005349 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 45005386 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45005614 G T Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 45005697 T C Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 45005959 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 45006035 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 45006083 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45006223 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45006224 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45006273 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 45006318 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 45006323 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45006389 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45006391 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 45006400 T A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 45006419 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 45006427 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45006455 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 45006747 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45006783 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 45007017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45007019 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 45007065 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45007168 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 45007174 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 45007187 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 45007286 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 45008313 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 45008896 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 45008898 G T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 45009069 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45010185 T A Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 45010380 A G Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 45010413 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 45010430 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45010562 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 45010675 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45010706 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45010713 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 45011076 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45011373 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 45011437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45011444 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 45011549 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45011699 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45011902 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45012325 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 45012748 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45012809 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 45013042 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45013164 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 45013379 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 45014084 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45014657 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 45015012 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45015178 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45015217 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45015309 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 45015332 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45015349 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45015360 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 45015486 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45015879 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 45016231 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45017097 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 45017134 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 45017229 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 45017286 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 45017298 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45017304 G T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 45017479 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 45018092 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45018100 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45018142 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45018377 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 45018412 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 45018429 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45018590 T G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 45018664 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45019189 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45019219 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 45019387 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 45019486 T C Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 45019515 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45019663 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 45019961 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45019990 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 45020030 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 45020061 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 45020405 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 45020565 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45021548 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 45021808 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 45022389 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 45022509 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 45022860 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 45022978 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45023078 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 45023213 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 45023231 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 45023239 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 45023489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45024058 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45024093 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45024098 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 45024342 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 45024352 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45024384 C G Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 45024445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45024482 A T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 45025036 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 45025725 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 45025790 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 45025866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45025997 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45026267 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 45026341 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 45026434 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 45026723 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 45027577 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 45028177 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 45028224 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 45028642 G T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 45028720 C A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 45028894 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 45028971 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 45029035 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45029255 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 45029383 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 45029392 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 45029494 T C Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 45029528 C T Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 45030682 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45030686 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45030830 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 45030855 C T Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 45031376 C T Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 45031595 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45031849 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 45031973 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 45031974 G C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 45032030 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 45032087 G T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 45032197 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45032316 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 45032331 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 45032449 A T N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 45032660 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 45032685 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45033073 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 45033228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45033277 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45033778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45033791 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 45033987 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 45036071 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 45036315 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 45036796 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 45036967 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 45037016 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 45037024 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 45037048 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 45037055 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 45037137 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 45037347 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45037376 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 45037474 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 45037576 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 45037648 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 45037686 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 45037687 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 45037737 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 45037798 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 45037890 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 45037913 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 45038216 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 45038252 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 45038359 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45038408 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 45038491 T G N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 45038833 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 45038938 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45039079 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45039129 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45039305 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 45039391 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 45039404 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 45039449 C G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 45039521 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 45039652 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45039721 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45039766 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45040114 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 45040195 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45040368 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 45040656 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 45040837 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45041003 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45041117 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45041163 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45041173 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45041273 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45041477 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 45041553 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45041609 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 45041621 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 45041800 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 45041905 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 45041921 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 45042022 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45042098 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45042214 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45042223 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45042335 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45042685 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 45042701 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45042720 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 45042732 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45042761 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45042795 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45042811 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 45042839 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 45042849 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 45043024 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45043110 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 45043192 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45043203 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45043221 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45043349 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45043450 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45043499 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45043601 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45043709 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45043742 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45043746 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45043939 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45044007 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45044102 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 45044166 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 45044209 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 45044245 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45044247 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45044371 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45044389 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 45044444 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 45044487 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45044540 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45044762 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45044991 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 45045200 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45045567 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 45045693 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45045916 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 45046434 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 45046890 G T N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 45047232 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 45049572 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 45049986 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45050349 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 45053933 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45054995 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 45056115 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 45057135 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45057232 C T N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0 0.75 0.25 9 15 0 9 3 3 45057286 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 45057352 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 45057962 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45058510 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 45058627 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 45058655 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45058719 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 45059072 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45059110 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45059321 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45059493 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45059694 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45059787 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 45060240 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 45061219 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45061413 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 45061492 T G Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 45061531 T G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 45061706 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 45061808 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 45061923 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 45061942 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45062005 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45062021 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45062057 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 45062062 C G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45062097 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45062113 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45062284 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 45062303 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45062328 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 45062379 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45062402 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45062444 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45062527 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45062529 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 45062614 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45062824 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 45062838 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 45062921 C T N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 45063049 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45063073 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 45063092 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45063182 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45063192 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45063251 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45063285 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45063346 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45063370 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45063418 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45063438 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45063520 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45063741 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45063766 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45063906 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45064071 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45064183 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45064240 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45064318 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45064372 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45064439 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45064509 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45064549 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45064661 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45064662 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45064695 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45064759 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45064807 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45065068 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45065095 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45065102 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45072628 A G N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 45072792 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 45073167 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 45073315 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45073339 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45073369 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45073481 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45073513 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45073571 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45073852 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 45074004 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 45074266 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45074461 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45074575 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45074635 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45074678 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45074712 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45074720 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45074797 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45074811 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45074884 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45074885 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45074920 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45074965 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45075073 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 45075119 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45075266 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45075428 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45075466 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45075528 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45075544 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45075881 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 45075998 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 45076063 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45076075 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45076077 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45076132 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45076341 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 45076556 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 45076654 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45077022 G A N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 45077516 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45077577 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 45077725 C G N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 45077932 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 45077935 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 45078066 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 45078254 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 45078708 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45078909 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 45078954 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45079328 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45079349 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45079398 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45079499 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45079574 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 45080311 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 45080696 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45080815 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45081163 A G N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 3 45081347 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 45081441 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45081483 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 45081521 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45081566 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45081705 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45081804 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45081952 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 45082088 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 45082436 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 45082549 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 45082711 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 45082847 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 3 45083469 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45084264 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 45085274 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 45085889 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45086376 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 45086457 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 45086559 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45086577 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45086775 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45086963 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 45087187 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 45088790 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 45089453 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45089876 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 45090201 T G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 45090988 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 45091467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45092154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45092615 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45093409 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45094175 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45096732 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45098366 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 45098551 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 45098766 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45098909 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 45099336 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45099439 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 45099502 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45099767 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 45099803 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 45100159 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45100193 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 45100194 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45100318 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 45100331 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 45100382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45100475 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45100479 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 45100487 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45100724 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 45100803 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 45100824 C T N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 3 45100831 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 45100836 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 45101259 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45101429 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45101589 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 45101637 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45101790 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 45102339 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 45102439 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45102639 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45103286 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 45103292 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 45103324 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 45103399 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.176470588235294 0.0588235294117647 0.764705882352941 7 27 3 1 13 3 45103419 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 3 45103482 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 45103539 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 45103641 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 45103664 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 45103921 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45104079 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 45104178 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 45104217 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 45104226 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 45104234 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 45104287 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 45104395 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 45104454 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 45104609 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45104630 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45105038 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 45105099 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 45105207 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 45105256 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 45105377 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45105905 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 45105986 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45106006 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 45106410 C A N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 3 45106631 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45106818 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45106832 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45106862 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 45106875 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 45107131 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 45107193 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45107241 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 45107638 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 45107678 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 45107902 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 45108045 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 45108199 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 3 45108674 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45108716 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 45108794 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45108866 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45109400 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 45109407 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 45109692 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 45109745 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 45109781 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45110205 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 45110236 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 45110306 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 45110366 A T N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 3 45110714 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 45110949 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45111250 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 45111406 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 45111523 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 45111730 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 45112555 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 45112781 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 3 45113608 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45113956 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45113961 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 45114045 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 45114106 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45114136 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 45114381 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 45114473 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 45114557 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 45115086 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 45115201 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 45115215 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 45115273 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 45115658 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45116277 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 45116393 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 45116496 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 45116591 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 45116663 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45116871 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 45117507 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 45117527 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45117665 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45118252 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 45118382 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 45118778 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45119020 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 45119403 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45119548 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45119713 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45119745 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 45119801 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 45119806 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 45119900 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 45120186 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 45120678 T A N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 3 45120931 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 45121896 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 45121901 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 45121967 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45121986 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 45122006 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 45122038 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 45122181 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45122210 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45122248 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 45122418 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 45122433 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 45122520 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 45122666 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 45122721 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 45122749 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 45122755 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 45122761 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 45122803 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45122907 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 45122951 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 45122977 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 45122993 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 45123120 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45123388 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 45123417 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 45123507 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 45123813 T C Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 45124442 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45124510 A G Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 45125140 A T Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 45125237 A C Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 45125379 T G Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 45125387 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 45125452 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 45125638 G C Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 45125860 T C Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 45125891 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 45126200 C G Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 45126339 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45126662 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45126771 T C Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 45127615 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 45127904 C G N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 4 20 2 0 10 3 45127964 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.133333333333333 0 0.866666666666667 4 26 2 0 13 3 45128265 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45128311 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 45128817 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 45128867 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 45128966 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45129078 T G N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 45129168 A G N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 45129757 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45129809 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45130503 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45131014 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 45131218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45132383 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 45132980 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 45134184 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 45134352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45135907 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45135931 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 45136449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45137006 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45138921 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45140160 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45140896 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45142292 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45143073 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45144278 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 45144804 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 45146349 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45146376 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45147047 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 45147167 C T N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 3 45147331 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45147522 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 45147643 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45147913 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45147989 G T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 45148146 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45148476 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 45149475 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45149531 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 45149626 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45149997 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 45150032 A T N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 45150771 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 45151092 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 45151189 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45151452 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 45151675 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 45151682 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 45151707 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 45151766 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 45151776 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 45151846 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 45151912 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45151954 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 45151984 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45152053 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 45152074 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 45158384 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 45158395 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 45158424 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45158450 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 45158475 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 45158578 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 45158638 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45158789 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 45158824 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45158858 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 45159055 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 45159065 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 45159083 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 45159277 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45159355 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45159377 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 45159412 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 45159423 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 45159441 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 45159919 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 45159962 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 45159976 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 45160012 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 45160118 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45160311 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 45160454 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 45160704 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 45160838 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 45160890 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 45160932 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 45160986 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45161143 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 45161203 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45161269 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45161365 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45161446 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45161637 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45161644 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45161659 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45161901 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45162258 C A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 45162544 A C Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 45162871 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 45163254 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45163630 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45163731 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45164632 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45165662 A C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 45165705 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 45166705 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 45166949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45167899 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45167900 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45167992 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45168013 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45168031 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45168067 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45168103 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45168325 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 45168401 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45168819 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45168860 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45169031 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 45169575 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45169707 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45169843 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45169946 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45169954 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45170071 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45170973 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45171001 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45171113 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 45171202 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45171287 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 45171304 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45171393 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 45172628 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 45172712 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45174266 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45174301 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45174475 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45174737 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 45175020 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45175218 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45175258 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45175296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45175319 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45175484 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 45175967 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 45176089 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 45177502 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45178341 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45179565 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45185655 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45187023 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45188301 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45188413 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45188872 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45189697 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45189750 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45189864 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45189936 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45190220 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45190501 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45190984 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 45191103 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 45191150 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 45191624 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 45191892 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45192502 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45192867 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 45192971 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 45193062 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45193380 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 45194192 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45194429 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 45194563 C A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 45194936 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45195985 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 45195988 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 45196050 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45196190 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 45196355 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 45196371 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45196741 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 45197011 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45197376 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45197630 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 45199178 G C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 45199705 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45199754 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45200093 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45200309 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 45200508 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45200659 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45201103 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 45201937 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45202471 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45203586 A T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 45206704 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 45206705 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 45207364 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45208011 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45208067 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45208130 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 45208626 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45208867 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 45209576 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 45210646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45211068 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45211188 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45211908 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 45211954 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45212307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45212641 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45213195 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 45215939 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 45216853 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45217136 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45217411 T A Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 45218111 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 45218117 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45218571 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45219061 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45220309 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45220497 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45220522 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45220719 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45220861 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45222079 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 45222503 C G N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 45222743 C T N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 45224579 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 45225856 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45225867 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45225910 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 45225952 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45226832 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 45226952 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45227430 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 45228000 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 45228279 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45228701 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 45229416 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45230926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45230930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45231081 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45231130 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 45231190 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45231383 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 45231425 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 45231511 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45231521 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45231825 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45231920 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45231934 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 45231935 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 45232110 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45233697 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 45233844 G A Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 45234038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45234194 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45234629 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45234974 C A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 45235306 G A Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 45235318 G T Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 45236069 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 45236188 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 45236594 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45237008 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45237277 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 45237293 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 45237385 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45237391 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45237412 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45237762 G A Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 45238267 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 45238338 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45238519 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45238560 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45238628 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 45238678 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45238749 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45239056 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45239063 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45239073 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45239178 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45239253 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45239268 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45239272 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45239322 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45239389 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45239438 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 45239650 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45239663 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 45239752 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45239753 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45239771 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45239807 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45239853 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45239866 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45239949 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45239962 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45240032 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45240094 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45240109 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45240144 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45240182 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45240526 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45240761 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45240813 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45241423 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45241433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45241693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45241785 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45241792 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45242103 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 45242304 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45242417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45242670 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 45242712 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 45243564 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45243579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45243594 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45243934 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45244260 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 45244437 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 45244634 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 45244724 C G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 45245036 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45245112 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45245164 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45245338 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45245422 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45245527 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45245991 G C N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 45246293 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 45246398 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45246433 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45246638 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45246716 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45246749 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 45246934 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 45246951 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 45247060 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 45247073 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45247233 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45247314 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45247371 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45247413 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 45247544 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 45247562 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 3 45247638 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 45247646 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 45249257 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 45250088 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 45250106 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45250994 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 45251158 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45251310 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45252415 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 45252648 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45252887 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45252888 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 45252946 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45252969 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45253033 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45253176 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 45253182 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 45253979 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45254153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45254617 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45255262 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 45256032 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45256390 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45256439 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45257257 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45258278 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45258348 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45259169 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45259445 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 45259675 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45260034 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45260598 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45260669 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45260866 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 45262351 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45262374 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45262588 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45262943 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45263669 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 45263977 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45264875 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45266283 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45266819 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45267884 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 45272417 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45272683 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45272872 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45274216 G C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 45274378 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 45275508 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 45275978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45276447 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45276629 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45276630 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45276687 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 45278102 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 45278393 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45278786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45278818 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 45278879 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45279355 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45280027 A G N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 3 45280098 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 45281419 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 45281465 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45281476 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45281489 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45281613 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45281614 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 45281741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45281807 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45281825 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45282180 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 45282276 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 45282353 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45282480 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 45282660 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 45282876 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 45283073 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45283123 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 45283512 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 45283517 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 45283614 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 45283628 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 45283717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45283852 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45283881 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45284032 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45284202 C G N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 45284478 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45284493 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 45284603 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45284771 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 45284791 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45285553 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45285941 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45286191 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45286338 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 45286686 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 45286737 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 45287504 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45287525 C G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 45288067 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45288176 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 45288296 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45288461 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45289115 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45289161 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45289176 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 45289706 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 45289765 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 45291200 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 45291218 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45291828 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45291901 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45291927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45292243 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 45292753 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45292829 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45292869 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45293217 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45293473 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45293522 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 45294685 T G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 45294815 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45294887 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45295749 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45295776 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45295919 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45296549 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45296646 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45296866 C T Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 45296939 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 45297152 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45297704 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 45297916 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45298214 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 45298867 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45298931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45298966 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45299045 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 45299984 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45300040 G T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 45300043 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 45300150 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45300172 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45301268 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45301290 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45301363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45301397 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45301635 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45301707 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 45301738 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45301889 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45302023 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45302026 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45302286 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45302476 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45302538 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45302545 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 45302596 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45302658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45302810 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45302906 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45303037 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45303112 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 45303198 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45303256 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 45303528 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45303652 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 45303955 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45304107 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45304152 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 45304975 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45305028 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45305319 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45305329 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45305467 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45305490 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45305553 C G Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 45305640 T A Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 45305866 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 45305922 C G Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 45305935 A G Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 45305959 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 45306072 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45306203 C A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 45306339 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45306365 T A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 45306488 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 45306510 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45306530 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45306541 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45306704 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45306730 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45307071 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45307303 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45307354 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45307479 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45307519 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45307525 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45308155 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 45308202 C G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 45308282 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 45308496 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 45308662 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45308793 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 45308878 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45309210 A T Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 45309280 T G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 45309283 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45309464 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45309663 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45309946 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45310115 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45310144 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 45310388 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45310557 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45310679 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45310736 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45310794 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45310860 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45311007 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45311014 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45311067 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 45311316 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45311366 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45311386 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45311455 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45311650 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45311690 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45311935 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45312309 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45312484 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45312929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45312990 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45313411 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45313712 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45313902 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45314011 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45314179 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45314304 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45314361 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45315508 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45315528 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45315736 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 45316358 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 45316399 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 45316521 G C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 45316800 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 45316808 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 45317426 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45318893 T C N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 45318922 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 45318966 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45319351 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45320446 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45320465 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45320588 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45320888 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 45321974 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45322066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45322509 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45323635 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45324135 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45326201 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45326388 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 45326418 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45326760 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45326954 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45327434 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45327641 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45328080 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45328478 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45329125 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45329137 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45329201 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45329542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45331023 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45331215 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45331336 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45332447 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 45332546 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45332710 A T N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 45332865 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45333256 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45333293 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45333311 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45333443 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45334512 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 45335023 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45335037 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45335078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45335138 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45335146 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45335157 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45335179 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45335207 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45335221 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 45335278 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45335308 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45335332 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45335384 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45335445 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45335458 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45335508 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 45335641 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45335666 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 45335692 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45335734 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45335870 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 45335900 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45335961 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45335974 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 45335981 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 45335994 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 45336187 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45336198 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45336283 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45337239 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45337260 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45337307 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45337313 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45337324 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45337339 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45337377 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45337386 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45337454 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45337458 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45337474 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45337485 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45337653 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45337767 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45337816 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45338035 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45338125 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45338246 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45338440 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45339198 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45339428 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45339485 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45339660 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45339835 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45340346 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45340462 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45340627 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 45340757 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 45341386 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 45341634 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45341812 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45341842 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45342102 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45343107 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45343180 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45343257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45343525 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 45343803 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45343842 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45344023 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 45344024 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45344040 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 45344223 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 45344353 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 45344373 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 45344569 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 45344777 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45344825 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45345637 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 45345663 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45346102 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45346472 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45346779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45346857 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45346913 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45347195 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 45347322 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45348453 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45348529 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45349180 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45349368 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45349572 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45349762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45349883 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 45349963 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 45350087 A G Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 45350495 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45350502 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45350542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45350567 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45350678 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45350749 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45350820 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45350884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45350932 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45350989 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45351000 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45351085 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 45351164 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45351186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45351501 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45351510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45351731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45351791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45354135 C T Y Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 5 5 2 1 2 3 45354152 C G Y N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 3 45354217 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 45354254 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 45354293 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 45354504 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45354551 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45354726 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45354843 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45354870 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 45355052 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 45355532 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 45355566 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 45355699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45355706 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45355848 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45355992 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 45356297 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45356421 G T Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 45356499 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45356563 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45356872 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45356877 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45356961 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45357536 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45357555 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45357560 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45357603 G C Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 45357756 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45357887 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45357890 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 45358138 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45358147 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45358173 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45358224 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 45358487 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45358570 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45358736 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45358940 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45358981 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45360011 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 45361809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45363106 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 45363312 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45366158 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45366563 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 45366839 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45366966 A C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 45367079 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 45367286 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 45367381 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45368036 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 45368186 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45368519 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45368637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45369393 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45369699 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45369877 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45370408 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45370781 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 45370916 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45372018 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 45372531 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45372733 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45374043 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45375169 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45375431 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45375955 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45376283 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45376330 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 45376338 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 45376365 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45376461 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45376528 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45376535 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45376560 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45376575 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45376656 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45376688 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 45377013 T A N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 45377290 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 45377637 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 45377772 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45377773 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45377862 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45377879 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45379628 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 45380312 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45380863 T A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 45380891 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 45380896 T A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 45380912 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 45381085 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45381101 G C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 45381360 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45381369 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 45381546 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 45381585 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45381880 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45381976 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 45382027 G C N N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 3 45382063 C A Y N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 3 45396174 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45396309 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45396376 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45396419 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45396590 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45396884 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 45396985 T A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 45397027 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 45397361 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 45397467 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45397672 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45397709 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45397851 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45397878 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45397938 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45398057 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45398145 G C Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45398345 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45398363 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45398427 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45398465 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 45398521 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 45398578 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45398679 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45398711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45398726 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45398763 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45398989 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45399217 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45399275 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45399364 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45399460 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45399535 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45399553 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45399621 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45399647 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45399681 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45399979 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45400087 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45400141 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45400169 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45400177 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45400318 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45400340 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45400346 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45400413 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45400424 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45400533 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45401017 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45401216 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45401793 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 3 45401870 C A Y N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 45402190 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45402395 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45402444 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45402556 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45402581 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45402781 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45403001 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45403042 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 45403165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45403193 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 45403663 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45403700 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45403864 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45403960 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45404239 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45404279 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 45404470 G C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 45404588 C T N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 3 45404616 T C N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 3 45404879 T G Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45404945 A T Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 45405170 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 45405174 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45405191 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45405299 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45405420 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45405744 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45405804 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45405899 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45406417 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45406472 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 45407456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45408327 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45408373 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45409145 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45409646 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45409647 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45409981 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45410229 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45410728 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45411433 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45412074 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45416696 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45417699 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45418818 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45418875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45420127 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45420847 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 45422909 C G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 45424418 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45426840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45428047 T C Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 45428808 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45428819 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45428862 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45429042 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45429116 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 45429119 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 45429211 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45429652 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 45429911 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45430199 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45430646 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 45430668 A T N N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 3 45430675 T G Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 45431571 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 45431603 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 45431619 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 45431745 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 45431878 G T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 45431881 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 45431936 C A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 45432394 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 45432670 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45432757 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45432790 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 45432791 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 45432869 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45432875 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45432930 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45432967 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45433003 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 45433144 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 45433205 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 45433292 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 45433361 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45433688 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45433731 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45433779 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45433890 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 45433891 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45433938 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 45433947 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 45434052 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 45434086 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 45434091 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 45434224 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 45434256 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 45434285 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45434335 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45434420 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45434514 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45434517 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45434560 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 45434573 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45434598 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 45434638 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 45434691 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 45434718 T A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 45434879 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 45434880 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45434890 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 45435125 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45435150 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45435166 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 45435252 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45435262 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45435391 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 45435440 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 45435483 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45435581 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45435790 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45435800 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 45435835 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 45435993 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45436059 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45436078 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45436096 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45436453 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 45436603 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45436604 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45436681 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45436727 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45436967 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45437051 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 45437076 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45437101 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 45437334 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 45437366 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45437412 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45437489 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 45437500 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45437519 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45437528 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45437549 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45437573 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45437619 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 45437821 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45437896 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45437936 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45438186 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45438213 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45438248 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45438601 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 45438656 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45438670 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45438716 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45438848 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45439013 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45439043 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45439096 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45439126 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45439535 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45439550 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45439676 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45439716 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 45439832 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45439937 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 45440294 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45440389 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45440445 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45440522 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45440620 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45440635 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45440724 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45440755 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45440815 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45440918 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45441006 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45441014 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45441051 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45441066 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45441101 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45441171 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45441172 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45441316 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45441319 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45441354 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45441375 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45441406 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45441422 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45441546 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 45443201 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45443675 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45444485 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45444513 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45444538 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 45444624 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45444666 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45444679 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45444721 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45444746 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 45444812 T A Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 45444839 C T Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 45444866 T A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 45444974 C A N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 3 45445069 T A N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 3 45445123 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 45445268 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 45445348 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45445352 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45445385 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45445769 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45445906 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45445945 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45445961 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 45445993 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 45446474 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 45446685 A C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 45446757 C T Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 45446788 C T Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 45446791 C T Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 45446826 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 45446928 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 45446933 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 45446945 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 45446950 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 45446963 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 45446995 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 45447001 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 45447111 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 45447165 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 45447176 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 45447197 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 45447207 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 45447216 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 45447303 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 45447354 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 45447396 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 45447404 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 45447416 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 45447527 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 45447536 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 45447577 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 45447665 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 45447671 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45447742 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 45447769 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 45447962 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 45447993 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45448055 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45448173 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 45448266 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45448405 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 45448423 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45448561 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 45448820 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 45449000 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 45449016 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45449121 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45449140 T C Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 45449170 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 45449228 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45449334 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45449390 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45449458 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45449582 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45450142 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45450143 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45450222 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 45450358 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 45450370 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 45450389 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45450409 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45450483 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 45450830 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45451104 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 45451138 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 45451305 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 45451356 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45451394 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 45451444 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 45451565 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 45451585 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45452855 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45452871 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 45452875 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45452920 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45453649 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45454243 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45454451 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 45454491 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 45454722 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45455104 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45455374 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45455637 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 45455758 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45456252 T A Y N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 45458434 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45458607 T C N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 45458903 A C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 45459172 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45459539 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45461033 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45462372 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45462388 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45462673 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45464337 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 45464501 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 45464517 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 45464552 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 45464628 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 45464742 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 45464833 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 45464869 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45464915 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45464928 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 45465021 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45465143 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 45465200 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 45465224 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 45465323 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45465331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45465441 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45465482 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45465504 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 45465516 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45465530 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 45465606 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45465700 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45465792 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 45465793 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 45465914 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45466062 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45466114 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45466117 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 45466164 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 45466215 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45466227 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 45466301 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45466311 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 45466381 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 45466410 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 45466412 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 45466509 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 45466540 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 45466544 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 45466658 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 45466689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45466718 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 45466723 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 45466769 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45466812 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 45466978 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 45467079 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45467156 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 3 45467202 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 45467253 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 45467255 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 45467291 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45467384 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 45467451 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 45467568 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 3 45467649 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 45467661 A G N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 3 45467727 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 45467743 A G N Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 3 45467907 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 45467956 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 45467988 C G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 45468057 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 45468123 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 45468130 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 45468246 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 45468263 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 45468279 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 45468280 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 45468338 T G N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 3 45468389 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45468453 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 45468471 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 45468604 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 45468877 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45468916 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45469012 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45469141 A G N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 3 45469152 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 45469159 C T N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 45469226 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 45469308 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 45469476 T C Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 45469495 C A N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 45469684 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45469753 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 45470173 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45470343 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45470530 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 45471104 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 45471217 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 45471540 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 45471700 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45472206 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45472735 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 45473013 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45473191 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45473231 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 45473358 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 45473532 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45473581 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 45474595 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45474620 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45474824 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45475431 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 45475444 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 45475647 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45475656 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45476098 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 45476172 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 45476366 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45476594 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45476695 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45476705 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45476790 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45476973 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45477017 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 45477271 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 45477309 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 45477402 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 45477696 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45477816 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45477983 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45477995 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45478006 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45478236 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45478352 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 45478448 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45478451 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45478465 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45478532 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45478586 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45478617 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45478680 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45478935 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45478945 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45478958 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45479003 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45479056 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45479152 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45479167 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45479519 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45479616 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 45479651 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 45479740 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 45479765 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45479809 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 45479900 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 45479932 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 45479977 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45480052 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45480192 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 45480282 T C N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 45480576 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 45480903 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45480940 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 45481000 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45481040 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45481046 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45481097 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45481102 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45481151 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45481314 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 45481343 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 45481835 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45481848 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45482075 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45482078 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45482211 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45482359 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45482418 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45482471 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 45482525 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45482563 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45482601 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45482654 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45482656 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45482773 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45482813 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45482856 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45482872 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45482877 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45482950 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45482975 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45483009 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45483041 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45483214 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45483258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45483358 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 45483520 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45483821 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45484268 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45484286 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 45484572 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45484762 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45484764 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45484925 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45485028 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45485032 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45485515 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45485677 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 45485845 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45485910 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45485914 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 45486001 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45486020 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45486039 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45486373 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45486374 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45486384 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45486506 T C N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 45486770 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 45486843 C G N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 45486975 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45487006 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45487462 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45487558 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45487634 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45487702 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45487823 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45488014 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45488053 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45488082 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45488375 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45488380 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45488442 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 45488474 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45488492 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45488515 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45488571 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 45488577 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 45488589 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45488605 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45488617 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 45488641 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45488779 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45488830 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 45488920 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 45488969 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45489134 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 45489276 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 45489301 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 45489314 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 45489331 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 45489429 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45489430 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 45489581 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45489721 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 45489827 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 45489906 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 45490006 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 45490564 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 45490589 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 45490609 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45490612 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 45490821 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 45490949 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45491336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45491515 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45491610 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45491854 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 45491930 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45492266 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 45492319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45492332 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 45492526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45492533 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 45492663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45492724 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45492900 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 45493082 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 45493109 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 45493238 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 45493254 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 45493328 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 45493424 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45493425 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 45493823 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 45493847 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 45494495 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45494528 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 45494742 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45494908 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45494970 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45494974 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45495046 G C N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 45495087 A G N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 45495297 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 3 45495305 A C N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 3 45495454 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45495466 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 45495490 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45495810 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 45496025 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 45496067 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 45496094 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 45496168 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45496170 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45496221 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 45496325 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45496341 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45496417 C G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 45496427 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 45496486 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 45496527 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 45496614 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 45496697 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 45496768 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45496907 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 45496908 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 45497342 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 45497365 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 45497534 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 45497540 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 45497600 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45497657 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 45497678 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 45497683 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45497704 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45497754 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 45497797 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 45498066 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 45498077 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 45498194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45498224 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 45498371 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 45498502 C A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 45498744 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 45498970 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45499085 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 45499088 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 45499099 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 45499173 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45499191 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45499330 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45499388 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45499456 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45499482 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45499514 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45499577 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45499600 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45499636 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45499761 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45499900 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45499993 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45500137 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45500152 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45500169 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45500263 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45500423 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45500695 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45500698 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45500786 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45500812 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45500979 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45501015 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 45501187 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 45501239 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45501313 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45501388 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 45501476 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45501547 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45502001 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45502082 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45502118 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45502121 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45502176 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45502206 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45502310 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45502377 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 45502588 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 45502625 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45502755 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 45503311 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 45503501 A C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 45503507 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 45503566 C T N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 45503690 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 45503730 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 45503737 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 45503823 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 45504428 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45504498 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 45504665 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45504705 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45504798 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45504832 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45504879 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 45504889 G T Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45504893 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45504949 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 45505047 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45505051 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45505119 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45505136 T G Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45505198 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45505253 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45505293 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45505382 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45505420 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45505531 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45505692 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 45505780 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45505800 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 45505806 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 45505819 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 45505971 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45505989 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45506043 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 45506079 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45506135 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45506173 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45506193 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 45506325 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45506454 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 45506748 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 45506824 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 45506829 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45506869 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 45506912 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 45506989 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 45506999 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 45507229 G C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 45507240 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 45507303 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 45507326 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 45507421 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45507458 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45507641 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 45507658 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 45507667 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 45507683 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45507718 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45507729 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45507787 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 45507841 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 45507859 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 45507918 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 45508010 T C Y Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.125 0.75 0.125 8 8 1 6 1 3 45508100 A C Y N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 3 45508291 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 45508314 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 45508353 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 45508681 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 45508743 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45508872 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45509115 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45509178 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45509344 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45509357 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45509362 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45509422 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45509527 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45509533 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45509552 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45509608 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 45509626 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45509671 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45509678 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45509773 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45509800 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45509822 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45509828 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45509838 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45509855 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45509925 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45509942 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45509963 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 45510083 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45510098 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45510114 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45510160 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45510312 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45510344 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45510406 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 45510423 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 45510557 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 45510601 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 45510833 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45510854 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45511492 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 45512407 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45513084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45513219 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 45513687 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45514301 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 45514343 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 45514889 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 45515072 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45515147 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45515402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45515593 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 45515604 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 45515639 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 45515670 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 45515681 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 45515720 G T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 45515761 A T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 45515816 A T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 45515834 T A Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 45515835 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 45515850 A T Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45516128 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45517429 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45517669 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45517988 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45518172 A C N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 45518413 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 45520880 G T Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45520944 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 45521148 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45521924 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45522857 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45523179 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45523287 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 45523822 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45523828 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 45524389 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45524408 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 45524483 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 45524484 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 45524883 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 45525705 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 45525954 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45526303 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45526316 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45526458 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45527278 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45527731 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 45527913 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45528745 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45528817 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45528863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45529303 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45530656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45531240 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 45531295 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 45531370 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 45531478 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 45531637 T A N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 45532800 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 45532908 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45535321 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45535366 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45535614 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45536595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45538453 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45538590 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45538895 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45539234 A T N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 45539323 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45541493 C T N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 3 45541498 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 3 45542772 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45543367 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45544397 A T Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45544524 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 45545087 C A Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 45545285 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45546031 T G Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45546373 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45546797 T G Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 45547121 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 45547125 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 45547335 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45547524 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45548618 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 45548862 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 45549084 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45549647 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 45550015 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 45550357 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 45550425 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45550499 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45550960 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45550997 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45551198 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45551801 T C Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 45551859 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45551860 G C Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 45551876 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 45552249 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 45553054 C A N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 45553065 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 45553080 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45553287 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45553314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45553323 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45553499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45553510 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45553841 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 45553891 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45553936 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45553945 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 45554103 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 45554128 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45554226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45554349 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45554460 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45554613 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 45555343 C T Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 45556005 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45556135 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 45556298 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 45556411 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 45556450 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45556636 A C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 45556846 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 45556867 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 45557136 T G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 45557173 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45557191 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45557480 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45557597 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 45557830 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 45558015 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45558092 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 45558108 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45558304 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 45558375 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45558465 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45558536 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 45558616 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45558734 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 45558776 A C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 45558861 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 45558868 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 45559031 A T Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 45559048 T C Y Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 45559070 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 45559348 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45559441 T G N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 45559599 T A Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 45559619 A T N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 45559864 T G N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 45559902 G C N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 45559948 C G N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 45560031 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 45560096 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 45560160 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 45560267 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45560362 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 45560388 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 45560671 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45560680 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45560835 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 45560968 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45560980 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45561117 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45561137 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45561341 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 45561379 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 45561793 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 45561825 A T Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 45561937 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 45562029 A C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 45562041 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 45562114 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45562547 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 45562720 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 45562790 C A N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 45562805 G C N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 45562873 A C N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 45563165 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 45563184 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 45563282 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45563308 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 45563418 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45563431 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45563716 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45563732 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45563899 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45563916 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45563958 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45563984 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45564030 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45564049 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45564090 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45564121 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45564133 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45564146 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45564174 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45564175 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45564192 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45564242 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45564918 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 45565055 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 45565247 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45565338 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 45565439 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45565575 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45566078 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45566426 G T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 45566625 T A N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 45566677 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 45566707 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45566805 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 45567014 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45567040 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45567066 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45567437 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45567497 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45567597 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45567716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45567749 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45567789 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45567851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45567880 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45567906 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45568094 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45568258 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 45568273 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 45568356 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45568595 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45568626 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45568668 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45568705 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 45568728 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 45568831 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45568943 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 45569028 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45569039 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45569097 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 45569149 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45569158 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 45569217 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45569363 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45569433 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 45569608 G T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 45569781 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45569821 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45570129 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45570517 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 45570654 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 45570775 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 45571621 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 45571939 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 45572130 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45572188 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45572254 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45572616 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45573007 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 45573080 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 45573369 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45573428 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45573670 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 45573862 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 45573995 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 45574077 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 45574180 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45574292 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45574318 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45574640 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 45574758 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45574794 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45574798 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45574815 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45574885 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45574980 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45575056 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45575267 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45575304 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 45575475 T G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 45575517 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 45575589 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 45575603 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 45575621 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 45575895 G A N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 45575956 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 45576207 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45576321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45576343 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45576362 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45576393 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 45576432 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 45576433 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 45576499 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 45576552 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 45576700 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 45577004 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 45577014 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 45577028 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 45577209 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 45577520 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45577609 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45577610 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45577628 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45577642 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45577669 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45577679 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45577714 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 45578970 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 45579691 C T Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 45579773 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 45579832 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 45579971 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 45580032 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 45580172 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 45580233 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 45580366 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45580559 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 45580682 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 45580802 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 45580926 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45580950 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45581000 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45581051 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45581215 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 45581262 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 45581388 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 45581530 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 45581544 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45581547 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 45581586 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 45581598 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45581727 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45581728 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45581745 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 45582053 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 45582054 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 45582147 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 45582218 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 45582326 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 45582379 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 45582387 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 45582401 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 45582443 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 45582591 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 45582729 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 45582776 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45582899 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 45583003 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 45583038 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 45583127 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 45583233 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 45583234 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 45583389 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 45583521 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45583533 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 45583657 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 45583763 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45583962 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45583990 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45584610 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45584653 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 45584691 A C N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 45584695 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 45584785 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 45584804 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 45584993 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45585006 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45585025 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45585087 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45585118 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45585195 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45585362 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45585467 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 45585532 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45585774 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 45586337 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45586357 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 45586366 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 45586369 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 45586392 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45586523 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45586563 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45586738 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45586755 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45587050 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 45587079 T A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 45587215 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 45587572 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45587584 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45587718 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45588179 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 45588360 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45588446 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45588459 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45588563 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45588693 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45589052 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45589290 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45589334 T C Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45589420 T A Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45590169 C A Y N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 3 45591802 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45592056 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45592148 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 45592168 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 45592616 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45592684 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45592837 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45593027 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 45593043 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45593277 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 45593427 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 45593546 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45593596 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45593635 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45593711 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45593915 C T Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 45593961 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 45593991 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 45594035 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45594046 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45594082 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45594172 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45594188 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45594377 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 45594399 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 45594522 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45594620 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 45594720 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 45594858 C A Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 45594869 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 45595181 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45595260 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45595368 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45595390 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45595437 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45595554 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 45595573 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 45595600 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 45595604 T G Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 45595784 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45595802 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45595816 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45595842 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45596879 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45596886 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45596897 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45596925 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45596955 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 45596962 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45597977 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45597991 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45598029 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 45598046 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 45598325 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45598349 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 45598382 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 45598413 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 45598457 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45598477 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 45598563 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 45598622 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 45598634 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 45598702 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 45598895 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 45598908 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 45599007 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 45599059 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 45599062 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 45599219 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 45599375 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 45599540 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45599672 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45599674 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 45599776 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45599886 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45599887 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45599911 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 45599995 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45600018 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45600065 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45600085 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45600561 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45600706 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 45600747 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45600797 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45601240 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 45601494 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 45601866 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45602001 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45602555 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 45603000 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45603368 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45604144 T G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 45604502 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 45605154 A C Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 45605534 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45605553 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45605962 C A Y N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 3 45606423 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45606472 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45606755 G T N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.2 0 0.8 4 16 2 0 8 3 45607111 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 45607345 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 45608394 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45608508 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45608672 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45608735 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 45609729 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45609793 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 45609909 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 45610448 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45610551 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 45610559 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45610582 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45610606 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45610613 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45610717 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45610767 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45610770 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45610793 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45611172 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 45611475 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45611540 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 45611599 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 45612297 A T N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 45613057 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45613084 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45613181 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45613498 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 45614155 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45614170 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45614247 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 45614408 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45614496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45614964 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 45615514 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 45615529 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45615644 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 45615703 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45615713 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45616027 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45616170 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45616617 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 45616873 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45617775 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45617942 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45619314 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 45619382 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45619438 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45619633 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 45619695 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 45619735 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 45619761 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 45625708 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 45625895 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 45625896 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 45626191 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45626388 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45626576 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 45627061 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45627251 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45627261 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45627627 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45627922 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45627928 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 45628243 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45628410 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 45628420 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45628451 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 45628795 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45628809 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45629428 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45629477 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 45629821 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45629965 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45630145 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45630278 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45631114 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45631185 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45631244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45631331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45631404 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45632442 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45632461 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 45633260 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45633383 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45635309 T A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 45635601 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45635607 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45635652 G T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 45636052 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45636074 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45636426 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45636450 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45636545 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45637125 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 45637150 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45637420 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45637758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45638237 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45638432 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 45638512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45639002 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 45639140 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 45639595 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45639785 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45639809 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45640059 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45640131 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45640712 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45640994 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45641059 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45641201 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45641244 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 45641246 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45641335 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45641488 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45641627 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 45641965 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 45641979 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 45642583 A C N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 45643050 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45643077 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 45643093 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45643111 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45643237 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45643342 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 45643396 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45643839 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45644207 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 45644477 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 45644518 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45645642 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 45646729 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45646965 G A Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 45647954 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 45648071 A C Y N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 5 7 0 5 1 3 45648790 C T Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 45649368 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45650025 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45650312 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45650880 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45651089 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 45651513 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 45652080 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 45652137 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 45654370 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 45654394 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 45654441 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 45654593 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45654632 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45654673 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 45654712 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 45654936 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45655350 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45655399 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45655485 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 45655529 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 45656606 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45657014 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45657964 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45658199 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 45658445 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 45658832 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45659851 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 45660271 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 45660573 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 45661054 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 45661408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45661506 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45662067 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45664002 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45664511 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 45665222 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 45667459 T G N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 3 45667679 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 45667785 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 45668123 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45668693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45669484 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45669644 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45669662 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45670070 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45671289 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 45671649 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45672043 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45673657 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45674708 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45675219 C A Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 45675320 A G Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 45675323 A T Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 45675955 C A Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 45675968 A G Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 45675979 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 45676545 G T Y N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 16 14 1 14 0 3 45677754 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 45678463 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45678474 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45678664 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45678907 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 45679025 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45679456 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45679595 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45680424 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 45680740 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45680745 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45680811 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 45681172 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45683691 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45683895 T A Y N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 3 45684010 G A N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 45684040 A T N N 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 3 45684176 G A Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 45684230 G T Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 45684985 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45686191 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45687780 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 3 45687918 T A Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 45687964 A C Y N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 45688192 G A Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 45688226 T G Y N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.153846153846154 0.846153846153846 0 15 11 2 11 0 3 45688364 T C Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 45688460 A T Y N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 45688466 G A Y Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 3 45688487 A C Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 45688565 T C Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 45688572 A T Y N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 45688657 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 45688839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45689084 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45689401 A T Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 3 45689436 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 45690459 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 45690804 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45691907 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 45692333 A C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 45692518 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 45692531 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 45692605 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45693253 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 45694763 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45695907 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45696490 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45703172 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45709322 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 45710597 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 45710666 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45710755 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45711483 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 45713097 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 45713282 A T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 45714503 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45714683 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 45715301 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 45716158 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 45716726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45716768 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45717599 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45719412 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45719744 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45720971 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 45722124 A C Y N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 45723618 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45724451 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 45724571 C T Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 45724679 T A Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45725585 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 45726084 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45726272 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45729302 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 45729710 C G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 45730562 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45731142 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45732076 G C Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 45732256 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45732561 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45732608 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45732925 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45733017 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45733123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45733766 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 45733844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45734213 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45734700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45735337 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45737036 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45738160 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45738564 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 45738767 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 45738927 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45739069 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45739782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45740099 T C Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0 0.764705882352941 0.235294117647059 13 21 0 13 4 3 45740248 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45740367 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 45740494 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45740826 A T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 45741689 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 45743410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45744551 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 45744830 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45745723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45747283 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 45747782 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 45748877 G A Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 45749897 G C Y N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 3 45750953 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45750990 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45751225 A G Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 3 45752838 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 45753570 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45754840 G C Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 45754886 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45755006 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45755037 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45755607 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45755742 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45755790 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45756175 T A N N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 45756942 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 45757225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45757344 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45758049 G A Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 45758967 G T Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 45758993 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 45759027 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45759267 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 45759375 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 45759606 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45759638 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 45759642 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 45759650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45759679 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45759786 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 45759809 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 45759823 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45759889 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 45759929 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 45759988 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45760038 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 45760119 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 45760217 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 45760389 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45760414 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 45760441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45760743 G T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 45760748 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 45761090 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45761174 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 45761231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45761242 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45761260 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 45761459 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 45761680 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 45761824 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 45761886 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 45762190 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 45762210 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 45762244 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 45762307 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45762341 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 45762345 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 45762356 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45762381 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45762447 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 45762500 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 45762567 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 45762639 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 45762929 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 45763148 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45763298 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.266666666666667 0.0666666666666667 0.666666666666667 9 21 4 1 10 3 45763636 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 45763664 T C Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 45764297 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45764410 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45764436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45764709 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45764732 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45764764 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45764793 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45764993 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 45765199 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 45765847 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 45766022 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 45766044 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 45766512 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45766558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45767453 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 45767722 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45767776 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 45768038 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 45768256 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45768455 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45768459 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 45768486 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 45768524 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45768533 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45768770 A C Y N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 45769135 G A Y Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 3 45769678 T A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 45769721 C G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 45769761 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 45770616 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45770833 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45770908 T C Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 45770945 C A N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 45771123 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45771689 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 45772084 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45772219 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 45773607 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45773727 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 45773900 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 45774427 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 45774501 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 45774573 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 45774671 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 45774831 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 45775207 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 45775217 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 45775268 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45775272 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 45775488 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 45775702 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 45775889 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45776135 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 45776255 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 45776271 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 45776338 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 45776643 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 45776760 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45776890 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 45777013 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45777049 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 45777056 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 45777351 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45777364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45777412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45777522 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 45777816 T C Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 45778132 G T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 45778250 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 45778251 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 45778288 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 45778529 C A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 45778545 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45778842 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45779000 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45779086 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45779501 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45779924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45780016 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 45780070 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 45780101 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 45780329 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 45780471 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45780604 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 45780821 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45781056 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 45781149 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 45781400 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 45781495 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 45781513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45781921 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 45782063 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45782226 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45782724 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 45782780 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 45782963 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45783081 G T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 45783258 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45783556 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 45783840 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 45784178 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45784542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45784745 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 45784877 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45784933 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45785047 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 45785260 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45786199 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 45786200 A T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 45786435 C T Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 45786436 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 45786535 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45786688 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45786783 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 45786784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45786795 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45786974 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 45787110 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 45787201 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 45787379 A T N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 45787513 T A N N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.454545454545455 0.454545454545455 0.0909090909090909 15 7 5 5 1 3 45788095 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 45788396 A T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 45788526 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45788696 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45788794 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 45788805 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 45788874 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 45788930 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 45789089 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 45789148 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45789151 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 45789164 A C Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 45789302 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45789399 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45789439 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45789447 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45789582 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45789628 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45789650 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45789695 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45789707 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45789877 C T Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 3 45789930 C A Y N 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 3 45789985 C A Y N 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 3 45795724 A G Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 45796005 C T Y Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 3 45796201 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45796343 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 45796390 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45796454 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 45796561 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45796986 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45797029 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 45797207 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45797476 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 45797928 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 45798268 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 45798381 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45798492 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45798635 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 45799277 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45799618 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45799911 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45799947 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45799965 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45800056 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45800127 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45800205 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45800221 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45800292 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45800642 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 45800841 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 45800887 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 45801151 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 45801334 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 45801425 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 45801719 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 45802209 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45802407 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 45802640 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 45802790 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 45803304 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45804686 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45804756 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45805064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45805807 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45806137 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 45806387 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 45806636 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45806754 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 45807091 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45807655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45807898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45808365 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45808623 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45808697 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45809061 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45809316 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45809609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45809998 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 45810216 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45810429 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 45810927 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 45811119 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45811151 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 45811198 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45812123 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45812331 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 45812632 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45812737 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 45813138 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 45813358 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 45813553 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45813748 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 45814000 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45814125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45814381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45814414 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45815217 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45815386 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45815484 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45816064 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45816736 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45817058 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 45817675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45818233 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 45818834 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 45819184 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45819632 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45819858 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45820598 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45820675 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45820875 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45821721 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 45821921 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 45822133 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45822588 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 45823252 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45823307 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 45823362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45823393 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45823394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45823728 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 45823735 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 45823881 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 45824154 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45824203 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45824215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45824229 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45824862 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 45824985 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45825003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45825275 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45825542 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45825665 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45825677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45825747 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45826002 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45826023 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45826088 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 45826169 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 45826191 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45826596 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45826779 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45827062 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 45827145 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45827540 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45827638 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 45827849 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45828507 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 45828528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45828573 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 45829325 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45829513 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 45829678 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45829728 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45829772 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45830115 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 45830130 C T N Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 3 45830131 G A N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 3 45830205 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45830249 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45830388 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45830466 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45830526 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45830626 C T N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 45830678 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 45830856 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 45831257 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 45831311 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 45831317 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45831611 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 45831612 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45831625 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45831643 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 45831644 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 45831998 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 45832069 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45832127 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 45832257 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45832706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45832881 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 45832948 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 45832989 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 45833200 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 45833340 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 45833680 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 45833695 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45833714 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 45833862 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 45833881 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 45833890 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45833959 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 45833969 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45834053 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45834210 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 45834316 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 45834369 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 45834497 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 45834572 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 45834639 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45834760 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 45834898 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 45835372 A G N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 3 45835640 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 45835874 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 45836082 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 45836174 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45836517 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 45836665 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 45836699 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 45836737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45836745 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 45836752 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45836761 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 45836909 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 45836931 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 45837018 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 45837207 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 45837350 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45837913 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 45837914 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 45838336 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 45838613 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45838843 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45839191 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 45839326 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 45839981 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 45840511 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 45840513 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45840573 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 45840831 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 45840841 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 45841112 G T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 45841131 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 45841175 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 45841284 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 45841437 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 45841458 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 45841587 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 45841722 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 45841723 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 45841801 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 45841821 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 45842007 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 45842008 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 45842225 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 45842301 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 45842409 T A N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 45842448 G C N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 45842587 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 45842601 A T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 45842634 G A N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 45842798 A T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 45842985 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 45842996 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 45843029 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 45843116 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45843372 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 45843390 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 45843429 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 45843463 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 45843532 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45843583 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 45843657 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 45843707 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 45843764 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 45843802 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 45843809 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 45843833 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 45843956 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 45844144 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45844318 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 45844321 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 45844414 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 45844483 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 45844563 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45844918 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 45845045 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 45845085 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 45845127 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 45845234 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45845668 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 45846791 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45846867 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 45848375 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45848658 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45849459 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45849869 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45850045 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45850088 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45850347 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 45850859 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45851009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45851075 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45851517 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 45852017 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 45852502 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45852895 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 45853075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45853287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45853508 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45854048 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45854609 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45854671 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45854865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45854891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45855104 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 45855261 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 45855282 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45855484 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 45855676 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 3 45855922 C G Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 45856015 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45856026 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45856176 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 45856202 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 45856203 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 45856228 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 45856463 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45856507 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45856544 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 45856548 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45856555 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 45856570 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45857249 C G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 45857294 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45857432 C G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 45857491 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 45857498 T G N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 45857852 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 45857981 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 45857985 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 45858114 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 45858137 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 45858150 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 45858180 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45858388 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 45858403 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45858453 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 45858465 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 45858478 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45858731 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 45859086 A C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 45859223 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 45859243 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 45859259 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45859336 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 45859432 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 45859562 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 45859692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45859710 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 45859711 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 45859942 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 45859955 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 45860169 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 45860281 G T Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 45860380 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 45860410 G T N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 45860430 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 45860478 T A N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 3 45860513 A C N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 45861053 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 45861100 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 45861116 G C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 45861293 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 45861313 C A N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.0769230769230769 0.769230769230769 0.153846153846154 12 14 1 10 2 3 45861339 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 45861469 C G Y N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 45861471 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 45861497 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 45861549 C A Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 45861560 A G Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 45861641 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 45861723 T C Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 45861737 G A Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 45861822 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 45861872 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 45861897 T G N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 45862230 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 45862358 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 45862513 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 45862519 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 45862712 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 45862761 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 45862934 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 45863007 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 45863026 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 45863083 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 45863121 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 45863135 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 45863228 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 45863454 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 45863499 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 45863526 A G Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 45863561 T C Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 45863572 A G Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 45863583 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 45863747 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 45863798 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45863839 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 45863859 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 45863911 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 45863982 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 45864097 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 45864098 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 45864116 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 45864214 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 45864227 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 45864238 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 45864239 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 45864565 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 45864568 A G Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 45864600 G C Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 45864664 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 45864837 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 45864838 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 45864929 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 45864932 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 45864992 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 45865021 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 45865022 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 45865110 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 45865165 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 45865237 G T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 45865282 C G Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 45865298 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 45865300 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 45865350 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45865365 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 45865379 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 45865418 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 45865459 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 45865472 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 45865513 G A Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 45865522 T G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 45865558 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 45865562 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 45865633 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 45865661 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 45865681 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 45865683 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 45865904 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 45865910 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 45865956 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 45866096 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 45866100 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 45866137 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 45866151 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 45866164 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 45866344 T A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 45866352 A T Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 45866376 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 45866393 A T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 45866420 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 45866596 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 45866618 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 45866619 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 45866660 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 45866810 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 45866864 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 45866875 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 45866882 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 45866933 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 45866946 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 45866966 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 45867012 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 45867095 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 45867122 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 45867217 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 45867254 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 45867384 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 45867422 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 45867500 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 45867519 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 45867565 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 45867601 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 45867651 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 45867670 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 45867734 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 45867916 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 45867924 A C Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 45868027 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 45868068 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 45868092 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 45868175 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 45868392 G T Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 45868395 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 45868549 C G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 45868550 T G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 45868574 G C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 45869021 G A Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 45869052 A G N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 45869116 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 45869125 T A Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 45869162 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 45869209 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 45869341 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 45869398 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 45869639 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 45870622 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45871743 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45872195 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45872985 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 45873158 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 45874934 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 45875008 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 45875229 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 45875250 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 45875570 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 45875964 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 45876014 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 45877240 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45877295 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45877339 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 45877446 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 45877718 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 45877890 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 45878293 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 45878369 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 45878567 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45878727 G T Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 45878818 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45879008 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 45880758 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 45880804 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 45880841 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45881206 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45881727 A G N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 45881962 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 45882031 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 45882081 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45882825 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 45884426 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 45884992 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45885735 T A Y N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 3 45885775 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 45886011 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 45886397 T A N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 45886769 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45887470 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45888168 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 45888516 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45888713 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 45888877 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45889062 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 45889193 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 45889282 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45889483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45889849 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 45891362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45891384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45891515 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45892811 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 45893067 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 45893744 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 45893940 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 45894324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45895125 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 45895212 A T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 45895448 A G Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 45896159 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 45896208 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45896373 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 45897654 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45897705 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 45898040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45898532 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45898644 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45898721 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45906644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45907592 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45908450 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45908656 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45908697 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45909421 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 45909450 G C Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 45910681 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 45911342 A T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 45912012 G T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 45912632 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45913269 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 45913314 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 45913615 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 45913924 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45914021 C A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 45914487 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 45914753 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 45916332 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 45917420 C G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 45917963 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45917982 G T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 45918039 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45918104 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45919690 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 45920956 G T Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 45921795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45922152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45922661 T C Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 45922900 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45923143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45923466 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45924601 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 45924843 T C Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 45925006 G C Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 45925012 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 45925891 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 45926341 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 45926342 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 45926827 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 45926839 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45926963 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45927048 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45927571 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 45927603 A G Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 45927646 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 45928092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45929351 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 45929353 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 45929544 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45930075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45930403 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45931365 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 45931425 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 45932477 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45933782 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 45933793 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45934405 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 45934763 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45935628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45936014 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 45938238 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 45939230 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45943484 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45943487 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45944564 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45952207 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 45952336 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45952779 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 45953295 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45953670 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45954022 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45954072 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 45954828 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 45955403 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 45955434 C A N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 45956273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45956744 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 45957232 T G Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 45957763 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45958206 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 45958987 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 45959027 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45959386 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45959500 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 45960017 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 45960057 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 45960389 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45960476 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45960958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45961521 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45961879 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 45961957 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 45963921 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 45964094 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 45964807 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 45965003 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45965066 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45965979 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 45966517 C A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 45966811 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45967144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45967224 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 45967299 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45967412 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45967413 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 45967435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45967582 T A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 45967753 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 45968353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45968458 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 45968684 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 45968770 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 45968923 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 45969076 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45969228 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 45969249 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45969433 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45969513 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 45969594 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45969637 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 45969717 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 45970117 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45970140 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45970399 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 45970439 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 45970896 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 45970959 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45971139 A T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 45971239 C A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 45971481 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 45971593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45972230 A C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 45972537 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 45973142 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 45973229 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 45973242 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 45973895 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45973986 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45974006 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 45974182 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45974817 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45974846 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 45975189 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45975209 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45975284 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 45975519 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 45975824 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 45976152 C T Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 45977873 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 3 45978469 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45979186 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 45979443 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 45979723 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 45979794 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 45980022 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 45980045 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 45980201 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 45980307 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 45980370 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 45980372 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 45980389 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 45980652 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 45980780 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 45981053 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 45981221 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 45981515 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 45981834 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 45982007 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 45982109 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45982200 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 45982950 C G N N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 3 45983381 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 45983516 A C N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 45983701 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 45983768 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 45984034 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 45984263 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45984437 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 45984505 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 45984539 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 45984559 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 45984827 C A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 45985149 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 45985198 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 45985208 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 45985226 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 45985419 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 45985555 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 45985602 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 45985621 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45985752 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 45985818 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45985879 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 45985919 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 45986015 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 45986180 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 45986584 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 45986644 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 45986830 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 45986967 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 45986982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45986999 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 45987085 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45987220 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 45987471 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 45987502 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45987644 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 45987765 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 45987810 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 45987811 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 45987867 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 45987893 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 45988005 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45988328 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45988757 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 45988761 A G N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 3 45988783 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 45988907 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45989105 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 45989146 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45989676 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 45989717 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 45989729 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 45989788 A C N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 3 45990104 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45990110 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45990158 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 45990257 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45990262 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45990271 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 45990328 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45990339 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 45990358 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 45990360 G T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 45990409 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 45990662 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45990669 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 45990832 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 45990973 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 45991114 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 45991379 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 45991715 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45991956 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45992102 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45992248 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45992454 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 45992519 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 45992647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45992666 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 45992858 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45992904 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45993051 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45993078 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45993198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45993210 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45993217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45993222 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45993278 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45993321 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 45993371 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45993382 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45993449 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45993495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45993502 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 45993512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45993519 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45993560 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 45993598 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 45993680 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45993688 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45993703 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45993711 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45993806 G C N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 45994098 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 45994150 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 45994379 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 45994893 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 45995314 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 45995330 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 45995334 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 45995410 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 45996216 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45997115 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45997324 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45997476 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 45997572 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 45997853 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45998284 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 45998379 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 45998562 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 45998615 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 45999054 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 45999370 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 45999816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 45999865 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46000796 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 46000812 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 46000850 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 46000920 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 46000948 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 46001020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46001040 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46001121 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 46001225 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46001290 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46001631 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 46001750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46002147 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 46002182 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 46002292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46009631 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 46009958 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 46010270 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 46010588 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46010646 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46011077 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46011297 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46011692 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46011693 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46011735 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46012622 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 46012676 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 46012686 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46012982 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46013237 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46013247 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46013380 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46014192 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46014217 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46014305 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46014471 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46014496 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46014979 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 46015727 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 46015807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46015867 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46015950 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46015976 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46016167 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 46016201 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46016203 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46016321 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 46016624 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46016854 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46017141 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46017271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46017332 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 46017738 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46018063 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46018402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46018606 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46019486 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 46019568 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46019698 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 46019846 G A N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 3 46020042 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46020044 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46020091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46020829 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46021467 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 46021512 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46021513 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46021803 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46021836 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46021987 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 46022141 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 46022168 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 46022212 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 46022226 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 46022246 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 46022452 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46022517 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46022630 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 46022660 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46022681 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 46022737 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46023001 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 46023431 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 46023769 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 46023783 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46024218 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 46024523 A T N N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 3 46024539 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 46024711 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 46024894 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46024950 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46024986 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 46025054 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46025165 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 46025338 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46025419 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 46025611 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46025724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46025778 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46025882 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 46025920 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46026102 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 46026103 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46026261 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 46026368 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 46026397 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 46026520 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46027033 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46027124 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 46027775 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 46027904 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46027922 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 46028156 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46028233 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 46028320 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 46028436 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46028700 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46028953 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 46029012 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46029357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46029706 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 46029774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46030114 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 46030190 T C N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 46030205 C G N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 46030791 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46031268 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46031368 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 46031649 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 46032071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46032072 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46032711 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 46033733 C T N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 3 46033791 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 46034185 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 46034414 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46034665 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46034889 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46035189 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46035537 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 46035640 T A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46035826 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46036025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46036270 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 46036490 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46036663 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46036899 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 46037230 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 46037259 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46037725 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46037777 T A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46037926 G T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 46038286 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46039011 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46039227 C A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 46039299 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46039454 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46039596 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 46039856 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 3 46039988 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 46040535 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 46040757 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 46040846 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 46041025 C G Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 46041334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46041964 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 46042287 G A Y Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 3 46042300 T A Y N 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 3 46048230 T A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46048608 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46049776 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46050234 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 46050488 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46050893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46051213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46051675 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 46051676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46051688 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 46051792 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 46051845 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 46051869 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 46052011 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46052091 C T Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 46052175 T G Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 46052320 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46052701 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46052831 T A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46053063 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46053122 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46053482 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46053701 C A Y N 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 12 8 4 4 2 3 46054026 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 46054136 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46054163 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46054365 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 46054391 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46054519 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 46054561 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 46054610 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 46054800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46054962 C G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46054970 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46055097 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46055196 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 46055285 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 46055309 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 46055310 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 46055438 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 46055457 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46055911 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 46055928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46056090 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46056158 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 46056179 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 46056345 T G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 46056512 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46056716 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 46056750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46056855 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 46056950 G A Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 46057222 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 46057883 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 46058135 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 46058378 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 46058420 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 46058660 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 46059184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46059393 T A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46059500 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46059515 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46059526 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46059554 C A Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 46059711 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46059859 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 46060081 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46060094 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46060268 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46060269 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 46060619 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46060649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46060660 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46060765 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46060807 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 46060873 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 3 46061184 A C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 46061380 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46061520 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46061848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46061880 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 46061920 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 46062685 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46062887 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46062935 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46062996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46063376 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46063505 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46063549 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46063672 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 46063815 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 46063826 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 46063852 A T Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 46064711 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 46064727 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46064854 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46064916 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46064977 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 46065060 G A N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 3 46065175 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 46065183 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 46065234 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 46065236 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 46065491 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46065615 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46065655 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 46065696 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46065977 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 46066151 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46066928 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 46067860 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46067956 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 46068394 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46068435 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46068441 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46068460 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46068486 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46069011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46069121 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46069556 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 46069610 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46069649 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46069738 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 46069774 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 46070060 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46070232 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 46070388 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46070923 T C N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 3 46071134 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 46071202 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 46071263 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 46071357 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 46071444 A C N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 46071537 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 46071971 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 46071988 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 46072104 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 46072142 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46072245 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 46072301 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46072305 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 46072313 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 46072346 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 46072445 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 46072573 G C N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 46072637 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 46072918 A C N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 46073180 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46073251 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 46073252 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 46073402 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 46073498 G C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 46073513 A C N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 46073523 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 46074136 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 46074252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46074303 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 46074369 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46074455 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 46074471 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46074509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46074514 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 46074599 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46074658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46074667 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46074741 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 46074758 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 46074759 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 46074796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46074875 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46074898 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46075195 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 46075296 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 46076030 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 46076080 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 46076170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46076202 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46076682 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46076696 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46076728 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46076758 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46077398 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 46077456 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 46077532 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 46077552 G T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 46077578 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 46077675 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 46077697 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 46077903 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 46078378 A T Y N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 46078412 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 46078490 G A Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 46078592 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 46079263 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 46079448 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 46079450 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 46079467 G T Y N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 46079752 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 46079876 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 46080127 G C Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 3 46080228 T G Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 46080423 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 46080562 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 46080601 G T Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 46080791 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 46080910 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46080927 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46080987 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 46080992 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46081034 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 46081035 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 46081253 A G Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 46081461 T A Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 46081633 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 46081775 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 46081833 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 46081856 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 46081906 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46082478 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 46082541 T G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 46082620 G A Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 46082630 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 46082708 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 46082824 A T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 46082842 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 46082882 C G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 46083029 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 46083042 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 46083151 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 46083254 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46083390 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 46083409 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 46083830 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 46083851 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 46083878 G T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 46083908 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 46084012 G C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46084063 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 46084080 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 46084132 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 46084139 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 46084151 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 46084167 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 46084173 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46084182 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 46084204 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 46084237 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46084333 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 46084430 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 46084432 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 46084572 T G Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 46084608 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 46084615 G A Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 46084655 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 46084898 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 46085021 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 46085465 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 46085532 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 46085651 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 46085656 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 46085893 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 46085970 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 46086060 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46086121 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46086170 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 46086175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46086188 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46086193 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 46086275 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46086337 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 46086364 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 46086412 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46086435 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 46086588 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46086631 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 46086719 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 46086770 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46086796 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 46086808 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 46086873 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 46086926 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 46086981 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 46087040 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 46087077 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 46087264 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 46087291 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 46087363 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 46087418 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46087451 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 46087459 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46087603 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 46087700 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 46088178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46088179 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46088273 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 46088307 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46088319 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 46088682 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 46088746 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 46088940 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 46089063 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46089080 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 46089176 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 46089333 A T N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 46089558 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 46089735 C A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 46089739 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 46090024 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 46090074 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46090137 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46090142 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 46090174 C A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 46090194 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46090426 A T N N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.272727272727273 0.181818181818182 0.545454545454545 8 14 3 2 6 3 46090548 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 46090630 G C N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 46090852 T C N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 46091195 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46091355 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 46091362 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 46091509 G C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 46091523 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 46091543 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46091660 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 46091891 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46091938 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 46091965 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46092157 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 46092165 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 46092321 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 46092507 C A N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 46092579 C T N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.181818181818182 17 5 8 1 2 3 46092621 G C N N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 3 46092980 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 46093463 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 46093949 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46094111 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46094282 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 46094334 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 46094431 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 46094551 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46094582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46094625 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46094758 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46095764 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 46095774 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46095861 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 46095864 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46095946 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46095983 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 46096037 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46096188 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 46096656 C T N Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 5 9 2 1 4 3 46096691 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.2 0.133333333333333 0.666666666666667 8 22 3 2 10 3 46096791 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 3 46097031 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 46097204 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 46097539 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 46098182 C T Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 3 46098233 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 3 46098303 A G N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 3 46098509 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 46098586 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46098596 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 46098625 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 46098684 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46098943 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 46098955 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 46099187 A T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 3 46099432 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 46100050 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 46100149 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46100338 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46100570 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46100615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46100792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46100864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46101037 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46101325 T C N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 46101495 C A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 46101648 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 46102373 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 46102469 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 46102542 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46102946 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 46103875 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46103968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46104800 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46105492 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46105551 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 46106296 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46107458 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46107612 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46107705 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46107762 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 46108192 G C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46108442 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 46108637 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 46108749 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 46109225 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 46109385 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46109588 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 46109694 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 46109712 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46109846 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46109861 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46109932 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46110010 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46110193 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 46111351 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 3 46112046 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46112220 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46112603 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46115330 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 46115874 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46115876 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46116013 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46116352 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 46117246 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46117326 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46117450 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46117597 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 46117691 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 46117711 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 46117804 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 46117809 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46117878 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 46117879 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46118501 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 3 46118794 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46118930 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 46119478 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46119568 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 46119719 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 46119751 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46119766 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46119786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46119788 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46119898 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46119953 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 46120031 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46120185 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 46120307 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46120321 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 46120479 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 46120552 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 46120703 A G N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 46120709 A G Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 46120774 A G N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 3 46121193 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 46121373 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 46121419 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 46121596 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 46122019 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 46122269 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 46122404 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46122464 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46122579 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 46122671 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46122746 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 46122988 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 46123026 A C N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 46123195 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 46123365 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 46123381 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46123387 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46123433 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 46123508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46123514 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46123539 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46123712 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46124329 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46124949 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 46124976 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 46125776 A G Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 46127793 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46128615 A C Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 46129199 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46129886 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46131902 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 46132184 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46132530 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46132768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46133039 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46133359 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46135343 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46136449 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46136484 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46136485 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46136913 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46137947 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46139315 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46139362 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46139380 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46140031 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46140883 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46141854 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46142087 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46142191 A G Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 46145750 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46147885 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46148413 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46148759 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46149748 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46150255 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46150945 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46151134 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46151352 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46151895 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 46152188 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46152294 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 46152318 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46152329 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 46152330 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 46152348 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46152451 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46152781 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46153782 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46154286 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46154421 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46154893 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46156756 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46157251 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46161450 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46161972 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46162388 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46163152 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46163429 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46163525 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46163772 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46163855 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46164967 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46165091 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46166085 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46166166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46167626 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46167964 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46168989 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 46169971 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 46170101 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46170716 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 46171384 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46171872 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46172051 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 46172052 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 46172331 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46173021 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46173215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46173288 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46174948 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 46175200 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46176001 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46176231 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46176339 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 46176737 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46177443 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46178907 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 46180210 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46180370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46180506 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46180921 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 46180939 A T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46181348 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46182112 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46182810 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46182876 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46182884 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46182921 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46183163 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46183252 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 46183641 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46183854 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46183953 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46184022 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46184046 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46184048 A G Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 46184193 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46184307 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46184425 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46184463 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46184689 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46184758 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 46184780 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 46185098 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46185312 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46186110 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 46186524 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46186979 A C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 46187003 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46187098 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 46187108 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 46187180 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46187253 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46187381 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46187487 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46187543 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 46187569 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46187662 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46187766 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46187831 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46187861 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46187887 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46187927 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46187942 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46188026 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46188041 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46188244 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 46188314 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46188332 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 46188343 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 46188443 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46188473 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 46188488 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 46188626 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46188644 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46188670 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46189166 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 46189182 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46189263 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46189413 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46189429 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46189551 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 46189713 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 46189714 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 46189909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46190048 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 46190285 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46190291 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46190297 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 46190342 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 46190445 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 46190457 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46190488 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 46190501 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46190558 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 46190597 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 46190609 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 46190611 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 46190620 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 46190633 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 46190675 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 46190676 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46190751 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 46190780 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 46190878 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 46190967 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 46190970 C A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 46191054 A T Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 46191087 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46191106 T A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 46191345 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46191368 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 46191379 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46191531 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 46191604 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46191650 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 46191664 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 46191901 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 46191902 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 46191953 T A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 46191979 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 46191998 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 46192004 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 46192267 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 46192399 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 46192440 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46192450 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46192558 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46192727 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 46192909 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 46193023 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46193027 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 46193195 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46193198 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46193225 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46193281 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 46193429 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 46193454 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46193491 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 46193684 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 46193788 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46193868 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46193878 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46193905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46193933 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46194111 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46194142 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46194603 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46194858 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46194899 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46194948 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46195045 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 46195068 C G N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 46195160 G A N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 46195184 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 46195309 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 46195618 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46195803 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 46195858 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46195875 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46195970 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46196044 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 46197261 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 46197340 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46197692 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 46197730 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 46197760 T A N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 3 46197877 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 46197922 T C Y Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 3 46198124 A G N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 3 46198129 T C Y Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 46198246 T C Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 46198256 C T Y Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 46198374 A T Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 46198499 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 46198522 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 46198652 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 46198685 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 3 46199269 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 46199285 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 46199310 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 46199392 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 46199612 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 46199623 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 46199681 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 46199688 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46199735 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 46199876 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 46199884 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 46200059 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 46200162 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 46200217 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 46200256 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 46200322 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 46200344 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 46200405 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 46200414 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 46200424 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 46200473 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 46200489 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 46200494 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 46200636 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 46200697 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 46200784 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 46200799 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46200810 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 46200829 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 46200837 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 46200868 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 46200912 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 46200920 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 46201092 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 46201162 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 46201172 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 46201269 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46201421 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46201422 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 46201463 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 46201493 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 46201529 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 46201532 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 46201547 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 46201567 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46201577 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46201696 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 3 46201702 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 46201723 T A N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 3 46202502 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.5 0.416666666666667 8 16 1 6 5 3 46202755 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46202818 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 46202849 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46202862 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 46202976 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46203254 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46203361 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 46203554 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 46203671 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46203692 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46203722 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 46203820 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 46204301 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 46204307 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 46204516 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46204592 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46204674 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46205474 T G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 46205976 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46206024 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 46206530 C T N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 46206616 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46207184 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46207458 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46208286 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46208616 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 46208680 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 46208954 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 46209245 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46209284 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46209423 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46209459 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46209525 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46209727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46209736 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46209783 T G Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 46210131 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46210145 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46210161 G T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 46210337 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46210589 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46210639 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46211308 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 46211692 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46211983 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46212150 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46212189 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46212207 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46212311 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46212651 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 46212759 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46212838 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 46213009 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46213143 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 46213389 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46213747 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46213805 C A Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 46213827 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 46213903 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46214034 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46214406 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46214831 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46215136 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46215227 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 46215364 T G N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 46215415 T C N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 46215439 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 46215564 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 46215654 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 46215730 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 46215749 A T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 46215895 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46216088 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 46216294 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46216383 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46216692 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46216705 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46216726 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 46216983 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46216990 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46217077 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46217165 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46217189 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46217197 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 46217336 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46217556 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46217562 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46217905 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46217909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46217933 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 46218309 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46218335 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46218559 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46218666 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46218938 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46219671 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 46220029 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 46220150 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46220225 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46220227 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 46220386 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 46220467 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46220650 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46220786 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 46220853 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 46221090 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 46221360 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 46221540 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 46221922 A C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 46222065 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 46222136 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 46222206 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46222273 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46222405 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46222422 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 46222635 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 46222941 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 46223148 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 46223156 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 46223283 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 46223417 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 46223456 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 46223516 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 46223716 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46223912 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 46223949 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 46224134 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46224201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46224262 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 46224265 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46224282 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 46224287 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 46224389 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 46224406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46224411 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 46224437 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46224449 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 46224490 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 46224659 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 46224668 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 46224751 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 46224846 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 46224945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46225062 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 46225104 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 46225120 T A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 46225333 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 46225461 T G Y N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 46226003 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 46226018 A T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 46226147 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46226269 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46226358 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 46226533 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 46226567 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 46226787 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 46226940 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 46227009 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 46227137 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46227231 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 46227666 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 46227728 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 46228152 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46228325 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46228335 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 46228919 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46229665 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 46231087 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46232378 G C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46232379 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46233921 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 46234090 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46235256 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46235838 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46236058 C G Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 46236630 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46237193 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 46237714 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 46237812 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46237968 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46238009 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46238205 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46238372 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46238616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46239122 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46240708 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46240913 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 46240980 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 46241056 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46241629 A T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 46242174 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 46242843 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 3 46242939 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 46243763 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46243938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46244301 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46244567 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46244685 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 46244841 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46244959 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46245371 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46245639 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46245941 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46246029 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46246187 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 46246206 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 46246309 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 46246335 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46246395 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46246580 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46247950 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 46252077 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 46252133 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 46252159 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 46252250 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46252300 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46252602 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46252862 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46252887 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 46253247 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 46253649 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46253673 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46253722 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46253933 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 46253946 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 46254668 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46255500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46255863 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 46255901 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46256258 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46256497 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46256509 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 46256741 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 3 46257221 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46257263 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46257347 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46257397 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46257674 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46257779 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46257861 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46258623 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46259023 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46259637 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46259904 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46261303 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46263093 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46264098 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46264400 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46270954 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 46276899 C T Y Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 3 46277233 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 46278685 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46278784 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46278819 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46279224 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46279385 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46279943 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46280151 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46280281 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46281113 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46281871 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 46281882 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46282153 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46283632 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46283732 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46284478 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 46288133 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46288682 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 46288705 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46288736 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 46289266 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 46290324 G T Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 46291131 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 46291600 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 46292307 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46292437 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 46292599 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 46292682 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46293040 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46293234 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46293725 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46294266 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46294267 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46294283 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46294334 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 46294514 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46294761 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46295068 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 46295293 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 46295331 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46295375 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 46295419 T A N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 46295896 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 46295899 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46296000 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 46296086 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46296107 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 46296337 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 46296436 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 46296475 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46296742 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 46296784 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 46296840 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 46296981 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46297301 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46297307 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46297393 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 46297819 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46297844 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46298268 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46298492 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46298496 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46299057 G T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 46299195 A G N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 46299257 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 46299956 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 46300038 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46300184 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46300211 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46300242 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 46300648 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46301129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46301181 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46301200 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46301632 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46301633 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46301752 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46301760 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46302273 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46302670 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46302728 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46302746 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46302935 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 46303531 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46303729 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 46304145 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 46304328 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46304404 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 46304552 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46304577 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 46304600 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46304663 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46304761 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46304789 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46304949 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46305153 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 46305971 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 46305985 T A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 46306027 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46306084 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 46306232 G T Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 46306268 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 46306277 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 46306435 G C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 46306495 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 46306497 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 46306530 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 46306549 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 46306578 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 46306591 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46306744 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 46306796 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 46306848 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 46306872 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 46306909 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 46306959 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 46307001 A G N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 46307051 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 46307098 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 46307100 A G N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 3 46307147 G A N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 3 46307196 A T Y N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 3 46307211 C A N N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 9 5 3 3 1 3 46307241 A C N N 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 3 46307340 A T N N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 3 46307427 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 46307438 T A N N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 9 7 3 3 2 3 46307483 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 46307554 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 46307584 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 46307983 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 46308171 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 46308249 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 46308653 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46308714 T G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 46308817 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 46308900 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46308961 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46308977 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46309009 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 46309077 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 46309094 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 46309108 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 46309118 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 46309133 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46309137 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 46309176 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 46309185 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 46309263 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 46309412 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46309472 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46309655 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 46309928 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 46310041 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 46310078 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46310111 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46310116 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46310255 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 46310288 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46310462 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46310464 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46310928 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46311052 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46311171 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 46311445 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46311645 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46311671 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46311698 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46311741 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46311787 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46311791 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46311848 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46312295 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46312304 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46312498 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46312567 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46312678 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46312751 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46312798 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46313009 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46313204 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 46313239 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46313971 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46314415 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46314486 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46314742 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46315186 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46315753 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46315780 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 46316334 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46316362 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46316806 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46319499 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 46320372 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 46320542 A C N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 46320990 T C N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 46321591 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 46321637 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 46321725 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46322178 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46323294 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 46323310 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 46323313 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 46323856 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46325933 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46326049 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46326295 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 46326332 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46326400 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46326666 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46326909 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46327037 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46327134 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46327185 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46327762 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46328172 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46328330 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46328384 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46328409 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46328821 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46329030 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46329228 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46329282 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46329902 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46330266 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46330480 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 46331294 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46331338 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46331557 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46331694 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46331707 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46331919 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 46332067 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46332301 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 46332541 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46332602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46332627 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46332804 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 46332833 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46332910 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 46333033 G A N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 46333541 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 46333977 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46334118 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46334183 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46334383 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 46334505 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46334869 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46335090 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46335178 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46335288 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46335470 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46337366 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46337527 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 46338145 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46338187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46338658 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 46338781 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 46340929 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46342607 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 46342878 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46342946 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46343092 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 46343104 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 46343290 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 46343305 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46343345 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 46343356 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 46343412 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 46343576 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 46343655 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 46343713 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 46343778 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 46343877 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 46343905 C A Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 46344062 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46344108 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 46344115 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 46344281 C A Y N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 46344307 G A Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 46344349 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 46344496 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 46344507 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 46344578 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0 0.736842105263158 0.263157894736842 14 24 0 14 5 3 46344608 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 46344634 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 46344654 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 46344730 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 46344756 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46344880 T A Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 46344908 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 46344965 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 46345035 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 46345038 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 46345101 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46345194 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46345431 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 46345518 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 46345532 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 46345710 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46345724 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46345757 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46345787 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46345803 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 46345827 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 46345860 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46345873 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46346001 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 46346044 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46346062 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46346068 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 46346109 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46346249 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 46346266 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 46346365 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 46346442 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 46346462 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 46346712 T A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 46347038 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46347144 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46347155 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46347194 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46347234 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46347315 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 46347327 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46347668 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46347743 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46348359 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46348566 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46348618 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46348629 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46348962 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46349033 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46349143 A C N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 46349185 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46349253 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46349600 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46349713 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46349760 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46350057 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46350167 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46350328 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46350502 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46350837 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46350911 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46350957 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46351034 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46351133 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46351148 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46351390 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46351420 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46351448 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46351537 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46351617 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46353081 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 46353300 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46353314 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46353525 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46353599 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 46353614 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 46353654 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46353932 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46353992 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 46354180 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46354494 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46354511 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 46354659 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 46354755 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46354898 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46354919 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46354966 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46355063 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46355182 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46355219 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46355552 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46355621 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46355636 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46355686 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46355694 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46355715 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46355732 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46355906 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 46356193 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46356319 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46356361 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46356527 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 46356572 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 46356595 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46356649 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46356869 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46356890 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46356904 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 46356956 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 46356988 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 46357000 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 46357045 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 46357071 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 46357084 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 46357118 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 46357281 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 46357390 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46357518 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46357596 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46357745 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46357789 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 46357811 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46357933 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 46358029 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 46358142 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 46358168 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46358235 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46358444 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 46358450 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 46358485 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 46358494 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46358592 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46358697 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46358734 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46358933 A T Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 46359158 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 46359170 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 46359314 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 46359336 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 46359575 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46359636 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46359658 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46359787 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46359863 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 46360108 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46360248 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46360823 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 46361237 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 46361841 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46361954 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46362672 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 46363086 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46363287 A C N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 46363723 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 46363724 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 46363743 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 46363815 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 46363959 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46364149 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46364204 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46364308 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46364588 A G N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 46364795 G C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 46364918 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46364938 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46365101 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46365107 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 46365486 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46365613 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46365651 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46365725 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46366199 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46366349 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46367368 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46367508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46367999 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 46368090 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46368706 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 46368745 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 46368834 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46368957 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46368961 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46369255 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 46369458 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46369916 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46370252 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46370310 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46370410 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 46371181 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 46371245 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 46371586 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46372232 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 46372481 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46372500 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46372634 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46372796 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46372843 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 46372877 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46372908 T C Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 46372925 T G Y N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 3 46372940 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 46372980 C G Y N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 46373402 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 46373469 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 46373526 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46373557 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 46373650 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46373761 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 46373856 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 46373864 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 46374236 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46374415 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 46374457 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 46374915 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46374969 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 46375000 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 46375177 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 46375230 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 46375355 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46375599 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46375840 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 46375932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46377106 T G N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.384615384615385 0.0769230769230769 0.538461538461538 11 15 5 1 7 3 46377272 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46377409 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46377564 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46378134 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46378475 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46378537 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46378880 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 46378947 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46378961 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46379004 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 46379059 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46379247 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46379459 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46379524 A T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 46379577 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 46379599 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 46379868 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 46380116 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46380406 A T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 46380470 A G N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 46380506 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 46380513 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 46380576 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 46380608 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46380627 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46380636 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46380640 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 46380662 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 46380677 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46380702 C A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 46380767 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46380898 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 46380967 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 46380980 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 46381032 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46381061 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 46381173 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46381204 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46381207 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46381254 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46381285 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46381368 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 46381581 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46381587 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46381595 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46381626 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46381778 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46381801 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46381953 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46381977 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 46382080 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46382246 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46382332 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46382377 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46382534 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 46382648 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46382659 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46382723 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46382858 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46382860 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46383242 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 46383803 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46383882 T G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 46383936 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46384170 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 46384354 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 46384407 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 46384517 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46384748 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 46384778 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46384797 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46384870 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46385008 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 46385012 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46385121 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 46385246 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46385273 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 46385380 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 46385587 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46386078 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 46386501 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 46387065 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46387143 A T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 3 46387250 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46387639 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 46388051 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 46388419 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 46388446 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 46388664 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46388690 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46388712 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 46388884 G T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 46390041 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46390246 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 46390262 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 46390325 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 46390364 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46390532 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 46390573 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46390613 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46390654 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46390664 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46390678 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46390759 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46390773 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46391353 C T Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 46391796 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46392147 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46392196 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46392338 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 46392471 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46392706 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 46392811 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46392990 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46393133 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 46393161 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46393254 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46393566 C T N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.272727272727273 0.181818181818182 0.545454545454545 8 14 3 2 6 3 46393575 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 3 46393581 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 46393987 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46394093 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46394119 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46394443 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 46394647 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 46395192 G T N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 46395234 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 46395257 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 46395400 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 46395416 T C N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 46395468 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 46395501 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 46395553 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46395713 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46395726 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 46395795 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46395915 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 46395956 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46396058 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 46396111 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46396167 T A N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 3 46396322 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 46396398 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46396478 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 46396562 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 46396569 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 46396590 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46396690 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 46396708 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46396819 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46396829 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46396837 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46397010 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46397021 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 46397122 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 46397150 G T N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 3 46397195 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 46397219 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 46397265 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46397307 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 46397396 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 46397689 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46397753 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46397870 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46397975 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 46398439 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 46398476 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46398563 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46398616 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46398646 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 46398874 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46399117 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46399127 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46399503 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 46399903 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46399961 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46399990 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 46400007 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46400138 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 46400188 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 46400410 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 46400532 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46400593 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46400597 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 46400701 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46401098 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46401130 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 46401165 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46401231 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 46401449 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46401603 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 46401639 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46401806 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 46401837 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46401839 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46401920 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46401983 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46402187 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 46402217 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46402446 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 46402500 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 46402527 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 46402602 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 46402638 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46402675 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 46402789 C A N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 3 46402822 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 3 46403253 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 46403294 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 46403337 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 46403338 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 46403401 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 46403480 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46403591 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 46403662 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 46403680 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 46403814 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46403840 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46403846 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 46404026 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 46404152 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 46404232 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 46404260 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 46404291 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 46404292 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 46404319 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 46404429 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 46404598 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 46404616 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 46404711 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46404769 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 46404825 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 46404844 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46404876 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 46404879 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 46404987 C A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 46405004 A T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 46405144 T A N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 46405282 T G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 46405753 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 46405791 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 46405900 A C N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 46405961 T A N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 46405975 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 46405991 C A N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 46406074 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 46406188 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 46406289 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 46406358 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 46406612 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 46406617 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46406677 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 46406738 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 46406822 G T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 46407285 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46407416 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46407752 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46407762 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 46407806 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46407951 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 46408372 T A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 46408473 A G N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 46408477 T A N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 46408582 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 3 46408718 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 46409147 T A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 46409191 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 46409230 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 46409325 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 46409447 C A N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 46409528 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 46409530 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 46409584 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46409678 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 46409768 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46409851 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 46410133 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46410327 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46410367 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 46410457 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 46410519 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 46410576 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 46410605 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 46410615 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 46410647 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 46410857 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 46410910 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 46410911 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 46410965 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 46411161 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46411253 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46411527 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 46411576 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46411609 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 46411765 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 46411766 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46411827 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 46411855 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 46412223 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46412262 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46412378 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 46412452 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 46412464 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 46412467 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 46412887 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 46413055 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 46413190 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 46413191 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 46413234 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 46413389 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 46413409 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 46413440 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 46413462 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 46413496 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 46413504 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 46413646 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 46413720 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 46414296 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46414314 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 46414515 T C N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 5 11 2 1 5 3 46414762 G A N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 3 46414807 C T N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 3 46414883 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 46415040 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 46415079 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46415192 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 46415282 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46415334 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46415604 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46415955 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46416293 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46416543 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46416571 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46416582 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 46417081 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46417173 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46417649 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46417933 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46417997 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46418145 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46418275 A C Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 46419025 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46419983 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 46420047 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46420215 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46420742 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46420765 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46421379 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46421850 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46422545 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46423090 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 46423199 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46423493 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46423542 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46423779 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46423856 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46423983 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46424232 C A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 46424701 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 46424717 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46424726 C A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 46424740 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 46424861 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 46424890 G T Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 46425198 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46425220 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 46425246 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46425661 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46426423 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 46426496 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 46426524 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 46426594 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 46426607 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46426633 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 46427087 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46427374 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46427431 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 46427579 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46427839 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 46428334 C T Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 46428652 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46428821 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 46428831 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46428835 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46428870 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46428935 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46429006 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46429047 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46429092 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 46429292 G C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46429315 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46429316 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46429775 G T N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.466666666666667 0.2 0.333333333333333 17 13 7 3 5 3 46430145 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46431264 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 46431283 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46431489 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 46431538 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 46431564 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 46431790 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46431792 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 46432245 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46432291 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 46432363 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46432367 A C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46432378 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46432631 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46432823 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 46432824 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46432910 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 46433022 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46433035 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 46433206 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46433243 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46433245 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46433292 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 46433418 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 46433614 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 46433672 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46433673 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46433756 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46433767 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 46433951 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 46433999 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 46434037 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46434149 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 46434174 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46434239 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 46434254 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46434560 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 46434616 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46434643 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 46434695 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46435261 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 46435493 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46435599 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 46435704 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 46435948 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 46435961 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46436096 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46436134 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46436138 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 46436372 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 46436403 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 46436594 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 46436645 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 46436661 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46436693 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46436696 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 46436781 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46436800 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46436848 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 46436887 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46436990 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 46437025 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46437158 C T Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 46437318 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 46437444 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46437470 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46437495 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46437506 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46437518 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 46437552 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46437574 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 46437661 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46438041 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 46438260 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46438313 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 46438469 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46438486 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 46438878 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46438965 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 46439192 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46439450 T A Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 46439561 T G N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 46439597 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 46439760 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46439843 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 46440003 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 46440021 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 46440065 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 46440368 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 46440402 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46440461 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 46440541 C G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 46440601 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46440625 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46440654 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 46440803 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 46440967 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46441127 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 46441137 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46441151 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46441169 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46441201 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 46441271 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 46441316 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 46441317 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 46441383 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 46441410 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 46441437 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 46441678 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46441679 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 46442407 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 46442489 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 46442493 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46442751 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 46442830 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 46442852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46442878 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46443639 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 46443655 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 46444177 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46444297 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46444447 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46444573 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46444859 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46444897 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46444964 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46445358 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46445403 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46445415 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46445615 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 46445669 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 46445676 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46445776 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 46445805 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 46445832 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 46445901 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 46445920 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 46445962 C A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 46445999 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46446038 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 46446068 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46446106 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 46446246 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 46446322 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 46446333 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 46446513 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 46446525 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 46446621 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 46446663 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 46446789 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 46446790 G T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 46446806 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 46446811 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 46446833 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 46446912 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 46446922 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 46446927 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 46447057 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46447071 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 46447122 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 46447125 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 46447153 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 46447162 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 46447206 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 46447241 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 46447455 G T N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 46447464 C T N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 46447487 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 46447488 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 46447561 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 46447577 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 46447661 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 46447782 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 46447799 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46447849 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46448248 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46448311 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 46448339 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46448392 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46448396 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 46448463 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46448761 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 46448893 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 46448906 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 46449180 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 46449200 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 46449201 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 46449278 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 46449413 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46449445 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 46449472 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 46449479 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46449664 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 46449674 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 46449746 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 46449784 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 46449808 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46449815 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46449848 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46449863 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 46449884 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46449899 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46449948 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 46449992 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 46450005 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46450031 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 46450033 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 46450065 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46450085 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46450122 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46450234 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 46450331 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46450355 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 46450365 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 46450405 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 46450518 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46450526 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46450547 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 46450660 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 46450717 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46450747 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 46450792 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46450963 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46451044 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 46451099 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46451108 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46451124 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46451126 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 46451177 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 46451200 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 46451304 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 46451334 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 46451363 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 46451378 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 46451429 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46451491 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46451538 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46451667 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 46451673 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 46451696 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 46451712 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46451730 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 46451762 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 46451767 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 46451807 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 46451818 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 46451854 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46451924 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46452005 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46452006 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 46452076 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46452114 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46452176 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46452210 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46452258 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46452278 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46452348 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46452354 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46452413 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46452518 A G Y Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 46452526 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 46452558 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 46452636 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46452778 T G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 46452788 G C N N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 3 46452847 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 46452870 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 46452915 C T N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 46452945 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 46452970 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 46452973 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 46459820 T C N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 46459822 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 46459867 G C N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 46459880 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 46459885 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 46459969 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 46459971 G A N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.571428571428571 0.214285714285714 0.214285714285714 19 9 8 3 3 3 46460044 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46460090 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 46460165 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 46460197 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46460300 A C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 46460364 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46460480 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 46460622 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 46460711 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 46460896 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46461066 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 46461277 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 46461418 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 46461463 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 46461856 G T N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 46461915 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 46461935 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46462124 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46462148 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46462177 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 46462192 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 46462364 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46462495 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 46462529 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 46462559 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 46462607 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 46462827 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 46462839 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 46462845 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46464395 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46464900 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 46465381 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46465607 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46465859 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46466462 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46466754 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46467224 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46467237 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46467384 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46467402 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46467461 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 46467629 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 46468169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46468468 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 46468635 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46468637 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46468760 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46469419 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 46469423 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46469690 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46469704 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46469869 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46469875 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46470081 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46470285 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46470311 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46470420 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46470679 T A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 46471009 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 46471199 T C N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 3 46471334 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46471493 G C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46471563 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 46471782 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 46471826 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46472196 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46472484 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46472639 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46472777 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 3 46472822 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 46473282 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 46473459 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 46473957 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 46474283 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 46474469 T A N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 3 46474602 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 46474616 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46474648 G T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 46475014 C T Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 46475088 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 46475151 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46475171 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 46475186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46475214 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46475356 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46475398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46475401 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46475487 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46475612 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46475613 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46475683 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46475861 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 46475879 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 46475896 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46475911 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46476019 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46476162 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46476360 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 46476691 G A Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 46476839 C G N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 3 46477068 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46477139 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 46477149 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 46477158 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46477168 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 46477205 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46477280 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 46477360 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 46477520 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46477545 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 46477563 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46477668 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46477684 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46477735 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46477780 C G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 46477781 A T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46478043 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46478060 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46478085 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 46478109 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 46478142 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 46478152 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 46478188 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 46478207 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 46478220 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 46478223 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46478255 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 46478299 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 46478309 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 46478585 T G Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 46478592 T G Y N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 46478605 A C N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 46478609 G T Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 46478633 A T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 46478672 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 46478700 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 46478748 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 46478763 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 46478774 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 46478816 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 46478830 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 46478848 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 46478850 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 46478893 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 46478924 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 46478927 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 46479091 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46479124 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 46479137 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46479163 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 46479239 G T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 46479396 T G Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 46479404 T C Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 46479407 A C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 46479425 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 46479437 T G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 46479438 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 46479499 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 46479535 G C Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 46479589 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 46479606 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 46479631 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 46479769 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 46479947 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 46479952 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 46479988 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 46479989 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 46480039 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 46480067 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 46480106 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46480249 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 46480255 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46480322 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46480373 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46480492 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46480576 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46480603 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46480607 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 46480620 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46480669 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46480740 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46480778 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46480779 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46480808 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 46480819 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 46480844 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46480848 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 46480916 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 46481172 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 46481189 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 46481236 A C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 46481294 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 46481359 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 46481445 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 46481523 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 46481553 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 46481558 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46481567 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46481586 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 46481600 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 46481699 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 46481774 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46481834 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 46481847 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46482143 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46482151 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46482193 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46482302 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 46482336 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 46482351 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46482475 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46482491 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 46482503 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46482528 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46482537 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 46482669 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46482897 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 46482924 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46482932 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 46482939 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 46482990 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 46483019 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 46483026 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 46483069 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46483189 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 46483252 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 46483346 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 46483354 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 46483436 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 46483454 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46483534 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46483540 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 46483572 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 46483616 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46483661 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46483770 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 46483777 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46483853 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 46483889 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46484221 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46484274 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 46484311 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46484675 C G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46484776 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 46484861 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 46485038 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 46485057 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46485093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46485309 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 46485328 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 46485349 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46485424 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 46485554 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46485613 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 46485622 G C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 46485648 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 46486054 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 46486162 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46486173 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46486216 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 46486287 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 46486355 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 46486366 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46486390 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 46486418 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 46486485 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 46486497 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 46486566 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 46486633 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 46486644 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 46486682 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46486702 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 46486774 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 46486799 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 46486837 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 46486898 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 46486953 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 46486971 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 46486978 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 46486982 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 46487083 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 46487098 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46487106 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 46487140 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 46487184 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 46487215 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 46487221 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 46487272 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 46487349 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 46487468 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 46487724 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 46487776 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 46487894 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 46487895 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 46487940 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46487985 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 46488060 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46488141 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 46488186 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 46488354 T A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 46489022 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 46489041 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 46489092 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 46489096 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 46489256 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46489299 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 46489321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46489420 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 46489436 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 46489547 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 46489662 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 46489690 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 46489882 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 46489937 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 46490043 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 46490234 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 46490323 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 46490382 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 46490405 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 46490461 T A Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 46490576 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 46490595 T C N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 46491014 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 46491079 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46491161 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46491259 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 46491353 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 46491610 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 46491679 T C Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 46491749 C A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 46491800 A G Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 46491883 G T Y N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 46491902 A G Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 46491918 A G Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 46492395 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 46492555 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 46492606 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 46492687 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 46492743 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46492873 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 46492941 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46492954 A C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 46493260 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 46493492 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 46493584 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 46493602 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 46493763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46493787 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46493860 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46493873 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 46493894 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46493933 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 46494217 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 46494218 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 46494245 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 46494269 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 46494332 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 46494424 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 46494426 A C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 46494774 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46494799 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 46494841 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 46494842 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 46494891 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 46494999 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 46495005 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 46495069 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 46495078 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 46495098 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 46495119 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 46495168 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 46495177 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 46495264 A C N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.230769230769231 0.538461538461538 0.230769230769231 13 13 3 7 3 3 46495272 A G Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 46495375 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 10 8 3 4 2 3 46495418 G A Y Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 6 6 2 2 2 3 46495424 T G Y N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 3 46495570 G C N N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.363636363636364 0.363636363636364 0.272727272727273 12 10 4 4 3 3 46495684 A C Y N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 46495707 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 46495907 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46496195 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 46496225 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46496365 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 46496378 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46496431 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 46496546 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 46496597 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 46496656 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 46496658 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 46496669 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 46496686 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 46496706 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 46496742 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 46496757 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 46496874 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46496895 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 46496944 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 46496946 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 46497009 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 46497097 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46497182 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 46497187 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46497243 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 46497817 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46497834 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 46497865 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 46497949 A T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 46497981 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 46498136 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 46498224 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 46498414 A T N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 3 46498456 A G Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 46498480 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 46498564 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 46498565 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 46498580 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 46498608 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 46498688 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46498770 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 46498787 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 46498839 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 46498902 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 46498990 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 46499159 G T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 46499175 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 46499266 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46499341 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 46499440 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 46499579 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 46499607 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 46499660 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 46499695 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 46499709 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 46499801 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 46499859 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 46499860 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46500015 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 46500036 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 46500180 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46500181 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46500419 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 46500441 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46500492 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 46500498 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 46500520 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46500543 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 46500654 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 46500957 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46501347 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 46502025 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46502117 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46502192 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 46502241 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 46503066 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46503739 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46503811 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46503973 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46504068 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46504085 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 46504318 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46504354 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46504505 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46504743 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46504826 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 46504847 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 46504953 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46505001 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46505018 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46505142 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 46505206 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46505447 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46505565 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46506222 A T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 46506918 C G Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 46507334 C T Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 46507359 C T Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 46507711 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 3 46507729 T C Y Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.454545454545455 0.454545454545455 0.0909090909090909 15 7 5 5 1 3 46508246 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46508331 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46508537 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 46508878 T A N N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 10 10 3 4 3 3 46509152 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 46509180 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46509229 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 46509246 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 46509274 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 46509313 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 46509346 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 46509350 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 46509368 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 46509401 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 46509446 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 46509498 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46509528 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 46509582 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46509589 T C N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 46509678 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.375 0.1875 0.4375 15 17 6 3 7 3 46509746 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46509811 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 46509928 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 46510011 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 46510120 T C N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.357142857142857 0.214285714285714 0.428571428571429 13 15 5 3 6 3 46510468 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 46510678 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46510704 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 46510865 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 46511076 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46511087 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46511106 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46511126 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 46511321 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46511833 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46511982 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 46512009 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 46512010 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 46512127 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 46512176 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46512297 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 46512707 G T Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 46513127 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46513163 A C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 46513212 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 46513234 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 46513259 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 46513433 G C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 46513454 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46513491 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 46513507 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46514079 T A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 46514104 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 46514147 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 46514288 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 46514381 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 46514405 A G Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 46514463 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 46514499 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 46514501 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46514511 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 46514575 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 46514604 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46514891 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46515081 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 46515117 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46515218 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 46515509 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 46515522 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 46515574 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 46515605 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 46515633 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 46515684 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 46515744 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 46515771 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 46515845 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 46515999 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46516053 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 46516070 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 46516072 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 46516101 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 46516145 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 46516201 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 46516213 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 46516266 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46516611 C G N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 3 46516624 T A N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 16 12 6 4 4 3 46516828 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 46516861 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 46516897 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 46516927 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46516943 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 46516950 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 46516978 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 46517000 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 46517154 T A N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 3 46517194 C T N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.454545454545455 0.454545454545455 0.0909090909090909 15 7 5 5 1 3 46517203 C T N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 3 46517264 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 46517309 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 46517369 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46517385 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 46517388 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 46517403 G A Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 46517425 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 46517435 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 46517438 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 46517457 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 46517503 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 46517516 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 46517544 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 46517609 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 46517635 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 46517714 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 46517727 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 46517778 T G Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 46517786 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 46517829 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 46517904 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 46517947 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 46517973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46518153 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46518240 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 46518278 T G Y N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 46518292 A T Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 46518530 T C Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 46518696 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 46518831 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46518875 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 46518912 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 46518982 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 46518998 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 46519049 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46519055 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 46519086 G T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46519198 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46519202 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46519234 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 46519236 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 46519270 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 46519334 G T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 46519634 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 46519639 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 46519686 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46519742 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 46519981 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 46520156 C A N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 46520222 C T N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 3 46520403 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 46520502 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 46520539 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 46520594 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 46521088 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46521272 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 46521358 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46521543 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 46521608 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 46521632 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46521794 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46521884 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 46521949 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46521978 T A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 46522179 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46522214 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46522265 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46522318 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46522381 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46522399 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46522425 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46522678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46522778 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46522832 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46523190 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 46523306 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 46523726 G T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 46523771 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46523854 G A Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 46524006 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 46524138 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46524237 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 46524625 T A Y N 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 3 46524626 G T Y N 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 3 46524682 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 46524762 G A Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 3 46524834 C A N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 46525215 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 46525375 A C N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 3 46525532 T A N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 3 46525552 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 46525918 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46525929 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 46525983 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 46526267 C G Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 46526335 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 46526370 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 46526413 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46526493 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46526977 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 46527101 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 46527105 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 46527216 A G Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 46527245 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 46527339 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 46527378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46527487 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46527672 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 46527693 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46527877 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46528959 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 46529078 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46529130 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46529153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46529255 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46529278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46529464 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46529531 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46529564 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46529735 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46529846 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46529890 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46529930 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46530076 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46530099 T A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 46530169 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46530176 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46530232 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46530338 A T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 46530366 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46530423 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 46530447 C G N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 46530678 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46530689 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46530903 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46530936 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46530958 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46530970 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46530984 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46531128 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46531529 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 46531582 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46531597 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46531611 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46531653 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46531690 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46531703 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46531760 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46531804 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46532093 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 46532144 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46532212 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46532240 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46532258 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46532360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46532419 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46532535 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46533156 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46533548 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46533719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46533964 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46534425 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46534707 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46534715 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46535004 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46535152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46535255 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46535943 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 46535973 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 46536756 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46536827 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46537631 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46538727 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46545994 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46546284 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 46546775 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 46547083 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46547112 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46547497 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46547909 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 46548292 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46548370 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46548851 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46549202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46549629 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46549633 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46549771 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46550001 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46550170 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46550246 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46551143 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46552590 A T Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 46553011 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46553153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46553267 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46554047 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46555108 A G Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 46555129 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46556026 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46556245 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46556956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46557291 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46557549 G T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46557897 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46559879 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46560158 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46560192 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 46560318 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46560638 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 46560749 A T N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 46561153 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46561730 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 46562506 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46562854 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46563063 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46563459 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46564306 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46564311 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46565099 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46565714 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46566731 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46566891 A G N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 46567521 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46568817 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46568961 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46569756 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46569969 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 46570742 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46573084 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46573167 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46573729 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46575955 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46576221 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 46576676 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 46576851 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46577205 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 46577221 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 46577256 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 46577269 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 46577730 C A N N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 3 46578092 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 46578887 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46578986 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 46579151 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46579207 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 46579475 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46579525 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 46579550 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 46579570 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46579797 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 46580107 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 46580186 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 46580335 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 46580674 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 46580767 A T N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 3 46581099 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 46581200 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46581232 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46581291 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 46581447 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46581448 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 46581566 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 46581686 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 46581772 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46582085 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46582283 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46582295 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 46582419 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46582437 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46582571 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46582691 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 46583001 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 46583037 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 46583085 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46583099 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46583338 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 46583343 C G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 46583389 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 46583692 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 46583825 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 46583830 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 46583890 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 46584090 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46584141 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46584197 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 46584214 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 46584223 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 46584731 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46584978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46585176 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 46585397 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 46585399 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46585482 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 46585565 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 46585589 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 46585606 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46585789 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 46585857 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46585869 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 46585873 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46585956 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 46585990 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 46586116 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 46586166 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 46586177 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46586178 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 46586195 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 46586212 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46586260 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46586300 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46586395 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 46586474 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 46586599 T C N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 3 46586621 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 46586692 A G N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 3 46586742 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 46586743 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46586772 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 46587000 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 46587083 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46587103 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46587444 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 46587645 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 46587733 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 46587844 A C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 46587847 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46587953 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46588004 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 46588113 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46588141 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 46588191 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46588411 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46588491 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 46588541 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 46589689 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46589702 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 46589724 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 46589753 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46589842 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 46589858 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46589888 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 46589939 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 46589988 G T N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 46590074 G T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 46590127 T C N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 3 46590202 T A N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 46590212 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 46590457 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 46590500 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 46590575 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 46590581 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 46590597 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 46590774 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 46590775 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 46590811 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 46590890 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 46590976 A T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 46591127 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 46591152 A G N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 46591299 G T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 46591320 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 46591464 A T N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 46591639 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46591724 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46591754 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46591774 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46591800 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46591805 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46591822 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46591896 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46591940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46592073 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46592225 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46592300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46592345 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46592479 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 46592514 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46592536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46592590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46592660 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 46592839 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46592870 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46592921 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46592955 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46593033 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46593074 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46593199 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 46593219 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 46593982 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46594621 A T N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 3 46594817 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 46595347 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46595612 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46595837 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46595982 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 46596144 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46596175 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46596183 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46596190 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 46596502 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46596646 G T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 46596992 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46597313 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46597371 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 46597529 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46597662 G A Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 46597780 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46597984 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46598006 C G Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 46598177 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 46598182 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 46598247 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46598450 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46598484 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46598542 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 46609674 G T N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 3 46609800 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46609825 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46609849 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46610136 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 46610156 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46610281 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46610363 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46610477 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46610611 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 46610672 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46610974 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 46611059 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 46611095 A T N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 3 46611675 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 46611899 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46611917 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46611986 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 46611991 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 46612121 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 46612149 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 46612177 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 46612225 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46612432 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46612811 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46613240 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46613445 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 46613454 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 46613524 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 46613805 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46613992 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46614290 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46614294 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 46614395 C A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 46614451 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 46614470 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46614709 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 46614711 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46614781 G C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 46614976 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 46615002 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46615204 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 46615258 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 46615349 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 46615389 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 46616074 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 46616325 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 46616387 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46616500 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46616604 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46616720 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 46616753 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46616768 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46616952 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46616975 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46616976 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 46617142 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 46617296 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46617352 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46617457 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46617970 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 46618186 A G N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 46618327 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46618367 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46618376 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46618394 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46618708 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46618815 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46618836 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46618839 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46618880 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46619243 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 46619285 C A Y N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 46619352 A C Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46619381 C T Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 46619433 A G Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 46619444 G C Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46619448 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 46619459 T G Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46619536 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 46619584 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 46619794 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46620203 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 46620219 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46620407 C G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 46620470 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46620615 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46620650 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46620688 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46620745 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46620931 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46620981 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46621008 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 46621045 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46621166 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46621213 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46621227 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46621309 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46621391 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46621502 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46621589 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 46621661 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46621792 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 46621815 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 46621886 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46622069 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46622105 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46622125 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46622174 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46622194 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46622222 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46622228 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46622244 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46622252 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 46622288 C G Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.0555555555555556 18 18 1 16 1 3 46622606 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46622653 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46622734 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46623228 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 46623449 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 46623453 G A N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 46623513 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 46623528 T A N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 46623601 G A N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 46623612 G C N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 46623669 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 46623868 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 46623934 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 46623993 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 46624012 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46624117 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46624120 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 46624180 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 46624215 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 46624233 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 46624241 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46624285 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46624397 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46624464 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46624509 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46624530 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46624568 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 46624629 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46624702 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46624942 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 46624970 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46624979 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46625257 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46625480 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46625747 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 46625866 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 46626209 G A N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 46626394 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46626398 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46626484 G T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 46626537 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46626659 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 46626945 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 46626988 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46627545 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 46627896 A C N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 46627934 A G N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 46628148 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 46628172 T A N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 46628696 C A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 46629089 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 46629156 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46629186 A C Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 46629228 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 46629338 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 46629395 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 46629415 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 46629452 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 46629563 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 46629643 G C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 46629712 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 46631442 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 46631583 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 46632044 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46632225 G C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 46632578 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 46632693 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46632850 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46633479 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46634086 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46635562 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46635892 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 46636338 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46636553 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46637224 A C Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 46637484 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 46637530 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 46637538 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 46638417 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 46639074 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 46639363 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46639452 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46639662 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46639841 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46640368 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46642695 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 46642755 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46642887 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 46643049 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 46643075 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 46643076 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46643319 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46643427 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 46643428 C G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 46643461 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46643687 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46643926 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 46643961 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46644074 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 46644103 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 46644433 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46644480 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46644487 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0 0.894736842105263 0.105263157894737 17 21 0 17 2 3 46644577 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 46644729 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46644761 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 46644797 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46644944 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46644965 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46645065 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46645338 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 7 11 2 3 4 3 46645460 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 46645603 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46645742 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46645807 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46646167 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46646238 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46646311 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 46646377 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 46646645 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46646755 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46646761 C G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 46647322 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 46647411 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 46647414 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 46647442 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46647547 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 46647557 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 46647663 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 46647671 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46648109 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 46648421 G T N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 3 46648948 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 46648958 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 46649014 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46649242 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46649418 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46649567 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 46649955 T G Y N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 46650071 T C Y Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 46650897 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 46650946 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46651021 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46651067 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46651106 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 46651243 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 46651245 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46651395 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 46651449 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46651528 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 46652076 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 46652125 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46652138 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 46652214 T C Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 46652337 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46652382 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46652677 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46652938 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46652950 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46652980 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46653081 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 46653725 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46653871 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46654017 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46654056 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46654221 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46654314 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 46654852 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 46654963 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 46655018 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46655131 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46655152 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46655232 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46655420 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46655594 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46655640 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46655645 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 46655837 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 46656092 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 46656141 C T N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 3 46656428 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 46656702 T A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 46656711 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46656859 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 46656925 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46656966 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 46657271 G C N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 3 46657312 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 46657337 G A Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.384615384615385 0.538461538461538 0.0769230769230769 17 9 5 7 1 3 46657528 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 46657674 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46657897 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 46658064 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46658518 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 46658607 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 46658836 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46658866 G C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 46659147 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 46659266 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 46659306 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46659427 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 46659699 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46659748 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46659759 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 46659790 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46659866 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46659931 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 10 8 3 4 2 3 46660085 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 3 46660158 A G N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 46660335 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46660481 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 46660675 C G Y N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 3 46660705 A C Y N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 3 46660753 A C Y N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0 0.909090909090909 0.0909090909090909 10 12 0 10 1 3 46660930 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46661235 A G Y Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 46661793 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 46662131 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46662300 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 46662522 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46663121 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46663602 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 46663706 G A N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.363636363636364 0.454545454545455 0.181818181818182 13 9 4 5 2 3 46664030 T C N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 46664682 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46664735 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 46664777 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46664900 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46665100 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46665126 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46665318 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 46665362 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46665705 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46665907 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46665914 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46666003 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46666160 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46666604 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46666669 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46666768 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46666901 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46666966 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46667051 C G N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 46667271 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46667434 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 46668048 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 46668132 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46668275 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 46668480 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 46668657 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46668764 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46668806 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46669292 G A N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 3 46669355 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 46669359 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 46669817 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46669880 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 46669984 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46670097 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46670129 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46670254 C A Y N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 3 46670465 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 46670476 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46670585 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.0555555555555556 18 18 1 16 1 3 46670921 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 46671007 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46671080 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46671103 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 46671126 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46671465 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46672032 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 46672045 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46672098 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46672293 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 46672569 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 46672824 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 46672827 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 46672912 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 46673390 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 46673426 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46673588 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46673642 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46674207 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 46674398 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46674409 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 46674416 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46674541 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46674807 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46675137 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46675931 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46676047 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46676074 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46676265 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46676852 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 46676874 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 46677159 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 46678038 T G N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 46678083 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46678097 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 46678119 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 46678294 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46678778 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46679727 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 46679946 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46680117 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46680278 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46680293 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 46680340 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 46680360 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 46680527 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46680528 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46680560 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 46680619 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 46680797 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46680815 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46681006 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46681028 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46681194 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46681204 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46681213 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46681293 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46681303 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46681343 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46681479 G C Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 46681480 T G N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.0625 0.625 0.3125 12 20 1 10 5 3 46682044 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46683196 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46683859 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46684694 C T Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 3 46684821 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46684909 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46685049 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46685098 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 46685148 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46686027 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46686524 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46686789 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46686952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46687207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46688096 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46688138 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46688164 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46688207 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46688270 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46688916 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46689423 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46689555 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46689630 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46689761 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46690839 G A Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 46691005 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 46692766 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 46693540 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46694754 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46695818 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46696061 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46696367 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46696628 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46696777 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46696861 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46698050 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 46698498 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46698499 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46698653 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46699452 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46700486 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46701176 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46701387 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46701426 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46701557 T G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46702793 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46702868 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46703129 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46703966 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46704369 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46704613 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46704678 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46704891 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46704939 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46705397 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46705408 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46705440 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46706740 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46707020 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 46707233 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46709003 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46710515 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46710556 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46710755 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 46713668 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46714166 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46720457 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 46720723 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46722248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46722295 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46723495 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46724322 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46732785 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46733454 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46733502 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46733551 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46740766 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 46741870 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46741968 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46743108 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46743495 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 46743596 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46746679 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46748484 C G Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 46749019 A T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 46749334 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46750062 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46751181 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 46751229 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 46751696 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46752107 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 46752528 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 46752562 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46752585 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46753069 T A N N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 3 46753124 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 46753980 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46754867 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46755376 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46755471 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46755757 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46756026 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46757639 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46758298 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46758568 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46759186 T A Y N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 46759491 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 46760759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46761038 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46761069 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 46761157 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46761226 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46761990 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46762153 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46762574 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46762830 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46764403 C T Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 46765118 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46765275 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46765592 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46765907 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46766724 A T N N 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 46766957 A T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 46767261 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 46767489 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46768159 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46768236 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46768555 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46769221 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46769922 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46770435 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46770603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46771838 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 46772641 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 46773733 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46775126 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46775702 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46775751 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 46775848 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 46776977 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 46777873 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46785776 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46787939 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 46788526 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46789090 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46791390 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46791528 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 46791778 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46792192 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46792254 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46792549 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 46796879 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46797095 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46797358 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46797851 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46798245 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 46798641 G T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 46798731 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 46800161 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46800866 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46802925 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46803458 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 46804305 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46804602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46804795 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46804978 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46805051 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46805444 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46806287 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46806653 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46807126 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 46807378 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46808231 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46808323 G C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 46809232 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46810324 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46811654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46813239 C T Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 46814473 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46814490 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46814928 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46815161 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46816439 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46816985 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46819141 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46819361 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46819677 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 46819956 A G Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 46820059 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 46820532 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 46820904 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 46820948 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46820974 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46821326 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46821417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46822467 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46824249 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46825077 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46825345 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46825590 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46825905 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 46826393 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46826618 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46826879 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46826924 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46826974 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46827030 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46827243 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46827599 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46827644 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46827748 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 46827794 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46827933 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46827970 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46828001 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46828065 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46828205 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46828260 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46828295 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 46828402 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46828534 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46828553 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46828937 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46828960 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 46829097 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46829113 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46829457 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46829620 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46829708 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46829771 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46829792 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46829906 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 46830135 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46830152 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46830704 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 46830947 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46831166 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46831962 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46832166 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46832300 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46832663 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46832880 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46833050 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46833169 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46833269 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46834379 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46834585 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46834610 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46835242 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46835647 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46835665 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46837634 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46837962 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46838076 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46838327 C G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46839103 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46839123 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46839139 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46840186 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46840343 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46840384 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46840735 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46840821 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46840831 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46840928 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46841846 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46841875 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46842153 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46842608 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46843465 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46843533 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46843604 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46843809 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46843952 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46843974 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 46844003 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46844284 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46845808 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46846170 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46846303 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 46846921 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46847818 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46848007 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46848063 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46848655 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46848994 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46849094 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 46849186 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46850238 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 46850583 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46850878 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46851048 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46851787 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 46851932 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46855823 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 46857479 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 46859479 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46859561 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46860056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46860601 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 46861995 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46862578 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46864024 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46865056 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46865395 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46866268 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 46867603 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 46867936 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46868067 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46868501 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 46868734 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46869008 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46869066 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46869632 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 46870043 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 46870250 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46870664 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46870903 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 46870907 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 46870930 A G N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 3 46874909 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 46875466 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46875500 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 46875778 A G Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 3 46882331 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46882535 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46882948 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46883294 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46883419 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46884164 G T Y N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 3 46885331 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 46885932 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46886152 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46886770 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 46887286 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46888656 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46889664 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46890934 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46890962 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46891143 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46891392 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46891919 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46891967 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46891976 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 46892267 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46892346 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46892570 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46892990 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46893110 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 46893236 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46893244 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 46893256 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46893310 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 46893410 G A Y Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 46893451 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46893460 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 46893532 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46893769 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 46893824 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 46894279 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46894348 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46894515 T G Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 46894612 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46894808 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46895702 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 46895955 T A N N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 10 10 4 2 4 3 46895979 T C N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 46896378 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 46896559 G T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 46896609 T C Y Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 46896620 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 46896695 A G N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.307692307692308 0.230769230769231 0.461538461538462 11 15 4 3 6 3 46897302 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46897419 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 46898887 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46899248 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 46899250 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46899930 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 46901259 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46903328 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46903675 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46903919 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 46904031 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46904389 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46904727 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46904862 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46905201 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 46905223 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46905407 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46906189 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 46906364 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 46907469 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46907730 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46909409 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46910649 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46910857 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46911909 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46912875 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46912893 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46913483 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46915252 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 46916248 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 46918285 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46918655 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46923528 A G N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.714285714285714 0.285714285714286 10 18 0 10 4 3 46925575 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46925774 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46927061 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46927108 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 46927111 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 46927218 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 46927251 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 46927290 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 46927359 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 46927370 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 46927409 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 46927498 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 3 46927549 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 46927595 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 3 46927630 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 46927860 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 46927905 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46927931 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 3 46927964 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 3 46928023 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 46928032 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 46928225 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 3 46928277 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46928337 A T N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.75 0 0.25 24 8 12 0 4 3 46928358 A C N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.8 0 0.2 24 6 12 0 3 3 46928594 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.294117647058824 23 11 11 1 5 3 46928610 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.611111111111111 0.111111111111111 0.277777777777778 24 12 11 2 5 3 46928659 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 3 46928700 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 46928730 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 3 46928870 C G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 3 46928917 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.611111111111111 0.111111111111111 0.277777777777778 24 12 11 2 5 3 46928989 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 46928992 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 46929038 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 3 46929133 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 46929139 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 46929216 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 46929230 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 3 46929292 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 3 46929337 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 46929343 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 46929524 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 3 46929565 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 3 46929570 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46929644 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 3 46929667 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 46929745 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 3 46929752 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 46929784 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 3 46929830 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 3 46929880 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 46929942 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.611111111111111 0.111111111111111 0.277777777777778 24 12 11 2 5 3 46929992 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 3 46930011 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 3 46930048 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 3 46930121 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 3 46930149 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 3 46930180 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 46930223 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 3 46930229 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 3 46930243 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 3 46930247 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 3 46930254 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 3 46930259 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 3 46930272 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 3 46930479 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 3 46930518 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 46930641 T G N N 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 3 46930695 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 12 6 6 0 3 3 46930697 C T N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 9 11 3 3 4 3 46930746 C G N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 46930813 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 46930895 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 3 46930945 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 3 46930959 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 3 46931045 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46931115 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 3 46931166 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 3 46931195 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 46931208 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 46931274 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 46931337 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 3 46931346 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.611111111111111 0.111111111111111 0.277777777777778 24 12 11 2 5 3 46931583 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 46931617 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.625 0.125 0.25 22 10 10 2 4 3 46931852 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 46932046 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 3 46932050 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 3 46932063 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 3 46932102 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 3 46932197 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 46933627 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46934667 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46935047 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46935411 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 3 46935490 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 46936084 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46936565 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46936660 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 46937059 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46937175 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46937296 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 46937323 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 46937336 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 46937340 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 46937352 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 46937399 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 46937413 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 46937546 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 46937588 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 46937644 G T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 46937658 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 46937665 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 46937754 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 46937806 T A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 46937846 G C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 46937864 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 46937899 G C N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 46937908 C G N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 46937997 A G N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 3 46938069 T A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 46938167 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 46938218 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 46938240 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 46938265 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 46938342 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 46938360 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 46938386 G C N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 46938431 C A N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 46938434 C A N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 46938457 A C N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 46938461 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 46938494 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 46938689 A T N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 46938814 T G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 46938828 G T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 46938960 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 46938996 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 46939031 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 46939126 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 46939196 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 46939450 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46939451 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46939783 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 46939837 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 46939931 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46939951 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46939982 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 46940083 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46940092 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46940121 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46940402 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46940585 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 46940965 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46941293 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 46941326 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 46941351 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 46941642 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46941824 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 46941825 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 46942358 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 46943060 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46943064 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 46943107 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46943181 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46943522 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 46943930 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46943978 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 46944047 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46944107 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46944118 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 46944592 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 46945400 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 3 46945422 C G Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 46945552 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 46945628 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 46945767 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46946036 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 46946037 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 46946227 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46946260 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46946665 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46946818 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.210526315789474 29 9 14 1 4 3 46946903 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 46946997 C G N N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 14 10 6 2 4 3 46947229 T C N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 15 5 7 1 2 3 46947347 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 46947423 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 46947495 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 46947571 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 46947605 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 46947939 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 46948024 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 46948296 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 46948623 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 46948764 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 46948781 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 46949008 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46949124 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46949283 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 46949376 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 46949413 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46949513 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46949586 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46949617 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 46949750 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 46949819 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46949868 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 46950109 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46950126 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 46950185 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 46950362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 46950576 T G Y N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 46950579 G A Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 46950639 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 46950977 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46951383 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 46951429 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46951465 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 46951526 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 46951574 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46952220 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46952347 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46952771 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46952822 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 46954320 C T Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 3 46954449 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 46954469 T G N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 46954998 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 46955038 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 46955310 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46956080 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 46957115 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46957323 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46957904 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46958225 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46958460 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46958493 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46958718 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46959185 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 46959447 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46959458 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46959462 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46959611 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 46959755 T C Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 46959843 C G Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46959926 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46959937 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 46960161 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46960297 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46960301 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 46960383 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46960429 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 46960541 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46960625 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 46960723 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 46960958 G A Y Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 3 46961077 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 46961087 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46961153 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 46961278 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46961289 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46961397 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46961452 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 46961512 T A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46961578 A T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46961758 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46961800 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 46961827 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 46961981 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 3 46961993 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46962025 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46962066 C T Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 46962227 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 46962325 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 46962495 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46962626 G A Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 46962642 T A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46962764 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46962941 T C Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 46962973 T A Y N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 46963070 A T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46963088 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 46963113 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46963185 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 46963258 A G Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 46963272 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46963429 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46963989 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46964097 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46964239 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 46964366 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 46964397 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 46964667 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 46964686 C G Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 46964785 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46964917 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 46964928 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 46965023 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 46965280 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 46965384 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46966310 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46966352 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46966576 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46966656 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 46966733 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 46966830 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 46966999 C A Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 46967109 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 46967952 A G N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 46968361 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46968463 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46968679 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 46968902 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46968947 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46969583 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 46969638 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46969654 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46970006 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46970134 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46970176 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 46970240 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 46970583 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 46970847 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 46970860 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 46971016 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 46971103 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46971389 C T Y Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 46972080 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 46972280 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46972380 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46972597 A C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 46972914 T A Y N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 46972930 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 46973019 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 46973038 G C Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 46973091 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 46973601 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46973602 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 46973625 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 46974510 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46974590 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46974969 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 46975010 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.25 0.166666666666667 0.583333333333333 8 16 3 2 7 3 46975241 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 46975383 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 46975524 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46976581 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 46976587 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 46976632 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46977679 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46977971 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46979134 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46979533 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46980144 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46981502 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 46984367 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46984436 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46984557 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46985243 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46985425 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 46985640 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46985641 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46985869 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46985941 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46985986 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46986372 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46986535 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46986634 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 46986788 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46986851 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 46987735 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46987843 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46987900 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 46987944 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46988031 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46988236 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 46988270 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 46988434 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46988544 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 46988555 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 46988559 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 46988597 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 46988675 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 46988688 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 46988767 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 46988801 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46989032 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 46989098 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 46989443 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 46989447 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 46989502 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 46989529 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46989575 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 46989577 T C Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 46989586 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46989592 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46989609 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 46989662 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 46989676 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 46989869 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 46990139 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 46990143 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 46990171 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 46990186 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46990242 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 46990277 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 46990398 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 46990410 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 46990424 G C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 46990475 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 46990478 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 46990573 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46990619 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 46990638 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46990689 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 46990746 G T Y N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 46990766 T G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 46990786 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 46990805 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 46990840 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 46990876 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46990947 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 46990960 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46991059 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46991066 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 46991081 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 46991121 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 46991324 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 46991334 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 46991443 C A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 46991728 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 46991747 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 46991847 T G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 46992035 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 46992073 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 46992083 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 46992100 C T Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 46992211 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 46992259 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46992325 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46992371 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46992539 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 46992550 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 46992557 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 46992568 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 46992586 T G Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 46992590 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 46992645 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 46992659 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46992695 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 46992760 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 46992770 T C Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 46993017 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 46993077 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 46993089 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 46993232 A C N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 46993510 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 10 8 4 2 3 3 46993519 C A N N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 3 46993680 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 46993691 C T Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 46993806 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 46993823 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 46993837 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 46993867 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 46993891 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 46994024 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 46994269 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 46994275 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 46994322 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 46994561 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 46994619 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 46995020 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46995266 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46995558 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46995665 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 46996082 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 46996258 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 46996383 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 46996550 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 46996590 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46996840 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 46996929 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 46996997 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 46997192 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 46997238 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 46997800 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46997986 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 46998217 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 46998653 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 46999022 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 46999819 A C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 47000678 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 47000803 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 47000826 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 47000928 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 47001004 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 47001029 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 47001449 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 47001562 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 47002400 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 47002702 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47002852 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 47002952 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 47003015 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47003044 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 47003053 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 47003062 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 47003172 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 47003215 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 47003362 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47003463 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47003653 C G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 3 47003665 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 47003700 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 47003759 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 47004032 C G N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 47004061 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 47004205 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47004277 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47004527 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 47004715 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 47004728 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47004785 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47004869 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47004872 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 47005009 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47005011 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 47005036 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 47005909 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 47005962 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 47006243 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47006338 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47006377 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 47007214 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 47007348 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 47007576 T A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 47007646 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47007694 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47007734 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47007748 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 47007784 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47007957 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 47008013 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47008110 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 47008122 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47008160 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 47008288 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47008395 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 47008513 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 47008534 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 47008631 T C N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 47008693 C G N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 47008793 G C N N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 3 47008888 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 47008907 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 47008972 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 47009272 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 47009350 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47009477 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 47009538 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 47009560 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47009580 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 47009769 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47009780 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47009919 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 3 47010095 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 47010327 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.214285714285714 0.142857142857143 0.642857142857143 8 20 3 2 9 3 47010437 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 47010456 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 7 11 2 3 4 3 47011103 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 47011137 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 47011434 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 47011462 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 47011537 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 47011643 A C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 47011644 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 47011784 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 47011932 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 47011993 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.266666666666667 0.0666666666666667 0.666666666666667 9 21 4 1 10 3 47012027 C A N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.2 0.133333333333333 0.666666666666667 8 22 3 2 10 3 47012061 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 47012102 G A N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.333333333333333 0.25 0.416666666666667 11 13 4 3 5 3 47012181 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 47012220 A T N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.25 0.166666666666667 0.583333333333333 8 16 3 2 7 3 47012309 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 47012365 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 47012898 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 47014079 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 47014648 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47014984 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47014995 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47015020 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47015216 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 47015548 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 47015549 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 47015571 T C Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 47015948 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47015996 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47016162 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 47016478 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47016590 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 47016905 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 47016926 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47017031 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47017131 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47017443 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 47017446 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 47017548 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 47017593 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47018238 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 47018270 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47018331 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47018650 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 47018695 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 47018893 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 47019177 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 47019185 G C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 47019750 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47019847 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47019886 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47019918 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47020178 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 47020396 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47020465 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47020551 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 47020589 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 47020664 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 47020684 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 47020998 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 47021006 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 47021335 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 47021414 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 47021434 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 47021851 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 47021908 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 47022248 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 47022271 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 47022299 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 47022514 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 47022547 A T N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0 0.846153846153846 0.153846153846154 11 15 0 11 2 3 47022858 G C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 47022859 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 3 47023005 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 47023020 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 47023037 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 47023073 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 47023478 A T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 47023496 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 47023619 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 47024129 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47024139 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47024165 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47024176 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47024315 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47024320 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47024345 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47024354 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 47024365 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47024398 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47024802 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47025118 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 47025185 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 47025214 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 47025306 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47025652 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 47025699 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 47025734 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47025819 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 47026370 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 47026416 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 47026445 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 47026501 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 3 47026742 A C Y N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 3 47026749 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 47026847 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 47026937 A T Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 47026998 C T Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47027014 T C Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47027166 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 47027193 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47027609 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 47027868 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 47027933 C G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47027987 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47028151 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47028174 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 47028238 A G Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 47028250 G A Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 47028281 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 47028386 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47028512 A G Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 47028698 G C Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47028945 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 47029075 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 47029083 A T Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 47029184 A T Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 47029263 T G Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 47029292 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47029323 A T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 47029375 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 47029722 C T Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 47029726 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 47029798 G T Y N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.2 0.133333333333333 0.666666666666667 8 22 3 2 10 3 47029875 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47030027 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 47030029 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 47030045 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 47030055 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 47030126 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 47030177 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 47030183 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 47030240 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 47030298 T C N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 3 47030318 G A N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 3 47030378 C T N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 3 47030533 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 47030553 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47030587 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47030633 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47030638 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47030650 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47030699 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47030775 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47030793 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47030816 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47030916 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47030966 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 47031026 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 47031093 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47031179 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47031262 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47031299 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47031787 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47031836 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47031848 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47031889 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47031982 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 47032005 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 47032035 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47032075 C A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 47032101 A C N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 47032389 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47032457 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47032593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47032627 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47032672 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 47032688 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47032769 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47032845 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47032924 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 47032928 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 47032955 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47032998 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 47033018 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47033112 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 47033147 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47033204 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 47033311 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 47033386 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 47033682 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 47033747 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 47033974 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 47033997 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 47034002 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 47034126 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 47034688 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 47034745 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47034755 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47034764 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 47034847 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 47035037 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47035287 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47035465 G C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47035528 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47035726 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47035860 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 47035901 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47035950 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47035981 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47036156 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47036294 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 47036330 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 47036340 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 47036458 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 47036472 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 47036540 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 47036850 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 47036978 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 47037025 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47037230 A T N N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 47037369 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 47037451 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 47037530 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 47037864 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 47038058 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47038083 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 47038252 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47038253 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47038264 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 47038401 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 47038493 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47038533 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 47038674 T G N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 47038800 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 47038875 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47039060 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 47039118 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 47039122 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 47039267 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47039302 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47039358 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47039405 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 47039631 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 47040056 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 47040166 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 47040233 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 47040318 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 47040418 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 47040765 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47041254 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 47041533 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 47041640 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47041708 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 47041718 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 47041719 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 47042037 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 47042133 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47042276 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47042345 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 47042407 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47042470 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47042480 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47042923 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 47043251 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 47043341 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47043569 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47043790 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 47043887 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 47044084 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 47044477 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 47044610 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 47044772 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 47045172 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 47045377 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47045387 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47045853 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47045874 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47045933 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47045974 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47046110 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47047045 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47047075 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47047414 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 47048043 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47048055 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47048502 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 3 47048705 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 47048808 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 47049032 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 47049068 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 47049965 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 47050080 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 47050143 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 47050288 T C Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 47050937 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 47050941 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 47050994 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 47051034 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 47051103 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 47051133 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 47051176 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 47051177 G T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 47051232 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 47051312 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 47051343 G A Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 47051419 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 47051670 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 47051822 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 47052005 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 47052318 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 47052466 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 47053246 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 47053467 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 47053595 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 47058931 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 47058932 T G Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 47059130 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47059775 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 47060195 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47062564 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47063939 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 47064924 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 47064949 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 47065754 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 47066611 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 47066902 C T Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 47067359 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47067913 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 47068551 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 47068982 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 47069027 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47069364 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47069422 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 47070773 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47072024 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 47072275 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47072461 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47072751 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47072921 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47073452 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 47073584 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47075634 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 47075910 T G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 47076564 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 47077061 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 47077343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47077839 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 47078022 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47078278 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 47078759 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47079329 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47079979 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 47080769 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 47080921 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 47080943 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 47081107 A G N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 47081198 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 47081207 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 47081777 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 47081819 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 47082066 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 47082151 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47082213 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 47082287 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 47082502 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 47082569 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 47082685 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 47083029 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 47083149 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 47083344 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47083347 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 47083377 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 47083744 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 47083887 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 47084162 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 47085561 G C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 47086305 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47086410 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 47086809 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 47093582 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 47093873 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47095078 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47098502 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47098732 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47100104 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 47101659 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 47101771 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 47101871 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 47102854 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47102904 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 47103482 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 47104607 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47105343 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47105557 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47106289 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 47106669 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 47107899 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47112690 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 47112796 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 47112826 T A N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 47112979 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 47113372 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 47113880 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47114018 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 47114052 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 47114273 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 47115700 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 47118982 A T N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 3 47119496 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47120156 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 47120435 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47120588 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47121917 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47122356 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 47123062 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 47123425 T G N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 47124849 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 47125727 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47126667 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47128110 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 47129897 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 47130542 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47132102 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 47132181 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 47133551 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47134288 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 47135107 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47135161 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47135361 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47135742 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47136543 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47138282 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47141035 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47141981 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47142782 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47143016 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47144962 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 47146997 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 47147059 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 47153898 G T Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 47154209 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47156311 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 47157628 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47159434 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47159709 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47160254 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47160505 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47160542 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47160588 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47160611 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47160622 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 47161224 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47161260 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47162487 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47162618 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47162796 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47162798 T A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47164372 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47165034 G A Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 47167159 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 47167217 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 47168936 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 47170854 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 47172379 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47172488 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47173545 C A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 47174272 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 47174511 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 47175034 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 47175374 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 47175489 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 47182396 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 47183984 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47184183 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 47184330 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 47185095 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47185692 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47185996 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 47186254 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 47186270 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 47186339 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47186404 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47186658 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 47186707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47186723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47186732 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47187617 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47187690 A C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47188609 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47188763 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47189661 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47189857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47190039 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 47190232 C T Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 47190428 G T Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 47190445 C A Y N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 47190506 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 47190930 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 47192270 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47192963 C G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 47193728 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 47193844 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47194857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47195361 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 47196384 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 47196533 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47196598 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47196735 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 47196763 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47196798 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 47196816 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 47197752 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47198739 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47198972 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 47201245 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47201685 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 47201945 A C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47203135 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 47211602 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 47213845 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47214408 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 47216450 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47217375 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47217445 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 47220115 C T N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 47220599 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47221188 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 47221346 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 47221983 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 47224894 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 47226034 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47226730 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 47226849 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 47226912 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47229643 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47229963 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 47229970 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 47230231 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 47231333 G T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 47232162 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47232412 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47233376 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 47234229 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 47234313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47234464 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47234465 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47234744 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47234903 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 47235564 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47235619 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 47235981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47236712 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47236934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47237978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47240908 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47242684 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47242863 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 47244089 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47244734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47245690 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 47245944 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47245946 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 47246654 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47248287 G T Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 47248576 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 47249287 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47251217 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47252334 C G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 47256657 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 47256835 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 47260537 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 47261214 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 47262371 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47263000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47263605 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47263710 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47263736 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47263769 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47263864 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47263881 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47264205 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47264682 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47265566 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 47265660 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47265828 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 47266354 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 47266939 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47267180 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47267886 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47267986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47268092 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 47268098 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 47268327 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47268709 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47268770 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 47268771 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 47269102 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 47269140 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 47269157 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 47269163 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 47269441 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 47269554 A G Y Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 3 47269622 C T Y Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 3 47269643 A G Y Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 47269705 C A Y N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 3 47269730 A T Y N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 47269771 G A Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 47269796 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47269812 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 47269854 T C Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 47269868 A C Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 47269908 G C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47269931 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47270566 G A Y Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 3 47270596 A G N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 3 47270599 A C N N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 3 47270637 T A Y N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 3 47270647 T C Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 47270653 G T Y N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 47270795 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47270813 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47270857 C A Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47270970 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47271089 G C Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 47271119 G A Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 47271195 A G Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 47271243 C G Y N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 47271305 G C Y N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 47271335 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 47271533 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47271535 C G Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47271706 T G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 47271874 T A N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 47271970 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47271971 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47271986 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47272099 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47272195 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47272214 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47272615 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47272753 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47273027 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47273324 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47273489 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47273792 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47274133 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 47274522 T C N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 47274866 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 47274961 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47275373 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47275638 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47275705 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47275742 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47275811 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47276023 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47276088 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47276307 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47276424 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47276513 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47276536 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47276786 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47276976 G T N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 47277084 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 47277154 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 47277274 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47277318 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47277372 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47277417 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47277419 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47277455 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47277512 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47277531 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47277573 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47277767 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47277770 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47277797 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 47277812 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47277813 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47277849 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47277879 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47278206 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47278282 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47278406 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47278760 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47278893 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47278902 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47278968 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47279027 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47279036 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47279048 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47279230 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47279557 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47279558 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47279657 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47279659 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47279677 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47280244 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47280396 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 47280468 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 47280489 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47280617 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 47280875 G T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 47280998 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47281298 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47281341 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47281770 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47282102 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47282579 G T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 47282720 T C N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 47282785 T C N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 47282940 T A N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 47283023 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47283163 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47283175 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47283209 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47283770 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 47283857 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47284113 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47284215 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47284255 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47284263 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47284584 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47284594 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47284620 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47284645 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47284649 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47284678 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47284809 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47284814 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47284845 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47284875 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47284910 T G Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47284994 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47285011 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47285085 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47285138 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47285139 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47285157 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47290067 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47290088 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47290221 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47290227 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47290235 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47290263 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47290273 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47290291 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47290306 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47290346 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47290370 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47290377 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47290426 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47290431 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47290505 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47290554 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47290571 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47290609 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47290628 T G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 47290631 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 47290675 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 47290912 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47291031 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47291140 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47291142 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47291184 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47291197 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47291211 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47291214 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47291241 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47291281 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47291394 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47291538 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47291559 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47291698 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47291703 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47291911 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47291937 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47291948 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47292004 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47292156 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47292218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47292248 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47292413 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47292447 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47292455 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 47292591 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47292719 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47292814 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47293003 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47293024 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47293035 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47293215 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47293232 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47293255 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47293269 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47293302 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47293423 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47293539 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 47293575 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47293607 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47293613 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47293647 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47293654 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47293768 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47293786 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47293815 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47293818 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47293870 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47294405 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47294943 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47295000 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47295121 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47295137 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47295355 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47295378 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47295504 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47295758 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47296015 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47296180 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47296191 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 47296196 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 47296293 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 47296304 T A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 47296713 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 47296941 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47297092 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47297094 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47297144 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47297161 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47297244 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47297262 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47297294 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47297460 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47297496 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47297556 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47297571 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47297691 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47297738 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47297876 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 47298200 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 47298326 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47298343 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47298476 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47298754 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47298755 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47298820 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47298826 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47298881 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47299188 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47299275 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47299364 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47299370 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47299381 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47299434 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47299458 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47299569 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47299675 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47299847 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47299885 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47300000 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47300104 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47300144 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47300152 A C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 47300342 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47300402 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 47300429 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47300622 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47300688 A C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 47300702 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47300769 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47301034 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47301333 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47301334 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47301607 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47302153 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47302292 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 47303088 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 47303882 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47304036 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47304203 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47304411 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 47304580 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47304854 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47304888 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47304914 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47304972 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47305041 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47305095 A G N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 47305118 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47305134 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47305142 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47305170 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47305172 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47305252 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47305303 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47305327 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47305405 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47305592 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47305694 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47305767 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47305810 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47305906 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 47305991 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 47306002 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 47306076 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47306091 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47306107 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47306239 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47306272 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47306351 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47306425 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47306452 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47306579 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47306607 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47306657 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47306671 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47306799 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47306852 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47306954 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47307054 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47307178 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47307309 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47307332 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 47307415 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 47307472 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 47307604 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47307622 A C N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 47307748 A G Y Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 3 47308014 C A N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 47308045 A T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 47308060 T G N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 47308083 T A N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 47308098 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 47308571 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 47308723 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47308962 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47309098 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47309279 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47309435 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47309533 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47309566 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47309667 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47309780 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47309813 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47309908 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47309942 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47309978 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47310529 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47310765 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47311022 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47311997 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47312462 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47312483 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47312541 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47312587 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 47312642 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 47312684 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 47312883 A C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 47313000 T A N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 3 47313189 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47313932 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47313975 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47314347 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47314361 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47314712 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47314866 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47315086 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47315111 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47315365 A G N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 47315720 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 47316290 G A Y Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 47316391 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47316414 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 47316559 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47316861 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 47317520 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47317544 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47317630 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47317716 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47317769 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47318014 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47318043 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47318097 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47318283 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47318471 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47319358 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47319383 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47319405 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47319844 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47319911 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47319971 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47320907 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 47320943 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47321159 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47321272 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47321348 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47321450 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47321469 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47321517 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47321563 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47321712 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47321844 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47321887 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47322085 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47322103 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47322248 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47322273 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47322352 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47322809 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47322886 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47322916 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47322951 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 47322958 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 47322987 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47322991 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47323129 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47323185 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47323193 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47323353 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47323356 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47323416 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47323533 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47323582 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47323598 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47323744 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47323770 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47323826 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47324003 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47324038 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47324045 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47324202 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47324371 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47324394 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47324406 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47324512 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47324707 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47324711 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47324836 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47324967 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47325092 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47325114 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47325464 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47325586 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47325658 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47325708 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47326191 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 47326262 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47326385 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47326512 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 47326687 T C N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 47326721 A G N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 47326735 T G N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 47327009 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47327165 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47327209 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47327267 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47327297 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47327306 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47327321 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47327343 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47327461 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47327507 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47327535 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47327536 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47327639 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47327690 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47327732 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47327772 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47327781 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47327850 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47327895 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47327922 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47327978 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47328007 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47328024 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47328072 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47328132 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47328193 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47328258 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47328299 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47328372 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47328633 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47328656 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47328728 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47328745 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47328746 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47328762 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47328844 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47328845 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47328908 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47328974 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47329010 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47329027 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47329117 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47329134 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47329141 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47329162 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47329231 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47329242 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47329245 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47329269 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47329318 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47329398 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47329407 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47329534 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47329566 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47329821 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47329842 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 47330043 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47330074 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47330077 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 47330120 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47330135 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47330321 C G N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 47330606 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47330638 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47330792 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47330945 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47331354 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47331739 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47331753 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47331965 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47332029 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47333696 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47334241 G T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47334594 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47334773 G A N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 47334863 C A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 47334874 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 47335308 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47335976 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47336123 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47336320 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47336347 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47336571 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47336621 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47336630 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 47336633 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 47337112 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47337172 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47337227 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 47337271 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47337300 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47337339 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47337344 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47337383 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47337431 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47337438 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47337499 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47337549 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47337556 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47337591 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47337651 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47338358 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47338374 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47338444 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47338523 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47338550 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47338581 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47338596 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47338618 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47338669 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47338684 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47338685 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47338732 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47338761 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47338770 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47338783 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47338797 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47338811 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47338824 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47338900 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47338908 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47339023 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47339067 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47339100 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47339113 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47339123 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47339141 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47339277 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47345556 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 47345701 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47345823 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47345841 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47345920 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47345927 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47345946 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47346043 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47346050 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47346073 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47346081 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47346100 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47346110 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47346144 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 47346145 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 47346167 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47346249 A T N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 47346267 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47346278 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47346417 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47346439 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47346455 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 47346470 C G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 47346474 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 47346482 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 47346506 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 47346654 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 3 47346683 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47346704 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47346743 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47346774 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47346895 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47346899 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47346983 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47347010 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47347016 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47347142 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47347149 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47347162 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47347232 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47347267 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47347333 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47347375 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47347381 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47347455 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47347498 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47347536 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47347611 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47347636 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47347656 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47347659 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47347676 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47347693 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47347753 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47347836 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47347900 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47348007 G T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 47348035 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47348062 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47348164 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47348213 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47348243 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47348276 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47348418 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47348592 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47348728 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47348731 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47348741 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47348768 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47348814 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47348829 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47348865 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47348948 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47348987 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47349001 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47349026 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47349102 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47349152 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47349201 C A N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 47349209 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 47349282 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47349315 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47349323 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 47349329 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 47349334 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47349373 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47349389 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47349408 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47349415 C G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47349424 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 47349500 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47349562 A C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 47349737 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 47349748 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 47349769 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47349802 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47349810 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47349864 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47349874 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47349884 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47349901 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47349942 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 47349947 T A N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 47350037 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 47350043 G A N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 47350090 C T N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 3 47350308 T A N N 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 6 8 2 2 3 3 47350318 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 3 47350335 T A N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 3 47350389 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47350409 C A N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 47350621 A G Y Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 7 13 1 5 4 3 47350669 T G Y N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 9 7 2 5 1 3 47350772 G A Y Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 3 47351635 A C Y N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 47351658 T C Y Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 47351906 C T Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 47352004 T A N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 47352007 G T Y N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 47352075 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47352209 G A N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 8 12 2 4 4 3 47352237 T G Y N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 3 47352244 G C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 47352275 T G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 47352288 T A Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 47352355 A C N N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 3 47352379 C T N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 47352417 G T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47352437 G C Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 47352569 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 47352635 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47352647 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47352700 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47352716 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47352728 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47352771 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47352842 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47352860 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47352950 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47353045 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47353099 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47353130 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47353165 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47353192 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 47353203 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47353230 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47353240 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47353264 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47353376 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47353440 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47353490 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47353557 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47353584 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47353754 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47353861 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 47353871 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 47354063 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47354100 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47354521 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47354527 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 47354572 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47354590 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47354681 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47354779 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47354801 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47355011 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 47355058 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47355089 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47355143 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47355157 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47355318 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47355367 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47355589 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47355614 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47355671 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47355683 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47355701 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47355725 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47355741 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47355842 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 47355932 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47356027 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47356072 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47356083 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47356121 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47356123 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47356152 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47356171 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47356196 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47356253 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47356260 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47356264 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47356279 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47356307 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47356377 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47356405 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47356411 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47356529 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47356558 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47356561 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47356631 G C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 47359256 G T Y N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 47359260 C T Y Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 47359302 A T Y N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 47359306 A G Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 47359370 C T Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47359530 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47359571 A C Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47359604 T C Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 47359809 T G Y N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 47359844 G A Y Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 3 47359926 C G N N 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 8 6 2 4 1 3 47359974 C A N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 3 47359987 G T N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 47360010 T G N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 47360013 T A N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 3 47360041 C G N N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 3 47360123 C A Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47360189 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 47360192 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47360206 G T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 47360212 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47360237 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47360253 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47360372 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47360514 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 47360599 C G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 47360621 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47360639 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47360731 C A Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47360761 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47360782 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47360783 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47360799 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47360849 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47360867 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47360906 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47360922 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47360978 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47360985 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47360995 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47361032 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 47361095 G T Y N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 47361139 G T N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 47361170 T G N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 3 47361194 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 3 47361200 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 3 47361282 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47361350 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47361595 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47361602 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47361688 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 47361691 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 47361717 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 47361806 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47361822 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47361847 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47361882 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47361896 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47361905 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47361932 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47362059 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47362098 C G Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47362128 A C Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47362174 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 47362383 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 47362441 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47362462 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47362512 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47362540 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47362584 G C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 47362600 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47362627 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47362638 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47362641 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 47362665 A C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47362767 A G Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 47362771 G T Y N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 47362797 A G Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 47362860 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 47362871 T A Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 47362874 T A Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 47362887 A G Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 47362901 A C Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47362943 T G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47363123 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47363131 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47363198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47363246 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 47363273 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 47363281 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47363327 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47363361 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47363607 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47363615 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47363641 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47363681 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47363772 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47363773 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47363881 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47363926 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 47364006 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47364064 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47364076 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47364088 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47364146 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47364183 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47364216 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47364221 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47364259 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47364261 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47364370 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47364374 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47364383 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47364404 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47364484 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47364532 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 47364546 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 47364555 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47364623 C A Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47364715 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 47364733 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47364754 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47364782 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47364832 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47364950 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 47365031 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47365053 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47365240 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47365281 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47365393 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47365456 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47365562 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47365563 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 47365634 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 47365648 T A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 47365959 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47366001 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 47366060 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47366121 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47366173 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47366194 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47366278 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47366313 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47366336 C A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47366348 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47366457 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47366458 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47366496 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47366527 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47366537 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 47366548 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47366556 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47366566 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47366624 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47366699 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47366709 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47366733 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47366751 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47366880 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 47366886 C G Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 47367082 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47367108 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47367110 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47367142 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47367149 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47367155 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47367254 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 47367282 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47367360 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47367423 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47367538 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47367634 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47367733 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47367774 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47367930 G T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 47369003 G T Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 47369052 C G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 47369379 T A N N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 3 47369405 A C N N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 3 47369602 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47369648 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47369993 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47370672 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47370916 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47371287 C A N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 47371708 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47371764 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47371911 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47372083 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47372166 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47372413 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47372943 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47373881 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47373938 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47373986 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47374024 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47374209 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 47374414 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47374559 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47374693 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47374978 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47375108 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47375257 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47375304 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 47375310 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47375317 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47375383 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 47375432 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47375582 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47375713 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47375788 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47376014 T A N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 47376064 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 47376804 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47377167 T C N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 47377262 A G N Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 3 47377373 C A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 47377985 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47378085 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47378090 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47378178 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47378310 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47378452 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47378768 A C N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 47379038 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47379189 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47379190 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47379331 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47379438 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47379885 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47380557 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47380603 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47380945 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47381323 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47381459 G T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47381550 A T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 47381565 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 47381572 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 47381641 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 47381721 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47382245 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47382665 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47382680 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47383256 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47383656 G T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 47383809 A C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 47384001 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47384147 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47384247 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47384289 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47384371 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47384632 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47385200 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47385448 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 47385573 T C Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 47385624 G A Y Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 47385691 A G N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.0909090909090909 11 11 1 9 1 3 47385692 A G Y Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.0833333333333333 12 12 1 10 1 3 47385931 G A Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 47385935 T G Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 47386291 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47386643 G A Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 47386740 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47386957 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47386973 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47387200 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47387241 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47388079 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47388230 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47388352 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 47388481 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47388497 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47388645 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 47388699 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 47388776 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 47388817 C G N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 3 47389116 T G Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 47389170 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 47389187 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47389191 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47389233 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 47389276 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47389280 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47389526 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47389605 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47389701 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47389746 T A Y N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.0625 0.6875 0.25 13 19 1 11 4 3 47389820 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47389923 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 47390079 C A N N 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 6 10 1 4 3 3 47390229 A C N N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 8 8 3 2 3 3 47390266 A G N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 3 47390446 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47390451 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47390481 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 47390606 A G Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47390620 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47390768 A T Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47390777 T C Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 47390860 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47390886 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47391080 G A Y Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 47391177 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 47391212 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47391835 T G N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 47392073 T C N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 3 47392115 C A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 47392197 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 47392267 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47392284 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47392376 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47392438 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47392440 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47392456 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47392510 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47392674 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47392676 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47392694 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47392756 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 47393000 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47393039 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47393228 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47393364 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47393438 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47393543 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47393588 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47393625 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47393893 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47393978 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47394016 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47394100 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.0526315789473684 0.842105263157895 0.105263157894737 18 20 1 16 2 3 47394103 T G Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 47394113 G A Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 47394261 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47394285 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47394311 C G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47394471 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47395247 A C N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 47395405 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 47395466 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47395487 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47395516 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47401439 T C Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 47402163 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 47402302 T A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 47402313 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47402398 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47402514 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47402534 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47402586 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47402598 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47402907 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47402910 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47402941 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47402999 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47403012 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47403069 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47403252 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47403582 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47403593 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47403663 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47404062 T G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47404078 A C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47404503 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47404743 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47404872 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47404886 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47404993 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47405008 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47405093 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47405116 G T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 47405168 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47405221 G C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 47405231 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47405241 G T Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47405243 C A Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47405338 A G Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 47405427 A T Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47405491 C A Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47405580 C A Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47405637 C A Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47405813 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47405959 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47405962 C A Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47406062 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 47406077 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47406111 T G Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 47406113 G A Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 47406221 G C Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 47406277 C G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47406334 A T Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47406385 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47406459 T A Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47406487 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47406542 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47406613 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47406688 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47406777 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47406793 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47406815 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47406819 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47406858 T G Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47406909 C A Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47406920 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47406927 A T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47407005 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47407067 A C Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47407270 C T Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 47407279 C A Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 47407428 T A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47407580 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47407605 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47407692 T A Y N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 47407766 C T Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 47407870 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 47408037 A T Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47408042 T G Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47408069 G T Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 47408458 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47408536 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47408557 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47408562 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47408602 T C Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 47408806 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47408902 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47408953 G A Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47408976 C G Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47408979 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47409032 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47409078 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47409093 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47409192 C T Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47409279 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47409303 A C Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47409342 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47409402 G C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47409542 T G Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47409574 T A Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 47409657 G C Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47409677 C G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47409689 C G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47409697 A C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47409717 C T Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47409883 G T Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47409900 T A Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 47409927 G A Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 47409970 G T Y N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 47410114 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47410193 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47410235 C T Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 47410253 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47410361 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47410372 G T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47410402 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47410403 T G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47410432 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47410461 C T Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47410483 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47410484 A G Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47410512 A G Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47410535 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47410552 C G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47410729 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47410885 C A Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47410900 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47410908 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47411041 G T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47411113 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47411114 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 47411464 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47411616 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47411652 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47411683 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47411718 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47411730 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47411834 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47411882 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47411884 T G Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47411946 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47412025 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47412121 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47412144 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47412168 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47412270 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47412375 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47412378 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47412391 T G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47412420 C G Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47412429 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47412462 G T Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47412595 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47412681 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47412722 T A Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47412794 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47412846 G A Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 47412853 G C Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 47413054 C G Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47413060 G T Y N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 47413160 G C Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 47413169 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47413250 C T Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47413312 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47413337 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47413338 G T Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47413389 A C Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 47413407 T C Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 47413509 A T Y N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 47413585 C G Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 47413664 G T Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47413700 C A Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47413817 T A Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47413855 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47413882 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47413883 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47413928 A G Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47414002 T A Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47414032 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47414036 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47414078 A C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47414105 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47414184 G T Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47414236 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47414253 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47414330 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47414419 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47414536 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47414597 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47414607 A T Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47414731 G T N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 47414810 G T Y N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 3 47414828 C T Y Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 8 10 2 4 3 3 47414837 A G Y Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 7 7 2 3 2 3 47414996 A G Y Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 3 47415200 C A Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47415209 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47415299 T G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47415383 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47415472 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 47415549 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47415573 C G Y N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 47415663 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47415763 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47415770 T A Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 47415830 A T N N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 7 13 3 1 6 3 47415836 T C Y Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.333333333333333 0.111111111111111 0.555555555555556 7 11 3 1 5 3 47415862 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 3 47415870 A C N N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 8 8 2 4 2 3 47415934 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 3 47416556 C A Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 47416606 T A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 47416698 G C Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47416723 C G Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 47416802 A T Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47416811 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47416824 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47416829 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47416899 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 47416921 C T Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 47416946 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 47416995 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 47417251 A G N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 8 12 3 2 5 3 47417270 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 47417308 A T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47417339 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 47417380 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 47417455 A G Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 47417530 T C Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47417532 T G Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 47417589 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47417845 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 47417872 G T Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 47417928 T C Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47417952 A T Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 47417984 G A Y Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 47418009 A T Y N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 47418023 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47418066 C A Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 47418144 T C Y Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 47418257 C A Y N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 3 47418302 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 47418461 T G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 47418505 C A N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 47418531 G T Y N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 47418585 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47418632 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 47418693 A T Y N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 47418784 G T Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47418785 A T Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47418811 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47418819 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47418904 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47418913 T A Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47418988 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47419031 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47419234 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47419899 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47419947 C A Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47419996 C G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47420049 C G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47420101 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47420172 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47420264 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47420359 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47420410 G T Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47420458 T G Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47420506 T A Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47420659 G T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47420669 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47420693 T C Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 47420759 T A Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47420784 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47420786 C A Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47420806 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47420822 T A Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47420883 C A Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 47421167 C T Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47421362 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47421600 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 47421626 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47421718 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47421752 T C Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47421775 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47421827 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47421923 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47421972 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47421993 T A Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47422043 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47422128 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47422162 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47422170 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47422177 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 47422224 A C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47422469 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47422475 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47422529 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 47422536 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47422733 C A Y N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 47422734 C A Y N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.571428571428571 0.357142857142857 10 18 1 8 5 3 47422787 G T Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47422836 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47422858 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47422924 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47422945 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47422965 G T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47422967 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47423108 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47423117 T A Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 47423242 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47423285 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47423289 T A Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47423363 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47423497 T A Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47423557 T C Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47423581 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47423599 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47423628 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 47423674 T G Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47423679 A T Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47423688 C A Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47423789 A T Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47423817 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47424055 C T Y Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 3 47424063 C A Y N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 3 47424103 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 47424140 T A N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 47424160 C T Y Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 47424189 A T N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 47424207 A G Y Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 47424287 A C Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47424297 A G Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47424628 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47425028 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47425152 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47425555 C G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47425802 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 47425840 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 47425853 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 47425900 G T N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 47425920 G C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 47425936 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 47426060 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 47426073 G T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47426126 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47426142 C G Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 3 47426143 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 47426212 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47426228 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47426354 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47426396 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47430581 G A N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 3 47430595 A T N N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 3 47430620 G A Y Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 3 47430757 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47430768 A T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47430820 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47430873 A T Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47430929 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47430935 T G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47431042 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47431154 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47431246 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47431275 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47431321 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47431351 G T N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 3 47431352 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 3 47432810 A T Y N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 47432840 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 47432898 C T Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 47432935 T C N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 3 47432979 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 47433525 G T N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 47433572 A G N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 3 47434158 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47434420 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 47434479 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47435051 G A N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 47435094 G T N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 47435582 T A Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47435593 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47435623 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47435654 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47436189 G T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47436274 A T Y N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 47436449 A C N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 47436635 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 47436718 T A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 47437026 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47437214 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47437346 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47437534 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47437548 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47437797 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 47437798 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 47438142 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 47438146 G C N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 47438368 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47438514 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47438735 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47438791 T A Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 47439029 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47439402 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47439403 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47439484 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47439625 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47439672 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47439874 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47440026 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47440032 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47440231 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47440389 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 47440399 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47440484 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47440617 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47440745 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47441323 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47441492 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47441662 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47441735 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47441759 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47441813 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47441914 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47441938 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47442038 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47442295 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47442405 G T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 47442505 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 47442829 T A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 47443709 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47443714 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47443724 T C Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 47444159 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47444256 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47444312 A T Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 47444320 C T Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 47444494 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47444906 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47444922 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47444949 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47445146 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47445159 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47445199 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47445250 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47445257 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47445270 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 47445279 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47445290 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47445315 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47445481 A C Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47445507 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47445515 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47445548 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47445582 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47445622 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 47445646 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47445647 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47445686 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47445704 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47445923 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 47446168 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47446361 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 47446516 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47446726 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47446920 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47447005 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47447053 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47447054 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47447087 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47447103 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47447215 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47447365 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47447734 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47447834 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47448066 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 47448297 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47448417 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47448435 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47448773 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47448843 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47448869 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47448897 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47449222 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47449308 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47449489 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47449859 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47449870 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 47449888 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 47453323 T G N N 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 7 11 2 3 4 3 47453371 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47453380 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47453387 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 47453463 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47453495 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47453516 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 47453577 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 47453588 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47453609 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47453615 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47453646 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47453651 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 47453673 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47453699 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47453745 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47453755 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47453805 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 47453816 A C N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 47453862 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 3 47453876 T A N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 3 47453888 A C N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.5 0.416666666666667 8 16 1 6 5 3 47453956 C T N Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.2 0.8 0 6 4 1 4 0 3 47454024 T A N N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 3 47454026 C A N N 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 47454141 G A N Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 6 6 2 2 2 3 47454183 G A N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 3 47454249 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 3 47454277 T A N N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 3 47454436 C A N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 47454448 C T Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 47454474 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 47454516 A C N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 47454544 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47454612 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 47454672 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 47454743 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 47454819 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47454844 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 47454859 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 47454930 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47454935 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47454952 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 47454979 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 47454982 T G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 47455012 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 47455076 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47455213 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47455250 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 47455286 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47455289 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47455303 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 47455313 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47455329 T A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 47455332 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47455340 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47455391 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47455419 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 47455420 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 47455446 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 47455460 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 47455482 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 47455492 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 47455507 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47455524 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47455535 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47455655 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47455728 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47455746 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47455753 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47455759 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47455800 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47455809 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47455812 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47455900 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47455907 G C Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47455981 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47455989 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47456011 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47456031 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47456067 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47456078 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47456081 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47456096 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47456109 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47456110 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47456139 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47456174 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47456177 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47456242 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47456253 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47456280 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47456291 C A Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47456320 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47456326 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47456352 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47456410 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47456454 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47456477 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47456497 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47456585 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47456629 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47456666 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47456674 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47456707 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47456886 C A Y N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 3 47456961 A G Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 3 47457022 G T Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 3 47457059 A G Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 3 47457070 T C Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 3 47457265 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47457345 T A Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 47457359 A G Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 47457367 G A Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 47457469 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47457498 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47457530 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 47457570 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47457594 T G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 47457603 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 47457660 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47457677 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47457691 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47457848 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47457867 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 47457931 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47458059 C A N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 47458077 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 47458106 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 47458129 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 47458199 G T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47458265 G T N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 47458286 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 47458321 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 47458965 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47459078 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47459122 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47459262 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 47459281 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47459390 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47459415 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47459495 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47459643 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47459657 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47459785 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47459792 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 47459805 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47459825 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47459895 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47459910 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47459969 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47459992 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47460004 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47460029 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47460148 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47460174 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 47460220 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47460249 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47460378 C A Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 47460672 A G Y Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.571428571428571 0.357142857142857 10 18 1 8 5 3 47462287 T G Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47462420 G A Y Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 3 47462444 G T Y N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.0666666666666667 0.733333333333333 0.2 13 17 1 11 3 3 47462466 C A Y N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 47463245 T A N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 47463296 T G N N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 47463312 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 3 47463348 T A N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 47463386 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47463449 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47463539 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47463666 G T Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 47464006 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 47464109 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 47464242 T A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 47464342 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 47464392 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47464474 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47464476 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47464512 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47464548 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 47464639 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47464670 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.0625 0.8125 0.125 15 17 1 13 2 3 47464689 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47464690 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47464741 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47464759 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47464773 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47464879 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47464934 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47465043 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47465276 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47465322 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47465352 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47465360 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47465372 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47465497 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 47465570 A T Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 47465909 G A Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 47466080 T A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 47466254 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47466342 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47466541 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47466761 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47466817 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47466852 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47466934 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47467051 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47467138 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47467291 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47467317 C G N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 47467351 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47467361 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47467424 C G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 47467453 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47467904 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47467995 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47468030 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 47468050 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47468152 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47468324 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47468393 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47468434 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47468461 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47468477 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47468487 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47468488 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47468555 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47468765 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47468836 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47468881 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47468907 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47469042 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47469054 T G Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47469227 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47469306 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47469378 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47469398 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47469409 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47469503 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47469528 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47469886 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47469901 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47469936 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47470056 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47470274 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47470490 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47470943 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 47471064 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47471162 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47471221 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47471251 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47471426 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 47471693 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47471800 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47471824 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47471851 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47471863 A T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 47471917 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47471967 A T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 47472018 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47472023 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47472046 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 47472074 A T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 47472224 T G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 47472413 C T N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 47472424 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 47472537 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47472549 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47472569 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47472703 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47472812 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47473193 G T N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 47473541 T C N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 3 47473670 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47473709 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47473798 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47473811 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47474317 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47474437 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47474789 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47474959 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 47474969 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 47475052 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47475262 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47475299 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47475878 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47475915 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47476117 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47476251 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47476260 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47476294 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47476308 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47476636 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47476819 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47476846 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47476934 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47476953 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47477303 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47477385 T G N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 47477559 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47477696 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 47477742 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 47478211 T G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47478214 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47479552 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47479716 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47479901 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47480158 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 47480326 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 3 47480513 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47480565 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 47480926 A T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 47481170 C G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 47482472 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47484419 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47484488 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47484591 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47484627 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47484647 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47484913 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47484951 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47485087 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47485487 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47485825 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 47486887 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47486893 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47488279 A G Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 47488727 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47489085 G A Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 47492741 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 47493724 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47494916 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47495632 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47495916 A T N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 47496523 T G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 47496970 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47496992 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 3 47497010 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 47497625 G T Y N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 3 47497761 A G Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 47497929 T A Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47498170 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 47498337 A T Y N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 3 47498458 G A Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 47498492 T C Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 47498715 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47498815 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47498897 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47499023 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 47499619 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47499755 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 47499837 A C N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 47500328 T G Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 47500564 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47501003 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 47501285 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47501376 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47501406 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47501513 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47501558 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47501768 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47501839 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47502085 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47502152 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47502357 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 47502486 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47502752 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 47502852 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47503421 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47503443 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47503498 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47503605 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47503642 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47504232 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47504716 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47504941 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47505019 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47505145 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47505264 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47505318 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47505470 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 47505663 T A N N 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 3 47505943 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47505978 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47505985 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47506178 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47506381 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47506431 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47506438 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47506459 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47506488 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47506759 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47506849 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47506966 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47507152 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 47507404 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47507438 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47507473 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47507479 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47507486 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47507601 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47507615 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47507625 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47507626 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47507663 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47507918 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 47507923 T C N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 3 47508013 C A N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 47508081 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47508216 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 47508517 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47508649 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47508653 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47508662 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47508672 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 47508686 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 47508836 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47508859 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47508884 G C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47508964 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 47508993 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47509030 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47509175 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47509220 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47509298 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47509498 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47509519 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47509533 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47509539 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47509551 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47509607 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47509644 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 47509786 A T Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 47509793 A T Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 47509809 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 47510008 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 3 47510034 C T Y Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 47510040 T A Y N 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 3 47510054 T C Y Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 6 8 2 2 3 3 47510117 G A Y Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 9 5 3 3 1 3 47510257 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 7 5 1 5 0 3 47510365 T A Y N 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 6 6 2 2 2 3 47510555 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 47510644 G A Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 47510696 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47510885 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47510904 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47511023 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47511055 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47511071 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47511214 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47511330 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47511349 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47511352 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 47511362 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47511371 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47511405 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47511459 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47511467 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47511544 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47511559 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47511637 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47511786 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47511823 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47512051 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47512238 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47512322 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 47512323 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47512336 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 47512345 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47512779 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 47512851 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47513109 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47513126 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47513182 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47513193 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47513208 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47513550 C G Y N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 47513723 T G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 47513805 T C N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 47513896 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 47513958 C A N N 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 5 9 1 3 3 3 47513989 A G Y Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 47514044 G A N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 47514065 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 47514094 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 47514112 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 47514151 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47514203 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47514256 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47514430 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 47514471 C A N N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 3 47514569 T A N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 47514908 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47515167 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47515364 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47515376 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 47515447 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47515452 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 47515470 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47515619 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47515652 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47515680 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47515892 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 47515934 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47516162 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47516302 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47516426 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47516617 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47516756 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47516962 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 47517065 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47517108 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47517179 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47517189 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47517241 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47517382 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47517474 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47517567 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47517577 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 47517649 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 47517679 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47517736 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47517987 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47518142 G T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 47518155 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47518164 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 47518289 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47518310 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47518564 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47519020 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47519148 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47519302 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47519781 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 47519888 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47520507 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47520558 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47520564 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 47521139 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 47521409 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47522193 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 47522207 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47522277 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47522411 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47522460 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47522509 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47522615 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47522622 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47523435 G T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 47523484 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 47523651 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47523730 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47523761 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47523793 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47523902 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47524297 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47524467 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47524620 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47524672 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47524793 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47524808 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47524839 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47524872 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47524906 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47524972 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47525052 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47525105 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47525195 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47525230 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47525241 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47525270 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47525271 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47525454 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47525469 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47525566 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47525586 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47525592 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47525641 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47525706 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47525760 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47525824 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47525900 G T N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 47525945 C A N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 47525987 T G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 47526047 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47526067 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47526232 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47526320 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 47526442 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 47526668 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 47526691 C G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47526761 A G N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 47526796 T A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 47526833 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 47526968 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 47527001 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47527004 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47527055 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47527076 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47527136 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47527159 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47527224 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47527273 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47527290 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47527394 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47527421 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47527456 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 47527573 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47527679 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47527695 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47527772 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47527784 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47527889 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47527910 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47527920 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47527959 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47527991 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47528049 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47528115 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47528198 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47528223 G C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47528288 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47528325 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47528341 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47528348 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47528361 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47528438 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47528448 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47528451 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47528481 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47528658 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47528665 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47528672 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47528805 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47528849 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47528899 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47528926 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47528965 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47529079 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47529274 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47529433 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47529441 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47529444 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47529583 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47529603 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 47529627 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47529641 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47529686 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47529691 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47529778 T G N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 3 47529808 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47529854 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 47529868 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 47529869 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 47529887 T A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 47529904 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 47529938 A G N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 3 47529976 G T N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.2 0.133333333333333 0.666666666666667 8 22 3 2 10 3 47530199 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47530390 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47530433 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 47530555 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47530629 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47530729 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47530738 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47530750 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47530916 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47530930 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47530951 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47531179 G T N N 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 5 9 1 3 3 3 47531203 T C N Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 3 47531436 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 47531485 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 47531496 A T N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 47531500 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 47531833 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47532030 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47532070 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47532071 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47532105 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47532106 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47532127 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47532152 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47532521 T G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 47532679 G A N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 47532939 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47533026 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47533059 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47533137 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47533166 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47533288 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47533349 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47533455 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47533536 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47533714 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47533742 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47533754 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47533863 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47533920 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47533923 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47533956 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47533985 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47533995 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47534033 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47534055 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47534108 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47534155 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47534492 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47534635 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47534664 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47534833 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47535050 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47535088 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47535112 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47535172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47535177 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47535243 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47535279 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47535608 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47535642 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47535705 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47535850 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 47535893 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47535899 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47535952 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47536126 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47536133 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47536387 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47536393 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47536573 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47536622 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47536655 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47536789 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 47536799 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 47536803 A T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 47536880 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47536892 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47536902 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47536920 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47536990 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47536996 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 47537250 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 47537351 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47537367 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47537437 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47537442 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47537644 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47537907 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47538028 T A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 47538116 G C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47538144 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 47538161 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 47538196 C T N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 47538201 G A N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 47538208 T C N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.272727272727273 0.0909090909090909 0.636363636363636 7 15 3 1 7 3 47538249 A G N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.2 0 0.8 4 16 2 0 8 3 47538408 C G N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 3 47538520 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 47538531 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 47538540 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 47538565 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 47538589 A T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 47538593 G C Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 47538610 A T N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 47538658 C T N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 47538675 C G N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.166666666666667 0.0833333333333333 0.75 5 19 2 1 9 3 47538718 C T N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.153846153846154 0.0769230769230769 0.769230769230769 5 21 2 1 10 3 47538748 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 47538784 C A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 47538834 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47538859 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47538888 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 47538982 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47539030 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47539170 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 47539188 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 47539194 T G N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 47539258 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47539262 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47539284 G T N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 47539321 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 47539341 C G N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 47539455 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 47539500 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 47539528 C G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 47539539 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 47539625 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47539751 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47539768 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47539781 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47539895 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47539951 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47540654 A G N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 3 47540656 T G N N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 3 47541029 G T N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 3 47541042 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 47541057 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 47541156 G T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 47541174 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 47541303 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47541305 G T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 47541384 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 47541397 G T N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 47541415 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 47541421 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 47541439 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 47541591 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47541709 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47541878 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47541979 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47542046 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47542057 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 47542063 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 47542077 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 47542142 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 47542257 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47542312 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 47542321 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47542336 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47542409 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47542591 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47542765 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47542777 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47542863 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47543056 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47543094 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47543211 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47543282 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47543418 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47543582 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47543645 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47543834 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47543846 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47544087 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47544141 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47544272 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47544286 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47544394 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47544606 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47544687 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47544795 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47544829 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47544968 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47545044 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47545128 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 47545149 A C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 47545155 A T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 47546016 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 47546165 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 47546173 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47546241 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47546301 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47546457 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 47546711 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 3 47546782 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47546848 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47547136 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 47547197 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 47547282 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 47547379 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47547409 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 47547511 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 47547667 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 47547674 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 47547715 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 47547878 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 47547879 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 47547939 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 47547961 T G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 47547986 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47547998 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47548061 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 47548117 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 47548196 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 47548200 T A N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 47548211 T C N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 47548291 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 47548322 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 47548385 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 47548447 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47548497 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47548558 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47548573 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47548778 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47548826 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47548880 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47548947 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47548983 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47549024 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47549048 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47549162 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47549203 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47549319 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47549336 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47549379 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47549381 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47549503 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47549546 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47549560 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47549751 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47549968 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47550029 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47550100 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47550685 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47550752 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47550771 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47550836 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47550878 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47550880 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47550982 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47551062 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47551105 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47551176 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47551177 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47551199 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47551233 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47551404 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47551511 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47551544 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47551635 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47551642 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47551668 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47551839 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47551845 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 47551912 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47551961 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47551971 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 47551976 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 47552037 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 47552175 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47552332 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 47552381 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47552426 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47552431 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 47552439 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47552447 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47552477 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47552510 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47552590 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 47552632 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47552660 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 47552718 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47552732 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47553019 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47553083 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47553109 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47553110 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47553154 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47553173 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47553213 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47553276 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47553328 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47553371 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47553387 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47553451 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47553566 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47553644 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47553778 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 47553803 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 47553927 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47553945 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47554028 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47554038 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47554075 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47554113 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47554261 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47554277 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47554309 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47554407 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47554459 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47554479 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47554515 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47554696 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47554829 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47554830 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47554880 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47554908 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47554987 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47554998 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47555001 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47555031 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47555073 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47555139 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47555173 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47555332 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47555357 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47555366 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47555413 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47555424 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47556113 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47556248 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47556399 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 47557177 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47557699 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47557768 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47557776 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47558057 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47558495 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47559073 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47559395 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47559687 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 47559755 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47559911 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 47560200 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47560228 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47560508 T A Y N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 47560649 A C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 47560836 C T Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 47560955 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47560998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47561348 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47561679 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 47562118 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47562534 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47562711 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47562923 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47563021 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47563254 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47563265 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47563584 C T N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 47563838 T A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 47564178 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47564293 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47564394 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47564582 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47564607 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47564653 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47565254 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47565285 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 47565351 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47565399 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 47565596 T G N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 47565831 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47565973 A T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 47566041 C A N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 47566092 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 47566410 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47566562 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47566827 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47567002 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47567125 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47567420 A T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 47567536 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47567557 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47567591 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47568256 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47568285 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47568396 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47572945 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47573275 A C Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 47574434 G C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 47575054 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47575193 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47575232 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 47575383 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47575419 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 47575827 G T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 47575837 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 47575849 G A N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 47575928 A C N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 47576175 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47576221 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 47576230 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47576412 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47576535 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47576991 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47577538 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47577770 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47579012 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47579844 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47579919 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47580820 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 47581586 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47581668 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47581776 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47582334 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47582757 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47582857 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47583322 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47583479 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47583517 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47584734 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 47585052 G A N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 47585459 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47585480 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47585526 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 47586096 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 47586141 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47586198 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47586809 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47586819 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47586829 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47587075 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 47587171 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47587595 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47587617 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47587756 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47587939 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47588007 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47588072 A T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47588233 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47588661 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47588663 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47588748 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47588783 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47588809 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47589415 A T Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47589698 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47589876 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47590470 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47590974 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47591007 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47591144 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47591167 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47591242 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 47591290 T G N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 3 47591826 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 47592186 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 47592390 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47592505 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47592541 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47592609 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47593070 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47593730 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47593996 T C Y Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 47594064 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47594075 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 47594182 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47594965 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47595431 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47595777 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47595811 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47595901 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47596128 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 47596194 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47597013 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47597071 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47597183 T G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47597223 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47597255 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 47597424 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47597562 A C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47597602 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47597654 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47598272 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47598621 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 47598674 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47598830 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47598831 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47598957 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47599022 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47599259 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47599322 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47599457 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47599723 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47599841 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47600032 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47600564 C G N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 47600960 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47601370 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47603629 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47603630 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47603646 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47603975 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 47603993 G A N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 47604052 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 47604170 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47604645 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 47605042 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 47606179 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47606323 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47606331 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47606379 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47606485 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47606807 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47607090 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47607207 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47607308 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47607386 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47607398 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47607820 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47607984 T C N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 47608021 C T N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 3 47608117 A G Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 47608146 A T N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 3 47608197 A T N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 3 47608218 C A N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 3 47608312 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 47608497 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47609189 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47609894 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47610004 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47610546 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47610722 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47610735 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47610994 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47612219 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47612590 A C N N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 5 7 0 5 1 3 47613970 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 47614196 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47614729 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47614766 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47614807 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47614994 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 47615057 C A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47615064 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47615131 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47615324 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47615336 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47615406 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47615574 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47615636 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47616502 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 47616738 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47616776 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47616843 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47617342 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 47617421 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 47617637 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 47617645 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47618016 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47618466 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47619263 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47620749 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47620828 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 47620927 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47620944 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47620977 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47621059 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47621074 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47621075 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47621091 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47621113 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47621198 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47622042 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47622725 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47622908 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47623047 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47623446 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47624429 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47624479 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47624827 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47624870 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47625269 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 47625517 C T N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 47625646 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 47625696 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 47625734 G C N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 3 47625755 A C N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 3 47625766 T C N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 47625797 C G N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 47625867 T G Y N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 47625932 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 47625947 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 47625969 C G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 47625977 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47626017 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47626154 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47626353 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47626632 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47626642 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47626697 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47626787 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47626803 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 47626877 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 47626887 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47626934 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 47626981 G C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 47627038 C G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 47627050 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 47627072 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47627092 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47627511 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47627606 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47627627 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47627681 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47627735 A C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 47627834 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47628071 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 47628319 A C N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 47628332 C G N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 47628344 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 47628362 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 47628390 A T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 47628567 G T N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 47628583 G A N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 47629207 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47629336 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47629374 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47629617 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47629725 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47629843 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47629871 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47629872 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47629988 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47630168 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47630269 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47630286 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47630368 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47630393 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47630558 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47630573 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47630574 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47630819 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47630824 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47630876 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47631060 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47631180 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47631204 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47631363 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47631504 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47631873 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47631903 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47631963 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47632170 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47632367 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47632485 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47632497 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47632630 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47632691 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47632718 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47632843 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47632858 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47632938 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47632951 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47633069 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47633087 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47633131 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47633352 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47633366 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47633439 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47633504 A T N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 47633616 A T N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 47633813 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47633989 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47634030 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47634074 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47634223 C A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 47634318 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47634554 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47634585 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47634681 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47634773 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47634880 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47634881 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47634903 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47634987 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 47635027 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47635188 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47635232 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47635379 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47635400 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47635486 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47635490 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47635621 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 47636091 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47636394 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47636409 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47636446 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47636510 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47636547 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47636573 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47636577 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47636627 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 3 47636672 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47636733 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47636813 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47637125 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 47637874 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 47638986 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47639681 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47640723 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47640808 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47641400 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 47641521 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47641960 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 47642024 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 47643190 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47643358 A C N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 47643479 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 47644546 T G N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 47644730 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47644805 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47644822 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47644921 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47644958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47645102 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47645130 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47645140 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47645388 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47645623 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47646242 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47646362 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47646726 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47647215 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47647593 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47647765 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47647940 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47647989 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47648108 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47648452 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47648535 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47648696 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47648841 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47649067 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47649098 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47649164 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47649766 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47649943 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 47650050 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47650462 G C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 47651258 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47651648 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47652596 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47652895 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47653336 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47653795 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 47653990 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47654001 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47654033 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47654067 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47654081 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47654086 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47654407 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47654504 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47654547 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47654777 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 47654806 A G N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 47654928 C T N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 3 47655172 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47655227 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 47655725 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47655745 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47655820 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 47655954 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47655999 A C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 47656020 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47658650 G C Y N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 8 12 2 4 4 3 47658651 G T Y N 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.181818181818182 0.454545454545455 0.363636363636364 9 13 2 5 4 3 47658895 C G Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 47658901 G T Y N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 3 47660101 T G Y N 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 47660279 G T Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 47660399 T C Y Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 3 47660422 T A Y N 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 3 47660585 A G Y Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.375 0.125 0.5 7 9 3 1 4 3 47660631 G T Y N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.363636363636364 0.545454545454545 0.0909090909090909 14 8 4 6 1 3 47661865 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 7 5 3 1 2 3 47661884 G A N Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 6 6 2 2 2 3 47661968 C T N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 8 12 1 6 3 3 47662075 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 47662123 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 47662214 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47662233 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47662249 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47662252 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47662303 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47662405 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47662479 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47662602 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 47662702 C A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 47662852 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.0526315789473684 0.736842105263158 0.210526315789474 16 22 1 14 4 3 47662932 T A N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 47663112 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 47663252 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47663308 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47663316 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47663489 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47663510 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47663666 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47663707 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47663723 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47664219 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47664273 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47664310 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 47664323 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 47664392 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47664778 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47664911 A T N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 47665138 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47665209 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47665252 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47665336 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47665420 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 47665578 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47665711 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47665915 C T N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 3 47666164 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 47666166 C G N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 47666234 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47666260 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 47666278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47666430 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47666495 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 47666536 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47666550 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47666682 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 47666891 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47667148 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47667228 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47667331 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 47667567 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47667795 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47667812 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47667857 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47667882 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47667908 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47667977 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47668072 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 47668105 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 47668110 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47668127 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 47668265 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 3 47668291 T A N N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 3 47668390 G T N N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 3 47668689 G A N Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.142857142857143 0.714285714285714 0.142857142857143 7 7 1 5 1 3 47668892 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47668913 C G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47668946 C T N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 47668972 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 47669114 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47669125 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47669135 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47669255 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47669320 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47669329 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47669363 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47669365 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 47669610 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47669623 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 47669654 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 47669703 G T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 47669773 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47669915 T G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 47669940 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 47669952 G C N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 47669961 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 47669993 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 47670013 A T N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 47670026 G A N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 47670133 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 47670161 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 47670242 G C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 47670256 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 47670376 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47670712 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47670800 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47670805 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47670889 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47671415 G C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47671449 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47671453 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47671501 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47671518 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47671532 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47671551 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47671554 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 47671608 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47671672 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47671693 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47671721 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 47671800 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47671941 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47671946 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47671957 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47672407 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47672444 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47672509 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47672526 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47672685 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47672764 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47672792 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47672839 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47672866 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 47672888 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47672943 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47672967 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47672982 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47673001 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47673028 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47673301 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 47673311 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 47673369 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47673399 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47673434 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47673479 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47673540 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47673693 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 47673751 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47673768 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47673769 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47674105 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47674130 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47674239 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47674310 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 47674342 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47674380 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47674460 G T N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 47674561 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 47674864 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47674989 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47675324 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47675375 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47675874 T G N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 47676409 A G N Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 7 7 2 3 2 3 47676421 T A N N 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 6 6 2 2 2 3 47676824 A T Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 47678038 T C Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 47678192 G C Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 47678242 G T Y N 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 7 5 3 1 2 3 47678306 G A Y Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 47679103 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 47680226 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 47680263 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 47681223 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47681253 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47681282 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47681362 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47681363 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47681551 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47682084 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 47682313 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47683410 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 47683431 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 47683929 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47684304 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47684386 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 47684694 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 47684772 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47685595 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47685929 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47685941 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47686096 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47686164 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47686495 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47686645 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47686980 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 47687052 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47687506 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47687530 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47687686 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47687936 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 47688112 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 47688884 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 5 13 2 1 6 3 47688892 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 5 13 2 1 6 3 47689185 C G N N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 6 12 2 2 5 3 47689420 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47689575 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47689642 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47689690 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47690562 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47690622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47690633 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47690649 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47690820 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47691143 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47691343 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47691349 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47691408 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47691437 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 47691453 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47691598 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47691659 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47691774 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47691842 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47692017 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47692110 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47692214 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47692404 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47692408 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47692485 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47692609 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47692813 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47692883 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47692924 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47693061 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47693140 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 47693329 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47693722 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47693871 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47694728 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 47695094 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 47695125 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47696025 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 47696125 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47696136 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47696375 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47696427 A T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 47696460 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47696528 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 47696667 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47696681 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47696729 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 3 47696745 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 47696884 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 47697198 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47697918 G C N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 47698065 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 47698168 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 47698228 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 47698648 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47698707 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47698732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47698878 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47698897 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47698905 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47698993 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47699017 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47699364 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47699931 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47700102 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47700271 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47700323 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47700489 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47700905 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47700919 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47700944 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47701060 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47701151 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47701250 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47702155 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47702190 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47702237 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47702354 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47702393 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47702576 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47702733 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47702852 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47703030 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47703068 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47703101 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47703481 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47703871 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47703890 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47703929 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47704047 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47704089 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 47704278 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 47704344 G A N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 47704347 T C N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 47704566 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47704767 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47704963 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47705064 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47705074 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 47705089 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47705146 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47705231 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47705301 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47705361 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47705382 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47705593 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 47705672 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47705807 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47705902 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47705972 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47705990 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47706034 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47706059 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47706073 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47706075 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 47706147 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47706206 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47706327 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47706344 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47706647 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 47706709 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47706710 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47706806 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47706916 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 47706990 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47707138 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47707259 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 47707504 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47707527 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 47707584 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 47707604 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47707670 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 47707815 A T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 47708369 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47708465 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47708567 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 47708939 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 47709054 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47709246 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47709308 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47709431 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47709461 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47709625 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47709733 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 47709766 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 47709851 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47710465 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 47710764 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47710850 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47711011 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47711177 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47711381 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 47711469 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47711814 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47712215 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47712344 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47712475 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47712807 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47712830 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47712890 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47712908 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47713026 C G Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47713027 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47713074 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47713169 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47713304 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47713324 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47713481 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47713713 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47713718 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47714157 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47714593 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 47714637 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 47714815 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47714856 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 47714924 A G Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 47714948 A G Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47715555 T G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47715556 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47715670 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47715820 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 47716194 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47716365 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47716639 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47716714 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47716809 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47716818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47716985 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47717111 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47717365 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47717514 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47717572 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 47717730 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47717781 T G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 47718230 A C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 47718256 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 47718360 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47718463 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47718877 T C N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 3 47718944 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 47719212 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47719230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47719247 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 47719306 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47719345 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47719418 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47719805 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47719965 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47719994 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47720104 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47720127 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47720507 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47720573 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47720604 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 47720769 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47721055 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47721137 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47721250 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 47721480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47721670 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47722196 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 47722256 C A N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 47722354 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 47722567 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47722748 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47722834 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47723277 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47723536 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47723564 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47724006 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 47724226 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47724488 T C N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 47724512 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.222222222222222 0 0.777777777777778 4 14 2 0 7 3 47724656 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 47724676 T A N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 47724971 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 47725005 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47725041 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47725127 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47725276 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47725482 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47725628 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47725663 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47725774 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47725801 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47725822 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 3 47725824 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 3 47725877 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47725878 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47725937 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47726006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47726121 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47726159 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47726340 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 47726372 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 47726475 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47726481 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 47726493 C A Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47726545 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47726597 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47726654 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47726712 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 47726854 C G N N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 3 47727097 T C Y Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 3 47727719 C T Y Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 3 47727802 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 47727832 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 47727859 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47727993 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 3 47728136 T G Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 47728144 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47728164 T C Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 47728170 A G Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 47728211 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47728297 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47728367 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47728374 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47728408 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47728427 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47728444 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47728464 T A Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47728524 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47728600 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47728642 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47728788 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 47728819 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 47728869 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47728920 A T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47728976 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47729046 A C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47729055 G T Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47729057 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47729093 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47729189 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47729305 A T Y N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 47729390 A G Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47729393 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47729521 G T N N 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.181818181818182 0.454545454545455 0.363636363636364 9 13 2 5 4 3 47729573 T G N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 3 47729579 C A N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 47729640 G T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 47729649 G A Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 47729750 A G N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 3 47729820 T G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 47729834 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47729859 A C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 47729876 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47729945 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47730015 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47730056 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47730194 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47730211 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47730269 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47730300 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47730491 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47730501 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47730524 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47730530 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47730542 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47730586 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47730628 C G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 47730629 T G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 47730705 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 47730759 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 47730779 A T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 47730817 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 47730977 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47731066 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 47731194 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47731283 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47731299 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 47731394 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47731521 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47731542 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47731562 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47731565 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 47731575 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47731586 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47731682 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47731685 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47731722 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47731743 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47731790 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47731812 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47731852 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47731890 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47731997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47732024 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47732038 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47732045 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47732053 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47732101 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47732146 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 47732181 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47732223 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47732329 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47732364 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47732390 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47732451 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47732487 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47732499 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47732521 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47732554 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47732555 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47732651 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47732669 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47732682 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47732736 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47732772 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47732773 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47732809 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47732850 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47732994 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47733008 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47733106 C A Y N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 47733155 A G Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47733181 A T Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47733305 C A Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47733324 G A Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 47733416 A C Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47733585 T G Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 47733599 T A Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 47733628 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 47733703 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 47733715 C G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47733936 G C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 47734027 A T Y N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 47734240 T C Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47734274 T C Y Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.230769230769231 0.153846153846154 0.615384615384615 8 18 3 2 8 3 47734377 A G Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47734411 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47734571 C A Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47734633 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47734660 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47734770 T A Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 47734847 C A Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 47734856 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 47734905 A G Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 47734924 T C Y Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 47735064 C G Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 47735181 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47735202 T C Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47735213 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 47735301 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47735313 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 47735314 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 47735485 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47735560 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47735563 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47735599 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47735602 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47735613 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47735650 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47735654 C T Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 47735681 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47735701 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47735828 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47735879 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 47735989 A T Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47736047 C A Y N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 3 47736086 G A Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 47736190 G A Y Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 9 5 4 1 2 3 47736223 G T N N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.363636363636364 0.181818181818182 0.454545454545455 10 12 4 2 5 3 47736250 G T Y N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 9 7 3 3 2 3 47736320 G A Y Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 10 10 3 4 3 3 47736412 G A Y Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 47736483 G A Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47736495 C A Y N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 47736726 G T Y N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 47736779 C A Y N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.230769230769231 0.153846153846154 0.615384615384615 8 18 3 2 8 3 47736867 A C Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47736890 T A Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 47736896 A C Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 47736906 A T Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 47737027 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 47737081 A T Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47737167 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47737171 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47737237 A G Y Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 47737328 G A Y Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 6 14 2 2 6 3 47737348 A T Y N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 3 47737401 T A N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 3 47737420 C T N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 7 9 2 3 3 3 47737421 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 7 11 2 3 4 3 47737434 A C Y N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 3 47737574 T A Y N 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 8 10 3 2 4 3 47737575 G A Y Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 8 12 3 2 5 3 47737632 G C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47737653 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47737689 T C Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 47737705 C T Y Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 47738033 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47738054 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47738159 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 47738176 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47738204 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47738229 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47738240 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 47738264 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47738329 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47738330 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47738426 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47738459 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47738488 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47738513 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 47738573 T G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 47738575 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 47738596 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 47738613 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 47738730 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47738769 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47738837 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47738838 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47738905 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47738919 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47738975 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47738992 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47739017 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 47739145 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47739203 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 47739330 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47739368 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47739418 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47739636 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47739646 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47739793 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 47740011 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47740062 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47740174 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47740225 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47740494 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 47740545 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47740596 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47740632 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47740665 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47740756 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47741083 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47741362 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47741806 A T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 47741838 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 47741854 A C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 47741925 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47741930 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 47742051 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 47742153 T A N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 3 47742199 T A N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 47742357 A T N N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 3 47742394 G T N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 47742822 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47742895 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47742912 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47742967 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 47742968 C G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 47743024 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 47743055 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 3 47743098 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47743151 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 47743234 C G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 47743256 A C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 47743269 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 47743281 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 47743351 T A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 47743366 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 47743397 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 47743411 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 47743429 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47743502 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47743513 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47743560 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47743593 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47743611 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 47743612 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 47743657 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 47743703 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47743743 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 47743803 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 47743816 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 47743826 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47743827 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 47743922 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 47743959 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47743961 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47743991 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47744030 T G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 47744081 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47744205 C A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 47744206 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 47744401 A C N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 3 47744425 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 47744458 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47744507 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 47744545 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 47744635 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47744727 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47744738 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47744741 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 47744860 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47744897 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47744907 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47744908 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47744924 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47744931 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47744972 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47745038 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47745050 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47745083 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47745105 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47745138 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47745325 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47745351 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47745385 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47745452 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47745464 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47745474 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47745536 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47745544 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47745729 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47745794 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47745813 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 47745826 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 47745847 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47745849 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47745903 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47745930 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47745997 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 47746014 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 47746044 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47746075 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47746130 A C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 47746141 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 47746185 T C N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 47746258 T A N N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 3 47746290 A G N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 47746292 G A N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 47746324 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 47746454 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47746641 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47746698 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 47746934 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47747165 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47747186 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47747255 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47747482 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47747647 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47747673 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47747737 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47747774 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47747852 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47747854 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47747979 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47747993 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47747995 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47748052 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47748065 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47748068 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47748083 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47748127 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 47748524 C T N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 6 14 2 2 6 3 47748610 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 47748732 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47748743 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47748988 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47749069 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 47749088 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47749095 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 47749100 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47749106 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47749150 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47749236 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 47749339 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 47749402 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 47749428 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 47749464 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 47749465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47749489 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 47749509 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47749711 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47749778 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47749797 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47750093 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47750148 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47750322 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47750595 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47750693 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47750792 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 47750901 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 47750954 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47751039 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 47751056 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 47751113 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47751123 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 47751164 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 47751309 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47751429 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47751452 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 47751470 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47751539 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47751563 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47751926 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47751956 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47752001 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 47752027 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 47752139 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47752152 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 47752194 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 47752265 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47752486 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 47752504 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47752648 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 47752661 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47752677 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47752704 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47752745 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 47752766 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 47752787 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 47752817 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47752849 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47752858 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 47752872 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 47752876 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 47752896 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 47752921 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 47752968 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 47753025 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47753036 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 47753078 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47753103 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47753111 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47753124 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47753132 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47753158 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47753359 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47753360 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47753428 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 47753558 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 47753631 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47754058 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 47754127 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47754323 A T N N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 3 47754445 C G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 47754670 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 47754894 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 47754993 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47755100 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47755170 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47755452 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 47755495 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47755586 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47755635 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47755716 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47755764 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47755821 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 47755990 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47756167 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47756412 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47756425 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47756440 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47756446 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47756508 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 47756585 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47756723 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47756778 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47756899 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47756982 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 47757528 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 47757561 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47757570 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47757645 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47757678 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 47757716 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47757765 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 47757783 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 47757807 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47757828 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 47757894 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47757973 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 47758075 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47758152 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47758390 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47758402 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47758471 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47758570 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47758614 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47758617 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47758639 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47758643 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47758751 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 47758845 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47758885 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 47758889 A T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 47759074 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47759114 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47759182 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 47759228 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47759262 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 47759277 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47759298 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47759301 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47759426 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47759718 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47759721 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 47759948 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 47759975 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 47760022 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47760214 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47760222 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47760240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47760334 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47760579 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47760660 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47760837 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47760871 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 47761166 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 47761322 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47761528 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47761630 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47761881 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47762028 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47762086 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 47762257 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47762321 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 47762482 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47762579 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47762607 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 47762699 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 47762755 A T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 47762947 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 47763163 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47763171 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47763200 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 47763259 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 47763274 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 47763293 C A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 47763326 T A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 47763460 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47763489 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 47763715 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47763768 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 47763794 T A N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 47763836 G A N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.214285714285714 0.0714285714285714 0.714285714285714 7 21 3 1 10 3 47763984 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 47764077 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 47764195 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47764214 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47764316 C G Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 47764394 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47764600 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 47764686 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 47764916 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47764961 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47764997 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 47765002 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47765016 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 47765017 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 47765047 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47765051 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47765069 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47765133 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47765455 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47765476 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47765551 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47765567 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47765603 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47765650 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47765822 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47765913 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47766177 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47766226 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47766252 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 47766304 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47766329 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 47766353 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47766402 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47766408 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47766506 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47766515 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 47766528 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 47766665 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 47766812 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47767717 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47767791 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47767820 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47767832 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47767845 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47767932 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47767955 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47767966 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47767973 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47768080 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47768088 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 47768119 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47768124 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47768146 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47768149 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47768183 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47768296 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47768442 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47768459 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47768482 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47768522 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47768569 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47768613 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47768734 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47768803 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47773128 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47773385 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 47773530 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 47773587 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47773721 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47773835 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47773843 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47773873 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 47773976 A C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 47774027 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 47774028 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 47774122 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47774208 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 47774221 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 47774373 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47774411 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 47774436 G T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 47774446 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 47774459 T C N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 47774496 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 3 47774800 C A Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 47774836 T C Y Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 5 13 2 1 6 3 47774840 G T Y N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 7 13 3 1 6 3 47774856 T C Y Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 3 47774859 T C Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 47774935 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47774940 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47774997 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 47775065 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47775182 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47775288 A T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47775330 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47775526 A C N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 47775565 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 47776311 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 47776415 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 47776449 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 47776581 G A Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 47776625 T G N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 47776727 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 47776734 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 47776769 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47776829 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47776842 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 47776969 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 47777119 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 47777327 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 47777372 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47777560 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47777716 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47777856 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 47777877 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47777927 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 47778027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47778090 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 47778222 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 47778257 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 47778690 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 3 47778723 T A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 47778886 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 47778925 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47779022 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47779038 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47779147 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 47779205 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47779373 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47779383 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47779756 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47779778 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 47779779 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 47779883 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47779887 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47780014 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47780076 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 47780090 T A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 47780095 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 47780122 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 47780180 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47780212 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47780451 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47780534 C A Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 47780584 A C Y N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 47780599 A C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47780602 G A Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.466666666666667 0.2 0.333333333333333 17 13 7 3 5 3 47780625 T A Y N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 3 47780692 C G Y N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 47780706 G A Y Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 47780723 G A Y Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 47780814 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 47780907 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 47780955 C T Y Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 6 14 2 2 6 3 47781187 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47781201 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47781275 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 47781327 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 47781343 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47781388 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 47781410 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 47781447 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47781488 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47781493 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47781529 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47781562 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47781719 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47781778 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 47781819 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 47781878 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47781908 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47782021 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47782036 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47782063 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47782107 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47782142 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47782146 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47782207 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47782238 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47782313 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 47782319 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47782326 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47782408 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 47782422 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47782457 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47782500 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47782501 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47782583 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47782588 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47782611 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47782637 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47782652 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47782729 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 47782758 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 47782765 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 47782780 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 47782812 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 47782870 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 47782900 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47782917 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 47782923 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 47783001 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47783013 A C N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 47783077 C G N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 47783156 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47783183 G C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 47783529 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 47783556 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 47783699 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47783874 G T N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 3 47783894 A T N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.266666666666667 0.133333333333333 0.6 10 20 4 2 9 3 47783976 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 47784006 G T N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 47784132 T A N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 3 47784263 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47784348 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47784521 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47784584 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47784589 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47784722 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 47784723 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47784733 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47784977 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47785026 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 47785058 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 47785185 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47785247 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 47785309 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 47785319 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47785482 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 47785742 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47785840 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47786235 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 47786266 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 47786267 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 47786385 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47786404 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47786464 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47786465 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47786557 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47786632 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47786674 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47786677 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47786688 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47786856 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47786969 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47787028 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47787029 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47787176 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47787511 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 47787522 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 47787548 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 47787582 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 47787749 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47787794 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47787832 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47787854 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47787872 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47787919 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47787938 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47787989 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47788028 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47788071 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47788085 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47788306 T C N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 47788379 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 47788532 T C N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.272727272727273 0.272727272727273 0.454545454545455 9 13 3 3 5 3 47788546 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 47788592 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47788633 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47788757 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47788819 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47788842 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47788886 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47789009 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47789111 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47789271 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47789276 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 47789337 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47789542 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47790130 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 3 47790263 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47790339 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47790348 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47790465 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47790484 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47790501 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47790633 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47791267 G A N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 3 47791358 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 47791473 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47791867 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47791912 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47792096 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47792204 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 47792255 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47792256 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47792774 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47792778 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 47793305 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 47793898 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47793977 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47794144 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47794538 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47794570 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47794693 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47794747 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47794939 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47794972 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47794978 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 47794983 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 47794996 T G N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 47795000 C A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 47795018 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47795292 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47795891 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 47796097 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47796102 C A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 10 22 4 2 10 3 47796110 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47796217 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47796322 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47796376 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47796441 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47796447 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47796489 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47796903 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 47796923 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 47797079 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47797145 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47797359 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47797458 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47797544 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47797556 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47797570 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47797678 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47797687 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47797901 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47797917 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47797947 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47798146 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47798190 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47798212 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47798299 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47798413 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47798538 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 3 47798904 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47799000 A C N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 47799180 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47799244 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47799343 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47799346 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47799355 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47799377 G T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 47799399 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47799755 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47799922 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47799952 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47800128 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47800143 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47800189 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47800267 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47800274 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47800299 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47800317 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47800371 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47800397 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47800408 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47800463 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47800465 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47800765 A C N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 47800837 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47800872 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47800915 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47801006 A C N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 47801047 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 47801088 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 47801115 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47801220 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47801300 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47801329 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 47801441 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47801619 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47801640 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47801803 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47801806 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47801896 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47801913 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47801951 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47802008 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47802158 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47802192 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47802245 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47802315 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47802333 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47802389 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47802396 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47802413 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47802429 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47802458 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47802483 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47802536 T G N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 47802576 A C N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 3 47802680 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 10 8 4 2 3 3 47802753 A C N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 3 47802951 C G N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 47805142 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47805218 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47805221 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47805324 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47805467 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 47805543 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47805909 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47805992 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47807044 A G Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 47807399 T A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47807532 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47807571 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47807812 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 47807842 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47807867 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47807910 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 47807933 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47808062 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47808132 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47814679 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 47814690 T A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 47814885 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47814938 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 47814958 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47815027 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47815068 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47815078 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47815119 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47815150 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47815188 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47815341 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47815355 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47815376 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47815385 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 47815458 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47815477 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47815514 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47815515 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47815554 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47815643 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47815664 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47815669 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47815686 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47815700 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47815706 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47815739 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47815781 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47815790 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47815838 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47815878 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47815953 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47815967 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47816002 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47816003 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47816091 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47816097 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47816290 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47816292 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47816449 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47816450 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47816469 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47816726 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47816881 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47816949 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47816989 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47817410 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47817436 A G N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 47817567 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47818395 C A N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 3 47818491 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47818513 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47818630 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47818642 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47818722 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47818744 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47818761 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47818769 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47818772 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47819151 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47819166 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47819178 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 47819185 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47819206 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 47819236 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47819249 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47819289 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47819320 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 47819394 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 47819469 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 47819614 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47819625 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47819820 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47819831 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47819902 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47819913 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47820226 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47820247 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47820264 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47820362 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47820445 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47820514 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47820534 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47820873 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 47821103 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 47821957 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47822131 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 47822164 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47822245 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47822258 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47822341 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 47822346 T G N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 47822492 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 47822592 A C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 47822778 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 47822896 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47823024 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47823688 G A N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 9 11 3 3 4 3 47824225 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47825494 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47825523 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47825630 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47825690 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47825733 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47826268 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 47826613 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47826626 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47826794 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47826993 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47827016 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47827437 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47827441 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47827712 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47827823 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 47827912 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47828083 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47828137 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 47828215 C T N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 47828269 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 3 47828412 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47828549 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47828637 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47828779 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47829125 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47829383 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 47829746 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47829818 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47829981 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47830185 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47830382 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47830478 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47831746 T C Y Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 47831791 A T Y N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 3 47831856 T C N Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 3 47836841 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 47836938 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47837263 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47837393 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 47837403 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 47837460 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 47837546 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47837611 A T N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 3 47837623 A T N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 47837646 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 47837656 T A N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 47837691 C T N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.416666666666667 0.25 0.333333333333333 13 11 5 3 4 3 47837934 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47837941 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47838391 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47838447 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 47838486 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47838522 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 47838665 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47838701 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 47838728 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47839043 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47839411 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47839518 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47839687 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 47839963 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47840028 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 47840281 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47840398 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47840428 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47840460 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47840466 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47840499 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47840519 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47840660 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47840678 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 47841227 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47841274 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47841302 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47841362 G A Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 47841422 C A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47841446 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47841596 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47841619 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47841681 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47841749 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47841896 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47841937 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 47841973 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47842273 T A Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 47842487 A T Y N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 47842604 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 47842894 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 47843004 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47843033 C G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 47843267 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 47843291 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47843307 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 47843754 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47843770 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 47843957 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 47843972 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 47844036 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 47844098 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47844422 G T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 47845095 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47845098 C T Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 47845118 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47845229 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47845358 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47845365 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47846031 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 47846145 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47846222 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 47846452 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47846540 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47846702 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47847042 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47847058 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47847099 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47847407 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47847464 A T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 47847943 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47847965 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 47848093 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47848133 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47848165 T G Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47848562 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 47848753 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47848829 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 47848873 T A N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 47849314 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 3 47849354 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 47849795 G A N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 47850613 G C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 47850750 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47851221 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47852136 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47852393 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47852649 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47852833 C G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 47853179 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47853267 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47853484 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47853645 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47853750 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47854337 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 47854457 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47854498 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 47854585 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47854764 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47855045 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47855207 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47855845 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47855914 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47856190 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47856219 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 47856438 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47856711 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47856833 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47856893 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47856921 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47856933 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47856991 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47857070 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47857184 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47857244 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47857320 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47857393 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47857529 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47857533 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47857763 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47857861 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47857923 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47857927 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47857945 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47857947 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47857975 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47857989 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47858014 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47858074 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47858144 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47858149 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47858187 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47858327 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47858338 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47859008 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47859299 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47859425 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47859465 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47859743 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47859878 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 47860115 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47860169 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47860243 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 47860272 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47860322 A C N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 47860456 T C N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.307692307692308 0.230769230769231 0.461538461538462 11 15 4 3 6 3 47860469 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 47860574 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47860722 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47860727 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47860772 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47860802 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47860824 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47860849 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47860857 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47860916 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 47861093 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47861100 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47861217 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47861302 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47861404 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47861752 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47861902 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47861938 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47862021 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47862577 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47862639 C G Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47862761 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47862832 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 47863342 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47863346 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47863452 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 47863525 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47863631 G A N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 3 47863887 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47863908 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 47864087 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47864193 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47864359 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47864380 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 47864499 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47864699 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 47864701 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47864717 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47864789 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47865345 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 47865372 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47865418 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 47865457 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47865545 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47865617 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47865766 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47865811 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47865965 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47865989 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47866083 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47866116 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47866231 C G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 3 47866302 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47866384 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 47866410 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 47866457 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47866473 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47866685 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 47866781 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47866826 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 47866935 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 47867022 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 3 47867057 T A N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 47867204 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47867236 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47867303 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 47867304 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 47867527 C A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 3 47867588 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 47867610 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 47867662 T A N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 47867914 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 47868017 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 47868144 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 47868337 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47868400 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47868440 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47868487 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 47868507 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 47868600 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47868707 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47868928 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47868965 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47868983 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47869173 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47869312 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 47869348 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 47869487 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47869500 T A N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 47869510 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 47869557 T A N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 47869637 C A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 47869711 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 47869764 G A N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 3 47869919 C A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 47870293 G C N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 3 47870343 G A N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 3 47870707 C T N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 47870995 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47871273 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 47871505 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47871512 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47871544 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 47871770 C T Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 47872840 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47872953 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47872974 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47873136 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47873152 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47873205 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47873270 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47873342 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47873405 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47873416 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47873538 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47873627 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47873628 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47874733 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 47874894 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47874905 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47874940 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47874951 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47875036 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47875587 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 47875637 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 47875755 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47876721 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.333333333333333 0.133333333333333 0.533333333333333 12 18 5 2 8 3 47876737 G A N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.384615384615385 0.153846153846154 0.461538461538462 12 14 5 2 6 3 47877209 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 47877415 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47878053 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47878542 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47878573 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47878649 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47879033 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 47879061 C T N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 3 47879082 C A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 47879164 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 47879311 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47879620 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 47879980 T G N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 47880260 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47880474 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 47880761 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47880789 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 47880825 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 47880834 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47880848 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 47881091 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47881324 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47881415 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 47881418 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 47881452 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47881497 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 47881571 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47881608 G C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 47881721 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47881835 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47881958 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47881973 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 47882609 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47882814 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 47882882 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47883138 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47883419 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 47883633 A G N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 3 47884149 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47884400 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47884487 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47884698 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47884802 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47884823 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47884824 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47885094 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 47885117 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47885442 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 47885656 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 47886017 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 47886186 G A Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 47886259 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47886299 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 47886364 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47886403 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 47886610 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 47886744 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47886806 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47886881 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47886945 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47887007 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47887026 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47887062 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47887145 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47887198 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47887224 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47887234 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47887240 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47887333 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47887345 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47887347 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47887394 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47887442 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47887457 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47887498 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47887556 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47887611 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47887621 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47887642 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47887644 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 47887691 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47887692 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47887751 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47887782 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47887783 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47887809 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 47887833 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47887901 A C N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 47888113 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47888219 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47888235 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47888272 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47888367 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47888449 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47888459 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47888629 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47888669 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47888708 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47888734 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47888761 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47888824 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47888856 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47888924 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47888929 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47888959 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47889018 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47889104 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47889143 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47889147 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47889192 G T Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 47889204 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47889223 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47889247 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 47889344 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47889369 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47889476 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47889493 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 47889501 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 47889535 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47889539 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 47889814 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 47889858 G A Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 47889871 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47889935 G A Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 47890022 G T Y N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 47890048 C G N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 47890052 T G N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 47890067 C T N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 3 47890224 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 47890226 C T Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 47890311 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47890325 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 47890338 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 47890389 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 47890469 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 47890539 G T Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47890576 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47890606 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47890654 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47890663 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47890667 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47890698 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 47890898 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 47890914 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 47890922 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 47891066 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47891074 C T Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 47891086 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47891103 C G Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47891107 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47891145 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47891151 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 47891197 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 47891273 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 47891291 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 47891315 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 47891389 G T Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 47891419 C A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 47891429 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 47891449 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 47891466 A C Y N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 47891484 G A Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 47891574 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47891606 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47891618 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47891624 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 47891696 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47891749 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47891800 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47891818 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47891860 G C Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47891871 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47891954 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 47891976 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 47892000 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 47892178 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47892242 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 47892270 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 3 47892277 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 47892294 G A Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 47892312 C A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 47892419 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 47892560 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 47892627 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 47892658 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47892659 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47892688 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 47892718 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 47892899 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47892928 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47892991 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47893039 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47893138 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 47893165 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 47893224 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47893271 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47893321 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47893323 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47893539 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47893599 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 47893604 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 47893611 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 47893838 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47893876 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47893920 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47893940 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47893954 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47893970 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47894037 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47894067 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47894129 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47894158 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47894275 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47894340 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47894349 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47894359 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47894546 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47894564 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47894588 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47894603 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47894620 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47894622 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47894644 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47894698 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47894742 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47894763 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 47894781 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47894789 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47894800 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47894840 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47894848 T G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 47894891 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47894936 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47894969 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 47895079 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47895249 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47895326 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47895384 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47895493 G C N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 47895545 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47895565 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47895592 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47895594 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47895603 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 47895656 C A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 47895669 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 47895683 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47895706 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 47895752 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 47895772 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47895780 C G Y N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 47895783 G C Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 47895943 T A N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 47896096 T G N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 3 47896122 A G N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.272727272727273 0.181818181818182 0.545454545454545 8 14 3 2 6 3 47896371 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 47896422 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47896449 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47896451 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 47896505 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47896535 T A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 47896545 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 47896598 G C Y N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 3 47896621 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 47896649 A G N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 10 18 4 2 8 3 47896668 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 3 47896677 A T N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 47896720 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 47896770 C A N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 3 47896822 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47896834 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47896847 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 47896891 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 47897145 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 47897160 G A Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 47897207 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47897248 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 47897267 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 47897288 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47897297 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47897325 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47897500 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47897501 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47897544 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47897592 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47897598 A T Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 47897659 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 47897683 C A N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 47897685 C A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 47897697 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 47897735 C G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 47897755 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 47897844 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47897847 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47897877 G T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 47897896 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47897923 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 47897924 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 47897962 G T Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 47897994 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 47897995 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47898008 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 47898029 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47898104 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 47898217 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47898363 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47898378 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 47898381 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47898398 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47898442 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47898519 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47898534 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47898563 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 47898582 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 47898588 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47898612 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 47898614 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47898667 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47898695 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 47898725 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 47898763 G A Y Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 47898812 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47898914 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47898932 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 47898954 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47898957 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47899066 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 47899112 C A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 47899134 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 47899190 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47899204 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 47899279 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47899296 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47899335 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47899351 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 47899362 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47899616 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47899662 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47899756 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 47899939 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47900012 G C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 47900065 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47900085 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47900113 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47900120 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47900153 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 47900300 T C N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 47900325 C T N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.333333333333333 0.2 0.466666666666667 13 17 5 3 7 3 47900352 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47900360 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 47900372 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 47900399 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 47900445 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 47900503 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47900682 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 47900709 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47900933 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47900937 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 47900976 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47901118 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47901198 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 47901205 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47901218 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 47901399 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47901458 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47901943 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 47902122 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47902261 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 47902399 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47902401 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47902439 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47902527 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47902536 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47902581 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47902593 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47902700 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47902722 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47902773 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47902824 G T Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47902840 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47902853 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47903199 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47903237 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47903282 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47903286 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47903302 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47903315 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47903385 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47903437 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47903449 C G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 47903478 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47903594 T A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 47904116 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47904328 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47904384 A C N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 47904396 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 47904441 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 47904451 C A N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 47904567 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 47904575 A G N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 47904663 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 47904704 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 47904778 G T N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 3 47904808 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 47904912 A T Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47904946 A C Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47905070 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 47905125 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 47905230 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 47905233 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 47905313 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47905373 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 47905633 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47905912 G A Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 47906004 G A Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 47906187 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 47906221 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47906292 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 47906366 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47906449 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 47906523 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 47906725 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47906768 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 47906769 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 47906849 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 47906910 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47906947 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47906996 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47907135 A C N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 3 47907146 A C N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 47907268 G A N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.384615384615385 0.230769230769231 0.384615384615385 13 13 5 3 5 3 47907282 C T N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.307692307692308 0.230769230769231 0.461538461538462 11 15 4 3 6 3 47907290 G A N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.307692307692308 0.230769230769231 0.461538461538462 11 15 4 3 6 3 47907310 C T N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.307692307692308 0.230769230769231 0.461538461538462 11 15 4 3 6 3 47907313 G C N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.307692307692308 0.153846153846154 0.538461538461538 10 16 4 2 7 3 47907346 A T N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 47907364 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 47907401 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47907444 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 47907550 G A Y Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 3 47907606 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 47907613 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47907782 C T N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 3 47907873 C A N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 47907923 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 47908587 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 47908818 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 3 47908862 C T N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.307692307692308 0.230769230769231 0.461538461538462 11 15 4 3 6 3 47909100 T G N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 3 47909140 T C N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 47909361 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 47909514 C A N N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 10 10 3 4 3 3 47909971 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 47909984 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 47910154 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47910234 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47910480 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47910695 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 47910804 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47911712 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 47912016 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47912721 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47912853 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47912984 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47913108 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47913128 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47913191 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47913382 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47913412 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47913541 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47913600 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 47913668 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47913681 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47913692 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 47913719 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47913739 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47913878 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 47914004 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 47914217 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 47914379 G C N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 47914806 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 47914901 A C N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 47914943 C G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 47915038 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 47915070 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 47915274 C G N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 47915392 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 47915644 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47915822 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 47915867 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 47915968 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 47915995 G C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 47916139 G T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 47916221 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47916237 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47916249 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47916306 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47916457 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47916564 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47916682 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47916699 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47916736 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47916901 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 47916929 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47917177 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47917257 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47917598 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47917620 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47917718 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47917816 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47917929 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 47918032 T C N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 3 47918380 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 47918384 G C N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 47918404 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 47918405 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 47918422 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 47918452 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47918583 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47918818 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47918827 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47918882 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 47918901 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 47918925 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47918960 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47919047 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47919072 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 47919147 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47919170 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47919249 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47919548 A T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 47919565 A G Y Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 47919759 C A N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 3 47919762 T C N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 3 47919795 G C N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 3 47919832 C A N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 47919916 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 47919925 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 47919981 C G N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 47920174 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47920287 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47920296 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47920340 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47920371 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47920403 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 47920405 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 47920477 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 47920495 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47920527 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47920633 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47920689 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 47920872 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47920914 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47920925 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 47921043 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47921338 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47921346 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 47921426 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47921503 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47921713 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47921745 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47921801 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47921877 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47921916 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47921934 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47922175 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47922295 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 47922430 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47922867 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47922932 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 47923471 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 47923550 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47923561 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47923562 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47923599 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 47923618 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47923741 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47923897 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 47923935 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 47923972 C G N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 47924005 C T N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 47924040 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47924992 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 3 47925396 A T N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 47925447 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 47925954 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47926648 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47926698 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47926735 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47927424 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 47928852 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 47928863 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47929307 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47929486 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47929522 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47930223 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47930329 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 47930601 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 47930742 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47930752 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47930866 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47931027 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 47931088 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 47931183 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47931335 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47932504 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 47932781 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47933025 A C N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 47933059 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 47933062 C G N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 47933178 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47933321 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 47933423 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 47933542 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47933634 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 47933705 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 47933793 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47933985 T A N N 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 8 10 3 2 4 3 47934231 G T N N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 3 47934655 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47934764 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47934788 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47934822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47934962 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47935323 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 47936023 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 3 47936273 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47936662 C G Y N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 47937338 T A N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 47937517 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47937641 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 47937761 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 47937805 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47938078 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47938190 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47938511 G T N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 3 47938859 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47938927 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47939146 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47939218 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 47939268 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 47939321 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 47939346 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47939365 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47939368 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47939392 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47939414 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47939443 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47939563 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47939839 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47939942 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47939944 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47939962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47940264 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47940304 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47941077 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 47941360 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47941361 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 47941391 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 47941416 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 47941448 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 47941465 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 47941499 G C N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 3 47941533 T A N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 3 47941571 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 47941670 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 47941991 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47942007 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 47942047 T G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 47942049 C A N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 47942167 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47942198 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 47942549 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 47942743 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 47943269 T A N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.384615384615385 0.230769230769231 0.384615384615385 13 13 5 3 5 3 47943548 A T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 47943656 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47943758 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47943787 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47943802 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47943880 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47943969 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47944017 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47944034 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47944045 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47944104 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47944202 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 47944252 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 47944273 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47944305 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47944362 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47944364 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47944396 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47944399 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47944453 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47944497 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47944682 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47944938 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47944966 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47944970 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47944987 A G Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47945006 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47945211 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 47945222 C G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 47945259 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 47945264 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 47945304 G T N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 47945331 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 3 47945391 T A N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 3 47945634 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 47945693 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47945946 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47945960 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47946204 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47946319 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 47946331 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.357142857142857 0.142857142857143 0.5 12 16 5 2 7 3 47946411 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 3 47946488 T C N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 9 15 3 3 6 3 47947311 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47947332 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47947577 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47947935 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47948005 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 47948138 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 47948148 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 10 18 4 2 8 3 47948450 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47948486 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47950057 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47950326 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 47950526 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 47950676 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47951147 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 47951611 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 47952272 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 47952805 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47952975 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 47953102 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 47953152 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 47953261 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47953470 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 47953782 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47953903 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 47953955 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 47954099 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47954115 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47954238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47954271 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 47954307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47954332 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 47954343 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47954415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47954583 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47954669 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 47955031 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 47955100 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47955207 A C N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 47955298 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47955319 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47955391 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47955470 A G N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 47955762 T A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 47955767 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 47956033 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47956093 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47956118 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47956125 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47956138 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47956511 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47956604 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47957050 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 47957119 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47957291 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 47957371 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 47957499 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47957544 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47957574 G A N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 3 47957606 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 47957683 C G N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 47958237 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 47958241 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 47958492 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 47958550 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 47958617 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47958629 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47958661 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 47958739 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47958799 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 47958815 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 47958820 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 47958871 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 47958892 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 47958904 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47958943 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47959017 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 47959053 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 47959063 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 47961837 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 47961848 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 47961884 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 47961906 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 47961913 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 47961929 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47961996 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 47962003 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 47962022 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47962034 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 47962082 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47962097 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47962118 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47962125 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47962160 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 47962450 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47962654 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 47962825 G T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 47962851 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 47962890 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47962993 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47963109 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 47963161 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 47963208 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47963421 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 47963620 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47963825 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 47963884 T C Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 47964048 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 47964075 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47964215 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47964228 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 47964237 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 47964353 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 47964416 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 47964430 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 47964440 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47964480 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 47964493 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47964572 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 47964613 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47964656 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 47964790 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47964812 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 47964872 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 47964886 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 47964918 G C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 47965021 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 47965037 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 47965085 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 47965290 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 47965448 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47965633 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 47965653 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47965677 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47965681 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47965752 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47965925 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 47966120 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 47966375 T G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47966429 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 47966563 G A N Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.5 0.125 0.375 9 7 4 1 3 3 47967087 A C N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.266666666666667 0.133333333333333 0.6 10 20 4 2 9 3 47967201 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 47967269 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47967287 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 47967354 A C N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 47967386 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 47967471 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 47967626 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47967654 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 47967780 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 47967790 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47967792 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 47968068 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47968226 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 47968252 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47968305 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47968402 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47968532 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 47968898 A T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 3 47968930 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.235294117647059 0.117647058823529 0.647058823529412 10 24 4 2 11 3 47968988 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 47969057 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 47969072 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47969131 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 47969160 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47969199 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 47969312 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47969393 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 47969482 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47969516 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 47969538 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47969651 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 47969690 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 47969737 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47969752 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47969772 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47969798 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47969920 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 47969943 T G N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 47970092 A G N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 3 47970133 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 47970425 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47976997 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47977302 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 47977350 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47977384 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 47977544 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47977609 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47977761 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47978344 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47978361 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 47978374 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 47978673 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 47978701 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47978707 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47979600 A T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 47979633 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 47979693 C T N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 3 47979970 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47980088 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47980111 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47980121 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47980231 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47980249 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 47980270 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47980281 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47980282 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47980306 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47980405 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47980417 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47980419 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 47980442 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 47980468 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47980492 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 47980496 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47980571 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 47980668 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47980769 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 47980780 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47980804 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47980814 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47980836 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47980973 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47980991 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47980994 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47981022 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47981060 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47981117 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 47981148 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47981167 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47981173 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47981213 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 47981222 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 47981260 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 47981440 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 47981474 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 47981579 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 47981584 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47981697 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 47981763 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 47981794 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 47982050 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47982137 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 47982148 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 47982268 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47982269 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 47982517 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47982546 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 47982664 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 47982737 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 47984780 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 47984840 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 47985000 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47985023 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47985350 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47985387 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 47985566 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 47985653 A T N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 47985777 C A N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 47985783 A T N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 3 47985821 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 47985958 T G N N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 3 47986155 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47986288 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47986468 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 47986631 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.214285714285714 0.142857142857143 0.642857142857143 8 20 3 2 9 3 47986641 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.2 0.133333333333333 0.666666666666667 8 22 3 2 10 3 47986772 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 47986807 A G N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 3 47986825 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 47986834 A G N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 3 47986907 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 47986927 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 47986991 G C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 3 47987002 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47987115 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 47987119 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47987162 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47987270 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 47987290 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 47987373 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47987452 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47987641 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47987644 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 47987718 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 47987720 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 47987751 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47987946 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 47988047 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 47988076 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 47988151 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 47988280 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47988363 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47988396 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 47988443 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47988904 C G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 47989180 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47989307 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 47989474 G T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 47989477 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 47989515 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 47989555 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 47989658 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 47989694 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47989808 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47989990 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 47990369 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 47990481 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47990488 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47990500 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 47990589 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 47990706 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47990717 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 47990801 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47990925 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 47991043 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 47991065 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 47991229 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 47991240 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 47991246 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 47991284 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 47991415 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 47991416 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 47991482 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47991605 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 47991623 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 47991716 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 47991827 A T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 47991882 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 47991962 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 47992016 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 47992154 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 47992183 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 47992243 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 47992317 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47992324 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 47992451 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 47992517 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 47992596 A T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 10 22 4 2 10 3 47992606 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 47992658 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 3 47992776 G T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 47992842 G T N N 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.272727272727273 0.272727272727273 0.454545454545455 9 13 3 3 5 3 47992843 T C N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 47992926 C G N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 9 15 3 3 6 3 47992967 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 47993027 T A N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 3 47993038 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 47993327 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 47993336 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 47993366 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 47993406 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 47993552 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 47993715 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47993772 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 47993829 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 47993860 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47994021 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 47994025 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 47994152 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 47994173 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 47994209 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 47994246 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 47994265 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 47994327 A T N N 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 10 14 2 6 4 3 47994407 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 10 8 4 2 3 3 47994593 A G Y Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 47995352 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 47995447 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47995461 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 47995615 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 47995670 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 47995708 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 47995799 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47995811 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 47995872 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47995876 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47995929 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47996136 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 47996206 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47996230 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47996252 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47996282 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 47996291 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 47996470 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 47996762 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 47996834 A G N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 47997227 C T N Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 9 5 4 1 2 3 47997312 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 47997352 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 47997785 A G N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 47997911 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 47998329 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47998432 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47998909 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 47999003 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47999122 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47999153 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47999207 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47999402 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47999410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47999480 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 47999750 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47999804 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 47999851 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47999855 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 47999866 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 47999904 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 47999945 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 47999998 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48000040 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48000047 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48000051 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48000128 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48000139 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48000163 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48000185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48000197 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 48000212 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48000748 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48001039 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48001390 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48002316 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48002863 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48003033 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 48003137 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 48003655 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 48003683 A T N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 48003951 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 48003966 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 3 48004030 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 48004297 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 48004348 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 48004491 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 48004677 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 48005115 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 48005201 T C Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 48005411 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 48005414 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 48005422 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48005620 A G N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 3 48005680 G A N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.272727272727273 0.272727272727273 0.454545454545455 9 13 3 3 5 3 48005955 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48005999 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 48006218 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 48006222 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 48006287 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 48006341 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 48006639 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 48006658 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 48006907 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48006927 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 48007035 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 48007097 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 48007201 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48007408 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 48007417 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 48007446 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48007657 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 48007729 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 48007856 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 48007863 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48007892 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48007933 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48007944 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 48008316 A C Y N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 3 48008942 A T Y N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 48009073 T C Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 48009077 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 48009109 T C Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 48009123 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 3 48009156 A G Y Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.454545454545455 0.454545454545455 0.0909090909090909 15 7 5 5 1 3 48009269 G C Y N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 3 48009367 C G Y N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 3 48009414 T C Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 48009576 T C Y Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.363636363636364 0.181818181818182 0.454545454545455 10 12 4 2 5 3 48009580 C T Y Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 8 8 3 2 3 3 48009793 G T N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 3 48009797 G A N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 3 48009847 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 3 48009869 C T Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 48009932 G T Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 48009947 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 48009967 C G Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 48010046 G T Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 48010079 G C Y N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 48010088 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 48010162 A G Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 3 48010231 T G Y N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 10 18 4 2 8 3 48010258 A G Y Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.363636363636364 0 0.636363636363636 8 14 4 0 7 3 48010322 T G N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.153846153846154 0.0769230769230769 0.769230769230769 5 21 2 1 10 3 48010330 G A Y Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.230769230769231 0.0769230769230769 0.692307692307692 7 19 3 1 9 3 48010398 C A N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 3 48010426 G A N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 3 48010513 A C N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 10 22 4 2 10 3 48010667 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 48010976 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 48011216 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 48011246 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 48011268 A C Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 48011304 A G Y Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 3 48011306 G A Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 48011339 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48011387 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 48011392 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48011443 T C Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 3 48011453 C T Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 3 48011464 C G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 48011582 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 48011608 A C N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 48011805 C T N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 9 15 3 3 6 3 48011807 A G N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 3 48011843 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 48011873 T A Y N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 48011888 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 48011900 A T Y N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 48012289 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 48012497 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 48012525 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48012528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48012622 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 48012668 T C Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 48013272 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 48013547 A C Y N 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 10 6 4 2 2 3 48013637 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 48013833 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 48014031 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48014163 A T Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 48014451 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48014509 C G Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 48014766 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 48014815 T C Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 48015138 C G Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 48016099 T G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 48016217 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 48016219 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48016369 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 48016523 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48017005 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 48017012 A G Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 48017574 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48017589 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 48017647 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 48017724 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48017848 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48018152 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48018172 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48018251 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48018725 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48018740 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48018925 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48019005 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48019024 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 48019205 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48019206 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48019791 A C N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 3 48020166 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 48020210 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48020656 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48020680 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 48020979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48021188 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48021229 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48021351 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48021711 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48021776 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 48021784 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 48021796 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 48021837 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 48021964 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48022008 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48022290 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 48022307 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48022324 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48022325 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48022468 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48022564 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 48022569 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 48022612 A T Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 48022784 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 48022822 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48023009 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48023277 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 48023347 T C Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 48023403 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 48023451 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48023480 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 48023573 T A Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.294117647058824 23 11 11 1 5 3 48023662 A C Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 48023698 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48023809 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48023860 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48023914 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48023915 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48023954 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 48023976 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 48024013 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 48024191 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48024239 A G Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 48024277 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48024342 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 48024437 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 48024663 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 48024739 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48024751 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48024804 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48024912 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48025074 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48025386 T G Y N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 48025417 T C Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 48025449 A G Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 48025499 C G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48025588 A T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 48026199 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48026275 C G Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 48026559 A C Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 48026631 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48026735 A G Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.235294117647059 0.117647058823529 0.647058823529412 10 24 4 2 11 3 48026916 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48027128 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48027176 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48027348 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 48027461 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 48028208 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48028248 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 48028433 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48028575 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48028678 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48028754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48028857 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 48028976 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 48028977 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 48028991 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48029090 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48029586 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48030150 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 48030283 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48030302 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48030452 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48030674 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48030764 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48030913 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48030975 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48030984 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 48031122 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48031183 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48031292 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 48031497 C G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48031797 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 48032125 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48032163 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 48032270 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48032531 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 48032750 G T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 48032916 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48033057 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 48033227 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48033251 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 48033504 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 48034290 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48034394 G C Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 48034435 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 48034562 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 48034804 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 48034915 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48034945 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48034952 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48035125 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48035529 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 48035713 T A Y N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 48035758 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48036227 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48036352 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48036782 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 48037294 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 48037332 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48037348 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 48037359 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48037380 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 48038355 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 3 48038481 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48039241 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48039693 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48039706 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48040813 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48041617 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48042824 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48043082 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48043407 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48043939 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48044142 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48044431 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48044655 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 48044702 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48044890 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48045321 C A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 48045589 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48045768 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 48045878 C A Y N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 48045919 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48045982 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 48046158 A T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 48046496 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 48047224 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 48047305 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48047424 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 48047474 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48047476 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 48047506 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 48047681 A C Y N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 6 12 2 2 5 3 48047700 A C Y N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 6 14 2 2 6 3 48047708 C T Y Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 3 48047754 T C N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.307692307692308 0.230769230769231 0.461538461538462 11 15 4 3 6 3 48047780 T C Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 3 48048212 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 48048309 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 48048544 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 48048678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48048712 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48048777 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48048805 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48048808 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48048849 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48048926 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48048996 T G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 48049017 T A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 48049025 T G N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 48049031 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 48049178 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48049223 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48049238 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48049279 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 48049383 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48049393 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48049427 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 3 48049436 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48049507 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48049599 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 48049831 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48049844 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 48049945 A C N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 3 48049983 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 48050127 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 48050318 A T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 48050419 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48050482 T A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.235294117647059 0.117647058823529 0.647058823529412 10 24 4 2 11 3 48050542 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48050600 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48050625 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48050635 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 48050896 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48051389 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48051401 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 48051742 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48051982 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48052060 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48052171 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48052199 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48052362 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48052423 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48052546 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48052770 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48052793 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48052992 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48053022 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 48053145 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 3 48053493 A C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 48053727 A G N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.307692307692308 0.230769230769231 0.461538461538462 11 15 4 3 6 3 48053766 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 48053991 C G N N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 8 12 3 2 5 3 48054056 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 3 48054502 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48054655 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 48054681 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 48054753 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48054766 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 48054786 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 48054899 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48055115 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 48055274 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 3 48055457 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 48055477 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 48055497 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 48055623 T C N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 3 48055750 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 48055819 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48056020 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 48057150 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 48057355 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48058015 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 48058586 T C Y Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.333333333333333 0.133333333333333 0.533333333333333 12 18 5 2 8 3 48058640 A T Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 48058748 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48059022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48060142 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48060381 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 48060588 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 48062222 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48062388 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48063882 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48064363 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48064733 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 3 48064940 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 48065744 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 48066538 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.294117647058824 0.117647058823529 0.588235294117647 12 22 5 2 10 3 48066587 G T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.294117647058824 0.117647058823529 0.588235294117647 12 22 5 2 10 3 48066824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48067517 T A Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 48068415 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 48068427 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 48069086 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 48069812 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48070552 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48070604 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 48072800 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48073102 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48073198 C G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48074494 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 48075307 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48076178 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48077090 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48077147 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48077494 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48077771 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 48077868 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48078067 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48078182 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48078221 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 48078270 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 3 48078379 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 48078399 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 48078701 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48079099 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 48079283 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48079407 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 48079596 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 48079711 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.25 0.166666666666667 0.583333333333333 8 16 3 2 7 3 48080552 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 48080553 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 48080947 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48081090 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48081136 T C N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 3 48082243 A T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 48082421 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 5 7 1 3 2 3 48083137 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 48083146 A T Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 48083467 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48083533 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48083544 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48084202 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48084365 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 48085448 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48085551 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48085595 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 48086352 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48086374 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 48086378 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48086871 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48086983 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48087032 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48087357 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 48088297 T A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 48088734 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48090254 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48090260 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 48090380 A G Y Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 48091050 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48092237 A G N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 3 48092274 G C N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 48092988 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48093696 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48094676 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48094723 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48094727 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48094773 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48094801 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48094813 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48094957 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48094988 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48095539 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48095689 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48095794 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48095871 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48095909 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48096108 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 48096147 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 48096206 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48096250 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48096369 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48097053 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 48097099 C A N N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 5 11 2 1 5 3 48097525 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48097527 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48097662 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48097774 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48097803 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48097819 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 48097857 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48098116 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48098195 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48098210 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 48098326 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48098525 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48098546 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48098564 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48098991 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 48099069 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48099074 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48099320 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48099459 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48099857 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48099866 G T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 48099936 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48099954 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48099996 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 48100044 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 48100076 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 48100159 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48100645 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48100667 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48100696 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48100702 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48100720 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48100784 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48100843 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48100915 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48100935 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48100981 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48101031 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 48101109 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48101146 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48101204 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48101223 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48101237 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48101249 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48101388 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48101393 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48101454 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48101635 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48101701 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48102239 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48102274 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 48102291 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48102301 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48102375 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48102384 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48102526 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48102553 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48102565 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48102599 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48102694 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 48102759 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48102768 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 48102778 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48102845 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 48102880 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48102891 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48102906 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48103016 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48103027 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48103047 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48103094 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48103168 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 48103261 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48103263 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48103386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48103402 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48103435 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48103476 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48103542 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48103556 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48103654 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48103670 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 48103674 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 48103717 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 48103763 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48104053 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48104188 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48104279 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48104297 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48104348 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 48104390 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48104392 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.266666666666667 0.133333333333333 0.6 10 20 4 2 9 3 48104470 A G Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 48104485 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48104576 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 48104599 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48104614 C A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 48104680 A G N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 3 48104819 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 48104820 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 48105062 C G Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 48105091 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 48105244 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 48105283 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 48105302 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48105393 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48105467 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48105509 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 48105537 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 48105703 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 48105744 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48105855 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48105869 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48105872 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48105900 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48105930 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 48105938 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 48105965 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 48106168 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48106169 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48106206 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48106239 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48106413 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48106489 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 48106510 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48106539 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48106541 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48106552 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48106614 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 48106679 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 48106718 A C N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 48106719 C A N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 18 14 4 10 2 3 48106780 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 48106834 T G N N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 3 48106949 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48106961 C G N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 3 48106985 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 48107030 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 48107053 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 48107072 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 48107085 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 48107086 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 48107097 C A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 48107117 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48107170 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48107224 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 48107234 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48107290 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 48107356 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48107374 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 48107441 G T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 48107458 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 48107483 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 48107497 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 48107507 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 48107563 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 48107607 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48107635 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 48107722 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 48107742 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 48107804 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48107844 C G N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 48107910 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 3 48108043 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 48108063 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 48108071 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 48108132 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48108163 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48108179 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48108192 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48108214 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48108293 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48108320 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48108341 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48108366 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48108465 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48108467 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48108516 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48109297 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 48109602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48109885 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48110378 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48110655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48110986 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48111363 G T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 48112302 C G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 48112619 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48112996 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 48113472 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48113897 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48113908 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48115740 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48116051 C G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 48116183 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 48116651 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48117642 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 48117734 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48117764 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48117882 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48118391 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48118419 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48118650 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 48125813 C A Y N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 48126333 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48126796 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48126955 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48127207 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 48127230 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48128131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48128180 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48128491 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48129217 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48129331 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48129836 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 48129866 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48130016 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48130039 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48130043 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48130067 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48130372 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48130409 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48130558 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48130575 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48130600 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 48130673 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48130951 A C N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 48131030 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48131113 T C N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 48131218 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 48131295 T A N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 48131333 T G N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 48131476 A C N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.266666666666667 0.133333333333333 0.6 10 20 4 2 9 3 48131540 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48131779 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48132389 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48132429 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48132964 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 48133046 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48133165 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48133987 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48134310 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 48134352 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48134621 C G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 48134750 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 3 48134770 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48134791 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48135415 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48135588 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48135675 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48135731 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 48135913 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 48136192 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48136200 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48136276 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 48136693 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 3 48136790 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48137054 C A N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 48137115 A G N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 48137846 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48138715 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48138837 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 48139988 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48140144 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 48140454 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48140565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48140720 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48140925 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 48140952 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 48141037 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48141110 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48141234 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48141245 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48141362 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48141469 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48141483 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 48141519 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 48141605 C G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 48141724 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 48141737 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 48141814 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48141844 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48141894 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 48141903 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 48142042 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 48142107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48142207 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 48142348 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 48142427 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48142689 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 48142714 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48142732 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48142836 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 48142861 A T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48142946 A C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 48143028 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48143057 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 48143319 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 48143381 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 48143394 G A Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 48143432 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 48143456 G T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48143667 G C N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 3 48143682 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 3 48143694 G A N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.307692307692308 0.153846153846154 0.538461538461538 10 16 4 2 7 3 48143719 T C N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.307692307692308 0.230769230769231 0.461538461538462 11 15 4 3 6 3 48143732 T G N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 3 48143739 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.25 0.166666666666667 0.583333333333333 8 16 3 2 7 3 48143744 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.25 0.166666666666667 0.583333333333333 8 16 3 2 7 3 48143779 T C N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 3 48143871 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 3 48143963 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 48144291 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 48144359 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 48144366 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 48144395 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 48144448 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48145215 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 48145246 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 48145281 G T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 48145302 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 48145573 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48145591 T G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 48145609 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48145680 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48145861 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48145940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48145992 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48146025 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 48146054 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48146160 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48146466 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48146491 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48146516 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48146688 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48146903 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 48146944 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48146964 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48146970 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48147014 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48147043 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 48147087 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48147108 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48147139 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48147251 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48147326 C T Y Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 48147383 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48147923 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48148032 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48148105 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48148106 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48148240 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48148274 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48148636 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48148747 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48148804 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48149184 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48149259 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48149485 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48149495 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48149537 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48149714 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48149842 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48149882 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48149991 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48150000 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48150106 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48150246 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48150290 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48150371 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48150491 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48150550 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48150710 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48150756 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48150936 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48150973 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48151067 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48151598 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48151762 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48151883 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 3 48151920 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 3 48151956 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 48151971 C T N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 3 48151979 T C N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 3 48152115 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 3 48152137 C A N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 3 48152241 T G N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 3 48152251 T G N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 3 48152301 A C N N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 3 48152376 C A N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 3 48152517 T G N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 3 48152589 C A N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 3 48152623 A G Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 3 48152799 A G N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 3 48152800 T A N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 3 48152819 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 3 48152832 G T N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 3 48152963 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 3 48152999 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 3 48153008 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 3 48153024 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 3 48153102 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 3 48153704 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 3 48153715 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 3 48153796 A T N N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 3 48153869 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 48154259 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 48154351 G T N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 3 48154405 C T N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 3 48154438 A T N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 3 48154487 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 3 48154562 A G N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 3 48154595 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 48154712 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 3 48154729 C A N N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 3 48154764 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 3 48155202 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 3 48155237 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 3 48156045 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48156194 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48156214 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48156264 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48156376 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48156430 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48156498 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48156550 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48156575 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48156625 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48156710 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48156717 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48156742 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48156760 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48157295 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48157352 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48157373 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48157376 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48157421 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48157491 T G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48157521 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 48157585 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48157648 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48157721 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48157731 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48157894 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48157966 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48158071 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48158124 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48158160 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48158266 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48158363 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48158458 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48158473 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48158518 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48158520 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48158575 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48158614 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48158656 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48158719 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48158734 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 48158804 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48158812 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48158929 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48159057 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48159088 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48159115 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48159124 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48159213 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48159223 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48159278 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48159370 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48159494 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48159503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48159507 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48159624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48159636 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48160194 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48160236 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48160293 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48160324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48160468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48160496 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48160574 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 48161767 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48162048 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48162052 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48162525 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48162773 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48163307 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48163357 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48163573 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48163762 G A N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 48166962 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48167147 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 48167649 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48168037 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 48168359 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48168363 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48168382 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48168694 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48168768 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48169097 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48169157 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48169439 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48169781 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48170363 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48170555 C T Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 48170583 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48170945 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48171273 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48171564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48171605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48171615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48172344 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48172687 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48172969 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48173394 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48173752 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 48173901 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48174080 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48174579 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48174778 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48174787 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 48174871 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 48174958 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48174976 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48175748 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 48175790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48175941 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48175967 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48176520 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 48176602 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48176667 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48178276 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 48178665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48178987 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48179030 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48179744 A T N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 3 48180139 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 48180178 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 48180672 T A Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 48180793 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 48180898 C G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 48182359 A G Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 48182866 G C Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 48182867 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 48183252 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48183470 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48183517 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48183676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48183698 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 48184169 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48184199 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 48184261 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48184294 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48184421 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 48184704 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 48184721 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 48184725 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48185039 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48185055 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48185371 T G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 48186504 T A Y N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 48187572 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 48188322 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48188414 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 3 48188452 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 48188622 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 3 48189055 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 48191033 G C N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 3 48191044 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 48191067 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 48191124 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 48191214 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 48191222 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48191246 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48191356 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48191409 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48191613 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48191768 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 48191818 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48191835 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48191889 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 48191907 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 48191971 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48191989 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48192076 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48192117 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48192121 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48192198 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48192267 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 48192367 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 10 22 4 2 10 3 48192494 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 48192508 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 48192527 C G N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 48192598 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48192715 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48192759 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 48192774 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48192815 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48192932 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48192935 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 48192959 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 48193028 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 48193035 A C N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 48193058 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48193065 G T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 48193084 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 48193124 T G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48193393 A T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 48193455 G A N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 3 48193529 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48193645 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 48193666 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48193751 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48193763 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48193803 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48193909 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 48193934 G T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 48194071 T G N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 48194138 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48194146 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48194193 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 48194227 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 48194232 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 48194261 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48194262 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 48194312 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48194437 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48194458 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48194548 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 48194747 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48195070 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48195206 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48195445 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48195459 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48195562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48195584 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48195669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48195806 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48195844 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48195856 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48195857 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48195968 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48195986 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48196100 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48196155 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48196206 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48196491 T C Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 48196777 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48196895 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 48197019 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 48197074 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48197083 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48197104 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48197404 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48197626 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48197982 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48198105 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48198124 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48198128 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48198137 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 48198154 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48198171 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48198177 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48198277 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48198330 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48198420 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48198899 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48199040 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48199162 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48199229 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48199278 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48199555 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48199569 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48199623 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 48199846 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48199884 A G N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 48199966 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48200107 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48200108 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48200139 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48200246 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48200273 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48200298 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48200356 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48200532 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48200745 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48200791 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48200830 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48200833 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48200987 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48201017 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48201025 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48201057 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48201117 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48201227 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 48201256 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48201286 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48201536 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48201819 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48201976 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48202068 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48202136 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48202202 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48202216 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48202468 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 48202760 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48203312 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48203430 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48203519 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48203597 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48203639 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48203663 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48203687 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48203891 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48203966 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48203981 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 48204224 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48204334 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48204577 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48204778 A G N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 3 48205463 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48205464 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48205482 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 48205509 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48205623 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48205675 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48206098 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48206200 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48206227 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48206843 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48206879 T A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 48207274 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48207390 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48207453 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48207501 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48207519 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48207779 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48207790 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 48207866 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48208176 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48208341 T G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48208395 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48208490 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48208965 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48209592 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48209615 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48209715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48209823 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48211199 G A N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 48211395 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 48211866 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48211898 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 48212188 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48212920 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 48212936 A C N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.25 0.0833333333333333 0.666666666666667 7 17 3 1 8 3 48212958 G C Y N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 48213080 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 3 48213170 C G N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 3 48213284 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 48213516 T A N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.214285714285714 0.142857142857143 0.642857142857143 8 20 3 2 9 3 48213559 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 48213598 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48213940 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48213996 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48214062 G T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 48214210 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48214242 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 48214331 T G N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 48214402 T C N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 6 10 2 2 4 3 48214731 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 5 7 1 3 2 3 48214798 C T N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 48214878 T C N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.230769230769231 0.153846153846154 0.615384615384615 8 18 3 2 8 3 48214898 A C N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.2 0.133333333333333 0.666666666666667 8 22 3 2 10 3 48215000 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 48215102 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 48215121 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48215240 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48215251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48215289 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48215319 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48215420 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 48215478 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48215635 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48215749 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 48215768 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48215803 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48215865 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 48215906 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48216006 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48216062 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48216125 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48216163 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48216190 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48216335 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48216340 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48216372 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48216377 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48217005 C A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 48217014 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48217032 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48217231 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 48217451 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48217498 T A N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 3 48217571 G C N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 3 48217714 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 48217940 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48217976 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48218025 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48218086 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 48218136 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48218137 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48218178 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48218193 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48218265 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48218294 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48218331 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48218359 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 48218446 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48218540 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 3 48218642 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48218666 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48218675 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 48218725 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 48218762 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 48218788 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 48218814 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 48218867 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48218871 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48218900 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48218915 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48218929 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48218962 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 48219017 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 48219138 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48219170 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48219185 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 48219216 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48219234 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48219258 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48219282 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48219297 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48219311 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48219356 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48219363 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48219393 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48219439 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48219465 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48219613 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48219620 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48219767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48219794 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48219828 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48219895 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48219909 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48219935 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48220117 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48220177 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48220223 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48220242 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 48220316 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 48220388 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48220400 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48220413 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48220426 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48220462 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48220526 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 48220543 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 48220631 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48220755 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48220773 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48220903 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48220921 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48220980 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48221009 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 48221051 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48221095 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48221142 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48221366 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 48221514 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48221675 T G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 48221862 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48222050 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48222083 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48222106 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48222157 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 48222177 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 48222259 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 48222310 C A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 48222447 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 48222540 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48222551 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48222626 T G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 48222744 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 48222854 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48222896 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48222913 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 3 48222966 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 48223006 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48223094 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.176470588235294 0.0588235294117647 0.764705882352941 7 27 3 1 13 3 48223205 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 48223291 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48223301 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 48223399 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.176470588235294 0.0588235294117647 0.764705882352941 7 27 3 1 13 3 48223426 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 48223455 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48223482 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48223493 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48223499 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48223577 C G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.1875 0.0625 0.75 7 25 3 1 12 3 48223604 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 3 48223648 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48223898 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 48223907 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48223913 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48224002 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48224016 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48224054 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48224212 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48224243 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48224347 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48224384 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48224396 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48224405 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48224488 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48224812 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 48224911 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 48224969 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48225099 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48225130 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48225143 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 48225148 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48225310 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48225339 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48225370 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48225429 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48225616 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48225899 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 48226157 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48226648 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48226672 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48226785 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48226920 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48226966 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48227281 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48227340 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 48227424 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48227830 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48227969 T G N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.428571428571429 0.142857142857143 0.428571428571429 14 14 6 2 6 3 48228012 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.4375 0.125 0.4375 16 16 7 2 7 3 48228343 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48228382 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48228414 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 48228443 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 48228468 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48228549 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 48228556 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 48228721 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 48228855 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 48228862 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 48229018 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48229135 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 48229212 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48229305 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48229425 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48229575 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48229781 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48229792 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48229972 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48230277 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48230347 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48230371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48230403 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48230483 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48230497 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48230576 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48230622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48230691 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48230749 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48231065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48231244 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 3 48231290 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48231374 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48231563 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48231683 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48231745 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48231764 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48231906 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 48231986 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48232008 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48232033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48232156 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 48232252 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 48232303 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48232478 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.5 0.111111111111111 0.388888888888889 20 16 9 2 7 3 48232589 A C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 48232597 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 3 48232602 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 3 48232705 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 48233317 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48233849 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 48233941 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48234060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48234071 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48234076 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48234182 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48234253 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48234323 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48234344 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48234487 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48234602 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48234620 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48234634 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48234701 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48234750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48234956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48235036 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48235049 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48235051 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48235068 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48235128 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48235188 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48235209 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48235216 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48235258 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48235267 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 48235269 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48235326 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48235349 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48235361 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48235371 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48235390 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48235431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48235441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48235573 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48235607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48235720 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48235755 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48235774 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48235775 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48235806 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48235830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48236184 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48236193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48236248 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48236254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48236261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48236273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48236280 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48236534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48236556 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48236584 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48236625 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48236695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48236713 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 48236741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48236755 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48236838 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48236916 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48237086 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48237170 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48237316 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48237363 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48237583 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48244785 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 48244835 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48244879 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48244906 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48244913 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48244959 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48244991 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48245201 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48245234 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48245269 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48245434 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 48245472 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 48245486 T C N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 3 48245554 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 48245571 A T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 48245590 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48245777 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 48245808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48245921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48245953 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48246077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48246176 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48246199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48246251 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48246415 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48246483 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 48246540 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48246686 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48246723 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48246770 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 48246804 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48246878 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48246915 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48246946 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48246956 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48247033 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48247035 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48247159 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48247284 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48247541 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 48247587 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48247610 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48247656 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 48247675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48247679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48247777 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 48247828 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48247893 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 48247913 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48247995 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 48248045 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48248056 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 48248071 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48248093 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48248176 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48248257 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48248281 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48248370 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48248439 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48248545 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 48248585 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48248590 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 48248636 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48248673 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48248678 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 48248777 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48248788 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48248864 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 48248914 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48248988 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48248992 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48249023 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48255348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48255446 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48255459 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48255490 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48255498 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48255501 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 48255521 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48255534 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48255540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48255609 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48255633 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48255701 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48255721 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48255760 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48255826 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48255855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48255897 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48255934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48256064 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 48256286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48256309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48256489 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48256521 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48256531 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48256916 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48257041 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 48257224 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48257246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48257355 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 48257701 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 3 48257816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48257875 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 48258044 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 48258732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48258735 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48259033 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48259156 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48259520 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 48259837 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48260042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48260340 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48260426 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 48260475 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 48260534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48260615 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48260669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48260831 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48260891 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48260904 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48261149 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48261412 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48261555 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48262281 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48262319 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48262425 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48262497 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48262512 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 48262555 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48262575 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 48262674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48262761 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48262832 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48263037 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 48265148 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48265189 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48265967 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 48266407 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 48266427 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48266484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48266519 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48266603 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 48266679 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48266788 C T N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 48266959 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 48267020 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 13 5 6 1 2 3 48267061 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48267071 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 48267091 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 48267113 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48267153 C A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 48267210 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48267302 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48267650 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48267740 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48267805 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48267809 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48267843 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48268055 T G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 48268478 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48268506 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48268622 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48268651 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48268737 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 48268861 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48268897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48268977 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48269106 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48269118 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48269134 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 48269151 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48269152 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48269187 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 48269244 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48269357 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48269406 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48269543 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48269752 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 48269818 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48270045 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48270097 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48270279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48270381 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48270391 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48270413 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48270513 T C Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 3 48271441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48271502 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48271556 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 48271569 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 48271653 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.176470588235294 0.0588235294117647 0.764705882352941 7 27 3 1 13 3 48271760 G C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 48272159 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48272686 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48272689 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48272754 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48272763 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48272776 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 48272790 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 48272906 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48273035 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48273104 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 48273166 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48273212 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48273420 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48273563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48273719 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48273762 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48273852 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48274501 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48274923 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48275048 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48276167 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48276235 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48276373 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48276621 C G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 48276640 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 48276663 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 48277259 T C N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.727272727272727 0 0.272727272727273 16 6 8 0 3 3 48277618 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 48277704 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48277863 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 48277909 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48277955 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48277982 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48278306 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48278696 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 48278744 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 48279425 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48279492 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48279591 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 48279593 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48279624 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 48279654 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48279749 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48280122 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48280188 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48280192 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48280264 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48280305 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48280377 C A Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 48280382 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 48280393 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48280513 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 48280553 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48280584 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48280608 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48280613 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48280663 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48281043 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48281061 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48281112 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48281177 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48281278 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48281347 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48281741 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48282108 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 48282125 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 48282312 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48282491 A C Y N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0 0.941176470588235 0.0588235294117647 16 18 0 16 1 3 48282515 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48282650 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48282675 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48282779 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48282789 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 48282871 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48282882 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48282918 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48282950 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 48282997 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48283481 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48283630 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48283675 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48283695 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48283706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48283727 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48283964 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 48284033 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48284138 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48284425 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48284458 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48284482 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48284499 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48284608 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48284644 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48284772 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48284787 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48284834 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48284921 G C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 48284978 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48285005 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48285021 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 48285066 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 48285200 C A Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 48285315 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48285360 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 48285379 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48285411 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 48285464 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48285470 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48285521 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48285583 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48285599 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 48285605 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 48285612 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48285683 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48285858 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48285956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48286094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48286377 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 48286406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48286435 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48286490 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48286662 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 48286756 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 48286804 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48287030 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48287357 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 48287464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48287729 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48287812 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 48287842 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48287852 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48288033 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 48288037 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48288064 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48288097 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 48288114 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 48288236 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 48288356 C T N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 3 48288460 A G N Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 8 6 3 2 2 3 48288895 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 48288936 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 48288948 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 48288998 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 48288999 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 48289024 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48289078 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48289103 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48289127 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48289230 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 48289283 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48289545 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48289684 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48289699 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 48289778 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48289825 A T N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 3 48289873 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 48290059 C T N Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.6 0 0.4 6 4 3 0 2 3 48290086 T A N N 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 6 10 2 2 4 3 48290289 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 48290293 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 48290359 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48290535 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 48290635 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 48290637 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48290679 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 48290761 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 48290789 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 48290815 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 48290951 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 48290975 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48290993 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 48291096 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 48291156 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 48291652 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 48291783 G A N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 3 48291956 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48292266 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48292321 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 48292486 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48292522 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 48292676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48293241 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48293300 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48293309 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48293445 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48293481 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 48293537 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48293562 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 48293582 C T Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 48293608 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48293678 C A Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 48293743 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 48293754 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 48293825 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 48294007 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48294106 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48294160 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48294270 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48294381 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48294411 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48294494 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48294538 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 48294671 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48294752 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48294756 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48294822 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 48294886 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48294897 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48294931 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48294962 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48294998 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 15 21 0 15 3 3 48295239 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48295367 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48295442 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 48295452 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 48295614 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 48295860 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 48295901 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 48295915 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 48295936 A G N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 48295938 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 48295978 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48296004 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 48296011 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 48296062 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 48296095 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 48296103 A T N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 48296111 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 48296123 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 48296194 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48296296 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 48296327 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48296411 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 48296736 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48296819 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48296879 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48296890 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48296961 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48297028 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48297352 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48297506 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48297624 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48297681 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48297696 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48297699 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48297848 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48297865 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48297888 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48298113 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48298152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48298160 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48298370 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 48298498 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 10 14 4 2 6 3 48298570 C T N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 48298659 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48298687 T A N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 48298921 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48298928 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48298974 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 48299108 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48299169 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48299185 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48299241 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48299278 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48299333 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48299336 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48299352 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48299490 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 48299513 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 48299574 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 48299744 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 48299884 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48299896 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48299930 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48299970 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48300114 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48300185 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 48300228 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48300330 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 48300348 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 48300399 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 48300567 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 48300613 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48300635 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 48300643 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 48300657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48300669 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 48300718 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 48300743 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 48300752 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 48300778 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 48300786 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 48300802 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 48300815 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 48300865 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 48300880 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48300923 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 48300955 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 48300987 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 48301029 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 48301127 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 48301257 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 48301279 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 48301417 T G N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 3 48301426 T C N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 3 48301430 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 3 48301439 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 48301540 T C N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.461538461538462 0.230769230769231 0.307692307692308 15 11 6 3 4 3 48301611 T C N Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 11 9 4 3 3 3 48301669 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48301712 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 48301723 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48301734 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 48301760 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48301762 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48301831 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48301886 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48301917 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 48302031 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48302043 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48302075 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 48302225 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 48302244 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 48302316 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48302628 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 48302943 G C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 48303254 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48303496 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 48303666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48303676 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48303793 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48303858 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48303879 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48304760 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48304791 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48305204 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 48305741 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48305812 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48306250 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 48306274 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 48307132 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48307501 T A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 48307616 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48307665 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 48307748 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 48307860 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48308151 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 48308343 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48308393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48308404 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48308577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48309762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48309957 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 48310231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48310457 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48310851 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 48310979 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48311037 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 48311098 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 48311112 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48311258 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48311354 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48311423 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48311598 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48311686 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 48311729 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48311790 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48311964 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48312498 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 48312514 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48312573 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 48312729 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48312870 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 48312881 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48312916 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48313166 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48313195 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48313408 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 48313628 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 48313742 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48313792 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48313884 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48313964 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48314064 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48314313 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48314351 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48314396 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48314708 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48314728 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 48314749 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 48314841 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 48315010 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 48315614 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48315626 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 48315637 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48315648 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 48315672 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48315734 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 48316051 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48316160 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48316193 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48316271 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48316391 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48316425 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48316458 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48316480 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48316539 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48316794 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48316873 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48316929 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48317003 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48317096 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48317121 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48317179 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48317190 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48317231 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48317249 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48317410 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48317471 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48317544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48317581 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48317611 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48317640 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48317655 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 48317699 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 48317714 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48317730 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48317784 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48317811 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48317830 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48318011 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48318077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48318120 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48318138 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48318225 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48318227 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48318295 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48318299 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48318436 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48318503 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48318749 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 48319315 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48319455 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 48319501 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 48319687 C T N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.333333333333333 0.25 0.416666666666667 11 13 4 3 5 3 48319772 T C Y Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 3 48319823 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 48319862 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 48319966 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 48320121 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48320275 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 48320395 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 48320461 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 48320468 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 48320857 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48321795 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48321860 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48321887 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48322270 A C N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 48322289 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 48322553 A T N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 48322594 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48322794 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48322798 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48323760 A C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48323964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48324068 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48324179 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48324225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48324394 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48324506 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48324544 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48324661 T A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 48324685 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48324705 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48324811 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48325095 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48325129 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 48325197 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 48325212 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 48325279 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48325627 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48325881 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48326173 A C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 48326182 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 48326291 A G Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 48326299 A G Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 48326527 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48326536 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48326958 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48327026 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48327215 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48327251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48327348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48328069 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48328601 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 48328726 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48328745 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48328799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48328821 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48328831 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48328898 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48328913 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48329040 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48329252 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48329283 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 48329328 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48329351 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48329364 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48329402 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48329407 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48329453 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48329466 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48329484 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48329510 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 48329573 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48329608 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48329823 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48329874 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48329929 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48329939 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48329956 T A N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0 0.846153846153846 0.153846153846154 11 15 0 11 2 3 48330011 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48330012 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48330145 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 48330157 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 48330177 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 48330195 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 48330260 G T N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 48330474 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48330480 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 48330579 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 48330622 C A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 48330645 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 48330692 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48330752 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48330941 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 48330951 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 48331014 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 48331059 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 48331366 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 48331394 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 48331409 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 48331502 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 48331537 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 48331602 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 48331661 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48331808 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48331828 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48331846 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48331865 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 48331940 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 48331955 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48332036 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48332062 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 48332329 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 48332810 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 48332893 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 48333164 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48333738 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48334188 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 48334444 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48334511 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 48334522 T G N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 48334536 C T N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 48334562 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 48334589 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 3 48335132 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48335146 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 48335180 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 48335210 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48335261 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48335276 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 48335337 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 48335353 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 48335356 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 48335419 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 48335444 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 48335467 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 48335502 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 48335537 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 48335544 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 48335604 C G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 48335615 C A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 48335621 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 48335636 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 48335651 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 48335684 C A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 48335718 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 48335743 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 48335777 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 48335813 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 48335875 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 48335987 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 48336003 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 48336145 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 48336198 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 48336276 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 48336350 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48336518 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 48336739 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 48337065 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48337155 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 48337171 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48337211 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 48337747 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 48338113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48338234 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 48338235 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 48338351 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 48338449 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 48338629 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 48338721 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 48338988 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48339104 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 48339306 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48339397 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48339512 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48339548 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48339559 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48339727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48339811 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48339863 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 48339996 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48340078 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48340135 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 48340179 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48341124 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48341310 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 48341483 T C N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 48341489 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 48341716 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 48341747 C A N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 3 48342070 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48342727 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 48342836 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 48342891 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48343006 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48343034 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48343102 T A N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 48343354 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48343368 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48343417 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48343420 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48343448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48343538 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48343542 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48343608 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48343647 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48343701 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48343819 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 48343867 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48343898 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48343990 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48344057 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48344223 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48344295 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48344409 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 48344551 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 48344570 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 48344624 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48344755 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48344766 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 48345122 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48345345 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48345474 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48345496 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48345554 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48346023 A C N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 48346052 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48346185 T C N Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 48346487 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48346498 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48346505 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48346536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48346537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48347115 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48347230 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48347252 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48347455 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48347661 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48347748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48347864 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48348023 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48348051 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48348272 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 48348662 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 48349128 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48349158 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48349260 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 48349291 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 48349305 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 48349320 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 48349328 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 48349357 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 48349380 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 48349415 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 48349513 T G N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 48349577 A G N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.461538461538462 0.230769230769231 0.307692307692308 15 11 6 3 4 3 48349692 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 48349733 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 48349811 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 48349906 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48349959 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48349990 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48350036 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48350077 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48350319 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48350326 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48350369 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48350415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48350454 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48350591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48350765 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 48350848 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 48350946 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 48350957 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 48350998 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 48351082 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 48351087 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 48351187 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 48351212 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 48351254 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 48351302 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 48351465 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 48351795 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48352531 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48352751 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48352948 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48353138 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 48353466 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 48353540 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 48353546 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 48353811 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 48354022 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 48354028 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48354177 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 48354343 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48354494 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48354521 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48354799 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48354804 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 48355005 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48355200 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48355205 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 48355506 A T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 48355812 C G N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 48355864 G T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 48356026 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48356151 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 48356191 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48356604 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48356859 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 48356988 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 48357103 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 48357266 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48357521 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48357573 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48357645 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48357761 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 48358037 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 48358149 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 48358484 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48358545 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 3 48359052 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48359167 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48359197 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48359235 C G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 48359260 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48359575 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48359641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48359778 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48359781 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48359920 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48359936 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 48360020 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48360090 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48360091 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48360259 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48360348 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48360618 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48360632 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48360779 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48361042 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48361066 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48361120 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48361311 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48361319 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 48362147 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48362155 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48362242 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48364579 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48364887 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48364961 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48364970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48365459 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48365605 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48365693 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48365759 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48365804 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48365933 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48366064 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48366086 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48366123 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48366140 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48366154 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48366219 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48366230 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48366260 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48366381 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48366402 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48366678 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48366680 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48366696 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48366884 A G N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 48366917 C A N N 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 3 48366958 T C Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 48367062 T G Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 48367722 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48367915 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48368150 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 48368155 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48368168 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48368247 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 48368260 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 48368265 T G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48368480 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48368574 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48368636 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48368681 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48368735 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48368788 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48368926 A G N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 48368965 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 48369012 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 48369049 C A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 48369302 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48369327 C G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 48369833 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48369873 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 48369965 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48370158 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48370189 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48370202 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48370212 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48370743 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48370793 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48370794 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48370833 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48370848 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48370859 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48370951 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48371000 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48372791 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48372798 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48372853 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48372956 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48372997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48373037 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48373128 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48373722 T C N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 3 48373825 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 48373925 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 48374137 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48374186 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48374299 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48374417 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48374518 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48374579 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48374634 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 48374800 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48374818 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48374880 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48375158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48375200 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48375692 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48375955 C T N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.533333333333333 0.2 0.266666666666667 19 11 8 3 4 3 48376007 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 48376058 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 48376108 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 48376109 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 48376184 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 48376205 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48376227 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 48376284 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48376295 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 48376321 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 48376359 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48376403 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 48376446 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 48376461 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 48376536 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 48376547 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 48376564 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 48376642 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 48376719 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48376823 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 48376857 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 48377027 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48377309 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 48377326 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 48377382 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 48377394 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 48377681 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 48377900 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48377916 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48377969 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48378055 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48378114 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48378146 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48378171 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48378262 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48378293 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48378362 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48379035 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 48379249 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 48379513 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48379523 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48379536 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48379539 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 48379946 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48380279 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48380442 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48380479 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48380493 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48380809 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 48380854 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 48380931 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48381296 A G N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.416666666666667 0.25 0.333333333333333 13 11 5 3 4 3 48381699 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48381705 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48381720 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48381760 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48381785 C A N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 48381810 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48381834 G A N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 3 48381849 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 48381855 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 48381895 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48381943 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 48382050 A G N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 3 48382196 T G N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 48382224 A C N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 48382261 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48382278 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48382403 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 48382852 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 48382863 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 48382864 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48382925 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 48383064 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 48383108 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48383170 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 48383591 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48383624 G T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 48383762 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 48384309 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48385403 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 48385717 C A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 48386349 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48386636 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48386970 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48386979 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48387088 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48387368 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 48387875 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48388417 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48388632 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48388965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48389123 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48389124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48389367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48389690 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48389852 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48389885 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48389889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48390217 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48390318 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48390417 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 48390641 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48390828 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48391005 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 48391163 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 48391189 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48391275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48391278 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 48391290 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 48391295 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48391375 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48391913 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48391993 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48392004 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48392030 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48392065 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48392601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48392749 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48392957 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48393016 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48393019 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48393216 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48393263 T A N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 48393341 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48393429 A G Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 48393439 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48393480 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48393537 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48393620 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48393665 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48393817 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48393973 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 48394023 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48394090 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48394163 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48394231 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48394553 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 48394567 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48394572 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48394617 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48394677 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48394900 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 48394904 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48394954 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48395144 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48395437 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48395672 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48395790 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48396067 C A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 48396070 A G N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 3 48396105 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 48396336 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 48396400 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 48396697 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 48396880 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48396976 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 48397220 G C N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 48397241 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 48397278 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 48397391 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 48397435 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 48397479 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 48397543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48397558 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 48397649 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 48397771 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48397801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48397825 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 48398049 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 48398151 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48398175 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48398244 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 48398273 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 48398309 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48398370 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48398636 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 48398789 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 48398854 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 48398905 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 48398920 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 48399022 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48399947 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48400591 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 48400764 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48401239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48401550 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48401678 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 48401796 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48402113 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 48402286 G A N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 48402331 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48402332 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48402601 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48402626 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 48402925 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48403010 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48403314 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 48403335 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48403389 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48403459 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48403537 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 48403583 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48403627 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 48403643 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48403707 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48403777 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48403863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48403997 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48404038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48404074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48404089 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48404116 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48404131 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48404150 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48404186 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48404228 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48404272 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48404296 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48404355 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48404362 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48404383 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48404459 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48404507 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48404558 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48404617 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48404834 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48404835 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48404920 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 48404923 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 48404941 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 48405083 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48405136 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48405392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48405462 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48405502 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48405579 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48405602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48405614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48405649 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48406280 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48406312 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48406500 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48406662 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48406823 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48407267 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48407546 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48407601 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48407606 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 48407697 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48407725 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48407954 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48408053 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48408102 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48408153 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48408215 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 48408304 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48408604 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 48408821 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 48408893 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 48409223 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48409279 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 48409281 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 48409526 A C N N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.2 0.8 0 6 4 1 4 0 3 48409667 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 48409672 T C N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 3 48409779 G A N Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 8 8 2 4 2 3 48409981 A C N N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 5 7 1 3 2 3 48409986 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 3 48410407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48410447 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48410530 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48410550 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 48410574 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 48410651 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48410660 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 48410669 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48410688 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 48410692 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48410701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48410726 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48410753 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 48410895 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 48410935 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48411000 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 48411010 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 48411098 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48411208 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 48411272 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 48411364 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 48411410 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48411460 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48411465 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 48411552 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 48411572 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 48411581 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 48411604 G T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 48411796 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48412033 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48412045 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48412215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48412222 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48412252 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48412659 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48412671 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48412765 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48413018 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48413139 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48413150 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 48413153 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48413184 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48413253 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 3 48413315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48413336 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 48414346 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 48414350 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48414398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48415113 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48415258 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 48415277 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48415453 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 48415829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48415862 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48415945 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48416121 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 48416252 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 48416312 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 48416323 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 48416338 A C N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 48416446 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 48416483 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 14 18 0 14 2 3 48416617 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48416721 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48416949 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48416967 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48416995 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48417054 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48417102 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48417103 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48417171 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48417182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48417196 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48417215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48417233 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48417259 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48417277 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48417310 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48417343 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48417515 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48417550 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48417723 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 48417732 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 48417761 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 48417834 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 48417843 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48417882 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 48417937 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 48417947 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48418049 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48418108 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48418193 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48418246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48418267 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48418346 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48418373 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48418397 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48418442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48418501 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48418640 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48418686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48418773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48418849 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48418915 A T N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 48418937 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.105263157894737 0.894736842105263 0 21 17 2 17 0 3 48419040 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48419049 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48419064 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48419106 A T Y N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 48419290 G T N N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.125 0.75 0.125 8 8 1 6 1 3 48419360 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48419399 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48419420 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48419472 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48419510 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48419580 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 48419705 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48419782 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48419790 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48419809 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48419866 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48419950 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48419986 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48419993 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48420009 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48420042 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48420071 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48420088 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48420102 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48420195 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48420285 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48420309 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48420348 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48420397 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48420551 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48420704 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48420723 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48420837 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 48420956 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 48420992 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 48421076 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 48421124 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 48421139 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 48421240 A T Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 48421332 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48421356 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48421492 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 48421602 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48421812 C G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48422046 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48422096 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 48422159 T A N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 48422967 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 48423144 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 48423267 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48423286 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 48423309 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 48423325 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48423387 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 48423611 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 48423643 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 48423705 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 48423786 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 48423887 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 48423985 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 48424005 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 48424010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48424036 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48424058 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 3 48424254 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 48424257 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 48424312 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 48424423 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 48424445 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48424473 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 48424576 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48424724 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48424755 A T N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 48424819 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48425056 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 48425122 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 48425242 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 48425283 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 48425288 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48425351 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 48425392 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48425780 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 48425786 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48425819 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 48425903 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 48425950 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 48426003 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 48426104 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48426180 C T N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 3 48426268 A G N Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 5 5 1 3 1 3 48426271 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 3 48426387 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 48426449 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 48426484 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48426503 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 48426522 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48426561 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48426569 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48426637 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48426661 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 48426663 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48426806 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 48426884 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 48426893 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 48427029 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48427181 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48427196 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48427216 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48427413 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48427434 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48427729 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48427790 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48427797 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48427851 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48427909 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48427944 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48427985 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48428188 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48428423 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48428442 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48428489 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48428587 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48428789 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48428920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48428961 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48429284 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48429361 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 48429387 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 48429423 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48429542 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 48429612 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48429762 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 48429833 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48430005 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 48430068 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48430070 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 3 48430140 G A Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 48430211 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48430233 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 48430280 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 48430354 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48430445 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48430499 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 48430547 G A N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 3 48430575 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 48430715 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 48430730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48430766 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48431001 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48431034 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 48431255 T C N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 3 48431390 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 48431426 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48431493 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 48431584 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 48431599 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 48431760 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48431767 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 48431864 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 48432030 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48432035 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48432063 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48432095 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48432233 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48432487 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 48432727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48432756 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 48432873 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48432927 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 48432949 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 48433061 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 48433072 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 48433085 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48433215 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 48433216 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 48433390 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48433447 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48433503 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48433603 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 48433651 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.25 0.166666666666667 0.583333333333333 8 16 3 2 7 3 48433739 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48433791 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48433796 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48433928 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48433956 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48433961 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48433996 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48434072 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48434135 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48434325 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48434609 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48434613 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48434640 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 48434649 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48434782 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48434864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48434918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48434997 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48435061 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48435138 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 48435156 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 48435308 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 48435317 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 48435379 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 48435468 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 48435674 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48436164 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 48436234 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48436584 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48436698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48436709 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 48436793 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48436901 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 48436986 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48437026 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48437044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48437045 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48437114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48437129 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 48437224 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48437655 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 48437727 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48437803 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 48437837 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48437838 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 48438023 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 48438037 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48438054 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 48438156 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48438430 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48438526 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 48438621 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48438818 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 48438872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48439072 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48439079 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 48439365 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 48439374 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 48439541 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48439553 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48439596 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48439598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48439650 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48439964 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48440338 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 48440369 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 48440488 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48441133 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48441186 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 48441256 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48441659 A G N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 48442540 C A N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 48442637 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 48442669 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48442765 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48442800 C T N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 3 48443052 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48443100 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48443346 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48443933 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48444645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48444658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48444947 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 48445133 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48445144 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48445171 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 48445337 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48445504 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48445506 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48445561 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48445675 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48445710 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48445747 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48446055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48446437 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 48446614 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48446814 A T Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 48446849 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48446962 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 48447015 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48447281 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48447400 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48447712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48447725 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48447826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48447843 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48447867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48447872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48447890 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48447900 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48447930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48447974 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48448059 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48448139 T G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 48448156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48448171 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48448175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48448187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48448201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48448203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48448269 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48448353 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48448396 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48448496 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48448517 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48448547 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48448628 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48448629 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48448681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48448687 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48448743 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48448837 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48448842 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48448927 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48448958 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48449005 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48449021 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48449089 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48449117 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48449222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48449264 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48449285 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48449325 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48449400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48449427 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48449468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48449475 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48449529 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48449582 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48449829 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48449891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48450066 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48450181 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48450245 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48450405 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48450506 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48450543 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48450745 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48450756 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48450844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48451031 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48451181 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48451242 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48451473 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48451487 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48451574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48451712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48451817 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48451890 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48452090 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48452160 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48452208 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48452400 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48453082 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48453206 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48453394 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48454223 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 48454458 T A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 48454639 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 48454646 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 48454660 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48454734 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48455187 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 48455261 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 48455619 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48455762 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48456379 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48456742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48456814 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48456888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48457190 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48457284 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48457300 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 48457492 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 48457638 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 48457656 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 48457792 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48458295 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48458377 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48458434 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48458463 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48458551 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48458575 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48458623 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 48458664 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48459119 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48459139 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48459140 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 48459169 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48459229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48459250 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48459968 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 48460101 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48460155 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48460161 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48460198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48460212 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48460237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48460339 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48460371 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48460377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48460464 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48460496 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48460556 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48460562 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48460572 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48460587 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48460589 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48460652 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48460697 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48460706 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48460872 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48460923 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48460952 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48461135 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48461202 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48461284 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48461291 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48461308 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48461352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48461459 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48461460 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48461665 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48461713 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48461729 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48462029 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48462178 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48462209 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48462332 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48463177 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48463425 G C N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 48463556 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48463736 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48463747 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48464079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48464325 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48464401 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 48464441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48464536 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 48464715 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 48464739 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48464742 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48464871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48464941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48465058 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48465390 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 48465649 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 48466715 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48467222 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48467410 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 48467567 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48467788 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48467814 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 48467815 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48468300 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48468631 G C Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 48468923 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48469020 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48469713 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48470271 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 48470452 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48470481 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48470490 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48470598 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48471231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48471237 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48471659 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 48471927 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48472352 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48472569 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48472617 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 48472783 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48473172 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48473173 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48473473 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 48473571 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 48473630 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48473650 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 48473671 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48473857 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 48473954 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48474506 C T N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.363636363636364 0.272727272727273 0.363636363636364 11 11 4 3 4 3 48474583 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48474922 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48475015 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48475076 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48475171 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48475248 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48475980 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48476091 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 48476122 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 48476137 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 48476279 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48476367 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48476763 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48476792 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48479432 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 48479433 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 48479659 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48479806 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48479922 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48480037 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 48480103 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 48480354 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48480381 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48480543 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48481304 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48481382 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48481800 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48481933 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48482204 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48482216 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48482291 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48482356 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48482597 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48482767 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48482861 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48482956 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48482985 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48482999 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48483043 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48483197 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48483278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48483289 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48483414 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48483426 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48483442 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 48483573 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48484186 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48484370 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48484504 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48484656 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48484773 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48485032 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48485075 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48485104 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48485122 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48485399 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48485639 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48485683 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48485775 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48485991 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 48486040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48486180 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48486205 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48486265 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48486360 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48486389 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 48486459 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48486502 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 48486572 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48486617 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48486649 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 48486655 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48486695 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 48486769 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 48486822 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 48486901 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 48486927 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 48486950 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48486992 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 48487078 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 48487132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48487145 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48487179 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48487340 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48487353 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 48487356 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48487390 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 48487517 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 48487541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48487575 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 48487609 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 48487943 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48488060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48488329 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48488445 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48488727 A G Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 3 48488819 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48488937 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48488938 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48489018 C A Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 48489089 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48489098 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48489105 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 48489151 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48489217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48489232 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48489335 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 48489346 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48489381 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48489403 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48489483 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 48489563 C T Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 48489740 C A Y N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 48489891 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 48489997 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48490000 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48490226 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 48490308 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48490338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48490539 G A Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 48490657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48490760 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 48490764 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 48490772 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 48490777 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48490947 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 48491210 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 48491233 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 48491249 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48491260 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48491266 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48491307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48491324 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48491397 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 48491496 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 48491553 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 48491890 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 48491956 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48492193 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48492215 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 48492262 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 48492434 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 48492438 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 48492543 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 48492554 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 48492702 G C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 48492785 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 48493095 A T N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 3 48493293 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48493581 A G Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 48493623 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48493754 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48493769 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48493802 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48493836 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48493854 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48493881 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48493923 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48493975 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48493994 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 48494370 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 48494419 A T N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 48494503 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48494686 T G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 3 48494688 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48494759 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 48494760 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48494807 A C N N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 3 48494922 A C N N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 8 8 2 4 2 3 48494941 A T N N 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 13 7 4 5 1 3 48494961 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 3 48495045 T C N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.363636363636364 0.363636363636364 0.272727272727273 12 10 4 4 3 3 48495059 A G N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.384615384615385 0.230769230769231 0.384615384615385 13 13 5 3 5 3 48495078 T A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 48495175 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48495304 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 48495312 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48495359 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 48495401 C G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 48495430 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48495513 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48495534 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 48495604 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 48495661 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48495662 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 48495827 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48495829 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 48495956 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48496021 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48496108 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48496155 T C N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 12 8 5 2 3 3 48496414 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 48496654 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48496733 G C N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 48496795 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48497052 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48497115 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48497179 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 48497269 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 48497313 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48497355 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48497364 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48497367 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48497444 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48497445 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48497547 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48497623 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48497770 T G Y N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 48497865 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48498578 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48498693 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48498881 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48498955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48498976 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48499058 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48499443 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48499551 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48499571 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48499585 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48499600 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48499614 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48499727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48499734 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48499817 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48499909 T C N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 48499969 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48500170 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48500232 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48500531 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48500586 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48500834 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48501057 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48501094 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48501311 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48501373 T A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48501394 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48501432 A G Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 48501442 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 48501458 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48501460 T A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48501481 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48501514 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 48501570 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48501575 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48501592 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48501595 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48501779 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 48501823 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48501939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48501950 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48502090 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48502219 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48502278 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48502428 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 48502645 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48502772 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48503144 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 48503665 T C Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 48503696 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 48503831 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 48503944 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 48504048 T A N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 3 48504057 T A N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 3 48504121 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 48504125 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 48504278 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48505512 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48505613 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48505763 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 48505801 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48505871 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48505900 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48505936 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48505986 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48506007 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48506028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48506130 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48506149 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48506406 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48506452 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48506464 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 48506796 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48506828 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48506880 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48506889 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48507801 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48508081 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48508139 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48508296 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48508327 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48508413 A C N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 48508466 A G Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 48508520 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 48508788 A C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 48508877 A C N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 48509268 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48509352 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48509700 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48510217 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48510240 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48510324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48510369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48510685 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48510897 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 48511465 G C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 48511519 A T Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 48511526 G A Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 48511592 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48511621 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 48511732 A G Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 48511957 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 48512331 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 48512727 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48512832 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 48513428 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 48513605 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48513630 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 48513641 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 48513676 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 48513931 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 48513939 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48514287 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.157894736842105 0 0.842105263157895 6 32 3 0 16 3 48514362 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 48514580 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 48514581 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 48514706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48514820 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48515023 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 48515335 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 48515354 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 48515388 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 48515428 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 48515437 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 48515634 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 48515815 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 48515847 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 48516585 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 48516705 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 48516778 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 48516822 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 48516851 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48516861 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 48517108 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 48517381 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 3 48517428 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 48517577 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 3 48518078 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 48519125 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48519212 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 48519241 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48519287 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 48519722 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48519891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48520154 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 48520198 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 48520451 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 48520485 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 48520539 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 48520550 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 48520593 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 48520655 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 48520785 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 48521512 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 48521551 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 48521604 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48522248 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48523601 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48523861 T A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 3 48523927 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 48523934 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 48523981 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 48524177 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48524207 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 48524278 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48524571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48524590 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 48524841 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48525066 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48525096 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48525198 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48525284 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48526788 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 48527140 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48527141 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48527614 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 48527704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48527789 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 48527881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48528443 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48528488 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48528775 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48529519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48529701 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48529902 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48529971 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 48530053 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 48530142 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48530213 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 48530346 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48530409 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48530518 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48530522 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48530532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48530737 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48530809 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48531048 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 48531180 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48531516 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 48532013 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.176470588235294 28 6 14 0 3 3 48532569 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48533104 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48533723 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48533886 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48533947 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 48534139 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 48534242 C G N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 48535715 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 48535835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48536480 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48537424 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48541239 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48541261 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48542317 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 48542373 T C N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 48542487 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48542717 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 48543993 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 48544371 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48545606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48545703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48545835 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 48545870 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48545973 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48546220 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 48546698 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.157894736842105 32 6 16 0 3 3 48546782 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48546925 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48546944 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 48547075 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48547879 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48549595 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 48550063 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48551110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48551403 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 48552145 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 48553176 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48553369 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48553954 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48554232 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48554383 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48554408 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48555372 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48555376 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48555807 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 48555954 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48556000 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48556073 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 48556785 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48557457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48557753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48560542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48562047 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48562124 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48562651 A T N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 3 48563420 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48563688 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48564345 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 48564442 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48564495 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48564676 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 48565279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48565489 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 48566050 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48566069 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 48566292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48566637 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 48566684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48566706 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 48566839 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 48566887 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 48566902 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 48567040 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 48567068 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 48567178 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48567204 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48567205 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48567247 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48567249 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48567271 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48567272 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48567892 T G Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 48568060 C T Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 48568102 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48568296 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 48568315 T C N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 3 48568842 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 48568861 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48568930 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 48569004 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48569012 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48569203 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48569533 A T N N 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 10 14 2 6 4 3 48569722 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 48569849 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 48570094 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48570120 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 48570190 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48570427 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48570472 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48570538 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48570539 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48570579 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 48570701 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48570731 A G Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 48570785 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 48570880 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48570895 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 48571025 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48571060 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48571091 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48571230 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48571234 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48571375 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48571416 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48571874 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48571879 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48571961 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48571990 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48572050 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48572107 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48572305 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48572517 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48572522 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48572634 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48572961 G A Y Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.75 0 0.25 6 2 3 0 1 3 48572967 G A N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 3 48573101 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.8125 0 0.1875 26 6 13 0 3 3 48573405 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48573547 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48574295 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 3 48574322 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.176470588235294 28 6 14 0 3 3 48574397 C G N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.8125 0 0.1875 26 6 13 0 3 3 48574531 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48574775 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48574987 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48575639 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 48575662 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48575663 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48575755 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48575839 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.157894736842105 32 6 16 0 3 3 48575939 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 48576003 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48576115 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48576498 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 48576596 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 48576930 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 48577013 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48577065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48577106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48577331 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 48577358 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 48577432 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 48577638 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 48577796 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48578473 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48578776 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48579064 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48579148 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48579172 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48579952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48580132 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 48580220 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48580363 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48580411 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48580483 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48581161 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48581562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48582290 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48582442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48584605 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 48585602 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 48586641 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48586852 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48587325 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48587810 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48588069 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48588357 C A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48588607 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48588863 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48589145 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48589224 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 48589398 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 48589410 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48589423 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48589427 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48589438 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48589476 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48589490 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48589597 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48589668 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 48589676 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 48590178 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48590301 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48590317 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48590593 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48590596 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48590686 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48590748 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48590806 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48590877 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 48590906 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48590953 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48590979 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48591044 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48591167 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48591174 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48591189 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48591243 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48591292 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48591320 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 48591605 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 48591823 T C Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.8125 0 0.1875 26 6 13 0 3 3 48592088 T C N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 3 48592123 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.222222222222222 14 4 7 0 2 3 48592244 A G N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 48592482 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 48592911 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48593029 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 48593242 A G N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 48593396 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48593493 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48593694 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 48593732 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 48593744 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48593841 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 48593897 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.0588235294117647 0.764705882352941 0.176470588235294 15 19 1 13 3 3 48594088 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 48594094 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48594600 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 48594750 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 48594776 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 48594858 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48594964 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 48594976 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48595076 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 48595486 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 48595530 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 48595729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48596066 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 48596666 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48596700 G T N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 3 48596926 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 48596936 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48597292 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48597635 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 48597730 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 48597990 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 48598057 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48598233 C A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 48598315 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48598401 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48598468 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 48598582 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 48598617 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 48598702 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 48599803 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 48599810 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 48600932 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 48601049 T G Y N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 10 10 3 4 3 3 48601101 A C Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 48601108 G A N Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 9 9 2 5 2 3 48601113 T A N N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 8 8 2 4 2 3 48601273 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 48601298 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 48601334 A C N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 48601363 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 48601368 C G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 48601473 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 48601479 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 48601489 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 48601563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48601571 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 48601608 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 48601679 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48602000 G A N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 3 48602159 A G N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 3 48602323 T A N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 48602338 T G N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 48602349 T A N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 48602380 G C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 48602595 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 48602742 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48602753 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 48602973 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 48603074 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 48603112 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 48603116 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 48603132 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 48603172 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 48603217 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 48603218 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 48603247 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 48603264 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 48603273 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 48603462 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.555555555555556 0.111111111111111 0.333333333333333 11 7 5 1 3 3 48603498 C T N Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.428571428571429 8 6 4 0 3 3 48603512 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 12 6 6 0 3 3 48603528 G A N Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.625 0 0.375 10 6 5 0 3 3 48603531 C A N N 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.625 0 0.375 10 6 5 0 3 3 48603563 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 12 6 6 0 3 3 48603572 T G N N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.7 0 0.3 14 6 7 0 3 3 48603623 G A N Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.625 0 0.375 10 6 5 0 3 3 48603640 A C N N 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.625 0 0.375 10 6 5 0 3 3 48603740 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 12 6 6 0 3 3 48603809 G A N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.7 0 0.3 14 6 7 0 3 3 48603833 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 12 6 6 0 3 3 48603867 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 48603886 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 48603915 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 48603974 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 48604004 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 48604029 A T N N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.7 0 0.3 14 6 7 0 3 3 48604077 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 12 6 6 0 3 3 48604078 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 12 6 6 0 3 3 48604099 T C N Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.625 0 0.375 10 6 5 0 3 3 48604123 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 48604135 A G N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.636363636363636 0.0909090909090909 0.272727272727273 15 7 7 1 3 3 48604136 A G N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.636363636363636 0.0909090909090909 0.272727272727273 15 7 7 1 3 3 48604204 C T N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 13 7 6 1 3 3 48604343 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 48604421 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 48604586 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 48604613 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 48604620 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 48604632 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 48604694 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 48605064 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48605577 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 48605664 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 48605701 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48605860 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 48605889 T G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 3 48606438 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48606466 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48606656 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48606731 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48606799 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 48606901 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 48606930 G A Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 48607569 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 48607871 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48607924 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48608116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48608192 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48609019 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48609045 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48609118 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48609454 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48609574 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48609656 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48609837 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48610285 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48610652 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48610670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48610675 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48610996 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48611148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48611525 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48611784 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 48611915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48612138 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 48612153 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 48613446 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48613490 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48613626 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48613791 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48613964 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48613974 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48614153 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 48614261 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 48614393 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 48614428 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48614690 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48615272 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 48615351 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48615548 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 48615700 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 48615981 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48616098 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 48616347 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48616545 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 48616973 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 48617393 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 48617448 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 48617449 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48617490 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 48617602 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 48617606 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 48617651 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 48617704 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 48617963 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 48618006 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 48618068 T A N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 3 48618240 G T N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 48618298 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48618330 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 48618380 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 48618405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48618419 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 48618421 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 48618517 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 48618579 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 48618610 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 48618672 C G N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 48618681 T A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 48618894 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48619068 G C N N 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 7 9 2 3 3 3 48619131 C G N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 48619446 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 48619562 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 48619642 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 48619777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48619791 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 48619797 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 48619937 T C N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.375 0.125 0.5 7 9 3 1 4 3 48620014 A G N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 48620058 T A N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 48620292 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48620342 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48620908 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48621144 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 48621253 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48621271 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 48621286 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48621436 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 48621577 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 48621585 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48621606 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 48621703 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 48621712 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 48621731 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 48621770 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 48621808 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48622369 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 48622869 A G N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.357142857142857 0.142857142857143 0.5 12 16 5 2 7 3 48623048 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48623102 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48623147 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48623234 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 48623362 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48623439 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 48623482 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 48623770 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 48623847 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48623971 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48624011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48624139 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 48624195 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 48624449 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 48624652 A G N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 48625089 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.153846153846154 0 0.846153846153846 4 22 2 0 11 3 48625105 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48625131 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 48625279 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 48625281 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 48625328 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 48625726 A T N N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 3 48625798 A G N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 3 48625908 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 3 48625951 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 48626080 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 48626103 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 48626193 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48626227 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 48626250 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 48626303 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48626365 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48626723 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 48626819 C G N N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.363636363636364 0.363636363636364 0.272727272727273 12 10 4 4 3 3 48626988 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48627064 T C N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 48627500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48628032 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 48628159 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 48628160 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 48628350 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48628400 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 48628551 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48628954 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 48629425 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 48629524 A C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48629922 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 48631057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48631120 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 48631402 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48631467 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 48631524 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 48631695 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48631715 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 48631876 T A N N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 48632005 C T N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.75 0.0833333333333333 0.166666666666667 19 5 9 1 2 3 48632150 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48632229 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 48632302 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 48632419 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 48632608 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48633001 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 48633331 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 48633428 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 48633782 G A N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.153846153846154 0.0769230769230769 0.769230769230769 5 21 2 1 10 3 48634678 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 48634853 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 48634870 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48634926 G C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 48635474 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 48635835 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48635928 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48635938 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48635959 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48636134 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 48636606 G T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 3 48636768 A T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48636860 T A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48637337 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48637358 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48637611 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48637662 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48637873 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 48637890 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48638001 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48638220 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48638311 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 48638501 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48638625 G T Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 48638763 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 48638909 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48638914 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48639664 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 3 48639794 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48639898 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 48640066 G C Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 48640260 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 48640549 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 48640566 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48640567 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 48640864 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48640936 T C N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.461538461538462 0.230769230769231 0.307692307692308 15 11 6 3 4 3 48640977 T G Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 48641086 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 48641367 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48641368 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48641388 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 48641424 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 48641587 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48641697 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 48641729 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48641742 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48641859 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48641906 T A N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.466666666666667 0.133333333333333 0.4 16 14 7 2 6 3 48641924 C T N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.466666666666667 0.2 0.333333333333333 17 13 7 3 5 3 48641940 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48642100 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 3 48642149 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 48642226 A G Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 48642239 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 48642248 G C Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48642311 G C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.176470588235294 28 6 14 0 3 3 48642377 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48642490 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 48642530 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 48642541 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 48642592 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 48642618 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 48642739 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 48642759 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 48642768 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 48642781 A T Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 48642810 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48642816 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 48642834 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 48642908 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48642979 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 48643204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48643277 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48643413 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48643653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48643676 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48643964 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 48644053 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 48644434 A C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 48644446 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48644472 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48644519 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 48644606 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48644607 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 48644773 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 48644840 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 48645009 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 48645100 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48645169 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48645179 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 48645284 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48645318 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 48645364 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 48645374 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 48645386 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 48645418 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 48645425 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48645486 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48645542 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 48645544 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 48645584 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 48645589 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 48645611 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 48645635 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 48645636 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 48645854 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 48645874 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 48645878 T A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48645906 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 48645916 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 48645982 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 48646088 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 48646139 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 48646185 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 48646191 A C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 48646253 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48646268 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 48646313 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 48646438 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 48646498 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 48646579 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 48646644 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 48646691 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 48646747 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48646933 T A N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5625 0.125 0.3125 20 12 9 2 5 3 48647234 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48647301 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48647435 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48647752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48647783 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 48647820 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48647981 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48648177 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 48648249 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 48648281 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 48648333 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 48648334 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48648381 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48648474 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48648477 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48648491 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48648534 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48648560 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48648576 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48648580 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48648626 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48648830 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48648958 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48648984 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48649127 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48649153 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48649282 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48649389 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48649437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48649928 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 48650413 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 48650551 T C Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 48650688 T G Y N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.214285714285714 22 6 11 0 3 3 48651100 G T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48651261 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 48651274 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48651328 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48651603 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 48651617 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48651663 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 48651685 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 48651741 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48651783 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 48651856 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 48651874 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 48651926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48651971 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 48652002 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 48652027 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 48652253 C A N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 48652257 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48652275 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48652373 A T N N 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.25 0.333333333333333 0.416666666666667 10 14 3 4 5 3 48652408 C T N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 48652452 G T N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 3 48652505 G A N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.454545454545455 0.181818181818182 0.363636363636364 12 10 5 2 4 3 48652537 T C N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 3 48652585 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 48652642 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 48652735 C A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 48652836 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 48652838 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 48652860 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48653051 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 48653109 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 48653124 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 48653144 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 48653384 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 48653403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48653439 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48653806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48653858 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 48653994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48654249 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48654283 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.157894736842105 32 6 16 0 3 3 48654356 C A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.8125 0 0.1875 26 6 13 0 3 3 48654523 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48654549 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.8125 0 0.1875 26 6 13 0 3 3 48654645 T G N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 3 48654672 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48654861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48654902 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 48654940 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48654945 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 48654957 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48655156 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 48655366 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48655380 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48655451 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48655484 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48655532 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48656131 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48656141 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 48656591 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 48656596 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48657055 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48657098 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48657397 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48657468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48657537 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 48660200 C G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 48660333 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 48660370 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 48660398 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 48660460 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48660466 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48660498 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 48660773 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 48660787 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 48661037 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48661064 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48661491 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 48661911 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48661920 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48662161 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48662332 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 48662399 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48662462 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 48662465 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 48662553 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48662565 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 48662858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48662990 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48663215 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 48663263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48663572 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48663614 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48663881 T A Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 48664177 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 48664184 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48664238 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 48664255 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48664325 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 48664369 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48664460 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48664508 T A Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 48664597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48664662 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48664769 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 48664922 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48664999 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48665216 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48665707 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 48665708 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 48665950 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 48666281 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 48666434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48666598 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 48666600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48666633 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 48666691 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48667345 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 48667346 T G N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 48667791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48667826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48667917 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48668132 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48668187 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48668395 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 48668586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48668688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48669258 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 48669345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48669866 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48669896 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 48670090 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48670594 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48670768 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 48670994 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48671111 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48671211 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 48671542 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48671591 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48671894 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 48672146 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48672382 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48672549 C T N Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.5 0.1 0.4 11 9 5 1 4 3 48672868 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48673197 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48673233 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48673508 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48673951 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 48674468 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48674992 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48675017 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48675271 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48675316 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48675445 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48676681 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48676858 A G Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 48676998 G A Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 48677311 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 48677464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48677533 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48677777 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48677896 G A Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 48677969 T G Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 48678036 T G Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 48678063 C A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48678158 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 48678192 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48678457 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48678669 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48678977 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 48679147 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 48680123 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48680194 T C Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 48681026 C T Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 48681202 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48681242 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 48681374 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48681610 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 48681647 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48681809 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48682164 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48683172 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.3125 0.125 0.5625 12 20 5 2 9 3 48683279 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48683481 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 48683490 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48683734 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.4 0.133333333333333 0.466666666666667 14 16 6 2 7 3 48683800 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48684024 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 48684787 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48684946 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48685812 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48686203 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48686858 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48687355 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48687509 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48687815 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 48688119 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 48688132 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48688167 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48688632 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48689069 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 48689082 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 48689796 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48689888 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48689925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48690073 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48690367 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48690392 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48690409 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48690421 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48691108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48691197 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48691232 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 48691238 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48691341 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48691992 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 48692036 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48692088 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48692518 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48693071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48693492 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48693798 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 48694551 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 48694976 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48695076 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48695214 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48695367 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 48695551 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48695667 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48695923 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 48696263 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48697360 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48697398 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 48697427 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48697498 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48698262 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 48698533 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48698751 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48698887 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48699092 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48699256 T C N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 48699361 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48699466 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48699850 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 48702381 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48702388 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48702424 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48703557 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48703670 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48704177 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48704181 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48704404 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48705528 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48705724 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48706543 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48706932 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48706996 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 48707019 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48707032 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 48707414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48707583 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 48707993 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48707996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48708121 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.157894736842105 32 6 16 0 3 3 48708134 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48708207 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48708880 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48708954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48709101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48709147 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 48709433 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48709572 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48709646 G T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48710079 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.157894736842105 32 6 16 0 3 3 48710841 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48711206 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48712050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48712060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48712340 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48712513 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48712592 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48712666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48712679 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48713022 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48713230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48713333 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48713557 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48713675 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48714386 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48714437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48714480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48714825 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48714871 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48714943 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48715040 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48715056 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48715451 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48715609 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48715699 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48715743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48715950 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 30 6 15 0 3 3 48716354 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48716414 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48716444 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48716626 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48716879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48717243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48717425 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48717440 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48717697 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48717954 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48718104 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48718492 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48718740 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48718823 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48719040 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48720151 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 48720205 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48720887 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48721084 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48721293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48721508 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 48721513 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 48721761 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48722511 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48722661 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 48722891 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48723127 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48723147 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 48723195 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48723769 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48724368 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48724629 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48724632 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48724676 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48724778 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48724956 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48724985 G C Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 48724987 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 48725210 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48725228 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48725245 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 48725330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48725373 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48725418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48725442 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48725467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48725468 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48725481 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48725654 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48725742 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48725779 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 48725793 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 48725835 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 48725841 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 48725874 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 48725942 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 48726069 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48726092 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48726116 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 48726135 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48726161 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48726264 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48726415 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 48726457 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 3 48726560 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48726584 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48726636 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 48726661 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48726680 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48726689 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48726691 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48726821 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 48726850 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48726858 A T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48726887 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48726890 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48726922 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48727010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48727115 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48727284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48727301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48727367 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48727418 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48727422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48727506 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48727514 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48727725 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48727819 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48727879 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48727917 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48728041 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 48728069 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48728203 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48728236 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48728237 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48728349 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48728365 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 48728400 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48728414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48728509 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48728541 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48728556 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48728569 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48728590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48728644 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48728769 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48728799 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48728862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48728922 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48728968 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48729034 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48729096 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48729205 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48729235 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48729261 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48729270 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48729398 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48729413 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48729457 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48729491 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 48729508 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 48729512 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 48729521 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 48729555 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 48729579 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 48729660 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 48729842 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 48729927 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48729942 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48729945 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48730003 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48730037 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 48730063 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 48730078 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 48730100 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48730127 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48730201 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48730263 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48730400 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48730403 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48730415 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48730486 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 48730523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48730535 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48730541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48730602 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48730628 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48730632 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48730651 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 48730660 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48730762 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.157894736842105 32 6 16 0 3 3 48730809 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48730889 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48730894 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48730973 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48730979 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48731064 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48731070 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48731091 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48731142 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48731213 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 48731246 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48731273 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48731293 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48731305 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48731320 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48731393 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48731394 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48731425 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48731605 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48731667 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48731722 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48731768 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48732005 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48732146 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48732185 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48732320 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 48732440 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48732646 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48732654 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48732861 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48732894 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48732895 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48733014 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48733162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48733180 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48733192 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 48733240 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48733426 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48733489 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48733506 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48733581 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48733599 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48733646 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48733796 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48733812 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48733872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48736982 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48737039 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48737417 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 48738624 T G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 48738987 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48739161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48739258 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48739280 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48739395 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48739401 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48739420 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48739556 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48739614 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48739684 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48739729 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48739816 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 48739962 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48740696 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48741050 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48741110 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48741163 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48741281 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48741329 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48741414 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48741509 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48741532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48741821 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 48741831 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48741941 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48741942 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48742356 T C Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 48742455 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48742483 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48742547 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48742553 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48742560 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48742581 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48742594 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48742854 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48743014 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48743036 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 48743057 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 48743072 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 48743116 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 48743215 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48743252 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48743328 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48743426 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48743791 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 48743921 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 48743922 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 48743967 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 48744104 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 48744197 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48744244 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48744419 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 48744431 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48744525 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48744613 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 48744616 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48744664 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48744792 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 48745310 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 48745353 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48745479 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48745555 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48745675 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48745880 T C Y Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0 0.642857142857143 0.357142857142857 9 19 0 9 5 3 48745976 C G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48745989 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48746420 C G Y N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 48746515 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 48746520 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 48746573 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48746727 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 48746738 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 48746926 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 48747088 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48747109 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48747221 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48747612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48747651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48747763 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 48747949 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48747976 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48747996 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48748031 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48748032 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48748152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48748155 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48748370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48748443 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48748457 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48748495 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 48748693 A C N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 48748716 G C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48748794 A C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48748811 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48748837 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48748900 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48748901 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48748915 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48748942 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48748954 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48749010 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48749195 A C N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 48749371 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 4 2 2 0 1 3 48749470 A G N Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 3 48749618 G T N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 48749674 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48749810 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48749861 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48750085 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 48750134 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48750165 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48750182 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48750205 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48750222 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48750237 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48750273 G T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 48750358 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48750362 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48750481 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48750560 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48750570 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48750642 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48750667 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48750741 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48750772 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48750774 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48750810 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 48750811 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48750862 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48750875 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48750977 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48750985 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 48750992 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48751090 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48751100 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48751129 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48751133 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48751156 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48751167 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48751237 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48751263 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48751307 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48751317 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48751336 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48751490 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48751611 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48751650 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 48751654 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48751693 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48751714 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48751798 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48751826 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48751869 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48751902 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 48751908 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48751939 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48751968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48752096 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48752236 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48752264 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48752265 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48752306 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48752366 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48752373 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48752380 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48752423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48752479 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48752593 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48752624 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48752724 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48752801 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48752816 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48752846 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48752891 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 48753048 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48753120 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48753143 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48753271 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48753288 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48753483 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48753552 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48753555 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48753566 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 48753596 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 48753616 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48753627 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48753670 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 48753870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48753874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48753911 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48753951 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48753979 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 48754019 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 48754080 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48754090 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48754101 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48754121 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 48754134 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48754230 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48754235 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48754260 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 48754297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48754299 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48754313 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48754319 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48754329 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48754376 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48754383 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48754461 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48754512 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48754513 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48754561 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48754577 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48754618 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48754647 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48754678 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48754686 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48754696 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48754712 A C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48754729 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48754748 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48754750 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48754768 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48754774 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 48754895 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48755024 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48755031 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48755036 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48755087 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48755152 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 48755190 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48755247 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48755284 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48755353 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 3 48755376 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 48755468 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48755479 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 48755487 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48755533 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 48755546 T C N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 3 48755921 G T N N 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.454545454545455 0.272727272727273 0.272727272727273 13 9 5 3 3 3 48756052 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48756139 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48756145 A G N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.428571428571429 0.214285714285714 0.357142857142857 15 13 6 3 5 3 48756190 A T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 48756471 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 48756478 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 48756484 G A N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 3 48756522 G C N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 48756587 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48756663 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48756977 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 48757184 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48757265 G T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 48757553 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48757789 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48757873 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48757969 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 48758091 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48758272 A C N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 48758274 A C N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 48758311 A C N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 48758326 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 48758419 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48758476 T A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 48758485 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 48758506 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48758525 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48758551 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48758570 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48758630 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48758646 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48758696 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48758783 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 48758790 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48758802 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 48758890 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48759096 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 48759224 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 48759235 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48759374 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48759429 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48759547 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48759575 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48759591 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48759882 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48759923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48759965 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48760011 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48760056 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48760110 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48760253 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 48760256 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 48760369 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48760517 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48760562 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48760722 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48760733 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 48760752 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48760757 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48760775 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48760800 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 48760835 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 48760872 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48760898 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 48760899 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 48760945 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 48761011 T C N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 48764118 G A N Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 3 48764548 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 10 8 2 6 1 3 48764610 A C Y N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 48764719 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48765090 G T Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 48766712 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 48766724 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 48766741 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 48766779 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 48766902 T A N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 48767203 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 48767319 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 48767334 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 48767367 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 48767420 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 48767606 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 48767642 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 48767659 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 48767795 T G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 48767860 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 48768020 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 48768109 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 48768120 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48768147 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 48768167 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 48768176 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 48768249 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48768272 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 48768291 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 48768318 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 48768373 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 48768389 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48768392 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48768418 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 48768443 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 48768476 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 48768485 A C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 48768497 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48768529 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 48768570 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 48768599 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48768610 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 48768625 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 48768684 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48768707 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 48768722 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 48768782 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48768798 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 48768870 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48768895 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 48768902 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48768943 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48769059 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 48769280 G T N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 48769373 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 48769423 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 48769454 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 48769455 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 48769497 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 48769498 C A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 48769533 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48769543 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 48769549 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 48769557 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 48769617 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 48769648 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 48769684 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 48769746 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 48769759 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 48769800 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 48769885 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 48769991 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 48770026 C G N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 48770086 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48770145 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 48770147 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 48770196 T A Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 48770352 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 48770403 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48770441 G A Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 3 48770459 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 48770482 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 48770520 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48770610 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 48770625 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48770652 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 48770676 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 48770741 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48770968 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48770974 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48771091 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48771156 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 48771164 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48771244 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 48771321 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 48771403 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48772492 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48772525 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48772705 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48772709 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48772841 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 48772935 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48773066 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48773096 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48773170 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48773195 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48773297 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48773346 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 48773383 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48773429 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48773496 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48773615 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 48773751 G T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 48774051 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48774108 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48774134 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48774213 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48774264 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48774287 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48774300 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0 0.894736842105263 0.105263157894737 17 21 0 17 2 3 48774342 A C Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 3 48774437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48774478 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48774479 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48774756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48774842 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48775025 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 48775065 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 48775106 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48775121 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48775126 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48775231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48775258 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48775352 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.157894736842105 32 6 16 0 3 3 48775358 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48775405 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48775417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48775655 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48775687 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48775709 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48775716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48776057 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48776185 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 48776194 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48776322 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 48776605 A C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 48776794 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 48776834 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 48777111 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 48777179 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 48783673 G A N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 48783772 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 3 48783904 C A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 48783943 T C N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 48784262 C G N N 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 3 48784305 A T N N 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 6 8 2 2 3 3 48784319 T C N Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 6 8 2 2 3 3 48784333 A C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 48784411 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48784413 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 48784462 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 48784464 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 48784531 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48784620 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 48784644 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 48784656 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 48784721 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 48784840 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 48784876 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48784887 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48784892 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 48784933 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 48784936 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48785068 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48785237 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 48785379 C A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 48785489 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 48785502 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 48785549 A C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 48785550 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 48785569 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 48785611 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48785614 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 48785692 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 48785739 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48785818 T A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 48785887 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48785888 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48785900 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 48785935 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48785946 G T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 48786095 A C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 48786104 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48786117 C A N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 48786118 T G N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 48786205 A C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 48786285 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 48786325 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48786508 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 48786965 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 48786970 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 48787071 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 48787133 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 48787498 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 48787532 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 48787556 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48787588 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 48787676 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48787681 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 48787693 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 48787855 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0 0.722222222222222 0.277777777777778 13 23 0 13 5 3 48787856 A T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0 0.705882352941177 0.294117647058824 12 22 0 12 5 3 48788125 A T N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 15 5 7 1 2 3 48788171 C T N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 3 48788328 T G N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 48788362 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 48788525 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48788988 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48789666 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 48789677 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 48789722 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48789748 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48790055 A G N Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.5 0.125 0.375 9 7 4 1 3 3 48790260 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48790706 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 48790764 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48791044 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48791482 C A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 48791504 C A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 48791509 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 48791603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48791757 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48791844 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 48792892 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48793226 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 48793497 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 48793637 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 48793647 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48793699 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48794059 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 48794287 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 48794291 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 48794401 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48794675 G A N Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 5 9 2 1 4 3 48794779 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 48794793 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48794957 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 48795032 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 48795083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48795311 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 48795323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48795337 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48795415 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48795536 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48795769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48795811 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48795937 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48795951 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48796043 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 48796334 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48797070 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 48797088 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 48797154 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48797213 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 48797756 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 48797804 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 48797990 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 48798223 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48798352 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 48798360 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 48798498 C A N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 48798931 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48799004 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 48799378 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 48799425 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48799476 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48799483 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48799725 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48800858 A G N Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 8 6 1 6 0 3 48801231 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 48801247 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48801321 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 48801341 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48801528 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 48801976 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48802002 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48802154 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48802534 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 48802557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48802766 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 48802831 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48803032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48803066 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 48803090 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 48803104 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48803124 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 48803129 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 48803432 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48803505 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 48803518 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 48803554 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 48803569 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 48803608 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 48803850 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 48803898 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 48803922 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 48803931 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 48803967 A G N Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0 1 0 7 7 0 7 0 3 48803976 T C Y Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 6 6 2 2 2 3 48803981 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 48803994 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 48804119 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48804133 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48804140 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48804170 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48804234 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48804266 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48804300 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48804323 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48804410 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48804465 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48804488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48804526 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48804539 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48804543 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48810907 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 48810951 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 48811077 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 48811096 G A N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 48811101 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 48811121 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 48811231 C G N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 48811318 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 48811361 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48811362 T G N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 48811444 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48811456 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48811474 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48811496 T A N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 48811619 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48811633 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48811646 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 48811678 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48811817 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48811838 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48811866 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48811907 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48811935 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48811995 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48812009 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48812015 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 48812209 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48812263 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 48812303 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48812361 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48812391 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48812424 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 48812465 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48812473 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48812517 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48812533 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48812544 A C N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 3 48812601 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48812650 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48812651 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48812721 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48812746 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48812799 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48812832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48812869 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48812888 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48812917 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48812942 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48812950 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48812968 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48812987 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 48813086 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 48813087 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48813208 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48813458 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 48813487 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48813516 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 48813704 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 48813854 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 48813887 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48813925 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48814031 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 48814122 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 48814372 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48814373 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 48814515 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48814615 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 48815085 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 48815086 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 48815481 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 48815579 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48816633 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 48816757 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 48816810 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48816881 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 48817205 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 48817207 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 48817906 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48818118 C A N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 48818256 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 48818563 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48819085 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48821032 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 48821065 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48821389 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48822416 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48822674 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 48822757 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48822813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48822886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48822978 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48822998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48823052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48824321 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48824574 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 48824624 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48824935 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48824964 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 48825497 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48825937 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48826308 C G N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 48826488 T C N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.307692307692308 0.0769230769230769 0.615384615384615 9 17 4 1 8 3 48826839 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48827507 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 48827543 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 48827645 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 48827874 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48827924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48828233 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48828317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48828359 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 48828377 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 48828425 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 48828460 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 48828461 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 48828553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48828607 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48828710 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 48828745 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48828779 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 48828806 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 48828898 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 48829026 C T N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 48829076 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 48829294 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48829346 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48829353 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 48829463 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48829874 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 48830021 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 48830077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48830347 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48830552 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48830718 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 48831207 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48831246 T C Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 48831334 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48831435 A C Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 48831450 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 48831452 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48831636 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48831709 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 48831862 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 48831913 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 48832052 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48832087 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 48832151 G T Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 48832361 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48832402 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 48832490 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 48832627 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48832917 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48833163 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 48833216 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48833409 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 48833467 A G Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 48833576 A T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 48833578 C G Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 48833709 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48833886 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48834038 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 48834373 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 48834573 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48835139 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48835234 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 48835280 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 48835554 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48835796 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 48835843 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48835853 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 48835881 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48836035 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48836063 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48836236 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48836337 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 48836340 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48836444 T A N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 48836543 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 48836598 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 48836744 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48836795 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48836980 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48836997 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48837054 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48837440 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48837498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48837602 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 48837876 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48837892 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48837893 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 48838037 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 48838138 A C N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 48838303 A G N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 48838342 G C N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.307692307692308 0.230769230769231 0.461538461538462 11 15 4 3 6 3 48838391 A T N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 48838607 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48838613 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 48838839 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48838846 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.526315789473684 0.105263157894737 0.368421052631579 22 16 10 2 7 3 48838880 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48838941 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 48838998 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 48839034 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 48839098 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 3 48839181 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.5 0.125 0.375 18 14 8 2 6 3 48839184 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48839245 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.3125 0.125 0.5625 12 20 5 2 9 3 48839295 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 48839388 G T N N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.583333333333333 0.0833333333333333 0.333333333333333 15 9 7 1 4 3 48839430 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 48839432 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48839457 T A N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 3 48839476 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 3 48839845 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48839886 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 48839994 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 48840029 C T N Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 11 9 4 3 3 3 48840030 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 11 7 4 3 2 3 48840670 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 48840744 A T Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 48840805 A T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 48840946 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48840965 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 48841023 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48841109 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 48841177 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 48841477 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48841495 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 48841706 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 48841824 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 48841838 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48842008 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 48842124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48842176 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.555555555555556 0.111111111111111 0.333333333333333 22 14 10 2 6 3 48842241 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48842282 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 48842337 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48842460 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 48842470 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48842473 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48842914 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 48842957 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48843086 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 48843154 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 48843174 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48843205 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48843306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48843335 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48843389 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48843569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48843571 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48843589 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 48843717 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 48843890 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 48843918 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48844009 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 48844076 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48844090 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48844136 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48844239 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 48844250 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48844341 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48844369 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48844534 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 48844691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48844761 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 48844813 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 48844849 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 48844894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48844902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48844908 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48844950 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48844983 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48845213 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48845231 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 48845265 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 48845308 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48845334 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48845477 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48845718 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48845740 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48845783 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48845793 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48845800 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48845843 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48845876 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48845902 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48845914 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48846002 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 48846020 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48846039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48846091 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 48846173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48846215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48846218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48846299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48846314 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48846348 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48846458 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48846487 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48846526 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48846546 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48846943 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 48847028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48847058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48847170 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48847227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48847417 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48847420 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48847434 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48847596 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 3 48847607 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48847645 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48847768 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48847851 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48848051 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48848081 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48848190 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48848363 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48848416 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48848486 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48848548 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48848566 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48848600 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 48848716 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48848736 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 48848761 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48848857 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48849668 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48849818 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48849820 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48849883 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 48849935 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48849942 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 48850020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48850350 G T Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 48850680 T A Y N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 5 7 0 5 1 3 48850681 T G N N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.2 0.8 0 6 4 1 4 0 3 48852309 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 48852319 T A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 48852894 A G Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 48853295 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48853322 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 48853508 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48853521 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48853769 C A N N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 48853853 G C N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 48853983 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48854100 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48854214 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48854328 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48854477 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48854752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48854765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48854782 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48854841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48854878 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 48854960 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48855018 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48855049 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48855050 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48855095 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48855122 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48855137 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 48855331 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48855392 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48855408 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48855475 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48856107 A C N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 48856123 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 48856186 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48856363 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48856862 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48856873 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48856882 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48857534 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48857544 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48857571 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 48857722 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48857902 C G N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 48857930 A C N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 3 48858538 A C N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 48858859 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 48860386 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48860627 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 48860641 C T Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 3 48860802 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48860873 T C N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 48860908 T C N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.333333333333333 0.583333333333333 0.0833333333333333 15 9 4 7 1 3 48860946 C G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 48861023 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 48861142 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 48861208 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48861335 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48861378 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 48861639 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48861992 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48862139 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48862242 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 48862624 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48862770 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48862855 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 48863078 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 48863145 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 48863265 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48863421 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48863424 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 48863673 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 48863685 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48863696 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 48863762 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48863966 G C Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 48864090 G A N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 3 48864136 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 48864220 A G N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.181818181818182 0.454545454545455 0.363636363636364 9 13 2 5 4 3 48864228 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 13 5 6 1 2 3 48864314 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48864498 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48864550 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 48864551 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 48864572 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48864589 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 48864601 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 48864604 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 48864618 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 48864620 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 48864767 A C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 48864856 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 48865253 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 48865261 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 48865286 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 48865318 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 48865331 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 48865432 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 48865521 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 48865608 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 48865697 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48865840 G C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 48865868 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 48865967 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 48865978 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 48866001 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 48866044 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 48866066 G C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 48866113 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48866153 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 48866159 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 48866374 C G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 48866401 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 48866421 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 48866630 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48866637 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 48866645 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 48866696 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 48866815 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48866952 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48867061 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 48867114 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 48867288 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 48867356 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 48867433 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48867502 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 48867771 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48867896 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48867942 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48867971 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48868082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48868232 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48868249 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48868397 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48868702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48868771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48868978 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48869003 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48869389 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48869509 T G N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 48869544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48869554 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48869650 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48869909 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48870119 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48870974 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48871079 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48871142 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48871159 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48871276 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48871590 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48871758 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48872106 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48872295 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48872474 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 48872488 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 48872586 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48872714 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48872748 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 48872802 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 48872901 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 48872902 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 48872983 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 48872992 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 48873021 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 48873186 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48873252 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 48873332 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 48873336 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48873350 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48873447 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48873837 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48873838 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48873875 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48873946 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 48874045 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48874059 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 48874114 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48874133 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 48874136 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48874157 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48874201 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 48874414 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48874442 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 48874635 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 48874651 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48874725 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48874850 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 48874899 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 48881313 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48881339 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48881536 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.133333333333333 0.666666666666667 0.2 14 16 2 10 3 3 48881629 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 48881699 A T Y N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 3 48881745 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48881795 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48881904 G T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 48881912 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48881985 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 48882172 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48882476 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 48882515 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 48882680 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48882707 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48882730 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 48882743 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48883141 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48883357 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 48883572 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48883624 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 3 48883638 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48883641 G T N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 3 48883883 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48884006 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 48884047 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48884059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48884069 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48884083 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 48884177 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 48884236 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 48884260 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48884319 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 48884343 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48884376 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 48884377 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48884481 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 48884501 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 48884632 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 48884695 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 48884696 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 48884724 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 48884755 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 48884768 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 48884769 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 48884784 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 48884792 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 48884815 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48884823 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48885005 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 48885019 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 48885036 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 48885426 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 48885565 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 48885612 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48885667 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 48885735 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48885739 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48885765 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 48886154 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48886179 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 48886423 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48886482 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 48886519 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 48886588 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48886605 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48886707 C A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 48886725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48886726 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 48886752 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 48886778 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48886781 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 48886796 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 48886816 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48886822 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48886862 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 48887002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48887199 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48887214 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48887379 C G N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 3 48887448 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48887524 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48887526 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48887644 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48887758 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48887803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48887870 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48887888 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48887897 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 48887913 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48887952 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 48887989 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 48888022 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48888154 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 48888179 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48888270 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48888276 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48888291 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48888358 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48888459 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 48888581 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48888717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48888735 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48888779 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 48888831 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48888851 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48888878 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48888918 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48888920 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48888952 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48888986 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48888994 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48889119 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48889226 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48889338 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 48889737 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48889751 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 48889766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48889873 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 48889926 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48889978 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48889988 C A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 48890002 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 48890137 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 48890143 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48890214 A C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 3 48890351 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48890354 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 48890390 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 48890510 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48890715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48890762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48891312 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48891404 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48891499 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48891576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48891880 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 48891906 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48892418 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48892554 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 48892565 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48892956 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 48893242 G T Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 48893348 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 48893481 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 48893534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48893688 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 48893766 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48893860 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 48893925 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 48894025 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 48894077 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 3 48894110 C T N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.333333333333333 0.583333333333333 0.0833333333333333 15 9 4 7 1 3 48894130 T C N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 13 7 4 5 1 3 48894165 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 12 6 3 6 0 3 48894363 A G N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 3 48894397 C G N N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.363636363636364 0.545454545454545 0.0909090909090909 14 8 4 6 1 3 48894620 G T N N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 3 48894682 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 48894751 C A N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.307692307692308 0.615384615384615 0.0769230769230769 16 10 4 8 1 3 48894845 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 3 48894960 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48895019 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48895059 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 48895159 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48895187 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48895195 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48895211 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 48895257 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48895258 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48895300 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 48895302 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 48895319 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 48895469 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48895504 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48895532 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48895537 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48895611 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.75 0.0625 0.1875 25 7 12 1 3 3 48895647 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48895670 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 48895839 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 3 48895893 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48895895 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48896076 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 48896089 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 48896498 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 48896547 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 48896569 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48896669 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 48896678 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 48896782 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48896783 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 48896846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48896857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48896878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48896884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48896904 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48897011 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 48897146 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48897181 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48897230 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48897295 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 48897327 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48897467 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48897483 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48897501 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48897560 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48897893 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 48897970 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 48898130 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 48898192 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 3 48898360 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 48898384 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 48898387 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 48898456 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 48898546 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 48898725 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48898782 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48898819 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 48898968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48898977 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 48898983 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 48898998 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 48899056 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48899244 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 48899330 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 48899392 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 48899419 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 48899469 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48899471 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 48899571 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 48899602 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 48899662 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 48899802 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 3 48899820 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 48899864 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 3 48899897 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 48899921 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.176470588235294 27 7 13 1 3 3 48900164 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48900213 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 48900220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48900234 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 48900327 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 48900362 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48900507 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48900666 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 3 48900684 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 48900730 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48900807 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.176470588235294 27 7 13 1 3 3 48900813 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.75 0.0625 0.1875 25 7 12 1 3 3 48900823 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.75 0.0625 0.1875 25 7 12 1 3 3 48900968 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 48901610 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 48901611 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 48901687 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48901701 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 48901757 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 48901789 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 48901965 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48901977 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 48902027 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 48902082 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 48902190 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 48902208 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48902214 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48902239 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 48902257 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 48902258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48902269 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48902314 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 48902324 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48902330 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 3 48902364 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 48902411 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 30 6 15 0 3 3 48902451 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48902483 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 48902485 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.157894736842105 32 6 16 0 3 3 48902517 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48902518 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 48902592 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 48902715 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 48902729 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 48902737 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 48902754 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 48902763 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 48902826 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 48902856 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 48902875 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 48902905 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 48902939 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 48903010 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48903023 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 48903164 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48903174 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 48903284 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 48903404 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 48903413 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48903445 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 48903497 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 48903536 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 48903617 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 48903645 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 48903666 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48903690 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 48903765 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 48903845 G T N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 3 48903859 G A N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.153846153846154 21 5 10 1 2 3 48903865 G T N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.0769230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 9 17 1 7 5 3 48903873 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 48903957 A G N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.75 0 0.25 12 4 6 0 2 3 48904157 A C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 48904187 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48904319 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 48904371 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48904385 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 48904416 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 48904499 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48904645 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48904646 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48904689 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48904789 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48904842 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48904843 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48904907 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 48904938 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48904991 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48905030 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48905077 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48905104 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48905120 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48905128 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 48905338 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 48905339 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 48905396 T A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 48905427 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48905430 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 48905453 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48905947 A G Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 48905998 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48906036 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 48906148 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48906151 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48906177 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 48906216 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 48906284 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48906350 T C N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0 0.769230769230769 0.230769230769231 10 16 0 10 3 3 48906438 T C Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 48906513 G A N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0 0.545454545454545 0.454545454545455 6 16 0 6 5 3 48906570 A G N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 3 48906610 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 12 24 0 12 6 3 48906611 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48906752 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 48906799 T G N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 3 48906870 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 48906944 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 48906987 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 48907547 A C Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 19 17 1 17 0 3 48907680 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.222222222222222 0.722222222222222 0.0555555555555556 21 15 4 13 1 3 48907692 A T Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.0526315789473684 19 19 1 17 1 3 48907802 T C Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 3 48908420 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48908426 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 3 48908656 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48909020 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48909169 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 48909170 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 48909224 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48909501 T G N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 48909549 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 48909638 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48909900 T G N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 3 48910278 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48910317 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48910471 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48910665 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48910880 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48910931 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48911201 A G Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 3 48911280 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48911443 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48911718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48911810 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48912385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48912399 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 48912432 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48912586 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48912711 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48912727 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48913003 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48913084 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48913110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48913325 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48913346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48913387 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48913394 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48913623 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48913740 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48913869 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48914226 A C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 48914319 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48914456 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 48914521 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 48914632 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48914691 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 48914835 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48915032 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 3 48915302 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 48915654 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48915777 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48915912 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48915957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48916040 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48916283 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48916619 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48916640 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 48916738 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48916837 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48917138 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48917371 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48917381 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48917428 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48917502 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48917595 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48917729 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48917800 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48917931 A C N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 3 48918178 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48918210 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48918442 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48918497 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48919307 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 48919329 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48919458 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48919768 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48920451 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48920632 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48920721 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48920794 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 48920917 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48921190 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48922309 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48922313 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48922561 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48922695 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 48923169 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48923610 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48923651 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48923652 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48923754 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48924335 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 48924531 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 48924670 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 48924899 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48925291 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 30 6 15 0 3 3 48925785 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48925863 A T N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 48925980 A T Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 48926047 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48932225 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 48932855 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48933006 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48933056 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 48933144 G T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 48933287 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 48933519 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 48933589 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 48933809 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48933861 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48934446 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48934464 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 48934516 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 48934544 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48934916 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48934962 T C Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 48935051 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48935126 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48935393 T G Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 48935523 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48935685 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48935787 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 48935909 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48935916 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48936029 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.157894736842105 32 6 16 0 3 3 48936154 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48936321 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48936334 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 48936389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48936450 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48936525 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48937029 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48937198 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.157894736842105 32 6 16 0 3 3 48937323 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48937395 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48937521 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48937785 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 48937931 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 48938037 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 24 4 12 0 2 3 48938580 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48938610 T C Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 3 48938691 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 48938770 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.8 0 0.2 24 6 12 0 3 3 48939116 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 48939175 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.157894736842105 32 6 16 0 3 3 48939272 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 48939313 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 48939370 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 48939405 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48939445 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 30 6 15 0 3 3 48939756 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 30 6 15 0 3 3 48939899 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.133333333333333 26 4 13 0 2 3 48940233 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48940292 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48940338 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 48940416 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 48940467 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 30 6 15 0 3 3 48940516 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48940814 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48940994 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 48941053 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 48941273 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 48941416 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 48941428 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 48941492 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.157894736842105 32 6 16 0 3 3 48941662 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 48941700 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 48941959 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 48942026 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 48942027 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48942114 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48942126 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48942249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48942294 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48942517 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48942548 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48942697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48942793 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48942803 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48943306 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.157894736842105 32 6 16 0 3 3 48943440 A C Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 48943483 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 48943549 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48943687 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 48943991 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48944036 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48944089 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 48944155 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48944165 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48944205 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48944318 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48944321 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48944351 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48944375 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48944397 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48944416 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48944944 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48945027 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48945405 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 48945646 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48946110 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 48946139 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48946150 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48946154 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48946190 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48946309 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 48946448 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48946535 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48946638 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48946780 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 48947092 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48947151 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48947332 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.133333333333333 26 4 13 0 2 3 48947408 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48947491 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 48947595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48947598 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48947706 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 48947781 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 48948088 A T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 48948094 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 3 48948127 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 48948248 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48948464 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 48948552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48948952 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 48948953 A C N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 3 48949127 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 48949209 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48949276 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48949631 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 48949649 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 48949728 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48949879 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 48949975 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 48950005 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48950021 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48950079 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 48950261 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48950274 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48950371 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48950385 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 48950444 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48950558 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 48950571 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 48950588 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 48950722 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48950740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48950767 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48950772 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48950824 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 48950854 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 48950953 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48951030 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48951164 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 48951385 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48951707 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 3 48951766 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 3 48951953 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48952038 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.166666666666667 0.722222222222222 0.111111111111111 19 17 3 13 2 3 48952100 A G N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 0.153846153846154 0.153846153846154 20 6 9 2 2 3 48952106 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 48952219 A T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 48952299 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 48952314 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48952506 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48952822 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 48952877 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48952890 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48953181 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48953247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48953300 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48953316 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48953334 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48953335 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 48953430 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48953516 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48953787 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 48953791 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48953840 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48953871 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.157894736842105 32 6 16 0 3 3 48953888 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48953896 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48953978 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48954136 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48954178 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48954179 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48954270 G C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 48954352 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48954362 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 48954442 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 48954699 G T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 48955241 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48955490 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48955982 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48956020 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48956066 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48956156 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48956320 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48956576 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 30 6 15 0 3 3 48956759 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48956799 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48957066 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48957225 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48957367 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48957493 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 48957523 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48957613 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48957837 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 48957894 A T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 48957917 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48957979 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48958315 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48958678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48958766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48958876 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48959422 A T N N 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.714285714285714 0.285714285714286 5 9 0 5 2 3 48959710 C G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 3 48959777 G C Y N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 48959824 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48960644 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48960710 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48960792 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 48960810 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48960908 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 48961065 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48961723 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48961853 T G N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 48962212 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48962273 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48962296 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 48962849 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48963202 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48963775 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48964007 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48964035 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 48964142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48964159 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48964464 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48964505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48964713 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48965469 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48965835 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48965913 T C Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 48966004 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48966082 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48966938 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48967220 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48967858 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 48968242 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48968324 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48969185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48969222 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48969236 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48969843 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 48971055 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48971528 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 48971662 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48971855 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 48972177 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48972207 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48972396 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48972418 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 48972459 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48972654 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48973250 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48973439 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48973884 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48973886 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48974183 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48974184 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48974310 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48974380 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 3 48974825 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48974874 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48974896 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48974995 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48975541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48975774 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48975961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48976044 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 48976165 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 48976249 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48976264 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 48976515 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 48976638 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 30 6 15 0 3 3 48976672 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48976840 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48976912 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48977088 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48977148 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48977286 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48977394 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 48977512 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 48977558 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48977576 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.157894736842105 32 6 16 0 3 3 48977592 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.157894736842105 32 6 16 0 3 3 48977629 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.157894736842105 32 6 16 0 3 3 48977818 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 30 6 15 0 3 3 48977961 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 30 6 15 0 3 3 48978006 G C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.8125 0 0.1875 26 6 13 0 3 3 48978131 T C N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.230769230769231 19 7 9 1 3 3 48978160 A T N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.214285714285714 22 6 11 0 3 3 48978205 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 3 48978226 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 48978240 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 3 48978343 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.8 0 0.2 24 6 12 0 3 3 48978356 T A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.133333333333333 26 4 13 0 2 3 48978535 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 3 48978579 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.176470588235294 28 6 14 0 3 3 48978654 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 48978890 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 48978935 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 48979057 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48979094 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 48979399 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 48979485 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48979536 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48979547 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48979661 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 48979902 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 48980170 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 48980272 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 48980627 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 48980733 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48981311 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48981679 A T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 3 48981741 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48981783 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48981818 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 48982893 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48983582 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48983751 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48983845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48984413 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 48984974 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48985039 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 48985171 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48985389 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48985618 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48985626 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48986222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48986275 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48986419 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48986666 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48987016 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 48987041 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48987330 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48987711 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48988066 C A N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 48988954 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48988998 A G Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 48989044 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48989199 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48989218 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48989350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48989477 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 48989959 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 48990083 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 48990108 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48990380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48990684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48991075 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 48991494 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 48991782 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48991849 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 48991891 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48992040 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48992084 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 48992100 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 48992348 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48992363 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48992448 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.157894736842105 32 6 16 0 3 3 48992470 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 48992494 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48992551 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48992556 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 48992573 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48992752 A T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.3125 0.625 0.0625 20 12 5 10 1 3 48992784 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48992804 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48992820 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 48992923 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 48992933 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 48992935 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 48993111 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48993289 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48993324 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 48994132 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 48994183 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48994317 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48994721 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 48994900 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48995021 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48995068 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 48995343 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48996282 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48996474 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48996479 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48996535 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48996575 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48996756 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 48996814 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 48997027 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48997048 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48997049 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48997094 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48997124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48997173 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48997249 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48997491 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48997505 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48997574 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48997581 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48997837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48997870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48998073 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48998282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48998406 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48998602 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 48998657 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48998830 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48998861 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 48998900 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48998916 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48998926 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48998951 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48998974 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48999203 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48999241 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48999267 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48999270 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48999285 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48999290 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 48999300 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48999313 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48999459 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 48999492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 48999493 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 48999533 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 48999563 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 48999625 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 48999746 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 48999885 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48999899 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 48999941 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 48999959 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 49000027 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49000040 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49000042 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49000101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49000219 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49000239 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49000385 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49000418 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49000660 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49000718 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49000809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49000856 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49000932 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49000983 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49000994 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49001079 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49001080 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49001127 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 49001139 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49001275 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49001282 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49001546 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 49001554 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49001592 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49001686 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 49002005 C A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 49002424 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49002467 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49002469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49002480 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49002563 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49002578 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49002627 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49002731 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49002936 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49002979 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49002988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49003500 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49003505 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49003702 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49003803 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 49003820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49003905 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49004011 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49004264 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 49004333 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49004413 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49004478 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 49004630 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49004678 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49005112 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49006065 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49006204 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49006229 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49006408 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49006463 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49006521 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49006595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49006605 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49006730 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49007012 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49007270 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49007645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49007855 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 49007920 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49008540 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49008593 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49008598 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49008708 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49009123 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49009180 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49009236 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49009260 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49009348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49009589 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49009697 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49009971 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49010546 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49010676 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49011037 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49011113 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 49011126 A T Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 49011473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49011481 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49012579 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 49012681 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49012693 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49012803 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49012852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49012954 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49013117 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49013165 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 49013205 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49013246 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49013406 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49013480 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49013615 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49013641 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49013738 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 49013836 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49013927 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49014041 A T N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 3 49014185 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49014875 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49015112 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49015137 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 18 14 4 10 2 3 49015468 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 49015529 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49015542 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49015545 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49015671 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49015744 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.333333333333333 0.6 0.0666666666666667 19 11 5 9 1 3 49015763 A G N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 3 49016077 A C N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 49016122 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 49016140 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 49016145 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 49016536 A C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49016953 T G Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 49017293 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49017414 C A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49017545 G C Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 49017769 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49018382 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 49018797 G C Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 49018859 A T Y N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 49018869 A C Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 3 49019016 A C Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 49019023 A G Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 49019442 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 49020264 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49020304 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49021282 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49021295 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49021409 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 49021410 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 49021423 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 49021470 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49021488 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49021647 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 49021895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49022129 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49022441 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49022562 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 49022660 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49022667 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49022746 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49022901 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49023015 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49023496 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49023583 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49023614 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49023627 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49023908 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49023958 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49024108 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 49024127 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49024251 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 49024382 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49024473 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 49024477 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 49024728 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49024782 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 49024852 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49025206 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49025235 T C N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 3 49025337 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 3 49025906 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49026053 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.157894736842105 32 6 16 0 3 3 49026181 G C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 49026392 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 3 49026516 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.133333333333333 26 4 13 0 2 3 49026634 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 3 49026699 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 49026944 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 49026990 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49027189 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.157894736842105 32 6 16 0 3 3 49027335 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.157894736842105 32 6 16 0 3 3 49027350 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49027507 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49027648 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49027830 G A N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.153846153846154 21 5 10 1 2 3 49027860 C T N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.727272727272727 0 0.272727272727273 16 6 8 0 3 3 49028043 G T N N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.363636363636364 0.363636363636364 0.272727272727273 12 10 4 4 3 3 49028288 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 49028342 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49028358 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 49028492 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 49028519 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 49028541 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49030162 A G N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 49030457 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 49030489 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 49030583 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49030663 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49030725 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 49030923 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 49030984 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 49031320 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 49031625 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 49031674 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.176470588235294 28 6 14 0 3 3 49031870 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 49031941 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 49031944 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 49031956 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 49031963 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 30 6 15 0 3 3 49031968 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 30 6 15 0 3 3 49031978 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 49031979 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 49032019 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 49032049 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 49032108 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 49032199 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 49032271 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.176470588235294 28 6 14 0 3 3 49032376 T C N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.230769230769231 20 6 10 0 3 3 49032625 A C N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.230769230769231 0.538461538461538 0.230769230769231 13 13 3 7 3 3 49032630 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 49032654 A G N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.153846153846154 21 5 10 1 2 3 49032665 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 49032666 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49032876 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.157894736842105 32 6 16 0 3 3 49033053 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 3 49033084 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 30 6 15 0 3 3 49033110 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 30 6 15 0 3 3 49033157 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.157894736842105 32 6 16 0 3 3 49033194 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 30 6 15 0 3 3 49033196 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 49033214 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 30 6 15 0 3 3 49033323 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 49033366 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 49033557 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 49033593 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 49033656 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.111111111111111 0.722222222222222 0.166666666666667 17 19 2 13 3 3 49033710 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 49033731 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 49033780 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 49033794 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49033799 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49033812 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49033864 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 49033904 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.157894736842105 32 6 16 0 3 3 49034034 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 49034213 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.157894736842105 32 6 16 0 3 3 49034278 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 49034311 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 49034392 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49034588 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 49034967 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49035052 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 49035075 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49035093 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 49035245 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49035246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49035355 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49035452 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49035510 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49035782 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 49035851 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49035861 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49035869 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49036017 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 49036295 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49036336 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 49036497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49036553 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49036672 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49036707 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49036742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49036816 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 49036876 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49036950 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49037001 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49037060 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49037234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49037618 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49037801 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 49037823 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49037835 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49037848 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49037859 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49037958 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49037965 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49037969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49037977 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49037993 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 49037999 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49038010 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49038051 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49038065 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49038151 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49038167 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49038171 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49038196 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49038254 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49038280 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49038297 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49038319 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49038371 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49038492 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49038511 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49038529 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49038535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49038730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49038768 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49038785 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49038816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49038986 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49039023 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 49039024 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 49039167 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49039263 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 49039295 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 49039302 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 49039321 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 49039326 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 49039334 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 49039363 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49039459 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 49039467 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 49039515 G C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 49039733 T C N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 7 13 1 5 4 3 49039758 T A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 49039808 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49039813 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49039841 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49039860 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49039910 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49039914 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49039997 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49040070 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 49040101 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49040115 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49040147 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49040210 T G N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 49040246 G C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 49040292 C A N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 3 49040360 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49040361 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49040409 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49040448 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49040548 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49040601 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49040658 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49040665 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49040765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49040838 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49040910 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49041153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49041154 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49041197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49041311 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49041327 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 49041330 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49041557 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49041589 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49041875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49041913 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49041974 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49042046 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49042051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49042085 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 49042100 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 49042131 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49042198 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49042297 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 49042299 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49042349 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49042361 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 49042362 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 49042428 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 49042429 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 49042592 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 3 49042684 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49042767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49042774 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49042850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49042896 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49042910 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49042994 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49043050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49043142 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49043303 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 49043335 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 49043338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49043364 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49043405 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49043423 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49043621 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49043685 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 49043783 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49043827 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49043844 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 49043884 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49043940 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49043990 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49044142 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49044215 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.157894736842105 32 6 16 0 3 3 49044263 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49044289 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49044353 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49044376 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49044424 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49044443 A T N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 3 49044479 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49044510 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49044519 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49044540 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49044651 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49044668 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49044689 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49044739 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49044741 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49044808 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49044819 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 49044853 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49044883 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49044896 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49044935 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49044988 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49045065 A T N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 3 49045091 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49045110 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49045199 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 49046199 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 49046216 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49046217 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 49046238 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 49046535 G C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 49046774 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 49046843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49046953 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 49047087 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 49047146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49047328 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49047544 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49047643 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 49047832 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49047973 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 49048030 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49048069 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49048095 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49048167 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49048422 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49048449 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49048890 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49048899 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49048996 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49049140 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 49049359 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49049409 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49049425 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 49049430 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 49049574 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49049600 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49049691 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 49049716 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 49049738 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 49049739 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49049858 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49050034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49050046 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49050066 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 49050097 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49050190 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49050214 A G Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 49050335 C A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 3 49050375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49050398 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49050400 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49050918 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 49050919 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 49050977 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49050989 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 49051006 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49051018 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49051041 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49051047 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49051076 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49051113 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49051167 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49051232 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49051310 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49051349 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 49051482 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49051489 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49051571 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 49051778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49051789 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49051835 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49051853 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49052196 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 49052279 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 49052300 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49052424 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49052493 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49052543 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 49052734 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 49052825 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49052971 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 49053020 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49053118 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49053739 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49054189 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 49054973 A G Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 49054986 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 49055128 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49055198 A C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49055234 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 49055249 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 49055660 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49055692 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49055838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49055991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49056034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49056056 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49056235 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49056240 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49056380 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49056393 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49056394 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49056528 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49056804 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49056831 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49057007 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49057122 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49057176 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49057237 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49057313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49057321 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49057371 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49057386 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49057484 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49057492 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49057603 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49057612 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49057668 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49057764 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49057844 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49057907 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49057922 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49057941 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49058054 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49058765 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49058859 G T Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 49062474 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49063620 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49063723 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49063918 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 49064161 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49064482 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49064551 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49064614 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 49064662 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 49064963 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 49065119 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49065131 T G N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 49065198 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 49065274 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 3 49065436 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49065481 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49065512 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49065607 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 49065615 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49065638 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49065748 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49065814 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49065904 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49065929 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49066009 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49066289 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49066321 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49066863 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49066958 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49067132 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 49067135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49067705 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49068096 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49068113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49068190 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49068361 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49068367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49068385 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49068495 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49068645 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49068849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49068853 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49068968 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49069359 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49069463 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49069668 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49069698 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 49069711 C A N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 10 20 0 10 5 3 49069985 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49070116 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49070210 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49070252 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49070328 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49070365 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49070369 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49070492 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49077033 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49077080 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49077147 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 49077203 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49077349 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49077485 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49077492 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49077600 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49077675 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49077941 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49077965 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49077969 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49078171 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49078474 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49078558 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49078750 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49078906 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 49079173 A G N Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 11 9 2 7 1 3 49079382 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 49079440 C G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 49079761 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49079819 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49079820 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49079988 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49080026 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 49080411 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49080468 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49080642 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49080725 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49080738 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49080795 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49080881 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49081068 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 49081314 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49081319 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49081393 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49081602 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 49081704 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49081838 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49081875 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 49081883 A G N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 3 49082030 T A N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 3 49082059 C T N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 3 49082114 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 3 49082125 T A N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.333333333333333 0.6 0.0666666666666667 19 11 5 9 1 3 49082298 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49082362 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49082387 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49082404 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49082425 T C N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 3 49082453 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49082457 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49082475 C A N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 3 49082493 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49082773 C A N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 3 49082816 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49082830 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49082847 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 49082854 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 49082878 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49082918 G T N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 49082940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49082958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49082972 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49083017 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49083168 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 49083216 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49083321 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49083333 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49083428 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49083464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49083579 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49083779 C G N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 3 49083837 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49084051 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 49084368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49084377 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49084510 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49084728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49084799 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49085080 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 49085261 A C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 49085395 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49085527 T A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 49086077 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49086340 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 49086602 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49086655 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 49086830 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 49087067 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 49087083 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 49087136 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.153846153846154 0 0.846153846153846 4 22 2 0 11 3 49087230 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 49087239 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 6 30 3 0 15 3 49087323 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49087327 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 49087548 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49087577 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49087724 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49087743 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 3 49088072 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 3 49088113 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 49088232 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.157894736842105 0 0.842105263157895 6 32 3 0 16 3 49088316 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 49088555 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 49088791 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.157894736842105 0 0.842105263157895 6 32 3 0 16 3 49088876 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 49088936 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49089128 T A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.1875 0 0.8125 6 26 3 0 13 3 49089139 T G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.1875 0 0.8125 6 26 3 0 13 3 49089484 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 49089971 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49090126 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.176470588235294 0.0588235294117647 0.764705882352941 7 27 3 1 13 3 49090425 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49090542 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49090914 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49090934 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49091338 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 49091635 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 49091770 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49091872 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 49091880 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 49091908 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 49091954 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.133333333333333 0 0.866666666666667 4 26 2 0 13 3 49091998 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 49092077 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 49092087 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 49092128 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 49092173 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 49092179 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 49092212 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49092213 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49092297 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 49092323 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49092357 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49092401 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 49092410 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49092456 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 49092577 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 49092671 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49092691 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49092713 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49093046 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49093146 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 49093155 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 49093336 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49093479 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49093595 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 49093873 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 49093875 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 49093897 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 49093947 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 49094058 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 49094230 A C N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.153846153846154 0.0769230769230769 0.769230769230769 5 21 2 1 10 3 49094370 G T N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 49094429 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 49094552 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 49094569 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 49094570 G A N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 49094649 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 49094700 C A N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 3 49094702 T A N N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 3 49094737 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 49094815 C T N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 3 49094929 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49094937 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49094946 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49095004 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 49095044 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 49095153 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49095173 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 49095191 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 49095310 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 49095353 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 49095429 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 49095467 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 49095493 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 49095522 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 49100223 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 49100245 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49100248 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 49100316 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49100367 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49100592 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49100675 T C N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 3 49100687 T G N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 3 49100764 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 49100769 A C N N 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 5 9 2 1 4 3 49100821 A C N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.153846153846154 0.0769230769230769 0.769230769230769 5 21 2 1 10 3 49100830 A G N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.142857142857143 0.642857142857143 0.214285714285714 13 15 2 9 3 3 49100918 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 49100955 C A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 49101023 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 49101046 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 49101291 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49101304 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49101324 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49101354 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49101368 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49101370 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49101420 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49101446 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49101501 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49101509 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49101526 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49101546 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49101574 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49101578 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49101621 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49101679 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49101705 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49101711 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49101722 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49101853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49101878 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49101882 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49101911 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49101922 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49102007 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49102017 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49102045 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49102059 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49102205 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49102234 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49102250 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49102328 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49102394 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49102397 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49102418 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 49102440 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49102460 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49102507 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49102548 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49102580 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 49102633 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 49102794 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 5 9 2 1 4 3 49106039 A G Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 49106063 C T Y Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 3 49106111 T G Y N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 5 5 2 1 2 3 49106137 A T Y N 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 6 8 2 2 3 3 49106243 T G Y N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 3 49106359 C T Y Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 3 49106365 C G Y N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.166666666666667 0.0833333333333333 0.75 5 19 2 1 9 3 49106412 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 49106423 G C Y N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 3 49106456 T C N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.166666666666667 0.0833333333333333 0.75 5 19 2 1 9 3 49106478 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 5 9 2 1 4 3 49106485 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 7 11 2 3 4 3 49106515 A C Y N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 3 49106550 A T Y N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 6 12 3 0 6 3 49106559 A G Y Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.285714285714286 0 0.714285714285714 4 10 2 0 5 3 49106749 A T Y N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 3 49106878 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49106896 T G Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 49106901 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49106926 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 49106987 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49107004 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49107008 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49107050 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49107057 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49107061 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49107183 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49107194 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49107219 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49107261 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49107265 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49107341 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49107388 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 49107389 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 49107399 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49107408 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49107411 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49107495 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49107579 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49107591 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49107595 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49107817 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 49107836 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 49107909 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49108032 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49108282 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49109071 C A Y N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 3 49109274 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49109368 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 49109384 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 49109415 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49109462 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 49109544 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49109547 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49109569 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49109677 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49109679 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49109688 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49109761 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 49109786 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 49109812 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49109827 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 49109866 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49109919 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 49109932 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49109981 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 49110065 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 49110186 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 49110197 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 49110274 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 49110338 C A N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 3 49110375 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 49110552 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 3 49110555 A T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.105263157894737 0.894736842105263 0 21 17 2 17 0 3 49110662 C A N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 3 49110677 C A N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 3 49110679 G T N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 3 49110691 A G N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 3 49110704 A T N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 3 49110820 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.416666666666667 0.5 0.0833333333333333 16 8 5 6 1 3 49110879 C T N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 3 49110923 A T N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 49110930 G T N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 49110955 T C Y Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 49111581 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49111649 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49111947 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49111957 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49112086 C G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 49112087 A C Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 49112107 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49112133 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 49112134 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49112200 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 49112342 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49112432 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49112501 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49112578 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49112682 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49112721 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 49113003 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 49113068 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 3 49113090 T G N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 3 49113266 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 49113311 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 49113541 G C N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 49113571 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 49113607 C T N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 49113659 G A N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 49113776 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 49113778 A C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 49113790 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 49113791 G T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 49113817 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 49113847 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 49113896 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 49113930 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 49113961 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 49113981 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49113990 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 49113995 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 49114023 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 49114238 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49114323 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49114329 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 49114465 G A N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 3 49114621 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 3 49114717 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 49114724 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 49114858 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 49114921 T A Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 49114994 A T Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 49117045 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 49117076 A T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 3 49117094 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.333333333333333 0.6 0.0666666666666667 19 11 5 9 1 3 49117201 C A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 49117333 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 49117349 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 49117386 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49117423 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49117437 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49117484 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49117549 A T Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 49117560 C T Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 49117561 A G Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 49117648 C G N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.125 0.75 0.125 16 16 2 12 2 3 49117713 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 49117737 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 49117768 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 49117795 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 49117873 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49117894 A C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 3 49118654 A T N N 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 3 49118692 T G N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 49118693 T A N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 49118845 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 49118859 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 49119017 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49119048 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 49119668 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 49119829 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49119872 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49120168 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49120372 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49120540 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 49120689 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49120707 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 49120733 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49120842 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49120865 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 49120903 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 49120916 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 49120939 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 49120960 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 49121054 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 49121133 G C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 49121219 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 3 49121246 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 49121270 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 49121376 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 49121382 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 49121390 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 49121444 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49121460 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 49121535 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49121845 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 49121874 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 49121889 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 49121892 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 49121909 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 49122002 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49122046 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49122260 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 49122329 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49122356 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49122873 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 49123071 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49123074 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49123138 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49123268 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49123960 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 49124146 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 49124545 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49124769 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49124956 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49125115 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49125587 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 49125827 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49126347 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49126469 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49126806 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49126850 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49127539 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 49127621 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49127645 T A Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 3 49127664 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 49127668 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49127765 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49127953 C G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 49127997 C G N N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 12 12 2 8 2 3 49128056 T A N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.181818181818182 0 0.818181818181818 4 18 2 0 9 3 49128166 A T N N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 12 12 3 6 3 3 49128220 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 3 49128548 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 49128701 G A N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.2 0.666666666666667 0.133333333333333 16 14 3 10 2 3 49128714 T A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 49128766 C A N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 3 49129283 C T N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 49129401 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49129460 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 49129636 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49129757 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49129819 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49129821 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49131804 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 49131833 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 49131837 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 49131891 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 3 49131997 G A N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 3 49132277 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49132306 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49132377 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49132383 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49132615 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49132674 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49132828 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 3 49132860 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49132902 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 49132917 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49132934 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 49132935 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 49132953 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49133048 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 49133185 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49133206 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 49133282 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49133367 C G N N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.230769230769231 0.615384615384615 0.153846153846154 14 12 3 8 2 3 49134216 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 49134249 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49134268 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49134278 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49134316 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49134388 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49134404 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49134469 T C N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.25 0 0.75 4 12 2 0 6 3 49134664 G C N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.307692307692308 0.538461538461538 0.153846153846154 15 11 4 7 2 3 49134703 G A N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 3 49134775 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 49134873 T A N N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.166666666666667 0.583333333333333 0.25 11 13 2 7 3 3 49134931 C A N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 3 49135019 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.153846153846154 0 0.846153846153846 4 22 2 0 11 3 49135111 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49135221 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49135226 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49135298 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 49135343 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 49135380 A T N N 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.1 0.7 0.2 9 11 1 7 2 3 49135403 A T N N 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.0909090909090909 11 11 1 9 1 3 49135506 C T N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 3 49136148 C T N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 3 49136427 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 3 49137039 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 49137466 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49137556 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49137929 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49138273 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49139447 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49139466 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 49139533 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49139656 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49139870 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 49140096 T C Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 49140154 G T Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 49140247 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 49140617 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 49140695 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 49140718 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49140814 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 49140840 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49140911 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49140945 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49140982 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49141131 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49141139 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49141184 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49141378 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 3 49141658 A G N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.2 0 0.8 4 16 2 0 8 3 49141803 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49141915 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49141934 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49142554 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49142685 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 49142742 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49143480 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49143496 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49143686 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 49143724 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49143949 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49143992 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 49144008 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 49144015 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 49144024 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 49144172 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49144288 A G Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 49145070 T A Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 49145433 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 49145435 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49145458 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 49145658 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 49145731 C T N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 3 49145742 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 3 49145760 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 3 49146235 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 3 49146566 G A N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.285714285714286 0.642857142857143 0.0714285714285714 17 11 4 9 1 3 49146579 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 49146642 G T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 49146905 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49146948 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 49147030 C G Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 49147041 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 49147110 T C Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 49147125 C T Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 49147157 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 49147298 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49147354 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49147447 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49147515 T G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 49147580 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 3 49147713 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 49147782 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 49147812 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 49147852 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 49147863 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 49147999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49148118 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49148150 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49148443 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49149062 G C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 49149175 A C N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.181818181818182 0 0.818181818181818 4 18 2 0 9 3 49149198 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 3 49149376 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 49149411 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 49149570 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49150155 T G Y N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.416666666666667 0.583333333333333 0 17 7 5 7 0 3 49150383 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 49150484 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 49150854 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 3 49150989 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.157894736842105 0 0.842105263157895 6 32 3 0 16 3 49151332 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 49151993 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 49152021 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 49152335 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49152382 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 49152849 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 49152950 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 49152951 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 49153002 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 49153262 C A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 49153288 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49153348 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49153863 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 49153903 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 49154390 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 49154976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49155095 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 49155450 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 49156046 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49156092 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 49156423 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 49156610 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49156721 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 49156724 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 49156895 A T Y N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 49156991 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.157894736842105 0.736842105263158 0.105263157894737 20 18 3 14 2 3 49157081 G C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 3 49157356 G T Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 3 49157460 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.176470588235294 0.705882352941177 0.117647058823529 18 16 3 12 2 3 49157589 A C Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 3 49157783 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.3 0.7 0 26 14 6 14 0 3 49157797 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 3 49157899 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 49158362 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 49158422 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49158493 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 49158668 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 49158695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49158705 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 49158748 A G Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 49158837 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 3 49159363 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 49159501 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 3 49159627 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 3 49159683 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 3 49159730 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 3 49159852 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 49159874 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 49159931 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 3 49160118 C A Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 49160127 G T Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 3 49160222 G A Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.176470588235294 0.705882352941177 0.117647058823529 18 16 3 12 2 3 49160287 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 49160305 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 3 49160320 C A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 3 49160324 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 3 49160407 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 49160421 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 3 49160442 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 3 49160460 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 49160540 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 3 49160590 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.111111111111111 0.777777777777778 0.111111111111111 18 18 2 14 2 3 49160597 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 3 49160642 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.125 0.8125 0.0625 17 15 2 13 1 3 49160677 G A Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 49160818 T G Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 3 49161613 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 3 49161675 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 3 49162494 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 49162781 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 3 49163247 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 49163253 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.0555555555555556 0.833333333333333 0.111111111111111 17 19 1 15 2 3 49163373 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.3 0.7 0 26 14 6 14 0 3 49163416 T G Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 49163430 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 3 49163435 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 49163499 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 3 49163519 C A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 3 49163662 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 49163675 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.15 0.75 0.1 21 19 3 15 2 3 49163696 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 49163753 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 3 49163819 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 49163929 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 49164207 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 3 49164390 C A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 3 49164715 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 49164749 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 16 8 4 8 0 3 49165149 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 49165234 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 49165262 T G N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 3 49165284 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 49165305 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 49165391 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 3 49165421 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 3 49165565 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 3 49165753 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 3 49166254 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 3 49166595 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0 0.684210526315789 0.315789473684211 13 25 0 13 6 3 49166664 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49166813 T C N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 3 49166846 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.133333333333333 0 0.866666666666667 4 26 2 0 13 3 49167804 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 49167858 G A Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 49168152 C A Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.0526315789473684 0.736842105263158 0.210526315789474 16 22 1 14 4 3 49168181 A C Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0555555555555556 0.722222222222222 0.222222222222222 15 21 1 13 4 3 49168342 A T N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 49168367 A G Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 3 49168432 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 49168497 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 6 30 3 0 15 3 49168589 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 49168716 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 49168723 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 49168789 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49168851 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49168934 A T Y N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0 0.764705882352941 0.235294117647059 13 21 0 13 4 3 49168966 T C Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 3 49169034 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 49169136 T G Y N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.0588235294117647 0.705882352941177 0.235294117647059 14 20 1 12 4 3 49169190 T A Y N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 49169322 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 49169337 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 49169468 A G Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 49169589 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 49169624 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 49169678 T C Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 49169878 A C Y N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.125 0.75 0.125 16 16 2 12 2 3 49170045 T C N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 3 49170191 A T Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 49170255 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49170286 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 49170391 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 49171943 A C N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 3 49172001 A T N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 49172050 G A Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 49172189 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49172312 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 3 49172746 T G Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 49172947 T C Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 49173155 A G Y Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 3 49173167 G A Y Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.166666666666667 0.0833333333333333 0.75 5 19 2 1 9 3 49173394 A G Y Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 6 10 2 2 4 3 49173949 C T Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 49173969 G T N N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 3 49174020 C T N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 6 14 2 2 6 3 49174203 C T Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.153846153846154 21 5 10 1 2 3 49174428 A C Y N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 3 49174691 A G Y Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 3 49174728 T C Y Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 3 49175569 T A Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 49175810 T G Y N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 5 15 2 1 7 3 49175844 C G Y N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 49176028 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 49176130 T G N N 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 4 8 2 0 4 3 49176282 G C Y N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 5 11 2 1 5 3 49176630 T G Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 49176730 A T Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 49176872 A G Y Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 3 49177069 C A Y N 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 7 11 2 3 4 3 49177351 C G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 49177456 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 49177654 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49178291 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49178547 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 49178727 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49178751 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49179077 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 49179148 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49179172 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 49179261 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49179305 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49179348 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49179407 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 49179444 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 49179451 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 49179456 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 49179517 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 49179595 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 49179667 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49179694 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49179737 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49179744 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49179802 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 49179830 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 49179887 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 49179996 C A Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49180203 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49180217 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 49180277 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 49180369 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 49180380 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 49180411 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 49180458 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 49180579 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49180762 A C N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 3 49180822 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49180869 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49180983 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49181024 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49181092 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49181099 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49181142 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 49186803 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 49186880 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 49186917 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49186971 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49187073 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 49187086 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49187234 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 49187261 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 49187268 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 49187273 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 49187296 A C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 3 49187305 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 49187457 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 49187506 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 49187513 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 49187602 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49187623 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 49187688 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49187711 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49187885 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49187903 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49187913 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49187974 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 49187976 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 3 49188000 A T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 49188017 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 49188018 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 49188163 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 49188169 A G Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 49188184 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49188270 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49188310 C A Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49188317 A T Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49188323 C G Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 49188365 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 49188409 A G Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 49188485 C T Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 49188524 A G Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 49188532 A T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 49188563 G A Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 3 49188576 A G Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 3 49188601 A G Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 49188656 C T Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 49188886 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49188949 C A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 49189123 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49189169 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49189173 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49189180 A T Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 49189237 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 49189409 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49189441 T C Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 49189596 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 49189619 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 49189689 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 49189698 T G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 49189807 A G Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 49189829 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 49189981 T A N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.307692307692308 0.538461538461538 0.153846153846154 15 11 4 7 2 3 49190008 T G N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 3 49190014 A G N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 49190055 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 49190145 A T N N 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 3 49190158 G A Y Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.272727272727273 0.545454545454545 0.181818181818182 12 10 3 6 2 3 49190194 T A N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 3 49190231 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 3 49190259 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 49190345 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49190366 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 49190394 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 49190444 A C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 49190499 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 49190535 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49190583 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49190613 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49190720 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49190792 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49190826 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49190906 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49190928 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 49190977 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 49191023 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 49191068 C G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 49191151 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49191184 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 49191202 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 49191222 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 49191225 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 49191251 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49191281 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49191302 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 49191358 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 49191403 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 3 49191416 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 49191444 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 49191465 A C Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 49191511 G C N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 49191604 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 49191631 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 49191652 G T Y N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 3 49191676 G A Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 49191746 T G N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.181818181818182 0.0909090909090909 0.727272727272727 5 17 2 1 8 3 49191890 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 3 49192190 C G Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 49192209 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49192242 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49192376 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49192423 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49192480 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 49192481 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 49192498 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49192624 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49192629 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 49192722 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49192748 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49193175 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49193221 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 49193242 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 49193260 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49193328 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49193338 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49193355 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 49193475 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 49193523 A C Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 49193579 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49193652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49193684 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.157894736842105 0 0.842105263157895 6 32 3 0 16 3 49193698 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.157894736842105 0 0.842105263157895 6 32 3 0 16 3 49193717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49193786 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.157894736842105 0 0.842105263157895 6 32 3 0 16 3 49193862 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49194075 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.157894736842105 0 0.842105263157895 6 32 3 0 16 3 49194141 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49194149 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49194214 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.2 0 0.8 6 24 3 0 12 3 49194267 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 49194349 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49194383 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 6 30 3 0 15 3 49194407 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49194490 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 49194748 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49194787 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.157894736842105 0 0.842105263157895 6 32 3 0 16 3 49194844 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.157894736842105 0 0.842105263157895 6 32 3 0 16 3 49194896 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 6 30 3 0 15 3 49194916 G C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 49195049 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 49195066 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49195132 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 6 30 3 0 15 3 49195154 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 6 30 3 0 15 3 49195207 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 49195280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49195388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49195470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49195475 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 49195499 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.157894736842105 0 0.842105263157895 6 32 3 0 16 3 49195516 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 49195577 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.157894736842105 0 0.842105263157895 6 32 3 0 16 3 49195648 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 49195829 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.176470588235294 0 0.823529411764706 6 28 3 0 14 3 49195963 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 49195989 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.176470588235294 0 0.823529411764706 6 28 3 0 14 3 49196160 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 49196225 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.157894736842105 32 6 16 0 3 3 49196450 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49196459 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49196476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49196490 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49196501 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49196597 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 6 30 3 0 15 3 49196704 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49196866 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 49196948 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49196958 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 49197080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49197200 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49197232 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 49197241 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 49197388 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 49197413 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 49197439 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49197587 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49197594 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49197626 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 49197647 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49197727 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.157894736842105 0 0.842105263157895 6 32 3 0 16 3 49197804 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49197849 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.157894736842105 0 0.842105263157895 6 32 3 0 16 3 49197864 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 49197983 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49198009 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 49198055 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49198084 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 49198097 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 49198099 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 49198127 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49198144 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 49198300 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 49198377 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 3 49198455 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 49198501 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 49198513 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49198559 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 6 30 3 0 15 3 49198609 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49198752 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 49198784 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 49198870 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 49198883 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 49198892 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 49198915 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 49198981 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 49199073 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49199074 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 49199103 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49199215 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49199235 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49199243 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.157894736842105 0 0.842105263157895 6 32 3 0 16 3 49199271 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 49199284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49199352 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49199394 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49199458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49199488 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49199558 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 49199778 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 49199781 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 6 30 3 0 15 3 49199797 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 6 30 3 0 15 3 49199820 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 49199871 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49199938 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 49200003 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.1875 0 0.8125 6 26 3 0 13 3 49200076 T C N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.25 0.0833333333333333 0.666666666666667 7 17 3 1 8 3 49200090 A T N N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.25 0.583333333333333 0.166666666666667 13 11 3 7 2 3 49200097 G A N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 49200365 C A N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 3 49200407 C G N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 3 49200591 C T N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 3 49200608 A C N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.2 0 0.8 6 24 3 0 12 3 49200627 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.1875 0 0.8125 6 26 3 0 13 3 49200638 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 49200687 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 49200773 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49200781 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49200856 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49200861 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 49200899 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 49200960 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 49200969 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49200975 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49201013 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49201047 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 49201097 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 49201110 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 49201132 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49201220 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.157894736842105 0 0.842105263157895 6 32 3 0 16 3 49201244 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49201264 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 49201293 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 49201322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49201347 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49201367 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.176470588235294 0 0.823529411764706 6 28 3 0 14 3 49201412 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49201416 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49201456 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49201596 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 49201608 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 49201742 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49201773 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49201804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49201856 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49201882 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49201965 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49201981 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 49202015 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49202122 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 49202136 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49202283 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 49202287 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 49202379 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 49202425 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 49202430 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49202460 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 49202479 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 49202484 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 49202509 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 49202588 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49202685 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49202691 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 49202747 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 49202769 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49202841 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 6 30 3 0 15 3 49203002 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49203007 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.157894736842105 0 0.842105263157895 6 32 3 0 16 3 49203044 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 49203158 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 49203188 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 49203194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49203232 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 49203310 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 49203324 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 49203543 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 49203562 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.157894736842105 0 0.842105263157895 6 32 3 0 16 3 49203590 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49203737 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 49203767 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 49203828 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.157894736842105 0 0.842105263157895 6 32 3 0 16 3 49203905 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 49204076 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49204198 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49204221 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49204329 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49204333 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 49204581 G T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 49204599 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49204713 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.157894736842105 0 0.842105263157895 6 32 3 0 16 3 49204877 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49205089 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 3 49205269 G T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.176470588235294 0 0.823529411764706 6 28 3 0 14 3 49205307 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49205346 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 49205394 T A N N 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 13 7 4 5 1 3 49205427 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 14 10 4 6 2 3 49205544 T A Y N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 3 49205722 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 7 5 3 1 2 3 49205808 G T Y N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.454545454545455 0.454545454545455 0.0909090909090909 15 7 5 5 1 3 49206072 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 49206106 A C Y N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.3 0 0.7 6 14 3 0 7 3 49206117 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 9 5 3 3 1 3 49206153 T C Y Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.6 0 0.4 6 4 3 0 2 3 49206196 T A N N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.6 0 0.4 6 4 3 0 2 3 49206206 T A N N 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.75 0 0.25 6 2 3 0 1 3 49206242 C T Y Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 49206267 T C Y Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.6 0 0.4 6 4 3 0 2 3 49206281 G A Y Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 6 6 2 2 2 3 49206910 A G Y Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.4 0 0.6 4 6 2 0 3 3 49206974 C T Y Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 3 49207122 G C N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 49207160 C A N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 3 49207194 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 49207377 A T N N 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 7 9 2 3 3 3 49207488 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 49207995 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.157894736842105 0 0.842105263157895 6 32 3 0 16 3 49208006 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.157894736842105 0 0.842105263157895 6 32 3 0 16 3 49208028 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 49208120 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 49208168 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49208183 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49208247 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49208262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49208316 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49208338 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49208389 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 49208700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49208709 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49208712 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 49208761 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49208762 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49208772 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49208806 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49208850 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 49208887 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49208907 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49208947 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 49209580 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 49209588 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 49209635 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49209875 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49210079 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49210139 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49210165 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 49210576 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 49211706 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49211849 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49212142 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49212293 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49212363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49212826 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49212895 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49213522 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 49213599 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49215544 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49215828 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 49216158 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 49216489 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49216825 C G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49216946 C T Y Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 12 16 2 8 4 3 49217286 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 49217370 T A Y N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 3 49217870 C G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49217926 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49217980 A T Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 49218009 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 3 49218119 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49218343 C G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 49218695 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49218700 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 49218715 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 49218870 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49218914 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 49219100 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49219101 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49219311 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49219728 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49219741 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49219832 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49219845 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49219981 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49219985 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49220038 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49220206 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49220434 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49220524 A T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 49220573 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49220828 T C Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 49221410 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49221443 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49221531 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49222056 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49222573 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49222690 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49222700 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49223075 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49223211 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49223847 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49224353 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 49224730 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49224762 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49225092 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 49225145 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49225235 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49225391 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 49225599 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 49225649 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49225692 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 49225872 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 49226190 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49226400 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49226469 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49226487 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49226531 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49226723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49226851 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49226877 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49226994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49227939 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49227990 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49228133 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 49228209 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49228298 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49228354 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49228609 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49228735 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 49229361 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49230152 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49230303 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49230619 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49230737 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49230910 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49231012 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49231173 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49232021 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 49232262 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49232307 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49232329 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49232365 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 49232710 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49233357 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49233455 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 49233541 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49233755 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49233774 T G N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.3125 0.625 0.0625 20 12 5 10 1 3 49234506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49234583 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49234737 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 49234867 T C Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 49235489 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49235985 G A N Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 49236925 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 49238131 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49238654 A G Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 49238712 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49238781 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49238894 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49239047 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 49239252 A G Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 49239313 C A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 49239486 C T N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 3 49239498 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 49239566 C T N Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.75 0 0.25 6 2 3 0 1 3 49239583 A C N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 49239628 C T Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 49240812 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 12 6 3 6 0 3 49241436 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 49241532 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 49242140 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 49242735 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 49243052 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 3 49243063 T A Y N 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 3 49243078 T G Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 3 49243107 A T Y N 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 3 49243118 C T Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 3 49243647 G C Y N 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 8 6 1 6 0 3 49243651 T C Y Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 3 49243768 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 11 7 2 7 0 3 49243773 A G Y Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.25 0.75 0 10 6 2 6 0 3 49244049 G A Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 3 49244117 C A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 49244204 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 49244579 C G Y N 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 3 49244697 A T N N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 3 49244708 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 3 49244769 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 49245858 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 49245929 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 49246048 G T N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 3 49246086 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 49246182 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 49246386 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 49246402 C T N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 3 49246421 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 49246612 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 49246625 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 49246680 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 49246718 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 49246743 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 49246754 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 49246769 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 49246881 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 49246905 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 49246908 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 49247009 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 49247068 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 49247102 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 49247115 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 49247132 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 49247140 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 49247147 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 49247174 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 49247198 C A N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 3 49247202 A T N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 49247242 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 49247288 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 49253795 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 49253812 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 49253889 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49254239 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49254278 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49254379 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49254483 T G Y N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.25 0.6875 0.0625 19 13 4 11 1 3 49254503 T A N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 3 49254752 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49254799 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49254819 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 49254835 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49254843 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49254955 C T Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 49255211 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49255227 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49255234 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49255239 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49255287 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49255514 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 49255527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49255562 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49255571 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49255593 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49255608 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49255658 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 49255819 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 49255821 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 49255898 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49256044 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 49256069 T A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 3 49256103 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 49256173 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 49256174 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 49256207 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 49256212 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 49256232 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 49256271 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.117647058823529 0.764705882352941 0.117647058823529 17 17 2 13 2 3 49256316 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49256381 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49256391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49256401 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 49256439 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 49256455 G T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 3 49256456 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 3 49256559 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49256642 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 49256795 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 49256939 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 49257035 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 49257048 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 49257067 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 49257180 A C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 3 49257308 G C N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 49257386 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 49257427 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 49257452 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 49257469 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 49257538 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 49257550 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 49257609 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49257713 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 49257730 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49257759 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49257767 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49257772 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49257795 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49257797 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49257813 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49257818 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49257868 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49257900 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 49257939 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49258034 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49258061 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 49258119 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49258142 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49258146 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49258204 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49258293 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49259081 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 3 49259088 T A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 49259098 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 49259163 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 49259342 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 3 49259430 G A N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 3 49259672 G C N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 3 49259755 C A N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 3 49259774 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.5 0.416666666666667 8 16 1 6 5 3 49259802 A T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 49259842 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 49259857 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 49259870 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 49259902 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 49259929 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 49259945 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 49260025 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 3 49260050 C G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 49260054 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 49260087 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 49260116 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49260136 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49260207 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49260219 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49260224 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49260278 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49260329 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 49260410 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 49260562 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 3 49260567 C T N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.0714285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 11 17 1 9 4 3 49260699 G T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 49260710 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 49260739 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 49260760 T C N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.181818181818182 0.818181818181818 0 13 9 2 9 0 3 49260876 T A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 49261194 C G N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 3 49261355 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 49261418 G T N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 3 49261461 A G N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 3 49261494 T G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 49261519 G A N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 3 49261553 T A N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.5 0.416666666666667 8 16 1 6 5 3 49261675 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49261740 A T N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 3 49261838 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 49261899 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 49261917 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 49261925 C A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 49261956 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49261961 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49262071 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 49262078 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 49262091 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49262192 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 49268683 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49268725 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 49268810 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 49268849 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49268918 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49269042 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 49269070 T G N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 3 49269182 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 49269196 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 49269205 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 49269253 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49269257 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49269281 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49269302 T A N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 49269305 A G N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 3 49269385 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49269492 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49269523 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49269564 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 49269578 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 49270044 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49270086 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49270117 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 49270125 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 49270158 A T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 49270231 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49270285 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 49270293 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49270323 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 49270354 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49270437 G C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 49270470 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49270516 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 49270579 T A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 49270621 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 49270655 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 49270663 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49270744 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 49270803 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 49270807 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49270834 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49270847 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 49270963 G T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 49271142 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49271320 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49271325 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 49271332 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49271339 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 3 49271348 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 49271398 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 49271545 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49271592 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49271599 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49271620 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49271712 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49271828 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49271833 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 49271875 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 49271947 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 49272158 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 49272162 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49272229 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 49272254 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49272321 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49272351 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49272391 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 49272396 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49272428 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49272444 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49272476 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49272512 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49272541 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49272668 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49272672 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49272720 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 49272760 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49272781 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49272796 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49272836 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49272844 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 49272913 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 49273006 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 49273028 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 49273040 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49273057 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49273119 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49273121 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49273142 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49273235 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 49273268 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49273315 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 49273377 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 49273402 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 49273424 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 49273448 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 49273501 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49273514 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 49273553 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49273566 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 49273672 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49273686 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 49273772 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49273773 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49273785 A T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 49273810 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49273853 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 49273854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49273927 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 49273997 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 49274009 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 49274017 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 49274084 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49274087 A T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 49274117 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 49274205 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 3 49274252 A T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 49274256 A C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 49274475 T C Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 49274592 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49274665 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49274816 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 3 49274890 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 49275001 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 49275036 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49275072 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49275078 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49275138 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49275142 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49275228 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49275258 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49275323 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49275403 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49275438 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49275459 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49275578 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49275594 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49275601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49275609 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49275617 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49275723 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 49275780 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49275811 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49275829 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49275874 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 49275953 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49275966 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49275990 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49276022 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49276028 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49276063 A C N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.0666666666666667 0.666666666666667 0.266666666666667 12 18 1 10 4 3 49276064 A C Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.3125 0.625 0.0625 20 12 5 10 1 3 49276228 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49276376 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49276402 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49276408 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 49276431 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 49276669 G C N N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 3 49276733 T C N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 12 16 2 8 4 3 49276758 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49276829 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 49276833 G C N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 49276858 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 49276881 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 49276893 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 49276925 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 49276930 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 49276964 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 49277217 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 49277290 A T N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 3 49277316 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 3 49277343 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 49277379 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 49277418 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49277429 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 49277520 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 49277561 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49277583 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 49277717 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 49277738 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 49277746 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 49277752 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49277807 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 49277870 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49278220 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 49278291 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49278334 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 49278355 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49278403 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 49278417 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49278421 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 49278437 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 49278440 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49286872 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 49286887 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49286922 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 49287007 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 49287027 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49287043 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49287056 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49287131 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49287137 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49287181 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49287234 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49287315 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49287337 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49287430 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 49287437 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 49287514 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49287555 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49287558 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49287609 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 49287637 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 49287648 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49287687 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 49287823 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 49287833 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 49288049 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49288113 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49288175 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 49288194 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 49288264 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 49288296 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49288493 A T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 49288502 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49288557 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49288578 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49288639 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49288680 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49288704 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 49288751 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 49288756 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 49288802 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49288879 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 49288908 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 49289007 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49289022 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49289111 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49289244 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49289436 T A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 3 49289599 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 49289839 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49289977 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 49290056 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49290136 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 49290194 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49290307 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 49290321 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 49290325 C G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 49290355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49290456 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 49290544 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 49290660 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 49290680 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49290722 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 49290859 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 49290931 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 3 49291028 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 49291039 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49291181 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 49291294 G T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.8125 0 0.1875 26 6 13 0 3 3 49291349 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 3 49291404 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49291407 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49291462 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 49291510 C G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 49291698 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.8125 0 0.1875 26 6 13 0 3 3 49291860 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 49292374 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49292612 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 49292685 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 49292704 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49292779 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49292798 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49292862 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 49293112 A G N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 49293135 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49293172 T G Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 49293200 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49293634 A C Y N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 3 49293636 A C N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 3 49293843 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49294205 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 30 6 15 0 3 3 49294231 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49294241 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49294454 A T N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 3 49294631 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49294743 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49295205 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 49295278 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49295287 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49295501 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49295566 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49295833 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 49295876 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49295892 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49296036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49296044 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49296060 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49296076 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49296172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49296260 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 49296308 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 49296387 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 49296506 T A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 3 49296522 A C N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 3 49296564 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 49296688 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 49296735 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49296756 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49296807 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49296820 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49296939 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49296960 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49296972 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49297023 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49297080 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 49297171 C G N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 3 49297187 G T N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.307692307692308 0.538461538461538 0.153846153846154 15 11 4 7 2 3 49297229 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 49297239 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49297283 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 3 49297311 A T N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 49297422 C A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 49297438 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 49297692 G C N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 3 49297820 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 49297851 T G N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 49297866 C G N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 3 49297959 G C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 49297969 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 3 49298051 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 49298155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49298158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49298176 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 49298266 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 49298380 G A N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.384615384615385 0.538461538461538 0.0769230769230769 17 9 5 7 1 3 49298566 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 3 49298567 C G N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 3 49298609 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 49298620 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 3 49298621 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 49298647 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 49298917 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49298931 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 49299020 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 49299058 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49299110 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49299116 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 49299122 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 49299429 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49299433 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 49299493 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 49299556 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 49299600 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49299610 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49299624 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49299629 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49299675 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49299680 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49299698 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49299730 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49299732 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 49299794 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49299814 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49299820 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49299846 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49299851 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49299874 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49299890 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49299996 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49300038 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49300053 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49300144 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 49300230 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49300326 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 49300385 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 49300446 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49300499 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49300564 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49300612 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49300628 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49300716 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49300743 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 49300756 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49300819 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 49300847 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 49301151 A G N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 49301230 T C N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 3 49301308 T C N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 7 13 1 5 4 3 49301436 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49301473 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49301523 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49301651 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49301666 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 49301704 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49301888 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 49301903 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 49302468 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 49302600 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 49302628 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 49302675 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 49302677 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 49302733 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 49302766 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 49302933 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 49303286 A T N N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 5 7 0 5 1 3 49303497 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49303502 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 49303548 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49303555 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 49303612 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49303657 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49303787 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49303975 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49303984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49303998 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49304105 G A N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 3 49304276 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49304281 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49304302 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49304325 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49304515 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49304542 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49304549 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49304568 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49304588 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49304609 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49304649 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49304696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49304791 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49304844 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49304912 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49304926 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49304938 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49304944 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49304964 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49304969 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49305012 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49305046 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49305071 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49305126 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49305147 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49305174 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49305191 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49305278 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49305281 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49305465 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49305505 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49305522 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49305647 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49305929 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49305949 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49305999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49306138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49306149 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49306178 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49306245 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49306273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49306311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49306440 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49306510 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49306600 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49306616 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49306713 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49306797 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49306847 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49306927 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 49306935 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 49306952 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49306953 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49306985 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 49307013 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49307038 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49307129 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49307134 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49307154 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49307168 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49307299 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49307339 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49307405 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49307441 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49307458 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49307473 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49307550 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49307566 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49307654 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49307713 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49307816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49307891 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49307967 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49307987 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49308165 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49308194 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49308216 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49308218 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49308230 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49308389 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49308545 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 49308787 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49308824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49309077 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 49309127 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49309186 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49309491 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49310001 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49310033 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49310115 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 49310166 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49310205 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 49311020 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49311086 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49311572 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 49311589 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 49311653 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49312014 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 49312167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49312203 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49312204 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49312522 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49312758 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49313143 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 49313307 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49313318 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49313319 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49313507 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49313733 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 49313750 C G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 49313864 T A N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 49313877 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49313897 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 49313899 A G N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 49313959 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49314006 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 49314013 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 49314147 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49314284 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49314317 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49314327 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49314442 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49314542 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49314685 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49314858 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49314873 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49315550 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49315554 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49315576 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 49315680 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 49315703 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 49315790 A G N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 49315872 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49315909 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 3 49315924 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49316007 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 49316016 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49316040 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49316193 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49316289 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49316311 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 49316422 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49316493 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49316533 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49316632 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49316751 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49316869 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 3 49317074 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 49317112 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 49317130 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49317313 A C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 3 49317328 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 49317481 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49317569 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49317604 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 49317632 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49317733 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 49317877 G A N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 3 49318059 C T N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.307692307692308 0.538461538461538 0.153846153846154 15 11 4 7 2 3 49318204 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 49318236 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 49318548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49318724 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 49318752 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49318761 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 49318792 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49318887 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49318893 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49318912 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49318917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49318928 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49318944 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49318972 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49318983 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 49319005 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49319133 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49319221 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49319339 C G Y N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 3 49319393 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49319680 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 49320176 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 49320229 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49320366 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49320660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49320672 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49320744 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49320833 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49321769 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49322619 T G N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 3 49323241 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 49323719 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49323987 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49324179 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49324604 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 49324605 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49324805 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49325272 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49325605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49325838 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49326173 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49326486 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 49326592 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49326632 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49326691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49326753 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49328146 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49328210 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49328528 C A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 49329488 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49329533 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49330711 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 49330798 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49330936 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49330998 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 49331059 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 49331175 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49331278 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49331291 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49331385 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 49331391 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49331440 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 49331612 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49331968 C A N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 3 49332041 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 49332269 T A Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 3 49332462 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49332559 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 49332681 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 49332741 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49332767 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49332788 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 49332820 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 49332842 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 49332856 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 49332868 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 49332921 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49332942 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 49332994 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49333001 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 49333036 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49333232 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49333290 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49333383 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49333495 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49333714 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.133333333333333 0.666666666666667 0.2 14 16 2 10 3 3 49333888 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 49333979 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 49334013 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49334027 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49334116 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 49334138 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 49334403 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 49334404 A T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 49334497 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 49334729 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49334775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49334849 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49334991 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 49335003 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49335007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49335057 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0 0.789473684210526 0.210526315789474 15 23 0 15 4 3 49335058 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 15 21 0 15 3 3 49335080 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49335149 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 49335224 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49335227 C T N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.0769230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 9 17 1 7 5 3 49335622 G A N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.153846153846154 21 5 10 1 2 3 49335743 A T N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.0833333333333333 0.583333333333333 0.333333333333333 9 15 1 7 4 3 49336052 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 3 49336111 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49336159 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 49336612 G A N Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.125 0.75 0.125 8 8 1 6 1 3 49337265 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 49337717 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 49337828 C A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 49338885 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49338914 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 49339014 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49339135 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49339268 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 49339370 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 49339430 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 49339434 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49339510 T G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 49339879 C T N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.181818181818182 17 5 8 1 2 3 49339950 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 49339993 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 49340010 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 49340211 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 49340568 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 49340632 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 49340735 T G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 49341179 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49341268 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 49341283 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 49341287 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 49341367 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 49341388 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 49341663 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 49342144 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49342232 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49342380 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 49342523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49343118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49343122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49343200 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49343443 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49344012 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49345461 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49345942 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49345982 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49346173 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49346340 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49346343 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49346392 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49346400 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49346458 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49346568 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49346647 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49346649 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49346673 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49346886 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49346895 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49346936 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49346966 T A N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 49346968 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49347631 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49347748 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 49347829 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49348507 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49348693 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49348694 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49348918 G T N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 3 49349000 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49349318 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49349382 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49349551 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49349699 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 49349937 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49350016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49350288 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 49350342 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49350618 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49350619 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49352682 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49353193 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49353379 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49353585 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49354048 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49354247 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49354882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49355801 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49355995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49356351 C G N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 49356536 G C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 49356607 A G Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 49356771 C T Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 49356782 G T Y N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 16 12 2 12 0 3 49356784 A G Y Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.230769230769231 0.769230769230769 0 16 10 3 10 0 3 49356810 C G Y N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 3 49356890 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49356935 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 3 49356938 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 3 49356985 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49357280 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 49357353 G A N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 49358023 G T Y N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 49358203 G T Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 49358447 G A Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 49358462 A T Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 49358616 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 49358799 A G Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 49358800 G A Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 49359022 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49359034 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49359251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49359309 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49359432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49359545 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49360106 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49360232 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49360293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49360301 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49360669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49360871 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49360946 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 49361037 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49361044 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 49361059 G T Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 49361196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49361314 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49361412 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49361485 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 49361512 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 49361615 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 49361626 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49361823 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49361910 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49362051 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49362110 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49362122 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49362171 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49362348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49362378 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49362418 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49362600 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49362700 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49362832 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49362849 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 49362897 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 49362935 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 49362984 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49363330 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 49363402 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49363522 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49363564 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49363779 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49364010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49364107 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49364120 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 49364201 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49364515 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 49364691 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 49364897 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49365091 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49365185 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 49365221 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 49365240 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49365347 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49365389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49365400 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49365762 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49365791 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49365793 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49365851 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49365908 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49365944 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49365984 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 49366300 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 49366326 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49366404 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49366437 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49366443 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49366468 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49366532 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49366600 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49366618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49366671 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49366743 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49366751 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49367249 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49367385 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 49367440 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 49367444 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 3 49367755 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49367861 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49367882 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 49368451 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49368770 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 49368796 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 3 49368878 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49369117 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49369141 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49369169 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49369182 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49369188 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49369211 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49369271 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49369498 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 4 24 2 0 12 3 49369577 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 49369587 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49369593 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49369661 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 49369810 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 49370265 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49370378 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49370424 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 49370516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49370539 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49370755 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49370786 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49370862 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49370889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49371035 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49371094 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49371139 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49371218 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49371299 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 49372101 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 49372213 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49372375 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49373057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49373187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49373227 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49373332 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49373452 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49373468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49374574 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49374780 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49374958 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49375127 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 49375200 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49375661 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49375997 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 49376059 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49376562 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49376854 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49377155 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49377678 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 49378559 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49378600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49379190 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49379225 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49379643 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49380028 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49380620 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49380656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49380950 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49380988 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49380989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49381031 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49381054 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49381141 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 49381150 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 49381191 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 49381218 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49381263 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 49381340 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 49381354 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.0625 0.625 0.3125 12 20 1 10 5 3 49381404 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 49381516 A G N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 49381544 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 49381852 C G N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.133333333333333 26 4 13 0 2 3 49382076 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49382351 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 49382399 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49382421 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49383536 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49383719 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49383822 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49384025 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49384063 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49384117 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49384216 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49384237 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49384310 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49384357 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49384581 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 49384619 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 49385412 A T N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 49385589 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49385624 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49385705 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 49385715 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49386239 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 49386372 G A N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 3 49386449 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 49386536 A G N Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 3 49386733 G A N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.333333333333333 0.6 0.0666666666666667 19 11 5 9 1 3 49386775 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 18 14 4 10 2 3 49387248 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49387337 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49387596 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.235294117647059 0.705882352941177 0.0588235294117647 20 14 4 12 1 3 49387881 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49387970 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49387984 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49387987 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 49388415 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 49388440 G T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 49388492 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 49388591 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 49388662 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49388680 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49388731 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49388752 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49388830 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49388859 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49389130 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49389228 A G N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 49389251 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 49389333 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49389415 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49389467 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 49389506 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 49389507 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 49389829 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49389845 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49389883 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49389930 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49390039 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49390055 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49390100 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49390115 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49390122 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49390293 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 3 49390384 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49390751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49390768 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49391144 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49391185 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 49391194 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49391532 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49391533 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49391592 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49391707 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49391889 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 49392132 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49392339 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 49392355 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 49392368 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 49392465 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49392486 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 49392538 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 49392565 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49392572 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49392656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49392811 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49392826 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49392947 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49392987 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49393013 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49393077 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49393269 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49393289 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49393312 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49393360 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49393363 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49393436 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49393464 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49393737 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49393869 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49393885 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49394030 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49394113 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 49394141 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49394222 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49394317 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49394408 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49394421 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49394494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49394541 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49394635 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49394637 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49394682 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49394706 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49394820 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49394898 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49395039 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49395160 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49395199 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 49395204 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49395212 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 49395241 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49395377 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49395485 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49395610 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49395614 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49395639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49395796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49395900 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49396059 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 49396200 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 49396325 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 49396331 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49396538 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 49396609 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49396713 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49396836 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 49397073 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49397167 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 49397241 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49397354 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49397527 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 49397563 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49397573 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 49397627 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49397634 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 49397642 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49397781 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 49397791 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 49397792 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 49397882 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 49397916 A G N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 12 12 2 8 2 3 49397920 C T N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.153846153846154 0.692307692307692 0.153846153846154 13 13 2 9 2 3 49399725 A C Y N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 49399991 C T Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 49400041 C T Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 3 49400081 A G Y Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.0769230769230769 0.615384615384615 0.307692307692308 10 16 1 8 4 3 49400173 T C N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 3 49400269 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 49400314 A T N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 49400359 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 49400443 T A N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 3 49400477 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 49400488 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 49400503 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 49400639 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49401181 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49401231 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 49401452 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49401789 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 49402048 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 49402082 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49402167 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 49402247 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 3 49402780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49402864 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 49402931 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49403056 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 49403159 A C N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 3 49403656 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 49403752 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 49403904 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49404018 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 49404618 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 49404680 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 49404696 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 49404814 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49404835 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 49404880 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49404940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49405029 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49405049 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 49405132 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49405171 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49405807 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49406173 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49406427 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 49406518 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49406588 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49406719 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49406877 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49406887 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49406953 C G Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49407046 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49407212 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49407267 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49407268 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49407440 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49407936 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49408060 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49408067 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49408111 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49408252 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49408587 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49408664 G T Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49408767 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49408827 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49408925 C G Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49409343 C G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49409643 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 49409709 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49409925 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49410081 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49410107 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49410165 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49410289 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49410658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49410731 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49410769 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49410962 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49411328 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49411384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49411387 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49411427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49411467 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49411481 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49411519 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49411844 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49411936 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 49412095 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49412120 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49412165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49412640 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 49412666 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49412703 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49412821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49412870 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49413183 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49413193 T G Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 49413262 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49413645 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49413980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49414046 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49414164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49414224 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 49414428 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49414429 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49414484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49414501 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49415075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49415095 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49415161 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49415188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49415224 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49415321 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49415337 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49415489 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49415506 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49415555 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49415683 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49415686 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49415797 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49415802 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49416025 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49416071 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49416072 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49416137 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49416615 T C N Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0 1 0 8 8 0 8 0 3 49416640 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 49416701 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 49416870 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 49416878 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 49416936 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 49416972 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 49417065 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 49417380 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 49417397 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 49417420 A C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 49417497 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 49417498 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 49417544 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 49417584 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 49417612 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 49417643 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 49417646 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 49417659 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 49417676 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 49417790 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 49417808 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 49417879 G A N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.375 0 0.625 6 10 3 0 5 3 49417910 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 49417952 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 49417955 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 49418026 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 49418090 T C N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 3 49418186 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 49418264 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49418276 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49418287 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49418332 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 49418344 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 49418350 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 49418378 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 3 49418417 C A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 3 49418420 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 3 49418468 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 49418476 A C N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 49418510 C A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.133333333333333 0 0.866666666666667 4 26 2 0 13 3 49418517 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.133333333333333 0 0.866666666666667 4 26 2 0 13 3 49418556 G T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.133333333333333 0 0.866666666666667 4 26 2 0 13 3 49418572 T G N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 4 20 2 0 10 3 49418662 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 4 20 2 0 10 3 49418710 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 3 49418746 T G N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 4 24 2 0 12 3 49418750 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.153846153846154 0 0.846153846153846 4 22 2 0 11 3 49418805 A C N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 49418917 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 49418929 G T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 3 49418934 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 49418955 T C N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.153846153846154 0.615384615384615 0.230769230769231 12 14 2 8 3 3 49418974 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 49418996 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 3 49418999 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 3 49419015 C T N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.333333333333333 0.6 0.0666666666666667 19 11 5 9 1 3 49419052 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 49419061 G C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 49419063 C G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 49419109 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 49419781 G C N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 4 20 2 0 10 3 49419800 T G N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.181818181818182 0 0.818181818181818 4 18 2 0 9 3 49419809 G A N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.2 0 0.8 4 16 2 0 8 3 49419844 G A N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.2 0 0.8 4 16 2 0 8 3 49419878 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 49419893 G T N N 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 0.0909090909090909 13 9 3 7 1 3 49419940 C A N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.181818181818182 0 0.818181818181818 4 18 2 0 9 3 49419948 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 4 20 2 0 10 3 49419955 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 4 20 2 0 10 3 49420074 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 49420076 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 49420115 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49420147 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49420175 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49420233 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49420235 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49420290 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49420336 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49420352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49420466 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49420488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49420590 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49420595 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49420649 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 49420666 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 49420838 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 49420951 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 49420962 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 49420996 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 49421053 A C N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 3 49421055 A C N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 49421272 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49421556 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49421908 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49422082 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 49422153 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49422173 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49422314 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49422398 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49422484 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49422516 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49422615 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49422640 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 49422785 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49423483 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49423839 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 49424882 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49424929 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 49424999 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49425074 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49425086 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 49425112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49425117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49425129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49425170 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49425211 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 49425249 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49425320 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 49425748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49425812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49425817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49426151 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49426209 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49426364 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49426432 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49426447 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49426729 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 49426780 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49427051 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 49427061 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 3 49427062 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49427122 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 49427216 G A N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 49428253 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 49428342 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49428565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49428617 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49428866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49429647 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 49429798 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49429803 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49429882 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 49429951 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 49429988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49430042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49430125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49430190 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49430274 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 49430275 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 49430455 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49430471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49430526 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49430786 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49430867 G T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 49430880 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49430897 A C N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.142857142857143 0.642857142857143 0.214285714285714 13 15 2 9 3 3 49430990 A C N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 49431497 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 49431666 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 49432201 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49432597 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49432805 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49432965 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49433237 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49433805 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49434461 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49434497 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49435073 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49435110 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49435130 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 49435163 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49435785 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49435852 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 49435957 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 49436225 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49436296 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 49436315 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49436316 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 49436345 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49436443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49436580 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49436611 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 3 49436821 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49436958 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49436993 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49437000 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49437147 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49437167 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 3 49437375 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 49437532 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 49437739 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49437867 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49437905 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49437935 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49437964 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 49438048 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49438113 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49438114 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49438204 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49438308 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 49438332 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 49438966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49439000 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49439124 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49439158 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49439423 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49439486 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49439735 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49439829 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49439848 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49439851 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 49439953 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49439958 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49440028 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 49440035 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49440427 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49440455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49440472 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49440527 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49440570 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 49440736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49440844 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 49440922 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 49440932 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49440951 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49441061 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 49441079 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 49441086 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 49441138 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49441222 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49441399 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 49441464 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 49441831 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 49442051 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49442273 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49442878 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49443009 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 49445307 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 49446197 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49446305 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49446320 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 49446329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49446384 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 49446644 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49446649 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49446674 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49447037 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49447192 A C N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.142857142857143 0.642857142857143 0.214285714285714 13 15 2 9 3 3 49447327 A G N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.153846153846154 21 5 10 1 2 3 49447785 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 49448031 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49448168 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 49448237 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 49448293 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 49448308 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 49448342 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49448366 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49448490 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 49448647 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49448676 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49448773 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49448987 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49449024 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 49449061 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 49449454 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49449812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49450268 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49450924 T A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 49451461 A G N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 49451704 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49451843 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 3 49452908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49452915 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49453163 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49453231 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49453379 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 49453454 C T N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 49453487 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 49453497 A C N N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.181818181818182 17 5 8 1 2 3 49453499 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.222222222222222 14 4 7 0 2 3 49453610 T G N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 49454160 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49454267 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 3 49454447 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49456522 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49456710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49457472 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49457771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49457786 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 49457822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49458023 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49458088 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49458255 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49458598 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 49459081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49459324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49459370 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49459520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49459717 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 49459759 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49459822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49459969 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 49459988 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49460430 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49460446 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49460508 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49460625 T C N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 49461223 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49461321 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49461415 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49461513 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49461695 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49461705 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49461857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49461915 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49461995 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49462092 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49463106 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49463223 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49463540 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 49463563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49463828 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49463848 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49463868 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49463894 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49463967 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49464032 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49464285 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49464313 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49464532 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49464636 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49464704 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49464754 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49464906 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 49464907 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 49465046 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49465048 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49465113 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49465186 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49465233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49465258 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49465280 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49465298 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49465300 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49465365 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49465444 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49465603 C A N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 3 49465678 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49465721 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49465938 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49465980 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49466190 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49466410 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49466462 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49466503 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49466614 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49466681 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49466771 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49466942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49467134 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49467165 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49467181 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 49467188 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 49467198 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 49467441 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49467649 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 49467742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49467782 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49467801 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49467828 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49467871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49468119 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49468153 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49468216 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49468222 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49468234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49468794 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49469037 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49469348 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49469415 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49469574 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49469810 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49469866 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49470093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49470212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49470296 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49470348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49470559 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49470770 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 49470957 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 49471272 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49471307 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49471453 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49471524 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 49472006 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49472085 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49472220 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 49472418 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 49472433 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49472459 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 49472737 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49472930 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 49473048 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49473086 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49473089 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49473187 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 3 49473302 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49473428 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 49473518 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49473564 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49473620 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49473749 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49473765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49473989 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 49474223 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49474263 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49474360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49474381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49474416 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49474753 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49474777 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49474943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49475139 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49475186 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49475195 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49475305 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49475315 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49475342 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49475488 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49475529 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 49476274 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49476319 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49476420 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 49476593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49476768 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49476933 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49476950 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49477089 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49477318 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 49477363 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 49477375 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49477386 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 49477407 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 49477455 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 49477464 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 49477612 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49477739 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49477747 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49477776 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49477804 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 49477823 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49477893 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 49477913 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49478021 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49478044 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 49478102 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 49478139 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 49478247 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 49478319 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 49478416 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49478477 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 3 49478488 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 49478520 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 49478546 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 3 49478582 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49478729 C A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 49478894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49478910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49479030 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49479047 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 49479099 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49479238 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49479256 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49479264 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49479313 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 49479367 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49479398 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49479509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49479635 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49479806 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49479819 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49480081 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 49480657 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49481036 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49481060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49481067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49481182 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49481325 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 49481406 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49481506 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49481512 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49481532 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49481559 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49481746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49481884 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49482023 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49482027 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49482257 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49482412 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 49482436 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49482438 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 49482458 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 49482493 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 49482507 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 49482513 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 49482522 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 49482533 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 49482563 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 49482659 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 49482791 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49482904 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 49482982 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 49483009 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 49483049 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 49483215 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49483452 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49483575 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49483602 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49483647 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49483795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49483842 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49484187 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 49484496 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49484564 T C N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 49484734 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49484903 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49485158 T C N Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 9 5 3 3 1 3 49485468 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49485534 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49485905 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49486108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49486164 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49486272 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49486491 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49486778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49486869 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49486919 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49487093 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 49487299 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 49487390 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49487456 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49487589 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49487591 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49487617 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 49487665 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49487670 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 49487694 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49488390 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49488438 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 49488525 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49488583 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49488751 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 49488952 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 49489063 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 49489064 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 49489608 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49489633 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 49489636 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49489808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49489933 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49489950 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49490236 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 49490531 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49490579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49490648 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 49490734 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49490755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49490910 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 49490937 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 49490942 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 49491098 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49491122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49491123 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 49491190 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49491192 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 49491225 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 49491253 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 49491259 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 49491341 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 49491438 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 49491452 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 49491498 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49491500 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49491567 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 49491577 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49491663 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 49491727 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49491809 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49492068 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49492102 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 49492108 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 49492303 T C Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 3 49492393 T C N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 3 49492407 T C N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 49492444 T C N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 49492461 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 49492490 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 49492592 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 49492693 C A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 49492721 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 49492723 T A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 49492755 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 49492757 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 49493010 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 49493080 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 49493150 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49493314 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 49493356 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 49493382 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49493391 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 49493407 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49493424 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 49493457 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49493461 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 49493469 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49493487 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 49493528 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 49493625 G A Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 3 49493847 A G N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 12 8 5 2 3 3 49493978 G A Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 3 49494018 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 49494065 T A N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 49494092 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 49494300 C T N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.363636363636364 0.454545454545455 0.181818181818182 13 9 4 5 2 3 49494306 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 49494330 C T N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 49494702 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 3 49494722 T C N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 3 49494757 G A N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 49494809 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 49494891 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 49494909 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 49494984 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 49494994 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 49495012 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 49495051 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 49495062 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 49495262 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 49495422 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 49495443 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49495452 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 49495457 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49495543 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49495557 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49495886 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49496011 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49496106 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 49496180 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 49496323 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 49496324 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49496334 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 49496364 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 49496413 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 49496469 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 49496616 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 49496619 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 49496667 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49496813 G A N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 49497475 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49497488 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 49497756 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 49498010 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49498468 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 49498781 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49498849 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 49498854 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49498865 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49498906 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49499166 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 49499199 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 49499275 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49499281 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 49499297 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 49499301 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 49499790 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 49499806 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 49500320 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49500360 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49500443 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49500850 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49500852 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49500890 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 49500907 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 49501131 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49501142 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49501213 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 49501316 G C Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 49501654 A T N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.538461538461538 0.230769230769231 0.230769230769231 17 9 7 3 3 3 49501744 T G N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.466666666666667 0.2 0.333333333333333 17 13 7 3 5 3 49501761 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 49501782 T C N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 3 49501893 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49502207 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49502215 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49502235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49502266 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49502302 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49502313 A T Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 49502398 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49502406 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 49502413 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49502610 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 49502619 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49502633 T G N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 49502733 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 49502825 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 49502887 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49502894 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49503062 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49503287 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 49503328 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 49503392 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 49503447 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 49503473 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49503625 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 49503630 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 49503756 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49503886 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 49503917 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 49504103 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 49504143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49504236 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 49504325 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 49504435 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 49504436 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 49504542 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49504565 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 49504733 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49504767 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 49504852 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49505108 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 49505318 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 49505356 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 49505397 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 49505406 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49505510 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49505517 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49505676 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49505687 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 49505792 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49505832 G C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 49505848 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 49505851 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 49505953 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49505961 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49505996 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 49506048 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49506203 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 49506301 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 49506405 A T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 49506424 A T N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 49506492 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 49506593 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 49506699 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 49506719 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 49506720 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 49506743 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 49506841 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 49506969 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49507420 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49507473 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 49507481 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49507484 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 49507564 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49507597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49507676 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49507894 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49507931 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 49508015 C A Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 49508020 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49508073 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49508144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49508234 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49508263 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 49508352 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 49508610 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 49508668 C G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 49508834 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49508981 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 49509000 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49509111 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49509507 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 49509513 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 49509771 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49510193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49510273 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 49510274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49510306 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 49510529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49510581 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 49510661 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49510680 T G Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 49510917 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 49511002 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49511012 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49511041 C T Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 49511367 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49511397 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 49511409 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49511468 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 49511683 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49511793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49511807 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 49512136 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49512137 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49512217 G T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 49512404 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 49512551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49512568 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 49512591 A C Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 49512638 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49512654 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49512712 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49512775 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 49512794 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 49512857 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 49512876 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 49513000 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 49513011 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49513020 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49513052 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 49513058 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 49513128 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 49513173 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 49513190 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 49513302 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 49513401 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49513726 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 49513776 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 49514116 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 49514145 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49514213 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 49514306 T A Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 49514386 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49514473 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 49514532 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 49514749 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 49514756 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 49514827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49514928 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 49515022 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 49515047 G A N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 49515632 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 49515679 T A Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 49515887 A T Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 49516067 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 49516284 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 49516425 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 49516429 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 49516580 T C Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 49516615 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 49516626 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 49516656 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 49516670 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 49516671 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 49516722 T C Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 49516744 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 49516812 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 49516840 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 49516859 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 49516993 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 49517021 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 49517080 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 49517116 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 49517125 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 49517263 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 49517270 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 49517278 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 49517395 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 49517457 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 49517677 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 49518228 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 49518269 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49518304 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49518459 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 49518966 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 49519466 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49519603 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 49519734 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 49520884 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49522498 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49522684 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 49522867 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 49522880 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 49523900 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49524272 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49524824 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 49524922 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49524934 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49524955 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49525143 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 49525228 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49525257 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 49525268 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49525411 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 49525424 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 49525553 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49525595 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49526030 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49526088 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 49526161 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 49526235 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 49526236 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 49526352 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49526528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49526587 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49526604 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49526637 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49526922 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49527138 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49527700 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49528348 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49528499 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49528727 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49528787 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49528807 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49528952 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49528955 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49529058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49529062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49529082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49529486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49529552 A C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 49529590 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49529610 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49529683 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 49529897 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49530076 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49530215 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49530260 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49530326 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49530518 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49530723 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49531039 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49531100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49538464 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49538583 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49538725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49538882 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49538892 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49539102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49539154 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 49539331 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49539383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49539425 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 49539471 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 49539493 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49539494 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49539545 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49539557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49539663 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49539744 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49539749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49539772 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49539840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49539843 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49539895 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49539896 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49539920 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49540115 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49540131 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49540165 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49540183 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49540185 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49540194 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49540230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49540292 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49540411 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 49540609 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49540773 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49540926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49540942 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49541110 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49541151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49541487 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 49541491 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49541516 C A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 49541874 C A N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.214285714285714 0.0714285714285714 0.714285714285714 7 21 3 1 10 3 49541934 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 49541953 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49542018 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 49542075 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 49542253 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 49542345 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 49542372 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49542450 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 49542495 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 49542525 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49542745 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49542785 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49542799 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49542853 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49542983 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 49543051 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49543221 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49543343 C A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 49543371 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 49543393 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 49543601 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 49543642 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49543647 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 49543699 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 49543705 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 49543712 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 49543793 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49543997 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49544050 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49544051 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49544104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49544142 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49544187 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49544253 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49544461 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49544547 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49544572 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49544670 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 49544693 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49544866 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 49544891 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 49544903 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49544927 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 49544932 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 49544974 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 49544987 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 49544994 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 49545013 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 49545026 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 49545060 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49545065 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 49545086 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49545152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49545165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49545170 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49545201 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49545213 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 49545238 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49545255 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49545297 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 49545333 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 49545355 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 49545402 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 49545451 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 49545520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49545539 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 49545964 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49546016 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49546024 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49546098 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 49546409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49546433 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49546439 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49546473 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49546502 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49546648 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49546719 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 49546777 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 49547411 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49547521 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49547663 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49547779 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 49547789 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 49547922 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49547924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49547982 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49548117 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 49548468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49548610 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49548737 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49549327 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49549397 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49549449 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49549535 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49549598 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 49549599 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 49549673 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49549904 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49550076 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49550085 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49551213 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 49551265 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49551368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49551464 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 49551524 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49551717 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 49552250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49552282 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49552467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49552586 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49552642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49552665 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49552866 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 49552976 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 49553055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49553258 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 49554110 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 49554174 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49554219 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49554246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49554261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49554403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49554531 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 49554549 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49554782 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 49555317 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49555349 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 49555360 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49555522 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 49555541 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49555723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49555852 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49556006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49556066 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49556082 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49556138 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49556425 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49557098 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49557297 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49558190 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 49559707 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 49561972 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 49561973 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 49562575 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49562576 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49562708 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49562757 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49563011 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 49563014 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 49563047 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 49563067 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 49563088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49563224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49563388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49563404 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49563419 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49563701 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 49563720 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49563953 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 49563967 G T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 49563984 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 49564014 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49564216 A C N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 3 49564225 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 49564355 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49564729 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 49564804 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 49564856 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 49564921 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49564939 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 49565117 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49565376 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 49565382 G T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 49565389 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 49565413 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 49565471 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 49565520 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 49565732 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49565740 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 49565757 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 49565800 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 49565939 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 49566286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49566758 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 49566802 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 49566814 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 49566816 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 49566858 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 49566894 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49566973 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 49567009 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 49567308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49567513 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 49567816 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49568411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49568541 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49568614 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49568665 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 49568688 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 49568708 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 49568767 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 49568781 T G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 49568886 C T N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 49569126 T A N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 49569142 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 49569153 C A N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 49569169 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 49569207 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49569268 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 49569290 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 49569296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49569302 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 49569371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49569378 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49569397 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 49569415 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 49569559 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 49569579 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 49569637 C G N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 3 49569650 C A N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 49569665 T C N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.307692307692308 0.230769230769231 0.461538461538462 11 15 4 3 6 3 49569680 C G N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 3 49569691 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.25 0.333333333333333 0.416666666666667 10 14 3 4 5 3 49569692 A G N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.272727272727273 0.272727272727273 0.454545454545455 9 13 3 3 5 3 49569735 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 3 49569787 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 49569930 C T N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 3 49570182 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 49570270 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 49570446 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49570495 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 49570671 T G N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 49570961 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 49571249 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 49571413 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 49571418 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 49571442 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 49571457 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49571660 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49571668 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49571869 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49571945 A T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 49572270 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49572349 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49572357 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 49572406 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49572623 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49572664 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 49573562 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49573590 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49573678 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49573696 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49573747 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49573791 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49574038 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49574072 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49574085 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49574153 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49574158 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49574429 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49574533 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49575392 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49575420 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 49575456 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49575458 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49575576 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49575613 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49575673 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 49575683 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 49575749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49575909 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 49576023 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49576093 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 49576141 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 49576177 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 49576343 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 49576763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49577019 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49577140 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49577227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49577434 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49577461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49577462 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49577483 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49577873 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 49578088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49578089 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49578120 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49578221 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49578247 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49578291 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49578333 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49578341 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49578413 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49578475 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49578480 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49578614 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49578671 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49578692 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49578737 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49579190 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 49579349 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 49579350 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 49579405 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 49579585 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49579641 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 49579653 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49579730 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49579876 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 49579927 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 49579944 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 49579977 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 49580028 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49580046 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 49580074 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 49580083 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 49580144 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 49580181 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 49580358 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 49580368 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49580420 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49580509 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49580527 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 49580639 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49580695 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49580866 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49580918 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49580966 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49581005 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49581155 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 49581186 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49581202 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49581425 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 49581449 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 49581521 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49582174 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49582191 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49582453 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49583074 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 49583132 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49583833 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 49584026 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49584805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49585117 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49585213 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49585275 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 49585359 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 49585498 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49586298 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 49586343 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49586840 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49587612 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49587662 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49587695 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49587749 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49588130 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49588440 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49588513 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49590656 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49592111 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 49592460 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 49593017 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49593134 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 49593269 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 49593320 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 49593370 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 49593373 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 49593392 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 49593671 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49593703 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 49593827 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49593829 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49593864 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49593882 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 49593889 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49593957 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49593965 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49593978 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49594058 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49594109 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 49594173 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 49594419 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49594623 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49594625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49594677 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49594732 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 49594741 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49594793 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 49594886 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49595310 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49595409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49595491 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 49595569 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49595666 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49595676 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49595836 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 49595840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49595938 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49595949 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49596005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49596072 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49596148 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 49596253 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49596855 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 49596895 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49596904 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 49596908 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 49596967 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49597077 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49597115 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49597225 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 49597232 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 49597269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49597426 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 49597434 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 49597561 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49597656 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49597710 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49597769 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49597839 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49597849 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49597934 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 49597956 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49598031 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49598119 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 49598147 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49598235 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 49598294 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49598376 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 49598393 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 49598398 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 49598430 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 49598604 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49598622 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 49598893 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 49599059 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49599159 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49599217 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 49599301 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 49599312 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 49599381 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 49599633 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 49600120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49600278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49600523 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49600734 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49607351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49607385 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49607414 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49607435 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 49607453 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49607485 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49607531 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49607585 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49607659 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49607790 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49607821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49607879 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49607988 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49608084 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 49608152 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 49608157 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 49608285 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 49608373 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 49608420 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 49608500 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 49608537 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 49608570 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 49608571 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 49608603 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 49608872 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 49608932 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49609166 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 49609285 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49609440 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49609466 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49609477 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49609634 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49609773 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 49609863 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 49609886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49609973 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 49609975 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 49610218 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49610246 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49610376 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 49610595 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 49610646 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 49611902 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49612102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49612871 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49613031 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49613431 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49613543 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49613612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49613818 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49614130 A C N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 49614391 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 49614703 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49614825 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49615008 G C Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 3 49615196 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 49615292 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 49615331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49615414 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49615556 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 49615596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49615718 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49615753 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 49615863 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49615969 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 49616103 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49616268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49616545 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49616552 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49616689 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49616694 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49616946 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49617083 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 49617147 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49617153 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49617228 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 49617257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49617388 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49617487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49617523 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49617555 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49617604 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 49617652 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 49617718 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 49617721 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 49617794 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49617911 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 49617990 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 49618004 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 49618324 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49618544 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49618642 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49618643 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49618674 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49618721 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 49619109 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49619294 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 49619450 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49620053 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49620253 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49620406 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49626620 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49626629 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 49626650 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49633258 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 49634365 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 49635352 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 3 49635722 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49635776 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49636154 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 49636271 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49636338 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 49636355 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 49636559 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 49636692 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 49636709 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 49636739 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 49636795 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 49636924 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49637204 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49637222 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 49637308 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49637359 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 49637465 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49637472 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 49637499 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49637737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49637792 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49638325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49638592 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 49638884 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 49638941 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 49638949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49639226 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 49639323 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 49639400 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 49639541 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 49641134 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49641744 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 49641800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49641847 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49642388 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 49642508 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 49642623 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49642658 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49642863 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49643006 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 49643023 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 49643220 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49643221 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49643253 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 49643276 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 49643682 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49644133 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 49644168 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49644435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49644649 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49644890 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 49645284 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 49645656 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49645837 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49645932 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49647825 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 49648045 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49648817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49648937 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49649183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49649883 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49650174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49650274 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49650383 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49650547 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49651045 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 49651062 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49651323 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49651512 T G Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 49651514 T A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.1875 0.0625 0.75 7 25 3 1 12 3 49652097 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 49652335 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 3 49652360 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 49652383 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 49652387 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 49652419 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 49652568 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 49652594 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 49652713 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 49652779 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49652813 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 49652866 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49652882 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49652974 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49653007 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49653008 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49653047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49653052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49653073 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 49653254 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 49653268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49653355 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49653387 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49653398 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49653406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49653475 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49653529 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49653568 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 49653575 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49653593 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49653617 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 49653678 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49653926 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 49654012 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 49654090 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49654094 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49654119 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49654151 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49654247 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 49654248 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 49654369 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 3 49654470 A T N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 4 24 2 0 12 3 49654554 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 24 4 12 0 2 3 49654625 A T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.133333333333333 0 0.866666666666667 4 26 2 0 13 3 49654737 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49654743 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49654801 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49654803 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49654860 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 49654911 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 49654932 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 49654985 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 49655012 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49655025 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49655092 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49655106 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49655181 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49655247 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 49655306 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49655366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49655456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49655470 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49655490 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49655540 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 49655646 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 49655661 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49655709 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 49655934 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 49655985 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 49656021 G A N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 3 49656046 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49656061 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49656111 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 49656368 A T N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 49656465 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49656541 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49656581 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49656589 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49656621 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49656669 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49656752 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 49656771 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49656806 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49656822 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 49656849 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49656864 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49656882 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49656900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49657488 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49657593 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49657650 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49657968 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49657987 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49658010 C A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 49658389 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49658708 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49658715 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49658739 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49658826 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49658888 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 49659107 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49659128 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 49659431 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 49659443 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 49659488 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49659765 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49659786 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 49659797 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49659936 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 49659974 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49660016 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 49660216 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49660237 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49660275 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49660276 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 49660375 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 49660421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49661035 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49661106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49661317 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49661870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49661884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49661965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49662142 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49662157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49662635 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49662840 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49662865 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49663128 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49663157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49663298 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49663512 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49663688 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49663725 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49664030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49664226 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49664542 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49664623 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49664698 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49665302 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49665986 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49666006 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49666203 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49666215 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49666455 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 49666523 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49667048 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49667466 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 49667598 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49667678 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49667694 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49668174 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49668243 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49668549 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 49668564 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49668812 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49668871 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49669392 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49670064 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49670082 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49670524 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49671095 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 49671158 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49671206 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49671251 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49671911 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49672041 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49672650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49672656 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49672840 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49672925 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49672983 T G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 49673136 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49673196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49673234 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49673327 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49673483 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49673642 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49673719 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49673749 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49673816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49673829 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49673908 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49673941 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49674008 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49674050 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49674052 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49674128 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49674202 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49674235 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49674254 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49674747 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 49674836 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49674958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49674965 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 49674969 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49674983 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49674994 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49675402 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49675514 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 49675745 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 49675823 C A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.133333333333333 0 0.866666666666667 4 26 2 0 13 3 49676150 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49676176 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49676419 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 49676432 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49676465 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49676980 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49677069 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49677248 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49677304 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 49677335 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49677546 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 49677581 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49677632 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49677707 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49677763 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49677892 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49677946 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49677955 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49677995 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49677996 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49678111 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49678139 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49678168 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49678675 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 49678837 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 49678876 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 49678964 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49679051 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 49679101 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49679307 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49679743 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49680606 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49680823 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49681124 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49681381 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49681501 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49681560 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49681871 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 49682428 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49682644 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49682645 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49682717 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49682813 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49682888 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49683426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49683581 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 49683674 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49683721 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49683869 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49683918 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49683941 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49683948 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49684052 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 49684058 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49684213 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 49684371 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49684383 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49684454 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49684505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49684578 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49684621 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49684969 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49685006 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 49685241 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49686091 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49686300 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49686358 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49686388 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49686427 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49686481 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49686525 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49686562 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49686744 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49686959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49687003 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49687124 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49687219 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49687310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49688383 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49689319 G T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 49689458 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49689491 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49689674 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49689762 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49690232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49690353 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49690362 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49690429 T G Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 49690437 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 49690462 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49690597 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49690598 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49690787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49690851 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49690932 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49690943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49690969 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49691035 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49691086 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49691088 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49691178 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 49691275 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49691319 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49691320 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49691405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49691842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49691864 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 49691906 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49691925 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49691986 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49692104 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49692266 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49692486 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49692619 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49692655 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49692733 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49692915 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49692952 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49692990 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49693058 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49693145 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49693278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49693395 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49693401 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49693431 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49693563 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49693690 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49693828 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49694360 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 49694365 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 49694382 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49694764 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49694793 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49695083 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49695099 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49695137 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49695223 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49695314 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 49695478 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49695531 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49695631 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49695824 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49695925 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49696147 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49696152 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 49696171 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49696199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49696231 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49696256 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49696469 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49696473 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49696604 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49696613 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49696649 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49696672 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49696747 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49696869 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49697021 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 49697764 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49698015 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49698255 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 49698514 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 49698642 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49698720 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49698835 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49698910 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49699218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49699996 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 49700069 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 49700103 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49700138 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49700217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49700914 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 49700920 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49701829 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49701859 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49702142 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49702179 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49702247 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49702636 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49702727 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49702751 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49702887 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49702890 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49702955 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49702960 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49703154 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49703214 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49703281 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49703364 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49703422 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49703442 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49703450 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49703471 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49703586 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49703589 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49703619 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49703678 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49704096 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49704811 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 49704969 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49705080 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49705260 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49705749 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49705807 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 49705895 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49706248 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49706263 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49706327 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 49706336 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 49706361 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 49706490 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49706536 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 49706545 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 49706630 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49706638 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49706666 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 49706853 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49706869 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 49706892 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49706902 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49707046 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49707461 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 49707526 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 49707559 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49707738 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 49707791 C G N N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 14 6 6 2 2 3 49707944 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 49707946 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49708020 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 49708099 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49708129 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 49708356 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 49708487 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 49708509 A C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 49708759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49708789 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 49708839 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 49708887 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 49708914 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 49709237 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49709290 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49709398 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49709454 G T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 49709847 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 49710008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49710062 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49711125 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 49711286 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49711316 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49711502 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49711529 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49711566 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49711751 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49712420 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49712684 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49712852 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49713288 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49713304 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49713308 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49713450 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49713716 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49713894 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49714035 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49714076 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49714316 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49714330 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49714374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49714380 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49714558 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49714573 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49714740 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49714756 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 49714844 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49714845 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49715017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49715140 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49715141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49715388 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49715434 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49715497 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49715602 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49715655 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49715657 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49715875 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49716102 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49716465 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49716486 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49716525 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 49716535 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49716543 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49716714 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 49716765 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49716839 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49716845 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49716901 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49716903 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49717058 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49717089 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49717111 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49717121 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49717133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49717169 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49717236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49717243 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49717272 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 49717301 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49717305 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 49717313 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49717351 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 49717482 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 49717507 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 49717569 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49717626 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49717682 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49717683 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49717723 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49717774 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 49717812 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 16 8 4 8 0 3 49717823 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49717915 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 49718008 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49718117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49718134 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49718162 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49718499 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49718501 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49718549 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49718584 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 49718652 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49718757 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49718781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49718835 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49718845 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49719069 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49719153 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49719169 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49719330 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49719399 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49719498 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49719526 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49719692 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 49719730 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 49719745 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 49719747 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49719816 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 49719905 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49720133 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49720137 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49720267 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 49720271 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49720370 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49720399 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 49720520 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 49720691 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 49720732 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49720740 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49720759 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49720799 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49720851 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49720897 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49720902 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49720909 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49720914 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49720928 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 49720956 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49721055 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49721132 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49721141 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49721161 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49721187 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49721188 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 49721265 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49721724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49721769 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49721905 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49722162 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49722301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49722595 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49722603 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49722750 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49722923 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49723564 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49723622 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49723638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49723877 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49723937 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49723994 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49723996 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49724250 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 49724377 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 49724878 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 49724960 G T N N 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0 0.9 0.1 9 11 0 9 1 3 49725016 G C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 49725020 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 49725543 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49725562 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49725642 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49725719 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49725800 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49725805 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49725966 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49726048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49726174 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49726733 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49726827 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49727263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49727468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49728995 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49729483 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 49730186 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49730225 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 49730326 A C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 49730578 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49731016 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49731175 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 49731252 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49731362 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49731365 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49731454 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 49731599 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49731813 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49732377 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49732380 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49732491 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49732542 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49732711 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49732803 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49732847 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49732882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49732909 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49733169 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 49733328 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49733355 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49733523 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49733589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49733676 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49733710 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49733825 T C N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 3 49733955 A G N Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 3 49734023 T C N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 15 5 7 1 2 3 49734129 A G N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 3 49734497 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 49734887 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49734911 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49734995 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49735077 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49735089 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49735092 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49735182 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49735193 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49735204 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49735237 A T N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0 0.615384615384615 0.384615384615385 8 18 0 8 5 3 49735396 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 49735434 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49735624 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49735638 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49735665 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49735771 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49735933 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49735934 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 49736038 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49736063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49736199 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49736286 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49736381 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 49736384 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 49736414 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49736419 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 49736579 A G N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 3 49736979 C T N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 49736981 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 49737013 C T N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 5 15 2 1 7 3 49737026 A T N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 49737151 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49737193 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 49737420 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 49737434 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49737499 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49737518 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 49737650 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49737702 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49737773 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49737895 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49737912 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49737925 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49738098 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 49738193 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49738283 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 49738293 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 49738303 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 49738349 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 49738793 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49738931 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 24 4 12 0 2 3 49739113 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 49739128 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49739212 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49739238 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49739295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49739354 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49739530 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49739590 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 49739677 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49739832 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49739903 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 49739986 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 49740027 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49740104 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49740241 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 49740482 A G N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 49740519 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 49740701 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49741069 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49741079 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49741217 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49741278 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49741749 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49741823 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 49742053 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 49742094 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 49742178 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 49742348 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49742413 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 3 49742721 T A N N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.181818181818182 17 5 8 1 2 3 49742731 G A N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.75 0.0833333333333333 0.166666666666667 19 5 9 1 2 3 49742761 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 49742783 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 49742895 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 49742997 T C N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 49743046 A C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 49743131 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.285714285714286 0 0.714285714285714 4 10 2 0 5 3 49743405 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49743481 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49743511 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49743568 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49743674 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49743828 C G Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 49743878 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49743993 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49744082 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49744134 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 49744240 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49744339 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49744341 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49744470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49744566 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 49744581 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 49744765 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49744790 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49744817 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49744829 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49745001 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49745008 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49745040 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49745056 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49745089 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49745106 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49745111 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49745134 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49745169 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49745212 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49745303 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49745425 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49745510 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49745772 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49745827 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 49746023 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49746079 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49746144 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49746195 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 49746324 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49746418 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49746711 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 49746757 T C N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.75 0.0833333333333333 0.166666666666667 19 5 9 1 2 3 49746759 A G Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.75 0.0833333333333333 0.166666666666667 19 5 9 1 2 3 49746795 T C Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.153846153846154 21 5 10 1 2 3 49746837 C T N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.75 0 0.25 12 4 6 0 2 3 49746847 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 8 4 4 0 2 3 49747142 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49747222 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49747296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49747460 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49747472 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49747474 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49747561 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49747963 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 49747996 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49748006 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49748341 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49748386 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49748417 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49748446 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 49748536 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49748778 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49748802 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49748904 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49749014 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 49749417 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49749506 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49749524 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 49749600 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49749609 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49749653 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 49749736 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49749790 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49749884 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49749979 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 49750126 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49750227 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49750275 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49750319 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49750346 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49750525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49750534 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49750593 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 49750594 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 49750652 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49750677 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 49750706 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49750709 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49750977 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49751242 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 49751450 G T Y N 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 49751528 T G Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 49751699 G A Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 49751776 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49751785 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49751819 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49751841 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49751858 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 49751933 C T Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 49751953 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 49752096 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49752327 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49752433 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49752746 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49752771 G T Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 49752860 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 49753046 T G Y N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 0.153846153846154 0.153846153846154 20 6 9 2 2 3 49753059 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49753498 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 49753509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49753685 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 49753733 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49753737 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 49753778 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 49753800 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 49753995 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49754089 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 49754257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49754303 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49754419 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 3 49754430 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 49754479 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 49754528 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 49754562 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49754655 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 49754656 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49755313 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 49755376 C A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 49755517 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 49755616 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 49755849 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49758261 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49758453 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 49758635 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 49758726 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 49758755 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49758809 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49758960 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49759023 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 49759048 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 49759201 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49759271 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49759306 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49759355 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49759364 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49759371 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49759391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49759402 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49759430 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49759487 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 49759664 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 49759880 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49760085 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49760208 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49760283 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 49760322 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 49760334 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49760358 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49760379 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49760554 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49760719 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 49760774 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49760777 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 49760817 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 49760919 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49761008 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 49761032 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49761063 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49761091 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49761176 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49761197 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 49761420 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49761469 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49761670 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 49761738 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 49762058 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49762392 T C Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 49762989 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 49763003 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 49763154 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49763200 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49763401 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49763487 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49763730 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49763773 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49763898 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49763905 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49764020 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49764028 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 49764118 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49764200 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49764250 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49764481 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49764532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49764620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49764906 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49764947 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49765009 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49765056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49765079 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 49765154 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49765351 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49765352 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49765380 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49765442 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49765456 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 49765486 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49765531 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49765535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49766071 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 3 49766392 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 49766456 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 49766513 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 49766514 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 49766873 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49766893 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49766894 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49766938 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49766974 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49767080 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 49767211 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49767236 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 49767271 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49767295 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 49767416 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49767606 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 49767783 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49767815 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49767838 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49767888 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 49767986 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49768053 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49768118 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 49768199 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49768240 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49768241 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49768526 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49768598 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49768657 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 49768660 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49768705 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49768733 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49768845 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49768951 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49768953 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 49768965 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49769178 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49769211 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49769305 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49769320 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49769342 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 49769353 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49769379 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49769536 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49769601 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49769606 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49769664 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49769816 C G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 49769851 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 49769875 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49769896 A C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49769957 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49770075 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49770269 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 49770360 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49770416 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49770544 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49770859 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49770943 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49770966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49770992 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49771050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49771083 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49771128 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49771184 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49771214 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 49771253 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49771330 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49771420 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49771532 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49771533 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49771631 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49771764 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49772002 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 49772035 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49772060 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49772145 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49772146 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49772172 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49772173 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49772218 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49772334 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49772357 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49772423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49772425 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49772455 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49772669 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49772681 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49772705 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49772707 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49772834 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49772880 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49772971 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49773095 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49773335 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49773377 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49773513 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 49773646 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 49773749 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49773925 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49773994 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 49774153 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49774331 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49774409 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 49774487 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 49774518 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49774641 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49774678 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 49774726 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 49774780 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 49774919 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 49775069 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 49775116 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 49775168 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49775207 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49775239 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 49775407 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49776098 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 49776156 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49776237 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 49776357 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49776535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49776654 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49776655 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49776679 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 49776695 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 49776978 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49777350 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49777840 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 49777933 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 49778009 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49778049 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49778099 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49778159 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 49778167 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49778522 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49778655 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 49778899 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49778979 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49779059 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49779073 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49779128 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49779142 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49779259 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49779346 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49779471 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49779550 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49779555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49779616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49779724 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49779730 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49779826 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 49779891 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49779895 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49779916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49779941 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49779959 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49780069 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49780087 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49780194 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49780596 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49780600 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49780652 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49780681 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49780717 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49780811 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49780985 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49781168 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49781187 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49781262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49781269 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49781295 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49781341 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49781353 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49781749 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 49781772 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49781852 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49781917 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49782140 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 49782207 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49782210 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49782256 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49782292 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49782294 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49782305 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 49782442 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 49782748 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 49782773 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 49782811 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49782864 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49782873 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 49782936 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 49782973 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 49782998 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49783170 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 20 4 10 0 2 3 49783187 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49783259 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 49783268 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 49783304 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 49783339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49783384 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49783416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49783524 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49783525 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49783555 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49783567 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49783617 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 49783637 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 49783653 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 49783722 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 49783750 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 49783891 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49783956 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 49783957 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 49783989 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 49784021 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49784030 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49784092 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49784119 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 49784583 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49786880 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49786948 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 49787130 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49787152 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 49787496 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 49787619 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 49787884 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 49788007 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49788040 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 49788051 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49788131 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 49788184 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 49788341 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 49788418 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 49788622 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49788658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49788783 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 49788789 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49788935 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49789026 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49789367 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 49789396 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 49789446 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 49789467 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 49789593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49789724 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 49789753 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 49789920 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 49789921 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49790092 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 49790153 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49790330 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 49790348 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49790549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49790561 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 49790644 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 49790655 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 49790667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49790726 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 49790755 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49790820 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49790861 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 49791158 T C Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 49791221 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49791242 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 49791347 G A N Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 3 49791608 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49791689 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49791738 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49791801 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49791820 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49791922 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49791990 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49792059 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49792136 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49792217 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49792280 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49792380 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49792396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49792469 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 49792480 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49792507 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49792569 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49793982 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49794744 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49795254 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49795515 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49795521 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49795730 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49795749 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49795929 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49796015 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49796132 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49796158 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49796343 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49796574 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49796979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49797081 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49797275 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49797297 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49797459 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49797534 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49797703 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49797895 G C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49797996 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49798041 A T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49798443 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49798499 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49798822 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49798957 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 49798958 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 49798972 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 49799084 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49799092 G T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49799153 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49799382 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49800034 C T Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 49800274 G T Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 49800468 A G Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 49800503 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49800627 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 49800840 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49800928 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49801546 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49801719 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49801745 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49801871 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49801890 A T Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 49801897 T A Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 49802040 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49802116 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49802284 T G Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 49802352 C T Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 49802517 G A Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 49802781 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 49803078 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49803288 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49803377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49803421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49803509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49803632 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49803771 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49804145 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49804244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49804263 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49804365 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49804383 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49804447 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 49804520 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49804619 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 49804651 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 49805065 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49805359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49805430 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49805936 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49806842 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49806917 T G N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 49806940 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 49807101 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49807177 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49807181 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49807612 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49807714 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49807743 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49807973 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49808534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49808716 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49808769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49809177 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49809199 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49809298 T C N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 49809504 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 49809514 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 49809556 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49809557 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49809569 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49809602 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49809703 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49809791 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49809898 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49809903 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49809961 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49809962 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49810014 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49810036 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49810059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49810302 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49810308 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49810316 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49810529 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49810708 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49810746 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49810837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49810881 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49810982 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 49811019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49811172 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49811178 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49811201 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49811210 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49811230 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49811354 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49811427 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49811464 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49811472 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49811502 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49811525 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49811541 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49811563 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49811641 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49811748 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49811785 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49811808 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49811838 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49811848 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49811908 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49811912 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49811932 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 49811967 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 49812030 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49812046 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49812085 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49812141 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49812154 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49812194 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49812241 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49812440 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 49812518 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49812650 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49812658 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49812749 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49812750 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49812886 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49813041 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49813066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49813094 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49813623 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49813831 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49813883 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49813931 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49813946 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49813948 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49814028 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49814029 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49814139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49814165 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49814314 A C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 49814374 A G N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 49814400 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 49814765 T A N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 49815168 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49815602 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49815617 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49815631 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49815668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49815691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49815736 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49815761 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49815784 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49815831 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49815857 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49815921 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 49816032 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49816068 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49816134 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49816174 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49816371 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49816372 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49816523 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49816594 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49816707 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49816876 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49816901 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49817211 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 49817275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49817502 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49817968 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49817993 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49818008 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49818463 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49818522 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49818738 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49818847 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49819191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49819431 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49819519 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49819661 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49819690 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49819705 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49819927 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49819971 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49820310 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49820320 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 49820332 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 49820438 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 49821219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49821230 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49821445 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49821515 T C N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 49821516 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 49821526 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 49821538 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 49821557 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 49821589 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49821796 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49821893 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49821916 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49821952 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49822094 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49822118 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49822174 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49822261 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49822264 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49822273 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49822279 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49822348 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49822414 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49822461 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49822612 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49822650 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49822728 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49822822 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49823444 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49823699 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 49823869 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49824210 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49824367 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49824519 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 49824710 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49824816 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49824893 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49825078 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49825129 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49826046 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49826207 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49826502 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49826572 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49827047 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49827087 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 49827763 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 49827764 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49828074 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49828199 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49828301 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49828527 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49828594 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49828644 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49829150 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49829939 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49829992 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49830195 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49830377 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49830508 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49830806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49830811 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49830955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49831101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49831139 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49831149 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49831774 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49831926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49831933 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49832018 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49832213 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49832386 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49832390 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49832716 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49833068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49833070 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49833138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49833237 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49833443 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49833488 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49833820 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49834166 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49834504 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49834521 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49834553 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49834622 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49834754 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49834760 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49835148 A G N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 49835253 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49835329 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49835354 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49835357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49835408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49835475 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49835525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49835560 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49835667 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49835693 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49835700 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49835774 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49835916 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49835986 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49836008 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49836028 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49836055 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49836365 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49836483 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49836542 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49836561 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49836590 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 49836644 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49836645 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49836672 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49836685 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49836803 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49836833 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49836847 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49836875 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49836876 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49836918 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49836932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49837085 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49837113 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49837338 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49837354 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49837477 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49837574 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49837643 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49838131 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49838135 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49838189 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49838251 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49838392 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 49838566 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49838650 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49838840 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0 0.9375 0.0625 15 17 0 15 1 3 49839214 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49839250 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49839271 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49839333 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49839364 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49839505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49839724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49839725 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49839805 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49840198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49840653 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49840757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49840893 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49840907 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49841212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49841284 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49841314 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49841376 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49841414 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 49841766 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49841991 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49842045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49842224 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49843143 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49843170 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49843326 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49843379 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49843382 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49843516 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49843588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49843609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49843634 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49843662 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49843695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49843819 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49843825 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49843978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49844001 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49844030 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49844125 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49844245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49844363 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49844364 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49844386 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49844436 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49845480 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49845689 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49845807 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49845910 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49845965 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49845970 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49846231 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49846243 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49846398 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49846440 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49847003 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49847019 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49847215 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 49847216 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49847307 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49847356 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49847430 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49847637 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49847683 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49848070 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49848336 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49848356 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 49848466 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49848723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49849067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49849262 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49849387 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 49849581 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49849588 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49849646 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49849740 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49849788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49849831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49849868 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49849870 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49850163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49850182 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49850319 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49850615 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49850668 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49850766 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49850800 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49850846 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49850849 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49850871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49850950 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49851328 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49852045 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49852479 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49852664 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49852716 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49852791 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49852809 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49853017 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 49853166 C A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 49853506 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49853573 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49853809 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49853827 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49853869 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49853912 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49853947 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49854013 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49854044 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49854068 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49854371 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49854385 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49854431 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49854471 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49854582 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49854790 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49855042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49855080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49855155 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49855156 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49855226 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49855261 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49855266 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49855273 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49855327 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49855386 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49855604 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 49856183 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49856214 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49856359 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49856474 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49856613 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49856720 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49856728 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49856786 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49856857 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49856894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49856909 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49857037 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49857046 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49857053 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49857061 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49857073 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49857090 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49857224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49857315 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49857433 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49857446 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49857580 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49857598 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 49864367 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49864410 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49864513 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49864689 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49864740 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49864898 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49865001 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49865453 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49865738 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49865762 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49865844 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49865981 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49866149 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49866162 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49866873 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49866893 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49866964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49867028 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49867085 G A N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 3 49867170 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49867172 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49867241 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49867572 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49867913 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 49868134 T G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 49868154 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49868245 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49868356 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49868358 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49868394 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49868435 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49868504 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49868571 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49868584 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49868658 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49868669 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49868677 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49868733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49868750 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49868941 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49868969 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49869153 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49869400 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 49869621 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 49869672 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49869761 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49869849 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49869870 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49869871 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 49869993 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49870152 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49870279 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49870385 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49870551 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49870651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49870658 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49870696 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49870710 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49870929 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49871002 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49871180 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49871319 A C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 49871496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49871498 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49871660 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49871891 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49871911 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 49871918 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49872097 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49872172 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49872219 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49872281 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49872292 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49872350 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49872426 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49872488 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49872711 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49872723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49873006 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49873044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49873107 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49873276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49873378 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49873539 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49873554 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49873687 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49873694 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49873708 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49874042 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49874068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49874083 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49874112 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49874132 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49874137 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49874164 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49874369 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49874385 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49874425 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49874479 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49874511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49874536 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49874543 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49874704 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49874714 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49874753 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49874774 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49875089 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49875167 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49875185 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49875195 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49875230 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49875263 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49875275 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49875408 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49875417 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49875438 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49875478 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 49875480 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 49875499 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49875520 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49875753 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49875843 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49875876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49875916 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49876052 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49876071 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49876170 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49876307 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49876402 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49876676 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49876771 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49876866 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49876887 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49877001 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49877096 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49877233 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49877248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49877263 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49877301 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49877324 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49877386 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49877575 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49877594 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49877601 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49877639 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49877670 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49877865 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49878036 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49878149 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49878158 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49878160 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49878176 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49878262 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49878442 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49878505 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49878714 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49879011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49879178 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49879181 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49879425 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49879573 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49879681 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49879835 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49880058 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49880143 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49880238 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49880246 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49880398 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49880493 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49880738 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49881052 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49881086 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49881111 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49881133 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49881145 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49881241 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49881280 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49881429 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49881439 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49881465 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49881543 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49881618 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49881645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49882101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49882321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49882415 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49882451 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49882471 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49883190 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49883364 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49883611 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49883615 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49883674 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49883841 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49883864 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49884064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49884080 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49884481 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49884675 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49884891 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49884920 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49885139 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49885238 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49885353 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49885481 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49885750 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49885870 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49886024 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49886048 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49886094 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49886145 G C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 49886228 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 49886467 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 49886715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49886790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49886861 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49886965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49887023 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49887032 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49887102 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49888001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49888137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49888152 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49888234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49888263 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49888616 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49888637 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49888710 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49888775 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49888897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49888927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49889120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49889159 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49889189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49889244 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 49889333 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49889361 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 49889414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49889567 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49889593 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49889642 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49889649 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49889676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49889680 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49889829 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49889945 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 49890905 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49891082 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49891222 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 49891363 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49891738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49892193 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49892210 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49892312 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49892355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49892377 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49892443 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49892575 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49892787 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49892820 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49893055 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49893253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49893386 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49893425 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49893459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49893512 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49893768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49896361 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49896391 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49896486 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49896492 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49896617 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49896742 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49896827 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49896922 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49897116 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49897322 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49897436 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49897706 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49897893 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49898163 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49898302 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49898455 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49898613 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49899086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49899380 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49899382 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49899753 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49899816 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49900345 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49900399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49900714 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49902248 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49902254 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49902401 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49902493 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49902599 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49902843 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49902876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49902903 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49903036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49903062 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 49903080 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49903093 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49903581 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 49903819 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49904064 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 49904425 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49904437 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49904492 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 49904526 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49904752 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 49904778 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49904982 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49905282 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49905291 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49905493 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49905515 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49905519 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49905770 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49905956 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49906116 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49906527 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49906602 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49906795 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49906987 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49907206 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49908280 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49909170 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49909178 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49909318 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49910039 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49910045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49910454 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49910607 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49910624 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49910862 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49910967 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49911029 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49911086 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49911272 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49911305 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49911639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49911659 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49911727 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49911859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49911872 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49911946 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 49912095 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 49912152 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49912204 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49912227 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 49912241 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49912273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49912486 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49912860 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49912994 G T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 49913006 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 49913052 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49913077 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49913148 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49913210 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 49913291 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 49913420 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 49913472 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 49913601 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 49913635 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 49913721 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49913743 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49913781 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49913794 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 49913809 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49913886 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 49913917 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 49913929 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49913940 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49913950 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49913967 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49913985 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49914017 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49914033 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49914038 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49914100 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 49914151 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49914211 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49914253 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49914278 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49914314 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49914471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49914472 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49914545 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49914791 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49914959 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49914970 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49914971 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49914989 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49915064 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49915198 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49915290 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49915312 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49915407 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 49915530 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 49915553 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49915615 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 49915616 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49915676 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49915684 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49915717 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49915752 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49915755 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49915771 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49915773 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49915903 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49915922 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49915997 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49916014 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49916034 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49916094 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49916137 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 49916149 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 49916170 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 49916251 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 49916327 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49916366 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 49916377 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 49916383 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 49916399 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 49916438 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 49916560 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49916592 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49916604 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49916648 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49916650 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49916756 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49916854 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49916883 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49916886 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49916940 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49917030 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49917169 T G N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 49917253 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 49917289 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 49917336 T A N N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 49917414 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 49917455 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 49917482 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49917960 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49918659 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49919223 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49919300 T A N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.153846153846154 0.538461538461538 0.307692307692308 11 15 2 7 4 3 49919340 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49919746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49919943 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49920055 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49920116 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49920480 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49920500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49921133 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 49921227 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 49921601 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 49921764 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 49921794 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49922017 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49922101 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49922337 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 49922552 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 49922933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49923028 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49923058 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49923300 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 49923950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49924221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49924809 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 49924868 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49924970 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49925274 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49925710 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49925785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49926050 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 49926094 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 49926116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49926134 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 49926169 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49926193 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 49926217 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 49926238 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 49926255 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 49926312 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 49926343 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 49926404 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 49926613 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 49926877 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49927022 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 49927081 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 49927316 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 49927417 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 49928545 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 3 49928740 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 49928894 T C N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 3 49928998 A C N N 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 12 8 4 4 2 3 49929050 C T Y Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.307692307692308 0.538461538461538 0.153846153846154 15 11 4 7 2 3 49929986 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49929987 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49930083 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 49930151 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 49930368 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 49930467 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 49930707 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49930887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49930888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49931333 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 49931335 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49931521 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49931745 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49931940 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49932489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49932645 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49932685 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49932704 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49932770 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49933061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49933108 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 49933273 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49933502 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49933552 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49933878 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49933958 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49934739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49935092 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49935103 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 49935287 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49935400 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 49935441 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49935755 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49935894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49936254 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49936422 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49936771 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49936956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49937003 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 49937141 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49937161 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 49937163 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 49937184 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 49937193 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49937295 A G N Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 6 8 2 2 3 3 49937356 T A N N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 3 49938797 G T Y N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 3 49938839 T C Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 49938938 C T Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 49938951 A C Y N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 49938968 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 49938993 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 49939006 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 49939091 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 49939097 A T Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 49939168 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 49939205 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 49939277 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 49939318 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49939330 T A N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 49939342 T G N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 49939373 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 49939388 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49940410 C T Y Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.363636363636364 0.545454545454545 0.0909090909090909 14 8 4 6 1 3 49940427 A G Y Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 49940451 G C Y N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 49940472 A T Y N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 3 49940486 G A Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 49940574 G A Y Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.230769230769231 0.769230769230769 0 16 10 3 10 0 3 49940596 C T Y Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.230769230769231 0.769230769230769 0 16 10 3 10 0 3 49940638 T A Y N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.133333333333333 0.666666666666667 0.2 14 16 2 10 3 3 49940669 T G Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 3 49940670 T G Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 49940776 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49940789 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 49940822 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49940940 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49941035 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49941065 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49941139 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 49941144 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 49941151 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49941175 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 49941180 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 49941221 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49941242 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 3 49941250 A G N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 3 49941352 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49941368 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49941391 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49941409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49941630 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49941635 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49941650 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49941687 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49941704 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49941827 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49941973 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49941995 T C N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 3 49942006 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49942030 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49942051 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49942117 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49942209 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 49942249 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49942303 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49942438 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49942655 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49942735 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 49942768 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49942841 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 49942954 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 49943017 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 12 16 2 8 4 3 49943333 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 49943446 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49943531 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 49943543 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49943583 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49943614 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49943750 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 49943802 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49943886 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 49943890 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 49943927 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49944244 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49944286 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 49944326 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 49944420 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 49944479 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 49944595 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 49944659 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 49944685 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49944821 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 49944916 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 49944964 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 49944965 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49944975 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 49944987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49945004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49945068 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 49945126 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 49945129 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 49945137 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 49945165 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49945248 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 49945292 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 49945297 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49947368 T A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 49947466 A G N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 3 49947485 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49947522 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49947534 G C N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 12 16 2 8 4 3 49947824 C T N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 49947880 T C N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0 0.6 0.4 6 14 0 6 4 3 49947993 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 49948017 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 49948139 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0 0.85 0.15 17 23 0 17 3 3 49948144 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 49948170 G T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 49948301 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49948320 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 49948326 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49948339 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 49948428 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49948456 G T N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 3 49948465 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49948600 A G N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.0909090909090909 0.636363636363636 0.272727272727273 9 13 1 7 3 3 49949004 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 49949075 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49949081 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49949211 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49949260 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49949291 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 49949334 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49949499 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 49949618 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 49949652 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 49949736 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 49949762 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 49949793 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49949965 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 49950152 T A Y N 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 3 49950734 G C Y N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 49951082 A G N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 49951205 G A Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 49951482 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 49951581 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 49951680 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 49951720 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 49951736 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49951775 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 49951795 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49951830 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 49951983 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 49952202 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 49952243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49952349 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 49952574 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 49952719 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 49952787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49953057 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49953086 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 49953095 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49953104 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49953169 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 49953185 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 49953450 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 49953493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49953684 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49953855 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 49953891 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 49953968 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 49954251 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49954277 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49954406 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 49954459 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 49954465 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 49954540 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 49954553 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49954586 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 49954595 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 49954608 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 49954802 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49954900 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49955108 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49955231 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 49955241 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49955275 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 49955482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49955681 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49955693 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49955714 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 49955722 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49955796 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49955841 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 49955856 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49955861 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 49955961 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 49956022 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49956040 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49956047 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49956067 G C N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 3 49956258 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 49956284 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49956372 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49956419 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 49956434 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 49956440 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 49956460 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 49956488 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 49956598 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49956728 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49957034 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 49957072 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 49957215 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 49957237 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49957272 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 49957303 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49957423 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 49957427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49957465 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49957471 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 49957909 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49957975 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 49958081 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49958146 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 49958388 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49958409 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 49958429 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 49958505 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49958745 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 49958775 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49958859 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 49958867 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 49958886 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 49958942 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 49959065 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 49959161 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 49959169 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 49959180 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 49959206 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 49959239 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 49959302 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 49959419 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 49959425 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 49959483 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 49959496 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 49959528 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 49959615 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 49959618 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 49959711 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 49960242 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 49960261 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 49960401 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 49960673 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49960975 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49961109 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49961197 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49961336 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 49961505 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49961916 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 49961999 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49962545 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 49962613 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49962776 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49963178 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49963190 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49963332 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49963348 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 49963351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49963502 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49963669 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 49963962 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49964865 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 49964902 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49965145 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49965288 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49965290 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 49965351 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 49965562 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 49965568 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49966062 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 49966453 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 49966464 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 49966697 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49966936 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 49966948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49966990 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49967028 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49967084 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 49967175 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 49967360 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 49967528 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 49968147 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 49968169 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49968445 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 49968808 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 49968841 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 49969081 T G N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 49969105 G A N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 3 49969242 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 49969244 T A N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 3 49969274 A G N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 3 49969391 C T N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.153846153846154 0.615384615384615 0.230769230769231 12 14 2 8 3 3 49969444 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49969514 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49969518 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49969562 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 49969563 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49969628 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 49969666 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49969667 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 49969837 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49969864 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 49969937 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49969996 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 49970191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49970286 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49970453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49970514 C A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 3 49970583 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49970893 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 49970901 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 49970959 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49970986 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49971252 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49971370 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49971638 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 49971723 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49971757 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49971839 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49971917 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49971946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49972153 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49972220 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49972626 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 49972633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49972687 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49972926 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49972942 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 49972957 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49972958 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49973302 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 49973396 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 49973443 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 49973457 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 49973516 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 49973583 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 49973719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49973720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49973740 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 49973748 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49973767 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49973815 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49973839 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 49973914 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49974049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49974062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49974108 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49974673 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 49974783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49974797 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49974816 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 49974901 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 49974946 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 49975009 G A N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 49975224 T C N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 3 49975297 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 49975298 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 49975327 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 49975359 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49975411 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49975431 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 49975514 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49975982 A G N Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 9 5 3 3 1 3 49976060 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 49976140 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 49976147 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 49976217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49976286 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49976448 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49976567 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49976763 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 49976937 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49976955 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 49976956 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49977078 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49977079 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49977175 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 49977290 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49977576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49977639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49977647 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49977658 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49977675 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49977779 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49977893 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49978008 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49978018 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 49978081 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49978090 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49978156 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 49978166 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 49978294 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 49978296 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49978354 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 49978497 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 49978499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49978542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49978608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49978645 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49978708 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49978915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49978979 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49978992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49979199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49979306 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 49979454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49979577 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 49979599 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 49979770 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 49979922 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49979923 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 49979949 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 49979978 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 49980077 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 49980091 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 49980092 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 49980112 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 49980113 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 49980177 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 49980187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49980589 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49980800 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49980962 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 49981112 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 49981508 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49981579 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 49981718 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49981719 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49981852 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49981877 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49981992 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49982028 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49982071 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49982525 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49982606 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49982919 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49983004 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 49983103 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 49983177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49983254 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49983261 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49983375 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49983410 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 49983451 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 49983493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49983499 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 49983548 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49983552 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 49983594 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 49983622 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 49983652 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49983785 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49983907 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 49983974 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 49984035 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 49984053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49984080 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 49984119 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 49984177 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 49984310 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 49984320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49984325 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 49984416 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49984432 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 49984453 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 49984456 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49984478 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49984517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49984796 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49984884 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49985120 G T N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 49985134 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 49985256 C G N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 49985264 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 49985434 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49985494 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 49985530 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49985639 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49985762 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49985779 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49985789 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49985896 A G N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.230769230769231 0.538461538461538 0.230769230769231 13 13 3 7 3 3 49986032 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 49986121 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49986136 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 49986555 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49986581 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49986664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49986787 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 49986832 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 49987034 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 49987068 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 49987138 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 49987224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49987230 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 49987448 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49988019 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 49988055 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49988416 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 49988580 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 49988668 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49988737 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49988958 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 49989080 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 49989141 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 49989383 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49989574 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 49989691 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 49989769 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 49989772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49989804 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49989823 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49989967 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49989988 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 49989998 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 49990235 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49990300 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49990720 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49990816 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 49991185 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 49991226 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 3 49991323 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 49991486 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 3 49991490 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 49991531 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49991627 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49991713 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49991772 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49991801 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 49991833 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49991918 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 49991982 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49992016 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49992020 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49992040 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49992343 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 49992408 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49992830 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 49993205 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 49993250 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49993272 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49993435 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49993436 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49993622 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49993687 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 49993720 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49993875 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 49994250 G C Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 49994417 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 49994441 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49994540 A G Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 3 49994846 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49994869 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 49995018 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49995472 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49995507 T G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49995590 G A Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 49995714 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49995995 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49996031 A C Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 49996064 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 49996306 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49996503 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49996772 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 49996786 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49996939 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49996976 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 49997095 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49997218 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49997415 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49997568 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 49997569 A G Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 49997611 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49997741 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 49997903 A T N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 49997983 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 49998011 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 49998329 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 49998330 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 49998494 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 49998587 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 49998624 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 49998729 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 49998817 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49999088 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 49999098 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 49999099 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 49999112 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 49999124 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 49999128 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 49999484 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 49999501 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 49999551 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 49999552 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 49999613 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 49999638 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 49999829 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 49999842 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 49999918 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 49999950 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 49999997 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 50000016 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 50000053 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 50000126 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50000149 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50000186 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50000208 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 50000236 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 50000250 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50000255 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50000300 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50000541 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 50000722 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 50000733 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50000781 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50000786 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50000828 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50000901 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50001107 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50001191 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50001233 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 50001263 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50001309 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50001419 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50001445 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 50001538 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50001923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50001949 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50002412 A G Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 3 50002413 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 50003106 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 50003151 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 50003219 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50003398 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50004141 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50004758 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50005016 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50005162 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50005468 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50005484 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50005545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50005546 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50005675 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50005820 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50005848 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50005864 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50006101 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50006113 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50006209 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50006475 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50006494 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50006522 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 50006531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50006553 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50006568 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50006571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50006600 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50006768 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50006813 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50006842 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50006872 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50006876 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50006898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50006937 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50007107 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50007160 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 50007180 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 50007246 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50007288 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50007303 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50007312 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50007338 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50007471 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50007526 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50007546 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 50007612 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50007678 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50007707 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50007710 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50007759 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50007791 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50007803 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 50007841 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 50007850 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 50007853 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 50007865 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 50007955 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 50008023 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 50008192 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50008231 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50008235 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50008307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50008346 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50008347 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50008357 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50008411 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50008441 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50008474 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50008568 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50008569 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50008783 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50008903 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50008956 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50009030 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 50009339 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50009352 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50009477 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50009546 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50009711 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 50009770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50009798 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50009815 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50009826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50009860 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 50009866 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50009876 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50009932 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50009951 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50009998 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50009999 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50010071 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50010085 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50010121 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50010123 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50010151 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50010544 T G N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 50010635 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50010948 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 50011281 T G N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 50011284 A T N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 50011452 C T Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 50011572 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 50011573 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 50011584 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 50011649 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50011729 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50011859 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50011939 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50011962 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50012092 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50012176 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50012344 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50013065 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50013133 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50013239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50013282 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50013470 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50013474 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50013635 A T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 50013655 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 50013688 T A N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 3 50013835 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50013837 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50013922 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50014612 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50014643 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50014781 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50014793 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50014838 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50014922 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 50014942 T A Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 50015249 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50015384 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50015389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50015459 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 50015764 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50015801 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50015865 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50015884 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50015997 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 50016242 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50016264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50016511 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50017149 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 50017212 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 50017286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50017289 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50017777 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50017875 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 50018108 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50018458 G A N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 50018477 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 50018501 A G N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 50018645 A C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 50018666 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50018673 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50018897 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50019023 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50019086 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 50019183 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 50019214 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 50019455 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50019482 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50019502 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50019584 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50019594 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50019604 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50019679 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50019690 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50019844 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50019845 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50019976 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50020011 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50020489 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 50020668 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 50020773 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 50020849 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50021001 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50021042 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 50021084 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 50021132 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 50021165 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 50021185 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 50021204 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 50021315 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50021330 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 50021579 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 50021584 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 50021590 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 50021624 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50021663 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 50021837 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 50021853 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 50022102 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 50022122 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 50022541 A C N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 50022622 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50022687 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50022743 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50022745 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50022777 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50022811 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50022918 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50022922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50022989 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50023050 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50023053 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50023169 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50023191 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50023224 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50023303 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50023306 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50023371 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50023423 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50023456 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50023557 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 50023627 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 50023643 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 50023965 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50024199 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 50024200 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 50024254 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 50024458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50024679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50025057 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 50025278 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50025706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50026415 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50026421 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50027268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50027601 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50027645 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50027915 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50028373 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 50028604 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 50029476 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 50029541 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 50029671 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50029685 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50029927 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50029962 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 50030002 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50030051 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50030259 C A N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 50030319 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 50030345 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 50030420 C T N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 50030467 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 50030492 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 3 50030833 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50031122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50031272 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 50032327 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 50032347 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 50032366 A T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 3 50032367 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 3 50032413 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50032474 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 50032542 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 50032617 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50032670 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50032695 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 50032717 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50032961 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50033065 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 50033076 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50033099 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50033134 A T N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 3 50033172 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 50033175 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50033217 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 50033261 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 50033413 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 50033531 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 50033554 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 50033667 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50033675 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 50033757 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50034105 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50034403 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 50034531 C T Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 50034532 A G Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 50034752 G C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 50034762 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 50034763 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 50034904 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 50034945 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 50035017 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 50035023 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 50035067 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 50035130 A C N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 3 50035143 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 50035162 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 50035263 A G N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 3 50035272 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 50035289 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 50035308 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50035324 C A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 50035662 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 50035665 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 50035811 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 50036168 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 50036262 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 50036263 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 50036285 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 50036446 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50036508 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50036688 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 50036837 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 50036865 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 50036934 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50037085 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50037246 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 50037460 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 50037480 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 50037505 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 50037721 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 50037776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50037816 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 50037845 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 50037943 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50037990 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 50038189 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 50038210 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 50038211 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 50038273 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50038288 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50038376 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 50038391 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 50038451 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 50038605 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 50038970 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50038995 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 50039121 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 50039305 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 50039555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50039570 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50039802 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 50039876 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 50040173 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50040195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50041418 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 50041430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50041561 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50041870 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50042895 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50043160 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50043195 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50044066 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50044218 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50044684 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50044925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50045068 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50045186 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 3 50045616 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 50045670 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 50045695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50046536 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50046776 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50046905 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 50046985 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50047074 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50047111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50047144 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50047604 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50047700 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 50047708 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50048153 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50048184 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50048242 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 50048251 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50048324 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 50048386 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50048426 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50048511 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50048535 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50048557 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50048562 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50048616 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50048634 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50048717 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50048725 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50049056 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 50049114 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50049150 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 50049297 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50049369 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50049488 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50049610 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 50049650 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 50049670 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 50049749 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50049808 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50049957 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 50050055 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 50050133 C A N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 50050538 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 50050612 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 50050895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50051223 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50051869 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 50051999 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50052047 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50052101 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 50052129 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50052368 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50052562 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 50052692 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 50052734 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50052836 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 50052837 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 50052918 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50052962 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 50053019 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 50053154 G A N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 3 50053305 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50053315 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50053321 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50053643 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50053644 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 50053706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50053815 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 50054048 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 50054143 G T N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 50054145 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50054174 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50054320 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 50054324 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 50054493 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 50054514 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 50054679 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50054714 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50054825 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50054869 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50054905 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50054928 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 50054955 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50054987 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 50055016 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50055017 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50055101 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50055199 C T N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 3 50055221 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 50055770 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 50056768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50056928 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50058089 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 50058318 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 50058726 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50058727 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50059088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50059293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50060632 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50061217 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50061536 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50061621 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50061695 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50061787 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50061984 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50062002 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50062205 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 50062215 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50062328 T A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 50062439 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50062483 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50062598 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50062636 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50062980 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50063194 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 50063377 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 50063820 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50063839 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50063916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50063940 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 50064216 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 50064247 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 50064345 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 50064395 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 50064412 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 50064813 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 50064826 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50064842 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50065053 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50065095 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 50065232 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 50065233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50065251 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 50065258 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 50065403 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50065434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50065817 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50066080 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50066185 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50066197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50066323 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50066462 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50066486 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 3 50066501 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50066526 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 50066723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50066745 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50066920 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50066921 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50066935 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50067079 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 50067206 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50067210 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50067249 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50067260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50067313 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50067340 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50067375 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50067521 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50067568 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50067577 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50067640 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50067660 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50067716 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50067770 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50067892 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 50068141 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50068157 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50068232 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50068266 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 50068317 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50068346 T G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 50068475 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50068516 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50068518 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50068604 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50068639 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50068653 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 50068659 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 50069016 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 50069055 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 50069086 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 50069125 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 50069142 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 50069180 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 50069227 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50069268 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 50069285 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50069318 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50069333 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 50069414 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50069584 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50069609 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 50069722 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50069728 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50069805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50069939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50069962 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50069976 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50070162 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50070382 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50070721 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 50070871 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50071125 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50071371 T A Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 50071674 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 3 50071692 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50072099 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 50072171 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50072197 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50072207 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50072230 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50072332 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50072367 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50072697 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50072758 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50072767 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50073253 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50073317 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50073369 T A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 50073454 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50073499 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50073583 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50073641 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50073706 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50073826 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50073959 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50073971 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50074003 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 50074111 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 50074169 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50074179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50074377 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50074385 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 50074503 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 50074555 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 50074838 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50074839 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50074867 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50074885 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 50074919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50074975 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50075043 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50075114 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50075143 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50075217 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50075237 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50075358 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50075838 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 50075877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50076038 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 50076125 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50076126 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50076442 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50076458 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50076467 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 50076688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50076920 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 50076953 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 50076975 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 50077229 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 50077254 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 50077614 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 50077872 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 50078380 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 50078412 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 50078461 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50078534 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 50078568 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 50078607 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50078632 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 50079338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50079396 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50079409 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 50079674 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50079803 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50079892 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 50080172 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50080179 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50080187 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50080228 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50080365 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50080423 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 50080831 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50080877 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50081006 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50081007 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50081083 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50081228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50081259 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50081267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50081505 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50082006 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50082212 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50082235 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50082706 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50082738 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50082762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50082885 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50083110 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50083282 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50083301 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50083400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50083443 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50083817 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 50083846 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 50083975 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 50084052 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50084059 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50084335 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50084704 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50085336 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50085422 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50085465 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50085501 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50085507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50086240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50086272 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50086442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50086451 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50086647 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50086677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50087212 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 50087423 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50087451 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50087676 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50087684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50087901 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50087924 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50087953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50088057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50088248 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50088258 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50088294 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50088466 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 50088822 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50089468 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 50089911 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50090418 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50090819 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50091078 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50091128 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50091188 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50091430 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50091754 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50091830 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50092048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50092227 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50092303 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50092896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50093076 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50093158 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50093301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50093426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50093447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50093588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50093849 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50094346 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50094475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50094707 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50094908 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50095013 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50095082 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 50095215 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50095264 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50095311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50095331 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 50095407 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50095831 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50096081 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50096150 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50096334 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50096851 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50096908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50097131 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50098065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50098866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50098961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50099307 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50099331 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50100735 T G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 50101239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50101846 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50102171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50103549 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50103792 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50103821 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 50103831 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50103917 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50104261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50104273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50105097 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50105303 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50105365 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 50106422 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50106854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50106913 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50106924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50106958 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50107029 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50107046 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50107190 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50107320 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50107404 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50107570 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50108053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50108330 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50108502 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50108746 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50108848 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50108921 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50110573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50111272 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 50111297 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50111319 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 50111323 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 50111394 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 50112737 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50112753 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50112818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50113549 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50113750 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 50114961 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50115163 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50115519 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 50115866 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 3 50116179 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50116216 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50116376 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50116476 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 50116525 G C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 50116568 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50116616 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 50116633 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50116701 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 50116803 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 50116844 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 50116877 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 50117010 C A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 50117034 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 50117054 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 50117069 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 50117070 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 50117102 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50117738 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50117775 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50118303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50118363 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50118382 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50118482 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50118855 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50118995 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50119010 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50119041 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50119155 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50119196 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50119528 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50119542 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50119556 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50119608 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50119788 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 50119800 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50119818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50119855 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 50119876 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50119923 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 50120125 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50120174 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50120195 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50120224 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50120308 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50120310 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50120379 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50120382 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50120431 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50120445 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50120491 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50120492 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50120563 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50120888 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50121072 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50121126 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50121177 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50121272 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50121283 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50121310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50121694 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 50121731 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 50121826 T C N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 3 50121855 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 50121891 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50122019 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50122160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50122535 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 50122623 C A N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 50122656 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 50122759 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 50122780 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 50122832 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50123015 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 50123182 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50123195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50123264 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 50123282 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50123465 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50123558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50123818 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50123902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50124030 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50124199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50124232 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 50124243 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 50124385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50124397 T G N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 3 50124419 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50124432 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50124433 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50124927 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50125001 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50125028 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 50125146 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50125169 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 50125256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50125288 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50125621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50125696 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50125870 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50126309 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 50126871 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50126896 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50127096 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50127245 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50127413 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 50127477 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50127942 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50127968 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50128034 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 50128763 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 50128855 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 50128899 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 50128913 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50128917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50129012 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50129120 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50129313 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 50129352 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50129413 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 50129415 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 50129522 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50129580 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50129614 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50129659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50129690 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50129712 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50129759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50129800 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50129819 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50129921 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50130028 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50130090 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50130136 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50130415 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50130538 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50130699 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50130713 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 50130735 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 50130789 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 50130800 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 50130889 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 50130979 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 50130984 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 50130992 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 50131145 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50131223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50131523 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50131666 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 50131734 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50131790 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 50131931 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50131957 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50131963 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50132013 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50132076 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50132180 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50132361 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50132371 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50132440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50132539 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50132540 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50132555 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50132614 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50132623 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50132693 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 50132712 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50133184 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50133256 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 50133274 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50133612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50133638 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50133709 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50133733 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50133779 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50133782 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50134069 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50134091 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50134097 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50134138 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 50134341 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 50134841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50134850 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50135001 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50135668 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50135780 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50136086 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50136154 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50136393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50137095 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50137144 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50137165 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50137308 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50137449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50138016 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 50138025 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 3 50138081 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 50138087 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 50138107 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 50138138 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 50138394 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 50138660 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 50138724 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50138955 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50140017 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 50140033 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 50140282 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50140283 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50140377 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 50140882 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50141228 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 50141358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50141494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50141697 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50142593 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50142900 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50142954 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 50143052 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 50143470 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50143536 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50144211 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50144248 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50144424 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 50144946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50145010 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 50145093 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 50145099 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 50145218 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50145273 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 50145312 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50145340 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 50145435 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 50145462 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 50145539 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50145564 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 50145654 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 50145667 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 50145760 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 50145876 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50145908 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 50146021 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 50146025 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50146045 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 50146170 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 50146188 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 50146217 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 50146221 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 50146254 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 50146270 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 50146283 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 50146299 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 50146401 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 50146525 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 50146625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50146956 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 50147204 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 50147386 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 50147400 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 50148243 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 50148292 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 50148311 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50148599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50148732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50148826 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50149016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50149838 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50149857 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50150060 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50150557 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 50150788 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 50150805 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50150819 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50151045 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 50151060 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50151212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50151675 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50151977 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 50152033 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 50152111 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 50152143 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 50152478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50152653 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 50152678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50152843 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 50152884 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 50153003 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 50153042 C T N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 3 50153115 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 50153118 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 50153145 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 50153386 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50153566 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 50154195 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 50154330 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50154331 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50154365 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50154419 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50154538 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50154581 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50154673 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50154691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50154714 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50154767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50154812 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50154863 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50154904 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50154932 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50154968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50155081 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50155095 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50155240 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 50155271 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 50155280 T A N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 3 50155409 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 50155506 T C N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 10 10 3 4 3 3 50155510 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 50155524 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 50155553 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 50155609 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 50155671 C T N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 3 50155698 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50155745 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50155765 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 50155884 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50155889 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50155902 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50155929 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50155964 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50155978 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50156082 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50156159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50156201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50156389 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50156455 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 50156555 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 50156681 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50156757 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 50156782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50157107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50157238 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50157460 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 50157677 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 50157956 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50158163 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50158196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50158413 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 50158432 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 50158451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50158737 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50159417 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 50159422 T C N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 3 50159433 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 50159559 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 50159567 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 50159573 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 50159599 G C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 50159686 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 50159689 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50159905 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50159909 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50160000 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 50160159 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50160219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50160240 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50160341 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50160370 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50160822 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50160861 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 50160869 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 50161083 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 50161184 G T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 50161324 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50161369 G C Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 50161492 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50161591 G A Y Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.153846153846154 0.538461538461538 0.307692307692308 11 15 2 7 4 3 50161645 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 50161666 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 50161772 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 50161999 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50162095 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50162115 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50162121 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 50162234 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 50162262 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 50162300 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 50162400 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50162413 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 50162454 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 50162528 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 50162529 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 50162608 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50162613 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 50162817 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 50162889 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 50163022 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 50163114 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 50163134 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 50163165 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50163347 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 50163408 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 50163616 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 50163629 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 50163799 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 50163877 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50163890 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50163907 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50164039 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 50164074 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 50164096 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 50164121 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 50164157 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 50164178 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 50164185 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50164260 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 50164399 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 50164713 A G N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 50164764 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50164812 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 50165168 G A N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 50165212 A G N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.545454545454545 0.0909090909090909 0.363636363636364 13 9 6 1 4 3 50165348 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 50165594 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 50165611 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 50165711 C T Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 50166457 A T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 50166491 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50166530 A C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 50166571 C A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 50166636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50166642 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50166685 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 50166813 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 50166832 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 50166836 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 50166852 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 50166866 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 50166874 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 50166973 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 50167045 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 50167132 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50167146 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 50167160 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50167208 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50167276 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50167415 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 50167458 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 50167588 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 50167609 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50167654 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50167929 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 50168023 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50168066 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 50168078 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 50168136 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 50168446 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 50168476 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 50168674 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 50168689 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 50168747 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 50168801 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 50168856 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 50168892 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50169497 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 50169701 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50169796 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 50170057 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50170233 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 50170590 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 50170643 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50170677 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 50170751 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50170752 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50170820 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 50170831 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50170835 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50170877 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50171132 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50171135 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50171283 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50171298 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 50171344 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50171412 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50171520 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50171665 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50171676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50171677 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50171763 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50171845 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50171907 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 50172018 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50172049 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50172050 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50172139 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 50172285 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50172353 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 50172525 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50172677 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50172728 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 50172851 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 50172858 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 50172877 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 50172902 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 50173074 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50173130 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50173218 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 50173252 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50173320 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 50173384 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 50173520 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50173546 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50174591 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 50174697 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50174737 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50174887 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 50174940 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 50175364 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50175454 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50175493 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50175524 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50175705 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 50175711 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50175923 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 50175964 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 50176056 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50176458 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 50176459 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 50176475 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 50176530 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 50176575 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 50176677 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 50177049 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 50177162 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50177180 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50177204 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 50177218 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 50177246 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50177338 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50177363 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50177600 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 50177645 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50177714 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50177813 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50177814 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50177939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50177949 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50178077 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 50178129 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50178267 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 50178332 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50178437 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 50178477 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 50178490 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 50178593 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 50178665 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 50178671 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 50178731 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50178749 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 50178792 G A N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 50178969 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50179124 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 50179170 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 50179237 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 50179719 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50179739 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50179764 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50179780 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50179792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50180193 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50180197 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50180330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50180614 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 50180740 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 50180833 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 50180871 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 50181340 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 50181347 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 50181432 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50181571 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50181924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50182066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50182201 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50182255 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50182516 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50182636 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50182776 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50183329 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50183330 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 50183428 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50183784 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50183900 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 50183926 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50183963 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50183969 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50184019 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 50184050 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 50184164 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 50184572 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 50185921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50186105 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 50186303 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50186564 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50186627 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50186704 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50186770 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50186999 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 50187083 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 50187283 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50187404 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50187438 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50187637 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50187669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50187725 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50187799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50187845 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 50188306 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50188379 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50188426 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50188429 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50188497 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50188529 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50188674 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 50188825 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 50188851 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 50189029 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 50189519 G T Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 50189683 C T Y Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 3 50189819 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 50189870 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 50189947 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 50189953 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 50190017 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50190026 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 50190539 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50190587 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 50190654 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50190734 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 50190796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50190955 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50190963 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50191002 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50191094 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 50191209 A T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 50191373 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 50191473 C T N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 50191666 G A N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 50191894 T A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 50191973 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 50192043 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 50192066 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 50192247 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 50192279 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 50192366 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 50192461 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50192664 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50192835 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 50192904 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 50193027 C G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 50193035 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 50193530 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 50193594 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50193657 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50193708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50193766 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50194258 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 50194367 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 50194460 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 50194461 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50194685 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 50194758 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50194770 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50194842 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50194971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50194997 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 50195109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50195167 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50195179 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50195204 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 50195470 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50196152 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50196297 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 50196473 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 50196481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50196744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50196853 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 50196861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50197055 T A Y N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 50197365 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 50197466 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50197633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50197674 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50197737 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50197863 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50197872 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50198109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50198220 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50198264 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50198273 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50198292 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50198459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50198479 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 50198504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50198528 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50198540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50198603 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50198621 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 50198729 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 50198746 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50199115 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50199138 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50199175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50199404 A T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 50199424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50199521 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 50199532 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 50199596 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 50199626 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 50199756 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 50199765 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 50199887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50199894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50200043 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50200145 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50200237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50200271 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 50200276 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 50200308 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 50200366 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50200419 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50200448 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50200505 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50200514 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50200571 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50200588 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 50200650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50200724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50200895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50201226 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50201246 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50201354 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50201418 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50201447 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 50201544 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50201618 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 50201909 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50201921 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50202021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50202046 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50202568 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50202571 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50202620 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 50202646 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50202721 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 50202767 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50202882 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50203005 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50203076 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 50203077 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 50203131 A T N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 3 50203466 C A Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 50203516 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 50203567 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 50203583 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 50203593 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50203623 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50203634 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50203657 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 50203705 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50203710 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 50203740 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 50203929 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 50203959 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50203988 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 50203994 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 50204020 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 50204039 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 50204096 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 50204126 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 50204157 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 50204224 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 50204271 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50204293 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 50204297 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 50204307 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 50204317 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 50204334 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 50204512 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 50204641 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50204706 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 50204819 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 50204855 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 50204868 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 50205008 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 50205209 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 50205298 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 50205334 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 50205561 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 50205647 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 50205731 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 50205774 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 50205964 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 50205992 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50206018 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 50206078 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50206236 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50206266 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50206510 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 50206552 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50206684 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50206719 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50206735 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50206879 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50206884 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50207014 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50207136 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 50207142 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50207154 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50207212 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 50207427 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 50207597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50207965 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50208009 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 50208011 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50208703 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50208707 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50208721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50208724 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50208743 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50208810 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50208907 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50209115 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50209142 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50209204 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50209227 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50209335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50209376 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 50209478 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 50209540 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50209559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50209653 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50209655 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 50209720 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50209878 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50209960 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50209994 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 50210064 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50210202 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50210251 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50210516 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 50210520 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50210959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50211054 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50211075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50211154 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50211228 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 50211327 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 50211463 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 50211602 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 50211614 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 50212081 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 50212222 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50212269 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50212318 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50212452 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50212463 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50212515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50212671 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50212703 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50212933 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50212993 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50213330 C A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 50213718 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50213778 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50214049 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 50214325 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 50214914 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50214977 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50214980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50215131 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50215899 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 50215917 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50217001 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 50217014 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50217260 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50217310 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 50217311 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 50217321 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50217335 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50217528 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 50217544 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50217675 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50217752 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 50217794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50217807 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 50217832 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50217879 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50217923 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 50217939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50218018 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 50218034 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50218047 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50218073 C A Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 50218087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50218104 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50218156 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 50218327 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50218346 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 50218354 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 50219186 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 50219214 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 50219334 G C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 50219359 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 50219478 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50219526 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50219529 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50219541 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50219659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50219958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50220078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50220117 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50220182 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50220471 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50220490 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50220547 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50220633 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50220659 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50221004 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 50221101 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50221249 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50221340 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50221395 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50221717 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 50221873 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 50221879 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 50221998 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 50222069 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 50222369 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50222588 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50222729 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50222764 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50222905 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 50222925 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 50223093 A C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 50223116 T G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 50223288 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 50223439 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 50223452 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 50223488 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 50223489 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 50223499 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 50223561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50223595 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50223599 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50223892 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50223935 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50224169 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50224240 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50224259 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 50224337 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 50224471 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 50224535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50224552 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50224594 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50224735 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50224759 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50224964 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 50224998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50225021 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50225107 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 50225131 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50225206 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50225208 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50225385 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50225436 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50225447 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50225502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50225605 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50225648 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50225649 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50225770 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50226388 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 50226637 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 50226840 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50226870 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50227068 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 50227379 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 50227499 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 50227560 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50227583 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 50228023 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50228263 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50228312 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50228391 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50228441 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50228519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50228712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50228867 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50229182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50229441 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 50229457 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 50229516 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 50229592 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 50229836 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50229869 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50229890 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50229895 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50230063 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50230068 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50230127 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50230197 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50230393 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 50230534 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50230630 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50230721 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50231241 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50231566 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50231922 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50231977 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50231978 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50232036 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50232103 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50232295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50232305 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50232678 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 50233104 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 50233171 A T Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 50233205 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50233298 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 50233411 G T Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 50233429 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 50233434 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 50233474 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 50233478 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 50233588 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 50234229 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50234379 T G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 50234418 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50234456 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50234469 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50234727 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50235084 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 50235166 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50235226 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 50235330 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50235398 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 50235419 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 50235597 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50235640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50235741 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50235818 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50235949 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50235972 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50236001 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50236082 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50236100 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50236101 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50236173 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 50236237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50236356 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50236380 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50236396 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50236453 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 50236498 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 50236533 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 50236782 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50237335 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 50237538 C A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 50237679 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 50237750 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50237835 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50237883 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50237884 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 50237922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50238109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50238150 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 50238226 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 50238305 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 50238322 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 50238437 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 50238447 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 50238451 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 50238519 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 50238597 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 50238612 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 50238650 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 50238651 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50238683 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 50238725 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 50238755 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 50238804 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 50238835 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 50238925 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50238958 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50239084 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 50239126 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 50239133 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50239191 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 50239233 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 50239457 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 50239527 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50239627 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 50239641 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50239660 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 50239847 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50240121 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50240165 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50240288 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50240304 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 50240503 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50240639 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50240656 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 50240837 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50241346 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50241860 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50242087 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50242961 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50243082 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50243127 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50243305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50243334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50243371 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50243411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50243418 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50243436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50243559 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50243574 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50243628 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50243665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50243882 C G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 50243884 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 50243940 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 50243980 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50244033 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50244072 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50244080 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 50244089 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50244148 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 50244226 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50244233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50244243 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50244270 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50244281 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50244286 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50244612 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50244673 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 50244686 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50244743 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50244787 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50244828 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50244859 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50244934 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50245271 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50245491 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 50245587 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 50245635 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 50245725 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 50246553 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 50247540 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50248869 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 50249181 A T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 50249234 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 50249490 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50249554 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 50249756 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 50249789 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 50249798 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 50249936 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 50250114 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 50250199 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50250471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50250491 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50250622 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50250637 C A N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 50250978 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50251438 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50251607 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50254697 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 50255681 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 50255854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50255906 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50256098 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 50256228 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50256286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50256401 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50256718 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50257130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50257644 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50258733 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50258996 G C Y N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 3 50259978 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50260220 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50260308 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 50261082 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50261176 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50261443 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50261611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50262367 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50262455 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 50262470 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 50262650 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 50262741 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 50262750 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50263089 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 50263141 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0 0.842105263157895 0.157894736842105 16 22 0 16 3 3 50263253 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 50263265 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50263484 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50265987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50266284 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50266301 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 50266346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50266564 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50266639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50266651 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50266693 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50266744 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 50266745 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 50266852 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50266883 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 50267093 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50267152 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 50267263 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50267265 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 50267292 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 50267679 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50267708 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 50267711 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50267847 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50267945 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50267976 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 50268086 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50268163 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50268700 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50268753 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 50275613 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50276021 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 50276447 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50278424 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 50278869 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50278948 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50279034 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50279329 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50279366 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50279397 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 50279734 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50279775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50280399 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50280515 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50280566 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50280578 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50280854 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50281279 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50281390 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50282428 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 50282733 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50283033 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50283395 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 50284173 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50284193 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50284215 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 50284540 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 50284851 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50284948 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50285244 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 50285731 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 50286116 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50286161 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 50287104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50287114 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50287477 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 50287890 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50288082 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 50288420 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50288864 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 50289083 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 50289910 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50290004 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50290411 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50291379 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50291418 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50293059 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50293945 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50294664 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50295530 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50295684 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50295700 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50295948 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50296151 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 50296327 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50296439 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 50296649 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50296906 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 50296935 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50297006 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 50297037 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 50297041 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 50297079 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 50297101 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 50297166 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 50297205 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 50297257 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50297308 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50297322 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50297472 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50297994 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 50298052 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 50298074 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50298093 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50298110 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 50298127 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 50298475 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50298532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50298583 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50298627 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50298830 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50299315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50299316 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 50299370 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50299404 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50299932 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50300855 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 50300925 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50301705 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 50301838 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 50302189 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50302890 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 50303308 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50303434 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50303478 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50303560 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50303820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50304039 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 50304106 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50304311 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50304792 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 50305463 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50305792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50306170 G A N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 50306184 A G N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 50307961 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 50308469 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50308497 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50308680 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50308948 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 50309014 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 50309080 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50309094 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50309136 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50309178 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50309179 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50309316 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 50309377 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50309386 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 50309483 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50309673 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50309695 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50310302 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 50310372 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 50310399 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50310565 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50310654 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50310892 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50310908 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50310910 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 50311159 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 50311268 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 50311550 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 50311851 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50311879 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 50312124 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50312290 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 50312543 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50312553 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 50312703 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50312867 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 50312959 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50312961 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50312984 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50313049 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50313120 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50313127 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50313466 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50313520 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50313598 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50313602 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50313618 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50313622 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50313685 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50313697 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50313831 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50313832 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50313971 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50313972 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 50314061 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 50314359 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 50314534 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 50314582 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 50314600 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 50314685 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 50314749 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 50314835 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 50315130 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 50315171 A G Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 50315256 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 50315287 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 50315296 C G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 50315341 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 50315357 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 50315380 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 50315418 T A N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 50315436 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 50315517 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 50315597 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50315615 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 50315616 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 50315693 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 50315734 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 50315852 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 50315926 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50315967 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 50316141 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 50316341 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 50316401 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 50316425 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 50316523 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 50317554 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50317884 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50317951 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50317960 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 50318358 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50318568 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 50318666 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 50318753 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50318828 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 50319234 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50319242 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 50319437 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50319474 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50319594 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50319718 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 50319768 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 50319769 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50319871 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 50319922 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 50319934 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 50320504 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50320555 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 50320567 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 50321060 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50321191 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 50321234 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 50321275 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50321277 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50321341 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 50321435 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 50321462 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 50321793 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50321813 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50321913 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 50322113 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 50322129 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50322498 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50322616 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50322639 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50322766 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50322782 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 50322786 A T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 50322803 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 50322840 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 50322908 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50323146 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 50323362 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 50323446 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 50323789 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50323871 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50323872 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 50323956 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 50324285 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 50324826 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50324888 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 50325026 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50325424 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 50325478 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 50325513 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 50325564 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50325601 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50325684 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50325687 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50325712 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50325725 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 50325939 C T N Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 3 50326109 G T N N 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 3 50326139 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 3 50326155 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 50326208 G A N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 3 50326257 T C N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 3 50326348 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50326366 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50326480 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50326517 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50326640 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50326680 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50327125 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 50327168 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 50327283 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 50327298 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 50327303 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 50327370 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 50327543 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 50327566 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 50327605 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 50327776 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50328231 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50328365 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50328367 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50328410 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50328514 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50328593 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50328735 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50328814 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50328894 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50328960 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50329008 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50329246 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 50329411 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50329492 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 50329575 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 50329728 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50330033 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 50330216 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50330300 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 50330543 G C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 50330852 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50330892 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50331011 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50331019 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50331184 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 50331189 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 50331197 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 50331211 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 50331215 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 50331257 A C N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 50331290 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 50331348 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 50331418 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 50331419 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 50331455 G C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 50331521 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 50332009 C G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 50332280 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 50332555 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50332801 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 50332805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50332844 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50333020 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50333050 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50333211 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50333332 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50333641 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50333666 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 50333670 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 50333764 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 50333765 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 50333882 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50333891 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50334019 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50334095 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50334168 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50334192 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50334207 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50334337 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50334612 T G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 50334626 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50335352 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50335622 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 50335686 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 50335763 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 50336100 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50336120 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50336241 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50336404 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 50336405 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 50336429 A T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 50336631 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50336884 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50336957 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 50337098 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 50337115 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50337186 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50337521 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 50337624 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50337998 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 50338402 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50338517 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 50338825 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50338853 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50338888 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50338967 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 50339060 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50339339 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50339357 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50339359 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 50339696 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50339739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50339751 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 50339804 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50340720 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50341039 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 50341462 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50341583 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 50341800 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50341915 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 50342044 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50342058 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50342205 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 50342305 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 50342469 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50342545 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 50342624 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 50342718 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 50342734 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50342935 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 50343324 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50344286 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 3 50351321 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 50351475 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 50351672 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50352701 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50352734 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50352774 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50352878 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50353320 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50353645 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 50353833 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50353867 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50353882 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50355331 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50355573 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 50355580 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50355932 G T N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 50356018 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 50356236 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50356463 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50356482 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50356497 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50356539 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50356622 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50356634 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50356666 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50356678 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50356824 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 50356843 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 50357004 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50357042 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 50357113 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 50357254 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 50357388 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 50357445 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 50357574 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 50357754 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50358005 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50359074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50359079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50359195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50359232 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50359254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50359370 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 50359436 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50359634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50359652 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50360339 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50360694 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50360711 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50361023 G C N N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 50361053 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 50361061 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 50361391 C A Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 50361680 T C Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 50366624 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 50366874 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 50367223 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50367300 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 50367389 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50367788 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50367928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50368014 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50368371 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50368584 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50370330 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 50370869 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50371136 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 50371147 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 50371163 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 50371391 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 50371532 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 50371534 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 50371583 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 50371616 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 50371702 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 50371743 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 50371813 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 50371838 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 50372117 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50372237 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50372406 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 50372488 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 50372655 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50372766 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 50373380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50373382 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50373397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50373502 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50373796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50373809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50373886 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 50373899 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50373922 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 50373933 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50374118 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 50374179 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50374191 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50374195 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50374222 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50374464 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50374491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50374585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50374590 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50374828 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50375040 G A N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 50375305 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 50376033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50376053 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50376178 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 50376260 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50376317 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50376474 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50376656 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50376806 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50376983 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 50376985 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50377007 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 50377008 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 50377035 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50377070 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50377170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50377265 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50377311 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50377543 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50377668 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50377703 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50377992 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 50378020 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 50378031 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 50378087 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 50378366 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50378371 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50378553 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 50378569 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50378586 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 50378757 G A N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 50378788 T C N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 50378968 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 50379025 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 50379066 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 50379098 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 50379420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50379461 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50379533 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50379740 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50380042 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 50380056 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 50380122 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50380230 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 50380272 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50380273 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50380306 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50380311 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 50380398 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 50380444 G A Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 50380484 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 50380488 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50380530 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 50380637 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 50380661 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 50380663 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 50380725 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 50380751 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 50380941 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 50380970 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 50381103 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 50381105 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 50381149 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 50381157 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 50381163 T A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 50381209 G A N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 3 50381233 A G N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 50381251 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 50381257 T A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 50381278 T C Y Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 3 50381334 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 50381880 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 50381916 A G N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 3 50381935 A T N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 50381967 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 50381984 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 50382017 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 50382034 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 50382075 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 50382085 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50382140 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 50382290 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 50382559 A T N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 50382587 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 50382604 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 50382679 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 50382707 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 50382747 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 50382782 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50383055 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50383204 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50383266 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 50383277 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 50383374 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 50383435 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50383481 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50383625 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 50383718 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50383740 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50383743 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 50383803 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 50383882 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 50383958 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 50384434 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 50384701 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50385654 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50385878 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 50386113 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50386453 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50386712 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50386713 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50386797 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50386842 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50387026 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 50387720 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 50387766 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50387850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50387920 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 50387938 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50388395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50388491 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50388526 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50388593 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50388613 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 50388813 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 50388834 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50388855 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50388868 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50388908 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50388926 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50388935 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50388961 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50388969 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50389003 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50389152 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 50389186 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 50389324 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50389427 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50389460 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50389483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50389535 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50390099 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 50390315 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 50391330 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50391366 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 50391464 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50391994 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50392914 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 50393083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50393185 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 50393233 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50393538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50393669 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50394821 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 50394916 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50395026 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50395329 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 50395342 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50396610 T C N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 50397500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50398449 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50398455 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50398592 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50398847 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 50398995 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 50399079 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50399365 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50399495 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50399539 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 50399681 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 50399831 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 50400051 A C N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 50400646 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50400733 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50400825 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 50400902 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50400981 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50401100 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50401137 A T N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 50401194 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 50401245 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 50401251 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 50401284 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50401287 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 50401390 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50401465 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 50401620 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50401626 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50401644 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50401698 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50401749 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 50401859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50401860 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50401872 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50401932 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50402007 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50402008 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50402052 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50402133 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50402149 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 50402159 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 50402225 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50402291 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50402298 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50402302 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50402330 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50402361 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50402474 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 50402814 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50402911 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50402999 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50403022 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50403142 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50403488 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50404779 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 3 50405192 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 50405200 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 50405988 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 50406158 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 50406990 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50407527 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 50407879 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50407985 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 50408030 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 50408034 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 50408073 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50408140 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50408225 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 50408644 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 50408657 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 50408658 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 50408712 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 50408873 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 50408894 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 50408960 G A N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.166666666666667 0.0833333333333333 0.75 5 19 2 1 9 3 50408988 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 50409020 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 50409211 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 50409558 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 50409615 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 50409622 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 50409801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50409814 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 50410165 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 50410352 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 3 50410399 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 50410901 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50410907 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 50411048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50411442 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 50411548 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 50411632 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50411741 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50411954 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 50411966 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 50412075 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 50412098 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 50412101 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 50412269 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 50412319 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 50412330 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 50412354 C A Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 50412378 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 50412403 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 50412445 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 50412531 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 50412710 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 50412842 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50412844 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50412873 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50413410 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50413787 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 50414121 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 50414223 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50414628 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 50414771 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 50414813 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 50414908 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50414912 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50415029 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50415556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50415847 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 50416300 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 50416345 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 50416470 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 50416597 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 50416630 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 50416931 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 50416954 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 50417019 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 50417023 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 50417133 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50417527 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50417710 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 50417786 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50418049 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50418558 G A Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 3 50418564 G A Y Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 3 50419021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50420299 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50420451 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50420503 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50420697 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 50420734 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50420751 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 50421332 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50421368 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50421597 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50421604 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50421650 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50421654 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50421783 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50421909 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50421952 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50421964 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50422508 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 50422601 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 50422761 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 50422906 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 50423282 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 50424924 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50425112 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50428452 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50428928 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50429062 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50429110 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50429715 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50429788 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 50429834 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 50430143 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 50430159 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50430209 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 50430910 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50431064 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 50431176 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 50431177 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 50431231 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 50431301 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50431311 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50431343 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50431410 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50431423 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 50431460 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50431627 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50431693 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 50431697 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 50432056 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50432261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50432570 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 50433492 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 50433764 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 50433785 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 50433859 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50433953 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50434284 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50434721 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 50435504 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50435554 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50435641 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50435749 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 50435788 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50436051 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50436151 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50436178 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50436282 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50436618 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50437763 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50437942 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 50438328 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 50438460 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50439089 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50439101 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50439141 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50439365 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50439434 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50439435 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50439546 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50439637 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50439664 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50440272 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 50440321 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 50440335 G C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 50440412 T C Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 50440452 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 50440780 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 50440980 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 50441032 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50441039 A T Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 50441047 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50441133 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50441188 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50441309 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 50441340 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50441687 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50441760 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50441762 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50441823 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50442314 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50442326 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50442577 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 50443053 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 50443111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50443389 C G Y N 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 5 13 2 1 6 3 50443818 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50443820 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50443870 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 50444212 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50444233 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50444423 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50444460 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50444825 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 50445054 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50445577 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50445693 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50446575 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 50446685 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50447054 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50447339 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50447398 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50447435 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50447633 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50447718 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50447920 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50447976 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50448618 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50448633 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50449219 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 50449491 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 50449903 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50450071 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50450473 C A Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 3 50450592 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50450702 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50450827 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50450849 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50450932 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50450948 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 50451008 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50451033 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 50451077 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50451115 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 50451527 G A Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 3 50451647 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 50451777 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50451805 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 50451873 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50451874 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50452035 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50452137 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50452221 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50452309 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50452312 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50452583 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 50453009 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50453066 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 50453364 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 50453805 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 50453997 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50454015 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50454063 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 50454120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50454304 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50454370 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 50454559 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50454756 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 50454819 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50455293 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 50455595 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50455629 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 50455678 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 50456110 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50456654 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 50456846 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50457243 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50458298 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50458521 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50458689 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50458814 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50459517 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50459556 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50459765 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50459799 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 50459856 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 50460346 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50460382 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50460880 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50461124 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50463271 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50463387 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50463807 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50463832 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50463971 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50464227 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50464316 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50464401 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50464967 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50465484 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50465522 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50465616 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50465770 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50466167 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 50466296 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 50466427 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50467506 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50468273 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50468860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50469165 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50469186 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 50469198 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 50469366 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 50469429 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50470130 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 50470151 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 50471072 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 50477867 A T Y N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 50478537 G T Y N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 50478744 C G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 50478965 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50478994 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50479284 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50480391 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50480404 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50481543 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50481666 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 50481753 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50481755 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50481908 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50482139 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 50482400 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50482779 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50483363 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50483619 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 50483938 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 50485056 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50485487 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50485886 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50486059 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 50486140 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 50486150 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50486153 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 50486200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50486282 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50486292 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50487680 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50487936 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50488328 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 50488386 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50488433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50488544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50488668 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 50488722 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 50488730 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50488749 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50488923 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50488928 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50489002 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50489017 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50489120 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50489401 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50489640 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50489750 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50489871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50490282 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 50490527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50490540 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50490845 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50490869 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50490975 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50491291 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 50491394 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 50491821 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50491825 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50492042 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50493029 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50493735 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50493810 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50493830 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50493869 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50493969 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50494130 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50494515 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50494816 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 50494903 G C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 50494905 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 50495452 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 50495483 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 50495570 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 50495848 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 50496008 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 50496256 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 50496430 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 50496468 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50496737 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 50497181 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 50497734 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 50497785 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 50497810 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 50497813 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50497985 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50498090 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50498221 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 50498458 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50498594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50498684 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50498741 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50499363 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50499454 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50499551 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50499590 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 50499967 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50500150 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50500281 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50500318 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50506594 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 50506646 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50506650 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50506663 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 50506840 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50506869 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 50506918 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 50506921 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50506936 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 50506937 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 50506991 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50506999 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50507048 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50507100 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50507114 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 50507155 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 50507162 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50507179 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 50507225 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50507239 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50507309 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 50507317 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 50507443 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50507512 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50507519 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50507528 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50507546 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50507584 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 50507613 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50507684 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 50507764 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 50507783 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 50507816 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 50507907 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 50507944 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 50508053 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50508131 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50508343 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50508378 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50508389 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 50508397 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50508406 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 50508417 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 50508499 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 50508710 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 50508716 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50508775 G A Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 50508794 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 50508868 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 50508921 C T Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 50508936 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 50508992 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50509002 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50509252 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 50509319 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 50509419 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50509940 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 50509950 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50509962 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50509967 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50509979 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 50510049 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50510050 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 50510080 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 50510132 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 50510522 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 50510836 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 50510931 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50510949 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50511599 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50512474 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50512743 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50513509 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 50513732 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50513839 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50513900 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 50513977 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 50514092 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 50514509 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50514511 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50514715 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50514852 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50514897 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 50514917 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50515169 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50515710 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50515762 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 50516680 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 50516783 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50516791 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50516935 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 50517048 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50517072 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50517129 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50517134 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50517245 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 50517340 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50517466 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50517502 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 50517503 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 50517602 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50517618 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 50517735 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50517926 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50518122 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50518443 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 50518965 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 50518983 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 50519194 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 50519422 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 50519655 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 50519675 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 50519773 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 50519881 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 50520207 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 50520280 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 50520366 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50520761 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50521102 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 50521173 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50522235 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 50522268 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50522287 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50522307 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 50522314 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 50522355 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50522362 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50522434 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 50522453 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50522659 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 50522757 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 50523724 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 50523959 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 50524963 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 50525443 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50525523 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 50525727 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50525736 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 50525770 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 50525794 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 50525820 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50525875 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 50525879 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 50525924 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50525935 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 50525982 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50526029 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50526682 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50526962 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50527239 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50527486 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 50527492 T A Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 50528032 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50528210 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50529149 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50529765 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 50529983 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50531116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50532259 A G N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 50532457 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 50532534 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50532730 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 50532742 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 50532958 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 50533048 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50533563 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50533645 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50533669 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50533746 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50533958 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50533998 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50534088 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50534380 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50534441 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50534516 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 50534895 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 50534913 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 50535099 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 50535183 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 50535362 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 50535512 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 50535817 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50536166 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 50536401 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 50536709 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 50536775 T A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 50536884 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50537242 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 50537307 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50537398 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 50537417 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50537878 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 50538378 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50538529 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50538541 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50538560 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50538572 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50538828 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50538933 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 50538963 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50539131 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50539143 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50539175 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50539243 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50539276 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50539293 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50539334 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50539349 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50539441 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50539443 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50539596 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50539643 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50539849 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50539892 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 50540460 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50540734 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 50541095 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50541492 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50542611 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 50542856 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50543000 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50543038 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 50543052 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 50543312 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50543348 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 50544009 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 50544013 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 50544130 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 50544145 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 50544186 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 50544254 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 50544280 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 50544423 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50544426 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50544754 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50544820 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 50544946 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 50545172 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 50545173 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 50545483 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 50545536 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50545550 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 50545574 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 50545609 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50545617 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 50545689 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50545697 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 50545786 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 50545800 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50545837 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 50545895 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 50545904 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 50545935 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 50545959 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 50545983 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50546001 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 50546033 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 50546089 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 50546120 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 50546129 G T N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 50546261 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 50546559 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50546671 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50546744 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50546769 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 50546784 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 50546787 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50546795 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 50546857 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 50547157 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50547163 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 50547185 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50547509 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 50547814 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50547847 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50547980 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 50548045 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 50548075 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 50548152 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 50548221 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 50548234 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 50548374 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 50548442 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 50548706 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 50548719 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50548739 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 50548791 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50548817 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 50548904 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 50548926 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 50548929 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 50548980 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50549009 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 50549619 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50549715 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 50549765 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50549856 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 50549946 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 50550036 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 50550100 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50550451 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 50550469 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 50550653 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 50550764 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 50550816 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 50550817 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 50550856 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 50550962 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 50551109 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 50551122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50551152 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50551403 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 50551511 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 50551565 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 50551568 C G Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 50551632 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 50551644 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50551735 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 50552094 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 50552108 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 50552282 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 50552311 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 50552396 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50552524 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 50552531 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 50552776 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50552822 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50552924 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50553197 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50553870 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50554020 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 50554155 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50554318 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 50555305 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50555344 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50555506 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50556687 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 50557036 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 50557164 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 50557464 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 50557637 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 50558582 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50558592 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50558839 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 50559202 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50559874 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 50560289 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50560536 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50560908 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50561093 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 50561106 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50561164 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 50561244 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50561528 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50561606 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 50561619 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 50562008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50562621 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 50562898 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50562961 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50562991 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50563114 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50563504 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50563545 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50563622 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 50563693 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50563695 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 50563853 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50563968 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50564104 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50564121 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50564136 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50564154 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50564195 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50564200 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50564226 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 50564319 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50564544 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50564605 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50564797 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50565047 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50565102 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50565175 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50565387 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50565599 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50565824 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 50566065 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50566067 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50566118 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50566373 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 50567024 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 50567178 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50618697 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50618701 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50618744 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50618788 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50618789 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50618871 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50618994 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50619000 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50619018 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50619169 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 50619202 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50619228 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 50619291 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 50619318 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 50619634 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50619641 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 50619754 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50619823 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 50619925 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50620186 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 50620327 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 50620334 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 50620344 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 50620357 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 50620402 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 50620450 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 50620458 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 50620461 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 50620490 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 50620839 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 50620913 A C N N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 3 50620993 A T N N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 3 50621341 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 50621409 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 50621445 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 50621538 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 50621612 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50621738 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 50622113 T C N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 50622246 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 50622406 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 50623683 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50623912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50624817 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 50624916 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 50625013 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 50625385 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 50625527 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50625664 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50625728 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50625775 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 50625791 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 50626006 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50626030 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50626096 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 50626189 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50626216 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50626261 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50626291 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50626316 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50626340 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50626350 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50626657 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50626748 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 50626765 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50626787 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50626806 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 50627046 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50627059 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 50627104 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 50627333 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50627408 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 50627416 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 50627429 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 50627690 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50627709 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 50627782 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50627821 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 50627835 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 50627892 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 50627912 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 50627951 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50627973 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 50628009 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 50628024 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50628031 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50628036 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 50628122 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 50628127 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 50628142 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 50628198 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 50628211 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 50628333 T A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 50628356 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 50628386 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 50628395 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 50628540 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 50628574 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 50628770 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 50628822 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50628960 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 50629007 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 50629008 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 50629235 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50629297 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50629299 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50629360 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 50629495 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 50629584 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 50629659 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 50629660 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 50629865 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50629881 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 50630625 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50630710 A C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 50630749 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 50630782 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50630803 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50630814 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 50631032 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 50631360 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 50631383 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 50631408 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50631503 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50631514 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 50631536 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 50631550 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50631556 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 50631565 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50631617 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50631673 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 50631835 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50631874 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50631998 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 50632045 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50632338 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 50632703 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 50632710 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 50632775 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50632778 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 50632789 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 50632823 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 50632847 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50632850 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 50632862 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 50632877 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 50633000 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 50633017 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 50633027 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 50633060 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 50633103 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50633164 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50633294 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 50633315 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 50633345 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 50633385 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50633399 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 50633475 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50633476 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 50634289 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 50634454 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 50634495 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 50634630 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50634810 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 50634867 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 50634897 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 50635176 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 50635187 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 50635374 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 50635737 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 50635777 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 50635821 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50636035 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 50636188 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 50636195 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 50636201 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 50636230 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 50636314 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 50636339 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 50636441 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 50636540 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 50636642 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 50636792 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50637033 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 50637517 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 50637875 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 50637944 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50638235 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50638260 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 50638273 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50638317 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50638377 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 50638419 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 50638529 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 50638531 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 50638610 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 50638697 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 50638700 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 50638787 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 50638812 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 50638860 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 50638891 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50638915 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 50638952 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 50638985 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50639035 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 50639158 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50639293 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 50639374 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 50639431 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 50639454 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50639500 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 50639514 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 50639523 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 50639672 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50639752 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 50639824 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50639827 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50639858 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50639864 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 50639901 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50640067 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50640408 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 50640419 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 50640441 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 50640475 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 50640502 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50640542 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 50640543 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 50640591 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 50640760 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 50640794 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 50640929 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 50640950 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50640963 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50641014 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50641086 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 50641108 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 50641513 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50641541 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50641565 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 50641942 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 50641979 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 50641990 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 50642056 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 50642512 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 50642553 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 50642563 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50642569 T C Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 50642634 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50642644 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50642687 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50642704 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50642818 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50642905 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50642941 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50642942 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50643023 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50643024 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50643037 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50643085 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 50643108 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 50643130 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 50643169 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 50643208 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50643213 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50643233 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 50643310 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50643389 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50643434 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 50643441 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50643451 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50643454 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50643467 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50643485 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 50643491 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50643500 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50643516 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50643569 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50643583 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50643612 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50643661 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50643718 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50643733 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 50643740 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50643757 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 50643760 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50643785 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50643962 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50644100 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 50644137 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 50644168 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 50644196 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 50644317 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50644349 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50644382 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50644410 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50644433 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50644443 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50644750 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50644797 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 50644880 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50644899 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50644916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50644945 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 50645005 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 50645059 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50645076 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 50645124 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 50645226 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 50645398 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50645581 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 50645601 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 50645648 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50645693 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50645734 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 50645735 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 50645803 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50645928 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50646003 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 50646039 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50646064 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50646081 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 50646090 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50646294 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 50646563 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 50646912 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 50646986 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 50647100 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50647185 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 50647406 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 50647408 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 50648005 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 50648099 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 50648301 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 50648348 T C Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 50648583 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 50648749 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 50649734 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50649752 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 50649917 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 50650128 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 50650209 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50650334 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50650336 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 50650355 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 50650559 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 50650654 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50650751 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50650828 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50650839 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50651163 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50651178 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50651207 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50651247 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 50651282 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 50651292 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50651322 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 50651679 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50651830 C G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 50651831 C G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 50653173 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 50653256 C G N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 3 50653316 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 50653350 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 50653377 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50653408 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50653710 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 50653766 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50654242 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 50654245 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 50654965 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 50655187 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 50655750 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 50656284 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50656345 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50656377 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50657212 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 50657508 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 50659609 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50659663 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50659716 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 50659801 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50659802 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 50659939 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 50660089 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50663207 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50663259 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50663385 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50663765 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50664136 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50664183 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50664398 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 50664864 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 50664879 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 50664890 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 50665051 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50665061 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50665337 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 50665491 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50665505 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 50666301 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50666379 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50667621 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 50668985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50670125 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 50670165 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50670932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50671391 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50671817 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50673014 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50673030 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50673863 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 50673960 G A N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.153846153846154 0.538461538461538 0.307692307692308 11 15 2 7 4 3 50673994 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 50674571 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50674595 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 50674761 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 50674763 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50674952 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 50674960 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50675057 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50675301 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 50675390 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50675393 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 50675457 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 50675643 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 50675939 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50676077 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50676102 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 50676132 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50676412 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 50676759 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 50677322 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50677704 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 50677930 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 50678075 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 50678095 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50678139 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 50678168 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 50678351 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50678364 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 50678622 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50678993 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50679038 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50679143 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50679251 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50679272 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50679325 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50679417 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50679452 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50679463 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50679466 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50679602 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50679781 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50679887 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 50679946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50680093 A C N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.1875 0.75 0.0625 18 14 3 12 1 3 50680358 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 50680386 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 50680483 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 50680505 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 50680756 A T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 50680882 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 50681070 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50681156 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 50681277 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 50681334 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50681413 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 50681582 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 50681586 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50681600 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 50681612 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50681645 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50681701 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50681818 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50681896 T G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 50682145 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50682267 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50682429 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50682439 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50682718 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 50682747 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 50682748 C G N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 50682762 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 50682781 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 50682852 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 50682922 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50683061 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 50683066 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50683170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50683213 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 50683276 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 50683972 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50684020 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50684195 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50684383 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50684553 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50684773 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50684941 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50685174 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50685329 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50685339 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50685572 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50685701 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50685932 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50686007 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50686886 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50686963 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50687639 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50687705 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 50688192 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50689105 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 50689120 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50689157 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50689459 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50689475 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 50690102 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50690243 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 50690358 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 50690545 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 50691013 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50691210 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50691248 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50691286 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50691518 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50691606 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50691706 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50691767 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50691915 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50692424 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 50692532 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50693318 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50693378 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50693440 C G Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 50693516 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50693812 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50694332 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 50694894 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 50695048 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 50695054 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50695067 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50695480 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 50695498 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50695540 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50695573 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 50695585 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 50695638 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50695690 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 50695737 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50695845 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50695858 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 50695947 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50696004 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50696065 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50696103 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 50696108 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50696133 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50696187 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50696221 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 50696350 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50696407 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50696511 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50696787 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50696815 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50697027 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50697171 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50697375 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 50697452 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50697681 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50697952 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50698021 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50698209 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50698853 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50698919 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50699037 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 50699187 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50699236 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50699336 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50699426 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50699462 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 50699532 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 50699541 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50699621 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50699659 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50699708 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50699756 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50699801 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50699808 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50699836 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50699843 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 50699938 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50700195 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50700214 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 50700281 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50700339 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 50700515 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50700677 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50700725 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 50700733 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50700874 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50700952 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 50700973 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50701018 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 50701063 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 50701078 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 50701136 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50701187 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50701230 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50701296 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 50701299 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 50701310 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 50701316 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 50701471 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50701520 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 50701563 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 50701591 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50701606 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50701626 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50701686 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 50701977 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 50702291 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50702590 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 50702593 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50702720 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50702744 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 50702793 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 50702870 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50703824 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 50704035 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50704135 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50704308 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 50704380 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50704422 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50704694 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 50704701 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 50704734 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 50705469 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50705515 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50705547 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 50705586 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 50705667 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 50705676 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 50705959 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 50706182 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50706278 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 50706316 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 50706354 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50706402 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50706493 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50706600 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 50706636 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50706722 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 50706772 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50706801 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50706894 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50706919 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 50706967 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50706986 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50707005 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50707088 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 50707237 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50707261 C T Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 50707619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50707756 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50707964 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 50707988 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 50708038 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 50708534 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 50708538 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 50708604 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 50708627 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50709005 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 50709171 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 50709388 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50709389 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50709603 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50709681 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50710643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50710842 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 50710909 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50711129 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50711238 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 50711284 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 50711365 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 50711427 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 50711781 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50711823 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 50711896 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50712012 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 50712054 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50712065 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 50712420 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 50712552 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 50712567 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 50713042 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 50713055 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50713122 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 50713135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50713248 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 50713435 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 50713523 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 50713962 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 50715255 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50715388 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 50715532 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 50715805 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50716022 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 50716031 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 50716045 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 50718341 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 50718357 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 50718387 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 50718953 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 50720046 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50720336 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50720722 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50720757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50720892 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 50720959 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 50721108 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 50721194 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 50721361 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50721448 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50721721 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 50721968 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50722004 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 50722139 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 50722980 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 50723302 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 50723382 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50723419 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50723623 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 50724542 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50724623 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 50724682 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 50724683 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 50724783 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 50724974 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 50724981 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50724997 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50725456 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50725559 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 50725563 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50725990 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50726096 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 50726151 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 50726523 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 50726629 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 50726693 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50726697 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50726722 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 50726797 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50726894 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 50726895 C G Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 50726975 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 50727283 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 50727296 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 50727301 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 50727546 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50727568 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 50727570 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50727872 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 50728152 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 50728230 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 50728496 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 50728510 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 50728516 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 50728559 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 50728624 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 50728640 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 50728650 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 50728775 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 50728802 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 50728868 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 50729438 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50729471 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 50729943 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 50729982 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50730005 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50730319 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50730781 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 50730782 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50731888 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50732606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50732634 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 50732697 A T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 50732878 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 50734226 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 50734252 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50734740 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 50734913 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50735209 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 50735315 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 50735329 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 50735428 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50735525 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 50735549 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 50735618 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50735640 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50735993 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 50736054 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50736397 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 50736510 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50737181 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50737286 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 50737763 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 50737837 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50737893 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 50738190 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 50738350 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 50738367 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 50738463 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50739166 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50739170 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50739352 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 50740173 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 50740251 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 50740498 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 50740552 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 50740868 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 50741509 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 50741662 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50742587 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 50743114 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50743330 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50743378 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50743413 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50743448 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 50743469 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 50743470 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 50743496 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 50743592 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50743690 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 50744154 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 50744680 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 50745387 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 50745470 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 50745545 G C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 50745639 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 50745977 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 50746008 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 50746135 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50746277 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50746807 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50746815 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50747169 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50747402 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50747508 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 50748397 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50749873 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 50750504 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50750505 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50750835 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 50750893 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 50750923 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50750946 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50751486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50751580 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50751871 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50752246 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 50752299 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50752300 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50752312 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50752357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50754069 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50754407 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 50755591 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 50755861 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50755902 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50755996 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50756052 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 50756091 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50756224 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 50756317 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50756466 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 50756474 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 50756557 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 50756570 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 50756646 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50756659 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 50756774 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 50756791 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 50756798 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50756896 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50756908 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 50757215 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50757952 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50757992 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 50758062 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 50758072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50758084 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50758086 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50758236 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50758272 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50758337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50758451 C T Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 50758565 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50759330 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50768008 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50768070 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 50768920 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50769195 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50769503 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 50769547 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50769685 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50769835 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 50770058 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50770266 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 50770313 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50770405 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 50771986 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 50772127 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 50772137 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 50772201 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 50772259 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 50772273 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 50772311 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50772607 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50772825 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 50772853 C T Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 50772996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50773367 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50773407 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50773846 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50774020 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 50774302 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50774349 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50774755 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50774921 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50775851 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 50775926 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 50775942 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50775950 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 50775955 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50776078 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 50776079 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50776418 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50776614 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50776633 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50777215 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 50777431 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 50777436 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 50777456 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50777594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50777759 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 50777823 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50777946 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 50778042 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50778087 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50778172 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 50778282 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50778315 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50778440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50778452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50778461 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 50778491 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50778512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50778520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50778538 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50778603 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50778655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50778670 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50779663 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 50779826 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 50780053 G A N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.545454545454545 0.0909090909090909 0.363636363636364 13 9 6 1 4 3 50780499 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 50780728 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 50780807 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 50780812 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 50780887 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 50781065 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 50781091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50781495 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 50781531 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 50781553 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 50781601 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 50781681 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 50781706 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 50781715 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 50781837 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 50781909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50781929 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 50781937 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 50781940 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 50782043 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 50782046 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50782166 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 50782228 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 50782310 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 50782340 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 50782785 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 50783468 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 50783617 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 50783760 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 50784222 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 50784472 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 50785109 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 50785200 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50785267 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 50786855 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 50787810 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 50789082 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 50789555 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 50789615 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 50789822 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 50789920 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 50790062 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 50790111 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 50790127 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 50790243 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 50790260 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 50790276 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 50790441 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50790580 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 50790685 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 50790809 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 50790815 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 50790920 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50791001 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50791442 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 50791443 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 50792723 C T Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 50793926 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 50794353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50795578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50797134 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 50798772 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50803401 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50803854 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50804831 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50810319 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 50811041 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 50811334 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50811987 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50812363 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 3 50813402 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 50813509 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 50813530 C A Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 50813594 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 50813618 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 50813708 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 50813730 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 50813773 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 50813814 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 50813850 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 50813963 T G N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 3 50813977 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 50814072 C T N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.416666666666667 0.583333333333333 0 17 7 5 7 0 3 50814351 T C Y Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 3 50814834 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 50814868 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 50814967 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 50815061 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 50815079 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 50815339 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 50816086 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50816141 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50816149 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50816153 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50816197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50816224 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50816516 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50818966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50820066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50820110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50820526 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50821888 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 50821949 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 50822024 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 50822200 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50822499 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50822765 A T N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 3 50823639 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50824074 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50824082 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 50824892 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 50824949 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50825016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50825028 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 50825093 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50825140 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50825204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50825250 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50825308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50825322 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50826017 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50826028 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50826055 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50826528 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50826944 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50827097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50827130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50827192 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50827412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50827455 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 50827483 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 50827506 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 50827676 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50827821 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50829071 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 50829849 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 50830055 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50830068 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 50830104 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 50830309 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50830325 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 50830409 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 50830466 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 50830469 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 50830577 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50830643 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 50830732 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50830761 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50830803 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50830919 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50831037 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50831503 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 50831521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50831695 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50831872 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50831992 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 50832089 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 50832180 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50832429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50833222 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50833466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50835400 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50835425 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50835985 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50836493 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50837034 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50837186 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50837584 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50837587 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50837908 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50838101 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50838139 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 50838850 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 50840651 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 50841189 C G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 50841386 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 50841822 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 50842719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50842819 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 50844171 A C N N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 3 50845884 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50847595 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50847905 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50848827 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 50851102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50851327 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 50852135 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 50852403 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50852448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50852625 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50852641 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 50852658 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 50852663 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 50852670 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50852688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50852697 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 50852807 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 50852820 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 50852823 C A Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 50852862 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 50852874 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 50852888 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 50853075 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 50853093 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 50853147 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50853248 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 50853284 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 50853646 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50853699 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 50853754 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 50853973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50854022 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 50854062 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 50854084 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 50854152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50854421 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 50854672 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 50854707 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50854790 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 50854890 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 3 50854911 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 50854934 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 50854936 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 50855028 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 50855167 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 50855213 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 50855240 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50855404 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 50855503 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 50855689 C G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 50855739 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 50858873 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 50859765 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50859813 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50859878 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50862108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50864095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50864495 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 50864581 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 50865434 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50866055 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 50866218 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 50866219 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 50866484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50866755 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 50866912 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 50866956 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 50867097 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 50867109 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 50867290 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50867808 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 50867928 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 50868142 C G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 50868223 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 50868432 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 50868493 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 50868818 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 50868849 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50868920 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 50868943 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 50869386 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 50869436 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 50869671 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 50869970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50870465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50870548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50870733 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50870935 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50871040 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50871182 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 50871191 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 50871209 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 50871443 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 50871694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50871854 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 50871961 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 50872254 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 50872265 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 50872406 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 50872442 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 50872653 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50872706 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 50872726 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50872758 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 50872770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50872870 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 50872888 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 50873011 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 50873094 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 50873203 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 3 50873227 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 50873389 C T N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 3 50874041 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 50874078 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 50874246 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 50874549 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 50874625 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 50874682 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 50874789 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50874924 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 50874988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50875152 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 50875643 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 50875878 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50875927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50875933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50875991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50876043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50876096 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50876100 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 50876108 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 50876139 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 50876780 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 50876831 T C Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 50876900 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 50876969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50877011 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 50877057 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 50877063 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 50877099 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 50877224 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 50877290 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 50877369 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 50877408 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 50877409 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 50877575 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 50877578 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 50877691 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 50877710 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 50877762 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 50877833 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50877847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50877973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50878365 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 50878463 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50878900 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 50879184 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 50879915 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 50879979 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50880227 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50880774 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 50880968 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 50881009 G T N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 50881365 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 50881704 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 50881762 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 50881837 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 50881875 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 50881876 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 50882274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50882343 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50882423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50882425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50883343 C G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 50883855 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50883903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50883930 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 50884052 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 50884471 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 50884508 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 50884608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50884707 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 50884734 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50884827 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50885071 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 50885092 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 50885174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50885229 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 50885235 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 50885246 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 50885324 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50885340 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 50885348 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 50885525 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 50885563 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 50885662 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 50886741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50886753 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 50886809 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 50886836 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 50886891 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 50886930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50886941 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 50887030 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50887031 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 50887089 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 50887161 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 50887303 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50887340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50887939 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 50888062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50888347 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50888358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50888436 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 50888588 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50888951 T G Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 50889047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50889622 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 50890023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50890331 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50890357 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50890359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50890500 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 50890510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50890565 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 50891163 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 50892416 G C N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 3 50892778 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 50892827 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 50894389 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 50894614 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 50894926 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 50895176 T A N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 3 50895990 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50896255 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 50896319 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 50896334 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 50896534 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 50898572 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 50898638 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 50899103 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 50899516 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50899747 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 50900741 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 50901104 T C N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 3 50901109 A G N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 3 50901263 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 50901572 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 50901847 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 50901860 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 50902102 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50902117 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 50902452 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 50902768 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50902781 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50902804 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50902826 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50902870 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 50903032 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50903964 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 50904383 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50904479 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 50904742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50904928 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 50909383 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 50909483 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 50909560 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 50909567 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50909607 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 50909638 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50909660 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 50909714 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 50909795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50909874 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 50909994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50910582 A C N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 50911204 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 50911374 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 50911440 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 50911478 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 50911524 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 50911541 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 50911569 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 50912437 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 50912465 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 50912682 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50913277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50913328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50913338 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50913527 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 50913609 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50913763 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50914025 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 50914044 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 3 50914275 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50914363 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50914381 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50914397 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50914719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50914737 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50914744 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50914829 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50914886 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50914926 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 50915307 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 50915308 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 50915443 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 50915488 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 50915552 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 50915728 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 50915733 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 50915859 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 50915886 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 50915887 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 50916304 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 50916356 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 50916745 G T Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 50916755 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 50917293 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 50917371 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 50917519 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 50917713 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 50917848 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 50917913 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 50918307 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 50918797 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 50918871 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 50918976 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 50919284 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 50919317 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 50919333 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 50919435 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 50919780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50919813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50919892 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 50919922 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 50919994 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 50920040 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 50920286 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 50921418 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 50921424 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 50921438 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 50921526 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 50921683 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 50921859 A T Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 50922740 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 50923085 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 50923287 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 50923799 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 50923816 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 50923917 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 50924404 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 50924832 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 50925421 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 50925883 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 50925959 A G N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 50926081 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 50927621 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 50929297 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 50930856 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 50930944 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 50930949 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 50931107 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 50931255 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 50931591 G C N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 3 50931721 C G N N 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 8 6 3 2 2 3 50932315 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 50932598 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 50932958 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 50933022 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 50933153 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 50933398 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 50933399 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.315789473684211 0.105263157894737 0.578947368421053 14 24 6 2 11 3 50933673 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 50933728 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50933994 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 50934084 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 50934125 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50934138 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50934623 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 50935006 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 50935054 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 50935300 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 50935350 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 50935664 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 50935766 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50935792 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50935827 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 50935913 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 50936469 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50936525 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50937956 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50937991 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 50939991 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 50940373 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50942837 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 50942902 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50942951 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50943114 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50943257 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50943371 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 50943798 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 50944437 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 50944738 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 50944829 A T N N 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 3 50945032 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 11 7 4 3 2 3 50945217 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 50946565 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50946876 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.176470588235294 0.0588235294117647 0.764705882352941 7 27 3 1 13 3 50947284 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 50947428 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50947739 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 50947849 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 50947940 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 50947943 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 50947976 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 50947999 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 50948006 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50948028 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 50948344 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50948584 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 50948843 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 50948929 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 50949339 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 50949498 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 50949704 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 50949742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50950419 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50951322 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 50951385 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 50951902 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50952811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50953524 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50954175 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50955000 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 50955649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50955661 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50957571 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 50958233 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 50958554 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 50958591 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 50958695 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 50958773 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 50959514 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 50959540 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50959750 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 50959991 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50960305 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50960322 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 50960344 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 50960570 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 50960634 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 50960939 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50961500 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 50961517 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 50961709 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 50961731 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 50961790 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50961905 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 50961913 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 50961950 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 50962076 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 50962130 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 50962376 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 50962378 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 50962436 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 50962554 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 50962570 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 50962583 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 50962809 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 50962864 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 50963083 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 50963822 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 50963886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50964130 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 50965092 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 50965223 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 50965226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50965539 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 50965606 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 50965730 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50965750 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50965754 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 50966264 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50966896 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 50967338 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50967951 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50968068 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50968653 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50968880 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 50969123 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 50969710 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 50969800 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50969944 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 50970101 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 50970119 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50970145 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50970192 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 50970239 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50970327 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 50970392 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50970428 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 50970491 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 50970674 T G N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 3 50971076 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 50971157 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 50971289 C G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 50971317 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 50971397 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 50971554 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 50971563 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 50971567 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 50971623 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50971698 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 50971715 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 50971882 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 50971957 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50971984 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 50971985 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 50972013 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 50972061 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 50972065 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 50972377 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 50972427 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 50972464 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 50972670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50972684 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 50972687 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 50972793 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 50972849 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50972872 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 50972930 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 50973155 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50973182 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 50973259 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50973473 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50973652 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50973722 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50973763 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50973781 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50973922 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50973947 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 50974264 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 50974270 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 50974305 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 50974594 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50974595 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50974628 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50974686 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50974770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50974817 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50974841 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 50974897 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50974923 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 50975006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50975099 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50975116 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 50975133 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50975399 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50975544 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 50975576 A G Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 50975584 C A Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 50975588 A G Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 50976092 T A Y N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 50976148 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 50976204 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50976299 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50976319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50976430 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 50976457 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50976475 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50976480 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50976625 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 50976971 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50977153 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 50977199 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50977275 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 50977276 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 50977370 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 50977421 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50977496 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 50977615 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 50977717 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 50977733 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 50977839 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 50978081 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50978315 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 50978544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50978776 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50978936 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50978959 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50979129 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 50980357 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 50980761 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 50981243 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 50981430 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 50982277 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 50982404 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50982449 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 50984064 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50984330 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50984682 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50984753 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 50984810 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 50984843 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50984953 C A N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 50984970 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 50984974 C A N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 50985050 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 50985058 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 50985182 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 50985338 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50985499 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 50985504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50985534 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50985912 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 50985965 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 50986011 C T N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 50986051 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 50986148 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50986169 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 50986179 G T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 50986361 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 50986399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50986567 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50986636 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50986751 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 50986795 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 3 50986796 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 50987009 C G N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 50987057 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 50987170 C T N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 50987227 A T N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 50987247 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 50987372 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 50987430 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 50987474 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 50987485 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 50987498 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 50987553 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 50987636 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 50987837 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 50987893 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 50987909 T G N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 3 50987936 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 3 50988149 G A N Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 5 5 2 1 2 3 50988275 G A N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 7 9 2 3 3 3 50988281 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 5 13 2 1 6 3 50988299 A C N N 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 8 10 2 4 3 3 50988328 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 8 10 2 4 3 3 50988337 T G N N 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 9 11 2 5 3 3 50988383 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 50988477 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 50988488 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 50988498 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 50988504 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 50988541 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 50988556 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 50988585 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 50988666 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 50989079 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50989159 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50989754 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50990185 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50990197 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50990393 T A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 50990437 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50990904 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 50990905 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 50991378 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50991585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50991673 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50992001 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 50992583 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 50992603 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 50992833 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 50992840 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 50992896 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 50992901 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 50993242 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 50993314 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 50993331 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 50993342 A T Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 50993363 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 50993449 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 50993460 A C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 50993881 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 50994279 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 50994657 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50994993 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50995451 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50995521 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50995619 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50995815 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50995931 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50995990 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50996016 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50996025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50996183 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 50996193 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50996317 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 50996331 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50996340 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50996382 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50996385 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 50996534 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50996569 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50996597 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50996667 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 50996717 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50996894 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 50996912 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50996936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50996939 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 50997007 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50997131 G C N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 50997342 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 50997452 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 50997501 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 50997559 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50997835 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 50997865 T A N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 50997883 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 50998105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50998335 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 50998421 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50998431 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 50998437 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 50998623 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 50998776 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 50999720 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51000039 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51000096 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 51000898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51001134 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51001194 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 51002177 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 51002287 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51002860 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 51002875 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 51003000 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 51003045 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 51003472 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 51003627 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 51003962 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51003976 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51004212 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 51004240 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 51004300 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 51004306 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 51004326 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 51004350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51004359 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 51004363 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51004674 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 51004688 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 51004720 G T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 51004722 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 51004748 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 51004787 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 51004812 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 51004866 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 51004872 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 51004891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51004910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51005207 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 51005513 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 51005568 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 51006855 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51006931 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51006949 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 51006950 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 51007017 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51007080 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 51007204 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51007266 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 51007322 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 51007363 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 51007376 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 51007408 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 51007443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51007473 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51007511 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 51007525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51007860 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51008601 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 51008632 G C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 51008718 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 51008812 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 51008836 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 51008968 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 51009080 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 51009285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51009587 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51009607 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51009625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51009901 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 51010448 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51010633 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51010864 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 51011836 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51012521 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 51012523 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 51013735 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51013945 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51014467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51014624 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 51014630 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 51014685 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 51014703 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 51014732 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 51014827 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 51014844 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51014906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51014943 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 51015086 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 51015104 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 51015127 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 51015157 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 51015180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51015451 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 51015456 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51015585 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 51015806 G C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 51016033 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51016186 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51016197 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51016214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51016215 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 51016404 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51016410 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 51016520 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51016588 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 51016738 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51016801 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51016847 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 51016956 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51016960 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51016996 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 51017191 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 51017266 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 51017321 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 51018015 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 51018088 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51018227 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 51018249 T C N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 51018254 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 51018286 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 51018394 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 51018894 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 51019005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51019050 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 51019095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51019115 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51019173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51019214 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 51019241 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 51019280 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 51019528 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 51019531 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 51019561 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 51019589 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 51019643 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51020746 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51020793 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51020811 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51020816 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51020883 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 51020896 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 51020922 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 51021049 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51021168 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 51022644 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51022652 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51022689 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 51022720 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 51022759 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 51022822 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51022954 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 51023633 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51023734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51024622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51024948 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 51025113 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51025629 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51025633 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51025881 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 51026160 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 51026743 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 51026749 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 51027063 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 51027418 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 51027437 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 51028031 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 51028166 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 51028662 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51029242 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 51029644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51029776 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51030121 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51030155 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 51030345 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 51031442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51032241 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51032259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51032538 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 51033288 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 51033489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51033927 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 51034521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51034663 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51034754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51035014 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51035018 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51035106 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 51035191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51035214 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 51035455 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 51035662 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 51035722 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51035723 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51035764 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51035809 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51036021 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 51036023 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 51036201 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51036256 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 51036336 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 51036366 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51036386 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 51036415 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 51036792 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 51036844 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 51036869 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51036874 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 51036927 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 51037050 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 51037107 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 51037195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51037222 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 51037223 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 51037808 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51037980 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51038065 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51038177 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 51038339 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 51038371 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 51038908 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 51039157 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 51039160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51039217 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 51039321 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 51039376 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 51039418 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 51039448 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51039568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51039580 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 51040273 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 51040300 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 51040520 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51040588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51040692 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51041174 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 51041287 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51041314 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 51041353 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 51041378 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 51041487 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 51041539 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 51041593 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 51041625 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 51041673 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 51041736 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 51041737 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 51041974 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 51041990 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 51042048 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 51042070 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 51042074 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 51042102 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 51042103 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 51042209 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 51042375 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 51042410 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 51042500 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 3 51042590 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 51042796 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 51042861 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 51042958 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 51043053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51043090 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 51043251 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51043473 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51049365 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51049642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51049842 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 51050049 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51050826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51050941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51051415 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51051540 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51051589 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51051609 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51051825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51052313 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51052477 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51052550 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 51052638 A C N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 51054268 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51057757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51058024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51058387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51059907 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51059942 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51060502 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51060549 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51060730 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51060779 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51060790 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51060806 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51060809 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51061403 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51061406 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51061453 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51061492 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51061534 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51063193 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51063611 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51063759 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51065707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51065912 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51067050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51067242 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51068022 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51068841 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51069139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51069336 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51069843 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51073143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51073836 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51075717 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51076428 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51076477 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 51076568 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 51077943 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51078015 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51079068 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51079711 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51081793 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 51082826 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 51083206 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51083636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51084025 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51084161 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 51084480 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51084869 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51085995 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 51086334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51090016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51090070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51090465 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51091540 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 51091982 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 51093593 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51093622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51093844 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51093874 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51093924 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 51094104 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 51094111 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 51094231 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51094439 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 51094479 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 51094600 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 51094605 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51095135 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 51095139 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 51095189 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 51095346 C A Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 51095495 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 51095552 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 51095554 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 51095712 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51096194 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51096220 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51096391 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 51098369 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51098513 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51099599 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51100346 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 51104243 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 51104350 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 51105203 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 51108770 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51109600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51110037 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 51110986 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51111287 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51114012 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51115459 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51116138 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 51117882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51121829 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51122564 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51125011 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51128749 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 51130286 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51132856 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51132908 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 51133038 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 51133053 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 51135522 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 51135884 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 51136530 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 51136916 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 51136974 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 51137286 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 51137893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51138651 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 3 51138698 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51139025 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 51139351 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51140733 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 51142306 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51143896 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 51145965 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 51146337 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 51149389 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 51149574 A C Y N 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 3 51149676 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51149705 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 51149721 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 51150409 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51151924 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 51153794 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 51153912 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 51153931 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 11 7 4 3 2 3 51154497 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51154677 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 51154692 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 51154741 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 51154798 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 51154822 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 51154898 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 51155102 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 51155276 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 51155510 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51155719 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 51156754 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 51156781 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 51157020 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51157053 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 51157235 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 51157283 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51157383 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51157412 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 51157413 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51157425 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51157545 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51157566 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 51157663 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51157797 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51157859 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51157903 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 51158183 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51158285 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 51158501 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 51158530 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 51158730 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 51159124 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 51159163 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 51159446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51160616 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 51161205 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51161321 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51161353 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51161579 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51161724 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 51161761 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 51162402 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 51162648 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 51163267 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51163830 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51163942 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 51164240 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 51164277 T G Y N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0 1 0 15 15 0 15 0 3 51164633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51164751 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51164761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51164905 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51165361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51165510 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 51165767 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 51165986 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 51166901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51166985 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51167088 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51167153 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51167191 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51167211 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51167857 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 51168361 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51168419 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 51168465 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 51168814 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51169042 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51169075 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 51169179 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 51169194 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51169334 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51169959 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 51170105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51170118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51170173 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 51170185 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 51170306 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 51170791 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 51170941 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 51170999 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 51172016 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51172121 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 51172189 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 51172214 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51172226 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 51172551 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 51172575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51173719 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 51174418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51174512 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 51175590 G A N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 51175820 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51175868 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51175892 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51176687 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 51176710 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 51176713 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 51176779 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 51176793 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 51176803 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51176818 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 51176831 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 51177092 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 51177123 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 51177131 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 51177215 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 51177317 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 51177332 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51177342 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 51177548 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 51177922 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 51178398 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51178556 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51178706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51179619 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51179873 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51181034 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51181037 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51182171 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 51182203 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 51182397 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 51182468 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51182515 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 51182629 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51182912 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 51182929 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 51183019 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 51183142 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51183143 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 51183156 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 51183245 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 51183274 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 51183387 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 51183425 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 51183472 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 51183605 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 51183638 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 51183719 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 51183799 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 51183803 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 51183872 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 51184103 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 51184286 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 51184335 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51184376 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 51184454 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 51184749 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 51184761 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 51184784 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 51184786 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 51184832 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 51184834 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 51184885 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 51184947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51184968 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 51185003 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 51185016 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 51185158 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 51185253 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 51185278 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 51185308 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 51185348 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 51185368 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51185379 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 51185447 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 51185505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51185696 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51185724 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 51186160 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 51186181 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 51186198 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 51186371 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 51186471 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 51186482 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 51186522 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 51186645 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 51186646 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 51186741 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 51186746 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 51186886 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 51186907 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 51186932 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 51187130 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51187152 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 51187167 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 51187429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51187437 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 51187658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51187672 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51187685 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51187742 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51187767 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51189189 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 51189531 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 51189570 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 51189795 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 51189832 T A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 51190009 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 51190040 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 51190042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51190179 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 51190229 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 51190422 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 51190429 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 51190536 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 51190561 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51190562 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 51190891 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51190928 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 51191200 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 51191248 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 51191267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51191412 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 51191478 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 51191498 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 51191519 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 51191546 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 51191649 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 51191762 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 51192176 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51192400 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 51192412 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 51192821 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 51192981 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51193000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51193179 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51193615 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 51193890 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 51194075 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 51194246 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 51194468 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 51194783 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 51194789 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 51194833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51194861 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 51194872 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 51194874 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 51194894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51194961 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51194969 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51195207 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 51195281 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 51195357 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 51195450 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 51195485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51196099 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 51196110 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51196265 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 51196289 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 51196335 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51196466 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 51196490 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 51196493 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 51196501 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 51196552 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 51196678 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 51196714 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 51196767 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 51196964 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 51197085 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 51197111 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 51197545 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 51197668 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 51197913 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 51197955 G T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 51198787 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 51199025 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 51199241 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 3 51199264 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 3 51199370 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 51199405 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 51199603 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51199609 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51199616 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51199686 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 51199695 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 51199821 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51199861 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51199958 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 51199989 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51200252 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51200328 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 51200386 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51201352 T A Y N 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 51201499 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51202641 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51202714 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51202770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51202871 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51202911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51203569 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51203656 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 51203790 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51203817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51205605 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 51207754 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51207944 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 51208159 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51208439 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 51209218 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51209728 C T Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 51210606 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51212103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51212645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51214291 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51215138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51216673 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51217243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51217285 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51217993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51218896 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51221451 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51224459 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51227895 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51227902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51228384 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 51229667 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51230635 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 51232933 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 51234591 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 51235009 A T N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 51237331 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51238414 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 51240081 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 3 51241615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51241783 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51242969 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51245366 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51245603 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 51246904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51248505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51248923 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51249305 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 51250756 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51253950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51254353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51256680 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51262772 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 51264006 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51264186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51265233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51265838 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 51265937 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51266650 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51267312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51268116 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51270083 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51270114 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 51272029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51273589 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51274723 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51277580 A C Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 51277750 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 51277759 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 51277827 A G Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 51281105 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51281756 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51288157 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51288174 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51288221 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51288994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51291933 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51292582 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51292592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51292593 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51292856 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 51292860 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51292935 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51293261 A T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 51293323 T C Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 51293718 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 51293787 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 51293906 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51293907 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 51294071 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51294118 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51294291 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51294633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51294728 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 51294764 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51295190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51298861 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 51299756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51300886 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51301044 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 51301216 C G Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 51301269 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 51301318 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51301321 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51301382 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51301408 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 51301668 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 51301790 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 51301847 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 51302267 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51302303 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 51302341 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 51302356 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51302389 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 51302603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51302629 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 51302660 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 51302726 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 51302808 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 51302813 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 51302880 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51303760 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 51303989 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51304000 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51306443 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51308818 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51308820 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51309193 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51309536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51311764 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 51311826 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 51311842 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 51311884 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 51311956 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51311959 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 51312036 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51312045 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 51312102 A G Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 51312228 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 51312235 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51312346 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51312490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51312669 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51312830 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51312926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51312949 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51313145 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51313203 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 51313287 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 51313878 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51314120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51314163 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51314298 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51314308 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51314379 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 51314428 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 51314528 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 51314590 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 51314883 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51314915 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 51314919 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51314972 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51314992 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51315196 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 51315385 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51315511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51315567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51315624 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51315631 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51315699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51315706 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51315799 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51315873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51316458 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51316586 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51316938 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51316952 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51316990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51317111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51317161 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51317162 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51317822 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51317853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51318030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51318039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51318086 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51318210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51318280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51318325 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51318329 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51318380 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51318391 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51318427 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51318562 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51318588 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51318623 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51318642 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51318666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51318688 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51318767 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51318820 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51318966 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 51319164 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51319224 C A Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 51319647 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 51319722 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51319735 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51319749 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51320091 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 51320101 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 51320928 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 51321358 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51321409 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51321887 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 51325617 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51326076 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51328019 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 51328136 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 51329166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51329954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51330528 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51330714 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51331533 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51332795 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51335420 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 51336191 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 51336316 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51336579 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51336627 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51337509 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51337671 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 51337678 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 51338119 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 51338123 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51338653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51338893 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 51338951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51339807 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51340365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51340482 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 51340591 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 51340597 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51341297 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51341871 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51342558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51342668 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 51343274 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51344322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51344891 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 51344900 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51345087 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 51345185 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51345705 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 51346340 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51346415 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51346800 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51346853 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51346910 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 51346929 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 51347010 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 51347071 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 51347116 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 51347126 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51347151 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 51347207 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 51347284 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 51347339 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51347428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51347529 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51347622 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51347632 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51347671 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 51347818 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51347831 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 51347857 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 51347899 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51347983 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 51348994 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 51349382 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51349393 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51349733 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 51350629 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51351898 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51352343 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51354102 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51354301 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 51354505 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 51354711 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 51354863 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51355007 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51356248 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51356729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51356909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51356919 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51356920 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51357025 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 51357771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51358231 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 51358259 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51358414 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 51358464 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51358607 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51358620 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51358628 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 51358704 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 51358813 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51358864 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51358866 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51358945 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51359009 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51359013 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 51359529 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 51359855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51360143 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 51360171 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 51360540 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 51361321 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 51361349 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51361622 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 51361703 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51361766 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51361926 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 51361927 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 51361981 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 51362202 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51362256 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 51362625 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51362830 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 51363219 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51363593 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 51364006 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 51364926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51364929 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51365431 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51365602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51365822 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51366066 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 51366133 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51366475 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51366622 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51367596 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 51367806 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 51367929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51368200 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51368351 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 51368618 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51368670 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51369017 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 51369075 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 51369405 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 51369444 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 51369573 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 51369600 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 51369659 A T Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 51369718 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 51369840 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51369901 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 51369933 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51369938 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 51370211 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 51370216 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 51370325 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 51370367 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51370610 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 51370782 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 51370862 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51371175 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 51371328 G C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 51372472 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 51372744 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51375000 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 51376360 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51376426 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51376952 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 51378013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51378496 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51378689 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 51378690 C A N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 51378791 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 51378802 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.375 0.1875 0.4375 15 17 6 3 7 3 51378860 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 51378970 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51379121 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51379264 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 51379281 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 51379354 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 51379378 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 51379398 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 51379681 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51379842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51380244 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51380409 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51380440 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 51380466 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51380529 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51380609 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51381255 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51381342 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51381367 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51381638 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51381923 G C Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 51381929 G C Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 51382057 T G Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 51382106 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51382351 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51382464 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51382469 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51382494 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51382759 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51382841 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 51382895 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51382932 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51382975 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51383234 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 51383291 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 51383368 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 51383432 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51383776 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 51383839 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 51383930 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 51383942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51383946 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51383963 G C Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 51384066 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51384069 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51384169 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 51384416 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 51384550 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 51384583 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 51384586 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 51384597 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 51384601 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 51384804 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 51384837 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51384893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51385043 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 51385067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51385093 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51385100 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51385189 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 51385244 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51385428 T A Y N 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 7 11 2 3 4 3 51385435 C T Y Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 3 51385496 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 51385705 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 51385719 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 51385736 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51385748 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51385895 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51386150 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51386161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51386187 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 51386201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51386283 T C Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 51386405 G T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 51386409 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 51386520 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51386532 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 51386652 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 51387776 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51387812 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51388133 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 51388178 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 51388355 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51388365 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51391322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51392592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51393576 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51394877 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 51395206 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51395259 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 51395569 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51395737 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51395773 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51396127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51396586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51396625 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51396685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51396809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51396829 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 51397085 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 51397119 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 51397421 T G Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 51397840 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51397930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51398278 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51398304 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51398403 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 51398483 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 51398693 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51398713 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51398781 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51398856 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51399050 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51400483 G A Y Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 3 51400570 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 51400924 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 51401476 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 51402710 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51402752 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51402834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51402939 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51402967 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51403140 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51403293 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51403423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51403571 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51403611 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51404228 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 51404283 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 51404424 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51404440 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51404560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51404872 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51405069 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 51405095 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51405113 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 51405235 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 51405761 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51405919 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 51405992 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 51406049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51406065 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51406580 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 51406615 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 51406846 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51406934 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 51407214 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 51407259 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51407277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51407517 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51407878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51408623 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 51408803 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51408934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51409059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51409139 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51410591 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 51410619 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 51410627 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51410661 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51410680 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51410720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51411261 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 51411508 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 51411538 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 51411550 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 51411563 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 51411571 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 51411579 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 51411591 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51411623 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51411641 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 51411781 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 51411826 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 51411859 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 51411860 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 51411871 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 51411921 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 51412063 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51412083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51412192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51412193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51412247 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51412249 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 51415149 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51416178 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 51417497 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 51417601 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51417811 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51418138 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51418168 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51418239 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 51418453 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51419035 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51419983 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 51428019 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 51428191 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 51428233 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51428924 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51428925 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51428969 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51429288 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 3 51429307 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51429361 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51429366 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51429595 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 51429699 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51429792 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51429811 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 51429860 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51429891 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51430002 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 51430091 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 51430799 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51431361 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 51431373 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 51431525 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51431562 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51431568 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51431581 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 51431639 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51431688 G A Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 51431731 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 51431994 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51432424 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 51432438 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51432470 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51432473 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51432604 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 51432790 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51433036 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 51433679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51433694 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 51433858 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51434173 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51434521 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 51434551 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 51434579 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 51434792 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 51434841 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 51434976 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 51435132 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 51435211 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 51435238 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 51435357 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51435408 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51435591 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 51436169 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51436308 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51436315 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51436468 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 51436881 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51436937 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51437047 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51437165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51437242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51437319 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 51437519 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51437536 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51437545 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51437576 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51437706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51437785 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51437863 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51438207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51438376 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 51438453 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51438519 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51439582 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51441043 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51443319 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51443427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51443537 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 51443694 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51443769 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51443782 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51443853 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 51443933 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 51444018 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 51444029 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 51444061 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 51444210 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 51444305 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51444340 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51444396 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51444426 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51444432 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 51444447 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51444482 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51444647 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 51444811 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51444899 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51444936 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 51444959 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 51445019 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 51445144 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 51445159 T G Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 51445203 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 51445278 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 51445343 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 51445427 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51445488 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51445635 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 51445677 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51445678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51445929 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51446379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51446446 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 51446497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51446518 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 51446588 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51446640 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 51446661 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51446684 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51447048 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51447072 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51447152 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51447180 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 51447311 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51447664 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51447765 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51447777 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51447814 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51447944 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51447947 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51447961 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51447963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51448226 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51448264 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51448282 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51448294 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51448334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51449055 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51449179 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51449427 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51449487 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 51449534 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51449570 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51449706 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51449716 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51449750 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51449792 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51449817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51449838 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51449892 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 51449932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51449960 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51450182 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 51450334 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 51450424 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51450733 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51450821 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51451243 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51451260 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51451279 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51451411 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51451462 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51451483 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51453212 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 51453231 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 51453380 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51453498 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 51453524 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 51453567 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51453590 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51453639 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51453666 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51453715 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51453768 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51453804 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51453839 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51453858 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51453880 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51453896 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51453898 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51454388 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51454458 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51455688 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51455942 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 51456171 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 51456236 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 51457769 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 51457942 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51458483 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51458634 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 51458693 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51458700 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 51458720 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51458982 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51458989 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 51459093 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 51459184 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51459206 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51459340 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51459387 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51459425 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51459464 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51459486 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51459490 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51459547 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 51459581 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51459609 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51459624 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51459632 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51461705 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51462043 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51462141 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51462167 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51463813 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51464002 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51464222 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51464704 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51464931 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51464988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51465571 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 51465877 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51466049 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51466221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51466724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51467399 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51467539 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51468216 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 51468811 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 51468816 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 51468906 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51469410 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51469469 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51470803 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51471190 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51471332 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51471606 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 51472604 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51473012 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51474668 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51475133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51475488 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51475851 T G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 3 51476318 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51476589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51477486 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51477640 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51477935 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51478552 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 51478908 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 51478957 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51478983 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51479094 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 51479119 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51479212 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51479601 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51479620 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51479646 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51479821 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 51479864 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 51479865 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 51479963 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51479977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51480143 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51480206 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51480295 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51480454 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51480601 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51480609 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 51480613 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 51480623 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 51480647 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 51480790 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 51480799 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 51480801 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 51480819 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 51480850 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 51480961 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51481049 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 51481077 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51481094 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 51481240 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51481294 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51481342 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51481360 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51481412 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51481455 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51481533 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51481694 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51481704 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51481784 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51481796 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51481837 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51481848 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51481862 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51481997 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51482018 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51482038 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 51482067 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51482086 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51482208 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51482243 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51482258 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51482400 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51482415 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51482500 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51482592 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51483104 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 51483428 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 51483510 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 51483641 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51483905 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51483918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51483973 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51483989 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 51483998 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51484027 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51484191 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51484214 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51484299 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51484427 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51484472 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51484492 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51484515 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51484545 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51484770 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51484842 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51484885 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51484916 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51484923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51484983 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51485144 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 51485206 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 51485220 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51485251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51485252 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51485285 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51485320 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51485368 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51485383 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51485460 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51485473 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51485518 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51485576 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51485624 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51485639 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51485647 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51485672 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51485715 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 51485783 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51485868 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51485894 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51486410 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51486419 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51486589 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51486624 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51486669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51486763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51486837 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51486853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51486900 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 51486904 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51486960 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51487089 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51487115 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51487211 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51487290 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51488214 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51488249 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51488743 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51488789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51488868 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51488900 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51488983 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51489154 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 51489464 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51489703 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51490018 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 51490074 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51490158 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51490832 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51491979 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51494740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51495266 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51495331 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51495435 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51495598 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51496100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51497320 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 51497357 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 51499024 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 51500863 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 51500869 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51501903 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 51503031 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51503148 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51503181 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 51503187 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 51503198 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 51503278 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 51506339 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 51506655 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51506921 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51507594 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51507806 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 51508319 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51508390 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51508580 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51508622 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51509175 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 51509300 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51509313 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51509370 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51509428 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 51510352 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51510865 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51510951 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 51511000 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 51511909 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 51511913 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51512007 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51512078 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 51512842 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51512868 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 51512931 T A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 3 51513553 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51513582 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51513760 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51514218 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51514519 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 51515389 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51515461 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 51515971 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51516096 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 51517860 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51518493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51520120 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51523360 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51523366 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 51523982 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51524411 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 51525427 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51526632 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51526758 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 51527608 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51527620 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51527637 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51527679 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51527819 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51527980 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 51528039 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 51528332 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51528394 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 51528438 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51528473 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51528739 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 51529026 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 51529149 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51529214 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 51529232 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51529502 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 51529619 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 51530316 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 51530709 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51530727 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51530730 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 51530834 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51530955 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51531032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51531549 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 51531626 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 51531689 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 51531756 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51531867 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 51531908 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 51532128 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 51532142 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 51532439 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51532737 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51532814 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51532932 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51533213 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51533429 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 51533647 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51533654 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51533964 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 51535012 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51535329 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51536152 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51536320 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51537297 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51538410 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 51538475 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 51538518 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51538549 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51538587 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 51538607 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51538760 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51538766 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51538894 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 51538913 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 51538970 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51539012 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 51539018 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 51539179 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51539247 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 51539257 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 51539258 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 51539300 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51539568 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51539889 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51539961 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51540128 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51540521 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51540532 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 51543125 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51546279 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51547668 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51548034 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 51548038 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 51548889 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51548900 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 51549237 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 51549349 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51550833 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 51551247 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 51551849 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51552614 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51554222 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51555470 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51555509 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51555612 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 51555885 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51556704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51557338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51557729 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 51557871 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51557922 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 51557935 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 51559785 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51561094 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 51561156 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 51561157 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 51561963 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 51562196 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51562516 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 51562719 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 51562752 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51562775 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51562875 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 51562918 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51562926 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 51563035 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51563119 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51563217 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51563228 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51563472 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51564791 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51566841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51567454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51571331 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 51571388 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 51571460 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51571800 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51571842 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51571957 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51571967 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51571993 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51572090 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51572093 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 51573155 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 51573272 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 51573386 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51573639 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51573644 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51573939 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51573955 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 51574093 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51574105 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 51574215 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51574314 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 51574329 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 51574335 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51574808 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 51574844 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51574884 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 51574917 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51574923 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51575017 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 51575027 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 51575321 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51575513 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51575568 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51575586 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51575644 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 51575661 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 51576191 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 51576267 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 51576426 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 51576453 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51576559 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51576639 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51576819 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51576886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51577190 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 51577428 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 51577442 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51577520 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51577615 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51577831 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 51577866 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51578083 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 51578106 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 51578290 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51578838 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 51579187 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 51579263 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51579271 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 51579473 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 51579583 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 51579700 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51579806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51579810 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51579923 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51580119 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51582224 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51582533 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51582572 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51583550 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51583597 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51584321 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51584747 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51586492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51586829 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 51588991 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 51589197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51590635 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51590658 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51590899 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51591175 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51591245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51591736 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 51591950 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51593151 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51593252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51593336 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51593606 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51593725 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51594942 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 51594979 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 51594980 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 51595109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51595325 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 51595379 A C Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 51595951 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 51595968 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 51596108 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 51596155 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51596393 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51596480 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51596953 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51597248 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51597745 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51597817 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51598312 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 51598697 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 51598698 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 51599361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51599853 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51600016 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51600174 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51600281 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 51600625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51600916 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51601643 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51601865 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 51602597 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 51603300 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51603459 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51603534 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51604080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51604868 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 51606892 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 51607396 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 51610441 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51611072 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 51611121 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51614035 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51616105 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51616141 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51618714 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 51620131 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51622190 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 51623321 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 51623572 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51624296 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 51626363 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51627735 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 51628118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51628127 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51628222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51628223 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51628287 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 51628289 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 51628301 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 51628401 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 51628404 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51628503 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 51628544 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 51628794 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51628890 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51629236 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 51629245 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 51629280 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 51629416 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 51629847 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 51629902 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 51630242 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 51630703 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51631054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51633908 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 51634672 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51636247 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51637237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51638132 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51639049 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51640948 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51643122 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51643805 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51643828 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 51644617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51644639 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51644700 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 51644839 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 51644998 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51645016 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51645102 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51645106 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51645126 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51645367 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 51645449 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51645742 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 51646475 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51646531 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51646540 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 51646612 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51646617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51646665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51646679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51646681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51646717 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51646725 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51646743 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 51646751 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 51646755 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51646851 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51646868 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51646887 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51646898 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51647025 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51647035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51647194 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51647513 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 51647531 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 51647553 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51647566 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 51648071 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 51648218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51648304 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 51648355 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51648475 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 51648608 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 51648738 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51648739 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51648785 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51648797 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 51648920 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51648946 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 51648997 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 51649037 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51649049 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51649062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51649221 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 51649269 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 51649357 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51649590 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 51649650 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51649801 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 51649838 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 51649948 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 51649971 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51650008 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51650085 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51650146 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 51650241 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 51650398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51650496 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 51650520 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51650523 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51650582 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51650641 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51650683 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 51651075 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51651314 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51651341 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 51651490 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 51651775 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 51651806 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 51651844 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 51652012 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51652018 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51652095 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 51652254 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51652269 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 51652946 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 51653025 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51653338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51653673 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51653958 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51654278 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51655597 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51655621 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 51655723 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 51655730 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51655980 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 51656068 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51656477 A C N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0 0.75 0.25 12 20 0 12 4 3 51656761 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51656766 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 51657069 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51657911 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 51658204 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 51659267 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 51659593 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51661327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51661343 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51662624 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51663064 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 51664013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51666865 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51667792 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51669338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51669461 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 51669487 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 51670120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51671527 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 51671590 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51671664 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 51671734 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51671869 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 51672460 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 51673576 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 51673708 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 51674573 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51675714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51677134 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51677929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51679521 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 51681881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51685406 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 51685734 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 51685931 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51687712 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 51690414 T A Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 51690578 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 51691361 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51691383 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51691400 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51691446 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 51691460 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51691467 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 51691472 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 51691527 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51691567 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51691629 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51691643 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 51691644 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51691726 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51691788 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51692134 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51692187 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51692417 A G N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 3 51693316 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51693533 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51693567 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51693617 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51694756 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 51694772 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 51694799 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 51694839 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 51694978 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 51695110 A G Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 51695119 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 51695245 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 51695286 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 51695475 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 51695476 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 51695710 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51695757 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51695775 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 51695962 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51695968 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51696108 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51696135 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 51696321 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 51696324 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 51696421 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51696437 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 51696462 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51696482 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 51696512 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 51696584 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 51696587 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 51696603 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 51696684 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 51696687 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 51696743 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51696767 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 51697170 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 51697396 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51697648 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 51697716 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51697734 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 51697780 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51697903 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 51697923 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 51698020 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 51698203 T A N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 51698428 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 51698746 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 51698870 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 51698871 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 51698924 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 51698952 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 51699007 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51699043 A T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 51699107 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 51699152 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 51699189 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 51699192 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 51699221 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 51699366 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 51699395 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 51699441 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 51699456 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 51699476 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 51699499 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 51699512 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 51699577 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 51699601 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 51699658 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 51699796 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 51699951 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 51699970 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 51699982 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 51700014 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 51700053 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 51700177 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51700195 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 51700231 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 51700332 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51700502 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 51700789 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51700808 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 51701285 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51701371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51701437 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 51701619 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 51701706 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 51701863 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 51701998 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51702167 G C Y N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 3 51702207 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51702214 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51702251 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51702753 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 51702799 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 51703132 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 51703197 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 51703441 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 51703503 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51703642 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 51703783 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51703820 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 51703863 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51703864 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 51704093 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51704733 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 51704809 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 51704858 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 51704892 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51705033 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 51705325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51705841 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 3 51706031 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 51706105 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 51706149 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51706150 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51706178 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51706255 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 51706385 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 51706529 T G Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 51706542 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 51706640 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51707514 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 51707723 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 51707816 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51707829 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 51707900 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 51708319 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51708811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51708978 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 51709090 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51709148 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51709391 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 51709423 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 51709466 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 51709472 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 51709492 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51709526 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51709543 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 51709633 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 51709710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51710346 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51710687 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51712316 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 51712549 C G Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 51712889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51713283 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 51713555 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51713583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51713635 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 51714433 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 51714535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51716016 G T Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 51716239 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 51716348 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 51716520 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 51716790 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 51716882 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 51717383 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 51717483 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51717532 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51717624 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51717840 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 51718218 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51718845 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51719787 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 51720300 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51720576 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 51720901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51721202 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51721214 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 51721469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51721781 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51721785 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 51721826 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51721845 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51721867 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 51721910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51721914 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 51721987 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 51721988 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 51722044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51722254 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51722364 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51722449 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51722477 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51722543 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51722663 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51722682 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 51722769 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 51722778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51722835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51722864 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51722914 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 51722944 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51723203 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51723223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51723441 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51723687 C A Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 51723694 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51723763 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51723818 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51724946 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51725027 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51725322 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 51725380 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51725414 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51725587 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51725602 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51725797 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 51725808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51727173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51727206 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 51727840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51729292 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 51729332 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51729865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51730138 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 51730163 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 51731225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51731231 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51731253 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 51731259 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51731296 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 51731316 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51731513 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 51731540 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 51731688 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 51731710 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51732005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51732707 G T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 51732909 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 51733124 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51733479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51738450 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 51738463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51738505 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 51738960 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51739221 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51739475 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 51739518 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51739702 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 51739714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51739932 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 51740032 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51740168 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51740261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51740504 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51740651 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51740652 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51740696 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 51740721 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 51740887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51740911 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51741075 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51741077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51741376 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51741753 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 51741857 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 51741918 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 51742247 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51742292 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 51742343 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 51742468 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 51743080 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 51743214 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51743241 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 51743307 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 51743582 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 51743763 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51743859 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51744071 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51744136 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51744159 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 51744524 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51744617 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51744633 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 51744678 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 51744820 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51745337 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51745459 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 51745466 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 51746505 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 51746730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51746789 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 51746870 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 51747071 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51747420 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51747504 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 51747588 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 51747594 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 51748418 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51748843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51749644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51750366 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51750808 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51751940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51752080 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51752356 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51752408 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 51752776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51752866 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51753248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51753490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51754572 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51754661 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51754680 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 51754701 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 51754726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51754768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51754813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51754864 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 51755183 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 51755255 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 51755392 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51756774 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 51756921 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51756941 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51757573 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51757962 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51759376 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 51759481 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 51759527 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 51759587 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 51759828 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 51759844 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 51760089 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 51760137 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 51760514 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 51760626 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 51761047 A G N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 51761099 A C N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 51761104 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 51761266 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 51761486 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 51761491 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 51761713 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 51761827 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 51761828 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 51762177 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 51762194 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 51762213 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 51762313 T G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 51762367 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 51762420 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 51762442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51762595 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 51762704 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51762864 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 51763005 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 51763078 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 51763088 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 51763102 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 51763205 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 51763398 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 51763640 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 51763910 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51763911 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51764319 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 51764340 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 51764349 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51764605 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51764964 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51765098 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 51765220 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 51765223 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 51765541 A C Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 3 51765732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51765993 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 51766056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51766210 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 51766454 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51766496 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 51766553 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51766589 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 51766611 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 51766752 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 51768943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51769035 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 51769717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51770361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51770398 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 51770419 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 51770433 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 51770541 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 51770652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51770896 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 51770991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51771240 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51771646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51771734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51771880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51771921 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 51771973 G C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 51772082 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 51772345 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 51772356 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 51772671 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51773205 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51773527 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51773582 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51774000 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 51774521 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51776481 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51777286 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51777399 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51778507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51779748 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 51779888 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 51779943 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51779984 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 51780169 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 51780393 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 51780769 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51781123 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51783059 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 51783235 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 51784329 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 51786174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51787713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51789835 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51791903 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51792258 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51792481 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51793133 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51793301 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51793857 C G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 51794031 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51794326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51796206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51798824 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 51799222 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51799652 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 51801133 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51802312 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 51802341 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 51802388 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 51802659 A C Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 51802674 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 51803133 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 51803212 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 51804206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51804565 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 51804908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51804994 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 51805016 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 51807199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51808988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51810389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51810457 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 51810771 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51813145 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 51813786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51814910 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51814911 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51814961 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 51814973 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51815011 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51815649 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 51815696 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 51815719 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 51815776 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 51816218 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 51816248 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 51816269 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 51816327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51816359 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 14 26 6 2 12 3 51816362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51816651 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51816716 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 51816926 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 51816947 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51817197 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51817207 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 51817714 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 51817735 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 51817822 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0 0.684210526315789 0.315789473684211 13 25 0 13 6 3 51817948 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 51818169 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 51818491 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 51818592 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 51818645 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 51818678 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51818866 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 51818884 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51818912 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 51819055 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 51819155 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 51819216 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51819229 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 51819334 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51819502 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51819780 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51819892 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 51819986 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 51820016 G A N Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 9 9 3 3 3 3 51820357 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 51820403 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 51820439 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 51820472 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 51820674 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 51820687 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 51820720 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 51820787 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 51820790 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51821329 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 51821330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51821430 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51821528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51821551 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51822266 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51823155 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 51823868 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51824549 C A Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 51825477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51825759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51826550 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51826861 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51827288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51827829 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51828216 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 51828254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51828850 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 51828991 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 51829248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51831718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51833318 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51834193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51837902 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 51841896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51841952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51843479 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 51844658 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51844661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51844807 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51846006 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 51846132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51846195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51846338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51847235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51848182 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51850010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51850027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51850312 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51851950 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51853103 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51854085 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51855708 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 51855829 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 51855853 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 51855986 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51856294 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 51856329 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 51856429 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51856801 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51856820 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 51856961 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51857142 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51857224 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51862897 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 51863904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51868364 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51868374 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51871357 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51871807 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51872489 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51872837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51873175 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51874172 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51874179 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 51874226 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 51874241 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51874242 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 51874345 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51874500 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51874601 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 51875583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51875709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51875785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51875851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51875855 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51875933 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51876050 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 51876074 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 51876890 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 51877181 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 51877691 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51877763 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51878102 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51878118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51878279 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51878525 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 51879861 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51879909 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51880067 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51880121 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 51880840 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51880972 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51881105 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 51881107 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 51881440 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51881868 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51881877 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51882444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51882543 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51882544 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51882934 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51882945 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51883476 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51883497 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51883524 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51883573 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51883574 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51883651 A G N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 51883674 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51883686 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51884861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51884864 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51884933 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51885280 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 51885421 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51885501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51885527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51885575 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51885709 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 51885731 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51885770 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51885844 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51886112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51886206 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51886324 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51886345 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 51886525 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 51886541 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51886599 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 51886601 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 51886769 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 51886851 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 51887021 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51887078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51887651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51888358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51888404 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51888595 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 51888615 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51888651 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51888654 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51888700 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51888847 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51889142 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51889238 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51889278 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51890267 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51890625 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51893465 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51893759 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51894014 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51894321 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51894504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51894907 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51894965 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51895100 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 51895131 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51895150 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51895441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51895704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51897895 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51898441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51898934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51899597 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51899870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51899919 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51899929 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51899998 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51901380 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51901911 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51903028 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51904891 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 51906792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51909270 A G Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 51909279 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 51909960 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51910356 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 51910647 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51910680 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51916011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51916571 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 51917170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51917357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51917443 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51917525 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 51918167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51918237 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51918433 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51918545 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51918547 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51919098 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51919110 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51919597 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51919720 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 51919840 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 51919910 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 51919956 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 51920085 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51920114 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51920236 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 51920286 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 51920291 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51920448 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 51920633 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 51920652 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 51920759 T C Y Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 8 8 3 2 3 3 51920787 C G N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.2 0.0666666666666667 0.733333333333333 7 23 3 1 11 3 51920819 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 51920929 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 51920973 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 51920979 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 51920987 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 51920996 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 51921054 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 51921058 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 51921110 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 51921119 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51921438 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 51921464 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 51921557 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 51921593 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 51921608 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 51921653 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 51921696 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 51921709 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 51921799 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 51921844 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 51921869 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 51921870 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 51921884 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 51921929 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 51921945 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 51921969 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 51921998 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 51922031 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 51922101 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 51922103 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 51922128 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 51922147 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 51922266 G A N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 51922469 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 51922510 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 51922545 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51922656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51922819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51922911 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51922962 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51923004 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 51923046 T A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 51923120 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51923155 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51923181 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51923234 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51923236 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51923398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51923414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51923435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51923622 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51923746 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51923822 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51924108 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51924167 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 51924169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51924234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51924504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51924630 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51924676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51924677 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51924725 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 51924853 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51924905 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 51925180 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51925263 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51925294 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51925340 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51925500 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 51925511 G A N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 3 51925583 T G N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 51925717 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 51925775 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 51925831 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 51925832 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 51925869 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 51925994 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51926230 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 51926246 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 51926275 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 51926289 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 51926349 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 51926350 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 51926559 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 51926578 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 51926645 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51926650 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 51926692 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 51926736 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 51926751 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 51926793 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 51926847 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 51926856 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 51926907 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 51926967 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 51927015 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 51927182 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 51927187 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 3 51927193 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 51927219 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 51927223 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 51927296 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 51927335 A C N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 3 51927337 C A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 3 51927452 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 51927489 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51927521 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51927793 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51927879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51928018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51928212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51928327 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 51928348 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 51928391 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 51928414 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 51928476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51928490 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51928600 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 51929532 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51930111 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 51930245 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 51931180 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 10 22 4 2 10 3 51931660 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 51931972 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 51932112 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 51932118 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 51932126 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 51932250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51932297 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 51932303 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 51932517 C T N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 9 15 3 3 6 3 51933132 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 51933137 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 51933153 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 51933171 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 51933191 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 51933784 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 51934058 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 3 51934219 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51934248 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51934261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51934445 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51934463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51934591 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51934726 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 0.142857142857143 0.214285714285714 20 8 9 2 3 3 51935359 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 51935415 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 51935430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51935481 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 51935873 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51936519 T A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 51936835 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51936874 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 51936998 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51937015 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 51937025 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 51937081 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51937110 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51937337 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51937450 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51937724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51937725 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 51937771 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 51937776 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 51937984 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51938442 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51938445 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51938454 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51938871 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 51939457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51939722 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51939950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51940122 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 51940136 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51940173 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 51940211 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 51940268 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 51940295 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 51940396 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 51940413 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 51941136 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51943207 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 51943456 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 51945282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51945311 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 51945324 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 51945328 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 51945534 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51945725 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51945990 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51946063 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51946289 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51946316 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51946486 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51946511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51946546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51946599 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51946612 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51946682 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51946878 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51946885 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51946902 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51946981 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51947069 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51947079 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51947134 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51947167 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51947189 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51947379 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51947743 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51947834 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51947840 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51947890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51947894 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51948007 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51948036 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51948188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51948208 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51948233 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51948327 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51948338 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51948399 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 51948440 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51948515 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 51948633 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 51948775 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51948833 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51948864 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51948868 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51948887 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51948977 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51949043 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51949302 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51949515 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51949626 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 51949766 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 51949775 A C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 51949872 A C N N 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 7 11 2 3 4 3 51950039 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 51950197 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 51950202 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 51950212 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 51950226 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 51950241 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51950261 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51950283 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51950289 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51950501 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 51950585 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51950607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51950622 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51950705 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51950714 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51950845 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 51951005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51951105 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 51951160 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 51951366 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 51951385 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51951446 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51951562 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 51952089 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51952319 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51952403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51952950 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51952984 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51952985 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51953057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51953179 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51953260 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51953311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51954074 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51954337 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51954347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51954403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51954486 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 51954487 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51954613 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51954719 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 51954724 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 51955200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51955391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51955406 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 51955488 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51956434 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51961796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51961960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51962678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51962780 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51963227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51963722 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 51965079 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 51965215 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 51965291 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51965893 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 51966014 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 51966062 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 51966156 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 51966484 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51966589 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 51966655 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 51967075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51967117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51967130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51967161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51967398 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51967421 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 51967427 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51967433 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51967439 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51967478 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51967494 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51967576 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51967583 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51967587 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51967651 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51967673 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51967683 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51967764 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51967902 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 51968046 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51968137 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51968889 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 51969092 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51969202 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51969241 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 51969591 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 51969985 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 51970398 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 51970445 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 51970489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51970569 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 51971024 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 51971144 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51971170 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 51971235 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 51971263 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 51971269 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51971833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51972074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51972512 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51973000 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 51973353 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 51973423 C G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 3 51973901 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51974032 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 51974475 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 51974774 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51974781 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51974984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51975014 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51975020 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 51975202 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 51975389 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51975619 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51975976 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51976214 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 51976235 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51976251 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51976364 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51976402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51976523 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51976576 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51976645 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51976652 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 51976661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51976669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51976793 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 51977217 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 51977228 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 51977251 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 51977279 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 51977288 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 3 51977321 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 51977333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51977371 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 51977379 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 51977421 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 51977422 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 3 51977466 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 51977467 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 51977516 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51977528 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 51977700 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 51977789 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 6 30 3 0 15 3 51977814 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 3 51977979 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 51978024 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 51978063 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 51978096 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 51978100 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 51978131 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51978181 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 51978756 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51979211 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 51979268 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51979315 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 51979355 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51979869 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 51979944 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51979987 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51980527 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 51980751 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 51980785 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 51980891 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 51980948 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 51981009 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 51981114 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 51981146 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 51981154 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 51981200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51981316 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 51981339 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 51981400 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51981433 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 51981494 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 51981552 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 51981561 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 51981594 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 51981611 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 51981889 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51982057 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51982456 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 51982785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51982850 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51983569 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51983675 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51983889 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 51983944 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51984369 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51984481 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 51984997 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51985113 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 51985294 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 51985380 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 51985387 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 51985515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51986261 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 51986626 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 51988607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51993231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51996358 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 51996904 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51996912 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 51997273 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 51997464 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 51997678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 51997788 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 52000161 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 52001288 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52001351 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 52001658 T A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 52001672 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 52001700 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 52001794 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 52001830 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 52001986 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52002794 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52002846 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 52003271 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 52003729 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 52003745 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52003874 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 52003932 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52003980 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52005464 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52005927 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52007607 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52009349 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 52009394 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52009867 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 52009896 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 52009920 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52010489 G C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 52010632 C A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 52010752 A G N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 3 52011040 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 52011055 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 52011150 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 52011158 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 52011226 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 52011228 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 52011263 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52011429 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 52011549 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 52011557 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 52011602 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 3 52011789 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 52011975 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 52012344 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 52012497 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 52012714 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 52012737 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52012775 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 52012787 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52012803 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 52012943 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52012996 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52013068 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 52013106 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52013118 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52013265 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52013741 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52014798 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 52015101 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 52015496 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 52015532 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 52015662 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 52015703 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52015791 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52015880 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52016296 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52016509 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 52017124 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 52017251 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 52017255 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 52017338 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 52017370 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 52017739 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 52017740 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 52017770 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 52017837 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 52017856 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 52017919 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 52018104 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52018367 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52018373 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52018451 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 52018452 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 52018467 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 52018617 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 52018621 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52018784 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52018923 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52019020 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52019370 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52019562 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 52019587 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52020019 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 52020089 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 52020128 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52020615 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 52020622 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 52020655 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 52020658 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52020709 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52020792 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52020845 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52020872 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 52020892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52021095 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 52021140 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 52021217 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 52021370 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52021545 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52021611 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 52021618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52021773 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52021993 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52022522 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 52022591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52022709 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 52022762 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52023227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52023244 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52023371 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52023458 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52023921 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 52024159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52024181 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52024212 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52024215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52024232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52024247 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52024495 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52024563 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 52024591 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52024639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52024696 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52024698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52024711 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52024769 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52024851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52024912 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52025090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52025220 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 52025320 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52025415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52025447 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52025729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52025798 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52025873 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52025954 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52026300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52026408 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52026486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52026507 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52026654 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52026926 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52026932 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52027033 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52027159 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52027199 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52027271 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52027324 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52027337 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52027378 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 52027506 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52027538 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52027717 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52027790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52027798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52027855 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52027926 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52028113 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52028118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52028149 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52028202 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52028243 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 52028244 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52028280 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 52028320 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52028336 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52028382 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52028453 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 52028574 T A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 52028613 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 52028711 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 52028808 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52028837 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52028893 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52028923 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52029017 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52029093 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52029455 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52029466 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52029474 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 52029561 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52029583 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52029717 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52029835 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52029964 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52029969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52029987 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 52030402 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52030506 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 52030509 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 52030651 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 52030744 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52030796 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 52031003 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52031035 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52031172 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 52031179 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52031207 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52031224 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52031278 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 52031365 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 52031433 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 52031437 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 52031454 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52031476 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 52031581 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 52031631 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 52031637 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52031823 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52031863 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52031866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52031919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52032800 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52033567 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 52037198 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52037578 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52037903 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52037906 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 52037927 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 52038196 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 52038238 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 52038248 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 52038449 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 52038463 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52038547 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 52038564 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 52038580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52038585 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52038693 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 52038722 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52038779 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 52038862 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52038982 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 52039003 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 52039036 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 52039231 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 52039309 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52039377 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 52039696 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 52039699 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 52039827 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52039957 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52040120 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 52040332 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 52040336 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52040369 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 52040376 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52040654 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 52040664 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52040681 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 52040697 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52040856 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 52040870 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 52040978 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 52041226 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 52041417 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 52041424 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 52041519 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52041617 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 52041652 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 52041958 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 3 52042049 T C Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 52042050 A C Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 52042083 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 52042157 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 52042178 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 3 52042209 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 52042213 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 52043099 G T Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 52043279 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52043385 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 52043386 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52043426 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52043444 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52043484 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52043512 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52043651 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52043775 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52043819 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52043857 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52043864 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 52044213 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 52044270 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 52044290 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 52044415 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 52044468 G A N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 52044523 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 3 52044584 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 52044590 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52044657 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52044706 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 52044786 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 52044793 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 52044811 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 52044824 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52044895 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52044996 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52045111 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52045119 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52045352 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52045486 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 52045489 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 52045573 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 52045744 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52046027 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52046310 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52046378 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52046795 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52046831 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52046952 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 52046962 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 52046963 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 52046982 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52047203 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52047424 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 52047442 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 52047486 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52047565 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 52047573 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52047606 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 52047778 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52047826 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52047858 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 52047913 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52047918 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52048000 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 52048138 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 52048229 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 52048271 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 52048325 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 52048346 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 52048516 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 52048822 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 52049050 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52049401 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 52049412 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52049419 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 52049619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52049684 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 52049762 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 52049769 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 52049862 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 52049870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52051237 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52051498 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 52051587 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52051639 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52051698 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 52051768 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 52051783 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 52051860 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 52051896 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52051961 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52051999 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 52052041 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 52052060 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 52052063 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 52052083 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 52052198 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 52052246 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 52052297 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 52052502 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52052546 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52052634 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52052843 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52052848 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 52052900 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52053135 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52053139 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52053395 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 52053689 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 52053958 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 52054015 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 52054394 G C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 52054480 C A N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 52054826 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 52054951 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 52055186 T C Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 52055475 G A Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 3 52055542 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.416666666666667 0.5 0.0833333333333333 16 8 5 6 1 3 52055561 G T Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 52055589 T C Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 52055686 C T Y Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 52055750 T G N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 52055765 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 52055767 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 52056405 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 52057070 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 52057231 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52057273 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52057344 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52057452 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52057515 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52057946 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52058058 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 52058389 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52058737 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 52058858 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52058878 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 52059058 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52059096 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52059292 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 52059394 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52059419 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52059533 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52059548 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52060013 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52060019 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52060193 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 52060243 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 52060299 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 52060329 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 52060378 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 52060397 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 3 52060401 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 3 52060429 T G Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 52061341 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 52061385 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 52061429 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 52061479 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 52061498 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52061525 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 52061560 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52061578 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52061761 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52061824 T G Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 52061839 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 52061841 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52061897 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 52061922 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52062759 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 52062870 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52063200 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52063240 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52063250 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52063265 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52063292 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52063432 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 52063447 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 52063513 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52063530 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52063662 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 52063731 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 52063744 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 52063987 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 52063988 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 52064280 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52064291 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52064396 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 52064407 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 52064412 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 52064465 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 52064500 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 52064520 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52064863 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52065045 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 52065082 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 52065350 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52065698 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52065699 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52065982 A T Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 52066007 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 52066054 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52066069 G A Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 52066266 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 52066312 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 52066380 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 52066388 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 52066407 C A N N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0 0.636363636363636 0.363636363636364 7 15 0 7 4 3 52066483 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52066609 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 52066664 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 52066670 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 52066751 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 52066835 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 52067587 C G N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.285714285714286 0.0714285714285714 0.642857142857143 9 19 4 1 9 3 52067760 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52067763 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 52067790 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52068789 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52069016 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 52069031 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52069078 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52069120 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52069254 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 52069340 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52070366 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 52071317 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 52071478 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52071541 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52071952 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52072105 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 52072338 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 52072396 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 52073386 G A Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 52073765 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52074281 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 52074575 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52075606 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52075658 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52075691 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52075777 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52076935 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52077200 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52077339 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52077550 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52077628 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52077692 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52079008 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52079009 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 52079218 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52079495 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52080132 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 52080459 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 52080486 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 52080575 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52080584 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52080606 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52080717 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 52080731 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52080751 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52080832 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52080975 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 52081618 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52081896 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52082370 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52082950 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52083323 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52083328 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52083378 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52083434 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52083502 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52083572 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52083716 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52083729 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52083812 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52083854 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52083859 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52083934 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52084014 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 52084227 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52084462 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52084507 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52084619 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52084851 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52084863 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52085401 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 52085437 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 52085603 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52086092 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 52086228 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 52086877 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52087917 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 52089073 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52090199 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52090291 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52090382 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 52090397 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 52090691 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52090938 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52090987 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52091021 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 52091083 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 52091523 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 52091603 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 52092091 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52092496 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52092841 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52093404 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52093465 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 52093482 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 52093777 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52094015 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 52094120 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52094524 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52094535 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 52094940 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52094941 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52095389 G C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 52096142 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 52097723 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52097887 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52099047 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52099368 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52100136 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52101106 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52101451 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52103451 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52103943 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 52104923 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52106351 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52107836 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 52108515 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52109640 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52110232 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52110713 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52110771 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52111143 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52111336 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52112032 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52113374 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52113424 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52113546 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52113680 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 52114092 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52114100 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52116562 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52116884 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52116987 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 52117268 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52117739 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52119633 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52120810 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52121126 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52121137 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52121281 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52121292 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52121341 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52121457 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52121502 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52121598 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52121617 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52121671 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52121799 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52121887 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52121962 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52122126 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52122236 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 52122573 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52122606 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52122629 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52122653 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52122776 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52122928 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52123004 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52123017 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52123397 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 52123604 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52123615 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52123910 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52123961 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52123985 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52124034 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52124146 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52124178 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52124206 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52124224 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52124264 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52124270 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52124697 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52126009 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52126440 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52127135 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52128068 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52128120 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52128570 T A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 52128803 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 52128877 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52130714 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52130900 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52131181 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52131407 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52133840 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52134153 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 52134219 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 52136344 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52137352 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52137586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52138373 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52140919 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52142296 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 52142326 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 52142918 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52143365 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52143568 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52143908 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52143928 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 52144442 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52144558 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52144938 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52146153 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52146700 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52146739 C T Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 52148358 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52148758 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 52148909 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52150299 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52150876 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 52151381 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52151656 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52152349 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52152414 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52152540 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52152603 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52152682 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52152834 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52152879 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52153093 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52153110 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52153224 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52153851 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52154078 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52154260 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52154293 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52154536 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52154950 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 3 52155025 G T N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 52155124 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 52155193 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 52155360 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52155378 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52155512 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52155796 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52155809 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52155823 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52155869 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52155944 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52155955 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52156090 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52156114 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52156174 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52156316 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52156368 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52156736 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52156743 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52157794 C A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 52158158 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 52158189 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52158459 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52158590 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52159169 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52159337 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 52159353 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 52159373 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 52159821 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52160457 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 52160486 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 52160632 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52160719 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52162519 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52162806 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52162808 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52162838 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52162958 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 52163009 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 52163022 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 52163044 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 52163062 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52163632 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52163640 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52163653 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52163716 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52163904 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52163971 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52164131 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52164263 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52164365 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52164372 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52164451 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52164479 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52164646 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52164815 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52164959 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52164988 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52165062 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52165161 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52165251 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52165428 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52165598 C T N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 52165743 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 52165841 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 52165880 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52165985 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52166009 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52166097 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52166400 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 52166465 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 52167005 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52167768 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52167795 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52167971 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52168144 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 52168371 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52168505 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52168514 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 52168960 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52169352 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52169422 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52169468 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52169893 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52170194 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52170634 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 52170748 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52170895 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52171129 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52171151 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52171166 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52171344 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52171374 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52171387 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52171409 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52171435 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52171883 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52171901 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52171985 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52172082 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52172310 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52172379 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52172547 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52172569 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52172649 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52172684 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52172701 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52172744 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52173045 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52173125 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 52173496 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52173531 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52173617 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 52173708 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52173802 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52173803 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52173878 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52174176 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 52174429 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52174568 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52175020 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 52175046 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52175358 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52175367 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 52175378 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 52175446 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 52175459 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52175471 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52175501 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52175510 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52175722 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52175780 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52175914 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52176023 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 52176126 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 52176327 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52176389 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52176617 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52176692 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52176742 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52176772 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52176882 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52176909 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52176911 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52177294 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52177387 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52177482 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 52177483 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 52177499 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 52177788 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 52177794 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 52177820 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52177822 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 52177847 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52178016 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 52178040 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 52178100 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52178133 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52178152 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 52178325 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 52178371 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52178426 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 52178482 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52178539 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52178633 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52178641 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52178715 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52178754 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52178767 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52178880 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 52179006 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52179007 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52179305 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52179513 C A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0 0.764705882352941 0.235294117647059 13 21 0 13 4 3 52179715 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52179729 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52179899 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52180249 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 52180345 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52180408 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52180523 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 52180641 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52180751 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52180800 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52181094 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52181126 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52181185 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52181408 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 52181630 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 52181764 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 52182057 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52182152 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 52182304 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52182374 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52182490 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52182616 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52182723 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52182945 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52183036 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52183118 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52183219 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 52183445 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 52183521 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52183761 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52183783 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52183788 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52183832 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 52183858 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52184001 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52184047 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 52184566 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52184638 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52184668 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52184729 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52184773 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52184810 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52185185 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52185238 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 52185250 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52185423 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52185425 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52185487 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52185620 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52185776 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52185863 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 52185891 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52185906 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52185914 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52185969 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52185976 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52185988 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52186120 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52186133 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52186154 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52186191 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52186204 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52186226 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52186284 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52186465 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52187940 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52188187 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52188900 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52189195 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52189290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52189325 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52189345 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52189361 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52189424 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52189503 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52189678 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 52189889 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 52189904 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 52190056 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 52190099 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 52190140 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52190178 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52190203 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52190227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52190273 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 52190274 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 52190536 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 52190604 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 52190746 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52190756 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 52191055 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52191186 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 52191246 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52191247 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52191263 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 52191457 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52191869 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52191875 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 52191992 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52192093 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 52192179 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 52192302 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 52192496 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52192513 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52192933 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 52193021 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52193249 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52193712 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 52194007 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52194146 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52194290 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 52194418 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52194650 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 52194758 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 52194786 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52194914 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 52195042 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52195101 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52195184 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52195573 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52195775 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 52196054 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 52196275 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52196337 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52196504 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52196723 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 52196896 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52197115 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52197180 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 52197217 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52197329 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52197376 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52197506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52197563 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52197599 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52197671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52198798 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52198824 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52199011 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52199214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52199294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52199309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52199347 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52199366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52199491 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52199497 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52199809 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52199973 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52200600 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52203073 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52203077 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52203631 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52203864 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 52203917 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52204309 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 52204423 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 52204677 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 52204795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52205401 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52205446 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52205957 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52206544 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52206619 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52206713 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52206787 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 52206811 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52206875 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 52206881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52206895 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52206907 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52206951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52207105 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52207235 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 52207339 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 52207435 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52207459 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 52208097 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 52208393 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52208728 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52208935 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52208975 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52209028 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52209105 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52209182 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 52209435 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 52209516 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52210100 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52210128 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52211334 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52212130 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52214291 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52214292 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52214317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52214330 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52215582 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52215711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52216453 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 52216467 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52216615 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 52216871 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 52216921 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52217044 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 52217083 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 52217123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52217142 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52217434 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52217596 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 52217602 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52219501 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52220117 C G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 52220146 G C Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 52220184 C G Y N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 3 52220252 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52220264 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52220391 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52220429 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 52220440 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 52220466 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52220507 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 52220697 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 52221020 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 52221125 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52221153 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52221186 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52221379 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52221443 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52221449 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52221567 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52221568 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 52221808 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52221820 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52221837 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52222334 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 52222499 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52222580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52222733 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52222877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52223828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52224440 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52224646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52225253 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52225475 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52225529 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52225539 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52225573 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 52225606 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52225709 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 52225853 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52225930 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52225959 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52226030 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52226050 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52226147 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52226228 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52226300 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52226317 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52226405 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 52226489 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52226576 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52226628 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52226642 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52226694 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 52226798 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52226828 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52226874 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52226881 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52226994 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52227014 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 52227024 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52227090 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 52227235 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52227258 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52227314 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52227330 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52228232 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52228330 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52228494 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 52228601 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 52228795 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52229000 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52229031 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52229089 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52229225 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52229315 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 52229344 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52229371 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52229498 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 52229643 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 52230167 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52230174 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 52230202 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52230842 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52230925 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 52231035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52231105 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52231184 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 52231227 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 52231310 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 52231376 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 52231386 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 52231422 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 52231482 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 52231492 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 52231575 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 52231619 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 52231789 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 52231811 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 52231833 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 52231892 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 52231912 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 52231932 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 52231964 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 52231990 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 52231996 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 52232108 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 52232566 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52232622 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52232669 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 52232681 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 52232716 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52232802 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52232834 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 52232940 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 52232946 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 52233153 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52233356 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 52233436 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52233441 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52233502 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 52233876 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 52234210 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52234221 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52234257 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52234311 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 52234525 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52241309 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52241607 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52241608 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 52241640 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 52241705 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 52241833 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52241934 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 52241999 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52242128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52242269 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52242405 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 52242409 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 52242751 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 52242838 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 52243035 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52243128 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 52243142 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 52243161 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 52243177 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52243391 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52243441 T A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 52243460 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52243521 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52243835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52244091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52245774 T C N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 52247033 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52247687 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 52247789 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 52248138 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52248159 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52248385 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52248475 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52248539 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52248574 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 52248714 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52249091 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 52249701 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 52250963 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52250973 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 52250997 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52251181 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 52251367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52251621 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 52252066 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52252076 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52252103 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52252126 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52252200 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52252260 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 52253250 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52253344 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52253708 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52253728 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52254356 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52254415 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 52254444 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52254468 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52254493 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 52254588 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52254829 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 52254892 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52254893 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52255776 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52255786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52256147 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52256245 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52257669 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 52257695 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 52257992 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52258054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52260106 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 52260215 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52260231 T G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 52260360 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52260381 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52260932 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52261109 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52261327 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52261509 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 52261949 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 52261959 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 52262083 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52262233 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52262304 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52262625 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 52262814 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 52263031 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52263039 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52263075 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 52263097 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52263291 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 52263398 G C N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 3 52264165 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52267601 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 52267827 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 52267919 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52267968 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 52268470 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52268572 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52268623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52268648 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 52269260 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 52269861 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52269881 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 52269959 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52270150 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 52270437 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52270552 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52270995 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 52271243 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 52271619 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52271669 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52271739 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 52272189 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52272396 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52272452 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 52272894 C G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 52273910 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52275089 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52275098 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52275545 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52275655 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52275695 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52275703 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52276270 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 52276288 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52276594 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 52276980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52277020 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 52277062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52277134 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52277204 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52277495 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52277662 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52278348 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 52278594 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52279169 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 52281103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52281187 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 52281236 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 52282020 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 52282147 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52282292 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 52282754 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52282953 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52283540 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52283612 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52283638 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52283704 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52283709 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52283728 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52283748 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52283785 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52283936 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 52284084 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52284216 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52284229 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52284520 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52284630 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 52284650 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 52284749 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52284785 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 52284948 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 52285069 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 52285133 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 52285139 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 52285193 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 52285310 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 52285431 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 52285453 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 52285512 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52286101 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52286139 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 52286187 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 52286435 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 52286672 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 52286698 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 52286714 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 52286769 A G N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 52286981 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52287065 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52287098 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 52287170 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52287253 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 52287301 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 52287581 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 52287598 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52287736 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 52288146 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 52288518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52288957 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52289550 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52290329 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52290666 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52290849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52290916 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52291665 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52291691 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52291967 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52292043 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52292233 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52292249 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 52292276 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52292289 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52293244 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52293935 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52293943 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52293949 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52293991 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52294084 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52294332 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52294365 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52294454 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52295532 G T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 52296401 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 52296429 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 52297588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52297645 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 52298107 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 52298136 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 52298762 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 52299124 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52299245 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52299296 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52300249 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 52300259 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 52300480 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 52300547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52300690 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 52300752 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 52300771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52300990 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 52301112 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52301139 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 52301207 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 52301461 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52301595 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52301951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52301958 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52303646 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52303872 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52304593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52305009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52305219 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52305328 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 52305477 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52305500 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52305883 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52306671 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 52306699 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52306790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52306854 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52306859 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52306885 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52306901 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52307402 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 52307502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52307561 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52307832 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 52307919 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52307946 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52308550 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52308660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52308762 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52308987 G T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 52309614 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 52309618 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52309745 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52309815 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 52309839 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52309869 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52309905 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52310383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52310495 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52310597 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52310622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52310645 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 52310662 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52310750 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52310773 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 52310798 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52310803 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52311036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52311184 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52311234 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 52311343 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 52311360 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52311374 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52311605 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 52311801 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 52311816 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 52312098 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52312112 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52312113 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52313213 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 52313232 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 52313578 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52313600 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52313626 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 52313650 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 52313718 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52314169 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52314338 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52314348 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52314563 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52314814 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52314996 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52315171 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 52315594 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52315678 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52315785 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52317289 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 52317449 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 52317532 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 52317613 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 52317949 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 52318820 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52319110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52319267 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 52319269 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 52319432 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 52319475 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52319564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52319737 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52319887 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 52320108 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 52320335 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52320450 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52320451 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52320536 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52320566 T C Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 52320647 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52320666 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52320960 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52321057 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52321063 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52321151 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52321195 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52321443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52322006 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52322026 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52322061 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52322111 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52322125 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52322168 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52322312 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 52322342 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 52322373 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 52322431 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 52322449 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52322619 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52322660 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52322695 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52322775 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52322813 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52322825 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52322837 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 52322838 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52323003 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52323004 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52323120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52323150 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52323312 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52323361 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52323461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52323551 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 52323606 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52323672 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 52324222 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 52324287 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 52324294 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52324364 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 52324388 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52324668 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52325284 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52325367 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52325666 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52325679 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 52325963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52326097 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 52326105 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52326163 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 52326186 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 52326208 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 52326381 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52326409 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52326729 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52326822 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52326841 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 52327055 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52327081 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 52327135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52327202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52327231 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52327454 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 52327622 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 52327629 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 52327703 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 52327862 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 52327913 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 52328015 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 52328028 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 52328095 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 52328168 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 52328379 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 52328505 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52328530 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 52328541 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 52328630 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 52328769 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 52328820 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 52328881 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52328899 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 52328902 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 52328912 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52328921 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 52328978 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52328999 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 52329064 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52329112 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 52329122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52329130 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 52329169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52329214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52329297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52329335 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 52329358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52329441 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52329569 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52329594 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52329686 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52329702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52329716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52329834 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52329839 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52329915 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52329927 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52329932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52330040 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 52330129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52330199 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52330364 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52330432 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52330468 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 52330533 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 52330615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52330627 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52330657 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 52330677 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 52330766 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52330789 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52330790 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52330837 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 52330862 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 52330914 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 52330932 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 52330948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52331070 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 52331238 G T Y N 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0 1 0 7 7 0 7 0 3 52331308 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 52331370 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52331498 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 52331618 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 52331826 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52331887 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52331966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52332003 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 52332137 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 52332142 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 52332256 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 52332281 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 52332377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52332391 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52332415 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52332600 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52332668 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 52332706 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 52332796 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52332845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52333042 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 52333347 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52333365 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 52333594 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 52334134 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 52334208 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52334252 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52334258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52334931 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52334938 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 52334942 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 52334950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52335121 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 52335167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52335204 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52335214 C A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 52335215 T G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 52335430 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52335680 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52335881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52336007 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 52336515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52336533 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52336655 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 52336722 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 52336767 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 52337648 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 52337840 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52338064 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 52338137 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 52338508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52338523 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 52338575 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 52339271 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 52339426 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52339648 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52340028 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52340596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52351938 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 52352062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52352132 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 52352728 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 52352971 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 52352977 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 52353193 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52353198 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52353476 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 52353490 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52353867 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52353972 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 52354389 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 52356507 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 52357360 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52357868 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52357934 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 52357954 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52357968 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 52357984 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 52359046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52360387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52360398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52360436 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 52360574 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52360583 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52361204 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 52362148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52362772 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 52362823 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52364145 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 52364857 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 52365040 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 52365060 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 52365343 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 52365815 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 52366144 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 52366450 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52366582 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52366855 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 52366911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52366929 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52366952 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52366964 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52367316 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52367458 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52367493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52367852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52367862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52367871 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52367934 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52367941 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52367954 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52368103 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52368409 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52369118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52369621 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52370499 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52371103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52371467 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52372383 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52372461 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 52373079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52373134 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52373429 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 52373430 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 52374299 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 52374367 C T Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 3 52374369 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0 0.75 0.25 12 20 0 12 4 3 52374541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52378139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52378446 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52378648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52380055 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52380798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52382383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52384204 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52384487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52385657 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52386097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52387125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52388779 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52390325 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 52390487 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52390492 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52390514 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52390613 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52390670 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52390719 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 52391276 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52391731 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52391890 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52391948 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52391993 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52392705 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52392734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52393046 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52393121 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52393176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52393346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52393436 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52393455 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52393561 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52393739 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52393873 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52394107 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52394274 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52394404 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52394999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52395226 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52395363 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52395430 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52395708 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52396028 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52396076 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52396114 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52396212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52396618 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52396993 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52397034 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52397467 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52399241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52403742 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52404410 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52404505 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52405670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52405906 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52406027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52408290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52408672 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52408784 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52408790 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52408821 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52408946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52409845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52409923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52410244 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52410642 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52410963 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52410997 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52412745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52412819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52414262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52414734 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52416592 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 52418809 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52419292 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52419366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52419968 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52420511 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52420625 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52420827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52420931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52421101 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52421121 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52421201 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52421214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52421244 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52421280 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52421282 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52421292 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52421540 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52422658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52422755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52422818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52423154 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52423570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52425299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52425835 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52426341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52427953 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52428097 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52428410 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52428901 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52428960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52429002 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52429135 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52429504 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52429715 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52429796 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52430219 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52430270 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52430581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52430822 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52431053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52431088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52431236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52431433 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52431465 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52431507 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52431715 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52431737 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52431749 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52431777 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52431822 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52431919 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52431986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52432131 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52432272 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52432488 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52432834 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52441019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52441146 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52441159 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52443232 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52445109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52446133 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52446296 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52448663 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52451566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52451595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52451615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52451708 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52451802 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52451811 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52451841 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 52452101 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52452340 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52452980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52453228 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52455076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52457506 T C Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 3 52458199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52458352 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52458377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52458798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52458897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52458898 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52459857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52460056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52460416 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52460838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52460987 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52461228 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52461689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52462355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52462671 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52463126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52463205 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52463380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52464003 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 52464190 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52464192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52464592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52464987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52465132 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52465340 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52465504 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 52466248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52466828 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 52467040 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52467098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52467229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52467644 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52468047 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52468426 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52468791 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52469769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52469995 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52470040 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52470786 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52472240 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52473821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52475231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52475686 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52476424 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52476615 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52476719 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52477749 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52477825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52477856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52477978 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52478483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52478490 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52478591 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 52478797 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52479193 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52479263 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 52479345 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 52479496 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 52480491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52480593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52480713 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 52481793 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 52482162 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 52482779 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 52483415 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52485189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52486177 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52486888 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52487337 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 52487451 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52487477 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52487550 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52488177 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52488644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52488871 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52489925 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52490793 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 52491014 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 52491107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52491229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52491764 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52493639 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52493854 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 52493942 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 52494017 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52494086 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52494134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52494239 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52494423 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 52494746 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 52494905 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 52494917 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 52494918 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 52495054 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 52495057 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 52495137 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 52495160 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 52495184 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 52495327 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52495849 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 52496331 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52496387 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52497483 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 52497527 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 52497557 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 52497909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52498281 C G N N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 3 52498418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52498906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52499375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52502020 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 52502317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52503345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52503413 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52503873 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52503962 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 52504419 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 52504440 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52508083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52508113 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52508151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52509394 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52509834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52509941 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52510065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52510485 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 52510596 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 52510653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52510847 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 52510962 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52511035 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52511092 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52511229 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 52511444 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52511700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52511807 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 52511858 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 52512205 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 52512230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52512293 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52512374 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52512478 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52512576 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52513237 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52514003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52516178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52517055 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52517392 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52517683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52517695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52517707 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 52517721 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52517805 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52517827 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 52517972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52518007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52518032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52518040 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52518182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52518442 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52518600 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52518768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52518787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52518870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52519305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52519486 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52519523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52519612 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52519657 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52519666 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52519674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52519715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52519733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52519859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52520165 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 52520230 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 52520861 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 52521048 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 52521418 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52521821 T G N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.0714285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 13 15 1 11 2 3 52522681 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52523393 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52523828 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 52523871 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 52524178 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 52524207 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 52524226 G A N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 52524258 A G N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 3 52524306 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 8 10 3 2 4 3 52524433 T C Y Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 3 52524481 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 52524492 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 52524597 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 52524666 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 52524842 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 52524849 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 52524861 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 52524903 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52524915 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 52524932 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 52524957 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 52524976 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 52524980 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 52525006 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 52525032 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 52525096 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 52525248 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 52525306 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 52525321 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 52525426 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52525501 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 52525595 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 52525618 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 52525634 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 52526009 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 52526021 T G N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 52526399 T G Y N 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 3 52526443 T C Y Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 3 52526855 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 52527521 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 52527752 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 52527829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52527876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52529742 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 52529780 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 52529792 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 52530037 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 52530792 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 52531876 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 52531895 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 52534146 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52535072 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52535794 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52535796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52535809 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52536146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52540330 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52540419 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52540484 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 52540750 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52541005 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52541073 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52541181 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52541463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52541540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52541578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52541808 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 52541873 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 52542040 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 52542203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52542318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52542337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52542841 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52542914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52542963 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52543164 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 52543287 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 52543309 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 52543313 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 52543366 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 52543367 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 52543419 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 52543527 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52543539 T A Y N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 52543672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52543962 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52545325 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 52545500 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52545627 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 52545701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52545802 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52545815 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 52545965 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52546018 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 52546043 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 52546186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52546278 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 52546581 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 52546816 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52546875 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 52547294 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 52547420 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52547449 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52547470 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 52547689 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 52547690 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 52547714 G A N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 52547889 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 52547951 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52548040 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 52548156 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52548672 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 52548695 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 52548782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52548948 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 52548966 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 52549061 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 52549098 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 52549184 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 52549267 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 52549575 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52549601 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 52549623 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 52549676 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 52549799 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 52549897 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 52549958 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 52549968 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 52549999 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 52550013 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52550069 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 52550115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52550161 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52550268 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 52550283 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 52550392 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52550409 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52550440 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52550455 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 52550563 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52550579 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52550625 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52550686 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52550749 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52550820 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52550897 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 52551094 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52551114 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52551115 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52551316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52551362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52551817 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 52551818 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 52552043 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52552169 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 52552511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52552812 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 52552911 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 52552914 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 52552941 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 52552956 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 52553221 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 52553405 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 52553428 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 52553531 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 52553767 T G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 52553872 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 52553983 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52554133 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 52554256 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52554411 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 52554708 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 52554826 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 52554835 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 52554905 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 52554999 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 52555011 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 52555053 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 52555146 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52555194 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 52555647 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 52555877 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52556454 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52556721 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52557279 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 52557413 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 52557457 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 52557569 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 52557672 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 52557747 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 52558022 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52558247 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52558270 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52558271 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52558319 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52558380 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52558462 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52558468 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52558603 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52558720 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 52558758 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 52558807 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52558826 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52558856 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52558919 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52559360 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 52560315 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52560384 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52560422 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52560595 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52560774 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52560884 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52560960 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52561015 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52561041 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52561083 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 52561182 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 52561194 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 52561460 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 52562056 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 52562443 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 52562560 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 52562617 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 52562993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52563085 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52563126 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 52563206 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52563208 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52563255 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52563366 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52563382 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52563464 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52564016 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 52564041 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52564170 A C Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 52564275 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 7 5 3 1 2 3 52564367 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 52564524 G A Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 52564640 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 52564649 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 52564715 G C Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 52564727 C T Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 52564728 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 52564850 A G Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 52564865 T C Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 52564918 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52564990 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 52565024 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 52565117 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 52565202 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 52565220 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52565269 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 52565270 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 52565305 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 52565407 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 52565431 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 52565445 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 52565479 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52565483 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 52565513 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 52565583 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 52565633 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 52565643 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 52565670 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 52565758 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 52565853 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 52565900 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 52566070 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52566198 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 52566665 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52567008 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52567405 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52567455 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52567616 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52567972 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 52568156 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52568168 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52568180 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52568300 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 52568382 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52568400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52568418 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52568569 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52568775 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52568780 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 52569181 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52570006 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52570150 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52570159 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52570178 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52570254 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52570294 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52570431 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52570451 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52570469 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52570471 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52570577 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 52570632 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 52570686 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 52571312 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 52571466 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52571520 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52572109 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 52572251 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52573692 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52575743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52575879 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52576390 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52577086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52577101 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52579502 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52580204 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52582068 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 52583371 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 52583485 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 52583528 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 52583738 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 52583962 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 52584118 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 52584149 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52584528 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 52585368 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 52585557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52586001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52589566 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52589654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52589694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52589706 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52589844 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 52589894 A C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 52590147 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 52590187 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 52590254 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 52590318 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52590480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52590591 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52590651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52590652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52590683 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52591682 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52591777 C A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 52591857 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 52591987 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 52592041 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52592076 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 52592078 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 52592250 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 52592324 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 52592441 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 52594026 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52594036 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52594058 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 52594471 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 52595501 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 52595573 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 52596989 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52597307 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52597516 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52597591 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52597592 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52597652 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52598214 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 52598394 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52598690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52599286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52599641 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52603020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52603760 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52603782 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52604030 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52604090 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52604366 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52604367 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 52604545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52604698 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 52604733 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 52604734 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 52605015 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 52605018 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52605338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52605847 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 52605874 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52606115 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52607037 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52607211 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52608106 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52608120 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52608489 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52608524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52609751 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 52615524 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52615771 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52615797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52616165 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52616582 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52617064 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52617441 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52617818 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52617861 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52617877 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52617927 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52617992 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 52618127 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 52619955 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52619990 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 52620029 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 52620276 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 52620395 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52620420 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52621215 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52623897 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 52624010 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 52624606 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52624740 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 52624792 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52624897 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52626107 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 52630539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52634670 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52636021 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 52636544 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52636672 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52636695 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52636747 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 52637087 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 52637133 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 52637211 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52638287 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52638407 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52638512 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52638547 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52638823 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52639125 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52640236 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52640286 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52640676 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52640748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52640752 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52641210 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 52644232 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52644309 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52644676 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52644913 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 52644949 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 52645297 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52645338 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52645936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52646027 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52646100 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 52646130 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52646139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52646203 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52646212 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52646277 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52646367 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 52646534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52647342 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52647409 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52647639 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52647763 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 52647888 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52648298 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 52648385 A T N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 3 52648434 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52649036 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52649381 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 52649411 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 52650140 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 52650154 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 52650191 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 52650284 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52652144 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 52652189 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 52652211 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 52652362 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52652490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52652505 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 52652589 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 52652621 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 52652679 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 52652731 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 52652737 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 52652791 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 52653028 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 52653111 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52653317 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 52653447 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 52653480 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 52653485 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 52653507 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 52653514 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 52653518 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 52653617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52654008 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52657061 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52657395 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52658427 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52659797 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 52659997 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 52662045 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52662396 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52663077 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52663234 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 52663279 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 52663516 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 52663616 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52668249 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52669488 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 52670283 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 52670371 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52670608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52670813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52671662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52672210 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 52672598 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52672801 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52673649 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 52673696 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52673802 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 52673868 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 52673881 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52673964 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 52674065 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 52674165 A T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 52674261 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52674275 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 52674277 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 52674613 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 52674921 C T N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 52674954 C A Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 52675766 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52675885 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 52676156 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52676222 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 52676445 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52676535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52676839 A T Y N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 3 52676881 C T Y Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.153846153846154 0.615384615384615 0.230769230769231 12 14 2 8 3 3 52676883 T G N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 52676975 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 52677033 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52677081 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52677183 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52677332 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 52677415 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 52677419 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 52677436 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52677580 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 52677649 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 52677685 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52677698 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52677797 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52677818 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 52677828 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52677830 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52677856 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 52678259 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52678709 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 52678723 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 52678905 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52678959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52679027 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 52679035 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 52679040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52679451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52679482 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 52679496 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 52679535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52679566 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 52679583 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 52679655 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 52679707 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52679752 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52680007 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 52680060 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 52680219 A C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 3 52680407 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52680439 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 52680486 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 52680881 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 52681100 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 52681247 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52681434 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52681666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52681835 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52682010 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52682028 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 52682057 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 52682301 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52682836 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 52682989 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 52682999 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 52683193 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52683218 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 52683312 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 52683317 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 52683464 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 52683628 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 52683723 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 52683881 C G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 52684078 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 52684087 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 52684129 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 52685310 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52685598 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52685707 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52685792 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 52685946 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52685980 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 52686005 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52686478 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 52686808 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 52688595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52689169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52689281 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 52689345 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52689483 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 52689529 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 52689662 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52689857 C A Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 52690290 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 52690363 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 52690395 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 52690407 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 52690428 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 52690600 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 52690606 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52690827 T G Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 52690828 T G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 52690964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52690986 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 52691156 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 52691177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52691181 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52691375 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52691404 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 52691413 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52691564 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 52691992 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52692018 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 52692026 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 52692217 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 52692270 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 52692331 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 52692466 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52692606 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 52692679 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 52692963 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 52693031 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 52693034 A T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 52693047 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 52693070 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 52693096 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 52693335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52693566 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52693791 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 52693855 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 52693967 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 52693990 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52694116 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 52694672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52695496 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52695663 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52695793 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 52698358 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 52698416 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 52698516 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 52698596 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 52698607 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 52698609 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 52698772 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52698789 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 52698798 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 52698808 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 52698826 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 52698915 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 52699077 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52699390 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 52699604 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 52699646 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52699666 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 52699721 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 52699729 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 52699789 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 52699809 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 52699850 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 52699888 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 52699972 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 52700211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52700712 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 52700740 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 52700757 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 52700758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52700999 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52701170 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52701189 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 52701206 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 52701234 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 52701258 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 52701341 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 52701429 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 52701470 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 52701642 A C Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 52701766 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52702113 C A Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 52702363 C G Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 52702628 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 52702890 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 52702906 G A N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 52703027 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 52703091 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 52703176 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 52703269 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 52703306 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 52703370 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 52703587 G T N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 52703598 A C N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 3 52703601 A C N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 3 52703693 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 52703810 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 52704229 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 52704841 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 3 52705911 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52706119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52706366 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52706374 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 52706396 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52707249 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52707412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52707534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52707626 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 52707740 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 52707917 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52708730 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52709141 T C N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 3 52709484 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52709608 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 52709648 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52710065 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 52710153 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 52710166 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 52710244 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 52710340 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 52710346 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 52710541 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 52710611 A C Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 52710645 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 52710661 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 52710664 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 52710735 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 52710746 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 52710762 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 52710819 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52711067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52711423 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 3 52711528 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 52711676 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 52711718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52711782 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 52711799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52711834 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 52711917 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 52712299 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 52712310 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 52712362 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 52712599 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 52713033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52713900 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 52714048 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52722523 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 52722648 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 52722659 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52722908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52722909 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52722947 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52722961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52723030 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52723379 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 52723399 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 52723537 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52723606 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 52723677 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 52723697 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52723720 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 52723902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52723991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52723996 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52725572 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52725738 G C N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 52725783 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 52725795 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 52725811 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52725851 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52725867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52725878 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52725934 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52726007 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52726039 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52726059 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 52726109 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52726345 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52726398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52726522 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52726610 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52726638 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 52726709 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52726804 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 52727248 A T N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 16 14 1 14 0 3 52727662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52728025 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52728966 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52729233 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52729928 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52729930 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52730591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52731259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52731310 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52731352 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 52731764 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52732007 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52732205 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52732215 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52732287 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52732406 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 52732417 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52732485 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52732499 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52732510 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 52732513 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 52732531 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 52732624 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 52732625 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52732653 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 52732781 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52732915 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 52732987 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 52733140 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52733171 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52733197 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52733221 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 52733289 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52733573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52733637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52733981 C G Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 52734210 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52734221 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52734418 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52734487 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 52734493 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52734528 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52734552 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 52734561 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 52734649 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52734805 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 52734824 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 52734845 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52734847 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52734906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52734911 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 52735085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52735121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52735143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52735266 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52735323 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 52735472 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 52735526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52735586 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 52735829 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52735910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52736274 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52736434 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 52736518 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52736605 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52736733 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 52736750 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 52736760 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 52736976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52737009 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52737340 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52737446 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 52737459 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52737465 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52737750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52737800 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52737821 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52737839 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52737856 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52737902 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52737924 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 52738092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52738151 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52738312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52738400 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52738675 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52738797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52738824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52738961 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52739048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52739126 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52739184 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 52739457 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 52739461 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 52739562 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 52739578 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52739690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52739704 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52739721 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52739742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52739750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52739766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52739776 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52739813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52739841 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52739875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52740075 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52740415 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52740420 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52740578 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52740843 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52741077 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 52741202 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 52741214 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 52741390 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52741492 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 52741634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52741647 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52741650 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52741757 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52741816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52742488 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52742557 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52742688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52742827 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52743042 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52743069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52743072 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 52743396 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 52743581 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52743648 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52743808 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 52744007 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52744143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52744242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52744274 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 52744330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52744335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52744346 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52744361 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52744391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52744394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52744417 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52744419 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52744495 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 52744597 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52744866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52745148 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 52745310 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 52745409 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 52745593 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 52745605 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 52745720 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 52745726 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 52745863 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 52745958 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52745983 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 52746249 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 52746346 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52746434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52746478 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 52746479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52746510 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52746526 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52746660 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 52746800 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52746853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52746882 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 52746900 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52747061 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52747118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52747126 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52747887 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 52748117 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52748159 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 52748452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52749400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52749602 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 52749853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52749874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52749967 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52750429 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52750497 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 52750878 A G N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 3 52751845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52751965 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52752002 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 52752067 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52752091 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52752146 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52752389 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52752496 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52752586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52753593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52755880 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52756233 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 52756777 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52757334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52758262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52758451 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 52758474 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 52758605 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 52758657 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 52758786 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 52758801 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 52759318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52760088 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 52760265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52760681 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 52760743 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52760931 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 52761014 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 52761033 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 52761037 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 52761062 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 52761134 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 52761171 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 52761270 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52761273 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 52761357 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 52763612 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52763676 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52763686 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 52764026 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 52764146 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 52764422 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 52764545 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 52764646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52764823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52765351 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 52765399 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52765420 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 52765490 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 52765508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52765584 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 52767972 A C N N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 3 52768808 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 52768866 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 52768875 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 52768951 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 52768989 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 52768992 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 52769015 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 52769359 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 52769761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52769817 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 52771127 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 52771149 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52771227 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52771278 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52771291 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52771328 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52771473 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52771486 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 52771949 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52771973 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52772458 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52772476 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 52772511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52772654 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52772852 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52773547 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 52774092 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52774334 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 52774336 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 52774392 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52774428 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52774453 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 52774558 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 52774559 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 52774789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52775257 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 52775625 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52775653 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52775734 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52775893 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52775902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52775956 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52776005 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52776347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52776378 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52776493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52777564 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52777832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52778782 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52778895 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52779021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52779159 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52779384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52779437 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52780121 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52780341 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52780450 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52780520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52780590 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52780629 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52780951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52781130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52781166 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 52781579 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52781782 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52781785 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 52781986 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52782052 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52782828 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52782832 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52783400 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 52783619 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52783701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52783722 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52784272 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52785309 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52785637 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 52785902 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52785908 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52785913 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52785967 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 52785992 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52786017 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52786018 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52786192 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52786685 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 52786958 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52787183 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 52787296 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52787326 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52787368 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52787406 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 52787433 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 52787972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52788023 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52788229 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52788410 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52788597 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 52788602 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52788724 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52788823 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 52788834 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52788920 G C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 52788938 A T N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 52789565 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52789567 T A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52789834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52790075 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52790131 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52790971 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 52791389 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52793089 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 52793377 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52793399 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52793658 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52794008 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 52794457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52794648 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 52794899 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52795707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52797107 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 52797292 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52797397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52797470 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 52797866 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 52798106 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52799453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52799818 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52800593 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52800659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52800824 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 52800919 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52801164 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 52801592 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 52801745 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52801753 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 52802475 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52803423 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52803467 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52804006 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52804950 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52805497 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52805511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52805604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52806523 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52806631 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52806792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52807010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52807157 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52807209 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52807478 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52807514 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52807695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52807757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52807762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52809796 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52809831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52810086 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 52810125 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 52810321 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52810430 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 52810877 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52810900 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52810907 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52810930 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52810978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52811739 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52811746 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52811861 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52811865 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52811899 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52811981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52813705 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52813865 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 52814474 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 52814740 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52815159 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52815177 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52817056 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52817075 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52819645 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52820046 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52820669 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52821781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52822642 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52823326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52823615 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52824480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52825413 C A Y N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.0714285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 13 15 1 11 2 3 52825414 C A N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.0714285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 13 15 1 11 2 3 52825466 C T N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 52825516 T C N Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 3 52825604 A G Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 52825821 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 52826441 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 52826510 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52826588 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 52826624 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52826783 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 52829782 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52830633 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 52830635 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52832965 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52833362 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52833373 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52833423 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52833834 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52834224 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52835294 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52835477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52837857 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 52840111 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52840937 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52841013 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52841502 C G Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 52842489 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52843383 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52843879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52844199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52844218 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52844226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52844690 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52846143 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52846523 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52849047 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 52849319 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 52849477 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 52849557 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 52849759 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52850050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52850091 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52850282 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 52850414 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 52850420 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52850617 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52850627 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52850745 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52850794 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 52851886 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52852333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52852552 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52852573 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52852607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52852763 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52853732 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52855080 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52855470 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 52855559 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 52855759 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52855766 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52855789 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52855803 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52855804 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52855890 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52855921 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52856065 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52856239 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52856241 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52856263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52856453 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52856623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52856795 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52856936 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 52857204 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52857256 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52857555 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 52857671 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52857683 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52861197 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52861330 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52863807 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52864613 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52865212 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52866692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52866919 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52866946 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52867000 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52867118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52867266 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52868735 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52869511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52869932 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52869956 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52870011 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52870090 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52870221 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52870251 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52870486 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52870542 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52870591 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 52870625 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52870654 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52870677 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52870853 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52870987 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52871050 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52871112 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52871130 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52871169 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52871190 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52871396 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52871495 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52871548 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52871820 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 52872193 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52872264 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52872333 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52872472 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52874052 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52874615 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52874924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52874931 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52875171 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 52875313 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52875363 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 52875378 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52875405 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52875636 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 52875904 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52876050 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52876086 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52876136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52876631 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52876957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52877366 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52877497 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52877740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52877747 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52877766 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52877844 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 52877979 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52878088 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52878150 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52878469 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 52879589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52880292 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 52880297 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52880431 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52880451 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 52880708 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 52880724 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 52880757 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 52880820 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 52880955 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 52880970 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 52881061 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52881079 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52882225 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52882463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52882510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52882921 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52883355 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52883545 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52883584 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52883664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52883671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52883688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52883768 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52883906 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52885280 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52885456 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52885493 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52885573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52885618 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52886123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52886172 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52886207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52886390 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52886406 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52886487 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52886527 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52886555 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52886586 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52886617 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52886636 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 52886868 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52886875 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52887141 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52887753 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52887960 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 52888599 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 52888681 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52888882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52890243 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52890446 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 52890694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52891278 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 52891279 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52892027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52892037 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 52892135 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 52892212 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 52892801 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52892848 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52893097 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52893159 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 52893454 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52893508 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52893510 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 52893603 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 52893776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52893823 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52894176 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52894758 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52894863 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52896017 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52896394 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 52896519 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 52896554 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 52896607 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 52896666 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 52896677 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 52896694 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 52896717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52896772 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 52896869 G T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 52897278 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 52897371 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52897385 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52898021 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52899805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52899839 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 52901166 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52901813 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52903278 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 52903546 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 52903587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52903678 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 52903786 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 52903790 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 52903812 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 52904075 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 52904497 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52904517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52904741 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 52904869 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52905472 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 52905697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52905762 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52905931 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52905949 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52906497 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 52906756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52906788 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 52906845 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52906915 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 52906987 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 52907475 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 52907520 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 52907835 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52908003 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 52908271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52908289 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 52908424 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52909467 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52909763 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 52910370 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52910496 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52910581 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 8 16 0 8 4 3 52912597 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52913624 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 52914015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52914516 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52914646 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 52914762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52914817 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 52915299 C G N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0 0.8125 0.1875 13 19 0 13 3 3 52915453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52915535 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 52915828 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52915899 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 52915936 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 52916361 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 52916682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52916842 C A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 52916948 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 52917113 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52917142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52917184 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52917222 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52917269 T G Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 52922917 C G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 52922935 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 52922958 A C Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 52923322 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 52923635 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52924237 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52925113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52926987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52927249 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52927562 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52927920 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52928506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52929143 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52929198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52929291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52929659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52929689 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52929834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52930104 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52930143 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52932132 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 52933001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52933041 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52933050 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52933321 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 52940949 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52941016 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52941315 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52941432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52941457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52941712 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52941844 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52941908 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52942011 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 52942028 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52942064 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52942084 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52942144 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52942161 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52944256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52944286 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52944337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52944704 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 52944989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52945016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52945050 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 52945122 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 52945174 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 52945207 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 52945212 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 52945431 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 52945570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52945587 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 52945688 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 52945821 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 52945965 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 52946236 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 52946510 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 52946577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52946618 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 52946731 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 52946763 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 52946769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52946807 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 52946968 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 52947427 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 52948075 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 52948157 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 52948318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52948870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52949887 A C N N 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 3 52951522 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52951827 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52952026 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52952371 C G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 52952376 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52952411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52952541 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52953544 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52955371 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52956629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52957229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52959227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52959324 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52959364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52959434 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52959723 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52959793 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 52959799 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52959824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52960000 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 52960102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52960113 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 52960161 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 52960198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52960292 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 52960390 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52960426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52960447 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52960515 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 52960595 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52960655 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 52961269 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 52961451 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52961483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52961527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52961733 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 52961744 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 3 52963151 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 52963176 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 52966987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52967630 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52971796 G T Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 52976554 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52976684 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 52976735 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52977469 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 52977554 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52977646 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52977729 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52978018 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 52978952 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 52979081 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 52979104 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52979125 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 52979266 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 52979272 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 52979553 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 52979644 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 52979680 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 52979710 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 52979719 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 52979756 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 52979784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52979857 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 52980041 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 52980304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52980377 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 52980641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52980683 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 52980903 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 52980950 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 52981241 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 52981542 C A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 52981738 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 52981775 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 52981855 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 52982192 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 52982532 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 52982571 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 52982661 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 52982681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52982772 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 52983133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52983343 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 52983551 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 52983689 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 52983896 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 52984065 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 52984344 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52984370 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 52984536 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 52984544 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52984556 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 52984625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52984628 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 52984708 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 52984721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52984788 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52984800 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 52984804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52984874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52984951 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52984980 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 52984999 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52985109 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52985170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52985229 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 52985508 T A N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 3 52985612 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 52985917 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 52986180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52986208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52986241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52986252 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 52986261 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 52986307 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52986348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52988371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52997418 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 52998127 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 52998635 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52999219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 52999627 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 52999721 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 3 52999933 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 53000223 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 3 53000239 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 53000357 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 53000390 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 53000423 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 53000430 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 53000436 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 53000478 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 53000516 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 53000742 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 53000745 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 53000931 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 53001005 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 53001233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53001312 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 53001467 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 53001501 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53001683 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 53001712 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 53001741 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 53001772 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 53001776 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53001841 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 53001857 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 53001872 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53001983 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53002210 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 53002286 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 53002351 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 53002373 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53002412 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 53002490 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53002651 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53002753 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 53002788 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53002815 T G Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 53002837 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53002863 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53002904 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 53002948 C A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 53002975 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 53002989 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 53003200 A G Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 53003260 C T N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 53003403 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53003414 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 53003469 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 53003533 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 53003668 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53003697 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53003804 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 53003843 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 53003861 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53003935 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53004086 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 53004224 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 53004761 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 53004891 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 53005605 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53007021 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53007049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53007138 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53008912 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53008946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53008979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53009811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53010195 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53010588 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 53011880 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 53011917 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 53012310 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53012594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53012953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53013195 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 53014334 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53014395 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 53014568 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 53014580 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53014602 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53014604 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 53014858 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 53015003 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 53015143 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 53015183 T G Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 53015240 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 53015612 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 53015669 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 53015681 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 53015729 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 53016050 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 53016123 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 53016264 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 53016981 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53017183 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53017917 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53017937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53020879 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53023289 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53023993 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53024065 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53024167 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 53024273 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 53024846 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 53025067 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53025241 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 53025313 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 53025374 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 53025406 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 53025412 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 53025449 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 53025531 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 53025572 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 53025620 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 53025820 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 53025840 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 53026038 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 53026229 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 53026354 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 53026355 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53026377 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53026424 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 53026498 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 53026545 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 53026570 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 53026705 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53027046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53027252 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53027648 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 53027877 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 53027885 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 53027960 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 53027971 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 53028291 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53028345 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53028818 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 53028878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53028979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53029243 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53029275 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 53030477 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 53030872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53030895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53031404 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53032935 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 53033108 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53033196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53033213 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 53034474 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 53034848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53034909 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 53034959 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 53035044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53035095 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 53035123 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 53035156 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 53035271 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 53035320 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 53035347 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 53035349 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 53035397 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 53035401 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 53035490 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53035552 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 53036505 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 53036537 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53036576 C T Y Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 3 53036619 C T N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 53036628 G A Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 53036669 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 53036723 G T Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 53036827 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53036860 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 53036865 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53036879 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 53036913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53036975 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53037013 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 53037028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53037192 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53037296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53037313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53037375 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53037410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53038302 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 53038311 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 53038401 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 53038455 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 53038857 G T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 53038979 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 53039206 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53039268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53039329 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 53039505 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53039532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53039594 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53039869 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53040929 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 53042229 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53042370 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53042809 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 53042830 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 53042842 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 53043689 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53044309 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 53044406 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53044478 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53044569 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 53044845 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 53044913 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 53045120 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 53045223 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53045690 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53046089 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 53046141 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 53046144 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53046161 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 53046173 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 53046176 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 53046292 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 53046567 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 53046605 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53046610 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53046842 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53046861 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 53046862 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53046924 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53046949 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53047017 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53047078 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 53047106 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 53047217 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 53047491 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 53047620 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 53047738 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 53047779 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53047790 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 53047811 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 53047948 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 53048466 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 53048707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53048833 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 53048925 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 53048934 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 53048985 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 53048994 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53049058 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 53049075 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53050016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53050402 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53050560 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53050573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53050815 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53050929 T A Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 53051145 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53051444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53051558 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 53051742 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 53051751 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53051762 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 53051778 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 53051821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53052237 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53052333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53052449 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53052608 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 53052752 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53052798 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 53053408 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 53053589 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53053611 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 53053628 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 53053647 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 53053764 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 53053964 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 53054181 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 53054182 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 53054286 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 53055478 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 53055692 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 53056331 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53056568 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 53057039 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53057049 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 53057152 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 53057214 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 53057421 G T Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 53057422 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 53057844 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 53057905 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 53058226 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 53058298 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 53058421 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 53058432 C T N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 3 53058435 G A N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 3 53058493 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 53058764 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53059070 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53059343 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 53059882 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 53060014 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 53060443 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 53060828 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53060847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53061357 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 53061360 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 53061370 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 53061924 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 53061941 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 53062030 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53062175 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 53062187 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 53062435 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 53062643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53062695 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53062741 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53062906 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53062907 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 53062919 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53062940 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 53063225 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 53063274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53063296 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 53063297 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 53063315 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 53063336 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 53063505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53063630 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 53063750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53065376 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53065624 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 53065737 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53065744 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 53065755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53065966 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 53066165 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53066280 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53066565 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 53066640 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53066694 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53066818 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 3 53066977 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 53067283 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 53067420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53067421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53067520 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 53067674 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 53067720 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 53067780 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 53068564 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53068700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53068735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53068993 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 53069027 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 53069147 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 53069644 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 53069705 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 53069801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53070261 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 53070393 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 53070525 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 53070643 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 53070764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53070798 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 53070824 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 53071005 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 53071494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53071579 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 53071621 G C Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 53071687 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 53071990 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 53072089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53072171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53072371 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53073146 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 53073422 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 53073655 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53074189 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 53074710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53074720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53075569 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53076049 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 53076715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53079100 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 3 53079430 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 53079663 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53079921 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53080136 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53080225 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53080256 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53080703 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 53080714 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 53081064 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 53081065 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 53081128 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 53081152 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53081169 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53081573 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 53081648 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 53081743 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 53081791 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53081817 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53081963 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53081994 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53082074 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53082082 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 53083021 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53083024 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53083430 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 53084039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53085773 G A Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 53086621 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 53087078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53087230 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 53087231 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 53087466 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 53087488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53088062 T G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 53088211 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53088416 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 53088424 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 53088747 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 53088896 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 53088941 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 53088993 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53089021 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 53089066 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 53089069 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 53089425 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 53089468 A G N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 3 53089603 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 53089703 T G N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 3 53089942 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 53090054 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53090059 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 53090866 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 53091039 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 53091196 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53091267 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 53091328 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 53091333 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 53091373 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53091471 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 53091545 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 53091549 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 53091606 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 53091611 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 53091661 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 53091890 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53091915 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 53092089 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 53092110 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 53092436 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 53092450 C G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 53092947 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 53093114 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53093222 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 53093266 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 53093540 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53093613 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 53093936 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 53094183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53094924 G A N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 15 13 1 13 0 3 53095128 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53095155 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 53095217 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 53095248 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 53095277 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 53095643 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 53095681 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 53095704 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53095729 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 53097142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53098670 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 53098672 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53099111 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 53099206 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53099268 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53099344 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53100265 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 53101132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53102612 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53102758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53102907 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 53103095 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53103211 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 53103702 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 53104859 A G Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 53104942 C T Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 53104946 T G Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 53105068 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 53105074 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 53105192 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53105351 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53105420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53105584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53105758 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53105953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53105981 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53106102 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 53106632 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 53107123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53107172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53107432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53107515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53107689 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53107743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53108091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53108244 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53108359 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53108655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53109081 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53109613 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 53110753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53110958 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53111053 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 53111647 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 53112597 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 53112725 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53112800 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53112912 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53112954 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 53112975 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53112982 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53113016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53113058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53113072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53113135 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53113552 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53113553 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53113675 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53113702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53114462 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 53114492 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 53114569 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53114628 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 53114662 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 53114722 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53114861 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 53114863 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 53114882 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 53114896 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 53114899 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 53114918 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 53114933 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 53114980 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 53115005 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53115134 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 53115140 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 53115209 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53115243 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 53115252 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 53115325 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 53115427 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53115633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53115780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53115858 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 53115925 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53116253 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 53116255 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 53116268 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53116424 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53116695 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 53116731 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 53116756 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53116780 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 53116829 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53116902 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 53117004 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53117350 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 53117378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53117484 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 53117581 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 53117585 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53117619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53117684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53117709 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53117806 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 53117826 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53118077 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53118173 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 53118174 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 53118270 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 53118281 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53118411 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53118500 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 53118551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53118736 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 53118874 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53118959 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53119111 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 53119154 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 53119317 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53119318 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53119329 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 53119470 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53119526 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53119778 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53119912 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 53120108 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 53120551 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53120666 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 53120931 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 53120932 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 53120960 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53121011 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 53121175 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53121338 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 53121621 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53122306 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 53123127 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 53123678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53123897 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53124023 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53124295 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 53124583 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 53125180 A T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 53125358 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 53126248 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53130586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53131548 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 53131795 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 53132513 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 53132650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53132986 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 53133059 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 53133240 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 53133283 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53133388 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 53133489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53133536 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 53133580 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 53133619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53133670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53133674 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 53133736 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 53133785 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 53133874 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 53133943 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 53134018 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 53134134 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53134317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53134338 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 53134360 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 53134428 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 53134473 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 53134487 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 53134632 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53134681 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53134780 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 53134863 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 53134900 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 53134917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53134936 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53135352 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 53135625 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 53135972 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 53135974 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53136049 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 53136050 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 53136136 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 53136206 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 53136224 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 53136311 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53136417 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 53136429 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 53136434 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 53136838 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 53136872 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 53136888 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 53136914 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53137068 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 53137098 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 53137507 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 3 53137678 G A N Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 5 5 1 3 1 3 53137931 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53138039 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 53138498 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53138613 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53138731 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53138753 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53139497 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 53139530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53139577 T G Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 53140273 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 53140304 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53140364 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53140539 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53140541 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 53140582 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 53140675 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53140886 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53140945 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 53140993 C T Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 53140994 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 53141127 C T Y Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 3 53141157 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 53141507 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53141664 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 53141730 T C Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 53141731 G A Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 53141854 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53141980 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 53142361 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 53142665 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53142887 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 53142920 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53143002 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 53143025 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 53143138 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53143736 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53143804 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53143884 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53143950 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 53143986 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 53144032 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 53144100 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 53144141 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53144250 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53144297 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53144411 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53144412 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53144439 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53144478 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53144511 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53144534 C G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 53144614 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53144646 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53144687 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53144698 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53144737 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53144742 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53144923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53144928 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 53145184 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53145276 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53145310 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53145361 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53145486 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53145546 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53145600 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53145935 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53145956 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53146037 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 53146143 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 53146208 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 53146213 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 53146221 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53146308 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53146425 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53146526 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 53146586 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53146667 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 53146678 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53147359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53147365 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53147493 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53147519 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53147871 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53147872 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53147979 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 53147987 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 53148001 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53148073 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 53148083 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 53148352 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 53148450 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 53148571 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 53148802 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 53149134 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53149426 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 53149499 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53149508 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 53149530 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 53149613 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 53149727 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53149848 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 53149927 A C N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 53149929 G T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 53150038 A T Y N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0 1 0 9 9 0 9 0 3 53150353 G T N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 53150378 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 53150935 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53150959 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53151100 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53151815 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53152461 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 53152545 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 53153702 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 53153849 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 8 4 4 0 2 3 53153988 G A N Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.6 0 0.4 6 4 3 0 2 3 53154026 G A N Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.6 0 0.4 6 4 3 0 2 3 53155164 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53155317 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 53155406 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 53155561 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 53155572 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 53155602 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 53155610 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53155677 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53155729 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 53155876 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53156733 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 53156747 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 53156880 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53157425 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53157577 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53157854 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 53157917 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 53157969 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 53157989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53158052 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 53158072 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53158396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53159142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53159289 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53160627 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 53160696 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 53161292 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53161294 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53161345 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53161395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53161701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53161799 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 53161807 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53161861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53162023 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 53162132 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 53162349 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 53162460 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 53162578 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 3 53162655 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 53162800 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 53162865 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 53162909 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 53163020 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 53163055 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 53163161 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 53164110 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53164585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53164729 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 53164999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53165032 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 53165170 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53166403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53166823 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53167508 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 53167520 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 53170180 A C N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 3 53172444 G C Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 53173182 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 53173188 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 53173284 A C N N 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 10 6 3 4 1 3 53173538 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 53173636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53173886 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 53173966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53173979 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 53174046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53174188 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 53174296 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 53174520 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 53174606 G A N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 8 12 2 4 4 3 53174749 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 53174862 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 53174959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53175416 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 53175423 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 53175739 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53175885 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 53176070 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53176313 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53176315 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 53176348 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 53176484 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 53176499 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 53176543 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53176640 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 53176818 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 53176878 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 53177120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53177602 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 53178236 A T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 53178257 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 53178284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53178320 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 53178323 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 53180087 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53180206 T G Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 53180571 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 53181064 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 53181448 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53181917 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53182017 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53182072 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 53182141 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 53182157 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 53182260 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 53182275 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53182454 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 53182523 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 53182539 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 53182588 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 53182593 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 53182673 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53182676 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 53182700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53182794 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 53182814 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 53182932 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 53182981 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 53182988 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 53183001 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 53183008 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 53183013 T G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 53183153 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 53183240 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 53183243 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 53183251 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 53183358 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 53183463 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 53183543 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 53183811 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 53183816 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 53183861 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53183903 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 53183961 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 53184042 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 53184099 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 53184122 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 53184144 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 53184145 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 53184161 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 53184167 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 53184287 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 53184454 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 53184462 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 53184516 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 53184748 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 53184788 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 53184826 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 53185504 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 53185531 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 53185560 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53185652 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 53185862 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 53185900 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 53185985 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 53185989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53186019 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 53186029 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 53186051 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53186295 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 53186359 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 53186464 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 53186562 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 53186563 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 53186581 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 53186793 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 53186806 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 53186863 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 53186976 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 53187053 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 53187064 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 53187433 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53187734 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 53187911 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 53187991 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 53188118 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 53188201 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 53188589 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 53188831 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 53188847 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 53188888 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 53188991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53188992 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53189175 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 53189185 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 53189233 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53189273 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 53189294 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 53189334 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 53189383 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53189553 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 53189556 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53189584 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 53189627 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53189649 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 53189755 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 53189769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53189834 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53189902 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 53189931 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53189966 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53189982 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53190055 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 53190070 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 53190119 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 53190262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53190327 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53190483 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53190524 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 53190580 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53190893 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53190934 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53190936 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53190962 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 53191057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53191093 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 53191387 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53191388 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 53191515 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53192159 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 53193252 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53193256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53193281 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 53193322 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 53193659 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53194113 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53194179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53197371 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 53197445 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 53197536 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53197748 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 53197836 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53197860 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 53197866 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 53197919 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 53197963 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 53197993 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53198379 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 53198446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53198470 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53198546 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53198550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53198799 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 53198829 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 53198943 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 53198955 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 53198988 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 53199014 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 53199023 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 53199032 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 53199071 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 53199170 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 53199197 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 53199220 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 53199248 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 53199251 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 53199581 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53199588 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 53199640 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 53199660 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 53199661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53199681 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 53199844 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 53199855 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 53199868 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 53200060 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 53200165 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 53200212 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 53200437 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 53200455 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53200483 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 53200497 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 53200527 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 53200539 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 53200555 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 53200651 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 53200653 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 53200703 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 53200758 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53200939 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 53201623 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 53201643 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 53201664 C A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 53201694 C G Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 53202046 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53203547 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53204950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53206159 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53208859 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53209125 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 53210514 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 53210516 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 3 53210648 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53210710 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 53210805 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 53210973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53211009 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53211583 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53212163 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 53212258 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 53212356 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 53212448 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 53212481 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 53212819 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 53212841 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 53212960 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 53213059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53213152 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 53213173 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 53213186 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 53213212 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53213218 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 53213234 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 53213413 A C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 53213750 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53213769 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 53213839 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53213883 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53213957 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 53214555 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 53214927 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 53214929 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 53214972 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 53214982 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53215044 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53215079 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 53215099 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53215256 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53215302 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53215459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53215472 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 53215544 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 53215553 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53215881 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 53216091 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53216209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53216234 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 53216259 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 53216388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53216480 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53216491 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53216531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53217255 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 53217285 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 53217622 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53217798 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 53217811 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 53217825 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53217843 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 53217913 A C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 53218049 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 53218055 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 53218429 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53218478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53218657 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 53218673 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53218725 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 53219125 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 53219231 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 53219813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53219976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53220094 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53220102 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 53220112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53220537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53220894 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 53220999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53221328 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 53221404 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 53221433 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 53221642 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53221673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53221674 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 53221696 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53221739 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53221748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53221879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53221970 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53222001 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53222514 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53222594 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 53222708 G C Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 53222728 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 53222804 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53223028 T C Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 53223117 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 53223268 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 53223446 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53223450 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 53223562 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 53223590 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 53223784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53224433 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53225204 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 53225222 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 53225460 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53225521 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 53225530 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53225550 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 53225563 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53225642 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53226844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53226917 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53227282 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53227399 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 53227654 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 53228068 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 53228083 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 53228890 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53230061 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53230157 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53235117 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53236384 A G Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 53236931 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53238063 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53238158 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53238215 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53238229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53238239 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53238264 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53238387 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 53238408 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 53238421 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53238505 A C N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 53238800 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53238986 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 53238994 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 53239000 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 53239020 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 53239027 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 53239060 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 53239447 T G N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 53239450 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53239482 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53239727 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 53239798 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 53239843 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 53239899 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 53239990 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 53239995 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 53240001 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 53240087 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 53240098 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 53240202 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 53240216 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 53240230 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53240236 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 53240394 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 53240401 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 53240406 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 53240422 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 53240453 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 53240521 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53240836 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53240847 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53240863 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 53240876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53241054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53241087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53241096 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53241101 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 53241291 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 53241556 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 53241558 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 53241654 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 53241850 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 53241868 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 53242081 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 53242392 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 53242433 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53242443 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53242570 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 53242598 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 53242619 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53242858 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 53243121 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 53243299 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 53243746 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 53244150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53244363 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 53244470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53244624 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 53244762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53244812 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 53244869 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 53244878 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 53245436 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53245827 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 53246028 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 53246074 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53246088 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 53246095 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 53246230 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 53246243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53246498 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 53246502 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 53246526 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53246538 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 53246653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53246695 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53247029 T C N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 3 53247254 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 3 53247309 C T N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 3 53247409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53247679 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 53247741 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 53247793 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 53247853 G T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 3 53247923 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 53248167 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 53248443 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 53248484 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 53250294 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 53252660 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53252766 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53252834 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53252947 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53254257 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 53255231 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53255443 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 53255946 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 53255969 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53256073 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53256193 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 53256295 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 53256400 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 53256605 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53256866 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 53256898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53257032 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 53257424 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 53258116 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53258483 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53259021 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 53259035 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53259059 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53259295 T C Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 53259401 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53259556 C G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 53259560 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 53259629 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 53259644 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 53259681 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 53259698 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 53259840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53260529 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 53260858 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 53260965 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 53261056 C A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 53261059 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 53261230 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 53261263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53261436 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 53262186 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 53262317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53263445 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53264312 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 53264374 T A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 53264588 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 53264656 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53264855 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53264884 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53264984 C T Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 53265178 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 53267706 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 53268463 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53268585 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 53268781 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53268786 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 53268894 T C Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 53269256 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53269382 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53269389 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 53269402 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 53269461 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 53269542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53269592 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 53269602 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 53269713 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 53270058 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 53270131 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 53270193 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 53270198 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 53270271 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 53270315 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 53270328 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53270412 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53270485 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 53270486 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 53270512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53270609 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 53270723 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 53270782 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53270795 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 53270831 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 53270898 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53270934 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53271065 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 53271175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53271192 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 53271411 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 53271609 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 53271615 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 53271875 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 53272206 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53272236 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53272456 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 53272508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53272614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53272642 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53272658 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53272659 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53272716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53272762 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53272765 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53272788 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53273513 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 53273538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53273641 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 53273822 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 53273958 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 53274008 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 53274063 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 53274100 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 53274165 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 53274234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53274491 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 53274553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53274588 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 53274616 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53274769 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 53274807 C A Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 53274834 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 53274842 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 53274855 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 53274922 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 53275331 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 53275462 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 53275490 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 53275520 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 53275522 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 53275577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53275592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53275595 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 53275717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53275729 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 53275733 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 53275838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53275877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53275890 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 53276025 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 53276172 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 53276283 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 53276337 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53276619 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53276628 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 53276641 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 53276930 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 53276945 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 53277050 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 53277097 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53277138 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53277213 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53277221 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53277303 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 53277345 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 53277375 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 53277379 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 53277515 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 53277519 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53277716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53278054 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 53278058 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53278081 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 53278501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53278872 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 53278878 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 53279026 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53279029 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 53279085 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 53279406 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 53279489 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53279562 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 53279667 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 53279679 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 53279713 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 53279807 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 53279811 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 53279906 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 53279936 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 53279959 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 53280054 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 53280228 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 12 16 2 8 4 3 53280506 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 53280635 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53280703 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 53280720 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 53280826 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 53280858 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 53280875 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 53280903 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 53280915 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 53280988 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 53281034 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 53281284 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53281418 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 53282477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53283296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53283427 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 53283442 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 53283551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53283602 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 53283733 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53283869 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 53283974 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 53283976 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 53283989 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 53284023 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 53284105 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 53284215 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 53284220 C G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 53284281 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 53284380 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53284430 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 53284451 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 53284469 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 53284547 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 53284742 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 53284924 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53285027 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 53285204 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 53285593 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 53285671 G T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 53285682 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 53285793 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 53285908 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 53285991 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 53286322 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 53286430 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 53286462 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 53286574 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 53286759 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53286820 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 53287021 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53287059 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53287067 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53287314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53287526 C G Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.3 0.7 0 26 14 6 14 0 3 53287527 C G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 3 53287549 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 53287579 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 53287744 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 53287793 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 53287981 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53288034 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53288069 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 53288111 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 53288218 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 53288264 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 53288288 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 53288394 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 53288409 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 53288422 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 53288520 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 53288571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53288604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53288627 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53289162 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 53289476 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 53289506 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 53289597 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 53290083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53290306 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53290706 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 53290729 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 53290733 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 53290821 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53290829 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 53290856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53292821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53293081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53293278 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 53294363 C G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 53294695 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 53296296 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53296524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53297610 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53299495 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53300502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53300556 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 53300784 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 53300812 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 53300837 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 53301359 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 53301605 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 53301609 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 53302020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53302066 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53302204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53302228 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 53302371 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53302401 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 53302422 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 53302573 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 53302657 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 53302808 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 53303180 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53303301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53303348 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53303788 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 53304002 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 53304062 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 53304063 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 53304269 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 53304391 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53304460 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53304575 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 53304617 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 53304639 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53304717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53304765 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53304839 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53305025 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53305120 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 53305129 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 53305159 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 53305205 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53305326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53306671 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 53306739 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 53307512 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53307747 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 53308380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53308781 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53308866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53309135 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 53309228 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53309932 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53309987 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 53310112 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53310285 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 53310383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53310589 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 53310938 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 53311094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53311696 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 53312852 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 53313240 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53313398 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 53313579 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 53313596 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 53313647 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 53313717 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 53314331 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 53314336 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 53314468 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 53314485 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 53314647 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 53314649 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53314807 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 53314818 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 53314925 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 53314942 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 53314969 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 53315023 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 53315099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53315104 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 53315266 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 53315490 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 53315523 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 53315543 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 53315558 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 53315854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53315915 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 53316022 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 53316042 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 53316082 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 53316100 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 53316300 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 53316303 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 53316312 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 53316374 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53316546 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53317064 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 53317210 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 53317232 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 53317716 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 53317730 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 53317780 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 53317798 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 53317811 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 53317818 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 53317914 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 53318153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53318435 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53318732 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 53318886 C A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 53319007 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 53319501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53319504 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 53320463 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53321026 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 53321070 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 53321304 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53321372 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 53321800 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 53321920 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 53321994 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 53321999 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53322018 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53322409 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 3 53322992 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 53323132 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 53323152 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 53323697 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 53323806 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 53323822 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 53325267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53325304 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 53325423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53325471 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53325483 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 53325503 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53325523 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53325939 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53325943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53325951 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 53326013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53326347 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 53326532 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 53326756 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53326762 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53326880 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 53327163 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 53327628 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53328436 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53328537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53328831 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.166666666666667 0.722222222222222 0.111111111111111 19 17 3 13 2 3 53329035 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 53329200 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53329489 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53329491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53330465 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 53330638 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 53331035 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 53331464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53331503 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 53331537 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 53331611 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 53331996 G T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 53332130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53332176 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 53332436 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 53332444 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 53332739 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53332754 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 53332922 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 53333017 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 53333164 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 53333204 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 53333718 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 53333719 A T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 53333748 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53333790 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53333922 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53333936 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 53334030 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 53334036 C A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 53334313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53334344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53334363 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 53334476 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 53336091 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 53336247 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 53336254 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 53336812 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 53336846 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53336949 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 53337131 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 53337179 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 53337216 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 53337228 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53337277 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53337396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53337435 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 53337588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53337736 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 53337822 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 53337847 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 53337871 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 53338045 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 53338113 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 53338150 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 53338159 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53338198 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53338351 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 53338449 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 53338522 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 53338526 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 53338594 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 53338618 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 53338655 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53338659 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 53338803 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 53339168 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 53339171 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 53339252 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 53339261 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53339357 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 53339548 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53339552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53340013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53340103 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 53340319 T A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 53341266 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 53341618 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 53342100 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 53342102 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 53342161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53342329 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 53342332 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 53342437 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 53342732 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 53342787 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 53342871 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 53342883 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 53342940 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 53342971 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 53343104 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 53343431 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 53344377 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53344788 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 53345094 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53345727 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 53346005 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53346345 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 53347133 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53348189 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53349438 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 53350838 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 53350873 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53350919 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 53350971 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 53351010 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 53351072 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53351169 A C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 53351222 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 53351420 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53351575 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 53351617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53351655 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53351784 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53351801 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 53351886 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 53351960 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 53351965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53352025 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 53352056 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53352082 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53352223 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 53352295 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 53352300 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 53352441 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 53352619 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53352630 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 53352644 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53352647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53352657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53352658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53352669 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 53352693 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 53352779 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 53352844 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53352861 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 53353095 C G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 3 53353226 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53353339 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53353363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53353390 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53353437 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53353729 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53354107 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 53354168 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53354914 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 53355297 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 53355303 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 53355315 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 53355485 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53356331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53356560 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 53356927 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53357026 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 53357906 T A N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 53359619 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 53360095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53361550 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53361577 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 53361591 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 53361700 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 53361712 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 53361802 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 53361824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53361868 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 53361929 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53361972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53362112 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 53362125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53362302 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 53362330 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53362346 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 53362350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53362398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53362551 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53362559 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53362579 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 53362983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53363023 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 53363084 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 53363313 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 53363335 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 53363343 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 53363429 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53363443 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 53363475 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53363592 T C Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 53363674 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 53363687 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 53363722 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 53363805 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 53363823 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 53363836 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 53363844 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 53363919 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 53363984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53364028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53364155 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 53364592 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53364633 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53364642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53364651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53364678 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 53364722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53364815 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 53365071 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53365083 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 53365095 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 53365384 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 53365527 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 53365712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53365752 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53365953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53366223 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 53366261 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53366280 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 53366338 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 53366493 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53366539 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53366873 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 53366917 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 53367077 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 53367231 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 53367251 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 53367269 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 53367383 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 53367395 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53367400 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53367534 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53367729 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 53368207 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 53368312 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 53368369 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.105263157894737 0.736842105263158 0.157894736842105 18 20 2 14 3 3 53368371 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53368435 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 53368440 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 53368490 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0 0.736842105263158 0.263157894736842 14 24 0 14 5 3 53368631 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53368779 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 53368791 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53368909 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 53369295 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53369554 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 53369595 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 53369609 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53369622 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53369652 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53369698 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53369721 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53369753 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53369775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53369937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53370342 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 53371992 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53372470 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 53372835 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 53372942 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 53373024 A C Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 3 53373038 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 53373079 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 53373240 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 53373585 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 53373831 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 53373890 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53373953 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 53374243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53374349 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 53374390 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53374409 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 53374592 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 53374594 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 53374609 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53374651 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 53374664 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 53374938 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 53374978 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 53375096 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 53375103 C G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 53375193 A C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 53375291 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 53375340 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 53375631 G T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 53375811 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 53376109 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 53376137 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 53376256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53376575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53376624 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 53376692 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 53377065 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53377905 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 53378817 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53379697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53379721 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53379804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53380002 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 53380027 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53380063 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53380319 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53381263 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 53381424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53381516 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53381554 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 53381687 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 53381894 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 53382038 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 53382041 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 53382292 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53382333 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53382433 T C Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 53382667 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 53382812 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53383751 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53383902 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 53383912 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 53384046 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 53384076 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 53384131 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 53384285 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53384325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53384397 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 53384420 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 53384589 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53384785 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53385004 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53385257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53385561 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53386490 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53386840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53386898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53387672 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53388404 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53388519 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 53388532 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 53388894 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53389382 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 53389613 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 53390049 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53390384 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53390396 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53390438 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53390454 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53390479 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 53390613 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53390688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53390803 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53391066 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53391080 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53391632 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 53391901 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 53391962 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 53392049 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 53392584 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53392614 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53392624 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53392706 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 53392811 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 53392857 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 53392996 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53393140 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53393298 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53393464 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53393672 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53393847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53393945 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53394471 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53394591 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 53394802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53394875 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 53395841 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53395892 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 53396033 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 53396184 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 53396241 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 53396270 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 53396290 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 53396334 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 53396714 C A Y N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.333333333333333 0.25 0.416666666666667 11 13 4 3 5 3 53396778 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 53397065 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53397237 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 53397306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53397345 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 53397358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53397399 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 53397524 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53397546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53397578 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 53397599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53397622 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 53397661 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 53397942 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53398012 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 53398034 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 53398099 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 53398177 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 53398196 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 53398247 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 53398310 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 53398311 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 53398442 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53398617 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53398618 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 53398844 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53398849 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53398882 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53398887 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53398932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53399041 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 53399259 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 53399323 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 53399382 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53400445 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53400571 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53400689 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53400953 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 53400995 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 53401284 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53401291 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53401700 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53401715 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53401798 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53401816 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53402252 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53402405 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53402424 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 53402455 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 53402832 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 53402893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53402946 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 53403107 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53403194 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53403293 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 53403481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53403506 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53403545 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 53403683 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 53403715 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 53403833 G A N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 3 53403849 C T N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 3 53403854 A G N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 3 53404050 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 3 53404150 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53404259 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 53405780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53405934 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53405957 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53406163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53406294 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53406319 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53406478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53407129 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 53407605 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53409427 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53409619 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53409723 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 53409750 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53409839 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53409883 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 53409901 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 53409958 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 53410004 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 53410070 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 53410182 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53410242 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53410278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53410394 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 53410562 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 53410880 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 53410891 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53410914 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53410966 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53411010 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53411097 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53411451 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 53411461 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53411503 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 53411629 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53411796 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53411836 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 53411868 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53412028 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 53412632 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53412946 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 53412964 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53413213 C T Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 53413275 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 53413643 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 53413701 A G N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 3 53413767 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 53413780 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 53413784 C A N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 53413816 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 3 53413902 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 53413985 C T N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 3 53413991 C A N N 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.272727272727273 0.272727272727273 0.454545454545455 9 13 3 3 5 3 53414048 T C N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 53414061 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 3 53414224 G C N N 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 9 11 3 3 4 3 53414283 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 53414381 G C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 53414445 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 53414458 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 53414468 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 53414540 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 53414598 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 53414622 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53414760 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 53414888 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 53414894 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 3 53415108 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 53415120 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 53415141 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 53415190 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 53415213 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 53415364 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 53415368 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 53415404 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 53415418 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 53415420 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 53415438 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53415838 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53415854 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53415908 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 53415996 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 53416269 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53416306 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53416343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53416487 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 53417025 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 53417118 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53417128 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 53417350 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 53417396 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 53417427 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53417627 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 53418444 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 53418459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53418930 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53419028 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 53419194 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53419456 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53420267 T A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 3 53420303 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53420306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53421583 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53422660 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53423950 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53426174 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 53426266 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53426326 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 53426355 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 53426359 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 53426601 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53426933 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 53427285 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53427446 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 53428297 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53428338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53428481 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53429159 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 53429666 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53429962 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53431008 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53431233 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53432465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53433242 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 53433594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53433639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53434012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53434599 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53435020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53439108 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 53439165 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53440030 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53440384 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53440560 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53440628 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53440785 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53441716 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53441891 C G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 53442661 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53443654 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 53444154 T C Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 53444159 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53444178 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53447925 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 3 53448226 A G Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 53449283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53449339 T C Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 53449793 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 53450378 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53450500 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.2 0.8 0 24 16 4 16 0 3 53450550 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53450758 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53451668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53452316 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53452377 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53452718 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 53453240 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53456384 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53460280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53461258 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53461291 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53461309 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 53461513 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 53462095 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 53462174 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 3 53462284 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 53462287 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 3 53462392 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 53462529 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 53462587 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 53462683 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 53462725 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 53462893 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 3 53462917 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53463487 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 53465397 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53465911 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53466204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53469438 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53469510 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 53469713 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 53469725 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 53469871 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 53470024 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53470056 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 53470070 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 53470111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53470269 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 3 53470386 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53470689 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 53470774 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53470909 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53470922 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 53471032 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53471051 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 53471120 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 53471523 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53471582 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53471786 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53471888 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 53471927 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 53471959 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 53472001 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 53472143 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53472192 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53472229 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 53472262 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 53472278 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 53472279 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 53472491 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 53472571 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53473263 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53473332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53473364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53473393 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53473839 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53473987 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 53474400 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 53474444 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 53474908 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53474930 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53475006 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 53475007 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53475140 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 53475408 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 53475493 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 53475511 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53475528 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 53476065 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 53476300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53477517 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53478002 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 53478275 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53478288 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 53478314 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53478321 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 53478375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53478459 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53478580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53478614 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53478615 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53478633 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 3 53478983 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 53479065 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 53479066 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 53479115 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 53479126 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53479164 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53479179 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53479321 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 53479421 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 53479588 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 53479659 A C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0 0.647058823529412 0.352941176470588 11 23 0 11 6 3 53479836 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 53479845 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 53480094 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 53480243 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 53480488 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 53480535 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 53480619 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 53480706 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 53480741 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 53480794 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 53480808 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53480809 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 53480931 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53481100 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 53481192 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 53481258 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 53481386 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53481495 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 53481576 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 53481723 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 53481870 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 53481892 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53482096 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 53482152 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 53482423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53482655 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 53482784 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 53482921 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 53482938 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53483267 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 3 53483402 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53483441 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 53483517 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53483611 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 53483697 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 53483746 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 53483789 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 53483885 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53483896 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53484195 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 53484533 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53484567 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 53484575 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 3 53484590 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 3 53484780 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53484830 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 53485062 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 53485102 C G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 53485273 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 53485315 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53485443 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53485502 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 53486019 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 53486030 C A N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 53486048 G A N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.384615384615385 0.538461538461538 0.0769230769230769 17 9 5 7 1 3 53486062 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 53486128 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 53486273 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 53486499 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 53486515 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 53486586 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 53486606 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53486722 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53486839 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 53488048 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 53488204 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 53488233 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 53488267 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 53488277 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 53488293 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 53488307 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 53488571 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 53488700 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 53489014 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 53489201 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53489402 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 3 53489606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53489624 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 53489674 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 53489795 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53489854 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53489928 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 53489984 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 53490072 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 53490115 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53490232 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53490252 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 3 53490428 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 53490770 G T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 53490810 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 53490813 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 53490836 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 53490846 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 53490928 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 53490957 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 53490969 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 53491181 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 53491195 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 53491392 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 53491628 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 53492394 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 3 53492396 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 3 53493133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53493634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53493677 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53493716 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53493762 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53493774 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53493831 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53493888 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 53494089 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 53494126 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53494354 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 53494704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53494932 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 3 53495173 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 53495252 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53495521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53495624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53495642 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 53495662 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53495667 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53495693 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53496192 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53497021 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 53497187 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 53497240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53497329 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 53497388 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 53497432 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 53497495 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53497515 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53497617 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53497662 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 53497846 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53497934 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 53498073 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 53498127 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 53498176 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53498245 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 53498252 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 53498649 C A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 53498677 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53499700 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 53500217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53500375 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 53500460 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53501189 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 53501226 A T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0 0.6875 0.3125 11 21 0 11 5 3 53501383 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53501519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53501554 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53501725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53501788 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53501858 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 53501876 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 53502052 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53502101 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0 0.647058823529412 0.352941176470588 11 23 0 11 6 3 53502117 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53502252 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 53502253 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 53502313 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53502367 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53502430 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53502452 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53502502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53502606 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53502659 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53502671 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53502674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53502715 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53502721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53502753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53502841 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53502874 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 3 53502876 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 53503068 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53503130 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53503316 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 53503453 A T N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 53503541 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53503791 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 53503801 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 53503887 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 53504157 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53504161 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 53504689 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 53504918 G T N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.333333333333333 0.2 0.466666666666667 13 17 5 3 7 3 53505130 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 53505164 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53505232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53505233 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 53505435 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 53505530 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53505555 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 53505612 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 53505661 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53505670 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 53505693 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53505722 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 53505838 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 53505840 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 53506040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53506108 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 53506138 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 53506159 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53506198 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53506253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53506256 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 53506444 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 53506458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53507166 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53507491 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53507514 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53507575 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53507665 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53507708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53507713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53507727 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53507740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53507792 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53507801 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53508354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53508526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53509622 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53509958 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53510965 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 53510966 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 53511713 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53511818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53511871 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53515310 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 53515705 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53518209 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 53518340 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53518685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53526207 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53526214 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53527926 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53528170 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53528299 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53528319 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53528330 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53528381 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53528430 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 53528481 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53528734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53528760 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53528794 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53528805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53528832 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 53528948 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 53528953 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 53529181 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 53529415 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53529506 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53529548 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53529831 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53530279 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53531147 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 53531752 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 53531786 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53531836 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 53531852 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 53531982 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 53531999 T A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 53532021 T C N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 3 53532932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53533380 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 53533381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53533417 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 53533419 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 53533788 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 3 53533815 T A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 53534187 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 53534460 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53534555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53535259 T C N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 3 53535355 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53535603 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 53535616 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 53535627 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53535635 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53535697 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 53535771 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 53535808 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53535940 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 53536179 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53536187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53536261 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 53536294 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53536324 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53536488 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 53536493 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 53536575 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 53536731 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 53536736 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 53536962 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53537030 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 53537043 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 53537096 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 53537184 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53537190 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53537248 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53537375 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53537384 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53537652 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53537733 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53537736 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53537799 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 53537968 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 53537969 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 53538003 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53538077 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53538106 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 53538188 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 53538233 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 53538488 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53538507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53538591 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 53538625 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53538687 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 53538725 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 53538865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53538880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53538885 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53538913 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 53538977 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 53539000 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53539055 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53539074 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53539102 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53539154 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53539175 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53539350 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 53539591 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 53539944 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 53539961 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53540099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53540174 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 53540196 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 53540223 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 53540359 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 53540369 C G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 53540416 G A N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 12 8 4 4 2 3 53540532 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 53540597 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 53540601 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 53540775 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53540794 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 53540858 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53541012 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 53541035 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 53541057 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 53541136 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 53541182 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 53541212 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 53541378 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53541400 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 53541484 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 53541630 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53541772 G T Y N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 9 9 3 3 3 3 53542039 C G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 53542252 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 53542308 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 53543543 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53544069 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 53544171 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53544207 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53544296 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 53544341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53544348 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 53544364 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53544540 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53544662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53544701 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 53544775 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53544776 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53544883 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 53544944 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53544967 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53545015 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53545222 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 53545443 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 53545479 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 53545493 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53545531 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53545641 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53545741 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53545767 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 53545778 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53545890 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 53546005 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53546039 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 53546123 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53546149 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 53546199 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53546209 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53546412 C G Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 53546491 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 53547491 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 53547561 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 53547594 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 53547637 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 53547710 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53547730 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 53547741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53547866 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 53547943 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 53548043 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 53548068 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53548108 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 53548122 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 53548126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53548133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53548154 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53548170 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 53548402 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 53548450 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53548506 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 53548509 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53548523 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 53548555 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53548563 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53548619 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53548707 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53548736 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 53548922 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 53548932 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 53548937 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 53549064 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53549099 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53549170 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53549248 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 53549255 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 53549275 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53549291 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53549374 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 53549425 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 53549876 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 53549892 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 53549927 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 53549960 C A N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 53549966 T C N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 3 53550587 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 53550700 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 53550756 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53550798 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 53550902 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 53551082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53551691 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 53551901 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 53552024 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 53552072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53552151 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 53552155 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 53552339 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 53552583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53552594 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53552971 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 53553048 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 53553106 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 53553154 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 53553939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53554936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53555039 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53555106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53555107 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 53555615 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 53555641 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 53555808 T G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 53556073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53556226 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 53556290 G C Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 53556337 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53556577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53556702 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53556814 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 53556834 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 53556884 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 53557308 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53557537 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 53557555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53557601 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 53557648 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 53557863 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 53557912 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 53557917 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 53558476 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53558981 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53559057 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 53559324 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53559697 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53559920 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53560540 C A Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 53560682 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 53560770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53560969 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53561174 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 53561624 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 53561676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53561732 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53561742 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 53561782 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 53561854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53561858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53561916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53562307 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53562361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53562587 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53562692 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 53562827 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53562874 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53562985 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53562988 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 53563183 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 53563190 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 53563227 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 53563331 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53563344 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 53563419 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 53563456 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 53563633 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 53563726 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 53563894 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 53564560 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 53564703 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 53564721 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 53564786 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 53564839 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 53565062 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 53565188 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 53565204 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 53565256 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 53565340 G C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 53565348 T G Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 53565361 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 53565526 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 53565603 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 53565641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53566441 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 53566899 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 53566956 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53567034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53567654 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 53567667 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 53567757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53570041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53571589 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53575025 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53575102 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53575111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53575300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53575313 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53575326 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53575562 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53575944 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53576173 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 53576215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53576485 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53576642 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53576721 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 53576812 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 53577696 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53577710 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53577736 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53577749 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53577790 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53577943 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53578009 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53578188 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 53581367 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53581625 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53582459 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53582529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53583860 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53584082 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 53584116 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 53584361 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53584479 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53584981 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53585102 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53585748 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53586143 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53586883 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 53587442 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 53587570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53587624 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53587636 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53587794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53587895 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 53588313 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53588517 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 53588528 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 53588607 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53588623 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 53588632 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 53588641 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53588685 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 53588789 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 53589999 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 53590116 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53593008 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 53593423 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53594131 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53594701 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53594865 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53594918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53595052 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53595218 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53595271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53595437 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 53595514 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53595553 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53595971 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 53595976 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 53596023 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 53596380 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 53596457 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 53596832 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53596957 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53597736 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 53597821 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53597914 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53598674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53599001 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 53599250 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 53599260 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 53599347 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53599598 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 53600137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53600444 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53600720 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53601141 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53602643 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 53602669 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 53602680 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 53605889 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53605962 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53606069 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 53606088 A T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53606155 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53606257 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 53606451 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 53606472 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 53606486 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 53606601 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53610501 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 53610560 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 53610609 T G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 53610884 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 53611203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53611310 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 53611727 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53611856 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53611868 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53611982 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53612221 G A Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 53612223 A G Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 53612264 A T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53612488 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 53612673 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 53612952 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 53614162 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 53614739 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 53619892 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 53620119 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53622255 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53622285 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 53622908 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53623375 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53623381 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 53623513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53623914 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 53624010 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53624130 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53624143 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 53624235 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53624358 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 53624546 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53624547 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53624584 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53624640 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 53624652 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 53625072 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 53625334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53625637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53626129 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53626627 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53626901 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53626995 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53627017 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53627029 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53628355 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53628679 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 53628854 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 53628959 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 53629053 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 53629127 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 53629194 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 53629288 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 53629369 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53629373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53629386 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 53629390 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 53629629 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 53629723 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 53630081 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 53630097 G A Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 53630144 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 53630436 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 53630510 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 53630545 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 53630766 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53630800 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 53630994 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 53631373 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53631559 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53631662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53631700 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53631725 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53631757 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53631826 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53631905 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 53632176 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53632182 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53632211 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53632214 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53632442 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53632449 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53632455 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53632468 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53633995 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53634319 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53634361 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 53634400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53634493 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53635037 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 53635704 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53637049 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53637079 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53637626 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53637834 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53637929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53638099 G C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 53638164 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53638710 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53638739 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 53638759 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 53638785 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 53639169 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53639902 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53646525 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 53646552 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53646583 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53646765 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53646785 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53647084 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 53647194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53647341 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53647348 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53647389 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53647547 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53647679 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53647741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53647801 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53647805 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53647832 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53647918 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53648078 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53648087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53648150 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 53648169 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 53648278 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53648302 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53648457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53648500 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53648602 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 53648633 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 53649464 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53651076 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53651204 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53651252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53656730 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 53656736 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53656801 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53656847 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 53656848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53658308 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53658312 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53658923 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 53659129 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 53659372 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53659497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53659584 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 53659893 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 53659956 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 53660047 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 53660200 T G Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.15 0.85 0 23 17 3 17 0 3 53660209 A T Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 3 53660269 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53660290 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 53660442 T C Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 3 53660461 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53661071 C A Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 3 53662657 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53662909 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 53662937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53662961 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 53663072 C A Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 53663358 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 53663547 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 53663610 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53663671 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 53663729 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53663756 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 53663882 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 53664120 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53664378 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53664518 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 53664545 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53664637 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 53664702 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53664881 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53664916 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 53665027 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53665741 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53666021 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53666242 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53666348 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 53666619 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 53666835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53667095 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53667817 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53667871 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53668055 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53668512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53669160 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53669221 C A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53669251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53669268 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53669270 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53669853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53669863 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 53670101 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 53670625 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53670961 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 53671635 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53672381 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 53672904 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53672986 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53673375 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53673996 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 53674089 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 53674125 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53674346 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53675004 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 53675278 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53675449 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 53675509 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53676417 A G Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 53681555 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53681859 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53682772 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53682791 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53682851 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 53683124 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53683128 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 53683838 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 53683961 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 53684369 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53684484 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 53684524 C A Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 53684639 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 53684687 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 53684692 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 53684705 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 53684775 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53684896 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 53685086 A T N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 53685112 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 53685128 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53687282 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53689342 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 53689554 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.0555555555555556 18 18 1 16 1 3 53689555 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.0588235294117647 17 17 1 15 1 3 53689924 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53690019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53690320 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 53690324 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53690333 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53690866 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 53691648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53691808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53691834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53691903 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53691916 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53691925 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53692212 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53692253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53692402 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53693807 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53694418 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53695214 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53697146 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 53697252 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 53697266 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53697507 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53698380 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53698659 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53698680 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 53698923 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 53698940 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53699105 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 53699266 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53699883 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 53700384 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53700756 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53701278 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53701877 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 53702075 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 53702177 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 53702662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53703545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53703675 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 53704571 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53705280 A C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 53705286 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 53705582 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53705677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53705719 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 53706439 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 53706636 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53707021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53707134 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53707652 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53707848 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53707922 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53707975 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 53708026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53708112 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53708205 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53708328 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53708421 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 53708461 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 53708480 G T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 53708492 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 53708574 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53708591 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53708632 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53708640 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53708651 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53708652 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53708682 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53708695 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53708698 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53708737 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 53708794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53708851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53709302 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 53709383 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53709469 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 53709626 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53709656 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53709668 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 53709706 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53709799 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 53709882 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 53709888 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 53709938 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 53709986 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 53710046 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53710065 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53710110 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 53710121 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 53710147 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 53710204 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 53710316 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 53710379 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 53710383 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53710401 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 53710593 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 53710622 G T N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 3 53710645 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53710908 T A N N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 3 53711079 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 53711163 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 53711177 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 53711257 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 53711414 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 53711508 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 53711614 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53711852 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 53711897 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 53711920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53711974 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53712006 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 53712102 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 53712115 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 53712117 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 53712165 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 53712171 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 53712273 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 53712311 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 53712356 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 53712498 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53712533 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 53712624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53712640 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 53712657 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 53712797 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 53712824 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 53712828 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 53712837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53712844 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 53712910 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53713349 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 53713595 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 53713945 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 53714168 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 53714213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53714557 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 53714720 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 53714859 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 53714861 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53714900 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53714980 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53715070 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 53715120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53715871 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53715879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53717140 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 53717153 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 53717180 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 53717227 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 53717245 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 53717378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53717461 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 53717587 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53717650 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 53717740 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 53717761 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 53719456 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 53719910 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 53719974 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53721613 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53721983 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 53722353 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 53722416 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 53722945 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53723176 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53723179 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 53723260 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53723707 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53723761 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 53724096 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53724235 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 53724440 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 53724856 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 53724861 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 53724908 G T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 53725008 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 53725063 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 53725074 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 53725336 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53725527 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53725865 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53726005 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 53726123 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 53726736 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53726765 T G Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 53727023 A G Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 53727235 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53727249 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 53727417 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 53727422 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53727440 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 53727607 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 53727609 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 53727695 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 53727764 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53727857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53727889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53727912 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 53727993 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 53728136 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 53729745 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 53729757 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53729830 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 53730757 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53731351 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 53731508 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53732055 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 53732214 A C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 53732333 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53732410 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 53732625 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53732635 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 53732655 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 53732736 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 53732825 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 53733129 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 53733132 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 53733157 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 53733288 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 53733507 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 53733621 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 53733627 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 53733718 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 53733720 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 53733749 T C N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 6 14 2 2 6 3 53733766 G A N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.272727272727273 0.272727272727273 0.454545454545455 9 13 3 3 5 3 53733943 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 53733955 G T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 53733978 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 53734043 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 53736244 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53736942 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53737022 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 53737038 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 53737052 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 53737222 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 53737303 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 53737328 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 53737369 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 53737528 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 53737875 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 53737910 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53737939 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 53737965 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 53738091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53738122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53738123 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 53738807 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 53738864 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 53738873 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 53739004 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 53739008 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 3 53739023 G C N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 3 53739056 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 53739072 T C N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 53739143 C T N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 3 53739150 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 53739154 C T N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 12 12 2 8 2 3 53739197 A G Y Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.142857142857143 0.642857142857143 0.214285714285714 13 15 2 9 3 3 53739342 T C N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 53739343 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 53739381 G T N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 3 53739450 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 53739468 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 53739479 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 53739529 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 53739583 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 53739849 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53739879 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 53740009 T A Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.176470588235294 0.705882352941177 0.117647058823529 18 16 3 12 2 3 53740430 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 53740572 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53740722 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 53740752 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 53741147 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 53741166 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 53741328 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 53741516 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 53741665 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53741730 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53741752 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 53741766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53741847 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 53741940 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 53741974 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53742057 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 53742067 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 53742080 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 53742229 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 53742247 T C Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 53742385 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 53742433 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 53742666 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 53742728 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 53742882 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53743755 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53743875 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53743931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53743979 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 53744021 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53744099 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 53744438 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 53744557 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 53744680 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53745063 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 53745268 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53745477 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53745487 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53745496 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53745553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53746026 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53746264 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53746380 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53746421 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 53746458 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 53746570 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 53746581 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53746621 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53746662 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 53746842 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 53746861 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 53746894 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 53746908 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53747690 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 53747741 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53747753 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53747761 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53747911 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53747984 A G Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 53748191 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 53748338 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 53748374 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 53748390 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 53748633 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 53748848 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 53748868 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53748936 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53749066 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 53749207 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 53749273 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53749334 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53749367 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53749400 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53749542 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 53749602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53749661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53749665 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53749678 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53749693 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53749815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53749829 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53749853 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 53749878 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 53749880 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 53750107 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53750141 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 53750404 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 53750621 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53750784 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53750916 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 53750943 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 53750964 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53750989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53750991 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 53751035 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53751060 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 53751118 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 53751196 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53751351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53751532 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 53751749 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 53751872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53751910 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53752046 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53752121 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53752207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53752211 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53752355 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53752424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53752465 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53752540 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53752550 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53752576 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53752616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53752761 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53752802 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53752806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53753091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53753111 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53753148 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53753257 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53753369 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53753475 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53753478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53753512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53753518 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53753524 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 53753564 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53753789 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53754068 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53754096 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53754180 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53754324 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53754372 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 53754389 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 53754497 G C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 53754504 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 3 53754806 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53754923 G T Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 53754982 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 53755081 C A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 53755083 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 53755569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53755601 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53755926 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53756406 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 53756688 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53757004 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53757412 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53758988 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53759128 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53759425 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 53759442 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 53759507 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 53759914 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53762245 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53762343 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53764050 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 53765724 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53766043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53766830 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53767443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53768467 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 53768493 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53768514 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 53768549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53768863 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 53768899 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 53768926 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 53769051 T A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 53769096 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 53769342 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 53769386 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 53769547 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53769712 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 53769714 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 53769779 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 53770064 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 53770225 C T Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 53770362 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53770554 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 53770939 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 53771106 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 53771324 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 53771569 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 53771798 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 53771812 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 53772242 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 53772387 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 53772416 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 53772736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53772912 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53773013 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53773394 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53773445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53773608 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 53773650 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53773871 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 3 53773891 G A Y Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 53773903 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 53773933 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 53773966 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53774381 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53774416 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53774717 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53774757 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 53774823 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 53775504 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 53775522 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 53775523 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 53775573 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 53775638 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 53775701 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 53775732 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 53775743 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 53776514 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 53776637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53776723 C A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 53776755 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53776780 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 53776791 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 53776848 A G Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 3 53776873 C T N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 13 7 4 5 1 3 53777076 C T Y Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 3 53777109 T G Y N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 3 53777262 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53777287 G A Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 53777376 C G Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 53777417 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53777527 G C Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53777617 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 53777636 A T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53777658 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 53777660 G C Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 53777690 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53777726 T G Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 53777737 C T Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 53777799 A C Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53777813 G T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53777817 G T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53777839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53777877 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53777903 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53777929 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53777938 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53777971 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53778159 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53778179 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53778238 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 53778378 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 53778615 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53778618 T A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 53778642 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 53778684 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 53778799 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 53778880 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 53779501 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 53779940 C A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 53780251 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53780348 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 53780449 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 53781015 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 53782677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53785843 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 53785850 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 53786489 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53787013 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 53787668 C T Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 53789209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53789709 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53794725 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53795250 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 53795507 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 53795509 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 53795634 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 53795635 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 53796066 G C Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 53796297 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 53796384 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 53796760 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 53796783 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 53796803 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 53796813 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 53796822 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 53796838 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 53796859 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53797319 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 53797336 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 53797509 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 53797512 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 53797554 A G Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 53797597 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 53797616 T C Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 53797771 A C Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 53797933 G T Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 53797947 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 53798021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53798110 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 53798999 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 53799200 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 53799339 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53799796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53799938 T C Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0 0.722222222222222 0.277777777777778 13 23 0 13 5 3 53800585 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 53800632 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 53801140 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 53801199 C G Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 53801457 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53801473 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53801550 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53802158 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 53802196 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53802459 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53802697 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53802731 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53802848 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 53802944 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 53802945 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 53802960 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53802966 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53803008 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 53803183 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53803251 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53804228 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53805080 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53805179 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53805529 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53805570 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53805931 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53806121 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53806612 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53806987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53807064 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53807296 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53808031 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53808112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53808144 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53808251 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53808670 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53809091 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53809254 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53809255 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53809297 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53809348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53809466 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53809599 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53809617 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53810297 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53810572 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53810686 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53810806 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 53811018 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53811054 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 53811315 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 53811573 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 53811751 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 53811832 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 53812014 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53812055 T G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 53812476 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 53812557 T A Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 53812914 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53812999 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53813961 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 53814632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53814709 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53814844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53814851 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53815026 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53815029 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53815073 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 53815084 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 53815125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53815178 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 53815273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53815364 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53815470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53815498 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53815749 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53815804 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53815837 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 53815854 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53815956 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 53816031 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53816066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53816162 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53816293 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53816324 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53816332 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53816498 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 53816509 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 53816666 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53816699 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53816702 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53816785 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53816873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53816945 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 53817323 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53817331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53817359 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 53817388 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53817478 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53817641 T C Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 53817729 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 53817793 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 53817806 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 53817816 A C Y N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 53817956 A T N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 53818157 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53818174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53818176 C T Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 53818224 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53818263 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53818401 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53818592 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 53818628 G A Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 53818939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53819121 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 53819141 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 53819164 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53819201 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 53819264 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 53819340 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 53820258 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 53820281 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53820360 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 53820369 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 53820380 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53820387 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 53820402 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 53820429 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 53820432 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53820519 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53820528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53820713 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 53820733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53820768 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53820773 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53820824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53821096 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53821144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53821439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53821474 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53821555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53821587 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 53821597 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53821628 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 53821634 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 53821726 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 53821829 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53822587 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53822647 G T Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 53822653 T G Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 53822697 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53822818 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 53823081 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53823529 A C Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 53823686 A T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 53823776 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 53823909 C A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 53823947 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53823963 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 53824095 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53824096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53824109 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 53824128 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 53824161 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53824279 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53824349 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53824469 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53824509 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53824514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53824551 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 53824944 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53824955 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 53828862 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53829287 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53830793 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53830874 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 53830881 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 53831164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53831713 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 53831852 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 53832505 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 53832545 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 53832708 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 53832978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53833194 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 53833347 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 53833748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53833760 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 53833940 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 53834179 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53834226 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 53834385 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 3 53834403 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 53834421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53834450 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53834509 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53834615 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53834923 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 53835775 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53836694 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53838238 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 53839361 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53839376 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53839625 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 53840876 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53841383 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53841536 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53841668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53842269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53842420 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 53842784 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53842824 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53843300 G C Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 53843416 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53844648 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53845313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53845475 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53850230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53850513 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53850982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53851857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53852020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53852987 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 53853273 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 53853283 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 53853351 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 53853398 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 53853421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53853676 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 53853824 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53854013 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53854340 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53854349 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53854755 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 53854948 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53855032 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 53855058 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 53855107 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53855138 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 53855184 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 53855227 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 53855329 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 53855551 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53855660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53855681 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53855707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53856320 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 53856321 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 53856413 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 53856448 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 53856617 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 53856627 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 53856650 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53856722 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 53856750 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 53856776 T G Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 53857002 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 53857085 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 53857090 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 53857099 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53857117 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53857136 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 53857253 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 53857272 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 53857365 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 53857438 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 53857493 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 53857610 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 53857695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53858005 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 53858106 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53858219 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53858258 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53858276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53858313 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53858397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53858494 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53858682 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 53858689 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 53858797 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 53858811 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 53858818 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 53858969 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 53859942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53859968 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 53860014 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53860053 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53860376 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 53860652 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53860680 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 53860694 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 53860767 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53860862 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 53860909 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53860949 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53860963 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53861005 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 53861170 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 53861214 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 53861324 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53861400 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 53861515 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 53861525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53861566 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 53861761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53863616 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 53865244 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53865438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53865462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53865487 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53866340 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53868471 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53869039 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53871357 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53875397 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53875427 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53876546 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53876647 A G Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 53876681 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 53876825 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 53877101 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 53877125 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 53877249 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 53877269 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 53877480 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 53877519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53877611 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 53877616 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 53877662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53877672 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 53877682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53877781 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53877810 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 53878299 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 53878573 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 53878794 A G Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 53879595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53879880 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53880405 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 53880481 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53880503 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53880574 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53880583 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53881144 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53881480 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53881597 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 53881685 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 53881775 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53881925 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 53882330 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53882403 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53882679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53882684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53882954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53883027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53883126 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 53883267 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 53883387 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 53883526 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 53883531 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 53883545 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 53883546 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 53883592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53883611 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 53883725 C G Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 53883784 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 53883829 T A Y N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 3 53883885 G T Y N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 53884016 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 53884369 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53884654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53884991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53885207 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53886016 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53886275 G C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 53887054 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 53887316 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53887330 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 53887490 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53887563 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 53887573 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 53887719 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 53887802 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 53887936 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 53888167 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 53888225 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 53888226 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 53888487 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 53889316 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 53889395 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 53889590 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 53889637 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 53889677 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 53889701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53889719 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 53889726 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 53889730 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 53889741 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 53889815 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 53889901 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 53889937 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 53890120 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 53890317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53890338 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53890430 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53890460 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 53890467 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 53890512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53890634 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 53890731 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 53890777 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53890873 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 53890878 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 53890895 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 53891041 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 53891047 G T Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 53891084 A T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 53891085 A T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 53891113 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53891227 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 53891332 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 53891499 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 53891668 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 53891671 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 53892250 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53892287 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 53892391 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53892432 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53892489 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 53892544 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53892564 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 53892688 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53892851 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 53892930 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 53893543 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 53893546 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 53893583 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 53893796 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 53893868 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 53893914 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 53894115 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53894117 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53895252 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 53895360 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53895499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53897163 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53897438 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53897453 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53897526 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53897562 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53898064 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53898072 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53898099 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53898649 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 53898779 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53898780 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 53898850 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 53898858 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 53898918 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 53899025 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 53899057 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53899310 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 53899323 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 53899399 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 53899526 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 53899568 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 53899609 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 53899777 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 53899795 G C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 53899831 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 53899841 G T N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 53900382 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 53900619 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 53900682 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53901950 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 53902796 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 53902797 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 53902937 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 53903003 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53903201 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 53903363 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 53903402 C A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 53903411 T A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 53903814 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 53904339 C T Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 53904511 G A Y Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 13 7 4 5 1 3 53904624 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53904666 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 53904679 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 53905403 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 53905432 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 53905468 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53905657 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 53905774 A C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 53905911 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 53906022 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53906367 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 53906372 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 53906429 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53906446 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53906474 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53906899 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 53906996 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53907096 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 53907297 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 53907491 C T N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 53907699 A T N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 53907731 A G N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.25 0.583333333333333 0.166666666666667 13 11 3 7 2 3 53907760 C T N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 10 10 2 6 2 3 53907762 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 53907825 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 53907925 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53907948 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 53907965 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 53908103 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53908172 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 53908248 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 53908905 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 53908984 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 53909054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53909506 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53909518 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53909548 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53909758 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53909781 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 53910092 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 53910218 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 53910355 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 53910417 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 53910475 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53910554 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 53910595 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 53910655 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53910885 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 53911029 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53911309 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 53911315 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 53911606 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 53911630 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 53912521 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 53912603 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 53912760 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 53912785 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 53912848 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 53912900 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53912995 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53913100 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53913125 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 53913202 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 53913212 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53913264 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 53913276 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 53913461 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53913504 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 53913531 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 53913599 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 53913632 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 53913648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53913707 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 53913790 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 53913850 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 53914008 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53914046 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53914147 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 53914230 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 53915095 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53915117 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53915215 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 53915216 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53915427 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 53915579 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53915883 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53915908 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53916016 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 53916057 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53916186 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53916286 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 53916398 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 53916441 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 53916511 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 53916563 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 53916612 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 53916653 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 53916659 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53916839 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 53916872 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 53917119 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 53917120 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 53917151 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 53917156 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 53917173 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 53917285 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 53917300 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 53917349 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 53917398 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 53917522 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 53917796 A G Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 53917835 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 53917917 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 53917922 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 53918091 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 53918101 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 53918103 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 53918197 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 53918285 G T N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 53918586 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 53918726 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 53918739 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 53918740 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 53918769 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 53918778 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 53919177 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 53919275 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 53919358 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 53919381 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 53919724 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 53920080 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 53920212 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 53920322 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 53920423 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 53920611 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53920785 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 53920844 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53921087 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53921541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53921788 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 53921873 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 53921943 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 53921972 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 53922015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53922107 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 53922149 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 53922366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53922369 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 53922468 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 53922489 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 53922581 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 53922590 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 53922620 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 53922639 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 53922651 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 53922657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53922700 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 53923375 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 53923616 G T N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 3 53924028 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 53924114 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53924127 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53924149 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 53924406 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 53924537 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53924551 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53925183 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 53925317 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 53925491 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 53926094 T A Y N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 53926467 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 53926475 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 53926522 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 53933212 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 53933226 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 53933240 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 53933305 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 53933438 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 53933512 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53933545 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 53934747 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53935032 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53935322 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53936208 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 53937687 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 53937798 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53938540 T C N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.133333333333333 0.666666666666667 0.2 14 16 2 10 3 3 53939710 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53942679 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 53942721 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 53942732 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 53942811 C G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 53942828 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 53943106 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 53943252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53943632 C T Y Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 3 53943685 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 53943740 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 53943753 T G Y N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 53943802 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 53943839 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 53944065 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 53944114 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 53944143 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53944223 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53944409 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 53944523 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 53944569 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 53944611 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 53945487 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 53945518 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 53945669 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53945791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53945832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53946736 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 53947048 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 53947056 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 53947140 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 53947463 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 53947679 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53947985 A G Y Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 3 53948483 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 53948783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53949122 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53949134 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53949241 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53949324 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53949546 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 53949683 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53949798 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 53949808 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 53949907 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53950214 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 53950369 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 53950496 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 53950588 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 53950673 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 53950806 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 53951300 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53951403 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 53952839 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 53958015 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 53958100 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53959187 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53960915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53961607 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53963373 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53965048 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53966729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53967013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53967529 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53968567 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53972000 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53975133 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53975832 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 53975910 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 53978781 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53979342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53979458 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 53979967 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53981049 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 53982201 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 53982480 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 53982930 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 53982967 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 53982985 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 53983235 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 53983551 C A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 53984133 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 53984144 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 53984315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53984505 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 53984622 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 53984830 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 53984938 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 53985153 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 53985314 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 53985726 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53985942 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 53986008 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 53986016 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 53986088 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 53986141 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 53986267 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 53986284 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 53986342 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 53986418 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 53986515 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 53986555 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 53986748 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 3 53986767 T G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 53987082 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 53987513 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 53987559 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 53987623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53987658 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 53987691 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53987718 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53987821 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 53987935 G A N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.428571428571429 0.214285714285714 0.357142857142857 15 13 6 3 5 3 53987976 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 53988071 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 53988116 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 53988809 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 53989046 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 53989104 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 53989121 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 53989129 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 53989211 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 53989308 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 53989514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53989655 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 53989789 T C Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 53990971 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 53991268 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 53991378 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 53991460 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53991533 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 53991632 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 53991701 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.333333333333333 0.2 0.466666666666667 13 17 5 3 7 3 53991961 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 53992414 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 53992447 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 53992464 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 53992472 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 53992487 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 53992696 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 53992773 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53992790 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53992828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53992851 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53992855 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53993009 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 53993043 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53993056 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53993111 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53993124 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 53993168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53993169 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53993255 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 53993942 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53993976 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 53994079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53994106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53994678 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 53995215 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 53995594 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 53995907 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 53996336 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 53998001 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 53998318 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 53998811 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53998889 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 53998998 G T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 53999182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53999210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53999345 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 53999797 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 53999927 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 53999993 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54000128 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 54000435 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 54000504 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 54000564 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 54000778 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54000896 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 54001010 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 54001121 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 54001254 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 54001339 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54002049 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 54002348 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 54002787 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 54003149 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 54003311 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 54003405 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 54003446 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 54003748 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54003837 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54004043 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54004243 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 54004344 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 54004369 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54004790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54004964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54004996 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 54005175 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 54005342 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 54005365 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54005416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54005462 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 54005472 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54005581 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54005582 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54005597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54005719 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 54005744 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 54005915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54006037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54006725 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 54007397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54007496 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 54008049 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54008617 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 54008651 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54008723 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 54008771 G T Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 54008821 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 54008877 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 54009365 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 54009895 T C Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 54009954 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 54010383 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54010430 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 54010439 G T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 54010495 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 54010502 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 54010510 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54010698 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 54010840 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 54011095 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 54011148 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54011238 A T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 54011329 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 54011348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54011467 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54011481 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 54011506 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 54011614 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54011880 A C N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 54011908 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 54011973 T G Y N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.0666666666666667 0.666666666666667 0.266666666666667 12 18 1 10 4 3 54012026 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 54012039 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 54012095 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 54012096 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 54012126 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 54012152 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54012237 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 54012238 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 54012336 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54012374 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54012444 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 54012714 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54012851 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54012881 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54012927 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54012992 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 54013142 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54013362 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54013485 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 54013496 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 54013709 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54014694 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 54014703 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54014711 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54014724 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 54014739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54014779 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 54014872 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 54014903 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 54015096 C G Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 54015113 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54015274 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 54015472 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54015691 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54016040 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 54016070 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 54016261 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54016543 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 54016840 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 54017092 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 54017555 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 54017567 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 54017569 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 54018341 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54018461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54018507 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 54018666 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 54018668 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54018782 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 54018783 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 54019100 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 54019326 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 54019484 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54019960 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54020034 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 54020141 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54020366 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54020426 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 54020453 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 54020462 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54020501 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 54020554 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54020581 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 54020624 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 54020631 T C N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 54020659 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 54020739 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 54020977 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54021300 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 54021564 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54021629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54021714 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54021716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54023070 G T Y N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 54023729 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 54024510 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54024763 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54024822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54024937 T G N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 54025365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54025548 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 54025640 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54025645 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 54025782 A G N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.0833333333333333 0.583333333333333 0.333333333333333 9 15 1 7 4 3 54025804 T C N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 12 12 3 6 3 3 54025846 A T N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 3 54025889 A G N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0 0.75 0.25 6 10 0 6 2 3 54025946 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 54025984 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 54026092 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 54028622 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 54029090 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54030833 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 54030874 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54033170 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 54033400 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 54033449 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 54033585 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 54033738 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 54033815 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 54033837 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 54033851 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 54033856 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54033906 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 54033915 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54033947 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54033964 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 54033968 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 54034115 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 54034151 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 54034229 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 54034315 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 54034328 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 54034388 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 54034405 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 54034757 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54034800 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54035042 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 54035136 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 54035357 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 54035366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54035368 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54035398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54035417 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54035577 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 54035649 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 54035740 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 54035773 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 54036006 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 54036207 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 54036316 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 54036591 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 54036894 G A Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 54036904 G A Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 54036973 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 54037037 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54037130 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 54037132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54037175 C G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 54038994 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 54039876 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 54040622 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54040677 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54040763 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 54040961 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 54041407 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 54041531 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 54041578 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54043592 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 54043597 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 54043926 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 54044050 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54044649 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 54044729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54044735 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54044758 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 54044760 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 54044876 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 54045148 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 54047823 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54048179 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 54048369 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54048391 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 54048414 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 54048695 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 54050951 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54051444 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 54051588 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54051768 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54052321 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 54052327 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 54052390 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 54052655 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 54052687 C T Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 54052688 G A Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 54052749 T A Y N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 3 54052755 T A Y N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 54052778 G A Y Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 3 54053049 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 54053098 C A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54053250 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 54053292 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 54053372 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 54053432 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 54053438 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 54053448 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 54053466 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 54053515 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 54053640 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 54053647 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 54053808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54053843 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 54054080 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 3 54054133 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 54054168 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 54054172 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 54054181 G T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 3 54054239 A G Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 54054412 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54054421 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 54054453 G C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 54054454 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 54054519 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 54054543 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54054554 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 54054556 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 54054572 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 54054584 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 54054655 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 54054688 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 54054701 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 54054702 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 54054749 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 54054752 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 54054761 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 54054865 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 54054900 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 54054935 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 54055031 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 54055088 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 54055114 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 54055159 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 54055177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54055216 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 54055247 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 54055254 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 54055270 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 54055363 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 54055380 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 54055390 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 54055442 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54055563 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 54055637 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 54055744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54055788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54055807 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54055827 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 54056097 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 54056100 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 54056636 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 54056648 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 54056659 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 54056701 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 54056714 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 54056719 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 54056761 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 54056959 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 54057001 A G Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 54057026 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 54057068 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 54057115 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 54057321 T G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 54057324 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 54057333 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 54057345 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 54057425 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 54057438 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 54057566 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 54057567 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 54057776 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 54057865 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 54057949 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 54057975 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 54058028 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 54058042 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54058228 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 54058776 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 54058945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54058990 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54059493 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 54059778 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 54059824 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 54060154 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 54060467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54060538 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 54060609 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54060679 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54060986 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54061085 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 54061206 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 54061276 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 54061363 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 54061406 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54061442 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 54061464 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54061511 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 54061646 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54061674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54061835 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 54062072 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 54062224 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54062483 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 54063200 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 54067629 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 54067708 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 54067731 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 54067862 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 54067880 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 54067988 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 54068116 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 54068189 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 54068244 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 54068578 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 54068590 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54068600 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 54069361 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 54069525 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 54069587 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54069817 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 54069819 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 54069971 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 54070104 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 54070566 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 54070602 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 54070720 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 54070842 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54071007 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 54071085 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 54071600 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 54071609 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 54071696 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 54071772 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 54071821 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 54071852 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 54071883 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 54071992 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 54072096 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 54072126 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 54072188 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 54072236 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 54072336 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 54072343 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 54072418 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 54072434 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 54072472 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 54072474 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 54072488 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 54072493 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 54072599 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 54072638 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54072738 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 54072952 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 54072979 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 54073041 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 54073135 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 54073174 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 54073255 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 54073839 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54074274 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54074493 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54074726 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54074736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54074747 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54074753 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54074995 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 54075282 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 54075744 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54076347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54076678 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54076765 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54076786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54076803 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54076805 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54077065 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54077106 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54077814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54077894 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54078239 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 54078295 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54078369 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 54078617 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54079044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54079213 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 54079227 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 54079242 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 54079318 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54079356 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54079613 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 54079633 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 54079729 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 54079855 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 54079899 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 54079954 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 54079981 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 54080710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54080800 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 54080901 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 54081082 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 54081159 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 54081224 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 54081263 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54081358 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 54081901 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54081984 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 54082029 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 54082129 A C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 54082191 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 54082297 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 54082298 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 54082311 A C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 54082344 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 54082396 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54082458 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 54082622 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54082712 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 54082715 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54082940 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54082952 A C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 54083044 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 54083143 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 54083394 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 54083492 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 54083616 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 54084189 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 54084341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54084507 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 54084800 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54084826 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54084854 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54084925 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54084951 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54084961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54084997 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54085384 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54085520 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 54085943 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 54086075 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 54086152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54086264 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 54088836 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 54090039 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54090213 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 54090231 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54091324 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 54091540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54092058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54092313 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 54092457 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 54093125 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 54093138 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 54093227 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 54093243 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 54093328 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 54093375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54093521 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 54093526 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 54093544 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 54093588 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 54094145 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 54094259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54094658 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 54094728 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54094733 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 54094747 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 54094797 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 54095976 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 54096031 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 54096070 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 54096585 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 54096594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54096615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54096658 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54096822 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 54096920 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54097243 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54097257 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54097459 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54097475 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54097518 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54097692 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 54097718 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 54097737 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 54097744 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 16 12 6 4 4 3 54097779 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 54097782 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 3 54097791 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 54097794 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 54097844 C A Y N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 3 54098071 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 54098076 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 54098303 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 54098519 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 54098646 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54098793 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 54098794 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 54098828 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 54098863 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54098900 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 54099203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54099223 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 54099374 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 54099422 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54099423 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 54099437 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54099590 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 54099859 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54099920 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54099935 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54100810 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 3 54101058 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54101059 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54101081 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54101189 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54101211 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54101232 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54101344 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54101409 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54101438 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 54101576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54102111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54102650 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54102803 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 54102909 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54102933 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 54102959 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54103153 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54103503 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54103525 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 54103575 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54103710 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54104300 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54104370 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 54104376 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 54105042 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 54105068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54107998 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54108348 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 54108360 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54109092 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54109396 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 54109624 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54109746 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 54109843 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 54109880 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 54109923 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 54109971 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 54110045 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 54110286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54110295 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 54110616 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 54110718 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 54110731 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 54110744 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 54110813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54110875 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 54110965 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 54111139 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 54111178 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54111200 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54111213 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 54111253 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 54111261 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 54111269 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 54111274 G C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 54111495 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54111595 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 54111740 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 54112191 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 54112203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54112206 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54112243 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 54112355 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 54112398 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54112722 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54112752 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 54112787 T A N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 54112986 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 54113286 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 54113297 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 54113477 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 54113548 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 54113578 T G N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 54113653 A C N N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 9 9 3 3 3 3 54113666 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 54113940 T C N Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.5 0.125 0.375 9 7 4 1 3 3 54114013 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 54114088 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 54114109 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 54114317 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 54114414 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 54114713 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 54114866 G C N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 3 54115338 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 54115421 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 54115495 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 54115524 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 54115565 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 54115579 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 54115737 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 54115764 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 54115848 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 54115931 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 54116024 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 54116093 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 54116117 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 54116131 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 54116262 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 54116296 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 54116318 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 54116414 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 54116642 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 54116683 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 54116684 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 54116714 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 54117152 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 54117256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54117286 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 54117504 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 54117533 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 54117549 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 54117678 G A N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 3 54117996 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 54118142 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 54118457 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 54118818 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 54118862 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 54118878 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 54118979 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 54119032 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54119075 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 54119133 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 54119235 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 54119262 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 54119343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54120018 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 54120095 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54120268 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 54120320 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 54120361 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54120463 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 54120504 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 54120517 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 54120614 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 54120641 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 54120808 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54120870 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54121083 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54121137 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 54121193 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 54121204 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 54121259 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 54121343 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 54121997 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54122051 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54122129 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 54122232 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54122247 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54122280 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 54122625 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 54122642 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 54122724 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54122736 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 54122748 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54122754 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 54122771 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54122829 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 54122884 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54123135 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 54123145 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 54123300 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54123346 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 54123357 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 54123379 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 54123407 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 54123479 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 54123491 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 54123500 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 54123681 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 54123877 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 54123880 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 54123937 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54124540 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 54124697 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 54124776 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 54124818 C A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 54125488 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 54125519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54126795 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 54127245 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 54129155 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 54129880 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 54130016 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 54130025 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 54130042 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 54130098 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 54130287 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 54130288 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 54130315 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54132121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54132236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54132451 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 54132955 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 54133155 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54134828 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 54135199 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 54138190 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54138550 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 54138703 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 54138777 C T Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.0625 0.9375 0 17 15 1 15 0 3 54138819 G A Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0 0.933333333333333 0.0666666666666667 14 16 0 14 1 3 54138826 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54138922 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 54139057 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 54139060 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 54139114 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 54139283 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 54139323 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54139416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54139431 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 54139528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54139555 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54139623 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54139759 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54139776 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 54139839 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 54140293 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 54140731 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 54140823 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 54140830 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54140849 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 54140951 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 54140973 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 54140987 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54141069 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54141074 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54141102 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54141165 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 54141240 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54141314 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54141344 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 54142064 T C N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 15 9 6 3 3 3 54142174 G T N N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 3 54142320 C T N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.363636363636364 0.272727272727273 0.363636363636364 11 11 4 3 4 3 54142409 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 54142561 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 54142873 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 54142918 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 54142931 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 54142986 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 54143031 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 54143056 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54143079 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 54143192 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 54143330 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 54143332 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 54143367 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 54143415 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 54143598 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 54143723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54143781 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 54143901 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 54144146 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 54144276 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 54144451 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 54144458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54144664 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 54144695 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 54144709 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 54144725 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 54144857 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 54145140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54145170 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 54145482 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54145548 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54145782 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 54147018 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 54147381 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 54147603 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 54147780 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54148218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54148266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54148292 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54148345 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 54148375 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54148440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54148467 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54148507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54148539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54148613 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54149090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54149434 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54152061 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54152261 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 54152284 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 54152829 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54153203 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54153490 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54153860 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54155116 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54155126 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 54155268 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54155627 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54155661 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54155701 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54156171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54157438 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54157691 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54158602 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54158740 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54160286 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 54161167 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54161888 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54163256 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54164470 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 3 54166012 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 54166700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54166833 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54167295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54168029 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 54168287 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 54168470 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 54168751 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54169199 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54169651 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54169691 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54169692 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54169734 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54169913 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54171033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54171405 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 54172971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54175277 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54175285 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 54175623 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 54175644 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 54175711 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 54175722 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 54175747 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54175751 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54175862 T A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 54175966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54175978 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 54176253 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 54176347 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 54176407 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 54176453 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54176466 A T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 54176496 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 54176571 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 54176573 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 54176660 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 54177090 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 54177135 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 54177239 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 54177240 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 54177513 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 54177600 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 54178086 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 54178097 T G N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 54178140 T C Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 3 54178305 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 54178443 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 54178459 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 54178864 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 54179427 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54179827 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 54180285 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 54180590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54181088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54182651 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54183312 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 54183522 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 54183579 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 54183650 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 54183963 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 54184231 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 54184777 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 54184892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54184916 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 54185704 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54187524 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54189155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54189897 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54189939 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54192215 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54192698 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 54194651 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 54195949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54196387 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 54196457 C G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 54196514 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 54196540 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 54196552 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 54196671 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 54196689 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 54196884 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 54197124 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 54197277 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 54197330 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 54197543 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 3 54197551 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 54197988 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 54198274 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 54198286 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 54198384 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 54198407 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 54198458 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 54198495 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 54198596 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 54198728 C G Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 54199037 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 54199077 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 54199311 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 54199538 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 54199598 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 54201667 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 54201756 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 54202088 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 54204682 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 54204867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54207087 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54208700 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54208821 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54209446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54209531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54211820 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54212254 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54214762 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54214779 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54215379 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54216380 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54219049 G T Y N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 3 54220922 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54221908 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 54222562 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 54222715 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 54223053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54224049 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 54224443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54224497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54224501 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54227093 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54228164 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 54228351 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54228418 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 54228688 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 54228726 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 54228804 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 54228917 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 54229094 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 54229264 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 54229552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54229578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54229914 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 54230163 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54230201 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 54230273 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54230297 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54230651 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.0625 0.9375 0 17 15 1 15 0 3 54230908 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 54231170 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54231308 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 54231326 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 54231332 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 54231337 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 54231351 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54231395 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 54231399 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 54231432 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 54231601 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54232312 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54232354 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54232903 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54232921 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54233018 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54233113 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54233290 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 54233373 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54233474 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54233577 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 54233588 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54233840 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54233852 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54233853 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54234474 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54235339 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.5 0.142857142857143 0.357142857142857 16 12 7 2 5 3 54235824 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 54235930 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 54235954 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 54236919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54237010 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54237035 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54238273 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54238296 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54238701 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 54238908 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54238990 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54239131 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54239170 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54239370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54240744 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 54240876 G T N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 54240986 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 54240996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54241031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54241230 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54241401 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54241795 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54241865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54241874 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54242024 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54242070 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54242153 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 54242155 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54242177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54242443 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 54242868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54242877 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54243010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54244693 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54244694 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54244717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54244780 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54245900 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 54245932 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 54245952 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 54246122 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 54246484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54246489 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54246744 C T Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 54246790 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 54247254 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 54247262 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54247351 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 54247352 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54247393 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 54247500 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 54247544 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54248123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54248272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54248336 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54248349 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 54248374 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54248680 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54249187 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 54249329 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 54249362 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54249546 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 54249548 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 54249593 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54249603 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54249669 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 54249720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54249938 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 54250085 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54250824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54250992 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 54251077 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54251156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54251165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54251183 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 54251263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54251609 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54251850 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 54252841 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54253093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54253446 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54254768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54254828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54254851 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54255291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54255352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54255383 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54255580 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 54255625 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 54255736 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 54255832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54256134 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 54256222 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 54256488 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 54256498 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54256543 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54256654 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54256819 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 54257276 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54257403 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54257453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54258414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54258711 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54260930 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54264300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54264678 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54265487 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54265754 T C N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 54266083 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54266833 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 54267264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54267291 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 54267389 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54267495 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 54267502 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 54267523 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 54268029 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54268345 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 54268696 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 54268753 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 54268755 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54268916 C T N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 54269276 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54269510 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54269730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54269798 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54269918 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 54270145 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54270146 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54270564 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54270576 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54270622 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54270660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54270762 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54270769 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54270822 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 54270848 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 54270904 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54270937 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 54270992 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 54271291 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54271585 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 54271655 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 54271928 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 54272271 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 54272342 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54272366 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 54272434 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 54273101 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 54273566 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 54274040 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 54274179 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 54274431 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 54274502 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 54274688 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 54274721 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 54274724 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 54275470 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 54275616 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 54275656 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54275741 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 54275973 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54276022 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 54276054 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 54276191 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 54276716 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 54277163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54277204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54277839 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54277963 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 54278273 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 54278467 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54278861 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 54281390 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 54283334 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54286924 T C Y Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0 0.8 0.2 4 6 0 4 1 3 54287028 A C Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 54287993 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 54288007 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 54288054 G A Y Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.0909090909090909 0.727272727272727 0.181818181818182 10 12 1 8 2 3 54290788 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54290853 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 54292418 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 54294710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54295099 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54295651 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54295672 A T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 54295863 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54295871 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 54296512 A C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 54296719 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 54297467 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 54297713 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 54297733 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 54297741 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 54297957 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 54297985 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 54298209 A G Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 54299393 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 54299409 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54299564 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 54299600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54299655 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 54299741 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 54299786 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54299834 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 54299944 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 54300041 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 54300132 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 54300230 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 54300361 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 54300401 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 54300437 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 54300513 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 54300592 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 54300702 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 54300846 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 54300918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54301581 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 54302069 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 54302265 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54302331 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 54302403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54302495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54302499 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54302530 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 54302596 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 54302718 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 54302807 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 54302845 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 54302868 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54302961 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 54303073 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 54303089 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54303172 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 54303206 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 54303214 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54303362 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 54303394 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 54303413 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 54303433 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 54303442 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 54303468 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 54303477 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 54303953 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 54304120 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 54304204 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 54304447 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 54304448 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 54304970 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 54305283 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 54305659 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 54305867 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 54305881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54305950 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 54306014 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 54306039 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54306292 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 54306391 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 54306493 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 54306560 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 54306637 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 54306725 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 54306765 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 54306770 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 54306787 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 54306800 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 54306849 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54307514 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54307903 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54308020 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 54308134 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 54308206 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54308241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54308275 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 54308352 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 54308353 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54308443 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 54308545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54308781 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 54308809 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 54308912 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 54309049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54309194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54309558 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 54309780 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54309810 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54309962 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54309976 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54310149 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 54310432 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 54310514 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 54310845 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54311032 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 54311144 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 54311168 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 54311278 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 54311312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54311358 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 54311425 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 54311464 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 54311468 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 54311482 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 54311655 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 54311937 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54311985 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 54311998 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 54312094 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 54312133 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 54312139 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 54312181 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 54312321 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 54312382 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54312787 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 54312858 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 54312972 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 54313932 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54313939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54313980 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 54314090 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54314401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54314433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54314526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54314560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54315313 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 54315406 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 54315505 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54315583 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 54315606 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 54315616 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54315646 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 54315658 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54315868 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 54315895 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 54315918 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 54315958 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54316266 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54316449 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54316497 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54316501 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54316513 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54316542 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54316934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54317007 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54317127 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 54317195 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 54317226 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 54317345 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 54317444 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 54317763 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 54317855 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54317858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54317866 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54318209 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54318228 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54318235 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54318309 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 54318410 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54318655 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54318666 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54318699 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54318709 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54318749 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 54318750 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54318827 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54318928 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 54319074 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 54319256 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54319282 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 54319539 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 54319799 T C N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.454545454545455 0.454545454545455 0.0909090909090909 15 7 5 5 1 3 54319915 T A N N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.454545454545455 0.454545454545455 0.0909090909090909 15 7 5 5 1 3 54319941 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 3 54320193 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 54320250 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 54320299 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 54320404 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54320625 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 54320730 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 54320806 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54321072 C A Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 54321193 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 54321219 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 54321281 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 54321411 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 54321575 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 54321618 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54321649 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54321689 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54321779 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54321781 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54321809 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 54321859 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 54321908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54321941 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54322018 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 54322052 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54322527 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 54322648 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54322869 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54323645 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54323708 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54323770 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 54324047 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 54324253 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 54324318 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 54324379 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 54324382 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 54324460 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54324763 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54324777 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54324799 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54324994 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 54325296 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54325617 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 54326409 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54327003 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54328112 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 54328240 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54328334 A T N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 54328352 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 54328428 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54328577 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54328653 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 54328810 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 54329157 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54329177 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 54329600 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54329641 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 54329728 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 54329753 G A Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 54329783 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54330001 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54330227 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 54330228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54330417 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 54330450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54330746 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54330870 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54331061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54331234 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 54331514 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54331915 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54332386 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 54332784 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 54333075 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54333525 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 54333687 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54334021 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54334774 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54334819 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54334820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54335861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54336138 G A N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 54336398 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 54336515 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 54337041 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54338258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54338306 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54339520 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54340938 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54341191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54341786 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54341846 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54341891 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54341979 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54342028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54342897 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54342899 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 54343100 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54343235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54343854 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54343930 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 54343943 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 54343970 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 54343997 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54344135 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 54344182 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54344347 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 54344488 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54344931 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 54344952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54347499 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54347853 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 54347878 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 54347901 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 54347976 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54347992 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54347995 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54348043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54348118 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54348226 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 54348522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54348627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54348815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54349594 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 54351003 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 54351845 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54352474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54354843 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54354869 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54354895 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54354959 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54354976 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 54356403 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54356778 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 54356985 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54357055 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54357113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54357120 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 54357190 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54357208 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 54357228 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54357296 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 54357336 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 54357337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54357358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54357449 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 54357967 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 54357976 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54359576 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54360503 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 54361581 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 54361856 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54361883 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54361886 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54361931 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54361933 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54362061 A G N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 3 54362077 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 54362092 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 54362095 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 54362104 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 54362119 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 54362172 G T N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 8 16 0 8 4 3 54362248 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 54362400 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 54362488 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 54362518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54362519 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54362539 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 54362646 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 54362962 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 54362980 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 54362993 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 54364130 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54364275 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 54364582 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54365257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54365853 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 54366281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54368092 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54368537 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 54368544 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 54368568 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54368624 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 54368693 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54369468 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54369550 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 54369735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54369883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54369905 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54369955 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 54370151 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 54370170 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 54370269 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54370386 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 54370407 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 54370442 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 54370463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54370547 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 54370776 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 54370883 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 54371071 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54371145 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 54371227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54371301 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 54371333 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 54371403 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 54371745 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54371755 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54371877 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 54371880 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 54371936 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 54371971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54372113 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54372219 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54372230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54372234 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 54372357 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54372359 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54372530 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 54372593 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 54372627 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 54372695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54372752 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54373039 T G N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 3 54373164 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54373803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54373854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54374143 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54374208 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 54374228 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 54374239 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54374370 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54374392 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 54374402 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 54374430 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 54374448 C A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 54374489 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 54374515 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54374569 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 54374688 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 54374708 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 54374723 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 54374725 C T Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 54374739 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 54374748 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 54374785 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54374822 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 54374830 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54374855 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 54374938 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 54374961 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54374984 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 54375054 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 54375145 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 54375193 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 54375242 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 54375255 G C N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 3 54375259 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 3 54375737 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 54375807 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 54375943 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54375948 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54376019 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 54376385 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 54376396 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 54376748 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 54377069 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 54377122 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 54377259 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 54377374 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 54377432 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 54377458 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 54377465 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 54377501 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 54377551 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 54377569 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 54377601 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 54377692 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 54377696 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 54378337 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 54378392 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 54378513 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54378637 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 54378689 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 54378817 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54378909 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 54378984 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 54379052 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54379339 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 3 54379355 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 54379414 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54379522 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54379547 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54379715 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54379947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54379966 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54380046 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 54380821 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 54380832 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54381218 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54381389 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54381391 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54381411 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54381534 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 54381557 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54383454 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54384517 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54384567 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54384755 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54384781 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.105263157894737 0.789473684210526 0.105263157894737 19 19 2 15 2 3 54385455 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 54386828 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54386842 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 54386855 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54387190 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54389152 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 54390360 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 54390495 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 54390613 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 54390619 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 54390763 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 54390830 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54391073 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54391398 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 54391586 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54391598 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54391614 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 54391652 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 54391916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54391935 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 54392208 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 54392234 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 54392288 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54392444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54392502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54392535 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54392536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54392554 C G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 54392556 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 54392577 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 54392603 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 54392681 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54392729 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 54392819 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 54392843 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54392847 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 54392887 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 54392912 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 54393128 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 54393262 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 54393275 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 54393288 T C N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 54393331 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 54393406 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54393442 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 54393559 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54393628 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 54393778 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 54393933 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54394623 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54394848 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54394858 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 54394900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54394943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54395101 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 54395162 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54395198 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54395217 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 54395396 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 54395412 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 54395413 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 54395581 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 54395705 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 54395735 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54395758 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54395759 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54395807 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54395983 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 54396076 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 54396276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54396391 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 54396420 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 54396610 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 54396710 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 54396726 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 54396747 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 54396755 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 54396798 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 54396810 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 54396818 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 54397023 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54397029 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54397047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54397104 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 54397125 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54397145 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 54397146 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 54397215 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54397325 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 54397328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54397381 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 54397402 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 54397406 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54397427 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 54397453 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 54397462 G C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 54397521 A T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 3 54397564 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 54397574 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 54397615 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 54397722 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54397727 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 54397748 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 54397757 C A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 54397774 T A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 54397850 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 54397858 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54397901 A G N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 54398163 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54398221 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 54398224 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54398237 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 54398276 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54398286 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54398599 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54398601 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54398679 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54398713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54399039 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54399052 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54399188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54399208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54399491 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54399596 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 54399776 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54399842 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54399876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54399933 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 54399979 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 54400030 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 54400061 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 54400072 T C N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 54400116 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 54400135 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 54400215 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54401189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54401478 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 54401620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54401716 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 54402218 G C Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 54402292 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54402300 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 54402326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54402717 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 54402847 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 54402896 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54403149 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 54403202 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 54403222 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54403262 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54403278 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 54403346 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 54403489 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54403534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54403788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54403903 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54403965 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 54404189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54404321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54404325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54404439 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 54404564 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 54404718 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 54404874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54405094 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 54405395 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 54405459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54405509 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54405610 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 54405622 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54405711 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 54405731 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54405918 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54405989 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54405995 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54406155 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54406171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54406245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54406800 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54406816 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 54406836 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 54407042 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 54407044 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 54407096 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 54407437 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 54407453 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 54408463 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54410829 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54411426 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 54411697 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54413845 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54413901 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 54414005 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 54414083 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 54414239 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 54414329 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 54414349 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 54414350 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 54414366 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 54414375 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 3 54414498 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 54414528 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 54414708 A G N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 0.142857142857143 0.214285714285714 20 8 9 2 3 3 54414740 A G N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.571428571428571 0.214285714285714 0.214285714285714 19 9 8 3 3 3 54414972 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 54415583 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 54415790 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 54415828 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 54415843 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 54415899 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 54416394 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 54416441 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 54416476 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 54416909 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 54416947 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 54416948 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 54417311 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 54417355 A G N Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 8 8 2 4 2 3 54417477 T C N Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 3 54417576 G T N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 54417596 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 54417671 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 54417682 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 54417700 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 54417742 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 54417784 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 54418212 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 54418223 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 54418226 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 54418327 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 54418347 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 54418479 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 54418486 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 54418669 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 54418675 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 54418843 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54418910 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 54418926 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 54419121 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 54419148 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 54419255 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 3 54419368 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 54419401 C A N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 54419543 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 54419587 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 54419905 G T N N 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.2 0.8 0 12 8 2 8 0 3 54420565 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54420840 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 54421173 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 54421659 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 54422032 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 54423031 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 54423284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54423579 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 54423627 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54423723 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54423830 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54424055 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 54424201 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54424287 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54424357 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 54424601 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 54424752 T A Y N 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 3 54424783 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 54424854 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 54424986 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 54425036 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 54425062 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 54425132 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 54425142 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 54425327 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 54425342 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 54425355 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 54425397 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54425460 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 54425461 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54425547 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 54425551 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 54425563 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 54425573 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 54425626 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 54425727 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 54425753 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 54425760 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 54425767 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 54425787 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 54425846 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 54425863 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 54425952 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 54425966 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 54425979 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 54425985 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54426164 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 54426166 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 54426248 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 54426275 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54426334 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 54426359 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 54426449 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 54426489 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 54426614 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 54426820 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 54426831 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 54426848 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54426886 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 54426940 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 54426957 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 54427066 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 54427072 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 54427275 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 54427292 G A Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 54427366 A C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 3 54427609 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54427617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54427681 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 54427714 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54428031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54428119 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54428381 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54428388 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54428476 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 54428580 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 54428622 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 54428689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54428710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54428753 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54429112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54429221 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54429250 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54429282 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 54429311 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54429314 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54429433 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54429551 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54429603 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54429803 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54429936 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 54429948 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 54429976 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 54430061 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 54430139 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54430205 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54430263 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54430351 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 54430460 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54430678 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 54430683 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 54430696 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54430742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54430774 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54430880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54430901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54431742 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 54431808 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 54431956 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 54432441 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 54432598 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 54432625 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 54432636 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 54432816 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 54432862 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54433109 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 54433168 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 54433281 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 54433301 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 54433601 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 54434151 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 54434326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54434346 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 54434539 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 54435191 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54435440 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 54435816 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54436152 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54436322 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54439283 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54440223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54440844 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54445011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54445015 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54446116 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54446599 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54447174 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 54448053 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54448514 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 54449513 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 54453546 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 54453610 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 54454254 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54455416 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 54457546 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54457565 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54457588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54457903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54458124 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 54458452 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 54458610 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54459477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54459809 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 54459984 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 54460025 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54460249 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54460695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54460811 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54460822 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54460893 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54461062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54461408 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54461529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54461549 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54461604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54461607 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54461618 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54461619 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54461741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54461742 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54462700 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54463002 C G N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 54463580 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 54463819 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 54463974 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 54464054 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54464205 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 54464206 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 54465039 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 54465630 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 54465753 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54466389 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54467454 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 54468548 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 54468562 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54469315 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54471987 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54473364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54473603 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 54473696 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 54473713 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 54473939 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 54474092 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54474246 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54474257 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54474262 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 54474300 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 54474325 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54474364 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 54474389 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 54474521 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 54474542 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54474576 A C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 54474585 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 54474679 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 54474849 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 54474857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54474991 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 54475080 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54475894 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54475938 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 54475939 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 54475979 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 54476016 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 54476054 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 54476203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54476375 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 54476381 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 54476386 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54476403 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54476412 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 54476713 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54478465 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 54478841 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 54478940 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54478965 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 54479033 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 54479129 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 54479153 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 54479165 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 54479224 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 54479234 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 54480226 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 54481187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54481204 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 54484608 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54485833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54486547 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 54486704 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54486722 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 54487805 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54487914 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54491127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54492227 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54492330 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 54492717 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54493622 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54493751 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 54495389 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54499361 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 54500167 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54500218 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54500433 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54502895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54503076 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 54506126 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54507148 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54507424 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 54507486 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 54507786 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54508173 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54508889 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 54508965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54509375 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54509969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54511925 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54514668 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54516355 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54517903 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54523281 T G N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 54526348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54526824 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54526913 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54527119 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 54527124 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 54527153 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 54529761 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54530356 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 54532686 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54532695 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54533000 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54533960 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54534645 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54534799 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54535755 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54536500 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 54537338 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54538789 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54541312 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54541348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54541863 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54542397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54543043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54543045 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 54543317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54544673 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 54545219 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 54546044 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 54546323 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 54546325 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 54546336 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 54546448 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 54546526 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54547013 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 54547074 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54547153 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 54547166 A C N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 54547167 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 54547239 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 54547934 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 54548297 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0 0.842105263157895 0.157894736842105 16 22 0 16 3 3 54548737 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54548772 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54548780 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54549863 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 54550657 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54550883 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54550894 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 54554141 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 54555864 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54558459 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54561801 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54562086 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 54562168 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 54562174 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 54562369 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54562445 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54562470 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 54562657 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54562809 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 54563116 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 54564481 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 54564578 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 54565987 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54567429 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 54568610 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54569951 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 54570189 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54570213 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 54570528 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 54571004 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54571081 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 54571118 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 54571188 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 54571196 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 54571735 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 54571986 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 54572135 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 54572232 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 54572539 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 54572543 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 54572655 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 54572656 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 54572925 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 54572936 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 54573292 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 54573374 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54573412 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 54573435 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54573629 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54573639 T A N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 54574122 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 54574235 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 54574342 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54574476 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54576497 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 54576508 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 54576606 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 54577212 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 54577538 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 54578930 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 54581189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54581274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54581291 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54581349 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 54581412 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 54581578 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 54581579 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 54581726 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54581736 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54581739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54581775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54581838 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54581839 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54581944 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 54581953 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 54581986 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54582109 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54582122 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54582127 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54582137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54582157 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 54582195 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 54582205 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 54582221 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54582279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54582300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54582577 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 54582616 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 54582671 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54582726 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54582740 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 54582818 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54582822 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 54582869 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54583042 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 54583191 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54583261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54583730 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54583747 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 54583846 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54584018 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54584079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54584157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54584189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54584600 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 54584657 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54584716 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54584753 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 54584879 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 54584927 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 54584969 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 54585161 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 54586054 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54586130 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54586281 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 54587414 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54587435 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54587729 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 54588161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54588165 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54588505 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54588509 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54588518 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54588520 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54588591 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 54588624 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54588887 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 54588894 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 54588966 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54589007 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 54589035 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 54589043 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 54589082 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 54589089 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 54589197 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 54589221 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 54589340 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 54589341 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 54589368 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54589469 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 54589530 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 54589580 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 54589659 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 54589790 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54590434 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 54590586 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54590891 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 54590947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54591002 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 54591014 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 54591134 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 54591267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54591344 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 54591409 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 54591437 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 54591454 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 54591771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54591829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54591861 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 54591919 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 54591937 G C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0 0.722222222222222 0.277777777777778 13 23 0 13 5 3 54592018 T A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 54592117 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 54592138 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54592325 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 54592470 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 54592502 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 54592721 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 54592736 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 54592794 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 54592873 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 54592876 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 54593259 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 54595420 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54596073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54596123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54596195 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 54596777 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 54596861 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 54596900 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54597032 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54597089 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 54597289 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 54597477 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 54597531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54597675 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54597695 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54597727 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54597733 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54597767 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54597787 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 54597857 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54597862 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54597948 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 54597983 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 54598029 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 54599110 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54599919 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 54599926 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 54599981 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 54600146 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 54600194 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 54600614 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 54600995 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 54601035 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54601090 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54601200 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 54601800 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 54601830 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 54601833 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 54601887 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 54602092 T A N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 3 54602093 T G N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 3 54602308 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 54602368 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54602705 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 54602747 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 54602756 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 54602814 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 54602973 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 54603249 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54603369 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54603541 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54603566 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54603580 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54603687 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54603738 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54603766 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54603986 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54604054 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 54604245 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54604260 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 54604306 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 54604477 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54604481 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 54604506 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54604539 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54604551 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54604553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54604643 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54604773 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54604786 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 54604875 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54605331 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54605518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54605550 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54605627 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 54606151 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54606365 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 54606523 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54606671 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 54607033 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54607158 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 54607353 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54607372 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 54607718 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 54607830 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 54607972 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54608036 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54608327 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 54608736 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 54608763 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 54608784 T G N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 3 54608791 A G N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 3 54608795 A T N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 3 54609058 G A N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.25 17 7 8 1 3 3 54609239 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 54609488 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 54609632 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 54609679 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 54609752 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 54609864 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 54610077 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 54610130 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 54610134 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 54610343 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 54610434 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 54610453 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 54610555 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 54610713 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 54610830 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54610927 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54611572 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54611639 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54611676 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54611868 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54611877 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54611906 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54612271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54612291 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 54612338 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 54612373 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54612382 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 54612423 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 54612425 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 54612546 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54612585 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54612591 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54612623 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 54612867 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54612950 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54613685 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 54613852 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 54613870 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 54615672 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 54615675 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 54615842 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 54615957 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 54616017 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 54616127 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54616139 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 54616158 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54616213 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 54616253 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 54616508 G T N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 3 54616581 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 54616636 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54616689 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54616696 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54616726 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 54616732 C T Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 54616744 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 54616785 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 54616825 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54616944 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 54616975 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 54616982 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 54617012 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 54617147 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 54617155 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 54617292 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 54617326 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54617474 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 54617520 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 54617725 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 54617916 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 54617972 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54618101 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54618236 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 54618468 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 54618518 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54618523 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54618542 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54618610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54618676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54619019 G A N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 54619032 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 54619088 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 54619102 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 54619162 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 54619247 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 54619363 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 12 6 5 2 2 3 54619383 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 54619471 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 54619937 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 54619947 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 54620050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54620222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54620310 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54620535 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54620573 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 54620633 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 54621358 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 54621904 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54622226 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54622401 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54622404 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54622970 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54623365 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 54623453 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 54623455 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 54623525 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54623565 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 54623760 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54624099 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 54624800 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 54624826 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 54624847 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54624926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54625077 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 54625110 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 54625219 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 54625292 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 54625306 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 54625520 T C Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 54625974 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 54626152 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 54626534 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 54626759 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 54626794 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 54626825 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 54626844 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 54626849 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 54626921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54626983 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54627187 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 54627877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54631147 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54631162 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 54631454 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54631615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54631748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54632433 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 54633135 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 54633400 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 54633458 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 54633680 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54634274 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 54634302 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 54634325 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 54634433 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 54634435 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 54634550 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 54634562 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 54634656 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 54634783 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 54634943 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 54634983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54635066 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 54635744 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54636135 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 54636169 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54638847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54639812 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 54642386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54642568 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 54642660 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 54642671 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 54642953 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 54643056 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 54643063 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54643125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54645097 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 54645358 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 54645570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54646101 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54648278 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54650089 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54650375 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 54650633 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 54650770 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 54651051 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 54662910 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54663158 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 54663176 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 54663186 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 54663356 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 54663510 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 54663603 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 54663661 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 54663686 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 54663826 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 54663858 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 54663860 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 54663926 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 54664173 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 54664314 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 54664747 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 54664804 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 54664874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54664978 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 54665105 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54665417 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54666110 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 54669134 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54671153 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 54671235 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54671683 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 54672268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54672742 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 54672807 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 54672810 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 54672822 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 54672904 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 54672944 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 54672966 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54672985 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 54673087 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 54673218 A C Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 54673729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54673899 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 54673979 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 54674306 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54674451 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 54674904 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 54674935 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 54674936 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 54675020 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 54675023 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54675247 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 54675253 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 54675332 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 54675370 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54675435 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 54675875 T C Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 54678326 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 54678374 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 54678408 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 54678654 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 54678946 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 54678974 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54679016 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 54679026 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 54679058 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 54679069 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 54679277 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 54679704 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 54679722 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 54679918 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 54679959 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54680171 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 54680286 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 54680303 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 54680429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54680448 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54680858 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54680926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54681167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54681287 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 54681331 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 54681366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54681559 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 54682545 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 54682610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54682650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54682699 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 54682853 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54683247 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54683357 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 54683823 T C Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 54684117 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54685192 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 54685350 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54685701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54685835 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54685865 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54685967 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 54686309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54686508 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 54686512 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54686587 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 54686605 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 54686685 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 54686718 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 54686748 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 54686765 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 54686817 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 54686854 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 54686887 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54687019 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 54687028 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 54687126 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 54687206 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 54687230 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 54687351 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 54687353 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 54687517 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54687662 G C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 54687686 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54688299 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 54689195 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 54689477 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 54691200 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54692077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54694147 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54694417 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54695608 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54696342 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 54696470 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 54696478 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 54696530 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 54696564 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 54696620 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 54696627 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 54696809 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 54696887 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54696893 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 54697022 C G N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 54697027 C T N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 3 54697055 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 54697157 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 54697251 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 54697261 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54697358 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 54697365 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 54697404 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 54697540 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 54697560 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 54697576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54697788 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 54698018 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54698134 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54698524 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54700746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54701155 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54702023 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54702559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54702983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54703067 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54703336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54703996 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 54704206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54704220 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54704818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54705130 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54705774 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54706401 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 54706753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54706854 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54707069 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54707196 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54707217 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54707287 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 54707302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54707387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54707441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54707487 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54707529 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 54707560 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 54707736 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54707895 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 54708019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54708241 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54708309 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 54708400 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 54708425 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 54708458 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 54708463 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 54708742 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 54708832 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 54708981 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 54709046 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 54709233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54709289 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54709366 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 54709459 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54709543 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54709578 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54709603 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54709660 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 54709821 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 54710053 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54710108 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54710171 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54710291 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54710316 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54710614 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 54710615 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 54710681 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54711164 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 54711544 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54711809 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 54711891 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 54712199 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 54712221 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 54712422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54712494 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54712530 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 54712866 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 54714490 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54714685 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54715203 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54715355 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 54715954 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 54716017 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 54716022 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54716034 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 54716224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54716606 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 54716621 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 54717035 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 54717158 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54717264 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 54717297 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 54717319 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 54717396 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 54717497 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 54717573 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54717635 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 54717735 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 54717771 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 54718123 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54718219 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 54718290 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54718394 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54718519 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54718828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54718885 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 54718893 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 54719101 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54719302 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 54719332 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54719344 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 54719426 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54719644 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54720220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54720293 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54721376 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54722858 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54723726 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54726315 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 54726347 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 54726465 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 54726547 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 54726805 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 54726849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54730236 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54731017 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 54732022 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 54733188 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 54733218 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 54733219 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 54733481 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54733596 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 54735886 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54736976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54738303 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54738344 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54738457 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54738774 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 54738799 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 54739033 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54739036 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54739117 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54739185 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54739194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54739296 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54739301 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54739438 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 54739569 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54739636 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 54739648 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 54739707 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 54739884 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54739933 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54740189 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54740228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54740460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54740486 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 54740618 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 54740743 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54740819 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54740851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54740878 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 54740998 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54741323 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 54741543 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 54741685 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 54741756 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 54741762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54741787 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 54742045 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 54742131 T C Y Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 3 54742234 C G Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 54742280 C T Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 54742338 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 54742377 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 54742442 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 54742772 G A Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.3125 0.625 0.0625 20 12 5 10 1 3 54743107 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 54743111 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 54743124 T G Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 54743154 C A Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 54743162 A C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 54743170 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 54743173 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 54743347 G C Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 54743395 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 54743565 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 54743566 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 54743622 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54743820 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54743910 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54744041 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 54744083 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 54744132 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54744164 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54744188 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54744207 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54744236 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 54744245 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 54744300 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54744307 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54744507 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54744598 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54744601 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54744627 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54744659 C A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54744762 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 54744797 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 54744838 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 54744860 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 54744871 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54744877 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54744913 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 54744931 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 54744934 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 54744988 G A N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 54745131 A C N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 54745136 G A N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 54745172 A G N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 54745590 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 54745616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54745625 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 54745708 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 54745728 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 54745730 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 54745745 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 54745798 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 54745855 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54745890 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 54746481 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 54746571 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54746798 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54747007 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54747048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54748113 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54748161 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54748283 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54748613 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54748629 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54749053 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 54749054 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 54749297 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 54749630 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54749797 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54750282 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54750817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54751695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54752372 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 54752375 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 54752888 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 54753751 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 54754154 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 54754406 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 54755166 G C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 54757365 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 54758772 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 54758920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54759155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54759370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54759735 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54760612 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54760763 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54760902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54760972 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 54761112 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 54761471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54762955 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54763721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54764131 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54765302 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 54765674 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54765804 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 54766014 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54766300 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 54766663 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 54766991 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54767111 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54768194 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 54768466 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 54768467 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 54768478 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 54768602 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 54768698 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54769003 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 54769161 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54769197 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54769562 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54770053 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 54770159 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54772030 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54772078 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 54773699 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 54773998 T C Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 54774015 C T Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 54774016 A G Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 54774031 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 54774040 G A Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 54774089 A T N N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 54774096 A G Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 54774108 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 3 54774114 A G Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 54774393 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54774480 C A Y N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 54774489 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0 0.733333333333333 0.266666666666667 11 19 0 11 4 3 54774496 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 54775575 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 54775603 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 54776002 A T Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 54776067 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 54776600 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54776636 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54776663 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54776751 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54776809 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54776942 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 54776978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54777293 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54777308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54777395 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54777551 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54777565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54777635 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54777731 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 54777790 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 54777851 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 54778066 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 54778124 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54778162 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 54778199 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54778266 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54778277 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 54778307 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 54778578 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 54778621 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 54778637 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 54778715 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 54778735 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 54778759 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54778821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54778880 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54779022 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54779133 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 54779143 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54779175 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 54779227 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54779250 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54779276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54779341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54779354 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 54779994 A T Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 54780308 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 54780331 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 54780345 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 54780671 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 54780689 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 54780875 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54780894 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54780901 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54781012 A T Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 54781037 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 54781045 T G Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 54781080 T C Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 54781081 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 54781183 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54781223 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54781374 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 54781396 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 54781560 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 54781909 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 54782232 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 54782300 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 54782994 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 54783075 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 54783121 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 54783302 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 54783823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54783916 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 54783953 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 54784258 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 54784279 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 54784345 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 54784380 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54784648 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 54784888 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 54785110 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54785391 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54785925 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 54785938 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 54785990 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54786081 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 54786106 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 54786132 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 54786605 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 54786724 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54786924 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 54787145 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 54787147 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 54787585 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 54787731 C G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 54788022 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 54788229 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54788697 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 54788907 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 54788958 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 54788992 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54789254 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54789349 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 54789547 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 54789781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54789820 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 54790411 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 54790470 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 54790509 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 54790524 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 54790550 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 54790582 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 54791141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54791179 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54791281 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 54791583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54791603 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 54791663 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 54791905 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54791925 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 54792102 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54792131 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54792213 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54792817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54793112 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 54793158 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 54793167 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 54793218 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54793289 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 54793748 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54793990 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54794001 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54794744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54795805 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54795827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54795887 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54795915 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54796192 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54797141 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54797160 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 54797227 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54797299 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54798248 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 54798281 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 54798321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54798616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54798837 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 54798886 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 54798890 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 54798990 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 54799024 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 54799147 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54799274 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 54799639 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 54799712 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 54799797 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 54799879 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 54800105 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 54800279 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 54800294 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 54800302 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.214285714285714 0.142857142857143 0.642857142857143 8 20 3 2 9 3 54800315 G C N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.230769230769231 0.153846153846154 0.615384615384615 8 18 3 2 8 3 54800319 C T N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.272727272727273 0.181818181818182 0.545454545454545 8 14 3 2 6 3 54801315 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 54801320 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 54801530 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 54801578 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 54801594 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 54801692 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 54801705 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 54801740 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 54801779 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 54802752 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 54803314 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 54803457 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 54803474 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54803500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54804061 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54804105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54804130 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54804157 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54804450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54804577 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 54804626 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 54804744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54804978 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54805377 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 54805560 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 54805628 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 54805700 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 54805957 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 54806055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54806700 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54806701 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54806801 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54807020 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54807213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54807288 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54807846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54809061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54809454 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54810149 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54814283 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54815590 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 54815773 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54815990 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54816494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54816617 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54816754 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54816861 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54816912 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54817114 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54817254 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54817324 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54817641 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 54817693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54817699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54817993 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54818145 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 54818597 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54818836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54819435 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54819641 G A Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 54819642 A G Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 54819672 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 54819683 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 54819926 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 54820086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54820169 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 54820214 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 54820342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54820449 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 54820667 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54820759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54820883 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 54820939 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 54821401 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54821918 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 54823768 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54823782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54825381 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 54825418 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54825574 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 54825592 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54825724 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54826190 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54826198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54826380 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 54826784 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54826875 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54826945 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54827267 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54828497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54828518 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54828952 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 54828991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54829031 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 54829097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54829175 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54829228 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54829247 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54829271 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54829336 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54829696 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 54829718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54830456 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54830578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54830700 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54830831 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 54830874 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54830944 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 54831423 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54831468 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54831502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54831562 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54831564 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54831633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54831634 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54832118 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54832418 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54832438 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54832725 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54832781 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54832834 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54832909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54832916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54833214 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 54833226 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 54833283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54833335 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54833444 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54833485 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54833597 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 54833718 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 54833794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54833826 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 54833829 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54833869 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 54833881 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54833947 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54834006 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54834166 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54834171 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 54834178 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 54834213 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 54834240 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54834287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54834362 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54834373 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54834857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54835477 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 54835892 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 54835935 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54836295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54836494 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54836829 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54836835 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54836890 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54836894 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54836902 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54837346 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 54837843 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54838416 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 54838459 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 54838494 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 54838560 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 54838666 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 54838675 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54838692 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 54838702 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 54839077 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 54839653 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54840979 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54841027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54842625 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 54843981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54845114 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54845308 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 54845497 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54845616 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54846335 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54846555 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 54846862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54847017 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 54847548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54847641 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54847643 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 54847744 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 54847758 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 54847806 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54847877 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 54847933 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 54848080 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 54848102 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 54848257 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 54848753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54848834 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54849069 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 54849120 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 54849198 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 54849244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54849642 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54849830 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 54850126 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 54850236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54850420 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54850426 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 54850473 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 54850595 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54850615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54851209 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 54851270 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 54851294 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 54851306 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54851460 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54851480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54851533 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 54851562 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54851587 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54851589 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54851602 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 54851623 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54851686 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54851781 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 54851790 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 54851910 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 54852223 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 54852239 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 54852390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54852468 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54852600 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 54852878 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54853263 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 54853465 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 54853873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54853943 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 54855409 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54857499 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 54857615 C G N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 54857619 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 54857632 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54857636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54857678 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54857717 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54858672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54859181 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 54859323 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54859379 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54859642 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54860088 G C N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 3 54860575 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 54860585 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 54861628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54861925 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 54862021 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 54862056 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 54862212 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 54862328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54862679 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54862951 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54863111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54863649 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 54863759 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 54863765 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 54863837 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 54864181 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54864301 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 54864950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54865051 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54865079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54865235 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 54865609 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54865686 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 54865792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54866015 G C N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 54866637 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 54866683 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 54867019 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54867056 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54867166 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 54867674 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 54868549 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54868766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54868857 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54870415 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54870424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54872240 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 54872686 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54872688 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 54873735 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54873796 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 54873885 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54873961 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 54873980 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54874197 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54874215 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54874611 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 54875139 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 54875917 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 54876062 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 54876515 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54876679 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 54877090 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 54877186 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 54877992 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54878472 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 54878754 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 54879191 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 54879265 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 54879458 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 54879564 A C Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 54879648 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 54879687 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 54879773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54879851 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54879868 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54880433 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 54880440 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 54880455 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 54880538 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 54880904 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 54880918 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54881207 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 54881219 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54881291 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 54881298 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 54881425 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 54881448 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 54881452 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 54881526 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 54881563 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54881583 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 54881592 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 54881621 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54881779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54881873 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 54881964 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 54882034 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54882069 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54882104 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54882124 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54882174 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54882356 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 54882457 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 54882495 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 54882501 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 54882521 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 54882565 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 54882934 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54883122 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 54883259 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 54883294 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 54883340 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 54883400 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 54883544 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54884122 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 54884166 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 54884171 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 54884228 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 54884828 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 54885741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54886095 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 54888797 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 54889221 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54889416 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 54889864 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 54890185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54890237 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 54890343 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54890397 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 54890405 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 54890447 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 54890470 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 54890483 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 54890618 C T N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 54890660 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54890703 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 54891122 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 54891347 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54891838 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54891847 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 54892700 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 54892806 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54892946 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54893005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54893071 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 54893477 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 54893577 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54893643 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54893775 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54894035 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54894576 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 54894595 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54894622 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 54894640 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 54894678 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 54894762 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 54894816 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 54894871 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 54894911 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 54894951 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 54895167 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 54895204 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 54895668 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 54895759 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 54895937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54896295 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 54896343 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 54896456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54897545 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54898725 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54899734 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 54900647 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54901130 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 54901541 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54901618 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 54901661 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54902208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54902422 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 54902678 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54903128 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 54903322 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54903477 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 54903585 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 54903880 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 54904050 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 54904076 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 54904419 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 54904445 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 54904489 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 54904494 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 54904829 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 54904882 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 54905062 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 54905113 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 54905164 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 54905216 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 54905239 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 54905354 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 54905576 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 54905687 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 54906610 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 54906740 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 54906786 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 54906796 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54906931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54906938 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 54906980 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 54907020 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 54907228 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 54907593 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 54907637 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 54908375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54910007 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54912219 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54912232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54912320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54912869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54913058 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54913498 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54913858 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 54914061 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54915407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54915495 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54915900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54916778 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54916920 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 54917897 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54918945 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54919004 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 54919643 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54919671 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54921953 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 54923901 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54924071 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54924100 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54924111 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54924207 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 54924208 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 54924250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54924815 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54924838 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 54924892 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 54924940 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 54925030 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54925296 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 54926027 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 54926689 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 3 54928343 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 54935112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54937434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54938199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54938377 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54941850 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 54942010 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 54942091 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 54942228 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 54942308 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 54942331 A T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 54942703 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 54942748 C T N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 54942933 A G N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 54942945 C A N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.5 0.416666666666667 8 16 1 6 5 3 54942949 C T Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 54943065 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54943377 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 54943646 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 54943685 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 54943704 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 54943836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54943843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54943881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54943930 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54943993 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54944011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54944132 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54944168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54944465 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54945007 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 54945028 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54945041 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54945077 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 54945100 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 54945101 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 54945142 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 54945148 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 54945687 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54945697 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54945762 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54946048 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54946169 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 54946199 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 54946250 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 54946257 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 54946423 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 54946456 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 54946457 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 54946520 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 54946527 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54946565 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 54946791 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54946914 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 54946923 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 54946926 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 54946950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54946951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54946961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54946964 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 54947161 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54947216 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54947231 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54947470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54947557 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54947704 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 54947832 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54947892 C G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 54948017 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 54948121 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 54948271 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54948686 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54948737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54948746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54949113 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54949136 G A Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 54949534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54949539 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 54949609 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54949659 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 54949900 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54950055 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54950094 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54950255 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 54950404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54950744 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 54950860 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 54951058 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54951094 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 54951198 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54952835 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54953688 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 54953729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54954902 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54954945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54956461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54957873 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 54957940 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.2 0.8 0 24 16 4 16 0 3 54958003 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 54958018 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 54958227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54958294 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 54958454 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 54958641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54958661 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 54959202 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 54959208 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 54959223 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 54959227 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 54959234 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 54959249 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 54959348 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 54959560 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54959657 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54959692 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 54959726 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54959750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54960274 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54960377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54960384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54961528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54961561 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 54962558 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 54962678 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54962806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54962873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54963675 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54963727 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 54963816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54964296 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54964919 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54965013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54965053 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 54965392 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54965816 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 54965827 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 54966077 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54966105 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 54966688 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 54966926 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 54966946 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 54967036 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 54967380 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 54968073 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54968498 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54968603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54968905 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 54968954 A T Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 54969267 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 54969290 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 54969291 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 54969336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54969433 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 54969595 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 54969600 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 54969607 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 54969628 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 54969644 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 54969693 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 54969819 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 54969822 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 54969863 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 54969869 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 54969945 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 54970016 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 54970034 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 54970271 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 54970425 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 54970436 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 54970448 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 54970451 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 54970576 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 54970615 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 54972085 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 54972191 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54973215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54974372 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54974460 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54974752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54974819 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54975902 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 54976152 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 54976714 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 54977108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54977203 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 54977779 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 54978078 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54981441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54981633 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54981897 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54983491 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54984581 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54986565 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 54986595 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 54987167 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 54987199 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54987222 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 54987333 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 54987494 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 54987767 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54987810 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54987930 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 54987948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54987969 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54988168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54988614 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54989994 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54991057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54991332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54991422 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 54991760 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 54991787 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 54991792 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 54991820 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54991831 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54991887 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 54991889 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 54991911 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 54991921 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 54991945 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 54992085 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 54992219 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54992450 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 54992458 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54992543 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 54992681 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 54992757 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 54992912 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 54992959 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 54993219 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 54993412 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 54993578 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 54993635 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 54993865 G C Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 54993923 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 54993948 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 54994033 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 54994121 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 54994370 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 54994841 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 54994846 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 54994887 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 54995165 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 54995169 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 54995305 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 54995365 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 54995407 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 54995506 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 54995851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54995930 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 54995950 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 54995997 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 54995999 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 54996097 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 54996135 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 54996204 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 54996299 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 54996656 G T N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 54996844 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 54997144 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 54997475 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 54997652 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 54997699 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 54998154 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 54998163 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54998168 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 54998227 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 54998483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54998531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54998866 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 54999259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55000454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55002197 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 55002683 C T Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 3 55002775 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 55003521 C G Y N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 55003843 G A Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 55004577 C T Y Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 3 55004760 G A Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 55006656 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 55008037 C A Y N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 0.0714285714285714 15 13 2 11 1 3 55009241 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55010256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55010914 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55014170 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55014536 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55014847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55015047 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55015237 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55016533 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55017646 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 55018283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55018602 A T Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 55018738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55018788 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55019118 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 55019396 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55019515 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 55019580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55019630 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55019687 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 55019717 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55019741 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55019780 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55019815 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55019909 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55020029 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 55020066 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 55020088 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 55020557 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55020606 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 55020781 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 55021040 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 55021623 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 55021706 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 55021718 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 55021756 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 55021856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55021866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55021913 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 55021980 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 55022001 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55022342 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 55022344 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 55022460 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55022464 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55022645 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 55022693 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 55022695 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 55022715 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55022747 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 55022767 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 55023347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55023526 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 55023555 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 55024618 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 55024707 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 55024896 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55024923 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55025190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55025209 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55025432 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55025511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55025621 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55025644 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55025721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55025742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55026128 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 55027305 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 55027360 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 55027397 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 55027475 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 55027546 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55027582 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55027593 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55028126 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 55028328 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 55028538 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55028556 T G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 55028893 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55029550 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 55029606 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 55029694 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 55029765 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55029976 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 55030027 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 55030045 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55030464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55031424 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55031542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55033923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55035342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55035859 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55040338 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55041010 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 55044804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55044891 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 55044956 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 55044981 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 55045144 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 55045599 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 55045964 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 55046085 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55046093 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 55047511 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 55047722 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 55047733 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 55047766 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55048058 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 55048198 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 55048668 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55048839 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 55048903 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 55049060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55049063 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55049154 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 55049161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55049255 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55049525 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 55049598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55049610 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 55049884 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 55049890 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 55050024 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55050499 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 55050627 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55051219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55051731 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 55051780 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 55052938 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 55053665 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 55053706 G A Y Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.538461538461538 0.153846153846154 0.307692307692308 16 10 7 2 4 3 55054861 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 55054877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55057752 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 55057876 G T Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 55059349 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 55059387 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 55062443 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55062675 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 55064827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55065539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55066357 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55068299 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55069129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55069158 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55069271 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55070211 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55070834 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 55071968 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55072427 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55072815 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 55073268 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 55073427 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 55073448 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 55073695 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 55073816 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 55073861 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 55073892 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 55073986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55074021 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 55074054 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 55074083 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 55074285 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 55074287 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 55074310 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 55074332 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 55074404 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 55074625 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 55074634 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55074851 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 55074908 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 55075213 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55075263 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55075274 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 55075364 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 55075380 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 55075387 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 55075399 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 55075429 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 55075476 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 55075542 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 55075563 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 55075761 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55075924 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55076770 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55077319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55077598 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55077830 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55078183 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55078746 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55080632 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55080736 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55080767 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 55081044 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 55081635 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55081814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55082044 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55082118 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55082718 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 55082876 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55083057 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 55083264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55083309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55083378 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 55083440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55083453 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 55083528 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 55083645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55083653 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 55083670 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 55083758 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 55083796 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 55083921 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 55083973 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 55084396 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 55084422 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 55084541 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 55085015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55086414 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 55086415 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 55086454 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 55086613 G C N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 3 55087851 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 55088371 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 55088429 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 55088430 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 55088455 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 55088464 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 55088624 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 55088692 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 55088702 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 55088731 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 55088786 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 55089413 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 55089425 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 55089593 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 55090544 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55092427 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55092553 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55092691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55092752 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 55095958 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55096016 T C Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 55096143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55096817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55096881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55098208 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 55099419 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 55099524 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 55099533 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 55099842 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 55099843 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 55100371 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 55100605 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 55100958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55100995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55101528 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55101569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55101667 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55102242 C G Y N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 3 55110014 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55111821 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55111845 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55112468 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55113159 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55113973 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 55114140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55114203 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55114417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55114984 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55115413 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 55115722 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 55116414 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 55116430 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 55116593 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55116903 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55117325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55117531 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55117598 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55117904 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55118032 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 55118057 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 55118116 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55118223 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55118314 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55118371 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 55118375 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 55118437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55118523 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 55118553 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 55118596 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 55118618 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55119066 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55119258 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 55119280 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 55119615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55119940 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 55120101 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55120147 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 55120205 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55120224 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 55120484 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 55120550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55120600 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55120924 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 55121330 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 55121541 C A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 55121547 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55121552 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55121629 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 55121774 G T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 55121777 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 55121824 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 55121854 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 55121987 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55122031 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 55122310 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 55122331 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55122565 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 55122619 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 55122636 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55122698 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55122872 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 55122880 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 55122919 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 55122981 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 55123080 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 55123351 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 55123451 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 55123573 G A N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 55123592 C A N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 3 55123761 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55123983 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 55124098 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 55124122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55124346 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 55124623 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 55125800 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 55125837 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55126168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55126265 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55126307 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 55126324 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 55126377 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 55126588 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55126681 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 55126778 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 55126804 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 55127465 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 55127996 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 55128128 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 5 9 1 3 3 3 55128821 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 55128967 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 55128997 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 55129138 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 55129378 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 55129385 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 55129713 G C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 55129811 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 55129883 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 55130009 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 55130044 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 55130116 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 55130168 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 55130174 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 55130345 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 55130615 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 55130625 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 55130674 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 55130764 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 55131452 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 55131550 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55131667 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 55131718 A T N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 3 55132628 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 55132852 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 55132946 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 55133937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55135817 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 55139415 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 55139454 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 55139542 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 55139639 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 55139649 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55139972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55140250 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 55140289 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 55140566 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 55140975 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55141515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55141934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55142072 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 55142185 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 55142424 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55142430 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55143152 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55143187 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55143982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55145105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55145605 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55145711 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 55145955 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55146347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55146428 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 55146448 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 55146514 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 55146528 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 55146564 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 55147163 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 55147197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55147252 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55147304 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 55147320 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55147356 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 55147404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55147498 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 55147666 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 55147780 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 55148294 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 55148704 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55148736 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 55148926 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 55149338 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 55149362 G C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 55149736 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55149955 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55150090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55150122 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55150162 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55150567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55151917 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55152177 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55153572 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55153724 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 55154161 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55154277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55154421 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 55154707 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55154754 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 55154771 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 55154845 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 55154964 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 55155219 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 55155329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55155460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55156714 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55157221 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55157301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55157430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55159235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55159945 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 55161064 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55161919 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55162055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55162392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55162695 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 55162957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55163085 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 55163116 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 55163189 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 55163410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55163460 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 55163832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55163947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55164068 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 55164214 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 55164333 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 55164374 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 55164540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55164556 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 55164560 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55164599 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55164624 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 55164779 G C Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 55164863 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 55164874 G T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 55164892 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 55164915 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 55164924 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 55164945 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 55165142 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 55165196 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55165232 T C Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 55165338 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55165368 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55165477 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55165504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55165692 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 55165888 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 55165941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55166621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55166817 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 55166887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55167071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55167221 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55167380 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 55168248 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55168419 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55168678 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55168788 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 55168793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55169153 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 55169163 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 55169445 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55169714 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55169906 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 55170687 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55170750 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55171085 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 55171107 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 55171162 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 55171197 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 55171220 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 55171232 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 55172329 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 55173476 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 55173734 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 55174459 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 55174755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55175013 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55175017 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 55175080 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55175250 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55175380 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 55175384 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 55175457 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 55175479 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 55175514 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 55175645 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 55175697 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 55175703 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 55176683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55176698 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 55176896 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55176918 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 55176965 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 55177026 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55177149 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55177317 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55177360 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55177463 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 55177501 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55177516 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 55177725 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 55177757 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55178303 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55178489 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 55179052 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55179198 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55179462 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55179511 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 55179543 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55179544 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 55179667 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 55179736 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 55179810 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 55179854 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 55179924 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 55179967 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 55180047 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55180056 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 55180525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55180607 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 55180648 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 55180872 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 55180885 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 55181233 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 55181370 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 55181375 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 55181808 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55181946 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55181961 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 55181970 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55182225 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 55182261 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 55182279 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 55182450 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 55182462 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 55182498 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 55183097 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55183115 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55183227 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55183261 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55183306 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55183439 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 55183512 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55183607 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55184126 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55184197 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55184396 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55184430 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 55185177 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 55185811 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55186093 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 55186309 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55186366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55186390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55186555 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55187875 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55188073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55188136 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 55188847 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55189186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55189571 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 55189677 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 55190105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55190825 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55190834 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55191084 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55192348 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 55192697 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 55193767 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55195836 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55196756 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55199737 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55205479 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55207326 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55209007 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 55210603 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55211329 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 55212087 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 55212598 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55213214 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55213386 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55213412 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55213415 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55213671 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55214273 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55214616 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55215707 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55216772 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 55217829 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 55218596 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55218872 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55218939 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 55219805 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55220592 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55220785 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 55220871 A C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 55220911 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55220954 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 55220964 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 55221286 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 55221427 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 55221548 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55221713 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 55221916 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 55222093 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 55222265 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 55222279 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 55222299 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 55222342 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 55222410 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55222509 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55222741 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 55222768 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 55223016 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55223117 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 55224666 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55224822 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 55224958 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55225123 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55225163 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55225294 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55225420 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55225645 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 55225787 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 55225875 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 55226007 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 55226100 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 55226224 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 55226464 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 55226521 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 55226522 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 55226893 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 55226895 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55227061 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55227071 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 55227086 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 55227108 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 55227109 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55227234 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55227887 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 55227923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55228028 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55228089 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 55228090 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55228122 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55228133 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 55228204 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 55228233 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 55228248 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 55228252 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 55228261 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 55228383 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 55228478 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55228481 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55228509 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55228535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55228576 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 55228807 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55228824 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55228940 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 55229020 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 55229084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55229086 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 55229296 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55229413 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 55229457 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 55229644 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 55229655 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 55229767 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 55229841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55229845 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 55230079 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 55230092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55230119 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 55230137 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 55230610 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55230753 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 55230769 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 55230776 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 55230809 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 55230849 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55230893 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55230944 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 55231050 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 55231162 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 55231290 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 55231689 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55231694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55231734 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 55232011 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 55232024 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 55232145 G C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 55232243 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 55232266 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 55232298 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 55232352 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55232382 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55232746 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55232833 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 55233340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55233518 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55233522 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 55233665 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55233750 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55233965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55233984 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55234457 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 55234556 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 55234934 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55235602 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 55235961 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 55236084 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55236371 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 55236406 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55236636 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 55236652 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55236666 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55237115 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 55237176 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 55237891 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55237916 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55237964 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55238215 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 55238347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55238363 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55238655 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 55238790 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 55238795 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 55238834 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 55238877 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 55238950 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 55239126 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 55239231 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 55239634 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 55239740 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 55239762 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 55239815 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 55239942 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 55240085 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 55240171 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 55240534 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 55240550 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 55240627 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 55240645 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 55240712 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55240775 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 55240798 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55241234 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55241256 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 55241348 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 55241685 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55241872 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 55241956 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 55241993 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 55242128 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 55242281 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 55242319 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 55242599 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 55242664 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 55242995 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55243017 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55243064 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 55243515 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 55243595 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 55243834 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55244014 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 55244104 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55245882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55246328 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 55246677 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55247112 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55247473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55247598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55247659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55247705 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55249847 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55249873 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 55249900 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 55249905 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 55250279 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55250298 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55251282 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55251561 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 55251589 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 55251650 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 55252561 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 55252716 T G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 55252732 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 55252808 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 55253714 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 55253784 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55253961 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55253980 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55254012 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 55254284 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55255014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55255116 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55255725 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 55256140 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55256298 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 55256315 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 55256411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55256554 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 55256643 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 55259401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55259974 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 55260219 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55260307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55260339 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 55260520 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 55260526 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 55260800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55261154 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55262048 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 55264191 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55264713 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55266047 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55266366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55269423 G C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 55269580 A G Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.222222222222222 27 9 13 1 4 3 55269602 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 55270105 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55270146 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55270231 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55270244 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 55271693 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55272286 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55272342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55272384 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55272446 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 55272644 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55275649 T C Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 55276424 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 55276743 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55276751 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 55277634 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 55278438 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55278582 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55279438 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55279448 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55279548 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 55279754 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55280976 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 55281357 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 55281512 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 55282292 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 55282486 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 55285513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55285572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55286377 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55286945 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55286974 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 55287503 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 55287881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55288501 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 55288699 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55289204 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 55289357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55289863 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 55290505 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55291516 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55291761 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 55291855 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 55294942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55295857 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55296447 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 55296786 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 55296989 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55297592 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 55298861 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 55299007 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55299970 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55300207 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55301234 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 55301370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55301424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55301642 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55303249 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55303833 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 55304675 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55309201 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 55311758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55312454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55314752 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55316794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55317187 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55317246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55318736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55318860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55319958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55321196 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55322997 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55323319 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 55325058 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55328143 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55329765 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55329841 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 55329933 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55329944 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55329979 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 55330056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55334277 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55335398 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55335419 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55335541 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55335591 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55335631 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55335748 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 55335920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55336328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55338889 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55339474 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55340968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55341287 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 55341297 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 55341960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55343615 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55346242 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 55346253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55348009 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55348045 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 55348213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55348251 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 55348268 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 55348689 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55348802 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55348867 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 55348883 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 55348944 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55349042 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 55349068 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 55349295 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 55349374 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55349477 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55349507 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55349542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55349873 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 55350122 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 55350222 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55350231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55350263 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55350704 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 55350731 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 55350751 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55351186 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 55351207 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 55351208 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 55351233 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 55351689 C T Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 55351921 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 55351936 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55352075 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 55352086 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 55352428 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 55352433 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 55352446 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 55352501 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 55352504 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 55352526 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 55352593 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 55352650 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 55352799 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 55352804 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 55352842 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 55352893 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 55353007 A T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 55353689 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55354664 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 55354767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55354890 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 55355225 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 55355323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55355367 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 55355414 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 55355417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55355508 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55355536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55355554 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55355588 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55355687 A T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 55355862 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 55355950 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 55355952 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 55355961 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 55356067 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 55356430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55356889 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55356891 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55357287 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 55357592 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 55357723 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55358272 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55358564 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 55358573 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55358742 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 55358855 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 55359021 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 55359382 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 55359413 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 55359458 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 55359474 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 55359547 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 55359555 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55359713 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 55359816 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 55359830 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 55359938 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 55359983 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 55359986 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 55360009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55360701 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 55360821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55363271 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55363914 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55365593 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55365614 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55365628 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55365648 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 3 55365660 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55366303 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 55366694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55366864 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55367164 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55368364 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55368620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55368826 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55368859 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55368905 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55368917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55368933 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55368943 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 55369066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55369299 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 55369828 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55369871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55369922 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55370538 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55370578 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55370624 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55370670 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55371238 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 55372196 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55373079 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55373556 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 55374138 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 55374342 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55376012 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55376014 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 55376049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55376211 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55376278 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55376453 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 55376499 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 55377156 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55377910 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55378024 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55378245 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 55378385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55378474 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55378589 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 55378671 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 55378700 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 55378703 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 55378723 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 55378866 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 55379026 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55379064 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55379101 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 55379199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55379213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55379324 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55379421 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55379544 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 55379596 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 55380175 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 55380319 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 55380436 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55380465 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 55380477 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55380545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55380602 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 55380652 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 55380679 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55380689 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 3 55380728 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 55380742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55380813 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 55380865 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 55380886 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 55380914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55381021 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55381062 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 55381110 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55381134 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55381158 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55381176 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 55381201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55381292 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 55381362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55381427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55381454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55381467 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55381578 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55391047 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55391100 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55391345 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55393112 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 55393362 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55393544 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55394087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55394242 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55397107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55399414 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55401539 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 55402804 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55404158 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55404173 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55404178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55404284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55404375 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55405097 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 55405148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55405163 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55405314 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 55405355 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55405369 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55405563 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 55405761 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55405819 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55414504 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 3 55414683 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 55414910 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 55414956 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55415102 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55415226 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55415296 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 55415310 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 55415684 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 55415834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55416051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55416091 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55416093 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55416934 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55418099 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55419583 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55419709 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 55420281 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 14 10 6 2 4 3 55420322 A G N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 16 12 6 4 4 3 55420679 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 55420691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55420840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55420981 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 55420982 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 55421042 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 55421169 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 55421216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55421275 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55421384 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 55421516 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 55421841 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 55422026 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55422091 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55422281 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55422295 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 55422318 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 55422465 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 55422603 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 55422631 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 55422869 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 55423129 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 55423251 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 55423349 G C Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 55423571 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55423631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55423781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55424035 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55424058 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 55424138 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55424173 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 55424291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55424471 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55424717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55424784 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55425053 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55425057 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 55425239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55425303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55425494 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 55425499 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55426061 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55426109 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 55426962 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55426972 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55427117 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 55427608 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 55427643 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 55427660 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55428147 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 55431013 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55431272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55433746 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 55437352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55439061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55442182 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55446322 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 55451746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55452725 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55452796 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55452915 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55453117 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55453157 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55453332 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55454121 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55454151 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55454299 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55455238 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55455508 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55456296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55456327 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 55457298 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 55457661 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 55458819 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 55459140 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 55459147 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 55459494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55459532 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55459650 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 55460064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55460648 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55460746 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 55460859 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 55461611 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55461719 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 55461728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55461874 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55462053 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55462054 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55462412 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55462567 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55463139 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55463159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55464020 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55464045 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 55464428 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 55464544 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55464591 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55464796 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55467784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55467868 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55468390 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 55468411 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55468446 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55468549 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55468981 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55469088 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55469174 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55470635 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 55470984 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55471486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55471583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55471686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55471703 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55471736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55471787 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55472071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55472137 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 55472141 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 55472262 C T Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 55472278 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 55472337 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55472389 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55472390 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55472636 T C Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 55473119 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 55473140 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 55473170 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55473300 G A Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 55473336 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 55473480 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 55473510 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55473533 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 55473724 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55473896 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.25 0.166666666666667 0.583333333333333 8 16 3 2 7 3 55473938 A C N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 55474097 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 55474385 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 55474388 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 55474437 T A N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 3 55474531 A T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 55474929 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 55475299 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 55475425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55475491 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55475680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55475809 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55475889 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55476049 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55476333 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55477326 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 55477582 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 55477718 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 55477780 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 55477863 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 55477940 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 55477993 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 55478162 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 55478747 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55478772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55478871 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 55479166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55479219 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 55479738 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55479890 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55479952 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55480103 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55480203 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55480811 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55480843 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55480937 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55481012 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55481046 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55481092 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55481147 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55481248 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55481273 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 55481322 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55481442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55481509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55481532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55481553 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55481814 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 55482321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55482365 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 55482578 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 55483467 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55483666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55484061 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 55484098 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 55484537 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55484576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55485119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55485453 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55485515 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55485606 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 55486016 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 55486052 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 55486133 T C N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 3 55486134 T C N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 3 55486363 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 3 55486385 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 55486688 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55486828 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 55487221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55487780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55488145 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55488265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55488392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55488395 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 55488561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55488612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55488623 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55488789 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55488843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55488971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55489156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55489164 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55489481 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 3 55489726 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55489887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55490074 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 55490215 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 55490604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55490749 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55490757 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55491010 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 55491447 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55491507 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 55491922 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55492075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55492319 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 55493183 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55493394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55493506 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55493532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55493992 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55494035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55494067 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55494163 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55494187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55494236 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55494360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55494409 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 55494422 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 55494721 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 55494736 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 3 55495012 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55495369 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55495406 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55495464 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55495472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55495566 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55495700 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 55495791 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 55495911 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55495925 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 55496145 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 55496211 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 55496220 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 55496290 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 55496654 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55496811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55497264 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55497306 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55497309 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 55497435 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55497445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55497492 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55497786 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55498170 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 55498418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55498465 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 55498510 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 55498604 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 55498890 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55498914 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 55498963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55498990 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 55499061 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 55499258 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55499282 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 55499291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55499325 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 55499331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55499632 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.5 0.1875 0.3125 19 13 8 3 5 3 55499658 A T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 55499798 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 55499811 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 55499859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55499865 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 55499892 G T Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 3 55499901 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 55499979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55500041 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55500098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55500551 C G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 55500713 C T Y Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 3 55500753 C T N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 3 55500833 G T N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 10 18 4 2 8 3 55500834 A T Y N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 10 18 4 2 8 3 55500919 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 3 55500942 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 55500949 C T N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.307692307692308 0.230769230769231 0.461538461538462 11 15 4 3 6 3 55501103 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 55501123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55501215 G C Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 55501574 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 3 55501639 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55501742 G A Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 3 55501865 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 55501912 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55501949 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 55501955 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55502051 T C Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 55502077 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 55502122 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 55502511 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 55502634 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 55502677 A G Y Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 55502932 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 55502968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55503067 T A N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 3 55503289 C T N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.466666666666667 0.2 0.333333333333333 17 13 7 3 5 3 55503313 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 55503415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55503529 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 55503565 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55503695 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 55503812 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 55504210 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 55504488 A C N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 3 55504799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55505782 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55505917 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55506236 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55507562 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55508160 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55508321 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55508335 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55508614 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55509969 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55510177 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55510189 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55510373 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55510415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55510519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55510613 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55510925 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55511605 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55513489 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55513510 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55514480 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55514734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55514859 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55514971 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55515034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55515045 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55516245 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55516290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55516565 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 55516688 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 55517644 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55517776 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55517849 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55517856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55517869 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55517870 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55518523 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55518745 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55518936 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55518967 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55518981 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55519114 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55519289 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55519327 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55519376 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 55519534 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55519592 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55519681 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55519693 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55519798 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55519841 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55520094 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55520296 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 55520682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55521049 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55521267 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55521282 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 55521369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55523925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55524092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55524139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55524511 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55525152 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55525318 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55525631 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55526375 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55526499 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 55526625 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55527521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55527619 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55527988 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 55528041 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55528538 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55528706 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55528798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55529173 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55529468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55529695 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55529989 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55530017 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55530047 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55530060 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55530064 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55530215 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 55532396 G A Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 55532418 T G Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 55532434 C A Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 55532506 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 55532516 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 55532691 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55532740 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55532784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55532943 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55532956 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55533284 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55533542 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55534314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55534452 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55534542 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55534746 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 55536839 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55536917 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55537765 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55538758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55538799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55538802 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55539477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55539686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55540370 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 55542972 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55543766 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55544476 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55544572 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55544604 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55544722 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55545286 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 55545329 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 55545492 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55545665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55545770 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55545944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55545950 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55545963 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55545981 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55546022 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55546362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55546516 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 55547020 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55547049 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55547173 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55547215 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55547548 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55547665 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55547728 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55547768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55547797 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55547808 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55547884 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55548441 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55548676 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55548694 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 55549021 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55549066 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55549221 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 55549249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55549420 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55549507 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55549727 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 55549781 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55550002 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55550569 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55550943 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55551834 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55552211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55552536 G C N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 55552610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55552639 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55554095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55554110 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55554358 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55559881 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55560129 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55562914 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55565956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55566045 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55566994 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 55571861 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 55572318 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55573433 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55574157 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 55574699 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55575265 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55575267 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55575540 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55577567 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55578626 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55578661 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55583520 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55584089 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55588303 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 55588466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55588986 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 55590989 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55593669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55593845 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55595702 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 55597702 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55598526 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55599834 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 55601162 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55601319 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55605035 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 55605406 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55605663 C G Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 55606142 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 55608412 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55609683 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55609986 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55610261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55612345 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55613982 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55614503 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 55615338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55615382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55616328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55616680 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55616722 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55616888 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55617064 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 55617129 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55617233 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55618606 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55618784 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55619335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55619423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55620319 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 55620627 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 55620641 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 55620669 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 55620684 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 55620729 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55620739 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55620908 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 55620916 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55621060 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55621065 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55621282 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55621551 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55621603 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55621608 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55621764 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 55621804 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55621991 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55622003 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55622042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55622071 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55622107 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55622351 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55622379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55622613 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55623169 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 55624539 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 55624576 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 55624813 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 55624878 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 55625062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55626335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55626896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55627699 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55627713 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55630877 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55630916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55632257 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55632881 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55633140 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55634408 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55634722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55634843 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55634903 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55636725 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55637469 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55637650 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 55638849 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 55639244 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 55639306 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 55639338 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55640125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55640242 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55640263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55640357 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 55641258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55642160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55643639 A C Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 55644657 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55645121 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55645440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55645860 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55645926 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55646005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55646094 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55646229 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55646332 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55647348 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55648013 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55648504 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55648673 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55649624 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55649842 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55650525 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55652336 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 55654232 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 55655443 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 55655591 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 55655874 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 55657571 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55657581 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55658195 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55658652 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55659544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55660526 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55663050 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55666878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55667333 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55667782 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55670786 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55671395 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55671721 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 55672849 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55674264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55674769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55677135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55678994 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 55681387 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55687470 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55687982 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55691484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55693744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55693859 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55694205 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55694409 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55695831 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 55696047 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55696134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55696152 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55696178 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55696505 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 55696570 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55696598 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55697147 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55697434 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55698116 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55698313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55698466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55698587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55698647 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55698806 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55698981 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 55700034 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55701290 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55701649 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55702140 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 55702816 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55702873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55703048 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55703132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55703294 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55703408 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55703445 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55703498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55703652 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55703984 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55704485 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55704561 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55705253 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 55706075 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55706293 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 55706703 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55707086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55707119 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55709745 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55710534 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 55711303 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55711328 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55713852 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55716201 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55716275 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55716715 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55726719 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55726912 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55729307 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55730470 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 55731044 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55731299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55736592 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55737641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55740322 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 55740420 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55744693 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55745764 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55745987 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55746675 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55747508 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55747773 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55752363 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 55752764 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55755033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55755186 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55757380 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55757400 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55759670 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55760258 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55760945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55761847 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 55763706 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 55764255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55765761 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55767547 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55767561 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 55768802 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55768934 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 55771245 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 55771745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55773672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55774327 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55776042 C G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 55781001 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 55781064 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 55781308 C T Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 55782805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55783893 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 55784720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55786523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55787238 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55787373 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 55788017 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 55788585 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 55788705 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 55789211 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 55789221 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 55789244 A C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 55789458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55789871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55789888 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 55789931 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55789935 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55790558 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55790586 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55790836 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55791046 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55791153 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 55791174 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 55791570 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55791588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55791664 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55791820 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55791836 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55792105 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55792140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55792324 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55792380 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 55792415 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 55792462 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 55792569 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55792600 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55792635 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55792645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55792660 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55792688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55792726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55792775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55792826 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55792970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55793022 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55793291 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55793312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55793338 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55793383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55793480 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55793514 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55793715 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55793834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55793868 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55794374 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55794442 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55794463 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55794502 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55794508 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55794539 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55794560 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55794744 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55794871 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55794978 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55795185 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55795298 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55795302 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55795332 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55795355 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55795368 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55795438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55795534 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55795581 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55795591 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55795673 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55795913 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55795976 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55796674 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 55797280 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55797433 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 55797732 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 55797955 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 55798369 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 55798560 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 55798731 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 55798785 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 55798932 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 55798957 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 55799200 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 55799238 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55799423 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55799479 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 55799573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55799715 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55799749 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55799783 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55799903 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55800001 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55800057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55800239 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55800249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55800261 T A N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 3 55800271 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55800443 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55800466 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55800496 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 10 14 0 10 2 3 55800527 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55800545 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55800575 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 55800582 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.5 0.142857142857143 0.357142857142857 16 12 7 2 5 3 55800686 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 55800836 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55800839 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 55801012 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 55801195 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55801219 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55801230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55801339 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55801395 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55801540 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55801665 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55801693 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55801763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55801774 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55801879 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55801922 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55801941 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55802018 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55802052 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55802094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55802112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55802113 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55802151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55802295 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55802361 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55802470 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55802618 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 55802729 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 55802763 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 55802840 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55802875 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 55802957 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 55802961 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 55803020 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 55803085 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 55803127 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55803425 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55803428 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55803445 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55803604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55803657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55803716 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55803721 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55803729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55803755 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55803856 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55803915 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55804040 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 55804065 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 55804092 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 55804102 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 55804139 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 55804140 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 55804240 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 55804244 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 55804295 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 55804355 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55804639 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55804865 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55805020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55805091 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55805098 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55805148 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55805152 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55805228 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 55805437 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55805440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55805449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55805451 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55805469 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55805534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55805588 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55805721 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55806106 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55806211 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 55806252 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 55806880 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55808005 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55809946 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55810167 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 55810806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55811321 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 55811632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55811755 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55812543 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 55812556 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55812564 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55812577 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55813019 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55813180 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55813294 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55813474 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55813755 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 55813863 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 55814106 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55814171 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55814303 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55814489 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55814574 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55814908 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55815165 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 55815181 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55815182 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55815556 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55816090 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 55816189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55816551 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55816567 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 55816745 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55816922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55817017 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 55817048 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55817105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55817110 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 55817152 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55817320 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55817438 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55817765 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55817857 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 55818021 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55818395 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 55818405 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 55818767 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 55818945 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 55819210 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55819400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55819616 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 55820398 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55820719 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 55821617 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55821771 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55822089 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55822115 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55822328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55822376 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55822571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55822929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55823975 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55824146 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55824727 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55824759 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 55824873 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 55830417 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55830646 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55830859 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55831244 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 55831401 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55831402 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55832171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55832185 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55832377 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55832543 C T N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 55832603 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 55833199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55833433 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55833703 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55834383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55835241 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55836679 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 55836842 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55837037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55837663 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 55838431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55838951 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55838964 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55839621 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 55839718 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55840093 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55840439 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55840651 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55841732 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 55841971 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55842138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55842528 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55843225 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55843535 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 55843800 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 55845856 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 55845918 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 55845947 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 55846093 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55846485 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55849554 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55851578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55852770 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55854381 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55854683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55854885 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55855972 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55856150 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55856646 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55857108 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55857381 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 55857854 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55857901 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55857990 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 55858424 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55858774 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55859213 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55859973 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55861243 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55862070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55862163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55862633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55863061 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 55863776 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55863931 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55864156 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55864227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55864404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55864524 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55864653 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55864720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55864921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55871163 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55871456 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55871522 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55871618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55871623 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55871795 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55871799 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55871872 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55871873 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55871889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55871931 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55871967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55872704 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 55872937 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 55880902 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 55881453 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55881799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55882891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55883249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55883762 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 55884136 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55884251 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 55885777 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55890776 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55890844 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55891843 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55892034 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55895071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55895863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55896404 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55898016 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55898393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55899283 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55899458 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 55899584 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55900165 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 55900481 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55901185 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55901454 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55901593 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 55902178 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55902852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55902915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55903088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55903166 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55904420 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 55904444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55904462 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55904463 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55904534 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55908091 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55908409 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 55909236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55911063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55911926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55912298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55913970 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55914122 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 55916150 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55917144 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 55917446 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55918089 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 55921154 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55921184 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 55921675 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55922335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55922349 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55922845 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55925480 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55927072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55927269 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55927815 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55928148 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55928738 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55930078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55930643 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55931563 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 55931928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55932156 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55932331 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55934862 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55935775 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55936017 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55937395 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 55937937 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 55938012 G C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 55938225 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 55938312 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 55938341 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 55938370 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 55938567 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 55939921 C A N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 55946860 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 55947876 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 55948002 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55948756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55948757 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55949226 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 55949356 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 55949421 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 55949571 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 55949602 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 55949609 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 55949644 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 55949695 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 55949862 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 55949867 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 55949996 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 55950138 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 55950142 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 55950233 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 55950478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55950511 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 55950698 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 55950753 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 55950843 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 55950852 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 55950919 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 55950942 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 55951222 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 55951224 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 55951350 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 55951354 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 55951401 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 55951433 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 55951440 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 55951453 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 55951480 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 55951494 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 55951502 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 55951506 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 55951528 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 55951563 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 55951610 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 55951657 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 55951752 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 55951765 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 55951953 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 55951965 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 55952029 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 55952092 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 55952108 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 55952225 C A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 55952379 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 55952409 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 55952500 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55952558 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 3 55952575 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 55952738 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 55952743 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 55952820 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 55953030 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 55953143 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 55953210 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 55953304 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 55953353 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 55953427 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 55953558 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 55953572 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 55953713 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 55953756 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 55953987 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 55954084 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 55954684 C G N N 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 55954841 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 55955245 A C N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 3 55955320 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 55955339 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55955906 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55956453 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55956510 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 55956692 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 55956945 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55956964 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55957256 C G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 55959514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55961287 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55961375 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55961419 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55962679 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55962806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55963234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55963283 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55964937 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55967519 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55967528 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 55968293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55968483 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 55968566 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 55969754 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55970113 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 55970130 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 55970676 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55971512 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55973806 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 55974680 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 55975907 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55976732 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55976993 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55977352 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55978923 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55979959 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55980961 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 55984737 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 55985975 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55986168 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55986389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55987887 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55987909 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55988012 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55988518 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55988581 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55988605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55988881 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55989082 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55989358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55990211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55990252 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55990388 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55991474 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55991761 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55991773 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 55993050 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 55993476 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55993655 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55994730 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55994887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55994991 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55995573 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 55996074 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 55999212 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 56001216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56001441 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56001776 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56003763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56004508 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56006637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56006815 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56007805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56008376 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56009091 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56010484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56011566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56013236 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 56021595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56021794 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56021999 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56022212 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56022680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56023253 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56023717 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 56023751 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56023885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56023901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56024031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56024370 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 56024455 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 56024635 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56024920 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 56025351 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56025526 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 56025538 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 56025555 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 56025887 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 56026003 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 56026043 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 56026058 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 56026226 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 56026227 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 56026253 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 56026481 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56026965 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 56026970 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 56027142 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 56027260 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 56027363 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 56027424 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 56027643 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 56027660 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 56027666 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 56027700 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 56027705 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 56028031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56028145 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 56028246 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 56028358 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 56028365 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 56028489 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 56028541 A C N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 56029027 G A N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 3 56029091 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56029208 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 56029215 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 56029388 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 56029410 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 56029606 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 56029744 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56029766 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 56030642 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 56030918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56031245 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 56031960 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56032694 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56032907 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56034166 T G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.0588235294117647 0.705882352941177 0.235294117647059 14 20 1 12 4 3 56034200 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 56038256 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56038650 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 56038931 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56038942 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56038985 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56039517 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56039789 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56039902 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56040433 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56040446 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56040961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56041226 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 56041310 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 56041443 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 56041467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56041478 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 56041526 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 56041562 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 56041698 C G Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 56041699 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 56041763 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56041812 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 56041855 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 56041881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56041930 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 56042487 C A Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 56042580 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 56042624 G C Y N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 56042741 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 56042808 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 56043158 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 56043172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56043355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56043608 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 56043636 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 56043970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56044213 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56044238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56044261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56044284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56044320 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56044331 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56044659 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56044755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56044838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56044967 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56045022 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56045195 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56045566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56045603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56045713 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56045722 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56045778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56045793 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56046562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56046620 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56046671 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56046757 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56046911 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56046933 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56047362 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 56047433 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56047667 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56048247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56050059 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56050109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56050465 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56057437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56057924 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56058200 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56058586 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56058653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56059526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56059752 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 56060084 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 56060403 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 56060618 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56061274 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 56061366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56062099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56062280 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56062327 A T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 56062358 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 56063383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56063486 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56064394 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56064599 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56064658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56064754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56064829 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56066284 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 56066570 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 56066730 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56068187 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 56068812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56069239 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56069510 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56069669 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56069774 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56069822 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56069893 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56070159 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56070339 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 56070469 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 3 56071696 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56072526 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56073387 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 56074526 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56074780 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56075940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56076375 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56076510 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56077083 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 56077148 C T N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 56077299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56078581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56078643 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56078705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56078904 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 56079224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56080319 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56080975 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 56081055 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 56082106 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56082168 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 56082255 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56082286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56082801 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 56082852 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 56082865 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 56082916 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56083035 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 56083042 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56083051 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 56083061 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 56083072 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 56083096 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 56083119 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 56083261 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 56083455 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 56083551 C G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 56083716 C T N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 56083753 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 56083757 C A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 56083798 G A Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 56083911 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 56083998 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 56084018 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 56084109 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 56084110 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 56084337 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 56084839 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 56084852 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 56086193 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 56086207 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56088261 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 56088277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56088367 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56088538 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56089045 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 56089195 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56090408 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56090813 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 56091306 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 56091452 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56091620 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56091646 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 56091815 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56091894 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 56091899 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 56091990 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56092059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56092196 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56093359 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 56093544 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 56093916 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 56094387 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 56094391 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 56094936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56095223 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 3 56095257 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 56095294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56095308 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 56095457 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 56095489 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 56095560 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 56095695 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 56095701 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 56095706 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 56095722 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 56095745 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 56095788 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56096053 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 56096138 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 56096184 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 56096213 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 3 56096234 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 56096259 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 56096575 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 56096782 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 56096784 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 56096876 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 56096959 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 56097253 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 56097272 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 3 56097328 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 56097423 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 56097464 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 56097655 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 3 56097765 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 56097868 C G N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 56098034 T A N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 3 56098093 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 3 56098126 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 56098188 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 56098199 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 3 56098203 A C N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 56098245 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 56098380 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 56098390 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 56098535 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 56098578 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 56098618 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 56098735 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 56099145 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56099213 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56099381 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 56100089 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56100854 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56101906 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 56102451 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56102977 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 56103231 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56103565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56103734 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56103769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56103850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56103858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56104057 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56104447 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 56104454 T G N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 56104615 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56104780 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56104828 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 56105830 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 56105854 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56105858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56105889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56105915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56106020 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 56106153 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56106160 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 56107702 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56107929 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 56108410 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56109162 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56109317 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56109822 A G Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 56110300 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56111234 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 56113417 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56115269 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56116866 C T Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 56116981 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56119386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56120522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56121015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56127867 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56129279 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56129989 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56133424 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 56134288 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56134683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56134916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56134941 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56135936 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56135953 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56137505 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56137529 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56138574 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56139097 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56141992 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56143470 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56143801 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56143980 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56144257 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 56144428 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56144855 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56144916 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56144982 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56144986 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56145012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56145096 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56145107 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56145385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56145390 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56145509 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56145513 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56145687 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56145895 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56145937 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56145977 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56145990 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56146084 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56146104 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56146154 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56146215 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56146282 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56146348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56146408 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56146409 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56146596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56146724 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56146968 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56147117 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56147203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56147304 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56147596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56147824 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56147828 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56149142 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 56149882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56149911 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 56150217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56150407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56150444 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56150472 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56150576 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56150728 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56151266 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56151408 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 56152106 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 56152217 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 56152426 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 56152442 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 56155166 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 56155360 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56156008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56156146 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56156221 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56156320 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 56156343 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56156426 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 56156495 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 56156516 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56156723 T C N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 7 9 0 7 1 3 56156738 C T N Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.75 0 0.25 6 2 3 0 1 3 56157285 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 56157290 T A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 56157321 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56157663 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56157767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56157830 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 56157979 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56158037 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56158175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56158213 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56158242 G A N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 0.153846153846154 0.153846153846154 20 6 9 2 2 3 56158743 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 56158789 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56158823 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 56158920 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 56159066 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56159184 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 56159347 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56161677 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 56162359 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56164658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56165995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56166053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56166166 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56167515 C T Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 56168001 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56168041 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 56168048 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56168463 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56168554 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56171657 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56172595 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56172795 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 56172874 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56174273 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 56174429 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 56174492 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 56174531 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 56182303 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56183231 A C Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 56183370 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56183408 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56183742 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56185587 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56186334 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56186372 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56186803 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56187923 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56188284 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56189234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56189712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56189789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56190660 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56191423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56193433 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56196654 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56197253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56200430 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56204311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56205294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56207320 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56207901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56208451 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 56208481 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 56208699 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 56208797 A C N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 56209244 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 56209477 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 56209509 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56209545 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 56209598 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 56212051 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56212322 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56212585 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56213185 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 56214212 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56214301 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56214315 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56214553 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56214563 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56214663 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56214696 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56215032 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56215119 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56215175 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56215186 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56215295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56215691 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56223136 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56223224 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56223225 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56223413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56225941 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56226612 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56227186 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56228081 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56228275 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56231387 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56231624 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56232001 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56232149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56232342 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56232588 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56234138 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56237837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56239575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56241554 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56242478 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56242488 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56242520 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56242556 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 56242585 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 56242638 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 56242697 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 56242820 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56242856 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56242865 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56242879 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56243080 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56243477 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56243678 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 56243775 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 56243805 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 56243926 C T Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 56243948 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 56243995 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 56244020 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 56244044 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 56244240 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 56244367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56244472 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 56244512 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56244565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56244591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56244594 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56244663 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56244735 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56244743 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56244910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56245072 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56245265 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56245446 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 56245470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56245531 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 56245561 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56245807 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 56246418 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56246517 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56246528 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56246819 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 56246828 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56246883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56246934 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56247126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56247160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56247244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56247285 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 56247330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56247392 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56247558 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56248216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56248241 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 56248269 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56248345 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56248564 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 3 56248666 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 56250043 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56251612 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56253460 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56253476 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56253495 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56253873 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 56254170 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56254321 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56255842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56256179 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56258578 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56259830 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56261116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56261259 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 56261562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56261609 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56261630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56261633 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56262340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56262819 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56263719 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 56263723 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 56264940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56267008 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56267885 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56269855 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56270922 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 56271523 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 56274204 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56274364 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 56274365 G A Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 56274497 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56274661 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56274699 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56275467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56275701 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 56276598 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56276614 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56277054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56277190 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56279267 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 56280018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56280082 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56281179 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56281186 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56281729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56282722 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56283115 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 56283138 T G Y N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 56286099 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56286935 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56287035 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56288006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56288874 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 56289405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56289469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56289502 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56290555 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56290741 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56290870 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56291270 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56292094 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56293031 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56293041 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56293846 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56293894 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56293906 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56293914 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56293917 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56293930 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56294042 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56294242 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 56294249 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56295091 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 56295135 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56295179 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56295832 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56295835 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56295853 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 56295900 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56295933 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 56295988 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 56296000 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56296003 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56296170 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56296204 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56296228 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56296288 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 56296354 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 56296396 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 56296433 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 56296470 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 56296533 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56296605 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56296812 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 56296835 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 56297043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56298201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56298682 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 56298683 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56298710 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56299014 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 56299045 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56299311 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56299340 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 56300017 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56300848 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 56300909 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 56300937 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 56300945 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 56301183 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 56301221 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 56301943 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 56302703 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56302730 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56302829 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 56302937 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56303842 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56303868 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56303893 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 56304265 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56304877 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56305626 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 56306557 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56307122 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56307824 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56307850 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56308917 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 56309177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56309656 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56309839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56310015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56310248 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56310866 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56311099 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56311370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56311439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56312118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56312767 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56313896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56315044 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56315316 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56315443 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56315665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56315676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56315679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56315745 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56315814 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56315941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56315967 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56316006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56316052 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56316440 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56324365 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56325969 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56326011 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56326045 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56326696 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56328627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56328928 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56329024 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56329396 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56329813 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56329936 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56329955 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 56329962 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56330061 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56330350 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56330411 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56331157 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56331776 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56331799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56332131 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56333060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56333805 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56334736 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56334746 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56334941 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56334981 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 56335226 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56335321 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56335338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56335506 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56335507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56335866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56336045 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 56336046 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 56336208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56336526 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56336661 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56336995 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56337334 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56337539 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 56337590 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 56337783 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56338305 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 56338404 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56338497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56338720 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56339024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56339305 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56339443 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56339509 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56340936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56341601 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56349707 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56357410 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56357607 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56357835 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56358463 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56358522 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56359005 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56359039 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56359047 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56359081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56359131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56359133 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56359209 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56359268 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56359287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56359566 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56359609 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56359717 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56359733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56359801 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56359980 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 56359983 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56360029 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 56360038 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 56360301 T C Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 56360367 C G Y N 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 3 56360595 C T Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 56360628 T G Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 56361141 G T Y N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 56361282 G A Y Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 56361285 C G Y N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 56361576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56361661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56361674 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56361699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56361779 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56361987 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 56361999 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56362020 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56362064 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56362082 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56362189 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56362202 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56362240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56362280 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56362305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56362319 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56362344 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56362382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56362422 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56362640 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56362877 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56362902 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56362949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56363079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56363142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56363236 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56363246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56363589 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56363780 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56363923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56365836 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 56369819 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56371303 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 56374167 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56376442 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 56377502 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56377906 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 56378274 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56378318 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56378372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56378777 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56378800 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 56378864 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56379818 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 56380093 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 56380149 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56380224 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56380256 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56380375 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56380398 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56380496 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 56380512 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56380560 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56380630 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56380694 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 56380706 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56380707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56380780 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56381117 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56381241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56381393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56382740 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 56384436 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 56384461 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 56384669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56384699 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 56384808 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56384837 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56384851 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56385763 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56385933 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56385998 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56386189 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 56386380 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 56386486 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56386577 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56386774 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56386839 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56387076 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 56387319 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56387406 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56387478 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56387558 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56387681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56387816 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56389170 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56389441 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56389639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56389995 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56390411 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56390812 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 56390889 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56390900 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56390943 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56392505 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56392924 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 56394088 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56400943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56401656 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56408598 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56410659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56411522 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 56411888 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56413754 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56416438 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56416701 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56418052 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56420683 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56421313 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56422051 A T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 56422052 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 56422094 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56422102 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56422733 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56423759 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56425211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56425576 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56428069 A T Y N 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 56429281 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56429443 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56430139 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 56430638 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56430970 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56431036 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56431175 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56431240 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56431455 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56431518 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56431592 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56431605 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56432042 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56432240 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56432447 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56432464 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56432939 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56433220 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 56433260 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56433681 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56433729 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56433913 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56434863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56435205 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56435658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56435759 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56435916 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 56435924 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56436636 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56438157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56438742 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56438956 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56439006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56439695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56440773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56442510 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56444780 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56445021 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56446157 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56448638 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 56448826 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56448924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56449184 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56450356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56451497 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56452092 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56452201 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 56452269 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56453138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56453993 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 56454296 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 56454363 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56454445 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56454555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56454618 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56454646 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56454750 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56454945 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56455306 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56455337 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 56455353 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 56455541 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56455725 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 56455987 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 56456017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56456031 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56456032 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56456223 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56456360 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 56456509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56456541 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56456595 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56456640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56456854 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56456864 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 56456878 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 56457061 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 56457157 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 56457270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56457284 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56457474 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 56457475 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 56457523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56457717 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56458953 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 56459098 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 56459360 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 56459361 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 56459514 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56459916 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56459990 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 56460073 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 56460212 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 56460286 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 56460344 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56460358 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 56460386 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 56460460 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 56460508 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 56460533 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 56460684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56460799 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56460820 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56461021 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56461063 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 56461683 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 56461819 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 56461912 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 56462040 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 56462154 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56462175 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 56462176 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56462266 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 56462325 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 56462630 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 56462789 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 56462941 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 56463082 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56463177 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56463407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56463563 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 56463630 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 56464054 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 56464128 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 56464147 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 56464160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56464655 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56464852 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56464907 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 56464923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56465018 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 56465085 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56465105 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 56465170 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 56465335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56465465 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 56465665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56465685 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56465696 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56465698 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56465733 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56465775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56465929 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 56466023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56466076 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 56466113 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 56466134 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 56466250 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 56466362 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 56466433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56466541 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 56466816 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 56466973 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 56466980 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 56467420 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56467594 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 56467622 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56467747 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 56467914 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 56468070 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 56468286 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56468445 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 56468569 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56468625 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56468687 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 56468829 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56468839 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56468860 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56468909 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56468938 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56469338 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 56469423 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 56469427 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 56469488 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 56469640 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 56469684 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56469731 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56469777 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 56469814 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56469885 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56470071 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 56470082 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 56470110 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 56470136 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 56470144 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56470170 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 56470194 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56470209 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56470342 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56470636 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56470678 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56470693 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56470700 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56470719 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56470741 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56470760 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56470769 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56470783 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56470818 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56471103 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56471177 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56471239 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56471615 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56471708 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56471839 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56471953 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 56472289 A C N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 56472358 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 56472467 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56472787 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 56473182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56473662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56473936 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56474169 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56474185 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56474248 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56474905 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 56475014 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 56475089 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 56475129 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56477187 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 56477593 T A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 56477731 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 56477766 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56477867 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56477947 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 56478346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56479021 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56480083 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56481284 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 56482132 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56484700 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 56485417 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56486207 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56486920 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56486994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56487106 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56487250 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 56487390 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 56488676 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 56488936 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56489603 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 56491410 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56492200 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 56492892 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56492947 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56493518 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56493926 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56494132 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 56494437 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56497301 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56498026 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 56499498 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 56499811 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56500263 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 56500274 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 56500580 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56500600 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56501882 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 56502535 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56502613 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 56502731 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 56502752 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 56502936 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56502947 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56503064 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 56503189 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 56503190 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 56503219 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 56503268 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 56503372 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 56503476 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56503588 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 56503605 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 56504147 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 56504364 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56504408 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 56504417 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 56504590 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 56504990 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 56505144 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56505570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56505704 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56506189 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 56506213 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 56506240 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 56506295 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 56507242 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56507995 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 56509010 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56509351 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56509454 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56509828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56510632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56510690 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56510729 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56510735 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56510749 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 56511002 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56511190 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 56511329 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56511763 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56511841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56513195 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 56513417 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56513654 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56514471 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 56514870 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 56515380 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 56515478 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 56515705 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 56515729 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 56515873 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 56516014 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 56516104 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 56516151 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 56516152 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 56516244 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 56516378 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 56516408 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 56516610 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 56516656 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 56516663 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 56516698 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56516713 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 56516719 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 56516747 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 56516770 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 56516788 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 56517189 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 56517347 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 56517616 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 56517901 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 56517905 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 56518096 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56518160 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56518470 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56518475 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56518548 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56518619 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56518652 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 56519072 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 56519135 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56519226 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56519394 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56519435 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 56519542 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56519617 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56519650 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56519769 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 56519830 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 56519848 T G N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 56519931 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 56520025 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 56520051 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56520103 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56520178 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 56520257 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 56520319 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 56520400 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 56520410 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 56520546 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56520571 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56520582 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56520585 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56520613 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 56520649 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56520651 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56520690 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 56520691 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 56520730 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56520856 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56521077 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 56521078 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 56521357 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 56521385 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 56521423 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56521479 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56521518 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56521595 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56521619 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56521666 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 56521685 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 56521817 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 56521826 G T N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 56521834 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 56522163 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 56522185 G T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 56522238 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 56522250 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56522365 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56522373 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56522381 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56522482 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56522627 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56522755 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56522783 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56522923 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56522951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56523018 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56523161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56523376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56523702 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56523749 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56523757 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56523861 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56523908 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56524667 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 56525162 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56526006 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56526008 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56526032 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56526033 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56526081 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56526287 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 56526785 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56526871 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56526897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56526928 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56526968 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56527675 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 56528540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56528802 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56528932 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56529555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56530134 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56530186 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 56530402 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56530449 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56530462 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56530480 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 56530670 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 56530801 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 56530971 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56531123 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56531202 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56531267 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56531427 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56531463 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56531504 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56531572 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56531667 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56531805 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56531889 A G Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 56531964 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56532028 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56532110 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56532209 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56532213 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56532263 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56532528 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56532858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56532886 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56532972 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56533006 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56533459 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 56533460 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 56533570 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56533623 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 56533864 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56534028 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56534186 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 56534220 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 56534235 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 56534240 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56534246 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56534270 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 56534326 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 56534337 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 56534345 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 56534515 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56534737 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56534906 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56534907 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56535494 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56535501 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56535507 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56535580 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 56535637 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56535667 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 56535709 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 56535776 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 56535843 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56535850 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56535904 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56536220 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56536321 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56536363 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56536384 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56536414 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56536433 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56536463 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56537049 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56537063 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56537078 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56537350 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 56537369 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 56537392 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 56537405 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56537410 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56537716 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 56538082 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 56538126 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56538202 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56538231 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56538261 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56538802 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56538981 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56539045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56539307 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 56540177 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56540714 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 56540976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56542690 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56542842 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56544840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56545096 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56545570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56546377 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 56546826 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56547152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56548346 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56549146 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 56550871 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56551813 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56552110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56552676 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56552928 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 56553203 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 56553481 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56554327 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56554710 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56554877 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56558141 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56558179 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56558344 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56559851 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56560316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56561269 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56562190 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 56562577 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56565755 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 56565820 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56567051 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 56567246 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 56567265 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56568017 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56569389 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56569842 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56570411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56571615 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56571859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56572980 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56573410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56574490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56575476 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56575824 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56575835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56575909 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56575915 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56575927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56575984 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56576031 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56576057 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56576111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56576127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56576202 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56576220 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56576278 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56576327 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56576523 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56576612 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56576860 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56577201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56577279 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56577662 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56577760 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56577909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56578229 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56579268 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56579410 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56579437 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 56579494 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56579625 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56579697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56580166 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56580278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56580365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56580473 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56580708 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56580764 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56581216 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 56581336 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56581573 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56581658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56581759 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56581906 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 56581961 G C N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 56581984 A T Y N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 5 7 0 5 1 3 56582709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56582827 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56582875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56583855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56584745 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56584987 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56585666 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56586433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56586671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56586691 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56586736 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56587107 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56587438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56588002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56589383 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56589401 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56589572 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56589893 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56589984 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56590102 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56590547 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56590934 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56591656 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 56591754 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56593550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56593716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56594400 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 56595675 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 56596262 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 56596433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56599950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56601221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56601741 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56603541 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56605101 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56605180 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56605833 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 56606426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56607580 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56608627 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 56612302 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 56612951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56613527 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 56613933 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56614056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56614065 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56614264 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 56614273 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56614467 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 56614844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56614889 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56614920 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56614958 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 56614967 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56615060 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 56615096 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56615102 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56615176 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 56615180 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 56615199 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 56615212 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56615370 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56615439 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56615455 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56615608 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56615836 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56615859 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56615955 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56616197 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 56616245 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 56616654 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 56616669 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 56616789 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56616809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56616859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56616860 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56616870 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56616899 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56616902 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56616911 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56617136 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56617215 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56617349 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56617381 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56617470 T C N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 3 56617473 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 56617491 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 56617861 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 56617957 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 56617986 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56618057 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56618067 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56618080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56618178 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56618277 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56618308 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56618443 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56618588 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 56618697 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56618710 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56618777 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56618918 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56618972 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56619215 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56619218 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56619282 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56619376 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56619428 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56619440 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56619448 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56619458 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 56619517 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 56619525 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 56619548 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 56619580 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 56619589 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 56619640 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 56619646 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 56619711 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 56619774 C G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 56619929 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56619953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56619996 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56620032 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56620056 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56620299 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56620425 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 56620435 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 56620445 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56620535 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56620563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56620630 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56620649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56620735 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56620781 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56620799 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56620921 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56620922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56620972 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56621114 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56621223 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56621244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56621287 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56621315 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56621320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56621419 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 56621475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56621593 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 56621711 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56621722 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56621738 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56621847 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56621962 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56621968 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56622010 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56622015 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56622041 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56622055 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56622173 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56622244 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56622259 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56622337 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 56624569 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 56624602 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56624799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56624826 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56624930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56624984 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56625023 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56625049 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56625053 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 56625064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56625091 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56625252 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56625280 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56625319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56625394 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56625415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56625471 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56625763 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56625830 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56625880 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56626063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56626081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56626100 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56626108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56626126 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56626168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56626257 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56626417 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56626425 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56626431 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56626491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56626597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56626856 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56626862 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56626871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56627137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56627163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56627239 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56627291 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56627560 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 56627564 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56627623 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 56627918 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 56627934 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 56628076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56628089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56628124 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56628207 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56628647 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56628793 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 56628869 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56629125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56629196 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56629242 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56629294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56629400 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56629475 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 56629477 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56629492 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56629493 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56629635 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 56629684 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56629754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56629781 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56629936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56630067 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56630101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56630465 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56630476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56630704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56630917 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56630935 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56630998 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56631354 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56631379 G A Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 56631411 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56631521 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56631804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56631807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56631940 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 56632314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56632891 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56633014 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56633036 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56633069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56633218 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56633412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56633973 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56634114 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 56634501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56634661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56634668 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56635473 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 56635726 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 56635742 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 56635814 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 56637041 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56637352 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 56637369 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 56638686 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56639446 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 56640418 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 56640433 T G Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 56640566 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56640579 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56640695 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56640729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56640788 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56641075 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 56641171 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56641253 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 56641280 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 56641311 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 56641312 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 56641334 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 56641346 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 56641351 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 56641634 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 56641677 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 56641760 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 56641828 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 56641844 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 56641853 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 56641926 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 56641936 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 56641947 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 56641989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56641997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56642044 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56642069 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 56642092 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 56642182 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 56642323 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 56642384 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56642442 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 56642450 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 56642682 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 56642718 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 56642723 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 56642938 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 56643027 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 56643086 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 56643102 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 56643136 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 56643184 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 56643191 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 56643937 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 56643946 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 56644087 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 56644088 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 56644115 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 56644142 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 56644289 A C Y N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.142857142857143 0.714285714285714 0.142857142857143 14 14 2 10 2 3 56644811 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 56644843 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 56644942 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 56644998 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 56645046 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 56645082 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 56645288 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 56645415 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56645566 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56645667 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 56645668 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56645855 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56645858 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56646104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56646243 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 56646297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56646340 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 56646358 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 56646400 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 56646423 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 56646501 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 56646554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56646649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56646762 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56646869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56647200 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56647640 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56650108 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56650926 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 56651703 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 56659022 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 56659467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56660226 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56664355 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56664516 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56665990 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56666067 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56666190 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56668120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56668239 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 56668319 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 56668391 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 56668426 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 56668595 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56668614 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 56668675 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 56669053 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56669125 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56669179 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56669217 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56669353 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 56669387 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 56669394 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56669490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56669931 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 56670047 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 56670302 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 56670391 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 3 56670442 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56670499 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 56670553 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56670595 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56670720 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 56670872 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 56670957 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 56671068 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 56671244 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 56671291 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 56671419 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 56671449 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 56671544 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 56671569 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 56671662 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 56671752 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56671860 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 11 7 4 3 2 3 56671877 T C Y Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 3 56672019 A T Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 56672033 T C Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 56672054 G C Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 56672243 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 56672261 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56672299 C G Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 56672330 G A Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 56672379 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 56672660 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56672775 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56672947 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56672974 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56673007 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 56673013 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 56673056 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 56673281 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56673294 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 56673346 G T Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 56673546 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56673594 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 56673600 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56673669 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 56673841 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56673950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56674010 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56674088 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 56674114 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56674204 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56674256 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56674286 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56674333 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56674361 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56674472 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56674590 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 56674602 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 56674658 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56674748 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 56674883 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 56674924 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56674978 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56675171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56675379 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56675380 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 56675410 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 56676648 T G N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 3 56676651 T G N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0 0.8 0.2 12 18 0 12 3 3 56676974 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 56676998 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56677043 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 56677187 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56677347 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56677357 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 56677486 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56677844 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 56678025 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 56678027 A C Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 56678253 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 56679665 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56679935 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 56680084 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.176470588235294 0.0588235294117647 0.764705882352941 7 27 3 1 13 3 56680189 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 56680276 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 56680336 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 56680622 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 56680629 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 56680637 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56680643 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 56680654 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56680724 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 56680836 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 56680837 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 56681583 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56681767 T C Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 3 56682030 C T Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 56682155 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56682175 A T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 56682398 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56682421 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56682504 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56682586 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56683278 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56683302 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 56683364 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56683673 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56683687 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56683759 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56683816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56683953 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56683973 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 56684019 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56684150 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56684171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56684372 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56684578 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 56684585 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56684617 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56684646 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56684713 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56684716 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56684822 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56684830 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 56684841 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56684850 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56684852 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56684977 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 56685010 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 56685056 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56685116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56685199 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56685258 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56685328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56685475 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56685493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56685722 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56685819 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56685898 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56685971 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 56686052 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56686076 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56686124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56686136 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56686153 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56686380 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56686391 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56686421 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56686499 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56686571 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56686809 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 56686841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56687060 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 56687326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56687409 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56687750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56688211 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56688271 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56688458 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 56688543 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 56689124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56689774 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 56690388 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 56690397 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56690588 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56690689 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 56690744 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56690788 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56691205 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 56691416 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56691595 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 56691802 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 56691985 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 56692161 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56692370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56692579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56692808 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56692913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56692949 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 56693532 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56693547 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56693596 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56693625 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56693694 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 56693810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56693851 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56693908 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56694013 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 56694044 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56694160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56694208 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56694429 T G N N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 3 56694551 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56694621 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56694709 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56694790 A C Y N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 56695179 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56695566 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 56695803 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56695910 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56695945 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56695958 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56696175 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 56696256 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 56696402 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 56696409 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56696420 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56696444 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56696495 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56696574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56696588 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56696700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56696811 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56696925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56696931 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56696952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56696985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56696998 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56697211 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 56697306 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56697334 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 56697389 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 56697497 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56697546 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 56697566 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56697582 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56697673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56698005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56698052 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56698071 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 56698078 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56698180 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 56698219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56698235 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56698284 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56698290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56698405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56698436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56698463 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56698551 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 56698584 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56698736 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56698826 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56698865 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 56699202 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 56699262 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 56699278 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 56699447 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 56699467 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56699512 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56699836 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56700065 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56700153 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56700215 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 56700271 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 56700292 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 56700325 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56700348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56700372 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56700454 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 56700495 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56700521 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 56700522 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56700585 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 56700594 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 56700609 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56700612 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56700640 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56700655 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56700851 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56700986 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56701151 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56701339 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56701367 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56701640 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56702335 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 56702819 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56703783 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 56703836 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 56704168 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56704248 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56704580 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56704779 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56705337 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 56705357 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 56705436 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 56706081 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56706115 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 56706126 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 56706140 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56706187 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56706481 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56706594 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 56706727 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56706769 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 56706772 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56706904 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 56707072 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 56707125 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 56707166 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 56707288 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 56707356 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 56714373 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56714646 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 56715349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56717013 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 56719086 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 56719619 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 56719686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56747815 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56748009 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56748074 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56748112 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 56748485 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56748512 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56748525 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56748563 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56748798 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56748972 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 56749118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56749263 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 56749271 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 56749474 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 56749821 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56749900 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56750003 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56750160 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 56750416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56750544 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56750655 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 56750684 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56750797 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56750834 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56751000 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56751107 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56751128 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56751177 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56751197 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56751368 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56751613 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56751614 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56751994 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 56752077 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56752134 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 56752173 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 56752243 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56752263 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 56753334 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56753357 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 56753640 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56753835 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 56753966 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56754823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56755060 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56757830 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56757899 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56758833 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56759333 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 56760248 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 56760705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56763203 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56765402 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 56765456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56766731 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56767607 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56767655 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56769312 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56769653 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56771809 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 56772244 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56773295 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56773410 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56775351 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 56775565 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56775843 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56776551 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 56777506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56777962 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 56778102 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 56778841 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56778851 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56781062 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 56781081 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 56781423 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 56781891 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56781942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56781989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56782104 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56782118 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56782196 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56782276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56782300 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56782395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56782438 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56782465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56782523 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56782565 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56782682 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56782905 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56782930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56782963 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56783053 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56783095 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56783155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56783169 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56783181 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56783207 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56783224 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 56783320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56783339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56783411 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56783468 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56783515 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56783553 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56783555 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56783608 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56783720 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 56783782 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 56783900 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 56784003 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 56784096 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56784108 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56784164 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56784197 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56784198 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 56784219 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56784237 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 56784240 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56784303 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56784336 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56784359 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56784409 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56784440 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56784478 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56784544 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56784545 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56784616 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56784884 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56785079 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56785211 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56785282 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56785295 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56785328 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56785440 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56785608 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56785609 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 56785691 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56785732 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 56785874 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 56786476 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56788941 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56789223 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 56790003 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56790382 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56790541 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56790725 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 56790918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56791006 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56791478 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56792011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56793519 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 56793839 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56793863 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56793924 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 56794050 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56794095 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 56795072 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56795265 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56795727 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 56796074 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 56796425 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 56796620 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 56796881 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 56797005 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56797270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56797338 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56797342 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56797362 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56797364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56797411 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 56797453 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56797982 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56798008 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56798614 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56799144 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56800355 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56802849 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56803217 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 56804212 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56804236 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 56805094 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 56807271 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56807701 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 56808353 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 56808389 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 56808445 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 56808619 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56809010 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 56809058 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 56809095 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 56809127 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56809178 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 56809426 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 56809623 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 56809653 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 56809680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56809787 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 56809894 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 56809953 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56810096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56810127 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56810222 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56810236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56810279 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56810302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56810340 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56810378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56810490 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56810745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56810840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56810857 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 56811194 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 56811521 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 56811879 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56812257 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 56812876 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 56813165 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56813738 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 56813817 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 56813924 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56813943 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56813954 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 56813983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56814005 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56814253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56814280 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56814361 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56814422 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 56814732 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56814949 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56814994 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 56815019 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 56815026 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56815196 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 56815225 C G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 56815335 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56815452 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56815794 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 56815815 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 56815829 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 56815965 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 56815973 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 56815983 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56815998 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56816146 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56816187 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56816250 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 56816298 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 56816677 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 56816972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56817031 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 56817095 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56817132 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 56817254 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 56817271 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 56817325 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56817371 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56817409 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 56818645 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.1875 0.75 0.0625 18 14 3 12 1 3 56818656 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 56818787 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 56819798 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 56819829 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56819861 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 56819961 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56820002 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56820064 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 56820096 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 56820146 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 56820235 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 56820474 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 56820623 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 56820760 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 56821081 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56821352 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 56821358 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 56821382 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 56821521 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 56822423 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 56822589 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 56822777 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 56823024 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 56823231 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 56823290 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 56823478 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56823538 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 56823570 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 56823705 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56823959 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 56823999 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 56824122 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 56824240 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56824293 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 56824524 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56825056 C T Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 56825103 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56825223 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 56825224 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 56825241 A C Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 56825456 C A Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 56825501 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 56825793 A T Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 56825794 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56825948 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 56825988 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 56825989 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 56826094 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 56826239 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 56826320 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56826356 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 56826761 T C Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 3 56826773 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 56827005 G A Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 56828203 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 56828322 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 56828698 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 56828727 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56828853 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56828976 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 56829032 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 56829488 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 56829568 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 56829975 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56830727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56830882 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 56831739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56831808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56832046 A T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 56832793 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56832948 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56833500 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56833963 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56834276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56835955 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56836625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56836712 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56837238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56837553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56837792 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 56838125 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 56838434 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 56839251 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 56839339 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 56839340 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 56840259 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56840394 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56840558 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56841634 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56844969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56845580 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56846081 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 56846462 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56846639 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56848190 A G N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 56848630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56849825 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56849828 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56849950 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 56850031 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56850656 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56853098 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56856318 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56856507 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56856543 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56856726 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 56856796 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56857189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56857489 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 56857632 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 56857670 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 56857686 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56857838 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56857955 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56858265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56858415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56859713 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56859862 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56860028 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 56860077 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56860161 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56860337 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56860442 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56860500 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56860519 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56860688 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 56860790 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56860797 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56860826 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56861237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56861455 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56861493 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 56861515 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 56861833 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56862155 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56863019 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 56863113 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 56863154 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56874153 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 56874320 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56874429 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56874539 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 56874864 C T N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 3 56875013 T C N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 56875243 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56875480 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 56876537 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 56876600 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 56878529 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56878663 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 56878941 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56879476 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56880308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56880390 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56880596 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 56880600 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 56880726 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 56881122 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 56881467 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56881661 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 56881811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56881829 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56881993 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 56882082 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 56882160 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 56882162 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 56882279 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 56882354 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 56882383 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 56882743 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 56882917 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56883222 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56883274 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56883398 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 56883517 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 56883582 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 56883700 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 56883725 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 56883838 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 56883863 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 56883939 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 56884377 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56884839 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56884961 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56885321 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 56887925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56889175 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56889855 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 56892291 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56894002 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56894012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56898762 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56900813 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56901111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56901538 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56901730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56901796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56902882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56902949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56903206 C G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 56903777 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56904370 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56905278 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56905456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56907023 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56907104 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56907177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56911263 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56911400 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 56913840 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56914500 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56916586 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 56918644 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56918696 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56918727 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56918830 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 56919029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56919097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56920097 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 56920108 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56920169 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56920300 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56920656 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56920664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56920787 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56920951 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 56921094 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56921323 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56921438 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56921857 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56921870 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 56921907 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56922111 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56922261 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56922359 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56922620 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56922771 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56923270 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56923484 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56923705 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56923780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56925847 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56925960 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56926030 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56926128 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56926270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56926299 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56926429 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56926450 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56926474 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56926478 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56926578 T G N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 56926889 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 56927240 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56927255 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56927397 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 56927617 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 56927676 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 56927872 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56928084 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56928099 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 56928126 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 56928206 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 56928376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56928415 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56928469 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56928477 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56928481 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56928529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56928609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56928711 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 56928798 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56928799 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56928853 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 56928866 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 56929269 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56929879 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 56929910 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 56929911 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 56929932 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56930027 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 56930116 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 56930182 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 56930933 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 56931255 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 56931287 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 56931333 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 56931381 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 56931422 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 56931495 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56931546 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 56931564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56931921 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 56931926 C G N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 56932033 T G N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 3 56932270 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56932374 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 56932570 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 56932580 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56932588 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56932599 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 56932691 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 56932768 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56932886 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56933080 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56933098 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 56933103 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 56933263 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 56933311 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 56933516 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 56933652 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 56933663 T G N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 56933728 C T Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 56933739 A C Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 56933748 T C Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 56933921 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 56933983 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56934142 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56934342 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 56934358 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 56934417 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 56934479 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56934504 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56934562 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 56934572 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 56934576 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 56934893 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56935150 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 56935169 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 56935251 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 56935316 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 56935328 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 56935361 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 56935366 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56935417 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56935488 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56935495 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 56935520 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56936179 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56936255 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 56936270 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 56936304 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56936342 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56936441 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 56936472 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 56936651 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 56936776 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 56936785 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 56936816 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 56936988 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 56937047 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 56937091 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 56937112 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 56937417 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 56937422 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 56937504 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 56937530 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 56937724 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 56937875 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 56937920 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 56938123 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 56938212 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 56938282 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 56938321 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 56938443 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 56938475 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 56938555 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 56938584 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56938660 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 56939135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56939295 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 56939442 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 56939448 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 56939749 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 56939842 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 56939967 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56940031 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56940044 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56940197 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 56940402 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56940512 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56940514 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56940623 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 56940843 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 56940851 G T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 56940856 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 56940902 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56940911 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56940972 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 56941024 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 56941090 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56941103 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 56941204 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 56941232 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 56941290 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 56941370 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56941381 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56941387 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56941397 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56941607 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 56941648 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56941662 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 56941699 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 56941731 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56941863 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 56942354 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56942624 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 56942731 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 56943044 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 56943052 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 56943120 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 56943143 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 56943360 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 56943385 T G N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 56943387 C T N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.3 0.7 0 13 7 3 7 0 3 56943399 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 56943409 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 56943410 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 56943430 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 56943436 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 56943441 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 56943453 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 56943570 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 56943583 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 56943773 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 56943863 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 56943869 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 56943936 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 56944185 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 56944199 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 56944215 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 56944242 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 56944257 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 56944335 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 56944442 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56944562 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 56944572 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56944623 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 56944697 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 56944812 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 56944819 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 56944905 A G Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 56944926 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 56944991 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56945339 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56945365 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 56945387 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56945388 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56945413 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56945792 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56945820 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 56945939 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 56945968 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 56946002 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56946011 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 56946115 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 56946137 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 56946746 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 56946842 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56947199 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56947294 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56947304 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 56947324 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 56947539 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56947832 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 56948777 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 56948833 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56949165 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56949372 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 56949780 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56949881 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56950070 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 56950102 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 56950324 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56950336 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56950340 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56950383 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 56950398 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.0666666666666667 0.8 0.133333333333333 14 16 1 12 2 3 56950462 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56950627 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 56950654 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56950683 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 56950700 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 56950706 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 56950712 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 56950725 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 56952149 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 56952160 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 56952161 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 56952207 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56952209 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56952260 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 56952297 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56952310 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56952379 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 56952382 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 56952400 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 56952628 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 56952640 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56952667 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 56952720 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 56952797 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 56953054 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 56953128 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56953262 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56953362 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56953475 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56953656 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 56953854 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56954059 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56954127 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56954168 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56954226 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56954323 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 56954338 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 56954424 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 56954456 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 56954487 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56954661 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56954735 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56954804 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 56954831 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 56954891 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 56954913 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 56954931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56955037 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 56955058 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56955071 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56955108 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56955425 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 56955432 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56955489 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56956670 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 56956695 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56957390 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 56957583 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 56958421 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56958435 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56959411 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 56959968 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56960476 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56960579 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56960845 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 56961236 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56961412 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56961945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56962201 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56962413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56962640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56963488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56963813 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 56963857 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 56964258 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 56964399 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 56964443 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56964480 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 56964560 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 56964615 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56964649 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 56964860 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56964993 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56965193 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 56965378 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 56965418 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 56965512 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 56965568 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 56965587 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 56965618 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 56965700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56965954 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56965956 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56966024 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56966048 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56966073 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56966261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56966276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56966301 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56966413 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56966443 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56966515 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56966636 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56966640 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 56966970 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56966987 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56967003 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56967028 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56967096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56967113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56967173 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56967174 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56967408 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56967766 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 56967860 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 56967958 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 56968047 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 56968087 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 56968138 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 56968377 G C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 56968499 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 56968631 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 56968663 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 56969401 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 56969523 G C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 56969560 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 56969583 T G N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 56969641 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 56970025 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 56970038 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 56970041 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 56970191 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 56970260 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56970267 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 56970308 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 56970324 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56970341 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 56970346 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56970369 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 56970394 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 56970464 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 56970496 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 56970502 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56970527 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56970535 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56970541 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56970566 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 56970586 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56970670 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56970677 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 56970710 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56970714 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56970772 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 56970798 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 56970800 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 56970871 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56970954 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56970991 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 56970998 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 56971100 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 56971108 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 56971256 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56971286 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56971288 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56971333 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56971354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56971359 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56971460 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56971463 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56971485 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56971503 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56971523 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56971692 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 56971705 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 56971763 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 56971776 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 56971819 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 56971866 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56972010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56972047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56972118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56972220 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56972238 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 56972271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56972324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56972368 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 56972554 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 56972612 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 56972801 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 56972822 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56973125 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 56973286 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 56973309 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 56973375 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 56973450 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 56973527 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 56974111 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 56974268 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 56974309 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 56974489 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 56974624 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 56974732 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 56974857 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56975049 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56975105 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 56975107 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 56975118 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 56975132 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.0555555555555556 18 18 1 16 1 3 56975133 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.0555555555555556 0.833333333333333 0.111111111111111 17 19 1 15 2 3 56975168 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 56975283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56976120 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 56976148 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 56976361 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 56976395 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 56976475 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 56976503 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56976507 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 56976561 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 56977060 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56977377 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 56978378 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56978579 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56979192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56979633 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56983701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56985527 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56985768 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 56986116 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 56986160 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 56986198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56986360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56991225 G A Y Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 3 56992700 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 56992864 C A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 56993121 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 56993781 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56994425 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56995168 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 56996861 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 56997168 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 56997201 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56997265 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 56997288 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56997324 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 56997463 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 56997701 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56997724 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 56998113 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 56998237 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 56998439 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 56998690 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 56999041 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 56999203 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 57001029 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57001303 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 57001360 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57001519 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57001848 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 57002013 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57002169 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 57002263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57004082 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 57004630 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 57004657 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57005298 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57005691 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57007476 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 3 57007496 A T Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 57008112 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57008506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57008658 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57008873 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57009001 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 57009967 A T N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 57010051 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 57010065 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57010460 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57010513 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57011125 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 57011147 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 57011168 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 57011210 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57011225 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 57011226 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 57011238 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57011249 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57011395 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57011396 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 57011432 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57011440 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57011564 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57011867 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 57012073 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 57012176 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 57012340 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 57012355 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 57012852 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 57012891 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57012927 A G Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 57013066 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57013197 G A Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 57013367 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57013415 G A Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 57013436 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57013666 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 57013667 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 57013943 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 57013959 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 57013994 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 57014065 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57014212 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57014522 T C Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 57014550 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 57014700 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57014940 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57015100 T A Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 57015111 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 57015139 C A N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 57015145 C T N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 3 57015233 C T Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 57015278 C T Y Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 3 57015460 T C Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 57015516 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 57015532 T A Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 57015697 C A Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 57015698 A T Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 57015730 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 57015835 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57015978 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57016036 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 57016096 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57016107 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57016193 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 57016200 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57016275 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 57016362 G A Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 57016443 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 57016487 T G Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 57016547 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 57016573 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 57016732 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 57016825 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 57016926 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 57016956 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 57016967 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 57016976 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 57016992 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 57017014 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 57017044 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 57017183 A G N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 57017200 A G N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 3 57017248 A T N N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 3 57017263 G A N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 57017325 G A N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 57017512 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 57017530 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 57017531 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 57017632 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 57017678 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 57017852 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 57018086 C A N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 57018198 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 57018475 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 57018550 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 57018686 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 57018728 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 57018796 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 57018871 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 57019042 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 57020113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57020253 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 57020524 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 57020640 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57020919 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57021076 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57021160 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57021280 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57021482 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57021930 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57023710 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 57024043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57024884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57024968 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 57025067 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 57025147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57026817 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 57028174 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57029641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57031024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57031091 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57031429 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 57032857 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 57033321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57033544 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 57034008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57034074 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57034221 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57034252 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57034474 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57034520 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 57034540 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 57035196 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57035299 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57035506 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 57035527 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57035741 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 57035799 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 57035930 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57036390 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57036599 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57036947 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57037158 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 57037268 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57037450 A T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 57037502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57037660 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57037733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57037739 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 57037765 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57037892 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 57038398 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 57038432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57038478 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57039445 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57039469 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 57040008 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 57040048 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57040198 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 57043885 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57044600 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57044663 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 57044826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57044863 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57045196 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 57045586 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 57045875 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 57046102 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 57046155 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 57046367 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57046494 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57046813 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 57046886 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 57046978 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57047074 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 57047263 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 57047384 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 57047629 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57047668 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 57047979 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 57048060 G A N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 3 57048163 T C N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 57048176 T A N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 57048210 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 57048249 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 57048268 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 57048450 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 57048491 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57048508 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57048659 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57049050 G T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 57049163 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57049195 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57049334 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 57049343 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 57049356 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 57049438 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 57049518 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 57049717 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 57050030 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 57050202 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 57050243 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 57050305 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 57050345 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57050373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57050624 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57050660 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 57050687 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 57050854 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 57051167 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57051177 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 57051255 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57052237 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 57052407 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 57052419 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 57052481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57052605 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57052742 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 57052978 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 57053019 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 57053073 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 57053202 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57053373 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 57053555 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 57053626 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57053824 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 57053834 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 57053851 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 57054338 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57054416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57054485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57055106 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 57056352 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57057107 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 57057256 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 57057402 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 57057763 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 57057874 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 57057896 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 57057922 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 57058329 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 57058549 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 57058642 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 57058744 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 57058846 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 57058883 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 57058930 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57059147 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57061764 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 57061789 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 57062010 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 57062235 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 57062447 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 57062542 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 57062785 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 57062786 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 57064266 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57064625 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 57065545 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 57066602 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 57067141 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 57067832 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 57068800 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 57068881 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57068931 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 57069200 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 57069423 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57070592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57073273 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57074913 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57075750 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57076003 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57077394 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 57077538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57078257 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57078356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57079780 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 57079836 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57080740 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57081126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57081985 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57082000 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 57082590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57082624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57082674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57083780 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57083912 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57084093 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57084373 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57084684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57084912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57084946 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57084948 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57085242 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57085317 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 57085402 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 57085427 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57085879 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57085964 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57085993 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57086253 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 57086578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57086697 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57087048 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57087068 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 57087230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57087336 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 57087361 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57087389 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 57087417 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 57087468 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 57087482 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 57087499 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57087526 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57087883 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 57088119 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57088337 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 57089570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57093647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57093981 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57094002 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57094035 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 57094095 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57094180 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 57094254 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 57094486 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57095072 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57095336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57095744 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57095749 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57095892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57095902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57095946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57096240 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57096391 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 57096398 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57096615 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57096626 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 57096657 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57097066 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57097082 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57097131 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57097147 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57097186 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57097215 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57097218 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57097308 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57097338 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57097373 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57097576 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 57097851 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57097975 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57098212 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57098750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57099663 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 57100034 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 57100068 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 57100126 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 57100308 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 57100772 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 57100793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57100838 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 57100843 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57101137 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 57101196 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 57101218 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57101229 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 57101534 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57101686 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57101701 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57101952 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57101963 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57102098 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 57102526 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 57102604 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57102629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57102772 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57102800 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57103210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57103334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57103466 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57103499 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57103561 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 57103603 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57103606 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 57103614 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57103779 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 57103926 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57104017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57104088 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 57104126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57104175 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57104177 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57104256 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57104291 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57104317 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 57104423 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57104602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57104673 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57104707 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 57104749 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 57104845 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 57104862 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 57104888 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 57105009 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57105074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57105089 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57105094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57105376 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57105403 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 57105435 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57105503 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 57105589 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 57105590 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 57105710 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 57105764 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 57105782 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 57105880 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 57105895 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57105966 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57105967 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57105984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57106003 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 57106047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57106131 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 57106809 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 57106830 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 57107032 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 57107053 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57107076 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57107648 A T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 57107711 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 57107713 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 57107740 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 57107988 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 57108173 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57108266 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57108404 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57108467 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57108629 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57108721 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57108755 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 57108944 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 57109163 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 57109189 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57109240 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57109404 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 57109415 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 57109451 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 57109479 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57109482 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57109718 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 57109776 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 57109815 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 57109838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57109884 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 57110036 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57110218 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 57110234 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 57110252 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 57110310 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 57110556 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57111031 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57111271 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57111278 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57111332 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57111617 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57111770 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57111886 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57112560 G C N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 57112792 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57112836 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57113006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57113314 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57113459 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 57113523 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 57113909 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57114010 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57114123 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57114127 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57114179 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57114193 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57114257 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57114358 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57114441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57114666 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57114681 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 57115508 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 57115666 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 57115737 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 57115825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57116000 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 57116141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57116231 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57116245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57116266 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57116701 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 57116858 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57117056 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57117135 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 57117188 T A N N 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 57117585 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 57117870 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 57118021 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 57118118 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 57118197 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 57118235 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 57118307 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57118513 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 57118829 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 57118868 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 57119031 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 57119108 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 57119340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57119401 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57119499 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 57119634 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 57119713 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 57119732 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57120337 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57120359 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57120413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57120545 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 57120607 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57120725 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 57120775 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57120789 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57120850 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57120939 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57120963 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 57121166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57121329 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 57121402 C A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 57121514 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57121549 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 57121569 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 57121649 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 57121662 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57122023 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 57122259 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57122915 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 57123112 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 57123374 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57123436 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 57123441 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57123595 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57123737 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57123896 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57124020 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57124232 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 57124388 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 57124396 C T Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 57124465 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 57124717 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57124756 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57124790 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57125059 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 57125411 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57125467 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 57125761 T G Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 57132037 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57132357 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 57132371 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57132428 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57132454 C G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 57132622 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 57132783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57132888 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 57132906 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 57133140 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 57133441 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57133488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57133550 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57133880 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57134077 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 57134328 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57134478 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57134626 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 57134702 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 57134791 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 57134889 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57134902 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57135573 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 57135746 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 57136143 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57136160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57136194 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 57136929 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 57137182 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 57137802 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 57137807 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57138329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57138428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57138796 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 57138847 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 57139168 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57140069 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57140645 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57141942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57142445 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57143272 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57144093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57144097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57144866 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 57145245 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 57145662 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57146587 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 57147182 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 57148033 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57148417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57148453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57148608 G C Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 57148911 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57148989 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57149231 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 57149624 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57149632 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57149725 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 57149745 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57149750 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57149763 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57149792 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57149818 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57150652 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57151807 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 57152468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57152729 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 57152899 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 57153361 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 57153386 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57153461 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57153472 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57153629 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 57153646 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 57153666 T G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 57153675 A T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 57155212 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 57155252 A C N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 57155300 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 57155395 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 57155513 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 57155535 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 57155555 T G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 57155614 A C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 57155914 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57156027 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57156028 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57156094 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57156097 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57156182 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57156362 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 57156434 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 57156440 A C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 57156456 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 57156616 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 57156670 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 57156922 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57156935 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57157020 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57157110 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57157243 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 57157308 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57157395 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57157444 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57157481 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57157601 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57157644 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57157651 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57157770 A G Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 57157812 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57157952 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 57158059 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 57158104 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57158167 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57158200 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57158418 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 57158491 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 57158503 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 57158645 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 57158765 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57158767 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57158823 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57158836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57158956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57159269 G A N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 57165430 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 57165513 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57165567 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57165597 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57165635 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 57165927 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 57166059 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57166310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57166516 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 57166529 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57167023 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57167058 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57167089 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 57167122 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 57167253 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 57167269 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 57167315 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 57167337 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57167349 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57167357 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57167367 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57167369 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57167401 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 57167434 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57167550 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 57167598 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 57167630 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 57167677 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57167739 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57167741 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57167759 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57167815 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57167825 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57167837 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57167925 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 57168064 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57168243 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57168295 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 57168392 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 57168436 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57168500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57168504 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57168534 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57168568 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 57168649 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 57168664 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57168668 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 57168836 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 57168888 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57169046 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57169086 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57169091 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57169286 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57169296 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57169317 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 57169375 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 57169418 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 57169474 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 57169759 G A N Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 3 57170108 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 57170254 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57170278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57170287 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57170340 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 57170357 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57170380 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57170461 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57170476 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 57170544 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 57170618 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 57170684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57170775 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 57170855 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 57170927 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 57171025 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 57171030 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 57171114 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57171320 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57171522 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57171533 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57171585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57171637 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57171856 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57171947 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 57172195 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 57172224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57172254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57172304 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 57172434 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 57172543 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 57173012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57173022 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 57173084 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 57173255 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57173364 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57173456 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57173461 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57173475 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 57173495 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 57173630 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 57173799 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57173831 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 57173896 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 57173992 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 57174069 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 57174089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57174309 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57174342 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 57174365 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57174419 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57174435 T A Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57174584 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57174821 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 57175016 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57175105 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 57175120 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 57175324 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 57175503 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 57175663 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 57183535 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57183547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57183634 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57183702 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 57183703 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 57183714 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 57183797 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 57183937 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 57184030 A C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 57184147 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 57184299 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 57184453 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 57184660 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57184731 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57184909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57184940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57184969 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 57185184 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57185340 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57185399 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57185454 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 57185480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57185765 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 57185989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57186989 T C N Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 3 57187752 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57188662 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 57188681 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 57188714 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 57188761 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 57188827 T A N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 3 57189254 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 57189274 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57189459 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 57189577 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57189658 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 57189685 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 57189805 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57189852 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 57189855 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 57189888 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 57189925 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57189944 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57189946 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57190049 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57190175 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 57190287 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57191633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57191978 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 57193228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57193804 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57201341 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57203720 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 57203980 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57204331 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 57204799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57206099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57206436 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 57206516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57209040 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 57209163 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 57209909 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57211329 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 57213249 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 57215454 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57215670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57216244 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57219886 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0 0.75 0.25 12 20 0 12 4 3 57221137 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 57221905 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57221996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57222790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57224038 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57225609 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57227959 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57229343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57230297 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57232962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57234899 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57234945 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57235152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57236794 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57238958 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57239131 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57239263 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57241535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57243284 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 57244068 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57244576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57247852 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57247885 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57247972 A C N N 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 3 57248211 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57248437 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57248771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57248806 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57248862 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57248916 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57249186 C A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57249227 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57249382 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57250040 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57250619 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57250833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57250856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57250889 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57250907 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57251045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57251475 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57252227 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57254290 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57254300 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57259624 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 57260557 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 57260775 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57262146 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 57263532 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 57263533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57263620 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57264176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57264388 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57264723 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57265219 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57266024 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 57267257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57268212 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57270483 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57270678 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57270679 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57271268 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57272195 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57272196 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57272325 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57272397 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57274955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57276892 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57278926 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57280130 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57280486 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57281732 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57283420 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57284221 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57284623 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57286068 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57286312 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57286334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57286411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57286427 A T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57286627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57286930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57287310 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57287379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57288020 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 57290184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57290716 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57290782 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57290835 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 57290900 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57290988 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57291028 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57291135 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57291205 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57291314 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57291325 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57291842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57292122 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57292151 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57292288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57293215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57293479 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57293485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57293771 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 57294022 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 57294196 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57294198 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57294229 T A Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 57294298 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 57294369 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57294527 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57294566 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57294577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57294753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57294783 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 57295112 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 57295500 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57295520 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57295592 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57295594 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57295708 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57295791 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57295877 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 57295908 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 57295920 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 57295944 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 57296025 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 57296104 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 57296200 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 57296258 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57296601 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 57296696 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57296771 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 57296776 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 57296948 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 57296963 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 57297061 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57297064 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57297091 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 57297147 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57297192 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 57297242 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57297309 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57297322 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57297326 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57297349 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57297376 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57297485 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 57297561 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 57297608 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 57297614 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 57297653 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57297775 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57297779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57297789 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 57297888 T C N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 57298136 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57298414 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57298452 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57298465 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 57298614 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 57298615 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 57298939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57299095 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 57299377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57300001 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 57300002 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 57300106 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57300113 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57300257 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57300354 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57300861 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57303705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57305291 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 57305397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57305440 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57306014 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 57306186 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 57306455 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 57306705 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 57306873 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 57306884 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 57307300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57307491 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 57308577 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 57308753 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57309959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57310410 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 57310423 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 57310443 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57310492 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57310524 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 57310847 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 57310897 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 57310973 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 57310985 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 57310986 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 57311038 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 57311368 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57311524 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57311814 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 57312049 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 57312147 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 57312691 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57312694 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57312892 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57313205 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57313224 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57313257 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 57313337 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57313362 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57313374 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 57313458 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 57313525 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 57313554 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 57313676 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 57313748 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57313785 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 57313806 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 57313817 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 57313990 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 57314075 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57314234 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57314915 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57315078 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57315186 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57315309 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57315496 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57316059 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57316164 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57316208 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57316407 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57316435 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57317086 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 57317099 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 57317280 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57317428 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57317976 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57318190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57318277 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57318758 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 57318894 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57318982 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57319599 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 57319929 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57319936 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57320471 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 57320524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57320686 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 57320693 G A Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 57320960 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57321062 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57321068 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57321670 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57321762 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 57322509 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57323445 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57324419 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57324433 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57324488 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57324501 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57324502 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 57324599 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 57324789 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 57324842 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 57325323 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57325377 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57325497 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57325508 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57325544 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57325715 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57325827 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57325891 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 57325920 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57326437 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57326444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57326470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57326471 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57326829 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 57327790 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57327803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57327924 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57328980 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57329034 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57329264 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57329614 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57329710 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57329762 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57329857 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 57329891 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 57330054 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57330060 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57330075 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 57330229 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 57330351 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57330365 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57330400 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57330448 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 57330497 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57330629 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 57330647 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57330768 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 57330822 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 57330867 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57331191 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 57331374 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 57331488 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57331508 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57331514 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57331543 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57331572 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57331664 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 57331698 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57331709 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57331796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57331818 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57331929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57331936 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57332300 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57332370 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57332459 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57332531 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 57332624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57332881 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57333152 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 57333255 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57333262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57333270 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57333287 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57333288 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57333486 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57333560 G C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 57333642 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57333645 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 57333756 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57333912 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 57333983 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57334071 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57334081 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57335861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57337792 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57338239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57338715 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57340633 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57341702 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57342470 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57342471 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57342716 G T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57342717 A T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57342731 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57344309 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57344355 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57344360 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57344601 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57344610 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57344640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57344931 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57345249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57345265 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 57345618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57345622 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57345665 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57345728 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 57345781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57346024 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 57346132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57346885 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57347383 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57348627 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 57348673 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 57348709 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 57348924 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 57348932 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 57348974 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 57349020 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57349071 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 57350040 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57350108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57350180 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57350194 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57350367 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57350399 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57350423 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57350435 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57350982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57351234 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57351253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57351303 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57351504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57351549 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57351685 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 57352006 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57352362 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 57352411 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 57352568 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57352587 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57352638 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57352982 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57352994 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57353051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57353127 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57353166 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57353173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57353180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57353208 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57353274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57353290 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57353298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57353305 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57353370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57353393 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57353488 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57353508 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57353517 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57353582 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57353588 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57353672 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57353687 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57353727 G T N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 57353934 G A Y Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 57354120 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57354206 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57354517 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57354992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57356296 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 57356605 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 57356808 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57358482 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57359708 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 57362798 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 57363145 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57363168 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 57363469 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 57363846 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 57364707 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 57364727 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57364880 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57365071 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 57365157 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 57366579 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 57367483 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 57368315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57368595 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 57369070 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57369608 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 57369734 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57369760 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57369848 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 57369941 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 57370129 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 57370138 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57370422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57370910 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57370986 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57371207 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 57371398 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 57371865 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 57372446 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 57372797 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57373140 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57373258 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 57373326 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 57375762 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 57375841 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 57375881 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 57375928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57376124 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57376175 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 57376281 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 57377133 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 57377203 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 57377384 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 57377766 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 57377870 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 57377917 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 57377919 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 57377976 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57380294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57380768 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57381069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57381495 A C N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 57381669 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 57382493 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 57383291 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57383450 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 57383617 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57384987 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57385173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57385260 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57385306 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57385503 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57385684 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57387511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57387563 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 57387604 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 57388619 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57389146 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 57390185 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57390299 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57390392 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 57390490 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 3 57390911 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 57390959 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 3 57390988 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 57391081 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57391311 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 57391373 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 57391527 A C N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 57391849 T A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 57392387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57393059 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 57393129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57393167 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57393704 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57394293 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57394326 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 57394336 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 57394362 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 57394469 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 57394533 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 57394561 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 57394563 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 57394719 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 57394743 T A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 57394859 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 57395062 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 57395075 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 57395229 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 57395268 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 57395271 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 57395297 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 57395329 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 57395584 G T Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 57395593 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 57395633 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 57395638 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 57395647 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 57395709 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 57395873 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 57395902 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 57395904 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 57395929 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 57395976 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 57396025 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 57396037 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 57396047 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 57396119 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 57396132 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 57396149 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 57396161 A T Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 57396244 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 57396268 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 57396276 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 57396334 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 57396370 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 57396470 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 57396474 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 57396490 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 57396497 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 57396567 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 57396635 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57396710 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 57396722 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 57396739 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 57396748 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 57396895 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 57396920 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57396973 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 57397122 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 57397211 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 57397275 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 57397336 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 57397416 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 57397476 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 57397490 C T N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 3 57397513 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 57397525 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57397611 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 57397613 T A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 57397686 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57397818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57397926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57398033 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 57398060 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 57398141 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 57398263 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57398287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57398295 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57398344 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57398362 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57398370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57398696 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 57399304 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57399395 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57399476 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57399561 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 57399785 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 57399805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57399853 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57400007 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57400068 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 57400529 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 57400745 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57401220 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57401380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57401556 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57401559 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57401637 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57401650 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57401674 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57401713 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 57401715 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 57401748 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57402199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57402261 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 57402809 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 57402817 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 57403179 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57403200 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 57403254 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57403327 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 57403387 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 57403407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57404077 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 57404247 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57404339 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57405244 G A N Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 57406635 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 57407384 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 57408506 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57408653 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57412584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57413596 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 57413631 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57413944 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57413960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57413969 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57414046 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57414050 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57414173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57414200 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57414210 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57414253 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57414863 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 57414881 A C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 57414904 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 57415135 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57415252 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57416330 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 57416502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57416939 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57419027 G C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 57419501 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57419648 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 57419880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57419972 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57420125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57420398 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57421334 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57422337 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57422483 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 57422484 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57422574 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57423906 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57425085 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57425160 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57425180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57425277 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57425423 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 57425453 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 57425458 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 57425465 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 57425514 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 57425551 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 57425810 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 57425843 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 57425917 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 57426218 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 57426572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57426922 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 57426923 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57429453 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57431248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57431299 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 57431581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57432560 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57433158 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57433286 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57433296 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57433346 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57433464 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 57434182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57435008 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 57435704 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 57435897 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 57435981 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 57436178 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 57438947 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 57439792 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 57440278 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 57440339 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 57441516 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 57442388 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57446621 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 57447488 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 57448402 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 57449068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57449279 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 57449593 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 57449778 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 57450590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57450766 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57450877 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 57451130 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 57451675 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 57451995 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57452033 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 57452077 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 57452092 T G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 57452304 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57452969 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57453430 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57454006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57454482 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 57454808 T A N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 3 57454965 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 57455428 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 57455446 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 57455503 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57455576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57455699 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57456551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57456604 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 57456841 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57457104 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 57457356 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57457529 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 57457608 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 57457825 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 57457988 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 57458000 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57458234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57458303 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 57458316 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 57458471 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57458672 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 57458744 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 57458982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57459158 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 57459353 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 57459379 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 57459560 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57459690 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 57459719 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 57459752 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 57459849 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57459982 T A N N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 3 57460612 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 57460851 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57460868 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 57460967 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57461028 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57461111 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57461175 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 57461283 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 57461731 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57461744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57461856 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 57461928 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 57461951 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 57462026 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57462099 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 57462109 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 57462173 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 57462262 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 57462359 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 57462410 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 57462435 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 57462479 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57462598 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 57462604 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57462665 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57462676 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57462708 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57462717 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57462893 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 57462980 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57463234 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57463261 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 57463289 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57463746 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 57463899 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 57463918 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 57463959 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 57464068 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 57464134 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57464172 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57467852 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57468036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57471599 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 57473053 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57474058 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57475391 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57475506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57477318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57477354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57478767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57480349 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57481088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57482246 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57483123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57483161 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57484541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57484607 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57485504 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57486017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57491677 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57493268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57494624 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 57494751 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 57494819 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 57494852 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 57495189 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57495528 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57496744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57496886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57497312 T A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0 0.764705882352941 0.235294117647059 13 21 0 13 4 3 57498596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57502024 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57503971 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57507887 G C Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 57507890 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 57510890 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 57512385 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57517365 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57517480 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 57518299 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 57520874 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57521774 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 57523058 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57523427 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 57523439 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 57523504 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57524208 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 57524366 A G Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 57524431 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 3 57524574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57524594 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 57524718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57524778 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57525808 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57526538 C A Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 57527203 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57527764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57527878 G T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 57528241 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57528637 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57529418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57530909 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 57534566 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57537787 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 57538665 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 57539531 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57540756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57541733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57542163 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57542694 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57544833 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57545469 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57548182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57548390 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57548748 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57548825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57548846 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57549055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57549452 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57550019 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 57550717 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57550780 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57550832 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57551468 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57552678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57552689 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57554279 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 57555628 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57555772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57555807 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 57556078 G C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 57557762 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57561463 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57566586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57566877 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57570404 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 57571227 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57571363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57572405 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 57572776 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57573355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57574689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57575104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57581628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57583736 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 57584446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57585892 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57586608 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57587306 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57590933 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 57591084 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57591129 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57591743 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57596810 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57598487 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57598905 A G Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 57598926 A G Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 57599270 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57600344 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 57601970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57602858 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57603478 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57603548 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57603718 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57605404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57606156 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57607934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57611064 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57611336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57611388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57611539 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57611551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57612167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57612878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57614608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57615062 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57615211 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57615342 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57617766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57618480 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57618988 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 57619295 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57619623 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57620074 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57620125 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57620138 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57620612 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57622922 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 57622930 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 57623100 T C Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 57623815 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 57624362 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 57626368 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57626460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57626778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57626900 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57627131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57627215 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57627308 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57627841 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57627982 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57628496 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57628682 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 57630250 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 57630405 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57630456 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 57630507 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57630778 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57630815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57631520 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57631677 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57633110 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57633537 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57635039 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57635946 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57636161 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57638176 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57638838 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57639459 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57639545 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57639788 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57639939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57640980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57640988 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57641014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57641022 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57641034 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57641206 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57641879 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57641977 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 57642094 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57642461 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 57642759 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 57643030 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57643760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57644416 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 57644616 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 57644623 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 57649747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57653686 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57654459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57654505 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57658767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57659378 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57661926 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57663151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57664445 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57664762 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57665120 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 57667596 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57670763 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57671080 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 57671953 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 57673134 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57673523 T C Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 57673834 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 57674238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57674806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57675196 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57675207 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57677654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57679927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57681006 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57682792 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 57683036 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57683912 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57684315 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57689878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57690513 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 57691490 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57691518 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57692344 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57693826 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 57694442 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57696242 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 57699001 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57702643 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57702923 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57703320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57703364 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57705344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57705389 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57705555 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57706319 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57708144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57708346 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57708907 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57708955 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57708971 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57709825 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57710045 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57710054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57710218 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57710219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57710544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57710819 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57711106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57712142 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 57712340 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 57712424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57712448 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57712453 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57712465 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 57712522 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57712527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57712571 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57712585 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57712587 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57712721 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57712809 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57712900 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57712917 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 57712944 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 57712977 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57712995 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57712996 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57713009 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57713024 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57713038 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57713431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57713494 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 57713763 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57714170 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57714769 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57714778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57714924 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57715958 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 57716135 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 57718698 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57720117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57721219 G C Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 57724532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57724845 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57726768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57729515 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57730790 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57734870 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57735993 T C N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 57736307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57736498 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57737683 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 57738315 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 57740475 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 57740625 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57740662 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57740813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57740874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57740918 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57740925 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57741084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57741100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57741175 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57741199 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57741216 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57741220 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57741256 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 57741384 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 57741425 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57741458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57741497 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57741730 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57741742 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57741784 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57741812 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57741854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57741875 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57741909 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57741981 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 57742023 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57742070 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57742094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57742117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57742145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57742197 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57742221 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57742273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57742366 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 57742461 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57742498 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57742555 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57742572 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57742610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57742700 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57742704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57742776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57742858 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57742956 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 57743057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57743092 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57743286 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57743327 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57743365 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57743376 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57743383 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57743413 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57743583 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57743763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57743908 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57744084 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57744107 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57744112 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57744394 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 57744510 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 57744576 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 57745514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57745774 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 57745840 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 57745874 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57745926 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 57745937 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 57746025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57746252 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57746550 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 57746618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57748058 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57748119 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57748152 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 57748174 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 57748350 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 57748763 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 57748894 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 57749195 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 57749249 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57749522 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57749748 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57751726 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57751981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57752027 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 57752879 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57753055 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57753331 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57754405 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57754596 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 57754920 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 57755202 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 57756089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57756907 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 57756917 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 57756963 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 57757127 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 57757164 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 57757313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57758038 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57759142 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57759233 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57759674 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57759702 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57759780 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57759908 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57759997 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57760003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57760071 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57760158 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57760215 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57760256 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57760324 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57760601 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57760632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57761306 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57761314 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57761330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57761387 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 57761418 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57761469 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57761921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57763081 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57763278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57763391 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57763760 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57763778 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 57763810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57763968 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57763976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57764009 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 57764033 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57764082 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57764318 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 57764449 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 57764755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57764795 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57764807 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57764839 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57764953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57764973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57765076 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57765317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57765838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57765941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57766072 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57766360 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57766374 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 57766387 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 57766388 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57766401 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 57766426 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 57766467 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 57766480 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57766583 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57766595 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 57766680 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57766866 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57766931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57767023 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57767374 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57767638 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 57767944 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 57768089 A T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 3 57768331 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 57768378 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57768491 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 57768493 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57768518 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57768848 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57769055 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57769128 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57769373 C T Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 57769391 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 57769817 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57770011 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57770182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57770403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57770452 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57770615 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57770626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57770689 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57770787 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57770955 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 57770966 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 57770982 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 57770984 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 57770994 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57771005 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57771168 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 57771240 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57771299 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57771323 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57771498 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57771531 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57771654 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57771674 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57771773 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57771927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57772025 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57772027 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57772055 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57772223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57772262 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57772293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57772347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57772360 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57772379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57772642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57772646 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57773112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57773309 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57773332 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57773596 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57773910 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57773929 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 57774493 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57775226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57775248 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57775263 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57775590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57775598 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57775608 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 57776264 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57777065 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57777205 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57777635 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57777883 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57777936 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57777969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57778514 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57778516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57778639 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 57778683 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 57778811 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57778883 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57778927 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57778963 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57779025 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57779291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57779309 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57779759 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57780310 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57780371 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57780418 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57780492 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 57781388 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 57781389 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 57781525 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57781798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57781802 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57781830 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57781845 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57781914 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57782030 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 57782318 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57782353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57782621 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57782995 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57783121 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57783340 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57783631 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57783910 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57784324 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57784840 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57785019 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57785472 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 57785952 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57786444 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57786535 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57786694 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57786877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57786897 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57787174 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57787233 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57787256 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57787279 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57787495 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57787600 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 57787702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57787724 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57787978 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57787986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57788113 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57788204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57788236 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57788259 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 57788347 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57788355 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57788366 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57788419 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57788447 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57788624 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57788657 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 57788689 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57788799 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57788810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57788828 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57789096 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57789107 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57789282 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57789394 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 57789404 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 57789519 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57789606 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57789653 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 57789795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57789871 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57789890 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 57789891 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57789928 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57789977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57790448 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57790690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57790882 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57791137 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57792388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57792528 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 57792761 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57792852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57793194 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57793248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57793354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57793886 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 57793934 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57793995 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 57794306 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 57794372 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 57794385 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 57794411 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 57794540 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 57794609 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 57794617 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 57794675 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57794944 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 57795190 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 57795381 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57795487 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 57795666 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57796352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57796370 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57796802 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57796825 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 57796952 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57797372 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57797518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57797605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57797686 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57797732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57797767 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57797779 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57797848 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 57797876 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57798016 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57798215 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 57798236 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57798508 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 57798629 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 57798793 A T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 3 57798986 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57800140 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57800481 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 57800511 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57800901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57801765 G C N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 57801821 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 57802088 C G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 57802195 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57802608 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57802915 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57803017 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57803021 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57804172 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57804244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57804399 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57804874 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57805101 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57805402 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 57806093 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57806639 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57806833 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57806868 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57806885 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57806951 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 57806968 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57807001 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57807025 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57807101 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 57807223 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 57807365 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57807652 G A Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 57807805 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 57807954 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57808075 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 57808411 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57808427 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 57808750 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 57809077 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 57809248 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 57809265 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57809278 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57809342 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 57809460 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57809509 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57809585 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 57809827 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 57810082 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 57817048 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57817176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57817443 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57817642 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57817693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57817787 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57817808 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57817855 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57817864 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57817956 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 57817958 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 57818124 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57818137 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 57818193 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 57818231 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57818232 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57818366 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57818463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57818504 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57818601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57818623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57818668 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57818895 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57819185 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 57819284 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 57819501 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 57819565 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57819581 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 57819758 T C N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 3 57819783 A T N N 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 10 6 4 2 2 3 57819791 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 57820044 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 57820182 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 57820194 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 57820203 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 57820470 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57820611 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57820715 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57820787 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57820976 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 57821223 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57821732 T A N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 57821787 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 57822178 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57822228 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57822235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57822284 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 57822512 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 57822558 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57822597 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57822616 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57822664 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57822760 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57822823 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57822846 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57823235 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57823406 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 57823408 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 57823871 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57823932 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57823985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57824247 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57824302 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57824354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57824373 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57824375 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57824540 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0 0.764705882352941 0.235294117647059 13 21 0 13 4 3 57824750 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57824813 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57824835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57824864 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57824975 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57824995 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57825177 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57825308 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57825831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57826042 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57826123 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57826276 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57826330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57826398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57826447 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57826880 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57826909 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57827246 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57827450 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 57827561 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 57827997 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57828027 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57828117 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57828254 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57828413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57831320 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57831982 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57831983 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57832147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57832339 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57832401 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57833715 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57836960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57838572 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57838783 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 57839262 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57841283 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57846144 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 57846757 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 57848205 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57848827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57849434 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57849529 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57850203 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57850678 G A Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 3 57853185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57853453 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 57854423 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 57859857 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 57861897 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 57862306 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57862309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57862327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57862474 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57862475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57862531 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57862607 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57862643 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57862660 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57862697 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 57862739 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 57862778 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57862791 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 57862794 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 57862885 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57862898 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57862902 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57863041 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 57863059 T A N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 16 12 2 12 0 3 57863073 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 57863108 C A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 57863239 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 57863358 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 57863385 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 57863435 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57863458 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57863503 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 57863519 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 57863598 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57863618 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 57863638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57863712 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57863864 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57864871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57866764 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57867522 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57868210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57868284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57868613 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57868919 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 57869173 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57869478 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 57869706 T A N N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 57869823 G A N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 57872084 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 57872256 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57872267 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57872357 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57872922 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 57873059 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57873078 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57873101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57873140 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57873248 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57873264 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 57873282 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 57873331 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57873381 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 57873494 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57873509 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 57873544 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57873597 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57873606 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57874297 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 57874339 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57874400 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57874511 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 57874541 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 57874545 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 57874714 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 57874784 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57874794 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 57874894 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 57874943 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57875043 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57875091 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57875167 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57875180 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57875181 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57875198 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57875246 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57875295 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57875358 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57875416 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57875545 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57875561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57875581 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57875654 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57875703 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 57875770 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57875790 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57875857 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57875935 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57875943 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57876109 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 57876119 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57876442 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 57876461 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 57876633 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 57876670 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 3 57876727 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 57877186 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57877396 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 57877524 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 57877562 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57877714 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57877717 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 57878069 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 57878126 T C Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 57878216 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57878247 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57878270 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57878291 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57878306 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 57878356 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57878383 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57878392 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57878415 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57878438 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57878456 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57878721 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57878727 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57878838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57878875 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 57878950 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 57878972 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57878999 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57879055 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 57879074 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57879154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57879157 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57879238 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57879358 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 57879407 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 57879543 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57879561 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57879576 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57879609 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 57879617 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57879647 A T N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 57879675 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 57879683 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 57879828 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 57879847 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 57879865 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 57879930 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 57880012 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 57880060 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 57880096 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 57880105 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 57880374 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 57880592 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 57880715 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57880763 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57880871 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57881009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57881245 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57881252 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 57881289 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57881317 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 57881365 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57881429 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57881533 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57881560 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57881581 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57881657 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57881899 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 57881933 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57881973 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 57882039 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57882041 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 57882132 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57882135 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 57882290 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 57882352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57882591 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57882714 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 57882966 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57883066 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 57883176 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57883213 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 57883471 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 57883495 C T Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 57883668 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 57883677 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57883687 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57883710 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57884015 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 57884163 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 57884276 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57884293 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57884396 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 57884475 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 57885409 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 57885458 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 57885463 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 57885469 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 57885640 A G Y Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 11 7 3 5 1 3 57885700 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 3 57885708 A G Y Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 3 57885931 T C N Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 57886050 T C N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 57886099 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 57886138 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 57886144 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 57886227 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57886241 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 57886445 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57886482 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57886834 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57886866 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 57886871 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 57886909 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57886981 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57887186 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 57887313 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57887338 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57887385 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57887398 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57887418 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57887469 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 3 57887551 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 57887748 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 57887755 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 57888025 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 57888074 C A Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 57888080 A C Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 57888109 A G Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 57888180 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 57888199 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 57888211 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 57888235 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 57888302 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 57888514 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 57888562 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 57888588 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57888655 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 57888818 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 57888830 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 57888846 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 57888918 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57888926 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 57888931 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57888973 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57889101 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57889289 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 57889326 A G Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 57889330 A T Y N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 57889379 G T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 57889405 T C Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 57889406 G A Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 57889484 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 57889560 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 57889602 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 57889634 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57889644 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 57889645 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 57889695 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57889714 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 57889902 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 57890126 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57890236 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 57890372 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57890410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57890647 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57890797 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 57890811 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 57890979 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 57891011 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 57891100 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 57891106 G A N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 57891246 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 57891381 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57891666 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 57891692 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 57891703 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 57891723 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 57891870 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 57891895 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 57892125 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57892186 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57892192 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57892265 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57892645 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57892663 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57892680 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57892694 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57892727 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 57892782 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57892806 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57892821 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57892839 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57892895 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57892907 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57892922 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57893033 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57893076 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57893082 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57893119 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57893498 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57893573 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57894012 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57894014 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57894037 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57894049 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57894684 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57895874 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57895877 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57896136 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57896352 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 57897144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57897186 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57897203 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 57898155 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 57898814 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57898818 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57899123 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 57899124 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 57899150 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57899754 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57900251 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 57900431 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57900486 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57900639 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57900731 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57900820 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 57900966 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 57900996 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57901055 A T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 57901129 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57901139 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57901183 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 57901243 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57901245 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57901905 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 57902074 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57902105 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 57902550 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57902780 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 57902907 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 57902933 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 57903255 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57903303 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 57903305 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57903345 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 57903563 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 57903602 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 57903730 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57903859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57903893 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 57904238 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 57904292 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57904596 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57904654 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 57904659 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 57904698 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57904847 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 57904877 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57905381 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 57905614 T C Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 57905897 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 57905989 A G Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 3 57906028 C T Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 57906097 T G Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 57908381 T G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 57909333 T A Y N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 57909538 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57909589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57909605 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 57909979 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 57910069 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 57910960 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57912719 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 57912825 A C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 57913038 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 57913400 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 57913864 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 57913911 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57914510 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 57914569 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 57914583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57914617 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 57914685 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 57914703 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 57914949 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 57915337 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 57916069 A C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 57916089 C A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 57916372 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 57919583 C G Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 57922750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57925698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57928826 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 57928855 T C N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 57928918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57929058 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57929936 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 57934744 A G Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 57934745 T G Y N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 57934803 G A Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 57934890 A G Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 3 57935032 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57935039 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57938177 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57938477 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57939379 C A Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 57941549 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57942312 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57943342 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57943480 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57945002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57945321 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57946428 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 57950458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57950841 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57951848 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57951880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57952348 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57952888 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57953070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57953868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57954102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57954741 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57954742 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57954952 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57955574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57955872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57956502 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57956731 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57957039 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57957052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57957085 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57957785 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 57957941 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 57958159 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 57958271 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57958545 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57958618 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57958681 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 57958980 T C Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 57959070 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 57959098 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 57959210 C G Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 57959232 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57959292 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57959331 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 57959396 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 57959703 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 57960304 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 57960372 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 57960494 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 57960503 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 57960511 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 57960526 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 57960528 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 57960617 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 57960652 T G Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 57960658 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 57960788 G C N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 57960822 A T Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 57960902 T C Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 57961044 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 57962149 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 57962626 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 57962960 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57963358 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57965250 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57965259 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57965331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57965481 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57965494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57965515 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 57966093 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 57966116 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57966384 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 57967287 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57967808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57968411 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 57968415 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 57968466 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 57968508 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 57968510 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 57968590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57968869 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 57968905 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57969109 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57969374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57969564 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 57969733 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57969779 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 57971098 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57971669 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 57971844 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57971932 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57972391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57972508 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 57972529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57972816 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 57972931 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57973057 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 57973270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57973596 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 3 57975002 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 57975786 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57975806 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57976068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57976101 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 57976196 C A Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 57976643 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 57976691 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 57976781 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57977172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57977250 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57977284 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 57977318 G T Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 57977563 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57977596 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57977999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57978824 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 57978857 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 57979191 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 57979555 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 57979654 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57979701 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57979918 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 57979951 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57980079 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57980117 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57980170 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57980186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57980411 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 57980774 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 57980823 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57980829 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 57981027 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 57981912 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57982310 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 57982705 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57983008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57983414 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57983563 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 57983683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57983748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57984163 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 57984596 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57984938 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 57984944 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 57984986 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 57985213 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 57985234 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 57985247 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 57985261 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 57985293 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 57985424 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57985431 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 57985440 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 57985592 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 57985619 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 57985655 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57985678 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57986120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57986153 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 57986368 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 57986600 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57986601 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57987032 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57989092 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 57990162 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 57990275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57990366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57997291 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 57997456 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 57997486 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 57997536 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57997609 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 57997656 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 57998394 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57998939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57999088 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57999146 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57999191 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57999247 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57999252 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57999264 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57999349 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57999394 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57999461 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 57999462 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 57999504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57999594 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57999737 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 57999804 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57999809 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 57999836 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57999968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 57999980 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58000057 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58000211 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58000392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58000416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58001062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58001276 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58002288 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58002442 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 58003078 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58003201 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 58003267 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58003416 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58003439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58003539 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58003654 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58004111 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 58004443 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 58005068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58006274 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58006829 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58007649 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 58007730 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 58007745 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 58007852 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 58007873 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 58007896 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 58008014 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 58008150 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58008385 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58008445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58008502 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58008785 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58008828 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58008984 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58009003 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58009153 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58009182 G T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 58009196 T A Y N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 58009291 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58009359 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58009653 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58009667 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58010146 A C Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 58011783 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 58011992 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58012160 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58012435 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58012609 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 58012716 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 58013002 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58013207 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58013871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58013900 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58014672 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58014918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58015917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58015982 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 58016030 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 58016109 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58016116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58016166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58016183 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58016184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58016367 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 58016469 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 58016511 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 3 58016578 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 3 58016601 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 3 58016615 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 58016678 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 58016733 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 58016741 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 58017167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58017464 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 58017559 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 58017706 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 58017950 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 58018077 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 58018101 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 3 58018149 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 58018177 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 58018526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58018641 T A Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 58018711 T A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 58018889 A G Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 3 58019179 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58019335 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 3 58019461 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 58019470 A T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 58019489 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 58019857 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 58020076 T A Y N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 58020264 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58020266 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58020276 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58020324 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58020411 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 58020635 G T Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 3 58020648 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58020688 G C Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.222222222222222 0.722222222222222 0.0555555555555556 21 15 4 13 1 3 58020802 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58020844 T G Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.157894736842105 0.736842105263158 0.105263157894737 20 18 3 14 2 3 58020909 T G Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.166666666666667 0.722222222222222 0.111111111111111 19 17 3 13 2 3 58021186 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58021223 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 58021225 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58022258 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 58022261 T C Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 3 58022286 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 3 58022465 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 58022528 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 3 58022541 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 58023089 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 58023202 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 58023240 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 58023355 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 58023471 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 58023566 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 58023667 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 58023723 T A Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 58023897 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58023934 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58023966 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 58024128 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 58024176 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 58024232 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 58024262 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58024337 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 58024445 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 58024468 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 58024549 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 58024758 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58025214 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58025479 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58025613 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58025669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58025897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58025918 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58026300 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 58026723 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58027242 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58027298 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58027468 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 58028030 G A Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 58028062 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 58028146 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58028996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58029132 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58029193 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58029307 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58029418 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58029573 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 58029574 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 58029662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58029727 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 58029733 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 3 58029740 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.117647058823529 0.705882352941177 0.176470588235294 16 18 2 12 3 3 58029826 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58030030 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 58030132 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 58030289 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58030581 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 58030617 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58030830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58031204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58031356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58031721 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 58032210 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58032211 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58032245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58032282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58032404 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 58032449 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58032750 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58033185 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58033426 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58033637 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58034067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58034545 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 58034608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58034731 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 58034757 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58034768 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58035265 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58035276 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 58035327 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 58035706 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58035769 C G Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 58035797 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58036434 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 58036634 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 58036882 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 58037119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58037361 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 58037487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58037530 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58037784 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58038047 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 58038496 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58038745 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 58038778 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58038879 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58039934 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58041065 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58041075 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 3 58041168 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58041178 T A Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 3 58041345 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58041347 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 58042660 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58042702 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58042799 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 58043012 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58043122 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58043131 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58043281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58043404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58043695 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58043943 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58044122 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 58044164 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58044210 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 58044265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58044446 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 58044453 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 58045106 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58045298 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58045408 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58045462 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58045544 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 58045567 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 58045809 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 58046012 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 58046135 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58046154 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58046678 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 58048082 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58048240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58048514 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58049061 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 58049331 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58050072 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 58050293 C G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 3 58050295 C G N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0 0.75 0.25 12 20 0 12 4 3 58053942 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58057516 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58058054 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58058115 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58058247 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58058651 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58059275 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58059867 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58060456 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58061035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58061407 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58061573 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58062753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58063083 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58063094 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58063240 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58063241 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58063370 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58063418 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58063450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58064010 A T Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 58064011 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 58064102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58064133 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58064168 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58064206 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58064293 T G Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 58064509 C T Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 3 58064633 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 58064880 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58064917 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58065208 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58065710 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58065718 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58065786 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 58066072 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 58066119 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58067025 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58067629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58068030 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 58068201 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58068333 A C Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 58068477 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58068679 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58070948 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58071288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58071815 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58072429 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58072458 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58073628 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58073734 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58073834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58073870 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58073876 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58073948 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58074363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58074559 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58074913 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58074958 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 58075088 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 58075106 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 58075430 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 58082577 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 58082929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58083867 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58084150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58085260 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58085724 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58085730 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58085876 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58086196 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58087300 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58088168 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58089311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58089853 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58090501 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 58091490 T G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 58091493 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 58091693 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58091919 A C Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 58091979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58091999 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58092020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58092035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58092150 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58092244 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58092274 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58092304 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 58092358 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 58092510 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 58092514 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58092550 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 58092632 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 58092841 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58092872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58093290 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 58093304 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 58093416 C G Y N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 58093553 C A Y N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 58093565 G A Y Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 7 9 0 7 1 3 58093572 A C Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 58093624 T C Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 58093703 C T Y Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 3 58093752 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 58094092 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58094155 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58094242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58094243 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58094416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58094439 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58094548 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58094616 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58094655 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 58094657 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 58094859 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58095304 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58095318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58095343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58095383 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58095541 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58095566 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 58095679 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58095778 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58095806 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58095841 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58095883 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58095894 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58095965 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58096188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58096378 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58096493 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 58096647 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 58096913 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 58096918 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58097097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58097129 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 58097153 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58097160 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 58097257 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 58097337 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 58097374 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 58097407 G C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 58097453 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 58097577 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 58097661 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58097667 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 58097699 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 58097714 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58097832 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58098548 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58098622 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 58098715 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58098799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58099393 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58099684 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 58099801 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58099839 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58099990 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58100164 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 58100573 G A N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0 0.545454545454545 0.454545454545455 6 16 0 6 5 3 58100613 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 58100880 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58100882 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58100983 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58101006 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58101010 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 58101347 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58102043 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58102100 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58102140 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58102273 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58102689 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58102718 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58102812 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 58102829 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58103645 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 58103723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58104087 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58104311 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58104590 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58105103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58105467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58105518 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 58106445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58106542 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 58106788 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 58106920 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58107090 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 58107706 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58107984 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 58108132 A C Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 58109343 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 58110563 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 58110617 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58111334 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 58111421 T G N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 58112036 T A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58113617 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 58114193 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58114542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58115786 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58116182 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 58116200 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 58117746 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 58117776 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 58117830 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58117879 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 58118156 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58118485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58118504 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58118903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58119814 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 58120680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58120750 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 58121301 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58121553 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58121978 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 58122104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58122179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58122616 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 58122757 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58123030 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58123185 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 58123312 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 58123676 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 58123729 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 58123905 C A Y N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 3 58124144 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 58124301 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 58124336 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 58124379 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 58124431 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 58124757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58124797 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 58125265 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 58125335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58125347 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58125401 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 58125405 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 58125445 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 58126359 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58128115 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58128315 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58129245 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 58131241 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 58131549 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 58131684 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58131746 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 58131750 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 58131771 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 58131791 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 58131799 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58131933 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 58131938 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 58132010 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 58132018 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 58132030 T A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 58132304 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 58132312 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58132389 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 58132420 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 58132432 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 58132444 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 58132668 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58132670 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58132739 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58132740 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 58132780 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58132865 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58132922 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58132924 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 58133061 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 58133072 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 58133088 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58133126 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 58133971 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 58134163 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58134790 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58135378 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58135700 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58136659 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58140508 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58140810 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 58141239 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 58141327 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 58141800 T C Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 58141811 A C Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58141889 T C Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 58142158 A C Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 58142588 C A Y N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 58142591 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 58142875 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 58143209 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 58143509 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58143561 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58144044 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58144114 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58144253 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58144277 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 58144307 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 58145636 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 58145917 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58145919 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 58146079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58146190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58146241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58146295 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58146338 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 58146599 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 58146675 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 58146784 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58147234 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58147235 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58147369 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58147450 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58148026 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58148281 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 58148571 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58148850 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58148868 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58148936 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58149308 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58149887 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58150082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58150165 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58150283 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58150422 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58150730 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58151020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58151041 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58151430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58151527 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58151545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58151557 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58151718 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58151868 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58152236 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 58152349 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 58152458 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 58152603 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 58152780 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 58153639 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58153803 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 58153855 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58153910 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58154464 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58154773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58155060 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 58155391 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 58156178 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58156536 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 58156930 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 58157537 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 58158541 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 58159848 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58165122 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 58165446 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58165609 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58168388 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58170650 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58171034 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58172045 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 58172560 C A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 58172837 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58174434 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 58174497 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 58174671 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 58174884 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 58175099 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58176737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58177335 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58177630 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58177709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58177886 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58178378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58179316 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58179961 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58180266 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58180352 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58180431 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 58180475 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58180645 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 58180675 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 58181610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58183178 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58183616 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58184238 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 58184594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58185474 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58186225 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58186599 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 58187720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58188396 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58189543 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58190632 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58190993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58191405 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 58196416 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 58196495 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58196815 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 58204159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58205123 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58205665 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58206231 G T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 58206928 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58207392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58208469 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 58208829 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58209778 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58211608 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 58211762 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58211839 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 58212004 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58212646 T C Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 58212803 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 58212849 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 58213177 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 58213458 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58213544 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58213591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58214069 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 58214665 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58214674 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58215687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58216121 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58221788 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58223205 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58224299 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58225756 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 58226216 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58226282 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58226305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58226845 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 58230924 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58231221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58232300 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58232310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58234573 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 58238252 C G N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 58238591 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58245017 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 58245054 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 58248001 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58248033 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58250128 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 58251100 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58251787 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 58251791 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58252314 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58252361 A T Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 58253364 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58254296 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58254557 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 58254581 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 58255757 C G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 58256141 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 58257414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58260777 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 58261126 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58261806 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 58262172 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 58266733 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 58269566 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58269619 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58272523 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58272911 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58274499 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58274823 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58275164 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58275208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58275256 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58275358 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 58275775 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58275896 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58276940 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58278869 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58279097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58279186 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 58279796 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 58279966 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 58280053 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58280949 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 58281118 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58282743 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58284080 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58284090 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58284091 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58284378 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58284588 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58285419 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58285612 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58287158 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58287582 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58287708 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 58287719 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 58287816 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 58287871 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 58287919 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 58288109 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 58288210 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 58288384 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 58288819 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58288870 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58288881 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58289018 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58289227 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 58289238 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 58289313 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 58289351 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58289383 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58289402 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 58289602 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58289625 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 58289668 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58289982 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58290118 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 58290466 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 58290489 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 58290556 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 58290598 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 58290682 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58290735 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58290810 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 58290822 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58290927 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58290934 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58291180 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58291244 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58291419 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 58291693 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 6 12 0 6 3 3 58292231 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 58292298 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 58292391 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 58292528 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58292538 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 58293089 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 58293552 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 58293752 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58294001 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58294209 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58294270 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58294749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58294754 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58294941 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58295498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58295514 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58295567 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58295731 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 58295857 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 58296145 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 58296209 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 58296218 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 58296327 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 58296367 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 58296379 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 58296385 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58296727 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 58296857 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 58296860 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 58296871 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 58297127 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 58297378 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 58297404 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 58297725 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 58297874 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 58297983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58298023 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58298102 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58298129 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 58298216 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58298245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58298324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58298354 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 58298392 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 58298410 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 58298461 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58298693 T A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 58298875 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 58298926 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58298940 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 58298972 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58299012 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58299014 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58299055 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58299228 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 58299229 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 58299437 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58299448 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 58299508 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 58299670 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58299758 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58299828 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58299916 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 58299930 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58299931 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58299960 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58299989 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 58300000 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58300087 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 58300156 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 58300176 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58300412 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58300432 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58300458 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58300470 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58300535 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58300538 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58300616 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58300740 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 58300744 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 58300904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58301003 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 58301020 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 58301175 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58301402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58301461 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 58301559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58301640 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 58301652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58301757 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 58302047 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 58302054 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 58302125 A G Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 3 58302146 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 58302203 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 58302204 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 58302255 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58302279 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 58302297 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58302312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58302491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58302543 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58302569 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58302573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58302629 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58302816 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58302829 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58302887 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 58302901 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58303037 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 58303049 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 58303054 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 58303077 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 58303102 T C Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 58303155 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 58303210 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 58303292 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 58303304 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 58303307 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 58303334 A C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 58303384 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 58303441 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 58303649 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 58303702 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 58303737 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58303752 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58303788 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58303816 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58303825 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58303844 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58304053 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 58304057 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 58304121 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 58304167 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 58304172 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 58304339 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58304349 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58304483 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58305494 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58305858 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58305861 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 58305929 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 58306007 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58306093 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58306276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58306492 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58306565 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 58306633 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58306858 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 58306945 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 58307008 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 58307107 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 58307168 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58307264 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58307272 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 58307345 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58307686 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 58307742 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 58307905 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58308068 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58308111 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 58308167 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 58308174 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 58308200 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 58308279 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 58308320 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 58308453 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 58308930 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 58309119 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 58309391 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 58309402 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 58309405 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 58309416 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58309694 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 58311052 A G N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 58311225 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 58311271 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 58311282 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 58311416 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58311473 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 58311493 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 58311520 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 58311579 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 58311617 A T N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 58311672 G A N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 58311739 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 58311943 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 58312529 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58312580 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 58313182 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58313907 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 58313941 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 58313957 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 58314684 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 58315357 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 58316654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58316774 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58316925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58317633 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58319197 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58319289 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58319497 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58319689 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 58319848 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 58320501 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58321467 C A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 58321631 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 58322491 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 58322609 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 58322621 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58322678 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 58322855 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 58322902 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58323036 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 58324299 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58327996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58328064 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 58328758 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58329541 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58330553 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58332145 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58332555 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58333736 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58333737 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58337350 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 58337622 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 58339488 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58339965 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58340432 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58341002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58343047 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 58343167 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 58343303 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 58343327 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58343402 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 58343618 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 58343636 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58343658 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58344130 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 58344313 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58344435 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58344453 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58344455 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58344469 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58344491 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58344683 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 58344822 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58345206 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 58345336 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 58345441 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58345497 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 58345549 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 58345855 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 58345918 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 58345946 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 58346024 C T N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 58346078 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 58346119 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 58346204 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58346218 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58346449 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58346515 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 58346650 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 58346654 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 58346778 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 58346910 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 58347072 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58347447 G T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 58347705 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58347746 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 58347755 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58347894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58347943 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 58348126 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58348143 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58348245 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58348296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58348428 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58348559 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58348570 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58348589 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58348630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58348633 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58349077 A T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 58349326 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 58349653 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58349698 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 58349715 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 58350028 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 58350311 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58350458 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58350675 A G N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 58351156 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 58351168 C A N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 3 58351187 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 58351444 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 5 13 2 1 6 3 58351821 G A N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.272727272727273 0.272727272727273 0.454545454545455 9 13 3 3 5 3 58351859 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 3 58351905 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 58351974 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58352048 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 58352127 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 58352370 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58352394 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58352568 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 58352706 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 58353368 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 58353399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58354025 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 58354030 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 58354220 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58354241 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58354317 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58354428 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 58354434 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 58354621 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 58354926 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 58354933 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 58355391 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 58355495 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58355503 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 58355531 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58355722 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 58355748 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 58355770 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 58356026 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58356058 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 58356441 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 58356619 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 58356934 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58357225 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58357287 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 58357487 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58357630 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58357746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58357888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58357939 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58358029 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 58358503 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 58358670 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58358881 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 58358918 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58358919 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58359605 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 58359746 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58360707 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58360805 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58360868 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 58360869 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 58362036 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 58362145 A G N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 58362351 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 58362447 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 58362578 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58362579 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58362841 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 58363330 G A Y Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 14 12 1 12 0 3 58363551 T G N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 58363694 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58363894 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58363985 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58365393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58365497 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 58365506 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 58366008 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58367552 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58368692 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58369960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58370211 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 58371097 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58371447 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 58372115 G A Y Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.153846153846154 0.846153846153846 0 15 11 2 11 0 3 58372671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58373249 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58374406 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 58374725 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 58374879 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 58376260 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58376371 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58376507 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58376811 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 58377402 C G N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 58377450 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58377475 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58377525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58377644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58377659 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58377713 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58377727 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58377810 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58377877 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58378074 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58378085 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58378140 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58378148 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58378233 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58378357 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58378435 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58378564 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 58378636 A C N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 10 20 0 10 5 3 58378774 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58378820 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58378928 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58378930 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58379147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58379592 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58379953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58382622 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58382714 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58384376 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 58385312 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58386032 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 58386514 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58390910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58392099 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 58393041 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58398072 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 58398164 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 58398187 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 58398848 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 58399070 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58399295 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58399299 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58399669 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58399926 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58400033 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 58400237 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 58400277 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58400302 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 58400415 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58400920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58401089 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58401179 G T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 58401454 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 58401640 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 58401946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58401968 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58401995 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 58402084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58402146 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 58402530 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58402656 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58403752 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58403818 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 58403998 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58404069 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58407133 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58407183 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58407233 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58407757 G C Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 58407760 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58408390 A G Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 58408539 G C Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 58409039 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58409043 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 58409054 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 58409057 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 58409134 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58410796 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58410823 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58410844 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 58411202 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 58411382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58411410 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58411566 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58411898 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58412569 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58412706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58412807 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 58412924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58412943 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 58412978 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58412984 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58413023 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58413039 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58413460 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58413478 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58413510 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58413516 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58413536 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58413690 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58413741 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58413847 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58413956 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58413959 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58413971 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 58414235 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 58414262 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 58414295 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 58414333 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58414352 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58414402 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 58414412 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58414495 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58414509 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 58414521 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58414653 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58414695 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58414853 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 58414856 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58414906 C A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 58415011 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 58415019 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58415030 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58415041 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58415077 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 58415087 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58415190 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58415204 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58415225 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58415321 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58415428 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58415503 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58415506 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58415528 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 58415585 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58415665 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58415709 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58415737 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58415812 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 58415872 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58415942 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 58415947 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58416425 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58418117 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58418954 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58419387 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58419413 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 58419433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58419449 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58419477 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 58419607 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 58419662 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58419693 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58419746 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58419861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58420592 G A N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 58420809 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58420883 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58421013 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58422284 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 58422525 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58422592 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58422836 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58423020 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58423082 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 58423577 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 58423713 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58423801 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 58424989 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58425321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58426297 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58427456 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58428549 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 58429675 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 58430272 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 58431549 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58431754 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 58431765 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 58431907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58433507 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58434883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58435670 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58439090 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 58441753 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58442824 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 58443241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58444032 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58450260 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58450296 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58450913 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58450923 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58454958 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 58456239 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58457220 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58458424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58460259 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58460399 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58460428 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58460536 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58460584 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58460602 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58460998 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58461961 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 58466354 A G Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 58466564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58467119 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58467120 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58467316 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 58467785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58467995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58468042 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 58468142 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58468184 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58468196 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58468252 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58468431 A T N N 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 3 58468435 T G N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 58468453 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 58468510 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 58468609 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 58468654 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 58468749 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 58468814 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 58469039 T C Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 58469174 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58469294 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58469435 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58470182 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58471770 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58472349 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58472431 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58472434 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 58472479 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 58472496 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 58472692 T C N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.166666666666667 0.583333333333333 0.25 11 13 2 7 3 3 58472696 C T N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 3 58472713 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 58472726 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 58472833 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58472974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58473147 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 58473990 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58474885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58475774 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 58476115 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58476272 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58476383 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58476983 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 58477024 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58477077 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58477116 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58477325 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58477864 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58477898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58478043 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58478117 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58478203 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 58478414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58478416 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 58480656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58480793 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58481282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58481392 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58481644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58481750 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 58481858 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 58481900 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 58482383 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58482620 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58484119 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58484132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58484914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58485092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58485429 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58488459 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58488468 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58494517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58498427 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58499829 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58502455 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58502456 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58503313 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58505719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58505863 G C Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 58510662 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58510756 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58510987 T A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 58511247 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58511383 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58511804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58511982 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58512004 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58513939 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58515495 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 58515693 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 58515822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58518008 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58518106 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58518377 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58518527 C A N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 58518583 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 58518596 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58518620 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 58518635 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 58518668 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58519078 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 58519124 T C Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 58519552 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58519566 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58520116 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58521074 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58521124 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58522490 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58523193 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58523279 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58523947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58525381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58526441 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58526774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58527220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58529985 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58533163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58534613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58535032 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58535184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58535409 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58536133 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58536213 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58536487 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58536692 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 58536763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58536777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58537009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58537698 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58537958 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58538578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58539108 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58539474 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58540939 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 58541358 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58542077 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58542313 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58542609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58544005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58547377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58550556 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58551870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58552103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58552949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58553285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58553448 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58553495 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58553948 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 58554034 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 58556760 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58557490 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58558822 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 58562458 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 58562491 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 58562497 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 58562518 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 58563226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58563352 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58563450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58563464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58563509 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58563539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58563645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58564065 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58564207 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 58564222 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 58564481 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 58564760 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 58564901 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 58564912 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 58564931 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 58564950 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 58565145 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 58565184 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58565188 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58565954 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58566017 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58566065 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58566076 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58566089 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58566144 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58566197 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58566243 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58573254 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58573287 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58573517 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58573732 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58573936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58574161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58575405 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58575721 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58576968 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58579988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58581638 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58582800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58582863 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58582910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58582911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58583239 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 58584035 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 58584098 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58585404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58586817 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58587000 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58587698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58587770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58588020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58588073 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58588233 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58588247 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58588283 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58588341 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58588452 T A Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 58588704 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 58588740 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58588818 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58589084 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58589123 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58589218 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 58589258 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58589841 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58591363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58591677 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58591777 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58592088 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58592089 A T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58592235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58592359 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 58592800 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58593207 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58593344 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58593938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58593973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58593974 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58594431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58594563 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58594692 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 58594697 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 58594787 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 58595232 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58595893 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58596018 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58596088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58596340 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58596345 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58596498 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58596809 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58596875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58597128 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58597185 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58597702 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58598203 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58598209 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58598246 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58598339 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58598347 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58598351 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58598577 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58598579 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58598625 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58598687 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58598692 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58598710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58598743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58598841 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58598949 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58598982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58599000 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58599044 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58599142 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58599438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58599472 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 58599476 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58599491 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58599845 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58599936 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58600017 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58600084 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58600199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58600219 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58600249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58600436 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 58600952 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58601457 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58603450 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58603505 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58603550 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58604075 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58604593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58604741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58605807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58606015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58606697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58607548 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 58608303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58608311 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58609103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58609522 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58609941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58610126 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58610469 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58610685 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58610726 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58610775 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58610860 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58611139 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58611226 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58611509 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58611577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58612273 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58612763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58612774 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58613195 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58615374 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58615932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58617350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58617534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58617829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58617855 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58617907 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58618089 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58618099 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58618744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58618836 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58618916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58619749 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58620121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58620462 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58620535 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58620543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58620551 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58620565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58620631 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58620746 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58620815 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58621031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58621053 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58621069 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58621157 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58621170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58621222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58621232 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58621265 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58621652 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58621698 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58621705 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58621960 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58622039 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 58622200 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58622205 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58622341 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58622360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58622491 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58622512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58622661 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58622788 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58623070 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58623369 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58623456 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58623476 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58623748 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58623886 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58623887 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58624053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58624384 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58624683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58624712 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58624941 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58625002 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58625203 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58625931 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58626947 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58627089 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58627092 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58627523 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58627643 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58627849 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58627971 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58627988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58630300 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58630476 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58630794 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58631540 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58631628 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58631785 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58631881 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58631888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58631989 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58632249 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58632276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58632295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58632309 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58632541 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58632544 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58632695 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58632851 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58633015 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58633034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58633069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58633102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58633134 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58633204 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58633220 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58633330 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58633403 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58633435 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58633459 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58633465 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58633473 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58633531 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58633590 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 58633756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58633768 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58633926 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58634126 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58634255 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58634368 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 58634565 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58635516 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58635522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58635530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58635767 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58635784 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58637069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58637186 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58637783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58637996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58638295 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58638367 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58640756 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58641687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58642988 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58643689 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58644362 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 58646542 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58648422 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58650393 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58650578 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58650927 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58652210 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58653481 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58654056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58655690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58667267 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58667270 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58667289 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58668593 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58668664 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58671126 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58671282 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58671620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58672806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58674591 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58676375 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58676446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58676628 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58676940 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58676964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58677028 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58677072 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58677115 A C Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 58677316 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58677506 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58677654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58677657 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58678053 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58678197 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58678233 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58678289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58678362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58678599 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58678802 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58678846 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58678948 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58678989 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58679066 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58679155 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58679202 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58679264 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58679345 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58679955 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58680145 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58680361 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58680447 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 58680616 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58680618 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58680783 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58680797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58680916 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58680979 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58681267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58681395 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58681399 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58681438 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58681439 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58681502 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58681558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58681595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58681596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58681657 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58681795 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58681823 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58681962 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58682002 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58682098 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58682167 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58682172 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58682187 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58682283 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58682927 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58683214 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58683238 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58683242 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58683470 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58683648 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58683735 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58685134 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58685325 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58685493 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 58685532 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58685768 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58686019 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58686099 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 58686114 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58686238 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58686301 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 58686571 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58688006 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 58688411 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58688414 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58688994 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58689134 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58689260 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58689381 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58689428 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58690417 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58690445 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58691785 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58692358 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58693018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58693069 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58693403 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58693593 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58693829 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58694146 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58694205 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58694446 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58694759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58694781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58695365 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58695482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58695515 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58695540 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58695549 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58695636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58695645 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58695725 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58695726 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58695870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58696027 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58696036 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58696141 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58696142 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58696232 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58696441 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58696562 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58696770 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58696831 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58696846 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58696958 G T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 58696972 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 58697104 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 58697172 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58697179 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58697187 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58697227 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58697257 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58697487 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58697630 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58697710 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58697774 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58697784 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58697872 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58697921 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 58697932 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 58697954 A C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 58698107 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 58698328 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58699485 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58699575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58699663 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58699753 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 58699760 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58699789 A G N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0 0.846153846153846 0.153846153846154 11 15 0 11 2 3 58700103 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58700150 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58700154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58700167 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58700254 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58700961 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58701162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58702458 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 58703294 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 58703793 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58704206 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58704347 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58704485 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58704774 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58704795 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58704816 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58705381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58705557 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58705684 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 58705912 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58707413 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58707531 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58707591 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58707682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58708319 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58708601 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58709201 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 58709266 G C Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 58709723 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 58709757 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58709962 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58710083 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58710177 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58710886 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58710929 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58711153 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58711162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58711291 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58711513 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58711541 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58711951 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58711973 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58712032 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58712301 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 58712525 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58715650 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 58715685 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 58716272 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58716772 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58717067 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58717402 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58717769 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58717880 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58717881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58718691 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58718790 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58718820 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58718830 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58718864 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58718951 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58719061 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58719192 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58719222 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58719235 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58719274 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58719297 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58719344 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58719384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58719395 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58719398 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58719470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58719594 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58719711 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58719730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58719756 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58719836 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58719912 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58719925 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58719974 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 58719988 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58720267 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 58720302 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58720318 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58720389 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58720479 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58720491 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58720538 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58720624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58720631 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58720635 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58720663 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58720697 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58720702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58720751 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58720810 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58720903 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58720920 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58721403 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58721426 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58721586 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58721804 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58722037 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 58722038 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 58722081 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 58722097 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58722280 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58722281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58722566 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58722932 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58723611 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58723737 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58723933 T A Y N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 3 58724004 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58724447 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58724835 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58725795 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58726090 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58726165 G T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58726690 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58726819 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58726875 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58727429 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58727911 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58728062 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58728206 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 58728444 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 58728525 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 58728916 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 58728934 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58730348 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58730370 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58730720 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58731963 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58732214 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58732226 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58732391 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58732418 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58732618 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58732791 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58732954 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58733009 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58733041 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 58734727 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58734865 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58735014 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 58735218 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 58735248 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 58735513 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58735547 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58735748 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58735759 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58735937 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 58736112 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 58736138 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 58736443 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58736558 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58736978 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58737010 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58737041 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58737882 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 58738064 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 58738123 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 58738166 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58738233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58738412 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58738599 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58738639 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58738864 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 58739053 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58739225 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58739289 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58739532 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58739674 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58739714 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58740110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58740172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58740255 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58740258 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58740402 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58740617 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58740623 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58741355 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58742178 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58743947 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 58745377 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58746465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58746491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58751059 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 58751098 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 58751278 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58751605 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58753111 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58754906 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58755168 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58756289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58756391 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58756462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58756492 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58756536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58757287 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58758272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58758556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58759867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58759895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58760230 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 58760536 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58760719 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58761823 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58762350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58762893 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58763389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58763617 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 58763715 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58764206 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58765261 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58766186 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58766924 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58767198 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58767399 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58767545 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58767928 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 58767971 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58770356 C A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 58770797 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58770834 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58771474 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58771611 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58771699 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58771725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58771752 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58772119 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58772574 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58773902 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 58774006 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58774356 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 58774448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58774802 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58775670 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58776475 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58776479 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58776494 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 58776497 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 58776764 C G N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 3 58777016 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58777463 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58777524 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58777566 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58777652 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58777660 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58777691 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58777702 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58777871 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58777940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58778023 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58778073 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58778098 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58778158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58779656 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58780862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58781083 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58781779 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58781789 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58782192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58783027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58783319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58784474 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 58784621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58785040 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 58785415 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 58785914 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58785936 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58787130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58787331 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58787506 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58787875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58788491 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 58788778 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58788808 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58789756 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58789788 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58791008 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 58793168 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58793248 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58797136 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58797296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58797459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58798773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58798938 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58798948 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58799513 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58799785 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58800044 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 58800319 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58800885 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58801166 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58804368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58804405 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58804571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58807235 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58808117 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58808235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58809241 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58811800 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58812734 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58812895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58813637 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58815391 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 58815406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58816063 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58816098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58816224 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58816243 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58816474 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58816660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58817529 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58817693 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58818005 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58818100 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58818226 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58818372 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58818562 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58822011 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 58822678 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 58822834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58823803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58827157 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58827241 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58827348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58827351 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58827475 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58827604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58827715 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58828030 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58828436 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58828535 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58828824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58828920 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58828970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58829009 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58829052 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58829256 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58829284 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58834236 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58834454 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58834527 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58834585 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58834966 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58835112 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58835151 C G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58835152 C G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58836802 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 58837183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58837191 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58840368 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58843803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58844925 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58844966 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 58844984 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 58845372 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58846107 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58846149 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58846497 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58846618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58846745 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58846762 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58846927 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58846976 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58846995 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58847853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58848018 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58848055 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58848264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58848690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58851119 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58855841 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58856114 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 58856152 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58856175 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58856244 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58856321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58856368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58857177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58857443 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58857774 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58858050 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58858419 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 58859733 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58859762 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58859808 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58859860 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58859953 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58860362 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58860586 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58860684 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58860770 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58860802 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58860945 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58861000 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58861005 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58861130 A C Y N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 58861142 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 58861143 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 58861188 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58861194 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 58861249 C T Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 58861250 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58861337 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58861405 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58861433 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58861553 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58861631 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58861739 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 58861871 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58861905 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58861909 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58861934 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58862173 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58862341 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58862765 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58862902 A T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58862979 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58863154 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58863686 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58863712 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58863721 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58863735 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 58863736 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 58863778 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 58863831 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58863858 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 58863968 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 58864478 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58864658 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 58864697 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 58864720 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 58864790 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 58864923 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58864963 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58865143 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58865292 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58865318 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 58865339 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58865393 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58865497 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 58865503 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 58865973 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58866190 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58866255 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58866267 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58866433 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 58866501 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58866502 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 58866616 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58867030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58867684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58867795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58868020 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 58868471 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58868844 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58869885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58869970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58870365 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58870381 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58870432 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 58870433 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58870464 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58870475 A T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58870584 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 58871410 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 58871414 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 58872356 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58873499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58873811 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58874312 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58875145 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 58875284 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 58875907 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 58875911 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 58875921 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58875943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58876047 A T Y N 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 3 58876169 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 58876192 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 58876198 C A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 58876212 C T Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 58876228 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 58876373 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58876386 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58876594 C T Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 58876993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58877222 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58877883 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 58877930 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58878061 A T Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 58878173 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58878341 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58878407 T G Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58878419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58878703 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58878753 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58878809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58878829 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58878881 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58878929 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58879009 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58879012 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58879178 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58879414 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 58879515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58879530 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 58879933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58880167 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58881729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58882096 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 3 58883327 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58889223 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 58889246 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 58889262 G T Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 58889351 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58890669 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58890710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58891166 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58891388 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58891469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58892024 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58896469 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58896530 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58896534 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58896645 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58897033 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58897049 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58897069 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58897092 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 58897266 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58897305 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58897910 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58897985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58898093 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58898112 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58898222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58898256 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58898270 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58898303 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58898329 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58898572 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58898578 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58898597 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 58898636 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58898642 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58898648 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58898700 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58898726 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58898753 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58898855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58898954 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 58899306 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58899312 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58899587 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58899636 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58899641 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 58899715 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58899873 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58899884 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58899996 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58900009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58900015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58900027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58900046 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58900206 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58900231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58900281 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58900282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58900413 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 58900469 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58900580 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58900668 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 58900907 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58901063 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58901167 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58901176 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58901201 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 58901209 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 58901248 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 58901283 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58901311 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 58901939 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 58902061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58902430 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58902485 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58902546 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 58902666 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58902752 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58902784 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58902850 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58902885 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58902973 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58902990 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 58903021 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58903325 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58903367 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58903642 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58904095 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58904098 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58904118 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58904161 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58904727 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58905247 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 58905777 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 58905891 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 58905937 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 58906192 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58906458 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 58906459 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 58906643 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 58907370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58907449 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58907793 T G Y N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 3 58909689 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58912598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58916959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58919132 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 58920620 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58920776 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58921422 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58923702 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 58924013 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 58924295 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58924401 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58924553 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 58926153 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58926178 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58926427 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58926465 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58926518 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58926604 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 58926607 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 58926644 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 58926683 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 58926879 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58926971 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 58927027 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58927082 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 58927107 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 58927759 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58927762 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58927802 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58928020 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 58928364 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 58928438 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58929298 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58929388 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 58929637 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58930120 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 58930644 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58930675 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 58930735 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 58930825 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58930899 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58930902 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 58931498 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58931987 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58933595 A T Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 58933597 T C Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 58934831 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58937912 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58938189 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58938688 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58940539 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58941136 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58941209 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58941399 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58941905 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58941936 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 58942274 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58943675 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 58944060 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 58944225 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58944299 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 58944300 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58944450 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 58944468 T A Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 58944482 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58945011 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58945092 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 58945177 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 58945875 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 58946396 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 58946519 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58947201 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 58947228 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 58947246 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 58947409 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58947410 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 58947452 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 58947652 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 58947757 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 58947827 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 58947847 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 58947922 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58947967 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 58947989 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58948086 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58948147 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58948257 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 58948286 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58948546 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 58948819 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 58948936 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 58948946 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 58948951 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 58949033 T C Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 58949207 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 58949249 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 58949250 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 58949293 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 58949354 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 58949511 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 58949824 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 58950088 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58950117 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58950475 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58950666 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 58950803 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58950820 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58951117 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58951420 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58951630 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58951737 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58951740 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 58951944 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 58952041 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 58952755 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 58953171 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58953226 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 58953444 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 58953545 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 58953969 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 58954002 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58954184 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 58954312 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58954408 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 58954535 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58954539 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58954563 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58954613 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58954648 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58954654 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58954686 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58954688 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58954788 C A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 58955411 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58955439 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58956245 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58956522 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 58956665 T G N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 58956714 G A N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 58956788 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 58956814 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 58956850 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 58956853 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 58957277 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58957773 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58957782 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58957801 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58958268 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 58958314 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 58958426 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 58958453 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58958603 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58958641 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 58958789 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58959023 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58959186 T C N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 58959770 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 58959866 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 58959883 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 58959952 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58960215 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58960379 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58961060 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 58961123 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58961664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58962632 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 58962659 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 58962896 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58963718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58964276 G A N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 58964830 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58966388 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58966640 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58967062 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58967768 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58971121 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 58972131 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58972879 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58973491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58973728 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 58973905 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58973907 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58973945 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58974450 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58974470 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58974670 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58974730 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58974771 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58974806 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58974812 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 58974836 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58974873 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58974936 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58975012 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 58975192 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 58975409 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 58975478 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 58975518 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 58975818 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 58976017 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58976404 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58976510 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 58976567 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 58976809 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 58976876 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 58976888 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 58976891 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 58976901 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 58976915 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 58976954 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 58977060 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58977199 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58977833 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 58977840 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58977964 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58978157 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58978180 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 58978311 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58978474 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58980131 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58980252 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 58980427 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 58980489 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 58980715 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58980831 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58980848 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 58980904 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58980957 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58981001 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58981035 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 58981041 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58981079 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 58981305 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58981429 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 58981656 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58981774 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58981776 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58981819 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58982148 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58982617 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 58982656 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 58982683 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 58982705 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58982717 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58982740 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 58982768 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 58982779 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58982795 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58982842 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58984141 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58984414 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58984913 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58984986 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58985028 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58985648 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58985828 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58985931 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 58986043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58986430 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 58986450 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58986464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58986506 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 58986559 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58986772 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 58986816 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 58986971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58987030 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58987155 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58987244 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58987260 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58987373 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58987421 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58987429 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58987655 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58987686 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58987733 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58987734 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58988009 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58988208 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58988343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58988358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58988565 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58988568 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58988654 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58988724 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58988799 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58988816 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58988876 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 58989013 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 58989032 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58989296 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 58989438 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58989439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58989533 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58989563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58989869 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58990077 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 58990200 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58990343 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58990352 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58990468 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58990821 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 58990830 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58990906 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58991163 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58991164 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58991189 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58991204 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58991214 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58991251 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58991674 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 58992032 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58992207 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58992319 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58992722 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58992753 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58992950 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58993013 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58993113 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58993153 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58993172 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 58993252 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 58993293 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 58993326 G T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 58993784 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 58993843 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58994020 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58994044 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58994206 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58994249 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58994293 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 58994386 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58994439 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 58994632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58994826 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58994956 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 58995307 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 58995447 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 58995837 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 58995844 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 58995917 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 58996803 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58997601 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58997920 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 58999846 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59000118 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 59001361 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 59001367 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 59003026 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59003716 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59004895 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59005304 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 59005463 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 59005854 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59006302 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59006388 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 59006715 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 59007256 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59007618 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59007937 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59009607 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 59009855 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 59010921 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59012274 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59012461 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59012584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59015013 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59015524 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59016652 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59016900 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59017287 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 59017416 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 59018717 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 59018968 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59019031 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 59019142 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59019277 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 59019561 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59019619 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 59019678 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 59020128 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 59020240 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 59020384 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59020475 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59020494 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59020498 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59020533 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59020629 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59021039 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 59021425 T C Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 59022218 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 59022222 A G Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 59022556 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 59022797 T G Y N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 59022839 A T Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 59022888 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 59023311 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 59023326 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 59023367 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59023574 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59023685 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 59023868 A G Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 59023952 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 59024134 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59024136 T A Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 59024626 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59025640 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59025761 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59025816 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 59025940 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59026081 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 59026359 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59026673 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 59026694 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59026722 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 59026724 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 59026756 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 59026963 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59027152 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59027282 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59027332 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 59027413 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59027529 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 59027560 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 59027585 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 59027893 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59027968 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 59028476 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59028711 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 59028731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59028773 A C Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 59028793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59028867 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59028920 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 59028963 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59030484 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 59030574 C G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 59030933 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 59030956 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 59031521 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 59032252 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59032417 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59032673 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59032688 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59032741 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59033265 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59033338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59033586 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59034428 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 59035412 G C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 59035726 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59036227 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59036498 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59036533 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59037444 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59037679 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59040035 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 59040068 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 59040130 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 59040221 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 59040608 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59040888 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59040944 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 59040989 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59041098 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 59041301 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59041952 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59042050 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59042189 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59042236 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59042306 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59042771 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59044087 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59044098 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 59044156 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59044489 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 59044622 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 59045154 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 59045161 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 59045657 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59046163 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59046244 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59046294 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59046360 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59047054 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59047097 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59047122 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59047145 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59047168 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59047184 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59047212 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59047237 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59047259 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59047279 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59047354 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59047370 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59047541 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59047702 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59047706 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59047789 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 59047892 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 59047958 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59048389 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59048463 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 59049007 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59049296 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 59050002 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59050029 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59050158 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59050891 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59050952 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59051075 C A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 59051128 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59051226 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59051605 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59052252 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59052484 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59052701 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 59052766 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 59052786 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 59052787 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 59052807 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 59053000 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 59053005 A T Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 59053019 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59053058 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59053316 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 59053324 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 59053368 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 59053436 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 59053521 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59053560 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59053648 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 59053776 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59053826 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59053828 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59053934 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59054122 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59054130 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59054205 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 59054267 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 59054614 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59054859 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 59054913 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 59054936 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 59054942 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 59055974 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 59056170 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59056200 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59056239 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59056305 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 59056323 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 59056365 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 59056368 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 59056459 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 59056460 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 59056841 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59056885 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59057030 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59057054 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 59057421 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59057982 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59058102 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59058173 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59058314 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 59058370 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 59058805 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 59059140 C G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 59059242 A G N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 59059409 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 59059775 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59060637 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 59060699 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59060781 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59060950 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59061069 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 59061392 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59061481 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59061523 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59061774 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59062047 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59062347 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59062420 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 59062556 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 59062573 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59062689 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 59062690 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 59062846 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 59062853 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 59062927 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 59062937 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 59062980 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 59063044 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 59063075 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59063094 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 59063172 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 59063231 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 59063244 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 59063267 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 59063326 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 59063346 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59063377 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59063382 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 59063389 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 59063395 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59063455 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 59063489 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59064062 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59064087 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59064233 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 59064242 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 59064294 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 59064312 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59064393 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 59064547 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 59064642 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 59064652 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 59064874 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 59064999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59065021 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 59065072 G C Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 59065375 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59065402 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59065639 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59065790 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 59066180 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 59066184 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59066301 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59066410 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 59066455 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59067387 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 59067579 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59067986 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59068088 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 59068137 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59068251 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 59068256 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 59068623 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59068687 C G Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 59068729 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59068784 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 59069264 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 59069301 T C Y Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 59069422 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 3 59069536 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 59069892 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 59069905 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 59069954 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 59070270 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59070335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59070538 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59071032 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 59071110 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59071128 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 59071403 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 59071434 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 59071438 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59071700 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59071729 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59072085 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59072140 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 59072257 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59072568 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59072579 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59072705 T G Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 59072758 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 59072784 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 59072799 T A Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 59072855 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59073139 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59073142 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 59073199 A C Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 59073225 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 59073380 A T Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 59073491 C A Y N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 59073518 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 59073543 C T Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 59073683 A G Y Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 6 10 2 2 4 3 59073737 G A Y Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 59073854 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59073896 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59073936 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59073993 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59074048 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59074101 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59074112 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59074280 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59074291 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59074346 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59074375 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 59074416 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59074445 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 59074480 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59074495 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59074610 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59074617 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59074676 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59074738 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59074858 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 59074937 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59074942 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59074969 T G Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59075090 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 59075342 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59075559 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59075758 A T N N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 59075781 A G Y Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 3 59075795 G A N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 3 59075801 T C N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 3 59075938 T A N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 59075954 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 59075999 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 59076119 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59076125 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59076178 A T Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 59076236 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 59076300 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 59076304 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 59076900 C G Y N 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 59077541 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 59077708 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 59078271 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59078279 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59078391 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59078410 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59078443 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59078445 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59078454 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59078516 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 59078917 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 59079119 T C N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 59079165 C G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 59079292 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 59079321 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 59079330 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59079349 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59079434 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 59079755 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59080067 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59080420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59080523 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59080873 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59080989 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59081000 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59081024 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59081478 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59081480 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59081599 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59083715 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59093449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59094001 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59097358 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 59097796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59098685 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 59099288 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59099599 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 59100666 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 59100687 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 59100765 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59102415 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59102696 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59102978 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59102983 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59103114 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 59103199 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 59103217 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 59103218 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 59103329 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 59103370 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 59103404 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 59103582 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59103624 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59104258 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59104746 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59105094 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 59105139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59105146 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59108006 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59108401 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 59108701 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59109052 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59109276 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59109330 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 59109362 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59109439 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59109512 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 59109532 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 59109560 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 59109635 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 59109813 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59109895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59110077 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 59110795 T A Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 59110796 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 59110897 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59111094 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 59111249 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 59111375 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59111498 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 59111809 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 59111871 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 59111879 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 59111968 C A N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 59112070 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 59112212 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 59112891 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 59112897 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 59113327 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 59113699 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 59113720 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 59113769 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 59113895 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 59114011 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 59114322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59114374 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59114376 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59114524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59114679 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59114783 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 59114804 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59114857 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 59114866 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59114880 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59114970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59115116 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59115509 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 59115538 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 59115586 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59115659 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59115684 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59115698 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59115864 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59115889 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 59115983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59116102 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 59116202 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59117568 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59118263 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 59118803 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59119088 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 59120053 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 59120199 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59123200 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59123366 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 59124793 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 59125268 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 59126511 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 59127516 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59128177 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 59128311 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 59128321 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 59128370 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 59128384 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 59128395 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 59128531 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 59128609 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 59128752 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 59128871 C A Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 59128882 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 59129159 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 59129302 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 59129317 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59129768 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 59129797 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59129878 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59129935 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 59130261 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 59130321 G T N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 59130327 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 59130852 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 59130970 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 59131009 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59131285 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59131520 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59131975 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 59132101 G T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59132102 G T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59132209 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59132248 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 59132300 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 59132367 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 59132391 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59132683 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 59132803 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59133035 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 59133528 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59134076 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 59140009 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 59141493 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59142516 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 59142519 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59142964 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 59143277 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 59143278 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59143521 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 59143590 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59144113 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59144209 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 59145680 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59147321 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59149931 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 59149933 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 59151617 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59152069 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59153064 A G Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 59154423 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59161135 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59161617 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59162562 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59163240 T G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 59163257 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 59166688 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59168957 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 59168995 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 59168996 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 59169046 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 59169934 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59170123 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 59170498 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59170718 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59170869 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 59171099 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59171475 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 59171509 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59172185 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59174306 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59182745 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59182811 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59182832 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 59182856 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59182890 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59182953 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59182977 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59183411 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 59183933 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59183934 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59184221 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 59184366 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 59184933 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59185354 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59185655 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59185883 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 59186442 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59187054 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59187181 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 59187336 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59187388 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59188239 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59188647 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59188816 A G Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 59188986 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59189167 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59189240 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 59189560 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 59189563 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59189613 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59189870 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59189999 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 59190435 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59190625 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59190669 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 59190691 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 59190767 A G Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 59190802 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 59190809 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 59191287 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 59191359 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 59192885 T C Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 59192916 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59193114 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 59193161 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 59193673 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59193997 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59194078 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 59194482 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59195040 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59195083 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59195227 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 59195430 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59195534 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 59195845 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 59196081 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59196095 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59196392 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59196817 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59197034 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 59197209 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59197473 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59197491 T C Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 59197515 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 59198033 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 59204896 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59204992 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 59205057 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 59205133 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 59205436 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59205612 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59206060 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59206243 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 59206362 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 59206430 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59206463 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 59206799 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 59207101 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 59207257 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59207566 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 59207574 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59207582 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 59207801 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 59208184 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 59208394 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 59208415 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59208433 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 59208566 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 59208832 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59208876 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 59209002 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 59209208 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59209245 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 59209446 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 59209621 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59209709 T G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 59209713 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59209885 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59209893 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 59209963 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59209994 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 59210099 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 59210109 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 59210135 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 59210187 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59210202 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 59210389 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59210413 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 59210445 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59210465 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 59210746 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 59210804 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59210824 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 59211007 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 59211056 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59211107 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 59211189 G C Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 3 59211219 T G Y N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 59211877 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 59212154 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59212420 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 59212708 T G Y N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 59212869 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 59213305 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59213415 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 59213593 C T Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 59213692 T C Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 59213792 A T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59213951 C A Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 59214815 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 59214841 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59215005 G T Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 59216117 C T Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 59216464 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59216597 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59216626 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 59216684 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 59216935 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 59217141 T C Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 59217243 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 59217305 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 59217431 C A Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59217487 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 59217585 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59217596 C A Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59217640 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59217682 T G Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59217723 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59217735 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59217811 A C Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59217879 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59218112 G A Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 59218551 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 59218583 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59218684 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59218734 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59218886 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 59218918 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 59219334 A C Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 59219335 C T Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 59219416 G A Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 59219460 G T N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 59220362 A T Y N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 59220693 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59220703 T C Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 59220704 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 59220739 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 59220886 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59220894 G T Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 59220897 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59221202 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59221301 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59221545 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 59221650 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 59221885 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 59221991 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 59222077 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59222153 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59222172 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 59222271 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 59222275 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 59222336 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 59222363 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 59222424 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 59222510 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 59222520 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 59222525 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 59222538 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 59222560 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59222962 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 59223069 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59224457 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59226318 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 59227409 G T Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 59228049 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 59228202 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 59228625 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 59230589 A G Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 59230774 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59230917 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59230982 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59231681 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 59233579 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59234092 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59234153 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59235019 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59235358 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 59235555 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59235574 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 59235794 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 59235895 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 59235909 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 59236243 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 59236365 T C Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 59236366 A G Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 59236450 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 59236460 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 59236483 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 59236577 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 59236630 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 59236671 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 59236901 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 59236912 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59237028 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 59237062 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 59237085 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 59237203 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 59237215 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 59237222 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 59237258 C T N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 59237285 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 59237290 C G N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 59238781 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 59238805 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 59238841 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 59238908 T G Y N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 59239212 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59239284 G T Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 59239286 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 59239351 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59239355 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59239365 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59239385 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59239414 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59239627 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59239747 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 59240037 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59240081 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 59240133 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59240149 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 59240163 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 59240200 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 59240279 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59240356 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 59240430 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59240464 C A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 59240535 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59240553 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59240570 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59240609 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59240643 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59240657 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59240673 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59240746 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59240842 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59240870 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 59240889 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59240928 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59240931 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59241043 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59241110 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59241181 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59241200 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59241202 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59241240 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59241368 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59241393 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59241394 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 59241415 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59241690 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 59241766 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59241803 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59241807 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59241815 T A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59241846 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59242180 C T Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 59242387 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 59242394 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59242512 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59243011 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59243069 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59243110 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59243304 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 59243399 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59243453 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59243482 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59243535 C G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59243545 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59243706 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59243713 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59243737 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59244030 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59244059 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59244065 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59244118 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59244132 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59244209 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59244244 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59244265 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59244346 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59244386 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59244572 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 59244631 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59244743 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 59245447 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 59245745 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59246435 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59246746 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 59246794 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 59247249 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59247364 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59247370 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59248235 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 59248305 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59248447 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59249305 C A Y N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 59249405 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 59249464 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 59249477 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 59249778 C T Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 59249779 A G Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 59249875 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 59249887 C T Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 59250021 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 59250154 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 59250420 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59250634 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 59250792 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 59250863 A T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 59250941 A T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 10 22 4 2 10 3 59250959 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 3 59251114 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59251435 A G N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 9 15 3 3 6 3 59251528 A C N N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 59251827 A T N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 3 59251830 A G N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 3 59251869 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 59251914 G C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 59252115 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59252199 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 59252470 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 59252662 T C N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 59252770 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 3 59252828 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 59253089 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 59253233 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59253498 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 59253586 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 59253980 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 59254105 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59254353 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 59254435 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59254461 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 59254543 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59254953 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59254995 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59255176 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 59255353 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 59255573 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59255589 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 59255605 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 59255611 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 59255708 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59255769 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 59256409 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 59256453 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 59256660 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 59256719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59256727 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59256837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59257047 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59257245 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 59257299 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 59257311 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 59257427 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 59257441 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 59257663 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 59257969 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 59258252 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 59258286 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 59258462 G C Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 59258655 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59260060 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59261866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59262643 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59266729 A C Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 59266741 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59267211 A T Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 59268073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59268088 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59269281 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 59269981 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59271288 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 59271722 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59271879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59272287 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 59273857 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59273901 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 59273982 C G Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 59274065 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59274667 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 59275107 T G N N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 5 11 2 1 5 3 59275127 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 59276020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59276109 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59276383 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59276403 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59276554 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0 0.736842105263158 0.263157894736842 14 24 0 14 5 3 59276596 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59276619 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59276950 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 59278434 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59278478 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59279080 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59280688 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59281389 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 59281879 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 59282541 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59282667 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 59284272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59287514 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59289201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59289372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59289449 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 59290447 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59290902 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59290909 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59290960 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 59291416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59291822 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59292028 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 59292309 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 59292582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59292644 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59292724 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59299227 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59299562 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 59300011 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59300135 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 59300382 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 59300400 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59300556 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59300584 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59300801 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59300876 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59301034 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59301680 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59303598 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59304816 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59304894 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 59307131 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 59308757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59308774 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59308780 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59308899 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59309100 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59309365 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 59309605 T A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 59309650 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59309775 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59309932 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59310092 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 59310261 C T Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 59310292 T C Y Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 6 10 1 4 3 3 59310315 G T Y N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 3 59310473 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 59310664 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59310754 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 59311023 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 59311573 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59311581 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59311585 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59311652 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59311823 A T Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 59312206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59313213 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59313384 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59313857 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59314320 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59314340 C T Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 59315484 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59315521 C T Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 59315822 A C Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 59315965 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59323159 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59323424 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59323699 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59324281 A G N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 3 59329777 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59330104 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59330591 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59331288 A G Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 59332123 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59333642 T C Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 59333986 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59334176 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59334716 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59336726 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59336847 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 59337909 T A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 59338946 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59338984 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59341108 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 59341566 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 59342305 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 59342340 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59342718 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59343008 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59343088 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 59343373 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 59343648 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 59344291 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59344664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59344692 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 59345067 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 59345163 A T Y N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 59345327 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 59345951 T C Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 3 59345952 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 59345994 G T Y N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.153846153846154 0.846153846153846 0 15 11 2 11 0 3 59346127 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 59346135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59346754 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59346812 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59347016 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 59347089 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 59347192 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 59347408 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 59347453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59347472 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59347499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59347800 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59348005 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59348084 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59348349 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59348594 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59349444 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59349713 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59349949 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59350289 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59350462 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 59350506 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59350589 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59350653 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 59351448 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59351534 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59351702 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59352296 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59352483 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59353374 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59353707 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59353801 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59353981 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59354204 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 59354335 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 59354766 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59355794 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59356037 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59357288 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59357374 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59357442 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59357605 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59357724 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 59357730 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59357761 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 59358033 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59358090 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 59358785 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59358881 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59358911 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59359185 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59359605 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59359998 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59360271 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59360369 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59360532 T A Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 59360859 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59360912 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59361081 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 59361209 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59361329 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59361515 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59361713 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59361854 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59364281 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59364324 G C Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 59364337 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 59365032 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59366744 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59366849 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59367906 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59368504 C A N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 59369060 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 59375076 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59375266 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59375832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59375941 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59376022 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 59376744 G T N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 59377237 C G Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 59377283 A G Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 59377729 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59377734 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59377844 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 59378295 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59378379 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59378464 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59378652 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59378661 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59378826 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 59378849 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 59378979 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59379002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59379253 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 59379526 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59379998 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59380231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59380255 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59380669 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59380732 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 59380799 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 59381037 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 59381161 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59381224 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59381311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59381639 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59381854 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 59381986 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 59382010 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 59382135 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59383653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59383773 G T Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 59384362 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59384778 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 59384941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59384949 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59385225 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59385437 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 59386144 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59388903 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59389243 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59389879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59394701 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59396301 T G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 59396396 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59397180 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 59399227 A G Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 59402668 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59402936 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59405724 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59405877 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59406207 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59406280 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59407510 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59407955 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59408337 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 59408556 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59408638 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59408780 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59409166 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59411321 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 59413057 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59413208 C T Y Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 3 59420022 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59423098 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 59423673 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59425403 C G Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 59426530 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59427379 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59428498 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59428576 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 59428680 G C Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 3 59428696 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 59428840 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 59428916 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59428952 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 59428997 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59429005 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 59437217 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 59437621 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59437811 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 59437941 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 59437955 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59438387 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 59438435 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 59438523 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 59438644 G A Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 59439676 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 59439737 G C Y N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.363636363636364 0.636363636363636 0 15 7 4 7 0 3 59440023 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 59440025 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 59440083 G A Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 3 59441305 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 59441396 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 59441443 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59441490 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 59441674 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 59441678 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 59441849 A G Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 3 59442440 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 59442443 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 3 59442517 C A Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 59442896 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 59443427 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59443584 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59443795 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59444036 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59444320 T C Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 3 59445366 A T Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0 0.894736842105263 0.105263157894737 17 21 0 17 2 3 59445454 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59445482 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 59445652 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 59445715 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 59445912 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 59445917 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 59445981 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 59446033 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 59446091 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59446178 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 59446193 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 59446260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59446321 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 59446391 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 59446439 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 59446481 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 59446490 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 59446508 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 59446510 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 59446539 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 59446580 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 59446667 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 59446670 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59446713 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 59446714 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 59446831 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 59446975 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59447215 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 59447260 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 59447364 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 59447396 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 59447454 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 59447565 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 59447721 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59447731 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 59447803 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 59447966 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59448061 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 59448102 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 59448512 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 59449883 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59451081 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59452711 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 59453148 A G Y Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 3 59455519 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 59455541 T G Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 59456222 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59456608 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59457891 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59457918 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 59458444 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59458445 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59459215 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59459325 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59459478 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59459512 C G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59464869 G A Y Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.636363636363636 0.181818181818182 0.181818181818182 16 6 7 2 2 3 59465568 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 59465704 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 59465708 C T N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 59465880 A T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 59466010 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59466800 T G Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 59466816 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 59466835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59466846 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59467388 G A Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 59469314 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 59471453 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59471681 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59472524 C G Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 59472824 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59473402 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59473780 G A Y Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 59473788 G T Y N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 59473831 C T Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 59473838 A C Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 59474138 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 59474178 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59474240 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 59474506 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59475147 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 59475155 C T Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 59475158 C T Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 59475956 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 59476296 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59476334 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59476813 T G Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 59476906 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 59477173 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 59478271 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 59480383 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59481367 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59482529 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59485529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59486244 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59486530 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 59493358 T G N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 59493627 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59494072 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 59494330 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59497230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59497990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59498255 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 59499891 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59499924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59502091 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59502947 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 59503631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59503704 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59509486 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59509847 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59510426 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59512329 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59512336 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59516265 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 59517633 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59519183 G A Y Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.583333333333333 0.0833333333333333 0.333333333333333 15 9 7 1 4 3 59522135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59522221 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59522597 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59523255 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59525879 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 59525989 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59526083 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59529654 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59529742 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59530371 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 59536418 A C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59537689 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59538546 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59538714 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59541288 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59544572 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59547179 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 59547677 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 59547771 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59548867 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59549272 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59550983 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59551743 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 59551841 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 59553739 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59554788 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59555575 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59555831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59556417 G A Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 59556591 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 59556762 A T N N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 3 59556845 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 59556924 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59557572 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59558196 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 59558376 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59558676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59559351 T G Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 59559488 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59559600 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59559613 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 59559639 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 59559724 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59560074 G C Y N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 59560497 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 59560595 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59560643 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 59560735 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 59561032 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 59561197 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 59561452 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 59561472 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 59561875 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 59562260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59563164 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 59563730 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59563847 T G Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 59564040 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 59564516 A C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 59565016 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59565459 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 59565537 A G Y Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 3 59565538 C T Y Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 3 59565636 T C N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 59565740 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 59566054 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59566270 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 59566620 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 59567381 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 59568368 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59568607 T A Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 59568673 G A Y Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 3 59569306 G A Y Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 59570455 C A Y N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 59570507 G A Y Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.214285714285714 0.0714285714285714 0.714285714285714 7 21 3 1 10 3 59570577 A G Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 59574237 A C Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 59574758 A G Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 59575004 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 59575255 G A Y Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 3 59576814 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59577010 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59577384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59577398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59579076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59579132 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59579236 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59579353 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 59580156 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 59580276 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 59580654 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 59581092 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59581114 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 59581156 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 59581216 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 59581346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59581661 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59581681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59581732 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 59582217 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 59582247 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59582270 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 59582520 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 59583006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59583203 C T Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 59583265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59583624 A G Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 59584308 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 59584392 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 59584401 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 3 59584544 G A Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 59584565 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 59584569 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 59584793 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59584794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59584829 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59584840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59585531 G T Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 3 59585564 G C Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 3 59585754 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 59585797 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59585808 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59585851 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 59586005 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59586234 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 59586366 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59586716 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 59586977 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59586979 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59586988 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59587003 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59587151 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59587217 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59587231 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59587244 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59587274 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 59587282 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 59587307 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 59587317 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 59587336 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 59587421 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 59587455 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 59587488 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 59587575 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 59587585 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 59587594 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 59587706 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 59587714 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 59587717 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 59587737 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 59587754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59587779 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 59587816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59587822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59587847 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 59587945 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59590368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59590743 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59591262 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 59591544 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59592141 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59592240 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59593444 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59594179 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59594195 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59595485 A T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 59598136 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 59598389 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 59599662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59600132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59600631 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59608160 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 59609148 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59609188 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59609683 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59610303 G T Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 59610717 T G Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.117647058823529 0.823529411764706 0.0588235294117647 18 16 2 14 1 3 59610898 A G Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 59611269 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59611290 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59613165 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59614158 A T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 59615687 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 59617584 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 59617609 G T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 59617613 T A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 59617632 T G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 59619560 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 59619655 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59620370 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59620514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59621316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59621400 G T Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 59622930 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59624083 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59624837 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 59625299 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59625386 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59625804 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 59626459 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59626463 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59627943 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 59629166 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59629645 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 59631884 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59631970 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59632149 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59632164 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 59632308 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59632432 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59632827 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 59634361 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59635328 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59635337 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59635442 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 59635664 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 59636164 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 59638208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59639264 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59642491 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59645802 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59646243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59648836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59652066 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59652952 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 59653239 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59654499 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59655441 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59659887 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59660673 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59663321 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 59664049 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59666379 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 59666705 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59666810 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 59668438 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 59668471 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59668553 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59669324 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59669431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59670086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59670330 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59672743 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59674271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59674359 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59674486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59675367 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59676865 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59677910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59678055 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 59678123 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 59678145 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 59678234 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 59678385 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59678474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59678489 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59679160 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 59679541 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 59679896 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 59680106 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59680239 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59680370 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 59681639 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59681688 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 59681858 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59681934 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59681992 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 59683214 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59683334 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59683795 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59683858 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59684007 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59684423 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59684632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59684650 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59684662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59684702 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 59684968 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 59685035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59685055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59685192 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 59685640 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 59686574 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 59687736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59688964 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59689980 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 59690944 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59694400 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59694451 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59698135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59699933 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59700226 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59701199 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 59704337 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 59704343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59707253 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59708295 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59710895 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59712116 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59712227 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59713222 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59713599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59715344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59717377 G T Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 59718437 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59719032 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 59719668 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59720025 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 59720408 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59720680 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 59720884 A G Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 59721540 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 59722338 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 59722355 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59722489 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 59723230 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59723280 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59723299 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59723530 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 59723561 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 59723747 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 59723994 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59724411 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59724446 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 59724449 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59725546 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 59725820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59726139 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59726697 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 59726888 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59726937 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59727651 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59728408 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 59728580 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 59729570 C G N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 59729615 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 59730821 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 59730857 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59731750 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 59731824 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 59732301 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59732490 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59732938 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 59733019 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 59733115 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 59733377 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 59733400 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59734034 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 59734110 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59735802 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 59735811 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59736448 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59736843 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 59736868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59736980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59737359 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 59737391 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59737776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59738834 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 59739214 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 59739263 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 59739497 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59741076 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 59741549 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59742775 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 59742812 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 59742896 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 59742992 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 59743077 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59743209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59743218 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59743287 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59743367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59743734 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59743778 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 59743989 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 59744100 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 59744394 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 59744442 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 59744499 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 59744595 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 59744791 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 59744807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59745182 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 59745527 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 59745721 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 59745787 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 59745788 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 59746092 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 59746109 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 59746480 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 59746617 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 59746851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59746887 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 59746954 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 59746975 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59747138 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 59747205 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 59747345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59747821 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 59747864 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 59747982 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 59748108 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 59748122 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 59748144 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 59748157 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 59748340 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 59748369 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59748435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59749282 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59749469 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 59750613 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59751400 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59752174 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59752352 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 59752522 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 59752719 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 59752776 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 59752907 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 59753329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59753357 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 59753429 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 59753464 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 59753657 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59753689 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 59753728 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 59753988 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59754488 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 59754951 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59755169 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 59755377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59755502 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 59758059 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 59758601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59759794 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 59760187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59760489 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 59760547 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 59760635 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59760719 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59760730 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59760810 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59760876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59760925 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59761170 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59761171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59761385 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 59761594 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59761987 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0 0.894736842105263 0.105263157894737 17 21 0 17 2 3 59762063 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 59762090 T A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 59762125 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 59762165 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 59762420 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59762469 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 59762523 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 59762955 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 59763083 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59763153 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59764013 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59764489 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59764962 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 59765024 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 59765486 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 59765663 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59765807 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 59766048 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59766148 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 59767409 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 59768181 A C Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 59768182 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 59768768 T A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 59769057 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59769620 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 59770247 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 59770613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59770844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59771633 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59772182 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59772202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59773523 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59773889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59774288 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59775865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59778038 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59778144 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59778408 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59778515 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59778594 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 59778601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59779016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59779119 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59779187 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 59779497 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59779868 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59781249 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59781498 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59782005 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59782175 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 59782469 A T Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 59782579 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59782657 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 59782677 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59782974 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 59783263 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 59783315 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59783503 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 59783528 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59783602 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 59783692 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 59783816 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 59783830 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 59783916 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 59783977 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59784108 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59784124 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59784367 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 59784382 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 59784496 A C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 59784605 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 59784917 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59785224 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59785301 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 59785420 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59785431 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59785437 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 59785521 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59785594 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59785606 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 59785613 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 59785713 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59785845 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 59786174 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 59786388 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59786604 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59786631 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59786644 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59786710 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59786752 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 59786783 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59786962 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 59787009 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59787090 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 59787102 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 59787114 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59787168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59787379 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 59787448 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59787478 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59787483 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59788199 A G Y Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 59788254 A C N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 59788338 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 59788485 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59788514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59788584 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 59788674 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 59788701 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 59788827 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 59789060 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 59789069 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59789524 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 59789659 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59789890 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59790341 G A Y Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 59790502 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 59790562 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59790582 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 59790622 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 59790808 G A Y Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 59790910 C T Y Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 3 59791014 G T Y N 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 3 59791031 G A Y Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 3 59791155 A G Y Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 59791232 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 59791404 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 59791804 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 59791889 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 59791896 A C Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59791928 C G Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 59791985 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59792121 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59792142 A C Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 59792168 A C Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 59792186 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 59792248 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 59792274 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59792374 T C Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 59792392 A C Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 59792405 C T Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 59792594 T C Y Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 3 59792609 G C Y N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 3 59792688 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 59792827 G A Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 59792852 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 59792900 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.105263157894737 0.842105263157895 0.0526315789473684 20 18 2 16 1 3 59792911 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 59792937 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 59792940 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 59793080 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 59793135 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 59793160 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 59793307 G T N N 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 6 6 2 2 2 3 59793312 C G N N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 3 59793336 C G Y N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 59793463 G A Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 59793574 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 59793592 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 59793625 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 59793677 G A Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 59793772 C G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 59793779 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 59793792 A C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 59793793 G T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 59793835 G C Y N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 59794004 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 59794118 T G Y N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 3 59794246 C G N N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 3 59794328 A T Y N 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 3 59794562 A T Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 59794574 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 59794656 G A Y Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 3 59794680 A T Y N 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 5 9 2 1 4 3 59794749 G T Y N 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 3 59794949 T G Y N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0 0.6 0.4 6 14 0 6 4 3 59795344 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 59795520 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59795550 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59795607 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 59795649 T C Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 59795778 G T Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 59795852 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 59796077 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 7 5 3 1 2 3 59796426 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59796604 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 59796684 G A Y Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 6 8 2 2 3 3 59796776 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 3 59796934 A G Y Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 3 59796999 T G Y N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 3 59797151 T C Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 59797167 G A Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 59797256 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 59797283 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 59797361 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 59797374 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59797458 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 59797465 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 59797796 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 59797833 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59797864 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59798012 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 59798049 C G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 59798188 G A Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 59798207 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 59798376 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 59798403 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 59798414 C T Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 59798458 T A Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 59798491 A G Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 59798645 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59798743 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59798786 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59798899 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59798935 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59799012 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59799047 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59799052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59799295 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 59799296 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 59799322 C G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 59799781 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 59799871 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59800229 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 59800319 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 59800394 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59800433 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 59800446 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 59800481 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 59800566 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 59800663 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59800786 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 59800833 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59800857 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59800862 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59800924 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59800956 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59801020 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 59801069 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59801212 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59801275 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59801462 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 59801477 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 59801747 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 59801783 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 59802044 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 59802228 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 59802235 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59802276 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 59802301 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 59802369 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 59802434 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 59802600 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 59802792 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 59802873 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59802907 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59803053 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59803065 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59803139 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59803213 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 59803260 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59803270 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 59803344 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 59803370 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 59803544 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59803568 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 59803600 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 59803627 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59803648 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 59803769 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 59803780 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 59803794 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59803798 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 59803901 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59803926 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59804057 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 59804103 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59804264 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59804275 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59804334 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59804422 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59804435 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59804531 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59804708 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59804878 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59804914 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59804927 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59805067 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59805116 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 59805132 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 59805140 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 59805155 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 59805213 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 59805338 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 59805415 A C N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 3 59805570 A G Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 59805691 T G N N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 5 5 2 1 2 3 59805703 A G N Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 5 5 2 1 2 3 59805739 A T Y N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 9 7 3 3 2 3 59805822 G A Y Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 59805835 C A Y N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 59805859 C A Y N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 3 59806817 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 59806897 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59806985 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59807042 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59807047 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59807084 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 59807091 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 59807096 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 59807103 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 59807110 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 59807279 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 59807358 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 59807501 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59807805 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 59807860 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 59807998 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59808182 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 59808214 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59808245 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 59808341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59808349 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 59808799 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59809266 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 59809288 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59809855 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 59810023 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59810184 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 59810666 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59810736 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 59811187 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 59811213 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59811310 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59811311 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59811783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59811815 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 59811882 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 59811988 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 59812070 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59812329 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 59812379 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 59812564 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 59812918 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 59813091 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 59813162 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 59813261 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 59813622 T A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 59813835 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 59813901 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 59814088 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 59814626 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59814738 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 59815166 T C Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 59815231 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 59815289 C A N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 59815538 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 59815822 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 59815909 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 59816039 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 59816130 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 59816276 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59816394 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 59816553 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59816610 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 59816629 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 59816636 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 59816735 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 59816810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59816961 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 59816975 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59817000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59817110 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59817591 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 59817609 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 59818288 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 59818569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59818594 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59818753 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 59818868 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 59818996 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 59820113 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 59820176 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59820225 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59820246 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59820285 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 59820394 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 59820535 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59820576 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 59820739 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 59820870 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 59820970 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 59821189 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 59823454 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 59824279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59825098 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59825190 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 59825322 T C N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 3 59825325 T C Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 59825339 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 59825538 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 59825630 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 59825760 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 59825842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59826128 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 59826473 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59826667 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 59826846 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 59827135 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 59827205 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 59827319 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 59827405 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59827748 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 59828128 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59829291 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 59829356 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 59829610 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59829805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59829830 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59830048 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59830323 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 59830447 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59830977 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59831139 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59831253 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59831806 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59836809 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59837834 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59837884 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59838652 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59839592 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59839867 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59839898 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59840133 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59840185 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59840304 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59841311 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 59841330 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 59841414 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 59841457 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 59841472 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59841687 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59841780 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59841909 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59842402 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59842600 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59842602 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 59842774 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59842786 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 59842805 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59843038 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 59843890 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 59844110 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59844117 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59844210 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59844254 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59844265 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59844293 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59844640 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59845029 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59845187 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59845301 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 59845317 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 59845383 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 59845556 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 59845563 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59845661 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59845859 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59846055 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 59846092 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 59846095 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 59846141 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59846318 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 59846344 T A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 59846545 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 59846617 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59846758 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59846799 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59846852 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59846853 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59846991 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59846999 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59847019 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59847200 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59847528 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59847975 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59848203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59848440 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59848460 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 59850181 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59850239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59850403 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59850529 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59850596 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59850627 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 59850801 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59850841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59850941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59851081 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59851110 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59851389 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 59851874 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 59852662 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 59852708 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59853185 C T N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 3 59853880 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 59854468 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59854900 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 59854913 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59855259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59855589 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 59855630 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59855735 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 59855829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59855862 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 59856045 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 59856091 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 59856240 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59856312 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 59856330 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59856431 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 59856473 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 59857170 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59857293 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59857575 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 59857621 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59857787 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 59857897 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 59857906 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59858153 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 59858166 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59860867 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59862063 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59864643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59866883 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 59871260 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59871927 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59872982 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 59873661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59873936 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59874354 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59875477 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 59875958 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59876188 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 59876638 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59877159 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59877489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59879497 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59880392 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 59880410 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59880678 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59880734 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59880735 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59880904 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59881321 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 59881655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59881753 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 59882172 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59882361 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 59882692 C G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 59882735 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 59882828 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 59882966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59883012 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59883153 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59883449 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 59883571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59883607 C A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59883794 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59883851 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59883902 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59883976 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59884263 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 59884289 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 59884291 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 59884325 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 59884483 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 59884508 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59884648 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 59884676 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 59884684 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 59884710 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 59884755 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59884900 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59885030 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59885312 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59885319 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59885332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59885344 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59885357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59885434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59885740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59885764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59885965 T G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59886327 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 59886403 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59886441 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 59886481 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59886623 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 59886703 A C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 59886727 A T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 59886740 G C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59886821 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59886869 G A Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 59886989 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 59887008 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 59887345 G A N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 59887527 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 59887912 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59888193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59888252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59888396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59888552 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59888563 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59888583 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59888656 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59888678 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59888767 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 59888872 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 59889167 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 59889206 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59889374 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 59889499 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 59889866 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59889871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59890100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59890602 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59890652 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59890800 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59891184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59891263 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59891285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59891321 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59891503 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59891588 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59891645 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59891788 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59891844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59891846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59891912 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59892039 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59892208 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 59892215 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 59892220 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 59892298 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59892378 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59892416 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59892668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59892883 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59893111 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59893261 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59893421 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 59893513 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59893677 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59894260 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 59894270 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 59894320 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 59894729 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59894816 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59894832 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59894967 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59895111 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59895226 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 59895370 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 59895375 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 59895474 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 59895534 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59895699 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 59895716 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 59895769 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 59895804 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59896447 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59896734 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 59896741 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 59897049 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59897050 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 59897182 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59897643 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 59899085 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59900137 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59900550 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 59903067 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59903617 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59904011 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 59904132 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59904439 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59904533 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59905960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59906078 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 59906357 A T N N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 3 59906636 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 59907169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59907772 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 59910827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59910928 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59911016 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 59911246 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 59911330 T C Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 59911773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59912022 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 59912056 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59912169 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 59912725 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59912878 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 59913130 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 59913461 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 59913725 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59913767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59914152 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59914156 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 59914698 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 59914733 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 59914738 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 59914773 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 59914782 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 59914936 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 59914956 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 59915002 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 59915030 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 59915032 C A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 59915276 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 59915419 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 59915446 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 59915483 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 59915651 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59915672 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 59915822 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 59915840 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 59915843 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 59915953 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 59916213 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 59916402 G C N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 3 59916460 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 59916461 G T N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 59916541 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 3 59916553 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 3 59916587 G T N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 59916639 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 59916755 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 59916924 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 59916936 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 59916940 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 59916960 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 59917085 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 59917100 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 59917169 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 59917329 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 59917674 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59917720 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59917842 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 59918246 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59918365 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59918575 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59918841 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59919038 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59919343 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 59919355 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 59920080 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 59920704 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59920767 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 59921383 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 59921696 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59921744 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 59921760 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 59922189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59922606 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 59922930 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 59923710 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59923712 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 59924087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59924463 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 59924983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59924993 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 59925303 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 59925317 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 59925404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59926179 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59926767 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 59926820 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 59927020 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 59927171 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59927613 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59928521 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59928919 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59929025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59929039 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 59929125 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59929133 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59929617 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 59929653 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 59929893 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 59929924 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 59929955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59930009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59930154 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 59930166 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 59930221 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 59930386 A T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 59930521 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 59930655 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59930692 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 59930836 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 59930846 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59931245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59931270 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59931426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59931740 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 59931778 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59931996 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59932119 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59932167 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59932181 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59932245 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59932429 T A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 59932555 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59932575 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59932698 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59932725 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59933278 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 59933381 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 59933559 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59934008 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 59934028 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 59934123 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 59934124 A G N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 59934177 A G N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 59934294 T A N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 59934614 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 59934750 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59934791 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 59935080 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 59935130 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 59935274 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 59935292 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 59935311 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 59935328 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 59935473 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59935482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59935522 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 59935541 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 59935572 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59935595 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59935602 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 59935669 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59935709 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59935718 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 59935772 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 59935802 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59935927 A C Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 59935965 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 59936030 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59936164 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 59936171 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 59936248 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 59936267 T C Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 59936357 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 59936656 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59936782 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 59936790 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 59936839 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 59936888 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 59936932 G A N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 3 59936950 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 59937020 T A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 59937022 C A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 59937037 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 59937056 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 59937197 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 59937259 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59937366 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59937416 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 59937510 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59937611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59937634 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 59937699 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 59937773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59937806 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59937822 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59938232 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59938305 C A N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 59938339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59938381 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 59938412 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 59938413 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 59938431 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 59938459 T A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 59938495 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 59938513 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59938565 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 59938639 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 59938707 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 59938721 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 59939039 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 59939062 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59939133 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 59939215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59939793 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 59939823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59940310 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 59940546 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 59940549 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 59940781 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 59942341 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59942762 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59942899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59942953 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59943257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59943345 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 59943362 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59943368 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59943508 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 59943675 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 59943678 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 59943736 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59943827 A C N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 10 22 0 10 6 3 59943919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59944019 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59945401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59945726 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59945790 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 59945871 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 59946028 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 59946078 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59946106 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59947304 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 59947413 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 59947500 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 59947797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59948042 G T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 59948245 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59948318 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59948688 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 59948711 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59948814 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59948835 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 59948845 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 59948857 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 59948941 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59949120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59949193 T C Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 59949339 G T Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 59949412 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59949675 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 59949728 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 59949743 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 59949759 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59949772 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59949861 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 59949883 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59949891 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 59949917 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59949918 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 59950273 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 59950457 A T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 59950535 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 59950699 A T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 59950766 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 59950831 T C Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 59951291 T C Y Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 59951309 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 59951582 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 59951707 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 59951743 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59951934 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59952099 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 59952153 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 59952446 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59952471 C A Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 59952815 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 59953061 T C Y Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 59953084 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 59953102 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 59953167 A C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 59953172 T G Y N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 3 59953181 A T Y N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 3 59953509 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 59953511 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 59953652 A G Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 59953706 A G Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 59953776 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 59953816 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 59953886 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59953891 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 59953899 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 59953908 G C Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 59954076 A C Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 59954158 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 59954352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59954363 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 59954443 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 59954453 A G Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 59954495 A G Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 59955172 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 59955399 C T Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 59955588 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 59955785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59955856 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59956131 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 59956260 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 59956305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59956453 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 59956671 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59956738 C A Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 59956854 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59956896 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 59956944 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 59957205 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 59957353 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 59957362 C T Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 59957376 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 59957430 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 59957622 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 59958012 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 59958077 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 59958126 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 59958446 C T Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 59958486 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 59958508 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 59958606 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 59958632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59958659 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 59958679 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 59959225 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 59959448 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 59959883 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 59959884 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 59960008 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59960374 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 59960588 A T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 59960756 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59960769 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 59961179 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 59961212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59961842 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 59962105 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 59962964 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 59962965 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 59963047 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59963067 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59963107 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 3 59963505 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 59963620 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 59963660 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 59963667 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 59963707 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 59963776 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59963798 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59963978 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59963979 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59964122 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 59964161 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 59964700 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59965062 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 59965320 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59966291 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 59967229 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59967270 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59968955 A G Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 3 59969106 A T N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 59969193 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 59969279 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59969379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59969414 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 59969458 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59970111 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59970142 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 59970422 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59970428 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59970660 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59970701 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59970707 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 59970752 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59970889 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 59971027 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 59971216 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59971646 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59971668 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 59971968 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 59971988 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 59972175 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 59972387 C A Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 59972422 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 59972461 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 59972479 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 59972598 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 59972678 A C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 59972874 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59972997 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 59973302 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 59973378 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59973589 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59973621 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59973655 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59973682 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 59974002 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59974026 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 59974088 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 59974221 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 59974283 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 59974298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59974299 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 59974380 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 59974406 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 59974436 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 59974448 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 59974459 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 59974548 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 59974618 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 59974934 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 59975215 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 59975223 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59975535 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 59976060 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 59976166 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 59976206 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 59976221 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59976293 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 59976323 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 59976340 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 59976363 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 59976491 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 59976526 G C Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 59976711 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 59977158 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 59977188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59977223 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59977235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59977276 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 59977397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59977867 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59978129 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59978349 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59979174 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 59980561 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59980689 G A Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 59980694 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 59980718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59980807 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 59980821 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 59980891 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59980986 T C Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 59981165 C T Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 59981520 C A Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 59981548 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 59981725 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 59981732 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 59981756 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59981786 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59982101 C G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59982147 T G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59982213 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 59982241 C G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59982286 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59982428 G C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59982456 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 59982457 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59982500 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59982539 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 59982553 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59982581 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59982590 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 59982649 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59982751 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 59982761 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59982771 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 59982836 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 59982980 T G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59982995 T A Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59983021 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59983066 G C Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 59983180 A T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59983267 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59983332 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59983410 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 59983497 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59983707 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 59983863 A G Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 59983877 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 59983883 C A Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 59983895 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 59983906 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 59983914 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 59983957 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 59984130 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 59984173 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 59984272 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 59984426 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 59984476 G A Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 59984484 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 59984635 C A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 59984946 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.25 0.333333333333333 0.416666666666667 10 14 3 4 5 3 59985111 A G Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 59985154 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 59985159 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 59985196 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 59985260 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 59985288 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 59985378 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 59985528 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 59985534 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 59985567 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 59985655 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 59985835 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 59986009 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 59986025 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59986030 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 59986146 T A Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 59986210 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59986337 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 59986369 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 59986451 C T Y Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 59986704 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 59986754 C A Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 59986832 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 59986908 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59987082 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59987458 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59987473 T C Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 59987626 A C Y N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.25 0.166666666666667 0.583333333333333 8 16 3 2 7 3 59988036 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 59988043 C T Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 59988059 G A Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 59988123 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 59988269 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 59988275 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 59988280 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 59988297 T C Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 59988454 G T Y N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 59988469 G A Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 59988801 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59988827 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59988846 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 59988873 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 59988899 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 59988900 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 59988996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59989002 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 59989036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59989728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 59990284 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 59990347 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 59990657 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 59990884 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 59990902 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 59991124 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 59991180 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 59991316 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 59991393 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 59991762 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 59991889 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 59991995 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 59992303 C A N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 59992463 G C N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 3 59992550 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 59992795 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 59992826 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 59992829 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 59992865 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 59992866 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 59992982 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 59993080 C A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 59993321 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 59993354 A C Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 59993489 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 59993502 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 59993534 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 59993633 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 59993704 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 59993709 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 59993735 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 59993808 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 59994740 A T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 59994977 G A Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 59995126 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 59996948 G A Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 59997221 A G Y Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 59997266 A G Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 3 59997298 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 59997326 G T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 59997334 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 59997353 C A Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 59997453 T A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 59997713 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 59997816 C T Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 59997820 T A Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 59997872 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 59997907 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 59998036 C A Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 59998235 T G Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 59998948 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 59999042 A C Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 59999090 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 59999126 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 59999135 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 59999223 A G Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 59999420 A G N Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 3 59999519 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 59999533 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 59999619 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 59999811 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 59999956 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 60000227 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 60000238 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 60000315 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60000365 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60000946 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 60001471 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 60001602 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 60001726 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 60001772 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60001791 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 60001952 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 60001953 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 60002018 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 60002171 T G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 60002637 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 60002704 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60002882 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 60003066 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60003196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60003606 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 60003613 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 60004126 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 60004899 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 60005063 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 60005366 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 60005677 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60006044 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 60006914 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60010379 G T Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 60011633 G T Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 60011724 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60012693 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60012806 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60014038 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60014811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60015522 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60016431 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60017746 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60017766 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60017925 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60018954 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60019804 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60021292 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 60022683 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60022938 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60024141 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60024245 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 60024651 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60024670 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 60024828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60025283 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 60026288 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 60026530 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 60026578 C G Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 60027564 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 60027697 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 60027727 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 60027758 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 60027795 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 60027854 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 60027877 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 60027884 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 60028024 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 60028184 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 60028461 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 60028586 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 60028650 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 60028718 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 60028829 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 60029170 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 60029247 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60029473 A T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 60029968 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 60030160 G T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 60030167 G C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 60030223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60030996 C A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 60031010 A T Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 60031017 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 60031040 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60031133 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 60031134 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 60031360 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 60031429 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60031432 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 60031576 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60031597 G C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 60031611 A T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 60031707 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 60031711 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 60031743 G C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 60031807 T A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 60031825 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 60031894 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 60032261 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 60032375 A T Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 60032446 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 60032472 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60032492 C T Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 60032514 G C Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 60032520 T C Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 60032594 T G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 60032701 T A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 60032758 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 60032770 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 60032821 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 60032832 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 60032892 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 60033002 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 60033052 G C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 60033058 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 60033064 C G Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 60034254 A T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 60034322 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 60034565 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60035040 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 60042218 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 60042462 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 60043894 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60044026 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60044262 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60044475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60044676 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60044701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60045143 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60045246 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 60045401 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60045421 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60045428 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60045534 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60045649 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 60045677 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 60045903 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 60046319 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 60046388 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 60046413 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60046628 T G Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 60047930 G T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 60048227 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 60048526 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 3 60049723 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60049740 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60049790 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 60049870 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 60050094 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 60050304 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 60050668 A T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 60050680 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 60050837 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 60050839 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 60050900 G C Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 60051140 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 60051168 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 60051526 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60051574 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 60052428 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 60052574 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 60052777 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60052801 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 60052861 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 60052955 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 60054550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60054711 C T N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 3 60054765 A G N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.363636363636364 0.545454545454545 0.0909090909090909 14 8 4 6 1 3 60054830 G A N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 3 60054942 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 60055052 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 60055329 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 60055689 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 60056038 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60056284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60056351 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 60056550 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 60056604 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60057189 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60058001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60058073 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60058258 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60058373 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60058540 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60058577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60058709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60059426 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60059529 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60059971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60059979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60060497 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 60060640 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 60060689 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60060846 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60060880 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60060904 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60061786 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60062209 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60062256 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60062266 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60062354 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60062378 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60062609 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60062611 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60063280 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60063396 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60063603 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60063680 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60064404 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60064414 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60064681 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60065472 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 60065695 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60066445 A C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 60066505 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 60066700 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60067048 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 60067695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60068123 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 60068276 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 60068843 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 60068895 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 60069229 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60069557 G A N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 3 60070723 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 60070870 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 60071273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60071301 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60071334 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 60071676 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60072135 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 60072271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60072932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60072983 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 60075215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60076442 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 60077070 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 60077142 T C Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 60077538 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60078142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60078578 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60078677 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 60078970 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60079853 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 60081854 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 60085436 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60085865 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60090668 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60090903 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 60091050 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60091557 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60092441 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60093091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60093360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60093404 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60093460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60094293 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60096462 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60096848 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60097359 G C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 60098456 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60099276 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60101797 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60101831 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60101988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60102137 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60102403 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60102923 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60103407 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 60103630 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60103633 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 60104035 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 60104460 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60104867 C A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 60107495 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 60107632 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60109215 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60110927 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60111966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60112307 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60112366 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60113396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60113422 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60114948 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 60115568 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60115839 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60115970 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60121335 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 60121401 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60121430 C T Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 60122600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60122829 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 60124621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60125128 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 60126485 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 60127069 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 60127688 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60128316 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60128711 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60129302 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60130643 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 60131023 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 60131234 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60134617 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60135655 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 60136209 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 60136356 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60136524 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 60136600 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60136628 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 60136634 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 60136689 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 60137227 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 60137322 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60137518 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 60137619 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60137782 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60137865 G T N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 3 60137951 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 60138231 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 60138277 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 60138316 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 60138392 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 60138402 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 60138438 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60138536 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 60138572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60138587 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 60138604 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60138633 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 60138691 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 60138709 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 60138714 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 60138725 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 60138736 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 60138780 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 60138925 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 60139069 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 60139075 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 60139097 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 60139149 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60139230 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 60139289 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 60139295 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 60139302 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 60139327 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 60139336 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 60139357 A T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 3 60139358 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 60139397 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 60139462 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 60139465 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 60139506 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 60139572 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 60139584 G C Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 60139606 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 60139620 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 60139680 T A N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 60139834 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 60140308 C T Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 60140480 G A Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 60140625 A C Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 60142355 A C Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 60143372 G T Y N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 3 60143387 T C Y Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.545454545454545 0.272727272727273 0.181818181818182 15 7 6 3 2 3 60143496 C A Y N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 3 60143601 A C Y N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 3 60143672 G A Y Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 3 60144927 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 10 8 2 6 1 3 60145073 G C N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 3 60145108 T G N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 3 60145192 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 60145250 G T N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 60145257 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 60145261 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 60145282 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60145348 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 60145366 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 60145382 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 60145424 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60145431 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 60145440 G T N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 3 60145447 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 60145462 G T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 60145477 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 60145490 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 60145559 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 60145617 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 3 60145627 A G N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.153846153846154 0.538461538461538 0.307692307692308 11 15 2 7 4 3 60145755 C G N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 9 15 3 3 6 3 60145795 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 60145841 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 60145870 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60145903 C T N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 3 60146062 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 60146097 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 60146159 G C N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 3 60146185 T A N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 60146242 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60146285 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60147791 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60148530 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 60148662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60148724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60148875 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 60148957 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60149100 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 60149105 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 60149117 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 60149192 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 60149203 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60149253 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 60149273 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60149296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60149444 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 60149535 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 60149547 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60149549 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60149559 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60149826 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 60149995 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 60150148 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 60150156 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 60150175 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 60150210 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 60150360 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 60150416 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 60150417 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 60150427 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 60150484 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 60150505 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 60150507 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 60150563 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 60150663 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 60150691 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 60150911 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 60150919 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60150946 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 60151031 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 60151086 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 60151098 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 60151113 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 60151174 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60151408 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 60151417 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 60151436 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 60151513 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 60151524 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 60151802 A G N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 13 7 4 5 1 3 60151926 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 60151985 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 60151998 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 60152032 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60152106 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 60152138 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 60152321 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 60152340 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 60152385 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 60152432 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 60152489 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60152536 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 60152704 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 60152792 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 60152794 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 60152858 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 60152860 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 60153027 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 60153159 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 60153204 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 60153309 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 60153342 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 60153459 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 60153482 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 60153491 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 60153557 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 60153639 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 60153825 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 60153894 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 60154655 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 60155038 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 60155043 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60155086 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60155142 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 60155248 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 60155257 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 60155260 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 60155408 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 60155491 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 60155492 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 60155534 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60155624 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 60155706 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 60155767 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 60155979 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60156041 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 60156101 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 60156123 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60156457 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 60156482 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 60156517 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60156608 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 60156730 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 60156768 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 60156816 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 60157227 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60157249 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 60157281 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 60157340 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 60157365 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 60157407 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60157482 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 60157535 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 60157725 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 60157727 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60157745 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 60157760 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 60158002 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60158011 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 60158025 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 60158060 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 60158305 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60158442 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 60158450 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 60158467 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 60158483 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 60158748 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 60158780 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 60158970 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60158985 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 60159033 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 60159275 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 60159387 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 60159411 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 60159441 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 60159825 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 60159885 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60159992 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 60160186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60160345 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 60160394 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 60160426 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 60160501 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 60160684 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 60161009 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 60161129 C T N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 60161215 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 60161251 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 3 60161291 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 3 60161373 A G N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 60161411 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 60161426 A C N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 60161431 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60161512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60161541 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 60161631 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60161723 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 60161773 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 60161782 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 60161888 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 60162059 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60162105 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60162144 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 60162249 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60162255 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60162276 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60162283 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 60162452 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60162575 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60162596 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60162610 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 60162664 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 60162748 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 60162786 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 60162822 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 60162860 A T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 60162866 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 60162878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60162907 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60162928 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 60162950 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 60163037 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 60163041 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 60163051 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 60163275 G T N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 60163449 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60163587 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 60163691 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 60163710 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 60163942 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60163995 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 60164116 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 60164360 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 60164499 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 60164525 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 60164584 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 60164641 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 60164663 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 60164681 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60164682 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 60164768 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60164792 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 60164820 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60164844 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 60164845 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60165212 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 60166884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60166893 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60167273 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60167768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60168815 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60169614 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60170266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60170764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60172510 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60172983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60173876 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60173933 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 60175673 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60176094 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60176213 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60177738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60182525 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60182646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60183326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60183602 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 60183755 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 60183893 A T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 60184517 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60184533 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60184585 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60185229 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60185327 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60185655 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60185890 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 60186125 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60186237 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 60186243 G C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 60187152 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60187945 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60187994 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60188060 T C Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 60188753 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60189516 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60189623 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 60189990 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 60190021 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60190759 A G N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 3 60191005 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 60191811 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60192142 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 60192415 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 60192631 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60192675 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 60192889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60193239 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60193466 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60193660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60194809 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60195375 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60196250 G A Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 60196442 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 60196478 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 60196516 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 60196564 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 60196607 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 60196652 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 60197710 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 60197778 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 60197780 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 60197817 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 60198230 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 60198257 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 60198270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60198397 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60198510 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60198693 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 60198992 T A N N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 5 5 1 3 1 3 60199398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60200185 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 60200840 G A Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 60200924 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60201291 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60202318 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60203720 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60203833 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60203959 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60205542 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 60207102 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60207978 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60209162 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60210068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60210531 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 60210673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60211028 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 60212023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60212127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60212306 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60212373 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60216736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60217166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60219229 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60220612 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 60220659 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 60221793 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 60222349 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60222531 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 60222602 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 60222664 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 60222711 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 60222793 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60222879 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60222899 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60223030 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60223228 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 60223235 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60223328 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60223351 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 60223363 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 60223377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60223454 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60223470 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60223474 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60223484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60223578 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 60223649 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 60223739 A T Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 60224365 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 60224373 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 60224485 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 60224560 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 60224606 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 60224623 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 60224671 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 60224703 G T Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 60224740 C T Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 60224796 G C Y N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 60224800 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 60225152 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 60225266 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60225388 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60225407 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60225448 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60225449 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60225485 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 60225619 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60225664 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60225981 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 60226153 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 60226408 C G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 60226527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60226582 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 60226587 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 60226718 C A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 60227213 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60227282 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60227289 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 60227307 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 60227372 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 60227378 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 60228745 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 60228747 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 60228781 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60229056 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 60229141 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 60229169 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60229333 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60229373 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60229492 T G N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 60229500 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 60229579 C G N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 60229593 G A N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 60229594 T A N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 60229838 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 60229957 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 60229982 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 60230178 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 60230607 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 60230668 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 60230710 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 60230760 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 60230793 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 60230795 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 60231007 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 60231193 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 60231219 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 60231349 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 60231430 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 60231441 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 60231559 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 60231579 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 60231676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60231765 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 60231816 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 60231941 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 60231949 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 60231966 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 60232100 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 60232448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60232478 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 60232497 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 60232519 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 60232559 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 60232561 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 60232622 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 60232648 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 60232821 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 60232958 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 60233008 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 60233107 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 60233128 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 60233606 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 60233782 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60233942 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 60234142 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60234251 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60234257 G A Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 60241153 G T Y N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 3 60241157 G T Y N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 3 60241432 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 60241446 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 60241605 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60241697 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 60241796 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 60242117 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 60242696 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60243111 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60243330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60244308 G T Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 60244632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60245300 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60246326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60246525 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60247453 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 60247695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60248131 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60250381 A T Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 60250563 G A Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 60250787 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60251248 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60251290 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60252985 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60253144 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 60253941 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60254908 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60254993 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 60255858 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60256517 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 60258085 T A Y N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 14 12 1 12 0 3 60258090 T C N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0 0.933333333333333 0.0666666666666667 14 16 0 14 1 3 60259917 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60261509 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60262264 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60263398 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 60264463 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60264603 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60265389 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 60265781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60265998 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60266108 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60266141 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 60266241 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 60266477 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60266550 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60266627 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 60266634 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 60266681 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 60266968 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60266970 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60267021 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60267099 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60267149 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60267318 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60267319 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60267356 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 60267615 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60267701 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60267861 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60268993 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 60271106 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 60271118 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60271379 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60271730 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 60271807 A T Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 60272025 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60272028 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60272130 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60273882 T A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 60274024 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60274810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60275427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60275628 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60275677 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 60276332 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 60276683 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 60276723 A C Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 60276755 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 60276770 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 60276806 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 60276895 A C Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 60277022 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 60277474 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 60277537 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 60277705 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60277804 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 3 60277856 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 60277981 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60281008 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 60281063 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60281068 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 60281108 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60281159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60281347 A G N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 60281565 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 60282088 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60284025 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60284946 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60285416 C T N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.307692307692308 0.615384615384615 0.0769230769230769 16 10 4 8 1 3 60285492 G C Y N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 60285847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60286600 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 60287916 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 60287937 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60288442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60288946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60289966 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 60290351 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60290378 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60290622 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 60290671 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60290858 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 60291209 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 60291303 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 60291967 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 60292184 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60292299 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 60292330 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 60292527 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 60292812 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 60292983 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60292998 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60293697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60299159 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60299224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60299309 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60299514 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60299524 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60299600 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60299699 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60299704 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60300054 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60300081 G C Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 60300149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60300189 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 60300231 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 60300283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60300404 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 60300652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60300682 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 60300852 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60300882 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 60301011 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 60301108 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60301403 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 60301692 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60301754 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60301819 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 60301842 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 60301932 G C Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 60301956 T C Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 60302408 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60302704 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60303148 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60303160 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60303341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60303777 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60304127 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60304356 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 60305642 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60306006 C T Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 60306091 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60306387 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60307542 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60308473 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 60309106 T C N Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 3 60309796 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 60310463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60310630 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60311275 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60311610 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 60311917 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60311967 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60312385 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60312453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60312487 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 60312550 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60312662 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60312743 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 60312760 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 60312761 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 60313556 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 60313707 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60314042 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 60314122 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60314859 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60317417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60318299 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60319000 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60320114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60321201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60322318 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60322584 T G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 60323469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60325167 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 60325859 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 60326016 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60326018 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60326050 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 60326089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60326503 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60327336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60328448 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60329941 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60330055 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60331193 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60331245 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60333508 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 60335557 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60335971 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60336475 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 60336702 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 60336902 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 60337287 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60337489 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60337511 C G Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 60337727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60337786 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60337836 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 60337906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60338112 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 60338410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60338799 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60338828 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60338868 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 60338977 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60339052 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 60339824 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 60339985 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 60340028 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60340185 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60340194 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60340297 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60340508 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 60340534 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60340720 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60340733 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60340809 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60340877 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60342014 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60342477 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60342848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60343090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60343770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60343805 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 60344065 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60344388 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 60344500 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60345038 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60345099 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60346029 A G N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 3 60346511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60347241 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60348583 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 60348712 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 60348910 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60349118 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60349399 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60350318 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60350376 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 60350408 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60351386 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60351956 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60352016 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60352355 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 60352528 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60353386 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60354820 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60354840 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60354884 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60354906 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 60355089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60355118 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60355359 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 60356491 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 60356542 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 60356779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60357062 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60357084 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60357126 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60357635 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60357674 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 60357915 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 60357959 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 60358206 G T N N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 3 60358233 A G N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 60358374 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 60358429 T A N N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 10 10 2 6 2 3 60358542 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60358553 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60358932 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60359259 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60359354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60359428 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60359729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60359962 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60360068 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 60360299 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 60360425 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60360428 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 60360514 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 60360576 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 60360619 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60360722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60360873 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 60361424 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60361551 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60361742 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60362030 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60362443 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 60362676 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60363385 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60363486 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60363897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60364393 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60364833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60364845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60364949 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60365156 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60365645 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60366252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60366594 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 60366596 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 60366970 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60369705 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60370276 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60370722 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60370875 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60373776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60379060 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60380241 A C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 60381208 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60381961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60382157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60382334 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60382608 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60382628 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60383010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60384004 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60384402 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60385901 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60387733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60387824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60388591 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60389700 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60389982 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60393356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60393918 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 60393930 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 3 60394233 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60394846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60394881 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60394900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60395042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60398624 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60398781 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60398812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60399252 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60399292 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 60399847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60399926 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60400729 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60400929 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60401797 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60404132 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 60404680 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60404798 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60405153 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60406375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60406941 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60407061 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60407263 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60407414 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60407606 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60407903 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60408090 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60408282 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60408577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60409301 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60409714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60409992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60410082 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60410430 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60410653 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60410802 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 60410886 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60411031 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60411098 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 60411190 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 60411394 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 60411463 A G N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 60411536 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 60411558 G A N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 60412567 G T N N 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 3 60413084 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 60413963 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60414189 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60414719 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 60414724 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 60415012 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 60415714 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 60416091 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 60416514 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60416734 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60416765 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60417476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60419806 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60422330 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60426731 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60427896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60428238 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60428275 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60429445 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60429515 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 60429576 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 60429592 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60430014 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60430083 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60430494 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60433859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60434383 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60434543 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 60434720 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 60434752 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 60435090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60435137 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60435375 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60435403 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60435454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60435690 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 60435724 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 60435762 T A N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 60435835 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60435855 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60436000 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60436110 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60436155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60436383 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 60436430 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 60436537 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60436546 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60436680 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 60436702 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 60437566 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 60437652 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 60438003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60439769 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60439809 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60441358 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60442416 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60442611 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60442626 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60442751 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60443330 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60445043 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60445915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60446320 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 60448168 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 60448503 A C N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 60452854 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 60452973 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60453827 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60455050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60457440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60457725 G C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 60458180 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60458848 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 60459050 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60459065 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 60459171 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60459307 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60459399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60459415 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 60459432 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60459441 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 60459478 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 60459601 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 60459628 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 60459657 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 60459681 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 60459690 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60459712 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60459720 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60459785 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60459839 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60459900 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 60460015 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 60460149 C T N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 3 60460150 T G N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 3 60460166 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 60460167 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 60460299 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 60460369 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 60460466 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 60460627 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 60460750 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60460777 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60460832 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60461048 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60461056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60461096 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60461097 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60461117 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60461141 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60461156 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60461301 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60461377 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60461424 A G Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 60461523 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60461584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60461671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60462162 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60462214 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60462273 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60462278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60462284 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 60462305 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60462317 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60462398 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60462436 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60462495 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60462566 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60462589 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60462614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60462697 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 60462892 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 60463294 C T N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 3 60463298 T A N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 3 60463431 C T Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 60463443 C T Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 60463480 T C Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 60463616 G A Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 60463768 A G Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 60463835 A G Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 60463890 T A Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 60464126 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 60464136 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 60464180 T C Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 60464257 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 60464319 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 60464343 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 60464352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60464355 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 60464439 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 60464460 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 60464660 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 60464724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60464973 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60465125 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 60465200 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 60465423 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60465440 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60465545 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 60465599 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60465639 G T Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 60465687 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60465769 A G Y Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 60465891 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 60465900 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 60465946 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 60465947 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 60465992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60466017 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 60466031 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60466032 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60466070 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 60466173 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 60466276 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 60467202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60467243 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 60467273 T A Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 60467285 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 60467406 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60467523 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 60467807 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 60468008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60474356 T C Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 60474756 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60474972 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60475197 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 60475327 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 60475345 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 60475552 G A Y Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 3 60475890 C T Y Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 60476183 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60477316 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 60477762 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60478347 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60478897 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 60479317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60479714 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60479870 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60479994 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60480216 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60480560 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 60480583 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60480701 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 60480791 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60481117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60481405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60481456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60481471 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60481648 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 60481658 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60481907 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 60481963 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 60482191 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60482214 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60482272 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60482283 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60482403 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60482492 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60482612 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60482632 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60482808 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60483321 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60483322 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 60483357 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 60483485 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60483932 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60484491 A G Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 60484539 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60485418 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60488306 G A Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 60488445 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60488751 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60488790 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 60489048 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 60489202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60489268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60489603 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60489660 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 60490877 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 60490893 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 60490894 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 60491091 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60491134 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 60491277 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60491313 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 60491612 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 60491650 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60491661 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 60491672 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 60491756 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60491829 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60491931 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 60491968 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 60492131 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60492212 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60492295 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 60492326 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 60492521 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 60492600 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 60492955 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 60493332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60493440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60493487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60493511 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60493546 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60493825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60493826 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 60494058 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60494229 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60494915 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60495158 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60495228 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60495297 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60495742 A G Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 60495746 C T Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 60495940 A G Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 60496173 G A Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 60496198 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 60496213 G T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 60496297 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60496320 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60496351 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60496657 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60496680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60496854 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 60496920 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 60497194 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60497422 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 60497496 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60497513 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60497595 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 60497679 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60498066 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60498078 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60500094 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 60500241 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60500242 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60502399 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60502446 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60502472 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60503438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60503556 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 60504669 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60504671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60504788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60505104 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60505287 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 60506327 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 60507620 C A Y N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 60508741 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60508795 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60508867 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60509326 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60509387 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 60509751 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60509874 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60509977 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60510616 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60510630 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60511361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60513833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60514160 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60514482 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 60515290 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 60515404 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 60518940 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 60518997 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 60519653 T A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60519701 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60519996 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60520062 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60520082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60520434 G T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60520435 A T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60520819 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60520883 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60520969 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60521374 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60521515 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60524322 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60526060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60526086 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60526869 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 60527331 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 60528920 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60529175 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 60529222 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 60529227 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 60529462 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60529551 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60529779 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 60529956 T C N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 3 60530014 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 60530210 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60530273 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60530281 C A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 60530308 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60530351 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 60530380 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 60530496 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 60530609 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 60530706 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 60530840 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 60530890 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60530902 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 60531027 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60531079 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 60531104 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 60531401 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 60532336 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60532382 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 60532498 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60533367 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60533570 T G N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 60533742 T C N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 60534471 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 60535125 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 60535512 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 60535729 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60537338 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60537919 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60538174 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 60538432 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60539332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60539375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60540956 A T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 60541359 C G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 60542528 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60543536 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60544777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60546637 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60547647 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60547799 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60547823 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60551658 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60551718 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60553000 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60554750 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60555216 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60556319 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 60556343 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60556423 G C N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 60556933 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60558145 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60559127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60559317 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60559599 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 60560884 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60562108 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60562434 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 60563115 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60563405 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60564575 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60564938 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60565254 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60566379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60566572 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 60567971 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60568125 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60568466 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 60568504 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60570720 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60570873 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60570972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60571230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60572766 C A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60572892 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60573071 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60573107 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60574079 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60574228 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60574508 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 60574925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60575671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60576178 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 60576604 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60576636 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60577233 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60578119 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60578849 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60580248 C T Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 60580860 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60581833 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60582973 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60583930 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60584875 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 60584876 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 60584941 T G Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 60586669 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60587920 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60589323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60589495 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 60590024 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 60590253 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 60590288 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60590449 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 60590574 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60590632 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 60590690 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 60590708 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 60590719 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 60590799 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60590812 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 60590954 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60591043 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 60591153 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 60591217 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 60591428 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 60591457 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60591473 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 60591487 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 60591512 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 60591514 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 60591540 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 60591548 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 60591654 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60591828 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60591986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60592106 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60593113 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60593157 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60595013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60595948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60595965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60596117 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60599278 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 60599694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60599786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60599974 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 60600000 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 60600053 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 60600140 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 60600145 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 60600251 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 60600279 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 60600436 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 60600446 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 60600583 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 60600704 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 60600715 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60600720 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 60600729 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 60600735 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 60600751 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 60600807 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 60600907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60600910 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 60601099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60601159 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 60601191 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60601841 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 60602110 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 60602148 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60602239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60602447 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60602688 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 60602752 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60602823 A C Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 60603097 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60603120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60603202 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60603206 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60603268 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60603429 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 60603602 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60603760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60603819 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 60603894 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60603932 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 60603936 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 60603949 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 60603976 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 60604014 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 60604116 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 60604128 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 60604198 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60604201 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60604215 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60604237 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60604326 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60604415 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60604606 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 60604679 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 60604688 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 60604848 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60605023 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60605381 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60605574 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60605646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60605653 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 60605705 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 60605953 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60606381 C T Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 3 60606395 C G Y N 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 3 60606417 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 60606503 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 3 60606509 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 60606705 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60606772 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 60606788 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60606797 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60606887 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 60606936 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60606951 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60606965 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60606994 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 60607003 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60607025 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 60607079 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 60607110 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60607173 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60607485 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60607533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60607577 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60607604 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60607605 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 60607640 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 60607652 C G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 60607677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60607832 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 60608063 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60608259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60608274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60608466 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 60608523 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 60608551 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60608593 C A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 60608653 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60608666 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60608675 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 60608695 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60608839 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 60608891 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 60609051 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 60609674 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60610149 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60610243 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60610262 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60610431 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60610541 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60610566 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60610629 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60610676 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60610685 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60610739 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 60610788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60610812 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 60610861 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 60610975 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 60611053 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 60611222 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 60611284 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60611351 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60611404 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 60611942 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 60613754 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 60613856 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 60613899 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 60614031 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60614064 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 60614291 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 60614489 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 60614827 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 60614905 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 60616212 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60616242 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 60616288 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 60616653 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 60616734 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60616886 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 60616919 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 60616930 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 60616956 G T Y N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 60617139 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60617205 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60617246 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60617265 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 60617321 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 60617586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60617799 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60617856 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 60618058 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 60618673 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 60618757 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60618855 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 60619228 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60620839 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60620850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60621165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60621353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60621443 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 60621480 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 60621547 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60621915 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 60622038 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 60622352 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 60622614 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60622615 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60623173 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60623495 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 60623523 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60623659 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60624494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60625688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60628385 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 60629726 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60630242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60631597 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 60631930 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60632050 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60632221 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60632345 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60633626 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 60633844 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60633887 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60634192 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60635588 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 60635932 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60635939 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 60636692 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60640009 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60640051 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60642401 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60642793 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60643305 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60644258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60645695 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 60646833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60650411 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 60650676 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 60652047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60653208 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60655987 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 60658591 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60664449 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 60665122 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 60666079 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60667699 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60668544 C A Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 60669213 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60670357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60672661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60674676 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 60674787 C T Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 60674835 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60683607 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60684662 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60686094 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60686382 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60688103 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60689853 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60689946 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60690354 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 60691183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60691552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60692016 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60692057 G A Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 60692386 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60692801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60693759 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60694812 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60695062 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60696127 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60697501 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60697858 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 60697862 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60698924 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60699071 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60699616 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 60699662 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60702212 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60702484 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.0588235294117647 17 17 1 15 1 3 60702488 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 60704007 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 60705640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60705817 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60705854 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60706895 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60707808 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60709986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60710197 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60710330 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60711232 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60711551 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60712232 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 60712283 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60712390 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60715395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60716493 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 60717178 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60718403 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60718997 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60719486 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60719620 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60721038 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60722523 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60725094 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60725464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60725999 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60726048 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 60726135 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60726346 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 60726506 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60727673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60728123 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60729138 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 60729405 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60729530 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60729578 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60729625 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60729646 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 60729656 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60729694 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60729861 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 60729987 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 60730403 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60730629 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 60730696 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 60730871 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60730887 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60730975 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60730991 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60731041 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60731047 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60731072 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60731118 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60731167 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60731176 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60731192 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60731199 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60731251 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 60731294 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60731323 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60731345 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60731359 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60731641 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 60731906 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60731917 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60731952 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60731990 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 60731991 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60732197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60732212 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60732578 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60732763 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 60732776 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60732858 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 60733091 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60734814 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60736119 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 60736906 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60737942 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60738609 G C Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 60739303 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 60741966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60741987 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60742549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60743531 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 60743871 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60743891 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60743946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60744066 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 60744089 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 60744140 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60744189 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60744413 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 60744555 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60744655 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 60744912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60745095 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60745134 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60745220 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 60745355 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 60745399 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60745467 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 60745752 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60745872 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60746197 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60749913 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60750852 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60751477 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 60751480 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 60751507 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 60753334 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60754537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60754934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60755206 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 60755328 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 60755394 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 60755419 G T Y N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 60757141 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60757315 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60758502 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60758515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60758592 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60758688 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60759023 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60759191 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 60759211 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 60759529 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60759599 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60759657 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60759699 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60759800 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60759959 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60760260 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60760287 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60761874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60763689 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 60764621 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60764720 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 60765256 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60765630 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60765753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60766028 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60767107 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 60767166 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60767273 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60767337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60768722 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60768774 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60768913 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60768965 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60769030 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60769175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60769317 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 60769802 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 60769957 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 60769962 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60770186 G T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 60770248 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 60770337 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 60770932 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60770986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60771104 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60771278 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60778774 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 60778775 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60778905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60779933 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60781922 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60782956 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60783018 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60786538 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60786638 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60786713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60788167 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60789124 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60790461 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 60792453 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 60792797 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 60793811 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60796713 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60797049 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 60797202 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 60797260 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 60797643 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 60797704 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60798163 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 60798654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60798728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60800836 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 60800861 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60800877 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60801005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60802436 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60802612 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60802687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60803520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60803744 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60804096 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60806521 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60809195 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60809438 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 60809545 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 60809836 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 60810066 G T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 60810193 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 60810201 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 60810280 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60810296 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 60810313 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 60810334 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 60810337 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 60810350 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 60810427 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60810489 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60810573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60810696 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60810697 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60810707 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60810900 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60811051 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60811129 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 60811201 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60811217 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60811409 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60811482 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60811498 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60812193 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 60812214 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 60812538 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60813427 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 60814345 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 60814489 G C N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 60814525 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 60814830 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 60815779 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60816431 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60816944 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60818495 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60819499 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 60820102 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60820135 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60820338 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60820480 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60820707 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60821308 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60821584 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 60821609 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 60821720 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 60821807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60821885 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 60821988 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 60822042 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 60822209 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 60822426 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 60822479 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 60822507 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 60822733 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 60822843 T A Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 60822871 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 60822889 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 60823071 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60823094 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 60823148 C A Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 60823162 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60823253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60823332 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60823633 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 60823673 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60823680 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 60823766 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 60823978 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 60824000 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 60824147 G C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60824200 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60824203 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 60824442 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60825074 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 60825153 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60825210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60825804 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 60825836 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 60825842 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 60825854 A T Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 60825885 T C Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 60825944 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 60826093 T A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 60826192 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 60826306 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 60826382 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 60826524 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60826612 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 60826638 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 60826673 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 60827018 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60827962 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60829416 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60829529 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60829826 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 60830332 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 60830540 C A Y N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 60830883 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60831153 A C Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 60831251 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60831316 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60831384 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 60831959 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 60832119 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60832400 C G Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 60832462 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60832567 C G Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 60832668 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 60832856 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60832933 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60833112 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60833703 C G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 60833888 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60834275 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 60834877 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60835001 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 60835474 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60835524 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 60835527 T G Y N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 60835884 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 60836162 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 60836252 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60838082 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60838913 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 60839313 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 60839354 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 60839711 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 60840550 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 60840645 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60841969 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 60842619 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60843489 G T Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 60843852 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60843930 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60844122 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60844590 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 60846259 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60847257 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60847883 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60853086 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 60854169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60855032 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 60855057 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 60855103 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 60855359 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 60855852 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60856299 A T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 60856438 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 60856532 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 60856541 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 60856605 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 60856747 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 60856768 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 60856849 C G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 60856972 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 60857039 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 60857172 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 60857463 T C Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 60857915 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 60858076 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 60858329 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 60858449 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60858498 C A Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 60858612 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 60858629 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60858658 C G Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 60858659 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 60858724 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 60858725 T G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 60858946 G A Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 60859181 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 60859264 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 60859471 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 60859476 T A Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 60859487 A G Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 60859683 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 60859742 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 60860288 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 60860318 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 60860560 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 60861466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60861612 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60861688 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 60861707 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 60862684 T A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 60864564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60864666 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 60864909 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 60864974 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60866939 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60867601 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60867628 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60867765 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60871162 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60871979 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 60872037 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60873059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60873099 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60873268 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60873515 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60874184 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60875885 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60877000 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60877463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60877822 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60877898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60877956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60879256 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 60879369 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 60879448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60879593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60879641 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 60879723 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 60879802 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 60879860 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 60880089 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 60880438 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 60881173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60881452 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 60888781 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60889162 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.0588235294117647 17 17 1 15 1 3 60889627 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60890456 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60890594 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60891408 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60892669 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60892951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60894197 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 60894338 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60895019 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60895414 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60897180 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 3 60897212 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 60897546 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60897643 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 60898389 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 60898677 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 60899356 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 60899638 A C Y N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 60900241 G A Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 60900716 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60900893 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60901005 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60901082 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60901122 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60901696 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 60901865 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60901964 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60902980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60903099 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60903111 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60903161 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60903723 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 60903802 G T N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 60905873 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 60905878 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 60906291 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 60906359 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 60907011 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60907245 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60907398 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60907621 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60908111 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 60908644 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60908664 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60909194 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60909209 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60909313 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 60909454 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 60909480 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 60909535 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60909542 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60909591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60909622 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 60910436 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 60910781 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 60911029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60911094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60911247 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 60911502 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 60911789 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60911857 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60911892 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 60912635 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 60913089 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60913338 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60913663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60914835 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 60914992 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60915064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60915475 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60915516 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60915877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60915899 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 60915997 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60916002 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 60916067 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60916104 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 60916141 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60916148 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60916216 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 60916230 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 60916281 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 60916311 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 60916429 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 60916480 A T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 60916604 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 60917050 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 60917384 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 60917469 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 60917637 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60917648 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 60917826 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 60917871 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60917949 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 60917970 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 60918068 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.263157894736842 27 11 13 1 5 3 60918093 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 60918160 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 60918543 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 60919108 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60919337 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60919502 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60919893 C A Y N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.266666666666667 0.0666666666666667 0.666666666666667 9 21 4 1 10 3 60919934 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 60920063 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 60920186 C A Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.222222222222222 0.0555555555555556 0.722222222222222 9 27 4 1 13 3 60920341 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 60920351 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 60920495 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60920649 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60920731 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 60920774 C A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 60920790 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 60920917 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 60920975 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60921257 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60921297 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60921778 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60921788 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60921824 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 60922323 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60923105 A G Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.176470588235294 0.0588235294117647 0.764705882352941 7 27 3 1 13 3 60923123 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 60923513 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 60924684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60924725 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60925023 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 60925350 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60926041 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60926093 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 60926409 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60926868 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 60927722 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60927962 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 60928119 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60929480 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60930018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60930138 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 60931980 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60932081 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60932468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60932826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60933081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60934721 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60935739 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60936435 T G Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 60936438 A T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 60937416 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60938737 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60940227 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60940536 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60940755 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 60942316 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 60942672 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 60943188 C G N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 60943242 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60943354 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 60943612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60943720 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60943883 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 60943991 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60943996 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 60944084 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 60944116 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 60944157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60944399 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60944521 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 60944846 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 60944896 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 60945057 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60945131 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60945247 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 60945260 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 60945297 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 60945321 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60945353 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 60945357 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 60945488 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 60945509 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 60945555 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60945581 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 60945653 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60945747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60945782 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 60945884 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 60945933 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60945949 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 60946306 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 60946471 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 60946497 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 60946555 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 60946628 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60946640 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 60946704 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 60946871 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 60946874 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 60947107 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 60947293 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60948146 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 60948488 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60949148 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60949423 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60949463 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 60949509 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 60949570 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 60949683 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 60949823 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60949913 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 60949927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60950290 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 60950341 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60950425 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 60950484 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 60950992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60950994 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60951157 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60951176 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60951514 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 60951668 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 60951815 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 60952201 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60952258 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60952350 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60952370 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60952443 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60952753 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 60952826 A C Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 60952827 T C Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 60952845 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 3 60953009 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 60953107 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60953291 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 60953305 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60953430 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 60953592 G T Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 60953599 C G Y N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 60953666 G C Y N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 3 60953781 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60953818 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 60953985 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60954011 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 60954037 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60954187 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60954205 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 60954232 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 60954583 T C Y Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 60954614 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 60954643 C G Y N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 60954862 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 60955225 T A Y N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 60955271 C T Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 3 60955596 C A Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 60955650 A G Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 60955754 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 60955775 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60955795 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60955846 A T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 60955868 G T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 60955889 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 60956015 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60956098 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 60956202 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 60956206 G A Y Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.153846153846154 0.0769230769230769 0.769230769230769 5 21 2 1 10 3 60956251 A C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 60956265 T G Y N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 3 60956266 A G Y Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 3 60956533 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 60956759 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60957146 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60957389 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60957811 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 60958108 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 60958169 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 60958396 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60958472 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 60958590 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 3 60958852 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60958951 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60959593 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 60959839 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60960136 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60960205 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60960891 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60961274 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 60961526 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60962146 T A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 60962481 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60962950 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 60963079 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 60963225 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 60963272 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.176470588235294 0.0588235294117647 0.764705882352941 7 27 3 1 13 3 60963292 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 60963900 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60963987 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60964058 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 60964083 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 60964339 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60964538 A T N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 60964540 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 3 60964833 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60965205 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60965230 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60965234 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60965607 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60965877 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60966677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60966932 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60967208 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60967239 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60967527 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 60967583 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60968137 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60968687 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 60968729 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60968817 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60968976 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60969256 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 60969438 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60969601 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 60970012 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60970202 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60970249 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 60970339 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60970362 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60970414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60970512 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 60970615 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 60970713 A C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 60970780 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60971125 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 60971126 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 60971191 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 60971687 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60971852 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 60971910 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 60971932 T A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 60972035 A T N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 4 24 2 0 12 3 60972352 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60972429 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 60972603 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60972692 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60972774 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60973059 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 60973061 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 60973074 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60973307 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 60973341 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60973779 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60973962 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 60973980 G T Y N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 60974351 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 60974410 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60974751 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60974880 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60975017 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60981939 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 60982020 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 60982102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60982380 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60982438 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 60982680 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 60982808 T C N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 60982867 T C N Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 6 6 2 2 2 3 60983469 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60983524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60983537 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60983709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60984092 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 60986575 C G Y N 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 3 60987341 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 60987374 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 4 8 2 0 4 3 60987936 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 60988003 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0 0.75 0.25 15 25 0 15 5 3 60988066 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60988613 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 60989455 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60990632 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 60990886 A T Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 60992170 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60992701 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60993497 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 60994908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60995997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 60996034 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 60997261 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 60999072 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 60999175 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61003894 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61007969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61013092 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61013356 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 61013923 T C Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 61014914 G A Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 61014998 T C Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 61016000 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61016112 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 61016981 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 61017846 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61018432 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61018543 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61018599 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61019191 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61020169 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61021481 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61022051 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61022097 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61022380 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61022843 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 61023707 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61023981 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61024080 C T N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 61024115 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61024127 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61024303 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 61024315 G A N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 3 61024316 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 3 61024370 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 61024401 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 3 61024428 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 3 61024472 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 61024500 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 61024509 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 61024519 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 61024520 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 61024543 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 61024555 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 61024558 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 61024594 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 61024670 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61024825 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 61024905 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 61024909 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 61024964 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 61025042 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 61025066 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61025077 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 61025107 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 61025125 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 61025139 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 61025180 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 61025181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61025242 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61025259 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61025281 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 61025307 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61025334 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 61025477 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 61025660 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 61025897 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 61026766 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61027117 G T Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 61027190 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 61027540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61027744 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61030492 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61030982 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 61031496 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61031681 C G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 61035345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61036601 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61037811 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 61038924 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61038987 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61039398 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61039475 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61039903 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61040390 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61040720 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61041471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61041836 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 61043196 A T Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 61046103 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61046133 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61046904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61048460 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 61048928 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61049283 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61049613 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61049663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61049931 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61050420 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 61050703 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 61050893 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61051263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61051578 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 61051634 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61052037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61052157 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 61052170 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 61052174 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 61052443 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61052453 C A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 3 61052516 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 61052600 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 61052601 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 61052727 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61052814 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61052910 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61053087 T A N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 61053118 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61053141 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61054426 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 61054542 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 61054569 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 61054713 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 61054761 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 61054893 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 61054952 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 61054996 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 61055148 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 61055368 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.352941176470588 0.117647058823529 0.529411764705882 14 20 6 2 9 3 61055495 A G N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 3 61055656 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 61055689 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 61056793 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 61056875 A C Y N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 3 61056906 G A Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 61056984 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 3 61057238 A C Y N 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 3 61057306 G A Y Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.6 0 0.4 6 4 3 0 2 3 61057423 T G N N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.416666666666667 0.0833333333333333 0.5 11 13 5 1 6 3 61057469 C A Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 61057580 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 61057727 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 61057941 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 61057963 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 61058188 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 61058268 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61058284 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61058299 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61058335 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61058444 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61058506 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61058725 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 61058972 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61059315 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 61059444 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 61059749 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 61060096 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 61061493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61061808 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 61061838 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 61062093 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 61062231 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 61062283 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 61062470 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 61062484 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 61062519 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 3 61063009 C A Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 61063033 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 61063326 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 61063341 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 61063380 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 61063497 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 61063533 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61063546 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 61063614 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 61063884 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 61064058 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 61064305 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 61064410 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61071435 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61071990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61072023 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61072109 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61072747 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61073207 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 61079796 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61079884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61080257 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61080350 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61080513 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 3 61080563 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61081067 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 61081196 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61081221 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 61081237 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61081392 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61081476 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61081566 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 61081583 T G Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 61081728 G C Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 61081847 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61081876 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61082099 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61082345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61082406 C A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 61082672 T C Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 61082875 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 61082950 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 61083079 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 61083220 T C N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.428571428571429 0.214285714285714 0.357142857142857 15 13 6 3 5 3 61083358 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 61083584 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 61083740 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61083854 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 61083944 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 61083949 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 61084067 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 61084084 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 61084100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61084355 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 61084382 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 61084403 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 61084457 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 61084509 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61084685 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 61084928 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61085202 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61085304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61087901 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61087902 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61089113 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61090522 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61092067 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 61092482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61092879 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61093951 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61094840 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61095079 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61095355 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 61096026 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61096027 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61097287 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61097707 C A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 61098384 T A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 61098466 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61098473 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 61098629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61098944 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61100239 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61100556 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 61100602 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61100695 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61100871 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 61100994 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61101012 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 61101063 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61101110 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61101117 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61101418 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61101495 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 61101742 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61101857 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61101956 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 61102064 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61102131 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 61102552 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 61102936 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61103405 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 61103591 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61103798 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61103999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61104137 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 61104676 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 61104700 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 61105180 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61105320 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61105686 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 61105783 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 61105847 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 61105989 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 61106048 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61106064 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61106163 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 61106289 G T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 61106400 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61106443 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61106818 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 61107117 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61107315 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61107316 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61107329 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 61107341 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61107375 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 61107416 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61107542 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61107846 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 61108110 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 61108142 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 61108282 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 61108379 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61108453 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 61108687 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61108697 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61108742 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61108748 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61108761 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61108769 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 61108816 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61108927 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61109101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61109164 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61109299 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61109323 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61109347 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61109401 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61109481 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61109585 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 61110093 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 61110139 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 61110234 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61110362 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61110431 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 61110442 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 61110456 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61110465 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61110470 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61110541 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61110574 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61110602 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 61110628 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61110661 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61110667 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61110962 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 3 61111008 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 61111024 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 61111059 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 61111094 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 61111108 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 61111119 G C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 61111231 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61111255 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61111405 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 61111886 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61112143 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61113003 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61113199 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61113268 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 61114519 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61116316 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61117481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61117573 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61117863 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61118309 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61118647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61121105 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 61121133 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61121281 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61121385 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 61121491 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61121754 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61121793 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61121890 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 61121895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61121925 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61122083 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61122084 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61122380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61122438 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61122526 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61122812 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61122877 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61123288 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61123553 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61123903 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61123927 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61123997 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61124234 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61124346 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61124359 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61124380 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61124407 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61124410 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61124465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61124923 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61124988 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61125252 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61125264 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61125987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61126027 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 61126028 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 61126456 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61126477 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61126494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61126582 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 61126669 C A Y N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 61126748 G A Y Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 61127026 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 61127072 A C Y N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 61127074 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61127192 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 61127269 C G Y N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 3 61127276 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 61127451 C G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 61127748 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 61128012 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 61128051 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61128056 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 61128325 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 61128360 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 61128436 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61128555 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 61128662 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61128815 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61128916 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 61128975 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61129051 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 61129086 C G Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 61129142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61129394 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 61129445 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 61129477 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 61129556 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 61129588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61129591 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61129641 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 61129809 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 61129853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61129985 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 61130003 G T Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 61130015 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61130174 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 61130791 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 61130795 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 61130912 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 61130918 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 61130988 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61131092 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 61131235 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 61131306 G A Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 61131406 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61131463 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61131889 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61131942 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 61132032 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 61132070 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61132095 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 61132602 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 61132683 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 61132707 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 61132813 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 61132833 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 61132900 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 61132974 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 61132992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61133082 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 61133172 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 61133189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61133211 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61133322 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 61133400 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 61133413 C A Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 61133547 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 61133612 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 61133617 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 61133633 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61133710 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 61133727 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 61133770 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 61133904 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61133921 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61133954 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61133980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61134017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61134087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61134100 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 61134185 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 61134281 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61134284 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61134337 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 61134377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61134432 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61134509 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 61134585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61134625 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61134719 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 61134732 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 61135018 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 61135030 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 61135052 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61135100 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 61135210 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61135231 A C N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 14 18 0 14 2 3 61135258 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61135273 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 61135274 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 61135296 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 61135330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61135402 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 61135774 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61135804 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61135854 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61135895 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 61135945 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61135977 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 61136010 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 61136012 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 61136041 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61136483 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61136489 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 61136494 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61136643 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 61136776 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 61137057 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 61137075 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61137079 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61137238 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61137398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61137428 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 61139389 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 61139397 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61139502 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 61139528 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 61139539 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 61139745 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61139758 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 61139787 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61139807 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 61139840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61139893 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 61139902 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 61139904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61139916 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 61139941 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61140206 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 61140244 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 61140257 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 61140296 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 61140335 A G Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 61140498 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61140537 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61141250 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 61141398 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 61142344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61142386 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61142398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61142400 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 61142532 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 61142595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61142989 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61143545 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61143553 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61143726 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 61143787 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 61143796 C A N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 61144117 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61144193 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61144325 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 61144371 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 61144407 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 61144572 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 61144752 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 61144789 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 61144846 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 61144901 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 61145204 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 61145266 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 61146017 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 61146074 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 61146657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61147850 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61148233 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 61148640 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 61150081 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 61150379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61150383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61150448 T A Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 61150542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61150563 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 61150595 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 61150629 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61150643 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 61150664 C G Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 61150687 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61150736 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61150754 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61150930 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 61151045 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 61151122 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 61151137 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 61151148 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 61151235 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61151269 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 61151292 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 61151371 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 61151394 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 61151415 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 61151432 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 61151441 C A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 61151587 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61151670 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 61151678 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 61151754 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 61151842 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61151927 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61151990 T A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 61152014 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61152160 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 61152184 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 61152503 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 61152519 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 61152816 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 61152826 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61152876 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 61152929 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 61153428 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61153495 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 61153707 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61153757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61153763 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 61153958 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 61154202 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 61154247 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 61154338 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 61154526 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 61154585 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 61154674 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 61154819 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 61154927 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 61155103 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 61155255 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 61155402 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 61155459 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61155697 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 61155717 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 61155821 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 61155911 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 61155989 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 61156204 T A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 61156211 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 61156230 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 61156231 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 61156336 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 61156587 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61156889 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 61157191 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61157238 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61157447 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61157905 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 61158108 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61158133 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 61158924 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 61159266 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 61160943 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61161190 C T Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 61161844 C A Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 61163559 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 61164879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61165131 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61165438 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61167233 C A Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 61167894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61168263 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61170760 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 61173645 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61173906 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61174396 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 61174919 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 61175064 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 61175795 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61175910 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 61176446 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 61176518 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61176821 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61176940 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 61178129 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61178268 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61178283 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61178640 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 61179225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61179309 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61180735 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 61180968 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61181259 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 61182535 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 61183597 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61184480 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61185267 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 61185430 T G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 61186972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61187111 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61187113 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61187231 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61187394 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61187953 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 61188037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61188371 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61188877 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 61189117 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 61189293 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 61189356 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 61190117 T A N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 3 61190336 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 61190346 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61191074 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61192251 T G Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 61192500 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 61193466 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 61193672 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 61193830 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61193929 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61193947 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 61194037 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61194089 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 61194340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61195019 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 61195049 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 61195076 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 61195178 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61195179 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 61195217 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 61195218 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 61195496 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61195579 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61195862 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61196131 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 61196213 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 61196454 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 61196543 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 61196874 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 61197143 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61197263 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 61197397 C A N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 61197406 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 61197450 A T N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 61198045 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 61198603 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 61198617 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 61198770 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 61198796 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 61199738 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 61199803 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61199852 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61199911 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61199995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61200053 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 61200118 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 61200138 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 61200152 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61200171 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61200232 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 61200450 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 61200576 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61200915 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61200944 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61201129 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 61201388 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61201483 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61201614 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 61201626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61201651 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61201685 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 61201690 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 61202284 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61202346 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61202542 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61202578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61202713 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 61203192 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61203212 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61203378 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61203537 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61204094 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 61204232 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 61204292 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 61204408 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 61204460 A T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 61204536 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 61204646 T A Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 61204745 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 61204821 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 61205216 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 3 61205239 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 61205750 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 61205768 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61205805 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61205840 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61205949 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61206061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61206062 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61206108 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61206130 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61206261 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61206299 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61206330 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 61206397 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61206410 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61206443 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61206466 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61206489 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61206591 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61206997 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61207014 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61207266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61207709 C T Y Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.363636363636364 0.545454545454545 0.0909090909090909 14 8 4 6 1 3 61207792 T C Y Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.272727272727273 0.545454545454545 0.181818181818182 12 10 3 6 2 3 61207992 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61208057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61208113 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61208125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61208175 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61208190 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61208352 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61208391 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 61208419 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61208549 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61208580 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 61208636 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 61208674 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 61208721 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 61208762 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61208880 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 61208954 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 61209095 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61209397 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61209664 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 61209843 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 61210210 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 61210737 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 61210739 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 61210805 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61212659 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61213050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61215073 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 61215251 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61215756 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 61217015 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61217542 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61218665 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61219246 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 61219635 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 61219786 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 61219804 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 61219825 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 61219830 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 61219841 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 61219847 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 61219853 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 61219995 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61223180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61223259 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 61223355 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61223581 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 61223617 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 61223643 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 61224076 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 61224085 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 61224247 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61224265 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 61224285 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61224848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61225065 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61225210 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 61225365 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61225481 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 61225625 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61226884 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 61227026 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61227120 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61227263 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61228286 A G N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 3 61228648 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 61228675 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 61228710 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 61228713 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 61228721 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 61228771 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 61228804 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 61228927 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 61228940 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 61228951 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 61228957 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 61228985 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 61229012 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61229031 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 61229077 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 61229123 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 61229157 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61229210 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61229256 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61229295 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61229332 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61229366 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 61229420 A C Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 61229460 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 61229616 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 61229617 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 61229746 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 61229752 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61229824 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 61229828 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 61229930 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61229973 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 61230008 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61230041 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61230059 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61230303 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61230619 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 61230701 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 61231045 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 61231049 G A Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 61231222 A T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 61231244 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 61231253 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61231327 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 61231370 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61231405 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 61231448 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61231620 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 61231631 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61231645 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 61231686 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61231724 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61231798 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 61231845 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 61231900 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 61231918 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 61231945 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 61231948 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 61232137 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 61232291 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 61232311 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 61232397 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 61232433 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 61232497 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 61232556 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 61232612 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 61232685 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 61232690 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 61232882 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 61232944 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 61233226 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 61233260 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 61233450 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 61233462 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 61233476 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 61233520 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 61233717 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 61233795 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 61234090 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 61234772 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61234862 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 61235320 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 61235473 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 61235631 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 61235785 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61235836 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61235910 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 61236004 A C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 61236224 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 61236235 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61236647 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 61236769 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61236771 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 61236844 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 61236975 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 61237195 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61237217 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61237349 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 61237464 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 61237736 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61237846 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61237945 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61238906 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61238974 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61240234 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61240690 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61241099 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61241259 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 61241513 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 61241595 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 61242212 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61242253 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61242528 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61242658 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 61242990 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 61243032 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61243055 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 61243389 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61243509 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 61243803 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 61243827 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 61244057 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61244121 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61244293 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61244602 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61244874 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61244906 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 61244918 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 61244991 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61245164 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 61245389 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61245403 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61245432 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61246225 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61246538 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 61246883 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61247248 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 61255756 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61256124 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61256639 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61259759 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61260724 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61261062 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 61261452 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61261547 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61262353 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61262394 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 61262609 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 61262734 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61263305 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61263385 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61264764 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61265274 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 61265402 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 61266910 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61267434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61267751 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61268140 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 61268709 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61269005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61269098 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61269109 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 61269297 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61269345 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 61269349 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61269645 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 61269781 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 61270038 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 61270451 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61270787 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61270897 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61271063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61272959 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61273322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61273637 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61273756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61273967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61274037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61275652 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 61275688 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 61275801 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61276101 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61276310 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 61276345 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 61276884 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 61277487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61278436 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61279239 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61279618 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 61280940 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61281364 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 61281546 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 61282849 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 61282913 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 61282924 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61283969 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 61284272 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 61284301 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 61284353 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 61284469 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 61284583 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 61284642 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 61284670 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 61284676 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 61284698 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 61284804 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 61284881 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 61284898 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 61284899 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 61285187 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 61285215 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 61285550 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 61285816 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 61286158 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61286304 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 61286484 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 61286616 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 61286672 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 61286837 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 61286920 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 61287028 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61287083 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 61287118 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61287152 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 61287172 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 61287198 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 61287260 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61287342 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 61287572 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61287650 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 61287872 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 61287873 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 61287924 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 61287955 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 61288064 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61288333 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 61288723 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 61288739 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 61288763 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 61289115 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61289184 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61289246 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61289281 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 61289429 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 61289520 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 61289667 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 61289703 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 61289761 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 61289824 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 61290017 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 61290222 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61290353 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 61290471 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 61290494 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61290519 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 61290536 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 61290572 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 61290583 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 61290704 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 61291164 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61291611 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 61292900 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 61295059 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61295491 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61295676 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 61295981 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 61295992 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61296663 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 61297095 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 61297455 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61297850 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 61297951 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61298264 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61298521 T C Y Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 3 61301097 T G Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 61302697 A G Y Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 61304415 T G Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 61304441 C T Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 61304442 A C Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 61305564 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61305970 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 61306211 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61306353 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61306435 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61306504 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61306575 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61306652 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 61307170 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 61307243 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 61307423 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 61307753 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 61310005 G C N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 3 61310091 G A N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.636363636363636 0.181818181818182 0.181818181818182 16 6 7 2 2 3 61310306 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 61310629 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61310660 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61311994 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 61312434 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 61312593 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61312757 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 61312766 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 61313238 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61314041 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 61314350 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61314541 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61314704 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61315267 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61315725 A T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 61316075 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 61316711 G A Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 61316895 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 61316941 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 61316989 A C Y N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 61317000 C A Y N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 3 61317915 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 61318253 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 61318385 A C Y N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 61318879 C T Y Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 8 6 3 2 2 3 61319009 G A Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 3 61319421 A T Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 61319577 C T Y Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.5 0.125 0.375 9 7 4 1 3 3 61319956 A T Y N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 61319965 A G Y Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 6 6 2 2 2 3 61319987 C A Y N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.25 17 7 8 1 3 3 61320735 T A Y N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.272727272727273 0.545454545454545 0.181818181818182 12 10 3 6 2 3 61321130 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61321317 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 61321684 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 61321755 G C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61321921 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 61322217 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61322810 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 61323169 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 61323298 C G N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 61323491 G A N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 12 4 5 2 1 3 61323880 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61323932 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61323953 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 61324094 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61324428 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61324974 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61325302 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61325978 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 61326338 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61326370 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61326786 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 61327533 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61327857 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 61328245 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 61328344 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61328953 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 61329006 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 61329640 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 61329772 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61330048 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 61330440 C A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 61330487 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 61330578 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 61330697 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.1875 0.0625 0.75 7 25 3 1 12 3 61330791 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 61330885 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.2 0.0666666666666667 0.733333333333333 7 23 3 1 11 3 61330930 T A N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 61331114 A G Y Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 6 8 2 2 3 3 61331539 C G Y N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 61331576 G T Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 61331587 T G Y N 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.333333333333333 0.111111111111111 0.555555555555556 7 11 3 1 5 3 61331670 G T Y N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 61332030 A G Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 61332167 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 61332317 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 61332388 C A Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 61333132 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 61333673 G A Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.615384615384615 0.153846153846154 0.230769230769231 18 8 8 2 3 3 61334287 A T Y N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 9 5 4 1 2 3 61334389 C A Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 61334465 A T Y N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 61334531 C T Y Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 3 61334681 A T Y N 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.333333333333333 0.111111111111111 0.555555555555556 7 11 3 1 5 3 61335240 T G Y N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 61335259 T G Y N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 61335415 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 61335886 G T Y N 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 3 61336033 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61336588 G A Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 61336868 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61337043 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 61337111 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61337421 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61337566 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61337897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61338201 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61338457 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 61338618 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 61338646 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 61339048 A T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 61339049 T A N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 61339294 T A N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 61339468 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 61340409 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61341218 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 61342635 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 61343181 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 61343286 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 61343526 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 61344121 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 61344954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61346253 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 61346498 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 61346563 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 61346745 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 61347523 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61347524 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61347573 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 61348902 G A Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 61349037 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 61349586 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 61350121 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 61350902 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61351057 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 61351111 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61351495 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 61351964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61352072 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 61353031 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61353587 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 61353768 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61353769 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61354941 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 61355929 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61356998 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 61357019 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61357165 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 61357202 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 61357744 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 61357757 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 61357870 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 61358048 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 61358112 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61358208 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61361737 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 61361783 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61362018 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61362228 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 61363866 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 61364428 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61365649 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61365817 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 61366047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61366596 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 61366697 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61367200 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 61367615 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 61367810 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61368133 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61368379 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 61368533 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 61369276 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 61369808 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 61370675 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61370714 C G Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 61370955 A G Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 61371993 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 61372024 G T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 61373200 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61373527 T G Y N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 61373564 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61373847 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 61373989 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61374212 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61374763 A G Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 61374795 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61374855 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61374901 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 61374997 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61375340 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61375348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61375496 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 61375596 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 61376914 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 61377953 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 61378203 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61378985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61381039 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 61381402 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 61381682 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61381829 A G Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 61381848 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61382334 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61382370 A C Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 61382445 G T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 61382585 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 61382591 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 61382810 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61382831 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61382996 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 61383628 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61384188 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 61384822 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 61384924 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 61384971 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 3 61385072 G A N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.625 0.125 0.25 11 5 5 1 2 3 61385213 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 61385446 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61385526 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61385553 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 61385975 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61386054 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 61386280 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61386308 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61386388 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61388158 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 61388595 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61388767 T A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 61388770 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61388902 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61388913 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61389001 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 3 61389210 G T Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 61389295 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 61389296 G C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 61389461 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61390110 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 61390156 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61390198 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61390692 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61391350 C A N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 61391797 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61391801 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61391861 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 61391918 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61392009 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 61392122 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 61392288 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 61392754 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61393220 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 61393250 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 61393595 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61394366 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 61394399 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 61394562 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 61394686 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 61394687 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 61394787 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61394810 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61395080 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 61395253 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61395299 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 61395324 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61395362 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 61395463 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 61395665 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 61395768 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 61395804 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 61395874 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 61395916 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 61395959 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 61396003 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 61396245 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61396291 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 61396313 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 61396875 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61396879 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 61396938 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 61397102 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61397198 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 61397858 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 61398724 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61399068 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 61399075 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 61399286 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 61399292 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 61399762 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 61400184 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61400226 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61400373 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61400692 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61402022 T C N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 61402633 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61402864 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61403365 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 61403547 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61404537 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61404830 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61405717 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61406175 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 61406563 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61406840 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 61407522 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61408468 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 61409698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61410585 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61410792 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61411638 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61413324 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61413509 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61413873 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61414459 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 61415451 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61415921 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 61420303 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 61420360 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 61420609 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 61420636 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 61420651 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 61420713 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 61420727 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 61420755 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 61420988 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 61420991 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61421099 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 61421143 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 61421152 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 61421191 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 61421261 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 61421340 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 61421354 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 61421529 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61421541 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 61421574 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 61421648 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 61421747 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 3 61421760 A C N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 3 61422074 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 61422107 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 61422111 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 61422133 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 61422146 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 61422159 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61422290 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61422310 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61422427 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61422470 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61422484 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61422508 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61422536 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61422555 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 61422600 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 61422609 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 61422661 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 61422678 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 61422728 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61422759 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 61422787 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 61422820 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 61422845 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 61422891 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 61422942 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61422956 A T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 61422974 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 61423008 C A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 61423081 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 61423230 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 61423642 C G Y N 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 7 9 0 7 1 3 61423688 A G Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.0666666666666667 0.8 0.133333333333333 14 16 1 12 2 3 61423882 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 61423918 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 61423930 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 61423967 C T Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 61424017 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 61424185 C T Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 61424280 G C Y N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 3 61424290 C A Y N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 3 61424308 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 3 61424333 G A Y Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 3 61424405 A G Y Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 61424487 G T Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 61424507 C A Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 61424681 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 61424716 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 61424824 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 61424959 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 61424982 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 61424996 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 61425089 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 61425093 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61425177 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61425193 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61425213 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 61425265 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61425300 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61425501 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 61425516 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 61425525 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 61425579 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 61425849 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 61425994 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61426129 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61426268 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 61426293 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 61426301 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 61426337 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61426394 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61426418 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 61426435 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 61426453 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61426476 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61426541 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61426562 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 61426576 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 61426802 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61426837 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 61426850 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 61426860 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 61426987 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 61427057 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61427130 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61427148 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61427171 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 61427192 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 61427216 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 61427314 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 61427355 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 61427356 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 61427464 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 61427472 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 61427490 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 61427501 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 61427530 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 61427892 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61427906 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61428034 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 61428043 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 61428049 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 61428120 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 61428168 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 61428268 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 61428351 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61428377 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 61428378 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 61428512 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 61428533 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61428584 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61428659 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 61428687 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 61428785 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 61428855 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 61428887 T A N N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 13 11 1 11 0 3 61428889 T A N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.0769230769230769 13 13 1 11 1 3 61428898 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 61428943 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 61429077 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61429176 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 61429248 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 61429281 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 61429288 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 61429294 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 61429346 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 61429372 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 61429378 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 61429383 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 61429415 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 61429421 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 61429457 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 61429663 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 61429767 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 61429786 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61429868 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 61432739 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 61433870 A T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61435341 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 61435581 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 61435616 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61435710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61436640 A G Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 61438083 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 61438750 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 61439831 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 61440025 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 61440118 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 61440315 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 61440378 C G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 61447212 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 61447553 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 61447613 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 61447756 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61447777 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 61447795 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 61447934 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 61447988 A C Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 61448198 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 61448200 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 61448377 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 61448628 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 61448656 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 61448880 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 61448890 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61448957 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 61449143 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 61449145 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 61449248 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 61449266 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 61449517 A G Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 61449664 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 61449764 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 61449864 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61449893 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 61449943 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61450071 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 61450786 A C N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 61450901 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 61451214 T C N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 61451618 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 61451657 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 61451764 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61451854 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61451944 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61452007 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61452325 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 61452501 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61453124 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 61453762 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 61453864 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61453870 C G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61453922 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 61454280 C G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61454849 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 61455060 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 61455211 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 61455221 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61456086 T A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 61456198 A C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 61456476 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61456771 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 61457148 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 61457336 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61457540 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61458419 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61458822 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61458838 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61458840 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61459106 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61459410 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 61459603 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61460274 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 61460766 A T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 61460783 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 61463406 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 61466059 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61469364 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 61469420 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61469687 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 61469764 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 61470342 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61470511 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61470640 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61470805 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61471220 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 61472472 C A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 61474328 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 61474382 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 61483165 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 61483613 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61483624 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61483820 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61484439 C A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 61485673 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61485718 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61486196 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61486368 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 61486596 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 61486741 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 61487513 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 61487686 A C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 61489708 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61490243 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 61490297 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 61491261 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61491340 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 61491473 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 61491888 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61492114 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 61492735 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61493339 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 61493519 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61494005 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 61495326 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 61495621 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 61496296 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61497738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61497992 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61499009 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 61500014 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 61500352 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61500521 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61500636 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61500834 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61501538 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61502815 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 61503211 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61503717 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 61503746 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61504500 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 61505985 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 61506002 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 61506450 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 61506619 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61507176 C T Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 61507687 A T Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 61507800 T A Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 61507941 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61509103 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 61509312 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61509448 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61510078 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61510401 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 61510635 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 61510768 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 61518144 C T N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 3 61518694 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61518814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61519066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61520763 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 61521709 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 61522848 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 61522880 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 61523867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61530966 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 61531934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61532180 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61532327 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61534160 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61534437 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61534870 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61535601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61536153 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61537024 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61538857 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 61540481 C A Y N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 3 61540940 A T Y N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.222222222222222 14 4 7 0 2 3 61541122 G A N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 61541537 G A Y Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 61541547 T C N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 3 61541921 T A N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 61542480 C T N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 14 6 6 2 2 3 61542482 A G N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 14 6 6 2 2 3 61542528 A G N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.545454545454545 0.272727272727273 0.181818181818182 15 7 6 3 2 3 61543036 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 61543734 C G N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 24 4 12 0 2 3 61544287 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 61545293 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 61545385 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61545477 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61546237 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61546292 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 61547544 G C Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 61548375 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 61548568 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 61548849 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 61549079 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61549637 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61550131 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61550489 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 61550952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61552251 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61552714 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 61553108 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 61553551 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61553570 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 61554167 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61555771 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61555887 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61555960 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 61556013 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 61556715 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 61557107 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 61557299 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 61558419 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61559221 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 61559543 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61561188 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61561526 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 61562162 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 61563929 A G Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 61563947 C T Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 61564501 G C Y N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.8 0 0.2 16 4 8 0 2 3 61565503 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61565688 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 61566057 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61566290 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61566619 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 61567450 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 61568106 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 61568235 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 61568495 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61571429 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 61572046 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 61572145 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 61572156 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61572303 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61572355 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 61572664 T A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 61572754 A T N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 3 61573089 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61573512 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 61573530 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 61573727 A T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 61573759 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 61573763 A C N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 61573772 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 61573782 T A N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 61573786 A T N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 61574129 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 61574301 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61574564 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 61574964 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 61575125 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 61575131 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 61575386 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 61575802 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61575977 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61576039 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 61576096 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61576143 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61576191 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61576243 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61576357 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61576412 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 61576413 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61576427 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61576508 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61576589 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61576602 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61576671 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 61576787 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61577625 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 61577730 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 61577786 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 61577793 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 61583949 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 61584392 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 61584538 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 61584567 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 61584841 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 61584867 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 61585516 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 61585537 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 61585748 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 61585766 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61585775 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 61585777 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 61586403 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 61586885 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61587408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61587529 A T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.1875 0.0625 0.75 7 25 3 1 12 3 61588015 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 61588130 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 61588267 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 61588301 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61588737 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61588875 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 61588908 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 61589452 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61589880 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 61589907 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 61589909 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 61590376 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 61590440 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61590531 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 61591424 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 61591427 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 3 61591479 C A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 61591507 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 61591575 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61591728 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61591736 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 61591910 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 61591918 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 61591960 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 61592034 A G Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 61592102 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 61592217 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 61592284 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61593098 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61593244 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61593271 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61594330 G T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 61594749 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 61595038 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 61595180 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61595275 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 61595429 C G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 61595539 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 61595625 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61595716 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 61595924 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 61596625 T C Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 61596657 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61596795 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61596808 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61596966 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 61597133 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61597308 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61597354 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 61597748 A G Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 3 61597788 G C Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 61597817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61598020 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 61598058 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61598337 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61598438 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 61599217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61599224 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 61599718 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61599795 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 61599835 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 61600351 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61600571 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 61600582 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 61601019 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 61601294 G T Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 61601576 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 61601601 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 61602012 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61602231 T A Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 61602309 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61602417 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61602661 G C Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 61602677 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61602738 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 61602746 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 61602824 T A Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 61603001 A T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 61603069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61603072 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61603506 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 61603585 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61603587 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 61603622 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61603709 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 61603710 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 61603797 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 61604024 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 61604122 T C Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 61604123 G T Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 61604138 A G Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 61604139 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61604429 G T N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 3 61604488 G T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.133333333333333 0 0.866666666666667 4 26 2 0 13 3 61605153 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61605323 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61605329 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61605413 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 61605507 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 61605527 A C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 61605580 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 61605591 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 61605653 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 61605750 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61606215 G C N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 4 24 2 0 12 3 61606460 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 61606506 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 61606793 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61607198 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61607435 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 61608701 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 61608926 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61609070 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61609288 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61609857 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61609915 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 61609998 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61610385 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61611139 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 61611212 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61611564 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 61611574 T C Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 61611612 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61611623 A T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 61611939 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 61611949 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 61612096 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 61613077 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 61613438 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61613545 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61613566 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61613711 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61613803 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61613998 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61614394 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 61614563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61614573 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 61614613 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 61614650 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61614656 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 61615072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61615182 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 61615295 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61615300 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 61615840 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61616016 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61616052 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61616228 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61616231 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61616558 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61616628 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61616992 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61617002 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 61617022 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61617551 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61617781 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 61618436 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 61618510 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 61618519 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 61618892 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 61619117 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 61619423 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 61619425 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61619487 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61620020 C A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 61620405 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 61621583 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61621725 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61622418 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 61623063 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 61623278 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 61623423 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61623550 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 61623954 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 61623963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61624233 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61624488 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61625154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61625329 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61625782 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61626000 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61626733 G C Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 61627035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61628451 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 61628465 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 61628572 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 61628613 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61628641 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 61628650 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 61628668 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 61628700 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61628816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61629026 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 61629070 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 61629089 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 61629095 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 61629102 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 61629205 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 61629214 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 61634146 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 61634213 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 61634257 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 61634271 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 61634277 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 61634376 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61634402 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 61634666 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 61634722 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 61634815 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 61634873 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 61634883 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 61634909 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 61635046 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 61635093 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 61635099 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61635150 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61635172 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61635182 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61635243 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61635262 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 61635337 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 61635403 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 61635419 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 61635469 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 61635477 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 61635535 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 61635544 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 61635574 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 61635583 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 61635595 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 61635627 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 61635676 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 61635786 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61635969 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 61635978 C A N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 61636000 A G N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 3 61636040 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 3 61636225 A C N N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 8 8 3 2 3 3 61636262 T G N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 3 61636338 T A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 61636579 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 61636590 T C N Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 3 61636983 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 61637011 A T Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 61637032 G A Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 61637331 A C Y N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 3 61637401 G A Y Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 61637465 C T Y Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 3 61637503 G A Y Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 3 61637525 A C N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 3 61637536 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 61637580 G A Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 61637646 A G Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 61637652 T C Y Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 61637692 T C Y Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 3 61637718 C T Y Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 3 61637769 G T Y N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 9 15 3 3 6 3 61637854 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 61637872 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 61637890 G A Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 61637904 A C N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 61637933 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 61637949 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61637962 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61637978 G A Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 61637990 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 61638008 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 61638025 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 61638041 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 61638117 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 61638175 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 61638187 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 61638188 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 61638240 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 61638330 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 3 61638380 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 61638434 A C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 61638439 G C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 61638494 A C N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 61638546 C A N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 61638591 A G N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 61638633 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 61638699 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 61638709 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 61638712 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 61638722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61638788 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 61638805 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61638951 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61638965 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 61638999 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 61639145 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 61639239 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 61639265 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 61639349 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 61639596 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61639631 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 61639749 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 61639876 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 61639886 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 61639887 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 61639976 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 61640115 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 61640152 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 61640312 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 61640466 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 61640517 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 61640560 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 61640604 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 61640633 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 61640728 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61640918 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61641046 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 61641197 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 20 4 10 0 2 3 61641244 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 61641320 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61641410 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 61641810 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 61641897 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 61641965 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 61642006 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 61642052 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61642251 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61642348 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 61642438 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 61642665 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 61642963 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61643145 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61643191 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61643211 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61643261 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 61643570 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 61643594 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 61643709 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 61643786 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 61643844 T A N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 61643965 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 61644128 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61644193 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 61644197 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 61644242 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 61644244 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 61644275 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61644330 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61644361 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61644385 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 61644449 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61644470 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 61644626 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61644745 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 61644793 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61644813 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61644841 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 61644849 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 61644865 G A N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.4 0.1 0.5 9 11 4 1 5 3 61645443 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 61645654 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61645754 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61645925 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61645960 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61645971 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61646041 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61646215 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61646324 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61646469 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 61646774 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 61646777 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 61646835 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 61646928 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61647020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61647196 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 61647342 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 61647349 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 61647425 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61647427 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 61647468 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 61647481 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61647507 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 61647548 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61647572 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61647604 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 61647605 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 61647691 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 61647732 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61647743 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 61647919 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61647925 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61647991 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61648041 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 61648072 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 61648203 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61648323 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 61648411 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61648503 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61648780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61648891 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61649111 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61649117 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61649129 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 61649209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61649312 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61649335 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 61649349 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61649407 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61649441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61649538 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61649689 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 61650430 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61650477 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61650528 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61650767 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 61652198 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61652601 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 61652993 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 61653032 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61653055 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 61653085 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61653578 G T Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 61653656 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 61653857 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 61653869 T A Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 61653913 T G Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 61653955 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 61654031 T C N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0 0.692307692307692 0.307692307692308 9 17 0 9 4 3 61654072 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 61654079 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 61654097 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 61654120 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 61654168 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 61654296 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61654330 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 61654554 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61655134 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 61655201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61655366 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 61655631 A T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 61656015 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61656153 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61656214 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 61656283 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61656290 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 61656343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61656401 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61656508 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61656545 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61656611 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61656629 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61656766 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61656774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61656859 A G Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 3 61663164 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61663196 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 61663241 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61663317 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61663359 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61663527 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 61663565 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 61663779 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 61663821 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 61663923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61663935 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61664123 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61664161 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61664199 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61664206 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 61664340 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61664487 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61664535 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61664635 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61664688 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61664838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61664851 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61664992 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61665016 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 61665017 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 61665243 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 61665383 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 61665473 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 61665600 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61665623 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61665881 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 61665946 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 61666010 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 61666038 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 61666049 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61666150 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61667082 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61667493 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 61667816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61667898 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61668685 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 61668965 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 61669007 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 61669080 G T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 61669190 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61669424 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61669521 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 61669677 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 61669708 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61669794 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 61669999 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 61670021 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61670671 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 61671163 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61671392 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 61672004 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 61672790 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61672806 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61673646 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61673941 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 61673996 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 61674166 T C Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 61674968 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61674998 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61675279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61675546 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 61675962 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 61676004 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61676202 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 61677108 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 61677242 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61677758 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61678355 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61678563 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 61678588 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61678829 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 61678853 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61678962 G A Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 61679010 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 61679077 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61679108 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 61679196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61679252 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61679307 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 61679312 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 61679346 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 61679361 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 61679427 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61679532 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61679539 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61679553 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61679594 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61679646 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61679702 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61679771 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61679809 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 61680032 G C Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 3 61680038 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 61680071 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.133333333333333 0 0.866666666666667 4 26 2 0 13 3 61680141 A T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 61680223 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61680232 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61680243 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 61680275 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 61680303 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 61680305 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 61680351 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 61680383 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61680423 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 61680553 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 61680569 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 61680574 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 61680581 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 61680596 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 61680674 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 61680742 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 61680754 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 61680774 G C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 61680866 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 61680881 A T N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.166666666666667 0.0833333333333333 0.75 5 19 2 1 9 3 61680933 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 61681026 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 61681107 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 61681109 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 61681255 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61681263 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61681280 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61681701 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61681786 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61681800 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 61681873 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61681938 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61681941 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61682082 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61682179 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61682468 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 61684129 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 61684234 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61684733 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 61685628 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61685962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61686638 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 61687113 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61687204 G C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 61687641 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61688061 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 61688723 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61689581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61691355 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 61691584 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61691604 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 61691912 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 61692928 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 61695330 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61695935 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 61696971 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61697500 A T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61697558 C A Y N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 61698163 G A Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 61698218 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61699942 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61700356 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61700403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61701538 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61703599 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 61703694 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61704128 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61704217 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61704909 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 61706007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61706304 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 61706397 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61707086 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 61713070 C T Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 61713810 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 61714292 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 61714476 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61714871 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61715382 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61715395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61715409 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61715570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61717441 A T Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61717860 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61718098 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61718374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61718805 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61718897 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61719230 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61719515 G C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 61719868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61721008 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 61721087 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 61721549 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61722128 T G N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.666666666666667 0.133333333333333 0.2 22 8 10 2 3 3 61722450 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 61722622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61722748 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61723038 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61723334 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 61723996 G A Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 3 61724348 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 61724737 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61724835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61725042 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 61725466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61725504 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61725606 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 61725609 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61725687 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61725854 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61725883 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61725913 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61725935 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61725937 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61726318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61726360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61726536 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61726597 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61726623 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61726624 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61727198 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61727362 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 61727777 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 61727780 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61727791 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61727810 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61727829 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61727848 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61727900 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61727923 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61727943 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61728053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61728127 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61728158 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61728178 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61728210 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61728311 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61728333 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61728348 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61728382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61728408 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61728499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61728554 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61728584 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61728657 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61728661 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61728680 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61728683 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61728713 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61728727 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61728743 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 61729217 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61729249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61729432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61729698 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61730253 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 61731556 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61731854 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 61732000 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 61733249 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61734598 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61735472 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61735485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61735572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61736191 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61736314 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 61736430 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61736605 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61737524 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61737886 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 61737989 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 61738955 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 61740743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61741960 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61742160 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 61744358 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61745148 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61745918 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 61747684 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61748319 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61748491 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 61748712 A G N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 3 61748713 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 61748877 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 61748898 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 61749644 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 61750104 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61750767 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61750781 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61750919 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61751608 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 61752569 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61752751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61752768 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 61752788 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61752799 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 61752973 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 61752995 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 61753168 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 61753291 A T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 61758331 G T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.133333333333333 0 0.866666666666667 4 26 2 0 13 3 61762839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61762932 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 61762959 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61763252 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61763380 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61765258 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 61765597 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61765728 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61766099 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 61766122 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 61766201 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 61766215 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61766230 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 61766249 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61766319 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61766439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61766829 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61767008 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61767105 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61767234 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61767582 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61767603 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61767752 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 61768239 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 61768669 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 61768825 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61768863 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.133333333333333 0 0.866666666666667 4 26 2 0 13 3 61768865 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.133333333333333 0 0.866666666666667 4 26 2 0 13 3 61770969 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61771048 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61771979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61772416 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 61774044 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61774503 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61774581 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61774766 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61774834 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61774861 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61774865 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61775789 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61775958 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61776583 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 61777217 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61777323 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61777345 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 61779510 A G Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 61783964 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61784028 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 61784238 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 61785092 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61785200 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61785226 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61785912 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61786022 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 61786681 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61787609 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 61787688 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61787709 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61788130 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 61789959 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 61790123 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 3 61791095 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61793848 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61794034 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61794368 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61794497 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61794648 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61794768 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61795002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61795631 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 61796416 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 61797187 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 61798410 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 4 8 2 0 4 3 61798671 C A Y N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 24 4 12 0 2 3 61798973 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 61800099 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61800132 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 61800147 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61800176 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61800292 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 61800407 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61800743 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 61800812 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 61800852 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 61801039 G A Y Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 8 6 3 2 2 3 61801151 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61801165 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 61801348 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 61801397 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 61801690 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61801759 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61801768 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61801790 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 61801904 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61802452 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 61802599 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 61802632 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 61803383 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61803524 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 61803837 C A Y N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 61803843 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61804097 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 61804359 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 61804651 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61805208 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 61805467 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 61805569 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61806279 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61806774 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 61807735 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61807885 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61807905 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61807966 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61807984 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61808244 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61809213 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61809249 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61809494 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61809773 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61809810 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61809811 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61809851 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 61809960 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 61809990 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.133333333333333 0 0.866666666666667 4 26 2 0 13 3 61810088 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61810119 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 61812635 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 61813230 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 61814285 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 61817173 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61817524 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 61817546 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 61817586 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 61817592 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 61817647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61817868 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61817923 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61818152 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 61818185 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61818209 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61818333 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 61818467 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 61818499 A G Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 61818595 T A Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 61818602 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 61818614 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 61818637 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 61818705 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 61818706 A G Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 61818753 T G Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 61818788 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61818878 A G Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 61819221 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 61819229 A C N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.285714285714286 0.642857142857143 0.0714285714285714 17 11 4 9 1 3 61819434 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 61819471 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 61819648 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 61819985 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 61820022 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61820043 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 61820051 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61820153 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61820156 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61820358 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 61820369 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 61820389 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61820410 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 61820416 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 61820475 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 61820488 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 61820668 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 61820861 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 61820873 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61820910 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 61820944 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 61820969 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 61821339 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 61821594 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 61821609 G C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 61821625 A G Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 61821636 A G Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 61821838 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 61821985 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61822046 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 61822059 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 61822108 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 61822147 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 61822184 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 61822281 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 61822302 T A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 61822359 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 61822496 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61822517 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61822696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61822716 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 61822778 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61823210 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 3 61823217 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 61823278 T A N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 3 61823286 G A Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 3 61823292 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 61823351 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 61823626 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 61823859 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 61824092 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 61824240 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 61824244 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 61824384 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61824408 C A Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 61824533 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 61824545 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 61824588 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 61824901 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 61825018 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61825189 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 61825267 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 61825458 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61825514 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 61825527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61825589 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 61825674 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 61825692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61826641 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 61826711 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 61826719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61826815 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 61826974 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61827177 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 61827192 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 61827221 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 61827241 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 61827247 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 61827484 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 61827538 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 61827597 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 61827601 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 61827798 C T N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 5 11 0 5 3 3 61828040 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 61828305 G C N N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 5 5 1 3 1 3 61829045 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 61829063 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 61829375 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 61829785 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 61830140 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 3 61830244 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61830278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61830284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61830436 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 61830627 T A Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 61831168 T C N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 3 61831240 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61831271 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 61831500 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61831834 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61831866 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 61831922 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61832900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61832951 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 61833756 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61833790 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61833929 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 61834608 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61834741 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 61835094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61835356 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 61835463 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61835645 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61835732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61835823 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 61835938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61836093 A C Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 61840132 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 61842368 G A Y Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.75 0 0.25 12 4 6 0 2 3 61842386 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 61842448 T C Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 61842545 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 61842556 G A Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 61842714 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 61842754 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61842875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61842946 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61843138 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61843339 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 61843445 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 61844074 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61844715 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61844800 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61845463 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61845988 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61846053 G T N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 61846166 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 61846175 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61846946 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61846963 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 61847056 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 61847064 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 61847269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61848099 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 61848351 G T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 61849335 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 61850249 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61851681 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61851972 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61853410 G T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 61854749 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 61857359 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 61857706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61862713 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61862877 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61862914 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61863034 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61863239 C A Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 61863294 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61864223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61864378 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61865174 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 61865194 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 3 61865471 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 61868617 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61868911 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61871887 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61872035 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61872297 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61875593 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61878440 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 61878614 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61880373 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 61880431 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 61880456 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 61880478 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61880511 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 61882718 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61883755 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61883905 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61883935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61884972 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 61885600 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 61885797 T G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 3 61885858 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 61886270 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61887100 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 61887126 G T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 61888885 G T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 61889962 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 61891048 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 61891988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61892323 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61892603 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61893474 G C Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 61893966 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 61894269 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 61894382 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 61895365 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61895596 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 61896178 A G Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 61897041 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 61897937 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 61898443 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 61899469 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61900354 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 61901314 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 61901495 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61901543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61902086 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61902177 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 61902203 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 61902410 C G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.133333333333333 0 0.866666666666667 4 26 2 0 13 3 61902681 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61902740 T G N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 61903274 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 61903352 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61903415 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61904065 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 3 61905786 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61905833 G C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 61906003 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61906031 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61906443 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 61906523 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 61906524 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 61906585 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 61906675 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 61906842 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 61906923 A G Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 61906947 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 61907371 A C Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 61907684 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 61907752 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 61907815 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61908189 C A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 3 61908313 G T Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 61908489 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 61908491 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 61908884 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 61908937 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 61908995 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 61909133 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 61909314 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 61909551 T A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 61909555 C G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 61909579 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 61909788 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61909885 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61909959 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61910042 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61910260 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 61910999 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61911145 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 61911802 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 61911856 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 61937744 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 61937982 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61938697 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 61939078 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 61939716 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61943310 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 61944185 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61944687 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61944824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61947611 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61950711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61950855 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 61950985 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61957540 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61958140 G A Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 61958844 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 61958845 T G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 3 61959691 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 61960717 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 61962242 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 3 61962891 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 61964569 A G Y Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.5 0 0.5 4 4 2 0 2 3 61967690 T C Y Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 3 61967952 G A Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 61968923 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 61969149 C T Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 61969315 G A Y Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 5 11 2 1 5 3 61970969 A C N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 16 12 2 12 0 3 61971203 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61971208 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 61971341 T A N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 3 61971444 T G N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 61971540 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 3 61971722 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 61971874 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 61972145 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 61972804 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61972922 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61973071 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 61973172 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61973204 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61973285 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61973303 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61973330 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 61973577 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61973583 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 61973934 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 61974303 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61974348 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 61974507 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61974563 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61975121 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61975298 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61975301 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61975363 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61975590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61975726 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61976509 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 61976559 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61976646 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 61977026 C T N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.25 0.0833333333333333 0.666666666666667 7 17 3 1 8 3 61977504 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 61979198 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 61979393 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61980492 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 61984461 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61987441 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 61987967 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 61988203 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 61997658 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 61999225 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 61999408 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 61999808 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62002495 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 62002498 T G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 62003397 G A Y Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.153846153846154 0.846153846153846 0 15 11 2 11 0 3 62005779 T G Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 62006976 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62008828 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62009380 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62009763 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 62017417 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 62017788 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 62017794 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 62017820 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 62017924 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 62017948 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 62018039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62018754 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 62018983 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 62019204 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 62019471 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 62019518 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 62019541 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 62019863 T A N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 3 62020073 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 62020213 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 62020252 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 62020509 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 62020533 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 62020755 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 62021012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62021258 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 62021378 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 62021669 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 62021822 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 62021837 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 62021859 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 62021862 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 62021874 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 62021996 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 62022062 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 62022078 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 62022116 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 62022265 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 62022459 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 62022663 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 62022686 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 62022726 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62022799 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 62023523 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 62023899 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 62023968 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62024103 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62024146 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 62024173 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 62024203 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 62024284 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 3 62024290 T G N N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 3 62024637 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 62024740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62025225 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62025229 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 62025409 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 62025569 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 62025652 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62025853 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 62025906 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 62026289 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.133333333333333 26 4 13 0 2 3 62026559 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 62026709 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62027269 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 62027403 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.0526315789473684 0.842105263157895 0.105263157894737 18 20 1 16 2 3 62027461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62027467 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 62027688 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 62028042 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 62028247 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 62028266 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 3 62028795 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 62028809 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 62028839 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 62028843 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 62028858 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 62028869 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 62028968 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 62028978 G A N Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 3 62029431 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 62029442 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 62029466 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 62029648 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 62030717 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 62030808 C A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 62030835 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 3 62031221 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 62031735 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 62031990 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 62032939 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 62032945 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 62033058 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 62033100 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62033173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62033579 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 62033627 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 62034294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62034586 G C Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 62034878 A G Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 62034903 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62034982 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 62035305 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62035474 G A N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 62035541 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 62035843 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 62035928 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 62036220 T C N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 3 62036228 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 62036332 A G Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 62036494 A C N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 62036615 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 62036616 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 62036657 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 62036766 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 3 62036805 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 62036891 A T Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 62037077 T G Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 62037146 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 62037414 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 62037906 T G Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 62037997 T A Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 62038100 A G Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 62038146 G C Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 62038169 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 62038288 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 62038292 C G Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 62038590 A G Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 62038833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62038909 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62038998 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62039057 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62039132 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62039625 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 62039627 A T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 62039939 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62039963 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 62040016 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 62040032 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 62040042 C A N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 62040075 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 62040321 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62040364 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 62040523 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62041286 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62041330 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62041518 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 62041747 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 62042132 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 62042134 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 62042554 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62042562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62042604 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62042609 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62042634 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 62043760 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62048482 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 62052284 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 62054590 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 62054698 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 62054914 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 62056266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62058929 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62059695 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62060139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62061905 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62064732 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62065078 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 62066142 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 62066149 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62066495 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 62068873 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62071475 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 62071901 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 62071929 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62073165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62073654 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 62074249 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62079063 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62081156 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62081369 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62083652 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62087655 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62088468 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62092226 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62093639 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 62093849 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62096993 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62099271 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62099757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62100525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62101869 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62101921 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62102411 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 62102626 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 62102642 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 62102645 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 62102709 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 62102790 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62102863 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 62103120 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 62103295 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 62104860 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 62105570 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 62107724 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 62115973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62117216 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 62117443 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62120029 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62122887 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62125319 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62128155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62130337 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62132518 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 62132595 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62132852 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 62133024 G C Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 62133092 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62133234 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62133283 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62133298 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 62133420 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62133577 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 62135094 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62135099 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 62135454 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62135589 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62135688 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 62135809 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62135952 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62135980 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62135997 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62136261 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62136296 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 62136492 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62136542 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62137003 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62137175 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62137577 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62137882 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62137975 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 62138027 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 62138200 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62138324 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 62138348 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62138505 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62138513 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 62138521 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62138613 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62138924 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62140046 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 62140110 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 62140584 A G N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 3 62140671 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 62140679 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 62140787 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 62140803 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 62140807 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 62140838 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 62141025 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62141276 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62141728 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62142063 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 62142265 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62142490 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62142826 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62142944 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62144777 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62144895 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62145031 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 62145055 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 62145096 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 62145131 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 62145504 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62145582 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62145949 C G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 62146353 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62147048 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62147246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62147655 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 62148371 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 62148577 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 62150269 C T N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 62150584 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62150616 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62151595 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62151711 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62151788 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62151793 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62151817 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62151929 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 62151932 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 62151957 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 62152088 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62152173 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62152183 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62152306 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62152383 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62152394 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62152759 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62153368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62154019 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62154104 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62154106 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62154151 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62154585 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62154630 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62154676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62154723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62154816 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 62154834 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62155152 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62155179 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62155218 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62155304 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 62155480 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 62155717 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62155938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62155942 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 62156190 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 62156221 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62156238 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62156738 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 62156877 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62156977 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 62157036 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 62157040 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 62157064 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62157095 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 62157132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62157296 T C N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 3 62157467 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 62157503 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 62157512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62157639 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 62157734 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62157778 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62157780 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 62157810 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 62157922 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62158340 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 62158376 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 62158379 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 62158583 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 62158600 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 62158676 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62158726 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 62159127 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62159589 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 62159826 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62160114 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62160269 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62171650 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62173213 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62173329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62173535 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62173652 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62174122 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62175310 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 62175355 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 62175382 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 62175638 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 62175853 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62175868 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62176390 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62176740 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 62177131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62177849 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 62177969 A T Y N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 3 62178182 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 62178413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62178737 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 62178797 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62179293 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62179779 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62179898 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62181188 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62181698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62181738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62181772 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62181843 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62181862 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62181881 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62181966 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 62182073 G C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 62182090 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62182203 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 62182266 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 62182287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62182454 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62182565 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 62182645 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 62182712 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 62182751 T C Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 62182799 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 62182999 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 62183190 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 62183192 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 62183223 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 62183283 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62183371 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 62183440 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 62183557 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 62183586 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 62183591 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 62183835 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62183839 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62184051 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62184399 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62184663 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 62184758 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62185294 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 62185496 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 62185901 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 62186089 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62186206 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62186279 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 62186390 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 62186438 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 62186538 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62186574 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62186585 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 62186653 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62186734 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62186858 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 62186875 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 62186947 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 62187532 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 62187767 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 62187787 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 62188330 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 62188398 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 62188585 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 62188711 G T Y N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 3 62188812 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 62188824 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 62188866 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 62188912 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 62188986 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 62189277 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 62189650 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 62190135 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62190264 C T Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 62190325 A G Y Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 7 7 2 3 2 3 62190769 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 62191202 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 62191425 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 62191446 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 62191487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62191556 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 62191586 A T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 62191662 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62191675 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62191941 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 62191974 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 62192120 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 62192404 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62192669 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 62192697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62193616 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62193909 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62194194 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 62194271 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62194796 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62197123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62197635 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 62198731 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62198758 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62198873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62199148 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 62199164 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 62199166 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 62199195 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 62199367 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 62199371 G C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 3 62199390 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 62199560 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 62200244 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62200406 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62200469 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 62200788 G T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 62200818 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 62200892 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 62201069 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62201089 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62201213 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62201263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62201400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62201436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62201828 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 62201902 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 62201995 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 62202121 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 62202225 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 62202551 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 62202596 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 62202950 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62203069 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62203083 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62203103 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 62203240 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 62203241 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 62203265 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 62203415 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 62203475 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 62203509 T A Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 62203569 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 62203759 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 62203762 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 62203875 T G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 62204006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62204083 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62204160 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 62204244 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 62204263 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 62204282 T A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 62204886 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 62205087 A C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 62205095 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 62205367 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 62205390 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 62205417 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 62205801 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 62205807 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 62206207 A C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 62206306 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 62206355 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 62206363 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 62206428 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 62206471 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 62206664 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 62206764 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62206765 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 62206808 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 62206829 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 62206852 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 62206904 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 62206976 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62207042 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 62207055 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62207093 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 62207160 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62207164 C A Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 62207211 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62207225 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 62207238 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 62207258 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 62207266 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 62207298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62207345 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 62207362 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 62207396 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 62207406 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 62207528 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 62207598 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62207626 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 62207641 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 62207652 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 62207653 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62207670 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 62207696 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62207804 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 62207929 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 62207995 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 62208046 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 62208084 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 62208106 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 62208219 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62208479 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 62208505 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 62208578 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 62208831 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 62208851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62208867 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 62208921 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 62208943 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62208978 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62209259 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62209387 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 62209392 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 62209403 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 62209415 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 62209458 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 62209505 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 62209560 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 62209583 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62209605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62209720 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 62209736 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 62211318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62211753 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 62211774 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 62211890 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 62212130 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 62212134 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 62212328 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 62212446 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 62212897 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62213029 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 62213427 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 62213433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62213492 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 62214344 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62214440 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62214679 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 62214687 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 62214711 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62214722 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62214817 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 62214903 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 62214943 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62214955 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62215083 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 62215104 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 62215162 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62215196 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 62215269 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 62215284 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 62215290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62215508 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 62215733 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 62215753 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 62216131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62216439 G T Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 62216649 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62216760 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62217101 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 62217295 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62217309 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 62217771 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 62217863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62217969 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62218092 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 62218455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62218847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62219810 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62220308 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62220783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62220948 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62220954 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 62221480 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62223054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62224092 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 62224509 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 62224754 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62226762 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62227634 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62227996 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62228035 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62228880 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 62230490 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62230658 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 62230682 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62231734 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62232022 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62232764 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62233170 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 62233295 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62233999 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 62234300 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62234314 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 62234522 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 62234716 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62235012 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62235629 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 62236247 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 62236965 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 62237254 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 62237285 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62237405 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 62238269 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 62238374 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62238400 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 62238647 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 62238666 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 62238696 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62238712 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62238753 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62238792 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 62238864 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62238868 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 62239181 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 62241837 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 62242881 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 62243512 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62244431 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62245327 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 62245429 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 62245443 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 62245689 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 62245743 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 3 62245770 T G N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 3 62245789 G T N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 3 62245983 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 62245984 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 62246030 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 62246059 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 62246292 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 62246557 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 62246564 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 62246573 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62246594 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62246669 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 62246702 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 62246874 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 62246897 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 62246926 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62246939 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 62247023 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 62247101 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62247172 A C Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 62247544 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62247573 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62248044 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62248197 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 62248219 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 62248226 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 62248374 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 62248908 T A Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 62248917 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 62249434 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62249462 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 62249797 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62249823 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 62250263 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 62251324 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62251834 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62252604 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 62252971 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62254119 G A N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 3 62254172 T G N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 62254184 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 62254194 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 62254259 A G N Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.142857142857143 0.714285714285714 0.142857142857143 7 7 1 5 1 3 62254561 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62254720 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 62254758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62254782 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 62254910 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 62254994 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62255283 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 62255446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62255613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62255731 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 62255789 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 62255825 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62255934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62255960 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 62255972 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 62255985 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 62256053 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 62256054 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 62256092 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 62256101 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 62256209 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62256335 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 62256347 T A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 62256365 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 62256434 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 62256439 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 62256511 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 62256577 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 62256759 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 62256965 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 62257165 C G Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 62257166 C G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 62257269 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62257347 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62257717 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62257758 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 62257806 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62257853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62258173 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 62258287 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 62258363 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62258376 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62258581 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 62258982 C A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 62258998 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 62259155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62259162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62259194 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 62259207 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62259491 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 62260290 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 62260866 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62260896 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 62260915 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 62260923 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 62260960 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62261154 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62261456 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62261483 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62261494 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62261538 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 62261794 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 62262082 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62262102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62262208 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 62262212 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 62262328 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 62262456 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62262902 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62262929 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62262990 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 62263040 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 62263145 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 62263213 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62263287 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62263288 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62263304 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 62263309 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62263533 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 62263650 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 62263792 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 62263809 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62263820 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62263853 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62263858 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62263868 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62263872 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62263909 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62263915 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62263924 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62263951 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62264003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62264050 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62264302 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62264682 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62264887 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62264919 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62264946 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 62265490 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62265542 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62265551 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 62265575 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62265875 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 62266096 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62266664 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 62266916 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 62266933 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62267271 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 62267338 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62267480 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62267515 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62267531 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62267626 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 62267676 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62267756 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 62269864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62269932 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62270835 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 62271739 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62271982 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 62272488 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 62272865 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62275067 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62276358 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 62277436 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 62277694 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62279204 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62279313 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62281072 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62281809 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62281814 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62283916 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62285641 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62286791 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62287079 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62288609 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62289088 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62289163 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62289432 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 62289481 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62290285 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62290663 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62290803 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62290849 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62291018 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62291313 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62291722 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 62291798 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 62292213 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62293001 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 62293350 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62295407 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62295969 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 62296553 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62297414 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62297542 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62299007 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62299580 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62299607 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62299830 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 62300642 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62301629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62303504 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62303629 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 62303765 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62304062 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62305396 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62305475 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62311046 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62311837 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62312555 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62313864 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62313960 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62315165 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 62321318 A C N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 62328481 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 62328554 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62329846 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62330290 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62331104 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62332862 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62333058 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 62333406 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62333782 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 62333987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62335094 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62336387 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 62336817 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 62337291 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62338970 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62339473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62339912 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 62340445 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 62340548 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 62340781 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 62340892 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 62340911 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 62340952 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 62341023 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 62341140 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62341192 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62341492 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 62341884 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62345262 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 62345279 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62345730 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62345803 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 62346176 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62346287 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62346473 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62346600 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62346603 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 62346777 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 62346787 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 62346788 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62346816 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62353115 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 62353217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62353251 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62353312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62353340 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62353396 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62353469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62353499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62353512 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62353577 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 62353589 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 62353642 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 62353659 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62353703 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62353770 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62353901 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 62353962 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 62354005 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 62354017 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 62354047 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 62354103 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 62354259 C A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 62354297 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62354320 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62354357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62354367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62354458 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62354493 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 62354564 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 62354606 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62354624 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62354634 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62355077 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62355088 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62355155 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 62355316 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 62355333 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 62355384 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62355418 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 62355475 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 3 62355532 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 62355599 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 62355762 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 62355784 T A N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 62355881 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 62355897 G T N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 3 62356105 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62356338 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62356363 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62356381 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62356393 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62356395 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 62356410 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62356520 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 62356530 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 62356541 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62356552 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62356554 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 62356570 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 62356587 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 62356652 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62356738 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62356742 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62356779 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62356833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62357032 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 62357035 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62357055 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 62357088 T G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62357101 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62357108 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62357123 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62357173 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62357232 G C Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 62357270 T G Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 62357289 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 62357511 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 62357525 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 62357554 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62357563 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62357566 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62357639 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62357706 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 62357768 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 62357799 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 62357827 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 62357885 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 62357899 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 62357917 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 62357919 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 62357929 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 62357943 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 62357967 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 62357973 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 62358000 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 62358029 A C N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 62358219 T A N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 62358230 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 62358243 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 62358244 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 62358378 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 62358385 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 62358438 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62358439 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62358497 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 62358554 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 62358606 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62358619 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62358656 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 62358683 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 62358692 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 62358719 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62359021 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62359094 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 62359162 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62359210 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62359259 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62359281 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 62359288 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62359337 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 62359368 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62359421 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62359423 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 62359441 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62359472 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 62359616 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62359949 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62359984 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62360036 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62360092 T G Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 3 62360131 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 62360290 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 62360460 C G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 62360479 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 62360543 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 62360572 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62360628 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 62360791 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 62360802 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62360883 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62360947 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62361001 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62361095 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 62361112 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 62361269 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 62361318 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62361361 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 62361482 A G N Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.428571428571429 0.142857142857143 0.428571428571429 7 7 3 1 3 3 62361750 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62361885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62361955 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 62361964 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 62362091 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62362439 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 62362509 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62362584 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62362594 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 62362596 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 62362814 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 62362843 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 62362890 C T N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 62363410 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 62368212 C G Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 62368740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62369338 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 62370565 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62371346 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62371395 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62373099 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 62373266 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62373294 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62373300 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62373340 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62373405 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62373441 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62373461 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62373565 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62374224 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 62374522 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62374546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62374735 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62375190 A C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 62375206 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 62375534 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 62375578 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 62375754 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 62375841 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 62375929 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 62375942 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62376077 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62376153 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62376197 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 62376251 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 62376279 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 62376286 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 62376298 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 62376384 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 62376545 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 62376581 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 62376688 A T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 62376731 C G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 62377124 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62384393 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 62384714 C T N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 62384867 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 62384902 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 62384941 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 62384999 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62385113 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 62385137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62385366 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 62385392 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 62385400 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 62385478 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 62385597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62385691 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 62385844 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 62386272 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 62386418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62386641 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 62386952 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 62387009 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 62387181 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 62387544 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62387662 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62387728 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 62387789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62388074 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62388386 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62388651 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62388900 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 62388947 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 62389213 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62389260 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 62389266 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 62389294 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 62389358 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 62389472 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62390084 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 62390103 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 62390372 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62390408 T G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 62390410 T A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 62390704 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 62391029 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 62391051 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62391056 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62391127 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62391146 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62391204 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62391225 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62391244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62391297 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 62391369 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62391378 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 62391504 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 62391532 C T N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 3 62391974 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 62392455 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 62392492 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 62392503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62392520 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 62392584 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62392900 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 62392975 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 62393127 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 3 62393157 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 62393162 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 62393341 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 62393403 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 62393413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62393442 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 62393456 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62393490 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 62393511 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 62393543 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62393660 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62393663 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62394217 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 62394344 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62394414 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 62394504 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 62394505 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62394853 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 62394969 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 62394983 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 62395104 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 62395213 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 62395241 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 62395343 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 62395402 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 62395461 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 62395569 G A N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 3 62395587 C T N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 3 62395647 C G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 62395691 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 62396551 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 62396613 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 62396712 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 62396755 T C Y Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 3 62396873 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62396947 C A N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 3 62397286 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 62397429 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 62397463 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 62397475 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 62397493 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 62397541 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62398283 C T N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 3 62398534 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 62398557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62398624 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 62398913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62399200 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 62399226 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62399235 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 62399542 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 3 62399581 T A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 62399617 A C N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 62399657 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 62399673 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 62399802 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 62399997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62400001 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62400114 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62400303 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 62400417 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 62400686 T A N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 62400729 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 62400766 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 62400813 C A N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 62400896 T C N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.454545454545455 0.363636363636364 0.181818181818182 14 8 5 4 2 3 62401016 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 62401566 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 62401747 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 62401895 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 62401953 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 62402560 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62402983 G T N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 3 62402986 C T N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 3 62403025 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 62403236 A C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 62403249 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 62403366 T C Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 62403367 T A Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 62403544 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 62403650 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 62403664 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 62403841 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62403844 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 62403883 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 62403945 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 62403977 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 62404013 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62404014 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 62404203 T C Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 62404255 T C Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 62404264 C T Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 62404811 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 62404828 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 62404856 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62405095 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 62405106 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 62405764 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 62406341 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62406545 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62406604 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62407048 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62407068 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62407135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62407179 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62407362 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 62407762 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 62407833 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62408650 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62409509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62409978 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62411040 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62411208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62411231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62412402 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62416352 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62418658 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 62418801 C G Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 62419014 T G Y N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 62419066 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 62419507 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62419793 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 62420581 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62421066 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 62421893 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 62422030 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62422223 A G Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 3 62423339 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62423832 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62424229 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 62425199 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 62425698 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 62426122 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62426221 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62426552 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62427625 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62428190 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 62428355 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62428910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62428944 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 62429694 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 62430490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62431287 A T Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 62432018 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62432420 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62435531 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 62435818 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 62435900 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62436144 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62436151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62436193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62437911 C A Y N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 62438205 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 62438419 T G Y N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 3 62438610 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 62440363 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 62440408 G A Y Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 3 62441970 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 62442668 C A Y N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 3 62442670 C A Y N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 3 62442692 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 62443111 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 62444311 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 62445231 A T Y N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 3 62447052 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 62447303 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 62447476 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 62448254 A T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 62449107 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 62449609 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 62449631 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 62449816 C G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 62451437 A C Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 62451532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62451810 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62452078 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62452197 A T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 62452575 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62453546 C A Y N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 3 62454126 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 62454246 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62454811 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62455002 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62455215 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 62456420 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62458753 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 62459438 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 62459797 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62460752 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 62461171 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 62461293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62462138 T C Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 62462213 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 3 62462364 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 62462724 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 62462761 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.555555555555556 0.111111111111111 0.333333333333333 11 7 5 1 3 3 62463681 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 62464842 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62465868 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 18 14 4 10 2 3 62466140 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 62468119 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 62468886 C A Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 62469461 T G Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 62470081 C A Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 3 62471005 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 62471232 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 62471375 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 62471446 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 62471701 C T Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 3 62471768 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 62471927 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62472030 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62472398 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 62472423 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 62473630 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62473743 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 62474537 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 62474731 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 62476089 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62476462 T C Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 62476543 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 62477100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62477721 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 62480114 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62480513 G T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 62480745 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 62481591 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 62482028 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62482147 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62483374 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 62483815 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 62484073 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62484423 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62485208 A C Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 62485623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62485756 A C Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 62485887 A G Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 62486617 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62486746 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 62486784 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62486824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62488275 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62488860 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62488994 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 62490881 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62492164 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 62493648 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62494591 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62495452 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 62495790 A T N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 3 62496101 T A N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 3 62496698 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62496872 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62497352 A T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 62498632 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 62498958 T C Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 62500780 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 62502707 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62504296 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 62505957 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62507179 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62507917 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 62507984 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62509345 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62510922 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62511019 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62512984 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62513232 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62514709 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 62514919 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 62515175 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 62517059 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62518460 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 62519593 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 62520644 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62521015 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 62521973 T G N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 62522383 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 62522480 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 62522506 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62522547 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62523693 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 62523785 G C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 62524452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62524509 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 62524748 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 62525084 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 3 62526861 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 62527514 A G N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 62527518 A G Y Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 3 62527590 G C Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 3 62527605 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 3 62527611 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 3 62527744 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 3 62527749 T A Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 3 62527775 C T Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 62527785 A G Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 3 62527789 T A Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 3 62531768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62533048 T G N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 3 62533061 C T Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 62533101 C A N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.0833333333333333 0.583333333333333 0.333333333333333 9 15 1 7 4 3 62533174 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 62534259 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62534720 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62535868 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 62538215 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 62538253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62539514 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 62540109 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 62546951 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62548704 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62548859 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 62550605 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 62553367 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 62556837 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62559187 G A Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 62559703 G T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 62561476 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 62562342 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 62562358 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 62563226 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62564217 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 62564324 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 62564341 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 62565017 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 62565240 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 62565532 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 62565573 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 62565799 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 62565946 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 62565960 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62566230 T G N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 62566398 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 62566525 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 62566530 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 62566632 C G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 62566643 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 62566731 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 62566761 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 62566787 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 62566992 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 62567027 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 62567040 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 62567135 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 62567264 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 62567353 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 62567479 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 62567494 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 62567576 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 62567612 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 62567712 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 62567744 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 62567879 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 62567895 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 62567903 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 62567928 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 62567940 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 62568065 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 62568094 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 62568097 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 62568121 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 62568502 A G Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 62569571 A G Y Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 3 62572139 C G Y N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 62573971 A G Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 62574428 T G N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 3 62574434 A C N N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 7 13 1 5 4 3 62574443 A T N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.5 0.416666666666667 8 16 1 6 5 3 62574501 A T N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 62574540 A T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 62574618 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 62574697 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 62574770 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 62575201 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 62575219 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 62575222 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 62575234 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 62575252 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 62575285 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 62575306 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 62575334 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 62575439 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 62575472 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 62575473 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 62575508 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 62575778 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 62575847 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 62576030 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 62576060 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 62576104 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 62576107 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 62576502 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 62576878 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 62577574 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 62577589 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 62577631 T G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.0588235294117647 0.705882352941177 0.235294117647059 14 20 1 12 4 3 62577712 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 62579526 T G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 62579550 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 62579617 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 62582173 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 62582708 G C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 62583166 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62583563 G A Y Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.307692307692308 0.538461538461538 0.153846153846154 15 11 4 7 2 3 62583638 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 3 62584457 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 62584500 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62584649 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 62585767 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 62586814 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 62588337 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62588821 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 62589096 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 62589172 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 62589308 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 62589728 A T N N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 3 62590127 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 62590455 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 62590489 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 62590549 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 62591066 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 62591244 A C Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 62591272 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 62591645 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 62592659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62592820 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 62593177 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 62593238 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 62593341 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 62593359 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 62593406 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 62593466 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 62593467 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 62593655 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 62593766 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 62594021 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 62594067 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 62594134 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 62594208 A T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 62594238 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 62594722 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 62594863 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62594900 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 62594937 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 62594987 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 62594993 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 62595041 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 62595049 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 62595121 T G Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 62595437 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 62595558 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 62595967 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 62595978 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 62596139 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 62596157 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 62596409 C A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 62596452 T A N N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 5 11 0 5 3 3 62596745 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 62596865 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 62596910 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 62597283 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 62598430 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 62598478 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 62598790 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 62598846 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 62599500 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 62599650 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 62599868 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62600039 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 62600499 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 62600616 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62600716 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 62600733 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 62600804 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 62600832 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 62601586 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 62601773 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 62601952 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 62602129 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 62602406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62602664 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62603478 C A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 62603568 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62603658 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 62603847 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 62604184 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 62604252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62604497 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 62604594 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 62604700 A T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 62604851 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 62604947 A C N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 62604979 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 62605020 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 62605026 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62605146 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 62605209 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 62605436 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 62605458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62605635 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 62605666 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 62605716 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 62605721 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 62605780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62605861 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 62605879 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 62605961 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 62606193 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 62606205 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62606370 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 62606413 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 62606604 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 62606776 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 62607007 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 62607114 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 62607321 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 62607412 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 62607554 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 62607665 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 62607711 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 62607881 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 62607887 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 62607904 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 62608128 A T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 62608222 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 62608231 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 62608293 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 62608355 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 62608399 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 62608463 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 62608549 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 62608578 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 62608676 C A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 62608690 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 62608792 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 62608865 G C N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 3 62608882 C G N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 62609058 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 14 10 4 6 2 3 62609130 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 62609215 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62609235 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 62609269 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 62609301 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 62609357 T A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 62609492 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 62609504 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 62609533 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 62609624 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 62609645 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 62609651 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 62609710 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 62609778 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 62609856 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 62609867 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 62609894 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 62609937 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 62609968 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 62609993 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 62610014 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 62610069 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 62610230 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 62610252 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 62610302 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 62610372 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 62610382 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 62610467 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 62610496 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 62610499 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 62610509 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 62610577 C A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 62610578 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 62610900 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 62610933 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 62611171 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 62611336 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 62612307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62612501 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 62612795 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 62613008 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62613053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62613075 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 62613741 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 62613810 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 62613847 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 62613925 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 62614031 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62614387 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 62614705 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 62614881 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 62614918 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 62615101 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 62615544 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62615769 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 62615834 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 62615868 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 62615927 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62616470 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 62616663 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 62617556 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62617848 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 62617967 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 62618334 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62618738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62618861 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 62618960 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62619024 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62619045 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 62619335 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62619659 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 62619739 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62620066 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62620205 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62621053 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 62621317 T C Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 62621373 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 62621385 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 62621956 A C Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 62622108 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 62622750 G C Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 62622942 T G Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 62623071 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 62623551 T C Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 62623552 A T Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 62624077 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 62624115 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 62624188 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 62624422 A G Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 62624439 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62624477 C T Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 62624957 T G Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 62625309 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62625497 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 62625840 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 62626726 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 62626979 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 62627105 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 62627164 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 62627518 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 62627731 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62627751 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 62627763 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 62627815 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 62627926 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 62628476 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62629573 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62629668 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 62630370 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 62631528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62632618 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 62633078 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 62634307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62634594 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 62634757 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62634759 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 62634792 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 62634998 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 62635033 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 62635114 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 62635129 T A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 62635157 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 62635273 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 62635294 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 62635359 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 62635384 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 62635417 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 62635460 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 62635508 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 62635509 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 62635637 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 62635644 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 62635674 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 62635757 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 62635814 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 62635834 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62635853 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 62635897 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 62635977 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 62636113 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 62636211 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 62636250 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 62636327 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 62636386 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 62636442 T A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 62636454 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 62636461 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 62636473 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 62636627 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 62636655 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 62636736 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 62636949 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 62637066 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 62637101 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 62637108 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 62637115 C A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 62637317 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 62637618 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 62637777 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 62638120 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 62638320 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 62639531 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62640254 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 62640381 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 62640478 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 62640496 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 62640498 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 62640532 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 62640613 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 62641363 A C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 62641416 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 62641490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62643013 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62643064 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62643529 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 62643826 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 62643889 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 62644124 G A N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 62644201 T A N N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 3 62644595 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62645196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62645290 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62645804 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62645838 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 62646543 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62646549 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62646582 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62647259 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 62647465 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62647990 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 62648455 G T N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 62648669 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 62648811 C A N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 62649670 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62649993 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62650179 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62650691 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62650882 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 62651003 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 62651653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62652182 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62653515 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 62653700 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 62653921 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 62654413 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62654563 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62655042 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 62655987 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62656013 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62656549 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 62656833 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 62657617 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62657822 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62657959 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 62658156 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 62658706 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 62659293 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 62659552 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62659554 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 62659781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62660685 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 62660767 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 62660960 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 62661088 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62662898 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 62663236 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 62663497 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62663632 A G N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 62663671 T A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 62663744 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62663873 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 62664006 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62664218 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 62664546 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 62664805 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62664937 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 62665366 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 62665804 T A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 62666234 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 62666719 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 62666788 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 62666963 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 62667269 C T N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.153846153846154 0.538461538461538 0.307692307692308 11 15 2 7 4 3 62668122 C G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 62668231 A T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 3 62668377 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 62668512 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 62669527 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 62669585 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 62670492 G A N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 62670695 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 3 62670875 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 62671030 A G Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 62671122 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 62671241 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 62671276 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62671325 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 62671791 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 62672093 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 62672153 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 62672685 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 62672732 A C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 62672980 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 62673094 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 62673921 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 62674142 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62674393 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62675260 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 62675346 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62675957 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 62676374 C A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 62683552 A G N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 62686596 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 62687343 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62687552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62688010 A G Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 62689971 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 62689977 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 62689983 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 62690034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62690099 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 62690439 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62690741 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 62690842 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62691769 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62692990 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 62693034 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 62693037 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62694562 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62695341 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 62695971 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62696945 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62697255 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62697569 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62697750 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62698259 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62698273 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 62698552 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 62699007 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 62699628 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 62699689 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62699978 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62700101 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62700138 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62700146 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62700423 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 62700640 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 62700716 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 62700745 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 3 62700746 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 62701045 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 62701160 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 62701210 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 62701408 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62701676 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62702069 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62702123 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62702250 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62702324 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 62703516 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62703573 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62703598 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 62703784 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 62703991 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62704338 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62704350 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62704556 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 62704596 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 62704667 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 3 62704770 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 62704775 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 62704888 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62704938 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 62705217 G A N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 62705221 G A N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 62705562 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 62705594 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 62705614 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 62705649 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62705747 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 62705750 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62705774 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 62706047 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 62706230 C G Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 62706521 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 62706546 C T Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 62706994 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62707033 C T Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 62707454 A T N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 3 62707546 C T Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 3 62707645 A T Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 62707678 A G Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 62707688 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 62707876 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62707882 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62707953 C T Y Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.363636363636364 0.545454545454545 0.0909090909090909 14 8 4 6 1 3 62708009 T A Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 62708073 T C Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 62708134 A C Y N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 62708319 C A Y N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 62708777 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62708892 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62708968 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62709031 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 62709050 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62709067 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62709115 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 62709310 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 62709676 C G Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 62709827 G C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62710797 G T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 62710828 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 62710840 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 62710986 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 62710995 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62711185 A C Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 62711198 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 62711392 T C Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 62711429 C G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 62711473 T A Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 62711639 T G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 62711665 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 62711966 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62712137 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 62712183 T A Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 62712189 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62712376 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 62712533 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 62712801 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 62712837 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 62713352 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 62713582 G A N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 3 62713621 T A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 62714124 C A N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 62714161 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 62714376 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 62714385 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 62714448 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 62714724 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62715014 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 62715296 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62715601 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 62715905 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 62715936 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 62716076 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 62716397 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62716401 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 62716426 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 62716505 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 62716591 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 62716836 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62716910 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 62716940 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62717023 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 62717147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62717204 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62717483 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62718066 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 62718504 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 62719222 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 62719248 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 62719406 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 3 62719761 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 62719840 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62720212 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62721139 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 62721411 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 62721664 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 62721984 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 62722216 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 62723133 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 62723219 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 62723315 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62723578 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 62723760 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 62723832 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 62723948 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 62724436 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 62724705 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 62724984 C T N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 62725736 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62725971 C A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 62725978 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 62726103 C G Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 62726139 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 62726302 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 62726372 A C Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 62726451 G T Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 62726507 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 62726583 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 62726944 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62727104 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 62727226 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62727833 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62728142 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 62728425 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62728437 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 62728727 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62729183 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62729610 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62729613 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62729656 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62729696 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 62729730 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62729913 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62729966 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62729977 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62730169 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 62730328 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 62730347 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62730591 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62730593 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62730795 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62730844 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 62731137 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 62731156 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62731546 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62731612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62731977 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 62732129 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62732149 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62732156 C T Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 62732203 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62732223 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62732285 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62732307 A G Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 62732345 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62732373 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62732455 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62732703 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62732818 T C Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 62732848 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 62732896 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 62733009 G C Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 62733070 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 62733071 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 62733144 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62733356 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 62733476 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62733531 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 62733628 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62733677 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 62733704 C G Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 62733841 A G Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 62733893 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 62733900 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 62734152 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62734208 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62734367 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 62734383 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 62734641 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62735099 G A Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 62735370 A G Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 62735533 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62735727 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 62735772 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62735862 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 62736260 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62736295 C G Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 62736421 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62736457 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62736486 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62736588 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62736720 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 62736999 G A Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 62737257 C T Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 62737658 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62737752 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62737940 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62738005 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62738299 A T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 62738355 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 62738846 T A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 62739245 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 62739392 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 62739438 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 62739490 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62739582 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 62739700 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 62739710 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62739840 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 62739845 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62740171 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 62740215 G C Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 62740340 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 62741081 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 62741159 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 62741180 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 62741240 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 62741260 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 62741634 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 62741691 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 62742326 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62742584 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 62742925 A G Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 62742962 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 62743176 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 3 62743979 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 62744100 A C N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 3 62744120 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 62744372 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 62744412 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 62744688 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62744790 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62745089 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 62745441 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62745450 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 62745603 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 62745703 A T Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62746061 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62746141 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62746171 T A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 62746172 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 62746309 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62746566 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62746630 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 62746748 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62747129 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62747548 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62747549 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62747597 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 62747744 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 62747764 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 62747829 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62748054 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 62748195 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 62748481 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 62748566 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62748782 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 62748846 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 62749085 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62749591 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62749709 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 62749710 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 62749762 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 62750607 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62750744 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62754656 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 62754692 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 62755395 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 62755442 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 62755521 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62755523 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 62755535 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 62755705 C A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 62755795 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62756120 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62756193 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62756213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62756282 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 62756302 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 62756441 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 62756460 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 62756879 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 62756982 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 62757926 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 62758029 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 62758338 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 62763315 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 62764854 T G N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 62765261 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 62765288 T A N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 3 62765325 G T N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 62765457 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62765490 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 62765810 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 62766067 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 62766179 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 62766422 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62766752 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 62766770 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 62767380 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62767588 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 62767892 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 62767962 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 62768183 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 62768504 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 62769128 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 62769287 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 62770055 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 62770171 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 62770351 C A Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 62770498 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 62770596 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62770615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62770690 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 62771283 G T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 62771286 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 62771356 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 62771660 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 62771693 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 62771865 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 62771942 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 62771949 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 62772178 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62772513 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62773082 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62773145 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 62773302 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 62773331 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 62773340 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62773383 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 62773492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62773772 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 62773839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62773867 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 62774141 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 62774244 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 62774276 A C N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 3 62774398 C A N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 62774627 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62774934 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 62774935 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 62774980 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 62775019 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 62775108 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 62775173 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 62775312 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 62775331 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 62775376 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 62775381 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 62775474 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 62775639 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62775728 T A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 62776192 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 62776198 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 3 62777447 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62777783 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 62777947 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62778740 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 62779421 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62779443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62779548 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 62779631 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62780034 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 62780379 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62780586 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 62780875 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62781004 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62781051 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62781146 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62781625 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62782056 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62782106 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62782141 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62782417 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62782434 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62782546 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62782705 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62782734 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62782751 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 62783134 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 62784293 C G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 62784691 T A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 62784709 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 62784807 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 62784919 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 62785233 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 62785269 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 62785296 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 62785315 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 62785342 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 62785366 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 62785415 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 62785549 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 62785684 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 62785713 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 62785717 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 62785729 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 62785784 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 62786211 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 62786666 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62786707 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 62786712 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 62786869 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62787064 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 62787192 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62787507 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62787549 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62787849 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62787869 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62787910 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62787940 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 62787947 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 62787968 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 62788008 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 62788015 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 62788025 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 62788029 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62788059 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62788236 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 62788293 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 62788294 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 62788366 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 62788408 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62788751 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 62788810 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62789384 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 62795934 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62796100 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 62796507 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 62796590 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 62797121 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 62797285 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 62797390 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 62797450 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 62797594 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 62797622 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 62798031 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 62798373 A G Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 62798618 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 62798633 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 62798671 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 62798739 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 62798740 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 62799253 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62799287 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62799691 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 62801087 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 62801404 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 62801780 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 62804068 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 62804359 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 62805067 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 62806332 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 62806917 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 62806933 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 62807318 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 62807516 G T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 62807651 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 62807858 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 62807938 G T N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 62808965 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 62808991 T G N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 62809585 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 62809645 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62809989 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62810031 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 62810794 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62810889 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 62811013 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 62811188 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 62811529 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 62811867 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 62812368 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 62812465 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 62812803 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 3 62813406 C A Y N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0.2 0 0.8 2 8 1 0 4 3 62813766 A G Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 62815487 T C Y Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 3 62817947 T G Y N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 3 62817999 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 62818137 C A Y N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 62818279 T C N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 3 62818612 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 62818732 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 62818796 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 62819051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62819571 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 62820623 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 62820697 A T N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 62820848 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 62820958 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 3 62821407 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 62821653 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 62822063 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 7 11 2 3 4 3 62822751 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62822976 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 62823099 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62823493 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62827446 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 62827962 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 62828921 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 62829749 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 62830565 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 62831689 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62832225 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62833285 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 62834188 A T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 62834374 G A Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 62834677 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 62836201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62836227 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 62837645 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62837672 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 62838902 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62839375 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62839514 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 62842348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62842607 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 62843085 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 62843285 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62843286 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62843847 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 62844096 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62846620 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 62846621 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 62847010 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62847327 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62847915 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62848095 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62850175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62850897 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62855753 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 62855792 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 62856757 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 62857093 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 62857957 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 62858208 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62859080 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 62859253 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62859574 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62859780 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 62860136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62860562 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 62860650 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 62861117 G A Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 62862583 T G Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 62862615 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 62863160 C A N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 3 62863259 T G Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 62863398 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 62864183 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 62864702 T G Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 62864913 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62865221 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 62866088 G C Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 62866089 G T Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 62866629 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62867402 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 62867556 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 62867670 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 62868123 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 62868464 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 62868771 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 62869455 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 62869479 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 62869492 G T Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 62869493 A T Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 62870661 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 8 10 2 4 3 3 62870860 T A Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 62871200 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 62871280 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 62871827 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 62872940 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 62873108 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 62873481 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 62873898 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62874304 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 62874972 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 62875786 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 62876053 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 62876726 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 62877088 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 62877568 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 62878229 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 62878435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62880682 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 62882157 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 62882275 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 62884485 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 62884634 A T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 62884973 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 62885381 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 62885784 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 62886143 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 62886194 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 62886195 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 62886293 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 62888291 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 62888946 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 62889122 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62889615 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 62889866 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 62890164 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 62890592 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62890680 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 62890863 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 62890892 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 62891895 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 62892415 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 62892709 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 62893033 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62893266 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 62893903 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 62894234 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62894687 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62895113 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 62895129 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 62895365 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 62896644 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 62897849 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62897858 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62901218 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 62903817 T C Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 62903832 A G Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 62903834 C G Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 62904957 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 62905226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62905466 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 62905557 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 62905603 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 62905756 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 62905772 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 62905835 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 62905847 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 62905907 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 62906163 T C N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.25 0.0833333333333333 0.666666666666667 7 17 3 1 8 3 62906173 T C N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.25 0.0833333333333333 0.666666666666667 7 17 3 1 8 3 62906456 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.235294117647059 0 0.764705882352941 8 26 4 0 13 3 62906507 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 62906512 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 62906559 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 62906587 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 62906657 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 62906844 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 3 62906909 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 62906992 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.333333333333333 0.0666666666666667 0.6 11 19 5 1 9 3 62907025 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 62907171 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 62907354 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 10 22 4 2 10 3 62907397 T G N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 3 62907400 G C N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.25 0.0625 0.6875 9 23 4 1 11 3 62907409 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.235294117647059 0.0588235294117647 0.705882352941177 9 25 4 1 12 3 62907525 A G N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 3 62907553 T A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.235294117647059 0.117647058823529 0.647058823529412 10 24 4 2 11 3 62907604 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.235294117647059 0.117647058823529 0.647058823529412 10 24 4 2 11 3 62907615 A T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.235294117647059 0.117647058823529 0.647058823529412 10 24 4 2 11 3 62907648 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 62907724 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 3 62907783 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 62907826 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 62910380 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 62911944 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 62912188 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 62912337 T C Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 62913763 G A Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 62913824 A T Y N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 5 11 2 1 5 3 62917977 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 62918023 A T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 62918120 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 62918384 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 62918564 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 62918733 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 62918734 G C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 62918951 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 62919009 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 62919299 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 62919905 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 62919915 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 62920129 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 62920162 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 62920184 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 62920623 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 62921208 C A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 62921646 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 62922638 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 62923289 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 62923510 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 62923675 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 62923688 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 62924274 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 62924480 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 62925291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62925606 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 62925621 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 62925993 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 62926205 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62926394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62926859 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 62927485 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 62928838 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 62929004 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 62929049 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62929680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62929722 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 62929882 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 62930138 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 62930339 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 62930575 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 62930600 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 62931312 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 62931369 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 62931654 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62931881 G C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 62932213 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 62932233 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 62932486 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 62932500 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62932529 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 62932555 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 62932672 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62932705 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 62933087 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 62933584 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 62934285 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 62934523 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62934810 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 62934915 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 62934931 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 62935264 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 62935286 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 62935416 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 62935545 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 62935562 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 62935569 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 62935598 T G Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 62935765 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 62935830 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 62935860 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 62935961 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 62935991 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 62935999 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 62936349 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 62936563 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 62936680 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 62937141 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 62937643 G A N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 62937690 C G N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 62937796 G A Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 3 62937805 C T Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 3 62937933 T C Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 62938011 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 62938024 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 62938411 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 62938635 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 62938660 C T N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 62938666 T A N N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.454545454545455 0.454545454545455 0.0909090909090909 15 7 5 5 1 3 62938780 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 62938793 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 62938881 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 62938941 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 62939032 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 62939080 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 62939291 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 62939343 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 62939386 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 62939426 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 62939534 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 62939620 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 62939640 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 62939692 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 62939743 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 62939857 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 62939963 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 62939997 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 62940007 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 62940166 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 62940221 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 62940273 C G N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 62940292 G A N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 3 62940339 G A N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 3 62940350 G A N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 3 62940424 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 62940559 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 62940608 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 62940609 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 62940733 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 62940816 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 62940847 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 62940927 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 62940976 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 62940988 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 62941025 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 62941026 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 62941648 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 62941663 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 62941769 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 62942112 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 62942138 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 62942221 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 62942245 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 62942406 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 62942502 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 62942660 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 62942671 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 62942693 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 62942695 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 62942783 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 62942823 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 62943186 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 62943216 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 62943486 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 62943563 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 62943640 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 62943810 T C N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 3 62943946 C G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 62944119 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62944176 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 62944227 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 62944828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62945023 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 62945204 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 62945487 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 62945609 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 62945884 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 62945890 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 62945977 T G Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 62946082 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 62946302 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 62946482 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 62946712 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 62946813 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 62946927 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 62946948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62946996 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 62947002 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 62947067 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 62947096 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 62947185 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 62947323 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 62947524 A T N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 62947736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62947813 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 62947909 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 62947973 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 62947994 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 62948178 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 62948499 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 62948668 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 62949446 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62949474 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 62949667 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 62949728 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 62950115 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 62950149 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 62950204 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 62950228 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 62950279 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62950285 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 62950299 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 62950510 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 62950545 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62950744 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62951216 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 62951722 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62952227 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 62952545 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62952688 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 62952780 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62952883 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62953348 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 62953611 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62954358 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 62955057 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 62955239 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62955722 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 62956384 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 62957257 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62957779 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 62957802 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 62958009 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 62958157 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 62958234 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 62958271 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 62958371 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62958423 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 62958766 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62958803 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 62958988 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 62959170 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 62959300 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 62959344 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 62959921 G C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 62960372 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 62960400 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 62960411 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 62960532 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 62960611 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 62960826 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 3 62961091 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 62961272 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 62961342 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 62961382 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 62961470 A C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 62961825 T C Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62962197 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 62962298 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62962319 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62962350 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 62962507 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 62962596 A C Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 62962617 A G Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 62962889 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 62963712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62963745 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 62963844 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62963914 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 62963934 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 62964288 C T N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 3 62964770 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 62964821 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62964858 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 62964865 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 62964875 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 3 62964911 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 62965248 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62965421 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 62965443 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 62965474 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 62965685 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62965731 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 62965738 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62965752 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62965760 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62965902 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 62965917 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 62965943 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62965972 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 62966020 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62966029 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62966039 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62966094 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 62966133 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 62966192 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 62966299 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 62966322 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 62966335 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 62966463 C T N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 3 62966658 C G N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 62966676 T C N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 62966893 T C N Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 11 9 3 5 2 3 62966903 T C N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 3 62966915 G C N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 3 62966927 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 62966939 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 62966946 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 62966977 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 62966989 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 62967059 G C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 62967064 C A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 62967235 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 62967250 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 62967265 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 62967273 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 62967314 G T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 62967328 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62967342 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 62967361 C G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 62967386 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 62967391 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 62967420 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 62967468 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 62967500 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62967532 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62967559 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 62967592 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 62967614 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 62967699 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62967728 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62967895 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 62967942 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 62967991 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 62968021 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62968055 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 62968078 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 62968091 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 62968128 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 62968186 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 62968195 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 62968230 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62968259 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 62968347 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 62968359 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 62968451 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 62968509 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 62968540 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 62968607 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62968778 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 62968783 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 62968861 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 62968916 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 62969037 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 62969058 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 62969076 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62969156 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62969205 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 62969222 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 62969342 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62969405 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 62969467 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 62969472 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 62969541 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 62969576 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 62969583 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 62969624 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 62969696 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 62969797 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 62969829 A C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 62969830 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 62969850 T A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 62969952 G C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 62969957 C A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 62970074 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62970093 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 62970105 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 62970137 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62970157 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 62970214 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 62970324 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 62970600 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 62970641 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 62970721 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62970733 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 62970735 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 62970755 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 62970807 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 62970854 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 62970906 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 62971036 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 62971210 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62971246 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62971309 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62971365 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 62971447 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 62971728 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 62971800 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 62971974 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 62972076 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 62972274 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 62972413 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 62972518 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 62972547 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 62972591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62972594 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 62972641 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 62972658 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 62972675 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 62972782 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 62972869 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 62972906 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 62972954 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 62972975 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 62973003 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 62973009 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 62973064 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62973104 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 62973110 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 62973134 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 62973216 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 62973442 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 62973524 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 62973527 A C N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 62973571 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62973767 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 62973770 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 62973783 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 62973808 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 62973930 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 62974057 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 62974157 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 62974174 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62974237 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 62974278 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 62974289 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 62974716 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 62974819 A T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0 0.6875 0.3125 11 21 0 11 5 3 62974957 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 62975086 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 62975224 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 62975268 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 62975404 C G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 62975616 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62975671 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62975826 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 62975850 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 62976056 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 62976364 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62976366 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 62976572 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62976601 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 62976847 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 62977373 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 62977588 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 62977601 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 62978207 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62978218 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62978380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62978493 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62978788 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 62978966 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62979035 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 62979090 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 62979147 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 62979301 G C Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 62979361 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 62979440 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 62979473 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 62979610 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 62979756 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 62979831 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 62980049 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 62980170 G A N Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 3 62980200 G A N Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 6 6 2 2 2 3 62980227 A G N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 3 62980307 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62980328 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 62980413 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 62980507 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 62980519 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 62980670 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 62980748 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 62980771 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 62980943 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 62981055 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 62981068 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 62981089 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 62981138 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 62981180 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 62981309 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 62981371 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 62981376 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 62981424 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 62981637 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 62981717 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 62981720 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 62982178 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 62982210 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 62982240 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 62982274 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 62982383 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 62982613 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 62982635 A C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 62982665 C A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 62982759 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 62982841 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 62982853 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 62983300 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 62983311 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62983636 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62983757 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 62983783 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 62984010 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62984459 T G N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 62984495 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 62984970 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 62985345 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 62985655 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 62985749 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 62985759 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 62986374 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 62987496 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 62987839 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 62987913 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 62987921 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 62988205 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62988210 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 62988283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62988327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62988339 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 62988385 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62988635 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 62988859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62988903 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 62989228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62989241 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 62989344 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 62989466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62989845 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 62989881 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 62989969 T A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 62990089 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 62990191 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 62990377 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62990435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62990448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62990494 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 62990592 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 62990784 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 62990820 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 62990901 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 62990906 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62990965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62991047 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 62991063 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 62991152 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 62991153 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62991228 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 62991392 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62991505 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62991859 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62991869 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62991915 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62992574 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 62993270 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 62993549 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 62993894 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 62993921 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 62993990 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 62994103 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 62994161 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 62994378 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 62994961 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 62995023 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 62995464 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 62995465 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 62995652 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62995725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62995783 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 62995852 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 62996125 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 62996136 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 62996152 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 62996153 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 62996214 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 62996236 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 62996355 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 62996397 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 62996546 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 62996582 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 62996627 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 62996643 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 62996714 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 62996778 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 62996838 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 62996843 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 62996934 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 62997222 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 62997247 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 62997414 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 62997427 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 62997538 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62997678 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 62997752 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 62997783 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 62997904 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 62997957 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 62997997 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 62998084 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 62998201 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 62998213 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 62998276 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 62998523 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 62999186 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 62999336 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 62999965 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63000387 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63000834 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 63000836 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63000877 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 63001137 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63001194 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 63001212 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 63001225 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 63001576 G T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 63001608 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 63001618 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 63001658 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 63001724 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63001810 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 63001860 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 63001903 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 63001933 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 63002036 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 63002185 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 63002426 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 63002427 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 63002475 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 63002488 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 63002523 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 63002537 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 63002554 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 63002675 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 63002755 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 63002800 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 63002916 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 63002920 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 63003064 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63003091 G T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 63003096 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 63003166 C T N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.384615384615385 0.538461538461538 0.0769230769230769 17 9 5 7 1 3 63003168 C A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 63003194 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 63003230 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 63003251 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 63003346 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 63003350 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 63003403 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 63003472 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 63003576 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 63003585 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 63003610 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 63003869 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 63003871 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 63003884 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 63003901 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63003907 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 63003929 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 63003954 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 63004119 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 63004124 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 63004179 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 63004210 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 63004270 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 63004302 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 63004329 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 63004440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63004448 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 63004485 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 63004515 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 63004597 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 63004608 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 63004784 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63004965 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 63004967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63005094 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 63005129 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 63005322 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 63005375 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 63005445 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 63005489 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 63005518 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63005681 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 63005752 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 63005754 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 63005819 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63005891 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 63005919 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 63006083 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63011996 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63011998 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63012204 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63012387 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63012571 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 63013128 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 63013659 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63013697 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63013748 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 63013768 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 63013922 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 63014037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63014346 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63014612 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63014624 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63014648 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 63014743 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 63014824 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63014835 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 63014876 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 63015154 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63015511 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 63015566 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 63015802 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63016027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63016414 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 63016525 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63016581 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 63016607 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 63016633 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 63016663 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63016751 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63016753 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 63016777 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 63016822 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63016841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63016881 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63016890 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 63016972 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63017057 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63017064 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63017241 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63017440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63017446 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 63017633 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 63017713 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 63017762 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 63017819 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 63017883 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 63017911 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 63017950 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63018055 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63018072 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63018124 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 63018352 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 63018416 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 63018549 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 63018717 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63018808 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 63018837 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63018991 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63019037 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63019087 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63019135 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63019202 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 63019250 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 63019316 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63019403 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 63019553 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 63019846 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 63019956 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63019979 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 63019998 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 63020040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63020068 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63020128 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 63020133 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63020164 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 63020175 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63020193 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63020280 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63020345 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63020379 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63020502 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 63020537 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 63020568 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63020587 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63020595 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 63020648 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63020660 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63020690 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 63020827 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 63021000 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 63021041 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 63021291 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 63021410 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 63021556 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 63021565 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 63021632 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 63021691 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 63021855 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 63021986 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 63022679 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63023073 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 63023727 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 63023748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63023827 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 63023940 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 63024047 A T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 63024058 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 63024085 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 63024160 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 63024208 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 63024256 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 63024280 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 63024302 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 63024424 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 63025387 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63025409 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63025421 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63025497 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 63025524 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63025528 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 63025569 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 63025625 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 63025691 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 63025989 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 63026131 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 63026343 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 63026391 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63026472 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 63026528 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63026648 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63027729 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63028886 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 63029030 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63029294 A G N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 63029628 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63030021 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 63030095 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63031111 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 63031120 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 63031126 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 63031132 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 63031401 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 63031449 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 63031450 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 63031628 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63031635 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63031942 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 63032201 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 63032361 C A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 63032381 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 63032406 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 63032751 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 63033283 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 63033396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63033429 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 63033504 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 63033544 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 63033618 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63033696 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63033697 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63033783 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 63033903 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 63034009 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 63034034 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 63034074 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 63034080 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 63034106 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 63034114 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 63034179 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 63034269 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63034279 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63034421 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 63034438 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 63034467 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 63034528 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63034681 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 63035207 C A N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 63035262 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 63035360 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 63035378 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 63035386 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 63035418 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 63035468 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63035516 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 63035524 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 63035545 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 63035610 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 63035637 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 63035989 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63036006 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 63036098 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63036303 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 63036346 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 63036502 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 63036543 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 63036572 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 63036625 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 63036677 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 63036699 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 63036719 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 63036720 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 63036749 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 63036966 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 63037204 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 63037262 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63037395 A C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 63037506 A C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 63037527 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 63037529 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63037605 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 63037820 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63038076 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63038203 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 63038226 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 63038242 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 63038262 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 63038281 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63038313 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 63038351 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 63038424 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 63038454 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 63038767 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 63038858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63038884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63038923 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63038951 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63039063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63039173 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63039216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63039349 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 63039358 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63039460 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 63039572 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 63039588 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 63039622 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 63039662 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 63039685 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 63039736 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 63039874 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 63040184 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63040456 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63040459 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 63040683 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 63040743 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 63040875 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 63040964 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63041053 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63041180 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63041272 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63041279 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63041565 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 63041598 T C N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 63041607 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 63041801 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63041844 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63041870 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63041928 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63041962 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63042053 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 63042067 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63042070 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63042143 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63042333 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63042336 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 63042492 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63042509 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63042536 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63042588 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63042778 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63042978 C A N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 63043091 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 63043134 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63043543 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63043581 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 63043691 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 63043843 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63044124 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63044155 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63044227 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 63044480 A C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 63044528 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 63044841 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63044908 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 63044954 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63045060 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 63045137 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63045200 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63045295 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 63045315 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 63046188 T A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 63046334 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63046529 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 63046853 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63046928 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 63046933 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 63047102 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 63047204 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 63047289 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 63047354 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 63047524 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 63047532 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 63047563 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 63047668 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 63047796 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 63048057 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 63048628 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 63048947 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 63049305 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 63049313 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 63049741 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 63049878 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 63049954 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 63050029 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 63050406 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 63050457 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 63050488 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 63050553 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63050567 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 63050832 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 63050848 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63051026 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 63051042 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 63051115 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63051138 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 63051171 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 63051321 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 63051356 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63051384 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 63051729 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 63051979 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63052078 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 63052091 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 63052400 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 63052479 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 63052616 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 63052747 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 63052753 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63052788 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 63053164 A G N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 63053674 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 63053753 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 63053964 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 63055141 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 63055168 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 63055270 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 63055366 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 63055466 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 63055476 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 63055501 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 63055815 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 63055825 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 63055931 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 63056023 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 63056061 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 63056122 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 63056308 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 63056315 G A N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 63056386 C T N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 3 63056448 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 63056544 T C N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 63056805 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 63056883 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 63056922 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 63056951 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 63056989 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 63057075 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 63057085 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 63057114 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 63057160 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 63057180 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 63057254 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 63057258 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 63057334 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63057355 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 63057519 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63057624 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 63057627 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 63057799 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 63057824 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 63057851 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 63057893 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 63057968 T A N N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 3 63058421 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 63058639 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 63059084 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 63059206 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 63059776 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 63060203 T A Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 63060390 G T N N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 3 63060637 A T Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 63060909 A G Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 63060976 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 63061315 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 63061433 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 63061512 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 63061693 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 63061900 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 63062022 G C Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 63062492 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 63062517 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 63062730 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 63063015 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 63063178 A T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 63063313 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 63063813 C G Y N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 63063839 G A Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 63064306 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63064389 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63064556 T A Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 63064643 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63065131 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 63065155 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 63065303 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 63065415 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 63065444 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 63065804 C T N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 3 63065807 A C N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 3 63065936 T A N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 63065985 T G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 63066078 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 63066261 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 63066405 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 63066456 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 63066478 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 63066521 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 63067220 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 63067335 A T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 63067646 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63067686 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63067904 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 63067938 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 63068029 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63068041 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63068083 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63068176 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63068512 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 63068546 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 63068866 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 63068872 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 63069124 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 63069360 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 63069382 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 63069417 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 63069466 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 63069607 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 63069619 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 63069782 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 63069843 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 63070441 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 63070489 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 63070575 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 63070576 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 63070802 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 63071808 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 63072427 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 63072470 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 63072502 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 63072509 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 63072533 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 63072624 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 63072836 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 63072894 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 63072915 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 63073162 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 63073203 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 63073310 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 63073391 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 63073440 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 63074083 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63074168 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63074257 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 63074294 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63074344 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 63074347 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63074387 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 63074778 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 63074779 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 63075027 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63075306 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63075619 G A N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 3 63077418 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 63077634 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 63079500 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 63079754 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 63080694 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 63080978 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 63081353 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 63081411 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 63082207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63085820 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 63085971 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 63086056 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 63086859 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63086944 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63087049 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 63087184 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 63087874 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 63088442 T A N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 63089043 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 63090676 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 63090716 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 63091566 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 63093128 G A N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 63093318 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 63093351 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63093451 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 63093618 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63093622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63094399 G A N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 3 63095125 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 3 63095510 T A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 63095540 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 63096344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63097066 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 63099004 C T N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 3 63099291 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 63099894 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63100163 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 63100864 A G N Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 6 6 1 4 1 3 63101026 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 63101039 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 63101052 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 63101772 A C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 63101847 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 63102264 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 63105144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63106118 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 63107826 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 63108160 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 63108177 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 63108896 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 63109080 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 63109305 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63109311 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63109345 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 63109396 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 63109428 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 63109603 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 63109838 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 63110046 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63110055 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 63110060 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 63110160 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 63110341 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 63110380 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 63110398 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 63110592 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 63110676 G C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 63110738 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 63110780 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 63110895 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 63110952 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 63110982 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 63111088 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63111126 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 63111215 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63111283 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 63111349 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 63111452 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 63111453 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 63111704 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63111977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63112167 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 63112272 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 63112309 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 63112364 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 63112448 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 63112539 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 63112639 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 63112659 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63112974 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 63113064 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 63113881 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63114139 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63114319 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 63114355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63114869 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 63115044 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63115282 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 63115838 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 63115860 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 63116016 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 63116021 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 63117389 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 63117733 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 63119673 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 63119702 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63119759 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 63119833 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 63119839 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 63120026 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 63120069 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 63120133 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 63120198 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 63120263 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 63120275 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 63120318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63120498 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 63120636 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63120772 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 63121704 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 63121904 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 63121940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63122006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63122407 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63122675 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 63123010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63123032 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 63123043 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63123122 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 63123276 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 63123310 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 63123602 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 63123644 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 63123653 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 63123696 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 63123724 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 63123749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63123832 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 63123850 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63123923 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 63123967 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 63123975 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 63124031 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 63124120 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 63124171 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 63124244 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 63124325 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 63124438 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63124552 A T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 63124644 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 63124817 T A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 63125003 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63125118 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 63125587 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 63125625 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 63125703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63125757 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 63126020 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63126395 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 63126447 A C N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 3 63128473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63128610 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 63129701 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 63130026 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 63130403 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 63131152 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 63131403 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 63131602 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 63132005 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 63132031 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 63132761 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 63132842 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 63132933 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 63134806 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 63135409 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 63136767 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63137468 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63138142 G C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 63140769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63143428 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63143794 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 63144129 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 63144519 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 63144693 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 63144900 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63145049 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 63145154 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 63145198 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 63145210 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 63145264 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 63145821 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 63146687 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 63147050 G T N N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 3 63147930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63149361 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 63149561 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63149696 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 63149770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63149799 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 63150774 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 63150909 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 63150984 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 63150996 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 63151160 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63151244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63151315 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63151585 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63151972 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 63152307 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 63152308 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 63152357 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 63152691 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63152788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63154013 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 63154132 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63154270 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63155113 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63155221 G A N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.230769230769231 0.615384615384615 0.153846153846154 14 12 3 8 2 3 63156015 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 63156052 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 63156189 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63157263 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63157326 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 63157865 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63158067 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 63158126 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 63158141 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63158271 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 63158477 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63158879 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63161035 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 63161056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63161975 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63163152 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 3 63163385 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63163403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63163573 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 63163648 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 63163701 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 63163912 A T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 63164507 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63166439 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63167012 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 63167074 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 63167267 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63167278 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63169897 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63170140 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 63170417 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63173667 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 63175201 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 63175667 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63176542 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 63176627 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 63176742 C T Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 63177460 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63179581 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 63182672 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63185084 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 63186191 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63187680 C A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 63188565 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 63189269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63189327 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 63189634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63190167 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 63191301 T C Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 63191383 T C Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 3 63191417 C T Y Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.230769230769231 0.769230769230769 0 16 10 3 10 0 3 63194667 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 63195562 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63196538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63196567 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 63196589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63196822 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 63197663 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63198321 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63200646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63200945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63202164 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63203042 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63203330 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63205857 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 63205979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63206507 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63207058 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63207386 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63207527 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 63207529 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 63207615 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63208901 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63209515 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 63210277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63210554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63211476 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 63211637 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 63211699 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63212153 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 63212469 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63213819 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.1 0.85 0.05 21 19 2 17 1 3 63214226 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 63214615 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 63216386 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63216445 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63217164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63217740 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63219107 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 63219197 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 3 63219219 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 63219390 A C N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 63219942 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 63220070 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 63220732 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 63220785 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 63221498 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 63221939 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63222228 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 63222443 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63222809 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 63222961 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 63223412 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 63223592 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 63224560 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 63224795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63224886 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63226549 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63226973 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63227391 A G N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 3 63227635 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 63227829 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 63228803 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 3 63228945 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 63228998 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 63229126 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63229260 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 63229304 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63229319 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63229322 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63229337 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 63229346 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63229399 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 63229530 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63229547 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63229970 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63230008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63230104 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63230294 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63230601 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 63230772 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 63231053 G A N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 63231068 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 63231127 A C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 63231173 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 63231300 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 63231623 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 63231679 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 63231751 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 63231931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63232184 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63232588 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 63232821 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 63232830 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 63232923 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 63232950 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 63232999 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 63233052 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 63233061 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 63233073 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 63233152 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 63233190 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 63233200 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 63233539 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 63233808 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 63233935 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63234109 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 63234320 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 63234410 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 63234796 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 63234801 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 63234866 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 63234879 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 63234927 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 63235258 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 63235598 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63236630 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63237057 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 63237749 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 63239170 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 63241922 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63242733 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 63243754 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 63244401 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 63244699 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63244727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63244817 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63248130 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 63248906 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 63249504 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 63249551 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 63249580 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63250384 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 63251982 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 63252091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63252581 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63252697 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63252699 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63253455 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 63253469 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63253718 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 63253853 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63254392 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 63254532 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63256417 G C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 63256447 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 63256749 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 63257166 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 63257452 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 63257670 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63257687 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 63258730 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63259846 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 63260895 C A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 63261327 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 63262433 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 63263580 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 63263704 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 63263849 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63264462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63264612 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63265100 A G Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 63265528 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 63265745 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 63267531 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63269464 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 63270611 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 63270900 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 63271601 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63271763 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 63273551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63273688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63277554 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 63279501 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 63279573 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 63279835 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 63279851 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 63279996 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 63280045 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 63280180 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63280221 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 63280285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63280322 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 63280324 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 63280462 T A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 63280697 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 63280863 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 63280890 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 63280911 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63281664 C G N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 63282454 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 63282963 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63285281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63287783 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63290654 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63291047 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 63291147 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63293506 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 63293865 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 63297361 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 63297847 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 63298281 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 63298330 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63298592 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 63298650 C T Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 3 63298723 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63298812 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 63298947 T A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 63299013 A T Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 63299076 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63299090 T G Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 63299103 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 63299134 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 63299344 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 63299494 A T Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 63300155 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 63300243 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 63300428 G C Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 63300745 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 63300892 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 63300993 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 63301070 C T Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 3 63301093 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 3 63301353 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 63301525 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 63301665 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 63301929 A T Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 63302445 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 63303130 G A Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 63303280 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 63303395 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 63303753 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63305825 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 63305939 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63306411 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63306951 G T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 63307029 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 63307044 G C Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 63307220 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 3 63307232 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 63307266 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 63307270 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 63307279 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 63307300 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 63307304 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 63307409 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 63307435 T G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 63307498 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 63307512 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 63307524 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 63307540 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 63307579 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 3 63307699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63307998 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 63308084 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 63308408 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 63308509 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 63308796 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 63308812 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 63308874 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 63308945 G A Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 3 63308973 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 63309033 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63309544 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 63309633 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 63311561 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63311759 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 63311768 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 63312641 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 63312954 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 63313544 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 63316145 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 63316264 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 63316358 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 63316693 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 63316901 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63317321 A T Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 63319595 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63320465 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 63320675 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 3 63321059 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 63321492 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 63322558 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 63322908 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 63323444 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 63323824 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 63323826 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 63324119 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 63327334 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63327441 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 63334609 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 63335594 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63335935 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63337713 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 63338335 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 63338336 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 63338653 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 63340459 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 63342442 A T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 63343396 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 63345178 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 63345531 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 63346989 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 63347195 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 63347397 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 63347452 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 63347620 A G Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 63347753 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 63347793 G C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 63347794 T G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 63347809 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 63347829 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63347855 T A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 63347951 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 63347999 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 63348039 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 63348046 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 63348069 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 63348072 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 63348098 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 63348345 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 63348510 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 63348569 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 63349367 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 63349586 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 63349621 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 63349736 C G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 63349914 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 63349922 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 63349959 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 63350005 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 63350008 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 63350090 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 63350106 T G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 63350159 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 63350173 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 63350212 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 63350236 C G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 63350245 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 63350256 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 63350259 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 63350282 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 63350443 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 63350506 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 63350536 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 63350766 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 63350934 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 63350940 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 63350982 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 63350998 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 63351010 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 63351012 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63351052 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 63351078 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 63351081 A G Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 63351426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63351450 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 63351477 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 63351768 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 63351788 C G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 63351914 A G Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 3 63351997 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 63352066 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 63352072 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 63352086 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 63352089 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 63352211 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 63352286 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 63352359 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 63352395 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 63352484 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 63352601 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 63352623 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 63352684 G T Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 63352732 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 63352809 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63352823 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63352853 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 63352914 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 63352917 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 63353060 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 63353230 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 63353277 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63357200 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 63357586 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 63358408 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 63358695 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 63358715 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 3 63358720 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 3 63358766 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 63358773 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 63358872 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63358928 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 63358979 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 63359213 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 63359401 C G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 63359462 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 63359506 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63359515 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 63359559 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 63359572 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 63359602 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 63359610 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 63359826 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 63359839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63359851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63359863 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 63359920 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63359991 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 63360047 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 63360181 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63360228 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63360285 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 63360301 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 63360332 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 63360338 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 63360345 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 63360502 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63360505 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 63360593 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 63360596 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 63360622 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 63360676 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 63360677 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 63360712 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 63360739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63360883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63360884 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63360908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63360919 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 63361044 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 63361271 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 63361441 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 63361478 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 63361519 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 63361570 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 63361630 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63361761 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63361795 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 63361819 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 63361860 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 63361913 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 63362133 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 63362144 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 63362193 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 63362459 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 63362524 G C N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 3 63362551 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 63362896 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63363021 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63363076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63363139 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63363160 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63363220 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63363274 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63363297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63363402 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 63363487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63363496 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63363557 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63363617 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 3 63363726 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63363730 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63363760 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63364119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63364126 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63364163 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63364175 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 63364191 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 63364248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63364291 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 63364335 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63364361 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 63364415 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 63364512 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63365225 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 63365395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63365504 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63365751 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 63365958 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 63366011 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 63366415 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 63366997 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63368571 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 63369296 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 63369433 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 63370450 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 63371024 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63371229 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 63373059 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63373131 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 63375865 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63376455 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63376637 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 63376961 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 63379651 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63379776 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 63379857 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63379973 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 63380151 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 63380155 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 63380206 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 63380256 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 63380284 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 63380311 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 63380315 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 63380402 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 63380456 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 63380569 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 63382322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63383466 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 63384750 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63387268 G C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 63388695 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 63389405 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 63389425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63389607 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 63389770 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 63390208 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 63390217 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 63390692 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63397247 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 63397748 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 63397781 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 63397863 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 63397864 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 63397936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63397978 A T Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 63397991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63397996 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63398266 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 63398402 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 63398937 A T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 63399330 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 63399448 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 63399468 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 63399693 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 63399720 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 63399740 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 63400158 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 63400205 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 63400920 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 63401587 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63402140 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 63402528 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 63402723 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 63402930 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63403141 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63403372 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 63403572 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 63403584 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63403754 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 63404012 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 63404668 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63405368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63405856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63406730 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 63406751 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 63407031 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63407232 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63407302 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 63407333 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 63407451 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63407490 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63408224 G A Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 63408727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63408739 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63408849 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63409048 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63409270 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63409825 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63409857 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 63410441 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63411162 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 63411263 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 63411308 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63411482 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 63413741 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63413879 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 63414124 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63414149 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63415062 A C Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 63415250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63415819 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 63416357 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 63416552 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 63416776 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 63419065 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63419920 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 63420144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63420159 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 63420307 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63420401 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 63420417 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 63420614 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 63420657 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 63420677 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63420692 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63420729 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 63420758 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 63420767 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 63420830 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 63420856 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63420862 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63420929 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 63420957 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 63421031 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 63421052 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63421098 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 63421129 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 63421163 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 63421236 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 63421348 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 63421463 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 63421496 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63421525 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 63421734 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 63421738 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63421746 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63421762 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 63421838 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 63421891 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 63421903 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 63421918 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 63421940 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63422109 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 63422147 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 63422170 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 63422375 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 63422410 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 63422431 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 63422466 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 63422479 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 63422524 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 63422725 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 63422751 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 63422765 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 63422773 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 63422833 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63422839 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63422928 C G Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 3 63423044 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 63423079 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63423081 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 63423144 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 63423196 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 63423272 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 63423284 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 63423292 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 63423332 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 63423362 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 63423417 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 63423514 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 63423542 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 63423562 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 63423684 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 63423689 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63423733 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 63423736 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 63423789 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63423790 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63423829 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 63423874 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63423892 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 63423909 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 63423913 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63423972 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63423980 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63424168 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 63424170 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 63424271 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 63424286 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63424410 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 63424430 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 63424481 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 63424486 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 63424563 T G Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 63424638 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 63424995 C G Y N 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 6 10 1 4 3 3 63425021 A C Y N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 3 63425764 A C Y N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 3 63426610 A T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 63426848 C G Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 63427026 A G Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 63427067 C G Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 63427135 C G Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 63427225 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 63427353 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 63427372 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63427385 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 63427393 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 63427441 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63427676 T G Y N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 8 8 2 4 2 3 63427735 A C Y N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 3 63427995 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 63428189 T C Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 63428210 C A N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 63429084 G C Y N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 63429169 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 63429542 T A Y N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 3 63429543 C T Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 63429597 C G Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 63429692 T C Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 63429728 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 63429750 T C Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 3 63429853 T G N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 63429928 G A Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 63429951 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 63429997 A T Y N 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 11 7 3 5 1 3 63430093 G A N Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 8 8 3 2 3 3 63430263 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 63430286 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 63430369 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 63430383 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 63430503 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 63430534 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 63430613 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 63430678 G T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 63430744 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 63430789 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 63430835 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63430895 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 63430902 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 63430908 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 63430918 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 63431138 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 63431153 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 63431191 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63431580 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 63431628 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63432247 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 63432359 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63432411 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63432528 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 63432810 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 63432982 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 63433636 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63434058 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 63434063 C G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 63434228 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63434289 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63434913 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 63434919 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 63434951 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 63435137 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63436186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63436200 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 63436786 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 63437281 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 63437847 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 63438338 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 63438634 A G N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.142857142857143 0.642857142857143 0.214285714285714 13 15 2 9 3 3 63438737 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63438983 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 63440012 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 63440054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63440600 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 63443247 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 63443861 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 63445126 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 63445867 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 63446177 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 63446293 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 63447172 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63448356 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 63448418 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63448804 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 63448809 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 63449159 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63449657 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 63450301 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63453889 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63453978 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63457382 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63457556 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63457778 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 63460393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63460566 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63460761 G T Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 3 63461677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63461753 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 63464120 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 63464502 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 63466444 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 63467352 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 63468721 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 63469094 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63469629 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 63469639 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63471010 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 63471039 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63471206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63471551 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 63471851 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 63472958 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 63473491 T A Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 63473585 C T N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.0769230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 9 17 1 7 5 3 63481457 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 63481475 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 63481664 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 63482256 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 63482675 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63482978 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 63483188 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63483779 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63483979 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 63484033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63484171 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63484209 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 63485067 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 63485215 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 63485856 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 63485861 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 63486352 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 63486467 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 63486526 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 63486574 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 63486725 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 63486860 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63486944 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 63487014 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 63487024 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 63487086 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 63487181 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 63487258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63487284 C G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 63487437 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63487455 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 63487576 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 63487721 T C N Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.111111111111111 0.777777777777778 0.111111111111111 9 9 1 7 1 3 63487976 T C Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 63488011 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 63488047 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 63488463 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 63488522 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 63488538 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 63488639 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 63488692 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63488703 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 63488714 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 63488725 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 63488733 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 63488738 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 63488772 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 63488853 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 63488881 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 63488919 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 63488953 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 63488981 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 63489009 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 63489028 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 63489149 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 63489218 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 63489507 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63489707 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 63489775 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 63490237 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63490287 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63491267 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 63491591 C A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 63491667 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 63491672 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 63492000 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63492028 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 63492043 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 63492046 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63492057 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 63492131 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 63492159 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 63492200 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 63492202 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 63492225 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 63492329 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 63492708 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 63492747 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 63492752 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 63492771 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63492831 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 63492874 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 63492943 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 63492957 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63492982 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 63493315 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 63493384 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63493405 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63493457 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 63493574 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 63493576 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 63493673 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63493850 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 63494072 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63494091 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63494102 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 63494119 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63494158 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 63494206 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63494226 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 63494266 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 63494268 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 63494455 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 63494477 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 63494485 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 63494513 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63494576 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 63494657 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 63494679 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 63494930 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 63495009 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 63495167 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 63495185 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 63495225 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 63495261 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 63495348 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63495369 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 63495379 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 63495499 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 63495518 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 63495596 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 63495609 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 63495658 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 63495719 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63495859 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63496009 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63496017 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 63496041 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63496195 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 63496225 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 63496279 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 63496313 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 63496374 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 63496401 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 63496463 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 63496565 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 63496601 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 63496606 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 63496618 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 63496667 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 63496668 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 63497046 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63497105 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 63497146 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 63497176 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 63497207 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63497422 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 63497469 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 63497480 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 63497484 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 63497575 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 63497612 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63497713 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 63497717 T A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 63497743 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 63497765 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 63497836 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 63498007 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 63498064 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 63498088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63498089 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 63498139 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 63498278 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 63498314 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 63498357 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 63498420 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 63498494 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 63498496 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 63498529 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63498612 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 63498891 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 63498984 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 63499089 T A Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 63499104 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 63499434 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 63499448 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 63499597 C A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 63499604 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 63499651 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 63499683 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 63499725 A T Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 63499903 T C Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 63499933 A G Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 18 14 4 10 2 3 63500685 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63500773 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 63500883 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 63500911 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 63501310 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 63501311 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 63501778 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 63503587 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 63504757 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 63505267 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 63506303 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 63506317 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 63506406 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 63506420 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 63506768 A T N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 63506862 T C N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 3 63506899 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 63507004 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 63507070 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 63507076 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63507103 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 63507169 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 63507189 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 63507239 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 63507338 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 63507470 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 63507494 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 63507602 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 63507780 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 63507786 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 63507806 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 63507848 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 63507852 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 63507880 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 63507984 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 63508025 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 63508077 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 63508193 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 63508244 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 63508389 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 63508733 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 63508994 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 63509028 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 3 63509059 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 63509157 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 63509186 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 63509200 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 63509281 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 63509336 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 63509348 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 63509351 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 63509373 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 63509397 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 63509416 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 63509470 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 63509485 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 63509535 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 63509568 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 63509602 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 63509617 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 63509627 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 63509717 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 63509722 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 63509730 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 63509773 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 63509846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63509875 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 63509908 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 63509915 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 63509925 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 63509934 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 63510031 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 63510045 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 63510210 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63510387 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 63510534 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63510536 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 63510623 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 63510626 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 63511143 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 63511224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63511257 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63511293 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63511440 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 3 63511454 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 63511474 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63511512 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63511513 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 63511526 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 63511612 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63511773 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63512575 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 63512620 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 63513242 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 63513377 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63513398 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 63513433 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 63513470 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 63513743 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 63513885 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 63513959 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63514027 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 63514071 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 63514107 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 63514191 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 63514230 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 63514231 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 63514250 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 63514391 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 63514410 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 63514462 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 63514618 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 63514866 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 63514878 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 63515041 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 63515142 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 63515273 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 63515369 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 63515376 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 63515434 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 63515647 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 63515776 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 63515877 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 63516037 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 63516087 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 63516198 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 63516222 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 63516241 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 63516268 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 63516379 C A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 63516389 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 63516442 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 63516583 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 63516652 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 63516782 A T N N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.181818181818182 0.545454545454545 0.272727272727273 10 12 2 6 3 3 63516937 G C Y N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 3 63517110 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 63517315 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 63517371 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 63517474 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 63517676 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 63517734 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 63517791 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 63517828 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 63518262 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 63518368 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 63518912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63519290 C G Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 63519610 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 63519842 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63520041 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 63520124 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 63520347 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63522741 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 63522762 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 63523391 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63523462 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 63523767 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63524249 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63524932 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 63525143 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63525187 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 63525326 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 63525578 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 63525763 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 63525950 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 3 63526016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63526153 A C Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 63526222 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 63526255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63526311 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 63526440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63526464 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63526473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63526555 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 63526588 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63526939 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63527044 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63527105 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63527201 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 63527238 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63527563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63527579 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 63527725 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 63527789 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 63528227 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 63528282 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 63528503 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 63528632 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 63528668 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 63528770 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 63528843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63528875 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63528898 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 63528966 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 63528978 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 63529004 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 63529105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63529236 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 63529300 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 63529325 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 63529503 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63529555 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 63529685 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 63529738 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 63530109 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 63530142 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 63530231 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 63530302 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 63530554 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 63530559 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63530587 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 63530931 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 63531100 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 63531634 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 63531738 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 63531798 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 63531890 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 63531920 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 63532146 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63532338 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 63532349 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 63532366 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 63532397 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 63532486 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 63532490 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 63532584 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 63532882 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 63532958 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 63532973 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 63533315 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 63533371 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 63533479 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 63533537 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 63535649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63536603 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 63536682 T C Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 63536710 C A Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 63536729 T C Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 63536786 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 63537171 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 63537646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63537713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63539537 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63540187 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 63542387 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 63543417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63544082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63544353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63544735 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 63544844 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 63545182 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 63546118 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 63547123 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 63547987 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63548252 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 63549045 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63550038 T G Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 63551205 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 63551224 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 63552154 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63552291 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 63553580 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 63553680 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 63554307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63554741 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63554757 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 63556448 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 63556917 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 63556979 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 63558779 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63558800 C A N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 3 63558818 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63559787 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 63560238 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 63560254 A T N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 3 63560555 T G N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.0769230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 9 17 1 7 5 3 63560565 C T N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.0769230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 9 17 1 7 5 3 63560605 A T N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.0833333333333333 0.583333333333333 0.333333333333333 9 15 1 7 4 3 63560886 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 63560892 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 63560913 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 63560964 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 63561040 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 63561118 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 63561180 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 63561248 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 63561282 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 63561284 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 63561393 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 63561436 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 63561482 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63561590 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 63561665 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 63561669 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 3 63561832 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 63561866 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63561892 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63561911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63561915 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 63562011 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 63562136 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 63562148 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63562206 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 63562213 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 63562223 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 63562292 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 63562389 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 63562567 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 63562579 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 63562670 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 63562788 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 63563582 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 63564152 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 63564216 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 63564370 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 63565171 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 3 63566588 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 63567693 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 63567748 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 63567802 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 63568151 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 3 63568466 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 63568808 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 63569476 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 63569551 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 63570116 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 63570976 G A N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 63572569 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 63572584 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 63572774 A G Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.117647058823529 0.823529411764706 0.0588235294117647 18 16 2 14 1 3 63572965 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 63573403 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 63573634 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 63573657 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 63573689 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 63573761 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 63573770 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 63573948 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 63574546 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 63574607 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 63574993 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 63574994 G C Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 63575293 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 63575573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63575753 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63575821 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 63576132 G C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 63576228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63576505 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 63576905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63577195 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 63577742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63578065 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 63578269 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 63578789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63578918 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 63579038 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 63579368 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 63579686 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 63579832 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 63579865 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 63579906 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 63580000 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 63580001 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 63580056 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 63580090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63580104 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 63580105 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 63580126 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 63580249 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 63580329 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 63580385 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 63580894 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 63580907 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 63580945 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63581021 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 63581129 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63581150 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 63581205 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 63581326 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 63581331 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 63581340 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 63581554 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 63581751 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 63581802 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 63581914 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63582410 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 63582439 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 63582487 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 63582621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63582774 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63582775 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63582819 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 63583318 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 63583352 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 63583526 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 63583742 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 63584311 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63584455 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 63584692 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 63584766 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63584850 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63584867 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63585056 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63585939 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 63586174 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63586242 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 63586373 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63586455 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63586555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63586563 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 63586575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63586585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63586609 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 63586638 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 63586997 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 63587007 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 63587008 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63587243 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63587253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63587291 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 63587308 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63587555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63587559 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 63587720 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 63588243 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63588753 C G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 63589012 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63589216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63589969 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63590022 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 63590034 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 63590036 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 63590223 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 63590292 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 63590504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63590738 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 63590856 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 63591056 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 63591098 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 63591235 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 63591252 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 63591415 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 63591420 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 63591524 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 63591542 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 63591601 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 63591659 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 63591909 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 63592176 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 63592389 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 63592485 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 63592644 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 63592661 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 63592849 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 63592872 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 63593160 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 63593233 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 63593423 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 63594502 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 63595584 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 63595824 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 63596487 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 63597409 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 63597662 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 63597812 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63597908 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 63597986 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63598092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63599427 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63600823 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63602478 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63602562 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 63602720 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63603675 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63604184 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 63604447 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 63606048 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63606469 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63606605 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 63606969 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 63607366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63608966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63611237 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 63612171 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 63612269 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 63612373 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 63613127 A T Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 63613174 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 11 7 2 7 0 3 63613229 C T Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 63614437 C A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 63615466 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 63615897 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 63616478 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 63616572 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 63616753 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 63616821 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63616901 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 63617048 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 63617059 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 63617742 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 63618000 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63618940 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 63618982 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 3 63619122 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 63619129 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 63619140 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 63619166 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 63619339 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 63619575 A G N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 63619582 C A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 3 63619592 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 63619612 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 63619653 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 63619801 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 63619870 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 63619901 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 63620157 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 63620540 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 63620575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63620801 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 63620824 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 63620966 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 63621176 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 63621265 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 63621318 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63621353 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 63621366 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 63621376 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 63621440 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 63621522 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 63621588 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 63621915 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 63622059 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 63622200 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 63622214 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 63622293 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 63622510 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 63622548 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 63622550 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 63622604 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 63622618 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 63622736 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 63622884 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 3 63622986 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 63623120 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 3 63623220 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 63623329 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 63623596 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 63623681 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 63623716 G C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 63623756 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 63623782 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 63623824 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 3 63624004 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 63624155 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 63624192 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 63624259 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 63624343 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 63625704 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 63625780 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 63625903 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 63625951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63626172 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 63626931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63627094 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 63627581 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 63627820 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 63628506 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 63629338 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 63629798 T C N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 3 63629953 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 63630180 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 63630514 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 63630571 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 63630838 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 63631012 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63631033 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 63631372 C T N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.461538461538462 0.230769230769231 0.307692307692308 15 11 6 3 4 3 63631459 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 63631959 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 63631975 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 63632004 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 63632039 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 63632255 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 63632275 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 63632371 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 63633535 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 63633661 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63633906 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 63634323 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63634333 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63634357 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 63634649 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 63635228 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 63635257 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 63635381 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 63635568 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 63635609 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 63635681 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 63635752 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63635853 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 63635942 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63636135 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 63636153 C G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 63636155 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 63636218 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 63636238 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 63636315 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 63636319 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 63636389 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 63636571 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63636647 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 63636725 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 63636734 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 63636834 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 63637034 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 63637058 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 63637082 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 63637112 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 63637259 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 63637326 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 63637355 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 63637456 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 63637548 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 63637721 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 63637839 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 63637957 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 63638180 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 63638209 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 63638282 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63638283 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 63638389 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 63638478 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 63638480 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 63638511 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 63638851 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 63638920 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 63638939 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 63638951 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 63639072 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 63639117 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 63639122 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 63639230 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63640354 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63640567 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 63640723 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 63640807 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 63641345 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 63641549 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 63641952 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63642208 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 63642298 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 63642302 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 63642314 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 63642526 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63642780 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 63643088 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63643810 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 63644121 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63644168 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63644447 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 63644741 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 63645073 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63645191 G C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 63645257 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 63645566 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 63646114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63646204 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 63646518 C A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 63646551 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 63646583 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 63646602 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 63647011 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 63647368 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 63647477 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 63647915 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63648031 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 63648445 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 63649343 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 63649867 T A N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 3 63650412 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 63650699 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 63650788 G T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 63650916 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 63651232 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 63651268 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 63651451 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 63651496 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 63651531 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 63651544 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 63651828 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 63651849 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 63651873 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63651907 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 63652486 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 63652863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63653072 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 63653114 A T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 63653226 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 63653700 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 63653724 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 63654132 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 63654471 C G Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 63654488 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 63655581 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63655605 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 63656700 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 63656757 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 63657191 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63657598 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 63657674 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63657676 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63657735 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63657812 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 63657851 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 63657928 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 63657986 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 63658095 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 63658259 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 63658290 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 63658536 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 63658559 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 63658603 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63658709 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 63658723 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 63658823 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 63658878 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63658965 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 63659051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63659329 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 63659478 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 63659590 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 63659624 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 63659757 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 63659802 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63660057 A C Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 63660353 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 63660390 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 63660422 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63660469 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 63660520 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 63660550 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 63660586 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 63660659 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 63660731 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 63660778 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 63661328 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 63662297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63663571 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 63663814 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 63664913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63665491 A G Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 3 63665680 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 63667574 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63668273 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 63668525 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 63670949 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 63671678 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 63672017 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63672801 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63673217 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 63673560 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 63673562 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 63675167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63676124 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 63676382 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 63676715 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 63677376 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 63677631 A G N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 3 63677652 G A N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.538461538461538 0.230769230769231 0.230769230769231 17 9 7 3 3 3 63677992 G A N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 10 10 3 4 3 3 63678201 G A N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 63678212 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 63678393 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 3 63678483 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 63678691 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 63678778 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 63678835 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 3 63678928 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 63678963 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 63678972 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 63679057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63679058 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 63679072 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 63679134 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 63679316 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 63679336 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 63679338 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 63679395 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 63679397 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 63679468 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 63679566 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 63679669 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 63679853 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 63680105 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 63680418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63680730 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 63680758 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 63680941 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 63681060 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 63681168 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 63681322 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 63681351 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 63681460 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 63681468 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 63681531 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 63681593 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 63681750 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 63681795 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 63681806 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 63681822 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 63681878 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 63681908 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 63681997 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.0588235294117647 0.764705882352941 0.176470588235294 15 19 1 13 3 3 63682670 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 63683866 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 63683914 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 63684638 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63685182 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 63686554 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63686609 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 63686655 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 63687009 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 63687774 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63687882 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63687970 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63688173 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 63688850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63689235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63689663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63689681 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63689877 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 63690252 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 63690317 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 63690702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63692196 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 63692244 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 63692384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63694323 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 63695573 C G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 63696385 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 63696552 G A N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 3 63698387 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 63698530 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63698565 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63698857 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 63698858 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 63699027 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 63699153 T G N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 63699234 A C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 63699444 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 3 63699531 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63699598 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 63699848 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 63700102 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 3 63700222 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 63701352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63702218 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 63702681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63702854 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 63704398 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 63704756 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 63705113 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 63705262 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 63705402 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 63705729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63706363 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 63706534 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 63706584 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 63706723 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 63707222 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 63707456 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 63707951 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 63708052 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 63708139 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63708463 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 63709192 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 63709312 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 63709523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63709585 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 63709775 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63709806 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 63709992 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 63710025 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 63710650 A T N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 63710921 C T N Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 8 6 2 4 1 3 63711923 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 63712046 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63712171 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 63714119 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63714853 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 63715012 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 63715018 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 63715110 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 63715113 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 63715156 A G N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 3 63715249 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 63715316 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 63715465 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 63715550 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 63715608 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 63715731 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 63715813 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 63715898 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 63715902 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 63715917 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 63716200 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63716242 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 63716272 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63716432 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 63716471 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 63716485 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63716547 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 63716627 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63716668 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63716712 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63716949 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63717048 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63717054 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 63717091 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 63717635 C A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 63717741 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63717751 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 63717926 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 63718352 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63718442 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63718773 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 63718786 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 63718792 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 63718809 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 63719041 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 63719192 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 63719219 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 63719225 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 63719327 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 63719362 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 63719422 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 63719425 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63719472 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 63719671 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 63719708 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 63719797 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63719893 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 63719972 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63720382 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 63720512 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 63720788 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 63720803 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63720862 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 63720865 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 63720890 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 63720925 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 63720938 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 63720949 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 63721003 G A N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 3 63721129 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 63721195 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 63721267 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 63721363 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 63721409 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 63721513 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 63721571 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 63721739 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63721953 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 63722022 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63722032 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 63722322 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 63722326 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 63722355 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63723027 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 63723802 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 63723858 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 63723909 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 63723915 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 63724059 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 63724134 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 63724135 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 63724501 A C N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 3 63725084 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 63725195 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 63725231 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 63725237 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 63725284 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 63725325 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 63725357 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 63725735 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 63725837 G C N N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 9 5 3 3 1 3 63726062 A C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 63726103 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 63726175 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 63726210 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 63726245 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 63726468 C G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 63726529 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 63726544 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 63726550 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 63726579 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 63726632 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63726694 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 63726804 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63726926 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 63726929 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 63727000 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 63727095 T C N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 63727103 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 63727116 T G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 63727249 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 63727290 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63727304 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 63727461 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 63727472 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 63727491 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 63727598 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 63727599 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 63727644 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 63727700 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 63727820 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63727892 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63727911 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63727996 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63728092 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 63728103 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 63728238 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 63728561 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63728575 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63728720 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63728725 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 63728739 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 63728761 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63728791 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63728823 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63728958 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63728993 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 63729026 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 63729034 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 63729140 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63729141 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63729181 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 63729240 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 63729256 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63729724 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 63729741 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 63730244 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 63730688 C T N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 3 63730765 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 63730797 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 63730847 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 63730860 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 63731037 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63731102 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 63731105 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 63731207 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63731282 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63731462 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63731552 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 63731615 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63731645 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 63731682 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63731685 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63731790 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63731879 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 63731908 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 63731912 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 63731922 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 63731969 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 63731985 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 63731997 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63732248 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63732267 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63732301 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63732391 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 63732423 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 63732557 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 63732870 G T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 63733142 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63733308 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 63733362 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 63733472 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 63733487 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 63733581 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 63733659 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 63733687 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 63733759 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63733795 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 63733845 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 63733968 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 63734025 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 63734052 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 63734072 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 63734126 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 63734248 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 63734344 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 63734366 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 63734515 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 63734529 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 63734621 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 63734753 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 63734801 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 63734948 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 63735055 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63735108 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 63735182 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 63735208 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 63735286 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 63735294 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 63735317 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 63735406 T G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 63735459 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 63735494 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 63735648 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 63735837 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 63736421 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 63736546 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 63736552 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 63736613 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 63736631 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 63736711 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 63736712 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 63736768 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 63736836 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 63736945 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 63736955 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 63737047 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 63737196 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 63737295 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 63737322 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 63737423 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 63738329 T A Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 63739981 T C Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 63740296 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 63741188 C A N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 3 63741264 C T N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.230769230769231 0.615384615384615 0.153846153846154 14 12 3 8 2 3 63741326 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 63741353 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 63741439 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 63741529 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 63742409 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 63742557 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 63743047 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 63743507 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 63744448 T C N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.307692307692308 0.538461538461538 0.153846153846154 15 11 4 7 2 3 63744897 A C N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 63745096 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 63745222 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 63745263 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 63745675 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63745762 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 63748133 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 63749548 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 63750711 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 63751332 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 63753004 A T N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 63755956 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 63755978 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 63758009 C T N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 63758197 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 63758641 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 63758844 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 63758959 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 63759167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63760862 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 63761081 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 63761184 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 63761304 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 63763597 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 3 63764456 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 63765273 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 63769025 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 63769515 T C N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 3 63769606 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 63769658 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 63769777 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 63770659 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 63771228 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 63771575 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 63771716 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 63771847 T C N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 12 12 3 6 3 3 63771894 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 3 63771924 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 63771935 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 63772079 G C N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 63772151 T G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 63772627 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63772657 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63773229 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 63773326 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 63773359 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 63773366 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63773568 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 63773709 G C Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 63773899 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 63774079 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 63774569 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 63774677 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 63774706 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 63774981 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 63774997 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 63775749 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 63777921 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 63777979 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 63778011 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 63778366 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63779593 A C Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 3 63779755 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 63779984 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 63780433 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 63780576 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 63780589 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 63780821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63781070 G T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 63781318 C A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 63781396 T A Y N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 63781682 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 63781948 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 63782102 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63782172 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 63782603 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 63782767 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 63782830 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 63783065 C A Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 63783813 T G Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 63784567 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 63785015 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 63786186 C T N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 63786981 A T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 63788742 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 63789888 A G Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 63790838 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 3 63790918 A G Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 63792106 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 63792509 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 63793305 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 63794319 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 63797064 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 63798284 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 63798361 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 63798523 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 63798744 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 63799551 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 63799602 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 63801109 T C N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 3 63802981 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 63805367 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63806069 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 63806591 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 63806594 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 63808034 C G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 63808049 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 63809657 T C Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.384615384615385 0.538461538461538 0.0769230769230769 17 9 5 7 1 3 63810769 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 63811221 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 63811242 T G Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 63811768 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 63812640 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 63813238 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 63813574 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 63813832 T C N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 3 63814127 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 63814174 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 63815315 C T Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 3 63816065 T C Y Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 3 63816094 T A Y N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 3 63817652 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 63818194 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 63818399 G C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 3 63819053 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63819070 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63819194 A C Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 63819550 G T Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 63819570 T A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 63819726 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 63820826 C A Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 63820887 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 63821087 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 3 63821272 G A Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 63821705 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 63822622 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 63823012 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 63823198 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 63823748 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 63823968 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 63824980 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 63826881 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 63827241 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 3 63828070 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 63828106 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63829004 G C Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 63829448 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63829449 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 63829488 A G Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 63830117 T G Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 63830511 T G Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 63830914 T C Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 63831418 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 63831557 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63832928 T G Y N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 3 63833021 T G Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 63833026 G T Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 63833032 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 63834614 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 63834909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63835578 C G Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 63835767 C T Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 63837177 A G Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.3125 0.625 0.0625 20 12 5 10 1 3 63837567 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 63837772 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63837946 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63838015 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 63838240 A G Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 3 63838317 T A Y N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 3 63839467 C T Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 63839855 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 63840340 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63840687 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 63840765 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63841209 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 63845446 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 63845592 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 63846235 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63847022 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 63847038 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63848352 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 63848489 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63848613 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 63849058 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 63849262 T C Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 63849291 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 63849348 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 63849366 A T Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 63849898 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63850057 G T Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 63850124 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63850372 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 63852906 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 63854498 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 63854571 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 63854894 A G Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 63855715 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 63856691 A C N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 63857499 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63857526 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63858091 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 63858183 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 63858608 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 63858685 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63859463 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 63859774 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63860412 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 63860470 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 63860591 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 63860818 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 63861111 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 63862509 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.05 0.85 0.1 19 21 1 17 2 3 63864811 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63865270 T G N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 16 12 6 4 4 3 63866536 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63866832 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63867495 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 63867565 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 63867861 G A Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 63868006 T C Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 63869071 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 63869337 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 63869369 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 63869447 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 63870047 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63870441 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63870696 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63871725 C T N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 63872353 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 63872745 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 63873537 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 63873582 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63874566 C T Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 63874787 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 63874884 C G Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 63874932 A T Y N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 63874968 G A Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 63874982 C T Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 63874985 A T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 63875000 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 63876045 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 63876597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63876825 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63877496 T C N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 7 9 2 3 3 3 63877516 T C Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 3 63877631 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 63878741 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 63879404 C T N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 3 63879500 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 63879583 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63880944 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 63881052 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 63881229 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 63881479 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63881521 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 63881694 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 63882112 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 63882430 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 63882520 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 63883150 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 63883454 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 63884395 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 63884628 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 63884749 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 63884824 T G N N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.454545454545455 0.454545454545455 0.0909090909090909 15 7 5 5 1 3 63885082 C A N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 63885165 G C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 63885189 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 63885271 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 63885900 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 63887008 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 63887432 G A N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 3 63888991 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63889049 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63889096 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 63889531 C G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 63889781 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 63889785 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 63889814 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 63892835 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63892857 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63894306 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 63894673 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 63895576 C G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 63896782 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 63897415 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63899759 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63899849 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63899933 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 63900037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 63900604 T C Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.1875 0.75 0.0625 18 14 3 12 1 3 63904992 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63905682 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 63905829 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 63906200 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 3 63906209 C G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 63906223 T A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 63906368 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 63906497 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 63906523 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 63906545 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 63906718 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 63906881 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 63907097 C G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 63907104 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 63907152 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63907223 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 63907388 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 63907776 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63907782 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 63907905 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 63908544 C G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 63911071 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 63911449 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 63912385 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 63912743 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 63914620 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 63914692 T A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 63915605 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 63915995 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63916451 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 63916975 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 63917408 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 63917607 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 63917935 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 63917997 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 63918050 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 63918839 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 63919346 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 63919673 A G N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 3 63921408 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 63921856 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63922192 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63922252 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 63922275 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 63922302 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 63922641 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 63922733 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 63923354 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63923612 T G N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 63923671 A G N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 3 63923797 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 63923842 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 63923863 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 63923920 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 63924046 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 63924155 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 63924181 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63924202 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 63924568 T G Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 63924981 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63925477 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63925526 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 63925737 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 63926229 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63926263 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 63926449 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 63926502 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 63926872 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 63927511 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 63927514 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 63927671 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 63927779 T G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 63928041 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 63928154 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63928334 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 63928502 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 63928567 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 63928634 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63928713 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 63928838 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 63928867 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 63928972 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 63929058 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 63929067 T G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 63929393 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 63929796 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 63929952 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 63930197 A G N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 63930585 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 63930667 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 63930810 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 63931068 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 63931190 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63931546 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 63931638 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 63931645 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 63931690 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 63931697 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 63932546 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 63934209 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 63934481 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 63934704 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 63936201 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 63936870 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63937647 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63938164 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63938816 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 63939878 C A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 63940035 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 63940133 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 63940195 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 63941092 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 63944179 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 63945034 A T Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 63945719 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63946017 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 63946306 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 63946476 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 63946518 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63946676 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63946756 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63946783 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 63947165 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 63947617 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63947779 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63947923 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63947972 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63948387 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 63950017 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63951597 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 63951740 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 63953310 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 63955123 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 63955873 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 63955878 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 63956283 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 63956314 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 63956344 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 63956527 C T N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 63956619 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 63956709 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63956787 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 63956821 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 63957213 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63957249 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 63957667 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63957778 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 63958260 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 63958594 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 63958620 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63958985 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63959962 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 63960203 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 63960603 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63961389 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63962297 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 63963649 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63963662 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63963681 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63963804 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63964463 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 63964542 A G Y Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 3 63965244 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 63966330 T C Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 63966817 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 63968409 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 63969995 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63970490 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 63971158 A C Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 63971228 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 63971952 C A N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 3 63972367 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 14 10 2 10 0 3 63972591 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 63973471 T G Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 63973588 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 63973668 T G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 63974356 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 63974685 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 3 63976772 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63976800 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63977124 T A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 63978510 G C Y N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0 0.647058823529412 0.352941176470588 11 23 0 11 6 3 63978519 A G Y Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.0625 0.625 0.3125 12 20 1 10 5 3 63978875 T C Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 3 63978936 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 63980825 A T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 10 22 0 10 6 3 63980929 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 63981429 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 63981745 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63983156 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63983277 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 63984290 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63985786 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0 0.65 0.35 13 27 0 13 7 3 63987949 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 63987962 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 63987981 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 3 63988225 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 12 24 0 12 6 3 63989433 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 63989558 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 3 63989638 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 63989904 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 63989962 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 63989975 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 63990530 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 3 63990928 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 63992223 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63992598 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 63992719 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63994019 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 63994050 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 63994230 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 63994796 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 63995375 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 63995940 C T Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 63996388 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 63996403 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 63996417 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 63996700 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63996724 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 63997363 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63997383 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63997600 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63997952 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63997973 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63998014 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63998464 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 63999511 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 63999523 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 63999618 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63999857 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 63999932 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 64000641 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 3 64000656 T G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 64001052 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64001278 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64001592 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64001993 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64003438 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 64003910 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 64004059 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64004103 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64004261 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 64004285 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64004300 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64004304 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64004354 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64004435 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64004506 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64004811 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 64005151 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 64005233 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 64005810 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64005894 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 64006117 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64006365 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 64007010 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 64007486 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 64007665 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 64007712 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 64007714 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64007813 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 64007883 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64007895 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64008633 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64008915 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64008936 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64008943 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 64008998 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64009040 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 64009052 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 64009576 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 64009590 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 64010604 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 64014283 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 64016632 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 64017258 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 64017446 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64017673 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64017976 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 64018362 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 64019274 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 64020844 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 64021078 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 64021667 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64021839 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 64025415 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 64026903 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 64027233 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 64027885 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 64027935 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 64028511 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 64029761 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 64029980 A T N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 3 64030367 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 64030884 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 64031007 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 64031570 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 64032630 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 64033260 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 64034223 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 64034531 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 64035966 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 64037654 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 64038711 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 64039763 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 64039887 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 64040179 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 64041039 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 64041176 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 64050248 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 64051041 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 64051268 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 64055734 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 64056726 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 64057869 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 64057999 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 64060386 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 64060394 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 64060491 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 64060498 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 64060510 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 64060530 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 64060604 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 64060621 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 64060657 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 64060675 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 64060912 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 64060938 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 64060950 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 64060951 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 64060961 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 64060963 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 64060988 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 64061029 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 64061182 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 64061205 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 64061215 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 64061242 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 64061464 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 64062843 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 64064247 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64064386 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 64064756 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 64064901 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 64065118 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64065220 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 64066866 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 64067555 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 64067697 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 64068286 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 64068901 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 64069140 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 64069242 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 64069258 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 64069919 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 64071379 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64071478 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 64071906 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 64072065 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 64072195 A C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 64072225 T G N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 64072649 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 64073660 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64073818 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64074163 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64080788 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 64081021 A C N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 64082239 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 64082256 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64082277 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 64082825 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 64083171 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 64083280 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 64083287 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 64083302 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64083506 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64083826 A C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 64083835 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 64083862 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 64084071 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 64084098 T G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 64084156 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 64084171 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 64084206 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 64084282 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 64084398 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64084408 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 64084417 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64084840 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64084876 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 64084933 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 64084937 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 64084986 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64085074 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64085075 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64085106 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64085237 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 64085241 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 64085265 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64085274 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64085677 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64085715 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64085716 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64086025 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64086051 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64086052 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64086155 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64086235 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 64086240 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 64086672 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64086688 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 64087059 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 64087168 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64087212 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64087314 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64087371 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64087375 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64087402 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64087437 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64087680 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64096246 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64119322 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 64132400 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 64135140 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64139555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64152817 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 64154972 G A Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 64159876 A G Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 64159966 A G Y Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 3 64159983 C T Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 64171624 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 64196674 A G Y Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 3 64200931 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64207136 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64211966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64217110 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64220169 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 64227075 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 64227624 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 64236546 A T Y N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 14 10 2 10 0 3 64240830 T G Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 64240902 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 64282805 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 64286545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64288884 C G Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 64288990 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 64289120 T A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 64289176 A T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 64289221 T G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 64289224 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 64289267 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 64289299 C G Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 64289308 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 64289334 A G Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 64289356 T A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 64289369 G C Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 64289372 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 64289405 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 64289420 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 64289432 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 64289457 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 64289489 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 64289604 C A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 64289608 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 64291790 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 64294505 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64300950 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 3 64301254 T A Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 64301454 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 64304274 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 64306135 C A Y N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 3 64306433 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 64310806 G C Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 64310821 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 64328677 G C Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 64328930 A T Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 64330497 T G Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 64331058 C T Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 64334026 G A Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 64336186 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 64336700 G C Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 64337426 T A Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 64338114 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0 0.894736842105263 0.105263157894737 17 21 0 17 2 3 64345778 G C Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 64345820 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 64347535 C G Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 64348160 A G N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 64348198 T C Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 64349103 A G Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 64349232 A G Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 64354657 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 64355114 T C Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.176470588235294 0.764705882352941 0.0588235294117647 19 15 3 13 1 3 64355972 C G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 64358687 C T Y Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.153846153846154 0.846153846153846 0 15 11 2 11 0 3 64361795 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 64364277 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 64365253 G A N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 64367965 A G N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 64385309 A C Y N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 64389201 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 64389239 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 64389328 C A Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 64389338 C G Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 64389627 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 64389635 G C Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 64389640 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 64389662 A G Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 3 64390970 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 64391312 T C N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 3 64393385 A C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 64393607 C T Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 64394678 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 64399272 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 64399307 T G Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 64403223 C T Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 3 64403228 G A Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 3 64403244 A T Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 3 64403288 A G Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 3 64403309 A G Y Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 14 12 1 12 0 3 64408530 A C Y N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 64409043 T C Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 64409541 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 64410447 C T N Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 3 64411328 A C Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 64411366 A C Y N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 64412684 C T Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 64412685 T G Y N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 64413076 C G Y N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 64417318 A C Y N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 3 64418501 T G Y N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 64429976 T G Y N 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 6 10 2 2 4 3 64429994 T A Y N 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 5 9 2 1 4 3 64433353 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 3 64434765 A C Y N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 3 64434777 C G Y N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 3 64448065 C A Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 64448274 A G Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 64448612 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 64449929 A C Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 64454120 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 64455110 G A Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 64458353 A T Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 64458466 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 64458492 T G Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 64484919 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 64493679 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 64499677 C T Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 64499690 A C Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 64499844 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 64501745 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 64503775 T C Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 64503776 G A Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 64513199 A T Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 64524878 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 64528522 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 64529510 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 64531795 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 64534710 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 64535224 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 64535420 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 64536205 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 64540074 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 64540079 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 64541201 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 64541972 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64542850 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 64542869 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 64544196 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 64544453 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 64544500 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 64544923 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 64546415 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 64547288 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 64547643 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 64547644 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 64548185 A T Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 64548342 G C Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 64548344 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 64549012 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 64549476 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 64549488 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 64549720 T A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 64551026 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 64551775 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 64552773 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 64553437 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 64553652 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 64554104 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 64555846 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 64556218 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 64556904 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 64558824 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 64560857 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 64562909 T A Y N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 64563438 A C N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 64563439 A T N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 64564490 T C Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 64564879 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 64565216 C T Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 64565223 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.266666666666667 0.133333333333333 0.6 10 20 4 2 9 3 64566156 T A Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 64566570 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 64566575 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 64567902 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 64568367 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 64569968 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 64571455 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 64571716 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 64573663 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 64573734 A T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 64574012 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64574771 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 64575417 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 64577046 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 64578949 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 64578957 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 64578964 C A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 64579826 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 64580121 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 64583007 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 64585509 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 64587687 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 64594683 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64594795 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 64597089 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 64614877 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 64615327 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 64628467 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 64636600 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 64636886 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 64637120 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64637666 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 64638003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64640300 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 64641944 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 64643441 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 64643585 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 64644105 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 64648140 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 64648717 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 64648908 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 64651974 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 64652779 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 64655141 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 64658927 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 64661157 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 64661479 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 64661483 T G N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 64662470 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 64666671 A C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 64666711 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 64667022 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 64667147 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 64667465 T A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 64668069 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 64668070 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 64668086 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 64668114 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 64668137 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 64668141 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 64668359 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 64668420 C T N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 8 12 1 6 3 3 64668539 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 64668549 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 64668583 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 64668794 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 64668820 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 64669344 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 64669484 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 64669765 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 64670523 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 64672781 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 64673321 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 3 64681876 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 64682193 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 64685527 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 64691206 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 64693366 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 64695421 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 64695488 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 64697485 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 64698170 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 64698673 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 64698987 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 64700351 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 64700621 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 64702164 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 64702202 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 64702215 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 64702345 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 64702377 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 64702707 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 64706236 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 64708491 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64708734 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 64708933 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 64711595 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 64711867 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 64714211 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 64714258 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 64717190 A T N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 64722501 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 64722881 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 64722899 A C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 64722990 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 3 64723282 A G Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 3 64723694 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 64724026 A G Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 64724255 G A Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 64724448 T C Y Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 3 64726171 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 64726343 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 64734207 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 64734213 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 64735094 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 64736020 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 64736096 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 64736347 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 64737511 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 64739341 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 64740211 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 64740570 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64741061 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 64743904 G C Y N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 8 12 2 4 4 3 64743951 A G Y Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 9 11 2 5 3 3 64744029 T C Y Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 7 11 2 3 4 3 64746349 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 64747233 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 64747670 A C N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 64748473 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 64748916 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 64756648 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 64757106 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 64758175 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 64767207 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 64767711 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64767803 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 64768193 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 64768251 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 64768334 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 64768739 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64768773 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 64768786 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 64768973 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64768998 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 64769010 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 64769134 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 64769204 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 64769299 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 64769370 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64769514 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 64769814 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 64769896 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 64769899 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 64769969 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 64770096 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 64770157 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 64770209 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 64770431 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 64770438 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 64770466 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 64770533 G A N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 64770666 G A Y Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.0625 0.8125 0.125 15 17 1 13 2 3 64770763 G T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 64770768 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 64770776 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 64770790 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 64771046 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 64771127 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 64771142 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 64771143 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 64771633 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 64771709 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64772466 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 64772562 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 64772622 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 64772854 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64773145 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 64773166 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 64776149 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 64776161 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 64776230 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 64776290 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 64776401 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 64776674 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 64776699 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 64776707 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 64776756 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 64776978 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 64776986 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64777012 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 64777016 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 64777322 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 64777381 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 64777387 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 64777394 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 64777418 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64777488 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 64777705 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 64777751 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 64777892 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 64777909 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 64777958 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 64777984 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 64777992 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 64778064 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 64778189 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 64778472 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 64778514 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 64778610 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 64778676 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 64778707 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 64778720 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 64778949 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 64778980 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 64779000 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 64779043 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 64779082 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 64779118 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64779153 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 64779329 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64779338 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 64779342 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64779387 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 64779415 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 64779519 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 64779530 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64779539 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 64779577 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 64779721 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 64779822 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 64779823 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 64779880 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 64779894 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 64780134 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 64780224 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 64780384 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64780448 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 64780581 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 64780637 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 64780674 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64780867 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 64781170 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 64781180 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 64781741 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64781843 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 64781901 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 64781987 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64781990 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 64782016 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 64782110 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64782145 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 64782392 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 64782453 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 64782504 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 64782570 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 64782612 T G N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 64782673 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 64782709 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64782839 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 64783005 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 64783071 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 64783079 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 64783228 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64783260 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64783261 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64783367 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64783414 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 64783458 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 64783519 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64783557 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64783610 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 64783625 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 64783672 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 64783768 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64783792 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 64783802 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 64783810 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 64783945 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 64783946 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 64784164 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 64784226 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 64784242 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64784647 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 64784844 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 64784940 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64784955 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 64785832 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 64785851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64785877 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64785885 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64785907 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64785911 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 64786100 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64786163 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 64786207 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64786272 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64786287 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64786311 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64786371 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64786383 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64786449 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 64786534 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 64786672 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64786673 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64786709 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64786743 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 64786764 A T N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 64786923 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64786951 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 64786959 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 64786995 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64787013 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64787051 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64787236 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 64787694 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 64787728 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 64787821 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 64788137 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64788200 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 64788329 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64788352 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 64788542 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 64788653 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 64788810 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 64788912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64788969 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 64789031 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 64789098 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 64789175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64789184 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 64789270 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 64789370 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 64789382 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 64789514 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 64789612 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 64789659 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64789696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64789798 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 64789831 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 64789925 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 64789951 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64790079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64791168 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64791429 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64791449 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64791800 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64792211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64792220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64792230 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 64792594 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 64792630 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 64792711 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 64792762 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 64792766 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 64792792 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 64792820 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 64792974 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 64793056 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 64793113 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 64793253 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 64793283 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 64793394 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 64793442 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 64793484 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 64793554 A C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 64793563 C A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 64793740 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 64793870 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 64794447 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 64795279 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 64795391 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 64795871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64796028 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 64796106 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 64796452 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 64796909 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 64796984 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 64797130 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 64797166 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 64797229 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 64797763 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 64797856 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64797870 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 64798127 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 64798157 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64798199 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 64798278 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 64798293 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64798330 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 64798356 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64799031 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64799311 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64799312 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64799675 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64799713 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64799733 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 64799768 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64799895 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64799903 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64800180 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64800262 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 64800707 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64800989 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 64801036 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 64801221 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 64801653 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 64802088 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 64802184 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 64802283 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 64802488 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 64802682 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 64802826 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 64803266 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64803293 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 64803332 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64803409 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 64803597 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 64803882 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 64803907 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 64804007 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 64804009 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 64804028 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 64804137 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64804252 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 64804360 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 64804375 C G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 64804388 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 64804431 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 64804443 A T N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 64804448 A T N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 64804608 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 64804706 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 64804723 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 64804846 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 64804850 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 64804866 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 64804919 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 64804991 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 64805011 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 64805031 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 64805056 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64805090 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 64805164 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 64805236 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 64805321 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64805348 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64805357 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64805373 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 64805379 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 64805384 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 64805417 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 64805498 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 64805591 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 64805601 A C Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 64805603 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 64805636 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 64805637 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 64805819 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 64805833 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 64805836 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 64806010 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 64806090 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 64806132 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 64806149 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 64806206 A T Y N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 64806212 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 64806349 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64806404 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 64806445 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 64806643 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 64806672 T C Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 64806693 T G Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 64806725 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 64806776 G A Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 64806838 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64806874 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 64806879 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64807063 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 64807118 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64807172 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 64807287 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 64807300 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64807782 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 64807805 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 64807831 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 64807938 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64807939 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64808013 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64808056 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 64808128 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 64808284 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 64808298 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 64808299 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 64808750 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 64809077 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 64809160 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 64809213 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64809226 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 64809305 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 64809465 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 64809554 A C Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 64809638 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 64809665 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 64809886 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 64809978 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 64810044 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 64810101 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64810123 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 64810124 A T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 64810135 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64810252 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 64810256 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 64810369 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 64810461 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 64810648 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 64810854 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 64810946 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 64810968 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 64810990 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64811049 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 64811130 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64811245 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64811267 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 64811363 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 64811439 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 64811547 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 64811573 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 64811674 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64811918 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 64811922 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 64811933 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 64811954 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 64811958 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64812048 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 64812049 T A N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 64812310 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 64812320 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 64812382 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64812392 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64812398 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64812421 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64812429 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 64812433 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64812570 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64812640 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64812649 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 64812738 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 64812750 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 64812776 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 64812847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64812868 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64812909 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64812949 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64812972 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64813029 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64813048 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 64813049 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 64813068 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 64813197 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 64813199 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 64813431 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 64813440 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 64813459 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 64813489 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64813569 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 64813640 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 64813677 A G N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 64813684 T A N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 64819676 T G N N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 9 5 4 1 2 3 64819731 A C N N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 14 6 6 2 2 3 64819864 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 64819897 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 64819905 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 64819966 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 64820092 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64820122 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 64820199 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64820697 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 64820973 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64821004 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 64821062 T A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 64821094 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 64821105 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 64821243 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 64821286 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 64821294 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 64821306 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 64821369 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 64821382 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 64821400 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64821419 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 64821712 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 64821736 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 64821852 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 64821887 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 64821894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64821984 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 64822119 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 64822205 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 64822306 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 64822348 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 64822359 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 64822383 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64822413 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 64822432 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 64822515 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64822537 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 64822663 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 64822664 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 64822836 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 64823063 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64823166 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 64823227 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 64823322 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 64823340 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 64823389 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 64823670 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 64823707 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 64823776 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 64823902 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 64824057 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64824082 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 64824137 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 64824163 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 64824446 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 64824559 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 64824614 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 64824622 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 64824628 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 64824762 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 64824763 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 64825024 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 64825175 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64825353 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64825406 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64825478 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64825665 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 64825696 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64825711 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64825762 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64825796 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64825798 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 64825852 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 64825907 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64825908 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 64825937 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64825999 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64826007 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64826046 G C Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64826075 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64826118 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 64826182 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64826340 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 64826381 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64826412 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64826429 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64826466 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64826509 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 64826629 C T Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 64826698 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64826702 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64826720 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 64826735 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 64826737 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 64826848 G C Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 64826895 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 64827033 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 64827217 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 64827269 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64827279 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 64827283 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 64827406 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 64827439 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 64827575 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 64827619 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 64827656 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 64827679 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 64827813 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 64827819 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 64827850 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 64827869 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 3 64828304 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 64828305 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 64828325 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 64828342 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 64828349 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 64828358 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 64828394 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 64828486 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 64828603 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 64828727 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 64828747 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 64828757 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 64829107 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 64829163 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64829186 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 64829340 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 64829347 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 64829389 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 64829659 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 64829836 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 64829883 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 64829909 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64830006 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 64830107 G T Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 64830471 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 64830525 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 64830744 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 64831036 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 64831095 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 64831148 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 64831183 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64831249 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 64831280 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 64831471 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 64831504 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 64831555 G T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 64831661 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 64831688 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 64831706 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 64831816 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 64831829 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64831890 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 64832436 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 64832528 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 64832683 G A N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 64832818 A G N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 64832830 A G N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 64833791 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 64833837 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 64833874 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64833945 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64833958 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64834076 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64834090 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64834184 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64834216 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64834230 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64834256 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 64834330 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 64834402 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 64834414 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 64834557 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 64834707 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 64834718 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 64834731 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 64835776 A G Y Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 3 64837174 G A Y Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 9 7 3 3 2 3 64837482 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 64837646 T C N Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 3 64837661 C G N N 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 7 5 3 1 2 3 64837812 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 64837850 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 64837889 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 64837940 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 64837967 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 64837987 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64838083 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 64838093 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 64838123 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 64838153 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64838207 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 64838249 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 64838273 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 64838277 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 64838289 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 64838297 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 64838352 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 64838366 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 64838459 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 64838486 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 64838487 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 64838544 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 64838552 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 64838561 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 64838614 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 64838630 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64838637 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64838647 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 64838653 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 64838746 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64838753 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 64838913 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 64838933 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 64838983 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 64839002 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 64839007 T A N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 64839094 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 64839142 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 64839154 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 64839169 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 64839184 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 64839243 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 64839257 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 64839263 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 64839283 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 64839411 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 64839583 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 64839660 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 64839671 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 64839799 G A N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 3 64839860 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 64839897 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 64839942 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 64839994 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 64840181 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 64840295 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 64840321 G T N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 64840340 T A N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 64840369 C T N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 64840495 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 64840549 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 64840688 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 64840745 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 64840860 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 64840862 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 64840886 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 64840924 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 64840925 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 64841054 A G N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 64841082 A T N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 64841106 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.0588235294117647 0.705882352941177 0.235294117647059 14 20 1 12 4 3 64841119 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 64841250 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64841255 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 64841326 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 64841413 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64841427 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 64841874 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 64841959 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 64841993 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 64842036 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 64842109 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 64842158 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 64842167 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 64842212 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64842264 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 64842275 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 64842315 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 64842452 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64842564 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64842586 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64842596 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 64842627 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 64842656 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 64842912 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 64842955 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 64843092 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 64843116 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 64843302 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 64843390 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 64843437 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 64843531 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 64843535 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64843737 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 64843791 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64843929 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64844006 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 64844084 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 64844090 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 64844115 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 64844146 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 64844310 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64844406 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 64844475 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64844505 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64844515 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 64844590 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 64844629 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 64844646 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 64844726 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64844748 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64844792 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64844950 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 64844951 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 64845227 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64845236 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64845295 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 64845332 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 64845437 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64845454 G C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 64845529 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 64845541 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 64845555 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 64845585 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64845664 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64845705 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64845728 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64845742 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 64845762 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 64845881 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64845980 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64846253 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 64846278 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 64846316 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64846331 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64846354 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 64846452 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 64846468 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 64846584 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 64846739 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64846825 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 64846935 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 64846946 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 64847021 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64847152 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 64847172 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 64847209 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 64847227 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64847312 A T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 64847361 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64847473 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 64847546 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 64847551 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 64847582 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 64847709 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 64847749 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 64847908 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 64847948 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64847949 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64847975 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64848198 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 64848324 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 64848440 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64848473 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64848520 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64848568 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 64848570 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 64848715 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64848757 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64848774 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 64848971 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64849056 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64849095 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64849128 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64849328 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64849355 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64849399 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64849500 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 64849507 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 64849595 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64849767 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64849808 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64849853 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 64849878 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64850066 T A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 64850071 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64850117 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64850249 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64850308 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64850501 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 64850522 G T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 64850537 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 64850552 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 64850569 T G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 64850846 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 64850916 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 64850929 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 64850966 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 64851083 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64851440 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 64851611 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64851704 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64851752 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64852009 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 64852115 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 64852281 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 64852352 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 64852460 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 64852604 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 64852627 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 64852755 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 64852841 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64852950 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 64852985 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64853066 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64853086 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64853263 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 64853280 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 64853317 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 64853328 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 64853390 C A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 64853410 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64853452 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 64853498 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64853661 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64853822 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64853836 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64853953 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 64853965 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 64854116 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 64854137 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64854193 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 64854233 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64854240 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64854277 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64854368 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 64854388 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64854578 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 64854623 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 64854625 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 64854705 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 64854717 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 64854748 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 64854760 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 64854775 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 64854778 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 64854814 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 64854829 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 64854865 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 64854868 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 64854908 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 64854919 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64854952 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64854967 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64855014 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 64855111 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 64855124 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 64855131 C A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 64855273 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 64855408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64855534 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 64855679 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 64855768 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 64855808 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 64855854 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 64855963 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 64856083 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 64856089 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64856212 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64856350 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 64856356 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 64856485 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64856633 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 64856749 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 64856805 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 64856849 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 64856907 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 64856999 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 64857049 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 64857099 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 64857127 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 64857580 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 64857871 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 64858055 T A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 64858184 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 64858710 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 64858735 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 64859087 C G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 64859123 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 64859221 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 64859339 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 64859414 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 64859456 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 64859511 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 64859523 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 64859669 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 64859769 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 64859846 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 64859942 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 64860105 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 64860127 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64860151 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64860175 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 64860204 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64860216 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 64860228 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 64860244 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64860306 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64860329 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64860369 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64860403 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 64860429 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64860431 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64860518 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64860763 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 64860831 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 64860833 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 64860967 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 64860970 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 64860990 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 64861121 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 64861151 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 64861219 A G N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 3 64861354 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 64861380 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 64861450 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 64861478 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 64861500 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 64861647 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 64861783 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 64861856 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64861904 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 64861972 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 64862010 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 64862019 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 64862227 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 64862231 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 64862351 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 64862384 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 64862571 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 64862626 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 64862657 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 64862695 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 64862708 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 64862722 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64862725 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 64862791 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64862908 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 64862997 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 64863038 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 64863184 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 64863451 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 64863527 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 64863640 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 64863641 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 64863657 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 64863692 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 64863745 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 64863814 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 64863833 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 64863857 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 64863908 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 64863975 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 64864073 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 64864137 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 64864573 T C N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 3 64864642 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 64864764 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 64864853 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 64865050 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64865097 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 64865106 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 64865124 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 64865146 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 64865529 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 64865589 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 64865609 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 64865661 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 64865982 G T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 64866013 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 64866052 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 64866186 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 64866214 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 64866275 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 64866426 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 64866490 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 64866491 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 64866536 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 64866560 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 64866631 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 64866741 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 64867052 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64867231 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 64867323 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 64867425 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 64867449 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 64867498 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 64867504 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 64867992 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 64868079 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 64868150 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 64868184 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 64868212 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 64868247 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 64868310 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 64868346 C A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 64868397 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 64868515 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 64868546 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 64868549 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 64868559 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 64868572 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 64868611 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 64868650 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 64868658 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 64868669 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 64868674 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 64868771 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 64869064 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64869160 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 64869175 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 64869214 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 64869279 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 64869335 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 64869402 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 64869420 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 64869552 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 64870225 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 64870315 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 64870412 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 64870538 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 64870672 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 64870682 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 64870704 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 64870928 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 64871041 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64871189 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64871224 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64871371 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 64871582 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 64871583 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64871626 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 64871674 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64871728 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 64871796 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 64871843 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 64871856 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64871859 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 64871882 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64871884 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 64871920 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 64871982 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 64872101 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 64872463 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 64872464 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 64872527 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 64872540 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 64872598 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64872668 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 64872739 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64872759 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 64873016 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 64873074 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64873186 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 64873294 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 64873666 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64873799 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 64873815 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64873914 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 64873931 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 64873936 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 64873963 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 64873967 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 64874043 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 64874086 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 64874180 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 64874373 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64874500 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 64874517 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 64874884 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64874895 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 64874917 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 64875014 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 64875092 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64875099 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 64875128 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 64875303 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 64875481 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 64875495 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64875605 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 64875660 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 64875710 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 64875759 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 64875863 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 64876039 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 64876076 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64876172 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 64876304 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64876383 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 64876523 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 64876741 G T Y N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 64876865 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 64876923 T A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 3 64877608 T C N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 3 64877630 T G N N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 3 64877875 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 64877938 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 64878005 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 64878024 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 64878116 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64878144 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 64878208 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 64878250 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 64878299 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 64878373 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 64878451 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 64878495 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64878513 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 64878520 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 64878675 G C Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 64878697 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 64878772 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64878863 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 64878925 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 64879052 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 64879150 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 64879288 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64879340 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 64879466 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 64879472 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64879560 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 64879873 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64879892 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 64880267 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 64880822 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 64880998 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 64881026 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 64881262 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 64881306 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 64882211 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 64882217 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 64882227 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 64882263 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 64882520 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64882576 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 64882654 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 64883081 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 64883248 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 64883259 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64883271 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64883326 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 64883954 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 64884064 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 64884065 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 64884367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64884578 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 64885158 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 64885159 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 64885184 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64885465 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64885489 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 64886094 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 64886207 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 64886363 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 64886401 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 64886487 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 64886759 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 64887363 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 64887411 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64887803 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 64887856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64888005 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 64888242 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 64888287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64888501 C A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 64888572 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 64888661 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 64888690 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 64889074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64889405 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 64889575 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64889615 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 64889670 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 64890105 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 64890178 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 64890430 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 64890725 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 64890810 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 64890940 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 64891096 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 64891099 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 3 64891374 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 64891389 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 64891551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64891650 A T Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 64891667 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 64891867 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 64891967 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 64892111 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 64892126 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 64892128 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 64892156 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 64892262 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 64892527 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 64892559 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 64892761 A G Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 64892808 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 64892815 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 64892823 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 64892911 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 64892998 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 64893224 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 64893260 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 64893277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64893312 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 64893437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64893488 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64893639 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 64893784 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 64893817 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 64893831 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 64893885 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 64894200 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 64894274 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 64894449 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 64894572 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 64894788 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 64894808 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 64894816 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 64894832 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 64894964 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64895071 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 64895094 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 64895109 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 64895165 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 64895244 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 64895248 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 64895351 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 64895456 T C N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 64895606 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 64895646 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 64895760 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 64895852 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 64895906 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 64895975 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 64896375 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 64896535 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 64896560 C A Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 64896586 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 64896754 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 64897373 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 64897442 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 64897481 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 64897550 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 64897575 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 64897655 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 64897765 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 64897801 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 64898219 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 64898669 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 64898692 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64898730 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 64898868 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 64899020 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 64899194 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 64899439 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 64899450 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 64899465 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 64899582 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64899996 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 64900037 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 64900180 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 64900189 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64900417 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 64900418 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 64900442 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 64900600 T A N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 64900721 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 64900736 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 64900784 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 64900879 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 64900900 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 64900936 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 64900964 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 64900999 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 64901049 A C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 64901116 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 64901152 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 64901259 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 64901287 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 64901289 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 64901306 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 64901324 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 64901413 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 64901488 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 64901544 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 64901699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64901817 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 64901852 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 64901858 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 64901875 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 64901900 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 64901944 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 64902004 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 64902023 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 64902053 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 64902117 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 64902212 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 64902218 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 64902237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64903036 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 64903067 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 64903077 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 64903078 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 64903153 T C Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 64903515 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 64903648 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 64903735 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 64903863 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 64903943 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 64903975 T G Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 64904180 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 64904679 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 64904722 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 64904873 T C N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 3 64904898 G T N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 3 64905439 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64905471 T A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 64905477 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64905523 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64905623 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 64907175 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 64907205 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 64907407 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 64908087 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 64908318 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 64908792 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 64909275 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 64909339 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64909415 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 64909461 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 64909547 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64909629 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64909681 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64909716 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64909773 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 64909785 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64909828 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 64909839 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 64910033 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 64910150 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 64910163 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64910192 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 64910263 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 64910312 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 64910315 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 64910374 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 64910404 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64910471 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 64910521 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 64910554 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 64910613 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 64910702 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 64910755 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 64910832 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 64910974 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 64911002 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 64911017 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 64911065 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 64911116 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 64911178 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 64911189 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 64911213 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 64911504 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 64911635 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 64911645 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 64911707 T A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 64911774 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 64911827 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 64911835 A C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 64912186 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 64912213 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 64912240 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 64912283 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 64912348 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 64912523 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 64913111 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 64913458 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 64913611 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 64913653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64913979 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 64914331 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 64914351 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 64914407 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 64914598 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 64914661 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 64914702 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 64914800 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 64914858 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64914881 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 64915114 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64915219 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 64915275 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64915313 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 64915338 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 64915471 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64915477 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 64915502 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 64915521 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 64915530 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 64915533 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64915542 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64915553 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64915584 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 64915616 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64915669 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64915734 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 64916030 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 64916071 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64916171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64916177 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 64916228 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 64916283 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 64916319 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 64916348 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 64916405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64916555 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 64916567 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 64916691 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 64916864 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 64916891 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 64916907 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 64916928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64917057 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 64917074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64917092 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 64917097 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 64917109 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64917378 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 64917472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64917520 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 64917558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64917579 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 64917623 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 64917631 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 64917865 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 64917888 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 64917915 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 64917919 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 64917940 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 64917969 G A N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 3 64917996 G T N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 3 64918525 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 64918727 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64918790 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 64918872 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 64919151 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64919393 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 64919555 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 64919863 T A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 64919909 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 64920284 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 64920323 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 64920724 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 64921120 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 64921198 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 64921335 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 64921805 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 64921812 C G N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 64921821 A G N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 3 64921833 A C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 64921847 T A N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 64921857 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 64921912 C A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 64922020 G C N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 64922035 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 64922217 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.15 0.85 0 23 17 3 17 0 3 64922323 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 64922376 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 64922454 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 64922473 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 64922478 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 64922734 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 64922934 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 64922944 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 64923087 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 64923229 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 64923253 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 64923266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64923304 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 64923338 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 64923355 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 64923388 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 64923454 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 64923634 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 64923756 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 64923936 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64924023 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 64924379 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64924383 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 64924896 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 64924920 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 64925252 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 64925493 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 64925825 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 64925899 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64925965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64926362 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 64926511 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 64926579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64926666 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 64927200 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 64927401 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 64927442 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 64927479 C A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 64927531 G C Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 64927609 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 64927672 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 64927814 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64927823 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 64928007 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 64928205 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 64928252 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 64928428 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 64928452 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 64928671 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64928760 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 64928764 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 64928915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64929008 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 64929111 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 64929278 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 64929500 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 64929559 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 64930054 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 64930331 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 64930849 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 64930940 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 64931022 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 64931355 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 64931849 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64932337 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 64934046 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 64934135 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 64934317 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64934421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64934471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64934620 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 64934673 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64934745 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 64934868 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 64934903 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 64934984 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 64934986 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 64935140 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 64935559 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 64935730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64936570 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 64936641 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 64936834 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 64938258 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 64938738 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 64938763 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 64938779 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 64938905 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 64938991 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 64939004 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 64939034 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 64939094 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64939108 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 64939163 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 64939166 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 64939189 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 64940214 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 64940415 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 64940736 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 64940778 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 64940950 T A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 64940959 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 64940967 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 64941030 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 64941066 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 64941108 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 64942695 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 64942724 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 64942842 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 64943079 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 64943122 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 64943660 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 64943769 G A Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 64944038 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 64944641 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 64944657 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 64944660 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 64944805 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 64944876 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 64945192 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 64945255 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 64945298 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 64945572 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 64945652 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 64945724 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 64945751 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 64945779 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 64946105 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 64946161 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 64946678 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 64946732 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 64946864 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 64946866 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 64946986 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64947290 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 64947675 T C Y Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0 0.8 0.2 4 6 0 4 1 3 64947717 A G Y Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 3 64948281 C G N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 3 64948359 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 64948469 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 64948526 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64948666 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 64948675 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 64948712 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 64948734 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 64948750 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 64948812 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 64948817 A G Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 64948886 A T N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 64949010 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 64949055 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 64949095 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 64949119 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 64949126 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 64949154 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 64949225 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 64949292 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 64949303 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 64949321 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 64949346 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 64949441 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 64949444 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 64949621 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 64949677 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 64949777 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 64949845 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 64949960 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 64949966 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 64949985 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 64950008 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 64950009 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 64950096 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 64950124 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 64950150 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 64950168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64950235 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 64950245 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 64950270 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 64950290 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 64950402 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 64950407 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 64950432 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64950504 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 64950581 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 64950606 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 64950642 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 64950643 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 64950710 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 64950736 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 64950737 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 64950871 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 64950913 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 64950958 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 64951105 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 64951238 T C N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 3 64951303 A C N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 3 64951369 G C N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 64951416 G T N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 64951442 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 64951443 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 64951485 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 64951526 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 64951581 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 11 7 2 7 0 3 64952278 T C N Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 8 8 3 2 3 3 64952282 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 8 10 3 2 4 3 64952330 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 64952582 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 64952643 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 64952655 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 64952803 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64952813 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 64952873 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 64952919 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 64952972 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 64953420 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 64953578 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64953633 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 64953701 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 64954063 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 64954207 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 64954497 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 64954591 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 64954846 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 64954862 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 64955462 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 64955652 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 64955697 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 64955996 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 64956281 A C Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 64956433 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 64956483 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 64956575 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 64956816 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 64956877 A G N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 64957295 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 64957423 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 64957493 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 64957693 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 64957717 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 64957752 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 64957815 G T Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 64957863 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 64957978 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 64958013 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 64958157 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 64958255 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 64958349 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 64958932 G T Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 64959054 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 64959077 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 64959222 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 64959257 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 64959267 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 64959288 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 64959299 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 64959690 T C N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 3 64959716 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 64959825 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 64959932 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 64959943 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 64959944 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 64960193 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 64960202 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 64960319 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 64960412 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 64960472 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 64960555 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 64960614 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 64960826 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 64961508 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 64962512 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 64963389 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 64963510 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 64964386 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 64964418 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 64964500 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 64964616 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 64964651 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 64965266 C G N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 64965898 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 64966128 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 64966362 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 64966457 T A Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 64966526 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 64966537 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 64966765 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 64966860 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 64966863 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64966897 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 64966970 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 64967054 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 64967123 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 64967180 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 64967283 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 64967358 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 64967361 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 64967377 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 64967409 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 64967598 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 64967622 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 64967644 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 64967649 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 64967756 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 64967882 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 64967888 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 64968255 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 64968343 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 64968438 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 64968450 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 64968521 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 64968621 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 64968643 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64968713 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 64968882 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 64968975 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 64969127 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 64969140 T G N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 64969170 T G N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 64969458 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 64969472 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 64969537 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 64970091 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 64970205 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 64970267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64970659 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 64970683 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 64970742 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 64970805 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 64970854 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 64970918 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 64970958 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 64970977 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 64971016 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 64971050 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 64971062 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 64971132 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 64971189 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 64971352 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 64971390 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 64971460 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 64971488 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 64971501 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 64971520 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 64971573 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 64971595 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 64971606 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 64971707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64971731 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 64971752 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 64971893 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 64971993 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 64972005 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 64972081 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 64972165 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 64972195 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 64972216 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 64972390 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 64972418 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 64972422 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 64972532 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 64973070 A G Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 64973109 C T Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 64973147 A T Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 64973150 A C N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 64973318 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 64973429 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 64973489 C A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 64973668 C G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 64973682 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 64973758 T G Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 64973884 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 64973911 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 64973912 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 64973972 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64974291 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 64974347 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 64974390 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 64974399 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 64974680 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 64974724 G C N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 64974814 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 64974987 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 64975133 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 64975145 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 64975185 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 64975204 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 64975338 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 64975422 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 64975477 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 64975482 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 64975531 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 64975566 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 64975695 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 64976351 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64976640 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 64976716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64976824 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 64976849 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 64976888 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 64977346 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 64977611 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 64977806 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 64977864 G C Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 64977899 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 64978036 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 64978085 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 64978126 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 64978615 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 64978648 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64978657 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 64978904 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 64978961 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 64979081 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 64979359 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 64979379 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 64979398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64979405 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 64979425 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 64979475 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 64979493 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 64979498 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 64979514 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64979532 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 64979639 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 64979651 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 64979670 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 64979681 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 64979724 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 64979752 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 64980793 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 64980845 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 64981033 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 64981063 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 64981185 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 64981687 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 64981730 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 64982711 T A N N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 8 8 2 4 2 3 64983032 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 64983037 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 64983208 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 64983399 T G Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 64983409 T G Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 64983596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64983696 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 64983776 A T Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 64983926 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 64984030 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 64984147 T C Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 64984193 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 64984207 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 64984269 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 64984313 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 64984333 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 64984337 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 64984443 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64984554 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 64984614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64984939 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 64984967 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 64985021 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 64985225 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 64985279 C A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 64985341 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 64985670 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 64985816 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 64985818 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 64985832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64986038 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 64986043 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 64986053 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 64986073 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 64986285 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 64986344 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 64986591 C T N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 3 64986677 A G Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 64986726 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 64987577 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 64987686 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 64987750 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 64987765 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 64987791 G T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 64987825 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 64987853 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 64987890 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 64987892 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 64988191 A T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 64988202 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 64988223 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 64988452 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 64988466 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 64988703 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 64988743 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 64988754 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 64988821 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 64989108 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 64989270 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 64990324 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 64990538 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 64990578 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 64990607 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 64990631 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 64990673 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 64990676 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 64991041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 64991616 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 64991706 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 64991745 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 64991795 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 64991839 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 64991872 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 64991961 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 64992428 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 65002084 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 65002119 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 65002132 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 65003546 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 65003920 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 65004002 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 65004761 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65005600 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 65005619 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65005709 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 65005833 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 65005835 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 65005911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65005939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65005979 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65005981 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 65005996 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 65006219 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 65006247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65006517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65006530 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 65006533 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 65006541 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 65006716 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 65006809 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 65007113 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 65007505 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 65008012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65008833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65008888 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 65009396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65009672 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65009952 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 65010038 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 65010102 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 65010108 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 65010231 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65010276 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 65010381 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 65010839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65010840 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65011302 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 65013098 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 65013682 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 65014130 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 65015267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65016401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65016571 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 65016622 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65017209 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 65019996 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 65022528 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 65022988 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 65023071 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 65023246 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65023840 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 65024297 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65024353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65024767 T C Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 65026125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65026178 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 65026392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65026727 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65028106 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 65028479 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65029553 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 65029625 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 65029905 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 65030130 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 65030141 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 65030151 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 65030161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65030287 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 65030425 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65030962 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 65031193 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 65031856 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 3 65032382 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65032464 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 65032859 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65033768 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 65033964 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 65034219 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65034761 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 65035179 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65036033 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 65036072 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 65036110 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 65036465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65036554 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 65036880 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 65037009 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 65037311 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 65037493 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 65038056 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 65038459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65038573 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 65039240 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 65040222 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65040586 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 65041031 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 65041099 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65041447 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 65041716 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65042150 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65042211 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65042573 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 65044189 G C Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 65044667 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 65044966 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65045052 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65045559 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 65047603 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 65048616 C T Y Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 3 65049265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65049526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65050153 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 65050462 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 65052785 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65053464 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 65053830 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 65053942 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 65054078 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 65054134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65054551 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65054578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65054678 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 65055044 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65055118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65055423 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65055437 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 65055478 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 65055624 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 65055883 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 65055908 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65056072 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 65056139 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 65056605 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65057370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65057430 C G N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 65057980 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 65058087 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65058264 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 65058296 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 65058308 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65058481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65058534 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65058850 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 65058863 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65058878 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 65058999 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 65059016 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65059076 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65059103 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65059514 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 65059571 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 65059649 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 65059828 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 65060064 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 65060161 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 65060284 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65060427 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 65060435 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 65060738 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 65060793 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 65061097 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 65061247 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 65061636 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 65061755 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 65061812 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 65061826 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 65061929 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 65062252 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 65062253 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 65062583 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 65062772 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 65062949 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 65063041 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 65063049 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 65063080 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 65063095 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 65063276 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 65063347 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 65063445 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 65063660 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 65063729 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 65063735 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 65063801 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 65063897 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 65064178 T A Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 65064245 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 65064385 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 65064388 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 65064565 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 65064589 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 65065677 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 65065795 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 65065852 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 65065876 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65067396 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 65068403 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 65068786 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 65068857 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65069016 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 65069292 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 65069364 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 65069563 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 65069710 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 65069735 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 65069737 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 65069748 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 65069841 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 65069904 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65070007 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 65070193 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 65070309 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 65070364 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65070391 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 65070443 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 65070489 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65070506 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65070508 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65070569 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65070692 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 65070721 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65070884 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 65071053 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65071696 T A N N 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 3 65071994 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65072173 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 65072441 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65072556 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65072592 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65072643 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65072776 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65072813 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 65072819 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65072826 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 65072912 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 65073196 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 65073227 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 65073356 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 65073361 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 65073440 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 65073499 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 65073849 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 65073961 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 65074141 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65074149 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65074217 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 65074258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65074426 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 65074444 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 65074455 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 65074484 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 65074556 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 65074661 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 65074869 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 65074900 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65075049 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 65075379 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 65075407 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 65075668 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65075718 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 65075754 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65075966 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65076025 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65076152 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65076415 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 65076848 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65077193 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 65077306 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 65077397 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 65077543 A C Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 65077940 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 65078643 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 65078768 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 65078791 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 65079495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65081204 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 65081283 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 65081362 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 65081429 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 65081645 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 65082028 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65082409 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 65082473 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65082476 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 65082527 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 65082543 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 65082608 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 65082615 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65082721 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 65082747 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 65083008 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 65083033 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 65083082 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65083188 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 65083302 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65083373 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 65083380 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65083410 C G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 65083454 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 65083687 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 65083802 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65083954 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 65083983 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65084089 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65084098 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 65084185 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65084228 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65084251 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65085274 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65085445 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 65085464 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 65085562 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65085636 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 65085811 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 65085870 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 65085898 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 65085945 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65085973 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65086022 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 65086043 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 65086126 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 65086127 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 65086161 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65086162 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65086175 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 65086250 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65086251 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65086281 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 65086299 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 65086383 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 65086453 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 65086465 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 65086478 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 65086819 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65086955 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 65086964 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65087017 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 65087069 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65087118 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 65087132 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 65087187 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65087309 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 65087352 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65087364 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65087397 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65087418 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65087547 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65087679 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65087846 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 65088071 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65088085 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 65088104 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 65088114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65088221 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 65088263 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 65088279 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 65088298 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65088310 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65088371 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65088376 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65088583 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 65088803 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 65088840 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 65088869 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65088877 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65089003 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65089388 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 65090467 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 65091629 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 65091929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65092194 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65093356 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 65093429 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 65093672 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65093681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65094467 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 65094685 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 65094753 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 65094810 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 65095560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65095985 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65097679 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 65098042 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65098377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65098455 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65098560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65098652 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 65099027 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 65099095 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 65100049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65100518 A T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 65100558 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 65100575 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 65100830 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 65101346 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 65101647 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 65102109 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65102195 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 65102213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65102265 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 65102292 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 65102332 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 65102407 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 65102429 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 65102956 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 65102957 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 65102974 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 65103050 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 65103057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65103107 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 65103178 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 65103230 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 65103388 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 65103568 C A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 65103713 C A N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 65103769 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 65103788 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 65103842 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 65103953 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65104066 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 65104205 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 65104223 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 65104495 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 65104509 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 65104535 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65104637 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 65104670 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 65104752 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 65104787 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 65104817 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 65104883 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 65104941 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 65104998 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 65105044 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 65105120 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 65105126 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 65105215 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65105269 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 65105301 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 65105350 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65105353 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 65105431 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 65105491 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 65105574 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 65105595 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 65105599 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 65105902 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 65105934 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 65106165 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 65106420 C A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 65106450 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 65106793 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65106938 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 65107025 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 65107214 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 65107235 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 65107247 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 65107274 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 65107779 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 65107850 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 65107985 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 65108075 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 65108503 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 65108586 G C N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 65108996 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 65109570 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65109959 A G N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 7 13 1 5 4 3 65110192 C A N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 3 65110292 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 65111359 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 65111424 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 65111665 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 65111679 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 65112108 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 65112332 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 65112415 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 65112483 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 65112533 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 65112743 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65112933 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 65113251 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 65113369 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65113470 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 65113475 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 65113517 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 65113758 G A N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 12 8 4 4 2 3 65113861 C T N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.214285714285714 0.642857142857143 0.142857142857143 15 13 3 9 2 3 65113864 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 18 14 4 10 2 3 65114080 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 3 65114087 T G N N 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 6 6 1 4 1 3 65114325 G A N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 3 65114371 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 65114457 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 65114563 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 65114579 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 65114630 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 65114686 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 65114816 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 65114849 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 65114854 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 65115075 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65115100 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 65115140 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65115803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65115971 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65116497 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 65116986 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 65117392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65118069 A C N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 65120318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65120441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65121126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65121990 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 65122121 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65122133 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 65122153 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 65122374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65122881 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 65123246 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 65125071 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 65126675 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65128621 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 65129072 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65129186 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65129244 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 65129492 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 65129796 C T N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 3 65129839 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 65129954 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 65130020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65130203 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 65130338 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 65130345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65130365 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65130434 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 65130460 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 65130473 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 65130571 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 65130572 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 65130727 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 65130854 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 65131226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65131249 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 65131266 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 65131333 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 65131978 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 65132911 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 65133378 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 65133404 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 65134193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65135995 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 65136264 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 65136273 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 65136283 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 65136336 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 65136371 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 65136416 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 3 65136472 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 65136616 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 65136638 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 65136687 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 65137115 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 65137211 A C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 65137236 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 65137324 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 65137931 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 65137947 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 65138029 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 65138048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65138366 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 65138589 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 65138606 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 65138673 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 65138728 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 65138823 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 65138824 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 65138854 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 65138973 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 65138978 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 65139238 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 65139654 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 65139801 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.157894736842105 0.736842105263158 0.105263157894737 20 18 3 14 2 3 65140013 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 65140626 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 65141306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65141409 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 65141545 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 65141864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65141927 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 65145353 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 3 65145411 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 65145647 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 3 65146638 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 65148180 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65151381 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 65152871 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 65154907 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65155069 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65155593 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65155676 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65155805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65155813 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65156214 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 65156520 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 65156622 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 65157365 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 65158381 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65158864 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 65159032 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 65159569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65159767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65159940 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65160073 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65160138 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 65160401 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 65160515 G T Y N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 3 65160566 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 65160599 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 65160627 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 65160767 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 65160838 C G Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 65160887 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 65160888 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 65161252 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 65161269 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 65161272 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 65161291 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 65163307 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 65163465 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 65164045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65164139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65164927 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 65165027 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 65165031 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 65165178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65165220 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 65165739 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 65165881 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 65165916 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 65165960 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 65165983 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 65167589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65170454 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 65170759 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65171217 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 65171421 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 65171469 G C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 65171831 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 65171915 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 65171987 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 65172183 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 65172205 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 65172208 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 65172229 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 65172237 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65172274 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 65172336 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 65172514 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 65172518 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 65172537 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 65172681 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 65172711 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 65172849 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 65172954 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 65173016 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 65173033 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 65173051 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.117647058823529 0.823529411764706 0.0588235294117647 18 16 2 14 1 3 65173055 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.111111111111111 0.833333333333333 0.0555555555555556 19 17 2 15 1 3 65173098 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 65173151 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 65173497 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 65173673 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 65173756 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 65173919 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 65174072 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 65174273 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 65174322 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 65174326 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 65175131 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 65175944 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 65176749 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 65176944 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 65177055 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 65177072 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 65177114 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 65177488 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 65177617 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 65177655 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 65177824 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 65177896 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65177980 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 65178002 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 65178627 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 65179237 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65179329 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65179397 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 65179454 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 65179753 A C N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0 0.882352941176471 0.117647058823529 15 19 0 15 2 3 65179869 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65179874 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65179922 T A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 65179966 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 65180050 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 65180068 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 65180134 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 65180157 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65180620 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 65181088 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 65181711 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 65181849 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 65181963 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 65181993 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65182001 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 65182066 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 65182100 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 65182211 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 65182350 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 65182466 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 65182500 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 65182565 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 65182737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65182833 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 65182897 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 65183052 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 65183275 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 65183459 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 65183487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65184317 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 65184824 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 65186167 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 65187006 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 65187148 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 65187963 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 65187965 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 65188084 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65188350 T G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 65188810 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 65188855 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 65188902 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 65188935 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 65190796 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 65191076 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 65191394 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 65191398 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 65191855 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 65191883 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 65191906 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 65191957 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 65192300 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 65192889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65193007 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 65193348 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 65193635 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 10 22 0 10 6 3 65193676 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65193715 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65193740 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 65193943 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 65193972 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 65194052 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 65194059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65194347 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65194353 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65194358 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 65194502 G A N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 65194538 G A N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 65194755 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 65195116 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65195291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65195371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65195512 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 65195522 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65195525 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65195660 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65195960 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 65196261 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 65196682 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 65196762 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65196889 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65200653 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 65200721 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 65200853 G T Y N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.307692307692308 0.538461538461538 0.153846153846154 15 11 4 7 2 3 65200866 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 65201132 C A N N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 3 65201467 A G Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 65201913 C G Y N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 65202107 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 65202109 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 65203250 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65203382 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 65203418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65203679 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65203786 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 65203893 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65203921 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 65203967 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65204123 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 65204541 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 65208191 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 65209386 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 65209627 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 65210221 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 65212085 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 65212771 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 65213005 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 65213167 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 65213364 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 65213391 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 65213479 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 65213526 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 65213536 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 65213563 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65213573 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 65213794 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 65213915 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 65213960 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 65214017 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 65214106 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 65214138 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 65214236 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 65214275 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 65214582 A C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 65214619 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 65214660 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 65214684 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 65214688 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 65214699 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 65214814 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 65214875 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 65214916 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 65215067 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 65215158 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 65215173 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65215194 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 65215306 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 65215488 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 65215645 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65215668 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65215687 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 65215731 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65215792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65215925 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65217968 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65218046 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65218348 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65218483 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 65218498 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65218536 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 65218637 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65218855 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 65218870 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 65218886 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 65218895 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 65218898 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 65219145 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 65219244 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 65219501 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 65220406 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 65220464 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 65220471 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 65220593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65220779 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 65220806 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 65220921 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 65221237 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 65221308 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65221577 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 65221604 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 65221639 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 65221668 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 65222541 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 65222546 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 65222573 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 65223087 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 65223840 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 65224829 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 65224960 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 65225932 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 65226447 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 65237416 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 65237601 C G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 65237715 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 65238457 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 65238473 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 65238810 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 65238813 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 65238898 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 65239189 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 65239239 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 65239408 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 65240410 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 65240448 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 65240902 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 65240941 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 65240957 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 65241359 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 65241365 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 65241384 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 65241684 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 65241720 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 65241943 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 65241982 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 3 65241999 A T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 65242180 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 65242328 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 65242356 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 65242389 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 65242430 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 65242473 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 65242498 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 65242613 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 65243336 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 65243353 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 65243406 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 65243421 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 65243540 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 65243624 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 65243711 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 65243717 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 65243789 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 65243816 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 65244006 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 65244193 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 65244194 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 65244210 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 65244367 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 65244381 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 65245697 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 65246755 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 65246960 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 65247388 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 65248552 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 65249267 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 65249360 A G N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 3 65251965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65252119 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 65252249 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 65252321 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 65252376 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 65252408 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 65252429 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 65252431 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 65252847 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 65252946 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 65252953 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 65252960 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 65253111 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 65253117 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 65253587 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 65253839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65253957 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 65254304 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 65254487 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65255021 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 65255044 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65255730 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65256346 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65256388 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 65256898 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 65257656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65257923 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65258189 T C Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 65258197 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65258337 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 65258663 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 65259094 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 65259250 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 65259290 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 24 4 12 0 2 3 65260266 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 65260346 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 65260464 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 65260651 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 65260652 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 65260672 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 65260776 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 65260788 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 65261117 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 65261293 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 65261487 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 65261497 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 65261501 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 65261548 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 65261564 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 65261611 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 65261685 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 65261910 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 65261974 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 65262200 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 65262578 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 65264524 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65264989 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 65265410 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 65266440 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 65266578 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 65266631 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 65266633 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 65266647 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 65266913 G A N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 3 65267519 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 65267548 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 65267627 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 65267637 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 65267678 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 65267737 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 65267756 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 65268029 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65268136 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 65268158 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 65268478 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 65268585 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 65268600 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 65268625 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 65268698 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 65268719 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 65268741 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 65269109 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65269125 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 65269154 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 65269175 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 65269229 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 65269954 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 65269986 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 65270187 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 65270322 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 65270390 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 65270395 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 65270455 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 65270703 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 65270986 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 65271036 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 65271257 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 65271315 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 65271454 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 65271480 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 65271581 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 65272051 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 65272091 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65272200 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 65272256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65272266 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 65272290 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65272379 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 65272473 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65272549 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 65272613 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 65272619 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 65272747 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 65272763 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 65272921 T G N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 3 65273010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65273049 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 65273113 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 65273458 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 65273495 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65273533 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 65274009 G A N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 65274177 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 65274595 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 65274634 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 65274769 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 65275191 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 65275296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65275501 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65275528 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 65275552 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 65275887 C A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 65275912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65275981 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 65276328 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 65276400 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 65276413 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 65276505 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 65276532 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 65276711 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65276764 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 65276991 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 65277145 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 65277330 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65277517 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65277557 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 65277607 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 65277708 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 65277711 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65277734 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65277742 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 65277850 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 65277948 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 65277999 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 65278084 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65278185 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65278197 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65278220 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 65278221 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 65278294 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 65278486 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 65278590 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 65278645 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 65278705 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 65278739 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 65278815 A G Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 65278825 T C Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 65278826 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 65278836 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 65278845 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 65279363 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65279512 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 65279533 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 65279558 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 65279563 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 65279590 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65279679 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65279688 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65279811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65279842 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65279973 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 65280359 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 65280507 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65280542 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 65280587 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65280649 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 65280660 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 65280734 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 65280840 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 65281142 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 65281161 C G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 65281188 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65281280 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 65281434 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 65281482 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 65281603 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 65281658 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65281742 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 65281753 C G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 65281819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65281859 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 65282215 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 65282250 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 65282474 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 65282757 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 65282827 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 65282828 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 65283000 G T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 65283227 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 65283286 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65283498 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 65283618 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 65283870 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 65284101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65284841 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65284856 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 65285619 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65285630 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65285659 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65285672 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65285684 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 65285707 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65285716 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 65285767 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65287998 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 65291510 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65291584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65294513 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65294686 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 65294865 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65295532 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 65296116 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 65297834 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65299085 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 65299901 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 65300070 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 65300301 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 65301666 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 65302271 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 65302398 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65302492 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 65303345 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65305393 G A Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 65306043 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65306737 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65307180 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 65307803 A G Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 65309481 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 65312107 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65312642 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 65313047 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65313823 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 65314583 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65314615 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 65314703 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65314710 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 65315167 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 65315269 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 65315390 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 65315615 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65315618 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 65316068 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65317368 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 65319783 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 65319819 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 65320328 G A Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 65321237 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 65321363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65321609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65321758 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 65321976 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 65322075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65322091 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 65322258 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65322282 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65322344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65322993 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65323091 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 65323116 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 65323341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65323378 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 65323545 C G Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 65323653 T A Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 3 65323706 A G Y Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.0769230769230769 13 13 1 11 1 3 65323743 G T Y N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 3 65323751 A T Y N 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 3 65324282 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 65324307 C A Y N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 65324591 A G Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 65324613 G A Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 65324624 C A Y N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 65324941 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 65325233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65325300 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65327924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65327937 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 65329697 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 65329941 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 65330102 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 65330726 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65331274 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 65334451 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65336650 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 65337790 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65339281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65340221 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65340907 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65341952 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 65342427 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 65343006 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 65343695 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65343733 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 65343877 T A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 65344862 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 65346189 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65346727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65346796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65346872 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65346988 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65347136 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 65347588 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65349649 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 65351020 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 65352055 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 65352149 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 65352340 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 65353114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65353212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65353804 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 65354254 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65354812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65354895 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 65354898 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 65357937 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 65358310 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 65358362 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 65358522 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 65359732 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 65362372 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 65363110 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 65363114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65363800 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 65364006 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65364739 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65365189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65365689 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65366637 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 65367316 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 65367346 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 65367581 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 3 65367603 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 3 65367612 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 65367790 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65367906 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 65368879 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 65369646 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65370455 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 65370596 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 65370817 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 65370993 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 65371152 A T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 65372247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65372710 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 65373262 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65373406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65374277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65375781 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 3 65375988 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 65376012 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 65376129 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 65376232 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 65376413 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 3 65376508 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 65376509 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 65376539 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 65376805 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 65377261 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 65377313 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 65377374 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 65377854 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 65378738 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 65378997 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 65379363 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 65379436 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 65379455 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 65379471 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 65379663 C A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 65379770 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 65379885 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 65379958 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 65380047 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 65380060 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 65380109 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 65380402 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 65380407 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 65380434 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 3 65380700 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65380765 A G Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 65380821 C A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 65380867 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 65380906 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 65380991 G A Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 3 65381063 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 65381102 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 65381139 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 65381167 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65381188 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65381207 T A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65381228 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 65381599 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65381816 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65381845 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 65381897 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 65382031 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 65382357 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65382742 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 65382781 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 65384344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65385780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65386946 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 65387026 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65387040 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 65387045 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 65387072 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 65387110 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 65387185 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 65387363 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 65387562 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65387587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65387683 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 65387713 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 65387781 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 65387783 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 65387867 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 65387945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65388049 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.0588235294117647 0.705882352941177 0.235294117647059 14 20 1 12 4 3 65388132 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 65388310 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 65388342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65388391 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 65388436 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 65388517 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65388713 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 65388816 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 65388852 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 65388969 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 65389002 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 65389009 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 65389038 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 65389070 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 65389411 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 65389963 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 65390263 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 65390490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65392898 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 65392933 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 65392997 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 65393047 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 65393050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65393069 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 65393198 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65393336 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 65393400 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 65393454 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 65393523 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 65393595 A T N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 65393622 G A Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 65393698 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 65393765 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 65393939 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 65394075 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 65394161 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 65394306 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 65394326 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 65394387 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 65394464 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 65394623 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 7 11 2 3 4 3 65394703 G T N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 3 65394706 A G N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 3 65394717 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 65394829 C A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 65394953 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 65395005 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 65395106 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 65395168 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 65395454 G C N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 65395580 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 65395656 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 65395675 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 65395693 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 65395869 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65396042 T A N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 3 65396049 T G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 65396055 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 65396148 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 65396167 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 65396879 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 65397001 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 65397107 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 65397151 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 65397264 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 65397336 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 65397597 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 65397647 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 65397774 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 65397780 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 65397877 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 65398162 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 65398308 G C N N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 3 65398525 A G N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 3 65398549 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 65398727 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 65398934 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 65399030 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 65399043 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.1 0.7 0.2 18 22 2 14 4 3 65399157 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 65399190 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 65399886 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 65400043 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65401837 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 65403081 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 65404039 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 65406844 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65408006 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 65408226 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 65408327 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 65408533 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65408837 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65409531 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 65409549 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 65409926 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 65410111 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 65410336 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 65410368 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 65410396 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 65410459 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 65410673 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 65410832 C A N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 3 65411076 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 65411570 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 65411591 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 65411625 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 65411683 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 65411900 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65412831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65412870 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65412901 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 65412902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65412943 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65413159 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 65413473 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 65413630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65413906 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 65414081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65415325 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 65415774 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65416366 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65417274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65417747 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 65417952 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65419265 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 65420140 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 65420452 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 65421058 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 65424675 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65424978 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 65427377 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 65427385 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 65427532 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 65428143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65428459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65428592 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65429631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65429909 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65429944 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65430680 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65431131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65431211 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 65431384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65431843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65432078 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 65432154 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 3 65432456 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.0666666666666667 0.8 0.133333333333333 14 16 1 12 2 3 65432557 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 65433210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65434293 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 65437232 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 65437385 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65437579 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 65439061 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 65439967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65439981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65440044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65440335 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65440379 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 65440935 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 65441460 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65441987 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 65442121 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65442347 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65442687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65443285 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 65444258 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 65444654 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65445054 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 65445711 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 65447263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65447622 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 65448682 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 65448965 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 65449064 G T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 65449332 A G N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 65449571 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 65449658 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 65449742 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 65450569 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65451187 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65451625 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 65451698 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 65451723 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 65451730 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 65452000 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 65452051 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 65452585 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65454386 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65455005 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65455380 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 65455736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65457951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65458950 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 65459011 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65459058 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65459098 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65459306 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 65459330 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 65460863 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 65461133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65461206 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65462662 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65463013 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 65463184 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 65464132 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 65464301 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 65464854 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 65464871 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 65465879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65466073 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 65466074 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 65466094 T A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 65468367 T A Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 65468587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65469124 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65469219 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65469796 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65470317 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 65470333 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 65471568 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 65473321 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65473432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65474784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65477262 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 65479503 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 65480645 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65481433 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 65481434 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 65481906 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 65482267 T G Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 65484317 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65485318 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 65485518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65486119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65489826 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 65490589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65493514 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 65495950 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65496024 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 65497272 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 65497594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65498192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65498350 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 65502681 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 65504784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65506123 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65509232 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65509626 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 65509811 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 65510673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65511145 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 65513837 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65513899 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 65514919 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 65515084 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 65515113 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65515146 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 65515262 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 65515337 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 65515439 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 65515552 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 65515593 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 65515701 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 65515759 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 65515779 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 65516151 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65516304 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 65516541 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 65516548 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 65516563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65516700 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65516708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65516781 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 65516826 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65517107 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65517154 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 65517229 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65517234 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 65517412 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65517455 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 65517644 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 65517665 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 65517853 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65517877 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65517964 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65518087 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65518275 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 65518295 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 65518475 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65518493 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 65518515 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 65518516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65518807 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 65518819 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65518842 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 65518918 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 65518938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65518948 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65518976 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 65518989 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 65518997 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 65519007 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 65519048 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65519183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65519239 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 65519262 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 65519333 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 65519598 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 65519803 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65519832 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 65519980 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 65520020 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65520044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65520045 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 65520151 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 65520299 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65520381 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65520506 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 65520597 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 65520615 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 65520746 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 65520846 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 65520955 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 65520970 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 65520971 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 65521071 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 65521143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65521501 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 65521668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65521692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65521716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65521831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65521846 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 65521867 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 65521949 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 65521954 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 65522037 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 65522227 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 65522316 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 65522340 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 65522376 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 65522387 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 65522436 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 65522489 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 65522624 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65522662 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65522686 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 65522824 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 65522836 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 65522904 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65523008 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65523082 A G Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 65523213 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65523263 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65523462 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 65523512 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65525339 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 65526268 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 65526411 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 65526963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65527059 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65527143 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65527601 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65527782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65527997 A T Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 65529806 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 65531295 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 65531467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65531802 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 65531871 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 65532118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65532303 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65532321 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 65532599 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 65532634 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 65532684 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65532731 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65532765 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 65532776 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65532789 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 65532803 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 65533085 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65533126 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 65533144 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 65533214 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 65533240 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 65533377 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 65533493 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 65533556 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 65533593 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 65533631 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 65533651 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 65533653 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 65533981 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 65533982 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 65533993 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 65534131 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65534165 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65534250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65534260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65534612 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 65534959 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 65534986 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 65535000 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 65535024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65535175 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 65535218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65535225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65535410 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65535802 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 65535864 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 65535942 T C N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 65536245 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 65536441 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 65536801 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 65537535 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 65537536 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 65537630 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 65537656 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 65537690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65537806 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 65537842 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 65538192 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 65540012 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 65540586 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 65540832 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 65540882 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 65541352 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 65541372 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 65541492 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 65541636 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 65541924 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 65542121 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 65542137 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 65542289 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 65542319 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 65542859 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65542908 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 65542951 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 65543053 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 65543167 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 65543436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65543504 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65543533 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 65543653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65543981 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 65544139 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65544172 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 65544216 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 65544316 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65544396 C G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.117647058823529 0.705882352941177 0.176470588235294 16 18 2 12 3 3 65544429 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 65544708 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 65544722 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65544833 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 65545004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65545029 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65545158 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 65545199 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65545212 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65545248 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65545461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65545580 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 65545650 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65545757 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65545886 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 65545910 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 65546077 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 3 65546143 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 65546154 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 65546390 T A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 65546430 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 65546464 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65546583 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 65546629 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 65546976 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 65547002 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 65547215 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 65547249 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 65547438 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 65547652 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 65548164 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 65548167 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 65548354 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 65549250 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65549328 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 65550214 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 65550324 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 65550329 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 65550342 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65550379 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 65550494 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 65550561 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 65550582 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 65550603 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 65550636 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 65550673 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 65550773 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 65550910 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 65550985 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65551065 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 65551309 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 3 65551456 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 65551470 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 65551475 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 65551504 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 65551616 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 65551658 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65551786 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 65551816 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 65552210 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 65552247 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 65552358 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 65552546 C A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 65552559 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 65552638 G T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 65553112 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 65553130 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 65553227 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 65553252 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 65553278 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 65553605 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 65553719 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 65553859 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 65554229 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 65554329 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 65554448 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65554522 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 65554524 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 65554573 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65554602 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65554860 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65554879 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 65554959 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 65555099 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 65555146 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 65555207 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 65555296 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 65555333 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 65555605 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 65555709 A G Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 65555753 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 65556200 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 65556216 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 65556242 G C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 65556350 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65556389 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 65556396 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 65556435 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65556448 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 65556460 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 65556479 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65556514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65556627 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65556911 T G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 65557026 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0 0.733333333333333 0.266666666666667 11 19 0 11 4 3 65557120 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65557144 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 65557203 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 65557236 A C Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 65557300 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.5 0.111111111111111 0.388888888888889 20 16 9 2 7 3 65557301 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 65557338 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65557350 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65557705 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65557721 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 65557790 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 65557872 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65557926 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65558053 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 65558090 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65558368 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 65558420 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65558441 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 65558451 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65558552 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65558570 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 65558675 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 65558705 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 65558799 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 65558883 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 65558949 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65559002 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 65559007 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 65559030 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65559046 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65559050 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 65559118 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65559172 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 65559229 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 65559501 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 65559533 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 65559567 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 65559575 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 65559593 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 65559627 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65559651 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 65566320 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 65566353 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 65566416 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65566749 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 65566755 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65566891 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 65567101 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 3 65567146 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65567179 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 65567183 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 65567208 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 65567283 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65567290 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 65567398 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65567437 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65567476 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 65567528 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 65567545 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65567550 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 65567683 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 65567803 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65567946 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 65568540 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 65568552 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65568933 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 65569094 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 65569410 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65569453 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 65569676 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 65569689 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65569883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65569884 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 65570479 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 65570804 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 65571427 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65571822 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 65571922 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 65572266 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 65574240 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 65574402 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 65574779 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 65575442 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65575876 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65576466 T G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 65577969 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65578008 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 65578284 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 65579114 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 65579654 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65579918 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65581429 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 65581501 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 65581659 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 65582284 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 65582667 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 65582692 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65582694 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 65583051 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 65583174 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 65583330 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65583578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65583836 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65584493 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65584564 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65585265 T A N N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 3 65586018 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65587106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65587858 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65588013 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65588904 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 65589567 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65590188 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 65591844 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 65592315 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 65593489 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 65593951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65594076 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 65594438 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65594795 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 65595385 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 65595943 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65596246 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 65596931 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 65597069 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 65598700 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65599690 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 65600625 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 65601580 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 65601672 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 65602877 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65603450 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65603864 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 65604908 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 65604948 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65605561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65605984 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65606735 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 65607286 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 65607822 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 65608017 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 65608187 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 65608237 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 65608582 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 65608729 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 65609416 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 65609592 A T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 65609725 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 65609746 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 65609826 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 65610002 G C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 65610064 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 65610227 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 65610321 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 65610364 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 65610409 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 65610734 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 65610786 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 65610951 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 65611212 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 65611237 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 65611287 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 65611294 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 65611656 C G N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 65611996 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 65612135 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 65612153 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 65612422 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65612495 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 65612698 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 65613106 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 65613290 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 65613350 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 65613660 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 65613677 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 65613767 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 65613897 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 65613901 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 65614005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65614054 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 65614067 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 65614085 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 65614119 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 65614198 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 65614221 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 65614308 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 65614376 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 65614379 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 65614389 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 65614455 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 65614457 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 65614648 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 65614757 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 65614831 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 65615127 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 65615277 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 65615391 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 3 65615402 A G N Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 3 65615501 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 12 6 3 6 0 3 65615509 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 3 65615532 A G N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 3 65615948 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 65615957 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 65616266 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 65616364 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 65616376 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 65616379 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 65616448 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 65616452 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 65616465 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 65616483 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 65616547 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 65616562 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 65616563 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 65616611 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 65616615 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 65616741 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 65616760 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 65616802 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 65616813 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 65616847 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 65616963 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 65616973 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 65616978 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 65617149 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 65617455 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 3 65617460 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 65617495 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 65617565 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65617581 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 65617590 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 65617812 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 65617892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65618103 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 65618202 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 65618220 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 65618340 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 65618401 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 65618482 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 65618567 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 65618686 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 65618721 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 3 65618834 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 65618845 C A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 3 65619036 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 65619046 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65619084 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65619122 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 65619124 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 65619300 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 65619349 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 65619358 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 65619547 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 65619645 A G N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 3 65619646 C T N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 3 65619730 T A N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 65620475 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 65620633 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 65620672 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 65620689 T C Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 65620839 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 65621155 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 65621176 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 65621271 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65622047 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65622184 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65622715 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65622984 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 65623745 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 65623784 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 65623884 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 65624353 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65624384 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 65624454 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 65624700 T C Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 65625318 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65627076 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 65627843 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 65627876 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 65628372 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 65628431 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 65628692 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 65629227 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 65629279 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 65629635 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 65630248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65631638 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 65633372 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65633754 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 65634385 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65635160 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 65635351 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 65635358 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 65635391 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 65635407 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 65635634 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 65635667 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 65635793 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 65636010 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 65636500 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 65636515 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 65636599 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65636675 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 65636992 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 65637024 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 65637534 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 65637547 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 65637643 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 65637736 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 3 65638592 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 65638857 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 65639364 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 65639490 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 65639521 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 65639765 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 65639974 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 65639984 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 65640035 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 65640089 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 65640240 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 65640334 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 65640428 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 65640573 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 65640806 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 65640944 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 65640982 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 65641035 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 65641278 A T N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 65641315 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 65641651 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 65641657 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 65641717 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 65641728 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 65641821 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 65641822 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 65641845 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 65641848 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 65641894 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 65641905 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 65641916 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 65641945 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 65641997 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 65642173 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 65642199 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 65642200 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 65642228 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 65642296 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 65642506 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 65642694 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 65642770 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 65642805 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 65642822 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 65642877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65642972 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 65643100 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 65643139 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 65643184 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 65643196 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 65643254 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 65643331 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 65643495 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 65643542 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 65643772 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65643922 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 65644026 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65644166 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65644443 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 65644605 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 65644987 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65645077 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 65645131 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65645362 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65645363 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65645469 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 65645822 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65645948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65646005 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 65646184 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 65646371 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 65646378 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 65646433 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65646500 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 65646551 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65646566 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65646586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65646671 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65646862 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 65646890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65647079 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65647140 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 65647291 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65647437 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 65647455 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65647485 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 65647501 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 65647557 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65647593 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65647603 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 65648264 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65648476 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65649135 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 65649416 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 65650267 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 65650504 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 65650733 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 65650846 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 65650944 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 65650981 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 65651075 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 65651122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65651319 T A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 65651382 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 65651385 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 65651570 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 65651660 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 65651802 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 65651881 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 65652380 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65652485 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 65652656 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65652774 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 65652794 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 65652915 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65653045 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 65653051 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 65653072 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65653099 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 65653124 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65653430 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65653496 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 65653517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65653578 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 65653640 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 65653654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65653967 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 65654052 A C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 65654166 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 65654243 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 65654293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65654317 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65654412 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 65654550 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 65654562 T G N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0 0.6875 0.3125 11 21 0 11 5 3 65654640 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65654704 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 65654948 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 65655054 G T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 65655145 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 65655173 C A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 65655189 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 65655475 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 65655653 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 65655878 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65656103 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65656181 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65656567 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65656682 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 65656717 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 65656737 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 65656753 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 65656764 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 65656855 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 65657119 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65657133 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 65657146 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 65657148 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 65657170 T C Y Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 65657429 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 65657637 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65658036 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 65658289 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 65658299 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65658636 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 65658657 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65658764 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65658780 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 65659338 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 65659404 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65659564 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65659645 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65659788 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 65660358 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 65660635 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65660869 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65661129 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 65661239 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65661663 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 65662140 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65662767 T C N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 3 65662780 T G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 65662841 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 65663096 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65663221 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65663418 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 65663676 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 65663777 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 65664057 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 65664145 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65664210 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 65664249 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 65664423 C T N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 3 65664582 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 65664643 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 65664726 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65664877 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 65664945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65665006 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 65665090 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65665351 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65665356 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65665365 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65665801 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 65665866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65666415 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 65667411 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65668426 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65669683 T G Y N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 3 65671559 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65672491 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65672787 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65672972 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65674171 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65674705 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 65676924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65677763 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65678447 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 65678507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65681378 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 65681445 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 65684259 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 65684581 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 65684602 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 65684797 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 65685651 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 65685660 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 65685750 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 65685765 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 65685861 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 65685913 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 3 65685927 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 65685939 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 65686107 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 3 65686195 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65686291 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 65686354 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 65686393 G C Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 65686658 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 65686672 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 65686726 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65687018 A G Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 65687180 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 65687186 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 65687445 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 65687870 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65687963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65688555 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 65689119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65689374 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 65689857 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65690298 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 65690343 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 65691391 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 65691419 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 65691629 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 65691935 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 65692505 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65692719 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 65693443 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 65693762 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 65693813 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65694004 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65694008 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65694068 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 65694330 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 65694354 T C Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 3 65694444 C G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 65694557 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 65694577 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 65694634 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65694663 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65694665 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 65694749 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65694801 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65694925 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 65695190 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65695350 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 65695428 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65695505 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65695511 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 65695583 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 65695762 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 65695866 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 65695903 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 65695992 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 65696004 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 65696029 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 65696110 G A N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 3 65696195 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 65696551 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65696658 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65696906 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 65697072 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 65697074 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 65697271 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 65697466 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65697584 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65697836 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 65698315 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65699046 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 65701639 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 65701955 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65702486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65702715 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 65703030 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65703996 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65706187 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 65706751 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65707066 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 65707587 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65708649 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65708900 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65709473 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 65709668 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 65710299 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 65710716 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 65710756 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 65710761 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 65711297 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65711334 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 65712550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65717001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65718102 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65719322 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65719352 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 65719677 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 65720008 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65720033 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65720057 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 65720118 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65720523 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 65720607 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65720611 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 65720721 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 65720832 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 65720876 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 65720896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65720997 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65721241 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 65722008 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 65723149 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 65723271 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 65723286 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 65723300 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65723609 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 65723719 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 65723848 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 3 65723867 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 65723894 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 65723896 T C Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 65723950 C G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 65723951 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 65724072 G A N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 3 65724088 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 65724334 G A N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 3 65724348 A G N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 3 65724422 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 65724496 T A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 65724614 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 65724768 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 65724795 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 65725033 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65725046 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 65725117 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 65725153 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65725171 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65725189 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65725260 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 65725419 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 65725428 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 65725496 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 65725497 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 65725532 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65725547 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 65725563 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65725616 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65725622 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 65725642 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 65725673 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65725749 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 65725923 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 65726120 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 65726142 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 65726454 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 65726478 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 65726553 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 65726604 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65726847 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 65726875 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 65726919 G T N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 65727034 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 65727170 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 65727253 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65727303 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 65727705 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 65727751 A G N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 65727988 T A N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 65728144 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 65728432 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65728616 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65728666 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65728833 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 65728953 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 65728954 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 65729099 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 65729198 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65729222 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65729290 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65729306 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 65729311 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 65729506 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 65730045 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65730168 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 65730174 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 65730241 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65730247 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65730762 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 65731284 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 65731406 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 65731434 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 65732885 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65732952 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 65733326 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 65733967 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 65734046 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65734129 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65734595 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65735126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65736416 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 65737113 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65739763 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65740023 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 65740392 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 65740826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65741033 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 65741150 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 65742237 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65742604 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65743195 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 65743689 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 65743700 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 65745831 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65746728 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 65746939 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65746992 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65748048 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 65748945 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 65749197 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 65749201 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 65749479 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65750470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65752943 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 65753903 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 65753909 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 65753916 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65753998 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65754011 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 65754492 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 65754831 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 65755653 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 65756992 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 65757467 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 65760189 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 65761372 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65761401 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65763814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65763843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65764726 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 65767796 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 65769010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65769056 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 65770108 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 65770457 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 65770854 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65771078 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65771670 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65772479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65772869 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65773275 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 65773387 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65773426 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 65773437 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 65773482 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 65773535 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 65773752 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65773923 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 65773997 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 65774002 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 65774265 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65774331 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 65774358 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 65774369 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65774555 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65774615 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 65774768 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 65774827 C A Y N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 3 65774913 T A N N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 3 65774971 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 65775030 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 65775205 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 65775221 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 65775264 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 65775300 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 65775320 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 65775380 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 65775551 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65775591 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65775640 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65775644 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65775987 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 65776361 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 65776431 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 65776567 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 65776578 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 65776623 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 65776643 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 65776716 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 65777136 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 65777148 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 65777324 C T N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 7 9 0 7 1 3 65777394 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 65777454 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 65777553 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 65777694 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 65777846 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 65777969 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 65778116 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 65778413 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 65778627 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 65778632 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 65778642 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 65778660 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 65778701 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65778795 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 65778817 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 65778928 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 65778940 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 65778945 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 65779058 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 65779068 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 65779213 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 65779238 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65779401 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 65779973 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65780072 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65780445 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 65780512 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 65780643 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 65780844 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 65781155 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 65781170 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 65781179 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 65781217 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 65781339 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 65781403 C T N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 3 65781448 C T Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 65781790 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65781847 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65782510 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65782531 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 65782532 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 65782582 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65782900 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 65782958 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 65783240 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 65783256 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 65783569 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 65784026 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 65784274 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 65784275 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 65784515 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65785318 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 65785369 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 65785820 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 65786078 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 65786726 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65787075 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 65787105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65787176 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65787347 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 65787587 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 65787707 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 65787715 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 65787733 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 65787897 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 65787988 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 65788057 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 65788242 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 65788245 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 65788343 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 65788506 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 65788625 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 65788733 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 65788753 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 65788844 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 65788945 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 65788952 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 65789089 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 65789436 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 65789492 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65789508 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65789570 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65789574 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 65789620 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65789652 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 65789681 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 65789705 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 65789709 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65789716 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 65789778 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65789794 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 65789965 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 65790287 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 65790293 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 65790298 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 65790390 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 65790521 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 65790741 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65790863 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65790964 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 65790965 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 65790992 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 65791033 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 65791145 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65791367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65791574 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 65791908 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65792648 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65792994 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65792995 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65793015 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65793022 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65793039 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65793244 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 65793261 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65793314 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 65793332 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65793440 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65793450 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65793473 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65793486 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65793517 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65793647 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 65793696 A G N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 0.153846153846154 0.153846153846154 20 6 9 2 2 3 65793705 G A N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 3 65794063 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 65794136 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 65794182 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 65794218 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65794244 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 65794266 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 65794280 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 65794309 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 65794400 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 65794431 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 65794443 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 65794543 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65794549 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65794569 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65794571 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65794852 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65794952 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65794984 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65795287 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 65795601 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65795783 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65795813 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 65795880 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65795992 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 65796049 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65796060 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 65796164 G A N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 3 65796171 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 65796200 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 65796213 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 3 65796308 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 65796326 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 65796345 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 65796382 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 65796439 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 65796464 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65796533 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 65796674 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 65796733 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65796775 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65796870 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65796871 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65796884 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65797498 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65797612 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 65797625 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 65797636 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 65797693 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 65797699 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 65797707 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 65797957 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65798091 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 65798792 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65798955 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 65799020 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65799046 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65799085 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 65799207 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 65799210 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65799417 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65799444 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65799460 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65799497 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 65799558 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65800114 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65800278 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 65800298 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 65800354 A C Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 65800362 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 65800373 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 65800519 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 3 65800779 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 65801490 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65801557 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 65801580 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65801645 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 65801732 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 65801812 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 65801844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65801862 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 65801874 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 65801882 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65801906 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 65801979 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65802024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65802149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65802276 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 65802281 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65802364 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 65802498 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 65802565 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 65802568 C T Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 65802576 G T Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 65802624 C T Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 65802635 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 65802657 C T N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 3 65802685 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 65802698 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 65802722 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 65802724 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 65803176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65803344 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 65803510 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65803543 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65803573 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65803680 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 65803761 T C N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 10 10 4 2 4 3 65803762 G A N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 10 10 4 2 4 3 65804030 C T N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 12 8 4 4 2 3 65804049 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 65804102 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 65804108 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 65804174 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 65804206 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 65805272 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 65805422 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 65807487 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 65807629 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 65807911 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 65808169 A G Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 65808218 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 65808541 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 65808546 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 65809099 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 65809229 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 65810711 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65810783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65810952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65811356 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65811576 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 65811664 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65812166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65812650 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65813182 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 65813370 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 65813909 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 65814018 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 65814029 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 65814085 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 65814118 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65814120 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65814136 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 65814198 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 65814260 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65814261 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 65814279 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 65814307 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 65814321 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 65814345 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65814351 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 65814584 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 65814655 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 65814686 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 65814799 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 65814859 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 65815010 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 65815067 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 65815253 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65815438 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 65815603 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 65815610 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 65815661 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 65815819 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 65815892 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 65816220 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 65816263 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 65816369 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 65816650 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 65816711 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 65816762 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 65817323 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 65817569 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65817951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65817976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65818116 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65818425 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 65818917 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65819088 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65819809 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65820710 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 65821406 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65821524 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 65821528 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65821690 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65821807 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65821815 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65821950 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65822116 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 65822167 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 65822299 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 65822332 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 65822346 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 65822468 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65822647 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65822661 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65822696 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65822764 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65822768 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65822783 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65822800 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65822824 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 65822848 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 65822876 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 65822882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65822918 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65822925 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65823086 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 65823186 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65823302 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65823404 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 65823534 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 65823921 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65824094 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 65824515 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65824521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65825572 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 65825732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65825733 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 65826194 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65826408 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 65826624 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65828836 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 65828953 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 65829743 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65829829 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65829896 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 65830050 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65830170 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 65830466 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 65830494 A T N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 65830496 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 65830644 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 65830656 G A N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 65830687 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 65830718 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 65830741 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 65830820 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 65830852 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 65830912 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65831073 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65831135 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 65831237 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 65831349 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 65831497 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65831520 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65831524 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 65831546 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 65831636 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 65831692 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 65831705 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 65831860 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 65832003 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65832039 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65832043 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65832059 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 65832129 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65832137 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65832188 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65832241 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 65832467 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 65832500 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65832694 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 65832695 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 65832737 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 65832758 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 65832918 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 65832924 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65833157 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65833162 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 65833366 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 65833421 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 65833449 A T N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 3 65833471 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 65835069 G A N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 3 65835115 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 65835208 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65835209 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65835281 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65835349 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 65835458 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 65835540 G A N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.545454545454545 0.272727272727273 0.181818181818182 15 7 6 3 2 3 65835567 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65835587 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 65835669 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65835748 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 65836056 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 65836057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65836082 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 65836203 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 65836557 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 65836889 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 65836936 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 65836989 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 65836991 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 65837018 C G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 65837060 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 65837065 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 65837199 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 65837215 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 65837299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65837331 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 65837362 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 65837527 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 65837988 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65838372 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 65838650 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65838659 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65838681 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 65838687 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65838922 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65839051 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65839267 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 65839290 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65839851 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 65839879 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 65839909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65839960 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 65840052 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 65840057 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 65840072 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 65840685 A G Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 65841819 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65842050 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 65842077 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 65842474 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65842488 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65842674 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 65842752 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 65842824 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 65842888 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65842896 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65843014 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65843101 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 65843122 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65843123 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65843147 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65843302 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 65843313 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 65843323 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 65843340 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 65843354 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 65843424 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 65843430 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 65843455 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 65843553 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65843696 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 65843894 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 65843990 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 65844018 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65844159 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65844206 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 65844277 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65844356 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 65844671 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65844853 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 65845008 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 3 65845058 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 65845206 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 65845475 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 65845591 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 65846272 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 65846332 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65846355 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.1 0.7 0.2 18 22 2 14 4 3 65846505 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.1 0.7 0.2 18 22 2 14 4 3 65846510 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 65846573 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 65846642 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 65846701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65847509 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 65847578 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 65848655 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 65849002 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65849017 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 65849039 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 65849190 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 65849528 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65850198 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 65851176 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 65851536 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65851560 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 65852362 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65852699 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65853016 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 65853092 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 65853119 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65853142 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 65853201 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65853459 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 65853690 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 65853692 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 65854157 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 65854187 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 65854412 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 65854521 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65854732 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 65854772 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 65854844 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 65855137 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 65855532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65855552 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 65855655 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65855658 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65855720 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65855723 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65855791 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65855820 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65855824 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65855954 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65855976 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65856006 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65856166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65856324 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65856353 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65856354 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65856430 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 65856501 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 65856690 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 65856699 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 65857003 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 65857277 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65858243 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 65858672 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 65858730 A C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 65859212 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 65859219 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 65859419 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 65859541 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 65859691 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 65859816 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 65860147 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 65860154 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 65860579 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 3 65861245 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65861676 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 65861739 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 65861742 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 65861984 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 65863402 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 65864227 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65865027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65865567 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 65866326 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 65868031 C G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 3 65868043 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 65868047 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65868069 G C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 65868413 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 65868762 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 3 65868953 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65869408 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65871413 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65871469 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 65871831 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65871875 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65872174 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 65872198 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 65872416 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 65872495 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 65872796 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 65872804 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 65872837 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 65872939 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 65872980 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 65873025 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 65873169 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65873259 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 65873332 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 65873415 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 65873428 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 65873465 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 65873472 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 65873487 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 65873655 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 65873712 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 65873845 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 65873867 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 65873920 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 65873969 G C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 65873985 A T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 65873993 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 65874042 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 65874052 G T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 65874093 A T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 65874188 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 65874223 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 65874250 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 65874306 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 65874447 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 65874468 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 3 65874947 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 65882162 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 65882182 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 65882671 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 65882718 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 65882796 T C N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 3 65882946 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65883469 A C Y N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 65883563 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 65883804 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 65883921 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65884713 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 65884732 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 65884877 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 65884887 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 65884911 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 65884944 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65885076 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 65885280 C T N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 65885389 G A N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 65885460 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 65885902 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65885959 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65885978 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 65886390 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 65886439 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 65886678 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 65886694 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 65886782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65886810 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65887342 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 65887403 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 65887457 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 65887730 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 65887765 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 65887909 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 65887917 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65888058 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 65889171 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65890400 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65891855 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65892677 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 65892822 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 65892846 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 65892909 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 65893476 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 65893815 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65894111 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 65894200 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65894325 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 65894351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65894371 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 65894459 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 65894525 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65894561 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 65894985 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65897590 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65898059 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 3 65899961 T A Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 65900937 C A Y N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 65901971 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 65901994 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 65902249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65904253 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65904418 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 65904452 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65904553 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 65904611 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 65905591 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 65905620 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 65905697 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 65905764 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 65906167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65906252 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65906296 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65906638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65906870 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65907130 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 65907946 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 65908195 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 65908207 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 65908375 A G N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.1 0.7 0.2 9 11 1 7 2 3 65908500 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 65908546 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 65908590 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 65908611 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 65908776 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 65908802 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 65908981 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 65909058 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 65909321 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65909340 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65909618 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 65909657 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65909681 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 65910036 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65910095 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 65910159 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 65910254 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 65910270 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 65910396 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65910618 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 65910621 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 65910835 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 65910873 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 65910901 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 65910927 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65910961 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 65911032 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65911036 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65911080 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65911084 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65911136 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65911178 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 65911200 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65911218 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 65911219 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 65911285 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65911292 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65911357 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65911378 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65911392 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65911471 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 65911622 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 65911728 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65911794 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65911795 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65911842 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65911883 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 65911969 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65911970 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65912045 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 65912092 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65912260 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65912267 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65912282 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 65912341 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 65912346 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65912400 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 65912780 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 65912939 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 65913138 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 65913304 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65913356 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65913393 G T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 65913830 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 65914092 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65914209 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 65916614 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 65917621 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 65918203 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65918758 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 65919365 C G N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 65919768 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65922185 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 65922219 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 65922245 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 65922321 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 65922357 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 65922376 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 65922436 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 65922704 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 65922948 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 65923048 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 65923111 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 65923194 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 65923427 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 65923521 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 65924295 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 65924402 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65924468 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65924492 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65924512 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65924520 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65924682 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65924807 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65924873 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65924941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65924942 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65924953 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65925022 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65925087 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65925110 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65925264 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65925321 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 65925364 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 65925417 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65925479 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65925557 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65925563 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65925670 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 65925933 T C Y Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 3 65926065 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 65926080 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 65926452 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 65926503 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 65926568 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 65926804 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 65926972 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 65927401 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 65927709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65927845 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 65928067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65928209 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 65928294 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65928306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65928328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65928621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65929629 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 65931219 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 65931735 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65933511 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 65934008 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 65934102 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 65934349 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65934633 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 65934746 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65935713 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65936338 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 65936354 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 65936356 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 65936495 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 65936505 C G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 65936548 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 65936554 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 65936578 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 65936610 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 65936618 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 65936691 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 65936961 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 65937207 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 65937230 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65937306 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65938356 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 65938357 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 65939335 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 65939384 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 65939444 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 65939521 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 65939542 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 65940397 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 65940401 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 65941426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65941545 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 65941969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65942080 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 65942160 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 65942391 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 65942496 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 65942586 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 65942801 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65942838 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 65942931 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 65942935 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 65942990 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 65943002 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 65943012 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65943026 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65943040 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 65943106 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 65943162 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 65943187 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 65943271 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 65943308 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 65943309 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 65943360 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 65943459 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 65943539 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 65943542 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 65943625 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 65943802 A T N N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.333333333333333 0.25 0.416666666666667 11 13 4 3 5 3 65944098 A G Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 65944145 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 7 5 3 1 2 3 65944374 C T Y Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.5 0.125 0.375 9 7 4 1 3 3 65945058 T A Y N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 65946301 C G Y N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 65946402 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 3 65947334 G C Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 65947352 T G Y N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 5 5 2 1 2 3 65947727 G A Y Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 65948352 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.583333333333333 0.166666666666667 0.25 16 8 7 2 3 3 65948409 G C Y N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 3 65948423 G A Y Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 65949333 T C Y Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 3 65949355 T A Y N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 3 65949379 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 65949415 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 65949488 T G Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 65949546 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 65949591 A G N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.384615384615385 0.230769230769231 0.384615384615385 13 13 5 3 5 3 65949634 G T N N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 3 65949714 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 65949792 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 65949865 T A N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 65950048 T C N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 3 65950087 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 65950160 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 65950233 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 65950287 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 65950343 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 65950405 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 65950413 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 65950418 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 65950470 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 65950501 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 65950794 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 65950804 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 65950825 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 65950827 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 65950869 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 65950881 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 65950922 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 65950949 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 65950995 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 65950998 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 65951190 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 65951198 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 65951244 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 65951305 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 65951321 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 65951347 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 65951352 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65951377 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 65951464 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 65951485 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 65951500 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 65951513 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 65951624 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 65951840 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 65951968 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 3 65952023 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 65952039 G T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 65952070 G T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 65952172 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65952182 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 65952199 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 65952242 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 65952285 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 65952290 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 65952357 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 65952429 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 65952721 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 65952723 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 65952752 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 65952890 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 65952914 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 65952933 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 65953054 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 65953213 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 65953218 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 65953244 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 65953318 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 65953359 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 65953575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65953596 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 65953709 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 65953741 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 65953742 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65953762 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65953853 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65953878 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65953915 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65953954 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 65953981 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 65954010 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65954020 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65954063 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 65954279 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 65954289 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65954348 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65954382 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65954415 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65954462 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65954556 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65954573 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65954580 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 65954624 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 65954632 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65954644 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 65954651 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65954787 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65954817 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 65954827 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 65955020 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 65955054 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 65955105 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 65955142 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65955176 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 65955259 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 65955282 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65955290 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 65955312 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65955315 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65955324 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65955329 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65955345 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65955346 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65955434 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 65955459 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65955496 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 65955545 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 65955656 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 65955660 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 65955678 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 65955686 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65955741 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 65955882 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 65955983 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65956085 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 65956091 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 65956097 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 65956104 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65956118 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 65956235 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 65956309 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65956337 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 65956479 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 65956534 T A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 65956545 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 65956568 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 65956645 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 65956780 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 65956818 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 65956884 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 65956981 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 65957083 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 65957166 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 65957211 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 65957309 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 65957322 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 65957337 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 65957444 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 65957521 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 65957528 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 65957552 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 65957652 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 65957742 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 65957877 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 65957928 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 65957961 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 65957962 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 65958017 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 65958028 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 65958049 A T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 65958091 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 65958484 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 65958503 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 65958770 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 65958772 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 65958866 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 65959031 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 65959273 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 65959766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65959882 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 65959909 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65960014 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65960285 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 65960529 T A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 65960588 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 65960874 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 65961112 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 65961264 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 65961331 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 65961405 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 65961651 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 65961946 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65962020 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 65962189 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 65962747 C T N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 3 65962750 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 65963557 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65965030 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 65965060 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 65965153 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 65965186 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 65965264 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 65965290 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 65965322 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 65965399 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 65966582 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 65966600 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 65966639 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 65966817 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65966971 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 65967020 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 65967134 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 65967196 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 65967348 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 65967633 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 65967641 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 65967799 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 65967886 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 65967930 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 65968006 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 65968440 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 65968819 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 65969203 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 65970536 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 65970699 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 65971931 G A N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 3 65972952 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 65973083 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65973630 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65974822 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 65975171 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 65975271 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 65975487 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65975563 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 65976674 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 65977970 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 65978033 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 65978858 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 65980945 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 65981004 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 65983124 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 65983157 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 65983378 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 65983583 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 65983706 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65984349 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 65984654 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65984877 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 65985435 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 65985524 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 65985562 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65986057 C T N Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 3 65986093 C T N Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 3 65986361 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 65986983 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 65987451 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 65987604 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 65987675 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 65987872 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 65987911 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 65988019 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 65988793 G A N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.272727272727273 0.181818181818182 0.545454545454545 8 14 3 2 6 3 65988990 C T N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 6 14 2 2 6 3 65989005 G A N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 65989031 A G N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 3 65989245 C T N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 3 65989276 C T N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 3 65989302 C G N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.230769230769231 19 7 9 1 3 3 65989416 G A N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 9 15 3 3 6 3 65989584 T C N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 9 15 3 3 6 3 65990099 G A N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 3 65990117 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 65990196 C T Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 65990321 T C N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 3 65990351 T G N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 65990406 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 3 65990628 G T Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 65990837 C A N N 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 3 65992040 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 65992211 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 65993322 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 65993582 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 65994187 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 65994669 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 65994706 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 65994754 G C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 65994851 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 65994855 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 65994916 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 65995241 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 65995253 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 65995258 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 65995340 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 65997047 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 65997209 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 65997482 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 65998049 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 65999325 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 65999455 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 65999646 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65999666 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 65999692 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65999720 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65999827 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65999870 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 65999920 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 65999960 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66000097 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66000100 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66000113 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66000249 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66000499 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 66000588 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66000762 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66000813 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 66000868 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66000900 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66000942 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 66001120 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 66001137 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 66001568 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66001863 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66001897 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 66001959 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66002189 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 66002565 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 66002692 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 66003240 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 66004370 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 66004608 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 66004617 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 66004703 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 66004838 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 66004888 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 66004889 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 66004932 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 66004959 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 66005080 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 66005211 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 66005225 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 66005261 G C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 66005511 A G N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 3 66005937 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 66005955 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 66005996 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66006451 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66006773 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 66006943 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66006995 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 66007896 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 66008319 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 66008881 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 66010628 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 66010818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66010966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66011099 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 66012020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66012197 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 66012328 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 66012359 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 66012400 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 66012408 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 66012438 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 66012595 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 66012712 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 66012847 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66013048 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 66013178 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66013354 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 66013389 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 66013564 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66014006 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66014010 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 66014027 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66014094 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 66014175 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 66014189 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 66014236 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 66014260 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 66014309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66014322 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 66014351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66014456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66014488 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 66014503 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 66014548 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 66014629 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 66014648 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 66014695 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 66014705 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 66014799 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 66014991 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66015002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66015081 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66015178 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 66015265 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66015334 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66015348 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66015620 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 66015723 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66015807 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 66015843 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 66016133 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 66016162 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 66016175 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 66016179 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 66016198 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 66016444 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 66016445 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 66016511 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 66016559 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 66016569 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 66016585 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 66016684 T G N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 3 66017276 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 66017364 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 66017425 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 66017446 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 66017454 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66017475 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66017599 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 66017611 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 66017671 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 66017673 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 66017930 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 3 66017951 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 66017971 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 66018042 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 66018160 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 66018238 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 66018398 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 66018553 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66018573 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 66018639 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 66018719 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66018789 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 66018826 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66018932 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66019005 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66019123 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66019265 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 66019519 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 66019629 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66019694 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66019877 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66019909 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 66019937 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66020025 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 66020062 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66020225 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66020777 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 66020787 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66020881 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 66020909 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66020932 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 66021025 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 66021166 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 66021184 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 66021532 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66021590 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66021690 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 66021765 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 66022050 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66022100 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66022131 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66022153 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 66022202 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 66022508 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 66022533 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 66022588 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 66022680 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 66022768 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 66022799 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 66022893 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 66022963 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 66022976 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 66022995 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 66023031 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 66023038 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 66023092 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 66023593 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 66023858 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 66023898 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 66023931 T G N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 3 66024101 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 66024479 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 66024502 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66024566 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66024660 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 66024827 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 66024865 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 66024942 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 66024988 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 66025040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66025105 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 66025347 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 66025378 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66025408 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 66025511 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 66025605 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 66025813 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66025836 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66025851 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66025918 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66025957 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66025966 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66025969 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 66026010 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 66026027 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 66026028 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 66026072 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66026149 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 66026189 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 66026232 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 66026312 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 66026348 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 66026376 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 66026387 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 66026434 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 66026701 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66026738 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 66026792 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 66027238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66027241 T A Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 66027283 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 66027481 C A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 66027650 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66027787 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 66027854 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 66027879 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 66027902 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 66028032 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 66028079 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 66028206 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 66028240 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 66028292 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 66028322 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 66028338 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 66028400 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 66028420 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66028531 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 66028893 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66029026 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 66029191 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 66029261 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 66029759 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 66029833 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 66029844 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 66029875 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 66029931 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 66030000 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 66030054 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 66030077 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 66030172 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 66037354 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 66037382 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 66037445 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 66037571 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 66037791 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 66038162 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66038298 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66038326 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 66038668 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 66038735 A T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 66038959 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 66039069 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 66039078 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66039162 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 66039194 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 66039295 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 66039375 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 66039569 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 66039779 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 66039784 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 66039840 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 66039873 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 66039887 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 66039927 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 66039930 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 66039950 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 66039989 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 66040003 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 66040077 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 66040079 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 66040096 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 66040254 T C Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 66040305 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 66040515 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 66040648 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 66040862 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 66040887 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 66040924 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 66040961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66041168 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 66041266 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 66041355 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 66041365 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 66041502 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 66041525 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66041555 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 66041580 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 66041780 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 66041817 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66041860 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 66041903 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 66041965 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 66041966 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 66042011 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 66042208 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 66042434 T G Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 66042696 G A Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 66042748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66043565 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 66043566 T A Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 66043801 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 66044319 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 66044379 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66044428 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 66044498 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 66044958 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 66045137 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 66045897 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 66046197 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66046481 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 66046554 T G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 66046857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66047088 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66047308 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 66047354 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 66047413 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 66047472 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 66047497 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 66047553 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 66047561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66047571 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 66047659 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 66047671 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 66047680 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 66047761 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 66047767 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 66047837 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 66047888 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 66047996 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 66048016 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 66048029 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 66048147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66048227 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 66048278 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 66048391 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 66048601 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66048923 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 66049033 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 66049066 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66049080 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 66049327 G A N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 3 66049330 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 66049375 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 66049377 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 66049484 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 66049517 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 66050162 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 66050235 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 66050478 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 3 66050571 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 66050669 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66050848 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 66051770 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 66051840 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66051879 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66051886 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 66051895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66052082 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 66052161 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66052177 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 66052453 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 66052505 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 66052517 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 66052622 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 66052650 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 66052653 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 66052669 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66052720 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 66052734 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 66052761 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66052817 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66052916 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 66053168 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66053186 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66053306 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 66053332 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 66053887 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66054099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66054117 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 66054126 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66054140 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 66054144 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 66054443 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 66054465 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 66054495 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 66054525 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 66054555 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66054578 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 66054816 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66054910 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 66055107 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 66055120 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 66055189 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 66055221 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 66055473 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 66055539 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 66055545 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 66055609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66055660 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66055750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66055835 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 66055949 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 66056317 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 66056470 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 66056488 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 66056638 C A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 66056772 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 66056774 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 66057523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66057810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66057910 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 66058121 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 66058387 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 66058412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66058502 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 66058609 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 66059142 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66059192 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66059203 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 66059251 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66059252 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66059292 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66059395 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66059399 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 66059578 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66059929 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 66060053 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66060099 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66060182 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 66060324 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 66060371 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 66060487 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 66060488 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 66060616 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66060674 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 66060688 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 66060723 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66060735 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 66060744 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 66061350 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 66061469 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 66061749 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 66061776 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 66061891 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 66061984 T C N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 3 66062239 G T N N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 66062247 C T N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 3 66062583 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 66062616 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 66062664 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 66062691 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 66062956 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 66063047 C G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 66063049 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 18 14 4 10 2 3 66063063 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 66063186 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 66063455 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66063467 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66063510 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66063719 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66063724 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66063779 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 66063803 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 66063846 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 66063864 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 66063951 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66064003 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 66064061 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 66064182 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66064231 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66064372 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 66064381 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 66064388 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 66064415 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 66064451 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66064526 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 66064542 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 66064553 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 66064668 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66064800 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 3 66064825 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66064885 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66064941 G A N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 66064979 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 66065107 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 66065129 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 66065155 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 66065164 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 66065183 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 66065239 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 66065263 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 66065771 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 66065937 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 66065988 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 66066029 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 66066031 G T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 66066140 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 66066168 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66066292 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66066617 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 66066703 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 66066752 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 66066862 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 66066896 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 66067289 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 66068254 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 66068409 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 66068531 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 66068690 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 66068805 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 66068854 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 66069087 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 66069110 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 66069149 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 66069254 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 66069275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66069339 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 66069567 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 66070061 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 66070105 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 66070174 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 66070263 C A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 66070290 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 66070295 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 66070365 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 66070370 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 66070378 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 66070381 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 66070583 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 66070686 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 66070688 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 66070782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66070820 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 66072543 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 66072690 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 66072700 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 66072751 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 66072854 A G N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 66079144 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 66079167 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 66079220 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 66079228 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 66079316 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 66079451 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 66079884 A G Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 66080975 T A Y N 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.333333333333333 0.111111111111111 0.555555555555556 7 11 3 1 5 3 66084905 T G Y N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 66085619 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 66085623 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 66085631 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 66085670 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 66085691 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 66085831 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 66085852 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 66085917 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 66085971 C G N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 66086009 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 66086049 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 66086075 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 66086548 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 66086602 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 66086784 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 66086789 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 66086807 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 66087049 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 66087056 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 66087127 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 66087227 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 66087282 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 66087297 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 66087682 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 66087712 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 66087723 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 66087807 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 66087857 A G N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 3 66087937 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 66087940 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 66087953 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 66087981 A T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 66087984 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 66089512 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 66089634 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 66089635 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 66089671 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 66089672 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 66089721 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 66089722 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 66089734 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 66090279 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 66090314 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66090394 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 66090473 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 66090489 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 66090931 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 66090948 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 66090972 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 66091004 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 66091076 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 66091077 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 66091105 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 66091291 T C Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 66091528 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 66091547 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 66091657 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 66091739 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 66091816 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 66092335 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 66092501 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 66092569 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 66092609 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 66092869 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 66092889 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 66092936 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 66092951 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 66092989 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 66093128 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 66093207 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 66093219 A C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 66093343 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66093366 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 66093377 G C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 66093443 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 66093561 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 66093655 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 66093657 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 66093827 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 66094010 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 66094055 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 66094107 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 66094126 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 66094156 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 66094236 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 66094243 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66094357 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 66094421 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 66094483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66094522 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 66094578 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 66094641 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 66094706 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66094739 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 66094798 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 66094872 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 66094997 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 66095108 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 66095117 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 66095137 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 66095529 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 66095662 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 66095844 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 66095967 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66095981 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66096056 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 66096201 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66096454 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 66096573 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 66096574 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 66096856 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66096909 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 66097034 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 66097078 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 66097266 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 66097351 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 66097365 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 66097467 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66097488 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 66097503 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 66097517 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 66097528 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 66097580 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 66097664 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 66097928 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 66098021 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 66098092 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 66098151 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 66098190 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 66098286 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 66098316 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 66098416 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 66098673 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 66098725 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 66098841 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 66098952 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 66099080 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 66099092 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 66099168 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 66099202 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 66099351 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 66099379 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 66099928 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66099964 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 66100191 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 66100478 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 66100487 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 66101526 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 66101795 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66102187 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 66102232 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66102440 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 66102621 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66102751 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 66103546 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 66103579 C G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 66104271 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 66104341 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 66104426 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 66104431 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 66104456 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 66104466 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 66104539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66104590 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 66104741 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 66104822 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 66104865 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 66104872 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 66104940 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 66104941 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 66105071 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 66105238 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 66105517 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 66105596 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 66105597 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 66105613 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 66106037 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 66106655 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 66107023 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 66107861 A C N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 3 66107940 A T N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 66108028 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66108298 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66108633 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66108774 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 66109630 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66110317 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66110475 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 66110531 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 66110737 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 66110753 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 66110927 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 66111139 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 66111678 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 66111833 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 66112159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66112532 A T N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 3 66112533 A T N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 66113217 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66113670 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 66114340 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 66114497 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 66114557 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 66118462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66118646 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 66118941 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 66118983 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 66119591 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 66119841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66120308 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 66120537 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66120875 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 66120911 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 66121045 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 66121105 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66121218 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66121246 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 66121693 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 66121963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66121982 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 66122147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66122490 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66122738 A G N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 66122792 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 66123277 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 66123609 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 66123652 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 66123810 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 66124167 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 66124194 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 66124230 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 66124309 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 66124431 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 66124447 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66124519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66124571 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 66124721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66124929 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66125020 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 66125743 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 66125804 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 66125815 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 66126219 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 66126556 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66126969 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66127372 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 66127846 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 66128576 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66128577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66128678 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 66128679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66128724 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 66129516 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 66130760 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 66130920 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 66131109 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66131988 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 66132233 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 66132245 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 66132340 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 66132381 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 66132516 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 66132582 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 66132665 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 66132910 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 66133089 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 66133266 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 66133522 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 66133849 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 66133994 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 66134148 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 66134271 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 66134351 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 66134525 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 66134541 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 66134623 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 66134659 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 66134833 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 66134847 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 66134947 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 66135049 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 66135105 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 66135146 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 66135197 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 66135243 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 66135441 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 66135442 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 66135454 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 66135483 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 66135539 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 66135559 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 66135592 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 66135717 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66135961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66136047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66136220 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 66136437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66136523 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 66136641 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 66136947 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 66137238 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66137239 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 66137383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66137506 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66137509 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66137711 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 66137720 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 66137848 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 66137853 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 66137876 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 66137882 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66137903 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 66137931 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 66137954 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 66137986 G T N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 66138043 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 66138078 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 66138106 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 66138159 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 66138213 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 66138440 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 66138592 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 66138625 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66138880 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 66138960 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 66139052 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 66139164 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 66139177 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66139209 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 66139263 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66139487 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 66139501 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 66139540 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 66139640 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66139713 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 66139773 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66139828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66139829 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66139842 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 66139851 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 66139884 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66140233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66140343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66140350 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66141295 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 66141715 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 66141742 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 66141752 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66142345 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66142381 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 66142391 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66142580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66142623 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 66142994 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 66143037 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 66143189 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 66143333 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 66143494 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66143519 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 66143536 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 66143735 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 66143987 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 66144149 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 66144245 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 66144289 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 66144789 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 66144912 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 66145026 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 66145137 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 66145514 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 66145545 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 66145558 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 66145767 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 66145878 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 66145901 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 66146029 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66146571 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 66147354 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 66147389 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 66147471 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 66147521 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 66147540 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 66147639 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 66147836 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 66147881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66148045 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 66148222 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 66148262 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 66148481 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 66148490 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 66148575 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 66148675 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 66148840 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 66148877 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 66148899 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 66148919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66148948 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 66149011 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 66149085 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 66149124 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 66149138 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 66149157 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 66149221 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 66149242 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 66149265 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 66149582 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66149816 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66149892 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 66149951 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 66149973 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 66149980 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66150143 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 66150172 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 66150346 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 66150379 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 66150386 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 66150417 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 66150419 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 66150428 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 66150569 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 3 66150629 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 66150690 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 66150843 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 66150874 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 66150875 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 66150899 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 66150941 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 66150946 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 66150991 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 66151038 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 66151043 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66151379 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 66151384 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 66151407 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 66151428 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66151536 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 66151665 G T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 66151869 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66151920 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 66152007 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 66152016 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 66152074 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 66152112 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 66152170 T A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 66152271 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 66152421 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 66152449 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 66152944 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 66153054 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 66153113 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 66153317 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 66153383 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 66153443 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 66153662 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 66153703 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 66154081 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 66154489 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 66154498 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 66154619 A C N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 66154822 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 66154861 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 66154946 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 66155012 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 66155114 G C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 66155264 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 66155265 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 66155373 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 66155461 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 66155914 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 66155989 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 66156061 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 66156181 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 66156297 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 66156320 T A Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 66156367 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 66156426 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 66156488 T G Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 66156489 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 3 66156509 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 66156528 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 66156556 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 66156565 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 66156588 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 66156597 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 66156681 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 66156840 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 66156869 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 66156972 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 66156998 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 66157064 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 66157080 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 66157128 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 66157129 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 66157170 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 66157193 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 66157286 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 66157313 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 66157360 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 66157399 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 66157410 C G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 66157421 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 66157444 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 66157459 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 66157468 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 66157483 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 66157484 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 66157532 C G N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 66157594 C T N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 3 66157651 G A N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 3 66157749 G T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 66157768 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 3 66157861 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 66157942 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 66157990 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 66158091 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 66158096 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 66158108 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 66158134 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 66158216 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 66158275 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 66158340 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 66158380 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 66158452 A C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 66158627 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 66158664 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 66158700 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 66158766 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 66158791 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 66158798 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 66158874 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 66159025 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 66159103 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 66159219 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 66159231 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 66159260 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 66159347 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 66159360 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 66159418 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 66159422 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 66159499 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 66159516 G C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 66159526 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 66159539 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 66159547 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 66159629 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 66159680 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 66159686 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 66159727 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 66159802 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 66159986 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 66159993 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 66160005 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 66160057 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 66160075 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 66160077 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 66160158 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 66160163 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 66160193 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 66160198 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 66160207 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 66160224 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 66160230 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 66160252 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 66160305 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 66160333 A C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 66160379 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 66160390 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 66160409 T A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 66160651 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 66160656 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 66160717 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 66160823 T A N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 66160847 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 66160859 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 66161027 T C N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 3 66161050 T C N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 3 66161110 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 66161113 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 66161123 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 66161134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66161173 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 66161205 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 66161206 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 66161310 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66161331 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 66161363 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 66161398 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 66161433 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 66161463 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 66161465 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 66161649 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 66161698 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 66161846 T A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 66161876 C A N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 66161903 C A N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 66161908 C G N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 66161942 C T N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 66161981 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66161996 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 66162011 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 66162017 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 66162186 G C N N 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 8 10 3 2 4 3 66162248 G A N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 3 66162346 A C N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 3 66162370 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 3 66162385 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 66162390 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 66162485 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 66162510 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66162625 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 66162635 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 66162675 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66162696 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66162837 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66163002 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 66163180 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 66163272 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66163295 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 66163391 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 66163705 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 66163741 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 66164127 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 66164196 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 66164290 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 66164351 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 66164364 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 66164435 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 3 66164629 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 66164929 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 66165055 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 66165119 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 66165212 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 66165450 C G N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 66165486 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 66165900 C T N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 13 7 4 5 1 3 66165995 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 66166091 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 66166120 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 66166161 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 66166419 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 66166487 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 66166972 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66167642 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 66167767 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 66167882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66168094 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 66168485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66168855 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 66170136 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 66170467 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 66171446 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66172447 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 66172454 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 66172613 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 66172926 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 66173014 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 66173233 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 66173312 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 66173378 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 66173630 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 66173753 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 66173762 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 66173789 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 66173857 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 66173931 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66174018 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 66174212 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 66174469 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 66174470 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 66174636 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 66174742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66174749 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 66174916 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 66174936 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 66174982 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 66175794 A C Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 66176222 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66176767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66177170 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66177696 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 66178309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66178532 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66179520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66180473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66181921 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66181942 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 66183239 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 66183585 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 66183953 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 66186841 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 66188410 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 66189449 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 66190385 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66190811 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66190942 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 66191244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66191472 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 66191568 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 66191583 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 66191603 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66191910 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 66191969 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 66192103 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 66192127 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 66192302 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 66192325 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 66192691 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 66192823 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 66192950 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 66192964 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 66192975 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 66193076 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 66193099 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 66195888 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66196340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66196884 G T Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 66197197 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66198354 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 66199029 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66199877 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 66201911 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 66202087 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 66203161 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 66205576 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66205706 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66205838 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66205951 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 66205977 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 66206033 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66206196 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 66206652 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 66207025 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 66207877 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 66209498 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 66210505 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 66210527 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 66210555 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 66210769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66210795 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66210950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66211190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66211828 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66211852 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 66213752 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 66213759 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 66213866 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 66214014 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66214291 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66214348 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 66214457 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 66214469 G T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 66214546 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 66214575 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 66215006 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66215253 T A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 66215254 T A N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 3 66215547 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.157894736842105 0.789473684210526 0.0526315789473684 21 17 3 15 1 3 66215548 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.157894736842105 0.789473684210526 0.0526315789473684 21 17 3 15 1 3 66215587 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66215901 G C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 66216010 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 66216044 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 66216137 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 66216224 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66216783 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 66218423 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 66219575 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 66219769 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 66219800 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 66220145 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66220379 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66220507 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 66221016 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 66221103 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 66221215 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 66221225 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 66221376 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66221393 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 66221419 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 66221450 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66221686 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 66221697 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66221736 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 66221765 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 66221778 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 66221836 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 66221914 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 66221930 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66221944 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66222072 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 66222148 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 66222166 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 66222502 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66222636 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 66222755 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66222885 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 66222929 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 66223141 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 66223543 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66224436 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66224447 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66224793 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66224841 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 66225110 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 66225674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66226003 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66227761 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 66228364 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66228708 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 66228841 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66229574 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66230194 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66230380 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 66230457 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66230589 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66231760 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 66231866 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66232361 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 66232392 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 66232719 A C N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 66232735 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 66233087 T G Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 66233360 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 66233378 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66233389 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 66233473 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 66233500 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 66234575 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 66234904 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66235162 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 66235447 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66235642 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66235870 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 66236481 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 66236593 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 66236614 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 66237133 A G N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0 0.545454545454545 0.454545454545455 6 16 0 6 5 3 66237148 G A N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 3 66237201 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 66239808 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 66240153 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 66240345 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 66240786 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 66241056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66242237 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 66242317 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 66242330 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66242433 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 66242471 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 66242479 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 66242587 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 66243129 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 66243723 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66243802 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66243893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66243965 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 66244093 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 66244221 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66244403 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66244476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66244592 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 66244614 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66244672 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66245454 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 66245462 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 66245810 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66245872 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 66246042 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66246072 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66246575 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66246766 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66247034 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 66247104 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66247105 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66247136 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66247155 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66247217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66247294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66247437 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66247657 C G N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 66247673 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 66247739 C A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 66248512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66248547 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66248811 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66248856 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66248943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66249087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66249161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66249219 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66249327 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66249529 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66249537 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66249799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66250220 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66250579 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66250648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66250877 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66250965 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66251129 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 66251966 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66252118 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66252376 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 66252404 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66252800 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 66252955 A T N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 66252971 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 66253561 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66253703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66254283 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66254289 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66261238 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66261385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66261403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66261483 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66261625 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 66261673 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66261708 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66261735 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66261797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66261807 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66261833 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66261837 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66261851 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66261857 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66261868 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66261951 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66261977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66262063 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66262064 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66262089 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66262155 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66262162 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66262319 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66262387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66262425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66262465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66262483 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66262606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66262663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66262707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66262718 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66262721 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66262742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66262772 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66262783 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66262800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66262824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66262940 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66262954 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66262998 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66263080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66263174 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66263197 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66263228 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66263268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66263449 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66263670 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66263845 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 66264006 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66264082 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66264341 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 66264972 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66264994 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 66265054 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 66265056 C G N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 66265073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66265085 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66265419 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 66265441 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66265448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66265457 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66265462 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 66265517 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 66265628 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 66265784 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66265799 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 66265831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66265857 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 66265904 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 66266091 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66266270 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66266391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66266591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66266722 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66267287 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 66267444 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 66267529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66268064 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 66268190 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66268193 G C Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 66268212 C A Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 66268594 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66268621 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 66269451 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66269465 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66270404 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66270479 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66270520 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66270779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66270908 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66271003 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66271125 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 66271535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66271703 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66271914 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66271963 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66272250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66272257 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66272325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66272362 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 66272547 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 66272631 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66272649 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66272701 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66272735 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 66272747 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66272845 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66273084 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 66273874 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 66274008 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 66275027 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66275093 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66275112 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66275467 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 66275543 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66275613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66275618 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66275802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66275924 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66276246 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66276694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66276780 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66277150 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66277151 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66277342 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 66277349 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66277553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66278270 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 66278753 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66279104 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66279119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66279125 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66279328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66279440 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66279882 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66279888 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66279942 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66279952 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 66280116 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 66280129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66280287 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66280350 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 66280405 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 66280471 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66280578 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66280601 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66280693 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66280821 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 66280937 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66280963 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 66280973 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 66281014 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 66281045 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66281091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66281253 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0 0.722222222222222 0.277777777777778 13 23 0 13 5 3 66281346 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66281449 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 66281450 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66281699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66281811 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 66282058 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 66282204 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66282473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66282538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66282726 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 66282936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66283081 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66283641 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66283919 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 66284097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66284103 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 66284114 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 66284213 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 66284379 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66284578 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 66284984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66285012 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 66285030 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66285052 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 66285131 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 66285138 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 66285150 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 66285240 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 66285447 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 66285599 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66285817 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 66285965 G C N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 3 66286201 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66286851 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 66287028 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66287049 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 66287203 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 66287300 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 66287558 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66287628 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 66287729 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 66287919 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 66287938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66287996 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 66288345 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66288647 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 66288663 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 66288817 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66288856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66288882 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 66289727 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 66291004 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 66291191 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66292662 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 66292687 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 66292705 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66292905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66294676 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 66296386 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66297221 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 66298517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66299791 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 66300280 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 66300383 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 66301552 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 66301813 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 66303054 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 66304074 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66304306 T A N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 66304416 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 66304504 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66304641 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 66304667 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 66304856 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66304927 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 66305061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66305062 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 66305343 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 66305497 G C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 66305644 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 66305751 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 66305843 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 66305899 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 66306036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66306154 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66306226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66306443 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 66306542 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 66306730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66306755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66306790 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 66306939 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 66307037 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 66307100 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66307152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66307195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66307310 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 66307404 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66307538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66307620 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 66307678 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66307741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66307817 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66307850 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 66308027 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 66308176 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 66308192 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 66308957 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66308990 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 66309068 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 66309205 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 66309242 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 66309274 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 66309310 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 66309453 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66309972 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66310606 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66310676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66310913 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 66310974 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66311434 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66311453 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66311462 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66311563 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 66311739 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 66313722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66313862 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 66314129 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66314211 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 66315140 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 66315197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66315281 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 66315285 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 66315303 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 66315489 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 66315553 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 66315566 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 66315616 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 66315710 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 66315873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66315899 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 66315967 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 66316615 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 66316657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66316706 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 66316837 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66317034 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 66317050 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 66317075 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 66317167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66317326 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 66317432 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 66317747 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 3 66318390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66319269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66319306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66319557 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66319784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66320271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66320282 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66320293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66321187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66321621 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66322178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66322749 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 66324139 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 66324190 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 66324330 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 66324364 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 66324450 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 66324673 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 66324741 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 66325086 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 66325300 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 66325316 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 66325345 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 66325526 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 66325744 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 66325888 T G N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 66325939 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 66326036 A T N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 3 66326195 A C N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 3 66326201 A G N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 66326212 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 66326217 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 66326232 G A N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 3 66326239 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 66326281 C A N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 66326368 T C N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 13 7 4 5 1 3 66326371 C T N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.454545454545455 0.454545454545455 0.0909090909090909 15 7 5 5 1 3 66326560 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 66326634 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66326640 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 66326728 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 66326849 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 66326923 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 66327076 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 66327184 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 66327538 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 66327694 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 66327792 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 66327829 C T N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.133333333333333 0.6 0.266666666666667 13 17 2 9 4 3 66327846 A G N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 3 66327901 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 66328025 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 66328134 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 66328136 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 66328265 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66328320 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 66328556 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 66328605 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 66329104 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 66329171 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66329231 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 66329236 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 66329275 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 66329313 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 66329314 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 66329448 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 66329451 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66329473 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66329489 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 66329587 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66329623 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 66329632 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66329655 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66329784 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 66329953 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 66329997 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 66330126 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 66330211 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 66330279 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66330304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66330569 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 66330635 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 66330638 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 66330799 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 66331001 A G Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 66331030 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 66331126 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 66331132 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 66331241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66331298 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 66331432 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 66331441 C G Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 66331565 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66331645 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66331647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66331768 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 66331796 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66332108 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 66332169 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 66332670 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 66332683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66333036 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 66333154 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 66333222 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 66333250 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 66333269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66333341 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 66333588 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66333600 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 66333613 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 66335631 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 66335914 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66338342 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 66339477 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 66339505 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 66339598 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 66339777 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 66339969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66341799 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 66342369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66342432 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 66342448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66342505 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66342922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66343298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66343717 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 66343733 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66343993 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 66344391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66344436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66344442 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66344570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66344804 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66344895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66345226 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 66345702 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 66345822 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 66345836 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66345913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66345979 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66345986 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66346188 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 66346202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66346315 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66346323 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 66346389 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66346444 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66347411 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66347429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66348598 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 66348752 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 66348755 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 66349899 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66350032 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 66350072 A T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 66350232 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 66350990 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 66351148 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 66351270 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 66351362 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 66351383 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 66351417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66351476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66351539 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 66351607 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 66351611 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 66351979 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 66352002 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 66352010 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 66352060 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 66352165 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 66352181 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 66352191 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 66352529 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 66352559 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 66352632 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 66353250 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 66353743 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 66354012 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 66354364 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 66354365 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 66355089 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 66355270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66355314 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 66355390 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 66355535 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 66355683 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66355815 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 66355912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66356305 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66356421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66356425 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 66356515 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 66356605 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 66356622 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 66356810 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 66357081 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66357147 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 66357167 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 66357548 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 66358247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66358909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66359526 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 3 66360102 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66360169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66360200 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66360213 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66360394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66360447 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 66360479 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 66360617 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66360740 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 66360784 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66361046 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66361408 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 66361622 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 66361868 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66364576 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66366969 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66367765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66368388 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 66368446 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 66369583 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66370083 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66371817 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66372403 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66373192 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66375620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66375769 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 66375825 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 66375838 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 66376084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66376956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66377140 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66377719 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66378040 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66378607 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66379006 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 66379383 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 66379412 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66381094 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 66381624 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 66382737 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66383805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66385026 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66385220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66386638 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66386955 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66387326 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66388095 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66388372 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 66388769 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66389841 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 66390176 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 66390203 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 66390279 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 66390343 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 66390491 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 66390756 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 66390863 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 66390910 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 66391219 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 66391246 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 66391346 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 66391347 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 66391628 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 66391650 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 66391683 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 66391766 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66391873 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 66391940 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 66392208 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 66392309 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 66392512 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 66392688 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66393798 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66393799 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 66394406 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 66394786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66394846 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66395330 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 12 6 5 2 2 3 66395377 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 3 66395389 C T N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 3 66395430 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 3 66395601 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 66395727 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 66395769 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 66395906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66396271 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66396340 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66396618 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 66397130 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 66397655 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 66398440 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 66398543 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 66398624 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66398772 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 66398803 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 66398804 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 66398907 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 66398918 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 66399204 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 66399211 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 66399415 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 66399437 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 66399462 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66400055 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 66400152 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 66400154 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 66400176 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66400193 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66400210 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 66400238 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66400278 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66400389 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66400639 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66400683 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66400743 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 66400909 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 66400923 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 66400957 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 66400982 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 66401025 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66401038 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 66401050 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 66401067 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 66401328 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66401347 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 66401388 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 66401821 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66402000 A T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 66402041 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 66402433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66402451 T G N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 3 66402598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66402697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66404031 C T N Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 3 66404662 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 66404674 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66404843 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 66405014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66405198 T G Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 66405216 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 66405712 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66405836 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 66406059 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66406149 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66406292 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66406304 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66406322 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66406406 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66406437 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66406575 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66406602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66406741 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 66406745 C A Y N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 3 66406849 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 66406944 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 66407007 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 66407014 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 66407096 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 66407098 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 66407386 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66407419 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66407484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66407528 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66407609 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 66407630 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66407750 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 66407763 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 66407863 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66408444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66412531 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 66412856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66413045 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 66413077 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66413245 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 66413263 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 66413400 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66413536 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 66413538 A C Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 66413578 A G Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 66413614 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 66413674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66414102 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66414200 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 66414381 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 66414515 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 66414559 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66414688 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 66414805 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 66415420 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 66415542 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 66415782 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 66416440 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 66416558 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 66416580 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 66416710 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66416879 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 66417010 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 66417260 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 66417312 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66417319 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 66417393 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66417424 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 66417886 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66418115 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 66418181 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 66418185 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 66418205 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 66418223 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 66418296 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 66418490 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 66418506 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 66418635 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 66418733 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 66418748 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 66418754 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 66418791 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 66418934 G A N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 66418996 G A Y Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 3 66419057 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 6 8 1 4 2 3 66419095 A G N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 8 12 1 6 3 3 66419114 G T Y N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.0833333333333333 0.583333333333333 0.333333333333333 9 15 1 7 4 3 66419156 C A N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 3 66419203 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 66419243 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 66419283 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66419295 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 66419699 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 66419725 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 66419850 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 66419948 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 66419960 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 66419962 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 66419979 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 66419986 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 66419997 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 66420160 A C Y N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 3 66420180 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 66420195 G T Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 66420246 G A Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 66420262 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 66420277 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 66420278 C G Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 66420306 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 66420310 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 66420321 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66420357 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 66420373 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 66420384 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 66420395 G T Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 66420403 A T Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 66420412 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 66420437 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 66420487 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 66420691 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 66420751 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 66420773 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 66421011 C T Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 66421068 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 66421092 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 66421115 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 66421142 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 66421218 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 66421288 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 66421358 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 66421482 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 66421505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66421972 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66421998 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 66422004 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66422138 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 66422215 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66422218 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 66422388 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66422393 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66422459 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66422462 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66422589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66422609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66422613 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66422634 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66422644 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66422648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66422694 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66422713 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66422739 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 66422782 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66422869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66422891 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 66422953 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66422965 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66422975 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 66422979 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66422990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66423107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66423172 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66423425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66423426 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 66423608 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66423609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66423772 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66423886 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 66423943 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 66424177 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 66424316 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 66424539 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 66424664 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66424774 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 66425107 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 66425138 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66425876 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 66425976 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 66426617 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66426688 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66426773 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 66427509 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 66427820 T C N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 3 66431066 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66440421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66442185 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66443780 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66443860 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66448736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66451628 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66451788 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66456094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66458180 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 66459151 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66459378 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66459379 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 66460036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66460430 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 66461582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66461751 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 66461935 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 66462538 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 66465005 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 66465821 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 66465836 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66466235 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 66466408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66466626 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 66466755 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66466946 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66467348 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 66467819 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66468482 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66468661 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 66468894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66469309 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66470067 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66471258 A G N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 3 66471288 T C Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 66471603 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 66472539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66473392 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 66473723 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66473832 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66481957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66481978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66483685 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66487436 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66487766 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66488239 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66488773 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66489395 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 66490737 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66493838 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66494583 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66496110 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66496807 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 66499192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66500234 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 66501444 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66501654 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66501671 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 66501858 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 66501862 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66501909 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66501957 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66502598 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 66503143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66503411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66503526 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66503721 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66503948 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66504229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66504256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66504284 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66504488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66505201 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 66506062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66506578 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66507276 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66507494 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66508576 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66509376 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66509499 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66509644 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66510197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66511638 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66516221 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 66516402 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 66516923 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66516943 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 66516949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66517010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66519295 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 66519377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66522876 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66524550 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66525717 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66526012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66528196 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66528587 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66531242 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66533348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66533538 C A N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 66535564 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 66535914 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 66535941 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 66536108 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 66536119 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 66536263 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 66536320 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 66536421 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 66536434 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 66536448 G C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 66536572 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 66536735 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 66537138 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66537151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66537243 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 66537247 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 66537304 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 66537355 A T Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 66537860 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 66537941 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66538168 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 66538229 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 66538230 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 66539001 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66539347 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66544089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66544327 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66545198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66546568 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66546778 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66550236 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66550562 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 66551449 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66551933 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 66553364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66554615 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 66555222 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 66556628 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66558279 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 66559511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66562912 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66563109 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66563165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66563957 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 66564576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66568640 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66569720 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 66571141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66571393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66573333 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66573766 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 66573914 A G Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 66574011 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 66574353 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66574354 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66574640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66574774 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66575372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66575427 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 66575618 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66575640 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 66575691 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66575699 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66575718 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66575719 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66575749 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 66576450 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66576758 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66578651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66578814 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66579174 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66579677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66579995 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66580401 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 66580456 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 66580465 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 66580468 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 66581873 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66583130 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66583440 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66585247 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66586066 A T Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 66586096 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 66589198 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66590448 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 66590481 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 66592356 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 66592386 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 66592399 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 66593279 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 66593375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66593694 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66593746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66593892 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 66594236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66594289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66594301 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 66594381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66594402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66594550 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66594569 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 66594573 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 66594591 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 66594592 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 66594629 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 66594734 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 66595290 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 66595692 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 66595711 T G Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 66595797 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66596235 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 66596331 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 66596336 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 66596756 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 66596859 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 66596968 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 66596980 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 66597144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66597419 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 66598242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66598642 A G N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 3 66598968 T G N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 66599108 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66599596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66599822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66599939 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66600123 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 66600655 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 66601175 A G N Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 3 66601331 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 66602262 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 66602734 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66603124 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 66603631 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 66603645 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66603892 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66604230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66604520 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 66604609 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 66605633 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 66605922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66606039 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 66606815 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 66606896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66607687 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 66607865 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 66609538 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 66609603 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 66610007 G T Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 66610040 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66610687 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 66610856 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 66611794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66611958 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 66612319 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 66612330 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66612421 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 66612694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66613114 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 66613274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66614072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66614129 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 66614823 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 66615341 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 66615616 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66615946 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66616184 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 66616798 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66618417 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 66618859 T C N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 66619506 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 66620494 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 66620624 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 66620979 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 66621488 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 66622435 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 66622557 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66622656 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66622694 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 66622721 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 66622729 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 66622970 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 66623000 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 66623059 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 66623106 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 66623112 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 66623163 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 66623297 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 66623331 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 66623332 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 66623367 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 66623404 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66623485 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 66624217 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 66624418 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 66624459 C T Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 66624473 G T Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 66624661 G C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 66624832 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 66625333 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 66625592 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 66625593 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 66625705 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 66625736 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 66625743 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 66625804 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 66627089 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 66627513 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 66627623 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66627883 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 66628493 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 66629012 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 66629406 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 66629599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66629613 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 66629689 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66630265 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 66630587 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 66630597 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 66630739 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 66633450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66634131 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 66634447 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 66634648 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 66634651 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 66634827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66634929 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 66636772 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 66636937 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 66637206 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 66639393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66639728 A C Y N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 66639781 T G Y N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 3 66646483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66646921 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66647032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66647439 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66648433 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 66650176 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66650698 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 66650723 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66652264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66652337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66652738 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66652794 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66652826 A T N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 66652893 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 66652915 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 66653048 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 66653084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66653116 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66653252 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 66653255 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66653304 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 66653327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66653470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66653501 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 66654557 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66657719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66658742 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66666423 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 66669005 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 66669093 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 66669166 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 66669366 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 66669407 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66669486 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 66669488 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66670047 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 66670058 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 66670071 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 66670445 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 66670461 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 66670662 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 66672520 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66672960 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 66673290 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 66673468 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 66673561 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 66673564 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 66674022 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 66674669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66675014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66675907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66676300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66676348 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 66676459 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 66676658 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 66677087 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66678106 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66678200 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 66679320 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 66680551 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 66680567 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66680651 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66682804 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 66683083 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 66683816 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 66684842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66686149 G A N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 8 12 1 6 3 3 66686593 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 66687345 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 66688910 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 66690077 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 66690980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66691187 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 66694715 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66695024 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 66696744 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 66696784 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 66697087 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 66697393 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 66697848 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 66697918 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 66697924 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 66697930 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 66697986 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 66698118 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 66698226 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 66698323 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 66698407 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 66698459 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 66698669 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 66698688 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 66698840 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 66698990 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 66699279 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 66699321 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 66699443 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 66699542 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 66699652 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 66699744 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 66699749 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 66699777 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 66699967 G T N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 66700050 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 66700064 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 66700222 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 66700257 G A N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 3 66701024 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 66701178 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 66701181 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 66701214 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 66701580 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 66701725 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 66701781 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 66701788 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 66701802 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 66701979 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 66702028 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 66702053 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 66702240 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 66702276 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 66702311 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 66702372 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 66702429 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 66702455 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 66702460 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 66702506 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 66702570 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 66702800 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 66702824 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 66702939 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 66702943 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 66703009 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 66703131 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 66703314 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 66703376 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 66703515 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 66703543 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 66703570 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 66703572 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 66703662 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 66703665 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 66703673 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 66703779 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 66703904 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 66704022 G C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 66704102 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 66704984 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 66705019 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 66705027 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 66705151 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 66705297 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 66705619 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 66706021 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 66706162 G A N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 66714461 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 66714518 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 66714696 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 66715099 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 66715266 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 66715290 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 66715436 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 66715572 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 66715630 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 66715779 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 66715819 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 66715910 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 66715928 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 66716156 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 66716200 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 66716644 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 66716702 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 66716741 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 66716742 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 66716752 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 66716782 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 66716804 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 66716814 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 66716953 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 66717082 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 66717084 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 66717341 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 66717358 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 66717359 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 66724964 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 66725380 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 66726412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66727348 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66727773 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 66727816 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 66728163 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 66728329 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 66728828 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 66729004 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 66729055 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 66729093 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 66729359 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 66729402 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 66729534 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 3 66729733 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 66729867 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 66729883 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 66730112 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 66730117 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 66730145 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 66730155 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 66730773 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 66731054 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 66731082 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 66731113 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 66731254 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 66731408 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 66731555 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 66731623 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 66731679 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 66731850 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 66731894 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 66731985 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 66732075 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 66732121 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 66732197 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 66732301 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 66732318 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 66732326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66732696 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 66732923 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 66733218 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 66733323 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 66733525 T A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 66733526 T A Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 66733675 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 66733942 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66733975 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 66734046 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 66734145 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 66734273 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 66734286 T C Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 66734366 T G Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 66735467 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 66735706 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 66735735 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 66735787 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66736351 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 66736513 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 66736613 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66736843 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 66737015 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66737026 C G Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 66737098 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66737203 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 66737295 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66737461 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66738337 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 66739466 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66740828 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 66740833 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 66741183 C A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 66741620 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 66741633 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 66741926 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 66741975 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 66742133 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 66742309 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 66742394 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 66742481 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 66744166 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 66744343 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 66744938 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 66745690 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 66745691 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 66746058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66746134 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 66749502 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66750248 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66752493 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66752838 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66753172 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66755978 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 66756622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66757508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66758589 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66760495 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 66764745 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 66768689 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66769182 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 66770580 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66775561 G A N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0 1 0 10 10 0 10 0 3 66776083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66781535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66782553 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66786586 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66788731 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 66791561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66792498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66793957 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66794635 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66794918 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66796167 A G N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 3 66796735 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66799344 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66799780 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 66802524 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 66802920 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 66804259 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 66807037 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 66811493 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 66811840 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 66813131 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66815000 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 66818035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66819042 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66820697 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66821299 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 66822610 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 66824193 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66824364 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66824552 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 66825986 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66826409 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66827554 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66830056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66830869 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 66834154 G C N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 66834700 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 66835093 A C Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 3 66842101 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66842890 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66844834 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66846423 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66847118 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66847135 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 66847222 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66848281 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66849404 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66849486 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66849662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66856843 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 66858150 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66859026 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66859522 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66867432 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 66868811 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 66869310 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66872006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66873045 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66875136 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66878713 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66880923 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66882823 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66883708 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66885088 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 66885760 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66887511 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 66890457 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 66891877 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 66892127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66892792 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 66894234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66894298 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66894544 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66895233 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 66895384 C A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 66895712 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 66896385 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 66897044 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66898760 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 66908265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66912327 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 66912881 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 66915554 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 66917813 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 66918407 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66923219 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66923596 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66925132 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 66925182 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66926527 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66926773 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 66927858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66928052 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 66929183 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66935372 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66938547 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66940552 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 66950503 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 66952773 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 66954198 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66955026 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66956516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66957509 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 66957582 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 66968561 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 66968797 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 66969267 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66972290 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 66974572 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 66975525 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 66976313 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 66978099 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 66978533 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66980062 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66980991 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 66981887 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66985106 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 66986396 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66986735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66987165 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66988684 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 66989392 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 66992233 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 66994636 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 66998790 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67001239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67003105 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67003198 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67004237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67005901 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67006938 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67009552 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67010807 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 67012064 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 67018644 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 67022497 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67024948 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 67026460 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 67026722 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 67030827 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67032972 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67032982 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67033493 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67034693 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67037292 T C Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 67039311 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 67041812 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67044258 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 67045773 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 67046008 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 67048312 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67048337 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67048430 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67048611 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67051488 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 67053137 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67053156 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67054097 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67054192 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67054360 A G Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 67055802 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 67056201 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67056407 C G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 67056690 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67056754 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67057675 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67059969 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67061316 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67063249 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67064360 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 67069993 T C N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 67070564 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 67071539 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 67073803 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67074094 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67075547 A T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 67075941 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 67078266 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67078784 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67082191 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67083138 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 67083421 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67084457 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67085406 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67085532 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67086248 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67086749 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67087385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67087406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67089904 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67091279 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67091473 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67091475 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67091544 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 67096097 C G N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 67102261 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67103853 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 67104088 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 67104106 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 67104839 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 67105940 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 67109022 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67109222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67110229 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67113938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67114336 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 67114358 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 67114539 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 67114594 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 67115219 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 67115295 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 67115735 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67115752 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 67117208 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 67117211 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67117479 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67120582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67122462 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 67126423 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67128771 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67130320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67131355 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67131454 T A Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 67131720 T G Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 67132318 T C Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 67132582 A C Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 67133036 T G Y N 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 7 11 2 3 4 3 67134221 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 67134237 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 67134506 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 67134703 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67135880 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 67136220 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67136344 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67136764 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 67136826 T C Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 67136963 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 67137009 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67137729 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67137788 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67138136 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67138142 T C Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 67138171 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67138177 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67138334 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67138514 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67138524 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67138662 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 67138691 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 67138737 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 67138768 C G Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 67138794 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 67139023 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 67139047 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 67139075 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67139247 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 67139352 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67139621 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67140527 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67141019 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 67141261 A T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 67141738 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 67141743 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 67142945 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 67143627 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67146771 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 67148363 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 67149505 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67150653 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 67151513 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67151558 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67151999 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67152147 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 67152186 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 67152473 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 67152847 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 67153054 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 67153588 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67153951 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67154029 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67154059 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67154077 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 67154112 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67154210 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 67154260 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 67154306 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67154313 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 67154333 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67154455 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 67154486 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67154501 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67154512 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67154756 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67154924 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67154967 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67154973 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67155049 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67155275 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67155324 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67155338 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67155718 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67155740 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 67156087 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 67156196 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 67156568 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 67156821 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67156845 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67156858 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67156898 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67156907 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67157161 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67157331 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67157408 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 67157425 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67157719 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 67157859 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 67158104 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 67158132 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 67158238 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67158346 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 67158664 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67158720 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67159168 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67159318 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67160469 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 67160723 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 67160754 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67160863 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67161361 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67161503 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67162106 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 67162128 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67162215 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67162430 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67162455 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67162681 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67162902 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67163201 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67163226 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67163489 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67163750 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 67163918 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67163930 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 67164145 T G Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 67164223 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 67164724 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67164777 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67164779 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67164789 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67164889 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67164893 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67164906 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67164918 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67165143 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67165156 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67165162 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67165507 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67165568 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 67165999 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67166196 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 67166323 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 67166602 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67166633 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 67166674 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 67166704 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 67166890 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 67167256 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67167719 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67167869 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 67171611 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67175930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67177194 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67177509 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 67178280 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67178431 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67179924 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67180154 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 67180465 T C N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 3 67180923 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67181051 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 67181059 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 67181167 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 67182817 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67183015 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67183087 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67183424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67183449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67184390 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 67184501 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 67185655 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67186842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67186992 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 67187052 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 67187285 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67187505 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67187899 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 67187993 G A N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 67188209 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 67188316 T G N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 3 67188679 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67188898 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67189122 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 67189246 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 67189294 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67190250 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 67191340 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67191987 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67192720 T G N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 67192947 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 67193023 G A N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 67193189 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67193466 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 67193690 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67193710 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67195011 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67195135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67195770 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67196030 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67197082 G A N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 67197094 T C N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 67197625 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67197679 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 67198182 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67198442 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67198995 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 67199105 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 67199467 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 67200299 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 67200555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67201191 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67201241 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 67202448 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 67202504 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 67202589 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 67202607 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 67202648 C A N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 67203497 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 67204191 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67205161 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 67205879 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 67206188 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67206741 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67206799 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67206885 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67207048 A G Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 67208175 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67208227 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67208584 A T N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 67208597 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 67208673 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67208828 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67209294 A G Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 67209441 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67210176 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67210731 C T Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 67210776 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 67211057 T A N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 67212036 G A N Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.25 0.75 0 10 6 2 6 0 3 67212053 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 5 9 1 3 3 3 67212105 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67212424 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 67212740 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 67212869 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 67212902 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 67213144 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67213355 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 67213382 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67213611 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 67213664 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67213834 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 67213895 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 67214916 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67216117 C A Y N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 67216935 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67219424 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 67219787 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 67220352 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 67220451 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67229725 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67229759 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67229882 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67230037 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67230042 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67230080 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67230272 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67230378 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 67230468 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67230496 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 67230699 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 67230775 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67230855 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67230884 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67231150 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67231195 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67231317 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67231495 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67231498 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67233445 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67233564 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 67233702 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 67233838 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 67234149 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 67234292 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67234479 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67234513 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67234521 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67234669 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67234865 C A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 67234937 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67235362 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67235461 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 67235472 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67235510 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67235521 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 67235528 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67235631 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67235749 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67236505 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67236579 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67236582 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 67236681 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67237025 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 67237035 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67237038 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67237085 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 67237142 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67237192 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67237244 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 67237363 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67237713 C T N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 67238099 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 67238140 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 67238144 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67238280 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 67238284 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 67238447 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 67238596 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 67238638 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 67238791 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67238822 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 67239286 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67239322 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67239482 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67239778 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67239794 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 67239860 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67240248 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 67240640 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67240768 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67240808 A T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 67240828 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 67240876 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 67241256 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67241461 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67241462 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67241611 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67241794 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 67241899 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67241926 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67242091 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 67242093 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 67242128 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 67242498 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67242631 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67242707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67242909 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67242965 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67243011 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67243359 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 67243369 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 67243372 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 67243503 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 67243588 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67243736 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67243862 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67244284 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67244325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67244416 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 67244449 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67244472 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67244547 T G Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 67244578 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67244624 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67244655 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 67244824 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67244840 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67244842 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67244872 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67244892 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67245056 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67245223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67245275 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 67245367 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 67245412 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 67245415 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67245427 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 67245645 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 67245769 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 67245840 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67246046 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67246069 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67246189 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67246225 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67246226 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67246482 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67246688 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 67246767 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67246802 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67247398 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67247993 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67248054 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 67248082 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67248126 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67248155 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67248592 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67249097 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67249126 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 67249261 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67249556 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67249572 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67249596 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67249867 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 67249905 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 67249948 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 67250403 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67250580 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 67250653 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67250868 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67250901 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67251008 C G Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 67251042 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 67251109 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67251135 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67251230 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67251441 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67251780 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 67251781 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 67252225 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67252235 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67252354 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67252379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67252578 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67252982 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67253135 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67253174 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 67253473 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67253603 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 67254076 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67254250 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67254489 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67254687 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67254837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67255068 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67255286 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67255385 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67255409 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67255410 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67255431 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67255517 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 67255857 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 67256035 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67256056 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67256349 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67256365 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 67256391 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67256441 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67256699 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 67256878 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 67257067 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67257864 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67257871 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67258246 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 67258341 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67258382 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 67258389 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 67258394 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 67258450 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 67258526 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 67258558 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 67258561 T G N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 67258682 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 67259153 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67259327 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67259335 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67259345 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67259431 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67259518 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67259712 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67260325 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67261275 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67261370 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67261394 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67261501 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67261645 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 67261731 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 67262023 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 67263467 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 67263789 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67264680 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 67264693 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67264786 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 67264804 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 67264990 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 67265132 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67265207 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 67265557 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 67265661 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 67265703 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 67266115 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 67266193 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67266247 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67266426 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67266463 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 67266613 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 67266897 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 67267117 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 67267167 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 67267904 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 67268014 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 67268035 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67268086 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 67268100 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67268112 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67268207 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67268444 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67268539 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67268609 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67268638 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67268713 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 67268751 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 67268872 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 67269189 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 67269204 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67269230 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 67269289 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67269347 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 67269600 A T N N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0 0.636363636363636 0.363636363636364 7 15 0 7 4 3 67269651 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 67269812 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67270269 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67270296 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67270383 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67270452 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67270782 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67270933 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67271040 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 67271076 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 67271105 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67271155 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67271194 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67271210 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67271268 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 67271318 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 67272248 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67273643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67273667 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 67273782 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 67273861 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67273881 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67273925 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67273928 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67273956 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 67274342 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67275135 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67275164 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67275286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67275325 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67275871 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 67275901 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 67275903 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 67276038 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 67276074 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 67276114 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 67276131 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 67276150 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 67276279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67276354 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 67276504 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 67276506 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 67276535 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 67276973 C G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 3 67277064 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 67277220 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 67277255 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 67277601 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 67277626 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 67277701 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67277783 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 67278025 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 67278272 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 67278305 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 67278313 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67278341 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 67278403 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 67278519 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 67278599 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67278854 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 67278893 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67279173 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67279385 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67279731 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67279790 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67279894 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67280177 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67280610 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 67280643 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 67281116 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67281120 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67281266 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 67281350 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 67281894 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67281939 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67282059 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67282212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67282283 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67283618 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67283662 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67283873 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67283938 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67284022 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 67284201 G T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 67284255 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67284357 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67284390 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 67284455 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67284745 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67284821 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 67285019 G A N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 3 67285194 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67285238 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67285353 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67285354 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 67285364 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 67285381 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67285382 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67285476 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67286262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67286419 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67286558 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 67286574 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67286812 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67286840 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 67286946 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67287045 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67287048 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 67287070 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67287178 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67287220 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 67287284 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67287361 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 67287610 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67287651 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 67287703 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 67288325 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67288333 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 67288675 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67288708 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67288711 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67288768 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67288891 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 67288901 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 67288902 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 67288998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67289094 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67289175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67289459 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 67289676 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67289789 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67289972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67290634 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67290846 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 67290910 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67291417 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67291571 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67292773 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67293000 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67293015 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67293078 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67293190 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 67293428 A C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 67293441 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 67293464 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67293569 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 67293589 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67293692 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67293697 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 67293717 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67293723 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 67293778 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 67293874 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 67293906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67293938 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 67293985 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67294052 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.0526315789473684 0.842105263157895 0.105263157894737 18 20 1 16 2 3 67294424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67294574 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 67294798 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67294964 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67295060 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 67295093 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67295104 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 67295294 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67295337 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67295455 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67295611 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 67295949 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67295980 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67296112 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 67296406 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67296547 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67296865 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 67297025 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 67297215 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67297607 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67297760 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 67297891 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67297955 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67298112 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67298124 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67298213 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67298233 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67298234 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67298343 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 67298362 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 67298393 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67298406 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67298459 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 67298840 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 67298868 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.421052631578947 0.105263157894737 0.473684210526316 18 20 8 2 9 3 67298954 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 3 67298971 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 3 67298983 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67299016 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 67299027 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67299097 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 67299168 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 67299297 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 67299450 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67299480 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 67299533 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 67299566 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 67300301 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 67300988 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 67301267 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 67301296 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 67301316 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 67301582 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 67301721 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 67302051 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67302104 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 67302515 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 67302608 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67302647 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67302897 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 67302913 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67303354 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67303999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67304093 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 67304322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67304988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67305189 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67305279 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67305712 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67305718 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 67305754 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 67305852 A C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 3 67306169 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 67306179 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 67306389 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 67306393 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67306456 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 67306474 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 67306686 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67307688 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 67307924 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 67308128 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67308198 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 67309126 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 67309630 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 67309871 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67309921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67310082 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67310973 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67311009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67311232 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67311260 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67311554 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 67311565 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 67311570 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67311976 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 67312241 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 67312261 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67312308 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67312477 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67312501 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67312575 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 67312846 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 67313090 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 67313131 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 67313491 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 67313540 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 67313555 G A Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 67314193 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67314332 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67314695 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 67314748 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 67314771 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 67314910 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67314956 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 67314996 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67315007 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 67315094 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 67315116 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67315128 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 67315168 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67315171 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67315258 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67315284 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67315506 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 67315518 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 67315531 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67315603 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67315659 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 67315682 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67315705 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 67315717 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67315744 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67315880 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67315934 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 67316048 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 67316073 G T N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 67316079 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 67316293 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67316421 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67316471 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67316541 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67316631 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 67316792 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67317129 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67317174 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 67317194 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 67317210 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67317345 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 67317356 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67317413 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 67317519 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 67317598 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67317631 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67317695 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 67317912 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67318299 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 67318348 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67318660 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67318717 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67318776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67318848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67318896 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67319224 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 67319236 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 67319280 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67319401 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 67319405 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67319522 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67319729 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67319918 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67320940 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 67320984 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67320986 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 67321026 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 67321094 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 67321114 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67321217 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67321261 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67321306 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67321351 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67321379 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67321391 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67321395 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67321463 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67321466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67321687 G C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 67321728 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67321755 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67321802 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 67321809 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 67321823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67321886 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 67321915 A C Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 67321920 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 67321943 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67321980 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 67321981 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 67322042 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67322140 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67322523 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 67322532 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67322582 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 67322659 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 67322660 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 67322687 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67322817 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 67322952 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67323091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67323191 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67323451 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67323706 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67323726 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 67323819 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 67323853 G A N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.384615384615385 0.307692307692308 0.307692307692308 14 12 5 4 4 3 67324135 G C N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 67324177 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 67324181 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 67324249 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 67324257 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 67324424 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67324438 C T Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 67324483 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 67324492 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67324604 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 67324652 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 67324668 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67324707 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 67324816 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67325104 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 67325186 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 67325243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67325284 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 67325308 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 67325342 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 67325411 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 67325529 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67325562 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67325656 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67325699 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 67325765 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67325827 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67325831 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67326019 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67326160 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67326299 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67326308 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67326356 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67326404 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67326413 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67326466 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67326506 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67326521 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 67326544 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 67326554 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 67326592 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67327054 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67327183 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 67327405 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 67327439 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 67327527 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 67327531 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 67327540 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 67327733 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 67327830 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 67328008 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 67328213 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 67328220 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 67328620 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 67328632 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67329017 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67329050 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 67329100 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67329247 C T N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 3 67329376 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 67329384 G A N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 67329467 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 67329473 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67329507 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 67329524 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67329532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67329674 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 67329904 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 67329910 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 67329933 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 67330068 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67330078 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 67330133 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 67330234 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67330610 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 67330803 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 67330876 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 67330902 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 67331081 T G Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 67331212 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 67331221 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 67331260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67331363 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67331365 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67331402 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67331425 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67331443 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67331982 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67332535 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 67332641 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67332810 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 67332946 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67333096 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67333146 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 67333153 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67333173 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67333183 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 67333227 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67333456 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 67333483 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67333679 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67334015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67334045 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 67334071 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 67334102 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67334135 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67334141 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67334203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67334266 A C Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 67334502 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 67334519 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67334551 C G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 67334603 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 67334663 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 67334684 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 67334734 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 67334765 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 67334830 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 3 67334831 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 3 67334916 C T N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 3 67334922 C T Y Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 3 67334992 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 67335031 T C N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 3 67335037 A G N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.454545454545455 0.363636363636364 0.181818181818182 14 8 5 4 2 3 67335068 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 67335342 A T N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 67335398 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 67335466 T C N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 67335491 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 67335565 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 67335588 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 67335649 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 67335723 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 67335728 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 67335784 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67335876 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67335905 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 67335926 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 67335972 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 67335996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67336053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67336054 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 67336100 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 67336101 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67336233 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67336283 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67336335 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67336444 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 67336499 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 67336772 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67336812 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67336893 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 67336964 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 67337069 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 67337170 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 67337373 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67337395 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67337462 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67337497 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67337570 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67337575 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67337676 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67337722 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67337801 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67337808 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67337996 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 67338097 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 67338110 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67338362 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67338422 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67338429 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67338464 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67338478 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 67338536 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67338733 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 67338763 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67338784 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 67338867 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 67338891 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67338914 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 67338969 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67338990 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67339014 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67339075 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67346158 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 67346185 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67346197 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67346510 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67346559 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67346574 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 67346591 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67346677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67346859 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 67346862 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 67346958 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 67347055 T C N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 67347249 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 67347427 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67347480 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67347557 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67347983 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67348249 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67348439 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67348476 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 67348503 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67348556 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67348612 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67349082 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 67349139 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 67349407 T A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 67349416 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 67349515 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 67349605 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 67349889 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 67349986 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 67350298 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 67350327 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 67350328 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 67350479 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 67350656 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 67350661 A G N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.416666666666667 0.583333333333333 0 17 7 5 7 0 3 67350763 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 67350903 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 67351194 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 67351396 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67351546 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 67351600 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67351651 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 67351815 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 67351906 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 67352113 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 67352127 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67352224 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 67352264 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 67352315 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67352750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67352931 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67353055 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67353061 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67353878 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 67354205 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67354382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67354446 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 67354459 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 67354673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67355614 C A Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 67356482 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67356642 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67357243 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67357491 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67357826 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67359000 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67360140 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67360159 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67360205 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67361117 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 67361738 T G N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 67361823 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67362395 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 67362429 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 67362434 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 67362503 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67362656 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 67362874 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67362895 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 67363196 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 67363227 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 67363258 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67363674 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67363773 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67363868 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 67363889 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67364057 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67364075 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67364816 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67364936 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67365084 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 67365156 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67365508 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 67365721 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67366101 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67366157 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67366306 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 67366406 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 67366474 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67366823 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67367065 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 67367085 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 67367086 C G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 67367106 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67367912 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67367985 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 67368158 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67368244 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 67368406 G T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 67368571 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67368721 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 67369729 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67369838 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67369903 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67369959 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67369997 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 67370632 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67370994 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67371975 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 67372524 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67372601 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67372687 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 67372791 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 67372997 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67373032 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 67373050 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 67373168 T G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 67373481 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 67373658 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67373667 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 67373700 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67373720 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 67373912 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 67373930 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67373998 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 67374002 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67374093 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 67374131 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67374164 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 67374199 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 67374218 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 67374304 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 67374411 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67374472 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 67374502 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 67374559 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 67374573 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 67374575 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 67374584 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 67375066 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67375478 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 67375563 C G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 67375615 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67375814 C T Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 67375901 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67375951 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67375975 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 67376128 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67376159 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 67376493 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67377092 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 67377141 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 67377352 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 67377360 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 67377475 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 67377581 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 67377662 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 67377961 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 16 12 6 4 4 3 67378412 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 67378472 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 67378473 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 67378538 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 67379221 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67379846 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67380127 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67380164 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 67380514 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 67380565 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67380648 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 67380660 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 67380712 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 67380779 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67380780 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 67380801 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 67380848 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 67380864 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 67380907 T A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 67380941 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 67380959 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 67381084 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 67381296 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67381303 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 67381312 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 67381378 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 67381404 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 67381733 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 67381810 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 67381934 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 67382013 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 67382052 T C Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 67382108 C A Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 67382140 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 67382304 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67382314 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67382363 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67382377 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67382436 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67382441 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67382454 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67382642 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67382716 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67382732 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67382745 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67382785 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 67382820 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 67383095 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 67383307 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 67383321 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 67383423 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67383552 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67383605 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 67383821 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 67384293 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67384456 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67384524 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67384566 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 67385359 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67386244 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67386245 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67386489 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67387290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67387668 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67388193 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 67388251 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67388529 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 67388544 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 67388780 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 67389078 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 67389124 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 67389151 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 67389170 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 67389187 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 67389220 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 67389244 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 67389246 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 67389256 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 67389328 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 67389346 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 67389388 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 67389396 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 67389412 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 67389453 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 67389516 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 67389537 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 67389701 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 67389745 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 67389836 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67390122 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 67390235 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67390332 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 67390393 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67390414 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67390535 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 67390815 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 67390841 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67391119 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 67391122 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 67391218 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 67391259 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 67393580 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67393684 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67393933 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67393959 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67394078 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67394127 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67394128 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67394288 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67394460 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67394700 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 67394716 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 67394937 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67395093 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67395132 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67395183 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 67395206 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67395225 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 67395239 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 67395982 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67396098 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67396297 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67396340 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67396368 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 67398009 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67398024 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 67398029 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 67398110 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 67398124 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67398375 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 67398474 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 67398541 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67398634 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67398748 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67399113 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67399165 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67399211 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 67399294 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67399505 A G Y Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 67399947 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 67399954 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 67399963 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 67400237 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 67400254 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 67400334 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 67400512 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67400546 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 67400622 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 67400729 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 67400750 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 67400756 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 67400804 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 67400805 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 67400946 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 67400965 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 67400986 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67401091 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 67401185 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67401261 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 67401262 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 67401272 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67401289 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 67401348 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 67401358 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67401440 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 67401468 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 67401495 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 67401729 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 67401801 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67401861 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 67401875 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67402278 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67402385 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 67402415 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 67402434 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 67402483 C A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 67402649 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 67402667 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 67402738 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 67402742 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 67402761 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 67403004 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 67403141 T A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 67403169 C A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 67403174 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 67403373 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 67403381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67403447 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67403645 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67404179 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 67405616 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 67405723 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67405884 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67405965 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67406701 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67406715 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67406829 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67407045 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67407264 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67407279 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67407355 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 67407507 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67407518 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67407602 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67407612 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67407682 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67407848 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67407965 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67408056 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 67408797 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 67408860 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 67408909 C A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 67410037 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 67410067 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 67410187 C G Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 67410277 G T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 67410400 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 67410655 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 67411546 T G N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 67411571 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 67412430 T A Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 3 67412571 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67412601 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 67413220 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67414270 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 67414301 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67414440 C A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 67414496 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67414616 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67414658 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67414728 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67414807 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67414898 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67415146 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 67415233 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 67415234 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 67415381 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 67415513 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 67415764 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 67415768 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 67415776 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 67415818 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67416228 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 67416285 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 67416329 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67416459 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 67416519 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67416562 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 67416565 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 67416678 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 67416723 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67416835 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67416894 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67416895 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67417048 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67417098 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67417125 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67417135 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67417149 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67417167 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67417195 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67417247 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67417276 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67417400 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67417436 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67417464 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67417479 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67417488 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67417864 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67417945 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67418540 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 67418783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67418879 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 67419916 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 67420642 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67420651 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 67420710 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67420758 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67421122 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67421223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67421280 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 67421291 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 67421332 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 67421479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67421515 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67421529 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67421536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67421617 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67421624 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67421679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67421682 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67421744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67421834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67422169 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 67422374 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 67422708 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67422732 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67422751 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 67422928 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67422946 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67422948 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67422966 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67422982 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67422992 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67423030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67423423 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67423454 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67423619 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67423620 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67424534 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 67424994 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 67425139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67425140 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 67425179 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67425198 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 67425232 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67425259 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67425269 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67425270 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67425320 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67425321 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67425333 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67425360 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67425383 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67425404 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 67425419 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67425537 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67425567 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67425573 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67425719 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 67425763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67425773 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67425917 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67425918 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67425944 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67425960 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67426036 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67426633 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67426722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67426735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67426771 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 67426772 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 67426803 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67427036 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67427171 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67427592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67428005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67428431 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67428544 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67428773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67428995 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 67429437 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67429965 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67429989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67430334 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67430999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67431435 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 67431891 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 67431945 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67432123 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 67432178 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67432347 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67432395 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 67432427 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67432430 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67432509 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 67432572 T A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 67432681 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 67432702 C T N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 67432837 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 67433276 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67433321 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67433442 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67434145 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67434339 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67434476 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67434975 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67435186 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67435662 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 67436389 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 67436396 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 67436460 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67436481 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 67436592 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67436720 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67436773 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 67436774 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 67436855 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67437269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67437347 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67437885 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 67439209 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 67439264 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 67439280 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 67439333 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 67439387 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67439489 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67439500 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67439743 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 67439751 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67439925 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 67440037 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 67440210 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 67440463 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 67440732 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 67440788 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 67440831 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 67441020 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67441118 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 67441152 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67441728 C G Y N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 67441744 G C Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 67441851 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 67441894 A G Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 67441909 T G Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 67441940 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 67441953 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 67441997 C A Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 67442844 C A Y N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 67442846 G A Y Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 67442856 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 67442868 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 67443237 G A Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 67443294 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 67443300 T C Y Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 3 67443402 C T Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 67443475 C T Y Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 3 67443487 G T Y N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 3 67443488 A T Y N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 3 67443501 G A Y Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 7 7 2 3 2 3 67443718 T C Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 67443757 C G Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 67444260 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67444327 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 67444461 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 67444498 A C Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 67444576 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67444624 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 67444785 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67444893 A G Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 67444940 C A Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 67445124 A C Y N 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 3 67445162 A T Y N 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 3 67445437 G C Y N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 67445444 T C Y Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 67445697 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 67445771 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67445920 G A Y Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 67445941 G T Y N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 67445951 T G Y N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 67446371 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67446897 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67446964 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67447486 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 67447564 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 67447835 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 67447973 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67448061 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67448210 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 67448492 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 67448575 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67448708 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 67448722 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 67448754 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 67449196 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67449218 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67449313 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67449446 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 67449678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67449754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67450080 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 67450148 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67450268 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 67450432 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 67450780 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 67450895 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 67451029 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 67451199 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 67451270 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67451287 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 67451332 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 67451382 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 67451397 A T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 67451432 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 67451680 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 67451695 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 67451911 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 67452039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67452047 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 67452075 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67452096 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67452179 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 67452194 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 67452203 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 67452207 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 67452242 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 67452662 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67452737 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 67452756 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67452812 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67452823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67453339 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 67453774 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 67454065 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67454217 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67454594 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67454842 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 67455241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67455569 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67455596 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 67455598 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67455643 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67455707 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67455758 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67455796 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67455818 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67456211 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67456778 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67456821 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 67456891 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67457040 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 67457574 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67457677 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 67457867 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67457921 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67457977 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67458074 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67458686 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67458912 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67460203 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67460445 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67460826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67462016 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 67462057 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 67462249 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67462353 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67462802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67463065 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67463079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67463212 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67463251 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67463317 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67463336 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67463365 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67463385 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 67463449 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67463620 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67463836 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67464157 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67464200 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 67464218 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 67464228 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67464262 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67464601 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67464651 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67464947 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67465232 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67465301 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67465319 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67465338 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67465403 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67465508 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67465537 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67465688 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67466105 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67466543 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67466664 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67466889 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67467000 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67467613 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67467645 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67467647 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 67467681 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67467691 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 67467808 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67467832 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67468207 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67468211 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67468260 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67468337 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 67468730 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67468744 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67468759 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67468818 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67468864 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67468885 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67468964 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67468969 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67469199 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67469264 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67469285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67469491 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 67469823 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 67470162 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67470293 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67470402 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 67470409 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67470967 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 67470975 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 67471002 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 67471007 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67471019 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67471091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67471109 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67471156 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67471209 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67471411 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67471579 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67471679 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 67471680 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 67471693 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 67471824 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67471845 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67471884 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67471957 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67471965 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67472004 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67472025 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67472050 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67472239 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67472310 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67472353 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67472533 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 67472540 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67472766 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 67472794 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 67472867 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 67472881 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 67472890 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67473102 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67473127 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67473145 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67473162 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67473205 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67473314 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67473371 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67473374 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67473390 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 67473439 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67473462 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67473545 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 67474166 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67474240 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67474264 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67474343 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67474708 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67475102 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 67475147 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 67475257 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67475270 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67475531 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67475556 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67475828 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67476096 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 67476590 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67476811 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67477147 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67477353 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 67477666 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67477820 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67478062 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 67478705 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67478858 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67479145 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67479149 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67479565 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67479634 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67479684 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 67479763 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67479796 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67479885 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67479978 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67480126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67480681 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67480702 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67480763 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67481013 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67482053 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67482422 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67482446 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67482479 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67482705 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 67482727 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67482841 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 67482915 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 67483056 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67483470 G A Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 67483484 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 67483541 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 67483559 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 67492422 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67492432 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 67492465 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 67492485 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67492562 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67493188 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 67493598 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67493874 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67493950 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 67494000 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67494221 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67494272 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67494373 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 67494656 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 3 67495130 C T N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 67495181 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 67495422 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67495520 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67495879 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67495938 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67496154 C T N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 67496168 C A N N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 67496190 A G Y Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 67496244 T A Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 67497412 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67497710 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67498142 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 67498210 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 67498718 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 67498975 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 67499580 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67500147 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67500377 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67500521 G A N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 67501728 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67501875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67501907 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 67502423 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67502789 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67503894 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67504059 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67504295 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67504485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67504929 C A N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 67505013 C T Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 67505091 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67505159 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 67505246 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 67505316 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 67505409 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 67505413 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 67505429 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 67505442 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 67505468 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 67505486 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 67505520 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 67505527 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 67505578 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 67505618 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67506276 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67506309 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 67507110 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 67507371 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67507436 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67507894 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 67507926 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 67508087 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67508249 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 67508260 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 67508312 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 67508318 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 67508376 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 67508398 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 67508429 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67508998 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67509121 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 67509843 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67510007 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67510095 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67510138 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67510215 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 67510573 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 67510603 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 67512068 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 67512470 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67512567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67512602 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67513177 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67514007 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67515089 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 67515373 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67515509 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67515621 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 67516261 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 67516456 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 67516522 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67516694 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 67517027 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67517763 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67518984 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67519034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67519569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67519609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67520324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67520885 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 67520908 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67521673 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67521756 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67522969 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67524303 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 67524670 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 67525492 C G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 67525715 T C Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 67526200 G T Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 67526599 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 67526873 G A Y Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 67527935 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 67528157 C G Y N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 67528559 C A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 67528630 G T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 67528737 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67528866 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67529257 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67530365 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67531389 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67531668 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 67532698 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 67532923 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 67533751 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67534239 T C Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 3 67534341 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 67536229 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67536333 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67536710 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 67537127 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 67537172 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 67537180 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 67537212 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67537262 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67537502 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 67537593 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67537875 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67537887 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67537927 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 67537930 C A N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 67537943 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67538060 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67538268 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 67538275 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 67538290 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 67538310 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67538411 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 67538424 T G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 67538429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67538436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67538488 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67538489 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 67539284 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67539287 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67539425 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67539861 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67539931 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67540046 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67540104 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67540130 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67540277 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67540284 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67540506 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67540601 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67540644 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67540658 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67540736 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67540819 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67540870 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67540887 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67541027 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67541107 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67541108 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67541123 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67541131 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67541152 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67541213 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67541289 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67541327 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67541384 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67541385 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67541406 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67541428 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67541436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67541526 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67541587 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 67541685 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67541780 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67541869 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67541915 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67542217 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67542321 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67542392 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67542424 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67542462 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67542466 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 67542548 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 67542704 G T Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 67542808 A T Y N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 67542837 C T Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 67543043 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 67543195 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 67543216 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67543238 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67543255 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 67543453 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67543768 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 67543780 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 67543837 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 67543847 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67543869 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 67543887 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67544042 A T N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 67544046 A T N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 3 67544065 C T Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 67544111 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 67544181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67544200 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67544456 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 67544459 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 67544508 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 67544628 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67544631 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67544791 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67544800 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67544968 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67545050 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67545266 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67545678 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67545681 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67545733 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 67545912 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67545991 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67546050 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67546065 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67546153 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67546193 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67546205 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67546207 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67546217 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 67546236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67546379 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67546414 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 67546466 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 67546539 G C Y N 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 67546554 T C Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 67546755 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 67546829 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67546833 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 67546873 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 67546892 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 67546946 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 67547005 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67547168 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67547479 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67547509 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67547580 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 67547611 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67547623 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67547688 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67547703 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 67547817 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67547836 T C Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 67547976 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67547989 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67547997 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 67548012 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 67548056 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 67548126 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 67548139 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67548147 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67548182 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67548219 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 67548242 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67548295 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 67548322 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 67548937 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67549108 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67549154 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67549179 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67549183 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67549252 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67549309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67549381 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67549520 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67549637 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67549652 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67549667 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67549683 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67549749 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67549763 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 67549764 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 67549800 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67550032 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67550144 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 67550235 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67550253 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67550275 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67550324 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 67550446 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67550603 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 67550651 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 67550790 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 67557761 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 67557837 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 67557897 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 67558002 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67558018 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 67558019 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67558179 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67558191 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67558261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67558336 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67558456 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67558524 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67558711 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 67558735 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 67558816 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 67558832 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 67558873 C A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 67558984 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67559013 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67559081 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67559116 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 67559714 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 67559859 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 67559888 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67559902 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 67559941 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 67559950 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 67560120 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 67560168 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67560182 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 67560194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67560261 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 67560289 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 67560325 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 67560337 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 67560360 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 67560407 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 67560412 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 67560542 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67560575 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 67560726 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 67560738 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 67560784 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67560821 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 67560835 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67560875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67561118 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 67561665 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 67561755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67561784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67561829 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67561830 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 67561941 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 67561961 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67561984 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67562046 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67562110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67562155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67562174 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67562290 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 67562331 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 67562560 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 67562606 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 67562710 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67562769 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67562875 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67562876 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 67562928 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67563042 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67563371 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67563390 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 67563550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67563567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67563760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67563957 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67564348 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67564404 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67564415 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67564418 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67564695 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67564790 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67565166 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67565183 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67565573 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67565586 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67565745 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 67565841 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 67565853 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67566120 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67566348 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67566406 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67566502 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67566674 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 67567387 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 67567417 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67567457 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67567616 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 67567663 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67567754 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67567770 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 67567807 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 67567874 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67568049 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67568128 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 67568180 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67568218 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67568231 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67568590 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67568668 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 67568704 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67568747 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67568759 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67568964 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67569000 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 67569027 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67569068 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 67569128 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 67569201 T A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 67569249 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 67569254 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 67569268 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67569293 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67569401 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67569407 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 67569537 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67569558 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67569574 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67569635 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67569660 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 67569813 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 67569933 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67569951 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67569977 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67570090 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67570122 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67570124 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67570136 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67570211 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67570238 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 67570245 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67570294 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67570304 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67570333 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67570405 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 67570502 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67570533 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67570596 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67570709 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67570750 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67570870 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67570888 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67570973 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 67570978 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 67571025 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67571088 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67571108 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 67571157 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67571389 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 67571420 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 67571421 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 67571442 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 67571490 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 67571592 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 67571733 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 67571799 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 67571828 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 67571854 A G Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 67571879 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67571982 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 67572033 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 67572056 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67572069 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 67572192 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 67572263 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 67572417 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 67572428 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 67572590 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 67572631 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 67572681 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 67572830 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 67572866 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67572868 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 67572963 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67572975 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67573031 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 67573041 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67573042 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67573053 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67573100 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67573111 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 67573164 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67573262 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 67573380 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 67573407 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67573412 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67573419 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67573434 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 67573525 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 67573562 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 67573567 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 67573586 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67573692 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 67573835 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 67574094 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67574637 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 67574646 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 67574698 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67574916 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67574924 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67574984 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67575044 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67575170 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67575281 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67575294 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 67575420 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67575423 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67575479 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67575560 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 67575768 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 67575904 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67575978 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67576021 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 67576243 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 67576311 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67576358 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67576727 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 67576749 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67576768 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 67576898 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67577050 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 67577066 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 67577176 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 67577206 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 67577284 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 67577302 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 67577927 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 67577936 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 67577943 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67577990 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 67578531 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67578650 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67578820 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67578827 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67578877 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 67579001 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 67579017 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67579190 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67579205 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67579234 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 67579260 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 67580115 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 67580121 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 67580133 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67580163 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 67581434 T C Y Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 67581538 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 67581551 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 67581650 A C Y N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 67581652 A G Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 67581694 C G Y N 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 3 67581696 A G Y Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 3 67581708 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 67581720 A G Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 67581852 G C Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 67581942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67582140 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67582218 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67582443 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67582704 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67582961 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 67582987 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 67583378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67583380 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67583489 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67584083 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67584153 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 67584217 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67584367 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 67584498 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 67584530 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 67584564 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 67584665 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67584667 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67584730 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67584750 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 67584821 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 67584959 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 67585055 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67585132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67585148 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 67585190 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 67585354 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 67585482 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 67585617 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 67585640 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 67585866 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 3 67586094 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 67586626 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 67586774 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67586824 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67586863 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67586888 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67586966 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 67587093 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67587307 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67587343 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67587361 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67587371 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67587483 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 67587535 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67587552 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67587596 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 67587665 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67587681 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 67587696 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 67587741 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67587766 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67588023 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67588024 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 67588101 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67588159 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 67588185 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67588206 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 67588218 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67588244 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 67588246 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67588260 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 67588293 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67588362 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67588422 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67588455 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67588523 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67588553 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 67588577 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67588851 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67588889 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 67588907 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 67588908 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67589084 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67589136 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67589325 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67589380 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67589416 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67589472 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67589476 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67589614 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 67589752 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 67589942 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 67589956 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 67589963 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67589977 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 67590049 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67590050 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 67590165 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 67590213 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 67597575 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 67597587 G T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 67597641 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 67597643 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 67597731 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 67597750 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 67597780 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 67597814 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 67597855 G A N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 67597878 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 67599661 C T Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 0.153846153846154 0.153846153846154 20 6 9 2 2 3 67599716 C G Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 67599729 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 67599925 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 67599963 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67599981 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 67600033 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 67600134 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 3 67600373 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.0555555555555556 18 18 1 16 1 3 67600496 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67600497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67600545 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 67600620 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 67600697 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67600698 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67600797 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67601008 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67601022 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67601222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67601283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67601521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67601537 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67601556 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67601654 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67601695 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 67601902 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 67601967 G T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 67602188 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67602317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67602590 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 67602824 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 67603014 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67603224 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67603259 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67603310 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67603522 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 67603603 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 67604044 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 67604048 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 67604164 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 67604327 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 67604365 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67604388 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 67604428 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 67604574 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67604637 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 67604691 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 67604731 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 67604853 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67605456 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67605581 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67605621 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 67605760 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67606016 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 67606303 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 67606306 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 67606576 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67606590 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67606655 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67606677 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67606696 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 67606880 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 67606883 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 67606912 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67607173 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67607272 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67607279 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 67607298 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67607349 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67607478 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67607544 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67607561 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67607568 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 67607651 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 67607726 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67607787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67608009 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67608015 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 67608050 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67608156 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67608169 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 67608247 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 67608261 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67608268 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67608344 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67608371 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67608460 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67608468 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67608509 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67608534 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67608555 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67608637 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 67608681 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67609021 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 67609271 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67609437 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67609779 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 67609788 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 67609816 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 67609885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67609930 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67609965 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 67609981 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 67610048 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 67610079 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 67610156 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67610223 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67610273 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 67610648 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 67610675 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 67610932 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 67611183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67611220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67611228 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67611381 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67611394 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67611402 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 67611496 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 67611510 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67611752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67611832 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67611833 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67611948 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67612001 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67612348 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 67612866 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67612946 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 67612955 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 67613019 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 67613064 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 67613083 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 67613128 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 67613185 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67613224 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 67613263 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 67613276 G C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 3 67613305 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 67613322 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67613332 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 67613335 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 67613400 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 67613437 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67613508 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 67613725 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 67613909 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67614023 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 67614184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67614331 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67614621 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 67615136 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67615217 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 67615221 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 67615315 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 67615332 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 67615344 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 67615360 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 67615389 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 67615598 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 67615633 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67615925 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 67616044 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 67616110 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 67616515 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67616552 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 67616595 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 67616791 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 67616814 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67616863 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67616958 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 67616978 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 67617101 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67617231 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67617264 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67617296 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67617310 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67617388 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 67617396 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 67617411 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 67617548 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 67617582 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 67617618 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 67617633 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67617653 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67617861 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 67617975 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67617984 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67618016 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67618062 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67618141 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 67618207 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67618460 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 67618505 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 67618517 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 67618804 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 67619011 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67619055 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 67619200 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67619346 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 67619362 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67619455 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67619484 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67619580 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67619715 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 67619747 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 67619756 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 67619844 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 67619905 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67619949 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67620066 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67620087 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67620095 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67620166 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 67620309 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 67620319 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 67620329 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67620445 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67620498 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67620644 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67620717 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 67620829 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 67620907 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67621155 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67621212 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 67621221 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 67621267 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 67621470 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 67621509 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 67621567 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 67621898 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 67621947 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67621991 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 67622090 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67622115 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 67622134 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 67623373 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67623380 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67624053 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67625063 C G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 67625520 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 67627591 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 67627602 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67627639 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67627716 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67627828 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 67627848 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 67627852 G C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 67627866 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67627878 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 67627986 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 67628049 G T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 67628125 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67628138 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67628146 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 67628191 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 67628250 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67628306 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67628320 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 67628363 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67628444 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 67628505 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 67628601 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 67628654 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 67628669 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 67628704 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 67628705 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 67628751 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67628945 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67628963 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 67628964 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 67629002 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 67629026 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 67629051 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67629078 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67629107 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67629165 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67629170 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67629187 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67629423 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67629463 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67629499 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 67629504 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67629524 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 67629525 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67629537 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67629583 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67629594 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67629601 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67629642 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67629652 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67629656 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67629685 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67630356 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67630422 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 67630667 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 67630737 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 67630744 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 67630770 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67630823 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67630913 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 67630971 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67631045 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67631128 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67631139 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67631195 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 67631373 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67631566 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 67631760 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 67631925 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 67631926 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 67632169 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 67632249 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 67632428 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67632524 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 67632619 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 67632904 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 67632930 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67633015 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67633496 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67634195 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67634269 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67634724 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67635336 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67635414 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67635973 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67638792 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67640263 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67640563 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 67640845 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67640997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67641130 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67641783 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67642350 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67642796 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67643937 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67646460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67649272 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 67649338 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67649400 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67649465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67649690 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 67649774 A G Y Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 3 67649889 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 67649955 T C N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 67650033 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 67650059 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 67650185 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 67650247 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67650347 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67650437 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67650439 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 67650506 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67650649 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 67650862 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 67651394 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67651547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67651627 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67652397 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67652855 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67652908 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 67652926 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 67652931 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 67652961 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67653014 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 67653325 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 67653346 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 67653349 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 67653383 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 67653439 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 67653440 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67653451 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67653460 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67653609 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67653616 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67653806 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67653898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67653899 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67653990 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 67653992 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 67654117 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 67654137 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 67654410 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 67654453 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67654481 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67654496 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67655327 G C N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 67655962 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 67656130 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 67656159 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 67656183 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67656220 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67656221 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67656800 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 67656974 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67657000 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67657245 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67657572 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 67657967 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 67658267 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67658787 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67659014 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67659026 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 67659066 A C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 67659367 C A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 67659848 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67661076 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67661336 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67661611 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67661727 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 67661728 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 67661769 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67661843 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67661883 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67661950 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67661951 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 67661989 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67662159 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67662412 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67662494 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 67662558 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67662560 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67662585 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 67662687 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 67662732 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 67662807 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67662953 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 67663268 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67663285 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 67663290 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67663755 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67663773 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 67663917 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67664119 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 67664150 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67664382 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 67664418 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67664628 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 67664714 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 67665048 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 67665531 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67665607 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 67665846 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67669686 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67671222 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67671958 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 67672036 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 67672375 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 67673134 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67673144 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67673145 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67673487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67674201 T C Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 67674372 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67674556 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67674597 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67674672 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67674767 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67675129 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67675717 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67675724 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67675742 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 67676168 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67676397 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67676582 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 67676588 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 67676772 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67677047 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 67677048 T G N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 67677413 A T Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67677443 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67677924 T G Y N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 3 67678152 G T Y N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 3 67678188 A G Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 67678241 C G Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 67678497 T A Y N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 67678805 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 67679062 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67679275 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 67679411 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67679480 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67679623 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67679799 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67680011 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67680057 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 67680105 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67680979 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67681298 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67681619 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67682202 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67682787 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 67682818 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 67682838 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 67682890 G A N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 67682895 G A N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 67682925 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 67682987 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 67683002 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 67683086 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 67683360 C G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 67683589 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 67683637 G C N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 67683694 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 67683832 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 67683955 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67684003 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67684056 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 67684063 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67684089 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67684295 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67684358 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67684373 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67684397 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67684467 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67684480 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 67684559 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 67684694 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67684744 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67684763 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67684820 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67685004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67685027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67685061 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67685071 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67685105 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67685137 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67685177 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67685185 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67685324 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67685354 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67685357 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67685468 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67685476 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 67685503 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67685528 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67685562 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67685624 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67685698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67685706 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67685734 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67685771 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67685778 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 67685848 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67685879 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 67685966 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67686035 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 67686112 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67686118 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 67686186 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67686309 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67686672 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67686895 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67687828 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 67688404 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67688610 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67688680 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67688703 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 67688812 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67688906 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67689382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67689395 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 67689475 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67689941 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67689951 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67690441 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67690564 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67690923 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67690993 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 67691145 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 67691596 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67691676 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 67691786 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67691793 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67691808 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67693368 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67693489 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67693509 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67693571 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67693816 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 67693942 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 67693956 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 67694067 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67694307 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67694481 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67694934 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67694985 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67695399 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67695410 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67696544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67697833 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 67698284 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 67698566 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67698788 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67698896 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67698990 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67699484 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67699613 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67699615 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67699760 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67699780 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67699793 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67699797 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67699806 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67699837 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67699917 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67699929 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67699949 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67700018 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 67700319 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67701075 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 67701249 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 67701596 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67701610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67701861 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67702179 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67702201 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67703600 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 67703604 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67703754 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67704223 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67704271 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67704557 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67704818 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67704923 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67704931 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 67704939 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 67705161 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67705198 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67705400 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67705433 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67705510 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 67705512 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 67705740 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67706198 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.714285714285714 0.285714285714286 10 18 0 10 4 3 67707186 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 67707548 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 67708413 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67709136 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67710123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67710475 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67711346 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67711351 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 67712710 C G Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 67712918 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67713003 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67713017 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 67713040 T G Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 67713082 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67713097 G C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 67713704 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67713707 T A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 67713821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67714890 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 67714938 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67715052 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67715484 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67715521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67719046 A G Y Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 3 67719683 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67719694 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67719932 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67722231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67723532 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 67723590 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67723752 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67723942 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 67724136 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67724763 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67725754 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67727857 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 67727880 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67727935 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 67728084 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 67728170 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 67728184 A G N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 3 67728434 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 67729925 G A N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 3 67729939 A G N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 7 13 1 5 4 3 67731951 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 67732086 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 67735673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67736430 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67737160 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67737357 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67738926 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67739624 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67741794 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67745714 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67746404 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 67746775 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67747225 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 67747300 G A N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 67747637 A C Y N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 67748492 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67748976 G A Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 67749184 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 67749307 G A Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 67749955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67750639 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 67751835 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67751856 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 67752429 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 67752494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67752559 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 67752573 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67752638 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 67752656 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 67752750 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 67752771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67752818 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 67752894 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 67752915 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 67753035 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 67753089 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 67753110 T G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 67753154 C A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 67753187 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 3 67753210 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 67753246 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 67753281 A T N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 3 67753412 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 67753429 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 67753595 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67753614 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67753628 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67753644 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67753657 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 67753688 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 67753815 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 67753840 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 67754235 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67754510 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 67754587 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 67754621 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67754716 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67754720 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67754767 A C N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.0588235294117647 0.764705882352941 0.176470588235294 15 19 1 13 3 3 67755394 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 67755467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67755750 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67756119 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 67756163 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67756870 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67758197 A C Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 67758932 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 67759028 G A N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 67759255 A G N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 67759555 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67759951 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 67760198 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 67760435 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 67760625 T C N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 3 67761282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67761411 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 67761744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67761925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67762025 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67762230 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67762704 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67763105 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67763134 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67763190 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67764529 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 67764942 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 67765552 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67765625 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 67765652 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67765672 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 67765815 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 67766016 C G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 67766224 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 67766277 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 67766291 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 67766363 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 67766518 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 67766526 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 67766539 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 67766557 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 67766590 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 67766641 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 67766737 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 67766779 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 67766818 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 67766900 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 67766925 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 67766947 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 67766974 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 67766985 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 67767013 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 67767065 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 67767069 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 67767135 G A N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.230769230769231 0.615384615384615 0.153846153846154 14 12 3 8 2 3 67767310 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 67767316 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 67767338 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 67767347 T A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 67767414 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 67767481 A G N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 3 67767569 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 67767595 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 67767660 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 67767730 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 67767742 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 67767747 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 67767785 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 67767830 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 67767848 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67767903 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 67767915 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 67768021 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 67768030 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 67768032 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 67768109 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 67768138 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 67768245 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 67768338 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 67768464 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 67768939 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67769935 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 67770050 A T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 67770749 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67770874 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67771006 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67771116 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67772165 C T Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 67773575 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 67773642 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 67773910 A G Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 67773918 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 67774001 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67774682 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 67774696 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 67774912 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 67775019 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67775120 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 67776031 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 67776135 A C Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 67776138 T A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 67776702 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67776993 C A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 67777511 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67777825 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 67778792 A T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 67779589 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67780148 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 67780167 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 67780423 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 67780959 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 67781059 T C N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 67781072 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 4 8 2 0 4 3 67781286 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 67781320 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 67781335 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 67781442 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 67781458 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67781608 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67781644 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67781705 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67781735 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67781787 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67781924 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67781926 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67781958 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67781996 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 67782042 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67782277 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 67782300 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 67782318 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67782667 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 67783286 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 67783467 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 67783943 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 67784079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67784164 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 67784260 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 67784267 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67784511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67784672 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 67785101 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 67785119 A G N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 15 9 6 3 3 3 67785454 T A Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 67785455 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 67785716 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 67785769 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 67786157 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 67786245 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 67786269 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 67786279 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 67786301 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 67786348 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 67786403 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 67786435 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 67786505 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 67786526 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 67786538 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 67786619 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 67786786 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 67787004 A C N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 67787042 C A N N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 3 67787092 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 67787128 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 67787179 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 67787199 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 67787218 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 67787286 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 67787333 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 67787389 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 67787535 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 67787668 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 67787708 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 67787783 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 67787798 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67788053 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 67789281 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 67789297 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67790338 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67790759 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67790930 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 67790937 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 67791057 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 67791165 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67791268 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 67791279 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 67791751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67791779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67792146 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67792248 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67792822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67793519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67794097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67794658 T C N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 3 67794764 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67799502 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 67799986 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 67800257 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67800469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67800577 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67800600 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67800948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67802065 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 67804455 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 67804543 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67805134 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67805167 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 67805171 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 67805221 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 67805243 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67805276 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67805469 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 67805494 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 67805722 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 67805853 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67806015 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 67806033 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 67806042 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 67806213 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67806234 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67806253 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67806750 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67806809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67806835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67807141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67807234 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67807413 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 67808246 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 67808359 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67808437 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 67808459 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 67808521 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 67808558 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 67808592 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 67808771 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 67808855 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 67808890 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67808920 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67808922 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67808978 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 67809001 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 67809036 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 67809221 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 67809277 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 67809902 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 67809983 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 67809984 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 67810208 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67810513 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67810578 T A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 67810734 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 67810909 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67810958 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67810965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67811009 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 67811024 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 67811032 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 67811180 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 67811312 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 67811508 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 67811550 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 67811699 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 3 67811764 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 67811817 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 67811856 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 67811932 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 67812065 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 67812122 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 67812163 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 67812432 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 67812440 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 67812738 T G N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 67812866 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67813206 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 67813246 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 67813430 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 67813713 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 67813754 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67813800 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67813814 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67813857 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67813913 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 67813949 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 67814156 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 67814170 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67814223 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 67814224 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 67814284 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67814406 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67814473 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 67814554 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 67814582 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 67814602 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 67814611 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67814627 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67814760 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67814859 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 67814910 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67814921 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 67814960 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67815184 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 67815242 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67815251 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67815419 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67815537 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67815581 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67815670 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 67816084 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67816116 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 67816177 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67816266 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67817021 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67817601 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67817611 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67818460 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 67818492 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67818559 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67818653 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67819739 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 67820808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67821635 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 67821990 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67823842 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67823923 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67824119 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67824148 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 67824154 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 67824389 C T N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.571428571428571 0.214285714285714 0.214285714285714 19 9 8 3 3 3 67824396 G C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 67824426 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 67824641 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67824686 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 67824857 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67825158 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 67826092 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 67826254 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67826413 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67826691 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67827000 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 67827049 A T N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 67827063 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 67827262 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 67827293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67827536 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 67827647 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 67827652 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 67827929 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 67827965 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 67828139 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67828291 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 67828307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67828353 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 67828405 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 67828436 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 67828444 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 67828843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67828856 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 67828887 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 67828899 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 67828973 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 67830333 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 67830469 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 67830533 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 67830714 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67830743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67831083 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67831197 G A N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 3 67831323 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67832407 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67832551 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67832701 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 3 67833107 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 67833249 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67833320 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 67833535 A C Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 67833965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67834135 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 67834964 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 67835394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67835406 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 67835414 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 67835588 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 67835608 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 67835957 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 67836214 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 67836314 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 67836352 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 67836384 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 67836431 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 67836438 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67836528 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 67836613 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 67836626 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67836709 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 67836731 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 67836770 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67836800 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67836802 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 67836833 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67836921 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67837067 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67837090 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67837109 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67837209 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67837297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67837354 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67837361 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 67837490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67837883 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67838329 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67838902 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 67838975 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67839008 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 67839936 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67840985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67841037 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 67841090 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 67841308 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67841381 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67841778 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 67841791 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 67841823 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 67841875 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67841908 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 67842028 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67842156 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67842229 C T N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 67842237 G A N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 3 67842760 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 67842840 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 67842909 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67842982 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67843021 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 67843263 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 67843391 T G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 67843406 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67843461 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 67843623 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 67843668 A G N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 3 67843713 T G N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 67843807 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67843819 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67843849 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 67843868 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 67844453 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 67844465 T C N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 67844482 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 67844793 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67844858 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67844870 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67844928 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67844931 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67844947 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67845023 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67845037 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67845290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67845365 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67845493 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67845500 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67845635 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67845660 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67845688 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67845726 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 67845753 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 67845768 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67845781 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 67846112 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 67846130 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67846131 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67846170 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67846611 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 67846622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67846711 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 67846712 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67846735 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 67846825 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 67846857 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 67846912 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 67847114 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 3 67847158 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 67847209 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 67847260 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 67847318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67847351 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67847389 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 67847429 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 67847438 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 67847552 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 67847594 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 3 67847620 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 67847945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67848085 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 67848183 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67848215 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67848302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67848320 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 67848344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67848392 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 67848544 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67850493 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 67850562 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67850987 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 67851998 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 67852090 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 67852746 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 67853182 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 67853383 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67853402 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 67853879 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67853920 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67853968 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 67854208 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67854446 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 67854761 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 67854786 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67855521 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67856199 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67856237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67856308 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67856547 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 67856750 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67856820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67856936 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 67857122 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67857348 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 67857883 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 67858003 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 67858009 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 67859001 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67859352 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 67859658 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 67860895 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67860990 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67861044 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 67861099 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 67861338 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 67861460 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67861497 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 67861545 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 67861598 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 67861600 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 67861699 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 67861738 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 67861755 T G Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 67861815 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 67861844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67861872 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 67861978 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67862005 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 67862137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67862205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67862239 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 67862268 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 67862441 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67862470 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67862588 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67862816 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67862977 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 67863172 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67863410 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 67863486 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67863729 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67863891 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 67864127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67864386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67865156 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67865247 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 67865272 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 67865319 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 67865327 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 67865411 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 67865441 A G Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 67865468 T C Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 67865516 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 67865915 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67865966 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67866018 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 67866176 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67866318 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 67866526 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 67866544 T C Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 67866622 T A Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 67866754 C G Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 67866790 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67866816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67866980 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 67867062 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 67867128 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 67867287 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 67867554 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 67867581 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 67867644 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 67867873 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67867945 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 67867953 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 67868492 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67871559 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67871882 A T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 67872591 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67872616 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67872824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67872857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67873763 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67874192 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 67874205 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67874522 T C Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 67874651 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67874884 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 67875235 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67875283 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67875712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67876283 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67876326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67876756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67876894 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67877058 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67877064 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67877129 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 67877232 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 67877521 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67877928 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 67878242 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67879158 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67879240 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67879418 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67879427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67879526 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67879579 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67879590 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67879596 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67879632 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67879682 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67879691 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67879778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67879977 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67880056 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 67880853 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 67880910 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 67881037 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 67882066 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 67882094 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 67882144 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 67882232 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67882307 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67882415 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67882428 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 67882623 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 67882754 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 67882758 A T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 67882797 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 67882918 A G N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 3 67883157 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 67883174 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 67883311 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 67883446 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 67884114 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 67884286 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 67884392 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 67884525 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 67884553 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 67884656 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 67884788 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67884795 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67884840 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67885072 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67885157 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67885212 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67885215 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67885536 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 67885583 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 67885703 T A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 67885726 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67885742 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 67885765 A T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 67885766 A C Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 67885803 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 67886122 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 67886140 T A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 67886339 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 67886361 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67886405 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 67887111 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67887242 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 67887263 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67887382 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67887440 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 67887457 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 67887567 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67887592 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 67887651 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 67887665 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67887734 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67887746 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67887772 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67887788 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67887894 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67887968 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67887974 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 67887997 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67888078 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 67888098 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 67888113 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67888143 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67888228 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67888307 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67888308 A T Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 67888320 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 67888345 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67888625 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67888720 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67888877 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67888904 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67889000 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 67889006 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67889176 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67889232 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67889640 G A Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 67889698 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 67889863 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67890004 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67890515 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67890577 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67890602 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67890615 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 67890741 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67890820 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 67890944 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67891015 C A Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 67891037 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 67891224 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 67891250 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67891765 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 67891770 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 67891792 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 67891858 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67892257 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 67892401 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 67892433 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 67892448 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 67892634 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67893506 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 67893570 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 67893591 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67893642 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 67893829 C G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 67893933 G A N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 67893977 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 67894087 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 67894161 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 3 67894189 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 3 67894595 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 67894606 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 67894684 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67894793 C G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 67894881 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 67894937 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67894954 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 67895078 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 67895216 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 67895236 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 67895258 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67895266 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 67895397 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 67895439 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 67895469 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 67895475 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 67895682 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 67895692 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 67895735 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 67895748 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 67895876 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 67895879 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 67895928 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 67896096 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 67896279 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 67896290 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 67896627 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 67896671 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67897115 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 67897146 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 67897522 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67897535 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 67897762 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 67897837 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 67897945 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67898000 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 67898007 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 67898191 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 67898311 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67898356 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 67898388 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 67898401 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 67898477 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67898527 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 67898655 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 67898717 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67898718 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67898781 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67898825 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67898859 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 67899106 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 67899661 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 67899731 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 67899871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67900440 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67900578 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 67900722 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 67900939 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67900943 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67901396 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 67901665 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 67901879 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 67902011 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 67902094 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 67902130 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 67902145 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67902162 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 67902259 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67902313 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 67902349 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 67902376 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67903008 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 67903245 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 67904538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67906024 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 67906145 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67907106 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67907670 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 67908550 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67910168 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67910436 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 67911834 A G Y Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 67911856 C A Y N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 3 67911907 G T Y N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 67912019 A G Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 67912734 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 67912861 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67913928 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67914059 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67915370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67915717 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67915727 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 67916041 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67916548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67916574 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67916983 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 67917240 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67917537 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67923562 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 67923783 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 67924103 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 67924120 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67925045 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67926361 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67926469 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67926855 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 67927571 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67927782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67927984 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 67928003 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 67928066 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 67928211 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67929037 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 67929602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67930338 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67932541 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 67932574 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67932610 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 67932611 C A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 67932639 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 67932762 T G Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 67932788 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 67932793 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 67932811 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 67932869 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 67932882 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 67932894 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 67932900 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 67933087 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67933511 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 67934424 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 67934434 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 67934510 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 67934611 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 67934645 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 67934675 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 67934709 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 67934743 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 67934816 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 67934817 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 67934938 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67935101 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 67935307 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 67935329 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 67935330 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 67935453 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 67935557 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 67935628 A T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 67935750 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67935897 A T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 67936142 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 67936145 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 67936164 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67936187 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 67936241 G A Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 67936342 A G N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 3 67936388 A G N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 67936463 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 67936532 A C Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 67936664 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67936710 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67936744 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 67936826 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67936903 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 67936925 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 67937026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67937039 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 67937059 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 67937086 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 67937242 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67937249 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 67937317 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 67937369 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 67937383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67937478 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 67937489 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 67937658 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67937697 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 67937869 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 67937889 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 67937914 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 67938095 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67938217 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 67938231 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 67938254 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 67938262 C A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 67938273 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67938891 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67938922 C T Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 67939008 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 67939107 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67939477 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 67939484 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 67939541 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67939882 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67940143 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67940163 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67940170 A T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 67940575 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 67941116 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67941287 A C Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 67941576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67941577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67941598 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67941936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67942007 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67942122 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 67942449 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 67942728 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67942734 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 67942743 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67942764 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 67942954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67943793 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 67943795 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 67944072 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 67944242 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 67944284 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 67944340 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67944467 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 67944475 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 67944484 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67944667 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 67944693 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 67944719 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 67944720 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 67944738 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67944749 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 67944814 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 67944900 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 67944935 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 67945184 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67945200 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67945332 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 67945512 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67945613 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67945665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67945727 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 67945737 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 67945846 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 67945935 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 67946305 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67946363 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67946370 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 67946387 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67947244 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 67947279 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67947343 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67947348 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 67947384 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 67947829 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 67947980 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 67948003 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67948634 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 67948827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67948925 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67949125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67949725 C G N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 67950218 C A Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 67950908 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 67951111 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67951264 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 12 24 0 12 6 3 67952191 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67952378 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67952581 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67952775 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67952815 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67952821 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 67952836 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 67952887 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 67952913 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67952919 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 67952946 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 67953089 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67953210 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 67953507 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67953688 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67953798 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 67953856 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 67953857 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 67954145 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67954237 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67954405 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67954451 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67954531 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67954732 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67954923 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 67955222 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67955440 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 67955473 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 67955525 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 67956304 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67956374 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67956582 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 67956676 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67956677 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67956709 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 67956778 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67956960 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67957038 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67957148 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 67957301 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67957536 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67957612 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 67957670 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67957752 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67958061 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67958069 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67958200 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67958647 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 67958810 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 67959012 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 67959386 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 67959761 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 67959853 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67960223 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67960294 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67960548 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67960607 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67960608 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67960712 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67960713 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 67960882 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67960896 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67960911 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67960943 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67961075 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 67961170 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67961208 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67961261 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 67961264 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 67961417 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67961419 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67961487 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67961529 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67961539 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67961673 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67961675 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67961687 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67961696 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67961932 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67962063 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67962372 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 67962695 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 67962814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67962923 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 67962964 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67963024 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67963045 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67963127 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67963128 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67963256 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67963280 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67963294 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67963420 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 67963552 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 67963902 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67963925 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67963958 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67964020 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67964276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67964500 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67964548 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67964568 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67964593 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67964622 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 67964675 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67964731 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67964741 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67964776 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67965033 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67965224 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67965278 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67965286 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67965296 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67965300 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67965316 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67965379 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67965583 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67965638 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67965651 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67965728 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67965767 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67965768 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67965815 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67965818 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67965827 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67965838 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67965924 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67966123 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 67966125 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 67966174 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67966201 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 67966254 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67966271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67966458 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67966516 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67966554 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67966628 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67966706 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67966743 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67966935 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67966969 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67966982 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 67967034 A G Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 67967069 A G Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 67967328 A G Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 67967619 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 67967809 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 67967837 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67967849 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67967895 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67967949 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67968095 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67968156 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67968199 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 67968301 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 67968720 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67968785 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 67968786 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67968909 C T Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 67969037 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67969138 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67970480 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67970547 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67970564 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67970590 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67970621 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 67970623 G C Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 67970684 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 67970695 G A Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 67970712 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67971017 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67971296 C T Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 67971457 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67971471 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 67971717 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67971797 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67971908 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67971976 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67971999 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 67972003 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 67972147 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67972150 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67972160 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67972182 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67972183 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 67972310 T A Y N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 67972337 G T N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 67972540 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67972546 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67972634 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 67972639 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 67972795 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 67972814 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 67972833 T G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 67972890 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67973020 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67973034 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67973160 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67973161 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67973294 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67973351 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67973412 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67973738 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 67973982 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67974041 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67974092 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67974178 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67974269 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67974271 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67974425 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67974466 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67974545 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67974558 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67974656 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67974676 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67974699 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 67974833 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67974847 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67974855 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67974885 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67974976 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67975031 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67975045 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67975092 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 67975174 G A N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 67975374 A G N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 3 67975416 T C N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 67975430 G C N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 3 67975471 C A N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 67975535 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 67975806 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 67975852 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 67975929 A C N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 67975963 A T N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 67975985 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 67976031 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 67976169 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67976182 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67976204 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67976235 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67976283 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67976324 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67976364 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67976371 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67976400 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67976482 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 67976496 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67976508 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 67976528 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67976615 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67976632 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67976674 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67976707 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67976711 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67976795 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67977093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67977097 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67977335 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67977339 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67977435 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67977496 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67977508 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67977609 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67977719 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67977795 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67977957 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67978140 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67978253 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67978321 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67978385 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67978457 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67978464 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67978515 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67978615 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67978658 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67978726 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67978780 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67978811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67978820 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67978876 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67978938 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67978944 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67978957 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67979323 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67979398 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67979412 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67979450 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67979486 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67979498 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67979523 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67979540 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 67979584 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 67979806 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 67979849 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67979887 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67979964 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67980000 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67980039 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67980058 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67980095 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67980165 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67980261 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67980371 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67980426 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67980478 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67980598 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 67980934 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67980941 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67981039 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67981394 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67981519 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67981535 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67981658 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67981765 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67981812 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 67982119 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 67982664 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 67982780 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67982886 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67982896 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67982915 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67983240 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67983424 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67983631 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67983713 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 67983716 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 67984235 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 67984254 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67984277 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67984369 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67984392 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67984429 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 67984447 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 67984527 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 67984570 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 67984585 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 67984643 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 67984652 T C Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 67984789 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 67984855 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 67985001 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 67985076 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 67985125 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 67985190 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 67985235 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67985292 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67985300 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67985512 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67985700 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 67985827 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67985900 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 67986246 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67986381 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67986415 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 67987011 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 67987036 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 67987067 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 67987107 C A Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 67987143 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 67987175 A G Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 67987841 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67988092 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 67988213 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 67988345 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67988349 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67988500 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 67988544 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 67988935 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 67989029 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67989053 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67989320 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67989623 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 67989845 G C Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 67989882 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 67990037 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 67990070 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 67990085 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 67990228 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 67990253 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 67990346 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 67990361 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 67990363 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 67990388 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 67990392 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 67990429 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67990500 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67990656 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67990915 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67990916 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67990999 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 67991043 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 67991112 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 67991236 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 67991383 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67991413 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 67991491 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67991540 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67991675 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67991711 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67991877 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67991933 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67991959 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67992018 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67992047 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 67992197 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67992223 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67992263 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67992363 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67992396 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67992421 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67992802 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67993023 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67993028 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67993077 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67993237 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67993301 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67993800 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67993975 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 67994068 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67994111 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67994139 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67994313 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67994427 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67994465 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 67994522 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67994530 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 67994614 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67994674 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67994695 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 67994696 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 67994827 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67994844 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67994871 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67994953 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67995000 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67995061 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67995069 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67995115 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67995168 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67995229 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67995362 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 67995411 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 67995431 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67995505 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 67995569 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 67995584 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 67995670 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 67995677 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 67995713 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67995759 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67995778 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67995828 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67995840 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 67995868 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67995921 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67995961 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 67995996 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67996010 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67996072 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67996101 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67996152 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67996191 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 67996550 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 67996626 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67996645 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67996682 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 67996818 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 67996834 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 67996875 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 67996919 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 67997000 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 67997044 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 67997063 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 67997067 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 67997098 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 67997113 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 67997155 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 67997278 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 67997290 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 67997321 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 67997372 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 67997396 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 67997409 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 67997963 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 67998020 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 67998154 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 67998158 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 67998245 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 67998311 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 67998386 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 67998403 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 67998694 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 67998886 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 67999026 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 67999040 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 67999580 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 67999581 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 67999699 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 67999882 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 67999983 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 68001102 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 68001116 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 68001387 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 68001409 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 68001455 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 68001465 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 68001497 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 68001503 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 68001525 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 68001542 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 68001584 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 68001723 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 68001748 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68001818 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 68001900 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68001905 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 68001913 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 68002046 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68002090 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 68002112 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 68002132 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68002204 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68002274 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68002302 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68002490 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68002516 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68002698 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68002735 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68002739 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68002940 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 68004278 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68004350 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68004423 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68004959 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68005017 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68005035 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68006205 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 68006550 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 68006678 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 68006683 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 68006939 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 68007512 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 68007646 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68007693 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 68007859 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 68007864 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 68008436 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68008535 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 68008561 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 68008621 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 68008720 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 68008792 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 68008849 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68008876 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68008887 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 68008970 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 68009014 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 68009600 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 68009602 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68009724 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 68009816 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 68009817 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 68009831 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68009848 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 68009913 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 68009935 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 68009936 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 68009948 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 68009993 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 68010009 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 68010018 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 68010102 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 68010153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68010208 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 68010255 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 68010387 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68010420 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 68010510 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 68010512 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68010530 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68010549 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 68010601 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 68010723 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 68010872 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 68010922 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 68010945 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 68010952 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 68011093 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 68011094 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 68011126 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 68011147 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 68011171 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 68011210 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 68011274 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 68011438 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 68011698 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 68011802 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 68012110 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 68012234 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 68012246 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 68012394 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 68012732 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 68012861 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 68013117 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 68013141 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 68013159 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 68013241 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 68013567 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 68013633 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 68013731 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 68013836 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 68013845 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 68014897 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 68015150 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 68015325 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 68016837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68017043 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 68017883 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 68018513 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 68018852 T G N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 68019112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68021966 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68022267 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 68023655 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 68024546 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 68025673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68025695 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68025701 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 68025801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68025943 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 68025964 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68026045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68026325 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 68026417 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 68026566 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 68026655 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 68026660 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 68026718 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 68026764 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 68026870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68027000 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 68027011 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 68027172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68027469 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 68028124 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 68028201 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 68028256 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 68028286 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 68028403 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 68028419 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 68028436 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 68028459 T G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 68028470 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 68028474 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 68029107 C T N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 68029165 G A N Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 10 6 3 4 1 3 68029219 C A N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.266666666666667 0.666666666666667 0.0666666666666667 18 12 4 10 1 3 68029249 A G N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.230769230769231 0.692307692307692 0.0769230769230769 15 11 3 9 1 3 68029261 G A N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.333333333333333 0.583333333333333 0.0833333333333333 15 9 4 7 1 3 68029271 A G N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.307692307692308 0.615384615384615 0.0769230769230769 16 10 4 8 1 3 68029710 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 68029712 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 68029791 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 68029837 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 68029859 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 68029909 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 68029920 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 68030649 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68031054 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 68031064 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 68031087 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68031215 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 68031332 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 68031340 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68031401 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 68031430 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 68031609 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 68031637 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68031734 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68031817 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 68031929 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 68032006 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 68032064 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 68032161 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 68032253 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68032328 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 68032347 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68032488 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68032507 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 68032622 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68032673 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 68032828 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 68033016 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 68033061 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68033096 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 68033136 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 68033183 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 68033274 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68033642 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 68033804 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68033816 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68033882 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 68033912 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 68033937 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 68033982 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 68034042 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68034055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68035467 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 68035473 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 68035522 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 68035591 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68035713 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68036708 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 68036814 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 68036857 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 68036860 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 68037099 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 68037110 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 68037198 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 68037244 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 68037346 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 68037357 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 68037491 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68037522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68037530 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 68037682 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 68038664 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 68039008 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 68039141 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 68039690 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 68039854 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 68039884 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 68040406 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 68040448 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 68040567 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 68040602 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 68040613 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 68040652 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 68040692 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 68040695 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 68040887 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 68041133 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 68041201 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 68041867 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 68042052 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 68042117 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68042351 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 68042621 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 68042641 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68042772 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 68042870 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68042905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68043107 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 68043218 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68043384 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 68043481 T G N N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.333333333333333 0.25 0.416666666666667 11 13 4 3 5 3 68043521 G A N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.363636363636364 0.636363636363636 0 15 7 4 7 0 3 68043650 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 68043717 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 68043731 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 68043818 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 68043880 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 68043895 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 68043947 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 68044016 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68044034 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68044172 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 68044372 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68044503 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68044575 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68044658 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 68044709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68044775 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 68044917 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 68044929 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 68044943 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 68045204 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68045253 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68045285 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68045318 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68045421 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68045435 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 68045504 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 68045510 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 68045637 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68045647 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 68045658 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68045816 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 68045817 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 68045827 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 68045913 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 68045961 T C Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 68046033 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 68046095 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68046121 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 68046182 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 68046491 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 68046740 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 68046825 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 68046877 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 68047365 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 68047771 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 68047999 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 68048190 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 68048281 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68048472 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68048788 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68049094 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 68049535 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 68049621 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68049671 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68049817 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68049895 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 68049896 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68051340 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 68051642 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 68051682 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 68051782 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 68052333 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 68052466 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68052480 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 68052483 G A Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 68052502 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 68052793 G A N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 3 68052928 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 3 68053025 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.416666666666667 0.5 0.0833333333333333 16 8 5 6 1 3 68053177 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 68053474 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 68053527 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 68053656 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 68053771 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68054181 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68054185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68054260 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68054341 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68055101 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 68055155 G A Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 68055278 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 68055785 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68056349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68056628 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68057304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68057548 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 68057635 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 68057715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68058203 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 68058626 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 68058664 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 68059262 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68059732 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 68060358 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68060467 A T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 68060531 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 68061300 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 68061362 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 68061717 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 68061983 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68062525 T A N N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 68063966 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68063981 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68064079 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 68064137 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 68064176 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68064206 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 68064339 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 68064604 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 68064915 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 68064929 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68064946 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68064965 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68065258 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 68065297 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 68065313 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68065366 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 68065380 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 68065385 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 68065401 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 68065642 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 68066131 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 68066405 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 68066906 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68067146 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 68067176 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 68067671 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 68067939 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 68068082 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 68068198 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68068334 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68068807 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68068989 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68069178 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 68069435 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68069668 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 68070217 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68070711 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68070928 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68071035 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 68071054 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 68071274 T A N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 68071751 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68072600 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68072721 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68074383 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68074810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68076356 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68077315 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 68077372 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 68077619 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 68077695 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 68077733 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 68077799 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68077818 T G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 68077839 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 68077933 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 68077935 T G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 68078413 G A Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 68078536 C G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 68078740 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68078764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68078793 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 68078794 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 68078814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68078954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68079053 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 68079070 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 68079087 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 68079209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68079299 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 68079620 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 68080167 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 68080393 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 68081048 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 68081190 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 68081314 G C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 68081501 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 68081518 C T Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 68081532 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 68081713 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 68081737 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 68081922 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68082323 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 68082564 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 68082638 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 68082740 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 68083025 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 68083116 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 68083359 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 68083455 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 68083558 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 68083777 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 68083778 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 68083795 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 68084085 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 68084301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68084391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68084450 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 68084589 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 68084620 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 68084635 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 68084643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68084661 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68085013 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 68085481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68085802 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68085824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68086019 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68086152 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 68088544 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68088706 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 68088707 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 68088838 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 68088917 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68088932 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68088938 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68088960 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68089131 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68089133 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68089157 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68089199 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68089307 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68089361 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68089433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68089547 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 68092061 C T Y Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 3 68092733 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 68092962 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 68092963 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 68093115 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 68093355 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 68093535 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68093722 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68093972 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 68094167 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68094312 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 68094473 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 68094690 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68094729 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68095295 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 68095419 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68095709 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 68095776 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 68095841 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 68095884 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 68096274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68096648 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 68097041 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68097133 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 68097193 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 68097222 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68097306 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 68097752 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 68097853 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68097875 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 68097914 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68098334 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68098537 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68099354 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 68099364 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68099449 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68099567 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68100033 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68100776 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68101143 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 68101590 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68103012 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68103194 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68104077 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68104481 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 68105059 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68105892 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 68107447 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 68107992 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 68108053 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 68108785 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68112758 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68113526 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 68113552 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68113611 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68113702 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 68113745 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 68113820 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 68113824 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 68114043 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 68114146 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 68114208 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 68114299 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 68114495 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 68114596 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 68114672 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 68114698 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 68114784 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 68114847 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68114850 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68114871 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68114907 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68115102 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68115124 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68115198 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 68115303 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68116145 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68116153 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68116522 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 68116542 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 68116676 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 68116724 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 68116799 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68116911 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68116952 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68117057 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 68117107 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 68117853 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 68118343 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 68118405 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 68118421 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 68118683 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68119064 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 68119182 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68119259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68119432 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 68119441 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 68119501 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 68120282 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 68120334 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68121062 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 68122292 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 68124252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68124438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68124887 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68124936 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68125110 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68125133 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68125291 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68126035 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68126120 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68126623 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68126720 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 68127022 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68127822 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 68129179 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68129796 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 68130083 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68131128 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68131492 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68131716 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68132272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68132349 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 68132363 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68132559 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 68132606 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 68132803 T C Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 68132831 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 68132883 A G Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 68132890 G A N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 3 68132902 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 3 68132957 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 68132981 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 68133038 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 68133096 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68133164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68133189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68133257 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68133271 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68133305 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 68133542 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 68133754 G A Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 68133922 G T N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 68134092 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 68134142 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 68134208 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 68134346 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 68134353 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68134442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68134509 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 68134530 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68134585 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68134593 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68134742 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68134757 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 68134810 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 68134821 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 68134866 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 68134870 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 68135206 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68135553 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68135851 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 68135974 A G Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 68136173 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 68136213 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68136377 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 68136446 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 68136724 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68137158 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68137242 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 68137271 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68137309 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68137324 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68137353 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 68137387 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68137416 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 68137434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68137537 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68137569 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 68137592 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 68137770 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 68137771 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 68137830 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 68138307 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 68138371 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 68138426 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 68138534 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 68138742 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68138932 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68139067 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 68139077 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 68139089 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 68139252 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68139518 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 68139626 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68139637 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68139642 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68139725 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68139927 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68140048 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68140111 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 68140190 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68140204 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 68140262 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68140892 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 68140920 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 68140956 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 68140967 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 68140968 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 68141064 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 68141065 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 68141087 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 68141124 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68141139 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 68141210 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 68141216 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 68141230 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 68141276 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 68141299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68141303 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 68141314 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 68141348 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 68141361 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 68141456 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 68141789 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 68141886 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68141896 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 68141920 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 68141962 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 68142075 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 68142084 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 68142087 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 68142131 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 68142184 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68142233 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 68142362 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 68142492 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 68142564 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68143153 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 68143297 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68143429 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 68143514 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 68143531 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 68143550 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68143612 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 68143747 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 68143939 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 68143940 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68143968 T G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.294117647058824 0.117647058823529 0.588235294117647 12 22 5 2 10 3 68143972 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 68144116 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 68144180 A T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 3 68144266 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 3 68144271 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 68144441 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 3 68144502 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 68144718 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68144961 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 68144967 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 68145069 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 68145078 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 68145111 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 68145331 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 68145341 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 68145373 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 68145407 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 68145440 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68145505 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 68145547 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 68145557 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 68145581 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68145693 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 68145695 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 68146238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68146285 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 68146375 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 68146522 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 68146544 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 68146845 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 68146847 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 68146949 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 68147092 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 68147356 T C N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 3 68147419 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 11 7 4 3 2 3 68147855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68148116 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 68148118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68148167 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 68148191 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 68148207 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 68148310 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68149381 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68149458 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 68149603 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68150518 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 68150559 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 68150764 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68151112 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 68151193 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 68151224 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68151252 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 68151303 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 68151384 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 68151408 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 68151420 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 68151422 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 68151594 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 68151970 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 68152028 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68152097 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68152117 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 68152175 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68152182 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68152393 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68152394 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 68152492 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68152536 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 68152562 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68152711 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 68152793 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 68152909 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68152927 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 68153170 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68153180 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 68153267 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68153272 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 68153316 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68153346 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 68153349 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 68153450 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68153472 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68153488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68153855 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 68154065 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68154117 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 68154264 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68154276 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68154288 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 68154384 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68154442 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 68154679 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68154692 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 68154712 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68154909 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68154985 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 68155057 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68155251 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68155255 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 68155397 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 68155495 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68155587 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68155834 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68155850 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68155868 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68155883 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68156261 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68156322 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 68156409 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 68156433 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 68156435 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68156505 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 68156538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68156877 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 68157094 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68157157 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68157295 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68157303 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 68157333 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68157334 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68157358 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68157374 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68157495 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68157748 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 68157754 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 68158048 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 3 68158072 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 3 68158422 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 3 68158431 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 3 68158554 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 68159006 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 68159009 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 68159055 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 68159063 C G Y N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 3 68159105 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 68159122 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 68159130 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 68159161 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 68159176 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 68159233 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 68159246 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 68159275 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 68159290 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 68159321 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 68159340 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 68159436 A T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 68159555 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 68159599 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68159738 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68159830 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68159858 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68159885 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68159919 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68159977 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 68160012 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68160028 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 68160036 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 68160057 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68160127 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 68160365 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68160652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68160818 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68161028 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68161903 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68162749 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68162822 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68164756 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68165018 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 68166572 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68167599 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 68168450 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 68168720 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 68168807 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 68169116 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 68169512 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 68169607 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 68169868 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 68169912 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 68170244 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 68170433 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 68170470 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 68170530 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 68170535 T A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 68170547 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 68170625 T A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 68170839 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 68170846 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 68170861 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 68170883 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 68170922 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 68170923 G C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 68171228 A G Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 68171278 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 68171404 A T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 68171494 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68171611 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 68171645 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 68171683 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 68171737 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68171771 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 68171825 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 68171851 A C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 68171954 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 68172187 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 3 68172276 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 68172346 A T N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 68172534 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 68172566 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 68172608 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 68172677 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 68172689 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 68172947 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 68172965 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 68172974 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 68172985 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 68173010 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 68173030 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 68173046 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 68173065 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 68173763 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68174267 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68175486 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 68177113 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68177434 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 68177707 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 68177740 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 68180459 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 68181801 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 68184105 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 68184114 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 68184151 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 68184152 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 68184352 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 68184380 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 68184394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68184587 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 68184651 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 68184703 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 68184778 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 68184894 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 68184933 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 68185055 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 68185104 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 68185173 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 68185196 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 68185220 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 68185361 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 68185373 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 68185557 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 68185648 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 68185699 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 68185721 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 68185894 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 68185914 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 68186005 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 68186026 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68186137 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 68186160 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 68186180 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 68186307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68186310 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 68186497 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 68186575 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 68186612 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 68186661 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 68186971 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 68187214 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 68187282 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 68187730 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 68187856 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 68187975 A T N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 68187976 A T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 68187989 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 68188054 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68188102 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 68188111 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 68188129 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 68188295 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 68188450 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 68188651 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68188652 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68188750 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 68188978 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 68189004 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 68189016 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 68189034 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 68189217 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 68189221 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68189237 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68189278 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 68189378 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68189379 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68189403 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 68189501 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 68189513 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 68189645 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 68189807 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 68189841 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 68189917 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 68190000 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 68190104 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 68190117 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68190177 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 68190202 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68190333 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 68190441 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68190754 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68191088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68191202 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 68191224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68191235 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 68191283 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 68191339 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68191391 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 68191446 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 68191529 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 68191535 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 68191643 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 68192172 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68192188 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 68192250 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 68192324 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 68192342 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 68192481 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68192489 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68192523 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 68192526 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68192627 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 68192662 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 68192854 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 68192934 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 68192939 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 68193174 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 68193410 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 68193608 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 68195061 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68195172 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68195671 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68196234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68197372 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68198090 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68200285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68200338 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 68200724 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 68200993 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68201797 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 68201955 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 68202077 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 68202162 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68202423 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 68202565 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 68202707 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 68203099 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 68203264 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68203890 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68203894 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68203918 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 68205572 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 68205778 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 68206304 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 68206769 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 68206818 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 68207652 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68208573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68208644 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 68208678 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 68209032 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 68209085 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68209323 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68209875 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68210273 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68211680 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68213976 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68214143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68215032 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68215176 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 68215187 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 68215197 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 68215815 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68216274 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 68216305 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 68216324 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68217695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68217978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68218825 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 68218942 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 68218953 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 68219032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68219224 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 68219225 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 68219286 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 68219410 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 68219590 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 68219749 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 68219761 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 68219845 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 68220024 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 68220069 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68220096 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 68220136 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 68220150 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 68220161 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 68220219 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 68220274 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 68220418 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 68220444 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 68220509 C G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 68220671 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 68220772 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 68220917 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 68221567 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 68221569 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 68221587 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 68221588 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 68221707 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 68221718 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 68221997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68222190 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 68222238 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 68222313 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 68222516 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 68222525 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 68222655 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 68222696 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 68222778 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 68222794 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 68222819 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 68222855 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 68222874 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 68222956 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 68223032 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 68223067 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 68223181 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 68223192 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 68223311 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 68223364 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 68223375 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 68223381 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 68223416 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 68223512 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 68223552 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 68223571 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 68223645 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 68223651 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 68223688 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 68223710 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 68223791 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 68223834 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 68223895 T G N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 68223985 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 68223987 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 68224069 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 68224106 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 68224154 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 68224183 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 68224209 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 68224294 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68224344 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 68224393 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 68224403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68224498 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 68224596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68224650 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68227748 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68228514 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 68228688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68229023 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 68229071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68229199 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68229241 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68229962 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 68230847 G T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 68231563 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68231917 C T N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 3 68232074 G C Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 68232104 C G Y N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.1875 0.6875 0.125 17 15 3 11 2 3 68232263 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 68232321 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 68232646 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 68233059 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68233116 G C Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 68233132 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68233150 G C Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 68233487 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 68233735 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 68233745 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 68233762 G C Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 68233767 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 68233799 T A Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 68233823 C A Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 68233834 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 68233937 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 68233949 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68233960 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68234071 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 68234228 G T Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 68234435 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 68234486 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 68234490 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 68234499 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 68234537 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 68234563 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68234564 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68234702 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68235041 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 68235081 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 68235253 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68235495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68235505 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68235695 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 68235937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68236035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68236102 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68236143 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 68236201 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 68237131 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68240187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68240419 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 68240433 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68240755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68240790 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 68241351 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68242345 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68242470 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68244246 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 68244334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68244575 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68245420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68247522 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 68248802 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68248916 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68251761 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68252031 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68254343 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68254419 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 68254943 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68255036 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68255543 A T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 68255817 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 68255826 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 68255909 A C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 68255914 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 68256021 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 68256026 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68256263 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 68256790 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 68256919 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68256958 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68257440 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 68257762 C G Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 3 68257796 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 68257839 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68257937 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68258004 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 68258100 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 68258137 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 68258426 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 68258457 G C N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 68258459 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 68258485 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 68258536 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68258712 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 68258738 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68258748 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 68258756 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 68258821 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 68258989 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 68259024 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 68259072 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 68259086 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 68259103 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 68259118 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 68259131 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 68259161 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 68259752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68260513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68260611 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68260940 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 68260993 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68261906 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 68262172 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68263074 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68263677 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 68263919 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 68264066 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68264338 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 68264653 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 68265065 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 68265665 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68265811 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 68265814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68266004 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 68266105 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68266477 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 68266603 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 68266626 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 68266656 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68266748 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68266802 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 68267015 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68267022 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68267249 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68267270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68267319 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 68267362 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68267407 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 68267611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68267652 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68267726 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 68267789 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 68267862 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 68267863 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68267878 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 68268166 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68268252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68268433 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 68268551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68269069 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 68269141 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 68269213 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68269225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68269268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68269464 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68269545 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68269588 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68269715 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68270390 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 68270527 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 68270534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68270568 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 68270759 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 68271020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68271176 T G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 3 68271701 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68271780 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68271815 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 68271817 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68271851 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68271906 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68271999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68272357 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 68272509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68272561 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 68272730 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 68272792 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 68272804 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 68273434 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68273504 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68273555 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 68273791 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68273955 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 68274043 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 68274090 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68274102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68274150 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 68274242 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68274276 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 68274667 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68274718 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 68275411 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 3 68275531 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 68275750 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 68275764 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 68275784 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 68275800 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68275830 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 68276179 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68276222 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68276645 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 68276915 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68277173 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 68277298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68277299 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68277348 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68277449 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68277477 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68277514 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68277569 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 68277617 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68277635 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68277948 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 68278037 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 68278091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68278112 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 68278115 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 68278195 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 68278218 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68278336 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 68278442 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 68278542 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68278593 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68278595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68278767 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 68279117 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 68279139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68279524 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68279535 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 68279866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68280155 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68280365 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68280373 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 68280519 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 68280520 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 68280553 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68280632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68280781 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68280851 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68281002 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 68281244 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68281255 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 68281287 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 68281289 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 68281360 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 68281647 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68281754 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 68281839 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 3 68282035 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68282049 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68282135 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 68282301 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 68282491 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 68282595 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68283061 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68283222 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68283268 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 68283503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68283875 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 68284321 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 68284461 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68285755 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 68285773 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 68285940 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 68285941 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 68286064 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 68286306 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68286494 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 68286576 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 68287075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68287100 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68287562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68287563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68289812 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68290563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68290802 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68291078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68291716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68292438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68292673 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68292713 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68292778 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 68294737 C A Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 68294844 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 68295192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68295327 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68296893 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68298210 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 68298462 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68300279 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 68300486 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68300636 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68300695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68300726 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 68301040 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 68301115 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 68301246 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 68301448 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68301576 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 68302124 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68302127 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68302138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68302191 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68302200 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68302258 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68302691 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 68302734 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 68302778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68302790 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 68303095 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68303131 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 68303193 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 68303197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68303290 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 68303398 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68303450 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68303501 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 68303705 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68303863 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 68304189 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 68304200 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 68304464 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 68304526 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 68304898 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 68305592 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 68306461 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 68309282 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 68310335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68311162 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 68314557 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68315334 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68315426 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68319063 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 68319121 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68319983 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 68321112 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 68321441 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 68321600 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 68322312 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 68329348 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 68329353 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68330524 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68330934 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68331829 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68332734 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68333471 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68335250 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 68335379 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 68335395 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68335396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68335406 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68335524 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68335613 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68335628 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68335663 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68335675 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68335712 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68335837 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 68335861 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68336073 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68336114 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68336257 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 68336314 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 68336400 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 68336833 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 68337556 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 68337742 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 68337848 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 68337855 G C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 68337897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68337946 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 68337962 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68338039 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 68338171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68338217 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68338262 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 68338607 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 68338704 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68338722 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68338857 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 68338885 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68338915 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68339099 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68339100 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68339159 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 68339162 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 68339379 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 68339411 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 68339471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68339538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68339577 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68339944 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 68339996 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 68340122 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68340174 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 68340176 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 68340411 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 68340462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68340486 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 68340556 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 68340610 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 68340645 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68340696 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 68340813 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68340937 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68341000 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68341011 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 68341022 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 68341051 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 68341133 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 3 68341239 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 68341316 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 68341384 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 68341411 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 68341457 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 68341492 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 68341557 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 68341593 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 68341680 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 68341692 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68341732 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68341758 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 68341788 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 68342132 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68342182 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 68342186 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 68342339 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 68342435 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 68342507 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 68342509 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 68342530 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 68342807 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 68342897 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 68342930 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 68342961 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68342970 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68343002 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68343022 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 68343027 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68343085 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68343247 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 68343357 T G Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 68343614 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68343654 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68343733 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68343984 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68344055 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68344406 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68344479 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 68344486 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 68344510 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68344666 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 68344680 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 68344700 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 68345170 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 68345210 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 68345389 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68345403 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68345615 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 68345872 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68345873 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68346009 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 68346135 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 68346166 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 68346288 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 68346322 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 68346449 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 68346594 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 68346791 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 68346889 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 68346933 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 68347071 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 68347220 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 68347502 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 68347549 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 68347581 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68347722 C A Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 68347765 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 68348115 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 68348272 C T Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 68348422 G C Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 68348441 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 68348472 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 68349102 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68349343 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 68349355 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 68349489 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68349526 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 68349705 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 68349736 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 68349930 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 68350055 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 68350152 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 68350234 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68350435 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 68350493 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 68350519 G A N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 3 68350698 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 68350790 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 68350837 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 68350867 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 68350895 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 68351191 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 68351305 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 68351330 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 68351541 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 68351754 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68351871 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68352009 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 68352295 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68352692 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 68352962 G A N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 68352975 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 68353387 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 68353389 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 68353416 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 68353488 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 68353688 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 68353772 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68353944 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 68354110 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 68354403 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 68354467 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 68354581 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 68354863 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 68354867 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 68354909 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 68354923 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 68354944 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 68354946 A T Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 68354988 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 68355106 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 68355322 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 68355592 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 68355610 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 68355777 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 68355778 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 68356077 A T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 68356269 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68356270 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 68356299 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68357068 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 68357089 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 68357258 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 68357349 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68357713 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 68358218 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 68359046 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 68359675 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68361617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68362106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68362604 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68362799 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 68365464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68367936 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68368484 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68368838 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 68372679 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 68372833 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68373510 A T Y N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 68374034 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 68375368 A G Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 68375426 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 68375447 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 68375498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68378252 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68378836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68378939 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68380327 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68381364 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68381814 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 68382143 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 68382331 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 68382518 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68382642 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 68382726 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68382869 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 68383929 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68384163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68384497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68385096 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 68385100 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 68386111 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 68386426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68386684 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 68386725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68386874 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 68386932 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 68386999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68388801 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 68389113 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 68389492 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 68389641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68389810 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68392740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68393619 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 68394391 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68395485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68397454 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.0526315789473684 0.789473684210526 0.157894736842105 17 21 1 15 3 3 68397509 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 68397700 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 68397759 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 68398036 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68398043 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68398145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68398155 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 68398333 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 68398479 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 68398558 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 68398800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68398857 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 68399216 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68399405 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 68399598 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 68399608 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 68399615 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 68399738 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 68400770 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68401431 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 68401432 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 68403265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68404642 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68405061 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68405386 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68405785 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68405987 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68406223 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68406422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68406705 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68407089 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68407123 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68407293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68407703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68407826 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68407831 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 68407845 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68408279 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68408836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68409020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68409201 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 68409531 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 68409897 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68414768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68415342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68416649 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 68416811 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 68416946 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 68417326 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 68417574 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 68418580 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 68418606 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 68418610 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 68418695 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 68418715 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 68418789 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68418813 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 68419799 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68420695 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68420805 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68421967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68422439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68423829 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 68424238 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68424303 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 68424314 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 68424658 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 68425143 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68426035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68426755 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 68426794 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 68426886 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 68426971 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 68427065 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68427089 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68427134 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68427191 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 68427199 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 68427339 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 68427349 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 68427681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68427761 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 68427887 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 68427966 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 68427971 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 68428010 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68428014 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68428065 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68428243 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68428300 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68428731 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 68429255 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68429317 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68429386 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 68429415 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 68429587 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 68429591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68430515 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68431531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68431918 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68432718 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68432798 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68433371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68434503 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68435542 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 68436589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68436794 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68437781 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68438191 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 68438213 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 68438314 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 68438345 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 68438412 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 68438439 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 68438560 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 68438626 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 68439629 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 68439750 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68440290 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 68440418 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 68440534 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 68441019 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68441040 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 68441053 A T Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 68441110 A T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 68441153 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 68441803 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68442159 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 68442345 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 68442420 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68442535 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 68442619 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 68442787 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 68443209 C G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 68443241 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 68443384 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 68443441 C A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 68443814 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 68443838 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68443865 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68443870 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 68443895 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 68444253 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 68444267 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68444313 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 68444670 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 68444922 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 68445004 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 68445066 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68445353 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 68445384 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 68445595 G C Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 68445605 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 68445808 T G Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 68447786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68451288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68451498 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68452483 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 68452542 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 68452638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68452915 C A N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 8 16 0 8 4 3 68453009 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68453232 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 68453394 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68453444 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68453469 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 68453565 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68453599 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68453606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68454259 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68454595 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 68454817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68454998 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 68455093 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 68455159 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 68455227 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 68455271 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 68455322 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68455452 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 68455490 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 68455568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68455725 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68455765 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 68457045 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68458542 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68460712 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 68461042 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68461524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68462382 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 68464228 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68466042 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 68466132 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 68466181 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 68466469 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 68467099 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 68467579 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 68468021 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 68468072 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 68470070 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 68470332 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 68470650 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 68470651 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 68470671 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 68470858 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 68470877 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 68470887 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 68470908 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 68471079 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 68471453 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 68471845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68471945 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 68472285 A C N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 3 68472379 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 68472483 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 68473214 C A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 68473431 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 68473506 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 68473559 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 68473580 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 68473770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68474119 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 68474299 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 68474618 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 68474721 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 68474730 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68475093 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 68475576 T G Y N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 3 68475600 A G N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 3 68475882 T C N Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 3 68475907 C T N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 3 68475973 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68476039 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 68476615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68476832 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 68477977 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 68479271 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68479537 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68482767 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68482852 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 68488307 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 68488658 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68489017 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 68489207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68490251 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 68490256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68492757 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 68492945 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 68492970 C G Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 68493003 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 68493022 G T Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 68493029 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 68493078 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 68493285 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 68493395 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 68493449 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 68493710 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 68493737 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 68493862 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 68494087 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 68494286 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 68494931 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 68494948 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 68495033 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 68495150 A T Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 68495525 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 68495528 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 68496122 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 68496166 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 68496909 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 68496960 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 68497260 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 68497320 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 68497369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68497393 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 68497407 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 68497463 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 68497486 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 68497512 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 68497542 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 68497754 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 68497803 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68497870 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68497896 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68498164 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 68498285 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68498287 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 68498309 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 68498377 C G Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 68498469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68498547 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 68498575 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 68498595 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 68498720 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 68498825 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 68498941 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 68498972 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 68498977 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 68498999 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 68499424 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 68499470 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 68499633 C T Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 68499857 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 68499963 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 68500025 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 68500026 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 68500037 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68500038 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68500048 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68500153 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68500168 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 68500247 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 68500256 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 68500267 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 68500278 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 68500366 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68500408 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 68500448 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 68500469 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68500521 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 68500546 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 68500605 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68500624 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 68500637 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 68500711 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 68500771 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68500793 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 68500885 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 68500914 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 68501072 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68501128 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68501154 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68501189 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68501211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68501473 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 68501479 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 68501561 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 68501575 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 68501663 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68501831 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 68501957 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 68502026 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 68502135 A C Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 68502145 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 68502172 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 68502212 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 68502247 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 68502327 C T N Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 9 7 2 5 1 3 68502487 C A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 68502549 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 68502697 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 68502789 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 68503142 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 68503221 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 68503231 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 68503461 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 68503754 T A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 68503783 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 68503818 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 68503828 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 68503832 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 68503901 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 68504098 C G N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 68504131 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 68504170 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 68504214 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 68504362 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 68504394 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 68504456 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 68504476 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 68504478 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 68504503 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 68504736 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68504879 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 68504956 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 68505030 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 68505041 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68505042 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68505131 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 68505243 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 68505258 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 68505309 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 68505314 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 68505334 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 68505346 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 68505577 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 68505677 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 68505748 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68505771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68506117 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 68506129 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 68506361 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 68506374 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 68506473 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 68506678 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 68506720 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 68506739 G C N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 68506865 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68506938 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 68507007 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 68507063 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 68507092 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68507128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68507223 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 68507233 T A Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 68507335 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 68507346 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 68507435 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68507509 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 68508657 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 68508670 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 68508731 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 68508856 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 68508940 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68508943 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 68508987 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 68509031 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 68509083 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 68509094 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 68509148 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 68509476 C T N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.5 0.214285714285714 0.285714285714286 17 11 7 3 4 3 68509715 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 68509802 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68509901 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68509930 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68509994 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68510003 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 68510013 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68510045 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68510127 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 68510261 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 68510283 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 68510426 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 68510454 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68510456 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 68510496 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68510518 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 68510544 C G Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 68510575 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 68510694 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 68510722 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68510723 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 68510744 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68510767 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 68510833 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 68510960 A T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 68510976 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68511037 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68511052 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 68511078 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68511146 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 68511156 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68511157 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 68511338 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 68511382 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68511421 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68511427 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68511448 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 68511450 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 68511523 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 68511524 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 68511585 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 68511645 T A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 68511891 A T Y N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 9 7 3 3 2 3 68511992 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 68512013 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 68512026 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 68512028 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68512092 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 68512203 C G Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 68512270 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 68512718 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 68512804 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 68512936 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 68513012 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68513275 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 68513401 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.25 0.7 0.05 24 16 5 14 1 3 68513771 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 68513805 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 68513850 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 68513852 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68513970 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 68514036 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 68514220 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 68514245 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 68514296 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 68514298 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 68514337 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 68514494 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68514571 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 68514584 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 68514642 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 68514779 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 68514782 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 68514804 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 68514926 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 68514945 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 68514984 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 68515119 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 68515132 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 68515155 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 68515165 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 68515183 T G Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 68515237 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 68515264 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 68515290 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68515448 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 68515518 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68515603 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 68516267 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68516296 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 68516393 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68516456 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68516487 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 68516488 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 68516569 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 3 68516585 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 3 68516615 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 3 68516689 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68516796 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68516873 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68516882 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68516945 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68517081 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68517110 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68517180 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68517212 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68517218 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68517264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68517268 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68517394 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 68517405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68517408 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68517732 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 68517767 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68517912 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68517965 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 68518161 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68518165 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68518213 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68518383 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68518419 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 68519475 G C Y N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 68519479 C T Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 68519491 G A Y Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 3 68519510 T A Y N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 68519692 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68519732 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 68519796 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 68519836 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 68519995 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 68520025 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 68520098 T A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 68520169 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68520189 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 68520296 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68520874 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 68521050 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 68521072 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 68521182 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 68521219 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 68521249 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 68521301 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 68521613 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 68521716 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 68522044 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 68522069 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 68522093 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 68522102 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 68522108 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 68522264 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 68522565 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 68522632 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 68522723 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 68522744 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 68522875 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68522895 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68522913 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 68522933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68522960 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 68523031 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 68523061 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 68523179 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 68523382 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 68523465 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 68523527 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 68523608 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 68523616 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 68523653 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 68523667 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 68523690 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 68523732 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 68523741 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 68523747 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 68523776 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 68523792 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 68523793 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 68523869 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 3 68523934 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 68523945 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 68524078 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 68524113 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 68524146 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 68524206 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68524998 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 68525052 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 68525058 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 68525066 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 68525105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68525138 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 68525227 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 68525313 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 68525374 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 68525542 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 68525581 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 68526047 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 68526115 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 68526197 T A N N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 3 68526492 T A N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 3 68526565 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 68526572 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 68526674 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 68526688 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 68526710 T A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 68526736 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 68526757 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 68526829 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 68526878 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68526880 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68527062 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 68527101 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 68527123 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 68527161 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 68527192 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 68527243 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 68527284 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 68527314 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 68527354 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 3 68527380 T C N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 68527602 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 68527653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68527673 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 68527788 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 68528497 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 68528632 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68528668 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68528706 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 68535904 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 68536019 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68536158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68543761 A G Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 16 12 2 12 0 3 68544156 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68544189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68544222 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68544350 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 68544448 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 68544529 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 68544570 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 68544571 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 68544582 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 68544668 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 68544838 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68544863 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68544938 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 68544945 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68544998 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 68545099 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68545125 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 68545131 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 68545220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68545268 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68545284 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 68545359 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 68545376 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 68545387 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 68545435 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68545463 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68545483 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68545491 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 68545744 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 68545973 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68546169 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68546171 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 68546205 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68546250 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68546420 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68546429 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68546455 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 68546457 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 68546489 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 68546530 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68546567 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 68546619 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 68546731 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 68546780 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 68547003 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 68547130 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 68547295 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 68547562 C A Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 68547563 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 68547944 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 68547945 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 68548039 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 68548053 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68548145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68548184 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 68548226 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 68548254 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 68548267 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 68548273 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 68548289 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 68548303 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 68548501 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 68548535 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 68548580 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68548617 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 68548618 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 68548657 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 68548752 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 68548794 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 68548813 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 68548840 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 68548957 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 68548992 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 68548993 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 68549098 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68549106 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68549120 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68549142 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68549147 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68549178 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68549213 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 68549248 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 68549261 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 68549312 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68549355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68549428 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68549495 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 68549763 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 68549788 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 68549799 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 68549808 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 68549812 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 68549937 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 68550891 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 68551001 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 68551041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68551050 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 68558446 G A Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 68558553 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 68558563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68558645 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 68558737 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 68558746 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 68558768 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68558844 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 68558970 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 68559332 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 68559446 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 68559618 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 68559647 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 68559661 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 68559747 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 68559757 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 68559805 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 68559822 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 68559863 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 68559876 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 68559986 C T N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 8 12 2 4 4 3 68560103 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 68560110 G A N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 68560117 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 68560152 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 3 68560373 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.176470588235294 0.0588235294117647 0.764705882352941 7 27 3 1 13 3 68560387 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 68560449 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 68560502 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 68560712 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 68560754 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 68560946 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 68560961 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 68561065 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 68561117 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 68561126 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 68561137 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 68561207 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 68561228 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68561234 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 68561306 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68561319 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 68561369 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 68561383 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 68561457 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68561495 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 68562119 C T N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.454545454545455 0.272727272727273 0.272727272727273 13 9 5 3 3 3 68562223 G T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 68562329 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 68563023 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 68563369 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68563415 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68563483 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68563725 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 68563732 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 68563860 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 68563928 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 68563963 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 68564022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68564027 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 68564033 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 68564055 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 68564327 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 68564333 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 68564343 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 68564472 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 68564560 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68564814 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68564878 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68565389 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 68565443 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68565675 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68566702 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 68566938 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68567204 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 68567374 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 68568188 T C Y Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0 0.75 0.25 12 20 0 12 4 3 68568400 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68568475 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 68568615 C G Y N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 68568674 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68568719 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68568807 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 68568922 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 68568939 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 68569055 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 68569649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68569952 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68570435 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 68570727 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 68570738 T G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 68570944 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 68570974 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 68571800 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68572543 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68573263 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68573484 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68573813 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 68574120 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 68574248 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68574530 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68574638 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68575362 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68575772 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 68575792 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 68576030 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 68576589 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68577782 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 68578173 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68578265 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68578888 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68579255 A T Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 68579489 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 68580842 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 68580856 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 68581097 G T N N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 68581188 G A Y Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 68581204 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 68581228 T C Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 68581239 C T Y Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 68581402 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 68581543 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 68581550 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 68581578 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 68581610 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 68581708 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 68581719 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 68581729 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 68581974 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 68582696 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 68582708 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 68582839 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68582885 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68583507 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 68583757 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 68584016 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 68584472 G A Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 68584512 A T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 68584611 A C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 68584754 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 68584904 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 68585224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68585596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68585716 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68585836 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68585941 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 68586176 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68586466 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68587288 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68588345 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68588346 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68589647 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68590435 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 68590444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68590457 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68591389 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68591779 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 68591921 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 68591988 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 68594126 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68595431 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68595685 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68596736 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.526315789473684 0.105263157894737 0.368421052631579 22 16 10 2 7 3 68596741 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 68596760 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 68596803 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 68596818 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68596850 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 68597186 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 68597355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68598708 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68598832 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 68598834 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 68598885 A T N N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 3 68598894 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 3 68599064 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 68599154 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68599359 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 68599423 T C Y Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 3 68599678 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 68599690 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 68599916 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 68600037 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 68600231 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 68600246 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 68600498 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68600569 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 68601130 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 68601417 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 68601715 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68602961 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68603065 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 3 68603642 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 68605758 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68606180 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68606208 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 68606789 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 68608543 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 68610527 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 68610541 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 68610553 A T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 68610561 A C N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.214285714285714 0.714285714285714 0.0714285714285714 16 12 3 10 1 3 68610580 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 68610582 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 68610632 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 68610646 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 68610716 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 68610770 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 68610795 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 68610952 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 68611195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68611314 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 68611416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68611428 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 68611501 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 68611638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68612145 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 68612268 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 68612447 T A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 68612457 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 68612506 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 68612701 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 68612779 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68612795 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 68612912 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 68613073 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 68613193 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 68613222 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 68613236 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 68613302 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 68613313 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 68613564 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 68613678 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 68613835 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 68613879 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 68614113 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 68614372 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 68614718 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 68614768 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 68614969 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 68615099 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 68615134 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 68615215 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 68615315 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 68615319 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 68615373 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 68615376 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 68615851 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 68616544 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 68616913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68618069 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68618109 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68619017 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 68619103 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 68619948 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 68620423 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 68621898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68621964 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 68622039 T C N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.230769230769231 0.153846153846154 0.615384615384615 8 18 3 2 8 3 68622242 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 68622247 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 68622329 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 68622482 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 68622558 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 68622923 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 68622987 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 68623059 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 68623166 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 68623198 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 68623205 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 68623385 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 68623413 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 68623597 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 68623674 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 68623697 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 68623971 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68624285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68626236 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 68627229 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 68630922 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68633235 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 68634127 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 68635161 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 68636042 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 68639151 T A Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 68639192 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 68641617 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 68642332 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68643471 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68644008 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 68644582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68645308 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68646272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68646512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68648876 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 68649629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68650951 C A Y N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.615384615384615 0.153846153846154 0.230769230769231 18 8 8 2 3 3 68652887 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 68653580 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 68654989 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68655092 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 68655618 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 68658081 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68658294 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 68658662 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 68658674 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 68658811 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 68660557 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68663599 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 68663679 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 68664233 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 68667247 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 68671997 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68672176 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68672854 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68674354 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68675535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68677279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68679688 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68682101 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68683614 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 68684579 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68684908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68685935 A T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 68686054 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68686579 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 68686823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68687239 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 68687774 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68688282 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 68688445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68688900 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 68690343 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 68693829 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 68696200 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68696298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68697116 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 68697117 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 68697365 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 68698679 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 68698913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68699569 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 68700031 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 68700437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68701360 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 68701732 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68701754 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 68702994 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 68708795 A G N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 68709388 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 68715162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68715443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68716661 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 68716979 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.578947368421053 0.105263157894737 0.315789473684211 24 14 11 2 6 3 68717053 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 68717315 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.222222222222222 27 9 13 1 4 3 68718140 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 68726449 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 68729739 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68730213 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68730620 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68731307 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 68731987 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68732218 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 68732912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68738308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68738984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68739755 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 68740636 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 68742749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68744701 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 68745201 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68745451 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 68745461 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 68745497 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 68745552 A G Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 68746429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68747645 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 68747715 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 68749009 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 68751376 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 68751915 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 3 68751931 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 68754820 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68755653 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68755654 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 68756143 A G Y Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 3 68758074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68758211 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 68758290 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 68758408 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 68759318 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 68759336 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 68759871 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68759908 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68760136 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 68761010 T A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 68761999 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 68762825 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68763267 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68766291 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 68766376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68768006 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 3 68773755 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68774864 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 68777665 T A N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 68778468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68782490 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 68782935 G A Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 68782971 C T Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 68784045 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 68785148 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68785233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68787388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68788296 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 68791171 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 3 68794660 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68804289 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 68805052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68805414 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68805937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68806036 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 68809742 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 68810256 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68812705 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 68813615 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 68815159 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68818440 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 68821211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68821942 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 68825536 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 68828581 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68829642 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68830620 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68830880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68830957 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68830981 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 68831633 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 68832628 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68833275 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 68835613 G C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 68836095 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68838492 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68839920 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68839981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68840428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68842149 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68844185 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68845506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68845799 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 68848944 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68849015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68849139 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 68850571 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 68850804 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68851010 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 68851018 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 68851109 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 68851277 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 68851278 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 68851386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68853532 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 68854988 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68857055 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68857335 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68857541 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68857595 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68857603 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 68857658 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68857674 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68857773 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 68858092 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 68858327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68858329 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68858381 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68858471 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68858473 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 68858562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68858780 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 68858802 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 68859378 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 68859725 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 68859776 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 68861626 G C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 68862678 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 68863289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68864283 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 68864364 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 68865351 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 68866593 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 68867122 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 68868360 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68868633 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68868716 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 68869798 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68870874 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 68871336 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68871509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68873780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68874253 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68874490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68874553 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68879709 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68879921 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68882699 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68882753 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 68883533 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 68884551 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68885093 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 68885359 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68889503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68891850 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 68892429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68893566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68893656 C T Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 68894149 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 68895304 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 68898636 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 68899343 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 68901086 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68901920 T G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 68902262 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68902633 G A N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 68902957 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 68902989 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 68903225 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 68904402 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 68907122 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68908762 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 68910969 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 68912711 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 68913227 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 68916145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68917681 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 68917700 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 68918171 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 68918172 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 68918631 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 68919120 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 68919146 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 68919332 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68919614 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68920683 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 68922306 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68923645 T C Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 68923654 A T Y N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 68923658 T A Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 68925326 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68926012 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68926236 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 68927752 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 68927786 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 68929288 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 68929695 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68929916 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68931015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68931092 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68931158 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68931510 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.25 0.05 0.7 11 29 5 1 14 3 68931516 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 68931576 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.277777777777778 0.0555555555555556 0.666666666666667 11 25 5 1 12 3 68931814 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 68931834 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 68931918 G A N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 68932239 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68932278 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 68932424 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 68932450 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 68932484 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68932498 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 68932557 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 68932958 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 68933025 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 68933104 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 68933165 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 68933265 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 68933408 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 68933466 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 68933684 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 68933709 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 68933779 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 68933780 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 68934074 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 68934090 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 68934202 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68934255 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.7 0.05 0.25 29 11 14 1 5 3 68934291 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 68934500 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 68934502 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 68934664 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 68934675 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68934684 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 68934719 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 68934802 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 68935118 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 68935145 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 68935183 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 68935242 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 68935290 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 68935304 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 68935519 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 68935666 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 68935737 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 68935848 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 68935863 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 68935920 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 68935947 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 68935956 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 68935959 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 68936075 T G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 68936122 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 68936159 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 68936399 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 68936402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68936436 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68936585 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 68936645 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 68936767 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 68938290 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68940330 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 68941963 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 68942333 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 68942375 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68942380 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68942613 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68942730 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 68942823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68943236 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 68943243 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68943249 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68943375 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 68943811 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 68945009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68946168 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 68946192 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 68947922 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68951102 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 68951678 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68955907 C T Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 68955938 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 68956193 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 68958384 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68958419 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 68958472 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68958490 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 68958514 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68958913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68960347 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68960542 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 68961195 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 68962096 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 68962133 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 68963254 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 68963909 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 68964119 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 68964168 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 68964287 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 68964345 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 68964393 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 68964505 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 68964514 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 68964525 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 68964618 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 68964716 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 68964789 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68964817 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 68964992 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 3 68965141 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 68965159 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 68965194 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 68965451 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 68965731 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 68965778 T C N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.166666666666667 0.0833333333333333 0.75 5 19 2 1 9 3 68965866 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 68966035 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 68966055 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 68966156 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 68966230 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 68966468 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 68966469 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 68966528 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 68966604 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 68967443 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 68967520 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 68967737 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 68968369 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 68968572 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68968705 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 68968879 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 68969393 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68969569 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 68969586 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 68969819 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 68969891 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 68970084 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 68970213 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 68970220 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 68970228 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 68970775 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 68971426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68971436 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 68971996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68972025 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 68973017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68973988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68974818 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68975726 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68976934 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68976981 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 68977035 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 68977122 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 68977361 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 68977503 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 68977553 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 68977565 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 68977601 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 68977630 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 68977656 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 68977668 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 68977695 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 68977698 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 68977710 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 68977818 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 68977924 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 68977969 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 68978093 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 68978140 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 68978630 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 68978645 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 68978712 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68978745 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68978904 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 68978935 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 68979006 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 68979018 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 68979099 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 68979140 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68979259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68979650 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 68980497 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 68980646 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 68980669 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 68980749 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 68980853 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 68980877 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 68982188 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 68982308 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 68982728 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 68982765 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 68983006 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 68983063 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 68983065 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 68983207 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 68983403 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68983895 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 68984223 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 68984400 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 68984472 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68984473 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 68984512 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 68984581 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 68984762 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 68984805 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 68984819 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 3 68984851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68984868 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 68984880 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 68984898 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 68984909 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 68984960 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 68985162 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 68985223 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 68985288 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 68985291 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 68985357 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 68985449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68985462 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 68985585 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 68985586 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 68985850 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 68985873 T C N Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 68986301 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 68986461 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 68987019 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68987280 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 68987519 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68987643 T C Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 68987654 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 68987707 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 68988286 C T Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.235294117647059 0.0588235294117647 0.705882352941177 9 25 4 1 12 3 68988455 C T N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 3 68988547 G A Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 68988565 G C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 68988596 T C Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 68988641 A C Y N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 68988672 G A Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 68988824 T C Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 68988920 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 68988969 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 68989442 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 68989724 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 68989893 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 68989964 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 68990035 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 68990075 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 68990089 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 68990158 T A Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 68990515 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 68991667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68991888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68992039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68992040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68993147 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 68993150 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 68994389 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 68995061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 68995487 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68996161 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 68996203 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68996508 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 68996802 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 68997449 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 68997929 T A N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 3 68997968 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 68998283 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 68998564 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 68998637 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 68998721 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.25 0.05 0.7 11 29 5 1 14 3 68998731 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.263157894736842 0.0526315789473684 0.684210526315789 11 27 5 1 13 3 68998834 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68998959 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.7 0.05 0.25 29 11 14 1 5 3 68999120 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 68999126 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 68999214 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 68999238 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68999261 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 68999292 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 68999992 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 69000225 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 69000453 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 69000915 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 69000945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69000960 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 69003527 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 69003529 A G N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 69003568 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 69003779 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 69003836 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 69004203 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 69004425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69005136 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 69005339 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69005563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69005747 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 69005813 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69006024 T C Y Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0 0.5 10 10 5 0 5 3 69006254 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69006347 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69008065 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 69008067 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 69008336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69009615 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 69009616 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 69009841 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69009880 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69010297 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 69010438 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 69010573 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 69010634 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 69010660 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 69010802 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 69010834 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 69010868 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 69010941 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 69011074 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 69011096 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 69011121 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 69011180 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 69011181 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 69011245 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 69012369 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 69012455 A C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 69012492 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69012496 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 69012515 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 69012567 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 69012595 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69013398 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69014650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69014863 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 69014992 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 69015431 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.277777777777778 0.0555555555555556 0.666666666666667 11 25 5 1 12 3 69015492 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 69015503 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.263157894736842 0.0526315789473684 0.684210526315789 11 27 5 1 13 3 69015514 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 69015526 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69016419 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 69016661 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 69016776 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 69017300 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 69017503 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 69017552 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 69017553 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 69017572 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 69017582 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 69017729 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69018424 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 69018642 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 69020393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69020649 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 69022534 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69023136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69023807 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 69024542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69024847 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 69025122 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 69025140 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 69025833 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 69026099 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 69026794 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 69027106 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69027422 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 3 69027733 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 69027748 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 69028108 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 69028172 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69028232 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 69028233 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 69028250 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69028299 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69028372 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 69028427 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 69028569 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 69028630 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 69028682 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 69029023 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 69029031 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 69029035 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 69029068 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 69029150 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 69029183 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 69029200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69029241 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 69029380 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 69029565 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 69029602 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 69029621 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 69029687 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 69029738 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 69030119 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 69030130 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 69030271 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 69030310 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 69030393 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 69030407 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 69030451 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 69030751 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 69030842 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 69031011 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 69031070 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 69031136 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 69031410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69031530 C A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 69031583 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69031724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69031829 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 69031917 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 69031932 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69032170 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69034855 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69035520 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 69035634 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 69035673 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69035675 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 69035695 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 69035824 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 69036673 C T Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 69036899 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 69037095 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 69037096 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 69037230 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 69037267 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 69037292 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 69037409 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69037571 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 69037574 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 69037666 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 69037767 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.263157894736842 27 11 13 1 5 3 69038080 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 69038189 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 69038196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69038261 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 69038408 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 69038526 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 69038534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69038764 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 69038765 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69038948 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 69038966 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 69039079 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 69040671 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 69043089 C G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 69043629 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 69044067 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 69044135 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 69044387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69044613 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69044703 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 69044798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69046937 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 69046950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69047000 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 69047202 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 69047212 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 69047268 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69047437 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 69047465 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 69047489 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 69047530 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69047540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69047565 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 69047634 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 69047676 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 69047947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69047986 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69048323 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 69048781 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 69048798 A T N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 3 69049384 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69049510 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 69050368 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69050375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69050535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69050568 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69050967 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 69051283 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 69051456 T A Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 69051521 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 69051568 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 69051585 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 69051659 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 69051671 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 69051692 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 69051700 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 69051783 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 69051798 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 69051811 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 69051828 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 69051959 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 69052028 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 69052225 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 69052227 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 69052312 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 69052407 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 69052436 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 69052448 A G Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 69052963 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 69053139 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 69053226 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 69053242 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 69053554 C A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 69053557 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 69053587 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 69053650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69053788 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 69053872 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 69053881 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 69053888 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 69053896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69054692 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 69054698 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 69054733 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 69054772 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 69054778 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 69054799 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 69054847 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 69054916 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 69054917 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 69055007 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 69055009 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 69055129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69055131 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 69055186 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 69055373 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 69055630 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 69055668 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 69055791 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69055794 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 69055846 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 69055867 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 69056037 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 69056540 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 69056633 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 69057697 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 69057709 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 69057836 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69058488 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 69058921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69059497 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 69062023 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 69062585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69062624 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69063597 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 69063822 T G Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 69064229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69064297 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 69064875 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 69065161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69065225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69065260 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 69065270 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 69065294 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 69065449 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 69065673 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 69065807 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 69065808 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 69065921 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 69066062 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 69067461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69068643 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69068674 T A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 69068826 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 69069009 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69069011 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69069055 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69069341 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 69069490 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 69069591 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 69069961 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 69070621 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 69070933 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 69071240 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 69071245 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 69071311 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 69071503 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 69071574 T G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 69071585 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 69072051 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 69072151 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 69072209 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 69072261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69072478 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 69073475 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 69074989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69075097 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 69075233 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 69075256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69075364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69075457 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 69075510 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69075658 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 69076157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69076227 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69076955 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69077704 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 69077740 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 69077852 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 69077874 C G N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 69077925 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 69077971 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 69078084 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 69078114 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 69078134 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 69078252 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 69078286 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 69078379 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 69078537 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69080165 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69080216 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 69082117 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69085229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69085487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69085869 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69087193 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 69087260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69087329 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69087587 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 69087797 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 69088686 T C Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 69088696 T C Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 3 69088756 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69088935 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 69088947 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 69089325 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 69089594 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 69089807 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 69091138 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 69091141 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 69095268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69095988 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 69098432 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 69098510 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 69098536 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 69098562 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69098683 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 69098729 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69098769 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 69098779 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69098782 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69098805 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69098823 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69098844 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69098867 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69098945 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69098947 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69099390 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69099411 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69099497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69099528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69099532 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69099765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69099857 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69099875 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 69099897 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 69099996 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 69099997 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 69100403 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 69100521 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69100537 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69100601 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 69100609 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 69100625 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69100767 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 69100787 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 69100809 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 69100905 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 69101186 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 69101504 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 69102070 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69102126 A G Y Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.357142857142857 0.214285714285714 0.428571428571429 13 15 5 3 6 3 69102132 A T N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 3 69102330 T C Y Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.7 0 0.3 14 6 7 0 3 3 69102331 G A Y Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.7 0 0.3 14 6 7 0 3 3 69102389 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 69102429 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 69102686 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 69102758 A T Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 69102902 C T Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 69102976 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 69103014 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 69103071 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 69103098 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 69103130 C T Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 69103147 A G Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 69103209 A G Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 69103241 G T Y N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 3 69103286 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 69103318 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 69103404 G A Y Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 69103429 G A Y Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 3 69103514 G C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 69103526 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 69103555 G T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 69103569 G A N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 69103570 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 69103757 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69103799 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 69103949 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 69104011 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 69104103 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69104159 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69104224 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69104234 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69104284 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69104370 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69104439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69104465 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 69104483 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 69104528 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 69104634 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 69104639 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 69104678 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 69104698 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69104742 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 69104776 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 69104805 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 69104815 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 69104818 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 69104909 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 69104955 T G Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 69105037 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 69105127 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 69105432 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 69105489 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 69105614 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 69105620 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 69105791 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 69105841 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69105886 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 69105887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69105900 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 69105901 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 69105941 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 69105959 G A Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 69106123 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 69106164 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 69106198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69106308 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69106363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69106379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69106479 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69106644 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 69106661 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 69106747 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 69106911 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69106917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69106925 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 69107174 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 69107480 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 69107846 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 69108052 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 69108088 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 69108114 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 69108259 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 69108285 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 69108304 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 69108341 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 69108356 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 69108379 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 69108382 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 69108487 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 69108582 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 69108616 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 69108618 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 69108738 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 69108740 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 69108951 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 69109158 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 69109176 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 69109244 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69109262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69109500 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 69109687 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 69109882 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69110063 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 69110095 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 69110245 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 69110336 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 69110380 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 69110450 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 69110652 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 69110862 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 69110870 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 69110899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69110900 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 69110919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69110924 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 69110945 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 69110957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69110996 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 69111020 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 69111030 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69111047 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 69111066 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 69111145 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 69111149 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 69111198 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 69111226 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 69111387 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 69111543 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 69111691 T A Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 69111692 C A Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 69111732 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 69111763 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69111877 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 69112658 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 69112904 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 69112981 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 69112999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69113079 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 69113118 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 69113318 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 69113443 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 69113466 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 69113497 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 69113566 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 69114130 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 69114132 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 69114251 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 69114390 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 69114425 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 69114560 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 69114572 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 69114580 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 69114603 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 69114635 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 69114640 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 69114722 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 69114813 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 69114893 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 69114984 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 69115145 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 69115274 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 69115331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69115497 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 69115701 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 69115740 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 69115775 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 69115843 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 69115933 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 69115937 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 69116061 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 69116091 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 69116172 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 69116234 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 69116286 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 69116299 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 69116346 A C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 3 69116373 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 69116393 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 69116449 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 69116633 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69116668 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 69116728 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 69116814 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 69117116 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 69117237 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 69117799 C G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 69117916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69118024 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 69118219 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 69118235 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 69118247 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 69118397 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 69118633 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69118755 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69118854 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 69118877 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 69118921 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 69119583 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 69119689 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 69119883 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 69119940 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 69119995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69120024 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 69120069 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 69120080 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 69120144 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 69120179 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 69120199 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69120251 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 69120371 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 69121126 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 69121450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69121946 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69121985 A T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 69122226 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69122234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69122249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69122298 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69122343 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 69122708 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 69122749 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 69122779 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 69122836 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 69122842 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 69122873 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 69122885 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 69122944 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 69122969 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 69122980 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 69123206 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 69123489 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 69123528 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 69123674 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 69123713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69123718 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 69123810 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 69123920 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 69123938 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 69123971 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 69123972 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69124041 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 69124165 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 69124167 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 69124326 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 69124358 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 69124383 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 69124407 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 69124429 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 69124437 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 69124478 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 69124924 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 69124992 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 69125048 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 69125521 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 69125713 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 69125774 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 69125985 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 69126080 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 69126282 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 69126314 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 69126377 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 69126489 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 69126510 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 69126542 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 69126636 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 69126810 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 69126908 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 69127085 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 69127162 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 69127206 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 69127228 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 69127516 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 69127583 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 69127596 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 69127651 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 69127723 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 69127791 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69127828 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69128390 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 69128400 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 69128873 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 69128887 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 69129010 G C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 69129108 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 69129149 C A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 69129382 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 69129386 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69129699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69130003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69130078 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 69130226 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 69131135 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 69131158 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 69131343 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 69131354 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 69131795 G A Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.8125 0 0.1875 26 6 13 0 3 3 69131834 G C Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 69133255 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 69133412 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 69133701 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 69133920 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 69133978 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 69134251 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69134296 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69134492 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69134616 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 69134714 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69134738 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 69134745 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 69134821 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 69134937 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 69135324 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 69136260 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 69136285 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69136639 A T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 69136651 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 69136679 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 69137254 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 69137270 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 69137306 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 69137914 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 69137965 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 69138078 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 69138137 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 69138142 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 69138152 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 69138239 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 69138294 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 69138555 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 69138786 G A N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 69138807 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 14 10 4 6 2 3 69139014 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 69139241 C G Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 69139354 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 69139372 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 69139455 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 69139481 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 69139593 T C Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 69139739 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 69139786 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 69140032 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 69140289 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 69140291 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 69140771 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 69140802 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 69141046 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 69141276 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 69141345 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 69141481 C G N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 69141482 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 69142115 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 69142168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69142270 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 69142883 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 69142979 G A N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 3 69143346 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69143678 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 69143726 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 69144221 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 69144312 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 69144399 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 69144465 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 69145068 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 69145193 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 69145408 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 69145471 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 69145520 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 69145529 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 69145541 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 69145703 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 69145828 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 69145843 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 69146044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69146152 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 69146577 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 69146764 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 69146897 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 69147049 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 69147214 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 69147341 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69147883 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 69148291 T C Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 69150200 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69150606 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 69150612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69150630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69151166 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 69151240 G A N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 15 9 6 3 3 3 69151438 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 69151930 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 69152052 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69152080 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69152150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69152222 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 69152283 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 69152452 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 69152890 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 69153551 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 69153637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69153802 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 69153928 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 69154323 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 69154330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69154384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69154480 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69154559 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69154574 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 69154614 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 69154704 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 69154732 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 69154863 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69154916 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 69155779 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69155836 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.0625 0.9375 0 17 15 1 15 0 3 69155935 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 69156110 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 69156528 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69156732 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 69156831 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 69157047 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69157049 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 69157146 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 69157185 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 69157202 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69157413 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 69157439 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69157605 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 69157738 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69157741 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 69157787 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 69158000 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 69158023 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 69158024 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 69158087 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 69158229 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69158246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69158258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69158293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69158406 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 69158423 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69158458 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69158553 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69158570 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69158608 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 69158786 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69158818 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 69158898 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 69158911 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69159224 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69159294 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 69159743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69159867 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69159937 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69159956 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 69160792 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 69160793 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69161198 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 69161442 G T N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 3 69161633 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 69161836 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69162166 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69162414 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 69162630 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 69162839 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69163580 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 69163611 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 69163633 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 69163677 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 69163697 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 69164014 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69164119 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 69164184 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69165798 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 69166353 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 69166482 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69166555 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69166573 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69166636 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69167455 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 69168881 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69169334 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 69169449 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69169685 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 69169733 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69170859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69170961 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69174512 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 69174567 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 69174971 C A Y N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 69175101 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 69175496 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69176031 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69176157 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69176337 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69176815 G C N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 3 69176892 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 69177783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69177999 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 69178433 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69179481 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69181377 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69183388 T C N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.375 0.125 0.5 7 9 3 1 4 3 69184590 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 69184890 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 69184984 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 69185250 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 69185409 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 69185578 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 69185812 T C N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 69185826 T C N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 3 69186055 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 69186551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69187076 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 69187568 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 69187737 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 69188064 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 69188176 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 69188232 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69188604 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69188858 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69189391 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 69189622 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 69189655 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 69189853 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69189879 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 69190491 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69191906 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 69191971 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 69192343 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 69192418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69192829 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 69193628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69193934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69194369 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 69194872 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 69195027 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 69195075 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69195187 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 69195443 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 69195464 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 69195512 T G N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 69195708 C T Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 69195969 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 69196208 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 69196412 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 69196423 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69196431 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69196692 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 69196744 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 69196752 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 69196771 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 69196847 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 69196915 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 69196996 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 69198079 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 69198214 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 69198249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69198477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69198493 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 69198532 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 69199029 G T N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 3 69199242 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 69199314 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 69199318 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69199370 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 69199423 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 69199532 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 69199647 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 69199724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69199832 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 69199869 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 69199920 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69199931 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69199952 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 69199966 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69200021 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 69200084 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69200102 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 69200171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69200176 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 69200189 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 69200392 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 69200415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69200446 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 69200455 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 69200484 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 69200526 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 69200539 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 69200544 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 69200562 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 69200703 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 69200752 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 69200865 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 69200996 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 69201262 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 69201527 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 69201660 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 69201731 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69201762 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 69201893 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 69202269 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 3 69202413 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 69202472 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 69202519 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 69202691 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 69202718 G T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 69202741 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 69202801 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 69202822 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 69202832 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 69202928 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69202993 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 69203065 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 69203112 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 69203145 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 69203183 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 69203230 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 69203283 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 69203303 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 69203487 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 69203501 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69203556 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 69203600 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 69203605 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 69203632 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 69204233 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 69204315 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 69204576 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 69204675 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 69204712 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69204762 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69204892 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 69204930 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69205203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69205504 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 69205550 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 69205601 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 69205661 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69205687 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 69205817 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69205840 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 69205859 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 69205875 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 69205927 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69206327 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69206334 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 69206666 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 69206685 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 69206736 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 69206789 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69206887 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 69207247 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 69207271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69207278 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 69207531 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 69207595 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69207926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69207942 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69207957 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 69208000 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69208100 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69208142 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69208229 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 69208234 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 69208290 G A N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 16 14 1 14 0 3 69208584 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 69208694 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 69208806 A T N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.133333333333333 0.6 0.266666666666667 13 17 2 9 4 3 69208898 T G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 69208899 T G N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 69208930 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 69209057 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 69209061 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 69209131 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69209151 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 69209170 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69209231 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 69209307 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 69209470 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 69209628 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 69209714 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 69209745 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 69209769 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 69209798 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 69209833 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 69209879 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 69210050 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 69210172 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 69210307 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 69210318 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 69210886 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 69210918 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 69210964 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 69211552 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 69211624 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69211696 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69211705 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69211716 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 69211725 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69211793 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 69211840 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69211876 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69211878 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 69212006 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 69212839 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 69212881 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69213037 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69213123 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 69213157 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 69213192 G T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 69213599 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 69213714 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69213715 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69213742 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69213753 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69213992 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 69214233 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 69214308 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 69214470 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 3 69214483 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 69214706 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 69214832 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 69214911 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 69214936 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 69214984 C A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 69215093 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 69215278 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 69215820 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 69216144 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69216360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69217849 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69218303 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 69218321 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 69219152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69219856 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 69219863 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 69219878 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 69219890 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 69220161 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 69220392 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 69220428 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 69220539 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 69220541 G C N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 69220794 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.466666666666667 0.2 0.333333333333333 17 13 7 3 5 3 69221076 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 69221237 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 69221249 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69221467 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69221639 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69221792 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 69221929 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 69222096 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69222224 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 69222244 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 69222291 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 69222302 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 69222314 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 69222352 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 69222399 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 69222422 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69222594 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 69222955 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 69223047 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 69223132 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 69223168 C T N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 3 69223221 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 69223318 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 69223481 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 69223644 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 69223678 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 69223700 T A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 69223902 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69223907 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 69223916 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 69223947 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 69224061 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69224275 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69224357 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69224379 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69224387 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69224409 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 69224450 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69224485 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 69224613 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 69224851 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 69225060 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 69225256 T A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 69225486 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 69225586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69225625 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 69225702 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 69225768 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 69225831 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 69225908 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 69225952 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 69226518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69226650 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 69226827 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 69227361 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 69227493 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 69228115 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 69228170 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 69228378 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 69228402 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 69228718 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 69228909 A T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 69229147 A T Y N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 69229811 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 69230165 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 69230689 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 69230745 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69230897 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 69230945 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 69231115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69231199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69231282 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 69231288 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69231317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69231323 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 69231349 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69231569 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69231576 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 69231588 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 69231645 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 69231649 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 69231739 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 69231832 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69231870 G C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 69233748 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69233790 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 69233802 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 69233983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69234310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69234537 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69234613 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 69234838 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 69234853 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 69234867 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 69234881 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 69235072 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 69235124 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 69235273 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 69235285 A C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 69235408 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69235443 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69235533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69235639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69235976 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 69236012 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 69236076 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69236189 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 69236407 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 69236465 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 69236659 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 69236699 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 69236792 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69236891 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 69237357 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 69237388 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 69237454 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 69237514 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 69237610 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 69237823 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 69238193 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 69238351 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 69238608 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 69239153 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 69240603 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 69240851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69241269 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 69241849 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 69242813 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 69242824 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 69242915 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 69242924 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 69242927 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 69242945 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 69243037 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 69243421 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 69243443 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 69243454 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 69243468 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 69243554 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 69243617 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 69243704 T A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 69244329 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 69244519 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69244537 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 69245018 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69245177 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 69245325 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 69245380 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 69246445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69246933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69246991 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69247101 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69247114 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69247149 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69247267 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69247313 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 69247355 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 69247446 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 69247510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69247733 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 69247818 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69247914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69247963 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69248009 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69248017 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69248074 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69248236 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69248379 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 69248484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69248648 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.0625 0.6875 0.25 13 19 1 11 4 3 69248649 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 69248660 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 69248748 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 69248832 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69248877 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 69248878 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69249210 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69249250 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 69249308 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69249466 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69249503 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69249516 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 69250005 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 69250170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69250334 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69250644 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69251169 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 69252018 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 69252973 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 69254029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69255631 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 69255729 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69256844 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 69257104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69257160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69257188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69257306 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 69257328 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 69257345 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 69257634 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 12 6 5 2 2 3 69257691 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 3 69259394 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 69259399 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 69259816 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69259818 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 69259915 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 69260169 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69260203 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 69260292 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69260369 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69260582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69260636 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 69260708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69260898 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69260934 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69261002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69261016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69261026 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69261072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69261116 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69261130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69261393 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69261653 G T N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 3 69261891 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 69261928 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 69261958 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 69262054 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69262097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69262219 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69262439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69262511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69262946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69263085 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69263192 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69263242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69263976 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 69264048 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69264091 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69264233 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69264249 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69264285 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69264508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69264541 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 69264554 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 69265004 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 69265007 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69265186 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69265422 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69265505 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69265537 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 69265547 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 69265699 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 69266613 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69266762 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 69266768 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 69266791 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 69266830 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69266866 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 69266872 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 69266909 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 69266923 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69266937 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69266941 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69267063 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 69267109 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 69267349 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 69267423 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 69267544 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 69267581 A T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 69267603 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 69268167 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 69268236 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 69268242 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 69268276 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 69268429 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 69268575 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 69268786 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 69269061 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69269251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69269444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69269524 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69269557 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69269611 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 69269625 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 69269823 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 69269852 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 69270030 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 69270033 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69270104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69270141 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69270207 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69270293 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69270324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69270368 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69270396 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69270528 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 69270544 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 69270613 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69270836 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 69270872 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 69271229 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 69271260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69271273 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 69271392 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69271448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69271510 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 69271548 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 69271575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69271743 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69271773 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 69272221 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 69272580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69273213 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69273466 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69273569 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69275021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69275374 A T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 69275538 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 69275627 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 69276099 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69276207 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 69277969 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.0625 0.6875 0.25 13 19 1 11 4 3 69278982 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 69279080 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 69279234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69279250 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 69279700 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 69279734 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 69279739 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 69280609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69280619 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69280878 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 69281064 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69281100 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 69281340 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 69281376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69281434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69281714 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 69282046 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 69282100 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 69282239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69282315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69282414 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69282419 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69282690 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 69282931 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 69283079 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69283213 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69283273 C T Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 69283535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69283594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69283690 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 69283694 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 69283730 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 69283740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69284005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69284182 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69284389 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 69284671 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 69284818 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 69284914 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69285290 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 69285490 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69285494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69285535 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69285715 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 69285735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69286569 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 69286609 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 69286665 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 69286874 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 69287174 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 69287333 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69287344 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69287412 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 69287724 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69288407 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 69288820 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 69289041 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69289117 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 69289204 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 69289218 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 69289559 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 69289637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69289838 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69290553 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 69290570 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 69290587 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 69290589 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69290805 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69290809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69290816 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69290849 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 69291127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69291197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69291266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69291379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69291771 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 69291890 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 69292005 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 69292243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69292321 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 69292581 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 69292599 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 69292600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69292775 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 69292948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69293007 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69293113 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 69293138 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 69293153 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 69293154 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 69293583 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 69293650 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 69293692 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 69293746 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 69294570 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 69294725 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69294823 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69294830 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69294841 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69294922 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69294934 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69294945 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69295067 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69295091 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69295102 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69295825 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 69296032 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69296465 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 69296605 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 69296696 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 69296722 G T Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 69296733 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69296981 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 69297607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69297648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69297656 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 69298058 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69298412 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69298482 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 69298497 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 69299201 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 69299334 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 69299510 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 69299789 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 69299933 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 69300140 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 69300145 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 69300348 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 69301207 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 69301211 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 69301365 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 69301670 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 69301683 T G N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 69301687 G C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 69302130 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 69302736 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69302768 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 69303312 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 69303372 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 69303552 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 69303608 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 69303702 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69303751 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69304229 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 69304658 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 69304661 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 69304939 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 69305001 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 69305139 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 69305210 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 69305236 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 69305245 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 69305282 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 69305383 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 69305456 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 69305475 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 69305484 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 69305515 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 69307256 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 69307412 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 69307550 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69307801 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 69308332 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 69308447 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 69308463 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 69308477 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 69308492 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 69308644 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 69308785 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 69308908 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 69308936 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69309129 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 69309135 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 69309272 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 69309298 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 69309374 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 69309384 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 69309414 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69309535 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 69309553 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 69309571 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 69309595 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 69309686 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 69309765 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 69310034 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 69310323 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 69310416 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 69311224 A T N N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 3 69311332 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 69311618 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 69311753 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 69311912 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 69312079 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69312229 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 69312300 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 69312327 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69312506 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69313069 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 69313114 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 69313173 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 69313182 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69313490 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69313581 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 69313627 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69314236 T A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 69314747 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69314861 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69314896 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69314948 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69315044 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69315501 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69316100 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69317764 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69318060 A G Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 69318138 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69318338 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 69318737 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69318852 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69318889 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69319046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69319079 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 69319125 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69319277 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 69319468 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69319708 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69319753 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 69320441 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69320453 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 69320518 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 69320543 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 69320555 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 69321069 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69321312 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69321514 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69321614 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 69322103 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69322187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69322213 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69322244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69322365 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69322383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69322396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69322489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69322495 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69322621 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 69322768 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 69322812 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69322927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69323102 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69323115 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 69323142 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 69323270 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 69323319 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69324053 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 69324112 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 69324148 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 69324344 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 69324562 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 69324621 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69324834 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69327556 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69328848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69329653 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69330440 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69330635 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 69331533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69331976 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 69332178 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 69332914 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 69333892 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 69334062 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 69334117 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 69334154 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 69334170 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 69334271 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 69334410 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 69334447 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 69334483 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 69334549 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 69334600 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 69334660 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69334738 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 69334751 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 69334920 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 69335086 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69335135 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 69335182 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 69335411 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 69335806 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 69335961 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 69335982 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 69335988 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 69335994 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 69336130 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 69336455 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.428571428571429 0 0.571428571428571 6 8 3 0 4 3 69336462 A T N N 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.375 0.125 0.5 7 9 3 1 4 3 69336623 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 69336786 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 69336788 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 69336798 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69336888 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 69336894 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 69336962 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 69337061 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 69337112 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 69337350 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 69337359 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 69337412 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 69337439 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 69337748 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 69337950 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.666666666666667 0.133333333333333 0.2 22 8 10 2 3 3 69337968 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 69337999 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 69338243 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 69338378 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 69338382 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 69338422 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 69338555 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 69338744 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 69338781 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 69338871 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69339132 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 69339165 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 69339335 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 69339378 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 69339381 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69339401 T A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 69339410 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 69339439 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 69339454 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 69339570 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 69339680 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 69339750 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69339765 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69339811 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69339915 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69339919 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69339975 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69339991 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69340493 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69340704 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 69340915 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 69340946 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 69341243 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69341244 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 69341609 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69341946 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69341999 A C Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 69342043 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69342149 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69342258 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 69342345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69342822 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69342842 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 69342953 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69343539 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69343554 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 69343566 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 69343747 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69343759 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 69343793 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 69343863 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69344496 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69345052 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 69345584 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 69345625 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 69345630 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 69345729 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 69345978 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69346165 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 69346303 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69346377 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 69346469 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69346687 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 69346782 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69346949 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 69347242 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 69347293 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 69347746 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 69347781 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 69347877 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 69347890 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69348030 C G Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 69348031 C A Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 69348053 C T Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 69348127 C G Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 69348214 T A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 69348250 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69348377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69348392 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 69348479 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 69348832 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69348909 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69348928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69349237 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 69349260 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69349272 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 69349277 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 69349459 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69349738 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 69349741 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69349797 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69349820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69349951 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 69350009 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69350168 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 69350169 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 69350279 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 69350307 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 69350889 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 69350914 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 69351078 A G Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 69351287 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 69351321 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 69351867 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 69352075 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 69352111 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69352208 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 69352269 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69352270 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 69352578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69352667 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 69353086 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 69353093 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 69353348 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 69353454 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 69353501 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69353655 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69354311 C G Y N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 3 69354470 G A N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 3 69354713 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 69354789 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 69356043 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 69356048 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 69356165 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 69357296 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69357326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69358223 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69358224 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69358372 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69359888 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 69360800 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 69361448 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69365122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69365828 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69366423 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69366491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69366585 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69371950 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69376516 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 69376885 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 69377064 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 69377566 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 69377869 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69378200 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 69378765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69379321 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69380402 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69380920 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69381865 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69384259 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69385031 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69385510 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69386807 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69386993 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69387114 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69387901 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69389088 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 69391711 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69392083 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69393255 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 69393279 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 69394357 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 69394562 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 69394584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69394859 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69396404 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 69396666 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 69396904 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 69398112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69398328 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 69399172 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 69399193 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 69399198 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 69399309 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 69399384 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 69399548 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 69399654 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 69399695 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 69399700 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 69399779 A T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 69399985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69400025 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 69400246 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 69400255 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 69400464 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 69400480 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 69400653 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 69400688 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 69400894 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 69401452 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 69401533 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 69401653 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 69401901 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 69402387 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69403237 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69405617 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 69405638 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 69405757 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 69405791 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 69406001 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 69406281 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 69406352 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 69406761 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69407237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69407238 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69407284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69407864 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 69407906 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 69408039 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 69408143 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 69408332 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 69408497 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69408580 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 69408692 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 69408831 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 69408842 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 69409102 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 69409173 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 69409185 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 69409263 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69409337 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 69409355 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 69409369 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 69409511 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 69409673 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 69409691 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 69409736 A C N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 69409841 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 69410067 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69410456 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 69410860 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 69410864 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 69411208 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 69411250 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 69411545 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 69411930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69412045 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69412998 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69413465 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 69414267 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69414555 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69414743 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 69415201 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 69416295 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 69416332 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 69416355 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69416377 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69416709 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69417726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69417933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69418208 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69418209 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69418361 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 69418397 C G Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 69418508 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 69419283 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 69419354 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69419398 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 69419456 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 69419795 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 69420689 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69420703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69420737 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 69420776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69421164 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69421224 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 69421842 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69427831 A C Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 69427932 T C Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 69429415 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69429430 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 69429467 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 69429473 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69429922 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 69429938 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 69429956 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 69429967 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 69429984 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 69429995 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 69430109 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 69430251 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69430255 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 69430279 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69430472 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 69430474 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 69430486 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 69430569 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 69430602 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 69430626 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 69430719 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 69430779 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 69431403 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 69431416 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69431491 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 69431595 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 69431631 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 69431781 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 69431807 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 69431968 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69432043 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 69432121 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69432130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69432209 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 69432456 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69432488 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 69432797 C A N N 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 0.0909090909090909 13 9 3 7 1 3 69432835 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 69432856 C T N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.181818181818182 0.727272727272727 0.0909090909090909 12 10 2 8 1 3 69432981 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 3 69433500 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 69433537 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 69433563 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69434006 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 69434053 T G N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 69434158 A C N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 69434492 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69434604 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69434718 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69434914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69435268 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69435387 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 69435478 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69435699 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 69436825 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 69437135 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 69437292 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 69437511 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 69437581 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 69437600 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 69437793 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 69437846 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 69437894 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 69437905 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 69437906 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 69437957 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 69437958 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 69438050 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 69438613 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 69438697 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 69438747 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69438766 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 69440584 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 69440844 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 69451210 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 69451858 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 69452118 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 69452402 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 69452598 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 69453067 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69454648 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 69454801 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 69455654 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69456095 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 69457937 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 69460759 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69462481 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69463022 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69463637 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69463673 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 69464284 C T N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 3 69467767 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69470480 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 69471866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69472241 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 69473312 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69473901 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69474214 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69474582 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 69474822 C A N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 69476648 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 69476731 T C N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 3 69476741 T C N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 3 69476840 C T N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 3 69476935 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 69476990 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 69477018 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 69477035 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 69477065 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 69477151 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69477162 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 69477222 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 69477305 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 69477577 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 69477819 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 69477841 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69477890 C A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 69478198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69478211 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69478226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69478252 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 69478281 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 69478295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69478346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69478362 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 69478379 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 69478442 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 69478531 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 69478719 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 69478843 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 3 69478937 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 69479078 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 69479366 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 69479388 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 69479409 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 69479440 T G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 69479487 A T Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 69479558 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 69479697 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 69479737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69479832 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 69479907 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 69479916 G T N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 69479919 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 69479929 A G N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 69479996 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 69480005 C T N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 69480014 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 69480064 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 69480094 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 69480120 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 69480232 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 69480233 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 69480373 T C N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 69480432 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 69480513 C T N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 0.153846153846154 0.153846153846154 20 6 9 2 2 3 69480564 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 69480586 T A N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 69480615 G T N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 69480746 C G N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 0.153846153846154 0.153846153846154 20 6 9 2 2 3 69480780 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 69480786 C A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 3 69480900 T C N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 69480919 T A N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 69480999 T A N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.666666666666667 0.133333333333333 0.2 22 8 10 2 3 3 69481009 G A N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.666666666666667 0.133333333333333 0.2 22 8 10 2 3 3 69481021 T G N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.666666666666667 0.133333333333333 0.2 22 8 10 2 3 3 69481126 T A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 3 69481139 T A N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 3 69481146 G A N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.307692307692308 0.230769230769231 0.461538461538462 11 15 4 3 6 3 69481166 A T N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.307692307692308 0.230769230769231 0.461538461538462 11 15 4 3 6 3 69481171 A G N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 3 69481200 C A N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 3 69481201 T C N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 3 69481233 C T N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.333333333333333 0.2 0.466666666666667 13 17 5 3 7 3 69481245 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 3 69481490 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 69481543 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 69481549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69481965 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 69482037 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 69482038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69482120 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69482124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69482291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69482506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69482637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69482656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69482793 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69482986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69483084 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69483295 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 69483406 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69483519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69483735 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 69483789 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69483951 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 69484030 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 69484070 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 69484238 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69484267 C A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 69484567 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69484625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69484845 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69484879 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69484889 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69485111 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69485174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69485281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69485334 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69485376 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69485467 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 69485731 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69485811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69485813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69486036 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69486268 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 69486566 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 69486607 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69486611 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69486708 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 69486723 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 69487374 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 69487386 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 69488217 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69488739 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69489027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69491529 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 3 69493941 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69494182 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69494295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69494404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69494566 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69494889 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 69495238 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69495268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69495437 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69496008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69496058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69496514 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 69497406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69497561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69497684 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69498498 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 69498509 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69498554 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 69498683 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 69498881 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 69498948 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69498978 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 69499937 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 69500149 A T Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 69500194 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69500280 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69500305 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 69500306 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69500699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69501044 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 69501051 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69501077 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69501294 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 69501452 C T Y Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 3 69501947 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 69502425 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 69502533 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 69502860 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 69502876 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 69502909 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 69503065 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69503137 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 69503676 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69503780 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 69504123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69504379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69504433 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 69504564 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 69504569 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 69504584 C T N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 69504598 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 69504896 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 69504903 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 69504986 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 69505098 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 69505111 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 69505178 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 69505334 C G Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 3 69505404 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 3 69505405 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 3 69505415 C T Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 69505418 T A Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 69505627 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 69505636 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 69505657 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 69505721 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69505748 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 69505808 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 69505850 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 69505939 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 69506073 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 69506155 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 69506208 T A N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 3 69506349 T G N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 3 69506373 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.5 0.416666666666667 8 16 1 6 5 3 69506444 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 69506928 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 69506977 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 69507003 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69507004 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69507021 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69507025 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 69507038 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69507140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69507184 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69507247 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 69507631 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 69507855 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 69507864 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 69507885 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 69507942 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69508064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69508095 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 69508121 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 69508140 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 69508246 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 69508266 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 69508577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69508714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69508752 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69508772 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 69509218 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 69509238 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 69509308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69509393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69509398 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69509434 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69509452 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69509473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69509524 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69509613 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 69509728 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69509836 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69509844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69509857 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 69509952 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69510016 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 69510221 A T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 69510226 C A N N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.2 0.8 0 6 4 1 4 0 3 69510255 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 69510390 C A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 69510394 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 69510426 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 69510472 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 69510576 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 69510587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69510670 C A Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 69510701 G C Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 69510716 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 69510819 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 69510845 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 69511015 C A Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 69511062 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 69511185 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 69511188 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 69511296 T C Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 69511370 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 69511393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69511399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69511521 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69511612 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 69511681 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69511833 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 69511919 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69511941 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69512217 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 69512285 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 69512506 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 69512735 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 69512795 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69513068 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 69513213 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 69513328 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 69513421 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 69513469 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 69514134 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 69514142 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 69514164 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 69514446 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 69514529 T C N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 3 69514848 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69514910 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 69514953 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 69514982 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 69514999 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 69515027 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 69515051 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 69515075 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 69515110 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 69515134 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 69515199 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 69515235 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 69515247 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 69515249 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 69515263 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 69515284 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 69515349 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 69515376 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 69515379 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69515387 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 69515408 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 69515539 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 69515832 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 69516008 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 69516015 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 69516048 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 69516190 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 69516222 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 69516319 G C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 69516464 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 69516481 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69516588 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 69517795 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69518365 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69519340 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 69519743 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 69520483 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69520550 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 69521335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69521427 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69521570 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 69521859 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 69521866 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69521947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69522643 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69522864 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 69522873 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 69523210 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 69523214 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 69523310 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69523639 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 69523663 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 69523671 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 69523674 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69523824 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69523904 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69525353 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 69525367 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 69525459 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69525794 C G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 69526217 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 69526734 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 69526868 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69527232 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 69528478 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69529349 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 69529629 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69529903 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 69530194 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 69530707 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 69532304 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 69532655 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69532898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69533163 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 69533834 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 69534170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69534251 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 69534365 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 69534709 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69534906 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 69534934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69535099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69535281 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 69536066 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69536465 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69537586 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69537788 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69537803 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 69538032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69538092 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69538107 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69538119 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69538854 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 69539055 A T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 10 22 4 2 10 3 69539082 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 69539122 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 69539134 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 69539144 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 69539251 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 69539359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69539368 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 69539490 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 69539692 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 69540206 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 69540274 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69540705 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69541071 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 69541456 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 69541538 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 69541954 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69542292 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69542451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69542849 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 69543384 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 69543420 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69543426 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69543675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69543707 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69543913 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 69544569 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 69545114 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 3 69545131 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 3 69545158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69545198 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 69545863 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 69546018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69546174 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 69546203 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 69546268 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 69546752 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 69546903 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 69546948 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69548776 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69550154 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 69550362 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 69550581 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 69550677 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 69550789 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69551175 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 69551243 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 69551377 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 69551480 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 69551524 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 69553043 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 69553447 G C N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.230769230769231 0.0769230769230769 0.692307692307692 7 19 3 1 9 3 69554122 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 69555020 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 69555079 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 69555367 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69555445 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 69555569 C G N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 3 69555574 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 69555689 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 69556121 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 69556236 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 69556782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69557634 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 69557788 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69558178 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 69558691 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69558894 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69558914 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 69558916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69559161 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69559381 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 69559426 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 69559433 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 69559446 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 69559489 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 69559742 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69559763 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 69559772 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 69559967 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69559976 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69560031 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 69560161 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 69560196 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69560419 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 69560520 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69560557 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69560593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69560650 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 69560693 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 69560756 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 69560787 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 69561253 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69561475 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69561499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69561513 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69561744 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69561793 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 69561842 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 69561893 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 69561911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69562780 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 69563294 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 69563299 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 69563461 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 69563616 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 69563822 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 69564775 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 69564887 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 69564919 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 69564925 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 69565015 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 69565019 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 69565084 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 69565701 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 69566142 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 69566152 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 69566281 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 69566424 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 69566471 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 69566473 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 69566555 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 69566763 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69566964 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69567229 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 69567319 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69567431 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69567821 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 69568060 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 69568073 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 69568099 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 69568129 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 69568370 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 69568409 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 69568486 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69568506 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 69568515 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 69568633 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 69568778 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 69569431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69569578 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69569912 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 69569925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69570068 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 69570132 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 69570134 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 69570144 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 69570197 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 69570316 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 69570368 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 69570432 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 69570502 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 69570533 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 69570568 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 69570622 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 69570623 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 69570685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69571568 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 69571845 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 69572145 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 69572146 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 69572196 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0 0.777777777777778 0.222222222222222 7 11 0 7 2 3 69572204 G A N Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0 1 0 7 7 0 7 0 3 69573032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69573033 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 69574678 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69574837 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 69575121 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69575244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69575247 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69576844 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69577425 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 69577564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69577594 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 69579761 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 69579821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69579970 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 69580195 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 69580441 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 69580454 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 69580537 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 69580631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69580658 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 69580672 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 69581567 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 69581574 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 69581610 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 69581732 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 69581817 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 69581861 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 69581904 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 69582004 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 69582146 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 69582676 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 69583003 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 69583009 A T Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 69583142 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69583500 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 69584061 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 69585061 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69585755 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 69585811 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 69586117 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 69586362 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 69586452 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 69586551 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 69586907 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69586954 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 69587059 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 69587315 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 69588400 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69588740 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69589289 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 69590665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69591227 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 69591426 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 69591535 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 69591724 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 69591725 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 69591832 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 69592997 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 69593408 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69593460 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69593611 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69593684 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69593691 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 69593719 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69593770 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 69593904 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 69594190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69594360 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 69594773 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69595083 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 69595208 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 69595794 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 69596047 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69596221 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 69596261 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69596285 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 69596354 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 69596408 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 69596455 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 69596477 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69597089 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 69598023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69598025 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 69598053 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69598145 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 69598227 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 69598248 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69598942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69599045 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 69599334 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 69600194 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 69600604 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69600663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69600791 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 69601096 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69601146 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69601206 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69601384 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 69602123 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 69602673 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 69602709 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 69602753 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 69602918 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 69602996 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 69603775 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 69604103 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 69604263 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 69604845 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69605213 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69605734 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 69605783 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 69606173 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 69606264 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 69606574 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69606733 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69606867 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69607101 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69607324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69607488 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69607750 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 69607772 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 69608126 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 69608417 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69608471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69608478 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69608837 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69609220 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69610044 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 69610242 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 69610286 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 69610446 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 69610451 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 69611127 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69611219 A C Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 69611220 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 69611308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69611377 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69611420 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 69611425 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 69611502 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 69611520 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 69612015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69612279 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 69612413 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 69612852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69615079 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 69615342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69615409 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 69616763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69617222 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 69617588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69618444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69618641 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69620272 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 69620638 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69621612 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69621921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69621967 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69622730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69623100 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69623153 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 69623546 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 69624381 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 69625228 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69625281 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 69626397 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69626668 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69629270 G C Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 69631168 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69633158 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69633430 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 69633508 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69634025 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69634883 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69636467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69636792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69638797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69639312 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69639884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69641895 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69641949 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 69642492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69643079 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 69644175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69644190 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69645741 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69646000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69646026 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69647968 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69648568 T C Y Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 3 69649161 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69649974 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69651104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69651611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69651687 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69658895 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 69659699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69661552 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69662743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69663766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69665378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69666034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69666273 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69666729 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 69666757 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69667462 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 69667960 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69668424 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 69668703 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69668769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69668958 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 69669054 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 69669224 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69669327 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 69669348 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 69669356 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 69669531 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 69669580 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 69669660 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0 0.842105263157895 0.157894736842105 16 22 0 16 3 3 69669715 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69669813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69669868 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 69670004 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69670110 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 69670187 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 69670413 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69671226 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 69671406 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 69672851 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69673020 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 69673183 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69673323 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 69673765 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 69674319 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 69674321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69674350 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 69674447 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 69674621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69674762 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 69674827 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 69674848 T G N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 69674962 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 69674967 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 69675068 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 69675083 A G Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 69675221 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 69675624 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 69675652 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 69676226 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 69676229 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 69676596 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 69677451 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69678026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69678948 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69679243 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69680451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69680679 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 69681082 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 69681175 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 69681516 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 69681565 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 69681939 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 69681950 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 69681971 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 69682171 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 69683085 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 69683099 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 69683615 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 69685142 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 69685272 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 69687031 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69687061 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69687201 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 69687211 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 69687389 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 69687404 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69687500 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 69687566 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 69687805 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 69687826 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 69688153 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 69688225 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 69688317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69688402 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 69689560 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 69689604 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 69689700 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 69689775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69690056 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 69690121 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 69690166 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 69690436 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69690848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69692396 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69693534 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 69693588 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69693818 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 69693843 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 69694165 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 69694345 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 69694830 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 69695826 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 69696471 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 69696673 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 69696747 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 69696832 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 69696857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69696953 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 69697247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69697346 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 69697351 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 69697400 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 69697421 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 69697679 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 69697709 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 69697716 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 69703795 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69704084 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 69704480 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 69704512 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 69704552 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 69704587 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 69704864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69704989 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 69705177 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 69705520 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 69705544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69705678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69706055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69707174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69710530 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69713818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69715064 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 69715215 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 69715218 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69715421 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 69715552 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69716011 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 69716187 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 69716227 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 69716349 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 69716487 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 69716553 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 69716593 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 69716666 T G Y N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 69716779 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 69716786 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69716806 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 69716811 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 69716972 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 69717079 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69717093 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 69717184 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 69717269 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 69717410 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 9 5 3 3 1 3 69717411 T C N Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 9 5 3 3 1 3 69723116 A G Y Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 3 69723311 T G N N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 9 9 2 5 2 3 69723328 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 10 8 3 4 2 3 69723539 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 69723564 T A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 69723568 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 69723755 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 69723792 G T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 69723815 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 69723876 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 69723902 G C N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 69723903 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 69723945 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 69723957 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 69724059 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 69724227 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 69724322 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 69724339 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 69724507 C G Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 69724907 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 69725004 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 69725075 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 69725253 C T N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 3 69725284 G A Y Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.454545454545455 0.181818181818182 0.363636363636364 12 10 5 2 4 3 69725307 C T Y Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.357142857142857 0.214285714285714 0.428571428571429 13 15 5 3 6 3 69725388 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 3 69725482 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 69725526 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 69725534 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 69725676 A C Y N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 3 69725720 T C Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 69725721 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 69725731 G C Y N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 69725736 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 69725745 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 69725753 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 69725823 C T Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 69725880 G A Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 69725893 C T Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 69726037 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 69726114 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 69726124 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 69726163 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 69726193 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 69726275 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 69726300 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 69726316 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 69726329 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 69726547 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 69726591 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 69726643 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 69726689 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 69726930 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 69727007 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 69727018 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 69727034 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69727076 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 69727092 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 69727133 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 69727326 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 69727340 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 69727429 A C N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 69727438 C A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 69727472 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 69727483 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 69727504 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 69727537 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 69727553 A G Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 69727728 A G Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 69727769 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69727892 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 69727893 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 69727928 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 69728068 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 69728074 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 69728141 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 69728166 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 69728216 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 69728240 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 69728274 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 69728329 A G Y Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 3 69728481 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 69728487 A G Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 69728509 C T Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 69728572 G A Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 69728616 C A Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 69728654 T A Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 69728686 C G Y N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 69728723 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 69728740 A G Y Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 69728762 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 69728778 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 69728818 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 69728870 G A Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 69729010 A G Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 69729029 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69729036 C T Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 69729046 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 69729122 A C Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 69729168 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 69729233 C T Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 69729304 C T Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 69729317 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 69729364 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 69729373 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 69729381 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 69729725 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 69729772 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69729779 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 3 69729786 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 69729831 A G Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 3 69729857 A C Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 69729869 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 69729923 T G Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 3 69729953 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 69730036 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 69730068 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 69730088 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 69730143 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 69730151 G C Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 69730191 T G Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 69730196 C T Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 69730239 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 69730251 A C Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 69730331 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 69730347 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 69730367 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 69730371 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 69730482 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 69730486 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 69730508 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 69730578 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 69730622 A C Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 69730626 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 69730665 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 69730717 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 69730733 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 69730736 C G Y N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 69730846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69731246 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 69731253 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 69731332 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69731339 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 69732030 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 69732033 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 69732088 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 69732278 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 69732366 A C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 69732474 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 69732575 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 69732763 T A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 69732795 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69732871 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 69733228 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 69733229 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 69733243 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 69733295 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 69733347 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 69733355 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 69733367 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 69733542 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 69733550 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 69733646 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 69733668 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 69733700 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 69733738 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 69733841 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 69733868 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 69733869 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 69733884 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 69733947 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 69734028 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 69734046 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 69734047 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 69734060 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 69734268 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 69734356 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 69734373 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69734403 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 69734523 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 69734742 A C N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 3 69734816 G T N N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.583333333333333 0.0833333333333333 0.333333333333333 15 9 7 1 4 3 69734925 G A N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 3 69734978 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 69735006 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 69735024 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 69735103 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 69735114 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 69735311 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 69735796 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 69735810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69735842 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 69735880 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 69735889 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 69735894 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 69736148 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 69736170 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 69736325 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69736442 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 69736476 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 69736498 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 69736669 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 69737092 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 69737197 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 69737281 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69737558 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 69737583 G A N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 3 69737588 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 69737680 G T N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 3 69738102 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 69738215 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 69738233 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 69738469 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 69738573 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 69738605 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 69738627 G A N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 69738644 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 69738645 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 69738660 C A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 69738674 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 69738717 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 69738743 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 69738750 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 69738843 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69739820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69741871 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 69741873 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 69742707 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69743012 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69746155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69746263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69754186 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 69754995 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 69755050 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 69755456 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69755729 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69756991 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69757627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69757739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69758850 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69758874 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69760427 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 69760704 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 69761154 T A N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 69761199 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69761489 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69764523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69764527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69764611 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 69764617 G C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 69765276 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.105263157894737 0.842105263157895 0.0526315789473684 20 18 2 16 1 3 69765415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69766281 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 69766282 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69766864 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69766922 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69769430 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 69769815 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 69772644 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69772829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69773475 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69773595 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 69774270 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 69775554 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69775706 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 69775783 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69775821 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 69775851 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 69776821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69777044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69777051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69777071 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 69777111 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 69777180 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 69777186 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 69777234 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 69777240 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 69777253 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 69777323 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 69777345 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 69778300 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 69778519 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 69780464 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69782786 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 69783122 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69784745 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 69785020 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69785264 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69786056 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 69786108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69786215 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69786285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69786293 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 69787462 C A N N 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 7 11 2 3 4 3 69788127 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69788191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69788541 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 69788903 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 69789292 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69789322 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69789678 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69789790 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69790303 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69790383 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69791142 C G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 3 69791436 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69791993 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69792287 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 69792305 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 16 20 0 16 2 3 69792479 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69792730 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69792804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69793211 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69793577 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69793619 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 69793714 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 69793735 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 69793770 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69793946 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 69793948 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69794061 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 69794176 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69794208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69794500 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69794801 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69794866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69794899 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 69795025 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69795071 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 69795151 A G N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 3 69795420 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69796719 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 69797178 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69797662 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 69797933 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 69798033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69798304 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 69798325 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69798461 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 69798564 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 69798630 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69798677 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 69798731 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 69798736 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 69799011 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 69799017 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 69799243 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 69799268 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 69799365 G C N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.230769230769231 0.538461538461538 0.230769230769231 13 13 3 7 3 3 69799428 T C N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 3 69799484 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 69799519 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69799618 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69799767 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 69799770 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 69799791 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 69799853 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 69799898 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 3 69799917 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 69800093 C T N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 3 69800155 A T N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 3 69800172 C T N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 3 69800540 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 69800581 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 69800605 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 69800631 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69801022 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69801028 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 69801059 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69801088 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69801107 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 69801156 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 69801165 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 69801216 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 69801236 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 69801239 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 69801316 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 69801390 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 69801443 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 69801449 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 69801466 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 69801474 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 69801480 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 69801493 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 69801552 G C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 69801581 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 69801717 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69801784 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 69801790 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 69801795 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 69801851 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 69801897 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 69801981 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 69802026 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 69802047 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69802627 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 69802702 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 69802757 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69802903 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69802913 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69802929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69802979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69803144 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 69803406 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 69805403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69805788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69805799 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 69805897 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 69805917 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 69805958 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69806280 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 69806497 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 69806613 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 69807086 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 69807433 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 69807894 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69807904 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69807946 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69807958 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69807963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69808397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69808414 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69808441 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 69808573 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69808593 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 69808711 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 69808717 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 69808826 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69808918 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69809061 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 69809207 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 69809249 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 69810244 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 69810517 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 69810737 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 69810990 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 69810991 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 69811031 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 69811097 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 69811131 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 69812015 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 69812105 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 69812162 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 69812480 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.578947368421053 0.105263157894737 0.315789473684211 24 14 11 2 6 3 69812582 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 69812796 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69813397 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 69813854 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 69813900 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69814095 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 69814331 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 69814724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69814841 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 69815247 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 69815548 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69815603 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 69817416 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69817641 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69817722 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69818416 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 69818482 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 69818492 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 69818774 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69819772 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69821407 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 69821448 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 69821528 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 69823241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69823257 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 69823930 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69824436 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 69824558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69830090 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69834437 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 69834944 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 69835142 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 69835590 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 3 69835667 C T Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 69836414 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69836776 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 3 69837137 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 69837601 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 69837732 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 69838016 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69838252 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 69838603 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 69839774 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69840515 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 69840721 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 69842296 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69843519 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69844682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69846168 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69846185 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69846502 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69846817 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 69857569 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69858235 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69859738 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 69860191 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 69863424 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 69864553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69865293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69871155 C G Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 69873292 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69874093 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 69874513 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69876314 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 69877383 A T Y N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 69877809 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69878285 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69879352 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69886662 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 69886681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69886777 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69886962 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69887516 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69888544 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69889598 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 69889733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69890043 T C N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 69890270 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 69890302 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69890591 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 69890858 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 69890860 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 69891920 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 69892160 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69893178 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69893669 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69895071 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 69895096 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 69897863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69900391 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 69900398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69900416 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69900457 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69900705 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69902044 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 69902102 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 69902127 T A Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 69902427 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 69902679 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 69903147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69903651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69903965 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 69903966 T C Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 69904011 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 69904049 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 69904086 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 69904112 T G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 69904115 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 69904140 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 69904144 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 69904157 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 69904288 C T Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 3 69904379 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 69904570 T C Y Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 10 8 3 4 2 3 69904619 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 3 69904967 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 69905047 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 69905066 T A Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 69905077 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 69905103 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 69905190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69905249 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 69905558 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69905611 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 69906064 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 69906760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69907496 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 69908104 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69908106 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 69908121 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 69908164 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69908188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69908351 G A Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 69908386 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69908539 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69908546 G C Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 69908572 A G Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 69908793 C T Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 69908816 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69908935 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 69909214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69909234 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 69909242 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 69909546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69909563 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 69909929 A T N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 3 69910219 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 69910476 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 69910512 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 69910739 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 69910787 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 69910943 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 69911032 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 69911238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69911266 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 69911393 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69911491 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69911537 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69911895 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 69911943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69912077 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69912097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69912196 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69912204 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 69912216 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 69912612 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 69912699 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69912700 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69912810 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 69912895 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69912926 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 69913034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69913069 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 69913137 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69913186 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69913358 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 69913432 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69913488 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 69913501 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 69913527 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 69913678 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 69913828 C G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0 0.705882352941177 0.294117647058824 12 22 0 12 5 3 69914594 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 69914641 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 69914737 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69914768 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 69915372 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 69915538 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 69917394 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69917478 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69918120 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 69918734 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69919336 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 69919373 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 69919451 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 69919488 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 69919510 T A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 69919646 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 69919743 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 69920026 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 69920043 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69920063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69920070 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69920161 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69920187 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 69920210 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 69920245 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 69920398 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 69920661 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 69920678 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 69920702 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 69920815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69920861 T A Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 69920967 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 69921032 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 69921063 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 69921449 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 69921462 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69921479 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 69921700 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 69921789 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 69921798 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69921844 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 69921863 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 69921912 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 69921996 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 69921997 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 69922085 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69922109 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 69922126 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 69922461 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 69922471 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 69922499 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69922597 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 69922602 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 69922965 A G N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 12 8 4 4 2 3 69923013 T C N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 3 69923067 A G Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 3 69923100 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 69923124 G A Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 69923170 G C Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 69923196 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 69923221 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69923325 A C Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 69923345 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 69923363 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 69923500 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 69923631 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 69923718 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 69924050 T A Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 69924238 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 69924382 T G Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 69924451 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 69925300 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 69925504 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69925884 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 69926487 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 69926558 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 69926565 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 69926626 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 69926761 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 69927208 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69927418 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69927566 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 69927602 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 69927628 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 69927714 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 69928258 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 69928291 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69928536 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69929165 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 69929677 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69930961 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 69931703 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69931825 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69931850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69932940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69934534 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69935028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69935038 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 69935394 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69935638 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69935911 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 69935913 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 69936727 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 69937089 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 69937402 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69937422 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 69937903 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 69938579 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 69940139 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69941534 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 69942177 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69942419 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 69943147 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 69943831 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69944163 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69944746 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 69945395 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69945577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69946469 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 69948161 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 69948726 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 69948789 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 69949007 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69949567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69952133 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69954022 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 69955222 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69956886 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69957148 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 69957292 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 69957387 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 69957561 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 69958164 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 69958321 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 69958408 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69958746 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 69958866 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 69958888 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 69958902 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 69959141 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 69959149 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 69959153 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 69959164 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 69959184 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 69959250 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 69959292 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 69966106 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 69966117 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 69966666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69966763 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69967129 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 69967361 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 69967383 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 69968154 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69968506 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69968896 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 69975158 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 69975183 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 69975370 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 69975436 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 3 69975555 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 69975557 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 69975581 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 69975582 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 69975656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69975670 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 69975930 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69976102 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 69976556 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69976676 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 69976868 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 69977226 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69977390 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 69977474 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 69977617 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 69977769 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 69978003 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 69978007 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 69978616 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 69978638 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 69978650 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 69978683 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 69978827 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 69978839 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 69978847 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 69978875 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 69978923 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 69979013 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 69979075 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 69979107 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 69979206 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 69979252 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 69979284 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 69979366 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 69982567 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 69983521 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 69983598 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69983899 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69984717 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 69984723 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 69984731 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 69985000 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 69985022 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69985316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69985717 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69986168 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69986539 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 69987269 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69987433 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 69987498 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69987520 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 69987590 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 69987633 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 69987700 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 69987766 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69987845 G A N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 3 69987871 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 69987901 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 69987954 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 69988176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69988237 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69988277 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 69988304 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69988449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69988500 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69988502 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69988549 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69988669 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69988800 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69988918 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 69989690 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 69989789 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 69989790 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 69989923 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 69990077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69990151 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 69990231 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 69990307 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69990713 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 69991199 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 69991663 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 69992131 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69992248 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69992280 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69992369 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 69992675 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69993270 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 69993275 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 69993283 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69993657 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 69993911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69993947 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69994015 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 69994927 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69995096 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 69995560 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 69995618 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 69996173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69996878 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 69996948 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69997256 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 69997312 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 69997456 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 69998886 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69998994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69999145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 69999498 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 69999520 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70000826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70000950 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70001477 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 70001827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70002163 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70005066 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 70005539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70005836 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 70005997 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 70007498 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70008556 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70009243 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70009544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70010908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70011168 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 70012617 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 70012835 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 70013456 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 70013604 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70013865 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 70013916 T A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 70013918 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 70013959 C A N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 70014213 C T Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 3 70014222 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 70014376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70014520 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 70014621 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70014696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70014981 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70015108 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 70015118 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 70015138 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 70015175 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 70015176 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 70015257 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 70015820 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 70015839 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 70016007 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 70016015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70016056 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70017064 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70017226 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 70018178 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70018378 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70018436 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 70018963 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70020236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70022754 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 70025043 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 70027348 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70028626 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70029893 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70030492 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70032489 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 70032537 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 70032545 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70032633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70032678 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 70034875 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70035590 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70035645 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70035663 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70035889 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70036514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70036803 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70037443 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70039131 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 70039224 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 70039624 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 70039714 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70039757 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 70039769 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70039773 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70039852 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70039910 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70039938 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70039970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70040023 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 70040044 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 70040638 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70040762 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70040959 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70041072 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 70041276 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 70041525 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 70041670 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70041721 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70041726 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70041798 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70041880 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70041882 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70041912 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70042033 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70042266 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 70042715 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70042906 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70043014 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 70043175 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 70043279 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 70043501 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 70043971 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 70043988 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 70044191 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 70044203 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 70044237 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 70044289 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 70044347 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 70044414 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 70044472 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70044548 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70044588 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 70044605 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 70044750 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70045252 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 70045263 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 70045370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70045485 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 70045521 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 70045527 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70045661 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 70045915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70045928 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 70045930 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 70045968 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70046037 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70046363 G A Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 70046364 G A Y Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 3 70046401 G T Y N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 3 70046596 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 70046635 G A Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 70046691 G A Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 70046702 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70046740 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70046762 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 70047013 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70047580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70047901 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 70048126 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 70048162 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 70048171 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 70048178 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 70048207 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 70048209 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 70048232 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 70048301 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 70048326 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 70048366 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 70048480 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 70048569 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.157894736842105 0.736842105263158 0.105263157894737 20 18 3 14 2 3 70048570 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 3 70048717 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 70048726 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 70048733 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 70048817 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 70048883 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 70048937 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 70048961 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 70048970 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 70048996 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70049003 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 70049172 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 70049180 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 70049227 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 70049243 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 70049246 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 70049284 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70049343 A T N N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 3 70049477 A G N Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 70049638 C G N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 70049744 A T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 70049831 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 70049878 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 70049904 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 70049934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70049950 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 70049961 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 70049963 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70049987 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 70050034 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70050036 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 70050141 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 70050145 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 70050154 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70050178 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 70050253 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70050352 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70050430 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70050439 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 70050454 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 70050593 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 70050639 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 70050652 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 70050732 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 70051013 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 70051175 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 70051177 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 70051228 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 70051278 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70051393 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 70051612 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 70051625 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70051635 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70051682 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70051820 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 70051822 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70051832 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70051895 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70051928 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70052029 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 70052030 G T N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 70052688 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70052879 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 70052896 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70053066 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70053155 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70053236 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70053245 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70053279 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70053281 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70053334 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70053384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70053414 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70053495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70053556 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70053634 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 70053660 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70053668 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70053684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70053702 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70053748 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70053919 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70054028 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 70054265 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70054380 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 70054696 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 70054717 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 70054786 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 70054787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70055167 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70055880 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 70056084 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70056283 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 70056305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70056359 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 70056380 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70056409 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 70056960 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70057563 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70057632 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 70058074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70058123 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70058580 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70058800 A C Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 70058901 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70059047 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70059089 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70059259 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70059315 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70059602 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 70059816 C T N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 70059924 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 70059950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70060164 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70060631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70060725 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70060760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70060763 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70060780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70060783 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70060868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70060953 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70061034 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 70061105 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70061661 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 70061829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70062342 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 70062402 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70063104 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70063149 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 70063386 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 70063509 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 70064960 T G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 70065324 A T Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 70065458 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 70065555 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 70065583 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 70065596 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 70065638 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 70065676 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 70065683 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 70065742 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 70065767 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 70066620 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 70066657 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 70066779 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 70066810 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 70066858 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 70067074 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 70067076 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 70067110 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 70067141 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70067167 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 70067265 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 70067519 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70067520 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70067809 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 70068339 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70068403 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 70068415 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 70068461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70068718 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70068787 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 70068982 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70070476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70071864 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 70077520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70077813 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70081331 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 70082486 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70082877 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 70088051 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 70090132 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70092947 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70093036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70093778 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70093790 T A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 70096398 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 70096542 C A Y N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.230769230769231 0.615384615384615 0.153846153846154 14 12 3 8 2 3 70096675 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 70096701 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70097217 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 70097743 A G N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 3 70097782 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 70097844 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 70098377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70098501 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 70098571 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70098620 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70099747 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70100389 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70100764 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70105285 A C N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 3 70106605 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 70106690 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70108054 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 70109884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70110492 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70112010 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 70112564 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70114552 A C N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 3 70114603 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 70114604 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 70115196 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 70115664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70115847 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 70115958 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 70116152 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 70117182 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 70118163 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 70118350 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70119253 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 70119452 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70119679 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70120093 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 70120281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70120920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70121352 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 70121568 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 70121579 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 70121898 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 70121914 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 70122102 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 70122110 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70122233 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 70122282 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 70122323 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 70122349 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 70122380 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 70122441 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 70122692 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 70122729 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 70122787 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 70122851 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 70122947 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 70123004 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 70123089 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 70123211 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 70123253 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 3 70123661 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70123748 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70123799 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 70123976 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 70124263 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 70124291 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 70124328 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 70124352 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 70124422 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70124659 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70124660 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 70124767 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 70124800 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 70124915 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70124943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70125212 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 70125297 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 70125421 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 70125439 G A N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 13 7 6 1 3 3 70125612 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 70125902 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70126281 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 70126795 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 70126856 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70126890 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70126984 T C N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 3 70127010 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 70127015 A T N N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 70127033 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 70127248 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 70127287 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 70127350 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70127667 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 70127692 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70128131 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 70128817 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70129387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70129814 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 70130281 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 70130432 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 70130510 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 70130636 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70130819 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70131858 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 70132078 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 70132171 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 70132184 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 70132428 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 70132785 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 70133114 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 70133116 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 70133133 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 70133189 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 70133263 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 70133286 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 70133315 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 70133350 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 70133422 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 70133623 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 70133765 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 70133870 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 70133895 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 70133916 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 70134113 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70134286 G C N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.333333333333333 0.2 0.466666666666667 13 17 5 3 7 3 70134310 C T N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 3 70134336 T G N N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 5 15 2 1 7 3 70134606 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 70134820 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 70135386 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 70135439 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 70135568 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 70135597 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70135649 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 70135712 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 70135848 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 70135932 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 70136040 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 70136129 A C Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 70136204 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70136278 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 70137251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70137600 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 70137641 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 70137830 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70138109 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 70138183 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70138438 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 70138745 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70140442 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 70140445 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 70141270 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 70141821 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 70141889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70143609 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 70143616 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 70143656 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 70143780 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 70143793 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 70144324 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 70144379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70144447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70144789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70145010 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 70145323 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 70146035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70147363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70149886 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 70154058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70154833 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 70155819 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70159129 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70159272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70159620 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70160541 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70161510 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 70162462 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70163396 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70163536 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 70163736 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 70163849 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 70163916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70163940 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 70164028 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 70164094 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70164227 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 70164251 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 70164515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70164576 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 70164605 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 70164626 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 70164647 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 3 70165377 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70165407 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 70165435 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 70165458 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 70165473 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 70165490 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 70165537 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 70165736 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 70165758 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70165763 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 70165781 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 70165880 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 70165888 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 70165953 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 70166023 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 70166041 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 70166085 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 70166255 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 70166345 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 70166367 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70166506 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 70166508 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 70166640 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 70166890 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 70166967 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 70166971 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 70167071 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 70167098 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 70167128 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 70167182 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 70167307 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70167368 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 70167382 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70167401 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 70167446 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 70167665 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 70167680 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 70167865 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 70167913 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 70167964 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 70168124 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 70168196 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70168212 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 70168254 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 70168269 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70168336 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 70168407 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 70168417 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 70168438 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 70168459 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70168475 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 70168681 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 70168686 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 70168734 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 70168752 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 70168759 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 70168773 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 70168820 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 70168850 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 70168859 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 70168881 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 70168951 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 70168964 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 70168971 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 70169156 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 70169225 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 70169233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70169244 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 70169285 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 70169499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70169567 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 70169579 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 70169606 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 70169687 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 70169699 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 70169701 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 70169727 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 70169823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70169842 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 70170000 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70170147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70170156 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70170232 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70170405 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 70170618 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70170639 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 70170811 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70170879 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 70170887 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 70170933 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70170993 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 70171042 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70171074 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 70171101 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 70171160 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 70171178 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 70171215 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 70171238 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 70171267 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 70171272 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 70171295 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70171453 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70171456 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70171478 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70171480 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70171580 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 70171594 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70171623 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 70171639 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 70171659 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70171818 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 70172017 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 70172093 G C N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.333333333333333 0.2 0.466666666666667 13 17 5 3 7 3 70172094 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 70172178 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70172203 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 70172444 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70172745 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 70172801 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 70172808 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 70172825 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 70173213 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 70173262 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70173263 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 70173719 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 70173726 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70174030 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70174160 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 70174199 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 70174416 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 70175396 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70175467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70175548 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70175890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70175931 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70176067 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70176207 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70177097 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70177271 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70177518 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70177839 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70178026 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70178048 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 70178583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70178946 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 70178968 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 70179095 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70180063 A G Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 70180785 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 70180879 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70180897 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70181292 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70181619 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70182126 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70182485 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70182518 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70183520 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 70183554 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 70184104 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70184551 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70184736 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70184932 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70185082 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70185115 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70185138 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70185738 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70186139 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70186717 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70187228 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70187232 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70189734 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 70190196 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70190239 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70190252 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70190432 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70190504 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 70190754 A G Y Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 3 70190798 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70191383 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 70191441 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 70191455 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 70191597 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 70191883 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 70191887 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 70192107 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 70192152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70192291 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 70192323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70192490 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70192593 T A N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 70192696 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 70192721 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70192896 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 70192913 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 70193079 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70193082 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 70193366 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70193622 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 70193769 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 70193818 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 70193927 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 70194060 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 70194135 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 70194250 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70194580 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 70194840 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 70194999 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70195221 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 70195227 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 70195308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70195401 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 70195430 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 70195540 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70195659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70195753 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 70195808 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 70195915 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70196045 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 70196113 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 70196174 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 70196304 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 70196422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70197810 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70198095 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70198096 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70198160 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70198246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70198403 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 70200010 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70200472 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70201621 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70202389 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 70202569 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70202738 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 70202814 A T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 70203440 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 70203514 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 70203589 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70203945 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70203976 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 70204085 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 70204114 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70204277 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 70204319 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70204361 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70204490 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 70204629 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70205600 C T Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 70205680 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 70206473 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70207141 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 70207470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70208913 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70209505 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70210145 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70210237 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70213852 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70216947 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70217781 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 70217818 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70217937 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 70218037 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 70218526 A T Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 70218663 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 70218738 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 70219737 A C N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 70219757 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 70219782 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70219870 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70220216 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70220690 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 70220756 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 70221094 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70222052 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 70222224 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70223057 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 70223085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70223109 T C Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 70223146 A C Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 70223171 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 70224382 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 70224535 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 70225177 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70225219 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 70225226 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70225309 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 70225377 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 70225460 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70225668 G T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 70225926 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 70226033 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 70226149 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 70226319 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70226382 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 70226563 G T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 70226589 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 70226940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70227115 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 70227116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70227134 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 70227280 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70227352 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 70227416 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 70227421 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 70227475 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70227521 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 70227529 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 70227593 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 70227643 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 70227694 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 70227746 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 70227789 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 70227829 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 70228066 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 70228406 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 70228728 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 3 70229684 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70229944 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 70230698 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 70231839 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 70231909 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 70232007 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 70232039 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 70232157 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 70232590 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70232726 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70232859 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70233185 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70233380 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 70233699 A G Y Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.230769230769231 0.692307692307692 0.0769230769230769 15 11 3 9 1 3 70233859 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70234010 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 70235122 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70235938 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 70236713 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70236998 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70237310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70237715 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70239615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70239684 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 70239797 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70240679 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70240748 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70240773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70241393 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70241412 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70241643 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70241873 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70242143 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70243395 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70243488 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70243489 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70243610 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70243655 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70244041 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70245143 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70245414 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70245644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70245893 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 70246096 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 3 70246169 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70246511 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70246579 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70246742 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 70246749 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 70246772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70246799 T A Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 70246826 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 70246859 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 70247179 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 70247194 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 70247311 G T N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 3 70247353 C A N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 3 70247373 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 70247461 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 70247570 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 70247637 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 70247717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70247935 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 70248020 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70248464 C T N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 70248698 A T N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 3 70249071 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 70249144 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70249172 A C N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 70249291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70249491 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70250289 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70250783 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70250879 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70250897 T C Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 70251070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70251657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70252742 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70253001 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70253692 A G Y Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 3 70253981 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70254030 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70254326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70254349 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 70254362 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70254602 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70254839 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70255093 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70255159 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 70255281 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70255379 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70255684 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70255696 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70255743 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70255782 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70255833 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70256229 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70256261 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70256292 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70256351 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70256456 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 70256463 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 70256528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70256645 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70256676 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 70256693 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 70256741 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 70256881 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70256953 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70256960 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70257104 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 70257113 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 70257132 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 70257292 T A N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 70257318 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 70258019 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 70258048 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 70258072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70258097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70258125 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 70258189 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 70258244 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 70258374 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 70258459 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 70258491 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 70258514 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 70258525 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 70258552 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 70258588 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 70258678 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 70258721 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 70258748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70259018 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 70259153 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 70260088 C A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 70260203 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70260249 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 70260271 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 70260292 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 70260305 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 3 70260356 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 70260362 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 70260609 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 70260714 C A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 70260728 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 70260766 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 70260913 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 70260930 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 70260976 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 70260978 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 70261024 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 70261026 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 70261127 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70261132 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70261227 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70261314 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70261335 C G Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 3 70262302 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70262393 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70262798 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70262864 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70262867 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70263090 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70263162 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 70263186 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70263203 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70263230 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 70263244 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70263674 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70263914 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 70263949 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70264070 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70264166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70264391 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70264423 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 70264527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70264689 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70264766 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 3 70264827 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70264952 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70265012 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70265064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70265413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70265432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70265455 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70265488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70265716 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70265775 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 3 70266138 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70266274 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70266422 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 70267155 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 70267551 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70267635 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70267646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70267734 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 70268503 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70269064 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 70269205 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70269369 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70269766 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70269815 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70269940 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70269941 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70269980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70269990 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70270174 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70270201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70270220 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 70270274 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70270384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70270397 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70270575 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70270950 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 70271097 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 70271170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70271181 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 70271201 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 70271432 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 70271656 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 70271852 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70271992 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 70272106 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70272394 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70272516 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70272615 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70273025 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 70273099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70273533 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 70274000 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70275307 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70275504 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70275980 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70276225 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70276577 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70276692 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70276788 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70276897 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70277193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70277794 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 70278323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70278746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70279066 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70279460 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 70280324 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70280815 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70281254 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70281384 G A N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 3 70281643 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70284637 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 70285027 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 70285613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70288117 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70288847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70289985 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70290367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70290413 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70290461 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70290513 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70290694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70290849 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70291900 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 70292462 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70293252 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70294965 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 70294966 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 70295433 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70296545 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70297231 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70297727 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 70298555 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70298986 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70301315 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70301571 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 70301620 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 70302473 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 70302526 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 70302782 C T Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.1875 0.0625 0.75 7 25 3 1 12 3 70302806 G A Y Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 3 70303227 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70303704 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 70304846 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70304887 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 70307139 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70308757 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70308840 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70309205 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70309665 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70311571 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70311690 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 70312622 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70314109 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70314126 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70314443 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70314723 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70315299 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.25 0.666666666666667 0.0833333333333333 14 10 3 8 1 3 70316528 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70317643 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 70317691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70317754 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 70317997 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 70318086 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 70318203 T C N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 3 70318207 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 3 70318419 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 70318421 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 70318451 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 70318463 G A Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 70318782 C A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 70318845 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 70319083 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 70319361 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70319481 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 70320813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70324746 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70324808 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 70325365 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70326494 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70327301 T C N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0 0.75 0.25 9 15 0 9 3 3 70328720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70329885 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 70330327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70331204 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70331402 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70331600 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70333741 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 70335245 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 70336704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70337281 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 70337391 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70338471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70339736 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70342685 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70343945 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70346752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70347622 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70348091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70348486 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70348571 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70349800 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70349882 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70350198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70350229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70350959 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70353455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70353552 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70354035 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70357052 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70357061 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70359046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70359380 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70360550 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70364690 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70366102 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70367132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70369664 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70370037 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 70370039 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 70370192 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 70373913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70374489 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70381876 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 70384758 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70385098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70385374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70385390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70386443 A T Y N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 70386668 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 70387111 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70388216 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 70388311 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70388490 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70390218 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70391076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70391452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70391818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70392671 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70392698 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70393239 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70393930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70394195 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 70394309 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 70395178 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 70395429 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70395840 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70395887 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 70396703 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70397556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70398650 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70398763 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70399333 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 70399814 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70401563 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 70402942 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70403738 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70404469 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70404881 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 70405721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70406398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70406665 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70406678 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70406758 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70407799 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 70408201 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70408661 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 70409457 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70410856 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70410982 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70411554 G T Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 70411556 A G Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 70412937 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70412992 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70414233 C A Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 70414381 T A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 70414882 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70415684 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70415927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70415954 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70415965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70416152 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70417029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70418533 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70421892 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 70422220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70422514 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70422756 G A Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 70423040 T C Y Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 6 8 0 6 1 3 70423070 C T Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 3 70423497 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70424400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70425510 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70425661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70426174 A C N N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 3 70426512 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70426756 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 70426976 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 70428774 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70429167 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70429339 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70429399 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 70430120 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70431750 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 70432132 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70432719 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70432841 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70433889 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 70434239 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70434303 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70434331 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70435919 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 70435999 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70436277 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 70436939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70436967 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70437539 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 70437846 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 70438065 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70438652 G C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 70439007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70439225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70440872 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70440962 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70441362 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 70442685 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 70443143 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70443466 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 70444008 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 70444434 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 70444732 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 70444897 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70444946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70445150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70445626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70446494 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 70447502 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70447539 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 70447554 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70447799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70447872 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 70447983 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70449371 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70451583 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70452326 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 70454192 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70454360 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 3 70454846 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70455745 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70455995 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70456442 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70456538 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70457543 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70457726 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70458159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70458474 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 70458675 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70458824 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 70459062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70459332 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70460273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70461287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70462144 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70462288 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 70462677 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70463377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70463892 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 70464511 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70465114 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70465230 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70465254 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70466086 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70466152 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70466399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70467107 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 70467701 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 70468338 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 70468953 A G Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 70469064 A G N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 70469187 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70469657 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 70469693 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 70469891 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 70469895 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 70470048 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 70470074 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 70470109 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 70470176 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 70470279 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 70470467 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 70470480 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 70470537 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 70470610 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 70470910 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 70471097 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 70471164 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 70471233 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 70471235 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 70471325 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 70471439 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 70471716 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 70471766 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 70471788 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 70471928 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 70472046 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 70472162 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 70472221 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 70472228 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 70472518 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 70472785 T A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 70472818 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 70472826 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 70472847 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 70472867 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 70472873 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 70473086 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 70473129 G A N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 3 70473177 G T N N 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.181818181818182 0.454545454545455 0.363636363636364 9 13 2 5 4 3 70473206 C T N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 3 70473255 A G N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 70473301 A G N Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 3 70473387 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 70473457 T G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 70473549 T G N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 3 70473581 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 70473641 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 70473726 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 70473772 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 70473855 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 70473959 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 70474017 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 70474082 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 70474121 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 70474240 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 70474292 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 70474338 G A N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.230769230769231 0.615384615384615 0.153846153846154 14 12 3 8 2 3 70474360 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 70483922 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 10 8 3 4 2 3 70484038 G A N Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.25 0.75 0 10 6 2 6 0 3 70484913 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 70484940 T G N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 70485006 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 70485122 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 70485185 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 70485214 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 70485266 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 70485281 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 70485352 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 70485442 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 70485647 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 70485671 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 70485980 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 70485993 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 70486011 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 70486161 C G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 70486162 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 70486199 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 70486460 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 70486589 C A N N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.153846153846154 0.769230769230769 0.0769230769230769 14 12 2 10 1 3 70486726 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 70486784 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70486956 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70486957 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70486998 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 70487008 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 70487024 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 70487399 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 70487467 A G N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 70487692 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 70487793 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70487878 G C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 70487919 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 70487988 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 70488044 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 70488047 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 70488177 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 70488281 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 70488376 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 70488439 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 70488476 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 70488758 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70488800 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 70488840 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 70488885 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 70488900 T A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 70489052 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70489114 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70489180 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 70489281 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70489320 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70489403 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 70489758 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70489760 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 70489792 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 70489837 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 70489960 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70490136 C T N Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.714285714285714 0.285714285714286 5 9 0 5 2 3 70490283 G A N Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 3 70490523 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 70490554 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 70490679 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 70490684 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70490692 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 70490705 T G N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 70490753 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 70490764 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 70490827 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 70490837 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 70490851 T G N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 70490941 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 70490983 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 70491024 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 70491069 G A N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 3 70491088 A G N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 70491160 T C N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 3 70491171 A C N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 3 70491186 C T N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 3 70491219 G A N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.181818181818182 0.545454545454545 0.272727272727273 10 12 2 6 3 3 70491228 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 3 70491275 A G N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.454545454545455 0.272727272727273 0.272727272727273 13 9 5 3 3 3 70491423 A C N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 70491533 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70491551 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 70491591 C T N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 3 70498755 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 70498881 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 70498882 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 70498904 A C N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 70498964 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 70498973 T A N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 3 70499003 G T N N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.333333333333333 0.25 0.416666666666667 11 13 4 3 5 3 70499728 C T N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 70499757 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 3 70499873 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 3 70499879 G T N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.0769230769230769 0.615384615384615 0.307692307692308 10 16 1 8 4 3 70500077 T C N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.181818181818182 0.545454545454545 0.272727272727273 10 12 2 6 3 3 70500084 A G N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.25 0.583333333333333 0.166666666666667 13 11 3 7 2 3 70500166 G A N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.153846153846154 0.538461538461538 0.307692307692308 11 15 2 7 4 3 70500250 T C N Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 3 70500522 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 3 70500536 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 70500549 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70500600 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 70500610 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 70500667 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70500673 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 70500715 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 70500722 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 70500731 T G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 70500809 G C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 70500838 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 70500878 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70500934 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 70501021 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 70501087 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 70501153 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 70501182 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 70501255 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 70501279 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70501347 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 70501373 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 70501424 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 70501433 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 70501674 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 70501688 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 70501756 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70502193 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 70502204 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 70502259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70502260 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70502330 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 70502816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70502842 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 70503010 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70503184 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 70503209 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 70503348 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 70503405 G A N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 3 70503419 T A N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 70503606 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 70503651 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 70503717 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 70503753 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 70503790 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70503967 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70504023 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 70504178 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 70504274 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 70504288 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 70504311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70504466 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 70504692 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 70504722 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 70504741 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 70504833 G C N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 70504979 G T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 3 70505048 C A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 70505104 A C N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 18 14 4 10 2 3 70505123 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 70505139 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 70505167 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 70505219 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 70505252 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 70505378 T G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 70505394 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 70505404 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 70505465 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 70505516 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 70505671 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 70505715 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 70505762 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 70505792 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 70505823 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 70505836 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 70505837 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 70505891 T A N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 70505892 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 70505954 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 70505956 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 70505967 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 70505980 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70506015 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 70506136 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 70506149 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 70506206 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 70506847 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 70507392 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 70507814 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70507878 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70508036 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 70508321 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70508420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70508464 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70508604 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70508692 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 70508694 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 70509053 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70509080 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70509436 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70509533 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70510060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70510177 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70510188 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 70510314 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70510348 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70510370 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70510406 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70510416 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70510495 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70510513 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70510653 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70510666 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70510707 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70510735 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70510863 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 70510909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70510927 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 70510945 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70510984 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70510985 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 70511042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70511208 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70511219 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70511252 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 70511271 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70511312 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70511373 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70511450 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70511526 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70511537 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70511699 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70511754 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 70511761 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70511796 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70511940 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70511955 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70512214 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70512330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70512492 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 70512503 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 70512514 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 70512659 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 70512734 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 70512902 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 70512959 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 70512982 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70513647 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 70513713 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 70513776 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 70513787 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 70513791 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 70513944 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70514040 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 70514120 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 70514165 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70514195 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70514576 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70514623 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 70514753 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 70514824 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70515052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70515091 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 70515751 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 70516905 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 70516930 A G N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.625 0.125 0.25 11 5 5 1 2 3 70516976 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 70517269 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 70517314 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 70517590 G C Y N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 70520094 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70520128 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 70520159 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70520389 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 70520469 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70520552 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 70520673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70520696 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70520738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70521068 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 70521092 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70521144 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70521206 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 70521313 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70521345 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70521421 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70521601 G A N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 3 70521976 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70521985 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70521990 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70522011 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70522114 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70522142 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70522153 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70522228 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 70522383 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70522478 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70529029 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70529114 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 70529118 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 70529149 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70529173 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 70529287 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 70529317 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 70529340 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 70529372 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 70529381 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70529440 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70529456 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70529577 A C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 70529686 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70529849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70529896 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70529954 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70529995 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70530054 G T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 10 22 0 10 6 3 70530071 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 70530079 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70530161 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 70530240 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 70530317 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 70530349 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 70530366 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70530418 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70530869 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 70530924 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 70530980 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70531058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70531236 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70531510 T G N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 70531676 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 70531702 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 70531770 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70531780 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 70531954 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 70531980 G C N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 70531997 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 70532095 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70532386 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70532415 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 70532491 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 70532595 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70532882 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 70532978 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70533002 G T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 70533421 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70533479 C A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 70533725 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 70533759 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70533943 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70533983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70534059 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70534244 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 70534312 G A Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 3 70534497 C A N N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 3 70535207 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 70535238 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 70535314 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 70535325 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70535429 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70536201 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70536211 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70536244 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 70536246 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 70536257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70536298 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70536316 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 70536444 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70536476 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70536490 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70536494 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70536761 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70536891 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70536907 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 70536954 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70537001 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70537051 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 70537060 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 70537073 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 70537237 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 70537367 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70537394 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 70537489 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 70537557 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 70537619 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 70538021 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70538081 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 70538099 G C N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 70538165 T A N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 70538185 T C N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 3 70538242 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 70538368 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.125 0.6875 0.1875 15 17 2 11 3 3 70538435 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70538451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70538459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70538462 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 70538564 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70538618 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 70538629 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 70538642 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70538667 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 70538751 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 70538859 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 70538927 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 70538969 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 70538991 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 70539156 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 70539283 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70539635 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70539753 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70539812 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 70539900 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70540028 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 70540031 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 70540098 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 70540174 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70540317 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 70540390 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70540419 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 70540450 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 70540548 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 70540598 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 70540624 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 70540653 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 70540683 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 70540810 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 70540840 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 70540990 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 70541550 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 70541579 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70541796 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 70541820 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 70541890 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 70541927 T C N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 70542043 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 70542057 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 70542070 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70542252 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 70542348 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70542349 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 70542393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70542694 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 70542745 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 70543467 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 70543484 A T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 70543493 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 70543656 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70543996 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 70544240 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 70544286 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 70544349 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 70544441 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 70544614 C A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 70544669 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70544928 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 70544940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70544959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70545013 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 70545063 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 70545167 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 70545356 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 70545499 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 70545518 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 70545938 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 70546069 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70546218 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70546392 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 70546648 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 70546680 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 70546843 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 70546873 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70547112 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 70547265 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70547376 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 70547550 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 70547580 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 70547608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70547643 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 70547771 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 70548118 T G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 70551532 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 70551608 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70551651 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 70551665 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 70551673 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70551711 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 70551715 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 70551741 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 70551814 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 70552110 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 70552151 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 70552326 T A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 70552549 C A N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 70552811 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 6 12 2 2 5 3 70552843 G A N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 3 70553176 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 70553342 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 70553355 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70553376 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70553464 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 70553840 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 70553893 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 70553951 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70554010 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 70554028 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 70554174 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70554541 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 70554600 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70554837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70554856 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 70555088 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 70555194 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 70555273 C T N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 3 70555330 C T N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 70555365 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 70555431 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70555466 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70555479 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 70555520 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70555533 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 70555556 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 70555576 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70555689 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 70555954 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70556265 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 70556311 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 70556335 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 70556618 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 70557045 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 70557122 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70557164 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 70557304 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 70557412 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 70557592 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70557677 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 70557814 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 70557944 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 70558098 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 70558423 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 70558551 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 70558922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70559130 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 70559243 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 70559260 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 70559299 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 70560349 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 70560406 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 70560701 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 70560746 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70560767 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70560907 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 70561010 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70561022 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 70561709 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70561715 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70562475 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 70562523 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70563188 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 70563250 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 70563275 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 70563504 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 70563539 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70563927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70564326 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 70564412 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 70564444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70564576 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70564790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70564825 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70565318 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 70565357 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70565415 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70565530 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70565696 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70565821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70565830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70566351 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70567739 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70568302 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70568374 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 70569319 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 70569381 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 70569550 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 70570656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70572577 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70573057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70573704 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 70573845 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70573846 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70573924 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70574467 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 70574489 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70574613 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70575253 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70575359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70576008 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70576971 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 70577089 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70577832 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70581176 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70581557 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70582932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70583290 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70586333 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70586603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70587134 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70588200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70588252 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 70590830 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 70590921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70592476 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70592809 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70593382 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70594744 T C Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0 0.647058823529412 0.352941176470588 11 23 0 11 6 3 70594756 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 3 70594764 T A Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 70594775 C G Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 70595223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70595394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70595796 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70596010 C G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 70606797 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70608529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70609968 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70610153 G T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 70611190 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70612309 T A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 70612883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70612916 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70615128 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70616129 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 70616191 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 70617105 C G N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 3 70617968 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70620002 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 70620477 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 70621029 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70621336 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70621894 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70622896 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 70625247 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 70625329 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70625729 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 70626229 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70626237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70627050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70627959 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70628848 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70629698 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70629928 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 70638164 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 70638545 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 70638567 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70638920 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 70639595 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 70639711 G A N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.533333333333333 0.2 0.266666666666667 19 11 8 3 4 3 70646925 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 70647846 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 70647999 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 70648521 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 70648522 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 70658778 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 70658780 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 70658802 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 70658930 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70659240 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70660279 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 70660649 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 70661067 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 70661660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70662104 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 70663454 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70666782 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70667643 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70668574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70668664 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70670970 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70671130 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70671147 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70672402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70672449 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70675088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70677686 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 70680248 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70681422 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70683058 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70683591 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 70685093 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70685250 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70686040 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70688796 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70688797 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70688881 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70689843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70690967 G A Y Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 3 70690968 T G Y N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 70691095 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70691337 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 70692856 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70692883 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 70693738 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70694281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70694462 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70694905 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 70694997 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 70695113 G C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 70695131 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 70695222 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 70695567 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 70695654 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 70695911 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 70695984 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 70696515 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 70697167 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70697519 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70697785 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70697961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70698036 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 70698072 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70698162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70698229 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70698240 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 70698264 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70698339 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 70698342 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70698490 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 70698494 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 70698502 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 70698523 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 70698550 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70698677 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 70698896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70699096 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70699200 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 70699337 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70699807 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70699947 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 70700091 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70700124 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 3 70700386 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70700407 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70700678 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70700975 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70700985 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 70701233 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 70701544 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 70701551 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 70701557 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70701576 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70701687 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 70701715 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 70701948 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 70702003 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 70702016 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 70702017 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 70702138 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70702149 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 70702206 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 70702213 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 70702248 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 70702294 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 70702460 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 70702468 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 70702578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70702619 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70702816 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 70703038 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 70703182 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70703183 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70703256 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 70703493 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 70703617 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70703645 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 70703972 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 70704048 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 70704164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70704238 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 70704263 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70704329 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 70704357 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 70704413 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 70704440 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70704514 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 70704828 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 70704862 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 70705027 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 70705058 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 70705063 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 70705215 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70705290 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 70706357 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70706371 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 70706385 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 70706741 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 70706908 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 70706932 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 70706956 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 70706957 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 70707096 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 70707223 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70707431 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 70707437 T A N N 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 6 8 2 2 3 3 70707704 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 70707775 T G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 70707841 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 70707888 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 70708107 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 70708120 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70708313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70708443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70708595 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 70709402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70709701 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 70709881 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 70709911 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70709938 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 70710056 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 70710218 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 70710482 A T N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 70711020 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 70711228 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70711256 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70711495 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70711576 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70711604 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70711750 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70711924 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70712033 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70712379 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70712488 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 70712595 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70712780 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70712814 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70713381 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70713778 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70714014 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70714409 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70715781 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 70717355 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70717621 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 70717635 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70719424 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70719808 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70719986 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70720342 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 70720711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70721091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70721692 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70721705 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70721916 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70723479 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70724466 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 70724772 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70724817 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70725590 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70727466 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70728578 T A N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 3 70729021 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70729661 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70729906 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 70730357 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70732022 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 70732477 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70733218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70733516 T C N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 70734311 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70734363 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70734407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70734693 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 70734922 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 70734954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70734979 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 70735044 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70735495 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 70735500 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 70735871 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 70736230 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70736580 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 70736668 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 70736906 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70737286 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70737846 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 70738122 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 3 70738238 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 70739993 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 70740009 A G N Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.625 0 0.375 10 6 5 0 3 3 70740108 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 70740236 C A Y N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 70740238 G A Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 70740533 C A Y N 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.285714285714286 10 4 5 0 2 3 70741694 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 70741868 T C Y Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.727272727272727 0 0.272727272727273 16 6 8 0 3 3 70742106 A C Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 70742117 G A Y Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.5 0.1 0.4 11 9 5 1 4 3 70742287 T A Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 70742313 T A Y N 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 13 7 6 1 3 3 70742336 G A Y Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.75 0 0.25 18 6 9 0 3 3 70742381 G A Y Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.25 17 7 8 1 3 3 70742515 T G Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 70742679 C G Y N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.636363636363636 0.0909090909090909 0.272727272727273 15 7 7 1 3 3 70743266 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 70743280 T C N Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.6 0 0.4 6 4 3 0 2 3 70744447 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70744464 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70744635 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 70744813 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 70745185 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 70745661 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 70747129 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70747314 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70748907 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70749237 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 70749374 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 70749595 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 70749920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70749986 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 70749995 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70750078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70750197 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 70750258 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 70750290 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 70750574 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 70751022 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 70751299 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 70751353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70751382 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70751540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70751587 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 70752873 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70753395 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70753503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70754199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70754316 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 70754372 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 70754383 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70754549 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70754650 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70754718 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 70754768 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 70754824 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 70754977 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 70755157 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70755310 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 70755324 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 70755607 T C N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 3 70755656 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 70755701 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 70755988 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70756496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70756677 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 70756921 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70756969 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70757229 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 70757234 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 70757519 G C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 70757529 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70757780 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 70757880 A C N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 70757926 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 70758137 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 70758606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70758776 C T N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 3 70759332 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 70759367 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 70759594 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 70760150 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 70760400 G T N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 3 70760429 C T N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 3 70760446 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 70760627 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 70760816 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70762329 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70762350 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70762432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70764571 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70765062 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70765131 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70765478 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70766052 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70768391 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70768828 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 70769630 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 70772851 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70772976 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 70773098 G A Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 70774668 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70775397 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 70775574 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70777121 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70778312 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70778559 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70778612 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70778856 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70780923 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 70784455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70787773 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70787946 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70791058 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70793249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70793390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70793640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70795982 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70797896 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70800051 T C N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 70808537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70812263 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70813671 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70814750 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 70817511 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70818656 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 70819039 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 70819225 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70819666 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 70820556 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70822024 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70822191 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70822787 G T Y N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 70824531 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70824703 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70824958 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70825000 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 70825366 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.2 0.75 0.05 23 17 4 15 1 3 70826719 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70827417 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70827637 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70828626 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 70829719 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70830558 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70832604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70834919 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70835043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70835569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70836015 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70836858 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 70837288 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 70838544 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 70838582 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70839261 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 70839662 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70840041 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 70840750 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70840797 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70841742 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70842115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70842738 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70842801 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70843417 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70843637 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70844551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70845186 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70846369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70846967 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 70849050 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70849563 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70850174 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70850204 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70851330 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70852653 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70853058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70853108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70853299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70854616 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70855640 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70856198 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 70856329 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 70859813 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 70860110 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70869945 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70870977 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 70871187 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70871949 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 70875538 T C Y Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 3 70876006 T C Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 70876059 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70876948 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70877029 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70878539 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70879197 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 70880268 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 70882880 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70883672 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70884069 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70884412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70884821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70885433 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70887105 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70894262 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 70894734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70895223 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70895768 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 70895886 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70897021 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 70898234 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70898255 C A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 70899261 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70899326 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70899477 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70899772 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70900719 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 70901013 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 70901238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70901728 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70901737 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70901784 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70905825 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70907805 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70908132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70908924 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70909167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70909484 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 70909603 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70910497 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70910686 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70912229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70914135 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70914348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70914549 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70918188 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70920099 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70920344 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70920866 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70928224 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70928433 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70931938 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70932072 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70932176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70934534 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70937075 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70937108 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70937823 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70938744 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 70939041 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 70939204 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 70939672 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 70939700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70939914 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 70939927 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70939968 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70940000 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 70940519 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70940537 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 70940561 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70940569 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 70940596 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70940711 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 70941162 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70941384 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70941472 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 70941476 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 70941573 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 70941766 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 70941823 A G N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 70941958 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 70942132 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 70942321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70942536 G T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 70942673 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70942854 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70942988 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70943347 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 70943399 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 70943474 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 3 70943575 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70943581 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70943732 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 70943785 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 70944264 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 70944630 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70944966 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 70945071 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70945131 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70945228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70945270 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70945357 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 70945499 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 70945501 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70945565 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 70945734 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 70945771 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 70945779 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70945985 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 70946306 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 70946332 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 70946388 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 70946417 T C N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 70946699 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 70946759 T G N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 70946824 C G N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 70946902 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 70947004 G A N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 9 11 3 3 4 3 70947339 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 70947354 T A N N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 3 70947361 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 70947519 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 70947558 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 70947664 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 70947705 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 70947766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70947946 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 70948002 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 70948110 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 70948164 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 70948262 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 70948263 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 70948276 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 70948292 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 70948347 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 70948587 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 70948798 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 70948801 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 70948822 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 70948952 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 70949037 C A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 70949308 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70949762 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70949769 T A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 70949840 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70949899 G A N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 3 70949929 G A N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.615384615384615 0.153846153846154 0.230769230769231 18 8 8 2 3 3 70950008 A C N N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.636363636363636 0.181818181818182 0.181818181818182 16 6 7 2 2 3 70950146 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 70950209 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 3 70950217 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 70950266 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 70950361 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 70950496 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 70950525 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 70950699 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70950714 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 70950838 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70950916 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 70951174 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70951324 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 70951373 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 70951393 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 70951406 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 70951456 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 70951496 A G N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 70951701 A C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 3 70951798 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 70951956 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70952040 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70952175 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 70952203 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 70952257 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 70952266 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70952272 A T N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 70952312 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 70952398 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 70952485 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 70952573 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 70952593 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70952645 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 70952696 C T N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 3 70952723 T A N N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 3 70952804 C A N N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 70952822 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 70952824 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 70952876 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 70952877 T C N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 3 70953010 T G N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 70953033 A T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 70953094 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70953228 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 70953537 T C N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.363636363636364 0.181818181818182 0.454545454545455 10 12 4 2 5 3 70953598 A G N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.384615384615385 0.230769230769231 0.384615384615385 13 13 5 3 5 3 70953599 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 70953752 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 3 70953763 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 70953774 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 70953832 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70953902 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 70953904 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 70954006 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 70954017 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 70954025 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 70954057 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 70954078 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70954206 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70954298 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70954369 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 70954375 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70954416 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70954481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70954494 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70954501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70954520 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70954531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70954546 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70954623 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 70954648 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 70954670 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 70954888 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70954939 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70954991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70955015 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70955452 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 3 70955485 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 70955548 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70955624 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70955626 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70955700 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 70955805 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 70955825 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 70955913 A G N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 15 9 6 3 3 3 70956027 C T N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.538461538461538 0.230769230769231 0.230769230769231 17 9 7 3 3 3 70956202 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70956203 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 70956269 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70956414 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70956469 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70956575 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70960215 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70960223 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 70960245 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 70960247 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 70960322 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 70960430 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70960504 C A N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 3 70960603 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 70960878 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70960897 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70960939 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70960957 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70961028 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70961076 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70961081 A T Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 70961135 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70961160 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70961480 A T Y N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 70961524 C A Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 70961542 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70961605 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70961610 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70961779 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70961810 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70961926 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70962079 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70962082 C T Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 70962127 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 70962196 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70962209 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70962490 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70962495 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70962579 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 70962645 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 70962653 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70962713 G A N Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.428571428571429 0.142857142857143 0.428571428571429 7 7 3 1 3 3 70962807 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70962812 T G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 70962896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70962933 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70963045 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70963097 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70963109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70963182 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70963229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70963253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70963335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70963356 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70963512 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 70963542 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70963716 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70963719 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70963823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70964033 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 70964081 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70964111 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70964114 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70964170 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70964229 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70964298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70964358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70964620 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70964802 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70964894 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70964991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70965026 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70965092 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70965114 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70965123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70965138 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70965206 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70965226 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70965311 A C Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 70965341 C G N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 70965374 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70965378 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70965417 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70965454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70965597 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70965627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70965652 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70965674 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 70965678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70965723 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 70965729 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70965838 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70965898 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70965916 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 70965960 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70966043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70966135 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70966144 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70966187 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70966209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70966247 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70966261 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70966267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70966445 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70966479 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70966498 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70966500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70966542 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70966581 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70966919 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 70966970 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 70967227 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 70967266 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70967286 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70967468 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 70967487 G T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 70967514 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 70967534 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 70967536 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 70967563 G T N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 70967787 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 70967856 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70967911 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70967944 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70968147 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 70968256 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 70968309 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 70968319 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 70968565 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70968589 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70968634 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70968668 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70968718 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70968944 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 70968966 C A N N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.333333333333333 0.25 0.416666666666667 11 13 4 3 5 3 70969182 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 70969196 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 3 70969324 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 70969372 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70969625 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 70969670 A T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 70969727 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 70969804 A G N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 15 9 6 3 3 3 70969826 G A N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.461538461538462 0.230769230769231 0.307692307692308 15 11 6 3 4 3 70969833 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 70969920 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 70970095 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 70970108 G T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 70970160 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 70970189 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70970233 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70970456 G C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 70970620 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 70970648 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70970751 C G N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 3 70971152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70971226 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 70971237 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70971301 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70971378 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70971673 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70971696 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70971753 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 70971864 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70971882 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 70971896 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70971924 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 70972008 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 70972027 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70972070 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 70972159 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 70972329 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 70972355 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 70972496 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70972513 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70972523 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 70972550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70972786 A G N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 3 70972973 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 70973035 G A N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.461538461538462 0.230769230769231 0.307692307692308 15 11 6 3 4 3 70973204 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70973345 G C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 70973401 A C N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 70973600 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 70973678 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 70973679 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 70973724 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 70973756 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 70973773 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 70973838 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70973973 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70974091 T A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 70974094 A T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 70974217 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70974224 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70974258 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 70974336 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 70974356 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 70974414 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70974417 C A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 70974499 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 70974648 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 70974677 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 70974722 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 70974726 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 70974805 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 70974839 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 70974874 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 70974893 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 70974909 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70974938 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70974954 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70974972 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 70974973 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 70975132 G T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 70975211 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 70975441 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 70975475 A C N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 70975476 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 3 70975496 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 70975544 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 70975562 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 70975611 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 70975651 G T N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 0.142857142857143 0.214285714285714 20 8 9 2 3 3 70975735 C T N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.285714285714286 19 9 9 1 4 3 70975954 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 70976125 T A N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.461538461538462 0.230769230769231 0.307692307692308 15 11 6 3 4 3 70976239 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 70976336 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 70976370 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 70976421 A G N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 70976461 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 70976491 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 70976555 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 70976632 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 70976714 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 70976738 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 70976767 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70976773 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 70976792 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 70976803 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70976829 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 70976867 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 70976871 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 70976960 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70976972 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70977074 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 70977093 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 70977107 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70977164 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70977197 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 70977243 A C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 70977271 A C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 70977319 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 70977384 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 70977391 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 70977486 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 70977494 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 70977506 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 70977508 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70977520 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 70977530 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 70977590 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70977639 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70977684 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 70977686 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 70977709 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 70977723 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 70977732 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 70977852 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 70978295 A G Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 0.153846153846154 0.153846153846154 20 6 9 2 2 3 70978303 A G Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 3 70978419 T C N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 70978454 A G N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 70978564 T C N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 70978600 T A N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 3 70978682 G T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 70978718 T G N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 70978732 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 70978733 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 70979386 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 70979559 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 70979976 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 70980004 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 70981302 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 3 70981345 A T Y N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 70981346 A T N N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 70981394 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 70981401 G A N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 70981415 A T N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 70981477 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 70981484 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 70981538 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 70981560 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 70981561 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 70981648 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 70981769 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 70981770 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 70981806 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 70981824 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 70981886 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 70981937 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 70981954 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 70981982 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70982023 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70982084 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 70982115 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 70982122 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 70982190 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 70982209 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70982248 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 70982252 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 70982290 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 70982412 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 70982461 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70982462 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70982539 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 70982546 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 70982633 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70982668 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 70982713 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 70982786 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70982788 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70982851 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70982884 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70982890 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 70982963 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70982982 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70984000 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 70984888 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 70985122 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 3 70985129 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 3 70985190 T A N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 70985258 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 70985314 G T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 70985380 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70985386 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70985411 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 70985442 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70985467 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70985473 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70985488 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70985587 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 70985626 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 70985650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70985662 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70985669 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70985708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70985717 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70985746 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70985754 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70985803 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70985811 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70985825 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 70985881 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70985914 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 70985926 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70985965 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70985977 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70986069 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70986177 C G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 70986214 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 70986230 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70986236 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70986310 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 70986311 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 70986463 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 70986566 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70986581 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70986589 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70986626 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70986666 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70986676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70986684 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 70986719 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70986726 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 70987029 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 70987037 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 70987190 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 70987224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70987232 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 70987240 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 70987324 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 70987339 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 70987357 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 70987390 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70987471 A G N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.615384615384615 0.153846153846154 0.230769230769231 18 8 8 2 3 3 70987644 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 70987678 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 70987681 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 70987716 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 70987770 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 70987779 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 70987846 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 70988087 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 70988178 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 70988230 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 70988329 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 70988353 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70988411 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 70988762 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 70989075 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70989121 T A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 70989128 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 70989258 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 70989385 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70989469 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 70989543 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 70989592 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 70989736 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 70989750 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 70989764 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 70990047 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 70990107 T A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 70990128 C A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 3 70990160 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 70990212 A C N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 3 70990286 A T N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 70990317 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 70990375 G T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 70990387 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 70990675 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70990849 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 70990872 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 70990891 G T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 70990934 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 70991108 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 70991187 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 70991258 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 70991561 T A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 70991681 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 70991722 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 70991734 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 70992033 A T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 70992039 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 70992058 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 70992193 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 70992279 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 70992359 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 70992378 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 70992442 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 70992474 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 70992567 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 70992655 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70992696 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 70992866 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 70992909 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 70992934 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 70992957 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 70992990 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 70993078 C A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 70993229 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 3 70993371 A G N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 70993397 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 70993401 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 70993435 G A N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 70993484 G C N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 3 70993505 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 3 70993513 G A N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 3 70993518 A T N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 3 70994307 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 70994352 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 70994364 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 70994376 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 70994396 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 70994420 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 70994450 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 70994707 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 70994795 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 70994884 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 70994885 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 70994937 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 70994967 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 70995006 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 70995077 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 70995184 C A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 70995234 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 70995384 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 70995415 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 70995535 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 70995629 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 70995733 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 70995734 T G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 70997202 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 70997370 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 70997465 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 70997913 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70998808 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 70999295 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 70999397 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71000094 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 71000136 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 71000360 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 71000426 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 71000509 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71000605 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 71001014 T C N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 3 71001090 C T N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 3 71001105 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71001195 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 71001249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71001278 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 71001329 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 71001893 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 71002180 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 71002272 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 71002291 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 71002446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71002780 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 71002809 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 71002973 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 71003115 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71003178 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 71003373 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 3 71003460 T G N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 3 71003464 A C N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 3 71003769 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 71003933 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 71004012 G A N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 7 13 3 1 6 3 71004051 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 4 2 2 0 1 3 71004432 G T N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 71004437 T A N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 71004465 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71004507 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 71004549 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 71004897 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71005025 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 71005170 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 71005249 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 71005353 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 71005462 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 71005522 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 71005555 C G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 71005636 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 71005693 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 71005730 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 71005786 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 71005870 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71006001 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 71006014 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 71006258 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 71008020 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 71008045 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 71008060 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 71008149 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 71008285 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 71008336 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 71008427 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71008542 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 71008609 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 71008687 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 71008698 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 71008709 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 71008796 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 71008870 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 71008880 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 71009067 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 71009119 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 71009170 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 71009282 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 71009409 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71009516 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 71009542 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 71009573 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 71009677 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 71009738 G C N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 71009806 A T N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 3 71009938 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 71010114 G C N N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 3 71010205 T A N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 3 71010335 G T N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 3 71010519 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 71010555 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 71010611 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 71010694 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 71010756 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71011155 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 71011714 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 0.117647058823529 0.352941176470588 20 14 9 2 6 3 71011758 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71011986 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 71012015 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 71012086 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 71012350 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 71012371 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 71012378 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71012612 A G N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 3 71013065 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 71013140 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 71013291 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71014585 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 71014793 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 71015135 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 71015181 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 71015290 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71015657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71016047 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71016261 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71016710 G A Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 71016773 G A Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 71016879 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 71017216 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 71017641 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71018004 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71018005 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71018223 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71018566 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 71018834 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71019687 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 71019751 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71019819 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 71019954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71020147 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 71020597 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 71020614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71021085 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 71021462 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 71021501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71021550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71021667 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71021719 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 71021846 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 71021905 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 71021922 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 71021927 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 71022039 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 71022050 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 71023277 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 71023585 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71023640 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 71023777 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71023778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71023992 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 71024125 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71024624 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 71024928 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71025025 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71025071 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 71025356 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 71025570 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 71025611 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 71025700 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 71025782 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 71025889 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 71026162 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71026298 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71026388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71026711 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71026811 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 71027029 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71027834 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71028481 A T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 71028963 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 71029176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71029727 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 71030555 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 71030789 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 71030849 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 71031084 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71032067 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71032397 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71032916 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71034574 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71034993 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 71035792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71036794 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71037487 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71037513 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71037559 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71038144 G T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 71038231 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 71038401 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 71038424 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 71038440 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 71038610 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 71038645 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 71038822 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71038858 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 71038902 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 71039154 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71039272 G C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 71039397 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 71039449 A C Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 71039679 G C Y N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 71039856 G T Y N 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 3 71039859 G A Y Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 3 71040143 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 71040238 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71040405 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 71040480 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 71040493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71040499 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 71040734 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 71040739 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 71040798 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 71040867 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 71040873 G T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 71040943 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71041020 A G N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 71041090 T A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 71041269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71041371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71041381 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71041477 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 71041559 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 71041645 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 71041674 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 71041804 A C N N 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 11 9 4 3 3 3 71043928 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 71043958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71044622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71044720 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71045062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71045748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71046497 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71047710 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71047745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71047815 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71048337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71048505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71049036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71049414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71050419 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71050690 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 71053153 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 71053364 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71054470 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 71055067 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71057565 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 71057644 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 71057891 A C N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 71058009 C G N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 71058248 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 71058283 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 71058302 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 71058356 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71058477 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71058613 C A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 71059038 C T N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 3 71059340 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71059428 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 71059429 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 71059555 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 71059873 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 71060283 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71060396 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 71060480 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 71061277 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71062337 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71062347 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 71062369 C G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 71062384 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 71062408 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 71062720 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71062872 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 71062975 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71063017 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71063029 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71063155 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 71063370 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71063612 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 71063613 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 71063663 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 71063741 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 71063764 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 71063779 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71063843 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 71063845 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 71063878 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 71063900 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 71063962 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 71063982 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 71064130 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 71064146 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71064327 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71064387 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 71064392 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71064427 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 71064573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71064714 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 71064909 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 71064991 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71065005 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 71065073 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 71065144 G T N N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.181818181818182 0.545454545454545 0.272727272727273 10 12 2 6 3 3 71065215 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71065230 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 71065231 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 71065268 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 71065558 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71065628 G C N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5625 0.125 0.3125 20 12 9 2 5 3 71065675 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71065733 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.533333333333333 0.133333333333333 0.333333333333333 18 12 8 2 5 3 71065771 A T Y N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 71065993 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 71066055 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71066112 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 71066220 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 71066233 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71066710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71066723 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71066743 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 71066754 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71066963 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 71066972 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 71067337 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 71067350 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 71067553 T A N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 71067611 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 71067623 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 71067624 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 71067711 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 71067902 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 71068173 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 71068185 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 71068581 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 71068650 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 71068767 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 71068958 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71069181 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 71069198 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 71069318 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71069463 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71069663 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71069665 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71069868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71071332 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71071763 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 71074081 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71074256 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 71075114 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71075275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71075316 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 71075662 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71075707 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71075917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71076964 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71077369 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 71077488 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71077605 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71077971 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71078431 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71080872 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71081567 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71082491 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71082864 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 71083082 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71083162 C G N N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 14 10 4 6 2 3 71083201 T G N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 3 71083292 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 71083622 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 71083806 C T N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 3 71084125 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 71084210 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 71084804 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71085967 G T N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 3 71086302 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71086303 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71086491 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71086706 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 71086747 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71087129 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71087148 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 71087252 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71087759 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71087781 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71087932 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71088014 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71088070 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71088126 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71088167 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71088189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71088284 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71088370 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71088433 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71088522 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71088728 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71088958 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71089052 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71089749 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71089902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71089976 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71090489 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71090512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71090680 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71091164 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71091660 G A N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 12 12 3 6 3 3 71091845 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71091931 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71092241 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71092365 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 3 71092589 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 71092612 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 71092635 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 71092713 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71092762 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 71093013 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71093161 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 14 10 4 6 2 3 71093390 G A N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 71093403 C T N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 71093474 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 71093702 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71093725 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71094264 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71094411 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71094569 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 71094622 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 71094828 T A N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 3 71094861 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 71095359 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 71095501 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 71095690 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71095827 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71096015 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 71096102 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 71096892 T A N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 3 71096913 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 71096996 C G N N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 8 12 2 4 4 3 71097079 G C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 71097143 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 71097440 A T N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 71097601 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71097898 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 3 71098002 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 71098111 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 71098114 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 71098339 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 71098372 C T N Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 9 9 3 3 3 3 71098608 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 71098626 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 71098862 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 71099234 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71099241 T C N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 71099271 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71099272 C G N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 71099328 T A N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 71099350 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71099359 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71099429 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 71099442 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 71099466 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71099517 G T N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 3 71099542 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 3 71099584 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 71099596 C A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 71099653 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71099821 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 71099982 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71100519 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 71100527 A T N N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 3 71101096 T C N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 3 71101255 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 71101500 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 71101602 A G N Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 5 5 2 1 2 3 71102085 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 71102141 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 71102147 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 71103153 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 71104993 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 71105672 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71107975 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71108530 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 71109689 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 71109715 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71112257 A C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 71112618 T C Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 71112858 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 71113085 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71113241 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71113426 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 71113537 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 71113838 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71113853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71113872 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71113915 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71115042 A C Y N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 3 71116594 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71117295 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71117634 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71117703 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71117839 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71118603 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71118764 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71120176 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71120614 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 71120723 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71122240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71122399 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71122923 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 71122982 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71123026 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71123401 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 71123777 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 71125625 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71125728 T C N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 71126992 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71127016 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71127772 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71127936 T A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71128136 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 71128284 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71128633 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71129060 C T Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 3 71130088 G A Y Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 71130131 C A Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 71130240 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71130339 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71130786 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 71130973 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 71131033 A C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71131252 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 71131357 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 71131409 G A N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 3 71131541 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71132183 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 71132260 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71132942 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71133406 C T N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 3 71134042 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 71134371 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71134818 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71138067 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 71138916 G C Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 71140146 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71142395 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 71142414 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 71142513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71143360 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71143872 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71144856 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 71144989 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71145305 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 71146354 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 71148170 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 71148990 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 71150307 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71151960 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71152042 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71152680 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71154194 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71155147 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 71156906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71156922 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 71157014 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 71157081 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 71157106 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71157307 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71161742 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 71162680 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71163645 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71166159 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71166510 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71169572 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71170355 C T N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 71171846 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71172313 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 71172570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71181924 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71181936 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 71183458 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71183910 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71183980 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71185995 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 71187003 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71189454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71191437 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 71191778 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 71192245 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71200431 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71200511 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 71200649 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71200967 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71201468 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71205172 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 71205517 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71207227 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71207757 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71209735 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 71211344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71213361 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71220112 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 71220189 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 71220353 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71220582 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71221472 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71222044 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 71223416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71224584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71225726 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71226491 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71227394 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 71227845 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 71230120 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71230325 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71230490 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71231252 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 71231264 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 71231375 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 71236667 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71236874 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71236920 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71237269 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 71237458 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 71237741 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 71237758 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 71237840 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 71238136 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 71238327 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 71238450 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 71238913 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 71240266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71240771 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71251840 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 71252206 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 71252213 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71252646 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71253157 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 71253659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71253938 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71253939 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71254544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71254725 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71255647 C A N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 71255704 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 71257553 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71257601 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71257893 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 71258123 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71258320 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 71258531 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71258564 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71259145 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71264578 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71264630 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71265147 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71265326 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 71265452 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71265549 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71265607 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71265717 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71265808 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71265826 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71265948 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71266961 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71267222 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71267541 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71267806 A C N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 71267830 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 71267871 A T N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 71267891 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 71268012 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 71268087 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 71268152 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 71268422 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 71268463 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 71268464 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 71268525 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 71268551 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 71268643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71268705 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 71269137 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 71269272 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 71269327 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 71269379 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 71269455 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 71269463 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 71269480 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 71269486 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 71269513 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 71269664 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 71269776 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 71269976 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 71269986 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 71269996 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 71270001 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 71270243 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 71270315 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 71270357 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 71270444 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 71270469 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71270727 T C N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 3 71270812 C G N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 71270911 T G N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 3 71270966 T C N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 3 71271339 C T N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 10 10 3 4 3 3 71271492 T G N N 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 9 11 2 5 3 3 71271651 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 71271672 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71271720 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 71271766 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 71271818 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 71271837 C A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 71271886 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 71271900 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 71271916 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 71271963 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 71272072 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 71272094 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 71272238 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 71272288 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 71272348 T A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 71272529 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 71272549 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 71272624 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 71272785 T G N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.307692307692308 0.538461538461538 0.153846153846154 15 11 4 7 2 3 71272948 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 3 71272994 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71273027 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 71273096 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 71273147 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 71273157 T C N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 3 71273276 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71273411 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 71273467 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 71273516 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 71273535 A C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 71273548 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 71273624 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 71273642 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 71273697 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71273856 T C N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 71273889 T A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 71274074 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 71274324 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 71274391 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 71274533 C A N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 71274534 A C N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 71274601 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 71274672 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71274778 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 71275067 A C N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 71275275 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 71275616 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 71275716 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71275776 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 71275930 A C N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 3 71275964 G T N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 3 71276626 T C N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.461538461538462 0.230769230769231 0.307692307692308 15 11 6 3 4 3 71276657 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 71276978 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71277138 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 71277262 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 71277357 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 71277371 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 71277443 T G N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 71277453 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 71277662 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71277920 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 71278299 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 71278342 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 71278469 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71278484 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 71278637 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 71278775 G T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 71278897 G T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 71279038 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 71279086 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 71279138 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 71279303 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 71279365 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 71279424 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 71279591 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 71279749 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 3 71279816 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 71279818 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 71279988 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 71280028 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 71280053 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 71280065 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 71280066 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 71280149 A T N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 71280394 A T N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 3 71280515 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 71280516 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 71280537 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71280631 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 71280636 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 71280768 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 71281360 G A Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 71281530 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 71281897 C G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 71282038 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 3 71283058 G C N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 71283106 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71283322 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71283388 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 71283616 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 71283669 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 71283766 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 71283867 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 71284044 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71284124 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71284276 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 71284368 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71284548 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 71284551 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 71284573 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71284691 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 71284735 A C N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 71284876 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71284902 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71284980 C G N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 71285055 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 71285104 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 71285140 A C N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 71285461 G C N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 71285520 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 71285555 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 71285637 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71285674 T A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 71285676 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71285742 G T N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.5 0.1875 0.3125 19 13 8 3 5 3 71285854 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 71285880 A T Y N 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 10 6 3 4 1 3 71286012 C G N N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.363636363636364 0.363636363636364 0.272727272727273 12 10 4 4 3 3 71286013 G A N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.363636363636364 0.272727272727273 0.363636363636364 11 11 4 3 4 3 71286267 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 71286325 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 71287574 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71287790 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71287995 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71288098 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 71288838 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 71289941 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71290634 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71291009 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71291139 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71291273 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 71291351 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71291587 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 71291671 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71291845 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 12 6 5 2 2 3 71291908 A C Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 71291940 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 71291977 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 71292091 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71292223 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71292277 A C Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 71292376 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71292553 G A Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 71292823 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71293148 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71293714 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71293835 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 71293884 T A Y N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 3 71294172 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 71294187 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71294264 A C Y N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 71294320 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71294506 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71294597 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 71294619 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71294800 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 71294935 A T Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 71295252 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71295327 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71296222 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 71296278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71296439 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 71296534 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71296634 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 71296985 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71297017 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 71297058 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 71297467 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 71297555 C T N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 71297692 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71297707 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71298199 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 71299834 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71299916 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 71299941 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 71299964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71300026 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71300139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71300147 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71300152 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 71300407 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 71300487 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71300502 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71300561 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71300719 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71300881 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71300967 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71301006 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 71301255 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 71301314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71301411 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 71301432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71301539 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 71301639 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 71302043 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71302347 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 71302383 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71302530 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71302538 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 71302710 G T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 71302973 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71302988 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71303069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71303088 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71303106 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 71303405 A T Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 71303516 T C Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 71303531 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 71303577 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 71303597 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 71303644 C T Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 71303646 A G Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 71304391 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 71304394 G T N N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 71304619 C T Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 71304883 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 71304887 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 71304989 G C N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.153846153846154 21 5 10 1 2 3 71305016 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71305076 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71305099 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71305145 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 71305150 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 71305181 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71305196 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71305234 C G Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 71305350 T A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 71305480 G C Y N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 71305517 G A Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 71305593 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 71305630 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 71305664 G T Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 71305773 C G Y N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 3 71305896 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 71305933 C A Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 71306097 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 71306142 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 71306468 T G Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 71306606 G A Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 71306822 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 71306927 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 71307011 A C Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 71307205 A C Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 71307325 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 71307503 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71307563 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 71307677 G A Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 71307680 C T Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 71307792 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 71307830 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71307903 G T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71307944 T C Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 71308055 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71308126 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71308165 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71308362 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71308493 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71308502 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71308593 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 71308630 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 71308871 A C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 71308916 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71309217 C G N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 3 71309431 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 71309614 C A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 71309908 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 71309936 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71310179 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71310297 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 71310304 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 71310319 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71310344 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71310483 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 71310731 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 71310763 A C N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 71310852 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71310973 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 71311162 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71311198 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71311580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71311655 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 71311739 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71311798 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71312141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71312159 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 71312231 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71312603 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71312956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71312977 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71313326 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71313410 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71313514 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71314516 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 71314773 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71314838 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71315036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71315079 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71315189 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71315514 A G N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 71315548 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 71315725 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 71316178 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71316319 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 71316612 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71317085 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 71317430 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 71317589 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71318126 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71318253 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 71318291 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71318639 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71318704 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 71318976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71319074 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 71319279 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 71319979 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 71320772 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71320901 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71321038 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71321204 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71321226 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71322036 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 71322207 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71322339 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 71322370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71322678 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 71322958 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71323007 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 71323020 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 71323089 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 71323408 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71323539 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 71323805 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71323953 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71324104 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 71324178 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71324660 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71325347 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 71326703 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 71327474 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71327611 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 71327770 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71327836 A T N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 71328199 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 71328317 G A Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 71328703 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71328876 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 71335068 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71335246 C A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71335463 T A Y N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 71336014 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 71336090 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71336179 A C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71336550 T A Y N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 71337324 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 71337356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71337800 G C Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 71338189 C T Y Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.714285714285714 0.285714285714286 5 9 0 5 2 3 71338461 T C Y Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 3 71338539 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 71338642 G A Y Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 3 71338738 A C Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 71338818 C G Y N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 71339770 G A Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.214285714285714 0.714285714285714 0.0714285714285714 16 12 3 10 1 3 71339851 G A Y Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 71341295 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71342339 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 71342474 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71342878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71343051 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 71343436 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 71343583 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71344053 T A Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 71344445 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71344620 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71344935 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 71345334 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 71345740 A C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71346565 A G Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 71346748 C G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71346782 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71346956 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 71348239 C A Y N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 71348423 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71348527 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71348564 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 71348577 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71349466 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71349546 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71349892 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71349904 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 71350479 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71350494 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 71351321 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 71351632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71352012 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 71352297 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71352615 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71352966 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71353510 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71353852 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71354035 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 71354329 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71354835 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71355021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71355069 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 71355129 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71356377 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 71358350 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 71359494 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71359561 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71360040 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 71361007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71361136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71361553 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71361615 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 71364169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71364903 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 71365581 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 71366352 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71366405 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 71366410 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71366510 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 71366993 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 71368132 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 71368237 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 71368579 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71368653 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71370806 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71371151 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 71371463 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71372105 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 71373177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71373516 T G Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 71373519 A T Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 71373896 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71374079 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71374143 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 71374279 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71374804 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71374847 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 71376074 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71376423 T G N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 71377702 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 71377973 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 71378172 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 71378203 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71378576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71378726 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71378938 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71378947 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 71379118 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 71379249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71379602 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 71379912 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71380082 G T N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 3 71380532 A G N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 3 71381188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71381497 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71382500 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 71382866 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71382913 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71384399 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71386780 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71386928 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 71387043 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 71387201 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 71387804 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 3 71388925 G A Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 71389413 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 71392196 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 71392249 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 71392414 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 71392793 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 71392874 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 71392919 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 71393244 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 71393478 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 71393501 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 71394042 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71394117 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 71394232 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 71394246 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 71394723 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71394903 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 71395414 A C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 71395704 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 71395844 G A Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 71399734 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 71400506 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 71400609 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71400771 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71401226 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71401649 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71402519 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 71402651 G T N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 3 71402952 A C N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 71402966 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71403190 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 71403382 T C N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 3 71403417 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 71403479 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 71404012 T C N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 12 4 5 2 1 3 71404730 C T N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 3 71404855 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 71404865 G A N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 3 71404965 G T N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 3 71405121 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 71405500 C T Y Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 3 71405635 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71405663 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 71406008 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71406408 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71406688 A C Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 71407054 A C Y N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 71407162 C G Y N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 71407266 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71407306 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71407532 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 71407586 C T Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 71408434 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71408891 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71409930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71410821 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 71411237 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 71411774 A T N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 71411805 G C N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 71412305 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 71412516 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 71412798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71412830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71412984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71413164 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 71413463 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 71414152 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 71414310 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 71414361 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 71414593 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 71414627 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71414868 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 71415628 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 71418513 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71420567 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71421702 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71421934 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71422197 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71423415 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71423777 C T N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 3 71424282 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71424363 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71424689 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71424821 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71426372 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71426757 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 71427021 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 71427851 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71430509 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71431239 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 71431807 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 71432071 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71433230 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71433676 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71433849 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71433994 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71434098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71434857 G A N Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 3 71435011 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71436437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71436688 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71437277 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71437423 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 71437874 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71438862 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71439037 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71439819 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71440483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71440596 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71442210 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71442389 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 71442761 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71443130 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 71443210 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 71444397 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 71444584 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 71445527 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 71446384 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 71446510 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 71446623 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 71447131 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 71448142 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 71448771 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 71448982 C G N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.4375 0.0625 0.5 15 17 7 1 8 3 71448995 T C N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.384615384615385 0.0769230769230769 0.538461538461538 11 15 5 1 7 3 71449185 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71449586 T C N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 71449977 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 71449980 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 71450476 G A N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.533333333333333 0.0666666666666667 0.4 17 13 8 1 6 3 71450479 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 3 71450586 A G N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.461538461538462 0.0769230769230769 0.461538461538462 13 13 6 1 6 3 71450626 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71451244 T G N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.5 0.0714285714285714 0.428571428571429 15 13 7 1 6 3 71451513 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71452054 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71452180 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71452205 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 71452340 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71454350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71454398 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 71455508 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71455658 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 71455672 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 71455688 T A N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 3 71455923 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 71457242 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 71457804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71457888 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71458462 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 71458493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71458904 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 71459165 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71459316 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71459415 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 71459623 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71461281 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71464072 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71464138 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71464639 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71469253 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71469495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71469616 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71470337 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 71471125 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71471938 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71472534 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 71473476 G C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 71474358 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71476664 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71477551 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71477735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71478964 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71480328 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71481777 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71484091 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71485830 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 71485951 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71486940 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71488579 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71489626 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71489725 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71491298 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 71491454 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71492963 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71493422 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 71494650 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71494859 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71494942 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71495455 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71497085 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71497379 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 71497495 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 71497551 C A Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 71497552 C T Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 71497620 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71497753 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71497959 A C Y N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 71497971 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 71498416 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71498828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71499894 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 71501921 G A Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 71501933 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 71502532 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71503277 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71503891 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 71504889 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71504966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71505292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71505979 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71506041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71506051 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 71506799 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 71507081 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71507984 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71508802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71509603 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 71510242 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71511438 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 71511519 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 71511871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71511911 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 71512629 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71513990 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 71516275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71516885 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71517105 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 71517934 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 71518169 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71519100 T C N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 71519220 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 71519789 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 71520616 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71520821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71520921 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 71520932 A T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 71521016 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 71521212 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 71521369 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 71521707 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 71521736 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 71522022 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 71522157 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 71522318 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 71522455 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 71522649 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 71522799 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 71522888 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 71522989 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71523132 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 71523411 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 71523500 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 71523613 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 71523621 A T N N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 3 71523740 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 71523780 G T N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 71523789 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 71523806 A T N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 71523929 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 71523943 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71523972 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 71523976 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 71524052 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 71524122 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 71524168 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 71524191 A G Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 71524301 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 71524317 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 71524897 T C N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 71524970 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 71525285 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 71525302 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 71525364 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 71525470 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 71525523 A C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 71525528 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 71525769 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 71525791 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 71525953 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 71525992 G C Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 71526045 G C Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 71526185 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 71526216 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 71526312 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71527291 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71527727 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71527792 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 71528202 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71528293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71528732 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71529042 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71529415 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 71530041 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71530274 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71531236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71531568 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71532180 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71532318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71532477 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71533905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71534038 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71534456 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 71535150 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71535681 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 71536175 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71536991 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71537020 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 71537207 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71537313 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 71537701 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71538145 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71538640 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 71538868 G T Y N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 71538931 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71539194 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71539590 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71539812 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71540054 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71540348 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71540512 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71540688 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 3 71542710 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 71542761 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 71543345 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 71543392 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 71544064 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 71545822 G T N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 71546420 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71546552 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71547065 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71547143 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71547240 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 71547844 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 71548685 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 71548755 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71548839 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71549107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71549215 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71549465 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 71549775 T A Y N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 71549817 G C Y N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 71549842 G A Y Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 71549872 G T Y N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 3 71549927 C T Y Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 71550009 G C Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 71550119 G T Y N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 3 71550191 C T Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 71550258 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 71550384 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 71550436 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71550468 T C Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 71550927 C A Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 71551114 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71551187 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 71552113 C G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71552707 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71552721 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71552833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71552953 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71553403 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71554225 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71554366 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 71554614 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 71554615 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 71554627 C G N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 71554631 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 71555170 A T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 71555322 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71555398 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71555420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71555447 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71555539 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71555573 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 71556006 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71556140 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 71556710 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71556758 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 71556779 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 71556800 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 71556833 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 71557045 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 71557063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71557185 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71557816 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71558143 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 71558169 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 71558352 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71558355 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71558899 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 71558912 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 71559219 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 71559373 A C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 71559407 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 71559551 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 71559590 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 71559644 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71559694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71559730 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71559940 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71560151 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71560191 A G N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 71560245 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 71560330 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71560415 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 71560675 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71560694 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 71560949 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71561572 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71561593 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71561629 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71561654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71561820 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 71562385 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 71562835 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 71562952 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 71563071 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 71563151 C G Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 71563241 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 71563267 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71563330 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 71563673 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 71563820 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 71564002 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 71564050 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 71564109 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 71564306 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 71564349 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 71564498 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 71564545 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 71564619 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 71564653 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 71564687 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 71564847 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 71564916 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71564965 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 71565122 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71565294 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 71565382 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 71565514 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 71565550 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71565602 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 71565668 T C N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.615384615384615 0.153846153846154 0.230769230769231 18 8 8 2 3 3 71565791 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 71565861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71565936 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 71566026 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 71566038 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71566170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71566289 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 71566304 T A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 71566347 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71566367 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 71566542 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 71566724 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 71566737 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71566853 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 71566897 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 71567409 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71567613 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 71567667 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 71568096 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 71568152 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 71568225 A C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 71568400 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 71568434 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 71568441 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 71568621 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 71568673 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 71568678 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 71568740 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 71568800 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71569131 A T N N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.454545454545455 0.363636363636364 0.181818181818182 14 8 5 4 2 3 71569153 T C N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 3 71569366 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 71569651 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 71569834 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 71570153 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 71570175 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 71570357 C A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 71570437 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71570971 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 71571193 C G Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 71571378 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 71571705 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 71572210 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71572597 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 71572792 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71573926 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 71575036 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 71578789 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71581984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71582126 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71582188 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 71582244 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 71582260 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 71582556 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 71582603 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 71582634 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 71582833 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71582838 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 71582847 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 71582928 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 71583042 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 71583131 T G N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 71583212 C A N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.571428571428571 0.214285714285714 0.214285714285714 19 9 8 3 3 3 71583682 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 71583761 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 71583778 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 71583982 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 71584009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71584066 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 71584199 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 71584276 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 71584550 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 71584555 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71584969 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 71585068 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 71585132 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 71585552 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 71585590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71585651 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 71585683 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 71585804 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 71585823 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 71585837 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 71585858 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 71585859 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71586148 A T N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 71586437 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71586511 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 71586622 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 71586639 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 71586947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71587083 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 71587440 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 71587930 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 71588077 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 71588085 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 71588248 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 71588429 G A Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 71588774 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 71588835 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 71588935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71589024 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 71589158 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 71589367 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 71589498 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 71589522 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 71589597 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 71589715 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 71589746 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 71589844 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 71590187 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 71590246 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 71590288 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 71590487 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71590696 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71591093 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 71591195 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 71591281 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71591378 A C Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 71591583 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71592170 A G Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 71592272 C T Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 71592424 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71592506 T A Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 71592580 C T Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 71592711 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71592817 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.666666666666667 0.133333333333333 0.2 22 8 10 2 3 3 71592833 C T N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 3 71592882 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71592898 T G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 71593050 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 71593323 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 71593345 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 71593561 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 71593606 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 71593898 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71594056 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71594134 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 71594308 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 71594626 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 71594735 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71594849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71594873 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 71594944 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71594967 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71594993 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 71595491 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71596128 C A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 71596268 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 71596504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71596739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71597165 C A N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 3 71597340 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 71597592 G T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 71597828 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71597840 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71598207 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71598328 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71598380 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 71598435 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71598487 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71598612 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71598868 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71598895 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71599576 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71600779 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71601921 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 71601957 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 71602152 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71602183 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 71603387 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71603439 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71603622 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71603674 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71603734 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71604217 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71604772 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 71605208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71605226 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71606035 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71606253 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 71606480 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71606749 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71606838 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 71607305 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71609558 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71609575 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71609769 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 71609809 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 71609823 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71609827 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71610151 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71610411 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 71610526 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 71610568 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 71610647 T C N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 71610700 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 71610755 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71610831 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71610842 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71610859 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71610870 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71611046 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71611053 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71611060 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71611090 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71611132 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71611211 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71611230 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71611240 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71611461 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71611521 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71611586 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71611599 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71611829 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71611890 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71612584 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 71612637 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71612899 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71612948 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71612979 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71613052 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71613333 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71613335 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71613476 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71613579 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 71613595 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71613599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71613610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71613650 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71613703 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71613745 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71613779 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71613793 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71613799 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71613866 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71613888 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71613922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71613940 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 71613996 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71614077 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71614171 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71614344 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 71614514 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71614556 G C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 71614582 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71614727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71614792 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71614900 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71615024 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 71615029 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 71615071 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 71615079 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 71615094 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 71615270 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 71615363 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71615409 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71615482 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 71615492 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 71615497 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 71615508 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71615511 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71615550 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71615570 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71615577 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71615586 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71615669 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71615723 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71615742 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 71615969 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 71615976 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 71615984 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 71616403 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 71616437 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71616490 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71616520 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 71616523 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 71616569 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 71616572 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71616657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71616683 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71616723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71616750 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71616850 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71616902 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71616920 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 71616921 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71616953 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71616968 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71616996 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71617039 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71617048 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71617140 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71617150 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71617193 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71617222 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71617399 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71617503 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 71617652 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71617668 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71617756 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71617793 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71617968 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71618223 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71618385 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71618724 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71618778 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71618923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71618986 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 71619236 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71619319 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 71619346 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71619464 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71619597 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71620035 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71620130 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71620216 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 71620495 C T N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 3 71620563 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71620566 G T N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 71620581 C A N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 71620715 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 71620734 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71620772 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 71620838 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71621218 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 71621285 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 71621293 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71621469 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 71621569 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 71621684 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71621729 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71621736 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 71621825 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 71621861 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 71621873 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 71621905 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 71621991 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 71622098 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 71622159 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 71622219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71622290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71622395 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 71622646 G A N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 71622803 C T N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 71622857 G A N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 7 9 1 5 2 3 71622895 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 71622900 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 71622907 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 71622964 G A N Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 3 71623029 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 71623038 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 71623100 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71623321 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 71623348 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 71623351 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 71623719 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71623839 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71624090 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71624159 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71624198 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 71624295 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 71624427 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71624437 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71624438 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 71624769 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 71624810 A T N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 71625288 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71625369 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 71625563 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71625570 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71625980 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71629121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71630867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71630881 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 71632939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71633095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71633282 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 71633318 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71633621 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 71633824 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71634041 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71634321 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71634449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71634522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71636817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71637046 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71637750 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 71637831 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71637943 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71638259 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71638350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71638423 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 71638623 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 71638679 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 71638776 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 71638888 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 71638939 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 71638979 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 71638996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71639005 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 71639013 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 71639037 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 71639062 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 71639068 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71639198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71639275 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71639341 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 71639379 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 71639470 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71639471 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71639584 A G Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 71639734 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71639814 T A N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 71639850 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71639969 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71640001 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 71640054 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 71640113 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 71640254 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 71640290 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 71640336 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 71640404 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 71640494 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 71640530 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 71640551 G C N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 71640604 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71640614 C G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 71640660 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 71640675 C T Y Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 12 8 4 4 2 3 71640677 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 3 71640770 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 71641389 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 71641792 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 71642127 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 71642188 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 71642347 G T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 71642547 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71642568 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 71642581 A C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 71642584 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 71642658 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 71642674 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 71642863 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71642990 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 71643113 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 71643177 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 71643178 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 71643353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71643494 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 71643555 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 71643621 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 71643623 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 71643704 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 71643764 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 71643819 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 71643906 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 71644028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71644306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71644931 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 71645158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71646822 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71647051 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71647604 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71648430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71648630 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71648731 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71648941 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71651587 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71652185 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71653105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71653296 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71653565 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71653628 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71654095 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 71655332 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 71656328 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 71656812 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 71657035 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 71657133 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 71657226 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71657628 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 71657659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71657780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71658188 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 71658534 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 71659304 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71659420 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71659559 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 3 71660030 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 71660080 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71660197 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71660286 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71660810 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71661525 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71661533 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71661885 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71661942 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 71662421 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 71668471 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71669192 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71669223 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 3 71669238 G C N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 3 71669609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71669764 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 71670181 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71670238 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71670431 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 71670610 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 71670662 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 71670703 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 71670769 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 71670851 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71670874 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 71670951 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 71671025 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71671172 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 71671208 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 71671308 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 71671321 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 71671351 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 71671488 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 71671491 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 71671506 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 71671552 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 71671608 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 71671666 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 71671681 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 71671700 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 71671805 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 71671837 C G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 71671892 C A Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.117647058823529 0.823529411764706 0.0588235294117647 18 16 2 14 1 3 71671902 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 71671914 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 71671921 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 71671945 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 71671965 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 71672054 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 71672077 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 71672087 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 71672093 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 71672100 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 71672127 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 71672140 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 71672144 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 71672188 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 71672239 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 71672309 G C N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 3 71672327 T C N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 3 71672331 T A N N 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 3 71672548 A T N N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 3 71672578 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 3 71672825 T G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 71673007 T A N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 71673018 T C N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 71673184 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 71673212 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 71673416 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 71673470 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 71673471 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 71673542 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 71673594 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 71673650 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 71673708 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 71673723 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 71673797 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.117647058823529 0.705882352941177 0.176470588235294 16 18 2 12 3 3 71673823 T G N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 71673842 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 71673844 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 71673902 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 71673918 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 71673966 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 71674092 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 71674095 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 71674169 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 71674227 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 71674250 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 71674271 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 71674296 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 71674309 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71674610 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 71674768 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 71674769 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 71674946 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71674971 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 71675063 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 71675201 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 71675305 T A Y N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 3 71675418 T A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 71675483 T A N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 3 71675496 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 71675517 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 71675606 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71675629 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71675636 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 71675646 A C N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 71675680 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 71675706 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 71675894 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 71676103 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71676749 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 71677771 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71678269 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71678395 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 71678996 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71679020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71679042 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71679055 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 71679129 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71679209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71679217 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 71679330 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71679357 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71679411 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71679566 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71679577 A T Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 71681173 A G N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 71683771 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71686865 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71687327 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71689349 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71690313 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 13 5 6 1 2 3 71692041 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71692559 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 71692900 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71694647 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 71695514 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71696837 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 71697182 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71697239 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71697384 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 71698572 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 71699663 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 71702465 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 71702650 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71703237 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71705983 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71706166 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71708184 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71708489 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71709753 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71709874 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71711761 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71712551 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 71713311 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71713717 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71714428 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71716627 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71716813 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71717636 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 71717849 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 71718448 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 71719753 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 71720583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71720598 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71720853 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71722268 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 71722616 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 71722925 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71723150 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 71723151 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 71723404 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71723895 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71724243 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71724873 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71725884 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71726421 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71726457 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71726493 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71726510 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71726714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71726741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71726966 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71727064 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71727081 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71727097 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71727110 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71727303 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71727330 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71727434 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71727441 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71727475 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71727511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71727576 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71727726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71727729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71727823 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71727969 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71728033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71728134 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71728144 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71728322 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71728463 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 71728973 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71729029 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71729134 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71729194 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71729650 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71729667 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71729684 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71729716 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71729744 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71730668 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71730980 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71730995 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71731029 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71731531 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71732091 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 71732488 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71732560 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71732668 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71732721 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71732776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71732830 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71732848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71732924 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71733018 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71733101 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71733217 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71733342 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71733362 T G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0 0.882352941176471 0.117647058823529 15 19 0 15 2 3 71733551 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71733737 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71733815 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71734730 G T N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 71734992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71735198 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71735276 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71735516 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 71735756 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71736501 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 71736558 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71736663 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 71736902 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 71737327 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 71737401 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 71737439 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 71737490 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71737546 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 71737547 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 71737582 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 71737730 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 71737853 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 71738199 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 71738251 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71738342 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 71738499 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71738594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71738864 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71739142 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 71739143 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 71739316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71739445 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71739567 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71739580 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71739810 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71739871 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 71740178 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71740263 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 71740316 T A Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 71740362 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 71740419 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 71740512 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 71740583 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 71740599 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 71740756 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 71740766 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 71740815 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 71740869 A G N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.307692307692308 0.538461538461538 0.153846153846154 15 11 4 7 2 3 71740909 A G N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 0.0909090909090909 13 9 3 7 1 3 71740970 T G N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 3 71741068 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 71741126 C G Y N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 14 10 4 6 2 3 71741162 C T Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 71741179 T C Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 71741348 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 71741386 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 71741402 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71741568 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71741695 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71741699 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71741709 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71741763 A C N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 71742379 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71742548 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 71742608 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71742690 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71742696 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71742741 C T N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 3 71742773 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71742801 C T N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 3 71742851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71742874 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71742883 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71742889 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71742902 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71742973 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71743022 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71743042 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71743335 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71743471 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71743535 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71743556 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71743629 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71743910 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 71743924 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71744011 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71744054 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71744072 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71744187 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71744313 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71744345 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71744350 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71744481 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71744495 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71744507 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71744625 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71744672 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 71744710 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71744730 G A N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 3 71744812 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71744974 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71745013 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71745065 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 71745106 A T N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 71745125 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71745164 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71745254 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71745281 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71745337 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71745355 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71745572 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 71745580 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 71745585 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71745668 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71745680 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71745881 A C N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.307692307692308 0.230769230769231 0.461538461538462 11 15 4 3 6 3 71745885 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 71745918 A T N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 3 71746793 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71746892 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71747017 C G N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 3 71747023 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71747041 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71747056 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.235294117647059 25 9 12 1 4 3 71747057 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 71747103 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.75 0.0625 0.1875 25 7 12 1 3 3 71747333 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 71747365 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71747382 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71747488 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71747595 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 71747620 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 3 71747638 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 3 71747774 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 71747803 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 71748005 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 71748024 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 71748322 A G N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 3 71748466 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71749046 T C N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.5 0.214285714285714 0.285714285714286 17 11 7 3 4 3 71749146 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71749157 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71749266 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71749334 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71749392 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71749500 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.25 0.0625 0.6875 9 23 4 1 11 3 71749512 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71750517 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71751404 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71752109 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71752622 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71752788 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71752919 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71753157 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 71753180 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71753201 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71753289 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71753550 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 71753656 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 71753665 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 71753755 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71753988 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71754083 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 71754153 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71754304 C A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 3 71754372 T A N N 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0 0.75 0.25 6 10 0 6 2 3 71754986 C G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 71755004 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 71755061 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71755077 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71755317 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 71755439 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 71755651 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 71755792 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71755974 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71755990 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71756012 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71756048 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71756740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71757019 T G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 71757061 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71757479 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71757724 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71757828 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71758227 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71758619 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 71758765 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 71761456 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 71761596 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71763437 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71765615 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 71765944 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 71766571 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71767030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71767182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71767285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71768462 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 3 71768609 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 71768641 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 71768878 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 71768982 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71769005 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 71769047 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71769056 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 71769098 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 71769200 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 71769201 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 71769284 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 71769406 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 71769481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71769487 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 71769525 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 71769639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71769690 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 71769781 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 71769896 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71770050 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 71770089 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 71770113 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 71770242 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 71770297 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 71770310 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 71770314 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 71770409 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 71770420 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 71770423 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 71770450 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 71770466 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 71770514 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 71770516 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 71770607 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 71770653 C G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 71770692 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 71770718 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 71770725 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 71770783 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 71770803 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 71770965 G T N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 3 71771023 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 71771140 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 71771187 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 71771202 G T N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 3 71771245 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 71771324 C A N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 3 71771417 T G N N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 5 11 0 5 3 3 71771564 A T N N 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 9 11 2 5 3 3 71771624 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 71771669 C G N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.0769230769230769 0.692307692307692 0.230769230769231 11 15 1 9 3 3 71771753 G A N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 71771825 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 71771897 A C N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 3 71771962 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 3 71772001 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 71772056 T C N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 3 71772110 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 71772116 G T N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 71772305 T C N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.153846153846154 0.538461538461538 0.307692307692308 11 15 2 7 4 3 71772320 T C N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 3 71772416 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 71772437 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 71772453 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 71772537 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 71773842 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 71774020 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 71774054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71774327 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 71774345 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 71774392 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 71774399 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 71774627 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71774669 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 71774681 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 71774858 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71774963 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 71775054 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 71775142 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 71775220 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 71775292 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 71775346 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 71775463 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 71775526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71775716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71775822 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71775826 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 71776015 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 71776047 G C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 71776109 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 71776373 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 71776428 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 71776434 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 71776487 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 71776551 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 71776756 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 71776767 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 71776801 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 71779450 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 71779538 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 71779550 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 71779715 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71779837 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 71780013 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 71780444 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 71780454 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 71780516 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 71780607 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71780715 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 71780764 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71780991 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 71781018 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 71781114 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 71781279 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 71781338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71781477 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 71781665 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 71781785 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 3 71781804 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71781851 T G N N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 3 71782093 A C N N 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 3 71782239 T C N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 3 71782447 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 71782477 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 71782943 T A N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.5 0.416666666666667 8 16 1 6 5 3 71783149 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 71783218 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71783689 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71783765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71784167 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 71784759 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 71785407 T A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 71785674 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 71785849 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 71786504 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 71787119 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71787319 G A N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 3 71787372 G A N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 3 71788555 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71788556 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71789235 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 71789738 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71792835 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 71794336 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71795617 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 71797111 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 71797560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71798602 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71799054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71801296 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71802054 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71803534 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71804870 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71805580 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71807443 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71807741 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 71807790 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71809732 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 71809876 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 71811662 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71813096 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71813796 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71814416 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 71815014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71815234 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71816442 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71816744 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71817604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71817999 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 71818195 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71818322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71818520 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71821987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71822219 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71822903 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71822950 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71824377 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71824417 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 71825140 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71825810 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71826882 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 71828796 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 71828848 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 71834879 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71835022 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 71835038 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71835314 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71836585 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71836683 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71837032 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71837241 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71837292 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71838872 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71839534 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71839907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71840152 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71840801 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71841060 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71841419 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 71841995 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 71842551 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71842578 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71842595 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71844202 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71845678 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 71846101 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 71846697 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 71848647 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71849017 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 71849299 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 71850411 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 71850503 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 71851123 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 71851219 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71851232 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 71851874 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 71851949 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 71853212 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71853462 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71854107 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 71854178 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 71854220 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 71854476 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 71855042 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 71855844 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71855863 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 71856065 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71856077 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 71856219 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 71856867 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71857506 T G Y N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 71857708 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 71858804 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 71858928 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71858969 T A N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 71859834 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 71859982 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 71860657 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 71861124 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71863487 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 71864272 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 71864438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71864482 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 71864756 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 71864781 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71865140 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71865193 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71865323 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71865382 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 71865569 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 71865672 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71866056 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 71866163 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 71866421 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 71866700 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 71866809 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 71866945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71867024 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 71867041 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 71867520 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71868642 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 71869278 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 71869674 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 71869722 A C N N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 3 71870172 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 71871028 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71871224 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 71871422 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 71871456 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 71871912 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71871985 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71872462 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 71872891 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71872923 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71873156 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71874258 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71874437 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71875066 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71875225 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71875258 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71875367 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71875490 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 71876248 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71876604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71877811 A T N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 71877885 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 71878312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71879182 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71879290 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71880227 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71880853 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 71881577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71881594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71881663 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71882333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71882660 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 71883484 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71883574 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71884102 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71885164 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 71885703 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71885802 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71886126 T A Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 71887703 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71888843 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71888867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71889120 A T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 71890454 T C Y Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 3 71891483 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 71891647 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71891875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71891943 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71892760 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71893347 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71893602 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 71894731 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 71895313 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71895697 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71895731 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71895773 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71895803 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71895873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71896192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71896200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71896859 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71897501 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 71898661 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 71898964 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71899381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71899559 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71899714 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71900189 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71900320 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 71900634 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71901368 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71901506 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 71901616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71903170 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71903418 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71903954 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71904871 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71905154 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71905160 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 71906409 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71906583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71907201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71907211 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71907235 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71907529 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71907547 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71908272 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71908620 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71909411 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71909986 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71910155 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71910821 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 71910892 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71911480 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71912589 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 71913064 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71914190 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71914613 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71914700 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71915478 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71915552 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71915580 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71916019 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 71916178 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71916271 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71916613 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71916993 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 71917364 G A N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 71918157 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 71918476 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71918568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71918901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71919367 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 71919791 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 71920153 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 71920227 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71920529 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 71922093 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 71922134 T G Y N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 3 71922351 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 71922858 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71923210 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 71923595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71923626 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 71923890 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 71924521 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71925103 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 71925347 G C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 71925352 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 71925860 G T Y N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 71926408 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 71928963 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 71930894 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71931426 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 71931741 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 71933863 C G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 71937119 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71937278 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 71937869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71938293 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 71939024 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71939032 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 71939108 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 71939119 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71939334 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 71940082 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 71940159 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71941074 C A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 71941722 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71942202 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71943875 G T Y N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 3 71943952 A T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 71944216 T G Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 71944428 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 71944607 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 71944710 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 71944808 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 71945322 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71945623 T C Y Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 71945669 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 71945831 T C Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 71945951 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 71946403 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 71948177 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 71949149 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 71950070 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 71950683 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 71950797 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 71951214 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 71951465 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 71951500 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71952308 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 71952611 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 71952676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71962364 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 71962960 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71963245 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 71963382 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 71963626 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 71963692 C A N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 71963812 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 71963840 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 71964017 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 3 71964455 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71964799 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 71964953 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 71965155 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 71965497 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 71966070 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 71966309 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 71966336 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 71966571 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 71966936 G T N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 71967007 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 71967215 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 71967931 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 71968214 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 71968281 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 71968985 C A N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.384615384615385 0.538461538461538 0.0769230769230769 17 9 5 7 1 3 71969452 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 71969703 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 71969713 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 71969938 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 71970380 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 71970384 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 71970700 A G N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 3 71970754 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 3 71971093 A C Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 71971113 G C Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 71971279 A C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 71971614 C G Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 71971729 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 71971828 A C Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 71971862 G T Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 71971985 T C Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 71972068 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 71972155 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 71972206 C G Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 71972218 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 71972236 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 71972333 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 71972666 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 71972667 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 71972747 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 71973074 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 71973330 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 71973525 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 71973594 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 71973676 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 71973966 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 71973975 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 71974576 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71974589 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 71974749 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 71975541 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 71975600 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 71975663 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 71975696 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 71975895 A C Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 71976012 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 71976207 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 71976239 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 71976963 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 71977278 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 71978273 T C Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 3 71978274 G T Y N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 3 71978289 A C Y N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 3 71978474 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 71978595 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 71978664 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 71979025 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 71979066 A C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 71979349 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 71979420 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 71979555 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 71979566 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 71979724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 71979765 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 71980066 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 71980105 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 71980128 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 71980945 T A Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 71980953 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 71981045 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 71981203 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 71981309 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 71981366 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 71981415 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 71981434 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 71981865 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 71982339 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 71982667 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 71982746 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 71982824 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 71982948 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 71983272 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 71984017 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 71984379 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 71984729 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 71984857 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 71984966 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 71985266 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 71985300 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 71985876 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 71986539 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 71987181 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 71987333 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 71987602 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 71987610 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 71987669 A T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 71987671 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 71987696 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 71987699 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 71987752 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 71987859 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 71987992 G A N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 71988030 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 71988046 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 71988054 G A N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 71988134 T C N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 71988347 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 71988402 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 71988456 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 71988548 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 71989242 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 71989287 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 71989463 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 71989542 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 71989543 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 71990041 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 71990193 G C Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 71990777 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 71991073 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 71991510 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 71992077 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 71992175 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 71992345 T G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 71992471 G A Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 71993526 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 71993601 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 71993758 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 71994008 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 71994167 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 71994227 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 71994545 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 71994754 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 71995587 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 71996462 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 71996654 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 71996843 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 71997038 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 71997473 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 71997684 G A Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 71997700 A T Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 71998447 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 71999080 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 71999126 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 71999147 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 71999584 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 71999639 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 71999680 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 71999730 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 71999844 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 71999858 T A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 71999938 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 71999976 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 71999980 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 71999998 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 72000002 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 72000070 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72000071 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72000096 T A Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 72000225 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 72000273 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 72000304 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 72000427 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 72000534 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 72000553 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 72000690 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72000906 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 72000933 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 72000967 T A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 72001169 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 72001210 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 72001482 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 72001499 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 72001520 G A Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 72001545 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 72001623 G T Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 3 72001639 A C N N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 3 72001649 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 72001672 C A Y N 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 3 72001743 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 72001763 G A Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 72001785 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 72001797 T C Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 72001812 C T Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 72002386 A G Y Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 72002417 A T Y N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 72002690 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 72003526 T C Y Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 72003556 C T N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 3 72003573 A T N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 3 72003576 C G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 72003833 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 72003856 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72003892 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 72003911 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 72004023 T C Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 72004080 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 72004088 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 72004198 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72004264 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 72004271 T G N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 3 72004395 G A Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 3 72004804 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 72005224 T A Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 72005399 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 72005423 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 72005449 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 72005511 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 72005566 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 72005612 A T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 72005711 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 72005868 T G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 3 72005941 T G N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 3 72006204 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 72006225 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 72006282 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 72006321 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 72006351 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72006510 T A Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 72006972 C G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 72007274 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 72008059 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 72008110 A G N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 72008483 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 72008491 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72008720 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 72008957 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 72009966 A T Y N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 72009968 A G Y Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 72009993 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 72010011 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 72010098 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 72010440 A G Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 72010914 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 72010982 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72011109 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 72011193 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 72011292 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72011301 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72011477 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 72011803 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 72011819 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 72011858 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 72011908 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 72011992 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 72012290 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72012337 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72012371 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72012385 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72012393 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 72012447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72012448 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 72012537 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 72012638 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 72012718 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 72013168 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 72013275 C T Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 72013409 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 72013416 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 72013473 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 72013486 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 72013519 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 72013540 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 72013594 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 72013863 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 72014310 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 72014684 C A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 72014697 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 72015830 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72015831 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72015844 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72016028 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72017581 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72017718 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72017900 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72017951 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72018345 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72018416 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72018699 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 72019081 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72019493 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 72019949 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72020021 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72020787 G A N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 72020839 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 72020886 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 72021015 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 72021244 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 72021506 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72021514 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72021624 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 72021737 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72021750 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72021861 A G N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 72021887 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 72022516 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 72022555 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 72022624 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 72022639 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 72022761 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72022846 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72023745 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 72023903 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72024167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72024261 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72024574 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72024907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72025078 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72025139 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72025428 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72025452 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72025672 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72026004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72026403 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72026501 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72026583 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72026792 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 72026933 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 72027321 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 72027427 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72027693 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72027963 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72028000 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72028066 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72028095 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72028278 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72028845 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72028894 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 72029809 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 72030245 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72031220 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72031592 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72031859 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72031904 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72032008 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72032490 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72032512 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72032805 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72033182 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 72034196 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72035220 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 72036212 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72036693 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72036913 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 72037271 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72037960 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72038804 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72039504 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 72039949 A G Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 72040854 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72042015 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72042219 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72043793 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72044356 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72044785 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 72045876 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 72046653 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 72046785 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72046792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72047366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72048153 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72048161 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 72048296 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 72048796 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 72049218 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 72049227 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 72049261 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 72049354 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 72049387 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 72049473 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 72049567 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 72049622 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 72049675 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 72049709 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 72050887 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72050982 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72051177 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 72051440 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72052149 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 72052610 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 72053441 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 72053573 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72053749 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72054065 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72055436 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72055613 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72056318 C A Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 72056453 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 72056947 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72057213 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72057893 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72058014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72058181 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72058621 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72058622 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72058638 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72058646 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72058713 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72059744 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72059956 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72067481 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72067850 G C N N 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 72068623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72068941 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72069848 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72070215 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72071224 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72071625 G A N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 72071980 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 72072021 T C N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.307692307692308 0.538461538461538 0.153846153846154 15 11 4 7 2 3 72072063 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72072101 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72072170 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72072409 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 72072766 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 72072848 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 72073167 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 72073247 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72073609 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72073933 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72074211 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72074612 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72074931 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72075299 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72075977 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72076014 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72076553 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 72076706 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72077126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72077263 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72083962 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72084205 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 72084365 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 72085148 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72085662 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 72086018 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72086466 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72086976 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 72087055 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72087093 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72087310 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 72088236 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72088903 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72089326 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 72089638 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 72089945 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 72090002 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72090329 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72090621 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72090667 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72098773 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72098774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72098855 G T Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 72098986 T C Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 72099121 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 72099163 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 72099547 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72099630 C A N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 72099700 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 72099731 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72099804 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72099984 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 72100254 A G Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 72100397 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72101152 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72101588 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72101978 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72102138 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 72102151 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72102160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72102449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72102831 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72104040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72104494 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72104847 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72105227 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72106769 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72107214 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72108771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72108840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72109743 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72109906 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 72110523 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 72110790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72110906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72111608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72112082 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72112131 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72112450 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72112740 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 72112814 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72112951 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72113385 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72114005 G A Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 72114033 T G Y N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 72114043 C A Y N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 72114917 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 72115423 T G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.133333333333333 0 0.866666666666667 4 26 2 0 13 3 72116812 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 4 20 2 0 10 3 72116922 A G N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.25 0.0833333333333333 0.666666666666667 7 17 3 1 8 3 72117016 T G N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 4 20 2 0 10 3 72117068 G A N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.545454545454545 0.181818181818182 0.272727272727273 14 8 6 2 3 3 72117168 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 72117757 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 72117962 T C N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.583333333333333 0.0833333333333333 0.333333333333333 15 9 7 1 4 3 72118842 C G N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 3 72119217 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 72119752 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 3 72119869 C A N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.181818181818182 0 0.818181818181818 4 18 2 0 9 3 72119900 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.153846153846154 0 0.846153846153846 4 22 2 0 11 3 72120048 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 72120131 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 72120278 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 72120820 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 72121500 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 72121515 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 72121982 G C N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 4 24 2 0 12 3 72122642 A G N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.166666666666667 0.0833333333333333 0.75 5 19 2 1 9 3 72122769 G T N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.153846153846154 0 0.846153846153846 4 22 2 0 11 3 72122907 A G N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 3 72123503 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 72123716 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 72124009 A T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 72124533 T G N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 3 72124561 A C N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.153846153846154 0 0.846153846153846 4 22 2 0 11 3 72125003 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.153846153846154 0 0.846153846153846 4 22 2 0 11 3 72125870 T C Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 72127655 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 72127949 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72128219 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 72129169 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72129261 A T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 72129820 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 72129841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72130033 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 72130062 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72130515 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72130610 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 72131794 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72131996 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72132302 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 72132445 C A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 72132476 A G Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 72132867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72133407 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 72133468 T A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 72133469 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72133553 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 72133576 T G N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 72133728 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 72133876 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 72135398 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72135607 T G Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 72135629 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72135998 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72136072 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72136563 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72136697 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72136724 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72136920 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72137249 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72137329 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72138658 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72138980 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 72139194 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72139256 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72139343 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 72139542 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72139812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72139921 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72139981 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72140245 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72140776 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72141577 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72141853 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72142245 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72142432 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 72143357 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72143359 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72144696 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72144745 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72144746 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72144856 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72145333 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72145711 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72146108 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72146182 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72146518 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72147684 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72148124 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 72148365 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72148664 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72148666 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72148677 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72148872 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72149009 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72149643 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72149857 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72149916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72149960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72150198 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72150322 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72150410 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72150748 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72151003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72151073 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72151099 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72152091 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72152203 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72152420 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72152481 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 72152641 C G Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 72153180 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72153247 T G Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 72153259 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 72153431 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72153816 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 72154008 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 3 72154707 G C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 72155117 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72155122 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 72155300 T G Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 72155658 T C Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 72155803 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 72155836 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72156148 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72156371 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72156641 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72156835 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 72156836 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72156863 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72156925 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72157106 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72157550 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72157812 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72157876 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72158599 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72158720 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72158735 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72158773 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72159461 C G Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 72159480 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72160373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72160522 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72160555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72161105 A G Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 72162436 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72163921 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72164040 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 72164092 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 72164217 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72164376 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72164391 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 72164840 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 72165203 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72165474 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 72166339 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72167223 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72168875 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 72168931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72169200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72169208 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72169866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72169936 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72170270 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72172101 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 3 72172686 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72173712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72174352 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 72174410 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 72174728 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72175655 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72175887 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72175906 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72176229 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72176305 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72176725 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72177285 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72177477 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72177761 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 72177896 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72178566 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 72178584 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 72179351 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 72179432 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 72179623 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 72180192 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 72180245 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72180429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72180550 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72181272 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72181795 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 72181865 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 72181996 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72182095 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72182304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72182460 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72182512 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 72182600 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72182900 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72183413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72184294 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72184389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72186355 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 72186681 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72186722 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72186870 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72187383 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72187387 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72187472 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72187649 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72188214 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 72188493 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 72188560 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 72189206 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 72189504 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 72189781 T A Y N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.153846153846154 22 4 11 0 2 3 72189922 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 72190096 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 72190107 C G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 72190189 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 72190258 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72190294 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 72190486 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72190525 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72190538 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72190543 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72191100 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 72191322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72191495 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 72191858 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 72191868 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72191923 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72192245 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72192463 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 72192468 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 72192738 A T N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 72192925 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 72193176 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 72193522 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72194711 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 72195218 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72195366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72195379 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72195520 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72196039 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72197258 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72197386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72197771 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 72197918 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 72198036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72200183 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 72200341 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72200429 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72201834 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72202086 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72202199 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72202964 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72203133 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72203193 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72203319 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 72203320 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 72203422 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 72204119 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 72204458 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 72204763 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 72205377 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 72206167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72206587 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72206728 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72206960 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72207061 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72207291 A C N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 72207299 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 72207892 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 72208312 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72209987 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 72210056 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 72210440 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 72210678 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 72210887 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72210927 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72211913 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 72212125 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72212147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72212182 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72212184 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72212408 A T N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 72212446 A C N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 72213214 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72214788 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 72214980 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72215318 G T Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 72215475 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 72216899 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 72216903 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72217511 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72218156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72218265 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72218283 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72218488 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72219086 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72220607 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72221935 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72222074 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72222828 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72223251 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72223404 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 72223548 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72223630 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72224180 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72224908 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 72225261 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 72226665 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 72228274 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72228432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72230076 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 72230484 T G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72232259 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 72233904 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 3 72233926 A T N N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 3 72234284 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72234806 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 72234881 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72235097 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72235339 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72235621 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72236593 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 72237821 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72238501 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 72238934 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72239038 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72241058 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 72241261 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72243184 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72243219 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 72243233 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 72244930 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 72245175 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 72245505 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72245970 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72245986 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72247226 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 72248032 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72249446 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72254133 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72254940 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72255985 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72256622 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72259477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72262939 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72263295 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72263939 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 72266253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72267778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72268903 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72270752 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72270771 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72270874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72271408 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72272243 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 72274370 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 72274697 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72279697 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72281534 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72283557 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72285013 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72287888 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 72290275 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72292492 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72294273 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72295785 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72295849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72295886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72296311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72298711 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72299183 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 72300128 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72300634 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 72301250 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72301251 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72301277 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72302522 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 72302666 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72303597 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72304647 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72305520 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72306005 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72306397 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72307216 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72308266 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72309065 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 72310270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72312297 C A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 72314908 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 72315000 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 72315284 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 72315344 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 72316136 C G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 72316186 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72316304 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 72317827 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72320352 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72320628 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 72320974 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72321282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72321520 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 72321548 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 72321629 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 72321717 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72322379 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72322833 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 72322952 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72324058 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72326709 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72327284 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 72327956 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 72328231 A G Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.117647058823529 0.823529411764706 0.0588235294117647 18 16 2 14 1 3 72328344 G T Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 72328532 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 72328636 C T Y Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 72328978 T C Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 72329911 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72330172 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72330889 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72331920 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72332354 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72332572 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72332596 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72332812 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72332921 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72333049 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72333856 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72334010 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72334351 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 72337040 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72338005 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72338143 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 72338254 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72338278 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72338567 A T Y N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 72338581 A C Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 72339810 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72342429 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72342929 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72343500 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72344315 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 72345182 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 72345252 T A Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 72346402 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72346822 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72347352 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 72347668 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 72349769 C T Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 72349776 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 72350360 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72350427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72350466 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72351343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72351704 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72353121 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 72353329 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 72354221 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72354478 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72354574 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72354954 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 72355589 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72355674 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72355985 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72356468 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 72356710 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72357342 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72357516 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72357675 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 72357781 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72358272 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72358343 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 72358733 A T Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 72358755 G A Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 72359029 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 72359396 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 72359662 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72360262 T C Y Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 72360338 G C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 72360493 C G Y N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 72360525 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72360611 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 72360948 C G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72361236 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 72361417 T A Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 72361615 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72361768 T G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 72361850 C A Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 72362086 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 72362111 G T Y N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 72362162 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 72362242 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72364225 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72364372 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 72364617 C A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 72364805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72366006 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 72366010 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72366065 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72366181 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72366398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72367027 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 72367861 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72368229 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72368658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72369068 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72369849 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 72369857 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 72370060 T A Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 72370218 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72370403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72370456 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72370473 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72370520 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72370706 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72370854 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72370973 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72371003 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72371252 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72371486 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72371688 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 72371954 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72372299 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72373134 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72373151 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72373161 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 72373206 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 72374135 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72374497 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 72374540 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 72375022 T A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 72375528 C T Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 72376502 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72376632 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72376861 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72377164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72377516 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 72377735 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72377736 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 72377915 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 72378746 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 72378969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72379133 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72379536 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72379824 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72380128 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72380152 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72380154 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72380321 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72380388 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72380418 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72380517 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72380653 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72380668 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72380702 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72380748 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72381192 C T N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 3 72381375 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72381408 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72381567 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72381624 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72381851 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72381897 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 72381992 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72382013 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72382219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72382542 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 72382552 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72382572 G T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 72382695 G T Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 72382711 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 72382894 A G Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 72382930 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 72382943 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72382962 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 72383053 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 72383075 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 72383220 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72383226 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72383406 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72383701 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72383742 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 72383757 G A Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 72383840 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 72383889 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 72384604 T A Y N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 72384627 C G Y N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 72384775 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 72384818 G A Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 72384848 G A Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 72385126 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72385225 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72385305 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72385311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72385320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72385341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72385343 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72385363 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72385386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72385433 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72385704 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72385721 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72385743 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72385755 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72385807 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72385868 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72386044 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72386047 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72386152 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72386167 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72386175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72386198 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72386212 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72386269 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72386329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72386408 C G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 72386449 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 72387098 C T Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 72387149 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 72387315 G T Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 72387382 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 72387400 C A Y N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 72387436 C T Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 72387447 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 72387463 C A Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 72387464 T A Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 72387486 G C Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 72387543 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 72387584 G A Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 72387593 A G Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 72387639 C A Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 72387667 T C Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 72388150 C T Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 72388551 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72388700 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72388747 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 72388821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72389052 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72389054 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72389108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72389583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72389610 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72389736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72389856 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72389899 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72389941 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72389950 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72389979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72389992 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72390007 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72390026 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72390069 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72390107 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72390211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72390262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72390383 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72390449 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72390471 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72390511 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72390793 T G Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 72390869 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 72390944 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 72391019 T A N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0 0.769230769230769 0.230769230769231 10 16 0 10 3 3 72391109 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 72391142 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 72391298 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 72391786 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 72391799 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 72391841 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72391867 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 72391871 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 72391905 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72391935 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 72391953 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 72391997 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 72391998 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 72392100 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 72392115 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 72392153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72392173 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 72392178 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 72392330 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 72392367 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 72392377 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 72392429 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 72392493 A T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 72392517 A G Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 3 72392553 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 72392613 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 72392774 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 72392790 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 72392801 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 72392805 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 72392818 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 72392836 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 72392855 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 72393024 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 72393043 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72393117 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 72393151 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 72393297 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 72393303 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 72393322 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 72393501 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 72393644 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 72393657 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 72393686 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72393710 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72393793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72393956 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 72394047 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 72394079 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 72394085 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 72394179 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 72394330 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 72394341 C A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 72394416 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72394448 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 72394490 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72394524 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 72394540 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 72394618 A C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 72394706 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 72394750 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 3 72394922 G A N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 72395034 C T N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 3 72395075 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 3 72395148 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 72395227 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 72395416 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72395608 C A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 72395637 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72395780 C A N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 72395925 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 72396578 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72396776 T A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 72396860 T A Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 72397070 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 72397487 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72397557 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72398033 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 72398177 G T Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 72398263 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72398488 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72398587 A G Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 72398858 C A Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 72398866 A T Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 72398961 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72399012 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72399447 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 72399462 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72399656 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72399707 A G Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 72399982 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 72400218 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72400400 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72400934 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72401077 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 72401362 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 72401565 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 72401768 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 72402073 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72402185 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 72402627 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 72403091 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72404482 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72404775 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 72405458 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 3 72406141 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 72406183 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72406191 T A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 72406333 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72406996 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72407215 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 72407314 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72407451 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 72407583 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 72407709 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72407762 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72407838 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72408335 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 72408340 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 72408395 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 72408957 T C Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 72409170 G T Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 72409329 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 72409476 G T Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 72409629 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 72409948 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 72409999 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72410146 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72410440 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 72410736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72410764 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72410814 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 72411845 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72411904 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72412125 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72412472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72412545 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72412629 A G Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 72412714 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 72412912 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 72413468 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72413492 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72413537 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72413603 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72413613 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72413628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72413716 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72413884 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72413923 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72414046 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 72414190 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 72414843 C A Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 72415020 C T Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 72415113 T A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 72415174 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 72415177 T G Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 72415263 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 72416094 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 72416139 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72416189 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72416276 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72416415 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72416422 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72416454 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72416515 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72416601 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72417409 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72417477 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72417658 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72417688 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72417704 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 72418023 G T Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 72418080 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 72419812 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 72419897 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 72420060 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72420430 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72420569 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 72420663 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 72420959 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 72421133 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72421177 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 72421198 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72421230 T A Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 72421233 T C Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 72421594 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72421715 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72421749 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 72421796 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 72421839 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72421858 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 72422040 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 72422153 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 72422325 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 72422330 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 72422343 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 72422560 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 72422561 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 72422592 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 72422617 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 72422685 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 72422696 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 72422707 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72422739 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 72422756 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72422791 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 72422797 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 72422818 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 72422838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72422844 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 72422849 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 72422877 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 72422886 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 72422910 A C N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 72422912 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 72422925 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 72422938 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 72422995 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 72423065 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 72423075 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 72423140 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72423146 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 72423217 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 72423314 A T Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 72423354 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 72423373 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 72423385 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 72423437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72423472 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 72423550 T A Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 72423846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72424030 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 72424038 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 72424135 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 72424170 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 72424478 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 72424479 G A Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 72424578 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 72424630 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 72424653 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 72424728 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 72424760 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 72424799 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 72424803 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72425004 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 72425049 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72425104 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 72425356 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 72425420 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 72425473 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 72425477 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 72425795 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72426195 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 72426257 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 72426772 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72426796 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72426891 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72427406 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72427517 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 72428735 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 72428863 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 72428989 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72428992 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 72429164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72429648 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72430059 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72431080 G C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 72432396 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 72432747 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 72433218 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 72434352 G C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 72434358 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72434382 A T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 72435020 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 72435244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72435371 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72435383 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 72436249 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 72436308 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72436491 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 72436606 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 72436717 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 72436782 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 72436783 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 72437170 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 72437622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72437650 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 72437708 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 72437979 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72438623 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 72439347 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 72439359 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 72439590 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 72440701 A C Y N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 72440805 T A Y N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 3 72440981 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72442452 A C Y N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 3 72442895 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 72443383 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72443422 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 72443442 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 72444395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72444539 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72444915 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72444925 T C Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 72444957 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 72445053 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72445059 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72445094 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 72445489 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72445534 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72445538 A C Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 72445788 A T Y N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 72445819 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 72445982 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72446296 T C Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 72446555 T C Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 72446613 T A Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 72446666 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 72446979 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 72446990 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 72447059 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72447117 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 72447118 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72447194 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 72447380 A C Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 72447428 A T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 72447463 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72447510 T C Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 72447552 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72447727 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72447913 C A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 72448538 A C Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 72448549 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 72448676 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72448994 A G Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 72449331 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 72449361 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 72449385 G C Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 72449392 C G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72449416 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72449438 T A Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 72449466 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72449517 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72449592 G T Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 72449605 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72449638 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72449728 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 72449737 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 72450102 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 72450332 G T Y N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 72451076 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72451673 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72452027 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 72452037 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 72452069 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72452192 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 72452384 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 72452392 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 72452765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72452812 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72452844 T G Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 72452920 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 72452981 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 72453108 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 72453109 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 72453352 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 72453353 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 72453503 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 72453606 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72453660 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 72453785 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 72453942 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 72453957 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 72454063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72454187 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 72454358 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72454518 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 72454716 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72456635 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 72456933 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 72457038 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72457070 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 72457129 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72457224 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 72457277 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 72458019 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 72458025 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 72458213 G T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 72458336 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 72458381 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 72458630 C T N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 8 12 3 2 5 3 72458915 A T Y N 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 72460573 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 72460997 C T Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 72461143 G C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 72461233 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 72461287 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 72461289 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 72461365 C T N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 3 72461667 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 72462134 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 72462149 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 72462620 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72462675 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 72462687 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72462827 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72462876 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 72463883 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 72464152 A C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 72464343 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.266666666666667 0.133333333333333 0.6 10 20 4 2 9 3 72464406 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72464882 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 72464895 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72465012 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 72465014 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 72465071 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 72465164 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 72465169 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 72466397 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72467190 C A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 72467308 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72467493 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72467513 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72467937 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 72467967 A G N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 3 72468534 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72468813 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72469285 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 72469739 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72470875 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 72471550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72474041 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 72475473 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72475948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72476830 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72476935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72477223 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72480105 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 72485822 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72486972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72491044 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72492239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72493445 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 72493465 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 72499139 G T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 72499932 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72500039 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72500562 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 72509960 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 72510314 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72512191 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72512776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72515103 T A Y N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 3 72515996 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72517366 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72517435 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72519916 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72521035 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 72525230 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 72525370 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72526671 G C Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 72527236 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72527251 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72527764 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 72527935 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 72528317 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 72528953 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 72530614 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72531063 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 72533277 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 72534538 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72535646 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72535886 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72535977 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72536766 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 72537920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72538923 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72539230 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72540800 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 72541147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72541150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72545611 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72547218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72548198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72548250 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72548934 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72549523 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 72550140 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72551620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72552207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72552264 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72553184 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72553448 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72553554 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 72557626 A T Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 72557640 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 72557652 G C Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 72557664 A G Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 3 72557804 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 72557857 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72557970 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 72557981 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72558485 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 72559071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72559329 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72560156 G T Y N 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0 1 0 6 6 0 6 0 3 72562131 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72562292 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72563016 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72563116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72563738 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 72564459 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72567286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72568120 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72569373 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 72571022 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72571583 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 72573349 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72576982 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72577020 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72577949 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72578288 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72578954 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 72579896 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72580162 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 72581093 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 72582450 T A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 72583266 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 72583531 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 72584844 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72584913 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72585072 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72585805 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72585990 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72586567 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72587775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72588507 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72589639 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72589760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72590501 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72590599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72590850 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72591475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72592026 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72594186 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72594315 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72602050 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 72604031 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72606371 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72607880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72608900 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72610630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72612954 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 72615504 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72615991 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72617032 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72620926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72621859 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72622134 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72623213 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72623495 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72623796 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72623834 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72623881 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72624653 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72625450 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72625530 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 72625574 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 72625604 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 72625649 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72625652 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 72625689 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 72625910 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72626176 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72626773 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 72627021 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72627223 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72627380 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 72627500 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 72627514 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 72627563 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 72627617 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 72627768 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72627819 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 72628014 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72628266 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72628557 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72628997 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 72629204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72629236 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72630418 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72630864 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 72630916 C G Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 72632133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72632845 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 72632895 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72634137 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 72634161 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72635238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72636149 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 72636217 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 72636365 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72636391 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72637187 C G Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 72637747 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 72637895 T C N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 3 72638016 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 72638281 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 72639211 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 72639332 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 72640411 G C Y N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 3 72641702 A T N N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 3 72643045 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 72644188 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 72644938 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72645419 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 72649234 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 72649634 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 72650367 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72651086 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 72651574 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72652044 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72653630 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 72654427 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72654923 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 72655428 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 72655501 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72656246 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 72656260 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 72656765 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 72657341 A G N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 72659733 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 72661162 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72661200 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 72661216 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 72661417 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 72661768 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 72665114 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 72666723 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 72667927 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 72668705 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 72669571 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 72669931 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 72670012 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 72670143 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 72670308 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72671073 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72672415 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72672858 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72674619 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72675526 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72675625 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72675801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72676516 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72677465 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 72677547 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72678024 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 72679039 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 72680337 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72680408 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72680506 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72680737 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 72683826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72684032 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 72684990 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72685802 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72685931 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72686561 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72687155 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72687345 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72687676 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72687689 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72687713 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72688155 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72688614 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72689093 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72689947 G T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 72690008 G A N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 3 72690134 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72690711 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72690925 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72691168 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72691279 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72691361 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 72691491 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 72691620 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 72691642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72691655 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 72691656 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 72691697 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 72691735 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 72691803 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 72691838 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 72691912 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 72691929 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 72691981 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 72691988 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72692026 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 72692144 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 72692165 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 72692196 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 72692283 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 72692302 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 72692370 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 72692379 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 72692400 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72692523 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72692603 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 72692698 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 72692719 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 72692768 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 72692952 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 72692966 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 72692968 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 72692996 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 72693012 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 72693066 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 72693145 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 72693446 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 72693487 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 72693560 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72693606 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 72693617 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 72693643 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 72693679 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 72693680 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 72693691 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72693700 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 72693702 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 72693712 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 72693742 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 72693777 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 72693794 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 72693871 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 72693894 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 72693968 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 72693989 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 72694069 A G N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 72694213 T G N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 72694261 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 72694413 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 72694509 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 72694573 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 72694710 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 72694717 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 72694785 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 72694800 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72694884 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72694887 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 72694916 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 72694942 T A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 72694989 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72695007 T G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 72695102 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 72695137 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 72695273 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 72695351 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 72695388 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 72695411 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 72695492 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 72695645 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 72695762 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 72695816 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 72695866 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 72695876 C A N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 72695902 T A N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 72695957 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 72695981 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 72696174 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 72696203 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 72696431 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72696453 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 72696483 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 72696584 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 72696592 C G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 72696757 T G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 72696991 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 72697094 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72703842 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72703921 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 72703942 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72703958 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72704014 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72704126 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 72704369 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 72704419 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72704532 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72704565 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72704594 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72704604 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 72704845 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 72705238 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72705415 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 72705416 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 72705530 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 7 11 1 5 3 3 72705947 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72706136 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 72706246 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 72706368 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 72706508 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72706590 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72706870 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 72706904 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72706994 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 72707100 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72707123 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 72707149 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 72707191 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 72707230 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 72707291 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 72707293 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 72707333 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 72707354 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72707413 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 72707476 C G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 72707482 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 72707495 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 72707518 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 72707540 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72707687 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72707736 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 72707748 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72707982 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 72708048 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 72708385 G A N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 72708660 A C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 72708711 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 72708949 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 72709294 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 72709337 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 72709449 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 72709825 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72709872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72709912 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 72709923 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 72710087 C G N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.4375 0.1875 0.375 17 15 7 3 6 3 72710256 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72710258 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 72710402 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 72710503 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 72710509 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 72710516 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72710539 A G N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 72710601 A C N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 72710615 T G N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 72710664 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 3 72710724 G A N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 72710949 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 72710976 T A N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 72711081 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 72711328 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 72711556 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72713504 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 72714020 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 72714078 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 72716412 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72716814 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 72718189 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 72718991 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72720838 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 72720893 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72721798 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 72724774 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 72728781 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 72729538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72729957 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 72730004 C A N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 72730072 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 72730601 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72732522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72735586 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 72736857 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 72737580 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72737592 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 72739329 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72739399 T A Y N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 3 72740767 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72741332 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 72741646 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72742197 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72744003 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 72746451 G A Y Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 72747438 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72748387 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 72748671 G A N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.166666666666667 0.0833333333333333 0.75 5 19 2 1 9 3 72749387 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72750688 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 72750997 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72753337 A C N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 72762160 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72762970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72764434 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 72764924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72765602 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 72765640 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 72767095 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72769079 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72769661 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 72770641 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72771113 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 72771206 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 72771436 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 72771691 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72771995 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 72773090 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72774287 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 72779825 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 72780362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72782943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72783692 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 72783836 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72785225 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72786208 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72786636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72787263 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72788186 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 72788750 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 72788894 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72788945 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72789047 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 72789954 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72790850 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 72796845 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72796896 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 72803210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72803568 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72803932 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 72804211 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72808490 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72809087 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 72841274 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 72841862 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72842915 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72844354 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 72847275 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72847404 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72848534 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72850413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72850852 C T Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 72851638 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72853454 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 72854174 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72855255 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72855723 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72863948 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 72866930 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72869230 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 72869241 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72872162 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 72873059 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72874463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72874584 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72874731 C G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 72874873 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 72875942 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72875978 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72878513 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72878909 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72879050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72879448 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72879472 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 72881936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72882503 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72883051 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72883277 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72887377 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 72887581 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72890649 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72891465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72898746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72898988 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72899061 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72899062 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72900988 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 72901118 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 72901304 G T N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 72901465 T A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 72901483 T C Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 72902844 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 72903051 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72903635 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 72903667 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72904034 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72904057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72904158 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72904197 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72904531 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 72904831 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 72905071 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72905368 A C N N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.272727272727273 0.181818181818182 0.545454545454545 8 14 3 2 6 3 72905528 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72905996 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72906080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72906151 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 72906204 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72906213 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72906267 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72906346 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72906466 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72906574 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72906588 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72906592 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72906603 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72906613 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72906659 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 72906673 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72906895 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72906905 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72907037 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72907186 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 72907677 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72907796 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 72908052 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 72908053 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 72908411 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72908593 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 72908734 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 3 72909174 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72909777 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72909826 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 72909935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72911008 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 72912246 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72914600 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72915244 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72915712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72916640 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72916681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72916739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72917763 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72918197 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 72919803 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72922124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72922881 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 72923713 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 72924016 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 72924967 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72925568 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72926836 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72928129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72929020 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 72930214 G A N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 72931645 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72932719 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72932889 G T Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 72932977 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72935298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72935363 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72936465 G C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 72937040 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 72937120 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72937347 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 72939514 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72939635 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72942232 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72942953 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72943708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72943806 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72945557 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72946288 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72949676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72949856 T A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0 0.823529411764706 0.176470588235294 14 20 0 14 3 3 72950584 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72950671 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 72950694 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72950714 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72950724 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72950795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72953876 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72956171 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72956876 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 72957274 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 72959967 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 72960656 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 72963202 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72965541 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 72966718 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72967587 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72969846 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72969892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72970961 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72971884 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72972558 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72974997 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72975510 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 72976709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72976951 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72978941 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72982829 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72984166 G T Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 72985680 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 72986072 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 19 17 1 17 0 3 72987246 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 72988658 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72988960 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 72991097 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72992948 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 72993153 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72993189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72993750 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 72994185 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72994581 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72994985 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72995130 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72995506 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72995713 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72995775 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 72996594 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 72996598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72996710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 72997055 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 72997360 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 72997389 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 72997724 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 72997775 G C N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 72997875 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 72998163 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 72998624 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72998797 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 72998987 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 72999354 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 72999357 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 72999911 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 73000087 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 73000634 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 73000662 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 73000956 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 73001413 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 73001456 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 73002611 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73002931 T C N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 73003163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73003903 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73004992 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 73005791 T A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 73006732 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73006763 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73006940 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73007590 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 73008507 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73008652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73008657 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 73008711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73008872 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 73008935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73009558 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 73009589 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73010226 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73010763 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 73010875 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 73011308 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73011816 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73012009 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 73013195 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 73013317 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73013361 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 73013574 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 73013788 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73014513 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73014517 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 73014571 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 73014607 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 73014997 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73015155 C G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 73015300 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 73015768 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73015953 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 73016005 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73016046 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 73016047 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 73018119 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 73018431 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73020242 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73020965 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 73020984 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 73022052 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73022867 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73022963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73023029 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73023393 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 73023442 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 73023472 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73023693 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 73023694 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 73023809 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 73024046 C G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 73025648 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73025660 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 73026634 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73027104 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73027457 T A N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 73027498 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73027596 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73027599 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73027720 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 73027866 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73028552 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73029151 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 73029188 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 73029218 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 73029483 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 73029618 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 73030018 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73032063 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73034214 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 73034622 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73035889 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 73035951 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 73037636 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73037764 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73038117 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73038430 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 73038976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73039733 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73041634 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73042023 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73042328 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73043633 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 73044642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73045334 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73045583 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73046011 C T Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 73046292 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73050178 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73050278 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 73050845 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 73054423 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73054455 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 73064522 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 73065256 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73065305 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 73065412 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73065710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73065825 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73065892 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73065904 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73065924 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73066157 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73066230 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73066271 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73066346 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73066383 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73066505 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73066606 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73066664 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73066672 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 73066708 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 73066740 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73066827 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73066961 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73068992 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 73069047 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73069156 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73069384 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 73069391 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 73069635 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 73069769 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 73069781 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 73069817 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73069831 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 73069864 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 73069964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73070025 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 73070083 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 73070239 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 73070260 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 73070746 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 73070762 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 73070977 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 73071014 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 73071056 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73071069 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73071153 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 73071169 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73071256 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73071403 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73071489 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73071564 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 73071939 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 73072003 G T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 73072079 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 73072094 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 73072112 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 73072131 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 73072260 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 73072533 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 73072788 C T N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 73073213 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73073252 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73073992 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 73074183 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 73074229 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 73074399 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 73074417 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73074455 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73075100 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 73075143 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 73075157 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 73075194 C G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 73075195 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 73075227 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 73075286 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 73075640 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 73075781 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 73076031 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 73076181 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73076347 G C N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 3 73076416 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 73076665 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73076760 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 73076801 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73076954 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 73076972 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 73076974 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 73077328 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 73077406 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 73077480 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 73077483 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73077558 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 73077586 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73077689 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73077808 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73077926 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73077971 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73078570 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73078826 C A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73080176 G C Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 73080915 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 73080953 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 73081054 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73081077 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 73081149 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 73081205 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 73081452 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73082382 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73082450 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73082702 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 73083109 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 73083199 C G Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 73083352 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73085330 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 73085420 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 73085589 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73085791 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 73086101 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73086132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73086183 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 73086560 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73086569 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73086724 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73087040 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73087051 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73087273 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73087375 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 73087846 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73087966 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 73087969 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 73088298 T A N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 3 73088389 T A N N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 3 73088410 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 3 73088480 C T Y Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 9 5 3 3 1 3 73088503 A G Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 73088520 A C Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 73088547 C T Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 3 73088571 A C Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 73088590 A T Y N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 73088885 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73088901 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 73088970 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 73088971 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 73089051 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 73089637 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73089786 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73090071 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73090098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73090395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73090672 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73090781 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 73090897 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 73091215 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 73091548 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 73091616 C G N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 73091670 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 73092140 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73092388 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 73092658 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73093156 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73093374 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73093660 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 73093868 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 73093956 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 73094095 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73094149 T A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 73094315 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 73094332 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73094340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73094531 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 73095015 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 73095161 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 73095165 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 73095193 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 73095520 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73095992 T C N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 3 73096012 T G N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 73096505 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 73096555 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 73096628 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73096725 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 3 73096875 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 73097006 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 73097099 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 73097121 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 73097122 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 73097195 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 73097211 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 73097340 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 73097410 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 73097496 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 73097552 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 73097577 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73097592 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 73097603 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 73097609 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 73097625 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 73097646 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 73097736 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 73097789 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 73097831 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 73097928 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 73098003 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 73098018 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 73098088 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 73098100 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73098160 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 73098263 G C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 3 73098329 A T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 73098336 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 73098515 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 73098579 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73098648 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 73098659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73098695 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 73098703 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 73098734 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73098779 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73098859 C G N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 73098881 C A N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 73098898 T A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 73098928 C T N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 73098936 A C N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 73098948 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 73098994 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 73098997 G A Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 73099026 T G Y N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 73099127 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 73099330 A T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 73099387 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 73099552 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73099578 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 73099592 A T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 73099634 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 73099655 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73099678 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 73099749 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 73099768 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 73099852 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 73099884 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 73099906 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 73099958 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 73100003 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 73100128 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 73100598 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 73100852 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73100855 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 73100880 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 73100951 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 73101014 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 73101080 T A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 73101124 C G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 73101135 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 73101203 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 73101286 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 73101412 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 3 73101472 T A N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 73101488 T A N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 73101621 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 73101685 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 73101768 G T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 3 73101849 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 73101854 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 73101867 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 73101880 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73101907 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73101977 A C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 3 73101995 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73102008 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73102028 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 73102106 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 73102154 G T N N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 3 73102176 A T N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 73102303 T A N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 73102579 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 73102634 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73102671 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 73102747 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73102859 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 73102966 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73103068 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73103078 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73103101 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 73103143 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73103177 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 73103207 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 73103221 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73103246 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73103316 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 73103449 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73103479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73103547 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73104715 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 73104724 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 73104841 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73104896 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73104900 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73105065 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73105129 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73105170 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73105229 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73105304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73105307 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73105512 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73105557 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73105600 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73105686 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73105699 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73105872 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73105953 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73105997 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 73106020 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73106039 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 3 73106200 G C N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 73106333 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 73106532 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 73106541 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 73106590 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 73106649 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 73106667 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 73106688 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 73106738 A G Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 3 73106804 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 73106952 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73106980 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 73106998 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 73107027 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73107040 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 73107042 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73107213 C A Y N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 7 13 1 5 4 3 73107261 A G Y Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 73107276 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 73107287 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 73107333 T G Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 73107354 A T Y N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 73107483 C T Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 73108826 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 73108837 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73109084 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 73112215 G A Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 73112306 C A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 73112436 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73112467 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73112495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73112760 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 73112788 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73112825 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73112887 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73112930 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73112949 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 73113016 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 73113057 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 73113120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73113130 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 73113146 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73113207 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73113222 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73113245 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73113257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73113479 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73113545 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73113721 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 73113944 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73114071 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73114084 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73114130 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73114270 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 73114325 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 73114648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73114688 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 73114744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73114904 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 73114913 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 73114954 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 73115096 C A N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 73115368 T A N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 73115646 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73115894 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 73116025 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 73116125 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 73116133 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73116156 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 73116311 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 73116436 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 73116472 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 73116520 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 73116661 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73116860 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 73116912 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 73116970 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 73117135 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 73117153 C G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 73117198 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 73117238 T A N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 73117405 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 73117635 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 73117657 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 73117819 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 73117971 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 73117994 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73118286 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 73118307 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 73118475 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 73118617 G C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 73118622 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 73118659 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 73118738 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 73118822 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 73118861 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 73119519 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 73119657 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 73119917 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 73119928 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 73119949 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 73120015 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 3 73120016 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 73120140 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 73120189 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 73120234 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 73120442 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 73120549 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 73120810 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 73120877 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 73120995 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 73121021 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 73121092 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 73122521 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 73122585 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 73122681 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 73122765 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73122780 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 73122802 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 73122818 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 73122821 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 73122835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73122998 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 73123133 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 73123140 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 73123148 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 73123311 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 73123338 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 73123359 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 73123376 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73123449 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 73123537 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 73123562 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 73123581 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 73123597 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 73123613 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 73123675 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 73123684 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 73123694 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 73123717 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73123758 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 73123793 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 73123800 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 73123815 A C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 73123865 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 73123872 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 73123925 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 73123962 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 73124009 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 73124250 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 73124338 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 73124341 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73124412 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 73124422 T A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 73124441 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 73124459 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 73124612 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73124626 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 73124694 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 73124701 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 73124868 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 73124932 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 73125024 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 73125192 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 73125438 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 73125483 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73125575 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 73125614 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 73125731 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73125793 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 73125869 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 73125910 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 73126171 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 3 73126242 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73126365 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 73126431 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73126643 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 73126977 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 73127108 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 73127145 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 73127177 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73127384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73127776 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73128201 G C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 73128216 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 73128472 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 73128480 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 73128640 C A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 73128653 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 73128668 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 73128706 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 73128773 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 73128955 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 73129060 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 73129073 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 73129122 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 73129139 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 73129184 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 73129228 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 73129239 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 73129267 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 73129288 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 73129328 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 73129425 T C N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 73129501 T A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 73129540 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 12 6 3 6 0 3 73129547 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 73129678 C T N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 73129870 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73129906 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 73129984 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73130097 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 73130359 G A N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 73130438 C T N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 73130711 C G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 73130721 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 73130791 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73130870 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 73130934 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 73130936 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 73130945 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73130972 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 73131128 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73131290 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 73131405 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 73131540 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73131720 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73131881 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 73131922 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 73131943 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 73132256 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73132456 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 73132472 A T N N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 3 73132740 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 73132993 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 73133185 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 73133196 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 73133224 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 73133317 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 73133562 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 73133719 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 73133795 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 73133816 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73133853 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 73133979 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 73134046 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 73134089 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 73134317 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73134358 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 73134614 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73134885 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 73134903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73134909 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 73134977 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 73135019 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 73135120 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 73135140 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 73135177 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 73135333 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 73135337 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 73135348 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 73135409 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73135434 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 73135566 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 73135584 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 73135680 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 73135868 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 73136019 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 73136104 T G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 73136116 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 73136138 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 73136141 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 73136161 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 73136303 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 73136307 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 73136339 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 73136363 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 73136506 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 73136573 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 73136617 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 73136716 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 73137590 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 73137757 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 73137811 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 73137894 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 73137965 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73138031 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 73138162 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 73138229 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 73138273 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 73138380 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 73138787 G C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 73139120 A G Y Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 73139280 G A N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 6 10 1 4 3 3 73139324 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 73141214 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 73141228 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 73141270 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 73141338 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73141639 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 73141824 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73141954 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73141976 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 73141996 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 73142053 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 73142096 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 73142178 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73142488 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73142490 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73142719 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 3 73142825 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73142978 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73143014 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73143165 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 73144641 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73144679 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 73145097 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 73145221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73145363 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73145478 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 73145764 C T Y Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 73145765 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 73146090 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 73146412 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73146564 G C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 73146625 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73146710 A G Y Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 73146781 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73146899 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 73147645 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 73148242 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 73148273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73148340 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 73148359 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73148593 G T Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 73148699 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 73148803 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 73148880 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 73148888 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 73148976 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 73149196 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 73149203 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73149275 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 73149434 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73149459 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73149690 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73149799 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 73149875 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73149974 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73150067 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73150213 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 73150323 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 73150434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73150607 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73150768 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 73150850 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73151062 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73151267 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 73151268 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 73151533 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 73152218 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73152527 T G Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 73152600 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73152732 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73153207 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 73153351 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73153430 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73154101 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73154183 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 73154420 T C Y Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.363636363636364 0.636363636363636 0 15 7 4 7 0 3 73154931 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73155007 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73155110 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73155275 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 73155865 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 73155906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73155991 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73155997 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73156151 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73156770 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 73156972 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73157060 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73157171 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 73157177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73157906 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 73157944 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 73158286 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 73158306 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 73158359 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 73158754 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 73158801 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73158846 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 73159390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73159446 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73159501 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 73159700 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 73159795 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 73159905 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73160036 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 73160907 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73161116 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73161301 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73161398 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73161420 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73161434 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 73161450 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73161481 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 73161505 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73161553 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 73161565 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 73161744 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 73161751 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 73161785 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73161919 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73162150 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73162220 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 73162274 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73162289 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 73162337 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73162356 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73162406 A C N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 73162453 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73162454 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73162472 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73162487 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 73162599 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 73162614 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 73162628 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 73162652 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 73162709 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 73162766 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 73162776 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73162894 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 73162944 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 73162949 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 73163028 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 73163180 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 73163235 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 73163285 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 73163905 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 73164030 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 73164196 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 73164837 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 73165949 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 73166249 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73168362 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73168452 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 73170630 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73170871 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73170928 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 73170977 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 73171034 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73171070 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73171131 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73171189 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 73171303 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 73171487 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 73171496 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 73172091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73172100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73173375 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73173717 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73174967 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73175006 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 3 73175183 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73175809 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73176288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73176340 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 73178251 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 73178254 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 73178333 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 73179949 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73181399 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 73181748 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73181796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73181928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73182184 T G Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 73183069 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73184037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73184420 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73184437 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73184833 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73185005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73185249 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73185972 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73186405 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 73186511 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 73186934 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73187058 A G Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 73187666 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73188042 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73188539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73188903 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 73191811 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73192687 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73193062 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 73193881 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73194504 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73194761 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73196365 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 73196399 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 73196934 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73198168 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73198984 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73199421 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 73199737 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73199909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73200186 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73201162 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73201174 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73201557 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 73201799 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73202647 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73202805 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73203201 G C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 73203325 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 73203656 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 73204977 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 73205163 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73205476 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73205932 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73205944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73206548 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 73206636 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73206776 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73206985 C G Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 73207125 T A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 73207457 A G Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 73207519 C T Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 73207580 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 73208797 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 73209639 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73209700 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 73209853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73210125 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 73210189 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73210280 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 73210297 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73210395 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73210551 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73210569 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 73210693 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73210716 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73210738 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 73210823 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 73210934 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73210956 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 73211088 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73211116 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 73211146 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73211179 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 73211315 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73211356 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73211357 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73211376 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73211404 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 73211455 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73211486 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73211575 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73211577 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 73211611 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 73211636 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 73211667 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73211699 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73211719 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73211747 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73211828 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 73211839 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 73211879 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 73211888 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 73211990 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73212023 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73212068 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73212154 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73212197 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 73212279 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73212297 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73212319 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73212325 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73212330 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73212404 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 73212681 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 73212693 C G N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 73212708 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 73212930 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 73212953 T G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 73213184 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 73213378 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 73213402 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73213422 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 73213531 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 73213562 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 73213679 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 73214717 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 73215089 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 73215237 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 73215282 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 73215589 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73215768 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 73215793 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73216089 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73216314 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73216610 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 73216659 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73216975 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73217335 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 73217410 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 73217863 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 73217889 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73218376 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 73219744 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 73220166 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 73220643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73221010 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73221273 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73221373 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73221886 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73222752 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 73223675 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73223773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73224337 T C Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 73224541 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73225047 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73226959 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 73227418 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 73228314 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 73228616 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73229524 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73229735 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 73229874 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 73229900 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 73230294 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 73230630 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 73230803 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73230826 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73230835 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73230870 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 73230896 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 73230950 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 73231046 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73231113 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 73231130 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73231169 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73231186 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73231249 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73231269 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 73231328 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 73231459 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73231494 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 73231658 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73231689 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 73232011 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 73238305 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73238505 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 73238524 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73238843 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 73239163 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 73239226 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 73239346 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 73239420 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 3 73239458 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 73239480 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 73239562 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 73239611 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 73239628 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 73239682 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 73240052 T G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 73240108 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 73240216 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 73240399 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 73240524 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 73240673 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73240751 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 73240769 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 73240815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73240845 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73240901 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73240945 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 73240970 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 73241330 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 73241455 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73241553 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 73241646 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 73241766 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 73241923 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73242027 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73242051 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73242111 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73242308 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 73242317 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73242391 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73242451 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73242512 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73242563 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73242648 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 73242885 A C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 73242894 G C N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 73242903 A T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 73242927 A G N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 3 73243093 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 73243105 T C N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.142857142857143 0.642857142857143 0.214285714285714 13 15 2 9 3 3 73243114 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73243324 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73243336 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73243430 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 73243458 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 73243482 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 73243500 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 73243530 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 73243656 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 73243706 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 73243725 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73243737 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73243788 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73243820 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73243896 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73243902 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73243968 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 73243970 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73243987 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73244182 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73244271 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 73244298 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73244656 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 3 73244718 C T N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.0909090909090909 0.545454545454545 0.363636363636364 8 14 1 6 4 3 73244722 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 73244859 A T N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 73244866 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 73244871 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 73244923 A T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 73244931 G C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 73244935 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73245071 G A N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 10 10 3 4 3 3 73245093 A T N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 3 73245117 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 73245158 C T N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 73245179 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 73245222 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 73245275 C A N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 73245345 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 73245389 G T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 73245448 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 73245573 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 73245682 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 73245695 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 73245699 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 73245842 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 73245857 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 73245943 T G N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 73246042 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 73246055 C G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 73246128 A G Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 73246404 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 73246545 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 73246560 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 73246640 A G Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 73246670 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73246765 G T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73246846 T C Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 73246921 C T Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 73246950 A T Y N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 73246969 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73247134 A G Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 73247296 G A Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 3 73248201 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 73248270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73248298 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73248432 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 73248448 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73248878 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73248973 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73249149 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73249154 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 73249254 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 73249643 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 73249822 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 73249891 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 73250029 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 73250046 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73250047 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 73250062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73250095 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 73250125 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 73250155 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73250253 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 73250335 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73250434 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 73250488 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 73250555 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 73250591 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 73250708 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 73250792 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 73250808 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 73250824 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73250858 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 73250880 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 73250898 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 73250910 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 73250972 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 73251003 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 73251058 A T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 73251097 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 73251125 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 73251267 A G Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 73251276 A T Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 3 73252017 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 73252166 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 73252174 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73252177 A C N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 73252207 T G N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 73252221 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 73252232 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 73252324 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 73252618 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 73252649 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 3 73252946 G T N N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.384615384615385 0.307692307692308 0.307692307692308 14 12 5 4 4 3 73252954 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 73253132 G C N N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.545454545454545 0.181818181818182 0.272727272727273 14 8 6 2 3 3 73253291 G T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 73253397 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 73253411 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 73253482 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73253547 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73253584 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 73253610 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 73253664 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73253667 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73253718 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 73253719 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 73253736 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 73253762 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 73253787 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 73253917 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 73253933 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 73254079 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 73254213 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73254223 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73254247 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73254373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73260869 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73260974 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 73261027 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 73261109 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73261131 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 73261264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73261499 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73261599 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 73261704 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73261722 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73261748 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73261776 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73261803 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73261873 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 73262011 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73262032 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73262048 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73262091 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73262117 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73262129 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73262159 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73262232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73262330 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 73262355 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73262404 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73262436 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73262445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73262469 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73262484 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73262513 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73262531 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73262572 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 73262758 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73262855 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73262944 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 73262961 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 73263087 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73263088 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73263119 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 73263179 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73263315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73263334 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73263751 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73263857 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73263994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73264093 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73264148 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 73264256 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73264393 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73264399 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73264404 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73264416 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73264457 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73264485 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73264758 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 73264764 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73264780 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73264783 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73264820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73264828 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 73264871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73264889 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73264919 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 73264972 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 73265116 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73265139 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73265178 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73265273 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73265325 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73265388 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73265419 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73265460 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73265519 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73265670 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73265780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73265848 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73265988 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73266005 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73266021 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 73266059 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73266088 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 73266142 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73266231 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73266265 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73266345 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73266397 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 73266401 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 73266415 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 73266459 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 73266495 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 73266573 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 73266657 G A N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 3 73266722 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 73266785 A G N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 73266891 C G N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 3 73266942 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73266973 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 73272925 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73272982 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73273062 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73273268 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 73273327 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 73273330 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 73273455 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 73273538 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 73273556 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 73273648 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73273686 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73273721 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73273730 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73273737 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73273864 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 73273865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73273877 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73273925 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73273931 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73273938 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73274061 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73274174 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73274194 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73274234 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73274236 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73274273 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73274310 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 73274428 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 73274433 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73274498 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73274591 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73274605 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 73274635 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 73274657 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 73274688 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73274704 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 73274715 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 73274772 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73274780 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73274824 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 73274870 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73275186 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73275216 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 73275286 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 73275343 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 73275366 A C N N 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 3 73275535 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 73275564 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 73275598 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 73275687 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 73275901 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73275943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73276004 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73276016 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73276112 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73276126 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73276130 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73276239 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73276318 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73276342 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73276383 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 73276388 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73276405 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 73276502 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73276514 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73276516 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73276530 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73276630 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 73276784 G C N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 73276893 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 73276962 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73276969 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73276998 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73277050 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73277270 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 73277388 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73277475 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73277593 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 73277970 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 73277982 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73278058 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73278213 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 73278216 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 73278447 C T N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 73278720 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 73279183 C G N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 3 73279292 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 73279317 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 73279853 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73279862 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73279926 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73280407 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 73280656 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73280689 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73280755 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 73280847 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 73281463 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 73281509 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 73281683 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 73281962 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 73281965 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 73282024 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 73282089 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 73282110 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 73282152 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 73282169 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 73282497 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 73282517 T G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 73282565 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 3 73282608 G C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 73282628 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 73282652 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 73282758 G T N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 3 73282788 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 73282812 G A N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 73282885 G A N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 3 73282971 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 73283052 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 73283209 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 73283245 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 73283267 A T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 73283297 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 73283334 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 73283472 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 73283473 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 73283483 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 73283502 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 73283508 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 73283592 G C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 73283839 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 73283865 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 73283969 A C N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 3 73284033 G A N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 3 73284107 T A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 73284118 T A N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 73284151 A G N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 73284378 A T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 73284626 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 73284648 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 73284663 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73284681 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 73284691 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 73284719 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73284774 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 73285077 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 73285088 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73285098 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 73285261 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 73285295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73285310 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 73285351 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 73285391 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73286658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73286771 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 73286871 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 73287315 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 73288319 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 73288325 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 73288395 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73289017 G T N N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 3 73289698 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 73290081 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 73290286 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 73290377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73290443 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73290451 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 73290731 G T Y N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 73291282 T G Y N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 73291807 T G Y N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 73291842 A G Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 73292931 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73294280 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 73294408 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73294444 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73294487 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73295146 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73295542 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 73295747 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73295762 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 73295866 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 73296791 C G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 73296977 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 73297120 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73297975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73298364 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73298722 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73299221 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73300214 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 73300233 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73300401 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 73300684 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 73300722 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73300809 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 73301096 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 73301378 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 73301517 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 73301549 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73301577 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73302069 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 73302351 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 73302420 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 73302444 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 73302514 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 73302593 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73302649 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73303046 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73303047 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73303095 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 73303680 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73303795 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 73304748 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 73304766 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73305801 G T Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 73305821 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 73306058 T A Y N 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.363636363636364 0.0909090909090909 0.545454545454545 9 13 4 1 6 3 73306092 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73306191 C T Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 3 73306207 A T Y N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 73306208 A G Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 73306354 T A Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 73306514 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73306544 T A Y N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 73306886 C T Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 73306961 T C Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 3 73306973 G A Y Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 73307007 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73307028 C G Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 73307093 C A Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 73307847 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73308647 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73308868 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 73308869 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73309180 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 73309668 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73309893 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73310208 G A N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 3 73310418 C G Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 73310427 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73311752 C T Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 73312111 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 73312149 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 73312186 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 73312228 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 73312297 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73312364 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73312606 A C Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 73312984 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 73313440 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 73314497 A C Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 73314798 G C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 73315023 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 73315171 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 73315187 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73315233 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73315342 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 73315370 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73315823 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73315824 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73315971 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 73316095 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 73316152 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 73316274 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 73316287 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73316443 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 73316462 G T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 73316628 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 73316727 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 73316728 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 73316760 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73316796 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 73316825 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 73317104 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 73317812 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 73318166 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 73318282 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73318372 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 73318387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73319184 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 73319461 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 73320052 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 73320521 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73320539 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73320701 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 73320870 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 73321027 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 73321507 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 73321621 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73321998 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 73322081 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 73322189 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73322252 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 73322317 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 73322725 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 73323303 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73323341 T A N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 3 73324485 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73324579 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 73325394 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 73325565 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 73328499 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73329108 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73330113 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 73331874 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 73332367 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73332565 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 73332631 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 73332644 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 73334150 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73335203 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 73335726 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73336062 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73336064 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73336420 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 73336666 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73336694 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73336804 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73336889 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 73336951 T G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 73337061 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73337101 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73337145 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 73337422 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 73337430 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73337492 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 73337519 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 73337587 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 73337590 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 73337748 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 73337768 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 73337838 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 73337898 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73338206 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73338223 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 73338224 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 73338267 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73338289 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 73338381 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 73338399 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 73338545 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73338566 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 73339430 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 73339436 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 73339447 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 73339469 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 73339470 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 73339560 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 73339722 T A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 73339771 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 73339809 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73339822 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73339880 T A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 73340034 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 73340035 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 73340054 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 73340095 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 73340199 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73340283 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 73340339 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 73340340 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 73340401 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73340427 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 73340500 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 73340543 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 73340570 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 73340638 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 73341070 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 73341481 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73342501 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 73342872 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73343018 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73344252 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73344303 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 73344308 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 73344987 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73345406 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73346263 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73346625 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73346677 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73347012 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73347555 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73347582 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 73347818 G A Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 73348301 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 73348395 C G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73348844 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 73349151 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 73349416 C A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 73350033 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73351539 C A Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 73351749 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 73352762 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 73352818 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 73352953 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73353722 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 73355174 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73356238 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 73357012 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 73357759 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 73358004 G T N N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0 0.6 0.4 6 14 0 6 4 3 73358026 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 73360371 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 73362925 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73363190 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 73363358 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73364012 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73364521 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73364660 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73365421 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 73367393 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73367881 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73368016 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73368041 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73369301 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73371225 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73371342 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73371654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73371838 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73372303 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 73372726 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 73372802 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 73372996 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73373073 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73373118 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 73373266 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73374487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73374749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73375394 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 3 73375400 A G N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 15 13 1 13 0 3 73375638 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73376641 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73378562 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73381601 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73383046 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73383622 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73385037 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73386320 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73386474 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73387985 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73388186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73388450 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 73391138 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73391178 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73391202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73392201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73393836 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73394036 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73394950 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73397609 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 73398548 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73398705 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 73399198 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73399320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73402121 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73402436 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73403156 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73403321 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 73403511 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 73403781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73405284 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73405950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73406161 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73406265 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 73406666 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73406878 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 73406967 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73407097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73407405 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73413289 A T N N 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 3 73413312 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 73413591 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 73414326 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73414375 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 73420482 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73421699 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73421772 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73424847 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73425710 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73425901 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73426148 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73426537 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73427673 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73428721 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73428835 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73430381 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73431280 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73431820 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 73432023 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73433449 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73433483 G T N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 73435821 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 73436289 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 73437874 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73437908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73437946 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73438805 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73439100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73439574 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 73440339 C G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 73442126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73442955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73443597 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73444471 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73444834 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73444917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73445993 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 73446541 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 73447009 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 73451484 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 73451914 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 73452196 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 73453587 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73454239 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73455654 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 73455938 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73456901 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73458002 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73458041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73458367 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73458592 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73459063 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73459790 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73461213 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73462178 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 73462533 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73462940 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73463480 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 73466082 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73466104 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73467525 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73467633 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73467663 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73469407 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73470082 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73470384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73470622 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 73470822 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73470891 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73472060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73472664 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73473132 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 73473151 C T N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 73473787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73473908 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 73474040 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 73474781 C A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 73475306 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 73475605 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 73475773 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 73476581 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73477302 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 73477679 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73477956 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73477997 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73478195 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73478278 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73478636 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 73479043 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73479655 A T Y N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 73480219 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 73480514 G A Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.25 0.0625 0.6875 9 23 4 1 11 3 73480622 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 73480815 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 73480884 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 3 73480938 A G Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.1875 0.0625 0.75 7 25 3 1 12 3 73481090 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 73481131 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73481145 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73481330 A T Y N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.2 0.133333333333333 0.666666666666667 8 22 3 2 10 3 73481443 C T Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.1875 0.0625 0.75 7 25 3 1 12 3 73481562 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 73481778 T A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 73481902 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 73481964 A G Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 73482073 T A Y N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 73482147 G A Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.2 0.133333333333333 0.666666666666667 8 22 3 2 10 3 73482447 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 73482675 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 73482705 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 73482767 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 73483463 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 73484008 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 73484625 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 73484730 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 73485258 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 73485396 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73485407 T A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 73485707 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 73485966 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73486159 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73486351 T G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 73486587 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 73486645 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 73486874 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 73487020 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 73487376 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 73487677 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73487688 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73487799 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 73487806 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73487872 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73487939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73489315 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73489593 G C Y N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 73489850 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 73491461 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73496335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73496947 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 73497966 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73499204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73500568 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73501432 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73501722 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73501910 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73503973 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 73506183 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73506450 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73508625 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73508777 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 73512160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73514306 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 73514446 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 73514516 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 73514585 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 73514604 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 73514869 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 73514912 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 73514922 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 73514928 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 73515005 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 73515034 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 73515055 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 73515172 A C N N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 3 73515735 G C N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 3 73515886 A C N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 3 73516287 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73518293 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73518539 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73518583 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 73519366 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 73520102 A G N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 3 73520971 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 73521289 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73523120 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 73523185 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 73523649 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 73523675 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 73526439 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 73528363 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73528806 C A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 3 73529111 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73529288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73529570 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73529828 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73530960 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 73531318 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73533156 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73533858 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73535877 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 73535954 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73536227 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73536462 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73542455 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73542617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73543451 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73544333 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 73544353 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 73545160 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73545539 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 73545745 C A N N 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 6 8 2 2 3 3 73545786 G C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 73546002 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 73546066 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 3 73546315 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73546562 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73546618 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 73546622 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 73546702 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73546916 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73547523 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73547779 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 73547810 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73547887 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73547899 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 73548007 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73548031 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73548165 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 73548236 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 73548297 T A N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 3 73548310 C T N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 3 73548368 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 73548428 C A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 3 73548652 G T Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 73548699 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 73548882 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 73548894 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 73549071 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73549214 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73549310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73549448 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 73549571 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 73549838 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 73549905 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73550000 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 73550012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73550562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73551322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73552291 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 73553477 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 73553970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73554115 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73554403 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73555059 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73557162 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73557825 T G N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 73559855 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73560028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73561095 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 73563767 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 73565732 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 73566126 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 73567323 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73568165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73568255 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 73568264 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73569517 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73569518 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73570740 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 73571763 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73572472 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73573092 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73573490 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73574761 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73574827 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 73575884 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73576424 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73576806 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 73576837 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 73577102 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73579296 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73580174 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 73580687 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73581315 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 73581421 A C Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.230769230769231 19 7 9 1 3 3 73582662 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 73583093 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 73583497 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 73584064 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 73584547 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73584927 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73585206 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73585371 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73585396 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73585518 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 73585651 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73585854 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 73585977 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 73586592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73586792 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73586867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73587346 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73587585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73587701 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73587998 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73588014 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73588360 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73588530 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73589984 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 73590399 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73590680 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73591113 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 73591212 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73592682 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73593059 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73594526 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73594639 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73595715 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73596179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73596556 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73596624 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73598877 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 73599046 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73599188 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 73599204 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 73599358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73599375 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 73599435 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 73599635 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73599649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73599751 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 73599930 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 73599972 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 73599986 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 73600018 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73600051 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 73600093 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 73600136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73600179 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 73600265 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 73600542 C A Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 73600579 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 73600662 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 73600990 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 73601405 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 73601566 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 73601615 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 73601650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73601832 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 73601867 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 73601913 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 73601939 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 73602147 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 73602380 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73602394 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 73602728 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 73602766 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73602857 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73603052 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 73603074 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 73603076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73603105 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 73603152 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73603328 T A Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 73603836 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 73603929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73603952 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 73604128 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 73604153 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 73604158 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 73604589 G C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 73604844 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 73605071 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 73605114 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 73605145 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73605335 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 73605381 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 73605819 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 73605820 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 73606537 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 73606741 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 73606891 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 73607276 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 73607800 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73608233 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73608246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73608390 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 73608560 T G N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.214285714285714 0.642857142857143 0.142857142857143 15 13 3 9 2 3 73609153 G T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 73609223 C G N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 3 73609686 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 73609757 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 73609796 C G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 73609856 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 73610133 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 73610496 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73610535 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73610993 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73611277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73611428 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73612062 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73612167 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 73612191 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73612384 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73612816 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73612989 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73613179 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73613945 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73615352 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73617130 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73618510 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73618622 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73619789 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73619972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73621337 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 73621834 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 73622128 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73623695 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73623739 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73625315 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73625326 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 73625666 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73626555 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73626912 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73630322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73631145 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 73631570 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 73631835 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 73631909 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 73631945 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 73632323 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 73632603 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 3 73632788 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 73633235 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 73633383 C T N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 73633487 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 3 73633715 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73633750 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 73634130 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 73634745 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 73634931 G T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 73634994 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 73635034 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 73635197 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 73635225 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 73635239 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 73635291 A G Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 73635305 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 73635338 A T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 73635378 A C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 73635433 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 73635467 T C Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 73635488 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 73635500 A T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 73635576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73635587 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 73635588 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 73635602 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 73635640 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 73635692 A C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 73635728 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 73635863 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 73635866 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 73635906 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 73635910 T A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 73635970 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 73636018 C A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 73636161 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 73636235 T A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 73636245 G C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 73636379 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 73636432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73636619 C T Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 73636686 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73636868 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 73636949 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73637017 C T Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 73637174 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 73637243 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73639899 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 73640062 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 73641273 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 73641438 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73643188 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 73643490 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 73644878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73645803 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 73647698 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73647804 T G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 73649008 C G Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 73649723 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73649724 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73650672 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73651063 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73651146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73651684 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73652196 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73652266 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73652357 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 73652373 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73652690 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73653086 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73656232 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73657605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73667397 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 73667474 C A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 3 73667536 C G N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 73667548 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 73667572 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73667632 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 73667662 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73667672 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 73667773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73675138 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73675198 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73676034 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73676088 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73676356 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73676584 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73677033 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 73678020 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73680111 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 73680113 C T Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 3 73681646 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73681875 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73682276 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 73682564 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73682700 C T Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 73683011 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 73683087 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 73683156 T A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 73683556 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 73684006 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73684110 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73684137 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 73684938 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73684949 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73686645 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 73686725 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73686764 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73687791 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73688753 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 73688857 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73688902 T G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 73688930 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 73692489 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 73692917 G C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 73694248 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73694909 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73697045 C T Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 73698703 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73699588 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73699604 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73700454 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73700623 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 73700944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73701179 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 73701553 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73701840 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73701885 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73702247 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73703221 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73703634 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73704075 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73704120 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73704427 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 73704742 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73704818 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73705242 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73705722 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 73706099 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 73706944 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73708485 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73708503 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73708530 C T Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 73710262 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 73710410 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73710795 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73711668 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 73712296 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73712396 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73713702 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 73713716 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 73714762 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73715068 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 73715404 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73718232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73719002 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 73719554 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 73719674 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 73720047 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 73720219 G A N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 3 73725500 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 73726031 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 73727049 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 73728334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73728991 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73729095 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73729118 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73729147 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 73730025 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 73730034 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73732141 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73733577 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 73733727 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73734922 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73735618 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 73735824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73737472 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73737534 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73737948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73741535 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73742128 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 73742459 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73743066 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 73743778 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 73744515 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 73747140 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73747176 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73747178 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73747191 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73747220 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73747346 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73747352 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73747381 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73747391 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73747432 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73747562 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73747675 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73747700 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73747814 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73747847 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 73748014 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73748031 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73748101 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73748208 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 73748644 A G N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 73748955 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 73749117 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 73749134 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73749135 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 73749223 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 73749230 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 73749259 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 73749314 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 73749535 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73749603 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73750271 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 73750307 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73750392 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 73750621 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 73750622 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 73750721 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 73750778 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73750827 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 73750847 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73750973 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 73751165 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 73751302 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 73751398 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 3 73751399 T A N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 73751426 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 73751542 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73751727 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73751846 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73751894 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73751938 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 73752006 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73752280 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 73752404 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 73752512 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 73752517 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 73752601 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 73752645 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 73752682 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 73752898 A T N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 3 73752909 T C N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 3 73753133 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 73753319 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 73753325 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 73753628 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 73753852 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 73754022 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 73754115 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 73754251 G T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 73754348 T G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 73754357 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 73754384 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 73754417 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 73754550 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 73754660 T A N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 3 73754665 A G N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 3 73754790 C G N N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 3 73754816 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 3 73755062 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 73755260 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 73755461 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 73755685 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73755723 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73755799 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73755825 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73755826 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73755893 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73755905 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73755944 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73756384 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 73756388 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 73756405 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 73756886 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 73757102 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 73757158 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73757166 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 73757176 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73757234 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73757251 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73757682 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73758048 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 73758166 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73758194 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 73759288 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 73759324 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73759350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73759751 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73759844 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73759868 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73759890 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73760004 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73760031 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73760079 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73760082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73760208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73760324 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73760598 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 73761215 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73761450 G A N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.545454545454545 0.272727272727273 0.181818181818182 15 7 6 3 2 3 73761568 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 73761835 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73761948 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73761992 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 73762048 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73762522 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73762673 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73763209 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 73763255 T C N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 73763556 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 73763696 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 73764117 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73764158 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73764481 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 73764660 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73764717 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 73764971 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 73764986 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 73765029 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73765098 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73765112 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73765147 A C N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 73765188 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 73765293 T G N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 3 73765394 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73765538 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 73765539 C A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 73765587 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 73765758 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73765767 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73765907 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 73765922 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73766177 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 73766234 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73766827 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73766889 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73766893 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73766914 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73767147 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73767167 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73767189 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73767250 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 73767273 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73767277 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73767315 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 73767354 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73767361 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73767571 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 73767585 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73767903 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 73768439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73768522 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73768589 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73768596 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73769645 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73770152 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73770156 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 73770541 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73770598 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73770652 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73770724 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73770748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73770887 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73770906 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73770907 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73770940 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 73771032 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73771183 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73771404 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73771424 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73771591 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73771680 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 73771825 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73771864 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73771890 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73772012 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73772096 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73772153 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73772178 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73772190 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73772401 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73772441 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73772464 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73772481 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73772534 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73772554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73772620 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73772677 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73772678 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73772736 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 73772803 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73772916 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73772926 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 73772936 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73773013 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 73773232 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 73773271 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73773278 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73773489 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73773527 T G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 73776166 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 73776749 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73777445 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 73777602 G C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 73777796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73777797 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73778005 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 73778107 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 73778596 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 73778891 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 73779527 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 73779806 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73779994 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 73780022 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 73780038 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73780054 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73780071 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73780082 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 73780215 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 73780216 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 73780405 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 73780513 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 73781110 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 73781134 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 73781163 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 73781237 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73781293 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 73781806 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 73781816 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 73781890 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 73781895 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 73781906 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 73781910 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73781963 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 73782048 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 73782152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73782176 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 73782186 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 73782196 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 73782215 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 73782262 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 73782328 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 73782386 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 73782417 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 73782469 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 73782475 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 73782488 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 73782521 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 73782534 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73782600 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 73782838 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73782850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73782928 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 73782965 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73783057 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 73783343 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 73783382 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73783673 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73783679 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73783764 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73783765 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73783821 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73783879 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 73783908 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 73783917 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 73783943 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73784038 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73784197 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73784338 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73784666 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 73785280 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73785457 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73785495 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 73785577 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73785690 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 73786283 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73787007 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 73787354 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 73787680 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73787746 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 73787904 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73788007 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73788093 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73788513 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 73788538 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 73788581 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 73788654 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 73788930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73788937 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 73789318 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 73789351 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 73789372 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 73790050 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73790162 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 73790459 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73790532 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 73790625 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 73790778 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 73790806 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 73790969 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 73791288 A G N Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 5 9 1 3 3 3 73791294 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 73791367 G A N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 3 73792298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73793236 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73793352 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73794524 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 73794773 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73795120 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73795275 C T N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 3 73796361 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73797489 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 73797846 A C Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 73798084 A C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 73798194 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 73798267 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 73798761 G T Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 73798783 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 73799092 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73799664 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 73799715 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 73799750 T A Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 73799761 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73800019 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 73800373 C G N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 73801210 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73802690 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73805837 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73806281 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 73806438 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 73807103 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 73808194 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 73808216 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 3 73811177 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73813659 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73813777 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73814313 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73814368 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73814847 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73815323 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 73816030 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 73816059 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73816822 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73818424 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73818547 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73819142 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73819981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73820042 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73820115 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73820469 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73820740 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 73821398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73821574 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73821681 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73822169 A C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 73822325 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73822358 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73824642 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 73824930 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 73825056 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 3 73825108 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 73825343 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73825354 A T Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 73825563 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73826063 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73826206 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73826802 T A N N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 73826951 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 73826971 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 73826989 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 73827950 C A Y N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 73827983 T C Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 73828002 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 73828163 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 73828194 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 73828309 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 73828656 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 73829189 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73829480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73829634 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 73829652 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73831267 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73831927 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73831951 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73832198 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73832831 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73833020 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 73833436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73833463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73833603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73834772 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73836521 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 73837814 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73837977 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73838205 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 73838241 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 73838541 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 73838941 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 73839883 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73840364 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73844815 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 73844880 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 73846990 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73846991 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73847245 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 73847635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73847684 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73847978 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 73848607 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73849121 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 73850222 C T N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 3 73850516 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73850916 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 73852109 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73852819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73853252 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73853354 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73853401 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73853438 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73853468 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73853966 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73853992 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73854671 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73855985 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 73857023 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73857404 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73857889 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73858922 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73859580 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 73859864 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73860269 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73860332 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73860416 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 73860525 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 73860659 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 73860712 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73860769 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 73860840 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 73860915 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 73860951 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 73860958 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73861101 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 73861117 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 73861128 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 73861190 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 73861404 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73861483 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 73861506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73861522 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 73861546 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 73861557 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 73861560 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 73861606 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 73861620 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 73861652 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 73861674 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 73861905 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 73861913 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 73861925 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73861942 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73862069 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 73862125 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 73862129 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 73862708 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 73862954 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 73863002 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 73863143 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73863423 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 73863853 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 73864705 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73865939 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 73866154 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 73866282 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 73866315 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 73866542 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 73866743 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73866769 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73866775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73866986 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 73867076 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 73867315 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 73867335 G T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 73867379 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 73868470 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 73868783 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 73868821 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 73869225 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 73869442 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 73869504 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 73869588 G C N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 73870182 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73870870 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 73871842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73874359 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73876648 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73877863 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73878063 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73878211 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 73878356 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73878675 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73879778 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73880170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73880471 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73880899 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 73880913 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 73881993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73882237 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73882728 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73885934 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73886570 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73886754 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73886810 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73887004 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 73887187 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 73887464 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 73887750 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73887783 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73887796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73887824 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73887986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73888202 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73888209 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73889451 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73890208 A T N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0 0.866666666666667 0.133333333333333 13 17 0 13 2 3 73890426 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73890567 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73890962 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 73890997 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 73891329 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73891864 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73892730 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 73892924 A G N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 3 73893003 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 73893034 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 73893058 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 73893062 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 73893172 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 73893193 C A N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 73893273 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 73893390 A C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 73893408 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 73893455 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 3 73893568 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 73893569 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 73893694 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 73893716 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73893988 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 73893998 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 73894010 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 73894048 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 73894188 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 73894321 T G N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 73894420 G A N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 3 73894435 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 73894531 T G N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 73894569 A T N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 3 73894624 C T N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 3 73894656 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 73894707 C T N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 3 73894746 T G N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 3 73894858 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 73894878 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 73894966 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 73895016 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73895184 A T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 73895206 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 73895232 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 73895246 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 73895395 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 73895648 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 73895737 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 73895913 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 73895979 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73896070 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 73896185 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 3 73896458 G A N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 3 73896488 C T N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 3 73896512 T A N N 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.181818181818182 0.454545454545455 0.363636363636364 9 13 2 5 4 3 73896520 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 73896541 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.25 0.333333333333333 0.416666666666667 10 14 3 4 5 3 73896564 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 73896606 A C N N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 3 73896679 G A N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 3 73896690 T G N N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 3 73896804 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 73896915 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73897005 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73899235 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 73899273 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73900171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73903506 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73903857 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73903868 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73905575 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 73905917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73911666 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73915675 A C N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 73918927 C A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 73919809 C A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 73922455 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73929353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73933598 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73933848 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73934470 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73934702 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73934752 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 73942028 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73942414 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73944039 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73944475 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73944660 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 73944785 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73944816 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 73945038 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73945103 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 73945148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73945328 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73945366 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73945401 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73945597 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 73946138 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 73946274 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73946384 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 73946431 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73947139 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73947168 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73947222 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73947572 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73947730 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73947756 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73947784 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 73947785 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 73948015 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73948923 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 73948983 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73949123 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 73950156 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73950175 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73950519 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73950712 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73950813 T G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 73951205 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 73951223 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 73951462 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 73951850 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 73951879 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 73951913 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 73952523 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 73953347 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 73955149 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73955313 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 73955596 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73956239 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 3 73956240 C G N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 73957098 T G N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 73958563 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73960502 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73961353 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73961766 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 73961834 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 73961941 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 73966503 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 73967292 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73967372 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73967503 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 73967556 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 73968185 C T N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.375 0 0.625 6 10 3 0 5 3 73971184 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 73974594 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 73974909 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 73975117 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73975310 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 73978811 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 73978837 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 73980250 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73980644 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 73981834 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 73982357 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 73983198 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 73984822 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 73984949 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 73986239 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73997360 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73998748 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 73998868 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74000373 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74001156 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74001473 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74001550 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74002344 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 74002826 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 74002950 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 74004064 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74004418 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 74004534 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 74004907 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74005118 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74005410 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74005433 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74006169 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74006185 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 74006197 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74006513 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74006588 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74006644 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74006706 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74006718 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74006748 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74006820 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74007031 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74007223 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74007654 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 74007806 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 74007983 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 74008107 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74008121 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74008801 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74008845 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74009018 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74009084 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 74009259 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74009267 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74009529 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 74009539 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 74009870 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74010173 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 74010337 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 74010512 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74011123 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 74011967 C T Y Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 9 7 3 3 2 3 74011986 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 74012269 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 74012295 C A Y N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 3 74012328 G A Y Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 3 74012464 G T Y N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 3 74012758 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 74013328 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 74013400 T G N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 3 74013608 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 8 6 3 2 2 3 74013663 G A N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 74014124 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74014755 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74021558 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 74022601 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74023296 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74024433 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 74024731 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 74026318 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74026492 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74026519 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 74026528 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74026547 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74027062 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74027081 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 74027092 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 74027122 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74027208 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 74027244 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74027250 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 74027368 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74027574 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 74027684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74027714 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74027728 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74027748 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74027762 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 74027936 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74028421 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74028436 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 74028547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74028634 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74028668 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74028741 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74028813 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74028838 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74028904 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74029007 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74029131 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74029289 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74029363 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 74029419 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 74029453 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74029614 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74029687 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74029722 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74029812 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74030024 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74030063 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 74030373 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74030434 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 74030580 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 74030656 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74030729 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74030730 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74031013 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74031167 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74031249 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74031316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74031333 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74031424 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74031429 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74031677 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 74031691 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74031864 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74031872 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 74031892 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74032095 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74032169 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 74032186 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74032256 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 74032274 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74032400 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74032719 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74032751 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74033119 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74033165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74033181 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74033377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74033512 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74033645 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74033848 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74033913 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 74034205 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74034222 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 74034243 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 74034431 A G N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 74039083 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74039252 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 74039387 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 74039390 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74039436 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74039471 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 74039506 T A N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 74039620 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 74039765 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 74039830 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 74041132 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74041182 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74041278 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 74041498 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74041639 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74041781 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 74041786 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74041899 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74041900 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74041994 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 74042019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74042154 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74042282 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74042376 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74042449 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74042493 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74042502 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74042571 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74042605 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74042688 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74042697 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74042758 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74042992 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 74043255 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74043285 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74043390 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74043428 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74043643 T A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 74043673 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74043749 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74043772 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74043834 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74043945 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74044022 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 74044052 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 74044152 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 74044163 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 74044187 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74044218 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74044254 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74044282 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74044335 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74044453 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74044499 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74045633 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74045724 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74045934 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 74045963 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 74046079 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 74046138 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74046180 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74046249 T G N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 74046311 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74046329 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74046533 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74046589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74046630 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74046632 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74046839 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74046891 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74046903 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 74046948 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 74047017 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 74047115 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74047125 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74047137 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74047299 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74047339 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74047528 A T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 74047593 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 74047627 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 74047791 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 74047801 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74047859 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 74047934 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74048080 A G N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 74048145 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74048152 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 74048162 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74048191 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74048266 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74048368 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74048458 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74048527 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74048552 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74048559 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74048723 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74048875 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 74048923 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74048942 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74049024 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74049094 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74049109 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74049158 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74049227 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74049240 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 74049333 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74049713 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74049741 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74049972 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74049985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74050236 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74050471 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74051397 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 3 74051442 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 74051581 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74051592 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74051664 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74051878 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74051946 C G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 74052045 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 74052051 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74052242 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74052484 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74052501 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74052647 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74052705 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74052804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74052849 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74053066 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74053096 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74053132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74053166 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74053179 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74053185 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74053217 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74053433 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74053469 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74053479 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74053483 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74053600 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 74053840 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74053902 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 74053909 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74053997 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 74054013 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74054063 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74054127 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 74054147 A T Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 74054268 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 74054414 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74054426 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74054458 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74054624 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74054769 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74054919 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74055038 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74055068 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74055155 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 74055323 C A N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 74055585 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74055765 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74055847 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74055866 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 74055916 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74056024 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74056080 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74056125 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74056189 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74056200 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 74056263 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74056310 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74056575 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 74056760 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74056785 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74056788 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74056891 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74057042 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74057174 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74057206 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 74057329 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74057376 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74057611 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 74057682 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74057770 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74057777 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 74057831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74057842 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74057921 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 74057973 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 74058053 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74058105 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74058224 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 74058315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74058606 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 74058637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74058671 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74058689 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74058722 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 74058736 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74058756 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74058778 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74058824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74058879 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 74059040 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 74059148 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74059203 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 74059316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74059359 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 74059366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74059428 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74059445 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 74059496 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74059510 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74059571 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 74059666 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 74059766 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74059789 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74059881 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 74059912 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 74059977 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 74060075 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74060265 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 74060280 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74060376 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 74060387 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 74060396 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 74060405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74060436 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 74060511 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 74060559 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74060781 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74076676 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 74078881 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 74079118 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74081483 A T N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 74081776 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 74082095 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 74082495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74082566 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74084954 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74088018 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74088679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74089121 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 74089225 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74089447 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74090020 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74090657 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 74090771 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74091377 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74091938 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74092621 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74093082 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74093180 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74094031 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 74094124 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 3 74094968 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74095167 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74095168 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74095254 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 74095400 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74095499 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74096335 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 74096909 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74099968 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74100167 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74100229 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74100618 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74100801 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74101094 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74101883 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74104114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74104343 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 74105528 C G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74105539 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 74107429 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 74107675 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74107735 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74110926 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74111867 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 74112137 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 74112862 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74113323 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74113947 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74114341 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74114542 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74115282 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 74118110 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74118124 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74118270 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74118429 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74118605 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74118928 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74118937 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74120363 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74120554 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74120837 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74121523 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 74122058 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74122635 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 74123554 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 74126276 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74126812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74126907 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74127341 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74127550 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74127780 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74128299 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74130755 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74131279 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74132420 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 74133363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74133748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74134583 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 74135291 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 74138353 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 74140202 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74140704 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 74140823 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74140832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74141440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74141977 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74142311 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74143397 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 74143635 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 74143641 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 74143795 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 74143913 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 74143918 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 74144022 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74144047 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 74144144 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74144160 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 74144246 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 74144310 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 74144364 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 74144406 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 74144428 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 74144589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74144594 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 74144603 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 74144622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74144683 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74144750 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74144884 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74144967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74145063 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74145240 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 74145394 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 74145415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74145427 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74145558 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 74145625 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74145649 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 74145692 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74145713 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 74145899 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 74145982 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 74146084 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 74146118 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 74146300 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74146570 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74146638 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74146706 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74146827 G A N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 74146966 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 74146999 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 74147100 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 74147172 A T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 74147605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74148261 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74149572 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74150235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74150705 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74151237 A C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 74151272 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 74151622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74151646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74151736 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 74151742 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 74152157 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 74152162 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 74152238 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 74152284 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 74152485 A T Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 74152648 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 74152705 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 74152727 C A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 74152754 C T Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 74152901 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 74153009 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 74153022 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 74153106 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 74153133 T G Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 74153263 C T Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 74153379 C A Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 74153425 A C Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 74153451 C T Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 74153539 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 74153761 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 74153778 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 74153887 C T Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 74153909 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 74154488 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 74154601 G A Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 74154627 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 74155662 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74155699 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74155771 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74156744 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 74157183 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74157482 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74157865 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74158014 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74158027 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74158206 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 74158634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74159332 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 74159433 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74159534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74160137 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 3 74160502 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 74160820 G A Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 74161038 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 74161265 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74161468 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74161583 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74161621 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74161716 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74162158 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 74162339 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74162590 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74162601 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74162806 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74162967 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74163353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74163443 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74164246 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74164561 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74164579 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 74164706 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 74164765 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 74164825 C A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 74164845 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74165114 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 74165236 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 74165287 A T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 74165290 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 74165298 C A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 74165344 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 74165373 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 74165375 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 74165718 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 74165820 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 74165942 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74165961 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74165964 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74166138 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74166473 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74166908 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 74167149 G A N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 74167200 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 74167244 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 74167419 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 74167758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74167928 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74168099 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74168244 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74168342 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74168941 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 74170282 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74170364 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74170368 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74172008 A G Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 74172138 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74172660 T C Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 74172733 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 74172840 G T N N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 74173029 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74173328 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 74173457 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 74173705 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 74173925 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74174623 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74174960 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74175106 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 74175159 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74176567 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74177041 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 74177199 A G N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 3 74177231 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 74177549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74177580 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74177581 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74177897 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74178101 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74178291 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74178456 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 74178512 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 74178569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74178730 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74178776 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 74179135 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 74179155 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74179220 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 74179228 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 74179285 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 74179303 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 74179308 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 74179373 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 74179473 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 74179553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74179588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74179809 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74179867 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74179899 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74180103 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 74180122 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74180249 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 74180310 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 74180320 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74180521 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 74180570 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 74180676 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74180810 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 74180859 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 74180904 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 74180927 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 74181196 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 74181205 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 74181355 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74181360 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74181389 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74181408 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 74181504 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74181539 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 74181661 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 74181754 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74181758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74181814 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74181859 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74181977 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74182018 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74182020 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74182157 C T Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 74182317 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74182513 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 74182518 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 74182590 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 74182643 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74182705 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74182711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74182725 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 74182751 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 74182791 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 74182805 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 74182925 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 74182946 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74183133 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 74183154 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 74183177 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 74183199 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 74183215 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 74183227 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74183328 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 74183367 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 74183427 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74183637 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 3 74183654 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 74183742 A C N N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 3 74183751 T G N N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 3 74183756 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 74183822 C T N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 3 74183922 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 74183975 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 74184029 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74184102 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 74184214 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74184328 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 74184377 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 74184416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74184460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74184519 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74184530 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74184555 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74184625 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 74184688 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 74184704 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 74184729 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 74184748 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 74184771 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 74184806 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 74184863 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 74184892 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 74184897 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 74184944 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 74184952 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 74184963 C A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 74184984 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 74185089 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 74185493 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 74185663 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74185764 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 74185802 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 74185805 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 74185830 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 74185860 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 74185867 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 74186187 G C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 74186213 G T Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 74186283 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 74186334 C T N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 15 5 7 1 2 3 74186376 A T N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 74186412 C T N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 3 74186427 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 3 74186428 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 3 74186455 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 74186456 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 74186771 A C N N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 3 74186817 T C N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 3 74186839 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 74187497 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 74187509 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 74187527 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 74187552 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 74187589 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 74187634 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74187725 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 74187875 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 74187883 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 74187905 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 74188027 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 74188047 A T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 3 74188163 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 74188277 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 74188326 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 74188359 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 74188382 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 74188414 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 74188481 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 74188519 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 74188593 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 74188655 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 74188700 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 74188743 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 74188844 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74188861 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 74188876 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74188940 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 74188982 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 74188995 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74189107 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74189224 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74189253 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74189357 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74189387 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74189450 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 74189536 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74189547 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 74189609 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 74189625 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74189627 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74189843 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74190066 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74190452 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74190653 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 74191331 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74191563 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74191682 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74192199 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74192245 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74192246 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74192351 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74192398 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74192688 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74192708 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74192961 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74193649 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74194026 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74195712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74195720 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74196022 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74196226 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74196880 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 74196895 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 74196907 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 74196999 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74197001 A C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74197947 A G Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 74199544 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74200029 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74200619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74202369 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74203313 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74205153 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74205538 A C N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 74205596 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74205697 T A Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 74206378 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74206552 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74208164 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74209161 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74210490 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 74212021 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 74212531 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74212723 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74213157 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74213837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74214207 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 74214729 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74216029 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74217664 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 74218247 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74219257 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74219362 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74219827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74220175 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74220560 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74220618 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74223103 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74223114 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74225148 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74225173 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 74226015 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74226431 G T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 74226538 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74226737 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 74227527 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 74227997 C A Y N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 74228699 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74228875 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74229033 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 74230115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74230149 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74231559 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 74232840 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74233429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74233443 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74233447 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74234371 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74234376 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74235654 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74236329 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74236452 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74237009 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 74238311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74238700 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74238776 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74239119 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74239644 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74247832 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74248129 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 74248298 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74248693 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74248908 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74249042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74251259 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 74252118 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74252256 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74252287 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74253225 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74253712 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74253763 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74254240 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74255446 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74265493 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 74266797 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74267470 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74268467 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74268794 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74269318 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74269371 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 74270658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74270659 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74270720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74272015 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74272020 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74272207 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 74283845 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 74284116 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 74284255 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 74284344 C A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 74285607 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74288210 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74291361 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74293738 A G Y Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 74293971 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 74294372 G T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 74294747 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74295153 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 74295462 A C Y N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 3 74295499 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74296754 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 74297088 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 74297152 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74297326 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74298937 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74299492 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74299989 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74300206 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74300403 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 74300594 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74300661 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74302217 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74302373 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74302612 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74302691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74303247 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74303965 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74304724 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74305031 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74305678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74305731 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74306220 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74306513 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 74308995 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74309054 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74309232 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74309571 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74309647 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 74309774 A T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 74309980 T G N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 74310581 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74310829 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74310986 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74311147 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 74311286 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74311309 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74311417 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74311831 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74311854 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74311983 C A Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 74312007 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 74312055 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 74312056 G A N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.181818181818182 0.545454545454545 0.272727272727273 10 12 2 6 3 3 74312087 G A Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 74312410 G C N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 3 74313203 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74313279 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 74313312 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74313443 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 74313576 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 74313803 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 74313954 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 74314019 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74314156 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 74314381 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 74314442 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 74314507 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 74314607 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 74314634 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 74314694 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 74314767 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 74314826 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 74314869 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 74314947 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74314961 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 74314998 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 74315058 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 74315153 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 74315174 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 74315246 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 74315253 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 74315257 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 74315274 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 74315278 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 74315316 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 74315354 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74315362 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 74315440 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 74315503 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 74315599 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 74315601 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74315627 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74315735 A G N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 74315738 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 74315757 A T N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 3 74315781 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 74315846 C G N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 74315871 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 74316016 A T N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 3 74316023 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 74316075 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 74316131 G T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 74316262 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 74316344 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 74316370 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 74316466 G A Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 74316643 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 74316685 C A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 74316726 G C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 74316770 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 74316804 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 74316852 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 74316897 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74317016 A C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 74317057 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 74317093 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 74317235 C A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 74317385 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 74317388 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 74317408 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 74317423 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 74317505 C G N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 74317518 C A N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 74317598 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74317655 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74317658 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74317679 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 74317871 T A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 74318324 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 74318383 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 74318393 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 74318683 G T N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 74318684 G A N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 74318717 A C N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 3 74318929 G A N Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 3 74319018 A T N N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 14 6 6 2 2 3 74319192 A G N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 3 74319858 G T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 74319948 A G N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 74320178 G C N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 74320184 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 74320402 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74320551 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 74320605 A C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 74320666 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74320676 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74320769 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74320866 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 74321028 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74321097 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74321250 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 74321353 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 74321372 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74321411 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74321417 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 74321520 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74321651 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 74321667 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74321700 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74321936 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 74321977 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74322133 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74322229 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74322240 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74322241 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74322343 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74322372 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74322419 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 74322452 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74322617 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74322626 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74322758 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 74322867 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 74322904 T A N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 74323040 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 74323104 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 74323131 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 74323388 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 74323404 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 74323425 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 74323461 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 74323587 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 74323669 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 74323841 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 74323919 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74324254 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74324300 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 74324318 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74324441 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74324463 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74324475 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74324535 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 74324550 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 74324653 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 74324739 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 74324813 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 74324849 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 74324907 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 74324987 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 74324991 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 74325180 C A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 74325399 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 74325537 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 74325575 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 74325580 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74326590 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74327769 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74329292 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74329465 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74329738 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74329778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74331916 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74332167 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74332468 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0 0.842105263157895 0.157894736842105 16 22 0 16 3 3 74332709 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74332732 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74332770 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74332803 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 74332875 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 74332876 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 74332896 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74333156 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74333180 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74333540 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74333614 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 74333911 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74334027 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74334449 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 74334656 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74334682 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74335332 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74335784 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74335805 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74336011 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74336313 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74336798 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74337214 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 74337603 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74337655 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 74337696 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74337756 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74338219 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 74338419 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74338484 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 74338917 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 74338935 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 74339174 T A N N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.363636363636364 0.545454545454545 0.0909090909090909 14 8 4 6 1 3 74339201 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 74339327 C T Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 74339486 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 74339597 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74339968 C G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 74340196 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 74340328 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74340392 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 74340492 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 74340685 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74340761 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 74341151 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 74341159 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 74341265 A C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 74341770 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74341777 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74341788 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 74341817 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74342028 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 74342342 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 74342434 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 74342836 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74342938 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74343071 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 74343296 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 74343321 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 74343322 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 74343419 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 74343617 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 74343783 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 74343831 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 74343928 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 74343929 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 74344104 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 74344113 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 74344166 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 74344214 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 74344235 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 74344300 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 74344410 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 74344650 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 74344675 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 74344707 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 74344776 C G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 74344897 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 74344966 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74344984 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74345024 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74345036 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74345121 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 74345170 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 74345676 A G Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 74345721 T C Y Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.2 0.8 0 6 4 1 4 0 3 74346498 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 74346656 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 74346657 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 74346739 A T N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 74346973 T A N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.384615384615385 0.538461538461538 0.0769230769230769 17 9 5 7 1 3 74346974 A G N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 3 74347033 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 74347090 T A N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 3 74347119 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 74347248 T G N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 3 74347269 T A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 74347591 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 74347594 G T N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 74347860 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 74348004 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74349067 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74349084 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 74349200 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74349216 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74350479 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 74350611 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 74351923 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 74352071 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74353562 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 74353764 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74353821 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74353935 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74353936 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74355005 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74355537 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74356203 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74356352 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 74357951 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74358514 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74359144 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74359204 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74359373 A G Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 74359390 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 74365773 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74366076 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 74366106 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 3 74367909 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74368182 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74369209 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 74369264 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 74370382 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74370409 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74370459 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74370694 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74371376 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74372955 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 74373059 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 74374114 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 74374249 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74374261 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74374684 C G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 74375184 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74377174 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74378630 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74378721 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 74378840 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 74379365 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74379413 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74379686 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74379687 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74379779 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74380510 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74381684 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 74381707 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74381795 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74381894 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74382127 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74382850 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 74383537 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74383956 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74384829 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74385310 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 74385421 A C N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 74392057 T A N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 74392142 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74393042 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74393409 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 74393580 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74393977 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74394443 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74402463 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 74403151 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74403163 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74403388 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74403664 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74403783 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74404478 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74405030 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74405318 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74407451 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74409613 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74410200 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74410611 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 74411457 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74412291 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 74413046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74415336 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74415615 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74418761 A C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 74418962 G C Y N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 74419734 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74420282 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74421039 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74421632 G C N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 74422127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74422816 A G N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0 0.545454545454545 0.454545454545455 6 16 0 6 5 3 74422827 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 74427383 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 74427437 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74428067 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 74428085 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74429178 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74429288 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74429913 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74430374 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74430782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74430801 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74431475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74431850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74432032 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74432299 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74432898 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 74435874 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74437435 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74437476 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74437509 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74437551 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74438709 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74438987 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74439381 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74439575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74440121 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74440190 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74440375 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74442281 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74442316 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74442384 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74442786 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 74443048 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74443642 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 74444433 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74444784 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74445282 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74445435 A G Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 74445637 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74445694 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74446023 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74446328 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74446400 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74446597 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74447656 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74449850 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74450000 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74451009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74454733 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74455165 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74456029 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74456138 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74457742 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74457904 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74458145 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74460053 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 74460234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74460242 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74460508 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74460923 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74461412 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 74461418 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 74461945 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 74463351 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 74463518 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74463635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74463782 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74463916 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74464035 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74464133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74464176 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74464527 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74465204 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74465500 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 74466050 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74466723 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74467261 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 74467725 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74468163 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74468678 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74469183 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74473207 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74477709 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74478100 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74480127 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74480438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74480749 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74480956 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74481605 G C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 74481874 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74482084 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74482962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74483499 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 74483519 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74483875 A G Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 74483998 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74484208 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74485018 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 74485121 G T Y N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 8 8 2 4 2 3 74486892 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74487511 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74487838 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74488093 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 74488220 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74488240 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74488258 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74489415 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74490806 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74492170 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 74492240 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74492300 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74492420 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74492752 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 74493158 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74493286 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74493568 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 74493708 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 74493995 G C Y N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 74494306 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 74494607 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74495252 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74495953 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74496044 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74496067 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74496177 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74496241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74496816 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74497486 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74498065 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74498336 G C Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 74498466 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 74498646 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74499103 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74499164 C T N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 3 74499349 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74499438 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 74499495 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 74501477 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74501804 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74501898 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74502291 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74502441 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74503405 T G N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 74503641 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74503678 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74503922 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74504249 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 74504273 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74504574 A T N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 74504592 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 74504645 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 74504765 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 74504839 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 74504879 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 74504892 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74505011 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74505025 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74505028 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 74505094 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 74505149 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 74505171 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 74505322 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74505761 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 74505776 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 74505856 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 74505889 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 74505899 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 74505992 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 74506036 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 74506065 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 74506150 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 74506280 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74506315 G T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 74506348 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 74506812 G T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 74506962 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 74507072 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 74507277 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74507286 T A N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 74507344 T C N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 3 74507388 C A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 74507401 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 74507455 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74507486 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 74507535 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74507549 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 74507657 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 74507720 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 74507814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74508096 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 74508109 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 74508278 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 74508331 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 74508339 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 74508380 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74508418 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 74508708 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 74508723 T G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 74508749 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 74508792 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74508796 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74508897 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74509312 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 74509329 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 74509346 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74509481 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 74509638 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 74510032 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74510323 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 74510362 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74510382 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 74510553 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74510788 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74510806 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 74510829 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74510894 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 74510911 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74510985 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 74511118 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74511153 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 74511345 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 74511423 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 74511432 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 74511459 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 74511537 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 74511571 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 74511669 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 74511695 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74511859 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 74511939 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 74511948 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74512024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74512056 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 74512149 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 74512456 G T N N 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 9 11 2 5 3 3 74512502 T C N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 3 74512603 G A N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 3 74512711 T G N N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 3 74512795 C T N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.181818181818182 0.636363636363636 0.181818181818182 11 11 2 7 2 3 74512906 A T N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.153846153846154 0.615384615384615 0.230769230769231 12 14 2 8 3 3 74512941 G T N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 3 74513003 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 74513027 A C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 74513109 C A Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 74513142 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 74513330 C A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 74513413 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74513541 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 74513779 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 74513783 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 74513797 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 74513856 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 74513944 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 74513967 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 74514072 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 74514089 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 74514094 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 74514138 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 74514150 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 74514263 T G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 74514277 A G N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 74514422 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74514423 G A N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 3 74514699 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 74514715 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 74514760 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 74514829 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 74514880 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74515017 A T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 74515046 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 74515070 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 74515263 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 74515264 C G N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 74515278 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74515286 G T N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 74515345 C A N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 74515390 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 74515472 T A N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 74515547 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74515578 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 74515691 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 74515729 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 74516202 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74516273 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74516286 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74516293 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74516348 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 74516371 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 74516532 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 74516603 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 74516624 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 74516665 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 74516736 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 74516760 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 74516773 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 74516874 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 74517024 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74517086 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 74517166 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74517195 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74517252 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74517272 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74517273 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74519339 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74520599 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74522043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74522781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74523779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74524059 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74525126 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74525269 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74525831 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 74526586 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74526813 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74527233 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74527343 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74527638 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74527999 T C Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 74528013 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 74529015 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 74529059 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74530099 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74530418 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74530490 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74531719 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74532045 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74532494 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74532729 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74532951 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74533175 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74533338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74533480 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74533830 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74534224 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74535751 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74537162 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74537610 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74537613 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74538721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74539027 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74539264 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74539427 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74539434 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74539467 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74539568 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74539977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74539989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74540069 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74540441 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74540568 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74540889 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74540898 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74541007 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74542042 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74542114 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74542478 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74542558 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74542806 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74542872 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74542957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74543289 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74543697 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74544147 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74544510 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74544540 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74544991 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74545239 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74545651 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74546416 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 74547640 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 74547799 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74547882 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74547901 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74548659 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 74549313 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74549580 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74549812 T G N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 74549913 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 74550753 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 74551739 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74552088 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74552744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74553590 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 74554397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74559386 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74560539 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74560591 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74560806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74560960 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74561005 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74561137 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74561513 C G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 74562449 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 74562454 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 74562861 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74562883 G T N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 74569930 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74570122 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74570170 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 74570601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74570650 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74571174 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74571877 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74572337 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74572743 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74573101 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74574135 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74574926 G A N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.230769230769231 0.538461538461538 0.230769230769231 13 13 3 7 3 3 74575087 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74575097 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74575299 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 74576602 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 74576953 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74577576 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 74578065 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74578354 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74578399 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 74578405 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74578424 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74578527 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74578605 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74579172 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74579777 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74580303 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74581027 G C N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 3 74581034 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 74581170 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74581296 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74581318 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 74581612 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74582697 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74583241 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74583999 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74584000 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74584284 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74584739 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74584893 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74584981 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74585045 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74585115 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 74585542 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 74587204 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74587244 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74588719 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74589633 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74590368 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74591411 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74592628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74592976 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 74594185 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74594363 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74594416 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 74595530 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 74595992 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 74596231 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 74596751 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74596969 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74597298 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74597391 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74597549 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74598019 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 74599692 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74600299 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 74600630 A T N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 74600721 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 74601876 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74602277 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74603688 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74605838 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74606012 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74606835 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74606919 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74607671 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74607968 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74609277 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74609928 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 74610373 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 74610576 T C N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 74610664 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74611235 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 74611297 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74611305 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 74611755 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 74612141 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 74612450 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 74612567 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74612610 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 74612642 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 74612833 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 74612834 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 74612844 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 74612938 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 74612999 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 74613033 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 74613037 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 74613045 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 74613103 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74613184 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 74613189 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 74613236 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 74613395 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 74613686 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 74613736 C A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 74613957 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 74614231 A T N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 74614294 A G N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 74614461 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 74614509 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 74614526 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 74614625 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 74614652 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 74614753 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 74614804 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74614857 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 74614961 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 74615040 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 74615048 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 74615140 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 74615150 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 74615436 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74615558 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74616177 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 74617131 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74617233 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74617270 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74617294 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74617717 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74617751 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 74618149 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74618306 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 74618780 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74619088 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 74620201 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 74621146 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74623504 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74623935 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74624352 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74624398 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74624490 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74624716 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74626323 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 74626882 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 74627712 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 74628112 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 74628693 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 74628826 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74629109 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74629575 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74629667 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 74630109 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74630690 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74630896 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74630976 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74631212 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74632177 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74632399 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74632518 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74632525 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74632694 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74634588 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 74634753 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74634769 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74634975 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 74634981 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 74635058 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 74635257 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 74635349 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 74635391 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 74635394 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 74635472 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 74635650 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 74635753 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 74635848 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 74635853 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 74635994 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 74636079 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 74636092 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 74636098 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 74636179 T G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 74636231 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 74636257 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 74636261 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 74636280 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 74636295 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 74636403 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 74636404 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 74636449 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 74636487 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 74636528 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 74636561 G A N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 74636604 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 74636625 C G N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 74636638 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 74637310 T C N Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 3 74637602 G T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 74638169 T G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 74645215 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 74645478 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74645755 T C N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.307692307692308 0.538461538461538 0.153846153846154 15 11 4 7 2 3 74645838 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 74646400 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 74646448 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74647081 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 74647168 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 74647585 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 3 74647850 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 74648297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74648498 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 74649205 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 74649314 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 74649460 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 74649487 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 74649499 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 74649610 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 74649677 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 74649751 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74649805 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 74649890 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 74649981 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 74650044 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 74650294 C A N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 74650459 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 74650697 A C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 74650708 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 74651193 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 74652011 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 74652191 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 74652210 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 74652416 C G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 74652436 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 74652454 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 74652622 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 74653097 T A N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 3 74653147 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 74653183 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 74653281 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 74653554 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 74653670 G T N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 3 74653837 G A N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 3 74653883 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 3 74653912 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 74654074 C A N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 74654384 G T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 74654769 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 74655517 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 74655528 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 74655560 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 74655661 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 74655667 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 74655746 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 74655890 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 74656153 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 74656516 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74656600 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74656745 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 74657048 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 74657797 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 74657862 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 74658335 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 74658732 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74658867 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 74659000 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 74659001 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 74660644 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 74661511 A G Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 74661973 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 74662216 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 74662236 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 74662282 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 74662374 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 74662452 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 74662543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74662585 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 74662704 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 74662722 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 74662751 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 74662796 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 74663127 T A N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 3 74663750 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74663791 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 74663920 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74663964 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 74664231 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74664338 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 3 74664396 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 74664604 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 74664779 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74664789 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74664841 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74664922 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 74665359 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 74665569 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 74665620 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 74665976 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 74666199 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 74666319 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74666368 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74666385 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74666596 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 74667152 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 74667502 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 74667649 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 3 74667875 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74667914 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 74668078 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 74668242 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 74668384 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 74668788 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74668916 T G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 74668917 T G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 74668949 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 74669023 T C N Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 3 74675151 C G N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 3 74675250 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74675322 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74675400 T G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 74675460 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74675464 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 74675589 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 74676039 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74676654 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 74676778 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 74677711 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74677801 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74677809 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74677887 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 74678213 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 74678310 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74678623 T C N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.181818181818182 0.454545454545455 0.363636363636364 9 13 2 5 4 3 74678960 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 74679434 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 74686038 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74686247 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74686264 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 74686303 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74686814 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74686826 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 74686889 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74687262 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 74687275 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 74687345 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74687498 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74687506 A T N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 3 74687737 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74687856 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 74688057 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 74688059 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 74688136 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74688146 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74688418 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74688499 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 74688941 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 74688947 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 74688999 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 74689128 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 74689403 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 74689528 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74689547 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74689696 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 74689727 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 74690014 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74690027 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74690190 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74690199 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74690730 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74690745 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 74690772 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 74691011 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 74691238 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 74691273 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 74691275 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 74691608 C G Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 74692533 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 74692534 A G Y Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 74692807 G A Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 74693157 A T Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 74693200 A C Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 74693314 T G Y N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 74693400 C G Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 74693427 C A Y N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 74694231 A T Y N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 3 74694715 A T Y N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 74695446 A G Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 74695512 A G Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 74695527 G A Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 3 74696967 A G Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 74697159 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 3 74697488 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 74697535 C A Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 74697576 C A Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 74697591 C T Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 74697632 A C Y N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 3 74697660 A G Y Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.133333333333333 0.6 0.266666666666667 13 17 2 9 4 3 74697841 C A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74697949 T A Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 74698446 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74698521 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74698538 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 74698849 T A Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 74698945 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 74698973 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 74699005 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 74699111 G A N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 74699170 T C Y Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 3 74699246 A C Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 74699400 G A Y Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 3 74699422 T C Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 74699583 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 74699908 G T Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 74700006 C T Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 74700069 T G Y N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.636363636363636 0.181818181818182 0.181818181818182 16 6 7 2 2 3 74700227 C A Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 74700326 C T Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 74700434 A T Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 74700692 G A Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 74700796 G T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 74701416 A C Y N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 74701677 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 74701803 T G Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 74701861 T A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74701884 A C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74702217 A G Y Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 74702277 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 3 74703139 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 74703248 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74703251 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 74703311 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 74703376 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74703736 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74704163 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 74704419 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74704613 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 74705552 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74705797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74706621 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74706769 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74708059 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74708184 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74708210 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 74708800 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 74708808 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 74709028 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74709087 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74709426 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 74709465 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 74709736 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 74709812 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 74710132 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 74710170 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74710196 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 74710256 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74710464 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 74710493 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 3 74710525 A T N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 3 74710574 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 74710597 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 74710613 C A N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.133333333333333 0.6 0.266666666666667 13 17 2 9 4 3 74710786 T G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 74710795 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 74710937 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 74711283 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 74711346 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 74711457 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74711479 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 74711542 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 74711769 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74711821 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 74712160 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 3 74712833 A T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 74713280 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 74713298 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 74713384 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 74713481 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 74713553 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 74713611 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 74713626 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 74713843 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 74713974 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 74714025 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 74714274 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 74714311 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 74714363 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 74714618 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 74714807 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 74714946 G A N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 3 74715097 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 74715155 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 74715189 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 74715193 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 74715360 C G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 74715407 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 74715609 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 74715614 T C Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 74715747 A C Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 74715888 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 74715986 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 74716253 A C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 74716545 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74716633 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 74716643 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 74716745 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 74716990 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 74717014 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 74717030 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 74717044 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 74717093 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 3 74717118 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 74717137 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 74717152 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 74717170 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 74717231 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 74717359 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74717558 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 74717573 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 74717680 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 74717775 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 74718466 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 74718532 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 74718694 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 74718745 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 74718849 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 74719279 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 74719328 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 74719705 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74719727 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 74719747 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 74719772 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 74719806 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74720149 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74721169 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74722075 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 74722398 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 74723367 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74723393 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74723439 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74726028 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 74726040 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74726103 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74726208 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 74726341 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74726359 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74726375 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74727539 C T Y Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 74727797 A G Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 74728201 A G Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 74728209 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74729022 A T Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 74729120 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74729337 G T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 74730032 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 74730060 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74730397 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 74730600 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74731185 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 74731247 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 74731319 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 74731381 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 74731392 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 74731440 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 74731819 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74732053 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 74732073 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74732206 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 74732215 G T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 74732534 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74732636 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 74732681 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 74732999 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74733026 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74733146 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 74733335 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74733850 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74733864 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 74733963 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74733969 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 74734001 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74734009 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 74734332 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 74734336 G C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 74734508 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 74734582 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 74734704 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 74734728 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 74735096 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74735170 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 74735603 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 74735626 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 74735723 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74735892 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74735896 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 74736124 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 74736172 A C N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 74736220 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 74736242 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 74736416 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 74736420 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 74736715 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 74736765 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74736850 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74737094 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74737108 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 74737181 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74737484 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74737852 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 74738243 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74738449 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 74739316 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 74739843 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74740183 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 74740278 C G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 74740496 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 74740740 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74741268 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74741321 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74741347 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 74741453 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 74741651 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 74741859 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.2 0.75 0.05 23 17 4 15 1 3 74742143 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74742236 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74742269 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74742395 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74743077 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 74743511 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74743514 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74744028 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 74744234 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 74744731 T A N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 74744799 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 74745012 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 74745048 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 74745114 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 74745222 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 74745299 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 74745323 T A N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 3 74745326 G A N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 3 74745336 T G N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 3 74745384 T C N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 3 74745410 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 11 7 3 5 1 3 74745634 G A Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 74745690 A G Y Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.307692307692308 0.538461538461538 0.153846153846154 15 11 4 7 2 3 74745749 G C Y N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.133333333333333 0.666666666666667 0.2 14 16 2 10 3 3 74745872 T C Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 74745950 C T Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 3 74746065 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 3 74746094 G C Y N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 3 74746371 G C Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 74746952 C T Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 74747002 G T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 74747092 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 74747193 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 74747217 G T Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 74747422 G T Y N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 74747468 C A Y N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 74747469 A G Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 74747479 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 74747487 T G N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 3 74747530 C A Y N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.454545454545455 0.454545454545455 0.0909090909090909 15 7 5 5 1 3 74747690 C A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 3 74747705 T A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 3 74747723 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 74747801 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 74747821 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 74747839 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 74747858 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 74747876 C T Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 74747950 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74748006 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 74748062 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 74748070 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 74748127 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 74748301 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 74748315 T G N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 3 74748384 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74748563 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 74748656 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 3 74748678 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74749323 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 74749362 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 74749377 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 74749393 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74749424 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 74749432 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 74749459 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 74749623 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 74749655 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 74749674 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74749688 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 74749738 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 74749801 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 74749808 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 74749822 A C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 74749873 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 74749890 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74749919 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 74749943 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 74749964 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 74749979 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 74750033 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 74750057 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74750116 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 74750151 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 74750159 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 74750174 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 74750205 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 74750318 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74750474 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 74750495 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 74750507 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 74750536 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 74750590 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 74750603 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74750605 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 74750880 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 74750881 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 74750920 C G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 74751026 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74751043 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 74751092 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74751103 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 74751134 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 74751183 C G N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 10 22 0 10 6 3 74751186 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 3 74751241 T G N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.2 0.666666666666667 0.133333333333333 16 14 3 10 2 3 74751257 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 74751337 A T N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 3 74751415 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 74751452 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74751488 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 3 74751534 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 74751609 T A Y N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 3 74751612 T C N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 3 74751636 T A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 74751863 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 74751937 C G Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 74751947 T A Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 74751951 A G Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 74752084 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 74752295 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 74752296 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 74752517 A G Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 74752524 A T Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 74752566 C A Y N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 3 74752585 T G Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 74752601 G C Y N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.384615384615385 0.538461538461538 0.0769230769230769 17 9 5 7 1 3 74752629 C A Y N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 3 74752666 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 74752719 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 74752747 C G Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 74752759 A T Y N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 3 74752797 C A Y N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.333333333333333 0.583333333333333 0.0833333333333333 15 9 4 7 1 3 74752816 T C Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.333333333333333 0.6 0.0666666666666667 19 11 5 9 1 3 74752885 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 74752904 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 74752922 G T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.3125 0.625 0.0625 20 12 5 10 1 3 74753103 A T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 3 74753116 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 74753117 C T Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 74753170 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 74753185 G C Y N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 74753251 A T Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 74753272 T C Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 74753319 C T Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 74753660 G T N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.307692307692308 0.538461538461538 0.153846153846154 15 11 4 7 2 3 74753678 T C Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 3 74753707 G A Y Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 3 74753760 T G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 3 74753802 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 74753815 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74753865 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 74753979 T A Y N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.333333333333333 0.6 0.0666666666666667 19 11 5 9 1 3 74754008 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 3 74754031 A T N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.384615384615385 0.538461538461538 0.0769230769230769 17 9 5 7 1 3 74754114 T C Y Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 74754129 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 74754136 G T Y N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 74754262 G C N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 74754318 T G Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 74754346 G C Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 74754376 G C N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.333333333333333 0.6 0.0666666666666667 19 11 5 9 1 3 74754589 C T Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 74754593 T C Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 74754809 T G Y N 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.2 0.8 0 12 8 2 8 0 3 74755019 T G Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 74755122 C G Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 74755353 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 74755380 C T N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 74755403 T A Y N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 74755408 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 74755507 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 3 74755561 T C N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 3 74755578 T C Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 74755669 G C Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 74755771 C A Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 74755790 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 74755818 T G Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 74755922 A T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 74755931 A G Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 74755955 G C Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 74755992 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74756041 T C Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 74756053 C A Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 74756080 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 74756118 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 74756124 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74756178 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 74756190 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 74756253 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 74756275 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 74756310 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 74756347 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 74756395 G A N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 3 74756396 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 3 74756535 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 74756545 C G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 74756622 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 3 74756753 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 74756766 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 74756783 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 74756802 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74757121 G T N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.230769230769231 0.538461538461538 0.230769230769231 13 13 3 7 3 3 74757125 C T N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 3 74757182 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 74757290 C T N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.0909090909090909 0.636363636363636 0.272727272727273 9 13 1 7 3 3 74757310 C T N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 3 74757314 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 74757413 A T N N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 9 9 2 5 2 3 74757447 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 8 10 2 4 3 3 74757558 C T N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0 0.636363636363636 0.363636363636364 7 15 0 7 4 3 74757587 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 74757592 G T N N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 3 74757598 A T N N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 3 74757777 T C N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 3 74757940 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 74757944 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74758097 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 74758111 A G Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.176470588235294 0.764705882352941 0.0588235294117647 19 15 3 13 1 3 74758290 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 74758323 G T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 74758543 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 3 74758581 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74758813 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 74759048 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 74759071 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 74759100 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 74759310 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 74759379 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 3 74759550 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 74759611 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74759625 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 74759644 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 74759864 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 74759948 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 74759969 T A N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 3 74759984 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 74760011 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 74760027 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74761067 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 74761107 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 74761393 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 3 74761712 T A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.1875 0.6875 0.125 17 15 3 11 2 3 74761757 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74761790 G T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 74761799 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74761874 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74762153 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 74762160 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74762270 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 74762349 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 74762424 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74762435 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 74762468 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 74762545 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 74762576 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 74762609 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 74762628 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 74762803 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 74762897 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 74763042 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 74763136 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 74763155 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 74763189 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 74763281 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74763516 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 74763559 G C N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 74763565 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 74763576 A T N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 74763589 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 74764860 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 74764989 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 74765091 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 74765404 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 74765426 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 74765489 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 74765491 A T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 74765517 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 74765638 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 74765784 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74765871 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 74766106 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 74766108 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74766165 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74766289 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 74766514 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 74766561 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 74766575 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 74766769 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 74766892 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 74766965 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74767729 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 74768211 A C Y N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 3 74768288 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 14 10 4 6 2 3 74768336 G A Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 74768563 T A Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 3 74769222 G A Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.2 0.666666666666667 0.133333333333333 16 14 3 10 2 3 74769614 A C Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 74770557 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74770599 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74770690 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 74771110 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74771297 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 74771673 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74771720 C A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 74771834 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 74771893 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74771944 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 74772180 T G Y N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 3 74772459 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 74773026 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 74773161 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 74773191 C T Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 74773404 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74774606 C A Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 74775299 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74775356 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74775408 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74778278 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74778749 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 74779173 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74779945 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 74780889 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 74781197 G A N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 3 74781295 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74781370 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 74781980 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74782097 A G Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 74782247 G A Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 3 74782293 C T Y Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 74782466 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 74782497 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74783003 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74783164 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74783494 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 74783522 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 74783719 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74783932 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74783949 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74784190 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 74784505 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 74784529 C T N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 3 74785173 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 74785262 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 74785482 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 74785712 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 74785897 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74785899 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 74786046 G C N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 74786538 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74787000 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74787131 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74787659 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74787881 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74788000 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74788048 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74788243 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74788467 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 74788524 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74788550 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74788997 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 74789338 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74790320 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74790375 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74790523 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 74790637 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74790640 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74790830 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74791055 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 74791056 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 74791094 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 74791515 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 74792439 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 74792449 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 74792914 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 74793098 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 74793556 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74793722 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 74794253 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 74794395 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74794966 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74795503 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 74795729 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 74795964 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 74796114 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 74796401 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74797255 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74797968 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 74798757 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74799281 G C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 74799740 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74800289 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 74800290 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 74800481 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 74801816 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 74802292 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 74802655 T A Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 74802714 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 74802766 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74802802 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74802819 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 74803384 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74803424 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74803460 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74803481 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 74804143 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 74804439 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 74804471 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74804552 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74804583 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 74804640 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 74804805 T A Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 74804893 C T N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 74805651 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 74805898 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74805999 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 74806547 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74807339 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 3 74808268 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 74808385 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74808474 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 74808517 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 74808621 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74808782 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74808876 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74808879 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74808988 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74809342 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 74809496 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74810186 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74810764 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74810892 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74811018 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74811059 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74811813 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74813032 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74813911 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74814194 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 74817039 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 74817252 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 74817586 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 74818080 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 74818533 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74818660 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 74818858 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74819216 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74820471 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 74821284 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74821285 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74821830 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74821977 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 74822148 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74822514 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74822894 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74823295 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74823439 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74824691 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74824700 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74825532 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74825646 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74825683 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74826314 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 74827848 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74828297 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74828511 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 74829177 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 74830214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74830904 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74832476 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74833209 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74833239 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74833720 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 74836446 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 74839547 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 74842951 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 74845089 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74845293 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74845347 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74845687 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74846290 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 74846493 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 74846673 G C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74847336 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74847978 C G Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 74848316 C A Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 74848380 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74849588 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74849707 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74851364 G C Y N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 74851371 A C Y N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 74851754 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74853835 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74853944 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74854006 T G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 74855962 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 74856115 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74856619 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 74856988 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74857191 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74857323 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 74857870 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 74857992 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 74858108 T G N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 74858496 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 74859185 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 74859327 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 74859425 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 74859437 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74861077 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74862148 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74862353 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74862912 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 74864389 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74864771 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74865814 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74866258 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 74866670 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 74867523 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74868619 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 74869464 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 74869929 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74870033 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74870194 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74870456 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74870478 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 74870606 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74872486 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74873113 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 74873211 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74873245 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74874514 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74875676 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 74875842 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 74875880 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 74876063 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 74876096 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 74877626 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 74878500 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74878679 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74880290 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74880597 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74880692 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74882348 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74883345 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 74883676 G A Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 74883889 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74884400 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74884667 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74884937 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 74886265 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74886621 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74888079 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 74888405 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 74890162 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74891044 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74891416 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74891417 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74891519 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74894771 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74894950 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74895256 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74895258 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74895493 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74895626 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 74896312 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74896326 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74896697 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 74896963 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74899388 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 74902376 C G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 74907521 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74908112 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74908363 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 74908923 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74910360 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 74910550 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74912007 G A Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 74912979 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 74913540 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 74915931 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 74916122 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 74917732 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74919526 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 74920019 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74920027 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74921098 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 74922405 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 74922451 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 74923035 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 74924277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74924840 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74925646 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 74926228 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 74927296 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 74928094 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 74928371 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 74928405 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 74928878 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74930221 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 74937898 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 74937971 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74940664 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 74942975 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 74942986 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74943077 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 74943303 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 74943312 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 74943352 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 74943366 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 74943763 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 74944391 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 74944421 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 74944430 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 74944577 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74945627 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 74945877 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 74946489 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74948372 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 74952449 A G Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 74953238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74954287 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 74955673 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74957695 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74957741 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74959758 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74962717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74962997 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 74964081 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74964585 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 74964635 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 74966600 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 74970588 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 74974240 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74974337 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 74975011 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74976316 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 74977704 C T Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 74978330 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 74979113 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74984644 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 74986255 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74988592 G A Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 74990667 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74992509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 74993599 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74995896 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 74997769 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75001237 C G Y N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 75002947 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 75003674 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75007544 T G N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 75007926 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75008229 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75008407 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75009077 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75009419 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 75009714 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 75009847 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 75010303 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 75010321 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 75010677 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75010699 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75011478 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75011547 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 75012059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75012148 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 75012186 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75013071 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 75013157 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 75013197 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75013227 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75013565 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 75013647 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75013857 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 75014002 A T N N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 9 5 3 3 1 3 75014101 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 75014188 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 75015427 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75015644 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 75015678 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75015705 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 75016063 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 75016643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75016885 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75017180 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75017320 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75018166 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75018183 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 75018475 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75018647 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75018683 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 75018698 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75018712 C T Y Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 75018927 C A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 75019281 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75019520 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75020484 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 75022294 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 75022592 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 75023045 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 75023069 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 75025588 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75026361 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75026757 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 75026836 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75027376 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75027531 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75027584 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75028277 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 75029406 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75029881 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 75031879 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 75032194 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75032848 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75033274 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75034133 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 75034344 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75034718 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75034771 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 75035392 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75035454 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75035745 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 75035760 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75035820 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75036374 G A N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 3 75036549 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 75036651 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 75036652 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 75036873 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 75036882 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75036892 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 75036893 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 75037054 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 75037056 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 75037191 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 75037218 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 75037236 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 75037306 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 75037345 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 75037393 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 75037404 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 75038003 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 75038159 G T N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 75038201 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 75038243 A T N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 75038344 T A N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 3 75038405 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75038544 G A N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 3 75038588 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 75038937 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 75038959 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75039035 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 75039068 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 75039122 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 75039302 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 75039352 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 75039366 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 75039379 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 75039585 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 75040239 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 75040582 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75041541 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 75041649 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 75041862 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75041881 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 75042353 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 75042555 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75042828 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75042905 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75043617 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 75043952 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 75044119 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 75044127 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 75044354 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75045780 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75045968 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75046756 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75047254 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75047259 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75048013 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75049637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75050020 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75052759 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75053676 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75055292 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75056185 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75059128 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75059517 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75059845 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75059929 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75060071 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75060277 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75060498 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75060555 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75060832 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75061573 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 75061576 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 75061960 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 75062284 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 75062406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75062719 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 75062729 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 75062807 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 75062869 T G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 75062978 C G N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 75063116 T A N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 3 75063235 G C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 75063291 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 75063296 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 75063644 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75063664 C A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 75063897 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 75064025 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 75064026 A C N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 75064066 C G N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 75064067 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 75064111 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 75064181 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 75064252 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 75064301 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 75064374 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 75064400 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75064424 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 75064464 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 75064477 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75064702 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 75064763 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 75064779 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 75064899 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 75065184 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75065258 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 75065352 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 75065361 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 75065441 C G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 75065454 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 75065781 C G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 75065803 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 75065840 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75065974 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 75066088 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75066188 G T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 75066255 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75066306 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 75066338 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75069291 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 75072096 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75072199 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75072258 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75073333 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 75073813 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75074269 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 75074282 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 75076321 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75076814 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75077220 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 75079363 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75079936 A C Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 75081547 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75082841 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75082983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75083655 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75084214 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 75084219 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75084388 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 75084564 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75084854 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 3 75085222 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75085242 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 75085268 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 75085368 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75085691 A C Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 3 75085753 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75091078 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75091114 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75091527 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 75091622 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 75091655 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75091677 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75091826 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75091909 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75092005 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 75092122 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75092306 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75092408 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75092441 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75092455 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75092459 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75092531 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75092585 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75093383 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75093413 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75093553 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 75093893 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75094061 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 75094168 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75094175 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75094499 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 75094521 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 75095008 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 75095312 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75095377 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 75095396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75095397 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 75095410 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 75095630 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75095675 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 75095707 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 75095747 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75095928 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 75096122 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 75096350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75096545 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 75096600 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 75096601 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 75096634 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 75096688 A G N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 75097020 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 75097042 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 75097080 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 75097090 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 75097148 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 75097152 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 75097192 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 75097223 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75097258 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 75097315 G T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 75097358 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75097380 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 75097606 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 75097612 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 75097617 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 75097773 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 75098102 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 75098215 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75098236 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 75098367 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 75098427 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75098479 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75098762 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 75098793 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75098794 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75098820 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 75098861 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 75099204 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75099525 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 75099542 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75099696 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75099901 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 75099940 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75100023 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75100318 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75100631 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 75100652 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 75100737 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 75100738 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75100776 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 75100795 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 75101029 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75101125 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75102035 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75102074 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75102202 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75102214 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 75102504 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 75102569 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 75102605 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75102834 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 75102857 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 75102962 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 75103441 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75103500 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 75103572 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75103811 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75103847 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 75103860 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 75103951 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 75104054 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 75104119 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 75104334 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 75104575 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75104605 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 75104647 A T N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 75104821 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 75105123 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 75105216 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 75105366 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75105376 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75105483 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 75105950 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 75106063 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75106087 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 75106096 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 75106139 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75106181 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 75106348 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 75106461 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 75106512 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75106567 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75106641 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 75106642 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 75106971 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75106993 A G N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 75107014 G A N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 3 75107092 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75107252 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 75107291 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 75107649 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75107966 C T N Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 3 75107969 C T N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 3 75108020 T C N Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 3 75108059 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 75108120 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 75108887 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75108931 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75109133 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75109455 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 75109598 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75110325 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75110366 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75110406 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 75110570 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75112335 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 75112366 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75112457 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75112513 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75112716 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75113015 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75113044 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75113214 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75113692 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75114090 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 75114481 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75114756 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 75115018 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75115516 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 75115657 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75116013 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75116145 G T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 75116222 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 75116326 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 75116419 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 75116828 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75116866 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75116968 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75117158 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75117204 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75117230 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75117262 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75117267 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75117375 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75117697 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75117715 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 75117760 G C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75117893 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75118427 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75118702 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75118705 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75118880 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75119255 A C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 75119546 T G Y N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 75119642 G C Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 75121312 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75121367 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75122008 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75122054 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75123737 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75123943 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75123963 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75123977 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75124002 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75124050 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75124092 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75125001 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75125015 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75125210 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75125283 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75125319 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75125367 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75125374 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75125381 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75125392 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75125845 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75125980 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75126017 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75126037 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75126079 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75126139 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75126355 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75126389 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75126431 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75126512 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75126572 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75126577 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75126638 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75126793 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75127316 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75127418 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 75127497 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75127577 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 75127580 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75127634 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75127750 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75127866 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 75127965 T G N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 75128221 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75128316 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75128430 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 75128493 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75128619 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75128632 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75128754 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 75128820 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75128842 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75128847 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 75128897 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 75129103 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 75129105 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75129191 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75129203 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75129223 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 75129248 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75129254 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75129260 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75129548 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75129643 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75129731 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75129785 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75129909 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75129920 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75129925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75129996 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 75130033 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75130037 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75130050 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75130053 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75130121 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75130213 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75130257 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75130286 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 75130331 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75130552 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75130564 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75130679 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75130781 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75130834 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75130847 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75131163 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75131228 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75131383 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75131387 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75131497 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75131623 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75131634 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75131645 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75131863 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75131870 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 75131976 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75132098 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75132167 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 75132177 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75132214 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 75132289 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75132466 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75132540 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 75132655 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75132674 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75132725 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 75132868 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75132988 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 75133048 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75133330 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75133425 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 75133455 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 75133505 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 75133559 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75133599 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 75133705 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75133751 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 75133759 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75133774 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 75133804 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75134035 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75134050 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75134077 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75134078 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75134088 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75134286 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75134424 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75134457 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 75134461 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 75134574 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75134586 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 75134634 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 75134641 A C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 75134652 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 75134718 A T N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 75134719 A T N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 75135307 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75135348 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75135536 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75135581 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75135625 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75135773 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75135836 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 75135973 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 75136016 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 75136057 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 75136220 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75136238 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75136245 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 75136436 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 75136455 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 3 75136476 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 75136486 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75136493 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75136553 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75136571 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 75136579 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75136617 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 75136647 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75136672 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75136705 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75136751 C T N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 75136963 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 75137190 G A N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 3 75137305 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75137312 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 75137362 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 75137385 T A N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 75137960 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 75137963 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75138356 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 75138707 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 75138896 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 75139203 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 75139881 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75139888 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 75139950 C G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 75140103 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 75140357 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75140411 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75140767 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 75140842 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75140915 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75140936 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 75140957 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 75140965 T A Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 3 75141265 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75141563 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75141663 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 75141714 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75142038 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75142362 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 75142448 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75142568 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75143089 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75143117 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75143232 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75143272 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75143521 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75143567 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 75143579 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75143612 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75143622 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 75143833 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75143869 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 75143917 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 75143950 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 75143953 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 75144083 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75144098 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75144164 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 75144230 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75144399 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 75144415 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 75144426 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 75144467 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 75144492 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 75144662 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 75144733 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75144751 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75144883 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75145018 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75145132 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75145179 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75145358 C G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 75145385 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 75145410 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 75145522 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 75145742 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75145866 T A N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 75146018 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 75146043 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 75146222 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 75146428 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 75146464 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75146467 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 75146512 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 75146516 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 75146532 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75146594 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75146605 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 75146742 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 75146751 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 75146769 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 75146931 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 75146989 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75147016 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75147077 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75147123 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 75147185 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75147203 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75147299 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75147368 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 75147434 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 75147863 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 75147931 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 75147980 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75147999 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75148152 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 75148211 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75148215 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 75148282 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 75148301 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 75148440 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 75148513 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75148546 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75148563 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75148587 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 75148637 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 75148681 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75148736 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 75148740 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 75148789 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 75148823 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75148933 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 75149046 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75149124 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75149234 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75149256 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75149338 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75149366 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 75149376 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 75149408 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 75149458 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 75149647 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75149744 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 75149745 G C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 75149843 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 75150075 A T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 75150114 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 3 75150513 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75150578 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75150657 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 75150821 A C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 75150859 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 75151117 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 75151231 C G N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 75151235 G C N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 75151247 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 75151334 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 75151433 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 75151458 C T N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 3 75151782 A C N N 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 7 9 2 3 3 3 75151910 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 75152313 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 75152323 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0 0.944444444444444 0.0555555555555556 17 19 0 17 1 3 75157319 C A N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 75157321 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 75157391 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 75157760 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 75157973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75158086 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75159050 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 75159102 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 75159909 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 75160070 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 75160157 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75160352 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 75160444 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75160635 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75160772 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 75160943 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75161734 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 75161880 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 75162232 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 75162334 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75162812 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75163414 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75163470 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75163751 G T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 75164189 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75164477 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75164681 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75164962 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75165872 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 75165939 A C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 75166776 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 75166893 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 75166997 A C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 75167103 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 75167134 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 75167175 A C N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 75167176 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 75167350 A T N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 75167758 C A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 75167759 A T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 75167784 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 75168114 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75168151 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 3 75168263 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75168296 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75168644 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75168663 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75169644 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75169715 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75169808 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75169984 G C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 75171148 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75171185 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75171219 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75171468 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 75171507 A G N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 75171610 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75171623 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75171786 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75171932 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75171997 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75172524 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75173202 C G Y N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.25 0.75 0 15 9 3 9 0 3 75173242 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75173413 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75173505 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75173992 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 75174283 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75174520 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 75174788 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75175386 A C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 75175640 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 75175667 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75176014 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75176159 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75182855 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75183040 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75183315 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75183583 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 75183602 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 75183609 T A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 75183656 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 75183670 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75183689 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75183697 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75183811 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75183862 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75183985 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75184693 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 75184858 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75184859 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75184919 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75184930 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75184951 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75184963 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75185728 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 75186688 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75186742 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75186940 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75187010 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75187258 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75188674 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 75189405 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75189456 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75190836 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75190984 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75191486 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75191514 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75191592 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75191636 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75191803 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75191861 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75191882 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75191898 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75191935 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75192013 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75192035 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75192159 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 75192167 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75192244 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75192292 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 75192473 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75192608 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75192636 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75192652 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75192670 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75192689 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75192839 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75192934 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 75192984 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 75193353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75193622 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75193985 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75194993 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 75195316 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75198265 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75198933 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75199011 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 75199141 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75199246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75200644 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75200754 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75200862 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75201063 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75201120 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75201439 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75201492 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75201677 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75201707 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75201787 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75201904 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75201982 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75202002 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75202227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75202262 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75202514 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75202526 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75202555 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75202607 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75202656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75202688 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75203101 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75203210 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75203516 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75203533 G T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 75203950 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75203995 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 75204223 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 75204275 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 75204378 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 75204419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75204441 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 75204787 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75204830 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75204979 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 75205180 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 75205213 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 75205255 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75205289 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 75205386 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75205488 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75205953 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 75206147 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 75206295 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75206321 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 75206404 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 75206806 T G Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 75206923 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 75207438 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75207604 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 75207913 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 75208050 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 75208515 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75208647 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 75208686 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 75208688 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 75208897 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75208984 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 75209016 G A Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 75209642 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75209657 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 75210352 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75210446 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 75210518 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 75210708 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 75210721 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 75211133 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75211453 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 75212063 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75212217 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 75212748 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 75220557 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75228374 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75228417 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 75228444 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75229011 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 75229134 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 75229313 T G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 75229508 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 75229705 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 75230309 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75230745 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 75230937 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75231081 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75231201 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75231293 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75231329 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75231346 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75231495 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 75231569 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 75232185 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 75232257 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 3 75232300 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75232496 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 75232527 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75232786 G C N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 3 75232893 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 75232963 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 75233043 C T N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 75233062 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75233110 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 75233377 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75233382 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75233583 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 75233766 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75233822 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75234003 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75234057 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 75234116 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75234139 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 75234164 A C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 75234248 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 75234282 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 75234374 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 75234393 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 75234439 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 75234490 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 75234503 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 75234525 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75234541 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 75234553 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 75234620 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 75234660 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 75234758 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75235193 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 75235326 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75235533 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 75235551 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75235734 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75236546 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 75236565 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75236693 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 75236704 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75238079 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75238283 C T Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 75238544 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75239945 G C Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 75242487 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 75242840 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75243056 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75243169 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75243367 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75243692 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 75243753 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 75243878 G C N N 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 3 75243881 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 3 75243994 A T N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 3 75244055 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 75244242 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 75244399 A G N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 3 75244476 C G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 75244497 T G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 75244513 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 75244620 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 75244652 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 75244685 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 75244729 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 75244754 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 75244884 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75244921 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 75244998 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 75245186 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 75245428 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 75245541 G A Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.285714285714286 0.642857142857143 0.0714285714285714 17 11 4 9 1 3 75245683 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 75245811 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 75245822 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 75245824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75245849 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 75245955 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 75246003 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 75246065 A C N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 75246084 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 75246143 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 75246209 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 75246211 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75246222 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 75246276 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 75246309 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 75246323 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 75246510 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75246525 T G N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 3 75246590 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75246615 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 75246732 A T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 75246788 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 75247322 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75247329 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75247341 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 75247374 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 75247386 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 75247394 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 75247413 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 75247912 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 75248134 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 75248199 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 75248275 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 75248395 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 75248765 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 75248809 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 75248882 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 75248894 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75248907 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75248924 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 75249145 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 75249929 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 75250151 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 75250223 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75250249 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75250320 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 75250326 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 75250630 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 75250655 C A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75250670 T G Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 75250736 C A Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 75251617 C G Y N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 3 75251653 A T Y N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 3 75251725 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 75251818 T C Y Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 75251898 A G Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 75251932 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 75252829 T C N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 3 75253053 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 75253079 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 75253088 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 75253333 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 75253760 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 75254569 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 75255031 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 75255141 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 75255568 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75255596 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75255616 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75255813 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75255840 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75255872 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 75255966 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 75256020 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 75256109 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 75256144 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75256208 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 75256354 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 75256380 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 75256435 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 75256478 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75256547 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 75256571 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 75256642 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 75256715 A T N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 75256825 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75256862 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 75256876 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 75256916 A C N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 75256926 G T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 75257019 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 75257031 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 75257038 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75257089 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 75257092 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 75257151 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 75257179 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 75257230 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0 0.789473684210526 0.210526315789474 15 23 0 15 4 3 75257510 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 75257947 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 75258562 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75258744 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75258963 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75259118 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 75259329 C A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 75259441 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75259643 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75260125 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 75260544 T A N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 75260793 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75260810 G T N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 75261361 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 75262212 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75262241 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 75262287 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 75262366 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 75262514 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 75262545 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 75262576 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 75262604 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75262618 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75262740 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 75262763 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 75262791 G T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 75262891 C A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 75262935 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 75263187 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 75263306 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 75263318 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75263446 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 75263533 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75263590 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75263837 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 75264009 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75264084 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 75264226 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 75264353 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75264746 A G Y Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 3 75264752 T G Y N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 3 75264897 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 3 75265216 A C Y N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0.2 0 0.8 2 8 1 0 4 3 75265415 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 75265445 C G Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 75266049 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 3 75268500 G A Y Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 3 75269510 T C N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 75270250 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 75270385 G A Y Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 3 75270395 T C Y Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 7 11 1 5 3 3 75270698 T G N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 3 75270816 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 75270951 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 75270991 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 75271033 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75271035 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75271103 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75271124 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 75271134 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 75271163 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 75271177 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 75271246 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75271405 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75271428 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 75271471 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75271527 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 75271547 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75271732 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75271793 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 75271823 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75271939 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75271970 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75272047 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75272106 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75272125 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75272183 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75272188 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75272219 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 75272242 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75272300 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 75272343 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 75272373 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 75272404 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 75272445 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 75272456 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 75272459 G T N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 75272502 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 75272512 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75272556 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75272697 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75272747 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75272776 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 75272778 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 75272798 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 75272829 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 75272968 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 75273001 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75273029 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75273136 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 75273141 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 75273289 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 3 75273368 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75273407 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75273477 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 75273482 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 75273546 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75273597 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75273609 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75273678 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75273760 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 75273821 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75273936 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75274002 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 75274057 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75274062 A C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 75274109 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75274116 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 75274125 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 75274140 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 75274144 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75274158 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 75274184 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75274215 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 75274303 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 75274317 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 75274504 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75274639 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75274785 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75274789 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75274887 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 75274896 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 75274939 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 75274984 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.2 0.75 0.05 23 17 4 15 1 3 75275009 T G Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 3 75275154 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75275176 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75275237 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 75275253 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 75275271 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 75275376 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 75275433 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 75275491 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75275838 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 75276038 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 75276158 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 75276201 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 75276291 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 75276343 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 75276865 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 75277079 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75277285 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 75277343 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 75277364 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75277554 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 75277748 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75277770 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75277821 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75277851 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75277904 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 75278032 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 75278106 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75278406 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75278448 G C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 75278460 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 75278583 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 75278623 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75278630 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 75278728 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75278871 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 75278882 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 75278983 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75279208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75279247 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75279314 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 75279318 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75279810 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75279972 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75280347 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75280452 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75280610 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75280691 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 75280699 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75280710 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75280713 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 75280750 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 75280764 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75280990 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75281124 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75281429 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75281472 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75281498 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75281569 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75281699 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75281757 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75281780 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75281863 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75281979 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75282019 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75282144 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 75282233 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75282291 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 75282375 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 75282444 G T N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 75282449 A G N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5625 0.125 0.3125 20 12 9 2 5 3 75282600 C G N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.625 0.125 0.25 22 10 10 2 4 3 75282671 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 3 75282733 C G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 75282770 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 75282819 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75282872 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75282966 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75282967 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 75283065 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75283103 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75283284 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 75283784 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 75283841 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 75283939 C G Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 75284033 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75284081 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 75284202 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75284464 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75284465 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75284581 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75284595 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75284759 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75284931 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75285335 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 75285369 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 75285510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75285548 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75285617 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75285779 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 75285888 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75285900 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75285992 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 75286472 C T Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 75286567 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75286623 A G Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 75286716 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 75286802 C T Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 75287016 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 75287284 A C Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 75287606 A T Y N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 3 75287697 A C Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 75287703 G A Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 75287721 C G Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 75287997 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75288017 C A Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75288024 T G Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75288065 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75288200 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75288215 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 75288431 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75288470 T G Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 75288489 G T Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 75288552 T G Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 75288849 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75288951 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75289139 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 75289152 G A Y Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 3 75289154 T A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 75289383 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75289423 G C Y N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 75289437 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75289480 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75289515 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75289606 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 75290451 T A Y N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 75290532 T A Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 75290571 T G Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75290820 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 75290889 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75290967 C T Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 75291072 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 75291122 G T Y N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 75291155 C G Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 75291292 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 75291304 G A Y Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 75291393 A C Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 75291687 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75291707 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75291944 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75292085 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75292177 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75292264 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75292274 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 75292347 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 75292471 C G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 75293023 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 75293450 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 75293460 T G Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 75293751 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75293813 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75293833 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75294355 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75294374 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75294465 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75294598 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75294629 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75294638 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75294712 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75294739 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75294875 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75294888 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75295106 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 75295162 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 75295236 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 75295397 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 75295452 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 75295609 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75295638 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75295742 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 75295750 G C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75295755 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75296350 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75296376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75296409 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75296441 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75296514 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75296545 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75296676 C A N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 3 75296678 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 10 22 0 10 6 3 75296743 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 75296985 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75297172 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 75297201 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 75297269 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75297339 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 75297435 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 75297527 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 75297596 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 75297633 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 75297650 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 75297672 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 75297677 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 75297732 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 75297856 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75297859 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75297868 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75297890 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75297903 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75298039 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 75298058 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75298181 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 75298247 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75298302 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75298351 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75298415 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75298467 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75298536 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75298575 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75298605 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75298630 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75298664 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75298703 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75298754 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75298774 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75299064 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75299455 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75299514 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75299727 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 75299952 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75299964 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75299989 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75300014 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75300043 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75300080 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75300117 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 75300165 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75300181 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75300312 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 75300328 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 75300338 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75300355 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75300487 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75300650 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 75300679 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 75300720 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 75300921 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 75300991 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75301006 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 75301073 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 75301187 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75301212 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 75301341 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 75301386 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 75301445 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 75301527 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 75301529 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 75301551 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 75302216 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 75302315 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 75302322 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75302489 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75302720 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 75303566 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75303588 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 75303618 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75303753 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75303772 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75303840 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75303843 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75303917 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 75304020 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 75304046 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 75304075 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 75304129 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 75304134 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 75304589 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75304651 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75304711 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 75305123 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 75305299 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75305304 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 75305439 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75305539 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 75305721 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 75306104 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 75306195 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75306490 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 75306584 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 75306737 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75306773 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 75306807 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75306819 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75307041 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 75307055 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 75307265 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75307293 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 75307325 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75307359 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75307369 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75307433 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 75307544 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75307560 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 75307604 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 75307666 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 75307694 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 75307717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75307729 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 75308038 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 75308225 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 75310518 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75310662 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75311473 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 75312146 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75312251 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 75313634 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75315566 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75316058 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75316587 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75319090 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75320006 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75320221 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75320265 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 75321563 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75322095 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75323755 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75323804 T A N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0 0.928571428571429 0.0714285714285714 13 15 0 13 1 3 75323805 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0 0.9375 0.0625 15 17 0 15 1 3 75324330 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75324729 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75324929 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75325276 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75325671 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75326107 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75327449 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75328223 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 75328529 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75329105 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75329454 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75330280 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75330621 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75331654 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 75332450 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 75332608 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75334394 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 75334459 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75334832 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 75335697 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75338265 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 75338632 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75340386 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75343005 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75343014 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 75343382 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75343383 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75343709 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75343767 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75343828 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75344098 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 75344295 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75344616 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 75344662 A T N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 75344853 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75344907 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75345469 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75345772 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75345847 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 75346154 A C N N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 5 5 1 3 1 3 75346249 A G N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 3 75346311 G T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 75346383 C T N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 75346686 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 75346804 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 75346993 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 75347429 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75347452 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75347507 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75347628 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 75347949 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75348111 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 75348311 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 75348378 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75348596 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 75348656 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 75348666 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 75348783 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 75349008 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75349139 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 75350122 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75350138 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 75350262 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75350469 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75350517 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75350617 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 75350664 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 75350667 A C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 75351109 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75351132 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 75351153 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 75351246 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 75351316 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 75351846 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 75351991 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 75352066 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 75352274 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 75352358 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75352578 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 75352753 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 75353168 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 75353440 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 75353619 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75353927 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75353930 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 75354040 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75354074 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 75354269 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75354643 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 75354681 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 75354780 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 75354885 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75354916 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 75354956 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 75355718 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75355719 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75355849 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 75355862 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 75355947 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 75356055 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 75356088 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 75356267 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75356274 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 75356336 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 75356377 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 75356378 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 75356840 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 75356909 G A N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 3 75356992 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 3 75357104 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 75357704 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 75357925 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 75358097 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 75358168 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 75358213 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 75358362 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 75358708 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 75358790 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 75358876 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 75358994 A C N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 3 75359214 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75359359 G T N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 75359432 T C N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 3 75359603 G T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 75359607 G T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 75359696 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75360508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75360514 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75360860 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75361027 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75361043 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75361098 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75363608 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75365085 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 75365932 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 75366732 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75367862 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 75367955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75367976 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 75368030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75368106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75368175 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75368890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75369360 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 75369551 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75369693 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 75369760 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75369781 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75370021 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 75370298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75370577 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 75370867 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75372267 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75372272 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75372387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75372431 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75372464 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75372557 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75373744 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 75373862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75373993 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75374731 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75374836 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75378828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75379035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75379464 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75379787 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75380260 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75380560 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75381513 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75382478 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75383533 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 75385482 T A N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 3 75385538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75386679 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75387056 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 75389970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75390622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75391763 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75392614 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 75395311 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75395403 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75395812 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75396170 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75396239 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75397703 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 75398024 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75398206 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75398355 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75399152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75399252 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75399273 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75399288 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75399539 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75399562 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75399597 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75399673 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75399718 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75399894 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75399953 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75399974 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 75400164 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75400199 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75400259 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75400343 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 75400727 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75400761 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 75400818 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75400831 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 75400865 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75400879 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 75400884 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 75400926 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75400930 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75401189 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75401420 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75401443 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75401537 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 75401577 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75401657 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75401674 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 75401690 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75401738 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 75401775 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75401806 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75402083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75402104 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75402120 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75402122 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75402187 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75402322 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75402390 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75402410 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75402441 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75402491 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75402542 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75402616 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75402645 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75402709 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75402845 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75403139 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75403144 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 75403255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75403476 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75403738 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75403883 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75403913 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 75403925 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 75404127 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75404130 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75404187 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 75404192 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 75404434 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75404576 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75404628 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75404698 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75404736 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75404779 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75404834 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75404928 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75404936 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75405013 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75405090 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75405242 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75405491 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75405541 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75405593 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75405603 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75405631 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75405641 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 75405686 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75405734 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75405806 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75405903 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75405904 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75405986 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75406142 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75406173 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75406190 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75406277 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75406307 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75406310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75406344 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75406369 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75406382 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75406403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75406428 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75406497 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75406503 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75406535 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75406609 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75406611 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75406861 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75406944 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75406960 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75407023 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75407373 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75407387 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75407392 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75407527 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75407781 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75407852 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75407872 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75407978 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75408144 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75408195 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75408296 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 75408319 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 75408357 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 75408435 G T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 75408463 A G Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 75408953 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75408974 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75409017 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 75409140 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 75409288 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75409647 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 75409668 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 75409701 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 75409739 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 75410112 C T N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 75410125 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 3 75410180 A T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 75410275 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 75410398 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 75410472 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 75410505 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 75410517 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 75410594 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 75410676 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 75410694 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 75410772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75410863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75410935 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75411140 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 75411394 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75411526 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75411640 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 75411856 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75411873 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 75411874 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75412120 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 75412121 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75412743 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75413012 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 75413541 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 75413558 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 75414024 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75414120 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 75414143 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 75414162 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75414171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75414280 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 75414360 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75414412 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 75414484 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75414885 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 75414887 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 75414917 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 75414945 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75415304 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 75415305 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75415448 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75415486 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75416052 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75416557 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75416586 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75416803 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 75417033 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 75417139 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75418257 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75418507 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 75418536 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75418730 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75419003 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75419668 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75419729 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75419974 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75419988 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75420052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75420106 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75420319 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75420321 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75420374 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75421086 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 75421503 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75422241 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75422714 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 75424893 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75425067 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75425130 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 75425329 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 75425361 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75426221 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 75427049 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75430584 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 75436411 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 75436483 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 75436994 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75437235 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75437474 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75437497 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75438677 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 75441398 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 75441519 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 75442737 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75443712 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75443878 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75443924 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75444948 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 75445482 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 75445548 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 75445582 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 75445663 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75445757 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75445935 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75445951 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75446597 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75447130 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75447149 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75447639 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75448403 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75448958 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75449521 A G N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 3 75450993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75452508 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75453412 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75453487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75454117 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75455064 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75455260 G A Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 75459034 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75460383 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75461169 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75461280 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75461519 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75461538 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75461852 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 75462086 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 75462125 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 75462209 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 75462220 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75462225 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 75462665 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 75463779 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75464361 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75468598 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 75469542 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75469796 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75470928 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75471887 G A Y Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0 0.583333333333333 0.416666666666667 7 17 0 7 5 3 75472236 G C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 75473159 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75473429 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 75473440 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 75474018 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75474764 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 75475084 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 75475351 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 75475838 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75475898 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 75475899 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 75475958 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75475979 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75475982 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75476111 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75476169 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75476208 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75476249 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75476330 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75476448 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75476963 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75476964 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75477048 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75477050 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75477256 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75477509 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75477789 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 75477809 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75477847 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75478204 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 75478214 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75478296 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75478318 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75478487 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75478808 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75478860 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 75478887 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75478989 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75479106 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75479173 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75479215 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75479246 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75479412 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75479426 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75479438 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75479451 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75479580 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75479644 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75479736 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75479773 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75479789 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75480339 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75480454 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75480522 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75480561 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75480567 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75480573 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75480607 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75480612 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75480778 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75481077 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 75481292 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75481852 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75481880 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75481951 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75482026 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75482208 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75482273 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75482302 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75482352 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75482354 G T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 75482630 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75482747 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75483056 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75483082 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75483541 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 75484076 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 75484112 A C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 75484832 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75484855 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75484931 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75484932 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75484964 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 75485081 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75485134 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 75486369 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 75486473 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75486487 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75486518 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 75486706 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75486871 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75486924 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75486943 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75487078 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75487095 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75487103 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 75487249 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75487314 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 75487374 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 75487465 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75487489 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75487502 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75487574 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75487726 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75487740 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 75487875 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 75487944 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75487945 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 75488021 T C N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 75488074 A G N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 75488088 C G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 75488105 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 75488717 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75489553 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75490595 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 75490610 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75490804 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75490824 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75490948 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75491569 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75492280 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75492366 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75492619 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 75494330 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75494866 A T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 75495041 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75496351 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75496540 C T Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 3 75496766 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75497698 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 75498106 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75498136 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75498266 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75498492 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75498892 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 75498976 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75499003 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75499032 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 75499056 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75499184 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75499211 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 75499230 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75499233 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75499244 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 75499363 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75499389 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75499402 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75499413 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75499439 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75499454 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75499588 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75499676 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75499735 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 75499744 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75499871 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75499929 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75499947 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75500040 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75500145 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75500484 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 75500485 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 75500496 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75500619 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75500623 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75500631 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75500658 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 75500661 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75500679 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75500691 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 75500695 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75500770 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 75500818 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75500835 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 75501013 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 75501482 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 14 10 4 6 2 3 75501515 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 75501542 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 75501570 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 75502043 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75502064 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75502085 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75502094 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75502183 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 75502200 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75502253 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75502298 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75502314 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75502374 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75502637 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 75502693 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 75502715 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 75502798 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75502830 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 75502916 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 75502935 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75502944 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 75502973 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75503012 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75503014 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75503040 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75503124 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 75503314 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75503389 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75503564 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75503900 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75503969 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75504006 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75504176 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 75504212 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75504298 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75504459 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75504471 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75504533 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 75504639 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75504679 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 75504725 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75504749 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75504779 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75504782 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75504844 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75504852 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 75504964 T G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 75505077 T C N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 3 75505142 C A N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 75505208 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 75505295 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75505564 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75505725 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 75505727 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 75506242 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75506346 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 75506464 C A N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 3 75506722 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 75506802 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 75506824 T G N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 75506893 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 75507044 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 75507181 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 75507242 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 75507293 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 75507369 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 75507373 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 75507387 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 75507412 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 75507422 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 75507463 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 75507468 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 75507484 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 75507503 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 75507523 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75507533 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 75507548 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 75507567 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75507572 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75507687 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 75507702 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 75507719 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75507749 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 75507755 A C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 75507824 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75507846 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 75507948 A T N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 75507996 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 75508019 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75508095 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 75508128 C G N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 3 75508220 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 75508272 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75508285 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75508309 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75508370 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 75508448 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75508453 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75508473 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 75508575 G T N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 75508919 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 75508971 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 75509015 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 75509053 G C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 75509056 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 75509087 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75509226 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75509259 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 75509278 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 75509335 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 75509366 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75509429 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75509528 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75509555 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75509611 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75509657 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 75509677 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 75509682 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75509690 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75509746 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75509758 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 75509777 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 75509788 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 75509825 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 75509846 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75509897 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75509922 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75510158 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 75510210 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 75510223 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 75510312 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 75510690 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 75510814 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 75511053 A C N N 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 3 75511064 T C N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 3 75511083 G A N Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 9 9 2 5 2 3 75511100 T A N N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 3 75511123 G T N N 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 7 11 2 3 4 3 75511259 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 75511403 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75511459 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75511475 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75511554 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 75511574 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75511630 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75511644 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75511647 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75511659 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75511780 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75511863 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75511949 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 75512019 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 75512059 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75512076 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 75512088 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75512124 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 75512189 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 75512227 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 75512320 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75512385 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75512405 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75512431 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75512668 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 75512752 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75513230 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 75513258 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75513412 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75513440 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 75513441 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 75513655 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 75513848 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 75513948 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 75513959 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75514023 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 75514029 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 75514162 T G N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 3 75514164 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 75514181 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 75514492 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 75514500 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75514523 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 75514535 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 75514643 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75514723 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 75514786 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 75514789 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 75514817 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 75514833 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75514915 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 75514936 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 75515284 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 75515361 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 75515381 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 75515394 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 75515442 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75515546 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75515547 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 75515604 C T Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 75515647 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 75516193 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75516206 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75516288 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 75516390 T G Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 75516591 T G Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 75516629 T C N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 3 75516644 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 75516656 T C Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 75516893 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 75517037 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 75517324 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75517708 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75517818 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 75517888 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75518052 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75519158 C T N Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.4 0 0.6 4 6 2 0 3 3 75519177 C T N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 3 75519275 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 75519517 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75519573 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 75519574 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75519617 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 75519810 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 75519839 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 75519894 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 75519915 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 75519996 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75520099 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75520248 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 75520380 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 75520396 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75520540 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 75520611 T A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 75520705 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 75520777 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 75520822 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 75520823 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 75520860 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 75520870 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 75521454 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 75521541 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 75521624 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 75522177 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 75522290 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 75522497 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 75522518 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 75522576 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 75522692 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 75522712 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 75522742 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 75522855 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 75522912 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75522913 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 75522938 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 75522969 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 75522984 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 75523013 T C N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.0769230769230769 0.615384615384615 0.307692307692308 10 16 1 8 4 3 75523034 G A Y Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 10 6 4 2 2 3 75523053 A C N N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 3 75523074 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 3 75523101 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 75523108 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 75523673 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 75523689 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 75523710 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 75523758 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75524024 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 75524088 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 75524178 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75524190 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75524209 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75524360 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 75524551 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75524593 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 75524855 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 75525154 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 75525356 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75525402 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 75525939 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 75526163 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 75526245 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 75526275 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 75526301 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 75526696 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 75526814 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 75526976 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 75527136 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 75527528 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 75527817 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75529222 T A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 75529312 A T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 75529530 T G Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 75529711 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 75529916 A C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 75529948 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75529954 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 75530200 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75530367 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 75530389 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 75530635 C G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 75530797 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75530861 C G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 75530902 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75531932 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75532161 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75532964 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 75532965 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 75532995 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75533018 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 75533429 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 75533559 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75533625 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 75533680 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 75533790 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 75533808 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 75533923 T C Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 75534069 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 75534082 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 75534456 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 3 75534479 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75534555 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 75534601 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75534641 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75534700 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75534728 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 75534818 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75534833 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 75535028 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 75535039 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75535208 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 75535629 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 75535646 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 75535908 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 75536086 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 3 75536514 A T Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 75536611 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 75536682 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 75536701 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75536772 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 75536785 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 75537226 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 75537269 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 75537281 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 75537468 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 75537479 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 75537540 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75537569 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75537628 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 75537632 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75537676 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 75537769 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 75537832 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 75537894 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 75537943 C A Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 75537973 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 75538099 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 75538118 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 75538183 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 75538207 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 75538212 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 75538239 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 75538327 G T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 75538377 A T N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 75538380 A G N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 75538421 A G Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 75538444 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 75538487 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 75538497 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 75538533 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 75538627 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 75538643 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 75538853 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 75538855 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 75538927 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 75538998 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 75539004 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 75539118 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 75539139 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 75539158 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75539193 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 75539202 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 75539695 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 75539721 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 75539764 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 75539824 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 75539829 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 75539890 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75540013 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 75540034 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 75540048 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75540072 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 75540094 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 75540132 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 75540141 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 75540286 G T N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 75540355 A T Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 75540524 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 75540652 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 75540666 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 75540871 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 75540892 A T N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 75541059 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 75541292 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 3 75541336 T A N N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 3 75541346 A G Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 75541454 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 75541481 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 75541629 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 75541689 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 75541697 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 75541702 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 75541777 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75541895 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 75541927 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75542049 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 75542151 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 75542160 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 75542194 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 75542203 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75542283 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 75542324 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 75542385 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75542616 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 75542649 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 75542651 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 75542721 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 75542732 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 75542807 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 75542837 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 75542991 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 75543067 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 75543111 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 75543459 T C Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 75544676 T A Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 75544740 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75544770 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 75544784 T A Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 75545445 C A Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 75545706 G T Y N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.285714285714286 0 0.714285714285714 4 10 2 0 5 3 75546057 T C Y Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 75546111 T C Y Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 75546118 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 75546176 A G Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 75546203 T G Y N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 3 75546251 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 75546269 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 75546335 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 75546378 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 75546491 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 75546494 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 75546531 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 75546583 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 75546589 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 75546604 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75546625 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 75546679 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 75546690 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 75546708 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 75546720 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 75546738 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 75546767 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 75546768 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 75547202 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 75547610 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75547950 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 75548496 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 75548543 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 75548565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75548695 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75548713 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 75548747 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 75550409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75550547 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75550958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75551371 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75551599 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 75551915 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75551973 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75552168 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 75552209 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75552282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75552346 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75552353 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75552375 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75552584 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 75552613 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75552645 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 75552854 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 75552982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75553174 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75553281 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75553335 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75553397 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75553550 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75553735 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75553772 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75553924 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 75553947 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 75554021 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 75554089 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 75554108 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 75554180 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 3 75554232 G T N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 3 75554256 G T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 75554307 C G N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.133333333333333 0.6 0.266666666666667 13 17 2 9 4 3 75554359 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 75554792 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 75554905 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 75554944 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 75555418 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75555501 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 75555556 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 75555654 C T Y Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 3 75555664 A G N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 3 75555700 C T Y Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 75555730 C T Y Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 3 75555871 A T Y N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.0909090909090909 0.727272727272727 0.181818181818182 10 12 1 8 2 3 75556026 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 75556155 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75556256 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75556381 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 75556400 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 75556421 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75556448 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 75556475 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 75556476 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 75556600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75556613 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75556653 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75556673 C G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75556712 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 75556737 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 75556779 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75556791 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75556814 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75556859 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 75556862 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 75557023 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75557034 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75557045 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 75557049 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75557117 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75557183 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75557239 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75557264 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 75557275 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75557276 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 75557337 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 75557467 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75557539 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75557780 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75557799 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 75557824 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75557908 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 75558076 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75558102 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75558112 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75558119 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 75558212 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75558219 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75558226 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 75558241 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75558277 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 75558390 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 75558408 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 75558480 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 75558504 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 75558533 C A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 75558547 T C N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 75558653 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 75558686 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 75558741 A C N N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 3 75559011 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 75559012 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 75559032 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 75559038 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75559049 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75559214 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 75559310 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 75559330 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 75559427 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 75559541 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75559755 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75559796 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75559990 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75560067 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75560132 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 75560155 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75560187 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75560224 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75560249 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 75560266 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 75560503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75560631 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75560790 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75561048 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 75561156 A C Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 75561395 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75561433 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75561689 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 75561999 T G Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 75562094 T C Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 75562249 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 75562595 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 75562607 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 75562690 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 75562705 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75562719 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75562733 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75562735 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75563716 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75563719 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75563818 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75563840 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 75563844 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 75563999 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 75564023 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75564089 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75564218 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75564331 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75564411 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 75564533 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 75564559 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 75564613 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75564659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75564724 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 75564994 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75565015 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75565040 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75565164 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75565257 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75565390 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75565427 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75565567 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75565672 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 75565696 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75565832 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75565873 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75565900 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75565969 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75566021 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75566058 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75566099 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75566399 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75566485 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75566577 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75566668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75566958 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75566971 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75567053 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75567439 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75567538 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 75567539 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75567568 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75567597 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 75567842 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75567942 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75567986 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75568051 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75568124 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75568146 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75568199 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75568249 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75568259 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75568280 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75568377 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 75568482 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75568514 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75568721 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 75568864 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75568933 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 75568982 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 75568993 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 75569033 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 75569139 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75569146 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 75569179 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 75569190 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 75569230 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75569245 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 75569367 C A Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 75569443 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 75569671 G C Y N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 9 7 3 3 2 3 75569774 T C N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 75569882 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 75569932 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 75570012 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 75570131 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 75570152 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 75570175 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 75570260 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 75570359 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 75570384 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 75570503 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 75570532 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 75570605 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 75570840 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 75570903 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 75570914 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 75570970 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 75571121 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 75571259 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75571282 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 75571388 C T Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 75571438 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 75572334 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 75572360 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75572665 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75572944 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 75573121 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 75573216 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 75573312 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 75573452 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75573579 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 75573597 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 75573736 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 75573803 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 75573892 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 75574483 T C Y Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 75574606 A G Y Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 3 75574621 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 3 75574622 G A Y Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 3 75574714 C G Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 75574793 A G Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 75574821 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 75574851 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 75575007 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 75575024 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75575093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75575354 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 75575372 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 75575634 A T Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 75575665 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 75575819 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 75575964 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 75576006 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75576056 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 75576182 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 75576310 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 75576351 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 75576457 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 75576816 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 75576831 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 75577053 T C Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 75577152 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 75577576 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 75577622 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75577640 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 75577672 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 75577742 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75577860 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 75577887 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 75578086 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 75578393 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 75578544 C A Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 75578849 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 75578861 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75578899 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 75578912 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75578979 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75579065 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75579113 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75579223 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 75579231 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 75579374 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75579516 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 75580181 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 75580189 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75580223 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75580391 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75580545 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 75580553 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 75580638 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 75580778 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75580784 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 75580832 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 75580997 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 75581005 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 75581019 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75581062 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 75581148 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75581338 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 75581392 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 75581420 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 75581442 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 75581471 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 75581561 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 75581587 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 75581927 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 75581988 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75582208 T G Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 75582236 C A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 75582259 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 75582308 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75582455 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 75582566 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75583085 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75583572 G T Y N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0 0.923076923076923 0.0769230769230769 12 14 0 12 1 3 75590271 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75590291 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75590409 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75590433 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75590453 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75590532 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 75590627 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 75590798 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75590920 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 75590938 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75590983 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75591020 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 75591123 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 75591170 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 75591199 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75591330 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 75591393 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 75591445 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 75591487 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 75591724 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75591741 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 75591765 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 75591777 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 75591974 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75592115 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75592203 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75592269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75592370 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75592487 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75592540 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 75592592 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 75592677 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 75592696 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75592731 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 75592764 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 75592954 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 75593087 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75593154 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 75593155 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 75593165 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 75593213 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 75593255 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75593310 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 75593384 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75593481 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 75593492 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 75593560 T C Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 75593580 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 75593608 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 75593682 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 75593813 A G Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 75593853 G A N Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 6 6 2 2 2 3 75594077 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 75594123 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 75594231 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75594234 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 75594521 T C N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 75594604 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 75594645 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 75594791 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 75594874 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75595003 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75595032 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75595154 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 75595336 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75595462 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 75595541 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 75595615 C A Y N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 75595616 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 75595709 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 3 75595763 A T Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 75596170 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75596235 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 75596256 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 75596309 C A Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 75596340 T A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 75596491 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75596827 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 75596846 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75597540 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 75597721 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75597749 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 75597753 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75597805 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75597842 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75597845 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 75597859 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75597901 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 75597946 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75597949 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 75597989 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75598397 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75598425 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75598448 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75598565 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75598600 T C Y Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 75598679 C G Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 75598751 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75599053 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75599300 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 75599362 A G Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 75599525 T G Y N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 3 75599538 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 75599603 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 75599605 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 75599702 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 75599713 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75599753 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 75599759 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 75599804 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75600065 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 75600185 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 75600236 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 75600301 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 75600313 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75600352 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 75600454 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75600476 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 75600599 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75600779 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 75600783 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 75600841 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 75600866 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 75600906 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 75600920 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 75601023 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 75601066 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75601087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75601432 A G N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 75601452 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 75601478 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 75601481 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 75601524 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 75601796 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 75601979 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 75601981 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75602184 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 75602284 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 75602329 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75602371 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 75602424 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75602514 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75602532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75602645 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75602747 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 75602883 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 75603054 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 75603055 A G Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 75603425 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 75603434 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 75603557 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 75603580 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75603719 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 75603777 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 75603812 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75603839 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 75603852 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75603938 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 75603962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75604087 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 75604131 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 75604258 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 75604363 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 75604388 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75604631 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 75604960 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75605146 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 75605380 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 75605408 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75605454 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75605585 T C N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 75605826 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75605923 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 75605930 G C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 75605983 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 75605994 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 75606128 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 75606348 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75606414 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 75606896 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75606903 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75607054 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75607119 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75607192 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75607254 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 75607313 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 75607637 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75607924 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75608122 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 75608212 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 75608813 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75609374 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75609471 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75610017 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75610206 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 75610986 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75611419 T A N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 75611517 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 75611604 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 75612047 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75612364 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75612404 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 75613903 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75614416 A G Y Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 75614977 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75615111 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75615266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75615287 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75615336 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 75615529 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75616156 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75616239 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75616245 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75616286 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75616592 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 75616716 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75616742 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75616864 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75616912 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75616915 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75616926 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75616998 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75617010 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75617067 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75617247 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 75617450 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 75617535 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75617551 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 75617674 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75617816 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75618019 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 75618145 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 75618287 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75618307 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75618316 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75618342 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75618416 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75618494 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 75618501 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75618524 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75618561 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 75618619 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 75618738 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75618861 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75618864 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75618907 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75619060 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75619112 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 75619115 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 75619155 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75619194 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75619222 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75619339 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 75619346 T G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75619495 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 75619506 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 75619977 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 75620238 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 75620367 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 75620373 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75620508 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 75620528 A G Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 75620542 C G Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 75620547 A G Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 3 75620575 T C Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 75620628 C T Y Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 3 75620655 G A Y Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 6 10 1 4 3 3 75620857 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 75620886 T C Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 75620914 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 75620988 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 75621078 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 75621086 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 75621129 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 75621169 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75621208 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 75621338 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 75621379 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75621382 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 75621547 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 75621561 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 75621623 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75621624 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 75621707 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75621792 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 75621820 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 75621973 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75622167 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75622230 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 75622265 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 75622280 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 75622533 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 75622555 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 75622683 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 75622725 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75622833 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 75622847 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 75622885 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 75623080 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 75623409 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 75623462 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 75623625 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75623647 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 75623671 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 75623771 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 75623852 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 75623984 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 75624043 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 75624048 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 75624057 T G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 75624082 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 75624197 G A N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 75624352 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 75624482 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 75624483 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 75624499 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 75624673 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 3 75624703 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 75624788 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 75624813 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75624865 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75624968 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 75625138 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75625193 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 75625326 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75625952 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75626079 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75626161 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 75626250 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 75626308 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 75626363 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75626824 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75626956 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75627075 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75627160 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 75627316 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75627410 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75627481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75627643 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75627719 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75627787 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75627881 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 75627945 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 75628255 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 75628264 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75628556 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 75628610 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 75628623 C G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 75628633 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 75628660 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75628671 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 75628784 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 75628897 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 75628938 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 75629089 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 75629091 G C Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 75629226 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 75629246 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 75629354 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 75629384 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 75629430 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 75629442 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 75629707 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75629744 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 75629773 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 75629821 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 75629864 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 75629967 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 75629970 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75630061 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 75630112 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 75630271 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 75630335 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 75630489 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 75630611 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 75630755 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 75630756 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 75631411 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 3 75631425 C T N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 3 75631431 A G N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 75631469 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 75631480 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 75631486 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 75631599 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 75631657 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75631662 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 75631772 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 75631808 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 75631982 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 3 75632011 T C N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 8 12 1 6 3 3 75632015 A G N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.0909090909090909 0.545454545454545 0.363636363636364 8 14 1 6 4 3 75632081 T G N N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.0909090909090909 0.545454545454545 0.363636363636364 8 14 1 6 4 3 75632099 G A N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 8 12 1 6 3 3 75632347 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 75632423 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 75632428 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 75632434 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 75632628 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 75632670 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75632698 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 75632955 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 75632972 T A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 75633073 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 75633095 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 75633232 T C N Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 6 8 1 4 2 3 75633326 C A Y N 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 3 75633362 T A N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 3 75633429 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 75633492 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75633502 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75633503 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 75633582 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 75633656 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 75633665 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 75633845 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 75633846 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 75633869 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 75633913 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 75633949 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 75633954 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 75633991 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 75634106 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 75634128 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75634150 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 75634203 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 75634258 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 75634279 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 75634301 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 75634345 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 75634427 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 75634480 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75634758 G A Y Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.2 0.8 0 6 4 1 4 0 3 75635216 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 75635256 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 75635267 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 75635273 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 75635333 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 75635369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75635376 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 75635533 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 75635660 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 75635795 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 75635997 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 75636172 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 75636245 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 75636251 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 75636264 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 75636296 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 75636319 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 75636359 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 75636377 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 75636417 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 75636497 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 75636529 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 75636569 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 75636609 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 75636625 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 75636651 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 75636676 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 75636717 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 75636740 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 75636759 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 75636784 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 75636809 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 75636884 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 75636902 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 75637033 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 75637652 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75637702 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 75637784 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 75637930 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75638113 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 75638218 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75638255 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75638267 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 75640422 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 75644286 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 75644721 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 75653500 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 75653693 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75653694 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75653929 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 75655007 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 75655040 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 75656961 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 75658508 G A N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 75659493 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 75659556 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75660966 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75661047 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75661306 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 75661878 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 75664187 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 75664515 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 75665050 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 75665214 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75665331 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 75665489 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 75665569 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 75665721 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75665735 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75665826 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75665846 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75665866 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75665900 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 75665952 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75666006 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75666035 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75666184 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75666448 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75666467 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75666559 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75666721 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75667022 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75667122 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75667859 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75668470 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75668557 A T Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 75668875 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75668988 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75671437 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75671455 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75674056 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75674498 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75676697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75677452 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75677723 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75678316 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75681123 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 75681158 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75681656 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 75681750 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 75681856 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 75681946 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 75681992 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 75682043 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 75682375 T C N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 7 13 1 5 4 3 75682781 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 75682929 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 75682931 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 75683011 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 75683101 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75683127 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 75683153 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 75683227 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 75683271 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 75683431 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 75683467 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 75683489 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 75683817 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 75683826 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 75683835 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 75683843 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 75683994 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 75684013 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 75684033 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 75684080 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75684117 G T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 75684152 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 75684164 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 75684239 A T Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 75684256 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 75684262 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 75684381 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 75684485 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75684583 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 75684700 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 75684709 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75684810 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 75684861 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 75684942 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 75684989 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75685276 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75685415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75685496 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 75685963 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75686046 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 75686523 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75686552 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75686972 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75687221 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 75687533 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 75687601 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75687640 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75687752 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75687834 T G Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 75687959 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 75687996 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 75688006 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75688051 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 75688144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75688233 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75688556 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 75688557 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75688708 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 75688729 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 75688915 C A Y N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 3 75689150 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75689199 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75689236 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 75689330 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 75689435 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 75689437 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75689488 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 75689572 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 75689594 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 75689709 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 75689856 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 75689870 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 75689990 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 75689995 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75690100 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75690161 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75690212 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 75690298 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 75690397 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 75690424 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 75690452 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75690460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75690467 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75690555 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75690556 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 75690838 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75691162 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 75691223 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 75691244 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75691274 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75691278 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 75691612 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 75691841 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75691845 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75691882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75691919 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 75692144 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 75692268 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 75692467 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75692533 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75692549 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75692573 T G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 75692652 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75692705 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75692726 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 75692738 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 75692879 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 75692884 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75693062 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 75693168 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 75693229 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75693350 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75693381 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75693417 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 75694254 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 75694256 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 75694345 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 75694407 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 75694664 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 75694783 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 75694796 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75694824 A C Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 75695127 G C Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 75695271 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 75695293 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 75695449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75696548 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75696575 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75696640 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75696661 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75696851 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75697037 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75697105 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75697508 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 75697602 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 75697865 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 75697873 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 75697888 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 75698037 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 75698125 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75698478 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 75698631 G A N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 75698637 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 3 75698666 T C N Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0 1 0 9 9 0 9 0 3 75699048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75699113 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75699160 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75699190 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 75699205 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75699219 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 75699229 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75699441 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75699469 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 75699475 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 75699502 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75700146 T A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 75700466 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 75700651 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75700745 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 75700787 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 75700887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75700920 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75700978 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 75701351 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 75701519 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 75702302 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75702543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75702698 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 75702758 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75703625 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75703872 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 75704192 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75704380 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75704638 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75704836 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 75705048 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75706100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75706429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75707064 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 75707094 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75709333 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75709673 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 75710033 G A N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 3 75710068 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75710629 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 75710638 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 75710814 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 75711279 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75711425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75711582 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75711593 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75711996 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 75712890 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75713093 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75713667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75714919 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 75714942 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 75715331 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75716288 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 75716351 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 75716357 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 75716473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75716871 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75716876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75716925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75716972 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75717381 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75717862 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75717920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75718021 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 75718235 A G N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 3 75718494 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75718704 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75719035 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 75719084 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75719139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75719164 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 75719223 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 75719321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75719575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75719629 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 75719692 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 75719826 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 75719839 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75719890 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75719997 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 75720010 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 75720021 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 75720061 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 75720105 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 75720190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75720250 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75720268 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 75720328 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75720362 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75720933 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 75721058 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 75721063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75721608 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 75721655 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75721665 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 75721691 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75721710 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75721821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75721825 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75721942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75722227 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 75722285 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 75722429 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 75722483 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 75722494 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 75722560 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75722609 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 75722633 A C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 75722699 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75722738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75722775 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75722963 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 75723025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75723058 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 75723384 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 75723524 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 75723858 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 75724264 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 75724357 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 75724462 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 75724644 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75724793 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 75724845 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 75724867 T G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 75725086 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 75725156 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 75725169 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 75725198 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 75725278 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75725297 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 75725411 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75725455 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 75725488 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75725643 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 75725652 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75725957 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 75725960 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 75725984 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 75726148 C G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 75726323 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75726566 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 75727124 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75727138 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75727145 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75727338 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 75727746 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 75727818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75727875 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 75727891 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75728001 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75728029 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75728047 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75728103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75728127 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75728355 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75728425 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 75728458 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 75728573 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 75728639 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75728649 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75728663 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 75728674 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75728891 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75729243 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75729510 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75729602 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75729697 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75729711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75729998 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 75730003 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75730110 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 75730193 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 75730218 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 75730287 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 75730425 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 75730599 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 75730915 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 75730991 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 75730995 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 75731002 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 75731046 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 75731234 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 75731273 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 75731447 C A N N 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 3 75731538 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 75731817 A G N Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 9 9 3 3 3 3 75731944 T A Y N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 3 75731948 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 3 75732030 A G Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 75732092 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 75732150 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 75732200 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 75732278 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75732387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75732612 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75732844 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 75733266 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75733278 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75733343 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75733347 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75733411 G T N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.384615384615385 0.538461538461538 0.0769230769230769 17 9 5 7 1 3 75733570 C G N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 3 75734146 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75734282 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75734287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75734298 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 75734312 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 75734428 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75734442 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75734511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75734564 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75734581 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75734628 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75734675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75734704 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75734769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75734799 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75735049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75735069 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75735091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75735103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75735138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75735160 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75735169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75735199 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75735228 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75735739 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75735782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75736066 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75736087 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75736127 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75736207 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75736280 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75736368 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75736433 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75736453 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75736580 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75736584 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75736868 A C N N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.0833333333333333 0.75 0.166666666666667 11 13 1 9 2 3 75737051 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 75737548 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75737687 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75737943 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75737984 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75737997 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75737998 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75738025 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75738233 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 75738247 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 75738474 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 75738484 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 75738611 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75738623 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 75738631 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 75738733 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 75739135 A C N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.333333333333333 0.6 0.0666666666666667 19 11 5 9 1 3 75739386 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 75739441 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 75740197 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 75740329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75740870 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 75740883 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75740898 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 75741029 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 75741364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75741709 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 75741812 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 75741815 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 75742363 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75742886 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 75743955 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 75745983 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75746318 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75746386 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75746387 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75746418 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75746420 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75746602 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 75746709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75746761 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 75747129 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75747195 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75747399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75747458 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75748375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75748513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75748878 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 75749484 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75751258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75752507 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75752813 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75753485 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 75753655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75753777 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75753851 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75753860 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 3 75753892 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 75753904 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 75753920 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 75753978 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 75754371 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 75754398 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.15 0.75 0.1 21 19 3 15 2 3 75754438 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 75754456 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 75754481 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75754693 C A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.117647058823529 0.705882352941177 0.176470588235294 16 18 2 12 3 3 75754798 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 75754855 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 75754934 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75755126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75755168 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 75755425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75755670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75755743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75756013 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 75756027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75756099 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75756252 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75756382 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75758474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75765385 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75768446 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75768633 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75769276 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75769345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75771850 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75772072 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75775446 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75775792 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75775869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75777107 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75777655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75777722 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 75777724 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75781009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75782816 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75786554 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75788882 A C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 75789085 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 75790507 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75792393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75792513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75792838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75793810 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75795053 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75795352 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75795429 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75795543 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75795675 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75795917 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75797933 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75797965 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75798029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75798044 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75799500 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 75802082 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75802586 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75802666 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75802805 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75803007 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75803223 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75803419 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75803500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75803566 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75803631 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 75803722 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75803978 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75804059 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75804088 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75804100 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75804142 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75804287 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75804670 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75804889 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75805888 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 75806427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75806772 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75806819 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75806825 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75807025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75807096 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75807108 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75807573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75807584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75807642 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75807969 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75808066 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75808405 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75809369 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75809943 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 75809946 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 75810058 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 75810526 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75810721 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75810782 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75811181 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75811459 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75811728 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75811956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75811990 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 75812275 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75812503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75812564 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75812581 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75813178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75813200 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75813258 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75813290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75813390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75813802 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75813848 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 75813849 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75813861 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75813865 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75813875 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 75813876 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75814036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75814063 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75814097 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75814272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75814275 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75814703 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 75815407 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75815424 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 75815449 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 75815451 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 75815581 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 75815610 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 75815761 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 75816233 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 75816341 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 75816446 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75816537 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 75816854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75817371 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75818208 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75818255 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 75818812 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75819050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75819156 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 75819478 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 75819629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75819702 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75819705 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75819919 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 75819980 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.0555555555555556 18 18 1 16 1 3 75819990 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75820110 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75820181 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75820213 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75820231 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 75820610 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 75820635 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 75820659 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 75820717 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75821011 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 75821251 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 75821329 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75821333 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75821393 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 75821483 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75821525 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75821964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75822052 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75822179 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 75822185 T A N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 75822246 C T Y Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 75822299 A G Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 75823226 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75823254 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75823255 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 75823329 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 75823334 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 75823374 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75823385 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 75823427 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 75823700 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75823765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75823768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75823960 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 75823967 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75824162 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75824297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75824305 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75824414 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75824435 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75824760 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 75826974 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75828051 G A N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 75830078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75830694 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 75831300 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75831985 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75832308 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 75832723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75832791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75833344 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75833499 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75833504 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 75833522 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 75833526 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 75833608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75833638 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 75833729 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 75834450 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 75834772 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 75834816 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 75835041 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 75835312 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75835457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75835500 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 75835504 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75835603 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75835632 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 75835875 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75835958 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 75836024 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75836073 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75836152 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 75836194 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 75836242 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 75836566 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75836624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75836640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75836843 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75836909 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75836916 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75837268 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75837329 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75837392 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75837488 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75837606 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75837615 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 75837723 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75837964 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 75838275 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 75838520 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 75838735 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 75839107 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75839217 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 75839303 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75839379 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 75839619 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 75839771 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75840127 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 75840152 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 75840311 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 75840537 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 75840983 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 75841020 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 75841259 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 75841327 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 75841345 G C N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 75841407 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 75841630 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75842860 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 75842935 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75842940 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75843118 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 75843606 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 75843662 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75844569 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75844817 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 75846177 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 75847915 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 75848034 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 75848059 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 75848099 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 75848166 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 75848486 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 75848602 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 75848696 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 75848862 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75848916 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75848995 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75849019 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 75849034 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75849086 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75849223 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75849273 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75849323 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 75849407 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75849475 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 75849499 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 75849577 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 75849725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75849749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75849845 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 75850164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75850239 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75850251 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 75850463 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 75850505 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75850527 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75850592 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75850602 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75850831 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75850924 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75850925 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75850951 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75851635 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75851695 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75851711 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75851727 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75851734 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75851807 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 75852011 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 75852168 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 75852194 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75852240 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75852249 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75852362 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75852469 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75852470 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75852575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75852635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75852759 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75853112 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 75853124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75853545 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75853549 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75853618 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75853620 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75853649 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75853672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75853684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75853777 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 75854072 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75854216 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75854237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75854496 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75854520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75854655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75854688 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75854717 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75854746 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75854763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75854774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75854826 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75854993 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75855007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75855043 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75855089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75855298 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75855669 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75856454 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 75856868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75857258 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75857782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75858630 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 75859432 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75859455 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75859500 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75859547 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75859551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75859638 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75859684 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 75861354 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75861619 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75861637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75862623 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75863105 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75863239 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 75863553 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75863631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75863679 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75863719 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75863722 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 75863759 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75863760 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75863835 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75863996 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75864134 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75864262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75864542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75864563 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 75864718 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 75864743 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 75864767 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75864777 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75864873 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75864906 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75864976 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75865029 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75866322 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 75866500 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 75866534 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 75866588 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 75866589 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 75867016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75867172 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 75867208 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 75867408 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 75867471 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 75867547 A G Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 75867628 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75867724 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75867830 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 75868027 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75868033 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 75868087 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75868277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75868359 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75868370 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75868397 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75868416 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75868469 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 75868484 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 75868502 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75868525 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 75868548 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75868605 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75868696 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75868717 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 75868741 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75868814 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75868848 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75868871 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75868879 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 75868884 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75868891 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 75868917 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75868945 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 75868973 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75868981 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 75869002 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 75869008 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 75869028 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 75869108 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 75869192 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 75869270 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75869373 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75869499 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75869744 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 75869776 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 75869815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75869823 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75869868 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 75870384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75870474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75870554 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 75870980 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 75871433 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75871435 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75871456 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 75871870 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75873072 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75873091 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 75873537 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75874225 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 75874699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75875083 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75875546 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75877550 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 75877562 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75877990 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75878359 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75878613 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75879304 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75879532 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 75879610 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 75879621 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 75880293 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75881854 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 75882173 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.222222222222222 0 0.777777777777778 4 14 2 0 7 3 75882424 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75882582 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75882628 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 75882669 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 75882738 T C Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 75882760 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 75882897 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75882913 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75883075 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75883089 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 75883893 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75887235 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75888574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75888670 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 75889298 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75890271 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 75890349 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 75890602 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75890632 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 75890752 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 75890760 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 75890789 T C N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.75 0.0833333333333333 0.166666666666667 19 5 9 1 2 3 75897718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75897746 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 75897791 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 75898046 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75898377 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75898673 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75898769 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 75899073 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75899082 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75899114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75899138 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75899154 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 75899209 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 75899434 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75899495 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75899721 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75899832 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75899922 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 75900005 C T Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 75900018 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 75900025 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 75900330 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 75901065 A C Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 75901150 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75901169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75901252 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 75901352 G A Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 3 75901515 A G Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 75901539 G T Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 75901677 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75901762 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 75901981 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75901988 C G Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 75902010 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75902046 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 75902050 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75902101 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75902107 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75902237 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 75902257 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 75902289 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 75902372 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75902515 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 75902577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75902649 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75902667 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75902698 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 75902711 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75902789 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 75902794 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75902835 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 75902919 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 75902924 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75903222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75903252 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75903327 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75903418 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75903450 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 75903565 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75903619 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75903646 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75903728 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75903812 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 75903857 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 75903863 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75903889 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 75903964 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75904058 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 75904102 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75904223 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75904308 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75904336 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 75904479 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 75904755 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75904841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75904875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75905103 C T N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 75905366 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 75905540 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75905554 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75905564 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75905578 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75905604 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75905654 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 75905699 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75905785 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75905861 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75905870 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75905901 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75905916 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75905967 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75906003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75906039 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75906152 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 75906199 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75906222 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75906406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75906445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75906463 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 75906475 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75906547 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75906617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75906641 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 75906664 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 75906733 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 75906763 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75906801 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75906883 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 75906911 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75906933 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75906943 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75907007 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 75907088 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 75907144 C A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 75907148 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75907184 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75907210 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75907220 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75907303 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75907395 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 75907443 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75907719 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 75907746 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 75907762 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 75907851 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75907965 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 75908008 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 75908034 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 75908257 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75908360 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75908424 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 75908429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75908456 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 75908511 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 75908768 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 75908774 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 75908788 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75908895 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 75908952 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 75909264 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75909308 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75909357 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75909370 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75909507 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 75909550 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75909567 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 75909659 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75909660 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 75909681 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 75909703 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 75909832 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75909850 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 75909888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75909904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75909906 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75909945 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75909959 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75910000 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 75910019 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75910282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75910306 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75910844 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75910930 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75911039 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75911089 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75911091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75911275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75911338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75911675 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75911885 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75912295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75912333 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 75912343 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 75912365 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75912499 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 75912725 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75912743 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75912857 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75912919 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75912942 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75913051 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75913082 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75913097 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75913117 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75913119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75913148 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75913155 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 75913235 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75913243 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75913275 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75913321 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 75913373 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 75913737 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75913951 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75913952 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75914037 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75914075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75914431 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75914469 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75914527 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75914558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75914602 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75914653 A T Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 75914725 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75914751 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 75914870 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75914899 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75914984 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 75915055 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75915060 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 75915131 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 75915156 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 75915183 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75915305 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75915344 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 75915484 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75915488 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 75915621 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75915709 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 75915739 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 75915934 C A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 75916055 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75916134 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 75916141 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 75916297 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 75916327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75916407 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 75916411 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 75916454 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 75916479 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 75916536 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75916635 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75916645 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75916795 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 75916799 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75916867 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75916948 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 75916954 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75917139 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75917169 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75917193 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75917200 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 75917209 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75917265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75917276 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 75917352 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75917355 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75917461 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75917471 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75917536 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75917727 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75917735 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75918083 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75918092 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75918102 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 75918181 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 75918234 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75918260 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75918353 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75918359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75918599 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75918641 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75918720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75918767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75918775 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 75918807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75918885 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 75918995 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 75918996 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75919080 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75919094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75919194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75919510 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75919519 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75919916 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75919971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75919997 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75920220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75920263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75920339 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75920445 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75920578 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 75920812 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75920853 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75920868 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75921023 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75921071 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75921086 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75921227 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75921249 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75921482 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75921651 T G N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 3 75921961 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75922027 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75922057 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75922070 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75922289 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75922343 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75922485 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75922563 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75922787 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75922864 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75922897 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75922922 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75923373 T C N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0 0.545454545454545 0.454545454545455 6 16 0 6 5 3 75923482 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 75923519 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 75923562 C A N N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 5 11 0 5 3 3 75923748 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75923885 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75923894 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75923991 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75924048 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 75924064 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 75924084 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 75924139 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75924175 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75924265 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 75924305 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75924429 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 75924450 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 75924523 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75924583 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 75924629 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75924686 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75924707 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75924720 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75924809 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75924877 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75925117 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 75925136 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75925219 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 75925389 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75925477 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75925541 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 75925652 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75926608 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75926669 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75926889 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 75927119 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 75927523 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 75927631 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75927656 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75927698 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 75927869 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75928527 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75928742 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75928841 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75928994 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75929138 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75929139 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 75929270 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75929329 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75929409 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75929513 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 75929525 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 75929531 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 75938196 A C N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 75938209 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 75938213 A C N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 75938310 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 75938391 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 75938546 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 75938813 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75938828 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75938856 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75938981 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 75938999 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 75939035 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75939036 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75939096 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 75939132 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75939144 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75939307 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 75939774 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75939948 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 75940090 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75940135 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75940163 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 75940242 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 75940587 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75940651 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75940759 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75940785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75940814 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75941114 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 75941264 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75941493 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 75941518 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 75941713 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75941883 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 75941988 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 75942054 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 75942090 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 75942101 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 75942223 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 75942265 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 75942522 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 75942526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75942636 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 75942640 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75942666 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75942764 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 75943535 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 75944070 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 75944688 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75944796 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 75945974 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 75946128 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75946158 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 75946268 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 75946450 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75946453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75946514 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 75946642 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 75946651 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 75946740 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 75946859 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75947137 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 75947151 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75947438 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75947751 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75948049 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 75948338 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75948464 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 75949128 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 75949459 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 75949543 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75949563 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 75949580 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 75949879 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75950893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75951012 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75951730 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 75951776 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 75951800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75951965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75952011 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75952098 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 75953255 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 75953793 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75953839 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 75954474 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75954551 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75954566 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75954726 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 75955306 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75955319 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 75955356 A T Y N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 3 75956143 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75956144 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75956281 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75956682 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75956783 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 75956913 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 75957078 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75957119 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75957612 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 75958031 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75958348 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 75958679 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 75959770 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 75961493 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75961494 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75961635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75961873 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75962655 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 75963626 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75964540 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75965008 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75965309 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 75965345 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 75965786 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 75965892 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75966281 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75966445 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 75966832 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 75967724 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 75967764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75968753 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 75969031 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 75969922 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 75970263 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75970403 G A N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 12 4 5 2 1 3 75970412 G A N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 3 75970480 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 75970646 C A Y N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 3 75970681 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 75970721 C T Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 75970914 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 75970962 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 75971041 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 75971124 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 75971132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75971304 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 75971324 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 75971367 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 75971379 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 75971569 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75971615 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75971707 T A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 75971761 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 75971825 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 75971909 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 75971986 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75972002 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 75972094 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 75972124 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75972384 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 75972411 A T Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 75972744 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 75972934 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 75972982 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 75972985 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 75973112 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 75973185 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75973212 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75973257 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75973268 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 75973412 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 75973513 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 75973529 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 75973770 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 75973811 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 75973829 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 75973844 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 75973853 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75973913 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 75974072 A T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 75974113 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 75974143 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 75974595 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75974716 A C Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 75974756 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 75975061 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 75975261 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 75975287 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 75975334 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 75975385 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 75975497 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 75975555 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75975572 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 75975583 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 75975610 A C N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 75975708 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 75975867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75975996 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 75976129 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 75976173 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 75976291 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 75976315 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 75976345 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 75976474 G C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 75976517 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 75976588 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.75 0.0625 0.1875 25 7 12 1 3 3 75976607 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 75976682 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75976726 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 75977179 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 75977184 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 75977488 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 75977489 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 75977573 G A N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.363636363636364 0.636363636363636 0 15 7 4 7 0 3 75979126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75980285 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75980923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75981119 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75981270 A C N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 3 75981297 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 75981298 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 75981326 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 75981468 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 75981736 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 75982643 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75983109 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75983256 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 75983415 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75983440 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 75983548 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 75983553 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75983676 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75983832 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75984090 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75985036 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 75985086 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 75985142 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 75985655 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 75985680 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75985845 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75985860 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75986169 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75986227 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75986326 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75986455 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 75986705 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 75987287 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75987467 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 75987767 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 75988014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75988262 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75988266 C G Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 75988483 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75988761 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 75988841 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 75988968 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 75989183 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 75989483 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 75989877 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 75990025 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 75990915 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75991695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75992110 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75992206 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75992692 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 75992774 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 75993575 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 75993576 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 75993861 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 75994011 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 75994147 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 75994290 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75994448 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 75996060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75997059 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 75997380 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 75997924 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 75998214 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 75998876 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 75999526 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 75999544 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 75999932 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 76000000 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 76000103 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 76000122 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 76001077 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76001141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76001679 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 76002463 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 76002630 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76002719 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 76003087 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 76003090 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 76003304 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76003644 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 3 76003672 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 3 76003801 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 76004042 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 76004145 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 76004174 A C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 76004387 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 76004472 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 76004744 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76005024 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 76005112 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76005423 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 76005573 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 76005704 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76005782 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 76005859 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 76006157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76006185 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 76006264 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 76006281 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 76006527 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 76006583 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 76006635 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 76007289 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 76007306 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 76007412 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76007609 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 76007718 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 76007786 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 76007816 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 76007877 T G N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 3 76007893 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 76008036 T C N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 3 76009126 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 76009152 T A N N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 5 15 2 1 7 3 76009600 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 76009609 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 76009648 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 76009716 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 76009752 G T N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 76010108 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 76010223 A C N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 76010339 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 76010487 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76010849 T A N N 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 7 9 2 3 3 3 76010857 A T N N 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 6 10 2 2 4 3 76011300 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76011356 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 76011359 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 76011368 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 76011420 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 76011449 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 76011658 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 76011669 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 76011713 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 76011735 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 76011744 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 76011873 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 76012051 T A N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 76012102 A C N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 76012193 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 76012391 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 76012475 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 76012501 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 76012550 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 76012587 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 76012616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76012663 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 76012725 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 76012835 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 76012929 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76012935 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 76012996 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 76013089 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 76013093 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 76013103 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 76013116 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 76013140 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 76013152 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 76013170 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 76013171 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 76013199 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 76013210 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 76013298 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 76013304 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 76013311 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 3 76013351 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 76013409 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 76013417 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 76013783 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 76013815 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 76014185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76014194 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 76014253 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 76014272 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 76014306 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 76014336 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 76014462 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 76016406 C A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 76016451 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 76016473 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 76016542 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76016687 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 76016818 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 76016901 C A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 76016912 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 76017286 A C N N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 6 12 2 2 5 3 76017385 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 76017412 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 76017539 C T Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 76017572 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76017612 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 76017654 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 76018206 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 3 76018263 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 76018328 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76018352 T A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 76018361 A T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 76018372 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 76018373 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 76018478 A T N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 3 76018593 G A N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0.2 0 0.8 2 8 1 0 4 3 76018606 A C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 76018867 A C N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 76018881 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 76019114 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 76019146 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 76019221 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 76019251 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 76019252 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 76019307 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 76019329 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 76019349 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 76019396 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76019411 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 76019435 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 76019438 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 76019543 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76020141 G T N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.166666666666667 0.0833333333333333 0.75 5 19 2 1 9 3 76020273 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76020691 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 76020692 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76020716 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 76020850 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 76021025 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 76021271 T G N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 76021308 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 76021327 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 76021346 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 76021347 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 76021380 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 76021385 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 76021391 C A Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 76021398 G T Y N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 76021467 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 76021468 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76021593 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 76021597 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 76021717 C G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 76021808 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 76021832 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 76021858 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 76021919 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 76021990 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 76022112 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 76022220 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 76022320 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 76022408 C A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 76022793 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 76022815 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 76023095 T G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 76023152 A C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 76023494 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76023678 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 76023906 C G N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 76023918 C A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 76023988 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 76024141 A T N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 3 76024148 G T N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 3 76024154 A C N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 3 76024230 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 76024231 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 76024512 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76024553 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 76024572 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 76025764 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 76026117 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 76026296 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 76026314 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76026405 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76026467 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 76027013 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 76027084 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 76027468 A G N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 3 76027699 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 76028234 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76028358 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 76028368 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 76028383 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 76028559 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76028680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76028754 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 76028816 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 76028934 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 76028964 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76028991 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 76029024 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76029077 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 76029155 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 76029215 A C N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 76029421 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 76029476 A C N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 15 5 7 1 2 3 76029548 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 76029829 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 76029984 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76030181 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76030646 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 76030650 C A N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 3 76030754 G T N N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 3 76031575 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76031953 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76031968 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 76032012 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76032080 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 76032149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76032347 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76032568 G T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 76032570 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 76032664 C A N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 76033979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76034086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76034105 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 76035417 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76035737 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 76035818 G T Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 76035866 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 76036079 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 76037696 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76037791 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76037842 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76037947 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 76038474 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 76039238 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 76040052 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76040252 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 76040356 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76040553 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 76040584 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 76040722 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 76041401 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76041408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76041424 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 76041528 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 76041839 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 76041861 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 76042024 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 76042193 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 76042448 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76042573 C G N N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 6 12 2 2 5 3 76043287 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 76043891 T A Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 76044181 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 76045367 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 76046392 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 76046904 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 76047235 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 76047403 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76047583 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 76047990 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 76048276 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 76048312 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 76048565 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 76048582 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 76048754 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76048877 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 76049298 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 76049333 G T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 76049402 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76049454 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76049993 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 76050318 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76050381 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 76050699 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 76050810 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 76050843 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 76050901 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 76050939 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 76050969 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 76051439 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76051509 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 76051859 T A N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 76051863 G T N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 76051891 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 76051971 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 76052110 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 76052127 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 76052322 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 76052376 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 76052423 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 76052441 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 76052653 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 76052656 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 76052797 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 76052823 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 76052987 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 76053064 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 76053139 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 76053165 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 76053205 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 76053211 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 76053241 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 76053268 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 76053301 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 76053386 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 76053391 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 76053411 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 76053419 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 76053660 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 76053840 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 76053931 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 76054028 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 76054143 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 76054281 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 76054335 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 76054411 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 76054471 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 76054482 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 76054494 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 76054757 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 76054784 A T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 76054919 A T N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 76055056 T A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 76055073 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 76055133 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 76055158 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 76055203 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 76055204 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 76055215 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 76055565 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 76055585 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 76055601 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 76055618 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 76055754 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 76055772 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 76055790 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 76056210 T C Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 76056312 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 76056356 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 76056366 A C Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 76056555 T A Y N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 3 76056584 A G Y Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 76057049 A G Y Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 3 76057103 A G Y Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 76057315 G A Y Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 3 76057324 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 3 76057387 A G Y Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 76057416 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 4 2 2 0 1 3 76057456 C T Y Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 3 76057462 C T Y Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 6 6 2 2 2 3 76057639 A T Y N 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 3 76058309 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 76058363 T C Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 76058439 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 76058479 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 76058489 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 76058511 A G Y Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 3 76058530 G T Y N 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 6 8 1 4 2 3 76058539 A G Y Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 3 76058547 C T Y Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 7 9 2 3 3 3 76058806 C G Y N 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 3 76059016 C T N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 3 76059026 T C N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 3 76059092 G A Y Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 76059109 G C Y N 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 3 76059258 T C Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 76059294 T C Y Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 3 76059303 G A Y Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 76059390 T G Y N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 3 76059408 C G Y N 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.75 0 0.25 6 2 3 0 1 3 76059433 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 76059440 C A N N 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.4 0 0.6 4 6 2 0 3 3 76059481 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 76059512 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 76059715 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 76059726 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 76059763 G T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 76059877 C G N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 76059896 T A Y N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 3 76059964 G A Y Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0.5 0 0.5 2 2 1 0 1 3 76060065 C A Y N 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 5 9 2 1 4 3 76060121 A T Y N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 3 76060132 C T Y Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 3 76060246 G T N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 3 76060247 G T N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 76060283 G T N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 76060485 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 3 76060498 T G N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 76060503 A T N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 76060546 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 76060557 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 76060581 A C Y N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 76060682 T C Y Y 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 3 76060797 A T Y N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 3 76060957 C T Y Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 3 76061030 T C Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 76061058 T G Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 76061118 A T Y N 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 3 76061170 T A Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 76061193 T G Y N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 76061235 G T Y N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 76061300 T A Y N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 76061402 C A Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 76061421 T A Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 76061435 G T Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 76061443 T A Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 76061476 A G Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 76061498 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 76061524 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 76061534 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 76061577 G T Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 76061595 T C Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 76061645 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 76061667 C A Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 76061900 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 76061950 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 76061958 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 76061969 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 76061991 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 76062215 T C N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 76062373 A T N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0 0.923076923076923 0.0769230769230769 12 14 0 12 1 3 76062418 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 76062422 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 76062502 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 76062579 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 76062597 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 76062635 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 76062804 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76062975 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 76063183 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 76063324 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 76063363 T G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 76063369 G T N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 76063424 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 76063568 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 76063593 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 76063785 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 76063856 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 76063911 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 76064197 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 76064250 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 76064325 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76064424 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 76064551 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 76064760 A G Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 76064827 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 76064871 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 76065077 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 76065122 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 76065166 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 76065353 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 76065373 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 76065433 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 76065444 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 76065466 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 76065481 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 76065542 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76065670 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76065789 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 76065912 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 76066049 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76066124 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 76066216 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 76066313 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 76066325 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 76066460 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 76066688 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 76067066 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 76067378 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 76067500 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 76067564 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 76067740 T G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 76067874 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76067900 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 76068303 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 76068793 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 76068900 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 76068915 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 76068953 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 76068963 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 76069388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76069559 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 76069690 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76069759 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 76069859 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 76069947 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 76070089 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 76070125 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 76070183 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 76070391 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76070451 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76070581 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76070590 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76071017 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76071301 T C Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 76071363 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 76071408 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76071433 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76071510 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76071749 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76071819 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76071873 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76071936 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 76072072 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76072130 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76072278 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 76072485 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76072646 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76072798 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76072945 C A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 76073160 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76073177 G A Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 76073385 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 76073467 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76073517 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76073601 A G Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 76073622 C T Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 76073774 T A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 76073863 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76074186 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 76074442 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 76074708 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76074734 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 76075282 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 76075655 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76077737 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76077950 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76078516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76078653 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76078798 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 76079625 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 76079652 C A N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 76079689 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76079718 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 76079787 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76079801 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 76079854 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 76080076 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 76080113 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76080695 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76080902 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 76080904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76081897 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76081987 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76082165 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76083273 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76083774 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76084059 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 76084174 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 76084491 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76085591 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 76085606 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 76085819 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76086164 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 76086199 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 76086233 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 76087409 T C N Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0 1 0 6 6 0 6 0 3 76088436 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 76088683 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76089203 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76089380 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 76089428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76089961 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76090020 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 76090616 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76091441 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76092475 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 76092656 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76093120 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 76093998 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76094560 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 76094704 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76095457 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 76095886 C A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 76095985 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 76096331 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 76096749 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 76097048 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 76097165 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 76098183 G C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 76098717 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76098936 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76099465 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 76100320 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 76101041 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76101549 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76101941 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76103648 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76104568 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76106200 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76107677 C G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 76108358 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76108642 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 76108865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76108920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76109305 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76109591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76110461 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76110774 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76110799 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 76110951 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 76111229 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 76111521 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 76111991 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 76112085 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76112484 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76112692 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76112860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76113338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76113482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76114756 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76115773 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76116402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76117025 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76118536 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 76118598 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 76118901 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76118996 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76119265 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76119789 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 76120626 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 76121369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76121930 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 76122141 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 76122164 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 76122379 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 76122644 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76122875 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76123798 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 76123899 A G N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 3 76123957 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76123991 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 76125781 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76127308 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76128408 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76128447 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76128486 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 76130225 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 76131348 T C N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.153846153846154 21 5 10 1 2 3 76131869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76132894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76134103 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76134833 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 76135682 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 76136314 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76136564 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 76137054 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76137686 G A N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 76138558 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 76139061 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 76139287 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76139348 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 76139457 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76139611 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 76140060 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76140064 G C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 76141716 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76141842 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76142217 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 76142257 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 76142403 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 76143075 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76143438 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76143939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76143974 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76144279 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 76144338 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 76144645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76145425 A C N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 76145451 T G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 76145688 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 76146752 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 76147759 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 76147874 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 76148744 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 76149601 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 76149607 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 76149710 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 76150347 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 76151534 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76151646 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 76151936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76153199 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 76153252 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 76153294 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 76153969 T C N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 76154124 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 76155377 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 76157290 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 76158283 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 76159012 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 76159999 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76160243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76160878 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76161032 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76161182 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 76161250 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 76161386 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 76161398 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 76161577 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76161603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76161611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76161627 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76161656 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76161706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76161948 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76161949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76161997 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76162033 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76162045 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76162145 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76162228 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76162390 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76162401 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76162402 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76162412 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76162498 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 76162528 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76162563 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76162580 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76162644 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76162656 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76162682 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76162694 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 76162737 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76162757 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76162784 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 76162785 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76162813 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76162836 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76162922 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76162964 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76163069 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76163073 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76163203 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 76163324 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76163349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76163372 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76163463 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 76163699 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 76163716 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76163720 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76163771 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76163789 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76163880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76163888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76163925 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76164016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76164122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76164165 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76164187 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76164346 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76164376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76164398 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76164470 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76164647 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76164681 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76164781 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76164858 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76164898 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76164922 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76164940 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76164944 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76164952 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76165015 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76165065 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76165121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76165223 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76165256 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76165317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76165324 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 76165407 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 76165430 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76165983 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 76166100 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 76166234 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76166310 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76166423 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 76166664 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 76166864 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76166990 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76167181 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76167230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76167273 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 76167298 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76167409 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 76167433 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76167479 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76167569 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76167577 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 76167618 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76167650 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 76167719 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76167786 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 76167789 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 76167816 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76167890 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76167918 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76167970 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76168000 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76168009 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76168120 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76168153 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76168344 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76168448 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76168573 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76168773 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76168833 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76168919 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76169030 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76169041 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76169052 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76169272 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76169340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76169397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76169403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76169508 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76169616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76169769 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76170127 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 76170449 A G Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 76170456 G C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 76171266 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76171780 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 76171850 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 76171942 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76172003 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 76172246 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76172354 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76172484 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 76172709 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76172780 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 76173140 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 76173706 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76173869 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76174647 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 76174818 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 76175410 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76175491 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 76175559 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 76175594 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76175822 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 76176138 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 76176187 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 76176287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76176366 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 76176445 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 76176517 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 76176557 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 76176621 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 76176729 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76176946 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76177294 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76177326 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 76177413 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 76177640 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76177734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76178346 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 76178426 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 76178731 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 76179205 G C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 76179370 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 76179498 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 76180114 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76180119 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 76180185 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76180336 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76180627 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76180923 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 76181352 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76181492 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76182096 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76182097 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76183259 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76183302 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 76184346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76184929 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76185312 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 76185359 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 76185569 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76185593 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 76185702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76185755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76185813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76185834 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76186001 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76186002 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76186093 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 76186165 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76186184 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76186201 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76186208 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76186242 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76186284 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 76186381 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76186393 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76186428 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76186548 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76186551 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76186563 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76186566 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76186614 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76186649 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 76186836 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76186932 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76187105 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76187165 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76187192 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76187218 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76187246 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76187257 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76187263 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76187626 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76187686 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76187698 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76187828 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76187934 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76188027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76188102 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76188133 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76188175 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76188183 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76188252 C G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 76188429 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76188441 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76188491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76188495 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76188615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76188633 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76188941 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76189021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76189065 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76189125 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76189296 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76189300 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76189341 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76189377 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76189380 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76189396 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76189448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76189472 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76189530 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 76189555 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76189635 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76189662 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 76189729 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76189765 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76189927 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76190077 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 76190155 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 3 76190226 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76190441 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76190772 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76190941 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76191078 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 76191148 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 76191287 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 76191415 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76191505 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 76192111 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76192265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76192271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76192349 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76192473 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 76192491 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 76192682 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 76192770 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76192871 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76193088 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76193207 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 76193663 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 76193734 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 76193755 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 76193922 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76194556 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 76194920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76195216 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 76195308 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 76196379 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76196430 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76197404 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 76197534 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 76197661 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 76198666 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76199104 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 76200080 A T Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 76200498 T C Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 76201316 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76201327 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76201455 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76202703 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 76203387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76203563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76203603 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76203604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76204365 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76204629 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76207603 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76209135 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76209892 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76211501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76212993 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76213332 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 76213418 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76213462 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76215735 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76215736 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76215948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76216155 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 76216296 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 76217192 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76219267 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76219479 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76219775 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76219913 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76220993 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 76221371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76221498 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76222066 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 76222306 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76222449 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 76222625 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76226237 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 76226883 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 76228178 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 76229255 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76230838 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76230948 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76231703 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 76232285 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 76233021 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 76233217 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 76233288 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 76233559 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76235100 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 76235205 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 76235446 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76235574 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76235597 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76236732 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76237311 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76237560 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 76237932 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76238020 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76238504 T C N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 76238693 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 76239154 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 76239165 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76239300 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76239427 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 76239492 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76239603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76240455 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 76240941 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 76240984 G A N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 76241337 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 3 76241780 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 76242005 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 76242136 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 76242164 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 76242269 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 76242432 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76244282 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 76244549 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 76245019 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 76245123 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 76245242 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 76246084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76247151 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 76248151 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 76248271 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 76248535 T G Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 3 76248937 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 76249021 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 76249213 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 76249316 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76249487 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 76249526 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 76250461 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 76250969 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 76251061 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 76251190 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 76251485 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76251648 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 76251830 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76252544 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76253125 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 76253342 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76254531 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76254710 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76254936 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76255129 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76255348 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76255479 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 76255778 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76255820 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76256014 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76257149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76257901 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76258185 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76259879 A T Y N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.230769230769231 0.769230769230769 0 16 10 3 10 0 3 76259947 T A N N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 3 76261184 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76262049 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76262166 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76263374 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76263418 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76266039 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76266342 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76267931 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76268833 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76269157 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 76269470 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76270606 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76271999 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 76272225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76272284 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76272787 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76273829 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 76274266 A G Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 3 76274564 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76274837 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76275749 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76276222 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76276927 T G Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 76277148 T A Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 76278002 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76278020 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76278916 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76278963 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76279064 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76279100 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76279504 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76280037 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76281776 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76282274 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76282711 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76283249 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76283339 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76284668 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76284740 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76285216 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 76285589 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76285770 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 76285872 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 76285880 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 76286688 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76288280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76288718 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0 0.705882352941177 0.294117647058824 12 22 0 12 5 3 76289176 C T Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 76289348 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 76289480 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 76290449 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76290778 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 76290934 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 76291325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76292303 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76293045 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76293533 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76293792 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76294556 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76294834 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76295064 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76295501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76296637 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76296750 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 76297022 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76297418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76297509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76298067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76298304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76298321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76299091 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 76299424 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76301826 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 76303308 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76303917 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76304767 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76305677 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0 0.894736842105263 0.105263157894737 17 21 0 17 2 3 76305687 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 16 20 0 16 2 3 76306066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76306260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76306377 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76306488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76307411 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76307693 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76307773 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76309189 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76309448 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76309695 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76309785 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76310352 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76310994 G A Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 76311311 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76311962 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76312041 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76312436 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76312505 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76313230 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76313393 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 76313674 C T Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 76314048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76314140 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76315108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76316443 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76316637 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 76317155 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 76317822 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 76318384 C G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 76318550 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76319439 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76319921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76320488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76320846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76321573 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 76323251 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76323406 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76324195 A C Y N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 76324661 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76324812 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76325473 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76325514 G T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 76326192 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 76326313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76327000 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76327212 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76327742 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76328488 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76329328 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76330304 A T N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 76330828 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76331192 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76331351 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76332562 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76333410 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76333577 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76333624 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 76333894 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76333929 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76334136 C G Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 76334391 C T Y Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.0909090909090909 11 11 1 9 1 3 76336485 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 76339894 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 76340002 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 76340425 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76340681 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76341471 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 76341594 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 76341633 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 76341655 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76342709 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76343646 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76344315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76344366 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 76344929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76344940 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 76344961 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 76345328 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 76346069 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 76346135 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 76346389 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 76346556 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76346648 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76347129 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76347325 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 76347752 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76347784 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76348410 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76348837 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76348844 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76349061 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76349646 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76349700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76349997 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76350079 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76350556 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 76350760 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76353650 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76354802 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76354988 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76355178 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76355663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76356484 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76356765 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76357953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76358051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76362150 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 76363292 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76363419 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76363459 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76365007 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76365700 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76365951 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76366643 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76366828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76366877 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76368082 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76368226 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76369691 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76369815 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76370682 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76371150 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76371209 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 76371304 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76372383 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76372403 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 76372749 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76372848 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76373509 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76373876 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 76374035 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76374823 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 76375361 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76376068 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76376651 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76377722 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 76378366 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76379095 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76379791 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76381570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76383300 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76383762 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76383781 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76383845 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76384885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76385063 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76386195 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76386246 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76387355 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 76388105 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76388482 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 76388740 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 76388819 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 76388879 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 76388891 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 76388990 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 76389086 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 76389476 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 76389587 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 76389627 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 76389707 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 76390342 A T Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 76390485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76390560 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 76390880 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 76391079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76391242 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76391484 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76392052 T A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 76392723 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 76393037 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 76393189 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 76393230 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 76393440 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76394004 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 76394673 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76394740 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76394759 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 76394788 A C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 76394812 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76395234 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 76395254 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 76395566 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76395881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76396139 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 76396147 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 76396324 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76396353 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76396373 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76396621 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76397137 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76397170 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 76397555 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 76397697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76398007 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 76398154 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 76398168 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 76398222 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76398319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76398614 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 76398778 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 76398896 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 76399482 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 76399604 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 76399613 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 76399817 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 76399997 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 76400016 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 76400220 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76400236 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 76400315 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 76400480 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 76400541 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76401364 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76401590 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 76401649 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76401939 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 76402190 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76402293 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 76402361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76402412 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76402423 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76402456 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76402473 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76402496 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76402557 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76402582 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76409037 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76409057 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76409059 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76409177 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 76409187 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76409199 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76409204 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76409215 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76409382 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76409530 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76410087 A G N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 76410313 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 76410512 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76410557 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 76410618 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76410707 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 76410792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76411077 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76411082 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 76411183 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76411202 T C N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.538461538461538 0.230769230769231 0.230769230769231 17 9 7 3 3 3 76411354 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 76411383 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76411432 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76411470 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76411593 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 76411776 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 76411784 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76411976 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 76412056 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 76412378 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76412389 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76412490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76412563 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76412817 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 76412828 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76412839 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76412840 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 76413395 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 76413401 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 76413607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76414585 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76414926 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76415404 G T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 76415414 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 76415422 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76415596 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76415641 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76415729 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76415732 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76415990 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76416021 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76416024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76416040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76416141 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76416599 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 76416662 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76416691 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76416717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76416944 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76417152 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76417234 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 76417275 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 76417286 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 76417310 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 76417345 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76417349 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 76417406 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 76417467 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 76417512 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 76417614 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 76417629 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 76417675 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 76417859 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 76417879 C G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 76417981 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76418115 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 76418117 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 76418185 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 76418391 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 76418428 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 76418494 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 76418501 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 76418516 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 76418582 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76418592 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 76418636 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76418666 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 76418743 A C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 76418763 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 76418831 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 76418832 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 76418887 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 76418894 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 76418931 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 76418951 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 76419080 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 76419128 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 76419199 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 76419478 A G N Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 8 8 2 4 2 3 76419610 T A N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 3 76419744 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 76419865 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 76420146 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76420336 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 76420349 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 76420688 T A Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 76420703 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76420832 G C Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 76421480 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 76421510 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 76422025 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 76422242 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 76422300 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 76422470 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 76422532 C T Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 76422545 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 76422637 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76422830 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 76423117 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76423211 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76423481 G A Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 76423812 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76423928 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76423953 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76424214 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76424218 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76424233 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76424301 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 76424303 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76424723 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76424749 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76424916 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76424920 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76424945 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76424964 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76425033 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76425202 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76425235 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76425400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76425411 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76425550 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76425627 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76425682 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76425796 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 76425829 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76425872 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76425974 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76426026 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76426042 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76426080 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76426131 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76426142 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76426157 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76426314 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76426332 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76426362 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76426496 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76426552 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76426876 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76426893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76426909 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76426975 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76427091 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76427099 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76427189 A G N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 76427225 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76427255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76427305 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76427311 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76427343 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76427748 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76429287 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76429653 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76429753 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76430102 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76430235 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76430439 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 76430935 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76431297 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 76431670 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 76432350 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 76433909 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 76434358 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76434452 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76435935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76436138 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76436740 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 76436962 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76437326 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76437829 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 76438489 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 76438698 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 76438705 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76438740 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76438755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76439548 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76439666 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76439803 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 76439948 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76440375 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76440448 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 76440902 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76441350 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76441503 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 76441842 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76441875 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76442241 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76442267 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76442552 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 76442563 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 76442596 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76442895 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 76442905 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 76442976 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 76442996 A C N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 76443020 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 76443125 A G N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 3 76443234 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76443321 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76443557 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 76443741 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 76443745 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 76443802 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 76443836 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 76443850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76444098 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 76444494 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 76444731 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 76445417 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76445726 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 76445841 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76446024 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76446084 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 76447457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76447489 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76447955 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 76448486 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76449623 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76449694 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76449826 C A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 76450181 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76450366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76450504 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76450657 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76451170 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 76451263 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76452566 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76452780 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76454014 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 76454708 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76455205 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76455263 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 76455580 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 76456399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76456522 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 76456565 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76456743 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76457063 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 76457610 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 76457653 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76457800 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 76458595 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76458841 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76458842 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 76458906 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76459087 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76459193 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 76459375 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76459458 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 76459526 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76459527 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76459548 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76459555 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76459717 T C N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 76460326 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 76460438 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76460575 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 76460642 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 76460864 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76461076 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 76462739 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 76462764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76462889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76463058 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76463067 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76463078 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 76463087 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 76463158 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76463734 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76463770 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76464137 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76464286 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 76464446 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 76464795 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76467137 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76468057 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76469236 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 76471419 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76471420 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76472938 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0 0.85 0.15 17 23 0 17 3 3 76476106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76477772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76479214 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76480017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76480179 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 76481290 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76483978 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76485444 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 76485671 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 76488713 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 76488782 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76488801 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 76489345 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76489381 A T Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 76489528 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76489713 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76489801 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76489853 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76490225 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76490651 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 76491020 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76491073 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76491284 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76491454 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76491540 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 76491586 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 76491744 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76492147 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 76492185 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76492195 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76492230 C A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 76492263 G A N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 76492287 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 76492328 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 76492354 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 76492417 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 76492570 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76492938 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76492950 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76493027 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76493098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76493109 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76493266 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76493295 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76493937 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76494176 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76494263 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76494295 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76494416 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76494473 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76494554 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76494661 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76494913 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76494918 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76494973 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76495007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76495101 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76495325 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76495376 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76495384 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76495403 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76495719 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76495884 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 76496053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76496318 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76496359 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76496369 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76496435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76496467 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76496511 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76496584 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76496610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76496623 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76496652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76496701 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76496709 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76496829 A G Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 76496998 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76497223 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76498428 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76499388 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76500535 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 76500568 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 76502274 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76503631 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76504003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76504004 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76504596 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 76506168 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76506328 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76508020 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76508255 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 76508368 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76508958 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 76510510 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76513029 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76513169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76513564 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76513591 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76514303 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76514534 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76514646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76514846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76515540 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76515748 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76517656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76518095 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76518848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76518858 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76519571 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 76519687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76519784 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76519797 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 76519824 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 76519892 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 76519930 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 76519962 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76520048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76520059 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 76520084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76520094 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 76520237 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 76520423 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 76520457 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 76520512 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 76523760 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76523791 G T N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 76523900 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 76524167 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76524248 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76524279 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76524317 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76524411 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76524530 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 76524683 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 76524690 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 76524710 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76524771 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76524847 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 76524976 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76525083 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 76525420 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 76525471 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 76525580 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76525611 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 76525878 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 76526831 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76526866 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76527105 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 76527187 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76527497 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 76527560 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76527608 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76527625 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 76527700 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76527772 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76527799 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76527844 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76527851 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76527973 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 76528049 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 76528192 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76528275 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76528323 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76528415 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76528433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76528449 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76528535 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76528585 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76528651 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76528660 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76528757 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76529414 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76529493 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76529743 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 76529864 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76530547 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 76530673 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76531091 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76531257 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76531445 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 76531754 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76533376 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76534084 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76535128 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76535303 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 76535658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76537284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76538248 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76538567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76538975 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 76539184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76539418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76542132 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76545381 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 76545918 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76545997 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76546936 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76548306 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 76548341 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76548372 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76550337 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 76550872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76551993 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76552155 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 76552522 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 76552645 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 76552931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76553603 T C N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.230769230769231 0.0769230769230769 0.692307692307692 7 19 3 1 9 3 76553799 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 76554087 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 76554103 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76554451 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76555286 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 76557953 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 76558311 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76558370 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76558855 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76559040 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 3 76559952 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76560150 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76560244 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 76560249 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76561653 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 76563060 T G Y N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 76563279 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 76565298 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76565323 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76565908 T G Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 76565911 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 76565921 T A Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 76565926 C T Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 76566010 T A Y N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 76566037 G C Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 76566436 T C Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 3 76566797 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76566871 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76567127 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 76567232 A C N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 76567952 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 76568962 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76569211 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76569485 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76569595 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 76569600 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76569711 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76570265 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76570291 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76570380 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 76570396 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 76570569 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 76570582 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 76570706 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 76571070 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 76571129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76571254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76571305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76571317 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 76571371 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76571396 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 76571410 T A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 76571420 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 76571513 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76571531 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76571613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76571617 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76571624 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76571641 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76571649 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76571773 A G N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 3 76571801 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 76571817 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 76571920 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 76571949 T A Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 76571963 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76571994 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76572063 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76572158 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76572270 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76572338 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76572421 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76572473 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76572522 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76572644 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76572679 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 76572702 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76572816 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76572907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76572936 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76573031 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76573067 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 76573124 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76573175 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76573176 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76573572 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 76573664 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 76573782 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 76573807 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 76573879 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76573882 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 76573995 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 76574062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76574121 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76574273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76574605 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 76574781 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 76574993 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76575441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76575585 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 76575653 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76575877 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 76576188 G A N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.166666666666667 0.583333333333333 0.25 11 13 2 7 3 3 76576600 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 76577199 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 76577208 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 76577297 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76577540 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76578110 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 76578481 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76582537 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76583052 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76583068 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 76583099 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76583150 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76583406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76583483 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76583796 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76584140 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 76584455 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 76584457 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76584486 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76584666 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 76584683 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 76584898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76585184 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 76585322 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 76585353 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 76585416 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 76585482 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 76586053 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76586083 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 76586116 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 76586149 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 76586162 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.210526315789474 0.0526315789473684 0.736842105263158 9 29 4 1 14 3 76586210 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76586246 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 76586425 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 76586543 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 76586571 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76586573 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 76587123 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 76587147 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 76587158 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 76587405 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 76587420 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 76587464 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 76587515 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 76587681 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 76587697 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76587752 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 76588088 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 76588196 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76588613 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 3 76588986 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 76589002 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 76589103 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76589262 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76589527 C G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 76589786 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 76590308 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 76590381 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 76590510 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 76590634 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 76590722 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 76590766 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76590782 G C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 76590886 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 76590961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76591533 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76591659 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 76592658 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76592667 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76592689 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76596096 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76597941 T C Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.615384615384615 0.153846153846154 0.230769230769231 18 8 8 2 3 3 76599383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76600378 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 76600846 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 76605502 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 76605911 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76607518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76609948 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 76609996 C G Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 3 76610014 C T Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 76610392 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76610783 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 76611789 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 76611806 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76613787 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76614351 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76614609 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76616854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76617661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76619958 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76625197 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76628555 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76628727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76629869 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 76632100 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76635006 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 76637003 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76638324 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76640204 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 76640395 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76640422 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 76640525 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76640927 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76640957 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 76641656 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76641920 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76642517 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 3 76642901 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76643202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76643278 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76643302 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76643366 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76643624 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76644045 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76644205 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 76644540 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76645180 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76646525 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 76647610 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 76648024 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 76648192 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76648209 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76648299 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 76648780 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76648781 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76648930 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 76648947 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 76649017 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76649855 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76649865 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76649907 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 76650025 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 76650389 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76650825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76650869 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 76652015 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76652253 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76652478 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 76652502 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76652712 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76652776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76653260 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76653383 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76653434 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 76653457 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76653484 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76653489 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76653557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76653603 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76653770 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76653823 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 76653826 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76653849 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76653850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76653876 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 76653892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76654027 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76654029 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76654100 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76654110 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 76654165 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76656980 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 76657302 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 76657480 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 76657494 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76657502 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 76657513 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 76657674 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.176470588235294 27 7 13 1 3 3 76657785 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 76657909 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76658017 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76658162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76658359 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 76658432 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76658528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76658566 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 76658626 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76658875 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 76658974 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 76659028 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 3 76659294 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 76659356 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 76659484 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76659657 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76659668 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 76660094 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76660330 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 76660493 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 76660833 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 76661024 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76661090 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76661235 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76661358 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 76661593 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76661675 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 76661798 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 76661950 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 76661980 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 76662022 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 76662107 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76662134 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76662364 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76662424 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 76663111 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76663130 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 76663191 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76663244 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76663950 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76663980 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 76664213 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 76664679 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76664796 C A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 76664804 A C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 76664852 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 76664874 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 76664889 C G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 76664965 T A N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 76664981 A T N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 76665165 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 76665171 C A N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 76665272 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 76665363 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 76665628 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 76665859 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 76665866 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 76665873 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 76666433 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 76666475 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76666596 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76666634 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76666641 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 76666665 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76666674 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76666685 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76666698 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76666707 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76666746 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 76666788 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 76666884 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76666919 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 76667009 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76667021 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76667057 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 76667071 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76667073 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76667140 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 76667161 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76667177 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76667257 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 76667319 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76667389 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76667409 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76667415 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76667629 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 76667654 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 76668239 A T N N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 76668253 C A N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 3 76668399 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 76668666 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 76668684 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 76668810 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76668848 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76668901 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 76669109 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 76669222 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76669437 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76669533 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 76669681 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76669742 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 76669812 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76669817 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76670046 A C N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 76670169 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 76670238 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 76670486 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76670564 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 76670576 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 76671187 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76671188 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 76671342 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 76671424 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76671442 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76671479 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 76671501 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 76671581 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76671663 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 76671668 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76671682 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 76671757 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 76671820 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76671909 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 76671983 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 76672095 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76672113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76672176 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76672308 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76672350 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 76672410 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 76672428 A G N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.75 0.0833333333333333 0.166666666666667 19 5 9 1 2 3 76672495 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76672510 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76672542 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 76672631 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 76672635 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76672858 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 76672886 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 76673039 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 76673283 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76673302 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76673361 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76673377 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76673479 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76673562 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76673623 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 76673654 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76673674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76673740 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76673742 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76673783 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76673785 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76673827 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 76673831 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 76673928 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 76673952 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 76674010 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76674088 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76674089 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76674103 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76674186 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76674225 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76674235 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76674240 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76674257 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76674266 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76674292 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76674299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76674303 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76674418 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76674465 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76674514 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76674900 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 76674901 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 76674952 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 76675188 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76675324 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76675332 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76675455 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 76675490 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76675524 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 76675568 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76675640 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76675747 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76675754 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76675783 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76675791 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76676035 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76676096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76676138 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76676165 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76676166 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76676245 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76676355 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76676519 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76676568 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76676590 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76676623 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76676813 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76677357 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76677376 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76677399 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76677448 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76677746 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 76677776 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 76677792 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 76677846 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76677850 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76677993 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76678081 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76678094 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76678167 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 76678239 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76678274 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76678361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76678712 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 76678830 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76678843 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 76678918 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 76679078 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76679145 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 76679161 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 76679169 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 76679357 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 76679391 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76679396 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76679546 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76679626 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76679794 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76680554 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76680734 G T N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 3 76680747 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 3 76680913 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 3 76681222 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 76681241 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76681310 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76681323 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 76681411 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76681499 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76681536 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 76681543 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76681582 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76681665 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76682302 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 76682437 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76682647 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76682698 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76682874 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76682896 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 76682926 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 76682927 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 76682960 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76683253 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76683312 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76683493 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76683497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76683916 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76684164 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76684431 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76684582 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76684598 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 76684613 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76684623 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76685145 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76685293 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76685622 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76685844 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 76685883 G T N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 76686160 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76686244 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 76686322 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76686572 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 76686575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76686737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76686810 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76686830 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76686935 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76687077 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76687118 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76687467 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 76687488 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76687657 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 76687675 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76687692 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76687852 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 76687881 C A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 76687941 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76688626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76688770 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76688851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76688893 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76689067 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 76689119 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 76689164 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 76689184 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 76689486 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 76689776 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76689927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76697929 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76697988 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76698394 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76699040 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76699069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76699583 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76699797 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 76699898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76700458 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 76700935 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76701049 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 76702022 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76702362 G C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 76702619 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 76702925 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 76702959 T A Y N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 3 76704426 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76704904 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 76706728 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76707060 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76708314 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76708714 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76708715 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76708777 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76708974 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76709105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76709251 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76709971 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76710258 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 76710812 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76711567 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76711677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76712714 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 76712790 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 76713162 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76713247 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 76714276 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76715148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76715918 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76716418 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76716556 G T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 76716614 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76716787 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 76717046 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 76717879 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 76718097 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 76720476 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76720704 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76721228 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 76721392 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 76721427 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 76721461 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76721533 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76721611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76722394 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76723371 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76724003 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 76724404 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76724814 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76726414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76726421 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76726675 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76726763 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76727008 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 76727188 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76727980 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 76728009 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76728133 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76728533 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 76728607 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76732798 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 76734813 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76737712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76737797 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76738115 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 76738132 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 76738237 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76738302 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 76738889 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76740053 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76740257 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76741252 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 76741390 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76741409 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76741761 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 76741844 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 76741873 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76742153 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76742159 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 76742542 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 76743076 A T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 76743209 T A N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 3 76743740 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76744097 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76744324 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 76744339 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 76744497 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76744545 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 76744978 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76744982 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 76745003 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 76745036 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 76745039 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76745082 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 76745100 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 76745129 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 76745163 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 76745164 T G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 76745248 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 76746001 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76746390 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 76746841 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76747533 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 76747633 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76747888 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 76747908 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 76748391 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 76748875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76750151 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 76750224 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 76750361 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76750951 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 76751329 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 76751369 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 76751416 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 76751532 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 76751874 T A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 76752093 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 76752249 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 76752287 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 76752383 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 76752463 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76752475 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 76752480 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 76752544 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 76752546 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 76752561 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 76752782 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 76752799 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 76752972 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 76752987 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 76753003 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 76753013 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 76753072 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 76753184 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 76753557 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 76753604 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 76753609 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 76753946 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 76754122 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 76754256 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 76754278 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 76754290 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 76754413 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 76754516 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76756585 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 76756744 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 76756750 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 76756804 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 76757162 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76757175 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 76757189 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76757261 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 76757319 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 76757339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76757402 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 76757447 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 76757494 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 76757549 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 76757627 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 76757770 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 76757774 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76757995 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 76758012 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 76758228 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 76758893 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 76759280 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 76759333 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 76759386 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76759437 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76759486 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 76760749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76760773 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 76760854 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76761050 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76762495 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76762550 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 76762573 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76763071 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 76763187 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 76763542 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 76763672 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 76763673 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 76763933 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 76763968 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76763976 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 76764327 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 76764603 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 76764752 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 76764838 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 76764973 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 76765027 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 76765034 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76765147 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76765533 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 76765688 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76765930 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 76765943 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 76766512 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 76766606 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 76766794 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 76767445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76768753 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76769676 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 76770167 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76772046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76772177 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76774680 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76774977 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76776214 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76777241 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76777324 G A Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 76782194 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76783284 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76783417 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76783730 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76786011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76788533 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 76788692 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 76788874 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76789068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76789235 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76790407 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76793173 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76794111 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76796184 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 76800177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76800296 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 76800644 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 76801006 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76801278 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76801785 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76801958 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 76802013 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 76802405 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 76802813 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76803219 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76803287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76803399 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 76803598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76803964 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76805553 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76806060 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76809754 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76810654 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 76812279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76814980 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76819276 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 76821061 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76828211 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76831427 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76834448 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76836559 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76837803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76841516 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76841655 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76842766 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76843887 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76845081 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76847300 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 76848173 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 76848812 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 76851975 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 76858376 A G Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 76859905 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 76860030 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76860209 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76860386 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76862246 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76863383 G C Y N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 76863858 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 76864068 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 76864960 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76865436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76865498 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76866676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76866704 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76868911 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 76869515 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76869806 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 76869835 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76870385 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76872509 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76873099 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76875057 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76875573 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76878173 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76878267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76878579 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76878720 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76878738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76878842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76878844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76881553 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 76881907 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76884014 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 76884703 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76885154 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76887275 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76888701 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76889005 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76889760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76890275 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 76890709 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76892303 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76892766 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 76894688 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 76896621 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76896692 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76897273 C T Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 76897560 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76897949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76898842 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76899002 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76901226 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76901284 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76901838 T G N N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 3 76903095 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76903147 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76903313 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76903566 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76903569 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76904310 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76904544 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76905059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76905195 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76905468 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76906654 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 76906959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76918120 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 76918188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76918772 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76918836 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 16 20 0 16 2 3 76919444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76919597 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76920429 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76920461 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76921642 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76921755 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76922997 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 76924244 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76924564 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76924646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76926068 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 76926879 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76927324 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 76929810 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76929865 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76929914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76930260 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76930520 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76930688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76930915 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76935913 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 76935947 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 76936517 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 76936983 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76937036 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76937759 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76940486 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76940701 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76941542 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76942741 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 76944129 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 76944837 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 76946559 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 76947841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76948222 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76951376 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76951627 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76954256 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76954992 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 76956706 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76957191 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76957428 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76957466 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76957720 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76958044 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76958397 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76958553 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 76962595 A C Y N 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.3 0.7 0 13 7 3 7 0 3 76962602 T C Y Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0 0.636363636363636 0.363636363636364 7 15 0 7 4 3 76963538 T C Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 76964171 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76965094 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76966623 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 76966947 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76967360 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76967598 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76968267 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76968684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76969581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76969673 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76971302 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76975511 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76976685 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76977514 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76977796 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76978131 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 76978186 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76979489 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76979812 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 76982472 G A Y Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 3 76982475 C G Y N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 76982584 C G N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 76983092 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76983145 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76983507 T G Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 76986538 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76986666 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76987388 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76994669 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 76995147 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 76995908 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 77000361 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77000875 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77000948 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77002081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77003018 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 77004478 T A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 77004775 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77004795 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77004854 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77005960 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 77006290 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 77007535 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77012074 G C Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 77012125 C T Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 3 77012168 C T Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 3 77012233 G A Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 77012245 A G Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 77012592 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.105263157894737 0.894736842105263 0 21 17 2 17 0 3 77014626 C G Y N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 16 12 2 12 0 3 77014641 T A Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 3 77015230 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 77015246 T C Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 77015299 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77016352 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77017007 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77017334 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77018611 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77023145 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77023200 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77025521 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77028309 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 77028520 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 77029719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77034732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77036754 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77044321 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77045772 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77045825 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77045874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77046114 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77046155 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77046275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77046380 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77046648 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77046822 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77046824 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77046909 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77046965 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77046989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77047097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77047264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77047354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77047369 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77047476 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77047519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77047776 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77048054 G A Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 77048144 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 77048182 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 77048336 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 77048558 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 77048848 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 77049686 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77049762 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 77049845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77049886 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 77050909 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77052241 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77052389 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.133333333333333 0 0.866666666666667 4 26 2 0 13 3 77052434 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77052443 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77052680 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77052709 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 77052710 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 77053016 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77053065 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 77053375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77053398 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77053520 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 77053535 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 77053779 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77053913 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77054083 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77054290 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 77054420 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 77054435 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 77054517 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 77054539 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 77054707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77054829 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77054920 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77054984 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 77054996 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77055004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77055076 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77055258 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77055319 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 77055349 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77055474 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 77055498 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77055598 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77055670 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 77055706 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 77055848 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77055850 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77055887 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 77055940 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 77055945 G C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 77055960 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 77055963 G T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 77056114 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 77056261 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 77056267 C A Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 77056457 G T Y N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 77056495 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77056570 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 77056602 T G Y N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 77056686 T G Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 77056711 A T Y N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 77056722 A C Y N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 77056812 C A Y N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 77056850 A C Y N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 77056859 C T Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 77063440 C T Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 77063487 C G Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 77063701 G A Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 77063720 T C Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 77063926 G A Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 77064248 G A Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 77064336 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 77064337 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 77064584 G T Y N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 77064597 C A Y N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 77064716 T A Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 77064833 T A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 77064861 G C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77064918 G T Y N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 3 77065013 C A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77065017 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77065088 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77065140 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 77065146 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 77065155 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 77065169 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77065208 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77065272 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 77065334 C A Y N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 77065585 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 77065889 A C Y N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 77065955 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77065957 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77067636 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77067672 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77067782 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 77067796 T G Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 77067885 C T Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 77068034 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77068046 G T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77068078 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77068099 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 77068109 G C Y N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 77068134 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 77068150 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 77068175 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77068198 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77068236 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77068284 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77068287 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 77068444 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 77068469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77068595 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 77068659 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 77068665 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77068685 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 77068732 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 77068830 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 77068945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77069009 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 77069161 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 77069166 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 77069269 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 77069298 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 77069299 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77069419 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77069457 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 77069518 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 77069519 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 77069572 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 77069654 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 77069664 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77069692 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77069706 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 77069731 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77069757 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 77069971 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77069993 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 77070032 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 77070083 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77070101 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77070138 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 77070197 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77070224 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77070235 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77070249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77070252 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77070260 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77070297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77070303 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 77070434 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77070534 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77070558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77070601 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77070619 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77070645 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77070990 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77071363 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 77071488 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77071805 C T N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 77071881 A G N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.272727272727273 0.181818181818182 0.545454545454545 8 14 3 2 6 3 77071907 T C N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 3 77072023 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 77072074 A C N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 77072131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77072165 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77072230 C G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 77072293 C A Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 77072455 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77072525 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 77072537 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 77072654 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77072675 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 77072697 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 77072748 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 77072768 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77073001 G T Y N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 77073995 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77074044 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77074061 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77074161 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77074207 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77074289 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 77074660 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77074695 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 77074916 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 77075010 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77075042 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 77075189 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77075338 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 77075371 C G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 77075429 T A N N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 12 12 2 8 2 3 77075448 C A N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.153846153846154 0 0.846153846153846 4 22 2 0 11 3 77075524 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77075697 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77075936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77075968 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77076222 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 77076355 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77076362 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77076371 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 77076466 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 77076525 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 77076591 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.153846153846154 22 4 11 0 2 3 77076706 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 77078636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77079231 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77079390 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77079440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77079951 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77080028 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 77080037 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 77080048 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77080096 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 77080121 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 77080154 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 77080180 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77080195 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77080223 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77080234 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77080273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77080318 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77080334 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 77080460 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 77080464 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 77080494 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77080526 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77080561 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77080568 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77080572 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 77080583 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 77080604 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 77080626 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 77080702 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 3 77081052 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 77081409 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77081433 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77081529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77081607 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 77081672 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77081677 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 77081713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77081738 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77081747 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77081807 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 77081937 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77082129 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77082233 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 77082380 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 77082578 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77082715 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77082913 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 77082922 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77083039 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77083089 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77083210 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77083254 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77083402 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77083523 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77083536 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77083998 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77084151 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 77084179 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77084190 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77084337 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 77084404 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 77084437 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 77084579 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 77084636 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 77084805 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77085121 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 77085228 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 77085641 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77085744 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77085751 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77085766 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77085842 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77085933 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77086196 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77086369 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77087231 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77087582 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 3 77087755 C A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 77088183 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77088219 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77088314 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77088655 A T N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 3 77088748 G C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 77088930 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77089130 A T Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 77089331 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 77089781 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77089887 A T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 77090009 C G Y N 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 5 13 2 1 6 3 77090059 T C Y Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 77090116 A G Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 77090301 T C Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 77090501 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77090975 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 77091135 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 77091205 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 77091277 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77091306 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77091320 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77091361 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77091432 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77091504 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77091601 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77091631 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 77091715 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 77091730 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77091960 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 77092017 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 77092993 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77093098 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 77093137 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 77097562 G A N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 77097628 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77097684 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 77097706 A T N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 77100733 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 77100901 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77101022 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 77101060 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77101077 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 77101106 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 77101202 G T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 77101252 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 77101333 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77106782 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 77106827 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77106874 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 77106952 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 77106967 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 77107005 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 77107197 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 77107386 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 77107446 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 77107457 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 77107636 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 77107677 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 77107717 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 77107944 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 77108199 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 77108479 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77108662 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 77109140 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77109232 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 77109306 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 77109415 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77109641 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77109643 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 77109731 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77109936 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77109963 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77110522 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77110622 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 77110791 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77110792 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77110815 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77110862 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 77110888 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77110967 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77111464 A C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 77111467 G C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 77111590 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 77112563 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77112896 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77113143 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 77114130 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 77114185 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 77114491 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 77114532 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 77114745 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 77114813 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 77115163 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 77115337 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 77118309 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77118465 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 77118536 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 77118704 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77119069 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77119110 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 77119190 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77121122 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 77121124 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 77121189 A C N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 3 77121190 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 3 77121206 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 77121213 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77121252 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77121360 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 77121389 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 77121467 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77121699 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 77121796 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77122250 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 77122276 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 77122355 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 77122390 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 77122443 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77122483 G T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 77122618 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 77122814 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77122850 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 77122879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77122894 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77122959 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 77123125 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 77123286 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77123291 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 77123322 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 77123397 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 77123453 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 77123484 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 77123685 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 77123841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77124016 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 3 77124157 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 77124173 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 3 77124223 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77124250 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 77124392 T G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 77124500 G T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 77124624 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 77124635 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 77124653 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 77124674 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 77125118 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 77125128 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 77125269 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 77125383 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 77125415 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77125437 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 77125442 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 77125449 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 77125470 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 77125497 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 77125516 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 77125540 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 77125577 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 77125587 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 77125826 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 77125986 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 77125997 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 77126378 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 77126396 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 77126423 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 77126503 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77126509 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 77126595 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77127008 C G N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 3 77127125 A C N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.153846153846154 21 5 10 1 2 3 77127252 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 77127312 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 77127351 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77127561 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77127597 A C N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 77127720 C T N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 77127733 T A N N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 3 77127753 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 77129168 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77130614 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77131651 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77132083 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77134594 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77134596 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77136262 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77138497 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77140664 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77140724 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 77142540 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77142879 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77143053 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77143519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77144721 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77145203 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77145601 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77145723 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 77145734 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77146366 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 77146414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77146658 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 77146666 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77146971 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 77147169 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 77147252 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 77147532 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77147736 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77148589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77148695 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 77149011 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77149534 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77150531 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 77150783 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77151129 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 77151235 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 77152879 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77154003 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77154124 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77154831 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77154842 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 77154961 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77154963 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77155438 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 77156547 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 77156605 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77156902 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77156925 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77157564 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 77157600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77158261 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 77158460 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 77158462 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77159478 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.133333333333333 26 4 13 0 2 3 77159943 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 77159958 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 77160162 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77160753 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 77160760 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77161319 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 77161489 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 77162115 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77162494 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 77162534 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77163104 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 77163383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77163411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77164328 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 77164329 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 77164408 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 77164756 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 77164763 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77165462 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77165747 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77166094 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 77166240 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 77166912 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77167004 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 77167490 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77167547 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 77167859 G T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 3 77168007 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 77168069 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 77168552 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 77168936 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 77168964 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 77168984 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 77169111 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 77169128 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 77169152 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 77169352 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 77169896 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 77170298 G T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 77170362 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77170589 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77170676 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 77170882 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 77171028 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 77171354 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77171458 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 77171661 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 77171699 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 77171776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77171879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77172104 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77172284 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 77172291 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 77172797 A C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 77172804 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 77172948 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 77173600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77173743 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77174441 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77176154 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77176473 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77177227 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77182000 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77182185 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77182526 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77182951 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77183436 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77184986 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77185098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77186169 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 77186901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77188897 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77189623 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77190197 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77191497 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77193439 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77193450 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77193451 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77195112 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77195875 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77197533 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77197534 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77197607 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77199557 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77201367 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77201938 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77202040 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 77203125 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77203299 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77203579 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77207560 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 3 77210847 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77210996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77212235 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 77212808 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 77213664 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77214443 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77215172 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77215174 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77215240 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 77215532 G T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77215585 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 77215671 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 77215859 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 77216232 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77216325 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 77216404 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77216458 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77216500 A C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 77216611 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.1875 0.0625 0.75 7 25 3 1 12 3 77216785 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77218684 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77219185 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 77219538 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77219652 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77219950 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77220046 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 77220124 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77221218 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77221388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77221705 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77222149 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77225103 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77227110 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77228206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77228469 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 77228759 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77229334 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77230656 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77230937 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77231374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77231568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77231615 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77232213 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 77233019 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77233723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77233837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77234986 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77235777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77236463 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77237497 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77237585 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77237701 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77237871 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77238047 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 77238073 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 77238095 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 77238120 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 77238140 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 77238153 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 77238369 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 77238405 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77238517 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 77239039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77239247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77239810 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 77239967 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77240033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77240276 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77240491 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77240661 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77240890 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 77241310 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 77241334 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 77242029 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77242248 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77242367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77242566 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77242620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77242689 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 77242890 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77243025 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77243666 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77243670 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77244519 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77244607 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77244698 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 77244709 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77244739 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77244772 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77244779 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77245081 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77245287 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 77245340 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 77245384 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 77245590 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 77245670 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77245868 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 77251030 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 77251050 T G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 77251065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77251096 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 77251137 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 77251830 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77251857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77251901 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 77252003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77252170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77252362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77252659 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77252822 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77252999 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77253095 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77253180 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77253756 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77253905 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77253949 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77254435 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 77254525 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 77254802 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77254840 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77255043 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77255077 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77255211 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77255973 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77256048 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 77256168 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 77256390 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77256404 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77257017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77257410 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77257416 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77260434 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77260814 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 77261246 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77262769 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77262956 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77262966 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77264918 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77265022 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77265268 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77265736 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 77265884 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77265896 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77266667 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77266681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77266961 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77267148 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77267165 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77267383 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77267452 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77268392 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77268472 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77268545 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77268777 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77268933 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 77269299 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 77269331 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77269533 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77269848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77269980 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77270054 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77270609 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77270706 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 77272847 T C Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 77272972 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77273244 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77273527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77273834 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77274870 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77274916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77275115 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77275730 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77276508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77276585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77276791 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77277609 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77277619 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77279503 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77280703 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77280815 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77282192 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77282984 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77283131 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77283529 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77284124 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77290010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77290063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77290429 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 77291705 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77292173 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77292644 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77293817 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77294702 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77294738 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77295149 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77295591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77295720 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 77295772 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77296191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77296287 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77296998 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77297201 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77297370 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77297423 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77297819 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77297964 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77297998 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77299126 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 77299474 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77299976 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 77300865 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 77301335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77301374 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 77301462 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77301483 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 77301731 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77301855 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77301956 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77301982 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77302301 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77303304 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77303625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77303960 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77304368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77304485 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 77304498 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77304984 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77307199 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 77308113 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77308362 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77309204 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 77309354 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77311095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77312066 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77312317 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77312443 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77312959 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77313411 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 77313909 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77314437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77314848 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77315553 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77315846 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77315985 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77316513 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77317379 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 77318341 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 77318504 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77318962 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 77319849 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77320986 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77321784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77321873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77321989 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77322429 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77323634 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77323865 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77324007 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77324259 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 77324346 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 77324614 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77324674 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77325379 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77325633 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 77326364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77326693 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77326830 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 77326911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77326917 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 77327792 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 77327827 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77328264 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77328473 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77328541 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77329252 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 77329700 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 77329740 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77330185 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77331085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77331167 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77331213 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77332096 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77332625 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77332637 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77332686 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77332827 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77332895 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77332990 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77333197 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77334561 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77335261 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77335679 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 77337583 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77337812 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77339467 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77342420 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77342889 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77343245 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77343447 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77344284 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77346700 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77346855 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 77347124 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77349028 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 77349763 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 77351987 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77353407 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77353484 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77354090 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77354298 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77354764 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 77354765 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 77354960 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77356036 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77360435 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77363609 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 77365457 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77368921 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77369351 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77369451 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77370810 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77370815 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77372126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77372134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77372558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77373323 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77375382 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77375495 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77375927 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77376248 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77380978 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77382660 G A N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 77384540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77385025 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77385736 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77385809 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77387555 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 77388481 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77388691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77389902 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77390625 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 77393341 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77395410 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77396943 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77396988 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77398453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77398555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77400139 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77408729 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77408868 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77408879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77409118 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77409448 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77411027 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77411198 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77411464 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77411753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77412328 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77412508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77413981 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77414676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77414955 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77415436 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77415840 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77416108 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77417528 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77421220 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77421653 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 77422079 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77423046 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77423957 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 77424033 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77424972 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77425349 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77426099 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 77426153 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77426245 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 77427093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77427493 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77427777 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 77427944 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77427961 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77428032 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77428048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77428123 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77428141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77428211 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77428527 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77428545 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77428585 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77428595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77428874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77428893 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77428981 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77428994 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77429156 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77429321 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77429372 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77429383 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77429633 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77429998 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77430009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77430263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77430328 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77430381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77430442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77430444 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77430493 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77430596 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77430951 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77430988 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77431234 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77431460 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77431509 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77431537 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77431650 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77431826 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 77432263 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77432327 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77432345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77432435 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77432443 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77432572 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77432579 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77432593 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77432775 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77432835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77433016 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77433080 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77433220 T A Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 77433288 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77433316 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77433350 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77433385 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77433449 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 77433526 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 77433530 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 77433607 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77433657 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77433667 A T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 77433696 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77433706 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77433771 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77433901 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77434612 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77435347 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77435405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77435705 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77435803 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77436089 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77436117 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77436135 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 77436574 T C Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 77436680 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77436877 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77437201 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77437415 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77437503 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77437773 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77438093 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77438151 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 77438423 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77438635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77438643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77438851 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77439128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77439810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77440082 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77440632 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77440701 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77442707 A T Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 77442715 A C N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 77442755 T G N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 77443020 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 77443636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77443920 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 77444663 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 77445089 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 77445835 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 77446748 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77447077 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77447359 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77447388 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 77447734 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 77447814 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 77448070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77449590 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77450385 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 77450501 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77451506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77451614 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77451780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77451821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77452733 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77453017 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 77453181 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 77453527 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 77453610 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 77453754 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 77454677 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 77455360 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77455994 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 77458255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77458348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77460023 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77460755 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 77461553 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 77465019 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 77465437 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 77467636 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77467944 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77469733 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77479010 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77479314 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77479394 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77480315 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77480321 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77480398 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77480593 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 77480678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77480796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77480890 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 77481057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77481106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77481278 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77481289 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 77481315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77481320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77481381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77481730 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77481870 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77481957 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77482088 T A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 77482145 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77482150 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77482215 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77482269 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77482528 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77482622 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77482723 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77485568 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77485665 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77490164 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 77490320 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77490446 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77490577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77490588 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77490594 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77490636 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77490640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77490971 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77491096 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77491252 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77491360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77491501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77491521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77491756 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77491908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77492135 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77492344 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77492787 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77492801 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77493082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77493140 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77493198 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77493457 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77493878 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77494253 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77494449 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77494573 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77494607 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77494626 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77494722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77494796 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77494839 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77494887 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77494951 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77494963 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77495095 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77495130 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77495149 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77495168 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77495176 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77495504 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77496107 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 77496927 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77496951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77496992 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77497109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77497197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77497213 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77497330 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77497375 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77497415 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77497421 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77497478 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77497499 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77497519 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77497562 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77497575 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77497600 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77497608 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 77497677 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77497705 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77497896 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77497922 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77497934 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77497984 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 77498032 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77498049 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 77498162 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 77498305 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77498337 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77498435 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77498492 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77498513 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77498528 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 77498606 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77498790 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77498891 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77499042 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77499065 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77499213 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77499247 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77499305 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77499352 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77499455 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77499582 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77499665 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77499673 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77499714 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77499720 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77499726 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77499775 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77499915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77499962 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77500043 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 77500066 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77500137 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77500174 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77500213 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77500293 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77500346 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77500462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77500546 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77500552 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77500622 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77500677 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77500753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77500793 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77500796 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77500806 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77500836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77500837 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77500869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77500877 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77500883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77500891 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77500962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77500980 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77500988 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77501061 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77501128 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77501154 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77501448 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77501473 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77501583 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77501592 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77501849 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77501880 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77502246 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77502402 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77502466 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77502536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77502570 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77502721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77502730 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77502931 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77502938 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77503474 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 77503529 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77503548 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77503575 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77503889 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77503966 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 77503980 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77504018 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 77504074 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77504125 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77504176 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77504202 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 77504271 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77504323 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77504398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77504535 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77504626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77504768 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77504769 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77504847 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77504923 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77504941 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77504972 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77505005 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77505246 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 77505348 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 77505899 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77505912 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 77506170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77506291 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77506680 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 77507164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77507227 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77507435 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77507468 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77508805 C G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 77516285 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77516300 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77516305 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77516394 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77516538 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77516604 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77516852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77516898 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 77517307 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77517310 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77517780 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77517984 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77518084 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77518378 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77518487 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77518712 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77519328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77519400 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77519524 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77519773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77519800 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77520124 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77520791 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 77521268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77521319 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77521359 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77521618 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77521810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77521831 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77522425 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 77522569 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77522647 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77522721 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77522965 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77523020 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77523469 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 77523776 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 77523885 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77523927 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77524026 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77524670 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77525537 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77527302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77527404 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77527907 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 77528088 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77528266 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77528567 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77528756 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77529304 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 77530171 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77530245 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77530271 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77530615 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77530719 T A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 77531106 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 77531306 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77531323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77531576 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77531940 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77532938 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77533420 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77533423 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77533980 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 77534528 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77534636 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77535455 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 77535464 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 77535484 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 77535512 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 77535572 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 77535628 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 77535718 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 77535742 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 77535752 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 77535832 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77535867 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77536841 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 77536842 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 77536862 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 77537019 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77537086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77537669 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 77537706 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 77537827 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77539539 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 77540033 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 3 77541691 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77541752 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77542211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77542227 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 77542349 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77542374 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77542389 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77542752 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77542781 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77542961 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77543985 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77544496 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77545050 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 77545057 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 77545352 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 77546963 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 77547043 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 3 77547998 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77549400 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 77549942 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77550097 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77551003 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77551404 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77553070 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77553071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77553366 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77553503 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 77554225 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77554692 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77555602 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77556102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77556227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77556535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77557152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77557191 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77557355 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77557702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77558338 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77559169 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77559875 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77559884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77559939 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77560298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77561329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77561723 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 77561869 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 77562144 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77562651 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77563258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77564657 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77564992 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 77566431 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77566897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77567236 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77567721 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77568106 A C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 77568651 T G Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 77568879 A T Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 77569014 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 77569035 G A Y Y 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 3 77569157 A G Y Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 77571479 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77572378 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77573811 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77574538 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77574912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77575105 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77575190 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77575517 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 77575710 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77575875 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77576235 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 77576378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77576812 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77576887 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77576961 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77577320 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77577592 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77577747 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77577931 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77578247 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77578360 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77578939 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 77579106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77579115 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77579232 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77579402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77579436 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77579491 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77579509 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77580082 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77580188 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77580594 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77581008 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 77581240 T G N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 3 77582485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77582911 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77583317 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 77583446 C G Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 77583987 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77584452 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 77584527 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 77585137 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77586426 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77586487 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77586752 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 77587474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77587542 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77587684 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77589502 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77591372 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77592413 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77593391 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 77593491 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 77593595 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77593596 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 77593710 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77593931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77594235 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77594579 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 77594949 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 77595078 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77595403 G A N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 3 77595734 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 77596324 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 77596415 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 77596453 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 77596492 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 77596777 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77596817 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 77596847 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77597244 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 77598111 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 77598114 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77598622 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77599391 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77599700 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77602247 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77602278 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77602316 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 77602736 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 77603522 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 77603855 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77605046 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77605369 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77605489 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77606338 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77607080 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77607177 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77608000 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 77608977 C A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 77609179 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 77609287 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77609784 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77610024 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77610101 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 77610186 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77610694 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 77612160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77612576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77612704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77614865 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77615017 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77615040 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 77622836 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77623053 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 77623360 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 77624069 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 77624425 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 77624432 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 77624478 A C N N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 3 77624974 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 77624999 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 77625040 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 77625119 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 77625639 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 77626096 G A Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 77626353 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 77626382 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 77626988 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77627078 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77627178 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 77627198 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 77627276 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77627365 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 77627499 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77627517 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77627539 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77627759 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77627787 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77627791 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77627961 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77628187 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 77628207 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77628248 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77628249 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77628345 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77628372 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77628426 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77628450 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77628545 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77628618 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77628649 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77628665 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77628698 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77628856 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77628895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77628942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77629002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77629009 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77629077 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77629285 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77629415 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77629424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77629492 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77629579 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77629645 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 77629705 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 77630089 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77630207 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77630324 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 77630367 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 77630377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77630386 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77630403 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77630417 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77630514 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 77630737 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77630777 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 77630815 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 77631020 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 77631101 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 77631170 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 77631202 G T Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 77631398 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77631461 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 77631489 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 77631574 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 77631593 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 77631603 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 77631616 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 77631669 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77631676 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 77631789 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 77631902 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 77631970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77632359 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 77632446 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 77632539 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77632621 G T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 77632688 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 77633353 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77633445 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77633516 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77633681 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 77633795 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 77633796 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 77633839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77633948 T A N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 77633961 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 77634053 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 77634191 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77634238 T G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 77634262 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 77634295 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 77634473 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77634505 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 3 77634513 A T N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 77634618 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 77634652 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 77634663 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 77634687 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77634800 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 77634954 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 77635054 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 77635096 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 77635140 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 77635178 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 77635261 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 77635378 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 77635387 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 77635411 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 77635439 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77635597 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 77635632 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 77635642 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 77635648 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77635781 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 77635801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77635961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77636082 C G Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 77636371 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 77636665 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77636968 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77636990 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 77637204 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 77637664 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 77637916 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77638055 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77638282 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 77638484 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 77638643 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 77638924 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77639131 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 77639174 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77639369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77639402 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 77640333 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77640689 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77641014 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 77641052 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 77641135 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 77641479 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 77641501 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 77641750 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 77642246 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77642357 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 77642850 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77643156 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77643404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77643516 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77643692 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 77643861 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 77643884 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 77643940 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 77643976 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 77644003 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 77644028 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 77644091 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 77644128 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 77644237 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77644262 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 77644323 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 77644768 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 77645686 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77646254 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 3 77646740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77647631 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77648531 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77648636 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77648645 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77649385 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 77650462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77651347 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77651511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77652872 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 77653272 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77654572 T G N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 77654688 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77655004 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 77655118 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77655925 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 77656505 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 77656660 C A Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 77657352 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77658315 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 77659045 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 77659612 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 77659697 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77661427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77661894 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77662895 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 77663525 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77664884 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 77666276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77666646 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77666804 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 77667183 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 77667342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77667774 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 77668040 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77668336 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 77668885 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 77669002 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77669060 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 77669261 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 77669439 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77669735 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77669771 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77670276 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 77670741 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 77670898 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77671451 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77671594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77672034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77672860 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 77672909 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77673304 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77673343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77673881 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77674595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77675589 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77677635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77678353 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77678441 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77678490 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77678814 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77679050 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 77679548 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77680076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77680874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77681061 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 77682265 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 77682539 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77683473 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77683930 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 77685724 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77685786 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77686960 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77686967 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77686999 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 77687590 T A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77687804 A C Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 77688113 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77688453 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77689605 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77690763 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77692702 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77692730 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77692979 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77693020 A G Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 77693032 C A Y N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 3 77693621 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77693908 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 77694928 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 77695475 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 77697149 A T Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 77697247 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77697262 C A Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 77697363 A G Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 77698063 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77698659 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77699124 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77699350 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 77699415 T C Y Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 3 77700501 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77700550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77701123 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77701196 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 77701512 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77702688 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77702861 G T Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 77703909 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77703996 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77703997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77705619 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77706560 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77706932 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77707091 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77708079 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77708281 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77708474 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 77708512 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77708644 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77708949 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77709091 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77709096 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77709107 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77709802 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 77709861 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77710068 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77710352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77710405 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77710465 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77710566 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77710643 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77711272 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77711589 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77711726 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77712023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77712253 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77712440 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 77712490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77712496 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 77712529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77712845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77712954 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 77713174 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 77714004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77714260 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77714342 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 77714348 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 77714363 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 77714453 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 77714491 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 77714685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77714959 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 77714983 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 77715327 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 77715734 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77716476 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77716617 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 77716734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77716799 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77716805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77717220 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77717454 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77717511 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77717539 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77717834 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 77717958 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 77718148 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77718166 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77718609 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 77718667 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77718865 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77718884 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 77718914 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 77718963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77718995 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77719154 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 77719184 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 77719204 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 77719229 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 77719561 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 77719614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77719636 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 77719846 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 77720137 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77720198 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77720209 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77720563 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 77721340 T G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 77721573 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77721632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77721724 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77721854 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77721985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77722029 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 77722129 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 77722166 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77722402 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 77722443 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77722503 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77723063 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 77723286 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 77723400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77723966 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77724110 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77724353 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77725366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77725406 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77727398 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77728987 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77729551 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77729716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77729802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77730373 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 77735425 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 77735462 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77735662 C A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 77736119 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77736405 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77736717 T G N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 77736835 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 77736855 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 77736926 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 77736956 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77737179 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77737216 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77737288 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77737434 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 77737905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77738608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77738711 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77738810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77739314 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77739447 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 77739473 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 77739614 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77739663 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 77739717 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77739784 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77739811 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77739917 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77739957 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77739960 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77740344 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77741021 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 77741052 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77741154 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77741387 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 77741444 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 77741467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77741507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77741549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77741734 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 77741809 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77741830 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 77741902 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 77741918 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 77741949 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 77741976 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77742014 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 77742048 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77742058 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77742076 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77742193 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77743068 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77743097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77744172 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77744736 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 77745205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77746508 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77746812 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77747002 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77747315 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 77748144 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77748233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77748347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77749510 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77749589 A G Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 77749997 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77751026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77752054 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77752160 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77754049 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77754143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77754672 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77757416 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 77757640 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77758199 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77759793 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77759896 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77760063 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77763225 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77764340 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77764572 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 77764705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77765663 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 77766195 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77766677 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 77767051 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77767194 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 77767384 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 77767554 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77767621 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 77767987 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77768261 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 77768400 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 77768508 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77768637 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 77768639 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 77768981 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 77769098 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 77769436 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 77769540 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 77769826 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 77769908 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 77770047 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 77770072 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 77770167 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77770238 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77770266 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 77770286 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77770449 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 77770726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77770907 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 77770970 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 77771040 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 77771178 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 77771365 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77771518 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 77774978 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 77775069 A T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 77775205 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 77775220 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 77775240 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 77775361 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77775549 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 77775567 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 77775572 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 77775676 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 77775706 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 77775769 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 77775809 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 77775810 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 77775862 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 77775877 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 77775883 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 77775919 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 77775963 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 77775964 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 77776014 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 77776083 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 77776091 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 77776123 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 77776232 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 77776451 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 77776496 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 77776520 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 77776842 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 77777057 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 77777081 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 77777114 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 77777255 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 77777339 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 77777382 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 77777477 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 77777480 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 77777535 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 77777542 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 77777558 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77777649 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 77777697 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 77777736 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 77777767 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 77777769 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 77777991 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 77778002 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 77778137 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 77778156 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 77778221 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 77778235 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 77778251 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 77778324 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77778340 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 77778354 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 77778668 T G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 77778729 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77778989 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77780431 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 77780773 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 77781559 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77781638 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 77782106 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77782107 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 77782256 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 77782333 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77782777 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 77782799 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77782880 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 77783031 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 77783064 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77783224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77783488 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77783728 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77783811 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77783904 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77783939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77784101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77784310 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77784511 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77784538 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 77784613 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77784705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77784715 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 77784719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77784772 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77784809 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77784907 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77784978 T C N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0 0.923076923076923 0.0769230769230769 12 14 0 12 1 3 77785057 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77785089 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77785205 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 77785360 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 77785555 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77785580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77785582 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 77785706 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 77785760 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 77785885 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 77785886 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 77785937 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 77786037 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 77786197 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 77786218 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 77786224 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 77786241 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 77786256 G C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 77786301 C A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 77786327 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 77786400 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77786470 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77786491 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 77786816 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77786846 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 77786887 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 77786896 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 77786906 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 77787034 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77787114 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 77787162 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 77787375 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 77787509 G C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 77787532 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 77787583 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77787595 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 77787609 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 77787678 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 77787715 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 77787832 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 77787842 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77787880 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 77788040 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 3 77788052 T C N Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 10 6 3 4 1 3 77788120 A G N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 3 77788149 G A N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 77788437 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 77788598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77788724 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77788893 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77788984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77789001 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77789030 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77789053 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77789085 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77789205 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77789244 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 77791810 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77792317 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 77792318 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 77792804 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77793310 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77793333 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77794222 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77794256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77794322 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77794466 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77794522 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77794718 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77794719 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77794749 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77794811 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77794925 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 77794971 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77795073 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 77795565 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77795661 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77795766 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77795834 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77795848 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77795908 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77795928 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77796024 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77796095 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77796150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77796169 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77796294 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77796299 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77796319 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77796350 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77796509 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77796559 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77796660 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77796667 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77796717 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77796796 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77797585 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 77798018 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 77798289 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 77798590 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77798752 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 77799185 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77799358 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77799446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77799526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77799626 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 77799639 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 77799874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77799923 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 77799978 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 77800010 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 77800069 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77800231 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77800490 A T Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 77800831 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 77800916 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 77801039 A T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 77801040 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 77801097 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 77801344 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77801351 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77801601 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77802171 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77803066 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77803754 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77804862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77806763 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77806839 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77806935 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77808329 C T Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 77808799 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77808913 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77808964 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77809742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77810363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77810549 C A Y N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.230769230769231 0.769230769230769 0 16 10 3 10 0 3 77810683 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 77810817 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 77811531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77811780 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77811888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77812510 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 77813276 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 77813887 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77814344 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 77814565 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77817116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77818066 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 77818087 C A Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 77818552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77818777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77818905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77819166 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 77819332 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77819514 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77819526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77820324 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77820481 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77821255 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77821345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77821926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77823211 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77823939 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 77824133 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77825084 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77825238 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77825439 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 77825578 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77826065 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77826272 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77827139 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77828749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77828913 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77829202 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77829293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77829531 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77829565 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77829781 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77837237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77837761 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77837826 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77838447 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 77838830 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77839222 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77840222 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 77840746 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77840857 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77840962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77842091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77844457 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77844838 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 77845003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77846445 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 77846693 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 77846857 C A Y N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 77847014 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 77847208 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77848567 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77848814 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 77849054 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 77850560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77852460 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77853007 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 77853530 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77853755 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77853786 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 77854504 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77856234 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 77856350 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77856783 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 77857563 T C N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 3 77857755 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77858428 T C Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 3 77858830 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77859044 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77859237 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 77860456 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77862757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77863952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77864586 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77865417 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 77866156 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 77869041 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77869359 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 77869585 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 77870093 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77870502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77870577 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 77870731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77870736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77870773 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 77870968 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 77871152 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77871775 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77873573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77873776 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 77874871 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 77875663 T A Y N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 77876048 T C N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 3 77876567 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 77876640 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77876926 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 77877369 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 77877563 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 77877585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77877631 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 77877735 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77877756 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 77877806 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 77877813 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 77878053 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77878132 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77878152 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 77878174 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 77878177 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 77878271 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 77878695 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77878712 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77878801 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 77878942 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 77879088 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 77879284 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 77879320 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 77879714 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 77879831 C T N Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 3 77879931 T A N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 77879958 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 77880030 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 77880080 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 77880290 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 77880331 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 77880354 T C Y Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 9 9 3 3 3 3 77880500 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 77880560 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 77880572 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77880574 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 77880706 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 77880747 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 77881032 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 77881069 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77881329 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77881384 C T Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 77881430 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 77881462 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 77881563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77882437 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 77882471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77883185 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77883246 A T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 77883551 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 77883728 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77883784 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 77883806 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 77883833 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77884353 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 77884691 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 77884953 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 77885071 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 77885258 T A N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 77885358 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 77885699 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 77885740 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 77886849 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77887633 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 77887662 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 77887766 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 77888449 T A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 77888477 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 77888915 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 77889716 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77889812 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 77889974 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 77889997 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77890020 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 77890023 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 77890117 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 77890197 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77890204 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 77890318 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 77890325 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 77890407 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 77890465 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 77890541 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 77890659 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 77890859 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 77890927 G T N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 77891103 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 77891697 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 77891780 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77891851 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 77891884 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77891954 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 77892018 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 77892076 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 77892322 T A Y N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 77892605 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 77892657 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 77892819 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 77893232 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 77893559 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77894009 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77894093 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 77894142 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 77894175 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 77894328 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 77894640 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 77894891 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 77895034 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77895071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77895085 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 77895101 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77895139 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 77895344 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 77895357 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 77895383 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 77895509 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 77895681 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 77895697 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 77895702 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 77895909 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77896094 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 77896277 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 77896315 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 77896464 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 77896495 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 77896548 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 77896567 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 77896583 A C N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 77896657 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 77896765 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 77896766 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 77896807 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 77896867 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 77896919 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 77897021 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 77897177 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 77897476 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 77897539 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 77897549 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 77898054 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 77898115 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 77898205 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 77898222 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 77898290 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 77898394 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 77898531 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 77898546 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 77898567 C T Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 77898697 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77898712 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 77898936 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 77898985 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 77899088 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 77899341 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77899348 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 77899482 T A N N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0 1 0 10 10 0 10 0 3 77899872 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 77899900 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 77899958 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 77900219 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 77900312 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 77900337 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 77900372 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77900405 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 77900409 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77900613 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 77900738 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 77900764 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 77900780 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 77900819 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 77900839 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 77900871 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 77900913 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 77900939 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 77900979 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 77901039 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 77901157 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 77901168 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 77901181 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 77901210 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 77901351 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 77901474 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 77901550 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 77901665 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 77901677 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 77901795 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 77901870 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 77901935 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 77902040 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 77902454 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 77902508 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 77902556 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 77902729 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 77902751 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 77902810 C T N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 77902990 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 77903194 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 77903248 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 77903284 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 77903322 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 77903564 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 77903598 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 77903617 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 77903703 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 77903731 A C N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 77903784 A C N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 3 77903965 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 77904048 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 77904084 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 77904466 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77904622 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77904648 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 77904769 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 77904784 C G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 77905122 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 77905232 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77905399 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 77905441 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 77905714 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 77905842 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77905909 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 77905910 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 77906027 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 77906058 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 77906172 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 77906219 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 77906224 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 77906230 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 77906238 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 77906423 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 77906424 G T N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 77906468 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 77906621 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 77906823 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 77906907 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 77906974 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 77906975 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 77907017 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 77907033 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 77907062 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 77907105 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 77907274 G A Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 77907314 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 77907346 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 77907598 T C N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0 0.615384615384615 0.384615384615385 8 18 0 8 5 3 77907782 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77907805 G T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 77907878 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 3 77907959 C G N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 77907998 G A N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 3 77908014 A T N N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 3 77908163 C T Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 77908306 A G N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.181818181818182 0.636363636363636 0.181818181818182 11 11 2 7 2 3 77908352 C A Y N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.25 0.583333333333333 0.166666666666667 13 11 3 7 2 3 77908357 A C N N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.25 0.583333333333333 0.166666666666667 13 11 3 7 2 3 77908475 G C N N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.272727272727273 0.545454545454545 0.181818181818182 12 10 3 6 2 3 77908618 C A Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 77908652 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 77908696 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 77908739 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 77908783 G A Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 77908784 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77908822 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 77908873 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 77908900 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 77908938 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 77908967 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 77909252 A G Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 77909281 A T N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 77909356 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 77909419 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 77909449 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 77909468 A T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 77909503 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 77909665 T G Y N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 77909699 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 77909738 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77909764 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 77909971 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 77910285 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 77910298 C A Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 77910346 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 77910556 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 77910948 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77911199 A T Y N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 3 77911314 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 77911356 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 77911424 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 77911478 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 77911814 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 77911838 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 77911938 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 77912135 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 77912314 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 77912328 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 77912385 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 77912414 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 77912535 C G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 77912555 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 77912574 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 77912623 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 77912745 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77912900 A C Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 77912955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77912972 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 77913056 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 77913058 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 77913169 A C Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 77913253 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 77913275 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77913304 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 77913344 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 77913383 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 77913588 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 77913800 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77914287 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 77914551 T A Y N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 77914568 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 77914806 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 77915442 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77915492 T C Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 3 77915542 T C Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 3 77915986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77916141 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 77916504 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 77916735 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77918293 A G Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 77918863 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 77918928 T A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 77919029 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 77919105 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 77919140 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 77919144 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 77919194 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77919207 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77919231 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 77919239 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 77919380 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77920742 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 77921456 T G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 77922000 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77922128 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 77922826 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77922887 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 3 77923294 G C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77923933 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 77924780 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 77925322 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77925673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77925846 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77926081 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77926470 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 77927709 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 77928039 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77928301 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 77929858 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77930251 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 77931296 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 77932019 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77932059 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 77932449 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 77932760 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 77932875 C T Y Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 77933648 C T Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 3 77934310 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 77934312 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 77934401 C A Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 77934672 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 77934740 C A Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 77935128 A G N Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 3 77935208 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 77935450 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 77936020 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77936391 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77936706 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 77937644 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 77938530 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 77938897 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 77939738 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77939787 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77940571 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 77941052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77941798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77941845 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 77942431 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77942981 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77943464 T A N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 77943569 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77943593 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 77943986 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77947158 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77947314 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77947782 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77948574 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 77948585 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 77949091 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77949112 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 77949776 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77949816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77951080 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77952796 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 77952911 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 77953174 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 77953531 C G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 77953779 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 77953811 T C N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 77953904 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 77954099 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 77954412 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 77954506 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 77954553 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 77954704 A C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 77954746 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 77954859 T A N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 77954882 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 77955026 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 77955041 C A N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 77955059 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77955124 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77955414 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 77955520 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 77955616 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 77955653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77955981 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77956077 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 77956308 C G N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 77956328 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 77957059 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 77957062 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 77957195 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 77957216 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 77957249 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 77957424 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 77957550 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 77957876 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 77957897 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 77957936 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 77958019 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 77958217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77958465 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 77958563 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 77958681 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77958706 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 77958825 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 77958902 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 77959094 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77959168 G C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 77959207 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 77959537 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 77959556 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 77959978 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 77960144 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 77960531 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 77960658 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 77960798 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 77960822 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 77961211 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 77961263 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77961507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77961530 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77961744 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77961962 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 77962145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77962153 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 77962703 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77962863 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77963439 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 77963624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77963683 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77964000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77964045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77965166 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 77965474 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77966050 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77966778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77966814 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77968059 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77968497 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 77969365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77969535 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77969703 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77970186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77972403 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77973125 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77973297 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 77973676 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 77973735 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77973827 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 77973896 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 77973923 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77975570 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77975635 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 77975730 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 77975733 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 77975805 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 77975859 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 77976174 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 77976203 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77976292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77976306 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77976368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77976446 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77976458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77976702 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 77976881 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 77976898 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77976959 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 77977013 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 77977032 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 77977081 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 77977156 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 77977157 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 77977272 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 77977471 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 77977644 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 77977682 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 77977695 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 77977760 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 77977806 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 77977824 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 77977871 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 77978159 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77978160 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 77978186 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 77978191 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 77978199 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77978343 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 77978348 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 77978554 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 77978576 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 77978663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77978716 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 77978920 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 77978926 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77979012 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 77979043 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77979098 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 77979116 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 77979134 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 77979401 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77979616 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 77979656 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 77979720 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 77979849 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77979885 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 77979945 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77979990 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77979995 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77980073 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 77980089 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77980284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77980361 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77980520 C A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 77980522 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 77980550 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77980668 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77981819 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 77981897 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 77981957 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 77982003 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 77982066 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77982127 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 77982173 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 77982301 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77982372 T A N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 77982581 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77982589 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 77982747 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 77982790 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 77983431 A T N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 3 77983662 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77983778 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 77983922 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 77983992 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 77983996 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 77984115 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 77984117 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 77984164 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 77984169 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 77984246 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 77984292 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 77984314 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 77984326 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 77984354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77984632 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 77984846 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 77984873 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 77985149 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 77985192 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 77988153 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77988224 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77988333 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77988478 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77988815 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77988914 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77989086 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 77989090 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 77989114 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77989429 A T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 77989512 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77989569 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 77989601 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77989928 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77989952 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77991271 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77991639 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 8 16 0 8 4 3 77991824 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77992269 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77992296 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77992564 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77992587 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77992966 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77993877 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77994010 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77994296 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77994528 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77994756 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77995119 C T N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 77995611 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77996253 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 77996268 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77996744 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77996762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77996811 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 77996826 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 77996958 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77997089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77997139 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 77997369 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77997467 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 77997572 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 77998242 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 77998415 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 77998629 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 77998842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 77998928 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 77999565 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 78000097 G T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 78000449 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78000654 T G N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 3 78000890 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 78001070 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78001247 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 78001442 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78001805 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 78002097 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 78002151 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 78002169 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 78002283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78002334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78002469 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78002549 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 78002568 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 78002584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78002615 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78002699 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 78002910 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 78003059 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 78003060 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 78003143 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78003270 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 78003287 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 78003459 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78003462 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 78003899 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78004660 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 78005086 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78005088 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 78005162 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78005171 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 78005406 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78005470 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 78005586 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 78005793 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 78005902 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78005924 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 78006225 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78006423 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78006503 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 78006514 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 78006515 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 78006641 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 78006796 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 78006818 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 78006846 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 78006868 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 78006902 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 78006946 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 78006999 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 78007020 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 78007271 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 78007278 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 78007284 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 78007292 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 78007334 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78007341 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78007411 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 78007413 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 78007450 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 78007481 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 78007669 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78007786 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 78007868 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78008077 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 78008613 C T Y Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 78008847 G A Y Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 3 78008868 A C Y N 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 3 78008970 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 78009088 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 78009293 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 78009483 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78009603 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 78009606 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 78009709 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 78009711 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 78009794 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 78009808 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 78009852 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 78009866 T A N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 78009881 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 78009886 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 78009901 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 78009912 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 78009978 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 78009996 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 78009997 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 78010050 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 78010059 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 78010094 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 78010146 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 78010212 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 78010240 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 78010360 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 78010383 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 78010390 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 78010518 G C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 78010617 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 78010652 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 78010836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78010906 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78010939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78011188 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78011195 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78011297 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78011308 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78011327 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 78011336 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 78011338 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 78011674 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78011942 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 78011999 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78012011 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 78012020 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78012476 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 78012661 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 78012667 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 78012681 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 78012728 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 78012735 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 78012782 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 78012813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78012865 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 78012981 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 78013480 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 78013515 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 78013743 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78014066 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 78014717 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78014907 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78015185 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 78015209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78015250 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 78015285 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78015290 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78015357 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78015617 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78015628 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78015656 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78015735 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 78015781 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 78015782 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 78015827 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78015915 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 78016134 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78016268 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 78016288 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78016305 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78016343 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78016396 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78016651 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78016871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78016967 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78016968 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78017067 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78017112 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78017310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78017382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78017418 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78017732 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 3 78017854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78017882 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78018147 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 78018952 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78019283 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 78019649 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78019912 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 78020236 C G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 78020698 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 78020749 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 78021003 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78021204 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 78021232 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78021250 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 78021287 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 78021323 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 78021854 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78021976 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 78022311 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78022467 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78022766 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78022963 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78023098 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78023148 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78023150 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 78023177 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 78023213 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78023227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78023358 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 78023756 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 78023879 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 78023966 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 78024067 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 78024146 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 78024225 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 78024526 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 78024528 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 78024556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78024606 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 78024618 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78024664 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78024783 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 78024847 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78024866 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 78024962 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78024967 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 78025103 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78025234 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78025254 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 78025261 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 78025415 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78025658 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 78025688 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 78025724 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 78025809 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 78025945 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 78025991 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 78026204 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 78026604 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 78026611 G C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 78026731 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 78026878 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 78027107 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 78027547 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78027781 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 78027845 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78027959 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 78028046 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 78028087 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78028258 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 78029283 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 78029335 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 78029370 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 78029446 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 78029461 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 78029466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78029593 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 78029626 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 78029668 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 78029908 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78029946 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 78030280 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 78030288 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78030344 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 78030786 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 78030885 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 78031886 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 78031899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78032126 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 78033547 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78034135 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78034927 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78035104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78035143 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 78035281 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 78035340 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78035449 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78036092 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78036178 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 78036311 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 78036470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78037136 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 78037626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78037733 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 78037904 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 78038155 A C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 78038333 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 78038494 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 78038576 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 78038743 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 78038808 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 78038946 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 78039094 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 78039582 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 78039647 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78039802 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78040700 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 78040773 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78040816 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78040924 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78041213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78041301 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78041484 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78041522 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78042241 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78042325 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78042418 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78043156 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 78043270 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 78043781 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78044815 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 78045286 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78045310 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78046043 T G Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 78046432 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78047269 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78047354 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78047376 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78047379 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78047408 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78047446 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78047566 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 78048000 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78048025 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78048036 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78048251 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78048522 A G Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 78050166 A C Y N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 78054516 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78054894 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78055201 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78055862 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78055900 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78057679 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78058215 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78058287 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78058328 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78059129 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78059338 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78059818 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 78059846 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 78060267 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 78060344 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 78061273 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78061372 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78061405 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78061430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78061513 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78062109 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78062512 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78062629 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 78062657 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 78062758 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 78063153 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78063203 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78063333 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 78063340 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78063438 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 78063460 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 78063602 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 78063740 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78063780 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78064251 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 78064800 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78064928 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 78065041 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78065096 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 78065138 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78065415 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 78065538 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78065595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78066369 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 78066452 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 78066760 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 78066778 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 78067072 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 78067291 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 78067335 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 78067570 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 78067674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78067728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78067967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78068151 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 78068178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78068203 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78068283 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 78068398 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78068887 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 78069208 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78069324 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78069694 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78070704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78070825 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 78070917 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 78071141 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 78071229 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 78071305 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 78071334 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 78071382 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 78071734 G T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 78072213 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 78072287 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78072344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78072394 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 78072563 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78072617 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 78072730 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78072819 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 78072829 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 78073026 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 78073038 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 78073262 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 78073356 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 78073394 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78073439 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 78073451 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 78073461 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 78073508 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78073571 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 78073576 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 78073588 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 78073681 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 78073692 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 78073719 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 78073762 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 78073911 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 78074001 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 78074141 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 78074260 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 78074283 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 78074291 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 78074309 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 78074330 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 78074341 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 78074376 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 78074379 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 78074499 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 78074571 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 78074615 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 78074674 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 78074714 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 78074756 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 78074827 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 78074855 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 78074881 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 78074920 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 78075071 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78075180 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78075197 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78075213 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 78075246 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78075283 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78075296 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78075303 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 78075435 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 78075465 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 78075577 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 78075588 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 78075605 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 78075688 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78075696 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78075718 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 78076008 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 78076029 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 78076122 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 78076304 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 78076520 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 78076774 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 78078576 A G Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 78078600 C A Y N 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 2 4 1 0 2 3 78079521 G T Y N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 78079623 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 78079626 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 78079657 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 78079701 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 78079747 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 78079767 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 78079835 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 78079847 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 78079854 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 78079859 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 78079870 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78080049 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 78080052 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78080065 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 78080090 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 78080121 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 78080144 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 78080177 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 78080180 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78080211 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 78080285 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78080286 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78080311 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 78080334 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 78080358 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 78080465 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 78080524 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 78080559 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78080669 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78080830 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 78081084 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 78081257 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 78081331 C G Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 78081354 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78081359 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78081383 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78081593 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 78081765 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 78081779 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 78081814 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 78081869 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 78081880 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 78081882 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 78081961 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 78081965 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 78082005 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78082218 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 78082362 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 78082398 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 78082423 C G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 78082427 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 78082474 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 78082486 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 78082522 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 78082756 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 78082823 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 78082887 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 78082892 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 78082996 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 78083017 T C N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 78083025 A G N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 3 78083136 A T N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 78083193 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 78083625 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78083637 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78083670 G A N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 3 78083805 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 78083924 A G N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 3 78084051 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 78084315 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78085153 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78085265 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 78085298 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 78085462 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78085530 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 78085574 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78085586 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 78085641 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 78085666 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 78085694 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 78087809 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 78087818 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78087872 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78088040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78088282 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78088283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78088349 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 78090073 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78092020 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78092102 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 78092455 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78092475 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 78094613 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78094880 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78095240 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78095355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78095361 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78095371 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78095449 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78095477 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 78095508 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 78095522 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 78095565 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 78095587 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 78096472 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78096476 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78096625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78096648 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78096657 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78096681 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78096697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78096759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78097372 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 78098685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78100112 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78100385 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78100397 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 78100513 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78101064 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78101148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78101907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78101922 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78101941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78102055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78102142 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 78102473 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78102479 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78102494 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78103075 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78103369 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78103753 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78103837 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78103861 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78103942 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78104503 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78104516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78104999 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78105253 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78105360 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78105398 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 78105401 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 78105527 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78105639 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 78105792 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78105973 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78106074 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78106100 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78106271 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78106520 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78106848 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78107107 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78107459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78107660 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78107661 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78107674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78108511 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78108682 G T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 78108693 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 78108759 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78108775 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78108785 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78108882 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 78108938 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 78108954 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 78108984 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78108990 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 78109004 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78109015 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78109028 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78109077 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 78109080 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78109242 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78109303 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78109348 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78109350 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78109374 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78109448 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78109461 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78109549 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78109561 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78109576 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78109663 G T N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0 1 0 14 14 0 14 0 3 78109664 T C N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0 1 0 15 15 0 15 0 3 78109918 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78110003 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 78110063 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 78110075 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 78110171 G T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 78110173 G T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 78110513 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 78110604 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 78110663 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 78110940 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78111404 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78111535 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78111551 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 78111618 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78111701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78111947 T C Y Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 3 78111952 C G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 78112242 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 78112483 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 78112667 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78112912 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78112915 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 78112958 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78112961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78113010 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78113047 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78113054 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78113147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78113191 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78113322 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78113347 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78113422 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 78113451 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78113506 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 78113520 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 78113529 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78113560 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78113729 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 78113740 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 78113882 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 78113884 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 78113910 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 78113995 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78113997 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78114275 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78114420 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78114542 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78114600 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78115053 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78115084 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78115655 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78116020 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 78116177 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78116450 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 78116561 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78116577 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78116609 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 78116633 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78116748 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78116756 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78116797 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78116802 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78116824 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 78116877 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78117264 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 78117346 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78117481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78117499 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78117556 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 78117791 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 78117850 T A Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 78117880 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 78117986 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 78118023 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78118205 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 78118300 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 78118463 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78118474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78118514 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 78118633 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 78118775 G T N N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 3 78118825 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 78119186 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 78119298 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78119339 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78119484 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 78119594 T C Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 78119633 A G Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 78119680 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 78119715 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78119764 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 78119796 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 78120139 T A Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 78120631 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 78120808 C T Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 78120910 G A Y Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 8 6 2 4 1 3 78120923 G A Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 78121373 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78121433 A C Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 78121468 A C Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 78121581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78121623 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78121727 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 78121795 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78121815 C G Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 78121824 C T Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 78121878 A G Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 78121897 G T Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 78121928 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 78121942 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 78122005 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 78122040 C T N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 3 78122087 C G N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 78122112 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 78122126 T G N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 78122127 G T N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 78122148 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 78122179 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78122195 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78122250 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78122390 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 78122430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78122527 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78122555 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 78123078 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 78123168 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78123254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78123288 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 78123312 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 78123449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78123495 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 78123616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78124167 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78124631 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78124690 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78124831 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 78125120 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 78125121 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78125131 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 78125290 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78125520 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78125753 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 78125845 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 78125862 T A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 78126407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78126564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78126656 G C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 78126902 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78127051 A C N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 78127060 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 78128385 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78128573 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78128626 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78128657 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78128678 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 78128815 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78128904 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78128908 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78128997 A C N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 78129958 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78130385 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78130476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78130904 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 78131103 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 78131344 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 78131562 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 78131948 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78132475 C T Y Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 7 9 2 3 3 3 78132787 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 78132879 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 78133001 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 78133020 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 78133046 T A Y N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 78133183 A T Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 78133442 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 78133497 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 78133519 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 78133541 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78133590 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 78133677 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78133693 T G Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 78133741 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78133784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78133850 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 78133911 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78133991 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 78134116 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78134741 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 78134915 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78135352 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78135556 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78135590 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78136089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78145523 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 78145902 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 78145937 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78145961 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 78146447 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78146479 A C N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 78146511 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 78146668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78146835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78146885 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 78146890 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 78147142 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78147531 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 78148455 C T Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 78148668 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 78148846 G C Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 78148847 G T Y N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 78149155 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 78149445 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78149663 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78149865 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 78150191 T A Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 78150797 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 78150844 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 78151590 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78151827 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 78151840 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78151867 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 78151920 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 78153417 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 78154172 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 78154209 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 78154210 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78154248 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 78154277 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 78154325 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78154328 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 78154413 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 78154477 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78154731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78154988 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 78155186 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78155621 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 78155891 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78155931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78155932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78156149 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78156281 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78156354 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 78156395 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78156763 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78156996 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 78158711 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78158893 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78159071 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 78159374 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 78159453 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78159592 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 78159676 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78159725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78159823 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 78159824 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 78159846 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 78159876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78160060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78160085 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 78160188 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78160310 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78161046 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78161239 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78161480 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 78161482 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 78161693 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 78161916 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78161942 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78161950 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78162276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78162610 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78162705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78162720 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78162850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78162919 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78163006 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78163521 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78163556 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78163647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78163921 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78164001 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78164036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78164228 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78164585 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78164858 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78164890 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78165274 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 78165451 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78165686 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 78165820 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 78166234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78166284 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 78166359 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 78166487 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 78166798 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 78166992 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78167075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78167144 G C N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 78167157 T G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 78167413 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78168000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78168033 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 78168088 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78168105 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 78168296 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78168330 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78168397 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78168475 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78168532 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78168570 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78168607 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78168912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78168952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78168998 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78169044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78169269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78169373 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78169399 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78169452 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78169453 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78169939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78170133 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78170316 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78170328 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78170392 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 78170420 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78170585 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78170740 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78170759 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78170811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78170869 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78170893 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 78170902 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78171590 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78171767 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 78172218 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78172381 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78172463 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 78172602 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 78172969 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 78172982 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 78173496 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 78173687 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78173772 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78173786 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78174265 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 78174447 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 78174467 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 78174616 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78174947 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78175084 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78175190 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78175197 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78175364 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 78175395 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78175400 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78175458 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 78175568 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78175711 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78175812 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78175813 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78175880 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78175919 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78176010 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78176080 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 78176254 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78176258 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78176391 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78176394 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78176560 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78176822 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 78176829 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 78176855 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 78176856 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 78177226 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78177281 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78177304 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78177308 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78177319 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78177364 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78177395 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78177418 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78177890 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78177962 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78178150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78178163 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78178169 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78178382 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78178510 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78178523 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78178591 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78178792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78179403 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 78180171 G T N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 78181122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78181976 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78183671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78184668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78184678 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78184680 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 78185177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78185350 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78186306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78186324 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78186327 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78186448 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78186593 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78186674 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78187166 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78187194 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78187199 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78187813 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 78187861 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78188172 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 78188359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78188483 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78188941 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78189002 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 78189271 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78189348 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78190599 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78190708 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78190854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78190879 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78190895 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 78190945 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78191580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78198196 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78199338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78201691 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78207837 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78208011 A C N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 3 78210043 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 78210448 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78211334 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78211775 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78211903 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 78211914 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 78213203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78216852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78217075 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78218034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78220452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78220753 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78221414 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78221814 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78223306 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 78224262 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78224322 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78224356 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78224385 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78224857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78230409 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78231718 C G Y N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 78231801 G T Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 78232275 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78233315 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 78235148 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78236108 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 78236444 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78237124 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78239542 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78239611 G T Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 78240144 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78240244 G T N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 78240369 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 78240436 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78241292 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 78241610 T G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 78241625 G A Y Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 3 78241792 G C Y N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 78241945 C T N Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 3 78242179 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78244463 G A Y Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 3 78244801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78249040 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 78249535 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78249562 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78249596 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78249621 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78249698 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78251443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78251512 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 78252759 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78261675 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78263150 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78263222 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 78263725 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78264075 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 78264320 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78264844 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 78265354 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78265430 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78265574 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78265643 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78265658 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78265695 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78266634 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78266790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78267610 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78269058 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78269356 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78270700 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78272514 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 78280062 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 78281981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78282156 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78282196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78282236 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78282316 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78282427 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 78282759 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 78283258 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78283456 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78283654 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78283678 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 78284275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78284322 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78285654 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78285948 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78285962 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78289772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78305625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78305700 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78305850 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 78306471 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78306799 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78307191 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78307413 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 78307656 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78307756 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78308139 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78308482 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 78308584 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 78308993 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78309093 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78309105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78309344 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78309722 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78309748 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78309872 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78309971 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 78311171 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78311253 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78312315 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78312472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78312550 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78312638 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78312846 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78313195 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78313362 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78315845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78316140 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78317132 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78317904 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78318351 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78318630 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78319075 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78319184 T C N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 78320043 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78320076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78320122 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 78320265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78320757 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78321146 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78322653 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78322845 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78323299 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78324024 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78324714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78326160 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78326764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78326876 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78327421 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78328539 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78330055 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78330562 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78330751 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78331349 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78331428 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78331706 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78331719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78331750 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78331902 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78332048 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 78332130 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 78332164 G T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 78332252 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78332289 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78332331 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78332375 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78332436 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78333116 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 78333734 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78333822 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78334023 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78334031 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 78334566 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 78334808 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78334823 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 78334842 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78335227 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78335560 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78335784 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78336344 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 78336636 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78336849 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78336936 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 78337036 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78337104 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78337564 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78337863 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78337870 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78338025 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78338054 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78338329 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78339727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78340140 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78340267 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78340436 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78340485 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78340669 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78341190 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78341716 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78342220 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 78344141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78344174 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78344187 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78344794 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78345371 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 78345456 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 78346022 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78346690 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78346723 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78346851 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78348238 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78348801 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78349175 A C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 78349360 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78349531 G C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 78349608 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78351223 T G Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 78352553 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 78352782 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 78353523 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78354144 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78354524 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78354525 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 78363974 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 78363975 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 78364331 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78364637 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 78364657 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 78365457 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78365458 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78366304 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78366342 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 78366842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78366853 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78367045 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 78367633 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78367683 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78367708 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78367743 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78368006 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78368096 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78368107 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 78368342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78368482 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78369087 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78369818 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78370054 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78370242 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 78370288 C A Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 78370797 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 78370860 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 78371248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78371313 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78371589 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78371886 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78372484 A T Y N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 10 22 0 10 6 3 78372618 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 78373430 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78373431 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78373577 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78373795 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 78373912 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 78373958 G T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 78374053 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 78375017 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 78375290 A T Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 78375306 T A Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 78375336 T C Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 78375492 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 78375771 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78375811 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 78375816 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 78375834 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 78376238 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78376283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78376678 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78376835 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78377026 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78377028 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78377281 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78377282 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78377531 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78377876 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78378112 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78379096 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78379899 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78380072 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78380159 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78380313 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78380764 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78381107 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78381144 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78381452 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78381508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78381766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78382194 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78382443 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78383731 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78383816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78384134 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78384143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78384954 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 78385098 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78385143 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78386347 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78386451 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78386982 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78387083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78387319 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78388111 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78388190 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78388787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78388903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78389806 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78392918 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78393265 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78393464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78393570 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78393865 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78394083 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78394169 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78394213 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78394426 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78394442 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78394467 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78394695 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 78394742 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 78395008 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78395102 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78395600 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78395836 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 78395927 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 78396078 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78396201 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 78396729 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78396954 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78397009 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 78397145 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78397211 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78397258 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78397381 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 78397454 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78397813 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78397819 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78398123 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78398128 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 78398391 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78398392 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 78398550 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78398629 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78398681 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78399181 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78399676 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78399694 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78399751 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78399779 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 78399816 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78400243 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 78400982 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 78401266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78401292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78401324 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78401440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78401811 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 78402315 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78403095 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 78403311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78403326 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78403391 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78403482 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 78403498 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 78403841 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 78404073 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 78404088 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78404136 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78404143 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78404155 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78404243 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 78404259 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78404273 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 78404277 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 78404500 C T Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 78404671 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 78404722 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 78404746 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 78404809 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78404824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78404885 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 78405114 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78405125 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 78405139 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 78405316 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 78405353 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 78405726 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 78405729 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78405808 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 78406177 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78406180 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 78406239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78406565 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78406773 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78406806 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78407342 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78407385 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78407401 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 78407416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78407427 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 78407469 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78407575 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78407653 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78407705 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78407844 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78414287 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 78415117 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78415269 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78415330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78415387 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78415578 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78415703 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78415739 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 78415802 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78416039 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78416069 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78416148 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78416198 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78416445 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 78416481 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 78416667 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78416790 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78416977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78417077 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78417218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78417219 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78417263 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78417296 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78417445 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78417532 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78417539 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78417604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78417664 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 78417722 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 78417766 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 78417816 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 78417821 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 78417838 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 78417839 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 78417894 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 78417895 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 78417911 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78417928 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78418075 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78418177 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 78418248 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78418270 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78418329 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78418436 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78418444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78418607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78418655 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78418683 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 78418687 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78418733 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78418771 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78418785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78418803 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78418843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78418858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78418926 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78418927 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78418943 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78418995 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78419013 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78419102 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78419177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78419245 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78419323 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78419433 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 78419561 G T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 78419577 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 78419594 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 78419607 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 78419643 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 78419649 A G Y Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 3 78419710 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 78419765 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78419987 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78419999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78420075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78420083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78420091 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78420099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78420150 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78420401 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 78420420 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78420606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78420797 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78420846 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 78420847 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 78420954 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78422426 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78422511 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78423196 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78423392 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 78423792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78423945 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78424046 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78424168 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 78425325 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78426306 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78426543 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 78426579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78427001 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78427041 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78427489 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78427787 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 78427884 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 78428652 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 78430592 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 78430885 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78430983 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78431074 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 78431105 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 78431447 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78431725 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78431758 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78431829 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78431834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78431921 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 78431927 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78432361 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78432636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78432711 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78432768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78433294 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78433437 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78433954 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78434335 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78435593 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78435744 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78436254 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 78438238 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78438297 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78438408 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78438617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78439606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78441985 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78442519 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78442526 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 78442983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78444178 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 78445451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78446040 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78449172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78449931 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78451715 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 78452046 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 78452811 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78453311 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78453412 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 78457795 C G Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 78457960 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78458797 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78458964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78458985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78459171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78459256 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78459276 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78459400 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78459488 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78459585 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78459599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78459610 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78459682 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78459801 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78460100 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 78460213 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 78460251 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 78460827 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78461089 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78461107 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78461148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78461162 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78461212 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78461240 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78461309 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78461342 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78461922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78462753 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78462818 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78462828 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78462908 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78462996 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78463038 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78463174 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78463298 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78463498 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78463669 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78463720 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 78463765 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78464135 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78464387 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78464407 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78464411 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78465023 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78465458 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78465488 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78465556 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 78465935 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78465986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78466061 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78466676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78467209 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78467333 G C N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 78467491 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 78467639 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 78467640 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 78467970 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 78468046 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 78468525 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78469480 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78469572 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78470088 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0 0.777777777777778 0.222222222222222 7 11 0 7 2 3 78471042 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 78471077 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78471265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78471781 G C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 78472248 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78472275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78472297 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 78472351 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78472468 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78472651 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78472982 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78473320 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78473366 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78473433 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78473456 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78473580 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78473919 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78474502 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78474789 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78474790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78474819 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78474983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78475399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78477123 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78477151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78477345 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78477363 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78477387 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78477539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78477573 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 78477642 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78477643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78477764 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78477843 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 78477915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78478134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78478307 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78478382 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78478575 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78478930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78478936 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 78478979 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78479009 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78479012 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78479029 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78479045 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78479070 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78479090 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78479197 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78479505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78479854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78480031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78480564 T C N Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 78480908 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78481648 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78481939 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78481958 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78481980 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78482054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78482079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78482315 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 78482395 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78482465 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78482604 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 78482643 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 78482733 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 78482734 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 78482769 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 78482794 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 78482823 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 78482883 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 78483086 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78483121 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 78483298 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78483363 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 78483784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78484749 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78484835 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78484984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78485494 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78485953 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78486844 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78487022 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78487950 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78488041 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 78488076 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78488378 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78488509 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78488630 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 78488671 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 78488708 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 78489359 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 78489440 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 78489532 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 78489558 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 78489676 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 78489704 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78490512 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78490583 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78490626 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78490795 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78491097 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78491151 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78491308 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78491380 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78491475 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78491515 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78491615 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78491716 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78491841 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78491985 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78492294 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 78492333 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78492449 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78492574 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78492772 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78493021 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78493080 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 78493089 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78493122 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78493946 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78494357 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78494436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78494633 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78495231 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78496081 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78496295 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78496432 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78496875 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78497088 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 78497282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78497283 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78497307 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78497429 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 78498028 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 78498138 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 78498210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78498264 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78498332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78499036 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 78499185 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78499208 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78499407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78499642 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78499737 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78499888 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78500050 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 78500217 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 78500227 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 78500361 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 78500441 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78500502 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 78500532 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78500604 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78500648 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78500709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78500716 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 78500816 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 78500852 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78500890 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78502604 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78502607 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78502657 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 78502658 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 78502871 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78502944 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 78503062 C A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 78503163 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78503308 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78503428 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78503620 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 78503661 A T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0 0.6875 0.3125 11 21 0 11 5 3 78503662 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0 0.722222222222222 0.277777777777778 13 23 0 13 5 3 78503779 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 78503859 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 78504014 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 24 4 12 0 2 3 78504115 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78504858 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78505052 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78505163 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78505527 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78505706 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78505739 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 78505809 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78506020 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78506257 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78506327 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 78506566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78506668 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78506737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78506776 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78506901 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78507044 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78507246 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78507249 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78507353 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78507499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78507511 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78507829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78508141 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 78508741 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78508992 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78509122 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78509317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78509374 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 78509388 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 78509482 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 78509530 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 78509725 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 78509951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78510039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78510054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78510070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78510562 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 78510801 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 78510849 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 3 78511116 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78511132 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 78511946 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78512024 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 78512065 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 78512103 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 78512143 T C N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.181818181818182 0.818181818181818 0 13 9 2 9 0 3 78512230 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 10 14 0 10 2 3 78512245 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 78512260 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78512272 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 78512317 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78512366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78512392 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78512404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78512420 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78512499 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78512606 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 78512613 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78512646 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 78512713 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78512714 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 78512882 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78513047 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 78513103 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78513192 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78513209 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78513243 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78513504 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78513551 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78513555 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78513638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78513771 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78513817 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 78513819 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 78513905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78513997 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78514188 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78514197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78514201 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78514225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78514353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78514357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78514394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78514564 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78514665 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78514666 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78514683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78514700 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78514860 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78514886 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78514929 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78515088 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78515246 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78515293 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78515491 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 78515509 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78515701 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 78515714 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 78515741 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 78515769 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78515872 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 78515890 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78515948 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78516008 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78516011 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78516021 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78516046 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 78516161 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 78516318 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78516353 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 78516392 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 78516656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78516659 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78516840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78516941 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78516961 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78516988 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78517044 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78517099 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78517125 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78517136 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78517140 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78517155 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78517393 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78517440 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78517454 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78517471 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78517543 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78517550 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78517555 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78517581 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78517592 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78517619 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78517664 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78517683 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78517782 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78517794 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78517873 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78517961 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78518310 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78518321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78518403 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78518455 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78518506 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78518539 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78518572 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78518616 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78518695 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78518732 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78518818 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78518886 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78518898 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78518899 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78519052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78519113 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78519125 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78519314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78519405 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78519480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78519490 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78519494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78519519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78519523 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78519595 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78519790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78520014 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78520201 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78520202 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78520398 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78520420 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78520635 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78520778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78520888 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78521090 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78521092 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78521255 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78521515 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78521516 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78521545 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78521798 T A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 78521978 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78522019 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78522168 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78522496 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 78522744 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78522764 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78522916 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78522918 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78522950 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78522969 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78522994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78523230 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78523241 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78523253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78523319 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78525104 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78525113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78525198 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78525275 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78525836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78525874 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78525882 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78525998 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78526047 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78526054 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78526076 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78526187 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78526202 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78526321 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78526676 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78526707 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78526762 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78527351 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78527441 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78527543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78527812 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78527876 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 78527997 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78528133 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78528204 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78528457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78528466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78528471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78528482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78528506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78528654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78528749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78528757 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78528805 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78529194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78529207 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78529224 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78529256 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78529382 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78529656 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78529928 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78530003 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78530118 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78530789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78531553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78531566 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78531606 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78531614 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78531626 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78531958 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78532291 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 78532892 C G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 78533782 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78535059 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78535070 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78535096 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78535097 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78535203 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78535301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78535681 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 78537005 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 78537556 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78537747 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78538082 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 78538279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78539483 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78539889 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 78544059 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78556884 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78557039 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 78558689 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78558712 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78559051 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78560423 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 78560581 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78560960 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 78561598 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78561877 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78561943 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78562175 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 78562482 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78562625 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78562865 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78562893 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 78563021 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 78563264 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78563525 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78563537 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 78563547 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78563595 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78563622 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78563735 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78563805 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78563931 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78564987 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78565217 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78566028 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78566092 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 78566204 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78566354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78566433 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 78566532 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 78566604 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 78566694 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78566826 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78566891 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78566965 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 3 78567004 C A N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 3 78567231 T A N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 3 78567640 C T N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 13 7 4 5 1 3 78567658 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 78567737 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 78567823 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78568015 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 78568142 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 78568253 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 78568818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78568887 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78569516 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78569652 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78569850 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 78569856 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 78569861 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 78569948 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78570093 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78570128 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78570133 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 78570377 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78570401 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 78570568 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78570705 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 78570729 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78570741 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 78570870 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 78570948 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 78571063 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 78571161 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 78571384 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 78571520 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 78571535 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 78571568 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 78571619 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 78571699 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 78571703 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78571823 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 78571869 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 78571882 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78571991 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78572200 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78572325 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 78572326 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 78572518 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 78572576 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78572640 C G N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.285714285714286 0.642857142857143 0.0714285714285714 17 11 4 9 1 3 78572688 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 78572701 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 78572989 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 78573023 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78573252 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78573277 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78573302 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 78573430 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 78573571 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78573609 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 78573680 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78573695 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 78573721 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78573723 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 78573784 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 78573807 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78573892 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78573981 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78574010 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 78574048 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 78574053 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 78581314 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78581354 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 3 78581448 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78581756 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 78581859 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78582427 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78582571 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78582590 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78582835 A C Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 78582914 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 78583100 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 78584274 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 78585099 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78585347 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 78585375 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 78587503 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 78587937 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 78588004 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78588093 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78588434 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78588995 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 78589367 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78590221 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78590738 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78590800 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78591487 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 78591566 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 78591642 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 78591648 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 78591723 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78591954 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 78593042 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 78593072 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 78593262 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78593311 T A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 78593364 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 78593386 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 78593440 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 78593476 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 78593477 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 78593599 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 78593681 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 78593696 C T N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.133333333333333 0.6 0.266666666666667 13 17 2 9 4 3 78593712 G C N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 3 78593783 C G Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 78593807 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 78593836 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 78593876 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78593945 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 3 78593983 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 78594133 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 78594148 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78594260 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78594272 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78594289 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 78594334 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78594347 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 78594368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78594387 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 78594406 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78594437 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 78594442 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 78594488 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 78594523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78594599 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78594657 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 78594833 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 78594863 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 78594869 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 78595161 A C Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 78595397 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78595463 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 78595683 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 78595837 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 78596012 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 78596394 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 78597003 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78597111 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78597172 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78597296 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78597881 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78597968 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 78598017 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 78598027 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 78598070 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 78598149 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78598232 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78598278 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78598319 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 78598584 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78598588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78598615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78598631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78598758 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 78599054 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78599185 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78599299 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 78599300 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78599391 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 78599532 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 78599874 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 78599883 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 78599899 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 78600118 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 78600787 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 78601069 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 78601316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78601688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78601766 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 78601793 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 78601868 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 78601900 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 78601959 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 78602929 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 78602962 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 78603027 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78603454 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78603568 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 78603660 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 78603666 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 78603689 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 78603725 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78603763 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78603797 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78603842 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78603883 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 78603903 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78603921 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78603958 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78604069 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78604072 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 78604086 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78604122 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 78604228 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78604525 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 78605391 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78605843 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 3 78606019 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78606037 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 3 78606580 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 78606699 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 78606769 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 78607279 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 78607493 C T N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 3 78608215 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 3 78608357 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78608978 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 78609787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78610756 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 78610956 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78611270 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78611715 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78612064 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78613209 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 78613287 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 78613429 C A N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 78613716 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 78613915 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 78614200 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78614244 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78614246 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78614393 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 3 78614469 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78614592 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 78615232 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78615530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78615596 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78615619 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78615684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78615786 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78615813 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78615884 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78615912 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78615970 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 78616132 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78616217 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78616254 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 78616264 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78616274 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78616438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78616465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78616488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78616561 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78616583 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78616607 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78616724 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78616812 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78616897 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78616907 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78616956 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78617075 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 78617090 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 78621186 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 78629181 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78629229 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78629230 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78629249 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 3 78629298 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78629669 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78629697 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78630190 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78630389 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 78630907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78631038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78631578 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78631887 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 78633749 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78634760 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 78635025 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 78636230 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 3 78636492 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78636612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78637669 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78637905 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 78638296 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 78638345 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 78638577 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 78638609 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 78638695 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 78638752 C G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 78638961 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 78639048 C T Y Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 3 78640301 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78640901 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78641359 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78641391 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 78641424 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78641440 C G Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 78641442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78641498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78641517 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78641524 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78641643 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 78641748 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78641832 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 78641863 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78642024 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 78642048 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78642144 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78642509 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78642656 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78642928 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 78643166 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78643571 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78643778 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 78644003 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78644228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78645132 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78645456 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 78645845 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78646168 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78646325 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 78646381 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 78646393 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78646498 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78646810 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 78646870 T C N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 3 78646972 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 78647251 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 78647335 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 78647371 G C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 78647487 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78647507 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78647593 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 78647934 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78648017 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 78648036 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 78648171 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78648226 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 78648254 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78648284 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78648312 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78648428 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 78648430 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 78648446 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 78648690 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 78648692 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 78648792 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78648846 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 78648874 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78648880 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 78649060 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 78649191 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 78649207 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78649558 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 78649605 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 78649616 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 78650070 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 78650108 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 78650201 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78650314 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 78650689 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78651124 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 78651256 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78651492 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78651508 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 78651512 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 78651543 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78651595 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 78651703 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 78651746 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 78651903 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78651923 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 78651990 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 78652029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78652042 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 78652156 C G N N 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 10 8 1 8 0 3 78652170 C T N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.363636363636364 0.545454545454545 0.0909090909090909 14 8 4 6 1 3 78652238 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 78652259 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 78652263 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 78652595 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 78652700 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78653126 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 78653133 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78653175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78653360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78653406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78653553 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78653620 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 78654087 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78654160 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78654162 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78654198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78654510 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78654568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78654824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78654960 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 78655042 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78655184 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 78655197 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78655251 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78655327 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78655533 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78655780 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78655881 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78655917 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78655978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78656052 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78656087 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 78656210 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78656241 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78656346 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 78656347 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78656410 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78656451 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78656677 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 78656689 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78656717 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78656760 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78656771 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78656777 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78656852 G T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78656923 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78656966 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78657108 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 78657155 G A Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 78662245 A G Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 78662391 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 78662613 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78662671 C T Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 78663005 C A Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 78663442 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78663533 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78663547 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78663564 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 78663586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78663707 C T Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 78663774 G A Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 78663805 A C Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 78663884 G A Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 78664014 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 78664044 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78664078 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78664182 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 78664242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78664300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78664328 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78664470 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78664649 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 78664758 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 78664881 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78665107 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 78665108 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 78665260 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 78665281 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78665286 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 78665424 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78665472 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78665500 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78665625 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 78665784 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78666010 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78666112 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78666142 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 78666389 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 78666514 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 78666551 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 78666697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78666828 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78667267 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78667370 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 78667458 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 78667466 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78667485 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 78667508 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78667541 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 78667623 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78667677 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 78667702 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78667725 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78667743 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 78668029 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 78668193 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78668308 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78668435 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 78668583 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 78669013 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78669049 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78669171 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 78669222 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 78669391 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 78669403 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 78669409 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 78669571 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 78669987 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 78669998 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 78670074 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 78670087 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 78670209 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78670367 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 78670519 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78670891 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 78671038 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 78671457 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 78671649 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 78671739 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 78671871 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 78671895 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78672070 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78672189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78672267 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 78672402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78672442 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 78672486 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 78672730 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78672753 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78672928 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78673230 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 78673254 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 78673262 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78673270 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 78673614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78673811 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 78674088 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78674114 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 78675827 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 78675867 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 78675951 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0 0.684210526315789 0.315789473684211 13 25 0 13 6 3 78675986 C G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 78676060 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 78676088 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 78676107 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 78676165 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78676173 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78676284 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 78676496 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78676518 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 78676533 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78676540 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78676935 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78677067 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 78677284 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 78678070 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 78678479 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78678803 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 78681443 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78681468 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78681636 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78681782 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 78681785 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 78682053 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78682108 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 78682165 G T Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.105263157894737 0.842105263157895 0.0526315789473684 20 18 2 16 1 3 78682226 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 78682273 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 78682278 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78682357 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 78682482 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78682498 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78682531 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78682640 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78682799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78682845 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78683067 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 78683124 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 78683260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78683494 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78683781 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 78684086 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78684996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78685279 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78686977 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 78687300 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 78687333 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 78687542 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78687573 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78687729 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78687751 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 78687884 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 78687955 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78688240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78688906 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78689993 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78690670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78690872 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78690989 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 78691129 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78692407 T A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 78692478 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 78692876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78693155 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 78693331 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78693554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78693764 T G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 78693846 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78693994 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 78693995 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 78694096 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78694119 C T Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 78694491 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78694521 G C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 78694526 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 78694562 G T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 78694630 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 78694790 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 78694842 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 78694967 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 78695117 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 78695188 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 78695221 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 78695350 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 78695535 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 78695575 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 78696170 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 78696365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78696480 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 78696495 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 78696538 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 78696544 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 78696710 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 78696932 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78696940 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 78696970 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 78698594 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78699308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78699776 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78700090 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78700148 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78700195 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 78700197 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 78700702 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 78700774 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 78702848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78703600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78704629 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 78704657 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 78704689 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78704703 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 78704730 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 78705077 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 78705160 C T N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 78705845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78706587 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78706785 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78707795 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 78708024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78708392 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 78708513 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 78708627 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 78708776 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 78708876 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 78708980 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 78709217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78709347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78709488 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 78709895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78710106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78710137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78710582 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78710601 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78710775 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 78710898 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78710908 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78711321 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 78711323 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 78713774 T A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 78713932 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 3 78714268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78714319 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78714329 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78714631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78714762 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78715105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78715294 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78715573 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 78717107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78717332 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78717363 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 78717384 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 78717426 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78717459 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78717731 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78718801 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 78719518 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 78719796 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 78722667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78722680 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78722863 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 78723135 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 78723705 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78724614 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78724854 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 78724903 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 78725422 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 78725477 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78725748 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 78726073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78726102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78726303 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 78726471 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78726475 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78726489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78726602 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78726643 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 78726967 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 78727172 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 78727207 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 78727235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78727427 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 78727772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78727922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78727995 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 78728033 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 78728069 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 78728120 C T N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 78728150 G T N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 78728240 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 78728525 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 78728555 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78728675 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 3 78729085 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78729222 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 78729293 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 78729295 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78729817 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 78730433 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 78730750 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78730943 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 78731272 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 78731288 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 78731579 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 78731585 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 78731617 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 78732201 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 78732243 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 78732325 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 78732397 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 78732484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78732491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78732581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78732603 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 78732605 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 78732721 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 78732742 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 78732770 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 78732845 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78733572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78733608 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 78733609 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 78733696 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 78733707 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 78733764 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78733787 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 78733833 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 78733837 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 78733878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78733888 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78733891 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 78734174 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 78734192 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 78734369 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 78734493 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 78734673 C G Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 78734676 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 78734765 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 78735293 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 78735865 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 78736687 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 78737823 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78738563 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78738648 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78741202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78741420 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 78742242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78742414 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 78742448 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 78742453 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 78742548 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 78742583 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 78742687 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78742725 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 78742816 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 78742958 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 78742986 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78742993 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 78743023 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 78743114 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 78743124 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 78743305 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 78743358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78743714 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 78743813 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 78743852 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 78744340 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 78744345 G T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 78744823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78744849 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 78744870 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78746440 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 78746468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78746858 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 78746880 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 78747764 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 78747798 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 78747832 G T N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 78747878 G C N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 78747959 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78748029 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 78748049 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 78748265 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 78748303 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 78751212 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 78752084 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78752999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78753901 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 78754222 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78754827 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 78754969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78755014 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 78755179 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 78755189 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 78755366 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78755407 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 78755526 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 78755541 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 78755704 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 78755705 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 78755755 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 78756041 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 78756159 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 78756657 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 78756916 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 78757227 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 78757415 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78758037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78758066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78758141 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 78758294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78758437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78758438 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78758600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78758608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78758743 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 78759075 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 78759120 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 78759194 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78759273 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78759323 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 78759335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78759353 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 78759354 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 78759368 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 78759471 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78759640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78760021 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78760706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78760833 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78761805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78762006 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 78764207 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 78764304 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78764368 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 78765409 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 78765589 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 78768034 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78768140 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 78768217 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 78768236 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78773162 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78773529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78774460 A G Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 78776582 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 78776979 A C Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 78777290 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78777393 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78777750 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78779190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78781499 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 78781504 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 78781689 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 78782018 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78782113 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 78782316 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78782422 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78782448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78782524 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 78782550 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 78782725 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 78782807 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 78783181 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78783563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78784806 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 78786724 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78787035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78787196 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78788229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78788284 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 78788293 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 78788945 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 78792452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78797363 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 78798374 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 78799146 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 78801558 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78801886 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78802002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78802091 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 78802258 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78802505 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78802515 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78802661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78803414 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 78803813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78804284 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78804350 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 78804501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78804934 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 78805576 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78805595 C T Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 78805706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78805971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78806140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78806641 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 78806886 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 78807300 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 78807351 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 78807607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78807883 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 78807919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78808531 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78808769 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78808783 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78808963 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 78809178 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 78809499 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 78809546 G T Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 78809888 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78809959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78810183 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78810758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78812342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78813912 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78814194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78819473 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78819955 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78820246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78820301 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78821185 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 78821673 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78821699 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 78821800 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78822066 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 78822117 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 78822205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78822339 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78822353 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78823135 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 78823177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78823314 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 78823420 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78823423 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78823933 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78824017 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 78824065 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 78824170 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 78824200 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 78824306 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 78824501 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 78824906 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 78825417 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 78825544 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 78825619 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78826531 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78826678 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78826799 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 78827130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78827138 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 78828180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78828909 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 78829062 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78829322 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 78829431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78829680 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78829723 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78829853 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 78830199 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78830200 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 78830360 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 78830362 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 78830389 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78830433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78830515 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78830645 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78831719 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 78831725 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 78831782 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 78831907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78831992 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78832042 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 78832731 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 78832736 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 78832945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78833031 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 78833132 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 78833495 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78833684 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78833869 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 78834004 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78834099 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 78834196 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78834302 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78834307 A G Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 78834380 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 78834421 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78834424 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 78834513 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78834605 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78834700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78834750 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78834868 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 78834884 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 78834939 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 78835036 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 78835047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78835242 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78835253 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78835343 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 78835417 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 78835494 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78835578 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 78835588 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 78835590 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78835663 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 78835788 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 78835797 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78835949 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78835991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78836393 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 78836492 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78836531 C A Y N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 78836550 A T Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 78836634 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 78836647 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 78836676 C T Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 3 78836678 T C Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 78836694 T A Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 78836760 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 78836853 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 78836917 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 78836943 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 78836982 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 78836992 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 78837017 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 78837020 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 78837038 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 78837120 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 78837299 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 78837457 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78837528 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 78837751 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 78837783 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 78837823 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 78837855 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 78837886 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 78838010 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78838232 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 78838256 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 78838284 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 78838285 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 78838359 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78838585 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 78839013 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 78839058 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 78839509 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78839543 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78839714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78839726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78840638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78841145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78841426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78846608 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 78847723 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78847883 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 78848572 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78848608 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78848614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78848626 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 78848742 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 78848753 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 78848784 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 78848802 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 78848805 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 78848844 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 78848867 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 78849355 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78849487 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78849490 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 78849528 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78849677 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 78849678 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78849702 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78849708 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78849790 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78849957 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78849981 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78850091 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 78850105 G A N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 78857098 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 78857102 T A N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 78857274 T G N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 78857422 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78857438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78857573 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78857860 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78858132 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78858903 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78859068 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78859237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78859502 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 78859522 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 78859994 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78860529 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 78860839 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 78860953 T A N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 78861027 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 11 7 2 7 0 3 78861109 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 78861175 A C N N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 3 78861278 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 78861282 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 78861528 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 78861897 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78862005 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 78862019 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 78862182 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78862221 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78862405 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 78862488 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 78862500 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 78862510 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78862555 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 78862889 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 78862899 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 78862920 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 78863009 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 78863062 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 78863116 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78863165 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78863166 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 78863212 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78863321 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 78863348 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 78863458 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78863707 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 78863714 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 78863734 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 78863953 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78863980 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 78864025 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 78864042 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 78864066 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 78864217 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78864264 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 78864298 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 78864427 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 78865003 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 78865015 C T N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 78865033 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 78865253 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78866030 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 78866155 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 78868611 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78868665 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 78868862 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 78868950 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78868967 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78869020 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78870234 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78871308 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78871317 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 78871528 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 78871909 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78871936 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 78872054 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78872132 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 78872315 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 78872356 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78872359 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 78872379 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 78872389 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 78872469 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 78872510 G A Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 78872575 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 78872593 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 78874301 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 78874424 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 78874668 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 78874750 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 78875069 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78875186 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78875300 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78875387 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 78875488 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78875534 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78875539 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78876048 A G Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 3 78876198 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 78876297 A G Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 3 78876420 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 78876466 T C Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 78876471 T C Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 3 78876575 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 78876788 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78876851 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78876978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78876984 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78876989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78877021 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78877077 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78877470 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78877508 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78877591 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78877702 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 78877744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78877900 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78877910 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78878213 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78878420 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78878470 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78878515 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78878928 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78879788 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 78879835 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 78880300 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78880525 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 78880547 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 78880656 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 78880871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78880873 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 78881088 C A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 78881184 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 78881215 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78881232 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78881270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78881294 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78881483 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78881525 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78881541 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 78881565 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78881603 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 78881604 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 78881701 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 78881705 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 78881792 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 78881900 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 78881903 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78881921 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 78881922 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78881986 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78882128 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78882142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78882173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78882282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78882283 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78882342 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78882377 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78882482 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78882502 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78882519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78882600 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 78882615 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 78882632 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 78882790 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 78882819 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 78882883 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78883052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78883193 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78883437 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78883476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78883615 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78883625 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 78883638 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 78883826 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78883895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78883929 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78883942 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 78884004 A T Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 78884154 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78884173 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 78884422 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78884431 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 78884434 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78884482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78884490 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78885262 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78885624 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 78885763 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78885764 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 78886477 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78886495 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 78886560 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78887942 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78888278 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78888316 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 78888334 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78888740 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 78889057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78890269 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78890553 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78890684 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 78890874 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78890925 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78890937 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78890971 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 78891003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78891140 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 78891653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78891790 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78892151 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78892169 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78892462 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78892485 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78892488 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78892540 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78892681 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78892750 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78892880 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78892915 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 78892974 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78893107 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78893183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78893201 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 78893209 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 78893264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78893377 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78894240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78894833 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78895129 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 78895141 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 78895155 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78895313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78895554 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 78895575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78895590 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78895599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78895601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78896040 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78896197 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78896251 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78896252 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78897568 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78897670 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78897807 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78898028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78898184 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78898580 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78898597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78898609 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78898948 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78899010 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78899075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78899199 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78899256 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78899344 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78899395 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78899454 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 78899505 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78899601 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78899605 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78899637 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78899678 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78899689 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78899729 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78899923 C T Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 78900095 A G Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 78900244 A G Y Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0 0.692307692307692 0.307692307692308 9 17 0 9 4 3 78900539 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78900554 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 78900570 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78900644 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 78900757 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 78900771 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 78900878 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 78901133 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78901338 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 78901363 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 78901462 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78901913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78901962 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78901963 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78902026 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78902038 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78902054 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78902102 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78902131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78902160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78902329 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78902510 C G N N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0 1 0 12 12 0 12 0 3 78902517 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78902527 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78902606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78902638 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78902711 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78902812 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 78902820 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 78903182 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78903535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78903571 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78903708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78903736 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78903765 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78903771 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78903789 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78903872 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 78903904 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78903923 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78904030 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78904143 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78904159 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78904196 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78904227 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78904243 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78904298 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78904319 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78904423 A C N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 78904608 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78904668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78904681 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78904701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78904944 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 78905046 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78905476 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 78905925 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78905933 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78905940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78906370 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 78906790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78906797 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78907017 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78907035 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 78907293 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78907599 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78907689 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 78907788 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 78907864 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78908309 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78908351 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78908432 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78908503 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 78909231 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78910006 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 78910230 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 78910234 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 78910254 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 78910500 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 78910541 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78910679 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 78910729 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 78910873 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 78911929 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78912213 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 78912857 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78912940 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78912941 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78913000 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 78913034 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78913266 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78913397 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 78913793 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 78914132 G T N N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 3 78914234 G T N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 78914616 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 78914629 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 78914676 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 78914700 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 78914776 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 78914823 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 78914861 T A N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0 0.75 0.25 12 20 0 12 4 3 78914916 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 78915076 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 78915213 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 78915267 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 78915382 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 78915383 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 78915493 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 78915520 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 78915618 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 78915801 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 78917543 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 78917618 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 78917872 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 78918242 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 78918328 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 78918521 A C Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78918866 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 78918981 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 78919451 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 78919768 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 78919869 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 78920298 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 78920309 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78920323 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 78920514 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 78920532 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78920673 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78920814 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78921077 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 78921087 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78921162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78921200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78921320 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 78921399 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 78921547 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78921598 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 78921620 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 78922061 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 78922228 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78922282 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78922318 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78922463 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 78922477 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 78922570 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78922694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78922742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78922801 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78922954 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 78923031 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 78923142 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78923159 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78923249 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78923523 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 78923549 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 78923744 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 78923829 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78923886 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78924158 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78924329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78924478 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 78924685 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78925235 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78925514 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 78925659 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78925792 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78925986 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 78926014 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 78926074 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78926258 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 78926882 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78927361 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 78927448 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78927744 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 78927778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78927981 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78928413 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78928825 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78928846 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78928872 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78929008 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 78929043 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78929083 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 78929385 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 78929511 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78929524 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 78929614 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 78929626 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78929675 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78929707 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78929894 C T Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 78930040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78930181 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78930308 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 78930332 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 78930783 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78930818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78930858 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78930864 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78930887 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78931089 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 78931244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78931251 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78931317 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78931364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78931438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78931491 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78931500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78931713 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78931866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78931889 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 78932138 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 78932149 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78932254 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 78932280 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 78933487 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 78935080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78937694 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78938649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78940736 A G Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0 0.944444444444444 0.0555555555555556 17 19 0 17 1 3 78940783 G A Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0 1 0 16 16 0 16 0 3 78941407 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 78941640 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78945173 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78945289 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78945403 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 78947449 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 78948585 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78951248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78954852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78957238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78958020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78958024 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 78958037 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 78958050 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 78958195 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 78958463 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 78959484 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 78960303 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78962780 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78964119 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78965336 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78966293 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78966676 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78967066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78970191 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 78971192 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78972730 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 78974246 T A Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 78974412 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78974432 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 78974826 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 78974846 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 78974853 T G Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 78974947 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 78975080 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 78975186 A C Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 78975364 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 78975365 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 78975455 G A Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 78975536 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 78975567 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78975614 G A Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 78975754 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 78975900 G A Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 78976195 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78976238 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 78976523 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78976606 C G Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 78976780 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 78976893 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 78977268 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78977309 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78977460 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 78977587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78977937 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 78977953 A C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 78978181 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 78978289 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78979035 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 78979061 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 78979080 A T Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 78979185 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 78979373 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 78979428 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 78979478 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 78979741 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 78979802 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 78980039 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 78980163 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 78980303 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 78980585 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 78980774 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78980985 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78980991 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 78981059 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 78981108 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 78981313 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 78981702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78981721 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78981985 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78982941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78983117 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78984428 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78985030 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78985418 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78985891 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78986078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78986775 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78987807 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 78988967 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78989183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78991809 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78993267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 78994501 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78994512 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78995086 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78997543 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 78997603 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 78997607 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 78998340 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 78998358 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 78998369 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 78998962 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 78999005 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 78999192 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 78999212 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 78999215 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 78999273 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 78999275 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 78999629 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 78999635 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 78999689 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 78999736 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 79000074 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 79000080 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 79000113 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 79000140 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 79000179 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 79000430 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 79000479 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 79000559 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79000631 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 79000769 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 79000893 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 79000923 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 79000958 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 79001043 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 79001160 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 79001211 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 79001308 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 79001350 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 79001357 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 79001574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79001646 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 79001748 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79001993 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79002190 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 79002294 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79002375 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79002737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79002902 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 79003456 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 79003729 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 79004814 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79004869 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79004935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79005061 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 79005350 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79005694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79005817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79006621 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 79007037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79007995 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 79008206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79009530 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79010790 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79011694 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79011844 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79011892 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79011940 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 79012706 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 79013861 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 79013912 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 79013950 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 79014058 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 79014121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79014139 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 79014425 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 79014688 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79015844 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 79015878 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79016039 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 79016262 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79016272 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79016309 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79016614 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 79016627 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 79016639 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 79016663 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 79017002 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79017593 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79017785 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79018463 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 79018543 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79018756 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 79018812 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 79019310 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 79019315 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 79019479 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 79019527 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 79019534 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 79019573 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 79019649 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 79019841 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 79019948 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 79020316 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 79020328 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 79020342 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 79020884 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 79020963 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79021230 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 79021313 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 79021367 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 79022271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79022717 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79022767 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 79022786 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 79023117 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79023167 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79023920 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79023951 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 79024328 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 79024366 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79024662 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79025111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79025216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79025233 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79025250 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79025380 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 79025381 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 79025410 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79025444 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 79025700 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 79025738 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 79025819 A C N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.142857142857143 0.642857142857143 0.214285714285714 13 15 2 9 3 3 79025896 T C N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 3 79026035 G C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 79026071 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 79026568 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 79026580 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 79026592 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 79026636 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79026711 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79026773 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 79026853 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 79026865 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79026877 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 79026911 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79026979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79027102 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79027122 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 79027148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79027369 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79027386 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 79027412 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79027500 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79027976 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79027999 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 79028195 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 79028248 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 79029094 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 79029524 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 79030000 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79030359 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 79030463 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79030530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79030843 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79032054 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 79032178 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 79032192 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 79032824 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 79032950 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 79033751 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 79034613 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 79034648 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79034665 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79034680 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79034695 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 79035146 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79035950 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79035995 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 79036054 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 79036321 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 79036325 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 79036386 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 79036482 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 79036487 C T N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.181818181818182 0.545454545454545 0.272727272727273 10 12 2 6 3 3 79036858 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 79036922 C G Y N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 3 79037323 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 79037691 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79037732 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 79037750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79037961 G T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 79038097 C A Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 79038207 G T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 79038296 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 79038320 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 79038321 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 79038422 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 79038435 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 79038486 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 79038565 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 79038849 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 79038909 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 79039008 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 79039026 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 79039027 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 79039168 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 79039602 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 79039625 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 79039640 T G Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 79039774 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 79039787 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 79039874 A C Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 79039888 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 79040244 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 79040343 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 79040355 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 79040440 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79040759 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 79040870 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79041058 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 79041136 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 79041311 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 79041452 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 79041600 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 79042235 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 79042532 A G Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 79042612 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 79042664 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 79042698 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 79042711 A C Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 79042713 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 79042803 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 79043172 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 79043187 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 79043203 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 79043277 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 79043340 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 79043360 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 79043363 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 79043779 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.416666666666667 0.5 0.0833333333333333 16 8 5 6 1 3 79043800 G A Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 79044311 T G Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 79044349 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79044426 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 79044514 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79044715 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 79045761 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 79045802 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 79046179 C A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 3 79046244 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 79046309 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 79047131 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 79047195 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 79047275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79048175 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 79049182 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 79049201 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 79050108 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79050396 T C N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 3 79050747 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 79051344 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 79051659 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 79052099 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 79052205 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79052284 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79052307 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 79052419 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 79052439 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 79052568 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 79052619 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 79052639 C A Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 3 79052768 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 79052952 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 79053257 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 79053313 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 79053371 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 79053580 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 79053783 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79053886 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 79053906 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 79053991 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 79054089 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 79054290 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 79054394 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 3 79054711 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 79055478 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 79055515 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 79055575 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 79055576 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 79055704 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 79055789 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 79055818 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79057090 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 79057281 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 79057646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79057839 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 79057866 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 79057892 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 79058440 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 3 79058534 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 79058546 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 79058587 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 79058807 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 79058820 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 79058835 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 79058978 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 79059009 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 79059193 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 79059210 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 79059325 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 79059594 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 79059616 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 79059667 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 79059779 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 79060020 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 79060682 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 79060700 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 79061299 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 79061567 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 79061693 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 79062135 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79062348 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79062546 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 79062565 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 79062619 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79062660 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 79062906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79063162 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79063233 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79063917 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 79064492 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 79064941 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 79065216 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 79065223 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 79065231 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 79065266 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 79065272 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 79065350 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79065362 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 79065412 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 79065420 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 79065463 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 79065469 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 79067779 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79067802 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 79067815 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 79068162 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 79068175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79068480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79070862 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79072357 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79074694 A C Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 79074791 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 79074905 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79074979 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 79075062 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79076457 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 79076862 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79077739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79078271 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79079024 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79079435 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 79079540 G C N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0 0.882352941176471 0.117647058823529 15 19 0 15 2 3 79079636 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 79080165 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79081284 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79081490 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79082350 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 79082488 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79083910 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 79084464 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79084502 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79084898 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79084944 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 79085250 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79085379 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 79085422 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79085454 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79087136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79087724 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79087731 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79087750 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79088225 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79089251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79090174 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79090240 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79090356 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79090618 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 79092740 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79094328 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79094427 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79094842 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79096388 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79098298 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79099731 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79100062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79100132 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79100239 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79100627 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 79100669 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 79101031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79101321 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79101702 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79101732 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 79101956 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 79102067 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79102880 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79103014 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 79103633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79104083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79106072 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79106700 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 79107175 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 79108627 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79110070 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79111404 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79111497 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79114330 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79114605 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 79115019 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79115291 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 79119434 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79119711 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79119746 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79120267 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79120697 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79121077 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79121393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79125221 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79126042 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79126066 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 79126161 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79126224 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 79126239 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 79126254 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 79126460 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 79126687 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79127253 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79127296 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 79127463 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79128078 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79128243 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79128479 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79129543 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79130670 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79131430 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79132135 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79133331 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 79134248 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 79134749 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 79136781 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79137270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79138012 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 79138915 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79139002 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79140391 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79140800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79141214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79141371 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 79141391 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79141400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79141423 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79141519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79141730 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 79141934 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 79142572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79143163 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 79143246 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79143380 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79143525 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 79143631 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79143836 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79143974 T A N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 79144189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79144608 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79144609 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79144671 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79144681 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79144762 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 79145134 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79145778 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 79146072 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79147123 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79147330 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79147414 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79148442 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 79148470 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 79148511 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 79148645 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 79148653 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79148750 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79148796 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 79148810 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 79149213 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79149527 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79149706 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 79149778 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 79149791 C A N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 3 79149800 T G N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 3 79149831 T G N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 79149895 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 79149933 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 79150039 A C N N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.363636363636364 0.545454545454545 0.0909090909090909 14 8 4 6 1 3 79150167 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79150341 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 79150352 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 79150449 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79150817 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79150951 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 79150954 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79151017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79151027 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 79151046 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79151297 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79151352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79151429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79151536 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79151572 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79153283 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79153851 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 79154353 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79154404 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 79154674 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 79154769 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79154813 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79154919 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79155324 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 79155381 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79155487 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 79155526 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79155567 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 79155670 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 79155979 G A Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 79156103 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79156108 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 79156225 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 79156296 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79156324 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79156483 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 79156498 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 79156547 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 79157174 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79157264 A T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79157552 G A Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 79157586 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79157693 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 79157717 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 79157731 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 79157914 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 79158009 A G Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 79158024 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79158273 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 79158329 T C Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 79158377 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79158525 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 79158595 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 79159138 G A Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 79159225 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79159328 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79159509 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79159561 T C Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 79159621 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79159631 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79159643 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79159724 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 79159766 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79159940 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79159950 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79159966 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79159979 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79159984 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79160006 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 79160055 T C Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 79160117 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79160324 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79160338 G C Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 79160347 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79160369 G T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79160515 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79160534 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79160566 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79160598 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79160600 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 79160793 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79160931 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79160942 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79160957 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79161048 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 79161103 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79161108 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79161210 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 79161527 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 79161551 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 3 79161772 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79161859 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 79161893 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79161997 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79162028 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79162032 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79162078 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79162562 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 79162956 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79163011 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79163087 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 79163127 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 79163908 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79164038 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 79164186 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79164341 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79164890 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79166305 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79166751 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79166851 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79166963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79168726 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 79168785 C A Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 79168874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79168891 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 79169012 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 79169080 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79169122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79169231 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79170320 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79170347 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79170509 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79170768 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79170799 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79171219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79171248 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79171406 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79171643 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 79171870 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79172137 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 79177232 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79177350 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79177359 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79177499 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79177530 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79177620 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79177696 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79178258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79179436 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79180057 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79181440 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79181575 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79185438 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79185503 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79185560 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79185789 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79185982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79186451 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79186520 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79188339 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 79188351 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 79188626 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79189664 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79189808 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79190866 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 79190945 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79190981 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79191380 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79191541 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79191700 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79191759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79191945 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79192093 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 79192105 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 79192564 A T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 79192822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79193880 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 79194123 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 79194228 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 79194257 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 3 79195970 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 79196842 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 79196953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79197360 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 79198298 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79199087 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79199403 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79199462 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79199770 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79199790 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79200792 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 79200830 C T N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 79200884 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 79201418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79201472 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79201509 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79201755 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79201950 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79202261 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 79202280 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79202319 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 79202410 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 79202455 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 79202991 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79203029 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79203080 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79203158 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79203186 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79203842 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79203845 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79204275 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79204300 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79204386 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79204593 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79204803 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 79205170 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 79205177 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79205196 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79205405 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 79205447 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 79205555 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79205996 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79206009 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79206112 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79206294 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79206366 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79206920 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79206932 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 79206938 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 79207187 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 79207270 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79207354 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79207484 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79207512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79207620 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79208102 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 79208113 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79208178 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79209368 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79209746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79209912 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79210017 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79211303 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79211370 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79211438 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79211571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79211819 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79211923 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79212588 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79212951 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79213001 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 79213861 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 79214277 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79214758 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79214968 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79215403 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 79217084 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 79217238 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79217291 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79217317 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79217377 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79217413 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79217641 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79217794 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79218090 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79218176 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79218204 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79218240 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79218322 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 79218409 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79218645 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 79218688 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 79218760 C T N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 3 79218761 T C N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 3 79219261 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 79219314 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 79219326 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 79219349 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 79219413 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79219430 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 79219438 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 79220659 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79220662 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79221316 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 79221317 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79221532 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 3 79222267 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79222669 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79222740 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 79223104 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79224589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79225921 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79226122 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79226908 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79227018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79228155 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79228266 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79228850 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 79229768 G C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 79229896 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 79229907 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 79230064 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 79231289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79231523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79231856 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79233319 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 79233674 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79235563 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79236628 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79237469 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 79238400 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79238525 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79239118 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79245453 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79246586 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79247190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79247377 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79248153 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 79250241 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79250911 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 79250918 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 79253583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79253596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79255132 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 79255268 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79255781 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79256428 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 79256585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79256614 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 79256836 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79256837 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79256929 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 79257120 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0 0.7 0.3 14 26 0 14 6 3 79257199 T C Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 79257218 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 79257269 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 79257472 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 79257887 A T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 79257900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79258780 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 79258890 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79259408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79259659 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79259744 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79259958 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79260427 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 79261601 C T Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 79262270 G A N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.545454545454545 0.0909090909090909 0.363636363636364 13 9 6 1 4 3 79262300 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 79262313 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 79262415 G C N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 79265257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79267779 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79270855 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79274790 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 79274814 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79275913 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79276432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79276770 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79277760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79277762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79278734 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79278856 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79279279 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79279655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79279805 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79280814 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79281049 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 79282029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79283032 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79283079 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79285062 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79285755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79288473 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 79290292 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 3 79290504 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 79290943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79291308 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 79294424 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 79295205 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79298877 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79301493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79301972 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79302673 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79303232 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 79305708 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79306478 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79309264 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 79310564 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79312330 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79315623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79318852 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79320824 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79321611 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 79326852 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79329826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79330061 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79330659 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79331653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79332085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79333383 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 79333652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79333956 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79334612 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 79334789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79334993 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 79337521 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79337780 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 79338058 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 79338488 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 79338677 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79338930 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79338933 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79338957 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79339007 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 79339062 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79339066 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79339114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79339379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79339433 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79339519 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 79339683 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 79340236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79340273 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 79340276 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 79340284 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 79340632 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 79340854 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 79340985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79341321 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79342085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79342179 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79342876 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79343801 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79344091 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 79344209 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79344491 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 79344684 G A Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 79344839 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 79345419 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 79345535 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 79345559 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 79345698 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 79346171 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 79346353 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 79346393 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79347353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79348214 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 79348758 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 79348951 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 79349213 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 79349286 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 79349342 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 79349682 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 79349687 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 79349710 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 79350970 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79351219 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 3 79351341 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 79351355 T C Y Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 10 10 4 2 4 3 79351363 T C Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 79351386 T C Y Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.363636363636364 0.181818181818182 0.454545454545455 10 12 4 2 5 3 79351777 T A Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 79351887 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79352255 T C N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 3 79352291 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 79352476 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79352498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79352524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79352680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79352817 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79353630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79353937 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 79356078 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 79359344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79359459 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79360846 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79360936 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79361358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79361417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79362100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79362532 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 79364088 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79364581 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 79372043 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 79372080 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 79372206 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 79372266 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 79372381 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79374801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79379590 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 79379919 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 79380209 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 79380994 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 79381053 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 79382638 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79383102 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79383982 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79384937 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79385037 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 79390117 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 79390757 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 79390808 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79392037 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 79392202 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 79392203 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 79392231 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 79392601 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79392614 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 79394570 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79394659 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79394722 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79394962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79395044 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79395056 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79395263 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79395264 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79395755 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79396720 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 79396821 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79397876 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79397967 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79398248 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79400216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79400256 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79400832 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79400885 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79401004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79401067 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79401116 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79401212 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 79401213 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 79401361 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79401506 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 79401660 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79401702 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79401940 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79401998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79402013 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79402809 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79402951 A C N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 79403129 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79403205 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 79403223 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 79403314 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 79403528 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 79403614 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 79403770 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 79403823 G T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 79404036 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 79404119 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 79404133 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 79404655 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79404997 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79405045 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 79405129 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79405198 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79405505 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 79405713 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 79405717 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 79405726 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 79405766 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 79405803 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 79406229 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 79406265 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 79406661 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 79407017 C T Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 3 79407081 A C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.0588235294117647 0.823529411764706 0.117647058823529 16 18 1 14 2 3 79407188 T A Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.0526315789473684 0.842105263157895 0.105263157894737 18 20 1 16 2 3 79407507 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.05 0.85 0.1 19 21 1 17 2 3 79408693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79410413 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 79410832 A G Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 79410874 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 79410935 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 79410990 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 79411009 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 79411426 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 79411449 T C N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 79411830 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79411912 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 79411970 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79412174 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 79412301 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 79412352 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 79412446 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79412466 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 79412484 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79412555 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 79412596 G C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 79412605 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 79412621 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 79412709 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79412903 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 79412915 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 79412957 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 79413271 C T N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 79413395 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 79413435 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 79413456 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 79413457 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 79413474 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 79413678 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 79413707 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79414000 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79414015 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 79414239 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79414249 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79414391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79414445 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 79414650 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79414653 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79415315 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 79415644 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79415831 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79416189 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 79416282 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 79416651 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79416673 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79416839 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79417027 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79417052 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79417437 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79417965 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 79418013 C G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 79418120 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 79418228 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 79418241 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 79418273 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 79418443 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79418503 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79418609 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 79418901 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79418976 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79419074 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79419251 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79419294 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79419352 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 79420491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79421073 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 79421798 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79421928 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 79422042 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79423863 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79424132 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 79424134 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79424163 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 79424169 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 79424423 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 79424641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79424687 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79424713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79424727 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79425040 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 79425129 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 79425171 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79425198 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79425227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79425230 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79425289 G A Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 79425390 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 79425618 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79425971 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79425984 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 79425987 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 79426203 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 79426370 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79426617 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 79426619 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 79426711 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 79427021 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79427218 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79427271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79427670 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79428063 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 79428524 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 79428666 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 79428953 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79428962 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79429113 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79429158 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79429247 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 79429300 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 79429563 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 79429629 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79429730 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79429748 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79429787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79429824 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79429881 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 79429988 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 79430057 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 79430597 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 79430604 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 79430628 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 79430729 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 79430802 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 79430931 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79430944 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 79430980 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 79430985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79430999 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79431010 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79431047 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79431347 C A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 79431380 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79431432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79431717 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 79431768 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79431792 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79433765 G C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 79434014 A T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 79434175 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 79434217 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79434271 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79434594 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79435037 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 79435251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79437167 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 79437179 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79437522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79437777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79437828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79437832 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79438076 A T N N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 3 79444751 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79445281 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79447803 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79447853 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79449683 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79449841 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79450859 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 79453819 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79454198 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79455528 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 79455547 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 79455767 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 79455775 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79455877 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79456861 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79456944 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79457060 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 79457585 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 79457602 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 79457732 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 79457767 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 79457823 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 79458103 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 79458646 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 79458686 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 79458837 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 79459056 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 79459087 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 79459109 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 79459185 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 79459235 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 79459361 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79459395 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79459433 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 79459450 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79459452 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79459724 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 79459880 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 79460082 T C Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 79460094 T C Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 79460125 A G Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 79460290 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 79460300 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 79460303 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 79460316 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 79460391 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 79460436 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 79460590 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 79460621 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 79460778 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 79460780 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79461005 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79461456 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 79461677 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 79461698 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 79461752 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 79461846 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 79461867 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 79462237 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 79462320 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79462341 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79462343 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79462567 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 79462687 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 79462945 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 79463178 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 79463193 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 3 79463534 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 79463771 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 79464321 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 79464470 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79464584 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 79464640 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 79464797 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79464882 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79464907 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79464920 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 79465427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79465469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79465575 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79465755 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 79465792 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 79466132 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 79466337 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79466406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79466449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79467691 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 79468150 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 79468260 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 79468528 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 79468597 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79468607 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 79468641 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79468838 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 79468874 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 79468881 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 79468896 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79470726 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 79471841 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79472312 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 79472401 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 3 79472469 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 79472713 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 79472715 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79472738 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79472853 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 79472888 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 79473001 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 79473010 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 79473205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79473243 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 79473710 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 79473730 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 79473982 T C N Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 3 79474376 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 79474477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79474511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79474554 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79475020 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 79475473 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 79475664 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 79475716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79475746 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79477876 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79478831 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79479694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79480012 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79480657 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79481085 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79483726 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 79485658 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 79486190 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 79486632 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 79486666 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 79486799 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 79486906 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 79486931 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 79486945 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 79487272 C G Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 79487487 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 79487532 C A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 79487708 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79487738 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79487747 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 79487779 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79487928 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79487949 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 79487994 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 79488087 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 79488104 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 79488240 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 79488338 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 79488381 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 79488428 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 79488451 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 79488467 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79488600 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79488614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79488912 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 79488922 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79489018 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 79489118 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 79489141 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 79489189 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 79490110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79490533 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 79491352 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79491365 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79491391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79491646 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 79491684 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 79491735 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 79491887 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 79491915 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 79491930 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 79491952 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 79492009 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 79492070 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 79492246 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 79492343 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 79492435 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 79492446 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 79492465 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 79492482 T C N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 79492516 G A N Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 3 79492531 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 79492544 T G N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 79492823 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79492846 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 79492870 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 79492952 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 79493473 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 79493497 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 79493654 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 79493668 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 79493742 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 79493865 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 79493869 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79493932 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 79493936 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 79494006 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 79494023 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 79494035 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 79494040 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 79494461 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79494469 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 79494522 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 79494652 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 79494741 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 79495027 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79495945 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79496840 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79496878 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79497005 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79497071 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 79497151 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 79497236 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79497415 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 79497455 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 79497463 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 79497473 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 79497537 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 79497645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79497681 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79497735 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79497757 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79497780 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79497806 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79497809 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79497885 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79497937 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79498013 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79498160 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79498237 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 79498269 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 79498481 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 79498499 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79498562 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 79498592 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 79498754 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79498916 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79498987 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 79499032 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 79499075 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79499080 T A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 79499896 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 79499902 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79500193 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79501163 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79501491 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79501764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79501767 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79501905 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 79501946 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79501966 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 79502194 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 79502235 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 79502308 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 79502320 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 79502377 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 79502522 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 79502533 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 79502561 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 79502603 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 79502689 T A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 79502799 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 79502841 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 79502941 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 79502961 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 79502968 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79502973 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79503018 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 79503094 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 79503105 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 79503114 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 79503161 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 79503186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79503205 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79503223 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 79503420 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 79503423 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 79503478 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 79503502 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 79503519 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 79503584 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 79503693 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79503725 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79503807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79503866 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 79503900 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 79504117 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 79504120 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79504189 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79504250 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 79504266 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79504272 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79504289 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79504372 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79504423 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79504445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79504488 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79504541 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 79504611 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79504660 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79505073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79505189 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 79505255 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79505536 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79505657 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 79505890 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 79505900 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 79505902 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 79505927 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 79505968 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 79505983 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 79506015 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 79506252 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79506269 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79506329 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79506352 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 79506413 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 79506540 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 79506702 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 79507006 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 79509057 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 79509851 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 79509957 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79510130 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79510161 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79510179 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79510194 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79510202 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79510213 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79510273 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 79510298 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79510346 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79510384 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79510438 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79510684 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79510694 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 79510695 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79510747 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79510794 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79511203 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 79511254 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79511364 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79511366 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 79511386 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79511402 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79511436 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 79511472 C A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 79511478 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 79511486 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 79512376 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 79512441 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79512469 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79512637 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79512691 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79512716 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 79512725 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 79512741 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 79512828 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 79512865 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79512872 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79512877 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79512898 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79512928 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79512932 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79512999 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79513081 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79513177 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79513205 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 79513248 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 79513556 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 79513568 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 79513637 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79513659 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79513756 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79513788 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79513804 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79513884 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79513941 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79513951 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79513968 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79513993 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79514080 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 79514110 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 79514116 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 79514125 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 79514132 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 79514136 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 79514187 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 79514303 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79514325 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 79514329 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 79514360 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79514368 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79514391 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79514451 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 79514578 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 79514581 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79514593 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 79515214 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 79515454 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 79515573 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79515855 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79516038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79516084 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79516100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79516234 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 79517672 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79517747 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79518182 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 79518189 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 79518226 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 79518239 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 79518326 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 79518379 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 79518492 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 79519037 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 79519112 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 79519230 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79519262 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79519325 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 79519344 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 79519486 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 79520289 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79520351 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 79520372 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 79520376 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 79520535 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 79520572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79520736 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 79520762 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 79520769 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 79520840 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 79520884 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 79520955 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 79520968 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79520974 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 79521014 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79521129 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 79521137 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 79521252 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 79521285 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 79521347 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79521558 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 79521726 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79521781 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 79521788 A C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 79522239 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79522242 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 79522318 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 79522342 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 79522379 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79522529 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79522724 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 79523125 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79523149 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 79523170 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 79523704 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 79524024 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 79524208 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79524311 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 79524402 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 79524476 A C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 79525504 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 79525674 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 79525681 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 79525712 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 79525790 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 79526065 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79526221 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 79526222 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 79526294 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 79526356 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 79526716 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79526785 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79526842 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79527588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79527599 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79527607 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 79527639 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79527695 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 79527749 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 79527771 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 79528218 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 79528305 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 79528594 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 79528673 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 79528804 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79528814 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79528912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79528976 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79528986 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79529115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79529122 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 79529216 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79529266 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 79529585 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 79529631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79529698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79529701 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79529970 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79530108 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79530229 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79531174 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 79531237 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 79531266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79532100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79532311 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 79532364 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 79532612 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 79532881 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79532906 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 79532941 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 79533035 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 79533067 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 79533106 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 79533130 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 79533246 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79533398 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79533573 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79533642 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79533777 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79533804 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79533825 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79533838 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 79533877 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 79533905 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 79533957 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 79534059 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 79534322 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 79534363 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 79534393 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79534436 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79534516 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 79534605 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79534675 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79534688 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79534699 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79534743 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 79534746 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 79534874 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 79535009 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 79535077 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 79535585 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79535597 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 79535665 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79535936 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 79535947 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 79535966 A G Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 3 79535995 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 79536010 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79536066 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79536252 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 79536262 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 79536267 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 79536284 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 79536378 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 79536403 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79536410 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79536529 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 79536706 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 79536783 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 79537044 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79537594 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79537625 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 79537699 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79538293 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79538318 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 79538546 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79539378 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 79539382 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 79539756 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 79539888 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79539907 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79540036 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 79540487 T G Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 79540553 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79540684 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 79541429 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79542384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79542646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79543073 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 79543288 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 79543304 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79543443 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 79543823 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 79543965 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 79543985 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79544066 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79544281 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 79544394 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 79544590 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79544673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79545094 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79545292 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 79545360 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 79545563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79545629 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79545893 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 79546214 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 79546336 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 79546601 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 79546889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79546944 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 79546965 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79546997 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 79547195 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79547812 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 79547885 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79548632 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 79549315 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79549355 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 79549432 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 79549488 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 79549522 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 79549722 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 3 79549932 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 79549951 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79549971 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 79549972 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 79549993 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 79550008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79550123 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 79550218 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 79550225 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 79550237 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79550262 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 79550716 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 79550728 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79550743 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79551008 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 79551441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79551916 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79552038 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 79552293 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 79552309 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 79552501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79552699 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79552937 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 79555431 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 79555676 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79556137 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 79559211 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79560395 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79560608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79560877 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 79561116 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 79561209 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 79561256 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 79561575 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 79561576 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 79561664 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 79561671 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 79561775 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 79561864 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 79561904 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 79561969 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 79562212 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79562429 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 79562430 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79562530 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79562565 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 79562842 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 79562885 G A N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 79563062 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 79563624 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79563761 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79563808 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79564282 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 79564486 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 79564554 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79564686 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 79564691 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 79564909 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 79564920 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 79565126 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 79565152 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 79565167 A C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 79565187 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 79565194 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 79565235 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 79565378 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 3 79565681 C A N N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 8 12 3 2 5 3 79565883 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 79565896 T C N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 3 79566155 T C N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 3 79574849 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 79575450 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 79575466 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 79575474 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 79575477 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 79575583 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 79575598 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 79575603 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79575756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79575800 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 79575837 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 79575888 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 79575890 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79575943 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 79576044 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79576124 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 79576256 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 79576319 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 79576501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79576556 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79576600 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79577200 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 79577214 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 79577500 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 79577655 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 79577725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79577823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79577914 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 79578105 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79578135 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 79578146 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 79578472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79578477 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79578489 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 79578502 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 79578531 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79578845 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79578870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79579213 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79579240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79579375 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79579483 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 79579617 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 79579710 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79579748 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 79579834 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 79579859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79579963 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79580540 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 79580594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79580638 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 79580645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79580670 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79580795 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 79580912 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 79580922 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 79580967 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 79580975 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 79581250 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 79581440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79581497 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 79581669 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79582057 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79582075 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 79585039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79585556 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 79585732 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 79585786 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 79585842 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79585892 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79585953 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79585959 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79586176 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79586203 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 79586260 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79586660 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79586680 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 79586845 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 79587274 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 79587534 G A N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.153846153846154 0.0769230769230769 0.769230769230769 5 21 2 1 10 3 79587679 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 79588119 G T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 79588206 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 79588425 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79588533 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79588796 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 79588871 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 79588879 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 79588882 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 79588956 T G N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 0.142857142857143 0.214285714285714 20 8 9 2 3 3 79589044 G C Y N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 79589045 A T Y N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 3 79589058 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 79589131 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 3 79589382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79589400 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79589609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79590125 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79590881 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 79590999 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 79591109 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 79591339 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79591384 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79591413 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79591431 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 79591665 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79591690 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79592047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79592439 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79592697 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79592762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79592767 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79592853 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79592971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79592975 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79593020 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79593080 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 79593230 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79593523 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79593658 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79593917 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79593924 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79593962 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79593973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79594087 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79594249 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79594551 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79594694 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 79595489 C G N N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 3 79595694 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79595723 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79595826 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79595827 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79595875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79595936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79595938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79595985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79596822 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79596893 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 79596918 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79597013 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79597110 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 79597130 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79597135 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79597193 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 79597272 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79597541 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79597549 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 79597605 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 79597733 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 79597739 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79598058 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79598091 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 79598123 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 79598209 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79598224 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79598472 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79598527 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 79598626 A C N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 3 79598724 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79598812 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79598823 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 79599161 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79599162 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79599562 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 79599702 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 79599726 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 79599779 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 79599921 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79600189 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79600331 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 79600500 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79602033 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79602192 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 79602433 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 79602436 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 79602509 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79602554 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 79602616 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79602657 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79602689 A G Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 79602694 A T N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 15 13 1 13 0 3 79602715 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 79602885 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 79603113 A T Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 79603240 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79603621 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79603686 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79603699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79603727 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79603813 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79603864 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79603872 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79604015 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 79604134 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79604370 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79604449 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79604502 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79604605 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79604677 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79604682 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79604722 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79604801 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 79604862 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79604880 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79604917 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 79605034 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 79605067 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 79605112 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79605136 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79605140 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 79605164 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 79605173 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 79605387 C G Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 19 17 1 17 0 3 79605399 A G Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 3 79605402 A G Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 16 12 2 12 0 3 79605411 T A Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 79605776 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 79605787 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 79605821 T A Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 79605830 T G Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 79606039 A G Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 79606120 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 79606126 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 79606212 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 79606313 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 79606370 A C Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 79606630 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 79606706 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 79606728 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 79606742 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 79606761 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 79606853 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79606887 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 79606997 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 79607062 T C Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 79607164 A T Y N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 3 79607190 A G Y Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 3 79607192 T A Y N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 79607381 C T Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 79607407 T C Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 79607537 G T Y N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 79607704 A C Y N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 79607737 T C N Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.75 0 0.25 6 2 3 0 1 3 79607813 C G Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 79607904 C T Y Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 3 79608132 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 79608164 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 79608173 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 79608184 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 79608292 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 79608303 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 79608342 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79608369 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79608412 T G Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79608441 T G Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 79608452 A C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79608495 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 79608501 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 79608700 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 79608941 A G Y Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 3 79609122 T C Y Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0 0.6875 0.3125 11 21 0 11 5 3 79609315 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 3 79609397 G T Y N 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 7 9 1 5 2 3 79609408 A G Y Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 3 79610253 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79610335 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79610344 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 79610396 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 79610397 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 79610438 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 79610457 C G Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 79610497 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 79610529 A C Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 79610641 G A Y Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0 0.692307692307692 0.307692307692308 9 17 0 9 4 3 79610784 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 79610819 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 79610977 T A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79611063 C A Y N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 79611111 T G Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 79611265 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 79611266 G A Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 79611506 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 79611769 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 79611779 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79611834 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79611864 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79611900 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79612004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79612162 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79612395 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79612509 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79612568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79612569 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 79612814 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 79612970 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79613162 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 79613247 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79613251 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 79613304 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79613307 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79613349 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79613800 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79613881 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 79614068 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79614090 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79614132 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 79614165 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79614363 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79614372 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 79614393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79614431 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 79614558 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79614594 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 79614595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79614621 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 79614674 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 79614678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79614826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79614859 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79615066 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79615359 A G Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 79615651 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 79615801 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79617900 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79619401 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 79620121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79622346 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79622566 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 79623554 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 79623600 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79623857 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79624031 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79624112 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79624127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79624554 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 79625066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79625389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79625474 T A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 79625540 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 79625574 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79625823 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79625848 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79625854 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 79625925 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79626060 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 79626168 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 79626188 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 79626196 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 79626215 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 79626243 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 79626527 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 79626644 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 79626680 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 79626719 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 79626807 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 79626899 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 79626928 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 79626984 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 79627121 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 79627129 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 3 79627224 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 79627230 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 79627271 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 79627387 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 79627400 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 79627445 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 79627643 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 79627649 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 79627763 T A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 79627915 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 79628012 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 79628128 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 79628134 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 79628206 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79628229 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 79628523 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79629028 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 79629408 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 79629563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79629659 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 79629707 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 79629727 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 79629750 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 79629778 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 79629785 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 79629873 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 79630014 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 79630022 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 79630087 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 79630284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79630640 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79630670 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79630709 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79630739 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 79630850 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 79630865 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 79630879 C A Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 79630970 G C Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 79631303 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79631319 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 79631358 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79631482 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79631801 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 79631844 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79632258 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79632423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79632787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79632799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79633343 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79633791 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79633812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79633874 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79633911 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79634043 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79634121 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 79634261 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79634641 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79634645 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79634723 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79634865 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79635302 T G N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 79635391 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 79635440 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79635473 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 79635870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79636137 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79636176 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79636198 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0 0.736842105263158 0.263157894736842 14 24 0 14 5 3 79636199 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 3 79636277 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 79636316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79636327 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79636489 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 79636515 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 79636520 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 79636545 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79636606 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 79636647 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 79636799 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 79636940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79637089 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79637215 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 79637386 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 79637387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79637761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79637791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79638393 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 79638444 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 79638461 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79638545 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 79638565 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 79638655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79638767 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79638899 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 79638910 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 79638913 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 79639291 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 79639324 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 79639342 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 79639375 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 79639406 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 79639481 T C Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 79639507 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 79639534 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 79639684 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 79639692 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 79639820 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 79639884 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 79640080 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 79640485 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79640548 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 79640623 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 79640636 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 79640658 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79640746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79640764 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79640786 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 79640800 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 79640840 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79640859 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 79640912 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 79640922 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79640941 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 79640957 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 79640994 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 79641095 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 79641199 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 79641794 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 79642134 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 79642170 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 79642177 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79642188 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 79642215 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 79642292 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79642354 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79642441 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79642726 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 79642734 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 79642912 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 79643032 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79643118 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79643340 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 79643366 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 79643383 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 79643765 G T Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 79643873 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 79643875 A G Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 79643914 G A Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 79643949 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 79644135 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 79644299 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 79644435 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79644451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79644481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79644861 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79644949 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 79645027 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 79645268 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79645396 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79645443 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79645444 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 79645496 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79645723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79646069 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 79647583 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79648059 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79648425 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 79648433 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 79648461 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 79648485 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 79648490 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 79648524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79648554 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 79648561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79648674 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79648678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79648786 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79649093 A T Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 3 79649095 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 3 79649128 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 79649519 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 79649554 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 79649726 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79649872 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 79649886 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 79649903 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 79649976 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 79650014 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 79650054 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 79650058 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 79650130 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 79650140 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 79650168 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 79650193 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 79650232 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 79650246 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 79650256 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 79650259 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 79650664 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79650748 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 79650774 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 79650781 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 79650831 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 79650902 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79651081 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 79651108 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79651348 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 79651400 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 79651418 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 79651451 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 79651769 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79651851 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 79652579 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79652606 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79652687 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 79652934 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79652985 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79653077 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 79653194 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79653209 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79653421 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 3 79653535 C T N Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 3 79653966 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79653988 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79654008 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 79654016 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79654112 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79654242 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79654326 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 79654344 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 79654416 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 79654476 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79654890 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 79655003 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 79655677 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79655770 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 79656080 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 79656173 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 79656247 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 79656321 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 79656328 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 79656352 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 79656359 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79656364 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 79656370 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 79656426 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 79656467 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 79656470 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 79656570 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 79656624 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 79656640 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 79657089 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 79657090 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 79657107 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 79657123 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 79657157 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 79657158 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 79657189 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 79657229 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 79657249 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 79657375 A T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 79657458 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 79657518 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 79657534 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 79657582 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 79658127 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 79658302 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 79658324 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 79658366 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 79658407 C A Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 79658458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79658476 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 79658591 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79658626 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 79658818 G C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 79658845 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 79658930 C T Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 79658994 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 79659044 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 79659072 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 79659112 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 79659212 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 79659262 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 79660415 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79660417 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79660493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79660507 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 79660562 C G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 79660600 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 79660615 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 79660622 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 79660855 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 79661710 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 79662368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79662555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79662717 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 79662997 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 3 79663145 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 79663458 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79663475 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 79663525 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 79663526 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 79663922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79664796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79665220 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79667940 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79668559 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79669134 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79670018 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79670046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79670153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79670382 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79674047 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79676831 T A N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 79677601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79680040 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 79680044 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 79680061 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 79680291 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79680767 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79680992 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79681690 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79681936 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 79682390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79682436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79682958 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 79683016 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 79683045 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 79683129 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79683263 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79683772 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 79683843 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 79684289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79684691 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 79684733 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 79684905 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 79684931 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79685152 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 79685163 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 79685205 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 79685357 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 79685426 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79685461 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79685506 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79685532 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 79685613 C A Y N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 79686415 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 79686527 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 79686722 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79686921 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 79686950 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79687276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79688276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79688863 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79689608 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 79689950 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 79691890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79692741 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 79694026 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 79696074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79696317 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 79698450 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79698464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79699091 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79701106 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79702035 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79703827 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 79705491 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 79706148 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 79706332 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 79706524 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79706784 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 79707133 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79707153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79707345 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 79707894 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 79708616 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 79709053 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 79709408 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 79709658 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 79710313 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 79710414 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79710463 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79710467 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 79710489 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 79710738 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 79711117 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79711729 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79711788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79711931 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79712238 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79712377 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79712441 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79712753 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 79712792 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 79712806 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 79712853 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 79712882 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 79712895 C G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 79712896 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 79713054 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 79713063 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79713280 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 79713289 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 79713543 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79713644 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79713657 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79713661 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79713779 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 79713837 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 79713884 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 79713911 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 79713934 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 79714132 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 79714145 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 79714155 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 79714189 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 79714283 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79714433 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79714758 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79714790 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 79714806 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79714860 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 79715588 G A Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 79715959 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79715962 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 79716128 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79716301 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 79717443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79718600 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 79719656 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79720458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79721723 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79721734 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79722763 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79724728 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79725543 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79726907 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 79729202 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 79729546 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79729684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79730179 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79730886 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79730949 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 79730959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79730987 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79731299 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79731517 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 79731544 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79731706 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 79731771 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 79731784 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 79731887 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79731892 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79731958 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 79732016 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 79732096 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79732711 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 79732806 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79732944 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 79733078 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 79733487 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 79733496 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79733912 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 79734137 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79735082 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79735897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79736225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79736623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79736649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79736791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79736800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79736976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79736986 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79737466 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 79738876 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79739144 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 79740720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79740788 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79740821 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79740864 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79740900 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79741228 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79741240 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79741259 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 79741260 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79741285 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79741296 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79741308 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79741463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79741483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79741534 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79741605 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79741610 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79741634 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79741729 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79741748 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79741750 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79741858 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79742271 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 79742397 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 79742803 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 79742855 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79743126 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 79743164 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79743172 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79743209 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 79743261 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79743821 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79743869 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79744198 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79744768 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79744847 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 79744961 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79745185 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79745192 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 79745729 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79745740 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79745756 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79746293 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79746605 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 79746936 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79747143 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 79747202 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 79747244 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 79747305 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 79747308 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79747489 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79747595 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 79747606 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 79747935 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 79748100 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79748323 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 79748544 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79748603 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 79748838 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79748857 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79748947 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79749035 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79749093 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79749123 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79749131 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79749192 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 79749214 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 79749316 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 79749508 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79749637 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79749830 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 79749845 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 79750127 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 79750251 G A N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 79750266 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 79750317 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 79750354 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 79750835 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 79750978 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79751042 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79751046 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79751136 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79751420 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 79751611 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79751727 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79752046 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 79752084 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79752273 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79752445 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 79752502 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79752595 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 79752603 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79752792 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 79752832 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79752963 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79753147 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79753451 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79753558 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79753596 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79753974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79754574 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79754828 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 79755288 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79757133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79757686 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 79757899 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 79759300 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79759782 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 79759873 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79760088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79762667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79762884 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79770550 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 79770628 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79771981 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79772317 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79772341 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 79772492 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79772903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79773463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79773994 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79774017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79774601 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79775265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79775698 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79776008 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 79776032 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 79776272 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 79777119 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79777193 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79777999 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 79778093 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79778208 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79778608 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 79779647 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 79780729 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79781019 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79785634 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79786112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79786129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79786555 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79786878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79786923 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79787664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79787806 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79788892 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79789827 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79791063 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79791941 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79793471 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79793721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79793921 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79794787 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79795065 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 79795145 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79795428 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79795668 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 79795917 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 79795970 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79796281 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79797012 T C N Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 3 79797384 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79797392 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 79797589 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 79797807 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 79797895 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 79798147 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79798323 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79798371 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79799181 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79799197 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79799236 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79799663 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79799718 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79799942 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79799983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79799999 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79800088 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79800111 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79800174 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79800185 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79800335 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79800338 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79800568 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79800593 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79800944 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79800967 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79801016 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79801041 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 79801304 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 79802209 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 79802356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79802589 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 79803208 T A Y N 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 3 79806919 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 79807673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79807925 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79809131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79809298 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79809447 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 79809490 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79809722 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 79809733 A C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 79809807 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 79809902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79809919 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 79809975 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 79810043 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 79810080 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79810450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79810477 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 79810809 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79810851 A T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 79810872 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 79810933 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79811031 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 79811313 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 79811463 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79811793 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 79811805 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79812391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79812443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79812593 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79812616 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79812734 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 79812891 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 79813121 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 79813153 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79813527 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79813780 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 79813863 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79813909 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 79813914 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 79814205 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 79814225 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 79814256 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 79814376 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 79814545 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 79823444 T C Y Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 3 79823607 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 79823649 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 79823709 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 79823747 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 79823770 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 79823771 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 79823839 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 79823894 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 79823911 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 79824103 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 79824161 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 79824215 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 79824247 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 79824822 T A N N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 3 79824833 T A N N 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 12 4 5 2 1 3 79824894 T C N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 3 79825003 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 79825097 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 79825158 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 79825200 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 79825213 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 79825250 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 79825261 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79825294 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 79825398 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 79825777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79825903 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 79826395 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 79826431 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 79826529 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79826540 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 79826687 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79826761 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79826818 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79826845 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79827015 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 79827118 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 79827331 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 79827490 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 79827514 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 79827567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79827608 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79827649 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 79827673 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 79827712 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 79827806 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 79827821 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 79827846 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 79827904 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79828095 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79828103 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 79828111 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79828358 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79828367 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 79828384 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79828464 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 79828619 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 79829215 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 79829229 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 79829498 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79829537 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 79829550 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79829624 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79829668 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79829702 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 79829740 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 79829747 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 79829834 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 79829928 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79829992 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79830046 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79830110 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 79830160 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 79830269 C A N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 79830547 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 79830568 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 79830574 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 79830619 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 79830629 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 79830769 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 79830774 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 79830800 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 79830827 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79830829 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79830887 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 79831119 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 79831129 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79831225 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79831243 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79831254 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 79831301 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79831343 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79831425 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 79831510 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79831650 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79831739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79832097 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79832180 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79832280 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 79832323 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 79832435 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 79832450 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 79832467 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 79832528 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 79832547 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 79832607 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 79832618 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79832667 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79832683 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 79832905 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 79832906 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 79832958 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 79832972 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 79833026 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 79833059 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 79833061 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 79833087 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79833217 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 79833303 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 3 79833331 G T N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 79833335 A G N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 3 79833841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79834437 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79834615 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79834620 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 79834745 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79835024 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79835171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79835754 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79835965 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79836964 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79837180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79837496 C T N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 3 79837520 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 79837784 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 79838029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79838284 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79838618 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 79839975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79840452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79842168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79842466 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79843181 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 79843846 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 79844304 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 79844622 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 79844789 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 79844809 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 79844816 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 79844831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79845281 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79845319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79845353 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 79845571 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79845604 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 79845614 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79845923 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79845956 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 79846137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79846271 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79846282 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79846493 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79846695 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79846715 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 79846957 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79847034 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79847041 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79847305 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79847353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79847398 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79847430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79847453 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79847659 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 79847677 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79847683 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 79847835 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79847908 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79848038 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79848050 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79848093 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 79848130 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79848164 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79848171 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79848205 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 79848282 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79848472 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 79848578 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79848618 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79848682 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79848804 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 79848818 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79848830 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79848846 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79848945 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79848978 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 79849005 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 79849483 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79849496 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79849549 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79849606 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79849626 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79849637 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79849651 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79849766 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79849958 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 79849972 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79850068 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79850091 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79850179 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79850180 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79850248 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79850253 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79850296 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79850328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79850341 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79850406 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79850433 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79850554 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79850601 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79850611 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79850616 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79850763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79850766 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79850790 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 79850799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79850819 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79850882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79850926 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79851021 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79851060 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79851120 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79851148 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79851197 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79851206 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79851234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79851312 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79851421 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79851516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79854474 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79854622 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79854892 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79854925 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79854948 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79855711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79855845 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 79857188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79857957 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79858002 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 79858448 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 79858901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79858953 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79861182 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79861395 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 79862070 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79862638 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 79863248 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 79863536 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 79863589 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79863931 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79864188 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79864229 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79864529 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79865044 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79865138 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79865722 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 79865938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79866129 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 79866201 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79866521 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 79868186 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79868229 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 79869958 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79870151 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79870432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79872200 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 79872603 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79872677 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79873073 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79873141 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 79873793 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 79874133 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79874208 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 79874231 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79874550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79874729 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79876829 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79876835 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79877541 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79877753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79877790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79877924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79877984 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79878002 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79878152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79878222 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 79878294 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79878346 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 79879581 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 79879589 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 79879618 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 79879668 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 79879695 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 79879736 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 79879822 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 79879841 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 79879872 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 79879899 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 79879952 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 79880011 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 79880088 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 79880113 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 79880125 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 79880139 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 79880281 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 79880287 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 79880293 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 79880309 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 79880313 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 79880320 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 79880359 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 79880439 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 79880466 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 79880540 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 79880577 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 79880581 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 79880607 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 79880631 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 79880651 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79880804 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 79881012 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 79881221 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79881408 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 79881449 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 79881655 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 79881671 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 79881674 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 79881711 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 79881988 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 79882306 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 79882373 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 79882404 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 79882536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79882541 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 79882552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79882644 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79882833 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 79882894 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 79882940 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79883344 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.111111111111111 0.777777777777778 0.111111111111111 18 18 2 14 2 3 79883415 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 79884430 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79885403 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79885481 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79886195 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79886493 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 79887101 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 79887149 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 79887154 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 79887162 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 79887240 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 79887256 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79887333 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79887492 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 79887583 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 79887594 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 79887598 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 79887720 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 79887732 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 79887752 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 79887760 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 79887869 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 79887944 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 79888017 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 79888039 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79888116 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79888446 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79888496 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79888812 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 79888849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79888883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79888970 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79889040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79889143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79889578 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79889597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79889604 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79890215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79890911 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79891134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79891360 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79891399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79891474 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79891512 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79891635 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 79891654 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79891700 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 79891718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79891726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79891735 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 79891784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79891914 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 79891982 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79891997 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79892213 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 79892228 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79892318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79892824 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 79892831 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79893763 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79894551 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79895863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79896858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79898228 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 79898490 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79898935 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 79900086 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 79900450 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79900485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79900858 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 79901662 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79902009 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79902460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79902581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79902780 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79902855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79903375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79903494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79903706 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79903853 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79904429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79906286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79906501 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79906650 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79907080 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 79908309 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79908492 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 79909167 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79910480 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 79910555 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 79910869 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79912112 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79912827 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79912955 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79913246 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79913621 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79914017 T C Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 79915714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79917237 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 79918015 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 79918320 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79919848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79920888 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 79920917 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 79921223 A G N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.214285714285714 0.714285714285714 0.0714285714285714 16 12 3 10 1 3 79923168 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79923204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79924229 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79925231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79926400 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 79926561 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 79926642 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 79926656 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 79926657 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 79926684 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 79926965 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 79927032 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 79927115 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 79927127 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79927151 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 79927157 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79927234 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 79927364 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 79927409 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 79927464 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79927683 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 79927785 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 79927796 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79927941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79928156 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79928226 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 79928573 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 79928935 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79929026 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 79929053 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 79929277 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79929723 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 79929738 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 79929760 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 79929892 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79930225 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79930543 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 79930571 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 79930616 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79930619 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 79930707 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79930723 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 79930746 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79931170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79931274 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79931280 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79931293 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79931304 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79931386 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79931440 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79931467 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79931516 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79931528 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79931534 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 79931552 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79931629 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79931721 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79931773 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79931785 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79931803 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79931838 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79931895 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79931968 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 79932022 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 79932035 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 79932120 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79932159 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 79932245 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79932289 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 79932339 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79932344 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79932359 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79932372 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79932410 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79932422 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79932436 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 79932554 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79932576 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79932589 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 79932654 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 79932664 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79932680 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 79932681 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 79932692 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 79932734 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 79932761 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 79932762 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 79932803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79932880 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 79933051 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 79933183 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79933188 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79933231 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79933243 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79933250 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 79933259 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 3 79933295 A T N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 79936861 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 79936902 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 79936903 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 79936927 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79937031 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 79937149 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 79937162 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 79937177 A C N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 79937216 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 79937310 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 79937337 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 79937467 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79937502 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79937531 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 79937557 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79937600 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79937623 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79937629 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79937676 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79937743 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79937853 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79937864 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79937875 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79937894 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79937915 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79937967 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79937975 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79938032 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79938048 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 79938053 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79938106 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79938186 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 79938227 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79938242 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79938269 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79938347 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79938375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79938390 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79938518 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79938527 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79938609 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 79938748 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79938766 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 79938835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79938925 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79938942 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79939028 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 79939034 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 79939116 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79939524 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79940649 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79942717 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79946210 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 79946758 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 79948194 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 79950044 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 79950861 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 79954825 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 79956958 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79957547 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79962573 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79962836 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79963152 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 3 79964627 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79964764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79964827 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79968793 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79968989 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79972066 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 79972726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79972809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79973261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79974952 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79975025 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79975883 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 79977218 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79980304 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 3 79980652 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 79980934 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 79981132 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 79981205 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 79981470 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79981549 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 79981612 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79981680 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79981704 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79982059 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79982067 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79982099 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79982106 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79982187 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79982197 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79982239 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79982360 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 79982418 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 79982483 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 79982496 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79982514 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 79982595 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79982617 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79982627 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79982637 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79982748 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 79982769 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 79982775 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 79982830 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 79983000 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79983006 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 79983084 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79983244 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79983322 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79983868 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79983907 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 79984049 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 79984087 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 79984120 T G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 79984371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79984490 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79984701 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 79984986 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 79985104 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 79985110 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79985868 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79986002 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 79986142 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79986161 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 79986316 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79986669 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 79986724 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 79986793 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 79986872 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 79986968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79987070 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79987081 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79987273 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 79987364 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 79987417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79987506 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79987669 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 79987919 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 79988119 T A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79988190 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 79988250 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79988422 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79988477 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79988565 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 79988700 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 79988751 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 79988789 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 79988839 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 79988856 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 79988867 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 79988879 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79988902 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79989037 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 79989151 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79989367 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 79989443 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 79989592 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 79989628 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 79989681 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 79989684 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 79989760 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 79989815 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 79990002 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 79990013 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 79990043 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 79990113 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 79990121 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 79990137 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79990155 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 79990177 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 79990475 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 79990542 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 79990672 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 79990677 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 79990685 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 79990721 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79990846 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 79990860 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 79990921 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 79991328 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79991411 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79991497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79991690 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79991773 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79991792 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79991795 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79991916 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79991976 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79992200 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79992270 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 79992277 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79992292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79992303 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 79992379 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79992443 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79992747 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79992890 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79993321 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79993330 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 3 79993378 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79993442 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79993494 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79993956 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79994009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79994115 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79994521 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 79994921 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79995178 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 79995696 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 79995929 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 79996033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79996080 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79996262 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 79996328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79996334 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79996674 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 79996813 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79996968 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 79997253 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 79997279 G A Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 79997345 G C Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 79997575 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 79997757 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 79997829 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 79997871 C T N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 3 79998253 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79998256 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 79998284 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79999318 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 79999327 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 79999661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79999791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 79999840 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80000720 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80000744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80000776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80001046 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80001051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80001078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80001109 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80001191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80001478 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 80001714 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 80002586 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80002606 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80002959 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80002991 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80003120 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80003270 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 80003479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80003703 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 80004085 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80004275 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80004297 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80004302 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80004318 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80004429 A T N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.0769230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 9 17 1 7 5 3 80004676 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80004786 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80004824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80004941 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80005005 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 80005303 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 80006270 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 80006289 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 80006346 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80006402 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80006406 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80006464 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80006483 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80006497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80006569 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 80006699 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80006734 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 80006945 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80007039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80007144 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80007259 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80007403 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 80007415 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80007498 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80007517 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80007533 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80007726 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80007870 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80007959 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80008215 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80009159 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 80010023 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80012736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80013031 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 80013461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80013770 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80014028 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80014095 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80014132 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80014141 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 80014277 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 80014339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80014459 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80014515 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80014964 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 80015005 T C Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 80015025 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 80015163 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 80015280 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80015369 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80015398 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 80015400 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 80015720 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80015813 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80015856 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 80015875 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 80016038 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 80016085 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 80016149 G T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 3 80016182 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 80016489 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 80016758 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 80016763 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 80016809 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 80016838 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 80016872 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 80016935 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 80016941 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 80016952 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 80017072 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80017142 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 80017191 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 80017288 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 80017369 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 3 80017413 C A N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 3 80017449 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 80017472 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 80017475 T G N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 80017600 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 80017642 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 80017678 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 80017730 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 80017793 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.0625 0.625 0.3125 12 20 1 10 5 3 80017807 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 80017828 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 80017875 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 80017876 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 80017951 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 80017967 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 80017979 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 80017989 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80017993 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 80018005 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 80018022 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 80018082 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 80018135 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 80018138 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 80018161 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 80018236 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 80018248 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 80018251 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 80018291 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 80018332 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 80018357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80018372 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 80018446 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80018498 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 80018574 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80018659 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80018825 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80018868 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 80019005 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80019191 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 80019481 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 80019677 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 80019777 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 80019813 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80019835 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80021038 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 80021805 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80021828 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 80021996 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 80022192 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80022323 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80022351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80022580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80022730 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 80022779 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 80022785 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80022805 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80022880 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 80022967 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80023170 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 80023231 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 80023328 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 80023345 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 80023441 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 80023516 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 80023520 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 80023585 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 80023599 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 80023671 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 80023943 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 80023947 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 80023965 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 80023971 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 80024008 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 80024065 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80024090 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 80024110 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 80024123 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 80024134 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80024171 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 80024367 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 80025021 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 80025842 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 80025897 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 80025934 T G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 3 80026237 G A N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0 0.615384615384615 0.384615384615385 8 18 0 8 5 3 80026251 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 80026716 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80029798 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 80029817 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 80029870 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80030015 G T Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 80030088 T G Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 80030235 A T Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 80030485 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 80030550 A T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 80030604 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 80030831 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 3 80030832 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 3 80031010 A G N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 3 80031039 T C Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 3 80031262 T C Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 80031437 T G Y N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 80031630 A G Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 80031958 T G Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 80032301 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 80032420 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 80032530 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 80032561 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80032613 A G Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 80032994 T C Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 80033426 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 80033542 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 80033677 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 80033704 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 80033815 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80033952 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 80034393 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 80034431 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 80034451 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 80034774 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 80034933 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80035091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80035187 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 80035387 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 80035730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80035849 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 80035875 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 80035986 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80036019 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 80036293 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 80036610 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80036693 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 80036822 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 80036895 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80036944 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 80037035 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80037249 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 80037694 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80037695 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80037862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80037934 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 80037947 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80038058 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 80038329 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 80038828 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 80038905 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 80039009 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80039335 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80041940 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80048209 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 80048218 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80048367 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 80048491 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 80048496 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 80048522 T G N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 80048799 C T N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 3 80048838 C T N Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 5 5 1 3 1 3 80048994 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 3 80049277 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 3 80049386 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 3 80049461 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.0625 0.6875 0.25 13 19 1 11 4 3 80049531 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 3 80049561 T A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 80049586 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 3 80049677 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 3 80049688 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 3 80049753 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 80049823 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80049865 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 3 80049914 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 3 80049973 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 80049978 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 80050028 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 3 80050035 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 3 80050040 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 80050052 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 3 80050121 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 3 80050236 C T N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 3 80050443 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 3 80050502 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 80050553 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 80050720 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 80050782 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 80050807 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 80050906 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 80050907 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 3 80050967 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 80050982 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 80051158 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 80051883 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 80053066 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80053444 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 80054248 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80055207 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 80055495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80057330 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80058717 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 80058875 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 80058916 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 80059280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80059442 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 80059601 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 80059664 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 80059665 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 80059791 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 80059823 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.3125 0.625 0.0625 20 12 5 10 1 3 80060049 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 80060167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80060247 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 80060356 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80060484 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 80060572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80060627 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80060651 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80060885 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 80060909 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 80061047 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 80061204 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80061275 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80061361 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80061489 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80061509 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80061806 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 80061883 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 80061891 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 80062108 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80062111 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80062202 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80062296 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80062315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80062494 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80062510 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80062522 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80062546 G C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 80062641 G A N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 80062656 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 80062664 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 80062702 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 80062736 A G Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 80062792 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 80062902 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80062945 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 80063014 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80063036 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80063175 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 80063179 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 80063332 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80063406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80063583 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80063674 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80063749 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80063760 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80063794 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80063844 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80063899 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80063994 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80064008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80064014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80064037 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80064045 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80064050 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80064104 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80064118 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80064164 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80064284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80064317 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80064325 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80064363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80064421 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80064443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80064578 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80064652 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80064680 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80064759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80064850 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80064901 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 80064991 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80065065 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80065117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80065174 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 80065258 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80065376 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 80066064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80066066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80066208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80066551 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 80066563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80066583 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80066596 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80066697 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80066725 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80066777 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80066905 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80066924 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80066967 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80066972 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80067046 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80067055 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80067121 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80067201 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80067407 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 80067571 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 80067620 T C N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0 1 0 13 13 0 13 0 3 80067744 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 80067955 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80068003 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80068156 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80068212 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80068282 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80068393 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80068415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80068685 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80068697 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 80068941 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 80068986 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80068989 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80069026 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80069043 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 80069110 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80069120 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 80069154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80069320 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80069450 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80069455 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80069479 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80069534 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80069619 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80069638 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80070165 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80070229 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80070234 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80070276 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80070318 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80070323 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80070350 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80070363 C A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80070602 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80070668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80070731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80070766 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80070811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80070833 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80070850 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80070917 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 80071044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80071070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80071101 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80071153 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80071154 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80071187 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80071198 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80071234 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80071460 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 80071574 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 80071689 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80071700 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80071714 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0 0.6875 0.3125 11 21 0 11 5 3 80071715 A G N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0 0.615384615384615 0.384615384615385 8 18 0 8 5 3 80071730 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 80071748 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80071752 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 80071849 T C Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 80071936 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 80071981 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 80072014 G C Y N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0 0.6 0.4 6 14 0 6 4 3 80072049 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 80072378 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 80072603 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 80072676 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80073280 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 80073335 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 80073646 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 80073741 C G N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 80073944 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80074104 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 80074355 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 80074371 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80074550 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80074642 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80074875 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 80075011 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 80075478 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 80075673 A G Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 80075851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80075895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80075973 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80076106 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 80076197 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 80076206 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 80076411 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 80076593 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 80076616 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 80076654 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 80076661 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 80076796 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 80076801 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 80076946 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 80077084 T G Y N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 80077119 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 80077125 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 80077181 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 80077261 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 80077472 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 80077794 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 80077798 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 80077868 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 80077899 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 80078104 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 80078337 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 80078344 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 80078351 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 80078506 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 80078548 C G N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 80078619 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 80078897 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.0588235294117647 0.705882352941177 0.235294117647059 14 20 1 12 4 3 80078967 T A Y N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 80078969 A C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 80079095 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 80079113 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 80079363 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 80079646 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80079655 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 80079673 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 80079812 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 80079951 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 80080381 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 80080570 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 80080929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80081000 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 80081193 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 80081429 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 80081520 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 80081998 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 80082051 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 80082274 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 80082457 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 80082565 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80082701 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 80082941 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80082987 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 80083013 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80083016 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 80083069 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 80083127 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 80083333 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 80083361 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 80084530 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 80084985 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 80085699 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 80085814 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 80086344 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 80086532 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 3 80086774 G C Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 80087022 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 80087157 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 80087536 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 80087794 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 80087923 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80087967 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 80087968 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 80088229 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 80088526 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 80088527 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 80088722 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80088745 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80088867 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 80088888 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80088989 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 80089036 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80089068 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 80089353 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80089409 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 80089424 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80089459 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80089493 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80089630 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80089674 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 80089794 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 80090343 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 80090358 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 80090415 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80090527 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 80090959 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 80091588 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80091766 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 80091767 G A Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 80092139 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 80092300 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 80092325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80092633 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 80092643 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80092664 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 80092782 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80092787 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 80092842 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80093385 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 80093517 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 80093979 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 80094111 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80094134 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 80094216 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 80094265 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 80094266 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 80094290 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80094321 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80094429 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 80094440 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 80094453 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 80094565 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80094763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80094815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80094828 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80094861 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80095086 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80095102 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80095111 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80095447 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80095536 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 80095690 G A N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 3 80095772 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 80095971 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80096089 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80096108 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80096221 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80096224 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 80096302 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 80096349 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80096357 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 80096597 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 80096634 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 80096811 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 80096899 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 80097052 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80097122 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80097330 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 80097616 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80097736 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80097776 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 80097866 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 80097976 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 80098123 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 3 80098157 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 80098376 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 80098474 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 80098522 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80098578 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 80098644 A G Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 80099009 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 80099130 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80099169 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 80099423 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 80099800 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80099870 C A Y N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 80100050 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 80100079 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 80100248 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80100344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80100357 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80100423 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 80100434 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 80100485 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 80100634 G T Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 80100681 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 80100904 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80100948 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80101129 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 80101148 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 80101187 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 80101200 G A Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 80101212 A G N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 80101283 T A N N 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 3 80101378 A G N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 3 80101425 T G N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 3 80101468 T G N N 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 9 11 2 5 3 3 80101479 A G Y Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 3 80101495 G A Y Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 9 11 3 3 4 3 80101500 T A Y N 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.363636363636364 0.272727272727273 0.363636363636364 11 11 4 3 4 3 80101569 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80101622 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80101726 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80101936 A C Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 80102033 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80102079 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80102082 A G Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 80102094 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80102148 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 80102326 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 80102330 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 80102400 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80102410 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 80102456 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 80102682 C A Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.105263157894737 0.842105263157895 0.0526315789473684 20 18 2 16 1 3 80102689 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.105263157894737 0.842105263157895 0.0526315789473684 20 18 2 16 1 3 80102842 A G Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 80102873 G A Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 80102887 T C Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 80102909 T C Y Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 80103074 A G Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 80103147 A C Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 80103209 G T Y N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 80103258 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80103285 T C Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 80103409 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 80103442 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 80103621 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 80103660 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80103783 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 80103809 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 80103985 A G Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 80104002 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80104129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80104141 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80104162 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80104178 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 80104244 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 80104352 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 80104426 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80104514 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80104538 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80104666 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 80104667 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 80104698 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80104799 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80104845 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 80104957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80104958 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80104969 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 80105024 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 80105045 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 80105223 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 80105260 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 80105295 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 80105306 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 80105319 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 80105466 C A N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 80105477 A G N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 80105508 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 80105518 T A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 80105584 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 80105641 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 80105773 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 80105781 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 80105805 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 80105813 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 80105880 T A N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 80105885 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 80105892 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 80105920 A G Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 80105999 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 80106022 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 80106186 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80106201 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 80106513 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 80106665 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 80106784 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 80106881 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 80107059 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80107077 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 80107099 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80107187 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80107210 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80107316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80107503 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 80107702 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 80108096 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80108474 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80108990 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80109065 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 80109107 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 80109477 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80109482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80109787 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 80109794 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80110105 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 80110223 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 80110814 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80110832 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80110985 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80111037 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80111076 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80111180 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 80111415 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80111465 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 80111799 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 80112073 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 80112092 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 80112104 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 80112202 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 80112253 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80112554 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 80112625 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 80112732 T A Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 80112733 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 80112863 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 80112879 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80112980 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 80113009 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 80113137 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 80113173 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 80113304 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 80113317 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80113336 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 80113349 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 80113350 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 80113369 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 80113379 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 80113406 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 80113436 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 80113465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80113504 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 80113526 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 80113572 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 80113716 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 80113739 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 80113882 A C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 3 80113922 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80114058 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 80114174 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80114421 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80114454 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 80114472 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 80114614 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 80114617 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80114710 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80114929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80115568 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80116027 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 80116106 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80116594 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 80116982 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80117107 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80117727 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80117734 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 80118257 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80118596 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80118912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80118978 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80120810 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80120892 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 80121998 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 80122750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80122928 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80123215 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80123870 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80123972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80124056 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 80124061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80124163 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80124416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80124428 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80124722 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80124735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80124797 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80124882 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80126113 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 80126142 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 80126569 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 80126573 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80126802 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80127690 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 80127997 T G N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 80128042 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 80128570 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80128599 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80128726 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 80128729 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80128747 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 80128756 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 80128776 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80128787 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 80128837 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80128861 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80128889 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80128890 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80128911 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80128927 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80128934 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80128972 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80128986 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80128993 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80129014 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80129034 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 80129165 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80129169 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80129235 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80129236 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80129302 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80129342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80129432 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80129437 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80129443 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80129503 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80129603 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80129773 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 80129999 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 80130052 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 80130151 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 80130375 G C N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 3 80130605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80130761 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 80130822 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80130979 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 80131012 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 80131081 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80131148 A C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 80131172 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 80131211 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 80131247 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 80131258 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 80131587 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 80131651 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80131776 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 80131983 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80132036 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 80132239 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 80132414 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80132502 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 80132622 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 80132640 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 80132641 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80132661 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80132786 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 80132831 C T Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 80132920 A T N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 80133121 A T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 80133170 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 80133214 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 80133273 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80133308 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80133499 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80133520 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80133534 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80133548 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80133552 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80134090 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 80134142 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 80134153 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 80134174 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 80134278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80134292 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80134434 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80134450 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80134560 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80134562 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80134582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80134623 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 80134662 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80135116 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 80135204 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80135444 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 80135497 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 80135518 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 80135566 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 80135601 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 80135608 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 80135791 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80135808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80135825 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80135921 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 80135932 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 80135995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80136004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80136407 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80136709 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 80136874 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 80137500 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80137606 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 80137629 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80137638 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80137692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80138235 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80138312 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 80138444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80138478 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 80138809 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80139023 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80139287 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 80139320 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 80139353 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 80139374 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80139384 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80139511 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 80139898 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 80139913 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 80141014 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80141185 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80141644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80141775 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80141991 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80142189 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 80142553 T A Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 80142942 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 80144110 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 80144151 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 80144646 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80145133 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 80145273 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80145376 C G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 80145397 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80145583 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 80145726 A C Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 80145755 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 80145804 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 80145859 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.25 0.6875 0.0625 19 13 4 11 1 3 80146028 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80146062 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 80146205 T A Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 80146300 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 80146359 A G Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 80146587 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 80146696 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 80146698 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 80146768 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80146828 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80146855 A T Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 80146924 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 80146929 A G Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 80147034 G A Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 80147096 C G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 80147228 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 80147249 G C Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 80147305 T G Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 80147503 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 80147525 A C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80147558 C G Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 80147605 T C Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 80147631 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 80147665 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80147729 T A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 80147789 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 80147816 A T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 80147819 A C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80147856 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80147958 T G Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 80148009 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80148222 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80148299 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80148334 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80148370 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 80148393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80148463 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 80148564 T A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 80148810 A C N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 3 80148832 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80149174 T A N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 80149330 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80149339 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80149383 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80149488 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80149661 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80149662 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 80149792 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 80149808 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 80149865 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 80149966 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 80151113 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80151120 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80151232 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80151421 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 80151445 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80151709 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 80151716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80151788 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80152438 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80152587 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80152613 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80152790 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80152806 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80152873 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80152901 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80152917 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80152993 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80153073 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80153092 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80159751 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 80159755 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80159795 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80159824 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80159848 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80159946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80160339 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 80160401 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 80160487 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 80160638 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 3 80160800 T A N N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 8 8 2 4 2 3 80160853 C T N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 80161063 T A N N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.333333333333333 0.25 0.416666666666667 11 13 4 3 5 3 80161072 A G N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 3 80161153 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 80161269 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 80161274 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 80161352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80161406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80161435 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 80161604 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 80161625 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 80161686 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 80161693 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 80161735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80161763 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 80161800 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80161966 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 3 80162023 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 3 80162097 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 80162112 G T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 3 80162123 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 80162175 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 80162264 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 80162359 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 80162386 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 80162415 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 80162545 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 80162558 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 80162564 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 80162614 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 80162650 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 80162696 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 80162794 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 80162901 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80162936 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 80162957 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 80162992 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 80163040 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 80163064 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80163098 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 80163206 C T Y Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 80163207 A G Y Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 10 6 4 2 2 3 80163275 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 80163336 A G N Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 3 80163387 T A Y N 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 7 9 2 3 3 3 80163464 T C N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.384615384615385 0.230769230769231 0.384615384615385 13 13 5 3 5 3 80163482 C A N N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.384615384615385 0.307692307692308 0.307692307692308 14 12 5 4 4 3 80163495 T C N Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 11 9 4 3 3 3 80163578 A C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 80163649 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 80164144 T G Y N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 3 80164749 A G Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 80164856 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80164931 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 3 80164954 C G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 80165113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80165286 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 80165290 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 80165307 T G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 80165370 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 80165471 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 80165482 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 80165648 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80165814 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 80165912 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80165943 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 80165960 C A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 80165967 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 80165979 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 80166054 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 80166135 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 80166153 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 80166233 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 80166298 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80166478 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80166511 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80166539 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 80166548 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 80166559 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 80166577 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 80166737 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 80166758 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 80166844 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 80166858 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 80166879 T G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 80166924 A C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 80166979 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 80167002 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 80167034 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 80167066 T G N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 3 80167182 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 80167184 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 80167387 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 80167530 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 80167554 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 80167733 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 80167815 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 80167917 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 80167925 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 80167959 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 80168019 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 80168096 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 80168137 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 80168157 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 80168299 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 80168311 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 80168462 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 80168619 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 80168688 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 80168842 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 80169050 G A N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 3 80169237 C A N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 80169691 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 80169719 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 80170040 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 80170494 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80170501 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 80170519 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 80170567 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 80170833 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 80170873 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 80171158 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 80171418 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80171516 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 80171556 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 80171704 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 80171725 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80172628 C T N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 3 80172760 A T N N 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 3 80172767 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 3 80172773 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 80173022 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80173085 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 80173306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80173330 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 80173572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80173652 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 80173733 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 80173826 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80174144 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 80174320 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80174885 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 80174965 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 80174986 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 80174999 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 80175431 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 80175727 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 80176362 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 80176503 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 80176591 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 80176730 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 80176812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80176850 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 80176956 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 80177247 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 80177497 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80177668 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 80177675 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80178293 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 80178550 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 80178731 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80178756 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80178909 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80179360 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80179650 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 80179916 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 80180066 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 80180367 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 80180833 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 80180891 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 80180986 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 80181410 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80181550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80182669 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80182871 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 80182983 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80183130 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 80183187 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 80184198 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 80184397 G C Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 80184649 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80184886 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 80185011 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 80185059 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 80185069 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80185254 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 80185501 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 80185592 A T Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 80185745 T C Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 80186106 C T Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 80186107 A G Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 80186401 A C Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 80186403 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 80186504 C G N N 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 3 80186745 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 80186875 T C Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 80187001 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 80187166 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80187343 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80187398 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 80188361 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80188465 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80188863 T C N Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 3 80189617 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 80189638 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 80189725 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 80189792 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 80190006 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 80190117 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80190307 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80190939 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 80191210 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 80191572 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 80191879 T A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 80191904 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80191918 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 80192219 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 80192320 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 80192337 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 80192366 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 80192376 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 80192535 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 80192672 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 80192678 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 80192690 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 80192703 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 80192712 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 80192714 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 80192737 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 80192749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80192915 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 80192962 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 80193192 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 80193295 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 80193308 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 80193424 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 80193509 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 80193554 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 80193583 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 80193586 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80193621 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 80193662 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 80193843 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 80194071 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 80194121 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 80194193 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 80194298 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 80194398 A G N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.363636363636364 0.454545454545455 0.181818181818182 13 9 4 5 2 3 80194497 G A N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 3 80194603 T G N N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 9 7 3 3 2 3 80194647 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 7 11 2 3 4 3 80194664 T A N N 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 5 9 2 1 4 3 80194791 A G N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 3 80194895 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 80194902 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 80194906 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 80194924 T A N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 80194940 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 80194959 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80194966 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 80194993 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 80195023 C G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 80195046 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 80195098 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80195185 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 80195209 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 80195361 A C N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 80195374 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 80195532 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80195579 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 80195609 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 80195647 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 80195732 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 80195831 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 80195874 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 80195918 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 80195919 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 80195943 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 80196123 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 80196226 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 80196284 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 80196313 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 80196337 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 80196367 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 80196376 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 80196425 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 80196471 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 80196605 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 80196777 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 80196844 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 80196848 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 80196922 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 80196929 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 80196943 T G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 80196954 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80196968 G C N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 80196969 A C N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 80196979 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 80197021 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 80197044 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80197051 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 80197161 T A Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 80197194 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 80197223 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 80197235 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 80197489 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 80197552 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 80197557 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 80197750 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 80197772 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 80197913 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 80197927 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 80197957 C A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 80197968 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 80198094 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 80198116 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 80198124 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 80198277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80198438 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 80198485 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 80198486 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 80198501 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 80198733 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 80198813 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 80199170 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 80199172 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 80199256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80199334 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 80199583 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 80199595 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 80199638 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 80199732 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 80199797 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 80199809 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 80199883 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 80200095 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 80200152 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80200257 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 80200281 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80200483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80200515 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80200740 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80200767 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80200785 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80200847 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80200859 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80200869 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80200909 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80200913 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80200980 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80201006 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80201133 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80201207 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 80201357 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80201381 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80201384 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80201599 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 80201614 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 80201670 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 80201795 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80202450 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 80202530 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80202834 T G N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 80203146 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80203667 C T Y Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.333333333333333 0.583333333333333 0.0833333333333333 15 9 4 7 1 3 80203840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80203853 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 80204110 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 80204469 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 80204788 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 80205209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80205316 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 80205873 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 80206135 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 80206811 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.1875 0.75 0.0625 18 14 3 12 1 3 80207656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80208130 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80208748 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 80208810 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80208958 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 80209289 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 80209364 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 80209836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80209880 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80209940 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80210044 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80210148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80210159 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80211043 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 80211119 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80211295 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 80211301 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 80211607 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 80211731 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80211868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80212079 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 80212168 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80212362 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80212434 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 80213008 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 80213055 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80213076 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80213105 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80213149 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 80213192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80213597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80213707 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 80213777 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 80213827 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80214387 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 80214505 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 80214513 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80214650 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80214696 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 80214712 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80214726 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 80214738 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 80214894 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 80215206 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 80215221 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 80215331 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 80215452 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 80215749 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80215756 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 80215781 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 80215802 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 80215838 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 80215887 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 80215888 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 80215907 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80215961 G C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 80215993 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 80216132 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 80216144 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80216154 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 80216172 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80216225 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80216236 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 80216269 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 80216387 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80216541 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80216710 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80216875 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80216903 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80216922 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80217034 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80217110 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80217114 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 80217375 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 80217420 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80217445 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80217446 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80217675 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80217823 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80217986 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80218019 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80218057 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80218071 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80218102 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80218115 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80218132 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 80218169 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80218238 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80218241 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80218296 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80218347 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 80218408 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 80218471 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 80218504 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80218532 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 80218593 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80218600 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 80218615 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 80218902 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 80219103 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80219110 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 80219146 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 80219157 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 80219189 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80219203 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 80219239 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 80219269 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 80219307 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80219343 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 80219539 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 80219556 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 80219886 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 80219894 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 80219989 T A N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 80220170 C A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 80220294 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80220300 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 80220558 C A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 80220576 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 80220624 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80220856 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80220899 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80221219 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80221258 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 80221283 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 80221325 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80221326 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80221353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80221454 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 80221570 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 80221892 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 80222077 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80222105 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80222146 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 80222266 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 80222341 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80222607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80222694 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80222721 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80222873 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80222882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80222957 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80223098 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80223129 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 80223235 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 80223285 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 80223406 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 80223598 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 80223625 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 80223874 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 80223880 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 80224254 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 80224277 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80224316 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 80224343 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 80224400 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 80224553 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 80224660 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80224781 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 80224948 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 80225092 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80225132 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80225179 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80225860 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 80226498 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80226598 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80226644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80226935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80227009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80227139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80227318 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80227910 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80228543 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 80228614 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 80228779 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 80228825 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 80229168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80230276 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80230338 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80231111 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 80231970 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80232360 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80232917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80233405 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 80233964 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80235152 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80235543 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80235775 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80236535 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80236597 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 80236865 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80237009 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80237065 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80237225 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80237231 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 80237450 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80238432 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 80238485 G A Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 80238633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80238784 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 80239170 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 80239610 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80239625 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80239970 T A N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 3 80240126 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 80241169 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80241295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80241402 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 80241727 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80241751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80242123 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 80248789 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 80249073 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80249201 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 80249367 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80249394 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80249604 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 80250810 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 80250815 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80250920 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 80251083 T G Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 80251740 T C Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 80251806 T G Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 80252244 A G Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 80252555 G T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 80252740 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80252863 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80252929 T C Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 80253111 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 3 80253234 T C Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 80253460 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 80254165 C G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 80254551 A C Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 80254587 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 80254592 G T Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 80254718 A G Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 80254755 A G Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 80256372 T C Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 80256527 G C Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 80256797 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80256856 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80257210 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 80257344 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 80257358 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 80257525 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 80257773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80257850 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 80258102 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 80258307 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 80258423 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80258429 T A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 80258507 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 80260371 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 80260647 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 80260992 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 80261008 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 80261506 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80261648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80261655 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 80261832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80261928 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80262041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80262186 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80262306 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80262345 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80262357 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80262543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80262726 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80263094 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80263401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80264100 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80264312 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 80264463 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 80264533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80264624 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 80265675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80265969 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 80266044 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80266058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80266066 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80266162 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80266298 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80266628 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 80266757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80266778 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80266877 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80266948 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80266983 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80267041 C A Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 80267063 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 80267185 T G N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 80267335 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80267509 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 80267771 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80267870 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 80267893 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 80267930 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 80267973 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 80268041 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80268158 G C Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 80268418 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 80268452 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 80268497 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 80268574 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 80268577 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 80268651 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 80268707 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 80268782 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 80268821 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 3 80268862 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80268984 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 3 80269097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80269182 A G N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 16 12 6 4 4 3 80269255 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 80276091 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 80276116 C T N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 3 80276156 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 80276229 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 80276258 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80276432 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 80276464 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 80276542 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 80276546 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 80276570 G T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 80276580 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 80276621 T C Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 80276626 T G Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 80276789 G T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 80276832 A C Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 80276839 T A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 80276850 G T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 80276878 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 80276973 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 80277114 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 80277122 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 80277135 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 80277275 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 80277498 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 80277576 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 80277595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80277608 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 80277799 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 80277964 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 80278008 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 80278033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80278091 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 80278177 C G N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 3 80278248 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 80278343 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 80278431 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 80278468 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80278473 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80278500 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 80278507 A C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 80278513 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 80278552 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 80278569 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 80278601 C G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 80278625 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 80278651 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 80278740 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 80278764 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 80278768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80278869 C G Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 80278891 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 80278955 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 80279094 A C N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.5 0.1875 0.3125 19 13 8 3 5 3 80279197 A G N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.533333333333333 0.2 0.266666666666667 19 11 8 3 4 3 80279211 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 80279352 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 80279449 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 80279565 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 80279572 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 80279666 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 80279679 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 80279699 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 80281617 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 80281653 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 80281654 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 80281797 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 80281994 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 80282013 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 80282034 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 80282056 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80282163 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 80282416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80282690 T G N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.466666666666667 0.2 0.333333333333333 17 13 7 3 5 3 80282890 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80283037 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 80283187 A C N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.571428571428571 0.214285714285714 0.214285714285714 19 9 8 3 3 3 80283557 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80283609 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 80283610 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 80283643 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80283740 A T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 80283756 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80283879 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 80284151 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 80284162 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 80284208 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 80284317 A C N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 3 80284321 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 3 80284328 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 3 80284529 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80284644 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 80284701 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 80284713 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 80284743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80284931 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80284955 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 80285040 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 80285138 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 80285179 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 80285181 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 80285303 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 80285325 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 80285443 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 80285485 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 80285562 G T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 80285615 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 80285708 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 3 80285753 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 80285877 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80286010 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 80286205 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80286538 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80286907 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 80287101 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 80287115 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 80287172 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 80287192 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 80287224 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 80287268 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 80287332 T A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 80287379 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 80287418 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 80287443 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 80287527 T C N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 3 80287528 A G N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 3 80287611 G T N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 80287648 G T Y N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 3 80287680 T C N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 3 80287906 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 80288073 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 80288133 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 80288167 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 80288208 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 80288359 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 80288384 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 80288542 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 80288629 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 80288635 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 80289007 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 80289017 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 80289049 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 80289062 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 80289087 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 80289175 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 80289250 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 3 80289256 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 3 80289270 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 80289519 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 80289602 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 80289723 C G N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 80289769 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 80289898 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 80289915 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 80289967 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 80290003 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 80290010 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 80290110 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 80290133 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 80290173 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 80290242 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 80290255 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 80290315 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 80290406 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 80290422 C A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 80290472 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 3 80290521 C A Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 80290532 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 80290547 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 80290556 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 80290652 T G Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 80290700 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80290755 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80290777 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 80290930 G C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 80290983 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 80291066 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 80291094 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 80291103 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 80291124 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 80291149 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 80291170 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 80291175 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 80291240 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 80291246 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 80291324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80291432 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 80291450 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 80291499 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 80291502 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 80291642 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 80291690 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 80291694 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 80291722 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 80291753 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80291811 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 80291858 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 80291946 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 80292084 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 80292093 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80292131 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 80292138 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 80292168 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 80292277 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 80292285 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 80292355 C A Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 80292357 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 80292423 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 80292535 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 80292549 G C Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 80292637 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 80292744 A C Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 80292839 A G N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 80292845 C T Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 80292927 A G N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 12 8 4 4 2 3 80293025 A G Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 80293038 G A Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 80293039 A G Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 80293243 G T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 80293286 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 80293308 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 80293326 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 80293338 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 80293347 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80293373 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 80293471 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 80293472 T C N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 3 80293488 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 80293497 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 80293595 T C Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 80293602 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 80293606 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 80293704 G C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 80293725 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 80293734 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 80293801 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 80293845 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80293914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80293918 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80294198 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 80294303 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 80294346 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 80294564 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 80295064 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80295065 A T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 80295296 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80295327 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80295334 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80295452 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 80295873 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80295887 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80296007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80296030 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80296053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80296065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80296113 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 80296180 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80296197 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80296242 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80296503 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 80296547 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 80296657 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 80296992 C G N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 80297159 A G Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 80297161 G C N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 80297969 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 80298158 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 80298200 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 80298314 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 80298345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80298500 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 80298778 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 80298808 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 80298849 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80299224 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80299297 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 80299359 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 80299490 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 80299524 T G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 80299589 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 80299704 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80299852 C A N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 80299972 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80300156 A T Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 80300256 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 80300314 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80300796 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 80300907 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80301172 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80301185 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 80301316 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 80301325 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80301361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80301681 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 80301756 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 80302551 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80303342 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80303542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80303891 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80304557 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 80304742 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 80304825 T A N N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 3 80304873 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 80304981 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80305711 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 80305810 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80305848 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 80306112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80306204 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 80306337 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 80306489 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80306609 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80306648 T A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 80306822 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 80306877 C T N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 80307143 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 80307321 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 80307414 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80307595 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80307649 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 80307685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80307690 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80307702 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 80307703 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80307733 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 80307870 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80307872 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 80307960 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 80308407 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 80308568 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 80308695 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 80308839 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80309280 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80309490 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 80309570 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80309704 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80309722 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80310007 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 80310046 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 80310078 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 80310092 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80310196 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 80310197 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 80310254 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 80310306 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80310409 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80310513 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80310526 G C Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 80310530 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 80310610 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80310677 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80310808 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 80310910 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 80311253 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 80311260 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 80311307 C T N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 80311342 A C Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 80311507 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 80311523 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 80311844 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80312309 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 80312335 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 80312372 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80312444 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 80312520 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 80312587 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 80312594 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 80312605 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 80312613 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 80312649 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 80312660 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 80312750 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 80312760 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 80312780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80312830 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 80312870 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 80313139 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 80313245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80313280 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 80313297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80313531 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 80313780 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 80314184 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80314345 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80314768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80314864 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80314889 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 80314936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80314974 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 80315159 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 80315342 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80315454 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 80315583 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 80316027 A C N N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 3 80317899 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 80317938 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 80318223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80318284 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80318432 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80318694 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 80318719 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80318885 T C N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 80319046 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80319134 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 80319232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80319273 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80319316 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 80319540 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80319565 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80319580 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80320890 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80320917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80323518 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80323784 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 80323800 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80323891 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80324121 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80324961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80325258 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80327593 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80330306 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80331055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80331292 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 80331369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80331429 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80331812 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80333053 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80334897 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80335085 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80335112 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80336521 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 80336813 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80337392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80337707 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80338923 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80340815 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80344978 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80345585 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80347344 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80347404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80347595 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80349047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80350003 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80351837 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80351976 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80353895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80354028 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80354072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80356057 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80356601 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80358314 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 80359181 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80359262 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80359955 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 80359966 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80360339 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 80360352 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 80360927 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80363202 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80363752 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80364286 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80364880 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80365208 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 80366560 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 80367435 T C N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 3 80368867 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 80369838 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80370508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80370512 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80371533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80371977 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80372029 G C Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 80373500 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80374896 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 80375318 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80375333 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 80375875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80376111 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 80377485 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80378955 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80379978 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 80380027 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80381458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80382134 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80382731 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80382970 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80383393 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 80385968 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 80388698 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80388801 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80389410 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 80391721 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 80391758 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 80391985 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80392119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80394891 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80394894 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80394987 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80394999 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 80395277 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 80395546 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 80395754 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 80395774 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 80395924 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 80396075 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80396119 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80396218 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80396321 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80396322 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 80396671 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 80396964 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80396987 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80397149 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 80397481 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 80398108 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80398179 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80398346 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 80398357 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 80398501 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 80399037 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80400048 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80400208 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80401760 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80402321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80402616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80403124 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80405384 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80405498 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 80406767 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 80407102 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80407416 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 80408172 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80408267 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 80408729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80408747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80408754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80409162 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 80409215 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 80409296 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 80409521 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 80409874 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80410054 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 80410370 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 80410430 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 80410531 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 80410663 C A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 80410830 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 80410920 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 80411148 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 80411184 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 80411290 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 80411406 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 80411417 A C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 80411474 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 80411560 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 80411681 C A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 80412018 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 80412165 T A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 80412210 A C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 80412229 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 80412274 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 80412681 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 80412722 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 80412824 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80412874 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 80412903 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80412934 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 80412935 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 80412946 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 80412947 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 80413021 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 80413116 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 80413189 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 80413249 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 80413378 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 80413406 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 80413483 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 80413496 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 80413524 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 80413577 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 80413813 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 80413843 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 80413852 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 80413984 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 80414000 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 80414176 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 80414179 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 80414216 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 80414267 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 80414448 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 80414483 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 80414565 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 80414586 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 80414613 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80414692 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 80414758 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 80414904 A C Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 80414926 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 80414947 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80415605 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 80415954 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 80415983 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 80416036 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 80416063 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 80416069 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 80416101 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 80416216 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 80416237 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 80416239 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 80416288 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80416407 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 80416409 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 80416560 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 80416686 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 80416916 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 80416953 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80417130 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 80417182 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 80417245 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 80417508 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 80417520 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 80417531 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 80417542 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 80417664 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 80417960 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 80418167 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 80418346 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 80418537 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 80418630 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 80418681 C G N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 80418682 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 80418826 G T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 80419080 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 80419084 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 80419168 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 80419337 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80419753 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80419821 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 80420129 A G Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 80420150 T G Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 80420157 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 80420225 G T Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 80420288 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 80420307 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 80420322 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80420391 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80420419 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80420529 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80420578 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80420714 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80421233 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80421457 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 80421463 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 80421628 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 80421856 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 80422926 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80423410 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 80423459 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80423952 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80424041 T G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 80424423 G C N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 80424782 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80425226 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80432572 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80432583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80432620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80435227 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80435290 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80436198 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80436269 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80437279 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 80437492 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80437958 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80438532 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80439395 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80439691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80439894 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 80440822 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 80441538 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 80441562 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80444407 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80451205 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 80453351 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80454331 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80455173 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 80455527 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 80456856 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80456906 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80458209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80458301 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 80458958 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80459438 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80459661 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 80459751 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 80459947 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 80459958 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 80459963 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 80460769 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 80461092 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 80461672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80461677 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 80461713 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80461714 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 80462074 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 80462827 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80462972 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80463984 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80464658 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 80465553 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80465735 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80469347 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80469374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80469476 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80470062 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 80470485 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80471663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80472216 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80472579 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 80472962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80473717 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80473822 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 80473842 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 80473849 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 80475660 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 80475828 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 80475918 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80476511 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80476947 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80476987 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80477852 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80478391 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80478602 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80481384 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80482752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80482913 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 80485305 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80485365 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80486932 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 80487614 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 80487747 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 80488158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80488178 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 80488610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80489149 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80490916 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 80491097 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 80491129 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80491160 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 80491296 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 80496011 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 80496308 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 80496941 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80497207 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80497310 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 80497506 C A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 80497620 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 80497642 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 80498604 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 80498724 C T N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 3 80498784 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 80498857 T A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 80498886 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 80498919 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 80498932 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 80498978 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 80499216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80499233 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 80499276 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 80499308 T A N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 80499313 A C N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 80499333 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 80499381 A G N Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 7 7 2 3 2 3 80499529 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 80499614 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 80499685 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 80499779 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 80499844 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 80499933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80499982 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 80500013 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 80500064 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 80500065 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 80500204 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 80500221 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 80500369 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 80500489 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 80500561 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 80500574 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 80500636 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 80501048 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 80501077 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 80501129 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 80501278 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 80501380 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 80501421 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 80501441 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 80501460 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80501557 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 80502264 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 80502299 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 80502654 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 80502680 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80502799 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 80502873 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 80503062 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 80503076 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 80503113 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 80503426 C A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 80503520 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 80503525 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 80503550 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 80503585 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 80504192 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 80504194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80504232 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 80504345 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 80504351 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 80504711 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80504823 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 80504934 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 80506054 C A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 80506702 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 80506832 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80506878 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 80506921 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 80507278 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 80507303 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 80507369 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 80507739 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80508989 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 80509082 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 3 80509418 T C N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 80511906 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80512031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80512197 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80512840 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80514161 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80514263 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80514571 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 80514710 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 80514959 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 80515839 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80516058 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80516118 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 80516211 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 80516285 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 80516541 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 80516716 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 80517112 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80517264 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 80517387 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 80517531 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 80517684 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80517868 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 80518085 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 80518665 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 80518812 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 80518949 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 80519236 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80519310 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 80519411 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 80519462 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 80520144 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80523024 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80526780 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80527491 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80527541 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80528917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80529455 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80530638 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80531505 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80531716 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80532197 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80532920 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80533178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80533467 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80534197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80534306 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80534372 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80537090 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80537673 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80538470 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80538929 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 80539186 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80539583 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 80540928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80541675 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80541944 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80544471 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 80553034 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 80553041 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 80553120 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80555538 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80555795 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80556939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80558775 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80559073 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80559725 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80559945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80560011 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80560048 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 80561268 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80561273 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 80562322 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 80562350 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 80562561 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80562898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80563083 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 80563111 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 80563926 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 80564151 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80564674 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80565491 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 80566580 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80566594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80567738 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80568093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80568376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80568779 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80569855 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 80570857 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80571733 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80573311 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80573668 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 80573961 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80573997 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 80574241 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80574493 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 80578448 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80578757 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80579846 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80582656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80583568 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80584025 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80584240 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80585699 C G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 80585709 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80585923 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 80588017 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80588758 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80589576 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80590570 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80590735 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80591980 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 80592238 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80592654 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80592893 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80594376 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80594401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80594797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80594926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80595526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80595853 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80595873 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80595969 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 80597349 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80597945 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80598623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80599418 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80600154 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 80601026 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 80602082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80604053 G T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 80605939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80605993 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80606945 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 80607223 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80607306 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 80607307 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 80607321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80607670 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80608591 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80608715 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80608977 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80609376 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80609950 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 80610381 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80610587 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80610590 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80610742 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80610770 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80610862 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 80610955 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 80611015 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80611035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80611104 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80611249 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80611312 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80611700 G C Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 80612072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80612695 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80612749 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80613995 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80614871 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80615262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80615929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80616070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80616132 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80616220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80616386 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80616475 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80616918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80616941 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 80617061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80617069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80617167 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80617285 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80617305 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80617377 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80617434 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80617455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80617474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80617611 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 80617684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80617800 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80618291 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80618524 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80618652 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 80619134 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80619146 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80619206 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80619294 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80619497 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 80619769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80619789 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80619838 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80620268 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80620581 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80620613 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80620739 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80620804 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80620811 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 80620994 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80621012 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 80621043 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 80621090 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 80621105 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80621107 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 80621134 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80621219 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80621372 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 80621744 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80621793 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80621858 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80621895 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 80622097 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 80622486 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 80623224 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80623813 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 80623856 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 80623883 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80624097 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80628263 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 80628265 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 80631813 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80631828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80632585 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 80632681 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 80633691 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80633720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80635009 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 80635118 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80635583 T C N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 80635588 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 80636001 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 80636209 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 80636551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80636598 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80636664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80636699 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80636973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80637090 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80637259 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80637321 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80637653 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80638427 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 80638903 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 80639151 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80639157 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 80639264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80639299 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80640060 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 80640296 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80640305 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80640307 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80640316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80640359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80640485 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 80640513 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 80640702 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 80640982 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80641062 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 80641111 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80641123 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 80641185 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 80641209 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 80641565 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 80641638 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80641695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80642076 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 80642174 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 80642566 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80642954 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 80643209 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 80643374 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 80643381 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 80643489 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 80643565 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80643824 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80644044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80644459 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80644919 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 80645147 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80645322 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80645408 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80645611 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 80645646 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80645666 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 80646059 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80646519 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80646982 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80647211 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 80647280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80647411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80647747 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80648560 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 80648703 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 80650038 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80650152 G C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 80650293 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 80650343 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 80650379 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 80650449 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 80650513 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 80650516 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 80650724 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 80650790 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80650791 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 80650807 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 80651004 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 80651119 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 80651142 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 80651164 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 80651180 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 80651193 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 80651209 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 80651223 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 80651267 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 80651280 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 80651292 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 80651299 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 80651323 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80651383 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 80651467 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80651551 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80651859 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80651893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80652012 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 80652029 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 80652038 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 80652118 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 80652237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80652735 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80653042 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80653180 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 80653255 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80653261 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80653305 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 80653906 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 3 80654731 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 80655135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80655222 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80655293 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 80655370 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 80655379 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 80655566 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80655598 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80655614 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80655619 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80655655 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 80655684 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 80655736 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80655863 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80655948 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80655973 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80656128 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 80656517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80656597 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 80656640 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 80656725 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 80656743 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 80656765 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 80656793 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80656939 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80656953 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80657174 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80657320 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 80657433 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80657447 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80657459 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80657494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80657667 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 80657674 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 80657836 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 80658015 C A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 80658131 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 80658156 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80658161 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80658203 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80658337 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80658338 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80658353 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80658388 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 80659211 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80659249 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80659874 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80660395 G A Y Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 80660456 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 80660543 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 80660602 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 80660702 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 80661388 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 80661394 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 80661516 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80661557 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 80661596 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80661734 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80661806 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 80662032 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 80662075 T C Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 80662136 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80662182 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 80662188 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 80662271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80662276 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 80662285 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 80662313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80662349 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80662526 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80662529 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 80662537 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 80662621 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80662800 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 80662868 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80662898 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 80662902 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 80663023 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80663059 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80663173 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80663175 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80663219 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80663236 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80663270 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80663471 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80663715 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80663838 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80663971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80664014 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80664033 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80664353 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80664473 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 80664589 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80664669 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 80664713 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80664957 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 80665099 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 80665250 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 80665251 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80665381 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 80665530 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80665543 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80665680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80665888 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 80665933 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80666062 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80666131 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 80666211 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80667589 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80667714 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80672114 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80674422 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80674835 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80674869 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 80676746 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80676831 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80677031 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80677493 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80677561 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80677723 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 80677951 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80678207 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80679562 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80682481 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80683027 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 80683439 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80684720 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80685271 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80686102 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80686784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80686905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80686962 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80687551 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80687743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80688241 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80690601 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80690837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80691910 A T N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 80692228 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80692742 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80693129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80693867 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80696320 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 80696594 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 80698382 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 80699214 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 80700268 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 80700368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80700813 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80701732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80702125 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80702838 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80703117 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80703492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80703591 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 80704334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80705254 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 80705655 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 80706277 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80706551 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 80706646 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80706952 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 80706965 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 80707348 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80707373 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 80707934 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80708100 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80708129 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80708404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80708507 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80708577 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80708593 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80708760 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80709042 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80709130 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80709591 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 80709710 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80710225 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80710321 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80710614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80710674 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80711115 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80711160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80711259 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80711465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80711470 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80711556 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80711595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80711648 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80711664 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80711887 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80711909 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80711923 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80711933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80712207 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80713227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80713394 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80713529 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 80713562 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80713755 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 80713806 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 80713815 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 80713998 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 80714023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80714046 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80714079 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80714216 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 80714323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80714493 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80714510 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80714603 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80714771 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80714836 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80714849 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80714864 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80714878 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80714892 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80714909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80714958 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80714993 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 80714994 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 80715014 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 80715028 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 80715084 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 80715105 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 80715138 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 80715222 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 80715266 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 80715318 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 80715330 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 80715365 G C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 80715373 C A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 80715448 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 80715463 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 80715516 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 80715532 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 80715601 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80715635 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 80715649 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 80715673 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 80715749 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80716101 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 80716159 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80716365 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80716757 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80717681 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 80717797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80718049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80718092 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80718153 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80718177 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80718428 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80718557 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80718771 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80719676 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80720767 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80720817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80720891 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80720925 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80720972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80723088 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80723991 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80725006 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 80725032 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80725089 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 80725120 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 80725212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80725276 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80725340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80725557 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80726113 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80726346 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 80726439 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80726805 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80726855 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80727025 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80727311 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80727552 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80727719 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80728056 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80728212 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80728306 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80728476 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80728519 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80728615 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80728669 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80728793 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80728944 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80728977 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 80729015 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80729160 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80729230 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80729281 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80729359 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80729398 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80729477 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80729539 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80729559 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80729570 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80729882 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80729920 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80729941 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80729957 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80730153 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80730160 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80730177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80730224 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80730300 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80730365 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80730473 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80730702 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80730890 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80732302 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80732458 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 80732675 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80732785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80732909 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80733059 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80733142 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80733340 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80733439 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80733462 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80733562 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80733709 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80733854 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 80733895 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80733907 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80733963 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 80733971 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 80734110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80734259 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 80734321 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 80734324 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 80734389 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80734918 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 80735186 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80736808 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 80736898 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 80738118 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80738216 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80738595 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 80738753 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80738814 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80738847 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80738923 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 80739026 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 80739034 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 80739131 C T N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.0769230769230769 13 13 1 11 1 3 80739197 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80739303 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 80739333 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80739516 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80739534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80740432 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80741323 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 80741838 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 80742515 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80742516 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80742611 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80742767 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80743396 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80744687 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80744990 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80745026 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80745468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80747734 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80747954 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 80752307 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 80752520 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80752672 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 80754203 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80754286 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 80754495 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80754576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80754678 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80754746 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 80755041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80755147 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 80755148 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 80755194 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80755435 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80755440 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80755828 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80755933 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80756011 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80756145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80756542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80756579 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 80756704 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 80756797 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 80756818 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 80756821 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80757120 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 80757361 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 80757491 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80757510 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 80757542 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 80757561 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 80757634 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80757647 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80757753 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80757821 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80757891 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 80758311 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 80758351 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 80758357 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80758363 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 80758745 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80758785 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80758804 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 80758848 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80758896 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 80758908 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 80758972 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80759018 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80759131 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80759283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80759388 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80759743 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80759777 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 80759866 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80759971 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80759980 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80760020 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80760179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80760218 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80760330 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 80760545 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80760860 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 80760916 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 80760936 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 80760994 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 80761057 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 80761138 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 80761446 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80761464 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80761561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80761609 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 80761764 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80761788 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 80762058 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80762140 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 80762168 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 80762241 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80762265 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80762329 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80762973 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80762999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80763028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80763040 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80763096 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80763376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80763497 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 80763602 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80764010 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80764303 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 80764591 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80764695 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80764818 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80765019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80765101 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80765256 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 80765288 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 80765307 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80765371 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 80765454 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 80765481 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 80765487 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 80765501 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 80765715 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 80766673 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 80767180 T G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 80767306 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 80767336 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 80767397 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80767460 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80767602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80767626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80767641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80767771 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80767790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80767794 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80767900 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80768088 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 80768610 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80769204 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 80769425 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80769548 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 80769652 G T Y N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 3 80770407 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80770433 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 80770604 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 80770786 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 80770795 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 80770828 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 80770855 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 80770856 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80770964 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 80771091 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 80771143 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 80771308 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 80771316 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 80771459 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 80771540 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 80771547 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 80771555 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 80771595 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 80771879 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 80772108 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 80772225 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 80772318 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 80772353 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80772400 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80772489 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80772577 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 80772707 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 80772723 G T N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 80772943 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 80772944 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 80773026 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 80773138 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80773543 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80773556 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80773793 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80773820 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 80773825 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 80774123 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 80774210 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80774453 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 80774478 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 80774662 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 80774715 T A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 80775053 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 80775163 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80775556 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 80775680 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 80775682 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 80775705 G C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 80775725 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80775811 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 80775822 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80775836 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 80775851 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80775898 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80775903 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80775917 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80776033 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80776047 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80776058 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 80776059 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 80776156 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80776204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80776220 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80776232 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80776247 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80776273 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 80776375 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80776458 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80776536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80776571 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80776692 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80776737 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80776870 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80776904 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80777052 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80777278 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80777286 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80777291 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80777351 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 80777400 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80777468 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80777494 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 80777624 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 80777655 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 80777682 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80777706 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 80777726 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 80777776 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 80777796 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80777853 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80777878 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80778040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80778140 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80778184 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80778221 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80778609 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 80778667 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 80778675 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80778766 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 80778881 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 80778909 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 80778953 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 80778995 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80779087 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80779110 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 80779186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80779602 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 80779753 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80779761 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80779822 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 80779876 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 80780037 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80780061 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 80780176 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80780185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80780270 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 80780305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80780310 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80780328 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 80780434 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 80780449 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 80780705 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80780840 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80781095 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80781196 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80781312 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 80781317 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 80781361 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 80781541 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 80781562 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 80781890 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 80781913 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 80781966 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 80782107 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 80782445 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 80782477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80782876 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 80783005 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 80783054 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 80783120 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 80783163 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 80783164 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 80783198 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 80783488 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 80783813 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 80783826 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 80784326 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 80784507 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 80784558 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 80784562 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 80784614 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 80784647 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 80784991 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 80785021 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 80785037 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 80785125 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 80785198 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 80785325 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80785522 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 80785658 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 80785669 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 80785746 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 80785755 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 80785779 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 80785790 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 80785824 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 80785829 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 80785850 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 80785908 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 80786066 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 80786116 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 80786184 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 80786217 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 80786238 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 80786267 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 80786282 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 80786305 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 80786330 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 80786447 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 80786458 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 80786475 T G Y N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 3 80786542 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 80786552 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 80786716 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 80786748 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 80786778 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 80786834 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 80786859 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 80786887 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 80786898 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 80786970 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 80787007 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 80787012 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 80787021 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 80787115 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 80787166 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 80787180 A T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 80787232 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 80787297 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 80787311 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 80787331 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 80787364 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 80787387 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 80787506 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80787673 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 80787686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80787698 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 80788031 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 80788042 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 80788063 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 80788081 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80788131 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 80788324 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 80788341 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 80788425 T G N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 80788548 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 80788576 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 80788578 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 80788621 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 80788640 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 80788657 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 80788670 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 80788671 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 80788681 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 80788713 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 80788727 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 80788769 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 80788807 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 80789015 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 80789106 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 80789446 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 80789785 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 80789909 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 80790003 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 80790138 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 80790186 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 80792484 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 80792621 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80792781 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 80792833 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80793352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80793604 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 80794069 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80794252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80794364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80794708 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80795165 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80795267 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80795813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80795814 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 80797103 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 80797104 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 80797496 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80797590 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 80797605 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80797703 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80797888 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 80798238 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 80798386 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80798985 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 80799117 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80799348 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80799875 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80799925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80800536 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 80800684 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80800745 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80800764 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80800972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80801004 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80801289 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80801662 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 80801753 G T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 80802519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80802748 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80803285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80805967 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 80807390 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80807521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80807652 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80808144 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 80808166 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80808196 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 80808250 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80808630 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80808754 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80809432 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80810445 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80810739 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 80811028 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80811563 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80812008 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 80812084 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 80813237 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 80813627 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 80813944 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 80814328 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80814336 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80814361 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80814538 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80814558 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80815337 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80815754 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80816418 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80816630 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 80816642 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80816669 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 80816769 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80816781 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80816803 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80817509 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80817639 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80817694 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 80817760 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80817982 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80818189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80818331 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 80818605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80818685 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80818729 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80818736 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80818740 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80818755 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80819025 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80819060 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80819201 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 80819281 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80819347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80819376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80819418 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80819659 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80819791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80819923 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80820382 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 80820478 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80820516 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80820878 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80820997 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80821251 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80826241 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80826251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80827993 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80828228 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80829682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80829933 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80830028 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 80831921 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80832292 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80832403 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80832788 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80832800 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 80833018 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 80833179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80833327 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80834170 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80834226 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 80834370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80834404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80835230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80835429 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80835921 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80835987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80835988 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 80836039 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80836402 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80838396 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80838467 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80839928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80840597 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 80840616 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80841561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80841648 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80842440 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80842977 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80843360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80843522 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80843542 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 80843663 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 80843669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80843706 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80843784 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80843860 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80843947 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80844034 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80844263 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 80844373 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80844640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80844882 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80844890 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80845180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80845942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80846542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80847356 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80848908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80849099 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80849115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80849156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80849246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80850037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80850844 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80851593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80852952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80853949 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80854932 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80855394 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80857645 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 80859201 A T Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 80859531 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 80861096 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80862162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80862520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80864592 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80865176 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 80865344 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80865510 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80865781 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80865972 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80866217 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80866553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80866730 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 80866742 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 80866795 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80866989 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80867192 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80867287 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80867476 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80867526 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 80867665 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80867712 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 80867750 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80867773 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80867787 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80867832 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80867923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80867978 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80868006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80868071 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80868104 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80868516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80868549 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80868713 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80868724 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80868869 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80868983 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80869099 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80869469 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80870110 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80871263 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80871275 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80871653 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80872604 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80873490 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80873514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80873863 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80881850 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80881959 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80882033 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80882509 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80882645 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80882651 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80883179 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80883848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80884340 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 80884538 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80886295 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80887936 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80888012 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 80889996 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 16 20 0 16 2 3 80890128 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 80893365 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80893368 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 80893508 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 80893710 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80894011 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80894302 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80894570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80894591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80894880 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80894893 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80894903 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 80895032 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80895038 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80895088 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80895393 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80896080 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80896120 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80896183 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80896697 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80896770 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80896902 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80897193 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80897194 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 80897217 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80897896 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80898577 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 3 80899850 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80900469 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80901990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80906872 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 80909557 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 80909567 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 80909705 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 80910009 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80910240 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 80910800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80910879 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80911661 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80911749 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 80912044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80912085 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 80912149 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80912384 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80912428 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 80912496 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80912981 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 80913273 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80913311 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 80913525 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 80913593 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 80914058 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80914078 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 80914237 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 80914337 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80914445 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 80914451 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 80914532 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 80914636 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 80914694 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 80914780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80914919 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80914939 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 80915127 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80915349 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 80915381 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 80915572 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80915674 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 80915694 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80915730 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80915886 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 80916155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80916239 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 80916262 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 80916307 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 80916401 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 80916737 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 80916882 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80917099 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 80917105 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 80917157 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 80917235 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 80917261 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 80917669 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 80917707 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 80917820 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 80917929 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 80918489 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80918508 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80918531 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80918575 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80918599 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 80918634 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 80918711 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80918714 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80919193 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80919457 T A N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 3 80919595 T A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 3 80919670 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 80919691 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 80919705 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 80919718 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80919725 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 80919744 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 80919866 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80919870 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80920113 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 80920151 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80920188 T A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 80920335 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80920395 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 80920469 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 80920475 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 80920507 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 80920637 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 80920642 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 80920659 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 80920755 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80920823 C G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.0555555555555556 0.833333333333333 0.111111111111111 17 19 1 15 2 3 80921824 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80922003 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 80922140 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80922141 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80922558 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80922804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80922890 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80922960 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80923135 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80923166 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80923177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80923218 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80923255 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 80923306 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80923464 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 80924015 G A N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 3 80924573 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80924760 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 80924763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80925510 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80926079 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80926338 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 80926408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80926987 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 80927199 G T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 80928160 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80928435 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80928494 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 80928829 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 80929397 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80930241 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 80930455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80931829 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80932789 A G N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 80933153 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80933219 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80934080 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80934650 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80934682 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80936680 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80937055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80937305 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80939326 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 80940703 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 80942378 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80942902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80943280 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80943876 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80946467 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80946653 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80947679 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80951518 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80951801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80955618 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80955794 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80957176 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80957287 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80957751 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80958425 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80958912 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80959143 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80959190 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80959510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80960100 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80960243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80960311 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80960352 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80960652 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80961067 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80961228 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 80961899 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80962199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80962602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80962739 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80962803 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80962860 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80963169 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 80963212 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 80963238 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 80963305 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80963331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80963397 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80963767 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 80964350 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80964425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80965099 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80965211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80966107 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80966370 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80966562 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80966636 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80967068 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80967478 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80968161 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80968521 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80968550 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 80968777 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80969041 A G N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 80969069 A C Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 80969419 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 80969961 T G Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80970158 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80970190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80970492 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80970578 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 80970590 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 80970758 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 80970905 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80971314 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80971611 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80971857 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 80972271 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80972419 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80972547 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80972781 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 80973368 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80973882 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 80974060 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80974359 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80974693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80974741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80974849 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80975162 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80975186 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80975267 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80975365 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80975770 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80975778 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80975992 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80976013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80976274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80976352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80976412 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80976597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80976628 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80976651 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80976658 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80976681 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80976888 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80976932 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80977033 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80977116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80977150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80977164 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80977295 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80977395 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80977411 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80977474 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80977617 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80977650 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 80977686 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80977719 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80978100 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80978672 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80979364 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80979504 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 80979967 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80980458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80980473 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80980700 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80980891 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 80981162 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80981476 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 80981799 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 80982400 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 80982749 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80982913 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 80983109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80983203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80983392 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80984024 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80984254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80984344 A T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 80984373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80985579 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 80985754 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 80985861 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 80985879 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 80985986 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 80986055 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 80986089 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 80986111 A T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 80986123 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 80986170 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 80986172 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 80986216 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 80986218 C G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 80986237 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 80986256 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 80986258 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 80986295 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 80986353 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80986377 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 80986548 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 80986608 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 80986620 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 80986632 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 80986791 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 80986980 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 80987101 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80987137 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80987142 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80987183 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 80987204 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80987241 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 80987345 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 80987432 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 80987436 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 80987448 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80987842 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 80988609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80988743 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80989128 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80989534 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80989594 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80989817 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80989994 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80990309 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80990549 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80990690 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 80990717 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 80990761 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80990801 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80990819 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80991025 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 80991419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80991455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80991475 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80991492 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 80991511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80991583 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80991612 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80991659 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80991712 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80991930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80991976 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 80992058 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80992090 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80992130 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80992146 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80992289 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80992302 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80992303 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 80992449 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80992479 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80992625 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80992751 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80992847 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80992926 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 80993000 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 80993025 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 80993165 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 80993379 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80993393 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80993451 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80993485 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80993976 C G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 80994087 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 80994107 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 80994181 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80994262 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80994308 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80994609 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 80994611 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80994626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80994840 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80995199 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80995465 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80995633 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 80995643 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 80995705 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 80995773 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 80995801 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80995844 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 80995923 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80995929 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80995984 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80996002 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80996013 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 80996056 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 80996084 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80996087 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80996192 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 80996203 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 80996226 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 80996255 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 80996379 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80996470 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80996609 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80997355 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80997387 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80997408 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80997409 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80997419 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80997491 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80997513 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80997520 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80997526 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 80997583 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80997662 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80997690 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 80997706 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80998015 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80998035 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 80998036 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 80998087 G T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 80998120 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 80998131 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 80998145 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 80998161 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 80998164 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 80998257 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 80998312 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 80998385 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 80998443 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 80998462 T A N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 80998496 G T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 80998574 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 80998690 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 80998729 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80998933 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80998940 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80999049 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 80999115 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 80999170 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 80999250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 80999301 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80999393 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80999529 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 80999590 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 80999601 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 80999616 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 80999642 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81000178 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81000248 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 81000723 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 81000830 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81001047 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81001269 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81001699 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81001746 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81002043 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 81002056 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 81002173 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 81002327 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81002790 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81002917 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81004939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81005691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81005739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81005946 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81006634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81009474 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81009781 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81011477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81011578 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 81011816 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 81012586 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 81012911 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81013736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81015131 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81015589 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81017173 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81017339 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81018982 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81019734 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81023446 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0 0.8 0.2 12 18 0 12 3 3 81024040 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81024110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81024777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81027514 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81027605 C T Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 81027635 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81027984 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81027990 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81028372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81028475 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 81028734 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81028834 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81029530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81030713 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81030739 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81031239 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81031829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81033605 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81034773 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81035022 C T Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 81035532 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81037105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81037907 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81037949 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81038102 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81038326 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 81038406 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 81038685 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81038689 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81038824 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81038869 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81039068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81039087 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81039108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81039159 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81039432 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81039464 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81039557 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81039706 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81039765 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81039895 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81040139 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81040273 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 81040296 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81040305 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81040452 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81040463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81040651 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81040670 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81040673 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81040770 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81040835 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81040869 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81040883 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 81040926 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81040948 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 81041124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81041153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81041208 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81041218 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81041246 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 81041484 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81041491 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81041565 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81041605 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 81041619 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 81041660 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81041666 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81041677 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 81041910 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 81042072 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81042073 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81042287 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81042290 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81042330 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81042399 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81042500 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81042663 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81042748 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81042770 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81042899 A T Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 81042913 G T Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 81043394 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81045171 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81045625 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81045686 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 81045939 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81045940 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81046867 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81047329 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81047443 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81047644 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81047787 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81047942 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81048422 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81048669 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 81048898 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81048974 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81048978 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81049375 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81049705 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81049965 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 81050017 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81050074 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 81050264 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 3 81050353 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 81051087 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81051150 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81051354 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81051815 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81052218 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81052261 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81052296 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81052344 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81052729 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81052789 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81052844 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 81053064 C G Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 3 81053560 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 81053680 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81053901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81054179 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81054195 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 81054256 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81054364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81054417 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81054457 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81054458 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81054570 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 81055120 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81055299 C G N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 81056092 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 81056269 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81056375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81056390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81056414 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81056461 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 81056481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81056484 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 81056613 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81056731 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 81056759 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81056862 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 81063208 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 81063339 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 81063429 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 81063675 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81063855 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81064063 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81064075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81064247 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81064381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81064586 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81064642 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81064861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81064897 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81065111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81066128 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81066655 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81066738 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81066790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81066971 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81066983 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81066989 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81067298 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81067413 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81067683 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 81068445 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81068510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81068664 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81068768 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81068848 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81069411 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81070751 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 81072825 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81074848 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81077171 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81077834 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81078300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81078609 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81078741 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81078759 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81078885 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81079090 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81079210 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81079324 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81079438 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81079582 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81079593 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81079732 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81079747 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81079957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81080051 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 81080428 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81080447 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81080462 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81080514 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81080569 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81080573 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81080606 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81080610 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81081421 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81081537 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81082032 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 81082130 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 81082337 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81082401 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81082503 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81082939 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81082941 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81083286 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81083383 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81083650 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81083796 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 81083797 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 81083843 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81083901 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81083926 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 81084081 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 81084132 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81084140 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81084256 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81084314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81084469 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81084495 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81084542 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81084817 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81084991 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81085257 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81085686 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 81085698 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81085736 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81085950 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81086006 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 81086018 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 81086040 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81086058 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 3 81086350 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81086546 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 81086559 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 81087032 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 81087040 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 81087165 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 81087263 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 81087748 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81087848 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81087936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81088004 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 81088241 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81088301 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81088736 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81088876 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 81088885 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 81088907 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 81088960 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 81089161 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 81089387 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81089772 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 81089816 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 81090111 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81090164 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81090192 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81090227 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81090269 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 81090344 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81090404 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 81090516 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 81090843 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81091038 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 81091057 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 81091179 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81091347 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 81091378 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 81091578 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81091595 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 81091630 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 81091995 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 81092016 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81092291 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81092418 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81092441 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81092480 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81092483 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81092590 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81092657 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81092804 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81092826 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81092893 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81093245 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 81093249 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81093318 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81093354 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81093370 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81093391 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 81093458 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81093462 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81093700 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81093801 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81093837 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81093898 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81093942 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81094130 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81094268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81094282 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 81094327 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 81094328 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81094356 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81094467 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81094535 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81094557 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81094589 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81094628 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81094657 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81094676 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81094684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81094733 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81094774 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81095115 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81095125 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81095137 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 81095151 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 81095172 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81095203 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 81095227 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81095275 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81095390 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81095603 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81095610 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81095642 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81095660 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81095682 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81095684 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81095790 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81095898 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 81095920 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 81096146 G T Y N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 3 81096236 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81096245 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81096247 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 81096373 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 81096571 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81096806 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 81096873 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 81096881 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81097047 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81097104 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81097151 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81097234 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81097251 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 81097636 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81097717 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81097828 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81097942 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 81097943 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 81098000 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 81098213 C T N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0.2 0 0.8 2 8 1 0 4 3 81098263 G T N N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 81098270 C T N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 81098391 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 81098420 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 81098429 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 81098458 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 81098722 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81098818 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81098887 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81098956 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 81099003 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 81099419 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81099518 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81099611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81099717 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81100032 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 81100134 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81100159 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 81100717 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81101877 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81106317 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81119231 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81122270 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81122485 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81128130 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81130935 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81131406 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81132554 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81139018 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81146987 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81147933 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81150092 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81153932 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81155029 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 81155955 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81156814 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81157257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81157575 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81159862 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 81160101 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81161341 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81162190 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81162407 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81162521 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81163689 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81163767 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81165087 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81172399 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81172811 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81173115 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 81173178 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 81173784 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81173785 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 81174104 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81174110 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81174211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81174249 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81174286 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 81174297 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 81174305 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 81174509 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81174740 A G N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 81174867 A G N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 3 81175013 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81175155 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81175159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81175313 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 81175375 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 81175459 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 81175468 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 81175480 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 81175512 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 81175525 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81175540 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81175606 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 81175681 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81175728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81175899 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 81175958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81176308 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 81176608 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 81176675 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 81177212 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81177229 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 81177296 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 81177889 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 81178489 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81178584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81178836 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 81180006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81180319 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81180328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81181741 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81181951 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 81183153 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81184038 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81184189 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81184206 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81184224 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81184529 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81184569 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81185355 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 81187173 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81187504 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 81188289 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81188548 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 81189723 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81190721 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81192406 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 81192423 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81192618 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81193234 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81193753 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81194760 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 81195972 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81196504 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81196694 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81197271 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 81198457 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81200642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81201253 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81201560 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81202354 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81204223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81205629 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81206360 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81206368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81206515 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 81206551 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81207230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81207514 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81208889 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81209680 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81209824 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81210873 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81210887 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 81210938 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81211308 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 81212071 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81212293 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81212672 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81213258 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81213707 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81214514 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 81214809 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81215596 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 81216477 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81216658 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81218449 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81218736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81219516 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81219718 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81219736 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81220930 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 81220955 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 81221459 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 81223500 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81223547 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81224475 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81224539 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81224546 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81224598 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81224839 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81224865 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81224871 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81224876 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81224919 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81224995 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81225054 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81225217 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81225344 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81225416 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81225474 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81225580 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81225798 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 81226423 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81226434 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 81227173 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81227910 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81228223 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81228570 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81229640 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 81229804 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81230459 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 81230655 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 81230771 C G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 81230778 C A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 81230910 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81231057 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 81231102 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 81231106 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 81231155 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 81231315 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 81231522 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81231672 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 81231693 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81231718 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 81231749 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81231876 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81232089 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 81232146 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81232268 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 81232314 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 81232444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81232457 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81233108 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 81233193 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 81233423 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 81233572 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 81233838 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 81233905 A C N N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 81234209 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 81234284 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 81234478 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81234684 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81234767 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 81234837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81235287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81235290 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 81235364 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 81235464 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 81235655 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 81235683 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81235707 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 81235898 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 81236291 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 81238519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81240138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81240599 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81240600 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81241222 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81241348 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81242232 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 81247079 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81247739 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81247832 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81247999 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81248136 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 81251673 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81251909 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81252181 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81252497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81253208 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81253290 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81254251 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81254532 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81255104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81256155 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81258624 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81259283 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81259809 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 81260877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81262466 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 81263137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81263144 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81263421 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 81263457 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 81263477 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 81263528 G T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 3 81263699 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.0526315789473684 0.789473684210526 0.157894736842105 17 21 1 15 3 3 81264070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81264264 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81264269 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 81264293 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81264327 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81264372 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 81264634 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 81264726 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 81264747 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 81264773 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 81264896 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 81264925 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 81265044 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 81265046 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 81265069 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 81265099 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 81265181 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 81265182 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81265207 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 81265415 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81265416 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 81265453 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 81265457 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 81265498 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 81265585 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 81265638 G T N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 81266157 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 81266250 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 81266381 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 81266447 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 81266539 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 81266588 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 81266652 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 81267454 A T N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 81267475 A G N Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 3 81267499 A T N N 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 3 81267532 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 3 81268028 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 81268069 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 81268793 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 81268845 G C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 81268936 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 81268938 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 81269064 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 81269282 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 81269346 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 81269405 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 81269593 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 81269715 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 81269953 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 81270209 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81270233 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81270302 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81270497 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81270521 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81270644 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 81270661 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 81270726 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81270932 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 81271018 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81271025 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81271050 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81271174 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81271208 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81271261 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 81271406 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81271810 A C N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 81271911 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 81272251 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81272406 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81272785 A G Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 81272803 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 3 81274866 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 4 8 2 0 4 3 81274878 G A N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.285714285714286 10 4 5 0 2 3 81275057 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81275126 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81275200 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 81275203 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 81275261 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81275282 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81275500 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81276123 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 81276656 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 81276694 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81276885 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81276956 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81276988 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81277113 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81277276 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 81277677 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 81278451 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 81278788 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 81278809 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81279139 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 81279189 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81279504 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 81279704 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 81279708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81279863 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 81279902 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81279924 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81280010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81280037 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 81280061 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81280155 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 81280167 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 81280311 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 81280318 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 81280406 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81280522 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81280532 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 81280572 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81280600 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 81280676 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 81280692 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 81280728 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81280769 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81280823 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81280918 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 81280925 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81280948 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81281012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81281077 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81281096 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 81281104 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81281397 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 81281437 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 81281438 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 81281628 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81281668 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 81281703 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 81281759 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 81281762 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 81281851 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 81281901 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 81281928 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 81282038 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 81282117 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 81282521 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 81282526 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 81282573 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81282617 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 81282621 C A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 81282685 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 81282724 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 81282751 C G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 81282754 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 81282875 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 81282961 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 81283125 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 81283343 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 81283396 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 81283430 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 81283563 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 81283576 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 81283586 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 81283602 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81283641 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 81283653 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 81283695 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81283875 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81283881 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 81284022 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 81284190 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 81284478 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81284490 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81284499 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81284668 G C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 81284687 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 81284688 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 81284700 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 81284712 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 81284749 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 81284762 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 81284864 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 81285288 C A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 81285324 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 81285415 C G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 81285498 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81285545 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81285566 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81285592 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 81285596 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 81285678 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 81285905 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 81285981 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81285992 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 81286518 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81286617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81286659 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81286660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81286879 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81286904 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81286995 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81287134 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81287178 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81287234 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81287240 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81287465 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81287572 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81287586 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81287615 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81287723 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 81287758 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81287787 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81287804 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 81287827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81287848 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 81287852 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81287945 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81288024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81288111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81288160 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81288175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81288382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81288571 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81288701 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81288791 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81288833 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81288838 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81288872 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81288949 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81289194 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 81289254 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 81289357 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81289646 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81289675 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81289705 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81289765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81289885 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81290026 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81290375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81290473 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81290737 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81290748 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81290797 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 81291185 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81291296 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81291499 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81291500 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81291553 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 81291598 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 81291929 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81292201 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 81292514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81292536 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 81292877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81293042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81293369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81293441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81293508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81294402 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81294465 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 3 81294734 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 81294954 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81295325 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81296093 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81296324 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81296697 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 81297037 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 81297261 T C Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 81297868 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81298685 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81299935 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81300002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81301855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81302044 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 81302137 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81302366 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81302495 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81302536 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81302555 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 81302922 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81303087 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 81303090 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81303351 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81303520 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81303530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81303560 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 81303719 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81303828 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81303862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81304054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81304075 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81304369 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81304487 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81304626 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81304951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81305307 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 81305386 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81305433 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 81305449 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81305637 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 81305783 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 81306107 G T N N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 3 81306165 G T N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 3 81306167 T A N N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 3 81306456 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 81306464 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 81306467 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 81306478 A T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 81306596 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81306699 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 81306752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81306757 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 81306791 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 81306863 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 81306878 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 81307027 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 81307041 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 81307075 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81307540 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 81307743 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 81307822 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 81307940 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 81307993 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 81308159 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 81308290 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 81308365 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 81308652 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 81308660 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 81308748 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 81308772 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 81308820 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 81308839 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 81308859 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 81308867 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 81308871 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 81309176 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81309224 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 81309234 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81309240 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81309378 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 81309473 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81309602 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81309635 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81309636 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81309935 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81310027 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81310049 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81310196 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81310197 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81310378 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81310393 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 81310400 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81310476 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 81310488 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 81310559 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 81310563 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81310588 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 81310642 A C N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 81310730 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81310749 G C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 81310832 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 81310834 C G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 81310943 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 81311042 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 81311048 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81311077 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 81311102 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 81311124 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 81311240 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 81311590 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 81311593 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 81311837 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 81311858 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 81312043 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81312051 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 81312309 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 81312334 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 81312432 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81312583 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 81312584 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 81312671 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 81312680 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 81312683 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 81312844 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81312888 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81312960 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 81313003 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 81313023 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 81313084 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 81313117 G C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 81313130 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 81313173 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81313176 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 81313215 T A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 81313290 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 81313355 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 81313386 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 81313407 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 81313423 C T N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 81313427 G A N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 81313501 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 81313534 T C N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 81313669 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 81313699 C G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 81313725 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 81313773 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81313807 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81313872 C G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 81313900 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 81313948 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81313959 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81313969 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 81314029 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81314045 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 81314084 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81314097 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 81314105 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 81314119 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81314147 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81314158 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 81314165 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81314220 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81314233 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81314236 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81314265 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 81314289 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81314328 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81314338 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81314348 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 81314444 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81314550 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81314556 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81314596 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81314598 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81314620 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 81314621 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 81314643 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81314645 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81314663 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 81314745 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 81315095 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 81315109 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 81315116 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 81315321 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81315346 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81315353 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81315444 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 81315469 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81315528 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 81315531 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 81315541 C T N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 81315703 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 81315837 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81315873 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81316000 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81316015 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81316020 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81316034 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81316037 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81316063 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81316141 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 81316210 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81316350 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81316440 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81316441 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81316458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81316645 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81316659 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 81316660 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 81316868 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81316879 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81316914 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81316928 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81316937 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81316978 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81317100 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81317144 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81317233 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81317409 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81317506 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81317512 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81317636 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81317674 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 81317688 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81317700 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 81317724 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 81317733 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81317860 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 81317878 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81317918 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 81317941 A C Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 81318018 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81318053 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 81318095 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81318102 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 81318135 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 81318145 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81318248 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81318309 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81318351 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81318441 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81318590 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 81318616 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 81318665 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 81318746 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 81318840 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81319049 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81319204 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 81319476 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 81319481 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81319504 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81319592 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 81319737 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81319747 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 81319850 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 81319874 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 81319934 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81319963 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 81319990 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 81319999 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 81320009 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 81320115 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81320225 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81320250 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81320272 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81320296 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 81320309 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81320321 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81320396 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81320403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81320409 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81320578 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 81320663 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 81320691 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 81320712 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 81320719 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 81320744 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 81320842 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 81320865 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 81321005 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 81321014 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 81321017 A C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 81321168 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 81321180 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 81321181 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 81321194 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 81321234 G C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 81321275 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 81321290 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 81321332 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 81321371 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81321450 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81321456 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81321518 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81321537 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81321543 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81321587 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81321607 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81321678 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81321689 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81321695 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81321703 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81321720 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81321723 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81321741 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81321746 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81321782 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81321924 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 81321931 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 81322035 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 81322099 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81322108 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81322127 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 81322146 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 81322165 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81322217 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81322220 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81322230 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81322283 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81322296 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81322346 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81322376 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81322380 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81322406 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81322417 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81322426 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81322437 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 81322471 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81322490 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81322494 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81322507 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 81322532 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81322539 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81322552 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81322553 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 81322570 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81322593 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81322619 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 81322664 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81322786 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81322809 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 81322821 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 81322862 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 81322871 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 81322887 T A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 81322909 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 81322939 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 81322954 T C N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 3 81322980 A G N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 3 81323008 G A N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 3 81323031 G A N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 81323101 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 81323120 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 81323201 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81323330 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 81323339 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81323350 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 81323387 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 81323389 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 81323414 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81323471 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81323590 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 81323610 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 81323648 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 81323654 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81323688 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81323869 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81323870 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81323927 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81323988 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81324007 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81324080 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81324134 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81324167 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81324189 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81324249 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81324271 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81324295 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81324323 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81324340 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81324367 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81324384 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81324394 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81324437 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81324446 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 81324448 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81324735 C G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 81324860 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81324933 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 81325043 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 81325106 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 81325229 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 81325249 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81325292 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81325304 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81325343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81325347 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 81325378 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81325411 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 81325725 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81325943 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 81326084 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81326103 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81326191 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81326228 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 81326266 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 81326279 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81326357 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81326403 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81328966 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81328974 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 81328977 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81329101 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 81329188 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81329245 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81329259 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81329300 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81329340 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81329386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81329446 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81329489 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81329593 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81329604 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81329736 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81330003 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81330007 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81330114 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81330122 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81330156 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 81330174 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81330227 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 81330279 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81330388 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81330419 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81330534 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 81330641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81330648 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81330665 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 81330712 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81330786 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 81330981 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81330991 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81331142 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 81331344 A G N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 5 11 0 5 3 3 81331353 G A N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 3 81331748 C A N N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 81331785 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 81331812 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 81331823 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81331869 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81331881 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81331963 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 81332068 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 81332072 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 81332115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81332158 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 81332232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81332253 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81332524 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81332619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81332693 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 81332876 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 81332965 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81333159 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81333160 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81333177 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 81333225 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 81333277 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81333443 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81333614 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81333617 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 81333683 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81333690 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81333702 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 81333714 T G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81333727 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 81333775 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81333804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81334668 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81335076 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 81335083 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 81335137 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81335224 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 81335256 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 81335758 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81335874 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81336295 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81336300 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81336570 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 81336868 A T Y N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 3 81336886 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 81336927 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 81336964 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 81337053 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 81337157 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 81337162 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 81337201 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 81337272 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 81337291 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 81337304 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 81337352 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 81337356 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 81337639 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 81338021 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 81338218 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81339157 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81339217 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81339265 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81339489 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81339529 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81339993 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81340077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81340120 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81340261 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81340338 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81340465 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81340482 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 81340971 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81341076 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81341084 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81341099 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81341233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81341300 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81341343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81341433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81341594 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81341915 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81341934 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81341944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81341956 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81342009 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81342010 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81342091 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81342138 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 81342256 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 81342276 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81342759 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 81342775 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 81342822 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 81342854 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81342868 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 81342958 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 81342983 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 81343033 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81343039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81343094 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81343136 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81343178 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81343200 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81343263 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81343282 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81343411 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 81343573 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81343597 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81343774 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81343851 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81344142 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81344158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81344192 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81344309 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81344336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81344398 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81344399 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81344434 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81346473 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 81346531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81346541 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81346840 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 81347311 C G N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 81347322 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 81347638 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 81348005 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81348020 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81348051 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 81348191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81348276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81348774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81348844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81348883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81348949 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 81348961 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 81349037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81349049 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81349180 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81349292 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81349371 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 81349390 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 81349647 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81349681 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81349749 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81349814 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81349863 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81349898 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81349915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81349986 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81350009 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81350196 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81350225 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 81350317 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 81350434 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81350585 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81350649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81350669 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81350681 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 81350817 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81350832 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81350854 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81351062 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81351170 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81351197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81351386 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81351424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81351535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81351673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81351921 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81352021 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81353600 A T N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 81353756 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 81353988 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81354670 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81355213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81355388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81356324 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 81356730 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81357706 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 81357765 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 81358426 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81361589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81361739 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81362029 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81362356 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81362758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81362820 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81362943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81363302 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81363478 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81363849 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 81363993 G C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 81364011 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 81364058 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 81364282 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 81364375 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 81364376 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 81364523 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 81364750 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 81364893 A T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 81365073 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 81365127 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 81365350 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 81365958 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81366060 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81366061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81366259 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 81366400 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81366587 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 81366798 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 81367131 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 81367426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81367481 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 81367560 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 81367561 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 81367933 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 81368634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81368672 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81368733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81368752 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 81368956 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 81369172 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 81369476 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81369478 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 81369792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81370898 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 81371301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81371640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81371675 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81372568 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81372657 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81373024 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81373210 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81373572 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81373767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81373997 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81374086 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81374105 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81374149 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81374174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81374176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81374278 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81374333 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81374391 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81374393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81374412 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81374439 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81374496 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81374511 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81374578 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81374586 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81374670 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81374699 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 81374733 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 81374910 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 81375002 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81375090 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81375108 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81375166 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81375172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81375328 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 81375359 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 81375403 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 81375494 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 81375499 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 81375510 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 81375511 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 81375526 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 81375552 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81375660 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81375698 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81375710 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81375765 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81376024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81376254 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81376265 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81376267 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81376279 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81376376 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81376515 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81376529 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81376563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81376717 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81376868 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 81376877 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81377036 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 81377193 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 81377226 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 81377372 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 81377373 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 81377462 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81377521 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81377533 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81377671 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 81377775 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 81377842 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 81377844 A C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 81377968 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 81378032 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 81378051 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81378066 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 81378067 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 81378235 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81378244 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81378270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81378285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81378381 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81378392 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81378425 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81378455 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 81378505 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81378531 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81378562 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81378586 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81378689 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81378771 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81379037 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81379101 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81379167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81379430 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81379440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81379521 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81379739 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 81379752 G T N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 81379915 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81380002 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81380008 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81380076 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 81380212 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81380323 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81380375 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81380402 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81380412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81380425 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81380495 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81380525 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81380563 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81380564 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81380579 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81380762 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81380818 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 81380915 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81381083 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 81381163 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81381620 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81381700 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81381895 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81381949 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81381970 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81382028 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 81382075 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81382160 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81382178 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81382240 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 81382276 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 81382277 T C Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 81382303 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81382341 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81382393 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81382410 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81382422 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81382470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81382483 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81382568 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81382585 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 81382586 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 81382630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81382679 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81382692 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81382839 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81382944 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81382973 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81383062 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81383129 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81383142 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81383151 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81383203 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81383227 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81383319 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81383321 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81383388 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81383602 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81383645 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81383915 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81384509 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81384870 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81385074 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81385217 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81385393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81385546 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81385685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81386411 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 81386623 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 81386756 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 81386765 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 81386804 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 81386839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81386867 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81386938 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 81386970 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 81387019 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 81387243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81387269 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81387282 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 81387319 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 81387419 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 81387726 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 81388543 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 81388568 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 81388576 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81388612 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81388624 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81388642 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81388778 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81389576 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81390358 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81391002 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81391146 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81391536 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81391859 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81392122 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81392263 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81392280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81392641 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81393231 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81393675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81394236 T A N N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 3 81394347 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 81394904 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81395109 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81395463 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81395882 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81396313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81396984 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81397284 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 81397427 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 81397471 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81397486 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81397491 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81398014 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 81398112 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 81398314 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 81398507 G T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81398595 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81398720 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 81398735 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 81398948 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81399235 A G Y Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 81399569 C G Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 81399804 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 81400340 T C Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 81400356 T G Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 81400363 T G Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 81400389 G C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 81400504 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 81400522 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81400684 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 81400756 G C Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 81400933 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 11 7 4 3 2 3 81401610 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 81401933 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81402166 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 81402230 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 81402274 A C Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 81402350 C A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 81402414 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 81402440 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 81402473 A G Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 81402499 T C N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 81402650 A T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81402812 A C Y N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 81402880 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81402909 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 81402918 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81402954 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 81403040 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 81403070 G A Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 81403081 G C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 81403139 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 81403175 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 81403284 G A Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 81403309 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 81403397 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81403429 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81403501 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81403557 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81403578 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 81403821 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81403897 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81403978 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81404098 C A Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 81404129 T A Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 81404205 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 81404233 T C Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 81404236 T G Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 81404319 T G Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 81404333 T G Y N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 3 81404471 G C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 81404701 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 81404775 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81404902 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 81404940 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81405162 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81405240 A T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81405477 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 81405712 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81405720 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81405843 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 81406168 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 81406229 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81406501 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81406690 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81406693 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81406837 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81406843 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81406856 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81407062 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81407110 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 81407149 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81407177 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81407356 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 81407583 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 81407780 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 81407822 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 81408014 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81408056 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81408478 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81408673 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 81408972 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 81409131 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81409399 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81409611 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 81409641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81409675 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81409870 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81410352 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 81410619 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81410805 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81410886 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81411009 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 81411391 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 81411597 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81411705 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81411761 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81411919 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81412029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81412144 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81412166 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81412342 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 81412347 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 81412397 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81412424 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81412486 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81412605 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 81412642 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 81412739 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81412859 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81412933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81413468 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81413508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81413520 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81413533 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81413650 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 81413651 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 81413744 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81413768 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 81413947 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81414016 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81414027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81414046 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 81414059 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81414106 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81414221 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 81414402 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 81414447 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81414602 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81414706 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81415126 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 81415441 A G N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 81415581 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81415617 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 81415628 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 81415659 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 81415906 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 81415965 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 81416070 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 81416101 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 81416103 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81416121 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81416265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81416410 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 81416446 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 81416493 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 81416921 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 81417943 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81417950 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81418046 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 81419214 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 81419348 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 81419477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81427094 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 81427843 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81428923 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81429240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81429260 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 81429325 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 81429387 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 81429635 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 81429926 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81430727 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 81431144 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81431500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81431527 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 81431738 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81432750 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 81432828 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81432981 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81433089 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81433732 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81435599 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81435736 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 81436186 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81436561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81436636 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81436670 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81436757 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81436971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81437029 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81437180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81437625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81437743 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 81438240 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81438524 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81438696 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 81438989 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81439270 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 81439793 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81440963 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 81441077 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 81441091 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 81441182 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 81442198 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 81442431 T C N Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.125 0.75 0.125 8 8 1 6 1 3 81442653 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 81443171 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81443183 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81443271 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81443305 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81443313 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81443385 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81443452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81443487 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81443630 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81443837 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81443996 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81444068 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81444124 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81444497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81444851 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 81445043 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 81445052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81445283 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 81445323 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 81445405 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 81445774 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81446141 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81446147 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 81446178 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81446519 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 81446781 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 81446812 C T Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 81446922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81447010 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81447142 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81447197 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81447416 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81447563 G A Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 81447638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81447743 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81447900 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81448043 T C Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 81448260 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 81450239 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 81450335 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81450446 G T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81450657 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81450774 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81450834 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81450945 C G Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 81451093 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 81451111 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81451123 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81451148 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81451164 A C Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 81451724 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81451948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81451975 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81452017 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81452225 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81452468 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81452531 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81452785 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81452827 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 81452836 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 81452951 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81453109 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81453194 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81453427 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81453499 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81453936 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81454149 T C N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 3 81458155 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 81458714 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 81459295 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81459638 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 81459646 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 81459753 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 81459955 A C N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 81460438 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 81460715 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81460735 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 81461259 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81461290 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 81461296 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 81461303 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 81461718 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 81461803 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81461812 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81462136 A G N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 81462220 A G N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 3 81462953 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81462968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81462988 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81463078 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81463372 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81463862 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 81463876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81464062 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 81464154 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 81464193 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 81464267 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 81464520 A T N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 81464618 T G N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 81464755 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 81464780 G C N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 81464871 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81464956 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81465211 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 81465222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81465503 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81465890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81466001 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 81466033 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 81466079 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 81466979 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81467817 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81467843 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81468097 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 81468174 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 81469286 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 81469676 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 81469954 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 81470296 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 81470365 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81470983 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 81471065 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 81471142 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81471212 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81471214 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 81471520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81474808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81475381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81476050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81476894 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81478497 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 81478898 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 81479379 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81479749 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 81481197 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 81481906 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81482224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81482496 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81484161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81484183 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81484207 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 81484221 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 81484291 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 81484302 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 81484333 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 81484944 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 81485379 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81485624 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81486094 A T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 81486944 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 81486976 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 81486990 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 81487276 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 81487922 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 81488436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81488747 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 81489052 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81489063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81489501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81489525 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81489887 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 81489942 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81490016 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81490101 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81490109 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81490375 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 81490632 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 81490737 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 81490753 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81490850 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81490853 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 81490936 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81490977 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81491234 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81491385 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81491417 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 81491477 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 81491659 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 81491702 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 81491863 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81492081 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81492207 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81492406 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81492934 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81493014 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 81493240 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 81501899 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81501917 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81502690 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81502874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81503183 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 81503328 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81503347 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81503353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81503723 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 81503742 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 81504174 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 81504248 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 81504819 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81505231 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 81505268 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81505382 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81505934 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81507134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81507197 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 81507219 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81507391 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81507890 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81508080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81508527 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81508638 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81508899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81509467 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 81517152 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81517189 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81517375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81518651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81518844 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81519784 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81520379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81521035 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81523388 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81524099 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81524548 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81525269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81526186 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81526276 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81527964 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81528565 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 81533558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81533841 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81536588 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81537798 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81539265 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81539444 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81539469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81539736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81539892 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81540595 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81541544 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 81542059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81544242 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81545028 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81545965 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81546019 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81547206 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81547480 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81549309 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81550302 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 81550383 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 81550420 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 81551149 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81551203 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 81552174 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81552446 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81552582 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81552772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81553743 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 81555037 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81555242 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 81555467 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81555538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81555860 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 81555879 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 81557569 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81560371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81560409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81560517 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81560600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81560841 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81561677 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81562024 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 81563111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81563954 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81564612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81565199 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81565507 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81566800 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81569468 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81573047 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 81576660 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81577743 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 81578171 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81578447 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81578574 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81586133 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 81586476 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81586650 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81587674 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81587837 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81588287 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81589390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81589427 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81589609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81590230 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81592088 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81592704 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81592917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81594264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81595960 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 81595977 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 81596238 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81596402 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81596413 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 81596464 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81596468 A T Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 81596992 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81597590 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81597931 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81598141 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81598313 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81599138 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81600102 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81602004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81602628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81603101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81603616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81604485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81604684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81604715 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81604959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81605092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81605482 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81607591 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81607744 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81610264 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81612027 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81614244 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 81614268 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81614545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81615895 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 81616824 A G Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 81618474 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81619914 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81620303 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81622471 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81623831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81624099 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81624115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81624239 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81624284 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81624485 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81624740 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81625010 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81625242 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81625514 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81627170 C G Y N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0 1 0 13 13 0 13 0 3 81628014 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81628901 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81631003 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81631192 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81632032 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81632778 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81635742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81636331 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81637018 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81639488 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81639499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81641268 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81642596 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81642618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81643028 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81643824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81644154 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81644738 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81644895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81644917 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81646355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81646493 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81647661 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 81648422 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 81648438 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81648866 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81649221 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81649249 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81649298 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81649685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81650109 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81650347 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81650508 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 81654190 C A Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 81660294 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81662777 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81662811 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81663585 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 81663608 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81664244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81664415 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 81664433 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 81664502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81664508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81664541 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 81664554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81664595 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 81664621 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 81664680 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 81664697 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81664922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81665053 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81665343 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81666422 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81667213 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81668709 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81670159 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81672601 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81673291 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 81673616 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81674784 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 81674790 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 81675098 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81675661 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81683421 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 81683523 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81683533 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 81684031 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 81684054 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81684505 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81684506 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 81684518 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 81684669 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81685027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81686280 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81687956 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 81688112 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 81688518 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 81688646 T G N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 3 81689020 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81689500 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81691255 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81691674 A T N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 3 81691818 A G N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 3 81692566 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 81693065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81693217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81693532 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81693696 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81693753 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 81694949 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81695140 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81695192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81695346 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81695494 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81695562 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81695567 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81696211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81696233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81696409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81696445 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81696475 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81696775 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 81696959 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81696991 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81697143 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81697406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81697464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81697696 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81697701 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81697807 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81697842 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81697894 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81697906 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81697943 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81697971 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81698055 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81698091 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 81698175 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81698380 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 81698450 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81698472 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81698527 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 81698593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81698635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81698792 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81698857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81698911 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81698999 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81699092 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81700599 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 81700673 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81701559 A C N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0 1 0 13 13 0 13 0 3 81701651 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81702078 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81702351 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81702844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81702951 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 81703150 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81703181 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81703216 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81703290 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 81704016 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81704271 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81705011 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81708940 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81709553 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 81709577 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 81709770 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81709793 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81710007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81710361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81711133 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81711233 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81712271 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81712742 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 81713104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81713462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81714929 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 81715010 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 81715035 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81715645 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81716018 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81717470 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81717781 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 81718933 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81720560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81720836 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81722490 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81722663 C A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 81724807 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81725179 T C Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 81725291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81725931 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 81726585 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81726874 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 81727673 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81727736 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81728100 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81728316 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 81728399 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81729549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81731457 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 81731500 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 81731505 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81731640 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81731715 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81731727 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 81731852 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 81732013 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81732059 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 81732265 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 81732275 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 81732329 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 81732338 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 81732387 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 81732642 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 81732644 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 81732657 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 81732857 A C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 15 21 0 15 3 3 81732949 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 81732954 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 81733017 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 81733084 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 81734079 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81734519 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 81734559 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81734562 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 81734577 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 81734760 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 81734788 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 81734804 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 81734895 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 81734984 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 81735009 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 81735024 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 81735051 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 81735093 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 81735306 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81735408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81735493 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81735495 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 81735521 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81735525 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81735536 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 81735539 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 81735575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81736019 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81736196 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 81736356 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81736565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81736642 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81737885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81738081 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 81738260 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 81738263 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81738394 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81738400 T A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 81738453 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 81738518 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 81738540 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81738595 A T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 81738613 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 81738647 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 81738690 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 81738725 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81738749 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 81738774 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81738805 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81738842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81738948 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81738981 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81739111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81739228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81739388 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81739484 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81739495 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81739631 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81739733 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81739738 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81739755 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81739801 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81739825 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81739870 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81739900 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81739902 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81740017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81740030 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81740039 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81740063 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81740100 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81740214 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81740308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81740328 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81740410 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81740435 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81740467 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 81740512 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81740786 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81740962 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 81741052 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 81741091 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 81741175 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81741179 G C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 81741224 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81741328 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 81741374 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81741375 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81741473 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 81741606 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81741685 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 81741729 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81741730 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81741849 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 81741886 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 81741920 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81741927 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 81742176 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81742200 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81742203 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81742276 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 81742289 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 81742343 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81742389 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81742601 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81742636 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 81742644 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81742648 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 81742904 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81743062 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81743119 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81743157 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81743222 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81743720 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81743738 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81743897 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81743934 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81743949 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81744016 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81744025 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 81744246 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81745055 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 81745130 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 81745200 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 81745784 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81746320 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 81746349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81746682 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81746855 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81747121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81747787 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81747917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81749412 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81749666 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 81749710 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81750188 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81750606 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81750997 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 81751007 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 81751152 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 81751218 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 81751509 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 81752390 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81752452 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81752482 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81752484 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 81752747 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 81752792 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 81752899 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 81753322 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 81753614 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81753617 C G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 81754121 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81754554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81755045 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81755252 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81756050 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81756632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81756660 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81757007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81757476 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 81757530 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 81757554 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 81757639 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 81757712 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81758130 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 81758135 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81758153 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 81758164 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81758667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81758908 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81759168 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81759234 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81759371 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 81759484 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81759531 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 81759782 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81759896 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81760071 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81760324 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 81760329 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 81760517 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 81760628 G T N N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 3 81760827 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 81760930 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 81761150 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 81761394 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81761861 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 81761868 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 81762145 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 81762345 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 81762530 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 81762604 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 81763091 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81763196 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 81763239 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 81763587 T A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 81763644 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 81763686 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 81763690 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 81763713 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81764218 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81764743 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 81765033 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 81765133 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 81766081 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81766428 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81766856 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 81767793 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81768325 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 81768878 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81769198 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81769866 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 81770141 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 81770449 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81770487 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81771095 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81771253 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81771463 A T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 81771642 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 81771787 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 81772080 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 81772591 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81772784 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81772785 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81772907 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81772991 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 81773132 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81773252 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81773265 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 81773281 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 81773307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81773315 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81773373 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 81773552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81773561 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81773640 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81773656 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 81773743 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81773819 T C Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 81774092 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 81774142 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81774310 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81774418 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81774559 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 81774665 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 81774670 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 81774894 A G Y Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 3 81775153 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 81775213 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81775661 T A N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 81775664 C G Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 81776548 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81776894 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81777072 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 81777722 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81779008 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 81779052 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81779335 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81780038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81782026 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81784110 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81784323 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81784327 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81784771 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 81784925 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 81785501 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81786161 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81786709 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81787141 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 81788493 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81788522 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81788534 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 81789632 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81790168 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81791216 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 81791362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81791371 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81791383 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81791462 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81791663 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81791679 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81791774 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81791775 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81791958 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81791959 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81792029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81792400 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81792833 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81793362 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81793588 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81793672 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 81793776 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81793784 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81794107 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81794193 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 81794953 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81794972 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81795169 T G N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 81795314 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 81795540 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81795789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81796258 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 81796432 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 81796561 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81796670 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81797035 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81797273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81797746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81797781 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 81798137 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 81798143 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 81798256 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81798275 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 81798352 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 81798455 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81798568 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 81798596 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 3 81798598 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 81798761 A G N Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 3 81799355 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81799446 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 81799690 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 81799784 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 81799887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81800256 C A Y N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 81801290 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 81801621 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81801849 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 81802006 T G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 81802111 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 81802112 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 81802333 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 81802386 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 81802476 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81802516 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81802549 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81802573 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81802635 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81802749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81803313 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 81803357 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 81803609 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81803828 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81803894 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 81804159 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81804221 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81804411 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81804503 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 81804739 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 81804886 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81804972 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 81804973 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 81804987 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 81805098 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81805295 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81805306 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81805369 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81805395 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81805439 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81805471 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81805589 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 81805633 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81805671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81805746 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 81805860 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 81806091 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 81806374 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 81806414 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 81807037 G C N N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.153846153846154 0.769230769230769 0.0769230769230769 14 12 2 10 1 3 81807278 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 81807279 C A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 81807309 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 81807551 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 81807605 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 81807606 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 81807661 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 81807685 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 81807687 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 81807800 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 81807864 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81808188 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 81808652 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81809024 C A Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 81809030 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 81809196 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81809226 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 81809229 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 81809451 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81809602 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 81809608 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 81809690 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 81809819 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 81810066 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 81810094 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 81810289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81810326 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 81810345 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 81810669 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81810760 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81810762 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 81810775 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 81810788 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81810863 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81810871 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81810890 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81810985 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81811000 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81811001 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81811042 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81811132 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 81811208 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 81811416 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 81811522 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 81811532 C A Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 81811699 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 81811999 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 81812060 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 81812063 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 81812076 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 81812078 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 81812125 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 81812371 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 81813173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81813367 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81813829 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 81814215 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 81815151 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 81815397 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81816778 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 81819389 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81819852 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 3 81820704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81820788 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 81821778 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81822106 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81822307 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81824093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81824659 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 81824724 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81825370 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81825641 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81825690 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 81825975 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81826020 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81826027 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 81826140 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 81826178 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81826333 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81826630 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 81826751 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81826795 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 81826862 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 81826870 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 81826893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81827055 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81827065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81827128 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 81827191 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81827226 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81827307 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81827326 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 81827378 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 81827542 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81827640 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 81827652 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 81827958 T A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 81827968 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 81828002 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 81828037 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 81828038 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81828099 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 81828161 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81828204 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 81828246 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81828334 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 81828480 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 81828587 C T N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 3 81828676 T C N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 81828814 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 81828990 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81829021 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 81829434 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81829449 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 81829486 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 81829492 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 81830070 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 81830073 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 81830119 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81830239 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 81830296 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 81830326 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 81830362 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 81830580 T A N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 3 81830641 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 81830719 A C N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 81830720 A T N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 81830763 C G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 81831012 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 81831026 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 81831160 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 81831534 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 81831627 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 81831678 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 81831686 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 81831700 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 81831704 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 81831723 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 81831796 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 81831823 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81831932 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 81832107 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 81832182 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 81832183 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 81832205 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 81832220 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 81832247 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 81832324 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 81832396 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 81832409 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 81832410 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 81832431 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 81832432 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 81832494 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 81832499 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81832513 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81832530 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 81832634 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81832851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81832920 T G N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 81833057 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 81833103 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81833254 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81833611 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 81833651 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81833830 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81833833 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81833859 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81834082 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 81834187 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 81834330 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81834372 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 81834595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81834754 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 81834782 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81834841 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 81834877 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 81834898 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81834907 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 81834927 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 81835180 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 81835194 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 81835211 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 81835217 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 81835226 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 81835248 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 81835261 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 81835320 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 81835387 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81835430 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 81835514 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 81835555 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 81835557 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81835649 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 81835752 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 81835823 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 81835824 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 81835921 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 81836414 A T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 81836456 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 81836491 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 81837111 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 81838085 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 81838435 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81839040 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 81839053 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81839108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81839110 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81839366 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 81839445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81839594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81839851 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 81839873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81839961 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 81840099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81840146 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81840176 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 81840258 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81840367 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 81840429 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 81840766 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 81841228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81841256 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 81841597 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 81841683 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81841785 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 81842084 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81842148 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81842401 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 81842427 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 81842428 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 81842466 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 81842555 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81842600 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 81842643 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 81842854 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 81842891 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81842928 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81843167 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81843266 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 81843302 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 81843374 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 81843405 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 81843457 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81843571 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81843953 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81843965 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 81845110 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81845708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81847077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81847479 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81847939 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81848233 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 81848662 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 81848805 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 81850306 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81850745 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 81850760 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81851199 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81851216 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 81853271 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81854455 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 81854460 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 81854609 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 81855437 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81855530 A T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 81856511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81857093 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 81857128 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 81857167 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 81857238 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 81857770 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 81857778 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81858027 T C N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 81858528 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 81858595 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81858932 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81859022 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 81859314 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 81859640 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81859735 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81859845 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 81859910 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81859963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81860604 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81860714 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81860964 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 81861039 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 81861556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81862030 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 81862055 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 81862130 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81862370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81863340 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81863435 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81863436 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81864086 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 81864637 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81866929 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81867468 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81868683 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81869792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81870506 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 81870597 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81870692 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81870808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81871039 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81871280 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81871362 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81871989 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81872621 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 81872993 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 81875060 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 81875085 C G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 81877461 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81878907 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 81878921 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 81878976 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81879369 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 81879561 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81879657 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81880322 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 81880641 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81880855 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 81882992 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81882999 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81883382 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 81884437 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81885273 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 81886941 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81888551 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 81889809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81890379 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81890480 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81890913 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 81890928 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 81891008 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 81891009 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 81891098 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81891551 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81891699 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 81891733 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 81891769 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 81892270 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 81892527 A G N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 3 81892650 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 81892665 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 81893114 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 81893178 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 81893476 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 81893568 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81893914 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 81894532 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81894868 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 81894873 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 81894895 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 81895291 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 81895295 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81895303 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 81895839 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 81896047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81896118 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81896296 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 81896972 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81897148 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 81897314 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81897336 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81897687 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81897804 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81897945 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 81898132 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 81898625 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 81898931 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 81899303 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81899379 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 81899391 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81899726 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 81899924 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 81900129 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81900155 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 81900205 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81900226 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81900253 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 81900353 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 81900372 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 81900507 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81900576 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81900999 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 81901186 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81901349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81901350 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81901857 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81901941 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81901978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81902557 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 81903350 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81903727 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 81903863 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 81903994 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81904039 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81905162 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81905564 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81906014 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 81906263 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 81906638 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 81906760 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81907018 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 81908390 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 81910017 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81910053 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 81910287 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81911205 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81911951 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 81912239 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81912573 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 81912646 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81914143 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81914379 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81914618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81915657 A G Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 81916109 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81917204 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81918003 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81918243 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 81918890 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81919756 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81921549 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81921627 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 81922050 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 81922103 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 81922115 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81922368 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81922453 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 81922478 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 81922923 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81922972 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81923588 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 81923623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81923931 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81924031 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 81924912 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 81924949 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81925017 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 81925069 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 81925246 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81925263 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 81925281 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81925343 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81925406 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 81925431 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 81925468 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81926009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81926069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81926163 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81926462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81926930 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 81926972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81926975 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81926986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81927061 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 81927069 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 81927082 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 81927084 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 81927250 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 81927309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81927373 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 81927388 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 81927550 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 81927626 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 81927700 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81927848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81927994 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 81928107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81928183 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 81928291 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81928554 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 81928575 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 81928831 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81928941 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81928984 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81929055 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81929062 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81929128 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81929161 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81929241 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81929355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81929485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81929513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81929528 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81929546 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81929611 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 81929656 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 81929673 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81929791 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81929981 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 81930013 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 81930209 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 81930210 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81930271 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81930393 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 81930529 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 81930795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81930909 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 81930937 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81930997 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 81931905 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81932566 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81932770 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 81934683 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81934771 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 81935078 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 81935752 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81936066 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81936443 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81937031 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81937294 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81937832 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 81938006 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81938365 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81938775 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81940700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81940740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81941887 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81942642 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 81943564 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81943855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81945307 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81947107 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 81947267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81947562 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81947941 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81948236 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 81948391 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81948614 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81948731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81948826 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 81948843 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81948878 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81948930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81948931 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81948976 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81949075 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81949152 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81949156 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 81950230 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 81950353 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81950647 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81950726 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81951144 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81951188 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81951200 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 81951383 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 81951497 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 81951557 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81951666 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81952002 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 3 81952015 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 3 81952035 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 81952174 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 81952190 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 81952194 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81952227 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81952279 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 81952329 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81952535 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81952721 A T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 81952737 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 81952809 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 81952895 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 81952925 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 81952937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81953130 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 81953337 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 81953359 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 81953522 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 81953859 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 81953918 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 81954037 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 81954050 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 81954051 G T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 81954111 C A N N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.416666666666667 0.583333333333333 0 17 7 5 7 0 3 81954149 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 81954244 C T N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.0714285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 11 17 1 9 4 3 81954374 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 81954391 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 81954402 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81954413 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81954415 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 81954481 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 81954525 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 81954526 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 81954741 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 81954925 C A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 81954951 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 81954984 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81955161 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81955359 C A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 81955367 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81955619 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 81955902 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 81955922 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 81955977 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81956166 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 81956645 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 81956665 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 81956681 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 81956696 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 81956823 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 81956906 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 3 81957484 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 81957774 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 81957881 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81958022 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 81958025 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 81958037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81958332 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81958341 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81958586 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81958800 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 81959050 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 81959062 C G N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 3 81959448 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 81959457 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 81959542 G T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 81959576 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 81959599 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 81959621 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81959646 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81959694 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 81959938 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81960952 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 81961346 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 81961347 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81961563 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 81961652 C A N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 3 81961674 C T N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 3 81961800 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 81961809 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 81961822 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 81961831 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 81961909 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 81962094 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 81962165 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 81962184 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 81962365 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 81962380 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 81962410 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 81962746 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 81963062 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 81963215 G C Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 81963729 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 81963893 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81963956 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81964082 T A Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 81964177 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81964587 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 81964683 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81964712 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 81964739 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 81964972 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 81965220 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 81965251 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 81965365 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 81965544 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81965612 A T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 81967836 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81968440 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 81968456 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 81969228 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 8 10 1 6 2 3 81970230 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81971747 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81971922 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 81972179 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81972459 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 81972755 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 81972757 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 81972797 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 81973172 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81973926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81975285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81975765 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81975795 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81977888 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 81978778 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81978918 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 81979803 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 81980003 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 81980388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81980419 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81980558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81981641 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81982038 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 81982064 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 81982088 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81982154 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 81982281 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81982295 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81982651 T A N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 81982853 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 81983146 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81983230 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81983378 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 81983951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81986746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81986767 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81986956 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81988174 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81988988 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 81989320 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 81989347 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81989352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81992546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81994560 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 81994861 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81994908 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 81994934 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 81996860 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81997284 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81997342 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 81997347 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 81997504 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 81997957 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 81998228 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81998255 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81998284 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 81998515 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81998647 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81998957 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 81999924 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 82001674 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 82001711 T G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 82002024 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82004230 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 82004243 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 82006404 G A N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 82007466 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 82007489 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 82007775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82008113 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 82009446 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82009519 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 82010148 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82012494 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 82012947 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 82015190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82021302 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 82021399 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 82021607 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82021934 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82022400 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82022819 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82023572 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 82025391 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82026166 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82028038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82028816 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82029159 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 82029222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82029839 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82030030 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 82030372 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82030774 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82031635 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82031894 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82032057 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82032089 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 82032777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82032943 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82033221 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82033391 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 82033840 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 82034021 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82034347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82034427 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82034571 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82039244 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82040274 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82041164 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82042002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82042026 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82042696 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 82042809 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82044739 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 82048432 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 82050185 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82051881 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 82052348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82052456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82052493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82052512 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 82052733 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82053545 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82054040 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82055750 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82056515 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 82056948 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82057726 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82059836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82061252 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 82061918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82063851 A G N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 82063883 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 82065233 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82065594 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82066632 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 82067040 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82068462 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82068487 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 82069056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82069629 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82070194 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 82070838 C A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 82071067 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 82072075 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 82073836 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82074640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82076694 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82078700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82081315 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82082033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82083360 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 82085297 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82095138 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 82095472 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82095520 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82095527 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82095535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82097921 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 82099191 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82099336 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82100893 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82101141 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82103723 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 82104662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82105020 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 82105292 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82105787 C A Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82106583 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82107009 T G Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82107474 G T Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 82108934 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 82108950 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 82110945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82111042 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82112596 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82112731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82112888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82113217 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 82114525 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82115035 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 82115094 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 82118794 T G Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 82119296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82119882 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 82121620 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82122859 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 82123184 C T N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 82125827 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82127181 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82127560 C A Y N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 3 82128056 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 82133517 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82134356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82134586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82135302 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82135946 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 82136057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82136142 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82136181 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 82136336 G A N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 3 82136637 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82136771 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 82136852 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 82136915 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 82137002 A G N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 82137004 T A N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 82137306 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 82137830 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82138450 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82138505 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 82139651 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 82139759 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 82139779 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 82139840 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82139882 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82139916 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82140066 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 82140128 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82140129 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82140186 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82140369 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82140383 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82140523 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82140583 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82141099 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82141325 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82141467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82141494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82141538 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82141914 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82142006 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82143069 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82143132 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82143603 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82143651 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82143852 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 82144858 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 82144879 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82146400 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82146522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82146957 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 82147317 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 82147620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82148154 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82149277 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82149889 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82149988 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 82150017 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82150252 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82150495 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 82150595 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82151194 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82151624 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 82151777 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 82151821 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 82151997 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82152445 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 82152452 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 82152670 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 82152952 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 82152972 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82152974 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82154175 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 82155087 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 82155207 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 82155219 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82155271 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82155377 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 82155481 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 82155523 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82155619 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82155683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82155708 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 82155858 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 82155916 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82156260 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 82156349 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 82156451 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 82156463 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 82156947 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 82156963 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 82157133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82157221 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 82157234 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 82157376 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 82157447 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 82157579 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 82157759 T G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 82157898 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 82157961 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82158042 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 82158579 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82158868 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 82158981 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 82160045 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82160867 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 82160974 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 82161116 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 82161135 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 82161286 A T N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 82161386 C T N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 3 82161486 C A N N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.545454545454545 0.272727272727273 0.181818181818182 15 7 6 3 2 3 82161494 C A N N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 10 10 4 2 4 3 82161576 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82162278 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82162318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82162784 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 82165119 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82165672 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82165745 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82165746 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82165933 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82165952 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 82165953 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82165999 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 82166022 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 82166246 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 82166358 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82166519 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82166525 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82166594 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82166686 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 82166700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82166774 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 82166796 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 82166820 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 82166821 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 82166837 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 82166844 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 82166892 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 82166945 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 82166952 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82167152 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 82167251 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 82167572 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 82167708 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 82167787 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 82167842 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82167856 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82167916 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 82167981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82167998 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 82168029 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82168030 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82168051 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82168240 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 82168288 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82168319 T A Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 82168352 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 82168530 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82168846 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 82168963 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 82169002 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 82169064 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 82169178 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82169192 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82169678 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82170516 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82172400 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 82173489 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 82174205 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 82174301 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 82174328 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 82174458 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82174505 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 82174542 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 82174567 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 82174698 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 82174729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82174746 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82174847 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82174936 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 82175009 C G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 82175011 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82175152 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 82175471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82176251 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82179186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82180730 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82181146 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82181222 T G Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 82183163 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82185934 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82186590 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82187015 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82187644 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82188025 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 82189027 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 82189152 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82189167 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82189505 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82189574 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 82189824 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82189969 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82192085 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82192539 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82192673 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82193733 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82196365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82196805 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82197067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82199573 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 82199784 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82199825 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82200006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82200635 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 82200827 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82201030 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 82201086 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 82201115 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 82201275 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 82201357 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 82201802 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 82201880 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 82201919 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82201927 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 82202089 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 82202108 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82202185 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 82202371 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82202486 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 82202519 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 82202900 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 82202930 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 82202933 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 82203516 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82203643 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 82203891 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 82203912 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 82203965 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82204100 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 82204186 A G N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 3 82204540 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82204638 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82204655 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 82204925 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82205047 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 82205736 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 82206087 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82207893 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 82208341 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82208660 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 82208671 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 82208938 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 82209034 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82209067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82209199 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82209239 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82209393 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82209460 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82209809 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82209871 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82210025 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82210052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82210364 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82210837 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82212364 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82212424 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82213767 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82214715 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82214995 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82215457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82215832 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82216239 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82218246 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 82220275 T A Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 82221157 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82221884 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82222427 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82222464 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82222601 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82222669 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 82223630 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82223987 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 82225904 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82225948 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82226005 T C Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 82226069 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82226119 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82226410 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 82226569 T A N N 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 3 82227370 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 82227450 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 82228597 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 82229153 G A Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 82229180 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 82229200 T G Y N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 3 82229237 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 3 82229352 T C N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 82229365 T C N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 82229541 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 82229671 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 82229798 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 82229903 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 3 82229909 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 3 82229925 A T N N 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 6 8 2 2 3 3 82229969 G C N N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 9 7 3 3 2 3 82230408 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 82230649 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82230765 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 82230878 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 82230884 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 82231054 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 82231440 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 82231510 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 82231559 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82231572 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 82231582 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 82231591 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 82231619 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82231742 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 82231805 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 82231857 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 82232170 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 82232245 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 82232257 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82232275 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82232320 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 82233059 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82233597 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82233853 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82234190 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 82234585 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 82234677 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 3 82234742 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82234905 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82235045 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82235057 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 82235327 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 82235672 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 82235673 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 82236681 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 82236831 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 82236952 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 82237372 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 82237583 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 82237912 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 82238189 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 82238207 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 82238597 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82238614 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82238727 G T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 82238737 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82238799 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82239131 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 82239415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82241354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82241952 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82242054 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82242190 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 82242825 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 82243482 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82243517 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82244624 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 82245079 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 82245586 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 82245587 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82247664 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82248782 C A N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 82249510 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82250331 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 82250702 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 82250939 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82250996 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 82251045 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82251111 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 82251223 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 82251390 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82251585 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 82251587 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 82252050 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 82252187 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 82252196 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 82252310 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 82252371 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 82252433 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82252450 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82252546 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 82252630 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82252649 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82252778 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82252779 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82252915 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82252932 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82252980 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82253076 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 82253105 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 82253155 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82253251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82253259 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82253270 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82253279 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82253281 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82253330 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82253336 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82253358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82253474 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82253483 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82253603 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 82253753 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82253855 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82253925 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82253953 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82253984 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82254022 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82254023 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82254062 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82254087 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 82254089 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82254223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82254268 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82254308 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82254338 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82254418 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 82254519 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 82254537 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 82254635 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82254668 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82254675 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 82254720 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82254758 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 82254770 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 82254807 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82254818 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82254841 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82254865 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 82254983 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 82255060 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 82255092 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 82255155 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 82255493 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 82256411 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 82256453 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 82257066 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 82257071 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 82257517 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 82257518 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 82257538 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 82257550 C A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 82257671 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 82257743 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 82257785 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82257841 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 82258653 T C N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 3 82258696 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 82258712 A C N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 82258803 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 82258865 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82258902 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 82258942 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 82259535 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 82259555 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82259589 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82259607 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82259680 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 82259858 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 82259909 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82260129 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82260401 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 82260545 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 82260577 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82260880 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82260925 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82261007 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 82261029 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 82261066 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 82261106 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 82261454 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 82261465 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 82261513 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82261944 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82261945 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82262033 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82262058 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 82262059 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82262133 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 82262134 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 82262437 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 82262710 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 82262747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82262777 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 82262784 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 82262898 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 82263074 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 82263078 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 82263089 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 82263184 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 82263194 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82263195 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82263227 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82263355 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 82263517 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 82263606 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 82263682 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 82263716 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82263974 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82263975 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82264020 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82264032 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 82264138 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 82264328 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 82264341 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 82265171 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82265398 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82265401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82265889 G T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 82268132 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82268250 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 82269164 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 82269195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82269205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82269444 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82269762 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 82270641 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 82271593 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 82271615 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 82271767 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 82271959 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 82272146 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 82272286 T G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 82272305 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 82272319 G C N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 82272500 G A N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 82272524 T C N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 3 82272620 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 82272655 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 82272691 G T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 82272705 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 82272741 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 82272836 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 82273026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82273097 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 82273191 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 82273501 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 82273578 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 82273651 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 82273658 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 82273672 G C N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.384615384615385 0.153846153846154 0.461538461538462 12 14 5 2 6 3 82273740 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 82273772 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 82273866 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 82273972 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 82274158 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 82274239 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 82274260 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 82274299 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 82274324 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 82274380 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 82274428 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 82274615 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 82274847 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82274860 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82275526 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 82276321 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 82276852 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 82276894 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 82276928 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 82276938 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 82277271 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 82277284 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 82277825 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82277912 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82277965 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 82277971 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 82278083 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 82278095 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 82278197 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 82278282 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 82278290 G T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 82278342 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 82279103 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 82279677 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 82280063 C A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 82280234 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 82280310 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 82280442 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 82280476 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 82280554 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 82280844 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 82280969 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 82281023 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 82281096 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 82281468 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 82281751 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 82282073 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 82282274 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82283965 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82284040 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82284043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82284058 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82284103 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82291975 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 82293069 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 82293085 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82293165 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82293345 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82293593 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 82293652 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 82293701 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 82293720 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 82293730 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82293769 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 82293775 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 82293780 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 82293803 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 82293883 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82293932 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82293950 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 82294034 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82294213 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 82294270 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 82294305 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 82294361 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82294824 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82295093 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 82295830 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82296398 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82296479 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82296838 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82297091 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82297121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82297160 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 82297400 T G Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 82297683 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 82297822 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 82298002 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 82298041 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82298138 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82298225 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82298424 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 82298479 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 82298482 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 82298519 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 82298542 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82298556 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82298672 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.222222222222222 27 9 13 1 4 3 82299074 C G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 82299391 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 82299499 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 82299564 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 82299625 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 82299687 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82299819 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82299831 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82299926 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 82299985 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82299992 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 82300035 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82300090 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82300212 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82300215 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82300226 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 82300331 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82300341 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82300444 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82300744 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82300773 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82300784 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82301042 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 82301062 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 82301132 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 82301204 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82301223 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82301243 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82301327 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 82301329 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 82301344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82301425 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 82301426 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 82301441 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82301456 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82301477 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82301539 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82301570 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82301613 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82301746 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 82301795 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82301841 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82301902 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82301909 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82301951 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82301980 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82302004 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 82302013 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82302044 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82302066 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82302088 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 82302264 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 82302348 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 82302360 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 82302362 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 82302452 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82302463 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82302495 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 82302903 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82303069 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82303554 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 82303812 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 82304441 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82304612 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82304947 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 82305615 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82305710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82306384 G A N Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 3 82306442 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 82307557 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 82307589 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82307611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82307894 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82307913 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82308014 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82308031 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82308336 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82308383 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 82308411 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82308423 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82308526 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82308665 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82308734 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82308785 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82308889 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82309277 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.333333333333333 0.111111111111111 0.555555555555556 14 22 6 2 10 3 82309333 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 82310397 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82310475 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82311137 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82311188 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 82311265 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 82311296 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82313685 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82313868 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82314049 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 82314101 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 82314669 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82314780 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 82316184 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 82316711 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82317318 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 82317369 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 82317489 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 82317652 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 82317669 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 82317986 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 82318115 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82318125 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82318209 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 82318246 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 82318357 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 82318522 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 82318583 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 82318616 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 82318647 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 82318765 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 82318892 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 82318934 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 82318943 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 82318961 T A Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 82319082 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 82319197 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 82319330 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 82319343 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82319436 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 82319462 A G Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 82319526 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 82319600 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 82320264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82320500 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 82320559 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 82320789 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82320836 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82320896 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82320959 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82321069 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82321094 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 82321398 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82321611 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82321922 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82321927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82322039 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82322368 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 82322423 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82322554 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 82322572 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 82322583 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 82322629 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 82322689 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 82322703 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 82322729 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 82322750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82322765 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 82322792 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 82322816 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 82322883 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 82322934 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82322938 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 82322962 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 82323003 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 82323019 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 82323128 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 82323171 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 82323221 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 82323262 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 82323362 A C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.235294117647059 0.117647058823529 0.647058823529412 10 24 4 2 11 3 82323404 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 82323416 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 10 22 4 2 10 3 82323423 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 10 22 4 2 10 3 82323993 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.25 0.0625 0.6875 9 23 4 1 11 3 82324061 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.2 0.133333333333333 0.666666666666667 8 22 3 2 10 3 82324147 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 3 82324199 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 82324430 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 82324504 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 82324557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82324573 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 82324930 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 82324962 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82324970 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 82325052 C G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 3 82325099 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82325133 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.625 0.125 0.25 22 10 10 2 4 3 82325454 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 82325660 A G N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 82325785 G A Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 82325840 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 82325882 T C Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 18 14 4 10 2 3 82325976 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 82326294 T C Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 82326301 C T Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 82326661 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 82326907 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 3 82327119 G T Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 82327136 C T Y Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 82327254 A C Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 82327431 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 3 82327682 A T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 3 82327778 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 3 82328195 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82328277 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 82328342 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 3 82328378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82328479 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 82328489 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 82328537 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82328573 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 82328637 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 82328651 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82328788 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 3 82328923 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 3 82329072 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 82329607 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82329642 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 82329836 A T N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.625 0.125 0.25 22 10 10 2 4 3 82329933 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 3 82329996 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 3 82330017 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.235294117647059 0.117647058823529 0.647058823529412 10 24 4 2 11 3 82330042 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 3 82330116 C A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 82330133 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 3 82330146 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 3 82330204 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82330341 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82330449 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 3 82330523 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 3 82330544 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.222222222222222 0.0555555555555556 0.722222222222222 9 27 4 1 13 3 82330714 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 82330997 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 82331317 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.75 0.0625 0.1875 25 7 12 1 3 3 82331343 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 82331394 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 82331413 A C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 3 82331443 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 3 82331494 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.277777777777778 25 11 12 1 5 3 82331643 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 3 82331664 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 3 82331699 C A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 3 82331836 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82331948 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 82332015 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 3 82332269 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 3 82332303 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 3 82332349 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 3 82332366 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82332404 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.611111111111111 0.111111111111111 0.277777777777778 24 12 11 2 5 3 82332469 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 3 82332484 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 3 82332609 A C Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 82332644 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 82332645 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 82332661 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 3 82332767 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 82332770 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 82332781 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 82332788 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82332814 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 82332823 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 82332928 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 82332943 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 82333047 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 3 82333107 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 82333136 T G N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 3 82333196 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 82333289 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 10 22 4 2 10 3 82333345 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 3 82333364 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 82335403 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 82335413 G T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 82335416 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 82335466 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 82335547 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82335591 G T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.176470588235294 27 7 13 1 3 3 82335594 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 82335626 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.333333333333333 0.0666666666666667 0.6 11 19 5 1 9 3 82335656 A T N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 82335685 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 82335791 T A N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 3 82335841 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 82335908 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 82335934 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 82335945 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 82336052 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 3 82336206 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82336218 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 82336230 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 82336294 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82336481 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 82336509 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 82336536 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 82336608 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82336671 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 82336910 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82336937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82336971 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 82337395 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 82337774 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82337989 A G N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.428571428571429 0.0714285714285714 0.5 13 15 6 1 7 3 82338506 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 82338565 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 82338750 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 82338766 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 82338782 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 82339112 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 82339126 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 82339188 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82339328 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82339346 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82339373 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82339394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82339399 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82339454 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82339940 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82340088 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 82340398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82340581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82340777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82340851 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 82340869 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 82341242 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82341349 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 82342180 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82342948 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 82343323 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 82343543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82343964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82344000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82344194 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82345482 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 82346919 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 82348346 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82348378 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82348592 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82349093 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 82349398 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 82349444 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82349524 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 82349619 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 82349621 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82349652 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82349713 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 82349753 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82349870 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 82349895 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 82350213 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82350233 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82350358 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82350359 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82350689 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82350848 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82350900 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82350972 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82351167 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82351938 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82353090 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82354091 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 82355212 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 82355925 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 82357130 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82357414 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82358486 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82359090 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 82359310 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 82359328 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 82359545 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82360994 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 82361907 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 82361979 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 82362126 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 82362184 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 82362279 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82362306 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82362621 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82362691 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 82362716 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82362752 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82362788 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 82362796 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 82362924 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 82363068 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 82363093 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 82363147 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 82363167 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 82363435 A C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 82363545 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82363611 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 82363687 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 82363695 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 82364127 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 82364142 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 82364315 A G N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 7 13 3 1 6 3 82364455 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 82364687 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 82364693 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 82364702 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 82364704 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 82364983 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82365052 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 82365821 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82365822 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82370452 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 82370601 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 82370781 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 82370793 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 82370966 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82372711 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82373299 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 82374517 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82377607 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82377803 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82378398 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 82378413 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 82380758 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82381491 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82382187 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82382773 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 82382797 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 82382810 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 82382820 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 82384084 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 82384458 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 82384875 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82387151 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 82387236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82388586 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82389167 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82391710 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.0555555555555556 0.833333333333333 0.111111111111111 17 19 1 15 2 3 82391787 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 3 82392424 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82392472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82398684 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82399479 C T Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 82399620 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 82400598 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 82400702 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 82401924 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82403830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82405132 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 82405833 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82406112 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82406172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82407609 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 82407628 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 82407652 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82407713 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 82407723 A T Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 82407741 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82407787 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 82407795 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 82408133 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 82409019 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 82409101 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 82409308 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 82409346 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 82409349 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 82409455 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 82409556 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 82410135 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 82410197 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 82410207 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 82411540 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 82413073 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82421427 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82421544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82421732 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 82422988 C A N N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.25 17 7 8 1 3 3 82423275 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 82423522 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 82423960 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 82424016 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82427445 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 82428134 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82428231 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82429063 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82432045 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82435144 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 82436124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82436174 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82436201 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82436587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82436725 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82436959 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82437005 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82437379 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82437777 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82437903 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82437922 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 82437937 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 82438151 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 82438252 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82438797 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82438964 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 82439021 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 82439025 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 82439036 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 82439047 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 82439081 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 82439103 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 82439117 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 82439118 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 82439176 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 82439201 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 82439202 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 82439230 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 82439378 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 82439384 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 82439496 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 82439526 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82439631 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82440556 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 82441109 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 82441126 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 82441211 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 82441432 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82441683 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 82441989 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82442160 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 82442390 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82442452 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 82442522 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 82442680 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 82442857 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82442964 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 82443077 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82443184 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 82443255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82443287 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82443694 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82443986 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 82444013 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82444044 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82444106 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 82444133 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 82444496 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82444655 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 82444858 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82445203 T A Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 82445515 T G N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 82445984 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 82446056 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82446117 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 82446625 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 82446705 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82447007 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 82447231 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82447446 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82447547 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 82448203 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82448466 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 82448616 T G N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 82448741 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 82448746 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82448890 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82449012 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82449192 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82449198 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82449260 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 82449451 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82449455 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82449512 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82449598 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82449812 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82450116 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 82450169 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 82450179 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 82450297 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 82450321 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 82450347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82450698 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 82450852 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 82451091 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 82451103 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 82451120 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82451287 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82451299 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82451444 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 82451543 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82451605 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82451788 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82451820 A G Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 82453723 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 82453725 T A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 82453837 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82453862 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82453868 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82453873 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 82453881 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 82453958 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82454014 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82454227 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 82454310 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 82454371 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82454445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82454570 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 82454701 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82454730 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 82454846 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82454848 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82454930 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82454949 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82454977 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82454986 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82455055 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82455188 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82455518 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82455737 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82455827 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82455845 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 82455904 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 82455928 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 82455948 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82456069 A T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 82456512 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 82456563 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 82456662 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82456760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82456920 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82457068 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 82457385 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82457445 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82457986 A T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 82458388 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 82458984 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82458995 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82459023 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 82459048 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 82459188 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 82459241 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 82459299 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 82459300 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 82459514 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 82459650 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82460046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82460338 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 82460435 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82460480 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82460600 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 82460638 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 82460700 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 82460711 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 82460712 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 82460783 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 82460830 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 82461068 T G N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 82461194 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 82461215 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 82461225 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 82461255 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 82461298 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 82461326 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 82461417 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 82461513 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 82461983 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 82462021 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 82462030 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 82462074 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 82462091 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 82462170 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 82462207 T G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 82462359 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 82462420 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 82462494 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 82462636 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 3 82462676 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 82462727 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 82462797 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 82462810 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 82462914 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 82462961 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 82463044 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 82463289 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 82463368 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 82464169 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 82464360 G A N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 3 82464406 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 82464509 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 82464627 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82464695 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82464712 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82464717 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82464785 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 82465087 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82465107 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82465182 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 82465371 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 82465373 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 82465461 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 82465466 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82465559 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 82465587 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 82465610 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 82465611 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 82465645 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 82465963 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 82466143 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 82466264 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 82466275 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 82466283 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82466465 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 82466674 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82466873 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 82466961 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82467326 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 82467554 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 82467571 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 82467607 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82467627 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82467701 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 82468057 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82468149 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 82468477 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82468541 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82468798 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 82468819 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82468840 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 82468845 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82469127 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 82469148 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82469156 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82469248 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 82469258 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 82469303 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 82469326 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82469339 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82469435 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82469469 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82469513 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 82469606 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82469798 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 82469819 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 82469824 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 82470270 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82470696 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 82470716 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 82470724 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82470866 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 82470867 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 82471751 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82471942 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 82472214 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 82472324 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 82472413 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 82473273 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 82473987 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 82475478 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 82475777 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 82476136 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82478130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82478786 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82478838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82479802 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 82480322 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82480478 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 82481514 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82483524 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82486024 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82486323 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 82486637 T C N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 3 82486902 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 82486927 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 82487601 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 82487619 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82487685 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 82488086 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82488122 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82488144 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82488311 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82488313 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82488504 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 82488551 G A N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.384615384615385 0.307692307692308 0.307692307692308 14 12 5 4 4 3 82488624 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 82488844 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 82489166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82489383 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82489426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82489490 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 82489559 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82489693 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82489726 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 82489740 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 82489744 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 82489855 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82490304 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 82490360 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 82490378 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 82490441 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82490470 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82490659 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 82490677 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82490773 T A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 82490969 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 82491027 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 82491055 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 82491176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82491203 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 82491208 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82491363 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 82491364 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 82491398 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 82491437 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82491438 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82491706 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 82492118 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 82492147 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 82492751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82492759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82493062 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 82493100 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 82493168 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82493216 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 82493218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82493258 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82493292 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 82493383 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 82493397 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 82493467 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 82493488 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 82493523 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 82493524 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82493551 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 82493584 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82493647 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 82493799 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82493917 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 82493969 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 82494070 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 82494154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82494253 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 82494339 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 82494347 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 82494570 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82494958 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 82495026 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82495088 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82495169 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82495215 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82495236 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82495451 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 82495492 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 10 14 2 6 4 3 82495939 T A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 82495963 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 82496129 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82496298 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 82496306 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 82496319 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82496346 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82496406 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82496475 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 82496494 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 82496518 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 3 82496628 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 82496807 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 82496905 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 82497329 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82497386 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82497407 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 82497491 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 82497510 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 82497654 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82497683 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 82497698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82498003 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 82498192 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82498244 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 82498271 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 82498283 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 82498362 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 82498375 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82498441 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82498765 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 82498889 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 82498951 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82499059 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82499234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82499267 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 82499313 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 82499342 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82499358 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82499382 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 82499404 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 82499421 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 82499477 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 82499535 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 82499541 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 82499558 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 82499773 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 82499782 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82499911 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82499953 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82499989 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 82500031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82500083 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 82500127 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82500239 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 82500423 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82500513 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82500581 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82500617 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82500622 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82500638 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82500704 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 82500754 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 82500909 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 82501521 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82501543 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82501738 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 82501915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82502247 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 82503767 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 82504387 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82504541 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 82505782 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82507825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82508105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82508779 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 82508944 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82510619 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82510620 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82511232 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 82515615 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82515755 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 82515803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82515921 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82518518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82519295 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82519382 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 82519654 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 82519659 T G Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 82519697 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 82519717 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 82519750 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 82519786 A G N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 82519857 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 82519907 A G N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 3 82520093 T G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 82520229 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 82520379 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82520391 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 82520405 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 82520414 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 82520498 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82520542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82520971 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82521612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82521837 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 82521920 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 82522045 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 82522606 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82523226 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 82523493 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82523776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82523945 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82524827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82525079 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82525137 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82525212 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 82525244 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82525740 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82525968 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82526283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82526361 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 82526457 A T N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 82526615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82526711 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82526785 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82527121 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 82527224 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82527584 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82527672 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82528866 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82530057 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 82530067 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 82530131 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82530262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82530283 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82530446 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82530692 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 82530740 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 82530772 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 82530834 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 82530865 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 82530935 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 82531029 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 82531229 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 82531262 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 82531458 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 82531658 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 82531904 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82532661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82534953 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82535380 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82535820 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82536137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82536332 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 82536352 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82536583 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82536777 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 82536870 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82536979 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 82537124 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82537331 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 82537483 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 82537526 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82537628 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 82537849 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 82538136 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 82538181 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82538907 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 82539199 T A Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 82539321 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 82539482 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 82539632 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82539876 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 82540078 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 82540107 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 82540339 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 82541006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82541434 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 82542752 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82542779 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 82543164 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 82543436 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82543593 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 82544025 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 82545456 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82545884 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 82546173 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82547794 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 82548112 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 82548114 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82548263 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82548388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82548421 T C Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 82548516 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 82548530 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82548540 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 82548544 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 82548564 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 82548587 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 82548593 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 82548645 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 82548742 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 82549006 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 82549144 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 82549149 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 82549208 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 82549315 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 82549425 C A Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 82549482 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 82549655 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82549659 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82549674 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 82549753 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 82549810 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 82549820 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82550008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82550475 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82550637 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82550693 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 82550713 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 82550738 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 82550742 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 82551070 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 82551121 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 82551212 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82551229 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 82551275 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82551278 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82551333 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 82551363 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 82551371 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 82551392 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 82551594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82551630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82551729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82551738 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 82551769 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 82551833 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 82552094 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 82552099 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82552128 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82552232 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82552241 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82552312 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 82552429 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 82552487 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 82552623 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 82552624 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 82552639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82552651 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 82552663 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 82552691 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 82552692 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 82552756 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 82552843 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 82552983 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82553021 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82553076 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82553096 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82553135 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82553223 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 82553332 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 82553376 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82553488 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 82553504 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 82553652 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 82553720 G T N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.230769230769231 0.538461538461538 0.230769230769231 13 13 3 7 3 3 82553873 G C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 82553961 C A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 82554097 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 82554123 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 82554309 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 82554375 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 82554389 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 82554898 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82554948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82554951 T A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 82554986 C G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 82555205 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 82555336 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 82555351 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 82555402 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 82555488 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 82555499 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 82555828 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 82555885 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 82555975 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 82556152 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 82556163 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 82556256 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 82556284 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 82556336 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 82556383 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 82556487 G C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 82556687 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82556710 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 82556780 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 82556788 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 82556837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82556886 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 82556915 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 82556916 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 82556936 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82556944 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 82557194 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 82557234 A C N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 82557238 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 82557287 A G N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 82557477 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 82557507 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 82557546 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 82557686 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 82557699 A T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 82557752 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 82557813 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 82557871 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 82557930 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 82557936 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 82558078 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82558160 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 82558178 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 82558179 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 82558624 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82558642 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 82558643 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 82558709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82558937 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 82559079 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82559159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82559199 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 82559217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82559250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82559281 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 82559282 A C Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 82559314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82559448 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82559603 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82559637 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 82559646 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 82559685 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82559699 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82559969 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82559976 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 82560177 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82560560 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 82562822 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82563609 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82563713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82564080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82564153 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82564413 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82565497 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82565739 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 82565892 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 82565897 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 82566351 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82566654 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82567263 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82570327 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 82571061 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82571082 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 82571452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82572857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82573153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82574181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82574247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82574307 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82574422 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 82575039 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 82575118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82575553 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82575563 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 82575817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82576123 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 82576435 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 82576513 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 82576904 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 82577207 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 82577276 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 82578087 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82578280 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 82578352 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82578486 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 82579187 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 82579197 C G Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 82579469 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 82580242 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 82580338 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82580382 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82580474 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82580521 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82580577 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82580635 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82580688 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82580791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82581296 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 3 82581382 A C N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 3 82581525 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 82581599 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 82581641 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 82581804 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 82581819 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 82581820 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 82581871 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 82581888 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 82581923 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 82581981 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 82582119 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 82582137 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 82582162 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 82582174 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 82582188 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 82582218 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82582230 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82582243 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82582256 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82582271 G C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 82582278 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 82582367 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 82582379 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 82582407 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 82582410 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 82582547 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82582570 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82582603 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 82582607 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 82582809 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82583051 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 82583161 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82583176 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82583204 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82583205 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 82583231 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82583235 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82583316 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82585342 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82585353 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82585363 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82585476 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 82585498 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 82585608 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82586748 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82586803 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82586829 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82586941 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 82587027 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 82587048 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 82587066 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 82587092 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 82587098 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 82587167 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 82587349 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 82587372 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 82587403 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 82587518 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82587529 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 82587585 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82587650 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 82587662 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 82587961 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82587979 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 82587983 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 82588309 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 82588780 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82588826 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82589058 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82589674 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82589801 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82589972 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82590264 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 82590430 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 82590709 C T N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 82590734 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 82591167 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 82591239 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 82591377 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 82591471 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 82591625 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 82591641 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82591649 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 82591742 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82591786 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82591806 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 82591982 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 82592140 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 82592152 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 82592168 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 82592176 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 82592187 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 82592310 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82592361 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82592820 G T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 82592973 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 82592978 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 82593052 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 82593061 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 82593088 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 82593137 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 82593219 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 82593250 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 82593264 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 82593282 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 82594143 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82596565 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 82597090 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 82597243 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 82597485 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 82597499 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 82597550 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 82597632 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 82597789 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 82597807 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82597849 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 82597888 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 82597993 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 82598191 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 82598202 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 82598362 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 82598623 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 82598667 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 82598991 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 82599081 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 82599111 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 82599421 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 82599429 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 82599476 G C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 82599483 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 82599492 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 82599551 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 82599645 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 82599650 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82599715 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 82599912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82599978 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 82600171 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 82600174 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 82600190 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 82600411 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 82600429 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 82600453 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 82600468 T G N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 82600501 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 82600633 C A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 82600677 T A N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 3 82600784 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 82600803 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 82600807 T G N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 82600864 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 82600885 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 82601038 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 82601051 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82601061 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82601074 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 82601152 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 82601181 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 82601264 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 82601290 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 82601544 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 82601573 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 82601698 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 82601771 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 82601904 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 82601913 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 82602052 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 82602069 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 82602115 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 82602140 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 82602182 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 82602192 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 82602218 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 82602245 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 82602329 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 82602340 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 82602343 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 82602409 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 82602423 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 82602437 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 82602629 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 82602659 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 82602705 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 82603027 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 82603455 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82603557 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82603784 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 82603894 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 82605232 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 82605245 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 82605304 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 82605322 C A N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 18 10 8 2 4 3 82605344 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 82605470 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 82605738 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 82606297 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 82607844 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 82607862 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 82608031 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 82609144 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 82609244 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 82609490 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 82609583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82609661 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 82610763 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82610770 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 82610776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82610879 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82610894 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 82610986 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 82611117 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82611564 C T N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 3 82611612 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 82611802 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 82611931 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 82611989 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 82612257 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 82612300 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 82612658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82613068 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 82613247 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82613327 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 82613481 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 82613559 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 82613594 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 82613798 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 82613952 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 82614146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82614250 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 82614471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82614646 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 82614684 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 82614700 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 82614769 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 82614896 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 82615012 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 82615062 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 82615386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82615402 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 82615773 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82615938 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82616170 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 82616171 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 82616181 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 82616344 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82616381 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 82617161 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82617912 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 82617964 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82619352 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82619547 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82622318 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 82622795 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 82622927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82623162 C G Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 82623533 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 82623735 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82623820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82624096 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 82624219 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 82624301 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82624380 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 82624475 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 82624494 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 82624531 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 82624954 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 82625201 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82625222 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 82625263 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82625658 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 82625683 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 82625722 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 82625812 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 82625842 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 82626053 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 82626081 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 82626092 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82626100 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 82626111 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 82626131 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 82626161 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 82626196 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 82626244 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 82626566 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82626724 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 82626741 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 82626810 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 82627032 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 82627063 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 82627205 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 82627343 G T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 82627574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82627597 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 82629913 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82630810 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 82630942 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 82633341 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82635308 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 82636759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82637060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82637068 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82639018 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 82643780 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82644831 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82645586 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82647755 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82648648 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82648891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82650902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82651355 G A Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 82651905 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 82652226 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82657467 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82657639 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82657870 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 82658465 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 82660455 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 82664767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82669680 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82670349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82670514 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82671963 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82673266 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 82675424 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 82675740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82676744 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82676844 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82679989 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 82681016 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 82681654 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 82682463 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82683297 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 82683915 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82684466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82685188 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 82686566 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82687571 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82689164 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 82689196 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82691099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82699489 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82699750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82701963 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 82702962 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82706125 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 82708131 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82708870 C T Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 3 82710000 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82710056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82710186 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82711686 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82712594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82714343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82715498 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82716549 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82716799 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 82716934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82718689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82718861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82719178 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 82719639 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 82720228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82720902 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 82721241 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82721242 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82722745 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82723622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82723855 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82725367 C T Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 82726798 A T Y N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 82728344 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82728527 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 82728531 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82728749 T G Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 82730060 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 82730359 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82730406 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82730469 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82730637 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 82730672 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82731697 G T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 82731914 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82732293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82733057 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 82733352 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82734316 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82734800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82735282 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 82736049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82737962 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82738539 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82740369 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82741567 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82741770 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82741851 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82743835 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82744991 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82746140 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82746437 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82748111 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82748739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82749652 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82749661 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82749681 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82749801 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82749852 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82749963 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82749993 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82750045 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82750629 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82750703 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82752477 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82752697 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 82752764 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 82753228 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82754137 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82754402 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82754502 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82754503 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 82754571 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82754594 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82758857 A G Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 82759448 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82760852 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82763918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82764383 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82764529 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82764624 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82764789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82764870 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 82764892 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82764926 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 82764929 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82765048 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82765259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82765260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82765707 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82766009 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82766060 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82766064 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82766107 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 82766399 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 82766915 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82767687 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 82767869 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 82767877 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 82767946 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 82768120 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82768202 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82768307 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82768477 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82768496 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 82768558 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82768824 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 82768869 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 82769017 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 82769029 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 82769245 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82769261 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82769274 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82769364 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82769805 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82769848 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 82769897 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 82770054 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 82770187 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 82770385 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 82770429 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 82770487 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82770645 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 82770814 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 82770857 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 82770926 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 82771011 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82771013 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82771160 T A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 3 82771190 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 82771262 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82771263 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 82771280 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 82771327 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 82771339 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 82771380 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82771413 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 82771447 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82771468 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82771477 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82771503 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82771750 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82771882 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82772011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82772538 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 82773070 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82773084 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82773088 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82773145 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 82773412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82773779 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82773805 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 82774152 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82774457 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82774464 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82774554 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82774643 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 82775058 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82775306 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82776390 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82783955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82784176 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82784534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82784745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82785153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82785332 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 82785346 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 82785348 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 82785477 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 82785479 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 82785510 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 82785593 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 82785610 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 82785705 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 82785709 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 82785932 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82785970 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82785980 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82786063 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 82786180 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 82786414 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 82786607 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 82786618 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82787183 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82787493 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82787556 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82787699 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 82789943 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82790539 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82790784 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82790788 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82790897 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 82790960 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82791077 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82791132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82791159 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82791186 T G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 82791888 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82791959 T G Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 82792250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82792813 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82793926 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82794361 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82794381 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82794411 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82794533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82794825 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82794984 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82795104 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 82795201 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 82795412 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82795474 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82795550 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82795623 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 82795688 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82795765 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 82796138 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82796301 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82796322 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 82796410 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82797328 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 82797759 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 82797778 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 82797811 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82798198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82799123 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 82799146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82799246 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82799398 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82799399 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82799435 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 82799436 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 82799588 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 82799640 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 82799766 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 82799835 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 82800003 T G N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0 0.75 0.25 12 20 0 12 4 3 82800127 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 82800236 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 82800393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82800500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82800581 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82800590 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 82800621 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 82801292 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 82801336 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 82801341 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 82801360 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 82801362 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 82801442 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 82801548 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 82801597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82801636 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 82801742 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82801987 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 82802097 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82802127 T C N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 3 82802188 C T N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 3 82802218 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 82802280 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82802328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82802359 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82802436 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 82802494 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 82802616 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82802700 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82802772 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82802791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82802792 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82802828 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82802902 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82802908 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82803011 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82803036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82803080 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82803262 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82803276 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 82803282 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 82803321 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82803373 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 82803437 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 82803519 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82803568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82803782 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 82804018 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 82804031 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 82804152 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 82804173 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82804261 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82804310 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 82804383 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 82804384 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 82804410 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82804414 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 82804442 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 82804461 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 82804484 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82804507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82804939 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82805100 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82805116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82805188 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 82805374 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 82805504 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82805568 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 82805821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82805906 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 82806067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82806085 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 82806264 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 82806283 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82806319 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 82806558 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 82806601 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 82806640 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 82806655 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82806703 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82806924 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 82807299 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82807740 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82807747 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82807817 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 82808116 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 82808597 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 82808679 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 82808683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82808733 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 82808813 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 82809218 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82809288 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82809413 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82809453 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82809748 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 82809846 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82809940 T A Y N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 82810045 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 82810086 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82810174 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 82810329 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82810452 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 82810540 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 82810609 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82810880 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 82810982 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 82811041 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 82811052 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 82811089 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 82811099 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 82811159 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 82811299 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 82811492 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 82811652 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 82811872 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82812181 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 82812223 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 82812322 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82812712 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82812940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82813520 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 82814352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82814517 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 82814564 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82814943 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82815515 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 82815544 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 82815568 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 82815614 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82815720 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 82815894 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 82815895 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 82816054 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82816088 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82816935 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82816994 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82817044 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82817049 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82817229 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82817407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82817554 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82817696 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82818304 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82819190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82819199 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 82819751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82820222 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82821458 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 82821828 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82822899 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82822927 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82822936 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 82822962 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 82823027 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 82824679 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 82824813 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82828718 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 82828719 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 82829594 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82830720 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82830794 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 82832111 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82832494 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 82833021 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82833523 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82834504 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 82835324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82837771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82837782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82838475 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 82838768 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 82838919 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82838954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82839535 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 82839797 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82840322 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82840370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82840919 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 82841130 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 82841425 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82842108 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82842510 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82842535 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82842696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82842744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82842783 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82843406 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82843767 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 82843846 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 82843930 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 16 20 0 16 2 3 82843941 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82843949 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 82843989 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 82844121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82844203 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 82844229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82844282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82844340 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 82844479 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82844519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82844762 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82844766 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82844795 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82844942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82845215 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82845248 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82845273 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82845351 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82845415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82845456 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 82845457 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 82845574 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82845605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82845692 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82845725 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82845733 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82845792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82845812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82845831 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82845836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82845888 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82845952 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82845953 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82846003 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 82846008 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 82846101 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 82846484 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 82847721 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 82847723 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82847733 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 82847748 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82848099 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 82848699 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 82849197 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82849434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82850584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82852808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82854621 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82856135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82856378 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 82856525 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82856559 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82856833 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82856846 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82856851 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 82857239 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 82857603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82857894 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82858394 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 82858461 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82858787 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 82860355 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 82860546 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82861411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82862246 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82862417 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82862917 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 82862932 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 82863293 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82863301 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82863320 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82863370 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82863489 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82864249 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 82866200 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82866783 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 82867505 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82868656 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 82868877 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 82869606 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82870130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82870212 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82870704 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82871913 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82875628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82875645 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82876002 A G Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 82876026 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 82876667 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82876747 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82877204 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82877211 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82877515 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82878109 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82878442 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 82878461 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82878572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82879239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82879568 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82879772 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82879791 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82879848 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 82879882 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82880031 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 82880037 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 82880043 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 82880078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82881046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82881848 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 82881883 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82882370 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82882439 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0555555555555556 0.722222222222222 0.222222222222222 15 21 1 13 4 3 82882532 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82882614 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 82882630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82882639 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 82882750 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82882893 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82882897 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 82883082 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82883429 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 82883917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82883928 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 82883936 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 82883961 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82884112 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 82884232 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 82884308 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 82884342 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 82884367 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 82884684 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 82886879 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 82887126 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82887732 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 82887952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82888396 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 82888849 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82888920 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 82889245 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 82889368 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82889596 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82890183 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 82890636 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82890692 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82890907 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 82890921 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 82891059 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 82891234 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 82891295 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 82891443 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82891470 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82891978 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 82892103 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 82892113 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 82892276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82892357 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 82892403 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 82892404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82892515 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 82892693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82892875 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 82892948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82893203 G T Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 82893252 G A Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 82893257 A G Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 3 82893674 A C Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 82893755 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 82893837 A G Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 82895437 G C N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 82895534 C T Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 82895669 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 82895859 T A N N 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 6 6 1 4 1 3 82895941 G A Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 82896017 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 82897471 T A Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 82897540 T A Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 82897586 C G Y N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 82897758 T C Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 82898014 A T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 82898069 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82898133 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 82898155 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 82898280 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 82898520 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 82898678 G A N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 3 82898698 G T N N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 3 82898790 A T N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 3 82898825 C A N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 3 82898913 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 82898923 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 82899102 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82899129 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82899154 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 82899176 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 82899200 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 82899210 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 82899389 C A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 82899452 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 82899578 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 82899842 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82899957 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 82900173 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 82900363 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 82900385 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 82900464 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 82900724 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82900896 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 82900908 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 82900928 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 82900938 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 82900976 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 82900985 C G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 82901022 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 82901223 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 82901443 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 82901448 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 82901603 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 82901609 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 82902116 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 82902259 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 82902616 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82902673 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 82902916 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 82903374 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 82903632 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 82903752 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82904183 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 82904245 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 82904248 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 82904398 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82904877 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 82905003 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 82905035 G T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 82905036 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 82909162 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82910281 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82910396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82910415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82913735 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82914805 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 82914819 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82914914 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82915534 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82915672 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82916203 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82917793 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82922685 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 82923798 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82924283 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82925206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82926277 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 82926278 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 82926291 C A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 82926523 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82927250 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 82927327 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82927365 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82927618 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 82927703 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 82927709 A G Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 82928475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82929841 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82931147 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82931748 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 82934176 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82934441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82934705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82935623 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 82935624 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 82935703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82937088 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82937640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82938319 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 82939144 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82940135 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82942411 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82942751 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 82943213 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 82944927 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82944975 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82945133 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 82945511 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 82945577 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82945883 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 82945957 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82945986 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 82946074 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 82946137 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82946354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82946752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82946953 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82947323 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 82947540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82947604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82947622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82947649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82947794 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 82947858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82947890 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82947934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82948032 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 82948092 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 82948196 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 82948279 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 82948378 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82948385 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82948401 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 82948441 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 82948448 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82948580 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82948830 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82948928 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82948982 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82949152 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82949411 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 82949657 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82949692 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82950038 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82950168 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82950293 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82950481 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82950496 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82950510 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82950542 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82950684 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82950823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82950943 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82951000 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 82951683 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 82952020 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 82952053 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82952342 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 82952463 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 82952497 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 82952546 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 82952561 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 82952583 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 82952616 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82952645 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 82952684 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 82952721 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 82953096 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 82953105 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82953157 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 82953171 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 82953198 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 82953283 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 82953423 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82953838 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 82954118 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 82954134 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 82954197 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 82954707 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82955598 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 82955778 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 82955957 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 82956060 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82956077 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82956190 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82956243 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82956548 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 82956576 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 82956623 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 82957265 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 82957418 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 82957602 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82957697 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 82961237 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82961570 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 82962957 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82963299 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 82963368 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 82963505 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82963602 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82963622 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82963822 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82963946 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82964052 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82964217 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82964347 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 82964521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82964538 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82964586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82964881 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 82965171 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 82965754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82966126 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 82966127 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 82966629 A G Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 82967160 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 82971090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82972220 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 82972281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82972738 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 82972894 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 82972991 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 82973225 T C Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 82973247 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 82973307 G C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 82973463 G A Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 82973531 C G Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 82973550 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 82973574 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82975432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82975857 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82977696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82980347 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82980839 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82981324 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82983191 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82983347 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 82983376 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82983379 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82983421 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 82983435 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 82983728 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82983729 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82983770 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82984101 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82984313 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82984662 G C Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 82984772 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 82985112 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 82985281 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 82985300 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 82985364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82985388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82985401 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82985659 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 82986072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82986210 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82986473 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82986724 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 82986787 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82986820 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82987191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82987253 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 82987329 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82987376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82987412 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 82987428 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 82987509 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 82987537 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 82987745 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 82987816 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 82987859 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82987918 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 82988129 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 82988278 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 82988670 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 82988680 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 82988864 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 82988866 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 82988892 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82988905 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82988925 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82988982 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82988984 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 82989360 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 82989444 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 82989477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82989572 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82989764 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 82990816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82990873 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82991566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82991814 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 82991875 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 82991915 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 82991951 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 82991982 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82992269 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 82992705 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82992990 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82995353 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 82995544 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82996961 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 82997568 G A Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 82997934 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 82998624 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 82999686 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83000617 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 83000628 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 83001373 A T Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 83001553 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83001568 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83001806 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83002023 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 83002108 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 83002287 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83002953 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 83003515 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83004016 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 83004150 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83004522 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 83004685 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 83004697 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 83004701 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 83004766 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 83004936 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 83004978 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 83005015 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 83005083 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 83005092 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 83005165 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 83005348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83005361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83005405 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83005566 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 83005595 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 83005604 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 83005676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83005690 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83005694 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83005748 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83005981 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 83006112 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83006140 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83006153 C A Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 83006256 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83006265 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83006292 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83006298 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83006316 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83006401 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83006403 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83006412 C A N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 83006456 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83006536 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 83006556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83006740 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83006772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83006838 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83006917 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83006956 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83006968 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83007173 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 83007357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83007888 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83008146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83008724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83009269 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 83009506 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83009600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83009656 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83009727 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 83010287 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 83010541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83010556 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83010697 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83010722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83011723 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83012035 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 83012078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83012748 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83012784 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83012886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83014172 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83015749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83016993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83017005 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83017239 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 83017469 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 83017480 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83017522 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83017575 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 83018029 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 83018325 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 83018493 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83019294 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 83019400 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 83019477 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83019644 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 83019750 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83019935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83020233 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 83020257 C T Y Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.8 0 0.2 16 4 8 0 2 3 83020314 A T N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 83020752 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 83020789 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 83020832 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 83020863 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 83020929 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 83021035 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 83021066 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 83021102 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 83021105 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 83021317 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 83021318 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 83021345 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 83021395 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 83021424 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 83021537 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83021787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83021863 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 83021893 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 83021899 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 83021965 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 83022367 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 83022409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83022520 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 83022549 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 83022590 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 83022625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83022667 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 83022816 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83022846 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83023012 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 83023045 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 83023152 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 83023163 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 83023265 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 83023326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83023605 G T N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 3 83023628 T G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 83023905 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 83023954 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 83023955 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 83024054 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 83024238 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 83024496 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 83024501 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 83024536 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 83024538 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 83024677 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 83024700 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 83024746 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 83024777 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 83024818 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 83025026 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 83025153 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 83025286 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 83025381 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 83025399 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 83025458 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 83025496 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83025656 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 83025697 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 83025784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83025977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83025980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83026494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83026736 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 83026784 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83026785 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 83026805 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 83026833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83026900 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 83027343 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 83027344 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 83027597 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 83027654 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83027678 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83027689 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 83027781 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83027855 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83027864 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83027876 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83027907 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83027908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83027982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83028015 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 83028172 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 83028180 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83028256 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 83028269 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 83028382 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83028405 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83028508 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 83028624 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 83028943 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 83029110 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 83029124 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 83029135 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 83029357 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 83029468 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 83029484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83029572 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 83029573 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 83029591 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 83029661 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 83029711 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 83029733 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 83029744 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 83029874 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 83029931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83029951 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 83029992 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 83030007 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 83030008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83030100 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 83030115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83030150 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 83030297 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 83030312 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 83030475 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 83030536 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 83030613 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 83030686 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 83030811 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 83030941 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 83030988 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 83031019 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 83031035 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 83031075 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 83031096 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83031102 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 83031107 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83031126 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83031165 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 83031175 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 83031195 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 83031197 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 83031217 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 83031233 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 83031245 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 83031249 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 83031256 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 83031265 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 83031274 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 83031394 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 83031411 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 83031506 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 83031522 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 83031528 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83031588 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 83031615 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 83031627 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 83031691 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 83031693 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 83031753 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 83031834 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 83031856 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 83031894 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 83031903 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 83032070 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 83032116 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 83032150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83032188 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 83032202 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 83032209 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83032231 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 83032233 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83032799 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 83032854 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 83033001 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 83033221 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 83033233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83033279 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 83033399 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 83033511 G T N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 83033811 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 83033814 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 83033828 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 83033842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83034001 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83034032 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 83034136 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83034151 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 83034689 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 83034740 T C N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 3 83034758 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 3 83034829 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 10 8 3 4 2 3 83034897 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 83034905 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 83034970 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 83034988 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 83034989 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83035000 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 83035115 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 83035140 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 83035173 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 83035323 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 83035590 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 83035643 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 83035791 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83036108 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 83036402 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83036407 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83036435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83036627 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 83036745 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83036823 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83037333 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 83037504 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 83037584 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 83037596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83037653 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 83037723 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 83037839 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 83037925 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 83038102 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 83038109 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 83038586 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 83038599 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 83038769 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 83038821 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 83039706 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 83039809 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 83039917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83040155 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 83040227 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 83040533 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83040557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83040907 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 83041021 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 83041062 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 83041248 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 83041390 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 83041523 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 83041663 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83041785 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83041922 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 83042210 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 83042587 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 83042757 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83042759 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83042777 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83043021 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83043100 A T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 83043649 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 83043670 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 83043708 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83043776 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 83043829 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 83044037 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 83044093 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 83044212 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 83044453 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 83044486 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83044499 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83044617 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83044636 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 83044685 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 83044772 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83044820 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 83044840 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83044993 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83045037 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 83045061 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83045190 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83045274 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 83045302 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83045309 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 83045336 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 83045706 G T Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 83045722 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 83045848 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 83045966 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83046006 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 83046105 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 83046163 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 83046466 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 83046571 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 83046626 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 83046663 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 83046843 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 83046847 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 83046854 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 83046895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83047066 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 83047899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83048200 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 83048318 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 83048341 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83048495 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 83048509 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 83048602 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83048648 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 83048667 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 83048693 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 83048739 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 83048769 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 83048854 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 83048862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83049320 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83049405 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83049541 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83050064 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83050101 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83050178 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 83050194 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 83050244 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83050367 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 83050446 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 83050511 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 83051300 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83051505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83051597 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 83051599 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 83051615 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 83051623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83051648 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83051687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83051734 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 83051789 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 83051936 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 83055030 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 83055241 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83055527 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83055624 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 83055739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83055953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83056044 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83056134 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83056601 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83056730 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 83057388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83057780 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 83057822 A C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 83057923 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 83058506 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 83058702 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83059034 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 83059276 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 83059420 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 83061122 A G Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 83061320 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 83061360 T A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 83061451 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 83061520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83061832 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 83062038 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 83062083 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83062156 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83062159 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 83062294 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 83062375 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 83062399 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 83062473 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 83062768 G C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 83063073 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 83063235 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83063394 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83063409 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83063433 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83063446 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83063465 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 83063707 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 83063808 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 83064077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83064095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83064241 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 83064318 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 83064321 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 83064363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83064414 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 83064492 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 83064586 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 83064660 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 83064671 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 83064701 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 83064714 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 83064729 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 83064730 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 83064806 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 83064820 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 83064891 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 83064895 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 83064937 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83065041 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 83065121 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 83065136 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 83065180 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83065329 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83065342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83065422 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83065659 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 83065722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83065877 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83066050 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83066453 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 83066639 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 83066649 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83066650 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 83066676 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 83066687 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 83066708 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 83066751 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 83066883 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 83066925 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 83066937 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 83066938 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 83066969 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 83067079 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 83067253 G T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 83067340 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 83067458 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 83067506 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83067522 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 83067723 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 83067735 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 83067814 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 83067915 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 83067927 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 83068378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83068850 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 83069369 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 83069489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83069708 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83069922 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 83069979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83070580 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83070682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83070767 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 83070805 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 83070881 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 83071279 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 83071340 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 83071706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83071716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83071795 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 83071805 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 83071830 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 83071880 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 83071887 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 83071903 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 83072017 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 83072282 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 83072297 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 83072303 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 83072320 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83072341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83072353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83072422 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 83072473 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 83072474 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 83072516 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 83072536 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 83072562 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 83072637 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 83072679 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 83072858 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83072960 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 83073026 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83073032 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83073223 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83073277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83073367 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83073424 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 83073520 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83073621 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 83073636 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 83073832 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 83073939 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 83073960 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 83073980 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 83074001 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 83074248 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 83074821 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 83074849 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 83074955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83075040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83075095 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 83075145 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 83075445 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83075812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83076353 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 83080178 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83080546 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 83082636 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83083174 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83083176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83083623 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 83083717 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 83083781 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 83083829 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 83083831 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 83083920 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 83083937 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83083965 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83083992 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83084214 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83084287 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83084309 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 83084321 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 83084487 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83084560 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 83084631 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 83084668 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 83084920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83084959 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 83084985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83085035 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83085045 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83085077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83085080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83085218 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 83085434 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 83085534 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 83085546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83086296 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 83086472 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83086488 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 83086559 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 83086572 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83086587 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 83086856 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83087557 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 83087577 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 83087860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83087878 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83088142 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83089087 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83089187 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83089217 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83089601 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 83089604 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83089711 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83090731 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83090935 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83091752 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 83091810 T C N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 3 83092446 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83093684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83094052 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83094384 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83094617 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 83094689 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 83094731 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83094748 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83094828 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 83094897 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 83094932 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 83094940 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 83095040 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83095060 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83095063 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83095216 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 83095245 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 83095360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83095873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83095919 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83096031 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 83096224 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83096498 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 83104201 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83105522 T A N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 3 83105565 T G N N 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0833333333333333 0.666666666666667 0.25 10 14 1 8 3 3 83105622 G A N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.0714285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 11 17 1 9 4 3 83105654 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 83105912 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 83106015 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 83106136 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83106320 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 83106436 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 83106505 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83106829 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83106996 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83107438 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83107585 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83107820 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 83107890 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83107976 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 83108170 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 83108221 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 83108302 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 83108315 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 83108435 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83108990 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83109245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83109572 C G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 83110522 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 83111031 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 83111103 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 83111555 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 83112116 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83112361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83112648 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 83112745 A G Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 83113000 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 83113559 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 83113585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83113589 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 83113645 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 83113670 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 83114049 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83114306 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 83114387 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 83114705 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 83115324 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 83115405 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 83116206 C T N Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 8 8 3 2 3 3 83116645 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83117450 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 83117461 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 83117513 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 83117542 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 83117652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83117920 G T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 83117936 A T N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 3 83118219 A G N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 12 16 2 8 4 3 83118598 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 83118623 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 83118829 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83118833 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83118911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83118992 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 83119180 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 83119227 T C N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 3 83119268 T G N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 83119299 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 83119346 G C N N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 3 83119466 A C N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 3 83119515 T G N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 3 83119550 A C N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 83119582 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 83119685 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83119705 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 83119717 A C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 83119793 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 83119823 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 83119848 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 83119856 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 83119983 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 83120468 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83120907 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 83120982 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 83121212 T C N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 12 4 5 2 1 3 83121271 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 83121276 T C N Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 3 83121511 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 83122123 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 83122473 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83122550 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 83122558 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 83122586 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 83122643 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 83122679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83122894 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83122934 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 83123201 A G N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 3 83123716 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 83123779 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 83123890 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 83123921 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 83124562 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83124657 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 83124784 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 83124839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83124846 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83124895 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 83124968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83125023 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 83125385 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83125495 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 83125552 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 83125637 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 83125810 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 83126419 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 83126735 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 83126895 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 83126927 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 83126938 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83127067 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 83127077 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 83127078 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83127445 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 83127477 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 83127637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83127849 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 83127869 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 83127902 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 83128016 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83128058 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 83128108 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83128158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83128354 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 83128466 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 83128495 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 83128552 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 83128620 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83128635 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 83128694 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83128864 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 83128966 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 83129522 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 83129551 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83129552 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83129683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83129708 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 83129906 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83129985 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83130001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83130064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83130141 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83130411 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83130422 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83130471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83130494 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 83130510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83130586 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83130663 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83130706 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 83131367 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 83131383 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 83131387 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83131405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83131508 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 83131580 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 83131690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83131990 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 83132000 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 83132011 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 83132233 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 83133299 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 83133431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83133608 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83134759 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 83137012 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 83137076 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83137178 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83137924 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 83138281 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83138344 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83138807 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 83139086 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 83148205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83148704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83148736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83148842 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 83149110 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 83149112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83149592 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83149723 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83149745 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83149746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83149806 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83149963 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83150048 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83152921 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83153674 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 83155139 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83156076 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83156497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83157580 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83158418 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 83159174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83159650 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83159665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83159811 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83160101 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 83160128 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83161293 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83161649 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83161719 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83161887 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83162085 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83163345 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83163791 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83163812 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83164242 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83164246 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83164386 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 83164435 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 83164611 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 83165097 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83165114 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83165162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83165188 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83165189 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83165345 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 83168319 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83170997 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83171496 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83171564 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83171690 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83171939 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83173452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83175057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83175398 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83176233 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 83176371 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83177524 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83177656 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83177969 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 83178425 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83180057 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83180979 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83181351 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83181488 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83182359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83183025 A C N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 83184334 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 83191270 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83191824 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83192130 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83192343 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83192795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83192882 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83193178 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 83193321 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83193613 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83194309 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 83195271 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83196396 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 83196493 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83197159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83198830 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 83199586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83200725 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 83200943 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 83201760 C A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 83202514 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83202803 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83202912 A G Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 83203540 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83204701 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83205082 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83206157 G C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 83207785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83207912 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 83208484 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 83210107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83210310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83210432 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 83211827 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 83211836 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 83212061 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83212568 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83214422 C G Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 83215406 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83215664 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83216968 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83217282 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 83217989 A C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 83218046 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 83219503 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 3 83219834 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83220009 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83220058 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 83220232 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83221940 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 83223955 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83226679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83227513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83227639 T A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 83228350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83228441 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 83228514 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 83228554 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 83228583 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 3 83228685 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83228698 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 83228831 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 83229055 A G N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.3 0.7 0 13 7 3 7 0 3 83229284 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 83229394 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 83229408 G A N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 3 83229555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83229606 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 83229678 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 83229765 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 83229895 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 83229914 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 83230283 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 83230360 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 83230400 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 83232055 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83234271 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83236633 C G Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 83238796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83238911 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 83239978 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 83240931 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 83240977 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83241065 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 83241081 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 83241263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83241716 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83241753 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 83242216 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83242623 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 83242674 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 83243387 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 83243502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83243783 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 83243825 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 83243833 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 83243846 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 83243901 C G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 83243951 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 83244003 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83244514 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83244614 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 83244649 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 83244669 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 83244756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83244873 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 83244976 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 83245219 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83245351 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83245431 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 83246112 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 83246237 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83246429 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 83246568 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83246639 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83249721 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83249796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83250329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83250479 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 83250626 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 83250665 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 83250710 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 83250767 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 83251085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83254262 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 83254361 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 83256006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83256081 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83256090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83256572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83257752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83257852 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 83258695 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83258911 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83262426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83265241 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83265784 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83266352 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 83268627 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 83269639 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83270069 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 83271106 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 83273244 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 83273574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83273900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83275320 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 83275804 A C Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 3 83276536 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 83277350 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83278046 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83281960 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 83285157 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83285831 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83286083 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83286128 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 83286273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83286905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83288935 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83289025 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 83291648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83291989 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83292612 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83292875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83293621 A T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 83295619 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 83296900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83297614 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83297842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83300756 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83304132 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 83304320 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 83304999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83305006 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83305181 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83305213 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83305260 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83305828 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83306665 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 83307086 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83307617 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 83308627 G C Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 83309068 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83309177 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83311706 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83311804 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83314490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83314882 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83315033 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 83315053 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83315745 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 83316713 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 83317047 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 83317205 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 83317354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83317455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83317490 A T Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 83318099 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 83318221 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 83318748 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 83318902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83319006 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 83319077 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83319094 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 83319178 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 83319271 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83319311 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 83319367 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 83319485 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 83319505 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 83319829 T C Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 83319918 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 83319968 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83320112 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83320223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83320232 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83320269 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 83320435 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 83320471 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 83320482 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 83320495 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 83320532 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 83320704 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 83320812 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 83321011 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 83321024 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 83321124 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 83321273 A C Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 83321458 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 83321551 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 83321848 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83321890 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 83321917 A C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 83321957 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 83322072 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 83322175 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 83322235 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 83323436 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 83323627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83323674 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 83323713 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83323733 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 83323797 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 83323848 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 83323915 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83323926 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83323956 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 83324030 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 83324211 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 83324439 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83324488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83325033 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 83325046 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 83325362 A C Y N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 14 10 6 2 4 3 83325605 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 83325856 C T Y Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 6 6 2 2 2 3 83325910 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 83326053 C T N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 12 4 5 2 1 3 83326067 G A N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 3 83326076 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 83326149 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 83326164 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 83326179 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 83326187 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 83326242 A G N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.538461538461538 0.153846153846154 0.307692307692308 16 10 7 2 4 3 83326769 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 83326996 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 83327226 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 83327277 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 83327362 C T N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 18 10 8 2 4 3 83327489 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 83327543 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 83327576 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 83327913 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 83328034 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 83328078 T A Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 83328313 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 83328411 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 83328463 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 83328498 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 83328531 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 83328572 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 83328615 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 83328688 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 83328784 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 83328819 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83328949 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83329044 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83329096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83329190 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 83329212 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 83329292 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 83329315 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 83329339 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 83330091 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 83330118 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 83330314 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 83330362 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83330578 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 83330638 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 83330771 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 83330807 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 83330808 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 83331167 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 83331543 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 83331655 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 83331808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83331902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83331957 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83332083 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83332140 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83333080 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83333102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83333180 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83333203 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83333275 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 3 83333299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83333465 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 83333490 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83333519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83333606 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 83333920 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83333992 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 83334027 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83334061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83334152 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 83334958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83335467 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83336458 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 83336763 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 83337991 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83338732 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83338965 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 83340721 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83341210 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83341480 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83342013 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 83342244 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83342348 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83342445 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83345506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83346785 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 83347125 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83353476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83353605 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 83355282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83355402 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83356319 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83356334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83356430 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 83356535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83356728 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 83356789 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83356811 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83356898 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 83357173 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 83357192 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 83357243 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 83357278 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83357292 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 83357364 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83357666 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 83357911 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83358294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83358450 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 83358507 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83358625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83358644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83358654 C G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 83358666 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83358839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83359000 T C Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 83359035 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 83359206 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 83359264 T A N N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0 1 0 12 12 0 12 0 3 83359363 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83359499 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 83359697 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 83359827 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83359842 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 83359850 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83359969 A T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 83359977 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 83360175 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 83360617 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 83360646 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 83360739 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 83360923 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 83361018 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 83361221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83361226 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83361799 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 83361879 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 83361922 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 83361945 A G Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 83362156 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83362407 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 83362411 G T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 83362442 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 83362572 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83362617 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 83362633 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83363017 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 83363200 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 83364544 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 83364817 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 83365681 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83365686 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 83365838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83366307 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 83366611 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 83366912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83367148 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 83367862 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 83367939 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 83367986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83368193 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 83368216 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 83368317 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 83368483 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 83368511 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 83368526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83368546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83369164 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 83369307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83369497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83369897 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83370620 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83371663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83371934 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 83372115 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 83372138 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 83372197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83372437 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 83372501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83373827 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 3 83374052 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 83374187 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 83375096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83376677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83377458 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83377523 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83377627 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83377654 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 83377685 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 83377750 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83377814 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 83377885 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 83377956 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 83378017 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83378124 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83378143 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83378205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83378245 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83378261 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83378371 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83378440 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83378441 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83378862 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 83379091 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 83379130 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 83379147 C G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 83379636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83380152 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83380283 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83380294 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 83380412 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83380482 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83380765 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83380814 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83380893 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 83380924 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 83381096 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 83381234 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 83381439 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83382017 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 83382373 T A Y N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 5 7 1 3 2 3 83382624 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83382814 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 83382990 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83383110 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 83383121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83383141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83383220 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 83383416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83383510 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 83383525 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 83383970 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 83384652 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 83385205 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83385954 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83385971 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 83386117 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83386282 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83386390 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 83387134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83387759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83387760 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 83387783 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 83388038 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83388182 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83388966 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83389566 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83390233 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83390251 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83390405 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83390414 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83390769 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83390892 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83390905 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83391040 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 83391379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83392317 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 83392983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83393020 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83393148 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83393176 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83393266 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83393277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83393313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83394296 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83394766 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83394892 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83395160 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 83395179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83395206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83395632 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83396631 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83397032 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83397102 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83398962 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83399020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83399446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83400133 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 83400822 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 83400929 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83401188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83401569 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83401660 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83401783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83402124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83402428 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83402463 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83404076 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83404839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83404887 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83405127 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 83405211 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83405341 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83405482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83405498 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83406225 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83406953 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 83407024 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83407560 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83407582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83408016 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83408618 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83408658 G A Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 83408715 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83408733 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 83408773 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83408868 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83409157 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 83409250 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 83409279 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 83409312 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83409373 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83409617 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83409623 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83409678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83409743 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 83410025 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 83410203 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83410249 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 83410282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83410296 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 83410659 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 83410661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83410683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83410855 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 83410985 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 83411208 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83411256 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 83411324 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 83411683 C G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 83412068 T G N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 83412250 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83412744 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 83412844 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 83412903 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 83413092 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83413093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83414344 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 83415817 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 83415967 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 83416039 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 83416130 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 83416132 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 83416363 G C Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 83416382 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 83416415 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 83416598 C G Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 83416909 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 83417237 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 83417428 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83417458 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 83417555 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 83417556 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 83417576 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 83417601 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83417760 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 83417788 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 83417795 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 83418016 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 83418106 A T Y N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 83418201 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 83418222 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 83418228 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 83418236 G C Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 83418243 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 83418307 T A Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 83418429 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 83418564 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 83418571 C G Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 83418696 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 83418701 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 83418738 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 83418767 T G Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 83418774 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 83418866 G T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 83418894 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 83419466 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 83419669 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 83419746 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 83420012 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 83420026 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 83420113 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 83420130 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 83420141 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 83420157 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83420183 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 83420316 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 83420323 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 83420458 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83420575 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83420780 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83421029 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 83421047 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 83421082 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 83421139 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 83421449 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 83421461 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 83421818 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83421876 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 83421970 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83422458 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83422497 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83422570 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83422654 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83422658 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83422694 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83424571 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 83425939 T C N Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 3 83427132 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83427254 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83427478 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 83427963 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 83428349 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 83428392 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 83428412 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 83428461 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83428547 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83429146 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 83429314 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 83429406 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 83430016 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83430063 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 83430168 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 83430234 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 83430282 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83430324 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 83430405 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 83430457 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 83430492 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 83430500 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 83430587 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 83430691 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 83430692 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 83431021 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 83431199 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83431537 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 83431831 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 83432262 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 83432318 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 83432344 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83432355 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83432429 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 83432619 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83432645 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 83432669 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 83432885 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 83433195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83433259 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 83433279 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 83433533 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83434042 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 83435731 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83437164 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83437272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83438065 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 83438618 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83439401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83440633 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 83440759 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 83442159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83446828 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 83449048 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 83449589 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83450435 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 83451696 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 83454387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83455301 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 83457092 A G Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 83457444 C T Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 83460593 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83461010 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83462975 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83463054 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 83463189 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83464015 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 83464037 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 83466248 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 83466717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83466750 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 83467141 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 83467377 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 83467425 G T Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 83467439 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 83467542 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 83467596 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 83467699 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 83467896 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 83467902 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 83467992 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 3 83468434 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 83468584 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 83468641 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 83468862 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 83468909 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 83468934 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 83469052 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 83469345 A C Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 83471136 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83471795 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 83471951 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83474402 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 83476223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83476792 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 83476795 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83477638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83477950 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83479720 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 83479988 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83480557 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 83480792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83480930 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 83480938 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 83480998 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 83481075 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 83481090 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 83481123 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 83481476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83481818 C T Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 83481855 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83481859 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 83482821 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83483065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83483086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83485784 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83487106 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83488616 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83490437 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83490451 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 83490714 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83492604 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 83492620 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83493591 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 83499035 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83499219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83499839 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83501141 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 83501740 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83504184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83504591 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83504732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83506128 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83508668 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 83509358 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83510233 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83512278 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 83512397 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 83512404 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 83512490 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 83512653 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 83512697 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 83512699 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 83512709 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 83512996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83513172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83513203 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83513679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83513758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83513779 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83513788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83513862 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83514117 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83514268 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83514274 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83514330 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83514580 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83514586 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83514616 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83514674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83514728 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83515317 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83515397 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 83515699 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 83516254 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 83516454 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 83516505 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 83516662 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 83517038 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 83517169 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83517183 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 83517454 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 83517531 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 83517717 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 83517863 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83518208 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 83518252 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 83518301 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83518633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83518947 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83519462 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 83519517 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83519633 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 83519651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83519680 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83520036 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83520053 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83520078 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83520104 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83520164 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83520168 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83520180 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83520255 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83520271 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83520328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83520415 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 83520446 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83520467 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83520574 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83520599 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 83520696 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83520734 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 83520941 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83520951 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 83521211 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 83521648 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 83521842 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 83521969 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83522153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83522338 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83522580 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 83522724 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83522775 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83522790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83522832 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 83522876 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83522892 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 83523060 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 83523330 C T N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 3 83523419 G C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 83523436 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 83523569 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 83523768 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83524041 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83524293 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83524294 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83524520 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83524527 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 83524573 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 83524592 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83524701 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 83524966 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 83524996 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83525004 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 83525146 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83525147 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83525286 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83525287 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83525312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83525449 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83525667 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83525710 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83525785 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 83525854 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83525981 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 83525993 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83526083 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83526709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83527265 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83527723 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83528187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83529710 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 83530725 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83530831 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 83531035 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 83531544 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83531593 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83532886 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83533835 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83534446 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83535106 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 83535798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83536435 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 83538054 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 83538058 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 83538291 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 83538316 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83538358 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 83538786 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 83539020 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 83539234 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 83539260 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 83539512 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 83539667 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 83539721 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83540138 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 83540140 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 83540150 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 83540479 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 83540709 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 83540735 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 83540747 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 83541217 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83541221 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 83542073 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83542105 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83542461 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83543628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83545610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83546838 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 83547483 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 83548821 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 83549379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83552330 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83556056 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83557639 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83558321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83560775 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83562290 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 83562909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83564521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83564760 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83564859 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 83565040 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83565124 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83565356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83565669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83566617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83566928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83569342 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 83569530 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83572595 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83572830 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83573155 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83574900 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83576225 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 83576551 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83577439 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 83578354 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 83578390 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 83578457 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 83578479 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83578486 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83578555 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 83578668 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 83578686 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 83578996 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 83579258 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 83579330 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 83579379 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 83579848 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 83582276 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 83582454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83583470 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 83584832 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83587430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83588414 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83589094 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 83589140 G T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 83594572 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83597943 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83598071 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 83598338 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83599404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83601931 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83604686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83604748 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83606866 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 83609537 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 83610451 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83610672 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83610815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83610865 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83612651 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 83612771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83612843 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83612924 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83612941 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83612950 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83613400 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83613417 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83613518 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 83613542 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83613555 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83613583 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83613622 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 83613681 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83613703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83613803 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83613889 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83613890 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83613977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83614562 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83615308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83615527 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 83619829 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 83622340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83622846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83624674 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 83625536 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 83626299 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 83626346 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 83630058 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 83630252 C T Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 83630351 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83630416 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83631077 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83631598 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83631727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83632946 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83633051 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 83633102 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83633200 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 83633252 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 83633670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83634051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83634106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83634116 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83634681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83634691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83634738 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 83635010 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 83635742 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 83635925 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 83636138 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 83636146 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 83636153 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 83636590 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 83636857 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 83637210 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 83637519 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 83637535 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 83637654 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 83639693 A C N N 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 7 7 2 3 2 3 83639714 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 83640153 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83641446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83641925 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83644396 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 83654586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83654614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83655958 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83657573 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 83658488 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 83660274 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83663113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83664612 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 83664683 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 83665229 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 83665393 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83666821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83667497 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 83667516 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 83667529 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 83668898 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 83668925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83669734 G C Y N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 3 83669751 G A Y Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.230769230769231 0.769230769230769 0 16 10 3 10 0 3 83671471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83672076 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83672626 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 83673352 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 83675680 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 83675803 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83676482 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 83676817 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 83678768 C T Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 83678817 C T Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 83678840 G A Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 83678841 G T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 83678874 A T Y N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 83678891 A C Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 83678897 G A Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 83678907 A T Y N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 83679129 C T Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 3 83680584 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83683255 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 83683824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83685495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83685718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83686602 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 83686944 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83687143 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 83687254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83687436 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83687465 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 83687557 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 83687766 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 83687848 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 83687879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83688106 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 83688146 T G N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 83688233 G A N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.133333333333333 0.8 0.0666666666666667 16 14 2 12 1 3 83688248 T C Y Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.181818181818182 0.818181818181818 0 13 9 2 9 0 3 83688449 T A N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 83688554 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 83688566 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83688653 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 83688827 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 83688980 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 83688998 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 83689031 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 83689976 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83689995 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83690516 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 83690539 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 83690631 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 83690638 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 83690793 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 83691634 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 83691770 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 83692227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83692345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83692426 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83692864 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 83692887 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 83692927 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 83692944 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 83693644 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 83693668 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83694072 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83695175 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 83695327 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 83695398 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 83695519 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 83696072 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 83696415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83696455 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 83696468 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 83696905 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 83696957 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83697050 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83697095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83697244 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 83697545 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83697548 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83697639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83697732 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83697839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83697844 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 83697959 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 83698071 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83698314 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 83698341 T G Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 83698573 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 83698648 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83698785 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 83698847 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 83699067 T G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 83700431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83700548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83701255 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83704938 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 83705185 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83705228 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83706535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83706717 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 83707624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83708148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83710723 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83711738 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83711880 C A N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 83713560 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 83713848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83714214 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 83714344 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83714467 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 83714696 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 83714757 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 83714758 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 83714789 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 83715020 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 83715128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83715673 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83715844 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 83721741 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83725568 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83725753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83726675 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 83727062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83727184 A C Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 83727645 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83727656 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 83728120 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 83728125 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 83728405 A G Y Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.181818181818182 18 4 9 0 2 3 83728725 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 83728756 T A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 83728983 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 83729027 T C Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 83729039 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 83729137 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 83729239 G A Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 3 83729426 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 83729433 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 83729493 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 83729520 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 30 6 15 0 3 3 83729601 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 83729620 A G Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 83729769 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 83729975 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83729997 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 83730461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83730601 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 83730684 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 83730843 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83731323 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 83731750 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83731855 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 83732139 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 83732191 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 83732465 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 83732669 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 83732812 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 83732834 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83732935 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 83733218 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 83733219 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 83733299 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 83733357 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83733527 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 83733930 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 83734158 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83734802 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 83736767 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83736995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83737970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83738084 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83739481 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83739615 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 83741322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83742625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83746592 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83747929 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 83750164 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83750749 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 83751080 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83751723 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83752102 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83752293 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83752429 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 83754831 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83754936 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 83755011 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83760038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83760094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83761631 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83764602 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83765324 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83765413 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83767063 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 83767418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83767670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83767897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83769148 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 83774316 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83774391 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 83775153 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 83776033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83777700 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 83777878 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83778045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83778099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83779151 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83779155 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83780058 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83781598 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83781804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83781935 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83782393 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83787027 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83787875 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83788818 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83788943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83788998 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83789021 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83789888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83790112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83790148 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83790359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83790910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83790967 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 83791090 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83791959 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83793269 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 83794644 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 83795063 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83795606 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83795906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83796600 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83796685 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83796956 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83797186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83797350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83797521 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83797596 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83797876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83798091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83798241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83798261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83798274 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83798317 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83798438 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 83798441 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83798466 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83798483 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 83798538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83798668 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83798682 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83799073 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83799258 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83799289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83799576 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83799682 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 83801283 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 83801575 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 83801794 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83803151 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83804050 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83804819 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83805111 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83805803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83806369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83807507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83808164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83808854 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83809591 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83809992 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 83811609 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 83812866 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83815506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83815588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83816853 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83816994 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 83818402 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83818410 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83822147 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83822489 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83823172 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 83823431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83824031 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 83824053 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 83824648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83827002 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83828217 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83828767 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 83828847 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 83828894 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 83829004 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 83829137 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 83829206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83829773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83830609 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83830895 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 83830938 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 83830996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83833835 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83834588 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83834755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83836020 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83836564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83838704 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83840942 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83841153 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83843782 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 83846019 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 83848958 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 83850621 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83854032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83854433 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83854818 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 83854846 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 83854879 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 83856276 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 83856370 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 83856579 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 83856632 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 83856771 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 83856778 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 83857016 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83857077 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 83857120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83857144 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 83857161 G A Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 83857169 A C Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 83857499 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83858218 A T Y N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 83860513 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83861283 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 83862422 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83863576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83864225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83864305 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 83864441 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 83864581 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 83864720 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83864763 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 83865044 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83865059 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83865338 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83865373 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83865460 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83865536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83865786 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83868074 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 83868161 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 83868165 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 83868405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83868693 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 83868790 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 83869034 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 83869075 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 83869285 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83869308 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 83869487 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 83869557 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 83869652 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 83869670 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83869694 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 83870220 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 83870228 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83870257 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 83870509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83870787 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 83870826 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 83870933 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 83870969 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 83871002 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 83871126 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 83871169 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 83871172 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 83871207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83871256 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 83871277 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83871463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83871630 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 83871809 T G N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 83871856 A G N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 3 83871944 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 83872081 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 83872218 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83872291 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 83872325 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83872327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83872771 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83872856 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 83873051 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 83873284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83873301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83873420 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83873733 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 83873744 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 83873752 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 83873936 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 83874000 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 83874048 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 83874137 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 83874174 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 83874512 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83875266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83875771 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 83875814 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 83876603 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 83876611 C G N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 83876622 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 83876625 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 83876644 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 83876992 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 83877118 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 83877293 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83877458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83879025 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 83879671 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83879814 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 83879940 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 83880770 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83881157 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 83881725 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 83882200 G A N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 83882289 A T N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 3 83882340 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 83882616 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 83882660 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 83883001 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 83883056 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 83883573 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 83883777 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 83883784 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 83883834 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 83883852 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83883961 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 83883995 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 83884017 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 83884058 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 83884089 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 83884267 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 83884339 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 83884344 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 83884729 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83884734 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 83885738 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 83885999 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83886383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83887149 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83887420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83887724 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 83888132 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 83888236 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 83888260 C T Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 0.142857142857143 0.214285714285714 20 8 9 2 3 3 83889271 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 83889372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83889391 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 83889402 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 83889640 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83889718 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83890059 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 83890277 A T Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 83890300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83890649 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 83890650 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 83890854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83893520 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 83897117 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83901203 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 83906984 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 83907199 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83908693 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 83910647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83910788 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83910907 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 83911994 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83912228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83912321 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 83912826 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 83914088 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83914462 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 83915166 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 83915501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83917778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83918257 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 83918413 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 83918418 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 83919544 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83920160 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83920946 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83921020 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83921055 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 83921249 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 83921309 A C N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 3 83921698 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83921828 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83921835 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83922147 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83922525 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83922761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83922897 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 83922913 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 83923856 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83924043 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83925230 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 83925462 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83925525 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83925637 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 83926639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83926887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83927101 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83927657 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83929337 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 83930131 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 83930873 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83933004 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83933098 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 83934367 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83934706 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83935025 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83935680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83935837 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83935907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83936238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83936317 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83938343 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83938750 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83942952 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 83943316 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 83943417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83943771 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 83943913 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 83943938 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83944015 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 83944048 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83944249 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83944330 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 83944358 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83944413 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 83944885 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 83944909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83945103 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 83945137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83945320 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 83945323 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 83945369 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 83945535 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 83953616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83953622 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 83953739 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 83953800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83953820 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83953902 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 83953906 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 83954619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83955415 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83957130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83958024 T A N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 83958026 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 83958048 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 83958148 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 83958332 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 83958453 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 83958574 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83958681 A T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 83958737 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83959381 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 83959399 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 83959553 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83959659 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 83959722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83959835 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83959885 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 83959889 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 83959954 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 83960614 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 83960707 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 83961210 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83961294 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83962604 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 83962651 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83962817 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83962842 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83962948 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83963030 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 83963407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83963542 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83963683 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 3 83963782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83963868 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 3 83963872 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 3 83963931 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83964009 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83964444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83966297 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 83966754 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 83972796 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83974191 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 83974650 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 83975344 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83975366 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83975667 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83975776 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 83977527 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 83979221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83979766 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83980064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83980673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83981739 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83981741 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83981818 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83982021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83982272 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83982858 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 83982898 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83982899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83983195 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83983260 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83984622 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83984675 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 83984753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83985194 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83985636 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 83985731 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 83985750 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 83985765 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 83985831 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 83985900 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 83985979 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 83985993 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 83986112 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83986235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83986429 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 83986459 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 83986841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83986866 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83986874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83986883 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83986902 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 83986920 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83987050 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 83987211 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 83987471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83988116 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83989954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83991467 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 83991900 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 83992165 T G N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 83992302 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 83992793 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83993050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83993533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83993678 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 3 83994200 C G N N 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 11 9 2 7 1 3 83996102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83996288 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 83997780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 83999232 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 83999680 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 83999781 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84000262 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84001333 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84001857 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 84002267 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 84002349 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 84002410 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 84002760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84002932 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84003064 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 84003129 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 84003549 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84003675 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 84004446 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84004463 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84004911 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84006090 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84006770 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 84007185 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84009217 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84009850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84010210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84011286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84012062 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84013512 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84014055 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 84015023 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 84015090 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 84015498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84015700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84015731 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84015888 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 84016450 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 84016745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84017642 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84018051 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84018242 G C N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 84018470 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84018558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84018848 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 84020172 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 84020177 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 84020203 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 84020244 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 84020311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84020602 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 84020604 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 84020677 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 84020692 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 84020715 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84020718 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 84020775 A T Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 84020776 A T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 84020798 T G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 84020945 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 84021031 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 84021040 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 84021071 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 84021652 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 84021779 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 84022238 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84022286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84022291 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84024910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84025211 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84025574 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84027071 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 84027171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84027645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84027682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84027974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84030947 C A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.15 0.85 0 23 17 3 17 0 3 84032430 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84034715 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84035461 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84035519 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84035535 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84035886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84035938 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84035943 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84036062 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84036092 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84036197 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84036300 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 84036761 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84036860 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84036946 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84036947 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84037246 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 84037268 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84037302 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 84037305 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 84037409 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84037629 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84037727 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84038262 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84038358 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84038419 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84038535 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84038683 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84038701 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84038703 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84038735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84038783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84038977 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84038985 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84039031 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84039039 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84039170 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84039312 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84039439 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84039487 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84041889 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84042096 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84042423 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84042444 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84042472 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84042508 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84042622 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 84042855 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84043056 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84043066 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 84043105 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 84043165 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 84043292 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 84043405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84043519 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84044027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84044081 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84044152 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 84044371 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 84044438 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 84044459 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 84044581 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84044996 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84045050 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84045147 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84045164 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84045825 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84046115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84046572 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84046596 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84046775 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84046829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84046838 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84046932 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84046978 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84046998 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84047114 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84047120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84047167 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84047805 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84048813 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84049240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84049629 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84050217 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84050296 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84050589 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84050759 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84050848 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 84051068 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 84051285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84051419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84051697 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84053790 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84053810 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 84053832 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 84053914 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84054048 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84054107 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84054382 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84054849 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84054861 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 84054891 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 84055141 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 84055171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84055203 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 84055249 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 84055255 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 84055274 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84055337 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 84055421 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 84055567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84055669 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 84056317 T G Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 84056340 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 84056553 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 84056918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84057048 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 84057066 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 84057107 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84057328 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 84057498 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 84057590 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84057701 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84057941 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84058929 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 84059587 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 84059990 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84060399 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84061034 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 84061254 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84061447 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84061480 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 84061495 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84061553 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 84064840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84065467 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84065659 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84065660 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84065683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84065774 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 84065799 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 84065900 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 84066043 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 84066158 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 84066272 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 84066473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84066480 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 84066505 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 84066620 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 84066627 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 84066648 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 84066686 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 84066699 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 84066700 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 84066745 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 84066752 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 84066767 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 84066776 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 84066835 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 84066856 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 84067264 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 84067269 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 84067443 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 84068871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84071130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84072318 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84072696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84075449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84076384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84076657 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84078186 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 84078571 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84078618 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 84078760 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 84078780 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 84079017 C T Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 84079115 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 84079135 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84079361 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 84079521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84081961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84082383 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84083173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84083276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84084119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84085196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84085631 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 84086548 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84086559 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 84086710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84086751 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84086836 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 84086863 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84087436 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 84087909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84087986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84088175 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84088310 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 84088753 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 84088788 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 84088836 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84089004 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84089168 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 84089575 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 84090116 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 84090135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84090150 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 84090171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84090713 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84090765 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84090781 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 84090845 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 84090856 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 84090870 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 84090886 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 84090909 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 84090910 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 84090944 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 84090959 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 84091042 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 84091144 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 84091166 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 84091234 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 84091522 G A Y Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 3 84091656 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 84091662 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 84091806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84092014 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 84092026 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 84092028 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 84092045 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84092096 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 84092115 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 84092175 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 84092393 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 84092503 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 84092563 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 84093068 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 84093149 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 84093291 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 84093356 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 84093398 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84094069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84094111 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84094123 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 84094205 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84094483 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 84094485 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84094540 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 84094541 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84096032 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84096033 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 84096076 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84096238 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 84096258 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 84096465 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 84096466 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 84097033 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84097621 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84097631 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 84097793 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.105263157894737 0.894736842105263 0 21 17 2 17 0 3 84097802 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84097812 T C Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 84097821 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0 0.8 0.2 12 18 0 12 3 3 84097827 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 84098132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84098224 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 84098487 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 84099883 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 84100167 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 84100378 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 84100466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84100728 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84102485 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84103774 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84103991 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84105054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84105068 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 84105773 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 84105856 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 84105892 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 84108065 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 84108379 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 84108613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84108932 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84109804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84110701 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 84111410 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 84111439 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84111801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84112456 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84113124 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84114260 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84115604 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 84115700 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 84115795 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 84115815 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 84115901 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 84115920 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84116058 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 84116330 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 84116339 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 84116356 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 84116456 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 84116499 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 84116500 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 84116560 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84116920 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84116969 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 84117187 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 84117191 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84117465 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 84117532 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 84117810 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84117871 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84117903 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84117907 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84118713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84118833 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 84118931 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 84119346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84119732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84119761 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84119879 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 84119900 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 84119912 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 84120010 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 84120101 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84120188 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84120208 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 84120371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84120515 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 84120577 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 84120618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84120718 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 84120901 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 84120967 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84121026 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 84121041 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 84121089 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 84121142 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 84121146 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 84121198 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 84121602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84121665 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 84121777 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 84121806 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 84122840 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 84122906 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 84123303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84123616 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 84123934 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84123935 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 84123975 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84124155 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 84124200 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 84124225 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 84124233 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 84124533 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84125102 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84125133 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 84125161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84125334 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 84125345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84125789 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84125837 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 84126659 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 84126917 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 84126920 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 84127399 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 84127503 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84127505 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 84127648 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 84127698 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 84127703 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 84127737 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84127856 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 84128207 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84128208 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84128462 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84128490 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 84128492 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 84128608 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 84128670 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84129427 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84129489 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 84129514 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84129857 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84130089 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84130145 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84130194 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84130197 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 84130231 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84130571 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 84130608 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84130673 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84130700 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84130716 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 84130769 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 84130889 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84130937 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 84131229 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84131352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84131453 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 84131487 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 84131592 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 84131680 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 84131693 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 84132178 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 84132251 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 84132264 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 84132301 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 84132478 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84132562 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84132594 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 84132606 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 84132658 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 84132697 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 84132737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84132997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84133011 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 84133116 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84133556 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 84133591 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 84133818 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84133827 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84133979 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 84134082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84134150 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84134205 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 84134260 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 84134322 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84134446 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84134450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84134699 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 84134734 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 84134876 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 84134886 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 84135002 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 84135017 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84135293 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 84135337 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 84135709 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84135834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84136250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84136266 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84136339 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 84136483 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 84136489 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 84136652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84136653 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 84136740 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84136747 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 84137341 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84137350 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84137454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84138493 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 84139362 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84139465 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84139494 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 84139821 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 84139863 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 84139885 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 84140393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84140480 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 84140601 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84143642 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 84144045 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84144303 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 84144895 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84145118 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84145272 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 84145381 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 84145438 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 84145519 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84145553 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 84145612 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84146003 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84146022 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 84146075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84146344 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84146350 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84146387 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84146426 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84146708 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84146981 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84146982 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84148002 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 84148052 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 84148445 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84149683 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 84150068 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84150072 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84150116 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 84150129 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84150225 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 84150381 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 84150398 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 84150416 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 84150663 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84150673 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84150686 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84150811 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84150829 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84150944 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 84150956 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 84151546 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84152095 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84152353 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 84152505 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 84152628 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 84155719 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 84157798 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 84158423 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 84158581 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 84158606 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 84158610 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 84158734 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 84158762 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84158795 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 84158806 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 84158832 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 84159090 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 84159117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84160667 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 84161206 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 84161222 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 84161316 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 84161332 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84161392 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84161532 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84161533 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84161754 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84161860 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 84161896 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84161974 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84162063 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84162104 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 84162374 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 84162375 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 84162830 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 84162934 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 84170750 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84170751 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84171011 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 84171040 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84171142 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 84171316 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 84171378 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 84171402 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84171490 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 84171495 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 84171864 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 84171899 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 84171957 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 84171967 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 84172029 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 84172084 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 84172173 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 84172222 C G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 84172265 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 84172276 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 3 84172279 C A Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 3 84172292 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 84172318 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 84172402 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 84172506 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84172570 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 84172583 G A Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 84172639 C T N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 84172864 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 84172951 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 84173025 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 84173029 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 84173171 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 84173327 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 84173334 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 84173359 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 84173369 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 84173482 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 84173522 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 84173591 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 84173620 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 84173624 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84173653 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 84173722 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 84173745 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 84173752 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 84173912 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 84173950 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 84174045 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 84174122 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 84174133 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 84174167 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 84174889 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 84174902 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84174988 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 84175675 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 84175824 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 84176912 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 84177074 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 84177195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84177367 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 84177714 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 84177786 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84177818 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 84177966 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 84178061 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84178368 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84178460 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84178487 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84178881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84179039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84179240 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 84179462 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 84179599 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 84179932 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 84180067 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 84180227 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 84180322 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 84180925 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84181006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84181211 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84181816 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84182528 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84182982 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 84183016 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84183419 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84183486 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 84183697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84183809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84183843 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84184145 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84184437 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 84184877 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84184878 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84185181 C G Y N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 3 84185198 A G Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 84185724 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 84185855 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84186056 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 84186135 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84190587 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84190716 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 84191060 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84191098 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 84191256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84191302 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84192239 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 84192850 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 84193073 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84193163 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84193195 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 84193225 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84193228 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84193243 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84193521 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84195348 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84195407 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84195523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84195591 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84195924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84195982 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84196453 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84197568 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84197769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84197951 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84198086 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 84198306 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 84198317 C G N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 84198343 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 84199402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84199630 A G N Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 3 84199974 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84200121 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84200437 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 84200639 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 84200648 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 84200874 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84201843 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84202132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84202287 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84202880 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84202934 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 84203242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84203565 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84203566 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84203999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84204018 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84204214 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84204632 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84204784 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84204848 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 84205001 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84205116 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84205149 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84205197 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84205209 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84205422 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 84205424 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 84205441 T C Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0 0.85 0.15 17 23 0 17 3 3 84205455 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84205652 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84205757 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84205862 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84206021 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84206109 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84206173 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84206449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84206528 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84206656 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 84206929 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 84207046 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 84207090 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 84207237 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 84207837 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 84208315 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 84208325 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 84208518 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 84208553 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84208699 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84208766 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84208772 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84208808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84209125 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84209365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84209575 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84210205 T C N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 84210975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84210976 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84211021 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84211088 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 84211091 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84211262 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84211329 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84211713 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84211786 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 84212060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84212078 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84212097 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84212177 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 84212226 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 84212244 C G N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 84212246 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 84212419 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 84212449 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 84212467 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 84212508 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 84212709 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84212727 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84212761 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84212778 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84213018 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84213498 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84214224 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84214539 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 84214588 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 84214634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84215651 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 84215791 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84215954 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 84215967 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84216140 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 84216271 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84218634 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84219752 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84219767 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84220165 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84222616 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84224087 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84224385 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84225563 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84225601 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84225668 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84225843 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84226045 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84226123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84226141 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84226935 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84227106 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84227277 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84227388 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84227425 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84227497 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84227541 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84227645 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84227914 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84227936 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84228234 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84228265 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84228304 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84228398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84228413 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 84228791 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84228792 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84229538 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84231858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84232350 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84232695 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84232765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84235894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84236963 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84237015 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 84237056 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84237450 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84237713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84237718 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84237752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84237800 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84237831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84237835 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84238844 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84238919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84239194 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84239603 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84239752 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84239823 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84239825 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84239866 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84241132 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84241248 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84241302 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84241339 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84241479 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84241488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84242451 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84242499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84242612 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84242624 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84242958 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84243902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84244076 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84244081 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84244856 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84245083 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 84245371 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 84245744 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84246937 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84247253 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84247267 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84247325 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84248869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84250336 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 84251253 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 84251952 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 84252000 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 84252319 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 84252561 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84252943 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84253099 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84253134 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 84253351 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 84253391 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84253489 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 84254124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84254197 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 84254898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84255096 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 84256248 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84256658 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84257378 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84258462 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84258516 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 84258551 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 84258561 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 84258571 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84258576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84258584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84258610 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 84258682 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84259013 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84260293 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84260424 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84261044 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84261077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84261305 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84261505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84263235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84263290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84263323 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 84263335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84263395 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 84263506 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84263837 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84263867 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 84263921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84264102 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 84264819 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84265705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84266270 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 84266338 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 84266673 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84266923 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 84267154 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 84267984 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84268120 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84268429 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84269975 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84270384 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84270616 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 84270735 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 84270970 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 84271195 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84271205 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84271651 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84271664 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 84271899 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 84273283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84274687 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84276371 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84277134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84277147 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 84279586 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 84279821 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84280032 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84280088 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 84280123 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 84280125 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 84280217 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 84280239 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 84280248 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 84280316 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 84280342 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 84280792 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84281471 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84281641 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84283226 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84283485 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84283523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84283566 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84284953 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84285097 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84285691 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84286189 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84286935 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 84286957 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84287949 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84287950 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84290314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84290747 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84293768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84296354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84298205 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 84298852 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 84300550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84301591 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 84302267 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 84304130 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 84304314 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 84305289 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 84305803 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84305860 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 84306800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84307640 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84308266 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 84308997 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 84309016 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 84309244 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 84309293 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84309993 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 84312095 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84312923 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 84313225 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 84314143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84315105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84315232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84315833 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 84316163 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84316437 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 84317721 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 84317899 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 84318120 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84318441 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 84319236 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84320518 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84321500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84321535 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 84321574 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84321654 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84321998 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 84322668 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84322689 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84322827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84322869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84323016 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84323122 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 84323334 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 84323506 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84323641 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 84323666 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84323957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84323985 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84323996 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84324433 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 84324516 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84324525 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 84325204 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 84326811 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 84328592 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 84328948 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84329187 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84329391 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 84329399 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 84329551 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84329620 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84329628 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84329941 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84330731 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84331016 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84331410 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 84331490 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84331960 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84332237 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84332271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84335209 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84335325 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84336835 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84336836 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84337634 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84337775 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84337779 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84337909 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84337922 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84337949 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84338118 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84338865 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84339084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84339229 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 84339722 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84339735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84339779 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84339959 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84340038 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 84340144 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 84340331 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84340554 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 84340677 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84341093 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84341640 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 84342159 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84342799 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84343863 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84344642 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84345062 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84345752 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84345782 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84345986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84346683 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84346745 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 84346862 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84346959 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 84347041 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84347195 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84347260 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84347445 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84347454 G A Y Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 84347543 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 84348004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84348190 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84348272 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84348396 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84348476 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84349347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84349503 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84349520 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84349577 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 84349762 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 84349844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84349848 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84350028 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 84350865 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84350946 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84351083 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84352077 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 84352876 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84353460 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84355534 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84355541 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84355865 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 84356210 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 84356438 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84356937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84357635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84357972 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84358384 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84359146 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84359683 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84360466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84360573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84360984 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84361418 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 84361556 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84361568 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 84361707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84361776 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84362069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84362289 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 84362346 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 84362349 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 84362681 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 84362709 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84363964 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 84363970 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 84364110 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84365914 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84365915 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84366859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84366901 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84366910 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84368547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84369182 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84369275 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 84369749 G C Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 84369781 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84369794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84369956 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 84370149 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84370361 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 84370402 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84371349 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 84371752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84371783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84372172 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84372354 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 84372455 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84372870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84373154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84373537 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 84373617 T G Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 84373873 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84374449 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 84374479 A G Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 84374619 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 84375204 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84375341 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 84375678 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 84375681 G C Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 84375769 C T Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 84375784 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84377035 C A Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 84377037 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84377180 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84377594 G T Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 84378073 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 84378143 A T Y N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 3 84378825 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84379055 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 84379109 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 84379295 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84379338 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84379598 C T Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 84379789 C T Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 84379938 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 84380025 C T Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 84380370 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 84380545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84382441 T A Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 84382829 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84382924 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84382934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84383129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84383142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84383202 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84383301 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84383375 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84383405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84383440 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84383498 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84383565 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84383804 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 84383983 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 84383997 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 84384212 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 84384245 A G Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 84384398 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 84384450 A T Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 84387184 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84387219 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84387227 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84387313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84387322 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84387365 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84387367 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84387606 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84387625 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84387657 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84387792 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84387799 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84387832 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84387908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84387952 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84388028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84388283 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 84388466 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 84388733 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84388748 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84388779 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84388923 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84388924 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84389188 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84389313 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84389363 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 84389760 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 84389792 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 84389872 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84389886 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84389950 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 84389974 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84390437 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 84390449 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 84390460 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 84390955 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 84391062 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 84391190 A G N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 84391482 T A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 84391815 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 84391900 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 84392650 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 84392688 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 84392702 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 84392752 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 84392848 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.0555555555555556 0.833333333333333 0.111111111111111 17 19 1 15 2 3 84392855 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.05 0.75 0.2 17 23 1 15 4 3 84392862 C A Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.0555555555555556 0.833333333333333 0.111111111111111 17 19 1 15 2 3 84392897 C A Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 84392911 C A Y N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 84394989 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 84397966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84399000 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84400013 G T N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 84401634 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 84402447 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 84403376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84404401 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84404426 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 84404442 C A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 84404489 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 84404501 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 84404664 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 84404710 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 84404968 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 84405151 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 84405187 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 84405403 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 84405429 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 84405875 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 84405878 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 84405940 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84406041 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 84406207 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 84406530 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 84406648 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84406975 T C Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 84407050 T C N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 84407059 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 84407432 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 84407536 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 84408014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84408130 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 84408573 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84409745 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 84409863 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 84409973 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 84410056 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 84410067 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 84410315 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 84410341 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 84410348 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 84410368 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 84410467 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 84410665 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 84411923 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84411944 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84412364 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 84412385 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 84412449 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84412592 G A N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.75 0 0.25 12 4 6 0 2 3 84412633 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.222222222222222 14 4 7 0 2 3 84412825 A T N N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 3 84412993 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 84413323 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 84413615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84413775 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 84413954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84414381 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 84414828 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84415362 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84415937 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84416683 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84417687 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84418309 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84418356 C A Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 84418357 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 84418382 G C Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 84418984 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84419216 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 84419261 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84419960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84420059 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84420180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84420329 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 84421360 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84423040 G T Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 84423759 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 84424319 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 84424703 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 84424899 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 84425574 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 84426172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84426762 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 84426795 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 84426915 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84426917 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 84428641 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84429717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84429958 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84430073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84430949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84431409 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84432435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84432683 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84433113 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 84434358 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 84434671 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 84434865 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84434877 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84434992 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84436487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84441238 A C Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 84443984 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84444192 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 84446980 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84446990 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84449549 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84450323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84450347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84454081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84454590 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 84454985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84458612 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84458625 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84458785 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 84459076 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 84459377 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 84459627 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 84459860 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 84460257 C T N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 9 11 3 3 4 3 84460264 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 8 10 3 2 4 3 84460328 T C N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.5 0.0833333333333333 0.416666666666667 13 11 6 1 5 3 84460355 C T N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.545454545454545 0.0909090909090909 0.363636363636364 13 9 6 1 4 3 84460359 A G N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.454545454545455 0.181818181818182 0.363636363636364 12 10 5 2 4 3 84460402 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 84460501 C A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 3 84460760 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 84460788 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 84460813 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 84461015 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 84461314 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84461864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84462506 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84462694 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 84463653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84464080 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84464776 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 84465029 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 84465965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84466999 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84468257 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84468352 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84468622 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 84468864 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 84470030 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84470733 C G N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 84470980 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 84471864 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84472013 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84472064 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84472183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84472408 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84472627 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84473080 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 84473156 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 84473158 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 84473171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84473329 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 84473333 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 84473361 T G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 84473400 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84473670 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 84473762 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 84473808 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 84473854 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 84473866 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 84474051 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 84474053 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 84474084 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 84474138 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 84474202 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 84474245 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 84474246 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 84474309 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 84474374 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 84474379 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 84474392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84474418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84474459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84474464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84474474 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 84474557 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 84474638 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 84474640 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 84474699 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 84474712 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 84474728 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 84474748 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 84474762 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 84474799 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 84475044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84475201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84475304 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 84475305 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84475317 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 84475370 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 84475378 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 84475443 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84475473 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84475971 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 84475983 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 84476263 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84476352 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84476587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84476832 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 84477827 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 84477833 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84478059 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 84478216 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 84478232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84478291 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84478446 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84478512 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 84479113 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 84479551 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 84479643 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 84479888 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 84479947 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 84480021 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 84480048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84480164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84481036 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 84481217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84481273 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84481382 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84481629 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84481697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84481849 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84481868 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 84481943 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 84482447 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 84482506 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 84482644 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 84482711 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84482945 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 84483167 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 84483458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84483693 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 84483748 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84483751 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84484013 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84484554 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 84484594 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 84484663 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 84484819 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 84484883 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 84484930 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84485130 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 84485300 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 84485391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84486044 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84486131 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84486242 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84486278 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 84486550 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84486564 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84486605 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 84486654 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84486774 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 84486799 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84486878 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 84486906 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.117647058823529 0.705882352941177 0.176470588235294 16 18 2 12 3 3 84486919 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 84487075 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 84487213 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84487232 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 84487997 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84488937 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 84489011 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 84489396 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 84489401 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84489660 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 84489716 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 84489790 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 84489886 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84489900 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 84489931 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 84489932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84489964 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 84490513 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 84490600 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 84490620 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 84490676 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 84490904 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 84490964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84491075 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 84491288 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 84491778 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84491951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84492743 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84492755 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84492839 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 84492958 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84493104 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 84493183 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 84493280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84493425 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 84493986 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84493997 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84494235 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84494371 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 84494400 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 84494415 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 84494466 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 84494555 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 84494580 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84494629 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84494660 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 84494946 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 84495088 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84495168 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 84495187 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 84495361 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 84495433 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 84495707 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84496445 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 84496729 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 84498017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84499189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84500802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84500806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84502127 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84502298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84502529 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84505218 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84505549 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84505981 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84506406 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 84506721 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 84507129 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84507271 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 84507333 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84508095 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 84508599 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84509347 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 3 84509359 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 84509402 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 84509412 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 84509413 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 84509443 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 84509444 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 84509472 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 84509543 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 84509557 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 84509602 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 84509639 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84510059 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 84510118 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 84510511 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 84510645 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 84512093 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84514249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84514274 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84514403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84515377 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84516520 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84516528 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 84516548 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84516623 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84516640 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84517077 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 84517082 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 84518519 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 84518571 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84518585 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 84518705 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 84518706 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84518775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84518794 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 84518809 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 84518881 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 84519023 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84519066 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 84519274 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84519429 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84519463 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84519810 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84519813 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 84519929 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84520001 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 84520020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84520137 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84520311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84520336 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84520416 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84520581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84520844 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84520957 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84520972 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 84521096 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84521564 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 84522055 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84522077 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84522115 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84522129 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84522209 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84522331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84522374 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84522390 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84522535 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 84522541 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 84522575 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 84522775 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 84523593 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 84523614 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 84523836 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 84524385 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 84524568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84524758 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 84524989 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 84525519 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84525587 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 84525592 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 84525676 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 84525718 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 84525760 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 84525798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84526041 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 84526160 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 84526426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84526634 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 84526705 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84526998 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 84528622 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 84529578 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 84529774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84530215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84530270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84530299 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84530337 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84530546 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 84530766 A T Y N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 84531389 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 84531678 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 84531683 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 84531771 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84532156 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 84532247 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 84532679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84533149 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 84533204 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 84533225 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 84533526 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 84533652 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 84533727 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 84533730 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 84533743 A T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 84533885 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 84534158 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 84534212 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 84534257 G C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 84534313 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 84534475 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 84534809 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 84534958 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 84534981 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 84535003 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 84535094 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 84536172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84536821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84536829 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84536841 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 84536875 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84536879 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84536970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84536974 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84537021 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84537041 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84537094 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84538030 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84538652 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84540954 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 84541397 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 84541885 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84542029 A T N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 84542473 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 84542475 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 84543560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84545679 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 84545820 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 84546154 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 84546280 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 84546532 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 84546794 C G Y N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 3 84546983 C T N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 3 84546984 A G N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 3 84547024 T C N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.25 0.0833333333333333 0.666666666666667 7 17 3 1 8 3 84547279 C T N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 3 84547494 G A N Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 11 9 2 7 1 3 84547760 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 84547814 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 84548013 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 84548407 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84549355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84550025 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84550483 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 84550490 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 84550779 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84550849 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 84550955 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 84551306 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 84551543 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 84551591 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 84551642 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84551664 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 84551714 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 84551721 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 84552037 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 3 84552226 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 84552571 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 84553193 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84553738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84553787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84554009 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 84554468 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84556532 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84556654 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84556658 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84556713 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84556853 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84556934 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84557066 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84557142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84557360 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84557522 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84557536 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 84557703 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 84557748 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 84557765 C G Y N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 3 84557841 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 84557896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84557917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84557974 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84558050 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 84558806 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84558975 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 84559102 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84560131 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84560920 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 84560925 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 84561223 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84561319 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84561402 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 84561532 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 84561842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84562037 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84562237 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84562594 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84562653 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84563317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84563647 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 84563762 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 84563936 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 84563937 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 84564522 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.125 0.6875 0.1875 15 17 2 11 3 3 84565002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84565810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84565835 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 84565939 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 84565970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84571483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84571503 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84572169 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 84573057 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84573069 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84573326 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84573815 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 84574055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84574159 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84574348 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 84574503 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 84574776 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 84574782 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 84574790 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84575244 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 84575256 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84575453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84575485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84575511 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84575641 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84575650 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84576111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84576120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84576369 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 84576424 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 84576841 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 84577042 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84577284 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84577542 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84577585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84577594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84577601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84577613 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84577869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84579260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84579276 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 84579503 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84581111 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84581176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84581387 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 84581646 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 84581732 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84582240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84582970 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 84583007 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 84583033 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 84583605 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 84584303 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84585383 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 84585469 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 84585493 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84585589 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84585648 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84585815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84585852 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84585875 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84585886 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84585944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84586071 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84586179 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84586293 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84586387 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84586491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84586544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84586763 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84586772 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84586814 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84586824 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84586876 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84586895 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84587015 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84587198 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84588059 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84588335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84588424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84588975 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84589166 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84589222 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84589635 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84589666 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84589821 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84589871 T C Y Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0 0.9375 0.0625 15 17 0 15 1 3 84590083 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84590665 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84590828 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84590894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84591075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84591115 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84591145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84591532 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 84591564 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 84591956 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 84592926 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84593225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84593389 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 84593659 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84593756 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84594291 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84594867 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 84594923 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 84595030 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 84595266 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 84596171 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84596653 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 84596912 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84596962 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84597185 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84598330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84598454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84600514 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84600581 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84601624 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84602604 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 84602610 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84602689 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 84602999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84603250 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84603852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84603923 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 84604158 C G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 84604900 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84606603 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 84606613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84607358 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84609362 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84609745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84611573 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84611586 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84616156 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 84616276 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84616349 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84617654 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 84619824 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84619905 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84621639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84624548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84625626 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84627829 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84630243 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84630330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84631485 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84631488 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84631503 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84635844 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84636596 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84636609 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84638984 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84639071 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 84640556 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84640784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84641059 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 84641076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84641813 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84643361 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84643893 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84644613 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 84644836 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84644844 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84645983 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 84646199 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 84647330 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84650167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84650266 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84650414 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84650532 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 84650695 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 84651070 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84651477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84652139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84652387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84652521 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84652683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84652728 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 84652865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84653062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84653107 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84653131 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 84653545 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84654056 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 84654272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84654778 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 84654875 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 84654918 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84655213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84655234 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84655296 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 84655618 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 84655798 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 84655901 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84656167 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84657021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84657670 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84658751 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 84658929 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 84659177 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84659607 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84659681 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84659779 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84659823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84660205 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84660673 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84661666 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84661701 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84661757 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 84661876 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 84662003 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84662189 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84662931 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 3 84664162 A G N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 84664698 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 84664717 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 84664745 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 84665108 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 84665122 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84665185 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84666282 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84666787 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 84666905 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84667176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84667193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84667404 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 84667413 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 84667553 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 84668431 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84668459 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84668464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84668975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84669094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84669363 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84669437 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84669547 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84669641 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 84669974 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84670632 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 84670685 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84670921 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 84672191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84672212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84672532 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 84672706 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84674532 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84674563 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84675027 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 84675421 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84675604 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 84675690 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84676989 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84677531 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84678411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84678505 G A Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 84679045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84679673 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 84680542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84681121 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84682503 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84682945 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84683166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84683544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84683773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84684130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84685008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84685348 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84685352 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84686288 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84686856 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84687160 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84687164 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 84687232 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 84687340 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 84687632 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84691904 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84693121 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84695212 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84697815 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84700868 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84702371 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84702415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84704985 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84707070 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84707375 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84708649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84708870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84715091 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84715542 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84716511 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 84722621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84723457 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 84728740 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 84732278 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 84736635 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 84737511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84739830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84742256 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84744368 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84747747 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 84751270 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 84753510 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84758826 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84759059 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84759687 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84759827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84761692 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84763319 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84768668 T C N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0 0.727272727272727 0.272727272727273 8 14 0 8 3 3 84774695 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84779603 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84779703 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84786109 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 84787017 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 84787044 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 84787059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84787143 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84787439 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84787476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84788606 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84788744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84789031 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84789933 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84790409 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 84791000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84792461 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84792824 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84792918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84793913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84794312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84798422 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 84802295 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84803445 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 84805352 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84806282 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 84809668 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 84809911 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84810033 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84810378 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 84811194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84811265 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 84811502 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 84811567 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 84811630 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 84811788 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 84811799 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 84811887 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 84812202 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 84812221 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 84812356 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 84812418 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 84812433 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 84812457 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 84812779 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 84813100 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 84813105 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 84813196 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 84813200 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 84813282 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 84813283 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 84813304 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 84813343 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 84813413 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 84813515 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 84813540 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 84813541 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 84813669 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84813675 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 84814045 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 84814159 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 84814208 G T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 84814282 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 84814355 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 84814377 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 84814383 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 84814457 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84814471 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 84814600 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 84814601 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 84814642 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 84814644 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 84814776 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 84814778 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 84815494 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 84815868 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 84815974 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 84815997 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 84816192 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 84816226 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 84816410 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84816542 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 84816561 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 84816841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84817814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84818122 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84818685 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 84818689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84818798 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 84819242 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84819277 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84819750 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84819791 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84819910 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 84819983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84820585 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 84820606 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 84821264 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 84821300 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 84821435 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 84821455 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 84822344 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 84822435 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 84822502 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84822544 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84822672 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84822729 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84822767 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84822903 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84822919 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 84823485 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 84823513 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84824542 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 84824581 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 84825233 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 84825671 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 84825745 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 84825750 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84825888 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 84826514 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 84826792 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 84827421 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 84827799 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84828856 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84828984 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84829228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84829908 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84829984 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 84830756 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84831836 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 84831952 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 84832056 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 84832357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84834034 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 84834749 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 84835023 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 84836067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84836795 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 84837602 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 84837888 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84838208 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 84838258 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 84838463 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 84838577 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84838612 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 84838803 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 84841673 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84841833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84843370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84843453 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 84843713 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 84843742 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 84843905 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84843938 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84843957 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84843987 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84844224 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 84844444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84844450 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 84844563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84844613 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 3 84844901 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 84844958 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 84845132 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84845260 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 84845278 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 84846414 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84846474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84846560 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 84846572 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 84846651 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84846678 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 84846698 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 3 84846946 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84847619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84847663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84847737 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 84847757 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 84847772 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 84848245 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84848371 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 84848464 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84848507 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84848596 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84848640 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84848867 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84849419 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 3 84849757 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 84849860 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84850077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84850129 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84850282 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 84850327 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84850417 G C N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.3125 0.625 0.0625 20 12 5 10 1 3 84850489 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 84850496 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 84850500 T A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 84850527 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84850643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84850740 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 84851165 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84851169 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84851196 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 84851340 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84851404 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84851458 G T Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 84851527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84851552 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84851645 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 84851782 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84851984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84852008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84852036 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84852110 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84852247 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 84852564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84852708 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 3 84852845 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 84852988 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84853023 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84853094 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 84853134 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 84853206 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 84853318 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 84853352 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84853493 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84853588 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 84853595 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 84853638 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 84853834 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 84853855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84854219 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84854348 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 84854592 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 84855437 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84855540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84855731 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 84855750 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84857156 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84857799 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 84859352 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 84861101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84861242 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84861823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84862971 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 84864851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84865197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84865957 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84866928 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 84867226 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 84867287 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84867567 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84867588 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84867705 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 84867755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84867803 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 84867970 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 84868040 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84868058 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84868157 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 84869073 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84869898 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 84870037 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84870424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84871251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84871522 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84872340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84874284 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84874360 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 84875358 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84875435 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 84875438 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 84875792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84875824 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84876220 T G N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 84876472 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84876504 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84876869 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84876970 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 84877029 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84877284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84877371 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 84877661 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 84877855 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 84877940 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84877970 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84878028 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84878123 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 84878132 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84878699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84878734 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 84878832 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 84878835 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 84878854 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 84878911 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 84878988 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84879010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84879072 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84879163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84879182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84879228 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84879235 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84879299 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84879435 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84879437 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84879469 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84879722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84879877 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84880008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84880057 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84880068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84880076 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84880246 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 84880461 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84880645 G T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 3 84880653 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84880697 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 84880699 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84880731 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84880758 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84880804 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84880877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84880890 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 84880907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84880931 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 84880956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84880975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84880977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84881079 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84881172 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84881181 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84881225 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84881226 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84881268 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84881306 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84881340 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84881407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84881448 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84881463 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84881577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84881622 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84881699 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84881745 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84881756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84881948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84881998 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84882082 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84882083 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 84882176 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 84882177 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84882204 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84882247 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84882278 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84882376 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84882426 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84882486 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84882491 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 84882535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84882626 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 84882714 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 84882779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84882896 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 84883091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84883150 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 84883201 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 84883346 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 84883371 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 84883450 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 84883484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84883760 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 84884238 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84884345 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 84884361 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 84884456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84885003 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 84885031 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 84885064 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84885511 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84885534 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84885552 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84885737 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84886030 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84886247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84886264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84886277 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84886284 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84888107 G A Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 84888993 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84889179 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84889206 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84890441 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84890894 A T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84892076 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84892337 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84893161 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84893830 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84893856 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84893908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84893959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84894070 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84894104 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84894188 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84894196 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84894252 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84894270 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84894346 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84894357 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84894554 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84894566 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84894807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84895173 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84895194 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84895367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84895800 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84895996 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84896048 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84896069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84896073 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84896087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84896383 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 84896394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84896537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84896589 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 84896639 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 84896737 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 84897012 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 84897231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84897517 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 84897599 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84897779 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 84897817 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 84897859 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 84897895 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 84897902 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 84897918 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 84898203 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 84898229 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 84898293 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 84898311 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 84898423 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 84898515 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 84898684 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 84898689 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 84898699 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 84898790 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 84898904 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 84899002 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84899054 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 84899088 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84899229 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84899336 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 84899373 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 84899428 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 84899475 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 84899547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84899568 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 84899576 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 84899640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84899649 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 84899687 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 84900050 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 84900071 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 84900126 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 84900219 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 84900366 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 84900452 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84900512 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 84900878 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 84900911 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 84901109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84901394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84901522 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84901949 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 84902037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84902745 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 84902914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84902987 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 84904369 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84904396 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 84904533 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84904727 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 84904928 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 84905161 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 84905170 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 84905728 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84905955 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84906262 G C N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 84906294 T C N Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 5 5 1 3 1 3 84906455 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 84906460 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 84906509 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 84906513 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 84906730 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84906770 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84906772 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84906943 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84907050 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 84907142 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84907155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84907270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84907442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84907451 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84907519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84907553 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84907710 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84907727 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 84907728 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 84907741 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 84908030 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84908045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84908090 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 84908279 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 84908301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84908722 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84908807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84909173 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84909684 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 84909969 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 84910050 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 84910136 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 84910845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84911675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84911963 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84912849 T G N N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.222222222222222 0 0.777777777777778 4 14 2 0 7 3 84912851 T C N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 5 15 2 1 7 3 84912899 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 84913055 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84913128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84913214 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84913528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84913609 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 84914048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84914067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84914649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84914705 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 84914939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84915219 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 84915228 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 84915281 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 84915282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84915655 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 84915714 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 84915728 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84915811 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 84916080 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 84916235 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 84916374 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 84916393 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 84916489 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 84916772 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 84916812 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 84916859 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 84916882 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 84916976 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 84917067 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 84917074 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 84917127 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 84917131 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 84917178 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 84917212 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 84917253 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 84917397 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84917414 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 84917481 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84917720 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 84918067 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 84918191 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 84918232 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 84918438 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 84918482 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 84919953 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84919989 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 84919993 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84920392 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84921040 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 84921045 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 84921298 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84921463 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 84921802 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84922019 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84922427 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84924062 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84924178 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 84924306 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 84924428 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 84924437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84924485 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 84924505 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 84924548 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 84924647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84924657 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 84924704 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 84924776 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84924844 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84925077 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 84925203 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 84925236 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 84925246 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 84925926 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 84925940 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84925946 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84925954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84926104 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 84926119 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 84926153 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 84926186 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 84926260 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84926708 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84929049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84929100 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 84929129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84929686 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 84932139 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 84932267 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84932571 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 84933115 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 84933243 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 84934384 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 84935268 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 84935390 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 84935430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84935522 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 84935983 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84936130 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 84936589 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 84936614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84936657 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 84936711 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84936768 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 84936861 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84936867 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84936914 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84937133 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 84937378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84937948 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 84938012 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84938364 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 84938459 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84938482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84938511 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84938519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84938772 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84939293 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84939489 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84939592 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 84939659 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 84939776 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 84940043 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 84940111 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84940139 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 84940244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84940473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84940703 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 84941067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84941185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84941196 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 84941336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84941623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84941754 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 84941984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84942204 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 84942221 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84942521 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 84943674 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 84943675 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 84943826 G T Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 84943956 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 84944072 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 84944096 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 84944319 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84944946 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 84945163 A C Y N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 84945445 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84945465 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 84945493 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 84945692 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84945817 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84946019 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 84946262 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 84946413 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84946643 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 84947281 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 84947332 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 84947933 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 84948113 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84948289 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 84948575 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84948744 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 84949647 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 84949654 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 84949665 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 84949768 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 84949789 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84949974 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84950039 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 84950365 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 84950692 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84950876 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 84950890 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 84950891 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 84951136 C A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 84951265 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 84951489 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84951571 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 84951756 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 84952391 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 84952882 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84953008 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84953229 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84953273 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84953678 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 84954101 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84954155 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 84954187 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 84954208 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 84954227 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 84954263 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 84954527 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 84954528 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 84954538 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 84954605 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 84954847 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 84955201 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 84955217 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84955267 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84955308 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84955776 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 84955780 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 84955997 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84956047 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84956503 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84956579 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84956648 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84956689 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84956723 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84956768 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84956850 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84957203 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 84957363 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84957447 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 84957469 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 84957678 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84957721 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 84958034 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84958038 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84958083 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84958164 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 84958191 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 84958303 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 84958568 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84958766 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 84958866 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84958867 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84960019 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 84960306 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 84960526 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84960802 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 84961205 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84961811 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 84962667 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84963144 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 84964072 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84964418 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 84964434 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84964544 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 84964554 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84964571 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 84964821 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 84965211 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 84965244 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 84965465 A G N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 84965763 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 84965813 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 84965881 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 84966106 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84966187 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 84966414 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 84966505 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 84966601 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 84966624 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 84967418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84967470 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84967782 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 84967844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84968067 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 84968068 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84968092 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84968198 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 84968248 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84968265 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84968405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84968528 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 84968561 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 84968586 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84968633 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 84968653 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 84968698 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84968764 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84968834 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 84968903 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84968948 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 84968978 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84969009 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 84969054 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 84969234 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 84969314 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84969324 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 84969331 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 84969339 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 84969470 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84969497 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 84969569 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 84969688 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84969708 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84969845 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 84969862 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 84969901 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 3 84970101 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84970249 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 84970415 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 84971269 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84971286 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 84971768 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 84971902 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 84972059 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 84972118 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84972208 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 84972389 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 84972545 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84972619 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 84972699 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 84973135 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84973177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84973473 C T N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 84973653 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 84973807 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 84973952 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84974103 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84974384 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84975244 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84975337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84975379 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84975901 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 84975927 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 84976023 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 84976068 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 84976251 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84976311 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 84976444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84976539 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 84976769 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 84976828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84976853 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 84976977 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84977057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84977394 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84977654 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84977824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84977894 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 84978116 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 84978120 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 84978414 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84978508 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 84978710 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 84978902 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 84978957 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84978999 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84979040 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84979175 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84979283 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84979383 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84979392 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84979479 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 84979482 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 84979927 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 84980035 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84980360 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84981402 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 84981639 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 84981905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84982015 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 84982201 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84982321 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84982570 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 84982743 A C N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 84982877 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 84983042 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84983115 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84983160 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84983408 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84983702 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84983703 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84983741 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 84983788 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 84983931 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84984067 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84984243 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84984270 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84984276 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84984313 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 84984357 T G N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 3 84984358 T G N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 14 18 0 14 2 3 84984417 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84984496 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 84984618 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84984656 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84984661 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84984678 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84984748 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84984755 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 84984762 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84985023 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84985055 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84985112 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 84985172 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84985204 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84985263 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84985344 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84985438 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84985439 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84985513 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84985552 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84985575 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84985669 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84985961 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 84986053 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 84986103 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 84986530 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84986543 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84986603 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84986646 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84986809 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84986817 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84986828 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84986850 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84986865 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84986876 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 84987095 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 84987154 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 84987187 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 84987271 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 84987420 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84987472 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 84987589 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 84987621 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84987631 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84987792 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 84987906 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 84988132 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84988790 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84988814 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 84988911 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84988928 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 84989621 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84989700 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84989715 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84989948 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84990053 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84991964 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 84992824 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84992962 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84993000 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84993845 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84993861 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 84993902 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 84993983 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 84994000 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84994696 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84995014 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 84995403 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 84995456 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 84995708 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 84995773 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 84995844 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 84996435 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 84996504 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 84996606 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 84996607 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 84996672 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 84996725 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84997003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84997075 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84997176 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 84997396 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84997544 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84997583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84997584 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84997595 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 84997717 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 84997747 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 84997754 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 84997764 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 84997784 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 84998031 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 84998072 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 84998098 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 84998168 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84998290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84998291 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84998391 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 84998441 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 84998551 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84998568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84998723 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84998770 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84998793 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84998835 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 84998888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 84999119 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 84999297 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 84999763 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 85000129 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85000256 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 85000296 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 85000342 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85000480 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 85000499 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85000564 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85000578 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85000628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85000678 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 85000872 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85001276 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85001470 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85001542 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85001621 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85001656 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85001718 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85001765 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85001773 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85001911 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85001916 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85001932 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85001991 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 85002023 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85002294 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85002458 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85002601 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85002752 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85002788 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85002802 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85003055 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85003386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85003408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85003430 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 85003494 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85003575 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85003815 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 85003865 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85004185 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85004353 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85004646 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 85004761 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 85004902 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85004970 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 85004994 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 85005485 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85005674 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85005704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85005731 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 85006338 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85006416 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 85006454 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85006556 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 85006793 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 85006796 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 85006896 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 85006898 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 85007133 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85007217 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85007445 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85007446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85007462 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85007560 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85007859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85008283 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85008840 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85009593 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85009802 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85011777 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85012038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85012254 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 85012268 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 85012808 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 85012814 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85013182 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85013963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85014090 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85014657 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85018310 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85018970 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 85019027 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 85019039 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85020115 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 85020176 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 85020305 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 85021762 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85023193 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85023256 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 85023304 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 85025304 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85025770 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85026342 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85026431 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 85026511 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 85026523 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85026765 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 85027009 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 85027165 A C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 85027358 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 85028086 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 85028345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85028652 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 85029159 G T Y N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 85029246 G A Y Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 85029248 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 85029934 G T Y N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 85031003 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 85031778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85031936 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 85032207 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85032325 A T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 85032448 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85032628 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 85032761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85035278 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85035377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85036114 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85036396 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85038096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85038768 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85039592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85039644 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85040186 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85040226 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85040263 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85040396 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 85040535 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85040662 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85040667 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 85040891 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85040913 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85040976 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 85040989 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 85043116 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85043231 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85043847 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85044131 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85044141 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 85044821 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85045550 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 85045551 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 85045747 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85045859 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 85045868 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 85045881 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 85045902 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 85048029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85048608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85048897 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85049322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85050260 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 85050872 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 85051047 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 85051061 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85051214 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 85051294 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 85051471 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 85051509 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 85051579 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 85051638 T G N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 3 85051679 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 85051746 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 85051835 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 85051872 A T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 85052020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85052055 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 85052137 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 85052207 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85052243 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 85052281 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85052290 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85052295 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85052318 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85052324 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85052338 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 85052347 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 85052510 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 85052522 T C Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 85052535 G T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 85052774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85052862 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 85052927 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85053037 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 85053046 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85053227 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 85053267 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 85053273 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 85053400 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 85053477 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85053497 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85053527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85053549 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 85053712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85053778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85053795 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85054523 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 85054551 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 85054630 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 85054645 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 85054679 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 85054791 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 85054838 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85054847 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 85055061 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 85055256 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 85055257 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 85055346 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 85055406 A C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 85055498 G T N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 3 85055601 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 85055634 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 85055660 T C N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 85055668 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 85055864 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 85055961 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 85056253 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 85056323 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 85056337 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 85056339 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 85056354 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 85056386 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 85056442 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 85056587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85056782 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85056915 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85056926 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85056929 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85057044 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 85057116 T G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 85057133 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85057218 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85057249 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85057292 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85057481 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 85057509 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 85057538 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 85058215 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85058281 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85058344 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 85058406 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 85058531 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85058545 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 85058567 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85058628 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 85058639 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 85058648 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 85059010 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 85059593 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 85059600 C A Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 85059983 A T Y N 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 3 85060285 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 4 8 2 0 4 3 85060328 A G Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 85060581 T C Y Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 3 85060727 C T Y Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 85060828 T C Y Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.3 0.7 0 13 7 3 7 0 3 85060882 G A Y Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 85061712 T C Y Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 3 85062288 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 85062337 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 85062820 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 85062954 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 85063078 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 85063551 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 85063614 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 85063655 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 85063887 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85064246 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 85064263 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85066204 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85066289 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 85066324 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85066630 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 85066834 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 85067066 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 85067114 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 85067115 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 85067217 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 85067277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85067345 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 85067424 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85067627 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 85067692 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 85067696 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 85067730 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 85067756 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 85067778 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 85067780 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 85067798 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 85068363 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 85068372 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85068383 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85068465 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 85068494 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85068565 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85068594 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85068752 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 85068850 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 85068872 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85068951 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 85069369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85069872 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 85069922 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 3 85069926 T A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 3 85069962 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 85069968 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 85070623 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85070635 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 85070727 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 85070894 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 85071228 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 85071522 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 85071546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85071576 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85071719 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85071775 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 85071873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85071999 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85072174 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85072182 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85072250 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85072323 C G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 85072335 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 85072379 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85072452 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 85072465 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 85072471 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 85072476 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 85072535 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 3 85072554 A T N N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 3 85072653 A G Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 3 85072717 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 85072779 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 85072791 A C N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 85072812 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 85072910 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 85072931 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85072951 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 85072982 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85072990 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 85073003 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 85073046 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85073057 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85073071 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 85073125 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 85073202 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85073222 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85073257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85073283 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 85073326 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 85073346 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 85073405 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85073499 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 85073557 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85073654 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85073676 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85073779 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85073812 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 85073904 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85073975 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 85073978 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 85074072 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 85074251 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85074285 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85074534 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85074836 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 85074844 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85074861 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 85074975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85075037 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 85075237 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 85075565 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85075652 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 85075676 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 85075777 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 85075789 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 85075811 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 85075863 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 85075947 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 85075973 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 85076062 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 85076157 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85076557 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 85076570 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 85076828 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 85076906 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85077212 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 85077217 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 85077330 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 85077344 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 85077352 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 85077616 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 85077660 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 85077729 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85077735 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85077825 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 85077845 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 85077940 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 85078129 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 85078772 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 85079294 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 85079441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85079474 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85079804 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 85080174 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85080368 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 85080452 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85080528 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85080621 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85080645 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 85081069 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85081387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85081589 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 85082891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85082966 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 85086635 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 85086670 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 85087182 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85087223 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 85087366 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85087535 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85087540 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85087577 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85087661 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 85087916 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 85088006 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85088024 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85088419 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 85088481 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85088677 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 85088884 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 85088942 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 85089067 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 85089288 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85089358 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85089432 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85089643 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85089696 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 85089723 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 85089744 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85089897 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 85089949 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 85089982 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 85090114 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85090163 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85090169 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85090332 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85090662 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 85090697 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 85090739 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 85092168 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85092441 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85093466 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85093514 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 85093622 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 85093643 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 85093661 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 85093688 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 85094487 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85094710 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 85094864 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 85095017 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85095100 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 85095124 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85095134 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 85095337 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 85095684 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85095941 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 85096282 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 85096304 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85096405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85096455 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 85096465 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85096537 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 85096696 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 85096733 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 85096759 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85096953 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 85096981 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 85097125 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 85097152 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 85097205 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85097670 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85097982 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85098707 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 85099595 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85099616 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 85099653 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 85099682 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 85099691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85099821 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 85099886 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 85099921 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 85099977 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 85100030 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 85100133 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85100187 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 85100193 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 85100222 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 85100229 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 85100284 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 85100314 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 85100316 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 85100485 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 85100490 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 85100498 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 85100506 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 85100630 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 85100714 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 85101155 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 85101397 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 85101436 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 85101948 G A Y Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0 1 0 12 12 0 12 0 3 85102118 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 85102136 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 85102156 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 85102380 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 85102516 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 85102891 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 85102986 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85103023 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 85103041 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85103062 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85103081 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 85103132 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85103141 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85103143 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85103303 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85103396 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85103480 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 85103642 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85103696 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85104615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85105155 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85105305 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85105457 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85106316 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85106447 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85107131 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85107361 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85108330 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85108504 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85108526 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 85108553 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85108693 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 85108738 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 85112372 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 85112639 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 85112746 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85112776 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85113674 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85113680 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85113711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85113723 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 85113796 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 85114322 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 85114403 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 85114505 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85114574 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85115056 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 85115722 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 85116430 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85116578 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 85116671 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 85117551 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85118600 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85118847 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 85119067 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85119346 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 85119389 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 85119707 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 85119739 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 85119754 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 85119916 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 85120047 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 85120639 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85120790 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85120971 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85121085 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 85121314 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85121741 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85122398 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85122437 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 85122562 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 85122852 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85122874 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85122888 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 85123067 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 85123210 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85123291 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85123358 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85123407 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 85123570 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85124012 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85124195 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85124452 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85124601 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85124672 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 85124673 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 85124698 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85124708 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85124838 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85124984 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85125146 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 85125203 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85125205 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85125225 T G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 85125319 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85125339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85125405 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85125498 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85125553 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 85125612 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85126176 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 85126309 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 85126485 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 85126529 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 85126541 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 85126542 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 85126561 G C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 85126569 C A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 85126590 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 85126599 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 85126646 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 85127560 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85127618 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85128252 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85128337 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 85128593 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85128755 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85128873 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85128958 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 85129030 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 85130695 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85130749 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 85131209 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 85131227 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 85132575 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 85132650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85132726 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85132808 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85132930 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85133117 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 85133257 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85133365 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85133450 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85133485 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85133517 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 85133622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85133635 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85133654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85133945 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 85133980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85134070 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 85134087 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 85134198 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 85134232 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85134406 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 85134453 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85134486 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85134721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85134783 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85134811 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 85134825 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 85134928 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85135085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85135118 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85135125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85135305 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85135358 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 85135434 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 85135542 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 85135636 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85135685 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 85135812 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 85135839 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85135924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85135927 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 85136163 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85136306 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 85136367 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 85136443 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 85136473 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85136657 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85136856 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85136967 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85137058 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 85137687 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85138057 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85138307 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 85138447 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85139001 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85139110 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85139616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85139711 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 85139716 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 85139739 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 85140519 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85140822 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 85140834 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85140854 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 85141644 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 85141795 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 85141810 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85142038 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85142337 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 85142859 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85143714 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85144581 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85144646 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85144844 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 3 85144966 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85144993 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85144997 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85145100 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85145174 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85145459 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85145543 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85145714 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85145767 C G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 85145995 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 85146103 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 85146210 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85146294 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85146355 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85146363 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 85146406 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85146549 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85147145 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 85147164 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85147297 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85147316 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 85147397 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85147468 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 85147475 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 85147485 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 85147486 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 85147611 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 85147632 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85147870 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85147975 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85147979 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85147997 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85148031 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 85148255 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85148281 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 85148592 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 85148716 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85148798 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85148805 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85148828 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85148872 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 85148947 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85148970 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85149148 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 85149165 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 85149185 G T Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 85149195 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 85149259 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85149327 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85149621 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 85149744 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85149755 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85149773 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85149789 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85149803 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85149810 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 85149864 G T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 85149878 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 85150001 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85150010 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 85150014 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85150399 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85150516 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 85150595 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85150631 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85150655 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85150938 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85151081 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85151086 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85151120 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 85151129 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85151258 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85151279 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85151329 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85151330 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 85151355 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85151441 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 85151547 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 85151647 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 85151668 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85151691 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85151835 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85151957 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85152063 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85152167 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 85152200 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 85152277 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85152390 C T Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 85152700 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 85153144 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85153316 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 85153657 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 85153855 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85154071 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 85154175 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85154234 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 85154295 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85154315 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 85154322 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 85154535 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85154638 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85154642 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 85154897 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85155016 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85155221 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85155374 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85155393 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 85155480 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 85155514 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 85155795 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85155899 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 85155909 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 85156077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85156118 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 85156177 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 85156233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85156234 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85157636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85158855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85159160 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85159604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85159768 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85160538 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85161772 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85161795 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85162021 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85162043 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85162118 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85162164 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85162182 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85162231 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85162266 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85162268 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85162280 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85162288 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85162304 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85162337 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85162759 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 85162774 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 85162899 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85162931 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85162998 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 85163006 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85163077 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85163140 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 85163184 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 85163205 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85163718 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 85163758 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 85163763 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85163775 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 85164091 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 85164098 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 85164179 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 85164192 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85164533 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85164562 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 85164593 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 85164628 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85164881 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 85164924 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 85165028 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 85165117 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 85165153 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85165187 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 85165277 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 3 85165280 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 3 85165390 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 85165523 C A N N 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.333333333333333 0.111111111111111 0.555555555555556 7 11 3 1 5 3 85165544 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 85165553 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 85165826 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 85166341 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 85166416 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 85166445 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85166530 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85167210 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 85167229 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 85167274 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 85167298 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 85167327 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 85167391 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 85167440 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 85167470 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85167550 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 85167667 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 85167668 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 85167908 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 85168058 G C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 85168088 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 85168224 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 85168235 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85168337 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 85168377 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 85168393 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 85168522 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 85168612 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 85168627 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 85168720 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 85169095 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 85169284 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 85169329 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85169344 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85169428 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85169453 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 85169457 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 85169602 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85169645 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85169674 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 85169690 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 85169759 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 85169799 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 85169805 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85169838 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85169844 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85169959 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 85169980 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85170028 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85170114 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 85170182 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 85170223 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85170281 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 85170356 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85170381 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 85170399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85170432 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 85170810 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85170908 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 85170909 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 85171541 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85171603 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85171898 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 85171949 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 85172019 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85172383 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85172387 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 85172693 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85173605 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85173708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85174665 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85174805 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 85175282 A T N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 85175347 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 85175361 C T N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 3 85175396 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 85175405 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 85175503 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 85175508 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 85175564 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85175575 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85175586 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85175604 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 85175670 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 85175868 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 85175926 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85175948 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 85176607 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 85176704 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 85176782 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 85176784 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 85178287 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85178472 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 85179830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85181376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85182488 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85183128 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85183374 G A Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 85184251 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 85184704 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85185828 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 85186607 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 85187062 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85188291 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 85189734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85190982 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85191008 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 85191326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85191714 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85192581 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85192784 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 85193094 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 85196621 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85196724 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 85196800 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85196930 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 85197101 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 85198858 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 85199257 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85199473 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 85199659 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 85200475 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85200800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85200840 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85200878 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85200914 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 85200985 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 85201036 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 85201049 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 85201328 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 85201356 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 85201391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85201660 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 85202737 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 85202847 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 85203356 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85203902 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 85204401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85204564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85205618 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 85206252 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 85206409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85207079 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85207436 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 85208185 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 85208197 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 85208517 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85208601 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85208606 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 85208615 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85208709 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 85208798 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 85208872 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 85209260 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 85209362 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 85209383 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 85210172 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85210217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85210472 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85211028 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85211305 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85211572 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85212045 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85212101 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85212320 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85212321 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85212464 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85212487 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85212536 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85212580 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85213145 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85213743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85213776 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85213861 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85213949 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85213963 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85214052 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85214403 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85214635 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85215063 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85215093 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85215212 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85215294 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 85215449 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85215618 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85215719 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85215779 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85216213 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 85216425 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 85216519 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85216557 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85218517 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85219134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85219395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85219943 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85220127 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85220710 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85220717 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85220882 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 85221043 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 85221327 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 85221388 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 85222358 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85222936 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 85223098 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 85223307 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85225385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85226143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85226157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85227007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85227096 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85227277 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85227870 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85227871 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 85227894 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 85227932 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 85228175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85228217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85228430 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85228470 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85228577 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85228632 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85228633 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85229483 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85229811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85230215 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 85230231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85230304 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85230383 T A N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 85231626 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 85231636 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 85231724 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 85231748 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 85231796 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 85231891 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85231934 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 85231955 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 85232085 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 85232158 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 85232271 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 85232281 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 85232354 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 85232415 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 85232530 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 85233097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85233346 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 85233351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85233357 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 85233367 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85233943 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 85234285 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 85235500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85236910 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 85236932 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85237088 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85237698 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85237814 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 85237940 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 85238157 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 85238172 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85238197 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 85238221 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 85238257 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 85238344 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 85238376 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 85238484 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 85238517 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 85238585 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 85238606 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 85238647 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 85238681 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 85238724 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 85238798 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 85238834 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 85238936 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 85239094 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 85239099 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 85239133 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 85239164 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.117647058823529 0.823529411764706 0.0588235294117647 18 16 2 14 1 3 85239288 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 85239494 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 85239516 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85239552 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 85239907 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 85240193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85240523 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85241154 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 85241442 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85241677 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85241850 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 85241864 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 85242182 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 85243083 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 85243571 A G Y Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.3 0.7 0 13 7 3 7 0 3 85243852 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 85244240 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 85244258 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 85244639 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 85247393 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85247837 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 85247869 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 85247926 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85248146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85248403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85248740 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 85248793 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 85250107 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85250575 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 85250971 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85252141 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 85252173 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85252683 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 85253660 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85253859 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85253914 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 85253929 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 85253955 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 85254178 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85254434 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85254466 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85254890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85255016 C G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 85255048 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85255062 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 85255074 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85255089 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 85255113 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 85255135 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 85255214 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 85255293 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 85255294 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 85255356 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 85255420 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85256103 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 85256701 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85256873 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85256912 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 85257001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85258371 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85258396 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 85258960 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85259000 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85259496 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85259587 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 85259970 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85260361 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85260450 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85261070 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85261137 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 85261212 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85261275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85262432 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85262712 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 85262863 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85263380 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85263632 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 85263667 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 85263788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85263950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85264230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85264239 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 85264364 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85264393 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85264509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85265877 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 85265912 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 85266108 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 85266459 T G N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 3 85266675 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85266853 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 85266923 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 85267212 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 85267347 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 85267475 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 85267490 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85267491 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 85268265 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 85268273 A T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 85268831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85269228 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85270159 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85270169 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85270811 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85271759 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 85272680 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 85272857 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 85273075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85273200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85274478 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85274873 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 85274880 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 85275221 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 85276200 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 85276354 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 85276356 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 85276386 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 85276560 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 85276730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85277048 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 85277050 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 85277140 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 85277307 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 85277334 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 85277437 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 85277455 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85277525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85277621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85277967 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 85278727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85281853 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 85281979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85281985 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85282071 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85283169 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85283329 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 85283489 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85284429 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85285586 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 85286650 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85286693 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 85286914 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85286916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85286931 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85286980 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85287025 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85287044 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85287442 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85289651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85293079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85294991 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85297511 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 85298706 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 85298825 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85300929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85300970 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85306730 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85307627 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85308574 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85312741 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 85312862 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 85313621 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 85313779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85314517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85315605 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85315971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85315982 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 85316013 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85316046 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 85316104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85316363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85316394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85316518 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85317022 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85317098 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 85317267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85317388 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85317434 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85317592 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 85317607 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 85317617 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 85317711 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 85317943 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85319335 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 85319625 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 85319983 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85320141 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 85320359 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 85320694 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85320764 C G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 85321355 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 85321361 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 85321405 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 85322356 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 85322394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85322954 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 85323543 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85323594 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 85324357 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85325396 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85325683 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85325743 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85326548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85326936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85327197 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85328562 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85328590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85329495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85332660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85333678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85336569 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85336584 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85336681 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85336734 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85336743 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85336924 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85337677 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 85337685 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85337711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85337892 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85338123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85338136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85338151 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85338359 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85338404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85338633 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85338786 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85345489 A G Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 85346130 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85346240 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 85347881 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 85347987 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 85349869 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 85356654 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85360568 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 85364130 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85364842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85365065 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 85366172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85366250 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85369119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85369884 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85371535 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85371590 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85372486 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85373324 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85374410 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85375672 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85377018 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85377127 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85377412 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85378943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85379229 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85381622 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 85384709 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 85385294 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85385462 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 85385723 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85385770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85385800 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 85386998 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 85387998 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 85388082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85388423 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85389292 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85389333 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85389457 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 85389514 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85390051 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 85390219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85390372 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 85391074 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85391302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85391790 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85391925 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85393146 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 85393147 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 85393527 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 85393610 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 85393616 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 85393791 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85393891 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 85394228 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 85394268 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 85394458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85394793 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85394814 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 85394929 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85394954 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 85395136 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 85395186 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85395191 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 85395447 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85395583 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 85395594 G C N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 85396026 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 85396210 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85396281 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 85396362 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 85396368 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85396404 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 85396741 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85396819 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85397154 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 85397361 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85397681 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 85397840 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 85398253 G C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 85398442 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 85398485 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.0625 0.75 0.1875 14 18 1 12 3 3 85398547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85398570 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 85398745 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 85398812 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 85398985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85399496 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85399920 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85400165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85400339 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 85401037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85402427 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 85402987 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85403499 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85404000 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 85404780 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85404829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85405042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85405565 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 85406012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85406049 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 85406689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85406798 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 85407028 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85408694 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 85409316 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85409384 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85409490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85409601 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85409707 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 85409728 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 85409799 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85410041 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85410063 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85410068 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85410503 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 85410588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85410630 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 85411018 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 85411028 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 85411155 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 85411317 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85411386 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 85411516 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 85411527 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 85411640 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85411778 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85411784 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 85412033 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 85412078 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85412332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85412755 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85412917 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 85412941 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 85412944 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85412962 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 85412988 A T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 85413003 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 85413034 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85413035 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85413241 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 85413257 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 85413288 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85413326 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 85413327 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 85413368 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 85413382 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85413417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85413445 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 85413473 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 85414287 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 85414382 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 85414875 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85414969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85414979 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 85415063 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 85415121 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 85415142 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 85415160 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 85415212 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 85415267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85415293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85415419 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 85415673 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85415700 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 85416042 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 85416062 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 85416290 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 85416327 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 85416482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85416759 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85417116 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 85417328 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85417386 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 85417705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85417811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85417865 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85417934 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85417951 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 85417973 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 85418074 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 85418381 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 85418715 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 85418976 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 85419016 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 85419047 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 85419082 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85419095 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 85419576 T G N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 85419828 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 85419862 A T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 85419880 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 85419953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85419958 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 85419967 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 85420596 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 85420824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85421249 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85421313 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85421355 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 85421619 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 85421672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85421877 A C Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 85421974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85422005 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 85422347 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85422519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85423283 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85423357 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85423491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85424173 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 85424255 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 85424410 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 85424550 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85424990 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 85424999 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 85425797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85426131 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85433584 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 85433774 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85433906 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85434127 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 85434201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85434206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85434243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85434365 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 85434449 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 85434491 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 85434493 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85434515 C G Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 85434537 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 85434764 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85435062 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 85435245 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 85435476 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85435642 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 85435845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85435866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85436025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85436093 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85436146 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85436170 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 85436314 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 85436336 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 85436497 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85436508 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85436550 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85436563 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85436578 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 85436608 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85436615 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85436631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85436661 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 85436670 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 85436699 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 85436700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85436713 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 85436725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85436744 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 85436777 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 85436796 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 85436875 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85436902 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 85436951 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85436992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85437111 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 85437212 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 85437295 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 3 85437304 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 85437387 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 85437639 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85437648 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 85437784 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 85437882 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 85437994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85438175 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 85438283 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85438672 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 85438892 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 85439139 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85439175 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 85439392 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 85439632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85439649 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85440657 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85440783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85444048 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 85447691 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85449096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85450386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85450977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85451473 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85451738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85452053 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85452450 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 85454855 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85455243 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 85457261 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85457310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85457407 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 85457843 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85459025 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 85459269 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 85459528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85459568 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 85459586 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85463847 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85464377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85464527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85465269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85466140 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85468130 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 85468282 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85468560 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85468584 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85468746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85468784 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 85468864 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 85469184 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85470187 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 85470504 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 85470571 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 85470822 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 85470941 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85470951 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 85471216 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85471273 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85471404 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85471829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85471830 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 85471927 A T Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 85472566 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85472588 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85472712 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85472827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85472852 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85473154 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 85473158 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85473818 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 85474072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85474187 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 85474340 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 85475007 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85475486 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85475643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85475662 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 85476838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85478021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85478780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85480908 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85481087 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85482784 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85482820 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 85482916 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 85482943 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85482952 A C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 85483314 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85483408 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85483693 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 85483697 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 85483704 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 85483913 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85484067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85484838 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 85485732 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85485922 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 85486148 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 85486269 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 85486282 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 85486442 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 85486486 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 85486562 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 85486966 G C N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 3 85487422 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 85487976 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85488156 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 85490971 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85491618 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85494157 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 85494305 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85494363 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 85494656 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 85497935 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 85498107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85498436 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85498506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85498734 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 85498827 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85499124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85499209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85499453 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 85499651 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85499953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85499966 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85499988 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 85500113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85500125 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 85500171 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85500182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85500186 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85500329 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 85501045 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 85501074 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85501148 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 85501180 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85501183 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85501247 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85501543 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 85501554 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85502199 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 85502362 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 85502374 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85502560 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85502951 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85502955 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85503121 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85503237 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 85503405 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85504275 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 85505019 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85505129 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 85505153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85505501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85506123 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85506129 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85506368 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 85506376 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 85506872 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 85507401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85507410 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85507426 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 85507436 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85507574 C A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 85507652 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85507773 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85507903 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 85507922 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 85508088 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 85508234 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85508618 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 85508619 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 85508906 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 85509091 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 85509333 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85509519 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 85509529 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 85509530 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 85509642 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 85509924 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 85509935 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 85510154 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 85510158 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 85510224 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 85510433 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 85510642 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85510807 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85510907 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 85510914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85510934 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 85510959 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 85511060 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 85511072 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 85511190 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85511294 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 85511421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85511712 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85511732 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85511790 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85511920 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85512130 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85512256 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85512336 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85512463 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 85512533 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 85513300 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85513393 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85513654 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85515014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85515305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85516956 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85516958 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85517139 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85518816 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85518951 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85519110 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85519145 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85519290 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85519302 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85519304 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 85519327 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85519580 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85519601 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85519616 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85519634 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85519643 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85519671 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85519692 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85519742 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85519749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85519850 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 85519858 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 85519869 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85520109 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85520263 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85520309 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 85520310 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 85520425 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85520491 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 85520512 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 85520518 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 85520600 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 85520823 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 85520862 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85521016 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85521073 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85521181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85521485 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85521556 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85521837 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85521866 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85521895 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85522038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85522149 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85522356 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85522515 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85522806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85522857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85522880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85522939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85522974 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85522978 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85523039 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 85523092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85523283 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85523289 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85523345 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85523427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85523514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85523917 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85523975 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85524120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85524207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85524744 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 85524800 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 85524824 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 85525283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85525297 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85525456 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 85525559 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 85525564 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85525775 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85525785 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85526254 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 85526291 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85526620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85526777 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 85526822 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85526859 C G Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 85526860 A C Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 85526957 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85526997 C A Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 85527098 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85527257 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85527906 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85527977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85528243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85528250 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85528370 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 85529196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85529507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85529982 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85530114 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85531730 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85532347 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85532557 T C Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 85532632 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 85532812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85532880 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 85533498 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85533967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85535237 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 85535671 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85536286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85536802 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85540385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85541201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85541868 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 85543007 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 85543848 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85544179 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 85544390 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85544737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85548374 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85548651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85549773 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85549787 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 85549943 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85550285 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85550492 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 85551730 C A Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 85552500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85552714 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 85553133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85553420 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 85554787 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85555737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85556860 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 85556914 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 85557091 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85557276 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 85557379 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 85557591 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 85557794 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 85557874 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 85557977 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 85558163 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 85558187 T C Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 85558212 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85558221 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 85558227 C G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 85558599 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 85558710 A G Y Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 85558733 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 85558791 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 85558893 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85559368 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 85559392 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 85559434 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85559942 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85559987 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 85560035 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85560343 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85560499 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 85560509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85560514 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 85560647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85560784 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 85560860 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 85564891 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85565366 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85565864 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85566459 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85567419 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85569404 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 85574681 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85575163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85576482 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 85576751 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 85576813 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 85576954 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 85577041 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 85577579 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 85577581 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 85577805 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 85578000 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85578001 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85578054 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85578156 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85578166 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85578469 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85578485 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85579522 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85579808 T A N N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.363636363636364 0.363636363636364 0.272727272727273 12 10 4 4 3 3 85580839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85584188 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85584989 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 85585060 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 85586385 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85586423 T G Y N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 85586501 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 85587828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85587829 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 85587854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85587930 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85588044 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85588236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85588289 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85588347 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85588375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85588378 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85588497 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85588499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85588582 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85588698 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85588716 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85588729 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85588936 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85588963 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85589163 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85589316 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85589329 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85590326 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 85590798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85590840 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85591161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85591484 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85591625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85591852 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85591977 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85591986 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85592036 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85592079 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85592199 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85592238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85592297 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85592380 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85592413 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85592457 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85592593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85592609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85592670 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 85592711 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85592807 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85593158 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 85593440 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85593541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85593632 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85593661 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 85593907 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85593916 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 85594422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85594497 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 85594533 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 85594571 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 85594711 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85594957 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85595074 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85595246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85595569 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85596100 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85596145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85596462 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85596601 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85596634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85597746 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 85597850 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 85598235 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 85598239 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85598339 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85598340 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85598385 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 85598582 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 85598584 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 85598697 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 85598699 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 85598801 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 85598867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85598897 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 85599247 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 85599265 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 85599266 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 85599312 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85599390 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85599543 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85599550 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 85599868 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85600010 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 85600032 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85600063 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 85600197 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85600220 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85600231 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 85600774 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85600788 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85600818 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 85600820 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 85600935 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85600945 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 85600996 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85601011 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85601169 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 85601218 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85601237 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85601433 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85601476 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 85601488 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 85601510 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85601599 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85602010 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85602055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85602065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85602114 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85602184 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85602423 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 85602492 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85602861 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85602870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85602875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85602945 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 85603007 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 85603105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85603108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85603116 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85603320 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 85603374 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 85603792 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 85603852 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85603918 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 85604315 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 85604659 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85604680 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 85604824 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 85604877 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85605021 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 85605569 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 85605752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85605787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85605981 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85606014 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85606444 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85606566 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85607433 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 85607485 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85607494 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85607546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85607588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85607967 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85608006 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85608256 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85608327 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85608367 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85608613 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85608720 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85608949 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 85608992 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85609053 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85609826 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85610001 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 85610420 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 85610770 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85610799 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85610831 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85610870 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85611060 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 85611279 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 85611322 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 85611666 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85612590 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 85612943 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 85613088 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85613745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85613791 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 85613836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85614050 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85614713 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85615466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85615527 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85615733 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 85615767 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 85616064 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 85616472 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 85616718 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 85617036 C T N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 3 85617156 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85617298 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 85617511 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 85617551 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 85617579 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 85617620 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 85617668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85617865 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85618066 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 85618229 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 85618310 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 85618396 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 85618489 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85618608 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 85618636 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 85618704 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 85618787 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 85618805 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 85618937 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 85619030 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 85619033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85619122 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 85620351 A T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 85620803 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 85620833 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85620875 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 85620949 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 85621139 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 85621170 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 85621238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85621244 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 85621303 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 85621639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85621847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85621855 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 85621976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85622058 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 85622501 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 85622582 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 85622670 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85622769 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 85622799 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 85623069 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 85623186 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 85623203 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 85623372 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 85623688 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 85624340 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 85624373 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 85624488 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 85624509 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85624670 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 85624769 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85625426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85625649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85625650 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85625700 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 85625726 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 85625771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85625833 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 85625836 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 85625866 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 85626142 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 85626949 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 85627061 T G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 85627098 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 85627353 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 85627412 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 85627501 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 85627527 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 85627556 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 85627793 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 85628085 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 85628101 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 85628194 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 85628290 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 85628394 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 85628493 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85628513 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 85628676 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 85628686 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85628824 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 85628830 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 85628949 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 85629025 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 85629085 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 85629138 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 85629146 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 85629160 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 85629222 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 85629236 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 85629454 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 85629551 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 85629840 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 85629882 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 85629902 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85629980 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 85629992 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85630144 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 85630245 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 85630317 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 85630517 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85630521 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 85630559 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 85630610 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85630630 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 85630691 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 85630699 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 85630733 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 85631057 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 85631094 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 85631166 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 85631517 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 85631605 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85632167 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 85632417 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 85632488 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85632820 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 85632907 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 85632908 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 85633375 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85633453 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 85633534 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 3 85633635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85633754 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 85633905 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85634278 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 85634300 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 85634888 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 85634929 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 85634978 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 85635030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85635083 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85635236 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85635267 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 85635378 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 85635471 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85635494 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85635524 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85635541 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85635575 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85635594 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85635609 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 85635690 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 85635737 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 85635820 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85635842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85635961 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 85636202 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 85636393 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 85636423 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85636503 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 85637084 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85637336 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 85637759 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85637996 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85638010 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85638589 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 85638657 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85638809 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 85639572 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85639788 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85640014 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85640166 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85640269 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85640324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85640354 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85640401 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85640521 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85640582 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85640591 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85640608 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85640657 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85640675 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85640739 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85640779 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85640879 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85640920 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85640940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85641001 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85641010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85641067 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85641113 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85641183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85641185 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85641223 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85641316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85641323 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85641443 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85641449 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85641495 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85641527 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85641538 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85641539 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85641894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85642227 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85642335 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85642514 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85642669 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85642937 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85643147 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 85643151 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 85643178 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 85643195 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 85643242 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85643287 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 3 85643382 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85643664 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85643712 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 85643714 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 85643839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85644198 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85644201 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85644302 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 85644375 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85644379 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85644415 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85644527 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85644640 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85644716 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 85644757 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 85644811 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85645070 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85645130 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85645186 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85645338 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 85646034 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85646233 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 85646304 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 85646347 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85646491 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 85646586 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 85646606 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 85646870 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 85647094 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85647100 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85647125 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 85647232 T A N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 85647372 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 85647383 A C N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 85647604 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 85647616 C A N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.571428571428571 0.214285714285714 0.214285714285714 19 9 8 3 3 3 85647689 G A Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.571428571428571 0.214285714285714 0.214285714285714 19 9 8 3 3 3 85647779 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 85647841 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85647854 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 85647882 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 85647940 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 85647946 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 85648112 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 85648182 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85648221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85648299 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85648418 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 85648591 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 85648594 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 85648649 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 85648760 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 85648840 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 85648951 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 85648958 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 85648976 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 85648980 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 85648992 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 85649144 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 85649202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85649229 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 85649300 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85649366 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 85649381 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 85649600 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 85649637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85649648 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 85649783 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 85649823 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85649831 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85649863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85649884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85650170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85650257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85650574 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85650735 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85651040 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85651385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85651454 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 85651562 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85651594 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 85651595 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85651680 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 85651929 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 85651990 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 85652180 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 85652193 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 85652354 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 85652560 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 85652636 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 85653016 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 85653089 C G N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 3 85653459 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 85653509 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85654051 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 85654065 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 85654116 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 85654181 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 85654362 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 85654629 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 85654702 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 85654714 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 85654782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85654791 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 85654823 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 85654928 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 85655023 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 85655046 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 85655145 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 85655257 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 85655278 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 85655316 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 85655722 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85656095 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 85656425 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 85656492 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 85656661 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85657115 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 85657309 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 85657338 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 85657617 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85657780 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 85657914 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 85657949 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 85658016 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 85658027 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 85658039 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 85658101 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 85658126 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 85658196 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 85658517 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 85658524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85658722 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85658742 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85658986 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 85659031 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 85659065 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 85659314 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85659429 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85659469 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 85659501 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85659521 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 85659531 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85659541 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 85659542 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85659565 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85659567 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85659611 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85659821 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 85659883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85659914 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85660886 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 85661142 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 85661181 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85661276 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 85661459 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 85661617 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 85661842 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85662025 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 85662291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85662299 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85662536 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85662589 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85662595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85662815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85662937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85662986 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85663040 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 85663199 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 85663471 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 85663497 C T N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.181818181818182 0.545454545454545 0.272727272727273 10 12 2 6 3 3 85663502 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 85663578 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 85663804 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 85663890 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 85663959 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 85663960 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 85663986 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 85663993 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 85664127 A T N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 3 85664259 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 85664325 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 85664482 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 85664780 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85665037 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 85665343 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85665379 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 85665508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85666317 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 85666409 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 85666530 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85666586 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 85666965 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 85667168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85667679 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85668057 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 85668127 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 85668823 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85669090 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85669216 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 85669484 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 3 85669525 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 85669680 A T N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 85669689 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 85670409 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 85670562 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 85670689 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 85670722 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 85670745 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85670767 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85670913 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 85671063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85671112 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85671223 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85671800 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 85671810 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 85672029 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85672125 C G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 85672203 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 85672219 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 85672372 T G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 85672542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85672630 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 85672658 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 85672770 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85672841 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 85672947 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85672981 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 85672999 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 85673026 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85673068 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 85673099 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 85673257 C T N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 3 85673264 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 85673443 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 85673475 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 85673490 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 85673642 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85673784 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 85673814 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 85673861 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85673935 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 85673939 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85674208 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85674238 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 85674251 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85674597 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 85674656 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85674699 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85674758 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 85674808 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 85674837 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 85674936 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 85674983 T A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 85675023 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 85675072 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85675104 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 85675208 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 85675228 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 85675234 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 85675264 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 85675292 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 85675382 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 85675430 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 85675508 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 85675664 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85676087 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 85676157 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 85676276 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 85676347 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 85676369 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 85676573 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 85676798 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85676806 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 85676920 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 85677341 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 85677410 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85677523 G T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 85677666 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85677838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85677845 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 85677873 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85677888 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 85677925 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85677997 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 85678156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85678518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85678638 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 85678666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85678858 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85679038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85679134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85679211 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85679644 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85679992 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85680147 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 85680223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85680347 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85680677 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 85680684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85680733 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85681615 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85681906 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85681946 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85681960 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 85681987 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85682009 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85682077 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85682177 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85682198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85682200 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85682564 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 85682583 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 85682845 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 85682869 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85682973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85683187 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 85683295 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85683730 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 85683798 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85683922 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 85683965 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 85684451 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 85684480 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 85684508 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85684961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85685896 T A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 85686125 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 85686294 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 85686556 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 85686676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85686773 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 85687125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85687310 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 85687450 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 85687465 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 85687483 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 85687989 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 85687994 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 85688186 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 85688254 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 85688261 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85688311 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 85688339 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85688384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85688451 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 85688702 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 85688733 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85688916 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85688937 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 85689057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85689678 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 85689690 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 85689716 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 85689729 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85689814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85690420 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85690729 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 85691531 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85691541 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85692148 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85695220 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85695415 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 85695794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85695838 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85696389 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 85696748 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 85697270 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 85697528 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.0625 0.9375 0 17 15 1 15 0 3 85697800 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85700253 A T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 85701726 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85702499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85702744 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85705149 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85705880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85706041 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85706316 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 85706530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85706689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85706982 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85707688 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85707758 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 85707789 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 85708969 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85709163 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 85709352 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 85709431 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 85709503 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 85709511 A G Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 85709561 G A Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 3 85709675 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 85709991 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85710044 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85710305 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85710320 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 85710401 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 85710403 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85710559 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85711548 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 85712827 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85713935 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85714488 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 85714883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85714936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85715038 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 85715122 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 85715341 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85715356 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 85715690 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85715934 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85716125 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 85716805 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85716816 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85716821 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85717021 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85717064 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85717173 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 85717223 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85717247 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85717278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85717360 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85717548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85718220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85718239 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85718293 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85718294 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 85718788 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85719145 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 85719370 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 85719654 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 85719787 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 85720132 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 85720429 G T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 85720843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85720939 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 85721136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85721579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85721706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85721771 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85721890 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 85722024 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85722390 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 85722541 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85722592 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 85722738 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85722774 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85722805 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 85722884 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 85723117 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 85723184 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 85723198 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 85723240 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 85723304 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 85723369 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 85723479 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85723697 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85723804 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 85723916 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85724030 A G N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 85724128 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 85724225 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 85724573 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 85724684 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85724759 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85724771 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85724807 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85724865 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85724870 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85725024 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85725314 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 85725577 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 85725623 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 85725683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85725718 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 85725853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85726957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85727326 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 85727329 C T Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 85727381 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 85727410 T C Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 85727741 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 85727757 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 85727783 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 85727822 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 85727979 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 85728277 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 85728288 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85728330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85728379 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85728451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85728793 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 85728849 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 85728985 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 85729005 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 85729050 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85729088 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85729114 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85729116 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85729343 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 85729382 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 85729393 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 85729489 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85729518 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 85729593 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 85729665 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 85729682 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 85729740 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 85729769 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 85729835 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 85729956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85729964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85729986 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 85730103 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 85730118 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85730192 C A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 85730242 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85730306 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85730309 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85730320 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85730352 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85730406 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85730631 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85731010 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 3 85731249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85731549 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85732002 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85732135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85732901 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85733150 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85733443 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85734672 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85734896 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 85734907 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 85735038 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85735769 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85736212 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 85736334 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 85736727 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 85736828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85736846 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 85736932 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 85736973 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 85737000 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 85737104 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 85737142 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 85737143 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 85737165 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 85737441 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 85737507 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 85737518 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 85738178 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85738315 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 85738416 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 85738738 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85738848 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85738855 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85738890 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85738893 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85738940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85738961 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85739193 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85739362 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85739422 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85739573 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 85739643 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 85739680 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85739883 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85739951 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85739965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85740066 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 85740700 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 85740865 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85741008 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85741019 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 85741030 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85741124 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 85741132 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85741366 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 85741550 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 85741584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85741736 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85741844 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 85741934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85741950 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 85742169 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 85742236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85742256 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 85742422 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85742533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85742546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85742561 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 85742577 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 85742581 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 85742616 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 85742843 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85742924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85742956 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85743005 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 85744729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85744786 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 85744793 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 85745440 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85745585 A G Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 85745800 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 85745895 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85747115 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85747140 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85747275 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 85748785 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 85748883 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 85748905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85749077 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 85749200 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85749349 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85749531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85749625 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85752268 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 85753183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85754820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85754912 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 85755004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85755312 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85755504 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 85755858 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 85756095 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 85757085 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85757107 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85758055 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 85758886 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85759713 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 85760541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85766712 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 85767087 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85768503 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85775040 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85776625 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85776858 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 85777032 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 85777474 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85777679 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85777891 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85778425 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 85778510 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 85779096 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 85779256 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85779257 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 85779283 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 85779470 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85779796 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85779879 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 85779963 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 85780076 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 85780106 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 85780182 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 85780222 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 85780431 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 85780545 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 85780643 T A N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 85781024 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 85781095 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 85781262 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 85781304 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 85781426 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 85781450 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 85782007 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85782020 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 85782296 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85782349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85782646 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85782654 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 85782714 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85783088 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 85783132 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85783207 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 85783309 T C N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 3 85783628 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 85783682 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 85783902 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 85783983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85784020 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 85784122 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 85784656 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 85784667 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 85784681 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 85784732 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 85784767 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 85784818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85784957 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85784959 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 85785008 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85785023 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85785047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85785081 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 85785704 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 85785723 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 85785742 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 85785784 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 85785838 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85786043 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 3 85786072 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85786137 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85786725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85786814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85786822 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85787689 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 85787811 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85788056 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85788101 T G N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 3 85788144 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 85788296 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 85788458 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 85788576 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85788966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85789071 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85789268 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 85789392 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85789398 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85789404 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 85789522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85789527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85789543 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 85789700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85789811 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85790130 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 85790191 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 85790249 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 85790256 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 85790305 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 85790409 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85790430 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85790431 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85790485 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85790498 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85790631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85790700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85790714 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85790715 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 85790832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85791140 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85791141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85791451 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85791465 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85791479 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85791495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85791526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85791626 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85791732 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 85791762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85791766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85792013 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85792502 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85792788 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85793308 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85795220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85795276 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85795317 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85795619 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85795651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85795668 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85795686 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85796215 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 85796216 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 85796446 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85796560 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85796614 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 85796652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85797122 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 85797140 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 85797361 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 85797593 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85797745 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 85797907 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 85798368 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 85800037 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 85800559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85800866 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85800910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85801218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85801559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85802903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85803226 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85803240 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85804278 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 85804890 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85804984 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85805066 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85805365 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 85805374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85805456 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85805465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85805708 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 85806207 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 85806254 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 85806463 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85806484 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 85806505 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85806566 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 85806590 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 85807113 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 85808451 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85808543 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 85808631 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85808632 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85808927 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 85808981 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 85808986 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85808992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85809050 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85809136 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85809599 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 85809624 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 85809987 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85810255 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 85810410 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 85813583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85814092 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85814249 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85814540 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85814693 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85815441 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 85815507 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 85815521 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85815594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85818891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85819212 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 85819370 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 85819592 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 85819593 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 85819634 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 85819656 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 85819763 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 85819769 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 85819830 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 85819983 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 85820055 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 85820180 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 85820407 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 85820477 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 85820565 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 85821019 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 85821171 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 85821356 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 85821412 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85821491 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85821509 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 85821528 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85821534 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85821757 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 85821860 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 85821878 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 85821980 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85822021 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 85822031 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 85822458 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 85822627 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85822677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85822807 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85822834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85822848 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85822909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85822912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85822941 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85822985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85823038 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85823069 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85823132 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 85823169 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 85823230 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85823248 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 85823274 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85823278 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 85823294 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 85823316 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 85823385 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 85823421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85823468 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85823526 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 85823541 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 85823887 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 85824633 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85824820 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85824841 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 85824944 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85824952 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 3 85825009 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85825071 T G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 85825328 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 85826723 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 85830243 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85831643 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85833040 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85835337 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 85835382 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 85835681 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 85836828 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 85837981 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 85838065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85838535 A C Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 85838657 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 85838658 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 85838803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85840548 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85841777 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85842195 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85842505 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85842575 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85843815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85844574 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 85846875 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 85847446 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85847456 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85848814 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85850820 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 85855467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85857724 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85857788 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 85858307 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85859025 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 85862103 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85862405 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 85862638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85862837 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85863106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85864634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85864847 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 85864939 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 85866711 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85866895 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85867220 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85868581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85870747 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 85870850 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 85871190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85871697 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85871702 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 85872335 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 85872687 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85873062 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 85873209 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 85873252 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 85873338 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 85873378 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 85873753 G T Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 85873766 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 85873788 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 85873800 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 85873829 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 85874058 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85875583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85875991 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 85876042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85876115 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 85876208 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85876272 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85876481 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85876524 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85876584 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 85876610 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85876761 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 85876899 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 85877010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85877029 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 85877113 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 85877159 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 85877255 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 85877648 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 85877692 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 85877759 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 85877773 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 85877802 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 85877819 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 85877901 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85877956 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 85878021 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 85878050 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 85878075 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 85878080 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 85878178 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 85878183 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85878230 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 3 85878312 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 85878315 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 85878594 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 85878607 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 85878609 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 85879152 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 85879496 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85879514 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85880047 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 85880048 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 85880118 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 85880142 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 85880299 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 85880332 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 85880360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85880386 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 85880395 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 85880425 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 85880450 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 85880494 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 85880633 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 85880739 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 85880762 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 85880805 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 85880871 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 85880878 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 85880897 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85880971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85881078 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 85881103 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 85881145 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 85881184 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 85881243 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 85881251 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 85881553 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 85881577 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 85881703 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85881739 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 85881751 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 85881935 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 85882022 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 85882029 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 85882120 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 85882142 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 85882156 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 85882170 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 85882273 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 85882409 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 85882562 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 85882573 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 85882676 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 85882779 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 85883203 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 85883212 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 85883250 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85883270 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 85883468 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 85883587 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 85883596 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 85885480 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 85885489 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 85885664 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 85885682 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 85885730 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 85885854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85885913 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 85885994 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 85886019 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 85886053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85886097 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85886126 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 85886229 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 85886332 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 85886454 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 85886546 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 85886626 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85886670 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 85886706 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 85886777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85887903 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 85888030 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85888108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85889260 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85889977 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85891830 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85892224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85893642 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 85894203 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 85894212 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 85894223 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 85894335 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85895442 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85895447 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85895767 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 85895825 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 85895834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85895887 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85896139 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 85897046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85897266 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 85898114 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85898941 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 85899799 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 85899812 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 85899815 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 85899836 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 85899957 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 85899969 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85900077 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85901223 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85901240 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85901257 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 85901535 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 85901633 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 85901640 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85901895 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85901920 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 85901964 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 85902197 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 85902305 G A N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 3 85902333 A G N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 8 12 1 6 3 3 85902465 G T N N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 3 85902636 C T N Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 3 85902673 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 85903264 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 85903286 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85903358 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 85903459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85903576 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85903855 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85903863 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 85903883 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 85903975 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 85903997 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 85904044 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 85904119 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 85904241 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 85904258 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 85904321 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 85904327 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 85904388 G T N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 3 85904520 A T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 85904523 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 85904578 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 85904962 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85904963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85905079 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85905617 C A N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 85905826 C A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 85905977 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 85906079 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 85906200 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 85906888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85907361 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85908751 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85908858 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 85909074 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 85910059 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 85910330 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85910361 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 85910645 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85911136 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85911980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85912152 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 85912269 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 85913615 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 85913638 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85913824 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85913850 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 85914073 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85914096 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 85914132 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85914241 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85914273 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85914280 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85914310 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85914347 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85914711 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 85915239 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 85916219 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85916441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85916777 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 85917126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85917398 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85917497 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85917570 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.176470588235294 0.0588235294117647 0.764705882352941 7 27 3 1 13 3 85917944 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85919868 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85919950 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 85920014 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85920016 C G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 85920028 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 85920051 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85920077 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85920891 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 85921092 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 85921226 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 85921425 G A N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 9 11 3 3 4 3 85922579 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 85922750 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85922754 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 85923320 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85923572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85923857 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 85924236 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 85924762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85925248 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85925749 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 85925943 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 85926792 A T N N 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0833333333333333 0.666666666666667 0.25 10 14 1 8 3 3 85927041 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 85927047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85927115 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 85927127 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 85927284 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 85927334 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85927438 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 85927585 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 85927807 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85927842 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85928171 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85929082 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 85929126 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85929138 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 85929337 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 85929341 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 85929392 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85929433 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 85929437 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 85929603 A G Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 85930217 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85930458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85930922 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85931086 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85931732 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 85931837 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85932391 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 85932583 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 85933045 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 85933255 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 85933942 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 85933950 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 85933960 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 85933980 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85934121 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 85934136 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85934196 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 85934261 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 3 85934282 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 85934291 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 85935010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85935060 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 85935305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85935350 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85935491 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 85935527 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 85935603 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 85935705 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85935781 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 85936151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85936273 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 85936348 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85936377 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 85936410 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 85936696 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 85937050 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85937934 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85939379 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85939491 T C Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 85939651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85940147 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 85940500 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 85940700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85940704 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85940733 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 85940786 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85940872 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 85940999 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 85941185 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 85941186 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 85941815 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 85941944 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85942196 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 85942547 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 85942687 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 85942858 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 85942930 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 85942944 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 85942991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85943334 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85943335 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85943349 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 85943372 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 85943448 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85943485 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 85943493 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 85943574 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 85943614 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85943628 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 85943743 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 85943778 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 85943910 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85944105 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85944130 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 85944656 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 85944876 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 85944915 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 85944932 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85945352 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 85945411 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 85945445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85945468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85945552 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 85945807 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 85946161 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85946218 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85946261 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 85946278 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 85946308 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85946624 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 85946929 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 85947248 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 85947340 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85947944 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85947988 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 85948223 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85948407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85948598 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85949017 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85949022 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 85949147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85949376 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85949382 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85949480 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 85949525 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 85949585 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85949916 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 85950045 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85950102 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85950435 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85950847 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 85952921 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 85953059 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85953605 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 85953640 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 85953643 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 85953750 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 85953796 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 85953836 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 85953839 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85953966 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 85953981 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85954212 C G N N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 9 9 3 3 3 3 85954238 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 85954492 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 85954802 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 85954955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85954969 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85954977 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 85954989 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85955290 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85955328 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 85955373 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 85955377 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 85955401 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 85955466 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 85955490 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 85955615 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 85964448 T A Y N 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 7 11 1 5 3 3 85964479 T C Y Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 9 9 2 5 2 3 85964801 C T N Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 3 85964903 G C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 85964928 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85964943 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85964995 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.4375 0.1875 0.375 17 15 7 3 6 3 85965308 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85965312 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85965446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85965515 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 85965764 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 85965768 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 85965821 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85965863 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 85965868 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 85965883 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85965994 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 85966114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85966143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85966232 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 85966274 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85966542 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 85966796 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 85966846 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 85967161 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 85967183 G A N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 3 85967412 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85967414 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 85967510 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 85967651 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 85968419 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 85970564 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85971822 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 85971942 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 85973430 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 85976007 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 85979100 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 85981269 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 85985452 A C Y N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 85987637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85989974 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85990098 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85990452 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85990671 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85991303 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 85991374 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 85992318 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 85992581 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85994306 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 85994356 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 85995792 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 85996268 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85997253 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 85998923 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86000066 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 86000321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86000672 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86000939 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86001338 A G N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 86001463 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 86002286 G A Y Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.363636363636364 0.272727272727273 0.363636363636364 11 11 4 3 4 3 86002290 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 86003050 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86003681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86003815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86003960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86004447 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86005331 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 86005440 A C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 86005472 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86005475 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 86005864 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 86005989 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 86006361 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 86006514 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 86006591 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 86006645 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 86006784 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86006834 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86006948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86007064 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 86007065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86007284 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 86007342 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 86007700 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 86008335 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86013034 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86014198 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 86014587 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 86016061 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86017256 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 86018276 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 86019421 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 86020272 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 86020830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86020879 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86021535 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 86021699 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 86021756 T C Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 86021775 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 86021819 G A Y Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 7 9 2 3 3 3 86021896 G A Y Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 86021908 G A Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 86021961 T C Y Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.5 0 0.5 4 4 2 0 2 3 86021978 T C Y Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.4 0 0.6 4 6 2 0 3 3 86022128 G T N N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 3 86022241 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 86022300 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 86022323 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 3 86022324 T G Y N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 86022423 C A Y N 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.0909090909090909 0.636363636363636 0.272727272727273 9 13 1 7 3 3 86022461 C G Y N 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 7 11 1 5 3 3 86022524 T G Y N 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 3 86022534 C A Y N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 3 86022552 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 3 86022600 T C N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 3 86022613 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 3 86022633 G C N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 3 86022736 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 86022807 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86022859 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86022943 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86023060 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 86023087 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 86023125 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 86023556 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 86023579 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 86023589 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 86023649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86023683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86023778 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 86024112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86024369 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86024565 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 86024674 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 86024741 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86024940 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86025011 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86025045 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 86028445 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86029947 C T N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 3 86029948 T A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 3 86030814 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 86031245 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 86031317 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 86033210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86036964 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86038144 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 86038950 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 86041432 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86048455 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86048581 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86048629 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86048709 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 86049352 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86050022 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86051856 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 86052062 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86052951 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86053119 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86053287 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86053391 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 86053673 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 86053732 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86054022 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 86054821 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86057385 C A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.294117647058824 0.117647058823529 0.588235294117647 12 22 5 2 10 3 86058225 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86058621 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86060115 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86061163 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 86061887 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86065345 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86065728 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 86066499 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86067844 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86068460 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 86068583 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 86068589 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86068763 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86068764 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86068774 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 86069441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86071081 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 86072067 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 86073055 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86073235 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 86073295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86073738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86074097 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 86075011 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 86075436 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86075796 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 86076179 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86076186 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86076285 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86076496 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86076525 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86076643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86076723 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 86076833 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 86076877 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86077106 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86077118 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86077252 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86077272 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86077327 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86077382 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86077416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86078061 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86078096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86079116 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 86079125 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 86079162 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 86079167 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 86079388 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86079389 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86079452 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 86079506 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 86079701 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 86079719 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 86079782 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 86080205 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 86080895 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86082425 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86083305 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86083478 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86083826 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 86083904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86084392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86085445 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 86086197 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86086455 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 86087142 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86087246 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86087397 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86087402 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86087486 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86087905 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 86088001 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86088536 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 86088750 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86088872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86088978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86090790 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86090866 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86091162 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86091271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86091355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86093499 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86093871 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86095073 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 86095455 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86095456 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 86095552 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 86095612 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 86095716 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 86095752 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 86096323 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 86096650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86097314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86097320 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86097394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86097409 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86097415 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86097430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86097438 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86097501 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86097934 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86097963 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86098030 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86098151 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86098357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86098448 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86098488 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86098501 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86098581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86098600 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86098714 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86099162 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86099248 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86099365 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86099600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86099691 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86099863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86099892 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86099972 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86100061 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86100080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86100399 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 86100472 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86100480 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 86100503 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 86100570 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86100670 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86101140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86101226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86101813 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86101849 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86102473 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86102504 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86102535 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86102568 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86102755 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86103424 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 86103501 G A N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 86103805 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86103977 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86104365 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 86104589 G T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 86104602 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 86104772 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86104799 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 86104878 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86104883 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 86105002 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 86106569 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 86106675 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 86106707 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 86106896 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86107069 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86107078 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 86107160 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 86107495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86107552 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 86107580 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86107844 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 86108039 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86108048 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86108147 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 86108764 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86109587 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 86109798 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 3 86109944 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 86110103 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 86110124 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86110129 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86110387 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86110591 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 86110887 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86110985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86111021 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 86111204 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 86111267 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 86111534 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 86111576 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 86111654 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 86111918 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 86112217 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86112712 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 86112843 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 86112917 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 86113029 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 86113040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86113074 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 86113155 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86113675 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 86113708 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 86114473 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 86114582 T C Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 86114909 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 86114934 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86115163 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 86115875 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 86115988 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86116067 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 86116085 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86116138 C G Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 86116141 C G Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 86116167 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 86116453 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 86116622 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86116657 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86116678 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86116788 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 86116854 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86116922 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 86116967 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 86117531 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 86117765 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86117931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86117993 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86118539 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86118673 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 86118697 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 86118944 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86118977 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86119146 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86119643 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 86119757 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 86119767 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 86120087 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 86120596 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86120668 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 86120672 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 86121044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86121218 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 86121227 C G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 86121232 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 86121314 C T N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 3 86121377 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 86121434 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 86121986 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 86122270 T G N N 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 5 9 2 1 4 3 86122316 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.428571428571429 8 6 4 0 3 3 86122543 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 3 86122552 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 86122600 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 14 10 6 2 4 3 86122939 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 86122963 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 86123066 T C N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 3 86123249 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 86124624 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 86125123 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86125165 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86125176 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 86125440 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 86125893 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 86126572 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 86126651 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 3 86126691 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 86126719 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 86126788 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 86126964 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 86127770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86127994 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86128292 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 86128306 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 86128348 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 86128371 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 86128521 C T N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 86128844 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 86129099 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 86129337 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 86129366 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 86129449 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 86129515 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 86129748 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 86129832 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86129988 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 86130858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86130905 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 86130925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86131149 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86131987 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 86140395 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86140851 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 86140948 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 86141066 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 86141069 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 86141301 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 86141471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86141753 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 86141906 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 86143080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86143118 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 86143347 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 86144274 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 86144476 T C N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 86145222 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 86146873 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 86147783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86149216 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86149434 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86150529 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86150632 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 86151672 G T Y N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.181818181818182 17 5 8 1 2 3 86151791 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 86151958 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 86155735 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 86157361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86159872 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 86162364 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86162640 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 86163784 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86163795 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86165889 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86166996 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86166997 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86167458 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86167871 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86168411 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 86172498 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 86172823 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 86173005 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 86173227 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86173262 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86173311 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 86173425 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 86173454 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86173768 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 86175931 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 86176527 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 86176607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86176831 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86177327 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 86177524 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86177546 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86178053 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86179947 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86185685 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86188607 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86190948 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86191807 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86191971 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86192171 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86192618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86192626 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86193680 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86194776 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86195532 T C N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 86195801 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 86196627 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86197342 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 86197429 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 86198278 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86199944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86200751 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86201388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86201471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86201716 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 86201720 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 86201997 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86202193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86202270 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 86202401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86202748 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 86202908 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86203156 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 86203664 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86203849 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 86203904 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 86204037 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86204471 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 86204906 C T N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 86204997 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86205264 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 86205499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86205583 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 86205789 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86205873 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86205884 G T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 86205901 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86206063 A C Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 86206701 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 86207573 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86207748 T G N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 86208029 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 86208478 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 86208725 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 86208884 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 86208960 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86209034 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 86212047 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 86212565 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86214185 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86214525 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 86214910 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86216703 C T Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 86218477 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86218777 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86218983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86226388 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 86226651 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 86226873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86227606 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 86227635 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86229454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86230758 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86233342 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 86233913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86234230 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 86235229 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 86236180 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86239346 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86239785 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 86240663 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 86240990 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86241523 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 86241644 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86242064 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 86249406 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 86258938 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 86260613 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 86265078 T A N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 3 86265209 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86265521 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 86265586 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 86267791 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 86267795 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86268070 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86269005 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86269658 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86269787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86270327 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86270467 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86274731 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 86274998 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86278774 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86279033 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 86280326 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 86280729 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86281624 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86282017 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86282089 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86283082 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 86283728 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 86288509 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86290545 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 86290677 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 86291943 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 86292282 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 86293056 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86293265 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86295143 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 86296403 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86296487 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 86303088 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86303809 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86304012 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86304172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86304729 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86305274 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86306462 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86306563 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 86306907 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86307293 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86307663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86308555 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 86309414 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86309984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86310219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86310597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86310876 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 86311421 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86311557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86312566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86312625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86314637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86314678 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86315228 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86317102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86317475 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86317823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86319770 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86321617 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86321870 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86322407 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86323571 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86324133 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86325334 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86325488 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86327257 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86328035 T G Y N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 86328161 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86328998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86332216 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86332964 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86333136 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86336422 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86337430 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 86341347 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86341475 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86342221 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86342978 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 86344804 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 86350166 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86355902 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86358890 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86359567 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 86360192 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86361294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86361303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86363879 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86365776 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 86366382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86367217 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86369040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86369107 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86370441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86371355 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86372468 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 86372789 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86372990 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 86373345 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 86376631 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 86377203 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 86377415 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 86377465 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86378512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86378601 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86378980 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 86380630 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 86380733 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86381301 A C N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.538461538461538 0.153846153846154 0.307692307692308 16 10 7 2 4 3 86381347 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 86381403 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 86381715 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 86383214 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86383562 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86383807 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 86384149 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86384191 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 86384198 G A N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 3 86384279 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86384939 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 86385262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86386394 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 86386448 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86386567 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 86386574 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 86387963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86388094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86389238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86390252 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86390544 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86393335 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86395896 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 86395959 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86396042 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86396516 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 86396606 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86397307 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 86397481 A G Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 86397500 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 86397544 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86397550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86397664 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 86397843 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 86397933 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 86398006 T A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 86398023 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 86398071 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 86398271 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 86398566 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 86398733 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 86398869 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86398990 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 86399168 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86399317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86399413 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 86399459 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 86399539 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86399637 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 86399869 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 86399953 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 86400091 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 86400457 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 86400465 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 86400675 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 86400685 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 86401038 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86401337 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 86401373 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 86401479 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 86401533 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 86401648 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 86402218 C T N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 3 86402935 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86403123 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86403124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86404977 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86405123 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 86405277 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86405559 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86407068 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 86407174 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 86407237 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86407818 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86408349 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86408365 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 86409126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86409326 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86410465 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 86410499 G A Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.5 0.1875 0.3125 19 13 8 3 5 3 86410652 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 86410883 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 86410893 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 86411009 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 86411327 G A N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 3 86411464 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 86411487 A G N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 3 86411652 A T N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 3 86411820 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 86411900 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 86411908 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 86412037 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 86412056 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 86412069 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 86412093 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 86412101 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 86412133 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 86412398 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 86412430 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 86412441 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 86412472 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 86412546 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 86412812 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 86412826 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 86413219 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 86413324 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 86413373 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 86413419 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 86413421 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 86413592 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 86414517 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86414614 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 86415159 G T N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 86415559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86416179 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 86416559 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86416631 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 86417127 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 86417133 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 86417145 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 86417297 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 86417875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86419157 T G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 86419984 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 86420062 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86420068 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86420352 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 86420445 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 86420768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86420872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86421353 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 86421624 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 86421637 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 86421759 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 86421775 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86421889 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 86421916 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 86421957 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 86422115 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86422228 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 86422355 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 86422409 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86422410 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86422679 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 86422737 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 86422791 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 86422830 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 86422855 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 86422994 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 86423008 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 86423037 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86423099 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 86423212 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86423599 T G N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 9 15 3 3 6 3 86423653 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 86423844 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 86423856 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 86423920 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 86424063 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 86424084 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 86424180 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 86424224 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 86424327 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86424392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86424412 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86424475 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86424488 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86424822 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86424901 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86424944 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 86425411 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86425454 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 86425466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86425523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86427040 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 86427110 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 86427150 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 86427311 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86427318 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 86427672 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86427782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86427950 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86428789 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86430350 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86430633 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86430886 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86431188 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86431216 C G N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 3 86431560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86431688 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86431828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86432028 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86432069 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 86432392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86432512 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 86432853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86433473 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86433521 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 86433579 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86433873 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86434197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86434593 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86434597 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86435636 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 86435755 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 86436079 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86436393 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86436415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86436989 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86437171 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86437255 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86437826 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 86438381 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86439102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86439331 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 86439363 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86439663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86441566 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86442680 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 86444335 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 86444538 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 86444570 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 86444891 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 86445215 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 86445703 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 86446676 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 86447161 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 86447714 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86447737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86449251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86449848 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 86450107 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 86450387 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 86450534 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86450608 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86450610 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86450722 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86450794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86450957 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86451021 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 86451132 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 86451235 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 86451358 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 86451416 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 86451499 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 86452232 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 86452344 T G Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 86452345 T G N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 3 86452372 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86452392 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 86452420 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86452554 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86452604 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 86452663 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 86452892 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 86453662 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 86453840 C G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 86453891 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86454002 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 86454114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86454520 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 86454564 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86454567 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86454602 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86454655 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 86454705 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 86454726 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 86454750 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 86454758 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 86455416 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 86455601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86456122 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 86456329 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86456565 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 86456570 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 86456812 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86456909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86457224 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86457339 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 86457419 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86457431 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86457496 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86457509 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86457523 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86457843 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86457873 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86458115 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86458130 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86458407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86458411 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86458475 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86458552 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 86458678 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86458682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86458755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86458850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86459031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86459153 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86459157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86459256 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86460178 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86460220 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 86460364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86460554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86460648 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86460956 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 86461010 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 86461067 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 86461473 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86461652 A C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 86461692 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 86461847 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 86462075 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 86462264 G T Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 86462678 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 86462831 A T N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 86462890 C A N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 86462923 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 86463023 T G N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 86463106 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 86463550 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86463627 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86463733 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 86463948 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86464244 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 86464346 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 86464383 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 86464500 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 86464649 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 86464816 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 86464962 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 86465169 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86465326 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 86465333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86465397 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86466532 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 86466572 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86466585 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 86467653 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 86469080 A G Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 86469081 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 86469404 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 86469450 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86469458 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 86470289 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 86470505 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 86470646 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86470966 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86471042 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 86471217 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86472517 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 86472845 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86473091 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86474036 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86474310 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86475091 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86475378 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86477429 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86477662 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86477701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86479709 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86480022 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86482857 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 86483620 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 86484512 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86484626 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86485669 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86486114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86486580 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86486861 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86487431 C T Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 86487563 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 86487602 C G Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 86488785 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86488968 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86490786 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86491584 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 86492048 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 86493800 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86494374 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86494452 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86497388 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86497615 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86497701 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86498407 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86498436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86499012 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86501593 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 86501781 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 86502138 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86502174 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86502279 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 86502570 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86502810 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86503859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86506626 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86506687 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86506702 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86510096 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86513961 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 86514941 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 86519987 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86520238 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86520502 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86522175 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 86522246 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 86522329 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 86522355 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 86522379 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 86522389 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 86522500 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 86522642 C T Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 86522702 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 86523630 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86524748 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 86525314 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86526567 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 86527281 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86528429 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86528961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86534645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86536386 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86539195 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86539541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86540224 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 86540301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86540873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86545496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86545520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86547509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86550711 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86551859 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 86552607 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 86552938 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86552953 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 86554121 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86554136 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 86554160 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86554161 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86555787 A G N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 3 86555837 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 86556247 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86557394 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 86557440 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86557491 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86557516 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 86557574 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 86557616 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 86557649 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 86558417 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 86558559 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 86558926 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 86559058 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 86559114 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 86559305 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 86560016 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 86560233 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 12 6 5 2 2 3 86560652 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86560665 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86560683 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 86560708 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86560901 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.4375 0.125 0.4375 16 16 7 2 7 3 86562241 T C Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 86562436 A C Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 86562664 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 3 86562913 G C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 86562916 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 86563488 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 86563684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86564154 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86565315 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 86565590 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86566109 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 86567683 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 86569213 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 86569221 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86569244 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 86569288 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86569575 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 86569696 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 86569905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86570104 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 86570134 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 86570315 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 86570379 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86570543 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 86570545 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 86570717 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86570855 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86570971 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 86571329 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 86571514 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 86571544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86571556 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 86571562 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 86571571 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 86571597 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 86571627 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 86571656 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 86571687 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 86571738 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 86571805 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 86571948 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 86571991 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 86572055 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 86572138 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 86572293 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 86572330 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 86572331 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 86572422 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 86572470 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86572495 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 3 86573226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86573535 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 86573587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86573639 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 86573685 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86573705 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 86573763 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86573772 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 86573774 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86573966 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86574214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86574227 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86574391 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86574752 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 86574791 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 86574850 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 86575017 C T N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.615384615384615 0.0769230769230769 0.307692307692308 17 9 8 1 4 3 86575034 G A N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.5 0.0833333333333333 0.416666666666667 13 11 6 1 5 3 86575122 T A N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.5 0.125 0.375 18 14 8 2 6 3 86575259 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 86575267 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 86575316 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86575405 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 86575636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86575772 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 86575785 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 86575947 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 86575949 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 86576013 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 86576128 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 86576157 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 86576261 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 86576461 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 86576508 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 86576573 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86576601 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86576612 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 86576620 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 86576682 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 86576766 A G Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 86576967 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 86577207 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 86577397 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 86577427 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 86577514 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86577527 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86577802 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 86577883 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 86578003 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 86578005 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 86578125 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 86578251 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 86578361 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 86578464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86578836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86579056 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 86579239 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 86579672 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86579752 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86579787 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 86580125 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 86580160 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 86580553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86580598 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 86581684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86581966 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86582018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86582078 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 86582089 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 86582168 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86582452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86582583 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 86582640 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 86582823 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 86583046 G C N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 86583355 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 86583357 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 86583414 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 86583473 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86583681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86584257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86584258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86584297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86584314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86584412 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86584558 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 86584645 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 86584655 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 86584734 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 86584873 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 86584880 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 86585591 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 86585901 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86586126 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86586571 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86586648 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 86586663 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 86587024 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 86587135 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 86587164 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 86587262 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 86587276 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 86587336 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86587391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86587422 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86587535 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 86587807 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 86588026 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 86588233 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 86588253 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 86588334 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 86588518 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 86588663 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 86588778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86588795 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 86588896 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 86589544 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 86589611 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86589718 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 86589747 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 86589921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86589925 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86589985 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86590161 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86590395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86590403 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86590579 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86591489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86591504 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86592077 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86592198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86592909 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86593707 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86594586 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86595270 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86595714 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 86598030 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 86598148 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 86598613 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86598761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86599021 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 86599170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86599696 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86600189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86601268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86603690 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86603951 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86604022 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86604090 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86604180 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86604248 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86604280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86604530 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86604593 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86604645 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86605272 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86605277 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 86605361 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 86605863 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 86607004 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 86607392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86608074 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86608696 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86609219 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86609264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86609296 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86609806 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86609987 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 86612518 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86612835 A T Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 86612878 A G Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 86612886 C T Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 86613125 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 86613847 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 86614073 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86614287 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 86614581 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86614632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86615146 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 86615265 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 86615549 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86616569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86618285 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86619576 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86619606 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 86621279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86623290 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86624157 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 86624597 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 86624620 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 86624665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86624984 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86626136 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 86626203 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86626419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86626482 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 86626553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86626572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86626707 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 86626756 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86626887 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 86626899 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 86627030 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 86627078 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 86627091 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 86627124 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 86627143 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 86627158 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 86627200 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86627230 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 86627250 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 86627372 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 86627420 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 86627548 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 86627578 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 86627609 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 86627725 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 86627737 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 86627816 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 86627843 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86627888 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86627943 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 86628019 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 86628138 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 86628163 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 86628197 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 86628222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86629057 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 86629572 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.0666666666666667 0.666666666666667 0.266666666666667 12 18 1 10 4 3 86630374 T C N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 3 86630477 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 86630645 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 86630647 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 86630712 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 86631339 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 86631384 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86631423 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 86631572 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 86631682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86631972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86631986 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 86632014 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 86632064 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 86632065 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 86632455 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86632908 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 86633024 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 86633038 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86633267 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 86633320 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 86633375 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 86633457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86633709 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 86633799 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 86634326 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 86634353 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 86634431 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 86635516 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86635615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86635619 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 86635910 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86636019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86636044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86636194 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86636216 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86636717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86636730 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86636985 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 86637043 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 86637128 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86637162 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 86637230 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86637529 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 86637704 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 86637856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86637985 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86638206 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 86638299 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86638404 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 86638622 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86638692 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86638907 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86638946 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 86639057 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 86639071 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86639105 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86639156 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 86639292 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86639644 G A N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 3 86639660 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 86639694 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 86639765 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 11 7 3 5 1 3 86639819 A G Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 86639940 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 86639951 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 86639960 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 16 20 0 16 2 3 86640068 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86640109 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 86640448 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 86640515 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 86641054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86641701 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 86641717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86641721 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 86641996 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 86642078 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 86642090 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 86642247 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 86642248 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86642338 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 86642448 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 86642464 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 86643594 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 86643608 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86643888 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 86643921 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86643958 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 86644857 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 86645004 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 86645586 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86646425 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 86646564 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 86647717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86647749 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 86647907 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 86648697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86649491 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86654023 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 86654131 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86654285 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 86654425 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86655255 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 86655296 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 86655363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86655369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86655448 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86655466 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 86655502 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86655714 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 86655738 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 86655745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86655750 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86655785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86656066 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86656447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86656596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86656654 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 86656837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86657212 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86657244 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 86657348 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86657378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86657465 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86657507 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86658061 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86658265 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 86658294 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 86658297 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 86658572 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 86658576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86658603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86658662 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 86658691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86659428 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86659714 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86659730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86659778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86659824 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 86660080 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 86660259 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 86660297 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86660412 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 86660445 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86660507 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 86660635 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 86660766 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86660769 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86661169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86661762 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86662348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86662389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86662946 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 86663010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86663302 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 86663326 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 86663330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86663341 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86663452 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86663547 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 86663657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86664141 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 86664309 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86664312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86664552 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 86664584 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 86664663 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86664718 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 86665219 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86665813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86666910 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86667038 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 86667080 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 86667433 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 86667658 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86667892 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86668334 A C Y N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 86668353 C T Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 3 86668357 C A Y N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 86668367 T C Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 86668374 T A Y N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 86668499 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 86668515 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 86668635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86668654 T C Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 86668664 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86668678 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86668680 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86668717 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 86669537 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 86669821 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86669835 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 86669919 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 86670239 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86670317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86670330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86671050 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 86671128 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86671221 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 86671320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86671325 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 86671375 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 86671526 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 86671739 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 86672176 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 86672650 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86672817 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 86672828 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 86672922 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 86672971 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 86673220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86673272 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 86673556 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 86673653 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 86673676 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 86673742 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 86673809 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 86673836 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 86674048 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 86674137 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 86674138 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 86674224 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86674607 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 86674786 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 86674837 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 86674924 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 86674926 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 86674991 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 86675004 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 86675152 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 86675174 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 86675539 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 86676015 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 86676061 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86676142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86677861 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86680365 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86680803 C A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 86684946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86684948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86685028 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86685072 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 86685203 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86685208 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86685518 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 86685809 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 86685893 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 8 16 0 8 4 3 86685930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86685947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86685951 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86686100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86686393 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 86686497 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 86686502 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 86686535 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86686646 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 86686773 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 86686796 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 86686806 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 86686844 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 86686964 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 86687016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86687025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86687486 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86687537 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86687661 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86687666 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86687733 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 86687782 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 86687878 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 86688685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86688696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86688985 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86689126 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86690073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86690265 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 86690296 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 86690303 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 86690551 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 86690587 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 86690602 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 86690653 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 86690666 G C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 86690667 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 86690732 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 86690878 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86691194 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86691229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86691302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86691395 G T Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 86691517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86691519 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 86691546 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86691548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86692474 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86692585 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86692813 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 86692895 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 86692917 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 86693017 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 86693090 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 86693105 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 86693173 T G Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 86693266 G C Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 86693281 G C Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 86693307 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 86693324 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 86693350 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 86693355 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 86693405 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 86693576 C G Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 86693635 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 86693709 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 86693881 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 86693996 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86694042 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 86694397 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 86694464 C T N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 3 86694690 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86694834 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 86694911 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 86695022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86695349 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 86695666 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 86695723 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 86695773 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 86695834 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 86695920 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 86695932 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 86696041 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 86696120 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86696157 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 86696481 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 86696814 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86696848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86696925 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86697275 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 86697425 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 86697469 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 86697497 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 86697604 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 86697659 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 86697714 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 86697777 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 86698001 A T N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 3 86698190 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 86698292 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 86698358 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 86698379 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 86698442 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 86698521 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 86698557 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86698681 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86698992 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 86699087 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 86699119 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 86699161 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 86699177 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 86699213 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 86699273 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 86699349 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 86699370 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 86699383 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 86699581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86699637 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 86699759 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 86699802 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 86699840 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 86699921 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 86700063 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 86700108 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 86700150 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 86700281 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 86700525 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 3 86700530 T C Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 86700581 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 86700587 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 86700630 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 86700684 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 86700701 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 86700780 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 86701090 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 86701294 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 86701500 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86701533 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 86701536 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 86701734 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86701842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86702062 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 86702086 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 86702155 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 86702177 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 86702397 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 86702482 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 86702544 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 86702608 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 86702610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86702678 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 86702759 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 86702809 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 86703177 C G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 86703196 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 86703749 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86703776 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 86703818 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 86703868 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 86703933 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 86703961 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 86704063 G T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 86704216 A G Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 86704328 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 86704437 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 86704442 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 86704508 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 86704512 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 86704534 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 86704578 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 86704609 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 86705164 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 86705309 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 86705354 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 86705643 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86705851 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 86705858 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 86705889 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 86705904 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86706019 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 86706057 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 86707084 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 86707122 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86707940 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86708177 T A Y N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 86708530 G C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 86708672 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 86708966 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 86708991 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 86709028 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 86709072 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 86709099 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 86709221 T A N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 86709292 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 86709304 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86709495 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 86709511 A T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 86709579 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 86709876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86710016 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 86710080 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 86710146 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86710275 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86710352 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 86710569 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 86710614 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 86710629 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 86710630 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 86710713 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 86710714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86710734 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86710753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86710989 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86710991 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86711026 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86711081 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86711194 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86711210 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 86711276 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 86711294 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86711314 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 86711378 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 86711734 G C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 86711950 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86712558 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 86713268 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86713515 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86713518 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 86713551 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86713627 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 86713633 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 86713783 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 86713856 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 86713934 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 86713964 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 86713978 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 86714050 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86714688 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86714692 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86714851 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 86714866 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 86714881 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 86714938 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 86714970 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86715513 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86715525 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 86715651 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 86715731 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86715868 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 86715943 G T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 86716965 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 86716995 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 86717236 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 86717383 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 86717607 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 86718506 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 86718728 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86718867 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86719163 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 86719183 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 86719203 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 86719208 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 86719254 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 86720052 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86720093 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 86720099 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86720259 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 86720262 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 86720605 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86720615 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86720677 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86721273 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 86721294 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 86721297 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86721372 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86721451 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86721463 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 86721539 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86721552 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86722065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86722128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86722731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86723146 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86723422 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 86723599 T G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 86724473 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 86724644 C T N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 86725803 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86725986 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 86726003 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86726465 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 86727574 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86727832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86730087 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 86730554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86731008 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86731132 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 86731532 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86731977 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 86732111 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 86732327 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 86732349 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 86732775 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86732785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86732948 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 86733214 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 86733276 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86733393 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 86733400 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 86733450 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 86733857 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 86733904 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 86733916 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 86733945 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 86734026 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86734095 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 86734110 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86734189 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 86734256 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 86734292 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86734331 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 86734502 A C N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 86734510 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 86734515 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 86734530 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 86734546 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 86734547 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 86734641 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 86734847 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 86734929 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 86734979 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 86735009 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 86735145 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86735183 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 86735383 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 86735456 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 86735550 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 86735647 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86735703 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86735711 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 86735818 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86736026 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 86736450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86736463 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86736464 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 86736768 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 86736788 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 86736954 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 86736961 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86736996 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 86737168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86737180 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 86737243 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86737304 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 3 86737306 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 3 86737378 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 86737608 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86737656 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 86737680 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 86737741 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 86737952 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 86738003 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 86738021 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 86738033 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 86738285 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 86738330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86738582 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 86738752 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 86738804 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 86739465 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86739513 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86739537 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86739581 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86739592 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86739665 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86739700 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86739704 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 86739779 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86740226 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86740431 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 86740619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86740815 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 86740842 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 86741091 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 86741224 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86741225 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86741283 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 86741312 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86741353 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 86741370 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86741509 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86741953 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 86742132 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 86742191 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 86742194 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 86742206 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 86742473 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 86742534 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 86742656 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86742994 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86743301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86743534 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 86743598 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 86744269 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 86744347 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 86744647 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 86745116 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 86745428 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86745482 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 86745517 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 86745700 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86745738 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 86745936 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 86745939 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 86746003 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 86746005 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 86751219 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 86751266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86751863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86752123 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 86752168 A C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 86752279 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 86752301 C T Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 86752524 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 3 86752658 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86753114 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 3 86753265 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 86753427 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 86753432 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 86753506 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 86753540 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 86753732 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 86753845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86754009 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 86754165 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 86754183 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 86754244 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 86754350 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 86754385 A T N N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.384615384615385 0.307692307692308 0.307692307692308 14 12 5 4 4 3 86754408 G C N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 86754471 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 86754667 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 86754693 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 86754764 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 86754805 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86754910 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 86755170 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 86755234 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 86755280 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 86755299 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 86755310 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 86755407 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 86755522 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 86755553 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 86755623 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 86755652 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 86755778 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 86755825 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 86756434 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86756558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86756987 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 86757136 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86757380 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86757458 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 86757587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86757639 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 86757897 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 86757952 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86758045 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 86758182 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 86758183 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 86758390 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 86758425 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 86758667 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86758705 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 86758794 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 86758829 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 86759048 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 86759061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86759163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86759208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86759241 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86759389 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 86759514 C G Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 86759644 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86759792 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 86759836 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 86759840 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 86759881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86759913 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 86759926 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 86760033 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86760160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86760176 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86760401 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 86760529 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86760633 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 86760659 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86760731 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86761174 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86761222 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86761400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86761413 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86761452 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86761538 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 86761561 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 86761573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86761692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86761816 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 86761822 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 86761839 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 86761908 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 86761951 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 86761988 A T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 86762005 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 86762034 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 86762099 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86762109 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 86762125 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 86762131 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 86762263 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86762282 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 86762325 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86762517 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 86763286 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 86763330 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 86763503 T A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 86763809 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 86763810 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 86763902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86764210 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86764239 A G N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 86764478 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86764754 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 86764980 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 86765202 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 86765815 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 86765846 C G Y N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 86765850 C T N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 3 86765978 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 86766101 A T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 86766211 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 86766501 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 86766726 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 86767047 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 86767071 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 86767134 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 86767204 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 86767375 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 86767388 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 86767397 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 86767503 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86767706 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 86767717 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 86767849 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 86767851 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 86767860 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 86768591 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 86768698 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 86768706 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 86768926 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 86769043 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 86769133 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 86769289 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 86769305 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 86769347 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 86769397 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 86769470 A G N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 3 86769507 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 86769549 C A N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 86769638 T C N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 86769679 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 86769858 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 86769897 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 86769899 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 86769947 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 86769951 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 86770004 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 86770209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86770287 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 86770374 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 86770566 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 86772044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86772127 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 86772369 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 86773216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86773360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86778887 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86779444 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 86781303 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 86781907 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86782074 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 86782286 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 86782376 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 86782379 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 86782444 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 86782463 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86782578 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86782719 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 86782766 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 86782823 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86782831 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 86782978 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 86783003 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86783018 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 86783113 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86783135 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 86783194 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 86783484 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 86783492 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86783757 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 86784040 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86784120 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 86784334 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 86784473 C T N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 3 86784942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86785185 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86785988 G T Y N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 86786001 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 86786171 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 86786204 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 86786223 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 86786652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86786719 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 86786796 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 86787522 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86787623 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86787667 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 86787671 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86787680 T C Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 86787692 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86787731 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 86788081 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 86788222 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86788305 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86788362 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 86788558 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 86788594 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 86788601 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 86788616 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 86788630 C A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 86788685 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 86788687 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 86788717 G A N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 86788796 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 86788851 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 86789150 T C Y Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 3 86789204 C T N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 3 86789297 T C Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 86789301 G A Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 86789311 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 86789361 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 86789546 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 86789605 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 86789611 A C Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 86789795 C A Y N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 86789819 C T Y Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 3 86789839 A G Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 86789942 T C Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 86789950 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 86789984 C T Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 86790136 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 86790247 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 86790398 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 86790447 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 86790467 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86790539 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 86790627 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 86790772 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 86790834 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 86791197 T A Y N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 86791301 A T N N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 3 86791338 G C N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.25 0.166666666666667 0.583333333333333 8 16 3 2 7 3 86791341 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.25 0.166666666666667 0.583333333333333 8 16 3 2 7 3 86791353 A G N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 3 86791368 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 86791469 C T N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 7 9 2 3 3 3 86791520 G A N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.363636363636364 0.454545454545455 0.181818181818182 13 9 4 5 2 3 86791532 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 86791535 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 86791593 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 86791795 T C Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 86791843 T G N N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 3 86791973 G T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 86791984 A C N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 86792001 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 86792127 A T Y N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 16 12 2 12 0 3 86792139 G A Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 86792524 C T Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 86792537 G C Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 86792848 G T Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 86793116 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 86793241 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86793261 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86793407 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 86793422 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 86793447 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 86793491 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 86793523 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 86793549 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86793667 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86793670 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86793782 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 86793920 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86794620 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 86794676 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 86794716 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 86794750 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 86794776 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86794994 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 86794998 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 86795078 G T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 86795092 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 86795141 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 86795157 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 86795295 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 86795327 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 86795362 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 86795417 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 86795503 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 86795530 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 86795594 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 86795609 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 86795621 G A Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 86795631 A G Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 86796332 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 86796727 A G Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 3 86796855 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86796873 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 86796884 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 86796972 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 86797498 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 86797838 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86797966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86798010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86798329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86798340 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86798341 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86798407 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 86798435 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 86798671 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86798780 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86798800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86798897 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86799076 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 86800370 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86800843 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 86800894 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 86800907 G T Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 86800933 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 86801597 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 86801633 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86801781 G A Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 3 86802179 A G Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 3 86803379 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86804008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86804193 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86804772 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 86806417 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 86806708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86806896 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86811983 A G Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 3 86812320 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 86814102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86814344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86814456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86815615 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86816959 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 86817314 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 86817421 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 86818137 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 86820032 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86820254 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 86820829 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 86820907 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 86821527 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86823036 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86823901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86823921 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86824029 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86825026 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86825449 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86825985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86827242 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 86827775 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 86827868 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86828342 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 86828349 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 86828463 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 86828555 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 86828749 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86828771 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 86828785 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 86828803 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86828843 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86828888 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86829010 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 86829221 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 86830425 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 86830580 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86830808 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86831299 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 86831491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86831648 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86831793 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86832141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86833043 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 86833124 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86833174 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86833349 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86833469 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 86833539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86833786 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86833800 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 86833925 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 86833939 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 86834054 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 86834107 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 86834198 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86834439 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 86835112 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86835162 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86835189 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 86835246 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 86835384 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 86835452 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 86835524 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 86835560 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 86835597 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 86835647 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86835750 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86835851 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 86835855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86835912 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 86836105 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 86836172 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 86836260 G A N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 86836333 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 86836394 T C Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 86836523 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 86836622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86836639 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 86836947 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 86837074 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 86837324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86837327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86837399 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86837450 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 86837539 A G Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 86837546 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86837558 C A Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 86837699 T C Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 86837716 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86837917 C T Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 86837956 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86838730 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 86838886 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 86838987 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 86839081 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 86839139 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 86839141 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 86839197 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 86839219 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86839928 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86840227 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 86840677 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 86841352 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86841829 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 86841881 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86842079 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 86843458 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86843932 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 86844082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86844104 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86844160 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 86844608 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 86844658 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 86844697 C G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 86844742 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 86844757 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 86845197 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 86845299 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 86845327 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 86845639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86845715 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 86845840 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 86845894 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86845945 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 86846197 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 86846217 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86846281 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 86846346 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 86846454 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 86846492 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 86846664 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 86846675 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86846683 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 86847222 T C N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 86847320 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 86847352 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 86847477 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 86847554 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 86847827 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86848003 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 86848550 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 86848628 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 86848711 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 86848732 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86848869 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86848907 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86848930 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 86848952 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 86848972 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 86848989 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 86849049 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 86849745 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 86850056 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86850159 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86850218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86850238 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 86850841 C T N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 86850886 T G N N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 86850935 T C N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 86850936 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 86851440 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 86851512 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 86852571 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86853327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86853464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86853613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86853635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86853704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86853742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86853765 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 86853859 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86853876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86853896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86853919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86853941 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86854022 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86854032 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86854286 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86854489 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 86854504 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 86854770 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 86854869 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86854970 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 86855040 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 86855241 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 86855290 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 86855324 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 86855356 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 86855361 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 86855436 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 86855678 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 86855701 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 86855876 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 86855882 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 86855980 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86856084 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 86856097 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86856111 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 86856399 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86856547 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 86856685 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 86856782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86856800 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 86856828 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 86856844 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 86856993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86856997 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 86857028 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86857044 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86857055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86857201 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 86857321 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 86857426 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 86857493 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86857560 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86857589 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86857779 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 86857886 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 86857907 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 86857996 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86858190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86858339 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 86858368 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86858410 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 86858674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86858702 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 86858792 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 86858798 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 86858804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86858842 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 86858873 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86859003 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 86859118 A G Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 86859324 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 86859728 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86859773 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 86859823 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 86859838 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86859840 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 86859929 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86859959 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86860047 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86860048 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86860147 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86860150 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86860356 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86860401 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 86860503 C T Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 86860534 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86860548 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86860630 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 86860671 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86860684 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86860721 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86860759 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 86861384 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 86861431 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 86861663 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86861680 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86861723 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 86861804 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86861839 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86861842 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86861884 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86862098 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 86862474 G A N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 15 9 6 3 3 3 86862749 A G N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 86863273 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 86863358 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 86863384 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 86863628 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86863812 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86863889 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 86864091 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 86864388 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86864597 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 86864635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86864728 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 86864741 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 86864775 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 86864799 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 86864882 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 86864886 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 86864944 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 86864952 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 86864957 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 86865432 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 86865634 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 86865737 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86865821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86865851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86866199 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 86866245 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86866409 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86866438 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86866491 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86866526 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 86866631 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 86866867 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 86867015 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86867144 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86867155 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86868187 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86869588 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 86869821 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 86869859 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86869896 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86869915 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86870059 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86870110 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86870117 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86872646 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 86872775 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86873081 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 86873099 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86873248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86873323 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86873415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86873429 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86873441 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86873472 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86873478 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86873532 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 86873588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86873603 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86873704 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86873721 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86873722 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86874194 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86874201 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86874386 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86874415 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86874559 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 86874585 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 86874596 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 86874597 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86874683 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86874733 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86874818 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86874869 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86874966 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86874984 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86875126 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86875163 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86875226 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86875340 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 86875380 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86875383 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86875656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86875726 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 86875739 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86875765 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 86875776 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 86875970 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 86876288 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 86876511 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86876624 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86877482 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86877549 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86877826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86877911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86878464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86878799 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86878919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86878999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86879081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86879278 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86879358 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86879365 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86879674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86879679 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86879708 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86879729 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 86879753 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86880087 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86880171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86880409 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86880513 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86880523 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86880748 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86880806 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 86880808 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86880995 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86881017 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86881127 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86881378 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 86881520 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 86882271 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86882451 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 86882781 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 86882801 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 86883160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86883415 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 86883510 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86884877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86886014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86891112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86892860 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 86893279 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86893709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86895387 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86895672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86895847 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86896242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86896344 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86896672 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86896978 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 86897233 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 86897306 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 86897655 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 86897744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86898474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86898962 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 86898991 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86899014 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 86899015 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 86899025 C A Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 86899249 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 86899320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86899444 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86901289 G C Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 86901884 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86903988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86905053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86911111 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86915752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86917361 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 86917500 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86917565 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 86917598 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 86918251 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 86918262 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 86918270 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 86918289 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 86918327 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 86918450 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 86918484 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 86918609 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 86918731 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86918859 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 86918974 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 86919360 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 86920643 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 86921835 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 86922046 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 86922585 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 86922813 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 86923220 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 86923230 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 86923231 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 86923591 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 86923766 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 86924031 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 86924058 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 86924060 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 86924130 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 86924292 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 86924403 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 86924539 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 86924566 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 86924635 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 86924691 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 86924700 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 86924729 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 86924872 C T N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 12 8 4 4 2 3 86924902 A T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 86925288 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 86925355 C A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 86925471 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 86925492 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 86925618 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 86925624 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 86925862 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86926044 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 86926085 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 86926270 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 86926277 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 86926412 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 86926501 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 86926694 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 86926706 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 86927412 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 86927465 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 86927651 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 86928004 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 86928070 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 86928813 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 86929379 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 86929546 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 86929629 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 86929883 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.133333333333333 26 4 13 0 2 3 86930067 A C N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.625 0.125 0.25 22 10 10 2 4 3 86930126 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.8 0 0.2 24 6 12 0 3 3 86930356 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 86930465 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 86930475 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 86930567 G A N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 0.142857142857143 0.214285714285714 20 8 9 2 3 3 86930686 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.583333333333333 0.166666666666667 0.25 16 8 7 2 3 3 86930836 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.176470588235294 28 6 14 0 3 3 86930885 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 86931263 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 86931348 T A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.8125 0 0.1875 26 6 13 0 3 3 86931414 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86931448 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86931453 T G N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.133333333333333 26 4 13 0 2 3 86931584 A T N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 3 86931615 T A N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 3 86931630 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 86931705 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 86931706 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 86931821 G C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 86931976 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 3 86932049 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 86932327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86932433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86932520 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 86932626 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 86932628 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 86932698 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 86932719 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 86932764 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86932842 C A N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 3 86932853 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 86932857 C G N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.307692307692308 0.230769230769231 0.461538461538462 11 15 4 3 6 3 86932899 G T Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 86933468 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 86933469 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 86933689 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 86933719 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 86933741 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 86933782 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 86933918 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86933941 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 86933967 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 86934771 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 86935235 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 86935244 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 86935255 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 86935277 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 86935289 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 86935311 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86935337 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 86935372 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 86935384 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 86936123 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86936287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86936327 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 86936690 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 86936730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86936783 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86936932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86936939 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 86937866 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 86937940 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 86938498 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86938550 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86938756 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 86938860 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 86938896 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 86939177 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 86939185 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 86939192 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 86939291 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 86939297 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 86939335 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86939743 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 86939995 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 86940064 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 86940101 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86940224 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 86940227 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86940381 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 86940415 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 86940466 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 86940468 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 86940520 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 86940694 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 86940729 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 86940752 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 86940873 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 86940886 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 86940893 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 86941049 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 86941149 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 86941438 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 86941515 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 86941564 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 86941800 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 86941804 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 86941878 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 86941984 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86941990 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86942020 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86942069 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86942159 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 86942208 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 86942210 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 86942243 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 86942401 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 86942425 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 86942434 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 86942474 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 86942493 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 86942500 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 86942558 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 86942793 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 86942827 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 86943393 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 86943479 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 86943562 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 86943766 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 86943977 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86944004 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86944088 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86944110 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86944127 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86944128 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86944150 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86944162 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 86944338 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 86944654 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86945199 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 86945201 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 86945542 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 86945778 G C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 86945813 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 86946101 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 86946130 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 86946211 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 86946354 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 86946376 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 86946494 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 86946545 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 86946618 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 86946913 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 86947161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86947872 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 86947929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86948144 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 86948272 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 86948820 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86949016 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86949073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86949092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86949274 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 86949614 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 86949827 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 86949850 A C N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 86949898 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86950326 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 86950422 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86951092 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 86951337 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86953097 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86953751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86954787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86955783 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86955906 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 86956229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86956244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86956360 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86956511 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86956806 G T N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 86956967 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 86957015 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 86957662 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 86957673 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 86957688 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86958093 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 86958756 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 86959212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86959656 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 86959952 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 86960439 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86960636 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86960952 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86961028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86961054 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 86961061 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 86961098 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86961978 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86962547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86962801 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86963091 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 86963126 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 86963140 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 86963153 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86963213 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 86963343 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86963389 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86963621 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 86963688 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 86963840 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86963997 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 86964164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86965642 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86965644 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 86965786 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86965890 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86965917 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86965978 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 86966889 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86966915 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 86966976 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 86967214 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86967260 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 86967346 T G Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 86967397 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 86967586 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 86967609 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 86967728 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 86967743 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86967850 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86967932 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 86967953 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86967964 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 86968060 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 86968560 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 86969166 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 86969191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86969672 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 86969673 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 86969747 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86969890 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 86970182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86970298 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 86970398 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 86970443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86970617 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86970624 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86970667 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86970748 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 86970870 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86971163 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86971178 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86971580 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86971754 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 86972723 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86972724 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86972759 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 86972813 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 86973365 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 3 86974211 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 86974216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86974445 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86974495 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86974517 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 86974527 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 86974539 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 86974613 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86975293 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86975514 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86976467 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 86976515 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 86976579 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86976957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86977398 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86977617 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86978383 C T Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 86978482 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86978581 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 86978931 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86979244 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 86979385 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86979640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86979699 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86980166 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86980230 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 86980639 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86980743 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 86980797 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86980880 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 86981157 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 86981435 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86981473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86982168 A G N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 86982198 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 86982245 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86982338 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 86982556 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 86982620 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 86982631 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 86982638 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 86983083 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 86983084 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 86983119 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 86983325 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 86983833 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86984168 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 86984185 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 86984199 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86984207 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 86984214 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 86984225 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 86984481 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 86984532 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 86984652 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86984783 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 86984903 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 86985010 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 86985084 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 86985210 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 86985372 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 86985396 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 86985412 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 86985489 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 86985607 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86985726 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 86985877 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 86985898 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 86985942 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 86985997 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86986037 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 86986041 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 86986348 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 86986814 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 86986967 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 86986984 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 86987121 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86987266 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 86987272 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 86987322 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86987333 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86987335 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86987795 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86987817 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 86987896 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86987914 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 86988104 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86988146 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 86988889 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86989549 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 86990048 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 86990576 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86990632 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 86990646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86990667 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 86991098 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 86991155 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86991315 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 86991373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86992082 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 86992784 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 86992882 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 86992903 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 86993078 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 86993082 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 86993274 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 86993528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86993605 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 86993927 A T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 86994122 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 86994301 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 86994366 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86994633 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 86995583 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86995973 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 86996009 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 86996177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86996224 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 86996699 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 86996962 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 86997030 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86997143 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 86997516 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 86997579 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 86997590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86997822 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 86998097 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 86998132 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 86998292 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 86998368 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 86998371 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 86998428 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 86998435 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 86999309 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 86999522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86999813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 86999819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87000017 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 87000969 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 87001500 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 87001751 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87002224 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87002278 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87002447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87002543 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 87002586 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87002745 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 87002863 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87002864 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87002994 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87003139 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87003221 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 87003388 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87003430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87004328 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 87004452 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87004584 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 87004637 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87004766 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 87004890 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 87004909 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87005009 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 87005096 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87005263 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87005446 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87005447 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87005472 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87005577 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 87005903 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 87006073 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 87006249 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87006387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87006621 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 87006635 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 87007089 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 87007164 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87007238 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 87007404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87007807 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 87007909 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 87007943 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87007960 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 87008693 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 87008842 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 87008902 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87008968 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 87009019 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 87009092 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 87009389 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 87010367 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87011922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87012109 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87012221 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 87012328 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 87012394 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 87012461 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 87012795 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 87012923 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 87013074 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 87013109 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 87013117 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 87013156 A T Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 87013236 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 87013321 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87013349 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 87013383 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 87013491 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 87013618 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 87013871 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87014168 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87014182 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 87014184 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87014201 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 87014209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87014213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87014294 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 87014747 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 87014790 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 87015034 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 87015133 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 87015521 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 87015647 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 87015685 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87016205 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 87016333 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87016528 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 87017175 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 87017375 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 87017545 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87017794 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87017929 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 87017933 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 87018568 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87018621 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87018777 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 87018796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87019144 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 87019524 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 87019876 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87019903 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 87019938 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 87020241 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 87020260 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 87020317 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 87020466 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 87020516 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 87020561 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 87020566 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 87020619 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87020699 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 87020805 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 87020898 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 87020993 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 87021014 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87021019 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 87021078 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 87021101 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 87021162 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 87021173 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 87021251 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 87021262 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 87021446 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 87021497 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 87021522 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 87021654 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 87021675 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87021711 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 87021785 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 87021933 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 87022041 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 87022048 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 87022102 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 87022144 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 87022146 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 87022167 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 87022283 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 87022488 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 87022603 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 87022628 G T Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 87022755 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87022783 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 87022839 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 87022844 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 87022887 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 87022970 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 87023019 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 87023550 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 87023897 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 87023989 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 87024047 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87024063 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 87024341 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 87024352 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 87024395 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 87024407 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 87024521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87024697 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 87024710 G C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 87024716 G T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 87024848 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 87024850 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 87024873 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 87025013 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 87025031 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 87025037 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 87025103 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 87025110 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 87025240 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 87025284 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 87025359 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87025458 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 87025519 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 87025883 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 87026318 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 87026358 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 87026365 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 87026388 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 87026601 T C N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 87026663 A T Y N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 3 87026882 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 87026987 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 87027256 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 87027312 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 87027465 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87027939 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 87027966 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 87028122 A T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 87028124 C G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 87028429 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 87028577 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87028585 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87028645 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 87028672 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87028808 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 87028861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87028884 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87029043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87029050 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 87030398 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 87031432 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 87032629 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87032987 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87033011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87033067 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87034058 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 87034711 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87034742 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 87035491 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 87035705 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87036082 G C N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 87036541 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 87037285 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87037392 A T Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 87037393 T C Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 87037445 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87037596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87037607 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87037718 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 87038249 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 87038283 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87038505 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 87038524 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 87038884 C T N Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 5 5 2 1 2 3 87038897 A C N N 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 10 6 4 2 2 3 87038913 C T N Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 9 5 4 1 2 3 87039066 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 87039071 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87039224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87039296 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 87039381 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 87039419 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 87039510 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87039606 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 87039633 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 87039759 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 87039958 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 87040020 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 87040141 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 87040181 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 87040311 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 87040389 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 87040434 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 87040710 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 87040717 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 87040781 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87040992 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 87041006 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 87041069 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 87041142 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87041155 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 87041200 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 87041291 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 87041345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87041455 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 87041502 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 87041511 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 87041553 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 87041596 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 87041651 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 87041667 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 87041680 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 87041790 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 87041796 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 87041918 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 87041938 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 87041973 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 87042018 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 87042039 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 87042214 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 87042243 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 87042251 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 87042265 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 87042268 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 87042482 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 87042593 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 87042700 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 87042721 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 87042729 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 87042736 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 87042759 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87042762 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87042814 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 87042895 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 87042991 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 87043051 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 87043063 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 87043099 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 87043150 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 87043210 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 87043229 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 87043318 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 87043333 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 87043421 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 87043454 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 87043596 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 87043645 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 87043657 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 87043681 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 87043698 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 87043818 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 87044073 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 87044080 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 87044180 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 87044243 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 87044310 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 87044599 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 87044760 G T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 87045292 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 87045505 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 87045514 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87045516 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87045547 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 87045630 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 87045946 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 87045983 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 87046000 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 87046830 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 87046832 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 87046917 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 87046939 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87047039 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87047167 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 87047368 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 87047548 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 87047567 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 87047584 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87047615 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 87047746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87047832 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 87047919 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 87048080 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 87048346 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 87048482 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 87048504 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 87048509 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 87048547 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 87048570 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 87048589 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 87048716 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 87048889 C T N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 3 87048893 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 87048928 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 87049024 C T N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 87049264 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 87049280 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 87049526 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 87049540 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 87049702 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 87049706 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 87049760 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 87049796 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 87049801 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 87049963 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 87049975 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 87050061 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 87050521 A G N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 3 87050708 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 87050730 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 87051334 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 87051600 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 87051626 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 87051639 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 87051641 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87051657 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 87051862 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 87051918 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 87051933 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 87052056 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87052098 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 87052158 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 87052161 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 87052172 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 87052268 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 87052314 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 87052329 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 87052370 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 87052421 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 87052481 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 87052614 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 87052836 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 87052922 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 87053077 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87053092 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87053117 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87053157 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 87053223 T G Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 87053445 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 87053557 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 87053609 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 87053639 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 87053660 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87053900 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87053913 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 87053916 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87053949 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 87053965 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87054383 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 87054424 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 87054446 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 87054491 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 87054539 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 87054555 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 87054622 C G N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 87054635 A G N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 87054755 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 87054762 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 87054837 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 87054860 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 87055011 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87055040 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87055054 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 87055112 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 87055140 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 87055176 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 87055190 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 87055581 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 87055585 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 87055816 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 87055828 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 87055872 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87055876 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87056014 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87056088 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 87056098 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 87056109 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 87056180 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87056801 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87057350 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 87057566 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 3 87057629 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 87057910 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 87057963 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87058085 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 87058323 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87058328 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 87058367 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 87058453 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 87058536 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 87058695 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 87058722 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 87058729 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 87058821 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 87058866 C A N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 87058907 A C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 87059030 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 87059172 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87059255 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87059296 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87059393 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87059448 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 87059683 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87059706 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 87059778 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 87059919 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 87059928 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 87059980 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87059982 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87060265 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87060310 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 87060361 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87060386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87060425 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87060729 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87060974 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87061016 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87061067 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 87061311 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87061417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87061495 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 87061666 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87061751 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 87061759 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87061964 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 87062011 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 87062150 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 87062252 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87062306 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 87062319 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 87062537 C G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 87062664 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87062675 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87062709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87062732 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 87063637 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 87063699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87063981 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87064115 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87064188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87064199 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87064215 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87064295 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87064362 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87064391 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87064561 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87064823 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87064861 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87064946 T G N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0 0.769230769230769 0.230769230769231 10 16 0 10 3 3 87064961 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 87065077 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87065157 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87065206 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87065720 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87065958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87065992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87066023 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87066300 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87066454 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87066501 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 87067404 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87067464 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87067580 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87067832 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87067901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87067905 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 87067926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87068042 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87068118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87068233 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 87068267 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 87068319 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 87068358 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 87068377 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87068435 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 87068585 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87068596 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87068601 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 87068620 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 87068681 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 87068853 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 87068977 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87069088 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 87069103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87069136 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87069173 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 87069175 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 87069191 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 87069205 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 87069291 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87069373 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 87069436 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87069469 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87069522 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87069640 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87070063 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 87070100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87070120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87070170 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87070534 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87070807 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 87070832 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 87070835 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 87070843 T A N N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 87070854 T C N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 87071056 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 87071239 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87071243 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87071507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87071888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87071958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87072170 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 87072296 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87072458 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87072628 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87072762 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87072790 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87072882 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87073007 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87073008 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87073059 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87073160 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 87074020 T C N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 3 87074040 A G N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 3 87074089 A G N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.333333333333333 0.2 0.466666666666667 13 17 5 3 7 3 87074169 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 87074233 C A Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 87074275 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87074718 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 87074984 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87075015 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 87075036 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 87075056 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87075637 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 87075663 A T N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 87076041 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 87076065 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 87076190 G A Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.75 0.0833333333333333 0.166666666666667 19 5 9 1 2 3 87076658 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 87076691 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 87076751 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 87077025 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 87077048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87077123 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 87077220 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87077243 G C Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 87077294 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 87077302 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 87077313 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87077360 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 87077404 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 87077473 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87077510 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87077528 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 87077717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87077835 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87077951 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87078275 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 87078297 G C Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 87078321 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 87078458 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 87078460 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 87078573 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.2 0.133333333333333 0.666666666666667 8 22 3 2 10 3 87078586 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 87078588 C G N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 3 87078760 A T N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.333333333333333 0.133333333333333 0.533333333333333 12 18 5 2 8 3 87078810 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 3 87078930 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 87079121 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 87079140 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 87079169 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 87079465 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87079628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87079830 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87079979 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 87080014 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 87080052 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 87080362 C A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 87080374 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 87080420 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 87080526 A C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.235294117647059 0.117647058823529 0.647058823529412 10 24 4 2 11 3 87080556 A C N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 3 87080558 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 87080618 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 87080718 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 87080781 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 87080831 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 5 13 2 1 6 3 87081110 G C Y N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 3 87081380 T C N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 3 87081384 A G N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 12 8 5 2 3 3 87081847 A G Y Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 3 87082247 G A Y Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 11 9 4 3 3 3 87082302 T C Y Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.333333333333333 0.25 0.416666666666667 11 13 4 3 5 3 87082560 C G Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 87082641 T G Y N 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.555555555555556 0.111111111111111 0.333333333333333 11 7 5 1 3 3 87082901 C T Y Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 10 6 3 4 1 3 87084203 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 87085019 T C N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.357142857142857 0.214285714285714 0.428571428571429 13 15 5 3 6 3 87085308 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 87085319 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 87085323 A T Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 87085417 A G Y Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.333333333333333 0.25 0.416666666666667 11 13 4 3 5 3 87085425 C T Y Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.333333333333333 0.25 0.416666666666667 11 13 4 3 5 3 87085942 G A Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 87086035 A C Y N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.416666666666667 0.166666666666667 0.416666666666667 12 12 5 2 5 3 87086113 C T Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.625 0.125 0.25 11 5 5 1 2 3 87086133 C A N N 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 10 6 4 2 2 3 87086186 A C Y N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 3 87086285 T G N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 3 87086496 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 87086497 T G Y N 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.333333333333333 0.111111111111111 0.555555555555556 7 11 3 1 5 3 87086629 G A Y Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 87086874 T C Y Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 87087119 G T Y N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 3 87088385 T C Y Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 3 87088413 C T Y Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 14 6 6 2 2 3 87088499 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 3 87088596 A G Y Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 13 7 6 1 3 3 87088602 C T Y Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.545454545454545 0.181818181818182 0.272727272727273 14 8 6 2 3 3 87088770 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 87088776 G T Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 87088817 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 87088838 T C Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 87089015 G C Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 87089035 T C Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 87089054 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 87089108 G A Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 87089136 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 87089155 T C Y Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 3 87089219 G C N N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 87089941 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 87090059 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 87090734 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 87090852 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 87091357 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 87091507 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 87091517 T C N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 9 15 3 3 6 3 87091518 G A N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 3 87091615 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 87091707 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 87091745 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 87091883 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 87091904 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 87091908 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 87091930 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 87092265 T A N N 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 3 87092502 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 87092551 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 87092614 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 87092704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87092724 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 87092766 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 87092805 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 87092814 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 87092888 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 87092956 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 87092964 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 87093013 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 87093124 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 87093138 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 87093153 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 87093178 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 87093185 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 87093282 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 87093405 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 87093487 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 87093515 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87093569 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 87093605 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 87093693 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 87093716 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 87093777 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 87093813 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 87093864 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87093917 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87093992 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87093993 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 87094146 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 87094189 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 87094231 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 87094332 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 87094392 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 87094566 T C Y Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 3 87094592 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 87094692 T G N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 3 87094813 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 3 87094911 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 87095098 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 3 87095148 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87095397 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 87095406 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 87095484 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87095569 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 87095627 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 87095872 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 87095923 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 87096300 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.25 0 0.75 8 24 4 0 12 3 87096475 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87096484 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 87096533 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 3 87096611 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 87096672 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 87097361 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 87097804 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 87098976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87100430 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87100806 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 87101375 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 87101789 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 87101900 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 87102426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87102654 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87102967 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 87103034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87103054 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 87103224 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87103349 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 87103388 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 87103425 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 87103887 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 87103902 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87103925 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 87104376 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87104404 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87104469 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 3 87104592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87104628 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 3 87104636 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 87104704 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 87104776 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 87105013 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 87105088 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 87105365 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87105461 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87105466 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87105549 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87105686 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 87105752 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 87105991 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 87106012 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87106050 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 87106059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87106091 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 87106094 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 87106198 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 87106208 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 87106218 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 87106276 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87106381 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87106393 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 87106616 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87106650 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 87106671 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87106860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87106871 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87106976 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87106984 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 87107136 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 87108633 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87108693 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87108785 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 87108796 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 87108807 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 87108838 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87109041 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87109137 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 87109146 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 87109163 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 87109187 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 87109208 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 87109291 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 87109330 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 87109358 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 87109591 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 87110411 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 87110504 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 87110526 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 87110649 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87110664 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87110754 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 87110774 T G N N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 3 87110834 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 87111112 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87111248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87111315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87111343 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87111364 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87111385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87111414 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87111549 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87111615 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87111700 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87111736 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87111824 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87111833 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87111836 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87111873 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87111970 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87111978 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87112018 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87112282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87112333 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 87112501 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87112759 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87112766 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87113023 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87113088 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87113101 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87113247 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87113296 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87113424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87113583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87113593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87113781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87113821 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87113835 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87113840 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87113865 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87114117 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87114183 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87114193 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87114230 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87114247 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87114407 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 87114722 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 87114750 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87114764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87114992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87115004 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87115301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87115410 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87115504 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87115696 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87116028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87116034 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 87116053 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 87116146 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 87116183 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 87116214 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 87116456 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 87116530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87116563 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 87116663 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87123515 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 87123915 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87124168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87125498 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 87125840 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87126351 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 87126727 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 87126896 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 87127231 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87127247 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 87127380 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87127449 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 87127590 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 3 87127885 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 87128048 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87128113 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 87128381 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 87128570 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 87128810 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 87129047 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 87129210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87129247 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87130000 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 87130082 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 87130113 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87130117 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87130193 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87130242 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87130380 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 87130390 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 87130860 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 87130866 A G N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 87131157 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 87131169 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 87131412 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 87131634 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87131669 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 87131751 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 87131755 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 87131765 A G Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 87131802 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 87131882 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 87131919 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 87132076 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87132246 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 87132250 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 87132456 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 87133064 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 87133432 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 87134128 A T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.25 0.0625 0.6875 9 23 4 1 11 3 87135026 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87135469 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 87135498 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 87135520 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 87136473 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87136548 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87136753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87138517 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 87138756 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 87139795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87139925 A G N Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 10 6 4 2 2 3 87140095 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 87140341 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 87141043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87141215 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 87141461 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 87141773 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 87141775 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 87141963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87142796 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87142817 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87142866 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 87143203 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87143261 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 87143301 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 87143434 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 3 87143435 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 87143485 T A N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.666666666666667 0.133333333333333 0.2 22 8 10 2 3 3 87143531 G A N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 3 87143606 C A Y N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 87143932 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 3 87143990 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 87144183 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 87144184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87144338 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 87144388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87144432 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 87144488 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 87144550 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 87144691 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 87144697 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 87144722 T G N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 87144999 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 3 87145253 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 87145305 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.666666666666667 0.133333333333333 0.2 22 8 10 2 3 3 87145587 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 87145754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87145782 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 87145815 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87145830 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 87145859 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 87145916 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 87145941 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 87145997 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 87146026 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 87146029 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 87146213 A G Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 3 87146263 C A Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.2 23 7 11 1 3 3 87146303 C T N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 3 87146334 T G Y N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 3 87146343 C T Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 87146559 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 87146892 G T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 87146920 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 87147309 A G Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 87147457 A G Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.625 0.125 0.25 22 10 10 2 4 3 87147636 G A Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 87147815 A G Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 87148293 C A Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 87148997 T C Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 87149700 T A Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 87149738 C A Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 87150098 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87150109 C A Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 87150161 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 87150174 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87150333 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 87150526 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 87150538 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 87150834 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 87150850 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 87150860 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 87150918 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 87150937 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 87150999 T G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 87151022 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 87151071 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 87151084 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 87151122 A T Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 87151149 T G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 87151191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87151332 T C Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 87151443 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 87151484 C T Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 87151553 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 87151727 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87151950 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87152024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87152202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87152484 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 87152573 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 87152646 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 87152765 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 87152900 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 87153063 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 87153072 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87153091 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 87153220 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 87153231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87153232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87154182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87154310 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 87155128 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 87155295 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 87155307 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 87155354 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 87155397 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 87155456 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 87155523 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 87155545 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 87155662 T A Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 87155685 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 87155707 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87155840 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 87155859 T G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 87155862 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 87155962 A G Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 87156020 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 87156128 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87156509 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87156751 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 87156924 C G Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 87157176 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87158213 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 87158255 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 87158346 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 87158575 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 87158875 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 87158893 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 87159036 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 87159115 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 87159426 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 87159510 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 87159524 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 87159557 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 87159645 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 87159767 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 87160129 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 87160136 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 87160152 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 87160164 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 87160231 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 87160470 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 87160484 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 87160570 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 87160716 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 87160717 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 87160746 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 87160857 A T N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 3 87162500 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 87162584 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 87162611 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 87162708 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 87162770 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 87162830 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 87162883 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 87162975 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 87164411 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87164444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87164460 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87164676 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 87164681 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 87164695 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 87164861 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 87164862 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 87164924 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 87165105 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 87165123 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 87165254 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 87165257 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 87165559 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 87165605 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 87165706 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 87165727 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87165777 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 87165782 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 87165884 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 87165912 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 87165913 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 87165959 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 87166101 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 87166135 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 87166142 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 87166206 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 87166340 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 87166497 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 87166803 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 87166815 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 87167302 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 87167753 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 87168081 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 87170393 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 87170713 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 87171093 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 87171299 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 87171330 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 87171419 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 87172432 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 87172453 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 87172873 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 87174004 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 87174754 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87174851 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87174936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87175620 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 87175633 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87175909 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 87176538 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 87176697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87176957 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 87177239 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 87178380 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 87179881 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87179945 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 87179973 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 87181276 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 87181412 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 87181454 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87181777 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 87182200 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 87182720 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 87182734 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 87182838 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 87182917 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 87182944 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 87183029 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 87183077 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 87183135 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 87183409 G T N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 87183491 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 87183568 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 87183601 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 87183622 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 87183906 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 87184337 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 87184545 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 87184705 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 87184811 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 87185571 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 87186090 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 87186694 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87186896 T A N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 87186924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87186993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87187042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87187058 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87187134 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 87187191 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 87187276 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87187302 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87187449 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87187486 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87187570 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87187590 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87187639 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87187756 T A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 87187934 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87187973 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87187983 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 87188041 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 87188047 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87188074 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87188451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87188946 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87189194 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87189245 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 87189316 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 87189331 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 87189387 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 87189401 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 87189483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87189537 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87189654 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87189967 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87189982 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87190010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87190023 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87190047 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87190050 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 87190070 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87190088 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87190097 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 87190100 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87190109 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87190139 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87190169 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87190196 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87190307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87190321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87190538 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87190565 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87190572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87190675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87190751 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87190945 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 87191154 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 87191312 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87191356 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87191484 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87191495 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87191709 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87192070 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87192146 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87192226 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 87192228 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 87192294 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87192301 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87192401 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87192591 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87192700 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87192701 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 87192874 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87192931 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87192976 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87193063 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 87193094 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87193144 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87193287 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87193576 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87193606 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87193985 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87194002 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87194176 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87194192 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 87194316 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87194369 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 87194452 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 87194695 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87194882 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87194957 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 87194971 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 87194992 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87195006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87195055 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87195339 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 87195567 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87195634 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87195665 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87195741 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87195849 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87195909 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87195914 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 87195958 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 87195989 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87196023 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 87196056 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87196236 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 87196243 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 87196296 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 87196316 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 87196339 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 87196340 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 87196497 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 87196597 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87196647 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87196700 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 87196718 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 87196763 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 87196771 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87196883 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 87196952 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 87197041 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87197148 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87197178 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87197235 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 87197262 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 87197268 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87197516 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 87197773 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 87197935 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 87198004 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 87199384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87200053 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 87200088 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 87200120 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 87200215 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 87200439 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87200622 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87200666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87200723 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 87200751 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 87200753 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 87200792 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 87200806 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 87200811 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 87201553 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 87201668 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 87201903 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 87201916 T G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 87201947 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 87201997 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 87202036 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 87202135 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87202144 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 87202274 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 87202277 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 87202349 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 87202352 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87202374 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87202569 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87202586 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 87202757 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 87202771 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 87203046 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87203516 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 87203829 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87203830 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87203959 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 87203992 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 87203995 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87204047 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87204284 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87204434 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87204458 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87204545 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87204783 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87204784 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87205040 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87205502 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87205547 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87205609 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87205944 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87207015 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87207111 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 87207408 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 87207752 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87207757 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87208011 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87208123 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87208146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87208219 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87208222 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87208369 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87208371 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87208386 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87208465 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87209875 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 87209903 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 87210021 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 87210329 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 87210829 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 87211612 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87211871 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 87211980 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 87212002 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87212111 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 87212205 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 87212271 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 87212281 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 87212384 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 87212571 C A N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 87212665 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 87212707 G T N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 87212841 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87212992 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87212993 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87213010 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87213176 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87213180 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87213194 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87213327 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87213351 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87213413 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87213498 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87213529 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87213566 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87214001 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87214025 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 87214180 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 87214283 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87214284 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 87214517 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87214525 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87214566 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87214635 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87214805 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 87214830 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87214901 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87214979 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 87215311 T A N N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 87215361 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 3 87215452 C T Y Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 87215719 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87215747 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87215848 G C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87215871 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87215970 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87216001 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87216009 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87216080 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87216348 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 87216388 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 87216896 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 87216904 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 87217038 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87217039 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 87217073 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87217144 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 87217263 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 87217362 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 87217399 G C N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 87217569 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 87217580 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 87217637 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 87217771 G A N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 87217904 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 87217918 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 87217941 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 87217994 G C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 87218059 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 87218210 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 87218278 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 87218392 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87218470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87218478 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87218578 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 87218584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87218589 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87218604 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87218653 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 87218720 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 87218768 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 87218974 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87219004 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87219029 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 87219186 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 87219276 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 87219329 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87219857 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87219888 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87219965 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87220103 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 87220106 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 87220142 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 87220262 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87220282 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87220298 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87220339 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87220341 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87220401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87220476 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 87220931 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 87221097 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 87221475 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87221599 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 87221815 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 87224309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87224533 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87224642 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 87224778 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 87225276 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87225561 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 87226100 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87226125 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 87226159 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 87226295 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 87226370 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87226374 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 87226508 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 87226527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87226586 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87226722 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87227101 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 87227119 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 87227133 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 87227239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87227360 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 87227386 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 87227475 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 87227493 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87227795 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 87227828 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 87227836 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 87228204 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 87228275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87228743 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87229755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87230085 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 87230888 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 87231130 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 87231236 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 87231295 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 87231331 T A N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 87231777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87232875 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87233413 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87233609 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87233698 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87233795 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87234263 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 87234281 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 87234318 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87234319 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87234459 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87234915 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 87234962 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 87236177 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87236327 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 87236474 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87237238 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87237389 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87237751 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 87238210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87238625 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87239381 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87239645 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87240269 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 87240450 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87241308 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 87241397 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87241485 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87241486 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87241753 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87241876 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 87241942 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87242313 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87242436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87242793 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 87243075 T G N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 87243156 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87243203 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 87243547 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 87243741 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 87243765 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 87243999 C A N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.166666666666667 0.0833333333333333 0.75 5 19 2 1 9 3 87244241 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 87244302 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 87244303 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 87244343 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 87244379 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 87244411 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 87244431 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 87244432 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 87244460 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87244756 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 87244870 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 87245076 T G Y N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 87246025 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 87246092 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 87246109 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 87246473 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87246504 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87246569 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87246653 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87246733 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 87246771 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 87247019 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87247061 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 87247327 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 87247339 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 87247427 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 87247588 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87247606 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87247761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87247889 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87247912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87248148 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87248186 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 87248229 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87248253 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 87248389 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 87248449 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 87248498 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 87248518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87248540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87248591 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87249049 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87249058 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 87249159 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 87249174 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 87249180 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 87249505 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 87249950 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 87250004 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 87250033 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 87250385 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 87250535 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 87250753 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 87250816 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 87251251 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 87251314 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87251327 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87251360 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 87251372 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87251387 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87251462 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87251519 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87251782 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87251812 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 87251912 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87252004 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87252432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87252552 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87252563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87252602 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87252645 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87252710 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87252812 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 87253398 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87253749 C T Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 87253888 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87254100 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87254430 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 87255217 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 87255309 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 87255749 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 87255773 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87255805 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87255843 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 87255848 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 87255915 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 87256203 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 87256570 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 87256673 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87256920 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 87256926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87256946 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87257003 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 87257348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87258066 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87258817 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87258855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87259886 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87259921 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 87260019 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 87260294 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87260625 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87260785 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 87261782 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 87262172 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87262429 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 87262544 C A N N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0 1 0 10 10 0 10 0 3 87262906 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 87263753 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 87264473 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87264558 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87264637 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87265914 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 87265961 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 87266248 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 87266664 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87266699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87266753 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 87266828 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 87266831 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 87266847 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87268033 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87268096 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87268990 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 87269641 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87269654 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87269950 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 87270344 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 87270621 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87270687 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87270929 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87270947 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87270958 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87270988 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87271031 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87271233 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87271254 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87271273 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87271341 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87271414 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87271670 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 87272281 G A Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 87272738 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 87272811 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87272815 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 87272836 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 87273005 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87273018 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87273027 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87273037 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87278769 T A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 87278871 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 87278918 C G Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 87278919 T G Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 87281324 T C Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 3 87282871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87282911 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87283538 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 87283682 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 87283851 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87284059 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 87284826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87284896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87285392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87285642 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87285808 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 87285869 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87285923 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87285974 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87285992 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 87286172 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87286256 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87286344 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87286441 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87286544 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87286766 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87286793 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87286794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87287364 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87287418 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87287450 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87287463 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87287580 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87287809 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87288063 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87288088 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87288223 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87288267 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87288277 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 87288467 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87288643 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 87289968 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 87290200 C G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 87290365 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87290391 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87290574 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87290722 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87290754 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87290781 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87290870 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87290887 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87290955 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 87291550 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 87291710 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87291895 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87291981 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87292413 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87293229 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87293331 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87293691 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 87294040 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 87294143 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 87294368 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87294474 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87294759 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 87295053 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87295208 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 87295475 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 87295576 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 87295627 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 87295684 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87295713 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87295794 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87295807 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87295854 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87295864 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87295865 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87295890 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87295908 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87295910 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87295925 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87295945 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87296057 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 87296130 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 87296174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87296262 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87296631 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 87296649 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 87296750 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87296787 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87296820 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87296834 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87296964 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87297260 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87297598 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 87298019 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87298119 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87298138 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87298306 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87298371 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87298393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87298395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87298443 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87298447 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87298507 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 87298533 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 87298546 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 87298560 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87298622 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87298631 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87298646 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87298762 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87298886 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87298937 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87298964 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87299062 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87299072 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87299192 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87299205 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87299302 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87299625 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 87299638 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 87299643 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87299758 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 87299763 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 87299877 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 87299916 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87299946 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87299959 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87300002 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87300060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87300067 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 87300139 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 87300297 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87300308 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87300459 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87300511 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87301110 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 87301805 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87301852 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 87301952 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 87302591 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87302633 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 87302673 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87302711 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 87302720 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87302759 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87302770 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87302973 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87303182 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87303356 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 87303631 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87303827 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87303864 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87304031 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87304350 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87304357 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87304434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87304466 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87304785 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87304802 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87304811 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87304813 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87304953 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87305420 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87305421 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87305572 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87305674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87305818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87305998 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87306080 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87306822 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87307051 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87307241 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87307433 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 87307437 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 87307521 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87307593 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87308086 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87308181 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87308212 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87308279 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87308356 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87308404 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87308533 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 87308904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87309034 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 87309100 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87309235 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87309527 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87309648 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87310231 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87310462 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87310868 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87310872 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87310927 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 87311412 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 87311666 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87311735 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87311875 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 87311924 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 87311935 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87311954 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87312151 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 87312312 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87312367 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87312385 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87312393 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 87312745 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87313432 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87313489 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87313802 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87313887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87314134 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87314635 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87314919 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 87314927 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 87314990 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 87315061 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 87315252 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87315363 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87315636 C T N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0 0.785714285714286 0.214285714285714 11 17 0 11 3 3 87315710 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87315758 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87315761 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 87315784 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 87316067 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87316299 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87316358 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87316731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87317791 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87318588 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87318636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87318809 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87318878 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87319017 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87319055 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87319110 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87319376 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 87319377 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 87319434 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87319751 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87319856 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87319881 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87320273 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 87320307 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87320605 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87320648 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87320665 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87320681 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87320719 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87320765 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87321295 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 87321333 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 87321575 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87321866 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87322096 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87322141 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87322147 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87322421 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87323006 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87323164 G A N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 3 87323935 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 87323936 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 87323996 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87324202 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87324407 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 87324484 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87324531 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 87324534 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87324835 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 87325003 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87325174 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87325535 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87325870 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87325892 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87326139 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 87328133 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87328576 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87328624 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87329320 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87329777 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 87330260 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87332083 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87332805 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87333090 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87333379 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87333542 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87333864 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87334039 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 87334829 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87334852 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87334950 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 87335163 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87335361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87335365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87335470 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87336779 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87337544 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87338156 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87338289 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87338306 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87338326 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 87338417 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 87340262 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87340393 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87340851 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87341384 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 87341855 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87342038 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87342794 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87342954 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87343083 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87344190 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 87344414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87345532 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87345713 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87345794 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87346029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87346106 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 87346970 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87347337 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 87347430 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87347472 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87347500 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87348062 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87348166 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87348241 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87348299 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87348685 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87348804 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87348822 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87348841 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87348905 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87349449 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 87349563 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 87349794 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 87350653 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87350958 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87351017 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87351078 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87351299 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87351647 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87351673 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87351838 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87351922 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87352242 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87352279 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87352377 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87352428 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87352461 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 87352716 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87352834 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 87352957 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87353244 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 87353991 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87354115 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87354135 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87354154 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87354183 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87354205 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87354222 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87354386 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87354450 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 87354452 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 87354507 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 87354711 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87354793 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87355031 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87355127 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87355240 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87355391 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87355505 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87355738 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 87355782 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 87355806 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 87355953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87355988 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 87356021 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 87356050 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 87356330 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87356371 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87357305 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 87357801 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87357837 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87357846 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87358175 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87358229 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87358243 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87358348 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87358373 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 87358525 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 87359548 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87359640 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 87359673 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87359709 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87359812 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 87359887 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 87359945 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 87359956 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 87359983 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87360660 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87360793 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87360872 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87360876 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 87360932 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87360954 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87360974 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87360987 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 87361014 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87361132 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87361421 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 87361452 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 87361825 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 87361904 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87361911 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87362349 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87362415 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87362515 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87362550 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87362614 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 87362830 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87363112 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87363227 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 87363419 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 87364068 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 87364078 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87364218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87364478 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 87364601 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 87364867 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 87365082 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87365121 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87365138 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87365163 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87365408 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87365609 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87365795 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87366052 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87366085 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87366607 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87366618 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87366827 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87366836 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87366960 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 87366963 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 87367099 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87367422 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87367461 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 87368239 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87368398 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87368462 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87368478 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87369310 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87369754 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87369949 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87370429 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87370607 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87370619 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 87370646 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 87370648 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87370832 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87370945 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 87371069 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87371127 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87371217 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87371354 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 87371433 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87371888 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87371902 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87371954 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87372019 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87372099 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87372140 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 87372181 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 87372289 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 87372383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87372401 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 87372406 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 87372484 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 87372504 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 87372609 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87372621 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87372626 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87372659 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87372684 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87372699 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 87372960 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87373009 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87373071 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 87373181 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 87373196 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87373206 G T N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 87373207 G T N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 3 87373473 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87373503 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87373534 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 87373539 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 87373620 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87373696 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 87374239 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 87374386 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 87374424 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87375053 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87375060 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87375071 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87375406 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87375543 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87375651 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87375941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87376185 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87376240 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 87376470 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87377774 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87377960 A C Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 87378593 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 87378872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87379487 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87379522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87379523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87381177 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87383847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87384172 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87384411 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87384444 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87384472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87384537 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 87384573 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 87384581 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 87384735 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 87384757 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 87384781 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 87384862 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 87384877 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 87384934 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87384961 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87385042 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87385055 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87386433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87386535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87386539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87386579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87386709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87386798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87387017 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 87387941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87388034 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87388292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87388809 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 87388862 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87388889 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87389007 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87389020 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87389145 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87389396 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87389422 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87389732 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87389922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87389948 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87390609 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87391279 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87392360 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87392470 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87392604 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 87392681 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 87392702 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 87393813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87394196 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87394464 C T Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 3 87394940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87394975 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87394979 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87395667 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 87395711 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 87396701 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 87397374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87399082 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87399319 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87400276 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87400328 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 87400441 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87400700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87401295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87401309 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87401397 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87402814 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87402907 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87403118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87403317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87403365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87404033 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87404944 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87405090 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 87405231 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 87405309 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 87405348 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87405585 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87405612 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87406135 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87406315 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87406325 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 87406329 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87406341 G A Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 87407148 T C Y Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0 0.615384615384615 0.384615384615385 8 18 0 8 5 3 87407666 A C Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 87409491 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87409522 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87410438 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87410943 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87410974 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 87411001 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87411055 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 87411079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87411967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87412149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87412343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87412565 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87412667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87413109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87413454 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 87413595 A T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 87413602 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 87414377 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87414639 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87414780 G T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 87414969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87415163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87416719 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87416720 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87417154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87417968 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87417991 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87418046 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87418291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87418906 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 87420117 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87420420 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 87420849 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87420853 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 87421097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87421178 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 87422503 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87422770 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87423531 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87424030 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87424307 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87424316 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87424358 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87424457 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87425194 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87425453 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87425654 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 87425949 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87426111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87426261 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87427139 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 87427480 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87427959 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 87431511 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87431859 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87432215 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87432507 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 87433073 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 87433392 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87434112 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87434754 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 87434812 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 87435097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87435628 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87435737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87435872 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87436291 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87436387 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87437487 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 87437636 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87437829 C A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 3 87438100 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87438172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87438185 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87438329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87438392 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87438409 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87439527 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87439555 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87440210 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87440490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87441620 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87441886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87442120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87442427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87442796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87442933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87443409 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 87443565 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87444714 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87445643 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87446120 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87446161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87446336 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87446447 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 87447445 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 87447518 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87448125 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87448279 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 87448520 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87448639 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 87449080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87449965 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 87450190 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87452598 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87453042 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87453099 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87453154 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87453579 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 87453585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87453608 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87453721 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87453833 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87454018 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 87454110 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 87454197 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 87454207 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 87454453 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 87454520 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 87454643 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 87454645 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 87454696 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 87454866 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 87454891 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87455001 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87455143 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87455304 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87455551 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87455652 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 87455718 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 87455900 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 87455934 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 87455939 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 87456075 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 87456082 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 87456089 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 87456295 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 87456318 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 87456502 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87456691 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87456725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87456726 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87456884 C T Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 87457012 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 87457158 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 87457188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87457306 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87457449 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87457602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87457646 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 87457690 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 87458015 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 87458141 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 87458260 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 3 87458308 A G N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.230769230769231 0.538461538461538 0.230769230769231 13 13 3 7 3 3 87458757 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.0666666666666667 0.666666666666667 0.266666666666667 12 18 1 10 4 3 87458783 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 87458829 G C N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 3 87458962 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 87458964 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 87459564 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 87460185 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 87461940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87462360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87464283 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 87465506 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87465650 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87465763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87466368 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87466418 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87466429 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87466509 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87466587 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87466599 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87466960 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87467063 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87467248 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87467467 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87467725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87467842 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87467884 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87468271 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87468719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87469276 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87469430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87469539 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87469598 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87469821 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87469829 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 87470024 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 87470034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87470166 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87470425 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 87470428 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 87470466 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87470744 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87471225 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87471400 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 87471581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87472323 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 87472342 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87472533 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87472555 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87472982 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 87473056 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 87473467 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 87473515 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87473547 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 87473811 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 87473937 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 87474015 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 87474349 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87474367 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 87475480 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 87476472 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 87476892 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 87476915 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87477486 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 87477934 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87478047 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87478064 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87478271 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87478753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87478787 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 87479185 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87479443 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87479459 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 87479467 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 87479504 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 87479581 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87479701 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87479866 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87479945 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87480107 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87480118 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87480197 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87480257 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87480280 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87480350 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87480478 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87480487 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 87480869 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87480978 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87480998 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87481099 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87481386 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 87481522 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 87481942 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87482011 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87482169 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 87482465 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87483595 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 87483883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87484083 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 87484156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87484622 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 87484711 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87484775 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 87485239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87486477 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87490135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87490549 A G N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 87490749 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 87490805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87491008 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87491844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87491976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87492416 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87492850 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87493288 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 87493626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87493789 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87494033 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87494427 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87494618 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 87495056 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 87495068 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 87495451 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 87495458 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 87495709 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87495828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87495994 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87496247 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87496351 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87496526 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87496587 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87496655 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87497091 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87497927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87499278 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87499291 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87500181 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87500222 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87500276 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87500289 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87500341 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 87500575 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87500591 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87500681 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87500831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87500936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87500971 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 87501130 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 87501134 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 87501159 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87501341 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87501421 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87501430 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87501752 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87501808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87502288 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87502515 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87502575 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87502599 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87502650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87502928 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87503120 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87503271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87503441 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87503910 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.0714285714285714 0.714285714285714 0.214285714285714 12 16 1 10 3 3 87503949 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 87504069 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87504094 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87504151 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87504199 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87504217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87504247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87504329 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87504409 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 87504472 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87504534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87504627 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87504744 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87504748 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87504837 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87504980 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 87505256 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 87505897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87506235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87506625 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 87508305 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87508437 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87508573 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 87508916 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 87510190 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 87512418 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 87513747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87514332 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87514678 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 87515211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87515787 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 87515963 A G N Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 3 87516218 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 87516799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87517048 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 87517622 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 87517900 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87518153 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 87518719 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 87519695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87520742 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87521272 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87521667 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 87521739 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87521758 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 87521766 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 87521795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87522698 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 87522703 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87522969 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87525192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87525259 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87526620 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87527016 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 87527683 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 87527852 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 87527995 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87528048 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 87528360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87528427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87528693 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87528739 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87528794 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 87528867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87529768 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87530398 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87531381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87531724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87531890 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87532452 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 87534480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87535965 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87537529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87538873 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87539552 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87540287 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 87540416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87542224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87544370 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 87544443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87545135 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87545280 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87545342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87545859 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87545915 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87545917 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87546164 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 87547077 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 87547350 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 87547537 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 87547730 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87547809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87548106 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 87548121 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 87548185 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 87548551 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 87548875 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 87548997 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87549500 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 87549706 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 87550336 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87550499 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 87550750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87551428 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87551624 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87551804 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 87551922 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 87552035 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 87552429 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87552622 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87552836 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87552910 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87555066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87555168 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87555283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87555345 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87555381 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87555498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87555556 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87555576 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87555619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87555620 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87555666 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87555736 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87560337 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87560581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87560743 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 87560749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87560760 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 87561054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87561394 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 87562699 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 87564504 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 3 87568353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87571247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87571995 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87572141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87573939 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 87574445 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87574536 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 87574545 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 87574966 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87574975 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 87575638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87576507 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 87576550 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 87576554 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 87576576 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 87577533 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87578264 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 87578378 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 87578405 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 87578919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87579662 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 87579885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87581781 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87583790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87590080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87590537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87591204 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87597320 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 87600858 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87607176 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 87608261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87608829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87610338 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87610419 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 87610717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87614338 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87616029 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 87617194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87617478 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87620265 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 87621101 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87621127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87621145 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 87621832 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87622671 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 87622736 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 87622855 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87623588 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 87623615 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 87623655 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 87624038 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 87624522 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 87624552 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 87624593 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 87624606 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 87625080 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87625364 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 87625501 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 87626248 T C Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 87626261 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 87627429 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 87629106 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87630545 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87631282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87631532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87631914 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87632325 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 87632584 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 87632702 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87632772 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 87633021 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87633992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87636946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87638031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87639881 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 87640019 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87640148 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87642694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87642777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87644001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87645288 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 87645728 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87646497 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87648760 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87648893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87649960 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87650137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87651036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87651212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87651298 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87652222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87653909 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87661590 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87661666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87664412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87664866 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87666437 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87667255 G T Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 87667278 A C Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 87667298 A T Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 87668178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87668271 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 87670500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87671360 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87673109 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87677084 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87678016 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 87678450 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87680437 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87680480 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87683399 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 87685912 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 87689528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87693383 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87695874 A G Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 87696627 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 87698656 A G Y Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.25 0.75 0 15 9 3 9 0 3 87699036 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87700935 G A Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 87702217 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 87705037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87706520 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 87707774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87710004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87711637 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87712596 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87713264 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87714105 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87715661 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87716865 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87720039 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87721849 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 87722744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87723175 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87723551 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87723979 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 87724007 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87726839 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 3 87726926 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87729141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87729935 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87730201 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 87730207 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 87730223 G T N N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 87730227 G C N N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 87732377 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 87735384 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87735674 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 87738543 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87740724 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87744075 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87745724 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87747907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87748463 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 87757904 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 87761263 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87761297 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87761571 A G Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 16 20 0 16 2 3 87761575 A T N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 87763341 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87763837 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87763882 G C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 87765018 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 87768206 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87768556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87774356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87776289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87777128 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87777313 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 87777578 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87777604 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87777766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87777791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87777839 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87778635 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87779060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87779419 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 87779650 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 87779729 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 87779961 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 87780274 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 87780298 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 87780909 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 87780921 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 87781379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87782191 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87782300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87782326 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87782338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87782750 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87783129 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87783407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87784180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87784601 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87784813 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87785097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87785131 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87785151 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87786003 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 87786025 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 87786083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87786718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87786765 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87787283 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87787389 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87787554 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 87787627 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87788050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87788217 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87788315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87788683 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87788746 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 87788775 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 87789648 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87789785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87789973 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 10 20 0 10 5 3 87790179 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87790197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87790265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87790286 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87790900 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87790989 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87791001 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87791119 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87791316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87791338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87791850 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87792465 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87792916 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87793327 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87793420 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 87793425 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 87793453 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 87794857 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87794968 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87795003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87795038 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87795040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87795218 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87795521 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87795841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87795846 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87795854 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87795909 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87800446 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 87801919 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87802881 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 87805427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87806676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87806858 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87807100 T G N N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 5 11 0 5 3 3 87807111 C T N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0 1 0 12 12 0 12 0 3 87807128 T A Y N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 14 12 1 12 0 3 87807232 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 87807262 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87808043 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 87808206 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87808678 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87809606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87809780 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87809804 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87809817 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87809884 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87810096 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87810623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87810653 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87810777 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87810878 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87811051 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 87811064 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 87811209 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87811259 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87811361 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87811558 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 87811753 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 87811801 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87812144 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87812305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87812371 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 87812535 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87812547 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87812827 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87813188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87813309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87813362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87813638 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 87813997 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 87815930 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87817515 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87817638 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87818127 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 87818290 G C Y N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 3 87818309 G A Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 87818316 A T Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 87818325 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 87818505 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87818585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87818665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87819056 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87819098 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87819119 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87819637 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87819959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87819992 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87820609 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87820634 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87820637 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87820685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87822945 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 87823742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87823805 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87824169 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87824533 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87825773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87828771 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 87829599 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87829662 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87830376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87830600 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 87830749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87830770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87830777 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87831015 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87831028 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87831211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87831342 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87831383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87831679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87831882 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87831976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87832673 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87833734 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87834334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87835223 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87835247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87835649 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87835746 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87835816 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87835824 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87835953 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87836231 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87836266 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87836282 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87836386 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87836453 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 87836614 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87836618 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87836754 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87836896 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87836920 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87837097 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87837330 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87837375 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87837410 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87837563 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 87837865 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87838302 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87838313 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87838945 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87839038 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87839040 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87839070 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87839102 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87839590 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 87839596 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 87839673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87839695 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87840767 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 87841274 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87841442 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87841663 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 87842231 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87842275 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 87842954 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87843351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87844304 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 87845364 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87845373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87845581 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87845664 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 87846964 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87847689 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87848956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87849649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87850374 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 87850382 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 3 87850394 A G Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 87850410 A T Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 87850725 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87850894 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87851999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87852054 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87852211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87852590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87853808 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 87853844 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 87854031 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87854631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87855534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87855853 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 87856486 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 87856590 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87856951 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87858308 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87858954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87859741 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 87860011 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 87860034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87860363 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87860706 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87860731 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87861342 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87861826 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87861840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87861861 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87862061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87862326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87862573 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87862642 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87862666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87862755 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87862865 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87862900 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87863044 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87863130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87863179 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87863249 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 87863313 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87863354 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87863389 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87863471 T G N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 3 87863575 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87863687 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87863741 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87863754 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 87863775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87863859 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87863867 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 87863883 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 87863916 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 87864151 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87864219 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 87864444 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87864519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87864522 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87864534 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 87864564 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87864719 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87864730 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87864779 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 87865691 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87865798 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87865844 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87865876 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87872035 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87873639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87874141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87875224 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 87875319 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 87875463 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 87875508 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 87875683 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 87875707 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 87875741 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 87875775 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 87875784 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 87876106 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 87876170 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 87876218 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 87877026 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 87877112 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 87877149 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 3 87878199 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 87879657 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87879695 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87880233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87880249 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 87880510 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 3 87880670 A T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 87880804 A C N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.214285714285714 0.0714285714285714 0.714285714285714 7 21 3 1 10 3 87881082 A G N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.2 0 0.8 4 16 2 0 8 3 87881091 A C N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 3 87881093 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 87881577 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 87881711 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87883719 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 87885235 T A N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 87885348 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 87887198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87887804 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87889666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87891870 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 87893944 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87894109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87894772 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 87895297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87895325 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87897244 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 87897773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87899388 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 87900610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87901979 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 87901983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87902559 C A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 87904158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87905679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87907204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87907328 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87909949 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 87909959 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 87910137 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 87910226 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87910373 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 87910983 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87912004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87912483 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87912836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87913819 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 87914621 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87914754 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 87914801 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 87914807 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 87914870 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87914987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87919302 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 87920289 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87921337 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 87921528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87922076 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87922495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87923152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87923880 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 87924924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87927778 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0 0.8125 0.1875 13 19 0 13 3 3 87928497 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87929300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87929310 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87929860 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87931802 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87932081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87933821 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 87936858 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 87938688 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 87952203 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87955627 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87956722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87961927 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87962661 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 87962669 A C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 87965317 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87966096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87972884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87977318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87977376 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87977788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87978967 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 87979206 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 87981525 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 87983529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87984157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87984311 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 87984628 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87985029 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87985157 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87985649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87986146 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 87987013 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87988007 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 87988583 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87989588 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 87989914 T C N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.363636363636364 0.363636363636364 0.272727272727273 12 10 4 4 3 3 87989919 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 87989990 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 87990754 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87991432 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 87994045 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87994080 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87994190 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87994893 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 87996802 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 87999240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 87999292 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 87999658 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88000082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88003337 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 88004052 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 88004117 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 88004593 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 88004634 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88004838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88005406 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88006047 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 88006863 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 88006875 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88007761 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88008018 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88008108 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88008441 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88012977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88013129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88014711 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88014840 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88015552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88018431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88020435 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88020871 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88023470 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 88025333 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 88025443 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 88027292 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 88030960 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 88031785 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88033492 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88035865 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88038854 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 88042300 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 88042462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88042711 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88043039 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 88048910 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 88049005 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 88049010 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88049345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88050094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88050211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88050345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88051186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88051435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88051463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88053031 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 88053077 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 88053094 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 88053137 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 88053211 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 88053222 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 88053399 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 88053425 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88053438 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 88053477 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 88053545 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 88053580 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 88053648 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 88053675 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 88053706 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 88053711 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 88053724 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 88053725 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 88053747 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 88053789 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 88053800 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 88053850 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 88053914 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 88053948 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 88053958 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 88054011 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 88054033 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 88054096 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 88054097 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 88054274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88054300 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88054399 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88054800 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 88054959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88055865 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 88055882 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 88055979 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88056195 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88056265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88056267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88056594 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 88056990 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88058850 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88061995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88062116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88062475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88064516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88064751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88065229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88065410 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 88065559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88065596 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 88065608 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 88065740 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 88065921 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88066360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88066507 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 88066516 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 88066613 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 88066659 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 88067744 T C N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 3 88068115 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 88068116 T G N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 88068198 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 88068387 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 88068396 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 88068416 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 88068419 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 88068429 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 3 88068430 C G N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 88068509 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 88068537 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 88068584 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 88069026 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 88069106 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 88069125 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 88069257 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 88069296 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 88069365 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 88069568 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88069604 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 88069647 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88069698 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88069807 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88069919 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88072264 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 88072700 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88072851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88073026 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88073039 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88073568 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88073820 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 88073946 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 88073981 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 88075383 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 88075436 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 88076059 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 88076526 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88076652 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 88076658 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 88076698 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88077875 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88079424 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 88079427 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 88079692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88079721 T C Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 88079731 G A Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 88080149 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 88080277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88080299 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88080452 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 88080475 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 88080521 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 88081049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88085389 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 88086159 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88086550 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88087244 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 88087920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88087961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88088010 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 88088406 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 88088601 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 88088833 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88089324 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88090201 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88090606 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88090995 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88091209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88091223 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 88091228 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88091297 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 88091506 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88091702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88092158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88094083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88094905 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 88094954 G A Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 88096193 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88096336 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 88096743 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 88096920 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 88096930 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 88096954 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88097479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88097627 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 88097827 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 88098010 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 88098011 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 88098060 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 88098068 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 88098176 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 88098322 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 88098333 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 88098337 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 88099457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88102702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88103198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88103229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88103722 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88104330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88104343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88104620 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88107240 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 88107789 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 88107974 A C Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 88107992 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88108106 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88109206 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 88109513 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 88110253 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88110321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88110581 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 88111790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88112742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88113395 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88113933 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 88114237 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 88114566 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 88116017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88116772 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88116926 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88117060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88117073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88117306 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88117367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88117933 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88117963 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88118112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88118343 A T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 88118615 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 88119429 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88119696 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88120096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88120158 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 88120481 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 88120919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88121207 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 88121443 C T Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 88121487 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 88121635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88121689 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 88121725 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 88122135 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 88123042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88123212 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88123254 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 88123966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88124154 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 88125111 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 88125262 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88125913 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 88126035 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88126981 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 88130978 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88132584 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 88132869 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88133891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88134434 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88135971 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 88136060 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88136108 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88137612 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88139473 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88140331 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 88141041 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 88141301 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88141373 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88143919 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88145810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88146134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88148438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88150016 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88150288 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88150531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88150929 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88154707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88156522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88157634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88160935 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88165707 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88166763 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88167258 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 88167286 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88170253 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88170276 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88170291 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88170322 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88170323 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88176250 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 88176420 C A Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 88176436 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 88176463 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 88177387 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 88177911 A G Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 88177958 T A Y N 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.375 0 0.625 6 10 3 0 5 3 88178261 C T Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 88178348 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 88178974 G A Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 88179887 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 88182809 C A Y N 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 3 88182837 C A Y N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 3 88183663 C G Y N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 88183672 T A Y N 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 3 88184893 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 88188017 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 88188631 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 88189381 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 88189591 T C Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 88189636 G T Y N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 88189643 T G Y N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 88190301 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 88190417 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88190803 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 88191048 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88191241 G A Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 88191386 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88191404 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 88191508 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 88191536 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 88192065 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88192461 A T Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 88192641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88192769 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 88193076 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 88193350 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88193592 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88193936 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 88195249 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 88196031 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 88196700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88196996 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88197741 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88198786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88199038 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88201301 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88201310 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88202698 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88204210 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 88204600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88204918 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 88205529 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 88206354 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88208460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88209077 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 88209736 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 88210349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88210829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88211766 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 88213072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88213579 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88214388 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 88216051 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88217167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88217300 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88220334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88221672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88222621 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88224085 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88225915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88226140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88226860 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 88226862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88226909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88227215 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 88227805 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88228882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88233451 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 88235291 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88236434 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 88236496 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88236894 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88237542 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 88238416 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 88239398 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88242814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88243046 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88243314 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 88243315 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 88245819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88245932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88246260 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 88247483 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 88250587 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 88250609 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88252133 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 88252719 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88253021 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88254306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88254673 C A Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 3 88254740 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88254977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88256902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88259096 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88259417 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 88261268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88261668 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88263247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88263920 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 3 88263985 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 88264102 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 88264177 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 88264183 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 88264192 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 88264265 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 88264397 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 88265258 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.277777777777778 25 11 12 1 5 3 88265398 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 3 88265578 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 3 88265585 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 3 88265591 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 3 88265856 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 3 88265857 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 3 88265877 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 3 88266072 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 3 88266083 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88266144 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 3 88266249 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.611111111111111 0.111111111111111 0.277777777777778 24 12 11 2 5 3 88266878 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.222222222222222 14 4 7 0 2 3 88266897 A G N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 15 5 7 1 2 3 88267137 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 3 88267202 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 88267205 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 88267264 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 88267485 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 3 88267611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88267755 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88267823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88268029 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 88268093 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 88268100 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 88268184 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 88268282 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88268386 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 88268426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88268430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88268776 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 88268799 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 88268807 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 88268835 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 88268863 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 88268883 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 88270339 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 88270663 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 88271844 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 88271962 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 88271973 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 88272063 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 88272100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88272405 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88272713 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 88272963 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 88273022 A T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 88273139 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 88273229 A G Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 88273259 T A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 88273294 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 88273330 G C Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 88273363 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 88273514 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 88273517 A T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 88273525 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 88273546 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88273677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88274369 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88275908 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88275942 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88277284 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88277327 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88277437 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 88277733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88278608 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88278933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88279031 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88279523 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88281819 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 88281847 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88283583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88284703 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88284733 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88284929 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 88284941 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 88284950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88285007 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88285277 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88289987 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 88290098 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 88290338 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 88291042 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 88291082 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 88291228 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 88291262 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 88291368 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88291454 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88291849 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 88292018 C G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 88292111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88292239 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88292436 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 88293446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88293514 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 88293515 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 88294324 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88294334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88294385 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 88295678 C G N N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 3 88296383 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 88296385 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 88296397 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 88296555 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 88299817 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88300130 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88301634 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88302855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88302857 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88302873 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88302913 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88303039 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88303605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88304048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88304266 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88304874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88305547 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88307926 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 88308479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88308677 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 88308704 G A Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 88310086 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88311750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88312474 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88312563 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88312820 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 88313179 G A N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 3 88313186 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 88313283 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 88313328 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 88313360 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 88313378 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 88313468 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88313710 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 88314214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88314627 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 88315422 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 88315625 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 88315627 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 88315729 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 88315749 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 88315770 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 88315784 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 88315855 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 88315901 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 88315941 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88316078 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 88316129 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 88316155 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 88316488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88316955 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88317425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88318413 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88320008 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88321909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88322026 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 88323251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88324129 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 88324344 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 88328136 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 88329674 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 88330454 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 88331955 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88332158 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88332722 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 88333185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88333810 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88334503 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 88334572 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88335665 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 88338214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88338265 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 88338267 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 88339285 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 88340933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88341855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88344112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88353454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88353984 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88355736 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88355908 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 88360348 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 88362365 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88363494 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88370753 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 88371510 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88372338 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 88374985 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 88375425 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 88376821 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88377355 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88383672 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88385575 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 88393578 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88394061 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 88395148 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88395260 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 88397640 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88398311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88399520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88400803 A C Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 88401224 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88402469 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 88402534 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 88402721 T G Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 88403628 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 88403976 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 88405288 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 88406211 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88408592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88409209 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88409321 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 88409554 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88410383 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 88410857 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88410920 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88414851 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88415098 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 88415382 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 6 8 2 2 3 3 88415417 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 88415427 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 3 88415445 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 88415502 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 88416244 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 88416765 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 88417200 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 88417897 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 88418256 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 88419121 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88419395 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 88419412 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 88419459 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 88419784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88419995 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88422778 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88423090 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88423216 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 88423530 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 88424232 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88425298 T C N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 3 88425566 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 88425631 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88425814 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 88426078 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88427035 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 88428224 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 88428761 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88428765 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88428783 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88428802 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88428888 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88428992 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88431152 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88432488 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88433118 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88435438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88435785 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88437590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88439226 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 88439619 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88439660 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 88439982 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 88440035 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88440041 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88440774 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 88440847 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 88440868 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 88440906 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 88441509 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 88441864 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 88441888 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 88441908 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 88442092 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 88442179 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88442218 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 88442373 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 88443170 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88444026 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88445035 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 88445338 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 88445379 C A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 88445502 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 88445508 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 88445528 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 88445560 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 88445624 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 88445639 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 88445882 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 88445906 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 88446145 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 88446166 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 88446603 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88446665 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 88446678 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 88446980 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 88447290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88447439 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88448187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88448927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88449456 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 88449546 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88449613 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 88452547 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88452689 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 88452755 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 88453025 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 88453163 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88453211 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88453362 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88453371 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88453625 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 88453668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88453717 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88453834 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 88454309 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88454467 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 88454477 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 88455034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88455492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88457159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88457316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88457491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88457535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88457752 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 88457950 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 88458052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88458962 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 88458972 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 88459133 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 88459640 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 88459690 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 88460004 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 88460043 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 88460077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88460088 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88460168 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 88460262 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 88461057 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 88461065 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 88461281 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 88461293 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88461392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88461780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88461844 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 88461866 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 88461936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88462069 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 88462094 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 88462516 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 88462763 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 88463350 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 88463372 A G Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 88463499 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 88463932 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88464101 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88464363 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 88464611 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 88465429 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 88465605 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 88465710 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 88465791 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 88466510 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 88466539 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 88466543 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 88466751 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 88466814 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88466897 T A N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 3 88467010 T C N Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 3 88467138 A G N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 3 88467318 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 88467562 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 88467682 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 88467760 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 88467955 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88468482 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88468540 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 88468645 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 88468663 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 88468737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88468761 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 88468868 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 88469382 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88469426 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88470027 A G Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 88470040 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 88470043 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 88470080 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 88470093 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 88470120 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 88470181 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 88470241 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 88477454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88477540 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88477710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88477728 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88477757 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 88477908 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88477937 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 88477959 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 88478020 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 88478031 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 88478113 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88478172 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 88478195 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 88479222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88479378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88479731 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 88480377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88480579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88483305 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 88484383 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88485834 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88487286 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88488431 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88491961 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 88492526 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88495122 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 88495329 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88496688 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88497748 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88498027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88498227 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88498819 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 88499159 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 88504604 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88509208 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 88509451 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88512901 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88513879 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88513896 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88513903 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88513946 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88514334 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 88515533 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 88517559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88519079 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 88519080 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 88520702 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88522002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88524772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88527118 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 88527475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88527689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88530542 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88531320 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 88531847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88532009 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 3 88534176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88536110 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88538478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88538836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88538919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88541077 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88541090 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 88557598 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88557887 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 88557918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88560701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88562619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88562668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88562783 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 88565330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88565332 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88566461 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88568893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88569877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88570101 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88570568 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88583353 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 88585164 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 88585167 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88585232 G C N N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 3 88586884 C T Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 88586972 T C Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 3 88587033 G T Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 88587046 A C Y N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 12 16 0 12 2 3 88592721 C A Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 88599536 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 88600011 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 88602020 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 88605533 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 88607152 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 88607596 G C N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 88609293 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88609304 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88609711 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88609799 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88614145 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 88614328 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 88616679 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88617612 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 88618165 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88618249 G C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 88618623 G C N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 88621981 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 88622218 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 88622800 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 88627228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88627235 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 3 88633489 G T Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 88637218 G C N N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.6 0 0.4 6 4 3 0 2 3 88637249 C T Y Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 3 88637328 T C N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 88637452 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88637519 A T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 88637661 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 88642611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88642799 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 88644826 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 88644874 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 88647238 T A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 88649087 C T N Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 88649127 A C N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 3 88651112 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 88652565 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 88652745 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 88652755 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 88652877 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 88653783 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88654730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88654769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88654770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88655319 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88655595 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 88656541 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88656938 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 88657370 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 88657391 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 88658002 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 88658464 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88659932 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88660053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88660136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88660154 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 88661378 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88661488 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 88662519 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88664252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88668795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88669852 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 88670461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88670477 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88670720 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 88677815 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 88686407 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 88687906 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88688113 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88688716 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88688826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88689445 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 88692490 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 88695788 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 88697834 G T Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 3 88697837 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 3 88701839 T C Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 88705653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88705901 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88706250 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88708660 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88710677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88712204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88716673 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88718341 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88722796 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 88723022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88723052 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 88726672 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88735323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88736240 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88744501 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88747326 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88747554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88748963 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88751337 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88763505 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 88772067 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 16 8 4 8 0 3 88773811 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 88774521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88780529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88783781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88783878 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 88784559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88785187 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88789785 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 88790800 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88794053 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88795058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88795438 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88795550 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 88795592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88797409 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 88798645 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88799884 T C Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 88802798 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88803314 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 88805079 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 88805552 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88805610 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88806758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88806873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88812785 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88812892 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88815097 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88815190 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88815859 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88817020 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 88818792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88819149 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88820979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88821258 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88825655 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88826361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88828071 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88829181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88832222 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 88837465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88843182 C A Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 88843676 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 88844977 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 88851080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88853350 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88857297 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88858459 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88858615 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88858901 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88860986 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88861969 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88862133 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88862216 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 88863192 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88863505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88865477 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 88866091 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88866488 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88869958 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88871210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88871330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88872050 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88872438 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88878283 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88878331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88880643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88880684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88881205 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88881374 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88881410 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88881534 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88882308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88885107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88887299 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 88888689 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88889016 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88897986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88902899 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88903506 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88904206 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88905428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88906128 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88907608 T C N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 88907694 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88908913 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 88909736 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 88910366 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88911313 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88911651 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 88912121 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88912565 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 88912810 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88912846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88913112 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 88913163 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 88913611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88913887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88914533 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88914758 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88914888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88915004 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88915214 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 88915245 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88915346 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88915361 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 88915557 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 88916050 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 88916103 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 88916151 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 88916312 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 88916324 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 88917522 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 88917544 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 88917678 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88917774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88917839 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88917919 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88917998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88918027 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88918037 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88918261 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 88918622 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 88918658 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 88918677 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 88919381 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88919432 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 88919447 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 88919797 A T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 88920013 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 88920021 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 88920049 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 88920161 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88920275 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88920294 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88920736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88920927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88921280 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 88921883 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 88921996 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88922018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88922054 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88922060 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88922151 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 88922163 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 88922201 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88922239 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 88922557 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 88922624 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88922631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88922716 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 88922772 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88922847 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88923555 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 88923585 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88923661 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 88923674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88923744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88923878 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 88924069 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88924176 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 88924233 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 88924271 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 88924310 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 88924347 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 88924371 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 88924910 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88925036 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 88925442 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 88925632 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 88925653 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 88925709 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 88925713 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 88925874 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 88925916 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88926203 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 88927248 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 88927258 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 88927843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88927913 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 88928251 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 88928483 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 88928807 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 88928836 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88929593 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 88929596 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 88930357 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 88930622 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 88930831 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 88930934 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 88930994 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 88931416 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 88931435 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 88933967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88934090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88934321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88935194 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 88937843 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88937970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88938556 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 88938852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88939072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88939142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88939460 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 88940762 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 88941779 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0 0.882352941176471 0.117647058823529 15 19 0 15 2 3 88942018 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 88945735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88947358 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 88948431 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88949615 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88953662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88954601 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 88959137 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88959324 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88962163 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88965908 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 88967058 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 88967432 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88969910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88974099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88974226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88977210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88977843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88980588 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88985661 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 88986805 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88989183 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88990673 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88990697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88992778 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 88993808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88994469 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88994842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88994992 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88995069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88995220 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 88995820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88995859 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88996058 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 88996396 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 88996828 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 88997143 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 88998591 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 88999797 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 89000825 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 89001199 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89001200 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89001645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89002756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89003861 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 89005150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89010122 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89011613 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89011678 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 89013417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89019940 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89023598 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 89024587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89025063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89025657 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 89025790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89025813 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89026366 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 89026560 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.0555555555555556 0.777777777777778 0.166666666666667 16 20 1 14 3 3 89026736 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89027474 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 89029686 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89030259 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 89031174 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 89031357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89031699 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 89032065 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89032232 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 89032968 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89034047 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 89034083 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 89034095 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 89034491 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89034494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89035310 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 89035322 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 89036068 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89036212 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 3 89036722 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 89036786 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 89037061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89037350 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89037439 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 89037549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89039319 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89040949 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 89041027 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89041140 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89042028 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89042197 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 89043471 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89043792 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 89043814 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 89043887 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 89043890 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 89043909 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89043949 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 89043956 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 89043995 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 89044050 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89044070 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 89044255 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 89044525 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 89044731 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 89044744 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 89044842 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 89045016 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 89045262 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 89045304 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 89045409 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89045457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89045543 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89045575 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89045693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89046657 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 89046989 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 89047044 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 89047521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89047911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89048430 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 89048495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89048884 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 89048964 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 89049370 C T N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 3 89051286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89051303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89053948 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 89056908 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 89058209 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 89058816 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89061842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89063290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89064247 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 3 89065748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89068226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89068591 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89070576 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89074988 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89075417 C G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 89075641 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89077017 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 89077155 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 89077441 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 89077490 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 89077493 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 89077689 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 89077934 A G N Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 7 7 2 3 2 3 89078057 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 89078239 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89078326 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 89078488 A C Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 89078537 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 89078574 C A N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 3 89078599 C A N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 3 89078630 G A N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 3 89079282 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89079383 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 89079395 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 89079443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89079555 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 89079559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89079585 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 89079614 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89081133 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89082898 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 89082950 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89083782 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 89084684 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89088160 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 89088255 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 89088309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89090113 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89090169 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 89090569 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89091091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89091624 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 89091682 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89091698 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 89091782 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 89091969 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 89091973 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 89092007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89092120 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 89092130 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 89092218 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 89092377 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 89093790 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 89094051 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 89094075 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 89094113 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 89094186 A G N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 12 12 3 6 3 3 89094254 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 89094265 T C N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 3 89094270 T C N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 89094641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89094839 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 89094856 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 89094865 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 89094879 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89096486 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89096506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89096720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89097877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89098021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89101922 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89103746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89105460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89106227 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0 0.764705882352941 0.235294117647059 13 21 0 13 4 3 89107477 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89110180 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89111716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89112437 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 89118363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89120227 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 89120782 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 89123652 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 89124114 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89131482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89133014 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 89133257 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 89133904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89134526 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 89135506 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89138344 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89138429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89142526 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89144040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89153833 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89156747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89158593 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89161219 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89161376 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89162379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89165033 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89165147 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 89165201 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 89169360 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89170466 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89170467 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89170910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89173879 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 89174039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89176026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89176090 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89177875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89178598 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89181209 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89181264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89182328 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89182426 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89185497 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89186315 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89188157 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89192504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89194445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89198508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89199432 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89200053 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89201793 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 89203376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89212200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89217239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89219620 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 89221357 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 89222602 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 89223097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89224759 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89224793 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89225583 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89227816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89228788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89232581 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 89236779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89237016 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89239774 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89240514 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89242072 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 89242955 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89244346 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89245028 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89245203 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89245544 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 89246156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89246551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89247298 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 89247473 G C N N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 12 10 1 10 0 3 89247777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89251081 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89251325 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 89251376 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89252038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89252304 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89252698 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 89253078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89253173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89255855 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 89256442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89257259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89257496 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 89257525 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89257615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89258411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89260099 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89260206 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 89260253 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 89260285 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 89261809 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89261998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89262735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89262982 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 89263097 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 89263379 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89263401 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 89263427 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 89263503 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89264882 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 89264976 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89265587 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 89265969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89265986 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 89266209 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89266962 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89267558 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 89267564 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 89267636 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 89267902 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 89268425 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 89268698 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89268928 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 89269226 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89269361 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89269792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89269899 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 89269985 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 89271002 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 89272253 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89272344 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89272530 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 89272588 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 89272788 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 89273104 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 89273254 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 89274005 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 89274725 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 89275202 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 89275285 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 89275666 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 89276119 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 89276134 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 89276357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89276440 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89276461 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 89276586 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 89277015 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 89277078 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 89277860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89278520 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 89278926 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 89279383 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 89279438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89279495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89279589 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89280496 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89281189 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89281837 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89282535 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89284077 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 89284304 C T Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 89288532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89293002 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 89293422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89294094 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 89295065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89295275 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 89295324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89296496 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89297277 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89298183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89298408 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89299933 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 89302859 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 89303694 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 89306302 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 89306480 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89306515 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89307259 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 89307501 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 89307581 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 89308971 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 89308981 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 89309108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89309175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89309386 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 89310123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89310205 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 89310207 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 89310414 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 89310445 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 89311142 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 89311217 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 89311326 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 89311395 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 89311629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89311884 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 89311886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89311896 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 89311898 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 89312563 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89312571 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 89312598 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89312678 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 89312698 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89314069 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 89314101 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 89314176 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 89314555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89314646 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 89314687 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 89315192 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 89316362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89316692 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89316750 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89318860 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89319944 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89323644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89323925 C G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 89324297 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89324375 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89327696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89329647 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89329739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89331450 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 89334577 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89334617 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89336746 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 89336984 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89337899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89339583 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89339666 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89339732 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89341233 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89341237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89341345 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 89341387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89342331 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 89342900 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 89343110 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89344313 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 89345087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89346239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89347288 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 89348008 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89348043 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 89348062 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 89348346 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 89348535 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 89348789 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 89348856 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 89348864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89349141 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 89349162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89349218 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 89349372 C T Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 89349390 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 89349396 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 3 89349964 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 89349981 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 89350030 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 89350094 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 89350735 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89352621 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 89353110 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.105263157894737 0.894736842105263 0 21 17 2 17 0 3 89353929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89355169 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 89357013 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89358934 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89359296 G T Y N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 3 89360398 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89360837 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89363659 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 89363837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89364422 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89364633 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 89364981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89366688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89367546 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 89367751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89368289 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 89368356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89368503 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89369603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89370435 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89370521 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 89371189 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 89371213 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89372541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89377324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89377436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89377664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89378430 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 89378513 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 89378741 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89379598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89380613 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89380630 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 89382021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89382917 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89383768 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89384093 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 89384271 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 89384318 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89385832 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 89387235 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 89387499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89388551 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89388615 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 89388821 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89388837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89389064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89389065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89389561 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 89391198 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 89391828 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 89392102 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 89392118 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 89392243 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 89392245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89392309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89392310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89392464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89392572 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89392952 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 89393090 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 89393101 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 89393115 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 89393229 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89393241 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 89393789 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 89393891 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 89394525 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 89394527 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89394842 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 89394956 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 89395126 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 89396081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89396085 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 89396739 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 89396939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89397053 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 89397164 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 89397255 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 89397418 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 89398151 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 89398569 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89398587 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 89398922 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89398970 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 89399022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89399045 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 89399080 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 89399296 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 89399439 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 89399452 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 89399693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89399844 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 89400456 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 89400684 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 3 89400726 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 89401708 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 89401716 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 89401755 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 89402568 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 89402660 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89403086 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 89403143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89403434 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89403446 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 89403522 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 89403793 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89403830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89404533 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 89404891 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89405269 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 89405273 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 89405290 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 89405362 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 89405786 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 89405790 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 89405812 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 89405979 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 89405980 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 89406568 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 89406620 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 89406659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89406731 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 89406887 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 89406971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89407054 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 89407117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89407225 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 89407577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89407678 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89408877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89408889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89409572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89410361 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89410805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89410893 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 89412375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89412606 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 89412783 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89412963 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89413097 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 89413949 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 89414176 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 89414485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89414664 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 89415151 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89415275 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89415821 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89415933 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 89416071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89416099 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 89416108 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 89417013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89417047 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 89417213 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89417257 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 89417266 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 89417276 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89417368 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 89417423 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 89417424 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 89417441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89417524 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 89417869 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 89417916 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 89418140 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 89418164 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 89418181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89418440 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 89418625 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 89419083 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 89419536 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 89419611 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89419867 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0 0.642857142857143 0.357142857142857 9 19 0 9 5 3 89419897 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 89420203 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89420513 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 89420517 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 89421040 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89421324 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89421364 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89421480 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89421510 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 89421763 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89422064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89422377 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 89422501 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89422888 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 89423240 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 89423305 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89423634 A G N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 3 89423637 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 89423651 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 89423678 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 89423710 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 89423734 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 89423972 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 89423988 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 89424069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89424098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89424112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89424165 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89424292 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89424561 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 89424627 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 89424935 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89425077 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 89425286 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89425320 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 89425397 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 89425421 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 89425442 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 89425446 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 89425487 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 89425592 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89425612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89425661 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89425778 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 89425828 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 89426063 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 89426480 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 89426518 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 89426591 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89426614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89426633 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89426721 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 89426877 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 89427215 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 89427229 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 89427302 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 89427533 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89428093 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 89428145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89428173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89428223 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 89429083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89429147 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 89429424 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 89429546 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89429819 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89429880 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 89429896 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 89429901 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 89430119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89433093 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89433514 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89433601 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89434343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89437849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89440229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89441701 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89442271 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89442448 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89442653 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89443421 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89443787 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 89443973 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89443996 C A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 89444022 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 89444051 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 89444107 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 89444158 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 89444161 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 89444319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89444330 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 89444410 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 89444464 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 89444674 C A Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 89445030 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89445455 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 89446260 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89446923 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 89447158 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 89447268 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89447355 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 89447365 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 89447433 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 89449143 C G Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 89449241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89449905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89450664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89452341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89452557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89453171 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 89453984 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89454492 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89454811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89454838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89458377 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 89459283 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89459749 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 89460611 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89461015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89461692 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 89461718 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89463669 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89466362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89466568 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89466639 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 89466778 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89467091 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 89467603 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 89467839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89467938 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89467956 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 89467959 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 89468010 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 89468086 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 89468147 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 89468232 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89468270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89468330 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 89468340 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 89468341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89468372 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89468415 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 89472783 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89473739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89475486 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89475573 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 89477152 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 89477889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89478516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89479977 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89480586 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89480978 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89481428 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 89482287 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 89482297 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 89482424 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89482634 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 89482719 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89482928 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 89483345 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 89483921 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89484041 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 89484243 G T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 89484299 A T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 89484394 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 89484568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89484836 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 89485043 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 89485139 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89485156 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 89485245 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 89485338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89485486 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 89485588 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 89485636 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 89485653 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 89485907 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 89486076 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 89486129 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 89486138 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 89486287 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 89486608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89486710 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89486731 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 89486787 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 89486857 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 89486881 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 89487141 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 89487308 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89487627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89489179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89489262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89489721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89490079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89490675 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 89491028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89491121 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 89491506 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 89492273 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 89492388 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 89492414 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 89492455 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 89492541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89492947 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 89493030 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 89493154 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 89493252 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 89494515 G A N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 3 89498057 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 89498373 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89498765 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 89499460 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 89499488 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 89499650 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 89499937 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 89500365 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 89500529 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 89500630 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 89500925 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 89501590 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 89501827 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89501957 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 89501974 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 89501975 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 89502598 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89502647 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 89503329 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89504352 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 89505100 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 89505161 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 89505395 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 89505399 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 89505615 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89505806 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 89505837 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 89505872 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 89505900 T A N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 89505980 G A N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 89506116 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 89506163 A C N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 89506612 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 89506613 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 89506632 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 89506674 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 89506723 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 89506835 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 89507460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89507539 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 89507672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89507706 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 89507944 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 89510572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89512487 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 89512890 C G Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 89515300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89516014 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89516353 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89518746 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89523953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89527933 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89531054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89531778 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 89533612 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 89536619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89537101 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 89537844 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89538256 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89539093 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89540564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89540987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89542267 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 89548084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89548418 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 89551277 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 89554040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89559531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89562880 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89567903 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89581349 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 89581540 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 89589325 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 89590541 T A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 89590569 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 89590728 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 89590750 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 89591210 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 89591583 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89597966 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89598494 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 3 89598495 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 3 89598823 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 89599078 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 89599142 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 89599783 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 89599805 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 89599841 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 89600057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89600073 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 89600299 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 89600413 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 89600450 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 89600454 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 89600532 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 89600689 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 89600692 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 89600885 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 89600894 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 89601007 G A N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 89601275 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 89601276 A G Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 3 89601640 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 89601655 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 89601660 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 89601667 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 89601710 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 89601937 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 89601952 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 89601953 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89601997 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 89602047 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 89602171 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 89602186 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 89602207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89602304 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 89602348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89602411 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89602418 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 89602430 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 89602838 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 89603242 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 89603337 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 89603472 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 89603505 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 89603604 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 89603697 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 89603717 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 89603730 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 89603767 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 89603876 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89603919 C A Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 89603923 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89604144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89604251 A C Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 89604272 C T Y Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 3 89604291 C T Y Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 89604571 A G Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 89604598 C T Y Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 3 89604916 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 89605256 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 89605367 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89605403 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 89605435 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 89605862 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89605866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89606462 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89606801 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89606908 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 89606959 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89607656 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 89607909 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 89607935 C A Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 89607936 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 89608012 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 89608044 T G Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 89608058 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89608067 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 89608176 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89608609 A G N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 3 89608667 T C N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 89608694 G C Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 89608790 T C Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 89609039 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 89609069 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 89609129 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 89609210 T A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 89609238 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 89609287 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 89609311 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 89609332 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 89609783 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 89609787 A C Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 89609896 T A Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 89609926 A T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 89609937 C T Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 89609986 A G Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 89609994 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 89610004 G T Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 89610017 A T Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 89610041 G A Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 89610068 A T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 89610071 A G Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 89610144 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 89610214 T G Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 89610260 G C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 89610291 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 89610360 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 89610497 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 89610614 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 89610806 T C Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 89610852 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 89610954 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 89611001 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 89611041 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 89611342 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 89611675 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 89611681 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 89612755 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 89613480 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 89614732 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 89614876 T A Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 89614956 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 89615001 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 3 89616303 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89616704 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 89616811 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 89616880 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 89617179 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 89617181 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 89617516 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 89617853 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 89617938 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89617941 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89618107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89618277 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 89618372 A T Y N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 89618706 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 89618751 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 89618784 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 89618830 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89618874 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89619061 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 89619166 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 89619287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89619434 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 89619466 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 89620410 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 89621042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89621728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89621904 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89622077 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89622263 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 89624358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89625241 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 89625290 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 89625332 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 89625457 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 89625462 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 89625782 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 89625811 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 89625970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89626182 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 89626461 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 89626478 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 89626917 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 89628259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89628408 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 89630064 C A Y N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 89630080 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 89630087 T A Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 89630505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89632057 C T Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 89634174 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 89634981 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 89635014 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 89635387 C G N N 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0 0.8 0.2 4 6 0 4 1 3 89635530 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 89636168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89636483 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89636512 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 89636550 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89636851 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 89637079 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 89637095 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 89637668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89638017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89639382 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 89639458 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 89639799 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 89639825 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 89639998 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 89641141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89641780 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 89642002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89642389 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 89642531 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 89644326 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 89645630 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89646969 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 89648750 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89649540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89650127 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 89651741 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 89652430 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 89653878 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 89655610 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 89656147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89656517 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89656732 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89657122 T C Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 89657893 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 89658078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89661131 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 89661647 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 89664634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89665176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89665361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89665910 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89666051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89666921 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 89667893 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89670125 G T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 89670291 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 89673073 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89673363 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 89673490 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89673747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89676260 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 89676436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89676519 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 89676559 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 89676563 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 89676591 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 89676772 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 89676780 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 89676832 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 89676854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89676903 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 89676956 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 89677481 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 89677618 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 89678162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89678201 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 89678265 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 89678295 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 89678332 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 89678556 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 89678590 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 89678606 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 89678766 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89679027 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 89679314 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 89679365 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 89679369 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 89679393 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 89679461 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 89680629 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 89680695 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 89680939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89681025 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 89682305 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 89682452 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 89682454 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 89682545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89682996 A T Y N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 89683065 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 89683324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89683744 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 3 89683751 A G Y Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 3 89683829 A G N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.416666666666667 0.166666666666667 0.416666666666667 12 12 5 2 5 3 89683836 A T Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 89684383 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 89684457 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 89684471 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 89684520 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 89684671 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 89684677 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 89684939 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 89684992 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89685040 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 89685159 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 89685620 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 89685663 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89685729 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89686408 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89686502 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 89686643 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89686750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89687007 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89689305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89690920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89691089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89691839 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89691840 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89692069 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 89692170 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 89692270 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 89692396 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 89694630 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89694951 C G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 89695594 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89695751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89697983 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89698434 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 89698469 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 89699604 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 89699643 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 89699659 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 89700116 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89700236 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 89700523 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 89700552 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 89703014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89703730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89704187 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 89704861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89710722 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 89711106 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 89711432 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89711725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89711947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89711992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89712188 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 89712213 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 89712336 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89712385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89712525 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 89712672 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 89712964 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 89712983 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 89713019 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 89713097 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 89713203 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 89713343 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 89713532 T C N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 89713870 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89714178 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 89714560 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 89714622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89714659 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 89714967 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 89715012 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 89716059 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 89716102 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 89716174 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 89716190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89716265 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 89716269 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 89717390 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89719748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89720288 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89720360 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89720509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89721334 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89722582 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89723022 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89724456 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 89725173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89726469 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89726517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89727741 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 89727831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89729814 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89730181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89730563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89731546 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 89731612 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 89731661 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 89731923 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 89732270 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 89734851 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 89735694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89735731 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 89736080 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 89736093 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 89736097 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 89736773 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 89736828 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 89736905 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 89737123 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89737128 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 89737172 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 89737181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89737225 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 89737248 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89737299 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 89737492 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 89737655 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 89738197 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89738343 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 89738408 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 89738675 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 89739267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89739302 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 89739357 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89739443 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 89739543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89739652 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 89740083 G A Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 89740221 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 89740492 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 89741626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89741980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89743187 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 89743792 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 89744000 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 89744929 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 89746140 T C Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 89752251 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89754870 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 89756893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89757158 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89757434 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 89757483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89757505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89760961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89761080 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 89764524 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89764630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89764685 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89767065 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 89767815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89769410 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89771382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89771978 G A Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 89772058 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 89773376 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89774226 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 89777065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89780001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89780568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89783518 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 89784504 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89785969 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 89786457 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 89786551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89789101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89798829 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89801987 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89807117 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89807157 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 89807548 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89808305 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89810296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89811893 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89812123 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89812705 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89815487 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89816421 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89816543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89818770 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89821834 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89825804 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 89828602 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89832539 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89835370 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89841596 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89845104 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89846761 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 89848994 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89850624 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 89852998 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89854198 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 89858439 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89859492 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89862601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89867041 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 89867352 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89868552 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 89868890 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89869136 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89870442 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 89871218 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 89871900 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89873455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89874310 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 89875120 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89876578 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 89877239 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89877296 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89877368 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89877483 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 89878052 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 89878473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89878582 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 89878664 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 89879197 G T N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 89879336 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 89879343 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 89879404 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 89879463 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 89879486 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 89879651 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 89879788 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89879970 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89880065 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89880097 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 89880815 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89881554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89885650 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 89885741 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 89885947 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 89886188 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89886351 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 89886387 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89887526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89887847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89889006 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 89889507 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89891744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89891909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89892937 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 89894655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89894786 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89895203 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 89896095 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89899372 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89899411 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89899426 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 89900455 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89900512 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89900901 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 89901274 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89901676 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89901678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89903025 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89903051 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 89904780 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89905317 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89905706 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 89905896 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89906121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89906185 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89906304 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89907099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89907158 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89907226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89907460 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89908447 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 89908941 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89909494 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 89909687 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89909807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89910205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89910411 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89911823 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89911953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89913703 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89915757 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 89916096 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89918933 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89919804 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89920502 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89923490 C G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 89924457 T C N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 89926191 C T Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 89926977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89927440 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89928899 A C Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 89929684 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89930573 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89932071 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89934411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89936185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89936265 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89937989 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 89939329 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89939482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89940950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89946947 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 89947905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89950146 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89950337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89951781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89951919 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89953625 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89954871 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 89955182 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 89955375 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 89955500 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 89958647 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 89960544 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 89961108 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89961114 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89961167 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89961190 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89961220 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 89961349 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 89961371 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 89961864 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 89964565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89965566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89966212 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89966478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89966687 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89967077 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89967342 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 89968231 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89968318 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89968529 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89968569 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89968742 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89969053 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 89969180 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89969204 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89969227 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 89970075 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 3 89970144 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 89970183 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89970205 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89970937 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89972819 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 89979388 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 89980345 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 89980356 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 89981968 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 89984093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89984969 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89986290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89988249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89988463 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 89989453 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89992615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89994956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89995833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89996091 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89998875 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 89998983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 89999416 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 89999628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90000277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90001810 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90002051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90002077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90003147 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90003180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90003313 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90003459 G A Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 90003501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90003690 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 90005452 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90006728 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 90007241 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 90007668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90007889 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90008394 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90010463 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90010972 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90011102 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90011472 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90011519 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90011532 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90011810 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 90012110 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 90013254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90014313 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 90015565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90015628 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90015649 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90015672 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90016267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90017458 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 90017606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90017897 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90018644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90019018 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90019746 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90023816 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90024041 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90025782 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 90025952 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90026426 C A N N 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.1 0.9 0 11 9 1 9 0 3 90027584 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90028138 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90029484 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90030429 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90030474 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 90030974 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90034899 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90034960 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 90036931 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 90037106 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 90037233 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 90037701 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90038018 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90038826 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 90038902 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 90039106 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 90039143 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 90039184 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 90039196 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 90039244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90039249 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 90039356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90039438 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90039766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90040091 A C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 90040156 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90040191 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90040294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90040647 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 90041574 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 90041801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90042815 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 90042833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90042965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90044340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90044372 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 90046942 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90047410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90047776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90051652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90052338 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90052982 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90053102 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 90053805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90054639 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90054797 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90055539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90055698 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90055763 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90062325 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90062746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90064455 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90068624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90069814 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90070892 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90071777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90072625 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90073290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90075283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90075948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90076150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90076681 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90077507 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90078477 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90079818 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90079860 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90081222 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 90081256 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90084546 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90085704 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 90086318 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90086718 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 90087033 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 90090185 A C Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 90091798 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 90091823 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90092140 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 90096484 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90103363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90104805 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 90105785 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 90112133 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 90115336 T G Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 90119678 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 90120927 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90122404 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90125426 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90128854 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90132483 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90137298 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90137419 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 90138923 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90140274 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90140985 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90143333 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90145776 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90146564 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90146582 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90148398 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90148749 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90148818 A G Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 90148878 T A Y N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.153846153846154 0.846153846153846 0 15 11 2 11 0 3 90151037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90153983 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90154257 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 90156270 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90160618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90162028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90162385 A T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 90166497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90167814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90173489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90173915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90175999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90176579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90176985 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 90177042 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90177119 G A Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 90177265 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 90177485 G C Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 90178583 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 90178786 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 90178788 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 90178824 C G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 90179483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90179517 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 90182208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90183932 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 90184613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90188024 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90190557 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90191454 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90194890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90195444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90198971 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90201072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90201261 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90201265 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90208302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90208655 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90208670 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90208969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90209762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90210844 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90212159 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90212672 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90212948 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90214330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90214378 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90216123 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90217011 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90217673 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90218187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90218315 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90219227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90220333 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90223357 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 90225162 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90226301 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90228623 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 90228876 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 90229067 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 90229071 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 90229164 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90229356 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90229925 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90232611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90236642 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 90238064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90238690 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90238766 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90239651 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 90240705 A C Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 90241097 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90241394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90241663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90241677 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90243457 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 90243825 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90244572 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 90245113 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90245157 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90246895 A G N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 3 90247562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90252957 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90253165 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90254043 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90254258 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90254863 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 90256783 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90256930 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90262714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90265948 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90266034 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90266305 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90266437 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90266942 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90267540 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90267550 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90267603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90267620 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90267660 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90270155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90271451 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 90271981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90274015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90274403 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 90274404 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 90274741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90275207 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90278302 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90278454 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90278603 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90278626 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90279163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90279529 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90279749 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 90280443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90281597 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90281816 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90281978 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90282155 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 90282268 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 90282601 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90282703 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90283170 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 90283186 T A N N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 3 90283202 T C N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.0909090909090909 0.727272727272727 0.181818181818182 10 12 1 8 2 3 90283304 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 90283401 T C N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 7 13 1 5 4 3 90283707 T C N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 3 90283845 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 90283992 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 90284051 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90284101 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90284424 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 90284454 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 90285094 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90285478 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90285618 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 90285629 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 90285962 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90286213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90286241 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 90286341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90286631 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 90286673 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90286748 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 90286770 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 90286794 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 90286975 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 90287315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90287318 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 90287422 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 90287467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90287525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90287747 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90287753 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 90287949 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90287952 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90287974 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90287992 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90288127 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 90288562 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90289050 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 90289318 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90289368 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90289369 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90289389 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90289417 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90289807 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 90290509 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 90290524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90290543 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90293811 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 90294023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90295130 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 90296868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90296879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90297150 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 90297169 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90297451 C T N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.166666666666667 0.583333333333333 0.25 11 13 2 7 3 3 90297862 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90298082 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90298263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90298291 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 90298302 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90299020 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 90299087 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 90300393 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 90300851 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 90301705 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90302717 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90304366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90307420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90308139 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 90308273 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90308300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90309244 C G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 90311411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90313904 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90314296 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 90314427 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 90314525 A C N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 3 90314616 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 3 90314667 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 90314942 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90316530 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 90318952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90319447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90319462 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 90320340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90320815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90320896 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90321368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90321477 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90321725 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 90321782 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90321860 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 90322337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90322867 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 90323233 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 3 90323899 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 3 90323916 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90324321 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90324483 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90324562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90324591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90324704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90325009 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90325070 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 90325279 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90325317 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 3 90325718 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90325761 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 90326122 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90326225 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90326314 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 90326345 A C N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 3 90326546 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 90326781 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 90327018 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 90327190 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90328402 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 90330414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90330510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90331740 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90334172 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 90335298 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90338145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90339700 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 90339837 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 90340216 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 90340835 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 90343550 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90343843 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90346773 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90347729 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90348117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90348517 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 90348635 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 90349022 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 3 90349023 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 3 90349412 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90349734 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90349774 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90350402 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 90350464 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90350699 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 90350919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90350965 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90350988 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 90351022 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90351038 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 3 90351112 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90351140 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90351298 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 90351353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90351373 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90351381 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90351389 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90351453 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90351671 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90351837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90351926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90351972 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90352014 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90352069 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90352174 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90352183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90352201 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90352387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90352431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90352447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90352606 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90352835 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 90352994 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 90353070 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 3 90353094 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 90353254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90353385 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90353430 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 90353663 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 90353818 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90353946 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 90354384 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90354837 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90356836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90358518 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90359889 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 3 90360576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90362901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90363009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90363030 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90363433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90364149 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 90364265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90364829 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 90365342 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90365344 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 90365528 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90365647 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 90365830 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 90365867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90366676 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90366743 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90366776 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90366804 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90367026 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 90367126 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90367262 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90367397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90367467 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 90367598 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 90367617 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 90367699 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 90367752 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 90367778 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 90367894 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 90367941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90368064 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 90368081 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 90368418 G A N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 90368472 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 90368772 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90368926 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 90369228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90369659 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90369972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90370048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90370131 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90370166 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90371259 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 90371541 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 90371556 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 90371688 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 90371798 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 90371981 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 90372218 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 90372224 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 90372235 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 90372303 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 90372333 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 90372779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90373764 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90373924 T A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 90374335 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90375330 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90375781 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 90376165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90376483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90376739 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 90376772 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 90376785 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 90376792 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 90376839 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90376856 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 90377502 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90377516 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 90377518 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 90377555 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 90377560 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 90377686 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90377812 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 90377837 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 90378400 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 90378488 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 90378771 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 90379291 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 90379327 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90379784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90380016 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 90380079 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 90380080 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 90380178 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 90380281 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 90380621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90380627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90380635 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90380663 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90380841 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90380890 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90380899 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90380907 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90380919 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90380927 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90380944 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90380969 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90380977 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90380999 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90381051 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90381069 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 90381109 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 90381139 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 90381236 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90381252 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90381299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90381341 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90381425 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 90381455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90381457 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90381528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90381633 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90381666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90381707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90381778 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90381848 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90381899 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90381980 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90382326 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90382438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90382702 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90382839 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90382862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90382869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90382923 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90382942 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90382962 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90383014 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90383118 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 90383120 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90383327 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90383388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90383512 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90383837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90383862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90383874 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90383927 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90384024 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90384086 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 90384091 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 90384123 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90384300 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90384311 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90384322 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90384374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90384402 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90384841 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 90385133 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 90385214 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90385372 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90385898 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90385954 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90385996 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 90386082 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90386109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90386188 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90386295 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90386465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90386694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90386799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90386805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90386945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90387062 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 90387160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90387505 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 90387519 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90387584 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90387700 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 90387714 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90388866 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90388957 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 90391625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90392822 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 90392867 C T Y Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 15 13 1 13 0 3 90393218 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90393352 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90394400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90394474 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90396536 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 90397752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90397905 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90398217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90398818 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90400381 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90400511 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90400591 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90400674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90400679 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90400686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90400747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90400984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90401305 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90401997 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90402597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90402642 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90403178 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90403342 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90403368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90403513 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 90403618 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90404418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90404702 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90404988 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 90405140 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 90406043 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90406329 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 90406599 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90406618 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90406669 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90406743 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90406850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90406875 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90406907 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 90406961 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 90407529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90407784 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90407962 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90408067 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90408092 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90408107 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90408134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90408167 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90408198 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90408222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90408415 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90408532 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90408633 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90408651 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90409966 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90409990 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90410475 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90410677 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 90410795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90410842 T A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 90410905 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 90411271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90411584 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90412142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90412433 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 90412718 T G N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 3 90413466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90413739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90414234 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 90415100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90415727 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90415768 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90415827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90416354 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 90416640 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90417143 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 90417234 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 90417857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90418447 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 90419136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90419198 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 90419298 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 90419304 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 90419316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90419363 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 90420463 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90420603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90420606 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90421395 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90421485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90421706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90421776 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90422279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90422346 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 90422823 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90424215 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90424952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90425263 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90425796 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 90425920 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 90425941 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 90425997 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 90426247 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90429290 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 90430176 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90430651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90431487 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90431668 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 90431795 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 90432109 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 90432128 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 90432250 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 3 90432253 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 90432264 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 90432290 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 90432328 G T N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 90432330 T C N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.0769230769230769 0.692307692307692 0.230769230769231 11 15 1 9 3 3 90432503 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 90432528 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 90432557 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 90432637 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90432825 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 90433028 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 90433098 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 90433131 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 90433162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90433564 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 90433633 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 90433682 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 90433695 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 90433698 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 90433744 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 90433808 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 90433936 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 90434073 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 90434092 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 90434209 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 90434288 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 90434294 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90434376 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 90434386 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 90434478 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 90434699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90434718 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90434787 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90435209 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90435300 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 90435352 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90435389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90435578 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90435673 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 3 90435797 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90435821 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 90435888 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 90435973 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 90436005 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 90436095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90436260 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 90436488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90436681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90436942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90437195 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 90437370 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 3 90437386 T A N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 3 90437517 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90437535 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90437606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90437773 G T Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 90437775 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 90438148 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 90438213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90438217 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 90438273 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90438322 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 90438742 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90438846 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90438868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90438938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90438976 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90439178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90439195 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90439208 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90439323 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90439366 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 90439600 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 90439613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90439626 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 90439667 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90439760 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 90439772 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 90439890 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 90439917 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90439991 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 90440059 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 90440313 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 90440386 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 90440434 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 90440505 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 90440548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90440553 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 90440640 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 90440980 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 90441122 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 90441612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90441631 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 90441650 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 90441651 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 90441690 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 90441928 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 90441938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90442097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90442123 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 90442134 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 90442249 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 90442297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90442527 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.111111111111111 0.722222222222222 0.166666666666667 17 19 2 13 3 3 90443161 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 90443226 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 90443265 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 90443288 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 90443313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90443444 C G N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 90443569 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 90443598 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90443690 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90443966 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 90444065 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 90444129 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90444139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90444212 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90444303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90444375 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90444522 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90444652 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90444673 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 90444949 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 90444962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90445008 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 90445035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90445077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90445688 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90445693 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 90445888 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 90445914 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 90446125 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90446278 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90446290 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 90446299 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 90446326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90446409 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90446489 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90446599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90446772 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90447036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90447748 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 90447900 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 90447996 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 90448243 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 90448284 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 90448320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90448425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90448510 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 90449306 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 3 90449597 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 90449697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90450073 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 90450098 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 90450343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90450502 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 90451855 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90452025 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90452412 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 90452578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90452792 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 90452793 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 90453041 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 90453117 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 90453150 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 90453243 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 90453263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90453287 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 90453325 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 90453404 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90453602 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 90453726 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90453746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90453899 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 90454076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90454124 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90454158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90454242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90454332 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 3 90454338 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90454344 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 90454393 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 90454626 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90454732 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 90454842 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 90454927 G A N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 3 90454978 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 90455015 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90455044 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90455159 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90455223 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 90455297 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 90455332 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 90455389 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 90455410 A T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 3 90455706 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90455751 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 90455797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90455799 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 90455814 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 90455816 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90455850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90455883 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 90456039 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 90456185 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 90456502 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 90456513 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90456617 G T N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.0625 0.6875 0.25 13 19 1 11 4 3 90457102 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 90457340 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 90457377 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 90457428 T G Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 90457454 G T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 90457471 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 90457579 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 3 90457661 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 90457736 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 3 90457782 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 90457801 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 90457809 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 3 90457970 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 90457986 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90458056 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 90458156 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 90458212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90458334 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 3 90458335 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 3 90458345 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 3 90458387 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 90458439 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 3 90458624 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 3 90458632 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 3 90459187 C G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 90459319 T C N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 3 90459336 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 3 90459415 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90459447 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 90459637 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 90459754 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90459798 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 90459807 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 90460444 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 90460563 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 90460573 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 90460576 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 90460586 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 90460727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90461104 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90461850 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90464535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90464750 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90465085 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 90465126 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 90465213 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 90466007 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 90466337 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 90466477 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 90466634 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 90466706 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 3 90466808 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 90466819 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 90466843 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 90467162 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 90467438 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 90467947 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 90468998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90469003 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 90469180 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 90469622 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 90469808 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 90470148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90470154 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90470527 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 90470578 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 90470602 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 90470753 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 90470863 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 90471493 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90471641 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90471940 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 90472023 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 90472161 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 90472214 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90472445 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90472560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90473205 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 90473397 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 90475644 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 90475682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90475792 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 90476430 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 90476576 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 90476582 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90476780 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 90477080 C T Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 90477926 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 90478025 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 90478044 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 90478232 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 90478424 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90478753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90478959 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90479047 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90479089 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90479506 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90479557 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90479571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90480209 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 90480872 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 3 90481179 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 90481321 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 90481336 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 90481561 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 90481696 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 90481729 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 90481764 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 90481866 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 90482754 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90483426 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 90484307 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90484768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90484915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90484925 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90485390 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90485937 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90486235 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90486904 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 90487006 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 90487093 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 90487172 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 90487432 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 90487497 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 90487630 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 90487684 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 90487706 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 12 24 0 12 6 3 90487727 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 90487741 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 90487879 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 90487907 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 90488036 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 90488111 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 90488116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90488442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90489697 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90490076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90491353 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 90491370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90491636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90491671 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 90491683 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 90491706 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 90491804 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 90491849 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 90491873 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90491879 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 90491944 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90491988 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 90492065 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 90492108 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 90492236 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 90492319 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 90492552 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 90492587 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 90493080 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90493549 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 90493754 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 90493846 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 90493873 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 90493895 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 90494074 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 3 90494283 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 90494319 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 90494418 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90494466 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 90495259 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 90495358 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90495706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90495765 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 90495938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90496381 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 90497042 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 90497074 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 90497553 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 90497746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90498147 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 90498391 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 90498532 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 90499076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90499351 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 90500834 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 90501958 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90501959 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90502555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90504605 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90507428 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 90508782 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90508798 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90508845 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90511818 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 3 90511920 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 90511963 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 90512389 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 90512940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90515003 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90515847 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90515956 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90515997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90516114 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90516208 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90516279 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90516290 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90518408 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90518629 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90520678 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 90521475 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 90521769 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90522295 A T Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 90522543 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90525499 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90526006 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 90526352 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90526799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90526987 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90529230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90529400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90529892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90530369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90531463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90532136 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90532255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90535002 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90535057 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 90536502 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90537085 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90537149 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90537617 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90541371 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90544585 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90545861 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90553552 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90557697 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90559974 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90560779 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 90561049 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90561321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90562924 C A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.15 0.85 0 23 17 3 17 0 3 90563008 A G Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 90563954 T C Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 90563956 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 90564223 G C Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 3 90564380 T C Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 3 90564384 G A Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 3 90566344 T C Y Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 3 90566712 T A Y N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 90574400 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90574464 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90574751 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 90575107 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 90578102 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90578345 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90589402 G A Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 90592780 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90616370 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 90616491 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 90617149 A T Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 90619213 G C Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 90619704 C A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 90619846 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 90619896 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 90621456 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 90622061 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90622874 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 90622957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90623310 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90623649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90625857 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90626324 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 90627144 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90627362 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90628143 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90628319 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90628930 G C Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 90629290 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 90630111 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90630422 C T Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 90631423 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90633187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90636825 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 90638141 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90638724 T A Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 90643234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90643552 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90644019 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 90646157 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90646372 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90646781 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90646953 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90647401 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90648544 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 90648815 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90648934 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90650527 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90651892 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90652099 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90652449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90652700 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90652908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90653841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90658078 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 90658160 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90658430 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90659952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90660049 C T Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 90661834 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90662061 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90662265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90662588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90666252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90676921 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90679134 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90681023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90683410 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90690677 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90692820 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90697833 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90700468 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90700530 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90700714 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90700764 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90701354 C T Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 90701819 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 90705553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90709879 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90710182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90714743 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90716614 T G Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 90716933 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 90753564 C T Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 3 90754218 G A Y Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.363636363636364 0.636363636363636 0 15 7 4 7 0 3 90754237 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 90755427 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 90760413 A T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 90762230 A G Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 90765605 C A Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 3 90775700 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 90776505 G T Y N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 90777471 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90778901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90782810 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90785021 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90786324 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90786906 A G Y Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0 0.75 0.25 9 15 0 9 3 3 90786909 G T Y N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0 0.75 0.25 9 15 0 9 3 3 90788708 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90788812 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90789315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90804338 A T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 90804970 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90805426 T A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 90809199 C T Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 3 90809648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90816049 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 90816831 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90816981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90819528 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90832789 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90840431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90841718 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90842510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90844330 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90844443 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90848447 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90851492 C T Y Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 3 90854486 A C Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 90855924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90857589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90860494 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90860495 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90866325 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90868875 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 90875048 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 90885319 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90887744 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90896933 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 90898025 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90910108 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90914414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90923874 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 90951381 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90953431 G T Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 3 90960612 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90961480 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 90962038 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 90962231 G A Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 90963214 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 3 90963689 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90963698 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.15 0.85 0 23 17 3 17 0 3 90970593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 90986025 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.15 0.85 0 23 17 3 17 0 3 90995004 T C Y Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 3 91001488 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91035039 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91043919 C A Y N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0 0.923076923076923 0.0769230769230769 12 14 0 12 1 3 91058315 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91078093 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91080255 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91081204 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 91081335 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 91089708 T C Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 91091773 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 91092554 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 3 91114761 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91122835 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 3 91123937 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 91127116 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91140355 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0 0.7 0.3 14 26 0 14 6 3 91142090 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 91152659 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91153869 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91163383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91174641 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91174972 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 91175888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91188092 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91189863 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91189977 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91199712 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91202829 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91213640 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91213809 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91227405 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91232411 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91233528 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91235201 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91246038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91252552 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 91254523 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 91255518 G A Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 91265328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91267329 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91267366 C A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 3 91280163 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91281460 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 91282315 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 91283688 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 3 91285503 T G Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 91285808 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91289785 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91293277 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91300967 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91301467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91302647 C T Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 91303156 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 91307135 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91311070 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91314619 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 91316678 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 91318018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91320183 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91320267 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91322577 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 91327750 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91329584 C A Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 3 91332613 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 91332653 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91332779 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91346718 C A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 91350621 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 91351616 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91352464 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91353548 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91353687 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 91355105 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 91361857 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91361971 G A Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0 0.8125 0.1875 13 19 0 13 3 3 91362147 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91364024 C G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 91391061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91393833 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 91396300 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 91400586 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91402272 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 91403748 G T Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 91404137 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91412273 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 91414775 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 3 91427544 A C Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 3 91428835 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91433164 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91435658 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91440137 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 91440289 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91440717 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 91440928 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91442237 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 91448338 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 91448576 T G Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 91448754 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 91450917 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 91450944 C T Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 3 91451583 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 91454721 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 3 91457541 T A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 91459756 A G Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 91466045 A G Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 91468810 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 91480866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91483371 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 91489464 T A Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 91489741 A G Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 91490869 C G Y N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 3 91492288 G A Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 91492483 T C Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 91494769 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91494805 A T Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 91495256 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91496102 T A Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 91497156 A G Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.133333333333333 0.666666666666667 0.2 14 16 2 10 3 3 91499517 G C Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 91501251 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 91502113 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91502366 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 91502457 A T Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 91515524 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 91515790 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 91515928 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91517245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91517366 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91524375 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 91525800 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 91527179 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 91528085 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 91534222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91535290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91536671 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 91542277 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91543607 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 91548851 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91549032 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 91550291 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 91551101 T G Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 91551276 G C Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 91551627 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 91554552 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 91554730 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 91557343 A C Y N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 91558249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91559478 A C Y N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 3 91559963 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91559977 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 91560019 T G Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 91560169 C G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 91560512 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91560636 C G Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 91562278 G A Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 91562647 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 91563033 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91563887 T A Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 91563941 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 91563945 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91565641 C A Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 91565682 G T Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 91565735 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91565928 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91565965 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 91565973 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91566256 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 91566448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91566756 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 91566810 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 91567090 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 91567091 A G Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 91567123 G C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 91567266 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 91567360 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 91567376 G C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 91568501 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 91568853 T A Y N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 91568872 G T Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 91568943 G C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 91569158 C A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 91570287 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91570299 G C Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 91570609 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 91570790 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91571166 G C Y N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 91571214 C G Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 91571544 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91571579 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 91571944 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91572315 A G Y Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0 0.75 0.25 9 15 0 9 3 3 91572911 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 91573326 G C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 91573582 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91573780 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 91574003 G C Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 91574094 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 91574675 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 91574718 T A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 91576102 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 91576352 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 91576974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91577111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91577158 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 91577186 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91577221 G C Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 91578130 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91578453 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91578490 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91578507 A C Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 91578664 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 91578812 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 91578826 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 91579007 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91579026 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91580176 C A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 91580274 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91580408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91580494 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 91580613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91580842 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91581102 G T Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 91581109 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91581117 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91581297 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 91581385 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91581634 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 91581753 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 91581851 C A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 91581855 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91582082 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 91582117 C T Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 91585853 A T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 91587301 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 91591367 T A Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 91611375 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 91622481 A C Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 91622699 T C Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 91622758 T C Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 91625998 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 91626103 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 91630929 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 91634330 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91634717 G T Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 91638647 T G Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 91639842 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 91640043 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 91641096 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 91641687 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 91643521 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91645552 T C Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 91648514 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 91650956 A G Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 91651543 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 91655492 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 91669543 G A Y Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 3 91714199 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91714376 C T Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 91714717 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91715208 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 91715835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91718322 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 91718323 T G Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 91718666 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91720983 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91722359 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 91723345 G T Y N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 91729453 T A Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 91731058 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 91739020 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 91740274 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 91740813 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 91742138 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 91744139 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91749561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91750989 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 91751583 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 91751606 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91751977 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 91752219 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 91755009 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91755772 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 91757052 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 91757390 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 91758021 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91759004 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91760779 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 91762485 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 91763316 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 91763541 A T Y N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 91763576 T C Y Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 3 91763588 T C Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 91764014 A C Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 91764421 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 91768670 C G Y N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 3 91775092 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91780139 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91790188 G A Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 3 91801865 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 91805431 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 91818688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91819432 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91821125 A G Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 91824211 T A Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 91824217 A G Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 91827061 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91829683 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91835564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91836027 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91837712 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91839746 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 91839883 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91840978 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91841594 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 91842039 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 91842740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91842947 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 91843331 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91843780 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 91845549 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91846102 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 91846880 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 91847572 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91847589 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91849132 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 91852075 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91853683 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91853901 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 91855694 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91855732 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91856487 G T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 91856698 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 91856708 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 91858549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91860211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91861204 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91861509 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91861642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91861890 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91867387 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 91867684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91868748 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91869029 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 91869538 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91872340 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91875369 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 91876453 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91877804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91877923 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 91878040 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91878474 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91880044 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 91881890 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91883840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91885918 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91885919 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91886016 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91886972 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91887453 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 91887477 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91887841 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91888155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91889846 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 91890694 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 91891488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91891684 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 91891840 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 91893057 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91894119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91895556 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91896548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91896635 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 91896662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91896702 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 91896775 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91898514 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91898767 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91899131 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91900590 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91901008 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91901063 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91902551 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91914350 G C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0 0.944444444444444 0.0555555555555556 17 19 0 17 1 3 91914356 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 91914366 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 91914368 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 91915276 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 91922866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91924798 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91925483 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 91925514 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91927315 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 91927381 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 91927388 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 91928458 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91928486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91929682 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 91930133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91933942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91934252 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 91935149 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91938354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91938883 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 91939712 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 91939958 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91939969 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91946463 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91947426 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 91952978 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91954556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91954599 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 91955134 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91955523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91956889 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 91956916 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 91956960 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91957170 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 91957192 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 91957265 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 91957294 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91957456 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 91958141 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 91958210 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 91958255 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91958573 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 91958678 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 91958745 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 91958814 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 91958820 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 91958882 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 91958929 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91958984 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 91959079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91959119 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 91959197 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 91959309 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91959388 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 91959453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91959579 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 91959582 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 91959790 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 91959794 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 91959910 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91959914 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 91960034 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 91960230 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 91960269 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 91960314 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 91960328 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 91960334 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 91960352 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 91960415 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 91960498 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 91960738 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 91960903 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 91960929 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 91960990 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 91961045 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 91961159 A C N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 91961294 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 91961349 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 91961376 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 91961433 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 91961471 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 91961484 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 91961600 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91961646 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 91961710 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91961711 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 91961728 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 91961763 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 91961835 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 91961875 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 91961912 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 91962036 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 91962075 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 91962286 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 91962297 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 91962314 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 91962352 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 91962382 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91962560 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 91962697 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 91962804 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 91962947 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 91962973 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 91962985 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 91963140 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 91963277 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 91963302 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 91963366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91963407 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 91963481 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 91963594 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 91963650 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91963687 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 91963693 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 91963719 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 91963749 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 91963757 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 91963763 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 91963769 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 91963878 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 91963916 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 91963972 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 91963990 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 91964016 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 91964256 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 91964679 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91964792 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91964835 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91964846 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91964906 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 91964915 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 91964945 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 91964961 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91964998 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91965007 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91965143 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91965318 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 91965354 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 91965418 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91965429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91965508 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 91965635 C A N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 3 91965681 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 91965805 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 91965853 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91965879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91965885 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91965968 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91965992 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91966081 T A N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 3 91966101 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 91968438 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 91968497 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91968541 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91968585 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91968622 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91968706 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 91968829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91968985 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91968997 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91969077 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 91969158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91969162 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91969232 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 91969283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91969296 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91969674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91969732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91969750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91970937 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 91970959 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91971173 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 91971319 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91971392 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 91971607 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 91972650 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91972880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91973022 A T Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 91974041 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91976117 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91977540 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91979039 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91979244 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91981813 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 91982712 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 91983110 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 91983135 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 91983189 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 91984511 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91984690 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 91985370 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91985477 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 91985720 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 91985778 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91986851 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91987315 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 91987503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91988068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91988713 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 91988768 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 91989157 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 91989170 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 91997042 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 91997918 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 91999328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91999491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 91999631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92001326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92003187 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92003271 A G Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 3 92003496 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 92003589 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92003723 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92005855 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 92007162 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92007886 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 92009992 A C Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 3 92010786 A C Y N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 92011732 G A Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 92014366 C G Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 92014468 T A Y N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 3 92096328 A C Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 92096352 T C Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 92098496 G A Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 92101851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92105376 T G N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 92106521 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 92107518 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92108075 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 92108139 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 92108310 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 92108607 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 92108661 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 92108850 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 92108880 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 92108950 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92109020 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 92109204 C A Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 92109212 T G Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 92109658 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 92109686 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 92109688 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 92109711 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 92109838 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 92110123 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 92110217 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 92110232 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 92110306 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 92110452 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 92110506 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 92110709 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92110901 G A Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 92113339 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92113428 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92113535 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92113569 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92113725 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92113876 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92114255 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92114315 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.0588235294117647 0.705882352941177 0.235294117647059 14 20 1 12 4 3 92114338 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92114582 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92114587 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 92114732 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 92115477 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 92115508 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 92115593 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 92115621 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 92115675 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.157894736842105 0.789473684210526 0.0526315789473684 21 17 3 15 1 3 92115686 C A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 92116068 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 92116121 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 3 92116200 T A Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 92116357 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 3 92116365 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 3 92116490 A G Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.222222222222222 0.722222222222222 0.0555555555555556 21 15 4 13 1 3 92116527 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 92116533 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 92116684 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.222222222222222 0.722222222222222 0.0555555555555556 21 15 4 13 1 3 92116718 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 92116775 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92116780 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.222222222222222 0.722222222222222 0.0555555555555556 21 15 4 13 1 3 92116836 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.210526315789474 0.736842105263158 0.0526315789473684 22 16 4 14 1 3 92116858 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 92116882 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.2 0.75 0.05 23 17 4 15 1 3 92116885 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.2 0.75 0.05 23 17 4 15 1 3 92116918 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.2 0.75 0.05 23 17 4 15 1 3 92116941 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.2 0.75 0.05 23 17 4 15 1 3 92116976 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.2 0.75 0.05 23 17 4 15 1 3 92116991 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.2 0.75 0.05 23 17 4 15 1 3 92117002 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.210526315789474 0.736842105263158 0.0526315789473684 22 16 4 14 1 3 92117043 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.166666666666667 0.777777777777778 0.0555555555555556 20 16 3 14 1 3 92117046 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.166666666666667 0.777777777777778 0.0555555555555556 20 16 3 14 1 3 92117057 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.166666666666667 0.777777777777778 0.0555555555555556 20 16 3 14 1 3 92117141 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.2 0.75 0.05 23 17 4 15 1 3 92117160 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.2 0.75 0.05 23 17 4 15 1 3 92117212 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.157894736842105 0.789473684210526 0.0526315789473684 21 17 3 15 1 3 92117236 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 92117271 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.157894736842105 0.789473684210526 0.0526315789473684 21 17 3 15 1 3 92117329 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 92117346 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 92117349 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 92117374 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.2 0.75 0.05 23 17 4 15 1 3 92117377 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 92117409 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.157894736842105 0.789473684210526 0.0526315789473684 21 17 3 15 1 3 92117423 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 92117462 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.166666666666667 0.777777777777778 0.0555555555555556 20 16 3 14 1 3 92117604 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.210526315789474 0.736842105263158 0.0526315789473684 22 16 4 14 1 3 92117610 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.222222222222222 0.722222222222222 0.0555555555555556 21 15 4 13 1 3 92117677 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.210526315789474 0.736842105263158 0.0526315789473684 22 16 4 14 1 3 92117690 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.210526315789474 0.736842105263158 0.0526315789473684 22 16 4 14 1 3 92117713 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.210526315789474 0.736842105263158 0.0526315789473684 22 16 4 14 1 3 92117832 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.222222222222222 0.722222222222222 0.0555555555555556 21 15 4 13 1 3 92117948 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.210526315789474 0.736842105263158 0.0526315789473684 22 16 4 14 1 3 92118019 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.2 0.75 0.05 23 17 4 15 1 3 92118103 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.2 0.75 0.05 23 17 4 15 1 3 92118140 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.2 0.75 0.05 23 17 4 15 1 3 92118176 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92118232 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 92118266 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.176470588235294 0.764705882352941 0.0588235294117647 19 15 3 13 1 3 92118337 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.222222222222222 0.722222222222222 0.0555555555555556 21 15 4 13 1 3 92118520 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 11 7 2 7 0 3 92118591 A C N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 92118820 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 92118867 C A N N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 3 92118911 A G Y Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 92118917 G A Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 92118954 A G Y Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.363636363636364 0.636363636363636 0 15 7 4 7 0 3 92119048 A T Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 3 92119089 T G N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 3 92119116 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 3 92119221 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.2 0.75 0.05 23 17 4 15 1 3 92119222 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.2 0.75 0.05 23 17 4 15 1 3 92119271 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.210526315789474 0.736842105263158 0.0526315789473684 22 16 4 14 1 3 92119354 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 92119492 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.2 0.75 0.05 23 17 4 15 1 3 92119514 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.2 0.75 0.05 23 17 4 15 1 3 92119518 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.2 0.75 0.05 23 17 4 15 1 3 92119580 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.210526315789474 0.736842105263158 0.0526315789473684 22 16 4 14 1 3 92119635 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.2 0.75 0.05 23 17 4 15 1 3 92119662 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.157894736842105 0.789473684210526 0.0526315789473684 21 17 3 15 1 3 92120022 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 3 92120107 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.157894736842105 0.789473684210526 0.0526315789473684 21 17 3 15 1 3 92120208 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 92120235 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 92120259 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 92120283 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.15 0.8 0.05 22 18 3 16 1 3 92120284 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.15 0.8 0.05 22 18 3 16 1 3 92120294 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.2 0.75 0.05 23 17 4 15 1 3 92120318 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.2 0.75 0.05 23 17 4 15 1 3 92120345 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.210526315789474 0.736842105263158 0.0526315789473684 22 16 4 14 1 3 92120347 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 92120393 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.210526315789474 0.736842105263158 0.0526315789473684 22 16 4 14 1 3 92120415 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 92120461 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 3 92120466 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.157894736842105 0.789473684210526 0.0526315789473684 21 17 3 15 1 3 92120529 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 3 92120719 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 92121199 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 92121343 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 92121344 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 92121454 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 92121565 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 92121724 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 92122019 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 92122407 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 92122481 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 92122537 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 92122563 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 92122823 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 92122826 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 92123282 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 3 92123304 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 92123727 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 92125744 T G N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 3 92125975 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 92126361 A G Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 92126430 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 92126471 G C Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 92126608 C A N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 3 92126649 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 92126726 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 92126853 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 92126870 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 92126879 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 92127621 A C Y N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 3 92127648 G T N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 92128048 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92128294 T G N N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 92128327 T G N N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 8 12 3 2 5 3 92128375 G C N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 3 92129072 C A N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 92129074 G C N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 92129163 G A Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 92129231 T G N N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.416666666666667 0.166666666666667 0.416666666666667 12 12 5 2 5 3 92129560 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 3 92129680 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 92129682 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 92129695 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 92129767 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 92129959 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 92130233 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 92130256 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 92130308 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 92130338 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92130399 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.210526315789474 0.736842105263158 0.0526315789473684 22 16 4 14 1 3 92131002 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.2 0.75 0.05 23 17 4 15 1 3 92131259 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 92131417 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 92131509 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 92131660 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 92132053 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 92132740 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 92132813 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 92133337 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 92133510 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 92133550 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 92133966 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 92134024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92134222 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 92134907 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 92135700 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 92137225 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 92137680 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 92139062 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 92139280 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 92139586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92139914 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 92140146 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 92140320 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 92142639 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 92142843 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92142857 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92142953 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 92143015 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 92143374 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 92144168 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 92144264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92144271 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 92144654 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 92144725 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 92144726 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 92144802 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 92144966 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 92144986 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 92145087 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 92145120 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 92145278 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 92145364 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 92145446 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 92145460 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 92145520 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 92145628 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 92145665 G T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 92145725 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 92145867 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 92145877 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 92145993 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 92146048 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 92146085 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 92147114 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 92147282 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92147342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92147783 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 92147983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92148037 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92148457 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 92148866 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 3 92149056 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 92149319 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92149343 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 92150026 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 92150078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92150497 A C N N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.272727272727273 0.545454545454545 0.181818181818182 12 10 3 6 2 3 92150553 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 92151238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92151742 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 92152861 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 92153474 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 92153578 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 92153881 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92154053 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 92155064 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 92155070 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 92155138 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 92155268 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 92155684 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 92155822 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 92155890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92155894 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92155925 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.157894736842105 0.789473684210526 0.0526315789473684 21 17 3 15 1 3 92156119 T A N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 92156177 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 92156217 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 92156550 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 92156552 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 92156845 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 92156899 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 92156935 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 92156986 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 3 92156989 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 3 92157525 T C N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.1 0.7 0.2 9 11 1 7 2 3 92157693 C T N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.230769230769231 0.615384615384615 0.153846153846154 14 12 3 8 2 3 92157956 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92158041 C A N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.0625 0.625 0.3125 12 20 1 10 5 3 92158367 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92158368 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 92158387 T G N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.25 0.6875 0.0625 19 13 4 11 1 3 92158404 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.0625 0.6875 0.25 13 19 1 11 4 3 92158621 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 92158666 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92158721 C T N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 3 92158728 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 92158779 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 92158819 T G N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 92158864 A C N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 92158866 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 92158962 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 92158972 T C N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 3 92159063 C T N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 8 12 2 4 4 3 92159165 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92159351 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 92159374 G T N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 92159484 G T N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 3 92159532 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 3 92159543 G C N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 3 92159572 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92159671 A C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 92159789 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 92159962 T G N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 3 92160452 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92160493 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 92160506 A C N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 92160590 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92160738 C T N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 3 92161112 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 92161986 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 11 7 4 3 2 3 92162405 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 92162423 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 92162442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92162460 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 92162727 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 92162731 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92162865 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92162879 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 92162906 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 92162914 A T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 92162969 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 92162976 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 92163113 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92163134 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92163157 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92163169 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92163368 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 92163971 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92164105 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92164132 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 92164153 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 3 92164159 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92164217 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92164225 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92164278 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 92164311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92164312 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92164400 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92164443 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92164461 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92164480 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 92164517 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92164545 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 92164602 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92164642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92164662 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92164674 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92164676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92164740 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 92164809 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92164912 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92164939 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92165030 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92165054 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92165071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92165124 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92165154 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92165194 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92165296 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92165455 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 92165516 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 92165518 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92165930 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 92166256 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 92166313 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 3 92166710 T G N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 92166751 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 92166792 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 92166898 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 92166918 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 92167068 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 92167091 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 92167101 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 92167213 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92167287 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 92167288 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 92167338 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 92167389 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 92167463 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 92167570 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92167573 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 92167700 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 92167710 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 92167721 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92167745 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 92167777 G C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 92167805 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 92167823 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 92167832 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 92167858 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92167945 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 92168047 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 92168061 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 92168071 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 92168239 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.117647058823529 0.764705882352941 0.117647058823529 17 17 2 13 2 3 92168268 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 92168314 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 92168347 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 92168379 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 92168457 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92168643 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 92168676 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 92168691 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 92169089 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 92169229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92169247 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92169445 A G Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 92169484 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.05 0.7 0.25 16 24 1 14 5 3 92169518 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.25 0.7 0.05 24 16 5 14 1 3 92170805 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92179071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92179603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92181273 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92181730 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92186308 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92191175 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 92191208 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92192433 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92192435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92192454 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92192542 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92192547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92192629 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92192633 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92192773 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92192824 T G Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 92192839 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 92192859 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92193023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92193095 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 92193120 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92193141 T A Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 92193142 C A Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 92193349 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92193655 G A N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.0909090909090909 0.636363636363636 0.272727272727273 9 13 1 7 3 3 92193712 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 92193821 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92193954 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 92194043 C A Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 92194064 A G Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 92194101 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92195770 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 92196133 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 92196211 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92196781 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92197668 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92197937 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 92198025 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92198153 T C Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.133333333333333 0.666666666666667 0.2 14 16 2 10 3 3 92199091 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92199172 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92200259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92204166 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92205543 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92206082 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92206392 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92207284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92207916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92214451 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92215368 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 92215396 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 92215423 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 92215471 T A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 92215552 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 92215562 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 92215649 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 92218152 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 92220072 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92220927 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 92224654 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92228104 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92228566 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 3 92228737 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 3 92229103 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 92229216 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92229306 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 92229423 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 92229915 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 92230219 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 92230351 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 92230365 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92230409 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 92230550 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 92230586 A G Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 92230853 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 92230887 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 92230953 C A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 92231058 T G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 92231063 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 92231086 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92231133 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 92231226 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 92231369 C A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 92231386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92231529 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 92231583 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 92231602 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 92231603 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 92231630 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 92231663 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 92231822 T G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 92231920 C T Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 92233437 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 92233464 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92233485 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92233748 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 92233912 A G Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 92233919 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92234195 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 92234333 A C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 92234385 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 92234386 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 92234480 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 92234736 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92235047 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 92235133 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 92235318 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 92235359 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 92235371 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92235560 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 92235739 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 92235984 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92236053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92236572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92237319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92238191 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 92239308 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92239818 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92240000 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92240160 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 92240436 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92240480 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92241444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92242385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92242416 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 92242459 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 92242464 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 92242526 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 92242579 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 92242861 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 92242881 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 92243080 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 92243108 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 92243188 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 92243329 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92243572 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 92243590 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 92243626 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 92243808 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 92243870 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 92243891 A T N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 3 92243979 G A N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 3 92244019 T C Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.235294117647059 25 9 12 1 4 3 92244066 T G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 92244683 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.583333333333333 0.166666666666667 0.25 16 8 7 2 3 3 92244773 T A N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 3 92244841 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 3 92244842 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 3 92244911 G C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 92244929 G C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92244943 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 92245019 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 92245084 T C Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 92245235 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 92245274 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 92245488 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 92245508 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 92245510 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 92245534 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 92245588 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92245652 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92245654 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92245758 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92245806 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92245819 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92245833 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92245834 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92245925 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92245933 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92245955 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 92246007 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 92246064 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 92246120 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 92246183 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 92246286 T A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 92246355 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92246402 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 92246605 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 92246683 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 92246710 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 92246711 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 92246773 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 92247285 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.583333333333333 0.166666666666667 0.25 16 8 7 2 3 3 92247290 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.583333333333333 0.166666666666667 0.25 16 8 7 2 3 3 92247306 T G N N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 14 6 6 2 2 3 92247481 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92247706 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 92247718 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 92247783 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 92247788 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 92247977 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 92248038 G A Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 92248191 G A N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 92248230 G T N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 92248416 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 92248437 G T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 92248503 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 92248517 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92248579 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 92248636 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 92248652 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92248782 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 92248844 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 92248875 T G Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 92248907 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 92248920 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 92248958 A G Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 92248973 A C Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 92249034 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 92249080 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 92249103 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 92249126 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 92249146 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92249195 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92249218 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 92249282 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 92249356 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 92249359 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 92249368 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 92249371 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 92249464 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 92249576 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 92249617 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 92249663 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92249679 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92249694 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92249812 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 92249827 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 92249840 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 92249855 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 92249942 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 92249970 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 92250045 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 92250057 C G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 92250147 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92250176 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 92250235 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 92250266 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92250351 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 92250444 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92250558 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 92250560 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 92250591 T G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 92250606 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 92250674 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92250740 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 92250867 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 92250891 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92250955 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 92251024 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 92251124 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 92251144 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 92251309 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 92251346 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 92251369 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 92251371 T A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 92251476 T A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92251487 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92251577 G C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92251696 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 92251708 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 92251790 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92251831 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92251848 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92251858 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92251923 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92251957 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92252123 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92252257 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92252285 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92252295 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92252299 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92252325 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 92252503 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 92252605 G T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 92252615 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92252616 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92252651 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92252746 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 92252767 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92252949 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92252994 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 92253188 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 92253222 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 92253261 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 92253326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92253349 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 92253481 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 92253676 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92253696 A T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 92253773 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 92253939 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 92253969 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 92254168 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 92254247 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92254483 C A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 92254547 A T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 92254728 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92254899 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92255062 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92255248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92255356 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92255431 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 92255819 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 92256058 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92256563 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 92256814 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92257626 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92258071 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 92258102 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 92258172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92258207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92258275 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 92258299 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92258383 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 92258432 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92258601 G T N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 92258736 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 92258943 G T N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 92259479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92259622 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 92259744 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92259856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92259878 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 92259883 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92259970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92259983 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 92260677 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92260678 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92261612 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 92261623 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 92261636 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 92261768 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 92261812 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 92261917 T A Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 92261962 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 92262280 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 92262294 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 92262321 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92262419 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92262650 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 92262915 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 92262947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92263047 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 92263071 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 92263167 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 92263169 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 92263385 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92263713 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 92263761 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 92263800 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92263921 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 92264071 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 92264756 C A N N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 6 12 2 2 5 3 92264789 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 3 92264846 G T N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 92264958 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 92265193 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 92265223 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92265276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92265465 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92265511 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 92265549 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 92265611 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 92265634 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92265668 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 92265704 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 92265812 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 92265858 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 92265899 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 92265918 T G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 92266011 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 92266020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92266059 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 92266230 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 92266285 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92266355 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 92266449 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92266492 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 92266547 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92266567 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 92266706 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92266914 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 92266976 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 92267019 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 92267077 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92267161 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 92267172 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 92267214 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 92267224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92267289 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 92267458 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 92267633 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 92267669 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92267844 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 92268022 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92268102 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92268153 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92268275 G T Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 92268409 C G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92268450 C T Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 92268478 T G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 92268547 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 3 92268830 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 3 92268913 C T Y Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 3 92268974 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 92269087 C A N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 3 92269095 A C N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 3 92269100 C A N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 92269122 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 92269182 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 92269189 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 92269201 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 92269434 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92269470 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92269489 G C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 92269656 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 92269701 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 92269752 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92269959 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 92269976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92270081 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92270108 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92270793 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92271505 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92271617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92271676 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92271719 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92271848 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92271902 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92272000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92272218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92272340 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92272957 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92274968 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92275381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92276395 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92276573 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 92277433 C A N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 92277996 A C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 92278883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92279173 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92281392 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92282095 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 92282802 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92282963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92284373 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92284594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92285016 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 92285073 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 92285548 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 92285659 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 92285907 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 92287720 T C Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 92287727 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 92289164 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 92289175 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92289436 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92289529 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92290191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92290538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92291522 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 92292869 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 92293674 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92294012 A C N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 92294155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92294986 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92295171 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92295815 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92296042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92296554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92296571 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92296607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92298153 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92298166 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92298495 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92299129 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92299644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92300287 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92300629 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 92300708 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92300876 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 92300969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92301432 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92301539 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 92302127 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 92302274 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92302293 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 92303089 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 92303129 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 92303418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92303820 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92304079 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 92304162 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 92304661 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92306326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92306480 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 92306695 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 92306751 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 92306902 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92307221 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92307455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92307557 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92307578 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92307692 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92308011 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92308688 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92309313 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92309314 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92310684 C T N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0 0.636363636363636 0.363636363636364 7 15 0 7 4 3 92310689 C T Y Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.636363636363636 0.181818181818182 0.181818181818182 16 6 7 2 2 3 92310704 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 92311544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92313277 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 92313610 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 92313631 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 92313641 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 92313646 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 92313924 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92315267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92315526 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92316314 T A Y N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 92317035 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 92317720 T G N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 3 92317811 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 92317933 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 92318487 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 92319464 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 92319506 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92319555 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92319565 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 92319589 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 92320211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92320434 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 92320589 G C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 92320683 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 92320746 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 92320784 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 92320813 G T N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 92320938 A G N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 92321100 A G N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 92321252 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 92321517 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 92321663 A T N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 92321901 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 92321973 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 92322387 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 92322479 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 92322629 A C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 92322831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92322984 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 92323056 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 92323060 T G Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 92323208 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 92323219 C G N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 92323258 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 92323373 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 92323509 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 92323631 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 92323662 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 92323696 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 92323707 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 92323862 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 92323941 C G Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 92324025 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 92324046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92324069 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 92324081 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 92324465 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 92324662 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 92324666 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 92324703 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 92324781 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92324805 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92324889 G T N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 92324925 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92325208 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 92325444 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92325475 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92325484 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 92325517 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 92325518 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 92325647 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 92325781 C A Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 92326185 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 92326255 A G Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 92326443 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 92326610 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 92326659 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 92326660 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 92326671 C T Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 92326770 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 92326837 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 92326917 T C Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 92327132 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 92327140 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 92327220 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92327287 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 92327424 T G Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 92327439 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 92327752 C T Y Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.0714285714285714 0.714285714285714 0.214285714285714 12 16 1 10 3 3 92328016 T A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 92328064 C G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 92328144 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92329133 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92329854 A T Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 92330169 A C Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 92331537 A C Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 3 92331912 G T Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 92332147 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92332240 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 92332296 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92332514 G T Y N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 92332597 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92332654 A T Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 92332702 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 92332809 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 92333123 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92333197 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92333220 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 92333296 C G Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 92333530 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 92333774 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92333938 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92334080 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 92334192 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 92334272 A G N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 92334389 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 92334764 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92334782 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 92334970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92335132 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 92335642 G A N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0 0.615384615384615 0.384615384615385 8 18 0 8 5 3 92336113 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 92336656 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 92337357 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92337770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92338100 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 92338414 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 92338424 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 92338541 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 92338894 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 92338953 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 92338983 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92338991 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 92339033 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 92339219 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 92339276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92339419 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 92339437 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 92339449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92339522 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 92340064 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 92340120 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92340131 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92340513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92340515 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92340527 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 92340596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92340869 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 92341002 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92341147 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 92341188 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92341195 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92341253 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92341352 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92341367 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92341370 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92341548 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92341582 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 92341602 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92341656 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 92341799 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 92341830 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 92342064 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92342076 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92342113 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 92342416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92342417 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92342459 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92342783 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92342785 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92342990 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92343138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92343734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92343739 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92343787 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92343818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92344053 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92344121 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92344441 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92344521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92344921 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92345231 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92345669 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 92345818 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92345892 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92345923 T A Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 92345958 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 92345961 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 92346045 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92346053 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92346224 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92346347 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92346763 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92346919 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92347107 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92347282 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92347313 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92347396 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92347529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92347541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92347565 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92347670 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 92347714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92348068 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92348793 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92348806 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92348824 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92348868 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92348891 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92348911 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92348974 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92349141 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92349148 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92349239 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92349540 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 92349543 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 92349628 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 92349659 T G Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 92349678 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92349699 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 92349957 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92349981 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 92350164 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92350192 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92350201 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92350349 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92350387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92350452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92358376 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92358425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92358472 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92358497 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 92358628 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92358653 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92358711 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92358732 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92358798 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92359841 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 92360027 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92360028 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92360046 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92360144 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92360181 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92360407 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92360534 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 92360823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92361353 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 92361665 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 92361670 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 92362155 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92362377 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 92362381 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 92362532 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 92362654 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 92362682 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92362906 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 92362920 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92362997 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 92363060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92363061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92363614 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92363721 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 92363781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92363881 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92363901 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 92363919 T G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 92363988 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 92364015 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92364075 G C N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 92364192 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92364197 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92364266 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 92364316 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 92364441 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 92364450 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 92364481 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92364490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92364529 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92364560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92364679 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92364694 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 92364743 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 92364770 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 92364853 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 92364902 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 92365122 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92365205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92365618 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92365869 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92367819 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 92368059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92368203 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 92368282 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 92368367 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 92368370 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 92368477 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 92368496 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 92368706 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 92368835 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 92368958 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 92369242 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 92369296 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 92369369 G T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 92369752 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 92369874 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 92370008 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 92370180 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 92370354 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 92370540 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 92370581 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 92370976 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 92371161 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 92371404 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 92371410 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92371446 T G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 92371491 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 92371928 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 92371941 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 92372222 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 92372238 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 92372316 G A Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 92372350 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 92372416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92372430 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92372463 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 92372466 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 92372489 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 92372725 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 92372747 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 92372759 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 92372933 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 92372988 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 92372989 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 92373000 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 92373081 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 92373086 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 92373099 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 92373121 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 92373129 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 92373173 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 92373418 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 92373428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92373456 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 92373635 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 92373652 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 92373659 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 92373668 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 92373731 G T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 92373743 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 92373758 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 92373824 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 92373924 A C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 92373933 A T N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 92373988 A T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 92373989 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 92374042 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 92374193 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 92374205 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 92374322 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 92374344 G A N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 92374467 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 92374488 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 92374497 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 92374531 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 92375412 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 92375989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92376326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92377487 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92378154 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92378274 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 92378281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92378611 T C Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 92378808 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 92379163 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92381403 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 92382251 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92382669 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92384312 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92384328 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 92389576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92391181 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92392579 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92393187 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 92394116 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92394119 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92394251 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92396541 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92396688 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92397005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92397849 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92397861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92398170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92398493 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 92401375 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 92401422 A T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 92402632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92403658 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 92405004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92405831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92405908 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 92405918 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 92406007 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 92406130 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 92406197 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 92406476 C A N N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 3 92406499 T G N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 3 92406990 G A N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 3 92407064 G T N N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 8 12 3 2 5 3 92407130 G T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 92407233 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 92407324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92407360 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 92407448 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 92407464 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 92407501 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92407557 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 92407613 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 92407630 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 92407999 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 92408016 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 92408080 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 92408141 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92408174 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 92408313 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 92408460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92408468 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 92408492 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92408549 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 92408734 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92408744 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 92408756 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92408758 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 92408956 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92409093 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92409386 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 92409429 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 92410539 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 92411135 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92411866 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92412823 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92415081 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92415498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92416575 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92418529 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92420167 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92421253 G A Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 92423327 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 92424113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92425019 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92425623 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 92426747 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92426775 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92427258 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92428562 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 92428925 G C N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 3 92429146 A C Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 92433879 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92434094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92434281 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92434288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92434347 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 92434426 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 92434456 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 92434461 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 92434508 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 92434562 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 92434576 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 92434610 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 92434658 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92434761 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92434778 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 92434802 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 92434835 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 92435298 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 92435318 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92435431 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 92435496 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 92435600 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 92435673 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 92435728 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 92435731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92435767 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 92436001 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92436017 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 92436097 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92436145 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92436197 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 92436246 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 92436448 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 92436540 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 92436557 C G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 92436585 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 92436666 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 92436806 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 92436827 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 92436830 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 92436924 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 92436966 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 92437079 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 92437158 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 92437192 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 92437223 A C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 92437259 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92437351 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 92437627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92438042 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 92438071 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 92438082 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 92438313 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 92438502 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 92438722 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 92438824 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92438835 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92438908 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92439080 A C N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 92439264 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92439272 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92439743 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92440200 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92440243 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92440316 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92440436 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92440937 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 92441059 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92441256 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92441686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92441765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92441906 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 92441961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92442221 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 92442330 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92442594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92442888 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92442903 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 92442990 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 3 92443146 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 92443265 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 92443337 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 92443575 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92443610 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 92443651 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 92443659 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 92443820 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92443983 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 92444041 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 92444060 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 92444087 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92444090 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 92444098 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 92444134 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92444167 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92444238 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 92444327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92444356 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 92444435 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 92444456 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 92444464 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 92444504 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 92444774 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92444875 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 92444935 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 92445151 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 92445209 C A N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 92445474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92445506 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92445771 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92445826 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92445829 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 92446223 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92446292 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 92446401 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92446472 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92446725 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92446840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92446867 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92447032 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92447089 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92447124 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92447175 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92447200 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92447233 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92447282 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92447367 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92447509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92447694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92447749 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92448002 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92448011 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92448013 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92448034 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92448042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92448240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92448241 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 92448289 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92448294 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92448324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92448350 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92448500 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92448513 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92448590 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92448617 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92448661 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92448666 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92448685 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92448698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92448787 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92448945 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 92448974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92449020 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92449027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92449160 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92449165 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92449251 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 92449254 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 92449265 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 92449410 T A N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 92449429 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 92449611 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 92450038 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 92450050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92450060 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 92450075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92450148 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 92450153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92450172 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 92450194 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 92450230 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 92450442 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 92450618 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92450809 A G Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 92450812 T G Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 92450839 G A Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 3 92450887 G A Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 92451133 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 92451147 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 92451154 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 92451277 G T N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 92451384 A C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 92451444 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 92451482 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92451493 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92451621 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 92451813 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92452002 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 92452016 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 92452027 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 92452091 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 92452208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92452397 A T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 92452581 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92452664 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 92452938 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 92453200 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 92453255 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92453402 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92453464 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 92453508 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 92453575 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92453983 G A Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 92454114 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 92454416 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 92454484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92454492 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92454741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92454762 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92454823 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92454892 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92454935 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92454936 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92455010 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92455032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92455069 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92455197 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 92455235 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 92455421 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 92455434 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 92455447 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 92455456 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 92455612 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 92455865 A C Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 92455890 A G Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 92456436 G A Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 92456503 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 92456507 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 92456671 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 92456712 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 3 92456749 T G N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 92456756 C T Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 92456814 G C Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 92456889 C A Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 92456975 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 92456994 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 92457005 C A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 92457006 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 92457045 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 92457398 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 92457433 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 92457564 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 92457584 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 92457652 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 92457656 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 92457698 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 92457862 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 92457934 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 92457972 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 92458097 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 92458141 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 92458153 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 92458164 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 92458172 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 92458186 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92458269 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 92458310 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 92458477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92458941 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 92458992 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92459250 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 92459337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92459460 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92459461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92459570 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92459640 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92459694 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92459943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92459955 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92459982 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 92459985 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 92460174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92460736 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92461143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92461150 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92461172 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 92461210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92461313 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92461317 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92461370 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92461414 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 92461472 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 92461780 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92461827 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92461990 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92462160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92462449 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92462636 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92462796 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92463244 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 92463306 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 92463320 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 92463440 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92463447 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92463508 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92463544 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92463681 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92463722 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92463740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92463756 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92463773 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92463929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92464329 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 92464379 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92464382 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92464542 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92464623 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92464696 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92464763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92464834 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92464847 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 92464879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92465036 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92465117 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92465294 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92465852 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92466287 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92466705 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92466943 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 92467040 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 92467163 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 92467336 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 92467437 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 92467517 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92467653 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92468008 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92468052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92468092 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92468189 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92468290 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92468350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92468415 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92468459 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 92468477 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92468516 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 92468570 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92468631 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92468647 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92468698 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92468727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92468771 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92468853 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92469176 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92469202 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92469315 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92469372 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92469473 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92469542 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92469645 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92469684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92469810 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92469870 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92469943 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92470170 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 92470239 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92470286 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92470292 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92470321 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92470360 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92470365 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92470591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92470748 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92470767 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92470783 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92470821 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92471068 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92471292 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92471479 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92471501 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92471784 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92471932 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92472422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92473146 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92473956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92474011 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92474119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92474425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92474503 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92474517 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92474547 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 92474852 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92474869 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92476772 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92476807 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92478727 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92479382 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92480158 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92481001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92481034 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92481104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92481348 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92481450 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 92482743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92482771 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92483464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92484276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92484976 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92485062 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92485106 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92485176 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92485671 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 92486143 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92486257 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 92486729 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 92487009 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92487443 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 92487932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92488799 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92488822 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92492343 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92499882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92499888 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92499980 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92501073 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92501632 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92501889 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92501904 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92502009 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 92502801 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92509720 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92513543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92515321 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92515592 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92515646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92515650 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92515785 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92515809 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92515856 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92515992 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92516063 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92516131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92516182 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92516206 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92516366 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92516390 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 92516422 G T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 92516443 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92516470 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 92516490 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 92516501 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92516545 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92516611 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 92516705 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92516956 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92516980 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92517191 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92517327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92517385 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92517386 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92517684 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92517712 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 92517860 C G Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 92517876 C G Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 92517888 C G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 92518195 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92518376 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92518406 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92518588 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92518752 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92518790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92518815 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92518986 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92519024 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92519028 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92519045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92519437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92519728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92519731 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92519750 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92519984 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92520260 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92520549 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92520634 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92520960 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 92520981 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 92521122 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 92521130 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 92521351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92522020 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92522084 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92522105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92522159 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92522182 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92522290 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92522297 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92522338 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92522366 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92522382 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92522409 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92522468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92522469 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92522545 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92522660 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92522836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92522995 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92523036 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92523123 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92523169 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92523295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92523576 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92523587 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92524255 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 92524426 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92524637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92524677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92524756 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92524839 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92524929 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92525155 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92525275 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92525356 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92525564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92525611 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92525615 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92525989 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92526157 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92526159 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92526355 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92526357 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92526714 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92526839 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92526887 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92526922 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92526925 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92526935 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92527035 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92527189 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92527241 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92527265 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 92527365 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92527470 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 92527645 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 92527740 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 92527877 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92528026 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 92528311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92528442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92529079 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 92529902 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 92530551 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92530829 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92531275 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92531312 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92531498 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92531564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92531783 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92531927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92532051 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92532299 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 92532508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92532644 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92532802 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92532822 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92532929 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92532930 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92533024 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92533056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92533128 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92533210 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 92533462 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 92533592 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92533627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92533732 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92533740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92533773 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92533808 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92534082 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92534112 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92534162 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92534171 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92534203 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92534243 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92534257 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92534395 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92534436 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 92534452 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92534537 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 92534568 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 92534667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92534759 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92534813 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92534852 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92534854 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 92534922 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92535057 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 92535123 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92535187 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92535218 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92535221 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92535281 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92535417 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92535595 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92535613 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92535618 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92535625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92535644 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92535699 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92535705 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92535867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92535900 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 92535904 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92536211 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92536277 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 92536340 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 92536401 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92536412 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 92536446 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92536466 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 92536638 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92536663 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92536664 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92536742 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 92536817 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92536942 C G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 92536992 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92537022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92537142 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92537224 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 92537302 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 92537422 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 92537581 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 92537649 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92537675 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 92537680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92537722 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 92537747 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92537789 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 92537892 T A N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 92537901 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 92537979 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 92537997 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 92538039 G T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 92538043 C A N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 92538079 A C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 92538088 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 92538113 C G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 92538209 A T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 92538410 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 92538427 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 92538502 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 92538607 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92538614 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 92538757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92538781 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92538834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92538880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92538894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92538928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92538939 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 92538995 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 92539065 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92539087 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 92539088 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 92539119 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 92539200 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92539203 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 92539260 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 92539347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92539362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92539423 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92539548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92539593 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 92539729 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92539759 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 92539883 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 92540123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92540146 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 92540175 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 92540233 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 92540235 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92540360 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 92540634 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92540764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92540870 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 92541047 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 92541055 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92541215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92541231 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 92541301 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92541384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92541477 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 92541845 G A Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.235294117647059 0.705882352941177 0.0588235294117647 20 14 4 12 1 3 92542242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92542883 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 92543148 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 92543157 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92543352 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 92545094 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92548086 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92549214 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 92549802 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 92550371 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92551654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92552422 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 92552435 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 92552444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92552736 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92553767 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92553770 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92555716 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92555869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92556928 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92557008 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92557215 T C Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 3 92557630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92557768 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92559819 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92561813 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 92562022 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92563580 T A Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 92563591 T C Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 92563670 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 92564130 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92565237 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 92567017 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 92568402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92568750 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 92570891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92571054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92571316 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92571859 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92572465 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92573418 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92573723 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92573832 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92574070 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92576338 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92576367 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92577037 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92577479 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92579270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92579490 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92579721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92580799 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92580807 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92581803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92581927 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92582400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92583296 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92584260 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 92584971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92585615 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92585845 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 92586026 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92586201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92586276 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92586466 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92586483 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 92586917 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 92587122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92587158 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92587267 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92587412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92588540 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92588973 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 92589357 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 92589596 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 92589664 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92590308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92591210 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92591374 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 92591437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92591760 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 92591764 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 92591778 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 92591779 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 92591903 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 92592635 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92593220 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92593338 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 92594143 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92594586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92594657 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92594854 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92594903 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92594973 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 92597306 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 92598859 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 92598861 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 92599124 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 92599276 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92599456 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 92599489 A C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 92599547 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 92599553 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 92600044 G C N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 92600379 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 3 92600407 A C Y N 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 3 92600421 T C Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 92600602 C A Y N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 3 92600622 T G Y N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 3 92600637 C T Y Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 7 11 2 3 4 3 92600679 A G Y Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 3 92600695 A G Y Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 3 92600762 A T Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 92601320 T A Y N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 9 5 3 3 1 3 92601323 T C Y Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 9 5 3 3 1 3 92601407 T C Y Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 92601438 A T Y N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 3 92601585 C A Y N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 92601601 G A Y Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 3 92601751 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 92602414 T A N N 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 3 92602463 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 8 4 4 0 2 3 92602586 G A Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 92602839 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92602857 C A Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 92602886 G A Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 92603022 C T Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 92603034 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 92603108 A G Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 92603204 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92603502 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92603536 G C Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 92603735 A T Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 92603860 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92604000 A G Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 92604054 T A Y N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 3 92604183 T G N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 92604255 G A Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 92604257 A G Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 92605069 A T Y N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 3 92605137 C T Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 92605140 C T Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 92605174 G A Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 92605190 G A Y Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 3 92605237 A C Y N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 3 92605240 G A Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 92605303 G T Y N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 3 92605369 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92605615 T G Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 92605737 A T Y N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 3 92605739 T C Y Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 92605750 T C Y Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 92606003 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92606030 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 92606172 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 92606185 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 92606210 T G Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 92606244 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 92606301 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 92606325 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 92606372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92606408 C A Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 92606514 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 92606569 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 92606579 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 92606596 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 92606802 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 92606992 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 92607009 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 92607194 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 92607472 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 92607514 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 92607751 C A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 92608092 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 92608254 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 92608287 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 92608572 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 92608748 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92608872 A T N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 3 92608891 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 92609693 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 92609923 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 92610169 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 92610186 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92610319 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 92610385 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 92610698 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92610753 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 92610891 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 92611026 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 92611077 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92611262 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92611366 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 92611434 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 92611435 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92611491 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92611736 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 92611908 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 92611928 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 92612037 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 92612121 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92612362 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92612527 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92612598 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 92612630 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 92612658 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 92612675 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 92612742 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92612873 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92612949 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92613054 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92613107 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92613140 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92613146 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92613319 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 92613333 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 92613353 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 92613451 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92613589 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92613719 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 92613823 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92613880 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92614003 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92614232 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92614326 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 92614341 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 92614465 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92614522 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 92614550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92614558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92614625 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 92614768 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92614897 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 92614968 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 92614976 C T N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 92615101 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 92615203 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92615314 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92615325 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92615360 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92615685 A T N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 3 92615770 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 92617036 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 92617067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92617432 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 92617530 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92617544 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 92617768 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 92617830 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92617845 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92617878 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92618054 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 92618169 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 92618267 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 92618302 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 92618338 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 92618350 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 92618384 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 92618469 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 92618545 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 92618564 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 92618733 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 92618755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92618959 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 92619218 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 92619276 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 92619591 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 92619621 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92619630 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 92619970 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 92620065 A T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 92620287 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 92620318 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92620432 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92620448 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 92620534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92620536 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92620559 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 92620636 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 92620777 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 92621015 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 92621206 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 92621393 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 92621413 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 92621540 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 92621547 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 92621620 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92621725 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 92621924 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 92622102 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 92624422 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 92625000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92625258 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92625971 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92626917 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92629042 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92629108 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 92629383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92630202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92630397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92630543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92631455 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92631920 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92632398 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92632509 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92632801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92633223 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92634981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92635539 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 92636660 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92637409 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 92637772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92638092 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92638616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92638859 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92639714 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92640073 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 3 92640756 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92641072 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92641529 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92641851 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 92641916 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92642403 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92642517 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92643019 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92643405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92644417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92644668 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92645068 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92649530 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92649715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92649755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92649772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92651281 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 92651720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92652181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92652897 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92653149 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92653615 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92653901 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92654955 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92656087 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92656147 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92656860 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 92658290 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92658366 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92659259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92660107 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 92660202 T A Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 92661162 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 92661692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92662893 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92663338 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 92663578 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 92663650 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 92664313 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 92664577 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 92665088 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92665119 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 92665516 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 92665720 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 92665789 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 92665849 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 92665851 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 92665972 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 92666001 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 92666262 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 92666276 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 92666736 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 92666817 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 92666844 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 92666913 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 92667067 A G N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 92667285 C T N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.75 0.0833333333333333 0.166666666666667 19 5 9 1 2 3 92667514 T G N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 3 92667597 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 92667775 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 92668021 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 92668313 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 92668771 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 92669336 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 92669409 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 92669693 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 92670923 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92671262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92671288 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92671310 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 92671362 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 92671496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92671613 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 92672136 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 92672155 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 92672750 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92672805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92672889 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 92673429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92673502 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 92673540 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 92673545 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 92673559 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 92673648 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 92673799 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92674844 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92675114 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 92677275 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92677839 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92678070 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92678218 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92679134 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92679971 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92680873 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 92680974 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92681645 G C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 92681663 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92681667 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92681861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92682309 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92682340 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 92682795 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 92683550 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 92683668 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 92684275 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92685703 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 92685916 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92686047 A T N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 3 92686460 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92686561 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92686666 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 92686752 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 3 92687446 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 92687902 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92688587 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92688771 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92689287 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 92690119 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92691667 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 92692797 G A N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 3 92693172 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 92693290 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 92693352 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92693592 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 92693684 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92693819 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92693843 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 92693892 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 92694588 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 92695432 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92696173 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92696554 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92697107 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 92697124 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 92697126 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92697251 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92697398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92697550 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92697999 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92698623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92699167 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 92699180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92699574 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92701167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92701299 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92702251 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 92702254 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92702299 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92702536 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 92702749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92703050 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 92704145 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92704150 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 92704296 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92704496 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92704571 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92704608 T A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 92704620 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92704750 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92705097 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92705400 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 92707182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92707547 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92707569 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92707585 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92707671 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 92707825 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92707833 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 92707926 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92708174 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92708252 G A Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 92708362 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 92708900 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 92708951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92708954 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 92709079 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92709319 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 92709443 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 92709486 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 92709507 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92709637 C G N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 92709873 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 92709893 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 92709959 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 92709968 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 92710277 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 92710344 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 92710472 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 92710490 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 92710506 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 92710840 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 92711045 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92711220 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 92711529 T G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 92711633 G T N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 92711657 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 92712855 T G Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 92713396 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 92713451 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 92713551 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 92713654 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 92714072 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 92714295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92714490 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 92714791 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 92714797 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 92714805 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 92714817 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 92714843 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 92714976 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 92715526 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92715541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92715707 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 92715741 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 92715783 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 92715872 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92716014 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 92716372 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 92716605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92717235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92719883 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 92719983 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92720193 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92720520 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92720979 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 92721477 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 92721488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92721544 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 92721560 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 92721583 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92721611 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92721627 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 92721708 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92721766 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92721805 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92721818 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 92721880 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92721892 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92721956 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 92721982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92722028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92722034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92722152 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92722177 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92722189 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 92722211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92722229 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 92722250 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 92722259 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 92722299 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 92722310 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 92722380 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 92722427 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 92722481 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 92722652 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 3 92722653 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 92722678 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.153846153846154 22 4 11 0 2 3 92722703 G A Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 92722768 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 92722857 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92722892 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 92722970 A G N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 92723112 C G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 92723180 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 92723230 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92723263 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 92723344 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 92723367 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 92723938 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 92723969 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 92724076 C G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 92724083 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 92724090 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 92724104 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 92724521 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 92724641 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 92724649 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 92724766 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 92724792 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 92724807 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 92724856 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 92724944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92725193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92725450 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 92725469 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 92725490 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 92725494 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 92725514 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 92725551 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92725605 G C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 92725851 G T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 92725913 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 92726139 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 92726259 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92726309 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 92726524 T G Y N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 92727126 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 92727236 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 92727456 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 92727654 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 92727691 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 92727780 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 92727916 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 92727929 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 92728006 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92728089 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 92728141 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 92728520 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92728533 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92729173 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92729540 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0 0.647058823529412 0.352941176470588 11 23 0 11 6 3 92729566 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 92729597 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92729696 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92729752 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 92729754 T G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 92729776 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.15 0.85 0 23 17 3 17 0 3 92729916 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 92729962 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 92729979 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 92730012 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 92730059 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 92730066 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 92730090 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 92730120 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92730132 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 92730184 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 92730186 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 92730434 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 92730441 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 92730559 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 92730591 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 92730878 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 92730890 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 92732291 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 92732497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92733880 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 92734768 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92735768 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92737652 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 92737733 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 92737757 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 92737860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92739018 T G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 92739109 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 92739690 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92739698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92740462 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 92741094 G A Y Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.142857142857143 0.714285714285714 0.142857142857143 14 14 2 10 2 3 92741243 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92741455 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 92741456 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 92741577 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 92741906 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 92742277 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 92742546 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92743079 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 92743158 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92743246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92743349 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 92743468 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 92744455 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 92744789 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 92744846 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92745537 C G Y N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 92745745 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 92745760 T A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 92746799 A T N N 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 3 92747078 A G Y Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 3 92747195 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 3 92747211 A G Y Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 3 92747227 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 3 92747231 T A Y N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 3 92747335 T C Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 3 92747791 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 92747948 C T N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.25 0 0.75 4 12 2 0 6 3 92748071 C G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 92748107 A T N N 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 4 8 2 0 4 3 92748110 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 92750040 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 92750989 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 92751312 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 92751313 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 92751337 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 92751341 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 92751391 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 92751484 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 92751605 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 92751742 G A Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 92751800 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 92751988 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 92752025 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 92752677 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 92752711 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 92753914 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 92753948 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 92753958 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 92754025 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 92754237 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 92754295 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 92754315 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 92754344 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 92754415 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 92755626 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 92756373 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 92756775 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92756849 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 92758808 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92758917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92759354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92760505 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92762132 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92762149 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 92762521 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92762528 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92762664 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 92763175 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 92763285 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92764014 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 92764037 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 92764040 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 92764061 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92764258 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 92764265 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 92764698 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 92765745 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 92766097 C A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 92766150 C T Y Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 6 8 1 4 2 3 92766385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92766584 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 92767614 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92767673 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 92768502 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 92768525 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 92768541 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 92768913 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92770702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92771006 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92771058 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92771365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92774948 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92775358 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92775649 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92775671 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92777108 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 92777465 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 92779573 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 92780261 A T Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 92781548 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 92781556 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92782049 A T Y N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 92782106 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92784970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92787450 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 92788441 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 92790606 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92792318 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92795095 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92796324 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 92796366 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 92796402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92796408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92796433 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92796438 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 92796462 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92796740 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92797139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92797151 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92797251 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92797261 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92797282 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92797512 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92797518 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92797531 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92797584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92797815 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92797838 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92797854 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92798267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92798442 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92798532 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92798692 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 92798693 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 92799122 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 92799293 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 92799361 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 92799362 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 92799610 C A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 92799742 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 92799825 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 92799850 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 92799870 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 92799895 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 92799909 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 92799914 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 92799956 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 92799971 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 92800202 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 92800205 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 92800234 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 92800407 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 92800476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92800704 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 92800742 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 92800799 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 92800949 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 92801125 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 92801334 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 92801396 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 92801459 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 92801527 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 92801600 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 92801620 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 92801642 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 92801660 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 92801919 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 92801924 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 92801934 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 92801960 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 92801972 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 92801998 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 92802111 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 92802125 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 92802156 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 92802177 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 92802295 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 92802305 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 92802405 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 92802851 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 92802870 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 92802888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92803379 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 92803757 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92804157 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 92804443 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 92804536 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92804560 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 92804705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92804732 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92804733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92804939 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 92805136 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 92805353 T C N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 3 92805366 C T N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 92805556 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 92805665 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 92805758 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 92805773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92805897 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 92806074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92806147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92806224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92806392 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92806474 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92806577 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92807707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92809183 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 92809303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92809304 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92810378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92811250 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92811650 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92813066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92814914 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92814915 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 92815905 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92820614 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92821780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92822998 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 92823783 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92823861 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 92824041 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 92824414 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 92824577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92824884 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 92826519 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92826533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92827145 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92827224 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 92827407 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 92827503 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92830115 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92830139 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92830269 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92830351 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92830402 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92830447 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92830511 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 92830524 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 92830542 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 92830559 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 92830595 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 92830601 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 92830742 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 92831293 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92831633 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92831899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92832004 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92832831 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 92833648 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92834031 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 92834220 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 92834319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92834375 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 92834470 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92834482 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 92835157 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 92835228 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 92835269 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 92835305 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 92835339 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 92835463 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 92835479 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 92836527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92838462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92839161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92839325 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92840073 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92840397 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92840444 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92840477 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92840590 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 92841429 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92844119 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92844928 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 92845629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92845912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92846090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92846522 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92847784 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 92848466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92849197 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92850084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92850569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92851103 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92852762 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 92853486 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 92853682 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 92853983 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92854132 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92855073 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 92855080 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92855125 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 92855895 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 92856192 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92856445 G T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 92856808 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 92856823 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 92856965 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 92856977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92857015 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92857264 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 92857322 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92857336 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 92857409 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 92857426 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92857507 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92857529 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92857534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92857552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92857856 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92857923 A T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 92857963 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92857976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92858157 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 92858223 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92858240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92858431 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 92858441 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92858570 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 92858585 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 92858597 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 92858655 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92858764 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 92858773 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 92858803 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 92858869 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92859017 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 92859191 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 92859602 A T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 92859755 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 92859788 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 92859981 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92860013 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92860110 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 92860258 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 92860566 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 92860811 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92860932 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 92861010 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 92861024 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 92861121 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 92861156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92861192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92861399 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 92861418 G A Y Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 92861448 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92861509 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92861528 C G Y N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 92861542 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92861586 C T Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 92861624 C A Y N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 92861633 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 92861734 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 92861815 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 92861834 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92861881 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92861921 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 92861933 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 92861958 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 92862020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92862085 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 92862088 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 92862174 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 92862380 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 92862532 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92866240 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 92866651 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 92867176 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 92867832 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 92868134 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92868462 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 92868636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92869306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92869749 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92870071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92870137 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 92870283 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92871821 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92872253 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 92872266 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 92872392 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 92872399 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 92872451 T A Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 92873010 A G Y Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.454545454545455 0.363636363636364 0.181818181818182 14 8 5 4 2 3 92874175 T A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 92874374 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 92874397 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 92875445 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92875720 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 92876193 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 92876385 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 92877242 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 92877275 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 92877848 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92877869 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92877955 G C Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 92877959 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 92877974 G C Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 92878000 C G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 92878002 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 92878033 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 92878053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92878060 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 92878251 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92878263 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 92878305 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 92878342 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 92878348 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 92878353 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 92878368 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92878389 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 92878417 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 92878426 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 92878436 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 92878437 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 92878543 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 92878545 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 92878631 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92878646 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92878708 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 92878718 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 92878784 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 92878796 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 92878915 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 92878960 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92879049 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 92879060 G A N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 3 92879232 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 92879354 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92880071 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92880312 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92880427 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 92880443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92880603 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 92882126 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92882160 T A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 92889793 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 92889833 C G Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 92890525 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 92890752 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 92890774 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92890834 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 92891711 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 92891787 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 92891878 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 92891913 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 92891999 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 92892018 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 92892224 C G Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 92892234 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 92894704 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92894861 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92894929 T G Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 92895032 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92896213 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92896710 G A Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 3 92896776 T A Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.0588235294117647 0.764705882352941 0.176470588235294 15 19 1 13 3 3 92896889 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 92897214 T A Y N 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 12 6 5 2 2 3 92897448 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 92897540 A C N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 92897922 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92899308 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 92899916 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92901295 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 92902933 T C Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 92904489 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92906136 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92907034 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92907096 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 92915233 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92915381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92919727 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 92919896 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 92920485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92920843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92920861 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92920999 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 92921000 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 92921112 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 92921180 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 92921209 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 92921253 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92921565 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 92921958 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 92921980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92922461 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92922550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92922612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92922685 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 92922716 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92922819 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92923247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92923497 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 92923718 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92923764 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 92923798 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 92923913 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 92924012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92924348 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 92924641 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92924707 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 92924820 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92924879 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92924962 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92925101 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 92925554 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92925723 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 92925724 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 92926114 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 92926414 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 92926439 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 92927331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92928493 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92928733 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92928846 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92929344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92929989 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92930082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92932332 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 92934316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92934937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92935173 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92935197 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92935290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92935655 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92936081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92936169 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 92936331 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 92936332 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92936460 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 92936494 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 92936656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92936818 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 92936856 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92936960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92937013 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 92937134 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 92937164 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 92937363 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 92937497 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 92937498 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92937586 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 92937592 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92937649 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 92938152 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 92938180 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 92938297 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92938341 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92938421 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92938494 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92938630 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 92938685 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 92938842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92939327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92940784 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 92940964 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 92941077 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 92941090 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 92941235 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92941443 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92941445 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 92941489 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92941675 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92941706 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92942049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92942266 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 92942532 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 92942539 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 92942658 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92942824 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 92943538 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 92943870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92944079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92944391 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 92944508 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 92944925 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 92944965 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92945265 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92945266 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92945861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92947810 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 92948822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92949105 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 92949134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92949163 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 92949385 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92949450 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 92949456 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 92949465 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 92949531 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 92949618 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 92949623 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 92950099 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 92950417 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 92950484 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 92950944 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92950950 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 92950987 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 92951157 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92951192 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 92951294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92951364 G T Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 92951437 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 92951567 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 92951573 A G Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 92951586 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 92951631 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 92952040 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 92952140 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92952149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92953323 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 92953583 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92953751 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 92953856 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92953884 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 92954136 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 92954402 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 92955162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92955368 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 92955505 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 92955903 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 92956290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92956409 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 92956412 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 92956794 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 92956986 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 92957000 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 92957763 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 92958253 G T N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 92958788 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 92958795 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 92958928 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92959630 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 92959642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92959839 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 92959932 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 92960069 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 92960252 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 92960445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92960489 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 92960515 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 92960534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92961124 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 92962760 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 3 92963211 C G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 92963452 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 92963563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92964191 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 92964211 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 92964382 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92964399 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92964620 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 92964624 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 92964639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92964842 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 92965073 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 92965417 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 92965666 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 92966301 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 92966917 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 92968187 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 92968299 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92968735 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92968907 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 92969060 C T N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 3 92969128 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 92969856 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 92970120 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 92970150 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92977310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92980165 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92980192 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 92980585 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92981812 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92982806 T G Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 92984973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92986601 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92989130 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92993995 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 92995451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 92997198 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 92999465 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93002065 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93002816 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93023836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93028847 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93029760 T C Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 93035092 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 93035215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93037037 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93038310 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93043607 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93045388 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93046863 T A N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 93048227 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93049080 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93050620 T G N N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 8 8 2 4 2 3 93050750 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.266666666666667 0.666666666666667 0.0666666666666667 18 12 4 10 1 3 93051931 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 93051957 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 93051991 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 93053078 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93053866 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93053873 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 93054380 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93057040 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93057109 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93058080 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 93058750 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93058991 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93059251 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 93060423 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93061819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93065630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93065810 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93066426 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93067023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93071701 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93074529 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93077694 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93078434 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93078463 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93078627 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93078968 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93079396 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93079895 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93080240 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93080331 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93083217 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93083270 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93083519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93083647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93084088 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93096925 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93097014 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93097039 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93097071 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93100085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93100124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93102525 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 93102567 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93102860 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 93105040 C T Y Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 3 93105076 C T N Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 5 9 1 3 3 3 93105082 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 3 93105088 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 3 93107872 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93112459 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93113816 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93115234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93115555 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93116112 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93116255 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93116509 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93120543 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93124680 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93135883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93137066 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93137159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93137169 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93140101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93140353 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 93140398 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 93141990 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 93143271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93143870 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93144381 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93145215 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93147580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93147912 C A N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 93150281 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 93151027 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93151133 G T Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 93151143 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93151595 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 93151669 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93152576 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93155206 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93155363 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93156730 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 93156867 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93157224 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93157589 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93157611 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 93158793 T A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 93161792 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93162573 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93163394 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93163413 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93163418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93163424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93163465 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93163561 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93163695 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93163889 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 93164390 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93164522 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 93164917 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93165111 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93165461 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93165604 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93167165 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93167178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93168776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93168942 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93169345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93169718 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 93169840 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93170032 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93170080 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 93170352 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93171018 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 93171024 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 93171036 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 93171068 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 93171144 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 93171165 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 93171178 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 93171180 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 93171988 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 93172008 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93172142 T A N N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.363636363636364 0.363636363636364 0.272727272727273 12 10 4 4 3 3 93172365 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 93172382 C T N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 93172902 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93172991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93173010 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 93173283 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 93173287 C A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 93173738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93175792 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93176515 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 93176829 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93177196 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93177198 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93179078 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93179540 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93180121 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 93180928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93181679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93181726 T G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 93181875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93181887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93181981 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 93182446 G T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 93182689 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 93182827 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 93183016 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 93183245 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93183286 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93183881 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93184712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93184806 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93184914 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93184928 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 93184973 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 93185171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93185252 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93185527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93185582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93185732 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93186017 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93186200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93186421 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93186667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93186979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93187177 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93187361 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 93187454 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 93187529 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 93187742 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93187822 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 93187890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93188181 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 93188326 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 93188392 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93188777 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 93189229 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 93189256 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 93189524 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 93189818 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93189994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93190167 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 93190172 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 93190206 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 93190547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93191313 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93191442 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 93191760 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93191766 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 93191780 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93191788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93191953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93191994 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 93192009 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93192070 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 93192156 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93193113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93193269 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93193625 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93193659 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 93193816 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93193848 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 93194030 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93194089 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 93194168 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 93194384 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 93194398 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 93194540 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 93195270 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 93195315 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93195372 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 93195392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93195427 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 93195431 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 93196062 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 93196088 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 93196120 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 93196190 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 93196272 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 93196826 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93197765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93197780 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 93197805 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 93201931 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93204711 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 93206606 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 93206785 A C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 93206801 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 93206876 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 93206883 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 93207752 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93207995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93208030 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93208501 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 93208622 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 93209186 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 93209350 G A N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 3 93209422 T A N N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 3 93210154 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 93210184 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 93210802 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93211118 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93211185 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 93211300 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 93211799 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 93212048 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93212558 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 93214491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93214978 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 93214979 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 93215375 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 93217015 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 93217041 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 93218835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93218983 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93219161 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 93219416 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93220911 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93222590 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93222634 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 93222980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93223316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93225965 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93226580 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93226679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93226693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93226718 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93226813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93226866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93226924 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93226931 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93226950 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93226970 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93227006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93227128 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 93227251 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93227278 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 93227296 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 93227398 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93227469 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 93227496 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93227595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93227607 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 93227717 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93228029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93228219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93229511 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 93229589 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93229617 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93230057 A G N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 3 93230552 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93230751 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 93230778 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93231108 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93231335 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 93231478 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93231800 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 93231892 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 93231917 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 93232305 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 93232628 A G Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 93232771 T C Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 93232849 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93233349 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 93233384 A T Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 93233385 A T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 93233772 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93234094 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93234096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93234111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93234117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93234205 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93234526 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 3 93234595 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93234609 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 93234666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93234822 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 93234842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93235951 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93235972 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93236034 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93236263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93237697 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 93237716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93238254 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93238255 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93238719 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 93238724 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 93238989 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93238992 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93239541 C A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 93240680 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93240766 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93241046 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93241090 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93241106 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93241207 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93241256 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93241285 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93241681 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93241775 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93241926 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 93242121 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93242369 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93243075 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93243478 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93243482 G T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 93243711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93243761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93243877 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93244172 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93244182 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93245108 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93245209 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93245330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93245336 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93245375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93246088 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93246208 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93246781 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93246841 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93246849 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93247336 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93249141 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 93250052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93250199 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93252542 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93252844 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93253059 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 93253681 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93253802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93254882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93256831 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93256885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93257076 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93258423 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93259735 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93260039 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 93265145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93265397 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 93265417 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 93265423 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 93265567 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93265570 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93265679 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 93266369 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 93266430 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93266455 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93266471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93266557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93266606 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93266625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93266653 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93266709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93266758 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93266759 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93266887 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93266890 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93266924 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93266964 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93266982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93266989 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93266998 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93267007 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93267054 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93267100 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 93267121 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 93267271 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93267445 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93267462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93267531 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93267606 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 93267662 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93267861 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 93267866 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93267894 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93267908 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93267977 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93268105 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93268954 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 93269268 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93269425 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93269931 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 93270695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93271417 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93271420 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93271588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93272106 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 93272126 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 93272248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93272694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93273152 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 93273569 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93273585 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 93273620 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 93273621 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 93273965 T A N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 93274532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93274753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93275031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93275049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93275139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93275281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93275590 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93275667 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93275784 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93275853 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93275879 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93275948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93275953 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 93275963 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 93276064 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 93276084 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 93276131 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93276443 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93276471 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93276561 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93276941 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93277298 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 93277330 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 93277652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93277661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93277839 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 93278049 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 93278283 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93278451 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 93279376 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 93279542 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93280441 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 93280614 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 93280819 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 93281069 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 93281250 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 93282236 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 93282315 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 93282334 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 93282383 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 93282428 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 93282437 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93282497 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 93282579 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 93282599 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 93282612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93282684 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 93282716 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 93282752 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 93282790 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 93282801 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 93283285 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 93283348 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 93283396 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 93283397 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 93283415 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 93283419 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 93283448 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 93283498 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 93283514 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 93283606 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 93283718 T A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 93283791 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 93283888 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 93284006 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 93284125 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 93284235 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 93284295 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 93284427 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 93284475 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 93284591 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 93285010 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 93285026 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 93285064 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 93285068 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 93285106 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 93285112 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 93285133 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 93285142 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 93285177 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 93285201 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 93285218 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 93285244 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 93285246 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 93285291 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93285316 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 93285430 A T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 93285440 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 93285686 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 93285759 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 93285900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93285946 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 93286111 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 93286126 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93286191 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 93286204 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 93286214 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 93286235 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 93286245 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 93286347 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 93286437 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 93286550 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 93286658 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 93286659 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 93286695 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 93286698 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 93286809 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 93286841 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 93286844 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 93286915 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 93286948 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 93286964 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 93286989 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 93286992 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 93287024 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 93287141 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 93287153 G A N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 3 93287185 A G N Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 11 9 3 5 2 3 93287200 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.25 0.333333333333333 0.416666666666667 10 14 3 4 5 3 93287202 A G N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 3 93287278 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 93287312 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 93287420 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 93287556 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 93288221 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93288382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93288751 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93288868 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 93289007 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 93289098 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 93289170 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 93289611 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 93289725 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93289833 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 93290873 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93294560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93296456 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 93300139 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93302589 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93303639 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93305048 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 93305958 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93306990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93309185 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93312506 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93313203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93315190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93315446 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 93315465 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93315674 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 93315804 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 93316601 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 93317418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93322386 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 93324486 G C N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 93324593 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 93324645 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 93324661 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 93324670 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 93324679 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 93324756 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 93324795 A C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 93324824 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 93324850 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 93325177 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 93325246 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 93325251 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 93325272 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93325422 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 93325497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93325508 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 93325646 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 93325931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93325935 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 93326130 T A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 3 93326244 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 93326261 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 93327456 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 93327507 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93327815 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 93327872 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93328125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93330177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93330256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93330292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93330742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93331617 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93332575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93332750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93334226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93334610 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93336298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93336974 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93339661 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93341280 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93341309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93342795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93344075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93344527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93344838 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93344936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93345537 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93346545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93346776 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93346807 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93347093 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 93347172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93349583 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 93349708 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 93349790 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 93349888 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93350046 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93350248 G A N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 3 93350366 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 93350409 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93350519 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93350585 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93350816 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93351536 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 93352638 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 93353722 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93355911 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 93357159 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 93357162 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 93357363 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93357726 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93357824 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 93357873 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 93357887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93357907 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 93357984 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93358021 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 93358203 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93358640 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93359357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93359741 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93359935 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 93361263 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93361270 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 93361274 G T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 93361682 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 93361888 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 93362299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93362672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93362807 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 93364243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93364768 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 93365591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93366694 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93367182 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93367293 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93367760 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 93367775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93367781 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 93367946 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 3 93368088 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 93368263 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 93368323 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 93369139 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 93369589 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 93369609 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 93369918 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93370137 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93370178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93370926 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 93371148 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 93371248 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93371652 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 93371784 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 93371867 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 93371920 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 93371927 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 93372653 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 93373161 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93373522 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 93373696 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93373741 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93373759 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93373770 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 93373771 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93373887 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93373991 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 93374042 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 3 93374115 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93374246 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 93374267 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 93374307 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93374316 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 93374379 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 93374469 C A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 93374488 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 93374503 C T N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.142857142857143 0.642857142857143 0.214285714285714 13 15 2 9 3 3 93374568 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 93374652 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 93374823 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 3 93374905 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 93374958 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 93375066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93375107 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93375236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93375275 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93375393 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 93375402 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93375427 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93375505 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93375517 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93375568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93375805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93375821 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93375827 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93376016 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93376722 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 93376878 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 93376977 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93377018 C G N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 3 93377090 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 93377112 T G N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 93377165 C T Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 93377291 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 93377292 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 93377488 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 93377721 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93377797 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 93377814 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93377888 A T Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 3 93378084 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93378147 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 93378234 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 93378242 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93378252 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93378259 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93378299 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 93378322 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93378416 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 3 93378542 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93378702 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 93378795 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93378812 C G N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 93378962 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93379002 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 93379070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93379222 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93379243 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93379250 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93379472 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 93379569 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93379596 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 93379618 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93379644 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93379663 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93379716 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93379824 C G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 93379852 C T N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 93380021 A T N N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 93380159 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 93380328 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 93380360 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 93380552 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 93380567 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 93380579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93380627 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93380653 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 93380715 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93380830 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93380888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93380918 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93380955 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 93381015 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93381385 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 93382588 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93382824 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93384118 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93385369 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93385890 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93387662 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 93387913 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93388809 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 93389010 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 93389095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93389264 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 93390493 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 93390689 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 93390694 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 93390732 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 93390784 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 93391048 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 93391099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93391127 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 93391527 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93391530 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 93391703 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 93391937 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93391988 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93392382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93392596 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93392646 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 93392747 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 93393143 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93393192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93393568 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93393866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93393879 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 93394039 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 93394266 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 93394336 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93394399 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93394416 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 93394417 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 93394458 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93394859 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 93394977 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 93395324 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 93395388 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93395394 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 93395581 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 93395639 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 93395981 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 93396047 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 93396063 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 93396370 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93396379 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 93396494 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 93396498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93396539 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 93396555 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 93396602 G C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 93396654 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 93398023 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 93398729 A T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 93398806 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 93399332 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 93399562 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93399763 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 93399817 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 93399870 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 93400025 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 93400194 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 93400815 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93401042 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 93401550 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93401840 T A Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 93402403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93404460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93406216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93406327 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93408431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93409184 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93411567 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93413134 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93413175 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 93413235 A C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 93413245 G T Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 93413372 T G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 93413494 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 93413590 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 93413704 G C N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 93413714 T C Y Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 3 93413805 A C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 93413867 C T Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 93414049 G A Y Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 3 93414370 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93414668 A T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 93415915 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 93415982 G A Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 93416048 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93416350 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 93424639 T C Y Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 15 13 1 13 0 3 93424678 T C Y Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0 1 0 15 15 0 15 0 3 93425127 C A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 93425438 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 93427600 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93427669 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93427706 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93428657 T C Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 93428938 T A Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 93429225 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 93429233 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 93430146 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 93430237 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93430247 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93430651 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93431013 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93431130 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 93431131 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 93431305 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 93431393 T A Y N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 93431558 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93431593 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 93431594 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 93431621 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 93432402 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93434227 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 93434296 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 93434327 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 93434427 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 93435057 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93435405 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93435529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93436068 A T Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 93436134 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 93436155 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 93436836 T C Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 93436892 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 93437356 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 93437373 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 93437616 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 93437686 G T Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 93437720 G A Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 93437825 T A Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 93438378 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 93438386 A G Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 93438721 C G Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 93438769 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93438791 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93438874 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93439169 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93439212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93439567 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 93439682 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 93440347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93440560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93440881 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 93440983 G T N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 93441076 G T Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 93441229 T A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 93441381 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 93441635 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93441709 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93442037 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93442481 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93442730 C G Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 93442732 T C Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 93443736 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93443785 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93443978 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93444120 G A Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 93444145 G A Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 93444595 C T Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0 0.722222222222222 0.277777777777778 13 23 0 13 5 3 93444852 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93445258 C T Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 93445362 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 93445711 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 93446259 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93446621 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93446626 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93446633 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93446645 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93447132 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93447357 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93447609 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93447648 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93448283 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93448633 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93448638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93448775 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93449006 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93449206 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93449269 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93449516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93449727 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 93449735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93449967 G A Y Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 12 10 1 10 0 3 93450021 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 93450508 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 93450509 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 93451146 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93451267 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93451795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93451817 G T Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 93451829 T C Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 93451842 A T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0 0.6875 0.3125 11 21 0 11 5 3 93451875 C T Y Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.416666666666667 0.583333333333333 0 17 7 5 7 0 3 93451920 T G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 93452343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93452349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93452379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93452387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93452464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93452466 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93452491 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93452524 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93452689 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 93452717 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93452986 C G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 93453213 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 93453253 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93453277 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93453648 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93454116 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93454230 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93454454 T C Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 93454692 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93454957 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93455009 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93455010 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 93455326 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93455509 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93455555 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 93455930 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93456254 G C Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 93457018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93457900 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 93457904 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93457965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93458076 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93458242 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93458376 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 93458436 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 93458499 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93458529 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93459268 G A Y Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 3 93459272 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 93459332 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93459360 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93459436 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 93459450 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93459583 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93459743 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93459798 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 93459816 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 93459873 C A Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 93459885 G A Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 93460195 G A Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 93460298 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93460393 A G Y Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 93460464 G C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 93460475 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93460488 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93460545 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 93460617 C T Y Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 93460637 G C Y N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 93460999 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 93461003 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 93461028 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 93461036 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 93461111 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 93461311 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 93461368 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 93461374 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 93461570 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93461594 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93461714 A C Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 93461726 T G N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 93461727 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 93462032 C A Y N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 3 93462273 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93462409 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 93462547 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 93462551 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93462593 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93462913 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93463017 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93463117 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93463130 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93463135 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93463257 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 93463428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93463637 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93463668 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93463971 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93464018 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93464135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93464190 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93464296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93464368 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93464408 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93464471 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93464577 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93464657 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 93464681 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 93464779 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93464821 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93464952 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 93464955 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 93464976 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93464978 G A Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 93465021 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93465231 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 93465315 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 93465524 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93465788 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93465973 C T Y Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 3 93466005 A C Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 93466036 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93466040 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93466056 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93466091 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93466094 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93466105 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93466137 C A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 93466166 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 93466199 A G Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 93466843 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 93466851 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 93467091 C T Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 93467165 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 93467175 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 93467206 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 93473309 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93473732 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 93473775 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 93473778 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 93473922 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93473933 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 93473978 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93474108 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93474143 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93474173 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93474220 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93476112 T C N Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 3 93476126 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 3 93476148 T G Y N 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 11 9 2 7 1 3 93476151 C G Y N 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 11 9 2 7 1 3 93476182 G A Y Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.0769230769230769 0.615384615384615 0.307692307692308 10 16 1 8 4 3 93476414 A T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 3 93476420 G C N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 3 93476669 G A Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 3 93476744 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 3 93476766 A G N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 13 7 4 5 1 3 93476834 T C Y Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 10 14 0 10 2 3 93476892 G C Y N 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0 0.818181818181818 0.181818181818182 9 13 0 9 2 3 93476896 T C Y Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.181818181818182 0.636363636363636 0.181818181818182 11 11 2 7 2 3 93477020 T C Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 3 93477067 A T Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 93477075 A T Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 93477169 G T Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 3 93477172 T C Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 3 93477282 G T N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0 0.692307692307692 0.307692307692308 9 17 0 9 4 3 93477548 T A Y N 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 8 6 1 6 0 3 93477602 T C Y Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 3 93477703 G A Y Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 6 8 0 6 1 3 93478552 G A Y Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 93478592 T C N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 93478768 T C Y Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 93478798 A C Y N 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 3 93478834 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 10 8 1 8 0 3 93478837 C T Y Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.111111111111111 0.777777777777778 0.111111111111111 9 9 1 7 1 3 93478882 A G Y Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0 0.642857142857143 0.357142857142857 9 19 0 9 5 3 93478888 T A Y N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 3 93478973 T C N Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0 0.8 0.2 4 6 0 4 1 3 93479125 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 93479171 G C N N 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0 0.9 0.1 9 11 0 9 1 3 93479184 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 10 8 1 8 0 3 93479261 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 3 93479367 G A Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 93479418 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.0555555555555556 0.833333333333333 0.111111111111111 17 19 1 15 2 3 93479475 G C Y N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 93479484 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93479694 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 3 93479704 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 3 93479716 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 93479799 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 16 20 0 16 2 3 93482501 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 3 93482550 A C Y N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 3 93482784 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 93482838 A C Y N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 93483651 A C Y N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 3 93483820 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 93484328 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 93484460 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 3 93484486 G A Y Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0 0.615384615384615 0.384615384615385 8 18 0 8 5 3 93485643 A C Y N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 10 22 0 10 6 3 93488745 A C Y N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.125 0.75 0.125 8 8 1 6 1 3 93489455 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93489588 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93489645 G C Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 93489659 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 93489703 T A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 93489738 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93489930 C A Y N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 93489983 T C Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 93490165 G T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 93490342 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 93490617 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 93490671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93490945 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 93492218 A C Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 93492342 G A Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 93561114 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93561912 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93562184 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93562217 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 93563259 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 93571264 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93571698 A G Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 3 93571744 G A Y Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0 0.916666666666667 0.0833333333333333 11 13 0 11 1 3 93577022 A T Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 3 93579553 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 93591844 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93616682 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93616690 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93620748 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93633037 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93634161 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 93634225 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 93634295 A G Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 93634308 G A Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 19 17 1 17 0 3 93634440 T A Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 3 93635002 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93635010 G T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.2 0.75 0.05 23 17 4 15 1 3 93635029 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.105263157894737 0.842105263157895 0.0526315789473684 20 18 2 16 1 3 93635683 T G Y N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 93635720 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93635765 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 3 93635888 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 3 93636283 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93637092 T G Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 3 93638236 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93638282 G C Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 93638866 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93639066 G C Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 93639074 T G Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 93639163 G A Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 3 93639783 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93639833 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93643357 C G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 93644325 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 93644342 G C Y N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.307692307692308 0.615384615384615 0.0769230769230769 16 10 4 8 1 3 93644350 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 93644478 T A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 93644501 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93644664 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93644737 C G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 93644745 G T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 93645090 T A Y N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 93645262 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 93645296 A G Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 93645363 C T Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 93645376 A G Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 93645434 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 93645760 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 93645784 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 93645851 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93645857 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93645990 G C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 93646015 C G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 93646150 C T Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 93648786 T C Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 93649501 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 93655676 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93655714 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93655832 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 3 93655844 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 3 93655975 G A N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.133333333333333 0.8 0.0666666666666667 16 14 2 12 1 3 93656088 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 93656116 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 93656309 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 93656427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93656513 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93656630 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93658666 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93658709 G C Y N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0 0.933333333333333 0.0666666666666667 14 16 0 14 1 3 93659355 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93660204 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.05 0.85 0.1 19 21 1 17 2 3 93662303 T A Y N 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0 1 0 11 11 0 11 0 3 93662336 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 93662366 C T N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 16 14 1 14 0 3 93662376 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.0625 0.9375 0 17 15 1 15 0 3 93662563 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93662631 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93663269 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93663764 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93663805 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93667596 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93668300 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93670587 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93670604 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93671725 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.105263157894737 0.842105263157895 0.0526315789473684 20 18 2 16 1 3 93671742 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93671860 C A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 93672000 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93672331 C G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 93673332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93673341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93673504 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93673507 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 93673829 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93673837 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93675686 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 93676335 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 3 93676410 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93680306 C A Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 93680609 A G Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 93685300 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93736123 A C Y N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 93753269 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 93786992 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93791229 A T Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 93817009 T C Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 93824249 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93831472 T A Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 93831736 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 93831770 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93832384 T A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 93834297 A T Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 93843313 A G Y Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0 0.9375 0.0625 15 17 0 15 1 3 93844847 A G Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 93848103 A T Y N 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0 1 0 7 7 0 7 0 3 93850719 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 93850755 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 93856002 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 93856099 G A Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 16 14 1 14 0 3 93856111 A C Y N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 93856213 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.0526315789473684 19 19 1 17 1 3 93856231 A T Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0 0.944444444444444 0.0555555555555556 17 19 0 17 1 3 93856245 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.0526315789473684 19 19 1 17 1 3 93873150 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 93880082 A G Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 93880203 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93885419 T G Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 93885899 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 93893005 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 93893036 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 93901963 T C Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 16 20 0 16 2 3 93905164 G A Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 93905214 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.157894736842105 0.789473684210526 0.0526315789473684 21 17 3 15 1 3 93905221 T G Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.166666666666667 0.777777777777778 0.0555555555555556 20 16 3 14 1 3 93905854 G T Y N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 16 14 1 14 0 3 93905901 G C Y N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 93906003 A G Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 93906015 A G Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 93906020 G T Y N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 3 93906335 T A Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0 0.944444444444444 0.0555555555555556 17 19 0 17 1 3 93906343 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0 0.944444444444444 0.0555555555555556 17 19 0 17 1 3 93906404 T G Y N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0 1 0 17 17 0 17 0 3 93906447 T C Y Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0 1 0 14 14 0 14 0 3 93906462 G A Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 3 93906506 A G Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.0625 0.9375 0 17 15 1 15 0 3 93906517 G A Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 3 93906529 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93907743 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 93910512 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 93910594 C T Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 93911689 G A Y Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 12 16 0 12 2 3 93919283 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93919862 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93919866 G C N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0 0.8125 0.1875 13 19 0 13 3 3 93920681 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0 0.85 0.15 17 23 0 17 3 3 93920701 C A Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0 0.842105263157895 0.157894736842105 16 22 0 16 3 3 93920733 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 93920777 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0 0.894736842105263 0.105263157894737 17 21 0 17 2 3 93922180 C T Y Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.230769230769231 0.769230769230769 0 16 10 3 10 0 3 93922206 T C Y Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 14 12 1 12 0 3 93926116 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93928395 C T Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 19 17 1 17 0 3 93928633 G C Y N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.230769230769231 0.769230769230769 0 16 10 3 10 0 3 93928634 G A Y Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.25 0.75 0 15 9 3 9 0 3 93929807 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 93929814 A G Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 16 14 1 14 0 3 93929861 A G Y Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0 1 0 15 15 0 15 0 3 93930222 T C N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0 1 0 13 13 0 13 0 3 93930303 T G Y N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 16 14 1 14 0 3 93932413 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93932679 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 93932794 G C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 93932977 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93933001 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 93933002 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 93933561 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 93933776 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 93934587 A G Y Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0 1 0 13 13 0 13 0 3 93939308 G A Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 3 93983756 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 93983781 A T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 93983829 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94004335 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 94004611 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 94006714 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 94007293 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94008281 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94014047 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 94021374 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94026448 T C Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 94026554 T A Y N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 3 94026615 G T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 94027107 T C Y Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 3 94034096 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94034133 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94035903 G C Y N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 3 94036007 G T Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 94037774 T C Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 94038115 G A N Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 3 94041709 A T Y N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 94043594 G T Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 94047479 T G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 94047503 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94048459 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94049416 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94053337 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94054794 T A Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 94054843 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 94055204 A G Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 94055779 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94056781 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94058984 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 94060380 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94060986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94061012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94061472 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94062253 G C Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 94063010 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94063817 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 94064352 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 94064523 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94064875 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94066588 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 3 94066682 C G Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 3 94066746 T G Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.105263157894737 0.894736842105263 0 21 17 2 17 0 3 94067758 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 94068692 G T Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 3 94068699 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 3 94068773 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 94068799 G C Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 3 94068925 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94069266 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 94071025 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94071078 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94071880 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94080956 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94080958 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94081069 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 94081555 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 94082492 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94082577 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 94084251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94084369 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94086303 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 94086514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94094601 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94096878 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94101941 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94102014 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94102581 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 94105073 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94109533 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94110496 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94112104 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 94114461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94116187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94116491 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94116637 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 94117029 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94117238 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 94118312 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94118886 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 94119051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94119150 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94119163 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94120804 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94121702 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94122109 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 94123155 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94123334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94123364 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94124667 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94124747 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94125426 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94125625 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94125967 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94126177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94126366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94127244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94127291 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 94127361 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94127716 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94127851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94128701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94128929 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94129411 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 94129431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94129506 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94129530 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94129570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94129678 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94129781 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94132522 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 94132523 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94132606 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94132758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94134548 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94135020 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94135744 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 94137148 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 94137279 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 94139519 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 94140224 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94142255 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 94142298 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94142428 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 94142445 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 94143878 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94144887 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94144892 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94145022 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94145322 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94145558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94146276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94147889 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94149689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94150455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94154600 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 94155807 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 94155901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94155902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94156582 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 94157330 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 94157431 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 94157450 C G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 94157487 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 94158028 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94158494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94159225 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 94159259 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 94160755 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 94161194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94161216 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 94161322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94162684 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 94162810 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94163897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94163949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94164303 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94164343 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94166240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94166579 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94166602 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94166613 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94166761 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94166764 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 94166784 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94166848 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 94166858 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94167032 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94167042 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 94167107 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 94167169 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94167485 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94167523 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 94167576 C A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 94168095 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 94168152 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94168719 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 94169149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94170457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94172881 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 94173277 T C Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 94173977 A C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 94175225 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94175395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94175551 A C Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 94175566 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94175937 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94176109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94176214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94177218 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94178593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94179457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94180179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94183704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94184458 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94185395 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94185439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94185732 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 94186052 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94186622 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94186755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94187997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94188066 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 94188160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94188177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94189678 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94189759 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94190612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94190655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94190969 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 94192368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94194420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94196055 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94196075 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94196155 G C Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 94196544 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94196663 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94197008 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 94197489 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 94197687 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94197724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94197743 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94197890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94197951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94197984 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94198382 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94198558 T C Y Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 5 7 0 5 1 3 94198625 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 94198667 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94198689 T G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 94199666 T C Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 94199789 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94200020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94200248 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 94200277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94201128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94201946 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 94202552 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94202803 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94203307 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94203431 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94203603 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94203705 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94203730 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94203797 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 94203910 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94204219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94205473 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 94205517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94205719 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94205725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94207712 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94207865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94208213 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94208324 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 94208356 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94208464 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94208892 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94210090 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 94210641 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94211553 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94211693 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 94213624 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94214418 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 94215772 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 94215794 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 94216662 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 94218291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94218408 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94218873 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94220967 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 94221948 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94227291 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94230969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94231960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94232448 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94233484 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94234078 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94235795 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94239851 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94240931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94245078 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 94245891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94246950 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94248749 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94249068 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 94249431 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94249922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94251018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94251668 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94255658 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94256768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94262775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94263928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94264372 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 94264400 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 94264455 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 94264958 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 94265009 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 94265055 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 94265669 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94270140 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94270704 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 94272204 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94272662 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 94274496 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94275364 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94276295 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94276464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94276900 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 94278904 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94279931 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94280297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94280843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94282012 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 94282514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94284935 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94285524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94287817 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94291825 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94292182 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 94293121 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94293615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94294552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94296841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94299138 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94299517 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94302110 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94302427 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94304040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94304942 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94305314 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94307918 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94309843 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94310068 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 94310262 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94314668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94315139 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94315984 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94319674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94322353 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94322801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94323198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94324459 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94324922 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94325714 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94325745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94325780 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94326353 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94326380 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 94328237 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94329238 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94329815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94329907 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94337226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94338188 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94338396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94340306 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94340552 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 94340787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94340874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94342040 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 94346603 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94346876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94347236 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 94347638 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94348627 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94349232 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94349831 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94349906 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94350632 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 94352757 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94353147 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94360824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94361790 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 94363837 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94364402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94367134 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94367203 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94369286 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94369500 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 94370668 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94370813 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 94374794 T G Y N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0 0.823529411764706 0.176470588235294 14 20 0 14 3 3 94375309 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94378497 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94378968 A T Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 94381520 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94381780 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94383769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94383784 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94384340 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94384378 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94384796 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94387320 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94391097 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94392969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94394086 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94395270 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 94400070 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 94400847 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 94401059 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 94401332 G A N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 3 94401392 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 94402029 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 94403631 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 94403705 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 94404238 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94404410 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94404660 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 94405331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94405495 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94407174 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 94407743 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94407810 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 94407821 C T Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 94407833 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 94407958 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 94408572 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 94409163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94409954 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 94409977 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 94410115 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 94410219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94410240 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94410264 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94411999 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 94412504 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 94413151 T A N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 3 94414896 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 94416090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94417074 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94417315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94417945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94420700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94420811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94421623 T C Y Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 94422592 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 94422857 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94426802 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94428140 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 94429473 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94430743 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 94431050 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 94433092 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 94433177 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 94433359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94435542 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94435561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94435672 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94435778 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94435783 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94436084 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 94436589 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 94437149 A G N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 94437150 A G N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 94438242 C T Y Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0.5 0 0.5 2 2 1 0 1 3 94438998 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 94439012 G A Y Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0 0.923076923076923 0.0769230769230769 12 14 0 12 1 3 94439044 T C Y Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0 0.615384615384615 0.384615384615385 8 18 0 8 5 3 94440292 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 94440319 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 94440603 A T N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 94440614 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 94440623 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 94440834 T C Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0 0.823529411764706 0.176470588235294 14 20 0 14 3 3 94441157 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 94441297 T A Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 94441360 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 94441377 C T Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0 0.705882352941177 0.294117647058824 12 22 0 12 5 3 94441626 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 94441766 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 94441904 C G Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 3 94442161 C A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0 0.823529411764706 0.176470588235294 14 20 0 14 3 3 94442580 G C Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 3 94444629 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 94445235 A T Y N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 3 94445479 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 94445889 C T Y Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.181818181818182 0.818181818181818 0 13 9 2 9 0 3 94446960 C T N Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 7 7 2 3 2 3 94447468 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 94447768 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 3 94450445 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94451133 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 94452552 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0 0.75 0.25 15 25 0 15 5 3 94452558 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94452564 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0 0.8 0.2 16 24 0 16 4 3 94452641 T A Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 94452656 T A Y N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 3 94455009 C T N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 94455690 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 94456472 A G Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 94456532 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 94456598 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 94459039 A T Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 3 94459120 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 94460651 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94460919 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94463317 A C Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 94463328 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 94463403 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 94463551 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 94463958 C G N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 3 94463984 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 94464025 C A N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 3 94464164 G C N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 94464226 C A Y N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.636363636363636 0.181818181818182 0.181818181818182 16 6 7 2 2 3 94464288 C G N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 94464716 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 94465652 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94469764 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94469773 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 3 94470162 A T Y N 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0833333333333333 0.666666666666667 0.25 10 14 1 8 3 3 94470185 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 3 94470207 C A Y N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 3 94470291 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 3 94470934 T G N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 94471725 G T Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 94472158 T G Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 94474234 C G Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 94474251 C G Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 94476037 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94476670 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94476836 A G Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 94478068 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94478823 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 94479728 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 94480754 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 3 94482283 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94482329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94483374 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94485402 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94486300 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 94486527 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94486544 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94486558 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94486751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94488669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94488835 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94489640 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94491266 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94492102 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 94493050 A G Y Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 3 94494038 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 94494198 G A Y Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 3 94495347 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 94495515 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94495730 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94495816 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 94496014 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94496652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94498077 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 94499300 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94500797 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94500829 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94502304 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94505163 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94505528 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94506574 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94507927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94508126 T C Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 94508276 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.05 0.7 0.25 16 24 1 14 5 3 94508840 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 94508951 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 94509060 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 94509488 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 94509771 A G Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 94512159 G A N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 94516161 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 94516550 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 94519073 C T Y Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.0714285714285714 14 14 1 12 1 3 94519121 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 94519216 G A N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 3 94519231 G T N N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0 0.6 0.4 6 14 0 6 4 3 94519235 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 6 12 0 6 3 3 94519244 A C N N 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0 0.75 0.25 6 10 0 6 2 3 94519330 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0833333333333333 0.666666666666667 0.25 10 14 1 8 3 3 94519474 A G Y Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 5 7 0 5 1 3 94519671 C A Y N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 94520377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94522748 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 94525551 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 94525931 T C Y Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 0.0909090909090909 13 9 3 7 1 3 94526364 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 94526518 A T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 94526557 G T Y N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.153846153846154 0.846153846153846 0 15 11 2 11 0 3 94526673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94526878 A T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 94527483 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 94528005 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 94528063 T G Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 3 94528567 A G Y Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 3 94528677 A G Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 94528716 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 16 20 0 16 2 3 94528768 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 94528826 G A Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 94536337 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 94536340 C A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 94536353 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 94536356 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 94536434 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 94536442 G A Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 16 12 2 12 0 3 94536471 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 94536678 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 94536685 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 94536690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94536794 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 94536809 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 94536842 T G N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 94536881 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 94537075 G A Y Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 94537689 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 94537940 A T Y N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 94538289 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 94538539 T G Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 94539086 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 94539101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94539452 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 94539528 T C Y Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 3 94541583 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94541713 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94541770 A G Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 94542219 G T Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 94543340 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94543662 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94545138 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94545431 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 94546010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94546160 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 94546168 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 94547157 T C Y Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 9 7 2 5 1 3 94547190 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 94547273 T A Y N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 8 8 2 4 2 3 94547288 T A Y N 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 7 11 2 3 4 3 94547340 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 3 94547698 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 94548737 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94548895 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 94548987 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94549087 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94549218 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 94549221 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 94549366 A C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 94549449 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94550099 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94551246 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 94551277 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 94552127 G T Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 94552268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94552412 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94552601 A G Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 94552850 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 94553091 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94553394 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 94553460 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94553491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94553524 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 94553799 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 94553804 A G Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 94553813 C G Y N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 3 94553826 G A Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 94554656 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94555034 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94555675 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 94556074 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 94556840 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 94557031 G A N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 94557208 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 94557355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94557583 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 94558195 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94558254 G A N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 3 94559307 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 94559839 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 94560059 G T Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 94560108 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94560370 A C N N 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 9 11 2 5 3 3 94563722 C G Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 3 94568798 A C Y N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 94569017 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94569800 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 94569807 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 94569936 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 94570007 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 94573766 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94573875 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94574856 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 94576228 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 94578646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94578766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94579700 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94580500 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94584683 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 94586124 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 94586312 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 94587165 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94587924 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 94589407 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94592035 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 94598280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94600642 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94600939 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 94602434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94603517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94603530 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 94603674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94604266 A G N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 3 94604643 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 94604881 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94605079 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 94605094 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 94605431 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 94605720 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94605875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94606155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94606683 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94606717 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 94606740 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94606807 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94607111 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94607189 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 94607264 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94607539 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 94607561 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 94608308 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 94608668 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 94608811 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 94608981 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 94609493 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 94609860 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 94610728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94612102 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94612442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94614322 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94614434 A C Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 94614892 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94614912 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94615156 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94615278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94616470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94616504 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94616520 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94619276 G A Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 94619718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94619974 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94621088 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94622438 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 94625317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94625367 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 94628103 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 94631222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94632140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94635476 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 94636101 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94637316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94637392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94638192 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94638961 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 94639135 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 94639380 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 94639409 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 94639696 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94639782 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94639863 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 94639894 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94640448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94640712 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 94640820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94641138 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 94643229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94643409 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94643417 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 94643430 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 94643508 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 94643772 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94643870 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94644178 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 94644297 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94644417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94644420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94644441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94644555 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94644770 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94644836 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 94644941 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 94645027 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94645192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94645342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94645383 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94645564 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94645593 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94645712 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94645714 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94645794 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94646360 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94646509 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94646593 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94646820 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94646831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94646843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94646890 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94646994 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94647026 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94647090 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 94647104 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94647198 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94647242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94647283 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94647385 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94647681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94647698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94648412 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 94648601 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94649198 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94649420 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94650146 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94650375 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94651570 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94652080 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 94653288 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94653376 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94653947 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94654091 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94654435 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94654681 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94654982 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94655220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94655966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94656039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94656405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94656685 T A Y N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 94657027 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94658089 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94658142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94658305 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94658529 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94658693 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94658709 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94658861 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94659136 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94659656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94660585 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94660740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94660947 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94661407 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94661907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94662270 A T N N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0 1 0 8 8 0 8 0 3 94662707 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 94663610 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94663671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94663973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94665386 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94666220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94666619 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94669897 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 94670844 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94671472 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94671484 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 94671991 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94672244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94673155 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 94673255 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 94673280 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 94673457 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 94674164 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94676442 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 94676706 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 94676782 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 94677016 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 94677442 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94677624 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 94677692 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 94677864 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 94677865 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 94677926 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 94678488 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94678583 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94678910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94678925 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 94679569 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 94679684 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94680022 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94680778 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 94681116 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94681254 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94681442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94681544 T A N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 94681596 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 94681629 A T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 94682793 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94684416 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94685827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94686057 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94686123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94686303 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94686310 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 94686396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94686503 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94686905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94687045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94687253 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 94687895 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94690242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94690755 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94690777 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94691971 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94692530 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94693771 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 94694220 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 94695988 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 94697401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94698088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94698626 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94699027 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94699524 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 94699694 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94699712 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94700549 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94706468 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94707774 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94708646 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 94710286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94710748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94711160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94711337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94713736 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94713829 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94715518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94716156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94717088 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94717346 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94720040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94722799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94723240 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94724291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94727915 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94729262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94729573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94730217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94730595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94731464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94733633 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 94733783 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 94734969 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 94735800 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 94735880 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 94737328 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 94738175 C T Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 94738929 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 94739302 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 94739658 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94739665 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94739924 A G Y Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 3 94740501 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 94740869 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 94742150 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94743239 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 94743250 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94743257 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 94743349 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 94743512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94743526 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 94743531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94743707 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94743774 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94743781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94744067 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 94744450 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 94744473 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 94744983 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 94745036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94745432 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94745457 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94745628 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94746967 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94748497 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 94748699 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 94749590 A G Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 94749678 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94749789 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 94751088 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94751218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94754469 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94754547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94756943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94763739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94774093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94774808 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94782524 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94785115 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94789175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94790729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94792273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94794597 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94804432 G T Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 94807805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94815839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94816710 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 94821845 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94822523 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 94823652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94823888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94824397 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 94825141 C G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 94825244 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 94825834 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94826105 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94826305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94827526 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94827653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94828844 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94829052 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94830032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94830671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94830914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94831284 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 94831285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94831332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94831716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94832277 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94832450 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 94834711 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 94835400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94841931 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94842506 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94843640 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 94845698 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94846976 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94847138 C A Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 94847850 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94850582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94851675 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94853146 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 94853449 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94855967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94857239 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94857800 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94858381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94859525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94860270 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94860704 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94861595 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 94861612 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 94862062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94864818 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94865159 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94865778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94866354 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94867330 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 94867416 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 94867709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94872600 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94877906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94878409 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94879205 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 94879942 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94880343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94881231 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 94884531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94885518 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94887205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94887397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94887542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94888966 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94889797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94890516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94892982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94893361 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94894317 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 3 94894321 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 94895010 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 94895203 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 94899945 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94900450 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 94901801 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 94903661 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94908414 C T Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 94908438 A G Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 14 18 0 14 2 3 94911950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94912646 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94914596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94915971 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94918996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94924291 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94924923 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94927679 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94929300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94931824 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94933531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94934117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94935934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94941928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94941977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94943230 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 94944928 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94944934 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94945129 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 3 94946006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94946404 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94947125 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 94947237 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 94947303 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 94947558 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 94948194 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 94948195 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 94948234 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 94948290 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 94948472 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94948915 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 94951293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94952387 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94952613 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94952797 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 94954517 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94954681 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94954743 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94955373 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94955508 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94955666 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94956512 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94956939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94958036 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94958562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94958608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94958938 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 94960218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94961191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94961303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94961571 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94961726 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 94961844 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 94962465 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94963170 A C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 94963510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94965506 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 94969193 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94969307 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94969466 A T Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 94970672 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94978058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94978441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94979233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94979526 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94981221 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 94981376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94983274 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 94985856 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94987873 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 94991388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94992520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 94995196 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 94998438 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 94999450 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 95001258 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95001346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95002366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95002711 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95003142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95003336 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95005288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95005457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95006665 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95006749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95006849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95007788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95009106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95009684 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95010614 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95013633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95013932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95015311 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 95016266 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95017026 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 95017314 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95017819 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 95018223 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95018267 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 95018464 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 95018494 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 95018775 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95019089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95019544 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 95019666 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95019708 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95019780 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 95019803 C T Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 95020327 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95020593 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95023934 T A N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0 0.75 0.25 9 15 0 9 3 3 95024365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95025604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95025778 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 95030270 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95033676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95034146 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95038635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95040541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95043045 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95043235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95044851 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95045222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95046457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95047995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95048839 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95054180 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95055268 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 95057970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95060769 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 95060858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95061324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95061352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95061592 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 95061804 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 95062049 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 95062330 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 95062535 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95062548 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 95062687 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 95063587 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 95063658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95063740 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95063884 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 95064109 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 95064245 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 95064559 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 95065330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95065631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95066422 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95066532 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95066911 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95067388 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 95067479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95068230 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95068281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95068612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95068949 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95069477 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 95069871 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 95070901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95073176 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 95073265 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 95073494 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95073540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95073805 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95073833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95074141 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 95074262 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95074283 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 95074779 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 95075064 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95075438 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 95075459 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 95075654 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 95075699 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95075709 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 95075844 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 95075872 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 95076034 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 95076116 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95076127 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95076430 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 95077053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95077309 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 95077822 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95077860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95077912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95077994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95078062 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 95079012 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95079147 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95079470 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95079552 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 95079553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95079742 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 95079917 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 95080227 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95080257 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 95080400 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 95080791 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 95080867 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 95080878 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 95080879 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 95080902 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 95081015 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 95081205 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95081772 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95083793 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95084113 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95085793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95088797 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95090988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95097138 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95097139 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95103176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95103321 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 95103712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95104137 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95106168 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 3 95106383 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95107044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95109755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95110671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95111800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95112586 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 95113708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95113905 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95113913 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95114614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95121530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95121607 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95124699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95125223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95126237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95128545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95130130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95131002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95131072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95143290 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95143595 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95145145 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95146290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95147710 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 95150116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95150440 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95151161 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95153047 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95156241 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95156318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95157183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95157222 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 95157598 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95157862 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95157958 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95158698 A G Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 3 95158701 A G Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 3 95159178 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95159618 T G N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 95161243 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 95162499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95162884 C A Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 95163002 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95163602 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95164096 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 95164917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95165262 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95165371 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95167052 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95174701 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95175903 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95176919 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95181183 A G Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 95182269 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 95185940 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95186557 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95186963 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95191666 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95194100 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95194573 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95195222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95197551 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 95205894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95208016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95209150 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95209603 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95209654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95211574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95211935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95212071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95212087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95212930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95213617 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95214210 T C Y Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 6 8 0 6 1 3 95215086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95215107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95215230 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95215544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95215902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95216014 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95216195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95216771 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 95216864 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95217717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95217882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95217900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95218134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95218514 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95219703 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95220101 T C Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 95220620 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95220820 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95221053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95221360 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95221502 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95221710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95221750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95222129 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95222133 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95222258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95222546 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95222552 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95223074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95224597 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 95225599 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95226047 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95226068 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95226553 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 95226632 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95226829 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 95226859 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95227067 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 95227210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95228801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95228882 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95230346 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95230396 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95231131 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95231245 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95231294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95233200 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95233386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95233882 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95235864 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 95236257 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95237744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95241315 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95242069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95242511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95244220 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 95244429 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95244828 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 95246866 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95247843 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 95248646 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95249564 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95249882 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95250828 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95251161 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95251830 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95251986 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95253084 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 95253577 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95254335 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 95254362 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 95254506 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 95255471 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95255705 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95257521 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 95258603 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95259101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95259211 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 95259551 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 95259761 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95259859 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 95260103 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 95260582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95261645 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 95261700 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 95261781 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 95262923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95263204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95263664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95263814 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95264172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95264225 T G Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 95266349 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95266903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95267227 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 95267586 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 95267667 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 95267670 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 95268595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95268651 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95268664 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95268929 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 95269266 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95270028 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 95270481 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 95270505 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95270772 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95270789 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95271051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95271058 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95271433 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95271482 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95271580 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 95271862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95272075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95272233 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95272722 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95273226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95273256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95273322 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95273448 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 95273462 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95273678 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95274419 T A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 95274635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95274890 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 95274950 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 95275119 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 95276857 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 95276986 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95277056 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95277242 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 95277293 G A Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 3 95277336 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 95277351 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 95277472 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 95277605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95277624 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 95277729 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95277788 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95278023 C T Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 95278403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95278404 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95278873 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 95278918 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95279285 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95279346 A G Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 95279548 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95280318 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 95280434 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 95280582 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 95280640 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 95280714 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 95280715 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 95280759 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 95280830 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 95280931 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 95280968 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 95281306 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95281412 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95281646 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 95283208 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95285830 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95287335 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 95287936 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95288373 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95289744 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 95290009 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95290753 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 95293821 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95294063 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 95294712 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95296660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95296704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95297225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95297552 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95298184 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95299458 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 95299781 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 95300980 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 95301275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95301533 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 95301980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95302098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95302332 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 95302371 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95302616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95302652 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 95302784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95303152 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 95303172 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 95304253 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 95304290 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 95304515 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95304892 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 95304913 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 95305125 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 95305147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95305171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95306001 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 95306306 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 95306407 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 95306659 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 95306689 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 95306747 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95306933 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 95307087 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 95307106 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 95307133 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 95307161 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 95307170 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 95307397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95307640 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 95307825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95307839 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 95307840 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 95307866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95308037 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 95308084 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 95308234 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 95308279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95309686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95313365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95315377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95315380 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95317259 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 95318151 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95318166 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95318238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95320287 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95320699 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95322982 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 95323605 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 95326161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95329738 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 95332127 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95332343 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95332364 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95333488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95334843 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95334943 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95335747 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95337857 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95337874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95337886 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95337938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95340375 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95340430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95340790 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95340866 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95342147 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 95342532 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95342592 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 95343511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95343852 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 95345037 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95347846 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95347875 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95348785 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 95348940 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95349020 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 95349083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95349165 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 95349168 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 95349231 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 95349272 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95349484 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 95349534 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95349567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95349810 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95350025 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95350300 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 95350756 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95350783 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95350900 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 95351081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95351104 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 95351122 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 95351130 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 95351143 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 95351488 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95351632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95351633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95351668 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 95351685 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 95351879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95351974 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 95352633 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 95352696 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 95352766 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 95352935 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 95352953 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95353002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95353007 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95353604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95353642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95353665 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95353675 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 95353685 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 95353795 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 95353822 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 95353971 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95353985 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 95354119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95354172 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 95354198 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 95354331 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 95354490 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 95354593 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 95354961 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95355000 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95355110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95355176 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95355241 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95355262 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95355333 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 95355527 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 95355530 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95355539 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95355565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95355604 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 95356079 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 95356367 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 95357015 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95357070 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 95358262 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95360334 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 95361396 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 95361554 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95361574 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 95361737 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 95362783 G C N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.2 0.133333333333333 0.666666666666667 8 22 3 2 10 3 95362803 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 95362898 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95362933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95362986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95363022 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95363110 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95363169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95363270 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95364495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95365762 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95366943 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95367411 T C N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 95368301 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95368963 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95373098 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95374639 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 95375326 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 95375624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95376284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95380550 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95383288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95383839 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 95383861 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 95386376 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 95387002 A G Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 95387631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95389128 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95390245 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 95390597 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95390894 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 95391678 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 95392009 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 95392530 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95393752 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95394457 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95395898 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 95396052 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95402751 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 95404908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95406807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95407422 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95407854 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95408523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95409668 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95409669 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95410107 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95410643 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95411629 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 95411659 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95412202 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95414325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95415639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95415892 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95421491 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95423164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95424487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95425344 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 95427047 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95427398 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95427491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95427769 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95427881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95428126 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95429554 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 95429989 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 95430565 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95431150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95436255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95436754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95436917 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95438781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95439457 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95440158 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95440664 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 95440855 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 95442009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95442252 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95442392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95443049 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 95443131 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 95443170 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 95443264 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 95443427 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95443890 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 95443961 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95444008 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95444511 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95444613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95444847 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95445137 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 95445287 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 95445513 T G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 95445718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95445722 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 95445820 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 95445844 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 95446227 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95446508 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95449060 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 95450866 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 95453473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95456383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95459728 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95459978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95460719 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95461181 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95461763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95462104 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95465100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95466132 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95467285 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95467545 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 95467790 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 95468718 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 95468852 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 95468954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95469607 T A N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.666666666666667 0.133333333333333 0.2 22 8 10 2 3 3 95469691 C A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 95469705 G T N N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 3 95469976 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.583333333333333 0.166666666666667 0.25 16 8 7 2 3 3 95470457 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 95470506 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 95470563 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 95470570 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 95470634 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 95470674 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 95470700 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 95470716 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 95470781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95470928 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 95471169 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 95471173 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 95471340 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95472497 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95472827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95472853 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95473864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95473867 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95474002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95474638 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 95474813 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 95476273 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95476278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95476629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95476737 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95477314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95477588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95477973 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95478855 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95478866 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95479399 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 95481526 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 95482782 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95482956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95484335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95486554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95486602 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 95486723 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95488018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95488120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95491244 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95493068 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95493330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95493640 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95496071 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 95496542 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95496747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95499658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95499706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95501983 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 95505609 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 95505985 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95507605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95507631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95507638 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 95507860 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95511762 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 95512842 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95513533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95513609 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95516131 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95517921 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 95518495 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95519244 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95519601 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95521334 C A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 95521538 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 95522287 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95522910 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 95524725 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 95525550 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95525591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95527596 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95527782 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 95529239 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 3 95529287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95533626 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 95533896 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 95534051 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 95534116 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 95534327 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 95534460 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95535039 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 95535061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95535157 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 95535175 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 95535379 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 95535512 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 95535549 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 95535550 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 95535777 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 95535849 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 95535950 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 95536234 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 95536383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95536439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95536507 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95537223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95537545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95537742 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95537768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95537937 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 95538799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95538821 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 95538860 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 95539059 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95539998 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 95540844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95541180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95543066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95545411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95545483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95548508 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 95548706 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95550401 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95550432 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95550437 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95550447 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95553318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95554368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95555669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95557408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95557879 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 95561604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95562101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95563559 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95563970 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95565766 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95567361 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95567621 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95568164 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 95572003 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95575017 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95578861 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95578920 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95579058 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95581007 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95584622 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 95585507 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95587559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95587927 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95589400 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95590635 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95593473 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95594259 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95596039 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95599324 A G Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 3 95601374 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95601399 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 95601562 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 95601713 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 95605002 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95610295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95610464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95614765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95617036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95618540 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95618640 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95619965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95620819 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95621195 A T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 95621754 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95624268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95625361 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95626265 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95627107 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95627478 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 95627580 G A Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 95630417 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95630419 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95630522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95630614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95631286 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 95633819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95633828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95634049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95635186 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95635381 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 95635384 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 95636817 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95637271 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95638513 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95640732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95640775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95650510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95650794 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95651492 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95651970 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95652441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95653419 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95654333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95655254 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95656491 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95656636 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 95657340 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95657969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95658187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95658881 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95658902 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95659139 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 95659441 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 95663400 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95663716 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95665382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95666470 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 95666486 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 95666524 G A Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 95667070 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95667183 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 95667875 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 95668960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95670422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95670456 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95673205 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95674130 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95674546 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95680036 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95687153 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95689104 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95693190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95694449 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 95694537 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 95694715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95695053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95695384 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 95695611 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 95696182 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 95697125 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 95697737 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95697845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95699815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95701449 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95701957 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95702626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95705985 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 95706026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95706176 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95706215 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95707691 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 95708067 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 95708072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95708785 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 95708877 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95709725 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95710112 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 95710866 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 95711304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95711454 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 95711639 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95712027 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 95712028 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 95712138 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95712749 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95713118 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95713135 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95713198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95714827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95715708 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 95718932 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 95719526 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 95720745 G A Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 95721329 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95723318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95725055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95725090 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95725317 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 95725378 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 95725396 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 95726663 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95727154 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 95727162 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 95727494 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 95727495 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95727505 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 95727506 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 95727528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95727549 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95728008 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95728743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95729323 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95729332 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 95732147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95734362 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95734472 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95735025 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 95735104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95735122 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 95735321 G C Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 95735577 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 95735578 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 95736019 T C Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 95736629 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 95736801 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 95737332 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95737746 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 95739160 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 95740173 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 95740812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95742419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95742684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95744556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95745175 T G Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.3 0.7 0 26 14 6 14 0 3 95745262 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 95745372 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 95745428 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 95745456 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 95745574 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 95745975 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 95746006 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 95746026 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 95746035 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 95746067 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 95746099 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 95746445 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 95747383 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95747548 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95747743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95749967 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 95750055 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 95750438 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 95750597 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95750789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95751171 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 95751236 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 95751459 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 95752408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95754681 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95755296 T C Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 95755501 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 95755585 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 95755599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95756061 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95756066 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 95756077 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 95756094 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95756326 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95756343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95756373 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95756431 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95756507 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 95756803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95756855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95757344 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 95757540 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 95757713 G C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 95757809 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 95757855 C A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 95757938 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 95758033 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 95758306 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95758449 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 95758475 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 95758512 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 95758596 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 95758634 A G Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 95758654 C T Y Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0 0.9 0.1 9 11 0 9 1 3 95758692 G A Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 3 95758870 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 95759009 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 95759050 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 95759228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95759331 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 95759382 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 95759505 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 95759563 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 95759611 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 95759679 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 95760244 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 95761662 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95762359 G A Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 3 95762597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95762633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95763314 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 95763732 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 95764212 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95764235 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95764250 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95765206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95765668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95766734 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 95767130 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 95767151 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 95768319 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 95768441 T G N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 3 95768577 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95768580 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95769440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95769567 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95770003 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95770143 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 95770952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95771144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95771375 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95777762 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95777812 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95777922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95777929 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 95778119 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95778121 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 95778160 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 95778215 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 95778321 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 95778378 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 95778414 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 95778430 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 95778564 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 95778670 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 95778700 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95778792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95779268 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 95779776 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 95782092 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 95782167 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95782478 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 95783227 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 95783952 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95785451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95785517 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 95785844 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 95785871 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 95785941 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 95786076 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 95786104 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 95786162 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 95786381 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 95786535 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 95786740 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95787166 C A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 3 95787392 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 95787432 G C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 95787451 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 95787501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95787569 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 95787609 A T N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 95787657 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 95787698 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 95787708 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 95787804 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 95787911 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 95788243 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 95788270 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 95788763 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 95789152 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95789397 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 95789672 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 95789834 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95789875 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95790013 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95790587 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95790720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95790736 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95790743 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 95790754 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95790813 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95790814 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95790855 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95790859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95790924 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95791313 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95791560 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95791651 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95792242 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 95792414 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 95792632 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 95797078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95798331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95799092 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95800870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95802680 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95802746 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 95802837 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95805963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95810834 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95811055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95812485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95813866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95814259 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 95815022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95815124 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95815445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95816261 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95816283 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 95816660 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 95817260 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 95817536 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 95817717 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 95817732 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 95817845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95817856 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 95817985 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 95818337 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 95818582 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95818589 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95818730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95818749 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95818793 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 95819227 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95819605 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95820203 G A N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 3 95820274 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95820278 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 95820289 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95820628 A G Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 3 95821524 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 95821571 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 95821834 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 95822174 G C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 95822194 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 95822223 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 95823308 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 95823474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95824574 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 95825074 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95826342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95827005 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 95827841 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95828474 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95830497 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95830519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95830737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95831387 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95832168 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95833342 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 95833896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95833960 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 95834185 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95835424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95835631 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 95835723 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 95836141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95836196 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 95836369 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 95837017 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95841292 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95843129 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95843418 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 95844645 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95845874 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 95846020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95846219 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 95846584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95846618 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95846825 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 95846861 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95847300 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95847655 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 95847696 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 95847771 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95847919 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 95847956 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 95847957 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 95848184 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 95848349 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95849018 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 95849124 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 95849185 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 95850202 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 95850247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95850500 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 95850548 C G Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 95850754 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 95851294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95851590 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 95852058 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 95852103 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 95852190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95852261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95852362 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 95852577 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 95852656 T C Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 3 95853020 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95853265 C A Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 95853268 G A Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 95853392 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 95853401 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 95853420 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 95853994 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 95854020 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 95854024 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 95854257 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95854295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95854297 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95854359 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 95854415 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 95854874 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 95854971 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95854984 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 95857160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95857186 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 95857377 T A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 95857946 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95858006 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 95858279 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95858568 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 95858667 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 95858747 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 95858803 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95858931 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 95858932 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 95859335 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95859428 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 95859583 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 95859599 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 95859959 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 95860034 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 95860038 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 95860060 G A Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 95860218 A T Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 95860224 C A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 95860269 A C Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 95860387 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 95860460 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 95860490 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 95860575 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 95860843 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95861259 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 95861385 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 95861502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95861884 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 95862369 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95862409 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95862477 G C N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 3 95862506 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95862995 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 95863122 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 95863521 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95863847 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95864242 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 95864365 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 95864456 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 95865147 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95865807 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 95865957 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 95866053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95866105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95866111 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 95866757 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 95866762 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 95866787 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 95866798 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 95866953 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 95866969 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 95867196 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 95867339 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 95867438 G A Y Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 95867624 C T Y Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 9 11 3 3 4 3 95867666 A G Y Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 95867793 G A Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 95867849 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 95868012 C G Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 95868044 G A Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 95868076 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 95868150 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 95868152 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 95868164 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 95868211 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95868238 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 95868385 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 95868614 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 3 95869251 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 95869379 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 95869410 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 95869540 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 95869603 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 95869729 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 95870003 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 95870010 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 95870127 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 95870225 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 95870294 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 95870303 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 95870326 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 95870408 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 95870504 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 95870591 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 95870702 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 95870765 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 95870792 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95870858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95870946 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 95871117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95871470 G A N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 13 7 4 5 1 3 95872102 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 95872116 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 95872595 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 95872873 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 95873032 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 95873174 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 95873396 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 95873420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95873434 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 95873701 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95874172 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 95874186 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 95874371 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95874651 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 95874707 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 95874850 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 95875202 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 95875262 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 95875403 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 95875429 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 95875469 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 95875924 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 95875941 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 95876011 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 95876109 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 95876331 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 95876401 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 95876409 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 95876497 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 95876630 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 95876757 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 95876787 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 95876910 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 95877030 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 95877095 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 95877113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95877428 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 95877483 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 95877917 A T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 95878019 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95878571 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95879038 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95881806 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 95882549 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 95882734 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95882966 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 95882977 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 95883458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95883549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95883575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95883719 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95883737 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95883753 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95883920 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95884604 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95884733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95885246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95887203 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 95887587 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 95888311 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95889945 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95891248 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 95891273 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95893331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95894016 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 95895239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95897167 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95897236 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 95897760 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95897814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95901983 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 95902031 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95902839 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95904396 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 95905362 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95911504 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 95912818 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95915232 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95916149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95916226 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95916232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95916237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95917113 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95917535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95917741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95918119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95918123 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95921289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95922070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95922209 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95922445 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95922643 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 95922736 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95923275 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95923701 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 95923748 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95926816 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95927412 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 95927707 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95929557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95930499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95930841 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95932640 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 95943375 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95943628 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95943670 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95947643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95949148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95950475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95951246 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95952112 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95952696 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95955029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95956010 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95957542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95961327 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95961451 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95962446 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95963384 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 95963823 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 95964840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95965311 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95965630 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 95967165 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95968641 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 95968844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95969228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95970594 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 95971636 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 95983594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95983603 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95984083 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 95985795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95988136 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95988224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95988249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95988615 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 95990463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 95991068 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 95991600 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 95991905 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96000106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96002060 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96002113 G T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 96002145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96002831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96002862 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96003123 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96003257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96003334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96003485 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96003971 C G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 96004124 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 96010747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96011075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96011196 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96011209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96011346 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96011684 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96011773 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96011820 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96011947 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96011964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96011989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96012009 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96012159 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 96012507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96012785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96012892 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 96012893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96014093 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 96014126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96015876 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 96015924 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96016675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96020344 A T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 96020488 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96021329 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96025879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96026041 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96027103 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96027544 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 96027636 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96027693 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 96027896 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 96027921 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96027931 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 96027954 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96028069 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96028151 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 96028365 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 96029839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96030308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96032044 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 96032067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96032132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96032750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96033604 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96034930 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96034939 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 96035480 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96035488 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 96035997 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96036464 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96036682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96037158 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 96037159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96037484 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 96037657 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96038299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96038313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96040799 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 96040975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96041038 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96041099 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96041314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96041630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96044467 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96051306 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96051655 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 96053406 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96054875 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96056273 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 96057010 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96057285 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96057353 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96059809 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 96062095 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 96062118 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 96062133 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 96063485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96066019 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96067228 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 96067649 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96068918 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 16 14 1 14 0 3 96068919 G A N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 3 96069019 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96069340 A C Y N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 16 14 1 14 0 3 96070988 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96073267 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96080817 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96085237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96085304 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96085346 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96085347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96085431 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96085433 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96085445 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96085463 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96085491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96085551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96085590 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 96085679 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96085688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96085743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96085956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96086084 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96086085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96086199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96086518 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96086541 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 96086866 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 96087069 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 96087153 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96087348 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96087825 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 96087833 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 96088043 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 96088146 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 96088207 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 96088556 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 96089112 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 96089172 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96089284 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96089369 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 96089416 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 96089827 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 96089834 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 96090375 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96091839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96092538 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96092911 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 96094070 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 96094466 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 96095586 A G Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 96096492 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96096518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96096735 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96096773 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96096882 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96097565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96097616 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 96098094 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96098102 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96098339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96098352 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 96098830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96098899 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96099536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96101171 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 96102488 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 96102499 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 96105321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96105323 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 96105637 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 96107327 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96110339 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96113936 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 96115877 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96119447 C T Y Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0 1 0 6 6 0 6 0 3 96125951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96126878 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 96130427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96132665 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 96133404 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96133913 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96136220 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 96136668 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 96138079 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96138438 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 96138494 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 96138700 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96138868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96142042 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96144281 G A N Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 7 7 2 3 2 3 96144369 C G Y N 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 6 10 2 2 4 3 96144556 T C Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 96144727 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 96145196 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 96145240 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 96145250 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 96145401 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 96145487 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 96145566 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 96145581 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 96145616 C A Y N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 3 96145618 C A N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 3 96145784 G A N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 3 96145853 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 96145961 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 96145984 G T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 96146017 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 96146165 A G Y Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 6 10 2 2 4 3 96146738 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 96146862 G C Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 96147069 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 3 96147370 T G Y N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 5 5 1 3 1 3 96147653 T C Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 96148110 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 96149241 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 96164924 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96164952 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 96165100 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96165644 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 96166352 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96166941 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96182984 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96194358 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96194359 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96194491 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96195618 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 3 96195628 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 96195643 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96196425 A C N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 3 96196577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96196799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96196932 C T Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 3 96196963 G C Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 3 96197426 A C N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 16 12 2 12 0 3 96197735 C G Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0 0.944444444444444 0.0555555555555556 17 19 0 17 1 3 96198041 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96198087 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96198736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96199433 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 96199942 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 96200260 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 96200564 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96201771 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96202520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96202587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96202972 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 96203561 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96203627 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96203891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96204510 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96206610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96208637 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96209954 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 96210993 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96211118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96211290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96212265 C T N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 96213220 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 96213307 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 96215109 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96215177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96217118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96222377 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 96222859 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 96225563 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 96226394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96226783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96228364 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96228646 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 96233861 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 96234364 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 96236910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96240413 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 96240444 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96240539 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 96240931 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 96241353 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 96241626 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 96241758 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 96241880 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 96241958 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 96242157 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 96242329 A C N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 96242336 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 96242481 T C N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 96242500 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 96242643 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 96242648 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 96242686 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 96242695 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 96242732 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 96242752 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 96242771 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 96242823 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 96242956 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 96242961 C A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 96243012 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 96243091 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 96243095 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 96243102 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 96243157 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 96243186 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 96243293 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 96243301 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 96243348 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 96243361 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 96243428 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 96243639 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 96243711 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 96244775 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 96245661 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 96245699 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 96245719 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 96245860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96245981 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 96246062 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 96246196 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 96246589 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 96247124 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 96247145 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 96247161 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 96247186 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 96247202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96247245 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 96247412 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 96247617 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 96247718 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 96247761 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 96248810 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 96248896 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 96249434 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 96250564 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96250683 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 96268501 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96269423 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96269564 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 96269629 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 96269667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96272019 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 96273695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96274463 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96275799 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 96275823 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 96276584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96276968 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 96277563 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96277979 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96279013 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96282206 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 96287329 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 96287385 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96287986 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96288053 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96288118 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96288196 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96289739 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96300572 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96300616 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96303425 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96304930 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96305454 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96307121 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96308533 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96308591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96309302 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96310139 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96310263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96310496 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96310572 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96311493 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 96311497 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 96321234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96321318 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96322206 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 96322357 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96322737 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96324790 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96325143 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96326901 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96327133 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 96327537 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96329624 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96329930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96332485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96332671 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96333350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96335339 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96335461 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96335463 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96335639 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 96335870 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96336203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96336249 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 96338244 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 96338250 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 96338584 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96338652 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96339109 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 96339110 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 96339136 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96339507 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 96340210 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96340215 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96340491 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 96340852 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 96341873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96342326 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96343273 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 96343760 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 96344399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96344552 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96346601 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96347479 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 96347638 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 96347840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96347910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96348133 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 96348207 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 96348399 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96348406 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96348410 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96348873 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96348946 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 96348997 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96349140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96349287 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96349434 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 96349875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96349906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96350129 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96351041 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 96351053 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 96351153 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96351182 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 96351268 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 96351343 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 96352131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96352280 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96352463 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 96352958 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 96353193 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 96353439 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 96353626 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96353636 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96354510 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 96354569 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 96354577 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 96354964 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96355050 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 96355192 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 96355689 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 96356295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96356306 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96356331 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96357400 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96358137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96358186 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96358565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96358862 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 96359576 A C N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 96359603 A G N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 3 96360078 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96360454 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 96360999 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96361730 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96361960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96362075 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96363135 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96364100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96365180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96366718 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96366952 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 96367069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96367098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96367146 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96367552 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 96367824 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 96367893 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96369358 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96370842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96371103 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 96373259 A T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 96373261 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 96375434 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 96375981 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 96376581 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96377239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96377449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96378606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96379446 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 96380288 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 96380572 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 96380650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96381617 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 96381634 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96381648 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96381655 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96381986 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 96382130 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 96384046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96384096 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.166666666666667 0.722222222222222 0.111111111111111 19 17 3 13 2 3 96385505 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 96386428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96391763 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 96391823 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 96393193 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96394837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96403770 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96404180 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96406969 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96407165 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96409521 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 96410098 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 96416806 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96423565 C G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 96426160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96426635 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96429777 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 96430619 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96432145 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96432438 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96436647 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 96436982 C A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 96437036 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 96437206 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 96437253 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 96437536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96438204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96438610 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 96438766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96438797 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 96438938 C A Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 96439583 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 96439588 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 96439705 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 96439885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96439890 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 96439982 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 96440016 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96440198 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 96440283 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 96441355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96442911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96444707 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 96445110 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96445850 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96445927 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 96446653 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 96447147 G T N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 96448494 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96451014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96451939 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96455255 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 96455520 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96455556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96457783 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 96457826 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 96458559 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96462246 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96463721 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 96464799 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 96464916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96464986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96465008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96465694 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 96465924 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 96466079 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 96466179 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 96466221 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 96466333 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 96466807 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 96467009 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 96467010 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 96467026 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 96467209 T C N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 96467486 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 96467569 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96467763 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 96468073 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 96468104 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96468168 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 96468171 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 96468197 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 96468440 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 96468481 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96470101 C G N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 96470103 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 96470309 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 96470621 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96470680 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96471825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96471924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96473407 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 96473799 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96473953 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96473989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96474168 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 96474259 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96474403 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96474845 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96475465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96475496 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 96476135 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96476362 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 96476642 A T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 3 96476911 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 3 96476951 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 96476989 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 96477790 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96478865 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 96478872 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 96478887 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 96478895 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 96478931 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 96478947 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 96479014 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 96480153 A G N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 96480167 A G N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 96480223 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.25 0.333333333333333 0.416666666666667 10 14 3 4 5 3 96480366 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 96480635 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96480676 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 96480696 C A Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 96481273 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 96481390 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 96481472 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 96481687 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 96481752 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 96481784 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 96482269 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 96482457 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 96482552 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 96482629 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 96482632 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 96482765 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 96483447 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 96483651 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 96483926 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96484029 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96484751 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 96484765 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 96485165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96485181 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96485224 T C Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 96485601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96486325 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96486556 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 96487116 G C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 96487121 C A Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 96487168 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 96487515 T G Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 3 96487549 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96487576 G C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 96489331 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96489433 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 96489454 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96490079 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 96490119 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 96490166 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 96490610 T A Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 96490644 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 96490889 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 96490937 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 96491015 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 96491107 C A Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 96491152 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 96491440 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 96491449 T A Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 96491810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96491886 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 96491955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96491994 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 96492106 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96492620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96492699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96492713 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96492835 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96493344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96493351 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96493517 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 96493536 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 96493571 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 96493707 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 96493885 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 96494357 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 96494416 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 96494489 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96494570 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 96494579 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 96494661 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 96494701 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96495071 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 96495092 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 96495305 C A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 96495490 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 96495652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96495910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96495917 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 96496366 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96496369 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 96496423 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 96496482 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 96496492 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 96496529 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96496668 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96496725 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 96496869 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 96500335 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96501342 C G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 96501697 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96501957 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96504006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96504171 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 96504800 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96505363 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96506113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96507819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96507925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96510142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96511258 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 96513070 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96514458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96514750 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96519518 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96520206 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96521811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96528582 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 96528882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96532018 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96538170 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 96538685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96540015 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96542320 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96542750 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96543209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96545433 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96549682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96549740 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96550075 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96550907 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96552733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96553482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96553693 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96554616 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96557350 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 96557389 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 96558780 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96559286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96559850 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96560767 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96562048 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96562049 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96562077 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96562967 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 96563217 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96563717 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96564814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96564964 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96565546 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 96566503 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 96567764 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 96567841 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 96568620 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96568796 G C Y N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 96569227 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96569784 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96570128 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96570264 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96571083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96572605 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96574673 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96576102 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 96577340 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96578847 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 96578963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96581193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96581715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96584814 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 96584815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96586310 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96587377 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 96587468 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 96588807 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96588862 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96589428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96589474 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96592737 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96593054 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96593083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96593152 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96593556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96594454 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 96597546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96597815 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96598219 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 96598229 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 96598391 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96598747 C T N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 96599285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96600194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96602079 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96605568 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 96606227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96606943 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 96607766 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 96607767 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 96607818 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 96608057 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 96608071 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96608143 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96608213 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 96608218 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 96608389 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96608837 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 96609014 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 96609191 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96609483 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96610409 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 96610980 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 96611320 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96611438 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 96611449 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 96611625 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 96611626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96611979 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 96612021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96612062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96612152 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 96612707 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 96613091 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 96613181 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 96613320 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 96613321 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 96613389 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 96613537 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96613849 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96613963 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96614448 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96615552 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 96615623 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 96616573 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96616894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96617031 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96617664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96617808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96618308 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96619753 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 96619921 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96620442 T C Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 96626490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96626506 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 96626516 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96626781 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 96626832 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 96626981 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 96627042 G C Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 96627054 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 96627090 T C Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 96627104 G C Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 96627150 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 96627204 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 96627208 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 96627323 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 96627489 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 96627560 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 96627689 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 96628071 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 96628139 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96628232 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96628234 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 96628269 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96628422 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 96628684 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 96628873 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 96628879 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 96628916 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 96628935 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 96629074 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96629104 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 96629177 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 96629263 T G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 96629278 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 96629346 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 96629379 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 4 2 2 0 1 3 96629488 T C N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 3 96629519 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 96629717 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 96629770 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 96629993 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 96630042 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 96630136 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 96630297 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96630317 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 96630327 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 96630340 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 96630614 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 96630644 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 96630719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96630737 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 96630838 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 96630857 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 96631220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96631626 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 96631869 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96632031 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96632183 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96632308 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 96632351 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 96632547 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 96632637 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 96632874 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96633182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96633276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96633356 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 96634125 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96634563 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96634612 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 96634779 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 96634795 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 96634816 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96634818 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 96634971 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 96635074 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96635091 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 96635217 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 96635233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96635367 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 96635521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96635610 C A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 96635858 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 96635928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96636579 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96636992 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96637752 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 96638177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96638384 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96640238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96640256 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96640538 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 96640565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96640754 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 96640799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96640936 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 96642633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96643705 C T Y Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 96649563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96650521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96651204 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 96651205 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 96651620 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 96651674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96654063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96654221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96654245 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 96654305 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 96654308 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 96654742 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 96655748 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 96656219 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 96656272 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 96656391 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 96656614 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 96656618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96656660 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 96656684 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 96657225 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96657265 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 96657273 T G Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 96657280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96657500 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 96657761 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 96657859 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 96657987 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 96658073 T C N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 3 96658087 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 96658160 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.15 0.85 0 23 17 3 17 0 3 96658331 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 96658350 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 96658480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96658783 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 96659217 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96659525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96660016 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 96660532 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 96660540 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 96660567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96660638 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 96660847 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96661164 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 96661519 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 96662170 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96662592 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96662894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96663614 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 96665363 A C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 96665416 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 96666112 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96666555 T C Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 96669077 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96669294 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96670195 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 96670786 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96671025 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96672004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96673738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96673846 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 96674133 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 96674334 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96674957 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 96675205 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 96675933 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 96676835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96676888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96677255 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 96677354 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96677869 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 96678182 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96679308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96679399 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 96679542 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 96679887 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 96679988 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 96681052 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96681249 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 96681376 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 96681505 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96681932 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 96681970 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 96682025 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 96682120 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 96682321 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 96682370 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 96682828 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 96682881 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96682932 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 96682969 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 96682997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96683035 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 96683046 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 96683054 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 96683106 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96683219 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 96683220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96683508 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 96683532 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 96683669 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96683852 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96683869 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 96683894 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96683912 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 96684169 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 96684253 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 96684299 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 96684388 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 96684997 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 96685021 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96685211 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 96685601 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 96685682 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 96685709 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 96687684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96688794 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 96688804 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96689076 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 96689111 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 96689224 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 96689260 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 96689298 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 96689327 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 96689385 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 96689487 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 96689552 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 96689869 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 96690384 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 96690560 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 96690583 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 96690671 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 96690688 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 96691139 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 96691297 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 96691422 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 96691851 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 96692608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96692882 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 96692958 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 96693502 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 96693540 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 96693691 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 96693708 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96693810 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96694062 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 96694380 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96694646 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 96695126 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96695241 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 96695339 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 96695391 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96695525 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 96695925 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 96696191 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96696299 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96696581 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96697212 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96697704 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 96697876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96698100 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 96698144 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96698562 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 96699780 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 96699894 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 96699951 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 96700210 C A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 96700274 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96700295 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 96700433 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 96700467 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 96700775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96700897 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 96701075 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 96701486 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96701560 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96701597 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96701880 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 96702351 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 96703524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96704316 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 96704359 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 96704953 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 96705134 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96705312 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 96705690 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 96705728 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96705761 A G Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 96705840 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 96705927 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 96707232 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 96707236 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 96707351 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96707366 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 96707486 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96707901 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 96708073 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96708121 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96708451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96708591 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 96709575 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 96709981 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 96710951 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96711474 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 96711874 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 96711958 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96712010 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 96712304 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96712432 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 96712482 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 96712850 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 96713036 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 96713276 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 96713729 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96713874 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 96713962 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96713987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96713992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96714034 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 96714091 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 96714107 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 96714139 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 96714153 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96714158 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 96714306 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 96714311 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96714392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96714447 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96714483 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96714511 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 96714644 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 96714659 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96714786 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 96714823 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 96714922 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 96714981 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 96714989 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 3 96714996 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 96715190 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 96715221 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96715343 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 96715524 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 96715686 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 96715851 A T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 96716082 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96716092 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 96716128 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 96716183 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 96716191 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 96716267 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 96716320 G A N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 3 96716324 G T N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 3 96716596 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 96716612 G A Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 96716630 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 96716669 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 96716789 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 96716851 T A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 96716874 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 96716901 G T Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 96716988 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 96717071 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96717114 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 96717130 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 96717497 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96717642 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 96717718 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 96717756 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96717811 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 96717867 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 96717955 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 96718019 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96718037 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 96718080 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 96718237 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 96718255 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 96718263 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 96718571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96718683 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 96718684 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 96718744 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 96718905 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 96718963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96719000 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 96719023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96719126 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 96719158 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 96719172 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 96719427 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 96719444 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 96719816 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 96719893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96719985 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 96720145 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 96720181 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 96720215 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 96720281 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 96720332 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 96720412 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 96720467 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 96720478 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 96720495 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 96720510 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 96720591 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 96720599 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 96720678 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 96720781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96720801 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 96720895 C G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 96720944 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 96721148 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 96721164 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 96721215 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 96721289 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96721307 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 96721452 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 96721471 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 96721621 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 96721784 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 96721811 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 96721924 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96722024 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 96722496 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 96722545 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96723230 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 96723235 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 96724516 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 96724845 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 96726169 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 96726775 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 96727160 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 96727201 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 96727222 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 96727223 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 96727382 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 96727420 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 96727460 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 96727737 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96727779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96727953 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 96728069 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96728388 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96728557 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96729082 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96729329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96729555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96731551 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 96731660 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 96731733 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96731755 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 96731992 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 96732645 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 96734071 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96734218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96734337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96735571 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 96735656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96735860 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96735930 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96736079 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 96736561 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 96736870 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96737680 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 96737739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96737748 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96737768 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 96737797 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96738189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96739073 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96739783 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 96740089 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 96740763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96741033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96741054 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96741146 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96741461 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96741576 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 96741586 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 96741917 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96742077 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96742524 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96743575 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96743625 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96743686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96746325 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96746531 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 96747507 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 96747644 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96747678 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 96748565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96748625 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96748999 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96750105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96750582 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 96751959 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96752333 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 96752996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96756559 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96756777 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 96756831 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 96756917 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 96756928 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 96756991 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 96757002 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 96757060 T G Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 96757299 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 96757358 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 96758791 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 96758866 C A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 96758995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96759009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96759244 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 96759379 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 96759824 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96759929 G C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 96760135 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96760353 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 96761267 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 96761530 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 96761647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96761778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96761951 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 96762109 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 96762235 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96762906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96762926 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96763109 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96763179 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 96763302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96764117 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 96764122 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 96764170 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96764403 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 96765811 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 96767048 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96767537 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 96767593 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 96767742 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 96768150 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 96768374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96768892 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 96770754 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 96772726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96773663 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 96773768 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 96774196 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96776078 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 96776257 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96776299 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 96776674 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96776708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96777782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96778928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96779842 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96779885 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 96780268 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 96785090 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 3 96785697 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 96785904 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 96786511 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 96786608 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 96786744 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 96787148 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 96787223 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 96787237 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 96787249 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96787342 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96787529 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 96788154 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 96788447 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96788514 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96788704 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96788727 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 96789130 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 96789198 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96789279 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 96789349 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96789370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96789376 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96789634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96789654 T A Y N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 96790296 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 96790496 T C Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 96790627 A G Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 96790937 T A Y N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 96790954 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96790971 C A Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 96791080 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96791236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96791262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96791662 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 96791690 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 96791747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96792451 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 96792473 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 96792767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96792768 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96792858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96792859 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 96793094 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96793166 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96793535 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 96793719 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96793933 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96794234 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96794293 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96794501 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 96794554 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96794652 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96794674 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 96794740 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 96794819 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96794824 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 96795008 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96795020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96795035 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96795051 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96795167 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96795196 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96795263 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96795824 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 96795845 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 96796102 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96796162 T A Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 96796165 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 96796409 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96796541 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96796687 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96796774 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96796853 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96796932 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 96796980 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 96797006 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96797135 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96797154 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96797165 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96797182 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96797251 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96797300 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96797433 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96797454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96797505 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96797520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96797541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96797554 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96797591 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96797632 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96797633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96797657 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96797699 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96797761 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 96797829 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96797875 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96797956 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96798177 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96798310 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 96798684 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96798897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96798934 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96798948 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96799102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96799284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96799426 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 96799469 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96800905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96804045 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96804932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96806182 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 96806213 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96806219 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96806229 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96806230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96806240 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96806247 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96807279 A C Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 96808474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96810034 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96811406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96813294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96814513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96814536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96815957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96816002 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96816183 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 96816354 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 96816451 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96816488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96816507 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96819516 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96819548 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 96819645 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 96819778 T G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 96819819 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 96819827 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 96819855 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 96820003 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 96820021 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 96820142 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 96820166 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 96820340 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 96820361 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 96820573 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 96820602 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 96820633 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 96820636 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 96820662 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 96820912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96821291 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 96821516 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 96821799 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 96821855 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 96821889 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 96821965 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 96822528 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 96822551 G A N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 96822740 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 96822799 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 96822865 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 96823160 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96823403 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 96823669 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 96823726 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96824126 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 96824186 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 96824213 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 96824257 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 96824497 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 96825677 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 96825746 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96826062 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 96826692 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96827780 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 96827791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96828267 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96828359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96828852 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96829245 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96829618 C T Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 3 96830197 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 96830753 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 96830987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96832063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96832140 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96832982 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 96833248 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 96833260 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 96833321 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 96833347 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 96833435 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 96833452 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96833622 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96833697 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 96833902 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 96833923 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 96833950 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 96834000 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 96834589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96834608 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 96834755 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 96834774 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 96834896 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 96834999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96835366 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 96835448 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96835449 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96835464 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 96835582 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96835745 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96835766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96835842 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96835868 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96836031 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 96836032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96836129 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96836223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96836494 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96836651 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 96836655 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 96836735 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 96836911 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 96836922 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 96836951 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 96836982 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 96837009 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96837060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96837886 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 96838055 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 96838629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96838915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96839118 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 96839364 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96839382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96839537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96839635 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96839665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96839725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96839818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96839836 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96840193 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 96840402 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 96840509 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 96840908 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96840996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96841055 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 96842155 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 96842508 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 96842529 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 96842748 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96843393 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96843424 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96843428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96843960 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 96844208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96844222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96844269 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96844316 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 96844396 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 96844429 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 96844440 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 96844482 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 96844552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96844581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96844595 A T Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 96844663 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96844664 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96844781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96845709 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96845920 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 96846008 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96846101 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 96846273 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 96846463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96846807 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 96846853 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96846947 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 96848667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96849265 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 96849344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96850055 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 96850304 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 96850436 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 96850963 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 96850985 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 96850986 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 96851021 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96852867 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 96853175 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 96853315 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 96853411 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0 0.882352941176471 0.117647058823529 15 19 0 15 2 3 96853444 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 96853793 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96853813 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96853886 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 96854122 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 96854174 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 96854233 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 96854349 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 96854376 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 96854496 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 96855379 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 96856471 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 96856678 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 96857930 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 96858727 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 96858776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96858865 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 96859125 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 96859233 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 96859745 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 3 96859751 C T Y Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 3 96860290 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 96860910 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96861178 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96861201 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 96861391 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 96861475 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 96861613 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 96861643 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 96861889 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 96862562 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 96862781 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 96862782 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 96862946 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 96863032 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96863043 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 96864870 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96865315 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96868245 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 96870030 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 96871249 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96875584 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 96875865 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 96876838 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96880480 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 96880519 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96880659 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 96880667 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 96880882 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 96880909 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 96881378 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.0526315789473684 0.736842105263158 0.210526315789474 16 22 1 14 4 3 96881619 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 96881671 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 96881841 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 96882125 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 96882155 G A N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 96882186 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 96882190 C T N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 96882210 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 3 96882374 A G N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 96882442 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 96882509 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96882582 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96882607 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 96882680 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 96882905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96883300 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 96884078 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 96884101 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96884135 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 96884140 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 96884172 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 96884292 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 96884303 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 96884304 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 96884849 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 96884855 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 96884860 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 96884939 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 96885197 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.1875 0.0625 0.75 7 25 3 1 12 3 96885207 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 96885221 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 96885277 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 96885376 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 96885480 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 96885493 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 96885533 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 96885566 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 96885629 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 96885756 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 96885828 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 96885857 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 96885873 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 96885888 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 96885935 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 96886395 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 96886401 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 96886470 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 96886500 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 96886513 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 96886543 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 96886555 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 96886753 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 96886763 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 96886771 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 96886994 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 96887069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96887234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96887584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96887825 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96888114 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96888150 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 96888297 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 96888303 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 96890637 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 96890650 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 96891938 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96892132 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 96892424 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96893024 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 96893194 C T Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 96893219 A G Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 96893331 A T Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 96893366 C A Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 96893377 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 96893431 G C Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 96894207 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 96895643 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96896090 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96896707 C T Y Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 96896858 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 96897094 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96897163 G C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 96897169 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 96897225 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 96897322 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96897438 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 96897462 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96897648 A G Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 96897651 A T Y N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 96898055 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96898071 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96898188 A G Y Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.272727272727273 0.727272727272727 0 14 8 3 8 0 3 96898369 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 96898734 T A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 96898757 G T Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 96899471 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 96899653 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96899841 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 96900014 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96900094 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96900130 C G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 96900222 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 96900252 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 96900269 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96900326 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 96900339 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 96900387 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 96900433 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96900679 T C Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 96900724 G C N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 96900813 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 96900832 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 96900859 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96900899 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 96901491 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96901530 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96901558 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96901637 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96901661 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 96901743 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96901849 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96902004 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 96902144 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 96902145 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 96902231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96902306 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96902311 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96902346 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96902377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96902610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96902653 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 96902842 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96902860 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 96902980 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96902989 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 96903013 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 96903235 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 96903252 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 96903359 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 96903402 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 96903405 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 96903523 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 96903550 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 96903737 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 96903759 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 96903869 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 96904025 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 96904030 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 96904069 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 96904841 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 96905152 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 96905304 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96905538 A T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 96905623 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96906429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96906473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96906640 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96906758 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96906981 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96907276 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96907312 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96907565 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96907574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96908182 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96908578 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 96908588 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 96908754 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 96908790 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96908895 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96908934 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0 0.764705882352941 0.235294117647059 13 21 0 13 4 3 96909051 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96909062 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96909067 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96909160 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96909203 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96909231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96909289 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96909363 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 96909416 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96909427 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 96909582 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 96909614 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 96909635 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 96909694 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96909758 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96909778 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96909779 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96909852 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96909894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96909900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96909925 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96909995 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96910009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96910013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96910021 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96910064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96910126 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96910127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96910158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96910172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96910194 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96910249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96910346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96910504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96910567 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96910662 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96910745 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96910856 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96911234 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96911267 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96911294 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96911346 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96911501 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96911539 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96911552 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 96911620 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 96911654 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96911799 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96911934 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96911953 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 96911991 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96912079 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96912098 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96912152 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96912242 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96912285 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96912348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96912367 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96912393 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96912437 T C N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0 0.9 0.1 9 11 0 9 1 3 96918754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96918971 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 96918976 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96919039 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 96919215 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96919282 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96919284 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96919312 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96919349 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 96919359 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 96919398 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 96919635 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96919912 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96920036 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 96920116 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 96920145 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96920170 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 96920418 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96920510 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 96920556 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 96920736 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 96920785 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 96920804 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 96920932 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 96920972 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 96921012 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96921153 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 96921253 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 96921388 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 96921404 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 96921413 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 96921428 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 96921723 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96921752 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96921820 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 96921838 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 96921839 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 96921863 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 96921911 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 96922017 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96922067 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 96922123 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 96922228 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 96922603 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96922677 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 96922776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96923340 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 96923352 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 96923354 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 96923379 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 96923473 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 96923509 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 96923579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96923604 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 96923706 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 96923750 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 96923764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96923795 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 96923920 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 96924235 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96924290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96924307 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96924416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96924422 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96924733 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96925347 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 96925809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96925813 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 96925821 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 96925870 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 96925964 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 96926044 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 96926067 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 96926104 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 96926158 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 96926510 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 96926688 T A N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 96926869 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 96927029 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 96927064 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 96927065 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 96927120 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 96927140 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 96927243 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 96927296 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 96927297 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 96927328 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 96927454 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 96927494 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 96927535 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 96927620 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 96927707 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 96928033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96928270 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96928283 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 96928365 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 96928366 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 96928578 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 96928797 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96929222 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 96929228 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 96929239 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 96929263 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 96929303 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 96929316 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 96929328 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 96929478 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 96929654 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 96929669 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 96929742 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 96929823 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 96929842 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 96929900 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 96929991 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 96930366 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 96930395 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 96930520 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 96930537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96930540 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96930697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96930873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96931023 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96931088 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 96931144 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96931175 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 96931296 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96931313 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96931397 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96931916 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96932258 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 96932426 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 96932444 A G Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 96932456 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 96932476 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 96932503 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 96932645 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 96932867 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96932898 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 96932973 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 96933002 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 96933112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96933204 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 96933237 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 96933262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96933480 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 96933495 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 96933593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96933695 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 96934148 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 96934263 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96934295 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96934599 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96934905 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96935254 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 96935960 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96936266 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96936378 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 96936566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96936604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96936616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96936949 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96937712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96937831 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 96937986 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96938059 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 96938320 C T Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 96938330 A T Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 96938332 T G Y N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 96938341 G C Y N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 3 96938372 C T Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 3 96938474 G T Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 96938574 C G Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 96938596 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 96939130 G T Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 96939778 C T Y Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 3 96940821 A G Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 3 96940867 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96941258 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96941951 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96941964 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96942166 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96943148 T A Y N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 3 96943281 G A Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 96943337 A T Y N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 96943470 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 96943540 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 96943619 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 96943707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96943731 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 96944314 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96944726 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96944984 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 96945489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96945600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96945622 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96945857 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96945966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96946037 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 96946185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96946211 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96946302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96946459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96946581 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 96946697 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 96946774 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 96946864 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 96947086 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 96947145 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96947244 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 96953527 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96953536 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96953700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96953741 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96953756 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96954119 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96954127 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96954326 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96954333 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 96954353 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96954380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96954487 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96954519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96954684 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96954775 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 96954800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96954804 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96954900 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 96954944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96954981 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96954999 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96955015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96955062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96955079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96955148 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96955211 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96955247 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 96955269 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 96955301 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 96955408 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 96955426 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96955486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96955742 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96955855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96955938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96955941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96956014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96956045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96956526 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 96956527 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 96957194 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 96957205 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 96957512 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 96957529 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 96957599 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 96957700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96957774 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 96957847 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 96958077 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 96958137 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 96958252 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 96958286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96959437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96959471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96959844 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 96960869 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 96961235 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 96961977 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96964186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96964582 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 96965242 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 96965999 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 96966151 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96966177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96966269 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96966757 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96966773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96966848 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96966921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96966925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96967510 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96967554 C A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 96967557 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 96968261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96970002 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 96970221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96974173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96974913 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96975049 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 96975624 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96975645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96975795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96977901 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96978014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96978527 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96978748 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 96978885 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96978926 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 96979037 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96979120 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96979192 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 96979332 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96979379 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96979818 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 96979841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96979878 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96979994 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 96980223 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 96980570 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96980812 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 96980862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96981006 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 96981174 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 96981196 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 96981209 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 96981291 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 96981328 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 96981365 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 96981445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96981585 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 96982044 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96982510 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96983611 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96983936 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 96984069 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 96984301 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 96984366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96984670 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 96985788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96989291 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96990895 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96991996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96993133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96994062 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96994593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96995104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96996464 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96997283 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 96998457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 96999135 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 96999620 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 96999977 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 96999990 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 97000292 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97001276 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 97001333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97002196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97004567 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97005914 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97006527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97006581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97007366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97007391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97011591 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 97013257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97022573 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 97025924 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97026889 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97027575 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97027598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97029407 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97032004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97033010 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97034550 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 97036848 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97036852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97036904 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97036996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97037334 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97038961 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97039481 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 97040585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97041761 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97042043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97042140 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 97042151 C A Y N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 3 97043347 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 97043467 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97044858 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 97045413 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 97045811 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97046367 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 97046711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97048226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97048256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97048636 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 97057139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97057267 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97062682 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97063124 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 97063286 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97063478 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97063573 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 97063607 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97063613 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97063692 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97063727 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97063766 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97064179 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97064299 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 97064382 C A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 97067786 T G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 97070709 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 97070721 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 97071760 A C N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 97071876 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 97072058 T G Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 97072209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97073493 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 97073574 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 97073912 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97074078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97075063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97075218 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 97075500 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 97075641 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 97075843 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 97076051 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 97076225 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 97076297 A C Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 97076333 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 97076360 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 97077514 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97077726 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 97078553 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 97078653 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 97078859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97079550 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97079564 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97079915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97079947 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97080791 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 97080810 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97080820 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97080860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97082817 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 97083272 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97087197 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 97087209 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97087331 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 97087685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97088205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97091753 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97093539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97094274 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 97095374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97097485 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 97097782 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97099070 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97102623 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 97102646 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 97103711 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 97106386 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 97107451 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 97107770 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 97108225 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 97108372 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97108674 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 97108707 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 97109070 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97109223 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 97110042 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 97110043 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 97110281 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97110498 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 97110579 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 97110647 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 97110659 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 97110725 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 97110730 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 97110749 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 97110750 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 97110864 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 97110936 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 97110981 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 97110996 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 97111017 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 97111059 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 97111062 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 97111106 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 97111118 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 97111227 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 97111238 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 97111241 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 97111324 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 97111337 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 97111387 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 97111404 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 97111491 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 97111503 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 97111588 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 97111651 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 97111862 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 97112509 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 97112806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97112840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97112857 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97112909 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97112961 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 97113008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97113012 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97113330 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 97113481 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97113626 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97113638 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97114078 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 97114321 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 97114382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97114441 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 97114589 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 97114687 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97115935 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 97116568 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97116591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97116654 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 97116662 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 97116753 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 97116782 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 97116919 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 97116942 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 97116974 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 97116981 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 97117103 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97117134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97117137 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97117221 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 97117401 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97117418 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 97117528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97117534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97117705 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 97117834 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97117897 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 97118573 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 97118705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97118745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97118783 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 97118821 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97119958 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97120163 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0555555555555556 0.722222222222222 0.222222222222222 15 21 1 13 4 3 97120197 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 97120265 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 97120687 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97120894 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97121217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97121431 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97121547 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 97122023 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97122083 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 97122200 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 97122244 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 97122259 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 97122293 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97122355 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 97123225 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 97123470 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 97124133 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97124644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97124948 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97125046 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97125630 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 97126803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97126957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97127007 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97127578 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 97127592 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 97127838 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 97128360 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97128365 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97128372 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 97128384 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 97128442 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 97128617 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 97128673 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 97128704 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 97128735 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 97129027 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 97129353 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 97129608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97130220 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 97132071 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97132983 G T N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 10 20 0 10 5 3 97133424 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 97133485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97134044 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97136282 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 97137562 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 97137898 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 97137952 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 97138084 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97138109 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97138201 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 97138325 A C Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 97139627 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 97139686 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 97139958 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 97140875 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97140902 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97145691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97149691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97152672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97153319 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97153622 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 97153658 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97155423 C G N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 97157144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97157521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97159064 T A Y N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0 0.846153846153846 0.153846153846154 11 15 0 11 2 3 97161142 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97161218 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97161731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97162225 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 97162395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97162476 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 97162478 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 97162521 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97162541 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97163707 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 97163893 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 97164799 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97165945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97166030 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 97166090 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 97166102 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 97166104 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 97166155 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97166156 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 97166188 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 97166392 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97166565 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 97166871 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 97166877 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 97166939 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 97167099 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 97167573 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97167574 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 97168147 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 97168481 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 97168694 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97168751 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97168790 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97169286 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 97169704 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97169736 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97169739 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97169858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97169870 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 97169879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97169907 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 97170061 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 97170340 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97170370 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 97170374 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97170439 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97170496 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 97170594 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97170823 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 97170839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97170897 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97170933 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 97171156 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 97171279 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 97171300 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 97171333 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 97171880 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 97172065 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 97173427 A G N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 3 97173631 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 97173774 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 97176611 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97176947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97177194 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97177196 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97177715 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97178786 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 97180750 G C Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 97180954 T C Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 97180984 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97181067 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 97181070 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 97181100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97181197 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 97181347 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97181762 A G Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 97182296 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 97183155 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 97183257 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 97183355 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 97183400 C A Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 97183475 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 97183701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97183811 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 97183917 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97184257 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97184554 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 97184944 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 97185476 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 97185751 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 97186028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97186250 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 97186801 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 97186972 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97187274 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97187394 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97187671 C T Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 97187939 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 97188121 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 3 97189769 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 97190033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97190127 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 97190181 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97190394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97190602 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 97190673 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97191764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97191847 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 97191921 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 97192970 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 97192982 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 97193140 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 97193329 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 97194019 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 97194614 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 97194657 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 97194974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97195260 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 97195390 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97195627 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 97195655 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 97195678 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 97195792 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 97195819 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 97195842 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97195867 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 97195976 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 97196015 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 97196108 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 97196149 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 97196169 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97196199 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 97196245 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 97196246 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 97196290 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 97196321 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 97196382 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 97196454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97196587 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 97196603 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97196662 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 97196671 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97196882 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97197062 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97197088 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 97198020 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 97198225 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97199621 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 97199714 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 97200012 A C N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 97200113 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 97200179 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 97200192 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 97200197 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 97200231 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 97200313 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 97200358 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 97200388 A G Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 97200406 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 97200446 T C Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 97200457 G T Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 97200502 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 97200506 G T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 97201240 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 97201337 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 97201477 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 97201495 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 97201614 C G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 97201659 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 97201887 T G Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 97201890 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97202287 T C Y Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 97202410 T C Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 97202445 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 97202532 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 97202826 G T Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 3 97202830 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 97202850 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 97202901 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 97202924 T C Y Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 97202944 A C Y N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 97202995 G A Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 97203030 A T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 97203064 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 97203441 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97203462 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 97203580 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 97203597 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 97203651 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 97203852 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 97203985 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97204034 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97204251 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 97204326 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 97204430 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97204525 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 97204548 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 97204598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97204607 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97204661 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97204784 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 97204855 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97205052 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 97205250 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 97205403 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 97205435 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 97205525 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 97205600 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 97205615 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 97205739 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 97205798 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 97205820 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 97205927 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 97205943 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 97205986 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97206347 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 97206584 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 97206803 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 97207246 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 97207508 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97207580 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 97207723 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97207932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97207991 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97208015 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 97208121 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 97208487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97209037 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 97209403 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 97209609 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 97210129 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 97210133 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97210389 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 97210954 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 97211528 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 97211779 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 97211943 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 97212503 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97212740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97213880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97222921 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 97225854 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97226546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97226707 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97229669 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 97234876 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97244572 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97256384 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97256508 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 97257472 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 97262352 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97263441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97263965 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97267141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97273074 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 97273143 T G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 97274513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97280243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97280822 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97281061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97281645 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 97287757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97289996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97290150 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97290200 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 97290267 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97297887 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0 0.75 0.25 12 20 0 12 4 3 97298416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97299487 C G Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 97299696 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 97299792 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 97303553 A G Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 97305868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97306105 G T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 97306326 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97306344 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97306591 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 97306675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97306898 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97307199 A G Y Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 97308222 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97308575 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97309405 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 97311742 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97312505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97312795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97314600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97314694 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97314717 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97315421 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 97315815 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97315981 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 97316549 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 97316550 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97316597 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97317620 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97319930 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 97319941 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 97320000 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 97322251 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 97323749 C T Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 97323961 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 97324100 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97324232 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97324254 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97324265 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97324287 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97324298 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97324311 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 97324442 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 97324475 A G N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 97324506 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 97324649 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97324754 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97324950 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97325188 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 97325357 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 97325774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97326278 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 97327011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97327020 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 97327171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97327416 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97327464 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 97328089 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97328608 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97328903 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 97328955 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97329044 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 97329103 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97329608 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 97330117 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 97330218 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97330343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97330792 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 97330891 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 97330966 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 97330999 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 97331035 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 97331044 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 97331123 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 97331125 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 97331493 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97331724 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 97331823 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 3 97332051 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 97332136 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 97332228 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 97332240 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 97332265 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 97332327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97332525 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 97332656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97332701 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 97332783 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 97332911 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 97332950 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 97333049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97333287 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 97333455 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 97333510 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97333529 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97333595 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 97333787 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97333812 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97333844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97334235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97334482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97335220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97335462 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97336140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97336274 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 97336281 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 97336747 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 97336793 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 3 97336864 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 97337511 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 97337523 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 97338041 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 97338291 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 97338740 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97339163 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 97339824 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97340100 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97340352 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97340366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97340651 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97340678 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 97340680 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 97340764 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97341128 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 97341268 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 97341995 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97342033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97342114 T G Y N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 97342502 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 97342503 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 97342622 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97342929 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97343199 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 97343467 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 97343587 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97344242 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97344384 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 3 97344771 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 97344813 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 97344846 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97344964 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97345169 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 97345306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97345333 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97345425 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97345540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97345703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97345721 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97345738 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97345761 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97345890 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 97345922 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 97346276 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97346465 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 97346619 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 97346740 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 97346783 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97347005 G C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 97347009 G T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 3 97347936 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97350036 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97351376 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97351377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97351912 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97353483 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 97353541 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97353962 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97354351 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97354643 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 97355447 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 97355521 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97355919 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 97355980 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 97356110 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 97356437 A G N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 97356746 T G N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 3 97357331 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 97357475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97357488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97357721 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97357900 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 97358021 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 3 97358048 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 3 97358141 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 3 97358150 T G N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 3 97358242 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 3 97358277 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 97358344 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 97358458 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 97358511 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 97358609 A G Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 97358632 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 97358636 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 3 97358711 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 97358737 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 97358842 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 97358850 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 97359032 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.578947368421053 0.105263157894737 0.315789473684211 24 14 11 2 6 3 97359107 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.578947368421053 0.105263157894737 0.315789473684211 24 14 11 2 6 3 97359177 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 97359303 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 97359316 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 97359400 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 97359418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97359829 T A Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 97359848 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97359943 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97359995 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 97360021 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97360038 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 97360098 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97360116 T A N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 97360321 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 97360344 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97360487 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 97360534 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 97360547 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 97360557 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 97360638 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 97360654 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 97360655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97360693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97360970 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 97360976 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 97361330 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 97361732 T A N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 97361741 T A N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 97361782 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 97361844 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 97361878 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 97361881 G T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 97361899 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 97361919 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 97361945 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 97362007 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97362096 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 97362135 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 97362464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97362477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97362717 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 97362928 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97362936 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97362949 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 97362969 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 97363147 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 97363167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97363183 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 97363226 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 97363246 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 97363390 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 97363417 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97363739 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 97363834 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 97363862 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 97363876 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97364138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97364433 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97364495 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 97364638 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 97364700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97364776 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 97364948 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 97365029 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 97365118 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 97365152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97365480 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 97365586 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 97366223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97366798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97369174 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 97369545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97370011 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 97370015 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 97370045 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97370046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97370428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97370502 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97370528 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97370534 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97370583 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 97370794 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97370809 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97370844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97370856 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97371029 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97371037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97371133 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 97371190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97371348 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 97371431 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97371447 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 97371504 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 97371776 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97371981 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97372052 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 97372057 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97372235 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 97372393 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97372400 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97372412 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97372443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97372605 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 97372770 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 97372783 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 97372789 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 97373342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97373373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97373412 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 97375727 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 97376192 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 97376219 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 97376406 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 97376415 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 97376669 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 97376705 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 97376855 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97377285 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 97379099 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 97379655 T C Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 97379783 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 97381090 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97381207 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 97381773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97384114 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97384805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97384921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97385344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97385857 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97386408 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97387555 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 97387574 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 97388742 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 97389932 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97389933 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97390120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97390995 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97392408 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 97392596 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 97392713 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97395359 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 97397418 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97397919 A T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 97398695 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97398778 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 97398790 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 97398975 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 97399158 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 97399293 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 97399381 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 97399528 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 97399813 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 97399901 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 97399902 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 97399926 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 97399947 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 97399956 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 97400166 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 97400796 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97400988 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 97401181 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97401244 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97401344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97402071 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 97402594 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97402858 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97403067 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 97403209 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 97403228 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 97403310 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 97403358 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 97403369 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 97404253 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 97404255 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97404874 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 97404892 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 97404938 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 97404968 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97405027 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97405656 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 97405931 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 97406169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97406186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97406347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97406542 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97406546 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97406630 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97406637 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 97406697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97406822 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97407217 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97407514 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 97407865 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 97408275 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 97408930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97408965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97409271 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 97409931 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97411011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97411142 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 97411319 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97412450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97414012 G T N N 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 6 8 2 2 3 3 97414034 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 97414088 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.214285714285714 0.142857142857143 0.642857142857143 8 20 3 2 9 3 97414138 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 97414301 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97416748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97417095 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97417308 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97418156 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 97421299 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 97421348 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 97422156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97423404 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 97423969 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97424808 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97424922 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 97424933 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97425659 C T Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 97425758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97425869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97426220 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 97426325 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 97426439 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97426740 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 3 97427472 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97428085 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 97428213 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 97428214 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 97428703 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 97429129 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 97429146 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 97430064 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 97430222 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97430706 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 97430975 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97430995 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97431020 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 97431162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97431165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97431258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97431525 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 97431829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97432100 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97432159 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97432188 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97432730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97432752 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97433510 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97434502 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 97435188 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 97435415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97435491 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 97436663 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 97436960 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97436984 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 97437132 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97437149 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 97437481 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97437715 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 97437729 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 97438357 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 97438558 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97438965 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 97439356 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97439404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97439700 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 97440015 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 97440521 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 97440529 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 97444082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97445283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97445934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97446664 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97446696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97446835 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 97446925 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 97447001 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97447111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97447184 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 97447298 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97447401 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97448096 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 97448232 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 97448510 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 97448512 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 97448552 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 97448841 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 97448922 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97448923 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97448933 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 97448946 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97448955 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 97449247 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 97449282 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 97449916 C T N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 3 97449921 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 97450413 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 97450595 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97450748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97450879 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97451014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97451081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97451341 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97451531 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97451894 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97452099 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97452224 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97452251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97452400 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 97452483 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97452573 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97452723 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 97452775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97452850 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 97452912 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 97453409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97453486 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97454411 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97455067 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 97456317 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 97456380 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97456710 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 97457003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97457109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97457200 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97457234 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97457235 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97457789 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97458102 A G Y Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 11 7 2 7 0 3 97458436 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97458500 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97458689 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 97458782 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 97458831 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97459425 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97460957 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 97461957 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97465955 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97467197 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97467942 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 97468308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97470452 C G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 97471778 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97471782 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97472249 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 97475465 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 97477400 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97478793 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 97478961 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97479556 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 97479919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97480093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97480347 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97481181 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 97483321 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 97483357 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 97483460 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 97483611 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97483850 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97486393 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97486880 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97487175 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97487486 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 97488285 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 97488295 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97488796 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97491903 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97492354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97492778 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 97492802 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 97493336 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97493390 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97495323 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 97499309 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97500341 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97500525 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 97500646 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97500659 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97501718 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 97501732 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 97501947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97502739 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 97502993 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 97503437 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 97504884 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 97505274 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 97506523 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97507091 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 97507234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97507256 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 97507426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97507540 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97507587 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97507593 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 97507804 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 97508155 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 97508181 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 97508191 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 97508223 G C N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 3 97508278 G C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 97508436 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 97508592 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 97508895 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 97510484 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 97511426 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97511598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97511848 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 97511970 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 97512500 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 97512504 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 97512701 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 97512745 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 97512791 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 97512815 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 97512859 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 97512872 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 97512959 A C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 97512971 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97513004 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 97513073 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 97513276 G T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 97513307 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 97513366 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 97514862 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97514990 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 97515109 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97515250 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97515254 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97515385 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97515864 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97515915 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97516007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97516082 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97516109 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97516199 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97516392 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97516401 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 97516439 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 97516514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97516607 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 97516662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97516675 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 97516698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97516705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97516753 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 97516794 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 97517220 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 97517308 C A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 97517801 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97518169 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97518362 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 97518591 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 97518593 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 97518714 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 97519204 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97519219 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 97519408 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 97519768 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 97519963 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 97519980 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 97520024 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 97520066 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 97520158 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 97520357 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 97520408 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 97521179 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 97521197 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 97521678 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 97521708 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 97521716 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 97521820 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 97522634 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 97523036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97523051 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 97523559 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 97523802 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 97523827 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 97523828 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 97523875 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 97523992 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 97524053 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 97524356 G C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 97524557 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 97525180 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 97525243 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 97525331 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 97525654 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 97525798 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 97526127 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 97526263 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 97526320 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 97526486 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 97526656 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 97527056 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 97527698 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 97529231 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 97529669 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 97529783 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 97530510 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 97530519 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 97530598 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 97530857 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 97530860 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 97531101 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 97531216 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 97531279 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 97531582 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 97531608 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 97531654 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 97531682 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 97531746 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 97531869 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 97531916 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97532652 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 97532734 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 97533000 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 97533646 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 97533706 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 97533838 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 97534069 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 97534159 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 97534383 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 97534646 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 97534999 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 97535009 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 97535109 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 97535457 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 97535560 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 97535746 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 97535865 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 97536151 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 97536449 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 97536840 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 97536891 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 97537076 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 97537237 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97537243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97537253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97537301 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97537582 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97537977 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 97538021 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 97538646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97539193 C T Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.0588235294117647 0.823529411764706 0.117647058823529 16 18 1 14 2 3 97539565 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97539713 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97540578 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97541948 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 97541974 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97542883 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 97543824 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 97543841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97544044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97544354 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 97544668 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 97544745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97544792 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97545011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97545025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97545355 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97545409 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97545768 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97545808 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 97545940 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97545965 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97545989 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 97546234 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 97546296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97546335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97546990 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 97547230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97547492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97547545 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 97547824 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 97548021 T C N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 12 16 2 8 4 3 97548053 T C N Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 6 8 0 6 1 3 97548826 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 97549362 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 97549729 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 97550105 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 97550482 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97550867 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97550976 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 97551140 G T N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 97551552 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 97551583 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 97551756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97552001 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 97552135 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 97552192 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 97552710 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 97552765 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 97553211 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 97553214 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 97553284 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 97553306 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 97553313 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 97553325 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 97553470 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 97553827 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 97553856 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 97554054 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 97554085 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97554128 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 97554241 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 97554422 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 97554517 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 97554742 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97554919 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97554923 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97555049 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 97555169 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 97555339 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 97556045 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97556963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97557710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97557735 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97557967 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 97558004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97558336 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 97558344 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 97558367 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 97558442 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 97558601 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 97558637 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 97558785 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 97558937 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 97558952 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 97559027 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 97559672 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 97559717 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 97559747 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 97559817 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 97559979 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 97560096 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 97560156 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 97560493 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 97560537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97560626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97560695 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97561030 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97561044 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97561959 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 97562063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97562089 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 97562313 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 97562451 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97562591 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 97562696 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 97563120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97563196 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97563294 T A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.1875 0 0.8125 6 26 3 0 13 3 97563357 T A N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 3 97563376 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 97563412 A G N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 3 97563426 G C N N 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 6 10 2 2 4 3 97563569 G A N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.615384615384615 0.0769230769230769 0.307692307692308 17 9 8 1 4 3 97563628 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 97563660 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97563836 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 97564348 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 97564385 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97564538 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97564596 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97564663 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 97564716 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 97564762 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 97564922 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 97564935 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 97564944 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 97565040 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 97565094 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97565576 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 97565749 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 97565811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97565893 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 97565895 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 97567264 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 97568587 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 97568664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97569028 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 97569924 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97571111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97572997 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 97576380 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97577708 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97578202 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 97578272 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 97578382 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 97578885 C G N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 97578967 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97579199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97580439 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97580469 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97580865 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 97580945 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 97581196 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97581295 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 97581538 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97581562 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 97581772 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 97581787 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 97581791 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 3 97581854 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 97582002 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 97582006 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 97582063 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 97582129 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 97582200 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 97582223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97582544 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97582824 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 97582836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97582854 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 97583019 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 97583046 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97583077 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 97583111 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 97583147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97583431 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 97586413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97588330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97589567 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 97589871 T G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 97589888 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 97589901 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 97590185 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 97590287 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97590342 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97590675 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97590920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97590971 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 97590985 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 97590993 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 97591001 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 97592393 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 97593133 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 97593185 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 97593395 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 97594026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97594278 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 97594310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97594607 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 97594766 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 97594792 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 97594830 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 97594841 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 97594933 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 97595312 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 97595444 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 97595453 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 97595607 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 97595913 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 97595977 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 97595994 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 97596162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97596177 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 97596708 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 97596831 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 97596965 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97596986 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 97597264 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97597331 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97597717 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 97598142 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 97598178 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97598182 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97598205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97598218 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 97598537 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 97598538 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 97598593 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 97598598 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 97598622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97598703 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 97598997 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97599048 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 97599312 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 97599505 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 97599532 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97599883 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 97600308 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97600618 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97600621 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 97600647 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97600822 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 97600844 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97600866 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 97600894 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 97601053 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97601107 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97601127 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 97601706 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 97601881 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 97602405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97603045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97603463 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 97604082 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97607699 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97608029 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 97608777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97609783 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97609958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97611181 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97611768 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97611930 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97611944 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97612519 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 97612877 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 97614111 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 97614340 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 97614465 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 97614487 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 97614630 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 97614823 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97614897 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 97615108 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 97615152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97615599 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 97616220 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 97616252 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 97616271 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97616296 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 97616332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97616558 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97617100 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 97617195 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 97617387 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 97617605 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 97617989 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 97618075 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 97618112 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 97618161 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 97618266 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 97618317 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 97618352 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 97618368 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 97618385 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 97618483 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 97618517 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 97618682 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 97618702 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 97618718 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97619058 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 97619076 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 97619078 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 97619472 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 97619481 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 97619516 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 97619540 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 97619585 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 97620190 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 97620202 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 97620403 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 97620562 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 97620595 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 97620774 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97621932 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97623596 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 97623611 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97623660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97623886 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 97623919 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97624472 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 97624589 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 97624626 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 97624712 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 97624807 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 97624885 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97624886 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 97625139 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 97625152 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 97625379 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 97625381 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 97625404 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 97625476 C G N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 97625585 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 97625592 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 3 97625931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97626062 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97626184 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 97626219 C G Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 97626270 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 97626355 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 97626531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97626624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97626693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97626746 G T Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 97626761 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 97626768 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97627170 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97627179 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97627196 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97627325 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97627349 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97627420 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97627635 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97628374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97628594 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 97628867 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97629289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97629896 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 97629907 G C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 97630431 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 97630432 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 97630522 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 97630832 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 97631319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97631430 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97631567 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 97631631 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97631779 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 97631793 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 97631840 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97631876 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97632119 T A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 97632211 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 97632748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97632760 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97632773 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 97632783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97632847 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 97632962 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97633384 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 97633476 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 97633477 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97634258 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97634410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97634747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97635641 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 97635805 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 97635835 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 97635866 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 97635890 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97635949 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 97635978 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 97636051 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 97636056 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97636171 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97637027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97638075 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 97638469 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 97638800 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97639058 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97639062 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97639070 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97639084 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97639089 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97639102 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97639111 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97639186 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97639230 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 97639340 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 97639341 G C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 97639379 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 97639577 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 97639596 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 97639684 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97639744 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97639784 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97640003 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97640066 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 97640119 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97640261 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97640347 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 97640394 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 97640434 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 97640436 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 97640445 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 97640448 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 97640457 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 97640462 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 97640602 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 97640617 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 97640619 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 97640695 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 97640765 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 97640795 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 97640894 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 97640926 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97641005 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97641020 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97641083 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97641109 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 97641244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97641607 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97641765 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 97644383 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97645137 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97645837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97646014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97646175 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 97646304 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 97647163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97648406 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97648714 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97649500 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97650153 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97650386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97650503 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 97651026 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97651382 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 97652498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97656485 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97656510 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97656790 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97657324 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97657510 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 97657912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97658638 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 97659405 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 97659662 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 97663029 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 97663345 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97663590 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97663606 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97663704 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97663805 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 97663819 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 97663885 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 97663993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97664004 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 97664118 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 97664265 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 97664357 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97664407 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97664521 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 97664721 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97664733 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 97665515 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 97665516 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 97665555 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 97665704 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 97665819 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 97665867 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 97666022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97666112 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 97667194 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97667525 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 97668165 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 97669478 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97669509 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97670501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97671256 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97671319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97671620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97671867 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97671869 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97672303 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 97672670 G C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 97672692 T G Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 97672784 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97672860 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 97672913 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97672914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97673006 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97673126 G C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 97673149 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 97673162 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 97673356 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 97673369 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 97673379 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 97674536 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 97674565 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 97674677 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97674838 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97675246 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 97675248 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 97675264 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 97675351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97675883 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97675975 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 97676860 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 97677236 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 97677370 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97677377 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 97677562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97677742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97677993 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97678109 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 97678468 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 97678577 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97678586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97678750 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 97678797 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 97679067 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97679117 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97679232 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97679256 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97679283 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97679310 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 97679419 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 97679424 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 97679550 A G N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 3 97679594 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 97679602 G T N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 97679930 G T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 3 97680028 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97680047 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97680221 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 97680259 A T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 97680403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97680471 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 97680597 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97681344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97681422 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97681721 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97681772 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97681899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97682217 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97682452 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 97682489 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 97682509 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97682575 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97682748 T G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 97682763 C A N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 97682807 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 97682963 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 97683102 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97683157 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97683161 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97683443 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 97683568 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97683797 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97684033 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97684061 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97684171 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97684243 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97684335 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 97684387 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 97684396 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 97684455 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97684475 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97684555 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 97684580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97684596 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97684691 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 97685258 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 97685621 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97685646 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97685752 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97685794 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97685814 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97685835 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97685894 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 97686134 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97686198 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 97686237 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 97686410 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 97686421 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 97686464 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97686544 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 97686669 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 97686691 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97686758 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 97686904 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 97686907 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 97686944 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 97686959 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 97687040 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 97687102 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 97687192 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 97687292 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97687341 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97687357 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 97687416 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 97687773 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97687970 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97688080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97688231 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97688779 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97688837 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 97688862 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97688919 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 97688991 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 97689181 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 97689221 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 97689276 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 3 97689335 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 97689361 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97689488 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 97689510 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 97689584 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 97689602 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97689662 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 97689727 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97689743 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 97689926 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 97689972 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 97690028 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 97690072 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 97690105 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 97690209 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 3 97690252 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 97690297 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 97690341 T A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 3 97690440 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 97690584 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 97690673 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97690878 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 97691082 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 97691114 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 97691153 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 97691291 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 97691374 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 97691378 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 97691524 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 3 97691714 C T N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.0909090909090909 0.545454545454545 0.363636363636364 8 14 1 6 4 3 97691969 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97692017 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97692955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97693271 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 97693715 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 97693802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97693958 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 97694290 A T Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 97694308 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 97694363 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 97695286 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97695334 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97695430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97695946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97696118 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97696701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97696916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97697341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97697812 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97701556 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97703115 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 97705230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97710002 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97711954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97712393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97714329 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97718490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97718890 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97719065 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 97719385 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97719699 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 97720032 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 97720047 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 97720778 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97721186 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 97722804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97723923 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97724086 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 97727220 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 97728083 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97729098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97730034 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97730041 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 97730214 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 97730391 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97730546 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 97733274 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97733704 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 97735890 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 97736077 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 97736812 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 97737208 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 97737370 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 97738111 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 97738274 A T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 97738340 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 97738356 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 97738366 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 97738455 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 97738475 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 97738492 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 97738507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97738508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97738596 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 97738605 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97738626 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97738810 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 97738954 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97739425 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 97739788 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97739889 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 97740281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97740383 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 97740709 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 97741011 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 97741027 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97741131 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97741800 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97741967 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 97742396 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97742484 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97742757 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 97742823 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 97742997 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 97743225 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 97743429 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97743557 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 97743751 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 97744389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97744433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97744524 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97744866 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 97745054 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97745223 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97746009 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97746178 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97746201 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97746832 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 97746906 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 97747183 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97747408 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97747659 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 97748036 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 97748075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97748159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97748399 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97748603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97749097 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 97749328 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97749567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97749595 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97749762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97749774 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97749845 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 97749917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97750077 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 97752740 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 97752852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97752984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97753079 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 97753723 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 97753955 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 97754102 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 97754168 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 97754191 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 97754200 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 97754315 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97754726 A G N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 97754735 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 97754737 T G N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 97756005 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 97756058 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 97756067 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 97756124 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 97756141 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97756142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97756402 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 97756644 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 97756689 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 97756701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97756778 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 97756817 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 97756873 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 97756927 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 97756932 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 97756960 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 97757041 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 97757132 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 97757223 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97757248 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97757316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97757415 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 97757638 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 97757820 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97757992 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 97758016 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97758362 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97758641 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97758765 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97759040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97759099 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 97759240 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 97759763 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 97760693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97761525 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 97761768 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97762039 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 97762185 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97762242 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97762346 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 97762552 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 97763569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97763578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97763786 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 97763866 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97763917 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97764176 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 97764345 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 97764356 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 97764397 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 97764403 G A N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 97764444 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97765093 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 97765192 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97765202 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 97765263 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 97765265 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 97765341 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 97765353 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 97765529 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97765648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97765754 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 97765800 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 97766463 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 97766538 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 97766565 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 97766993 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 97767210 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 3 97767255 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.555555555555556 0.111111111111111 0.333333333333333 11 7 5 1 3 3 97767375 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 97767462 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 97768134 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 97772191 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97772261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97773048 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97773106 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 97773512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97774755 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97775099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97775102 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97776331 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 97776720 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97776736 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97776764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97777175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97777699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97778386 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 97779402 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97779949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97780711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97781394 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97781632 C A Y N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 3 97785283 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97786201 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 97787418 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97788951 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97789147 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 97789349 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 97789444 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97791675 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 97792601 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97795185 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 97795761 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97796213 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 97796963 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97797292 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97797297 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97797431 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 97797513 A T N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 97797675 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97797796 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97797808 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 97797875 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 97798036 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 97798401 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97798412 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97798413 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97798843 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 97798900 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97798908 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 97799054 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 97799150 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97799255 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97799920 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97800377 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 97800430 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 97800991 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97802151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97802374 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97802440 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97802588 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97802612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97803225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97803327 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97805108 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 97805156 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 97805277 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 97805296 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97805836 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97805838 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 97806231 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 97806438 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97806603 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 97806610 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97807125 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97807643 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 97807864 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 97807944 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 97808036 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 97808235 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 97808350 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97808601 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 97808610 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 97808617 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.263157894736842 27 11 13 1 5 3 97808744 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97809595 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 97809614 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97810381 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 97811155 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 97811275 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97811449 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97811461 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97811463 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 97811493 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 97811505 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 97812571 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97812603 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97812641 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 97812797 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97812812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97812908 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 97813029 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 97813041 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 97813076 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 97813154 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97813983 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97817109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97817753 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 97818295 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97819364 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 97819827 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 97820496 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97820702 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 97820704 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 97820714 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 3 97822360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97822622 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 97822937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97822968 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 97823024 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 97823033 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 97823310 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 97823378 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 97823940 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97824248 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97824303 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97824323 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97824375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97825396 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97825480 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97825535 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 97825719 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97825922 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97826503 A T N N 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 3 97826521 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 3 97826593 T C N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 97826870 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97826881 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97826884 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 97827550 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97827558 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 97827631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97827649 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 97827710 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 97827756 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 97827911 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 97828007 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97828530 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97829007 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97829118 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97829256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97829353 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97830135 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97831788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97834039 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 97834341 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 97834485 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 97835009 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 97835074 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 97835364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97837490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97838101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97838429 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97839012 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 97839106 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 97839342 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97840370 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97841798 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 97842288 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97842364 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97842491 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 97842565 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 97842704 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97842710 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 97842929 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 97843884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97844089 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 97844376 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 97844751 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 97845294 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97845872 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97845998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97847147 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97847528 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 97847784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97847875 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97848158 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 97848182 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 97848216 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 97848499 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.35 0.1 0.55 16 24 7 2 11 3 97848510 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 97848551 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 97848721 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97849344 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.35 0.1 0.55 16 24 7 2 11 3 97849389 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.333333333333333 0.111111111111111 0.555555555555556 14 22 6 2 10 3 97849702 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97849794 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 97850129 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 97851021 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97851051 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 97851104 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 97851877 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 97852272 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 97852506 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 97852605 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 97852627 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 97852886 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97852897 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 97853004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97853079 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97854021 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97855170 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97856170 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97856295 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 97857316 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 97857484 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 97857487 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 97857731 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 97857827 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 97858070 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 97858353 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 97858399 C G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 97858434 C A Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 97858460 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97859065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97859125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97859368 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97859551 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 97859680 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97859697 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97859819 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 97859843 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97859954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97860102 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97860414 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97860891 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 97861139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97861282 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 97861382 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97861383 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 97861482 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97861619 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97861620 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97861818 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97861866 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 97861912 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 97862198 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 97862259 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97862270 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97862321 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 97862537 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 97862745 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97863608 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 97863697 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97863859 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97863984 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97864013 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97864551 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97865199 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97865220 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97865270 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 97865286 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97866014 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97866015 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97866098 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97866704 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 97866745 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97866795 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97866891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97866987 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 97867042 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97867125 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 97867414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97867418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97867454 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 97867514 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 97867624 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 97867706 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97867772 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 97868281 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 97868423 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 97868437 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97868491 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 97868999 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 97869015 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97869346 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 97869375 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 97869578 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97869755 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97869760 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97869980 T A N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 97869994 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 97870107 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 97870185 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 97870229 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 97870870 A T Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 97871714 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 97871788 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97871852 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97872478 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97873715 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97873776 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97874084 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97874137 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 97874151 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 97874372 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97874486 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 97874681 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 97874714 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 97874870 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97874912 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97875162 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 97875204 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 97875269 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 97875306 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97875430 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 97875467 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 97875611 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 97875711 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 97875885 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97875933 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97876953 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97877319 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 97877358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97877477 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 97878169 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 97878185 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 97878415 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97878563 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 97878578 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97878580 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 97878907 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 97878931 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 97879391 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 97879463 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 97879623 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97879797 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 97880051 T C N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 97880083 C T Y Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 3 97880192 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 97880203 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 97880236 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 97880528 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 97880793 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 97880989 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 97881077 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97881186 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 97881237 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97881347 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 97881377 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 97881460 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 97881476 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 97881544 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 97881637 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 97881737 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 97881744 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97881806 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 97881808 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 97881861 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 97881869 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 97881948 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 97882015 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 97882104 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 97882792 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 97882960 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97882995 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 97883525 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97883852 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97883882 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97883943 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 97883973 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 97884049 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97884062 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 97884169 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 97884251 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 97884436 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 97884554 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97884973 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 97885072 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 97885141 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 97885346 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97885471 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97885700 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 97886571 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 97887683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97887685 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97888675 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 97888711 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 97888893 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97889023 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 97889516 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97889536 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97889673 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 97889729 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 97889866 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97889957 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 97890130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97890192 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 97890511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97890617 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97890625 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97890639 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97890701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97890992 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97891023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97891031 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97891212 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 97891303 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 97891397 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97891535 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97891551 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 97891602 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 97891821 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 97891850 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97891862 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97892062 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 97892155 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97892580 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97892646 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 97892731 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 97892791 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97893111 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97893191 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 97893341 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 97893479 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 97893746 G T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 97893747 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97893825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97894437 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 97894498 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97894635 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97895063 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 97895221 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 97895516 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 97895553 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 97897132 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97897134 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97897205 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 97897245 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 97897425 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 97897573 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97897644 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 97897706 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 97897756 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 97897998 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 97898047 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 97898123 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 97898233 G T N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 97898646 C T N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 97898973 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97899136 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97900033 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 97900367 C A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 97901154 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 97901316 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 97901367 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97902536 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 97902588 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97902618 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 97902703 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 97902886 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 97902915 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 97903021 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 97903106 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 97904389 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97905567 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97906834 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 97906945 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 97906993 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 97907381 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 97907422 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 97907474 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 97907507 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 97907688 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 97907749 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 97907793 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97907826 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97908184 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97909015 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97909454 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97909519 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 97909676 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 97909810 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97909942 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 97910087 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97910298 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 97910374 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 97910522 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 97910613 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97910717 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 97910952 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 97911019 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97911275 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 97911280 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 97911299 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 97911311 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97911457 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 97911596 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 97911669 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97911740 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97911877 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 97911964 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 97912053 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 97912231 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97912417 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 97912653 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 97912799 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97912867 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 97913007 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97913219 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 97913816 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 97914141 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 97914344 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97914372 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 97914637 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 97914972 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 97915077 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 97915128 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 97915949 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 97916464 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 97916494 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 97917084 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 97917591 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 97917971 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 3 97918076 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 97918084 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 97918137 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 97918146 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 97918263 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 97918314 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 97918598 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 97918656 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 97918866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97918898 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97919375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97919429 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 97919460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97919549 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97919703 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97919779 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 97919857 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97919913 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 97919951 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97920031 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97920087 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97920159 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97920185 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97920349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97920508 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 97920509 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 97920840 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97921667 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97921774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97921827 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97921835 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97922016 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97922054 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 97922182 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97922187 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97922211 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97922249 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 97922312 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 97922426 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 97922492 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97922494 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97922520 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97922696 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97922902 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97922958 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97923026 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97923053 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97923281 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97923309 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 97923328 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97923357 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 97923363 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97923399 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97923415 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 97923477 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97923493 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97923608 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97923622 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97923634 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97923788 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97923791 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97923883 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 97923905 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 97923984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97924017 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 97924115 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97924126 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 97924132 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97924169 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97924171 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97924229 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 97924251 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 97924335 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97924453 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97924489 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 97924503 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97924540 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97924620 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97925564 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 97925699 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97925716 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97926128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97926614 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 97926641 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 97926724 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 97926739 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 97926797 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 97926976 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 97926995 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 97927107 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 97927111 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 97927231 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 97927249 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 97927264 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 97927286 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 97927310 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97927440 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97927499 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 97927550 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 97927648 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 97928670 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 97930025 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 97930403 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 97931512 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 97932220 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 97934348 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 97935446 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 97936355 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97936569 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97936746 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 97936954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97936967 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 97936981 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 97937230 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97937247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97937325 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97937874 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97940412 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 97940953 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 97941672 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 97941704 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 97941810 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97942132 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 97942243 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 97942292 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 97942426 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97942504 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97942743 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 97943205 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97943321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97943370 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97943425 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 97943631 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97943853 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 97943932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97944239 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97944426 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 97944637 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97944665 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 97944815 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 97945087 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 97945125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97945148 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 97945160 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 97945180 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 97945267 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97945293 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 97945906 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97946119 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 97946133 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 97946238 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 97946371 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 97946372 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 97946410 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 97946440 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97946474 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97946512 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97946521 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97946555 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 97946557 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97946622 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97947149 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97947246 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97947401 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97947581 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 97947677 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 97947826 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 97947934 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97948200 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97948495 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97948527 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 97948598 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 97948649 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 97948682 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 97948707 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 97948777 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 97948830 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97948875 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 97948931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97949073 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97949091 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97949098 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97949122 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 97949229 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 97949292 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 97949309 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97949331 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 97949345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97949364 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 97949371 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 97949490 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 97949546 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 97949802 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 97949829 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 97949839 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 97949849 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 97949857 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 97949923 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 97951748 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 97951871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97951906 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97952161 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97952266 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 97952362 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 97952363 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 97952899 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 97952900 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 97953082 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 97953255 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 97953652 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 97954502 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 97954600 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 97954838 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 97954949 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 97955093 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97955118 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97955172 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97955180 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 97955200 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 97955394 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 97955424 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 97955451 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97955503 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97955551 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 97955571 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 97955591 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97955832 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97955854 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 97956024 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 97956031 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 97956346 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 97956353 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97956401 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 97956536 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 97956635 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97956653 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 97956751 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 97956852 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 97956864 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 97956865 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 97956974 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 97956977 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 97957028 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 97957480 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 97957583 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97957594 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97957670 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 97957755 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 97957881 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 97958027 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 97958262 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 97958284 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 97958586 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 97958923 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 97959542 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 97959600 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 97960277 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 97960488 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97960658 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 97960684 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97960688 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97960765 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 97960774 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 97960847 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 97960889 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97960921 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 97960954 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 97961219 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 97961237 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97961278 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97961681 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97961755 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97961814 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 97961910 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 97962011 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 97962436 G T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 97962813 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 97962998 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 97963072 G T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 3 97963297 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 97963355 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 97963525 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 97963706 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 97963890 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97964104 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 97964451 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 97965354 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 97965816 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 97965837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97966172 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97966752 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97967474 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97967542 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 97967547 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97967576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97967775 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 97967947 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 97968447 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 97968575 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 97968615 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 97968663 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97968843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97969231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97969490 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97969583 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97970381 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 97970494 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 97970599 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 97970820 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 97970861 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 97970893 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 97971035 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 97971174 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 3 97971217 C T N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 3 97971585 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 97972071 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 97972675 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97972791 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97972975 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97973127 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97973153 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97973213 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97973337 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 97973384 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 97973472 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97973541 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97974256 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97974288 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 97974432 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97974493 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97974625 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97974629 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97974653 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97974700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97974930 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97975613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97975686 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 97975695 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 97975877 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 97975891 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 97975940 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97975956 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 97976000 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 97976031 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 97976456 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 97976589 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97976635 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 97976638 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 97976662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97976740 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 97976774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97976776 G C Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 97976844 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 97976873 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 97976880 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 97976982 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 97977067 G A Y Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.0714285714285714 14 14 1 12 1 3 97977215 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 97977234 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 97977238 T G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 97977276 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 97977287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97977300 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 97977399 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 97977504 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 97977535 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 97977626 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 97977660 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 97977666 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 97977919 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 97977927 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 97977988 G T Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 97978002 C G Y N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 97978090 T A Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 97978276 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 97978478 C T Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 97978648 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 97978687 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 97978700 T G Y N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 97978716 T C Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 97978863 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97979006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97979826 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 97979830 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97980689 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97980830 T C Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 97980890 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 97980907 A G Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 97981088 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 3 97981095 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 97981207 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 3 97981232 A G Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 97981523 T A N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 97981666 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 97981701 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 97982277 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 97982306 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97982313 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 97982784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97983484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97983519 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 97983553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97983620 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 97983815 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97984500 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97986806 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97986901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97987428 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 97988267 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97988619 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 97988685 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 97988784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97989567 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 97989607 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 97989703 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 97990008 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 97990099 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 97990158 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 97990217 T A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 97990485 G T N N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.272727272727273 0.181818181818182 0.545454545454545 8 14 3 2 6 3 97990519 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 3 97990627 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 97990767 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 97990962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97991153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97991347 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 97991383 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 97991679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97991845 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 97991944 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 97991953 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 97991973 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 97992179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97992688 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 97992975 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 97993066 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 97993178 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 97993233 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 97993335 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 97993476 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 97993771 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 97993846 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 97994113 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 97994168 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 97994170 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 97994329 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 97994777 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97994815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97994835 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 97995059 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 97995080 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 97995200 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 97995308 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97995817 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 3 97996030 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 97996104 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97996168 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 97996289 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 97996324 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 97996354 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 97996387 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 97996431 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 97997132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97997136 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 97997336 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 97997581 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 97997691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97997768 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 97997825 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 97998082 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 97998315 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 97998350 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 97998489 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97998863 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 97999335 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 97999429 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 97999551 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 97999931 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98000035 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 98000086 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98000133 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98000315 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98000449 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 98000618 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98000653 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98000661 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98000723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98000728 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98000901 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 98000978 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 98001010 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 98001074 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 98001509 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 98001547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98001743 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 98001769 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 98001801 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 98001911 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98002428 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98002438 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98002563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98002688 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 98003145 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 98003239 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 98003386 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 98003467 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 98003499 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98004432 A G N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 12 8 3 6 1 3 98004466 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 98004496 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 98004777 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 98004814 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98004887 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98004937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98004963 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 98004973 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98005083 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 98005165 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 3 98005345 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 98005365 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 98005416 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 98005457 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 98005458 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 98005482 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 98005498 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 98005606 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 98005617 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 98005713 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 98005862 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 98005908 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 98005909 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 98005928 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98006209 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 11 7 3 5 1 3 98006214 T C N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 3 98006829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98006967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98007045 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 98007076 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98007178 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 98007454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98007677 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98007709 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98007727 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98008022 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98008050 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98008070 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98008211 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98008326 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98008344 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98008582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98008662 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 98008734 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 98008804 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 98008879 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98008910 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 98008925 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 98009226 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98009380 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98010101 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 98010504 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 98010675 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 98011847 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98012287 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98013821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98014241 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 98014266 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 98014526 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 98016683 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98017371 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98019150 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 98019531 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98019943 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 98020332 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98020343 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98020815 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 98020861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98021209 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 98021254 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 98021255 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 98022045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98023101 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98025555 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98026039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98027393 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98027608 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 98028005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98028799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98029298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98029406 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98029413 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98029478 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98030147 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98030636 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 98030708 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 98030729 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 98030777 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 98030873 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 98030946 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98031229 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 98031282 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 98031312 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 98031338 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 98031389 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 98031435 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 98031580 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 98031602 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 98031606 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 98031616 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 98031618 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 98031967 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 98032018 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 98032040 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 98032048 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 98032052 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 98032139 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 98032148 A C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 98032224 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 98032604 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 98032639 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 98032664 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 98032780 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 98032824 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 98032830 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 98032887 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 98032903 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 98032914 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 98032932 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 98032988 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 98032995 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98033002 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 98033012 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98033035 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 98033108 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 98033176 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 98033185 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 98033565 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 98033943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98033964 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98033979 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98034001 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98034028 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 98034350 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 98035033 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98035055 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 98035214 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98035273 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 98035298 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 98035561 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98035594 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 98035617 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98035642 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 98035663 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 98035749 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 98035795 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 98035834 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98035908 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 98035983 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 98036158 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 98036231 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 98036376 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98036488 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 98036565 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98036593 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98036637 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 98036648 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 98036762 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98036782 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98036830 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 98036942 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98037052 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 98037255 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98037402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98037451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98037452 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98037633 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 98037671 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 98038003 G T N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 14 18 0 14 2 3 98038260 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 98038263 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 98038296 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 98038380 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98038444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98038516 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98038658 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98038680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98038709 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98038830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98038836 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 98039013 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98039826 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 98040294 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98040303 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 98040427 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98041101 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98041369 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 98041410 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 98041734 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 98041762 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 98041786 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98041798 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98041870 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 98041878 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 98041901 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 98041956 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98042030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98042377 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 98042380 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 98042445 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 98042555 G T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98042577 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98042582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98042685 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98042728 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98042780 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98042919 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98042969 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 98043133 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98043144 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98043205 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98043209 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98043267 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98043410 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98043431 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98043671 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98043675 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 98043712 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 98043714 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 98043758 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 98043783 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 98043842 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 98043886 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98043887 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98043909 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98043967 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98044060 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98044194 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 98044389 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 98044869 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98046246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98046454 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98046463 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98046502 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 98046841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98047479 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 98047717 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98047861 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 98047907 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98048217 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 98048460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98048556 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 98048873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98049421 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98049476 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98049509 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98049522 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98049586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98049593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98049605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98049622 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98049651 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98049661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98049790 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98050063 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98050496 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 98050723 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 98050725 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 98051226 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98051496 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98052707 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98052774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98052832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98053980 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98054083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98054580 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98054590 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98056188 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98056698 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98057614 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 98057697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98057711 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98057735 G T Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 98057869 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98057929 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98058223 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98059248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98059483 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 98059873 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 98060212 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98060803 C G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 98061123 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98061337 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 98061476 T C N Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 6 6 2 2 2 3 98061603 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 98061788 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 98063177 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 98063206 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 98063250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98063281 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98063790 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 98064115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98064292 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98064866 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98066173 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 98066317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98066514 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98067711 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98067996 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98068398 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98069162 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 98069567 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 98069572 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 98069714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98069715 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98070729 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98071634 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 98071762 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98071880 T A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 98071882 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 98071905 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 98072055 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 98072068 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98072076 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 98072408 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 98072549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98073306 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98073391 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 98073791 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98074185 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98074387 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 98074728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98074911 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98074924 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98074930 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98075319 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98075342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98075357 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98075384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98075434 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 98075506 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 98075507 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 98075524 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 98075554 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 98075654 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 98075711 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 98075892 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 98075963 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 98076022 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 98076061 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 98076090 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 98076139 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 98076140 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 98076248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98076299 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98076312 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 98076319 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 98076497 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 98076744 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 98076762 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98076786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98077135 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98077306 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 98077392 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 98077927 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 98078087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98078099 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98078191 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 98078215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98078300 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 98078303 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 98078358 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 98078375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98078520 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 98078534 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 98078562 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 98078712 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98078802 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98078973 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98079337 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 98080036 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98080041 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 98080092 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 98080117 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 98080132 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 98080139 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 98080411 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 98080444 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 98080485 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98080581 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 98080629 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 98080682 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 98080698 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 98081026 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 98081070 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 98081099 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 98081100 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 98081277 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98081305 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 98081396 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 98081561 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 98081654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98082001 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 98082386 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 98082502 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98082627 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 98082801 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 98083109 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98083293 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98083402 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 98083504 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 98083567 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98083596 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 98083600 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 98083648 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 98083666 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 98085360 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 98085399 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 98085549 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 98085645 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98086375 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 98086388 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 98086422 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98086628 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98087131 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 98087132 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 98087236 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 98087263 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 98087282 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98087493 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 98087592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98087749 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98087843 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 98087875 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 98087961 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98088055 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 98088088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98088245 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98088254 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 98088531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98088559 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 98089224 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 98089530 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 98089546 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 98089566 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 98089807 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 98089859 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98089933 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98090013 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98090049 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98090219 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 98090242 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98090360 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98091618 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98091915 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98092189 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98092258 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 98092290 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98092315 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98092365 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 98092825 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98093273 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 98094450 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98098251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98098342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98099059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98099782 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 98099801 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 98099952 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 98100342 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 98100367 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 98100522 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 98100844 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 98101011 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 98101251 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98101494 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98101528 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98101741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98101770 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98101839 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98101863 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98101927 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98101932 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98101981 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98101988 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98102005 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98102014 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98102370 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 98102502 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98102665 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98102864 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98103157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98103237 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98103268 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 98103331 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98103550 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 98103608 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98104086 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98104231 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98104250 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98104257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98104331 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98104380 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98104579 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98104627 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98104710 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 98104726 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 98104744 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 98104754 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 98104776 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 98104809 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 98104815 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 98105107 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98105175 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98105240 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98105470 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98105657 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98105664 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98105687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98105707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98105881 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98105999 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98106005 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98106013 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98106019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98106029 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98106070 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98106134 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 98106517 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98106757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98106888 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 98106902 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 98107026 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 98107039 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 98107194 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98107286 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 98107372 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 98107555 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 98107582 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 98112390 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 98112673 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 98112947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98113848 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 98114039 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98114203 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98114321 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98114330 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98114355 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98114369 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98114371 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98114410 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98114416 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98114435 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98114504 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 98114578 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98114624 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98114648 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98114915 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98114926 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 98115025 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98115126 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98115131 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98115570 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98115904 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 98116067 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 98116235 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 98116357 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 98116655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98116829 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98116930 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 98117307 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 98117412 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 98117457 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 98117482 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 98117486 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 98117495 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 98117708 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 98117886 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 98117932 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 98117933 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 98118248 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98118513 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 98118641 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 98118646 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 98118946 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 98119069 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 98119177 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 98119215 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 98119222 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 98119260 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 98119299 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 98119320 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 98119395 T C Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 98119577 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98119770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98119818 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 98119873 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 98119910 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 98119912 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 98119928 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 98120037 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 98120071 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 98120086 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 98120223 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 98120815 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 98120962 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 98121415 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 98121639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98121772 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98122021 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 98122093 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98122109 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 98122671 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98122784 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 98122824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98123314 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98123346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98123425 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98123504 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98123534 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98124254 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98124293 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 98124360 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 98124367 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98124385 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 98124811 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 98124858 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 98124883 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 98124954 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 98125007 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98125057 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 98125079 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 98126201 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 98126264 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98126298 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 98126309 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 98126856 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98127547 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 98127628 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 98127684 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 98127714 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 98127769 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 98127773 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 98127790 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 98127798 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 98127856 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 98127922 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 98127927 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 98127935 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 98127987 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 98127993 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 98128008 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 98128093 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 98128188 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 98128200 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98128400 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 98128490 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 98128498 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98128555 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 98128586 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98128625 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98128640 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 98128645 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 98128691 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98128693 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98128750 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 3 98129381 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 98129395 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98129556 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 98129771 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 98130000 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 98130546 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 98131168 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 98131266 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98131306 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98131635 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98131672 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98131769 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 98132511 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98132604 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98132605 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 98132635 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98132694 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 98132729 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 98133221 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 98133235 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 98133844 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 98133897 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 98133972 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 98133976 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98134082 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98134640 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98134644 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 98134745 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 98134990 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 98135097 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 98135174 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98135408 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 98135500 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 98135514 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 98137315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98137515 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 98137963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98138047 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 98138057 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98138133 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 98138175 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 98138181 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 98138196 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98138210 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 98138268 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98138369 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 98138602 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 98138703 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98138741 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 98138836 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98138855 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98138870 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 98138873 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98140023 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98140130 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 98140252 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 98140343 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98140352 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98140409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98140618 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 98140784 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 98141092 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98141418 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 98141445 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 98141904 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 98142313 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 98143065 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 98143118 G A N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 98143317 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98143514 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 98144066 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98144616 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98145173 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98145284 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 98145322 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 98145427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98145757 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98146198 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 98146523 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 98146555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98146597 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98146687 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 98146699 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 98146970 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 98147031 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 98147192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98147391 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98149112 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 98149152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98149472 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98149481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98149622 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98149657 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 98149658 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 98149671 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 98149690 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98149806 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 98149835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98149866 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98150174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98150305 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98150332 C T Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 98150453 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 98150476 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 98150546 G A N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 3 98150732 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98150792 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 98150919 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98151156 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98153790 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98156446 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 98156606 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 98156932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98157190 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98157721 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98157797 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 98158737 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 98158780 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98159609 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 98159794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98160448 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98160678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98161785 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 98162217 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 98162373 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98163380 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98163598 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 98164100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98164789 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 98164796 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 98165238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98165653 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98166262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98166292 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 98166691 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98167401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98169773 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98169932 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 98169935 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 98170079 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 98170952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98171240 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98171964 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 98172659 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 98172667 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 98173240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98174074 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98174637 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98174953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98175346 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 98175501 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 98175634 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 98175673 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 98175701 C G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 98175833 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 98176046 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98176330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98176349 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 98176365 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 98176379 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 98176398 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 98176567 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 98176587 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98176771 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 98177261 T G N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 3 98177817 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98179344 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 98179476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98179500 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 98179744 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98180316 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98180363 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98180373 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 98180425 G C Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 98180484 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 98180485 G T Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 98180681 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98180880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98180907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98181053 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98181169 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98181400 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98181439 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 98181483 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 98181688 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 98181826 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 98181842 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 98181994 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 98182034 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 98182189 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 98182280 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 98182308 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 98182418 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98182429 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 98182430 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 98182626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98182673 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 98182737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98182759 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 98182793 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 98182974 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98183074 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 98183076 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 98183573 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98183762 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 98183825 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98184259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98184617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98184656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98185219 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98185265 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98185266 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98188109 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98188475 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98191627 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98191911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98192527 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 98194726 T C Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 98195190 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 98195191 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 98195259 G T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 98195376 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 98195400 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 98195436 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 98195440 A C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 98195501 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 98195565 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 98195609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98195724 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 98195749 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 98195850 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 98195957 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 98196122 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98196172 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 98196207 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98196345 T A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 98196810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98196892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98197324 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98197475 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 98197577 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 98197686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98197703 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 98197843 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 98197958 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98198057 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98198261 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 98198262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98198296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98198473 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98198674 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 98198947 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 98199057 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 98199125 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 98199175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98199199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98199918 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 98215732 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 98216134 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 98216234 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 98216581 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98216689 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98216960 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 98217117 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 98217255 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 98217305 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 98217414 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98217415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98217982 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 98218629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98218791 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 98219110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98219486 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 98219535 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 98219553 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 98219765 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 98219879 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 98219937 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 98220013 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 98220112 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 98220167 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 98220186 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 98220241 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 98220257 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 98220277 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 98220327 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 98220391 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98220428 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 98220648 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 98220801 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 98220855 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 98220884 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98220924 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 98220943 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 98221062 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98221186 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 98221843 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 98222141 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 98222149 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 98222258 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98222281 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 98222358 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98222504 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98222506 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98222641 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98222667 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98222683 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98222684 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98222715 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 98223409 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 98223690 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 98223996 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 98224050 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 98224237 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 98224473 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 98224520 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 98224599 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 98224800 T G Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 98225259 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 98225280 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 98225303 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 98225606 T G Y N 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0.5 0 0.5 2 2 1 0 1 3 98225644 A G Y Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 3 98225931 A G N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.75 0.0833333333333333 0.166666666666667 19 5 9 1 2 3 98226190 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 98226328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98226370 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 98226390 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 98226408 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 98227597 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98228012 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98228017 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98228068 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98228350 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 98228427 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98228470 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 98228502 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98228604 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 98228774 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 98228787 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 98228789 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 98229215 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98229530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98229613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98229614 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98229656 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98229708 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98229733 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98230069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98230130 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98230191 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 98230293 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98230682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98230882 G C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 98230898 T G N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 98232565 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98232676 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 98232702 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 98232807 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98234094 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 98234589 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98234925 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 98235335 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98240223 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 98240699 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 98240967 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98241624 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 98242207 C T Y Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 98242447 A T Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 98246138 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98246913 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98247372 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 98247378 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 98248481 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 98248506 C G Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 3 98248548 T A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 98253043 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 98258261 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 98258414 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 98265286 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 98370798 C T Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.0666666666666667 0.8 0.133333333333333 14 16 1 12 2 3 98370895 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98370981 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0 0.842105263157895 0.157894736842105 16 22 0 16 3 3 98371273 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 98371331 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 98379048 A T Y N 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 3 98379100 T C Y Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 3 98379146 G C N N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 98379189 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 98379241 A G Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 3 98379329 A T Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.2 0.8 0 24 16 4 16 0 3 98380484 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 3 98383146 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98383657 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 98389222 T G Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.105263157894737 0.894736842105263 0 21 17 2 17 0 3 98390356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98390833 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 98391396 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98394941 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 98395068 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98395360 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98395805 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98398409 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98401608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98402402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98406090 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98406091 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98407446 A G Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 98407733 A G Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 98407766 A C Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 98408353 A C Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 98409355 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98412644 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98414545 T G Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 98414711 A T N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 3 98414723 C G Y N 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 7 9 1 5 2 3 98414740 A G Y Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0.2 0 0.8 2 8 1 0 4 3 98415159 C T Y Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0 0.777777777777778 0.222222222222222 7 11 0 7 2 3 98416593 G A Y Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 6 6 1 4 1 3 98417598 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 98418167 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 98418179 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 98419310 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 98419516 C T Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 98422073 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 98422136 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98422801 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 98423187 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 98423206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98423298 G C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 98425286 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 98426074 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 98426666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98427853 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98428678 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 98429802 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98430984 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98431135 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98431644 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 98431646 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98433796 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98433944 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 98434062 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 98437544 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 98437577 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98447526 T C Y Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 12 10 1 10 0 3 98450921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98451254 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98451364 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98456098 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 98456253 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 98456560 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98456814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98457111 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98457130 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98457251 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98457252 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98457282 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98457516 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 98457706 A T N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 98457875 A G N Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 3 98458301 T A N N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 98458917 T A N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 98458977 C A N N 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 98459077 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 98460507 G T Y N 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 3 98464427 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 98464437 T G N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 98464483 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 98464602 C T Y Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 98465230 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98466183 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 98466248 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98466257 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98466525 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 98466546 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 98466711 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 98466820 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98467174 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 98467697 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 98468167 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98468701 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98469357 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98469377 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98469454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98469563 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98469582 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98469699 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98469719 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98469870 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98470150 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 98470205 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 98470438 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98470527 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 98470976 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98470983 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98471031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98471116 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98471172 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98471174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98471337 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98471390 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98471413 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98471416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98471948 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98472209 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98472459 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98472544 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98472747 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 98472809 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 98472850 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98472860 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 98472970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98472982 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98473038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98473273 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98473410 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 98473562 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98473587 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98473783 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98474379 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 98474611 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98474675 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 98474807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98474854 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98476350 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 98476366 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 98476423 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98476468 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 98476818 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98477435 T C Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 98477523 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 98477569 C T Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 98477612 G T Y N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 98477617 A T Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 98477665 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 98477720 A T Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 98477731 C A Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 98477881 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 98477906 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 98478054 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98478074 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98478198 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98478387 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98478760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98478781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98478880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98479182 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98479254 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98479713 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 98480086 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 98480094 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 98480102 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 98480861 A C N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 98481103 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98481212 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98481242 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98481315 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98481510 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98481524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98481542 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98481544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98481584 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98481681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98481710 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98482078 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 98482176 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98482687 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98482806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98483056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98483143 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98483158 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98483437 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98483439 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98483566 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98483583 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98483772 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 98483842 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98483890 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98484101 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 98484118 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 98484251 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98484465 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98484789 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 98488296 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98488564 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98489121 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 98490066 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98490090 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98490327 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98490790 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 98491330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98491630 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98491655 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 98492539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98501510 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 98505059 A T Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 98505598 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 98505753 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 98506792 A T Y N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 3 98511318 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 98516497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98516878 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 98517138 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98518595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98520565 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98521343 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98521980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98523744 T C N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0 0.636363636363636 0.363636363636364 7 15 0 7 4 3 98524554 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 98527668 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 98528559 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98537032 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 98538498 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98539323 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 98539529 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98539578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98540091 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 98542301 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98542841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98542897 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 98543125 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 3 98543949 A G N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 98544225 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 98545508 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 98547928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98551294 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98552636 C G Y N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 98552654 C T Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 98554375 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 98556372 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98556918 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 98559158 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 98561856 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98567115 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 98567813 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98569162 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 98569630 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 98570821 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 98571798 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98572314 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 98573917 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98574140 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 98574218 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98574220 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98576829 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98583240 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 98583840 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98584291 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98586095 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98586217 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98586442 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98586827 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 98586845 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98587385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98587396 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98587711 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98587767 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98588183 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 98588637 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98590441 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 98590501 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 98590516 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 98591146 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 98591263 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98592175 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 98592599 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98592780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98594141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98594984 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 98595524 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 98596490 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98596806 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 98598914 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98599493 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98599934 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98600494 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 98600822 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 98602112 C G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 98602594 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98604089 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98604201 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98604355 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 98604416 A G Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 98604426 G A Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 98604756 C T N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 98605942 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 3 98607589 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 98609744 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 98610993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98612171 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98612736 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98612829 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98613307 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98613336 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98613560 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98613568 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98613719 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98613727 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98613911 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 98613979 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 98614204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98614344 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98615138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98615412 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98615811 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98615871 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98615971 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98616715 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 98616783 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98616824 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98616918 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 98616920 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 98617372 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98617603 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98619154 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98619960 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98620927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98623458 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 98623565 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98623573 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98623577 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98623589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98626711 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98626917 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 98627341 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98627392 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98627587 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98627592 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98627610 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 98627677 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98627749 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98627808 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98627817 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 98627991 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 98628124 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98628196 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 98628269 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 98628276 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 98628281 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 98628290 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 98628350 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 98628500 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98628688 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 98628704 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 98628763 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 98628786 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 98628798 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 98628802 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 98628818 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 98628929 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 98629032 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 98629038 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 98629052 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 98629053 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 98629215 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98629369 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 98629683 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 98629748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98629818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98629836 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98631792 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98632052 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98632661 A G Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 98632662 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 98633175 C G Y N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 3 98633176 T G Y N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 98635381 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98636350 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 98637658 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 98638633 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98642812 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 98642853 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98642858 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98642891 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 98648993 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 3 98649152 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 98649401 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 98649407 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 98649550 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98649645 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98649650 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 98650189 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 98650245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98650377 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98651551 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98651724 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98651799 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98651908 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98652176 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98652192 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 98652227 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98652318 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98652381 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98652442 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 98652507 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98652512 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 98652672 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 98652699 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98652740 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98652830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98652875 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98653059 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98653108 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98653400 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 98653401 G C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 98653486 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98653518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98653719 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 98653873 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98653898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98654001 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98654235 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98654264 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98654524 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98654661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98654839 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98654877 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98654903 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98655036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98655207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98655219 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98655293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98655342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98655369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98655389 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98655723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98656166 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98656185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98656875 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98657403 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98657571 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98657670 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98657728 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98658192 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 98658273 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98658345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98658367 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98658370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98658386 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 98658938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98659034 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98659074 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98659087 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98659488 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98659592 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98659798 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98659899 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98661321 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 98661323 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98664851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98665202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98665210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98667254 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98670656 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 98671371 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98671391 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98674117 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98674290 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98675123 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98675459 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98676188 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98676792 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98677532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98677948 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98678022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98679092 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98680840 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98680858 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98682661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98685283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98685300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98685817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98686413 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 98687439 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98687969 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98688494 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98688819 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 98690995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98691046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98691412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98692119 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98693682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98693697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98694383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98694541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98696484 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98696831 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 98701149 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98701680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98711827 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 98712971 T C Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 98713575 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98714196 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98714934 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 98716445 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 98717253 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98717594 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98718280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98722703 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98723357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98729716 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98732795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98735457 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 98736106 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98736306 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98738012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98738279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98738789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98739274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98740751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98741236 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 98741492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98741498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98743051 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98743868 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98743930 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 98744632 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98747068 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98748213 A T Y N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 6 12 0 6 3 3 98749155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98750352 A C N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0 0.769230769230769 0.230769230769231 10 16 0 10 3 3 98752151 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98752339 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 98754049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98754612 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98755101 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98755886 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 98755887 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 98756087 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98756101 G T Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 98756244 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98756282 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 98756311 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98756410 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98757067 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98757783 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 98758334 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 98758358 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 98758366 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98758413 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 98758961 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 98759270 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 98759329 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 98759330 A G Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 98760527 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 98761186 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98761352 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98761415 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98761464 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 98761741 C A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 98762432 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98763374 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98764924 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98768240 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98768608 C T Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 98769916 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98772196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98773076 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 98773406 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98773612 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 98773623 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 98773922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98774132 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 98774810 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 98775127 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 98775581 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 98775657 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98775802 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 98775867 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 98775910 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 98776003 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 98776039 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 98776248 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 98776336 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 98776402 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98776434 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98776503 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98776526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98776678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98776836 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 98776975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98776979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98777243 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 98777401 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 98777578 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98778255 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98778480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98778811 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 98779523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98779697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98779698 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98780370 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98780640 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98780746 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98781092 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 98781112 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98781170 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 98782827 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 98782898 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 98782908 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 98785471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98785732 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98786266 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98786529 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 98787710 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 98787794 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 98787939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98788379 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98788405 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98788476 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98789995 C G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 98791303 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 98791350 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98793456 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 98793485 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98793961 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 98794301 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98794837 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98794876 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98794954 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98794971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98795591 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98796538 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 98796858 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 98796865 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98796883 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 98797752 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 98797996 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98798675 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98798695 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 98798821 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 98798906 A T N N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 3 98799128 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98799154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98799253 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 98799886 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 98800091 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 98800094 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 98800143 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 98800781 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 98800809 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 98801471 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 98801532 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98801611 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98801612 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 98801623 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 98801690 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 98801827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98801843 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 98801946 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 98802108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98802586 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 98802608 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 98802629 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 98802724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98802864 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 98802888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98803182 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98803724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98803768 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 98804538 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98804539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98804717 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98804808 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 98805167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98805410 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 98805893 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98806420 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98806977 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 14 10 2 10 0 3 98807248 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 98807298 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98807511 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98809279 A T Y N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 98818507 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 98818629 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98818755 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 98818927 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 98819471 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 98819556 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 98820328 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98821110 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98821585 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98821613 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 98821960 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98822134 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98822522 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98823389 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98823654 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98823822 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98824103 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98824186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98824686 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98824699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98825715 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 98825796 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 98826035 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98826383 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 98826465 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98826686 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98827290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98827703 G T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 98828077 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 98828560 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 98828743 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 98828744 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 98829042 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 98829829 C T N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 3 98830169 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 98830394 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98830468 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98830496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98830613 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98830761 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98830853 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98830942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98831048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98831196 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 98831326 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 98831382 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 98831587 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 98831763 G A Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 98831785 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 98831825 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 98832804 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 98832844 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 98833065 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98833198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98833259 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 98833300 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 98833322 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98833989 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 98834059 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98834119 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98834164 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98834275 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 98834295 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 98834458 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 98834467 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 98834629 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98834664 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98834793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98835095 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 98835181 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98835188 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 98835338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98835371 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98835384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98835407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98835510 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98835631 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98835701 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98836209 C T Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 3 98839235 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98839245 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98839326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98839412 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98839516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98839547 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 98839751 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 98839752 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98839956 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98839962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98840312 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 98840680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98840728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98840883 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98841354 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98841692 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98842018 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 98842193 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 98842409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98842462 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 98842500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98842516 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98842608 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98842628 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98842655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98842722 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98842908 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98842989 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98843083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98843165 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 98843175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98843225 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98843332 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98843344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98843352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98843482 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98843502 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98843602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98843623 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98843691 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98843721 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98843722 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98843747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98843881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98843987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98843988 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98844205 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 98844209 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 98844279 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98844312 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98844370 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98844373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98844416 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 98844529 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98844544 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98844584 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98844642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98844661 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98844849 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 98844851 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 98844930 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98845005 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98845333 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98845607 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98845630 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98845659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98845749 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98845759 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98845787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98845831 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98845883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98846076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98846144 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98846449 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98846543 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98846564 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98846568 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 98846627 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98846704 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 98846864 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98846865 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98846896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98846941 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98847013 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98847180 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98847200 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 98847201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98847302 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98847354 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98847366 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98847424 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98847459 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 98847571 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98847581 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 98847610 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 98847647 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98847671 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98847687 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98847709 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 98847712 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 98847740 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98847856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98847962 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 98848085 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98848246 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98848351 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 98848356 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98848364 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 98848468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98848487 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 98848544 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98848560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98848622 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98848630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98848709 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98849192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98849516 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98849553 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98849681 G T N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 3 98849811 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98849872 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 98849878 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 98849972 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98850024 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98850214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98850427 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98850732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98850901 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98850952 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98850973 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98851313 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 98851332 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98851484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98851669 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98853271 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98853333 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98853415 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 98853423 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 98854777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98855499 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98855729 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 98855787 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 98856119 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 98856463 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98857111 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 98858816 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98859219 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98859265 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 98859294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98859561 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98859630 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98859661 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98859695 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98859747 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 98859817 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 98861047 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98861116 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98861125 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 98861141 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 98861154 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 98861232 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 98861310 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 98861316 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 98861344 A G N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 3 98861408 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 98861467 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 3 98861493 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 3 98861585 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 98861710 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 98861995 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 98862016 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 98862055 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 98862424 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 98862429 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 98862560 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98863110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98863480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98863583 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98863846 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98863848 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98863882 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98863950 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98864169 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 98864568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98864655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98864676 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98864826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98864920 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 98865387 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98865390 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98865421 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 98870744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98872248 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98872254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98872279 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98872874 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 98872916 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98873025 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 98874187 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98874558 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98876369 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 98877014 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 98878026 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98878324 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 98879512 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98880325 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 98886886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98887113 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98887118 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 98888468 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 98889147 G T Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 98889415 C G Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 98889449 A G Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 98892624 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 98893803 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98895379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98896745 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98899286 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 98899606 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98902697 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98903758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98903905 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 98904158 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98904969 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 98905097 T A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 98905603 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 98905749 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 98907783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98909765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98910099 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98910671 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 98910697 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 98910749 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98910823 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 98910870 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 98911177 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98911729 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98912685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98913257 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 98913746 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 12 24 0 12 6 3 98913894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98914890 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98915031 G A N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.461538461538462 0.153846153846154 0.384615384615385 14 12 6 2 5 3 98915169 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 98916199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98916269 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 98916280 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98917371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98917483 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 98917484 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 98918128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98918848 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98918873 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98920033 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98920399 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98920409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98921034 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98921519 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 98922910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98923090 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98923597 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 98924667 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 98926251 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 98926642 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98928526 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98931622 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 98931813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98932260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98934997 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98935504 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 98935840 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98935880 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98935962 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98936378 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98936870 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 98937798 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 98937915 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98938183 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98938981 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 98939288 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 98939299 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 98939480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98940059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98940851 A C Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 98941608 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 98942507 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 98943583 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 98943645 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 98943764 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 98943787 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 98943799 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 98943875 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 98943937 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98944294 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 98944526 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98945480 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 98945635 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 98945686 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 98946078 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 98946237 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 98946278 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 98946345 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 98946406 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 98946707 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 98946713 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 98947547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98949079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98950034 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98950314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98950721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98951336 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98951941 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 98952044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98952100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98952226 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98952700 C G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 98952795 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98952852 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 98953257 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 98954276 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 98954505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98955090 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98955510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98956043 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 98956044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98956494 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 98956985 A C Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 98957018 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98957812 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98958452 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98958527 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98959028 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 98959149 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 98959714 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98959748 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98959857 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 98959880 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 98960323 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98962425 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98963662 A G Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 98963883 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98963910 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98963989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98965239 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 98965241 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 98965285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98965446 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98965839 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 98966330 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 98966355 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 98966759 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98966903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98967687 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 98967784 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 98968023 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 98968035 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98968087 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 98968435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98968943 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 98969203 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98969487 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98969946 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98970206 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 98970223 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98971916 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 98972960 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98973457 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98973927 A T N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 98973999 C T N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 3 98974791 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 98975005 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 98975068 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 98975192 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 98975252 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 98975269 G T Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 98975349 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98975438 T A Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 98975570 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 98975634 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 98975885 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 98975908 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 98975951 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 98976286 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 98976838 C T Y Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 7 11 2 3 4 3 98977255 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98977257 G C Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 98977420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98977566 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98977631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98977767 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 98977982 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 98978033 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 98978067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98978314 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 98978328 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 98978501 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98978513 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98979448 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 98979467 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98979886 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 98980202 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98980272 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98980313 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98980465 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98980477 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 98981166 G A Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 98981386 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 98981419 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 98981600 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 98981647 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 98981694 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98981908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98981910 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98982042 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98982288 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 98982328 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 98982329 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 98982342 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98982367 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98982436 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98982650 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98982714 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98982978 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98983202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98983230 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98983273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98983304 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98983764 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98983780 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98984377 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98984384 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98984443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98984736 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 98984786 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98985303 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 98985754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98985933 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 98986397 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98987268 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 98987530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98988842 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 98988850 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 98989008 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 98989049 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98989310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98989385 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 98989674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98989688 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 98989809 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 98990340 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98991043 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 98991707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98992364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98992529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98994105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98994121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98994143 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 98994908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98996018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98996803 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98996950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98998708 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 98999288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99000613 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99001901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99002279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99003211 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 99005589 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 99005944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99005945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99005992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99006018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99006430 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99007190 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99007258 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99007265 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99008001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99008124 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99008134 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99009271 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 99009291 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 99009430 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 99012595 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 99014252 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99014490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99015273 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99018960 C T Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 99019000 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 99019009 T C Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 99019014 C T Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 99020420 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99021357 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 99021541 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99021912 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99022212 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99022285 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99022426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99023423 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 99023436 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 99024980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99027044 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 99028669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99030460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99030750 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 99030793 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99033055 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99033524 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99033539 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 99033781 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99034534 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99035273 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99035347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99039137 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99040115 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99041420 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99041462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99041619 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99041892 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 99042319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99042899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99043196 G T Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 99043393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99043572 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99043884 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 99044098 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99044676 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 99044752 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 99044878 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99044950 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99045100 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99045280 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99045457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99045856 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99046242 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 99046711 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99046750 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 99047299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99047599 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99048705 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99049210 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99049345 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99049461 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99050119 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99050884 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99050998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99051511 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99051599 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99051776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99051907 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99052378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99052990 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 99053095 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99053905 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99054759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99054950 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 99055343 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99055456 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99056093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99056186 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99056199 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 99056205 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 99056441 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 3 99056467 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 99057008 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 99057385 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99057627 G T N N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.0909090909090909 0.545454545454545 0.363636363636364 8 14 1 6 4 3 99058929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99061257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99064051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99064272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99064414 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 99064908 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99065236 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99067064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99067969 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99068300 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99068683 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99070498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99070856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99071111 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 99071670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99074458 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99075288 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 99075639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99076522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99077280 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99077394 A T Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 99078952 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99079100 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99079122 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99079913 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99080095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99082736 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99083639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99085114 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99085156 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 99085413 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 99085607 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99085892 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 99085951 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 99085953 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 99086021 T G Y N 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 7 5 1 5 0 3 99086052 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 99086165 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 99086186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99086205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99086287 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99086288 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99086774 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99086853 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99086985 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99087149 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 99087167 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99087237 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 99087298 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 99087349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99087676 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 99087711 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 99087718 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 99087775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99087826 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99087897 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99088385 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99088476 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99088776 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99088808 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99088833 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99088890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99088962 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 99089200 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99089452 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99089489 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99089500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99089613 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99089751 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99089758 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99089782 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99089824 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99089902 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 99090078 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99090158 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99090232 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 99090292 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99090612 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 99090707 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99090925 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 99090976 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 99091384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99091437 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99091467 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99091673 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99091889 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99091909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99092479 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99092606 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 99093133 G T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 99093343 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 99093424 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 99093468 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99093638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99093723 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99093918 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99093976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99093977 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99094085 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 99094234 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 99094990 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99097489 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 99098098 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99098773 G T Y N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.117647058823529 0.764705882352941 0.117647058823529 17 17 2 13 2 3 99100343 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99101949 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99103365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99103460 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99106755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99106926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99107031 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 99107204 T A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 3 99107518 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 99107731 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99108498 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99108597 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 99108694 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99108744 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 99108848 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99108878 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 99108904 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 99109113 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 99109215 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99109270 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 99109619 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 99109974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99110368 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99110607 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99111038 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 99111596 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 99111610 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 99111659 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 99111753 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 99112004 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 3 99112080 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 99112084 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 99112167 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 99112268 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99112453 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 99114707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99115031 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99115227 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99117188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99118268 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99118400 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99120120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99120813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99121337 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99121854 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99122807 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99122808 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99123638 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99123801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99124182 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99125598 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 99125811 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 99130150 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99131608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99132094 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 99132098 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99132152 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 99132243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99132429 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99132491 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99132665 A C N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 3 99132862 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99133095 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 99133237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99133262 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 99133263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99133452 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 99133615 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99133674 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99133734 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 99133794 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99134455 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 99134734 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99135282 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 99135788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99135847 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99136461 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 99136820 A G N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 3 99136955 A G N Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 3 99137457 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99137784 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99138053 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 99138146 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99138590 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99138821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99139309 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 99139337 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 3 99139373 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 99139470 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 99139474 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 99139493 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 3 99139510 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 99139683 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 99139685 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 99139940 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 99141235 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 99141528 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99141821 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99143201 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99144386 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99144722 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 99144969 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 99145488 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99145688 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 99147055 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99147157 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99147161 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99147297 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99147425 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99147469 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99147524 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99147544 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99147703 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99148144 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99148196 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99148278 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 99148475 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99148608 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99148633 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 99152017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99152220 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99154146 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 99155706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99157070 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99157087 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99157538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99157605 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99157735 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99157908 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99158759 T C Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 99159600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99161630 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 99161782 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 99161871 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 99169031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99169584 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99169833 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99169932 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99170124 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 99170888 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99171228 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99172400 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99172428 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 99172545 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99172624 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 99172661 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99172744 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99173016 C A Y N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 3 99173387 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99173867 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 99175161 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 99175244 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99175310 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99175352 A T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 3 99175421 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 99175456 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 99175470 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 99175495 C A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 99175734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99176842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99177109 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99177742 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99179467 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 99179772 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 99180416 T C N Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 99181257 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99181474 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99181683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99182536 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99184095 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99184488 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99187823 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 99187824 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 99188509 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 99190201 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99192377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99202636 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99202737 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 99203020 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99206942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99207473 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99210009 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 99216747 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99226589 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 99228819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99229387 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99230414 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99230908 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99231419 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99232662 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99240556 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99242280 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99243603 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99245389 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99247457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99247860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99249730 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 99250234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99250761 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99252265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99252509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99255094 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 99255108 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99255234 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99255414 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99256043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99257083 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99257542 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99257578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99257674 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99257774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99258685 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99259068 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99259828 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99260492 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99261438 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99261598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99261828 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 99262436 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99262990 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99263070 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99264387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99264725 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99265123 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99265241 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99265791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99265824 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99265867 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99266060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99266191 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99267924 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99268000 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99268103 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99268144 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99268858 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99268874 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99268909 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99269210 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 99269632 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99269739 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99269751 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99269815 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99269908 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99270213 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99270584 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99270719 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99270764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99271052 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99271109 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99271182 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99271341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99271368 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99271398 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99273059 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99273243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99273405 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99273647 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 99274802 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99274834 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99274944 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99275049 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99275102 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99275139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99275151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99275185 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99275226 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99275235 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99275381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99275383 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99275411 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99275493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99275496 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99275580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99275634 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99275690 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99275725 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99275748 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99275797 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99275921 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99276192 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 99276226 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 99276254 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 99276262 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 99276280 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 99276302 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 99276585 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99276687 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99276703 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99282885 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 99282904 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 99282905 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 99282928 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 99282932 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 99283011 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99283344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99283379 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99283445 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 99283580 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 99283826 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 99283877 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 99283966 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 99283979 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 99284143 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99284236 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99284278 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 99284280 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 99284306 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99284422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99284545 C A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 99284572 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99284577 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 99284588 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99284718 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99284753 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99284840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99284895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99284933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99284934 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99284994 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 99285123 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99285174 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99285304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99285383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99285454 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99285575 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99285709 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 99285787 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99285838 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99285857 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99286284 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99286390 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99286411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99286506 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 99286516 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 99286887 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 99286922 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 99287018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99287249 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99287420 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99287518 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99287718 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99287775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99287932 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 99287962 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 99287990 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 99288033 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 99288040 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 99288048 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 99288067 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 99288319 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 99288364 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 99288377 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 99288503 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99289190 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99289465 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99289642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99290955 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99291243 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99291593 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99291880 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99291962 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99292217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99292963 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99293136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99293202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99295271 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99295357 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99297007 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99297426 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 99298723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99300799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99301606 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99301837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99302232 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99302768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99302950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99303126 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99303150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99306200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99306237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99306286 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99306354 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99306727 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 99306742 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99307110 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 99307656 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99309222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99309539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99309889 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 99310138 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 99312851 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99313546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99313709 G T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 99313998 A G Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 3 99314005 A T Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 99315437 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 99316950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99318185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99318655 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 99319977 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99320980 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99323088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99325897 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99326057 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99326397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99327904 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99328069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99329520 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99330605 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99330765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99331300 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99332091 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99332616 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99332675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99334357 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99335077 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99335196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99337684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99339119 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99339616 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99340915 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99340929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99341093 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99341272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99341735 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99342591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99344056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99344233 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99345275 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 99346164 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99346526 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 99348415 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99348969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99349891 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99349978 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99351046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99351297 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 99351842 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99352824 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99353082 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99354078 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99354353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99354520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99354726 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99355748 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99356050 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99356079 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 99356089 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 99356164 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99356432 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99356702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99356962 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99357002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99357174 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99357637 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99357638 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99357730 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 99357880 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 99358068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99358238 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99358252 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99359095 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99359353 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99359495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99359541 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99359895 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99360218 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99360266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99360510 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 99360940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99360950 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99360990 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99361274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99361286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99361338 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99361451 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99361741 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99361780 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99361791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99361890 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99362435 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 99362478 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 99362502 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 99362578 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99362603 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 99362645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99362678 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99362897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99362980 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99363001 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99363010 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99363068 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99363229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99363289 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99363373 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99363407 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99363456 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99363481 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99363828 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99364042 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99364132 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99364257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99364261 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99364284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99364324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99364354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99364366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99364377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99364427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99365264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99366054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99367202 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99368068 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99368199 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99368256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99368294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99368472 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 99368613 C A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 99368646 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 99368908 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99369035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99369424 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 99369656 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 99369743 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 99369843 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 99369976 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 99369981 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 99370085 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 99370235 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 99370381 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99370403 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 99370437 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99370592 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 99370612 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 99370653 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99370705 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99370751 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99370755 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99370783 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99370825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99370843 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 99370860 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99370888 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99370896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99370966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99370987 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99371024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99371070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99371075 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99371269 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99372620 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99372676 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99373349 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99374400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99374524 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99374925 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 99375133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99375361 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99375413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99375493 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99375576 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99376321 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99376405 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99377019 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99378578 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99378603 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99378688 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99378693 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99380329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99381015 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99381032 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99381122 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99381235 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99381363 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99381380 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99381451 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99381876 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 99381942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99382753 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99382978 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 99382992 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99383024 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99383324 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99383601 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99383712 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99383953 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99384229 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99386276 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 99387041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99388123 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99389712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99390161 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99391089 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99391499 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99391532 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99391639 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99391792 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99392042 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99393020 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99393787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99396148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99396734 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99398170 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99398355 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99399068 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 99399233 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 99400671 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99402296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99404473 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99404790 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99407266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99407414 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99407882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99408740 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99409373 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99409466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99410036 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 99411621 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99412620 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99412881 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99413045 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 99413276 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99413280 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99413547 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99414088 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99414435 G T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 99414628 G T Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 99415606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99423402 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 99424296 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 99427437 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99428172 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99428970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99429207 C A Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 99429211 C T Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 99430400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99430486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99432672 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99432743 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99433877 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99434238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99434249 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99434443 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99434536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99435012 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99435100 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99435140 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99435204 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99435260 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99435312 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99435359 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99435382 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99435437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99435457 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99435508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99435545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99435578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99435635 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99435764 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99435945 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99436058 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99436185 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99437464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99437663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99438363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99440348 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 99441376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99441580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99442775 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99443405 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99443809 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 99444583 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99447240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99447623 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 99447923 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 99449441 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99449729 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99450071 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99451226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99453306 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 99454606 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99457339 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99458574 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 99459566 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99460101 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99460636 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 99460726 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 99460762 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 99461208 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 99461235 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99461240 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 99461278 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99462705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99463069 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99463415 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99463663 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 99465156 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 99465859 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 99466041 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99468739 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99471318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99474266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99475038 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99476037 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 99478114 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99479145 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 99479788 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 99481348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99482049 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99483235 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 99483359 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 99484777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99484837 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99485796 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99487534 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 99489416 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 99489878 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99491184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99492032 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99492389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99492703 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99492975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99493000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99493905 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99494345 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 99495617 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99495619 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99496292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99497281 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 3 99498125 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99499398 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99499905 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 99500240 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99500900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99502785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99503467 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 99503610 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 99504262 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 99504554 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99504649 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99504944 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99505145 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99505838 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 99505896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99506365 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99506371 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99506456 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99512465 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99514092 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99514269 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99516208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99516473 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99516964 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99517962 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99523352 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 99524048 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99525056 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 99527004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99530160 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99535383 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 99535385 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99535551 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99536381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99536715 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 99536935 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 99537900 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 99539996 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99540828 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99541620 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 99541844 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99542224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99542300 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99542598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99543249 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99543638 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99544287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99544588 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 99546922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99547135 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99547942 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99550155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99550277 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99554042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99554108 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 99554402 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 99557004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99557165 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99557354 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99557447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99557505 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 99557509 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 99558082 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99561170 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 99561294 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 99561504 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 99562555 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99562629 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 99563666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99564487 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99564583 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99564760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99564998 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99565259 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99565359 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99565684 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 99566406 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99567370 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 99568805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99569592 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99569732 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99570032 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99571786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99571855 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99571895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99571968 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99572025 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99572105 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99572274 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99572315 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99572792 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 99572892 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 99572909 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99573052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99573217 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99573238 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99573296 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 99573340 C T Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 3 99574463 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 99574473 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 99574496 T C N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 3 99574735 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 99574911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99574931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99575379 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 99575603 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99575613 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99575622 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 99576016 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 99576256 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 99576661 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 99577036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99577460 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 99577487 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 99577492 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 99577676 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99577722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99577861 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 99577883 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 99578181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99579175 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 99579191 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99579217 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 99579648 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99579774 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99579830 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99580020 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99580053 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99580106 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99580547 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 99580773 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 99581831 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 99581876 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99581991 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99582392 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 99582964 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99583041 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 99583051 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99583736 T A N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 99584018 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99584117 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99584493 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 99584677 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99585376 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99585484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99585551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99585560 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 99586606 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 99586795 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 99586932 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99587046 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 99587070 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 99587096 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 99587294 T A N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 3 99587639 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 99587678 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 99587757 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 99587768 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 99587956 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99587987 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 99588026 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 99588092 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 99588104 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99588115 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 99588194 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 99588203 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 99588253 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 99588368 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 99589547 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 99589720 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99590852 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99590862 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 99594108 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99594930 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99595840 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99596240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99597218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99597360 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99597451 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 99597500 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99603480 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99604851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99606058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99609992 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99610041 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99610220 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99610712 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99611066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99611137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99611152 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99611779 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99611783 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99611880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99611924 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99612342 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99612430 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99612795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99613209 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99613642 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 99614346 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99614677 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99615789 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99616513 G A N Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 99617730 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99617925 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99619359 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99621885 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99624145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99624523 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99626135 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99627033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99628905 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 99631897 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99633906 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99635862 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99635887 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 99636714 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99637717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99639405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99639603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99639816 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99640811 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99642335 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99642688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99645167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99645317 C G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 99645444 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99645816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99649566 T A Y N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 99651592 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 99652185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99652421 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 99653288 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 99653678 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 99654025 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 99654065 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99654252 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 99654360 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99655060 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99655510 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 99655793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99656097 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 99656149 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99656186 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 99656309 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99656568 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99656779 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 99657407 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99658807 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99658869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99658908 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 99658968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99659187 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99659537 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 99659755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99659836 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99659861 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 99660437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99660449 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99662057 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 99662667 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 99662848 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99666648 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 99668768 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99669230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99671514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99671741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99672123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99674124 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99674276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99674845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99675166 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99675282 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99675355 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99675710 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99675837 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99676028 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99676080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99676179 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99676679 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99676991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99677724 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99677881 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99677950 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99677992 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99678069 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99678094 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99678109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99678223 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99678262 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99678310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99678442 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99678467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99678622 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99678669 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99678731 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99678740 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99678758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99678761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99678919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99678980 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99678988 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99679005 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 99679319 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99679391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99679491 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99679589 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99679647 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99679673 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99679852 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99679993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99680029 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99680319 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 99680368 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99680372 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99680421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99680662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99680765 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99680973 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99681003 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99681552 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 99682359 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 99682458 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99682577 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99682628 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99682824 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99682825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99682879 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 99682964 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 99683005 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99683035 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99683134 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99683202 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99683271 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99683291 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99683329 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 99683339 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 99683340 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 99683489 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 99683539 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99683551 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 99683803 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99683824 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 99684267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99684353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99684437 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99684641 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99685339 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99685358 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99686022 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 99686419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99686583 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99686639 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99686815 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99688587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99689022 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 99689150 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99689507 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99691090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99694285 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99694763 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99696422 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99698900 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99699161 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99700240 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99700750 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99700756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99701211 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99702039 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99702547 A T Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 99702548 G A Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 99703075 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99703780 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99703782 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99703815 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 99704562 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99704582 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 99704631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99705050 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 99705410 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99712044 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99712428 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99713644 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99715077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99715547 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99716733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99718246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99719882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99720974 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99721401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99721436 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99722804 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99722875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99723829 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99725275 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99725392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99725440 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99725457 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99725479 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99726237 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99726463 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 99727492 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99728511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99732795 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99732875 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 99733254 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99733290 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 99734242 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99734291 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99734397 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99736345 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99736361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99736901 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99736912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99737366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99738401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99738686 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99739072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99739240 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99739248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99739869 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99739912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99740065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99740419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99740566 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99740593 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99741220 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99741290 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99741328 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 99741389 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 99741403 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 99741425 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 99742054 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99742243 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99742295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99743036 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99743195 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 99743252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99743365 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99743376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99743392 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99743889 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99744069 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 99745183 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99745374 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99745460 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99745678 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99745878 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99745938 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99746046 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99746283 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99746294 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99746474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99746509 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99746525 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99746610 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 99746803 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99746904 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99746964 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99747011 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99747367 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99748419 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99748450 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99748545 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99748888 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 99749154 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99749600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99749731 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99749770 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99751293 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99753559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99753972 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99754670 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99755324 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99755372 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99756627 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99756727 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99756929 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99757334 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99759179 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99760961 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 99761309 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99763743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99764645 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99764728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99765276 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99765307 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99768545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99769253 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99770209 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99770235 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 99770597 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99770724 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99770880 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99771337 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99771867 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99772125 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 99773181 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99773362 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 99773469 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99773481 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 99773770 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 99774227 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99774303 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 99774390 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99774410 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99774631 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 99774908 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99775374 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99775558 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99775712 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99775792 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99778392 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99778534 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99778895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99779186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99779246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99779290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99784825 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99785984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99786252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99788806 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99790971 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99791824 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99794410 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 99794478 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99794639 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99795448 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99795968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99797232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99797313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99797421 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99797796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99798363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99798492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99798688 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99799657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99800447 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99800750 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99800875 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99801032 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99802599 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99802947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99803272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99803468 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 99804595 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99804672 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99805780 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99807838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99809258 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 99809461 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 99810812 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99810902 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99811428 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99811526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99812268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99812937 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 99813088 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99813588 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99814277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99814411 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99814593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99815322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99818217 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 99818901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99827568 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 99827798 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99828320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99829137 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99829803 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 99835212 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 99840423 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99841118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99842142 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 99842197 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99842785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99843175 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 99843526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99843551 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 99844621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99844750 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99845146 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 99845147 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99845755 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99846073 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99846641 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99846974 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 99848044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99848679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99848709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99852325 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 99852859 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99853635 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99853852 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99853928 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99854385 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99854786 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99854896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99856093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99856769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99856830 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99859566 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 99859606 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 99860626 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99860733 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99861233 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99861537 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99861588 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99862075 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99862292 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99862306 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99862509 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99862836 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99863757 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99863790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99864138 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99864378 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 99864533 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99864703 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99865194 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99865506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99866719 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99871648 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99872924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99874562 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 99875081 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99875144 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99876138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99876549 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 99877198 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99877500 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 99878364 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99878624 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99878637 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 99878663 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 99878683 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 99878695 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 99878805 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 99878820 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 99878986 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99879030 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 99879036 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99879183 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 99879202 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99879222 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 99879270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99879306 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 99879697 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 99879844 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 99879858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99879922 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99880018 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 99880077 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99880156 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 3 99880311 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 99880402 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 99880417 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 99880554 A C N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 99880608 G T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 99880661 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 99880699 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 99880739 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 99880818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99880824 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 99880935 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 99880960 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 99881004 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 99881036 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 99881362 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99881470 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 99881583 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99881628 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99882055 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99882104 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 99882171 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99882175 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99882250 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99882481 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99882509 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 99882559 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99882637 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 99882654 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 99882769 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 99882776 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 99882953 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 99883059 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 99883065 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 99883100 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99883315 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99883444 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 99883499 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 99883553 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99883615 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99883676 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 99883723 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 99883903 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99884074 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99884267 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99884281 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99884341 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99884407 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99884412 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99884736 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 99884792 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 99884883 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 99884946 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 99884984 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99885002 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99885003 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99885061 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 99885235 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99885277 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99885521 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99885587 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 99885603 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 99885680 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 99885686 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 99885849 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99886008 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99886396 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99886425 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99886490 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99886610 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99886631 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99886680 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 99886715 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 99886730 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 99887137 T C Y Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.0769230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 9 17 1 7 5 3 99887157 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 99887220 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99887230 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99887417 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99887443 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99887931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99887940 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99888255 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 99888290 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99888357 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 99888363 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99888661 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 99888794 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99888833 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 99888954 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99888965 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99889032 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99889041 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 99889125 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 99889198 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 99889201 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 99889384 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 99889409 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 99889443 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 99889470 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99889513 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99889614 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 99889725 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 99889896 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99889921 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99889938 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99890016 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99890263 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 99890290 A G N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 99890372 C G N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 99890385 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 99890406 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 99890442 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 99890459 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 99890489 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 99890560 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99890633 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99890748 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99890763 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99890782 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99890796 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99890920 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 99890921 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 99891134 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99891249 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99891392 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99891456 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99891463 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 99891890 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 99892027 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99892333 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 99892432 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 99892460 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 99892497 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 99892524 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 99892536 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 99892547 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99892575 A T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 99892868 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 99892948 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 99892958 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 99892994 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 99893089 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99893297 A G Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 99893339 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99893344 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99893373 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99893454 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 99894739 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 3 99894764 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 99894769 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 99894871 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 99894872 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 99895124 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 99895154 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99895165 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99895244 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 99895272 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 99895325 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99895339 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 99895461 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99895533 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99895754 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 99895827 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 99895906 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 99895968 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 99895976 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 99896067 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 99896096 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 99896238 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 99896499 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99896513 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99896800 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 99897199 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 99897507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99897990 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 99899965 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 99899995 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99900177 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 99900314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99900346 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99901366 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 99902745 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 99904249 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 99905498 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 99905509 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 99905693 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 99905861 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99906489 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99906510 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99906553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99906640 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99906921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99908220 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99908407 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 3 99908768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99909016 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 99909069 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 99909263 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 99909819 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99910061 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 99910075 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 99910749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99912061 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 99912103 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 99912331 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 99913104 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 99913421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99913824 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 99913831 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 99914377 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99916672 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 99917534 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99917841 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99917915 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99918139 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99919120 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99920341 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99920413 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 99920680 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 99920806 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 99920845 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 99920846 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 99920882 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99920924 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 99921268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99921981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99922236 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99922667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99922695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99922737 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99924365 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 99924779 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 99925394 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 99925670 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99925743 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99926165 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 99926513 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 99926603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99926619 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99926640 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99926669 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 99926761 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 99926794 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 99926813 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 99926840 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 99927174 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 99927175 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 99927355 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99927916 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 99928122 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 99928692 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99928826 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 99928827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99928943 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 99928982 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 99929018 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 99929024 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 99929034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99936879 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 99936889 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 99936914 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99937237 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99939283 C T Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 99939732 G C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 99940309 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99940952 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 99941525 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 99941565 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 99941571 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 99941625 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 99941956 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 99942181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99942653 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99942774 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 99944036 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 99944736 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99945923 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 99945934 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 99945947 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 99945954 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99945982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99946043 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 99946204 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 99946517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99946670 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99946672 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99946693 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99946748 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 99948378 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 99948387 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 99948451 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 99952444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99953556 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 99953980 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99954417 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 99955067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99959632 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99961645 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 99961834 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99962354 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99962787 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 99962866 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 99963581 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 99964333 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 99964356 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 99964452 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99964503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99964785 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 99965115 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99965331 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 99965352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99965383 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 99965617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99965699 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99965727 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 99967720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99968272 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99968521 C T N Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.142857142857143 0.714285714285714 0.142857142857143 7 7 1 5 1 3 99968640 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 99968655 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 99968665 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 99968831 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99969371 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99970490 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 99971273 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 99971282 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 99971302 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99971380 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 99971383 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 99971659 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 99971746 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99971756 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 99971825 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 99971893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99972413 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 99972456 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 99972471 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 99972958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99973038 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 99973077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99973089 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 99973116 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99973258 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 99973279 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 99973292 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 99973312 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 99973606 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 99973913 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99974061 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 99974121 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 99974234 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 99974636 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 99974716 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 99974724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99974815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99974830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99975002 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 99975104 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 99975147 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 99975203 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 99975409 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 99975722 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 99975834 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 99976040 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 99976075 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 99976106 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 99976419 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99976675 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 99976843 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 99976911 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99977220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99977277 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 99977282 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 99977299 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 99977607 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 99977616 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 99977754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99977811 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 99977884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99978065 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 99978133 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 99978540 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 99978656 A C N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 3 99978840 T C N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 99978858 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 99979132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99979238 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 99979258 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 99979265 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 99979330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99979672 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 99979735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99979825 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99980037 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 99980520 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 99980545 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99980772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99980786 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 99980787 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99980809 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 99980903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99980965 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99981034 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 99981084 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 99981095 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 99981145 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 99981149 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99981250 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99981314 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99981401 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 99981449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99981722 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 99981923 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 99981990 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 99982125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99984283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99984998 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99987834 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99988049 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 99988395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99988633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99989399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99989905 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 99990534 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 99991596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99991726 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 99991846 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99992487 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 99992798 A G N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 3 99995090 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99995754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99995785 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 99995846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99995851 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99995946 A T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0 0.823529411764706 0.176470588235294 14 20 0 14 3 3 99996085 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 99996219 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99996246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99996359 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 99996370 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 99996373 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 99996798 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 99997069 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 99997367 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 99997416 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 99997442 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99997473 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 99998200 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 99998561 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 99999103 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 99999157 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 99999268 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 100000023 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100000095 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100000418 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100000566 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 100000567 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 100001151 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 100001404 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 100002528 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 100002620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100004280 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 100004297 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100004491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100004505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100005162 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100005293 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100006387 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100006784 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100008681 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100009242 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100009582 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 100009784 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100010624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100011259 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 100011349 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 100011610 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 100011656 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 100011677 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 100011891 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 100012165 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 100012216 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 100012303 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 100012482 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 100012491 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 100012708 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 100013854 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 100013958 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100014159 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 100014522 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100014719 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100014821 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100015182 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 100015378 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100015423 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 100015652 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 100015916 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 100016038 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 100016222 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100018288 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 100018719 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100018733 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 100019018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100020203 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100020990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100022514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100022720 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 100022844 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 100023104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100023302 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 100023463 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 100023657 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100023719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100023759 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100023915 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100024216 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100024218 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100024321 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 100024383 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 100024417 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 100024493 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 100024599 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100024771 A T N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 100025059 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100025350 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 100025673 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100026071 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 100026488 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 100026506 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 100026665 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 100028505 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100030459 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100031346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100031928 T C N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 3 100032105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100032275 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100032635 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100032794 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100032832 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100033331 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100033534 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100033551 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100033554 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100033663 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100033811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100034088 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 100034288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100034351 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100034739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100034891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100035845 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 100040144 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100040477 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 100040716 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100040840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100041402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100041485 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 100041701 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 100041863 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 100042511 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 100042536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100042944 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 100043042 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 100043205 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 100043254 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100043262 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 100043512 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100043594 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 100043760 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 100045277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100045449 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100045802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100047127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100047996 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100048241 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100048291 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100048953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100048973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100051118 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 100051515 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 100051766 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 100052768 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 100053422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100053638 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 100053882 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 100053905 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 100054397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100054441 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100054905 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 100055037 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 100055058 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 100055272 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 100055287 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 100056143 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 100056176 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 100056191 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100056994 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 100057101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100057137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100057142 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 100057173 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 100057671 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 100060024 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100061309 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100063052 T C Y Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 3 100070493 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100071814 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100073380 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 100073392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100073814 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100074229 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100074414 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 100074903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100075549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100075619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100076078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100076438 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 100077880 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 100077968 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 100078169 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 100078285 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 100079067 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 100079316 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100079968 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100079977 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 100080322 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 100080374 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 100081048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100081125 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 100081867 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 100082506 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100083004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100083260 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 100084192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100084690 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100085409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100085924 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100086601 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100086654 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100087120 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100087133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100087156 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100087215 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100087537 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100087594 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100087788 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100087792 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 100087827 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 100087962 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100087972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100087978 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 100087997 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100088042 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 100088210 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100088600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100089241 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100089271 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100089486 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100090727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100091012 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 100091912 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100091977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100093548 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100093556 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 100096239 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100096279 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 100097858 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 100097909 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100098794 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 100099450 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100099629 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 100101207 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100101979 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100102013 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 100102019 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 100102431 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 100102754 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100102845 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100103065 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100103218 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100103445 T G Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 100103953 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 100104222 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 100104501 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100105030 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 100105167 G A N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 100105211 T A Y N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 100105234 G A Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 100105248 T C Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 100105282 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 100105308 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 100105417 T C Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 100105871 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100106440 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 100106562 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100106658 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100107432 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100107564 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100107608 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100107629 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100107678 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100107794 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100107804 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100108115 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 100108143 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 100108360 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 100108572 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100108608 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100108947 A G N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 100109961 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100110229 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 100110739 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 100110876 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 100111034 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100111154 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100111383 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100111504 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100111667 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100111729 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100111734 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100111779 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100111814 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100111830 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100111892 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 100111964 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100112075 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 100112305 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 100112386 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 100112507 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100112704 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100112721 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100112874 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100113225 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 100113226 C G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 100118923 T G N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 100119184 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100119274 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100119348 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100119392 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 100119479 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100119554 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 100119582 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 100119633 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100119814 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 100119851 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 100120049 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 100120154 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 100120236 G T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 100120276 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100120300 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 100120487 G T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 100120489 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 100120514 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 100120530 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100120564 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 100120565 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 100120741 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 100120754 A T N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 100120929 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 100121066 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 100121102 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 100121107 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 100121150 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100121282 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 100121417 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 100121490 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 100121502 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 100121745 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 100121908 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 100122016 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 100122113 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100122185 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 100122320 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 100122413 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 100122887 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 100122929 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 100123796 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100123898 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 100124000 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 100124258 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100124329 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100124359 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100124666 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100124715 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100124732 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100125067 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100125079 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100125148 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100125189 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100125201 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100125500 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 100125701 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 100125884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100126034 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 100126732 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100126798 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100126852 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100126891 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100127043 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100127093 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100127212 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 100127218 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 100127242 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 100127266 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 100127412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100127422 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100127434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100127464 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100127553 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100127554 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100127580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100127633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100127680 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100127830 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 100127931 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100128006 A G N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 13 11 1 11 0 3 100128034 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 100128258 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100128260 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100128401 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100128559 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100128580 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100128608 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100128755 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100128818 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100128918 C G Y N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 100131024 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 100131367 T G Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 100131885 G T Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 100131919 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100132835 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 100132856 C A Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 100132876 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 100133018 C T Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 100133222 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100133578 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 100133600 C T Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 100135897 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 100136093 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100136456 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100136763 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100136839 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100136977 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100137523 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100137683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100137916 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 100137918 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 100137958 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100137983 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 100138015 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100138194 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100138506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100138595 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 100139206 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 100139279 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100139803 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100140110 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100140897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100141617 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 100142356 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100143038 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 100143241 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100143370 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100143549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100143745 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100143904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100145337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100147814 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100147855 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100147954 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100147997 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100148008 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100148561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100148682 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 100149488 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100149555 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 100150838 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 100151079 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 100151096 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100151299 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100151387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100151497 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100152359 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100160524 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100160677 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100160856 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100160857 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100161221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100161325 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100161405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100161409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100161456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100161503 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 100161614 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100161715 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100162101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100162152 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100162192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100162265 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100162331 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100162336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100162347 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100162397 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100162448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100162551 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100163953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100164792 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100164931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100165076 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100165109 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 100165590 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 100169307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100170252 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100170494 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100171728 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100172214 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100172863 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100173439 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100174416 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100174615 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100174676 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 100174734 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100174851 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 100177600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100178551 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100178823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100179566 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100180679 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100181219 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100181644 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100181979 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100183908 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 100185614 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100186311 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100186351 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100186368 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100186607 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100186970 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100187081 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 100187747 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100187895 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 100191181 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 100191348 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 100191843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100192207 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100194599 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100195960 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 100197081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100202961 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100203560 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100203882 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100204847 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100204859 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100206139 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100207728 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 100208231 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 100208827 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 100209217 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100209512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100210054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100210721 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100211013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100212910 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 100213158 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100213198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100213306 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 100213373 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100213758 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100214588 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100215289 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 100216216 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100216270 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100216324 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100216347 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100216563 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 100216714 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 100216885 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 100217151 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100217166 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 100217256 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100217310 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100217925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100217981 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100218073 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100218088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100218581 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100218758 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100219616 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100219710 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100220078 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 100220205 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100220501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100220758 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100220856 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100220907 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100220977 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100220978 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100221052 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 100221057 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 100221117 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100221124 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 100221279 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 100221349 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 100221360 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100221400 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 100221405 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 100221434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100224868 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 100225454 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100225715 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100226151 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100226185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100226327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100226763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100226900 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100227096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100227743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100229841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100230199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100230241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100230283 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 100230455 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100230511 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100231099 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100231192 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100231338 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 100231389 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 100231741 G T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 100231751 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100231783 T G Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 100231811 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 100231832 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100232011 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 100232121 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 100232422 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100232489 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 100232527 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 100232538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100232557 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 100232668 A G Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 100232688 A G Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 100232691 A G Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 100232775 A G Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 100233025 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 100233026 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 100233056 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100233115 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 100234463 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 100234498 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 100234942 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 100234989 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 100235021 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100235098 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100235114 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 100235195 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 100235467 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100235571 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 100238052 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100238076 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100238313 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100238326 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 100238484 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100238633 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100238677 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 100238756 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 100238825 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100238833 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 100238862 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 100238909 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 100239050 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 100239503 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 100239512 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 100239519 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 100239558 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 100240612 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100240622 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 100240639 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 100240643 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 100240746 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 100240965 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 100241352 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 100241485 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 100241594 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 100241598 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 100241615 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 100241662 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 100241759 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 100241894 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 100241909 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 100241940 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 100241973 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 100242001 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 100242052 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100242108 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 100242179 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 100242275 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 100242431 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100242555 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 100242777 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 100243188 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 100243610 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 100243915 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 100244286 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 100244778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100245017 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100245457 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100246306 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100247883 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 100248180 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100248782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100248991 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100249030 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100249091 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100249100 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100249123 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 100249331 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100249398 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100249412 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 100249473 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100249726 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100249763 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100250869 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 100251218 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100251235 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100251286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100251300 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100251665 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 100251841 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 100251899 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 100251971 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 100252033 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100252104 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 100252129 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 100252692 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 100253058 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 100254334 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100254689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100255549 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 100255794 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 100255823 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 100256122 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100256130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100256937 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100256992 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100257092 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100257109 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 100257302 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100257309 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100257317 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100257350 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 100257472 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100257550 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 100257956 G T N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 100258029 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 100258057 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 100258109 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 100258194 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 100258211 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 100258331 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 100258374 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100258590 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 100258655 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 100258910 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 100258937 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 100259166 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 100259176 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 100259184 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 100259314 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 100259544 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 100259580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100260697 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100262264 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 100262939 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100263358 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100263843 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100264624 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100266034 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100267804 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100268251 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100268446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100268448 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100268495 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100268633 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 100268712 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100268977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100269112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100269202 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 100270682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100271348 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100272782 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100274108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100274437 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100274565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100275420 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100278234 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100278816 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100279007 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 100279598 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 100279885 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 100280457 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100280734 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 100281127 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100281623 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100281899 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 100282713 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100282900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100283071 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100284792 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100284962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100285201 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100285708 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 100286497 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100287102 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100287769 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100287934 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 100288315 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100288921 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100290591 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100292120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100295263 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100295323 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100295625 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100297026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100297885 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100297973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100298403 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100298453 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100298524 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100298746 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100301896 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100303035 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100304053 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 100304666 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100305329 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100306264 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100308233 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100308664 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100308953 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100309937 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100310246 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100311641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100311674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100313953 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100314279 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100314448 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100316029 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100318279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100319382 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100320715 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100322160 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100322349 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100326137 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100326676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100327688 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100328062 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 100329362 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100329747 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100330233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100330591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100330631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100330790 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100331068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100332116 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100332482 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100335358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100335960 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 100336496 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100336649 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100337777 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100339216 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100340741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100342144 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100343226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100344579 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 100344652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100345942 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100346385 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100347398 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 100348070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100348928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100349053 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100350985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100351445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100351585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100351890 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100352061 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100353630 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100354622 A T Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 100355196 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 100356115 C A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.0588235294117647 0.823529411764706 0.117647058823529 16 18 1 14 2 3 100356462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100357888 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 100359977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100360494 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100360703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100362622 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100364012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100367218 T C Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 100369587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100369707 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100375430 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 100375764 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100384079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100385469 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100388702 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100392041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100394172 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 100394890 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100404720 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100406362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100409894 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 100413536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100413593 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 100415289 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 100417598 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100426134 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100427511 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100429192 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100429449 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100429736 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 100432240 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100433851 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100434928 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 100435174 T A N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 100435270 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 100435324 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100436063 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 100436931 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100437889 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 100438377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100438417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100438421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100438595 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100438629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100438719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100438996 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 100439002 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 100439084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100439931 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 100440876 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 100441194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100441238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100441482 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100441819 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 100441926 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100442417 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 100442712 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100444540 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 100444674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100444839 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 3 100444918 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 100445546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100445626 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 100445939 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100446515 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100447183 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100447246 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100447401 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100447713 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 100447880 T A N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.3125 0.125 0.5625 12 20 5 2 9 3 100447907 T C N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.230769230769231 0.153846153846154 0.615384615384615 8 18 3 2 8 3 100447913 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 100448075 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 100448081 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 100448567 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100448668 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100448845 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 100449208 C T N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 3 100449393 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 100449513 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100449752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100450104 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 100450108 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 100450118 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 100450206 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 100450352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100451749 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 100451758 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 100452180 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 100452291 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 100452583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100452720 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 100452817 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100452893 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 100452938 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 3 100452965 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 100452981 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 100453083 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100453264 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100453314 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100453475 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 100453771 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 100453789 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 100453935 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100454445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100454489 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100454694 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 100454725 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100454882 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100454938 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 100455359 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100455404 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 100455716 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.375 0.1875 0.4375 15 17 6 3 7 3 100455814 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 100456311 G C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 3 100456337 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100456371 T A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 100456532 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 100456616 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100457036 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100457111 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100457640 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100458051 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 100458529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100458608 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100459042 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 100459208 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100459308 C A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 100459357 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 100459686 A C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 100460231 C A N N 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 10 14 4 2 6 3 100460899 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100461167 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100461224 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100461270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100461634 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 100461841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100461950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100462074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100462169 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100462188 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100462209 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100462212 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100462250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100462257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100462288 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100463263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100463333 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100463410 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100463585 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100463677 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100463678 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100464156 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100464276 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 100464296 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 100464317 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 100465068 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100465415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100465621 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100466570 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100466625 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100466734 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100467014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100467260 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 100467511 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100468303 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100469308 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100473132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100473352 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100473721 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100474147 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 100478425 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100479101 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100479139 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100479189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100479228 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100479637 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100480363 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 100480471 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 100480635 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100480759 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 100482744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100483019 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100483076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100483128 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100483149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100483626 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100484045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100484751 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100485229 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100485631 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100485913 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100485932 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100486077 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 100486113 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100486224 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100486243 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100486352 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100486504 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100486964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100487957 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100488012 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100490817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100490923 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100491056 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100491341 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100491553 G A N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.454545454545455 0.363636363636364 0.181818181818182 14 8 5 4 2 3 100491753 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 100491789 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100491979 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 100495088 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 100495494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100495506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100495578 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100498429 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100498548 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100498724 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 100499372 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100499709 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100500212 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 100500780 A T N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.571428571428571 0.357142857142857 10 18 1 8 5 3 100501182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100501278 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 100501812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100502434 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 100502466 G C Y N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 100502785 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 100503730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100503757 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100504234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100504239 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 100504256 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100504425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100504776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100504803 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100505098 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100505219 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100505349 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 100505832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100508206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100508265 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100508808 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 100508889 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 100509014 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 100511472 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100511631 T C N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 3 100512099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100512412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100512923 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100513403 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100513438 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 100513678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100514332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100517270 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 100517426 T G N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 100517576 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 100517673 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 100519352 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100520099 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100520511 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100520635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100520871 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100521287 A T Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 100521369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100521527 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 100521568 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 100521590 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 100522099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100522375 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 100522405 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100522665 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100523705 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 100523828 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 100524002 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100524124 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100524371 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100524818 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100524985 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100525074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100525237 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 100525367 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100525766 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 100525864 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100526022 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100526346 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100527228 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 100527258 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100527367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100527457 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 100527491 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 100527513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100527525 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 100527724 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100527785 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 100528116 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 100528185 C G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 100528201 G C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 100528228 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 100528291 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100528366 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 100528484 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 100528498 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 100529186 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 100529187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100529263 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 100530626 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 100531031 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 100531328 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100531357 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 100531417 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100531504 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 100531505 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100531516 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 100531575 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 100531630 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 100531759 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100532041 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100532750 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 100532887 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 100532982 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 100533114 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100533126 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100533128 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100533157 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100533676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100534313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100534373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100534516 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100534597 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 100534811 C A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 100535152 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100535164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100535189 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100535273 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 100535376 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100535456 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 100535638 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 100535713 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100535831 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 100535933 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 100535943 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 100536074 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 100536586 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 100536606 G A N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 100536636 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 100536975 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100536996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100537003 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100537219 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 100537289 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 100537296 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 100537380 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100537406 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 100537437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100537901 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100538227 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100538320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100538575 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100540296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100540308 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100540663 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100540779 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 100540927 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100541485 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 100541699 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 100541705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100541745 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 100542297 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 100542341 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 100542462 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 100542522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100542945 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 100542994 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 100543285 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 100543403 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 100543475 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 100543490 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100543746 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 100543785 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 100543806 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100543816 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 100543888 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 100543897 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 100543911 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 100543942 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 100544457 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 100544664 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 100544783 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 100544789 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 100545601 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100545619 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 100545651 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 100545686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100545702 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100545724 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 100545820 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100545825 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 100545941 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 100546039 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 100546150 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 100546162 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 100546214 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100546367 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 100546482 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 100546739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100546976 T A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 100547037 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 100547469 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 100547543 C G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 100547779 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100547843 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 100547854 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 100547859 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 100548280 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 100548309 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 100548409 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100548472 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 100548490 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 100548515 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 100548575 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 100548612 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 100548782 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 100548936 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100549295 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100549693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100549762 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 100549849 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100550146 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 100550360 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100550405 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 100550644 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 100550652 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 100550670 T G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 100550895 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 100550961 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 100550963 C A N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 100550985 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 100551271 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100551503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100551637 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100551739 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100552585 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100552834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100554267 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 100554412 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 100554480 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100554548 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 100554565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100555104 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 100556193 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100556686 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 100556734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100556845 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 100556857 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 100556864 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100556876 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100556923 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 100556952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100556957 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 100556989 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 100556993 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 100557022 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 100557045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100557054 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100557064 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 100557167 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 100557208 A T N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.466666666666667 0.2 0.333333333333333 17 13 7 3 5 3 100557460 C T N Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 5 9 1 3 3 3 100558436 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 100558460 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 100558616 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 100558645 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 100558705 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 100559096 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 100559100 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 100559906 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 100559928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100559955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100560127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100561415 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100561919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100562111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100562583 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100562761 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 100562765 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100563265 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 100563286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100563386 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 100563508 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 100563779 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 100563805 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 100563894 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100563897 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100563922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100563998 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 100564053 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 100564251 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 100564283 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 100564383 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 100564513 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 100564532 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 100565373 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 100565566 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 100565616 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 100565875 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100566124 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 100566167 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100566222 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 100566263 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100566411 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 100566430 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 100566696 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 100566721 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 100566925 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 100567084 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 100567321 G A N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 100567644 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 100567700 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 100567786 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 100567936 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 100568132 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 100568292 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 100568321 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100568577 A C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 100568614 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100568767 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 100568772 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 100568885 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 100569021 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 100569113 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 100569180 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 100569207 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 100569663 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 100569963 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 100570012 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 100570018 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 100572791 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100574051 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100574263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100575553 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100575555 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100576345 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 100577094 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 100577344 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 100577489 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 100578680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100578977 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100579917 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 100580084 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 100580230 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 100580421 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 100580510 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 100580707 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 100580935 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 100580984 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 100581008 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 100581050 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 100581207 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 100581393 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 100581783 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 100582054 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 100582259 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 100582360 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 100582375 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 100582410 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 100582448 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 100582514 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 100582620 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 100582643 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 100582993 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 100583033 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 100583061 C G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 100583134 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 100583173 T G Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 100583207 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 100583332 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 100583372 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 100583611 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 100583617 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 100583688 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 100583800 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 100583819 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 100584055 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 100584290 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 100584468 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 100584484 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 100585206 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 100586533 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 100587219 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 100587371 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100588014 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 100588838 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100588885 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100591702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100593940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100594321 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 100595265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100595552 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 100597204 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 100598645 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100598849 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 100598884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100598943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100598972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100599133 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100599212 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 100599253 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 100599258 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 100599495 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 100599619 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 100599840 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100599948 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 100600739 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 100600879 T G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 100600895 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 100600917 C A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 100601182 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 100601248 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 100601269 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 100601301 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 100601310 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 100601396 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 100601472 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 100601700 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 100601780 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 100601969 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 100602292 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 100602393 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 100602432 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 100602582 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 100602748 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 100603037 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 100603044 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 100603204 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100603226 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100603800 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 100604328 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 100604369 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 100604437 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 100605859 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 100605988 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 100606081 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 100606154 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 100606518 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100606551 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 100606570 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 100606576 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100606594 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 100606629 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 100606664 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100606676 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 100607765 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 100611269 G C Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 100614851 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 100615960 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 100616173 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 100616227 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 100616329 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 100616368 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100616371 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 100616712 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 100619113 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 100620022 T G Y N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 100620025 T G N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 100620427 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100620637 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 100620641 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 100621103 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 100621256 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 100621569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100621587 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 100621911 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100622343 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 100623132 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 100623155 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 100623213 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 100623265 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 100623419 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 100623535 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 100623586 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 100623587 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 100623637 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 100623647 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 100623814 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 4 8 2 0 4 3 100623822 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 4 8 2 0 4 3 100623829 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 4 8 2 0 4 3 100623911 T C N Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.5 0 0.5 6 6 3 0 3 3 100624023 A C N N 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.428571428571429 0 0.571428571428571 6 8 3 0 4 3 100624060 T C N Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.5 0 0.5 6 6 3 0 3 3 100627089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100627115 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 100627231 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100627475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100628049 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 100628809 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 100629154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100629781 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 100629960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100630512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100630782 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100630881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100631168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100631240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100632369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100633849 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 100634237 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100635386 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100635395 A G Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 100635408 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 100635436 T A Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 100635457 T C Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 100635458 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 100635881 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 100635924 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100635954 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 100637259 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100638876 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100639072 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100639616 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100640145 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 100640451 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100640686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100640727 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100640968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100641112 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100641170 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 100641180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100641222 A G Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 100641272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100641372 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 100641412 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100641414 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100641431 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100641454 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100641459 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100641549 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100641696 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100641865 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 100641870 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100641986 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100641996 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 100642002 C G Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 100642074 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 100642345 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 100642366 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100642441 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100642498 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100642511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100642570 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100642571 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 100642630 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100642690 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100642809 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 100642975 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 100643029 G T Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 100643079 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100643087 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 100643433 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100643759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100643827 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 100644124 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 100644294 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 100644365 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 100644431 C T N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 100644616 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 100644678 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 100644702 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 100645249 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100645291 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 100645309 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100645340 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100645528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100645596 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 100645767 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100645791 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 100646153 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 100647020 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 3 100647052 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 3 100647116 A G Y Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 3 100647415 G T Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 100647553 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 100647573 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 100647588 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 100647736 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 100647802 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 100647804 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 100647890 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 100647893 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 100647936 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 100648263 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100648272 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100648710 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100648815 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 100648862 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 100648875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100649169 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100649180 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 100649190 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 100649205 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 100649328 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100649490 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 100649516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100649581 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 100650023 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100650154 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100650410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100650627 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100650628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100650649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100650665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100650864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100650910 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100651096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100651097 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100651484 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100651639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100651656 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100651671 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100651693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100651718 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100651879 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100652017 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 100652030 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 100652048 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100652075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100652096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100652436 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100652437 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 100652582 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 100652705 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100652840 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 100652881 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100652918 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100653001 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 100653013 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100653199 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 100653203 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100653351 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 100653352 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 100653478 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100653502 C A Y N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 100653929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100654549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100654757 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 100654794 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 100654804 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 100654903 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 3 100655119 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 100655443 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100655444 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100655691 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 100655820 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 100655847 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 100655864 A C N N 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 3 100655903 A T N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 100656009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100656031 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100656119 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 100656173 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 100656203 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 100656217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100656236 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 100656237 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 100656261 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 100656369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100656400 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 100656430 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 100656462 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 100656481 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100656571 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 100656604 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 100656612 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 100656722 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 100656723 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 100656856 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100656924 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100657753 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 100658183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100659602 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100661166 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100662375 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100662827 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 100663158 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100663776 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100663790 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100663919 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100664265 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100664933 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100665465 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100668307 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 100668870 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100670002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100670102 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100670379 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100670414 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 100670711 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100671612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100673420 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100674955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100677673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100681361 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100681807 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 100682061 G A N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 100685651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100686250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100686251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100686452 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100686486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100686614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100687984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100689595 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100689904 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 100689953 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 100690125 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 100690370 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 100690421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100690728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100691692 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 100692196 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 100692211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100692378 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 100692428 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 100692454 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 100692657 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 100692720 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 100692842 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 100693055 G C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 100693139 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 100693410 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100693415 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100693466 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 100693527 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100693555 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100693560 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100693657 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100693695 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 100694051 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100694086 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100694269 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100694449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100694478 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 100694582 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100694587 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 100694807 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 100695034 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 100695120 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 100695160 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 100695258 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 100695281 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 100695373 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 100695448 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 100695522 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100695542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100695623 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100695899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100696491 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 100696535 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 100696926 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 100696966 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100697107 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100697391 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 100697392 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 100697801 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 100699201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100700146 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100700713 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100700864 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100701029 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100701239 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100701249 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100701280 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100701519 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100701693 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 100701800 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100701853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100702874 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 100703218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100703234 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100703962 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100703979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100704477 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100704540 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100704553 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100704597 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100704598 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100704608 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100704630 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100704740 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100704772 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100704916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100704983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100705102 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100705211 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100705420 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100705437 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100705540 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100705597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100705643 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100705865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100705891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100705936 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100705959 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100706025 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100706042 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100706069 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100706139 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 100706141 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 100706300 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100706346 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100706510 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100706561 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100706580 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100706601 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100707109 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100707143 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100707171 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100707208 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100707267 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100707345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100707434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100707565 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100707704 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100707873 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 100708251 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100708422 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100708437 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100708462 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100708486 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100708746 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100710044 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 100710198 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100710422 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 100710495 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 100710504 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 100710518 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 100710531 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 100710552 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 100710777 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 100710804 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 100711137 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100711527 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 100711857 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 100712317 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100712703 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100713173 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100713245 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100713378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100713451 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100714219 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 100714327 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100714420 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 100714537 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 100714738 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100714748 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100715027 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 100715227 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 100715266 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 100715276 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 100715277 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 100715368 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 100717403 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100718608 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 100718638 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 100718747 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100718749 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100719229 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100719280 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100719360 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100719404 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 100719591 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100719645 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100719700 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100719728 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 100719752 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100719806 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 100719810 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 100720033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100720065 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100720189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100720195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100720246 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100720262 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100720286 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100720319 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100720337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100720395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100720417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100720700 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100720830 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100720881 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100720955 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100721008 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100721012 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100721020 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100721033 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100721209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100721234 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 100721284 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 100721336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100721344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100721373 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100721820 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 100723171 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100723643 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 100724321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100726975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100729185 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 100730778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100731348 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100732886 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100732887 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100735760 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 100736041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100736899 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100737073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100737735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100738234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100739273 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100740892 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100742578 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100743861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100745491 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100745571 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100749455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100750337 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 100750895 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100752838 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 100753889 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100754179 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100754274 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 100754334 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 100754386 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 100754398 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100754643 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100754650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100754657 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 100755412 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 100755659 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 100755969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100756723 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 100756743 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 100756864 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 100757092 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 100757425 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 100757588 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 100757599 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100757668 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100757690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100757844 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100758119 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 100758243 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100758359 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 100758443 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100758475 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 100758638 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 100758895 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100758905 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100758941 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100759346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100759826 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100759841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100760038 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100760104 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100760306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100760338 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100760546 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 100760627 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 100760760 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 100760898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100760907 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 100760911 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 100760922 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 100762281 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 100762476 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 100762486 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 100763020 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 100763338 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100763436 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100763619 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100763828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100764448 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100764527 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100764598 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100764643 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100764917 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100765071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100765156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100765462 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100765522 G A Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 100765595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100765628 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100765633 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100765736 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100765978 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 100766082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100766198 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100766729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100766773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100766804 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 100766811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100766908 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100766943 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100767156 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 100767409 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100767970 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100768203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100769331 C T N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.0769230769230769 0.769230769230769 0.153846153846154 12 14 1 10 2 3 100772147 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100772333 C A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 3 100772462 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100773083 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100773132 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100773331 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100773517 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100773537 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100773800 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 100773947 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100774210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100774285 G A Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 100774289 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 100774307 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0 0.882352941176471 0.117647058823529 15 19 0 15 2 3 100774310 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0 0.882352941176471 0.117647058823529 15 19 0 15 2 3 100774624 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100774847 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100774891 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 100774910 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 100774999 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 100775344 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100775358 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100775398 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100775412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100775590 A G N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0 0.846153846153846 0.153846153846154 11 15 0 11 2 3 100775638 T C N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 14 12 1 12 0 3 100775654 T G N N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.416666666666667 0.583333333333333 0 17 7 5 7 0 3 100775665 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 100775878 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 100775957 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100776094 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 100776439 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 100776537 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 100776565 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 100776868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100777352 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 100778236 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100778253 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 100778387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100779020 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 100779050 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100779198 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 100779208 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 100779272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100779312 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 100779504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100779610 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 100779721 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100779792 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 100779917 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 100779918 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 100780123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100780135 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100780468 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100780627 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 100780672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100780795 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 100781071 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100781084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100781173 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 100781257 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 100781370 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 100781375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100781539 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100781563 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 100781590 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 100781690 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 100782177 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100782193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100782232 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 100782263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100782882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100783357 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100783469 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100783615 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 100783625 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100783955 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 100784128 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100784682 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100784785 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100785268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100786595 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 100786911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100786937 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100787116 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100787138 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 100787195 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100787227 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100787274 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 100787356 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 100787427 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 100787619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100787638 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100787693 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 100787974 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 100788114 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 100788158 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 100788370 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 100788483 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 100788514 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 100788600 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 100788616 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 100788860 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 100788891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100791670 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 100791801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100791962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100792009 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 100792014 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 100793048 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100793175 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 100793585 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100793586 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100793636 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100793770 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 100793788 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 100793844 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 100793850 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 100793953 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 100794016 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 100794057 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 100794449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100794457 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 100794489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100794589 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 100794727 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 100794741 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 100795189 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 100795230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100795246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100796844 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 100796862 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 100796899 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 100796950 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 100797373 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 100797435 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 100797674 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100799105 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 100799169 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 100799186 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100799460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100799629 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 100799794 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100799968 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100800089 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 100800107 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100800238 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100800290 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100800816 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100801110 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100801146 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 100801201 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100801644 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 100801823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100802017 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 100802046 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 100802196 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100802441 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 100802492 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 100802594 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 100802668 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 100802688 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100802832 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 100802846 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 100802956 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100803206 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100805694 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100805730 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100805760 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100805914 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100805916 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100805979 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100805986 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 100806055 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100806462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100807902 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100808455 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 100808840 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 100809110 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100809866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100810229 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100810417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100812160 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100812669 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100812818 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 100813093 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100813103 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 100813359 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100813433 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100814213 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100815263 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100815314 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100816543 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100816839 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 100817538 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 100817543 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 100817766 T G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 100817820 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 100817868 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 100817888 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 100817997 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 100818053 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 100818077 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 100818080 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 100818121 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 100818125 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 100818168 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 100818260 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100818305 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 100818425 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 100818587 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100818621 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100818929 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 100818967 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 3 100818968 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0 0.8 0.2 16 24 0 16 4 3 100819129 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100819152 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100819158 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100819189 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 100819607 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 100819745 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 100819854 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 100819907 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100819963 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100820009 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100820099 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100820312 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100820342 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100820427 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100820463 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 3 100820574 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 100820627 G C N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.3125 0.625 0.0625 20 12 5 10 1 3 100820637 A T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 3 100820813 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 100820982 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 100821092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100821106 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 100821268 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 100821675 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100821710 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 100821805 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100821897 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100822225 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100822307 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 100822338 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 100822605 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100823506 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100823646 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100823861 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 100823952 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100824085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100824091 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 100824255 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100824279 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 3 100824529 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 100825855 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100826491 A C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 100826627 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 100826899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100826956 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100827716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100828126 C A Y N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0.2 0 0.8 2 8 1 0 4 3 100828157 G A N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 3 100828551 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 100828641 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 100828837 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 100828963 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 100829155 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100829306 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100829475 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100829653 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 100829951 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100829976 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100830556 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100830608 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100830812 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 100830853 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 100830984 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 100831402 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100831427 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100832197 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 100832230 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100836017 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 100836520 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100836544 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100837387 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100837615 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100837718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100837937 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100839244 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100839259 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100839584 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100840239 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 100840756 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100841646 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100842704 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100843201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100843405 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100846911 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 100847330 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100848333 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100848625 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 100848829 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 100848963 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100849953 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100850442 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 100850697 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100852309 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 100852386 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100852452 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 100852660 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100852815 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100852912 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100852919 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 100853098 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100853242 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100854086 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100854233 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100854304 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100854311 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100854321 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 100854347 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100854396 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100854451 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100854503 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 100854504 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 100854743 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 100854745 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 100854969 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100855200 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100860086 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 100860833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100860946 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 100861995 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100862792 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100863087 A C Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 100863099 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100863757 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 100863949 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100864257 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 100864992 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100864997 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 100865672 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 100865708 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 100865810 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 100865819 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100865843 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100866254 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 100866264 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100866302 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 100866305 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 100866348 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 100866360 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 100866370 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100866389 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100866549 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100866686 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 100867474 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100867496 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 100867529 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 100867555 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 100867619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100868566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100868651 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100868870 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100869043 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100869050 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100869057 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100869929 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100869977 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100870151 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 100870186 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100870229 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100870452 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100870456 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100871129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100871320 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100871675 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 100872177 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 100872180 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 100872198 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 100872253 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 100872469 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 100872479 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100872654 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 100872656 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 100872781 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 100872809 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 100872810 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 100873050 C T Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 100873216 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100873333 C A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 100873764 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 100873799 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 100874153 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100874208 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 100874216 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 100874451 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 100874494 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 100874501 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 100874555 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 100874606 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 100874730 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 100875169 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100879939 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 100880029 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100880055 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100880944 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100881649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100882132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100883325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100883401 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100884868 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 100885002 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 100885035 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 100885044 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 100885154 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 100885262 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 100885271 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100885385 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100885392 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 100885466 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100885477 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100885774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100885841 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100886039 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100886141 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 100886170 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 100886177 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100886196 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100886225 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 100886297 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100886316 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 100886324 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100886608 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 100886692 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 100886694 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100886730 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 100886790 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100886801 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 100886808 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 100886823 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 100886847 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 100886881 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100886967 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 100886973 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 100886981 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100887001 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 100887037 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100887042 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 100887060 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100887065 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100887101 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100887153 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 100887289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100887474 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 100887540 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 100887566 G T Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 100887611 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 100887702 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 100887714 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 100888302 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100888325 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100888333 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100888590 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 100888665 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100888793 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100888848 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 100888856 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100888880 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100888889 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100888964 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 100889650 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100889882 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 100890152 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 100890683 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100891823 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100892139 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100892177 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 100893551 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100893683 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100894204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100894252 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100894253 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100894494 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100895056 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 100896667 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100896900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100896906 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100897602 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100899058 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100899088 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100901363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100901418 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100901667 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 100903795 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100904370 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100904496 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 100904964 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 100904977 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100904996 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 100905092 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100905104 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 100905199 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100905264 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 100905388 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100905720 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100905788 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100905857 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 100905968 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 100906488 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100906683 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100906725 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 100906777 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 100906897 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 100906928 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 100907034 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 100907101 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100907735 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100908440 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 100908444 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 100908478 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100908492 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100908650 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100909429 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100909513 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 100909764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100910057 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100910171 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100910176 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100910384 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100910734 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 100910745 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 100911153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100911236 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100911407 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100911533 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100911647 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100912299 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100912707 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100913082 G C Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 100916264 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100916849 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100916859 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100917200 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100917417 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100917429 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100917826 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100917897 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 100917934 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 100917971 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 100917977 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100917984 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 100918045 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 100918070 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 100918175 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100918323 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100918353 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 100918354 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100918447 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100918646 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 100918692 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100918817 A G N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 100918950 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 3 100918990 G T N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 100919255 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 100919925 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 100920156 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100920307 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100920377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100920542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100920543 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100921099 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100921703 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100921813 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 100921933 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 100921934 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 100922001 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100922190 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100922459 T A N N 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 7 11 2 3 4 3 100922472 T G N N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 3 100922488 G A Y Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 3 100925257 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 100925376 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100925811 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100925918 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100926163 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100926365 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100927021 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100927086 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100927135 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 100927149 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 100928041 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100928300 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 100928321 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 100928463 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100928624 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 100928744 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 100929177 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 100929382 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 100929633 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 100929974 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 100930618 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 100930623 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 100930722 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 100930784 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 100930879 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 100930942 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 100931033 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100931086 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100931155 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100931165 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100931415 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 100931636 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100931678 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100931953 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100932100 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100932286 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100932306 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100932338 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 100933290 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100933308 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100933342 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100933403 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100933864 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100933871 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100933886 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100933898 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100934121 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100934325 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 100934532 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 100934799 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 100934860 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 100934886 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 100935038 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 100935040 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 100935104 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100935114 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100935143 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100935402 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100935694 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100935822 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100935878 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100935885 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100935938 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100936656 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100937177 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 100937205 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100937242 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100937276 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100937524 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 100937649 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 100937662 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 100937852 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100937955 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100937989 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 100938559 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 100938593 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100938721 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 100938759 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 100938798 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 100938970 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100939275 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 100939302 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 100939318 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 100939328 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 100939368 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100939376 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100939392 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 100939416 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100939470 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100939482 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100939681 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100939858 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 100939961 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100940032 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 100940091 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100940281 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 100940810 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100942086 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 100942265 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100942370 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100942573 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100942961 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100943173 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100943181 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100943374 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100943395 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 100943466 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100943627 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100943740 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100943753 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100943775 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100943820 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100943822 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100943896 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100943942 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 100944061 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100944281 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 100944465 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100944736 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100944891 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100944966 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100945090 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100945145 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 100945159 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 100945324 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100945538 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100945621 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100945727 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100945765 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 100945821 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100946272 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100946580 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 100946735 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100946824 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 100946835 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100946861 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100946882 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100946885 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100946923 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100947020 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100947279 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100947354 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100947371 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 100947890 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 100947994 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100949247 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100950664 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100950935 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 100951073 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 100951235 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100951457 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 100951882 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100951930 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 100951939 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 100952007 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100952128 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 100952220 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 100952303 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 100952308 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 100952525 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 100952690 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 100952714 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 100952809 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 100953383 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 100953482 G A N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 13 11 1 11 0 3 100954005 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 100954329 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 100956250 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100956429 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100956811 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 100956823 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100956846 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 100958092 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100958179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100958257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100958308 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100959110 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100959174 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100959195 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 100959233 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 100959366 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 100960430 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100960532 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100964300 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100965041 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 100965046 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 100965174 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 100965722 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100967165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100969128 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 100969533 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100969609 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 100970842 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100971019 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 100971024 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 100971105 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100971153 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 100971203 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100971413 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 100972364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100974159 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100975116 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100977076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100977078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100977696 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 100978124 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 100978887 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100979959 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100980693 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 100980743 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 100980781 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 100980974 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 100981184 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 100981401 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 100981645 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 100981674 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100981681 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100981994 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100982599 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 100982807 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 100983029 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100983100 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100983180 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 100983610 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100983718 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100984036 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 100984041 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100984241 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100984383 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 100984570 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 100984841 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 100985010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100985182 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100985330 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100985371 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100985442 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100985500 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 100985651 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 100985772 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 100985922 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 100985958 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100986047 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100986238 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100986423 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100986525 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100986784 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 100987246 G C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 100987372 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100987375 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 100987465 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100987520 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100987585 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 100987636 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 100987652 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 100987730 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100987771 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100987868 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100987947 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100987955 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100987993 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 100988014 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 100988113 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100988263 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 100988355 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 100988385 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 100988479 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 100988526 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100988529 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 100988537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100988584 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 100988803 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 100988805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100988952 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100989001 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 100989046 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100989128 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 100989218 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 100989247 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 100989268 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100989317 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100989358 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100989364 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100989384 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100989412 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100989432 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100989692 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 100989700 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 100989775 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 100989854 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 100989887 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100989951 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 100990004 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 100990053 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 100990157 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 100990189 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100990225 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 100990285 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 100990369 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100990442 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 100990498 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100990583 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 100990869 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100990914 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 100991126 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100991184 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 100991509 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100994277 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 100994564 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100994899 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100994946 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100994964 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 100995070 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 100995087 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 100995117 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 100995524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100995927 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100996194 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 100996366 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 100996793 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 100997065 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 100998215 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 100998268 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 100998418 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 100998662 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101001287 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101001875 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101002353 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 101004521 T C Y Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 8 12 1 6 3 3 101005447 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 101006187 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101006203 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101006239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101006324 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101006508 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101006586 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101006624 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101006840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101006948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101007005 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101007065 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 101007083 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101007109 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101007133 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101007184 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101007187 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101007353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101007507 C G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 101008032 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101008131 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101008138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101008396 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101008975 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101009132 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101009190 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101010264 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101010316 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 101010344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101010669 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101010865 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101011008 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101011017 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101011052 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101011085 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101011225 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101011237 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101011264 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 101011452 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101011465 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101011483 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101011484 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101011615 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101011632 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101011697 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101011818 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101012007 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101012016 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101012197 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 101012215 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 101012289 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 101012477 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 101012481 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 101012535 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101012778 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 101012781 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101012839 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 101012849 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 101012901 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101012935 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101012962 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 101013232 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 101013248 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 101013249 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101013753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101013768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101013935 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 101014317 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101014341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101014352 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101014356 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101014428 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101014541 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101014563 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101014564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101014578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101014752 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101014787 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 101014815 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 101015042 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101015194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101015281 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 101015449 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 101015582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101015612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101015665 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 101015995 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 101016072 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 101016512 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 101016755 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 101016800 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 101016802 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 101016819 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 101016950 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 101017722 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 101017765 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 101018370 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101018457 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101018541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101018915 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101018951 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 101018977 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101019140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101019159 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 101019189 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 101019211 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 101019248 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101019284 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101019537 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 101020313 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101020316 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101020532 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101020562 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 101020605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101020679 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 101020780 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 101020781 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101020833 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 101020862 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 101020900 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 101020905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101020937 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101021037 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101021189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101021628 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101021897 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 101021980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101022147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101022152 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 101022385 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 101022439 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101022470 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 101022647 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 101022679 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101022695 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 101022721 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 101023098 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 101023135 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101023195 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 101023272 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101023303 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 101023625 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 101023768 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 101023845 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 101024048 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 101024068 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 101024097 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 101024158 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 101024161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101024321 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 101024365 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 101024432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101024474 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 101024483 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 101024552 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 101024589 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 101024734 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 101024757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101025161 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101025342 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 101025552 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 101025783 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 3 101025866 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 3 101025909 G T N N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 101025995 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 101026065 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 101026077 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 101026648 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101026789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101027091 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 101027230 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101027354 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 101027556 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101027615 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101027773 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 101028004 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101028046 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101028305 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101028801 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101029193 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 101029492 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 101029736 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 101030000 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101030066 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101030067 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101030181 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101030636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101030675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101030688 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101031671 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 101031748 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 101032018 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 101032200 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 101032325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101032382 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101032864 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101033122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101033154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101033337 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 101033409 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101033559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101033653 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101033770 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101034320 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101034356 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101034377 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 101034444 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101034778 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101035234 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101035694 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 101035818 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101035936 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101036032 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101036537 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101036580 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101036963 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101037017 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101037377 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101037431 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101037468 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 101037471 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 101037558 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 101037954 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 101038058 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101041021 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101043537 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101043710 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101044223 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101045803 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101046126 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 101047618 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 101050110 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101050864 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101051342 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 101051389 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 101051856 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101052049 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101052068 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101052160 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101052241 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101052576 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101052625 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101053051 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101053146 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 101053270 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101054848 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101055649 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101056374 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 101056558 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 101056952 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 101057323 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 101058276 T A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 101059091 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 3 101059474 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101059535 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101060643 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101061182 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 101061188 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 101061920 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 101062186 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 101062234 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101062322 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101062548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101062726 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101062749 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 101062987 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 101063057 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101063079 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101063093 C A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 101063153 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101063740 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 101063752 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 101063762 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 101063947 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 101064002 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101064344 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 101064385 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 101064400 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101064725 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101064789 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101064843 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 101065014 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 101065381 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 101065409 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101065449 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101065963 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 101066115 T C Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 101066197 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101066200 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101066336 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 101066379 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101066591 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 101066636 T A N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.25 0.6875 0.0625 19 13 4 11 1 3 101067147 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 101067170 A T N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 101067224 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 101067239 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 101067240 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 101067266 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101067271 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 101067359 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101067363 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 101067440 C G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 101067452 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 101067525 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 101067606 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 101068197 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101068389 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 101068527 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 3 101068564 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 101068733 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101068742 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101068845 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 101069050 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101070599 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101070604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101070950 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101072507 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101072593 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101072793 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 101072882 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 101073669 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101074176 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101074690 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101075702 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101075811 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101076311 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101076363 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101076401 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101077214 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101077508 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 101077758 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101079184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101079256 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 101079316 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 101079339 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 101079495 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 101079526 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101079595 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101079612 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 101079676 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101079991 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101080107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101080183 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101080199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101080212 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101080434 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101080620 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101080957 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101081117 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101081355 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101082087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101082217 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101083211 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101083566 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101083583 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 101084055 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 101084131 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 101084136 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101084161 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 101084347 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101085447 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 101085703 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 101085705 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 101085943 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 101086256 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 101086373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101086411 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101086525 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 101086541 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 101086636 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101086669 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101086689 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101086750 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 101086825 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 101086883 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 101086974 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101087025 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101087167 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 101087560 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101087617 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101088496 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101088537 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101088585 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101089218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101089353 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101089837 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 101089974 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 101090133 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 101090140 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 101090268 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 101090290 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 101090301 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101090309 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101090352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101090674 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 101091143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101091678 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 101092022 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101094609 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 101094931 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 101095272 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 101095778 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101095793 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101095812 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101095973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101096385 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101097183 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101097261 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101097328 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101097422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101098237 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 101098301 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 101098399 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 101098891 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101098916 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101098973 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 101099061 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101099216 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 101099244 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 101099388 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 101099468 T G N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 101099481 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 101099514 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 101100020 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 101100230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101100255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101100288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101100331 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 101100473 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101100500 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 101100539 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 101100612 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101100798 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 101100853 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 101100878 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 101101122 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101101782 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101101970 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 101102370 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101102687 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 101102729 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101102796 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 101102969 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 101102984 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 101103192 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 101103370 A C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 101103545 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 101103636 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101103734 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101103846 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101103916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101104097 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 101104397 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 101104721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101104896 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101105062 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101105786 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 101105810 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101105850 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101106820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101107296 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 101107336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101107470 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 101109003 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101112924 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101112946 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 101113009 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 101113040 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 101113336 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 101113357 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 101113372 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 101113385 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 101113505 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 101113545 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 101113781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101113993 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101114004 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 101114035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101114141 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 101114158 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 101114169 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 101114814 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 101114881 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 101114961 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 101114962 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101115107 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 101115176 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101115297 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 101115671 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101115873 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 101115929 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 101116251 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 101116892 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 101117144 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 101117193 A C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 101117210 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 101117483 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101117561 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101117598 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 101117695 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101117823 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 101117906 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 101117938 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 101118063 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101118123 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 101118229 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101118232 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 101118250 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 101118276 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101118335 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101118420 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101118460 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101118478 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101118583 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 101118596 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 101118947 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 101119382 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 101119415 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 101119606 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 101119661 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101119957 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101120008 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 101120102 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 101120146 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101120148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101120177 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101120182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101120227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101120244 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 101120298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101120315 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101120348 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101120435 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101120952 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 101121823 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101121859 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101122230 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101122535 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101123442 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101123520 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 101124339 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101124359 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 101124374 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 101124438 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101124593 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 101124710 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101124728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101125115 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101125132 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101125741 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101126062 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101126824 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101126826 C A Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 101126925 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101126947 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 101127475 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 101127858 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 101127881 G C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 101127965 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 101128239 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101128444 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 101128545 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 101128591 T C N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 0.153846153846154 0.153846153846154 20 6 9 2 2 3 101128821 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101129023 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101129081 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101129085 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101129680 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101129685 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101130719 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 101134270 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101135500 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101135967 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 101136018 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 101136025 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101136036 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101136197 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101136535 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101136730 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101136802 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 101136905 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 101136908 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 101136923 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 101138560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101139709 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 101139723 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 101139757 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 101139786 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 101139946 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 101140115 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 101140141 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101140154 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 101140369 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 101140408 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 101140441 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 101140473 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 101140514 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 101141069 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 101141147 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101141652 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 101142452 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101142485 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101142996 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101143297 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 101143789 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101144307 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101145452 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 101145457 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 101145466 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 101145680 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101145932 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 101148146 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 101148305 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 101148494 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101148523 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101149039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101149152 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 101149394 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101149421 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 101149564 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101150004 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101150037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101150047 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 101150133 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101150189 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 101150192 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101150251 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101151155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101151175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101151383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101151559 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 101152650 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101152797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101152836 A T Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 101152842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101153050 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 101153066 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101153814 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 101154276 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101154666 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101154837 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101156303 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 101156666 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101156788 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101157091 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101157461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101157842 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 101159381 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101159452 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101159752 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101160083 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 101160092 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 101160095 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 101160372 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101160392 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 101160579 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 101160591 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 101161353 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 101161659 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 101161702 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 101161954 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101162069 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101162501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101162609 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101162715 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101162790 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101162963 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 101163372 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101164139 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 101164377 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101165306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101166537 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101169704 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101169762 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 101170163 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101170164 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 101171879 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101172340 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 101172429 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101172588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101172720 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101172828 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101173463 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 101174334 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101174505 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101175398 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101175560 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101177162 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101177523 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101177526 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101178322 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.0555555555555556 0.833333333333333 0.111111111111111 17 19 1 15 2 3 101178671 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101178750 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101178944 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101179672 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 101180134 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101182631 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101182917 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101182988 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101183457 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101183519 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101183540 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101184295 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101184831 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 101185897 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101186601 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 101186887 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 101187946 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101188026 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 101188186 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101188494 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101188546 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 101189368 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101190237 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101190319 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101190473 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101191642 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 101191989 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101192222 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101193715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101194761 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101195440 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101196369 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101196615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101196854 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101197093 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101197223 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101197467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101199362 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101201581 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101201622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101202454 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101203602 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101203607 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101203664 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101203722 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 101203725 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 101204167 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 101204306 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101204461 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101204693 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 101206039 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101206394 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101207749 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 101208372 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101209651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101209783 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 101210128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101211797 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 101211970 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 101212007 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 101212015 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 101212124 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101212157 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101212383 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101212446 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 101212481 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 101212582 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101212683 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 101212927 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101213007 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 101213072 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 101213422 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 101213441 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101213444 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 101213798 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101213972 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 101214030 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101214167 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101214194 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101214369 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101214516 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101214640 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 101215055 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 101215074 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 101215207 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 101215392 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 101215499 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 101217122 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 101217544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101217545 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 101219479 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101223849 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101224851 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101225984 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 101227510 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 101227772 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 101227893 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101228939 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101230430 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101230715 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 101230946 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101233636 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 101233993 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 101234053 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 101234057 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101234475 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101234897 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101234940 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101235084 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 101236011 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101236029 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 101236165 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 101236212 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101236221 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101236708 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101237022 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101237038 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 101237064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101237095 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101237265 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 101237311 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101237618 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 101237641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101237687 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 101237741 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 101238006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101238148 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 101238285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101238461 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101238588 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 101238869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101238949 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101241807 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101242086 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101242297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101242316 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101242325 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101242492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101242523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101242613 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 101242813 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 101243156 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101244473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101244591 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 101244805 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 101244963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101244993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101246445 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 101246501 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 101246521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101246545 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 101246654 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 101246663 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 101246776 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 101246875 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 101247004 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 101247592 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 101248914 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101249002 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 101249084 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101249148 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 101249252 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101249286 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101249287 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101249327 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 101249473 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 101249648 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 101249784 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 101249845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101250388 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101250393 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 101251467 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 101251485 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 101251518 T A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 101252011 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101252212 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101252219 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 101252231 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 101252296 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101252546 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101252642 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 101252934 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 101253009 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101254696 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101256993 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 101258168 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101258695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101262378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101262533 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 101263891 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101264278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101265761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101266549 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101266550 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101267155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101267270 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101267392 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101269682 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101269689 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101270827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101272780 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101273395 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101274539 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101275430 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101276013 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101276578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101277467 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101278974 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101279070 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 101279642 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 101280312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101282301 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 101282337 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101282606 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 101282845 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 101282853 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 101282890 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 101282935 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 101284125 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101284136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101284338 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 101284685 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 101288715 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.15 0.85 0 23 17 3 17 0 3 101289704 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101290093 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 101291278 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 101291519 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 101291538 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 101291539 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 101291904 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 101292206 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 101292233 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101292278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101292319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101292388 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101292487 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 101292503 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 101292851 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 101292913 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 101293272 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 101293575 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101293589 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 101293601 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 101294311 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 101294536 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 101294631 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101296065 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 101296299 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101296345 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 101296493 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 101296523 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101296581 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101296641 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101296713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101296730 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101296822 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101296843 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101297389 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101297515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101297661 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 101297710 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 101299263 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101300042 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101300239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101300557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101300705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101300726 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101300759 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 101301068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101301395 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 101301804 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 101301932 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 101302095 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 101302441 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 101302992 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 101303285 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 101303417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101303464 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 101303482 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101303520 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101303663 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101303704 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 101303738 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 101303759 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 101303951 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 101303982 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 101304016 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 101304132 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101304136 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101304540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101305185 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 101305186 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 101305205 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 101305236 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101306106 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 101306577 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 101309715 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 101310555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101310635 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101311775 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101311904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101311978 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101314876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101315483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101317164 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 101317467 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101321898 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 101325882 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101325909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101327136 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101327217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101328133 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101328303 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101331415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101331873 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101332095 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101332383 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 101333428 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101334033 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 101334181 G C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 101334485 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 101334852 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101334881 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 101335764 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101336098 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101337602 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 101339808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101339962 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101340085 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101340546 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101341178 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101341999 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101342901 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101342916 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101343083 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 101343100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101343101 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 101343301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101343317 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101343324 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101343330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101344438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101345278 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 101346623 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101347069 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 101350210 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101350685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101353908 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101357290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101359424 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101359970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101360159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101360163 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 101360361 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 101360382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101360496 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101360786 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101360910 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101360920 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101360924 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 101361274 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101361278 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101361286 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101361297 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101361314 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101361319 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101361468 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 101361612 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101361783 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 101362055 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101362062 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101362139 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101362158 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 101362169 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101362174 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101362338 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101362376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101362534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101362629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101362642 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101362747 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101362800 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101362857 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101363283 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101363316 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101363543 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101364088 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101364132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101364327 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101364353 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101364571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101364751 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 101364769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101364819 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101364931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101364952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101365184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101365228 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101365302 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 101365493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101365498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101365588 T A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 101365745 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 101365757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101365827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101365884 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 101366113 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101366133 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101366138 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101367388 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 101367498 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 101367514 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101367586 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 101367618 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 101367787 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 101367962 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 101368085 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 101368103 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 101368137 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 101368159 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 101368182 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 101368254 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 101368331 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 101368550 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 101368997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101370586 C T Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 101371668 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 101372964 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101373333 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101373802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101373934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101374107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101374588 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101375311 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101376175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101376287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101376848 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101377556 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101377586 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101377710 T C N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 101377932 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101377947 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101378009 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101378728 G C Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 101378841 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101378866 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101378910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101379087 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101379116 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101379126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101379221 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101379223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101380519 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 101380968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101382479 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101383357 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 101384796 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101386240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101386460 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101388901 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101389340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101390652 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101391052 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101391057 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101391654 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 101393434 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101394705 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101394711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101394806 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101396202 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101396583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101397064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101397528 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101397870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101397880 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101398374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101398657 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101398812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101398822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101400577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101401530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101403677 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101404298 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101404482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101406090 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 101409955 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101410030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101410418 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101410776 C A Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 101410807 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101410842 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101410910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101411946 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 101413256 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101413851 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101413916 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101414046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101414100 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101414101 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 101415594 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101415955 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101418963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101419666 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101419769 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101420068 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101420752 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 101421466 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101425305 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101425535 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101425866 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101427298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101427932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101429113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101429483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101430053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101432373 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101433204 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101434963 T A N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 3 101437225 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101437757 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101438163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101438411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101439854 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101440992 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101441129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101442211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101442755 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101442799 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101447327 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101447590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101448129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101448756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101449194 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101449487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101450241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101450260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101450276 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101450295 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101450310 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101451335 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 101452498 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101452609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101453947 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 101455298 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101455733 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101455740 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101457186 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101457674 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101457782 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101458835 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 101458950 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 101459083 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101459149 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 101459162 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 101459227 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101459493 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101459682 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101459979 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101463063 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 101463448 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101463576 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 101467676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101468175 T A Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 101469142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101473383 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101475454 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 101475465 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 101475592 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101475598 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 101475682 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101475702 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101475744 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101475813 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101476435 A C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 101476622 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101476722 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101476813 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101477835 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101477872 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101477922 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101477925 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101478238 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101478614 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101478946 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101479149 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101479279 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101479346 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101479989 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101479993 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101480059 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101480078 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101480156 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101480246 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101480423 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 101480461 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101480462 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 101480475 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101480490 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101480564 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 101480592 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 101480870 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 101480940 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 101480967 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 101481211 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101481659 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 101481665 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101481718 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101481732 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101481754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101481818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101481975 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101482011 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101482055 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101482156 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101482338 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101482421 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101482468 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101482475 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101482480 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101482495 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101482543 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101482544 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101482559 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101482570 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 101482658 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101482685 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 101482781 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 101482904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101482981 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101482991 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101483136 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101483394 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101483528 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101483603 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101483919 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101484904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101485355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101485505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101486820 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101487288 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101487491 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 101487654 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101487748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101488164 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 101488285 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101488324 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101488475 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101488747 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101488870 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101489115 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101489767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101489932 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101490169 T A Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 101490877 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101491633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101493231 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101493814 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101493979 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101493981 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 101493993 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101494337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101494527 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101494671 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 101494691 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 101494692 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 101494735 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 101494798 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 101495237 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 101495698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101496294 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101496986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101497003 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 101497096 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 101497210 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101497806 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101500270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101500590 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101503098 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 101503187 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101503673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101503740 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101505008 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101505159 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101505221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101505572 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 101506262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101507112 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101507834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101507858 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101507926 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 101507997 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101508142 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101508170 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101508173 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 101508194 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 101508292 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101508298 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 101508739 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 101508885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101508917 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101508944 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101509396 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101509502 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 101509609 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 101509641 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101509714 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 101509719 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 101509764 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 101509777 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101509866 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101509936 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101510019 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 101511230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101513231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101514073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101519023 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101519096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101519280 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101519327 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101520617 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101521225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101522066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101522178 G C N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 101522227 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101522297 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101522446 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101522582 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101523121 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 101524020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101525011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101525649 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101526631 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101528513 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 101530331 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101530351 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 101531152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101531176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101531279 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101531286 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101531716 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101532271 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 101532335 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101532656 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101533067 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101533113 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101533118 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101533310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101533318 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101533364 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101533443 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101533509 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101533513 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101533594 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101533599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101533961 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101534022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101534122 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101534171 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101534742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101534804 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101534970 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 101534981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101535056 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101535327 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101535438 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101535755 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101536206 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101536379 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101536396 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101536465 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 101536794 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101537126 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101537217 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 101537681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101537772 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101537911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101538389 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101541297 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101541326 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101541510 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 101541867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101542047 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101542278 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101542379 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101542728 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101542829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101542857 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101542908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101542961 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 101542972 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101543003 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 101543044 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 101543618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101543953 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101544231 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101544421 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101544734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101547203 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 101547402 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 101547514 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101547676 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101547751 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101547810 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101547876 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101547877 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101547890 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101547897 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101547915 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101547916 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101547933 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101547949 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101548174 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101548366 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101548405 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101548492 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101548827 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 101549368 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 101549370 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 101549428 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 101549478 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 101549740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101550207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101550541 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 101551198 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 101551357 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101551401 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101551467 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101551496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101552458 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101552758 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 101552776 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 101552833 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101552872 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101552887 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101553466 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101553564 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 101553750 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101554031 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101554652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101554750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101554991 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101555015 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101555161 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101555218 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101555270 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101555314 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101555408 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101555718 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101555768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101555786 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101556032 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101556486 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 101556615 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 101557302 T A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 101557357 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 101557431 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 101557438 C T N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 101557532 G A N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 101557619 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 101557628 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 101557727 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101557962 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101558082 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 101558139 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 101559288 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 101559295 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 101559332 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 101559399 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101559425 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101559451 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101559470 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101559501 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 101559565 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 101559660 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 101559777 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 101559785 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 101559789 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 101559848 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 101559899 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 101559989 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 101560009 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 101560062 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 101560091 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101560137 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101560305 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101560329 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101560342 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 101560347 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101560474 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101560511 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 101560579 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101560606 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 101560613 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 101560724 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101560767 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 101560796 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101560843 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101561034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101561091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101561111 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101561126 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101561246 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101561264 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101561267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101561403 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101561440 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101561461 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101561831 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 101561867 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 101561975 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101562002 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101562252 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101562397 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101562582 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 101562632 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 101563072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101563195 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101563427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101563504 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101563530 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101563546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101563615 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101563799 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101563804 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101564234 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101564266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101564306 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101564310 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101564325 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 101564791 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101564816 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101564928 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101564937 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101564971 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101565218 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101565333 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101565366 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101565424 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101565682 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101565715 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101565726 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101565911 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101565972 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 101565974 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101566011 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101566017 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101566218 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101566221 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 101566274 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 101566382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101566398 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 101566416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101566435 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101566452 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101566501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101566535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101566558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101566806 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101566852 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 101568018 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101568051 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 101568131 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101568190 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 101568322 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101568323 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 101568341 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101568672 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 101568728 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 101568791 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101568907 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 101568915 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 101568935 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101569136 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101569170 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101569175 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101569248 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101569270 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101569286 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101569315 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101569365 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101569461 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101569514 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101569631 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101569715 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101569764 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101569765 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101569850 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101569861 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 101569888 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101569976 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 101569977 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 101569991 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101570214 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101570410 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101570738 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101570754 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101570874 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101570995 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101571062 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 101571104 A G Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 101571140 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101571201 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 101571211 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 101571219 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 101571335 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101571338 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101571377 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 101571486 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101571527 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101571814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101571997 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101572023 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101572158 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101572170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101572205 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101572262 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101572394 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101572593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101572931 C G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 101573013 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101573280 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101573346 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101573466 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101573512 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101573519 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101573538 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101573556 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101573677 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101573863 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101573917 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101573921 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 101574177 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101574181 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101574199 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101574267 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101574386 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101574586 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101576114 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 101576287 T C Y Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 101576517 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 101577221 A C N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 101577304 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 101577389 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 101577395 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101577447 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 101577460 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101577495 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 101577549 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101577650 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 101578514 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101578529 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101578701 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 101578704 A T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 101578947 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101578980 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101579019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101579069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101579075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101579102 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101579270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101579327 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101579475 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101579484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101579538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101579546 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101579602 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101579904 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101580573 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 101580827 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101580929 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 101580955 T A Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 101582899 G A N Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 3 101583135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101583475 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101583506 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101583805 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101583850 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101584193 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101584521 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101584639 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101584641 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101584705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101584708 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101584732 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101584891 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101585275 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101585670 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 101586973 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101587240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101587786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101593192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101596288 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101597205 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101599131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101600027 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101602865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101603009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101603112 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101603321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101603712 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 101603774 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101604060 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101604176 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101604403 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101605157 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 101605315 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101605447 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 101605466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101605572 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101605586 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101605589 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101605681 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101605685 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101605902 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101605967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101606168 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101606256 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101606269 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101606303 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101606310 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101606454 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101606473 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101606475 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 101606584 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101606594 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101606617 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101606883 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101606960 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101607436 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101607625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101607721 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 101607861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101608143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101608329 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 101608733 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 101608875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101608979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101609052 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101609146 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101609166 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101609175 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 101609197 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101609340 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101609614 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101610636 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 101610648 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 101610681 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 101610715 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 101610801 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101610874 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101611113 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101611186 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101611295 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101611834 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 101611930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101612145 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101612151 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 101612197 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101612363 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101612408 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101612409 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 101612474 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 101612481 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 101612508 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 101612677 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 101612978 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 101612993 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 101613012 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 101613026 A G Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 101613060 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101613144 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 101613154 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 101613204 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101613544 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 101613567 A T Y N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 3 101613624 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 101613807 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101614289 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 101614308 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 101614352 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 101614423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101614548 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 101614574 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 101614607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101614626 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 101614653 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 101614872 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 101614970 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101614973 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101615071 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101615151 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 101615170 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101615274 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101615427 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 101615454 T A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 101615547 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 101615551 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 101615594 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 101615608 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 101615618 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 101615619 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101615667 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101615837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101615970 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101616096 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101616222 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101616351 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 101616445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101616733 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101616825 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101616838 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 101616936 G T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 101616947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101616951 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 101616964 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0 0.933333333333333 0.0666666666666667 14 16 0 14 1 3 101617013 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101617146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101617383 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101618004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101618655 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101618679 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101619429 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101619494 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101620771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101621156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101621430 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101623096 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101624571 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101625737 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101626202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101626743 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101626941 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 101627941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101627964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101628306 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101628845 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101628889 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101628956 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101629139 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101629228 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101629809 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 101629944 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101629969 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101630056 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 101630372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101630949 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101630987 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 101631635 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101631981 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 101632129 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101632195 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101632385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101632408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101632456 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101632678 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101633290 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 101633522 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 101633530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101633576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101633749 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101633920 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101634050 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 101634102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101634227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101634699 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101634756 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 101634875 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 101635002 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 101635756 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101635855 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 101636300 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101636310 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101636320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101636323 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101636567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101636991 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101637136 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101637220 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101637234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101637280 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101637749 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 101637882 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101638354 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101638580 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101638585 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101638593 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101638605 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101638645 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 101638660 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 101638724 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101639407 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 101639613 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 101639633 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 101639638 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 101639663 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101639800 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 101639848 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 101639867 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101639964 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 101639988 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101640005 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101640022 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101640038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101640453 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101640514 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101640522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101640773 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 101640775 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101640790 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 101640795 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 101640822 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 101641075 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 101641988 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101642019 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101642146 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 101642147 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 101642232 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101642310 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101642617 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101642622 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101642669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101643308 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101643755 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 101643793 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 101644043 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101644572 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101644714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101645201 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101645303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101645456 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 101645549 A G Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 3 101645781 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 101646078 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 101646182 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101646205 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 101646315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101646354 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 101646394 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 101646582 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101646703 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101646835 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101646928 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 3 101646999 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 101647662 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101648277 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101648381 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101648673 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101649284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101649424 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101649481 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101649817 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101649835 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101649894 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101650042 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101650109 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101650151 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101650507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101651090 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101651885 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 101652887 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101653305 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 101653505 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101653578 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101653616 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 101654545 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 101654549 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 101654605 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 101654707 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 101654786 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101655112 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101655366 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101655528 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101655608 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 101655637 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 101655743 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 101655780 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 101655822 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101655907 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 101655915 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 101656104 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101656734 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 101656786 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101656803 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 101657183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101657761 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 101657810 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 101657921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101657970 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101657972 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101658300 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 101658784 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 101658870 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101659798 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 101659820 A T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 101659999 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101660151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101660224 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101660426 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101660604 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101660669 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101660684 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101660685 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101660716 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 101660901 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 101661435 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101661583 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 101661608 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 101661775 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101662004 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 101662163 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101662211 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101662244 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 101662433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101662458 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 101662540 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 101662544 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 101662595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101662687 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101662915 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 101663362 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 101663694 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101663699 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 101664488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101664751 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101664768 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101664907 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101665171 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 101665203 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101665313 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101665314 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 101665355 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101665358 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101665472 G A Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 101665489 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 101665494 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101665515 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101665536 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101665548 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 101665589 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 101665609 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 101665633 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 101665634 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 101665750 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 101665794 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101665803 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101665926 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 101665930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101665987 A T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 101666077 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101666172 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101666430 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 101666444 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101666456 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101667279 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101667397 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 101667477 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 101667498 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 101667510 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101667538 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101667568 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 101667589 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 101667628 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101667643 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101667691 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101667710 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101668035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101668168 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101668396 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101668478 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101668502 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101668517 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101668609 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101668623 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101668630 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101668651 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101668687 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 101668834 A T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 101669033 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101669073 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101670040 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101670369 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101670379 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 101670413 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101670540 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 101670578 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101670991 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101672060 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101672106 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 101672108 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 101672549 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 101672665 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101672728 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101672818 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101672825 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101672982 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101672996 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101673029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101673037 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101673166 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101673245 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101673300 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101673444 G T Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 101673466 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101673948 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101674033 T G N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0 0.75 0.25 12 20 0 12 4 3 101674259 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 101674279 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 101674389 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101674418 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101674460 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101674481 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101674675 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 101674735 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101675045 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101675050 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101675059 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101675074 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101675096 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 101675140 T C Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 101675151 T C Y Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.2 0.8 0 6 4 1 4 0 3 101675174 T C Y Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.0833333333333333 12 12 1 10 1 3 101675243 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101675251 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101675377 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101675389 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101675487 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101675515 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101675589 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101675639 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101675646 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101675738 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101675763 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101675768 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101675794 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101675893 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101675900 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101675943 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101676461 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101676505 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101676619 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101676791 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 101677352 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101677360 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101677491 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101678515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101678525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101679038 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101679070 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101679123 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101679198 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101680068 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101680115 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101680882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101681496 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101682125 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101682343 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101682385 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101682583 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101682885 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101683750 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101683949 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101683955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101684220 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101684241 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101684249 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101684321 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101684465 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101684747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101684778 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101684841 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101685026 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101685590 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101685687 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101685809 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101685854 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101686135 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101686201 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101686385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101686561 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101686869 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101686942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101687716 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101687787 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101687885 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101687894 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101688085 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101688375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101689122 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 101689182 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101689646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101689951 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101689952 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101689993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101690121 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 101690140 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 101690145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101690291 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101690377 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101690413 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101691180 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101691212 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 101691219 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101691251 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101691296 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101691333 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101691334 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101691387 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101691484 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101691535 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101691582 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101691598 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 101691673 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 101691691 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101692051 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101692166 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101692290 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 101699131 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 101699332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101699408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101699422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101699589 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101699699 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101699765 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101699813 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101699906 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101699969 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101699999 G C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101700055 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101700152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101700280 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 101700421 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101700504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101700613 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101700655 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101700660 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101700763 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101700975 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101701352 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101701467 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 101701574 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101701642 A G Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 101701776 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101701943 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101702152 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101702207 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 101702243 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101702462 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 101702637 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101702877 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101703055 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101703081 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101703297 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101703312 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 101703537 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101703538 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101703651 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101703671 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101703875 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101703922 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101704673 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 101704699 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101704854 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 101705204 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 101705230 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 101705930 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101705994 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101706324 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101706511 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101706609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101706631 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101706658 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101706728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101706745 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101706779 G T Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101706808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101706901 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101707113 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101707127 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101707521 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101707594 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101707605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101707697 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101707737 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101709063 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101709142 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101709169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101709647 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101709733 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101709772 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101709790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101709803 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101709939 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101709942 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101709968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101710055 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101710124 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 101710171 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 101710255 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 101710320 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 101710348 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101710353 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101710476 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101710536 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101710608 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 101710657 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101710664 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101710692 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101710835 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101710858 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101710893 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101711041 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101711106 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101711123 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 101711185 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 101712132 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101712217 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101712223 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101712297 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101712325 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101712543 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101712584 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101712714 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101712772 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101713232 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101713251 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101713410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101713418 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101713527 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101713575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101713640 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101713676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101713684 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101714205 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 101714299 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101714339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101714506 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101714755 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 101714774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101714790 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101714813 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101714826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101714906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101714932 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101714937 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101714971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101714974 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101715104 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101715118 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101715140 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 101715197 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101715232 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101715300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101715320 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101715333 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 3 101715348 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101715383 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101715458 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101715540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101715572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101715579 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101715638 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101715691 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 101715718 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101715794 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101715814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101715845 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101715874 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101716382 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101716419 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 101716448 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 101716449 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101716487 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101716548 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 101716655 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 101716681 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 101716761 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 101716764 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 101716919 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101717328 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101717386 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101717539 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101717550 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101717602 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101717682 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101717697 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 101717719 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101717732 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101717756 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101717940 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101717956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101718027 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 101718061 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101718109 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101718111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101718189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101718276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101718330 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101718356 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101718373 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101718435 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101718574 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 101718864 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 101719023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101719043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101719171 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 101720018 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101720027 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101720030 G C Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 101720164 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101720285 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 101720397 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 101720455 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 101720461 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 101720645 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101720678 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101720905 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 101720927 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 101720989 C A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 101721028 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 101721239 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101721951 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101721961 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101722069 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101722100 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101722145 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101722190 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101722870 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101723054 C T Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 101723395 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101723431 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 101723485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101723525 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101723804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101723847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101723848 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101723992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101724181 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101724306 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101724423 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101724442 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101724478 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101724646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101724738 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101724764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101724796 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 101724823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101724879 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101724893 G T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 101725129 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101725279 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 101725418 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101725651 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101725655 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101725717 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101725769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101726054 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101726441 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101726599 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101726631 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101726663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101726735 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101726807 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101726975 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101727076 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101727077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101727118 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101727173 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101727178 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101727477 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101727481 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101727717 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101727909 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101728430 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101728968 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101728995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101729498 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 101729721 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 101729747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101729962 T G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 101730217 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.588235294117647 0.117647058823529 0.294117647058824 22 12 10 2 5 3 101730855 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101731345 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101732901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101733499 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101733984 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101734221 G T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 3 101734323 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101734511 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101734747 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 101734974 T G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 101735851 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 101736284 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 101736358 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 101736461 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 101736671 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.611111111111111 0.111111111111111 0.277777777777778 24 12 11 2 5 3 101736729 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 101736750 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 3 101736761 T G Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 101736775 T A N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 3 101736922 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 101737161 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 101737212 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 101737301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101737651 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.277777777777778 0.0555555555555556 0.666666666666667 11 25 5 1 12 3 101737829 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101737855 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 101737890 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101737951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101737986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101738047 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 101738240 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101738250 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101738814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101739072 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 101740677 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101740952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101741338 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101741535 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 101741554 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 101741764 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 101741804 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101741869 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101742061 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101742070 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101742158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101742179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101742269 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101742272 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101742282 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 101742754 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101742926 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101743052 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101743099 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101743447 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101743518 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101743520 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101743559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101743560 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101743722 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101743770 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101744045 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 101744064 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 101744304 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 101744315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101744360 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 101744429 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 101744487 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 101744779 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 101745226 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101745248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101745352 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101745370 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 101745526 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 101745680 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 101745790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101745812 A C Y N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 3 101745851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101745867 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 101745889 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 101745899 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 101745988 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 101746190 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 101746198 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 101746257 A G Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 101746332 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 101746409 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 101746488 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 101746527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101746589 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 101746878 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 101747393 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 101747413 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 101748029 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 101748113 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 101748174 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 101748279 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 101748471 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101748492 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 101748508 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 101748551 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 101748763 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 101748840 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101748900 G T Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 101748988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101748989 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 101749161 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101749252 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101749294 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101749304 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 101749552 T G Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 101749592 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 101749597 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 101749719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101749909 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 101749948 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 101749998 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 101750002 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101750017 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101750023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101750044 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 101750122 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 101750159 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 101750218 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 101750247 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101750258 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 101750259 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 101750406 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 101750460 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 101750534 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 101750559 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 101750561 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 101750574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101750865 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 101750897 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101750942 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101751039 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 101751250 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 101751344 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 101751446 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 101751488 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 101751520 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 101751543 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 101751569 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 101751596 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 101751615 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 101751671 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 101751672 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 101751711 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 101751737 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 101751744 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 101751749 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 101751800 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 101751904 C G Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 101751962 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 101751974 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 101751991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101752309 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 101752331 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 101752416 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101752571 G A Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 101753698 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101753979 T G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 101753984 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 101754072 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 101754090 C A Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 101754838 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 101755404 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 101755497 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101755871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101756738 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101756746 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 101756778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101756868 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101756926 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101756937 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 101757143 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 101757144 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 101757226 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101757335 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 101757457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101757494 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101758113 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 101758653 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 101759046 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 101759100 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 101759156 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101759226 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 101759432 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 101759680 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 101759745 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 101760683 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101760706 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 101760931 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 101760948 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 3 101760961 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 3 101760983 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 101761315 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 101761447 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 101761482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101761537 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101761538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101761560 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 101762004 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 101762248 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 101762603 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101763681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101763795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101764245 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101764485 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101764544 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 101765282 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101765313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101765330 A C Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 101766056 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 101766070 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 101766084 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 101766115 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 101766200 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101766369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101766438 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101766449 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101766596 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101766775 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 101766928 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101766945 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101766983 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 101766988 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101767243 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101767347 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101767391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101774989 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 101776207 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101776288 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101777105 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101777198 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101777205 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101777222 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 101777227 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 101777589 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101777787 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101778220 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 101778611 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101778888 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101780017 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 101781166 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 101781259 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 101781397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101781452 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101781721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101781737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101782205 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101782227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101782340 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101782349 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101782549 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 101782733 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101782968 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101782987 A T N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0 0.769230769230769 0.230769230769231 10 16 0 10 3 3 101783451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101783476 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101783485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101783677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101783846 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101784083 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 101784251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101784353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101784420 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101784958 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101784996 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 101785749 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101785954 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 101786125 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 101786197 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 3 101786244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101786321 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 101786670 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101786772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101786790 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101787115 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101787265 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 101788861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101788963 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101789131 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101789133 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101789196 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 101789369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101789386 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 101789471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101790891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101791448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101791752 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 101792126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101792135 T C Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 101792383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101792472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101792525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101792630 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 101792816 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101792902 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101793019 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101793169 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 101793262 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 101793490 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101793491 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101793695 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101793989 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101794003 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101794017 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101794310 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101795977 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 101795987 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 101795990 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 101796010 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 101796263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101796274 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 101796456 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101796772 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 101796846 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 101797231 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101797783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101798029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101798316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101798495 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 101798634 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 101798680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101798687 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 101798730 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101798762 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101798987 T A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 101799010 A T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 101799012 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 101799094 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 101799099 C T N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 8 12 3 2 5 3 101799260 G C N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 101799368 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101799369 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101800044 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 101800099 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101800336 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101800353 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101800526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101800613 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101800614 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101800807 G T Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 3 101801634 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 101801659 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101802637 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101802812 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 101802932 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 101802962 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 101803028 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 101803486 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101803855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101803927 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101804085 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101804186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101804446 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101804903 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101804990 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101805067 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101805297 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101805658 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 101805723 T C N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 101805891 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 101805918 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 101807079 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101808002 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101808271 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101809177 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101809411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101810919 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101811845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101812871 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101812890 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101812933 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101813183 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 101813282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101814340 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 101815059 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 101815517 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101815620 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 101815711 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101816165 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 101816309 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101816366 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101816726 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101820770 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 101820794 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 101820927 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101822223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101822419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101822637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101822668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101822728 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101822834 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101822933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101822940 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101823050 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 101823250 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 101823252 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101823286 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101823598 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101823728 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101824077 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 101824225 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 101824350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101824460 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101824792 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101824827 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 101825925 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101826049 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101826068 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101826073 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101826147 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 101826183 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 101826240 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101826338 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101826351 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101826435 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 101826528 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101826567 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101826922 G A N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 0.142857142857143 0.214285714285714 20 8 9 2 3 3 101827139 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101827145 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 101828143 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101828215 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101832774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101835687 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101837635 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 101839727 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101840640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101843754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101844639 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101844650 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101844740 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101844780 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 101845766 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 101845923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101845924 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101846266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101846593 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 101846718 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 101846917 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101847293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101847345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101847354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101847366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101847517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101847579 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101847714 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101848985 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101849502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101849821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101852707 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101853074 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 101853426 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 101855888 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101859606 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101859612 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101860253 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101860277 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101860526 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101861336 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101862482 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 101863731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101864294 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101864523 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101865136 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101865146 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101865158 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101865443 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 101865471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101865577 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101865696 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 101866408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101866480 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101867165 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101867220 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101867707 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 101867808 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101868142 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 101868343 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101868406 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 101869040 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101869157 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 101870290 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101870801 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101871434 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101871532 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101871720 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101872466 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 101872757 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101872957 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101872993 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101872998 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101873023 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101873101 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101873707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101873744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101873873 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101873959 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 101874163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101874911 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101875014 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101875108 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101875446 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101875507 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101875586 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101875716 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 101875861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101876575 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101876718 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101876731 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101877000 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101877343 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 101877376 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 101877536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101877558 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101877766 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101877862 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 101878147 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 101878325 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101878355 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101878843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101878960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101879568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101879848 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101879929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101880060 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101880703 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101881235 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101881593 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101881693 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 101882605 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101882931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101883178 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101883394 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101883397 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101883874 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101883875 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101884111 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 101884371 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101884388 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 101884506 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101884644 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101884883 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 101884912 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 101884934 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 101884945 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101885006 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101885014 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101885017 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101885050 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101885251 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101885322 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 101885352 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101885423 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101885486 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101885671 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 101886528 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101886959 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101886980 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101887002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101887082 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101887627 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101887677 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101887723 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101887838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101887857 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101887882 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 101888826 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 101889169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101889763 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 101889793 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 101889899 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101890042 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 101892529 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 101892540 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 101892574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101892672 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101893158 T C N Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 3 101893166 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 3 101893676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101893925 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 101893988 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101894131 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101894164 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101894217 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101894737 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 101894742 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101894749 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 101894769 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 101894778 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 101895092 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101895448 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101895480 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 101895531 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 101895535 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 101895545 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 101895561 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 101895565 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 101895581 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101895645 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 101895660 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101895702 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 101895707 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 101895805 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 101895975 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 101896261 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 101896266 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 101896291 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 101896387 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 101896391 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 101896541 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 101896610 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 101896635 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 101896693 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 101896859 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 101898023 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 101898067 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 101898258 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 101898261 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 101898437 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101898458 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 101898468 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 101898533 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 101898582 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 101898743 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101898973 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101899953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101900004 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 101900107 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 101900171 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 101900207 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101900209 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101900378 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 101900786 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 101900837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101901333 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101901576 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 101903337 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 101903599 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 101903614 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 101903627 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 101903664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101904335 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 101904406 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 101904494 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 101904553 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 101904564 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101905948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101906196 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101906369 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 101906380 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 101906726 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 101907225 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 101907628 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 101907908 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 101908273 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101908332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101908944 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 101909076 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 101909522 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101911618 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 101911920 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101912011 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 101912722 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 101913138 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101913195 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101913295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101913673 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 101913943 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101914596 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 101914871 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101914952 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101915220 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101915229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101915343 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 101915502 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101915651 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 101915777 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 101915843 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 101915844 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 101916018 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 101916059 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101916088 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101917266 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 101917273 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101917312 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101917878 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101917951 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101917986 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 101918000 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 101918076 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101918413 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 101918770 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 101919086 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101919425 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 101919522 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 101919530 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 101919763 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101919858 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101920077 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 101920237 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101920273 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 101921588 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101922262 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101922629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101923665 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101923952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101924103 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101924104 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 101924285 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101924608 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 101924688 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 101924798 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 101924864 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101924922 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 101925001 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 101925204 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 101925242 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 101925257 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101925268 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101925289 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 101925299 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 101925330 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 101925343 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 101925452 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 101925506 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101925536 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101925550 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 101925814 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101925905 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 101926179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101926458 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 101926478 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101926506 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 101926658 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101926681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101926699 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101926723 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101926871 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 101926986 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 101927024 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101927069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101927454 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101927465 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 101927744 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 101927772 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 101927875 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 101927967 A G N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0 0.909090909090909 0.0909090909090909 10 12 0 10 1 3 101927987 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 101928031 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 101928084 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 101928159 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 101928544 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 101928585 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 101928871 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 101929187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101929428 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 101929927 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 101929933 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 101930148 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 101930405 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101930446 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101930447 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101930513 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 101930540 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 101930558 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 101930614 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 101930646 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 101930655 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 101930712 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101930768 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 101931575 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101932121 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101932163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101933108 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101933435 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 101933641 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101933757 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101934957 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101935456 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101936810 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101936838 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 101938814 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101939488 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101939561 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101939706 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 101939924 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101940085 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101940803 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101940983 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 101941000 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 101941001 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 101941056 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 101941566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101941581 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101942356 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 101942576 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101942975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101943473 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101943802 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101946545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101948501 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101948601 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101948850 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101949023 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101950548 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101951544 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101954315 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101954644 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101955294 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101955414 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101955738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101956136 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101956166 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101956390 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101956394 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101956792 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101961790 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 101961794 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101963580 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101968259 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101968722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101969061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101969583 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101970134 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101971048 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101972137 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101976537 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101978793 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101978796 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101979960 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101980500 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101981565 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101981581 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101983398 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101986276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101988634 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101988993 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 101989166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101989581 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101989661 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101989847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101989886 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101989943 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 101990908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101990994 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101991061 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101991331 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101992756 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 101992770 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101995004 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 101995504 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 101995884 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 101995971 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101995981 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101996244 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 101997151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 101997919 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 101998390 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 101998908 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 101999161 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 101999246 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101999249 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 101999470 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 101999933 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 101999977 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 102000123 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 102000272 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 102000346 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 102000415 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 102000957 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 102001054 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 102001079 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 102001205 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 102002240 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 102002294 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102002379 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102002387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102002908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102003135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102003473 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102004215 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102004279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102004294 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102004310 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102004386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102004443 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 102004676 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102004759 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 102004822 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102005058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102005134 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102005304 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102005673 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102005843 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 102005883 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 102005975 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 102006155 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 102006321 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102006350 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 102006748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102006768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102007092 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102007095 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102007194 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102007288 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102007659 C A N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 102007711 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 102007764 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 102007945 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102008928 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 102009200 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102009225 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 102009244 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 102009350 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 102009494 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 102009520 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 102010184 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 102010194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102011784 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102012326 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102013083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102014172 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 102014186 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 102014256 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 102014282 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 102014370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102014385 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 102014471 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 102016186 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102017352 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 102018271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102018470 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102018515 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 102018534 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 102018657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102019128 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 102020857 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102022379 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 102022520 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102022644 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 102022973 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 102023027 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 102023411 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102023435 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 102023507 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 102023581 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 102023817 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102023869 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 102023903 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102023923 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 102023942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102023985 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102024077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102024121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102024425 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 102024469 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 102024985 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102025003 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 102025288 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 102025509 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102025681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102026411 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 102026417 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 102026467 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 102027979 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 102028268 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 102028320 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 102028323 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 102028673 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102028726 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 102028755 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 102028765 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 102028931 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 102029545 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 102029615 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102029831 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 102029867 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 102030198 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 102030416 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 102030565 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 102030655 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 102030764 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 102030774 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 102031352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102031407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102031488 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 102031545 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 102031609 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 102032286 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 102032606 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102032619 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 102032657 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 102033440 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 3 102033670 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 102033857 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 102033904 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 102034300 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 102034368 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 102034528 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 102034542 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 102034554 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 102034563 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 102034629 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 102034683 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 102035111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102035586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102036048 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102036288 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 102036337 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102036619 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 102036623 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 102037010 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102037019 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 102037034 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 102037162 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102037170 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 102037456 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102038029 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 102038108 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102038290 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 102038588 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102038620 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 102039636 A G Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 102039669 C T Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 102039670 A G Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 102039691 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102039716 T C Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 102039790 A G Y Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.133333333333333 0.733333333333333 0.133333333333333 15 15 2 11 2 3 102040193 C T Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.0625 0.9375 0 17 15 1 15 0 3 102040196 C T Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.111111111111111 0.722222222222222 0.166666666666667 17 19 2 13 3 3 102040255 T C Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 3 102040319 T G Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 19 17 1 17 0 3 102040361 T C Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 3 102040469 T C Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 102040486 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 3 102040564 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 102040618 A C Y N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.0625 0.9375 0 17 15 1 15 0 3 102040637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102040639 C T Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 102040810 C T Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 102040876 A G Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 102040878 A G Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 102040905 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102040933 T C Y Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.230769230769231 0.692307692307692 0.0769230769230769 15 11 3 9 1 3 102040969 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 102040981 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 102041872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102042688 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 102042794 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 102042812 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 102043079 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102043099 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 102043102 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 102043114 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 102043145 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102043165 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 102043285 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102043453 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 102043538 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 102043601 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102043643 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 102043774 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102043815 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 102043889 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 102043907 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 102043922 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 102044375 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 102044681 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102044749 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 102044817 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 102044939 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 102045206 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 102045247 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 102045359 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 102045360 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 102045480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102045602 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102045700 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 102045727 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 102045818 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 102046277 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 102046368 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 102046424 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102046564 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 102046588 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 102046682 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 102046739 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 102046923 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 102047017 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 102047083 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 102047917 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102050682 A T N N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.125 0.75 0.125 8 8 1 6 1 3 102050717 T C N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 102050774 T A N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 102050808 A G N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 3 102050830 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 102050994 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 102051006 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 102051107 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 102051141 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102051205 A G N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 102051229 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 102051303 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 102051381 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 102051384 A T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 102051423 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 102051776 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 102051798 T G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 102051799 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 102051827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102051878 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 102051936 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 102052012 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 102052213 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 102052415 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102052497 G C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 102052586 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 102053178 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 102053399 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 102053477 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 102053717 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 102053728 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 102053749 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 102053750 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 102053780 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 102053939 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 102053943 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 102053955 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 102054037 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 102054783 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 102054791 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 102055291 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 102055496 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 102055692 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 102055853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102056082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102056094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102056269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102057719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102058131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102059499 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 102059504 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 102059519 G T N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 3 102059524 A G N Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 6 6 2 2 2 3 102059644 A G Y Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 3 102059699 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.555555555555556 0.111111111111111 0.333333333333333 11 7 5 1 3 3 102061419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102063685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102065632 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 102066555 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 3 102066636 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102067453 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 102067674 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 102067680 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 102068289 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102068358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102068661 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 102069049 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 102069124 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102069479 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102069585 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102070217 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102070315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102070656 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102070739 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102071344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102074430 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 102074436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102074632 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 102074669 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102074712 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 102074727 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 102074767 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 102074815 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 102074854 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 102074885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102074909 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 102074927 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 102075076 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 102075189 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 102075404 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 102075410 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 102075424 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 102075430 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 102075459 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 102075499 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 102075592 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 102075603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102075622 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 102075623 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 102075678 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 102075704 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 102075709 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 102075838 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 102076328 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102076571 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102077060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102077137 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 102077647 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102077695 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 102078128 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 102078300 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102078625 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 102079354 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 102079524 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 102079617 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102079703 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 102079726 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 102079954 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 102079971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102080011 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 102080142 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 102080830 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 102080852 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 102080999 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 102081229 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 102081505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102081663 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 102081841 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 102082022 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 102082083 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 102082171 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 102082724 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 102082939 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 102082942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102082985 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102083024 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102083076 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 102083077 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 102083206 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102083274 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 102083314 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 102083322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102083373 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 102083676 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 102083736 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 102083811 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 102083822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102084238 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 102084347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102084461 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 102084624 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102084883 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102084897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102085087 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 102085094 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 102085193 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 102085450 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 102085479 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 102085502 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 102085505 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 102085888 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 102085889 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 102085951 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 102085984 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102086011 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 102086020 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102086132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102086180 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 102086206 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 102086269 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 102086305 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 102086334 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 102086336 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 102086919 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 102087227 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 3 102087379 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 102087489 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102087520 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 102087537 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 102087762 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102088035 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102088148 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 102088233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102088249 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 102088385 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 102088401 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102088554 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102089120 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 102089184 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102089209 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102089381 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 102089528 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 102089553 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 102089572 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 102089649 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 102089652 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 102089676 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 102089707 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102089912 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102089998 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 102090050 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 102090059 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 102090065 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 102090105 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 102090147 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 102090233 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 102090241 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 102090248 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 102090276 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 102090456 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102090562 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 102091121 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 102091392 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 102091414 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 102091416 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 102091488 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102091503 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 102091600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102091636 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 102091690 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 102091781 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 3 102091854 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102091868 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 102091948 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 102091981 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 102092003 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 102092011 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 102092020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102092122 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 102092129 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 102092139 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 102092310 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 102092366 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 102092509 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 102092565 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 102092876 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102092883 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 102093045 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 102093076 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 102093200 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 102093292 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 102093295 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 102093829 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102093839 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102093932 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102094028 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 102094424 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 102094501 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 102094550 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 102094575 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 3 102094751 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 102094766 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 102094844 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 102094900 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 102094904 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 102094913 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 102094933 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 102095451 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 102095475 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102095483 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 102095513 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 102095785 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 102095838 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102095917 T A N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 3 102096056 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 102096141 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102096273 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 102096470 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 102096649 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102096810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102096943 T A Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 102097003 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 102097650 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 102097742 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 102097764 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 102098027 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 102098039 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 102098151 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 3 102098205 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 102098228 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 3 102098238 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 102098247 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 102098434 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 102098573 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 102098756 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 102098782 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 102098877 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 102098890 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102098965 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 102099047 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 102099059 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 102099067 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 102099131 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 102099157 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 102099192 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 102099253 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 102099377 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 102099435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102099500 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 102099811 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102099813 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102099932 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 102100822 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102101357 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 102101805 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 102103713 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102106787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102107454 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 102110469 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 102112152 G C Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 102112597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102114225 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102114331 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 102115575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102115752 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 102116412 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 102118090 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102119310 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 102120151 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102120757 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102122235 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 102122511 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102122698 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 102122759 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 102122769 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 102122777 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102122951 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102122964 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102122968 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 102122998 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 102123299 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102123629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102123691 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102125610 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 102125737 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 102125804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102125820 G T Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 102125964 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 102125967 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102126102 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102126224 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102126285 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 102126600 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 102126647 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 102126706 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 102126751 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 102126752 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102126832 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 102126835 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102126881 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 102126890 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102126894 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102126906 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102127738 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 102127794 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 102127958 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 102128218 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 102128220 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 102128446 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 102128495 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 102128787 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102128989 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102130259 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102130360 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102130494 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102130560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102131177 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102131412 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 102131443 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 102131491 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 102131737 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 102131747 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 102131779 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 102131842 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102131964 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 102132183 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102134062 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 102134355 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 102134418 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 102135108 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 102135245 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 102135294 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 102135346 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102135371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102136409 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 102137777 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102137830 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 102139706 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 102140031 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 102140237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102140267 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 102140315 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 102140436 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 102140441 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 102140615 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 102140824 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 102140866 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 102140876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102141063 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 102142172 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 102142450 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 102143132 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 102143586 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 102144187 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 102144402 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 102144705 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 102144730 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 102144732 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 102144840 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 102145030 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 102145467 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 102145471 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102145623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102147615 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 102150418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102151067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102151869 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102152432 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102153853 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102154187 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102154344 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 102155307 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102158640 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 102158652 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102161368 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102162516 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102163057 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102163324 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102163719 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102164266 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102165361 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 102165472 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102165481 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 102166300 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 102166551 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102166619 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102166682 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102166704 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102166891 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102166934 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102167859 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 102170696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102171575 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 102171586 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 102171660 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 102172734 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 102173085 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102174810 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 102175467 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 102175851 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 102175858 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 102176712 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102177694 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 102177923 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102179533 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 102180293 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 102180432 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102181071 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102181578 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 102181746 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102181978 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 102182162 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 102182259 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 102182534 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 102182689 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 102182754 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 102183008 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 102183101 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 102183246 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102183381 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102183420 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 102183820 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 102183915 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102184069 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102184183 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102184515 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102184836 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102185132 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 102185255 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 102185434 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102185522 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 102185760 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 102186097 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102186137 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 102186258 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 102186315 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 102186356 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 102186370 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102186372 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102186404 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 102186424 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 102186451 C A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 102186456 C G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 102186493 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 102186606 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 102186922 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 102186934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102187082 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102187507 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102188884 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102189338 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 102189465 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102189544 C G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 102189698 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102189893 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 102189908 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102190280 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 102190624 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 102191206 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102191440 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 102191470 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102191570 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 102191698 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 102191706 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 102191722 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 102191833 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 102191834 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 102192124 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 102192145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102192298 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102192312 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 102192398 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 102192430 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 102192439 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 102192605 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 102192633 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 102192636 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 102192679 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102192695 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102192849 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102192948 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102193037 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 102193099 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102193180 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102193199 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102193224 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 102193238 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102193260 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102193264 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102193317 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102193329 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102193976 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102193982 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102194074 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102194090 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102194091 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102194155 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102194189 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102194190 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102194208 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102194536 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 102194545 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102194555 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102194782 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 102194838 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 102194846 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102194983 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102195733 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102195951 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102196272 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 102196369 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 102196518 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 102196579 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102196602 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 102196781 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102196805 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102197325 T G Y N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0.2 0 0.8 2 8 1 0 4 3 102203777 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 102203781 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 102204010 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102204073 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 102204139 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102204363 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 102204652 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 102204708 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 102204729 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 102204741 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 102204821 T A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 102204885 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 102204893 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 102204997 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 102205252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102205292 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 102205455 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 102205463 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 102205901 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 102205956 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 102206051 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102206067 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 102206215 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 102206229 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 102206236 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 102206245 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 102206420 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 102206440 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 102206585 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 102206630 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 102206716 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 102206773 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 102206814 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 102206885 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 102206976 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 102206990 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 102207022 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 102207047 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 102207058 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 102207078 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 102207159 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102207474 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 102207513 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 102207751 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 102207880 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 102208437 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 102208556 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 102208689 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102208698 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 102208745 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102208813 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102208971 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102208974 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 102208982 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102209090 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 102209161 A C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 102209193 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 102209227 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 102209780 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102210415 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 102210438 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 102210439 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 102210513 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102210578 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102210764 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 102210828 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 102210884 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 102211631 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 102212215 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102212313 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102212395 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102212483 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102212585 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 102212795 G A N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0 0.545454545454545 0.454545454545455 6 16 0 6 5 3 102212931 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 102212990 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 3 102213369 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 102213376 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 102213551 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 102213587 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 102213789 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 102213800 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102213831 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 102213854 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 102214052 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102214054 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 102214068 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 102214096 C T N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 3 102214333 G A Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 3 102214406 C T N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 102214426 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 102214479 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 102214491 C A N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 102214527 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 102214541 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 102214737 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 102214755 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 102215138 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102215225 A G N Y 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 3 102215649 A G Y Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 3 102215787 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 102215802 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102215997 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 102216140 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 102216141 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 102216229 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 102216283 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 102216455 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102216469 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102217067 C G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 102217237 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102217296 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 102217307 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 102217389 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102217391 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102217403 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102217569 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102217590 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 102217671 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102218294 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 102218748 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 102218913 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102218960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102219254 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102219259 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 102219276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102219482 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 102219505 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102219528 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102219647 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 102219685 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102219886 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 102219923 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102220226 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102220237 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102220328 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 102220657 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 102220821 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 102220827 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 102221126 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 102221173 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 102221367 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102222343 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102222887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102223330 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102223336 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 102223591 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 102224172 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 102224602 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102224859 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102224999 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102225437 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102225850 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102225911 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102226371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102226415 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102226738 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102226868 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 102226935 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102227010 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102227101 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102227547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102227582 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 102227606 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 102227607 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102227882 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102227884 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102227909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102227944 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102227996 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102228091 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102228109 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102228152 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 102228154 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 102228202 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102228409 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102228455 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102229075 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102229988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102231086 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 102233530 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102241591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102246905 C G N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 102248602 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102248897 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 102249366 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 102250145 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102250322 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 102250435 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102250669 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102254890 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 102257222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102258422 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102258500 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102258501 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102258594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102258601 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102258820 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102258916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102258943 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 102259146 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102259301 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 102259347 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 102259397 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 102259635 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 102259670 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 102259825 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 102260101 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 102260143 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 102260420 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102260758 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 102260823 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 102261102 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 102261120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102261122 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102261187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102261213 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102261384 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 102261386 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102261493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102261522 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102261673 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102261739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102261801 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102262061 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 102262301 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102262361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102263222 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102263441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102264349 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102266011 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102266467 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 102268027 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 102268916 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 102269024 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102269513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102269546 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102271359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102272429 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 102272870 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102273021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102273098 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102273231 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 102273917 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 102273925 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 102273936 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 102274303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102274321 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102274419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102274465 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 102274503 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 102274636 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 102274696 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 102274875 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 102274906 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 102274942 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 102275139 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 102275639 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 102275655 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 102275742 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 102275794 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 102275804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102277184 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102277910 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 102277937 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 102277979 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 102277997 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 102277998 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 102278157 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 102278213 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 102278430 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 102278557 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 102279067 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102281151 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102281550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102281706 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102282021 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102282232 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102282237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102282345 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 102282741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102283034 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102283904 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102283947 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102284239 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102284393 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 102284472 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102284576 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 102284594 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 102284707 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102284719 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102284853 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 102284872 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 102285008 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 102285044 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 102285070 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 102285167 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 102285304 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102285455 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 102285494 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102286151 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102286179 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 102286275 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102286441 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102287031 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 102287073 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 102287183 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102287786 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102288273 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102288320 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 102288747 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 102288758 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 102288826 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 102288864 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 102289139 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 102289267 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 102289279 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 102289296 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 102289773 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 102289802 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 102289873 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 102289904 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 102290194 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 102290252 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 102290264 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 102290293 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102290438 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 102290563 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 102290627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102290688 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 102290747 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102291255 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 102291257 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 102291275 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 102291366 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 102291384 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 102291386 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102291604 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 102291617 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 102291634 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 102291694 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 102292116 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102292348 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 102292684 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 102292691 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 102292792 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 102293971 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102294038 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102294201 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102295098 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 102295699 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 102296114 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102296168 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102296202 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102296538 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 102296647 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 102296687 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102296762 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102296809 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102296818 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102296930 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102296942 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102296958 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102296983 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102297038 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102297304 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102297352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102297780 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 102297806 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 102297857 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 102298059 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 102298315 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 102298362 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 102298377 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 102298426 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102298537 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 102298669 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 102298929 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102299104 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 102299106 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 102299308 C T Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 102299509 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 3 102299563 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 102299673 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 102299739 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 102299858 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102299904 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102299912 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102299935 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102300236 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102300309 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 102301294 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102302628 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102304728 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102304729 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102306263 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102306303 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102306460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102306564 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 102306641 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 102306670 T G Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 3 102306878 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 102306949 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 102307014 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102307062 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102307254 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 102307272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102307285 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 102307802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102308814 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 102308831 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102308966 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 102309460 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102309489 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102309496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102309907 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102309924 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102309983 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102310187 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102310246 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102310877 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102310998 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102311163 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102311216 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102311301 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 102311400 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102311422 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 102311477 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102311544 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 102311651 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 102311849 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102311905 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102312641 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 102312661 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 102312684 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 102312722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102313183 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102313579 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102314073 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 102314202 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102314395 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 102314600 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 102314658 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 102314801 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102314814 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102314958 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102315020 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102315774 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102315822 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102315847 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 102315907 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102315908 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102315923 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102315947 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102316391 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102316460 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 102316466 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 102316495 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 102316611 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 102317271 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102317280 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102317336 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102317338 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102317711 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102317823 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 102317854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102318124 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 102318354 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 102318446 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 102318802 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 102318954 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102319032 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102319231 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 102319345 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 102319346 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 102319385 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 102319431 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 102319446 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 102319616 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 102319628 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 102320028 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 102320040 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 102320061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102320476 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102320489 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102320565 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 102320596 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 102320851 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102321884 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102321925 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102322179 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 102322228 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 102322246 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 102322248 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 102322269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102322397 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 102322546 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 102322658 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102322718 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 102322721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102323034 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 102323549 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102323849 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 102323867 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 102323892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102323960 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 102323980 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 102324900 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 102325060 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 102330173 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 102330768 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102331617 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 102332256 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102333173 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 102333566 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102336870 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102337462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102338068 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102340157 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102340836 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102340923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102340956 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 102341218 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102342731 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 102342815 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 3 102343035 A G N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 3 102343411 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 102343659 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 102343660 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 102343882 A C N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 102343903 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 102344344 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 102344353 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 102344408 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 102344459 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 102344482 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 102344555 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 102344572 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 102344608 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 102344622 G T Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 102344669 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 102344684 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 102344760 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 102344824 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 102344836 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 102344887 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 102344889 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 102344915 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 102344935 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 102344965 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 102345536 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 102345674 A G Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 102346070 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 102346076 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 102346194 G T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 102346267 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 102346909 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 102347039 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 102347064 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 102347151 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 102347185 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 102347254 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 102347309 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 102347335 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 102347349 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 102347405 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 102347413 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 102347424 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 102347441 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 102347804 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 102348219 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102348264 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102348482 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 102348703 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 102348843 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 102348932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102348971 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 102349148 T C N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 102349201 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 102349219 T G N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 3 102349234 T G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 102349238 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 102349278 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 102349290 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 102349417 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 102349421 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 102349465 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 102349533 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 102349580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102349646 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 102349684 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 102349801 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 102349809 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 102349878 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102349967 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 102350431 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 102350451 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 102350790 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 102350803 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 102350804 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 102350913 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 102351148 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 102351161 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 102351295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102351517 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102352248 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 102352272 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102352293 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 102352311 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102352335 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 102352338 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 102352425 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 102352611 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 102353259 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 102353271 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102353380 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102353564 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 102353832 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 102353907 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 102353917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102354013 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 102354286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102354383 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102354507 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102355077 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102355156 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102355559 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 102355610 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 102355732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102355832 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102356265 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 102356843 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 102356879 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102356900 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102357204 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 102357214 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 102357242 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 102357445 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102357549 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 102357756 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 102358293 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102358712 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102358796 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 102358991 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 102359140 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 102359178 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 102359800 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 102359802 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 102359823 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 102360031 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 102361467 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102362226 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 102362273 G A Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 102364718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102364782 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102364975 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102365665 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102368191 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 102368457 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102368693 C A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 102368715 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102368749 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102369175 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 102369491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102371135 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102372784 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 102373038 A C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 3 102374314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102374765 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102374867 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 102374973 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 102375797 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102375798 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 102376002 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102376192 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102376657 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 102376783 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 102376991 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 102377201 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 102377624 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 102378325 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 102378666 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102379052 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102379158 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 102379174 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 102379203 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 102379211 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 102379414 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 102379418 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 102380172 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102380881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102380995 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102381030 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102381800 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 102382811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102383928 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102384050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102384078 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102384099 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102384154 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102385039 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 102385331 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 102385428 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 102386126 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102386899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102387557 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102387775 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102389207 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102389379 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102389682 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102392070 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102392127 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102392169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102393098 G C N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 3 102393327 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 102393685 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 102393930 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 102393997 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 102394070 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102394590 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 102394647 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 102399041 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 102399055 A G N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5625 0.125 0.3125 20 12 9 2 5 3 102399193 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 102399336 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 102399357 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 102399431 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 102399432 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 102399620 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 102399745 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 102399865 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 102399955 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 102400009 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 102400025 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 102400038 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 102400305 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 102400423 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 102400489 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 102400513 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 102400555 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 102400875 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 102403747 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 102407469 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102408000 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102409266 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102410714 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102410985 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102411431 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102412049 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102415803 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 102416777 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102417286 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102418402 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 102420199 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 102421218 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102421283 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102422058 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102423809 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102424731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102427036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102427207 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102427435 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102427716 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 102427998 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 102428288 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102428400 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102428445 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 102428471 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 102428702 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102428828 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 102429117 C T N Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 10 6 3 4 1 3 102429272 T C N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 3 102429274 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 102429833 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 102429846 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102430100 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102430113 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102430151 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102430240 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102430373 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102430483 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102430527 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 102430983 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102431826 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 102431827 C A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 102432016 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 102432195 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 102432259 G A N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 3 102432424 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102432458 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 102432462 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102432755 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 102432962 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102433030 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102434184 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 102434669 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 102434863 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 102435212 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102435305 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 102435399 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 102435422 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 102435437 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 102435850 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102436026 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 102436113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102436140 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 102436143 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 102436733 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102436758 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102436768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102436904 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102437109 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 102437313 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102437322 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 102437525 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102437544 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102437557 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102437577 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102437579 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102437618 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102437749 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102437880 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 102438201 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102438277 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 102438554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102438623 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 102438892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102438975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102439083 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102439232 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102439320 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102441407 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102442888 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 102444248 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 102445278 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102447740 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 102448826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102449958 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102451806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102452855 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102453287 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102455142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102455511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102456305 C T Y Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0 1 0 10 10 0 10 0 3 102457423 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 102458641 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 102458668 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 102458747 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 102458978 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 102459005 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 102459022 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 102460024 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 102460055 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 102460061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102460238 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 102460247 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 102460263 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 102460462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102463760 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102464755 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102465219 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102465239 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102465258 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102465977 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102467237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102469806 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102469924 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 102469926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102471213 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102471902 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 102473649 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 102475299 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102476622 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102476718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102479081 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 102479505 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 102479516 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 102479561 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 102479724 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102479798 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 102479880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102480083 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 102480102 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 102480148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102480160 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102480249 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102480902 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102480928 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 102480937 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 102480954 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102480991 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102481015 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102481071 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 102481120 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 102481647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102481785 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102481975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102482082 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102482150 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102483385 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 102483733 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102483809 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102485442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102485596 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102487273 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102487666 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102489754 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 102489920 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 102490000 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 102490003 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 102490020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102490029 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 102490036 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102490314 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 102490513 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102490953 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 102491388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102491397 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102491570 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102491596 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 102492252 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 102492302 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102492582 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 102492645 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102492699 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 102493088 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102493727 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 102497547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102497621 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 102498685 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102498799 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 102498849 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 102498863 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 102500634 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 102501312 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 102501445 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 102501581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102502758 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102503031 A G Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 102503146 A T Y N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 102503199 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 102503247 G A Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 102503366 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 102503510 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 102503687 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 102504125 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 102504366 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 102504427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102504969 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102505155 A G N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 102505250 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 102505316 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102505924 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102506764 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102507316 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 102509322 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 102509340 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 102509569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102509681 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 102509771 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 102510027 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102510405 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 102510684 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 102510867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102510918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102511076 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 102511078 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 102511422 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102511441 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102511727 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 102511907 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 102512249 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102514130 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102514138 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102514370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102515495 G A Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 102515689 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102515715 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102516944 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102517969 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 102518228 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102518695 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102519700 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102520372 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102520746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102521220 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102521232 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102523114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102523197 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 102523500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102524317 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 102524394 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 102524668 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 102524695 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 102526911 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102527603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102530977 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 102531931 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102532544 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 102537326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102537852 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102538650 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102540759 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 102544682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102546603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102549271 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 102549504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102552534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102552896 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 102552904 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 102556079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102556541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102558026 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102558641 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 102558794 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 102558836 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 102560298 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 102563058 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102565578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102565674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102565816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102566382 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102569008 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102570697 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102572721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102574985 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 102575585 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102576896 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102579049 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102579638 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102579752 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102581509 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 102582680 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102583102 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102584273 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 102584789 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 102584811 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102587959 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102589400 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102591187 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 102591275 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102591680 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 102593862 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 102595714 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 102597740 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102599175 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 3 102599516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102600102 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 102602599 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102603524 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 102606247 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102607342 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102607522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102608827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102609100 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102609297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102610930 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 102611238 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 102611482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102611671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102612104 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102614057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102614088 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102615652 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102615938 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102622653 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 102622718 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 102625948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102629004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102629129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102629513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102630512 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102634067 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 102634259 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102634988 A T Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 102635023 C G N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 102635777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102636192 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 102644328 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102644505 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102644777 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 102648773 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 102649430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102651117 A G Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 102651926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102654112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102654393 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 102656706 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 102657279 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102659051 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102659185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102659732 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102660301 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102661476 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102661695 A G Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 102661909 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 102662801 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102663601 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102663692 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102663757 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102663940 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102664942 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102665323 T C Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 102666314 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 102667378 G A Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 24 4 12 0 2 3 102667725 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102668664 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102668764 T G Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 102669991 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102670169 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102676761 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 102676933 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102678657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102679386 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 102679389 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 102682001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102682423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102683325 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 102684618 C A Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 102685818 A C N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.230769230769231 0.153846153846154 0.615384615384615 8 18 3 2 8 3 102685866 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 102686390 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102687549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102687881 A C N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 102688600 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102688775 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102688831 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102690694 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 102690726 C T Y Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 3 102697840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102698272 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102699432 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 102701920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102702470 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 102704413 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102707137 G A N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 3 102707797 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102708237 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102715995 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 102717180 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 102717221 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 102717248 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 102717834 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 102717892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102717933 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102719057 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102723800 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 102725693 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 102725957 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 102726204 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 102728323 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102729251 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 102730301 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 102731937 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 102736337 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 102736930 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102737311 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 102737818 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 102738800 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102739383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102739422 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102739448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102739870 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102740259 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102741073 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 102741707 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102742982 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 102743078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102743442 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 102743829 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 102744130 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 102744438 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 102744449 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 102744497 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 102744552 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 102744692 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102745476 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 102745870 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102746114 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102746547 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102747919 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102748880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102750836 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102751445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102752401 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 3 102752754 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 102753006 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102753254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102753518 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102753682 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102754784 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 102754887 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102755473 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102756829 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 102758266 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102760014 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 102760972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102760988 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102761572 A C N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 102765148 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102765589 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102767146 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102768038 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 102768048 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 102768112 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102769478 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 102769501 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 102769553 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 102769634 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 102769700 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102769742 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 102769874 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 102769901 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 102769923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102769938 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102769994 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 102770042 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 102770059 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102770128 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102770150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102770198 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 102770226 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 102770237 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 102770246 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 102770262 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 102770333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102770361 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 102770872 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 102770913 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 102771188 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 102773034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102776334 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102779763 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102783783 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102785160 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102796819 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102802271 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102802803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102805206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102806222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102817527 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102821197 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 102821649 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102821906 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 102823524 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 102823654 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102825774 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102825852 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 102826703 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 102826711 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102826975 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102828223 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102828876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102830158 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 102834156 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102834566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102834664 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 102836406 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 102837002 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 102837525 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102837621 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102837930 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102838645 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 102840015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102840409 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102840492 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102840714 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102840992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102841449 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102841863 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 102842411 G A N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.416666666666667 0.25 0.333333333333333 13 11 5 3 4 3 102843182 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 102843240 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102846074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102846106 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102848026 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102848139 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102848172 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102849645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102850137 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102850554 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 102850601 G A Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.214285714285714 21 7 10 1 3 3 102852360 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 102853742 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102854211 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102854741 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 102855150 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102855416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102856089 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 102856548 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 102856959 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 102858076 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102860565 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102863323 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 102864667 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102865856 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102865994 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102867185 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102869238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102873409 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102878621 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 102878870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102879444 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 102880195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102881902 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102889182 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 102891904 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 102897715 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 102897894 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 102905172 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102905495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102906141 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 102907302 G C Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 102907608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102907992 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102908091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102908109 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 102908139 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 102908148 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102908170 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 102908231 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 102908255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102908560 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 102908865 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102910614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102910950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102911549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102912477 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102912926 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102912998 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102913134 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102913616 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102913988 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 102914240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102914468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102915115 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102915581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102915606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102916775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102916900 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 102917189 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 102918392 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 102918394 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 102918409 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 102918619 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102918660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102919034 C T Y Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 9 7 1 7 0 3 102919118 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 102919152 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 102919159 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 102919183 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102919314 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102919342 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102919440 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 102919443 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 102919581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102919664 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102919732 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 102919756 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 102919787 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 102919926 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 102920000 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102920088 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 102920293 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 102920397 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102920523 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102920641 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102920704 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102920718 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102920807 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102921032 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102921176 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102921247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102921273 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102921596 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102921616 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102922125 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 102922765 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 102923316 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102924403 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102924473 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102927017 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102927173 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 102927390 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102928239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102929436 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 102929619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102930575 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102930929 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 102931103 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 102931446 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 102934604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102935006 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 102935314 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102935795 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102936244 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102936302 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102938436 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 102940551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102940962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102943149 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102943750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102943935 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102944020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102944254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102944568 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 102944834 A C Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 102945170 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 102945817 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102948587 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102949064 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 102949296 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102949543 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102949712 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 102949734 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 102949891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102950120 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102950172 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 102950315 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 102950463 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 102955260 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 102955828 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102958163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102958422 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102958499 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 102958523 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 102962305 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 102963146 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102964682 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 102967604 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102967692 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102968096 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102968258 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102970809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102970846 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102971129 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 102971337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102971358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102971390 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102974289 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 102974582 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 102975609 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 102976682 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102977163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102977941 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102979788 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102980000 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102980879 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 102982211 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102982543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102986034 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 102986054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102986148 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 102987933 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102988328 A C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 102988427 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102988464 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 102988856 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 102989028 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 102989579 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 102990912 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 102991238 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 102991272 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 102991510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102991972 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 102991973 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 102992577 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 102995486 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 102995524 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 102995571 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 102995586 A T N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 102995595 T A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 102995727 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 102996059 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 102996064 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 102996261 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 102996538 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 3 102996543 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102996698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102996718 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 102997002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102997831 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 102997903 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 102997933 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 102998240 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 102998598 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102998793 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 102999009 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102999132 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 102999651 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102999655 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 102999725 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 102999781 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103000240 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103000691 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 103000745 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 103001412 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 103005649 A C Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 3 103012366 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103015048 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103016934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103018908 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103021484 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 103022386 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103022420 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 103022436 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 103022859 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 103023003 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 103023007 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 103023057 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 103023099 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 103023217 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 103023246 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 103023418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103023458 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 103023497 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 103023553 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 103023564 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 103023659 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 103024483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103025324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103026597 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103027118 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103027296 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103028195 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 103028310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103028394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103028401 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103028469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103028569 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103028675 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 103028715 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 103028725 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 103028736 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 103028748 G C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 103028880 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 103028928 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 103028945 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 103029498 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 103029707 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 103030046 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 103030253 G T Y N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 103030533 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 103030538 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 103030723 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 103031165 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 103031182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103031428 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 103031467 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 103031470 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 103032539 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 103032557 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 103034497 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 103034568 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 103034807 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103035514 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 3 103035642 A T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 103035701 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 103035838 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 103035861 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 103036074 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103036572 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 103036596 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 103036610 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 103036615 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 103036642 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 103036677 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 103037308 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 103037396 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103037989 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 103038534 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103038613 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103039756 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103040508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103041732 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 103042342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103043662 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103045182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103046391 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 103046452 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 103046559 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 103047889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103049396 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 103051359 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103051581 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 103051669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103051689 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 103052002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103052065 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103052771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103053381 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103053908 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103053946 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 103054022 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103054070 A G N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.0714285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 11 17 1 9 4 3 103054299 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 103054441 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103054623 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103054717 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103056585 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103056736 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103056829 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 103057310 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 103058929 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103059365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103059372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103059408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103059413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103059587 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103060379 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 103060414 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 103060545 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103060729 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103061277 C A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 103061300 A C N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 103061312 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 103061314 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 103061387 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 103061800 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103061815 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 103062135 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 103062192 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 103062419 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 103062737 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 103062943 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 103063541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103064084 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 103064112 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103064173 T A N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 103064579 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103064747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103065120 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103065585 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103066185 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 103072253 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 103073165 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 103076962 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103077609 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103080466 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103081866 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 103082970 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103083059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103083489 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103085148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103086843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103087205 C T Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 103087925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103089104 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103089212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103092104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103093226 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 103093614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103094194 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103095872 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103099572 A T Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 103099593 A G Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 103099598 C G Y N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 103099611 A G Y Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.3 0.7 0 13 7 3 7 0 3 103099617 A G N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 103099963 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103102358 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103103854 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103104751 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103106817 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 103108141 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103109165 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 103110440 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103112247 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103113351 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103115440 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103116469 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103117938 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 103119653 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103122944 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103124298 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103124311 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103124834 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 103130003 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103130058 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 103134344 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103136856 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103136859 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103137549 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103137656 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103140784 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 103143351 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103143843 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103144742 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 103147401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103147655 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103148534 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103148949 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 103151539 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 103153644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103156352 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103159634 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 103160033 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103161544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103162236 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 103163073 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 103163400 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103164010 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 103164044 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 103167568 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103168765 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 103169208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103170281 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 103170501 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 103170504 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 103170596 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 103170772 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 103170854 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103171115 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103171801 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103172161 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 103172167 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103172280 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103173127 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 103173455 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 103173483 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 103173751 T C N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 103174346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103174374 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 103174641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103174646 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 103174911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103175384 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103176156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103176911 T C Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 103176946 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0 0.894736842105263 0.105263157894737 17 21 0 17 2 3 103176966 C T Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 3 103178437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103178494 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103179373 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 103179620 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 103179705 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 103179757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103179928 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 103180232 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103180384 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 103180621 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 103180709 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 103180800 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 103180810 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 103180900 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 103180912 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 103180963 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 103180996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103181239 A G N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.2 0 0.8 4 16 2 0 8 3 103181456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103181575 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103181700 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 103181723 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 103181745 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 103181896 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 103182241 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 103182298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103182325 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 103182502 A G Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 103182520 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 103182848 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103183060 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 103183098 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 103184086 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 103184129 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 103184167 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 103184640 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 103184682 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 103184739 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 103184804 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 103184860 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 103184912 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 103184928 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 103184977 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 103185040 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 103185248 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 103185605 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 103185873 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 103186130 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 103186197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103186743 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 103186805 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 103186807 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103186933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103187093 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 103187328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103187363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103187392 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 103187452 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 103187490 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 103187656 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 103187691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103187745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103187803 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 103187812 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 103187852 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103188048 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 103188218 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 103188490 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 103188529 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 103188662 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 103188693 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 103188922 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 103189144 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 103189934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103192714 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 103193044 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103193764 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103194246 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 103194922 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 103200552 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103201251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103201515 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 103201527 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 103201560 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103201945 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 103201963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103202075 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 103202114 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103202215 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 103202712 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 103202733 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 103202773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103202821 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 103202859 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 103202881 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 103202886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103204378 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103205684 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103206060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103206176 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 103206238 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 103206397 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 103206999 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 103207034 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103207430 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 103207692 A G N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 3 103207845 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103209995 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 103209996 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 103210162 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 103210548 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103211995 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 103213916 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103213945 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 103214030 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103214321 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 103214536 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 103214540 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 103214552 T G Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 3 103215386 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 103215768 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 103215798 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 103215817 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 103215926 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103216064 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 103216662 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 103217170 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 103217314 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103217466 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 103217497 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 103218840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103218851 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103218864 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103219077 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 103219470 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 103219633 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 103219695 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 103219828 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 103220292 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103220293 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 103221232 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 103221482 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 103221511 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 103222117 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 103222851 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 103222903 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 103222940 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 103222960 A T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 103222961 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 103223180 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103223390 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 103224057 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103224545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103224625 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 103224628 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 103224671 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103225028 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103225747 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103226054 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 103227887 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 103227933 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103228115 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 103228180 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 103228199 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103228588 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103229928 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103229979 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103231137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103234381 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103238813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103239439 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103240132 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 103241295 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103241480 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 103241485 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 103241607 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 103241634 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 103241691 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103241890 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 103241896 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 103242365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103242513 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103242665 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103242705 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 103242845 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 103243011 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103243148 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 103243155 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103243194 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 103243214 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 103243295 G T N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 3 103243439 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 103243918 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 103243926 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 103243981 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 103244100 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103244223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103244237 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103244259 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103244619 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103245052 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 103245104 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103245177 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103245612 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 103245759 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 103245859 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103245899 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103245919 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103246084 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 103246351 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103246359 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103246665 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 103246965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103247004 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 103247063 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 103247080 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 103247222 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 103247235 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 103247306 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 103247364 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103247451 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103247509 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 103247657 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103247836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103247846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103248006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103248812 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 3 103248956 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 103248983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103249012 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 103249030 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 103249112 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103249448 C T N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.363636363636364 0.545454545454545 0.0909090909090909 14 8 4 6 1 3 103249473 A G N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 103249713 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 103249743 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 103249778 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103249871 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 103249895 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 103249970 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 103250027 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 103250568 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 103250621 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 103250637 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 103250640 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 103251722 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103251754 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 103251967 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 103252122 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 103252769 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 103253479 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103253903 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 103254263 A C N N 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 3 103254489 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 103254566 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 103254674 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 103254707 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 103254770 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 103254911 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 103255321 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103255381 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 103255509 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 103255884 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 103255889 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103256804 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103257224 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103257562 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 103258897 C T Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 103258898 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 103259195 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 103259424 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 103259438 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103259863 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103260755 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 103261470 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 103263222 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103263709 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103266418 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103267240 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 103268033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103269000 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103269837 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 103271166 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103272157 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 103274134 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103274663 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103275469 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 103277517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103277753 T A N N 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 5 9 1 3 3 3 103279454 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 103279930 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103283335 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103286380 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103286409 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 3 103289152 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103289207 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103289209 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103289411 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103290310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103290798 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103290825 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103290922 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 103291029 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 103291117 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 103291141 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 103291196 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 103291219 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 103291226 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 103291303 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 103291562 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 103291571 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 103292124 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.4375 0.1875 0.375 17 15 7 3 6 3 103292416 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 103292461 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 3 103292618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103292810 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 103293099 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 103293286 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103293325 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 103293732 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 103293803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103293821 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 103293891 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 103293898 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 103294028 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 103294214 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103294362 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 103294402 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 103294449 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 103294469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103295141 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 3 103295180 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 103296922 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 103297012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103297161 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103300518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103300924 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103301640 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103303769 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103303807 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103305573 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 103305947 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 103305986 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103306599 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103306601 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103306649 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103306671 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103306803 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103306841 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103306930 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103306989 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103307027 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 103307081 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 103307125 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 103307293 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103307424 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103307527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103307580 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103307585 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103307602 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103307784 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103307883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103308031 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103308109 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 103308595 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103308607 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103308620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103308766 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 103308784 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 103308921 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103308930 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103309051 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103309141 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 103309186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103309212 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103309268 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103309371 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 103309424 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 103309479 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103309620 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103309735 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103309805 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103309866 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 103309876 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 103309943 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103311542 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103311606 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 103312769 T C Y Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 3 103312963 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 103313159 T A Y N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 103313564 A T Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 103313641 G A Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 103314589 C G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 103314607 T G Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 103314608 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 103315308 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 103315601 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 103315626 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 103315717 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 103315757 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 103316211 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103316243 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103316253 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103316310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103316363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103316576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103316683 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103317150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103317256 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103317656 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 103318004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103318848 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103319933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103320191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103325564 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 103325663 T C N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 103325775 C G N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 103325789 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 103325814 G C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 103326020 C G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 103326072 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 103326352 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 103326447 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 103326560 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 103326561 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 103326847 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 103327233 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 103327299 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 103327306 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 103327334 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 103327497 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 103327647 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 103327695 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 103327755 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103327903 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 103327986 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 103328270 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 103328293 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 103328689 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 103328904 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.235294117647059 0.117647058823529 0.647058823529412 10 24 4 2 11 3 103328973 G T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.294117647058824 0.117647058823529 0.588235294117647 12 22 5 2 10 3 103329009 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 10 14 4 2 6 3 103329046 T C N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 3 103329067 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 3 103329144 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 103330074 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 103330375 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 103330582 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 103330583 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 103330630 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 103330633 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 103330667 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103330690 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 103330843 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 103331018 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103331670 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 103331684 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 103331748 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 103332193 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103332564 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 103332761 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103333039 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 103333157 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103333852 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 103333970 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 103334063 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 103334110 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 103334243 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 103334260 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 103334280 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103334347 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103334419 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 103334839 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103334910 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103334957 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103335094 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103335176 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 103335226 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 103335302 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 103335524 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103335544 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 103335759 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 103336073 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 103336075 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 3 103336101 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 103336607 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 103336628 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103336890 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 103336929 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 103336940 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 103337006 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103337286 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 103337343 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 103337370 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 103337637 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103337662 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 103337673 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 103338119 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 103338178 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103338587 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 103339078 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103339089 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 103339097 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 103339251 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 103339301 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103339487 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 103339625 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 103340042 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 103340165 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103340292 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 103340608 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 103340655 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 103340732 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 103340836 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103340839 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103340947 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 103340974 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 103341080 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 103341109 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103341210 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 103341228 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103341285 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103341335 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 103341464 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 103341600 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103341617 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103341826 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 103341858 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 103341980 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103342021 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 103342547 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 103342569 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103342775 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 103342793 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 103342863 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 103343122 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 103343719 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103343762 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 103343787 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103343913 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 103344077 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 103344211 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 103344233 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 103344273 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103344361 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103344409 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103344586 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103344627 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 103344647 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103344996 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 103345452 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 103346227 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 103346520 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103346523 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103346540 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103346541 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103346581 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103346644 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103346697 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103346700 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103346740 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103346780 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103346800 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103346924 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103347336 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103347366 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 103347388 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103347428 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103347515 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 103347600 C T N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 103348054 G C N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 103348055 C A N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 3 103348065 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 103348077 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 103348198 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 103348286 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103348445 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103349113 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 103349121 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103349228 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 103349651 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103349656 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103349666 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103349699 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 103349783 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103349895 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 103350126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103350289 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 103350299 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 103350618 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 103350619 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 103350639 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103350689 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103350782 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103350815 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 103350917 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 103351011 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 103351424 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 103351430 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103351465 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 103352103 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 103352172 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103352177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103352218 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103352556 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103352640 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103352744 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103353085 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 103353339 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103353420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103353438 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103353473 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 103353491 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 103353612 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103353773 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103353869 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 103354119 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103354486 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103354538 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 103354716 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 3 103354874 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103354955 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 103355064 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 103355195 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 103355404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103356528 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 103358384 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103358482 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103358640 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103358682 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 103361428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103362054 C T N Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 3 103362181 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103362285 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103363203 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 103363463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103363709 C A N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 3 103363730 C T N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 3 103363986 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 3 103364165 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 103364188 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 103364315 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 103364316 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 103364371 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 103364372 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 103364396 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 103364397 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 103364447 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 103364476 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103364489 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 103364586 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103364597 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103364676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103364727 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103364746 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103364926 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 103365012 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 103365291 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 103365310 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 103365329 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 103365355 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 103365417 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103365519 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 103366258 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 103366531 A C Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 103366549 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 103366561 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 103366744 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103366781 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 103366871 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 103366885 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 103367987 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 103368010 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 103368065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103368072 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103368177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103368397 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 103368438 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 103368503 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 103368523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103368535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103368555 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 103368570 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103368582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103368603 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103368661 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103368716 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 103368797 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103368837 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103368987 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103369001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103369043 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103369063 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 103369652 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 103369672 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 103369686 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 103369706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103369843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103369893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103370031 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 103370157 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103370336 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103370398 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103370652 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103379262 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103380506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103382476 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 3 103383147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103383407 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 103383410 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 103388562 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 103393455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103394222 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103394354 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103394627 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103398696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103398751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103398769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103398770 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 103399420 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 103400408 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103400644 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 103400783 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 103402746 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 103403263 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103404133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103404618 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 103405551 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 103405932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103406060 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103406199 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 103406206 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 103406232 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103406252 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103406433 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103406679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103407347 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 103407447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103407600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103407624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103407773 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 103407774 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103407925 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103408430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103408600 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 103408946 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 103408950 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 103408987 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 103409025 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 103409062 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 103410127 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 103411548 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 103411630 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103411668 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 103411810 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103411998 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103414003 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 103414429 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 103414496 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 103414503 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103414508 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103414702 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 103414704 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 103414737 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 103414757 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 103415059 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 103415235 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 103415281 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 103415300 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103415338 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103416298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103416460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103416864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103418382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103418400 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 103418411 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 103419852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103421322 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 103421350 T A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 103421500 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103421562 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 103421760 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 103422202 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 103422307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103422987 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103422992 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103423162 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 103423440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103423500 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103425017 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 103427924 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103428319 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103428347 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103428503 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103429506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103430355 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 103430663 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 103433507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103434031 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103434925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103435289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103435759 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103435778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103436690 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 103438050 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103438329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103438350 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103438581 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103438734 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 103439302 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103439978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103440730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103442241 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 103442258 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 103442842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103443852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103444819 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 103445775 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103450355 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103450547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103451433 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 103451730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103451793 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103451837 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103451840 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 103451875 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103451882 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103451991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103452172 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103452279 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 103452476 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 103452617 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 103452646 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 103452707 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103452791 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 103454079 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 103454230 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103454441 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 103454640 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 103454648 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103454877 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103454944 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 103455005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103455152 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103456101 A C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 103456535 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 103456552 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 103456830 C G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 103456919 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 103457027 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 103457236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103457371 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 103457643 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 3 103457912 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 103458029 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 103458758 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103458830 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103458876 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103459390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103460899 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103466607 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 103467748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103467840 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103468109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103468555 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 103469780 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 103472339 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103473053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103473246 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 3 103473569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103474291 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 3 103474596 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.388888888888889 0.111111111111111 0.5 16 20 7 2 9 3 103474770 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 3 103475149 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 3 103475718 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 103479004 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 103482262 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 103482639 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 103482719 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103482797 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 103482842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103482863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103483209 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 103483307 G A Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 3 103483523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103483639 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103483663 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 3 103483696 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 3 103483768 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 3 103484769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103485586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103486743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103487248 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 103487266 G C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.411764705882353 0.117647058823529 0.470588235294118 16 18 7 2 8 3 103487351 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103487538 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103488115 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 103488229 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 3 103488397 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 103488676 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 103488822 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 103488968 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103490284 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 103490461 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 103490507 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 103490658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103490856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103491090 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 103491144 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 103491227 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103491234 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103491376 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103491421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103491564 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 103491576 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 103491657 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 103492390 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 103492441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103492743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103492830 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 103492832 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103492863 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 103493202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103493275 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103494144 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.388888888888889 0.111111111111111 0.5 16 20 7 2 9 3 103494250 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 3 103494338 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103494405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103494495 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 103495483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103495622 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 103495768 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 103495794 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 103495860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103495928 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 103495951 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 103496091 C G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 3 103496746 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103497091 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 103497092 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103497675 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103497946 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103498594 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103498658 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 103498913 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103499349 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103499462 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103499526 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 103499575 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 103499578 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 3 103499639 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 103499644 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 103500352 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103500962 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 103501215 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 103501229 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 103501784 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 103502067 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103502082 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 103502160 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103508151 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 103508384 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 103508673 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 103509986 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 103509996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103510795 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 103511072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103511120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103511471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103511492 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103511611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103512133 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103513004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103513495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103514182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103514197 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103514200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103514212 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103514320 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103514583 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103514651 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 3 103514659 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103514814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103514867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103514869 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103515076 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 103515639 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103515767 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 103515962 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 103516175 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103516274 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103516494 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 103516672 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103516703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103516958 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 103517068 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 103517108 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 103517217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103518178 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 103518560 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103518735 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 103518754 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 103518865 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 103518866 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 103519064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103519189 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103519473 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 103519474 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 103519551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103519608 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 103520101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103520247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103520257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103520367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103520390 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 103521532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103521600 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103521735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103521753 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 103521810 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103521861 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103521900 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103521952 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103521955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103521965 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103521985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103521992 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103521997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103522044 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 103522136 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 3 103522332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103522584 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 103522873 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103523126 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 103523263 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103523602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103523713 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103523799 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 10 22 4 2 10 3 103524003 G T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 103524122 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 103524132 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103524133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103524545 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103524567 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 3 103524656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103524740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103526006 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 103526030 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 103526386 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 103526397 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 103526493 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103526784 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103526826 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 103526871 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 103527073 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 103527226 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 103527271 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103527291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103527308 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 3 103527430 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 103527453 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 103529902 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 103529912 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 103530130 C A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 103530394 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 103530448 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 103530536 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103530764 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 103530971 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 103531025 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 103531121 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 3 103531349 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 103531703 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 103531729 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 103532390 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103532712 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103532950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103534537 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 103534541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103534588 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 103534742 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 103534873 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 103535139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103535461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103535556 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103535674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103536021 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103536075 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103536080 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103536149 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103536153 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103536178 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103536189 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 3 103536304 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103536339 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103536361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103536390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103536529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103536595 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 103536687 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 103536781 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103537304 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 103538528 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103539082 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 103539540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103540523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103541717 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103541935 C A N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 103542157 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 103542473 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 103542683 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 103542952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103543301 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 103543586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103548466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103549995 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103550048 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103550093 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103553945 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103554979 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 103555187 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 103555819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103555837 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 103557989 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103559657 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103561133 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103561528 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.25 0.666666666666667 0.0833333333333333 14 10 3 8 1 3 103566261 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103567523 G A N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 103569757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103571999 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 103572822 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103572960 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103572987 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 103575083 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 103578065 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103579437 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103581118 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103583944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103585291 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 103586232 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103588096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103588789 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103589104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103589399 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 103590689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103591412 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103593901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103594517 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103594699 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103595463 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103595729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103597336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103600214 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103603131 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103603571 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103604078 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103604433 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 103604742 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 103604919 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 103605062 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 103605067 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 103605090 A T N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 3 103605290 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 103605542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103605869 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 103605892 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103606786 G A N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.384615384615385 0.307692307692308 0.307692307692308 14 12 5 4 4 3 103606873 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 103608156 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 103608237 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 103608597 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 103608693 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103609199 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 103609283 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103610110 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 103610388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103610412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103610543 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103610563 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103611202 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103611640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103611717 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103611976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103612846 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103614129 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 3 103614193 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 103614330 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 103614483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103614750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103614929 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103615218 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 103615425 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 103615555 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 103615686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103615823 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103616197 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103616570 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103616845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103617571 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103618496 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 103618626 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103618988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103623538 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103623618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103623750 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103624103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103624737 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 103625536 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103625546 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103625774 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 103625790 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 103626179 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103626407 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 103626456 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 103626534 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 103626836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103626983 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 103627026 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 103627055 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 103627201 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103627247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103627633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103627790 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103628045 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 103628141 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 103628326 A C N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 103628491 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 103628956 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 103629112 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 103629171 G T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 103629280 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 103629716 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 103630899 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 103631631 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 103631961 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103631965 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 103632577 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 103633151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103633269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103633769 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103633806 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103634595 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 103634810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103635016 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 103635305 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 103635355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103636741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103637938 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103638986 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103640117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103641180 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 103641461 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 103641515 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103641938 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 103642580 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103643050 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 103643926 T C Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 103644214 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103644376 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 103644399 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 103644415 C A Y N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 103644443 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 103644906 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103645116 A C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 103645438 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103645496 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 103645608 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 103646332 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103646532 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103646537 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103646783 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103647138 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103647178 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 103647250 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 103647368 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 103647433 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 103647446 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 103647508 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103647771 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103647853 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 103647906 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103648041 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103648051 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103648093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103648094 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 103648544 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 103648745 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103648772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103648947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103648953 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 103649554 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 103649676 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103649729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103649738 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103649842 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 103650114 A C N N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 3 103650131 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 103650137 T C N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 3 103650201 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 103650464 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 103650750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103650753 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103650890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103651277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103651321 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103651374 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103651404 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103651484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103652037 T G Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 3 103652040 C T Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 3 103652281 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 103652572 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 103652697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103653563 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 103653566 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 103654084 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 103654136 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 103654341 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 103655104 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 103655306 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 103655382 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 103655397 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 103655462 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 103655713 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 103655764 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 103655831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103656323 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 103656333 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 103656338 A T N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 103656405 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 103656563 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103656574 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 103656895 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 103657293 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 103657319 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 103657421 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 103657439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103657450 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 103657492 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 103657536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103657580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103657616 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 103658026 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 103658073 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 103658083 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103658152 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 103658177 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 103658336 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103658483 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 103658501 T G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 103658554 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 103658767 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 103658768 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 3 103658808 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 103658955 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103658995 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 103659028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103659167 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 103659206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103659207 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 103659320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103659596 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103659773 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 103659882 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 103659924 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103659971 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103659980 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 103659983 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 103660163 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103660165 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103660477 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103660509 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103660806 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 103660974 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103660984 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 103661210 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103661461 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103661520 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 103661553 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103661761 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 103661768 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 103661818 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 103661904 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103661939 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103661993 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 103662077 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103662211 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 103662240 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 103662549 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 103662733 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 103663206 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 103663399 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 103664724 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103664751 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 103664764 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 103664809 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 103664863 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 103665071 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 103665139 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 103665390 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 103665638 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 103665760 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103665973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103666135 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 103666440 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 103666695 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 103666719 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 103667076 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 103667209 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 103667656 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 103668425 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 103669119 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103669567 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103669880 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103670146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103670705 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 103671777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103672435 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103674091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103674844 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103674862 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 103675855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103675871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103675976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103676140 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 103679682 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 103679933 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103680117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103680149 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 103680826 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 103680840 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103680966 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103681057 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 103681119 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103681485 A C Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 103681496 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 103681607 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 103681671 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 103681685 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 103681877 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 103681973 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 103682573 C T Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 103682601 A C N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 103682630 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 103682878 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103682894 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 103683188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103683917 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 103683996 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 103684295 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103684674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103684682 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 103684719 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 103684824 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 103684848 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103685103 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 103685343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103685754 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 103686040 A G Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 103686332 G C N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 103686448 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 103686462 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 103686463 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 103686479 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 103686480 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 103686550 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 103686641 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 103686653 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 103686838 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 103686971 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 103686991 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 103687050 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 103687111 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 103687234 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 103687238 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 103687274 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 103687295 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 103687364 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 103687375 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 103687392 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 103687406 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 103687524 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 103687542 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 103687597 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 103687777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103687791 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 103687834 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 103687860 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 103687862 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 103687936 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 103688077 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 103688702 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 103688935 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103689013 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103689091 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103689126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103689167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103689247 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 103689274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103689284 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103689340 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103689362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103689446 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 103689717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103689903 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 103689926 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 103691145 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 103692029 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 103692431 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 103692592 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 103692840 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 103693056 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 103693077 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 103693104 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 103693172 C A N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 103693225 A G Y Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.0909090909090909 0.636363636363636 0.272727272727273 9 13 1 7 3 3 103693327 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 103693357 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 103693730 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 103694159 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 103694536 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 103694874 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103694884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103695265 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103695596 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 103695700 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 103695790 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 103695913 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 103695957 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 103695970 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 103696110 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 103696120 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 103696197 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 103696381 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 103696386 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 103696392 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 103696426 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 103696497 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 103696697 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 103696850 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 103698617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103700323 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 103701916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103702079 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 103702139 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 103702196 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103702737 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 103702903 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 103702940 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 103703079 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103703101 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 103703302 G C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 103703303 G A Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 103704704 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 103704746 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 103704862 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103705031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103705170 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 103705391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103705425 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103705810 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103706231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103706239 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103706650 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103707260 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103708203 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103708665 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103709855 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 103710298 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103710565 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 103711497 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103712497 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103713401 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 103713559 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 103714448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103715670 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 103716178 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 103716265 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 103716465 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103716572 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103716861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103716951 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 103717746 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 103717921 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103719752 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103720334 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103721038 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103721211 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 103721963 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 103722061 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 103723332 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 103723396 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 103723882 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 103723943 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103724415 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 103724438 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 103724515 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 103724545 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 103724674 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 103724712 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 103725116 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103725770 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103725884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103726027 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 103726081 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103726282 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 103726388 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 103726394 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 103727157 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 103727438 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 103727573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103728222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103728232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103728874 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103734363 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 103737660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103737810 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103740376 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103742211 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103746645 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103750205 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 103752833 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103752923 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 103753067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103756462 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103757409 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103757902 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103762558 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 103762682 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 103763841 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103767764 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103771127 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103772591 G A Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 103773365 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 103778898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103779038 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103782556 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103786301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103788717 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103788849 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103789348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103790329 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103793895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103797978 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103802862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103803370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103803689 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103803690 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103805047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103809130 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 103809208 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103811091 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 103812129 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 103815105 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 103818839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103819491 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103821692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103826061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103830668 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103830704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103830877 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103830891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103831187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103832131 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103832161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103833289 A T Y N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 3 103835252 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103836487 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 103836534 G T Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 103837838 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 103838638 A C N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 103839390 A T Y N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 16 8 4 8 0 3 103839503 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 103839572 G T Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 103839682 G T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 103839685 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 103839764 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 103840208 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 103840460 T A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 103841222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103841601 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 103843326 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 103843616 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 103851482 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 103853965 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103854506 T A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 103857599 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103859574 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103859582 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 103859626 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103859631 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 103859796 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103859860 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103861063 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 103863659 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 103863759 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103864007 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103864356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103865560 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103865679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103867750 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 103870120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103870926 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103871866 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 103874487 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 103875736 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103876069 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103876103 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103877698 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103878767 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103879458 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 103879481 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 103879833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103882919 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 103883162 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103888035 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 103889396 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 103890058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103890270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103890516 A T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 103891978 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 103892503 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103893828 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 103894237 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103894252 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103896180 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 103896341 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 103896605 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 103896863 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 103896977 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 103897561 G C Y N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 103902704 A T N N 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 3 103903254 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 103904084 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 103904254 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 103905144 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103906180 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103909105 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 103910343 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103910851 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 103912338 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103912353 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 103913742 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103914939 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 103915836 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 103915961 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103916575 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103917859 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.75 0 0.25 24 8 12 0 4 3 103919405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103920593 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 103927831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103928288 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 103928965 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103929660 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 103929798 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 103931920 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 103934293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103934361 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 103934446 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 103937067 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103937681 T G Y N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 103937736 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 103938353 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 103938671 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103939979 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 103941146 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103941386 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 103941817 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 103942558 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 103943346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103943512 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103944030 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 103944355 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 103945234 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 103945356 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 103945389 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 103946244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103946934 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 103947161 G A N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 103947895 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 103948195 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 103948198 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 103948431 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 103948455 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 103949211 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 103949416 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 103949529 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 103949679 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 103949942 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 103950185 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 103950228 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 103950641 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 103950701 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 103951113 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103951575 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 103951684 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 103952086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103952142 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 103952179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103952374 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 103952585 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 103952806 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 103953424 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 103953431 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 103953448 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 103953540 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 103953651 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 103954200 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 103954543 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 103954684 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 103954790 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 103955175 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 103955796 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103956474 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103956759 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 103957901 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 103957920 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103958058 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103958128 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 103958632 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 103958702 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 103959230 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 103960342 A G Y Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 5 9 1 3 3 3 103960408 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 3 103960762 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103960912 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 103961270 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 103961333 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 103964555 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103964842 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103970674 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 103970707 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103970945 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 103973612 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103973892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103977694 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 103978819 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 103980306 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103980730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103981522 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 103983188 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 103983840 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 103986396 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103986424 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103989349 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 103989376 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 103989999 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 103990753 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 103997669 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 104011691 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 104012357 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104012552 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 104012937 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 104013539 A G Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 104015960 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104017162 T A Y N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 104017233 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 104017248 T G Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 104017251 G T Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 104017385 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 104017424 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104019231 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 104020606 G A N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 104022531 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104022572 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 104022894 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 104024879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104025921 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104026637 C G Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 104026837 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104027509 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 104028547 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104028747 A G Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 104034548 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104035018 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 104035139 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 104035247 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 104035269 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 104035277 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 104035902 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 104035948 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 104036001 C A Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 104036094 A C Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 104036133 T G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 104036178 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 104036231 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 104036361 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 104037311 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 104037522 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104037523 G A Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 104037844 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 104038026 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 104038296 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 104038566 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 104038748 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 104038797 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 104038944 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 104039324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104039808 A G Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 104040308 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 104040383 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 104040633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104041794 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104041942 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 104042568 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 104042867 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 104043054 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 104043445 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 104043579 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 104043602 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 104043606 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 104043805 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 104043884 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 104043951 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104044006 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 104044059 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 104044132 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104044494 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 104044925 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 104045240 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 104046274 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 104046723 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 104047024 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104047782 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 104047939 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 104047973 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 104048791 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 104048852 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 104049151 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 104049307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104049430 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 104049439 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 104049468 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104049522 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 104049549 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104049566 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 104049591 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 104049611 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 104049669 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 104049901 C A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 104050092 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 104050113 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 104050135 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 104050331 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 104050564 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 104050749 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 104050786 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 104050858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104051049 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 104051864 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 104051980 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 104052061 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 104052329 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 104052929 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 104053033 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 104053189 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 104053940 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104054024 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 104054155 A T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 104054333 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 104054520 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 104054666 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 104054796 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 104054825 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 104054858 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 104054878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104054978 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 104055111 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104055521 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 104055580 A T N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 3 104055635 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 3 104055715 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 104055783 C T N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.75 0.0833333333333333 0.166666666666667 19 5 9 1 2 3 104055948 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 104056000 C T N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 3 104056121 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 8 6 1 6 0 3 104056255 C T N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 104056271 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 104056274 G C N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 104056353 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 104056421 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104056787 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104056811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104056822 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 104057343 T C N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 104057548 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104057563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104058050 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 104058084 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 104058221 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 104058247 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104058364 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 104058575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104058818 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 104058909 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 104059034 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 104059196 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 104059203 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 104059553 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 104059574 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 104059612 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 104059704 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 104059741 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 104059830 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 104059840 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 104059946 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 104060315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104060474 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 104060867 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 104061277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104061417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104061454 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 104061531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104061543 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104061568 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104062228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104062236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104062241 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 104062718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104062839 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104062856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104062970 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104063063 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 104063272 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 104063487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104063771 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 104063772 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 104063837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104064384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104064775 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104064790 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104065102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104065117 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104065183 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 104065294 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104065316 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104065690 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104065914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104066086 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 104067084 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 104067198 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 104067222 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 104067381 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104067499 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 104067758 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 104068214 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 104068282 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 104068284 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 104068321 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 104068392 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 104068457 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 104068465 A T Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 104068562 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 104068606 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 104069039 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 104069115 T G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 104069837 A C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 104069896 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 104070091 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 104070138 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 104070152 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 104070174 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 104070242 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 104070458 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 104070993 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 104071192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104071211 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 104071333 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 104071644 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 104071702 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104071797 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 104072036 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 104072246 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 104072424 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 3 104072426 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 104072503 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 104072646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104072663 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 104072704 T G N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 16 12 6 4 4 3 104072762 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 104072766 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 104072844 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 104073217 T G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 104073218 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 104073294 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 104073419 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 104073734 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 104073756 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 104073773 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 104073857 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 104074115 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 104074294 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104074311 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104074491 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104074497 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104074583 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104074606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104074653 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104074772 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 104075523 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 104075566 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 104075595 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 104075708 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 104075721 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 104075735 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104076623 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 104076703 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 104077014 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 104077208 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104077570 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 104077709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104077718 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 104077868 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 104078000 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 104078852 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 104079107 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 104079570 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 104079869 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 104080408 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 104080550 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104080742 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 104080855 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 104080859 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 104080925 T G N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 104081082 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 104081106 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 104081159 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 104081201 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 104081384 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 104081442 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 104081451 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104081557 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 104081562 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 104081614 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 104081682 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 104081689 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 104081710 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 104081972 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 104082040 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 104082138 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 104082179 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 104082322 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104082635 G T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 104082646 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104082715 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 104083058 C T Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 104083184 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 104083211 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 104083228 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 104083247 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 104083415 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 104083818 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 104083831 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 104083832 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 104083914 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 104084022 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 104084236 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 104084328 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 104084346 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 104085126 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 104085131 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 104085276 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 104085288 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 104085296 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 104085531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104085646 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 104086121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104086716 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 104086805 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 104087531 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 104087547 A T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 104087621 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 104087757 C T N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 104087972 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 104088041 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 104088314 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 104088334 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 104088354 C G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 104088363 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 104088400 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 104088432 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 104088445 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 104088559 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 104088933 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 104089276 A T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 104089394 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 104089443 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 104089541 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 104089782 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 104090175 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 104090190 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 104090439 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 104090661 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 104090887 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 104090907 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 104091328 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 104091489 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 104091645 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 104091647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104091878 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 104091885 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 104091906 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 104091963 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 104092050 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 104092571 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104092651 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 104092663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104092869 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 104093020 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104093063 C T N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 104093148 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 104093212 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 104093250 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 104093281 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 104093763 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 104093947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104094414 T G N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 3 104095126 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 104095453 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 104095548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104095639 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104095966 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 104096125 T G Y N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 3 104096445 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 104096877 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 104097511 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 104097544 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 104097559 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 104097649 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 104097960 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 104098212 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 104098564 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 104098942 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 104099404 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 104099626 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 104099769 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 104100059 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 104100193 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 104100523 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 104100598 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 104101104 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104101327 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104101859 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 104101957 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 104102007 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 104102287 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 104102292 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104102352 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104102847 A T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 104103485 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104103887 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104103935 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 104104102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104104277 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 104104359 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 104104411 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 104104479 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 104104577 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 104104739 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 104104915 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 104105184 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 104105232 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 104105609 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104105795 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 104105836 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104105867 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 104105916 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104106077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104106099 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 104106144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104106414 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104106540 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 104106605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104106615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104106636 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 104106683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104107259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104107260 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104107379 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 104107653 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 104107760 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104107770 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104107806 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104108156 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 104108239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104108310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104108768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104108819 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 104109159 G T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 104109301 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 104109459 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104109461 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104109516 C T N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 0.0714285714285714 15 13 2 11 1 3 104109656 G C N N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 3 104110140 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 104110179 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 104110295 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104110352 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 104110355 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 104110553 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 104110683 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 104110702 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 104110928 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 104111573 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 104111785 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 104111791 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 104111840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104112265 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 104112407 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 104112473 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 104112542 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 104112569 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 104112611 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 104112612 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 104112677 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 104112692 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 104112823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104112998 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 104113007 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 104113067 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 104113146 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 104113189 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 104113212 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 104113232 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 104113239 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 104113293 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 104113303 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 104113317 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 104113399 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 104113407 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104113445 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 104113477 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 104113744 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 104113859 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 104113956 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 104114015 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 104114189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104114196 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104114710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104114907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104115480 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 104115751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104116186 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104116506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104116882 T C N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 3 104116926 A G N Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 3 104117287 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104117588 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104117743 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 104117909 A G Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 104118247 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104119108 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104119773 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 104120200 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 104120402 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 104121573 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 104121796 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 104121813 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 104121821 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 104122307 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 104122451 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 104122875 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104123040 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 104123083 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104123745 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 104123836 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 104123962 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 104124015 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 104124089 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 104124646 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 104124829 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 104125139 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104126733 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104126794 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 104126905 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104126942 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 104126955 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 104127678 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 104127714 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 104128157 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 104128573 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 104129371 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 104129450 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104129839 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 104129979 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 104130835 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 104131344 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 104132473 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 104132881 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 104135783 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104135839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104136361 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104137037 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104137643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104138715 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 104138848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104138992 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 104140404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104141117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104142371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104145094 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 104145420 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104145912 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 104146513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104149264 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104149753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104151107 A G Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 104152359 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104153471 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 104154074 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 104154081 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 104154768 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104155140 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 104155267 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 104155287 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104155573 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 104155615 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 104160321 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 104160581 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104161957 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 104163154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104163367 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104166390 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104166467 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 104166486 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 104169152 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104169230 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104169269 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 104169618 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 104169772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104169849 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.1875 0.75 0.0625 18 14 3 12 1 3 104169886 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 104169920 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 104170047 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 104170103 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 104170104 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 104170118 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 104170444 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 104171756 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 104171758 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 104171879 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 104171895 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 104172015 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 104172252 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 104172275 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 104172831 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 104173302 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 104174245 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104174278 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 104174631 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 104175177 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104175198 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 104175697 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104175771 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 104175941 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104176182 A C Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 104176262 T C Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 104176635 C A Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 104176808 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 104176913 T A Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 104176967 G A Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 104177232 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 104179240 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 104179613 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 104179738 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 104179879 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 104181176 C T Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 104181404 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104182832 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.333333333333333 0.111111111111111 0.555555555555556 7 11 3 1 5 3 104183406 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 104183502 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 104187253 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 104187974 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 104188283 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 104188325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104188629 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 104188757 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 104189121 T G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 104190123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104190499 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 104190618 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 104191719 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 104191791 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104192005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104192835 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 104193019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104193035 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 104195515 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 104195942 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 104195991 T A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 104196275 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 104196374 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 104196430 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 104196508 A C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 104196525 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104196675 G C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 104196702 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 104196808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104196856 T A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 104196857 A T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 104197005 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104197081 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 104197249 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 104197445 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 104197485 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 104197522 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 104197527 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 104197546 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 104197901 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 104198071 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104198264 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 104198473 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 104198492 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 104198547 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 104198649 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 104199128 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 104199481 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 104199616 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 104199713 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 104200090 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 104200497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104200529 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104200764 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 104200804 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 104200838 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 104200890 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 104200971 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 104201026 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 104201112 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 104201133 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 104201169 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 104201195 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 104201305 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 104201339 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 104201451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104201531 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 104201620 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 104202146 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 104202174 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104202602 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 104202687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104202767 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 104204988 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104205637 A G N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 3 104206326 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 104206576 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 104206645 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 104206743 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 104211832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104213222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104214589 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 104214688 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104214844 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 104214854 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 104215274 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 3 104215303 T A Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 3 104215414 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 104215916 C G N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 104216106 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 104216463 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 104216475 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 104216636 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104216741 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 104216770 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 104216778 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 104216999 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 104217025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104217190 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 104217226 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 104217630 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104217929 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 104218397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104218715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104218792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104218825 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 104219295 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 104219332 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 104219398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104219416 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104219478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104219533 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 104219629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104219733 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 104219878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104219910 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 104220288 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 104220351 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 104220362 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 104220369 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 104220375 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 104220398 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 104220437 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 104220465 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 104220510 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 104220833 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 104220859 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 104220869 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 104221058 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 104221059 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 104221403 C T N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 104221607 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 104221666 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 104221704 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 104221739 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 104221742 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 104221893 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104221898 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 104221955 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 104222041 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 104222070 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 104222074 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 104222113 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 104222124 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 104222173 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 104222179 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 104222196 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 104222224 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 104222325 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 104222473 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 104222479 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 104222559 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 104222641 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 104222929 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 104222937 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 104223413 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 104223558 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 104223660 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 104223896 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 104224264 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 104225424 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 104225545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104225608 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104225614 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104226475 A G Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 104226498 T A Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 104226528 G T Y N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 3 104226542 G A Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 104226688 A G Y Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.214285714285714 0.142857142857143 0.642857142857143 8 20 3 2 9 3 104226701 T C Y Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 3 104226805 A G Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 104226824 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 104227351 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 104227694 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 104227723 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 104228331 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104228345 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104228514 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 104228750 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 104228945 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 104228951 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 104229008 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 104229058 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 104229134 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 104229317 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 104229445 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 104229775 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 104229842 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 104229872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104229964 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 104229981 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 104230270 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 104230413 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 104231294 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 104231402 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104232789 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 104233630 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104233675 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 104234022 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 104235107 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 104235157 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104235623 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 3 104235643 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 3 104236118 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 104236350 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 104236469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104236520 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 104236635 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 104236640 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 104236935 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 104237048 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 104237100 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 104237817 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 104238181 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104238477 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 104238525 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104238565 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 104239084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104239232 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104242415 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104242731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104243829 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 104244018 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104244058 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104244526 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104244659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104244702 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104245089 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 104245332 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104245636 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104245760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104245846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104246436 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 104246993 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104247053 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 104248326 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 104248768 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104249540 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104249794 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 104250302 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 104250309 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104250446 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104250668 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104250765 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 104250799 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 104250815 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 104250907 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104250930 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 104250993 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104251025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104251076 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104251598 C G N N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 3 104251611 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 104251636 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 104251770 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 104251797 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 104251966 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 104252772 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104252840 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 104252981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104253153 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 104253164 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 104257323 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104257339 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104257415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104257589 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104257672 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104257712 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 104257931 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 104258109 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104258351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104258479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104259026 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104268344 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104279219 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 104289298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104289878 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104300341 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 104308080 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 104312176 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104313679 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104316103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104316191 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 104316292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104316340 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 104316401 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 104316473 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 104316542 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 104316588 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 104316634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104316896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104316956 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 104318206 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 104318207 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 104318888 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 104323623 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 104325219 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 104326920 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 104330793 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 104332165 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104333196 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 104336276 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 104336554 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 104336686 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 104336734 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 104337129 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 104337794 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 104337920 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 104338005 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104338758 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 104338776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104339460 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 104339716 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 104339832 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 104340047 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 104340090 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104340661 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 104341389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104341488 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 104341612 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 104341897 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 104342166 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 104342554 A G Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 104342613 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104342901 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104345632 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 104346106 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 104346868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104348058 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 104348707 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 104348725 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 104349984 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 104352524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104352845 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 104352909 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 104352910 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 104354574 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 104354655 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 104355042 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 104356742 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 104357187 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104357442 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 104357619 A T Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 104358426 T C Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 104358447 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 104358662 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104358703 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 104358811 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104358815 T A Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 104358829 A G Y Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 104358963 T C Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 104358971 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 104359000 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 104359002 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104359053 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104359083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104359282 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104359434 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 104359515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104359558 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 104359758 G T Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 104359770 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 104359961 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 104359967 C T Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 104360031 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104360365 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 104360666 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 104360791 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 104361198 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 104361224 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104361236 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 104361244 A G Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 104361365 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104361475 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 104361685 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104361772 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104361790 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104361796 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104361834 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 104362319 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104362325 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 104362438 G T N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.153846153846154 0.692307692307692 0.153846153846154 13 13 2 9 2 3 104363033 T A N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 3 104363947 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 104364179 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 104364371 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 104364463 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 104365272 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 104365449 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 104366063 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104366172 G A Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 104367307 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 104367447 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104367519 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 104367910 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 104367911 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 104368257 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 104368332 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 104369096 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104370368 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104370369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104370390 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 104370482 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 104370515 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 104370519 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 104370610 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 104370617 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 104370726 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 104370768 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 104370779 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 104370789 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 104370805 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 104370813 T C Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 104370840 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 104370910 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 104370950 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 104371030 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 104371106 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 104371284 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104371310 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 104371329 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 104371385 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 3 104371413 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 104371482 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104371486 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 104371547 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 104371575 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 104371630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104371753 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 104371893 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 104372378 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 104372458 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 104373035 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 104373076 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 104373139 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 104373177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104373187 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 104373528 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 104373556 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 104373956 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 104373994 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 104374023 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 104374026 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 104374042 T G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 104374352 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 104374435 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 104374584 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 104374628 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 104375056 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 104375166 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 104375696 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 104375711 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 104375913 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 104375985 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 104376029 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 104376070 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 104376173 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 104376203 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 104376255 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 104376346 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 104376687 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 104377121 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 104377222 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 104377405 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 104377529 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 104377543 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 104377850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104378374 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 104378438 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 104378596 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 104379182 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 104379184 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 104379237 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 104379260 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 104379374 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 104379407 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 104379668 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 104379742 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 104379803 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 104379863 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 104379897 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 104379923 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 104379995 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 104380175 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 104380215 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 104380225 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 104380269 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 104380457 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 104380725 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 104380946 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 104381049 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 104382124 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104382146 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104382210 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104382447 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 104383132 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 104384301 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104384510 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104384886 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 104386248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104387367 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 104387868 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104390090 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104390230 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 104400499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104400517 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 104400959 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 104401862 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104402164 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 104402562 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104402690 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104403107 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 104403164 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 104403226 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 104403423 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 104404142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104404320 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 104404643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104405190 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 104405591 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 104405749 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104405811 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 104405854 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 104406244 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 104406596 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 104406634 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104406821 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104406850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104406851 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104407000 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 104407002 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 104407388 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 104407410 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 104407428 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 104407649 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 104408391 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 104408868 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 104409895 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104410047 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 104410517 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 104410769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104411064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104412042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104412143 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104412437 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 104412445 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104412475 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104413512 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 104415285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104415306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104416465 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104416656 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 104416888 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 104417726 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 104418146 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104419153 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104419154 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104419336 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 104419337 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 104421853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104422192 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104423303 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104423939 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104427056 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 104432337 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 104432486 A C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 104434137 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 104435403 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 104435673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104435674 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104436942 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 104436949 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104437911 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104439095 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 104439182 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104439719 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 104442239 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 104442867 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104443287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104443369 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104443483 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104443809 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104443885 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104443926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104445300 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 104445521 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 104445632 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 104446082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104446757 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104447316 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104448189 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104448195 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104448307 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104450042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104450087 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104450228 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104450562 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104450569 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104450707 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 104450795 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 104451214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104451989 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104452104 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 104452139 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 104452268 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104452900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104453415 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104453488 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104453964 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104454667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104454718 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104455200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104455428 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104455932 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 104456091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104457574 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104458102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104458393 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104459159 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104459636 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 104459806 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104460505 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104460645 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 104461365 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 104462158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104462366 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104462372 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104463180 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 104463219 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 104463735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104463769 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104464078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104464110 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104464141 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 104465582 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 104465606 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 104465668 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 104465670 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 104465728 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 104466617 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 104466659 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 104466784 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 104466789 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 104466937 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 104467066 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104467399 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 104467675 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 104467705 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 104468140 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104468266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104468960 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 104470911 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 104470982 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104470983 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104471429 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104471453 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104471814 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 104471915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104471926 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104472133 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104472343 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 104472436 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 104472463 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 104476610 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 104483943 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104484270 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104484772 A T Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 3 104484965 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104486366 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104486569 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 104487269 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104487427 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 104487443 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104487501 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 104487600 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 104487620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104487631 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 104487636 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 104488069 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 104489101 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 104489686 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 104491101 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104491256 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104494594 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 104495655 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 104495765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104495879 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 104497926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104497954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104500794 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104501588 C G Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 104501848 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 104502465 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 104503890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104504995 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104505065 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104507714 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104508374 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104509228 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104509926 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 104509928 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 104511765 G C N N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 3 104512478 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104514245 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 104514264 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 104514630 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 104515614 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104516658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104517197 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 104517576 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 104518854 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104519082 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 104519320 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 104519340 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104519396 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 104519487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104519579 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104519630 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 104519640 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 104519711 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104519823 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 104519914 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 104519970 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104520261 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104520549 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 104520664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104522481 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104522792 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 104523168 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 104523730 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 104523938 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104525016 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 104525017 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 104525027 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 104525148 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 104525225 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104525606 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 104525726 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104525760 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104525879 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104525996 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 104526109 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104526277 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 104526448 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 104526458 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 104526513 G A N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.153846153846154 21 5 10 1 2 3 104526519 A G N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 104526542 T C N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 104526543 G C N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 3 104526560 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.133333333333333 26 4 13 0 2 3 104526578 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 104526589 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 104526630 C G N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 104526708 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 104526803 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 104526923 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 104526935 G C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 104526949 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104526968 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 3 104526978 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 3 104526998 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 104527138 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 3 104527291 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 3 104527318 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 104527344 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 104527469 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 104527537 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 104527605 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 104527771 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 104527806 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 104528065 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 3 104528082 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 3 104528208 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 104528230 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 104528287 A G Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.176470588235294 27 7 13 1 3 3 104528413 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 104528740 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 104528772 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 104528831 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 104528997 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104529019 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 3 104529127 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104529201 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 104529401 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 104529423 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 104529458 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 104529459 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 104529572 T A Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 104529698 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 104529702 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104529731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104530023 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 104530139 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104530204 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 104530268 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 104530329 C G Y N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 104530368 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 3 104530991 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 104531315 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 104531415 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104531480 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 104533578 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 104533691 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 104533781 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 104533851 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 104533877 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 104534050 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 104534108 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 104534667 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 104534884 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 104535092 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 104535172 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 104537428 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 104537977 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 104538189 G A N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 104538193 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 104538284 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 104538304 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104538319 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104538598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104538607 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104538624 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 104538643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104538659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104538674 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104538694 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 104538696 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104538728 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104538933 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104539149 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 104539426 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 104539600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104539645 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104540016 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104540155 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104540194 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 104540212 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 104540215 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 104540226 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 104540227 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 104540362 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104540413 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 104540439 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 104541395 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104544795 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104547155 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 104547351 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 104548380 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 104548705 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 104548740 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 11 7 4 3 2 3 104548770 A T N N 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.25 0.333333333333333 0.416666666666667 10 14 3 4 5 3 104548904 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 104549530 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 104549902 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104549988 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 104550012 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 104550758 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 104550869 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104550902 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104551021 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104551022 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104551071 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 104551112 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 104551136 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 104551176 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 104551209 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 104551211 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104551224 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 104551342 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 104551391 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104551424 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 104551457 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104551704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104551904 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 104551996 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 104552044 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 104552184 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 104552401 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 104552826 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104552863 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104552875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104553040 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 104553170 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104553192 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104553618 C T N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 104553892 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 104554292 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 104554526 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 104554630 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104554756 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104554800 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104555883 A G Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 104555921 T C Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 104555951 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 104556125 T C Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 104556166 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 104556362 A G N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 3 104556713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104557056 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 104557638 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 104557696 A G Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 104557763 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 104557982 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 104558254 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 104558558 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 104559139 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 104559151 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 104561367 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104562506 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104563403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104566395 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104571259 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104572821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104577126 T C Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 104577402 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 104577609 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 104577745 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 104577781 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 104577937 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 104577941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104578034 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 104578053 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 104578334 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 104578351 A G Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 104578530 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 104578550 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 104578676 C G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 104578750 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 104578758 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 104578960 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 104579104 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 104579136 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 104579173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104579223 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 104579266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104579278 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 104579328 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 104579340 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 104579583 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104579705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104579744 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 104580286 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 104580819 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104580881 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 104581299 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 104581506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104581624 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 104582697 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104584874 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 104587797 G T N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 3 104588042 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104591269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104592167 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104592372 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104596204 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104599131 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104600426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104600758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104600887 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 104604291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104604919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104604939 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104606022 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104607548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104608426 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 104609350 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 104610508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104610980 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104611339 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 104613990 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104614585 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104614948 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 104616472 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104617061 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 104617294 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 104617947 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104619389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104619603 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 104620348 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104621577 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 104621899 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104622090 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 104622091 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104622351 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 104622364 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 104623144 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 104623275 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 104623295 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104623507 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104623634 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 104623787 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104623882 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104624069 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 104624198 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 104624515 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104625110 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 104628255 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104628381 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104628756 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104629257 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 3 104629656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104629950 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 104630728 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 104631957 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104631988 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104632479 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104633865 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104634888 C A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 104634912 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104635158 G C Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 104635612 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104635666 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104636600 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 104636703 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104636904 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104637573 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 104638194 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 104638400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104639740 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104639970 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104640385 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 104640536 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 104642440 A T N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 104642832 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104643550 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 104643896 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 104643951 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 104644000 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 104644395 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104644433 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 104644459 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104644583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104645327 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 104645438 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 104645787 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 104646786 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104646798 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104646905 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104647060 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 3 104647063 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 104647166 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 104647220 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 104647341 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 104647497 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104647626 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 104647711 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 104647744 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 104647982 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 104648006 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104648085 C T Y Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 104648125 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 104648524 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 104648598 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104648836 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 104649079 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104649087 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104649193 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104649217 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104649401 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104649421 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 104649426 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104649790 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 104649897 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104650147 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104650316 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104650347 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104650362 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 104650380 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104650409 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 104650524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104650602 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104650606 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104650632 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104650683 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104650747 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104650813 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 104650824 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 104650919 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104651101 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 104651306 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104651316 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 104651402 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104651408 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104651507 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104651717 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 104651741 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 104651788 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104652021 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 104652024 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 104652045 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 104652259 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 104652261 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 104652291 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104652421 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104652529 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 104652549 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104652590 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104652651 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104652729 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 104652879 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104652897 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 104652898 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 104652915 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 104652982 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 104653043 A C Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 104653089 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 104653096 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 104653174 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 104653247 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104653294 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 104653300 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104653338 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104653385 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104653449 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 104653488 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 104653614 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104653806 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 104653951 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 104654098 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 104654105 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 104654117 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 104654369 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 104654853 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104654854 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104654921 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 104654929 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 104655138 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104655281 C A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 104655353 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 104655481 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 104655707 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 104655757 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104655785 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 104655877 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104655970 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104655991 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 104656052 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 104656650 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 3 104656682 C G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 104656687 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 104656743 G T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 3 104656989 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 104657029 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104657036 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104657048 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 104657119 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104657140 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 104657172 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 104657257 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 104657499 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 104657622 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 104657765 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 104657886 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 104658250 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104658689 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 104658700 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 104658707 A T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 104658711 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 104658766 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 104659268 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104659339 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 104659347 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104659576 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104659638 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104659650 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104659971 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104660090 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 104660109 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104660132 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 104660158 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 104660167 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 104660263 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 104660454 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104660677 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 104660707 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 104661239 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 104661247 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 104661250 A T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 104661598 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104662169 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104662658 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104662977 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 104664154 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104665311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104665848 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104666304 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 104667437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104671372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104672809 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 104675364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104678239 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 104678551 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104682916 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 104687518 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 104688555 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104688614 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104691849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104693085 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 104694874 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 104698315 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 104699899 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104702161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104703978 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 104704428 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104707731 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104708496 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104708529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104709749 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104710573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104711214 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 104711911 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 104713054 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104713265 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104713606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104714073 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 104714161 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104714395 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 104715357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104716561 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104717990 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104719004 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 104719080 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 104719193 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 104719899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104720316 C T N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 104720708 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 104720823 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104721612 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104722632 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 104722665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104722928 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104723410 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 104723532 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104723568 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104723665 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104723776 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 104723980 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 104724459 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104724464 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 104725309 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 104725428 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104728000 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 104728502 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 104728649 G T N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.357142857142857 0.214285714285714 0.428571428571429 13 15 5 3 6 3 104730302 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 15 21 0 15 3 3 104730316 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.117647058823529 0.764705882352941 0.117647058823529 17 17 2 13 2 3 104730340 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 104730412 T C N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 3 104730413 A T N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 3 104730544 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 104730590 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 104730668 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 104730909 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 104730934 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 104731768 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104732626 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104732672 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 104734039 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 104734423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104735024 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104735518 G T Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 104735849 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104735856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104736059 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104736354 G C Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 104736431 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104736513 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104736514 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 104736899 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 104737476 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 104737500 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 104738425 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104739283 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104739940 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 104740187 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104740243 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104740736 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 104740836 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.25 0.05 0.7 11 29 5 1 14 3 104741068 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 104741282 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104741287 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104741296 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 104741345 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104741464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104741965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104742116 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.263157894736842 0.0526315789473684 0.684210526315789 11 27 5 1 13 3 104742135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104742323 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.25 0.05 0.7 11 29 5 1 14 3 104743035 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.315789473684211 0.105263157894737 0.578947368421053 14 24 6 2 11 3 104743098 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 104743396 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 104744275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104746597 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104747364 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104747417 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 104748327 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 104748394 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 104748559 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 104750237 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 104750377 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.555555555555556 0.111111111111111 0.333333333333333 22 14 10 2 6 3 104750581 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104750948 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104751435 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104752004 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104753428 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104754308 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 104754386 T G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 104754551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104754562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104754852 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 104756076 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 104756365 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 104756643 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 104756678 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104756980 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 104757089 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104757142 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104757147 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104757197 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104757329 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 104758013 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 104758146 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 104758168 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 104758183 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104758250 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 104758400 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104758754 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 104758998 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 104759254 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 104760235 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 104760248 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104760467 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104760667 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104760692 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104760724 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104760783 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104760794 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 104761043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104761463 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 104762301 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 104762362 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 104763321 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104764089 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104764367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104764539 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 104764870 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104765836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104766261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104766887 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104767024 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 104769470 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104769724 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 104769888 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104770526 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 104771415 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104771940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104772548 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104773426 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 104773471 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 104773766 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104775147 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104775151 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 104775267 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 104776046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104776504 T C Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 104777294 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 104777924 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 104778002 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104782588 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 3 104782815 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104783784 C G Y N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 104783787 A G Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 3 104783971 A T Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 104783979 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 104783992 G T Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 104784768 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 104786543 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 104787144 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 104789611 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 104789676 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 104790610 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 104790871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104790904 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 104791091 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 104794045 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 104794280 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 104795533 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 104795539 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 104795766 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 104796512 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 104796531 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 104797252 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 104798232 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 104799789 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104799830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104800329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104800883 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 104800940 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 104800976 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 104800977 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 104801000 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 104801237 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 104801393 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 104801595 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 104801855 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 104802021 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 104802240 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 104802241 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 104802260 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 104802290 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 104802302 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 104802303 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 104802329 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 104802401 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 104802418 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 104802466 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 104802507 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 104803376 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 104803647 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104807748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104808383 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 104809035 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 104810085 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 104811538 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104811883 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 104812642 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104812900 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 104813029 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104813219 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 104815049 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104815158 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 104815316 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 104815325 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 104815440 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 104815592 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104817107 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 104817190 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104817973 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 104818223 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104819281 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 104819287 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 104820405 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 104820471 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 104820486 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 104820489 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 104820756 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 104820780 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 104821025 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104821132 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 104821143 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 104821375 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 104821395 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 104821702 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 104821737 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 104821751 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 104821836 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 104821868 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 104821882 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 104821893 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 104821915 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 104822047 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 104822098 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 104822372 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 104822616 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 104822712 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 104822735 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 104822826 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 104823025 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 104823146 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 104823260 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104823337 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 104823338 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 104823400 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 104823463 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 104823517 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 104823625 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 104823812 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 104823940 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 104824106 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 104824191 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 104824201 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 104824232 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 104824367 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 104824465 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 104824481 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104824632 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104824711 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 104824723 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 104825156 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 104825214 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 104825280 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 104825362 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 104825776 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 104825795 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 104825931 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 104826038 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 104826191 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104826372 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 104827009 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 104827542 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 104827563 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 104827707 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 104828159 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104828513 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 104829329 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 104829437 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 104830131 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 104830362 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104834842 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 104836135 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 104836720 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104837112 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 104837491 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 104837562 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 104837724 G T Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 104838295 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 104838605 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104838612 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104839044 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 104839071 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 104839104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104839189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104839900 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 104841221 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 104842444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104843584 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 104843624 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 104843800 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 104844038 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 104846580 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104846937 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 104847489 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 104849091 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104850523 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104853161 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104853824 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104855946 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104856795 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104857197 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 104857204 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 104859116 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 104861940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104862464 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104862862 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104864526 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 104865181 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 104865407 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104866378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104866599 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104867719 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 104868314 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104868389 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 104869484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104872932 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 104873824 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104873960 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104874368 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 104874395 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104874493 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 104874663 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104874715 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 104874801 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 104875004 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 104875012 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 104875046 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 104875215 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 104875297 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 104875416 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 104875826 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 104875847 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 104875932 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 104875982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104876124 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 104876366 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 104876410 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 104877259 G T N N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 104877456 T G N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 104877481 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 104877727 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 104877780 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 104878187 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 104878239 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 104878327 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 104878342 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 104878344 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 104878399 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 104878409 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 104878515 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 104878537 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 104878627 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104878723 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 104879013 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104879088 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 104879608 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 104879642 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 104879817 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104879916 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 104880117 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 104880641 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 104880670 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 104880725 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104880763 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104881011 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 104881121 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104881187 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 104881617 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104882152 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 104882290 T A Y N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 104882440 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 104882471 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 104882617 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 104882686 A G Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 104882695 G A Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 104883092 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 104883157 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 104883590 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 104883725 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 104883903 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 104883988 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 104883996 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 104883999 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 104884019 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 104884043 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 104884058 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 104884114 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 104884117 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 104884151 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 104884332 G C Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 104884450 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104884521 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 104884840 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104885212 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 104885247 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 104885462 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 104885517 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 104885551 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 104885649 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 104885721 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 104885823 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 104885833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104885914 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 104886249 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 104886517 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 104886545 C A N N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 9 5 4 1 2 3 104886860 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 104887031 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 104887573 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 3 104887579 C A N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 104887704 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 104888110 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 104888351 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 104889260 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 104889338 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 104889348 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 104889773 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 104889863 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 104890633 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 104890876 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 104890963 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 104891219 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 104891245 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 104891290 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 104891300 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 104891810 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 104891862 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 104891939 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104891973 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 104892336 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104895788 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104895999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104896219 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104896953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104897028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104897044 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 104899006 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104899299 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104899419 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 104899963 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104900493 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 104902493 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 104902762 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 104903005 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 104905203 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 104906909 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 104908365 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 104910781 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104911097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104911336 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 104914924 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104915521 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104915699 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 104915715 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 104915767 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 104915937 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 104917153 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 104918382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104918494 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104919810 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104919818 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104920255 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 104921180 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104921296 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 104921496 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 104921731 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 104921910 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 104922006 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 104922007 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 104922103 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 104922125 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 104922181 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 104922792 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 104922919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104923095 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 104923110 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 104923384 G A Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 104923510 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104923621 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 104923638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104924822 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104925217 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104926517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104926531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104926728 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104926857 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104927116 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104928148 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104928341 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104928402 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104928411 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 104928427 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 104930615 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 104930707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104932206 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104933666 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104936288 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 104936372 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104936478 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 104936843 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104936965 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104937411 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 104941180 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104942480 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104944449 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104945056 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104945355 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 104945738 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 104946228 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 104946908 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 104947263 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 104947321 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 104947364 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 104947614 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 104947699 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 104948094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104948845 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 104948976 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 104949296 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104949441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104949535 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 104949567 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 104950946 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 104951038 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 104951235 A G N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 3 104951534 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 3 104951615 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104951654 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 104951673 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 104951687 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 104951997 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 104952623 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 104952715 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 104952912 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 104954021 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 104954443 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 104954461 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104955339 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 104955424 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 104955755 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 104955861 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104956131 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104956377 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 104956867 A C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 104956919 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 104956966 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104957092 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104957117 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 104957187 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 104957374 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 104958093 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 104958178 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 104958320 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 104958322 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 104958547 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 104958703 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 104958791 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 104958820 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 104958930 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 104959000 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 104959631 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 104959879 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 104960724 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 104960970 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104961337 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 104962207 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 104962328 A C Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 104962359 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 104962408 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 104962651 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 104963323 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 104963699 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 104965012 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 104966822 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 104966967 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 104967019 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 104967838 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 104968381 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 104968394 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 104969225 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 104969310 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 104969617 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 104969792 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 104970009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104970133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104970162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104970245 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 104970299 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 104970319 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 104970336 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 104970370 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 104970468 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 104970761 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 10 14 2 6 4 3 104970857 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 104970866 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 104970977 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 104971088 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 104971109 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 104971132 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 104971143 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 104971275 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 104971392 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 104971521 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 104971885 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 104971906 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 104971982 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 104972048 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 104972124 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 104972647 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 104972702 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 104973093 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 104973331 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 104973855 C A N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 104974165 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 104974211 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 104975022 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 104975100 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 104975354 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 104975368 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 104976885 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 104976924 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 104977320 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 104977336 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 104977407 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 104977631 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 3 104977963 G T N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.3125 0.125 0.5625 12 20 5 2 9 3 104978172 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 104978185 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.368421052631579 0.105263157894737 0.526315789473684 16 22 7 2 10 3 104978221 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 104978260 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.368421052631579 0.105263157894737 0.526315789473684 16 22 7 2 10 3 104978314 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 3 104978486 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 3 104978533 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 3 104978899 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104979168 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 104979260 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 104979441 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 104979511 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.375 0.1875 0.4375 15 17 6 3 7 3 104980011 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 3 104980286 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 104980421 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 3 104980477 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 104980484 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 104980501 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 104981257 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 104981269 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 104981281 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 104981286 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 104981460 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 3 104981599 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 104981629 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 104981703 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 104981708 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 104981880 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 104982130 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 104982411 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 104982557 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 104982711 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 104982793 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 104982822 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 104982945 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 104982955 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 104983065 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 104983418 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 104983554 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 104983557 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 104983780 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 104983908 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 104984122 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 104984383 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 104984736 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 104984774 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 104984779 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 104984808 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 104985064 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 104985090 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 104985189 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 104985191 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 104985244 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 104985328 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 104985777 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 104985783 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 104985889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104987476 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104989460 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 104989605 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 104989676 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 104989721 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104989932 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 104989973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104990128 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 104993864 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 104993869 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 104993883 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 104994083 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 104994512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104994563 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 104995413 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 104995787 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 104995871 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 104995933 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 104996183 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104996251 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 104996362 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 104996536 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 104997030 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 104997099 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104997130 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 104997154 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 104997197 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 104997221 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104997250 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 104997272 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 104997330 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 104998112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104998138 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 104998277 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 104998503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 104998665 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 104998833 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 104998863 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 104999135 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 104999416 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 104999907 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 104999908 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 104999963 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 105000489 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 105000533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105001157 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 105001760 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 105001809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105002305 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105002377 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 105002517 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 105002575 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 105002796 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105002819 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 105003176 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 105003205 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 105003403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105003658 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 105003946 A G N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 3 105004466 A T N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 3 105005082 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 105005173 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 105005195 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 105005247 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 105005542 C T Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 105005837 C T N Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.5 0.125 0.375 9 7 4 1 3 3 105005839 C T N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.625 0.125 0.25 11 5 5 1 2 3 105006044 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 105006090 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 105006098 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 105006144 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 105006217 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 105006299 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 105006321 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 105006333 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 105006394 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 105006395 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 105006492 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 105006548 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 105006586 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 105006602 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 105006624 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 105006633 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 105006639 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 105006691 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 105006782 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 105006803 T A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 105006856 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 105006895 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 105007086 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 105007136 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 105007152 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 105007217 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 105007368 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 105007445 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 105007768 G C N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 105007772 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 105007785 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 105007801 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 105007857 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 105007892 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 105007960 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 105008015 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 105008019 C A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 105008253 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 105008274 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 105008296 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 105008345 A G Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 105008355 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 105008379 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 105008437 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 105008448 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 105008484 T A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 105008487 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105008502 C T Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 105008512 C G Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 105008537 T G Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 105008543 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 105008552 T A Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 105008557 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 105008872 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 105008902 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 105009284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105009297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105009460 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105009475 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 105009615 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 105009628 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 105009661 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105009736 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 105009832 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 3 105009900 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 105009944 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 105009961 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 105010095 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 105010126 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 105010206 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 105010220 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 105010232 C G N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 105010248 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 105010339 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 105010462 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 105010576 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 105010610 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 105010782 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105011145 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 105011188 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 105011564 A C N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 105011575 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 105011796 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 105011906 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 105011990 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 105011994 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 105012042 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 105012140 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 105012292 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 105012625 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 105012726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105013184 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 105013733 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 105013963 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105014897 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 105015113 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 105015242 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 3 105016929 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 105017239 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105018797 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 105019078 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105019432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105019858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105020298 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105020621 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 105020640 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 105020758 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 105020772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105021591 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 105021780 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 105021887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105021948 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105022164 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 105022165 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 105022292 A T Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 105022399 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 105022515 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 105022742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105022760 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105023231 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105023345 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 105023357 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 105023405 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 105023427 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 105023605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105023803 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 105024048 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 105024232 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105024300 C T Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 105024714 A T Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 105024768 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 105024928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105025253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105027120 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 105033828 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 105037050 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 3 105037370 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 105039907 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 105040342 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105040763 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 105041418 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 105042105 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 105042657 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 105043374 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105044510 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 105045235 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105045775 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 105046160 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 105046563 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105046591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105046637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105046951 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 105047820 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 105048927 G T N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 3 105049083 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 105049234 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 105049709 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105055678 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 105056047 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 105056156 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105056228 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 105056236 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 105056374 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 105056450 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 105056530 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105056607 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 105056674 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105056730 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105056865 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 105056887 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 105057021 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105057107 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105057150 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105057186 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 105057275 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105057394 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105057424 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 105057429 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 105057554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105057666 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 105057687 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 105057720 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 105057727 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 105057848 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 105057887 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105057999 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105058167 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105058312 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105058751 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 105059006 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 105059024 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 105059033 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 105059041 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 105059180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105059293 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 105060154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105060333 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 105060449 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 105060602 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105061285 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 3 105061908 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 105062053 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 105062219 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 105063894 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 105064307 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 105065153 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 105065176 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 105065183 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 105065356 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 105065900 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 105066099 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 105066137 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 105066482 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 105068043 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 105068266 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 105068556 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 105068757 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 105069012 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105069342 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 105069920 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 105070105 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 105070227 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105070325 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 105071769 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 105072124 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105072149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105074420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105075062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105075906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105076682 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 105077943 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105078860 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 105079287 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 105079857 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105082329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105082888 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105083506 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 105083532 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 105083602 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 105083624 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 105083625 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 105083687 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105083703 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 105083975 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 105084001 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 105084177 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 105084215 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 105084235 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 105084373 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 105084461 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 105084517 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 105085228 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 105085290 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 105085383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105085497 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 105085600 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 105085745 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105085798 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 105085819 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 105085841 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 105085972 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 105086039 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 105086095 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 105086143 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 105086234 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 105086235 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 105086252 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 105086254 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 105086276 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 105086291 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 105086495 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105086519 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105086678 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 105086683 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 105086981 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 105087017 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 105087038 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 105087077 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 105087247 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 105087295 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105087296 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105087318 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 105087494 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 105087564 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 105087708 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 105088490 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 105088840 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 105089121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105089249 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105089262 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 105089315 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 105089325 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 105089339 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 105089502 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105089610 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105089684 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 105089806 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 105089832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105091301 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 105091304 T C N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 3 105091433 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 105091505 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 105091556 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 105091899 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 105091934 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105091947 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 105091948 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 105092262 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 105092429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105093792 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 105093804 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 105093820 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 105094790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105094869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105095095 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 105095123 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 105095128 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 105095151 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 105095234 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 105095276 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 105095342 T A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 105095386 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 105095431 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 105095481 A T Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 105095492 T A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 105095545 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105095610 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 105095818 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 105098160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105098319 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 105100066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105100602 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 105101735 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105102578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105102856 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105108689 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105109714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105112886 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 105115769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105117289 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 105118084 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 105121061 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 105121116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105122929 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105123364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105125389 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105127092 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 105127852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105133117 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105133280 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 105133454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105134577 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 105135478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105136827 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 105139107 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 105139237 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 105139458 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 105139506 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 105139526 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 105139612 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 105139679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105139774 C A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 105147503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105151564 A G Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 105151588 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 105151595 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 105152394 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 105152795 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 105153180 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 105153280 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 105153447 G C Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 105153721 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 105153965 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 105154334 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 3 105155636 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 105156269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105158410 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 105159845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105160212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105160795 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105161958 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105162927 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 105162998 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 105165785 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 105167049 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 105167055 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 105167147 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 105167208 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 105167628 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105167985 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 105168999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105169436 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 105169990 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 105170347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105171520 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 105171779 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 105172598 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 105172622 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 105173304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105175243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105175906 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 105177521 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 105178941 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105179380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105182811 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 105182840 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 105182980 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 105183036 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 105183074 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 105183122 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 105183359 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 105184230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105184254 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 105184255 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 105184325 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105185111 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 105186109 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105188007 G T Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 105188025 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 105191724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105191744 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105191913 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 105192500 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 105192635 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 105192822 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 105193374 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105194947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105195002 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 105195417 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 105195501 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 105195642 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 105196898 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 105198189 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105200958 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 105203224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105203354 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 105203399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105203509 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 105203522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105203526 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 105203547 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 105203587 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 105203835 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 105203862 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105204170 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 105204705 C A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 105205092 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 105205216 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 105206852 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 105207531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105207971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105208122 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105209638 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 105210534 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 105210544 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 105210562 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 105210909 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 105210994 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 105211019 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105212493 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105212540 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 105212918 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 105212987 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 105213458 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105213769 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 105213845 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 105213852 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 105214257 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 105214616 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 105214899 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 105215085 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 105215239 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105216763 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 105217228 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 105217250 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 105217433 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 105217434 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 105217454 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 105218479 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 105218624 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105218814 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 105219287 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 105219356 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 105219357 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 105219451 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 105219507 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 105219556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105219728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105220309 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 105220915 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 105222679 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 105223387 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105223789 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 105223841 A G N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 3 105223914 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 105224064 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 105224171 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 105224178 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 105224762 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 105225182 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 105225270 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 105225293 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105225848 C T N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.428571428571429 0.214285714285714 0.357142857142857 15 13 6 3 5 3 105226217 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 105226276 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 105226282 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 105226327 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 105226339 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 105226453 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 105226501 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 105226572 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 105226625 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 105226630 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 105227537 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 105228568 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105229112 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 105229352 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 105229520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105229552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105229553 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105229876 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 105229913 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 105229924 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 105229930 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 105230902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105230944 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105230956 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105231153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105231193 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105231509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105231538 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 105231585 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105231769 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 105232102 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 105232181 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 105232679 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 105233093 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 105233166 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 105233458 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 105233467 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 105233535 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 105233642 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 105233724 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 105233742 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 105233814 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 105233836 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 105233955 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 105234054 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 105234152 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 105234236 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 105234634 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 105234726 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 105234803 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 105234814 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 105234817 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 105234850 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 105235019 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 105235179 T A N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 105235206 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 105235599 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 105235796 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 105236029 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 105236133 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 105236200 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 105236227 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105236439 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 105236516 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 105236858 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 105237137 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 105237530 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 105237532 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 105237619 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 105237925 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 105237949 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 105237987 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 105238015 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 105238611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105238748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105238960 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 105238971 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 105239112 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 105239178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105239551 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 105240304 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 105240688 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 105241040 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 105241158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105241204 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 105244240 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 105244340 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 105244361 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105244893 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 105244932 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 105244943 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 105245542 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 105245544 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 105245571 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 105245657 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 105245776 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 105245808 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 105247008 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 105247017 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 105247227 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 105247292 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 105247327 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 105247640 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 105247877 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 105248402 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 105249091 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105250251 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 105250455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105250893 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 105251203 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 105251255 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 105251466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105253396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105253482 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105254226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105256051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105256794 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 105256966 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 105257849 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 105258135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105258141 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 105258226 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105259192 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 105259252 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 105259376 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 105259743 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 105260058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105260205 G C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 105260390 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105260499 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 105260507 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105261138 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105261331 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 105261589 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 105263741 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 105263914 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 105264639 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 105265519 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 105265815 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 105266617 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 105266895 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 105268338 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 105268346 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 105268406 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 105268436 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 105268802 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 105269004 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 105269573 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 105269636 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 105269747 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 105269852 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 105270022 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 105270036 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 105270138 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 105270189 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 105270196 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 105270321 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 105270445 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 105270932 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 105271160 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 105271541 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 105271542 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 105271599 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 105271734 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 105271764 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 105272146 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 105272279 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 105272283 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 105272399 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 105272542 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 105272699 G T N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 3 105273095 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 105273322 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 105273877 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 105274026 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 105274483 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 105274697 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 105274828 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 3 105274903 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 105274914 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 105274969 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 105275267 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 105275343 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 105275516 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 105275584 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 105275608 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 105275918 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 105276392 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 105276751 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105276764 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 105276769 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 105276892 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 105276933 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 105276985 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 105277060 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 105277165 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 105277509 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105277609 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 105277670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105278540 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 105279549 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 105280291 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 105280415 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 105280443 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 105280600 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 105280654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105280684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105281662 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 105282923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105283432 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 105294258 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 105294259 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 105294405 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 105295082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105295232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105297008 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 105297099 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 105297337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105298497 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105300597 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105302224 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 105302402 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 105302675 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105303111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105304695 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105307153 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105309495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105312979 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 105313203 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 105313467 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 105313571 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 105316336 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 105316604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105316921 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105320487 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105322544 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105323172 C G Y N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 3 105326364 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 105327715 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 105328165 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 105329376 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 105329503 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 105329564 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 105329737 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 105329796 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 105330080 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105330162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105330181 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 105330211 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 105330257 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 105330649 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 105330885 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105330897 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105331060 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 105331061 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 105331239 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 105331259 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 105331782 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 105332318 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 105332464 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 105332765 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 105332906 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 105332998 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 105333003 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 105333107 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 105333315 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 105334093 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 105334317 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 105334382 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 105334410 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 105334865 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 105334964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105336309 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 105336415 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 105336927 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 105336997 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 105337007 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 105337021 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 105337310 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105337340 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 105337393 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 105337430 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 105337564 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 105337710 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 105338032 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 105341523 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 105344415 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 105345110 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 105345564 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 105345991 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 105346068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105346796 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105349568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105350399 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 105350484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105352918 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 105353240 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105353546 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 105354862 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 105355070 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 105355241 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 105355285 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 105355333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105355408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105357228 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 105357238 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 105359084 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 105359113 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105359346 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 105359543 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105359922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105359929 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 105360051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105360155 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105360261 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 105360267 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 105360327 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 105360531 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 105360584 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105360744 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105360776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105361305 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105361473 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 105362722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105364134 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 105365194 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 105365521 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 105365742 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 105365977 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 105366569 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 105366585 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 105366594 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 105366621 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 105366655 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 105366662 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105372904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105373007 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105373372 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 105373421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105373435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105374074 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 105374224 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 105374378 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105376636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105376739 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 105377280 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 105377325 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 105378830 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105378841 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 105378945 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 105379058 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 105379279 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 105379528 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 105379876 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 105380257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105380477 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 105380491 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 105380619 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 105380741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105380882 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 105381111 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 105381829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105381879 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 105382337 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 105382379 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 105383406 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 105386653 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 105387947 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 105388293 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 105391359 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 105391401 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 105391472 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 105394674 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 105394807 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 105395085 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105395465 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 105395567 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105396410 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 105396875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105396936 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 105399883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105401223 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105401319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105402446 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 105402566 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 105403012 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 105404954 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 105406230 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 105406544 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 105406790 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 105407018 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 105407046 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 105407097 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 105407204 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 105408244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105408359 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 105408803 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 105409124 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 105409543 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 105409545 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 105409654 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 105409776 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105410580 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 105410973 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 105411010 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 105411019 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 105411025 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 105411114 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 105411145 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 105411222 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 105411274 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 105411404 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 105411450 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 105411459 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 105411464 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 105411724 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 105411725 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 105411749 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 105411766 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 105411767 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 105412097 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 105412541 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 105412667 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 105413003 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 105413560 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 105413860 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 105413865 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 105413890 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 105413982 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 105414142 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 105414179 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 105414214 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105414383 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 105414384 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 105414410 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 105414633 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105415078 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 105415155 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 105415323 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 105415335 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 105415336 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 105415661 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 105415662 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 105415692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105416160 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105416273 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 105416822 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105416958 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 105416980 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 105416997 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 105417014 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 105417148 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 105417216 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105417472 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 105417475 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 105417596 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 105417809 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 105417926 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 105418028 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 105419259 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 105420371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105421957 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105422174 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105422433 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 105422447 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 105422471 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 105422515 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 105422727 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 105423175 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 3 105423242 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 105423317 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 105423452 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 105423498 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 105423522 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 105423684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105424219 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 105424292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105424647 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 105424725 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 105424798 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 105424881 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 105424908 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 105424941 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 105425075 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 105425251 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 105425370 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 105425910 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 105425999 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 105426241 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 105426243 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 105426872 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 105426878 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 105427365 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 105427470 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 105428092 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 105428177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105428179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105428232 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 105428286 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 105428685 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 105429306 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 105429307 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 105429489 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 105429985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105430010 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105430582 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 105430997 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 105431771 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 105431845 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 105432363 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 105432537 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 105433183 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 3 105433194 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 105433223 A T N N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 3 105433477 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 105433593 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 105433668 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 105434415 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 105434422 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 105434506 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 105434567 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105434627 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 105434741 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 105434779 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 105434781 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 105434913 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 105435075 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 105435230 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105436048 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 105436157 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 105436324 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 105436426 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 105438018 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 105438298 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105438318 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 105438722 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105438947 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105439857 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 105441407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105443209 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105443630 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 105445328 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 105445692 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 105448382 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 105448622 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105450619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105450692 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 105450699 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 105450734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105450822 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 105451198 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 105453146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105453548 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105453748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105454516 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 105454797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105454946 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 105454997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105455389 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 105455408 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 105455827 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105455828 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105455983 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 105456447 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 105457630 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105458145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105458531 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105458607 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105460495 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105461372 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 105462280 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105463133 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 105463155 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 105463179 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 105464497 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 105464621 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 105465305 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 105465829 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 105465877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105465879 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 105466135 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 105466975 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 105467114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105467168 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 105467181 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 105467656 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105467819 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 105468358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105470274 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105472438 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 105478623 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 105479668 G A N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 3 105480213 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 105481728 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 105481744 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 105482544 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 105483740 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 105488389 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105488505 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 105488859 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105488888 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 105488894 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105489019 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105489191 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 105489282 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105489283 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105489355 T G Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 105489602 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 105489831 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 105489955 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 105489969 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 105490333 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 105490358 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 105490969 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 105491041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105491212 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 105491227 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 105491623 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 105491624 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 105491663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105491956 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 105492005 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 105493138 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105494300 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105494488 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 105495321 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105495703 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 105497231 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105497453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105497483 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 105498259 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 105499746 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 105500323 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105500404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105500531 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105500715 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 105500807 A T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 105500848 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 105501039 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105501308 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 105501478 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 105501554 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 105501558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105501617 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 105501644 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 105501802 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 105501811 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 105501871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105501886 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 105502063 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 105502533 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 105502615 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 105502932 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 105506794 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105509517 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105510908 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 105514718 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 105516700 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 105517600 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 3 105520454 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105520871 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 105521111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105522827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105524093 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105525717 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 105525849 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 105525978 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 105526153 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 105526729 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105527554 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105527924 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105529624 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105532287 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 105533051 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 105534853 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 105534855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105534866 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 105535156 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 105535175 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 105535318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105535529 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 105536800 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 105536871 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 105538424 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 105541922 T A Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 3 105541923 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.166666666666667 0.722222222222222 0.111111111111111 19 17 3 13 2 3 105542690 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 105542981 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 105544264 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105546636 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 105547487 T C Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 105547804 T A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 105548533 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105548601 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 105550473 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 105550502 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105550963 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 105551076 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 105551848 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 105551849 A C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 105552030 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 105552587 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 105552588 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 105553147 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 105555663 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 105556667 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 105557044 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 105557301 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 105558028 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 105558405 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 105559837 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 105560452 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105560732 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 105561584 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 105562793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105563306 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105563340 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 105563580 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 105563587 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 105564029 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 105564966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105565836 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 105567130 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105567741 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105567835 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 105568419 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 3 105568848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105570621 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105570981 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 105571666 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105571780 A T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 105571822 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 105574893 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 105576021 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 105577046 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105577545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105577565 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 105577984 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 105578302 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 105578669 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 105580999 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 105581170 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 105581684 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.1 0.85 0.05 21 19 2 17 1 3 105581949 T A N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 105583082 G T N N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 3 105583876 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 105584714 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 105584896 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105586551 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105586579 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 105588056 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105588643 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105588704 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105588880 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 105589099 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 105589258 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 105589388 A T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 105590984 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105591484 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 105591873 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 105593054 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 105593055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105595006 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 105595416 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105595851 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 105596890 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105597390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105597696 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 105599131 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 105599371 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 105601742 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 105602583 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 105603326 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105603451 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105603651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105603854 A G N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 3 105604875 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105604885 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105606995 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105607273 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105608327 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105609121 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105609153 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 105610607 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105611159 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105611208 T A N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 105611518 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105612151 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105612225 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 105612250 C A N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 3 105612975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105613059 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105613133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105613149 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105613274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105613600 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 105613622 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 105613713 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 105613768 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 105613793 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 105613855 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 105613919 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 105614083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105614197 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 105614247 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105614395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105614417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105614503 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105614600 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105614608 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105614617 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105614650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105614658 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 105614796 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105614926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105615374 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105615456 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 105615915 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105615937 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 105616009 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105616077 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 105616201 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105616218 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105616243 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105616254 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105616369 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 105616377 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 105616433 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 105616470 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 105616504 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 105616505 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 105616571 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 105616589 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 105616623 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 105616639 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105616773 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105616964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105617126 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105617225 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105617243 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105617300 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105617305 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105617321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105617447 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105617510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105617523 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105617637 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105617642 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105617659 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105617878 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105617921 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105618122 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105618287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105618510 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105618575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105618580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105618874 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105619420 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105619671 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 105619698 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 105619811 G A N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 105619820 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 105619973 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105620086 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105620161 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 105620377 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 105620403 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 105620469 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105620589 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 105620612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105620655 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105620660 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105620932 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105621015 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105621077 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105621345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105622555 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 105622580 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 105622969 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 105622980 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 105629113 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 105630846 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 105631076 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 105631198 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 105631288 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 105632060 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 105632504 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 105632506 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 105632741 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 105632927 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 105633293 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 105633306 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 105633799 T G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 105633938 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 105633970 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 105634293 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 105634465 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 105634516 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 105635117 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 105635268 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 105635589 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 105636498 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 105636635 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 105636680 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 105636827 T A Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 105636952 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 105637174 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 105637252 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 105637423 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 105637462 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 105637609 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105637666 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105637869 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105640706 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 105642976 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 105645194 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 105646008 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 105646057 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 105646058 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 105646086 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 105646383 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105646392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105646480 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105646588 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 105646691 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 105646924 G A Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 105647047 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105647166 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105647206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105647232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105647428 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105647471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105647515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105647561 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105647636 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105647657 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105647684 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105647693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105647722 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105647823 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105647907 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105647936 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105647970 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105648063 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 105648114 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 105648164 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105648929 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 105649257 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105649431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105649519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105649534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105649541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105649682 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105649696 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 105649883 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105649885 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105649980 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105650376 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105650653 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 105650709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105650832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105650892 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105650907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105651374 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105651442 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105651590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105651634 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105651716 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105651717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105651785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105651809 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105651826 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105651931 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 105652032 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 105652055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105652084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105652135 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105652400 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 105652450 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105652766 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105652844 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105652861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105652930 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 105653055 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105653126 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105653387 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105653394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105653777 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105653904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105653912 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 105653949 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105653962 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105653971 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 105654014 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 105654020 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 105654047 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 105654070 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 105654090 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 105654126 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 105654160 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105654196 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 105654250 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 105654251 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 105654267 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105654335 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105654536 G A N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 3 105654678 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 105654901 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105655318 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105655883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105655980 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105657205 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 105657664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105658229 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105658521 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105659354 G T N N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 105659687 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105659790 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 105659855 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 105660591 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105661286 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105661491 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 105661830 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105662422 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105662656 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105663125 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105663211 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105664462 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 105664517 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105664860 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 105664935 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 105665453 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105665557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105665826 T G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105666131 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 105666138 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 105666587 C A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105666697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105666796 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105666899 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105666941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105666970 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 105667125 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 105667208 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 105667278 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105667326 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105667477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105667844 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105667892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105667933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105667995 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105668523 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105668640 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105669481 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 105669865 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105670039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105670323 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105671400 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105673022 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105674215 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 105675426 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 105675845 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 105677144 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 105677277 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105678369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105679201 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 105682236 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105682632 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 105683094 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105683609 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105684888 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 105685658 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 105685927 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 105686675 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105690210 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 105692495 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105692782 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105693144 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 105695311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105696087 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 105700179 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 105700265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105701170 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 105701572 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 105702307 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 105707440 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 105708459 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105708493 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 105709636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105710819 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105711325 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 105711710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105711986 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 105711987 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 105712382 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 105712950 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 105713061 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 105713659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105713807 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 105714360 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 105714444 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 105714563 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 105714636 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 105715193 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 105716307 C G N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 105716401 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 105716659 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 105716709 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 105717459 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 105717464 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 105720129 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 105720187 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 105720326 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 105720716 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 105721041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105721236 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105721327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105721744 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 105721841 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 105721985 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105722632 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 105723226 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 105723407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105723678 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 105723828 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 105724415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105724441 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 105724900 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105724980 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 105725019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105725282 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105725433 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105725595 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 105725956 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 105726073 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105726111 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 105726212 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 105726232 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 105726342 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 105726384 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 105726506 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 105726643 C T Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 3 105726664 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 105726795 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 105726888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105726927 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 105726984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105727028 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 105727040 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 105727831 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 105728529 C T Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 105728530 A G Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 105728615 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 105729059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105729674 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105730002 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 105730205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105730540 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 105731124 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 105731379 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 105731527 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 105731719 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 105731751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105731861 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 105733536 T C Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 105735018 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 105735286 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105735352 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 105735709 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 105736463 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 105736840 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 105736897 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 105737088 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 105737220 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 105738892 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 105739850 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 105742675 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 105743158 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 105751106 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 105751184 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 105751411 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 105752444 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 105754012 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 105754158 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 105754827 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 105754876 C G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 105755190 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 105755191 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 105755950 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 105756296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105756342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105756513 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105756639 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 105756853 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 3 105757083 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 105757138 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 105757422 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 105757695 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 105757706 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 105757916 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105758050 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 3 105758059 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 3 105758076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105758230 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 105758629 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 105758705 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 105758753 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 105758764 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 105758875 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 105758959 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 105758971 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 105759173 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 105759564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105759595 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 105759757 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 105759883 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 105759888 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 105759905 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 105760141 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 105760182 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 105760186 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 105760355 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 105760685 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 105761040 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105761047 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 105761235 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 105761255 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 105761534 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 105761562 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 105765129 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 105767714 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 105767879 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 105768464 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 105769565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105771256 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 105772418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105772800 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 105772803 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 105772995 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 105774884 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 105774955 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105774985 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105775765 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 105776365 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 105776650 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105776819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105776871 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 105777363 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105778288 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105778762 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 105778791 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 105778934 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 105779822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105780809 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 105781106 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 105781124 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 105781148 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 105781431 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 105781585 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 105781598 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 105781646 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 105781769 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 105781860 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 105781882 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 105782068 C A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 105782199 T G N N 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 7 11 2 3 4 3 105782625 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 105782695 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 105782988 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 105783217 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 105783586 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 105783729 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 105783790 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 105783810 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 105784024 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 105784105 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 105784138 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 105784180 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 105784608 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 105784634 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 105784779 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 105784796 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 105785222 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 105785361 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 105785646 G C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 3 105785951 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 105785977 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 105786017 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 105786034 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 105786100 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 105786572 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 105786641 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 105786946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105787042 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 105787745 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 105787852 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 105787911 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105788158 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 105788283 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 105788776 C T N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 3 105789189 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 105789327 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 105789338 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 105789345 G T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 105789803 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 105790044 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 105790059 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 105792459 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 105793244 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 105796240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105801032 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 105807335 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 105816077 T C N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 3 105817216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105817898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105822802 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 105823120 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 105823478 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105824384 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105825182 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 105825418 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 105825491 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 105825749 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105827631 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105828320 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 105828740 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105832221 A T Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 105832226 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 105832782 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 105832965 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105833076 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105833684 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 105834000 G A N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 3 105834304 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.25 0.666666666666667 0.0833333333333333 14 10 3 8 1 3 105835688 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 105835737 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 105837414 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 105837436 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105838889 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 105840164 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105840725 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105841916 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105841970 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 105842028 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105842078 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 105842487 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 105842751 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 105842763 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 105842962 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105842985 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105843097 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105843369 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 105843519 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 105843546 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 105843687 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 105844038 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105844321 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 105844796 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105845409 A G Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 105845562 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 105846409 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105846410 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105846423 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105846429 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105846504 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 105846525 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105846610 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 105846948 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105846954 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105848171 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105848210 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105848256 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105848419 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105848516 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105848619 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105848627 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105848647 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105849682 T C Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.1875 0.75 0.0625 18 14 3 12 1 3 105849842 T C Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.176470588235294 0.764705882352941 0.0588235294117647 19 15 3 13 1 3 105849846 C A Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 105855774 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 105855845 A T Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 105855860 T C Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 105855867 T C Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 105855889 T A Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 105858950 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.583333333333333 0.166666666666667 0.25 16 8 7 2 3 3 105867163 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 105872470 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 105873730 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105873743 A T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105873785 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105881729 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 105890848 A C Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105890927 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105890980 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105891261 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105891383 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105891597 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 105891902 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 105892286 T G Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105892751 C A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 105892956 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105893043 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105893661 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 105893691 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105893845 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105894207 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105894564 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105898380 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 105900834 T A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105901619 T A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 105902349 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105905588 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 105905595 A C N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 105906577 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 105906712 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105906923 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 105907245 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 105908040 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105908097 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105909682 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 105909895 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105910942 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 105912261 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 105912495 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 105912690 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 105913395 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 105915525 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 105916595 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 105916964 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 105917160 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 105917250 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 105917300 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 105918110 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 105918676 C G Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 105918824 C G Y N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 105919732 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 105919928 C T Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 105921073 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 105921946 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 105922233 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 105923229 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 105923630 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 105924039 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 105924350 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 105924623 T G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 105924669 C T Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 105924680 C T Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 105924959 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 105925151 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 105925203 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 105925943 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 106016206 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 106044424 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 106044462 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 106051491 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 106076050 T G Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 106109696 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 106114697 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 106114746 A G Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 106115485 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106115566 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 106115970 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 106116382 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 106116808 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106120108 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106120288 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106120911 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106122675 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 106123453 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 106123782 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 106123785 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 106124012 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 106124543 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106124760 A T Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 106126350 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106126887 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106126902 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106127329 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106127378 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106128125 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 106128592 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106129000 C G Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106129387 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106130160 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106130161 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 106130189 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 106130265 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 106130868 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106130933 A G Y Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 106130965 G A Y Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.153846153846154 0.538461538461538 0.307692307692308 11 15 2 7 4 3 106131135 C G Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 106131155 C T Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 106131215 T C Y Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 106131386 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 106131444 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106131562 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106131611 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 106131649 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106131736 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106131909 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106132097 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106132126 G T Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106132310 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106132314 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 106132759 T G Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106132828 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106132909 T G Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 106132947 G T Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 106132995 T G Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 106133041 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106133189 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106133208 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106133214 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106133251 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106133398 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 106133405 C A Y N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 106134004 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106134044 C T Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0 0.823529411764706 0.176470588235294 14 20 0 14 3 3 106134098 T C Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 16 14 1 14 0 3 106134267 T C Y Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.25 0.75 0 15 9 3 9 0 3 106134356 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.1875 0.75 0.0625 18 14 3 12 1 3 106134433 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106134485 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.15 0.85 0 23 17 3 17 0 3 106134657 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 3 106134676 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.2 0.8 0 24 16 4 16 0 3 106134946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106134974 G T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.15 0.85 0 23 17 3 17 0 3 106137241 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 3 106137394 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106137509 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106138164 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106138321 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 106138322 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 106138421 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106138645 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106138731 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106138756 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106138773 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106138790 C T Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 106140208 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 3 106140376 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.2 0.8 0 24 16 4 16 0 3 106140521 C A Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 3 106140675 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 3 106140708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106143671 T G Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 3 106144144 T G Y N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 3 106144587 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 3 106144601 G A Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 3 106144660 A T Y N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0 1 0 14 14 0 14 0 3 106145538 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 106145593 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 106145631 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106145749 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106145906 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106146163 A G Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 106146243 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106146606 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 106146803 G C Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 106147228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106147237 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106147611 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 106147634 G T Y N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 106147808 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106147832 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106148023 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106148028 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106148146 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106148613 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106148687 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106148839 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106148936 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106149076 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106149587 G A Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 106149729 G T Y N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 3 106149756 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 3 106149872 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 106155676 C A Y N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 106155725 T G Y N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 106157216 G A Y Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 3 106157354 C T Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 106157411 G T Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 106157449 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 106157461 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106157503 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106157595 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 106157654 C T Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 106157668 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 106157816 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106157944 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106158130 A C Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106158163 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106158228 A T Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106158256 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106158290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106158392 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106158724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106159044 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106159576 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106159637 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106159691 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 106159748 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106159753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106159775 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106159855 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106160200 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106160257 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106160510 C A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106160794 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 106160860 A T Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106160873 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106160874 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 106160936 A G Y Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 106161302 G A Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 106161455 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106161705 G A Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 106161764 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 106161774 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 106161965 A T Y N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 106162214 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 106162419 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106162707 C A Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 106162827 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106162903 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106163528 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106163556 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 106163587 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106163770 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 106163785 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106163893 C G Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 106164068 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106164069 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106164132 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106164141 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 106164157 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106164208 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106164649 C A Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 106164997 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106165033 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106165051 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106165443 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106166365 G A Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 3 106166462 A C Y N 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.1 0.9 0 11 9 1 9 0 3 106166611 A G Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 106168471 C A Y N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0 1 0 13 13 0 13 0 3 106168480 T G Y N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0 0.928571428571429 0.0714285714285714 13 15 0 13 1 3 106169395 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106169402 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106169499 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 106170260 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.2 0.8 0 24 16 4 16 0 3 106170392 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106170479 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 3 106170526 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 3 106170776 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106170999 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 106171004 G A N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 3 106171306 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 106171325 G A N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.0833333333333333 0.583333333333333 0.333333333333333 9 15 1 7 4 3 106171369 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106171407 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106171685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106171722 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106177582 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106177750 C T N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.384615384615385 0.307692307692308 0.307692307692308 14 12 5 4 4 3 106177820 G T N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 106178119 A C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 106178778 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106178984 G C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 106179042 C G Y N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 106179057 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106179061 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 106179112 A G Y Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 3 106179134 A C Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 106179177 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106179359 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106179411 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106179481 G T Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106179497 A G Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106179587 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106179706 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106179814 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106179864 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106179942 A C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 106179951 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106179963 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 106180031 T A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 106180032 A T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 106180089 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 106180147 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 106180195 A C Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 106180289 A G Y Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0 0.8 0.2 4 6 0 4 1 3 106180296 T G Y N 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0 0.8 0.2 4 6 0 4 1 3 106180354 A C Y N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 106180414 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 106180535 A C Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 106180588 A T Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 106180613 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106180745 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106180820 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106180971 A C Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106181110 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 106181120 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 106181539 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 106181710 G C Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 106181726 G T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 106181771 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106181871 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106181903 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106181976 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106181995 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106182068 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106182181 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 106182379 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106182410 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106182481 A T Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 106182482 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106182512 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 106182740 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 106182752 T A Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 106182773 C G Y N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 3 106182794 C A Y N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 106182945 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106182967 A C Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 106183087 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106183117 C G Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 106183132 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 106183143 G C Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 106183346 A G Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 106183390 G T Y N 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 6 8 0 6 1 3 106183399 G C Y N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0 0.636363636363636 0.363636363636364 7 15 0 7 4 3 106183421 G A Y Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.153846153846154 0.692307692307692 0.153846153846154 13 13 2 9 2 3 106183502 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 106183570 C A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 106183700 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106183902 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106183965 T C Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 106184170 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106184273 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106184301 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106184370 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106184636 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106184765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106184791 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106184996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106185082 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106185224 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106185285 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106185479 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106185977 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106186324 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106186344 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 106186460 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 106186551 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 106186875 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106186911 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 3 106188964 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 3 106188991 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 3 106189074 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106189417 C G Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 3 106189425 A T Y N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0 0.705882352941177 0.294117647058824 12 22 0 12 5 3 106189434 A G Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 14 18 0 14 2 3 106189730 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106190096 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 3 106190299 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106190399 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106190407 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106190449 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106190490 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106190601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106190640 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106190699 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106190700 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106190826 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106190830 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106190933 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106190998 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106191023 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106191078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106191119 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106191129 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106191234 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106191376 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106191378 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106191478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106191489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106191659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106191724 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106191754 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106191776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106192110 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 106192172 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106192311 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106192361 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 106192491 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106192494 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 106192696 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106192761 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106192811 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106192872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106192899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106192926 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106193023 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106193132 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106193454 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106193472 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 106193590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106193603 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106193659 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106193870 G T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 106193877 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106194010 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106194016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106194129 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106194372 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 106194386 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 106194407 G A N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 106194480 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106194511 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106194533 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106194567 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106194571 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 106194613 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106194629 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106194715 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106194817 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106194836 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106194939 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106194950 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106194990 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106194995 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106195149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106195203 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106195240 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 106195241 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 106195400 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106195406 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106195433 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106195465 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106195533 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106195539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106195560 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106195567 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106195615 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106195626 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106195715 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106195782 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106195809 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106195840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106195849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106195928 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106196033 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106196127 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106196179 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106196183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106196307 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106196312 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106196470 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106196516 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106196745 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106196753 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106196934 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 3 106196968 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 106197170 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106197209 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106197258 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106197447 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106197597 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106197670 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106197714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106197739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106197822 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106197891 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106198111 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106198323 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106198368 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106198418 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106198527 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106198537 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 106198540 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106198577 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106198612 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106198624 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106198679 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 106198698 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 106198738 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106198756 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106198804 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106199032 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 106199078 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 106199155 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 106199384 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106199465 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106199488 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106199496 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106199499 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106199564 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106199764 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106199837 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106199853 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106199870 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106199909 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106199918 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106199982 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106200001 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106200042 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106200069 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106200078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106200148 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106200163 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 106200167 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106200212 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106200224 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106200325 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106200393 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106200420 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 106200421 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 106200444 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106200494 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106200495 A C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 106200581 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 106200589 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 106200696 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106200739 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 106200793 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106200838 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106200930 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106200970 C A Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106200971 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106201058 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106201116 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106201169 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106201196 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106201245 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106201289 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 106201318 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 106201342 C A Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106201365 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106201380 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106201433 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106201443 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106201466 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106201483 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106201545 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106201594 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106201638 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106201657 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106201820 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106201840 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106201847 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106201864 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106201896 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 106201913 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 106201948 A C Y N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 3 106201993 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 106202009 C A Y N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 106202282 C A Y N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 106202314 G A Y Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 3 106202331 A C Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 106202369 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106202425 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106202463 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106202594 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106202772 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106202784 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106202790 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106202864 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106202875 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106203032 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106203060 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106203100 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106203114 C T Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 106203195 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106203215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106203249 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 106203292 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106203384 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106203396 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106203499 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 106203547 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106203680 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106203769 C A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 106203839 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106203857 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106203860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106203874 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106203923 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 106204054 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 106204079 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 106204093 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106204151 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 106204161 C G Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 106204194 G T Y N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 106204294 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 106204295 G C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 106204367 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106204437 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 106204454 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106204484 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106204514 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106204550 G T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 106204741 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 106204834 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106204931 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106204995 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106205015 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106205026 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106205035 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106205091 C T Y Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 106205235 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 106205264 T G Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 106205329 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 106205411 C T Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 106205414 T A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 106205426 A C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 106205491 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106205492 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 106205583 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106205664 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106205669 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106205692 G T Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106205746 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106205761 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106205795 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 106205800 A C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 106205848 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106205885 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 106205889 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 106206082 A T N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 106206229 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106206269 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106206372 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106206422 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106206617 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106206685 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106206696 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106206700 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106206801 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106207095 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106207134 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106207180 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106207211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106207257 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106207292 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106207370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106207425 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106207441 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106207459 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106207498 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106207528 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106207534 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106207592 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106207620 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106207691 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 106207773 A T N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 3 106207812 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 106207862 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 106207979 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 106208010 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 106208042 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106208161 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106208217 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106208235 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106208256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106208261 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106208295 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106208373 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106208403 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106208459 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106208562 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106208570 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106208594 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 106208595 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 106208616 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 106208625 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 106208636 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 106208858 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 106208911 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106208922 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106208936 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106208956 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106208973 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106209016 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106209024 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106209316 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106209331 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106209390 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106209441 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106209453 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 106209540 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106209625 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106209747 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106209757 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106209806 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106210016 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106210036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106210076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106210107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106210167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106210188 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106210196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106210211 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106210228 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106210248 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106210274 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106210302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106210356 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106210384 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106210488 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106210499 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106210522 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106210549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106210566 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106210809 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106210815 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106210821 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106210838 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 106210843 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 106210993 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106211017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106211046 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106211299 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106211315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106211332 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106211342 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106211494 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106211577 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 106211607 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 106211654 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106211679 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106211753 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106211879 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106211932 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106211938 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106211990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106212046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106212120 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106212178 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106212275 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106212302 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106212345 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106212380 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106212442 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106212472 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106212538 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106212574 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106212606 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106212655 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106212681 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106213010 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106213107 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106213152 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106213324 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106213374 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106213427 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 106213620 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106213683 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106213831 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106213890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106214051 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106214131 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 106214132 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 106214147 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106214155 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106214200 G T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 106214254 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 106214374 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 106214389 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 106214517 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 106214748 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106214787 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106214835 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106214863 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106214868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106215095 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 106215129 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 106215234 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106215400 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106215474 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106215625 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106215706 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106215782 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106215836 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106215925 G A Y Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 106215973 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106216066 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106216093 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106216259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106216393 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106216482 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106216530 G C Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106216601 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106216610 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106216822 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106216887 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106217026 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 106217209 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 106217210 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 106217228 C A N N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 8 12 3 2 5 3 106217293 A G Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 106223913 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106223997 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106224002 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106224025 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106224124 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106224141 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106224315 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106224501 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106224526 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106224552 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106224652 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106224653 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106224686 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106224787 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106224824 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106224914 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106224978 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106225222 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106225328 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 106225371 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106225385 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106225401 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106225639 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 106225646 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106225694 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106225704 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106225826 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 106225844 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106225901 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 106226113 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106226301 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106226466 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106226549 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 106226719 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 106226885 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 106227063 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 106227183 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 106227287 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106227336 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106227448 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106227533 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106227764 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106227769 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 106227775 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106227971 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 106228073 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106228125 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106228134 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106228185 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 106228293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106228581 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 106228602 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106228752 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106228753 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106228963 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106229381 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106229520 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106229566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106229635 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106229798 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106229859 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106230063 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 106230436 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 106230480 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106230489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106230495 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106230604 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 106230615 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106230653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106230702 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106230944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106231015 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106231270 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 106231281 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106231365 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106231441 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106231688 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106231806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106231811 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106231867 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106231942 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 106232062 C A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 106232116 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 106232458 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106232484 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106232706 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106232867 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 106232933 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106233260 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106233282 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106233934 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 106233952 G A Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 106234446 A G Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.166666666666667 0.777777777777778 0.0555555555555556 20 16 3 14 1 3 106234787 G A Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 3 106234966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106234975 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106235016 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 106235030 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 106235039 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 106235694 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 106235772 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106235823 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106235883 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106235893 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106235960 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106236058 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106236066 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106236178 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106236323 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106236868 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106236899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106236970 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106237203 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 106237265 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 3 106237403 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 106237803 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106238013 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106238025 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106238247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106238820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106238832 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106238899 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106239015 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106239143 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106239202 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 106239401 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 106239538 G A Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 3 106239835 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 106239848 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106239903 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106239912 A G Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 106239953 A C Y N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 106240107 C T Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.125 0.75 0.125 16 16 2 12 2 3 106240487 A G Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 106240616 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 106240698 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 106240709 T C Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 106240768 C T Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 106240856 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 106240898 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 106241417 C G Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 106241887 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 106241920 G T Y N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 106242172 G C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 106242201 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 106242205 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 106242856 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106242867 T G Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 106242946 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 106242950 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106243207 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106243304 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106243640 G T Y N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 106243717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106243806 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 106243822 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 106243884 C T Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 106243919 G A Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 106244161 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106244317 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106244521 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106244552 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106244571 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106244589 G T Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106244609 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106244634 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106244820 A C Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 106245013 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 106245051 G T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 106245224 T G Y N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 106245360 C A Y N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 106245751 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106245892 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106245954 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106245955 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106246198 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106246481 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 106246508 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 106246528 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 106246557 G A Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 106246596 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106246696 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106246767 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 106246812 G A Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 106246917 C A N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 106247011 G T Y N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 106247091 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 106247221 C T Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 106247334 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106247536 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106247540 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106247994 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 106248144 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 106248164 T G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 106248247 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106248275 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 106248405 A G Y Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 3 106248462 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 106248466 T A Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 106248541 G A Y Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 3 106248601 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 3 106248626 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 106248664 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106248706 C A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 106248808 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 106248820 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 106248935 T A Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 106248995 G T Y N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 106249537 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106249639 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106249648 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 106250242 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106250331 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106250409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106250414 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106250504 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106250727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106250739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106250899 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106250925 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 106251148 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 106251358 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 106251394 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 106251567 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106252263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106252423 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106252656 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106252729 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106252834 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106252880 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106253375 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106253500 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106253624 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106253783 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 106253804 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 106254155 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106254185 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106254255 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106254493 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106254592 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 106254658 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106254678 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106254721 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106254759 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106254806 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106255073 A G N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0 0.6 0.4 6 14 0 6 4 3 106255286 G A N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 106255351 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 106255467 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106255701 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106255736 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106255775 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106255794 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106255866 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 106255984 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 106255990 T G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 106256397 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 106256476 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106256651 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106256674 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 106256757 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106256944 G A Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 106257567 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 106257657 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106257723 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106257752 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 106257839 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106258048 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106258141 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 106258151 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 106258238 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106258314 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106258483 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 106258882 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106259099 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 106259132 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 106259370 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 106259392 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 106259413 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 106259422 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 106259622 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 106259747 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 106259831 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 106259921 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106260242 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 106260294 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106260295 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 106260377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106260696 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106260789 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106260842 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106261292 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 106261582 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 106261720 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106261792 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106261830 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106261844 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106262238 G C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 106262948 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106264161 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 106264229 G T N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 106264292 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106265636 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106265946 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 106265974 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106266136 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106266514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106266599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106266682 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 106266770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106267234 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106267363 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106267770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106267827 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 106268246 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106268268 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106268313 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106268538 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 106268875 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 106268992 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106269401 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106269431 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106269696 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106269908 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 106270138 C T Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 106270237 G A Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 106270275 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 106270285 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 106270492 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 106270988 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106271060 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106271210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106271255 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106271593 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106271639 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106271671 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106271758 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106271772 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106271788 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106271840 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106272222 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 106272230 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106272235 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 106272279 G C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 106272634 T C N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 3 106272636 C T N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 3 106272688 T A N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 106272705 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 3 106272750 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 106272836 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 106272848 G T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 106272890 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 106272909 A C N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 3 106272933 C A N N 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 12 8 4 4 2 3 106273111 G A N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 3 106273199 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 106273516 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106273603 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106273613 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 106273640 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106273671 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106273807 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 106273863 C A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 106274232 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106274296 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 106274332 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106274347 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106274412 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 106274417 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 106274724 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 106274857 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 106275083 T A N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 106275173 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106275239 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106275327 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106275373 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106275411 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 106275497 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106275508 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106275541 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 106275685 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 106275698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106275855 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106275955 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 106276070 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 106276086 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 106276134 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106276218 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106276405 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 106276410 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 106276575 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 106276716 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106276739 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106276846 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106276851 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106276990 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106277144 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106277271 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106277291 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 106277327 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106277452 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 106277900 T C Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 106278655 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 106279655 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 106279710 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106279798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106279839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106279850 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106279882 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106279898 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106279908 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106280151 A C Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.176470588235294 0.764705882352941 0.0588235294117647 19 15 3 13 1 3 106280152 G C N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 106280506 C A Y N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.153846153846154 0.769230769230769 0.0769230769230769 14 12 2 10 1 3 106280534 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106280609 G T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 106280758 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 106280799 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106280819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106280902 T A Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 106280910 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 106281088 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 106281208 T C Y Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 106281269 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 106281366 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106281408 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 106281427 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 106281439 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 106281548 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106281634 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 106281647 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 106281659 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 106281687 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106281704 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106281712 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106281885 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106282064 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106282227 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106282279 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106282748 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 106282959 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106283004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106283573 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106283827 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106284025 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 106284118 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 106284378 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 106284432 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 106284439 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 106284549 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 106284554 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 106284694 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106284911 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106285019 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 106285335 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106285381 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106285648 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106285876 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106285927 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106285945 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106286067 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 106286409 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106286410 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106286495 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106286501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106287330 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106287377 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106287546 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106288429 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 106288462 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106288534 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106288612 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106288614 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106289423 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106289828 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 106289975 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106289985 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106290168 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 106290175 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106290337 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 106290572 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106290603 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106290738 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106290849 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106290870 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106290915 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106291233 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 106291349 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106291505 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106291614 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106292135 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106292211 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106292256 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 106292592 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106293044 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106293080 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106293220 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106293248 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106293388 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106293731 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106293901 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106293910 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106294010 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106294027 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 106294482 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106294869 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106294881 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106295019 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106295164 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 106295169 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106295251 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 106295256 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106295644 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106295673 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106295739 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 106295968 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106296311 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106296323 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106296674 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106298736 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106300126 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106301093 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 106301242 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106302006 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 106302307 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 106303075 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106303311 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106305867 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 106306840 C A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 106306944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106307446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106307506 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106308248 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106309927 C T N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 3 106311790 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 106315216 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106323783 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 106323994 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 106326269 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106326781 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106326789 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 106326881 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106328227 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 106329499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106330933 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106335492 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106335936 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 106336452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106340573 A T N N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 106341172 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 106347670 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106348178 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106348588 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106350555 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106352410 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 106355595 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 106355605 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 106355763 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106359609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106368795 G T Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 106369473 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 106369606 A C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 106371358 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106371692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106376124 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 106381438 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106385573 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106392825 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 106396378 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 106396496 C T Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.153846153846154 22 4 11 0 2 3 106397206 C A Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 106397256 T C Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 106397262 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 106397329 C T Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 106397366 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 106397370 G A Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 106397582 T C Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 106399425 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 106400221 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 106401305 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 106410142 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 106411970 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106411973 A C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106412170 T G Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 106413406 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 106420028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106420569 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106423125 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106425151 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106426081 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 106426503 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106427491 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106427937 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106434355 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106434959 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 106435947 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 106436700 C A Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 106440729 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106441721 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 106442893 A T N N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 3 106442959 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 106451412 C A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 106453766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106455231 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106456349 C T Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 106456352 G A Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 106456374 A C Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 106456389 T A Y N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 106458439 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106460348 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106463035 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106463980 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106464312 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106470146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106472385 C T N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 106475129 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 106475452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106476004 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106476388 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 106480452 T A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106485984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106492611 T G Y N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 106493373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106494008 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106497023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106505228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106506834 G A Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 106509414 G C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 106510503 A G Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106521862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106526355 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 106527442 T A N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 3 106528244 G T N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 106530422 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 106530965 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106531766 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106532068 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 106532351 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 106532392 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 106533137 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106537554 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 106537780 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 106538091 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106538773 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 106541338 T G Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 106541887 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 106542843 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 106542979 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 106543343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106543454 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106543666 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 106543684 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 106543718 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 106543961 A C Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 106543983 C T Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 106544179 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 106544588 T A Y N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 106545739 T G Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 106547350 G T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 106547656 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106548495 T G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106548892 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 106548917 G A Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 106549477 C A Y N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 106549499 T C Y Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 106550612 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106550676 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106551333 A C N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 106551338 T C N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 106551345 T C Y Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 3 106551488 T C Y Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.2 0 0.8 4 16 2 0 8 3 106551505 G A Y Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 3 106551513 T A Y N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 3 106551931 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 106552182 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106552682 C T Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 3 106553534 T C Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 3 106554019 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 106554791 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 106554815 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106555690 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106556410 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 106556502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106558369 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 106559415 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 106559664 G C N N 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.0909090909090909 11 11 1 9 1 3 106559669 G C Y N 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.0909090909090909 11 11 1 9 1 3 106559750 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 106559934 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106563712 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106565792 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106565914 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 106567211 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106567352 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106567621 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 106567885 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106567967 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106568047 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 106568491 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 106568512 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 106569674 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 106569863 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 106569945 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 106570639 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 106570916 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106570999 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106571660 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 106571737 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 106573334 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 106574498 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 106575071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106575107 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106575167 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 106575195 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 106576013 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 3 106576598 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 106576890 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 106577063 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106577130 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 106577562 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 106577578 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106577771 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106577918 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 106578147 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106578306 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 106578351 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106578523 C A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 106578645 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 106579331 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 106579364 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 106579643 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 106580674 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 106581422 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 106581479 T C Y Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 4 24 2 0 12 3 106581717 T A Y N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 106582979 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106583148 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 106583150 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 106583200 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 106583224 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 106583880 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 3 106584046 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 106584204 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 106584570 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106585449 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106585690 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106586350 G A Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 106586657 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 106586706 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 106586956 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106586958 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106587099 T A N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 106587239 A G N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.454545454545455 0.363636363636364 0.181818181818182 14 8 5 4 2 3 106587295 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 3 106587447 C T N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 3 106587567 C T N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 106587828 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 106588167 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 106588848 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 106588978 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 106589107 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 106589263 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 106589413 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106589737 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106590174 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 106590333 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 106590356 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 106590420 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 106590501 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106590520 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 106590529 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 106590734 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 106590786 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 106590976 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 106591078 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 106591080 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 106591296 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 106591298 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106591688 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 106591792 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106591816 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106592730 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106592952 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106594388 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 106594449 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 106594619 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 106594870 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106595220 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106595932 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 106596210 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106596250 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106597418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106597436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106598371 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106598372 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106598522 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106599044 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 106599170 C T N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 3 106599182 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 106599217 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106599370 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106599479 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 106599792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106600087 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106600486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106600592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106600772 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 106601641 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 106601920 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106602065 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 106602328 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106602390 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 106602529 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106602595 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106602676 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 106602776 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 106603062 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 106603233 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 106603426 G A N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 3 106603467 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 106603478 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 3 106603776 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 106603891 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106603914 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 106604038 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 106604164 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 106604522 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 106604800 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 106604853 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106605220 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 106605829 C G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 106606494 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 106606583 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 106606756 G C Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 106607459 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 106607634 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 106609666 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106611318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106613593 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 106613852 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106613880 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 106615382 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106616118 G A Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 106616229 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106618754 T A Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.133333333333333 26 4 13 0 2 3 106620417 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 106620665 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 3 106621232 T A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 106623996 G T N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.153846153846154 22 4 11 0 2 3 106625559 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106625652 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106626199 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 106626242 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 106626322 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106626342 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106626459 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 106626645 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 106626749 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106626775 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 106626836 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 106626840 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 106626879 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 106627090 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 106627254 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106627483 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106627535 A G N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 106627560 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 106627581 T C Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 106627679 T C Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 24 4 12 0 2 3 106628308 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106628409 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106628494 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106628551 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106628971 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106628973 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106628991 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106629182 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106629196 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106629465 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106629644 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106629731 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106629851 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106629944 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106630340 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 106630376 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 106630513 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 106630691 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 106630978 A C N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.133333333333333 26 4 13 0 2 3 106631318 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106631454 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 106632394 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106632533 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106632758 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106633100 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106633128 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 106633393 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106633655 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106633739 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106633940 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106633957 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106633980 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106635345 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106635371 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106635548 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 106635549 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 106635835 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106635924 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 106636299 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 106636304 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 106637183 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 106637268 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 106637270 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 106638325 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106638546 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106638753 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106638819 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106638825 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106638860 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106639020 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106639045 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 106639241 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 106639291 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 106639330 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 106639387 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 106639423 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 106639521 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106639522 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106639598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106639626 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106639759 A G Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 106639946 A G Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 106640007 G A Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 106640432 C G Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 106640439 A C Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 106640543 A T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106640613 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106640799 C A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106641127 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106641161 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 106641248 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 106641256 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106641476 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 106641575 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 106641620 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106641638 C A Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 106641770 T A Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 106641822 A C Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 106641969 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 106641991 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 106642070 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106642129 C A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106642377 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 106642550 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106642588 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106642707 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 106642744 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 106642881 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106642939 A T Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 106643200 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 106643214 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106643215 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106643450 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 106643534 G T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 106643796 A C Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106643806 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106643918 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 106643928 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 106644199 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106644577 T G N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 106644900 G A N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 106645025 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 106645096 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106645462 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 106645690 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106645752 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106645989 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106646533 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 106646929 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 106647087 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 106647156 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106647573 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106648217 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 106648297 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 106648675 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 106648729 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 106648770 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106648844 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 106648875 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106649199 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106649223 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 106649260 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106649597 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 106649744 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 106649777 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 106649787 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 106649799 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 106649874 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 106650119 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 106650190 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 106650430 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 106650447 C A Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 106650751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106650753 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106650773 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106650934 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106651172 G T Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 106651304 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 106651508 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106651545 G T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106651602 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106651809 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106652257 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106652286 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106652336 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106652396 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 106652598 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 106652641 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 106652756 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106652786 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 106652973 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106653103 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106653213 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106653223 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106653498 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 106653500 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 106653595 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 106653634 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106653655 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106653745 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106653815 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106653861 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106653863 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106653919 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106653969 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106654068 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106654187 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106654219 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106654271 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106654289 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 106654360 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106654365 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106654618 T G Y N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 3 106654684 A G Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 106654728 T A Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 106654749 A C Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 106654794 C G Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 106654922 A C Y N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 106655091 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 106655279 T C Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 106655402 G C Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 106655502 G A Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 106655527 T A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 106655644 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 106655645 T A N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 106655693 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 106655921 C G Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 106656142 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 106656211 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 106659822 A C Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 106659900 A C Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 106659903 C T Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 106660045 T A Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 106660351 T A Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 3 106661109 G A Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 3 106661247 A C Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 106661357 A T Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 106661468 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 106661501 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 106661526 A G Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 106661545 G A Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 106661563 G A Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 106661574 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 106661764 G A Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 106661918 G T Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 3 106662082 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 106662244 C A Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 106662298 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106662331 C A Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 106662346 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 106662392 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 106662395 A G Y Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 3 106662558 G C Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 106662621 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106662650 G T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 106662668 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 106662739 T G Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 106662824 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 106663085 G C Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 106663157 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106663160 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 106663206 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106663218 A T Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 106663219 A T Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 106663340 T C Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 3 106663520 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 106664048 A C Y N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 106664063 G T Y N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 106665782 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 3 106665800 A T Y N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 106666091 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 106666095 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 106666285 A G Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 106666306 T C Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 106666410 G A Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 106666477 A T Y N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 106666498 C T Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 106666645 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 106666981 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106667021 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 106667031 A G Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 106667033 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 106667050 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 106667084 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 106667230 C G Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 106667242 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 106667276 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 106667303 A C Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 106667318 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 106667389 G T Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 106667393 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 106667542 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106667672 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 106667699 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 106667734 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 106668126 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 106668160 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 106668162 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 106670412 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 106670535 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 106670579 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106670651 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106670693 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 106670730 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 106670810 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 106670846 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 106670860 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106671026 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106671270 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106671300 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 106671334 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 106671385 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106671424 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106671636 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 106671639 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106671679 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106671689 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 106671736 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106672763 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106672941 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106673215 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106673332 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106673418 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 106673629 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106673645 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106673942 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106673983 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106674152 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106674307 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106674906 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 106675100 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106675124 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106675146 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106675177 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106675201 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106675267 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106675345 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106675608 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106675755 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106675785 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106675944 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106676116 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 106676313 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106676564 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106676782 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 106676911 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 106677153 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106677294 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 106677338 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106677393 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 106677630 C T N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 3 106677900 C T Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 3 106678513 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106678639 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106678828 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106679029 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106682639 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 106684952 A C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 106687262 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106688236 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106690252 A G Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 106691011 T G Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 106695899 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106698406 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106698596 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106698862 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106701272 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 106707053 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106708337 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106708548 A G Y Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.454545454545455 0.454545454545455 0.0909090909090909 15 7 5 5 1 3 106708605 G T N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 3 106709098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106710111 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 106710422 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106710768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106711373 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106711708 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 106712601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106716250 T C Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 106719202 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106720720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106720971 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 106722102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106722401 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106723552 G T Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 106724276 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 106724945 T G Y N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 3 106725662 C A Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 3 106725693 T G N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 24 4 12 0 2 3 106725799 A T Y N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 106725837 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 106732589 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 106733266 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 106734573 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 106734783 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106736136 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 106736388 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106736504 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106738611 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106739611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106740227 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 106744584 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 106745099 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106745130 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 106746852 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 106749406 A C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 106750209 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106750949 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 106752504 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106752558 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106753831 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106754169 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106754372 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 106754554 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106755478 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106755967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106756339 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106756604 A C Y N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 3 106757321 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106758560 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106760714 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106760945 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106763256 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106763609 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106766064 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 106767906 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 106769147 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 106769818 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106770211 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106770652 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 106771160 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 106772462 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106773459 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106774227 A G Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 106774589 A T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 106774636 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 106775644 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 106775709 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 106775965 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 106776081 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 106776101 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 106776204 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 106776292 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106776525 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 106776638 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 106776767 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106777306 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 106777540 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 106777764 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106778104 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106779743 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106779750 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106780007 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106780089 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 106780334 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106780452 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 106780525 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106781212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106781418 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106781459 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106781493 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 106781494 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 106781558 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 106781807 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106782752 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106782893 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106783001 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106783101 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 106783126 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 106785023 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106785341 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106785485 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106785612 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106785652 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106785746 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106785790 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106786055 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106786164 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 106786253 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106786638 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 106786868 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 106787211 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106787581 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106787674 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106787692 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106787697 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106787775 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106788027 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106788056 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106788077 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106788113 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106788189 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106788251 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106788432 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106788469 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106788481 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106788484 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106788584 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106788885 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 106789380 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 106789513 G C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 106789698 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106789953 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106790194 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106790251 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 106790277 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 106790450 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106790645 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106791013 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106791052 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 106791130 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106791290 C G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106791333 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 106791341 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 106791364 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 106791478 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106791531 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106791679 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106791800 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 106791918 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106791957 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106791982 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 106792046 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106792101 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106792378 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 106793255 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 106794313 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106794457 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106795606 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106795800 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 106795804 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106795884 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 106795969 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106796067 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106796130 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106796372 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 106796418 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106796534 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106796567 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 106796641 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 106796845 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 106796902 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 106797066 C G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 106797144 G T N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 106797151 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 106797174 A G N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 14 6 6 2 2 3 106797306 G T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 106797529 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106797574 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 106797625 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 106797626 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 106797657 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106797957 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 106798005 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 106798028 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106798168 G C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 106798272 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106798544 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106798556 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106799023 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106799608 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106799674 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 106800195 T C N Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 9 9 2 5 2 3 106800249 A G N Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 3 106800290 C A N N 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 3 106800529 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106800942 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106801401 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106801817 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106801955 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 106802288 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106803068 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106803106 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 106803258 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 106803528 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106803571 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106803652 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 106804022 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 106804091 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 106804142 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106804231 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 106804266 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106804279 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 106804299 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 106804324 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 106804345 T A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 106804506 A T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 106804562 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 106804645 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 106804866 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106804970 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106805036 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106805076 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106805265 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106805558 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 106805575 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106805970 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 106806003 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 106806530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106806613 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 106807088 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 106807108 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 106807695 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 106807756 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 106807805 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 106807999 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106808039 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 106808368 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 106808383 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 106808583 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106808683 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 106809963 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106810013 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 106810372 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106810685 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106810883 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106810884 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106810968 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106811235 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 106811362 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 106811525 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 106811597 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 106811611 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106811964 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106811995 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106812083 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 106812229 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 106812763 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106812818 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 106812824 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 106812897 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106812998 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106813006 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106813044 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106813101 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106813175 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106813184 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106813190 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106813198 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 106813202 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 106813356 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 106813366 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106813448 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 106813491 A T N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 3 106813520 A G Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 3 106814577 C T Y Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0 0.866666666666667 0.133333333333333 13 17 0 13 2 3 106815972 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106815988 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 106816109 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106816132 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106816139 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106816156 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 106816263 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106816275 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106816457 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 106816517 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 106816518 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 106816685 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 106817535 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 106817719 T G Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 106818137 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 106818311 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 106818495 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 106818518 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106818555 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106818627 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106819464 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106819505 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106819577 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 106819584 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 106819692 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106819735 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 106819833 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106819834 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106819898 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 106820013 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 106820041 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106820179 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106820338 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106820342 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106820464 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106820465 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106820519 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 106820606 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106820720 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 106820837 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106821062 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 106821076 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 106821495 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106821513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106821833 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106821935 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106821942 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106822024 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106822568 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106822752 A C N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.133333333333333 26 4 13 0 2 3 106822795 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 3 106823026 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 106823069 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106823136 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106823146 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106823195 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106823246 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106823328 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106823525 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106823546 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 106823559 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106823594 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106823628 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106823646 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106823683 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106823721 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106823741 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106823878 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106823887 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106823921 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106823997 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106824036 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106824168 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 106824266 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 106824323 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106824639 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 106824726 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 106824736 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106824804 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106824972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106825081 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 106825595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106825668 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106827028 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 106827370 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106827548 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106827881 G C N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 106828013 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 106830331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106831429 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106831503 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106831645 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106832882 C G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106833755 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106833796 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106833797 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106833834 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106834178 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106835035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106835190 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 106835600 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 106835681 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 106835904 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106836020 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106836184 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106836273 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106836357 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106836858 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106837515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106837814 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106838084 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 106838188 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 106838555 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 106838604 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106838835 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106839532 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106841340 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106841523 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106842080 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106842188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106842349 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106842588 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106842605 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106842813 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 106842861 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106842930 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106843148 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106843633 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106843796 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106843855 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106843871 A T Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 106844029 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106844050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106844111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106844132 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 106844237 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106844411 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106844561 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106844736 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106844791 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 106844808 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 106845149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106845731 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 106845791 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106845886 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 106846122 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106846201 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106846235 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 106846410 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 106846784 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106846802 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 106847123 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 106847298 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106847546 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 106847553 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 106847851 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106848110 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 106848378 C A Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 3 106848497 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 106848642 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106848691 A T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 106848833 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 106848837 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106848894 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 106848988 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 106849051 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 106849083 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 106849166 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106849235 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 106849478 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 106849527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106849625 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 106849755 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106849825 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 106849859 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 106849872 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 106849940 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 106849976 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 106849993 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 106850096 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 106850106 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 106850209 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106850426 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 106850688 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 106850691 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 106850863 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 106850865 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 106850880 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 106850989 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 106851213 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106851446 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106851696 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 106851981 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106851987 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106852210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106852441 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 106852452 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 106852686 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 106852878 T A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 106853307 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106853338 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106853347 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106853380 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106853722 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106853723 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106853814 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106854194 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106854323 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106856238 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 106857308 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 106858428 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106859021 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106859424 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 106860357 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 106861259 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106861670 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 106863692 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 106864756 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 106866205 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 106868466 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 106869509 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 106870185 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 106871683 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106873070 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 106873714 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106875134 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 106875278 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 106875466 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 106875477 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 106876360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106877226 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 106877248 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 106877314 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 106877660 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 106877881 A G N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 106877923 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 106878177 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106878269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106878338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106878380 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 106878465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106878469 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106878726 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106878739 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106879104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106879319 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 106879437 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106879526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106879601 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106879690 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 106879724 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 106879862 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 106879894 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 106879960 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 106879973 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106880033 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 106880052 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 106880234 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 106880235 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 106880540 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106880543 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106880755 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 106880782 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106880809 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 106881094 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 106881102 A G Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 106881129 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106881704 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106881856 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106881877 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106881884 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106881903 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106881940 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106882082 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 106882250 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 106882322 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 106882681 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 106882850 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 106882943 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 106883002 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 106883676 C T Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 106883692 C A N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 106883736 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 106883794 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 106883821 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 106883880 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 106884016 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106884039 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 106884159 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 106884168 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 106884187 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 106884277 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 106884301 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 106884314 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 106884461 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 106884476 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 106884592 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 106884594 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 106884613 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 106885002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106885072 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106885073 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 106885086 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 106885203 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106885252 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 106885281 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 106885421 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106885574 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106886025 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 106886250 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 106886393 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 106886520 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106886781 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106886821 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 106886901 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 106887725 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106888115 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106888319 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106888737 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106889098 A G Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.153846153846154 22 4 11 0 2 3 106889287 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 106890352 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 106890514 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 106891563 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 106891669 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 106891957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106892355 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 106892366 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 106892477 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 106892526 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 106892529 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 106892751 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 106893050 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 106894123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106894150 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 106894165 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 106894203 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 106894299 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 106894965 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106894988 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 106895804 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 106897338 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 106897573 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 106900369 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 106906933 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106907862 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 106912983 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 3 106913010 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 3 106916112 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106916975 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 106917950 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 106918351 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106918622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106919096 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 106919101 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 106919383 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106919651 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 106920074 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106920129 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106920423 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 106920587 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 106922140 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106922217 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106922232 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 106922254 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 106922271 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 106922420 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 106922435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106922647 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 106922859 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 106922909 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 106923059 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 106923087 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 106923455 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 106923495 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106923591 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 106923605 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106923878 G C Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 106923900 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 106924378 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 106924443 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106924859 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106924894 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 106924988 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106925005 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 106925011 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 106925091 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106925106 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 106925166 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 106925209 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 106925226 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 106925719 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 106925799 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106925818 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 106925912 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106925949 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106925950 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106926121 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106926168 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 106926360 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 106926635 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 106926648 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 106926791 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 106926923 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 106926997 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 106927030 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 106927317 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 106927318 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 106927391 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 106927472 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 106928238 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 106928786 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 106929001 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 106929002 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106929518 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 106930043 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 106930070 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 106930073 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 106931091 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 106931243 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106931342 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 106932189 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 106932571 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 106932862 A C Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 106933234 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106933461 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 106933467 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 106933879 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 106934014 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 106934255 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 106934351 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 106934387 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 106934486 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 106934546 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 106934701 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 106934803 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 106934869 C A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 106934908 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 106935653 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106935715 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106936026 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106936583 A T N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 3 106936716 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 106937297 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 106937352 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 106937577 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 106937765 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 106938085 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 106938212 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 106938354 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 106938415 G T N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 106938680 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 106938896 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 106938988 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 106938995 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 106939098 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 106939155 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 106939202 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 106939224 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 106939417 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 106939724 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106940223 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106940301 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106940302 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106940329 G A N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 3 106940428 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 106940479 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 106940680 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106940750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106940794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106940832 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106940962 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106940969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106940987 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106940992 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106941069 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 106941132 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 106941295 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 106941418 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 106941434 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 106941460 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 106941761 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106941782 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106941794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106941870 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106941890 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106941938 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106941954 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106942044 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106942422 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106942458 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106942554 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106942809 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106942944 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 106942985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106943087 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106943101 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 106943147 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106943406 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106943448 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 106943554 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106944033 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106944037 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106944203 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 106944204 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 106944395 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106944426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106944791 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 106944809 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 106944867 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 106944947 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 106945185 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 106945315 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 106945693 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 106945933 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 106946880 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106948000 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 106948024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106948026 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106948148 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 106948308 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106948312 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106948531 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106948554 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106948774 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 106949248 T A N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 3 106949816 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106949892 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106949908 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106949911 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106950186 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106950271 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106950339 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106950432 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106950475 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106950547 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106950592 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106950603 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106950625 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106950697 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 106950762 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106950794 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106950925 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106950962 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 106950964 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 106951054 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 106951063 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 106951100 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 106951256 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 106951264 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 106951329 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 106951343 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 106951374 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106951414 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 106951421 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106951500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106951590 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106951648 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106951653 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 106951736 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106951852 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 106951949 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 106952010 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106952248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106952267 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 106952278 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 106952578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106952689 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 106952737 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106952775 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 106952900 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 106952941 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106952944 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106952964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106952982 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 106953023 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 106953031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106953087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106953214 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106953296 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106953361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106953388 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 106953666 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106953775 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 106953783 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 106953786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106953885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106953888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106953934 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 106953953 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106954110 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 106954828 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 106954834 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 106954847 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 106954864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106954866 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 106954962 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 106955021 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 106955023 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 106955075 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 106955076 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 106955266 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106955280 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 106955292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106955369 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 106955424 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106955470 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 106955501 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 106955674 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 106955735 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 106955839 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 106955900 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 106956021 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 106956054 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106956067 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106956129 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 106956185 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106956218 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106956227 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106956237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106956369 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106956511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106956521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106956771 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106956942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106957002 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 106957316 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 106957348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106957494 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106957526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106957689 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 106957718 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 106957876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106957952 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106958019 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 106958171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106958211 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106958216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106958680 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106958722 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 106958948 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 106959039 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106959040 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106959111 G T N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 3 106959160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106959189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106959219 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 106959334 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 106959694 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 106959970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106960107 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 106960194 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 106960204 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 106960238 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106960260 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 106960263 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 106960277 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 106960354 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 106960484 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 106960685 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106960855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106960931 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 106960951 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 106960963 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 106961042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106961078 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 106961189 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 106961208 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 106961270 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 106961430 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 106961456 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 106961458 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 106961519 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 106961528 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 106961602 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 106961656 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 106961679 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 106961837 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 106962434 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106962719 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 106962735 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 106962776 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 106962778 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 106962818 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 106962828 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 106962849 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 106963315 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 106963399 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 106963545 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 106964407 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 106964531 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 106965204 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106965404 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 106965451 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 106965602 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 106966170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106966282 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 106966385 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106966519 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 106966586 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 106966639 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 106966672 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 106966781 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 106966965 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 106967072 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 106967379 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 106967477 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106967600 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 106967634 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 106967710 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 106967740 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 106968012 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 106968133 G T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 106968146 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 106968185 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 106968226 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 106968229 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 106968265 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106968275 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 106968286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106968318 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 106968626 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 106968677 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 106968749 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 106968890 T G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 106968897 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 106968942 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 106969138 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 106969708 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 106969747 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 106969828 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 106970051 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 106970075 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 106970098 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 106970209 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 106970295 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 106970576 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 106970581 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 106970690 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 106970985 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 106970995 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 106971060 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 106971129 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 106971247 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 106971534 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 106971573 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 106971673 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 106971760 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 106972033 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106972044 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 106972740 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 106972773 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106972910 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106972931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106972983 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 106973072 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 106973206 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 106973216 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 106973285 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 106973532 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 106973665 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 106973678 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 106973800 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 106973862 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 106974029 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 106974079 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106974204 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 106974307 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 106974389 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 106974599 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 106974857 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 106974872 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 106974879 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 106974904 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 106974931 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 106974954 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 106975029 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 106975097 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 106975160 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 106975169 C T Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 106975196 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 3 106975267 A T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 106975325 A C N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 106975468 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 106975488 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 106975545 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 106975578 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106975670 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106975747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106975791 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 106975886 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 106975931 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 106976076 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 106976126 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 106976152 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 106976194 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 106976273 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 106976297 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 106976323 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 106976335 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 106976393 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 106976406 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 106976433 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 106976557 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 106976562 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 106976733 A C N N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 3 106976797 G T N N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 3 106976916 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 106976986 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 106977012 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 106977044 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 106977201 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 106977227 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106977245 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 106977445 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 106977501 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106977570 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 106977624 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 106977699 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 106977956 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 106978400 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 106978693 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 106979022 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 106979292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106979347 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 106979791 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 106980058 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 106980073 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 106980171 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 106980415 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106980639 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 106980817 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106980831 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106980902 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 106980991 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 106981013 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 106981353 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106981637 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106981768 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 106981771 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 106982082 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 106982274 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 106982432 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 106982443 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 106983875 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 106983995 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 106984141 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 106984916 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 106985042 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 106985043 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 106986343 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 106986457 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 106986731 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106987287 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 106987317 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 106987318 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 106987429 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 106987432 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 106987481 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 106987486 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 106987513 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 106987585 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 106987747 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 106989288 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 106989387 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106989475 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 106989476 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106989499 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 106989534 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 106989548 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 106989578 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 106989722 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 106989785 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 106989857 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 106989986 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106990223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106990320 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 106990405 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 106990545 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106990555 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 106990736 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106990877 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 106991151 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 106991224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106991567 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 106991707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106991804 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 106991990 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106992502 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 106992560 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106992665 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 106992690 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 106992870 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106992975 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106993027 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106993248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 106993286 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 106993740 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 106994604 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 106995495 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 106995950 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 106999057 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 106999657 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 107000134 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 107000145 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 107000161 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 107000552 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 107000871 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 107001069 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 107001248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107001711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107001941 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 107001958 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 107001977 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 107001996 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 107002075 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 107002092 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 107002282 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 107002301 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 3 107002374 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 107002528 C G Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 107002691 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 107002736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107002773 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 107002827 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 107003143 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 107003159 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 107003293 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 107003296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107003347 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 107003363 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 107003507 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 107003712 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 107003735 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 107003769 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 107003926 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 107003984 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 107004158 A C Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 107004179 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 107004256 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 107004794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107004849 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 107004880 C A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 107005018 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107005538 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 107005614 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 107005752 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107005770 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 3 107005862 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 107005919 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 107005936 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 107005977 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 107005989 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.4 0.1 0.5 18 22 8 2 10 3 107006041 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 107006070 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 107006071 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 107006099 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 107006232 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 107006251 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107006313 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 107006512 A C Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 107006524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107006544 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 107006566 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 107006567 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 107006952 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 107006953 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 107007012 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 107007017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107007024 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 107007028 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 107007099 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107007162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107007249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107007288 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107007289 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 107007337 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 107007347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107007370 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107007377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107007385 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 107007611 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107007613 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107007710 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107007739 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107007740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107007892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107008011 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107008031 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 107008219 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 107008412 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 107008417 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 107008436 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107008673 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 107008786 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 107011158 C G Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 107011653 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107011852 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 107012493 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 107012501 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 107012690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107013003 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107013154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107013425 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 107013502 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107013546 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 107013960 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107014057 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107014511 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 107014926 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107015326 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 107015331 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 107015364 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107015591 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107015839 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107016285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107016312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107016328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107016368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107016393 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107016448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107016479 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107016681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107016690 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 107016801 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107016829 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 107016841 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107017504 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107017569 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107018328 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 107018659 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 107018775 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107019294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107019709 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 107019890 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 107020349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107020409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107020442 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 107020528 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 107020738 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107021017 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 107021232 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 107021233 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107021347 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 107021409 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 107021480 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 107021524 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 107021576 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 107021844 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107022002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107022192 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 107022315 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107022427 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 107022794 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 107023135 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 107023655 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 107023656 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 107023677 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 107023833 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 107024048 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 107024226 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 107024736 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 107024793 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 107024916 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107025291 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107027722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107027883 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 107027885 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 107028211 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107028404 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107028593 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107028604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107028877 T A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 107028915 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 3 107028947 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 107028969 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 107029034 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 107029115 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 107029640 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 107029904 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 107030009 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 107030057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107030148 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107030257 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107030266 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 107030306 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 107030468 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107030519 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107030521 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107030564 G C N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0 0.583333333333333 0.416666666666667 7 17 0 7 5 3 107032190 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 107032311 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 107032421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107032971 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 107033005 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 107033019 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 107033361 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107033386 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107033391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107033666 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107033675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107033816 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 107033817 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 107033887 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107034148 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 107034342 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107034441 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107034521 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107034574 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107034624 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107034723 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107034772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107034813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107034939 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107035025 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107035065 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107035088 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 107035104 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107035124 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 107035176 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107035183 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107035195 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107035329 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107035357 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107035385 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107035401 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107035414 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 107035418 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 107035450 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 107035525 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107035529 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107035553 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107035669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107035816 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107035982 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107036020 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107036110 G A N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 3 107036265 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 107036281 G T N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 3 107036376 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107036494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107036621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107036696 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 107036765 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 107036772 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 107036910 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 107036967 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107037198 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107037207 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107037223 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 107037781 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 107038089 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107038791 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 107038839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107038938 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 107039058 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 107039190 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 107039236 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 107039306 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 107039335 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 107039343 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 107039423 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 107039684 T G N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.0769230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 9 17 1 7 5 3 107039742 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 107039750 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107039899 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107040039 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 107040081 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 107040176 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 107040196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107040202 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 107040250 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107040436 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107040444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107040472 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 107040732 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 107040735 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107040900 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107040949 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 107041138 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 107041564 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107041587 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 107041641 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 107041707 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 107041902 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107041997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107042056 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 107042130 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107042173 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107042191 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107042372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107042868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107042980 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107043158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107043259 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107043490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107043728 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107043853 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 107043924 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107043964 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107044030 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 107044090 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 107044181 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 107044187 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107044226 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107044413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107044495 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 107044497 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107044506 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107044529 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107044531 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107044546 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107044747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107044765 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 107044893 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107045325 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107045979 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 3 107046033 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 3 107046249 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107046479 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 107046568 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 107046633 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 107046792 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 3 107047200 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 107047717 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107047767 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 107048373 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 107049549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107049924 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 107049970 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 107050030 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 107050303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107050958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107051171 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 107051693 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 107052561 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 107052562 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 107052612 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 107052724 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 107052726 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 107052767 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 107052810 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107052976 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107053391 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107053739 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107053948 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 107053961 T G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 107054077 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 107054206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107054235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107054299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107054383 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 107054541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107054558 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107054588 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 107054605 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 107054627 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107054718 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 107054737 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 107054782 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 107054801 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 107054851 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 107054872 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 107054892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107054926 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 107054952 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 107054967 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 107054970 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 107055012 A C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 107055026 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 107055145 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107055233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107055250 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 107055287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107055291 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 107055583 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107055648 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 107055688 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 107055698 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 107055724 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 107055833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107055877 A T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 107055883 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 107055894 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 107056001 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 107056061 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 107056126 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 107056177 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107056187 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 107056354 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 107056981 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 107056982 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 107057375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107057393 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 107057407 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107057415 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 107057439 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 107057691 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 107058028 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 107058108 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 107058147 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 107058148 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107058247 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107058406 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 107058470 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 107059264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107059784 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 107060155 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 107060194 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 107060226 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 107060227 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 107060242 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 107060311 G T N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 107060319 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 107060330 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 107060332 G A N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 107060552 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 107060582 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 107060649 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107060688 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 107060695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107060709 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 107060865 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107061425 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 107061914 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 107062114 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 107062137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107062411 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107062466 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 107062575 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 107062731 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107062795 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107062945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107062950 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 107062974 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 107063075 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107063101 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107063118 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107063139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107063141 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107063186 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107063327 A T Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 107063573 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 107063672 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 107063972 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 107064215 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 107064506 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107065763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107066618 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 107066992 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107067617 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 107070304 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 107070484 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 107070584 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 107070842 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 107071093 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 107071121 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 107072817 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 107073047 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 107074059 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 107074286 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 107075206 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 107075304 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 107075357 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 107076243 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 12 6 3 6 0 3 107076244 T G Y N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 3 107077049 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 107077141 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 107077902 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 107078418 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 107078451 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 107078461 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 107078550 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 107078596 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 107078625 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 107078867 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 107078924 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 107078933 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 107079000 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 107079093 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 107079105 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 107079155 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 107079172 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 107079204 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 107079266 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 107079275 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 107079414 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 107079545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107079914 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 107080079 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 107080164 G T N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 3 107080190 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 107080270 A C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 107080317 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 107080424 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 107080469 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 107080483 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 107080539 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 107080979 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 107081216 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 107081346 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107081500 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 107083259 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 107083516 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 107084090 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 107084133 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 107084246 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 107084741 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 107084843 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 107085035 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 107085089 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 107085598 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 107085932 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 107085952 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 107086506 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 107086623 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 107086926 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 107086978 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 107087480 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 107087663 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 107088221 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 107088874 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 107089148 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107089181 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 107093610 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 107100266 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 107100298 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 107101521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107102351 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107103789 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107106210 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 107106215 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 107107195 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 107107874 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 107109962 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 107113011 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 107114224 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 107114689 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 107116600 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107117423 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 107117899 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107118766 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 107121573 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 107122058 T G Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 107123121 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 107123358 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107123525 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 107123528 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 107124270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107124350 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107124355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107124470 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107124571 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 107126683 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107130104 A T N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 107130426 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107137831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107137990 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 107138761 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 107140806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107141559 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 107141870 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 107142179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107145110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107145498 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 107146084 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 107146134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107146717 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 107146902 C A N N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 107147147 C G Y N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 107147315 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107147323 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107147492 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 107147663 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 107147693 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 107149677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107149806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107150523 C G Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 107150678 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 107152540 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107156035 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 107156094 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 107156177 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 107156727 G T Y N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 8 8 2 4 2 3 107156930 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 107157574 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107157625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107158198 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 107158259 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 107160023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107160112 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 107160175 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 107161408 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107163164 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 107163482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107163676 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 107163711 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 107163889 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107164397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107165727 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107166508 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107167200 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107168885 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 107169381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107169745 G C Y N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 3 107169781 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 107169905 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107171439 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107172496 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 107173011 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107173811 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 107174265 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 107174295 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 107174495 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107175987 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107177252 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 107178359 T G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 107183177 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 107185428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107185512 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107186304 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 107187480 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 107187936 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 107188516 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 107188517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107190545 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 107191015 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 107191062 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 107191070 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 107191128 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 107191174 A T Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 107191195 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 107191356 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 107191384 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 107191389 A G Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 107191614 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 107191917 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107192041 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107192049 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107192087 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 107192134 T G Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 107192235 A C Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 107192246 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 107192247 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 107192289 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 107192292 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 107192587 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 107192592 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 107192645 A G Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 107192655 C A Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 107192662 A G Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 107192671 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 107192692 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 107192702 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 107192725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107192814 G C Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 107192843 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107192848 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 107193027 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107193160 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 107193439 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 107193629 T C Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 107193812 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 107194277 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107194285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107194373 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107194388 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 107194608 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 107194802 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 107194844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107194913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107194930 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107194954 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107194974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107195011 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107195022 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107195263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107195509 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 107195542 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107196099 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 107196128 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107196141 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107196534 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 107196703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107197077 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 107197190 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 107197284 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 107197353 T C Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 107197382 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 107197919 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 107201915 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 3 107202080 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 107202107 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 107202716 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107202984 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 107204432 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107204690 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.157894736842105 0.736842105263158 0.105263157894737 20 18 3 14 2 3 107204705 T A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.176470588235294 0.705882352941177 0.117647058823529 18 16 3 12 2 3 107204878 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 107204919 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 107205088 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 107205192 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 3 107205941 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 107206358 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 107206847 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107207254 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 107207953 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 107209107 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 107209339 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 107210007 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 107210372 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 107211264 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 107211874 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 107212303 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 107214236 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 107214400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107214651 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 107215015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107215286 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 107216182 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 107217592 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 107218452 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 107220941 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 107222078 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 107222139 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 107222216 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107222944 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 107223627 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 107224073 C A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 107224272 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 107225582 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 107226654 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 107229568 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107235399 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 107236761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107239171 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107240077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107241626 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 107242929 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 107243242 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 107243690 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 107243845 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 107243978 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 107244146 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 107244302 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 107244303 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 107244474 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 107244557 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107244998 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 107245020 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107245397 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107246425 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 107247230 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 107247612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107248106 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 107248124 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 107248490 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 107248535 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 107249023 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 107249075 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 107249307 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 107249312 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107249372 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 107249578 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 107250058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107250151 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 107250156 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 107250194 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 107250197 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 107250328 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 107252068 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 107252119 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 107252443 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 107252494 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 107253031 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 107253099 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 107253185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107253222 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 107253307 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 107253342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107253388 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 107253808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107253840 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 107253938 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107254126 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 107254182 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 107254186 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 107254353 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 107254585 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 107254599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107254630 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 107254887 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107255001 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107255014 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 107255042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107255094 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 107255177 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107255199 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107255210 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 107255349 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 107255667 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 107255696 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 107256459 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 107256492 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 107256557 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 107257456 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 107257779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107258027 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 107258070 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 107258865 A T Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 107259275 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 107260601 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 107260618 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 107264309 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 107264447 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 107265124 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 107266801 G C Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 107266856 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.222222222222222 0.722222222222222 0.0555555555555556 21 15 4 13 1 3 107267131 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107267271 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 107267437 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107267549 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107267598 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107267761 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 107267767 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107267921 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107268143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107268185 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 107268351 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 107268366 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 107268690 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 107268738 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 107268806 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 107269000 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107270340 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 107270422 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107271160 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 107271380 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 107271534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107271799 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 107271811 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107273295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107273483 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 107273619 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107274652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107274719 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 107274847 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 107274851 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 107275047 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107275384 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 107275558 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 107275838 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 107276169 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 107276277 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 107276338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107276645 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 107276667 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 107278268 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 107278392 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 107278534 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 107278547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107278731 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 107278801 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 107278802 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 107278840 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 107278902 A C Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 107278919 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 107278974 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 107279131 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 107279262 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 107279346 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 107279572 T C Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 107279640 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 107279856 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 107279947 C A Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 107279948 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 107280625 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107280749 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 107283709 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 107283765 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 107283780 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 107283782 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 107283988 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 107284135 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 107285013 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 107285246 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 107285770 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 107285821 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 3 107285849 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 107286128 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 107287533 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 107288080 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107288155 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 107288161 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 107288278 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 107288337 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 107288366 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 107288904 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 107289078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107289283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107289416 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 107289898 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 107290447 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 107290581 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 107290751 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 107290766 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 107290785 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 107291020 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 107291157 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 107291170 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 107291204 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 107291295 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 107291357 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 107291411 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 107291414 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 107291532 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 107291554 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 107291885 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 107291995 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 107292319 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107292410 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107292677 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 107292693 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 107292925 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 107293027 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 107293067 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 107293115 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 107293156 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 107293170 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 107293361 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107293522 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 107293548 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 107293660 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 107293741 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 107293989 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 107294051 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 107294874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107294961 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 107295915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107297327 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 107297471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107297866 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107299115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107299286 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107300056 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 107300757 A C Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 107300851 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107301121 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 107301190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107303758 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 107303949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107304115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107304460 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 107305169 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107305611 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 107305846 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107305967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107306012 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 107306159 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107306185 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 107306191 A C Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 107306269 T G Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 107306358 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107306426 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107306427 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 107306612 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107307083 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107307162 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107307204 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107307234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107307251 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 107307381 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 107308042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107309202 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107309822 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107309951 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107309983 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 107310244 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 107310459 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107310936 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 107310990 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 107311427 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107311590 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107311744 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107311783 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107311973 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 107312007 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 107312102 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107312373 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107312388 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107312402 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107312524 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 107312580 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 107312767 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107312785 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107312789 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107312994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107313072 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107313224 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107314074 C T N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.230769230769231 0.615384615384615 0.153846153846154 14 12 3 8 2 3 107314683 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107315249 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107315383 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107315558 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 107315575 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107315578 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107315623 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107316361 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107316418 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 107316421 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 107316739 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 107317027 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107317182 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107317300 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107317324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107317433 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107317496 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 3 107317514 G C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 3 107317557 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 3 107317569 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 3 107317637 G A Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 107317858 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 107317977 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107318065 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107319923 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107321039 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107321802 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107322096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107322435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107322571 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107322792 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107325024 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 107325333 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 107325956 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107326585 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 107327844 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 107328303 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107328899 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 107328994 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 107331672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107332571 C A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 107333198 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107335141 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107335208 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107338644 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 107340448 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107341484 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 107341837 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 107342892 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 107343050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107345212 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 107346390 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 107346549 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 107346611 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 107347398 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107348060 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107348495 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 107349068 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 107350258 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 107350384 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107350531 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 107350602 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 107350744 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 107350751 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 107350897 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107350918 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 107350921 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 107351830 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 107351935 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 107352029 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 107352052 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 107352317 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 107352322 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 107352521 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 107352801 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107353091 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 107353290 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 107353512 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 107354350 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 107355256 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107355275 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107355462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107355755 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107355815 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107355994 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 107355997 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 107356016 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 107356025 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 107356040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107356049 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107356079 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 107356114 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107356256 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 107356284 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107356331 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 107356457 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 107356537 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107356548 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107356685 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107356692 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107356702 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107357013 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107357285 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107357288 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107357501 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 107357816 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107358248 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107358273 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107358307 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107358333 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107358341 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107358398 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 107358418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107358452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107359690 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 107359723 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107359771 C A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 107362708 G T Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 107363191 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107363433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107363771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107363904 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 107364235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107365641 C A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 107365664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107366088 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107366410 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107366567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107366926 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 107367451 G T Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 107367645 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107369343 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107369448 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 107369624 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107371980 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107373355 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107376504 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 107378018 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107379352 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 107379587 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 107380344 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 107380778 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107382194 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107383919 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107384293 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107385180 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 107386241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107386331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107387448 C A N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 3 107387999 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107388506 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 107389947 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 107390929 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 107390943 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 107391757 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 107392314 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 107393484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107394529 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107394901 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 107394927 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 3 107397323 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 107399224 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 107400466 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 107400868 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107400931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107402111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107402117 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 107404675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107405300 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 107406261 C G Y N 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 6 8 0 6 1 3 107406263 C A Y N 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 3 107406909 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 107408462 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 107409090 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 107410410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107410461 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 107411598 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 107414586 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 107415254 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 107415258 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 107415310 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 107417068 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107419640 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107419846 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107420013 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107422815 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 107425388 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 107425966 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107429329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107436198 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 107438886 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 107439288 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 107439784 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 107444336 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107444815 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 107446413 T A Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 107447326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107447690 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107448024 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 107448653 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107448752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107448773 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107450548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107451979 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 107452205 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 107452832 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 107453375 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 107453387 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 107453572 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 107454119 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 107456323 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 107456763 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107456785 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107457431 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 107458531 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 107461669 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 107462249 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 107463596 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 107463754 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 107464289 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 107465269 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107466055 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107467058 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 107468531 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 107471297 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 107471774 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 107472365 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107473533 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 107476804 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 107476870 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 107481128 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 107481204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107482702 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 107485124 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 107486481 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 107486650 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 107487467 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 107487607 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 107487861 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107489044 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107489432 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 107490205 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 107490715 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107492049 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107494385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107494961 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 107494994 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107496280 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 107499558 C G N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 107499659 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 107505983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107506114 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 107506177 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 107508219 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107510534 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107513913 T G Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 107515263 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107516922 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107518273 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 107519559 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 107520108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107520669 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 107520983 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 107521422 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107521776 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107521871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107522396 T C Y Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0833333333333333 0.666666666666667 0.25 10 14 1 8 3 3 107522881 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 107523289 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 107525009 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 107525358 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 107525981 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 107526060 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 107526816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107527519 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 107528299 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 107529387 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107529553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107529554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107529761 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107530883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107531075 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 107531143 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 107531927 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107531960 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 107533123 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 107533145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107533183 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 107534034 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 107536522 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 107536731 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 107536732 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 107537627 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107539159 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 107540368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107542908 C A Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 107543083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107556054 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 107558797 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 107560234 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107560482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107563414 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 107564589 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 107567138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107572583 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107577255 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 107580310 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 107581183 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 107581336 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 107583340 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 107583926 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107585781 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 107585802 A C Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 107586641 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 107586846 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 107587510 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 107587516 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 107587643 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 107587694 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 107587886 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 107588022 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107588235 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 107588636 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 107589087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107589257 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107589344 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 107589541 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 107590033 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 107590050 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107590211 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 107590567 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 107591907 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 107592829 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 107593710 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 107593811 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 107594230 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 107594568 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107598099 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 107598181 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 107598798 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 107598809 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 107599086 A T Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 107599110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107600046 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 107600455 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 107600514 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 107600848 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 107601091 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 107601264 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 107601478 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 107601492 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107601498 G A Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 107601907 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 107601934 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 107602600 G C Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 107604004 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 107604147 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 107607796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107610562 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107610769 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 107611419 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 107612371 C G Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 107613783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107614763 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 107614787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107615766 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 107620328 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 107625217 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 107625436 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 107625501 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 107625657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107627254 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 107627853 C T N Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 8 6 3 2 2 3 107628407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107628626 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107630088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107630798 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 107633333 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 107634798 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 107634858 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 107635044 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107635426 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 107636043 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 107636044 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 107636318 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 107636374 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 107636425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107636461 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 107636507 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107636527 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107636622 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107637000 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 107637142 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107637258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107637804 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 107637968 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 107638146 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 107638338 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 107638357 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 107638794 T A Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 107639060 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 107639232 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 107639273 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 107640700 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107641465 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 107641679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107642200 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107644378 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 107644379 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 107644738 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 107644766 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 107644793 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 107644916 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 107644964 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 107645553 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 107645562 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 107646059 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107646214 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 107646351 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107646577 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 107646866 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 107647941 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 107648007 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 107648186 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 107648211 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 107648306 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 107648357 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 107648358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107648422 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 107648474 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107648522 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 107648623 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 107648652 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 107648693 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107648701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107649010 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107649018 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107649038 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 107649094 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 107649165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107649221 A T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 107650160 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 107650258 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 107651064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107651144 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 107651299 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 107651434 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 107651903 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 107651984 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 107652164 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 107652339 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 107652340 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 107653629 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 107653954 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 107656178 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 107656230 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 107656242 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 107656243 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 107656295 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 107657829 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 107658817 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 107659124 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107659253 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 107659299 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 107659633 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 107659688 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107659769 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107660042 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 107660185 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107660659 G A Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 107660809 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107661077 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107661408 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 107662645 G C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107662684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107662866 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 107662926 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107664195 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107664910 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 107666400 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107666964 C G Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 107668507 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 107669357 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 107669602 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 107670709 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107670738 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 107670971 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 107671476 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 107671919 C G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107672091 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 107672299 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.214285714285714 0.142857142857143 0.642857142857143 8 20 3 2 9 3 107672724 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 107674032 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 107675352 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 107675359 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 107675551 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107676278 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 107679897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107680822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107680974 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 107681065 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 107681426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107681484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107682021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107682697 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107682769 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 107682895 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107683267 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107683299 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107683321 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107683529 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107683550 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 107683620 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107683717 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 107683849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107683892 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 107684229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107684897 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107684992 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107685025 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107685161 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107685232 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107685455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107685494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107685670 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107685884 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107686110 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 107686658 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107688461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107688750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107689052 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 107689130 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107689195 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107691068 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107692482 C T Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 107693683 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 107694096 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107694122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107694170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107694720 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 107694775 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 107694858 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107694926 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107695438 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107695806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107696751 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 107696943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107696994 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 107697440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107698252 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 107698374 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 107698607 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 107698771 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 107699007 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107699073 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 107699376 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107699385 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107699781 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107700144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107701122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107701303 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107701577 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 107702731 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107703011 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107703093 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107703246 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107703397 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 107703638 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 107703640 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 107703791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107703826 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 107703864 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 107703921 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 107704100 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107704242 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 107704254 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107704462 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107704465 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107704493 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 107704534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107704612 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 107704763 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 107704788 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107704861 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107705353 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 107705440 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107705737 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 107706045 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 107706187 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 107706259 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 107706380 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 107706389 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 107706444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107706475 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 107706476 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 107706715 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 107706885 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 107706977 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 107707070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107707189 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107707201 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 107707615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107707637 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 107708029 T C Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 107708052 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107708062 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107708148 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 107708152 A C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 107708309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107708417 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 107708711 A T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 107708942 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 107709008 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107709080 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 107709163 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107709179 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107709245 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107709254 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107709271 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107709323 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 107709354 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107709401 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107709407 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107709475 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 107709480 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107709792 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107709797 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 107709875 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107710386 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 107710400 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 107710495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107710564 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 107710847 G T Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 107710864 T C Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 107710878 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107710921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107710968 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 107711095 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 107711134 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 107711141 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107711153 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 107711188 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 107711277 T C Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 107711291 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 107711460 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 107711466 T A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 107711551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107711580 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107711598 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 107711627 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 107711695 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107711708 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 107711712 C A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 107711723 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 107711725 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107711758 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 107711763 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 107711817 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107711926 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 107712234 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 107712249 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 107712349 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 3 107712463 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 107712464 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 107712485 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 107712497 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 107712502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107712652 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 107712780 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107713539 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 107713705 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107714657 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107714723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107715305 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107716333 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 107717335 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 107717336 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 107717964 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107718170 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 107719282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107719354 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107719515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107719517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107719608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107719796 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 107719853 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.235294117647059 0.117647058823529 0.647058823529412 10 24 4 2 11 3 107719958 G A Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 107719967 G A N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 3 107720018 C A Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 3 107720046 A T Y N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 3 107720109 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 107720115 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 107720126 G T Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 3 107720128 A T Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 3 107720179 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 107720472 T G Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 107720582 T C Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 107720682 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 107720785 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 107721196 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107721369 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 107721393 G C Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 3 107721415 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 107721474 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 107721670 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 107721770 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 107721932 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107721963 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107722022 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107722063 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107722175 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107722242 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 107722301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107722314 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107722888 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 107722940 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 3 107723019 G A N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.363636363636364 0.454545454545455 0.181818181818182 13 9 4 5 2 3 107723162 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 107723178 G A Y Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 3 107723327 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 107723762 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107723980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107724209 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107724310 C G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 107724335 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107724392 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107724440 A T Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 107724601 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 107724678 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107724717 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 107724903 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 107725552 C T Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 107725573 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 107725575 T C Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 107725729 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 107725891 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 107726371 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 107726840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107726903 G T Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 107726951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107727034 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107727294 C G Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 107727535 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 107727579 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107727628 T C Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 107727750 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 107727770 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 107728035 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 107728599 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107728623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107728681 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107728686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107729193 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107729326 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 107729433 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107729479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107729681 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 107729790 A C Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 107730353 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 107730371 G T Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 107730386 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.166666666666667 0.722222222222222 0.111111111111111 19 17 3 13 2 3 107730490 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 107730501 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 107730921 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 107730964 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107730993 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 107735356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107736622 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 107736653 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 107736840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107740515 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 107741635 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 107747472 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 107749336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107751794 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 107751922 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107751934 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107754077 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 107754401 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107754494 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 107755530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107755823 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 107757794 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107757979 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107758819 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 107761085 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 107764472 T G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 107765100 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 107767222 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107768682 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 107768787 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 107768828 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107769031 G T Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 107769071 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 107769465 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 107770213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107771191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107771217 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107771241 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107771288 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107771309 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107771318 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107771483 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107771509 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107771539 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107771774 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107771818 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107772008 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 107772015 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 107772061 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 107772066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107772109 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 107772237 C G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 107772258 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 107772531 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 107775136 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 107775261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107776382 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107778109 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 107778495 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 107778923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107779230 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 107779660 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 107779751 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 107779872 A C Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 107779895 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 107780625 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 107780646 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107780778 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107780782 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107780789 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 107780823 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 107780883 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 107781618 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 107781632 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 107781715 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107781735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107781853 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 107781918 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107781928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107781955 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 107781976 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107782697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107782714 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107782742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107782976 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 107783137 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 107783145 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 107783306 T C Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 107783341 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 107783469 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 107783641 A G Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 107783725 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 107783994 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 107783995 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 107784048 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 107784094 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 107784111 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 107784208 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 107784238 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107784439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107784574 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 107784715 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107785610 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 107787004 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 107787008 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 107787038 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 107787039 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 107787643 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 107788662 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 107789113 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 107789142 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 107789145 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 107789471 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 107789703 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 107796578 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 107796726 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 107796899 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 107796954 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 107797030 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 107797069 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 107797352 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 107797522 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 107798125 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 107798146 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 107798218 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 107798411 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 107798563 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 107798578 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 107798797 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 107799146 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 107799169 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 107799259 C A Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 107799338 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 107799347 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 107799640 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 107799825 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 107800295 C T Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 3 107800442 T G Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 107800466 T A Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 107800784 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 107800858 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 107800873 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 107800906 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 107800933 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 107801031 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 107801186 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 107801271 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 107801621 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 107801783 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 107802008 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 107802191 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 107802212 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 107802364 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 107802385 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 107802575 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 107803218 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 107803226 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 107804136 G T N N 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 12 8 3 6 1 3 107804336 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 14 10 4 6 2 3 107804657 C T N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 107805885 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 107805931 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 107806125 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 107806337 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107806382 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 107806443 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 107806642 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 107806653 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 107806865 C T N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.166666666666667 0.583333333333333 0.25 11 13 2 7 3 3 107806941 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 107807101 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 107807222 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 107807466 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 107807590 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 107807964 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 107807967 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 107808212 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 107808281 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 107808306 G C Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 107808690 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 107808890 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 107808921 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 107809112 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 107809130 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 107809147 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 107809152 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 107809176 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 107809206 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 107809248 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 107809271 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 107809435 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 107809529 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 107809659 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 107809955 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 107810571 A G Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 3 107810690 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 107811014 A G N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 10 10 3 4 3 3 107811543 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 107811739 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 107811953 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 107813115 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 107813118 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 107815092 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 107815201 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 107817965 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 107818097 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 107821846 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 107822247 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 107822252 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 107822430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107822848 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 107825466 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 107825485 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 107825687 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 107825692 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 107825711 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 107826123 T C N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 107826350 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 107826386 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 107826615 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 107826749 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 107826928 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 107827615 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 107827706 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 107828110 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 107828214 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 107828215 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 107828239 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 107828271 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 107828299 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 107828306 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 107828578 T G Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 107828674 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 107828798 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 107828803 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 107828817 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 107828822 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 107829251 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 107829292 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 107829298 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 107829457 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 107829900 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 107829965 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 107830038 A G N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 3 107830258 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 107830315 G T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 107830326 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 107830337 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 107830360 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 107830817 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 107830825 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 107830828 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 107830869 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 107830944 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 107830971 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 107831065 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 107831073 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107831159 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 107831163 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 107831407 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 107831454 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 107831585 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 107831771 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 107832136 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 107832253 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 107834682 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 107835859 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 107835946 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 107836118 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 107836435 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 107836628 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 107837505 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 107838720 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 107840065 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 107840424 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 107840850 A G Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 107841250 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 107842794 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107843371 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107844242 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107845757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107847850 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107848571 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 107848691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107848695 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 107848709 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 107848796 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 107848994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107849018 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107849075 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107849085 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 107849372 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107849484 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 107849505 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107849660 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107849675 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107849676 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107849710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107849867 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 107850863 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 107851562 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107853358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107855287 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107855644 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 107855763 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 107857009 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 107858741 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107859584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107859870 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107860026 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107860037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107860145 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107860181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107860194 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107860406 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107860552 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107860878 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107860962 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107861047 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 107861171 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107861685 T A Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 107861927 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 107861935 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 107862789 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 107862884 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107862891 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 107863242 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 107863592 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 3 107864359 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 107864447 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107864587 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107864596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107864918 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 107864963 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107865063 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 107865076 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107865100 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107865152 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 107865463 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 107866253 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 107866363 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 107866649 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 107866679 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 107866883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107867957 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107868446 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 107868567 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 107869185 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 107869347 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 107869464 C G Y N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 107872025 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107873093 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107874995 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107875405 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107875996 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 107876945 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107877145 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 107877146 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 107882668 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 107882862 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107885318 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 107885466 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 107885501 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 107885960 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 107886176 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107886911 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 107888484 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107888724 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107888939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107889517 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107890478 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 107891146 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 107892001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107893024 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 107893266 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107893484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107893666 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 107893825 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 107893872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107893980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107893991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107894207 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 107894212 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 107894237 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107894326 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107894992 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 107895739 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107896084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107898154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107899900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107900020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107901445 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 107901513 A C Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 107901514 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 107901529 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 107903948 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 107904005 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 107905491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107907944 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107908012 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107908128 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 107908599 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 107908619 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 107908682 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 107908746 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 107909370 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 107909521 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 107909569 T A Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 107909629 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 107909726 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 107909816 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107909973 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 107910176 A C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 107910381 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 107910706 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 107911321 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107911729 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 107912716 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 107914174 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107917525 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107921269 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107925513 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107927407 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 107927622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107928200 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107928676 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107931187 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107931763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107931904 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 107937209 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.105263157894737 0.842105263157895 0.0526315789473684 20 18 2 16 1 3 107937377 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107938337 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 107938782 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107939740 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 107946387 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 107946826 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 107949326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107949645 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107949910 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107950013 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107950314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107950979 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107951336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107952495 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107952514 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107956017 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 107956971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107957709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107958564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107958783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107959356 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107959849 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 107960101 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 107960940 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 107961035 A G N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 107961229 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 107961293 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 107961350 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107961874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107962121 G C Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 107962256 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 107962345 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 107962502 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 107963589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107963610 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107963619 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 107963863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107964113 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 107964259 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107964338 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107964955 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 107965103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107966375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107966468 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107967976 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107968191 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 107968347 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107969804 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 107969962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107971598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107972022 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 107972641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107972815 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107974017 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107974345 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 107975510 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107975803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107978180 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 107978848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107979831 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 107981022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107982191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107982257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107984382 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107984643 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107985326 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107991714 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 107992204 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107992982 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 107993868 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 107994121 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 18 14 4 10 2 3 107994139 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 107994362 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 107997415 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 107998658 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 107998731 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 107999135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 107999958 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108001625 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108001779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108003258 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108008907 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108009002 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 108011347 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108011901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108020417 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108021069 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108023283 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108023781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108027498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108027997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108029562 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 108029563 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 108030791 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108032342 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108033112 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108033596 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108038516 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 108042580 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108058718 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 108058733 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108059997 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 108060801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108062565 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108064154 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108066086 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108068635 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108069321 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 108069695 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108070239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108070428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108072099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108072279 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108072647 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108072731 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 108072958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108073359 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108073850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108074041 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108075810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108075944 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108076483 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 108077711 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108077906 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108078962 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 108080379 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108080381 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 108081779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108082470 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108085623 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108088644 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 108089290 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 108089535 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 108089748 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 108089759 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 108089967 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108091157 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108092141 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108092673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108094982 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108095952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108096434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108097261 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 108097344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108099177 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108101822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108104672 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108106273 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 108106458 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 108110225 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108110492 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108112536 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108112921 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108113152 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108113199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108113371 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 108113379 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 108117052 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 108117095 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108117188 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 108118261 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108118787 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108121134 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108121821 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108121833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108122186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108124472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108124556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108124630 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108127078 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 108127351 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108127374 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 108127452 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 14 26 6 2 12 3 108127882 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 108127986 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 108128347 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 108128871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108132585 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108134011 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 108136298 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108136393 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 108136429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108140375 C G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 108140482 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108140579 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108143017 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108143139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108144452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108147023 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108147365 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108147510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108149344 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 108149735 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 108150471 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108150530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108150561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108150749 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108150983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108151353 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108152027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108152289 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108157568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108158619 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108158635 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108158643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108158752 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108159640 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 108159876 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108160614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108163956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108165111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108166062 G C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 108166331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108166425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108166653 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108168390 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108169622 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 108170593 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 108170668 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108171982 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 108172104 T C Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 108172881 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108173102 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108173177 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 108173297 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108174330 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 108174811 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 108176894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108177239 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 108178721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108180061 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 108181351 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108182535 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 108183018 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108184392 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 108184407 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 108184449 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 108184624 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108185074 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108185349 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108185875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108187572 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 108187598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108187607 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 108187801 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 108188014 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 108188179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108188292 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 108188419 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108188703 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 108188907 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 108189015 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108189108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108189305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108189397 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 108189608 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 108190336 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 108190635 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 108190926 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108191992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108193287 C T Y Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 3 108195161 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 108196395 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108196987 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 108198586 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 108205832 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 108208515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108209180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108209186 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 108211563 G T Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 108213941 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 108213942 C T Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 108214524 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 108214560 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 108214590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108214760 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 108214790 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 108214821 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108215494 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108223907 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 108230737 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108232551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108234257 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108234863 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 108235387 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108235518 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108236480 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108237779 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 108238310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108238940 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108239184 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108241696 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108241732 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108242197 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 108242227 C G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 108243214 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 108243237 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 108243322 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 108243359 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108243786 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 108244137 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108244913 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108248202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108248380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108250108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108250480 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108250610 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 108250631 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 108251306 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108252055 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 108256698 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 108257414 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 108257419 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 108257813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108258239 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 108258403 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108258579 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108258997 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 108259066 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108259518 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 108259587 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108259796 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 108259838 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 108259891 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 108259979 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108260226 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108261140 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108262144 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108262513 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 108262557 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 108262558 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 108262880 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 108262884 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 108262923 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 108262959 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108263048 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 108263061 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108263088 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108263169 A C N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 3 108263434 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108263458 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108263526 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108263582 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 108263739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108263781 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 108263813 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 108263895 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 108263907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108265140 A T Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 108265232 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 108265581 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108265685 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 108265731 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 108265766 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 108265779 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108265861 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 108265956 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 108265970 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 108265998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108266285 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 108266344 G A Y Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 3 108266354 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 108266503 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 108266533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108266553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108266558 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 108266662 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 108266706 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108266792 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 108267799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108267860 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 108267911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108268226 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 108268380 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108268463 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 108268623 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 108268765 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108268792 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 108268838 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 108268920 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 108269009 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 108269042 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 108269047 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 108269058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108269068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108269178 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108269229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108269387 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108269407 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 108269419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108269426 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 108269473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108269590 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108269820 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 108270083 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 108270114 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 108270135 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108270629 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 8 10 1 6 2 3 108271163 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 108272491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108273305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108273360 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 108273370 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108273428 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 108273476 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 108273566 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 108273584 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 108273739 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 108273769 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 108273842 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 108274013 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 108274136 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 108275252 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 108275381 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 108275398 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108275540 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 108276732 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 108276979 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108277327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108277393 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 108277671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108277822 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 108277837 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 108277851 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 108278148 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 108278192 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 108278202 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 108278335 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 108278342 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 108278730 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 108280192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108280273 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108280748 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108281523 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 108281658 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108282160 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108282195 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108282282 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 108282626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108283330 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108283357 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 108283535 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108283765 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108284021 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 108284063 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 108284949 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 108284973 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 108286636 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108286753 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 108286775 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108286821 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 108287324 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 108288429 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 108288579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108288631 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108288907 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 108288927 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108288998 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108289153 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 108289196 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108289240 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108289435 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 108289480 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 108289558 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 108289590 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108289868 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 108290042 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108290331 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 108290943 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 108291118 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108291145 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 108291402 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 108291505 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 108292142 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 108292461 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 108292487 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 108292488 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108292507 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 108292574 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108292728 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108292801 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 108292927 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 108293058 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 108293109 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 108293118 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 108293184 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 108293185 C G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 108293396 G C Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 108293646 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 108294020 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 108294293 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 108294422 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 108294425 T A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 108294435 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 108294520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108295389 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 108295401 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 108296017 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108296191 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 108296263 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108296279 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 108296450 T A Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 108296467 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 108296505 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 108296573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108296685 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 108296687 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 108297268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108297270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108297777 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 108297805 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 108297922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108297946 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 108298668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108298798 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108298921 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 108299088 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 108299148 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 108299447 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 108299617 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108299635 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 108299648 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 108299679 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 108299750 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 108299766 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 108299936 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 108300122 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 108301093 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 108301464 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 108301537 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108301602 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108301665 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 108302096 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108302181 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108302425 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 108302448 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 108302522 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 108302569 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 108302706 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108302710 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108302865 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 108303192 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 108303269 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108303288 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 108303511 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108303558 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 108303680 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 3 108303778 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108303788 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 108303801 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 108303881 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 108303961 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 108303993 T C Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 108304025 G C Y N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 108304108 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 108304327 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 108304533 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 108304895 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 108305051 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 108305357 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 108305698 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 108305843 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108305968 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 108306094 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 108306200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108306225 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 108306234 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 108306271 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108306395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108306780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108306803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108306917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108307096 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108307125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108307136 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 108307138 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108307168 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 108307676 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108307817 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 108307871 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108307971 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108307982 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108308908 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108309271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108311320 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 108311337 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 108311444 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108312358 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108312391 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 108312524 T C N Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 10 6 3 4 1 3 108312528 T C Y Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 3 108312951 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108315137 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 108315181 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108316198 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 108316699 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108317874 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108318779 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 108319153 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108319571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108322052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108322744 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 108322949 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 108324781 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108325049 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108325457 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 108325484 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108329504 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108330565 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 108330581 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108331566 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108333734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108333900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108334009 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 108334527 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108334854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108335838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108335999 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108338010 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 108338888 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108340030 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108340433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108340701 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 108341190 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108341480 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 108342642 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108343258 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 108343547 G A Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 108346301 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 108347253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108347363 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 108351386 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108352373 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 108352402 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 108352627 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 108353161 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 108354236 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108354429 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 108354740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108355017 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108355815 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108356358 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 108356550 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 108356788 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108357559 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108358104 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108358207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108358536 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 108358611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108358917 A G Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 108358928 G T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 108358940 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 108358956 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 108359206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108360016 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 108360294 T G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 108360378 A C N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 108361892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108364650 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 108365500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108365866 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108366010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108366973 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 108368129 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108368302 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 108368374 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 108368698 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108368721 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 108368926 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108369904 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 108370203 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 108370806 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 108370926 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 108371009 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 108371040 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 108371393 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 108371426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108372162 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 108373057 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 108374795 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108375060 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108375069 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108375296 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108375432 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108375570 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108376067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108376110 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108376237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108376397 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 108376802 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 108376859 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 108376861 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 108377467 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 108378844 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 108379155 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 108379220 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108379540 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 108379611 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 108380280 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 108380472 A T Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 108380540 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 108381086 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 108382169 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108382199 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 108382331 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 108382448 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 108382480 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108382975 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108383035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108383075 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 108383280 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 108383513 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 108383594 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 108383642 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 108384161 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 108384727 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108384988 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 108385076 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 108385162 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 108385412 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 108385679 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 108386358 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 108386673 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 108387588 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 108387600 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 108387664 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 108387844 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 108387880 C A Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 108387882 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 108387911 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 108389160 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108390633 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108391305 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108393807 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108394308 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108394468 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108395691 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108395703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108395742 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 108396129 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 108396561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108396604 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 108396606 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 108397377 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 108397405 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108397551 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 108397630 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 108397637 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108397763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108397767 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 108398023 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108398257 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 108398518 C T N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 15 13 1 13 0 3 108398565 A G Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 108398979 G A Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 108399864 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108400339 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 108400380 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 108400827 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 108400890 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108400987 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 108401015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108401456 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 108401524 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 108401802 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 108401816 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 108401950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108402121 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 108402502 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 108402834 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 108402941 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108403581 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108403712 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 108403926 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 108404429 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 108404705 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108404844 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 108404951 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 108405186 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 108405302 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108405718 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108406055 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 108406228 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 108406409 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108406510 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 108406952 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108407932 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108407989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108408185 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108408469 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108408525 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 108409070 A G N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.5 0.142857142857143 0.357142857142857 16 12 7 2 5 3 108409081 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 108409199 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 108409326 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.444444444444444 0.111111111111111 0.444444444444444 18 18 8 2 8 3 108409991 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 108409992 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 108410071 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.375 0.125 0.5 14 18 6 2 8 3 108410125 G T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.411764705882353 0.117647058823529 0.470588235294118 16 18 7 2 8 3 108410156 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.421052631578947 0.105263157894737 0.473684210526316 18 20 8 2 9 3 108410310 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 108410602 T C N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.333333333333333 0.2 0.466666666666667 13 17 5 3 7 3 108410647 T A Y N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 15 15 6 3 6 3 108410845 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108410904 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.25 0.0625 0.6875 9 23 4 1 11 3 108411161 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 108411376 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 108411560 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 108411743 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 108411790 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 108411823 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 108411848 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 108411976 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 108412209 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 108412467 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 108412664 C G Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 108413275 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 108413838 A G Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 108413933 A G Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 108413968 T A N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 3 108413973 G A Y Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.307692307692308 0.230769230769231 0.461538461538462 11 15 4 3 6 3 108414074 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 108414107 C T Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 108414245 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 3 108414523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108414780 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 108414903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108414909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108415011 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108415070 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 108415131 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 3 108415204 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 108415363 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 108415538 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108415697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108415849 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 108415910 G T Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 108415945 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 108415977 G T Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 108416016 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 108416159 C G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 108416178 T C Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 3 108416267 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 108416397 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 108416629 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 108416757 T G Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 108416993 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 108417009 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 108417071 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 108417089 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 108417148 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 108417537 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 108417567 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 108417624 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 108418151 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 108418765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108419654 G T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 108419743 G T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 3 108419863 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 108419887 G A N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 3 108419935 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 108420077 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 108420110 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 108420268 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 108420314 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 108420339 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 108420517 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108420614 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108420766 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108420844 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108420854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108420970 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 108420980 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108420996 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108421010 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 108421050 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108421057 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108421063 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108421085 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108421124 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108421129 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108421135 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108421144 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108421174 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108421266 G C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 108421695 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 108422270 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 108422303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108422432 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 108422466 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 108422543 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 108422626 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 108422816 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 108422859 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 108422935 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 108423015 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 108423035 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 108423142 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 108423264 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 108423718 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 108423741 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 108424166 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 108424615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108424882 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 108425034 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108425063 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 108425093 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 108425101 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 108425140 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 108425296 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 108425961 C T Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 108425981 A T Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 108426352 A G Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 108426642 A G N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 3 108426980 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 108426989 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 108427185 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 108427525 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108427659 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108427704 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 108427881 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 108428442 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108428951 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 108429073 T A N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 108429154 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 108429327 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 108429468 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108429585 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 108429652 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 108429677 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 108429696 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 108430103 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 108430154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108431205 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108432570 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108432882 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108433341 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 108433381 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 108433585 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 108433884 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 108434151 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 108434196 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 108434264 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108434267 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 108434299 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 108434335 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 108434355 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108434383 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108434443 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108434455 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108434475 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108434486 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 108434487 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108434537 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108434545 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 108434640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108434733 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108434879 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 108434880 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 108434908 T G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 108434982 G A Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 108435223 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 108435250 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108435255 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108435387 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108435418 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108435457 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 108435512 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 108435636 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 108435658 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 108435738 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 108435905 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 108435917 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108436050 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 108436296 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108436416 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108436469 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 108436538 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 108436761 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108436810 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108437009 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 108437046 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 108437097 C G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 108437190 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 108437216 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 108437225 C T N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 108437332 A T N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 108437340 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 108437407 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 108437411 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 108437441 A T N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0 1 0 15 15 0 15 0 3 108437442 A T N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 3 108437607 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 108437692 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 108438252 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 108438325 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 108438555 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 108438614 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 108438783 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108438875 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 108438887 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 108439055 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 108439096 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 108439108 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 108439175 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 108439197 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 108439241 A C Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 108439263 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 108439362 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 108439388 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 108439702 T C Y Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 3 108439760 A G Y Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 108440065 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108440131 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 108440461 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108441005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108441046 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 108441370 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 108441864 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 108442658 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 108443873 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 108445832 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108446500 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 108446559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108446940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108447307 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108447341 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108450963 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 108452016 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 108452363 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108452449 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 108452586 T C N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 108452665 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 108452799 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108452918 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 108452922 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 108453599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108453690 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 108454707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108454833 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 108455273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108455358 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 108455466 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108455514 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 108456060 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 108457323 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 108457667 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 108459589 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108460776 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108460791 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 108460828 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108464438 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 108464713 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 108466223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108466918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108468622 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 108468847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108471468 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 108471688 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 108472686 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 108472849 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108473436 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 108473658 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108474279 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 108474311 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 108474313 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 108474596 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 108474813 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 108475480 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 108476460 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 108478464 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108479692 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108480020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108480280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108481297 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108481638 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108481976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108482665 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 108482763 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108482788 G C Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 108482930 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108482971 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 108482998 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 0.105263157894737 0.421052631578947 20 18 9 2 8 3 108483004 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 0.105263157894737 0.421052631578947 20 18 9 2 8 3 108483903 C G Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 108483920 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 108485565 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 108485586 T G Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 108485786 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 108485913 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108486442 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 108486549 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 108486709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108488590 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 108489941 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108490064 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 108491402 G T Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 108492521 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 108492621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108493915 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 108494575 T C Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0 0.882352941176471 0.117647058823529 15 19 0 15 2 3 108498008 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.375 0.1875 0.4375 15 17 6 3 7 3 108498153 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 3 108498343 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 108498964 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 108499138 A T N N 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 10 6 4 2 2 3 108499139 T C N Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 10 6 4 2 2 3 108499261 A G N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 3 108499577 C T N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.533333333333333 0.133333333333333 0.333333333333333 18 12 8 2 5 3 108499631 C A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 108499770 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108500311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108500408 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108500420 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 108500423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108500590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108500718 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 108500807 G C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 108501058 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 108501116 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 108501230 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 108501248 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 108501356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108501415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108501475 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 108501494 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108501636 A G Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 108501643 T G Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 108501672 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 108502057 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108502251 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 108502383 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 108502418 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 108502596 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 108502628 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 108503104 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 108503145 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 108503161 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 108503505 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 108503544 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 108503659 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 108503769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108503916 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 108504078 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 108504089 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 108504090 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 108504271 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 108504476 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 108504504 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 108505281 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 108505561 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 108505701 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 108506108 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 108507868 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 108507899 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 108508396 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 108508438 A T Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 108508839 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 108509327 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108509402 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 108509481 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 108509605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108510130 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108510388 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 108510404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108510455 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 108510470 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.45 0.1 0.45 20 20 9 2 9 3 108510712 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 108510793 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 108510906 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 108511052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108511193 G C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 3 108511293 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108511326 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 108511447 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108513046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108513205 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108513383 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108513402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108513555 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 108514099 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 108514699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108515064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108515138 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108515215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108515363 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 108515564 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108516580 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108517009 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108517281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108517576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108520175 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108520406 A C N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 108520672 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108521588 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 108521606 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 108521622 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 108521638 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 108521749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108521790 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 108523285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108523706 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108523710 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 108524369 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108527186 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 108528302 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 108528851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108529468 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108529738 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108529797 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108529818 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 108529965 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 108530331 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 108530354 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 108530828 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 108530855 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 108530900 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 108530980 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 108531115 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 108531225 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 108531233 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 108531241 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 108531318 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 108531391 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 108531764 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 108531832 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108531843 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 108532129 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 108532224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108532377 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108532402 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 108532424 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108532601 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 108532683 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108532728 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 108532955 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108532962 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108532968 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 108533418 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 108533606 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 108533674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108533809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108533979 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 108534047 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 108534391 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 108534429 C T N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 108534526 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 108534573 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108534696 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108534834 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 108534837 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108534918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108534954 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 108534955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108535418 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 108535607 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 108535973 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 108536115 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 108536226 A T N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 108536345 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 108536410 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 108536438 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 108536607 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 108536902 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 108537155 A T N N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0 0.7 0.3 7 13 0 7 3 3 108537163 C T N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0 0.7 0.3 7 13 0 7 3 3 108537273 A T N N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 3 108537277 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 3 108537458 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 108537466 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 108537630 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108537661 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108537727 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108537926 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108537938 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108538064 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108538128 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108538404 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108538752 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108538807 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108538810 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 108539160 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 108539191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108539426 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108539446 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 108539702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108539855 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108539999 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 108540000 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108540023 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108540074 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 108540115 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108540127 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 108540129 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 108540139 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108540244 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108540264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108540890 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 108540937 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 108541079 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108541996 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 108542596 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 108542669 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108542765 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 108542833 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 108542899 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 108542955 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108543057 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108543069 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 108543114 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 108543192 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 108543254 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 108543429 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 108543602 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 108543726 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108543751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108543791 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 108543846 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 108543854 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 108543904 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 108543941 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 108543968 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 108544062 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108544070 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 108544143 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 108544197 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 108544209 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108544267 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 108544408 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 108544553 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 108544589 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 108544607 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108544621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108544645 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 108544660 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 108544704 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108544705 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108544850 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 108544869 T C N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 108544883 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 108544948 T C N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 108544953 T A N N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 108545106 C T Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 108545133 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108545141 G A Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 108545193 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 108545413 T G Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 108545446 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 108545613 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 108545621 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108545728 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108545797 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 108545850 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 108546248 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 108546311 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 108546315 T C Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 108546377 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 108546401 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 108546447 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 108546452 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 108546462 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 108546598 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 108546622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108546741 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 108546969 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 108546977 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 108547064 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108547071 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 108547249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108547261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108547273 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 108547376 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108547416 T A N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 3 108547459 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 108547580 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 108547834 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 108547993 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108548114 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 108548142 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108548237 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108548247 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 108548369 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108548391 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 108548420 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 108548527 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 108548772 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 108548773 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 108548990 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108549020 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108549033 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108549040 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108549081 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 108549093 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108549102 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108549163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108549189 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108549332 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108549471 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108549613 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 108549745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108549863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108549872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108549896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108550004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108550084 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108550223 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108550451 C T Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 108550476 T C Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 108550850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108550954 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108550998 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108551031 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108551492 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108551565 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108551774 G T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 108551852 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108551869 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 108552001 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108552112 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108552254 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 108552300 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108552383 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108552393 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108552400 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108552494 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108552704 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108552713 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108552855 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 108552861 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 108552875 T C N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 108553168 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108553188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108553216 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108553547 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 108553584 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108553599 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108553811 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 108553863 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 108553993 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 108554180 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 108554274 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108554331 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 108554585 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 108554838 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108554914 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108555056 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108555083 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 108555124 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108555164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108555436 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 108555663 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108555819 T C N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 108555825 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 108556139 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 108556164 G C Y N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 8 16 0 8 4 3 108556357 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 108556390 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108556631 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108556678 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 108556842 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 108557041 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 108557196 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 108557260 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108557804 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108557829 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 108558020 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108558025 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108558159 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108558408 C T Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 108558537 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108558753 C G Y N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 108558841 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108559259 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 108559811 A C N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 108559833 C G N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 3 108560098 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 108560102 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 108560339 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108560370 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108560502 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 108560526 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 108560639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108560773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108560819 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 108560923 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 108560962 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 108561050 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108561052 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108561088 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 108561203 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108561682 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108561731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108561732 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 108561844 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 108561944 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 108561949 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 108562029 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 108562036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108562277 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 108562338 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 108562357 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108566069 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 108566114 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 108566134 T G N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0 0.8125 0.1875 13 19 0 13 3 3 108566331 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 108566341 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 108566347 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 108566477 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 108566529 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 108566624 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 108566636 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 108566821 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 108566822 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 108566941 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 108567028 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108567121 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 108567520 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 108567521 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 108567549 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 108567732 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 108568049 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 108568312 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 108568352 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 108568505 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108568641 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108568648 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 108568686 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 108569106 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108569405 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108569450 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 108569656 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 108569919 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 108569972 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 108570004 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 108570059 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 108570062 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108570185 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 108570253 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 108570395 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 108570407 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108570447 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108570474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108570696 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 108570701 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108570725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108570952 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 108570987 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 108571178 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108571617 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 108571915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108572149 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108572356 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108572688 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 108572980 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 108573281 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 108573572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108573615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108573889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108573949 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108573950 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108574023 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108574033 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108574036 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108575131 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108575730 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.0625 0.8125 0.125 15 17 1 13 2 3 108576209 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 108576227 C T N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 3 108576325 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 108576384 G A N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 108576391 G C N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 108576470 G C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 108576540 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 108576603 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 3 108576784 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 108576864 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 108576974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108577295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108578071 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108578353 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 108578377 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 108579017 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108579111 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 108579180 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 108579221 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 108579937 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 108582022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108584593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108585975 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 108586339 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108586617 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108587190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108589016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108589163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108590324 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 3 108590666 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108591309 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108592455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108594587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108594959 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108597110 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108598452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108598648 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108599227 G T Y N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 108599261 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 108599722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108600102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108600770 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 108601354 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108601929 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108602501 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108603120 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 108604028 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 108605627 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 108606766 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 108606767 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 108606810 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 108607909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108609046 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108609376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108610913 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108612132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108613203 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108613887 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 108613926 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 108614603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108615145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108615431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108616080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108616085 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108616092 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108616486 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108616893 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 108617921 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108617928 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 108618441 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 108618624 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 108619209 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 108619338 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 108623252 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 108623287 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108623347 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 108623375 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 108623469 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 108623645 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 108623721 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 108623955 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 108624029 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 108624053 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 108624292 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 108624942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108625117 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 108625262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108625582 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 108625922 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 108625993 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108626241 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 108626538 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 108626558 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 108626586 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 108626746 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 108626828 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 108627390 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 108627484 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 108627495 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 108627519 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 108627569 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 108627594 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 108627648 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 108627701 T G Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 108627722 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 108627892 A G N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 108627897 A C N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 108627962 G A N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 108628620 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 108628649 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108628741 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 108628781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108628805 A T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 108629064 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 108629144 T A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 108629225 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 108629296 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 108629358 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 108629542 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 108629576 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 108629587 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 108629903 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108630384 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 108631257 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108631395 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 108631457 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 108631526 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 108631718 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 108631919 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 108632178 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 108632199 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 108632208 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 108632269 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108632295 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 108632355 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108632583 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 108632887 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 108632923 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108633014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108633117 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 108633222 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 108633297 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 108633387 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108633407 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 108633418 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 108633679 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 108633800 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 108633840 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108633891 A T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 108634093 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 108634157 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 108634254 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 108634342 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 108634401 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 108634562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108634630 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 108634797 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108634804 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 108634830 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108634844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108634990 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 108635048 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 108635189 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 108635306 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 108635359 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 108635402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108635567 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 108635575 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108635668 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108635681 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108635718 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108635728 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 108635777 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 108636146 C T Y Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 3 108636478 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 108636517 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 108636562 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 108636578 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 108636903 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 108636938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108637189 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 108637259 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108637304 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108637380 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108637381 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 108637396 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 108637409 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108637417 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 108637459 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108637568 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 108637585 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 108637598 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 108637616 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 108637700 A G Y Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 3 108637715 G A Y Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 3 108637745 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 108638290 A C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 108638321 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 108638334 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 108638341 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 108638403 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108638423 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 108638433 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 108638439 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 108638507 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108638520 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108638528 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108638552 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108638586 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108638641 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108638736 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108638815 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 108638874 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108638895 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 108638916 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 108638976 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108639017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108639067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108639104 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108639137 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108639168 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 108639197 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 108639208 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 108639212 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 108639298 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 108639392 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 108639600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108639624 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 108639716 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108639722 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108639730 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108639742 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 108639756 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 108639815 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 108639930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108640000 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108640023 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 108640040 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 108640055 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 108640059 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 108640085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108640243 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108640263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108640514 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108640538 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108640613 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108640706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108640728 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108640753 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 108640824 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 108640849 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108640947 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108640950 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108640993 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 108641224 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108641303 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 108641378 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108641472 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108641489 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 108641715 T G Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 108642029 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108642069 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108642111 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108642169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108642284 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 108642454 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108642717 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108643035 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108644345 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108644701 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108645824 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108646202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108646223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108646470 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108648019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108652366 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108652553 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108652588 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108653093 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 108653121 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 108653169 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108653176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108653351 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108653442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108653485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108653636 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108653694 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108653701 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108653723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108653730 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 108653786 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 108653890 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 108654032 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108654300 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 108654377 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 108654506 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 108654508 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 108654636 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 108654794 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108654945 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 108654993 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 108655006 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 108655049 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 108655080 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 108655748 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108655964 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108656178 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108656523 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108656652 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108656701 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 108656915 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108657210 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108657307 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 108657338 G C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 108657369 C A N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 108657506 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 108657538 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 108657558 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 108657742 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108657959 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108658029 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108658644 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 108658689 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108659244 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108660328 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108660329 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 108661031 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108664649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108664755 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108667403 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108667437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108668171 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108671109 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 108671206 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 108671839 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 108671943 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 108671956 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108671968 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108672477 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 108672508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108672523 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 108672702 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108675699 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 108677086 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108682626 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108682794 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108684938 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108685043 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108686073 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 108686176 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 108687026 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108688305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108689091 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 108689410 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 108690344 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 108690963 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108691114 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108692049 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108702134 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108702405 T A N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 108717227 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108717944 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108720597 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108720612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108721296 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108724757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108726680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108727221 T C N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0 0.818181818181818 0.181818181818182 9 13 0 9 2 3 108729011 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108732583 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108732634 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108732775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108734481 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108734786 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 108735011 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108735149 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108735188 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 108735219 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108737532 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 108737583 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 108737860 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108741792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108743762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108744651 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108746572 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108746724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108747700 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108747740 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 108748065 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 108748442 C A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 108748659 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108749701 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 108754863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108756013 G C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 108756229 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 108756246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108756256 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108757370 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108757571 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 108757650 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108758442 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 108758443 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108759028 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 108759187 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 108759238 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108759583 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 108759776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108760011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108760189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108760515 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108760623 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108760742 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108761090 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108761101 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108761326 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108761423 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 108761664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108762431 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108763001 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108763321 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 108763732 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 108763849 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108763988 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108764429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108764447 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108764462 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108764476 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108764618 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108764638 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108764647 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108764809 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 108765056 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108765110 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 108765161 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 108765289 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108765332 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108765415 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108765552 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108765747 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108765753 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108766231 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108766462 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108766856 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108767508 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 108767697 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108767860 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108769755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108770128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108770599 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 108770867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108772771 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 108773128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108774554 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108775388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108776480 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 108777513 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108778370 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108778397 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 108778403 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 108778769 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 108778782 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108778809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108779539 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108779786 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108779871 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108779914 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 108779928 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 108780290 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 108780434 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 108780497 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108780502 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 108780554 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 108780719 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 108780904 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108780916 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108780966 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 108781034 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108781111 G A N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 108781121 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 7 11 2 3 4 3 108781460 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108781536 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 108781555 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 108781864 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 108781900 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 108781958 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 108782019 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 108782241 C G Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 108782280 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 108782338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108782411 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 108782415 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 108782428 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 108783060 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 108783235 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108783324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108783616 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 108783880 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 108784008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108784187 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 108784208 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108784233 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 108784274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108784326 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 108784331 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 108784624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108784691 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 108784757 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108785135 G T Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 108785347 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 108785363 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 108785440 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 108785758 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 108786757 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108786803 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 108786978 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 108787046 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 108787063 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 108787077 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 108787191 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 108787395 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 108787479 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 108787557 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 108787577 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 108787675 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 108787873 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 108787958 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 108788222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108788246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108788410 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108788500 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108788608 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108788764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108788954 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 108789992 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 108790030 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 108790076 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 108790095 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108790196 C A N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 108790239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108790404 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 108790679 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 108791240 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108791653 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108791811 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108792074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108792129 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 108792379 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 108792450 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108792613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108792671 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108792691 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 108792748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108793381 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 108793483 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108793487 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108793765 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 108793899 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 108794125 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 108794131 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 108794145 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 108794162 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 108794170 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 108794175 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 108794296 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 108794343 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 108794449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108794526 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 108794651 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 108794729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108794813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108794850 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108795047 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 108795060 C A Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 108795210 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 108795248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108795344 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 108795360 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 108795486 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 108795725 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108795729 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108795860 C A Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 108796118 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 108797279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108797325 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 108797883 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 108797951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108798027 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 108798608 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 108798647 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 108798679 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 108798813 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108798851 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108798886 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 108799258 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 108799449 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108799882 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108799897 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 108800205 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 108800326 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108801190 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 108801199 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 108801482 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 108801493 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 108801498 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 108801627 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 108801628 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 108801657 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 108801665 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 108801795 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 108801800 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 108801862 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 108801926 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 108801960 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 108802093 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 108802241 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 108802294 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 108802331 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 108802344 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 108802345 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 108802636 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 108802709 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 108802715 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 108802737 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 108802762 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 108802770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108802854 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 108802953 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 108803035 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 108803047 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 3 108803055 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 108803095 T A Y N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 3 108803125 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108803134 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108803161 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 108803224 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 108803229 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 108803482 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 108803500 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 108803588 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 108803626 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 108803679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108803802 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 108803837 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 108803941 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 108804042 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 108804199 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 108804227 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 108804362 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 108804462 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 108805211 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108805334 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 108805350 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 108805608 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 108806152 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108807102 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 108807129 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108807355 C T Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 108807934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108809171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108809525 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108809821 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 108811396 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 108811520 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108811663 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108812350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108814317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108815241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108816603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108818166 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108818998 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 108819537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108819730 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108820315 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108820814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108821516 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108821521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108821543 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108821743 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108822075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108822093 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108822149 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108822160 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108822395 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108822436 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 108822494 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 108822599 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 108822795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108823062 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 108823109 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 108823393 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 108823583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108823632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108823645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108823693 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 108823836 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108823855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108823968 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108824152 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 108824186 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 108824269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108824368 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 108824454 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108824483 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 108824683 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108825193 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108825329 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 108825375 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 108825476 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 108827179 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108827912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108827962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108828395 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108828624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108829548 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 108829652 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108829691 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108829757 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 108829766 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 108829840 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108829948 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 108830981 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108831032 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108831963 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 108833401 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108833607 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108834636 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108835737 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 108835831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108836552 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108837556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108838184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108839190 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108839649 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 108839658 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 108844406 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108845362 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 108848347 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108849541 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 108849545 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 108850036 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 108850117 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108850246 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108850249 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 108850388 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108850400 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 108850460 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 108850487 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108850629 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108850630 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108850660 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 108850662 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 108850678 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108850726 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108850897 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108850942 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108850985 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 108851050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108851275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108851368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108851522 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 108851608 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 108851798 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108851847 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 108852076 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108852379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108852796 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 108853106 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 108853275 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 108853300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108853356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108853765 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108853774 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 108854325 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108854429 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108854817 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108855829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108856565 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 108857096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108857958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108858484 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108859392 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 108859421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108859439 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 108859488 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108859578 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 108859606 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108862545 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 108865228 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 108865659 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108866841 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108868092 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 108868296 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 108868516 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 108868866 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 108868974 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 108869074 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 108869721 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108870082 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 108878628 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 108879400 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 108880065 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108883092 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108884592 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108884594 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 108884689 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108884714 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 108885190 T C N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 108886447 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108886775 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 108887125 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108889556 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108889636 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 108890229 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 108890502 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108891079 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108891616 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108891634 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 108891978 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 108892145 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 108892242 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 108892263 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 108892431 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 108892536 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108892545 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 108892620 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 108892623 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 108892689 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 108893068 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 108893221 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 108893293 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 108893548 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108893876 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 108894016 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108894039 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 108894073 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 108894100 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 108894107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108894201 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 108894242 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 108894247 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 108894264 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 108894284 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 108894608 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 108895246 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108895412 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 108895428 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 108895435 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 108897061 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108898198 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 108898654 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108899065 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 108899349 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108899518 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108901166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108901773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108902497 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108902720 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 108902803 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108902996 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108903159 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 108903164 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 108903518 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 108903692 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 108903721 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 108903797 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 108904019 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 108904414 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 108904812 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 108904827 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 108905003 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108905160 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 108905206 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 108905252 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 108905267 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 108905279 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 108905293 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 108905301 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 108905343 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 108905418 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 108905465 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 108905481 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 108905489 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 108905534 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 108905752 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 108905781 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 108905986 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 3 108905987 T C N Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 3 108906330 A G N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 3 108906417 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 108906577 G C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 108906599 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 108906637 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 108906652 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108906661 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 108907355 G C Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 108907362 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 108907629 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 108908323 A G N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 3 108908833 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 108909306 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108909895 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108909913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108910587 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 108910919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108910920 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108910947 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 108910990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108911133 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 108911172 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 108911256 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 108911314 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 108911500 C T N Y 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 3 108911610 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 108911635 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 108911873 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 108911875 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 108912023 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 108912182 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 108912215 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108912222 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108912348 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 108912349 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 108912461 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 108912691 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 108912741 G C N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 108912792 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108912918 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 108913266 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 108913320 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108913448 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 108913527 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108913541 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108913689 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108913708 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 108913739 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108913750 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 108913824 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 108913830 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 108913839 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 108913841 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 108914152 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108914286 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108914314 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108914410 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 108914772 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108914912 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108915616 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108915729 G C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 108916119 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 108916282 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 108916662 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 108916718 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 108916979 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 108917021 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 108917057 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 108917074 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 108917186 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 108917219 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 108917477 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108917584 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 108917835 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108917895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108917930 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 108918178 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 108918532 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108918544 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 108918997 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 108919022 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 108919426 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 108919496 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 108920087 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 108921401 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 108921414 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 108921415 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 108921554 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 108921621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108921666 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 108921764 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 108921891 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 108922139 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 108922574 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108922662 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108922817 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 108922892 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 108922896 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 108922911 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 108923021 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 108923102 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 108923154 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 108923364 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 108923378 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 108923397 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108923412 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 108923464 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 108923529 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 108923555 T A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 108923609 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108923709 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 108923752 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 108923785 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 108923870 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108923910 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 108923934 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 108923996 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 108924113 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 108924124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108924217 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 108924257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108924342 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108924485 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108924488 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108924663 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108925002 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 108925317 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 108925376 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108925660 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 108925750 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 108926146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108927295 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 108927615 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 108927621 G T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 108927673 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108928243 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108929166 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 108929270 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 108929415 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 108929470 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 108929473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108929488 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 108929543 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 108929604 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 108929704 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 108929763 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 108929766 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 108929803 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 108929811 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 108929816 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 108929872 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 108929876 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 108929942 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 108929948 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 108930024 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 108930068 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 108930301 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 108930370 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 108930419 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 108930440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108930456 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 108930541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108930684 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 108930701 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108930717 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 108930777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108930784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108930850 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108930851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108930893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108931027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108931115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108931158 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 108931251 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 108931287 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 108931339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108931397 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 108931419 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 108931449 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108931460 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108931533 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108931582 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108931593 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 108931608 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 108931919 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108932075 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108932158 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108932405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108932427 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108932514 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108932567 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108932674 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108932728 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 108932790 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108932984 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 108933003 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 108933154 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 108933390 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 108933392 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 108933417 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 108933429 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 108933519 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 108933604 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 108933845 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 108934117 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 108934131 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 108934234 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 108934502 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 108934696 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 108934910 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 108935043 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 108935172 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 108935297 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 108935499 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 108935759 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 108935996 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 108936096 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108936270 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108936328 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108936397 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108936513 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 108936884 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108936925 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108936945 C A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 108937013 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 108937290 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108937750 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 108938249 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 3 108938380 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 108938538 C A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 108938578 T G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 108938597 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 3 108938703 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 108938742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108938743 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 108938833 T G Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 108938877 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 108938878 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 108938978 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 108940001 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 108940848 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 108941705 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 108941848 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108941951 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108949086 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108949140 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108949291 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 108949466 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 108950199 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 108951502 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 108951526 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 108952016 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108952280 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108952982 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 108953168 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 108953249 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108953315 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108953594 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108953637 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108953653 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 108953661 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 108953678 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108953788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108954001 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 108954038 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108954039 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108954053 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 108954106 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108954134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108954151 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108954200 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 108954271 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 108954305 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 108954315 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 108954341 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 108954872 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 108954911 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 108954972 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108955185 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 108955194 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 108955235 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 108955339 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.166666666666667 0.777777777777778 0.0555555555555556 20 16 3 14 1 3 108955502 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108955569 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 108955717 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108955728 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108955748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108955767 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108955871 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108955907 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108955912 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 108955996 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108956059 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108956320 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 108956390 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108956420 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108956438 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108956458 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108956548 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108956673 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108956698 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 108956724 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 108956787 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108956824 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 108956911 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 108956940 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 108956952 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 108957081 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108957392 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108957498 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108957603 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108958260 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 108959051 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108959231 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 108959243 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 108959260 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 108959279 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 108959280 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 108959328 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 108959358 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 108959551 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 108959556 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 108959566 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 108959616 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 108959969 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 108959980 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 108960094 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108960176 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108960188 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108960314 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 108960412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108960432 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108960468 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 108960506 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108960517 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108960532 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108960591 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108960611 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108960672 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108960695 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108960942 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108960986 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 108961052 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 108961062 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 108961206 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108961207 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108961270 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 108961789 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 108961812 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 108961880 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108961890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108961937 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108961969 T G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 108961998 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108961999 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 108962049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108962122 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108962283 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 108962427 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 108962464 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108962470 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 108962522 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 108962534 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108962550 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 108962558 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 108962562 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108962583 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 108962632 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108962645 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108963820 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 108963821 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 108963858 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 108964010 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 108964019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108964068 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108964110 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 108964296 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 108964545 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 108964554 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108964600 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 108964643 A T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 108964657 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 108964797 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 108964905 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 108964913 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 108965000 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108965040 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 108965046 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 108965250 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 108965311 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 108965323 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 108965405 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 108965529 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 108965537 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 108965543 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 108965575 T G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 108965754 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 108965776 A T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 108965877 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 108965881 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 108965895 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 108965934 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 108965986 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 108965990 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 108966083 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 108966109 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 108966183 C G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 108966202 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 108966256 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 108966262 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 108966531 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108966693 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 108966705 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 108967003 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 108967153 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108967174 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108967198 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 108967241 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 108967294 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 108967361 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 108967419 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108967582 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 108967722 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 108968004 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 108968115 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108968131 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 108968176 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 108968195 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108968291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108968347 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108968400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108968415 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 108968468 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 108968482 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108968508 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108968595 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 108968599 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 108968620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108968631 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 108968649 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108968731 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 108968839 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 108968912 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 108968928 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 108968996 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 108969058 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 108969114 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 108969141 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 108969635 A C Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 108969752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108969881 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 108969920 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 108969929 C G Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 108970070 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 108970092 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 108970426 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 108970529 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108970927 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 108971118 T A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 108971148 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 108971150 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108971574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108971592 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 108971971 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 108972020 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 108972465 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 108972596 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 108972610 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 108973285 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108973367 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108973540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108973554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108973649 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 108973698 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 108973943 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108974139 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 108974179 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108974298 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 108974570 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108975530 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108975698 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108975864 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 108976348 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 11 7 4 3 2 3 108976898 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 108977230 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108977243 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 108977561 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108977584 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 108977647 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 108977756 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 108977933 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108978290 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 108978405 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 108978958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108979111 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 108979191 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 108979247 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108979279 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 108979356 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108979587 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 108979628 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108980239 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108980311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108980455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108980557 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108980563 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108980592 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108980632 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 108980657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108981061 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 108981154 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108981164 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108981324 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 108981335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108981407 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 108981459 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108981519 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 108982034 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 108982182 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 108982228 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108982318 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 108982334 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108982408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108982422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108982783 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 108983133 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108983294 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 3 108983310 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108983550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108983804 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108983951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108984348 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 108984365 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108984432 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108984436 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108984553 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108984798 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 16 20 0 16 2 3 108985127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108985140 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108985528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108985700 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108985723 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108985887 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 108985998 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 108986015 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 108986054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108986341 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108986367 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 108986387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108986727 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 108986813 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 108987393 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 108987529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108987548 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108987552 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 108987652 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 108987721 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108987769 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108987826 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108987910 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 108987943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108987953 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108987954 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 108988215 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108988226 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108988552 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108988665 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108988768 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 108989146 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108989209 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 108989229 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 108989365 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108989464 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108989537 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108989914 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108989971 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 108990095 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108990119 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108990135 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108990283 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 108990454 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 108990459 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108990471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108990489 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108990490 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 108990692 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 108990695 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 108990724 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 108990728 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108990776 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 108990884 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 108990900 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 108991022 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 108991096 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 3 108991108 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 3 108991122 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 108991390 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 108991402 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 108991564 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 108992008 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 108992230 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 108992463 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 108992475 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108992528 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 108993381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108993460 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108993513 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 108993552 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 108993726 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108994897 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 108994997 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 108995076 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 108995280 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 108995324 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108995787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108996028 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 108996118 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 108996637 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 108997024 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 108997134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108997246 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108997417 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108997484 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 108997572 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 108997743 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 108997773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108997836 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 108997868 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 108997901 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 108998022 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 108998159 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108998211 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108998254 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 108998274 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 108998307 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 108998349 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 108998405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108998406 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 108998445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108998561 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108998696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108998767 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108998810 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108998938 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 108998947 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 108999063 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108999366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 108999570 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 108999915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109000039 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 109000298 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109000363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109000690 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109001085 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 109001098 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 109001131 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 109001164 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 109001189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109001199 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 109001414 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109001496 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 109001718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109001832 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 109001921 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109001942 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109001952 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109001953 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109002020 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109002236 A T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 109002282 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 109002567 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.416666666666667 0.5 0.0833333333333333 16 8 5 6 1 3 109002851 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 109003081 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 109003296 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 109003616 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109003706 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109004024 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 109004198 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109004717 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109004747 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109004760 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109005306 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109005666 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109005793 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109005894 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109005910 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 109006115 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109007025 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109007687 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109008006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109008887 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109009173 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109009195 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 109009965 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109010005 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109010227 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109010323 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109010437 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109010489 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109010507 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109010568 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109011418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109011669 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 109011980 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109012809 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109012885 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109012899 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109012900 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109013050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109013140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109013141 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109013170 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 109013228 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109013388 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109013415 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109013440 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109013530 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109013775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109013785 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 109013908 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109013936 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 109013953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109014055 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109014074 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 109014098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109014128 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 109014229 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 109014236 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 109014271 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109014346 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109014362 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109014557 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109014565 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109014638 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109014662 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 109014745 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 109014750 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 109014833 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 10 20 0 10 5 3 109015786 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 109016463 A T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 109016478 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109016936 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 109017805 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 109018414 G T Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 109018419 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109018471 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109018486 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109018565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109018648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109018709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109018723 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109018756 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109018777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109018836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109018837 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109018918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109018936 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109018963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109018997 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109019009 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109019070 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109019080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109019129 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109019162 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109019182 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109019195 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109019243 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109019264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109019273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109019321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109019677 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109019719 C A Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 109019761 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 109019894 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109019909 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109019982 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109020004 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109020101 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109020138 A G Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 109021240 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109021254 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 109021286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109021288 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109021305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109021460 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109021470 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109021499 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109021516 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109021719 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109021785 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 109021809 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 109021891 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 109021997 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 109021998 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 109022052 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109022107 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109022130 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109022242 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109022288 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 109022293 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 109022333 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 109022378 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109022528 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109022725 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109022784 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109022992 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109023064 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 109023065 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 109023160 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 109023320 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109023585 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109023664 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109023790 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 109023845 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109024066 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 109024414 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109024619 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109024635 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109024692 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 109024779 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109024812 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109024835 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109024932 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109025134 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109025150 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109025161 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109025205 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109025220 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109025235 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109025264 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109025294 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109025316 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109025344 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 109025354 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109025420 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109025421 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109025433 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109025444 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109025501 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109025516 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109025673 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109025723 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109025759 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109025861 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109025953 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109026156 A T Y N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 109026194 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 109026550 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 109026650 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109026880 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109027118 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 109027137 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 109027584 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109027621 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109027647 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 109027688 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109027699 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109028237 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 109028332 C A N N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 8 12 2 4 4 3 109028417 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 109028667 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109028803 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 109028824 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109028841 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109028849 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109029042 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 109029710 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 109029731 C A Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 109029770 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 109029835 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 109029859 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 109030067 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 109030580 T C Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 109030921 A G Y Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 3 109031004 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 3 109031054 C T Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 109031104 G T Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 109031107 C G Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 109031235 T G Y N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 109031242 C T Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 109031523 G A Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 109031549 G T Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 109031556 G A Y Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 109031606 A G Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 109031639 C A Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 109031641 A T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 109031719 C T Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 109031754 T G N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.25 0.166666666666667 0.583333333333333 8 16 3 2 7 3 109031905 G A Y Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 109031967 G T Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 109032295 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 109033152 G T Y N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 3 109033161 T C Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 3 109033180 A C Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 3 109033188 C T Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 109033371 C T Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 109033395 G T Y N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 109033468 A G Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 109033648 T A Y N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 109033948 T A N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 3 109034005 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 109034040 A G N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 109034365 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 109034413 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109034455 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109034529 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 109034570 C A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 109034638 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 109034660 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 109034692 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 109034736 C T Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 109034849 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109034881 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109034908 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 109034947 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 109034954 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 109035088 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 109035114 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 109035177 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109035344 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 109035444 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 109035481 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 109035571 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 109035667 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109035687 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109035703 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109035724 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 109035756 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 109035904 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109035983 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109036132 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109036146 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 109036148 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 109036284 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109036298 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109036412 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109036486 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 109036514 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 109036587 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 109036778 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 109036823 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 109036842 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 109037076 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109037114 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109037194 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109037340 A C Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 109037349 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109037576 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 109037623 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109037710 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 109039861 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109039992 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 109041332 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109041370 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 109041433 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109041450 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 109041745 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 109041789 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109041813 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 109041815 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109041830 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 109041879 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 109041910 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 109042488 T A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 3 109042692 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 109042693 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 109042742 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 109043371 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 109043396 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109043432 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 109043931 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 109044192 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 109044440 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 109044773 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 109044809 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 109044845 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109044926 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109044957 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 109045032 C A N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 109045076 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 109045118 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109045225 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 109045265 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 109045398 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 109045517 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109045612 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 109045616 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 109045641 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 109045678 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109045694 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109045725 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109045977 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 109046002 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 109046247 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 109046274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109046352 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 109046431 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109046499 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109046504 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 109046511 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 109046555 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 109046578 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 109046629 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109046883 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 109046938 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109046943 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109046956 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 109047026 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 109047054 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 109047077 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 109047092 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 109047137 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 109047158 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109047167 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 109047329 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 109047353 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 109047375 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 109047379 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 109047434 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 109047452 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 109047514 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 109047598 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 109047624 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 109047697 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109047839 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 109047882 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 109047937 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 109047942 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 109047968 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 109047978 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 109048049 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 109049398 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109049631 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109049850 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109050771 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109051026 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109051145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109051189 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109052560 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 109052569 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109053955 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109054391 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109058373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109058598 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109059045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109059169 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109067605 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109067888 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 109068292 C A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 109069822 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109070054 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109070829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109070988 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109072298 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109072734 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109073089 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109073127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109073211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109073796 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109074839 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 109074960 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 109076492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109076958 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109076979 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 109077147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109077198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109080728 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 109080831 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109081206 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 109082069 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109083145 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 109083232 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 109083277 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 109083922 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 109083954 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109084164 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 109084292 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109084637 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109084643 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 109084757 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109084777 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109085204 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 109085696 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 109085719 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 109085762 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 109085838 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 109086052 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 109086413 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109086414 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 109086576 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109086630 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109086703 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 109086775 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 109086934 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 109087068 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 109087154 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 109087594 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 109087663 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 109087719 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 109087729 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 109087846 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 109087951 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 109088000 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 109088048 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 109088077 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 109088078 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 109088186 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 109088405 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 109088550 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 109089078 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 109089442 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 109089888 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 109089988 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109090416 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 109090539 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109090936 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 109091100 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109091234 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 109091375 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 109091513 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109091547 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 109091555 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 109091783 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109091827 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 109091835 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109091839 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 109091857 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 109091929 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 109091930 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 109091943 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 109091982 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109092119 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 109092224 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 109092231 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 109092272 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109092304 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109092337 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109092374 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109092407 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109092466 A C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 109092474 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 109092534 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109092609 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 109092804 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 109092844 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109092865 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 109093215 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 109093286 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 109093367 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 109093442 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109093466 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109093492 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 109093501 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 109093559 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109093619 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 109093637 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 109093725 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 109093800 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109093868 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 109093911 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 109093924 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 109094066 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109094081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109094116 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 109094161 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109094457 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109094765 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 109094863 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109095098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109095243 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109095392 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 109096227 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109096889 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109097804 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 109097999 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 109098025 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109098073 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 109099749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109099927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109100607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109100649 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109101173 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109101938 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109102876 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109103306 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109103349 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 109103801 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109104727 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109105620 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109105679 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 109105681 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 109105787 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109105889 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 109106078 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109106311 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 109106318 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 109106690 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 109106839 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 109106892 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109106894 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109106949 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109106981 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109107028 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109107043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109107196 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 109107253 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 109107577 T G Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 109107795 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 109107796 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 109107827 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 109107847 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 109107867 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 109107921 A C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 109108122 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109108379 A C Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 109108404 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109108623 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109108714 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 109108748 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 109108838 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109108856 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 109108893 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109108988 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 109109328 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109110136 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109111802 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109113336 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109113834 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 109113844 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 109114245 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109114518 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109114521 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109114908 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109115085 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 109115541 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 109115731 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 109115752 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 109115806 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 109115814 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 109115954 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 109116000 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109116048 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 109116176 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 109116209 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 109116270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109116347 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 109116381 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 109116412 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109116517 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109116632 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109116659 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109116830 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 109116855 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 109116870 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109117093 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 109117254 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 109117313 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 109117403 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109117414 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 109117434 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 109117474 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 109117488 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 109117495 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 109117533 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109117554 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109117638 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109117658 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109117746 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109118014 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109118024 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109118076 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109118218 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 109118222 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 109118305 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109118400 T C N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 109118401 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 109118836 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 109118928 G C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 109118942 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 109118964 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 109119075 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 109119200 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109119339 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 109119614 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 109119666 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 109119753 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 109119830 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 109119984 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 109120224 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109120256 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109120466 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 109120498 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 109120513 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 109121645 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 109122055 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 109122082 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 109122936 C G Y N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 109123114 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 109123127 T G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 109123222 T A Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 109123299 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 109123535 T G Y N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 3 109123581 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 109123673 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 109123898 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109123977 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109124037 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109124202 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109124406 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109124538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109124739 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109124905 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 109124920 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 109124936 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 109125535 A G N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 109126141 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 109127177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109127705 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109127738 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109127918 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109127967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109128117 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109128173 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 109128579 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109128591 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109128602 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109128627 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109128703 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109128876 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109129148 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109129192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109130267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109130525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109132328 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109133829 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109134377 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109134648 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 109134954 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109135844 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109135978 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109136179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109136400 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109136782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109137086 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109138800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109140901 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 109142152 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109142487 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109142733 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109143017 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109144493 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109145393 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109145566 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109146956 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109147504 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109149068 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109149278 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109149646 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109151105 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 109152091 T C Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 3 109152176 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 109152292 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109152490 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109152498 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109153296 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109153352 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109153395 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109153517 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109154497 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 109156150 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109156210 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109157051 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109157269 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 109157280 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 109157291 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109157309 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 109158337 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 109159918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109165795 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109165841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109167012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109170169 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109170367 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109171945 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109173889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109174249 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109174959 G T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 109175150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109175249 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109175446 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109175740 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 109175930 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109176056 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109176525 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109176556 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109176813 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 109176815 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 109176847 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109176884 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 109176973 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109177310 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109177322 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 109177338 A G Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 109177451 C T Y Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 3 109177459 C T Y Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 109177555 A G Y Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 3 109177610 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 109177616 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109177712 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109177755 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109177830 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109178181 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 109178183 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 109178197 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 109178218 C A Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 3 109178259 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 109178292 C T N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 109178298 C A N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 109178376 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 109178384 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109178606 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109178614 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 109178671 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 109178887 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109178959 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109179031 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109179160 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109179345 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109179362 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109179379 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109179432 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 109179462 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109179493 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109179580 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109179634 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 109179782 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 109179821 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 109179845 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 109179860 A T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 109179960 T G N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 109179973 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 109180031 C T N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 109180033 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 109180623 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 109180633 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 109180634 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 109180650 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109180675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109180710 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109180922 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109180950 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 109181054 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 109181084 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 109181103 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 109181118 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 109181240 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109181243 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 109181264 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109181357 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 109181370 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109181388 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109181560 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109181689 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109181925 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 109181932 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 109181958 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109181999 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109182013 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 109182269 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109182303 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109182596 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109183626 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109184237 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109184455 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 109184474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109184635 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109185289 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109185499 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 109185717 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 109185966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109186200 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109186201 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109186217 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109186256 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109186384 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 109186537 G C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 109186663 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 109186674 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109186677 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109186808 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109186923 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 109186971 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 109187023 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109187180 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 109187197 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109187214 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109187222 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 109187665 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109187728 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 109187817 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109187962 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 109188033 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 109188041 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 109188109 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109188136 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109188382 G T Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 109188513 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109188778 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 109188992 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 109189070 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 109189080 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109189089 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 109189184 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 109189218 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 109189274 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 109189276 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 109189341 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 109189552 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 109190451 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 109190535 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 109190545 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109190711 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 109190723 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 109191455 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109191811 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109191814 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109191976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109192024 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109192126 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109192324 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109192504 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 109193018 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 109194057 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109194108 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109194281 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109194731 G C N N 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 7 7 2 3 2 3 109195244 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109195500 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 109195512 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 109195705 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109195813 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 109195875 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109196109 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109196422 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109196769 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 109196786 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 109196805 T A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 3 109196838 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 109197630 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 109198141 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 109198174 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 109198254 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109198346 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109198435 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 109198458 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109198463 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 109198617 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 109198618 A C N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 3 109198753 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 109198880 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 109198894 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 109198926 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 109199021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109199224 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109199364 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 109199400 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109199402 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109199544 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 109199614 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 109199629 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 109199760 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 109199789 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 109199991 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109200068 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 109200096 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 109200147 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109200236 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109200284 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109200514 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109200538 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 109200552 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 109200576 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 109200679 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109200747 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 109200817 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109200969 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109201021 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109201024 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109201095 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 109201232 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109201243 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 109201245 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 109201281 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 109201525 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109201575 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 109201600 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109201626 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109201873 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109201960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109201963 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109201979 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109202004 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 109202023 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 109202069 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109202624 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109202701 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109202754 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109202910 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 109202921 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 109202966 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109202973 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109202988 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109203132 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109203191 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 109203215 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109203283 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109203342 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109204074 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 109204412 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109204546 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109204587 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109204593 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109204625 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109204650 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109204694 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109204710 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109204733 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109205816 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 109206296 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109206804 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 109206807 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109207272 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109207335 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109207659 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109208026 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109208146 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109208378 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109209543 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 109209805 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109209845 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109210068 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.1875 0.75 0.0625 18 14 3 12 1 3 109210094 C G N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 3 109210560 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109210596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109210638 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109210803 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109211283 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 109211348 A T N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 109211358 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 109211498 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 109211954 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 109211995 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 109212224 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 3 109212240 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 109212344 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 109212568 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 109212575 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 109212592 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 109212756 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109212757 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109212831 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109213547 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109214128 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109214217 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109214230 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109214263 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109214281 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109214329 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109214833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109214857 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 109215043 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109215292 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109216196 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109216239 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 109216420 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 109217044 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 109217283 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 109217417 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109217418 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109217438 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 109217448 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 109217482 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 109217518 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109217583 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 109217644 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 109217705 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109217895 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109217932 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 109217956 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 109218070 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109218118 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109218134 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109218154 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109218172 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 109218216 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109218289 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109218307 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109218373 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 109218541 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 109218900 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109218924 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109218998 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 109219012 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 109219227 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 109219228 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109219274 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 109219308 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109219472 T A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109219530 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 109219685 G A Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 109219702 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109219726 T C Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 109219955 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109219963 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109220102 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109220283 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 109220294 A G Y Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 3 109220346 G T Y N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 3 109220379 C A Y N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 109220465 C G Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 109220479 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 109220848 T G Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 109221370 C T Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 109221702 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 109221840 T G Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 109221845 C T Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 109222005 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109222128 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 109222337 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 109222451 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109222458 T A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109222473 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109222474 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109222548 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109222577 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109222688 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109222706 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109222733 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 109222837 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109222905 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109223016 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109223031 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109223053 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109223102 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 109223131 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 109223154 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109223183 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109223217 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 109223326 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109223333 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109223483 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109223621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109223779 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109223780 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109223868 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109223869 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109223902 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109223917 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 109223956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109224036 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109224221 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109224425 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109224538 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109224885 T C N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 109224910 G A N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 109224976 A G N Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 3 109224982 A G N Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 3 109225210 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 109225215 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 109225222 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109225303 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109225364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109225922 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109225964 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109226020 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109226105 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109226116 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109226417 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 109226492 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109226615 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109226730 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109226745 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109226827 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109226959 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109227060 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109227070 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 109227112 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 109227141 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109227163 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109227201 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109227267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109227273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109227368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109227498 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109227505 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109227921 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109227954 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109228007 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109228079 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109228243 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109228480 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109228492 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109228961 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109229051 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109229351 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 109229470 T C N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 3 109229605 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 109229611 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 109229728 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109229929 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109229942 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 109230032 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 109230041 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 109230048 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109230082 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 109230092 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 109230140 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 109230985 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 109231017 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109231045 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109231106 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 109231153 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 109231241 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 109231250 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109231260 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 109231274 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 109231425 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 109231430 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 109231487 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 109231523 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109231577 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109231620 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 109231704 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 109231706 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 109231772 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109231782 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 109231993 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 109232337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109232348 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 109232402 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109232642 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109232662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109232787 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109232788 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 109232831 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 109232915 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109232955 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109233120 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109233611 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109233859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109233871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109233975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109234091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109234120 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 109234338 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109235024 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109235137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109235587 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109235632 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109235640 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109235670 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 109235710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109235949 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 109236267 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109236414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109236447 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109236451 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109236504 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 109236554 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109237032 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109238344 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109238382 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109238385 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109238435 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 109238657 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 109238670 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 109238747 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 109238778 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 109238800 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 109238905 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 109238911 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 109239078 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 109239141 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 109239144 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 109239195 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 109239303 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 109239319 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 109239355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109239363 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 109239370 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109239376 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 109239390 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109239702 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 109239823 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109239859 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 109239951 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109240065 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 109240103 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109240128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109240225 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109240252 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 109240274 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 109240314 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 109240328 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 109240366 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 109240478 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 109240536 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 109240558 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 109240600 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 109240662 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 109240683 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 109240775 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109241013 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 109241075 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109241122 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 109241133 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109241183 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109241209 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109241311 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109241313 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 109241414 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109241430 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 109241460 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109241502 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109241522 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 109241552 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 109241648 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109241688 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 109241780 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 109241783 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109241847 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 109241867 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 109241971 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 109241995 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 109242142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109242151 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 109242155 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109242509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109242617 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 109242851 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 109243047 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 109243183 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 109243783 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 109243817 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 109243836 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 109243930 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 109244011 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 109244173 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109244308 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109244352 G T N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 109244373 T G N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 109244378 T C Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 109244833 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 109244855 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 109244933 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 109244989 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 109245164 C A N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 3 109245183 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 109245194 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 109245195 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 109245346 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 109245369 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 109245531 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109245635 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 109245639 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 109245770 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 109245773 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 109245869 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 109245875 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 109246058 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 109246176 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109247083 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 109247247 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 109247711 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 3 109247722 C T N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 3 109247745 C G N N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 3 109247759 C T Y Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 3 109247760 C T N Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 3 109248278 A C N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 3 109248430 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 109248492 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 109248519 G A Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 109248981 G C Y N 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 11 7 2 7 0 3 109249049 A C N N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 7 13 1 5 4 3 109249273 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 109249354 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 109249385 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 109249585 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 109249782 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 109249810 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 109249813 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109249834 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 109249856 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 109249858 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 109249896 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 109249953 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 109249993 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 109250033 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 109250179 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 109250199 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109250248 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109250351 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 109250389 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109250525 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 109250565 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109250582 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109250715 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109250933 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109251123 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109251238 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109251255 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109251469 T C Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 109251799 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 3 109251808 C T Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 109251873 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 109251880 C T Y Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 3 109251904 G A Y Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 3 109252003 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 109252204 A G N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 3 109252295 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 109252560 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109252577 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 109252611 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 109252653 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 109252702 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 109252750 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109252781 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 109252825 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 109252987 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109252995 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109253182 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 109253246 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 109253266 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109253310 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109253671 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109253703 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109253730 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 109253802 T C Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.125 0.8125 0.0625 17 15 2 13 1 3 109253904 T C Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 109253943 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 109254016 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 109254072 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 109254073 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 109254096 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 109254126 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 109254141 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 109254225 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 109254330 C G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 109254451 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 109254549 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109254937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109255126 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 109255428 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109255465 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 109255725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109255732 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109255818 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109255953 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109255966 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109255979 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109256029 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 109256032 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 109258553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109259318 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109259369 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 109265692 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 109266012 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109266456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109266501 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109266531 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 109267183 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 109267304 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 109267364 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109267493 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109267556 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109267609 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109267950 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 109268007 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 109268110 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 109268111 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 109268135 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109268181 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 109268183 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 109268209 A T N N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 3 109268317 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 109268320 A G N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 3 109268336 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 5 7 1 3 2 3 109268342 G T N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 109268684 T G N N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 3 109268845 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 109268856 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 109268904 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109269324 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109269388 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109269472 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109269549 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109269721 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109269746 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109269771 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109269835 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109269904 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 109269923 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 109270148 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 109270288 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109270336 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109270383 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109270609 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 109271002 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109271400 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109271402 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109271414 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109271587 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109271593 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 109271609 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 109271706 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109271800 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109271824 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109271825 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 109271845 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109271847 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109271986 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109272036 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109272092 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109272101 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109272194 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109272521 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109272873 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109272897 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109272901 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109273110 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109273241 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109273263 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109273287 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 109273288 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 109273340 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109273396 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109273550 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109273692 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 109273711 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 109273752 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109273822 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 109273933 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109273982 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109274004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109274108 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 109274214 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109274224 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109274353 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109274412 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 109274503 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109274588 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 3 109274604 C T N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 109274654 C G N N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0.2 0 0.8 2 8 1 0 4 3 109274663 C A N N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 3 109274691 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 109274740 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 109274761 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 109274858 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 109274943 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109275012 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109275033 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 109275048 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109275208 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 109275223 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 109275228 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 109275245 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109275249 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109275262 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109275275 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109275330 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109275355 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109275369 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109275408 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109275452 A C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 109275480 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109275486 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109275519 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109275587 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109275631 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109275768 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109275853 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109275855 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 109275867 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109275879 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109275914 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109275918 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109275938 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109275943 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109275971 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109276043 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 109276078 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 109276111 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109276142 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 109276337 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 109276377 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 109276412 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109276414 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109276678 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109276708 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 109276921 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 109276971 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 109277212 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109277548 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109277679 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109277851 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109277909 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 109278690 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109278955 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109279108 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109279134 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 3 109279257 C A N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 109280217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109281373 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109281381 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109281749 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109283659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109284487 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 109284741 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109285171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109285321 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109285733 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109286317 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 109286457 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109286921 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109287143 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 109287202 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 109287656 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 109287708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109288192 G T Y N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.0769230769230769 13 13 1 11 1 3 109288196 G T Y N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.133333333333333 0.8 0.0666666666666667 16 14 2 12 1 3 109288474 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 109288555 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 109288642 G A N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 12 8 3 6 1 3 109288730 C A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 109289150 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 109289210 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 109289227 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109289352 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 3 109289400 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 109289472 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 109289519 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109289557 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 109289631 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 109289701 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109289736 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 109289855 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 109289881 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 109290048 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 109290267 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 109290295 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109290364 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 109290870 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109290940 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109291014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109291086 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109291473 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109291479 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109291697 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109292141 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109292142 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109292157 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109292203 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 109292299 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109292373 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109292386 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109292400 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109292490 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109292500 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109292543 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109292548 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109292557 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109292594 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109292608 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109292671 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109292679 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109292723 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109292823 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109292853 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109292983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109293293 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 109293506 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109294225 T G Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 109295154 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109295202 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 109295449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109296664 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 109296682 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 109297357 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109297443 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109297787 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 109297917 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 109298132 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 109298167 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 109298198 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 109298262 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 109298264 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109298329 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109298335 T A N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 109298366 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 109298388 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 109298674 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109298769 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109298822 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 109299833 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 109299917 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 109299954 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 109300207 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 109300610 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109300727 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109301069 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109301114 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109301459 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109302846 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109303409 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 109304160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109304187 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 109304344 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109304356 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 109304623 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109304665 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109304701 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109304832 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109305015 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109305036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109305139 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 109305397 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109305428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109305429 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109305492 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 109305501 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 109305660 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 109305850 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109305928 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 109306088 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109306209 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 109306219 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109306228 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109306244 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 109306630 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109307355 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 109307421 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109307566 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109307734 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109307739 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109308336 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109310071 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109310189 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 109310749 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109310836 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 109310865 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109311017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109311240 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109311335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109311602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109313330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109314435 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 109314602 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109314893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109315185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109315395 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 109315488 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 109315518 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 109315597 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 109315633 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109315699 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 109315818 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 109316028 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 109316102 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 109316170 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 109316688 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 109317660 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 109317665 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 109317704 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 109317750 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 109317781 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 109317897 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 109318016 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109318027 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 109318031 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 109318049 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 109318153 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 109318244 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 109318351 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 109318414 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 109318516 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 109318641 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 109318657 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 109318712 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 109318747 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 109318810 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 109318823 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 109318868 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 109318888 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 109319060 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109319075 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 109319145 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 109319306 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 109320301 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109320531 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109320554 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109320764 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 109321318 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 109321336 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109321408 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 109321414 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 109321499 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109321510 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109321656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109321953 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109322074 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109322147 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 109322261 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109322282 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109322295 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109322335 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 109322700 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109322860 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109322885 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109322924 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109322947 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 109323296 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109323607 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109323691 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109323719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109323740 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109323760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109323879 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109323931 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109323936 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109324011 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109324149 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109324535 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 109324903 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 109324921 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 109324999 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109325051 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109325198 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109325222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109325226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109325270 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 109325329 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109325338 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109325341 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109325446 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109325473 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109325477 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109325513 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109325514 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109325537 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 109325550 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 109325727 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109325785 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 109325912 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109326056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109326066 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109326067 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 109326158 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109326275 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109326595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109326750 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 109326787 C G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 109326804 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 109326935 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109327112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109327129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109327615 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109327835 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 109328009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109328125 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109330208 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109330627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109331405 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109332966 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109334395 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109335401 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109335491 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109335862 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 109336019 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 109337025 G A N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 109339387 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 109339456 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109339603 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 109340138 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 109340271 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 109340440 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109341328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109341451 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109341620 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109341634 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109341651 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109341797 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109342080 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 109342212 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109342294 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109342674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109342734 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109343057 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 109343517 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109343548 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109343803 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 109343809 C A N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 109343816 T G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 109343831 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 109343875 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 109344227 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 109344230 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109344479 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 109344979 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 109345553 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 109345947 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109346571 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109347169 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109347288 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 109347482 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109347500 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 109347570 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109348067 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109348219 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 109349050 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109349812 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109350094 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109350353 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 109351021 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109351723 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109352092 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109352175 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 109352180 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109352198 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 109352346 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109352446 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109352494 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109352495 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109352879 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109352894 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 109352927 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109353014 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 109353051 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 109353132 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109353133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109353143 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109353168 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109353190 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109353209 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109353219 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109353255 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109353264 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 109353275 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109353912 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109353925 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109353927 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109353940 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109353942 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109354002 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.375 0.1875 0.4375 15 17 6 3 7 3 109354329 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109354500 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 109354908 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109355018 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109355052 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109355069 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 109355221 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 109355237 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 109355248 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 109355260 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109355317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109355387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109355575 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 109355587 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 109355626 C A N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 109355673 T C N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.272727272727273 0.272727272727273 0.454545454545455 9 13 3 3 5 3 109355707 C A N N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 6 14 2 2 6 3 109355762 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 109355801 C A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 109355814 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 109356130 T A N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 109356267 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 109356272 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 109356574 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 109356771 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 109356777 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 109357347 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 109358428 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 109358471 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 109358568 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109359266 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109359497 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 109359694 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 109359752 T C N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 3 109359816 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 109359951 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 109359959 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 109360060 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 109360097 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 109360166 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109360205 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 109360206 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109360304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109360397 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109360815 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109360817 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109360869 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 109360981 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 109361038 A T N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 109361121 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109361757 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 109362155 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109362177 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109362237 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 109362239 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 109362396 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 109362404 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109362451 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109362522 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 109362616 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 109362641 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 109362650 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 109362688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109362716 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 109362731 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 109362877 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 109363100 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109363205 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109363803 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109364521 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 109364781 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109365268 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 109365337 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 109365447 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 109365481 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 109365876 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 109365935 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109366354 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109366750 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 109367419 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 109367526 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109367534 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 109367585 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 109367715 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 109367819 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 109367893 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 109367988 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 109368092 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 109368350 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109368353 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 109368478 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 109368485 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 109368543 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109368773 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 109368850 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 109368948 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 109369064 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 109369468 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 109369483 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109369590 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 109369699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109369909 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 109369957 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 109369982 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109370053 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 109370153 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109370198 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109370748 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109370892 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 109371215 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109371314 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 109371426 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 109371642 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109371688 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109371783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109371959 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109372140 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 109372494 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109372765 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109373812 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109374347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109374362 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109374454 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109374529 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 109374616 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 109374652 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 109374669 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109374721 G C N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 3 109374738 A G N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 109375011 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 109375154 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 109375164 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 109375319 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 109375347 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 109375419 G C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 109375429 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109375574 T C N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 109375582 G A N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 3 109375640 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 109375691 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 109376061 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 109376158 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109376195 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 109376266 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 109376268 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 109376311 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 109376356 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109376867 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109377160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109377471 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 109377484 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 109377521 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 109377543 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 109377564 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109377957 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 109377959 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 109378050 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 109378176 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109378455 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 109378759 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109379376 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109379579 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 109379891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109379910 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109380170 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 109380325 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 109380503 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 109380722 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109380733 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 109381025 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109381077 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 109381078 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 109381127 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 109381147 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109381436 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109381529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109381549 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 109381631 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109381713 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 109381723 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 109381819 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109382338 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 109382379 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 109382415 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 109382416 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 109382593 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 109382606 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 109382651 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109382655 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109382767 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 109383142 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109383351 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109383697 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109383754 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 109384066 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109384137 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109384816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109385036 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109385680 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109387662 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109388140 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109388170 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 109389618 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 109390393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109391980 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109393171 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109394700 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109394897 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109396037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109396180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109396330 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109396637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109396778 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 109396987 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 109397491 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109397878 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109397946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109398846 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109401370 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109401828 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109402812 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109402959 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 109402970 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109403114 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109403172 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109403369 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 109403561 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109405506 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109406429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109406928 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109407059 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109408541 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 109412930 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109413349 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 109413526 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109414115 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 109415303 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109415318 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109423374 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 109423738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109423889 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109423953 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109424278 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 109424398 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 109424450 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 109424632 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 109424678 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 109424841 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 109425024 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 109425050 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 109425309 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 109425768 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 109425793 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 109425833 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 109425836 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 109425908 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 109425937 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 109425943 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 109425948 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 109425960 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 109425964 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 109426068 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 109426141 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 109426154 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 109426196 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 109426210 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 109426264 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 109426357 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 109426392 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 109426526 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 109426527 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 109426543 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 109426587 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 109426610 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 109426616 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 109426629 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 109426732 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 109426870 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 109426946 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 109427021 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 109427047 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 109427102 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 109427138 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 109427201 T G N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 3 109427215 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 109427351 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 109427382 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 109427397 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 109427424 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 109427521 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 109427702 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 109427724 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 109427749 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 109427925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109428394 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 109428596 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 109429054 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109430822 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109431167 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109431521 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 109431776 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109432096 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 109432315 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 109432369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109432444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109432463 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109432618 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109432680 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109432847 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109433113 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109433278 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 109433314 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109433949 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 109433970 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 109434130 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 109434141 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 109434234 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 109434313 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 109434383 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 109434412 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 109434517 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109434818 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109435074 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109435956 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 109435984 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 109436017 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109436039 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 109436461 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 109436797 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109437288 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109437672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109439635 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 109440993 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 109441378 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109441767 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109442794 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109442848 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109443071 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109443110 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109443123 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109443166 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109443453 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109443470 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109443890 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 109444185 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109445041 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109445217 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109445260 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109446312 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 109446581 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109446589 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109446642 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109446687 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109447621 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109448341 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 109449929 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 109450108 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 109450781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109451096 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109451185 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 109451632 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109453210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109454069 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 109454577 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109454900 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109454989 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109455190 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109455308 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109455559 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109455643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109455669 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109456049 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 109456218 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 109456297 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 109456550 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 109456608 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109456614 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109456675 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 109456702 T A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 109457044 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109457126 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109457219 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109457969 C A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 109457990 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109458051 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 109458452 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109458539 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109459218 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109459448 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 109459575 T G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 109459779 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109459999 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109460094 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109461646 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 109461647 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 109461709 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 109461755 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109462171 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109462598 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 3 109462651 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109462844 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109462982 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109462995 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 109463026 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109463356 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.0625 0.625 0.3125 12 20 1 10 5 3 109463468 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 109463576 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 109463602 A G N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 3 109463604 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 109463893 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 109463925 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109463939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109464021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109464103 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109464146 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 109464223 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109464232 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 3 109464269 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109464298 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 109464307 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109464333 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109464359 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 109464672 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 109464821 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109464994 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109465129 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109465371 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 109465623 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109466087 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109466109 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109466599 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 109466638 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109466682 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 109466812 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109466884 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109466925 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 109466955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109467046 G C Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 109467107 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 109467148 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 109467208 C G Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 109467388 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 109467548 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 109467579 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 109467627 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 109467648 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 109467655 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 109467767 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 109467823 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 109468174 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109468197 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109468272 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109468349 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109468553 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109468844 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 109468924 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109469821 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109469879 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109470081 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109470633 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109471921 G A N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 109474227 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 109475522 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 109475681 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109475704 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109475756 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 3 109476069 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 109476461 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 3 109476524 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 109476536 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 109476547 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 109476639 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 3 109476658 T A N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 3 109476772 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 109476781 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 109476816 T G N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.125 0.6875 0.1875 15 17 2 11 3 3 109476953 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 3 109477009 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 3 109477053 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 109477092 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109477114 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 109477204 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 109477208 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 109477459 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 109477479 A T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 3 109477502 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 109477750 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109477809 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109477924 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 109477930 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 109477996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109478291 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 109478423 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 109478474 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 109478576 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 109478595 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 109478644 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 109478693 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 109478812 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 109479078 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 109479086 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109479118 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 109479291 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 3 109479319 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 109479393 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109479399 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109479426 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 109479578 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 109479700 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109480133 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 109480877 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109481379 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109481679 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 3 109481736 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109481938 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 109481987 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109482549 A G N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 109482659 T C N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 109482791 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109483717 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 3 109484840 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109484978 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109485319 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109486166 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 109486227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109488181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109489007 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109489022 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109489055 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109489193 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109489385 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109489841 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109489953 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109490009 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109490054 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109490132 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109490201 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109490324 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109490461 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109490496 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109490602 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109490632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109490699 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 109490735 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109490747 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109490821 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 109492571 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109492902 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109492965 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109493198 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 109493934 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 109494092 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109495889 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 109496001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109496019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109496149 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109496752 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 109496774 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 109498545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109498612 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109498637 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 109498734 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109498761 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109499324 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 109499686 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109499863 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 109500053 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 109500054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109500545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109504271 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109506038 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109506828 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 109507051 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 109507274 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109507399 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 109507691 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109508175 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 109508286 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 109508576 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109509062 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 3 109509148 A T N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 109510104 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 109510175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109511470 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109511490 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 109511553 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 109511651 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 109511673 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 109511676 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109511691 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 109511768 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 109511769 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 109511899 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 109511922 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 109512078 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 109512101 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 109512181 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 109512245 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 109512280 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109512392 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 109512495 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 109512540 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 109512556 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 109512851 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109513020 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 109513201 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 109513259 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 109513315 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 109513415 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109513448 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 109513466 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109513557 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109513869 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109515385 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 109515457 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 109515579 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 109515600 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 109515848 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109515881 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 109515887 T A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 109516173 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 109516406 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 109516461 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 109516588 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109516606 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 109516671 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 109516952 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109517257 T A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 109518268 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109518323 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109518468 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 109518488 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109519494 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 109519697 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 109519988 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109520278 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 109520615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109520892 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109521537 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109523577 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 109524281 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109525463 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109526391 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109527042 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 109528113 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109528192 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109528254 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109529272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109530555 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109531791 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109532390 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109532487 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109534442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109534483 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109534730 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109535185 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 109535323 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 109535564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109538468 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 109538510 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 109540732 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 109541087 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109541454 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 109541676 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109542746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109543454 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 109543467 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 109545022 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109545390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109545729 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.105263157894737 0.789473684210526 0.105263157894737 19 19 2 15 2 3 109545834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109545837 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 109545928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109546132 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 109546366 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109546711 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109546879 G C Y N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 109547555 A G Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 109548352 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109550105 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109550665 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 109550721 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109551135 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 109551155 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109552160 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109552595 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109553098 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109553112 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 109553879 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109554364 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109554724 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109554827 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109554888 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109555485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109555497 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109555579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109555864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109556031 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109556073 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109556508 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109556894 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109556989 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 109557312 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109557705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109558379 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109558399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109558627 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109558733 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 109558735 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 109558779 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 109558872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109558950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109559018 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109559209 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109559244 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 109559245 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 109559334 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 109559784 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 109559802 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 109559842 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 109559858 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 109559970 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 109560165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109560185 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 109560264 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 109560266 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 109560296 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 109560309 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 109560962 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109561027 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 109561032 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 109561200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109561239 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 109561290 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 109561313 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 109561472 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 109561554 G T N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 109561684 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 109561874 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 109562008 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 109562023 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 109562184 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 109562204 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109562477 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 109562639 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109562937 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 109563227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109563442 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109563760 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 109563992 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 109564453 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 109564532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109565723 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109566160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109566792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109567360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109567621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109568228 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 109568445 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109569198 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 109569219 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 109569919 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 109570306 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 109570325 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 109570468 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109570490 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109571617 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109571730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109572223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109573603 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109573682 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 109574171 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109574395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109574567 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109575853 T A N N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 3 109575967 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109576059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109576852 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 109577100 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 109578023 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109578070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109578518 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 109579061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109579370 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 109580155 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 109581013 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109581180 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 109581669 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109581893 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 109582344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109583286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109588536 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109589798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109589820 A C Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 109589866 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109589868 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 109589906 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109589967 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109590165 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109590423 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109590446 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109590495 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109591095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109591284 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109591308 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109591347 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109591481 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109592194 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 109592419 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109592601 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109592681 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109592697 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109593060 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109593067 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109593218 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109593557 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109593745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109593893 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109594139 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109594348 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109594774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109594856 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109594866 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 109594895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109595414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109595438 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109595566 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 109595657 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 109596034 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109596035 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109596045 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109596297 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109596323 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109596376 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109596401 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 109597005 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109597102 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109597225 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 109597328 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109597335 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 109597367 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 109597442 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 109597507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109597691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109597722 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109597932 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 109598477 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109598804 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 109599101 C T N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 3 109599270 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109599297 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109600738 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109601396 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109602113 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109603656 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109605484 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 109607253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109608395 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 109609953 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109611036 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 109611060 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109611245 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109611355 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109611367 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109611432 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109611551 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109611907 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109611908 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109611921 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 109612174 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109612453 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 109613645 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109614447 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 109614700 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 109615075 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109615210 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109615476 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109615510 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 109616754 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109617134 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109618184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109618901 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109619107 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 109619118 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109619253 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109619948 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109619992 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109620247 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 109620439 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 109621200 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 109621313 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 109621432 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 109621642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109621995 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 109622144 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109622154 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109622155 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 109622202 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 109622243 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 109622432 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 109622469 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 109622622 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 109622665 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 109623080 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 109623089 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 109623097 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 109623320 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109623570 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 109623628 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 109624046 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 109624147 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 109624562 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 109624994 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109625288 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109625356 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109627025 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 109627223 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109627988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109628052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109631185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109632403 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109636558 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109636880 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109637735 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 109639367 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109640379 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 109640998 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109641260 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109641300 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109641485 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 109641640 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 109641653 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 109642505 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 109642642 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109643160 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 109643509 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 109643574 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 109645726 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109645793 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109646250 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109646810 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109647352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109647896 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109649707 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109649775 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109650391 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109653299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109655818 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109656479 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109657788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109658058 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109658167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109659015 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 109659940 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 109660018 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109660641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109660790 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109660892 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109660996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109661068 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 109664295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109664536 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109664811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109665350 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109665567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109666726 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109666979 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.210526315789474 0.736842105263158 0.0526315789473684 22 16 4 14 1 3 109668639 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 109668801 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 109671118 T C Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 109671506 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 109672629 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109672707 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109672822 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109672906 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 109673605 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 109673669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109673717 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109673787 T G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 109673903 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 109673942 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 109674101 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 109674106 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 109674129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109674152 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109674817 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109675732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109675935 A C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 109675954 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 109675957 G C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 109675966 A C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 109676136 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 109676424 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109676440 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109676719 T C Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 109677344 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 109677492 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 109677505 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 109677663 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 109677897 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 109677937 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 109677945 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 109678052 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 109678080 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 109678095 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 109678101 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 109678125 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 109678379 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 109678409 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 109678528 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 109678644 A C N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 109678753 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 109678863 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 109679203 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 109679346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109679655 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 109679824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109680948 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109682960 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 109683433 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 109683450 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109683500 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109683786 A C N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 109685601 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 109685731 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109686092 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109686299 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109686496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109686497 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109687012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109687018 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109687100 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 109687315 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 109687383 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 109687403 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109687470 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 109687532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109687653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109688013 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109688332 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 109688355 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 109688720 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 109688796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109688973 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109689000 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109689004 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109689101 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109689172 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 109689339 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109689347 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 109689352 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109689432 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 109689523 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 109689587 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 109689805 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 109689948 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 109689953 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 109689960 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 109690072 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 109690183 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 109690301 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109690361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109690672 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 109690688 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109690776 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 109690849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109690866 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 109690897 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109690900 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109690949 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109690952 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109691020 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109691024 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109691204 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109691423 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 109691526 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109691536 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109691781 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109691963 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109692000 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 109692059 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 109692105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109692130 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109692300 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109692311 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109692350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109692356 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109692364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109692647 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 109693057 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 109693119 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 109693328 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109693989 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 109694639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109695722 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109697773 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109697885 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 109700820 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109700927 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109702241 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 109703516 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109703992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109705031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109706718 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109708263 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109708282 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109709414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109709657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109710082 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 109711725 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 109711905 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109712127 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 109712161 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109712698 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 109712861 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109713382 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109714034 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109717222 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109717675 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109718414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109720279 C G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 109720671 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109721531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109721808 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109721836 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109722584 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109723886 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109724367 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109724606 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109725250 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109726448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109726591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109726644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109728113 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109728253 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109728304 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 109728334 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109728340 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 109728429 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109728487 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109729427 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 109729615 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109731017 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 109731093 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109731468 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109731513 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 109731948 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109732121 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 109732234 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 109732315 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109732432 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 109732478 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109732724 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 109732772 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 109732805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109732836 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109732881 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 109732885 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109732892 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 109733042 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109733047 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109733135 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 109733142 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109733162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109733186 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 109733244 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 109733286 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109734469 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 109734472 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 109734495 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109734890 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 109735156 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 109735176 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109735514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109735621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109735633 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109735643 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109736159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109736303 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109736395 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109736681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109737160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109737353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109737600 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109739162 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109739436 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109740156 T G N N 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 109741403 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 109741794 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 109741804 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109741835 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109742175 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109742184 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109742373 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109742695 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 109742829 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 109742954 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109743272 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 109743365 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 109743994 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109744083 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109744196 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109744206 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109744408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109744636 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109744684 G C Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 109744954 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 109745162 T C Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 109745444 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 109745481 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109745532 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 109745696 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109745711 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109746875 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109747310 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109747526 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109748074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109748096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109749293 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109749336 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 109749643 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 109749981 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109750146 T G N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.2 0.733333333333333 0.0666666666666667 17 13 3 11 1 3 109750416 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 109750530 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109750738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109751533 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109751641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109751955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109752410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109752517 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109752769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109752874 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109753251 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109753278 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109753293 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109755485 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109756349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109756479 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109756492 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109757027 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109757400 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109761221 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109761748 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109762341 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109765744 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 109767429 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 109767899 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 109768132 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109768192 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109768291 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 109768680 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 109768711 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109768728 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109768743 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109768994 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109769062 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109769165 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109769216 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109769235 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109769250 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109769304 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109769321 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109769341 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109769498 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 109769833 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109769871 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109769918 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109769922 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109770013 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109770028 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109770051 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109770080 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 109770178 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109770212 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109770365 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109770384 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109770409 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109770416 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109770429 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109770455 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 109770457 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109770469 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109770546 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 109770556 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 109770568 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 109770575 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 109770600 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 109770611 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 109770625 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109770647 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 109770687 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 109770695 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 109770809 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 109770830 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109770865 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109770900 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109770905 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109770932 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109771036 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109771088 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109771091 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109771115 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109771661 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 109771987 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109772488 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109772689 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109772949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109773616 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109774011 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109774023 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 109774027 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109774057 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 109774171 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109774491 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 109774649 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 109774651 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 109774719 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 109775102 T C N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 109775178 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 109775184 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 109775510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109775848 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 109775861 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 109776430 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109776904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109777234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109777333 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 109777629 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109777905 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 109779082 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109779472 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 109779517 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 109779530 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 109779620 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109779810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109779967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109780039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109780046 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 109780105 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109780206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109780223 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109780640 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109781103 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 109781107 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 109781450 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109781461 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 109781747 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 109781792 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 109781941 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 109781991 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 109781998 G T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 109782019 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 109782111 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109782196 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109782207 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 109782362 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109782855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109783189 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109783624 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109783692 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109783999 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109784035 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109784540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109784645 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109784817 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109784818 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109785834 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109785838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109786113 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109786209 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109786258 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109786262 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109786731 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109786906 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109787009 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109787087 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109787967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109788981 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 109790027 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109796433 A T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 109796576 G A Y Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 109796658 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 109796737 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109796822 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109796925 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109797481 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109797814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109798563 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109799637 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 109800223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109802229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109802266 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 109802368 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109802541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109802604 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109802940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109802988 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109803109 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109803240 T G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 109803863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109803920 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 109803958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109804119 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 109804320 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109804333 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 109804611 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109804671 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109804785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109804797 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109804990 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 109805266 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 109805954 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109806028 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 109806110 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 109806121 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109806417 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109806490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109806779 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109807032 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109807075 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 109807126 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109807188 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109807494 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109807521 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109807543 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109807719 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 109807790 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109807793 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109808057 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 109808225 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 109808246 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109808827 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 109809053 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 109809122 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 109809124 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 109809167 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 109809478 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109810292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109810321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109810731 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 109811230 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 109811468 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 109811857 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 109812692 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 109812998 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 109813964 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109814311 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109814884 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 109814944 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109815320 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109817726 A G Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 109818507 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109818701 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109818794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109819154 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 109819344 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109819863 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 109820573 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109821829 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109822094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109822301 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 109822652 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109822743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109822803 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109822876 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109822889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109823737 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109823834 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109824059 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109824229 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109824540 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109824956 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109825038 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 109825178 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 109825323 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109825381 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 109825723 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 109826496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109827179 G C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 109828852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109830502 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109830632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109831725 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 109831884 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 109832367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109832589 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109832779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109833411 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109833621 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 109833699 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 109834152 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 109834298 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 109834509 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109834598 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 109834602 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 109834615 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 109834673 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 109834713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109834734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109834914 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109835188 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109835210 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109835230 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109835332 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 109835341 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 109835427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109835563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109835612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109835637 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 109835647 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 109835664 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109835669 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 109835769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109835786 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 109835823 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 109836041 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 109836637 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 109837210 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109837992 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109838346 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 109838484 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 109839200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109839239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109839242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109840945 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109841062 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109841124 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109841239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109841922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109842588 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 109842602 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 109842681 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109843223 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 109843365 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109843816 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 109845598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109847734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109849446 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 109849496 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109850439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109850506 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 109850679 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109852066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109852180 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109853402 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109853630 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 109853649 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109853688 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109853757 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 109853772 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 109853793 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 109853823 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 109854854 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109855331 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 109855712 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109855876 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 109855912 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 109855934 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109856015 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 109856022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109856043 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109856167 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109856168 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109856189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109856545 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 109856553 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 109856565 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 109856567 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 109857956 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109858571 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 109858910 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109859625 T C Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 109867309 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109867517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109868778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109869537 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109869610 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109869618 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109871812 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109871947 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 109872132 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109872446 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 3 109873261 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109873553 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 109874666 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 109874760 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 3 109874812 G A Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 109875068 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109875377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109877322 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 109878249 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109878713 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 109879466 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109880524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109881745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109881933 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 109882129 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109882638 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109882848 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 109882987 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 109883403 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109883830 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109884827 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109885621 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109885656 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 109885901 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109886574 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109886981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109887234 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109887652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109887987 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109888011 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109888146 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109888275 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109888557 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109888661 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109888753 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109888778 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109889071 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109889187 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109889209 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109889490 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 109889547 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 109889586 A T N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 109889587 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 109890254 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109890351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109890433 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109890436 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109890491 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109890643 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109890644 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 109891447 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109891509 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109891510 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109891610 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109892460 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109892520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109892632 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109892707 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109892825 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 109893005 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109893254 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 109893334 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109893335 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109893420 G A Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 109894299 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 109894319 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 109894392 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 109894435 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109894455 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109894540 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109894555 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109894567 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109894593 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109894697 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109894755 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109894765 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 109894778 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109894779 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109894811 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109895004 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109895942 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109895975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109895977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109895996 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109896007 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109896097 A G Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 109896107 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109896168 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109896265 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 109896458 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 109896486 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 109896556 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 109896562 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 109896638 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109896863 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 109896905 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109897342 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109897651 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 109898066 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109898222 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109898492 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 109898543 G T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 109898627 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 109898680 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 109899109 T G Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 109899225 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109899410 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109899513 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109899630 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 109899830 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109900055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109900874 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 109901131 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109901900 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109902472 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109903346 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109903563 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109904379 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109904514 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109904553 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 109904570 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 109904595 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109904758 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109904975 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109905003 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109905795 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109906028 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 109906114 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 109906207 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109906216 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109906371 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109906433 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109906500 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 109906751 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 109906794 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 109906907 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 109906999 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 109907045 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 109907100 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 109907120 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109907181 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 109907217 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109907243 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109907333 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109907355 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109907382 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109907398 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109907481 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109907503 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109907535 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109907544 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109908084 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 109908093 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109908235 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109908252 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109908433 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109908525 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 109908537 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 109908939 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 109908940 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109909032 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109909075 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109909380 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 109909503 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109909504 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 109916372 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 109916514 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 109916782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109916838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109917186 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109917189 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 109917243 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109917246 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109917469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109917486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109917494 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109917859 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109917924 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 109918228 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 109918369 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 109918374 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 109918384 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109919005 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109919006 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109919028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109919168 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109919177 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109919213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109919542 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 109919774 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109919904 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109920004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109920458 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109920915 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109920930 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109920987 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109921035 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109921037 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109921087 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109921145 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109921147 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109921182 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109921232 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109921253 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109921256 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109921277 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109921286 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109921291 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109921329 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109921342 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109921377 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109921481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109921650 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109921736 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 109921823 A C N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 109921897 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 109922157 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109922230 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109922287 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109922354 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109922514 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109922571 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109922609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109922845 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 109922948 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109922974 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109923319 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109923352 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109923648 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109923723 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109924103 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 109924289 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 109924332 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109924450 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109924531 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109924749 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109924835 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109924848 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109925037 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109925040 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109925170 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109926177 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 109926745 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 109926927 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109927136 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109927418 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109929127 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.0555555555555556 18 18 1 16 1 3 109929334 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109929404 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109929532 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109929661 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109929680 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109929699 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 109929809 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 109930292 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 109930341 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 109930354 T G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 109930764 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 109930961 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109931027 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 109931041 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109931133 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 109931679 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109931722 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 109931781 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109931986 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109932057 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109932220 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109932651 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109932952 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109934064 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 109934806 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 109934815 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109935691 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109935909 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109935968 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109936049 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109936189 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109936226 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109936846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109937049 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109937369 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109937405 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 109937481 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 109937767 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109937964 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109937975 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109937988 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109938687 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109938893 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109939858 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109939978 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109940430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109940558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109940600 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109940841 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109940857 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 109941467 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109941818 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109945277 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109946063 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109946150 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0 0.733333333333333 0.266666666666667 11 19 0 11 4 3 109946643 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109947433 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109948001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109949754 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 109949959 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109949990 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109950227 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109950805 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109951243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109951251 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109951916 T G Y N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 109952588 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109952700 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109952703 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109952790 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109952930 C A N N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 109952985 T A N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 109952995 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 109953008 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 109953009 C A N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 109953327 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109953334 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109953436 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109953487 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 109954214 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109954369 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 109954401 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 109954468 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 109954532 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 109954610 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 109954623 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 109955393 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109955511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109955844 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109955906 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109956313 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109956462 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 109956523 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109956529 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109956746 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109956785 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 109956826 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 109956827 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 109957303 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109957324 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109957464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109957679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109957861 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109957915 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109957937 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109957953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109957964 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109958044 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 109958056 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109958135 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109958538 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109958839 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109959004 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109959107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109959197 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109960041 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109960113 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109960316 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109960393 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109960557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109960650 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109960922 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109961031 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109961116 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109961153 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109961196 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109961212 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109961395 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 109961667 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 109961668 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 109961939 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 109962246 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109963051 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109963128 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109963209 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109963345 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 109965473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109965969 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109966271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109966346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109966420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109966425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109966928 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 109967000 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109967164 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 109967290 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109967302 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109967446 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109967473 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109967490 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109967744 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109967779 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109967941 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109967974 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109968365 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109968369 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109968512 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109968751 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109968794 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109968801 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109968895 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109969003 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 109969084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109969133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109969191 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109969452 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109969744 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109969800 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 109970019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109970101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109970265 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109970645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109970811 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109971092 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109971281 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109971403 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109971493 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109971689 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 109971881 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109971909 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109971959 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109972094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109972141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109972166 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109972943 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109973190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109973255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109973302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109974888 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109975309 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109976262 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 109977669 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109977742 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109981066 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109981312 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 109981318 T A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 109981403 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109981783 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109981817 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 109981937 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109981965 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109982026 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109982072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109982171 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109982323 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109982403 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109982762 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109983302 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109983390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109983413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109983551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109983915 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109984243 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 109984936 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109984994 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109985107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109985580 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109985809 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109985810 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109987166 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109987304 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109987635 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109988290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109988849 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 109989359 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109989382 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109989684 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109989784 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109990104 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109990266 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109990353 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109990404 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109990519 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109990626 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109990701 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109990728 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109990782 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109990798 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109990804 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109990823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109991054 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 109991168 G T Y N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 109991236 A G Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 109991274 C G Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 109991277 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 109991286 A G Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 109991370 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 109991385 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 109991499 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109991602 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109991608 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109991671 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109991774 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109991781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109991866 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109991930 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109992041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109992089 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109992223 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109992237 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109992254 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109992469 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109992713 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109992831 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109992901 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109992905 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 109992982 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 109993000 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 109993084 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 109993091 C G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 109993117 C G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 109993125 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109993216 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 109993235 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 109993360 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 109993547 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 109993826 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109993836 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109994722 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109994729 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109994971 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109995372 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 109995728 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 109995776 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 109996050 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109996056 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109996277 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109996279 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109996298 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 109996393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109996475 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109996484 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109998698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109999423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 109999668 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109999898 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 109999993 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110000907 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 110000922 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110001639 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 110002671 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 110003745 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 110003795 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 110003816 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 110003856 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 110004163 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110004765 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 110005203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110005280 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 110005369 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110005418 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 110005569 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110005957 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 110006239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110006279 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110006462 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110006893 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110006931 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110006946 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 110006957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110007203 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110007431 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110007584 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110007643 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110007750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110008148 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 110008182 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 110008348 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 110008375 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 110008383 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 110008403 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 110008440 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 110008461 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 110008475 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 110008501 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 110008513 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 110008603 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 110008746 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 110008815 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 110008885 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 110008914 C G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 110008961 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 110009210 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110009316 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 110009320 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 110009425 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110009626 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110009751 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110009755 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110009806 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110009833 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110010497 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110010602 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110010950 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 110010952 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 110011089 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 110011227 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 110011494 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110011585 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110011789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110011796 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110011879 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110012104 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110012139 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 110018687 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110018876 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110018909 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110018923 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110018961 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110019051 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110019060 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110019216 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110019244 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110020145 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110020507 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 110020508 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110020709 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 110020790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110020839 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110020922 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110022802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110022991 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110023653 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 110023684 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110024366 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110024412 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110024932 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110025017 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110026237 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110026307 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 110026597 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110026706 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110026763 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 110026834 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 110027321 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 110027322 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 110027347 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 110027379 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110027436 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110028020 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110028021 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 110028066 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 110028852 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 110029525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110029796 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110029882 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110030130 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 110030180 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 110030189 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110030195 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110030223 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 110030263 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 110030264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110030921 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 110031185 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110031210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110031792 A T N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 110031884 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 110031913 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 110032212 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 110032524 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110032628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110032661 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 110032828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110032941 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 110033300 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110033334 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110033778 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110034043 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110034094 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 110034179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110034194 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110034221 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 110034489 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 110034516 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 110034625 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110034630 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 110034682 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 110034729 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110034741 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 110034742 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 110034819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110034829 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110034901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110034992 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110035068 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 110035120 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 110035178 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 110035412 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 110035697 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 110035793 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 110035811 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 110035851 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 110036002 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110036025 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 110036188 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 110036245 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110036295 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110036567 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110036911 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 110036922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110037008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110037038 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 110037097 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 110037100 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 110037173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110037540 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 110037576 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 110037622 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 110037627 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 110037648 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 110037967 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 110039777 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 110039985 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110040030 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 110040369 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110040490 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 110040773 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 110041271 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110041300 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110041494 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 110042153 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 110042472 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 110042523 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110042764 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110042863 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110043061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110043168 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110043176 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110043380 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 110043488 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 110043489 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 110043582 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 110043680 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110043731 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110043778 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110043833 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110043841 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 110043905 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 110043994 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110044553 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110044885 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110044910 C T Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 110045016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110045042 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110045161 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110045177 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 110045230 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 110045331 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110045358 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 110045418 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110045516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110045588 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 110045662 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 110045729 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 110045752 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110045817 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110045854 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 110046039 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110046074 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110046126 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110046283 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 110046295 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 110046478 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 110046695 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110046807 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 110047075 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 110047342 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 110047353 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 110047632 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110047929 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 110047935 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 110048991 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 110049205 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110049983 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110050118 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110050556 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 110050587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110050675 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 110050821 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 110050942 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 110051685 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 110051892 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 110051968 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 110051986 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 110052033 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 110052059 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 110052068 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 110052219 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110052310 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110052330 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 110052653 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 110054107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110054393 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110054467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110055072 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110055117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110055151 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110055301 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 110055309 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 110055369 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 110055375 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 110055436 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110055463 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 110055504 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 110055638 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110055716 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110055730 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 110055783 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110055925 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 110056024 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 110056295 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110056297 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110056549 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110056552 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 110056624 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 110056773 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 110056808 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110056811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110056848 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110056862 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110056880 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110056885 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 110056933 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 110056982 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110057045 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 110057075 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 110057162 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110057226 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110057256 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 110057435 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110057466 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110057654 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110057690 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110057771 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110057784 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110057838 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 110057927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110057956 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110058040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110058110 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110058120 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 110058121 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 110058200 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110058372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110058378 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 110058392 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110058419 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 110058436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110058464 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 110058541 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 110058803 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 110058808 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 110058873 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 110058895 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 110058934 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 110058963 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 110058964 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 110058975 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110059229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110059303 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 110059318 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 110059334 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 110059700 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 110059706 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 110059714 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 110059866 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 110059922 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 110059960 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 110060132 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 110060138 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 110060207 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 110060253 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 110060256 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 110060268 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 110060293 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 110060312 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 110060363 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 110060384 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 110060385 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 110060422 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 110060538 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 110060621 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 110060665 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 110060757 G T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 110060775 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110061149 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 110061151 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 110061171 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 110061196 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 110061225 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 110061293 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 110061337 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110061619 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110061632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110061645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110061878 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110062012 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 110062092 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 110062113 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 110062175 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 110062581 T C Y Y 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 3 110065804 A G Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 110065967 A C Y N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 110065977 T C Y Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 110066008 A T Y N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 110066195 T A Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 110066202 A G Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 110066220 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 110066247 A T Y N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 110066290 C A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110066399 G C Y N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 110066438 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 110066449 C T Y Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 3 110066450 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 110066508 T C Y Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 3 110067829 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110067993 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110068045 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110068112 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110068183 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110068227 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110068230 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 110068265 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110068333 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110068370 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110068410 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110068431 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110068549 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110068580 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 110068598 A C Y N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 110068647 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 110068917 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 110069235 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110069358 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110069390 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 110069495 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 110069501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110069572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110069591 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110069602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110069720 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110069732 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 110069757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110069808 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 110069847 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110069883 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 110069953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110069985 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110069999 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110070044 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110070064 C G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 110070091 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110070144 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110070153 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 110070186 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 110070232 A G Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 110070271 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 110070345 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110070382 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110070446 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110070451 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110070530 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110070657 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110070699 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110070774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110070899 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 110071372 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110071523 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110071597 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110071642 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 110071889 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 110071931 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110072264 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110072388 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110072467 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110072581 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110072630 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110073010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110073060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110073091 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110073131 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 110073293 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110073320 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110073379 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110073390 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110073419 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110073441 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110073490 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110073509 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110073531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110073648 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 110073668 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110073684 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110073765 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110073782 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110074036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110074037 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110074166 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110074227 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110074394 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 110074423 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 110074432 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110074460 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 110074470 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110074506 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110074519 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110074527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110074543 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110074595 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110074603 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110074943 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 110074980 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 110075377 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110075506 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110075519 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 110075788 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 110075828 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 110076029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110076038 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110076079 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 110076134 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 110076239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110076401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110076492 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110077858 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110077938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110078070 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 110078102 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 110078185 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 110078198 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 110078473 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 110078497 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 110078541 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 110078551 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 110078685 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 110078769 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110078810 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110078816 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 110078854 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110078857 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110078871 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 110078903 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110078939 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 110079122 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 110079182 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 110079218 G T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 110079367 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 110079441 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 110079454 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 110079490 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 110079508 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 110079559 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 110079577 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110079698 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 110079715 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 110079719 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 110079778 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 110079806 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 110079808 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 110079821 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 110079860 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 110079863 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 110079892 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 110079907 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 110079918 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 110080219 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 110080327 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 110080481 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110080589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110080721 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 110080887 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110080963 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 110080973 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 110081045 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110081150 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 110081294 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 110081306 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 110081318 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110081340 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 110081354 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 110081467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110081608 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110082150 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 110082160 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 110082272 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110082419 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 110082463 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110082894 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 110083022 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 110083206 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 110083422 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110083622 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 110083648 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 110083653 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 110083776 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 110084136 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 110084196 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 110084292 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 110084336 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 110084397 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 110084678 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 110084759 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 110084904 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110085147 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 110085314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110085353 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 110085540 T G Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 110085584 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 110085914 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 110085923 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110086250 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 110086398 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 110086761 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 110088098 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110089591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110090958 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110091280 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 110091427 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110091886 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 110091908 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110093606 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 110093619 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 110093849 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 3 110093991 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 110094349 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110099071 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110099213 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110099352 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110100143 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110100260 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 110100412 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 110100627 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110100641 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110100661 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 110100675 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 110101214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110101808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110102370 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110103259 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 110103271 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110103822 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 110104168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110104367 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 110104620 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110104906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110105243 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110105269 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110105283 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110105783 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110106771 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110106942 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110107575 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110108246 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 110109047 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110109537 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110109742 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110109852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110110297 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 110110512 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 110111039 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 110111162 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 110111428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110111535 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 110111570 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 110111668 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 110111669 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 110111924 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 110112155 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110112864 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 110113040 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110113111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110113169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110113355 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 110113374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110113471 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 110113584 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 110113800 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 110114453 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0 0.764705882352941 0.235294117647059 13 21 0 13 4 3 110114649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110114795 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 110114852 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 110115124 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110115726 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110115774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110115799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110115824 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 110115848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110115915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110115931 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110116871 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110116968 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 110117198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110117206 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 110117346 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110117359 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110117805 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110117825 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110117842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110118133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110118227 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110118248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110118430 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110119064 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110119705 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110119745 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110120298 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 110120631 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 110120707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110120814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110121069 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110121262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110121376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110121541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110121718 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110121725 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 110121742 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110121839 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110122022 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110122289 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110122538 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110122548 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110122549 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110122730 G C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 110129560 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110129625 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110129635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110129681 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 110129849 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110130261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110130538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110130990 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110131101 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110131924 T C Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 3 110131976 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 110132010 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 110132042 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 110132094 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 110132108 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 110132246 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110132631 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110133122 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 110133184 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 110133408 G T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 110133561 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110134132 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 110134135 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 110134293 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 110134926 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110135521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110135677 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110136126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110136276 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110137633 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110137691 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110138246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110138343 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110138360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110138369 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110138645 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110138707 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110138883 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110139105 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110139243 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110139282 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110139345 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110139552 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110140165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110140210 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110140264 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110140441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110140576 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110140630 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110140665 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 110140697 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110140794 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110140814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110140873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110140911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110140915 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110141178 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110141469 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 110141480 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 110141546 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110141738 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 110141753 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110141965 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 110141982 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 110142372 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110142727 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110142791 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 110142802 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 110143164 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110143554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110144053 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 110144327 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110144661 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 110145662 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110145671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110145683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110145791 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110146391 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 110146671 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110146672 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110146754 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110146810 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110147067 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 110147276 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110147278 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110147412 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 110147489 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 110147542 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 110147623 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 110147628 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 110147660 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 110147746 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 110148105 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 110148246 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 110148259 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110148385 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 110148416 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 110148560 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110149243 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 110149607 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110150034 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110150335 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110150571 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110150796 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 110151290 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 110151297 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 110151332 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 110151382 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 110151399 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110151499 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 110151524 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 110151547 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 110151559 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 110151571 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 110151606 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 110151856 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 110151887 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 110151976 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 110152151 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 110152938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110153262 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 110153354 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 110154432 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110155126 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 110155445 A C Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 110155548 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110155720 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 110156991 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 110157407 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 110157563 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 110157641 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 110157709 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 110157749 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 110157758 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 110157828 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 110158016 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 110158128 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 110158190 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 110158207 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 110158368 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 110158562 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110158599 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 110158854 C T Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 110158941 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 110159031 C A Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 110159264 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 110159304 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 110159414 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110159562 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 110159637 C A Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 110159704 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 110159916 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110160785 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110162274 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110162331 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110162625 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110163436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110163838 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 110163876 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 110163958 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110163988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110164099 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 110164165 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110165041 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 110165475 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110165602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110165675 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110165686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110165700 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110165792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110165814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110165880 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110165887 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110165892 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110165938 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 110166017 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110166045 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110166104 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110166247 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110166434 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110166489 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 110166575 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110166576 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110166589 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110166590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110166636 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110166878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110166886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110166987 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110167007 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110167026 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110167125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110167152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110167219 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110167301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110167639 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110167738 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110167866 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110167870 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110167936 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110167948 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110167993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110168000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110168025 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110168172 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 110168301 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110168413 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 110169465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110169921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110169964 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110170743 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 110170860 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110171411 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110171489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110172084 T G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 110172312 C T Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 110172526 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110172566 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110173338 A T Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 110174492 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110174570 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110175077 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110175355 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110175559 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 110175608 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110175694 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110175812 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 110176419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110176762 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110177491 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110177657 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110177669 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 110177689 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110177765 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 110177823 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 110178167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110178848 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110179364 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 110179489 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110179853 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110179953 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 110179986 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110180619 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110180670 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110181123 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 110181169 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 110182106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110182535 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110183000 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110183205 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 110184353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110184524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110184791 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110184870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110185233 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110185310 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110185410 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110185907 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110186091 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110186271 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110186297 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 110186310 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110186601 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110187136 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110187156 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 110187484 C A N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 110187804 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110188184 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 110188257 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 110188292 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 110188296 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 110188505 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110188674 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110188878 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 110188923 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 110189281 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 110189316 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 110189708 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 110190154 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110190180 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110190220 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110190338 C G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 110190346 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110190422 G C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 110190767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110191337 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110191347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110191436 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 110191437 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 110191483 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 110192015 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110192049 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 110192080 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 110192264 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 110192308 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 110192344 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 110192580 T G N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 110192688 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 110192742 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 110192750 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 110192783 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 110192855 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 110192870 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110193186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110193329 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 110193543 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 110193966 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110194029 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 110195730 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110195992 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 110195994 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 110196006 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 110196014 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 110196025 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110196124 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 110196221 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 110196261 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 110196296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110196334 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 110196410 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 110196448 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 110196489 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 110196548 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 110196616 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 110196704 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 110196745 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 110196783 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 110196854 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 110197036 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 110197042 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 110197153 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 110197159 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 110197211 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 110197290 A C N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 110197402 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 110197739 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 110197781 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 110197960 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 110197992 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 110198026 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 110198107 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 110198132 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 110198333 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 110198337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110198377 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 110198400 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 110198525 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 110198536 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 110198545 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 110198592 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 110198601 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 110198606 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 110198659 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 110198759 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 110198802 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 110198951 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 110199038 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 110199067 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 110199070 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 110199126 A G Y Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 110199213 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 110199222 G T Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 110199334 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 110199340 T C N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 3 110199382 T C N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 3 110199383 G A N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 3 110199413 G A N Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 3 110200118 A G Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 110200139 C T Y Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 3 110200140 T A Y N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 3 110200231 T C Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 110200261 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110200301 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110200331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110200365 T C Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 110200366 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 110200633 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 110200691 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 110200692 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 110200870 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 110200892 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 110200926 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 110200948 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 110201246 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 110201364 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 110201522 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 110201594 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 110201603 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 110201607 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 110201626 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 110201675 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 110201724 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110201747 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 110201812 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 110202061 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 110202080 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 110202086 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 110202091 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 110202133 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 110202322 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 110202431 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 110202537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110202642 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 110202679 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 110202706 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 110202727 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 110202773 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 110202793 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 110202883 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 110202936 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 110203074 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110203176 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 110203200 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 110203220 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110203272 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110203296 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110203329 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 110203394 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 110203439 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 110203813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110203850 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110203933 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110204037 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110204958 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110205028 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 110205310 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 110205483 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 110205610 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 110205616 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110205623 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 110205663 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 110205677 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 110205773 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 110205813 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 110205846 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 110205956 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 110206057 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 110206962 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 110207137 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 110207388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110207723 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 110207853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110208200 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 110208421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110208829 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 110210029 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 110210093 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 110210573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110210580 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 110210657 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110210663 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110211025 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110211206 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110211296 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110211348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110211384 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 110211396 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110211666 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 110211779 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110211975 T A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 110212317 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 110212579 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110212653 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 110212846 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110212915 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110212930 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 110213192 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 110213463 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110213541 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110214207 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 110215069 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110215618 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110216309 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 110216830 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110217363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110217777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110218887 A C Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 110225188 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 110225506 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110225536 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 110225999 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110226177 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110226699 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 110227061 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 110227100 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 110227378 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 110227384 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110227413 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110227638 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110227648 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110227700 T G N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 110227727 A G N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 110227860 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 110228026 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 110228042 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 110228155 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 110228265 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 110228291 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 110228340 C A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 110228569 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 110228573 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 110228594 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 110228820 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 110228838 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 110228989 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 110229116 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 110229194 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 110229205 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 110229229 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110229264 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 110229294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110229322 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110229376 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 110229494 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 110229497 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110229817 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 110229848 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 110229910 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 110229912 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 110229986 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 110230018 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110230051 A C Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 110230057 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 110230117 C T Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.235294117647059 0.705882352941177 0.0588235294117647 20 14 4 12 1 3 110230202 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110230327 A T Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 110230543 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110230573 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110230654 A C Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 110230667 C T Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 110230694 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 110230715 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 110230926 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 110230947 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 110230952 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 110230985 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 110231000 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 110231066 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110231393 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 110231614 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 110231640 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 110231677 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 110231840 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 110231886 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 110231899 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 110231982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110232098 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 110232288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110232391 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 110232496 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 110232543 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 110232668 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 110232692 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 110232720 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 110232804 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 110232839 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110232911 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110233006 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 110233041 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 110233084 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110233085 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 110233218 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110233402 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 110233479 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 110233861 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110234046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110234113 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110234369 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110234370 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110234469 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110234511 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 110234632 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 110237805 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 110237836 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110237883 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110238082 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110238296 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110238837 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110239056 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110239092 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 110239260 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110239450 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110239453 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110239829 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110239967 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110239973 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110240067 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110240181 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 110240357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110240609 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110240698 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 3 110240783 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 110241183 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110241282 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110241341 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110241352 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110241362 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 110241445 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110241469 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110241519 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 110241618 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110241965 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110242416 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 110242469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110242738 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110242806 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 110242819 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 110243146 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110243228 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 110243319 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 110243511 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110243535 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110243666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110243695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110243716 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 110243733 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110243755 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 110243835 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 110243908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110244088 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 110244118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110244119 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 110244249 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110244701 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110244809 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110244904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110244907 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110244919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110244959 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110245042 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110245044 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110245055 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110245060 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110245289 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110245344 C T N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 110245374 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110245470 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110245590 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110245618 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 110245818 G C Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 110245826 G A Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 110245853 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 110245874 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110245878 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110245892 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110245904 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110245966 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110245976 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110246039 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 110246056 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110246165 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110246208 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110246236 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110246253 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110246506 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110246588 A G Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 110246607 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 110246676 A C Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 110246727 G A Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 110246763 C A Y N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 110246830 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 110247015 T A Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 110247261 G A Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 110247848 T C Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 110247932 C T Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 110247933 A G Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 110248101 T C Y Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 3 110248103 T C Y Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 3 110248189 A C Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 110248193 G A Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 110248205 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 110248207 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 110248222 C T Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 110248242 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 110248247 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 110248267 T C Y Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 110248293 C A Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 110248395 T C Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 110248493 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 3 110248508 C G Y N 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 3 110248633 A C Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 110248728 A T Y N 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.714285714285714 0.285714285714286 5 9 0 5 2 3 110248747 C A Y N 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 6 8 0 6 1 3 110248903 C G N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 110248921 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 110248950 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 110249008 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 110249065 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 110249104 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 110249153 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 110249163 T A Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 110249426 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110250068 C G Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 110250095 G T Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 110250132 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110250171 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110250199 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110250289 A C Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 110250316 T A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 110250333 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 110250556 G T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110250664 G A Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 110250736 C A Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 110250830 T G Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 110250846 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 110250863 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 110250895 G A Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 110250945 T A Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 110251046 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110251275 C G Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 110251339 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 110251375 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110251389 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 110251417 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110251429 C T Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 110251446 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110251456 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110251559 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110251588 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110251690 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110251799 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110251868 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 110253876 C A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 110253879 A G N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 110254068 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110254179 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110254335 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110254394 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110254460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110254554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110254746 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110255163 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110255961 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110256056 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110256327 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 110256410 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110256778 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 110256853 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 110256954 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110257161 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 110257183 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110257629 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 110257880 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110258208 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110258879 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110259270 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 110259938 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 110259957 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 110260554 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110260628 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110262047 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 110262263 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 110262371 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110262678 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110262699 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110263085 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110263235 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110263656 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110264182 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110264422 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110264842 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110265253 T G Y N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 110265601 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110266060 G C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 110266066 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110266169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110267156 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110267206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110267374 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110267393 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110267541 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110267770 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110267936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110268124 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110268273 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110268274 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 110268641 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110269035 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110269335 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 110269542 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110269733 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110269737 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110269794 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110270492 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110270904 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110271340 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 110271377 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 110271879 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 110272356 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110272544 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 110272762 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110273263 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 110273264 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 110273307 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 110273665 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110273944 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 110274357 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110274657 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110274684 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 110275428 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110275491 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110275699 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110275932 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 110276150 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110276171 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 110276331 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 110276552 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 110276683 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 110276974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110277043 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 110277317 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 110277419 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 110277700 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 110277717 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 110277769 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 110277828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110277941 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110278064 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110278632 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110279094 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110279148 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110279151 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110279364 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110279412 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110279654 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110279872 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110279912 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110280006 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110280020 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110280021 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110280134 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110280295 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110280405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110280490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110280519 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 110280521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110280874 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 110280957 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 110281009 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110281065 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 110281087 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 110281103 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 110281142 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 110281180 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 110281217 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 110281252 A T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 110281378 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 110281453 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 110281464 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 110281761 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 110281831 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 110281837 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 110281843 C T Y Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 110281849 C T Y Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 110282016 C G Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.111111111111111 0.722222222222222 0.166666666666667 17 19 2 13 3 3 110282182 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 110282316 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 110282333 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 110282527 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 110282611 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110282706 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 110282825 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110282934 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 110283072 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 110283269 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 110283315 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 110283405 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 110283665 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 110283698 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 110283855 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 110283957 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 110284002 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 110284012 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 110284061 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 110284078 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110284114 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 110284260 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 110284410 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 110284419 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 110284422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110284509 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 110285145 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 110285188 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 110285309 G A N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 110285417 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 110285441 C T N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 110285482 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 110285514 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 3 110285714 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 110285753 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 110285762 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110285769 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110285783 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 110285944 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 110286069 G A N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 110286221 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 110286260 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 110286305 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 110286310 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110286389 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 110286403 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 110286414 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 110286564 C A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 110286917 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110287019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110287032 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 110287130 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110287328 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 110287381 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 110287411 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 110287431 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 110287491 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110287640 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110287677 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 110287679 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 110287750 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 110287757 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 110287810 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 110287823 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110287972 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 110288029 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 110288048 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 110288062 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 110288074 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 110288119 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 110288124 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 110288231 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 110288355 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 110288434 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 110288558 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 110288646 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 110288688 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 110288965 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110289011 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110289031 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 110289112 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110289249 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 110289324 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 110289430 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 110289495 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 110289523 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110289723 T A N N 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 6 6 2 2 2 3 110289809 C A Y N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 3 110290016 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110290130 G A N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0 0.636363636363636 0.363636363636364 7 15 0 7 4 3 110290206 C G Y N 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 3 110290338 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 110290637 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 110290664 G T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 110290667 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 110290696 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110290961 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 110290962 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 110291006 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 110291029 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 110291034 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 110291277 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110291515 C G N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 110291839 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 110291893 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 110291894 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 110291918 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 110292228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110292230 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 110292369 T G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 110292464 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 110292542 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 110295004 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110295050 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 110295266 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 110295271 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 110295374 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 110295428 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110295685 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110295838 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 110295913 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 110295987 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110296109 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 110296210 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110296900 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 110297281 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 110298798 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 110298812 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110298892 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 110299117 T A Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 110299185 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110299789 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 110300755 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 110301104 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110301883 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 110302632 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 110302854 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 110303085 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 110304875 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 110305369 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110305786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110306012 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110306033 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 110306293 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110307245 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 110308223 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 110308274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110308753 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110308771 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110309233 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110309241 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110309276 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 110309339 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 110309490 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 110309724 T C N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 110310014 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 110310108 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110310478 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110310725 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110310852 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110311482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110312002 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110312341 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 110313420 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110313678 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110314668 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110314956 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110317030 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110319129 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110319273 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110319812 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110320254 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 110321723 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110321973 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110321993 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 110322296 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 110323165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110323230 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 110326654 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110326902 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110326903 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110328021 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110330798 A G Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 110330836 T G Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 110330845 T G Y N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 110332842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110332933 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 110333578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110333716 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 110333759 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110334080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110334442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110334942 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110335215 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110335244 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110336396 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110336437 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 110336453 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110336565 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110336640 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110337522 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110337959 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110338273 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 110338343 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 110338379 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 110338405 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 110338428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110338538 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 110338614 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 110338702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110338835 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 110338843 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 110338849 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 110338861 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 110339011 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 110339040 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 110339082 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 110339115 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 110339126 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 110339137 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110339382 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 110339572 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 110339627 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 110339639 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 110339672 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 110339712 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 110339874 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110340382 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110340444 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110340455 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110340478 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110340637 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110340666 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110341698 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 110341755 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110341920 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 110342127 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110342132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110342339 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110342363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110342411 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110342687 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 110342764 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110342803 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 110343063 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110343280 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 110343606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110343677 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110343995 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 110344185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110344337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110344497 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110344646 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110344703 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 110345144 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110345320 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110345698 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110346112 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 110346144 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110346378 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110346425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110347149 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 110347385 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110347432 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 110347635 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110347707 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110347772 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 110347809 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 110347819 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 110348143 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110348774 T G N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 3 110348779 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 110349792 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 110350021 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110350626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110351225 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 110351277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110351603 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 110351660 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110352331 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110354005 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110354114 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110354383 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110354436 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110354622 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110354643 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110354835 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110354880 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110355444 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 110355564 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 110355870 T C Y Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 110355983 T C Y Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 110356024 C T Y Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 3 110356202 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 110356250 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110356331 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 110356471 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110356487 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 110356881 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110357297 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110357557 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 110358229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110358894 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 110358987 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 110359338 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110360825 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110363032 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110363474 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 110363827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110364416 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110364555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110365355 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110365585 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110366429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110366824 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110367133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110367261 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110371113 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110373581 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110374088 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110375637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110376692 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110377064 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110378313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110378429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110379254 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 110379255 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 110379570 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 110380988 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110381338 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 110381790 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110381892 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110383967 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110384033 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110384624 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110387217 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 110390049 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110392442 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 110396509 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110397711 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110398242 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110399134 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110399704 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110402234 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110403267 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110403619 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110403686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110403706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110403725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110403757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110404019 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110404063 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 110404163 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110404171 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110404196 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110404417 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110404447 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110404448 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110404464 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110404482 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110404503 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 110404513 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 110404534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110404567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110404635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110404680 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110405023 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110405120 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110405129 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110405140 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110405170 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110405213 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110405291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110405397 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110405447 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110405461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110405500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110405540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110405644 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110405738 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110405777 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110405786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110405851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110405884 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110406080 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110406132 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110406175 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110407062 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110407092 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110407106 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110407297 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110407396 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110407457 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110407651 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110407729 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110407766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110407806 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110407836 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110407909 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110408038 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 110408169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110408389 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110408415 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110408476 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110408552 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110408562 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 110408646 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110408996 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110409343 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110409534 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110409842 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110410156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110410204 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110410500 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110411772 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110412606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110413482 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110413520 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110414637 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110416303 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110416350 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 110418953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110419401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110419851 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 110419962 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110420590 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110420981 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110422205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110422328 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 110422397 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 110422710 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110423297 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 110423800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110423837 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 110424630 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 110424732 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110426466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110426531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110427450 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110427937 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110427945 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110428026 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110428409 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110428550 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110428641 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 110432170 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110432299 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110432945 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110433872 T A Y N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 3 110437021 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110438763 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110438783 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110438894 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110439213 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110439706 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 110439842 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110440016 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110441041 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110441593 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110441845 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110441919 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110442823 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110444546 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110444577 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110444596 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110445198 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110445667 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110445686 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110446654 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110447016 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 110447163 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 110447193 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110447258 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 110447410 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110447476 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110448043 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 110448133 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 110448255 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 110448546 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 110448580 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 110449143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110450172 T A Y N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 110451076 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110451118 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 110451241 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110451443 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110451579 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110451616 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110451753 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110451783 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110451932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110453410 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 110453412 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 110453678 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 110454512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110455437 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110456112 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 110457166 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 110457203 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 110457215 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 110457333 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 110457348 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 110457357 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 110457364 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 110457676 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 110457958 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 110458037 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 110458052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110458103 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 110458378 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110458519 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110458611 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110459253 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 110460840 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110461168 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 110461843 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110462677 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110463736 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110464044 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110464054 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110464447 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110464608 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 110466764 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110466887 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110467569 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110468776 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110469990 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110470047 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 110472835 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110475866 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110478229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110479232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110487599 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110488488 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110489459 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110491636 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 110491786 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110492270 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110493350 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110493884 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110494420 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110494448 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110494866 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 110495443 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110495493 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110495647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110495755 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 110495757 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 110496271 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 110496272 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 110496834 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110496972 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110497159 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110497576 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110497831 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 110498199 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110498408 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 110498531 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110498738 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 110499090 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110499528 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110499540 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 110499555 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110499693 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 110499718 C A N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 110499731 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 110499778 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 110499831 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110499857 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 110499877 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110500017 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110500040 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110500063 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110500281 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110500304 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110500315 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110500478 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 110500516 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110500581 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110500599 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110500621 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110500656 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 110500663 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 110500670 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110500756 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 110500848 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110500873 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 110500934 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 110500968 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110501081 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110501134 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110501204 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110501257 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 110501264 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 110501322 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110501525 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 110501543 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110501729 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 110501904 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110502441 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 110502630 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110503039 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110503256 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 110503733 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110503823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110503892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110505318 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110505439 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110505566 C T Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 110506923 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 110508954 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110509191 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110509312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110509534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110509539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110510357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110510489 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110510798 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110511549 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 110512219 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110512841 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 110514822 G A Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 110515252 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110517409 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110519559 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110519735 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110519926 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110520257 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110521474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110521550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110522497 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 3 110522534 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 110522761 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110523659 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110524979 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110526342 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110527370 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110527709 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110527783 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110530054 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110530505 C A N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0 0.846153846153846 0.153846153846154 11 15 0 11 2 3 110530808 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110530854 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 110531108 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110532318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110534548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110534839 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110535304 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110535881 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 110536088 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110537012 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110537595 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110539027 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110539307 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110539990 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110540776 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110541714 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110542644 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110543200 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110543473 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 110543552 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 110546334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110549502 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 110549779 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110549977 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110549987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110550097 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 110550699 C G Y N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 110551296 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110552988 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110553255 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110554593 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110555091 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110555192 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110555243 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110555297 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110555488 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110557567 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110558901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110559352 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 110560261 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110560322 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110560678 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 110560757 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110561329 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110562165 A C Y N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 16 12 2 12 0 3 110562400 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110562655 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110562672 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110563291 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110564173 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110564686 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110565593 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110565619 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110565842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110566767 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 110566970 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110567000 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110567195 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110567239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110568442 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110568664 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110568836 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110568999 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 110569087 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110569661 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 110569708 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110569741 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 110570452 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110570493 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110570503 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 110570524 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110570918 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110571090 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 110572187 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 110572196 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110572543 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 110572567 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 110572715 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 110572719 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110572739 T G N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 110572800 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 110572892 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 110578196 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 110578226 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 110578233 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 110578495 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 110578591 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 110578601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110578602 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 110578939 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 110578970 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 110578997 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 110579132 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 110579184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110579307 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 110579310 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110579473 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110579803 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110580063 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 110580125 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 110580514 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110581136 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 110581296 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 110581326 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 110581342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110581407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110581433 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 110581798 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110581956 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110581967 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 110582092 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 110582173 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 110582427 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110582439 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 110582519 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 110582532 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 110582559 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 110582584 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 110582721 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 110583159 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 110583189 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110584002 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110584533 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 110585066 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 110586770 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 110587800 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110588078 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110588395 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110588465 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110588603 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110588919 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110589212 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110589795 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 110589880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110591077 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110593946 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 110595966 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 110596189 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110596240 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110596428 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 110596818 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110598729 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110599974 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 110605009 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110606937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110606978 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110608382 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110610526 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110610836 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110611156 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110611487 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110611985 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110611996 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 110612075 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110613844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110613891 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110614457 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110614634 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110616972 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110617428 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110617798 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110618026 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110618509 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110618866 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110619342 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110620393 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110621490 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110621934 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 110622150 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 110622241 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 110622283 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 110623312 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110623448 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110624589 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110625067 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110625384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110625702 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110627499 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110628439 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110628793 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110629416 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110629886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110629988 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 110630534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110630959 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110631370 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 110631719 G A Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 110631724 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 110632408 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110633393 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110634658 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110635078 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110635614 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110636279 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110636514 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110636805 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110636828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110636834 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110636899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110637102 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110637425 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110637526 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110637852 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110638560 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110639794 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110640564 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 110641712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110642299 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110642317 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110642342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110642737 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110642998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110643121 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110643863 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110645078 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110645303 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110646113 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110646446 G T N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 3 110646594 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 110647490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110647613 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110648684 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110649619 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110650082 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110650483 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110650683 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110650887 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110654931 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110657999 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110658851 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110658896 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110659176 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110659774 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110660194 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110660716 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110660914 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110660954 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110661906 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110662068 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110662086 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110662630 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110662965 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110663181 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110664207 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110664216 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110664449 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110666060 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110666454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110666472 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110666659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110668698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110669450 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110670300 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 110670688 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110670903 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 110671190 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 110671248 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110672312 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110673846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110674494 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 110677007 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110677798 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110679517 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 110679966 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110680863 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 110682208 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110682861 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 110683480 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 110684857 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110685446 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 110686394 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 110686487 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110686488 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110687701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110688346 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110689716 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110690404 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110690419 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110692548 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110693081 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110693547 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 110694778 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 110695627 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110695979 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110696789 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110696941 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110697046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110698225 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110698872 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110700426 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110700867 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110701260 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110701461 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110701480 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110702565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110702627 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110703318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110704065 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 110704264 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110705481 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 110707555 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110707603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110707724 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110707936 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 110708234 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110710435 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 110710461 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 110710484 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 110710577 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 110710583 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 110710677 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 110710703 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110710730 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 110710787 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 110710895 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110711038 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110711049 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110711069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110711384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110711631 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110712059 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110712085 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110712845 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110713141 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 110713229 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110713292 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110713333 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110713695 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110713782 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110713864 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110713942 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110714013 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 110714069 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 110715012 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110715014 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110715065 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110715221 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110715517 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110716715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110716790 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110716837 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110717134 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110717303 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110717608 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110717923 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110718303 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110718490 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110718708 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110718895 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110718979 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110719158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110719166 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 110719898 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 110719945 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 110720018 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 110720019 A G Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 3 110720063 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 110720090 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 110720155 T C Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 110720157 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110720295 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 110720467 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110720471 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110720625 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110720706 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110720774 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 110720858 C A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 110721038 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110721092 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110721114 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110721204 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110721231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110721265 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110721287 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110721384 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110721547 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 110721689 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110721876 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110721967 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110721995 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110722075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110722281 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 110722301 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110722814 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110723042 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110723120 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110723176 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 110723180 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 110723188 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110723224 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 110723333 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 110723334 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 110723438 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 110723492 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110723536 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110723663 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 110723808 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110723917 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110724332 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110724335 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110724554 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110724646 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110724648 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110724706 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110724931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110725053 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110725549 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110725728 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110725833 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110726214 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 110726422 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 110726789 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 110726899 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 110727148 A T Y N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 110727405 A C Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 110727465 C G Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 110727521 T G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 110727676 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 110728085 A G Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 110728089 C A Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 110728150 T A Y N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.133333333333333 0.666666666666667 0.2 14 16 2 10 3 3 110728283 G A Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 110728577 G C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 110728604 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110728705 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110728867 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110728970 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110728983 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 110729073 G A N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 3 110729344 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 110729893 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 110729948 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110730140 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110730227 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 110730229 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110730452 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110730502 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110730601 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 110731162 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 110731234 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110731476 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110732111 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110732312 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 110732621 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 3 110732663 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110733543 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 110733632 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 110734109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110734481 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110734675 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110734748 T A N N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 14 12 1 12 0 3 110735036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110735186 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 110738019 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110738156 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110740229 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110740689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110741185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110742399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110749204 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 110750805 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110750944 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110751562 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 110751647 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110753191 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110753654 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110754383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110755588 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110755726 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110756656 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110756695 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110757012 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110757541 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110758311 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110758785 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110760230 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110760273 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110760309 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110760406 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110761676 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110761892 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110762089 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110762154 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110762215 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110763281 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110763421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110765154 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110765204 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110766841 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 110767271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110767642 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110767906 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110768790 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110769578 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110769667 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110770896 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110771458 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110772160 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110772728 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110774715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110774860 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110774987 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110775415 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110776032 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 110776300 T C Y Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.416666666666667 0.583333333333333 0 17 7 5 7 0 3 110776639 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110780054 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 110780068 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 110780100 G A Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 110780130 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 110780378 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 110784896 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 110787676 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 110788241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110788502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110788667 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110789134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110790450 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110793510 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 110794898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110795806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110796629 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110797881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110797949 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110798935 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 110799337 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110799618 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110802100 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110802233 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110803204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110803229 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110803410 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110803617 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110804421 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 110804428 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 110804481 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 110804493 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 110804502 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 110804532 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 110804556 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 110804568 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 110804642 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110805057 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 110805061 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110805179 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110805394 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 110805677 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110805956 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110806711 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 110806794 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110807064 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110807065 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110807116 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110807164 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110807169 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110807214 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110807764 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110808204 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110808352 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110808359 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110808364 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110808589 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110808598 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110808659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110808721 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110808804 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 110808812 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110808829 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110808892 G T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 110808936 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110808962 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110808967 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110809010 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110809021 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110809048 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110809079 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110809300 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 110809326 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110809476 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110809479 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110809492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110809498 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110809518 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110809619 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110809725 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110809987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110811851 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 110813148 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110814926 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110815769 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110816887 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110818525 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110818581 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 110818608 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 110819479 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 110819548 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110819579 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 110820070 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 110821508 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110821596 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110822613 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110823675 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110823958 G T Y N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 3 110826621 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110826750 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110826778 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110826823 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110826835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110826926 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110826968 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110826990 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110827074 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110827156 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 110827230 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110827259 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 110830579 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110832379 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110832689 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 110832849 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 110832858 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 110832913 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 110832996 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110833624 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 110833638 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 110833703 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110833826 A G N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 3 110833827 T G N N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 3 110833849 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 110833954 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 110834100 C T Y Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 110834122 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110834291 C T Y Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 3 110834313 G C N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 110834351 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 110834579 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 110834837 A G Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 110835123 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110835155 G C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 110835168 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 110835248 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 110835336 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 110835397 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 110835411 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 110835430 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 110835449 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 110835482 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 110835532 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 110835602 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 110835609 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 110835724 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110835815 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 110835965 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 110836006 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 110836050 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 110836176 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 110836206 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 110836224 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 110836264 T A N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 12 16 2 8 4 3 110836265 T A N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 110836321 T A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 110836333 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 110836429 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 110836457 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 110836868 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 110837112 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 110837150 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 110837199 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 110837229 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 110837242 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 110837303 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 110837377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110837411 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 110837467 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110837499 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110837536 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 110837790 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 110837916 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 110837918 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 110838107 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 110838141 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 110838163 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 110838216 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 110838484 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 110838536 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 110838572 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110838684 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 110838767 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 110838971 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 110839013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110839061 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110839184 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 110839268 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 110839322 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110839390 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110839395 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110839424 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110839496 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110839707 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110840134 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 110840254 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110840494 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110841176 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 110841282 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 110841297 A C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 110841428 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110841703 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 110841759 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 110841860 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 110842249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110842519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110848966 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 110848975 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110849073 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110849682 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 110850315 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110850359 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 110850509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110850674 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110851038 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 110851071 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 110851153 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 110851183 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 110851197 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110851214 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 110851393 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 110851535 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 110851610 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 110851661 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 110851720 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 110851798 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 110851852 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 110851914 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 110852270 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 110852337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110852369 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 110852414 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 110852492 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 110852585 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110853217 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 110853299 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 110853455 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110853467 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 110853489 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 110853608 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 110853629 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 110853722 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 110853775 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110853833 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 110853932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110854046 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 110854162 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110854181 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 110854308 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110854462 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 110855368 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 110855466 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 110855481 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 110856192 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110856501 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110856548 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 110856589 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110856972 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 110857177 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 110857243 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110857285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110857437 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 110857682 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 110857911 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 110857926 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 110858147 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 110858194 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 110858805 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110858842 T A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 110858913 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 110859190 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 110859374 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110859444 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 110859512 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110859551 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 110859583 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 110859607 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 110859711 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 110859917 G T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 110859960 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 110859972 C G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 110860112 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110860231 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 110860235 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110860481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110860953 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110861357 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110862004 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110862030 A T N N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.153846153846154 0.769230769230769 0.0769230769230769 14 12 2 10 1 3 110862140 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110862501 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 110863007 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110863191 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 110863442 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 110863633 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110863721 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110863979 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 110864382 G A N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.214285714285714 0.714285714285714 0.0714285714285714 16 12 3 10 1 3 110865026 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 110865990 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110867651 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 110867908 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110867909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110870370 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110875101 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110875387 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110876073 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110876644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110877900 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110878386 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110879041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110879248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110879622 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 110879742 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110879828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110880093 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110880373 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110881502 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110881869 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110883315 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110883326 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110883646 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110883946 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110885119 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110886568 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 110886585 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 110886753 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110886884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110888440 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110890708 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 110891889 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 110891947 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110891966 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110892036 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110892371 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110893065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110893082 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 110893446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110894412 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110895692 A G Y Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0 0.733333333333333 0.266666666666667 11 19 0 11 4 3 110895820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110895835 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110895995 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 110896011 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110896050 T A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 110896121 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 110896202 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110896549 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110896615 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110896633 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110896663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110896707 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110896812 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 110896813 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 110896886 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 110896919 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110896927 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110896987 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 110897004 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110897110 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110897166 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 110897246 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 110897265 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110897388 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 110897449 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110897580 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110897797 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 110897894 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110897961 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 110898093 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 110898188 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 110898268 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110898339 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110898592 C T N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 110898603 C T N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 3 110898697 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 3 110898751 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 110898862 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 110898904 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 110898951 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 110899058 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110899127 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 110899205 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 110899270 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 110899489 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110899492 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 110899516 C A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 110899525 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 110899697 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 110899743 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 110899747 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110899758 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 110899800 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 110899890 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110900153 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 110900207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110900235 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 110900470 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 110900651 C A N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 110902837 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 110902922 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 110902942 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 110903100 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 110903137 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 110903173 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 110903180 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 110903254 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 110903357 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110903464 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110903551 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 110903629 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110903724 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 110903751 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 110903765 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 110903819 A T N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 110903827 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110904139 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 110904146 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 110904164 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 110904255 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 110904342 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 110904419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110904562 C G Y N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 110904572 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 110904576 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 110904644 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 110904786 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110904910 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 110904914 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 110904955 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 110904986 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 110905039 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 110905620 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 110906220 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 110906229 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 110906427 G C N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 110906445 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 110906515 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 110906534 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110906591 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110906628 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 110906629 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 110906668 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 110906705 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 110906797 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 110906824 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 110906968 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 110907054 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110907274 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110907401 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110907418 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 110907610 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 110907843 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 110907973 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 110908039 T G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 110908059 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110908351 C G N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 110908377 C A N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 110908393 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 110908422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110908426 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 110908597 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110908623 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110908689 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 110908777 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 110908867 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110908879 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110908880 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110908983 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 110909026 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 110909048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110909174 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110909384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110909600 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 110909606 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 110909688 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 110909744 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 110909785 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 110909792 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 110909870 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110910049 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 110910073 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 110910083 G C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 110910099 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 110910213 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 110910308 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 110910368 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 110910415 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 110910623 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 110910662 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 110910841 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 110910878 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110913845 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 3 110915147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110915629 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110916952 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 110917252 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 110917378 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 110917809 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110918020 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110918449 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110918864 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110919122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110919516 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 110922435 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110922548 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110923168 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 110923217 C A N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 110923466 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110923621 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 110923998 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 110924027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110924103 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110924127 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 110924229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110924855 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 110924868 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 110924943 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110925119 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 110925895 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110926258 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110926417 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 110926420 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110926482 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110926880 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110927089 T G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 110927154 C G Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 110927749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110927903 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110928376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110928560 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110928609 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110928679 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110928817 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110928881 T G Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 110928910 G T Y N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 3 110928969 G C Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 110928997 G C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 110929033 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 110929263 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110929407 G T Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 110929449 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 110929476 G A Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 110929547 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110929925 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110929990 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110930006 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110930124 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 110930140 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110930266 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 110930301 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 110930310 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 110930425 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110930790 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 110930877 C T N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 110931548 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110932048 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 110932196 A T N N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 110932760 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 110932888 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110932940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110933048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110933142 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110933188 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 110933206 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 110934321 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110935373 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110935387 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110935876 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110936005 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110936549 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 110936817 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 110936825 G A Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 110936884 G C N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 110936979 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110937021 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 110937259 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110937297 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110938131 G C Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 3 110938380 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110938525 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 110938626 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 110939655 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 110940172 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 110940401 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 110940655 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110940864 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 110940913 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110941090 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 110941133 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110941743 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 110941841 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 110942345 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 110942360 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 110942546 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 110942669 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110943796 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110943964 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110944152 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 110944863 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110945038 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 110945279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110945317 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 110945621 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110945918 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 110946012 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 110946056 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 110946239 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 110946473 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 110947363 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 110947459 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 110947862 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 110948381 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 110948419 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 110948446 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 110948530 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 110948796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110948868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110948988 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 110949126 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110949318 G A Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 110949412 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 110949869 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 110949885 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 110949976 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 110950227 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110950332 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 110950333 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 110950618 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110950623 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 110950667 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 110951037 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110951065 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 110951119 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 110951153 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110951217 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110951287 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 110951309 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 110951375 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 110951578 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 110951829 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 110952273 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 110952362 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110953268 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110953849 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 110953884 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 110954248 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110954847 A T Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 110954943 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110955169 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110955288 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110955537 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110955779 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 110955796 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110955859 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 110956747 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110957084 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 110957483 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 110958330 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110959389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110959564 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110960585 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 110960634 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 110960696 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 110960818 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 110960851 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 110960880 A C N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 110960921 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 110960945 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110960946 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110960971 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110961010 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110961061 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110961155 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110961230 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110961292 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 110961299 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110961349 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 110961435 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 110961438 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 110961453 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 110961461 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 110961900 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110961929 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 110961950 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 110961964 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110962062 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 110962084 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110962192 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110962199 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110962239 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110962307 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110962309 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110962329 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110962368 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110962397 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110962400 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110962549 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110962569 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110962717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110962749 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110962764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110962804 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110962892 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 110962929 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110962935 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110962951 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110962967 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110962968 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110962987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110963024 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110963053 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110963057 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110963065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110963068 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110963088 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110963161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110963189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110963200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110963282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110963283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110963300 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110963330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110963347 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110963383 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110963391 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110963478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110963488 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110963682 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110963714 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110963762 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110963830 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110963848 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110963857 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 110963926 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 110963967 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 110964086 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 110964168 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110964230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110964251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110964259 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110964263 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110964298 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110964377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110964398 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110964410 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110964450 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110964472 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110964474 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110964508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110964541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110964589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110964628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110964669 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110964699 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110964755 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 110964911 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110964950 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110965023 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110965078 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110965087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110965111 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110965116 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110965128 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110965134 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110965172 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110965177 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110965243 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 110965266 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110965391 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110965423 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110965439 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110965557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110965564 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110965638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110965696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110965815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110965872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110965905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110966175 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110966236 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110966249 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110966545 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110966546 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110966657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110966966 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110967356 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110967642 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110967795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110967873 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110968718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110968945 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 110969093 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 110969184 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110969218 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 110969220 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110969352 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110969414 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110969575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110969621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110970867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110970883 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110972554 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110972980 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110973369 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110973899 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110973988 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110974027 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110974137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110974325 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110974344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110974670 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 110974714 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110974849 G T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 110974946 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110974951 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110975023 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110975216 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110975240 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110975263 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110975396 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110975414 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110975539 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110975585 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110976137 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 110976223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110976413 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 110976624 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110976738 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 110976934 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110976956 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110977026 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110977228 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110977302 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110977372 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110977484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110977906 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110978213 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110978359 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110978444 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110978500 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110978539 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110978547 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110978576 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110978612 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 110978699 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110978700 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110978886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110978919 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110978977 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110978987 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110978994 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110979044 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110979125 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110979126 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110979153 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110979192 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110979198 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110979209 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110979246 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110979253 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110979326 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110979381 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110979443 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110979454 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110979490 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110979626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110979770 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110979781 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110979782 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110979894 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110979985 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110980029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110980098 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110980148 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110980222 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110980295 C G N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 110980447 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110980472 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110980479 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110980504 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110980526 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110980534 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110980627 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110980712 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110980831 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 110981021 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 110981463 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110981477 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110981503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110981588 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110981723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110981778 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110981823 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110981857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110981865 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110981905 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 3 110981929 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110981948 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110981975 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110982061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110982181 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110982348 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110982351 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110982395 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110982434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110982473 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110982500 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110982550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110982557 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110982603 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110982618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110982679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110982718 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110982801 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110982842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110982995 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110983000 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110983105 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110983186 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110983247 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110983280 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110983316 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110983555 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110983616 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110983740 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110983758 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110983919 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110983938 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110984040 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110984066 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110984123 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110984170 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110984286 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110984318 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110984618 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110984696 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110984725 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110984756 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110984924 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110984927 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110985191 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110985225 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110985263 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 110985336 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110985381 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 110985418 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 110985422 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 110985531 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 110985539 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 110985582 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110985601 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110985730 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 110985873 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 110985951 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 110986309 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110986327 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110986365 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110986412 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110986469 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110986479 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110986511 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110986571 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110986601 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110986613 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 110986623 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110986680 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110986689 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110986768 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 110987039 C T Y Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 110987223 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 110987290 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110987300 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110987316 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110987396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110987472 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 110987526 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 110987529 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110987539 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110987550 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 110987679 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 110987729 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 110987780 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 110987910 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110987962 A C Y N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 110987974 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 110988017 G T Y N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 110988159 T C Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 110988237 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 110988587 G C Y N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 3 110988981 A G Y Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0.5 0 0.5 2 2 1 0 1 3 110989020 G T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 110989432 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 110989526 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 110989583 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0 1 0 16 16 0 16 0 3 110989603 A T N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 110989638 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 110989644 T G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 110989747 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 110989984 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 110989996 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 110990008 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 110990468 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 110990566 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110990604 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 110990667 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 110990695 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 110990733 C A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 110990767 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 110990793 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 110990856 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 110990969 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 110991041 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 110991129 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110991303 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110991381 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 110991392 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 110991442 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110991490 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110991559 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110991571 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110991613 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 110991620 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 110991625 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 110991673 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110991802 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 110991806 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 110991934 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 110991990 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 110992158 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 110992176 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110992198 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110992234 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 110992396 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110992512 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110992538 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110992708 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110992735 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110992845 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110992859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110992878 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110992894 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 110992967 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 110993023 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 110993147 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 110993157 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 110993193 A C N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 110993275 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110993590 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 110993786 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 110993811 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 110993895 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 110993960 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 110994047 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 110994053 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 110994072 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 110994136 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110994292 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 110994308 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 110994354 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 110994378 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 110994478 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 110994479 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 110994497 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 110994531 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110994582 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 110994640 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110994688 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110994714 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110994824 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110994909 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 110994952 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110994974 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 110995093 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 110995102 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110995123 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110995130 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110995188 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 110995265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110995288 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110995293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110995342 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110995419 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 110995489 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 110995527 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110995540 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110995543 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110995633 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 110995695 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 110995707 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110995748 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110995796 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110995893 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110995916 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110995935 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110995956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110996000 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110996055 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110996141 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110996188 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110996203 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110996248 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110996263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110996315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110996336 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110996414 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110996450 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110996475 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110996503 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 110996627 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 110996729 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110996849 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110996850 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110996886 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 110996888 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110996947 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110996977 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110997048 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110997090 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110997200 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 110997219 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 110997232 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 110997510 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110997522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110997556 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110997557 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110997580 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110997634 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110997653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110997810 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 110997828 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 110997870 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 110997916 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 110997941 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 110997963 G T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 110998069 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 110998076 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 110998305 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110998313 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110998426 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110998511 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110998523 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110998581 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 110998637 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 110998731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110998752 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 110998830 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 110998831 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 110998849 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 110998894 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 110998941 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 110999141 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110999183 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110999184 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 110999234 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110999316 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 110999352 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110999363 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 110999378 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 110999469 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110999529 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110999539 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110999548 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 110999858 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 110999897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110999950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 110999977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111000041 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 111000218 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 111000313 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 111000402 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111000651 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 111000676 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 111000836 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 111000906 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 111000951 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111000984 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111001000 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 111001043 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111001298 T C Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 111001311 A C Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 111001398 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 111001440 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 111001500 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 111001505 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111001549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111001560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111001924 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111001968 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 111001970 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 111002360 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 111002451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111002536 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 111002547 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111002558 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 111002634 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111002713 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111002836 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111002843 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111002996 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111003417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111003419 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 111003687 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 111003745 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 111003827 A C N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 111004206 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111004336 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111004474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111004528 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 111004561 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 111004757 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 111004828 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 111005005 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111005056 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111005083 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111005110 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111005201 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111005490 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111005556 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111005622 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111005740 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111006123 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111006239 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111006601 C T Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 111006686 C T Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 111006688 G A Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 111006958 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111007070 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111007165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111007194 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111007242 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 111007286 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 111007314 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 111007664 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111007700 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111007845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111008011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111008226 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 111008317 A T N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 111008431 C T N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 111008640 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 111008717 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111009063 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 111009206 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 111009383 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 111009412 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 111009661 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 111009835 T C N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 3 111009848 T C N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 111009972 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 111010037 G T N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 111010070 A C N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 111010105 T A N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 111010146 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 111010284 A G N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 111010364 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111010398 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 111010458 T G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 111010693 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 111012579 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 111013144 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111013291 T A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 111013533 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111014727 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111014762 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111014822 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111014905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111015169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111015322 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111016407 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111016620 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111016684 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111017230 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111017426 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 111017528 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 111017605 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111017689 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111017727 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 111017819 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111017918 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 111017960 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111018059 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111018071 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111018325 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111018574 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111018601 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 111018929 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 111018957 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111018999 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 111019170 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111019337 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 111019353 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111019386 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 111019531 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 111019648 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111019693 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111019740 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 111020264 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111020772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111020886 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 111021009 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111021012 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 111021517 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111022123 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111022146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111022332 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 111022560 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111023011 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111023287 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111023525 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111023865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111024078 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111024227 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111024257 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111024267 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 111024338 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111024351 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111024378 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111024436 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111024788 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 111025384 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 111025806 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111026226 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111026335 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 111026656 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 111026749 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 111027141 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 111027194 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 111027195 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111027219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111027393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111027860 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 111027880 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111027938 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111028139 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111028234 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111028334 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111028360 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111028379 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 111028425 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 111028907 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 111029473 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111029704 G C N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 111029716 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 111030422 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111030673 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111031020 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111031137 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 111031478 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 111031547 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 111031607 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111031619 G C Y N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 14 18 0 14 2 3 111031620 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 16 14 1 14 0 3 111031709 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111031903 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111032020 T G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 111033425 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111034233 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111034735 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111034763 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 111036591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111036844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111036886 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 111037069 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 111037200 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 111037231 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 111037455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111037552 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111037572 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 111037598 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111038549 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 111039319 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 111040348 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 111041637 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111041755 A T Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 111042653 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 111042708 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111043384 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111043570 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 111044092 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111045608 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111047405 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111047473 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111048838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111050138 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111050516 C T Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 111050807 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111051644 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 111052282 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111052348 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111052474 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 111052519 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 111052565 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 111052875 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 111053311 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111053393 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 111053413 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111053773 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 111053892 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 111053929 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 111053984 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 111053987 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 111054056 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 111054095 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 111054198 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 111054229 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 111054514 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 111054848 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 111055052 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 111055108 A T N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 111055121 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 111055171 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 111055327 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 111055371 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 111055613 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111055736 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111055787 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 111055803 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 111055807 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 111055940 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 111056106 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111056214 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 111056364 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 111056605 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 111056964 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 111057567 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 111057608 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111057940 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111058487 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 111058682 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111058840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111058916 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 111064881 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111064985 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 111065015 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111071933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111072051 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111072097 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 111072434 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111072648 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111072743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111072864 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111074876 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111075341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111075515 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111076363 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 111076444 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 111076685 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111076688 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 111076696 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111077439 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111077734 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 111078243 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 111078326 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111078702 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111078785 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111079521 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 111080138 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111080374 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111080818 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111081598 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111082081 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111084111 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111084503 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111084554 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111086253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111089530 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 111090402 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111091128 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111091584 T G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 111093281 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111093395 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111093525 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111093869 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111094543 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111094712 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111094818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111095044 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111095969 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111096124 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111096465 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 111098709 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111098937 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111099547 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111100399 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111100872 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111101044 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 111102016 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111102256 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111103141 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111103149 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111105441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111106604 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111107434 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111108928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111110407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111110972 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111111066 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111113131 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111113185 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111113261 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111113384 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111114049 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 111114761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111115644 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 111117345 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111118061 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111118684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111119405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111119807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111119808 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111121155 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111121301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111123277 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111123354 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111125111 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111127620 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111127716 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111130431 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111136981 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111138975 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111140954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111141461 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 111141994 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111145870 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111146273 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111148125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111148412 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111148541 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111148586 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111149897 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111151592 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111154293 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 111155437 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111156083 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111156551 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111156697 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111157797 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 111158315 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 111159873 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111160034 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111162088 G A N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 111163424 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 111163432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111163835 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 111164290 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 111165228 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111166564 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111166605 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111167387 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111168274 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111168829 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111170903 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111170968 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111171210 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111171716 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111171841 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111172139 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 111172960 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111173056 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111173965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111174459 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111174663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111175681 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111177731 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111178030 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 111178039 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111178277 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111178464 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 111179044 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111179461 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111179491 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 111181510 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111182448 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111183072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111184010 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111184334 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 111184580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111184583 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111184658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111184918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111186299 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111188094 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111188290 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111189503 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111190825 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 111190912 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 111192116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111192315 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 111192534 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 111192589 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111192946 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 111193278 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 111193759 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111193831 G A N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 3 111195104 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 111195156 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 111196247 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111196446 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 111196706 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111197071 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 111197590 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 111198000 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 111198348 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111198517 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111198538 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111199002 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 111201257 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 111201800 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 111201914 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 111205223 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111206025 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 111206320 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 111208298 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 111209306 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111211456 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 111212437 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111214159 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111214368 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111218471 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111218709 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111221741 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111223316 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111223608 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111224351 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111225538 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111225621 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111225735 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 111226641 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111226813 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 111226878 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 111229645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111232330 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111232578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111232803 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111234810 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111235263 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111235307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111235950 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 111236548 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111238448 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111238954 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111239394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111239436 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111239998 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111240185 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111244063 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111244347 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111244449 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111244466 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111245706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111245965 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111246318 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111247090 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111249102 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111249557 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 111250488 A G Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 111252060 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 111252203 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111254966 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111256350 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111257247 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111257451 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111257834 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111257957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111259475 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111259994 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 111260151 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111260441 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111261470 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111261594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111261595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111261906 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 111264262 C A N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.0625 0.8125 0.125 15 17 1 13 2 3 111264643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111265225 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111265464 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0 0.722222222222222 0.277777777777778 13 23 0 13 5 3 111265802 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111266513 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111266707 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111267623 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111267656 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111267677 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111268396 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111268456 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 111268940 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111269620 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111270462 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 111270646 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 111270908 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111271046 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111271575 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 111272124 C T Y Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 3 111273922 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 111274002 G A Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 111274674 T C Y Y 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 3 111275071 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111275425 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111275487 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111275488 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111277716 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111277896 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111278311 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111279463 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 111280371 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111280599 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111280754 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111281669 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111281721 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111282020 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111282246 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 111283940 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111284933 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 111285551 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111285658 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111285953 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 111287078 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 111287171 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111287729 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111289039 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 111289327 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111290063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111291068 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111291479 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111292104 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111292872 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111293923 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111294164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111294194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111294257 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111294437 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 111294595 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111294672 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111294886 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111294915 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 111294953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111295112 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111295463 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111295491 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111295541 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111295782 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 111295858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111295995 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111296000 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 111296210 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111296241 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111296355 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 111296448 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 111296586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111296610 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 111296650 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111297308 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111297782 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111298899 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111298910 C G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 111299941 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111300087 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111301487 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111301819 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111302041 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 111303517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111304056 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111304247 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 111304720 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111305586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111306763 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111307389 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111307465 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111307875 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111308663 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111308882 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 111309997 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 111310237 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111310502 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 111312001 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 111312069 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 111312174 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 111312252 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 111312347 C T Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 111312485 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111312778 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 111315514 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111316832 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111316919 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 111317606 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111317937 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111319606 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111320779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111320972 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 111320997 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111321060 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111326224 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 111327076 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 111327086 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 111327665 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111328377 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111328627 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 111329977 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111330469 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111332462 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 111332887 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111332959 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111333258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111333476 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111336032 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111339199 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 111339295 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 111339332 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111340890 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111344294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111344621 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111345940 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111346345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111346541 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111346582 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111346823 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111348587 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 111349427 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111349666 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111349869 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111350289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111350722 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111351138 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111352954 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111353593 G A N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 111354783 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 111354953 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111355454 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111355562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111355736 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111355749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111356429 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 111356527 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 111356638 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111357397 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 111357488 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 111357596 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111357606 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 111357720 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111357861 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111358332 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111358961 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111359364 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111359391 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111359580 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111359784 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111360232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111361147 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 111362534 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111362598 C A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 111363641 A T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 111363669 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 111363851 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111363905 G A Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 111363911 G C Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 111365160 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 111365409 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 111365593 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 111365707 A T N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 111365767 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111365779 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111365839 C A Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 111366001 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 111366015 A G Y Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 3 111366555 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111367315 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111367730 T A Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 111367883 G T Y N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 111368377 T A Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 111368388 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111368567 G C Y N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 111368576 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 111369228 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 111369252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111369599 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111369767 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111370088 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111370232 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111370693 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 111372050 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111372059 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111372387 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111372533 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111372669 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111372770 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111373482 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111374086 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 111374461 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111374596 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 111375776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111376632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111376782 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111377507 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111378077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111378176 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111379264 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111389630 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 111390490 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111390667 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111390669 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111391193 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 111391714 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111392377 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 111392764 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111393135 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111393327 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111393938 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111394299 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111395102 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111395841 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111396230 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111396335 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111396928 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 111397129 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111397240 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111397489 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 111398247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111398534 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111399005 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111410973 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111411046 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111411079 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111413391 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111413723 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111414712 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 111414767 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111415304 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111417947 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 111419194 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111419339 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111420706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111421216 A C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 111421675 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111421808 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 111421846 G C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 111421894 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 111421913 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 111422357 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 111422384 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111422465 T A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 111422938 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 111422991 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 111423109 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 111423334 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 111423422 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 111423474 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 111423786 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 111423861 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 111423944 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111424101 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 111424112 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111424248 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 111424249 A T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 111424338 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111424394 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 111424546 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 111424957 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111425109 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 111425208 G T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 111425611 C T N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 111427097 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111427427 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 111428002 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111428085 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 111428130 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 111428157 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 111428216 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111428273 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 111428424 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 111428645 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111428701 T C N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 3 111428702 G A N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 3 111428741 A T N N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 3 111428968 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111429196 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111429336 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111429399 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111429531 C T N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 111430245 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 111430267 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 111430285 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 111430661 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 111431267 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 111431920 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 111431947 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 111431988 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 111432185 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 111432328 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111432405 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 111432593 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 111432602 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 111432656 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111432702 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 111432995 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 111433288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111433679 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 111433776 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 111433820 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111433964 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 111434032 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 111434065 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 111434326 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 111435272 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 111435273 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 111435639 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 111435816 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 111435959 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111436091 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 111436129 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 111436293 T C N Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 6 8 0 6 1 3 111436635 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 111437179 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 111437479 A G N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 3 111437687 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 111437740 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111437822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111438066 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 111438134 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 111438219 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 111438695 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 111439116 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 111439428 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111440215 G A N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 3 111440591 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111440604 A T N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.0666666666666667 0.733333333333333 0.2 13 17 1 11 3 3 111440660 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111441822 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 111443353 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 111443411 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 111443560 G T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 111443828 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 111443911 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 111443918 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111444153 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 111444381 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111444696 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111445348 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 111445634 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 111445741 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111445904 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111445989 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111446531 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 111446618 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111446820 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111448565 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111448858 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111449149 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111450591 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111451571 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111453217 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 111454570 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 111454812 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111456115 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111456165 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111456529 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111456666 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111457413 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111458509 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 111458630 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 111459689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111459758 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111460308 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111460322 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111460401 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 111460566 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111460567 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 111461758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111461818 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111462675 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111462679 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111462904 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111464759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111464840 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111465127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111467940 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 111468026 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111468336 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111468552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111468816 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111469600 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111469749 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111470075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111470364 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111471381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111471816 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 111471916 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 111472062 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111472114 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 111473213 A T N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 111473352 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111474319 T G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 3 111474336 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111475018 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 111475059 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 111475468 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111475975 C A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 111476076 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 111476230 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 111476460 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111476615 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 111477328 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111477583 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111477628 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111477706 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 111477992 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111478037 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111478133 A G N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 16 12 2 12 0 3 111478374 G A Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 111478524 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111479003 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111479245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111480984 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111481000 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111481097 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111481553 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 111481627 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 111481840 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111481998 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 111482164 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111482316 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 111482359 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111482415 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111482431 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111482490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111483425 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111483641 T A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 111483665 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111483848 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111484545 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111484630 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111484912 G C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 111484977 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 111484994 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 111485275 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 111485554 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111485583 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111485696 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 111485827 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111485905 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111485979 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 111486088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111486133 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 111486151 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111486836 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111486993 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111487050 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 111487826 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111487990 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 111488067 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 111488138 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 111488244 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 111488270 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 111488449 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111488650 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111488777 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111488779 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111488884 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111496425 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111496453 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 111496479 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 111496756 C G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 111496784 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111496958 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111497234 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111497600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111497798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111497799 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111497897 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111497931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111498212 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111498225 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111498263 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 111498314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111498345 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 111498376 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111498666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111498727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111498938 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111499170 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 111499509 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111499943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111499965 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111499976 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 111500124 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111500565 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111500738 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111500846 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111501059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111501105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111502210 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111502263 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111502392 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 111502431 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111502586 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 111502601 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111502642 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111502658 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111502713 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 111502741 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111502841 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111502923 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 111502973 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 111503017 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 111503067 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111503306 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111503307 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111503425 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 111503453 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 111503551 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 111503554 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 111503564 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 111503600 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111503647 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 111503794 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111503863 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 111504155 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 111504188 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 111504232 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111504441 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111504639 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111504769 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111505081 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111505084 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111505138 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111505255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111505290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111505380 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 111505437 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111505445 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111505462 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111505569 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111505715 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111505801 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 111505950 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 111505996 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111506021 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 111506189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111506290 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 111506618 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 111506695 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 111506749 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 111506758 T A Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 111506760 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 111506818 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111507151 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111507245 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 111507319 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 111507553 A G N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 10 10 4 2 4 3 111507664 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 111507688 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 111507742 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111508438 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 111508628 G T N N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 111508665 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 111508927 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 111509071 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 111509077 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111509146 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 111509183 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111509789 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111509871 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 111510152 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 111510211 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 111510233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111510476 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111510540 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 111510724 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 111510796 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111510936 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 111511994 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 111512158 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 111512206 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 111512207 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 111512379 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 111512419 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 111512422 A G N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 111512612 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 111512886 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 111512962 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 111513152 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 111513287 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 111513428 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 111513434 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 111513556 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 111513704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111513746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111513782 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 111513829 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 111513940 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 111513945 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 111513972 G T Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 111514031 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 111514102 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 111514138 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111514199 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111514345 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111514367 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111514369 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111514423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111514502 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 111514556 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111514565 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111514620 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111514668 A G Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 111514733 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111514897 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 111514982 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111515020 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111515021 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111515078 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 111515100 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111515205 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111515314 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111515336 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111515348 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111515442 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 111515642 T A Y N 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 3 111515709 T A Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 111515787 A C Y N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 111515931 G A Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 111515977 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111516092 C G Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 111516151 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111516153 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111516189 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111516401 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111516482 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111516529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111516542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111516561 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111516648 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111516700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111516716 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111516760 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111516852 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111516985 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111517042 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111517065 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111517154 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111517194 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111517208 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 111517239 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111517248 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111517257 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111517322 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111517342 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111517372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111517396 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111517443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111517490 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111517528 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111517606 T C Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 111517625 T C Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 111517659 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 111517831 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111517879 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111517948 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111517970 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111517977 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111518123 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111518125 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111518220 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111518300 T G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 111518367 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 111518423 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111518458 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111518616 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111518652 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 111518701 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111518716 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111518722 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111518784 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111518822 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111518847 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111518970 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111519063 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111519066 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111519165 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111519179 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111519594 T G Y N 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 2 4 1 0 2 3 111519598 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 111519639 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 111519736 C G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 111519760 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 111519955 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 111519980 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 111520109 G C Y N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 111520272 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111520278 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111520290 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111520309 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111520388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111520473 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111520630 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111520648 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111520689 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111520780 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111520799 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111520835 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111520929 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111520938 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111520968 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111521021 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111521053 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111521060 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111521109 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111521148 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111521193 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 111521245 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 111521543 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 111521599 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 111521681 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 111521703 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111521780 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111521826 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111521870 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111521896 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111521983 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 111522383 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 111522679 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111522754 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111522832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111522873 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111522899 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111522924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111522961 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111522967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111522980 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111523022 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111523052 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 111523111 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111523249 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111523259 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111523265 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111523325 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111523354 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 111523383 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111523459 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111523491 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111523523 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111523524 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 111523610 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111523625 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111523650 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111523700 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111523793 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111523802 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111523854 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111523890 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111523986 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111523992 G C Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 111524018 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111524114 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111524142 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111524196 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111524209 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111524216 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111524232 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111524270 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111524283 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 111524333 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111524368 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111524372 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111524394 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111524579 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111524730 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111524769 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111524829 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 111524860 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111524870 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111524884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111524941 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111525019 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111525042 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111525063 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111525098 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 111525346 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111525385 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111525442 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111525466 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111525515 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111525516 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111525527 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111525534 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111525627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111525649 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111525680 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111525697 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111525797 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 111525865 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111525898 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111525913 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111526091 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111526141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111526179 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111526233 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111526282 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111526441 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111526478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111526509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111526628 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111526844 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 111526898 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111526989 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111526997 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111527028 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111527056 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111527108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111527125 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111527176 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111527196 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111527209 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111527210 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111527271 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111527281 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111527283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111527342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111527392 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111527429 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 111527462 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 111527484 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111527491 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111527527 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 111527560 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 111527602 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 111527646 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 111527653 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 111527691 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 111532614 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 111532640 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111532641 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111532881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111532932 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111532978 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111532980 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111533015 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 111533132 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 111533171 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111533199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111533334 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111533463 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 111533543 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111533620 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 111533712 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111533772 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111533787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111534241 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111534262 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111534320 T G Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 111534321 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111534353 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111534405 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111534603 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111534772 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 111534803 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 111534805 C A Y N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 111535107 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 111535116 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111535270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111535333 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111535486 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111535879 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111535985 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111536002 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 111536193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111536317 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 111536417 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111536430 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111536553 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 111536559 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 111536655 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 111536678 C A Y N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 111536709 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 111537239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111537342 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111537415 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111537449 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 111537483 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111537545 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111537639 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111538513 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 111538612 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 111538877 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111539072 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111539258 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111539727 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111539909 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 111540922 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111541021 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111541022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111541191 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111542056 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111542094 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111542105 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111543751 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111544033 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111544666 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 111545182 A T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 3 111545307 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 111545339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111545832 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111546100 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111547487 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 111548589 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111549078 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111549586 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 111549719 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 111549961 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 111550008 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 111550068 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 111550111 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 111550512 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 111550526 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 111550681 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 111550833 G C Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 111552952 G C Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 111553141 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 111553347 C A Y N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 111553715 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111556389 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 111557397 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 111557574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111557580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111557588 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111557600 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111557610 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111557796 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111558385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111558460 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 111558600 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 111558716 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 111558961 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111558988 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 111558990 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111559007 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111559414 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 111559475 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111559608 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111560047 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111560064 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111561095 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111561116 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 111561239 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 111561363 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 111561422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111561442 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111561459 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111561488 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111561496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111561537 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111561543 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 111561745 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 111561777 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111561944 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 111561963 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 111561968 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 111562001 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 111562010 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 111571864 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111572117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111574584 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111579773 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111580730 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 111581869 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111583225 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 111588756 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 111589930 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 111590369 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111593409 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111593639 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111602432 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111603586 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111603797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111604961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111605046 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111606899 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111612955 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111613169 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111614543 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 111614548 A C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 111615711 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 111615887 C T Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.5 0.214285714285714 0.285714285714286 17 11 7 3 4 3 111619202 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111623239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111623981 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 111624565 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111624900 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111625336 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 111625795 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111625802 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111626156 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111626328 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111626496 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111626625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111627243 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111627298 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111631783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111631797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111631941 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111640184 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 111641722 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111641955 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111642385 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111642518 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 111642661 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111642817 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111642868 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111643029 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111643095 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111643124 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111643165 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111643268 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111643459 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111643515 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111643601 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111643693 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111644079 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111644347 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111644490 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111644561 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111644587 G T Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 111645104 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111645123 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111645344 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111645407 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111645569 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111645601 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111645683 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111645970 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111645998 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111646123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111646174 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111646416 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111646598 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111646620 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111646895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111647199 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111647219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111647379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111647648 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111647747 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111648003 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111648164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111648200 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 111648368 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111648391 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111648470 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111648544 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111648599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111648839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111648841 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111649192 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111649562 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111649606 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111649803 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111650039 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111650195 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111650261 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111650470 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111650527 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 111650660 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111650812 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 111650902 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 111650970 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 111651065 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 111651091 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111651130 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 111651201 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111651265 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 111651310 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111651376 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 111651438 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111651616 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 111651778 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 111651803 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 111651921 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111652019 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 111652024 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111652197 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 111652244 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111652272 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111652720 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111652721 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111652840 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 111652936 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 111653108 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 111653189 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 111653197 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 111653427 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111653480 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111653586 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 111653596 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 111653608 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 111653639 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 111653642 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 111653692 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 111653693 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 111653780 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 111653783 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 111653797 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 111653814 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 111653848 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 111653917 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 111653941 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 111653956 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 111653962 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 111653985 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111653995 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 111654010 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 111654060 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 111654069 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 111654104 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 111654166 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 111654177 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 111654227 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111654250 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 111654319 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 111654440 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 111654573 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111654629 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 111654683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111654760 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111654791 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111654808 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 111654916 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 111654917 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 111654936 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 3 111655007 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 111655089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111655174 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111655263 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 111655284 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 111655367 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 111655378 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 111655391 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 111655403 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 111655405 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 111655462 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 111655493 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 111655513 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 111655584 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 111655704 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 111655890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111656331 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111656984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111657168 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111659133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111659535 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111661527 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 111667834 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111668613 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 111669932 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 111670012 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 111670327 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 111671696 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 111674063 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 111674148 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111674333 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111674394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111681114 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111682178 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 111682248 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 111682301 T A Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 111682323 T A Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 111682700 C A Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 111682763 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 111684402 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111686542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111688035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111689523 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 111690217 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 111690565 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 111691234 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 111691316 G T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 111691342 A G Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 111691391 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111691432 G T Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 111691754 T A Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 111691755 A C Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 111691788 C T Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 111691789 T G Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 111691880 G A Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 111691907 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 3 111692040 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111692128 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 111692142 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 111692216 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 111692229 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111692277 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 111692339 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 111692619 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111692682 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 111693182 T A Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 111693211 A G Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 111693437 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 111693735 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111694193 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 111694223 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 111694633 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111694656 C A Y N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 111694738 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 111694851 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 111694923 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 111694938 C T N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.363636363636364 0.363636363636364 0.272727272727273 12 10 4 4 3 3 111695668 C A Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 111695760 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111695820 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 111695916 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 111695959 T A N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 111696173 C A N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 111696294 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 111696426 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111696956 G T N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 3 111697009 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111699553 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111700316 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111701264 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111702974 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111704689 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111704908 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111710927 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 111711602 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111711769 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 111712963 C T Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 111713436 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 111714910 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111716179 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 111717394 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111718002 G T N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 3 111718428 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111720559 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111720987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111721450 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 111723543 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111724987 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111725399 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111727146 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111727180 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 111733753 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 111735433 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 111736167 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 111737949 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 111738419 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111740414 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 111740794 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111741241 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 111741560 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111742160 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111742656 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111743766 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111744895 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 111746389 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111746777 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111747186 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 111748220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111748777 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111750708 G C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 111750953 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111751096 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111751397 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111752716 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 111752988 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111753152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111753680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111754102 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111754336 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 111754453 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111755179 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111755765 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111756422 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 111757876 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 111758541 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111758841 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111758894 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111758990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111760249 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111760323 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111760342 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111760687 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111760846 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111761081 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111761888 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 111762438 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111763439 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111764122 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111765132 A C Y N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 111765201 C G Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 111766420 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111766549 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111766678 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111767177 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111767275 T C Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 111767499 A C Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 111767711 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111768561 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 111768646 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111768680 C G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 111768969 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111769031 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111769390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111771488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111772124 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111772855 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111773044 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 111773066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111773331 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 111773462 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 111773692 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111773720 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111774054 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111774069 A T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 111774247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111774416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111774448 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111774460 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111774484 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111774542 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111774623 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111774651 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111774860 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111775026 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111775275 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111775292 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111775793 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111775915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111775944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111776031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111776097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111776131 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111776197 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 111776401 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111777186 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111777298 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111777328 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111777477 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111777942 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111777963 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111778022 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111778035 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 111778132 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111778210 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111778258 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111778310 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111778497 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111778520 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111778759 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111778890 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111778954 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111778966 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 111779012 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111779019 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111779743 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111779771 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111779891 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111779941 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111780012 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111780060 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 111780214 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 111780341 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111780349 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111780379 G C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 111780611 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111780635 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111780829 C A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 111780866 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 111780972 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111780984 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111780992 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111781076 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 111781225 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111781422 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 111781822 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111782064 C G Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 111782113 G C Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 111782288 C A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 111782635 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111782636 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111782704 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111782736 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111782778 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111783097 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 111783129 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111783400 C G Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 111783431 G T Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 111783439 A C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 111783682 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111783707 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111784106 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111784195 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 111785073 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111785164 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111785183 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111785249 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111785273 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111785308 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111785325 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111785832 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111785887 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111786101 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111786289 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111787153 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111787235 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111787254 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111787314 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 111787449 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 111787450 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 111787618 A T N N 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0 0.818181818181818 0.181818181818182 9 13 0 9 2 3 111787836 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 111788365 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 111788380 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 111788544 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111788583 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111788935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111788982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111789000 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111789181 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111789476 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111789575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111789675 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111789884 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111790070 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111790140 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111790142 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111790167 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111790211 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 111790261 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111790273 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111790282 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111790380 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111790423 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111790507 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111790639 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111790950 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111791122 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111791192 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111791317 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111791362 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111791754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111791810 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111791947 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111792132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111792141 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111792154 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111792366 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111792393 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111792884 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111793081 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111793351 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111793390 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111793497 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111793632 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 111793658 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111793770 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 111794436 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111794903 T A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 111794991 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 111795113 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 111795213 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 111795447 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111795866 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111796028 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111796164 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111796189 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 111796503 G T Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 111796643 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 111796779 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111797461 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111797465 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111798151 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111798191 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111798243 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111798424 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111798488 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111798502 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111798791 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 111798830 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 111798938 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111799098 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 111799299 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111799346 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 111799391 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111799485 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111799891 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111800134 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111800395 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111800437 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 111800468 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 111800527 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 111800625 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 111800679 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111800760 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111800799 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111800877 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111800879 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111800957 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111801015 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111801092 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111801203 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 111801383 A T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 111801458 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111801547 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111801742 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111802011 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111802021 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111802190 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111802277 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 111802431 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111802559 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111802669 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 111802919 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 111802928 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111803067 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111803165 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111803170 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 111803245 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 111803367 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111803378 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111803394 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111803639 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 111803940 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111804026 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 111804079 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111804130 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111804174 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111804268 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111804398 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111804416 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111804443 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111804479 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 111804485 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111804606 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 111804622 A C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 111804625 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 111804998 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 111805040 A G N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 111805082 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 111805265 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 111805283 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 111805338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111805347 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111805377 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111805524 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111805583 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 111805588 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 111805672 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 111805690 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 111806439 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 111806519 C T Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 111806549 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 111806584 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 111806634 G C N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 111806660 T C N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 111806689 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 111806778 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111806924 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111806927 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111806953 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111807013 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111807217 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111807243 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111807350 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111807689 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 111808064 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111808135 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111808165 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111808224 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111808242 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 111808389 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111808443 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 111808489 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111808545 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111808607 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111808720 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111808751 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111808808 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111808842 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111808849 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111808878 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111809018 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111809065 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111809876 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111812829 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 111812956 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111812989 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111813039 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111813071 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111813318 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 111813549 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 111813811 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 111813933 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111813983 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111814000 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111814026 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111814287 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111814372 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111814569 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111814609 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111814852 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111814940 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111814988 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111815036 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111815310 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111815413 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 111815414 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 111815612 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111815644 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111815653 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111815684 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 111815698 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111815742 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111815769 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111816094 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111816222 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 111816245 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 111816277 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 111816458 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 111816493 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111816534 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 111816557 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 111816599 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111816735 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111816845 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111816875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111817001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111817103 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111817143 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111817189 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 111817191 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111817239 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 111817253 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 111817330 A T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 111817379 T G Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 111817448 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 111817466 G T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 111817472 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 111817500 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 111817501 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 111817538 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111817950 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111818087 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111818311 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 111818326 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 111818333 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 111818339 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111818353 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 111818370 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111818475 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111818489 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111818493 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111818505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111818513 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111818534 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111818563 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111818640 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111818712 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111818716 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111818754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111818787 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111818894 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111818982 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111819013 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111819062 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111819063 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111819157 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 111819176 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 111819201 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111819505 T A N N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 111819989 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 111819997 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111820100 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111820178 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111820301 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 111820359 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111820404 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 111820451 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 111820610 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111820805 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111820823 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 111820835 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 111821012 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111821094 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111821095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111821175 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111821301 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111821302 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111821344 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111821474 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111821478 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111821601 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111821658 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 111821715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111821729 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111821942 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111821944 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111824007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111824541 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111825460 C A Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 111825675 T G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 111825939 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111826630 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111826757 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111827260 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 111828061 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111828366 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 111828566 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111828797 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111829256 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111830289 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111830323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111830690 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111830926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111830941 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111831279 T G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 111832082 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111832705 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111832870 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111833184 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 111833250 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111833369 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 111833695 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 111833936 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111833945 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111834842 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111834902 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111835318 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111835553 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111836098 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111836187 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111836188 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111836467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111836544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111836567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111837456 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111837490 A T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 111837757 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111838008 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 111838013 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111838179 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111839010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111839395 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111839648 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111839957 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 111839968 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 111840582 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 111840822 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 111840824 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 111841031 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 111841699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111841914 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 111842430 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111844167 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111844617 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 111844918 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111844962 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 111845401 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 111845403 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 111845869 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 111846310 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111846353 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111846618 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 111846726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111848165 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111848444 A T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111848830 C T Y Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 111848832 C A Y N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 111849330 T G Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 111849851 A T Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 111850684 T A Y N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 111851410 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111851430 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 111852103 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111852478 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111852690 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111853220 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 111853289 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 111853942 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 111854067 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 111854073 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 111854295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111854447 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111854874 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111855909 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111855972 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 111856391 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 111856721 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 111856762 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111856962 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111858128 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111859493 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 111861905 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111863046 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 111863105 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 111863987 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 111864347 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111864413 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111864430 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 111865191 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111866530 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 111866936 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 111873505 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111874093 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 111875197 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111875572 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111875789 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111876140 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111876632 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111877291 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111877941 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111878888 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111879772 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111880103 C G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 111880197 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111881328 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111881687 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111883054 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111883326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111883759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111884320 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111884972 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111885701 C A Y N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 111887020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111887922 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111888984 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 111889446 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111889805 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111890051 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111891150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111891644 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 111892989 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111893170 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111893319 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111893781 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 111893800 G C Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 111893830 T A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 111894114 T A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 111895461 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111896025 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111896289 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111896290 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111896375 C A Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 111897245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111897363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111897676 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 111897968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111898379 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 111898754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111898826 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111899484 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 111899612 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111900292 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111900591 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111900964 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 111901274 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 111901658 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111902014 C A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 111902096 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 111902274 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 111903340 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111903547 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111903621 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111904666 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 111904675 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 111905254 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111905423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111905482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111905580 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 111905644 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111905647 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111905750 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111906268 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111906370 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111906583 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 111907049 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111907219 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 111907496 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 111907559 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 111907960 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111908001 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111908128 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 111908420 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 111908495 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111908530 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 111908654 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 111908854 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 111908998 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 111909034 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 111909043 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 111909075 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 111909316 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 111909318 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 111909421 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 111910110 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111910175 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111910217 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 111910460 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111910524 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111910525 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 111910806 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111911217 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 3 111911349 C G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 111911357 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 111911400 G A N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 111911423 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 111911542 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 111911611 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111911614 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111911655 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 111911715 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111911956 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111912039 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111912100 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111912702 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 111912789 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 111913128 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 111913396 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111913435 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111913436 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111913607 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 111913774 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111913802 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 111913812 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 111913893 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111913949 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 111913995 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 111914002 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 111914256 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111914356 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 111914358 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111914475 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 111914535 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 111914640 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 111914906 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 111915220 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111915273 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111915287 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 111915314 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111915551 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111915572 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 111915841 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 111915880 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 111915959 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 111916236 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 111916332 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 111916345 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111916458 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111916581 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 111916594 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 111916879 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111916959 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111916999 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111917129 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 111917169 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 111917468 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 111917678 A T N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 111917879 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 111918457 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 111918535 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111918886 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 111918945 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 111919226 A C N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 111919573 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 111921480 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111921508 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111921581 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111921752 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 111921797 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 111921834 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 111921865 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 111921966 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 111922008 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 111922075 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 111922083 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 111922114 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 111922196 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 111922315 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 111922357 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 111922414 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 111922415 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 111922484 G A N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 111922495 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 111922553 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 111922880 G A N Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 3 111922884 T C N Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 3 111922984 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 111923000 C A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 111923033 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 111923090 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 111923192 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 111923215 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 111923232 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 111923240 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111923245 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 111923394 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 111923544 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 111923611 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 111923724 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111923748 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111923902 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 111923928 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111923933 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111924505 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 111924922 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 111925284 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111925404 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 111925462 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 111925471 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 111925504 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 111925691 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111925713 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111925777 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111925823 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 111925869 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 111925910 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 111925939 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111925987 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 111926029 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 111926101 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 111926121 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111926181 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 111926207 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111926223 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111926314 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 111926341 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 111926391 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 111926470 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 111926481 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 111926527 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111926558 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 111926561 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 111926622 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 111926623 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 111926648 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 111926737 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111926748 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111926757 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111926898 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 111926910 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111926965 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 111927361 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 111927445 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111927454 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111927457 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111927477 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111927488 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111927590 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111927627 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111927633 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111927661 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111927673 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 111927707 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111927726 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111927768 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 111927776 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 111927783 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 111927819 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 111927822 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 111927928 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 111927984 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111928030 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 111928045 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 111928063 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 111928650 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111928677 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111929158 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 8 10 0 8 1 3 111931618 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111931655 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111931656 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111931856 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111931992 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111932766 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111932861 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111932904 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111933252 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111934027 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111934379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111934393 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111934992 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111935054 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 111935499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111936552 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 111938954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111943655 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111944417 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 111944627 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111945070 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111945451 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111946247 T A Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 111948448 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111949529 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111951257 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 111951485 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 111952195 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 111952775 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 111953230 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111953399 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111953497 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111953616 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111953659 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111953681 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111953785 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111953828 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111953992 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 111953993 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 111954024 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111954080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111954351 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111954374 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111961025 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111961083 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111961139 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111961188 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111961198 C A Y N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 111961268 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 111961433 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 111961624 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111961660 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111961679 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111961702 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111961746 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111961819 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111962027 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111962038 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111962136 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111962147 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111962222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111962463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111962481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111962531 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111962669 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 111962696 G A Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 111962714 T C Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 111962753 G A Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 111962758 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111962772 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 111962782 A C Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 111963024 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111963030 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 111963087 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 111963124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111963709 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 111963809 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 111963835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111963923 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111963985 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111964113 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 111964123 G A Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 111964169 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 111964234 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 111964642 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 111964690 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 111964734 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 111964818 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111964862 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 111964904 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111964930 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111964941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111964984 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111965014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111965086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111965089 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111965188 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 111965725 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111966081 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 111966384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111966569 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111966647 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 111966888 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 111966916 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111967246 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 111967695 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 111967974 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111967975 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111968025 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 111970714 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111975981 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 111976010 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111976087 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 111977490 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111977817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111978190 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 111980177 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 111980329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 111980358 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 111980538 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 111981784 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 111983084 G T N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 111984939 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 111985932 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 111987002 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 111987623 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 111996007 T A Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 111997889 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 111998600 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 111999063 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 111999411 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 112000410 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 112002686 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112002914 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112003207 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112003372 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 112004641 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 112006244 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112006866 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112007293 T G Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 3 112007296 G T Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 112007429 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112007800 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 112008425 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112009095 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112009161 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112010212 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 112010271 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112013636 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112014850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112015866 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112016655 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112018011 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112018153 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112018487 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112019017 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112020757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112021189 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112021489 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112025186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112025344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112026605 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 112028261 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112030269 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 112030337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112030366 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 112030646 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 112031157 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 112031688 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 112032255 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 112032574 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112032906 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 112033045 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 112033934 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 112034602 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 112034792 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 112035456 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 112035497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112035505 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 112035553 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 112036059 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 112036286 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 112036324 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 112036388 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 112036407 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 112036449 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 112036507 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112036758 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 112036898 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112037064 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112037188 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112037349 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112037352 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 112037527 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 112037564 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 112037610 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 112037709 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 112037797 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112037824 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 112037836 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 112037841 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 112037908 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 112038054 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112038066 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112038075 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 112038277 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 112038443 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 112038520 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 112038610 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 112038811 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 112038874 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 112039020 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 112039052 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 112039142 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 112039147 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 112039161 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 112039236 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 112039262 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 112039320 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 112039337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112039523 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 112039593 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112039687 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 112039832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112040181 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112040367 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112040428 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112040472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112041106 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112041128 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 112041208 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 112042183 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112042208 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 112042217 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112042302 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112042334 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112042514 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112042875 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 112042976 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112042996 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 112043093 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112043123 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 112043416 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112043475 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112043518 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112043589 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 112043628 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 112043977 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 112044107 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 112044717 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112044828 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 112045109 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 112045125 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112045130 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112045693 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112045705 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 112045718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112045734 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112045792 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112045843 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112045854 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112046003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112046302 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 112046466 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112046502 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112047488 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112047548 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 112050091 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 112050151 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112050891 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 112050932 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 112051074 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112051400 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 112051599 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 112051630 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 112052416 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112052600 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112052741 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112052838 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112053835 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112054315 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112054323 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112054902 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 112055452 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 112056107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112056134 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112056172 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112056429 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112056757 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 112057001 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 112057160 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112057516 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 112057527 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 112057588 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 112057994 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112058490 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 112059121 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112059166 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112059175 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112060510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112061083 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112061119 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 112061547 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112062062 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112062153 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112062167 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112062201 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 112062849 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112062921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112063278 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112063395 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112063732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112063926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112064197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112064449 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112064586 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112064768 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112064959 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112065064 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112065328 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 112065344 A G N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 112065397 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 112065444 T C N Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 112065445 T A N N 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 112065545 T A N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 112065812 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112065827 C G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 112066260 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112066314 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112066671 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112066685 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112066767 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 112066782 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112066805 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112066874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112066993 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112067027 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112067031 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112067403 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 112067447 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 112067486 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112067582 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112067637 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112067681 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112067787 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112067793 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112067951 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112068096 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 112068098 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 112068189 G T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 112068191 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112068561 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 112068599 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112068648 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112068758 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112068773 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112068850 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112068904 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112068988 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112069164 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112069979 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112070053 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112070221 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112070582 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 112070786 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112070920 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 112071134 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112071148 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112071503 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112071606 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 112071609 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112071665 T G N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 112071847 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112071850 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112072013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112072040 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112072101 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112072215 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112072216 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112072392 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112072446 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112072739 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112073048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112073168 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112073198 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112073209 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112073314 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112073350 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112073375 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 112073397 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 112073400 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112073514 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112073888 A T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 112074491 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 112074493 T A Y N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 112074517 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 112074683 A G Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 112074873 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112074887 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112075050 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112076303 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112076461 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 112076779 A G Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 112077174 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112077463 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 112078821 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 112078918 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112078993 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 112079446 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112080063 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112080128 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 112080145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112080154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112080778 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112080948 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112081484 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112081504 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112082260 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112083106 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112083547 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 112091516 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 112091799 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112092178 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112092432 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112092563 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112092971 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112093622 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 112093683 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 112094276 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 112094320 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 112094856 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112095338 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112095828 G T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 112096417 C T N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 112096758 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 112097264 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112097296 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 112097565 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 112097740 C T Y Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 112097965 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 112097970 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 112098105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112098777 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 112098825 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 112099952 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 112100009 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 112101064 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 112101389 C T Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 112101727 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 112101758 A T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 112101939 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112102719 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112103619 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112103704 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 112104910 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 112107076 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112107196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112108131 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112110840 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112112477 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112112684 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112114275 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 112114535 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112114608 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112115200 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 112115230 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112115312 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 112115541 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 112115876 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 112116090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112116598 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 112116982 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 112123289 T G Y N 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 3 112124428 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112124436 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112124537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112125103 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112125118 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 112125945 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 112127113 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112127443 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112127827 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112128441 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 112128753 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 112130642 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 112130890 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 112131310 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 112131710 G A Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 112132306 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112132824 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 112132987 C A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 112133003 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 112133630 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112134022 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 112134217 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 112134240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112134566 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 112134645 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112141152 G C Y N 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 3 112141381 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112141670 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112142093 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 112142661 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 112142918 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112143216 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 112143713 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112145032 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 112145144 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112145551 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112145778 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 112147472 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112147775 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112148040 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112148708 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 112148839 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 112149181 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 112149613 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112149731 A C Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 112149997 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112149999 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 112150089 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112150139 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112150205 A C Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 112150558 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112150573 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 112150585 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 112150700 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112150854 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 112150865 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112151055 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 112151247 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 112151303 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 112151515 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 112151901 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 112151902 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 112151941 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 112151950 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 112152047 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 112152070 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112152402 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 112152463 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 112152661 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 112152717 T A Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 112152767 A T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 112153132 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 112153138 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 112153179 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 112153456 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 112153579 C G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 112153662 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 112153705 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 112153792 G C N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 112153805 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 112153820 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 112153856 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 112153886 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112153891 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112153908 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112153962 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 112153965 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112153978 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112153985 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112154112 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112154202 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112154213 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112154220 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112154230 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112154238 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112154312 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 112154375 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112154404 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112154431 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 112154459 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 112154493 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112154495 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112154570 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112154636 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112154643 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 112154662 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112154735 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112154744 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112154866 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112154929 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 112154954 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112154982 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112155038 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112155071 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112155189 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112155592 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 112155693 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 112155718 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 112155727 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 112155782 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 112155783 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112155907 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 112155989 C G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 112156017 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 112156028 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 112156252 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112156301 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 112156305 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 112156333 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 112156339 C G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 112156376 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 112156397 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 112156449 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 112156476 A T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 112156492 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 112156580 A T N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 112156588 T A N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 112156615 G T N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 112156617 G A N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 112156945 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 112156948 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 112156957 G T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 112156971 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 112157007 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 112157032 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112157081 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 112157097 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 112157101 A C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 112157248 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 112157296 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 112157385 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112157486 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112157497 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112157740 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 112157743 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 112157803 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 112158206 G C Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 112158447 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 112158461 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112158549 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112158609 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 112158620 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112158833 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 112158886 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112158918 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 112159117 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112159122 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 112159270 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 112159308 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112159312 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112159349 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 112159383 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112159432 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 112159516 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 112159611 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 112159621 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 112159622 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 112159643 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 112159737 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112159820 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112159899 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112159996 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112160013 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 112160094 A C N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 112160330 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 112160334 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 112160372 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 112160395 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112160402 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112160461 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112160517 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112160542 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 112160558 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112160566 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 112160576 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112160619 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112160687 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112160852 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112161187 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 112161192 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112161208 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 112161271 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 112161272 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112161366 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112161409 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112161476 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112161567 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112161756 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 112161809 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 112161949 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112161962 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112162183 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112162397 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112162510 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 112162608 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 112162842 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 112162982 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 112164009 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 112164057 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 112164070 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 112164076 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 112164118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112164277 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 112164311 A G N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 112164332 A G N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 112164333 T A N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 112164617 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 112164930 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 112165001 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112165163 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 112165234 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112165585 G C N N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 112165764 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 112165785 A T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 112165932 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112165987 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 112166089 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112166112 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 112166232 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112166237 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112166439 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112166462 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112166512 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112166857 A G N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 112166985 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 112167022 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 112167058 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 112167110 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 112167284 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 112167420 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112167490 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 112167593 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 112167787 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 112167808 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 112167876 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112168082 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 112168253 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112168271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112168667 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 112168737 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 112168873 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 112169174 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 112169274 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 112169409 G C Y N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 112169498 A T Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 112169725 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 112169805 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112169891 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 112170021 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 112170171 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 112170581 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 112170600 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 112170838 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112170842 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 112170970 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112171258 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112171315 G C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 112171416 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112171588 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112171796 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 112171959 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112172498 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112172653 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112172794 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112172854 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112173126 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112173648 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112173674 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112173910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112174026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112174346 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 112174976 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 112174981 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 112175336 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112175578 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112175794 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112175853 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112177007 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112177099 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 112177145 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112177236 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 112177251 G T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 112178000 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112178384 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 112178894 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112179016 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112179101 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112179181 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112179272 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112179531 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 112179926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112179997 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 112180318 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112180780 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112180862 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112181051 G T N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 112181390 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 112181481 T C N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 112181559 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112181844 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112182524 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 112182723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112182754 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112182849 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112183201 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 112183316 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 112184167 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112184700 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 112184775 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112184799 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112184865 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112184914 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 112184932 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 112185264 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112185526 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112185589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112185596 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112185618 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112185753 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112186142 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112186367 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112186413 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112186512 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112186920 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112186972 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112187055 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 112187090 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112187275 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112187598 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112187689 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112187707 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 112187835 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 112187891 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 112188058 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 112188192 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112188613 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112188863 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112189000 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112189031 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112189599 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112189712 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112189755 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112190255 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112190467 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 112190654 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 112190814 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112191035 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112191562 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 112191716 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112192301 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112193014 G C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 112193319 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 112193605 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112193631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112193736 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112193971 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112194074 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112194358 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112194375 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112194428 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112194590 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112194610 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112194692 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112194753 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112194856 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112194899 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112194952 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112194992 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112195102 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 112195132 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112195446 C T N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 112195459 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 112195573 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 112195796 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 112195844 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 112195868 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 112196204 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 3 112196272 C T N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 112196414 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 112196800 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 112197017 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112197071 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 112197229 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 112197419 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 112197610 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 112198005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112198282 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 112198302 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112198425 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112198831 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 112198858 C G N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 112199190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112199243 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112199368 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112199689 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112199878 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112200054 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112200069 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112200234 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112200281 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112200371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112200805 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112200806 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112200889 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112200982 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112201037 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112201149 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112201235 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 112201392 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112201478 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112201692 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 112201815 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112202140 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 112202520 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112202611 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112202879 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112203164 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 112203347 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112203611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112203640 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 112203909 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 112204180 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112204318 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 112204342 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112204439 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112204566 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112204670 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112204672 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112204756 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112205344 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 112205372 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112205441 A G Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 112205673 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 112205714 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 112205931 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112205969 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112206049 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 112206113 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112206137 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 112206148 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112206282 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 112206310 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112206335 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112206451 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112206548 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 112206554 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 112206644 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112206679 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 112206844 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 112206850 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 112206911 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112207049 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112207138 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112207202 T G Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 112207518 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112207788 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 112207819 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112208236 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112208378 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 112208425 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112208480 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112208532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112208575 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 112208652 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112208770 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112208786 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 112208937 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 112208991 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 112209140 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112209182 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 112209220 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 112209333 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 112209470 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112209569 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 112209600 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112209631 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112209795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112210028 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 112210159 G T Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 112210423 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 112210564 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112210591 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112210645 G C Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 112211371 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112211453 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112211479 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112211493 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112211535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112211620 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112212352 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112212403 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 112212560 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 112212699 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 112213008 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 112213260 G T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 112213296 A T N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 112213328 T A N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 112213349 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 112213374 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 112213426 T G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 112213764 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 112213806 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112213857 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112213977 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112214141 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112214163 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112214171 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112214640 A C N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 112215167 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112215660 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 112215710 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 112216076 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 112216283 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 112216380 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112216598 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 112216727 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112216866 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 112216994 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 112217174 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 112217184 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112217289 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 112217386 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112217407 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 112217448 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112217493 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 112217648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112217773 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112217843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112218253 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112218437 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 112218461 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112218555 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 112218567 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112218616 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112218806 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112218832 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112218841 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 112218976 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112219084 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112219123 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112219145 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 112219148 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 112219161 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 112219179 A T N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 112219497 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112219520 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 112219603 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112219629 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112219664 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112219808 A G N Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 9 9 3 3 3 3 112220667 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 112220692 G A N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 112220764 A T N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 112220784 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112220819 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 112221472 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 112221531 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 112221549 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112221563 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112221567 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112221754 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 112221768 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 112221779 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 112221795 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 112221833 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 112221901 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 112221945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112221983 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 112222044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112222108 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 112222208 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112222219 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 112222289 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 112222354 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112222487 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 112222494 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 112222682 C G N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 112222923 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112222988 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112222997 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112223010 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 112223067 G T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 112223113 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 112223355 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112223393 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112223415 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112223459 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112223470 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112223571 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 112223572 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112223773 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 112223977 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112224063 T A N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 112224297 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 112224309 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 112224339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112224824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112224827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112224869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112226135 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 112226181 T G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 112226348 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 112226357 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 112226448 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112226522 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 112226751 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 112226827 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 112226866 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 112226908 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112227081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112227089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112227152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112227335 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112227431 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 112227448 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 112227529 C G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 112227772 C G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 112227810 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112227846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112228118 G A Y Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 112228772 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112229945 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 112229962 A T N N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 112229985 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 112230039 G T N N 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 112230062 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 112230620 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112230668 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 112230848 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112230880 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 112231211 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 112231396 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112231401 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 112231464 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112231576 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112231611 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112231666 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112231815 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 112232129 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 112232164 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112232225 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112232489 G T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 112232494 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112232681 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112232767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112232859 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112233020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112233172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112233533 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112233629 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112233658 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 112233697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112233783 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112233794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112233795 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112233919 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112234076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112234147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112234171 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112234172 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112234223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112234273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112234310 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112234379 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112234440 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112234518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112234621 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112234662 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112234734 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 112235167 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112235188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112235229 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112235279 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112235352 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112235393 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112235422 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112235437 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112235468 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112235753 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112235814 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112235876 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 112235957 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112235966 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112235978 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112236043 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112236103 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112236299 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112236494 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112236495 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112236513 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112236530 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112236739 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112236865 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112237095 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112237225 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112237334 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112237337 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112237394 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112237395 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112237559 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112237586 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 112237609 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 112237626 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112237685 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112237726 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112237741 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112237769 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112237872 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112237921 C A Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 112237947 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112238113 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 112238243 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112238244 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112238426 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112238449 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112238475 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112238499 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112238530 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112238601 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 112238640 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112238736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112238760 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 112238848 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112238900 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112238944 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112239092 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112239151 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112239175 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 112239184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112239304 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112239342 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112239396 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112239670 A C Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 112240141 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 112240345 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112240432 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112240724 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112240823 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 112241032 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112241174 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 112241456 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112242160 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112242717 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112242730 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 112243109 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 112243403 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112243404 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112243640 G C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 112243686 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 112243874 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112245428 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 112245632 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 112245799 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 112246047 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 112246490 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112246498 G T N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 112246558 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112246584 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 112246712 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 112247247 C A Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 112247762 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112248150 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112248550 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112248587 A C Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 112249073 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 112249352 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112249528 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112249824 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112249825 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112249992 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112250213 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112250534 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 112250716 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 112250803 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112251091 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 112251620 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 112251891 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 112251939 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 112252776 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 112253357 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112253415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112253907 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112253952 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 112254027 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112254028 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112254104 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112254428 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 112254471 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112254478 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112254525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112254860 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 112255192 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 112255200 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112255346 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 112255756 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 112255793 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 112255920 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 112255959 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 112255976 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 112256211 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 112256529 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112256654 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112256710 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 112257368 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 112257450 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 112257483 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 112257652 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 112257751 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 112257957 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 112258218 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112258319 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112258366 A T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 112258430 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 112258935 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 112259050 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 112259065 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112259540 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 112259809 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 112259895 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 112259901 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112259976 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112260146 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 112260460 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 112260484 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 112260679 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 112260781 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 112260918 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 112261059 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 112261090 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112261250 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 112261402 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 112261716 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112261748 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 112261809 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 112261831 T G N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 112262191 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 112262597 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 112262881 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 112262906 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 112262937 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 112262968 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 112263282 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 112263402 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 112263903 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 112264119 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112264391 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 112264763 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112264885 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112264962 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 112265093 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 112265158 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 112265396 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112265453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112266188 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 112266196 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 112266331 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 112266488 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 112267732 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 112268292 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112268569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112268634 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112268656 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112268693 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 112268752 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112268753 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 112268913 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 112268961 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 112269151 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 112269456 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 112269526 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 112269664 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 112269719 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 112269873 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 112270128 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 112270258 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 112270410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112270472 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112270784 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 112270879 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 112270906 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 112271276 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 112271543 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 112271592 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 112271719 G A N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 112271929 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112271971 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 112272045 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 112272173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112272189 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112272217 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 112272231 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112272364 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 112272373 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112272517 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 112272582 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112272593 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112272614 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 112272654 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 112272666 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112272726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112272784 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 112272863 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 112272911 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112273180 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 112273222 A T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 112273348 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 112273841 T C N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 112274043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112274346 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112274563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112274579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112274661 G C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 112274904 C T N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 112274937 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 112274957 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 112275007 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 112275017 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 112275089 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112275237 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112275589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112275790 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 112275867 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112276210 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 112276285 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112276293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112276315 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 112276760 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112276772 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112276873 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 112276991 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 112277014 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 112277050 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 112277106 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 112277262 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112277344 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112277372 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 112277405 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 112277505 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 112277572 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112277648 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 112277687 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112277844 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 112277856 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 112277866 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 112278107 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 112278145 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 112278336 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112278351 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 112278574 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 112278733 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 112278758 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 112279015 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 112279020 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 112279353 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 112279422 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 112279503 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112280218 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112280282 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 112280561 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112280628 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 112280805 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112281154 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 112281754 T C N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 3 112281869 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112282079 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 112282481 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 3 112283613 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 112283793 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 112283843 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 112284435 A G N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 3 112284694 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112284916 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112285041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112285550 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112285597 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112285701 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 112285804 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 3 112286024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112286507 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 112286556 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 112286590 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 112287133 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112287224 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 112287273 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112287600 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 112287926 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 112288259 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 112288646 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112289852 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 112289952 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 112290113 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 112290243 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112290303 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112290623 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 112291086 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112291186 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 112291419 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 112291471 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 112291649 G T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 112292156 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112292182 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112292236 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 112292285 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112292537 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112292549 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112292578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112292682 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112292727 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112293228 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112293532 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112293607 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112293780 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112293781 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112294308 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112294326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112294464 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112294566 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112294640 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112294690 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112294752 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112294764 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112294778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112294940 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112295198 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112295203 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112295492 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112295570 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 112295632 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 112295635 A T Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 112296385 G T Y N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 112296446 A G Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 112296555 C T Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 112297236 A T Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 112297451 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112297491 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112297528 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 112297660 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 112297833 A C Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 112297881 T A Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 112297919 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112298224 G T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112298350 T G Y N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 112298745 C G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 112298821 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 112298944 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112299139 G A Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 112299319 G C N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 112299705 T G N N 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 3 112299999 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112300036 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112300053 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112300063 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112300068 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112300146 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112300406 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112300409 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112300477 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 112300688 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112300698 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 112300811 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112300828 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112300873 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112300919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112300921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112300966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112301062 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112301088 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112301089 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112301125 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112301155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112301359 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112301366 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112301396 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112301483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112301721 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112301786 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112301809 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112301815 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112301843 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112301874 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112301974 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112302000 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112302153 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112302278 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112302338 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112302404 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112302538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112302669 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112302826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112302836 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112302919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112303053 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112303268 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112303296 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 112303337 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112303358 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112303461 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112303470 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112303562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112303672 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112303685 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112303686 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112304049 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112304077 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 112304193 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112304271 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112304279 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112304296 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112304370 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112304412 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112304490 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112304535 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112304606 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112305063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112305282 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112305725 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112305731 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 112305752 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112305791 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112305803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112305828 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112305930 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112306014 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112306500 G A N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 112306612 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112306628 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112306640 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112306730 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 112306766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112306784 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112306838 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112306932 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 112307029 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112307045 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 112307169 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 112307316 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112307358 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112307406 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112307415 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112307551 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 112308014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112308091 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 112308279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112308298 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112308305 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112308427 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112308575 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112308614 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112308643 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 112308821 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 112308871 C G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 112308873 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 112308918 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 112311534 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112311544 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112311984 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 112312627 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112312998 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112314395 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 112314749 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112316292 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112317046 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 112317352 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112317595 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112317829 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112318899 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112319126 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112319254 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 112320038 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112320790 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 112321118 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112321357 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112321427 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112322014 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 112324524 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112324702 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 112324964 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 112325778 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112327155 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 112327775 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112328405 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 112330712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112330993 A C Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 112331034 C T Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 112333524 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 112337745 C G Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 112339018 A G Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 112339155 A T Y N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 112340298 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 112342026 A T Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 112342060 C G Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 112344926 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112344951 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112345601 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112346676 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 112354829 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 112357049 A T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 112357748 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112357784 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 112357850 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 112358006 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 112359616 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 112360980 G A N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 3 112361223 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 112361898 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 112369598 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 112371978 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112372131 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 112373323 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 112375598 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112375831 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112376003 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 112378572 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 112379742 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112379963 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112380558 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112380963 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112381237 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112382870 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 112384085 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 112384159 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112385313 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112385784 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112388848 C T Y Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 3 112389948 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112390982 A G Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 112391735 A T Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 112392766 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112392768 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 112394385 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112394773 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112395222 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 112395322 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 112395508 T G N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 12 16 0 12 2 3 112396028 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112396776 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 112396934 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 112397145 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 112397266 A C N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 112397274 A T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 112400446 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112400797 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 112405355 A T Y N 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 3 112406847 A T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 112407579 G A N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 112409172 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112409352 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112410064 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 112418412 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 112419514 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112420414 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112423533 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112423636 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112424242 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 112424573 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112425229 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 112425750 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112430179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112430904 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112432184 T A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 112434483 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112437098 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112439803 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 112442569 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 112449480 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112449921 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 112450610 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112453466 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112457519 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112458337 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112465236 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112465614 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 112468005 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112469299 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112470979 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112477163 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112478763 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 112479502 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112479984 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112480466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112482310 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 112483733 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112485839 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112486258 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112489449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112489703 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112492664 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 112493212 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112493225 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112493899 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112494356 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112494390 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112494444 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112495204 C T N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 112495283 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112495596 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 112495711 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112495830 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112495986 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112496079 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 112496951 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112496954 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112497544 C A N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 112497597 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112497880 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112497985 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112498039 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112498048 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112498201 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112498248 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 112498530 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112498548 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 112498567 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112498662 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 112499076 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 112500164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112500371 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112500704 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112500737 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112501487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112501523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112502409 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112502496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112502497 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112503404 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 112503679 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112504176 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112504475 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112504808 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112505596 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112506515 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112507196 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112508031 A T N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.714285714285714 0.285714285714286 10 18 0 10 4 3 112508469 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112511809 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 112512127 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112513024 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 112513233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112513352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112513466 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112513532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112514079 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 112514733 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 112514789 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 112514952 A C Y N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 3 112515176 A T N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 3 112515202 A G Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 112515219 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 112515224 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112515434 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112515720 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 112515967 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112516183 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112516186 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112517223 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 112517583 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112517785 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 112519758 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112519798 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112520505 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112521244 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112521272 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112521274 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112521337 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112521552 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 112521831 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 112523456 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112524551 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112524622 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112525142 T C Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 112525333 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112525848 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 112526253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112526310 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 112527400 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112528662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112529709 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 112529711 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 112530066 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112530278 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112530299 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 112530371 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112531540 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112533684 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112533865 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112534338 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112534502 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112534711 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112534716 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 112535329 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112535855 C G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 112535859 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 112536231 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 112536306 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 112536534 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 112536623 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 112536859 A T N N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 3 112537257 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 112539668 A G Y Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 112539756 T G Y N 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 3 112542015 T C Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 112542650 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 112542721 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 112544062 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 112544551 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112546396 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112548698 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112549658 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112549923 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112549976 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112550370 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112550556 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112550607 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 112551149 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 112551713 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112551836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112552040 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 112553094 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 112553146 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112553366 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 112553686 C A Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112553700 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112554933 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 112555021 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112555601 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112556099 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 112556302 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 112556663 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112557054 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 112557883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112558093 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112558647 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 112558987 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 112560255 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112561899 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112561988 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112564761 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 112564846 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 112567145 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112567716 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 112567793 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112568139 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112568926 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112570464 T A Y N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 3 112570693 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 112571666 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 112571795 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 112574133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112574352 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112574586 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112574603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112575772 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 112577434 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112577484 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112577680 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112578669 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112578977 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112579338 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112580529 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 112581368 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 112581586 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112581670 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112581830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112582366 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 112582552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112583129 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 112583164 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 112583181 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112583857 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112584447 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112585992 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 112586716 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 112587341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112588147 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112588412 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112589122 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112589200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112589991 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 112591552 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112593837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112593882 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112594200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112594249 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112594293 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112594298 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112594469 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 112594876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112595712 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112596298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112596379 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112596601 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 112598681 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112598692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112599366 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112600623 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 112600683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112602226 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112602363 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112602505 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112602778 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112603893 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 112604533 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 112605041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112607148 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112607880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112608353 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112609156 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112611339 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 112611608 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112612111 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112613351 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112613689 A G Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 112614445 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 112616380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112616893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112617071 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112619431 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112619907 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112621022 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 112622286 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 112623106 G A N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 112624652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112625543 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112625708 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112627364 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112628735 C G N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 112629138 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 112630529 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 112632626 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 112632934 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 112634827 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112635906 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 112636101 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 112636190 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 112636355 A C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 112636486 A T N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 112636675 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112636725 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112636796 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 112636818 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 112636819 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 112643661 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112643861 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112644655 T G Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 112645890 G A Y Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 112646160 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112646809 A C Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 112646944 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112648926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112650005 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112650006 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112650350 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 112650943 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112653142 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112653953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112654297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112654725 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112655141 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112655781 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112656473 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112658348 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 112658730 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112659016 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112659156 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112660062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112661140 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112661442 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112662257 T A Y N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 112662675 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112662793 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112662926 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112663477 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112663498 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112663544 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112664830 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112664875 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 112665390 A G Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 112668240 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112668359 C T Y Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 3 112669207 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112669253 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112669272 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 112670347 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112670413 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112670743 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112671573 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112673605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112673606 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112674791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112676000 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 112677477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112677511 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112678068 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112678081 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112678232 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112678306 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 112679279 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112679469 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 112680057 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112680850 A G N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 3 112680853 A G Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 112681577 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112681646 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112681902 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112686622 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 112686836 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112686855 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112689579 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 112689851 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 112690181 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 112690905 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112691323 A C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112692118 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112692828 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 112693633 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112694562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112695603 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112695872 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 112695942 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 112696926 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112697014 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112699247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112699283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112699626 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112699948 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112701093 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112702280 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112703458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112704497 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112705062 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112705804 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112706262 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112708200 A C Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 112708485 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112708684 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 112709292 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 112709737 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112709855 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 112710603 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 112710609 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112711035 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 112711312 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112714348 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112724943 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112725260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112726534 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112726680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112726841 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 112731923 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112731924 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112732606 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112733334 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112734443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112735037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112735123 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112736666 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112737481 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 112738934 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112739260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112739541 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 112739701 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112739990 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112740538 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 112740932 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112741315 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 112741393 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 112741621 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112741981 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112742109 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112742139 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112742453 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 112742537 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112742572 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112742661 T C Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 112744647 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112744666 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 112745257 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112746898 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112747220 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112747286 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112747634 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112747643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112747729 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112749065 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 112749134 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112749392 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112749726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112750170 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 112750525 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 112751028 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112751222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112751260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112752449 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112753080 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112754137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112754833 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112755322 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112755556 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112756671 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112756830 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112758175 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 112758312 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 112758507 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 112759413 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 112761057 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 112761155 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 112761628 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112762062 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 112762449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112762499 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112762945 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 112764260 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 112764626 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112764687 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 112765864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112765880 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112766579 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112766590 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 112767207 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112767251 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112769673 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112769819 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112770652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112771119 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112773434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112773614 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112773652 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112773653 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112773805 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 112773817 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112773831 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112774528 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112774956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112775436 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 112776120 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 112776898 T A N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 112777201 A T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 112779277 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 112779970 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112781745 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112783508 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112783519 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112785740 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112787012 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 112787401 G C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 112788036 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112788110 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112788168 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112788192 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112788472 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112788510 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112789385 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112789609 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112791018 C T Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 112792331 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112792545 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112792980 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112795934 T G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 112796103 G C N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 112796298 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 112796891 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112797011 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112798314 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112798320 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112798721 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 112799686 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112799742 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112800005 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112800199 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112800221 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112800457 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 112800500 T C N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 112800512 G A N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.153846153846154 21 5 10 1 2 3 112800589 T G N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 3 112801003 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 112801025 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112801047 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 112801054 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 112801166 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 112801761 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 112802020 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112802425 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 112802883 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 112803577 A C N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 112803624 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 112803793 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 112803826 T G N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 112803835 T C N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 112803838 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 112804161 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112804251 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 112804280 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 112804365 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 112804445 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112804554 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 112805037 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 112805055 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 112805168 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112805207 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112805423 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 112805511 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112805647 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 112805707 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112805740 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112805766 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112805808 A C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 112805809 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 112806069 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112806130 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112806269 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112806711 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 112806794 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112807040 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112808497 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 112808684 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112808702 G T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 112808994 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112809014 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112809018 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112809172 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112809174 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112809219 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 112809260 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112809261 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112809357 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112809411 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112809418 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 112809599 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 112809631 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 112809737 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112809859 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 112809911 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112810041 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112810102 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112810145 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 112810465 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 112810519 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112810660 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112810815 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112810826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112811032 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112811172 C G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 112811203 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 112811204 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 112811340 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 112811455 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 112811483 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 112811570 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 112811782 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112811792 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 112811826 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112811957 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112811969 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112812104 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112812142 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112812282 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112812515 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 112812589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112813238 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 112813301 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112813533 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112813639 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 112814231 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 112815993 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112816147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112816408 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 112816651 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 112817017 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 112817237 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 112817272 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 112817609 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 112817830 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112817864 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112817996 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112818081 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112818179 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 112818292 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112818495 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112818857 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 112818879 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112818996 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112819012 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 112819072 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 112819300 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 112819342 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 112819428 A C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 3 112819442 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 112819591 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112819759 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112819900 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112819925 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112819977 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112820024 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112820036 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112820182 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 112820345 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 112820982 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112820984 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112821095 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112821172 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112821314 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112821413 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112821575 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 112821600 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112821631 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112821650 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112821658 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 112821824 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112821834 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112821865 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112821945 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112822007 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 112822267 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112822375 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112822438 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112822461 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112822555 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112822667 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112822808 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112822991 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112823009 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112823100 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112823250 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112823394 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112823410 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112823640 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112823660 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112823775 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112824072 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112824196 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112824805 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112824830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112824848 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112824873 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 112825217 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112825271 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 112825349 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112826235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112826454 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112826611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112826615 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112827498 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 112827996 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 112829174 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 112829211 G A N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 112829330 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112829488 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112829589 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112829657 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112829766 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112830422 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 112830510 C T N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 112830610 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 112830641 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112830642 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112830840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112831023 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112831582 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112831829 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112831931 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112832050 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112832279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112832462 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112832504 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112832705 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112832783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112832784 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112832840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112833055 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112833098 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112833343 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112833661 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112835255 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 112835265 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 112835496 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112835590 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112835789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112836215 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112836595 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112837027 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112837421 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 112838232 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 112838391 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112838912 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 112838923 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112839235 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112839517 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112839635 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 112839788 C A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 112839849 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 112839973 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112840052 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 112841113 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 112842439 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 112842745 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112843235 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112843727 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 112844173 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 112846387 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112846769 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112847560 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 112847711 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 112847742 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 112847853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112848024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112848080 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 112848894 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 112849004 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112850043 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 112850161 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 112850244 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112851062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112851196 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 112851329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112851469 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112851612 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112851714 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112853596 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 112854018 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 112854504 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 112854705 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 112854796 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112854800 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112855114 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 112855402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112855738 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 112855894 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112855928 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112855997 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 112856229 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 112856302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112856399 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112856416 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 112856449 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 112856649 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 112856967 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112857026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112857076 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 112857111 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112857383 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112857659 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 112858097 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 112858128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112858385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112858439 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 112858499 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 112858608 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112858718 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 112858723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112858750 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112858797 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112859076 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 112859137 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112859257 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112859546 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112859647 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 112859958 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112859998 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112860078 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112860456 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112860867 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112860982 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112861780 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 112864287 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112865825 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112866814 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112868104 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 112868389 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112868475 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112869943 C A Y N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 112875505 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112875592 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112876361 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112876884 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112879312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112879481 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112879756 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112880314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112883739 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 112884542 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112885252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112885738 C T N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 3 112885898 A G Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 112886179 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 112888388 T G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 112888556 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 112888867 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 112891059 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112892417 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 112895580 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 112895620 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 112896646 A G Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 112900663 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 112900904 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112901437 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 112901490 A G Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 112901556 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 112901866 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 112901969 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112902073 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 112902426 C A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112902697 G A Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 112903429 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112904626 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 112904693 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 112904729 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 112904818 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 112905339 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 112905348 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112906066 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 112906100 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 112906866 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112906882 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112906939 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112907098 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112908215 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 112909348 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112909667 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112910143 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 112910199 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 112911118 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 112911263 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112911594 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112912134 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112912595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112912622 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112912684 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112912685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112913240 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112913303 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 112914597 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112914631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112916061 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 112917169 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112917776 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112918322 T G Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 112918495 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 112918831 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112919157 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 112919857 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 112920059 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 112920753 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 112920787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112921318 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112921383 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112922124 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 112922484 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112923335 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112923596 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 112923600 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 112924570 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 112924906 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 112924921 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112924948 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112925715 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112926203 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112926566 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112926683 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 112926684 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 112928170 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112928339 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112928377 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112928405 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112929295 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112929496 G A Y Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 3 112929860 T G Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 112930653 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112930749 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112930837 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112931669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112932340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112932416 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112933233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112933423 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112934442 G T Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 112935595 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112935803 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112935826 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112935908 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112936155 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 112936673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112937294 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112937656 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 112937880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112938010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112938855 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112938894 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112939136 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112939158 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 112939745 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 112939760 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 112939967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112939976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112940039 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112940411 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112940582 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112940664 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 112941318 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112941395 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 112942489 C T Y Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 3 112942603 A G Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 112942830 G T Y N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 8 20 0 8 6 3 112942875 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 112942921 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112942948 T G Y N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 112943000 T G Y N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 112943014 A G Y Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 112943262 C A Y N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 112943266 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 112943407 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 112943468 G C Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 112943551 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 112943644 A C Y N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 112943698 G T Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 112943730 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 112943833 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112943896 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112943908 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112943925 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112944033 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 112944075 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 112944163 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112944580 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112944586 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112944644 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112944668 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112944895 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112944922 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 112944970 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112945045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112945125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112945236 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 112945270 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112945278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112945282 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112945299 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112945352 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112945373 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112945438 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 112945508 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112945595 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 112946020 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112946080 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 112946137 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 112946259 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 112946273 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 112946362 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 112946409 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 112946536 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112946551 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112946685 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 112946751 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 112946770 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112946801 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 112946809 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 112946832 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 112946862 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 112946880 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112946962 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 112947018 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112947183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112947274 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 112947281 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 112947427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112947433 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 112947452 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 112947793 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112947960 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112948040 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 112948134 A T N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 112948227 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 112948232 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112948624 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 112948875 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 112948947 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 112949525 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 112949529 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 112949913 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 112950409 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 112950865 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 112950880 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 112951036 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 112952075 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 112953076 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112953621 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 112954109 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112954617 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 112955669 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112955786 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112956349 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 112956450 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 112956501 A T N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 112956522 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 112956553 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112956554 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 112956579 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 112956692 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 112956759 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 112956771 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 112956803 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 112956990 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112957044 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 112957278 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 112957343 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112957474 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112957555 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 112957696 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 112957702 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112957728 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 112957773 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112957833 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112957871 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 112957894 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 112957951 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112957955 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112957981 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 112958099 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 112958132 G A N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 112958243 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 112958715 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 3 112958927 A C N N 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 5 9 1 3 3 3 112959261 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 112959269 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 112959318 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 112959391 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112959914 C G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 112960218 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 112960329 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112960406 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112960421 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 112960459 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112960472 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112960510 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112960656 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 112960660 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 112960744 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 112960948 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112961401 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112961755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112961840 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112962092 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 112962438 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 112962570 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112963310 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112963854 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112964076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112964176 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 112964934 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112965276 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 112965801 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112965828 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 112967154 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112967303 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112967389 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112967412 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 112967472 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112967813 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112968295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112968519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112969044 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 112969147 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 112969291 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 112969315 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 3 112969565 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 112969686 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 112969840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112969846 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 112969855 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 112969910 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 112970021 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 112970361 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 112970373 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 112970430 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 112970467 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 112971851 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 112972154 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 112972274 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 112972601 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 112972663 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 112972719 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112972762 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112972960 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 112973188 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 112973236 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 112973324 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 112973401 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 112973523 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 112973581 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 112973668 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112973675 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 112973794 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 112973811 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 112973844 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 112973912 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 112974118 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 112974131 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 112974403 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 112974612 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 112974678 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 112974815 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 112974818 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 112975043 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 112975051 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 112975123 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 112975357 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 112975359 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 112975370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112975426 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112975599 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 112975729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112976521 T A N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 112977185 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 112977301 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 112977666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112977880 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112978213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112978249 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112978342 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112978642 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 112979472 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 112979867 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112979909 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112979925 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112980053 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 112980625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112981019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112981208 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112981384 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 112981439 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 112981496 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 112981740 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112981756 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112982139 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112982141 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112982574 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112982593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112982804 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 112982915 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112983164 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 112983295 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 112983339 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 112983442 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 112983643 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 112983649 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 112983762 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 112985743 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112985782 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 112985871 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 112985882 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112985891 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112985931 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112985961 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 112985983 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 112986238 G T N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 112986319 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 112986337 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 112986491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112986514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112986576 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112986600 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112986662 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 112986736 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112986758 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112986769 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112986807 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112986947 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 112986949 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 112987023 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 112987055 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112987454 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 3 112993101 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112993154 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 112993188 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112993379 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112993661 T A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 112993721 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 112993733 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 112993738 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 112993813 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112993819 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112993863 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112993873 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112993953 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112993967 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112993976 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112994042 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112994269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112994317 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112994342 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112994359 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112994373 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112994825 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112994887 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112994898 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112994908 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112995108 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112995111 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112995139 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 112995146 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112995180 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112995197 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112995234 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112995267 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112995278 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 112995290 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 112995902 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112996820 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112996856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112996955 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112996988 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112997104 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112997188 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112997239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112997240 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112997281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112997318 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112997379 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112997526 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112997527 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112997539 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 112997540 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112997686 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 112997888 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112997930 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112998016 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112998266 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 112998282 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 112998288 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 112998317 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112998329 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112998381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112998465 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 112998480 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 112999404 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 112999998 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 112999999 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113000060 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113000142 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113000268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113000685 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 113000696 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113000697 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 113000884 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 113000887 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 113001134 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113001136 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 113001487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113001617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113001665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113002021 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113002495 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113002719 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113002798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113002827 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113002850 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 113002921 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113002941 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113002954 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113003018 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113003038 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113003168 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113003172 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113003340 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 113003367 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 113003446 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 113003450 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 113003491 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 113005402 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113005494 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 113005526 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113005562 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113005734 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 113005739 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 113005789 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113005831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113005935 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113005966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113005987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113005989 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113006057 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113006082 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113006087 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113006115 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113009873 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113009986 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113010070 G T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.15 0.85 0 23 17 3 17 0 3 113010870 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113012544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113014012 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113014060 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113014482 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113014615 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 16 20 0 16 2 3 113014626 T A Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 113014833 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113014839 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113014847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113014865 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113015117 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113015209 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113015224 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 113015227 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 113018168 C G Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 16 20 0 16 2 3 113018225 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.0526315789473684 19 19 1 17 1 3 113018236 C T Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0 0.941176470588235 0.0588235294117647 16 18 0 16 1 3 113018314 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 113018331 A G Y Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 3 113018621 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 113018646 C A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 113018862 C T Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 3 113020189 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 113021153 C A Y N 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.2 0.8 0 12 8 2 8 0 3 113022543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113022620 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 113022789 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113023805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113023912 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113024194 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 113024233 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113024249 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 113024263 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113024462 A T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.105263157894737 0.894736842105263 0 21 17 2 17 0 3 113024466 G T Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 3 113024479 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113024571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113026065 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113026143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113026469 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113026685 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113027022 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113027036 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113027158 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113027320 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 113027321 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0 0.944444444444444 0.0555555555555556 17 19 0 17 1 3 113027710 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113028425 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113028431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113029103 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113029118 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113029165 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113029469 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 113029758 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113029774 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113029938 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 113029954 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 113029955 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 113030044 T A Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 3 113032144 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113032243 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113032381 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 113032396 A T Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 113043138 G A Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 113043949 C A Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 113049092 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 113049255 A C Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 113050844 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 113050876 C A Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 113051748 T A Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 113053762 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 113230809 T C Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113231063 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 113231118 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 113231940 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113233084 G A Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.117647058823529 0.823529411764706 0.0588235294117647 18 16 2 14 1 3 113233812 A C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 113233985 T C Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 113234301 A G Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.133333333333333 0.8 0.0666666666666667 16 14 2 12 1 3 113234361 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 113234470 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 113236037 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113237546 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 113238558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113238679 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113238985 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113239157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113242628 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113242916 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113247483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113247650 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113249150 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 113249466 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 113251732 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113252008 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 113252093 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113252577 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113252738 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 113253374 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 113253377 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 113253926 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 113255411 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 113255671 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113255736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113256405 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113256448 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113256708 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113257536 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 113257564 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113257587 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 113258387 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113258534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113258814 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 113260598 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113261403 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 113261640 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 113263826 A T N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 113263979 G C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 113264380 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 3 113264684 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113265903 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 113266393 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 113266394 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 113266628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113266963 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113266985 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 113266989 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 113267026 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 113267084 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 113267103 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 113267358 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 113267509 C T Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 113267629 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 113268679 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113268699 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113269912 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 113270211 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113270252 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113270717 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113271042 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113271965 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113272560 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113273044 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113276000 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113276811 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113277157 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113277308 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113277444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113277968 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113278316 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113278355 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113278406 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113278509 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113278522 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113278874 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113283678 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113284889 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113288142 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 113288267 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 113288283 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 113288983 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113291494 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113292951 G A Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 3 113294152 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113294332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113294771 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113295275 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 113295444 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 113296941 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113297032 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113298205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113298347 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113299229 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113300268 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 113301004 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113301172 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113302051 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113303244 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113304423 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113308420 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 113314270 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 113316118 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 113316466 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113326226 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113328599 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113328725 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113329145 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113330957 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 113333144 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113338195 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 113341160 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113343768 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 113350579 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113352223 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113353223 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 113358453 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113359411 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113359519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113359527 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113361384 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113361839 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113361920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113364396 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113365215 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113365435 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 113365521 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 113365535 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 113365619 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113365710 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113365712 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113365967 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113366097 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113366109 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113366110 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113366142 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113366161 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113366183 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113366203 A C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113366236 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113366282 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113366305 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113366369 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113366420 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113366431 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113366499 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113366513 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113366537 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113366565 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113366693 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113366730 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113366750 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113366838 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113366874 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113366961 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113366988 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113367033 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113367113 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113367247 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113367257 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113367293 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113367297 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113367324 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113367453 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113367511 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113367519 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113367581 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113367648 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113367702 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113367783 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 113367809 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113367849 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 113368052 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113368076 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113368310 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113368384 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113368503 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 113368572 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113368578 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113368590 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113368684 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113368702 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113368706 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113368804 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113368910 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113369187 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113369205 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113369217 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113369223 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113369239 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113369268 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113369284 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113369429 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113369451 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113369463 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113369476 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113369614 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 113369617 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113369633 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113369635 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113369663 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113369675 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113369975 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113369997 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 113370145 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113380971 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113381032 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113381050 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 113381065 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113381099 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113381139 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113381170 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 113381236 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113381244 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113381267 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113381442 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113381591 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113381822 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113381960 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113381994 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113382154 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113382160 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113382238 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113382929 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 113382944 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113383019 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113383124 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113383253 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113383262 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113383582 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113383657 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113383773 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113383774 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113383939 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113383954 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113383978 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113384125 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113384251 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113384284 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113384318 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 113384395 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113384432 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113384648 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113384679 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113384710 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113384820 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113384935 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113384956 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113384961 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113384970 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113385127 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113385130 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113385258 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113385268 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113385292 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113385293 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113385305 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113385316 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113385335 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113385336 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113385432 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113385567 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113385571 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113385668 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113385809 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 113385907 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 113386009 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113386193 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113386275 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113386304 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113386369 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113386382 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113386414 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113386437 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113386500 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113386561 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113386738 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113386783 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113387039 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 113387196 C G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 113387764 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113387789 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113387861 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113388146 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113388313 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113388405 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113388409 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113388442 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113388503 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113388702 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 113388863 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113388992 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 113389109 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113389184 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113389285 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113389366 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 113389464 T C N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 113389584 C T Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 113389742 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113389984 C G Y N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 113390017 T A Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 113390126 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113390172 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 113390201 C T Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 113390292 G A Y Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 3 113390293 C A Y N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 3 113390447 C T Y Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 3 113390638 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113390694 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113390717 A C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113390920 T C Y Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 113391048 T C Y Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 113391055 C T Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 113391067 C G Y N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 113391078 T C Y Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 113391113 T G Y N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 3 113391206 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 113391264 G A Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 113391303 C A Y N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 113391464 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 113391689 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113391788 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113392081 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113392209 T G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 113392267 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 113392502 C G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113392534 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 113392563 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113392575 A C Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113392739 T A Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113392855 T C Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113392906 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113392961 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113393133 T A Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113393152 G C Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 113393196 C A Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113393271 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113393294 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113393343 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113393354 C A Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113393458 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113393611 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113393620 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113393703 G T Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113393715 G T Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113393740 C T Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 113393800 G A Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 113393871 C T Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 113393892 A T Y N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 113394396 G A Y Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 113394408 G T Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 113394559 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 113394566 A T Y N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 113394759 T C Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113394796 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113394809 A C Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113394885 T C Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 113394985 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113394994 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113395033 G C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113395053 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 113395073 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113395263 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113395357 C T Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 113395441 A G Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 113395611 C T Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 113395656 G A Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 113395743 G C Y N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 113395862 A G Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 113395867 A G Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113395921 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 113395995 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113396059 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113396067 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113396233 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113396356 A C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113396375 T G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113396379 T G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113396458 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113396499 G C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113396823 G T Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 113396864 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 113396900 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113396975 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113396994 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 113396995 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 113397040 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113397056 G C Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113397090 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113397157 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113397222 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113397356 T G Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 113397436 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113397484 T G Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113397627 G C Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113397794 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113397913 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113397929 T G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113398185 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113398216 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113398241 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113398295 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113398417 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113398434 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113398600 C A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 113398636 T A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 113398653 G T N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 113398723 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 113398990 C A N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 113399038 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 113399068 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113399273 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113399349 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113399385 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113399577 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113399792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113399844 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113399855 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113400026 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113400031 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113400163 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 113400517 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113400527 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113401342 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113401587 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113401623 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 113401665 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113401675 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113401730 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113401777 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113402002 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113402031 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113402248 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113402302 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113402467 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113402740 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 113402910 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113403255 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113403508 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 113403621 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113403727 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 113403892 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 113404012 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 113404021 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 113404090 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113404108 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113404121 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113404262 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113404369 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113404985 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113405495 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113405766 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113405890 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113406010 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113407015 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113407025 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113407200 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113407344 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113407528 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113408022 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 113408240 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113408241 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113408920 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 113409304 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 113409659 C G Y N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 113409794 C T Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 113409824 A C Y N 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 3 113410188 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 113410239 T C Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 113410371 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 113410707 C A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 113410847 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 113411337 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 113411345 C G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113426398 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113426434 T A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 113426699 T A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113426853 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113426855 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113426877 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113427262 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 113427366 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 113427391 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113427495 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 113427515 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113427706 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 113427880 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113427884 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 113427984 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 113428011 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113428634 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113428877 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113429044 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113429411 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 113429548 A C Y N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 113429629 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 113429842 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 113429843 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 113430287 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 113430654 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 113431131 C A Y N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 113431256 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 113431579 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113431962 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113432065 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 113432143 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113432465 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 113432512 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113433607 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 113433785 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113433899 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 113433919 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 113434095 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113434259 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113434367 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113434521 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113434566 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 113434806 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 113434895 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113435327 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 113435359 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 113435387 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113435516 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 113435593 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113435711 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 113435746 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113435765 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113435825 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 113435933 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113436013 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113436049 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113436410 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113436428 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113436504 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113436720 G T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113436776 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113436821 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113436972 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113437005 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113437206 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113437231 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113437273 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113437288 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113437313 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113437494 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113437594 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113437612 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113437622 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113437650 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113437661 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113437733 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 113437807 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113437853 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113437911 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113438053 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113438064 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 113438100 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113438247 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113438267 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113438288 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113438295 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113438365 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113438386 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113438454 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 113438461 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113438479 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113438622 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113438926 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113438937 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113439162 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113439181 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 113439183 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113439204 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113439230 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113439315 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113439365 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 113439662 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113439712 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113439757 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113439833 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113439886 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113440048 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 113440078 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 113440091 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 113440366 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113440418 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113440440 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113440459 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 113440478 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113440494 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 113440579 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113440809 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113440877 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 113440892 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 113440898 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 113440909 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 113441413 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113441483 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113441707 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113441720 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113441775 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113441784 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113441791 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113441824 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113441877 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113441949 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113441993 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113442000 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113442307 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113442403 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113442423 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113442513 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113442590 A C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113442735 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113442738 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113442837 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113442863 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113442869 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113443000 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113443119 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113443198 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113443236 T A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 113443259 T G N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 113443319 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 113443638 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 113443729 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113443748 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113443879 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113443889 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113444211 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113444273 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113444277 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113444330 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113444502 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 113444571 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 113444602 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 113444613 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113444626 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 113444727 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113444737 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113444773 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113444919 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113444940 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113445094 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 113452009 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113452020 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113452036 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113452085 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 113452222 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113452328 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113452400 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113452496 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 113452531 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 113452701 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113452817 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 113452943 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 113453248 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 113453451 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113453639 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113453647 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113453884 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 113453891 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113453949 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113453960 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113453992 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113454015 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 113454105 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 113454185 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 113454332 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 113454345 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 113454383 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113454452 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113454468 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113454483 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113454514 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113454565 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113454726 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113454734 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113454797 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 113454809 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 113454866 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 3 113454998 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 113455027 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113455035 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113455106 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113455180 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113455217 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113455222 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113455232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113455502 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113455505 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113455516 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113455681 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113455701 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113455849 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 113455893 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113455906 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 113455907 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113456037 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113456054 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113456103 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113456109 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113456120 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113456256 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113456339 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113456387 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113456470 T C Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 113456500 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113456627 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113456653 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113456655 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 113456857 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113456907 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113457009 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113457024 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113457036 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113457117 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113457164 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113457265 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113457272 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113457285 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113457659 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 113457662 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 113457671 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113457719 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113457758 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113457769 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113458046 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113458067 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113458102 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113458117 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113458136 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113458144 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 113458577 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113458593 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113458715 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113458730 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113458759 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113458782 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113458979 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113459011 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113459189 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113459423 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113459499 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113459526 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113459576 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113459577 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113459615 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113459692 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113459841 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113460028 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113460029 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113460136 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113460324 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 113460576 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113460683 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113460806 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113460933 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 113461054 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113461208 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113461282 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113461313 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113461356 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113461444 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113461452 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113461677 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113461720 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113461783 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113462041 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113462070 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113462078 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113462090 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113462191 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113462538 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113462645 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113462985 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113463134 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113463151 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113463228 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113463295 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113463357 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113463894 T G N N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 113463910 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 113463926 C A N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 113464054 G A Y Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 113464098 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 113464126 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113464171 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113464260 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113464298 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113464321 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 113464439 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 113464818 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113464861 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113465249 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113465326 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113465387 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113465413 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113465593 C G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 113465645 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 113465793 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 113465860 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 113465873 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 113465913 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 113465950 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 113465955 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 113466026 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113466033 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113466279 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113466305 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113466351 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113466374 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113466409 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113466449 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113466498 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113466524 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113466538 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113466632 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113466676 G T Y N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 113467291 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113467303 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 113467349 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113467357 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113467374 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113467407 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113467408 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 113467496 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113467506 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113467587 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113467659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113467774 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113467838 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113467842 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 113467882 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113467935 G C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 113467994 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 113468041 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 113468515 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113468679 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113468708 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113468863 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113468937 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113469291 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113469301 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113469384 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113469635 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113469688 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113469691 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113469729 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113469797 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113470016 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113470197 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113470251 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113470458 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113470479 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113470626 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113470653 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113470870 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 113471327 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113471346 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113471478 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113471724 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113472172 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 113472664 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113472691 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113472752 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113472809 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 113473147 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113473331 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113473339 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113473362 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113473377 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113473462 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113473874 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 113473982 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 113474052 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113474084 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 113474137 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 113474401 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113474416 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113474499 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113474767 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113474822 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113474844 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113474906 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113474912 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113474973 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113475177 A C Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 113476180 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 113476277 A T Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 113476463 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113476472 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 113476547 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 113476595 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113476639 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113476655 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113476703 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 113476770 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113476790 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113476803 A C Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 113476954 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113477067 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113477081 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113477087 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113477093 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 113477234 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113477438 C G Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 113477499 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113477512 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113477529 G A Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 113477796 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113478246 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113478274 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113478355 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113478447 G T Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113478515 C G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 113479176 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 113479346 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 113480382 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113480535 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113480690 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113480990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113481345 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113481372 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113481649 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113481730 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113481774 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113481855 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113482109 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113482329 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113482330 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113482668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113483600 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113484044 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113484495 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113485093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113485111 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113485217 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113485307 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113485313 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113485703 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 113485762 C T N Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 3 113486358 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113486606 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113486648 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 113487188 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113487264 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113487374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113487759 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113487937 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113488646 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113489308 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 113489374 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 113489410 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113489827 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 113490436 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113490873 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113491335 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113491406 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113491480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113491544 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113491597 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113491639 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113491761 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113492382 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113492412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113492612 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 113492865 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113492990 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113493750 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113493886 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 113493894 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 113494158 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 113494237 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113494440 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113494592 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113494595 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113494887 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113495044 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113495360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113495581 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113495673 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113496050 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113496274 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113496275 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113496480 G T N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 113496712 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 113496986 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113497135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113497812 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113498042 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 113498503 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 113499670 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113499772 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113500012 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 113500159 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113500238 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 113500297 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113500376 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 113501223 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113501465 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 113502083 A G N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 113502085 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 113502098 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 113502148 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 113502174 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 113502330 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113502331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113502443 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113502535 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113502740 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113502782 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113502792 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113502973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113503463 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113503549 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113503645 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113504140 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113504163 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113504197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113504203 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113504222 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113504243 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113504300 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113504303 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113504594 A G N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 113504696 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113504706 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113504720 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113504722 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113504760 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113504833 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113504868 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113504876 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113505175 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 113505189 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 113505322 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 113505335 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 113505343 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113505355 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113505422 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113505427 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113505572 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113505595 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113505645 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113505691 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113505713 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113505721 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113505737 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113505769 G T Y N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 113505810 C A Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 113505853 T G Y N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 113505888 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 113505940 T A Y N 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 4 2 2 0 1 3 113506444 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 113506493 A C Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 113506512 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 113506545 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113506555 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113506587 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113506623 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113506684 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113506811 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113506827 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113506851 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113506869 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113506871 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113506960 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113507033 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113507088 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113507162 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113507280 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 113507290 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 113507570 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113507633 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113507653 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113507717 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113507722 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113507760 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113507895 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113508053 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113508072 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113508073 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 113508109 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 113508149 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113508220 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 113508306 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113508405 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113508418 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113508427 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113508460 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113508504 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113509010 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113509025 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113509040 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113509398 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 113509489 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113509568 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113510134 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113510174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113510237 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113510238 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113510572 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 113510654 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113511192 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113512168 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 113512512 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113512513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113512549 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113512573 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113512674 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113512920 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113513028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113513170 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113513306 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 113513602 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113513822 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113514196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113514226 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113514340 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113514342 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113514383 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113515035 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113515682 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113515713 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113515779 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113516121 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113516278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113516400 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113516511 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 113516730 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113516790 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113516820 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113516912 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113517009 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113517268 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113517412 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113517463 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113517847 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113517859 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113517863 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113517876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113517980 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113518016 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113518019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113518042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113518052 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113518061 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113518064 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113518126 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113518207 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113518241 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113518252 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113518315 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113518317 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113518338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113518469 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 113518477 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 113518963 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 113518970 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 113519453 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 113519464 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 113519477 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 113519490 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 113519554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113519560 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113519626 T G N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 14 18 0 14 2 3 113519661 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 113519693 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 113519707 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113519745 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113519752 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113519797 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 113519805 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113519811 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113519838 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113519869 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113519923 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113520002 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113520197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113520237 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113520341 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113520358 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113520560 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 113520620 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 113520680 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113520788 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 113521223 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113521224 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113521657 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113521772 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113521805 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113522134 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113522206 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113522242 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113522367 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 113522520 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113522538 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113522645 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113522651 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113522845 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113522901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113522922 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113523098 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113523549 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 113523609 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113523749 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 113523765 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113523794 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113523919 A T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 113524039 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113524061 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113524107 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113524145 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113524216 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113524280 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113524298 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 113524304 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113524387 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113524455 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113524456 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113524470 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113524918 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113525028 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113525085 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113525367 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113525420 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113525436 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113525437 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113525482 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113525656 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113526011 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113526073 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113526406 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 113526443 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 113526504 C G N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 113526520 G A N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 113527013 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113527528 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113527549 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113527675 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113527946 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113528192 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113528196 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113528313 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113528340 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113528447 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113528478 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 113529043 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113529151 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113529167 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 113529355 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113529368 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 113529434 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113529440 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113529455 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113529458 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113529692 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113529847 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113529926 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113530093 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113530111 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 113530119 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113530157 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 113530218 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113530247 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113530255 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113530363 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 113530439 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113530589 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 113530599 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 113530676 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 113530717 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 113530875 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113531085 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113531174 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113531277 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113531278 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113531301 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113531303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113531426 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113531496 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113531720 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113531805 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 113531882 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113532435 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 113532639 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113532860 A T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 113533185 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113533257 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113533419 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113533601 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 113533605 A T N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 113533928 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113533978 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113534151 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 113534284 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113534300 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113534566 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113534811 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113534893 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 113534923 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 113535014 G C N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 113535102 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 113535131 A G N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 113535156 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113535246 A C N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 113535283 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113535977 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 113536028 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 113536224 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113536266 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113536271 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113536296 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113536303 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113536784 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113536876 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 113537091 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 113543441 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113543574 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 113543663 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 113543748 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113543874 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113543891 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113544757 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113544763 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 113544780 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 113545360 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 113545548 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113545565 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113545799 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 113545854 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113546155 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113546329 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113546486 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113546640 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113546727 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113547004 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 113547031 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113547079 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113547184 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113547759 C A Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.117647058823529 0.823529411764706 0.0588235294117647 18 16 2 14 1 3 113548041 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113548334 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113548367 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113548469 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113548477 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113548485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113548563 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113548698 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113548879 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113548886 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113548907 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113549275 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113556070 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 113556212 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 113556290 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 113556453 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113556478 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113556550 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113556583 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113556693 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113556736 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113556795 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113556820 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113556827 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113556853 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113556855 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113556869 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113556880 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113556936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113556937 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113557055 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113557068 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113557095 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113557134 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113557209 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113557211 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113557356 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 113557368 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 113557481 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113557535 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113557563 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113557570 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113557621 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113557751 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113557753 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113557831 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113557852 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113557932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113557952 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113558120 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113558134 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113558173 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113558203 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 113558685 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113558768 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113558797 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113558847 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113558955 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113558964 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113559121 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113559150 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113559171 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113559199 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113559206 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113559285 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113559315 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113559316 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113559367 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113559373 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 113559421 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113559429 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113559457 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113559496 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113559500 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113559533 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113559664 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113559752 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113559844 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113559926 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113560239 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113560260 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113560269 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113560421 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 113560524 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113560567 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113560657 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113560792 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113560828 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113560923 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113560954 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113560992 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113561018 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113561033 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113561103 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113561139 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113561144 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113561206 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113561254 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113561260 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113561291 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113561495 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113561535 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113561540 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113561548 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113561756 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113561797 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113561802 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113561888 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113561926 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113562144 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113562156 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113562162 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113562201 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113562425 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113562430 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113562457 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113562516 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113562578 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113562619 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113562888 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113562896 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113562975 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113563292 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 113563887 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113563925 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113563956 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113563964 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113563997 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113564061 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113564495 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113564505 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113564529 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113564623 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113564659 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113564706 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113564717 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113564776 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113564861 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113564898 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113564907 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113564923 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113564949 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113565044 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113565056 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113565086 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113565127 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113565381 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113565382 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113565569 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 113565828 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113565937 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113565938 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113565968 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113565996 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113566006 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113566023 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113566103 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113566151 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113566170 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113566182 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113566185 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113566897 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 113566903 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113566915 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113566970 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113566982 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113567020 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113567196 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113567353 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113572593 T G Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 113572813 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113572834 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113573060 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 113573132 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113573153 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113573169 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 113573303 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 113573391 G C N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 113573482 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 113573529 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 113573593 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 113573655 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 113573682 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 113573731 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 113573737 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 113573810 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 113573816 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113573991 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113574123 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113574278 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113574395 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113574406 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113574433 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113574459 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113574534 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113574583 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113574591 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113574628 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113574648 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113574696 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113574757 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 113574768 G C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 113574824 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113574851 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113574858 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113574868 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113575033 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113575063 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113575096 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113575141 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113575278 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113575291 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113575377 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113575393 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 113575652 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113575688 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113575765 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 113575772 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 113575864 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113575953 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113576005 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113576049 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113576058 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113576080 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113576114 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113576115 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113576149 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113576384 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113576433 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113576456 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113576470 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113576472 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113576563 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113576650 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113576656 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113576687 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113576688 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113576707 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113576714 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113576718 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113576967 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113577128 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113577189 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113577203 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113577253 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113577721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113577868 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113577881 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113577989 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113578072 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113578078 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113578155 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113578179 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113578235 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113578289 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113578312 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113578355 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113578363 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113578388 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113578419 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113578514 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113578603 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113578658 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113578664 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113578763 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 113578854 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113578889 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113578967 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113579067 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113579093 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113579135 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113579146 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113579304 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113579376 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113579428 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113579457 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113579541 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113579594 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113579872 G A N Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 3 113579873 C A N N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 3 113579892 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 3 113579965 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 3 113579992 G T N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 113580022 T A N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 113580039 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 113580043 C T N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 113580053 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 113580181 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 113580222 A T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 113580265 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113580274 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113580292 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113580301 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113580318 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113580351 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113580386 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 113580388 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113580533 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113580604 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113580642 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113580662 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113580673 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113580784 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113580798 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113581011 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 113581148 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113581239 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113581259 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113581340 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113581405 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 113581461 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113581479 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113581492 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113581524 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113581542 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113581546 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113581581 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113581639 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113581912 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113581973 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113582000 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113582113 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113582121 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113582141 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113582238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113582263 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113582267 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113582420 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113582443 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113582513 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113582670 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113582820 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113582821 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113583547 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113583580 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113583731 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113583846 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113583854 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 113583877 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113583945 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113583971 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113584049 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113584133 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113584199 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113584254 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 113584311 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113584343 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113584524 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 113584834 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113584867 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113584886 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 113584927 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113584938 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113585006 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113585044 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113585119 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113585198 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113585252 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113585276 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113585335 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113585387 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 113585419 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113585484 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 113585562 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 113585740 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 113585752 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113585873 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113585905 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113585929 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113586015 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113586157 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113586459 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113586503 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113586584 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113586669 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113586713 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113586723 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113586941 A T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 113586954 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 113586977 C G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 113587155 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113587364 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 113587370 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113587427 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113587885 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 113587917 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113587931 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 113588031 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113588289 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113588374 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113588395 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113588454 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113588571 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113588694 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113588720 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113588847 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113588866 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113589167 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113589646 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113590026 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113590192 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 113590381 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 113590812 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113591127 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 113591349 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113591529 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113591909 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113591921 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113591969 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113592165 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 113592192 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 113592226 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 113592642 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 113592753 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 113592772 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113592783 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 113592804 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113592817 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113592939 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 113592984 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 113593003 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113593039 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113593051 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113593066 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 113593125 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 113593131 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 113593176 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113593182 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113593219 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113593260 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113593322 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113593365 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113593389 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113593459 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 113593471 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113593500 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113593530 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113593610 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113593619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113593657 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113593691 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113593729 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 113593911 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113597357 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 113597408 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113597522 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 113597541 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113597549 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113597607 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 113597646 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113597693 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113597719 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113597727 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113597741 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 113597763 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113597820 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113597873 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 113597874 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 113597981 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 113598072 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 113598075 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 113598098 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 113598099 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 113598112 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 113598116 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 113598298 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113598350 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113598392 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113598493 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113598498 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113598612 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113598633 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113598660 A C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 113598762 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113598896 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113598975 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113598977 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113598997 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113599019 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113599090 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113599104 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113599132 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 113599145 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113599166 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113599196 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113599197 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113599220 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113599378 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113599380 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113599611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113599622 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113599636 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113599681 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113599770 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113599805 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 113599856 T A N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 113599894 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113599989 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113600042 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113600072 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 113600088 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113600221 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113600255 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113600270 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113600293 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113600373 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113600384 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113600395 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113600439 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113600440 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113600451 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113600463 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113600469 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113600515 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113600555 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113600616 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113600726 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113600813 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 113600829 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 113600837 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113600843 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 113601035 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 113601044 G C N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 113601407 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 113601526 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 113601528 A G N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 113601546 G A N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 113601677 T A N N 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 3 113601729 T A N N 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 113601740 C T N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 113601885 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 113602065 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113602139 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113602144 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113602180 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 113602242 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113602281 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113602282 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113602297 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113602362 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113602370 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113602388 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113602397 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113602519 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113602640 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113602652 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113602666 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113602674 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113602679 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113602701 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113602721 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113602728 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113602809 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113602893 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113602926 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113602938 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113602966 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113602971 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113603004 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113603037 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113603050 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113603485 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113603491 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113603753 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113604037 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 113604089 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 113604274 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113604295 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113604334 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113604441 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113604478 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113604517 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113604711 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113604760 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113604790 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113605319 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113605581 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113605790 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113605843 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113605888 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113605927 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113606129 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113606191 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113606247 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113606449 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113606508 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113606520 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113606572 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113606573 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113606624 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113606646 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113606699 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113606765 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 113607110 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113607116 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 113607191 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 3 113607236 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 3 113607307 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 3 113607346 T A N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 3 113607355 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 3 113607425 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113607467 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 113607527 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113607550 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113607712 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113607848 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113607895 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113607942 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113607995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113608008 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113608284 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113608318 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113608353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113608357 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113608434 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113608551 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113609328 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113609683 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113609792 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113609817 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113609873 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113609874 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113610099 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113610131 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113610163 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113610229 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 113610247 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113610413 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113610419 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113610482 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113610500 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113610506 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113610535 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113610559 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113610598 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113610795 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113610937 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113610940 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113610964 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113610991 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113611034 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113611172 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113611358 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113611585 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113612090 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113612102 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113612126 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113612139 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113612175 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113612689 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113612843 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 113612905 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113612921 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113613010 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113613035 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113613088 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113613101 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113613206 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113613228 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113613232 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113613248 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113613319 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113613516 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113613645 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113613667 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113613691 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113613709 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113613767 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113613805 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113613870 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113613942 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113614015 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113614066 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 113614198 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 113614517 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113614573 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113614787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113614890 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113615457 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113615527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113615539 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113615627 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113615734 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113615856 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113616000 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113616062 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113616091 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 113616501 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113616688 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113616694 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113616921 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113617030 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113617046 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113617058 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113617138 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113617156 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113617157 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113617172 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113617218 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 113617518 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113617539 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113617574 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113617728 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113617754 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113617806 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113617951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113618024 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113618068 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113618106 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113618244 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113618267 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113618297 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113618382 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113618525 C A N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 113618672 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 113618693 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 3 113618701 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 113618776 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113618839 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113618869 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113618948 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 113619187 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 113619193 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113619229 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113619258 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113619264 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113619294 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113619313 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113619340 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113619356 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113619360 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113619403 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113619452 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113619467 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 113619549 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113619561 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113619577 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113619582 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113619620 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113619631 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113619644 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113619780 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113619872 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113619880 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113619884 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113619917 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 113620755 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 113620788 A T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 113620840 C G N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 113620861 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113620883 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 113620901 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113620976 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 113621010 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 113621096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113621119 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113621132 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113621149 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113621219 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113621252 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113621286 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113621335 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113621353 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113621358 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113621408 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113621409 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113621524 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 113621620 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113621711 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113621776 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113621802 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113621812 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113621841 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113621872 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113621896 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113622138 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113622158 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113622166 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113622227 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113622239 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113622261 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113622262 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113622307 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113622493 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113622519 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 113622556 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113622586 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113622672 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113622686 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113622705 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113622728 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 113622893 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113622905 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113622938 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113622944 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113622992 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113623010 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113623031 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113623033 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113623060 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113623094 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113623351 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113623439 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113623455 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113623681 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113623934 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113623969 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113624100 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113624190 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113624310 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113624362 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113624464 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113624529 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113624630 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113624871 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113624885 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113624951 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113625066 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113625155 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113625228 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113625470 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113625542 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113625592 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113625682 A G Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 3 113625684 G T N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 113625693 G T Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 113625723 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 113625934 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113625992 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113626052 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113626082 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113626137 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113626185 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113626205 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113626325 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113626331 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113626342 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113626358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113626387 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113626475 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113626517 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113626552 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113626559 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113626661 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113626677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113626822 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113626872 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 113626916 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113626917 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113627034 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113627117 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113627254 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113627388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113627730 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113627787 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113627788 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113627816 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113627838 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113627943 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113628005 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113628051 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113628131 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113628166 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113628180 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113630427 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 113630451 A C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 113630682 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113630684 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113630762 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113630858 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 113631131 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113631345 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113631467 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 113631738 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113631926 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113631958 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113631971 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113632003 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113632040 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113632059 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113632543 T C N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 113632557 C T N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 113632658 T G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 113632723 G C N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 113632911 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113632932 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 113633022 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113633074 T C N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 113633202 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113633245 C G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 113633552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113633843 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113634914 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 113634949 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113635077 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113635086 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113635171 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113635842 C T N Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 11 9 4 3 3 3 113637384 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113637646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113637971 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 113638000 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113638040 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 113638090 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113638340 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113638352 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113638416 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113638505 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113638524 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113638543 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113638628 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113638662 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113638674 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113639694 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113639724 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113639732 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113639760 T A N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 113639900 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 3 113639907 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 10 14 2 6 4 3 113639937 C T N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 3 113639960 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 113639969 T A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 113640000 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113640045 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113640053 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113640069 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113640119 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113640587 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113640641 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113641008 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113641206 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113641277 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113641319 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 113641354 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113641570 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113641888 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113641948 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 113641999 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 113643320 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113643520 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113643602 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113643928 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113644162 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 113644221 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113644284 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113645040 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113645451 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113645649 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113645897 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113646084 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113646564 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 113646656 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113646712 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113646716 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113646746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113646855 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113646914 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113647461 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 113648325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113649752 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113649935 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113650257 T A N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 113650299 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 113650354 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113650455 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 113650919 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113650972 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113651102 A C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 113651197 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113651438 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 113651519 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113651858 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113651932 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113651965 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113652281 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113652835 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 113652862 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 113652989 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 113653064 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 113653210 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 3 113653368 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113653774 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113654221 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 113655025 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113655080 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 113655278 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 113655578 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113655698 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113655757 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 113655999 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113656101 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113656116 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113656620 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 113656653 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113656754 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113656839 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 113656840 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.470588235294118 0.117647058823529 0.411764705882353 18 16 8 2 7 3 113656922 C A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 113657411 G T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5625 0.125 0.3125 20 12 9 2 5 3 113657481 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113657586 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113657738 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 113658299 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113658507 G C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 113658595 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113658737 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113659027 C A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 113659319 G C N N 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0 0.818181818181818 0.181818181818182 9 13 0 9 2 3 113659568 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 113659582 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113659615 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113659794 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 113659921 C A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 113659951 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 113659979 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 113660053 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113660111 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 113660174 T A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 113660364 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113660367 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113660443 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 113660483 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113660533 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113660908 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113660914 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113661052 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113661080 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 113661251 C T N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 113661264 G C N N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.222222222222222 0 0.777777777777778 4 14 2 0 7 3 113661270 G A N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 3 113661425 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113661473 G A Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 113661563 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113661592 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113661605 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113661688 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113661763 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113661847 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113661896 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113661960 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113662070 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113662086 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113662087 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113662127 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113662275 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113662495 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 113662508 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 113662553 G A N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 3 113662601 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113662641 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 113662767 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 113662815 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113662973 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113663239 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113663330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113663471 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113663816 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113664172 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113664279 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113664661 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113664719 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113664774 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113664956 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113664957 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 113665059 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113665229 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113665272 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113665473 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113665484 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113665518 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113665670 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113665811 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113665846 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113666082 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113666101 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 113666223 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 3 113666290 T A N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 3 113666451 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 113666654 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 113668744 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 113668942 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113669015 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113669047 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113669119 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113669206 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113669334 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113669570 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113669597 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113669629 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113669725 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 113669878 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113670371 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113670570 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 113670866 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 113671099 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 113671268 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113672164 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113672168 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113672912 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113672986 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113673414 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113673889 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113674003 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113674132 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113674359 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113674394 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 113675528 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113675636 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 113675824 G C N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 113675978 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113676136 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113676175 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113676234 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113676250 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113676444 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113676689 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 113677078 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 113677105 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 113677110 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 113677466 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 113677769 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113677784 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 113677827 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113677879 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113678066 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113678103 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113678178 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113678913 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113678972 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113679019 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113679061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113679408 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113679480 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113679655 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 113679836 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 113680170 G A N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 3 113680263 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 113680270 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 113680753 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113681016 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113681245 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 113682122 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113682637 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113682694 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113682770 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113682866 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113682947 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113685495 T A Y N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 3 113686226 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113688711 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113688842 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113688946 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113689036 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113689080 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113689120 T G N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 113689179 T G N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 113690311 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113690455 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113690532 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 113690722 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 113690772 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113690893 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113691481 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113692442 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113692455 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113692661 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113692700 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113692743 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113692932 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 113693022 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 113693145 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113693251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113693355 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113693480 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113693611 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 113693822 G C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 113693891 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 113694442 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113694622 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 113694716 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113694718 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113694760 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113695291 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113695339 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113695600 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113695693 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113695718 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113695845 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113697310 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 113697562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113697615 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 113697808 G A N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.357142857142857 0.214285714285714 0.428571428571429 13 15 5 3 6 3 113698671 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 113699135 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113699286 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113699331 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113700023 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 113700104 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113700202 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113700230 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113700446 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113700510 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113700594 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113701088 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 113701115 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113701312 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 113701689 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113702312 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113702503 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 113702717 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 113703036 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113703112 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113703156 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113703165 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113703192 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 113703336 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113703348 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113703351 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113703384 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 113703402 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 113703515 C G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 113703793 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113703813 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113703871 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113703886 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113703902 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113704063 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113704128 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 113704251 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 113704320 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 113704437 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 113704530 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 113704568 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113704658 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 113704741 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 113704940 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113705130 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113705260 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 113705360 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 113705478 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113705590 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 113706157 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 113706210 A G N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.357142857142857 0.214285714285714 0.428571428571429 13 15 5 3 6 3 113706355 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 113706366 A T N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 3 113706468 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 113706603 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113706644 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 113706878 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113707217 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113707332 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113707467 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 113707514 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113707608 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 113707717 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 113707770 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113707916 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 113708004 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 113708082 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113708458 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 113708883 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113708910 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113708979 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 113709111 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 113709236 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 113709330 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113709837 T G N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.5 0.142857142857143 0.357142857142857 16 12 7 2 5 3 113709862 A C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 3 113710005 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 113710017 G T Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 113710147 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113710225 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 113710302 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113710468 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113710476 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 3 113710481 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113710540 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 113710611 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113710654 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 113710682 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 113710715 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 113710726 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113710759 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 113710781 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 3 113710810 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113710819 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113710827 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113711000 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113711017 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 113711019 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 3 113711274 T G N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 3 113711289 T A N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.533333333333333 0.2 0.266666666666667 19 11 8 3 4 3 113711941 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 113712042 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113712090 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113712091 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113712301 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113712444 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113712766 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 113713120 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113713208 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 113713451 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113713717 C T N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 3 113713764 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.25 0.333333333333333 0.416666666666667 10 14 3 4 5 3 113714128 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 113714253 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 113714258 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 113714697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113714761 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113714830 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 113714902 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 113714934 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113714950 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113714989 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113714997 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113715020 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113715120 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 113715193 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113715227 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113715365 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 113715395 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113715463 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113715544 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113715563 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 113715610 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113715639 G C Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 113715643 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 113715858 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 113716048 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 113716051 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113716114 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113716116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113716178 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 113716258 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113716273 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113716318 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113716342 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113716388 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113716389 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113716399 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113716408 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113716494 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113716521 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113716642 T A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 113716688 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113716910 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 113716990 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113717005 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113717024 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113717092 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 113717302 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 113717352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113717361 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113717377 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113717400 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113717403 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113717413 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113717426 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 113717497 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113717532 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113717549 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113717566 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113717575 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113717604 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113717621 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113717626 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 113717648 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 113717708 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 113717711 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 113717846 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 113717853 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 113717902 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 113717974 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 113718037 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 113718103 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113718357 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113718423 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113718434 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113718435 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113718463 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113718570 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113718586 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113718594 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113718614 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113718661 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113718666 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113718766 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 113718770 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 113718840 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113718905 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113718971 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113718976 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113719009 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 113719051 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 113719074 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113719133 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113719139 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113719184 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113719282 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 113719313 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113719334 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 113719342 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 113719364 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113719433 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113719445 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 113719451 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113719478 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 113719485 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 113719492 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 113719561 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.4375 0.125 0.4375 16 16 7 2 7 3 113719571 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 113719629 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 113719689 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113719690 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 113719732 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 113719797 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113719830 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113719849 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 3 113719873 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 113719903 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 3 113719979 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113720014 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113720037 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113720121 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113720165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113720201 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113720635 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113720640 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113720663 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113720723 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113720798 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113720916 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113720978 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113720993 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113721099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113721169 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113721243 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113721311 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113721313 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113721356 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113721543 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 113721950 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 113722024 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 113722037 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 113722057 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 113722068 G T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 113722149 A C N N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.454545454545455 0.181818181818182 0.363636363636364 12 10 5 2 4 3 113722222 T C N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 3 113722225 G A N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 113722327 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 113722422 T C N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 113722478 T A N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 113722694 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113722869 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113722986 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113723131 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 113723339 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 113723825 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113723864 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113723929 C T Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 113723999 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 113724062 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113724082 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 113724123 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113724178 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113724187 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113724314 T G Y N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 113724367 A T Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 113724390 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113724496 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113724506 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113724534 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113724629 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113724680 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113724786 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 113724787 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 113724803 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113724830 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113724831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113725841 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 113725891 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113725950 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113725956 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113726034 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 113726059 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113726071 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113726106 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 113726149 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113726214 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.4375 0.125 0.4375 16 16 7 2 7 3 113726311 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113726344 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113726395 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113726428 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113726436 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113726483 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113726568 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113726670 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 113726912 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113726999 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113727065 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 113727089 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113727127 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113727177 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113727179 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 113727189 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113727233 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113727242 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 113727298 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 113727353 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113727368 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113727671 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113727946 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113728006 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 113728020 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113728029 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 113728043 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113728052 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113728103 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113728131 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113728165 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113728198 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113728244 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113728282 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113728464 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113728650 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113728658 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113728663 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113728677 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113728692 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113728696 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113728703 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113728854 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113728867 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113728875 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113728913 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 113729151 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113729152 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 113729168 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 113729207 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 113729346 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113729356 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113729421 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113729583 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113729666 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113729725 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 113729867 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113729977 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 113730140 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 113730143 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 113730293 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 113730445 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113730467 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113730501 T G Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 113730510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113730632 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 113730729 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113730878 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113730896 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113731085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113731200 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113731223 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113731436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113731479 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113731505 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113731623 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113731684 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113731698 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113731726 G T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113731829 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113731918 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113732037 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113732074 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 113732266 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113732272 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 113732376 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113732448 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 113732814 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113733106 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 113733220 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113734051 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113734158 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113735173 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 113735174 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113735687 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113735707 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 113736027 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 113736820 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113736948 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 113737269 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113737879 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113738114 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113738928 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 113739423 A C N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 113739508 T C Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 113740309 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113740676 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 113740975 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113741053 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113741583 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113741783 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113741913 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113742307 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 113742318 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 113742351 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113742581 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113742624 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 113742626 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 113742670 A T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 113742701 T G N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 113742838 C T N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 113743048 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 113743073 A T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 113743142 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 113743275 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 113743304 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 113743365 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 113743660 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 113743701 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 113743829 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 113744090 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113744364 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 113744476 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 113744708 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 113744863 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113744938 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113745210 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113745373 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113745607 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113745679 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 113745845 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113746805 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 3 113747103 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 113747148 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 113747416 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 113748119 C A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 113748309 G C N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 113748324 G T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 113748569 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113748744 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113748842 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 113748906 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113748955 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 113749075 G T N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 113749121 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 113749185 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113749189 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113749234 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113749294 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113749583 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113749893 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113750209 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113750252 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113751700 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113752123 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113752383 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 113752707 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 113752925 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 113753250 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113753364 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 113753568 G T N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 113753581 T A N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 113753598 G A N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 113753632 G T N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 3 113753642 T C N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 3 113753794 T C N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 3 113754474 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113754754 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113754791 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113754919 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 113755156 T A Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 113755738 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113755835 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 113756294 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 113756325 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113756458 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 113756472 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 113757594 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113757930 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 113757972 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 113757993 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 113758133 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 113758258 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113758267 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113758356 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 113758468 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 113758780 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 10 8 4 2 3 3 113758799 G A N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 113758805 A T N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 113758810 C T N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 113758822 A C N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 113759048 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 113759075 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 113759128 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113759195 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 113759308 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 113759318 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 113759359 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 113759365 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 113759415 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 113759598 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113759697 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 113759714 C A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 113759861 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 113759944 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 113760043 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 113760079 T G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 3 113760422 G C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 113760469 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 113760483 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 113760592 C A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 113760611 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 3 113760679 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 113760822 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 113760868 A T N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 113760916 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 113761029 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 113761052 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 113761129 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 113761146 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 113761223 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 113761310 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 113761413 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 113762108 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 113762119 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 113762209 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113762642 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113762748 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 113762813 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 113762853 T A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 113762875 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 113762942 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 113763070 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 113763077 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 113763323 G T N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 113763531 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113763572 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113764490 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113765064 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113765154 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 113765286 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113765370 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 113765411 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113765525 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113765793 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 113765990 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113766017 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113766029 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113766218 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113766226 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113766385 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113766508 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113766532 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113766538 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113766595 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 113766746 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113766796 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113766811 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113766844 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113766854 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113767000 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 113767078 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113767107 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113767354 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113767468 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113767589 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113767689 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113769208 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113769286 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113769303 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 113769830 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 3 113770472 G T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 113770473 T C N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 113770523 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 3 113770572 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 113770577 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113770621 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 113770636 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 113770722 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 113770827 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113770922 T G N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 3 113771109 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 113771120 C G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 3 113771146 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 113771369 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113772046 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 113772628 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113773148 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113773189 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113773631 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 113773872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113774180 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 113774669 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 113774713 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 113774843 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113775029 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113775205 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113775314 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113775333 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 113775749 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113775833 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113775883 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113776089 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 113776257 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 113776263 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113776364 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113776381 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 113776594 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 113776616 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113776631 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113776712 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113776748 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113776804 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113776975 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 113777010 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113777311 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 113777493 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113777551 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 113777605 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 113777647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113777658 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 113777776 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 113777854 C T N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.357142857142857 0.142857142857143 0.5 12 16 5 2 7 3 113777889 C T N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.307692307692308 0.230769230769231 0.461538461538462 11 15 4 3 6 3 113778196 G C N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 3 113778245 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 113778444 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 113778494 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 113778839 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113778848 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113778913 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113779049 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 113779068 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.0666666666666667 0.666666666666667 0.266666666666667 12 18 1 10 4 3 113779073 A C N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.0666666666666667 0.666666666666667 0.266666666666667 12 18 1 10 4 3 113779085 G T Y N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 113779098 C T Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 113779099 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 113779135 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113779177 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113779223 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113779314 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113779418 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113779441 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113779459 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113779529 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113779534 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113779544 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113779586 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113779593 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113779621 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113779632 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113779734 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113779740 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113779767 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113779932 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113780091 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113780136 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 113780246 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113780364 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113780378 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113780385 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113780443 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113780491 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113780579 T G N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 3 113780580 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 3 113780657 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 113780800 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113780848 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113780915 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113780943 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113781028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113781060 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113781073 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113781144 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113781180 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113781183 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113781201 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 113781280 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113781326 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113781822 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113781832 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113781840 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113781859 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113781875 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113782026 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113782027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113782237 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 113782238 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 113783376 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 113783443 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 113783856 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113784631 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113784776 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113784793 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 113785169 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113785253 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113785508 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 113786090 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113786189 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 113786375 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 113787240 C T N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 12 4 5 2 1 3 113788129 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113788206 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113788346 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113788415 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 113788802 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113789402 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 113790428 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 113790570 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113790633 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113790687 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113791025 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 113791132 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.411764705882353 0.117647058823529 0.470588235294118 16 18 7 2 8 3 113791366 T G N N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.272727272727273 0.181818181818182 0.545454545454545 8 14 3 2 6 3 113791739 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113791853 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113791884 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 3 113791898 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113791901 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113792046 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 113792048 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113792248 A C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 113792509 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113792582 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 3 113792612 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 3 113792627 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 113792788 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 113792942 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113793707 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 113793897 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 113793915 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.4 0.133333333333333 0.466666666666667 14 16 6 2 7 3 113794182 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113795081 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 113795361 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113795534 T C N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.357142857142857 0.214285714285714 0.428571428571429 13 15 5 3 6 3 113795540 G A N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.357142857142857 0.214285714285714 0.428571428571429 13 15 5 3 6 3 113795825 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 113795840 A G N Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 9 7 3 3 2 3 113795900 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 113796036 T C N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.363636363636364 0.454545454545455 0.181818181818182 13 9 4 5 2 3 113796413 T A N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 113796522 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 113796597 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113796598 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113796608 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113796925 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113797110 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 113797120 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 113797688 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 113798534 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113798535 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113799639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113801721 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 113801731 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113801831 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113801979 T A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113802492 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 113802613 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 113804504 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 113804750 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 113805655 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 113805908 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113806384 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 113807779 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 113808786 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 113808846 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 113808858 C G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 113808996 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113809592 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 113809674 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 113810046 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113810290 T C Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 113810725 A T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 113811260 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113812055 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 113813244 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113813962 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113814833 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.5 0.1875 0.3125 19 13 8 3 5 3 113815016 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113815442 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113815490 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 113815628 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 113815833 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113816275 T A N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.375 0.1875 0.4375 15 17 6 3 7 3 113816570 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 113817241 G T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 113817252 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 113817296 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 113817317 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 113817423 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 113817435 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 113817554 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 113817570 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 113817893 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113817916 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113817932 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113818101 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 113818140 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 113818166 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 113818173 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113818204 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 113818211 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 113818276 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113818281 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113818513 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113818526 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 113818547 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113818734 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113818822 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113818826 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113818857 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113818872 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113818906 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 113819092 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113819269 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 113819275 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 113819408 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113819479 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113819545 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 113819755 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 113819944 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113820389 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 113820690 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 113821075 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113821243 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 113821342 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 113821421 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 113821555 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 113821694 G T N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 113822173 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 113822318 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113822324 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 113822473 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113822485 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113822839 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 113823516 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 113823917 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113825090 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113825138 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113825785 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113826135 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113827128 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 113827586 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113830003 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113831721 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 113831788 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 113831876 A T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 113832688 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113832894 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 113833323 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113833491 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113837163 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113837712 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 113838256 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113839242 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 113839271 A G N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.384615384615385 0.307692307692308 0.307692307692308 14 12 5 4 4 3 113839492 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 113843615 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113843616 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113844038 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113845345 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113846820 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 3 113847606 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113847778 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 113847850 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113848670 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113849061 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113849296 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113849481 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113850056 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113850114 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113850769 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 113851205 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113851233 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113851281 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113851415 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113851468 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 113852095 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113854242 T G N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 113855031 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 113855347 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113855444 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 113855659 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113855923 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 113855965 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 113856070 C T N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 3 113856379 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 113856380 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 113856395 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113856450 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113856527 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113856546 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113857162 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 113857205 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113857245 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113857265 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113857348 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113857364 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113857374 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113857492 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 113857536 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113857545 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113857903 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 113857914 A T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 113858073 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 113858095 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113858176 C G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 113858264 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 113858313 G C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 113858471 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113858547 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113858570 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113858720 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 113858970 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113858989 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113859017 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113859025 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113859078 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113859150 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113859187 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113859317 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 113859379 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113859453 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113859665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113859821 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 113859857 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113860009 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113860066 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 113860275 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113860323 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 113861305 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113861649 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 113861770 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 113861798 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 113861919 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 113862717 A T N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 113863490 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113863590 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113863730 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 113864728 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113864858 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 113865168 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 113866844 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 113866938 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 113867638 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 113867714 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 113867917 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 113867998 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 113868112 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 113868284 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113868339 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113868552 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113870316 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113871214 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 113871387 T C N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 3 113872026 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 113873550 A C N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 113875040 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113875533 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 113876139 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 113877059 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 113877567 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113877653 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 113877879 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 113878343 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 113878480 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 113878482 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113879060 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113879748 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 113879901 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113881086 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113881428 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 113881680 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 113882054 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 113882625 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113882714 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 113882903 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.6 0.133333333333333 0.266666666666667 20 10 9 2 4 3 113883673 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113883781 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 113883886 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 113883973 C G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 113884115 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113884359 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113884393 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113884698 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 113884710 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 113884739 G T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 113884886 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 113884902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113885247 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113885319 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113885642 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 113885825 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 113885828 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 113886028 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113886412 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 14 10 4 6 2 3 113886413 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 14 10 4 6 2 3 113887146 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113887174 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 113887381 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113887450 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 113887826 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 113887860 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 113888025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113888360 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113888515 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 113889550 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 113889717 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 113889823 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113889908 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 113890280 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113890703 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113890738 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 113890775 A T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 113890788 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113890855 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113890872 A T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 113890873 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113890896 T A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 113891242 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 113891513 A G N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 0.142857142857143 0.214285714285714 20 8 9 2 3 3 113891535 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.235294117647059 0.0588235294117647 0.705882352941177 9 25 4 1 12 3 113891978 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 113892021 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 113892086 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 113892187 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 113892295 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113892362 C G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 113892431 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 113892436 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 113892795 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 113893744 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113893759 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113893906 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113894035 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 113894371 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 113894390 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 113894750 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 113894881 T C Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 113895995 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 113896133 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 113896417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113896469 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113896477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113898078 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113898508 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113898656 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113899043 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 113899292 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 113899345 T A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 113899486 A T N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 113900846 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113900896 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113900904 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113900966 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113901082 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113901243 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113901653 G A N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 3 113901871 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 113901960 T G N N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 10 10 4 2 4 3 113902099 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 113902149 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 113902687 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 113902935 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113902957 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113903183 G C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 113903263 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 113903280 A G N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 3 113903281 T A N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 3 113903334 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113903523 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113903728 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 113903907 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113904034 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113904223 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 113904297 T C Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 113904629 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 113904866 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113905012 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113905092 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 113905118 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113905249 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113905341 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113905770 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 113905789 T G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 113905869 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 113905911 T G N N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 3 113906270 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 113906326 C G Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 113906461 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 113906572 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113906778 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 113906805 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113906827 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113906939 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 113907056 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 113907198 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 113907363 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113907451 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 113907467 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113907497 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113907587 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113907604 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113907647 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113907725 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113907780 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113907880 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113908162 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 113908232 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 113908296 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 113908557 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 113908589 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 113908611 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 113908670 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 113908836 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 113908870 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113908878 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113908919 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113908920 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113909081 A C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 113909089 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 113909123 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 113909178 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113909280 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113909367 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113909386 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113909393 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113909494 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 113909598 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113909652 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113909735 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113909773 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113909795 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113910065 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113910110 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 113910124 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113910156 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113910175 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113910223 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 113910263 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 113910455 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113910510 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 113910552 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 113910817 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113911650 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113911838 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113911840 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113912018 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113912512 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113912779 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113913723 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113914077 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113914087 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 113914436 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113914661 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 113914679 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113914750 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 113914759 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113914762 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113914794 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113914798 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 113914821 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 113914921 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113915085 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113915197 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113915606 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 113915636 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 113915659 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 113915732 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 113915752 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 113915998 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113916367 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 113916381 A C N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 3 113916459 T A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 113916567 T A N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 3 113916627 T C Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 113916636 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 113916666 T A Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 113916670 A G Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 113916717 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 3 113916734 C T N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 113916753 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 113916792 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 113916948 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113917013 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113917121 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113917589 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113917715 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113918017 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113918232 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113918507 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 113918563 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 113918659 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 113918737 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113918814 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113918915 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113918936 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 113918969 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113919428 G T N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 113919545 A T Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 113919701 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 113920219 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113920220 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113920907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113920952 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 113920959 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 113921046 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 113921244 T A N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 3 113921437 T A N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 113921470 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 113921474 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 113921500 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 113921526 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 113921535 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 113921548 T G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 113921622 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113921770 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113921822 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113921853 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113921863 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 113921867 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 113921902 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 113921934 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113921945 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113921946 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113922065 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 113922079 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113922163 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113922352 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113922378 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113922420 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113922644 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 113922778 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 113923153 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 113923550 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 113923685 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 113923731 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 113923866 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 113924043 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 113924484 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 113924559 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113924642 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113924989 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113925193 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 113925333 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113925359 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113925408 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113925467 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 113925642 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 113925677 T G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 113925738 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 113926074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113926185 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113926543 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 113926603 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 113926777 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 113926801 T C N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.0714285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 11 17 1 9 4 3 113927053 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 113927334 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113927335 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113927446 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113927485 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 113927539 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113927744 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113927878 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113927888 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113927970 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113927978 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113928001 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113928072 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 113928240 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 113928451 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 113928580 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 113928647 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113928672 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 113928676 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113928862 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 113928941 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113929141 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113929161 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 113929305 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113929384 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113929487 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 113929599 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113929641 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113929699 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113929761 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113929856 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113929857 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113929912 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 113930050 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113930072 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 113930338 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 113930349 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113930646 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113930682 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113930906 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113931282 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113931286 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113931300 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 113931508 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 113931553 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 113931618 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113931794 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 113931843 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113931893 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113931965 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113931978 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113932230 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113932235 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113932286 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113932291 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113932347 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 113932369 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 113932377 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 113932449 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 113932636 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 113932730 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113932813 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113932839 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 113932935 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 113932945 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 113932951 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 113933029 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113933069 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113933166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113933209 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113933245 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113933301 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113933340 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113933369 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113933383 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113933384 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113933430 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113933627 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113933642 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113933689 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 113933717 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113933725 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113933752 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113933766 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113933800 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113933817 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113933861 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113933870 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113933965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113933986 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113934020 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113934276 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113934317 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113934375 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113934420 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113934485 C T N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 113934501 C T N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 113934502 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 113934526 T G N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 113934547 A G N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 113934557 C T N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 6 14 2 2 6 3 113934566 A G N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 3 113934706 C A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 113934853 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113934928 C T N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 113934966 G C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 113934996 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 113935049 A G N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 113935126 G A N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 113935150 A G N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 113935156 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 113935241 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113935264 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113935282 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 113935356 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113935396 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113935448 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 113935467 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 113935469 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 113935538 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113935733 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113935758 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113935818 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 113935871 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113935914 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113935921 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113935969 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113935978 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113935988 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113935995 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113936002 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113936009 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113936049 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113936088 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113936121 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113936159 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113936172 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113938177 A T Y N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 3 113939286 T A N N 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 3 113939300 G T N N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 113940079 C A Y N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 3 113940170 C T Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 113940218 A C Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 113940364 T C Y Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 113940380 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 113940483 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 113940615 G T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 113940647 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 113940674 C G Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 113940724 T G Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 113943005 A C N N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 3 113943121 C T N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 3 113943152 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113943303 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 113943322 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113943335 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113943366 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113943442 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 113943452 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 113943522 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 113943527 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113943559 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113943597 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113943646 A T N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 3 113943707 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113943808 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113943863 C G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 113943909 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 113944127 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 113944371 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 113944406 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 113944775 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113944971 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 113946468 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113946479 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113947115 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 113947321 C T Y Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 113947365 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 113948179 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113948987 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 113949303 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 113950380 C A N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 113951013 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 113951038 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113951052 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113951579 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113952229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113952493 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113952535 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113952557 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 113952836 G C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 113952915 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113952927 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113953008 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113953059 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113953095 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113953222 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113953343 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113953383 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 113953399 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 113953427 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113953438 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113953461 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113953481 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 113953560 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 113953661 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113953678 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113953879 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 113953978 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113954053 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 113954152 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 113954380 G A N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 3 113954880 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 113954943 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113955095 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 113955210 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113955301 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113955626 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 113955673 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113955682 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113955709 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 113955746 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113955787 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113955838 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 113955840 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 113955856 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 113955875 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 113955920 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113955945 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113955986 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113956032 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113956098 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113956101 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113956117 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113956125 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113956221 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113956447 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 113956465 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113956667 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 113956881 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113956883 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113957045 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 113957202 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113957440 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 113957603 T A N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 113957624 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 113957650 T A N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 113957667 A C N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 113957748 A C N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 113957781 G T N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 113957829 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 113957831 A C N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 113957917 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 113958087 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113958089 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 113958113 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113958202 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 113958219 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 113958304 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 113958324 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 113958335 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 113958384 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 113958446 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 113958509 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 113958548 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 113958757 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113958758 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 113958789 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113958879 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113958889 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113958890 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113959020 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 113959067 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 113959357 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113959361 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113959436 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113959547 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 113959636 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113959724 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113959757 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 113959883 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113959887 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113959912 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113960167 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 113960381 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113960456 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 113960629 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 113960698 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 113961164 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113961344 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 113961500 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113961730 G A Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 113961913 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 113961999 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113962089 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113962141 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 113962157 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 113962167 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 113962264 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 113962383 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113962539 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 113962613 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113962677 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113962695 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113962864 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 113962924 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 113962940 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 113963042 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 113963197 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 113963505 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 113963511 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 113963522 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 113963527 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 113963544 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 113963554 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 113963601 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 113963620 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 113963635 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 113963685 C G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 113963766 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 113963768 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113963900 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113963952 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113963961 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113964243 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 113964319 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113964511 C T N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 3 113964526 C T N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 113964534 C T N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 113964856 G T Y N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 3 113964973 G A N Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.75 0 0.25 6 2 3 0 1 3 113965154 T C N Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 3 113965248 T G N N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 3 113965473 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113965487 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 113965545 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 113965902 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113965944 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 113965997 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 113966214 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113966326 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 113966435 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113966542 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 113966556 A T Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 113966560 C G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 113966615 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 113966833 A C N N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 3 113966888 C T N Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 3 113967248 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 113967420 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 113967486 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 113967501 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 113967525 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 113967526 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 113967611 G T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113967646 A C Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113967869 G T N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 113967870 G T N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 113967981 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 3 113968132 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 113968291 G C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 113968292 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 113968342 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113968358 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 113968402 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 113968492 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113968577 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113968590 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 113968598 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 113968700 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 113968708 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 113968940 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 113969145 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 113969162 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 113970215 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 113970414 C A Y N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 6 14 2 2 6 3 113970418 C G Y N 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 113970446 T C Y Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 5 5 2 1 2 3 113971060 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113971064 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 113971197 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 113971203 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 113971256 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113971263 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113971295 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113971317 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 113971348 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113971452 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113971468 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113971496 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113971503 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 113971514 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 113971539 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 113971818 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113971877 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 113971915 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 113971933 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 113971957 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113971975 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113972060 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113972195 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 113972214 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 113973026 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113973075 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 113973171 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 113973195 C T N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 113974625 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113974708 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113974765 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 113974766 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 113974860 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 113974870 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 113974879 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113975010 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 113975105 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 113975121 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 113975171 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 113975196 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113975206 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113975281 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113975334 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113975364 C A N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 113975384 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 113982079 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 113982112 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 113982145 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 113982213 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 113982236 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 113982242 G A N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 113982258 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 113982277 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 113982302 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 113982321 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 113982339 T G N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 113982341 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 113982417 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 113982477 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113982521 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 113982693 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 113982913 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113983050 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 113983053 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 113983100 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 113983150 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 113983167 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 113983195 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 113983204 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 113983209 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 113983232 A T N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 113983282 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 113983297 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 113983361 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 113983389 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 113983432 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 113983471 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 113983492 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 113983760 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 113983771 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113983873 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113984008 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113984009 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113984021 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113984142 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 113984147 A T N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 113984182 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 113984193 A T N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 3 113984339 C T N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 113984474 T C N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 12 8 3 6 1 3 113984475 C A N N 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 11 9 3 5 2 3 113984491 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 113984499 G A N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 113984516 A T N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 113984533 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 113984655 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 113984762 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113984821 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 113984861 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 113984891 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 113984899 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 113984980 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 113985133 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 113985176 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113985482 G C N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 113985576 T A N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 3 113985996 A C N N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 3 113986051 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 113986067 A T N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 113986141 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 113986209 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 113986346 A T N N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 9 5 3 3 1 3 113986837 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 113986925 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113987173 G T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 113987243 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113987245 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113987321 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 113987358 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113987455 C A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 113987488 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 113987824 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 3 113987835 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 3 113987903 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 113988023 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113988041 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 113988217 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 113988275 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 113988750 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 8 4 4 0 2 3 113991062 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 113991108 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113991115 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113991213 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 113991332 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 113991413 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 113991467 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 113991469 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 113991516 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 113991531 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113991551 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 113991608 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 113991659 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113991781 T A N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 113991850 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 113991894 T G N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 3 113991972 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 113991978 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 113991997 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 113992147 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 113992202 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 113992207 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 113992365 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 113992409 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 113992490 C A N N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 3 113992494 A G N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 3 113992521 T A N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 113992538 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 3 113992549 C G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 113992563 T G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 113992578 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 113992625 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 113992700 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 113992785 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 113992808 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 113992871 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 113992900 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113992922 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 113992923 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 113992995 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 113993039 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 113993054 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 113993080 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 113993094 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 113993120 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 113993199 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 113993215 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 113993220 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 113993306 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113993316 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 113993427 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 113993462 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 113993485 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 113993795 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113994042 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 113994336 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 113994731 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 113994900 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113994922 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 113995174 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 113995341 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 113995499 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 113995803 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 113996048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 113996067 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113996224 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 113996304 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 113996311 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 113996333 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 113996336 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 113996382 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 113996531 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113996598 T A Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 113996620 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 113996634 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 113996684 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 113996686 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113997280 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113997514 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 113997666 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 113997807 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 113998238 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.1875 0 0.8125 6 26 3 0 13 3 113998308 A T N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.214285714285714 0 0.785714285714286 6 22 3 0 11 3 113998326 A C N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 4 24 2 0 12 3 113998377 G C N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.214285714285714 0 0.785714285714286 6 22 3 0 11 3 113998580 G T N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.214285714285714 0.142857142857143 0.642857142857143 8 20 3 2 9 3 113998597 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.153846153846154 0 0.846153846153846 4 22 2 0 11 3 113998607 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 4 24 2 0 12 3 113998616 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 4 20 2 0 10 3 113998818 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 113998839 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 113998931 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 113998976 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 113999159 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113999443 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113999565 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113999632 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 113999635 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113999826 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113999839 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 113999933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114000151 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114000426 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114000789 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114000859 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114000975 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114001100 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 114001429 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114001674 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114001986 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114002790 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114002999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114003003 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114003012 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114003014 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114003240 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114003251 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114003328 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114003342 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114003399 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 114003454 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 114003957 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114004089 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 114004249 C A N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 114004936 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 114006194 C T N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 114006337 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 114006434 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 114006702 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114006769 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114006818 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114006844 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114006946 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 114007134 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114007169 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114007339 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114007468 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 114007652 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114007715 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114007756 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114007973 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114008008 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 114008180 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 114008581 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 114008978 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114009563 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114010098 A G N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 114010120 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 114010440 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 114010459 G C Y N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 114010477 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 114010627 G C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 114010629 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114010787 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 114011252 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 114011530 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 114011559 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 114011867 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 114011936 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114011945 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114012050 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 114012055 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 114012164 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 114012240 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 114012326 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 114012774 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 114012790 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114013030 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 114013038 T C Y Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 114013118 T A Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 114013592 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114013668 C G Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 114013697 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114013738 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114013793 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114013819 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114013881 T G Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114013937 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114013995 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114014048 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 114014131 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114014132 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114014155 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114014190 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 114014321 C T Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 114014431 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114014501 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 114014658 T C Y Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 114014728 A G Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 114014733 G C Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 114014767 C T Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 114015042 T C Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 114015053 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 114015302 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114015366 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 114015451 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114015676 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 114015731 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114015775 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114015795 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114015850 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 114016085 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 114016158 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 114016212 G C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 114016213 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 114016433 T G N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 114016528 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 114016603 C T N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 114016727 A G N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 114016842 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 114016932 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 114016958 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 114017027 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114017112 T A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 114017168 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 114017192 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 114017205 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 114017267 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 114017271 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 114017699 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114017750 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 114017894 C A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 114018041 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 114018068 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 114018527 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114018570 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114018810 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114018839 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 114018852 G T N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 114019138 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114019432 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114019622 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 114019647 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 114019849 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 114020136 T A N N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 3 114020157 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 3 114020207 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 114020414 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114020623 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114020657 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 114020725 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 114020780 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 114020890 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 114021007 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114021361 A T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 114021474 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114021486 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 114021684 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 114021687 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 114021695 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 114021781 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 114022057 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114022198 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114022219 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 114022234 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114022372 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114022400 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114022422 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114022496 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114022522 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114022649 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114022656 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114022663 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114022692 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114022735 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 114022769 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114022782 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 114022823 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 114022847 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114022849 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114022869 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114023165 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114023166 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114023179 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 114023260 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 114023311 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 114023333 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 114023350 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 114023449 A T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 114023483 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114023915 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 114024239 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 114024243 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 114024258 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 114024283 C G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 114024287 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 114024398 T G N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 114024547 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114024572 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 114024824 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 114025056 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 114025066 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114025125 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114025134 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114025191 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114025249 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114025265 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 114025267 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 114025689 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114025718 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114026083 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 114026216 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 114026407 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 114026408 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 114026460 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114026470 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114026560 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 114026568 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 114026616 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114026624 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114026684 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114026737 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114026775 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114026875 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114026892 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114027007 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114027148 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114027149 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 114027423 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114027464 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114027486 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114027599 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114027973 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114028080 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114028105 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114028132 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114028310 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114028331 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114028432 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 114028483 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114028493 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 114028882 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 114029077 C A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 114029168 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 114029269 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114029296 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114029412 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 114029464 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 114029466 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 114029567 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114029615 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 114029656 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114029797 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114029986 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 114029992 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114030089 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 114030154 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114030233 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 114030244 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114030380 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114030481 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114030563 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114030588 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 114030712 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114030716 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114030767 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114030811 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114030921 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114030962 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114031155 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114031200 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 114031293 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114031309 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 114031443 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114031639 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 114031710 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 114031784 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 114031787 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 114031877 T G N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 114032017 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 114032031 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 114032058 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 114032145 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 114032149 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 114032232 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 114032237 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 114032250 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 114032271 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114032302 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 114032318 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114032480 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 114032563 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114032658 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114032676 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114032677 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114032728 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 114032776 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114032778 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 114032793 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 114032845 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114032876 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 114032890 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 114032893 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 114032920 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114032972 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114033005 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114033010 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 114033156 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114033266 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 114033292 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 114033448 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 114033480 C T N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 114033523 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 114033589 A T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 114033743 T C N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 114033779 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 114033821 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 114033899 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114033902 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 114033931 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 114033948 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 114033981 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 114034055 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 114034083 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 114034099 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 114034199 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114034223 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114034232 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 114034403 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114034433 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 114034552 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114034590 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 114034597 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 114034666 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114034674 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114034684 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114034709 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 114034827 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114034871 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114034928 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114034970 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114034977 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114035066 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114035106 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 114035158 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114035167 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114035209 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 114035222 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 114035245 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 114035368 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 114035436 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 114035450 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 114035458 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 114035551 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 114035577 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 114035609 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 114035637 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 114035644 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 114035671 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114035677 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 114035776 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114035816 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114035913 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114035941 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114036016 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 114036026 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 114036069 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 114036120 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114036150 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114036151 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 114036169 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114036175 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114036272 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114036304 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 114036342 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114036358 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114036411 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 114036551 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 114036642 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 114036686 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 114036761 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 114036780 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 114036859 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114036950 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 114036982 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 114037191 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 114037401 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 114037461 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114037582 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 114037668 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114037670 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114037750 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114037761 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114037781 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114037878 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114037901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114037907 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114038017 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 114038142 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 114038201 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114038227 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 114038235 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 114038305 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 114038381 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114038593 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 114038614 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 114038651 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114038671 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 114039118 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114039159 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114039182 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 114039204 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114039345 A T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 114039567 A C N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 114039608 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 114039729 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 114040055 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114040222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114040253 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114040397 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 114040575 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114040595 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 114040732 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 114041058 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114041185 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 114041206 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 114041399 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 114041452 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 114041482 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 114041513 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114041666 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 114041710 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 114041755 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114041857 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114041876 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 114041878 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114041963 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 114041979 A T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 114042214 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 114042318 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 114042361 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 114042607 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 114042640 A T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 114042712 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 114043025 T C N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 3 114043056 G C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 114043216 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 114043253 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114043364 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 114043368 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114043386 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114043502 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114043531 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114043535 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114043593 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114043625 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114043879 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114043895 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114043959 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 114043978 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114043992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114044006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114044038 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114044101 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114044102 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114044117 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114044152 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114044168 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 114044394 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 114044425 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 114044450 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 114044458 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 114044962 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 114044968 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114045004 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 114045031 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 114045041 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 114045188 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114045223 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114045272 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114045793 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114045801 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114045999 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114046609 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114047056 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 114047109 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 114047272 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 114047303 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 114047475 C G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 114047780 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 114047807 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 114047824 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 114047910 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 114048005 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114048077 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114048164 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 114048187 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114048277 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 114048285 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 114048297 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114048351 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 114048440 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 114048534 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 114048555 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 114048600 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 114048602 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 114048621 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 114048705 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114048728 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 114048757 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114048788 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114048834 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 114048857 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114048933 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114049047 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 114049078 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114049128 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 114049170 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114049215 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114049223 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 114049251 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114049274 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114049301 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 114049340 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 114049369 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 114049430 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 114049441 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 114049453 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 114049478 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 114049546 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 114049620 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114049651 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114049653 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 114049681 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114049690 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 114049735 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114049965 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114049976 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114050006 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114050105 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114050218 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114050300 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 114050331 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114050441 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 114050454 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114050456 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114050615 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 114050618 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 114050796 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114050865 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114050868 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114051084 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 114051173 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 114051245 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114051438 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 114051450 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 114051451 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 114051489 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 114051519 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114051529 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114051793 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114051911 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 114052091 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 114052199 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 114052299 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 114052332 C T N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 114052339 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 114052386 T A N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 114052539 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114052690 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114052854 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 114052988 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114053013 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114053047 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114053093 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 114053156 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114053237 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114053247 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114053321 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 114053360 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114053463 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114053478 C A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 114053539 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114053659 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 114053660 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 114053753 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 114053856 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 114053960 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 114053962 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114053973 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 114054061 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114054251 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 114054284 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114054287 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114054405 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 114054424 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 114054498 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114054704 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114054712 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114054723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114054738 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 114054746 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114054759 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114054855 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114054891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114054899 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114054936 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114054995 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114055003 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114055007 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114055023 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114055076 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114055152 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114055208 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114055286 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114055449 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114055473 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114055622 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114055627 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114055785 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 114055788 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114055802 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 114055831 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 114056644 T A N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0 0.785714285714286 0.214285714285714 11 17 0 11 3 3 114056797 C A N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 114056888 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 114056993 G T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 114057106 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 114057368 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114057482 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 114057574 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 114057801 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114058008 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 114058219 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114058352 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 114058404 A T N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 114058469 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 114058475 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 114058501 A T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 114058560 G C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 114058625 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 114058730 C T N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 114058741 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 114058747 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 114058892 G T N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 114058983 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 114059145 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 114059162 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 114059210 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 114059360 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 114059429 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 114059501 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 114059602 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 114059603 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114059634 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 114059636 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114059708 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114059931 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 114059943 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114060059 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114060154 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 114060189 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 114060298 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114060328 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114060336 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 114060411 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 114060468 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114060493 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114060505 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114060530 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114060616 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114060647 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 114060784 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 114060805 T G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 114060807 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 114060816 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 114060823 C G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 114060882 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 114060896 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 114060962 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 114060976 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 114061012 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 114061044 A G Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 114061065 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114061098 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 114061126 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114061192 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114061238 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114061254 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114061303 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 114061353 C T Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 114061437 C A Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 114061458 T A Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 114061466 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 114061548 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 114061564 C T Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 114061642 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 114061659 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 114061676 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 114061685 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 114061695 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 114061722 G T N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 114061763 C A N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 114061972 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 114062018 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 114062099 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 114062122 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 114062278 G C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 114062346 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114062507 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114062553 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 114062631 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114062657 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 114063003 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 114063264 G A N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 3 114063277 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 114063304 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 114063332 A C N N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 114063347 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 114063421 A T N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 114063534 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 114063572 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114063673 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114063717 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114063799 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 114063811 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 114063831 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 114063888 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 114063962 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 114064341 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 114064368 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 114064449 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 114064499 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114064510 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 114064542 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114064557 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114064788 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 114064797 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 114064878 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 114064899 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 114064905 C G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 114065093 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 114065134 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 114065136 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 114065200 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 114065264 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 114065477 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114065552 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 114065585 C A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 114065594 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 114065978 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114066125 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114066192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114066204 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114066306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114066308 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114066323 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114066336 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114066349 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114066372 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114066378 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 114066420 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114066426 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114066432 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114066542 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 114066559 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114066969 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114066981 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 114067075 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114067112 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114067115 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114067382 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114067572 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114067574 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 114067656 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 114067657 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 114067715 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114067735 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114067739 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114067773 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 114067781 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 114067846 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114067850 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114068024 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114068210 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 114068383 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 114068391 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 114068684 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 114068728 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114068911 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 114068985 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 114069047 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 114069070 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 114069109 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 114069124 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 114069176 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 114069280 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 114069420 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 114069542 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 114069672 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 114069757 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 114069777 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114069875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114069977 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 114069996 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114070317 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 114070361 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 114070498 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 114070548 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 114070798 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 114070833 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 114070879 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114070882 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114070981 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 114071028 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 114071048 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 114071051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114071071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114071085 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 114071144 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114071230 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 114071376 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 114071506 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 114071565 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114071577 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 114071708 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 114071757 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114071853 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114072061 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114072184 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114072273 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 114072296 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 114072378 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114072408 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 114072458 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 114072606 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 114072814 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114072973 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 114073059 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 114073126 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 114073177 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 114073290 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114073341 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 114073420 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 114073564 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 114073640 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 114073675 A G N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 114073809 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 114073867 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 114073971 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114074133 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114074147 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114074180 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114074191 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114074298 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114074456 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114074505 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114074646 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 114074669 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 114074733 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 114075141 T C N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 114075164 A G N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.3 0.7 0 13 7 3 7 0 3 114075165 A T N N 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.2 0.8 0 12 8 2 8 0 3 114075180 T C N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 114075213 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 114075298 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 114075324 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 114075401 G T N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 114075403 T G N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 114075434 T C N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 114075491 G A N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 114075505 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 3 114075573 C T N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 3 114075614 A G N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 114075691 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 114075799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114075826 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114075873 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114075939 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114075968 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114075987 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114076043 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114076084 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114076241 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 114076270 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114076427 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114076447 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 114076513 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114076669 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 114076681 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 114076740 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 114076761 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 114076774 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 114076788 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114076825 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114076892 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 114076910 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 114077011 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114077055 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114077076 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114077113 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114077186 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114077240 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 114077261 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 114077315 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 114077426 T G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 114077513 A T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 114077548 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 114077562 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 114077597 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 114077602 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 114077624 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 114077692 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 114077726 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 114077797 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 114077840 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 114077896 T G Y N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.0666666666666667 15 15 1 13 1 3 114077927 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114077943 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114077948 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114077975 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114077994 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114078037 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114078046 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114078061 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114078117 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114078145 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114078160 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114078403 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114078412 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 114078442 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114078543 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114078555 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114078642 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114078657 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114078763 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114078818 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 114078851 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114078853 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114078930 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 114078995 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114079059 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114079080 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114079473 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114079478 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114079514 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114079561 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 114079919 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114080508 T G N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 3 114080551 T G N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 114080595 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 114080802 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114080925 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114081231 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114081249 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114081710 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114081728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114082706 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 114082744 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114082770 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 114083202 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114083300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114083421 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 114083889 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114084222 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 114084227 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 114084245 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 114084251 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 114084329 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114084437 G A Y Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 3 114084718 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 114086451 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114086999 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114087493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114087865 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114088356 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114088560 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114088612 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 114088663 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114088873 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114088937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114089094 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114089537 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114089659 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114089695 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114089873 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114090266 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114090404 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114090458 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114090836 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114090985 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 114090999 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114091090 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 114091097 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 114091107 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 114091476 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 114091486 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 114091499 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 114091512 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 114091557 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 114091767 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114092187 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 114092209 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114092235 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114092548 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114092627 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114092767 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 114092873 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114092911 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 114092956 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114093101 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114093102 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114093136 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 114093211 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 114093212 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 114093385 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 114093419 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 114093470 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 114093542 T G N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 114093593 A G N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 114093673 C T N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 3 114093692 A G N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 114093763 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 114093835 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 114094016 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 114094427 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 114094682 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114094996 C A N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 114095020 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 114095155 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 114095190 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114095252 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114095336 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 114095342 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 114095357 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 114095508 T C N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 114095777 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114095817 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 114095827 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114095955 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114095966 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114095982 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114096032 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114096100 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114096243 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114096463 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114096737 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114096765 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114096840 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114096851 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114096917 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114097033 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114097057 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114097071 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114097076 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114097092 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114097205 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 114097500 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 114097516 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 114097521 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 114097541 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 114097572 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 114097579 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114097709 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114097772 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114097773 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114097943 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114097991 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114098107 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 114098164 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114098210 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114098268 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114098451 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 114098472 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114098516 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 114098543 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114098544 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114098558 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114098580 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114098586 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114098684 A C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 114098770 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114098771 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114098884 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114098937 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114098938 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114098964 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114099146 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114099362 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114099394 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114099459 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114099546 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 114099557 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114099568 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114099636 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114099661 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114099693 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114099708 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114099721 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114099744 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114099824 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114099855 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114099870 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114099981 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 114100041 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114100193 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 114100266 A G N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 114100355 T G Y N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 114100367 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 114100408 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114100526 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114100650 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114100740 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114100834 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114100859 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 114100936 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114101023 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 114101208 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114101455 T G Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 114101650 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114101706 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 114101741 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114101893 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 114101948 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 114102477 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 114102772 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114102829 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114102888 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114102926 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114103023 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 114103081 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114103118 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114103150 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114103151 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114103184 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114103232 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114103274 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114103299 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114103345 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114103374 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114103403 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114103433 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114103524 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114103560 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114103575 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114103592 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114103626 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114103648 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114103674 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114103723 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114103789 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114103824 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 114103849 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114103947 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114104152 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 114104233 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 114104252 C T N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 114104358 A T N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 114104403 A T N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 3 114104452 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 3 114104462 G A N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.2 0 0.8 4 16 2 0 8 3 114104470 A G N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 114104503 T G N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 114104528 A C N N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 3 114104620 G A N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 3 114104650 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 114104779 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 114104795 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 114104926 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 114105023 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114105062 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114105087 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 114105153 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114105180 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 114105199 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 114105341 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114105352 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114105379 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114105555 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114105570 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114105808 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 114105821 T A N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 114105886 G T N N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 3 114105900 G A N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 114105913 T C Y Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 114105924 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 114105977 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 114105990 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 114106044 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 114106059 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 114106081 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114106132 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 114106137 C G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 114106192 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 114106258 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114106566 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 114106581 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 114106664 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 114106672 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 114107010 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 114107042 C T N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 3 114107247 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114107318 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114107393 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114107420 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 114107423 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 114107470 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 114107615 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 114107858 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114108074 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114108075 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 114108129 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114108134 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114108205 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114108242 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114108271 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114108342 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114108549 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 114108563 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 114108613 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 114108846 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114108975 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114109008 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 114109129 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 114109134 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 114109205 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114109209 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 114109419 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114109563 C G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 114109607 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114109798 C A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 114109821 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 114109849 C T N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 114109855 A G N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 114109956 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 114110188 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114110327 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114110329 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114110546 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 114110662 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114110756 G T N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 3 114111018 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 114111124 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 6 30 3 0 15 3 114111134 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.222222222222222 0 0.777777777777778 8 28 4 0 14 3 114111270 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 114111389 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 114111516 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 114111760 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 114111817 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 114112129 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 114112272 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 114112327 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114112333 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 114112340 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114112345 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114112467 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 114112494 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 114112749 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 114112755 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 114112840 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 114112896 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114112946 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 114112964 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 114113027 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114113078 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114113184 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114113209 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 114113215 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114113222 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114113299 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114113449 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114113452 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114113463 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114113497 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 114113516 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114113574 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114113650 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 114113691 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114113713 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114113747 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 114113851 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114113874 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114113912 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114113961 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114113988 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114114129 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 114114316 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 114114433 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 114114595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114114669 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 114114687 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 114114690 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114114726 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 114114961 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 114114997 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114115005 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 114115123 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 114115236 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 114115264 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114115270 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 114115291 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 114115317 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 114115351 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114115365 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 114115433 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114115531 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 114115556 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 114115573 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 114115584 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 114115703 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 114115834 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 114115867 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 114115892 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114115898 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 114115943 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 114115976 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 114117983 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114117987 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 114118022 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 114118062 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 114118368 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114118384 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114118413 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 114118447 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 114118531 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 114118542 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 114118723 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 114118752 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 114118956 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 114119102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114119364 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114119369 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 114119387 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 114119528 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.3 0.7 0 26 14 6 14 0 3 114119539 A T Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 114119545 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 114119572 A T Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 3 114119614 A T Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 114119765 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 114119812 T G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.235294117647059 0 0.764705882352941 8 26 4 0 13 3 114120033 C T N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 3 114120070 C T N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.25 0 0.75 4 12 2 0 6 3 114120547 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 4 20 2 0 10 3 114120564 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 114121173 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.266666666666667 0.0666666666666667 0.666666666666667 9 21 4 1 10 3 114121175 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.235294117647059 0.0588235294117647 0.705882352941177 9 25 4 1 12 3 114121274 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.222222222222222 0.0555555555555556 0.722222222222222 9 27 4 1 13 3 114121452 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.25 0.0625 0.6875 9 23 4 1 11 3 114121481 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 4 24 2 0 12 3 114121544 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 114121545 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 114121590 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 4 8 2 0 4 3 114121921 A G N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0.2 0 0.8 2 8 1 0 4 3 114122054 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 114122235 T A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 0.117647058823529 0.352941176470588 20 14 9 2 6 3 114122282 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 114122463 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 3 114122730 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 114122858 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 114123210 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.1875 0 0.8125 6 26 3 0 13 3 114124156 C T N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.214285714285714 0.0714285714285714 0.714285714285714 7 21 3 1 10 3 114124215 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 4 20 2 0 10 3 114124301 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 3 114124455 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 3 114124677 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114124693 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 114124727 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114125001 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 114125184 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114125265 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114125394 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 114125606 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114125633 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 114125741 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114126042 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114126047 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114126062 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114126191 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 114126266 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114126268 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 114126282 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 114126313 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114126346 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114126572 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114126596 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114126604 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114126618 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114126938 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114127130 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114127179 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 114127389 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114127415 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 114127418 G T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 114127511 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 114127620 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114127668 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114127748 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114127877 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 114127903 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114128015 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114128056 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 114128086 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 114128347 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114128450 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 114128638 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114128707 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114128833 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 114128885 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 114128995 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 114129011 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 114129046 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 114129060 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 114129125 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 114129140 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 114129184 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 114129288 G T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 114129405 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114129494 T A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 114129536 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114129608 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114129718 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114129753 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 114129768 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 114129780 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 114129954 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 114130068 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114130105 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114130111 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114130181 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 114130186 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 114130225 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 114130367 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114130423 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114130436 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114130462 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114130558 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 114130574 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114130673 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 114130680 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 114130747 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114130804 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 114130920 C A Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 114130942 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 114130977 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 114131011 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114131034 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114131039 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114131147 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114131226 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 114131271 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 114131289 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114131308 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 114131485 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 114131511 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 114131525 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 3 114131600 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114131611 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 114131612 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 114131648 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 114131680 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 114131842 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114131860 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114131879 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 114132124 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 114132138 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114132412 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114132432 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114132482 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114132627 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114132694 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114132774 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 114132780 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114133273 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114133956 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 114133996 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 114134058 G C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 114134184 T G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 114134261 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.133333333333333 0 0.866666666666667 4 26 2 0 13 3 114134510 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 114134678 G T N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 114134819 G A N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 114134827 C A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 114134837 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 114135028 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 114135031 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 114135100 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114135293 C T N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.153846153846154 0.0769230769230769 0.769230769230769 5 21 2 1 10 3 114135592 C A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 114135637 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114135710 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114135712 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114135753 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114135784 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114135875 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114135929 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114135982 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 114135985 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114136102 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114136475 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 114136552 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 114136640 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 114136663 A T N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 114136694 A G N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.153846153846154 0.0769230769230769 0.769230769230769 5 21 2 1 10 3 114136709 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 114136946 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 3 114136998 A C N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 114137043 C G N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.166666666666667 0.0833333333333333 0.75 5 19 2 1 9 3 114137199 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 114137310 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 114137363 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 114137460 A C N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 114137548 G T N N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.333333333333333 0.583333333333333 0.0833333333333333 15 9 4 7 1 3 114137608 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 114137839 G T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 114137926 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 114138059 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 114138081 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 114138703 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 114138915 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 114139214 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 114139502 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 114140069 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114140282 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114140357 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114140458 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114140978 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114141213 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114141253 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114141547 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114142184 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114142363 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 114142367 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114142435 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114142465 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 114142496 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114142508 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 114142625 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 114142803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114142806 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 114142830 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114142896 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 114142934 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114142999 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 114143288 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 114143289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114143354 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114143561 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 114143604 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 114143816 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 114143860 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 114143865 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 114143961 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114144118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114144292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114144313 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 114144323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114144345 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 114144400 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 114144472 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 114144937 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 114145020 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 114145503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114145736 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114145777 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 114145812 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 114146299 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114146821 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114146997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114147356 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 114148036 A G N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 3 114148282 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 114148981 A G N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 3 114149419 G A N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 3 114149486 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 114150475 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114150540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114150603 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 114150700 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 114151063 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114151384 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 114151734 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114151987 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 114152303 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114152451 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 114152862 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114152952 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 114153359 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114153507 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 114153518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114153880 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 114154048 A T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 114154234 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 114154291 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114154521 G T Y N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 114155219 C G Y N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 114155487 A C Y N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 114155657 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114155905 G A Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 114156067 A G Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 114156361 A C Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 114156590 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114157291 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 114157428 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114157925 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114157951 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114158104 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114159168 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 114160226 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114160265 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114161022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114161112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114161339 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114161582 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114161813 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 114161877 C A N N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 3 114162826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114163560 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 114163631 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114163681 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 114163832 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 114164243 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 114164727 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114165939 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114166183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114167386 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114167425 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114167427 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114167910 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 114168026 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 114168039 G T N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 114169040 G T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 114169721 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114169749 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114169786 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 114169967 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 3 114170865 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114171040 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 114171609 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 114171637 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 114171689 T C N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.461538461538462 0.230769230769231 0.307692307692308 15 11 6 3 4 3 114171815 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114171960 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 114172071 C T N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.466666666666667 0.2 0.333333333333333 17 13 7 3 5 3 114172073 C T N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.466666666666667 0.2 0.333333333333333 17 13 7 3 5 3 114172229 T C N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.428571428571429 0.214285714285714 0.357142857142857 15 13 6 3 5 3 114172385 A C N N 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 8 6 1 6 0 3 114172390 A C N N 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.142857142857143 0.714285714285714 0.142857142857143 7 7 1 5 1 3 114172577 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 114172690 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 114172858 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 114173019 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114173284 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 114173795 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 114174153 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 3 114174226 T C N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 3 114174405 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 3 114174539 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 114174567 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 114174623 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 114174859 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 114182686 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114182880 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114182899 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 114183889 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 114183955 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 114184061 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 114184538 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114184789 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114185201 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114185594 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 114185884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114186570 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 114186793 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114187328 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114187385 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 114187583 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114188085 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 114188239 T G N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 3 114188323 G A N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 3 114188690 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114188759 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114188833 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114188874 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114188943 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114189338 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114190197 G C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 114190399 C T N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 3 114190814 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 114191063 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114191412 T G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 3 114191839 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 114192192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114192232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114192501 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 114193035 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 114193076 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 114193449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114193468 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114193617 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114193666 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 114193701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114193710 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114193805 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114194102 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 114194113 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 114194201 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 114194973 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 114195148 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114195175 A G N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 114195433 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 114195620 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114195814 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114195827 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 114195936 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 114195940 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114195969 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 114196079 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 114196221 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114196574 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 114196619 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114196644 G A N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 114203376 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 114203398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114203557 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114203615 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114203649 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114203744 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 114203829 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114203935 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 114204133 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 114204177 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114204334 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114204472 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114204523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114204676 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 114204753 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 114204837 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 114204918 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114204987 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 114205243 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114205309 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 114205459 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114205460 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114205470 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114205503 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114205586 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114205597 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114205714 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 114205744 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 114206187 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 3 114206616 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114206724 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114206890 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114206933 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 114207052 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114207472 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114207801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114208175 A T N N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 3 114208176 A T N N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 3 114208465 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 114208488 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 114208584 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 114208768 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114209307 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 114209918 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 114210101 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114210237 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 114210595 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114210605 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114211027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114211704 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 114211711 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 114212336 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114212364 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 114212385 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 114212920 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114212935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114212978 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114213050 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114213056 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114213064 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114213152 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 114213199 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114213321 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 114213434 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114213521 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 114213553 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 114213612 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 114213660 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 114213835 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114213837 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114213873 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114214038 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 114214061 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 114214198 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114214270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114214302 G C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 114214439 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114214456 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 114214464 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 114214535 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114214663 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 114214695 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 114214702 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114214746 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 114214759 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 114214807 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 114214974 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114215007 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114215083 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114215096 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 114215225 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114215246 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 114215383 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 114215384 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 114215435 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 114215535 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 114215541 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 114215556 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 114215568 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 114215593 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 114215656 A C N N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.363636363636364 0.636363636363636 0 15 7 4 7 0 3 114215692 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 114215697 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 114215710 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 114215781 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 114215811 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 114215858 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 114215861 T G N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 114215887 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 114215927 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 114216139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114216190 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 114216276 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 114216304 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 114216352 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 114216365 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 114216380 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 114216407 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 114216480 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 114216515 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114216524 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114216529 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 114216546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114216679 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114216793 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 114216815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114216992 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114217059 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 114217148 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 114217231 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114217337 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 114217429 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 114217579 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 114218124 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114218162 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 114218204 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 114218425 A G N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 8 12 2 4 4 3 114218663 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 114218708 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 114218943 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 114218956 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 114218995 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 114219333 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 114219522 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 114219665 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114219832 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114219846 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 114220104 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 114220152 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114220244 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114220421 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 114220763 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 114220764 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 114220782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114220797 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114221010 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114221231 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114221387 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 114221388 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114221754 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114222501 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 114222610 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 114222784 C T N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 3 114222838 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 114223318 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114223731 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114224210 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 114224477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114225205 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 114225255 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 114225298 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 114225306 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 114225317 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 114225445 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 114225542 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 114225714 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 114225743 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114225805 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 114225849 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 114225856 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 114225863 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 114225880 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 114225888 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 114225942 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114225943 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 114225983 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 114226038 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 114226054 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 114226120 C G Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 114226142 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 114226267 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 114226278 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 114226304 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 114226454 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114226529 T C Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 114226572 C A Y N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 3 114226617 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 114226657 T A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 114226789 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 114226834 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 114226927 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 114226955 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 114227028 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 114227171 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 114227308 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 114227330 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 114227375 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 114227464 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 114227506 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114227590 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 114227598 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 114227653 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 114227768 T C N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.0833333333333333 0.583333333333333 0.333333333333333 9 15 1 7 4 3 114227861 A G N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 114228158 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 114228225 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114228252 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 114228424 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 114228554 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 114228579 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 114228623 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114228708 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114228814 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 114228846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114228916 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 114229234 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 114229283 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114229367 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 114229474 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 114229573 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 114229627 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 114229824 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114229868 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 114230059 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.5 0.416666666666667 8 16 1 6 5 3 114230083 A T N N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 3 114230217 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 114230404 C T N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.0833333333333333 0.583333333333333 0.333333333333333 9 15 1 7 4 3 114230497 T G N N 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 7 9 2 3 3 3 114230573 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 114230645 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 114230646 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 114230667 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 114230680 C A N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 114230726 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 114230760 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 114230947 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 114231000 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 114231048 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114231179 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 114231183 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 114231337 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 114231363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114231369 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114231498 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 114231519 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 114231555 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114231766 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114231779 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114231902 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114231937 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114232046 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 114232224 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 114232303 G A N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 3 114232321 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 114232529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114232587 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114232600 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114232616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114232703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114232714 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114232765 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114232785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114232842 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114233409 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114233465 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114233726 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114234026 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114234097 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114234984 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114235661 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114236028 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 114236271 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 114236799 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 114236934 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114237461 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114237832 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 114238090 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114238264 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114238319 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114239079 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 114239147 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 114239299 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114239614 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 114239615 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114239764 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 114239776 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 114240105 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114240109 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 114240156 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 114240463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114241640 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 114241655 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114241776 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114241917 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114241922 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 114241978 G C Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 114241984 A G Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 114242785 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 114243727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114244379 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 114244479 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114244845 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 114244873 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 114245017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114245169 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 114245445 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 114245706 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 114245778 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 114245962 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114245968 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 114246019 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114246046 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 114246090 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 114246111 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 114246143 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 114246168 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 114246185 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 114246416 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114246505 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114246573 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114246660 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 114246662 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 114246767 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 114246805 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 114246841 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 114246866 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 114246928 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 114246974 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 114247290 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 114247324 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 114247526 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 114247660 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 114247828 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114247921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114247958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114247998 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 114248196 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 114248267 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 114248321 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 114248340 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 114248434 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114248605 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114248854 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 114248904 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 114248911 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114249288 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 114249505 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114249554 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 114249678 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 114250036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114250052 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 114250060 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 114250111 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 114250171 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 114250225 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 114250258 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 114250263 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 114250278 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 114250476 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 114250536 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 114250611 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 114251052 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114251057 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 114251065 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114251255 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 114251532 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 114251558 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 114251581 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 114251587 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 114251603 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 114251627 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 114251670 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 114251674 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 114251703 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 114251741 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 114251771 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 114251943 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114251974 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 114252010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114252057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114252066 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114252162 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 114252189 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 114252286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114252398 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114253179 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 114253211 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114253446 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 114253830 A G N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 114253885 C T Y Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 3 114253896 C A Y N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 3 114253907 A T Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 114254139 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114254163 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114254447 C G Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 114254689 A G Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 114254748 C G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114255142 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 114255433 T C Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 114255541 T G Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114255920 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 114256085 T G Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 114256293 G A Y Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 3 114256305 C A Y N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 3 114256306 C A Y N 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 5 9 2 1 4 3 114256596 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114256668 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114257250 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 114257475 T G Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 114257776 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 114257848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114257853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114258044 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114258137 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 114258177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114258180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114258215 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114258223 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 114258235 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114258289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114258321 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 114258360 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114258527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114258642 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 114259110 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 114259327 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114259328 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114259348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114259755 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 114259918 C A N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 114259950 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 114259989 A T N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 3 114260024 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 114260046 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 114260102 A G N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 114260170 C G N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 114260251 C G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 114260306 T A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 114260309 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 114260352 G T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 114260571 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 114260631 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 114261098 G T Y N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 3 114261276 C G Y N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 114262210 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 114262457 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 114262586 C T Y Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 114263630 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 114263883 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 114263888 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 114263895 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 114264131 G T N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 114264219 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114264231 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 114264276 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 114264331 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114264587 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 114264881 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 114265115 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114265553 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 114265660 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 114265821 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 114265939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114266015 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114266146 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 114266177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114266246 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114266253 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114266604 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 114267449 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114267467 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114267643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114268473 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114268522 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114268743 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114268926 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114269742 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114269814 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 114270099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114270269 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114270808 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114270841 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114271646 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 114271714 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 3 114272479 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 114273548 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 114273859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114273890 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 114274301 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 114274528 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 114274587 A G N Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.5 0 0.5 8 8 4 0 4 3 114274949 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114275016 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 3 114275184 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 114275196 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 114275226 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 114275397 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 114275404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114275570 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 114275656 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 114275776 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 3 114275781 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 114276008 G C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 114276127 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 3 114276272 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 114276445 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 114276686 T C Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 3 114276764 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.333333333333333 0.6 0.0666666666666667 19 11 5 9 1 3 114276800 A T N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.384615384615385 0.538461538461538 0.0769230769230769 17 9 5 7 1 3 114276848 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 114276877 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 114276881 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 114277365 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 114277537 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 114278115 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 114278405 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 114278470 G T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 114278543 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 114279614 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 114279766 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 114280028 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114280259 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114280464 A C N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.5 0.1875 0.3125 19 13 8 3 5 3 114280555 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 114280619 A G N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 3 114280901 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114280902 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114280912 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 114280943 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 114281004 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 114281091 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 114281175 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 114281235 T G N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 3 114281450 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 3 114281460 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 3 114281477 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 3 114281547 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 114281690 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 114281718 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 114281726 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 114281755 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 114281835 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 114281893 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 114281950 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 114281986 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 114282211 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114282281 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114282692 C T N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 0.142857142857143 0.214285714285714 20 8 9 2 3 3 114283134 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 114283538 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 114284025 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 114284378 T G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 114285045 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 114285172 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 114285250 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114285508 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114285655 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114285673 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 114286285 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 114286489 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 114286494 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114286503 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 114286576 G C N N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 3 114286586 G T N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 114286610 T A N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 3 114286611 G T N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 3 114286638 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 114286961 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.375 0.1875 0.4375 15 17 6 3 7 3 114286970 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 114287034 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 114287072 A C N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 114287078 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 114287171 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 114287203 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 114287210 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 114287330 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114287567 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 114288357 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 114288488 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 114288595 G T Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 114288615 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114288658 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114288832 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114289071 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 114289445 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 114289797 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 114289891 C G Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 114289953 C A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 114290013 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 114290120 T A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 114290137 T A N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 3 114290177 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 114290189 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 114290198 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114290211 G T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 114290229 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 114290230 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114290241 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 114290253 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 114290379 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 114290430 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 114290549 T C Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 114290560 T C Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 114290591 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 114290684 T G Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 114290703 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 114293633 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 114293861 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 114293903 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 114293913 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 114293919 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114293974 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 114294956 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114295032 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 114295045 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 114295094 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114295155 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 114295570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114295757 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 114295945 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 114295957 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114298915 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 114298930 G T N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 114299007 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114299027 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 114299472 G A Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.588235294117647 0.117647058823529 0.294117647058824 22 12 10 2 5 3 114299606 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114299820 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 114300134 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 114300410 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 114300428 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114300741 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 114300769 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114301549 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114301632 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114302723 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 114302933 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114302948 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114303220 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114304032 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114304081 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114304322 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114304557 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 114304736 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114304806 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 114304815 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 114304858 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114305126 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114305338 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114305409 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 114305507 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114305670 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114305758 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 114305766 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 114305862 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 114305900 C T N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 3 114306017 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 114306259 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114306373 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114306383 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 114306488 T A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 114306959 A G Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 114307091 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 114307123 T A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 114307239 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114307391 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 114307633 C A N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.5 0.214285714285714 0.285714285714286 17 11 7 3 4 3 114307645 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 114307778 G A N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 15 9 6 3 3 3 114307813 A C Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 114308048 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114308079 A T Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 114308224 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 114308227 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 114308243 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 114308267 C A N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 114308279 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114308533 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114308573 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 114308721 A T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114308847 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114309000 A T Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114309003 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114309158 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 114309286 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 114310123 T G Y N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 114310408 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 114310440 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 114310932 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 114310992 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 114311092 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 114311154 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114311343 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114311653 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114311704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114311792 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114312392 C T N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 3 114312403 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 114312494 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114312510 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114312555 A C N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 3 114312685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114314030 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 114314106 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 114314852 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114314955 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 114315713 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114316241 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114316343 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114316567 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114316806 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114319587 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114319728 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114320011 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 114320033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114320152 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 114320667 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114321703 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114322103 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114323042 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114323372 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114328147 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 114328262 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114328425 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 114328760 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 114328945 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114328983 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114329025 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114329834 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 114330627 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 114331032 G C Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 114333387 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114333469 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 114333516 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 114333517 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 114333591 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 114333617 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 114333630 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114333718 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114333721 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114333787 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114333869 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114333878 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114334141 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114334159 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114334164 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114334390 C G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 114334395 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 114334412 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 114334441 G C N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 114334561 A T N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 114334623 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 114334632 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 114334755 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 114334914 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114335260 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 114335515 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114335927 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 114335958 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 114335971 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 114336046 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 114336058 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 114336119 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 114336201 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 114336232 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 114336467 G C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 114336469 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 114336542 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114336589 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 114336683 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114336730 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 114336748 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 114336769 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 114336784 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 114336799 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 114336846 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 114336874 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 114336915 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 114336987 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 114337085 C G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 114337120 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 3 114337140 A C N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 114337204 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 114337217 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 114337253 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 114337263 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 114337269 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 114337276 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 114337362 C G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 114337377 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 114337423 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 114337534 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 114337698 A T N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 114337706 A C N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 3 114337744 C G N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 114337790 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 114337921 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 114337990 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 114338051 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 114338092 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 114338110 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 114338134 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 114338186 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 114338228 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 114338234 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114338450 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114338615 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 114338725 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 114338726 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114338821 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 114338922 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114338930 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 114339186 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 114339321 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114339398 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 114339414 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 114339517 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114340168 A C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 114340242 T G Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 114340301 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114340345 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 114340370 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 114340383 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 114340403 A C N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 3 114340477 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 114340533 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 114340565 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 3 114340625 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 114340709 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 114340717 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 114340807 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114340856 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 114341007 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 114341114 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114341208 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114341216 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114341314 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 114342185 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114342497 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114342702 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 114343026 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 114343041 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 114343142 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 114343311 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 114343439 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 114344108 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 114344360 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 114344779 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 114344948 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114345451 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 114345518 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114345862 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 114346546 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 114346658 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 114346662 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 114347039 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 114347082 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 114347179 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 114347210 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114347267 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114347320 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 114347556 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 114347668 T G Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 114347859 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 114347896 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 114347941 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114347942 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114348018 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114348093 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.0625 0.625 0.3125 12 20 1 10 5 3 114348233 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 114348659 T C N Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 3 114348805 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 114349145 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 114349173 C T N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 114349288 G A N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 114349297 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 114349307 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 114349316 C T N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 3 114349520 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114349726 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 114350029 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114350248 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 114350359 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 114350360 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 114350486 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114350837 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 3 114351410 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114352299 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 114352951 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 114353322 G A N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 114353805 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 114353881 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 114353957 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 114353986 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 114354104 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114354115 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 114354247 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114354688 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 114354820 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 114354963 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114355071 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 114355140 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 114356130 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 114356524 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 114356586 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 114356618 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 114356789 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114356891 C A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 3 114357363 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 114357606 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 114357635 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 114357722 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 114357905 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 114358216 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114358318 G T Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 114358666 G C Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 114358685 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114358697 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 114358715 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114358774 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 114358859 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 114358899 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 114359011 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 114359111 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 114359189 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 114359243 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 114359328 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 114359662 A C Y N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 114359681 A C Y N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 3 114359773 T C Y Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 114359779 G A Y Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 114360241 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 114361400 A G Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 114361449 A G Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 3 114361473 C T Y Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.416666666666667 0.166666666666667 0.416666666666667 12 12 5 2 5 3 114361554 G C Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 114362257 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 114362372 A G Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 114363071 T G Y N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 3 114363159 A C Y N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 3 114363318 T C Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 16 12 6 4 4 3 114363336 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 114363361 A T Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 114363489 G C Y N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 3 114365612 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114365720 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114365993 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 114366118 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 114366126 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 114366132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114366163 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114366272 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 114367427 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 114367544 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 114367833 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 114367890 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 114368030 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114368044 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 114368072 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 114368199 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 114368219 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 114368483 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 114368669 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 114368818 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 114369498 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 114369502 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114369522 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 3 114369553 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114369632 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 114369714 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 114369775 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114369785 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 114369913 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 114369939 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114370010 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 114370211 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 114370268 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114370638 T A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 114370854 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 114370987 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114371298 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 114371599 T G Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114378931 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 114379050 C A N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 10 18 4 2 8 3 114379149 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114379175 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114379181 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 114379219 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 114379403 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114379665 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114379838 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114380050 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114380179 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 114380255 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 114380810 G C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 114380891 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 114380986 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 114381137 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 114381472 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 114381574 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 114381587 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114381708 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 114382242 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114382426 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 114382445 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 114382592 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114382617 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114382924 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114382956 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 114383001 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114383091 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114383759 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114383781 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 114383812 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114384124 T A Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 3 114384398 G A N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 114384824 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 114384834 C G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 114384884 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 114384925 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 114384954 A T N N 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.1 0.9 0 11 9 1 9 0 3 114384989 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 8 10 2 4 3 3 114385015 T A N N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0 0.8 0.2 8 12 0 8 2 3 114385113 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 114385133 A T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 114385159 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114385179 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 114385231 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 114385289 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114385320 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114385342 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114385351 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114385355 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 114385380 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114385389 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114385416 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114385480 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114385489 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114385513 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114385541 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114385799 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 114385864 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114385958 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 114386016 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 114386051 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 114386062 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 114386087 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 114386176 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 114386195 C T N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0 0.615384615384615 0.384615384615385 8 18 0 8 5 3 114386238 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 114386294 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 114386301 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 114386320 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 114386350 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114386374 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114386401 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 114386402 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114386619 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114386686 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114386799 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114386875 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114386882 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114387000 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114387095 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114387116 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114387226 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114387274 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114387294 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114387345 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114387383 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114387446 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114387477 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114387487 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114387500 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114387519 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114387554 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114387666 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114387729 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114387813 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114387843 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114387900 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114388079 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114388087 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114388195 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114388234 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114388238 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114388253 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114388260 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114388334 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 114388365 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114388392 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114388634 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114388657 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 114388846 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114388960 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114389065 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114389083 A T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 114389087 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 114389136 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114389139 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 114389247 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 11 7 3 5 1 3 114389371 T G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 114389418 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 114389421 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 114389432 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 114389533 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114389572 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114389578 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114389593 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114389713 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 114389762 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114389763 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 114389845 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114389948 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114390077 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114390111 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114390159 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 114390160 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 114390225 G A Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 114390235 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114390248 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114390272 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114390372 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114390392 T C Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 114390418 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 114390476 A T Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 114390500 A T Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 114390569 C T Y Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 5 9 2 1 4 3 114390577 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 114390605 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 114390619 C T N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 3 114390640 G A N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 114390708 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 114390725 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 114390751 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 114390769 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 114390794 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 114390803 C G N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 114390809 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 114390815 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 114390891 T A N N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0 0.636363636363636 0.363636363636364 7 15 0 7 4 3 114390945 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114391005 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 114391030 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114391158 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114391234 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 114391282 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114391332 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114391363 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114391457 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114391469 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114391516 G T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 114391997 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114392013 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114392025 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114392036 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114392099 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114392227 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114392286 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 114392293 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 114392317 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 114392876 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114392877 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 114392897 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114392966 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114393076 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114393094 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114393106 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114393244 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 114393282 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 114393314 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114393400 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114393631 C G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 114393778 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 114393837 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 114393917 G C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 114394037 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 114394050 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 114394057 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 114394131 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114394169 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 114394223 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114394311 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114394368 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114394484 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114394783 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114395046 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 114395099 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114395108 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114395117 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114395253 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 114395302 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114395342 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114395371 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114395446 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114395464 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114395502 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114395504 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 114395569 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114395578 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114395582 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 114395594 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114395699 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114395755 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114396149 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 114396183 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 114396189 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 114396194 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114396226 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114396415 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114396477 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114396530 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114396536 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114396726 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114396842 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114396858 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114396874 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114396898 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114397042 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114397065 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114397104 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 114397112 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114397144 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114397167 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114397169 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114397205 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114397279 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114397299 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114397416 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114397602 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114397724 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114397759 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114397881 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114397913 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 114398047 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 114398356 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 114398358 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 114398395 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114398413 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 114398567 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114398667 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114398696 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114398720 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114398721 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114398799 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114398837 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114399161 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 114399243 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 114399292 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 114399371 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 114399410 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114399412 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114399551 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 114399651 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114399952 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114400053 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114400105 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114400140 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114400157 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114400184 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 114400204 A C N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 3 114400267 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 114400280 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 114400316 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 114400355 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 114400422 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114400484 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114400669 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114400678 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114401203 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 114401219 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114401233 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114401268 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114401299 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114401569 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114401893 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114401941 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 114402258 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 114402317 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 114402403 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 114402419 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114402529 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 114402703 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 114402715 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114402826 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 114403125 C G N N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 9 5 3 3 1 3 114403194 T A N N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 3 114403302 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 114403449 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114403516 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 114403756 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 114403999 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114404016 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114404112 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 114404127 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 114404193 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 114404660 T C Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 114404921 T A Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 114405266 A G Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 114405481 G A Y Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.363636363636364 0.545454545454545 0.0909090909090909 14 8 4 6 1 3 114405522 T C Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 114405644 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 3 114405695 A T Y N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 114405819 T G Y N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 114406280 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 114406500 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 114406702 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 3 114406747 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114406891 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 114407548 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 3 114407607 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 114407685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114407956 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 114407999 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 114408091 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 114408115 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114408130 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 114408247 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114408857 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 114408865 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114408930 A T N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 114408944 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114408949 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114408960 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 114409008 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 114409066 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 114409158 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 114409163 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114409206 A C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 114409263 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 114409301 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 114409335 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 114409340 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114409376 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 114409420 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 114409450 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 114409578 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 114409702 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.375 0.1875 0.4375 15 17 6 3 7 3 114409715 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 114409759 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 114409770 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 3 114409868 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 114409874 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 114409963 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 114409977 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 114410077 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 114410153 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 114410171 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 114410174 T G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 3 114410226 G A N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 114410266 A C N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 3 114410320 G C N N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 3 114410527 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 114410562 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 114410592 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 114410605 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 114410694 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 114410720 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 114410768 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 114410893 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114410917 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 114411012 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 114411150 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 114411161 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 114411201 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114411212 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114411271 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 114411273 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 114411301 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 114411307 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 114411312 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 114411469 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 114411703 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114411813 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114411868 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 114412291 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 114412354 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 114412370 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 114412408 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 114412752 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 114412775 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 114412897 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114413109 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 114413136 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 114413181 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 114413800 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114413850 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 114413922 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 114414008 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 114414241 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114414757 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 114414778 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 114414981 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 114415503 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 114415603 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 114415832 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 114416559 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114416912 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114416922 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 114416942 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114417034 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 114417125 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 114417159 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 114417192 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 114417394 C T N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 3 114417426 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 114417466 T C N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 114417477 T C N Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 3 114418530 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114418631 A G Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 114418634 T A Y N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0 0.764705882352941 0.235294117647059 13 21 0 13 4 3 114418740 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 114418761 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 114418767 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 114418867 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114418873 A C Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 26 14 12 2 6 3 114418942 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 114423319 A G N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 114423352 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 114423378 G T N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 3 114423425 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 114423498 C T Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 3 114423512 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 114423513 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 114423602 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 114423617 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114423628 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114423657 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 114423873 A C N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 114424170 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 114424336 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114424494 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 114424518 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114424901 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114425247 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114425272 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114425362 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114425485 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114425606 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 114425846 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 114425873 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 114425890 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114425932 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 114426342 C T N Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 3 114426490 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 114426628 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 114426677 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114426685 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 114426711 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 114426729 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 114426753 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 114426859 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 114427000 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114427124 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114427138 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114427232 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114427386 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 114427561 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114427597 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 114427751 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 114427762 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 114428000 T G N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 3 114428410 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114428435 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 114428593 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 114428821 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 114428841 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114429028 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114429186 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 114429310 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114429796 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 114429802 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114429985 T C N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 3 114430050 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 114430399 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114430448 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 114430482 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 114430557 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 114430777 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 114431061 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 114431150 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 114431152 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 114431276 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114431302 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114431359 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 114431688 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 114431723 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 114431731 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114432051 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 114432083 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114432185 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 114432712 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 114432829 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 114432850 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114433205 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 114433566 G C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 114433597 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 114433648 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114433681 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114433744 A C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 114433964 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 114434181 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 114434342 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 114434461 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 114434478 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114434898 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114434909 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 114435223 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 114435224 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 114435286 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114435367 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114435593 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114435719 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114436029 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114436135 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 114436156 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114436163 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 114436568 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114436971 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 114438368 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114438823 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 114438928 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114439032 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114440081 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114440177 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114441494 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114441759 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114441760 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114442355 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114444014 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114444042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114444082 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 114444424 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 114444436 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114444527 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 114444718 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 114445248 C T N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 13 7 4 5 1 3 114445642 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 114445644 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114445851 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 114445856 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 114446184 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114446247 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114446498 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114446557 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 114446675 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 114446746 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 114447001 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 114447927 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 114448185 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 114448494 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 114448596 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 3 114448932 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 114449150 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114449826 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114449843 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114450030 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114450717 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114451331 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 114453048 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 114453071 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 114453107 T G N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 114453367 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 114453449 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114453763 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114454279 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 114454491 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 114454742 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114454999 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114455062 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114455344 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114455419 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114455566 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 114455783 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 114455966 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 114456784 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 3 114457095 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114457146 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 114457229 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 114457872 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 3 114458115 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 114458152 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 114459069 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114459391 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114459582 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114460969 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114461001 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114461481 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114462657 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 114463460 A T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 114464100 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114464634 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114464650 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114464699 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114464807 A T N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 114464883 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114464933 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 114464970 A T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 114465364 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 114465899 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114466086 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114467202 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114467249 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114467534 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114467761 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 114468122 T C N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 114469455 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114469956 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 114469958 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 114469977 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 114470120 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 114470299 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 114470398 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 114470447 C T N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 114470491 A G N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 3 114470558 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 114470592 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 114470604 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 114470820 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 114470949 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 114470980 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 114470988 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 114471000 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 114471025 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 114471115 T C N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 3 114471217 G T N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 114471347 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 114471420 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 114471428 C G N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 3 114471476 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 114471487 T G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 114471532 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 114471555 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 114471558 G C N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 114471599 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114471600 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 114471661 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 114471705 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114471762 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 114471794 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 114472076 A G Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 114472267 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 114472337 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 3 114472341 A C N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 114472473 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 114472478 A C N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 114473102 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 114473128 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 114473143 G T N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 3 114473165 A C N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 3 114473205 C T N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 3 114473280 C T N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 3 114473287 T C N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 114473319 A C N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 114473332 T G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 114473352 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 114473379 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 114473430 A G Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 114473555 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 114473645 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 114473659 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 114473666 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 114473690 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114473716 G T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 114473779 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114473781 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 114473818 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 114473836 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114473851 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 114473900 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 114473905 G C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 114473931 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 114473981 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114473996 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 114474032 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 114474046 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114474143 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 114474192 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 114474201 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 114474289 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 114474348 A C N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 114474553 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114474644 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 114474883 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114474975 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 114474991 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 114475003 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114475034 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 114475054 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114475111 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114475127 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114475166 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114475195 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114475201 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114475220 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114475249 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114475293 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 114475297 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114475388 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 114475397 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 114475455 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 114475464 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 114475536 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 114475664 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114475668 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114475838 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114475848 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114475849 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114475935 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114475987 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 114476124 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 114476237 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 114476269 A G N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 114476270 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 114476336 A T N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 114476362 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114476492 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 114476528 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 114476542 A C N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 114476583 A C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 114476624 G A N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 114476705 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 114476714 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 114476755 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 114476760 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 114476790 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 114476856 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 114476872 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114476891 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 114476903 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 114476954 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 114476955 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 114477040 T A N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 3 114477159 C A N N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 114477288 A C N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.384615384615385 0.538461538461538 0.0769230769230769 17 9 5 7 1 3 114477336 T C N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 3 114477441 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 114477578 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114477589 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 114477607 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 114477617 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114477618 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114477655 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114477741 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 114478136 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 114478357 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114478575 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114478684 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114479618 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 114479776 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 114480303 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114480384 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 114480867 A C N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 114482159 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114483764 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114488544 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114490472 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 114490582 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 114491033 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114491206 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114491537 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114491571 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114491577 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114491721 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114491723 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114491775 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114492003 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 114492073 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 114492336 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 114492663 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 114492710 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114492991 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114493077 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 114493675 T A N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 3 114493728 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 114493951 A T N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 3 114494571 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 114494692 C G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 114495252 C T N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 3 114495679 G T N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 3 114495866 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114495980 C A N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 114496115 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 114496208 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114496268 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 114496332 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 114496457 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 114496673 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 114496714 C T N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 3 114496915 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114496972 T G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 114497672 A C N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 114497741 A G N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 114497808 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 114498007 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 114498100 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 114498148 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 114498416 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114498477 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 114498634 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 114498881 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 114499029 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 114499393 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 114499430 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 114499439 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114499687 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114499784 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 114500491 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114500529 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114500751 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 114501115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114501458 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 114501510 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114501761 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114501795 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114502850 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114503128 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114503231 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 114503232 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114503711 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114504043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114504329 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 114504674 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114505531 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114505552 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114505650 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114505695 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114506273 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114506323 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114506517 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114506723 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114506853 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114507024 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114508025 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 114509250 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 114509422 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114510387 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114510389 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114511413 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114512085 A T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 114512306 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 114515557 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 114515563 G A N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 3 114515663 T A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 114515667 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 114516036 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 114516224 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 114516333 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 114516417 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 114517305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114517329 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 114517402 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114517639 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 114517768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114517832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114517866 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114517889 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114518166 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114518179 C T N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 114518253 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 114518316 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114518350 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114518399 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114518409 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 114518623 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 114518697 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 114518703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114518777 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114518803 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 114519106 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114519157 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 114519167 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114519224 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 114519560 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114519808 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114519999 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114520094 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 114520219 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 114520228 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114520280 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 114520310 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 114520413 A G N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 114520417 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114520472 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 114520932 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 114520936 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114520985 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114521030 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114521135 C A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 114521136 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 114521171 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 114521241 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114521318 T C N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 114521339 G C N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 114521412 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 114521424 T C N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 3 114521547 T G N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 3 114521551 T G N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 3 114521611 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 114521625 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 114521697 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 114521788 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 114521864 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 114521890 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114521966 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 114522131 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 114523627 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 114523835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114525115 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114525166 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114525237 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114525266 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114525377 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114525381 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114525421 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114525505 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114525537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114525612 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114526729 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 114526775 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114526784 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114526822 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114526936 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114527125 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 114527178 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114527227 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114527265 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 114527275 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114527404 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114527422 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 114527510 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 114527606 A T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114527642 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 114527671 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 114527857 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 114527876 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 114527970 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114528012 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 114528066 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 114528081 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 114528206 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 3 114528476 C A N N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.5 0.125 0.375 9 7 4 1 3 3 114528602 C T Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 114528651 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 114528662 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 114528677 G T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 114528678 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 114528866 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114528943 T A Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 114529005 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 114529149 G A Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 114529216 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 114529350 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114529479 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 114529758 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114529859 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114529864 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114529888 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114529953 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 114529992 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 114530225 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 114530279 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 114530314 C G N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 114530519 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 114531139 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114531291 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 114531338 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 114531344 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 114531359 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114531363 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114531469 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114531506 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 114531511 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 114531530 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 114531549 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 114531585 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114531614 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114531675 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114531761 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114531766 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114531787 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114531827 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 114531990 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 114532013 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 114532095 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 114532120 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 114532176 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114532187 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 114532295 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 114532382 G T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 114533314 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114533376 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 114533423 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114533705 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114533802 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 114533870 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 114534333 G T N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 3 114534534 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 114534929 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 114534979 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 114535130 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 14 10 4 6 2 3 114535234 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 114535430 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 114535500 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 114535850 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 114535910 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 114536021 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 114536712 T C N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.25 0 0.75 4 12 2 0 6 3 114536771 A G N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 3 114536802 T A N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 3 114536848 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 114536886 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 114536910 G A N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 114537303 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 114537690 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114537797 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 114537828 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 114537892 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 114537932 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 114538008 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 114538044 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114538163 A C N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 114538338 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 3 114538339 G A Y Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 10 6 3 4 1 3 114538785 A C Y N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 3 114539153 G T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 114539259 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114539407 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 114539425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114539623 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114539936 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 114540062 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114540095 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114540142 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114540161 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 114540169 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 114540457 G A N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 3 114540499 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 114540576 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 114540809 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 114541166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114541248 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 114541286 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114541458 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 114541562 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 114541713 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114541923 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 114542048 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114542348 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114542358 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114542391 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114542503 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114542597 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114542639 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114542676 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 114542683 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 114542687 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 114542725 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 114542763 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114542839 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114542916 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114542939 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114542941 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114543081 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114543180 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114543211 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114543556 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114544988 T G Y N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 3 114545739 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 114545778 T C N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 3 114545783 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 114545839 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 114545870 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 114545891 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114545901 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 114545959 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114546021 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114546073 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114546126 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114546230 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114546250 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 114546316 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114546358 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 114546449 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114546601 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 114546636 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114546679 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114546684 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114546694 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 114546703 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 114547089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114547204 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114547371 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114547402 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114550516 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 114550701 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114550758 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 114550772 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 114551194 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 114551249 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 114552682 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114552890 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114560931 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114561472 G T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 114561610 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 114561677 G C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114561683 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114561893 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114561996 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114562049 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114562192 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114562236 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114562258 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114562348 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114562447 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114562782 C A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114562892 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114563150 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114563193 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114563230 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114563240 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114563441 A C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114563515 C G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114563739 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114563749 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114563979 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114564167 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114564385 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 114564492 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 114564950 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 114565352 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 114565373 A C Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 114565374 A C Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 114565941 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 114565966 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 114566005 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 114566022 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 114566054 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114566349 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114566391 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114566393 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114566434 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 114570176 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 114570437 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 114570568 A G Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 114570572 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 114570586 G A Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 114570599 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 114570826 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 114570907 A T N N 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 3 114571163 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114571211 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 114571234 G T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 114571383 A G Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 114571396 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 114571460 T C Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 114571720 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114571769 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114571783 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114571829 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 114572017 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114572069 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114572429 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114572591 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114572812 G A Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 114572839 T G N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 114572917 G A Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 114573015 C T N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 3 114573145 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114573219 C T Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 114573276 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 114573341 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 114574071 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114574380 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114574463 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114574506 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114574534 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114575066 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114575293 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114575463 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114576336 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 114576365 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114578283 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114578315 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114578365 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114578457 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 114578701 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 114578884 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 114579859 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 114579868 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 114579951 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 114579990 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 114580171 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 114580430 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114580925 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 114581919 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 114582523 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 114583027 T C Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 114583173 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114583728 G C Y N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 3 114583788 A G Y Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 3 114584541 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114584743 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114584791 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114584807 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114584855 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114584869 G T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114585011 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114585194 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114585381 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114585554 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114585683 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 114585686 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114585820 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 114585935 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114586008 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114586050 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114586229 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114586311 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114586357 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114586423 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114586438 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 114586447 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114586548 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114586640 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114586748 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114586757 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114586777 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114586845 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114586903 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 114586909 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 114586934 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 114586991 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 114586995 T G N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 114587007 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 114587256 A T N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 114587269 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 114587356 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 114587401 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114587418 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114587422 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114587523 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114587528 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114587573 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114587589 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114587630 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114587665 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114587689 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114587711 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114587727 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114587748 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114587964 C A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 114588210 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114588316 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114588326 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114588559 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114588599 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114588601 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114588809 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114588928 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114589025 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114589076 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114589184 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114589353 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114589423 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114589454 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114589491 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 114589680 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 114590060 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 114590169 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 114590170 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 114590248 A C Y N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 16 14 1 14 0 3 114590299 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114590341 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114590455 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114590456 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114590555 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114590715 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114590871 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114592124 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 114592210 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 114592309 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114592392 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114592504 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 114592554 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114592569 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114592727 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114592847 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114593156 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 114593749 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 114594254 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114594258 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114594401 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114594509 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114594929 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114594935 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 114594940 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114594951 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114595157 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 114595161 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 114595168 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 114595181 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 114595508 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 114596008 A T Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114596068 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 114596468 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114596546 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114596598 T A Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114596619 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 114596664 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114596715 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114596776 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114596858 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114596866 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114596892 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114597055 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114597099 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114597191 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 114597199 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114597212 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114597256 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 114597481 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114597626 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114597706 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114597853 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 114598014 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114598142 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114598177 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114598231 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114598303 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114598356 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114598647 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 114598733 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 114598799 G A Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 114598801 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 114598810 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 114598856 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 114598900 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114599021 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114599103 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114599192 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114599286 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114599384 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114599525 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 114599628 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 114599717 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114599771 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114599824 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114599909 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114599936 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114599994 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114600000 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114600042 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114600099 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114600145 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114600182 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114600186 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114600318 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114600384 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114600417 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114600444 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 114600515 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114600659 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 114600833 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114600961 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114600986 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114601122 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114602933 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114603708 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114603991 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 114605633 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114606130 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 114606176 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114606204 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114606266 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114607541 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114607926 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114608503 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114609335 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114609479 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 114609480 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 114610005 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 114611627 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114612345 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 114612675 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114612961 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114613070 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114614316 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 114614520 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114615551 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114615832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114616187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114616291 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114616914 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 114617220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114617432 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 114617773 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114617861 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114618310 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114618563 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114618613 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114618616 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114619285 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114619978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114620009 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114620040 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114620603 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114620974 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114621227 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114622400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114622578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114623081 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114625377 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114626218 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 3 114626785 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114626977 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 114627711 T C N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 114627717 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 114628288 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 114628589 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114629003 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 114629403 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114629482 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.05 0.75 0.2 17 23 1 15 4 3 114629744 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 114630388 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114630626 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 114630894 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114632611 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 114632613 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114633138 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 114633239 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114633739 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114634281 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 114634847 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 114635552 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114637519 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114638161 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114638201 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114638222 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114638251 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114638406 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114638431 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114638437 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114638478 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114638493 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114638512 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114638514 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114638601 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114638772 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114638816 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114638823 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114638920 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114638948 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114638987 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114639023 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114639186 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114639206 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114639262 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114639347 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114639388 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114639403 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114639429 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 114639576 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114639725 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114639735 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114639800 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114639867 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114639894 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114639945 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114640068 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114640115 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 114640506 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114640648 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114640697 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114640721 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114640737 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114640915 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114640950 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114641003 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114641239 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114641248 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114641262 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114641359 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114641441 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114641486 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114641600 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 114641604 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114641819 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114641884 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114641900 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114641901 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114641953 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114642042 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114642079 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114642126 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114642168 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114642560 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114642635 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114642713 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114642776 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114642777 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114642815 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114642996 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114643031 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114643080 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114643149 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114643159 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114643356 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114643451 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114643488 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114643576 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114643589 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114643658 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114643680 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 114643681 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 114643697 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 114643746 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114643779 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 114643871 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 114643883 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 114643901 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 114643965 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114644009 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114644155 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 114644156 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 114644186 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114644211 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114644253 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 114644286 G C N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 114644426 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 114644829 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 114644844 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 114645425 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114645579 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 114645996 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114645997 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114646046 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114646196 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114647054 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 114647363 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114647499 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114648262 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114648681 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114648989 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114649042 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114649161 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114649552 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 114649760 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114650077 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114650169 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114650928 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114651177 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114651637 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 114652348 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 114652351 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 114653169 T A N N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 114653384 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114653389 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 114653633 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114654048 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114654177 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114654795 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114654956 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114655420 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114656161 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114656298 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114656301 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114657156 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 114657313 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 114657442 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 114657728 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 114657816 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 114657949 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 114657950 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 114658018 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114658142 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 114658145 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 114658207 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114658216 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114658291 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 114658301 C A N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 3 114658302 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 3 114658361 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 114658551 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 114658626 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 114658659 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114658660 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 114658673 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 114658795 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114658803 G T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 114659022 G T N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 114659111 C G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 114659151 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 114659163 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 114659191 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 114659288 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 114659291 T C N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 3 114659462 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 114659464 A C N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 114659504 A G Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 114659519 G A Y Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.230769230769231 0.615384615384615 0.153846153846154 14 12 3 8 2 3 114659540 T A Y N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.214285714285714 0.642857142857143 0.142857142857143 15 13 3 9 2 3 114659556 C A Y N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 114659588 A G Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 114659794 T A Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 3 114660030 G T Y N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 114660036 C T Y Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.25 0.75 0 15 9 3 9 0 3 114660078 A G Y Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 3 114660079 C A Y N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 114660119 C T Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 114660371 G A Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 114660416 G T N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 114660444 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 114660453 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 114660478 C T Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 114660566 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 114660782 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 114660789 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 114660843 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 114661054 C T N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 114661058 A T N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 114661100 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 3 114661571 G C N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 114662125 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 114662151 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 114662195 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 114662918 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114663048 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114663677 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114663864 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114663874 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114663957 G T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 114664055 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114664183 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 114664205 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114664305 C T Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 114664359 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 114664414 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 114664422 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 114664635 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114664751 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114664768 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114664803 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114664857 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114664932 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114664933 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114664946 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114665054 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114665243 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114665290 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114665298 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114665485 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114665648 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114665816 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114665874 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114666033 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114666081 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114666198 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114666217 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114666375 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114666578 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114666587 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114666604 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114666671 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114666822 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114666919 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114667334 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114667633 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114667676 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 114667945 C T N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 3 114668042 T A N N 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 0.0909090909090909 13 9 3 7 1 3 114668282 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 114668406 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 114668472 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114668506 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 114668516 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 114668647 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114668662 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114668887 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 114668936 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 114669208 C A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 114669297 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 114669303 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 114669351 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 114669456 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 114669465 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114669481 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114669639 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114670263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114670730 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114670781 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114670826 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114671405 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114671419 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114671620 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 114671928 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114671936 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 114672209 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 114672654 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114672731 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 114672888 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114673047 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 114675543 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 114677139 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114678420 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 114679146 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114679160 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114679303 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114679313 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114685935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114687438 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114687678 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 114689218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114690292 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114692729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114694734 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114694781 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114695370 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 114698267 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114698613 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114698655 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114698792 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114700232 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114700333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114700346 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114700450 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114700467 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114700499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114700533 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114700844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114700934 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114701270 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114701276 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 114701286 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114701362 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114701380 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114701383 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114701421 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114701684 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 114702889 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114702922 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114702949 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 114703041 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114703042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114703108 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114703512 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114703577 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114703602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114703649 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114703707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114703836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114703884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114703940 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114704028 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114704053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114704064 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114704282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114704385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114704487 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114704851 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114705044 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114705071 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 114705365 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114706110 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 114706563 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114706781 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114707183 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114707358 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114707472 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114707527 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114707970 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114708088 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114708133 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114708240 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114708311 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114708383 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 114709106 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 114709244 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114709367 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114710066 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114710370 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114710422 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114710771 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114710772 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114710805 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114710844 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114711150 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114711192 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114711674 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114711787 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 114711801 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 114711866 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114712477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114712510 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 114712686 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 114713559 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114713615 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114713857 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 114714160 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 114715749 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114717308 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114717382 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114717856 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 114717976 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114718339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114718767 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114719031 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 114719122 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114719611 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 114719912 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114720719 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114721818 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114721897 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114722334 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114722831 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 114722899 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 114722946 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114723595 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114730080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114730261 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 114730464 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114731403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114732196 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114732809 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114733523 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114733652 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 114733837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114733849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114733903 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114734018 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114735325 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114735721 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114735761 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114736050 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 114737816 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114738423 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114738626 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114739853 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114739938 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114740086 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 114740567 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 114741230 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114741613 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 114741634 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114741873 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114742458 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 114742510 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 114742738 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 114742771 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 114742802 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 114742833 T G N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 114742860 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 114742953 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114742962 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114743115 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 114743180 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 114743225 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 114743260 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 114743294 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 114743331 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 114743508 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 114743564 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 114743667 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 114743779 G A N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 3 114743786 A G N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 3 114743822 A G N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 3 114743925 G A N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 3 114744021 G T N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 114744105 C T N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 6 10 2 2 4 3 114744106 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 114744143 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 114744292 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 114744388 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 114744435 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 114744609 C G N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 114744619 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 114744962 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 114745089 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 114745235 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 114745268 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 114745288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114745902 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 114746898 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 114748026 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 114748155 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114748383 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114749479 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 114750220 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114750282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114750293 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114751904 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114752121 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114754005 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 114755099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114755563 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114755997 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 114756264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114757094 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114757264 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114757582 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114757851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114759790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114760920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114761368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114762281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114762857 T G N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 3 114763650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114763984 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114764032 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114764056 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114764171 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114764216 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 114764639 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114764648 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114765429 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114765543 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114765884 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114767226 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114767819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114768299 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114768816 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114769812 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114770973 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114771190 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 114772322 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114772323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114772761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114773311 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114773338 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114774974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114775098 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114775638 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114776212 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 114779804 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114780417 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 114783056 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114783129 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 114783216 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 114783218 A T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 114783427 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 114783663 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114783754 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114784793 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114785334 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114787692 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114788905 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114790872 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114794049 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114796511 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114796598 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 114796658 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 114796809 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 114797008 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 114798464 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 114800333 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114800377 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 114803287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114803965 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114804182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114806002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114806853 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 114807119 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114810856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114811252 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 114812944 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114813054 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114813650 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114814243 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 114814371 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 114814958 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 114815096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114816163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114816190 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 114816239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114817111 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114817669 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114818278 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114818878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114819315 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114820393 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114822018 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114822195 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 114822480 A C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 114822725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114823744 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 114824790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114824864 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114826077 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 114827255 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114827328 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 114827669 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114829003 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 114829175 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114829413 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 114829709 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 114830362 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 114830442 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114830591 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114831571 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114831689 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114832124 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114832364 T G N N 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 13 7 4 5 1 3 114832790 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 114832933 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114834675 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 3 114834808 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 114834809 G A Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 114835232 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 114835819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114836235 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 114836580 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 114837057 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114837133 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114837589 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 114837750 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 114837796 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114837817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114838356 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 114838556 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114839164 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 114840079 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 114840528 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114841015 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 114841551 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114841981 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114842191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114842366 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114842919 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114843026 G A N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 3 114843246 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 114844793 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 114844835 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114845109 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114845757 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 114845799 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 114845892 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 114846438 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 114846490 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 114846565 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114846571 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 114846576 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 114846839 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 114846880 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 114847041 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 114847187 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 114847227 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 114847412 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114847478 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 114847717 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 114847825 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114848007 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114848057 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 114848158 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 114848975 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114849298 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114849452 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114849682 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114849799 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114850290 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 114850377 G T N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 3 114850517 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 114850656 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 114850712 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 114850730 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 114850832 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 114850854 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 114851179 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 114851255 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114851338 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 114851511 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114851521 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 114851541 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 114851583 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114852044 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 114852105 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 114852501 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 114852620 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 114853028 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 114853227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114853494 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 114853543 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 114853725 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 114854998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114855067 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114855595 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 114855931 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114855987 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 114856037 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114856042 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 114856282 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 114856644 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 114856988 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114857157 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 114857262 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 114857644 C G N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 114857657 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 114858018 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 114858019 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 114858037 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 114858038 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 114858143 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 114858381 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 114858655 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 114858918 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 114859002 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114859034 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 114859124 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 114859376 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 114859418 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 114859520 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 114859603 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 114859801 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 114859807 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 114859950 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114860220 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 114860477 C A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 114860489 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 114860550 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 114860577 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 114860601 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 114860677 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114860805 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 114860973 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 114861113 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 114861257 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114861833 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 114862209 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 114862676 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 114862697 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114862948 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 114863645 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 114863810 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 114863908 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 114863997 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 114864557 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114864585 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114864729 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114865843 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 114866752 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 114867770 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 114868813 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 114868824 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 114868825 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 114868876 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 114870975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114871016 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114872342 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114877035 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114877323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114878538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114880035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114880136 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114880238 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 114880335 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 114880695 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114880993 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 114881037 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 114881354 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 114881640 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114882752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114883052 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114884159 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 114884224 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 114884251 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 114884400 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 114884432 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 114884497 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 114884621 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114884645 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 114884661 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 114884736 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 114884766 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 114884823 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 114884889 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 114884923 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 114884955 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 114884973 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114885017 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 114885019 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 114885097 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 114885205 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 114885241 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 114885304 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 114885384 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 114885401 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 114885461 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 114885744 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 114885990 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 114886007 G A Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 114886303 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 114886359 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 114886514 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 114886607 T G Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 114886625 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 114887172 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 114887174 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 114887287 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114887321 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 114887384 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114888903 C A N N 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0 0.8 0.2 4 6 0 4 1 3 114889137 C T N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 114889367 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 114889708 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 114890903 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 114894991 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114895482 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114895815 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114896206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114897788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114898918 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114899697 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 114899736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114899826 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 114900596 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114900879 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 114904809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114907578 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114907835 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 114908175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114909951 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114910032 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114910062 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114910144 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 114910234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114910363 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 114911224 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114911736 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 114911788 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 114911907 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 114912629 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 114912669 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114912747 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 114913642 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 114914347 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 114914838 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114916705 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 114919601 A G Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 114920853 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114921293 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 114921612 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 114922381 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114922812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114923132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114923387 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114925324 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114926031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114929471 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114929517 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114930005 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 114930451 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114930584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114931264 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114931718 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 114932803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114933126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114934662 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114935440 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 114935612 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 114936443 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 114936608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114936664 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 114936793 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114937108 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 114937260 G T Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 114937322 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 114937364 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114937550 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 114937582 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 114937871 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 114938074 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 114938135 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 114938147 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114938731 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 114938760 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 114938761 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 114938791 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 114938949 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114939004 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 114939157 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 114939162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114939177 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 114939471 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 114939480 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114941240 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 2 4 1 0 2 3 114941672 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114941693 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114941697 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114941787 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 114942039 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114942190 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114942207 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114942364 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 114942368 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 114942414 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 114942549 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114942587 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 114942604 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 114942787 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 114942973 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 114943149 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 114943154 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 114945531 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 114945740 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 114945744 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 114946292 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 114946529 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114947411 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 114949815 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 114950714 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 114950882 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 114950939 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114951004 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 114951647 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 114954329 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 114956150 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114958414 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114959342 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114960218 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114960950 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114961143 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114961174 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114962864 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 114963001 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 114963305 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 114963843 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 114964361 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 114964447 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 114964588 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 114964683 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 114965228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114965748 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 114967759 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 114968196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114968893 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 114969475 G C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 114969910 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 114970581 C G Y N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 114970837 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114971033 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 114973479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114973780 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114974502 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 114974553 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 114976491 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114976614 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114977073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114977913 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 114978484 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 114978488 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 114978628 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 114978636 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 114978658 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 114978684 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114978883 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 114978979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114979140 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 114979664 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 114980302 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114980828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114980961 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 114981581 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 114981699 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 114981757 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 114981928 C T N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 114982400 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 114982772 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 114982891 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114982923 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 114983019 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 114983020 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 114983274 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 114983743 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 114983870 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 114984238 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 114984267 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 114985045 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 114985071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114985117 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 114985175 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 114985528 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114985622 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114985852 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114986171 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114986667 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 114986679 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 114986714 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114986745 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 114986758 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 114986799 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 114987222 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114987227 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114987238 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114987258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114987260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114987324 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114987352 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114987443 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114987566 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114987638 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114987734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114987738 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114987921 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114987947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114988162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114988165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114988228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114988353 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 114988391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114988452 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114988470 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114988486 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114988514 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114988568 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114988582 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114988587 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114988670 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114988802 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114994963 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 114995461 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 114995480 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114995493 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114995531 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114995551 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114995558 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114995579 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 114995594 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114995599 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114995649 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114995677 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114995752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114995788 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114995854 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114995909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114995910 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114995920 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114995933 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114995958 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114995964 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114995995 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114996000 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114996135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114996200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114996252 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114996264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114996287 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 114996402 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114996750 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114996843 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114996904 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 114997011 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114997069 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 114997297 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114997414 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114997566 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114997750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114997780 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114997781 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114997835 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 114997879 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114997928 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 114997931 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114998061 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114998108 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114998167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114998388 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114998521 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114998775 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114998825 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114998843 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 114998901 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 114998905 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114999069 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 114999187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114999311 C A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 114999519 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 114999619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114999622 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114999719 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114999754 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 114999855 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 114999929 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115000049 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115000143 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115000193 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115000273 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115000407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115000475 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115000636 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115000678 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115000752 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 115001161 C G N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 115001233 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115001910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115001911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115002049 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115002125 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 115002156 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 115002171 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 115002244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115002372 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115002396 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115002451 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115002533 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115002624 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 115002931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115003408 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115003897 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 115003904 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 115003975 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115003990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115004127 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115004489 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115004501 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115004529 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115004627 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115004664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115004690 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115004695 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115004727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115004759 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115004820 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 115004826 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 115004861 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 115004969 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 115005087 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115005089 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 115005514 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115005660 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 115007077 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 115007115 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 115007532 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115007654 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115007922 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115008118 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115008332 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115008687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115008974 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115009081 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115009454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115009885 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 115010443 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115012344 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115013483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115015731 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 115015803 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115016082 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115016531 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115016571 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 115016692 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 115016698 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115016813 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115016832 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115016928 T A N N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 3 115017082 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 115017098 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 115017310 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 115017612 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 3 115017613 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 115017822 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 115017950 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 115017952 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 115017979 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115017984 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 115017993 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 115018003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115018176 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115018292 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115018398 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115018708 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115019094 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115019125 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 115019508 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115019757 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115020016 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 115020082 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 115020159 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 115020227 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 115020448 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 115020848 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115020859 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115020860 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115020931 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 115020978 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115021037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115021092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115021213 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 115021733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115021742 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 115021777 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 115021961 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115022282 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115022368 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 115022449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115022625 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 115022630 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 115022868 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115023022 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115023140 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 115023143 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 115023234 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115023484 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 115023504 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115023508 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115023975 A T N N 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 3 115024122 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 115024184 C T N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 3 115024311 T G N N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 115024397 T C N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 3 115024425 G C N N 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 3 115024427 G A N Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 3 115024472 A T N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 115024488 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 115024713 T G N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 115024776 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 115024786 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 115024789 G A N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 3 115024828 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 3 115024835 G T N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 115024844 C T N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 115024850 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 115024855 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 115025408 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 115025665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115025698 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115025749 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115025807 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115025825 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115025993 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 115026008 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115026064 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 115026113 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115026338 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 115026343 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115026354 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 115026583 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115026678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115026685 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115026704 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115026746 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 115026815 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 115026963 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115027057 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 115027124 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 115027409 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 115027412 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115027543 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115027709 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115027961 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115028039 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115028249 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115028270 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115028271 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115028431 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 115028517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115028634 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115029137 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115031264 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115031307 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 115031700 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 115032756 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115033834 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 115040431 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115042613 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115043619 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115044216 G C N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 115044409 C A N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 115044696 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115045705 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115046314 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115046583 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115047157 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 115047236 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115047741 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115049563 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115049642 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115049706 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115049834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115049981 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115050129 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115050145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115050622 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115050644 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 115050940 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 115051159 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 115051993 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115052264 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115053379 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 115053861 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 115053879 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 115054650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115054705 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 115055034 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 115055760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115055891 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 115056142 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 115056990 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 115057339 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 115057575 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115057779 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 115058268 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115059231 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 115059499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115059672 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 115059918 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115060045 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 115061596 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115062092 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 115062407 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 115062912 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 115063071 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 115064088 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 115064216 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 115064323 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 115065578 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 115065875 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 115066404 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 115066484 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 115067512 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 115068120 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 115068163 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 115068178 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 115068181 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 115068191 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115068489 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 115068599 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 115068611 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 115069029 A G N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 3 115069119 T G N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 115069169 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 115069327 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 115069411 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 115069577 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 115069589 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 115069602 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 115069620 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 115069636 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 115069674 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 115069725 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 115069748 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 115069847 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 115069855 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 115070014 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 115070070 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 115070099 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 115070105 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 115070182 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 115070194 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 115070196 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 115070214 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 115070215 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 115070235 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 115070243 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 115070247 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 115070290 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 115070548 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 115075062 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 115075127 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 115075143 C A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 115075230 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 115075253 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 115075287 C G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 115075382 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 115075405 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 115075611 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 115075741 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 115075743 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 115075826 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 115075956 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 115075969 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 115075992 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 115076109 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 115076143 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 115076365 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 115076376 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 115076599 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 115076609 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 115076619 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 115076658 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 115076749 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 115076804 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 115076830 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 115076881 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 115077091 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 115077106 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 115077183 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 115077191 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 115077284 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 115077290 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 115077326 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 115077433 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 115077499 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 115077505 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 115077553 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 115077569 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 115077605 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 115077637 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 115077650 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 115077693 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 115077760 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 115077764 C G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 115077776 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 115077785 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 115077787 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 115077870 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 115077971 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 115078071 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115078082 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 115078099 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 115078115 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 115078129 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 115078149 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 115078173 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 115078179 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 115078215 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 115078373 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 115078438 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 115078463 G T N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 115078534 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 115078683 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 115078695 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 115078696 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 115078940 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 115078990 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 115079026 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 3 115079069 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 115079089 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 115079100 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 115079140 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 115079327 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 115079330 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 115079410 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 115079459 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 115079510 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 115079607 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115079715 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 115079805 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115079867 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 115079882 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 115079900 T A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 115079905 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 115080023 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 115080382 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 115080431 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115080486 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 115080798 A G N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.571428571428571 0.214285714285714 0.214285714285714 19 9 8 3 3 3 115080929 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 115081063 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 115081439 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 115081473 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 115081700 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 115081809 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 115081824 T G N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 115081961 C A N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 115082192 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 115082214 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 115082276 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 115082692 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115082712 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 115082749 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 115082769 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 115082788 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 115082813 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 115083043 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115083241 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 115083258 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 115083307 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 115083347 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115083363 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115083440 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115083524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115083944 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 115084304 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115084357 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 115084416 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 115084457 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 115084566 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 115084642 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115084696 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115084700 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115084727 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115084821 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 115085428 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115085466 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115085669 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 115085696 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 115085938 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115086003 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 115086081 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115086175 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 115086211 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 115086267 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115086287 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 115086334 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 115086387 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115086469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115086584 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115086605 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115086683 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115086732 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 115086875 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 115086926 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 3 115086944 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 115087175 T G N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 115087189 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 115087243 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 115087256 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 115087259 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 115087327 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 115087398 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 115087410 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 115087449 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 115087635 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 115087717 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 115087951 T G N N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.272727272727273 0.545454545454545 0.181818181818182 12 10 3 6 2 3 115088229 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 115088264 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 115088289 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115088290 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 115088321 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 115088398 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 115088738 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 115088852 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 115088963 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 115089011 G C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 115089086 C T N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 115089111 A C Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 115089166 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 115089189 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 115089418 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 115089423 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 115089514 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115089628 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 115089896 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 115089907 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 115090016 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 115090035 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 115090090 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 115090247 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115090344 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 115090370 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 115090375 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 115090400 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115090568 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115090591 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115090752 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 115091344 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 115091482 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 115091520 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 115091830 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 115092182 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 115092409 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 115092418 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 115092453 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 115092458 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 115092645 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 115093087 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 115093178 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 115093200 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 115093360 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 115093395 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 115093538 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 115093691 A C N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 115093723 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115093830 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 115093967 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 115094019 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 115094036 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 115094105 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 115094399 T G N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.214285714285714 0 0.785714285714286 6 22 3 0 11 3 115094443 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.2 0 0.8 6 24 3 0 12 3 115095759 C G N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 12 16 2 8 4 3 115095763 T C N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.153846153846154 0.615384615384615 0.230769230769231 12 14 2 8 3 3 115095777 A G N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.133333333333333 0.6 0.266666666666667 13 17 2 9 4 3 115102885 A G Y Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 3 115102939 T A N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.571428571428571 0.357142857142857 10 18 1 8 5 3 115102960 T G N N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0 0.6 0.4 6 14 0 6 4 3 115102996 G T N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.0833333333333333 0.583333333333333 0.333333333333333 9 15 1 7 4 3 115103025 G A N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 12 12 2 8 2 3 115103109 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 115103152 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 115103167 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 3 115103220 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 115103338 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 115103424 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 115103466 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 115103500 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 115103605 T A N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 115103616 G C N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.333333333333333 0.6 0.0666666666666667 19 11 5 9 1 3 115103644 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.25 0.666666666666667 0.0833333333333333 14 10 3 8 1 3 115103668 G A N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 0.0909090909090909 13 9 3 7 1 3 115103899 C T N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.266666666666667 0.666666666666667 0.0666666666666667 18 12 4 10 1 3 115103953 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 115104000 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 3 115104097 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 3 115104194 A T N N 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.181818181818182 0.636363636363636 0.181818181818182 11 11 2 7 2 3 115104202 T C N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.181818181818182 0.727272727272727 0.0909090909090909 12 10 2 8 1 3 115104444 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 3 115104557 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 115104616 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 115104618 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 115104656 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 115104681 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 115104698 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 115104932 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 11 7 3 5 1 3 115104951 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 11 7 3 5 1 3 115105014 A T N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.285714285714286 0.642857142857143 0.0714285714285714 17 11 4 9 1 3 115105080 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 115105305 T G N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.214285714285714 0.642857142857143 0.142857142857143 15 13 3 9 2 3 115105648 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 115105743 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 115105826 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 115105856 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 115105899 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 115105904 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 115106038 T A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 3 115106251 T C N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 3 115106305 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.133333333333333 0.666666666666667 0.2 14 16 2 10 3 3 115106329 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 115106378 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 115106401 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 115106450 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 115106500 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 115106522 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 115106580 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 115106667 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 115106764 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 115106799 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 115107005 C T Y Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.416666666666667 0.583333333333333 0 17 7 5 7 0 3 115107012 C T Y Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.416666666666667 0.583333333333333 0 17 7 5 7 0 3 115107024 T C N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 3 115107028 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.153846153846154 0.0769230769230769 0.769230769230769 5 21 2 1 10 3 115107050 C A Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 3 115107052 C T Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 3 115107324 G A Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 115107400 A G Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 3 115107427 G A Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 3 115107452 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 115107492 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 115107507 A C N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.25 0.6875 0.0625 19 13 4 11 1 3 115107726 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 115107742 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 115107836 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 115107913 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 115107973 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 115108073 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 115108138 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 115108155 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 115108172 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 115108177 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 115108291 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 115108322 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 115108343 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 115108628 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 115108783 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 115108951 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 115109054 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 115109252 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 115109384 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 115109505 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 115109758 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 115109783 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 115109830 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 115109846 A G N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.307692307692308 0.538461538461538 0.153846153846154 15 11 4 7 2 3 115109855 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 115110471 A T N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 3 115110736 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 115110778 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 115110987 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 115111022 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 115111110 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 115111160 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 115111187 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 115111194 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 115111308 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 115111526 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 115111557 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 115111921 A G N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 115112100 A T Y N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 115112834 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 115112948 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 115113089 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 115113101 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 115113487 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 115113498 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 115113672 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 115113694 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 115113735 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 115113763 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 115113790 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 3 115114162 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 115114257 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 115114272 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 115114406 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 115114639 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 115114699 G T N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 115114768 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 115115093 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 115115218 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 115115392 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 115115780 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 115115840 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 115115892 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 115116065 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 115116429 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 115116439 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 115116441 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 115116708 G A Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 115116962 C G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 115116971 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 115117002 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 115117032 C T Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 115117186 A C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 115117196 A G Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 115117338 C A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 115117347 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 115117579 T C Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 115117648 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 115117675 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 115117767 C T Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 115117796 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 115117884 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 115118108 A G Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 115118131 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 115118167 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 3 115118373 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 115118405 G C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 115118656 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 115118757 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 115118960 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 115119580 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 115119979 T C N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.333333333333333 0.25 0.416666666666667 11 13 4 3 5 3 115120104 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 115120197 T G N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 3 115120206 G A N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.363636363636364 0.363636363636364 0.272727272727273 12 10 4 4 3 3 115120301 C A N N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.384615384615385 0.307692307692308 0.307692307692308 14 12 5 4 4 3 115120525 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 115120589 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 115120664 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 115120681 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 115120855 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 115120884 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 115120920 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 115120950 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 115121098 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 115121403 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 115121877 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 115122145 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 115122290 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 3 115122351 C T N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.153846153846154 0.0769230769230769 0.769230769230769 5 21 2 1 10 3 115122392 C T N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 3 115123291 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 115126412 A C N N 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0.5 0 0.5 2 2 1 0 1 3 115129977 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 115130182 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 115130323 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 115130384 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 115133383 A T N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 3 115133529 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 115134472 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 115134837 T A Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 115135611 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 115136886 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 115137225 G A Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 115138555 C A N N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 6 12 3 0 6 3 115138796 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 4 8 2 0 4 3 115139878 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 115139936 C T Y Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.428571428571429 0.142857142857143 0.428571428571429 7 7 3 1 3 3 115147207 C G N N 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.375 0 0.625 6 10 3 0 5 3 115147738 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 6 12 3 0 6 3 115147837 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 115148009 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.222222222222222 0 0.777777777777778 4 14 2 0 7 3 115149363 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 115150132 C T Y Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 3 115150313 C G N N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 115150354 G A N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 7 9 2 3 3 3 115150576 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 115150948 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 115151262 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 115151474 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 115152098 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115152108 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 115152660 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 115153609 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 115153941 A T N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 3 115153961 T C N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.272727272727273 0.272727272727273 0.454545454545455 9 13 3 3 5 3 115153981 C T N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 9 15 3 3 6 3 115154006 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 7 11 2 3 4 3 115154057 G T N N 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 6 6 2 2 2 3 115154067 T C N Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 7 7 2 3 2 3 115154075 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 7 11 2 3 4 3 115154363 G A N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.166666666666667 0.0833333333333333 0.75 5 19 2 1 9 3 115154474 T C N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 5 15 2 1 7 3 115154564 A C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 115154623 T A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 3 115154667 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 115154748 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 10 22 4 2 10 3 115154757 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 3 115154841 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 115154994 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 115155736 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 115155787 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 115155798 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 115155889 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 115155890 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 115155912 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 115156051 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 115156076 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 115156115 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 115156245 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 115156252 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 115156303 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 115156314 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 115156370 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 115156446 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 115156482 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 115156588 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 115156963 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 115157049 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 115157086 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 115157105 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 115157162 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 115157297 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 115157416 T G N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 115157429 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 115157525 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 115157527 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 115157589 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 115157615 C G Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 115157630 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 115157651 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 115157681 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 115157868 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 115157888 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 115157896 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 115157916 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 115157939 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 115158032 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 115158074 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 115158099 T A Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 115158230 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 115158328 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 115158338 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 115158596 C A N N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 3 115158611 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 115158621 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 7 5 3 1 2 3 115158724 G A N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.166666666666667 0.0833333333333333 0.75 5 19 2 1 9 3 115158750 C T N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 115158789 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 115158888 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 115158896 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 115159042 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 115159087 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 115159238 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 115159283 A T N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 3 115159290 T A N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 3 115159331 A T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 115159341 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 115159375 C A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 115159457 A G N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 3 115159506 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 115159600 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 115159680 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115159689 G C N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 115159721 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 115159734 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 115159740 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 115159870 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 115160102 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 115160240 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 115160289 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 115160444 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 115160501 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 115160561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115160683 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 115160684 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 115160723 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 115160887 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 115160914 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 115160945 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 115160978 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 115161043 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 115161099 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 115161209 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 115161217 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 115161245 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 115161386 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 115161420 G C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 115161607 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 115161628 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 115161700 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 115161760 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 115161796 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 115161804 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 115161836 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 115161915 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 115162217 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115162302 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115162362 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115162547 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 115162563 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 115162944 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 115163025 C A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 115163049 C A N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 115163266 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 115163324 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 115163349 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 115163370 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 115163428 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 115163546 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 115163548 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 115163588 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 115163767 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115164431 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 115164696 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115164729 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 115164798 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 115164908 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115164995 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 115165020 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 115165029 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 115165035 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 115165194 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 115165249 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 115165376 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 115165405 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115165452 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115165488 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115165670 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115165951 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115166048 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 115166179 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 115166195 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115166200 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115166232 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 115166294 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 115166316 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115166336 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 115166348 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 115166370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115166422 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 115166466 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115166493 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 115166515 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115166561 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115166562 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115166629 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115166783 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 115166789 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115166940 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 115167144 T A N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 115167147 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 3 115167189 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 115167194 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 115167352 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 115167473 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 115167504 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115167539 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115167596 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115167728 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 115167756 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 115167785 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 115167803 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 115167846 C A N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 115167902 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115168032 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115168055 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115168060 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 115168108 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115168142 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115168159 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 115168177 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 115168196 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 115168221 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 115168626 C G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 115168674 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 115168745 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 115168884 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 115168931 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115168989 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 115169122 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 115169129 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115169139 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115169160 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115169186 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115169221 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115169232 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115169296 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115169327 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 115169328 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115169403 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115169415 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115169421 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115169471 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115169507 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115169536 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115169699 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115169776 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 115169859 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115169874 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115169961 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 115169993 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115170053 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 115170082 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 115170120 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 115170168 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115170241 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 115170326 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 115170539 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 115170989 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115171100 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115171279 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 115171350 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 115171371 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 115171459 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 115171475 G T N N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 3 115171504 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 115171783 A G N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 3 115171913 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115171927 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 115171959 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115171981 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115172048 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 115172080 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 115172111 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115172166 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 115172257 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115172380 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 115172478 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 115172494 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 115172504 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 115172516 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115172517 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 115172532 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 115172533 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 115172550 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 115172553 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115172699 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 115172844 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 115172901 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 115172935 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115173030 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 115173049 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 115173088 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 115173255 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 115173339 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 115173466 C A N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 3 115173507 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 115173512 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 115173524 C T N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 115173611 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 115173641 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 115173826 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115173850 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115173861 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115173940 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115173969 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115173970 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115174022 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 115174365 A G N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 3 115174446 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 115174450 C G N N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 115174663 C A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 115174846 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115174914 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115175091 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115175118 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115175153 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115175254 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115175478 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115175695 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115175732 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115175741 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115175848 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 115175886 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115175914 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115175935 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 115176204 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115176222 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115176306 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 115176368 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 115176410 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 115176419 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 115176534 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 115176580 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115176590 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 115176591 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 115176957 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 115177072 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 115177148 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115177261 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115177342 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115177503 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115177544 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115177734 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 115177761 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115177791 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115177839 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115177874 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 115178084 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 115178138 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 115178181 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 115178253 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 115178267 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 115178455 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 115178470 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115178635 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 115178652 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 115178950 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 115178974 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 115179010 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 115179095 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 115179463 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 115179507 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115179530 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115179623 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 115179824 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115179929 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115179945 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115180072 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 115180266 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 115180404 A G N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 115180448 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 115180468 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 115180529 A G N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 115180554 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 115180593 C G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 115180626 C T N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 115180691 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 115180781 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115180881 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 115180918 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115180956 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115180996 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115181085 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 115181115 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115181269 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 115181270 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 115181677 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115181795 C A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 115181803 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 115181874 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115181881 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 115181920 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 115182095 A G N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 3 115182648 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 115182660 A T N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 115182678 C G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 115182942 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 115183508 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115183537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115183684 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115183727 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 115183757 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 115183892 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 115183893 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115183904 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 115183915 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115183950 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 115184057 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 115184113 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115184145 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115184250 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115184283 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 115184351 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115184352 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 115184488 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115184504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115184659 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 115184760 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 115184822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115184831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115184890 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 115184955 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 115185021 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 115185050 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 115185063 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115185070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115185141 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 115185180 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 115185253 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 115185336 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 115185961 G A Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 115187056 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 115187086 A G Y Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 115187286 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 115187304 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 115187439 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 115187557 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 115187574 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 115187822 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115187942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115187955 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115187971 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115188034 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 115188097 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 115188140 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 115188205 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 115188220 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 115188379 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115188380 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115188670 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115188807 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 115188910 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115189063 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115189100 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 115189101 G T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 115189128 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115189311 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 115189328 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 115189357 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 115189494 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115189551 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 115189583 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 115189638 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 115189751 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 115189857 A T N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.230769230769231 0.153846153846154 0.615384615384615 8 18 3 2 8 3 115190114 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 115190435 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 115190446 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 115190700 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 115190739 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115190816 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 115190866 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 115190953 A C N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 115190967 T A N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 3 115191269 T A N N 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 8 6 2 4 1 3 115191311 A T N N 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 3 115191454 G A N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 3 115191473 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 115191715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115192120 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 115192424 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 115192748 C A N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 115193023 A C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 115193056 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 115193491 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115193585 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115193986 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 115194036 C A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 115194113 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 115194137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115194307 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 115194339 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 115194743 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115194837 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 115195181 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115195494 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 115195842 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 115195858 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 115196192 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 115196384 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 115196494 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 115196746 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 115197424 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 115197696 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 115197745 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 115197748 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115198245 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 115198463 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 115198956 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 115199012 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 115199024 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 115199427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115199506 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 115199537 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 115199547 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 115200049 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 115200082 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 115200092 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 115200106 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 115200113 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 115200134 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115200146 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115200189 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 115200222 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 115200232 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 115200248 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 115200585 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 115201230 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 115201294 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 115201417 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 115201418 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 115201433 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 115201469 T G N N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 3 115201478 C T N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 3 115201480 A T N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 115201592 G A N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0.2 0 0.8 2 8 1 0 4 3 115201901 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115202155 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115202300 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115202355 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 115202763 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 115202774 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 115202966 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 115203055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115203207 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 115203660 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 3 115203845 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 3 115203928 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 3 115204061 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 115204427 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 115204643 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 115204659 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 115204739 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 115204783 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 115204872 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 115204887 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115204893 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 115204980 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 115205106 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 115205131 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 115205169 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 115205204 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 115205210 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 115205276 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 115205328 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 115205365 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 115205370 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 115205414 A C Y N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.0625 0.875 0.0625 16 16 1 14 1 3 115205415 A C N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 3 115205438 G C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 115205474 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 115205480 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 115205500 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 115205536 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 115205597 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115205764 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 115205806 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 115205826 G C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 115205909 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 3 115205989 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 115205997 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 115206065 G A N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 115206184 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 115206202 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 115206227 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 115206413 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 115206426 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 115206437 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 115206453 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 115206506 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 115206556 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 115206679 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115206719 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 115206898 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 115206921 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 3 115207181 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 115207363 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 115207487 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 115207584 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 115207610 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 115207674 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 115207774 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115207841 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 115207860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115207873 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 115208062 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 115208080 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 115208120 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115208170 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115208174 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 115208265 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 115208358 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 115208593 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115208689 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 115208761 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 115208833 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 115209145 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115209166 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 115209294 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 115209449 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115209520 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 115209766 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 115209869 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 115209942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115210084 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 115210162 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 115210255 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115210266 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 115210374 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 115210564 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 115210591 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 115210718 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 115210824 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115210837 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 115210856 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 115210871 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 115210997 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115211027 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 115211360 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 115211486 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115212205 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 115212257 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 115212262 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 115212373 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115212380 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 115212427 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 115212572 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 115212631 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 115212690 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115212715 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 115212855 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115213183 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115213254 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115213400 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115213592 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 115213704 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 115213705 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 115213800 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 115213827 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 115213913 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 115213976 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 115214030 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115214081 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 115214099 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 115214127 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 115214229 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115214436 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115214520 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 115214692 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115215848 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115215862 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 115216294 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 115216604 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 115216613 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115216785 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 115216800 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 115217169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115217871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115218062 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115218103 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115218445 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115218552 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115219069 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 115219828 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 115220140 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115220147 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115220315 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115220993 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115221245 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 115221541 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115221642 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115221743 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115221754 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 115221963 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115221979 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 115222126 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 115222636 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115222728 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115223556 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 115223978 C G N N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 3 115224160 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 115224191 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 115224284 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 115224285 G T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 115224295 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 115224322 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 115224356 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 115224382 A C N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 115224427 G T N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 115224432 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 115224488 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 115224567 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 115224645 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 115224676 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 115224706 A C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 115224723 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 115224729 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 115224779 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115224785 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 115224835 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 115224869 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115224880 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115224891 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 115224937 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 115224992 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115225018 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 115225105 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115225115 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115225141 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115225160 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115225167 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 115225338 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115225374 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115225390 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115225447 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 115225598 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 115225722 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115225759 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115225763 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115225934 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 115226101 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 115226175 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115226190 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 115226291 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 115226370 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 115226378 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 115226396 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115226434 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 115226501 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 115226569 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 115226727 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 115227088 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 115227274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115227349 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115227363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115227709 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115228357 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115229273 G A N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 3 115230280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115230811 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115231126 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 115231164 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 115231584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115231744 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115231771 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 115231776 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115231801 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 115231840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115231884 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 115232046 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 115232193 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115232245 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115232627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115232662 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 115232781 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 115232857 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115232970 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 115232985 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 115233068 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 115233091 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 115233239 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 115233257 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 115233271 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 115233323 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 115233340 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 115233444 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 115233453 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 115233455 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 115233891 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115233993 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 115235554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115237263 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115237531 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115237663 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115237897 G T N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 115239089 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115239533 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115239586 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 115241514 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115241750 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115242350 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115242518 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115243417 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115244840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115245531 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115245824 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115246203 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 115247234 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115248037 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 115249584 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115250315 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 115252604 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 115253052 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115254048 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 115254061 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 115254097 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 115254107 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 115254132 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 115254147 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 115254179 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 115254234 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 115254365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115254531 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 115254537 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 115254544 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 115254551 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 115254575 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115254584 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 115254717 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 115254721 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 115254745 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115254760 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115254820 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 115254825 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 115254864 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 115254890 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 115254892 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 115254901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115254917 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 115254937 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 115254951 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 115254978 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 115254991 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 115255316 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 115255605 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 115255635 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 115255653 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 115255680 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 115256200 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 115256418 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 115256451 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 115256492 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 115256579 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115256620 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115256702 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 115256717 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115256994 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 115257014 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115257020 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115257233 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 115257246 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 115257365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115257721 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 115257751 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115257982 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 115258001 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115258195 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115258281 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 115258300 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 115258372 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 115258491 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 115258619 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 115258712 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 115258751 G A Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 115258771 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 115258882 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 115258956 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 115259163 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115259182 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 115259420 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115259461 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115259819 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115259863 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 115259931 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 115260005 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115260107 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115260247 T A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 115260670 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 115261164 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 115261536 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 115261730 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115261860 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115262235 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115262578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115263546 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115264946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115264995 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115266537 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115266695 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 115268919 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 115269595 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 115269950 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 115270627 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115270662 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115270664 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 115270858 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115270880 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 115271046 C G N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 115271463 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 115271464 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 115272430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115272457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115272541 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115272715 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 115273735 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115276191 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115277172 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115277495 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115277820 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115280553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115280679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115280983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115281095 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 115283178 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115283826 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115284269 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 115284518 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115287299 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 115288474 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115288576 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 115288906 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 115288957 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 115288992 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 115289037 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 115289067 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 115289129 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 115289209 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 115289401 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 115289470 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 115289605 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 115289632 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 115289662 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115289723 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 115289741 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 115290071 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115290218 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 3 115290362 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 115290373 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 3 115290728 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 115290761 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 115290786 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 115291003 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 115291021 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 115291107 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 115291327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115291522 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 115291690 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 115292046 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 115292085 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 115292147 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 115292163 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 115292205 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 115292611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115292910 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 115293085 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 115293331 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 115293349 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 115293375 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 115296645 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 115296707 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 115296795 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115297673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115297795 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 115297836 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115297854 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 115297975 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 115298582 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.25 0.333333333333333 0.416666666666667 10 14 3 4 5 3 115298638 C T N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 115298660 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 115298852 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 115298857 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 115299033 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 115299142 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 115299259 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 115299285 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 115299287 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 115300072 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 115300331 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 115300366 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 115300413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115300882 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115301018 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115301091 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115301708 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 115301735 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 115301966 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115301979 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 115302010 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 115302015 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 115302058 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 115302063 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 115302151 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 115302192 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 115302273 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 115302293 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 115302346 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115302424 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 115302577 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115302617 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 115302621 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 115302727 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115302841 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115302850 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 115302852 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 115302894 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 115302895 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115302973 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 115303178 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 115303199 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 115303208 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 115303287 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115303303 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115303346 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 115303439 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115303592 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 115303699 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 115303779 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 115303892 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 115303938 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 115303981 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 115303994 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 115304027 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 115304041 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 115304152 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115304179 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115304218 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 115304293 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 115304334 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 115304395 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115304433 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115304586 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 115304603 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115304653 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115304654 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 115304768 T A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 115304826 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 115304836 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 115305051 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115305084 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 115305397 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115305511 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115305575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115305576 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 115305599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115305717 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 115305733 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 115305775 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 115305797 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 115305911 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 115306166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115306263 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 115306383 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 3 115306445 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 115306561 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115306958 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 115307068 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115307140 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 115307171 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 115307455 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115307926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115309667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115309677 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 115310213 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 115311919 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 115313313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115315174 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 115315323 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 115315608 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 115315803 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 115316536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115316658 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 115316670 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 115316764 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 115316881 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115316896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115316932 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 115317111 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115317234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115317238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115317252 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115317285 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115317382 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 115317389 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 115317657 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115317819 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115317938 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 115317989 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115318007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115318054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115318112 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115318260 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 115318459 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 115318679 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 115318705 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 115318934 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115319284 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 115319285 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 115319437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115320222 T C N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 115320247 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115320325 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 115320901 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115321467 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 115321736 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 115322190 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 115322441 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 115323123 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115323731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115323952 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115325351 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115325560 C A Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 115327084 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115327243 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115327612 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 115327871 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 12 6 5 2 2 3 115327901 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 115328177 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115328229 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 115328282 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 115328303 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 115328316 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 115328338 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 115328361 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 115329334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115329363 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 115329440 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115330094 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115330105 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115331897 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115332047 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 115332328 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115332492 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115332589 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115332719 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115332819 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115333236 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115333595 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 115333613 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 115333627 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 115333674 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 115333935 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115334058 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 115334340 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 115335148 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115338934 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115339236 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115339381 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 115341697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115343832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115343904 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115343937 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 115343941 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 115343974 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115344107 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 115344347 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115344367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115344642 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 115344858 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 115344912 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 115344945 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115345033 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 115345779 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 115345866 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 115345869 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 115345952 A T Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 115346338 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115346375 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 115346396 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 115346402 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 115346411 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 115346451 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 115346566 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 115346626 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 115346631 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 115346664 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 115346741 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 115346799 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 115346842 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 115346875 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 115347014 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 115347043 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 115347045 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 115347140 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 115347162 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 115347297 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 115347313 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 115347427 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 115347653 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 115347784 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 115347788 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 115347856 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 115349625 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 115350704 A G Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 115352034 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 115352257 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 115353107 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 115353409 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 115353480 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 115353509 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 115353541 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 115353632 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 115353646 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 115353941 C A Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 115354033 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 115354034 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 115354067 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 115354261 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 115354434 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 115354504 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 115354535 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 115355347 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 115355424 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 115355523 A G Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 115355761 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 115355839 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 115355861 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 115355989 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 115356290 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115356879 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115356911 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 115357018 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115357167 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115357248 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 115357280 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 115357350 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 115357638 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 115357648 T A Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 115357754 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115357755 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115357861 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 115357917 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115357931 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115357953 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 115358031 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 115358036 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115358139 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115358290 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115358362 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115358390 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115358476 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 115358487 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 115358498 G C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 115358521 C T Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 115358626 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 115358664 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 115358700 C G Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 115358726 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 115358749 A T Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 115358808 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 115358924 T C Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 115358986 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 115359004 T C Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 115359006 A G Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 115359037 C A Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 115359092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115359105 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115359169 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 115359386 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115359410 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 115359412 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 115359702 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115359737 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 115359885 C A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 115360126 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115360866 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 115361241 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 115361248 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 115361471 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 115361680 T G Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.111111111111111 0.777777777777778 0.111111111111111 18 18 2 14 2 3 115361789 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 115361872 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 115361880 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 115362207 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 115362386 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 115362454 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 115362491 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115362501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115362567 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115362568 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115362713 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115362824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115362853 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115364375 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 115364419 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 115364581 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 115364662 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 115364783 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 115364803 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115364900 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115364905 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 115364965 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115364985 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 115365108 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 115365355 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 115365419 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 115365442 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115365576 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115365679 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 115365709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115365847 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115366019 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 115366100 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 115366265 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 115366791 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 115366977 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 115367003 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 115367042 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115367060 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115367108 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 115368038 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 115368082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115368174 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 115368225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115368243 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115369428 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 115369650 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 115369701 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 115369916 T A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 115369917 C T N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 115370444 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115370799 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115370987 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 115370997 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 115371942 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 115372114 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 115372312 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 115373334 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 115373389 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 115373420 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115373613 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 115373694 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 115374104 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 115374148 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115374240 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 115374272 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 115374321 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 115374600 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 115374749 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115375476 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115375569 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 115376493 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 115376523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115376582 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 115376855 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115376914 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115376935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115377664 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 115378002 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 115378057 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 115378162 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 115378361 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 115378420 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115378760 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 115378781 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 115382122 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115383189 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115385305 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 115385877 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115385982 G A Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 115386301 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115386888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115387560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115387631 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 115388100 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 115388362 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115388561 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115388769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115389363 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115389689 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 115390410 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115390883 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 115391007 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115392305 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 115392658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115392749 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 115393122 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 115393517 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115393872 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115394130 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115394300 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 115394662 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115395209 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115395262 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115395368 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115395508 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115395572 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 115395626 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115396411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115396755 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 115397272 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115397465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115398507 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 115398579 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115398940 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115399306 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 115399330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115399874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115400367 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115400431 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 115400689 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 115401101 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115401233 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 115401494 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 115401549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115401858 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 115401895 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 115402029 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 115402035 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115402495 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115402566 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 115402654 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 115402778 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 3 115403041 G A N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.625 0.125 0.25 11 5 5 1 2 3 115403097 A G N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.545454545454545 0.181818181818182 0.272727272727273 14 8 6 2 3 3 115403106 C G N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 0.153846153846154 0.153846153846154 20 6 9 2 2 3 115403117 A T N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 3 115403248 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 115403423 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 115403454 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115403642 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115404895 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115405705 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 115405773 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 115405777 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 115407055 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 115407267 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 115407394 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 115407403 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 115407509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115408504 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 115408660 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115408957 A G N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 3 115409343 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115412464 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 115412533 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 115412912 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 115413314 G T N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 115413336 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 115413669 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 115413814 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 115413865 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 115414006 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 115414026 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115414456 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 115418544 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 115418864 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 115419471 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 115420157 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 115420195 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 115420287 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 115420468 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 115420683 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 115420727 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 115420974 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115421193 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 115421211 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 115421212 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115421291 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 115421316 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 115421682 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 115421693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115421831 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 115421837 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115421908 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 115422074 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115422099 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 115422439 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 115422471 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 115424245 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 115424646 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 115425070 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 115425234 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 115425498 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 115425840 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115425973 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 3 115426227 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 115427184 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 115427244 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 115429751 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115429880 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115429908 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 115429994 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115430565 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 115431691 T A N N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 6 12 2 2 5 3 115432413 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 115433346 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 115433835 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 115434163 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 115434580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115435378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115435383 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 115435828 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 115436811 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 115437367 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 115437799 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 115439369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115439513 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 115441527 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115444068 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 115444859 A G Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 115445302 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 115445331 C A Y N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 115445430 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 115445475 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 115445646 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 115446138 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 115446364 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 115446444 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 115447061 G T N N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 115447086 G A N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.333333333333333 0.0833333333333333 0.583333333333333 9 15 4 1 7 3 115447090 C G N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.307692307692308 0.0769230769230769 0.615384615384615 9 17 4 1 8 3 115447266 C T N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.416666666666667 0.0833333333333333 0.5 11 13 5 1 6 3 115447333 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 10 22 4 2 10 3 115447464 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 115447486 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115447503 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 115447514 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 115447523 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115447570 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 115447714 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 115447982 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 115448004 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 115448070 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 115448088 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115448134 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115448148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115448176 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115448179 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115448213 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115448235 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115448236 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115448341 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 115448524 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 115448581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115448624 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 115448633 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115448656 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 115448709 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115448798 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 115448815 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 115449036 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 115449064 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115449161 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 115449216 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 115449296 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 115449373 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115449394 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 115449436 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115449687 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115449705 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115449734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115449788 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115449802 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115449818 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 115449846 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115449886 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 115450073 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115450492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115450547 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 115450602 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115450670 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115450790 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115450922 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 115450932 T A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 115450937 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 115450953 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115450970 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115451033 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115451084 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115451101 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 115451214 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115451223 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 115451237 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 115451238 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 115451387 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115451464 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115451558 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115451606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115451630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115451646 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115451647 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115451687 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115451745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115451769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115451832 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115452031 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115452034 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115452157 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 115452168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115452268 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 115452270 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115452403 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115452448 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115452525 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115452540 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115452589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115452602 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 115452712 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115452824 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115452843 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 115452884 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115453032 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115453045 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 115453192 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 115453198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115453212 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115453226 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 115453429 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115453464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115453488 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115453497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115453555 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 115453617 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 115453627 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 115453815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115453825 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115454055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115454069 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 115454166 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115454230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115454281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115454302 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 115454309 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115454544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115454910 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115455081 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115455126 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 115455165 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115455194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115455302 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 115455352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115455439 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115455657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115455862 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 115455932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115456032 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 115456093 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 115456192 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 115456619 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 115457117 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 115457129 A C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 115457138 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 115457164 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115457191 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 115457260 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 115457320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115457339 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 115457359 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 115457480 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 115457699 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 115458249 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115458251 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 115458306 C A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 115458345 T A N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 3 115458346 T A N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 115458448 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 115458453 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 115458539 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 115458578 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115458648 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 115458733 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 115458780 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 115458852 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 115458887 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 115458981 C A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 3 115459284 T C N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.2 0 0.8 4 16 2 0 8 3 115459380 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 115459510 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115459609 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 115459648 G T N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.25 0.166666666666667 0.583333333333333 8 16 3 2 7 3 115459663 A C N N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.272727272727273 0.181818181818182 0.545454545454545 8 14 3 2 6 3 115459839 T A N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 3 115460036 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 115460040 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 115460142 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 115460202 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 115460219 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 115460255 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.15 0.8 0.05 22 18 3 16 1 3 115460256 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 3 115460365 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 115460415 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115460502 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 115460576 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 115460682 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 115460765 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 115460909 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115461050 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115462584 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 115462632 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 115463840 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 115464464 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 115464991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115465344 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 115466418 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 115467801 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 115467806 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 115468051 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 115468121 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 115468147 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 115468718 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115469047 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 115469935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115472770 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 115474904 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 115475239 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115475638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115476145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115476865 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115477146 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 115478388 T A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 115478406 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 115478500 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115478590 A G Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 3 115478823 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 115479200 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 115479269 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 115479295 G T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 115479325 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 115479332 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 115479361 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 115479453 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115479503 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 115479601 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 115479605 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 115479614 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 115479648 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 115479715 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 115479947 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115480013 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115480129 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 115480555 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 115480633 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 115483409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115484169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115484236 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 115484256 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115484330 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 115484355 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 115484443 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 115484491 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 115484709 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 115484781 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 115484971 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 115485003 G A N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.5 0.214285714285714 0.285714285714286 17 11 7 3 4 3 115485057 A C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 0.117647058823529 0.352941176470588 20 14 9 2 6 3 115485327 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 115485333 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 115485955 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 115486134 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 115486272 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 115486455 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 115486703 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115486706 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 115487023 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 115488681 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 115488860 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 115488878 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 115488889 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 115489079 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115492761 A G N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 115492864 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 115493683 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 115495593 T G N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 115496821 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 115497966 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 115498038 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 115498146 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 115499826 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115501429 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 115501950 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115502080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115502166 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 115502726 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115502926 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115503990 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115504251 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115504612 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115504748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115504959 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115504980 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115504997 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115505040 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115505109 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115505135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115505152 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115505175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115505250 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115505281 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115505412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115505447 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115505467 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115505705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115505751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115505781 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115505800 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115505825 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115505870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115505876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115505906 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115505966 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115506036 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115506194 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115506635 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 115506731 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115506806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115506927 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 115507145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115507438 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115507564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115507838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115507944 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115508039 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 115508948 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 115508997 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 115509283 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 115509406 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115510102 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 115510515 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115510867 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115510903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115511167 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 115511234 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115511432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115511935 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 115512044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115512315 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 115512339 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 115512370 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 115512406 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 115512437 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 115512466 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 115512503 G C N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 115512550 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 115512601 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 115512615 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 115512686 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115512746 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 115512850 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 115512941 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115512951 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 115513028 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 115513096 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 115513279 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115513307 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 115513372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115513381 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 115513386 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 115513439 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 115513444 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 115513493 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 115513593 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 115513604 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 115513784 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 115513807 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 115513874 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115513899 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 115513943 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 115513958 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 115513983 T A N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 3 115514001 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 115514013 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 115514014 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 115514109 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 115514140 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 115514302 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115514344 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115514396 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 115514559 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115514639 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115514711 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 115514712 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115514921 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115515131 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 115515146 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 115515193 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 115515266 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 115515381 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 115515451 T C Y Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.230769230769231 0.769230769230769 0 16 10 3 10 0 3 115515475 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 115515934 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115515969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115516207 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115516279 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 115516327 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 115516382 A C N N 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 115516857 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 115516932 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 115517038 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 115517072 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 115517154 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 115517303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115517487 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 115517870 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 115517871 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115517921 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 115517956 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 115517957 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 115517989 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115518488 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 115518517 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 115518908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115519331 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 115519723 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 115519799 C A Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115519846 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115520043 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115520182 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 115520234 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115520249 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 115520252 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 115520355 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 115520527 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 115520557 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 115520620 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 115520662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115520681 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 115520692 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 115521393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115521425 G C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 115521435 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 115521466 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 115521483 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 115521585 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 115521880 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115521927 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 115521952 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 115521996 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 115522053 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 115522309 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 115523091 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115524418 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115524697 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 115525752 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115525817 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115526346 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 115526425 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 115526785 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115528032 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115528176 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 115528642 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 115528718 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 115529017 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 115530189 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 115530200 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 115530226 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 115530262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115530334 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 115530353 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 115530541 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115530702 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 115530892 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115531563 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 115531927 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 115532436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115533566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115534045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115534320 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 115534349 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 115534808 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 115535128 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 115535551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115535978 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115536606 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 115536752 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 115537420 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115537573 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115538176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115538257 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 115538560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115538563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115538710 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115538923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115539070 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 115540866 G T Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 115541575 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115541633 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115541799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115542653 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115542822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115545498 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115545640 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115545712 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115546362 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 115546489 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115546726 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115546806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115546820 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 115546895 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 115546907 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 115546950 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 115546970 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 115547378 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115547413 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115547443 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 115547466 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 115547483 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 115548447 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 115548590 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 115548657 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 115548668 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 115549227 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115549306 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 115549441 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115549465 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115549493 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 115549551 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115549652 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 115549653 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 115549676 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 115549685 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 115549713 G C N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 115549951 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 115549981 A T N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 115550377 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115550434 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115550585 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 115550621 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115550623 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 115550664 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115550747 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115550797 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 115550923 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115551004 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115551012 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115551041 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115551042 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115551105 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 115551131 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115551274 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 115551397 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 115551421 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115551513 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 115551990 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 115552186 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115552452 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115552621 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115553069 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115553556 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 115553616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115553682 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 115554433 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 115554763 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115555226 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 115555323 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 115555482 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 115555612 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 115556196 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 115556211 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 115556424 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 115556779 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 115556813 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 115556887 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 115556911 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 115556918 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 115556922 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 115556932 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 115557150 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 115557176 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115557344 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 115557356 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 115557840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115558053 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 115558298 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 115558328 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 115558401 C A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 115558940 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 115559014 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 115559161 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 115559322 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115559393 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 115559606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115559990 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 115560023 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 115560090 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 115560093 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115560201 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 115560208 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 3 115560219 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 3 115560276 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 115560430 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 115560596 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 115560688 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 115560840 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115560862 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 115560881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115560943 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 115560969 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 115561020 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.210526315789474 0.0526315789473684 0.736842105263158 9 29 4 1 14 3 115561242 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 115561249 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 115562577 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115562637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115562725 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115562836 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 115563273 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 115563578 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 115563830 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115563996 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 115564212 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115564542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115564823 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 115565040 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 115565075 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 115565092 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 115565114 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115565329 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115565421 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 115565585 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 115565797 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115565826 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 115565906 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 115566078 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 115566114 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 115569606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115569811 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 115569860 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 115569869 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 115569919 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 115570048 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 115570423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115571462 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115571466 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115571978 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 115573707 T C Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 115575025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115575442 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115576872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115576927 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115579498 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115580476 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115581862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115582255 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115582535 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115582573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115582674 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115583028 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115583151 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115583192 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 115583216 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115583245 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115583276 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 10 22 0 10 6 3 115583356 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115583875 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115584214 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115584346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115584361 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115584381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115584388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115585046 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115586397 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 115586643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115586878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115586953 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115587334 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115587352 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 115587546 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 115587576 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115587749 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 115587795 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 115587860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115588007 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 115588088 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 115588091 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 115588127 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 115588165 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 115588234 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115588290 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115588481 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 115588499 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 115588519 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 115588688 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 115588760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115588980 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 115589281 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115589439 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115590511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115590937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115592382 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115592452 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 115592483 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115592718 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115595188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115595208 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115595314 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115595995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115604501 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 115607896 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115608021 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 115608347 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115608919 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115609097 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 115618496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115627630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115629216 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 115629223 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 115629403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115630058 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115632650 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 115632905 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115633330 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 115634295 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115634539 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115635386 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115637807 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 115639062 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 115639500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115640405 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115640980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115641327 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115642193 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115642330 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115642564 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115642675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115643303 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 115643428 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 115645367 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 115645756 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115645893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115646175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115646254 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 115646440 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 115646670 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 115646737 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 115646746 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 115646860 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 115646891 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.25 0.166666666666667 0.583333333333333 8 16 3 2 7 3 115647131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115647183 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115647187 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115647194 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115647333 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115647444 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 115647548 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115647570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115647631 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 115647654 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115647658 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115647786 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 115647790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115647916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115647926 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115647942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115647953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115647955 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 115648102 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 115648113 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115648187 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115648310 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115648340 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115648383 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115648441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115648565 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115648624 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 115648753 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115648786 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115648791 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115649861 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 115653732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115654996 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 115656052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115657423 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 115658654 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 115659487 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 115660118 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 115660156 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 115662144 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115662225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115662421 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115664349 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 115664361 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115664637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115664818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115665048 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 3 115666285 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 3 115666981 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 115667101 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 115667180 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 115667535 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 115668391 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115668411 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115669037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115669330 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115670887 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115670943 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115671074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115671639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115671665 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 115672408 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115672917 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115673352 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115673683 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 115673866 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 3 115674546 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115674933 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 115675136 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 115675151 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 115675208 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 115675280 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115675922 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 115676362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115676489 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 115676671 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 3 115677014 A T Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 115677270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115677480 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 115677836 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 115680512 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115681995 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115682128 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115682747 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115682775 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115683062 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 115683237 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 115683262 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 115683420 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115683432 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115684100 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 115684420 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115684469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115685322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115685513 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115685633 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 115685715 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 115685849 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 115685874 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 115685878 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 115685964 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115686009 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115686067 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115686272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115686829 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115687005 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115687024 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 115688035 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 115688566 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 115688612 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 115688717 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 115688750 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 115688943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115688958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115689722 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115689885 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 115689981 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 115690395 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 115690755 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 115691486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115692494 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 115692512 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 115693304 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 115693624 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.176470588235294 0.0588235294117647 0.764705882352941 7 27 3 1 13 3 115694214 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 115694342 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 115694394 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 115694481 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 115694506 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 115694594 G C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 3 115694615 T G N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 115694616 T C N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 115694714 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 115694982 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 3 115695008 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 115695052 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 115695551 C T N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 3 115696018 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 115696056 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 115696385 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 115696399 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 115696415 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 3 115696691 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 115696828 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 115696893 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 115697248 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 115697257 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 115697280 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 115697328 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115697370 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 115697402 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 115697455 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 115697474 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 115697515 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 115697746 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 115697786 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 115697845 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 115698041 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 115698085 G C Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 115698136 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 115698215 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 115698245 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115698627 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 115698883 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 115699661 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 115699854 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115699888 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 115700214 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 115700283 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 115700391 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 115700758 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 115700857 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 115701118 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 3 115701170 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 3 115702617 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 115702870 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 115703125 C A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 115703759 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 115704677 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 115704688 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115704690 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 115705044 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115705192 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 115705197 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115705583 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 115705586 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 115705984 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 115706115 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 115706387 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115706410 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 115706545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115706604 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 115706714 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 115707310 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115707389 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 115707465 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 115707722 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 115708132 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 115709481 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115710588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115712288 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115712440 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115713098 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 115713785 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 115713989 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 115714259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115715024 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115715114 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 115715752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115715831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115716078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115716149 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 115716465 G A Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 115717097 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115717422 G T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 115717454 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 115717880 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115718321 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115718345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115718363 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 115719544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115722359 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115722645 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 115722828 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 115723003 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 115723479 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 115723595 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 115723608 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 115723627 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 115723647 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 115723939 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 115724156 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 115724397 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 115724624 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115724689 A T N N 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 10 6 3 4 1 3 115724794 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 115724841 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 115725002 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 115726570 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 115728947 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 115729949 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115731870 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 115731886 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 115731931 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 115731978 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 115731991 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 115732397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115732489 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 115732578 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 115732714 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 115732749 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 115732802 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 115732823 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115733255 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 3 115733416 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 115733434 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 115733513 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115733563 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 115733670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115734186 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115734293 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115734687 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 115735008 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 115735133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115735156 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115735404 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115735466 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 115735695 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115735697 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 115735710 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 115735772 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 115735864 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 115736020 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 115736046 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 115736137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115736175 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 115736573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115736721 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115736732 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115736762 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 115737126 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 115737167 T G N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 115737191 A C N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 115739362 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115739367 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115739562 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 115739642 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 115739721 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 115739785 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115739874 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115739913 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115739931 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115739960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115740159 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115740895 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 115740985 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 115741001 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115741168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115741285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115741308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115741356 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 115741370 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 115741383 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115741445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115741533 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 115741538 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 115741582 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 115741837 A T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 115742015 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115742304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115742337 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 115742489 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 115742560 A C N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 115742676 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 115742688 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 115742732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115742803 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115742859 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 115742893 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 115742899 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 115742921 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115742953 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115743103 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 115743121 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 115743129 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 115743157 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 115743158 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 115743180 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115743337 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115743338 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 115743534 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115743633 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 115743641 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 115743649 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 115743934 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115743974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115744113 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115744281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115744493 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 115744546 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 115744548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115744576 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 115744675 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 115744690 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 115744777 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 115744819 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 115745068 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 115745272 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115745274 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 115745438 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 115745470 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 115745532 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 115745611 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115745766 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 115745794 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115745948 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 115746037 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 115746087 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 115746089 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 115746133 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 115746291 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 115746292 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 115746304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115746422 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 115746446 T G N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 3 115746467 A T N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 3 115746503 T A N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 115746514 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 115746564 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115746571 C G N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 115746697 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 115746710 T A Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 115746808 T A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 115746809 A G Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 115746875 G C N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 115746885 G A Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 115746895 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 115746930 G T Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 115746934 G A Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 115746944 T A N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 115746948 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 115747081 C T Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 115747220 A T Y N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 3 115747229 C T Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 3 115747422 T C Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 3 115747525 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 3 115747705 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 115747724 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 115747768 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115747777 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 115747803 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 115747816 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 115747821 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 115747920 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 115747970 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 115747974 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 115748039 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 115748210 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 115748243 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115748248 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 115748466 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 115749121 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115749381 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 115749431 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 115749769 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 115749863 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115749926 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115750238 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115750330 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115750367 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115750394 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115750501 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115750552 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115750556 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115750909 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115750926 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 115750965 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115750994 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115751025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115751337 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115751339 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115751348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115751366 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115751396 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115751458 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115751592 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115751727 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115751862 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115752019 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115752067 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115752104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115752197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115752270 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115752273 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115752380 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115752477 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 115752498 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115753063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115753084 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115753140 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115753347 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 115753355 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115753574 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115753864 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 115754160 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 115754185 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 115754308 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115754333 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115754542 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 115754659 G A Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 115754790 C T N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 9 11 3 3 4 3 115754964 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 115755037 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 115755055 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 115755149 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115755195 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115755213 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115755242 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115755282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115755712 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 115755923 T C Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 115755962 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 115756017 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 115756058 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 115756104 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 115756124 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 115756160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115756294 T A Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 115756471 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 115756637 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115756781 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 115757423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115757849 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 115758050 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 115758374 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 3 115758908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115759250 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 115759395 C G N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 115759440 T G N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 3 115759545 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.1875 0.0625 0.75 7 25 3 1 12 3 115759847 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 115759937 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 115759959 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115759984 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 115759990 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 115760033 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 115760044 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 115760103 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 115760112 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 115760132 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 115760142 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 115760172 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 115760192 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 115760229 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 115760273 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115760322 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 115760373 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 115760433 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 115760495 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 115760541 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 115760552 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 115760562 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 115761200 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 115761209 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 115761263 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 115762746 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 115762949 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 115762963 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 115763123 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 115763154 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115763481 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 115763557 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115763558 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115763668 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 115763834 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 115763972 C T N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 115763977 T C N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 3 115764008 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 115764009 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 115764066 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 115764067 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 115764096 T C N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 115764141 A C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 115764276 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115764333 A C N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 115764341 G C N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 3 115764402 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 115764433 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 115764530 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 115764581 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 115764586 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 115764785 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 115764831 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 115764932 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 115764960 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115765244 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 115765315 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 115765322 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 115765356 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 115765448 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115765466 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 115765738 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 115765950 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 115766166 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 115766251 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115766296 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115766303 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115766651 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 115766684 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 115766725 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115766736 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115766851 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 115766918 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115766999 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115767206 C T N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 115767226 G A N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 115767251 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 115767380 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 115767390 T G Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 115767401 G T Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 115767456 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115767522 G A Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 115767530 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 115767562 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115767577 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 115767648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115767688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115767719 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 115767748 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 115767775 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 115767891 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 115768386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115768441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115768568 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 115768653 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115769028 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115769060 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 115769230 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 115769258 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 115769343 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 115769590 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 115769896 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115769934 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115769964 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115770060 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 115770102 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 115770189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115770249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115771457 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 115771458 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 115771746 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 115772269 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 115773024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115773099 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115773291 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 115773678 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 115773716 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 115773818 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 115773868 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 115773889 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 115773920 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 115774073 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 115774300 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 115774357 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 115774424 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 115774449 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 115774478 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 115774486 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 115774555 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 115774650 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 115774886 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 115775037 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 115775202 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 115775458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115775529 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 115775567 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 115775752 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 115775897 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 115775907 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 115775978 C G Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 115776043 C T Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 115776152 G T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 115776204 G A Y Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 115776459 T C Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 115776514 T C Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 115776547 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 115776657 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 115776731 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 115776831 A T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 115776911 C A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 115776949 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115777039 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 115777048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115777181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115777220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115777234 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 115777257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115777267 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115777465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115778167 G T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 115778251 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 115778269 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115778587 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115778677 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 115778680 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 115779508 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 115780244 C A N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 115780453 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 115780832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115780847 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115781189 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115781416 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115781425 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115782860 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 115783411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115784389 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115786907 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 115787128 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115792986 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115793315 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 115799962 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115802159 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115802250 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115803083 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115805787 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 115807363 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115808050 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115808262 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 115808396 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 115808453 C G N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 3 115808472 C T N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 6 10 1 4 3 3 115808908 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 115808952 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115809206 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115809222 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 115809482 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 115810283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115811636 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 115812086 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 115812400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115812408 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115812435 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 115812569 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 115812795 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115812903 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115812912 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 115812965 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 115813050 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115813257 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115813339 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 115813414 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 115814144 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115814371 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115814410 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115814424 T A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 115815105 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 115815149 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115815630 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115815640 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115815673 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 115815752 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115816027 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115816083 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 115816259 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 115816668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115816861 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 115817756 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 115817842 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 115817865 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115818161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115819182 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115819209 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115820539 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115820552 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115823152 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 115823219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115824053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115824054 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115824225 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115824623 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115829707 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 115829708 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 115830160 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 115831683 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 115832146 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 115834316 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115835997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115836541 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 115837588 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 115838267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115838329 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115839263 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 115839728 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 115839743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115841313 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115843133 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 115843439 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115843613 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115843714 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115843795 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115843801 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115843819 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115843862 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 115844076 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115844226 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 115844335 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115844432 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115844462 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 115844628 C T N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 3 115844728 C A N N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 115844977 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 115845021 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 115845263 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115845524 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 115845704 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 115845827 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 115845833 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 115845868 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 115846337 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 115846664 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 115846719 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 115846760 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 115846781 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 115846787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115846842 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 115846950 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 115846951 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 115847046 G T Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 115847162 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 115847173 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 115847225 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 115847286 C G Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 115847363 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 115847457 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115847490 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 115847656 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 115847743 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 115847887 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 115847962 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 115848069 C A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 115848080 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 115848087 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 115848115 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 115848156 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 115848241 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 115848369 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 115848392 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 115848445 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 115848471 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 115848805 G C Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 115848922 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 115849033 T A Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 115849106 T G Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 115849129 T C Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 115849151 T C Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 115849198 G A Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 115849257 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 115849331 C A Y N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 115849733 A G Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 115849782 A G Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 115849909 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 115850003 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 115850014 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 115850033 G A N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 115850419 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 115850439 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115851048 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 115851539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115851652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115852055 C A N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 115852249 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 115852694 T C Y Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 3 115853175 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115853562 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 115854128 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115854211 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 115854240 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 115854401 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115854537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115854646 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 115854681 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115855156 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 115855305 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 115855347 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 115855604 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 115855662 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 115855777 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 115855823 C G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 115856134 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 115856174 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 115856248 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 115856448 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 115856524 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115856555 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 115856643 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 115856789 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 115856892 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115856936 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 115856983 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 115856991 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 115856998 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 115857104 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 115857244 T G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 115857471 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 115857485 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 115857525 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 115857545 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115857551 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 115857565 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 115857606 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 115857630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115857640 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 115857682 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115857712 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 115857857 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115857887 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115857998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115858123 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 115858201 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115858327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115858394 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 115858567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115858651 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115858681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115858840 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 115858870 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115859055 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 115859153 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 115859195 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 115859231 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 115859232 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 115859294 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115859323 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 115860551 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115860694 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115861021 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 115861130 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 115861165 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 115861166 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 115861283 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 115861336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115861580 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115861609 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115861649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115861784 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115863446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115863736 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115863965 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115864474 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 115864479 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 115865323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115865524 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115865562 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115865683 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115866598 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115867187 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 115867352 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 115867698 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115868663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115869598 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115869692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115870278 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115870526 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 115870677 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 115871127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115871671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115871786 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115872027 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 115872293 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 115873113 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 115873682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115873729 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 115873768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115873821 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115874532 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115875523 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 115875575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115875598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115875704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115875880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115876226 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115876256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115877221 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 115877315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115877363 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 115877372 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 115877414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115877765 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 115877771 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 115881253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115882529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115883490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115883562 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115883612 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 115883802 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 115884268 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 115884747 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 115884906 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 115887001 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115887524 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 115887601 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 115888067 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115888621 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 115888650 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 115888680 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 115888816 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115888838 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115888988 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 115890701 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115891174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115892939 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 115893154 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115893404 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 115893484 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 115893501 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 115893573 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 115893655 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 115893739 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 115893989 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 115894069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115894335 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 115894507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115895174 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115895175 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115895193 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 115895324 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115895353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115895531 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115895679 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115895702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115895796 G C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 115896144 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115896186 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115896223 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115896249 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 115896587 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115896728 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 115896772 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115896802 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115897060 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 115897074 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 115897165 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115897243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115897342 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 115897343 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 115897456 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 115898732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115901173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115901191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115901413 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 115901716 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 115902093 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 115902245 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 115902339 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 115902486 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 115902533 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115902569 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 115902625 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 115902641 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 115902691 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 115902798 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 115903014 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115903108 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 115903173 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 115903179 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115903317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115903516 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 115903570 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 115903782 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 115903862 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115903869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115904088 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 115904123 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 115904205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115904228 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 115904274 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 115904521 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 115904899 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 115904912 A T Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 115905022 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 115905339 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 115905357 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 115905396 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 115905573 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 115905576 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 115905596 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 115905625 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 115905633 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 115905718 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 115905838 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 115906158 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 115906246 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 115906257 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 115906329 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 115906376 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 115906384 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 115906399 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 115906506 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 115906728 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 115906759 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 115906770 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 115906801 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 115906814 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 115906879 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 115906975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115907046 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 115907058 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115907059 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115907573 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 115907677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115907921 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 115907977 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 115908282 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 115908340 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 115908476 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115908887 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 115908982 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 115908990 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 115909001 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 115909102 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 115911003 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 115911037 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 115911071 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115911546 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115912106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115912768 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 115912798 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 115913016 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115913288 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 115913445 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 115913586 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 115913838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115913906 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 115914027 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 115914162 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 115915621 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115916178 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 115916204 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115916289 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 115916293 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115916387 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115916459 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 115916498 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115916522 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 115916559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115916600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115916699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115916709 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115916882 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 115917055 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115917206 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 115917599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115917676 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 115917710 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 115917729 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 115917775 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 115917845 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115917949 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115917970 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 115918081 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 115918191 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115918241 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 115918363 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 115918469 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 115918485 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 3 115918490 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0 0.7 0.3 14 26 0 14 6 3 115918591 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115918645 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 115918970 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 115919291 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 115919513 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115919832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115919880 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 115919920 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 115919933 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 115919935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115920800 A T Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 115920885 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 115923601 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 115923615 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 115923688 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 115924361 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115924428 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115924482 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115925820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115926071 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 115928279 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115930287 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115930447 A C Y N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 115932093 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 3 115932180 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 115932284 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115932288 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 115932319 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 115932478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115932825 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115932900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115932930 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 115932933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115933035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115933049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115933334 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115933372 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115933386 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115933403 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115933421 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115933443 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115933444 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115933846 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115934290 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 115934344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115934453 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 115934507 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 115934639 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 115934675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115934876 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115935043 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 115936060 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 115936168 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115936583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115938772 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 115940198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115941411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115943482 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115945087 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 115945625 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115945663 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115945803 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 115945923 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 115945977 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 115946031 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 115946335 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115947138 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115947139 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115947192 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115947198 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115947229 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115947258 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115947321 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115947746 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115947911 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 115948907 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 115949220 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 115949277 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 115949278 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 115949291 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 115949306 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 115949540 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 115949600 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 115949626 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 115949775 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 115949826 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 115949869 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 3 115949888 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 115949911 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 115950302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115950335 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 115950411 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115950442 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115950749 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 115950803 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 115950961 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 115951233 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 115952117 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 115952878 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115953341 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 115955036 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115956283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115956776 T C N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 115957104 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 115957142 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 115957244 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 115957333 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 115957592 A G Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 115957778 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 115957855 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115957890 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 115957904 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115957931 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 115958135 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115958234 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 115958243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115958452 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 115958459 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115958473 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 115958488 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 115958548 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115958714 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 115958894 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 115958996 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 115959075 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 115959078 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 115959185 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 115959243 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 115959377 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 115959540 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115959615 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 115959623 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 115959777 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 115959944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115960004 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 115960103 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115960198 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 115960412 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115960427 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115960513 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 115960649 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 115960702 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 115960703 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 115960714 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 115961098 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 115961128 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 115961129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115961185 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 115961191 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 115961206 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 115961290 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 115961297 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 115961321 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 115961435 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 115961487 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 115961639 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 115962024 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115962030 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115962185 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 3 115962258 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 115962437 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115962484 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 115962505 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 115962558 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115962622 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115962703 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 115963045 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 115963072 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 115963144 T G N N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 115963542 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 115963727 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 115963976 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115963980 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 115964029 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115964070 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 115964162 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 115964200 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115964222 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 115964223 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 115964260 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 115964375 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 115964402 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 115964407 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 115964460 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115964482 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 115964492 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115964544 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 115964579 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115964587 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 115964648 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115964691 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 115964701 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115964751 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 115964755 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 115964785 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115964814 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115964832 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115965031 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 115965107 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 115965410 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 115965464 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 115965474 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115965513 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 115965670 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 115965748 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 115965788 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 115965811 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 115965899 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 115966002 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 115966038 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 115966423 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115966522 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 115966588 T A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 115966837 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 115966848 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 115966864 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 115966884 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 115967394 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115967726 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115967991 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115968225 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115968236 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115968314 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115968458 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 115968556 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115968822 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 115969168 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 115969170 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 115969191 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 115970996 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 115971066 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115971313 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115971439 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 115971503 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115971504 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 115971610 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 115971774 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 115971789 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 115971890 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 115971967 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 115972049 A C N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 3 115972145 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 115972271 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 115972332 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 115972347 G A N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 115972582 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 115972743 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115972774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115972804 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 115972870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115973073 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 115973446 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 115973497 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 115973556 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 115973557 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 115973584 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 115974212 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115974434 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 115974602 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 115974815 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115975107 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115975131 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115975187 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 115975210 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 115975641 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115975824 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115975865 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 115975905 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 115975923 C T Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 115976491 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 115976603 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 115976682 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 115977177 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 115977889 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115978167 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 115978173 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 115978331 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 115978505 C T N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.454545454545455 0.181818181818182 0.363636363636364 12 10 5 2 4 3 115978527 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 115978553 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 115978840 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 115978846 A T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 115978965 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 115979132 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 115979217 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 115979374 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115979480 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115979496 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 115979555 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115979561 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 115979857 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 115979980 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 115980011 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 115980123 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115980455 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 115980525 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 115980581 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 115980592 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115980754 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 115981205 C A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 115981350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115981517 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 115981824 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115984871 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115985986 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 115986302 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 115987420 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 115987658 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 115987668 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 115988193 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 115988307 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 115988477 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 115988566 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 115988830 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 115989295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115989410 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 115989700 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 115989864 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 115990705 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 115991653 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 115992209 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 115994336 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 115995811 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 115995938 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 115995943 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 115996122 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 115996263 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 115996285 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115996390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115997277 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115997583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115997757 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 115998085 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 115998982 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 115999047 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 115999101 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 115999341 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 115999547 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 115999635 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 115999711 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 115999969 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116000029 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 116000215 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 116000237 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 116000361 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 116000383 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 116000431 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 116000701 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 116000930 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 116001648 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116001745 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116001838 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 116001925 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 116002063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116002193 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116002213 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 116003051 T C N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 3 116003056 G C N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 116003293 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 116003319 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 116003424 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 116003454 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 116003474 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 116003561 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 116003577 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 116003609 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 116003664 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 116003775 C G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 116003814 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 116003870 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 116003892 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116003999 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 116004034 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116004240 A T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 116005674 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 116005829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116006153 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 116006167 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 116006369 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 116006399 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 116006411 T C N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.307692307692308 0.538461538461538 0.153846153846154 15 11 4 7 2 3 116006445 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 116006467 A T N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 116006499 G T N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 116006649 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 116006650 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 116006715 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 116006722 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 116006738 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 116006761 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 116006828 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 116006843 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 116007014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116007037 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 116007038 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 116007074 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 116007162 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 116007443 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 116007461 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 116007517 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116007811 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 116008050 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 116008059 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 116008277 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 116008427 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 116008841 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 116008877 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 116009033 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 116009220 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 116009412 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 116009413 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 116009678 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 116009717 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 116009729 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116009924 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 116010843 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 116011318 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 116011685 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 116011707 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 116011726 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 116011792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116012203 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 116012328 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 116012717 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 116012810 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 116012819 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 116012871 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 116014923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116014997 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116015321 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 116015372 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116015929 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 116015960 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 116015974 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 116016136 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116016278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116016354 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 116016428 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 116016481 C A Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 116016493 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 116016723 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116018220 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 116018485 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116018981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116019018 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116019075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116019847 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 116020050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116020280 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 116020465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116020670 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 116021097 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 116021167 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 116021194 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 116021418 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116021946 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116021986 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 116022010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116022077 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 116022692 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 116022844 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 116023149 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 116023336 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116023550 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116023625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116023711 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 116025858 G A N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 3 116026160 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 116026161 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 116026230 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 116026299 A T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 116026466 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 116026506 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 116026902 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116026921 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116027265 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 116027450 A T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 116028152 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 116028732 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 116028789 A C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 116028812 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 116028824 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 116028959 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 116029126 G T N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 116029184 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.133333333333333 26 4 13 0 2 3 116029422 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116029924 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 116029955 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 116030054 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 116030435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116030534 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 116030683 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 116030839 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 116031029 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 116031073 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116031146 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 116031351 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 116031373 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116031861 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 116031869 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 116031952 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 116032270 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116032279 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 116033032 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116037692 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 116040656 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116040733 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116040976 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 116041032 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116041285 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 116041391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116043037 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 116043064 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 116043152 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116043568 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 116043591 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 116043799 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 116043962 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 116044053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116044266 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116044349 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116044787 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116044849 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116045134 G C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 3 116045526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116045566 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 116046261 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 116046533 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 116046587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116046758 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116046816 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 116046825 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 116046864 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 116046871 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 116047190 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116047269 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 116047280 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116047294 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116047322 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 116047717 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 116048048 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116048068 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 116048181 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116048726 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 116048952 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116049344 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 116049751 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116049801 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116049831 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116049887 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 116049965 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116050081 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116050163 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116050177 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 116050377 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 116050428 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 116050523 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 116050619 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116050622 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116050737 T G Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 116050792 G A Y Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 10 6 3 4 1 3 116050825 G A Y Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 9 5 3 3 1 3 116050891 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 116050904 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 116050994 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116051131 A T N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 116051327 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 116052128 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 116052214 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116052270 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 116052369 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 116052537 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 116052666 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 116053786 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116054332 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116054809 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 116055019 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 116055150 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 116055204 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 116056079 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116056618 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 116056649 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116058444 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 116058605 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 116058656 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 116058935 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 116058980 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 116059126 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116059146 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 116059170 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 116059552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116059634 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 116060277 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 116060961 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 116061007 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 116061053 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 116061131 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 116061134 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 116061249 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 116061281 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 116061317 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 116061442 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 116061453 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 116061601 A C Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 116061608 A G Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 116062128 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116062131 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116062152 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 116062246 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116062364 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116062509 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 116062520 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116062567 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 116062571 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 116062654 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 116062719 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 116062811 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 116062996 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 116063370 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 116063517 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 116063758 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 116063793 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 116063880 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 116065052 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116065053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116065596 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 116065761 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 3 116065774 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 116067103 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 116067678 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116067936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116069140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116069947 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116070335 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116070399 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116071854 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 116072258 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116072330 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 116072466 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116072610 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 116072728 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 116073033 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 116073122 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 116073201 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 116073611 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116074499 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 116074821 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116075034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116075749 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 116077130 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 116077279 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116077441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116077541 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116077697 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 116078404 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 116078908 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 116079002 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 116079013 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 116079019 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 116079139 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 116079212 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 116079312 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 116079521 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 116079606 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 116079821 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 116079995 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 116080072 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 116080363 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 116080518 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 116081218 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 116081275 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 116081567 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 116081675 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 116081798 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116081833 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116081894 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116082090 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 116083231 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 116084056 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116084459 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116084716 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 116085847 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116087016 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 116087450 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 116087484 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116087572 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116088108 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116089147 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116090415 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116090419 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116090656 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 116090921 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116093591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116094464 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 116097188 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 116097207 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116098495 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 116100715 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 116100729 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 116100819 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 116101097 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116101117 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116101398 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116101415 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116102612 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116102750 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116103390 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 116103440 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 116103535 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116103628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116103635 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116103789 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 116104044 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 116104085 T A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 116104843 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 116105594 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 116105939 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 116106202 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 116106412 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 116106719 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 116106776 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 116106800 T G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 116106816 G C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 116106828 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 116106990 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 116107083 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 116107402 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 116107771 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 116108244 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116108250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116108618 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 116108648 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116108853 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 116108951 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 116109136 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 116109151 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116109156 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116109169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116109351 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 116109361 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 116109707 T G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 116109740 T G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 116109802 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 3 116110829 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116110841 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116110991 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 116111022 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116111096 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116111136 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116111177 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 116111212 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116111222 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 116111275 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116111290 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116111293 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 116111466 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 116111776 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 116111943 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 116111960 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 116113216 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 116114538 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 116115018 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 116115139 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116115156 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 116116529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116117547 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 116118233 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116119672 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116119673 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116119810 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116120028 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 116120489 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 116121489 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 116121854 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 116122321 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116123936 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 116124128 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116124435 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 116124681 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116124701 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 116124747 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 116125031 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 116125054 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116125100 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116125790 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116126111 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 116127166 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 116127741 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116128703 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 116129101 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116129422 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116129423 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116130029 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116130396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116130561 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116130596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116133158 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 116133175 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116133202 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116134541 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116134688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116135260 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116135394 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 116137654 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116138525 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116138834 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 116138839 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116139069 G T N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 3 116139238 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116139681 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116139866 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116139943 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116140251 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 116140259 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116140377 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116140840 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 116140937 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116141056 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116141092 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116141103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116141127 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116142039 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 116142049 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 116142220 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 116142796 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116142822 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116142904 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116143007 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 116143128 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116143171 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 116143214 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 116143651 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116143702 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116143925 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116144087 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116144678 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116145466 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 116145539 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 116145588 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 116145705 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116145728 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116145822 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 116146084 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116146105 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 116146130 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116146540 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 116146681 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 116146701 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 116146717 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 116146985 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116147147 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 116147166 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116147247 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116147805 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116148187 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 116148510 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 116148559 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 116148629 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 116148641 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 116149357 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116149573 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 116149842 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 116150448 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 116150509 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 116150814 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 116150853 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 116151130 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 116151189 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 116151251 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 116151253 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116151344 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 116151360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116151395 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 116151450 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 116151481 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 116151716 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 116151733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116151734 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116152059 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 116152245 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 116152253 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116153336 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 116153721 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 116153790 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 116153809 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 116153811 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116153822 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116153992 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 116153999 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 116154054 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116154240 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 116154268 T G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 116154479 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 116154492 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 116154511 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 116154586 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116154603 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 116154604 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116154632 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 116154661 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116154682 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116154694 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 116154781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116154799 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116154844 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 116154899 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 116154905 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 116154957 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 116154989 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116155468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116155469 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116155487 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116155788 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116155855 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116155961 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116156787 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 116156969 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116157217 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116157241 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 116157574 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 116158015 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116158049 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116158051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116158149 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116158302 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 116158360 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 116158498 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116158810 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 116158934 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116159225 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116159655 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 116159824 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116159852 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 116160047 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116160061 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116160115 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116160479 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 116160510 C A Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 116160835 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 116160836 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 116160970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116161074 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116161269 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116161426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116161498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116161509 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116161579 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116161904 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 116161953 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116161985 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 116162002 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 116162038 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116162149 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 116162342 A T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 116162401 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 116162403 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 116162478 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 116162523 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116162560 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116162623 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116162625 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116162712 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 116162757 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 116162814 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116162871 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 116163026 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 116163345 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116163391 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116163528 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 116163733 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 116163912 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 116163946 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 116164160 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116164255 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 116164377 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116164490 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116164560 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 116164562 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116164611 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116164707 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 116164809 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 116164910 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116164930 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 116164957 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 116164976 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 116165002 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 116165130 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 116165133 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 116165196 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 116165317 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 116165497 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 116165498 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 116165560 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116165590 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 116165616 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116165628 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 116165683 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 116165684 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 116165723 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 116165726 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 116165807 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116166044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116166046 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116166077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116166216 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116166218 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116166240 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116166445 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116166456 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 116166463 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116166627 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 116166635 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116167070 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 116167078 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 116167217 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116167296 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 116167837 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 116167890 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 116167893 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116167937 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 116168303 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116168665 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 116168680 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116168962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116169622 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 116169860 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 116169889 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 116169901 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 116170102 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 116171505 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116172418 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116172896 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116173926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116174719 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 116174742 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116174862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116174944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116174980 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116176467 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116176520 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 116176561 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116176967 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 116177485 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116177486 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 116177504 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116177552 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116177835 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116178766 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 116178828 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 116178867 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 116178883 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 116179360 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116179385 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 116179388 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 116179700 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 116179733 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 116180246 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 116180247 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 116180771 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116181134 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116181210 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 116181267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116181285 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116181640 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116182220 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116182702 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 116182711 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 116182802 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116182881 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116182900 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116183381 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116183606 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116183621 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116183626 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116183784 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 116183842 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 116183852 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116183913 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 116184536 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 116184538 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 116184588 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 116184592 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 116184871 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 116185372 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116185461 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116185548 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 116185565 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116185705 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 116186192 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116186242 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116186265 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 116186267 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 116186358 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116186406 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116186645 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 116186666 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 116186752 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 116186914 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 116186958 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 116187053 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116187248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116187279 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 116187463 G T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 116188034 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116188035 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116188610 C A N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 116188641 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 116188678 C T N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 3 116188679 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 3 116188834 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 116188835 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 116188864 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116188869 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 116189006 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 116189046 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 116189129 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 116189189 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 116189213 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116189243 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116189467 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116189584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116189685 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116189697 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116189727 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116189794 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116189801 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116189829 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116189841 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 116189889 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 116189910 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 116189951 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 116189986 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 116190024 T C Y Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 3 116190037 C T Y Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 3 116190053 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 3 116190102 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 116190110 G C N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 116190140 C T Y Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 3 116190189 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 3 116190250 C G Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 116190292 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 3 116190382 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 116190397 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 116190487 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116190517 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 116190525 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 116190553 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 116190627 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 116190725 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 116190732 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116190855 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 116190926 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 116190939 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116191050 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116191051 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116191080 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 116191139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116191140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116191565 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116191602 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116191727 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116191830 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116192434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116192519 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116192558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116192742 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116192787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116192807 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116192815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116192919 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116192935 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116192936 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 116192981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116193045 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116193217 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116193241 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116193368 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 116193567 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116193568 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116193613 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116193734 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 116194047 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 116194239 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116194434 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 116194449 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 116194479 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116194520 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116194547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116194587 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 116194829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116194990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116195009 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 116195057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116195153 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116195359 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 116195387 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116195716 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116195728 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116196023 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 116196055 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 116196259 T G N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 3 116196346 A G Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 116196454 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 116196499 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 116196535 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 116196543 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 116196684 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 116196760 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 116196796 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 116196974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116197253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116197293 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116197307 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116197372 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116197504 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116197511 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116197516 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116197535 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 116197604 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116197617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116197621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116197781 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116197901 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 116197942 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116197955 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116198002 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 116198028 A C N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 116198031 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 116198325 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 116198354 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 116198364 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 116198377 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 116198454 G C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 116198463 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 116198541 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116198659 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 116198881 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 116198905 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116198907 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 116198920 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 116198925 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 116199063 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116199069 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 116199089 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116199179 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116199232 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116199278 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116199383 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116199424 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 116199492 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 116199529 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 116199543 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 116199547 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 116199559 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 116199563 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116199600 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116199655 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116199750 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116199789 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116199828 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 116200210 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 116200226 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 116200255 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116200274 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 116200286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116200385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116200591 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116200711 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116200831 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116200882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116200886 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116200947 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116201023 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116201050 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116201091 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116201744 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116201834 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116201912 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 116201952 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 116201977 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 116201989 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 116202292 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 116202308 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 116202316 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 116202322 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 116202454 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 116202627 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116202644 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116202692 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 116203313 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116203405 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 116203541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116203548 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116203575 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116203644 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116203677 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116203956 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116203998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116204287 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 116204355 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116204397 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 116204605 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 116204618 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 116204643 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116204722 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116204794 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 116204886 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116204905 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116204964 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116205050 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116205108 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116205135 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 116205869 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 116205882 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116205895 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 116205907 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116206028 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116206211 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116206266 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 116206329 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 116206408 T G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 116206842 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 116206863 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116206902 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116206911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116207200 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 116207541 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 116207632 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116207707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116207737 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116208071 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116208132 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 116208256 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116208269 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 116208309 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116208406 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 116208438 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116208532 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116208554 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116208651 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 116208720 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116208784 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 116208885 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 116208890 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 116208932 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 116208941 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 116208946 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 116208953 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 116208980 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 116209011 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 116209012 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 116209195 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116209331 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116210247 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116210431 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 116210995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116211132 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116211153 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116211346 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116211452 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 116211846 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 116212117 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 116212680 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 116213022 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116213308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116213533 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116213853 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116215235 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116215353 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116215386 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116215425 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 116215794 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 116215810 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116215917 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 116216370 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116217154 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116217458 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116217476 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116217674 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116217687 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116218011 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116218068 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 116218233 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 116218295 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116218311 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 116218448 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 116218709 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116218749 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116218844 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 116218947 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116219076 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116219088 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 116219289 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116219317 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116219339 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116219437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116219517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116219542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116219574 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 116219598 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 116219605 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 116220161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116220180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116220277 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116220306 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 116220382 C T Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 116220589 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 116220604 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 116220666 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116220706 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116220834 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 116221013 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116221094 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 116221116 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116221356 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 116221485 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 116221487 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 116221561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116221610 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116221617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116221667 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116221752 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116221772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116221828 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116221839 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116221919 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116221996 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116222030 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 116222087 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 116222221 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116222254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116222375 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 116222413 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 116222696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116222754 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116222823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116222851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116222947 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116222955 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116223129 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116223189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116223336 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116223359 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116223391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116223414 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116223615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116223624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116223628 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116223672 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116223715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116223767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116223782 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116223786 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116223840 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 116223850 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116223864 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 116223930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116223948 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116223964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116224130 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116224222 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 116224326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116224406 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 116224435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116224457 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116224473 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116224642 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116224657 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116224722 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116224946 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116224974 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116225046 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 116225052 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 116225197 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 116225203 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 116225245 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116225287 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116225418 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 116225628 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116225637 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116225676 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116225740 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116225742 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116225793 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116225806 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116225823 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116225839 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116225842 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116225890 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116225923 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116225992 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116226001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116226116 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 116226177 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 116226178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116226366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116226606 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 116226620 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 116226646 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116226657 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116226675 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116226694 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116226722 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 116226795 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 116226824 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 116226835 C T Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 116226887 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 116226917 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 116226997 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 116227073 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 116227139 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 116227157 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 116227179 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 116227366 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116227564 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116227567 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 116227584 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116227598 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116227859 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116227886 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116227908 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 116228059 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0 0.75 0.25 12 20 0 12 4 3 116228062 T A Y N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 3 116228290 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 116228396 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116228450 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116228524 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116228539 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116228626 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116228837 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 116228858 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 116228916 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 116229173 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 116229183 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 116229358 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 116229409 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 116229869 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 116230080 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 116230145 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 116230337 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 116230409 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 116230424 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 116230445 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 116230453 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116230504 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116230552 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 116230568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116230573 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 116230598 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 116230602 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 116230629 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116230631 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 116230658 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 116230763 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 116230769 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 116230825 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 116230839 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 116230876 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 116230882 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116230921 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 116230935 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 116231025 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116231034 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116231038 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 116231054 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 116231087 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116231124 A G Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 116231360 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116231384 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116231492 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116231548 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 116231642 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 116231745 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 116232051 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 116232289 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 116232328 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116232330 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 116232356 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116232388 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116232586 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 116232601 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 116232734 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 116233058 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 116233068 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 116233098 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 116233130 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 116233135 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 116233141 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116233147 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116233997 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116234064 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 116234116 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 116234119 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 116234415 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 116234954 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116234965 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 116234990 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116235092 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 116235125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116235189 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 116235629 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 116235734 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 116235895 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116235905 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 116235925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116235929 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116235941 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116236012 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 116236018 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 116236051 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 116236063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116236091 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116236106 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 116236350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116236463 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116236475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116236744 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 116236838 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 116237357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116238910 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 116239236 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 116239301 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116239612 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 116239726 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116239906 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 116240183 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116240465 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 116240665 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116241675 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 116242269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116242348 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 116242435 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116242538 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116243067 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116243777 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116244360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116244429 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 116244450 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 116244956 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 116244962 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 116245028 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116245109 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 3 116245827 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 116247864 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116248228 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116248233 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116257307 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 116257332 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 116257967 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 116260834 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 116262010 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 116262125 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116262161 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 116262914 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116264660 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 116265068 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116265133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116265398 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 116265702 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 3 116265804 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 116266120 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116266249 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 116266384 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 116267587 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 116268105 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 116268687 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116268749 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 116268921 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 116268942 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 116268995 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116269014 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116269268 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116269398 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 116269579 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 116269942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116270578 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 116270731 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116271164 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116271184 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 116271352 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 116271398 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 116271534 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116271581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116273337 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116273989 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 116274180 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116274268 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116275424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116276132 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116276613 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116279979 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 116280609 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116282083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116282125 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 116282239 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 116282328 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 116282477 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 116282585 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 116282655 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 116282715 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116282819 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 116282872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116282947 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116283037 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 116283506 C G Y N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 116283700 G C N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 116284486 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 116284639 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116284754 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 116284783 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 116284807 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 116284826 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 116284832 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 116284928 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 116285085 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 116285750 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116285765 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116285810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116285839 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116286197 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 116286298 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116286368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116286554 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 116287191 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 116287392 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116287472 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116287483 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 116287565 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 116287626 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 116287638 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116287908 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 116287911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116288078 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 116288118 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 116288148 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116288278 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 116288476 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 116288954 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 116288973 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 116288975 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 116289066 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 116289267 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116289402 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 116289543 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116290048 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116290092 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 116290568 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116290779 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116290796 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116291103 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116291298 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116291324 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 116291543 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 116291567 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116291646 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 116291647 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 116292018 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 116292130 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 116292245 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116292393 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 116292582 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 116293025 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 116293136 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 116293425 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 116293497 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 116293670 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116293701 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116293849 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116294058 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116294074 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 116294647 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116294648 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 116294728 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 116294799 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116295224 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 116295336 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 116295657 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116295885 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 116295921 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116296213 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116296284 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 116296412 T A N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 116296435 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 116296496 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 116296529 G C N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 116296533 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 116296643 C T Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 116296723 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 116296739 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 116296846 T A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 116296875 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 116297069 T C N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 116297111 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 116297129 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 116297269 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 116297322 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 116297340 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 116297421 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 116297472 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 116297500 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116297634 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116297676 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116297750 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 116297996 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 116298303 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116298334 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116298486 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116300478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116301747 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 116302088 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 116302100 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116303480 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116304082 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116304180 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116304473 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116304851 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 116304977 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 116305316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116305456 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116305963 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 116306072 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116307677 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 116307869 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 116308452 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116309195 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 116309803 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116309817 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116311376 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116311939 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 116312251 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 116312254 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 116312271 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 116312361 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116312902 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116313874 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 116314308 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116314816 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116317204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116317236 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116317538 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116317566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116320346 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 116320975 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116321157 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 116321397 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116321434 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 116321653 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 116321799 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116321806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116321991 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 116322101 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 116322630 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 116323369 A T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 116323714 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116324039 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 116324133 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 116324683 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 116326245 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 116326875 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116326928 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116328382 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116328464 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116328801 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116328912 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116329400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116329516 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 116329531 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 116329585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116331505 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 116331514 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 116332299 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116332417 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 116333065 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 116333212 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116333602 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116333872 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116334866 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116335452 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 116335700 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 116335839 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 116335845 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 116336219 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 116336280 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 116336342 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 116336395 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 116336582 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 116336812 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116337347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116337499 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116338393 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116338850 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116339126 A T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 116339516 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116340027 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116340722 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 116340803 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116341406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116341416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116341526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116344646 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 116345446 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 116345564 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116347109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116347915 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116348189 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116348684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116348992 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116349298 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116349390 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116349738 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116350609 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116350647 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116350917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116351400 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 116351575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116351603 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116353161 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116354874 A T Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 116354943 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116355291 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116355292 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116355303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116355909 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 116356521 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116356850 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 116356994 C A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 116357704 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116361756 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 116362997 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116363634 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 116363686 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 116363899 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116365284 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 116366736 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116368280 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 116369779 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 116369849 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116370128 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116370374 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 116370866 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116371053 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116371731 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116372113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116372274 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116373574 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 116373867 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116374501 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116374547 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116374848 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 116375005 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 116375471 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 116376047 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116376897 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116377145 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116377281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116379728 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 116380089 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116381103 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116382126 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116383188 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 116383827 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116384690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116385423 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 116385496 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 116385513 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 116386208 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 116386275 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116386999 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116388617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116389325 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 116389420 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116391870 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 116392292 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116392701 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 116396254 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116397195 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116397293 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116399755 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 116401322 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 116402033 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116402283 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 116402542 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116403190 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 116403653 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 116404018 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116404428 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 116404621 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 116404851 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 116404856 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116405576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116406401 A G Y Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 3 116407382 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 116407436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116408504 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116409488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116413057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116413457 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 116414126 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116414514 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116415802 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116415841 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116415914 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 116416140 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 116416191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116416212 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116416327 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 116416524 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 116416552 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 116416621 C T Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 116416740 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116416784 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 116416967 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 116417178 A C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 116417219 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 116417567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116417734 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116419546 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116420218 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116420990 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116421457 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116423006 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 116423196 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 2 4 1 0 2 3 116423224 T C N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 116425375 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116426742 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116427023 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 116427554 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 3 116427573 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 3 116427591 G A N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 3 116427612 A G N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 116427936 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 116427960 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 116428040 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116428197 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 116428663 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 116428977 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 116429100 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 116429416 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 116429652 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116430035 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116430092 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116430117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116430187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116430462 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116430467 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116430663 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116430799 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116431061 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116431187 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116431272 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 116431311 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116431771 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 116432010 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.0588235294117647 0.764705882352941 0.176470588235294 15 19 1 13 3 3 116432215 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116432500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116432721 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 116432722 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 116432941 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116433214 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 116435093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116435644 C T N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 3 116435930 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 116436912 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116437299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116437852 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 116438444 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 116439670 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116440797 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116441236 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116441412 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 116441783 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 116441884 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116441930 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116442403 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116442417 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 116442495 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 116443148 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 116443150 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 116443475 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 116443536 T G N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 116443849 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 116444282 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 116444332 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 116444353 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 116444400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116444490 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 116444662 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 116444711 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 116444776 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 116444838 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 116444845 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 116444923 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 116445072 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 116445117 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 116445188 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116445220 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116445419 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116445632 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 116445793 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 116445858 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 116445862 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 116446076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116446340 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 116449369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116449752 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116451279 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116453761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116456577 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116456679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116456822 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 116456997 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 116457342 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 116457548 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 116458018 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 116458257 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116458431 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 116458712 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 116459361 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116459611 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116459839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116460296 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116460854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116461002 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116461394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116461765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116462476 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 116469110 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116471945 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116472825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116472863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116473200 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116474678 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 116474978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116477260 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116477423 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 116477527 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116477543 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116477570 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116478137 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 116478845 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116480086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116480142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116481812 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116481845 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116482760 T G N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.214285714285714 0.714285714285714 0.0714285714285714 16 12 3 10 1 3 116483110 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 116483439 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116483878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116483915 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116483997 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116486877 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116487076 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116487178 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 116487595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116487666 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116487670 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116487705 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 116487728 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 116487897 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116488253 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116488513 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116488785 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116488888 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116488918 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116488991 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116489033 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116489068 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116489212 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116489221 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116489298 G T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 116489299 A T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 116489379 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 116489459 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116489614 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 116489942 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116489958 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116490086 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116490467 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 116490938 C T N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 3 116491012 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 116491183 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116491388 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116491495 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116491971 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 116492004 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 116492005 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 116492090 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 116492202 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 116492230 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 116492434 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 116492554 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 116492596 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 116492603 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 116492629 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116492654 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116492815 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 116492854 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 116492874 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 116492971 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 116493038 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116493054 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116493102 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116493130 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116493143 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 116493203 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 116493254 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 116493265 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 116493276 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 116493379 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 116493435 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 116493503 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 116493536 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 116493611 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 116493619 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 116493658 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 116493743 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 116493747 G C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 116493756 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 116493758 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 116494000 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 116494286 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 116494317 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 116494492 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116494544 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116494696 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 116494809 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 116494839 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 116494862 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 116495118 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 116495121 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 116495316 A C N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 3 116495327 C T N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 3 116495660 G T N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 3 116495666 A T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 116495674 T A N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 3 116495687 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 116495738 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 116495760 A T N N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 3 116496076 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 116496092 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 116496102 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 116496291 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 116496325 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 116496379 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 116496400 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116496957 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 116497022 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 116497341 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 116497356 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116497621 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 116497888 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 116497961 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116498019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116498680 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 116499215 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116499275 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116499510 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 116499543 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116499571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116499871 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 116499953 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 116499980 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 116500627 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 116500803 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 116500856 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 116500959 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 116501036 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116501210 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116501240 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 116501292 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 116501293 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116501359 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 116501492 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 116501817 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 116501823 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 116501921 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 116501992 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116502127 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 116502226 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 116502261 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 116502424 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 116502527 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 116502729 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116502800 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 116502806 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116502851 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116502875 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 116502886 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116502982 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 116503001 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 116503097 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116503178 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 116503314 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116503426 C G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 116503548 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 116503614 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 116503844 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 116503955 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 116504015 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 116504241 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 116504298 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 116504373 G T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 116504391 G T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 116504392 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 116504482 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116504579 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116504789 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116504938 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 116507082 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 116507374 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 116509121 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 116511072 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 116511442 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116511486 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116512121 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116513059 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 116513144 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116513500 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 116513543 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 116513581 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 116513620 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 116513634 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 116513673 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 116513716 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116513761 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 116514173 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 116514255 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 116514264 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 116514394 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116514553 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 116514567 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 116514588 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 116514733 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 116514987 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 116515010 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 116515024 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 116515074 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 116515669 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 116515686 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 116515735 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 116515740 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 116515795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116515919 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 116516193 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 116516269 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 116516562 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 116516874 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116516896 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 116516986 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 116517071 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116517160 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 116517280 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 116517329 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116517402 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 116517411 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116517544 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 116517833 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 116517872 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 116517885 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 116517930 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 116518058 G C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 116518121 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 116518345 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 116518357 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 116518597 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 116518795 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 116518864 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 116518924 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 116519079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116519434 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 116519849 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 116519888 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 116519889 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 116519928 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116520016 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 116520041 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116520099 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 116520114 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 116520273 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116520284 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116526048 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 116526094 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 116526447 A G N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 116526451 G C N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 116526542 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 116526598 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116526618 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 116526621 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 116526676 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116526752 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 116526789 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 116526816 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 116526871 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116526873 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 116527251 A C N N 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 8 10 3 2 4 3 116527598 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 116527735 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 116527851 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 116527934 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116527953 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 116527974 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 116527993 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 116528047 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 116528252 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 116528629 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116528821 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116528878 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 116528983 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 116528991 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 116529006 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 116529154 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116529279 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 116529395 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 116529480 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 116529721 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116529731 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116529850 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116529989 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 116529998 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 116530001 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116530144 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 116530148 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116530171 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116530224 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 116530299 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 116530551 C T Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 116530639 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 116530651 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 116530775 A G Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 3 116531074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116531156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116531206 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116531212 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116531339 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 116531405 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116531463 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116531508 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116531821 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 116531916 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 116531972 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 116532105 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 116532293 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 116532299 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 116532421 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116532534 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116532564 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116532573 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116532608 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116532612 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 116532691 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 116532727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116532937 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116532964 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116533281 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116533406 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 116533520 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 116533636 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 116534276 G A N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 3 116534303 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 116534400 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 116534476 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 116534504 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 116534729 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 116534799 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 116534823 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 116534835 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 116534979 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 116535052 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 116535249 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 116535275 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116535290 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 116535316 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 116535373 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 116535420 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 116535488 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116535524 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 116535531 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 116536105 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116536110 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116536417 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116536957 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 116537200 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 116537359 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 116537395 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 116537658 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 116538281 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116538382 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116538408 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 116538531 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 116538670 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 116538826 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116539516 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116539743 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 116539853 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116539919 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116539954 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116539971 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116540111 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 116540167 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 116540176 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 116540218 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 116540263 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116540273 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 116540516 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 116540744 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 116540770 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 116540951 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116540974 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 116541013 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 116541203 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 116541204 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 116541230 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 116541368 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 116541378 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 116541384 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 116541389 G T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 116541461 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 116541474 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 116541513 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 116541536 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 116541704 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 116541802 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 116541924 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 116541939 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 116542907 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116542946 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 116543380 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116543418 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 116543432 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 116544034 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 116544452 C G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 116544812 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116544861 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 116544978 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 116544990 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116545085 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116545476 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 116547270 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 116547657 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116548056 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116548396 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116548592 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 116548675 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116548895 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 116548950 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 116549146 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 116549481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116549936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116550394 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116550879 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 116551061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116551134 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 116551135 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 116551463 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 116551601 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116551748 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116551767 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116551901 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116553896 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 116554450 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 116554885 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 116554901 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116555054 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 116555068 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116555083 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116555094 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 116555104 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 116555144 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116555169 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 116555218 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 116555327 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116555341 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116555405 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116555439 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 116555562 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 116555566 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 116555696 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 116555748 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116555990 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 116556063 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 116556202 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 116556267 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116556302 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 116556717 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 116556796 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 116556903 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 116556922 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116557090 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 116557091 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 116557207 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 116557348 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 116557426 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 116557574 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 116557575 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 116557657 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 116557690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116557729 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 116557758 A G Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 116558169 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 116558265 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 116558327 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 116558516 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 116558543 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 116558563 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116558726 A C N N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 3 116558818 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 116559008 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 116559039 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 116559117 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 116559513 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 116559537 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 116559538 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 116559564 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 116559667 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 116560216 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116560248 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 116560325 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 116560594 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 116560754 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 116560811 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116561345 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116561370 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 116561689 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 116561872 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 3 116562367 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 116562716 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 116562756 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 116562787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116562878 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 116562879 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 116564042 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 116564105 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 116564531 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 116565492 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 116565508 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 116565567 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 116566626 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 116567742 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 116567881 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 116568120 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 116568578 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116569680 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 116570849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116571040 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 116571053 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116571225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116571886 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 116571985 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 3 116572675 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 116572769 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116572789 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 116573107 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116573292 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 116573683 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116573902 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 116573920 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 116573992 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 116574342 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 116574488 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 116574528 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 116574696 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 116574787 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 116574959 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 116575021 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 116575286 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 116575293 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 116575386 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 116575390 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 116575471 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 116575486 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 116575487 G T N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 116575719 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 116575795 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 116575825 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 116575835 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116576146 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 116576162 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 116576425 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 116576570 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 116576593 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 116576651 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 116576692 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 116576735 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 116576800 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 116576809 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 116576940 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 116576974 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 116577113 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 116577169 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 116577194 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 116577590 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 116577632 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 116578307 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 116578343 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 116578735 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 116578813 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 116579476 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 116579499 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 116579545 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 116579666 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.2 0.0666666666666667 0.733333333333333 7 23 3 1 11 3 116579679 G A N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.25 0.0833333333333333 0.666666666666667 7 17 3 1 8 3 116579729 T G N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 3 116580649 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 116580721 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 116580834 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 116580861 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 116580874 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 116581536 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 116581639 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 116582159 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116582525 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 116582651 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 116582700 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116583047 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 116583096 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 116583314 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 116583416 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 116583436 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 116583445 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 116583487 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 116583490 T G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 116583797 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 116583868 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 116583943 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 116584184 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 116584200 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 116584548 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116585172 G C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 3 116585226 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 116585950 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 116586033 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 116586125 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 116587069 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 116587400 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 116587455 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 116587496 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 116587678 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 116587702 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 116587716 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 116587746 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 116587937 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 116588001 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 116588810 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 116588860 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 116589415 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116589618 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116589741 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 116589758 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 116589895 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 116590533 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 116590693 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116590781 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116590782 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116590792 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116590956 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116591040 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 116591111 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 116591543 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 116592936 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 116593088 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 116593592 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 116593825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116593877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116594997 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 116595663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116596157 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 116597060 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 116597957 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116598358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116598479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116598680 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 116599406 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 116600095 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 116600126 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 116600438 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 116600533 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 116600545 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 116600848 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116600860 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116600865 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116600871 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116600942 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116600994 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116601031 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116601155 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116601218 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 116601386 G C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 116601388 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 116601634 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 116601718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116601762 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 116602189 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 116602275 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 116602814 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 116602827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116602892 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 116603753 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 116603798 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 116604167 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 116604447 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116604897 T C N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 3 116605131 G A N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.25 17 7 8 1 3 3 116605135 C T N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 116605362 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116605934 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 116606049 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 116606189 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 116606294 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 116606295 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116606317 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 116606956 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 116607812 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 116607836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116607975 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 116608196 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116608874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116609594 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 116609633 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 116609652 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 116610364 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 116610539 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 116610921 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 116610990 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 116611002 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 116611052 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 116611147 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 116611166 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 116611521 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 116611559 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 116611582 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 116611673 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 116611732 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 116611897 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 116612016 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 116612056 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 116612069 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116612072 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 116612089 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 116612178 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 116612220 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 116612297 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 116612307 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 116612316 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 116612523 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 116612531 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 116612585 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 116612622 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 116612671 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 116612825 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 116612846 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 116612919 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 116613007 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 116613108 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 116613114 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 116613143 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 116613227 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 116613815 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 116614040 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 116614084 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 116614309 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 116614333 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 116614401 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 116614437 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 116614469 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 116614482 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 116614539 T C N Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 3 116614671 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 116614749 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 116614820 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 116615090 G C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 116615158 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 116615220 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 116615225 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 116616627 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 116617486 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 116617577 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 116618194 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 116618440 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 116618486 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 116619019 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 116619212 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 116619308 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 116619370 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116619604 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 116619611 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 116619932 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 116620123 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 116620163 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 116620391 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 116621544 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116621810 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116622564 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 116622706 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116622770 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 116623197 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 116623372 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 116623405 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 116623666 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 116623800 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 116624199 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116624201 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 116624492 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116624536 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116624830 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 116624866 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 116624945 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116624979 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116625233 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116625271 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 116625588 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 116625938 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 116626035 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 116626859 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 116627018 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 116627111 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 116627144 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 116627286 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 116627336 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 116627696 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 116628041 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 116628221 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 116628605 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 116628673 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116628704 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116628729 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116628830 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 116628955 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 116629037 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 116629222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116629250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116629402 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 116629422 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 116629460 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 116629502 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 116629516 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 116629548 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 116630087 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 116630315 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 116631028 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 116631062 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 116631082 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 116631113 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 116631157 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 116631339 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 116631358 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 116632315 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 116632513 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 116632526 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 116632586 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 116632631 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 116632684 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 116632745 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 116632792 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 116632793 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 116632826 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 116632844 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 116632853 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116632880 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 116632937 A G Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 3 116633065 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 116633080 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 116633135 T A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 116633256 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 116633359 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 116633415 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 116633448 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 116633585 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 116633800 T G Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 116633824 T G Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 116633828 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 116633864 A G Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 3 116633902 A G Y Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 3 116633930 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 3 116634095 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 116634204 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 116634205 T G Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 116634217 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116634280 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 116634354 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 116634435 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 116634452 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 116634478 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 116634567 A T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 116634590 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 116634593 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 116634729 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 116634937 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 3 116635068 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 116635098 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 116635121 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 116635264 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 116635618 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 116635620 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 116635687 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 116635867 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 116635947 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 116636022 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 116636154 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 116636658 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 116636962 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 116636965 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 116637052 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 116638042 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 116638394 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 116638408 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116638417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116638429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116638466 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 116638551 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 116638597 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 116638675 A T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 116638708 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 116638857 T A N N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 3 116638943 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 116638993 C G Y N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 116639423 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 116639577 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 116640081 T G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 116640564 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 116643682 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116644018 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116644033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116644455 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116645103 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 116645138 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116645166 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 116645196 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 116645207 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 116645393 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 116646043 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116646158 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116646426 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 116646460 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116646489 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116646715 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116647096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116647206 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 116647222 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 116647326 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116647329 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 116647755 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116648364 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 116648561 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116648601 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116648683 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 116648697 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 116648706 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 116648818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116649250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116649758 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 116649837 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 116650049 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 116650563 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116650594 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116650625 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116650662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116650678 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116650708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116650855 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 116650909 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 116650915 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 116651004 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 116651078 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 116651103 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 116651213 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 116651426 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116651441 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116651445 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 116651725 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116654142 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 116654784 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116654837 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116655162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116655811 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116656303 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116656821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116657373 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 116658139 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116658213 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116658403 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 116658905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116658945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116658996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116659026 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116659497 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116659597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116659871 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 116660000 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 116660163 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 116660614 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116661186 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116661221 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 116661291 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 116661407 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 116661555 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 116661568 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116661569 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 116661831 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 116661937 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116661957 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116662038 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 116662103 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 116662215 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116662492 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116662599 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116662645 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 116662653 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 116662878 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116662889 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 116662890 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 116663120 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116663130 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116663179 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 116663186 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 116663359 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 116663480 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 116663568 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116663582 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116663736 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116663815 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 116663840 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 116664081 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116664099 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116664408 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 116664445 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116664649 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 116665271 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 116665279 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 116665305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116665790 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 116665944 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 116666311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116666524 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 116666715 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 116666819 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 116666893 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116667019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116667315 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 116667449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116667554 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 116667640 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 116667651 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 116667705 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 116667735 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 116667766 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 116667785 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 116667792 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 116667814 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 116667880 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 116667901 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 116667905 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 116667938 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 116668088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116668098 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116668115 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116668231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116668348 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 116668397 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 116668428 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 116668518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116668527 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116668595 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116668626 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116668627 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116668830 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116668884 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 116668961 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 116669390 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 116669513 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 116669533 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116669558 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 116669765 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 116670393 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116671864 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116671886 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116671949 G T N N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 3 116672129 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 116672183 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 116672481 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116672945 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116673012 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 116673025 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 116673203 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 116673222 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 116673292 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 116673317 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 116673452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116673466 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 116673483 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 116673670 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 116673671 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 116673771 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 116673871 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 116673962 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 116673974 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 116674063 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 116674126 G T N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 3 116674144 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 116674182 T A N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 116674223 A T N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.0769230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 9 17 1 7 5 3 116674316 G T N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 3 116674324 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 116674361 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 116674393 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 116674445 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 3 116674516 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 116674560 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 116674667 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 116674751 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116675082 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 116675235 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 116675599 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 116675697 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116675761 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116675802 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 116675976 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 116676043 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 116676435 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 116676481 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 116676622 G T N N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 3 116676632 G A N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 3 116676642 A G N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 116676685 T A N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 3 116676708 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 3 116677579 A C N N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 3 116677694 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116677699 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116677725 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 116677729 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 116677774 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 116677828 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116677829 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116677958 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116678001 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116678003 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116678039 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116678337 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116678379 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116678525 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116678591 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116678797 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 116678928 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 116678942 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 116678960 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 116678965 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 116679016 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 116679073 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116679343 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116679359 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116679518 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 116679545 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 116679562 T G N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 3 116679885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116679899 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116679948 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 116680031 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 116680716 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116680737 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116680837 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 116681094 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 116682330 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116684825 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116685903 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 116686503 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116687060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116687368 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 116688260 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116688637 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 116688862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116688910 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 116689001 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 116689100 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 116689478 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116689626 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116689655 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 116689745 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116689764 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116689879 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116690099 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116690543 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 116690702 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 116691117 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116691152 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116692055 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116692122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116692161 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 116692370 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116692408 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116692443 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116692469 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116692673 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116692822 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116692832 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116692840 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116692869 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116692898 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116692918 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 116692953 A G N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 3 116693107 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 116693122 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 116693179 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 116693255 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 116693279 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 116693285 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 116693314 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 116693614 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 116693674 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 116693832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116693927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116694598 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116695275 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116696166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116696466 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116696500 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116696688 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116696777 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 116697023 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 116697057 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 116697100 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 116697133 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 116697208 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 116697229 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116697238 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116697244 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116697381 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116697423 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 116697440 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116697446 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116697884 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 116697910 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 116697925 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 116697945 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 116697969 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 116698364 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 116698650 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116698981 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 116698983 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116699114 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116699180 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116699182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116699459 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116699469 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116699987 C G N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 116700084 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 116700303 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116700512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116701055 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116703343 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 116703385 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 116703555 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116703739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116703772 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116703822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116703871 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 116703897 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 116703920 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 116703943 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116704020 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116704174 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116704230 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 116704327 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 116704536 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 116704710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116704761 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116704868 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116705123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116705897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116706319 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116706359 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 116706722 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116707827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116707975 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 116708279 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 116708288 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 116708300 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 116708319 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 116708945 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116708946 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 116709303 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 116709328 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 116709362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116709364 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116709379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116709483 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 116709504 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116709706 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 116709772 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 116709938 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116710018 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116710308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116710908 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 116711291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116711620 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 116711621 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 116711711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116711733 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 116711846 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 116711872 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116711900 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116712029 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116712101 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 116712124 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 116712268 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 116712404 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 116712418 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 116712994 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116713416 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116713559 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116713943 G A Y Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 7 11 1 5 3 3 116714011 A G Y Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 3 116716138 A T Y N 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 116717641 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116717870 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 116718582 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116719098 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 116719113 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116719718 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116723265 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 116723348 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116723677 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116723718 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 116723777 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 3 116723930 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 3 116724353 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 116724479 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 116724728 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 116724908 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 116725070 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 116725273 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 116725277 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 116725373 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 116725379 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 116725398 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 116725411 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 116725428 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 116725479 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 116725500 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 116726217 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 116726725 A G N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 116726844 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 116727020 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 116727052 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 116727118 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 116727122 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116727417 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 116727472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116727506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116727796 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116727956 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 116728062 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 116728098 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 116728147 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116728418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116728572 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116728706 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 116728749 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116728809 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 116728957 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116729036 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116729333 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116729375 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 116729377 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 116729410 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 116729744 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116729860 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 116729896 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 116729921 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 116729994 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116730003 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 116730013 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116730165 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 116730174 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 116730311 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 116730336 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 116730388 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 116730511 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 116730533 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 116730673 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 116730708 G T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 116730839 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 116730938 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 116730968 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 116731014 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 116731047 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 116731091 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 116731152 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 116731353 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 116731400 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 116731402 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 116731472 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 116739863 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116741065 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 3 116741096 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 116743097 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 116743158 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116743503 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116743702 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116743881 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 116744171 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 116744347 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 116744972 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 116745140 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116745162 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116745182 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 116745212 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 116746047 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 116746125 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 116746145 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 116746268 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 116746292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116746408 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 116746410 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 116746456 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116746461 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116746525 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 116746630 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 116746691 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 116746734 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 116746779 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116746825 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 116747017 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116747028 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 116747074 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116747095 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 116747113 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 116747164 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 116747174 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 116747180 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 116747215 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 116747222 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 116747262 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 116747279 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 116747291 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 116747351 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 116747714 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 116747729 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 116747747 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 116747789 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 116747821 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 116748141 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116748179 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 116748193 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 116748248 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 116748273 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 116748527 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 116748531 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 116748555 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 116748579 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 116748583 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 116748636 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 116748643 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 116749743 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 116749751 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116749825 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 116750202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116750360 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116751436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116751645 G C Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 116751685 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 116751747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116751757 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116751781 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 116751796 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 116751993 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 116752089 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116752108 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 116752134 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 116752161 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116752225 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 116752411 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 116752422 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 116752688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116752705 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 116753166 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116753200 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 116753266 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 116753372 T G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 116753585 T G N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.133333333333333 0.666666666666667 0.2 14 16 2 10 3 3 116753601 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 116753604 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 116753612 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 3 116753700 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 116753703 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 116753868 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 116753930 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 116753941 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 116754129 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 116754178 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 116754281 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 116754283 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 116754369 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116754404 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116754490 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116754817 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 116754820 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 116754884 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116754923 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 116754924 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 116754969 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 116755000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116755079 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 116755095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116755141 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116755271 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116755624 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 116755640 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116755658 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116755679 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116755683 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116755714 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116755724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116755948 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116756183 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 116756235 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 116756404 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 116756554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116756855 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116757484 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 116757542 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116757755 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116759045 A T N N 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.3 0.7 0 13 7 3 7 0 3 116759181 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 116759415 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116759783 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 10 14 2 6 4 3 116760031 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116760159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116760516 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 116761046 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116761591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116761595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116761615 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 116761697 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 116761715 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 116761725 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 116761940 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 116762999 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116763021 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 116763063 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 116763129 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116763152 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116763170 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116763204 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116763239 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116763258 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 116763379 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116763431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116763552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116763594 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116764004 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116764120 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116764232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116764304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116764340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116764346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116764356 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116764426 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 116764464 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 116764520 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116764837 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 116765218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116765221 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 116765764 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 116766363 G T N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 3 116766533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116766605 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 116766760 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 116767201 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 116767270 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 116767298 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 116767362 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 116767739 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 116767923 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 116768061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116768069 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 116768310 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 116768315 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 116768399 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 116768418 G C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 116768452 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 116768494 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 116768611 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 116768641 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 116768896 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 116769078 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 116769232 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 116769287 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 116769311 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 116769390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116770201 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 116770936 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116772034 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 116772067 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 116772881 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 116772882 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 116773237 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116773377 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 116774017 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 116774043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116775123 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116775541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116775703 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 116777748 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 116778202 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116781295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116784150 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 116786806 G A Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 116786863 G C N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 116786966 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 116787206 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 116787784 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116788734 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 116788854 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 116788901 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 116789075 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 116789196 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 116789250 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 116789276 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 116789314 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 116789559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116789672 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 116789882 C A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 116790092 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 116791778 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 116791871 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 116792344 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 116792636 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 116794057 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 116794068 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116794071 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116794131 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 116794193 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116794205 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 116794325 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 116794426 T C N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.625 0.125 0.25 11 5 5 1 2 3 116795599 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 116795619 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116795639 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116795655 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116795672 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 116796027 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 116796031 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 116796139 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 116796169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116796435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116796460 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116796502 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116796519 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116796651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116797597 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116798299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116798369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116798463 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116798568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116798586 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 116798925 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116798942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116798967 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116799132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116799158 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116799189 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116799268 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116799310 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116799519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116799607 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116799644 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116799970 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 116800195 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116800262 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116800271 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116800494 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116800525 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 116800682 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 116800818 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116801080 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 116801149 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116801253 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 116801277 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 116801321 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 116801455 A G N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 12 8 4 4 2 3 116801823 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 116801871 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 116801946 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 116801958 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 116802022 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 116802028 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 116802141 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 116802294 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 116802330 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 116802361 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 116802387 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116802644 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 116802689 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 116802744 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 116802791 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 116802838 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 116802889 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116803024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116803039 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 116803062 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 116803137 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 116803261 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 116803266 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 116803466 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 116803637 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116803688 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 116803721 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 116803796 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 116803937 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 116804581 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 116804607 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 116804968 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116804988 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116805223 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 116805544 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 116805608 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116806244 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116806302 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116806577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116806664 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116808895 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 116808967 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116811290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116811529 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116814072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116815109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116816003 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 116816658 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116816928 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116817005 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116817257 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116817355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116817689 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 116818582 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116819602 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116819610 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 116820670 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 116821212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116823076 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 116823181 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 116823969 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116824165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116824346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116824351 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116824369 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116824529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116826130 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116826211 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 116826373 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116827633 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 116830153 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116830844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116830931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116830989 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116831286 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116831315 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116831355 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116831368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116831708 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116831802 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116832180 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 116832322 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 116832329 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116832379 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 116832403 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116832439 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116832454 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116832456 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 116832501 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 116833165 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 116833199 G T N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 116833203 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 116833220 C T N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 116833250 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 3 116833273 C A N N 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 116833353 C T N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 3 116834231 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 116834288 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 116834312 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 116834357 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 116834428 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116834487 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116834564 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116834613 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 116834687 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116834725 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116835120 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116835363 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116835473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116835785 A T N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 116835982 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 116836021 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 116836208 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116836239 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 116836583 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 116836778 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116836801 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 116837011 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116837347 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 116837457 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116837728 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116837759 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 116838471 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 116839206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116840473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116841909 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 116842114 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116842528 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116842611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116842740 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116842813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116842835 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 116842867 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 116842965 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 116842983 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 116842998 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 116843014 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116843067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116843081 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116843146 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 116843200 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116843219 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 116843237 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116843343 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116843390 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116843398 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 116843524 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 116843561 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116843586 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116843641 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 116843711 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 116843717 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 116843799 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 116843900 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 116843921 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 116843978 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 116844063 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 116844074 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 116844077 T G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 116844223 T A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 116844383 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116844399 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 116844486 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116844543 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 116844544 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 116844585 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116844590 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116844608 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116844633 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116844737 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116844820 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 116844858 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116844982 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 116845224 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116846908 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116847360 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116848594 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 116849737 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116850751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116850897 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116850902 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 116851038 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116851059 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116851157 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116851167 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116851192 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 116851327 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116851335 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 116851572 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116851611 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 116851889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116852072 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116852988 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116853485 A G N Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 9 9 2 5 2 3 116854122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116854530 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 116854684 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 116854726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116855128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116855529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116855586 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 116855598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116855659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116855671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116855682 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 116857372 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 116860649 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 116861782 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116862407 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116863187 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 116864512 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116865678 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116865996 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 116866636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116867454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116868578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116869057 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116869620 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116869976 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 116870162 A T Y N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 116873059 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 116874579 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 116877240 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 116878979 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116879494 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 116882310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116883000 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 116883169 C A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 116883556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116884680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116884973 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 116886761 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116886908 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116887104 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116887650 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 116888341 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 116889030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116889048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116889308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116890816 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116891169 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116891434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116891809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116891914 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116892078 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116892737 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116893251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116894190 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 116894191 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 116895235 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116896232 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116896324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116896608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116896733 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 116896905 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116898634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116900044 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 116900663 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116900930 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116901653 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116903103 G C Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 116913968 G T Y N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 116914018 A C Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 116915671 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 116916481 A G Y Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 116918361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116919197 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116919348 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116922753 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 116923157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116923948 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116924027 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 116924213 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116924796 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116924870 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 116924960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116925831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116926299 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 116926304 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 116926404 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116931932 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116933147 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116933970 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116934107 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 116934625 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116934754 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116935040 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 116935196 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 116935354 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116935711 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116935993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116936255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116936901 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116936960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116936997 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116938015 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116938344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116938512 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 116941425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116941896 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116942134 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116942151 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116942389 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 116942415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116942691 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 116942695 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 116942802 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116943274 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116943472 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 116944096 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116944111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116944512 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 116944522 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 116944721 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116945173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116945348 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116945377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116945436 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 116945511 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116945701 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 116945969 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116946511 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 116946518 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 116946964 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 116947012 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116947113 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116947174 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 116947467 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 116947622 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116947709 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116947764 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116947993 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116949355 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 116949371 A T N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 3 116949946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116950400 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 116950481 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 116950495 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 116950512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116951120 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116951505 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116951558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116951568 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116952994 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116953809 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116953930 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 116953976 T G N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 116953986 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116954331 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116954500 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116954505 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116954530 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116954541 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116954695 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116954797 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 116954837 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116954848 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116954867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116955095 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 116955121 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 116955229 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116955250 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116955288 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116955351 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116955472 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116956657 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 116956717 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 116956975 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 116957031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116957079 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 116957103 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 116957492 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116957510 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 116958078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116958124 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 116958132 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 116958164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116958275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116958533 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116959131 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 116959198 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116959616 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 116959764 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 116960246 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 116960287 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 116960869 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 116961381 A T Y N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 116961390 T C Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 116961559 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 116961713 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 116962176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116962424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116962585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116962777 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116963073 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116963603 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116964090 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 116964201 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116964234 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116964335 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 116964364 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 116964726 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116964736 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116964749 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 116964926 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 116965384 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 116965404 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116965444 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116965787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116966041 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 116967707 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116967800 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116967881 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116967896 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116967978 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116968257 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 116968506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116973749 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116973988 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 116974065 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116974593 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116974902 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116975279 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116975473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116975995 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116976045 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116976534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116976572 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116976682 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116976954 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116976971 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116976972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116977014 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116977098 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116977111 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116977134 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116977177 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116977195 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 116977206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116977213 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116977241 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116977450 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116977506 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116977522 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116977956 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 116978111 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116978536 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116978574 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 116978739 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116978831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116978925 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116979065 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 116979130 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116979195 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116979683 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116979712 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 116979741 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 116979762 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116979808 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116980080 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 116980391 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 116980497 G T Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 116980691 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116981052 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 116981083 A T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 116981093 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 116981308 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116982290 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 116983081 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 116983116 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 116983870 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116983957 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116984040 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116984047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116984062 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116984065 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116984112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116984142 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116984173 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 116984224 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116984389 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 116984505 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116984539 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116984910 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116985029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116985243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116985596 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116985708 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116985843 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116985844 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116986492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116986589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116986738 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116986762 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 116986807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116987375 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116987384 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116987412 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 116987479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116987535 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116987571 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116987646 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116987709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116987712 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116987812 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116987822 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116987864 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 116987940 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116987963 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116987967 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116988188 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 116988204 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 116988397 G A N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 116995487 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 116995509 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116995533 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 116995552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116995561 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116995566 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116995582 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116995684 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116995757 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 116995798 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116995946 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 116996067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116996105 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116996126 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 116996135 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116996226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116996249 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116996346 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116996385 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116996493 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116996512 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116996583 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116996645 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116996712 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116996743 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116996769 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 116996787 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 116996933 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 116997037 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 116997168 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116997216 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116997270 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116997273 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116997396 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116997986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116998002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116998135 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116998198 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 116998219 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116998462 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116998480 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 116998676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116999004 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116999194 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116999220 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 116999327 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 116999416 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 116999438 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116999529 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 116999885 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 116999995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117000296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117000859 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117001133 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117001836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117002023 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117002091 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117002433 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117002439 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117002496 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117004111 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117006289 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117006347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117007130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117007591 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 117007613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117011468 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117012112 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117014986 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 117019216 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117020317 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117021290 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117021698 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117022674 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117022857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117022909 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117023080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117023109 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 117023640 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 117023716 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 117023822 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 117024084 C T Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 3 117028415 C A Y N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 117031876 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 117032653 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 117032877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117035113 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117036384 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117037871 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 117039813 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 117040882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117041076 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117041084 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117041110 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117041139 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117041158 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117041235 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117041273 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117043540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117044399 C G N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 117044478 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117044650 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 117046551 T C N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 117046962 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 117046983 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 117047105 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117048086 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117048371 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117048725 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117048958 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 117049027 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 117049159 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 117049706 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 117049733 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 117050004 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 117050105 G A N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 3 117050259 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 117050736 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 117051032 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 117051241 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 117051280 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 117051303 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117052034 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 117052097 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117052203 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117052338 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117053388 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117054966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117055568 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117055629 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 117055715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117055982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117056269 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117056431 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117056440 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 117056457 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 117057086 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 117057134 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 117057328 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 117057330 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 117057391 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117057461 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 117057471 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 117057499 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 117057517 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 117057594 T G Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 117057700 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 117057841 A C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 117057942 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117058024 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 3 117058966 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117058974 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117059864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117060494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117061838 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117062177 T C Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 117063943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117064659 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 117064805 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117064959 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117065304 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117067214 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 117067660 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117068543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117068595 T G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 117068660 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 117068736 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117068813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117068886 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117068966 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 117069022 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117069072 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 117069861 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117069963 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117070682 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117070719 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117070786 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 117071112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117071338 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117071489 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117072814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117073524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117073944 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 117074161 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 117074183 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 117074229 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 117074273 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 117074500 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 117074503 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117074514 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 117074664 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117074665 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 117075864 T A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 3 117075959 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 117076228 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 117076303 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117076839 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117077187 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 117077575 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117077615 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 117077987 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117078331 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 117078871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117079171 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 117079206 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117079295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117079431 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117079451 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117080117 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 117080154 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 117080166 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 117080178 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 117081363 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117081479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117089725 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117090167 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117090192 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 117090879 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 117090965 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 117091588 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 117092034 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117092262 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 117092352 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 117092468 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 117092763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117093574 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 117094499 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 117094668 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 117094807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117094946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117096090 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117096148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117097260 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117098967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117099174 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117099506 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 117099599 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117100053 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117100204 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 117100294 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 117100395 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 117100622 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 117100739 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 117100754 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 117100929 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 117100947 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 117101047 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 117101144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117101244 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 117101254 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 117101285 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 117101317 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 117101432 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 117101495 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117101735 A T N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 117101923 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117101928 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 117101936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117102056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117102081 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 117102108 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 117102120 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 117102122 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 117102142 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 117102372 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 117102619 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 117102701 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117102718 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 117102850 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 117102859 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 117102909 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 117102959 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 117103047 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 117103066 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 117103077 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 117103103 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 117103169 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 117103196 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 117103254 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 117103258 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 117103321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117103324 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 117103367 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 117103425 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 117103445 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 117103457 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117103518 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 117103541 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 117103610 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 117103641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117103659 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 117103815 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 117104002 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 117104013 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 117104025 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 117104088 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 117104195 C G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 117104268 C A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 117104281 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117104288 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 117104317 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 117104345 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 117104354 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 117104582 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 117104613 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 117104651 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 117104657 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 117104809 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 117104874 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 117105010 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 117105040 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 117105055 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 117105360 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117105376 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 117105989 G T Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 117106034 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 117106300 T C Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 117106474 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 117106561 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117106583 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 117106597 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117106627 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 117106680 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117106696 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117106851 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117106852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117106906 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 117106910 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 117106992 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117107038 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117107051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117107053 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 117107078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117107100 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117107120 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 117107177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117107291 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117107407 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117107499 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 3 117107743 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117108590 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117108668 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 117108990 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117108998 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117109003 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117109015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117109061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117109097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117109111 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 117109162 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117109269 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117109304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117109353 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 117109561 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117109588 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117109726 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 117109746 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 117109755 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 117110158 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117110261 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117110310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117110328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117110534 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 117110540 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117110963 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 117111252 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 117111322 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 117111412 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117111636 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 117112223 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117112313 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 117112436 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 117113163 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117113178 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117113188 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117113354 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 117113703 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 117113794 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117113852 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117113974 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 117113985 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 117113993 G T N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 117114024 C T N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0 0.916666666666667 0.0833333333333333 11 13 0 11 1 3 117114339 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117114436 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 117114478 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117114487 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117114548 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117114591 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 117114635 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117114640 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117114907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117114940 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 117115116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117115123 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 117115142 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 117115189 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 117115250 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117115370 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 117115429 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117115489 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117115528 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 117117155 T G Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 3 117118839 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 117118849 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117120449 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117120492 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117123115 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117124101 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117124427 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 117124647 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 117124991 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 117125066 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 117125131 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117125175 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 117125264 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117125382 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117125467 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117125584 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117125667 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117125678 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117125959 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 117126098 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 117126413 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 117126589 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 117126829 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117126893 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117126955 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117126994 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117127203 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117128490 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117128582 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117128618 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 117128662 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117128731 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117129216 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 117129316 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 117129379 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 117129427 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 117129455 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 117129471 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 117129531 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117129640 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 117129643 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 117129655 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117129901 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117130032 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117130192 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117130214 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 117130271 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 117130394 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 117130411 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 117130420 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117130546 G T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 117130611 T A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 117130683 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 117131020 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 117131103 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 117131243 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 117131573 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 117131972 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 117132280 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 117132576 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 117133126 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117133142 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 117133288 T G N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 3 117134002 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 117134442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117134812 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 117134853 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117134891 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117134894 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117135058 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117135127 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 117135287 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 117135345 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 117135396 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 117135471 A T N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 3 117135922 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117136149 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117136188 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117136204 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117136219 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117136318 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117136339 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 3 117136432 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 117136771 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117136887 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117136933 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117136971 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117137036 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117137236 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 117137295 G A Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 117137298 A T Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 117137497 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 117137815 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117137972 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117138449 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117138530 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 117138579 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117139027 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 117139413 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117139666 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 117139918 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117139927 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117139967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117139992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117140108 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 117140241 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 117140274 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 117140370 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117140426 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.15 0.75 0.1 21 19 3 15 2 3 117140504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117140546 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117140549 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 3 117140639 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 3 117140686 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117140689 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 3 117140712 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 3 117140886 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.157894736842105 0.736842105263158 0.105263157894737 20 18 3 14 2 3 117140977 C T N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.2 0.8 0 12 8 2 8 0 3 117141313 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117141355 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117141383 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117141512 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 117141513 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 117141750 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117141872 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117141937 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 117141960 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 3 117141965 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 3 117142023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117142139 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117142343 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117142354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117142398 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 117142554 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117142633 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117143113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117143131 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117143224 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 117143239 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117143283 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117143320 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117143422 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.111111111111111 0.722222222222222 0.166666666666667 17 19 2 13 3 3 117143440 C T N Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.1 0.9 0 11 9 1 9 0 3 117143590 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117143975 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117144240 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 117144304 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 117144328 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 117144431 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117144505 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 117144564 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117144665 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 117144680 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 117144683 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 117144931 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 117145245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117145288 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117145341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117145381 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117145732 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.105263157894737 0.736842105263158 0.157894736842105 18 20 2 14 3 3 117145747 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117145790 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 3 117145798 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 117145811 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 3 117145846 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 117145865 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 3 117145929 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 117146175 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117146176 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117146196 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117146227 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117146674 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117146740 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 117146768 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117146823 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 117146934 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.111111111111111 0.722222222222222 0.166666666666667 17 19 2 13 3 3 117146947 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 3 117146982 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 117147024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117147214 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 117147250 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 117147381 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117147410 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 117147454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117147490 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 117147530 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 117147557 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 3 117147576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117147621 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 117147729 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 117147758 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 117148012 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 117148112 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 117148177 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 117148213 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 117148272 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 117148285 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 117148316 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 117148351 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 117148353 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 117148444 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 117148474 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 117148535 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 117148582 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.166666666666667 0.722222222222222 0.111111111111111 19 17 3 13 2 3 117148656 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 117148666 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 117148687 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 117148770 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 117148849 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 3 117149187 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 117149291 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 117149369 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 117149537 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 117149688 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 117149718 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 117149724 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 117149997 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 117150015 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 117150455 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117150921 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 117151357 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 117151391 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117151674 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 117152313 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 3 117152336 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 117152339 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 117152514 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117152536 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 117152616 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117152635 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117152695 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117152769 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 117152804 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 117153053 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 117153210 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 117153433 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117153621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117153685 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117153732 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 117153753 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 117153770 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 117153896 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 117154058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117154134 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 117155624 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117155732 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 117156520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117157349 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 117157370 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117157656 G A N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 3 117157694 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117157699 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117158293 G C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 117158403 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117158412 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 117158462 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117159112 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 117159131 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 117159192 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 117159717 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 117159778 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 117160024 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 3 117160025 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 117160077 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 117160152 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117160215 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 117160391 T C N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 3 117160447 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117161432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117161671 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117161752 C T Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 117163118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117163168 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117163676 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117163808 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117164741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117164885 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117165330 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117165377 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117165605 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117166401 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 117168355 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 117168553 T C N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 117168879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117169138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117169334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117169464 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117171044 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117171120 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117171719 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 117171876 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.166666666666667 0.777777777777778 0.0555555555555556 20 16 3 14 1 3 117171979 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 117172281 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117172654 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 117172690 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 117172735 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117172877 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 3 117172890 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.157894736842105 0.736842105263158 0.105263157894737 20 18 3 14 2 3 117172968 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.15 0.75 0.1 21 19 3 15 2 3 117173100 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117173418 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.157894736842105 0.736842105263158 0.105263157894737 20 18 3 14 2 3 117173505 C A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.117647058823529 0.764705882352941 0.117647058823529 17 17 2 13 2 3 117173624 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.166666666666667 0.722222222222222 0.111111111111111 19 17 3 13 2 3 117173874 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.157894736842105 0.736842105263158 0.105263157894737 20 18 3 14 2 3 117174202 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.15 0.75 0.1 21 19 3 15 2 3 117174320 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 3 117174902 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 117175062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117175103 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 117175252 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 3 117175382 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 117175383 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 117175449 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 3 117175716 C A N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.266666666666667 0.666666666666667 0.0666666666666667 18 12 4 10 1 3 117175994 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.1 0.75 0.15 19 21 2 15 3 3 117176084 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.1 0.75 0.15 19 21 2 15 3 3 117176258 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 3 117176296 A G Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.0526315789473684 0.789473684210526 0.157894736842105 17 21 1 15 3 3 117176302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117176350 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 117176548 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 117176673 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 117176760 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.15 0.75 0.1 21 19 3 15 2 3 117176941 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117176973 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117177193 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.1 0.75 0.15 19 21 2 15 3 3 117177315 T A Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.1 0.75 0.15 19 21 2 15 3 3 117177345 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.1 0.75 0.15 19 21 2 15 3 3 117177497 G C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.111111111111111 0.722222222222222 0.166666666666667 17 19 2 13 3 3 117177741 A G Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.153846153846154 21 5 10 1 2 3 117177805 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 117177890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117177906 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 117177959 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 117177974 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 117177995 C A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 117178019 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117178102 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 117178356 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 117178398 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 117178449 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 117178536 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 117178658 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 117178781 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 117178787 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 117178799 T A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 117178920 A G Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 117179269 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117179357 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117179548 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117179560 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117179599 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117179646 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117179737 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117179844 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117179865 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117179961 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117180107 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117180138 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117180168 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117180333 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 117180647 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117180696 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117180735 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117180803 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117180820 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117180877 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117180878 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117180949 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117181006 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117181027 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 117181160 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 117181474 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117181527 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 117181579 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117181622 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117181637 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117181765 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 117181930 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 117182007 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 117182214 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117182336 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117182373 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117182378 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117182441 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117182444 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117182521 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117182537 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117182563 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117182567 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117182594 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117182861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117182934 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.15 0.8 0.05 22 18 3 16 1 3 117182946 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117182999 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117183011 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117183052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117183079 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117183092 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117183103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117183194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117183312 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 117183333 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117183350 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117183354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117183398 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117183442 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117183461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117183635 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117183756 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117183791 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 117183819 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117183867 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117183938 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117184638 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117184655 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117184669 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 117184706 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 117184777 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 3 117184865 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117184926 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117185080 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 117185111 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 117185191 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 117185202 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 117185213 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 117185244 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 117185289 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 117185425 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117185471 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117185508 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117185534 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117185547 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 117185570 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117185594 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117185601 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 117185637 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117185696 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 117185727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117185877 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117185935 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117185960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117186039 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117186049 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117186071 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117186114 A T N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 117186148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117186164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117186167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117186248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117186255 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117186306 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117186313 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117186416 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117186488 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 117186489 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 117186527 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 117186592 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117186594 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117186669 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117186900 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117186998 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117187005 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117187032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117187087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117187111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117187184 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 117187190 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 117187337 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 117187528 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 117187656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117187912 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117187946 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 117188323 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117188555 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 117188572 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117188691 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117188710 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 117189106 A G Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 117189263 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 117189322 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117189499 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117189613 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117189663 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117189681 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117189702 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 117189703 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 117189858 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 117189886 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117190162 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 117190168 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 117190237 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117190416 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 117190429 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 117190454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117190470 G C Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 117190713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117190834 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 117190912 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117191122 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 117191215 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 117191365 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 117191456 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 117191999 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117193604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117194130 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117194726 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117194872 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 117195402 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 117195600 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117196105 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117196274 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117197123 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117197206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117197416 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 117199062 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 117199249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117199503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117199924 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117199962 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117200460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117200520 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117200532 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 117200614 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117201381 A G N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 3 117201625 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 117201988 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 117202006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117202158 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 117202335 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 117202361 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 117202379 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 117202490 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 117202718 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 117202725 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 117202755 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 117202768 T G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 117202788 A T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 117202832 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 117202897 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 117202942 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117202984 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 117203019 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 117203120 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 117203121 A T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 117203171 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 117203174 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117203359 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117203464 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 117203631 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 117203632 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 117204135 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117204721 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117204815 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117204828 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117204984 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 117205378 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117205894 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 117205960 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 117206200 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117206205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117206223 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117206235 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 117206437 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117207515 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 117208261 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117208312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117208358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117208648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117208955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117209122 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 117209267 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 117209280 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117209577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117209808 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 117209918 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 117209973 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 117210021 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 117210095 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117210229 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 117210722 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 117210793 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 117210884 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 117210901 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 117211119 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 117211131 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 117211144 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 117211213 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 117211222 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 117211379 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 117211385 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 117211403 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.333333333333333 0.2 0.466666666666667 13 17 5 3 7 3 117211478 C T N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 9 15 3 3 6 3 117211499 G T N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 117211556 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117211586 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117211644 G C N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 117211749 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 117211786 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 117211875 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 117211877 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 117211894 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 117211918 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 117211934 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 117212089 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 117212102 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 117212148 T A N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 3 117212229 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 117212242 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 117212395 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 117212513 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 117212622 G T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 117212624 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 117212633 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 117212670 G T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 117212690 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 117212861 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 117212938 A C Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 117212974 A G Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 117213290 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117213392 G A Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 3 117213443 A G Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 117213508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117213516 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 117213556 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 117213635 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 117213643 T A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 117213787 G A Y Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 3 117215689 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 117216185 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117216429 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 117218306 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117218852 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 117219231 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 117219532 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117219666 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117219700 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117219911 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 117220217 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117221694 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 117223125 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117223144 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117223284 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117223299 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 117223606 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117223707 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 117223854 C A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 117223968 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 117224016 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 117224223 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117224237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117224284 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117224434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117224441 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117224460 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 117224526 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117224589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117224809 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 117224982 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117225701 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 117225754 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117225782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117225927 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 117226673 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117227413 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117227821 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117227895 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117229217 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117229224 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117229641 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117229924 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117230261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117230301 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117230510 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117230809 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117230981 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117231260 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117231808 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117231810 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117238254 C G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 117239382 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117239483 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117241023 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117242273 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 117242890 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117243422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117243613 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117244630 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117244992 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 117245107 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117246139 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117246330 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117247078 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117247337 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117247440 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117247642 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117250512 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 117251671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117252435 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 117252944 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117252999 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117253372 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 117253580 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117254242 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117254413 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 117254606 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117254977 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117255034 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117255101 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117255122 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117255174 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117255317 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 117255611 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117256051 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 117256153 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 117256285 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117256304 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117256793 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 117256826 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 117256895 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 117257007 A C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 117257448 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117257571 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117257863 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 117258089 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 117258125 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 117258257 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 117258437 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117258479 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 117258497 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 117258793 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 117259014 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 117259153 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117259186 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 117259315 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 117259318 A G N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 117261306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117261319 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117261443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117261611 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 117261642 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117261658 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 117261746 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 117261991 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117262003 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 117262041 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 117262093 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117262136 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 117262269 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 117262343 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 117262535 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 117262600 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117262603 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117262671 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117262705 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117262793 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117262841 A C Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 117262842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117262877 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 117263054 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117263193 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 117263666 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 117263826 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 117263828 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 117263896 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 117263948 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 117263970 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117264821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117266092 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117266639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117267525 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117268020 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117269292 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117269606 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117270101 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 117270746 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 117272691 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117274227 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117274765 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117275213 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 117275257 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117275930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117277657 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117277741 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117277979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117278630 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 117279083 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117279133 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 117279194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117279218 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 117279352 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 117279538 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 117279763 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117279795 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117279956 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 117280128 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 117280147 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 117280175 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117280176 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117280248 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117280253 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117280681 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117280682 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117281093 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 117281251 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 117281263 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 117281318 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 117281324 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 117281962 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 117282012 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 117282014 C T N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 117282033 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117282040 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.533333333333333 0.2 0.266666666666667 19 11 8 3 4 3 117282051 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 117282148 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 117282187 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 117282189 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 117282219 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117282226 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 117282356 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 117282371 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 117282523 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 117282744 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117283218 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117283257 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 117283311 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 117283377 T A Y N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 117283874 A T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 117283958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117284051 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 117284265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117284400 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 117284406 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 117284418 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117284523 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117284532 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117284678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117284715 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 117284809 A T N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 3 117284933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117285050 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 117285131 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 117285174 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117285461 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117285620 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 117285921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117285927 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 117285994 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 117286039 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 117286095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117286199 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117286383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117286440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117286502 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117286510 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117286591 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117286634 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117286646 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 117286754 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117287360 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117287409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117287462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117287582 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 117287975 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 117288085 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 117288107 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117288186 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 117288286 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 117288338 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117288362 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 117288658 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 117288677 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117289584 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117289657 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 117290306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117290657 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117293342 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117293678 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 117293681 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 117293934 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 117294239 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 117294292 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 117295828 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 117295910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117296089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117296764 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117297064 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 117297179 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 117297709 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117299950 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117300405 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117301559 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117302521 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117302637 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117302892 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 117302928 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117303612 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117303873 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 117304162 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117304967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117304999 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 117305035 A G Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 117305613 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 117305633 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117305697 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117306267 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 117306675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117307081 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 117307352 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 117307584 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 117307695 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 117307747 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 117307797 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 117308069 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117308254 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 117308342 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117313471 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 117315087 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 117315344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117315374 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117315424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117315997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117318068 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 117318308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117319077 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 117319186 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117319338 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117319744 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117320070 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117320176 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 117320180 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 117320197 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 117320216 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 117320251 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117320289 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 117320298 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 117320320 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 117320422 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117320481 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117320595 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 117320648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117320785 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117320788 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117320818 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117322317 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 117327225 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 117327317 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 117327442 T A Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 117328046 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 117328432 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117329158 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117329179 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 117329768 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117329843 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 117329849 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117329877 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117329893 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117330257 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117330307 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 117330421 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 117330724 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 117331092 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117331336 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 117331473 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 117331539 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 117331664 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 117332182 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 117332252 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 117332758 C A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 117332775 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 117332924 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 117332973 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 117333068 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 117333076 A G Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 117333168 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 117333517 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 117333559 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 117333574 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 117334041 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 117334107 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 117334376 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 117334410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117334663 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 117335213 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 117335220 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117335370 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 117335528 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 117335542 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 117335832 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 117336014 T G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 117336055 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117336082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117336197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117336211 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 117336361 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 117336550 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 117336566 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 117336602 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 117336640 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 117336700 C T N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 117336710 T G N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 3 117336887 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 117337273 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 117337358 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 117337430 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 117337600 T C Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 117337664 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 117337869 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 117337889 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 117337950 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 117338097 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 117338177 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 117338211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117338246 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 117338247 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117338285 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 117338323 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 117338345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117338402 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117338419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117338426 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 117338503 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 117338635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117338948 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117338994 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 117338995 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117339711 T G N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 117339836 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117339848 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 117339899 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117340098 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117340632 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117341066 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 117341109 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 117341212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117341718 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117342237 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117342352 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117342353 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117342429 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117342446 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 117342447 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117342537 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117342678 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 117342704 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 117342733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117342748 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 117342750 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 117342819 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 117342849 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 117342895 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117342940 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117342945 A T Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 117342956 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117343078 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117343091 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117343122 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117343124 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117343135 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117343173 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 117343177 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117343193 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 117343254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117343278 C A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 117343375 G A Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 117343520 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 5 7 1 3 2 3 117343626 C T Y Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 3 117343680 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 117343725 C T Y Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 3 117343739 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 117343751 G T Y N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 117343969 A C Y N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 3 117344129 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 117344191 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 117344230 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 117344289 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 117344463 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117344595 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 117344672 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 117344697 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 117344707 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 117344717 C T Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 117344754 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 117344802 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 117345015 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117345055 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 117345101 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 117345181 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117345235 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 117345299 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 117345392 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117345622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117345978 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 117346022 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 117346088 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 117346339 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 117346563 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 117346574 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 117346618 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 117346776 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 117346797 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 117346804 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 117346901 C T Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 117347004 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 117347063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117347083 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 117347443 G T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 117347452 T A N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 3 117347502 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.0625 0.9375 0 17 15 1 15 0 3 117347649 G A N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 3 117347688 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 117347717 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 117347737 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 117347769 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 117347772 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 117347824 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 117347908 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 117347930 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 117347941 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 117347972 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 117347990 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 117348097 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 117348175 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 117348449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117348762 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.5 0.416666666666667 8 16 1 6 5 3 117348767 A G N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 3 117348932 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 117348970 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117349112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117349239 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117349429 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117349756 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117349808 T C Y Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 3 117349809 T A N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 3 117349822 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 117349831 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 117349936 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117349978 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 117350024 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117350053 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 117350121 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 117350202 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 117350219 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 117350225 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 117350231 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 117350365 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 117350450 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117350471 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 117350838 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117351207 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117351215 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117351302 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 117351934 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 117352084 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 117352138 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 117352386 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117353010 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117353137 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117353165 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 117353519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117353634 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 117353923 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 117354101 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117354121 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117354341 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117354390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117354538 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117354572 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 117354630 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 117354680 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 117354769 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117354811 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117354828 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117354895 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117355162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117355422 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 117355524 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 117355547 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117355844 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 117356181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117356317 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117356410 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 117356983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117357128 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117357156 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117357284 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117357339 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 117357547 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 117357752 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 117357768 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 117357791 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 117357894 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 117357914 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 117357919 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 117357930 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117358017 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 117358044 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117359039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117359468 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 117360075 T C N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 117360988 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117361163 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117361634 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117361986 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117362597 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117362773 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117362948 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117363238 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117363893 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117364067 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117364134 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 117365352 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117365561 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 117365587 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 117365712 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 117365932 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117366078 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117366242 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 117366470 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117366791 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117366792 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117367075 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 117367087 G T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 117367132 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 117367289 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 117367568 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 117367718 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 117367943 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 117367973 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 117368061 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 117368253 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117368280 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 117368289 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117368363 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 117368392 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 117368509 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 117368579 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117368800 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117368815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117368820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117368845 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 117368872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117369028 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117369062 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117369241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117369423 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117369721 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 117370676 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 117370869 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 117370964 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 117370969 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 117371007 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 117371275 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 117371335 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 117371806 A T N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 3 117373309 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117373345 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 117373479 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117373831 T A N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 117373845 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 117373877 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 117373997 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 117374225 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117374636 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117374898 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117374985 G T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117375079 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117375295 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117375436 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 117375486 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 117375686 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 117375863 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117375929 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 117376273 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 117376474 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 117376548 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117376565 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 117377054 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117377119 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117377251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117377265 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117377285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117377692 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117377732 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117377735 G A Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 117378374 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 117378420 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 117378473 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 117378497 A T Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 117378536 C A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 117378539 A T Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 117378585 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 117378680 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 117378716 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 117378985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117379119 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 117379161 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117379280 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 117379288 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117379344 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117379417 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117379424 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 117379625 G A Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 117379682 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117379772 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117380155 T C N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 3 117380463 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 117380619 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117380674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117380726 C A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 117381158 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117381166 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117381294 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117381971 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117382078 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117382414 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117382531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117383854 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 117384460 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0 0.733333333333333 0.266666666666667 11 19 0 11 4 3 117384493 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 117384566 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117384622 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 117384717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117384749 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 117384814 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 117384891 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 117384901 C A Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 117384904 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 117384985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117385098 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117385397 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 117385820 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117385974 C G Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 117386014 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 117386056 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 117386077 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117386109 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117386245 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117386706 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 117386759 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 117387577 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117387824 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 117387835 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 117387952 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 117388050 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117388297 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117388502 A G Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 117388613 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 117388738 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 117388894 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117389152 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117389229 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117389497 T C Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 117389671 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117393175 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117395105 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117395835 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 117396179 G A Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 117396662 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 117396833 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117398091 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117399315 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117399452 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 117399463 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 117399491 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117399497 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117399551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117400505 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117400693 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117400736 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 117400810 T C N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 3 117400890 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117400903 C T N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 3 117401054 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 117401068 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 117401073 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 117401110 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 117401216 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 117401244 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 117401245 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 117401422 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 117401468 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 117401890 A C N N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.181818181818182 0.545454545454545 0.272727272727273 10 12 2 6 3 3 117401893 A G N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 9 11 2 5 3 3 117402066 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 117402067 A C N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 3 117402111 C T N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 3 117402122 G T N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 3 117402144 G C N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 3 117402171 A T N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 3 117402207 T C N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 3 117402222 C T N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 3 117402670 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117402682 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 117402790 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117402847 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 117402897 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 117402906 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 117402983 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 117402999 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 117403181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117403202 C A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 117403656 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117404285 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 117404396 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117404430 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 117404520 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 117404545 C T Y Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 117405240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117405810 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 117405812 C G Y N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 117405824 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 117405898 A T Y N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.153846153846154 0.538461538461538 0.307692307692308 11 15 2 7 4 3 117405913 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 117406001 C A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 117406037 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117406138 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 117406144 G C Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 117406163 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 117406192 C A Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 117406399 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 117406431 C A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 117406436 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117406748 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117406813 T A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 117406879 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 117406890 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 117406910 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117407117 C T Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 117407118 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 117407144 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 117407145 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 117407184 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 117407240 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 117407282 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 117407298 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117407314 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 117407414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117407495 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 117407591 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 117407886 C T Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 117407943 C T Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 117407988 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117408012 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 117408218 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 117408540 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117408549 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117408714 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117408816 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117408847 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 117408918 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 117409134 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 117409240 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 117409597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117409917 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 117409968 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117410081 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 117410542 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 117410582 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 117410925 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117411230 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 117411294 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117411536 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117411572 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117411651 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117411748 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117411767 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 117411787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117411872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117412132 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117412179 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117412200 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117412467 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117412646 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117412730 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117413060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117413070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117413134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117413157 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117413289 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117413425 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117413518 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117413705 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117413723 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117413870 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117413897 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117413983 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117414058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117414087 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 117414103 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117414356 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117414373 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 117414410 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 117414581 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117415081 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 117415098 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 117415138 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117415491 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117415870 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117415890 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 117416232 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117420798 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117420876 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117421816 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117421985 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117422119 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117422305 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 117422866 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 117423033 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 117423300 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 117423309 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 117423332 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 117423352 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117423470 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 117423779 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117423831 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 117423833 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117423880 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 117424087 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 117424142 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 117424163 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 117424214 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 117424335 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 117424476 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 117424574 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 117424640 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117424650 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 117424929 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 117425114 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 117425172 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 117425239 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 117425302 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117425317 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 117425482 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 117425521 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 117425631 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 117425645 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 117425665 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 117425711 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 117425842 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 117425844 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117425937 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 117426047 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 117426211 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 117426334 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 117426359 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 117426370 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 117426377 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 117426389 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117426409 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117426416 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 117426451 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 117426462 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 117426475 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 117426497 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 117426743 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117426923 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 117426961 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 117427134 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 117427191 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 117427434 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117427561 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 117427572 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 117427665 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 117427680 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 117427688 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 117427810 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117427861 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 117428040 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 117428046 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 117428164 G T N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0 0.692307692307692 0.307692307692308 9 17 0 9 4 3 117428185 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 117428258 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 117428407 G A Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 3 117428542 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 117428551 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 117428602 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 117428663 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 117428669 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 117428827 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 117428905 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 3 117428996 A C N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 117429006 G T N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 117429093 G A N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 3 117429131 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 117429158 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 117429241 T G N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 117429590 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 117429682 C T N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 117429991 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 117429999 C G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 117430056 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 117430176 C T N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 3 117430287 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 117430531 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 117430604 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 117430727 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 117430813 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117431021 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 117431127 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 117431129 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117431156 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 117431268 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117431305 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 117431316 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 117431585 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 117431643 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 117431657 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 117431790 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117431837 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 117432593 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117432606 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117433491 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 117433763 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117434347 T G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 117439115 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117443071 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117443541 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 117443803 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117448828 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117449180 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117449976 A G N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 117450720 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 117450747 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 117450968 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 117450983 A C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 117451054 T C Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 117451392 T A Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 117451787 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 117452003 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117452005 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117452054 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 117452638 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117453950 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 117453963 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 117454620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117455168 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117456179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117456381 A T Y N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 9 7 2 5 1 3 117456444 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117457432 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117459642 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117462077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117463731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117465483 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117466410 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 117466520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117466806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117468018 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117469047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117469314 G A N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 3 117470486 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117471827 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 117473375 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117476521 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 117477122 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117478543 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117480086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117481557 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 117481592 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 117481667 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 117481774 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 117481808 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 117481876 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 117482054 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 117482290 T A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 117482325 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 117482388 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 117482447 A T N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 117482576 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 117482668 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 14 10 4 6 2 3 117482678 C T Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 117483021 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 117483215 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 117483495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117483517 T G Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 117484037 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117484063 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 117484231 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117484291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117484292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117484431 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 117484504 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 117484561 C A Y N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 117484571 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 117485053 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 117485213 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117485525 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 117485535 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 117485979 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 117486000 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117486144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117486300 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117486312 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117486399 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117486796 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 117486808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117486947 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 117487028 C T Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 3 117487264 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117487267 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 117487301 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 117487307 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 117487322 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 117487410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117487476 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 117487496 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 117490706 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117490842 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 117491095 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 117491102 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117491142 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117491149 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117491175 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117491200 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 117491430 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117491453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117491542 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 117491706 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 117491879 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 117491930 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 117491936 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 117491943 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 117491983 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 117492296 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117492711 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 117493177 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 117493294 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117493351 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 117493370 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 117493398 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 117493406 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 117493414 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117493429 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 117493638 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117493643 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 117493694 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 117493762 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 117493904 G A Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 117494053 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 117494211 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 117494251 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 117494273 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 117494302 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 117494436 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 117494452 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 117494453 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 117494510 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117494611 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117494814 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 117494832 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117494936 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 117494950 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 117495027 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 117495028 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 117495072 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117495131 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 117495212 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117495227 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117495386 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 117495421 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 117495457 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117495468 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117495566 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 117496052 G A N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 3 117496239 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117496283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117496415 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117496496 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117496505 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117496564 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117496669 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117496710 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117496758 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 117496894 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 117496941 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 117497087 T C Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 117497092 T C N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 3 117497098 C T N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 117497116 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 117497439 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 117497530 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117497650 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117497731 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 117497808 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117497880 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117497939 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 117497983 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 117498028 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117498298 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 117498358 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117498371 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117498394 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117498408 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117498498 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 117498543 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 117498594 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 117498629 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 117498640 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117498738 T A N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 117498798 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 117498983 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 117498994 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 117499130 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117499275 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117499447 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 117499564 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117499568 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117499736 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 117499875 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 117500006 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 117500103 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 117500133 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117500138 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 117500340 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 117500444 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 117500459 A T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 117500570 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 117500627 T C Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 117500685 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117501465 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117501578 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 117501755 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 117501764 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 117501787 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 117501815 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 117501940 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 117502054 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 117502172 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 117502294 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 117502422 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 117502449 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 117502625 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 117502996 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 117503259 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 117503291 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 117503362 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 117503428 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 117503587 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117503620 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117503660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117504228 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 117504286 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 117504309 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 117504396 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 117504711 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 117505269 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117505290 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117505584 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117505805 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117506166 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 117506439 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 117506464 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117506618 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117506739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117506997 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 117507404 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 117507408 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117507434 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 117507515 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117507531 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117507548 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117507557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117507642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117507650 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 117507812 A G Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 117507881 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 117508317 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 117508380 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117508520 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117509232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117509478 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117510661 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 117511130 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117511835 C G N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 117512219 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 117512257 G C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 117512294 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 117512945 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 117513488 A T Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 117513706 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 117513743 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 117513922 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 117514038 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 117514051 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 117514268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117514480 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 117514704 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 117514810 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 117514819 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 117514942 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117514981 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 117515048 A T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 117515396 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 117515435 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 117515913 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 117516917 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117517077 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 117521149 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117521550 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117523841 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117525058 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 117525162 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117525814 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 117525827 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 117526891 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 117527062 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 117529081 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117529272 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117529299 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117529522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117529525 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 117529769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117530014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117533388 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117533880 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117533958 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117535664 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117537206 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117537376 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117537380 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 117537749 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 117539779 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117540578 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 117541174 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117545756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117547330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117548381 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117549203 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117549440 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 117549695 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117549772 G C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 117549809 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 117549815 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 117549841 T G Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 117549854 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 117550163 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 3 117550329 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 117550407 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 117550509 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 117550583 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 117550595 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 117550612 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 117550838 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 117551099 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 117551150 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 117551151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117551177 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 117551181 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 117551261 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 117551578 A G N Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 3 117551642 A C N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 3 117551699 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 117551757 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 117551818 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 117551869 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 117552006 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 117552125 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117552906 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117552907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117552984 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117553295 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 117553677 G A Y Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 6 8 1 4 2 3 117553685 G A Y Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 9 7 1 7 0 3 117553926 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117553952 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117554408 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117554494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117554808 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 117554859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117554981 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 117555066 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 117555243 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117555415 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117555494 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117555522 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117555980 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117556304 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117557448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117558144 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117558153 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117558381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117558532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117558635 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 117558652 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 117558741 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 117559038 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117559044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117559202 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117559439 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 117559483 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117559514 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117559540 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 117559672 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 117559862 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 117559878 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 117559927 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117560265 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 117560343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117560411 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117560444 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117560613 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 117560722 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 117560969 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 117561123 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 117561683 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 117561984 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117562085 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117562706 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117562756 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 117562998 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117563264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117563578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117564084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117564109 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117564275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117564564 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117565126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117565289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117565380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117565610 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117565677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117566078 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117566276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117567024 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117567053 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117567128 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117567143 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117567184 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117567211 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117567212 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117567281 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 117567815 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117567998 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117568323 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 117568349 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117568390 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117568570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117568802 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117569207 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117569267 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117569368 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117569432 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117569482 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117569586 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117569611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117569634 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117569778 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117569927 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 117572091 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 117572679 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 117573561 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117574134 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117575435 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117576209 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117577887 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117578217 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117578529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117578632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117579658 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117580910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117581004 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117581235 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117581460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117581758 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117581891 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117582016 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117582055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117582065 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117582407 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117582481 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117582982 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117583029 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117583170 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117583214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117583973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117584393 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 117584615 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117584841 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117585212 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117585319 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117585350 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117585769 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 117585821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117586230 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 117586316 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117586567 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117586769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117587356 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117587705 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117588033 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117588295 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117588367 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 117588378 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 117588536 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117588552 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117588557 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117588690 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117588907 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117588916 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117588926 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117589276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117589544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117589946 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117590338 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117590481 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117590626 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 117590654 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 117590775 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 117591057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117592527 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117592573 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117593753 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117596750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117598742 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 117603067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117604092 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117604986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117604996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117605102 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117605228 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117605447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117605774 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117605916 A C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 117605928 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117606085 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117606260 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117606298 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117606494 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117606580 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117606653 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117607480 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117607616 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117608722 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117609360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117609713 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117610072 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 117610200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117610540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117610689 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117610947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117611034 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117611675 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117611839 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 117613839 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117613948 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117614080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117614200 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117614382 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117614384 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117614412 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 117614656 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 117614992 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117615113 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117615262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117615429 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117615564 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117615576 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117615605 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117615624 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117615649 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117615689 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117615798 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117616283 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117616516 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117616802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117617283 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117617421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117617845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117617869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117617978 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117618084 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117618143 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117618225 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117618272 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117618485 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117618557 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117620330 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117621117 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117621150 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117621378 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117622108 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117624501 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 117625517 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 117627160 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 117627575 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117628104 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117628875 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117631898 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117631935 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117632141 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117632338 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117633038 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117634187 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117634198 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117634239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117634371 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117634784 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 117635004 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117635062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117635263 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 117635708 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117636401 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117636600 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117636640 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117636809 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117636834 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 117637365 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117638601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117639839 G C N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.153846153846154 0.846153846153846 0 15 11 2 11 0 3 117642158 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117643752 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117644036 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117644195 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 117644437 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 117644442 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 117645310 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117645680 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117646175 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117647025 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117647629 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 117647955 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 117648441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117648779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117648787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117648937 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117649490 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117649521 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117649540 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 117649572 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117649606 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 117649726 C G N N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 3 117649748 T C N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 3 117649770 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 117649773 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 117649815 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 117649901 C T N Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 3 117649958 T C N Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 3 117649996 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 3 117650336 A C Y N 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0 0.75 0.25 6 10 0 6 2 3 117650865 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 117650883 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 117650923 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117650951 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117650964 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117650969 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117650977 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117650999 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117651086 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 117651359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117651486 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117651728 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 117651809 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117651949 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117652766 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 117652767 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 117653240 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 117653369 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 117653505 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 117654056 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117654117 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117654134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117654218 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 117654350 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 117654393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117654497 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117654567 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117654574 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117654642 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117654647 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117654693 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117654695 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117654871 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117655029 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117655192 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117655355 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 117655461 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 117655564 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117655687 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 117655707 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 117655834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117656121 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117656170 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117656186 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117656204 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117656231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117656239 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117656306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117656422 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117656427 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117656470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117656514 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117656524 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117656602 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 117656610 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 117656665 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117656693 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117656737 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 117656853 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 117656859 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 117656869 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 117656975 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 3 117657197 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117657247 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117657294 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117657333 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117657427 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117657535 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117657576 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117657593 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117657675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117657715 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117657764 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117657797 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117657871 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117657919 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 117658037 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 117658071 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117658123 G T N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0 0.8 0.2 12 18 0 12 3 3 117658226 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117658254 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117658446 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117658715 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117658716 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117658819 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117658957 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 117659060 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117659232 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117659370 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117659500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117659558 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117659844 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 117660038 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 117660312 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 117660507 C G N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 117660539 G A N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 117660790 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 117660901 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 117660994 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 117661075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117661441 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117661472 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117661619 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 117661708 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 117662042 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117662154 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117662193 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117662306 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117662394 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117662544 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117662725 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117662868 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117663120 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117665228 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 117665285 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117665358 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117665374 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117665449 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117665476 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117665525 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 117665588 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117665609 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117665611 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117665697 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 117665706 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 117665753 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 117665817 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 117665844 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 117665915 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 117666752 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 117667224 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117667371 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 117667582 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 117667685 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 117667970 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 117667988 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117668016 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 117668115 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 117668250 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 117668290 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117668322 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 117668363 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 117668395 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 117670243 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117670504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117671011 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 117671235 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117672334 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117672933 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 117673910 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 117674228 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117674365 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 117675300 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 117675920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117675943 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117675992 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117676041 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 117676423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117676447 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117676452 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117676498 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 117678308 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117679367 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 117679462 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 117679555 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117679652 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117679783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117679855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117679910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117679928 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117679934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117679952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117679956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117680027 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117680178 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117680384 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117680567 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117680699 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117680879 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117681147 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 117681218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117681230 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117681504 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117681564 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117681578 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117681579 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117681728 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117681754 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117681772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117681786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117683496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117683580 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117684453 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117684552 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117685327 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117685856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117685857 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117685869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117686070 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117686125 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117686741 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117686849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117687404 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117687463 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117687693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117687833 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117687887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117688167 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117688182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117689080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117689488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117689502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117689580 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117689606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117689642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117689833 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117689873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117689980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117690081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117690129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117690134 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117690324 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 117690455 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 117690592 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117690756 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117690788 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117691436 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117691486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117691506 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 117691571 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117691582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117692070 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117692284 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117692399 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117692764 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117692774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117692799 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117692949 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 117692962 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117693297 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117693542 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 117694011 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117694060 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117694208 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117695369 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 117696072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117696678 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117697211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117697516 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117699001 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117700090 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 117700270 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117700337 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117700744 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117702242 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117703641 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117710657 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117711567 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117712021 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117713363 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117713556 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 117714261 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 3 117714817 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117715161 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 117715353 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117715887 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117715999 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117716348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117716742 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 117716947 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 117717495 G A N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 117719074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117720601 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117720682 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117720786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117721748 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117723360 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117723557 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117723874 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117724681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117725047 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 117725061 T A N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 117725464 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 117725645 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117725910 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 117726353 G A N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 117726548 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 117726585 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 117726600 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 117726995 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 117727068 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117727156 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117728901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117729433 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117729466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117729574 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 117730315 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117730356 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 117730783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117730856 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117731090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117731110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117731431 T A N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0 0.583333333333333 0.416666666666667 7 17 0 7 5 3 117731668 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117731675 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 117733073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117733225 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 117736463 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117736842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117738513 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117740865 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117741120 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117743117 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117743200 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117743627 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 117743628 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 117753244 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117753530 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0 0.764705882352941 0.235294117647059 13 21 0 13 4 3 117755770 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117756249 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117757402 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117757857 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117763651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117764344 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117764410 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117766880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117767212 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117768870 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117768952 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 117769155 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117770271 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117770748 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117771064 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 117771114 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 117771538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117771879 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 117772164 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 117772225 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117772320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117773201 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 117773235 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117773314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117773762 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117773824 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.0555555555555556 18 18 1 16 1 3 117773972 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117773996 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117774003 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 117774127 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 117774338 A C N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 117774409 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 117775746 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 117775927 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 117776327 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117776370 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117777071 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 117777091 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 117777452 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 117777453 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 117777467 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 117777530 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 117777638 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117777671 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117777953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117778553 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 117778700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117779375 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117780989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117782218 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117785026 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117787660 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117788467 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117788884 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117791272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117791374 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117793056 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117793597 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117794987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117795075 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117795473 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117798118 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 117798781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117800904 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117801894 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 117802103 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117802252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117802592 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117803635 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 117803653 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117803812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117804072 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 117804534 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117805412 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 117805535 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117806174 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 117806233 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 117806990 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 117807098 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 117807118 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 117807218 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 117807671 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117814275 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117814277 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117814297 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 117814358 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 117814431 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 117814442 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 117814841 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 117814861 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117815542 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 117815749 A C N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 117815775 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117816147 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 117816188 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 117816232 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 117816288 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 117816366 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 117816420 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 117816532 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117816572 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 117816595 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 117816796 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117816903 A C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 117816934 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 117816942 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 117817059 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 117817172 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 117817178 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 117817257 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 117817347 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 117817377 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 117817505 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117819517 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117820845 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117821838 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 117822851 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0 0.722222222222222 0.277777777777778 13 23 0 13 5 3 117826792 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117828797 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117831103 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 117831121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117831433 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117834684 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117835381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117837210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117838849 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 117840726 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117841244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117842188 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117843659 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117844153 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117845102 G T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 117845105 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 117846107 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 117846416 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 117847153 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117849155 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117849261 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 117850693 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117853104 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 117853765 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 117853923 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 117855355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117856880 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117856986 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117857004 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117858809 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117859026 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 117859215 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117859335 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117861380 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117864164 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117865900 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117867543 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 117868153 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117868291 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 117868335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117868972 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 117870312 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117870735 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117871938 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117874757 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117875303 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117875886 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117876192 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117876226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117877526 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117877939 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117878105 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 117878160 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 117878169 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 117878923 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117879998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117880129 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117880393 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117880467 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117881031 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117881537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117881639 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117882009 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117888728 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117888821 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117889484 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117889491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117889608 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117889623 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117889725 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117889919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117889970 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117890102 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117890656 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117890740 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117890771 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117890772 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117890793 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117890891 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117890896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117891192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117891206 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117891320 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117891326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117891434 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117891516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117891671 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117891730 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117892709 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117893586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117893656 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117893686 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117893763 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117893942 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117895161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117895325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117895832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117896127 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117897761 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117898346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117899034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117899082 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117900098 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 117900341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117902388 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117902820 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117906899 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117907412 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117908962 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117909289 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117909728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117910474 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117911299 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117912488 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117912742 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117912927 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117914308 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 117914803 G C N N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 117915137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117915366 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117916020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117916234 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117917971 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117919157 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117919786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117919809 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117920328 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117920509 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117920703 A C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 117921216 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117922420 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 117922921 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 117923416 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117923800 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 117923945 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117924053 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 117924065 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 117924096 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 117924113 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117924260 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 117924278 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 117924368 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 117924657 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117924839 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 117924958 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 117924965 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117925060 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 117925384 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 117925542 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 117925892 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117925923 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117925947 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117925980 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 117926361 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117926580 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117927717 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 117928039 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117928696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117931683 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117931895 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117932110 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 117932170 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 117932379 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 117932396 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117932453 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 117932497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117932502 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117932525 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 117932553 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 117932663 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 117932709 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 117932786 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 117933073 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 117933133 A T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 117933193 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 117933213 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 117933248 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 117933266 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 117933301 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 117933468 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 117933523 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117933530 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 117933628 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 117933645 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 117933842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117933845 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117934039 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 117934110 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 117934150 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117934285 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 117934424 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 117934505 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 117934535 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 117934609 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 117934639 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 117934908 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 117935037 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 117935062 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 117935069 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 117935327 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117935328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117935356 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117935469 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117935486 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117935487 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117935500 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117935745 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 117935806 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117936032 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117936069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117936100 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 117936218 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117936283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117936429 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 117936483 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 117936604 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117936612 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 117936863 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 117936923 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 117936990 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117937421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117937623 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117937651 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 117937743 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117937940 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 117938317 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 117938418 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117938440 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 117938442 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117939046 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117939049 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117939118 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117939126 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117939574 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117939602 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117939878 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117942447 A T Y N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 117942779 T A Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 3 117942815 C T Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 117942863 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117943222 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 117943325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117943464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117943905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117944190 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117944822 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117944987 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 117946966 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 117947163 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 117947297 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 117949178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117952355 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 117953625 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 3 117953850 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 117956850 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117957866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117958696 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117959555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117961952 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117962513 T C N Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0 0.8 0.2 4 6 0 4 1 3 117963188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117963474 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 117963577 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117963628 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117963693 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117964774 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 117964814 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 117965126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117965289 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117965538 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 117965733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117966126 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117966292 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117966552 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117966557 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117967117 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117967400 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 117967415 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117967679 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117968065 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 117968066 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 117968117 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 117968121 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 117968192 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 117968701 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 117969164 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117969224 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117969296 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117969860 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 117970186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117970367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117971051 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117973260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117974420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117975416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117975634 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 117977446 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117977731 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 117977940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117979982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117980524 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 117980562 C G N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 117982347 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117982519 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 117982560 T A Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 117984320 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117985616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117986019 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117987575 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 117988581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117988774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117989420 G A Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 117990749 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117991258 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117991769 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117992121 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117992183 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117992288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117992653 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 117992985 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117993273 C G Y N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 3 117994783 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117996187 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117996268 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117996377 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117996521 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 117996813 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117996824 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117997312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117998637 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117999033 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 117999045 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 117999356 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 117999803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 117999944 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 117999991 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118000015 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118000041 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118000249 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118000292 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118000701 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118000781 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118000965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118001260 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 118001316 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118001407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118001826 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118001976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118003967 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 118004196 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118004443 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 118004466 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 118004480 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 118005253 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118005694 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 118006711 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118006736 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118007017 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118007806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118008158 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118008262 A C N N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.363636363636364 0.636363636363636 0 15 7 4 7 0 3 118010406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118010510 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 118012411 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118012469 A T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 118012790 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118013823 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118013954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118014023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118014082 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118014090 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118014192 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 118014265 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.0625 0.75 0.1875 14 18 1 12 3 3 118014580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118015044 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 118015601 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118015704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118015877 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118015996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118016179 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 118016367 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118016423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118016427 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118016630 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118016703 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118016813 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118016978 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118017068 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 118017106 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118017142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118017152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118017202 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118017220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118017308 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118017322 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118017546 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118017766 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118017785 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118017919 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118018050 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 118018331 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118018335 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 118018413 C A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118018477 T C Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 118018494 C A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 118018618 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118018703 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118018719 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 118018740 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118018776 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118018880 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 118018885 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 118018901 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 118018904 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118018964 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118019011 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118019092 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118019152 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 118019276 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118019361 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118019900 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 118020061 C T Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 118020229 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 118020295 G A Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 118020321 A T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 118020418 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118020422 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118020436 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118020813 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118021058 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 118021241 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118021719 A G Y Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 3 118021739 G T Y N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 3 118021849 A T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 118021896 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 118022104 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 118022193 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118022639 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 118022723 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118022782 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 118022798 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 118022814 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 118022858 A G Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 118023195 A G Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 118023312 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 118023373 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 118023426 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 118023471 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 118023548 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 118023989 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 118024395 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 118024429 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 118024458 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118024555 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118024783 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118024930 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118024976 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 118024987 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118024991 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 118025062 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 118025082 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 118025100 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118025135 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118025169 G C N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 118025211 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 118025229 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 118025401 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 118025643 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118025683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118025832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118026564 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 118026594 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 118026619 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 118027103 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 118027120 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 118027204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118027642 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118027762 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118028422 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118028904 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118029043 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118029537 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 118031587 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 118032374 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 118032962 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 118033243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118033282 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118033447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118033808 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118034242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118034281 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118034513 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118034906 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118035664 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118035973 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 118037078 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118037231 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118037692 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 118037750 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118037775 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 118038516 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118038611 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 118038619 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118038663 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 118038666 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 118045355 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 118045475 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118045948 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118049142 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118050694 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 118050749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118050914 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 118051317 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118051515 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118051875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118052068 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 118052083 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 118052844 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 118052937 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118054539 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118054576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118055325 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118057018 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118057514 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118057556 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118058112 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 118058506 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118058522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118058536 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 118058734 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 118059196 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118059807 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118059871 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 118060239 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 118060381 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 118060444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118060588 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 118060631 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118060648 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 118060798 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118060940 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 118061286 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 118064464 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 118064519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118064569 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118064887 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 118065045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118065286 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 118065314 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 118065797 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 118066000 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 118066135 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118066683 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118066774 C A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 118066960 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 118067121 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118068425 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118068719 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118069057 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118069204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118069237 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118069606 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118069607 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118069691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118069810 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118069977 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118070319 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118070323 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 118070482 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118070560 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118071121 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118071235 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118071349 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118071353 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118071599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118071612 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118071622 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118071930 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118071968 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118072067 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118072090 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118072218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118072238 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118072642 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118072668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118072694 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118072709 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118072807 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118072954 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118073019 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 118073066 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118073091 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118073107 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118073300 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118073354 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118073388 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118073391 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118073492 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118073510 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118073606 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118073849 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118073919 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118074004 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118074042 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118074091 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118074154 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118074310 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118074346 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118074515 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118074541 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118074583 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 118074602 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 118074685 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118074711 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118074737 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118074799 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 118074874 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118075065 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118075579 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 118075660 G C Y N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 118075722 A T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 118075756 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 118075767 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 118075809 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 118076072 A G Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 118076093 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118076141 T A Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 118076152 T A Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 118076390 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118076537 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118076591 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118076607 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118076613 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118076654 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118076679 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118076997 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118077002 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118077132 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118077203 T C Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 118077204 G T Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 118077235 G C Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 118077305 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118077361 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118077367 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 118077501 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118078079 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118078108 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118078143 G T Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 118078380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118078400 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118079045 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 118079094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118079295 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118079358 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118079491 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118079525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118079788 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118079896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118080043 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118080289 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118080325 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118080943 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118081036 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118081316 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118081355 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118081416 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118081511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118081599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118082215 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118082235 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118082428 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118082601 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118082629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118087301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118087486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118087602 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 118087947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118088147 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 118088317 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118088608 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 118088853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118089044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118089122 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118089993 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 118090070 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118090134 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 118090795 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 118090949 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 118090969 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118091172 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 118092450 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118093932 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118094265 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118094929 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 118095016 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 118095867 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118097293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118098842 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118100923 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118101539 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118101571 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 118102307 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 118103390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118103872 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 118105995 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118106022 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118108753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118110195 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118111922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118111941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118111961 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118112022 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 118112046 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 118112047 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 118112183 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 118113059 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118113496 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118113503 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118115680 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118115835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118116189 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 118116428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118116789 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 118117401 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118117939 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118118168 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 118120467 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118120505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118121508 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118124371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118126476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118126788 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118126950 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118126981 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118127003 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 118127747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118128697 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118128933 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118128963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118130623 A G Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 118130628 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 118130645 C A N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.153846153846154 0.538461538461538 0.307692307692308 11 15 2 7 4 3 118133929 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118134471 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118135202 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118136453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118137399 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118140026 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118140083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118140265 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118140959 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118141945 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 118142675 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 118143108 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118144204 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 118145640 A G Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 118146096 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 118147400 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 118147683 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118148860 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118148926 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118149558 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118149662 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118150009 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 118150645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118151014 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118151707 C T N Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 3 118152237 A T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 118152446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118155104 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118155354 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118158477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118158822 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 118159730 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118164240 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 118164666 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118165559 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118165670 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118167546 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 118167855 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 118167939 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118168258 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118169114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118169214 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 118169270 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 118169354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118170080 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118170156 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 118170230 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118171787 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118171812 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118173956 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118174024 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118176089 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 118176094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118176108 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118176165 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118176186 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118176203 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118176320 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 118176351 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 118176402 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 118176422 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 118176581 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118176724 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 118178047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118178086 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 118178098 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 118178219 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118178246 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118178561 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 118178590 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118178601 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118178605 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118178617 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118178852 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118179179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118179375 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 118179376 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 118179429 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118179444 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118179491 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118179522 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118179636 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 118179754 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118179926 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 118179972 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 118179988 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 118179999 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 118180018 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118180107 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 118180156 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 118180204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118180264 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118180292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118180302 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 118180428 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 118180519 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 118180636 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 118180646 C A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 118180653 A C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 118180692 G T N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 118180931 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118180985 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 118181050 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 118181085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118181157 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 118181217 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 118181393 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 118181769 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118181795 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118181810 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 118181866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118181873 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118182366 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 118182431 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118184186 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118185642 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 118186552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118186726 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118187789 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118191087 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 118191192 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118191350 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 118191397 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118191420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118191572 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 118191605 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118191689 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 118192074 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 118192092 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 118192671 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 118192714 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 118193067 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 118193232 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 118193320 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 118193562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118193766 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 118194076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118194434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118194826 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 118194980 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 118195062 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 3 118195160 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118195249 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 118195445 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 118195503 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118195654 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118195733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118195791 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 118196079 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118196346 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118196581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118196798 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 118197363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118198287 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118198290 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118198307 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118198318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118198432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118198462 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118198559 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 118198582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118198644 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 118198839 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118198915 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 118198943 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118199101 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118199178 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118199280 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118199411 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 118199446 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118199502 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118199561 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 118199577 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118199727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118199777 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118199851 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118199857 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118199967 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118200005 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118200012 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 118200062 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118200305 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 118200315 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 118200339 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118200389 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118200396 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118200443 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118200456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118200571 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 118200627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118200666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118200742 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118200768 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118200780 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 118200809 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 118201191 G A N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 3 118201218 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 118201220 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 118201243 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 118201254 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 118201444 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 118201507 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 118201786 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 118201795 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118201895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118202036 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 118202106 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118202113 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 118202141 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 118202168 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 118202192 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 118202215 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118202232 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 118202281 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 118202312 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 118202321 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 118202370 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 118202484 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 118202553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118202601 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118202790 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 118202801 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 118202887 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 118204347 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 118205686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118205952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118206933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118209703 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 118209806 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 118209819 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 118209904 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 118210021 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 118210167 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 118210242 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 118210372 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 118211632 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118212914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118213352 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118213571 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118213721 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118214543 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118214550 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118215406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118215684 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118216693 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 118216930 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 118217403 A C Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 118218420 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118218849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118218878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118219267 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 118219765 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118219894 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118220243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118220517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118221053 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118221321 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118223282 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118223665 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118224986 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118225694 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118226508 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118226571 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118226796 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118228793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118229043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118229177 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118230890 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118231085 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 118232089 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 118232299 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 118233432 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118233449 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 118233526 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 118237820 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118239934 T G Y N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 3 118240678 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 118240888 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118240959 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118241804 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118242181 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118242239 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118244255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118244827 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118244963 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118245379 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118245574 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118245815 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118247689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118247783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118247784 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118248047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118248119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118248874 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118248956 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118248977 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118249328 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118249843 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118250500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118252200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118255381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118255698 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118255938 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 118256690 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118256871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118257909 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 118259939 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118260087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118261636 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118262421 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 118263129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118263574 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 118266919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118267500 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118267608 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118267617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118267631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118267639 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118267718 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118267723 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118267781 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118267787 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118268239 T A N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 118268511 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118269754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118270379 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118270429 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118270760 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118270769 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 118272345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118272346 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 118272409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118272436 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 118272486 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 118272572 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118272643 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 118272679 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118273789 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118274134 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118281531 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 118283737 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 118283851 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118286188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118286268 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 118286689 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 118287074 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 118287305 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118288314 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 118288425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118288683 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118289326 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118289365 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 118289383 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 118289384 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118289396 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 118289461 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 118289484 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 118289539 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 118289591 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 118289645 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 118289709 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 118289723 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 118289882 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 118289956 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 118290214 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 118291245 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118291303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118291529 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 118292232 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 118293506 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118294252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118295210 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 118295361 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 118295447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118295586 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 118295882 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 118296049 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 118296247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118296662 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118296687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118296790 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118296916 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118296927 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 118297019 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 118297044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118297456 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 118297645 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118298119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118298919 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118300056 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118300375 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 118301770 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 118302393 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 118303097 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118303494 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118303754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118303774 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118303826 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 118303977 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 118304420 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 118305163 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118305700 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 118306292 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118307341 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118309153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118309180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118311514 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118312466 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118313785 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118313818 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118314441 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118315270 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118316524 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118316757 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 118318142 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 118319384 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118319602 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118319757 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118319804 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118320734 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 118321205 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118321630 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118321642 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118321767 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118322424 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118322602 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118322712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118322714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118322735 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118323424 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118323463 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118323489 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 118323572 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118323653 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118323786 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 118323787 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118323920 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118324033 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118324350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118324392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118324401 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118324531 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118324665 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118324682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118324689 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118324706 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118324799 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118324950 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118324962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118325043 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118325093 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118325137 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118325157 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118325317 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118325339 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118325396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118328769 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118329054 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118334162 G T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 118335544 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 118335825 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118338551 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 118338687 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118339016 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118339337 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 118339501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118340968 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 118341127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118341129 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 118341149 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 118342333 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 118342350 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 118342384 A C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 118342390 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 118342406 A T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 118342561 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 118342648 A G Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 118342660 A G Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 118342704 T G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 118342867 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 118342961 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 118343094 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 118343121 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 118343163 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 118343206 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 118343263 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 118343271 C A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 118343278 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 118343307 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 118343311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118343320 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 118343329 A C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 118343352 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 118343407 T G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 118343432 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 118343454 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 118343470 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 118343503 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 118343504 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 118343531 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 118343605 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 118343629 C G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 118343646 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 118343666 G C Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 118343704 C A Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 118343745 A T Y N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 118343807 T C Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 118343930 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 118344109 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 118344115 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 118344144 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 118344330 T C N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 118344333 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 3 118344371 C A Y N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 118344413 T A N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 3 118344483 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118344515 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118344596 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118344706 A G N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 3 118344940 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 118345203 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 118345308 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 118345409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118345432 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 118345486 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 118345503 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 118345527 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 118345552 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 118345634 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 118345687 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118345774 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 118345847 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 118346149 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 118346204 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 118346252 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 118346356 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 118346677 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 118346687 C T Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 118346966 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 118347285 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 118347326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118347419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118347448 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 118347934 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 118348596 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118349185 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 118349426 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118349962 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 118349976 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118350184 A G N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 118350219 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 118350228 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 118350247 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 118350311 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 118350359 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 118350503 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 3 118350746 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118351135 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118351548 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 118352004 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 118352086 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 118352180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118352204 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 118352217 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 118352435 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 118352547 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118353316 T A N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 118353330 T A N N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 3 118355439 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118355935 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 118356142 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118356230 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118356282 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118356390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118356407 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118356419 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118356587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118356671 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 118356707 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 118357172 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 118357178 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 118357283 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 118357314 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 118357372 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 118357672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118357975 C T Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 118358432 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118358454 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 118358683 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118359319 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 118359431 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 118359517 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 118359540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118359703 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 118359783 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 118359846 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 118359937 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 118359960 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118359977 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 118360013 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 118360626 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 3 118360627 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 118360720 C G N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 118360807 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 118360870 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 118361023 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 118361076 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 118361145 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 118361238 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 118361480 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 118361528 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 118361718 T A Y N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.153846153846154 0.846153846153846 0 15 11 2 11 0 3 118361720 T A N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0 1 0 14 14 0 14 0 3 118361746 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 118361765 G T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 3 118361807 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 118362004 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 118362015 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 118362624 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 118362625 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 118363521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118363524 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118364797 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 118365170 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118366167 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 118366253 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118366325 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 118366347 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 118366386 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 118366397 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 118366452 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 118366712 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118366803 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118367008 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118369784 T G Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 3 118370769 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118371071 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118371370 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 118371839 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 118371856 T G N N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 3 118372374 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 118373163 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118374030 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118374273 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118374286 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 118374842 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118375214 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118375299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118375816 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118376400 T C N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 3 118377263 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118377426 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118377574 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118377622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118377948 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 118378951 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118378978 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118379153 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118380898 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 118381089 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 118381277 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118382555 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118386882 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118388482 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118389458 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118391154 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118391802 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118393204 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118394213 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118396864 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118397326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118398781 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118399434 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118399977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118400379 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 118400467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118401159 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118401763 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 118401791 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118402365 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118402505 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118402629 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118402631 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118402761 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 118404351 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118404423 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118404790 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118405539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118405661 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 118405709 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118405817 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 118406365 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 118406555 T A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 118406630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118406682 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 118406694 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118406798 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 118406938 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 118406957 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 118406972 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 118406980 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 118407132 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 118408103 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118408340 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 118408645 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 118408685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118411206 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118413961 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118414284 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118414642 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118414883 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118414886 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 118416631 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118424001 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 118424452 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118426332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118426955 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118427036 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118427408 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118428062 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118428071 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118429164 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118430173 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118431355 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118432149 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 118434824 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118436576 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118437142 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118437485 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 118437716 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118438463 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118438982 G T Y N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 3 118439009 G T Y N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 118439024 A G Y Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 3 118439073 G A Y Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 118439168 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 118440046 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118441727 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118442422 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118442564 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 118442685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118442688 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118443125 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 118443142 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 118443283 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 118443481 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 118443493 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 118443589 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118444445 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 118445127 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 118445265 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118445729 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 118448193 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118448235 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118448298 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 118449946 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 118450015 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 118450162 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118451552 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118451709 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118451932 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118452628 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 118453145 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118454037 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118454070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118455172 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118455531 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118455601 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 118456036 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118456797 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118456856 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118456942 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118458089 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118458633 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118458929 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118461718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118464202 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 118464457 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118465413 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118465922 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118466100 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118466367 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118466426 T A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 118467050 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 118467105 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118468090 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 118468186 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 118468201 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 118468245 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 118468330 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 118468721 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 118468731 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 118468897 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 118468933 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 118469164 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 118469231 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 118469261 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 118469387 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 118469640 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 118469772 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 118469895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118470025 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 118470473 C T N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 118470773 A T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 118470898 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118470999 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 118471085 C A Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 118471162 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 118471208 C T Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 118471223 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 118471390 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 118471391 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 118471630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118471648 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 118471758 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 118471880 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 118471891 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 118472161 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 118472230 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118472263 T G Y N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 118472264 T G Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 118472559 T C Y Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 118472568 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 118473621 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 118473958 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 118474076 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 118474112 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 118474127 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 118474186 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 118474204 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 118474211 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 118474220 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 118474247 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 118474415 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 118474552 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118474644 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 118474711 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 118474739 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 118474817 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 118474887 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 118474937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118475057 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 118475106 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 118475186 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 118475214 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 118475233 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 118475377 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 118475896 G T N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 3 118476105 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 118476697 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118477415 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118477765 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118477953 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 118478028 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 118479281 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 118479289 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 118479471 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 118480022 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 118480390 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 3 118480524 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 118480543 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 118480877 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 118481047 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118481080 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118481528 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118481677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118482402 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 118482792 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118482890 G T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 118483022 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 118483111 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 118483271 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 118483297 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 118483590 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 118483883 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 118484339 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118484519 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 118485910 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118486311 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 118486327 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 118486363 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 118486605 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 118486832 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118486845 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 118486911 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 118487086 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 118487190 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 118487205 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 118487300 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 118487522 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 118487563 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 118487620 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 118487639 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 118488368 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118488467 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 118488512 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 118488558 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 118488650 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 118488657 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 118488684 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 118488696 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 118488703 G C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 118488757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118488772 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 118488825 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 118488872 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 118488898 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 118488905 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 118488918 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 118488933 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 118488979 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 118488982 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 118488994 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 118489106 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 118489167 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 118489240 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 118489458 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118489571 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 118489650 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 118489665 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118489717 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 118489777 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 118490013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118490027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118490095 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 118490354 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 118490366 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118490550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118490780 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 118490792 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 118490820 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 118490878 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118491173 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118491311 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 118491476 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 118491503 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118491538 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 118491541 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118491631 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 3 118491689 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 118491770 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 118491821 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 118491993 A C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 118492341 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 118492355 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 118492430 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 118492436 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 118492448 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 118492541 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 118492548 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118492580 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 118492597 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 3 118492611 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.3 0.7 0 26 14 6 14 0 3 118492631 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.3 0.7 0 26 14 6 14 0 3 118492660 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 118492693 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 3 118492752 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 3 118492761 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 3 118492792 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 3 118492808 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 118492810 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 118493072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118493339 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 118494009 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 118494187 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118494314 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 3 118494325 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 3 118494559 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 118494582 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118494619 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 3 118494620 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 3 118494641 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 3 118494650 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118494699 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 3 118494809 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 118494895 A G N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 118494988 T C N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.230769230769231 0.769230769230769 0 16 10 3 10 0 3 118495342 A G N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 3 118495581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118495789 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118496605 A T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 118496983 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 118497367 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 118497992 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118498120 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 118498142 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118498492 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 118498728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118499155 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 118499416 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 118499570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118499944 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118500058 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 118500534 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118500821 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 118500930 G A Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 118501031 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 118501376 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118501384 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118501763 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 118501990 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 118502392 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 118502849 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 118502861 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 118503384 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 118503642 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118503727 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 118503806 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 118504180 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 118504902 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 118504942 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 118505264 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 118506802 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118506945 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 118506962 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118507073 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118508627 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118508980 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118510063 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118510382 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118510578 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118511456 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118511671 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118512708 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 118512776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118513267 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118513471 T C Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 118514359 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 118514378 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 118514383 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118515322 C A Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 118515388 C T Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 118515505 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 118516058 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118516419 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118516677 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118516919 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118517039 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118517280 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 118519000 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 118519059 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 118519108 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 118519913 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 118519935 A T Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 118519975 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 118520356 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118520419 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 118520745 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 118520759 A T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 118520780 T A N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.2 0.666666666666667 0.133333333333333 16 14 3 10 2 3 118520860 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 118521030 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118521223 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 118521287 G T Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 118521290 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 118521402 C A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 118521441 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118521654 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 118521724 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 3 118521756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118522027 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 118522188 C G Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 118522608 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118522663 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 118522763 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118522783 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118522831 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 118523082 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 118524756 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118525504 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118526310 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118527220 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118527513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118528375 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118528546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118528619 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118528740 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118529799 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118529911 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118530066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118530483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118530712 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118530980 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 118531041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118532734 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118532797 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118535769 A C Y N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 3 118536815 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118537339 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118537563 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118538184 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118539127 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118539151 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118539430 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118540065 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118542247 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118542885 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118543175 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118543668 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118545725 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 118546931 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 118547049 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118547840 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118548482 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118548797 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118548831 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118549059 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118549694 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118551276 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118551314 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118551664 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 118552114 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 118552157 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 118552388 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118552426 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118552453 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118552585 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118552696 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118552882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118552910 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118552961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118553343 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118553410 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118553543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118553593 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118553743 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118553894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118554058 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118555347 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118556744 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118556908 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 118557229 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118557759 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118558408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118558956 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118559036 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118560349 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118560811 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118560975 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118561297 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 118561299 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 118561550 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118561562 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 118561594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118561710 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 118561833 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118561950 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118562379 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 118563525 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118566316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118567876 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118568999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118569902 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118570331 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118570755 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118570774 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 118570824 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 118571960 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118572241 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118572323 T G Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.176470588235294 27 7 13 1 3 3 118572832 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118572933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118575939 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118576201 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118576211 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118576684 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 118577436 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118578393 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 118578873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118579620 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118580344 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 118580838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118581002 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 118581034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118581228 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 118581614 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 118582009 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118582404 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 118582408 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 118582566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118582643 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118582823 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 118582871 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 118582968 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118583082 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 118583214 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118583457 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118583589 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 118583617 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 118583683 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 118583719 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118584057 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118584168 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118584225 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118584226 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118585034 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 118585077 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118585364 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 118585805 C G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 118585851 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 118586280 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 118586311 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 118586570 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 118587150 C T Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 118587370 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 118587404 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 118587479 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118587517 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118587609 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118587879 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118587891 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 118587943 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 118587952 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 118588076 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118588102 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 118588147 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118588215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118588220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118588476 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 118588580 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 118588761 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 118588876 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 118588928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118589188 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 118589266 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 118589270 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 118589435 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 118590292 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118590382 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 118590388 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 118590478 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118590940 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118591281 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 118591901 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 118592092 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 118592444 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 118592519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118592614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118593444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118593448 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118593474 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 118593957 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118594453 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118594574 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118594892 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 118594995 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 118595125 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 118595254 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 118595355 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118595805 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 118595881 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 118596748 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118596916 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118597504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118597520 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 118597736 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118598029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118598673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118599012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118599399 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118600356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118602196 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118603049 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118604814 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118605394 T G N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 118605936 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 118606567 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 118606800 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118609749 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118612293 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118613534 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 118613781 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118614861 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 118615414 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 118615422 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 118615581 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 118615606 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118615662 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 118615790 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 118616234 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118616348 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 118616406 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 118616515 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 118616606 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 118616666 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 118616679 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 118616829 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 118616927 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 118616928 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 118616971 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 118616986 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 118616993 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 118617035 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 118617090 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 118617138 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 118617145 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118617153 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 118617197 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118617266 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118617276 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 118617307 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 118617317 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118617374 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 118617377 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 118617456 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 118617472 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 118617568 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 118617581 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118617584 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 118617779 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 118617859 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 118617967 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 118618054 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118618067 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 118618249 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 118618375 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118618784 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 118618965 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 118619006 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 118619670 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118620457 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118620660 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118621024 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118621599 T A Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 118621707 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118621945 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 118623740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118623849 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118626058 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 118626798 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 118629767 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 118632702 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118633295 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118634861 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118634894 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118635002 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118635014 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118635248 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118635328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118636264 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118636676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118636773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118636986 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118637240 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118638759 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118639709 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118639786 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 118639787 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 118641304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118641910 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 118642042 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118642065 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118642090 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118642126 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118642135 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118642223 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118643369 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118644150 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118644287 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 118644476 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 118644614 C G Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 118644622 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 118644633 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 118644721 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118644739 T A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 118644754 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 118644808 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 118645009 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 118645260 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 118645352 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 118645365 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 118645409 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 118645556 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 118645606 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 118645710 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 118645814 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 118645822 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118645854 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118645876 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118646444 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 118646533 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 118646641 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 118646749 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 118646880 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 118646983 A G N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 118647020 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 118647557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118647660 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118647689 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118647916 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 118647965 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 118648124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118648302 C G N N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 3 118648712 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 118648798 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 118649093 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118649146 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 118651194 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118651317 C G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 118651327 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 118651599 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 118651845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118651887 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 118651914 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 118652010 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 118652075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118652120 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118652256 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 118652257 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 118652292 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 118652336 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 118652416 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 118652437 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 118652559 G C N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 118652591 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 118652633 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 118652826 C T Y Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 3 118652912 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 118652933 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 118652972 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 118652985 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 118653041 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 118653136 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 118653146 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 118653214 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 118653244 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 118653261 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 118653398 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 118653499 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 118653503 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 118653614 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 118653722 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 118653740 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118653748 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 118653759 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 118653788 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 118653814 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 118653839 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 118654098 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118654202 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 118654230 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 118654343 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118654427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118654453 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118654974 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118655264 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118655306 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118655323 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 118655454 C T Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 118655977 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118658976 A T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118659160 A C Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 118662183 G T N N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 3 118662554 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118662832 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118663065 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 118663132 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118663441 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 118663532 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118663636 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 118663760 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 118663796 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 118664059 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118664806 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118665082 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 118665467 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 118665564 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118665568 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 118666073 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 118666823 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118667248 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118667521 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 118667573 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118667617 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 118668942 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 118669041 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 118669668 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118669857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118670405 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 118670567 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118670772 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118671522 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 118671834 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 118672298 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118672729 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 118672856 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 118672935 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 118673051 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118673062 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 118673437 A C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 118673540 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 118673769 T C Y Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 118674715 T A Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 118674830 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 118674917 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118674944 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118674969 A G Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 118674971 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 118675009 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 118675385 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118675548 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 118675561 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118675617 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 118676119 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 118676587 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118676598 A G Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 118676733 C T Y Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 118676750 T G Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 118677709 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 118677764 T G Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 118678014 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 118678527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118678729 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 118678788 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118678902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118679312 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118679561 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 118679897 T C Y Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 3 118680552 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118681029 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118681118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118681159 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 118681853 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118683049 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 118684334 A T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 118684420 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118684455 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 118684659 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 118684690 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 118684851 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118685165 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118685527 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 118685706 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 118685993 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 118686284 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 118686599 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118686801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118687142 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118687616 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 118687619 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118687786 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118687807 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 118688134 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 118688257 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 118688645 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118688657 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 118689466 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 118689646 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 118689764 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118689993 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118690202 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 118690753 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 118690755 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118690945 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118690990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118691131 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 118691211 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118691274 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118691501 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 118691855 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 118691898 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 118691914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118691920 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 118692015 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 118692106 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 118692139 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 118692385 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 118692480 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 118692500 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 118692555 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 118692903 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 118692974 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 118693000 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 118693001 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 118693034 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 118693052 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 118693056 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 118693155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118693254 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 118693464 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 118693551 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 118693559 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 118693577 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 118693846 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 118694859 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118695140 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 118695144 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 118695269 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 118695486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118695527 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 118695528 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 118695776 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 118695882 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118695936 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118697518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118697535 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118697606 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118698193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118698207 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118698603 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 118698991 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 118699131 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 118701426 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118702383 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 118703854 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 118704196 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118704348 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118706381 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118707192 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118708295 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 118708308 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 118708433 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 118709113 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 118711602 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118711772 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 118714514 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 118716671 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118717441 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118717728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118718155 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118719043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118719933 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 118721978 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118722234 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118722385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118723577 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118725366 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 118725685 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118725826 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 118726066 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118727233 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 118728420 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 118728823 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 118728894 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 118728900 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 118728915 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118729100 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 118729145 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 118729985 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 118730388 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118730535 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118730633 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118731957 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 118733551 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118734154 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 118735687 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118736812 A C Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 118736946 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 118737715 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118737748 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118740196 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 118740983 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118742431 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 118743728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118743735 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 118744562 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118745294 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118745812 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118747170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118747219 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118747857 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118748454 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 118748703 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118749086 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118749088 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118749925 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118751974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118752263 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118752302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118753573 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118753769 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118754069 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118754337 G A Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 118755198 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118757963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118758470 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118758785 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118761053 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 118764454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118767770 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118767787 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 118768055 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118768708 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118769572 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118770101 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 118770404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118771456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118771553 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 118771965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118772849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118773143 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118773479 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118774045 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118775031 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118775494 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118775633 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118775965 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118776184 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118776377 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118776899 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118777526 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118778049 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118779410 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 118780346 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118780943 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 118781030 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 118781482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118782025 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118782276 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118782416 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118782494 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118782671 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 118783769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118785742 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 118786943 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 118790589 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118791209 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118791411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118792179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118792288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118792770 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118793901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118794773 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118795304 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118795977 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118796708 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118798076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118798193 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118798435 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118799673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118800021 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118800468 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 118800688 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118800774 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118800892 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118802731 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118804410 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 118806232 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118806454 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118809356 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 118810118 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 118810893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118810964 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118811485 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 118811959 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118812052 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118812652 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118812679 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118813022 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118813217 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118813600 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 118813898 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118814141 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 118814653 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118814789 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118815138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118815452 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 118815775 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 118816496 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118817897 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 118818086 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118818161 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118818436 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118818703 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 118818754 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 118818780 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 118818809 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 118819432 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 118819600 T G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 118819677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118819825 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 118819873 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 118819893 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 118819960 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 118820081 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 118820415 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 118820600 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 118820646 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 118820804 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 118820848 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 118820956 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 118821114 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 118821195 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 118821251 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 118821265 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 118821268 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 118821439 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 118821661 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 118821667 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 118821859 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118821965 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 118822156 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118823890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118824651 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 118824772 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 118825699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118827748 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 118827753 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 118827768 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 118827779 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 118827853 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 118828001 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 118828620 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118828651 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 118828980 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118831034 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118831706 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118831995 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118834223 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118834581 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118834841 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 118836346 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118838035 C G Y N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 118838260 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118839681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118842081 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118842520 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118842956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118843217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118843462 A G Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 118847910 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118848487 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 118848600 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118849367 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118851069 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118851087 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118851291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118851430 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118852075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118852082 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 118852758 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 118853996 A C N N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 3 118854655 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118854717 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 118854741 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118854742 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118855020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118855280 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118855582 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118855625 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 118856239 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 118856463 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118856488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118856592 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 118856942 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 118856960 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118857179 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 118857951 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118858749 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 118858819 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118859838 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 118860661 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118860694 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118863917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118868020 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 118868179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118868589 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 118870213 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 118870340 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 118870368 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 118870668 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 118870756 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 118870906 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 118871223 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 118871235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118871932 T A Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 118872540 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 118872811 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 118872822 G A N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 3 118873138 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 118873166 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 118873349 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 118873414 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 118873591 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 118873985 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 3 118874041 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 3 118874050 C T N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 3 118874094 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 118874152 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 118874160 T G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 118874235 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 118874302 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 118874387 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 118874816 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 118874853 T G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 118875021 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 118875088 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118875089 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118875440 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 118875498 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 118875513 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 118875652 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 118875707 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 118875823 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 118875836 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 118875899 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118876202 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 118876258 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 118876462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118876477 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 118876507 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 118876588 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 118876677 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 118876871 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118876896 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 118876940 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 118877137 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118877790 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 118878642 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 118879062 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118880115 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 118880256 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118881039 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118881417 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 118882661 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 118882664 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118884457 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118886681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118886748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118887818 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 118888048 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118888871 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118889346 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 118889483 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 118890494 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118890559 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 118891062 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 118891320 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118892394 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 118892745 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 118892778 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 118892799 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 118892848 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 118892851 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118892864 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 118892951 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 118893019 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 118893123 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 118893165 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 118893241 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 118893330 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 118893633 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 118894112 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 118894171 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 118894213 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 118894237 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 118894265 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118894380 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 118894613 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118894805 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118894886 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 118894948 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 118895031 A G N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 3 118895063 T C N Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 3 118895254 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 3 118895269 C T N Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 9 7 3 3 2 3 118895289 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 3 118895299 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 118895322 G C N N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 3 118896521 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 118896622 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 118897061 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 118897306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118897350 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118897413 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 118897881 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 118897932 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 118897975 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 118898363 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 118899988 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 118902021 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118903076 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 118903391 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 118904150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118904662 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118907044 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118909656 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118910028 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118910885 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 118911863 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 118912194 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 118914510 G T Y N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 118914511 T C Y Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 10 14 0 10 2 3 118916425 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 118917932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118918173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118918742 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118919279 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118919583 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 118919665 T A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 118920560 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118920673 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118920738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118920846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118922977 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118923091 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 118923250 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118924770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118924775 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118924941 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118925049 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118925214 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118925693 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118927138 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 118927393 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118930205 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118930752 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 118930916 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118930987 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118931037 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118931076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118935749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118935866 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118936136 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118936405 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118936580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118937373 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118941029 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 118943172 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118945610 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118948001 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118948445 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118949110 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118950206 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118950731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118951244 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118951464 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118953105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118954464 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118954971 C G Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 118955911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118956779 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118957703 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118958581 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118961510 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 118961812 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118964606 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118965245 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118967070 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118967115 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118969222 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118969467 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118970071 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 118970098 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 118970167 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 118970175 G T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 118970259 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 118970286 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 118970644 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118971115 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118971405 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 118971509 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 118971568 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 118971581 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 3 118971650 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 118971748 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 118971764 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 118971766 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 118971891 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 118971943 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 118972040 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 118972067 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 118972097 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 118972101 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 118972120 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 118972137 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 118972196 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 118972241 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 118972312 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 118972359 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 118972385 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 118972386 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 118972422 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 118972442 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 118972455 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118972487 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 118972493 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 118972516 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 118972574 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 118972603 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 118972617 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 118972645 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 118972646 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 118972684 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 118972699 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 118972727 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 118972743 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 118973003 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 3 118973012 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118973057 A C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 118973140 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 118973230 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 118973359 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 118973401 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 118973416 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 118973441 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 118973487 C A Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 118973515 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 118973674 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 118973737 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 118973793 A C Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 118973795 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 118973804 G A Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 118973821 T A Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 118973866 T G Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 118973974 C A Y N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 118974040 C T Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 118974048 A C Y N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 118974073 T A Y N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 118974177 T G Y N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 118974199 T C Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 118974209 G T Y N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 118974210 A T Y N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 118974235 C T Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 118974259 C A Y N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 118974302 G A Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 118974310 C T Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 118974320 C A Y N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 118974551 C T Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 118974614 T C Y Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 3 118974817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118974834 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 118974842 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 118974912 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 118974997 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 118975044 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 118975068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118975071 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 118975097 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 118975103 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 118975118 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 118975149 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 118975228 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 118975276 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 118975347 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 118975365 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 118975406 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 118975415 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 118975590 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 118975628 A T N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 118976168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118976189 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118976608 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118977537 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 118977930 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 118978150 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 118978807 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 118978982 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 118979050 C A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 118979267 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118979304 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118979381 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118979674 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118981145 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 118981485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118983080 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118985069 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 118985567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118985680 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118986013 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 118987243 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118988240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118988449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118989222 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 118989239 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 118989401 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118990903 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118991176 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118991679 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 118991805 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 118992593 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118993055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118993120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118993185 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118993331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118993645 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 118995313 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118996188 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118996204 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 118996831 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118997433 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 118998456 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118998905 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 118999277 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 118999933 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 118999938 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 119000032 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119000125 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119000218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119000287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119000388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119000664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119001439 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119001589 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119002072 A T Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.8125 0 0.1875 26 6 13 0 3 3 119002073 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.1875 0 0.8125 6 26 3 0 13 3 119002299 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119002848 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119003562 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119003589 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119004065 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119004430 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119004619 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119004797 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119005352 G T Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 119005908 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119006029 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119006397 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119006398 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119006437 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119006442 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119006469 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119006506 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119006508 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119006570 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 119006633 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 119007083 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119007269 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 119007370 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 119007746 G A Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 119007986 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119008121 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119008245 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119008460 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 119008543 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119008917 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 119009241 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 119009851 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119011616 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 119014303 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119015371 A C Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 119017798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119018740 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119018793 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 119019082 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119019237 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 119019479 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 119019509 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 119019688 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 119019786 C G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 119019792 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 119019821 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 119020444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119020534 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 119020543 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 119021359 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 119022082 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 119022172 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 119022193 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 119022224 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 119022353 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 119023347 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 119023381 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 119023459 T C N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.333333333333333 0.25 0.416666666666667 11 13 4 3 5 3 119023551 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 119023989 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 119024082 T A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 119024117 A C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 119024243 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 119024302 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 119024429 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 119024456 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119024457 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 119024483 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119024564 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 119024794 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 119024834 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 119024843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119024902 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 119025096 G T N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.357142857142857 0.214285714285714 0.428571428571429 13 15 5 3 6 3 119025106 T C N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 119025110 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 119025126 G A N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 3 119025174 C A N N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 3 119025344 A G N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 12 12 3 6 3 3 119025398 A G N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 3 119025433 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.25 0.666666666666667 0.0833333333333333 14 10 3 8 1 3 119025581 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 119025628 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 119025659 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 119025662 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 119025710 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 119025744 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119026238 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119026339 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 119026364 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119026375 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 119026404 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119026421 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119026452 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 119026496 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 119026609 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 119026752 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119026753 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119027136 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 119027233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119027283 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119027314 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 119027336 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119027365 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119027447 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119027450 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 119027526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119027543 T C Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 119027599 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119027726 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 119028021 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 119028099 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 119028225 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119028554 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119028740 G T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 119028771 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 119028836 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119028888 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 119028945 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 119028975 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 119029054 T A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 119029059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119029265 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 119029477 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 119029504 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 119029570 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119029588 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119029912 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 119031224 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119031342 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119031485 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119031909 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119032019 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119032193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119032343 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119032836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119032911 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119032986 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119033160 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119033242 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 119033327 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 119033482 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 119033652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119034153 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119035310 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119038050 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 119040169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119040454 A G N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 119040649 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 119040775 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 119040896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119040930 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 119040943 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 119041126 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 119041148 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 119041157 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 119041176 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 119041200 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119041207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119041236 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119041263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119041277 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119041349 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 119041434 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119041542 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119041641 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 119041649 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 119042120 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119042131 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 119042386 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 119042541 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119042706 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 119042813 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 119042931 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 119043006 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 119043800 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 119044909 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 119045123 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 119045341 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 119045896 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 119046957 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 119047752 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119047949 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119049509 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 119049552 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119049806 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119050049 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 119050297 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119050545 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119050602 T C Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 119050915 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 119050942 T C Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 119050975 G T Y N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 119050991 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 119051026 T A Y N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 119051056 A G Y Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 119051073 C T Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 119051120 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119051167 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119051328 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 119051610 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119052677 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119052867 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 119052889 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 119053062 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 119053068 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 119053172 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119053530 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119053814 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 119053957 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119054198 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 119054487 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 119054560 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 119054754 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119054952 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 119055610 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119057601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119057887 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119064425 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119067595 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119069828 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119070531 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119070710 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 119071383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119071594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119072464 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119072594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119074099 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119074246 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119076618 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 119078847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119079314 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 119079336 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119079745 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119080010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119080295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119081460 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119082544 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119083266 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 119083885 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119083985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119084246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119084518 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119084565 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 119084703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119085172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119085779 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119087696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119088140 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119088672 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119088673 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119088831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119089107 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119089553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119089587 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119089623 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 119089790 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119093400 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119093931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119094757 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119095117 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 119095168 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 119095169 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 119095183 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 119096365 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119097518 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119098454 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119100652 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119100668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119101631 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119101786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119101810 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119102043 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119102076 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119103796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119104098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119104413 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119104421 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119104836 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119104902 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119104908 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119104928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119104958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119105157 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119105299 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 119105658 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 119105704 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 119105729 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119105788 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119105791 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119105801 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119105984 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119106000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119106425 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119106509 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119106552 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119106583 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119106599 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119106692 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119106750 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119106766 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119106815 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119106826 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119106859 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119106973 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119107011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119107027 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119107053 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119107073 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119107118 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119107119 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119107186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119107226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119107624 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119107810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119107847 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119108014 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119108570 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119108609 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119108646 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119109943 G A N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 119110390 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119111123 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119112073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119112297 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119112673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119113905 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119113936 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119113960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119116719 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119116914 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119117966 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119119977 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119120488 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119123458 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 119124547 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119124757 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119124879 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119124880 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119124940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119125143 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119125416 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119125458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119125673 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 119126024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119126886 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 119127115 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119127757 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 119127806 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 119127934 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 119127935 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 119128115 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119128192 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119128616 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119128794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119128881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119128976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119129236 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119129441 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119129472 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119129698 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119129794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119129824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119129847 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119129911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119130101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119130259 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119130296 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119130312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119130391 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119130506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119130678 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119131259 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119131261 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119134954 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119136088 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119136533 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119137350 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119138581 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119139167 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119139835 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 119141797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119142155 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119142432 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119142806 T A N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 119142807 C A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 119144655 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119144838 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119146816 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 119148479 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119148683 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119149098 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119149708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119150662 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119151473 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119153781 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119153900 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119155070 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119155264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119155631 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119156607 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 119156841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119158291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119159302 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119160204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119162889 T G Y N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 119164491 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 119166213 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 119167447 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119167525 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119168180 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 119169503 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 119169655 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 119169748 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 119169830 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119169847 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 119170118 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119170670 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119172136 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119172602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119172892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119173269 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119173281 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 119174019 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119174073 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 119174114 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 119174119 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 119174136 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 119174150 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 119174155 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 119175321 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119175649 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119175655 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119175794 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119175879 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119176402 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119176985 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119177326 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119179333 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119180012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119180884 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119181150 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119181945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119182778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119182804 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119182828 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 119182862 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119182973 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 119183032 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 119183086 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 119183123 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 119183213 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119183372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119183411 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 119183637 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119183744 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 119184550 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119185332 A T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 119186629 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 119186774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119186885 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119187288 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119187345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119187767 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 119187828 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 119187914 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119188264 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 119188268 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119188309 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119188432 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119188519 C A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 119188570 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 119188605 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 119188653 T A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 119188776 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 119188845 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 119188879 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 119188920 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119188933 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119189018 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119189136 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119189221 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 119189424 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119189489 T C Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 119189539 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119189663 A C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 119189669 C A Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 119189688 A G Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 119189710 T A Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 119189720 A G Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 119189796 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119189797 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 119189933 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 119189972 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 119190025 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119190030 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119190062 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 119190212 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 119190246 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 119190347 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 119190348 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 119190515 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 119190608 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 119190634 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119190723 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 119190752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119190766 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 119191341 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119192743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119194116 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119195196 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 119195267 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119196976 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119197473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119198625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119199699 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119200700 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119201412 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 119201442 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119201756 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119202939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119204734 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119206207 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119207063 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119207239 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119207762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119208084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119208825 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119209192 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119210391 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119213104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119213271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119213361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119215214 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119215713 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119216570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119217609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119220238 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119220306 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119220386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119222827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119222851 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 119223252 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119225447 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119225724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119226929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119227502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119228706 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 119229147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119229357 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119229473 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 119229631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119230538 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119231079 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 119233194 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119234493 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 119234940 T A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 119235598 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119235632 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119235763 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 119236584 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119237531 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119237562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119241545 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 119243211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119243481 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119244245 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119244746 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119244985 G A Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 119245673 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119245813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119246190 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119248846 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119249816 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 119250215 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119259031 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 119260813 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119261648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119261878 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 119262275 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119262367 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119263437 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119263846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119265026 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119265089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119265332 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119266202 T G Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 119266212 T G N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 119266214 A C N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 119266502 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 119266612 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 119266807 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 119266925 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 119266933 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 119266957 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 119267399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119267456 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 119267658 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 119267765 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 119268376 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 119268526 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 119268712 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119268768 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119268829 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119268906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119269808 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119270914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119271070 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 119271260 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 119271746 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119272434 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119272749 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119272879 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 119273206 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 119273335 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119273372 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 119273474 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 119273500 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 119273537 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 119273621 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 119273636 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119273646 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 119273732 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 119273743 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 119273765 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 119273813 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 119274137 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 119274162 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 119274486 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 119274694 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 119275039 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 119275293 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 119275374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119275457 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119275639 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 119275677 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119275678 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 119275870 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 119275927 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 119276038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119276108 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 119276227 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 119276258 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 119276423 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119276573 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 119276710 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 119276758 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 119277078 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119277180 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 119277198 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 119277217 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 119277362 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 119277513 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 119277534 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 119277639 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 119277730 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 119277902 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 119277905 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 119277945 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 119277958 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 119277961 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 119277984 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 119279174 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 119279366 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119279515 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 119279531 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119279624 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119279983 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119280391 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 119280504 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119280509 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119280521 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119280532 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 119280559 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 119280596 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 119280617 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 119280693 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 119280697 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 3 119280708 A T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 119280724 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119280731 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 119280746 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 119280782 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119281108 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119281194 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119281234 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 119281281 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 119281391 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119281447 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119281467 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 119281575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119282049 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119282151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119282769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119283652 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119284150 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 119284173 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 119284188 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 119284370 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 119284447 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119284532 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119284744 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119284883 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119284905 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119284908 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119284924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119284961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119284982 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119285015 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119285073 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119285171 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119285264 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119285306 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119285311 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119285639 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119285720 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119285747 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119285791 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119285792 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119285807 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119285819 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119285834 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119285844 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119285953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119285968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119285990 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119286154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119286238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119286276 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119286404 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119286425 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119286435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119286466 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119286568 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 119286621 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119286627 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119286711 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119286767 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 119286860 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 119286890 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119287082 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119287583 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 119289358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119290014 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119290230 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 119290390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119290474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119290665 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119290860 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119291460 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119291781 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119292979 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119293743 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 119293995 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119294059 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119294436 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119294520 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 119294769 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119295067 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 119295175 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119295591 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 119295628 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 119295753 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119295944 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119296691 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119297081 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 119297316 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119297505 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119297557 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119298688 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 119299244 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 119299279 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119299545 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 119301166 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119301608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119301726 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 119301857 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119303513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119305259 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119305818 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119306371 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119306497 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119306503 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119306657 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 119307787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119309661 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 119309845 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119310394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119310910 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119310955 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 119311690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119312181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119313453 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 119313985 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 119314556 T C Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 119314591 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 119314595 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 119314901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119315109 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119315347 A T Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 119316272 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 119316520 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119316571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119316693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119316736 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 119317333 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119322888 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119323104 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119323915 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 119325227 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119325888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119327094 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 119329706 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 119330590 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119330764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119330960 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119331248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119331607 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 119332051 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 119333542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119336025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119337438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119338351 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119338813 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119340386 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119340452 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119341221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119341356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119341616 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 119342168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119342248 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 119342294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119342611 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119342642 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119342921 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119344633 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119346152 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119346432 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 119347018 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119348552 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119348812 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119349272 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119349330 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 119349393 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119350168 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 119351812 T A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 119351868 G C Y N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 119352381 T A Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 119353866 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 119355186 C G Y N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 119355325 T C Y Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 3 119355373 A C Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 119355983 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 119356086 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119356592 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 119356945 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 3 119357166 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 119357204 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 119357492 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119357555 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119357996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119360794 C A Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.0555555555555556 18 18 1 16 1 3 119362950 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 119363190 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119363521 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119364337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119365079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119365295 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 119365368 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119365563 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 119366378 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119366415 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119367311 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119367748 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 119368092 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119371216 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119371556 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119372108 A T Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 119376892 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 119377089 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119377202 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 119377221 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119378436 A C Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 119378907 C A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 119384331 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119384805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119385583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119386164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119386244 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 119386342 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119386456 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 119386811 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119388343 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 119388430 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 119389617 G C N N 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 7 9 1 5 2 3 119392067 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 119392163 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 119393177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119394504 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119395302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119395730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119396870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119399738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119400395 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119400746 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119401354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119401576 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 119401834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119402388 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 119402424 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119402657 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 119403246 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 119403343 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 119403791 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 119403818 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 119403892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119403941 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 119404240 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 119404337 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119404453 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119404525 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 119404606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119404728 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119404741 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119405400 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119407974 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119408075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119408603 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119408962 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119409481 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 119409577 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119409848 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 119410590 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 119411554 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 119411631 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119411855 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119412127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119412359 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119412478 G A Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 119413802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119414378 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119414753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119415501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119416773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119417311 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119418342 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119425381 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 119426996 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119428287 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119430406 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119431135 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119432015 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 119432918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119434662 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119435140 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119435276 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 119436235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119436332 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119438510 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119438874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119440154 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119441196 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119441520 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119443144 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119443613 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119443794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119444059 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119444525 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119445661 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 119446281 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119446751 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119446802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119447133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119447622 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119448287 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119448800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119451213 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 119453081 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119453287 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119453719 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119456414 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119456736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119457751 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119458592 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119459958 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119462607 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 119463363 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119469330 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119473483 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 119475332 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119478957 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119479261 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119479357 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 119484804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119487083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119487116 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119487281 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119487414 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 119487544 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119487734 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119487764 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119487822 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119487940 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119488014 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119488227 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119488267 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119488268 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119488941 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 119488964 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119490692 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119491622 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119492498 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 119492601 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 119492609 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119492618 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119492674 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119492717 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119492862 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 119493157 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 119493204 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 119493217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119493598 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119493638 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 119493678 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 119493708 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 119493947 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 119493948 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 119493998 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 119494065 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119494076 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119494164 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119494218 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119494238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119494316 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119494346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119495013 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 119495041 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 119495374 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119496267 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119496408 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 119498369 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 119498490 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 119498673 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 119498715 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 119498774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119498851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119498915 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119498994 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119499118 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119499249 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119499401 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119499580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119499648 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119499944 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 119500001 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119500087 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119501471 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119501503 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 119501889 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119502667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119503130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119505142 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119505568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119505923 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119506955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119507547 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119509471 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 119509498 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 119509819 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 119509828 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 119509952 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119510106 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119510253 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119510315 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 119510522 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119510543 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119510557 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 119510562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119510577 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 119510581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119510600 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119510604 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119510627 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 119510665 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 119510678 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 119510711 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119511043 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 119511636 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 119511844 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 119511873 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 119511886 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 119511981 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 119511988 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 119511997 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 119512063 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 119512064 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 119512321 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 119512360 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 119512605 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 119512722 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 119512773 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119512789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119512818 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 119512860 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 119512917 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119513331 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 119513382 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 119513519 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 119513614 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 119513720 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 119513721 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119514029 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 119514119 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 119514240 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 119514258 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 119514312 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 119514894 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 119516280 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119517282 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 119517286 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 119519942 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119519978 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119521357 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119522969 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 119524395 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119524465 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119525062 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 119527385 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 119527779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119527836 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119528293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119528492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119529409 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119529683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119530453 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119531555 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 119532331 A T N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 119533675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119535082 G T Y N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 9 7 1 7 0 3 119542812 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119543947 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119544055 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119544866 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119546087 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119548392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119550193 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119550600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119552183 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119552226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119553624 T A N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 119553820 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119554104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119556028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119556612 T C N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.181818181818182 17 5 8 1 2 3 119556843 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119557329 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119557963 A C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 119558525 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119559777 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119559966 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119560567 A C Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 119561197 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119561403 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119562155 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 119563766 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119565706 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119566705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119567350 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119571115 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 119571502 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119571710 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119572378 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 119573051 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119573981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119575313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119576383 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119578672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119581779 G A Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 119582297 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 119583664 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119584722 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 119584723 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119585139 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119585325 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119585609 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 119585923 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 119586106 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119586272 C G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 119586348 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 119586404 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 119586411 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 119586515 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 119586520 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119586618 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 119586630 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 119586712 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 119586762 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 119586775 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 119586913 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 119587453 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 119587640 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 119587717 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119587752 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 119587804 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 119587841 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119587889 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 119587945 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119588131 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 119588392 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 119588397 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 119588482 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 119588711 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119588815 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119588835 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119588865 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 119589416 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119589435 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 119589810 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 119590385 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119590610 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119591145 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119591197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119591251 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119591325 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 119591415 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119591497 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 119591519 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 119591555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119597029 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 119598440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119598867 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119599110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119600381 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 119600739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119601379 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 119601393 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 119601394 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 119601474 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119601544 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119601771 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119602070 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 119602131 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 119602166 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 119602177 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 119602225 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 119602287 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 119602302 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 119602303 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 119602332 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 119602344 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 119602428 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 119602440 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119602533 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 119604691 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 119604741 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119604888 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 119605087 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 119605091 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 119605130 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 119605156 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 119605244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119605382 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119605881 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119606567 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 119607490 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119608225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119609463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119611124 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 119611140 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 119611883 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 119611894 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 119612151 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 119612183 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 119612198 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119612289 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 119612354 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 119612415 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 119613125 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 119613126 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 119613157 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119613211 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 119613229 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119613233 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119613293 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 119613307 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 119613369 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 119613494 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 119613500 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 119613532 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 119613560 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 119613620 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119613703 G C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 119613755 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119613768 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 119613799 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 119613902 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 119614073 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119614144 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 119615406 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119615993 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 119616448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119617103 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 119617189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119617447 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119619498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119620624 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119620633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119620783 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119620847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119621404 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119623338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119623480 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 119623628 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119623754 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119623922 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119624461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119624735 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 119624749 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 119624791 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119624863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119624878 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 119625476 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 119625886 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 119625985 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119626001 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119626336 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 119626459 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 119626729 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 119626891 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119626938 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119627455 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 119627489 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119628314 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119629050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119629800 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 119631893 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119634902 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 119634957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119635062 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 119635176 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119635245 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119635246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119635444 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119635594 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119635638 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119636534 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 119636676 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119636847 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119636886 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119637066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119637071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119637155 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119637173 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119637209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119637213 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119637315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119637376 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 119637568 A G N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 119637576 A C N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 119637819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119637978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119638009 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119638026 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119638044 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119638272 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 119638423 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 119638431 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 119638824 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 119638846 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 119638976 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 119640112 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119641570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119641631 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119643612 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 119643826 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119644146 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119645823 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 119645825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119646164 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 119646267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119646711 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 119646830 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 119646905 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119647241 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119648274 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 119648797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119648897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119649635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119650731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119651425 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 119651609 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119651667 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119652345 G C Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 119653610 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 119653863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119654902 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 119655035 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119655725 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119658166 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119658408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119658760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119658972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119659608 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 119660176 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119660823 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119661312 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 119661550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119664091 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119664551 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 119665247 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119665354 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119666186 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119666808 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 119668725 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 119668815 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119669828 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119669836 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119670728 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 119671997 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119672226 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 119672231 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 119672360 G C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 119672690 A G Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 119672753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119672918 C A Y N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 119673033 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 119673164 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 119673305 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 119674141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119676254 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 119676542 C T Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 3 119676603 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119676924 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 119677000 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 119677066 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119677169 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 119677186 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 119677238 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 119677247 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119677282 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 119677352 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119677739 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119677979 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 119677983 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 119678055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119678073 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 119678488 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 119678621 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 119678798 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 119678814 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 119678815 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 119678909 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 119678973 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 119679017 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119679029 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 119679088 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 119679299 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 119679331 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 119679371 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 119679577 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119679599 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119679677 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119679829 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119679841 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119679944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119680160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119680200 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119680218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119680261 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119680307 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119680470 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119687138 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119687363 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119687404 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119687520 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119687538 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 119687576 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 119687645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119688785 A G Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 3 119689073 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119689650 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119689838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119689888 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 119689906 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 119689974 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 119690024 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 119690047 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 119690130 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119690552 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 119690930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119690948 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 119691042 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 119691171 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 119691311 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 119691358 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119691424 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 119691486 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 119691578 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 119691740 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 119691784 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 119691907 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119691971 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119692081 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 119692291 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 119692385 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 119692455 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 119692459 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 119692569 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 119692643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119692655 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119692670 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119692710 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119692765 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119692771 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 119692803 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 119692836 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119692853 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119692854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119692910 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119693245 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 119693254 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 119693318 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119693324 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 119693380 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 119693735 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 119693821 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 119693852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119693889 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 119693923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119694125 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 119694152 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 119694341 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119694404 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 119694567 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 119694612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119694669 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 119694798 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119694866 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 119694945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119695272 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 119695712 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 119695824 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119695998 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119696015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119696113 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119696251 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 119696272 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 119696279 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 119696304 T A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 119696451 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119696452 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 119696565 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 119696647 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 119696849 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119696875 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119696895 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 119696935 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119696950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119697207 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119697305 C T N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 119697534 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 119697613 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 119697636 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 119697641 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 119697835 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 119697863 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 119697903 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 119697942 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 119698002 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 119698035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119698134 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 119698171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119698300 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119698532 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119698579 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 119698594 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 119698601 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 119698783 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 119699021 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 119699024 T G Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 119699059 G A Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 3 119699062 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 119699095 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119699187 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 119699252 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 119699360 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 119699394 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 119699411 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119699454 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 119699569 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 119699640 A T Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 119699764 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 119700023 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 119700050 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 119700077 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 119700279 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119700701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119700715 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119701055 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 119701072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119701119 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 119701184 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119701294 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 119701306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119701468 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 119701518 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 119702135 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119702294 G C Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 119702297 T C Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 119702320 T C Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 119702400 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 119703059 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119703494 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 119703528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119703563 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 119703603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119703717 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 119703755 G T Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 119703802 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 119703885 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 119703906 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 119703961 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 119703974 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 119704033 T A N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 3 119704052 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 119704077 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 119704238 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 119704438 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 119704894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119704965 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 119705100 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 119705127 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 119705140 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 119705520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119705532 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 119705558 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119705959 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 119705987 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 119706073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119706084 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 119706118 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 119706155 T G Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 119706202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119706205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119706444 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 119706473 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 119706480 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 119706507 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 119706509 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 119706546 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 119706582 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 119706649 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119707052 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 119707584 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119707613 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 119708246 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 119708292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119708622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119708894 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119708926 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119708942 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 119708944 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119708985 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 119709065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119709424 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119710025 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119710231 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 119710511 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 119710539 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 119710652 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119710719 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 119710824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119710830 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 119710841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119710902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119711077 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119711446 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 119711513 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119711667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119711696 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119711711 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119712047 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119712225 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 119712384 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 119712488 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 119712644 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119715926 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119718134 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 119718146 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119718343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119721100 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 119721676 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 119721705 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 119721722 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 119721725 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 119721956 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 119722113 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 119722361 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 119722771 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 119723620 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 119723635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119724064 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119724112 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 119724336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119725314 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 119726590 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 119727698 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 119727765 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 119727776 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 119727848 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 119727905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119727940 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119727972 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119727980 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119728113 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119728308 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119728393 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119728852 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 119729283 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119729557 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119729592 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119729600 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119729930 G C N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 119729984 T C N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 3 119730291 A C N N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 3 119730433 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 119730728 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 119730739 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 119730843 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 119730888 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 119730901 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119730940 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 119731055 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 119731366 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 119731429 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 119731531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119731630 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 119731982 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 119732078 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 119732251 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 119732256 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 119732330 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 119732474 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 119732534 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 119732555 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 119732576 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 119732610 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 119732794 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 119732901 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 119733081 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 119733299 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 119733375 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 119734594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119735498 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 119736067 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119737601 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 119737618 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 119737670 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 119737704 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 119737714 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 119737716 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 119737756 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 119737790 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119737816 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 119737838 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119738009 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 119738586 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 119738686 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 119738789 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 119738949 G C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 119739015 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 119739020 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 119739062 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 119739118 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 119739150 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 119739258 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 119739335 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 119739346 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 119739406 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119739601 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 119739667 A T N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 3 119739669 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 119739832 C A N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 119739856 A T N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 3 119739887 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 119739990 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119740108 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119740134 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119740143 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 119740191 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119740277 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 119740279 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 119740346 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119740362 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 119740404 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 119740468 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 119740573 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 119740635 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 119740640 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119740701 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 119740800 T A N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 3 119740841 G C N N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.454545454545455 0.454545454545455 0.0909090909090909 15 7 5 5 1 3 119740872 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 3 119740958 C G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 119741125 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 119741174 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 119741206 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 119741405 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 119741418 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 119741563 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 119741564 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119741803 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 119741824 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 119742052 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 119742178 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 119742604 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 119743366 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 119743474 A T Y N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 3 119744884 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119745515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119745812 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119746568 G C N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 119747046 C T Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 119748350 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119748370 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119748862 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119748930 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119749815 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 119749953 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 119750007 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119750143 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 119750164 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119750204 T G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 119750205 T G N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 119750220 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119750250 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 119750289 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 119750301 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 119750338 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 119750352 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119750373 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 119750380 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 119750455 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 119750490 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 119750517 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 119750649 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 119750730 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 119750824 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 119750903 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 119750999 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 119751302 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 119751339 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 119751486 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 119752240 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 119752419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119752510 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119752593 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 119752802 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 119752844 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 119753655 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 119753681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119755049 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 119755187 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119755332 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119755417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119755553 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119755737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119755792 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 119755957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119756320 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 119757574 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 119758199 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119759192 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119760223 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 119760236 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119760479 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119761030 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119761058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119761817 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 119763204 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119763674 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 119763691 G T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 119763702 G A N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 3 119763898 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 119763958 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 119764153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119764250 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 119764370 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119764588 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 119764771 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119764782 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 119765304 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 119765376 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119765381 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 119765393 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 119765482 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 119765515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119766656 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119769413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119770284 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119770881 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 119771098 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 119772144 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 119772438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119772586 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 119773051 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119773110 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119773236 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119774235 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119774555 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119774565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119775268 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119776105 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119777520 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119778232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119778375 C A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.117647058823529 0.764705882352941 0.117647058823529 17 17 2 13 2 3 119782234 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119783112 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119784929 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 119785012 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 119785093 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119785228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119785237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119785640 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 119785644 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 119785663 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 119785929 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 119786434 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 119787195 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 119787343 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 119787735 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 119788306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119788874 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119789448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119790196 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 119792205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119794274 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119794427 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 119794987 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 119795025 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119795176 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 119798373 A C N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 119798386 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 119798387 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 119798576 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 119798755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119798832 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 119798910 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 119798950 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 119799081 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 119799364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119799821 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 119800118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119800528 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 119800683 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119800914 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 119801024 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 119801034 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 119801057 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 119801128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119801369 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 119801373 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 119802014 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119802040 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119802288 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 119802300 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119802435 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 119802569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119802656 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 119802726 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119802801 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119803216 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 119803221 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 119803230 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 119803277 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119803361 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 119803367 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 119803374 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 119803643 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 119804110 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 119804212 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 119804215 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119804244 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119804286 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 119804316 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 119804446 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 119804452 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 119804723 A C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 119804804 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119804814 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119804862 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 119804876 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 119804895 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 119804919 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 3 119804920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119805167 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119805323 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 3 119805393 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 3 119805426 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 119805489 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 119805570 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 119805783 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 119805809 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 119805980 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 119806021 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.25 0.6875 0.0625 19 13 4 11 1 3 119806089 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.235294117647059 0.705882352941177 0.0588235294117647 20 14 4 12 1 3 119806200 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.1875 0.75 0.0625 18 14 3 12 1 3 119806296 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 119806535 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 119806654 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 119806738 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 3 119806803 A G N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 3 119806862 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 3 119806891 G T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 3 119806904 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 3 119806925 C A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 3 119807014 G C N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 18 14 4 10 2 3 119807070 A T N N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 12 12 2 8 2 3 119807088 T A N N 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 12 8 3 6 1 3 119807100 A G N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.333333333333333 0.583333333333333 0.0833333333333333 15 9 4 7 1 3 119807211 A G N Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 3 119807219 T G N N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 3 119807391 A G Y Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 3 119807531 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 7 5 1 5 0 3 119814589 A G N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 3 119814835 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 3 119814843 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 119814851 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 119814945 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.3125 0.625 0.0625 20 12 5 10 1 3 119814969 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 119815128 C T Y Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 3 119815264 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 7 5 1 5 0 3 119815374 C T Y Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.230769230769231 0.692307692307692 0.0769230769230769 15 11 3 9 1 3 119815400 C T Y Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.181818181818182 0.636363636363636 0.181818181818182 11 11 2 7 2 3 119815603 C T Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 119816010 T C Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 119816104 C T Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 119816297 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 119816346 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119816381 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 119816383 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 119816395 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 3 119816419 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 119816428 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119816446 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 3 119816474 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 119816513 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 3 119816524 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 3 119816612 G A N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 3 119816615 G A N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.307692307692308 0.538461538461538 0.153846153846154 15 11 4 7 2 3 119817034 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119817077 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 119817083 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 119817122 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 3 119817142 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 119817172 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 119817197 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 119817325 G A N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.307692307692308 0.615384615384615 0.0769230769230769 16 10 4 8 1 3 119817345 T C N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.333333333333333 0.583333333333333 0.0833333333333333 15 9 4 7 1 3 119817346 G A N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 0.0909090909090909 13 9 3 7 1 3 119817368 A T N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.307692307692308 0.538461538461538 0.153846153846154 15 11 4 7 2 3 119817389 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 119817573 T A N N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.230769230769231 0.615384615384615 0.153846153846154 14 12 3 8 2 3 119817582 T A N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 3 119817621 G C N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 3 119817643 C T N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 3 119817657 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 119817745 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 119817893 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119817909 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 119817919 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 119818004 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 119818238 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 119818272 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 119818477 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 119818569 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 119818633 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119818692 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 119818729 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119818880 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119819101 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119819143 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 119819854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119820309 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 119821003 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 119821160 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 119821269 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 119821527 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 119821738 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 119822337 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 119822376 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 119822434 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 119822491 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119824227 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 119824233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119824423 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 119824677 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119824713 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119824728 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 119824858 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 119825058 A T N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 3 119825093 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 119825117 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 119825124 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 119825151 A C N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 119825242 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 3 119825391 T A N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 3 119825485 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 119825508 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 119825576 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 119825580 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 119825632 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119826016 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 119826048 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 119827551 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 119827724 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 119829558 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119829644 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 119829659 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119829774 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 119831483 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 119831643 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 119831906 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 119832048 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 119832216 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 119832401 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 119832511 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 119832735 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 119832754 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 119832944 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 119833090 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119833305 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119833619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119833757 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 119833807 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 119836734 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119836747 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119837145 C G Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 119837278 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 119837982 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 119838387 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119841098 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 119841413 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 119841424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119841427 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 119841462 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119841516 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 119841920 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 119841941 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 119842365 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119842451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119842473 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119842535 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119842591 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119842783 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119842812 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119842978 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119843065 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 119843151 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119843165 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119843248 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119843260 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 119843261 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119843469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119843552 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 119843620 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 119843776 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119844078 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 119844171 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 119844210 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 119844476 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119844484 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119844554 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 119844584 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119844621 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119844664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119844695 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119844730 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119844792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119844802 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119844842 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119844849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119844904 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119844931 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119845129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119845318 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119845331 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119845354 T A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 119845385 T C N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0 0.692307692307692 0.307692307692308 9 17 0 9 4 3 119845430 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.05 0.85 0.1 19 21 1 17 2 3 119845440 G C Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 119845620 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 119845731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119845797 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119845804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119845823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119845856 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119845866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119845945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119845971 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119845977 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119846016 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119846024 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119846029 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119846095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119846146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119846264 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119846497 A T N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 3 119846538 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119846546 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119846735 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119846769 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119846803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119846861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119846891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119846939 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119847180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119847210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119847258 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119847274 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119847309 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119847484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119847747 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119848996 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119849082 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 119849096 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 119849127 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119849210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119850575 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119850691 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119850894 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119851561 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119851659 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119853064 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 119853587 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119853645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119853899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119855043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119855817 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119855958 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119857164 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119857773 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 119858269 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 119858485 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119858761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119859020 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119860147 C A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 119860777 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119861072 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119861818 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119862014 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 119862031 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 119862198 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 119862756 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 119863203 T A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 119863643 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 3 119863673 C T N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 3 119863897 G T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 119864097 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 119864672 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 119865419 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119865929 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119866207 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119868526 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 119868803 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 119868820 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 119868858 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119868974 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 119869014 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 119870438 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 119871280 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 119871508 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 119871671 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 119871728 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 119871777 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119871806 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 119871870 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 119871887 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 119871911 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 119872078 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 119872186 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 119872218 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119872390 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 119872565 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119872660 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 119872843 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 119872869 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 119873017 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 119873115 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 119873134 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 119873184 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 119873253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119873409 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 119873479 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 119873619 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 119873707 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 119873756 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119873824 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 119873826 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119873951 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 119874143 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 119874228 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 119874229 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 119874254 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 119874333 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 119874486 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 119874543 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 119874580 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 119874664 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 119874719 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 119874771 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 119875010 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 119875182 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 119875214 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 119875510 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 119875511 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 119875567 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 119875684 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 119875731 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 119875896 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 119876319 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 119876333 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 119876374 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 119876414 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 119876491 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 119876553 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 119876585 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 119876599 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 119876644 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 119876728 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 119876735 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 119876802 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 119876803 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 119876820 C T N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 3 119876855 C T N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.571428571428571 0.357142857142857 10 18 1 8 5 3 119876856 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 119876924 A C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 119876957 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119876973 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 119877115 G A N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 119877180 T A N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 3 119877209 G A N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 3 119877224 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 3 119877522 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 119877621 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 119877756 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 119877769 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 119877770 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 119877821 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 119877914 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 119877917 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 119877991 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 119878038 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 119878317 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 119878842 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 119878879 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 119878902 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 119878929 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 119879054 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 119879241 C T N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 3 119879681 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119879982 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 119880019 C A Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 119880429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119880523 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119881654 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119881924 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 119882092 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119882228 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119882534 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 119882686 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 119882761 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 119882934 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 119885880 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 119886002 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 119886075 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119886079 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119886999 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119887981 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 119888367 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 119890357 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 119892005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119892280 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119893026 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119895144 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119897051 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119900864 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119901896 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119902460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119902638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119903594 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119906488 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119906524 A T N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 119907326 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119907464 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119909830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119910455 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119910893 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119911381 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119913402 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119914104 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 119916045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119917862 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119918038 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119918150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119918298 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119918299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119919171 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119919424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119919792 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 119921833 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 119922547 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 119922812 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 119923126 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 119923137 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 119923150 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 119923188 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 119923345 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 119923488 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 119923577 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 119923587 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 119923652 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 119923848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119923851 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 119923944 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 119923987 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 119924107 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 119924234 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 119924483 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 119924515 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 119924626 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 119924638 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 119924945 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 119924980 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 119924996 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 119925198 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 3 119925450 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 119925472 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 119925488 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 119925671 A G Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 119925732 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 119926668 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 119927011 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 119927028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119927052 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 119927296 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 119927381 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 119927466 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 119927522 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 119927580 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 119927799 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 119928220 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 119928225 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 119928307 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 119928673 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 119928828 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 119928866 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 119929049 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 119929231 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 119929258 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 119929556 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 119929597 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 119929680 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 119929938 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 119929945 G C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 119930047 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 119930261 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 119930266 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 119930345 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 119930358 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 119930397 G C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 119930492 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 119930589 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 119930616 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 119930621 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 119930805 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 119930972 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 119930986 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119931118 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 119931127 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 119931140 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 119931148 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 119931187 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 119931246 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 119931254 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 119931296 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 119931366 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119931378 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 119931465 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 119931538 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 119931541 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 119931551 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 119931595 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 119931645 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 119931655 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 119931713 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 119931742 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 119931774 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 119931876 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 119931902 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 119932139 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 119932187 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 119932190 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 119932199 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 119932221 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 119932291 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 119932320 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 119932329 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 119932385 T G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 119932419 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 119932511 C T N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 3 119932837 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 119932845 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 119932899 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119932932 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 119932941 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 119932987 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 119932988 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 119933010 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 119933011 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 119933043 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 119933331 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 119933416 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 119933458 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 119933477 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 119933532 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 119933533 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 119933557 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119933612 C G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 119933709 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 3 119933744 C G N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 119934069 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 119934100 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 119934752 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 119934754 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 119934924 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 119934929 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 119935022 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 119935125 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119935130 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119935329 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 119935407 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 119938182 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119939645 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 119939709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119940055 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119943710 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 119946111 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 119946180 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 119946442 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 119946443 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 119946586 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119946651 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119946836 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 119946946 G C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 119947434 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 119947492 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119948435 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 119948921 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119949493 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 119949702 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 119949895 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 119950103 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119950182 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 119950222 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 119950446 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 119950667 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119950678 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 119950786 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 119950818 A T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 119950915 A G N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 3 119950924 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.5 0.416666666666667 8 16 1 6 5 3 119950932 A C N N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 3 119951086 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 3 119951283 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119951360 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 119951372 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 119951499 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 119951736 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 119951769 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 119951789 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 119951797 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 119951877 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 119951897 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 119951915 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 119951979 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119951994 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 119952028 G A N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 3 119952235 T C N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.545454545454545 0.272727272727273 0.181818181818182 15 7 6 3 2 3 119952323 G A N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 3 119952330 C T N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 3 119952417 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 119952510 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 119952613 A T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 119952761 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 119953096 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 119953097 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 119953300 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 119953509 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 119953520 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 119953786 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119953960 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 119954036 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 119954040 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119954063 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119954066 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 119954093 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 119954149 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 119954170 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 119954341 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 119954373 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 119954379 A T N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 119954946 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119955130 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 119955312 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 119955343 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 119955378 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 119955586 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 119955600 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 119955601 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 119955649 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 119955790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119956041 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 119956322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119956406 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 119956480 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 119956625 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 119956661 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 119956666 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 119956681 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 119956691 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 119956789 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 119956821 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 119956859 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 119956914 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 119956925 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 119956961 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 119957086 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 119957671 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 119957727 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119957912 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 119958196 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119958234 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119958418 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 119958617 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119958628 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119958864 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 119959216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119959226 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119959439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119959576 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 119959611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119959856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119960364 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119961151 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119961186 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119961353 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 119961359 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 119961500 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 119962473 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 119963752 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 119963763 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119963900 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 119963921 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119964359 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 119964602 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119964761 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119965772 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 119965793 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 119965869 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 119966030 C T N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 3 119966772 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119967146 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119967435 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 119967904 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 119967955 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 119968131 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119968244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119968369 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 119968425 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 119968439 A T N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 3 119968572 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119968930 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119969153 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 119969278 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119969389 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 119969593 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 119969652 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 119969747 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 119970119 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 119970186 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 119970514 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 119970639 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 119970653 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 119970765 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 119971298 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 119971335 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 119971475 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 119971496 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 119971789 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 3 119972144 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 119972303 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 119972601 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 119972696 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 119972765 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 119972854 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 119972902 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119972931 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119972985 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 119972988 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119973115 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 119973219 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119973312 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119973329 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119973671 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 119973809 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 119973824 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 119977057 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119977639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119977701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119977777 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119977785 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 119977794 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 119977862 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119978197 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119979595 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 119979919 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 119980856 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119982385 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119982620 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119984010 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 119985678 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 119986971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119987131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119987358 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119988349 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 119990807 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119990830 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119991290 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 119991345 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 119991351 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 119991558 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 119991659 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 119991752 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 119992535 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119992731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119992785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119992815 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119992888 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 119992945 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119992971 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 119993009 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119993056 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119993169 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119993263 C A Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 119993482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119993564 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 119993762 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 119994361 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119994947 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 119995800 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 119996990 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119997334 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 119997903 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 120000845 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 120000881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120001206 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 120001652 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 120001786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120001924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120002203 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 120003378 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120003392 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120003771 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 120003910 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 120005411 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120005502 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120005523 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120006232 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 120007218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120007880 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 120009243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120009783 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120009832 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120010087 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120013267 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 120014004 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120015010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120015211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120016196 C A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 120017015 T G Y N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 120017044 A T Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 120017666 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 120018017 C T Y Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 120018163 G C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 120019470 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120019937 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120020938 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 120021909 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 120022025 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 120022167 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120022334 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 120022783 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120023920 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120027185 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120030799 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120031710 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 120032202 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120032325 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 120032409 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 120032964 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 120033389 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120033819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120034022 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 120034226 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 120034485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120036002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120037172 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 120038555 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 120039435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120039686 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120040209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120040304 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120040459 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120040491 T G Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 120044354 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 120044829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120045141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120045415 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120046327 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120046569 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120051202 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120051752 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120051756 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 120052279 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120052413 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120052458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120052513 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120052557 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120052573 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120053083 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120053427 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120053497 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 120053523 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 120053617 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 120053618 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120053702 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120054219 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120054829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120055386 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120055532 T C N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 120055543 T C N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 3 120055564 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 120055566 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 120055583 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 120055832 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 120055842 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 120056144 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 120056542 G T N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 3 120056645 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 120057189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120057362 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 120057402 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120057661 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 120057662 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 120057672 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 120057728 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 120057749 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 120057784 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 120057841 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 120057989 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 120058095 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 120058782 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 120058790 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 120058842 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 120058909 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 120058915 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 120059821 G A Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 120059920 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 120060074 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 120060116 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120060185 C A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 120060276 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 120060297 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 120060348 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 120060375 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 120060555 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 120060996 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 120061199 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 120061410 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 120061431 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 120061784 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 120061957 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 120062190 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 120062372 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 120062589 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 120064144 G T Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 120064203 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 120064222 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 120064256 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 120064420 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 120064481 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120064989 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 120065443 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 120065472 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 120065562 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120065714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120065731 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120065823 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 120065824 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120065858 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120066033 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 120066091 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 120067225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120067353 G C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 120067364 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 120067389 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 120067415 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 120067540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120067832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120069235 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 120069391 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 120069951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120070206 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 120070819 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 120071200 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 120071238 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 120071410 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 120072575 A T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 120072709 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120072783 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 120072799 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 120072815 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120072910 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 120073207 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 120073388 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 120073607 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 120073853 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 120074457 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 120074785 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 120074949 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120076402 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120076668 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 120076826 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120077915 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 120081949 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120083236 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120083298 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 120083789 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120084099 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120084100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120084189 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120084680 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120085888 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 120086244 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 120086520 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120086629 T C Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 120087026 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 120088096 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 120088823 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 120089118 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 120089345 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 120089586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120091015 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 120091163 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 120092503 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120099328 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 120099684 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 120099797 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120100038 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 120100134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120101095 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120101557 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120103023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120104244 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120104601 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 120105453 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 120105717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120106116 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 120106128 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 120106250 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 120106608 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 120106612 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 120107174 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 120108196 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 120108722 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120108833 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 120109426 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 120109737 C T N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 120109753 G A Y Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 120109759 C T Y Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 120109810 T G Y N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 120109850 A G Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 120109923 C T Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 120110032 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 120110108 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 120110378 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 120110380 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 120110398 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 120110505 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 120110863 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 120110891 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 120111109 C A Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 120111166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120111421 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120111555 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.5 0.416666666666667 8 16 1 6 5 3 120113637 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120114187 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 120115643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120117111 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120117750 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 120117967 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 120118177 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 120118409 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 120118423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120118901 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 120119015 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 120119034 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 120119223 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 120119328 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 120119466 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 120119481 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 120119539 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 120119540 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 120119686 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120119700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120119724 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 120119938 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 120120333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120120736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120121004 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 120122365 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 120123284 T A Y N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 120123667 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120124258 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 120124318 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 120124375 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 120124972 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 120125324 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 120125487 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 3 120125780 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 120125857 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 120125962 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 120126037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120126067 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 120126565 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 120126635 T C N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 3 120126730 G C N N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 3 120126831 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 120126894 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 120126924 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 120127067 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 120127112 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 120127151 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 120128092 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120128125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120128314 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 120128809 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 120128849 T G Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 120129038 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 120129157 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 120129441 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120130290 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120130560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120131352 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120131589 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120131815 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 120131829 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 120131870 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120131936 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 120132009 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120132103 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120132182 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120132327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120133228 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 120134099 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120135308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120135353 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120136452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120136580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120137135 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120137176 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120138636 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 120138800 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120139073 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120139411 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 120140479 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 120140527 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 120141159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120141348 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 120141455 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 120141461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120141490 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 120141516 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120141531 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 120141561 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 120141639 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 120141859 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 120141980 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120142108 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 120142451 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 120143288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120143415 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120144290 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 120145381 G T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 120145387 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 120146343 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120146386 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 120146708 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120146732 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 120146839 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 120146855 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 120146898 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 120146966 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 120146999 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 120147006 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 120147088 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 120147089 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 120147136 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 120147229 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 120147245 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 120147272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120147287 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 120147405 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 120147488 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 120147489 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 120147501 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 120147591 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 120147642 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 120147660 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 120147714 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 120147752 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 120147853 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120148099 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120148122 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 120148269 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 120148371 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120148541 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120148583 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 120148636 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 120148693 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 120149040 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120149043 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120149127 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120149415 C A Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 120149570 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 120149575 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 120149592 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 120149625 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 120149886 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120150021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120150109 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 120150259 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120150452 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120151037 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120151515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120151951 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 120151997 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120153887 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120154132 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 120154392 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 120154581 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 120154606 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 120154619 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 120154959 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 120155006 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120155093 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120155429 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120155481 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 120155520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120156086 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120157210 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120157554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120157623 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 120158709 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120158822 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 120161218 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 120161300 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 120161478 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 120161532 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120161576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120161898 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120161917 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120162229 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120162280 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 120162286 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 120163167 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 120163201 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 120163524 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 120163661 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 120163968 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 120164077 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120164105 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 120164680 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120164893 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 120164958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120165240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120165329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120165393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120165597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120165602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120165791 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 120165862 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 120165863 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 120166319 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 120166399 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 120166581 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 120166672 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120166963 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 120167071 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120168240 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120168783 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120169887 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 120170102 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120170453 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120170673 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120172950 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 120173621 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120173916 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 120174012 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120174194 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120174460 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120178393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120178517 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120178747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120178776 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 120179270 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 120179470 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 120179752 A T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 120179782 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120179820 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 120179862 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120179863 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120180026 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120180340 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120180407 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 120180592 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120180793 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 120182097 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120183772 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120184956 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120185024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120185077 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120185868 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120185986 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120186439 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120186623 A T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 120187488 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120188197 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120188532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120190224 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120190437 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 120190557 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 120191314 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120191400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120191936 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120192015 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 120192167 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120192185 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 120193289 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 120193312 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 120193324 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 120193613 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 120193645 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120194263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120194356 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 120194682 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120196038 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120196651 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120198404 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 120198692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120198783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120198800 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 120198994 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120199033 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120199340 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120199939 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120200314 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120200520 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120201168 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120201217 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120202390 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120203431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120203443 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120204009 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120204496 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120204514 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120204529 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 120204709 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 120204987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120205000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120205903 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120206344 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120206396 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120206621 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120206713 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120206748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120206866 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120206925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120206962 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120207174 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 120207583 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120207715 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120208145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120208592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120210035 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 120210611 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 120210704 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 120211145 T C N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 3 120212750 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120212900 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120212902 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120213064 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120213077 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120213087 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120213172 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120213691 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120214203 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120214507 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120214603 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 120220463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120222124 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120222463 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120222717 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120224518 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120225132 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120225421 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120225422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120226425 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120227305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120227728 A C N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 120228675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120229439 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 120229818 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120230295 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120231146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120231648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120233305 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120233528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120235593 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120235985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120236246 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120237415 T A Y N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 120239679 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120240681 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120245413 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 120250033 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 120250080 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 120250092 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120250228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120250371 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120250375 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120250444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120250445 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120250704 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 120250852 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 120250920 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 120250982 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 120251017 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120251178 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120251203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120251318 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120252244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120254784 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120254832 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 120258391 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 120260050 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120260188 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120262185 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120263108 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 120263912 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120264711 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120264857 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 120265010 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 120265728 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120266142 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120267010 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 120267521 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120269157 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120271654 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120271890 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120271957 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 120272157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120274116 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 120274383 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120276093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120276373 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120276645 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120276746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120276902 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 120278913 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 120279944 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 120280606 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120282516 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120283376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120283395 C G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 120283431 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120285852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120286666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120287646 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120287894 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120289046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120291391 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 120291764 C T N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.307692307692308 0.538461538461538 0.153846153846154 15 11 4 7 2 3 120291797 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120292360 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120294629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120294821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120295217 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120295651 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 120298624 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 120299472 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120300272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120300371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120301220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120301419 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 120302303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120302461 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120302680 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 3 120303540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120303634 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120303762 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120303788 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120303922 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120305285 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 120305331 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 120305814 T C Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 120305926 T C Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 120306361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120307058 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120307137 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 120307195 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 120307287 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120308296 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120308407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120308971 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120309230 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120309358 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 120309611 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 120309863 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120310137 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 120310199 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 120310225 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 120310238 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 120310403 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 120310428 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 120310477 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 120310488 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 120310549 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 120310563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120310578 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 120310621 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 120310662 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 120310726 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 120310732 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 120310737 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120310819 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 120310941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120310944 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 120311508 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120311563 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120311881 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 120311887 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 120311898 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 120312032 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 120314760 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 120317907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120321513 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120321880 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120321898 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 120322053 T A N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 120322059 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 120322109 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120322268 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120322761 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 120323678 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 120323757 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 120324075 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120324182 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 120324578 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120324601 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120325463 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120326660 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120328213 T A Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 120328432 C T Y Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 9 11 2 5 3 3 120328890 C T Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 120329027 A C Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 120330112 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120330426 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120331753 C T Y Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 3 120333283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120333585 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 120333638 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 120334122 C T N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 3 120336948 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 120337170 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120337269 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 120337443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120337449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120337901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120338501 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120340047 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 120340919 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120342041 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 120344352 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 120347598 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 120347639 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120348037 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120348192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120348515 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 120348559 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120349419 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 120349463 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120349808 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 120350519 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 120350664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120350817 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120351207 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 120351447 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120351492 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120351567 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120351742 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120352513 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 120353022 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 120353861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120354914 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 120355542 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120356211 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120356342 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 120356624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120356687 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120357068 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120358034 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 120358399 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 120358905 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 120359607 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120359626 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 120359699 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 120359945 C T N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 3 120360135 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 120360559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120360858 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 120361057 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120361547 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 120361553 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 120361769 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 120361990 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 120362060 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 120362864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120362902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120363515 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120363699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120364408 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120366045 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120366082 A G Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 120366130 G T N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 120366169 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 120366210 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 120368095 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 120368576 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 120368716 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120368770 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 120368879 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 120368978 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120369065 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 120369373 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 120369799 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120370041 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 120370179 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 120370832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120371515 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 120372264 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 120372735 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120373445 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 120373710 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120373924 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 120374171 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 120374999 G T Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 120375448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120375767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120376241 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120376466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120376571 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 120376890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120377488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120377506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120377535 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 120377640 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 120377707 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 120377763 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 120377992 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 120378023 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120378101 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 120378182 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 120378191 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 120378252 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 120378361 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120378412 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120378477 A C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 120378478 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 120378497 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 120378507 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 120378555 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 120378625 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120378637 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120378767 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120378788 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120378822 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120379100 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120379734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120379886 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120380495 C G N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 3 120380831 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 120380862 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 120380874 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 120380917 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 120380965 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 120381339 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120381347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120381485 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120381813 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120381832 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120381945 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120381946 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120381961 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 120382040 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 120382077 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120382121 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120382340 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120383900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120384656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120385648 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120386535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120388198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120388307 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 120388727 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 3 120388785 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 120388799 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 120388955 A T N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.133333333333333 0.733333333333333 0.133333333333333 15 15 2 11 2 3 120389194 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 120389210 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 120389480 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 120389496 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 120389514 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 120389606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120389684 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 120389946 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120390057 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 120390281 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120390282 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120390354 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 120391441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120391864 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 120392191 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120392679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120392797 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120393395 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 3 120393400 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120394430 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120394579 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0 0.764705882352941 0.235294117647059 13 21 0 13 4 3 120394836 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 120395115 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120397372 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120397374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120397473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120397610 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 120397645 G A Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 3 120397869 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 120397943 A T Y N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.0588235294117647 0.823529411764706 0.117647058823529 16 18 1 14 2 3 120398253 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 120398370 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 120398543 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120398576 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120398580 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120398661 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 120398964 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 120399009 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120399687 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120401302 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120401799 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120402806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120402862 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120402994 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 120403020 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 120403025 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 120403047 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 120403085 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 120403151 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 120403232 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120403506 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120403566 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120403871 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120404148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120406303 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120406366 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120406370 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120406410 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120406555 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 120406689 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120406694 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120406863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120406882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120406884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120406937 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120406966 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120406990 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120407008 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120407234 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120407492 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 120407512 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 120407519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120407635 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 120407678 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 120407758 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 120407775 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120407894 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 120407912 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 120407979 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120408000 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 120408019 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 120408060 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 120408306 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 120408309 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 120408321 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120408373 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 120408410 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 120408431 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 120408455 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 120408459 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 120408485 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 120408493 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 120408519 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 120408526 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 120408533 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 120408630 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 120408740 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 120408835 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 120408843 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 120408851 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 120408911 A G Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 120408928 A C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 3 120409215 G T N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 120409291 C T N Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 5 9 1 3 3 3 120409331 A G N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 120409379 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 120409486 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 120409555 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 120409742 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120409811 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120409832 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 120409888 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 120409918 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 120409957 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 120410089 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 120410090 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 120410197 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 120410227 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120410263 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120410301 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120410378 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 120410453 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120410788 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 120410840 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 120410913 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 120411135 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 120411141 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 120411151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120411155 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 120411199 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 120411200 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 120411228 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 120411289 A T N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 3 120411344 A G Y Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 120411551 T A N N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.272727272727273 0.545454545454545 0.181818181818182 12 10 3 6 2 3 120411600 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.125 0.6875 0.1875 15 17 2 11 3 3 120411736 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 120411747 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 120411800 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 120411867 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120411948 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 120411979 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 120412119 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 120412232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120412287 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 120412357 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 120412433 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 120412958 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 120413065 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120413074 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120413107 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120413112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120413183 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120413189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120413253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120413277 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 120413325 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 120413425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120413577 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 120413702 A G N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 12 8 4 4 2 3 120413714 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 3 120413924 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 120413976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120414037 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 120414116 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 120414128 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120414130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120414148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120414177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120414187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120414319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120414325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120414500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120414616 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 120414688 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 120414694 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 120414776 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 120414821 T C Y Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 3 120414878 G C Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 120414883 G C Y N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 120414960 G A Y Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 120414993 A C Y N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 120415033 A C Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 120415653 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 120415742 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 120415881 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120415922 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120415938 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 120415941 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120415997 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120416098 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 120416322 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120416326 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120416342 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120416377 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 120416812 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 120416819 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 120416899 T C Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 120416932 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120416973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120417014 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120417146 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 120417169 A T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 120417296 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120417312 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 120417504 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120417532 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120417586 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120417601 G C Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 120417631 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120417753 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120417820 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120417929 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120417965 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120417970 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120418006 G A Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 120421665 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 120421699 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 120421783 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120421792 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120421855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120422051 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 120422197 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120422331 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 120422446 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120422580 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 120422634 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 120422667 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120422701 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120422884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120422998 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120423047 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120423060 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 120423080 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120423168 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120423172 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120423271 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120423291 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120423320 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120423331 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120423346 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120423394 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120423475 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120423514 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120423700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120423754 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120423985 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120423990 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 120424009 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 120424085 A G Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 120424086 A T Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 120424464 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 120424500 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120424549 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 120424689 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120424711 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 120424866 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 120424890 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 120425021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120425292 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120425444 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120425473 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120425547 G T Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 120425721 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 120425748 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 120425834 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 120425887 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 120425917 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 120425960 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 120426044 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 120426095 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 120426101 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 120426113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120426265 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 120426307 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 120426360 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 120426412 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 120426422 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 120426438 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 120426446 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 120426478 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120426481 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.3125 0.625 0.0625 20 12 5 10 1 3 120426534 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120426550 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120426586 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 120426723 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120426740 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 120426903 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 120426958 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 120426996 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 120427001 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 120427057 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 120427061 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 120427079 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 120427119 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 120427159 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 120427325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120427373 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 120427404 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 120427405 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120427427 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 120427550 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120427566 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 120427624 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 120427672 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 120427697 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120427761 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 120427785 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 120427833 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 120427860 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 120428000 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 120428097 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 120428129 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 120428173 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 120428232 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120428445 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 120428483 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 120428507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120428524 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 120428833 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 120428865 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 120429074 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 120429153 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 120429328 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 120429651 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 120429682 A T N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 120429741 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 120429946 C G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 120430007 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 120430025 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 120430030 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 120430036 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 120430151 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 120430163 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 120430426 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 120430478 T C N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 120430534 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 120430601 A G N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 3 120430789 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 3 120430819 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 120430881 G A N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 3 120430885 C T N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 3 120430916 C T N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 3 120431039 T G N N 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.181818181818182 0.454545454545455 0.363636363636364 9 13 2 5 4 3 120431045 T C N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 3 120431148 T G N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 120431195 C T N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 3 120431197 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 120431314 A C N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 120431433 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 3 120431680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120432058 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 120432332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120432536 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120433873 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120434473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120436548 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 120436636 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120437266 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 120437482 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120437811 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 3 120445665 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120446530 G A N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 3 120447043 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120447398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120447420 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 120447532 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 120447676 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 120447797 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 120447850 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 120447929 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120448447 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 120448992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120449075 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 120449674 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 120449729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120450148 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 120450432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120450523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120450786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120450879 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 120451140 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120451150 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120451211 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 120451397 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 120451408 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 120451763 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 120451981 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120451995 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120451996 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120452019 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120452154 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 120452305 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120452358 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120452508 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120452722 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120452760 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120452917 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120452930 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120452954 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120452999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120453107 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120453108 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120453285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120453456 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120453564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120453594 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120453605 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120453716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120453731 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 120454056 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 120454116 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120454134 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120454173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120454199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120454269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120454426 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120454585 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120454659 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 120454673 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 120454753 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 120454762 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 120454859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120455387 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120457729 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 120459378 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120459765 T A Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 120459903 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120459967 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120460105 A C Y N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 120462093 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 120464163 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 120465836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120466590 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120468216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120468694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120468993 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120469802 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120470271 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120470353 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120470804 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120470997 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 120471083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120471125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120471479 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 120471745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120471798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120471868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120472007 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120472188 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 120472484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120472949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120473745 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 120473813 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120473886 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120474300 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 120474328 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 120474384 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 120474391 C A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 120474407 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120474425 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120474457 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120474486 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120474763 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 120474848 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 120474936 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 120475116 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 120475137 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 120475248 T G Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 120475396 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 120475675 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 120475719 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 120475734 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 120475750 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 120475827 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120475905 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120476622 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 120478457 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120478716 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120480992 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120481154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120481203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120481598 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 120481737 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120481802 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 120481866 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 120482274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120482385 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120482419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120482495 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 120482693 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120482729 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 120482742 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 120482930 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 120483597 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 120483630 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120483691 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 120484661 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120484733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120486652 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 120487041 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 120487202 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 120487616 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 120487687 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 120487719 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 120488041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120488435 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 120488890 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 120490378 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120491229 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 120491842 C G N N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 3 120492617 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120492644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120492726 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120492797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120493061 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 120493381 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 120493643 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 120493660 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 120493686 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 120493740 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 120493779 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120494033 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 120494350 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 120494731 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120494811 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120494962 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 120495196 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120495237 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 120495276 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120495298 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 120495405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120495416 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120495466 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 120495540 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120495680 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120495925 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 120495926 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120496092 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120496180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120496440 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120496652 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 120496823 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 120497025 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120497080 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120497241 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120497447 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 120497551 T C Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 120497646 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120497825 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120497897 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120497915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120497921 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120498023 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120498043 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120498065 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120498167 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120498183 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120498229 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 120498246 C G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 120498291 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120498364 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120498371 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120498550 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 120498660 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120498696 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120498837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120498871 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 120499081 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 120499591 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 120499652 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120499668 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120499777 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 120499807 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 120499864 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 120500186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120500550 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120501040 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120501216 A T N N 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 8 6 1 6 0 3 120501848 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120502972 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 120503549 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 120503556 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 120504534 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 120504735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120505195 C G Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 120505242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120505249 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 120505265 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 120505277 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120505435 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120505562 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120505573 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120505710 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 120505719 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120505858 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 120506043 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 120506270 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 120506755 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 120506872 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 120507044 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 120507051 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 120507143 T A N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 120507198 G A Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 120507289 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 120507393 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 120507434 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 120507657 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 120507782 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 3 120507863 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 120507893 A T Y N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 3 120508089 C T N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.266666666666667 0.666666666666667 0.0666666666666667 18 12 4 10 1 3 120508156 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 3 120508231 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 120508273 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 120508275 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 120508355 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 120508461 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 120508587 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 120508596 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 120508653 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 120508828 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 120508865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120508878 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 120509312 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120509381 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 120509693 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 120509743 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 120510156 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 120510319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120510676 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 120511701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120511783 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120512225 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 120512769 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 120512958 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120514534 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120515690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120517430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120520075 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 120521115 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120521121 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120521752 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120522327 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120523023 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120523390 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120523925 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 120524145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120525211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120527338 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 120527775 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120535683 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 120536092 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120536583 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 120538542 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 120538566 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 120538654 A G N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 3 120538682 C T N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 3 120538774 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 120539082 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120540328 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 120541014 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 120541333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120541342 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 120541361 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 120541443 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 120541789 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 120541814 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 120542386 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120542513 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120542680 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120542779 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120543367 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 120543797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120543868 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120544376 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 120544380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120545237 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120545380 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 3 120545629 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120545680 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 120545792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120545810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120545998 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 120546063 A C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 120546094 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120546325 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120546737 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 120546971 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 120546994 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 120547018 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 120547027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120547188 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 120547677 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 120547799 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 120548339 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 120548349 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 120548475 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 120548476 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 120548534 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 120548601 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 120548676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120549099 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120549357 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120549587 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 120549637 A T N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 120554627 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 120554635 C G N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 120554764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120555082 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120555167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120555170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120555193 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120555221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120555305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120555403 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120555890 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120556121 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 120556411 G C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 120556472 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 120556487 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 120556804 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 120556953 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120557000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120557100 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 120557448 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 120557843 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 120558259 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 120558350 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 120558416 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 120558482 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120558518 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 120558576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120558587 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120559035 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 120559055 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 120559178 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120559203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120559747 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120559749 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 120560275 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 120560420 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 120560434 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120560588 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 120560614 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 120561736 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 120561983 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 120562089 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120562945 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 120563054 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 120563112 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 120563131 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 120564949 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120565192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120565196 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120566598 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120567885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120568005 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120568267 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120568509 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120568913 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120568960 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120569013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120569211 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120569404 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120569467 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 120569692 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 120569718 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120569737 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 120569933 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120570704 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120570838 A G Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 120570891 T A N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 3 120571103 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 120571205 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120571404 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120571457 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 120571942 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 120572007 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120572022 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 120572145 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 120572174 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 120572202 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 120572255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120572395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120572845 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 120572849 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 120572933 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120572936 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 120573537 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 120573653 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 120573713 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 120573857 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120573934 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 120574078 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120574098 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120574102 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120574209 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120574252 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120574303 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120574313 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120574329 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120574331 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 120574425 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120574435 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120574532 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120574640 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120574730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120574994 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120575062 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120575097 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120575217 C G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 120575428 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 120575580 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 120576488 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120576647 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 120577494 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120577763 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 120578431 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120578508 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120578519 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 120579055 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 120579898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120579935 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120581462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120582353 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 120582359 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 120582394 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 120582552 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 120582564 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 120582801 G T N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.5 0.214285714285714 0.285714285714286 17 11 7 3 4 3 120582815 C G N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 120582824 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 120582881 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 120582900 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 120582992 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 120582996 A C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 120583197 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 120583211 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 120583256 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 120583289 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 120583311 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 120583493 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 120584026 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 120584110 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 120584178 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 120584271 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 120584352 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 120584375 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120584659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120584767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120584885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120584931 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120585135 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 120585541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120585603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120586891 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120586943 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120586967 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120587094 G C N N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 120587582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120588632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120588663 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120588841 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120588892 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 120589774 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120589943 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 120590011 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 120590182 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 120590185 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 120590215 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 120590234 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 120590271 C A Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 120590318 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 120590333 T A Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 120590351 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 120590397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120590628 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 120590661 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 120590971 T G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 120591032 T C N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 3 120591373 T C N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 3 120591427 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120591501 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 120591579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120591588 C A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 120591628 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 120591635 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 120591652 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 120591704 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 120591742 A T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 120591826 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 120592037 G T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 120592124 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 120592149 T A Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 120592214 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 120592760 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120592971 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120593080 A T Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 120593208 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120593340 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 120593404 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 120593541 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 120594023 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 120594236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120595175 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 3 120595474 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 120596680 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120596868 C A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 120598295 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120598312 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 120598317 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 120598464 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 120598522 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120598853 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 120598968 A T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 120599013 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 120599031 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 120599235 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 120599346 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 120600269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120600329 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 120601182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120601258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120601640 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 120601860 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 120601862 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 120602164 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120602893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120603222 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120603902 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120603960 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 120604181 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120604805 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120605520 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120605734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120606210 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120606251 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 120606582 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 120606627 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 120606717 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120606859 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120607194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120607225 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120607251 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 120607384 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 120607602 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 120607603 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 120608224 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 120608244 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 120608614 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120609703 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120613776 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 120613932 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 120614295 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 120614319 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 120614711 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 120616497 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120616631 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 120617008 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120617024 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 120617104 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120617242 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120617338 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120617413 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120617453 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 120617495 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120617496 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120617616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120617636 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120617704 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120617930 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120617944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120618122 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120618156 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 120618167 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120618249 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 120618344 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120618757 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 120618827 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120618882 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120619096 A C Y N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 3 120619339 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120619428 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 120620092 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120620792 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120621439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120621543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120621746 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 120621836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120623106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120623621 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120624021 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120624287 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 120632128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120632568 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 120633003 C A N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 120633045 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 120634342 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120634755 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120635121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120635553 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120635906 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 120636835 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120638564 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120639181 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120639225 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 120639406 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120640267 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 120640367 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 120640709 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 120640737 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 120640758 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 120640797 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 120640812 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 120640846 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 120640924 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120640937 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 120640957 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 120640959 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 120641120 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 120641146 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 120641337 G C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 120648495 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 120649900 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 120650807 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 120651003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120651128 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 120651590 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 120652493 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120652619 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 120652849 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 120653103 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120653400 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 120653587 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 120653737 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 120653782 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 120653811 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120653891 G T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 120654012 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 120654021 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 120654147 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 120654182 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 120654215 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 120654248 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 120654250 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120654416 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 120654441 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120654483 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 120654801 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 120654920 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120655753 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 120655830 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 120656223 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 120656331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120656372 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 120656565 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 120656675 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 120656697 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120656856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120656961 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 120656963 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 120657080 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 120657097 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 120657175 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 120657181 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 120657224 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 120657335 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 120657359 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 120657440 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 120657467 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 120657625 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 120657662 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120657761 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 120657821 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 120657835 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 120657952 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 120658018 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 120658033 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 120658285 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120658418 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 120658455 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 120658489 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120658502 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 120658604 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 120658605 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 120658634 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 120658653 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 120658858 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 120658906 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 120658921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120658936 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120658996 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 120659127 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120659674 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 120659693 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 120659930 C G Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 120660801 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 120660995 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 120661488 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120661518 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 120661618 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 120661747 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120661807 A G Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 120661829 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 120662945 A G Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 120663177 G T Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 120663546 G A Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 120663683 A G Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 120663706 C T Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 120663920 G A Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 120664047 T C Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 3 120664169 G T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 120664282 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 120664930 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 120665015 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 120665029 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 120665410 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 120666256 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120667482 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120668891 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 120669031 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 120669076 C G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 120669638 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 120669733 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 120669904 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 120669917 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 120669986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120670049 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 120670174 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 120670219 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 120670358 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 120670457 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 120670547 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 120670581 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 3 120670841 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 120670910 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 120670943 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 120671074 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 120671132 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 120671314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120671894 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 120673836 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 120673886 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 3 120678355 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120680658 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120681145 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120682760 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120686728 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120688522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120691133 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 120691379 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 120691403 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 120691695 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 120691750 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 120691843 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 120691847 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 120692407 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 120693598 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120695140 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 120697925 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120703119 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120704793 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 120705173 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120706270 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120706890 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 120708041 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 120709297 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 120710374 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120711460 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120711759 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 120712006 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 120712407 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 120712542 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 120712643 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 120712660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120712722 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 120712726 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 120712740 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 120712748 A C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 120712756 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 120712766 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 120713014 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 120713517 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120714357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120714494 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120715363 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 120715382 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120715448 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 120715483 A G Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 120715553 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 120715567 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 120715578 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 120715619 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120715699 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 120715701 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 120715798 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 120716055 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 120716311 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 120716335 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120716401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120716856 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 120717116 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 120717521 C G N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 3 120717530 T C N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 3 120717616 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 120717632 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120717658 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 120717745 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 120717833 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 120717917 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 120717918 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 120717973 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 120718068 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 120718143 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 120718219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120718243 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 120718264 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120718299 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 120718352 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 120718378 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 120718424 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120718549 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 120718550 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 120718755 T C Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 3 120718915 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 120718950 A G Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 120719230 C T Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 120719326 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120719671 T C Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 120722829 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 120722921 A T N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 120722933 A G N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 120722934 T G N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 120723038 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 120723277 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 120723286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120723365 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120723705 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 120723855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120723901 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 120723916 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 120723988 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 120724013 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 120724037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120724047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120726036 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 120726097 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 120726408 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 3 120728161 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 120728306 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 120728380 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 120728963 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 120729440 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 120729785 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 120732918 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120733583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120733757 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120733782 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120733822 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120734034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120734817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120734864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120736804 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120737735 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120737876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120742390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120743020 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 3 120744370 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 120744446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120746091 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120746319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120747091 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 120750185 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 120757852 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120757857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120758254 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 120759196 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120760965 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120763515 C A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 120764009 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120765586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120769254 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 120769315 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120769734 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 120769794 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 120769935 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 120770001 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120770028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120770043 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120770286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120770431 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 120770522 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 120770620 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 120771874 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 120771934 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 120772057 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120772070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120772074 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120772469 G C N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 120772603 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 120772706 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120772722 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 120772864 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 120773833 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 120774039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120776054 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 120776494 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 120776751 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 120776919 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 120777279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120777318 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 120777500 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120777680 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 120778165 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 120778364 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 120778454 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 120778525 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 120778708 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 120778912 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 120778949 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 120779464 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120779624 A T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 120780453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120780829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120780985 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 120781184 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 120781227 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 120781491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120781526 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 120782030 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120782082 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 120782091 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120782120 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 120782149 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120782167 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120782183 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 120782706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120782754 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 120782812 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 120782828 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120783654 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 120784203 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 120785417 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 120785651 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 120785654 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 120785722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120786008 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 120786554 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 120786581 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 120786994 C T N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 3 120787139 A T N N 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 8 6 2 4 1 3 120787222 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 120787313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120787404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120787456 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120787497 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 120788005 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 120788171 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 120788181 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 120788551 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120788621 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120788722 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120788879 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 120788916 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 120789119 C A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 120789287 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120790846 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120794443 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 120794666 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120794858 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 120795101 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 120795350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120795391 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120795851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120795985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120796117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120796165 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 120796308 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120796450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120796460 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 120796467 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120796642 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 120796733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120796741 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 120796754 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 120796793 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 120797094 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 120797338 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 120797388 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 120799667 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 120800503 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 120800537 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 120800762 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 120800879 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 120801105 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 120801160 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 120801168 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 120801221 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 120801274 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 120801295 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 120801309 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 120801390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120801401 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 120801402 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 120801416 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 120801451 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 120801483 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 120801736 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 120801802 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 120802053 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 120802719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120803844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120806231 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120808015 G T Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 120808035 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 120808047 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 120808289 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120808332 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120808365 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120808368 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120808526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120808544 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120808637 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 120808858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120809191 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 120809222 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 120809235 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 120809577 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120809604 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120809643 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120809651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120809662 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120809820 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 120809854 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 120809911 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 120809954 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 120809968 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 120810113 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 120810118 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 120810706 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120810804 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120810954 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 120811020 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120812107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120812323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120812482 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120812846 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120812909 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120813443 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120813572 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 120813785 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120814026 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120814769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120814999 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120815819 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 120817045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120819240 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120819794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120819846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120820346 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120820602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120821147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120821220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120822027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120822530 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 120822866 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 120823232 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120823360 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 120823396 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 120823643 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 120823795 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 120823881 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 120827987 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 120828030 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 120828212 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 120828241 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120828284 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 120828394 A T N N 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 6 10 1 4 3 3 120828458 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 3 120828541 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120828854 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 120828886 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 120830203 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 120830208 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 120830220 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 120830279 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 120830315 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 120830346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120830379 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 120830466 T A N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 3 120831096 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 120831283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120831470 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 120831474 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 120831504 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 120831742 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 120831806 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 120832372 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 120832390 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 120832416 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 120832474 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 120833273 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120835731 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120838527 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120843067 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120843942 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120848319 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120849071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120850182 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120850643 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 120850756 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 120851093 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 120851139 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 120851163 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120851177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120851277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120851291 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120851833 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 120851834 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120851934 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120852005 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120852261 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 120852471 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 120852482 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 120852658 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120854787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120854794 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 120854954 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120854969 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 120855032 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 120855070 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 120855193 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120855267 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120855331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120856208 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120856225 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120856244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120856258 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120856296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120856370 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 120856376 A G N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 14 12 1 12 0 3 120856386 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120856501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120856507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120856541 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120856568 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120856569 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120856625 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120856744 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.157894736842105 32 6 16 0 3 3 120856823 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 120857412 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120857591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120857772 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 120857774 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 120857857 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 120857859 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 120857885 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 3 120858065 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 120858531 A G N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 120858540 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 120858926 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 120858999 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120859453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120859645 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120859659 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 120860302 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 120860998 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 120861920 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 120862730 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120863540 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120863541 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120863736 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 120863755 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 120863833 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 120863878 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 120863993 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 3 120864158 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 120864165 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 120864325 G T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 120864681 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 120864689 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 120864717 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 120864732 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 120864748 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 120864823 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 120864826 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 120865074 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 3 120865092 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 3 120865168 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 120865398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120865404 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 120865423 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 120865425 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 3 120865451 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 120865620 A G N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 3 120865648 C A N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 120865658 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 120865684 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 120865757 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 120865800 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 3 120865861 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 120866007 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 120866021 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 120866033 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 120866126 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 120866161 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 3 120866448 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 120866550 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 120866571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120866601 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 120866605 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 120866617 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 120866646 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 120866668 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 120867378 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120867596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120867906 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120868145 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 120868450 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 120868965 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 120869594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120869920 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 120870237 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120870798 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 120870820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120871020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120871026 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 120871172 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120872138 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120873443 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120874590 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120876202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120876398 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120876767 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120877835 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120879267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120879268 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 120879529 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120880027 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 120882177 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120882704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120884413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120886491 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120888807 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120889485 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 120889715 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 120889816 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120889904 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 120890473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120892142 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 120892327 C G Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 120892394 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 120892406 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 120892417 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120892486 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 120892572 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 120892588 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 120892958 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 120892962 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 120893165 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 120893547 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 120893567 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 120894407 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120894411 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120895377 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 120895383 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 120895397 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 120895515 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 120895542 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 120895584 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 120895598 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 120895627 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 120895663 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 120895903 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 120895941 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 120896045 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120896053 A C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 120896069 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 120896082 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 120896088 G T N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 120896163 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 120896181 T A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 120896231 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 120896335 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 120896377 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 120896379 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 120896812 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 120896818 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 120896852 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 120897096 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 120897363 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120897412 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 120897522 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 120897686 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 120897964 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120898128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120898672 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120898738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120900277 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 120900678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120901928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120903139 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120903402 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 120903677 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 120903723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120904007 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 120905283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120905436 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120906977 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120907157 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 120907428 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120908056 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120908106 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120908235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120908737 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 120909643 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120909986 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 120910004 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 120910523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120911202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120912181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120912183 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 120912289 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 120914397 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 120915127 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 120915242 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 120915292 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 120916010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120916109 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 120916368 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 120916561 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 120916624 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 120916640 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 120916648 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 120916873 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 120917075 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120917333 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 120917362 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 120917529 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 120918113 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 120918934 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 120919159 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 120919160 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 120919181 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 120919256 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 120919377 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 120919711 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 120919801 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 120920094 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 120920165 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 120920226 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120920307 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 120920324 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 120920397 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 120920496 T G Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 120920607 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 120920621 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 120920835 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 120920837 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 120923868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120924349 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120924755 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 120924765 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 120925768 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 120925777 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 120925810 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120925817 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120925845 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120925901 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 120926333 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120927471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120927487 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120927682 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120928282 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 120928370 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120929191 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120929347 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 120929690 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 120930000 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 120930065 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 120930152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120930529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120931012 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120932070 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 120933729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120933843 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 120934211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120934268 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120934640 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120934645 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 120934850 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120934894 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120935303 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 120935378 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 120935382 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 120935579 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 120935595 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 120935597 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 120935655 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 120935660 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 120935680 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120935947 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120936317 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 120936821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120936870 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120937373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120937773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120938169 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120938314 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120938963 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 120941475 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 120941924 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120943949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120944916 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 120944919 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 120944994 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120945589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120945911 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 120946083 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120946359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120946423 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 120946471 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 120946698 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 120946851 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 120947087 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 120947109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120947289 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 120947383 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 120947397 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120947414 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 120947439 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 120947490 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 120947585 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 120947612 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 120947701 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120947717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120947729 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 120947767 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 120947828 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 120947975 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 120948158 G A Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 120948504 A G Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 120948537 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 120948641 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 120948662 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 120948879 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 120948896 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 120948953 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 120949119 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 120949155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120949186 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120949229 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 120949262 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 120949404 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 120949445 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 120950731 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120950878 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120951530 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 120951641 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 120951832 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 120953727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120953897 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 120954221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120954519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120954900 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120954939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120956982 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120958800 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120959624 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120960391 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120961589 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120961682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120962351 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 120962563 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 120962598 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 120962651 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 120962718 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 120962736 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 120962862 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 120962902 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 120962962 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 120962988 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 120963458 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 120963998 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 120964104 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120964487 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 120964801 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120965182 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120966363 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 120974438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120975420 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120975762 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120976114 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120976529 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 120976533 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 120976567 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 120977353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120977518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120977665 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120977785 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120978831 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120979724 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120979914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120980337 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 120980538 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 120981345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120981403 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120982288 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120982562 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 120982598 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 120982658 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 120985094 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120985855 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120986243 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 120988696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120988797 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120989671 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 120990015 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 120990488 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120993147 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120997822 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120998374 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120998376 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 120998793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120998952 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 120999986 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 120999991 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121001434 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121001868 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121002118 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121003334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121003661 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121004547 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121005243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121006182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121006256 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121010031 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 121010161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121010180 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121010214 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 121010845 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 121010864 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 121010866 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121010957 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 121010962 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121011099 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 121011234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121011327 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121011400 G T Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 121011497 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121011758 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 121011830 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 121011919 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 121011920 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 121012028 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 121012189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121012245 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121012246 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121012267 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121012330 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121012521 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 121012897 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 121012959 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 121013206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121013301 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121013390 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 121013477 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121013492 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 121013752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121013782 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121013906 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121014018 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121014461 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 121014471 A G Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 121014522 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 121014631 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 121014637 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 121014755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121014895 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 121014925 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121015052 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 121015062 T G N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 3 121015158 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121015226 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 121015241 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121015254 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 121015281 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 121015589 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121015607 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121015695 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121015797 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121015877 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121015897 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 121015986 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121016119 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 121016133 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 121016435 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 121016474 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121016476 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121016990 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121017095 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 121017297 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 121017404 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 121017421 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 121017436 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 121017534 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 121017597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121017634 G T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 121017807 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 121017886 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 121017967 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 121017982 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 121018020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121018025 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 121018035 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 121018045 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 121018210 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 121018216 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 121018332 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 121018407 C A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 121019102 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121019158 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 121019163 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 121019199 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121019509 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 121019544 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.25 0.333333333333333 0.416666666666667 10 14 3 4 5 3 121019560 C G Y N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 3 121019593 C A Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 121019780 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 3 121019829 G T Y N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 3 121019885 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 3 121019936 G A Y Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 14 12 1 12 0 3 121020150 A T N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 121020299 A G N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.384615384615385 0.307692307692308 0.307692307692308 14 12 5 4 4 3 121020851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121021155 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121021205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121021813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121022682 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 121022714 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121022749 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 121022778 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 121022840 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 121022852 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 121023516 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 121023649 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 121023722 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 121023838 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 121023870 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 121023922 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 121023924 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 121023940 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 121023965 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 121024055 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121024128 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 121024159 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 121024319 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 121024440 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 121024989 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 121025014 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 121025038 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121025236 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 121025327 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121025348 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 121025439 T G Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 121025567 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121025568 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121025608 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 121025802 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 121025852 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 121026203 T A Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 121026281 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 121026588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121026613 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121026781 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 121026849 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 121027013 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 121027089 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121027104 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121027151 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121027168 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121027190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121027304 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121027315 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121027386 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 121027838 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 121027965 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121028072 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 121028313 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121028489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121029069 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 121029391 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121029774 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 121029932 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 121029935 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 121029949 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 121030025 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121030071 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 3 121030176 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 121030351 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121030371 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 121030384 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 121030522 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121030732 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121030923 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 121031305 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121031551 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121032148 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 121032348 G A Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 121032813 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 121032911 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 121032922 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 121032936 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 121032979 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 121033122 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 121033127 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 121033151 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 121033304 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121033446 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 121033547 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121033610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121033640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121033691 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121034316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121034331 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121034591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121035022 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 121035071 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121035250 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 121035550 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 121035687 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 121035716 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 121035723 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 121035901 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 121035915 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 121036086 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121036195 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 121036433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121036439 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 121036486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121036673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121036691 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 121037261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121037396 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121037399 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 121037422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121037617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121037646 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 121037704 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 121037708 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121037772 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121038498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121039018 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121039064 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121039067 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121039435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121039451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121039630 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 121039890 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 121040011 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 121040071 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 3 121040465 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 121041155 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 121041216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121041859 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 121041951 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121041981 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121042596 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 121042647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121042669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121042699 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 121042763 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 121042834 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 121042836 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 121043055 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 121043073 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 121043228 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121043262 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 121043325 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 121043357 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 121043409 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121043922 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 121044077 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 121044097 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 121044181 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 121044302 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121044321 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 121044558 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121044638 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 121044716 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121044723 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 121045330 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 121045635 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 121045757 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121045839 G T Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 121046253 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121046279 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 121046289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121046436 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121046538 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121046767 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 121047081 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121047110 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121047188 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121047670 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121047791 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 121047894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121047986 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121048069 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121048511 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 121048608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121048945 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121049012 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121049073 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 121049515 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 121049647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121049749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121049757 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 121051281 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121051357 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121051765 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121051767 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 121051876 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 121051923 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 121051951 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 121052141 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121052546 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121053346 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 121053377 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121054377 C G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 121054378 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121054455 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 121054539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121054617 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121054747 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 121055005 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 121055044 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 121055454 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 121055468 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 121055562 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 121055582 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 121055611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121055813 T C N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 3 121055998 C G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 121056035 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 121056038 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 121056417 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121056639 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121056665 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 121056772 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121056826 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 121057086 T C N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.307692307692308 0.615384615384615 0.0769230769230769 16 10 4 8 1 3 121057413 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 121058548 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121059296 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 121059411 T A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 121059759 C G Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 121059905 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 121059922 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 121059946 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 121060154 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 121060158 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 121060214 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121060303 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121060524 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 3 121060682 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 121060701 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121060806 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 121060859 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121060940 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 121061150 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121061272 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121061368 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 121061625 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 121061793 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121061812 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121062131 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 121062135 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 121062312 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121062428 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 121062550 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 121062774 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 121062812 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121062911 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 121063418 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 121063890 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121064197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121064208 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 121064349 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 121064361 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 121064371 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 121064421 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 121064545 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 121064566 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 121064706 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121064773 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121064790 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121065011 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121065032 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 121065198 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121065266 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 121065307 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 121065318 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 121065332 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 121065395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121065409 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121065480 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 121065665 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 121065812 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 121065965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121065987 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121066194 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 121066212 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 121066213 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 121066229 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121066235 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 121066563 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 121066565 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 121066762 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 121066777 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 121066985 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 121067015 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 121067208 A C Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 121067459 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 121068448 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 121069466 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 121070162 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 121070189 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 121070224 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 121070323 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 121070935 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 121071238 T C Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 121071280 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 121071328 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 121071358 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 121071494 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 121071584 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 121071605 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 121071648 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 121072431 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 121072434 G T Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 121072507 C A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 121072902 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 121072959 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 121073055 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 121073196 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 121073489 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 121073620 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 121073629 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 121074025 A T N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 3 121074161 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 121074646 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 121075141 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 121075229 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121075234 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121075245 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 121075252 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 121075365 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121077783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121077871 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 121077973 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 121078064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121078297 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 121078363 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 121078573 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121079181 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 121079362 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121079928 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121081643 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 121081656 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 121081869 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 121082167 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 121082257 G T Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 121082482 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 121083076 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 121083280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121083310 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 121083317 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 121083321 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 121083501 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 121083764 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 121083765 T A N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 3 121083805 A C N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 3 121084366 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121084584 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121085035 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 3 121085126 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 121086472 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 121086561 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 121086567 C G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 121086618 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 121086660 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 121086868 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 121086877 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 121087359 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 121087527 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 121087554 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 121087572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121087635 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 121087637 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 121087798 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 121088070 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121088132 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 121088341 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 121088868 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 121089049 C G N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 121089290 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 121089464 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 121091369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121091370 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 121091747 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 121091820 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 121091970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121092006 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121092019 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 121092028 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 121092133 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121092227 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 121092255 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 121092261 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 121092268 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 121092346 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 121093217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121094781 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121094994 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121095083 T G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 121095851 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 121096504 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0 0.684210526315789 0.315789473684211 13 25 0 13 6 3 121096658 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 121098501 T A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 3 121098852 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121100571 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121101158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121101741 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121103769 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 121103893 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 121103933 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 121103961 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 121104140 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 121104197 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121104548 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 121104639 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 121104685 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 121104758 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 121104804 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 121105214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121105437 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 121105777 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121106114 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121106297 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 121106399 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121106468 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 121106558 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121106669 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 121106874 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 121106903 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 121106973 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 121107016 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121107207 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 3 121107222 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121107254 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 121107270 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 121107307 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 121107672 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 3 121108575 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 121108759 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 121109286 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 121109400 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 121109714 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121109733 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 121109891 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 121109910 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 121110054 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 121110058 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121110137 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 121110235 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 121110398 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121110844 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 121110848 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 121111436 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 121111513 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 121111750 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121112181 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 121112409 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 121112471 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 121112525 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 121112526 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 121112561 T C Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 121112564 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 121112999 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 121113025 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 121113089 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 121113170 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 121113384 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 121113612 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 121113626 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 121113748 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121113918 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 121114288 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 121114453 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 121114622 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121114873 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 121114896 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 121115043 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121115060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121115083 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121115118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121115160 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121115248 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 121115255 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 121115269 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 121115303 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 121115332 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 121115449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121115486 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 121115677 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121115897 G T Y N 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 3 121115913 C T Y Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 3 121115921 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 121116091 C G N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 121116304 T A N N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 121116317 A C N N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 5 5 1 3 1 3 121116598 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 121116620 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 121116789 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 121116841 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 121116905 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121116913 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 121117068 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 121117111 A G N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 121117326 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 121118086 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 121118250 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 121118354 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 121118356 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 121118368 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 121118632 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121118645 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 121118676 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121118796 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 121119353 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121119362 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121119950 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121120333 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 121120491 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 121120529 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 121121948 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121122865 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121122899 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 3 121123266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121123741 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 121124102 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121124349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121124617 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121124667 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121124850 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 121125041 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 121125043 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 121125056 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 121125092 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 121125187 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 121125334 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 121125644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121126182 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 121126217 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 121126408 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 121126578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121126667 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 121126702 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 121126731 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 121126734 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 121126747 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121126822 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 121127067 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 121127111 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121127252 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 121127750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121128439 G C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 121128617 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121128631 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 121128709 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121128760 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121128777 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121128835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121129013 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121129546 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 121129833 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 121130058 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 3 121130486 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 121130509 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121130542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121131332 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 121132446 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121132447 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 121132609 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 121132626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121133858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121133969 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 121134023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121134132 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 121134150 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 3 121134197 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 121134198 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 121134367 T A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.4375 0.1875 0.375 17 15 7 3 6 3 121134372 C G N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.5 0.1875 0.3125 19 13 8 3 5 3 121134406 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 121134416 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 121134500 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 121134624 C G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.529411764705882 0.0588235294117647 0.411764705882353 19 15 9 1 7 3 121134627 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 3 121134694 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 121134778 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 121134809 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 121134890 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121134902 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121134963 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121135139 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 121135160 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121135166 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121135207 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 121135233 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 121135253 T C Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 121135334 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121135340 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 121135389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121135684 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 121135813 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 121135820 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 121135954 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 121136067 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 121136094 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 121136227 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 121136312 T G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 121136464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121136675 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 121136776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121136854 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121137354 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121137383 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121137989 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 121138109 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121138224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121138356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121138797 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121138893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121139099 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 121139201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121139405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121139491 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 121139492 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 121139539 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121139646 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121139660 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121139684 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121139691 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121139789 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121139814 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121140092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121142293 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 121142629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121142696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121142784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121142833 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121142947 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 121142997 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 3 121143017 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 121143018 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 121143061 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 121143182 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 121143263 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 121143282 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 121143329 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 121143341 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 121143362 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 121143456 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121143522 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 121143560 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121143719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121143827 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 121143935 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 121144661 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121144882 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 121144914 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 121145219 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121145277 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121145451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121145666 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121145964 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 121146052 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121146077 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 121146157 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 121146198 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121146249 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121146298 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 121146317 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 121146497 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 121146500 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 121146522 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 121146884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121147134 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121147457 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 121147729 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 121148539 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 121148610 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 121148826 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 121148842 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 121148915 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121149001 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 121149315 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 121149332 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 121149718 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 121149924 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 121150072 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 121150442 G T N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.0769230769230769 0.615384615384615 0.307692307692308 10 16 1 8 4 3 121150513 G A N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 121150636 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 121151420 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 121151836 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 121153626 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121153707 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121154342 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 121154754 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 121154781 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 121154967 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121155131 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 121155132 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 121155235 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 121155320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121155335 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 121155473 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121155529 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121156104 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121156107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121157684 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121158070 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 121158480 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 121158609 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.583333333333333 0.166666666666667 0.25 16 8 7 2 3 3 121158779 G T N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 4 20 2 0 10 3 121158878 C T N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 3 121158912 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 3 121159293 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 121160881 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 121163163 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121163416 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 121163825 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 121163864 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 121163960 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121164008 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 121164062 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121164172 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 121164251 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 121164295 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121164481 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 121164495 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 121164640 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 121164726 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 121164967 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 121165038 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 121165247 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 121165769 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121165831 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 121165864 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121166087 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 121166199 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121166656 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 121170223 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121171987 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 121172141 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 121172153 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 121172837 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 121172874 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121172919 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121172963 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121173060 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 121173168 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 121173169 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 121173180 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 121173196 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 121174062 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121174073 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 121174155 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 121174208 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121174285 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121174306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121174341 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121174401 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 121174700 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 121174762 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 121174865 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 121174934 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 121174937 T G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 121174954 C T Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 16 12 6 4 4 3 121175430 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121175482 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121175732 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 121175769 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 121176024 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 121176052 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 121176104 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 121177239 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121177240 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121177780 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121178262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121179507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121179884 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121179928 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 121180190 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 121181184 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121181571 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121182413 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 121182599 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 121183019 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 121183045 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 121183100 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 121183185 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121183760 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 121183772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121183778 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121184419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121184645 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121185410 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 121186282 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 121186296 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 121187581 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 121187595 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 121187648 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 121187689 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 121187692 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 121187847 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 121188343 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121189589 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 121189613 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 121189636 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 121189742 T G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 121189757 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 121189818 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 121189872 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 121189921 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 121189951 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 121189960 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 121190125 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 121190147 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 121190288 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121190300 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 121190379 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 121190397 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 121190451 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 121190550 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 121190609 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 121190617 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 121190653 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 121190654 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 121190684 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 121190779 G C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 121191167 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 121191254 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 121191321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121191370 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 121191386 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 121191390 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 121191466 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 121191576 C A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 121191757 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 121191875 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 121192033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121192116 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 121192146 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 121192216 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 121192217 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 121192300 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 121192442 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 121192922 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 121193055 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 121193060 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 121193397 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 121193518 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 121193875 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 121193902 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 121193919 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 121193959 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 121194090 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121194116 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121194134 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 121194139 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 121194251 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121194257 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 121194279 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 121194317 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 121194353 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 121194399 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 121194405 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121194417 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 121194420 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 121194506 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 121194514 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 121194587 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 121194636 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 121194659 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 121194708 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 3 121194720 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0 0.6875 0.3125 11 21 0 11 5 3 121194765 T A N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 12 16 2 8 4 3 121194791 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 121194989 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 121195159 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 121195202 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 121195628 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 121195633 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 121195645 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 121195760 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 121196182 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 121196243 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 121196255 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 121196420 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 121196430 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 121196480 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 121196514 A C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 121196569 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 121196673 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 121196972 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 121196982 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 121196999 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 121197035 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 121197061 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121197496 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 121197568 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 121197722 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121197915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121198004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121198057 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121198072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121198135 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 121198182 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 121198186 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 121198205 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 121198250 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121198287 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121198371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121198376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121198388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121199682 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 121199756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121200156 A G N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.454545454545455 0.272727272727273 0.272727272727273 13 9 5 3 3 3 121200753 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 121200780 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 121200805 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 121201014 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 121201056 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 121201666 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 121202112 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 121204067 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 121204729 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 121204786 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121205153 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 121205180 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121205196 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121205314 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121205415 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 121205417 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 121205434 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 121205442 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 121205494 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121205655 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 121206078 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 121206086 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 121206117 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 121206142 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 121206188 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121206339 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121206374 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 121206402 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 121206404 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 121206437 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 121206442 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 121206624 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121206636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121206639 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121206727 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 121206738 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 121206746 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121206815 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 121206833 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121206858 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121206864 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121206886 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121206965 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121206985 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121207128 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121207152 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121207340 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 121207537 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121207576 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 121207593 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 121207649 A C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0 0.764705882352941 0.235294117647059 13 21 0 13 4 3 121207863 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 121207881 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 121207901 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 121207902 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 3 121208025 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 121208113 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 121208121 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 121208192 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 121208231 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 121208285 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 121208393 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 121208455 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 121208488 T C N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 3 121208531 A G N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.357142857142857 0.142857142857143 0.5 12 16 5 2 7 3 121208704 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 121208942 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121208963 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 121208966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121209032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121209047 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 121209057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121209229 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121209252 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 121209707 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 121209750 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121210270 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 121211696 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121211823 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 121211851 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 121211869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121211928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121211930 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121211971 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121212013 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 121212046 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121212280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121212594 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121212596 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121212838 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 121212849 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 121212877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121212935 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 121213047 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 121213068 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121213411 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 121213445 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 121213455 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 121213503 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121213595 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121213631 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121213913 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121213981 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 121214072 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 121214093 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 121214122 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 121214232 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 121214418 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 121214614 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 121214651 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 121214723 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 121214881 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 121214975 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 121215038 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 121215104 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 121215105 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 121215182 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 121215289 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121215345 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 121215481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121215550 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121215643 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 121215719 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 121215771 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 121215829 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 121215896 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 121215922 G C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 3 121216257 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 121216366 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 121216462 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 121216588 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 121216919 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 121216925 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121216937 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 121217035 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 121217160 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 121217164 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 121217421 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 121217612 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 121217796 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 121217907 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 121217935 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 121218074 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 121218189 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 121218305 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 3 121218386 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 121218496 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 121218497 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 121218598 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 121218632 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 121218649 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 121218654 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 121218673 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 121218776 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 121219034 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 121219106 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121219109 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 121219139 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121221710 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 3 121221763 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 121221766 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 121221816 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 121221840 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 121221954 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 3 121222004 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 121222101 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 121222102 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 121222150 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 121222156 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 121222273 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 121222301 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 121222434 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 121222450 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 121222485 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 121222872 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 121222936 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 121223062 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121223205 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121223525 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 121223548 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 121223969 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 121224124 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 121224462 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 121224602 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 121225005 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 121225089 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 121225345 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 121227434 A C N N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 9 9 2 5 2 3 121227982 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 121229009 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 121230262 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121231143 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121232395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121232469 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121233554 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121234064 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121234278 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121234789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121234981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121235059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121235064 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 121235073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121235112 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 121235117 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121235153 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 121235352 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 121236916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121237004 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121238757 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121238877 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121239209 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 121239212 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 121239847 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 121239898 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 121239964 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 121240074 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 121240084 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 121240227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121240234 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121240308 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 121240363 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 121241268 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121241522 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 121241551 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 121241605 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 121241786 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 121241787 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121241967 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121242075 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121242148 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 121242179 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 121242203 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 121242337 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121242677 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 121242830 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 121242831 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 121243023 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 3 121243109 A T N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 3 121243389 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 121244538 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 121245113 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 121245143 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 121245220 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 121245223 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 121245770 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 121245943 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 121245997 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 121246012 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 121246031 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 121246090 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 121246168 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 121246340 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121246536 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121246583 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121246658 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 121246674 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 121246730 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 121246754 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 121246790 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 121246823 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 121246952 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 121246996 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121247032 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 121247077 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 121247087 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 121247376 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 121247434 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121247506 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121247553 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 3 121247621 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 121247676 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 121247705 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 121247730 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121247785 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 121247930 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 121248194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121248269 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 121248353 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 121248385 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 121248703 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 121248731 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 121248874 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 121249159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121249223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121249286 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 121249305 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 121249451 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 121249641 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 121249774 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 121249859 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.1 0.7 0.2 18 22 2 14 4 3 121249919 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 121249997 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 121250269 G A N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 13 7 6 1 3 3 121250319 T G N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.25 0.166666666666667 0.583333333333333 8 16 3 2 7 3 121250395 C T N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.75 0 0.25 18 6 9 0 3 3 121250396 A G N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.25 0 0.75 6 18 3 0 9 3 121250423 A G N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.181818181818182 0 0.818181818181818 4 18 2 0 9 3 121250438 G A N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.2 0 0.8 4 16 2 0 8 3 121250779 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121251703 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 121251725 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 121251947 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 121252253 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 121252379 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 121252726 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 121253048 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121253052 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 121253120 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 121253143 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 121253333 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 121253339 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 121253358 C G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 121253472 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 3 121253518 T G N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 3 121253533 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 3 121253762 T C N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 121253845 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 121253951 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 121254120 T C N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 121254173 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 121254595 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 121255155 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 121255168 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 121255170 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121257148 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 121257158 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121257191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121257257 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 121257466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121257520 T G N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 121257573 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121257680 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121257696 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121257713 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121257775 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121257826 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 121257899 G A N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 3 121258261 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 121258286 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 121258438 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 121258459 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 121258484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121258687 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121258784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121258789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121258831 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 121258883 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121258897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121258908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121258923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121260034 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 121261454 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 121261776 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121262096 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 121262102 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 121262107 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 121262116 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 121262180 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 121262370 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 121262396 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 121262409 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 121262413 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 121262523 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 121262856 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 121262903 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 121262916 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 121263007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121263211 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 121263229 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 121263272 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 121263339 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 121263492 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 121263575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121263595 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 121263637 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 121263716 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 121263717 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 121264436 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 121264580 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121264604 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 121265101 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 121265102 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 121265112 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 121265129 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 121265131 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 121265140 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 121265408 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 121265451 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 121265484 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 121265500 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121266403 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 121266623 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121267116 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121267618 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 121267736 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 121267804 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 121267860 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 121267872 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 121268026 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 121268052 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 121268068 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 121268186 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 121268209 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121268214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121268492 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 121268558 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121268594 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 121268604 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 121269138 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 121269260 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 121269307 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 121269334 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 121269422 C A N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 3 121269607 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 121269897 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 121269899 C T N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.0666666666666667 0.733333333333333 0.2 13 17 1 11 3 3 121269945 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.0625 0.6875 0.25 13 19 1 11 4 3 121269971 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 121269992 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 121270005 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 121270421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121270426 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 121270441 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121270462 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121270497 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.05 0.7 0.25 16 24 1 14 5 3 121270498 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 121270707 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 121270743 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 121270878 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 121270903 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 121271058 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 121271075 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 3 121271077 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 3 121271225 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 121271241 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 121271254 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 121271294 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 121271470 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 121271572 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 121271585 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 121271609 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 121271745 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 8 10 1 6 2 3 121271802 A G Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 121271892 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 121272062 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121272084 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121272193 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121272405 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 121273371 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 121273990 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 121273992 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 121274059 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 121274195 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 121274269 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 121274273 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 121274435 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 121274451 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 121274463 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 121274469 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 121274524 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 121274566 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 3 121274597 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 121274601 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 121274632 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 121274748 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 121274794 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121274951 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 121275176 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 121275178 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 121275374 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 121275397 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 121275423 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 3 121275436 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 121275471 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 121275524 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 121275541 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 121275599 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 121275607 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121275676 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 121275694 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 121275728 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 121275854 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 121275856 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 121275867 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 121275891 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 121275911 C G N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 121275921 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 121276053 T G N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 121276161 T C N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 3 121276163 T C N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 9 15 3 3 6 3 121276172 A G N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 3 121276210 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 121276232 C A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 121276335 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 121276532 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 121277011 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 121277057 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121277118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121277152 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 121277227 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 121277241 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121277387 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 121277411 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 121277540 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 121277633 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121277712 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 121278023 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 121278303 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 121278554 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121279481 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121279562 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 121279701 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 121280077 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 121280143 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 121280745 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 121280777 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 121281072 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 121281126 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121281182 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121281758 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 121283480 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 121283519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121283619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121283904 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 121284042 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 121284059 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 121284081 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 121284233 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121284975 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 121285436 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121285727 G T N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 121287263 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121287381 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 121288597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121288737 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121289577 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121290696 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 121290940 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 121291029 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121291047 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 121291084 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 121291891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121293700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121295274 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 121295510 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121297441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121301404 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 121302786 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121302866 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 121302976 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121303186 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 121306298 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 121307336 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 121307511 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 121307682 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 121308137 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 121308540 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121308761 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 121308927 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 121310169 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121310344 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 121310412 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 121310419 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 121310854 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121311258 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 121311270 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121311332 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 121311514 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 121311668 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 121311714 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121311764 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 121311856 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 121311883 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 121312305 C A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 121314044 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 121314808 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 121314816 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121317020 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 121317314 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 121317316 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 121317467 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 121317704 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121317720 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121318157 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121318222 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121318354 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 121318721 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121318737 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121318871 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121318885 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121318975 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121319081 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121319090 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121319153 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 121319168 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121319202 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121320031 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 121320532 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121320664 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121320778 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 121320808 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 121320975 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 121321390 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 121321391 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 121321574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121322045 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 121322216 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 121322259 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 121322352 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 121322505 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121322506 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 121322634 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121322672 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 121323004 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121323090 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 121323133 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 121323267 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 121323286 C T Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 121323290 A G Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 121323467 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 121323502 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 121323510 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 121323541 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121323606 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 121323852 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 121323865 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 121323874 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121323968 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121324089 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 121324101 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 121324113 A T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 121324135 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 121324337 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 121324634 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121324737 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 121324837 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121324842 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121324853 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121324994 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 121325096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121325135 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 121325162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121325182 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 121325201 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 121325227 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 121325234 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 121325278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121325298 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 121325316 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121325342 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 121325408 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 121325485 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121325557 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 121325663 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 121325676 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 121325735 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 121325846 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 19 17 1 17 0 3 121326095 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 121326114 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 121326127 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 121326223 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 121326402 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 121326433 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121326471 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121326575 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 121326581 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 121326589 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 121326660 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121326793 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 121327483 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121327692 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121327771 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121327872 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 121327991 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 121328035 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121328247 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 121328586 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 121328614 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 121328738 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 121328814 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 121328854 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 121329426 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 121329476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121329702 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121329875 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 121330246 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 121330325 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 121330366 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 121330404 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 121330505 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 121330507 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121330690 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121331064 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 121331456 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 121331957 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 121332056 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 121332081 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 121332111 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 121332270 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121332348 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 121332380 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 121333020 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121333054 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 121333055 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 121333072 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 121333106 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 121333197 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 121333278 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 121333288 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121333430 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 121333601 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 121333917 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 121333941 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 121334004 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 121334072 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 121334087 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 121334363 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 121334381 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 121334479 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 3 121334559 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 121334568 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 121334667 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 121334907 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 121335079 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 121335171 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 121335219 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 121335230 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121335239 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121335260 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 121335299 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 121335458 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121335613 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 121335761 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 121336751 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 121337978 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121338433 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121338993 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 121339020 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 121339071 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 121339086 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 121339087 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 121342124 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 121342509 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 121343252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121344335 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121345028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121345246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121346042 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121346052 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 121348084 T G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 121348596 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 121348648 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 121348679 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 121349405 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121350244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121350316 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121350497 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 121350512 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 121350545 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 121353883 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121355766 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121356539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121357397 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 121358922 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 121359061 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 121359117 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 121360619 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121360868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121361197 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121361895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121362150 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 121362657 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 121364365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121365140 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 121365142 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 121365230 C G Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 121365397 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121365447 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 121365460 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 121365480 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 121365763 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 121365793 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 121365934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121366013 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121366282 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 121366714 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 121367444 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121368525 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121370134 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121370871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121371014 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 121372068 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121372272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121372311 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121372374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121372517 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121372608 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121373173 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 121373535 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 121373684 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121374368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121374369 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121374679 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121374764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121374867 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 121374903 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 121375237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121375320 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 121375603 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 121375791 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121375838 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 121375932 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 121375952 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 121376277 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 121376720 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 121376966 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 121377531 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121377536 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 121377603 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 121377685 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 121377803 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121377892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121377924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121377934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121378102 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 121378382 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121378627 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 121378822 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 121378848 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 121378958 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 121379005 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 121379112 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 121379152 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 121379274 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 121379398 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 121379494 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121379504 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 121379557 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 121379614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121379718 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 121379778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121379794 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 121379797 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 121379869 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 121379892 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 121379944 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 121380098 A T N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 3 121380152 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 3 121380192 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 121380328 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 121380416 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 121380678 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 121380742 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 121381471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121381946 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121382068 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121382542 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121383073 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121383097 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 121383600 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 121383615 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 121383683 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 121383722 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 121384323 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 121384338 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 121384505 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 121384974 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 121385028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121385287 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121385425 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0 0.789473684210526 0.210526315789474 15 23 0 15 4 3 121385498 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 121385548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121385734 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 121385862 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 121386073 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121386171 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 121386351 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 121386719 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 121386742 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121386797 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121386900 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 121387198 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 121387221 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121387265 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 121388695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121388784 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121389634 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 121389678 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 121390228 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 121390453 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 121390537 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 121390544 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121390567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121390702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121390709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121391263 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 121391336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121391382 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121391657 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121391688 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121391762 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121391816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121391889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121391915 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121392036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121392257 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 121392439 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 121392442 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 121392489 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 121392628 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 121392645 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 121392886 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121392972 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121393010 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121393148 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 121393157 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 121393173 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 121393218 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121393267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121393500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121393734 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 121393735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121393773 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 121393971 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 121393982 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121394024 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121394180 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121394226 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121394363 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 121394385 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 121394422 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 121394482 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 121394510 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121394586 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 121394637 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121394654 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121394917 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 121394962 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 121395025 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 121395170 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121395252 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 121395355 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121395377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121395420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121395469 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121395473 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121395527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121395544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121395711 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121396571 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 121396711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121396925 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 121396941 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 121396943 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121397104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121399129 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121399137 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121399389 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 121399424 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 121399604 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 121399709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121399774 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 121399782 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 121399799 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121399844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121399874 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 121399897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121399990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121400025 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121400059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121400159 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 121400189 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 121400195 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 121400333 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 121400544 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121400640 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 121400641 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 121400818 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121400891 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 121401105 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 121401121 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 121401206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121401316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121401367 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 121401803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121401915 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 121402012 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 121402034 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 121402091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121402318 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 121402327 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 121402343 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 121402454 C G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 3 121402843 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 121402889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121402912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121403778 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121403887 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 121403944 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121404395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121404531 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 121404537 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 121404947 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 121405336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121405713 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 121405799 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121406075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121406120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121406290 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121406882 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 121406886 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 121406956 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 121406968 T G Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 121407190 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121407205 T C Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 121407804 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121408802 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121410513 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 121412329 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 121412574 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 121413698 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121415969 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121417533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121417686 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 121418059 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121418098 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121418491 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121418572 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 121418651 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 121418700 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121418727 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121418741 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 121418808 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 121418818 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121418834 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121418917 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121419339 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121419384 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121419479 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 121419491 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121419540 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 121419627 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 121419792 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121420706 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121420797 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121420799 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121420964 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121420973 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121421193 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121421247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121421265 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121421276 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121421339 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121421673 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121421748 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121421980 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121422336 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121422379 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121422380 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121422530 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121423824 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 121424246 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 121424358 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121424384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121424467 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121424531 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 121424552 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121424607 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121424710 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121424888 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121424890 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121425432 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 121425604 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121425885 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121426172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121426298 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121426355 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121426768 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 121427048 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121427277 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 121427296 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 121427474 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 121427547 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 121427563 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 121427608 G A N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 3 121427783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121427785 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121427992 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 121428016 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 121428057 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121428084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121428226 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121428278 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 121428297 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 121428306 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 121428489 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121428556 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121428628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121428739 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121428860 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121428890 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 121429108 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121429154 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121429533 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 121429590 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 121429931 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 121429955 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 121430031 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121430069 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121430073 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121430087 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121430111 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 121430127 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 121430245 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121430340 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 121430548 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 121430604 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 121430609 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 121430707 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 121431149 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121431226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121431270 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121431378 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121431941 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121432255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121432665 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121432744 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 121432783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121432819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121432872 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 121432882 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 121432908 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 121433164 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 121433253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121433321 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 121433332 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 121433336 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 121433362 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 121433819 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 121433858 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 121433878 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121434166 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 121434259 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121434349 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121434449 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 121434480 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 121434515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121434871 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 121435196 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 121435245 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 121435513 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 121435542 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 121435568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121435569 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 121435600 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 121435700 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121435765 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 121435771 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121435994 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121436067 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 121436134 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121436243 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121436317 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 121436327 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 121436386 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121436546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121436770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121437343 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 121437985 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 121437998 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 121438012 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121438024 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121438081 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 121438086 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121438262 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121438299 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121438402 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121438435 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121438487 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121438537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121438576 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121438848 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 121439421 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121439428 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 121439453 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 121439529 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121439690 C A N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 121439951 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 121440305 T G N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 3 121440597 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 121440848 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 121440881 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121440899 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 121441075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121441092 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121441137 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 121441347 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 121441552 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 121442765 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 121442869 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 121442898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121443065 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 121443247 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 121443317 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.466666666666667 0.2 0.333333333333333 17 13 7 3 5 3 121443896 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121444878 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 121444880 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 121446721 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 121447855 C T Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 121447887 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 121450350 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 121450506 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121450589 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121450722 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121451140 A G Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 121454580 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 121454943 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 121455947 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121456572 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121457032 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 121458839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121459697 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 121461314 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 121461811 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121463341 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 121465222 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 121466574 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121466600 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 121466922 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121467286 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121467290 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121467889 T C Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 121468498 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 121469762 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 121470175 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121470485 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 121470533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121470797 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 121470831 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 121470832 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 121470843 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 121471286 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 121471341 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 121471681 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 121471707 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 121471951 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 121471972 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 121471996 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 121472004 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 121472048 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 121472059 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 121472339 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 121472418 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 121472716 G T N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 121472942 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 121473058 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 121473222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121473388 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 121473429 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 121473479 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 121473955 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 121473994 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 121474029 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 121474033 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 121474056 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 121474125 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121474223 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 121474238 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 121474268 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 121474513 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 121474639 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 121474670 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 121474676 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 121474684 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 121475583 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 121475605 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 121475662 T C N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 121475764 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 3 121475906 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 121476580 A C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 121476593 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121476774 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 121476864 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 121476866 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 121476886 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 121476978 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 121477039 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 121477165 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 121477220 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 121477227 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 121477313 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 121477328 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 121477497 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 121477549 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 121477555 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 121477622 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 121477681 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 3 121477730 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 121477800 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 121477839 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 121477897 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 121477912 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 121477914 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 121477957 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 121477972 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 121477977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121477990 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 121477998 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 121478211 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 121478279 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 121478305 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 121478420 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 121478635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121478684 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 3 121479850 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 121479864 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 121480339 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 121480345 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 121480353 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 121480615 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 121480659 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 121480695 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 121480911 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 121481691 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121481826 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121481960 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 121482020 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 121482835 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121482861 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 121482886 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 121483006 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 121485642 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121485855 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 121486116 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 121486601 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 121486647 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121487076 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 121487177 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121489945 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 121490890 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 121491088 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 121491415 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 121491606 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 121491716 C T N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 121492055 T C N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 3 121492662 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 3 121492708 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 121492736 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 121492853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121493081 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 121493197 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 121493207 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 121493210 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 121493379 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 121493494 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 121493621 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 121493628 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 121493716 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 121493789 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 121494396 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 121494559 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 121495542 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 121495889 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 3 121496278 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 121496655 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 121497092 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 121497128 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 121497141 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 121497222 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121497263 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 121497295 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 121497412 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 121497515 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 121497651 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 121497850 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 121497909 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 121497953 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 121498077 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 121498222 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 121498277 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 121498317 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 121498360 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 121498495 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 121498570 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121498791 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 121498833 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 121498849 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 121498969 T A N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 3 121498981 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 121498989 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 121499453 T A N N 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.181818181818182 0.454545454545455 0.363636363636364 9 13 2 5 4 3 121499689 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 121499897 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 121500190 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 121500203 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 121500312 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 121500429 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 121500436 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 121501922 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 3 121502052 G T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 121502286 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 121502374 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 121502394 C T N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 121502497 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 121502532 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 121502663 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 121502689 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 121502785 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 121502938 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 121502939 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 121503088 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 121503118 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 121503164 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 121503329 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 121503339 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 121503374 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 121503391 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 121503448 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 121503542 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 121503830 C A N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 121503844 C G N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.142857142857143 0.714285714285714 0.142857142857143 14 14 2 10 2 3 121503885 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 121503961 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 121504113 G C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 121504132 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 121504146 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 121504154 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 121504329 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 121504469 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 121504497 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 121504633 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 121504991 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 121505023 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 121505045 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 121505256 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 121505257 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 121505269 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 121505280 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 121505364 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 121505372 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 121505428 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 121505435 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 121506706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121507019 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 121507918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121508223 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 121508300 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 121509882 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121510076 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 121511423 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121511775 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 121512092 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 121512182 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 121512288 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 121512505 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121512573 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 121512595 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121512659 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121512707 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 121512732 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 121512760 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121512791 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121513270 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 121513486 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 121513809 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121514244 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 121514370 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 121514478 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121514547 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 121514609 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 121514777 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121514837 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 121514964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121515329 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 121515550 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 121515610 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 121515695 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 121515874 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 121516102 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 121516154 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121516195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121516428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121516837 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 121517026 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 121517297 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 121517757 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 121518263 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 121518265 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 121518688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121518834 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121519084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121519456 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121519497 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 121520378 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 121524617 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121525209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121525210 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121525307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121525332 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121525411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121525826 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121525905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121526214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121526330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121526336 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121526376 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121527521 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121529301 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121529419 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 121531310 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121531929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121533938 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121533954 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121535787 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121536013 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 121536035 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 121536047 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121536116 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 121537199 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121537285 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121537630 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 121537670 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 121538065 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 121538073 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 121538222 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 121538360 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121538407 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 121538578 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 121538767 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 121538946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121539641 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 121539733 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121539752 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 121540458 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 121540495 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121540510 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 121540529 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 121540622 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 121540689 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 121540978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121541061 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 121541077 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121541090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121541097 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 121541118 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 121541151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121541269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121541284 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 121541305 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 121541343 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 121541368 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 121541598 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 121541712 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 121541715 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 121541727 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121541734 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121541809 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121541857 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121542043 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121542317 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121542467 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 121542616 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 121542640 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 121542727 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 121542751 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 121543026 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 121543399 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 121543451 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121543598 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 121543720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121543844 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 121545420 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 121545828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121545933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121547380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121547643 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121549258 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 121549321 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 121549681 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 121549758 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 121550306 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121550641 G A Y Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.363636363636364 0.636363636363636 0 15 7 4 7 0 3 121550946 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 121551199 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 121551260 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121551312 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 121551433 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121551442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121551528 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 121551557 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 121551579 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 121551653 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 121551680 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 121551787 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 121552027 T C N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.166666666666667 0.0833333333333333 0.75 5 19 2 1 9 3 121552101 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 121552362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121552379 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 121552439 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 121552526 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 121552554 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 121552579 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 121552668 C A Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 3 121552692 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 121552717 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 121552786 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 121553032 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 121553068 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 121553125 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 121553157 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 121553177 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 121553340 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 121553385 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 121553407 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 121553416 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 121553669 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121553901 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 121553965 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121553981 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 121554421 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 121554425 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121554471 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121554512 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121554598 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 3 121554971 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 121555061 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 121555149 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121555153 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 121555214 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 121555215 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 121555476 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 121555513 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121555540 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 121555558 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 121555623 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121555635 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 121555669 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 121555685 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 121555708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121555731 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 121555742 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 121555765 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 121555997 T G Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 121556031 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 121556115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121556157 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 121556296 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 121556511 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 121556639 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 121556657 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 121556743 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 121556835 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 121557083 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 121557643 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121557844 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 121557903 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 121557912 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 121558168 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 121558185 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 121558254 A T N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 3 121558297 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 121558508 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 121558692 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 121558913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121559083 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 121559087 G C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 121559506 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 121559542 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 121559571 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 121559725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121559747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121559768 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121559817 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121559886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121559917 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 121560590 A G N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.461538461538462 0.230769230769231 0.307692307692308 15 11 6 3 4 3 121560617 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121560848 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 121561042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121561110 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 121561199 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 121561309 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 121561313 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 121561795 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 121561803 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121561951 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 121562015 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 121562032 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 121562114 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 121562147 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121562172 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 121562370 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 121562512 T C N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0 0.8 0.2 12 18 0 12 3 3 121562581 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0 0.777777777777778 0.222222222222222 7 11 0 7 2 3 121562582 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0 0.777777777777778 0.222222222222222 7 11 0 7 2 3 121562611 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0 0.777777777777778 0.222222222222222 7 11 0 7 2 3 121562619 G A N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 3 121562900 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 121562979 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 121563092 G C Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 121563261 T A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 121563359 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 121563633 A G N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.166666666666667 0.583333333333333 0.25 11 13 2 7 3 3 121563635 A G N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.166666666666667 0.583333333333333 0.25 11 13 2 7 3 3 121563826 A G N Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 3 121563966 A G N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.230769230769231 0.692307692307692 0.0769230769230769 15 11 3 9 1 3 121564263 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 3 121564267 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 3 121564283 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 3 121564286 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121564414 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 121564453 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 3 121564709 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 121565090 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121565310 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 121568273 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121568703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121568844 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121568870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121568874 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121568940 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121569129 T C Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.0625 0.9375 0 17 15 1 15 0 3 121569147 C T Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 3 121569281 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 3 121569341 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 121569361 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 121569484 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 121569877 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 121569878 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 121570121 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 121570166 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 121570372 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 121570559 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121570617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121570786 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 121571293 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 121574108 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 3 121574129 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 121576801 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121577777 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121580245 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 121580255 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 121581069 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121581654 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121581864 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121581941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121582910 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 121582911 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 121582922 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 121584473 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.15 0.75 0.1 21 19 3 15 2 3 121584496 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.15 0.75 0.1 21 19 3 15 2 3 121586522 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 121586523 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121586544 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 121586985 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 121586989 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 121587043 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 121587089 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 121587192 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 121587298 G A Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 121587327 T C N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.363636363636364 0.454545454545455 0.181818181818182 13 9 4 5 2 3 121587346 A G N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 121587448 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121587536 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 121587560 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 121587687 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 121587753 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 121587801 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 121587915 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 121588134 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121588168 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 121588273 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 121588322 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 121588331 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121588352 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121588683 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 121588783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121588814 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121590404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121590648 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 121590899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121591569 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121591776 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 121592145 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 121592149 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 121592285 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 121593015 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 3 121593369 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 121593686 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 121594734 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 121594755 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 121594917 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 121595048 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 3 121595105 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 121595113 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 12 24 0 12 6 3 121595179 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121595187 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 3 121595235 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 121595529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121595593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121595596 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121595648 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 121595650 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 121595686 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121595688 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 121595940 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121596224 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 121596233 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 121596412 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121596536 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121596575 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121596829 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121597159 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 121597263 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 121597390 T G N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 121597442 G T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 121598506 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121598576 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 121598620 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 121598718 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 121598751 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 121598764 A T N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 15 15 6 3 6 3 121599154 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 121599161 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 121599224 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 121599250 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121599258 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 121599883 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121601015 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 121601018 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 121601661 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 121605073 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121605910 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 121606011 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121606091 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121606232 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121606300 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 121606387 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 121606640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121606874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121607153 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 121607196 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 121607310 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 121607653 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 121607699 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 121607990 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 121608089 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121608772 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 121608814 A G N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 121608822 C T N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 121608952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121609060 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121609274 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 121609284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121609346 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121609348 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.2 0.8 0 24 16 4 16 0 3 121609433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121609798 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 121609837 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 121609933 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 121610051 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 121610111 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121610239 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 121610335 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121610383 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 121610771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121610824 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121610910 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121611234 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121611744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121612114 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121612174 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 121612220 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121612536 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 121612621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121612816 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 121612945 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121613134 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 121613165 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 121613333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121613524 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121613701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121613730 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121613849 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121613954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121614111 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121614117 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121614257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121614429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121614438 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121614444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121614562 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121614565 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121614606 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 121614620 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121614653 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 121614818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121614893 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121615196 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121615213 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121615261 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121615279 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121615826 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121615924 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121616113 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 121616177 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121616212 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121616521 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 121616728 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 121616758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121616759 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121616841 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121617034 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121617115 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121617156 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 121617235 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 121617270 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 121617404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121617470 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121617507 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 121617702 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 121617725 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 121617770 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 121617802 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 121617829 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 121617858 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 121618420 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121618788 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 121618894 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 121618922 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 121619027 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 121619047 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121619133 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121619154 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121619182 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 121619202 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 121619208 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 121619324 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121619325 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121619492 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121619524 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121619531 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121619747 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121619806 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121620430 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121620508 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121620528 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121620819 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121620845 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121620937 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121620950 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121620962 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121621248 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121621284 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121621290 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121622495 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121622590 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 121622897 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121624586 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 121625749 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 121626272 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 121626374 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121626579 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121626963 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121627076 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 121627105 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 3 121627109 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 3 121627401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121627432 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121627439 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121627453 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121627487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121627902 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121628086 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121628199 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 121628274 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 121628276 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 121628423 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 121628445 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 121628537 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121628694 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 121628899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121629345 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121629493 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121629584 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 121630007 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121631009 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121631377 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121631871 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121632184 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121633069 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121633884 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121634093 C G Y N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 3 121634666 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121634725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121635053 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 121635115 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 121635128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121635252 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 121635334 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 121635423 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 121635917 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121636704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121636742 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 121636769 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 121636799 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 121636860 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 121636864 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 121636982 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 121637027 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 121637251 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 121637388 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 121637418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121637432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121637948 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 121637979 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121637985 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 121638011 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 121638051 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 121638174 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 121638388 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 121638402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121638964 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 121642771 T A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 3 121642993 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 121642994 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 121643180 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121643523 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121643804 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 121643859 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 121643991 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 121644036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121644686 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 121644872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121644914 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 121645138 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 121645301 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 121645451 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 121645497 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 121645736 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 121645791 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 121645837 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 121646077 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 121646356 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 121646358 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 121646391 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 121646455 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 121646595 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 121646617 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 121646625 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 121646954 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 121647012 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 121647117 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 121647370 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 121647504 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 121647625 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121647640 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 121647677 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 121648818 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 121650127 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 121652268 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 121652481 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 121652522 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 121652557 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 121652634 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 121652794 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 121652823 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 121652837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121652932 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 121653455 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 121653461 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 121653532 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 121653571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121653628 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 121653656 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 121653679 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 121653688 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 121653696 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 121653716 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 121653871 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 121653984 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 121653989 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 121654151 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121654182 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 121654286 C G Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 121654380 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 121654526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121654601 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 121654751 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121654925 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 121655019 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 121655142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121655798 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 121655869 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 121656685 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121658684 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121658685 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121658948 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121659493 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121662219 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121662261 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 121662446 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 121666575 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 121666808 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121666891 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121671924 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121677811 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 121682209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121682210 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121682708 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 121684086 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121685391 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121686055 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 121686165 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121686318 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121688192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121691022 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121694074 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121694256 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 121696250 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 121696878 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 121699491 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121699500 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 121701028 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 121703959 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121704044 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121704765 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121704965 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 121704992 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 121705006 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 121705007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121706290 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121707578 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121709126 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 121710146 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121712606 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121719216 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121719440 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 121720109 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121721730 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121722074 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 121722757 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 121723438 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121723661 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 121724033 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 121725274 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 121725634 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 121726587 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 121726681 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 121726749 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121726931 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 121726947 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121726961 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 121727293 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121727296 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121727392 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 121727431 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121727468 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121727498 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121727530 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121727662 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 121727820 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 121728085 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 121728088 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 121728171 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121729364 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 121730307 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 121730438 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 121730519 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 121730799 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121731561 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121739449 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 121741738 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121742616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121743986 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 121744074 A C N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 3 121745425 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121746580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121747392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121747587 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 121747588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121748365 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121748434 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121750797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121751520 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121753084 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121753517 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 121753529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121753690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121753971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121755645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121757341 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 121758233 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 121758289 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 121759020 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 121759587 G A N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 121759682 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 121759924 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 121760156 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 121760213 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 121760308 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 121760327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121760731 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 121760882 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121760974 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121761042 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 121761273 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121761370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121761421 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 121761534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121761764 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121761863 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121762251 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121762380 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 121762661 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 121763137 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 121763161 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 121763248 G T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 121763495 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 121763628 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121763952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121764120 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 121764147 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 121764148 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 121764454 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 121764641 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 121764659 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 121764776 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 121764806 G T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 121765058 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 121765076 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 121765210 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 121765225 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 121765248 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 121765306 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 121765621 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 121765624 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 121765804 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 121766386 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121766774 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 121766968 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 121767065 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121767078 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121767174 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121767249 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121767321 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 121767798 T A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 121768121 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 121768147 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121768397 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 121768453 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 121768632 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 121768635 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 121768778 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 121768989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121769232 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 121769261 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121770057 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 121770151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121770195 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 121770362 A T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 121770395 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121770520 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121770535 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 121770583 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 121770723 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 121770736 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 121770738 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 121770828 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 121770892 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 121770966 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 121771265 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121771307 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 121772418 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 121772631 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 121772635 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 121772751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121772757 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 121772913 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 121772959 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 121772988 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 121773065 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 121773171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121773474 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121773605 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 121773674 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 121773777 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121773873 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121773943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121774256 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 121774274 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121774297 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 121774405 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 121774928 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 121774937 A C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 121775003 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 121775032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121775215 A G Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 121775385 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 121775471 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 121775502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121775514 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121775585 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 121775603 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 121775612 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 121775655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121775694 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 121775777 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121776363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121776840 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 121776931 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121777268 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 121778564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121778687 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121778741 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121780772 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121781433 G C Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 121781491 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 121781545 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 121782352 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121782734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121786323 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 121786571 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121787179 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 121787315 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 121788178 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 121788609 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 121789058 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 121789204 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 121789670 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121789858 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 121790110 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 121790757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121790772 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 121791000 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 121791023 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121791046 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 121791047 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 121791791 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 121791859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121792034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121792420 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121792503 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 121792569 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121792751 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 121792818 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 121792878 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 121792927 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121793090 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 121793141 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 121793203 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 121793220 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 121793408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121793429 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121793591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121793659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121793749 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 121793935 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121794029 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121794157 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121794675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121794694 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121796308 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 121796367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121796577 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 121796642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121796703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121797181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121797241 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 121797405 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 121797459 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 121797485 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 121797488 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121797596 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 121797766 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 121797860 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121798183 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121798235 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 121798272 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 121798913 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121800127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121800163 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 121800182 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121800204 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 121800268 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 121800394 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 121800636 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121800733 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 121800750 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 121800918 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121800986 T A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 121801111 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 121801202 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121801288 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 121801320 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 121801429 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 121801619 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 121802000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121802278 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 121802307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121802362 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 121802398 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 121802405 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 121802829 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121803158 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121803268 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121809024 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121809477 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 121809983 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121810467 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 121810501 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 121810786 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 121811484 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 121811492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121811793 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 121811794 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 121811812 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 121812033 G T Y N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.5 0.125 0.375 18 14 8 2 6 3 121812036 G A Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.533333333333333 0.133333333333333 0.333333333333333 18 12 8 2 5 3 121812089 A G N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.285714285714286 19 9 9 1 4 3 121812105 G A Y Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.545454545454545 0.0909090909090909 0.363636363636364 13 9 6 1 4 3 121812326 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 121812450 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 121812505 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121812912 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121814100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121814485 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121814994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121815833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121816434 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 121816699 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 121816723 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 121816829 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121816938 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 121817859 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121817928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121817991 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 121818030 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121818058 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 121818097 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 121818110 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121818114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121818154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121818172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121818175 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121818270 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 121818597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121818927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121818952 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 121818969 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121819148 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 121819204 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 121819610 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 121819716 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 121819891 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121819912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121819983 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121820011 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 121820070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121820291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121820598 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 121820741 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121820824 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 121820974 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 121821066 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 121821101 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 3 121821102 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 3 121821112 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 121821123 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 121821214 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5625 0.125 0.3125 20 12 9 2 5 3 121821249 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 121821264 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 121821361 G T Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 121821482 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121821525 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121821669 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 121821890 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 121822441 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121822886 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 121822896 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 121823161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121823182 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 121823462 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 121823583 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 121823704 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 121823959 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 121824406 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121824423 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 121824503 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 121824739 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 121824992 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 121825208 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121825249 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121825568 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 121825772 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121826197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121826369 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 121826395 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 121826406 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 121826678 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 121826746 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 121826830 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 121826991 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 121827013 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 121827014 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 121827766 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 121828483 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 121828695 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 121828964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121829274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121829324 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121829983 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121830510 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 121831279 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 121831450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121832535 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121832748 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 121832939 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 121833239 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 121833243 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 121833423 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 121833576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121833703 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121833737 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 121833753 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121833979 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 121834096 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 121834124 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 121834236 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 121834259 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 121834265 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 121835404 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 121835436 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 121835779 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 121835810 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 121835816 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 121835826 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 121835887 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 121836002 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 121836177 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 121836404 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 121836972 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 121837443 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121837588 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 121838750 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121839842 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121839982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121840269 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 121840628 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121841005 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 121841012 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 121841049 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121841153 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121841161 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121841165 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121841212 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 121841477 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 121841484 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 121841498 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 121841603 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 121841750 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121841813 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 121841874 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 121841875 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 121841951 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121841988 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 121842325 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 121842440 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 121842673 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 121842692 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 121842927 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 121843333 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 121843422 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 121843506 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 121843523 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 121843647 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 121843772 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 121843913 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 121843925 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 121843932 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 121843980 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 121844108 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 121844232 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 121844282 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 121844297 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 121844346 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 121844502 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 121844525 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 121844746 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 121844828 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121844836 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 121844845 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 121844870 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 121844888 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 121844898 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 121845001 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121845052 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 121845073 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 121845123 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 121845140 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 121845326 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 121845376 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 121845415 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 121845578 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121845699 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121845737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121845768 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121845772 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121845834 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121845846 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121845848 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121845992 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 121846178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121846253 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 121846263 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 121846272 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 121846286 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 121846490 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 121846540 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 121846541 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 121846571 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 121846651 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 121846740 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 121846852 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 121847019 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 121847117 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121847151 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121847170 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121847208 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 121847249 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 121847331 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 121847337 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 121847394 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121847465 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 121847850 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121847897 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 121847930 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 121848026 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121848140 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 121848235 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 121848257 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 121848264 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121848303 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 121848328 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 121848368 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 121848384 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 121848424 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 121848557 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121848630 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 121848651 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 121848675 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121848686 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 121848755 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 121848778 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 121848804 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121848854 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 121848882 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121848883 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 121849032 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121849035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121849055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121849112 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 121849114 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121849128 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 121849160 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 121849170 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 121849227 G C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 121849230 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 121849490 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 121849720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121849762 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 121849777 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121849797 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121850017 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121850074 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 121850102 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 121850150 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 121850193 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 121850278 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 121850329 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 121850474 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 121850497 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121850551 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 121850578 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 121850925 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121851127 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 121851136 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 121851145 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 121851278 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 121851329 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 121851514 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121851994 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121852010 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 121852199 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 121852204 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 121852259 G A N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 3 121852283 T A N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 121852315 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 121852338 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 121852351 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 121852457 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 121852669 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 121852735 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 121852777 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121852781 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 121852807 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 121852853 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 121852889 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 121853508 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121853617 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121853742 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121853755 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 121853809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121853849 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121853871 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121853953 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 121854031 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 121854040 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 121854089 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121854164 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 121854640 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 121855138 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 121855233 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 121856278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121856622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121856708 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 121856950 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121857334 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121857378 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 121857399 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121857537 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 121857562 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121857751 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 121858041 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121858615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121858656 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 121858807 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 121858843 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 121858991 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 121859034 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 121859283 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 121859406 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121859545 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 121859559 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 121859587 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 121859614 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 121859722 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 121859811 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 121859989 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 121860075 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 121860141 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 121860288 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121861087 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 121861202 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 121861417 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121861885 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 121861944 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 121861949 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 121861999 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121862000 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 121862170 C G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 121862301 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 121862316 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 121862371 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 121862633 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 121862672 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 121863121 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 121863130 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 121863239 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 121863256 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 121863445 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 121864152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121864659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121865377 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121866361 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121866387 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121866927 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121867007 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121867056 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121867129 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121867235 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121867280 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121867398 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121867508 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121867520 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 121867596 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121867798 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121867810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121867848 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121867914 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 121867934 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 121867959 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 121868250 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121868306 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121868350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121868393 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 121868608 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 121868626 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121868827 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121868850 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 121868897 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121868899 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121869243 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 121869270 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 121869804 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121869921 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121870026 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 121870045 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 121870465 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 121870877 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 121870940 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 121870963 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 121870964 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 121871026 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 121871106 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121871149 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121871164 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 121871175 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121871205 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121871220 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 121871269 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 121871340 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121871377 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 121871847 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 3 121871865 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 121871884 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 121872083 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 121872734 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 121873125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121873164 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 121873352 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 121873439 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 121873482 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 121874427 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 121874437 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121874518 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121874545 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 121875204 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 121875355 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 121875388 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121875462 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 121875475 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121875484 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121875491 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121876573 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121877619 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 121878088 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121878224 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 121878418 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 121878827 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 121879024 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 121879136 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121880052 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121880159 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121880542 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 121880572 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 121880622 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 121880653 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 121880985 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 121881030 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 121881031 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 121881177 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 121881254 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121881282 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 121881313 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 121881357 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121882065 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 121882074 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 121882279 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 121882594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121882646 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 121882677 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121882730 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121882748 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121882783 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121882788 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121882829 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121882895 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121882955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121882964 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 121883040 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 121883193 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 121883276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121883398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121883409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121883459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121883475 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 121883517 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121883569 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 121883706 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121883729 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121883769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121883820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121883837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121884242 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 3 121884299 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121884549 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 121884640 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 121884815 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121884880 A G N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 3 121885166 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121885523 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 121885852 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121885891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121886117 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121886126 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121886740 A C N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 121886925 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121886928 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121886989 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 121887006 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121887010 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121887147 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 121887164 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121887442 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121887747 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121888045 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 121888389 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 121888422 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121888848 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121888993 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121889405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121889718 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121889778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121890127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121890143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121890835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121891409 C G N N 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0 0.818181818181818 0.181818181818182 9 13 0 9 2 3 121892413 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121894180 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121894200 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 121894423 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121894606 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 121894612 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121894623 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 121895043 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 121895700 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121896016 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 121898640 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 121899063 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121899376 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 121899813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121900348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121900515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121900535 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121902786 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 121902997 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 121904411 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 121904739 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121905064 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121905542 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 121905548 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 121905829 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121905904 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121905927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121906217 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 121906230 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 121906295 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 121906430 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 121906592 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 121906617 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 121906697 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121906729 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121906927 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121907104 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 121907154 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 121909533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121911519 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 121911598 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 121911601 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121912290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121913502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121913923 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 121914428 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121914571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121915649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121916628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121917655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121917813 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 121921021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121921158 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121921240 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 121921383 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121921422 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121921608 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121921728 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 121921829 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 121922142 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 121922690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121923218 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 121923427 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121923731 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 121924570 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121924663 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 121924889 G T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 121925146 C T Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 121925187 C T Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 121925436 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121926021 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121926034 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 121926660 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121926789 C G N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 121926880 A C Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 121927066 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121927099 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121927103 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121927135 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121927137 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 121927178 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121927193 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 121927313 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 121927368 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 121928219 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 121929277 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121929413 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121929779 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 121930277 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121930279 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121930426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121936396 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 121936455 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 3 121937556 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 121937721 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 121942367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121942969 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121943643 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 121944111 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 121944450 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 121944810 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121944881 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121945292 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 121946645 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 121947141 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121947431 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 121947710 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121948217 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121948328 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 121949219 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 121949594 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121949595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121949697 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 121949711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121949922 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 121950113 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121950363 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121950372 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121950690 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121950929 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 121952575 A T Y N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 121953231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121953562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121957221 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121957810 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121958014 A G N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 121959634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121960197 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 121960393 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121961320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121962057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121963504 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 121964133 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121966803 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 121968996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121969610 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 121969713 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 121970605 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 121971123 A C N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 121971259 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 121972009 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121973649 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121973969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121977735 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121978078 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 121978087 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121978819 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 121978861 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 121978979 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 121980163 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121980249 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121980267 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 121980341 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121980471 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121980537 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121980622 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121980657 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121980990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121981123 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121981544 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 121981556 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 121981612 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121981953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121982084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121982180 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121982195 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121982287 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 121982411 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121982577 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121982601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121982811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121983015 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121983017 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121983061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121983111 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121983260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121983294 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121983444 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 121983467 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 121983472 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 121983557 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121983752 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121983800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121983875 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121983893 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121984121 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121984158 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121984510 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121984725 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121984886 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121985151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121985152 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121985463 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121985562 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121985603 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121985949 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121986188 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 121986231 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 121987054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121988230 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 121988391 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121988505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121988703 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 121988758 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121988810 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 121989222 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121989381 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121989499 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 121989540 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121990171 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121990277 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 121990312 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121990317 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121990351 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 121992086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121992158 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 121992664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121993122 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 121993283 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121993284 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 121993769 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121993983 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121994576 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 121995396 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121997123 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 121997139 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 121997999 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 121999002 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 121999130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 121999416 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 122000579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122001801 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 122002440 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122002475 G C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 122002510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122003878 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122004107 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 122004181 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 122004493 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 122004641 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 122004731 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 122004785 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122004828 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122004846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122004860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122005059 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 122005082 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122005150 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 122005684 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 122005757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122005767 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 122005889 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 122006158 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 122006416 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122006812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122007335 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 122008960 A C N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5625 0.125 0.3125 20 12 9 2 5 3 122009291 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 122010045 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 122010467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122010472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122010527 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 122010604 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122010740 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 122010850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122010861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122010879 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 122011813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122011918 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 122012041 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122012079 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122012248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122012274 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 122012362 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 122012581 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122012601 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 122014361 A G N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.133333333333333 0.733333333333333 0.133333333333333 15 15 2 11 2 3 122014376 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 122014400 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 122014405 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 122014625 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 122014682 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 122014802 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 122015036 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122015550 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 122015613 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 122015647 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 122015715 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 122015920 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 122016690 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122016781 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 122016898 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122017787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122017973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122018134 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 122018155 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122018205 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 122018588 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 122018589 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 122019064 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 122019074 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 122019140 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 122019263 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 122019274 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 122019412 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 122019427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122019503 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 122019530 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122020100 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 122020121 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 122020183 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 122020212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122020331 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 122020691 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 3 122020702 A C N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 3 122020751 C T N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.636363636363636 0.0909090909090909 0.272727272727273 15 7 7 1 3 3 122020752 A G N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.333333333333333 0.0833333333333333 0.583333333333333 9 15 4 1 7 3 122020861 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 122021475 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 122021499 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 122021517 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122021542 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 122021545 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 122021607 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 122021676 G C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 122021773 G A Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 122021777 G A N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 122021803 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 122021838 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 122021926 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 122022002 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122022050 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 122022572 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 122022573 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 122022679 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122022796 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 122022834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122022861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122024574 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 122024640 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 122024760 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 122024777 G T N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 18 14 4 10 2 3 122024904 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 122025006 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 122025097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122025219 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 122025295 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122026877 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122029000 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 122032573 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122032604 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122033120 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122033175 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122033201 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 122033337 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122033484 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 122034547 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122034865 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 122035062 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122036511 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 122037120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122037290 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 122037723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122037768 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122038020 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 122038145 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 122038252 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 122038315 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 122038416 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 122038430 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122038510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122038516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122038667 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122038825 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 122039121 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 122039136 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 122039421 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 122039654 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 122040588 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 11 7 4 3 2 3 122042137 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 122042151 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 122042242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122042300 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122042707 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 122042932 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 122043078 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 122043899 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 122044355 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 122044370 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 122045036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122045088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122045092 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 122045109 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 122045225 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 122045277 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122045351 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 122045627 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 122045667 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 122045905 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 122046469 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122046751 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 122047138 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 122047198 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 122047310 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 122047846 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 122048399 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122048488 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 122048498 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122048537 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 122048573 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 122048687 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122048860 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 122049088 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122049609 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 122049618 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 122049763 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 122049784 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122051379 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122051408 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 122051494 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 122051586 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 122051630 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 122051631 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 122051900 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 122052001 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 122052071 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 122052171 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 122052264 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 122052423 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 122052541 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 122052895 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 122052949 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 122052985 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 122053125 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 122053140 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 122053145 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 122053275 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 122053305 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 122053376 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122053568 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 122054015 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 122054256 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 122054366 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 122054373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122054396 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 122054427 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 122054669 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 122054824 T G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 122054906 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 122055644 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 122055683 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 122055721 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 122055751 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 122055856 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 122055867 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 122055887 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 122055962 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 122056009 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 122056336 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 122056512 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 122056526 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 122056615 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 122056776 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 122056841 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 122056920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122056930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122056953 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 122057123 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 122057144 T A N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 122057399 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 122057412 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 122057457 G T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 122057627 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 122057638 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122057917 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 122057986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122058091 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122058450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122058477 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122058714 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122058818 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122058829 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122058844 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122058981 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 122059351 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 122059602 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 122059772 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122059818 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 122060566 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 122060671 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 122060685 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 122060767 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 122060783 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 122060803 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 122060841 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 122060852 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 122060904 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 122060908 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 122060934 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 122061300 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 122061814 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 122062271 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122062428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122065148 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 122065337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122065604 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 122065959 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 122066209 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122066377 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 122068694 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 122070629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122071219 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 122071413 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 122073087 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 122073171 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122073397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122073537 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 122073667 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122073686 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122073782 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 122073783 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 122073809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122073884 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 122074013 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 122074016 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 122074154 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 122074645 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 122075054 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 122075068 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 122075128 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 122075234 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 122075259 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 122075376 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 122075589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122075885 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122076047 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 122076116 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 122076145 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122076194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122076799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122076897 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 122076922 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 122076944 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 122077143 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 122077240 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 122077432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122077824 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 122077844 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 122078000 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 122078103 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 122078112 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 122078122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122078239 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122078264 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 122078286 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 122078330 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 122078347 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 122078726 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 122078896 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 122079016 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 122079425 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 122080062 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 122080150 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 122080153 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 122080206 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 122080232 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 122080326 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 122080427 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 122080537 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 122080568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122080676 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 122080731 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122080780 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122081112 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 122081206 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 122083928 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 122084141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122086787 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122086795 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122087268 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122087274 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122088589 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 122088812 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 122088898 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 122088932 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122089621 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 122089673 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 122089684 G T Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 122090179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122090531 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 122091377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122092345 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 122092502 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122094136 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122095541 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 122095830 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 122097290 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122097885 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 122097994 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 122098015 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 122098080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122098117 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 122098491 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 122099031 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 122099050 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 122099067 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 122099674 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 122100671 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 122100680 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 122100749 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 122100850 T C N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 3 122100853 T C N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 3 122100882 T C N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.166666666666667 0.0833333333333333 0.75 5 19 2 1 9 3 122100939 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 122100940 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 122100972 T C N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 3 122100996 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 122101110 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 122101321 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 122102164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122102165 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122102185 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122102206 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122102898 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 122103105 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122103791 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 122103926 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122104373 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 122105040 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122105322 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 122106776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122107439 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 122109112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122112282 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 122112303 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 122112353 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 122112388 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 122112532 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 122113353 T C N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 122114743 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122114825 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 122114972 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 122114994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122115005 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122115084 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 122115102 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 122115402 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 122115674 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 122115895 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 122115909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122116049 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 122116068 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 122116166 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 122116239 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 122116381 G T N N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 3 122116481 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 122116993 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 122116999 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 122117087 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 122117415 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 122117425 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 122117481 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 122117488 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 122117574 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 122117764 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 122117981 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 122118047 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122118128 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 122118129 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 122118309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122118319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122118435 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 122118641 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 122118727 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 122118750 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 122118751 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 122119159 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 122119193 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 122119321 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 122119388 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 122119401 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122119597 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 122119629 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 122119676 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 122119873 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 122120656 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 122120678 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 122120695 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122120707 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 122120734 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 122120788 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 122120939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122122071 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122122543 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 122122932 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122123074 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 122123082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122123123 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 122123768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122124274 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122124275 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 122124529 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122124552 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 122124640 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 122124785 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 122125267 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 122125385 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 122125426 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122125492 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 122125587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122125690 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 122125833 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 122126087 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 122126112 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 122126226 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 122126264 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 122126363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122126434 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 122126453 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122127157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122127229 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 122127306 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 122127388 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 122127477 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 122127570 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 122127748 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 122127858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122128468 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 122129232 T G Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 122131567 G C Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 122131568 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 122135775 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122137334 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 122139165 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 122139248 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122140118 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 122140183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122140371 A C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 122141470 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 122141689 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122144126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122145639 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 122145858 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122146002 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 122146012 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 122146093 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 122146391 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 122146395 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 122146454 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 122146669 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 122146745 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 122146824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122148319 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 122148373 G T N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 122148458 C T N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 122148483 A G N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 3 122149088 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 122150377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122150386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122150859 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 122150879 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 122152188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122152569 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122152701 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122152878 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 122152941 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 122152982 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 122152988 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 122153238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122153335 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 122153713 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 122153880 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 122153954 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 122154039 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 122154070 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 122154183 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 122154228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122154272 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 122154378 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 122154529 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122154609 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 122154612 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122154639 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122154842 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 122155257 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122155307 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 122155501 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122155590 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 122156272 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 122156387 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 122156391 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 122156467 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 122156523 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122156559 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 122156584 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 122156612 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 122156613 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 122156688 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 122156717 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 122156721 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 122157426 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 122157496 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 122157596 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 122157959 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 122158168 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 122158495 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122159833 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 122160008 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 122161026 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 122161088 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 122161150 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 122161410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122162048 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 122162072 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 122162245 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 122162397 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 122162494 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 122162577 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 122162584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122162593 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 122162597 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 122164285 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122164403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122164634 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 122165621 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 122165641 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 122165919 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 122165962 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122166135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122166940 T G Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 122167133 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 122167521 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 122167853 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 122168043 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122168189 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 122168202 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 122168222 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 122168553 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 122168716 C A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 122168752 T A N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 122168773 T G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 122168866 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 122169035 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 122169140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122169202 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 122169306 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 122169451 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 122169654 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 122169670 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 122169710 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 122169892 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 122169899 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 122169931 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 122170052 T C Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 122170106 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 122170141 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 122170216 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 122170224 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 122170258 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 122170509 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 122170649 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 122170709 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 122171078 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 122171278 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 3 122171483 G C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 122171754 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 122171778 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 122172194 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 122172316 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 122172500 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 122172591 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 122172727 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 122172917 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 122173089 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 122173194 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 122173204 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 122173270 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 122173290 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 122173316 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 122173366 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122173380 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 122173455 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 122174394 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122175462 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122176203 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 122176540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122176622 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 122176868 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 122177061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122178686 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 122183689 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122183845 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 122183903 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 122183912 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 122183951 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 122183953 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 122184241 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 122184381 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 122184763 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 122184802 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 122185076 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 122185351 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 122185364 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122186359 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 122186889 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122187006 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 122187019 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 122187345 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122188268 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122188697 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122188835 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122189478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122190506 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122190657 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122191804 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 122192536 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122193550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122193742 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 122194473 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 122194835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122194954 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122195190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122195483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122196985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122197033 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 122197731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122198259 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122198273 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122198338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122199475 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 122205060 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122205076 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 122205082 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 122205985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122206165 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122206186 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122206194 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122206297 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 122208475 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122209506 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122210094 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122211697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122211730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122212395 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 122212790 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 122213458 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 122214954 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 122216167 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 122216183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122216619 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 122216945 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122218034 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122218555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122221742 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 122222835 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122224531 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 3 122225249 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 122227308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122227312 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122232725 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122232726 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122233356 C G Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 122234604 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 122234660 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122234747 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122234751 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122235343 T C Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 122235365 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 122236965 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 122238522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122239230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122241133 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122241711 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122243234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122246121 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 122252802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122253702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122254064 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122254890 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 122255579 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 122256207 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 122256872 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122258227 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122261347 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122261619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122261639 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122261651 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122261660 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122261887 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 122262655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122262969 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122265108 C A N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 3 122265540 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122266512 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 122266613 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 122266709 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 122268174 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122268261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122268979 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122269161 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122269187 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122269854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122271005 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 122271522 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122272682 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122274366 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 122274396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122274397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122274409 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122274424 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 122274437 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122274466 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122274655 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122274761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122274821 T G N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 122274851 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122275398 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122275750 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 122276796 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122276859 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 122276948 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122277031 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 122277329 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 122277429 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 122277441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122277532 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122277608 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122277822 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 122279341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122282212 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 122282213 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122283164 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 122283253 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 122283255 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 122283290 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 122283291 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 122285243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122285426 G T N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 10 20 0 10 5 3 122286009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122287822 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122290012 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 122290072 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122290170 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 122290301 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 122290736 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 122290743 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 122293881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122296863 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 122298005 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 122300001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122300142 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 122300491 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122300497 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 122300639 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 122300770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122300929 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 122301205 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122301229 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 122301277 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 122301536 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 122301625 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 122301636 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 122301648 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 122301681 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 122301828 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 122301836 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 122302116 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 122302168 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 122302191 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 122302222 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 122302229 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 122302560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122302562 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122302578 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 122302797 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122302816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122303280 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122303667 T G N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 3 122303882 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 122304232 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122304276 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0 0.65 0.35 13 27 0 13 7 3 122304343 T A Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 122304478 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 122304492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122304605 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122304751 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122304813 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 122304909 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 122305007 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122305238 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 122305343 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122305372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122305766 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122305828 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 122306001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122306061 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122306380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122306476 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122306738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122306870 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122307032 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 122307169 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 122307398 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 122308039 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 122308086 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 122308168 T G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 122308815 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122308869 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122309114 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 122309192 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 122309942 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 122310014 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122310240 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122310846 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122310905 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 122310959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122311221 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 122311312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122311408 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 122311439 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122311512 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 122311793 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122311911 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122312203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122312309 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 122312835 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122312852 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122312859 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 122312905 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 122312918 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122312935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122313004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122313768 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 122313791 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 122314022 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 122314085 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 122314348 A G Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 122314763 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 122314780 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122314825 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122315255 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 122315365 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122315372 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122315399 T C Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 122315401 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 122315958 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 122316315 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 122316340 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 122316480 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 122316698 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122316893 A G Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 122317039 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122317097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122317235 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 122317247 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122317248 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 122317272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122317594 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 122317628 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 122317818 C G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 122317848 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122318255 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 122318355 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 122318377 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122318674 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 122318747 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 122318819 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122318832 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 122318835 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 122318984 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122319183 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 122319259 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 122319265 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 122319363 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 122319979 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 122320197 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 3 122320212 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122320228 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122320246 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 122320354 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122320421 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122320528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122320655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122321006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122321050 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 122321147 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 122321226 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 3 122321257 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 122321361 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 122321642 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 122321733 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 3 122322864 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.5 0.416666666666667 8 16 1 6 5 3 122322895 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 3 122323094 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 122323301 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 122323373 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 122323389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122324057 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 122324095 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 122324980 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 122325821 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 122325994 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 122326202 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 122326273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122326318 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 122326705 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122326715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122327123 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122327314 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122327512 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 122327986 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122328063 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122328157 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 122331322 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 122331588 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 122331634 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 122331789 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 122332634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122332684 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122333303 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 122333776 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 122333798 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122333799 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122333859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122333984 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 122334021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122334927 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122335721 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 122335829 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 122335834 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 122336009 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 122336041 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 122336061 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 122336075 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 122336077 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 122336216 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122336234 C T N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 3 122336476 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 122336791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122336874 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122336903 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 122337063 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 122337341 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 3 122337815 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122338716 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 122339002 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 122339038 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 122339068 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 122339108 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122339178 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 122339472 C T N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 3 122339528 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 122339560 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 122339707 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 122339738 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 122339782 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 122339838 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 122340020 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 122340190 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 122340226 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 122340421 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 122341308 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 122343105 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 122343122 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 122343266 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 122343310 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 122343332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122343454 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 122344601 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122344611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122344986 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122344997 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122345137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122345167 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122345178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122345247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122345313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122345588 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 122345669 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122345793 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 122345841 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 122345983 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122346334 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122346626 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 122347758 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 122348018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122348040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122348293 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 122348330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122348343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122348370 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 122348494 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 122348646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122348662 T A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 3 122348664 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 122348682 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 122348687 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 122348796 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 122349008 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 122349029 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 122349320 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 3 122349874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122349916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122349977 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122350055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122350063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122350118 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122350189 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122350213 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 122350226 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 122350281 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122350316 G C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 122350457 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 122350528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122350529 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 122350546 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122350736 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 122351232 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122351270 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122351457 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122351552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122352186 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122352579 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 122352597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122352667 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 122352944 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122353087 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 122353804 G T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 122353924 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 122354366 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 122354449 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 122354725 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122354774 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 122354834 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 122354849 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 122355151 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122355270 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 122355342 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 122355665 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122355792 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 122355855 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 122355856 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122355892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122356051 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122356743 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122360591 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122360831 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 122361729 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 122361786 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122361904 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 122361944 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122362221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122362552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122362597 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 122362729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122365113 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 122365250 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 122365373 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122365641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122367049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122367462 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 122367528 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 122367563 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 122367594 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 122367713 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 122367738 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 122367763 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 122367790 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 122367851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122367867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122368002 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122368032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122368132 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 122369308 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 122369857 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 122370158 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122371397 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122372186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122372187 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122373014 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 122373054 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 122373073 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 122373153 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 122373177 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 122373285 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 122373320 T A N N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 3 122373481 A C N N 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 3 122373487 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 3 122373568 C T N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 122373658 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 122374136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122374173 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 122374205 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122374216 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122374261 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 122374480 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 122374522 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 3 122374574 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 122374644 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 122374649 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 122374688 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 122374858 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122374902 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122374993 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122375024 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122375026 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122375127 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122375342 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 122375423 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122375427 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122375491 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122375558 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122375617 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122375719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122375762 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122375904 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 122376275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122376437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122376771 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122378620 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122379392 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122379607 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 122379661 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 122379722 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 122379769 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 122379799 A C N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0 0.769230769230769 0.230769230769231 10 16 0 10 3 3 122379850 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122379860 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122379911 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122379968 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 122380370 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 122380602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122380808 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122380921 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 122381031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122381149 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 122381221 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122381261 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122381269 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122382080 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122382199 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122382369 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122387049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122389318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122389561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122392014 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122392787 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 122393502 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 122394528 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 122394542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122394562 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122395387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122395417 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 122395536 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 122396027 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122396064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122396091 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 122396252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122396550 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 122396565 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 122396720 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 122397317 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 122397384 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122397527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122397661 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122397749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122397752 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122398567 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 122398612 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122400353 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122402154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122404509 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122408367 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122409603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122409650 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 122411111 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 122411251 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 122412146 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 122413298 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 122413404 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 122413859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122414161 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 122414242 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 122414657 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 122414761 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122414897 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 122415325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122415332 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 122415370 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122415575 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122415619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122416137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122416216 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122416225 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122416374 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 122416383 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 122416515 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 122416602 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 122416632 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122416642 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122416697 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 122416793 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 122416828 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 122416942 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 122417145 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 122417321 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122417331 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122417364 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122417819 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 122417833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122418185 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122419128 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122419226 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122419385 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122419485 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 122419573 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 122419628 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 122419641 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122419654 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 122419803 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 122420014 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 122420020 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 122420120 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 122420166 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 122420180 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122420256 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122420322 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 122420457 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 122420769 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122421847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122422163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122422759 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 122422764 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122423214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122423436 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122423550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122425503 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 122426220 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 122432337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122433007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122433526 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 122433980 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 122434241 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122434539 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 122435106 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 122435329 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 122435371 T A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 122435404 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122435534 C A Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 122435631 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 122436347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122437536 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 122437545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122437579 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 122437622 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 122437736 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 122437891 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122437935 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122438007 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122438503 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122438513 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122438568 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122438624 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122438673 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122439374 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122439658 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122440018 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122440598 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 122440693 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122440959 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 122441066 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 122441123 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 122443911 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122444935 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122444936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122444990 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 122445875 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 122445903 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 122446169 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 122446809 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122447205 C A N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.428571428571429 0.214285714285714 0.357142857142857 15 13 6 3 5 3 122447273 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 122447305 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 122447462 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 122447970 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 122448176 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 122448284 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 122448380 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122448502 C G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 122448719 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122449072 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 122449149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122449432 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 122449599 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 122450234 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122450303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122450396 A C Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 122450596 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 122450852 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 122451291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122451572 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122451586 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122451670 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122452269 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 122452439 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122452544 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122452561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122452706 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122452810 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 122452811 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 122452917 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 122452967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122453047 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 122453075 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 122453165 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 122453336 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 122453375 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 122453414 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 122453460 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122453640 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122453743 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 122453803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122454074 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 122454146 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 122454199 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 122454221 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 122454268 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 122454438 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 122454442 C T N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 3 122455315 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 122455502 T G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 122455560 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 122455781 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122455908 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122456214 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122456241 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122456773 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122456897 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 122457030 T A Y N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 122457386 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 122457427 A G Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 122457509 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 122457540 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 122457559 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 122457720 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 122457776 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 122457926 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 122457945 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 122457948 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 122458037 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 122458195 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 122458206 C A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 122458315 C A N N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 122458316 C T N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 122458343 A T N N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 3 122458393 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 122458543 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 122458593 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 122458604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122458614 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 122458644 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 122458724 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122458871 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 122458879 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122458922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122458939 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122459015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122459045 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 122459105 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 122459168 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122459330 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 122459340 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 122459342 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122459474 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 122459698 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122459739 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122459778 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122460038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122460188 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122460720 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122460804 G C Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 122460901 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 122460909 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 122460948 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 122461079 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 122461138 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 122461147 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 122461156 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 122461158 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 122461168 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 122461255 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 122461260 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 122461522 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 122461532 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 122461870 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 122461874 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 122461987 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 122462405 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 122463580 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 122466041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122466203 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 122466336 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 122470556 G A N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 3 122470747 A T N N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 3 122471561 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122471742 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 122472405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122474004 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 122474303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122476347 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 122476378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122477027 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122478930 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122481468 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122483193 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 122483777 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 122486432 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122488136 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 122488280 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 122488301 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 122488312 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 122488376 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 122488388 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 122488428 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 122488439 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 122488524 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 122488603 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 122488633 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 122488648 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 122488688 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 122488706 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 122488736 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 122488777 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 122488910 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 122488930 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 122488962 C A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 122489072 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 122489078 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 122489093 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 122489101 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 122489129 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 122489197 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 122489243 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 122489589 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122489788 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122491666 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 122492121 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 122492164 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 122492208 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 122492213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122492219 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 122492345 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 122492347 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 122492399 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 122492462 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 122492914 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 122493331 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 122493365 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 122493379 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 122493431 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122493454 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 122493479 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 122493752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122494239 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122495352 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122496094 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122496176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122496957 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122496959 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122498798 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122499927 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122500730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122502725 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 122506818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122507088 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 122507762 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 122507835 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 122508805 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 122508882 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 122509289 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122509290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122509311 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122509341 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 122509389 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 122509498 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122509569 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122509575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122509626 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 122509636 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 122509641 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 122509704 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 122509766 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 122509772 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122510140 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 122510440 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 122510589 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 122511131 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 122511142 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 122511179 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 122511333 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 122513192 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122513211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122513367 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122513688 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122514215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122514862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122514951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122514952 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122515058 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 122515090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122515094 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 122515150 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122515360 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0 0.705882352941177 0.294117647058824 12 22 0 12 5 3 122515763 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 3 122516343 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122516373 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122516377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122517114 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122517149 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122517241 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 122517453 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 122517627 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122517804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122519178 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122520139 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122520620 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 122521082 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 122521949 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 122522119 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 122522172 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 122522383 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 122522664 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122522757 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 122522764 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 122523369 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 122523507 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122524563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122526569 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 122527506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122529571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122531447 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 122531801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122536961 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122540367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122540626 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122541614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122542281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122542586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122544016 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 122544509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122545385 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122546713 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122546806 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122547069 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 122547361 A T N N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 7 13 1 5 4 3 122547824 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122547861 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 122547881 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 122548274 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 122548281 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 122548336 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122548337 G A Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 3 122548619 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 122549916 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122550132 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122551397 A T Y N 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 3 122551827 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 122552312 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 122553068 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122553207 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122553250 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122553292 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122553357 G C N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 122553492 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 122553833 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122554009 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122554309 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122554322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122554475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122554521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122554524 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122554550 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122554714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122554743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122554789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122554806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122554812 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122554841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122554860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122555049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122555055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122555079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122555127 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122555141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122555224 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122555278 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122555437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122555482 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122555533 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122555558 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122555611 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122555616 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122555736 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122555773 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122555829 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122555840 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122555847 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122555882 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122555888 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122556133 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122556149 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122556261 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122556281 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122556314 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122556316 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 122556352 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122556562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122556669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122556789 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122556822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122556889 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122556940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122557041 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122557055 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122557067 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122557151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122557266 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122557376 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122557420 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122557783 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 122558327 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122558611 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 122558702 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 122558775 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 122558784 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 122558823 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 122559218 A G Y Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 9 9 2 5 2 3 122559220 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 122559300 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 122559387 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 122559556 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 122559623 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 122559749 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 122560234 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 122563482 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122586666 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 122591391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122614218 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 122616340 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 122617154 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 122622298 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 122633191 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 122633194 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 122635574 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 122637020 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122637918 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122639231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122639348 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122641838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122659403 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122664564 T C N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.0833333333333333 0.75 0.166666666666667 11 13 1 9 2 3 122666870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122667015 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122668286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122668464 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122668640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122671100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122671176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122671522 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122672595 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 122673084 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 122673220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122674743 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 122675237 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 122675564 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 122676129 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 122676168 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 122676274 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122676587 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 122676743 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 122676990 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 122677496 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 122677605 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 122677661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122678039 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122678272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122678506 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 122678805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122678832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122678879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122680162 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122680210 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122680223 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122680378 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122680661 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122680940 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122681401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122681552 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122681576 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122682697 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 122682798 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 122682859 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 122683002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122683317 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 122683380 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 122683676 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 122683723 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122683795 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 122683912 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122688069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122688429 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 122689195 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 122689270 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122689719 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122689941 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122690415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122690612 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122690988 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 122691037 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 122693250 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 122693302 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 122693318 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 122693779 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122693880 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122694004 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122694248 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122695041 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 122701505 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 122701663 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122702846 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122704292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122704626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122704644 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 122704922 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 122704933 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 122705137 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 122705184 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 122705216 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 122705260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122705308 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122705447 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 122705527 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 122705929 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 122706058 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 122706123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122706182 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 122706418 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 122706521 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 122706623 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122706726 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122706731 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 122706801 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 122706932 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 122707684 G T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 122707691 G T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 122707942 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 122707983 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 122708038 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 122708083 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 122708161 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 122708362 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 122709049 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122709102 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 122709104 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 122709275 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 122709628 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 122709632 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 122709837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122709856 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122709879 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 122709891 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 122709904 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 122709962 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 122709964 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 122710017 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 122710158 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 122710181 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 19 17 1 17 0 3 122710338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122710358 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 122710395 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122711694 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 122711761 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 122711768 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122711942 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 122712047 T A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 122712057 G C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 122712060 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 122712159 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 122712229 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 122712294 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 122712465 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 122712470 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 122712482 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 122712515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122712649 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122712781 A C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 122713042 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 122713315 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 122715774 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 122715780 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 122715785 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 122716002 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 122716101 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 122716285 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122717672 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 122717768 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 122719185 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 122719436 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 122719681 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 122719683 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 122719832 C A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 122719833 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 122720306 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 122720544 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 122720724 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 122721338 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122721842 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 122721881 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 122722081 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 122722172 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 122723504 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 122724686 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 122725992 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 122726881 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 122726934 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 122727708 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 122727930 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 122728152 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 122728178 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122728379 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 122728388 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 122728890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122728949 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 122728968 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 122728984 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 122729465 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122729612 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 122729635 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 122729769 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 122729867 G C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 122729871 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 122730192 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 122730481 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 122731012 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 122732897 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122733212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122734155 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122734693 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122735168 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122735467 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 122736002 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122737986 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122738087 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 122738750 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122738849 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122739707 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 122740068 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122740459 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 122740932 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 122740956 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 122741334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122741347 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122741439 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122741460 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122741487 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122741519 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122741549 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122741632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122741691 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 122741748 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 122741785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122741852 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 122741853 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 122742001 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122742073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122742096 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 122742104 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122742263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122742595 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 122742733 C A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 122742770 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 122742812 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 122743157 A T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 122743214 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 122743832 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 122744011 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122744191 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 122744257 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 122744390 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122744755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122745417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122746102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122746276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122746295 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 122746404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122746418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122746646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122747526 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122747527 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122747537 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122747575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122747741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122747777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122747871 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122747904 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 122748208 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122751367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122752826 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122753023 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122755016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122755416 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122755571 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 122756087 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122756518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122756925 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122757013 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 122757100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122757901 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 122757980 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 122758052 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 122758062 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 122758064 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122758098 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 122758215 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 122758407 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 122758585 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 122758609 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 122758615 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 122758868 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 122758884 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 122759054 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 122759079 T G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 122759083 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 122759136 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 122759137 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 122759153 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 122759218 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 122759254 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 122759264 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 122759314 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 122759338 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 122759349 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 122759389 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 122759400 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 122759762 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122759834 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 122759972 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 122760004 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 122760005 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122760075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122760191 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122760270 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 122760394 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 122760431 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122760473 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 122760541 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 122760593 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 122760609 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 122760631 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 122760686 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 122761410 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122761549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122762260 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 122763607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122763714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122763793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122765226 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 122765406 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122765471 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 122765486 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122765530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122767093 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122767540 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122767645 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 122767847 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122767927 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 122767944 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 122767947 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 122768071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122768135 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 122768146 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 122768147 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 122768305 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 122768439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122768472 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122768483 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122768516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122768759 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 122768875 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 122768900 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 122769440 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 122769500 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 122769606 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122769891 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 122769932 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 122770090 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 122770095 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 122770784 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 122770839 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 122771993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122772170 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 122772468 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 122772524 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 122772539 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 122772821 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 122773000 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 122773189 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 122773241 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 122773294 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 122773302 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 122773836 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 122773840 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 122774011 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 122774191 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 122774308 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122774317 C G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 122774372 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 122774428 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122774500 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122774745 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122774758 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122775025 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 122775076 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 122775086 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 122775350 T G N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 3 122775969 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 122776040 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 122776149 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 122776238 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 122776246 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 122776633 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122776774 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 122777091 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122777199 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 122781424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122782551 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 122783280 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 122783326 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 122783498 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 122783671 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 122783708 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122783789 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122783991 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122784303 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122784340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122784722 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 122784850 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 122784918 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 122784929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122785128 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122785265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122786307 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122786516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122786967 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122787233 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122787735 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 122788340 G A N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 3 122789770 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 122789814 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122790400 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 122791861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122792165 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122792254 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122792289 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122792553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122793016 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122795210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122795423 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122795740 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122795812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122796393 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122796399 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122796563 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122796866 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122796890 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 122798194 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 122801939 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122802115 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122802483 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 122802912 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122802913 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122805980 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122807172 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122807488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122808075 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122808291 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 122808370 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 122808419 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 122808498 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 122808617 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 3 122808699 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122808731 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 122808750 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 122808773 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 122808803 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 122808848 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 122808906 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 122808923 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 122808944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122808971 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 122808999 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 122809005 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 122809042 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 122809234 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 122809248 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 122809268 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 122809328 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 122809392 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 122809397 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 122809442 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 122809464 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 122809559 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 122809585 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 122809616 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 122809673 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 122809726 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 122809769 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 122809773 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 122809876 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 122809884 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 122809928 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 122810397 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 122810421 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 122810540 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 122810575 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 122811308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122811356 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 122811357 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122811516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122812012 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 122813735 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 122815250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122819563 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 122820528 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122820814 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122820992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122821026 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122821055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122821063 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122821221 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 122821653 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122824026 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122824615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122824645 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 122824972 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122825010 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 122825918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122826047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122826353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122828268 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 122828944 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122828945 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122831639 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 122832576 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 122832619 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 122832669 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 122832874 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 122834283 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 122834398 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122834482 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 122834646 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 122834648 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122834736 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 122834769 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 122834783 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 122834868 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 122834914 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122834953 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122835002 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122835037 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122835264 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 122835294 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122835361 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122835395 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 122835411 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 122835518 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 122835684 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 122835704 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122835726 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 122835732 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 122835745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122835752 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 122835895 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122835931 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 122836022 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 122836096 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122836115 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 122836168 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122836502 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122836645 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 122837109 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 122837403 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 122838291 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 122839259 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122839789 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 122840815 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122841005 C A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 122841136 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122841452 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122842868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122845527 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 122846999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122847420 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 122848149 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 122849283 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122849455 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 122849456 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 122849472 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 122849502 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 122849981 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 122850139 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 122850200 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 122851824 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122853161 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122853688 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122853693 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122854696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122856030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122857582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122857911 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122858496 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 122858942 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 122858957 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 122860903 C A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 122860994 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 122861132 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 122861206 G C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 122861242 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 122861260 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 122861343 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 122861384 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 122861434 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 122861450 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 122861524 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122861553 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 122861744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122861761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122861795 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 122862212 G T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 122862287 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 122863196 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 122863297 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 122864539 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 122864554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122864747 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 122864780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122865138 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122865206 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122865251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122865274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122865790 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 122866038 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 122866052 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 122866064 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 122866110 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 122866279 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 122866398 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 122866421 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 122866449 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 122866508 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 122866523 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 122866684 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122866865 C G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 122867027 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 122867074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122867218 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 122867220 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 122867660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122868411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122868545 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 122868810 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 122868903 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 122869115 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 122869177 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122869233 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 122869259 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 122869431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122869732 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 122870149 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 122870160 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 122870163 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 122870353 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 122870363 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 122870798 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 122871014 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 122871073 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 122871209 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 122871265 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 122871288 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 122871427 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 122871548 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 122871645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122872066 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 122872720 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 122872767 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 122872817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122872958 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 122872972 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122873034 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 122873036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122874066 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 122874130 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 122874686 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 122874742 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 122875020 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 122875138 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 122875219 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 122875250 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 122875608 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 122875890 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 122876585 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 122877053 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 122877078 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 122877169 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 122877650 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 122878235 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 122878276 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 122878447 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 122878579 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 122878813 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 122878825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122878938 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 122878953 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 122879078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122879280 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 122879552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122879735 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 122879967 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 122880045 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 122880798 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 122881315 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 122881603 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 122881733 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 122882712 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 122882806 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 122882885 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 122883289 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 122884195 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 122884241 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 122884306 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122884312 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 122884532 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 122884615 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 122884686 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122884772 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 122884789 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 122884861 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 122885027 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 122885158 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 122885325 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 122885337 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 122885389 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 122885438 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 122885565 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 122885622 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 122885660 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 122885688 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 122885719 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 122885757 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 122885796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122885987 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 122886016 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122886021 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 122886126 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 122886225 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122886632 G A N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 3 122886685 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 122886789 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 122886854 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 3 122886865 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 122886907 A G N Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 11 9 4 3 3 3 122887172 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 122887252 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 122887256 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 122887344 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122887389 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 122887506 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 122887783 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 122887787 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122887839 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 122888059 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 122888072 C G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 122888107 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 122888405 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 122888483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122888489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122888512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122888532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122888612 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 122888651 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 122888775 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 122888782 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 122888933 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 122889004 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 122889039 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 122889055 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 122889189 A T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 122889260 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 122889351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122889446 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 122889495 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 122889524 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 122889922 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 122889949 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 122890261 T G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 122890310 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 122890451 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 122890568 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 122890843 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 122890869 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122890896 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 122890901 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 122890932 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122891026 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122891076 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122891234 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 122891375 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 122891417 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 122891426 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 122891473 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 122891493 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 122891644 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 122891657 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 122891685 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 122891750 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122893474 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122893495 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 122893743 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122893744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122893791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122893936 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 122894333 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 122894776 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 122894797 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 122894856 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 122894905 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 122894908 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 122895030 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 122895217 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 122895218 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 122895236 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 122895308 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 122895332 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 122895340 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 122895352 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 122895418 A C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 122895436 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 122895527 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 122895563 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 122895572 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 122895634 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 122895679 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 122895782 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 122895784 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 122895828 T G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 122895954 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 122896066 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 122896069 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 122896261 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 122896425 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 122896430 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 122896447 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 122896751 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 122896842 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 122897090 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 122897471 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 122897576 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 122897594 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 122904291 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 122904800 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 122904840 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122904848 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 122904981 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122905316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122905352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122905472 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 122905611 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 122905867 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122906016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122906046 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122906067 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122906095 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 122906125 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122906210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122906904 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 122906905 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 122906928 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122906982 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 122907164 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 122907232 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122907253 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 122907345 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 122907364 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 122907409 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 122908626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122908631 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 122908755 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122908787 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 122908811 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 122908818 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 122908890 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 122908931 C T Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 122909046 A G Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 122909109 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 122909357 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122909402 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122909403 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122909842 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 122909917 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 122909993 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 122910020 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 122910031 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 122910033 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 122910085 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 122910094 G A N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 3 122910117 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 122910200 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 122910271 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 122910283 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 122910432 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 122910508 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 122910538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122910655 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 122910757 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 122911175 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 122911402 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 122911490 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 122911525 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 122911535 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 122911654 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 122911748 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 122911824 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 122911841 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 122911874 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 122911979 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 122911990 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 122912053 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 122912058 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 122912132 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 122912425 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 122912708 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 122912727 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122912851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122912886 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 122913273 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 122913293 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 122913457 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122913569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122913653 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 122913759 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122913860 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 122913959 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 122914005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122914352 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 122914354 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 122914422 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 122914523 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 122914639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122914790 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 122914808 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 122915359 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 122915461 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 122915533 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 122915562 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122915696 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 122916032 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 122916111 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 122916221 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122916403 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 122916422 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 122916937 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 122916940 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 122917134 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 122917220 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 122917329 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 122917351 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 122917442 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 122917450 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122917675 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 122917781 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 122917805 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 122918099 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 122918392 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 122918552 T C N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 122918553 G A N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.454545454545455 0.0909090909090909 0.454545454545455 11 11 5 1 5 3 122918932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122919654 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 122919670 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 122919729 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 122919890 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 122919955 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 122919972 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 122920025 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 122920032 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 122920094 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 122920095 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 122920139 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 122920186 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 122920190 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 122920208 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 122920216 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 122920249 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 122920262 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 122920377 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 122920429 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 122920488 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 122920563 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 122920595 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 122920676 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 122920906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122921058 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 122921278 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122921652 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 122921818 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 122921895 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 122922065 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 122922109 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 122922344 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 122922648 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 122922691 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 122922737 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 3 122922746 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 122922810 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122922908 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122923016 G A N Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 3 122923973 A C Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 122923986 A G Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 122924080 C T Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 122924142 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 122924230 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 122924753 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 122924827 A T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 122924836 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 122925290 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 122925501 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 122925781 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 122925801 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 122926048 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 122926315 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122926352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122926449 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 122926503 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 122926674 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 122926928 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122927196 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 122927197 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 122927216 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 122927299 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 122927350 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 122927565 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 122927670 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 122927776 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 122927902 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 122927914 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 122927933 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 122927975 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 122928006 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 122928219 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 122928271 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 122928484 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 122928505 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 122929298 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 122929361 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 122929416 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 122929470 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 122929608 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 122929699 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 122929935 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122929961 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 122930082 C T Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 122930258 T A Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 122930416 C G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 122930498 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122930520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122930563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122930596 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 122930696 A T Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 122930761 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 122930785 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 122930830 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 122930904 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 122930912 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 122931120 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 122931127 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 122931755 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122931796 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122932502 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 122932509 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 122932515 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 122932537 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 122932707 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 122932757 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 122932838 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122932846 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 122932930 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 122933123 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 122933222 G A Y Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 122933441 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 122933449 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122933532 G A Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 122933622 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122933640 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 122933963 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 122934471 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 122934580 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 122934645 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 122934684 T G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 122934685 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 122934834 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 122934867 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 122935041 T G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 122935139 A T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 122935434 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 122935492 T G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 122935510 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 122935601 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 122935603 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 122935628 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 122935666 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 122935767 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 122935857 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 122935872 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 122935970 G A N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 3 122936033 G A Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 122936090 A G Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 3 122939173 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 122939553 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 122939569 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 122939603 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 122939622 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122939654 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122939738 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 122939886 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 122940002 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 122940068 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 122940890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122940905 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 122941199 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122941272 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122941689 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 122941737 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 122941768 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 122941981 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 122941982 C G Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 122942130 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 122942249 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 122943589 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122943996 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 122944254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122944321 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 122944621 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 122946245 C A Y N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 3 122946257 G A Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 18 14 4 10 2 3 122946273 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 122946378 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 122946561 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 122946598 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 122946636 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 122946816 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 122947267 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122947616 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122948589 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 122948623 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 3 122949022 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 122949193 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122949340 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 122949445 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 122949515 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 122949532 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 122949553 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 122949606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122949860 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 122950225 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 122950777 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 122951341 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 122952165 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 122952803 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 122953034 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 122953091 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122953382 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122953580 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122954593 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 122954603 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 122954862 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 122954992 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 122956421 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 122956427 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 122956582 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 122956596 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 122956650 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 122956655 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 122956748 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 122956815 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 122956897 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 122957101 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 122957347 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 122957588 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 122957670 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 122957839 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 122957859 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 122957899 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 122958011 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 122958406 T A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 122958438 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 122958507 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 122958751 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 122958755 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 122958957 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 122960658 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 122961060 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122961231 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 122961271 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 122961549 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 122962048 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 122962062 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 122962092 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 122962097 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 122962107 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 122962191 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 122962195 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 122962205 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 122962228 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 122962241 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 122962253 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 122962290 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 122962343 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 122962403 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 122962453 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 122962455 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 122962482 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 122962641 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 122962699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122962845 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 122962921 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122962934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122962954 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 122963010 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 122963020 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 122963023 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 122963046 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 122963069 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122963103 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 122963503 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122963523 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122963532 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122963840 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 122963855 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122965344 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 122966147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122966148 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122967781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122968098 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122968241 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 122968260 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 122968283 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 122971281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122971301 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 122973354 T G N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 122975166 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 122975357 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 122975453 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 122975726 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 122976162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122977648 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 122981608 T A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 122981621 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 122981657 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122982251 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122989742 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122991896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122992632 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 122992661 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 122992911 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122992917 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122993112 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 122993153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122993703 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 122993709 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 122993876 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 122993924 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 122994049 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 3 122994071 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 122994088 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 122994268 C A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 122994414 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 122994563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122994931 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122994943 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 122994994 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 122995006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122995274 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 122995538 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122995557 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.210526315789474 0 0.789473684210526 8 30 4 0 15 3 122996088 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122996180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122996202 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122996289 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 122996399 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 122996693 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 122996873 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 122997028 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 122997162 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 122997320 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 122997374 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 122997595 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 122997744 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 122997813 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 122997937 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 122998189 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 122998809 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 122999194 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 122999370 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 122999538 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 122999544 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 122999713 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 123000063 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123000159 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 123000461 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 123000491 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123000509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123000718 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123001130 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 123001190 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 123001423 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123001517 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123001630 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 123002391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123002720 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 123002762 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 123002789 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 123002830 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 123002884 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123002889 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 123003409 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 123003556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123003660 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 123003967 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 123004023 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 123004151 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 123004232 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123004460 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 123004546 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123004896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123005448 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 123005459 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 123006017 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 123006035 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 123006093 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 123006195 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 123006604 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 123006633 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123006996 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 123007108 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123007518 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 123007944 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 123008351 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 3 123008492 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 3 123008498 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 123008601 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 123008602 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 123008624 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 123008636 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 123008730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123008742 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 123009136 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 123009141 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 123009258 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 123009339 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 123009587 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 123010256 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 123011243 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 123011938 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 123012542 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123012730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123012983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123013797 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123014346 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 123014662 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123016123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123016166 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 123016356 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 123016382 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 123016599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123016968 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 123017253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123017947 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 123018224 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 123018515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123018523 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 123018615 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 123018705 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 123018706 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 123018718 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 123018720 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 123018800 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 123018836 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123018888 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 123018925 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123019032 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 123019042 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 123019068 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 123019089 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 123019490 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 123019634 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 123019654 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 123019665 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 123019712 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 123019755 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 123019876 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 123019886 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 123019929 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 123020026 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 123020140 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 123020155 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 123020194 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 123020327 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 123020373 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 123020405 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 123020454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123020869 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 123020987 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 123021142 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 123021254 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123021261 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 123021301 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 123021321 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 123021332 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 123021407 G C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 123021433 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 3 123021646 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 123021980 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 123021981 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 123022125 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 123022127 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 123022266 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123022864 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 123022877 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123023244 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 123024878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123026345 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 123027443 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 123028061 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 123028218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123028229 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123028321 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 123029989 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 123032365 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 123032871 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 123033286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123033728 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123033731 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 123033793 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 123033831 C G Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 3 123033901 A T Y N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 3 123033932 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 123033969 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 123034269 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 123034397 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 123034696 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 123034760 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 123034885 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123034930 A C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 123034939 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123034942 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123034957 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 123035010 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123035019 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123035406 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 123035475 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123035536 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123037749 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 123037811 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 123037932 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 123038005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123038021 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 123038025 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 123038048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123038107 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123038131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123038300 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123038337 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123038566 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123038588 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 123038663 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 123038673 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 123038964 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 123038984 C T N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 3 123039042 C A N N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 3 123039164 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 123039260 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123039308 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123039543 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 123039568 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123039574 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123039596 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 123039649 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 123039745 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 123039770 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 123039849 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 123039928 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 123040009 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 123040054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123040128 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123040187 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 123040264 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 123040565 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123040707 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 123040870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123040924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123041287 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 123041291 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 123041300 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 123041324 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123041377 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123041759 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 123041945 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 123042062 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123042168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123042232 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123042264 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 123042268 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 123042302 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 123042339 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 123042376 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 123042472 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123042663 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123042870 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 123042911 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 123043094 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 123043100 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123043168 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123043372 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 123043438 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 123043575 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 123043595 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 123043669 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 123043740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123043881 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 123045438 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 123045457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123045545 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123045557 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123045747 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123046175 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 123046202 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 123046258 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123046408 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 123046444 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 123046634 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 123046849 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 123047299 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 123047507 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123047821 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 123048024 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 123048070 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 123050267 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 123050383 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123050667 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123053809 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 123053841 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 123054251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123054377 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123054498 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 123054518 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 123054627 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123055064 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 123055069 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 123055209 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123055518 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 123055803 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 123056316 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 123057150 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 123057797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123059014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123059547 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123059950 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 123060511 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 123060547 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 123061594 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 123063067 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123064454 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 123065077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123066811 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123067503 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123067822 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123068934 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 123069038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123069039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123069056 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 123069116 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 123069492 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123070856 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123071196 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123071626 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123072273 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 123072553 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 123073152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123073186 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 123073616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123073786 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123075219 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 3 123076154 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 123077047 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123077283 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123078689 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 123078734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123079431 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123079735 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 123079795 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 123080741 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 123080911 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 123081720 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 123081721 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 123081862 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 123081884 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 123082472 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123082848 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0555555555555556 0.722222222222222 0.222222222222222 15 21 1 13 4 3 123083271 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123083380 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123083904 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 123084162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123084469 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123084517 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 123084667 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 123084751 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 123084979 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 123085229 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123088740 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123088951 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123089024 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123089310 G A Y Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 3 123090277 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 123090368 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123090511 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 123090517 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123094289 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123094386 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 123094679 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123095455 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123095468 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123095827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123095923 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 123096225 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 123096286 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 123096329 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 123096369 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 123096396 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 123096572 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 123096594 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 123097912 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 123098034 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 123098051 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123098191 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 123100077 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123101540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123101950 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 123102001 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123102042 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123102068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123102102 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 123102158 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123102188 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123102213 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 123102247 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123102601 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123102640 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 123102720 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 123102761 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 123102900 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 123103705 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 123104538 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 123104701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123104723 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123105011 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 123105422 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 123105758 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123106108 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 123106141 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 123106239 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 123106844 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 123107016 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 123107164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123107165 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 123107288 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 123107611 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 123107773 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 123107789 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123107914 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 123107933 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123108602 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 123108632 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 123108663 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 123108777 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123108997 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 123109131 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 123109143 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 123109239 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123109269 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 123109443 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 123109508 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 123109629 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 123109731 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 123109896 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 123110091 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 123110117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123110145 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123110165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123110252 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 123110374 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123110513 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123110756 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 123110920 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 123111320 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 123111348 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 123111516 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 123111573 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 123111690 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123111706 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 123111761 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 123112835 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123113009 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 3 123115311 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 123115450 C T N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.153846153846154 0.0769230769230769 0.769230769230769 5 21 2 1 10 3 123115736 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123116087 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123116241 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 123116278 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 123116298 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 123116719 G T N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 123117269 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123118082 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123120802 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123120902 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 123120983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123122079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123122488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123124207 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123125264 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123125342 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123125949 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 123126219 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 3 123126426 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123126455 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123126487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123126492 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 123126613 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 123126692 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 123126943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123126944 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 123126956 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123126957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123127072 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 123127856 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 123127942 T G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 123127969 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123128068 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 123128163 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123128228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123128252 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 123128271 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 123128354 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123128554 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123128583 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123128656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123129206 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123129211 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123129223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123129477 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 123129494 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 123129594 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 123129636 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123129697 T G Y N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 123129782 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123129819 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 123129868 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123129886 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123129888 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123130103 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 123130162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123130292 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 123130371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123130570 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123133294 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123133314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123134249 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 123134936 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123135324 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123135921 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123140870 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123140883 C T Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 123141703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123142027 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123145185 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 123145600 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 123145784 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 123145829 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 123145842 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123145862 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 123145866 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123145998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123146005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123147120 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 123147132 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 123147143 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 123147146 C A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 123147241 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 123147273 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 123147281 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 123147286 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 123147502 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 123147584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123147785 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 123147849 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 123147979 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 123148473 G A Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 3 123148557 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 123148574 T G Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 123148619 G A Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 123148635 G A Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 123148637 G A Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 123148702 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 3 123148786 G A N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 123148799 A G N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 12 12 3 6 3 3 123148904 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 123148943 C G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 123149010 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 123149351 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 123149703 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123149721 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 123151515 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123152117 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123153269 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123153295 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123153334 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123153373 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 123153755 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 123154002 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 123154030 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 123154072 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 123154118 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 123154241 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 123155055 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 123155057 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 123155131 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 123155155 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 123155160 A C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 123155184 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 123155294 A G N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 3 123155795 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 123157712 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123157888 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123157923 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123157986 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 123157987 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 123158039 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123158215 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123158327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123158438 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123158573 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123158608 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 123158631 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123158649 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 123158652 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123158675 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123158860 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123158864 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 123158913 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123158915 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123159186 T A N N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0 1 0 8 8 0 8 0 3 123159322 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 123159490 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123159495 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123159540 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123159874 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 123160121 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123160171 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123160328 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 123160515 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123160525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123160538 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123160909 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 123160941 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123161375 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123161427 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 123161435 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 123161484 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 123161538 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 123161706 A T N N 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 10 14 2 6 4 3 123161935 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 123162380 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 123162632 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 123163014 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123163064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123163090 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 123163348 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 123163425 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 123163574 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 123163658 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123163769 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 123163820 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 123163968 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123164365 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 123164794 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 123164873 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 123165030 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 123165125 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123165129 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123165158 C T Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 123165289 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 123165322 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 123165592 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 123165632 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 123165700 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 123165762 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 123165775 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 123165785 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 123166272 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 123166361 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 123166590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123166599 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123167788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123168072 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 123168232 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123169071 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123169468 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 123169892 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123170336 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 123170435 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 123170622 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123171645 G A N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 123172323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123172511 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 123173088 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 123173356 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 123179280 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123180015 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123180149 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 123180179 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 123180434 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 123180477 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 123180538 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123180694 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123180973 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 123181269 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123181624 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123184954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123187177 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 123188471 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 123191348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123193497 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123194124 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123196799 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123197553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123198165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123198888 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123200359 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 123202794 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123202950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123204356 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 123204504 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123207446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123208954 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 123210097 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123210189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123210770 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 123210843 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123212132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123212176 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 123212446 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 123212481 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 123212953 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 123213074 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 123213346 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 123213415 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 123213699 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 123213882 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 123213908 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 123213971 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 123214096 T C N Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 6 6 1 4 1 3 123214452 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 123214489 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 123214517 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 123214525 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 123214537 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 123214635 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 123214655 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 123214694 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 123214799 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 123214814 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 123215693 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 123215970 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 123216298 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 123216368 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 123216376 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 123216399 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 123216432 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 123216496 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 123216558 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 123216815 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 123216889 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 123216915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123217189 G A Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 123217232 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 3 123217274 A C N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 123217309 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 123217388 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 123217502 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 123217768 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 123218104 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 123219301 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 123219343 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123219353 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 123219425 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 123219469 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 123219519 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 123219550 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 123219924 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 123219972 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 123220275 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 123220923 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 123221073 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 123221223 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 123221332 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 123221496 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 123221561 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 123221711 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 123221830 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 123221907 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 123222003 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 123222135 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 123222168 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123222932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123223792 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 123223859 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 123223870 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 123223885 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123223916 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 123223961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123224080 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 123224094 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 123224141 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 123224162 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123224239 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 123224375 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123224473 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 123224577 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 123224605 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 123224742 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123224928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123224939 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 123224969 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 123225038 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 123225059 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 123225329 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 123225494 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 123225500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123225510 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 123225536 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 123225560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123225774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123225785 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123225836 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 123225853 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 123226012 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123226026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123226036 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123226200 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123226229 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 123226278 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123226461 A C N N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.384615384615385 0.307692307692308 0.307692307692308 14 12 5 4 4 3 123226541 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 123226687 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 123226775 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 123226900 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123226929 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 123227015 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 123227429 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 123227548 T C N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 123227706 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 123227823 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 123228035 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 123228181 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 123228373 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 123228516 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 123228597 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 123228670 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 123228901 T A N N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 3 123229004 G T N N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 123229011 T C N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 123229344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123229377 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 123230926 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 123231039 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 123231112 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 123231522 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 123231593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123232362 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 123233864 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 123234215 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 123239264 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 123239849 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123240092 C G N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 123240678 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 123242037 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 123242534 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 123245953 T A N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 123246165 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 123247044 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 123247106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123247225 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123247544 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123250552 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 123250881 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 123250883 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123251517 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 123251714 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123252776 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 123253531 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 123253542 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 123253607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123253677 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123253748 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 123253820 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 123253890 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 123254911 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 123254968 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 123255050 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123255204 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 123255475 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 123255686 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 123255911 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 123256093 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 123256112 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 123257022 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 123257834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123257922 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 123258407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123258778 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123258869 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 123258970 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123259224 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123259463 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 123260155 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 123260236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123260292 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123260732 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 123261405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123261916 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123262331 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123263241 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123263244 C G N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 123263283 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 123263323 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 123263333 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 123263360 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 123263425 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 123263426 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 123263939 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 123263986 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 123264050 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 123264089 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 123264110 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 123264133 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 123264259 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 123264365 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 123264665 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 123265055 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 123265102 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 123265278 A C N N 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 3 123265890 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 123265900 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 123265951 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 123266292 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 123266326 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 123266427 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 123266483 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 123267354 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 123267401 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 123267458 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 123267553 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 123267734 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 123267774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123267822 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 123267877 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123267931 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 123267948 T G Y N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 123267972 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 123267997 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 123268081 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123268238 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123268457 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123268536 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123268575 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123268682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123268833 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123268897 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 123268901 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 123268941 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 123269091 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 123269571 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 123269684 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 123269687 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 123269737 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 123269806 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 123269813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123270073 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 123270160 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 123270188 A C N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 3 123270290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123270410 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 123270418 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 123270455 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 123270609 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 123270734 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 123271319 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 123271337 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 123271342 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 123271489 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 123271508 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 123271723 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 123272789 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 123272892 G A Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 123273243 A C Y N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 123273245 T C N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 123274543 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 3 123274547 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 3 123274766 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 123274813 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 123274856 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 123274870 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 123274892 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 123274907 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 123274968 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 123274994 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 123275020 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 123275100 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 123275172 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 123275402 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 123275500 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 123275839 G T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 123276083 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 123276306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123276551 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 123277189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123277526 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123277677 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 123277777 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 123278608 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123278749 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123278850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123278948 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123279143 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 123279726 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 123279727 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 123279771 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 123279814 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 123280189 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123280582 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 123282030 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 123282061 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 123282078 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 123282136 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 123282201 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123282202 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123282330 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 123283959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123284150 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 123285007 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 123286172 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 123287282 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 123287918 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 123288008 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 123288227 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123289476 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123290160 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123293677 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 123293785 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123294440 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 123296154 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123296187 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123296392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123296525 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123299985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123300298 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123301138 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123301865 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123302884 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 123302887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123302993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123303023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123303815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123304787 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 123304839 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 123310483 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123311380 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 123314796 T C Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 123316492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123318481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123321955 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123325124 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123328238 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123329609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123331364 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 3 123331410 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123333975 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123337153 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 123337315 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 123337798 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123341736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123345487 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123349584 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 123350703 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123356236 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 123356455 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123357536 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 123357631 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 123357760 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 123357848 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 123357995 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 123358017 C A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 123358076 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 123358082 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 123358173 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 123358174 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 123358190 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 123358224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123358296 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 123358365 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 123358378 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 123358521 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 123358532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123358602 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123358707 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 123358801 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 123358824 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 123358905 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 123359029 A G Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 123359132 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123359252 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 123359268 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 123359278 A C N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 123359392 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 123359405 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 123359465 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 123359554 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 123359691 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 123359758 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 123359789 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 123359890 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 123359894 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123360027 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 123360053 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123360099 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123360111 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 123360146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123360210 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 123360244 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123360330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123360367 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 123360441 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 123360571 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123360635 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123360780 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 123360796 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123360819 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123360829 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123361082 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 123361357 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 123361374 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 123361653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123363456 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 123364506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123364719 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 123367751 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123367762 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 123368863 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 123369001 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 123369314 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123372244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123372948 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 123373233 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 123375097 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 123377104 A T N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 123377144 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 123377404 G A N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 3 123377468 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 123377536 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 123377592 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123378045 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123378713 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123384221 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123384316 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123384700 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 123384951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123386268 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123387760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123389196 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 123390668 T G Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 123390935 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123391304 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123391841 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123393214 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123393344 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123393740 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 123394605 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 123394635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123394815 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 123394857 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123395478 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 123395523 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123395639 A T N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 123396944 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123397736 G A Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 3 123398207 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123399016 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123399053 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 123399136 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 123399189 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 123399214 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123399751 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123400086 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123400199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123400320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123400806 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123401870 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 123402318 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 123402425 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123402737 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123403414 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 123406372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123406386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123407497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123407886 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 123408425 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123409546 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123412658 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 123412800 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 123413101 T A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 123413261 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 123413392 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123413414 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123413528 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123413985 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 123414160 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 123414379 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 123414426 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123414562 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 123415925 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123416288 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123416512 G T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 123417337 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 123418673 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123421161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123421366 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123423906 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123424256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123427458 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123428247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123428800 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 123430172 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123438684 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 123439276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123439357 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123439988 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123446584 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123447438 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123447964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123451941 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 123453222 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123454042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123454890 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123455742 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123456418 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123457910 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123458532 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123458625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123461621 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 123461828 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123462674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123462758 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123464365 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 123464589 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 123464636 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 123464732 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 123464785 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 123464822 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 123464849 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 123464911 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 123464998 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 123465019 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 123465026 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 123465092 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 123465252 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 123465515 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123465752 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123465772 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 123466220 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 123466316 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 123466709 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 123466900 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 123467005 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 123467201 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 123467212 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 123467230 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 123467246 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 123467330 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 123467373 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 123467410 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 123467501 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 123467508 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 123467593 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 123467693 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 123468093 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 123468177 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 123468325 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 123468782 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123468819 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123469817 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123472952 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123473368 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123473975 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123476545 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123481220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123482613 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123484992 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123485262 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123485698 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123485759 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123486567 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 123487979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123489561 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 123491639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123494041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123495332 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123495996 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 123497471 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 123498589 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123499691 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 123499796 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 123500299 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123500609 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123501095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123501978 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 3 123502015 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 123502154 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 123502156 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 123502320 A C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 3 123502758 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 123502787 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 123503073 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 123503129 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123503149 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 123503218 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 123503302 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 123503304 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 123503509 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 123503760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123503888 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 123503964 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 123504063 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 123504149 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 123504165 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 123504192 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 123504214 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 123504510 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 123504580 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 123504724 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 123504777 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123505010 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 123505022 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 123505175 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 123505190 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 123505330 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 123505499 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123505923 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123506525 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 123506531 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123506918 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123507311 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123507425 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123507844 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 123507882 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123507946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123507947 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 123508165 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 123508166 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 123508279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123508452 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 123508468 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 123508503 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 123508504 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 123508624 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123509000 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 123509107 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123509610 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 123509958 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 123510158 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 123510162 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 123510540 T C N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 123510675 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 123510721 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 123511254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123511479 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 123511650 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 123512199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123512677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123513035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123513563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123514438 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 123514626 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123514963 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 123515030 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123515589 A G N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 123515713 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123516129 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123516280 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 123516287 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 123516491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123516987 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123517201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123517422 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 123517648 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 123517687 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 123517859 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123517903 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123518253 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 123518477 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 123518492 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 123518628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123518630 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123518837 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123518870 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 123518969 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123519121 A T Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 123519187 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 123519323 A C Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 123519485 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123519922 A C Y N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 123526977 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 123527029 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123527045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123527334 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 123527341 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 123527383 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 123527402 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123527413 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 123527422 A G Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 123527545 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123527563 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123527674 C A N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 123527863 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123527909 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123527921 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123527989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123528151 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123528465 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 123528499 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 123529674 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 123530100 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 123530469 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123530529 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123530544 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 123530937 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123530959 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123531134 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 123531218 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123531359 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 123531367 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 123531402 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123531727 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 123531834 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 123531890 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 123531911 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 123531937 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123532110 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123532284 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123532437 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123532438 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123532501 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 123532548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123534263 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123534562 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123537248 C A Y N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 123539160 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 123539904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123539905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123540145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123541087 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 123541206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123542685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123543078 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123543148 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123543178 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123544265 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123545469 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123546192 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 123547239 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 123552225 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 123552663 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 123559103 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123559170 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 123559486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123559612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123560379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123561278 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 123564399 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123564425 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123564450 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123565390 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 123565426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123565548 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123565929 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 123565944 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 123566009 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 123566307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123566458 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 123567672 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123567706 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123568095 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 3 123569481 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123569572 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123570266 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 123572167 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123576998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123588458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123590101 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123590431 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 123591494 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123591696 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123592013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123592366 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123594504 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123594831 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123599551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123602094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123604622 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123605984 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123613243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123613285 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123613504 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123613767 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123620191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123620831 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123621406 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123623053 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123623116 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 123623200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123623327 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123623475 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123623527 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123623545 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 123623798 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 123623829 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123623862 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123624125 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 123624410 A C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 123624675 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 123624759 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 123624822 T C N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0 0.75 0.25 9 15 0 9 3 3 123624823 G T N N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0 0.7 0.3 7 13 0 7 3 3 123624974 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123625011 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 123625024 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 123625178 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123625321 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123625338 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123625392 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123625423 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123625427 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 123625439 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123625499 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 123625600 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123625615 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123625649 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 123625684 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123625744 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123626150 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 123626201 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 123626203 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 123626239 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 123626553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123626562 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123626710 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123626807 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 123626945 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123626979 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 123627470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123640875 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123641346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123641409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123641699 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 123641847 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123641858 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 123641906 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 123641965 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123642024 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123642065 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 123642128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123642251 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123642307 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 123642336 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 123642505 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123642540 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 123643015 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 123643048 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 123643123 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 123643677 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 123643685 C A N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 123643721 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 123643742 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 123643974 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 123643987 T A N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 123644031 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 3 123647436 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 123648287 C G Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 123648331 G C Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 123648339 T A Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 123649213 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 123650836 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 123650879 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 123650883 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 123650919 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 123650929 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 123651164 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123651172 A G N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 123651194 C G N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 123651258 C G N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 123651284 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 123651317 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 123651326 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123651634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123651640 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 123651690 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 123651701 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 123651893 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 123652372 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 123652470 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123652545 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 123652676 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 123652740 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123653167 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123653403 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123656388 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123657644 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123658084 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 123658155 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 123658167 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123658241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123658278 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123658383 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123658415 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 123658419 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 123658462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123658495 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123658662 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 123658708 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 123658969 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123659010 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123659032 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123659108 C G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 123659289 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123659365 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123659405 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 123659765 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 123660724 T G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 123661148 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123661160 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123661344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123661415 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123661426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123661910 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 123662043 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123662216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123662806 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 123662904 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123662920 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123663250 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123663317 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123663564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123663659 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123663707 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 123663746 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123663934 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 123663939 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 123664127 G A Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 123664738 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123664746 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 123664884 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 123665171 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123665265 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123665493 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123665824 T G Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 123665881 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123665884 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123666106 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 123666201 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123666521 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123666612 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 123666848 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 123667069 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 123667166 A G Y Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 123667413 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 123668355 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123668402 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123668480 A T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 123668544 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 123668545 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 123668565 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 123668605 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123669147 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 123669359 G A N Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 3 123669560 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 123669604 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 123669623 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123669661 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 123669711 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123669780 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123669832 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 123669918 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123670168 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123670205 C A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 123670219 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 123670225 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 123670237 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123670291 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123670305 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 123670308 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123670493 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 123670737 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123670789 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123670885 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123670886 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123670920 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 123670972 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 123671007 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 123671025 C T N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0 0.636363636363636 0.363636363636364 7 15 0 7 4 3 123671264 T C Y Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0 0.818181818181818 0.181818181818182 9 13 0 9 2 3 123671272 T C Y Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 3 123671281 G A Y Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0 0.8 0.2 8 12 0 8 2 3 123671358 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 123671570 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123671742 G A Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 123671958 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 123672040 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 123672048 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 123672172 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123672230 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123672238 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123672247 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123672255 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123672267 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123672287 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123672322 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123672336 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123672338 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123672364 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 123672378 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123672400 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 123672401 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123672650 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123672746 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 123673016 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 123673107 C T N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 123673113 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 123673153 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123673242 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 123673282 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 123673353 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 123673504 G A Y Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0 0.7 0.3 7 13 0 7 3 3 123673543 G C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 123673669 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 123673906 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 123673919 C A N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 123674037 C T N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 3 123674142 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 123674225 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123674384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123674459 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123674731 G C Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 123674835 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123675028 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123675223 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 123675338 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 123675344 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 123675464 T G N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 123675482 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 123675740 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 123675887 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 123675890 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 123675964 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 123675974 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 123676129 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 123676242 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 123676392 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123676737 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123677972 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123678256 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 123678331 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 123678378 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 123678669 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123678702 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 123679067 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 123679253 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 123679471 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 123679975 G C N N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 3 123680395 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123680489 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 123680986 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 123682420 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123682427 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123682713 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123682836 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 123683012 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123683208 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123683239 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123683295 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123683296 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123683338 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123683351 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123683354 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123683733 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123684105 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123684150 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123684214 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123684232 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 123684608 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123684700 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123685191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123687868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123689145 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 123689657 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123689978 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123691615 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 123695597 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123695913 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123696881 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123698464 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123698586 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123699360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123699403 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123699898 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123699982 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123699989 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 123700310 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 123700420 G T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 123700458 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123701272 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123701328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123701402 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 123701769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123702031 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123702414 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123702476 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123702559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123703794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123703983 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123704547 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123704969 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123705521 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123706397 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123708490 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123708626 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123709666 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 123710859 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 123711792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123711877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123713428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123713450 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 123713468 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 123713482 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123715348 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123715806 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123716118 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123716137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123716175 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123716254 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123716270 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123716300 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123716316 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123716597 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 123716648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123716652 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123716836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123716872 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123717827 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123717999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123718048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123718325 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123718559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123718615 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123718812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123718952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123719454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123719552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123719821 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123719833 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123719901 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123720121 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 123720654 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123720661 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123720690 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123720691 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123720761 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123720913 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123720921 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123720965 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123720988 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123721001 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123721106 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123721107 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123721224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123721262 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123721558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123721593 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123721646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123721651 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123721675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123721874 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123721895 A T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 123721958 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123722166 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123722181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123722236 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 123722419 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 123722518 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 123722591 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123722700 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 123722723 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123722806 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123722882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123722889 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123722910 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123722915 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123722966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123723033 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123723098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123723117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123723130 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123723174 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123723228 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123723411 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123723418 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123723532 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123723940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123724318 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123724368 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123724384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123724400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123724673 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123725022 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123725996 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123728759 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123729699 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 123731337 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 123731465 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123731561 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123731616 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 123731734 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 123731784 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 123731891 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 123732068 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123732360 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 123732730 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 3 123732944 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 3 123733520 T C N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 123733522 C T N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.230769230769231 0.769230769230769 0 16 10 3 10 0 3 123733664 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123733730 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123733908 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 123733919 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123734087 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 123734088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123734354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123734441 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123734474 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123734508 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123734896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123735113 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123735127 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123748789 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 123748860 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123748876 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123748903 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123749019 A G Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 123749154 A G Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 123749174 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 123749175 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123749406 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 123749519 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123749528 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 123749627 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 123750418 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123751132 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123751249 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123751252 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123751466 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123751535 G C N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 3 123751551 C G N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 3 123751590 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123752067 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123752185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123752496 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123752617 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123752777 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 123752948 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123752999 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123753318 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123753400 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123753401 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123753411 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123753483 T A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 123753563 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 123753596 G C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 123753743 C G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 123754030 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 123754124 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 123754804 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 123754869 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123754878 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123755052 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123755145 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123755185 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123757999 G A N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 3 123760285 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 123761418 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 123761879 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 123761936 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 123762570 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 123765875 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123770103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123776958 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123782764 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123784256 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123788535 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 123793600 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 123794117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123799854 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123804000 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 123807576 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123807856 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123809394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123809785 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123809990 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 123810675 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123810807 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123811372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123811524 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123811526 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123811910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123811931 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123812962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123813065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123813475 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123813560 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123814793 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 123816746 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123818052 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123818131 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123820471 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123821841 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123822260 A T N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 123823104 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123824106 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123825987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123826166 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123826294 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123826307 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123826579 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 123826818 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123826897 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123827180 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123827186 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123827362 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123827375 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123827376 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123827425 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123827454 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123827458 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123827793 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 123827804 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123827807 T C N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 3 123829358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123829360 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123829425 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123829551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123830492 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123830541 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123830556 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123830822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123830974 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123831145 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 123831241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123831794 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123832423 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123832736 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123832749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123832937 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123833426 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 123833460 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 123833626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123835408 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123835752 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 123836038 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 123836310 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 123836376 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 123836559 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 123836669 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 123836679 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123836680 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123837769 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 123837951 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 123838450 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 123838459 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 123838496 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 123838502 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 123838520 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 123838548 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 123838563 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 123838599 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 123838659 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 123838734 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 123838742 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 123838846 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 123838875 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 123838921 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 123838924 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 123839125 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123839280 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 123839704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123839727 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123840092 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 123840141 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 123840275 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 123840340 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 123840657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123840708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123840719 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 123840737 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 123840778 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 123840795 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 123840810 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 123840835 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 123840853 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 123840950 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 123840953 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 123841113 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 123841149 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 123841213 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 123841238 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 123841244 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123841253 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 123841312 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 123841359 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 123841375 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 123841879 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 123842031 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 123842432 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 123843057 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 123843119 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 123843182 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 123843315 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123843388 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 123843471 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 123843476 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 123843498 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123843521 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 123843535 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 123843541 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 123843553 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 123843654 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 123843799 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123843827 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 123843905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123843983 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123844143 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 123844149 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 123844184 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 123844257 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 123844285 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 123844393 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 123844521 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 123844657 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 123844723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123844731 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123846706 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123847870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123848249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123848274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123849007 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123850337 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123850639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123850853 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 123852143 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123853027 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123854659 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123854839 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123858871 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 123860666 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123861684 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123861782 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123862719 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123862892 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123869743 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123869852 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 123871314 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123871857 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123872591 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123872904 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123873323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123874023 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123875967 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123876446 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123878753 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 123879146 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 123879501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123880099 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 123880195 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123880250 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 123880341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123880823 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123880904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123881054 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123881242 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123882497 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123883115 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 123883306 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 123884622 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123886104 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123886882 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123887047 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 123887465 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123887533 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123888979 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123888999 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 123889387 A T Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 123889859 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123890110 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123890720 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123890876 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123891416 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123891708 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 7 5 1 5 0 3 123892518 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 123893458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123893636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123893658 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123894173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123894548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123894872 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123895147 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123896549 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 123905185 G T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 123905375 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 123905725 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 123905841 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123911216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123911865 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 123912276 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123912698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123912858 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123913168 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123914085 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 123914303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123914624 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 123914635 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 123915007 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123915140 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123916231 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 123916457 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 123916460 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 123917361 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123917416 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 123917672 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 123918253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123919903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123920505 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 123920510 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 123920643 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 123921122 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123922111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123922180 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123922756 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 123922782 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 123923202 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123923203 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123923725 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123924288 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 123924709 A G N Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 123924864 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 123925270 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123925429 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 123925610 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123925670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123925686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123926291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123927723 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 123929079 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123929151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123930364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123932344 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 123932491 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 123934052 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 123935243 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 123935382 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 123936984 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 123937959 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 123938034 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123938078 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 123939077 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123939650 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123939898 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 123947591 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123948958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123949559 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123951507 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123953357 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 123957195 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 123958551 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123960061 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 123961552 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123977180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 123980380 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 123991452 T C Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 3 123991727 T C Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 3 123991842 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 124018009 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124019772 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124021198 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124021835 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 124022594 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124028346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124028362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124029165 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124029369 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 124029452 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124029798 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124029823 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 124030015 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124030109 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 124030254 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124031789 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 124032357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124032418 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 124033808 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124035367 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 124036502 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124037104 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124037826 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124038976 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124039746 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124040153 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124040718 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124040908 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 124041774 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124042474 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124043518 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124044141 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124044329 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124044537 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 124044790 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124048057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124048219 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124048361 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 124048829 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124049071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124050188 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 124050360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124052949 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124053079 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124053361 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124053398 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124053453 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 124053705 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 124054338 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124054587 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124054955 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 124055011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124055030 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 124055064 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 124055076 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 124055209 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 124055238 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124055825 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124056046 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124056629 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124056753 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124056754 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124056837 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124057354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124057497 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124057545 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 124057590 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 124057805 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124057869 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124057870 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 124058072 C A N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 124058168 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 124058425 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 124058683 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124058888 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 124058907 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124059180 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124059205 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 124059368 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124059437 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124059541 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 124059706 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 124059750 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 124060053 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 124060082 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 124060307 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124061557 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 124061563 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 124061585 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 124061607 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 124061608 T C N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 124065716 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124067708 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124068669 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124069740 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124071260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124071467 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124072601 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124073965 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124075093 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124077797 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124077937 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124078509 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124078603 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124079427 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124080597 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 124081351 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124083269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124084513 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124084515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124084634 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124085107 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124085190 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124085400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124086089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124090183 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124090335 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124092401 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124092610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124095270 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124096904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124098588 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124098880 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124099138 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124101264 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 124102446 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 124104776 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124105110 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124105483 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124106561 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124106578 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124106635 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124107088 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 124107094 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 124107100 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 124107106 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 124107112 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 124110782 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124110923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124111289 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124111837 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 124113547 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124114243 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124114289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124114754 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124115993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124116068 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124116348 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124117591 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 124117791 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124118176 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 124120495 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 124121361 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 124121929 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124121946 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124122099 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124122308 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 124122457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124122760 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 124123067 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 124123344 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124123456 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 124123643 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124124239 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 124124309 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 124124348 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 124124413 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 124124416 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 124124769 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 124124890 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124124898 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 124124999 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 124125050 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 124125056 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 124125114 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 124125209 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 124125260 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 124125317 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 124125328 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 124125402 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124125435 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124125440 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124125564 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124125583 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 124125585 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 124125596 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124125920 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124125930 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124126106 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124126122 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124126189 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 124126223 T G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 124126229 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124126276 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124126420 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124126430 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 124126450 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124126462 G A N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 124126526 A T N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 124126565 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 124126607 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124126612 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124126755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124126782 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124126912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124126933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124127131 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124127188 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 124127438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124127737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124128009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124128021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124128504 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 124128534 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124128614 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 124128640 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124128658 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124128876 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 124128969 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 124129008 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 124129701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124129724 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124129852 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124129878 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 124129891 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 124130037 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124130082 T G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 124130164 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 124130202 C T Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 124130221 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 124130439 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124130505 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124130580 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 124130719 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 124130813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124130830 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124130836 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124130889 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124130916 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 124130943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124130971 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124131010 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124131036 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124131055 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124131095 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124131268 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 124131322 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 124131434 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 124131455 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 124131537 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 124131612 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124131677 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 124131696 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 124131763 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124131767 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124131954 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124132071 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124132235 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 124132343 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 124132385 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124132488 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 124132490 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 124132523 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 124132526 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 124132640 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 124132663 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 124132769 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124133127 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124133228 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124133827 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124133928 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124134035 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124134054 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 124134073 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124134090 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124134126 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124134133 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124134142 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 124134147 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124134155 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124134413 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 124134451 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 124134467 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124134529 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 124134567 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124134600 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 124134781 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 124134804 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 124134815 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124134864 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 124134954 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 124134983 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 124135031 A G Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 124135118 T G Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 124135251 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 124135280 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 124135310 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 124135311 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 124135367 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 124135480 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 124135526 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 124135646 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 124135693 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 124135720 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 124135840 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124135929 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 124136237 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124136395 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124136463 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 124136700 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 124136701 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 124136976 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 124137108 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 124137110 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 124137300 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 124137409 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 124137790 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124137932 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124137993 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124138117 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124138175 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 124138326 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124138345 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 124138532 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 124138705 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124138948 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 124138964 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 124138976 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 124138981 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 124139071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124139261 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 124139284 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 124139528 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 124139575 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124139879 C T N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 124139912 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 124140046 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 124140328 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124140553 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124140694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124140790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124140817 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124140845 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124140896 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124141084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124141282 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 124141370 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124141408 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124141468 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 124141718 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 124141788 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124141796 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124141923 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 124141969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124142087 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 124142134 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124142168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124142416 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124142437 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 124142491 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 124142657 G A N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 124142761 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 124143076 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124143101 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 124143220 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 124143296 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 124143305 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 124143391 A G N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 124143538 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 124143654 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 124143755 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 124143788 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124144000 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 124144011 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 124144121 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124144157 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 124144198 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 124144723 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 124144798 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 124144815 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 124144976 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 124145146 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 124145534 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 124146807 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 124146902 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124147932 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 124148169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124148647 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 124149191 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124149275 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124150591 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124151012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124151095 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124151099 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 124151146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124151232 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 124152918 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 124152999 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124153499 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 124154386 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124154491 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124154717 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124155401 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 124155455 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124155582 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124155814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124156182 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 124156651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124156672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124158029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124158171 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124158968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124159241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124159342 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 124159486 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124159501 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 124159861 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124160056 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124160087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124160241 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124160382 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124160577 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124160645 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124161179 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124161183 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124161334 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 124161403 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124161466 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 124161479 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124161483 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 124161516 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 124161591 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124161691 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124161699 A C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 124161718 C A N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 124161747 T A N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 124162170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124162496 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124162819 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124162865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124162919 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 124163011 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124163040 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124163163 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 124163165 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124163196 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 124163300 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 124163336 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124163571 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124163668 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124163755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124163843 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 124163924 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124163946 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 124163951 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124164151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124164164 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 124164300 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124164403 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124164504 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 124164515 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 124164535 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 124164556 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 124164649 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 124164752 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 124164874 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 124164960 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 124165027 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 124165089 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 124165449 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 124165758 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 124166050 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 124166100 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 124166108 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 124166146 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 124166181 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124166199 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 124166228 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 124166240 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 124166259 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 124168191 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 124168869 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124168907 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 124170825 G C Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 124171384 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 124172004 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124172874 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 124174126 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124175009 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 124175889 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124175911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124177839 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124178116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124179870 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124180174 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124180289 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 124182410 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 124182426 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124186699 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124186746 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124187679 T C Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 124187770 T G Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 124187942 A T Y N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 124189900 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124189972 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 124190887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124191457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124191805 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 124193390 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 124193750 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124194525 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124195021 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124196345 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124196427 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124197009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124197779 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124198209 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124198816 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 124199304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124199725 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124200127 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 124200520 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 124201388 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 124201965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124202892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124203871 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 124205429 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124205504 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 124207213 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 124207284 A G Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 14 18 0 14 2 3 124212095 G A Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 124214783 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124215012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124220356 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 124221528 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124222175 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124223666 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124223902 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124225160 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124227348 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 124227638 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 124227918 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 124228438 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124229857 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124230043 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124232260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124232705 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124233523 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124235040 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124235290 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124236657 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 124237017 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124237721 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124238985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124239134 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124239462 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124240091 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 124240385 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 124240763 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124241723 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 124242541 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124242755 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124243464 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 124247967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124251074 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124251393 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124251432 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124252398 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 124252472 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 124252679 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124252974 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124253049 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124253082 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124253636 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124253663 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124254435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124254515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124255629 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124256899 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124257399 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124257437 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124258192 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124258237 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124260219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124262080 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 124262286 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 124262581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124263059 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124263216 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124265345 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124265489 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 124266869 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124267327 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124268243 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124268536 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124268869 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124268933 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124269250 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124269448 T A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 124269455 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124271146 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 124272093 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124272280 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124272369 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124272732 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124272944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124273041 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124273101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124275156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124275694 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124276498 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 124276708 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124276838 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124277356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124277688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124278839 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124279653 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124281596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124283083 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124283608 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124286872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124287228 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124287812 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124287956 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124291476 G C Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 3 124291929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124292096 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124293112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124293191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124294280 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124294998 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124296012 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124296049 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124297744 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124297971 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124298308 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 124298883 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124299319 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 124300065 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124302157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124302974 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 3 124303367 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124303453 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124303478 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 124303738 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 124303768 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 124303858 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 124303896 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 124303967 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 124303980 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 124304121 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124304145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124304273 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 124304415 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 124304458 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 124304476 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 124304478 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 124304512 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 124304591 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 124304838 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124304839 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124304869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124304901 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124304991 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124305019 A T N N 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.25 0.333333333333333 0.416666666666667 10 14 3 4 5 3 124305031 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 124305314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124305605 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124306136 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124306371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124307171 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124307379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124307403 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 124307449 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124307992 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124308113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124308219 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 124308403 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124308458 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 124309056 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124309680 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 124310160 T G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 124310208 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 124310284 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 124310305 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124310406 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124310648 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124310684 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124310814 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124311512 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 124311819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124311991 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 124312014 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 124312026 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 124312040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124312206 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 124312317 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124312383 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 124312855 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124313152 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124313159 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124313231 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 124313465 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 124313522 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 124313638 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124313869 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 124314116 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124314500 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 124314651 C A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 124314713 C A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 124314879 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 124315069 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124315112 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124315308 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 124315359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124315525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124315597 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 124315732 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 124315779 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124315823 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124316108 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 124316227 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 124316427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124316693 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 124316713 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 124317063 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124317307 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124317436 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124317809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124318108 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124318260 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124318277 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 124318366 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124318379 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124318406 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124318437 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124319640 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 124319774 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124320754 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124321313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124323138 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124325600 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 124327523 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124330408 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124330508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124330582 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 124331078 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 124331301 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 124331350 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 124331380 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 124331537 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 124331569 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124331644 C G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 124331745 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 124331917 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124332007 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124332108 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 124332209 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124332474 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124332512 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 124332544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124332963 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124333396 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124333810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124333841 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124333955 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124334494 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124335138 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 124335702 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124336028 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 124336345 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 124336408 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 124336438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124336470 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 124336506 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 124336528 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 124336557 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 124336568 A C N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.466666666666667 0.2 0.333333333333333 17 13 7 3 5 3 124336593 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124336615 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 14 10 6 2 4 3 124336643 T G N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 3 124336914 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 124337174 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 124337377 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124337465 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124337661 T C N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 3 124337786 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 124337806 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124337827 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 124338022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124338160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124338212 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124338226 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 124338271 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 124338290 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 124338305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124338444 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124338460 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124338824 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 124338868 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 124338885 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 3 124338923 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 124339044 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 124339226 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 124339330 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124339592 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 124340183 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 124340424 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 124340529 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 124340534 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124341029 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 124341054 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 124341178 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 124341228 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124341358 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 124341492 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124341970 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 124342135 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 124342163 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124342222 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124342261 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 124342488 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 124342526 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 124342569 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 124342819 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 124342951 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 124343006 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 124343119 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124343172 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 124343190 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 124343289 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 124343324 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 124343395 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 124343423 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124343486 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 124343517 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124343522 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124343676 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124343822 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124343849 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 124343985 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 124344186 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 124344198 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124344202 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124344285 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124344339 G A N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 124344369 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124344422 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.0588235294117647 0.764705882352941 0.176470588235294 15 19 1 13 3 3 124344423 A C N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.266666666666667 0.666666666666667 0.0666666666666667 18 12 4 10 1 3 124344551 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 124344674 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124344768 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 124344868 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124344893 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 124344899 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 124344968 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124344969 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124344995 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 124345007 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124345025 T G N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 124345041 A T N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 124345054 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 124345191 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 124345431 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 3 124345433 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 3 124345487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124345543 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124345646 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124345651 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 124345792 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 124345809 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124346107 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124346368 A C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 3 124346496 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124349315 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 124351155 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 124351166 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124355262 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 124355300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124355345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124355636 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124355904 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124356310 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124356360 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124357549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124358206 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124358678 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124359253 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 124359928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124360236 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124360507 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124360790 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124361193 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124362304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124362548 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124362740 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124363404 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 124363741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124364017 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124364371 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124364384 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124365339 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124365962 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124366652 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124366892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124366917 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124368326 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 124368707 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124368838 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124370219 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 124370771 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 124370800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124370954 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124370968 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124370989 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 124371031 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 124371038 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 124371110 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124371173 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 124371213 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 124371234 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 124371257 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 124371264 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124371317 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 124371401 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 124371468 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 124371553 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 124371578 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 124371607 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124371627 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 124371643 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 124371810 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 124371852 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 124371869 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 124371883 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 124371961 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 124371982 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 124372047 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 124372049 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 124372217 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 124372350 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 124372356 A C N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 124372419 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124372571 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124372589 A T N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 124372610 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 124372625 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 124372628 G T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 124372690 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124372741 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 124372806 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 124372816 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 124372823 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 124372856 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 124372942 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 124372990 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 124373039 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 124373165 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 124373172 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 124373229 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 124373239 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 124373387 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 124373469 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 124373644 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 124373710 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 124373747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124373769 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 124373939 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 124373940 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 124373950 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124374052 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 124374186 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 124374242 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 124374248 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 124374266 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124374474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124375105 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 124375224 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124375394 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124375407 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 124376086 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 124376126 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124376150 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124376191 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124376223 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 124376344 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124376513 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 124377581 C A Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 124378170 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124378304 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124378361 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124378381 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124378407 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124378432 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124378469 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124378511 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124378699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124379123 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124379853 C T N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 3 124379899 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 124379992 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 124379998 G T N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 124380123 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 124380205 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 124380214 C T N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 124380416 A T N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 124380469 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 124380579 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 124380593 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 124380671 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 124380693 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 124380745 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124380773 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 124380842 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 124384222 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 124384276 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124384458 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124384794 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 124384802 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 124384863 C G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 124384976 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 124385001 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124385279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124385304 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 124385352 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 124385418 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 124385477 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 124385595 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 124385619 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 124385705 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 124385779 G A N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 124385843 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 124386110 C T N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 124386184 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 124386380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124386444 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 124386463 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 124386543 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 124386544 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 124386565 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 124386614 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 124386625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124386657 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124386703 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 124386705 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124386725 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 124386756 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124386778 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124386787 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124386925 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 124386955 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124387020 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 124387029 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 124387048 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 124387071 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124387192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124387260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124387298 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124387434 T A N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 124387435 T A N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 124387907 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124387942 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124388235 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124388305 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124388333 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124388796 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124388859 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124389094 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124389373 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124389427 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124389762 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124389906 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124390079 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124390211 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124390849 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124390958 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124391436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124391465 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124391494 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124391505 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124391547 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124391588 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124391705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124391789 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124391826 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124391880 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124391884 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 124391903 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124392188 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124392231 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124392424 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124392436 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124392646 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 124392670 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124392729 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124392740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124392782 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124392808 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124392812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124392847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124392880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124393037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124393058 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124393064 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124393285 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124393297 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124393342 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124393346 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124393371 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124393388 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124393473 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124393484 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124393581 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124393615 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124393672 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124393714 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124393756 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124393971 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 124393973 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 124394003 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124394040 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 124394051 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 124394075 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124394192 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 124394226 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 124394284 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124394683 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124394689 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124395117 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 124395134 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 124395166 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 124395427 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 124395465 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 124396395 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 124396663 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 124397258 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 124397900 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 124397923 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124398505 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124398721 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 124398854 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 124398998 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 124399312 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124399342 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124399943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124400127 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124400153 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124401043 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 124401435 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 124401768 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 124401866 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 124401926 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 124402132 A T N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 3 124402174 A T N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 124402233 T G N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 3 124402367 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 124402515 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 124402581 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 124402717 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 124403437 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 124403655 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 124403673 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 124403987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124404020 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 124404209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124404571 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124404669 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124404895 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124405824 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 124405875 T C N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.153846153846154 0.538461538461538 0.307692307692308 11 15 2 7 4 3 124405912 A T N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 3 124406078 A C N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 124406092 A T N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 124406104 A T N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 3 124406476 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 124406801 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124406881 A C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 124406901 T G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 124406905 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 124406953 A T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 124406979 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 124406994 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 124407022 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124407040 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 124407082 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 124407275 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 124407454 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124408458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124408717 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124409111 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 124409308 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 124410043 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124410109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124410154 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124410180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124410181 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124410267 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124410497 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124410595 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124410725 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124410845 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124411589 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124411594 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124411618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124411652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124411982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124412036 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 124412075 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124412125 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 124412148 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124412186 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124412409 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 124412776 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 124412999 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124413041 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124413099 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124413177 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124413320 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 124413459 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124413603 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124413753 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 124413880 C A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 124413883 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 124414036 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 124414576 A C Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 124414834 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124414846 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 124415159 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 124415176 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124415436 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124415756 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 124416010 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 124416087 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 124416124 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 124416157 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124416166 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 3 124416183 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 124416371 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 124416406 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 124416915 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 124416972 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 124417195 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 124417225 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 124417260 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 124417278 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124417352 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 124417364 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 124417402 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 124417508 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 124417532 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 124417553 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 124417584 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 124417598 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 124417645 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 124417790 A C Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 124417794 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 124417914 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 124418038 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 124418065 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 124418130 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 124418308 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 124418321 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124418338 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 124418378 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124418392 C G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 124418431 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 124418479 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 124418484 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 124418520 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 124418521 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 124419109 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 124419124 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 124419155 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 124419166 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 124419169 T A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 124419405 T G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 124419417 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 124419538 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 124419597 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 124419619 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 124419673 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 124419697 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 124419826 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 124419831 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124419858 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 124419865 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 124419880 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 124420013 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124420042 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 124420045 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 124420145 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 124420173 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 124420179 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 124420252 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 124420411 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 124420419 G C Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 124420426 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 124420431 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 124420450 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 124420534 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 124420565 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 124420659 A G Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 124420699 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 124420701 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 124420747 G T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 124420793 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 124420805 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 124420864 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 124420881 T G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 124420894 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 124420896 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 124421013 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 124421014 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 124421049 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 124421119 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 124421180 T C Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 124421191 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 124421210 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 124421252 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 124421558 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 124421568 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 124421569 C G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 124421670 A T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 124421685 A T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 124421784 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 124421786 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 124421896 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 124422032 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 124422037 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 124422048 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 124422139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124422189 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124422565 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 124422655 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124422810 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 124422941 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 124423045 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 124424486 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 124424789 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 124424833 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 124425081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124425136 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 124425196 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124425216 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124425243 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 124425244 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 124425452 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124425659 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124425723 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 124425874 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 124426047 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 124426081 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124426120 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 124426147 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 124426161 T A N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 124426168 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 124426182 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 124426266 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124426393 T A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 124426433 A C Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 124426441 G A N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 3 124426543 G A Y Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 0.0909090909090909 13 9 3 7 1 3 124426626 A C N N 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 8 10 2 4 3 3 124426740 T G Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 124426823 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 124426962 C A N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 3 124427162 A C N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 3 124427215 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124427272 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 124427296 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 124427359 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 124427570 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 124427580 A C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 124427628 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 124427658 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 124427852 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 124428217 T C Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 124428273 A C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 124428458 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 124428786 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 124428794 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 124428924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124429040 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 124429188 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124429406 C G N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 124429552 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 124429686 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124429733 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 124430193 C G Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 124430980 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124431485 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124432742 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124432908 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124433749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124434125 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124434209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124434845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124435263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124435361 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124435388 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 3 124435673 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124435785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124436091 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124436200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124436884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124437578 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124439235 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 124439362 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 124439653 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 3 124440844 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 124441778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124444188 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124445148 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 124445663 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124446121 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124447226 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124447579 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124450587 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124450760 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124451262 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124451343 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 124453392 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124454989 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 124456414 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 124456818 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124456939 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124456978 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 124457048 A T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 124458563 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124459572 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124460398 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 124461066 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124461111 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124461263 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124463080 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 124464209 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124465080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124465505 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124466127 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124466226 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124469820 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 124470757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124471180 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 124472051 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124472140 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124472151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124472504 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124472632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124472670 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124473255 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124473362 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124473372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124473516 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124473647 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124473846 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 124473862 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 124473880 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 124473885 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124474029 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124474050 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124474052 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124474062 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124474071 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124474104 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124474133 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124474140 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124474156 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124474160 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124474172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124474257 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124474310 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 124474364 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 124474736 C T N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 3 124475060 T C N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 3 124475149 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124475210 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 3 124475307 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124475480 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124475519 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124475562 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124475683 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124475724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124475754 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124475770 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124475962 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124476023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124476052 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124476129 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124476151 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124476326 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124476640 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124476650 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124476724 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124476804 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124476939 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124476960 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124476963 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124477077 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 124477083 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 124477098 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 124477110 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 124477118 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 124477406 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124477423 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124477694 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124477882 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124477894 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124477941 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124478080 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 124478115 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124478156 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 124478179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124478220 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 124478251 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124478366 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 124479230 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 3 124479348 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 124479359 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 124479478 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 124479493 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 124479544 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 124479617 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 124479691 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 124480330 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 124480863 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 124481006 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 124481187 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124481232 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 124481267 T A N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 3 124481843 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 124481938 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 124482421 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124482458 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124482504 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 124482525 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 124482821 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124482972 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124483093 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124483135 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 124483191 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 124483224 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124483419 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 124483519 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124483522 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 124483630 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124483650 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 124483719 T A N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 124483749 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 124483763 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 124484208 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 124484248 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 124484407 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124484505 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 124484545 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 124484691 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124484745 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 124484766 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 124484808 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124484947 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 124485118 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124485139 C T N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 3 124485163 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124485180 A T N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.1875 0.6875 0.125 17 15 3 11 2 3 124485229 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124485265 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 124485483 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 124485487 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 124485649 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 124485691 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 124485799 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124485895 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124485976 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124486267 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124486336 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 124486494 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 124486801 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 124487045 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124487163 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 124487293 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124487395 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124487675 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 124487821 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124488298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124488319 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124488560 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124488882 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 124488937 T C N Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 3 124489053 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 3 124489061 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124489111 C A N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 3 124489247 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 124489493 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124489679 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124489929 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124489944 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124490225 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 124490228 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124490615 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124491134 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124491209 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 124491356 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 124491602 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 124491690 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124492174 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124492310 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124492771 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124492940 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124494220 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 124494908 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124495073 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124495158 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124495335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124495612 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124498200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124498639 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124498926 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 124499449 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124500359 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124500741 T C N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 10 10 3 4 3 3 124501422 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124504606 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124505259 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 124505675 G T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124506083 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124507341 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124507646 A C Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 124507726 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 124507869 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124508142 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 124509107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124509236 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124509361 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 124510191 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124511585 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124515596 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124515831 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124516053 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 124516293 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124516469 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 124517432 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124518494 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124518721 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124519606 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124520015 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124521028 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124521036 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124521288 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124521571 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124524826 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124527217 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124527661 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124528822 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124529398 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124529704 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 124529750 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 3 124530418 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124530511 T A Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 124536806 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 124539690 A G N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 124539821 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124541240 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 124541485 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 124541831 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124542028 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 124542277 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124543620 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124544164 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 124544585 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124544741 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124545461 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124546340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124548353 T A N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 3 124548748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124549010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124549993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124550755 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 124551496 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124552063 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 124553100 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124553225 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 124557797 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124557818 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124559312 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124559992 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124564539 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124564563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124572229 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 124577469 G T Y N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0 1 0 17 17 0 17 0 3 124582491 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124588482 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 124588732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124589091 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124589727 G A Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 124589761 G A Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 124590317 A G Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 124591805 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124597723 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124597838 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124598796 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124599766 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124599980 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124601350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124602428 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124603358 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124606545 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124608611 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124610055 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124610063 A C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 3 124612016 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124612693 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124615521 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124615838 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 124616190 G C Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 124616531 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124619134 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124619250 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124619519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124619973 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124620350 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124620672 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 124620895 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124621355 G T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 124623095 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124623444 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124623703 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124626568 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 124627888 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124628414 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124628795 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124629151 G A N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0 0.545454545454545 0.454545454545455 6 16 0 6 5 3 124629254 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 124629463 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124629693 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124632181 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124632577 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 124633186 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124635936 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124636172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124637400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124638558 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124639016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124639881 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124640743 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124640800 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124643532 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124645573 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124649179 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124649265 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124652045 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124652877 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 124653316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124653325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124653423 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124654584 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124657261 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124657290 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124657315 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124657889 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124660632 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 124661123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124661309 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124662690 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 124664828 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 124665349 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124665929 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124667447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124668054 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124676989 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124677177 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124677213 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124677878 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124679638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124680863 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124681083 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124681498 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124681800 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124682373 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124682523 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124682611 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124683543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124684161 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 124684285 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124685619 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124686403 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 124686564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124687457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124687650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124688516 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124688968 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124690361 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124690537 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 124690637 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 124691655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124691858 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124693577 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124694106 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 124694543 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 124694567 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 124694919 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124694920 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124695036 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124695492 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124695777 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124696020 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 124696193 G C Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 124696274 G C Y N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 124702455 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124702601 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124702824 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 124703442 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 124703704 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124703765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124703992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124704221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124704368 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124704795 A G Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 124705145 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 124706665 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 124706807 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124707182 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124707220 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124707739 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124707762 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124707852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124707980 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124708466 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124708738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124708832 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124708938 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124709269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124709417 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 124709418 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 124709621 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124709675 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124709836 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 124710110 C A N N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 3 124710282 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 124710662 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124712690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124712765 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124712972 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124713163 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124713250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124713287 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124713745 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124713810 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124714343 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.25 0.7 0.05 24 16 5 14 1 3 124714359 G A Y Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 124714624 C T Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 124714808 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 124715053 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124715242 G A Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 124715558 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124715564 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124715811 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124716391 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 124716402 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124716677 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124716982 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124717192 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 124717632 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124718969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124719363 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124720684 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124720952 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124721635 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124721843 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124722494 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124722725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124723086 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 124724657 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124725106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124725803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124726143 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 124726266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124726531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124726680 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124726988 A G N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 3 124727950 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124728636 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 124729682 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124730528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124730786 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124732128 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 124732598 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124732745 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 124732808 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 124732824 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 124732977 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 124733028 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 124733038 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 124738852 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124738953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124738962 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 124739565 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124739618 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 124739642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124739671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124739682 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124739696 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 124739803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124739950 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 124740442 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 124740484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124740539 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124740675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124740999 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 124741123 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124741155 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124741854 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124745125 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124748833 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124750590 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124752341 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124754174 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124754360 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124754464 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124754682 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124755137 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124756689 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 124757409 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124757646 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124758861 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124759792 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124760943 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 124761402 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124762568 G T Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 124763418 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 124763440 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 124763850 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 124764489 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124764886 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 124767476 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124767645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124767821 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 124767967 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 124768524 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124768576 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124768905 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 124768926 T A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 124768965 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 124769288 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 124769633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124769689 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 124769887 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124769942 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124770005 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124770389 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 124770504 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 124770619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124770637 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124770710 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124770750 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.166666666666667 0.777777777777778 0.0555555555555556 20 16 3 14 1 3 124770816 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 3 124770829 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 124770832 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 124770841 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 124771026 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 124771114 T G Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 124771323 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 124771375 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 124771399 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124771434 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124771691 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124771766 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124771776 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 124771825 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 124772065 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124772154 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 124773473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124775551 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124775622 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124775674 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124776275 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 124776413 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124776419 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124776740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124776824 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124777175 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124777301 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 124777329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124777645 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124777808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124790375 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124790762 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124791262 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124792066 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124793415 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124794117 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124794430 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124797097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124798858 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124799152 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124801469 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124801915 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124803346 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 124804787 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 124804793 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 124804970 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124806426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124808386 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124810033 A G Y Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 3 124810510 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124810656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124811490 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124811547 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124812918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124813330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124814113 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124814167 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124815026 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124815725 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124818032 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124818098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124818473 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124819387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124819659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124820163 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124820190 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 124820219 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124820262 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 124820301 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 124820440 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124820449 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124820889 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124820923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124821035 C A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 124821100 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124821474 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124821534 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124821597 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124821694 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124821723 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124821875 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 124822015 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 124822055 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 124822101 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 124822787 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 124822806 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 124823136 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 124823140 G C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 124823212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124823244 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124823325 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 124823392 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 124823442 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124823464 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 124823467 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.133333333333333 0.666666666666667 0.2 14 16 2 10 3 3 124823700 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 124823750 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124823814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124823885 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 124823889 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 124823904 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 124823989 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 124824002 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 124824088 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124824269 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 124824343 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124824428 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124824452 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 124824569 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 124824647 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 124824688 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124824854 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 124824947 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 124825058 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124825093 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124825133 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 124825181 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 124825185 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 124825249 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124825372 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 124825376 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124825463 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124825482 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124825501 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124825531 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 124825541 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 124825574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124825611 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 124825621 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124825661 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 124825693 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 124825731 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 124825737 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 124825761 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124825780 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 124825818 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124825918 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 124826206 G A Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 124826207 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124826275 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124826281 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124826301 G C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 124826325 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124826383 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124826454 A T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 124826617 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 124826646 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 124826674 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 124826903 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 124826952 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124827094 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124827196 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124828426 T G N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 3 124828427 C G N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 3 124828534 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 124828555 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 124828560 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 124828597 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 124828654 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 124828716 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 124828789 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 124828804 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 124828829 C A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 124828848 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124828892 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124829004 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 124829018 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124829032 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 124829151 C T N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 3 124829180 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124829239 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124829247 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 124829312 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 124829431 A T N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 124829461 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 124829498 G C N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 124829519 G A N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 3 124829531 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 124829565 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124829621 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124829627 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 124829638 C A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 124829855 C G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 124829861 C A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 124829990 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 124830050 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 124830093 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124830225 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 124830242 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 124830251 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124830359 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 124830360 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 124830407 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 124830765 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124830906 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124831196 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124831244 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 124831406 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124831524 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124831546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124831727 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 124831752 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124831889 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124832642 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 124832677 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124832762 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124832809 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124832864 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124832923 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 124833081 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 10 8 1 8 0 3 124833204 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124833244 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124833257 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124833311 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 124833322 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124833372 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124833407 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124833432 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124833457 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124833551 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124833622 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124833672 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124833707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124833723 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124833761 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124833826 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124833831 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124833909 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124833945 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124833991 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124834002 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 124834308 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 124834403 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 124834535 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124834543 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124834776 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 124835049 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124835119 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124835121 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 124835160 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124835242 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 124835483 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 124836619 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124837071 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 124837400 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124837602 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 124837764 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 124838059 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 124838258 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 124838804 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 124838819 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 124839293 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124842199 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124842476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124842839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124843109 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124843113 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124843477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124845281 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124845749 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124846319 A G N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 124846658 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124847224 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124848255 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124848773 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 124849067 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124849118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124849781 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124850103 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 124852064 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124854815 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124854938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124855181 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124855451 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124855680 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 124855731 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124855747 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 124855755 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 124855791 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 124855816 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 124855890 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 124855898 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 124855901 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 124855983 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 124856094 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124856112 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 124856394 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 124856435 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124856636 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124856731 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124856752 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 124856761 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 124856894 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 124857021 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124857190 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124857194 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124857402 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124857493 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 124857622 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124857776 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124857860 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 124857886 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 124857963 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 124858021 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124858541 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124858547 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 124858557 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124859100 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124859289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124859439 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124859719 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124860021 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124860038 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124860059 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124860121 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 124860206 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 124860250 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 124860253 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 124860326 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 124860390 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 124860516 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 124860560 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 124860583 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124860843 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124861005 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 124861160 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124861164 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124861304 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 124861321 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124861414 G T N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 124861459 A C N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 124861714 G A N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 3 124861718 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 124861796 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 124861928 C A N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 124862061 G C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 124862071 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124862120 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 124862145 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 124862215 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 124862678 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 124862692 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 124862697 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 124862773 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 124862947 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 124863081 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124863330 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 124863427 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124866210 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 124867176 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124867401 T G Y N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 124867440 T C Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 3 124867499 T A Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 124867551 T A Y N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.230769230769231 0.538461538461538 0.230769230769231 13 13 3 7 3 3 124867626 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124867636 A G Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 124867649 G A Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 124867728 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 124867868 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 124868210 A T Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 124868234 T C Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 124868277 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 124868420 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 124868428 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124868466 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 124868511 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 124868583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124868636 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124868650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124868656 G A Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 124868681 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 124868718 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 124868884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124868915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124869032 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124869122 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124869193 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124869390 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124869657 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124869663 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124870044 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124870408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124870709 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 124870953 T G Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 124871005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124871029 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124871038 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124871050 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124871104 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124871137 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124871253 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124871299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124871319 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124871350 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124871351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124871485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124871504 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124871532 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124871544 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124871556 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124871674 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124871710 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124871748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124871761 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124871775 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124871781 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124871853 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124871865 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124872036 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124872082 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124872356 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124872434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124872454 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124872482 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124872510 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124872584 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124872738 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124872944 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 124873004 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 124873057 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124873159 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 124873172 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 124873173 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124873200 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124873275 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124873418 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124873423 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124873552 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124873602 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124873690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124873738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124873769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124873876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124873904 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124874003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124874049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124874064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124874204 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124874235 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124874239 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124874275 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124874403 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124874927 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124874968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124875198 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124875244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124875276 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124875353 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124875382 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124875396 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124875432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124875597 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124875922 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 124875995 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 124876088 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124876124 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124876171 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124876282 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124876291 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124876348 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124876352 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124876567 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124876655 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124876875 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124876951 A G Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 124876954 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124876994 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124877266 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124877330 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124877349 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124877350 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124877380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124877456 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124877521 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124877589 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124877690 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124877767 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124877769 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124877789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124877809 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 124877849 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124877898 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124877921 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 124877922 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 124878224 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124878265 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124878359 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124878374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124878382 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124878475 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124878486 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124878543 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124878569 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124878595 C A N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 124878614 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 124878618 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124878636 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124878687 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124878751 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 124878821 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 124878823 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 124878837 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124878852 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124878883 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124878897 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124878911 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 124879089 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124879102 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124879148 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124879178 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124879194 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124879216 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124879228 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 124879294 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124879351 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124879400 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124879680 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 124879718 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124879742 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124879794 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124879817 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124879879 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124879974 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124879984 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124880009 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124880021 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124880125 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124880155 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124880194 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124880233 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124880437 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 124880460 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124880496 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124880640 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124880650 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124880675 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124880739 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124880784 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124880798 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124880952 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124880996 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124881139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124881208 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124881281 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 124881305 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 124881380 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124881394 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124881450 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124881522 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124881527 C G Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 124881553 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124881631 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124881694 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124881714 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124881814 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124881848 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124881869 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124881910 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124881914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124881933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124881978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124882011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124882029 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124882128 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124882165 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124882166 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124882183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124882197 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124882333 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 124882395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124882458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124882504 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124882513 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124882620 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124882808 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124882841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124882890 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 124882898 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124882956 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124882975 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124883004 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124883054 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124883148 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124883214 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 124883245 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124883266 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124883275 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124883452 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124883499 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124883601 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124883639 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124883727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124883790 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124883919 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124883920 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124884060 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124884103 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124884237 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124884265 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124884272 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124884348 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124884385 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124884431 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124884522 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124884542 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 124884571 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124884572 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 124884736 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124884863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124884929 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124885076 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124885259 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124885841 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 124886190 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124886215 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124886288 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124886340 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124886429 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 124886444 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 124886737 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124886781 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124886831 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124886837 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 124886845 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124887000 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124887024 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124887315 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124887528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124887540 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124887659 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124887759 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124887760 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124887799 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124887959 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124887961 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124888059 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124888085 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124888114 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124888200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124888277 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124888282 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124888308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124888349 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 124888368 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124888400 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124888573 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124888586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124888591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124888614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124888690 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124888746 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124888823 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 124888998 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124889015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124889022 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 124889079 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 124889262 T C Y Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 3 124889521 T C Y Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 3 124889557 C G Y N 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 3 124889582 A C Y N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 124889703 C T Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 124889736 G A Y Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 124889750 A C N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 3 124889960 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 124890029 T C Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 124890081 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 3 124890149 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124890212 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 124890362 C T Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 124890444 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 124890490 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124890514 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124890684 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124890794 G C N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 124890800 T G N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 124890811 T C N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 3 124890850 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 124891008 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 124891030 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124891147 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 124891153 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 124891172 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 124891190 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124891200 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 124891221 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 124891243 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 124891264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124891301 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 124891306 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 124891314 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 3 124891369 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 124891394 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124891399 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 124891419 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 124891452 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124891454 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 124891496 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 124891565 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 124891598 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 124891649 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 124891705 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124891845 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 124891860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124891865 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124891934 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124891957 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 124892018 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124892062 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124892100 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124892269 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124892360 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124892366 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124892565 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124892669 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 124892828 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 124893164 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124893823 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124894172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124894701 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 124895808 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 124895855 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 124895888 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 124895919 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 124896267 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 124896389 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 124896517 C A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 124896899 G A N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 124896936 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 124896946 T C N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 124896948 C G N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 124896961 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 124896997 A T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 124897023 G A N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 124897065 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 124897090 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 124897097 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 124897223 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 124897272 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 124897302 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124897337 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 124897429 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 124897451 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 124897520 A C N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 124897533 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 124897536 A C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 124897582 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 124897598 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 124897703 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 124897760 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 124897770 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 124897778 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 124897832 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 124897837 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 124897854 A C N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 124897946 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 124897962 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 124898026 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 124898032 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 124898055 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 124899103 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 124900644 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 124901180 A C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.0588235294117647 0.705882352941177 0.235294117647059 14 20 1 12 4 3 124902546 G C Y N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 124903018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124903790 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124904641 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124906775 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124906812 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124908291 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 124911181 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124911328 T G N N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 3 124918656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124919621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124919789 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124919986 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 124920967 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124921077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124922052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124922673 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124925186 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 124927516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124929052 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 124929394 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 124929754 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 124929956 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 124930251 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 124930931 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 124931170 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 124934963 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124935229 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124935862 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124936424 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 124936965 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124937572 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124937717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124938700 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124939244 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124943145 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124943187 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124943765 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124944667 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124945227 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124945955 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124946060 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 124946256 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124946368 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124950822 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124951044 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 124951121 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 124951563 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124951803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124952866 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124953410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124953522 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 124953606 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124953607 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124953992 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124954571 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124955056 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 124955424 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124955975 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124956233 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124956335 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124957290 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124958632 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124959346 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124959459 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124960277 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 124961607 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124963462 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124963632 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 124964019 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124965527 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124966115 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 124967390 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124967803 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124969310 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124970524 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124970723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124973319 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 124975451 G C N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 124975843 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124976008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124976020 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124978498 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124979955 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 124980840 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 124981361 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 124981535 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 124981728 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 124982049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124982108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124982469 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124982640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124982769 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 124982861 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 124983027 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 124983596 C A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 124983646 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 124983846 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124984006 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 124984873 T A N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 3 124986471 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 124988316 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124988445 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124990317 C T N Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0 1 0 5 5 0 5 0 3 124990606 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124990679 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 124991644 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124991960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124992238 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124992339 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124992592 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124993281 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 124993874 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 124994163 G C Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 124994237 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124997290 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 124997505 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124997628 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124998054 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124998921 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124999198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 124999277 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 124999981 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 125000240 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125000573 T C Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 125000615 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125001427 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125001619 A C Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 125001961 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125002138 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125002228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125002341 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125003342 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125003468 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125003471 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125005806 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 125006097 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 125008393 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125008538 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 125010358 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125011352 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125011552 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 125013480 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125014466 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 125014511 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 125015866 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 125018628 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125018936 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125019096 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125021465 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125022998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125024377 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 125024533 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125025142 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125025641 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125027438 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125027515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125028540 A G Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 125029660 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125029771 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 125030011 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125030661 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 125031160 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 125031937 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125031950 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125033761 A C Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 125034049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125034274 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125034738 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125035028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125036028 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125041020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125045117 G C Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 125047865 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 125048697 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125049898 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125051916 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125052200 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125053034 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 125053265 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125055917 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125057886 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0 0.705882352941177 0.294117647058824 12 22 0 12 5 3 125059722 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125061488 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125061539 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125061810 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125063899 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 125075116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125076997 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 125079558 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 125082271 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125086298 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 125086512 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125086983 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125087579 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 125088994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125089751 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125091302 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125091515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125092487 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125097664 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 125097672 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 125098730 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125099185 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 125100710 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 125100733 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 125102917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125102954 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125103799 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 125104379 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125105506 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125106233 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 125108970 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 125113113 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 125113850 T C N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 3 125115300 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125115983 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125116549 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 125116717 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125124493 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125126741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125127162 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125127695 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125128263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125130089 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125135059 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125135783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125138247 A C N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 125140165 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125142535 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 125144514 T C Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 3 125146735 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125146740 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 125146833 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125147701 G A Y Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 3 125147927 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125149032 T A Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 125151744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125151907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125153839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125154271 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 125154503 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125154787 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 125158674 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125162231 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 125162550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125162551 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125163562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125164227 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125164654 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125167169 C G Y N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 125167711 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125168907 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125170163 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125170735 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 125171177 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125171548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125173239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125174800 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 125174872 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125175879 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125176462 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 125176545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125177994 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 125179080 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125179356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125179856 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125180362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125180697 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 125180813 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125181443 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 125182002 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125182147 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125182267 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125182345 T C N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 125182571 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 125182697 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125182713 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125182739 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 125182782 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 125182786 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 125182800 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 125182890 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125182988 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125183064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125183140 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 125183152 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 125183333 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 125183349 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125183524 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 125183559 C T N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 3 125183573 T C N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 3 125183582 C T N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 3 125183639 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 125183704 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125183790 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125183809 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125183933 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 125184139 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 125184288 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 125184326 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 125184368 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 125184393 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 125184394 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 125184452 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 125184465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125184487 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 125184618 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125184777 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125184811 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 125184812 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 125184887 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125184978 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 125185112 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125185176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125185184 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 125185189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125185218 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 125185516 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125185592 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 125185609 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125185712 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 125185755 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125185764 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125185797 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 125185877 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 125185886 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125185937 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125185942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125186170 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125186199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125186261 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125186264 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 125186280 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 125186362 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 125186426 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 125186492 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 125186561 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 125186593 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 125186612 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 125186633 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 125186715 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 125186825 T A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 125186913 A C N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 125186980 A T N N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 3 125187215 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 125187231 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 125187339 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 125187376 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 125187394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125187421 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 125187450 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 125187539 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 125187653 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 125187722 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 125187723 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125187746 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 125187803 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 125187908 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 125188424 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125189760 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 125190066 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125190636 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125191782 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125191856 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125191959 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125192109 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 125192192 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 125192337 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125192593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125192722 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 125193107 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125193148 T A Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 125193487 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 125193506 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 125193526 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 125193595 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 125194046 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 125194067 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 125194451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125194885 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125196155 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 125197469 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125197654 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125198152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125198439 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125198593 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125198997 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125201058 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125201564 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125202403 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125203010 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125203050 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125203073 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 125204047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125205320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125205428 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 125205984 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 125206564 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 125207265 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125208807 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125209180 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125209444 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125210078 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125210106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125210354 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125211563 A G Y Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 125213140 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125213514 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125215174 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 125215434 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125215442 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125215924 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125216112 A G N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 125216580 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125216643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125216661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125216838 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 125217504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125217797 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 125218580 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 125218980 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125219719 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125219873 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125219904 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 125220390 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 125220632 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125220834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125221077 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 125221421 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125221507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125221534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125221545 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 125221588 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 125221626 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 125221642 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 125221697 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 125221986 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 125222083 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125222089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125222216 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125222647 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125223684 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125224040 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125224423 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125224494 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125224559 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125224743 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125224839 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 125224879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125225790 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 125226021 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 125226119 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 125226141 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 125226200 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 125226442 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 125226508 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 125226643 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 125226705 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 125226842 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 125227030 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 125227369 C G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 125227503 C G N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 125228123 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125228243 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125228280 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 125228286 A G Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 125228422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125228593 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 125228919 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 125228995 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 125229222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125233209 T A Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 125233211 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 125233223 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 125233301 T C Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 125233540 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 125233830 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 125234298 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 125234744 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125235636 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125247335 C T Y Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0 0.615384615384615 0.384615384615385 8 18 0 8 5 3 125247826 C T Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 125252229 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125254528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125260161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125261726 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 125262567 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125262772 G T N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 125262885 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 125263039 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 125263761 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125263804 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125263808 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125263932 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125264041 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125264495 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125264562 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125264724 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 125265053 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 125265392 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 125265404 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125265447 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 125265474 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 125266006 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 125266089 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 125266627 T A N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 125266949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125267031 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 125267079 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 125267329 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 125268793 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125269759 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 125270270 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 125272874 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125273085 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 125277731 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125280426 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125282053 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125282384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125283497 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125283541 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125284982 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 125286333 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 125286393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125286476 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125286625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125286964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125287238 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 125287277 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 125287652 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125287665 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125287732 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125288318 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125288412 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125288637 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 125289032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125289074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125289679 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 125289901 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125291783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125292259 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125292641 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125293086 G A N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0 0.692307692307692 0.307692307692308 9 17 0 9 4 3 125293156 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 125293461 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 125293521 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 125294470 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125295811 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125296384 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 125296564 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 125296572 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125296588 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 125296755 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 125297051 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125297118 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 125297266 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 125297340 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125297568 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 125297655 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 125297662 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 125297717 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 125298189 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 125298993 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125299104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125299386 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125300035 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125301046 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125301082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125301499 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 125301517 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125301557 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125301847 T G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125301877 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125302396 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 125302399 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125302426 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125302539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125302909 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125302931 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125303418 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125303608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125303624 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125303641 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 125303821 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125303941 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125304162 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125304385 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125304641 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125304978 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125305089 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125305652 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125306250 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125306706 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125307252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125309350 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125309907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125309927 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125309995 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125309998 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125310117 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125310194 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125310368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125310469 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 125310497 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 125310503 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125310600 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125310605 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125310865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125311813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125312021 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125312043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125312617 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125312722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125312972 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125312973 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 125313207 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125313584 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125318079 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125318506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125320464 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 125321247 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125321633 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125323023 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125323444 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125324035 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125324182 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125324261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125325115 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125326382 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 125328235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125328751 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 125330026 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125333914 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125333933 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125335574 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125337112 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 125337602 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 125339414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125340219 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125341408 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125343146 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125344609 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125346097 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 125347347 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125347526 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125349040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125349143 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125349168 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125349339 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125349403 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 125349933 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125350028 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125350069 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125350188 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 125350240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125350367 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 125350623 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125350677 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 125350720 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 125350825 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 125350877 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 125351085 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 125352081 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125352529 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 125353085 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 125353396 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125353437 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125353455 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125353696 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125353796 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125353805 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125353837 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125354675 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125355303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125355370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125355381 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125355425 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 125356034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125356273 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125356661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125356827 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125356968 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 125357059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125357081 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125357092 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 125357142 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125357159 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125358138 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125358224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125358463 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125358626 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125359026 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125359114 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125359146 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 125359267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125359380 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 125359382 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 125359393 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 125359465 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125359576 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125359735 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 125360013 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125360203 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125360296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125360391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125360448 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 125360547 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 125360684 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 125360707 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125360709 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125360760 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125360807 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125361032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125361406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125361418 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125361579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125361684 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125361752 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125361774 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125361794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125361821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125361937 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125362035 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125362038 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125362050 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125362124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125362265 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 125362296 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125362406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125362415 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125362434 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 125362712 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125363098 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 125363119 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 125364108 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125364151 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125364184 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125364211 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125364451 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125364841 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 125366411 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125366541 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125366991 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 125367169 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125367183 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125367206 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125367224 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125367374 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125367378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125367393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125367942 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125368648 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125368764 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125369205 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125369699 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125370154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125370462 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125370506 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 125370520 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125371037 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125371133 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125371144 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125371266 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125371777 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125371902 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125374944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125377561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125378300 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125378573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125379052 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125381061 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125382663 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125384169 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 125385677 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125387208 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125387928 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125390377 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125390697 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125390789 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125391251 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125391637 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 125392688 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 125393750 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125394929 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125396301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125396613 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125399581 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125399657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125399870 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 125400497 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125400518 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125400728 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125402550 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125402809 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 125404414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125404417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125404555 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 125404718 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 125404863 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 125405244 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125405356 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125405382 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 125405551 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 3 125405610 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 125405676 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 125405820 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 125405898 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125405944 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125406038 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 125406085 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 3 125406312 A G N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 3 125406471 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 125406526 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 125406544 A C N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 3 125406613 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 125406741 C A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 125406799 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 3 125406930 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125406950 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125407136 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 3 125407198 G C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 3 125407276 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 125407371 A G N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.230769230769231 0.153846153846154 0.615384615384615 8 18 3 2 8 3 125407435 G A N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.272727272727273 0.272727272727273 0.454545454545455 9 13 3 3 5 3 125407472 G A N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 3 125407487 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 125407490 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 125407513 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 125407521 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 125407530 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 125407558 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 125407569 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 125407595 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 125407598 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 125407607 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 125407610 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 125407684 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 125407687 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 125407703 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 125407803 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 125407838 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 125407878 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 125407903 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 125407914 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 125408076 A C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 3 125408136 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 125408137 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 125408721 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 125408871 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 125408933 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 125409040 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125409266 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125409332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125409465 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125409568 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125409612 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125409744 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125409805 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125409832 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125409848 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125410202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125410218 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 125410240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125410261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125410307 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125410667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125410871 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 125411743 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 125411976 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125412072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125412374 G A Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 125412398 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125412465 A G Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 125412504 T C Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 125412574 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125413544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125413573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125413789 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 125414157 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125416711 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 125417437 C A Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 125417635 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125417764 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 125418619 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125418796 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 125419175 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 125419704 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125419770 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125420422 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125420622 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125420908 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125420925 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125420926 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125420968 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125421032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125421087 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125421381 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125421400 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 125421454 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125421631 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125421643 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125421914 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125422187 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125422768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125423294 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125424096 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 125425213 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 125425327 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 125425861 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 125425875 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 125425970 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 125426786 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125427509 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125427977 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 125428490 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 3 125428605 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 125428656 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125429055 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125429065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125429386 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125429436 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125429921 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.583333333333333 0.166666666666667 0.25 16 8 7 2 3 3 125430170 C T N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 3 125431627 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 125432136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125432178 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125432515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125432520 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125432527 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 125433376 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125433796 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125434484 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125435112 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125435224 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125435396 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125435511 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125436161 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125437146 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125437234 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125437375 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125437410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125438009 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125438109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125438204 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125438248 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125438261 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125438265 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 125438797 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 125438975 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125439720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125440730 A T Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 125440742 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 125441059 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125443359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125443533 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 125444477 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125444717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125445590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125445935 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125446613 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 125447507 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125448700 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 125448739 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125448849 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 125448897 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 125448951 A G Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 125449084 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 125449211 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 125449499 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125449817 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 125449820 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 125451752 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125451894 A T Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 125451909 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 125452200 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125452298 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 125452400 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 125452449 A G Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 125452472 A G Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 125452761 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 125452874 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125453159 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125453587 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125453817 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 125453849 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 125454094 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125454270 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 125454293 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 125454311 T G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 125454312 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 125454383 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 125454399 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 125454412 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 125454491 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 125454609 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 125454667 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 125454783 T G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 125454937 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125455199 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 125455542 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125455684 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.210526315789474 0.0526315789473684 0.736842105263158 9 29 4 1 14 3 125456281 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 125457412 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125457674 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125457728 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125457845 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 125457896 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 125457924 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 125458017 A C Y N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 0.142857142857143 0.214285714285714 20 8 9 2 3 3 125458058 A C Y N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.545454545454545 0.181818181818182 0.272727272727273 14 8 6 2 3 3 125458123 T C Y Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 3 125458265 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 125458268 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 125458284 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 125458330 G A Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 3 125458467 G T Y N 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 3 125458520 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125458618 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 125458735 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125459580 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 125459584 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 125459672 C G Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.666666666666667 0.133333333333333 0.2 22 8 10 2 3 3 125459684 T A Y N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.214285714285714 21 7 10 1 3 3 125459695 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 125459734 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 125459840 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125459864 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125460000 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 125460051 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 125460084 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 125460097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125460117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125460192 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 125460207 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 125460210 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 125460233 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125460527 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125460596 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 125461138 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125461266 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125462600 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125463679 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125464117 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125464221 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 125464226 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 125464323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125464420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125464602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125464863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125465364 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125466765 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 125468093 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125468604 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125472039 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125472629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125473218 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125476620 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125476719 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 125476944 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125477344 T A Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 125477560 C G Y N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 125477575 C T Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 125477615 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 125477853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125479746 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 125480151 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125480561 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 125480667 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125482497 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 125482559 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 125482961 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125483130 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125483140 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 125483169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125483208 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 125483210 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 125483476 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 125483543 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125483584 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125483623 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 125483784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125483793 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125483801 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 125483815 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125483833 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 125483900 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125483967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125484001 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 125484010 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 125484087 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 125484355 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125484481 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 125484849 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 125484987 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 125484998 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 125485017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125485104 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125485175 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125485238 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125485279 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 125485289 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 125485376 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 125485416 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 125485610 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 125485714 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125485741 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125485814 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 125485837 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125486146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125486170 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125486174 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 125486269 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125486369 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125486482 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 125486908 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125487853 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125487857 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125492749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125494628 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125497279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125500259 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 125501104 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125504657 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125505471 C A N N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 125508146 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125509669 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125512094 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 125512631 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125512966 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125513003 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125513051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125513147 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 125513154 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 125513184 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125513227 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 125513269 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125513282 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 125513348 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125513349 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125513361 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125513620 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125514072 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 125514160 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 125514192 C A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 125514393 G T N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 125514722 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125514797 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 125514844 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 125514863 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 125514876 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125514879 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 125514949 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 125515595 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 125515604 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125515652 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125516228 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 125516287 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125516763 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 125518334 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 125518513 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 125518663 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 125520539 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125523125 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125527603 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 125528968 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125529627 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125529640 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125529812 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125530064 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 125530129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125530642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125530713 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125530725 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125531380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125531498 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125532105 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125532147 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125532399 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 125533439 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125534927 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 125535455 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 125535947 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 125536016 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 125536041 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 125536186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125536527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125536574 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125537318 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 125537366 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125537450 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125537791 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125537808 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125537832 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125537942 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125538404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125538456 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125538792 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125539266 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125539312 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125539331 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125539336 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125539394 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125539559 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 125539949 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125540386 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 125540430 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 125540485 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125540668 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 125540858 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 125540981 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 125541039 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125541628 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125541886 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 125541961 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 125542023 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 125542371 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 125542391 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 125542625 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125542847 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125543168 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 125543214 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 125543379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125543791 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 125543875 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125543884 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125544227 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 125544321 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 125544390 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 125544414 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125544556 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125544591 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125544733 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125544880 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125545013 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 125545113 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 125545254 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125545407 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 125545431 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125545462 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125545523 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 125545622 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125545648 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125545655 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125545675 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 125545870 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125546089 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125546199 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125546210 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125546229 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125546301 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125546435 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125546520 A C Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 125546751 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 125546754 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125546766 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125546985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125546989 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125547170 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 125547178 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 125547221 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 125547511 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 125547621 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 125547671 G T Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 125547727 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 125547817 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 125548104 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 125548119 A G Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 125548271 T G Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 125548367 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 125548508 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125548663 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125549627 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125550113 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 125550947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125552037 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 125552424 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 125552429 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 125552797 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 125552838 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 125553055 C T Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 125553227 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 125553474 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125553639 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125553651 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125553693 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125553857 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 125553925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125554012 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 125554093 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125554188 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125554226 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 125554307 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 125554471 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 125554578 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 125554591 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 125554863 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 125554919 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125554966 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125555153 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 125555258 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 125555416 A T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 125555525 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 125555587 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 125555666 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125555689 T A Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 125555737 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125555764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125555908 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125556345 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125556584 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125557137 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 125557154 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125557384 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 125557438 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 125557758 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125558223 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125559089 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125559203 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 125560288 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125560326 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125560774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125560891 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 125560979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125561266 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125562371 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125562528 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125562641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125563194 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 125563218 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 125563314 G T Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 125563420 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125563433 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 125563487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125563515 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 125563612 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125563654 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 125563674 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 125563828 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125564013 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 125564063 C T Y Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 3 125564262 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 125564394 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 125564527 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125564670 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125564686 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125564694 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125564700 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125564708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125564752 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125564886 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125564927 C A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 125565085 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125565191 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 125565215 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 125565222 T A Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 125565369 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 125565518 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125565575 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125565588 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125565763 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 125565764 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 125565788 G A Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 125565822 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 125565823 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 125565872 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 125565880 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125565903 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125566021 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125566162 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 125566183 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 125566192 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 125566202 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 125566212 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 125566329 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 125566332 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 125566673 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 125566811 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 125567088 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 125567249 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125567618 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125567649 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 125568475 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125570052 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125570920 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 125571085 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125571444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125572000 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125572525 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 125573254 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 125573505 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 125576067 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 125576445 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 125576669 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 125577184 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 125577496 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 125577864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125578873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125580396 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 125581781 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125582318 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 125582449 T A Y N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 125587275 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 125587727 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125588714 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 125592865 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125593280 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125593534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125593695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125594131 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 125594149 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 125594567 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 125594735 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125594871 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125595650 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 125595743 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125597143 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125597589 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 125597960 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125598318 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125598330 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 125598467 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 125598549 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125598880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125598884 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125598977 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125598990 C T Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 125599018 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125599054 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 125599082 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 125599134 T C Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 125599136 T G Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 125599148 C T Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 125599234 C T Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 125599379 T C N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 3 125599499 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 125599572 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 125599869 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 125599894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125599914 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 125600015 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 125600030 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125600040 T C Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 125600320 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125601544 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125603064 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 125603238 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 125603265 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 125603269 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125603390 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125603543 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 125603603 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125603796 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125603938 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 125603942 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 125604468 T G N N 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 3 125604574 C T N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 125604611 C T N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 125604686 T A N N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 3 125604898 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 125604934 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 125604988 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 125605128 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 125605232 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 125605458 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 125605513 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 125605561 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 125605575 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 125605592 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 125605651 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 125605703 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 125611960 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 125611980 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 125612137 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 125612356 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 125612392 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 125612400 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 125612651 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 125612660 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125612898 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 125612953 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125612959 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125613016 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125613126 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 125613200 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125613265 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125613278 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125613285 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125613450 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125613643 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 125613827 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 125613843 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 125614051 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 125614116 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 125614119 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125614130 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 125614239 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 125614274 C G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 125614709 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 125614730 C A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 125614816 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 125615010 T C Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 125615245 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 125615260 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 125615503 T A Y N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 125615639 T C Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 125615780 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125615825 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125615886 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 125615965 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 125616985 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 125617299 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125620599 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 125621341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125622758 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125622786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125623250 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 125624926 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 125625713 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125628684 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 125629552 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 125630059 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 125631172 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 125632210 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 125634537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125635616 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 125640591 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125642277 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 125644185 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125644187 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 125644200 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 125644337 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 125644556 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 125644668 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 125644701 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125644728 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 125644828 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125644839 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 125644858 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 125645034 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 125645052 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 125645084 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 125645138 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125645243 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 125645279 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 125645434 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 125645447 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 125645473 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 125645499 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 125645539 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125645542 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125645580 T A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 125645618 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 125645739 G C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 125645926 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 125645934 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 125645983 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 125646115 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125646119 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 125646224 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125646309 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 125646398 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125646499 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 125646610 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 125646616 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125646650 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125647077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125647081 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125647100 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125647116 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125647214 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125647235 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125647244 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125647411 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125647441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125647627 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125647869 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125648064 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 125648120 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125648123 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 125648133 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 125648146 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 125648189 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125648194 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125648242 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125648447 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 125648567 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125648656 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 125648793 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 125648854 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125649005 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125649090 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125649123 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125649188 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 125649225 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125649392 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125649404 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125649456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125649667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125649700 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125649709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125649839 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125649884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125649920 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125650045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125650089 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125650119 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125650146 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125650277 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125650308 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 125650377 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 125650676 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 125650931 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 125651014 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125651433 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125651539 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 125651587 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125651588 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125651660 A G Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 125651888 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 125651989 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 125652028 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 125652062 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 125652123 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 125652171 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 125652325 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 125652361 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 125652369 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125652407 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 125652467 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 125652477 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 125652484 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 125652626 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 125652766 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 125652819 G A N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 0.153846153846154 0.153846153846154 20 6 9 2 2 3 125652820 A G N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 3 125653106 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 125653187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125653188 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 125653235 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 125653577 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 125653593 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 125653613 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 125653701 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 125653799 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 125653838 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 125653877 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 125653991 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 125654030 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 125654062 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 125654063 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 125654079 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 125654096 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 125654198 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 125654199 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125654300 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 125654343 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 125654380 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 125654396 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 125654406 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 125654426 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 125654491 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 125654539 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 125654546 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 125654558 A T N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 125654615 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 125654621 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 125654723 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 125654816 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 125654846 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 125654885 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 125655057 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 125655098 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 125655102 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 125655130 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 125655173 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 125655194 A C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 125655204 A T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 125655259 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 125655262 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 125655356 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 125655577 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 125655659 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 125655740 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 125656020 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 125656025 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 125656091 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 125656152 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 125656307 T A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 125656590 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 3 125657190 T A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 125657629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125658833 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 125659041 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 125659182 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125659892 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125660248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125661679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125661890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125669292 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125669944 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 125671020 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125671036 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 125671099 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125671442 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 125671524 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 125672397 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125672786 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 125673178 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125673459 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125673470 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125674291 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125674956 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125674990 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125677263 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125677348 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125677368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125678892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125678912 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 125679902 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125680111 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125680380 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125681832 C T Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 125684157 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 125684585 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125685920 A G Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 125685964 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 125687026 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125688033 T C Y Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 125688768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125689646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125690898 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 125692019 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 125692023 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 125692098 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125692206 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 125692299 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125692592 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 125693006 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 125693348 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125694401 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125694932 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125695129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125695880 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 125695980 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 125697138 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 125698450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125698682 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125698923 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 125699156 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125699294 T C Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 125700063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125700100 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 125700360 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125701010 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 125701011 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125701086 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125701234 C G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 125701418 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125701593 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 125701779 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125701825 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 125702025 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125702190 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125702343 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 125702664 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 125703113 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125703295 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 125703307 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125703315 T A Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 125703489 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 125703536 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 125703588 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 125703639 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125703641 T G Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 125703650 A T Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 125703701 A G Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 125703922 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 125704056 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125704134 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 125704165 C G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 125704300 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 125704343 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 125704393 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 125704759 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 125704869 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125704906 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125704933 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 125705677 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 125705848 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125705999 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 125706163 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 125706354 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 125706573 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 125706963 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 125707005 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125707549 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 125707900 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125708226 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 125708255 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 125708272 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 125708387 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 125708392 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 125708439 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 125708451 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125708991 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 125709044 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125709863 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125709866 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125709879 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125709980 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 125710128 T A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 125710642 A G Y Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 9 7 1 7 0 3 125711325 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125711554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125711721 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 125712536 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125713646 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125713946 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 125714365 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 125714404 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 125714548 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 125714711 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 125715157 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125715612 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 125715660 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 125715811 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125715851 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 125716002 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 125716040 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 125716227 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125716270 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 125716331 T A N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 3 125716454 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 125716665 T C N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 3 125716682 T G N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 125716692 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 125716827 C T N Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 8 8 3 2 3 3 125716831 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 8 10 3 2 4 3 125716981 T A N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 125716993 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 125717090 A C N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 125717119 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 125717142 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 125717193 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 125717222 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125717301 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 125717305 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 125717392 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 125717400 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 125717410 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 125717426 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 125717554 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125717740 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 125718025 C G N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 125718050 G T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 125718059 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 125718100 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 125718268 T G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 125718292 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 125718358 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 125718369 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 125718417 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 125718478 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 125718504 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 125718642 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 125718702 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 125718757 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 125718766 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 125718779 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 125718872 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 125718888 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 125719045 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 125719070 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125719145 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 125720210 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 125720252 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 125720473 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 125720638 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125720639 G T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 125720725 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 125720777 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 125720817 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 125720914 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 125720942 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 125720945 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 125721023 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 125721051 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 125721066 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 125721067 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 125721136 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 125721245 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 125721327 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125721357 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 125721523 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 125721604 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 125721647 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 125721703 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 125721889 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 125721925 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125722092 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 125722130 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 125722202 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 125722568 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 125722652 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 125722852 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 125723448 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 125723579 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 125723619 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 125723699 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 125723778 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 125723794 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 125723842 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 125723844 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 125723982 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 125724053 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 125724097 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 125724188 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 125724296 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 125724305 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 125724566 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 125724574 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 125724670 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 125724934 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 125724936 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 125724994 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 125725011 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 125725297 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 125725322 T G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 125725325 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 125725333 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 125725359 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125725368 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 125725401 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 125725612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125725926 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 125725930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125726223 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 125726246 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 125726433 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 125726440 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 125726470 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 125726540 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 125727207 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 125727357 C G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 125727454 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 125728363 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125728502 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125728565 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125729805 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125730162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125730735 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125730860 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125731007 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125731325 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 125731461 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125731550 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125732134 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 125732267 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125732288 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 125732314 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 125732371 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 125732422 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125732559 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 125732603 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 125732687 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 125732921 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125732941 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 125732962 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 125738546 T C N Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 3 125738612 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 125738644 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125738692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125738703 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125738890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125738944 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 125738997 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125739017 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125739034 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125739129 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125739270 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 125739314 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125739376 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125739407 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 125739644 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 125739756 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125739765 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125739918 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125739939 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125739996 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125740057 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 125740145 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 125740187 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125740217 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125740287 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125740304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125740308 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125740326 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125740328 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125740344 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125740372 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125740573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125740593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125740640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125740658 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125740659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125740843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125740864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125740948 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125741027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125741052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125741511 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 125741527 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125741547 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125741616 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 125741756 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125741834 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 125741977 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125741985 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125742169 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125742506 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 125742565 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 125742600 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125742625 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125742674 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125742894 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 125742996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125743021 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125743040 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125743243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125743258 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125743447 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125743570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125743607 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125743727 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 125743906 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 125743927 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125743936 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125743947 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125743959 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125744098 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125744118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125744186 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125744200 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125744290 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 125744320 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125744357 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125744457 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125744563 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 125744649 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125744677 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125744736 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125744777 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125744833 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125744850 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 125745083 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125745114 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 125745182 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 125745470 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125745651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125745693 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125745866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125746281 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125746318 A T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 125746470 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 125746471 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 125746574 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 125746872 T A Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 125746885 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 125746946 G T Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 125747081 A G Y Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 10 8 4 2 3 3 125747511 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 125747802 A C Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 125747805 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 125748058 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125749376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125749615 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 125749634 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125749691 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 125749700 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 125749739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125749829 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125749892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125750018 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 125750289 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 125750342 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 125750610 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 125750615 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 125751003 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 125751233 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125751306 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125751422 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 125751785 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 125752005 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 125752042 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 125752356 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 125752880 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 125752906 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 125753175 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 125753244 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 3 125753530 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 125753588 C A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 125753613 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 125753637 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 125753834 T C Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 125753842 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 125754137 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 125754260 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125754288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125754373 C A Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 125755014 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125755510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125755582 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 125755839 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 125755846 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 125756449 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125756485 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 125756589 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 125756648 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 125756886 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 125757013 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 125757027 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 125757038 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 125757125 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 125757175 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 125757586 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 125757654 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 125757673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125759974 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125760807 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125769780 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 3 125771036 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125772317 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125773591 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 125773606 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 125774507 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125774827 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125774961 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125775384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125775484 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125777163 G T Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 125777599 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125777895 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 125778096 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125778316 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 125779362 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125779582 G A Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 125780001 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125780075 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125780576 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125780798 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 125781046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125781218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125781226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125782492 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125782635 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 125782636 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 125782652 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 125782669 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 125782893 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 125783096 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 125783169 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 125783259 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 125783356 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 125783435 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125783859 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 125783990 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 125787749 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125789306 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 125790166 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125790172 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125791576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125791755 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125792350 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125792391 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 125792537 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125792839 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 125793325 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125793501 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125793544 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125793813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125794451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125794612 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125799110 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 125799163 C A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 125799192 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 125799234 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 125799287 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 125799377 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125799407 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 125800126 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 125800151 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 125800235 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 125800616 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 125800647 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 125800712 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 125800756 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 125800763 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 125800803 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 125800838 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 125800866 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 125800953 A C N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 125801075 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 125801078 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 125801099 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 125801135 A C N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.3125 0.0625 0.625 11 21 5 1 10 3 125801203 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 3 125801230 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.25 0.1875 0.5625 11 21 4 3 9 3 125801367 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 125801487 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.266666666666667 0.133333333333333 0.6 10 20 4 2 9 3 125801687 G T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 125802130 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 125802376 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 125802403 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 125802438 T A N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.2 0.133333333333333 0.666666666666667 8 22 3 2 10 3 125802534 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 125802561 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 125802598 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 125802796 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 3 125802957 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 125802962 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 125803071 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125803092 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 125803098 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 125803141 C G N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 125803363 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125804497 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 125804800 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125804863 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 125805062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125805383 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125805658 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125805687 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 125805913 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 125806047 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 125806194 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 125806219 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125806248 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 125806385 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125807191 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125807382 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 125807458 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125807980 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125808293 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125809649 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 125810456 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 125810688 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125812378 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125813247 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 125813362 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125813874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125814815 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125815559 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125816046 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 125816122 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 125816185 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 125816260 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 125816406 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 125816424 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 125816521 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 125816711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125816826 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125818471 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 125820063 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125820497 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125821603 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 125822267 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 125822302 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 125825186 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125826052 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125827482 G C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 125827550 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 125827658 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 125827828 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 125827900 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 125829653 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125839173 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 125839242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125839505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125839547 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 125839568 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 125839630 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 125839892 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 125840124 C T N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.384615384615385 0.538461538461538 0.0769230769230769 17 9 5 7 1 3 125840182 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 125840564 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125840694 A C Y N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.5 0.416666666666667 8 16 1 6 5 3 125840706 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125841653 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 125842141 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125842414 A G Y Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 9 7 2 5 1 3 125842459 A T Y N 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 7 11 1 5 3 3 125842515 C T Y Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 6 8 1 4 2 3 125842551 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 8 10 2 4 3 3 125842563 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.5 0.416666666666667 8 16 1 6 5 3 125843903 C A N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 125843960 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.5 0.416666666666667 8 16 1 6 5 3 125843971 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.5 0.416666666666667 8 16 1 6 5 3 125844147 T G N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 3 125844342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125844407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125844518 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 125844616 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 125844746 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125844797 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125845494 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 125845658 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 125845695 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 125845739 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125846039 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 125846050 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 125846075 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 125846149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125846155 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 125846163 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125846392 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125846940 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 125846955 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 125847214 G T Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 125847262 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 125847316 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125847347 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 125847365 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 125847474 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 125847490 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 125847763 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125848584 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 125848921 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 125848992 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125850035 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125850078 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 125850341 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 125850564 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 125850694 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 125850695 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 125851160 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 125851178 T C N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 3 125851197 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 125851320 A C N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 125851330 C T N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 125851562 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 125851573 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 0.142857142857143 0.214285714285714 20 8 9 2 3 3 125851599 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 125851606 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 125851618 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 125851756 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125851870 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125851893 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125851914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125851941 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125851948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125851991 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 125852689 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 125852804 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125853584 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 125853625 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 125853715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125853950 G T Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 125854014 T C Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 125854157 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 125854165 C T Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 125854260 T A Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 125854316 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 125854367 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 125854378 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 125854420 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 125854775 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 125854783 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 125854815 A T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 125854946 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 125855013 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 125855290 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 125855296 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 125855350 T G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 125855358 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 125855397 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 125855599 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 125855618 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 125855853 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 125855980 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 125856042 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 125856076 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 125856089 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 125856129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125856179 G C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 125856198 A G Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 125856223 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 125856261 C A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 125856409 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125856487 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 125856798 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 125856937 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 125857083 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 125857097 C A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 125857131 T G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 125857247 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125857881 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 125858170 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 125858399 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125859631 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125860378 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 125860434 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 125860472 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 125860474 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 125860485 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 125860488 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 125860528 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 125860573 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 125860589 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 125860627 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125860786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125861101 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 125861476 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 125861641 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 125861697 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 125868711 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125868746 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125868802 G T N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 3 125869014 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 125869070 T G Y N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 16 12 6 4 4 3 125869397 T C N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 3 125869564 C G Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 125869656 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 125869943 G C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 125870064 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 125870154 T A Y N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 125870183 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 125870907 C T Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 3 125872014 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 125872035 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 125872362 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 125872399 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 125872492 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 125872753 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 125872778 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 125873113 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 125873320 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 125873411 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125873426 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 125874517 G T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 125874578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125874579 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125874707 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125877707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125878949 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125879416 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125881551 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 125882397 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 125883652 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 125884070 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 125884193 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125884316 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 125884419 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125884439 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 125884545 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 125884573 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 125888132 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 125888750 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 125888849 G T N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 3 125889032 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 125889070 G T Y N 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 10 8 4 2 3 3 125890140 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 125890661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125890922 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125891152 G A N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 3 125891340 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125891435 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125896848 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 125896891 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 125896958 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 3 125897163 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125897190 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125897371 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 125897429 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 125897725 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0 0.65 0.35 13 27 0 13 7 3 125897768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125898645 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125898788 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125898794 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125898825 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 125898974 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 125899034 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125899100 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125899153 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125899344 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125899367 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 125899381 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 125899427 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 125899535 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 125899554 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 125899644 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 125899698 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 125899714 T C N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 125899721 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 125899747 G A N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 3 125899866 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 3 125899893 G C N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 125899912 A T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 125900357 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 125900406 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 125900437 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 125900469 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 125900521 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 125900556 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 125900576 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 125900947 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125901095 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 3 125901108 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125901185 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125901370 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 125901549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125901601 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 125902157 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125902468 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 125903098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125903260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125903465 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 125903679 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125903769 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 125903879 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 125903916 G C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 125904044 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 125904094 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125904147 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 125904308 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 125904801 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125904823 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 125904850 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 125905185 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 125905207 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 125905320 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125905336 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 125905405 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 125905510 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 125905551 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 125905571 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 125905637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125905654 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 125905680 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 125905720 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125905900 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 125905911 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 125905964 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 125906002 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 125906019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125906050 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 125906090 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 125906159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125906254 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 125906290 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 125906364 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 125906372 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 125906390 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 125906393 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 3 125906447 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 125906466 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 3 125906485 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125906518 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 125906604 T A N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 125906648 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 125906673 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 125906753 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 125906775 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 125906798 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 125906807 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 125906858 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 125906938 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 125907032 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125907062 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125907244 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125907343 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 125907366 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125907416 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 125907427 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 125907456 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 125907867 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 125908307 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 125908582 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125908709 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125909144 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 125909145 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 125909322 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125909743 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 125909900 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 125909942 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 125910003 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 125910012 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 125910101 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 125910281 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 125910722 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 125910906 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125911087 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125911102 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125911235 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 125911266 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125912068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125912309 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 125912322 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 125913030 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 125913191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125913235 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 125913320 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 125913686 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125913860 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125913959 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 125914430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125914482 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 125914513 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125914539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125914798 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 125914836 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125914914 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 125915175 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 125915410 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 7 5 1 5 0 3 125916367 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125916590 C G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 125916621 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 125916723 C A N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 125917389 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125917533 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125917624 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 125917941 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 125918000 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 125918131 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 125918236 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125919457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125920079 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 125920868 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 125920951 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 125921195 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 125921307 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 125921627 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 125921756 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 125922149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125923312 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 125923711 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125923823 G A Y Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 12 8 4 4 2 3 125923841 A T Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 125923930 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 125924599 T A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 125924651 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125925119 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 125925303 G A Y Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 125925463 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 125926148 A C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 125926172 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125927454 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125927652 T A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 125927736 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 125928164 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125928174 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125928263 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125928432 G A Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 125928535 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 125928797 G C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 3 125928914 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 125929221 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125929946 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 125929957 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 125930268 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125930343 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125930359 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125930472 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125930551 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125930634 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125930827 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 125931022 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 3 125931038 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 125931105 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 125931412 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 125931424 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 125931477 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 125931565 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 125931615 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 125931629 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 125931704 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 125931724 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 125932186 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125932282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125932383 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 125932393 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 125932401 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 125932432 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 125932501 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 125932553 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 125932561 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 125932595 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 125932656 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125932690 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 125932890 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 125932943 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 125932947 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 125932962 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 125933000 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 125933001 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 125933072 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 125933076 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 125933299 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 125933514 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 125933735 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 125933779 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125933856 T G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 125933988 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 125934056 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125934211 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 125934317 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 125934339 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 125934552 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125934730 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 125934856 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125935016 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125935260 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 125935368 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 125935370 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 125935438 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125935520 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 125935542 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 125935634 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 125935652 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 125935725 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 125935782 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 125935791 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 125935882 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 125935895 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 125935928 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 125935970 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 125935995 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 125936026 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 125936054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125936211 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 125936440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125936579 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 125936608 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 125936636 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125937048 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125937178 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 125937225 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 125937235 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125937299 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 125937460 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 125937639 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 125937773 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125937894 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 125938188 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 125938232 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 125938250 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 125938347 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125938383 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 125938417 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 125938422 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 125938454 T G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 125938564 C T Y Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 3 125938609 G C N N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 3 125938672 T C Y Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.272727272727273 0.545454545454545 0.181818181818182 12 10 3 6 2 3 125938693 G A Y Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 3 125938695 A C Y N 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 3 125938707 A G Y Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 11 9 3 5 2 3 125938735 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 125938821 T A Y N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 3 125938859 C A Y N 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 12 6 3 6 0 3 125938957 C A Y N 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0 0.75 0.25 6 10 0 6 2 3 125939033 G A Y Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 3 125939175 G T Y N 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 3 125939192 G A Y Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 9 11 2 5 3 3 125939260 T G Y N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 3 125939319 G C N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 125939415 G A Y Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 3 125939567 A T N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 125939711 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 125939713 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 125939757 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 125939783 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 125939805 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 125939831 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 125939852 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 125939893 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 125939923 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 125939940 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 125940148 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 125940295 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 125940320 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125940446 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 125940539 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 125940612 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125940701 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 125940726 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 125941327 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 125941400 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125941555 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125941659 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 125941816 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 3 125941906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125941939 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 125942013 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125942020 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125942195 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 125942416 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 125942613 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 125942658 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125942667 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 125942845 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 125943396 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 125943841 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 125943933 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 125944145 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 125944345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125944999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125945076 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 125945704 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 3 125945729 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 125946691 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 125946695 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 125946778 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 125946951 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 125947250 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 125948191 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 125948192 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125948360 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 125948465 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 125948926 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125949189 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 125949204 C A Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 125949947 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125950596 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 125950853 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125951029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125951281 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 125951827 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125951932 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125951953 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 125952311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125953414 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 125953971 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 125954790 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 125954840 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 125954924 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 125955099 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 125955111 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 125955150 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 125955212 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 125955222 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 125955280 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 125955360 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 125955369 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 125955472 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 125955485 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 125955498 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 125955535 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 125955550 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 125955570 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 125955600 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 125955685 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 125955714 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 125955728 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 125955733 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 125955859 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 3 125955973 C A N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 125956229 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 125956240 A G Y Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 3 125956310 G A N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 3 125956329 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 3 125956353 G A N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 3 125956425 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 125956472 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 125956488 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 125956489 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 125956507 G T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 125956547 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 125956600 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 125956602 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 125956689 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 125956692 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 125956771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125957142 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 125957610 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 125957908 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 125957932 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 125958030 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 125958179 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 125958293 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 125958420 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 125958471 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 125958631 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 125958691 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125958869 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 125958961 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 125959151 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 125959213 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 125959236 T G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 125959237 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 125959285 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 125959286 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 125959296 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 125959318 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 125959332 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 125959343 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 125959352 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 125959488 A C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 125959603 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 3 125959668 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 125959696 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 125959715 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 125959875 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 125959908 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 125959934 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 125960043 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 125960163 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 125960241 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 125960252 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 125960419 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 125960440 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 125960503 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125960524 T G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 125960646 A G N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 125960698 C T Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 3 125961238 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 125961511 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125961713 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 125961854 G T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 125962023 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 125962054 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 125962223 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 125962285 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 125962295 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 125962306 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 125963378 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125963766 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 125963810 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 125964012 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 125964544 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125964589 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 125964739 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 125971837 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125972044 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125972372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125973053 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 125973524 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 125973581 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125973592 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125973880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125974551 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125974674 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125974975 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 125975176 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125975231 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125976842 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 125976965 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 125978911 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125980047 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125980146 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125980254 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125980712 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125980944 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 125982017 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125982534 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125983317 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125985962 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125987496 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 125989027 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125989480 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125989781 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 125990600 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125990751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125991596 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125991867 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125992150 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125992849 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125994722 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 125995366 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 125997020 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125997285 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125997446 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 125998194 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 125998221 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125998257 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 125998644 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 125998786 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 125999233 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 125999311 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 125999654 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 126000050 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 126000070 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 126000071 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 126000331 T G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 126000573 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 126000589 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 126000622 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 126000645 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126001032 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 126001647 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126003303 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126003312 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126003509 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 126003518 G A Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 126003528 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126003548 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 126003624 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126003782 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 126003834 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 126003882 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 126003912 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126003976 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 126004095 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 126004568 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 126004607 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 126004775 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 126004957 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 126005079 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126005119 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 126005202 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 126005698 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 126006200 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 126006291 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 126006301 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 126006314 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 126006778 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126006789 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126006913 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126006953 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 126007111 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 126007236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126007266 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126007433 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 126007449 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 126007472 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 126007510 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 126007522 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 126007752 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 126007753 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 126007840 A T N N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 3 126007880 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 126007884 T G N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 126008178 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 126008253 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 126008323 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 126008446 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 126008468 A G N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 3 126008491 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 126008600 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 3 126008620 A G N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 3 126008644 C T N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 126008702 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 126008751 C G N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 126008917 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 126008922 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 126008977 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 126009037 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 126009077 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 126009167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126009172 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 126009217 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 126009327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126009378 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 126009390 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 126009438 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 126009489 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 126009544 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 126009614 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 126009627 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 126009724 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 126009759 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 126009814 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 126009828 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 126009853 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 126009951 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 126010005 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 126010132 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 126010150 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 126010180 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 126010249 T A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 126010330 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 126010338 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 126010403 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126010406 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 126010510 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 126010535 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 126010691 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 126010738 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 126010773 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 126010842 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 126010848 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 126010904 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 126010926 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 126010960 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 126010982 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 126011035 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 126011141 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 126011212 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 126011379 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 126011449 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 126011532 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 126011538 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 126011575 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 126011662 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 126011753 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 126012169 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126012235 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 126012282 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 126012299 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 126012533 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 126012549 C G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 126012557 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 126012616 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 126013185 A C N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 126013276 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 126013335 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 126013605 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 126013854 A T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 126014015 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 126014118 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 126014208 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126014468 A G Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 126014661 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126014723 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 126015196 G A N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 126016832 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126017822 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 126018411 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126018899 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 126020805 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126021193 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 126021326 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 126021365 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 126021400 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 126021498 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126021989 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 126022078 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 126022133 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 126022217 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 126022287 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 126022323 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 126022338 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 126022386 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 126022425 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 126022519 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 126022555 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 126022566 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 126022579 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 126022588 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 126022627 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 126022774 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 126022926 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 126023013 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 126023053 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 126023091 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 126023096 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 126023228 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 126023243 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 126024531 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 126025981 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 126026149 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126027559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126027912 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126028120 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126028750 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126028762 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126028808 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126029869 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 126029952 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 126030257 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 126031561 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 126031826 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126032303 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 126032402 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126034031 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 126034975 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 126035535 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 126035675 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126035971 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126036929 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 126037020 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126038203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126039844 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126040420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126041091 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126041118 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126041367 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126042818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126042854 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126043118 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126043595 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 126043974 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 126044171 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126044272 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 126044443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126044563 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 126044588 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 126044627 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126044654 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126044713 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126044772 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 126045114 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 126045409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126045442 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 126045521 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 126045809 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126046330 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126046535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126046751 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126046815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126046872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126047006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126047112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126047299 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126047431 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 126047839 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126047910 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126048097 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126048154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126048166 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126048367 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 126048373 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 126048453 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126048624 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126049084 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 126049281 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126049489 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126049832 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126049852 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126049881 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126050209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126050308 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126050948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126051364 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126051452 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126051549 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 126051954 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126052034 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126052082 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126052093 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126052396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126052927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126053105 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126053128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126053408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126053500 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 126053720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126053789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126053895 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126054011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126054036 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126054103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126054110 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 126054144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126054367 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126054645 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126054700 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126054825 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126055177 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 126055244 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126055396 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126055961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126056001 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126056328 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126056663 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126057814 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126057911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126058216 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 126059685 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 126059756 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 126059912 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 126059920 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 126060297 G T Y N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 126060298 T G Y N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 126060383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126063526 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126064233 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 126065038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126065993 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126066602 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126068627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126068632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126069326 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126070302 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126070490 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 126071039 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 126071320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126071330 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126072248 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126072661 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 126072692 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126072737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126072826 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126073291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126073334 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 126073351 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126073433 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126073440 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126073775 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 126073840 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 126074033 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126074211 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 126074219 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 126074250 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 126074555 C G N N 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.5 0.1 0.4 11 9 5 1 4 3 126074584 C T N Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.5 0.1 0.4 11 9 5 1 4 3 126074588 G A N Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.5 0.1 0.4 11 9 5 1 4 3 126074596 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 126074632 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 126074660 A C N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.25 0.166666666666667 0.583333333333333 8 16 3 2 7 3 126074772 G T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 126074930 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 126075042 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 126075044 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 126075128 T C N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 3 126075134 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 126075841 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126075852 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 126075873 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126075877 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126075886 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126075937 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126076054 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126076165 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126076594 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 126076787 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 126076804 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 126076820 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 126076848 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 126076874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126076915 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 126076933 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 126077078 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 126077123 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 126077148 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 126077149 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 126077200 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126077208 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 126077230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126077391 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126077529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126077644 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 126077684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126077692 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126077699 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 126078047 A T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 126078056 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 3 126078132 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 126078472 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126079368 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126079623 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 126080297 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126080426 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 126080489 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126080596 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 126080683 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126080995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126081020 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 126081590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126081693 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 126081745 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126082162 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 126082260 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126082379 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 126082547 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 126082680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126083052 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 126083180 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 126083241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126083254 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 126083708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126083753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126084627 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126085172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126085749 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 126086166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126086258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126087087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126087496 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 126088397 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 126088445 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 126088626 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 126088690 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 126088808 A G N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.181818181818182 0.454545454545455 0.363636363636364 9 13 2 5 4 3 126088918 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 126089305 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 126089307 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 126089324 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 126089333 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 126089352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126089355 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 126089456 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 126089508 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 126089569 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 126089594 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 126089649 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126089761 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 126089785 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 126089866 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 126089873 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 126090000 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 126090007 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 126090047 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 126090169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126090199 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 126090529 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 126090542 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126090571 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 126090698 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 126090722 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126090758 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 126090780 T G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 126090893 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 126091661 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 126091744 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126091809 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126092108 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126092188 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 126092276 G T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 126093092 A C Y N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 126093865 G T Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 126096893 A T Y N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 126097155 T G Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 126097156 T A Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 126097199 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126097453 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126098888 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126099116 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 126100440 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126100465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126101182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126101375 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 126103147 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126103760 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126106436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126106781 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126108129 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 126108192 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 126108886 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 126109306 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126109482 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126109652 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 126110545 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 126112622 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 3 126112783 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 126112784 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 126112916 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 126112963 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 126113036 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 126113043 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 126113065 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 126113157 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 126113334 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 126113377 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 126114217 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 126114382 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 126114640 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 126114722 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 126114958 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 126115209 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 126115457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126116865 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 126117018 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 126117030 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 126117481 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 126117490 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 126117935 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126118541 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 126120790 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 126124013 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126124420 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 126124793 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 126125367 T G Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 126125462 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 3 126125473 T A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 126125679 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126126562 G T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 126127068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126128130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126128382 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 126128897 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 126129195 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 126130586 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 126131511 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126132501 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 126132907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126133093 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 126133124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126133143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126133307 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 126133411 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126135177 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 126135565 G A Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 126135731 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126136296 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 126136448 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126137555 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126138185 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 126138392 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126138471 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126138602 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 126139246 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 126139411 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126140633 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 126140865 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126142343 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 126142429 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 126142488 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126142748 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 126142811 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 126142815 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 126143037 G T Y N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 126143147 T C Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 3 126143192 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 126143523 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126143637 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126143819 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126143886 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 126143892 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 126144050 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 126144051 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 126144694 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 126144698 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 126144767 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 126144876 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 126144905 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 126144929 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 126144931 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 126144995 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 126145088 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 126145527 C A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 126145708 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 126145958 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 126145997 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 126146324 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 126146334 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 126146335 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 126146387 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 126146449 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 126146470 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 126146544 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 126146701 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 126146713 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126146728 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 126146729 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 126146975 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 126147609 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 126147881 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 126148108 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 126148463 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 126148520 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 126148546 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 126148868 A T N N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 3 126148884 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 126148907 A C Y N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.545454545454545 0.272727272727273 0.181818181818182 15 7 6 3 2 3 126148954 A G N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 126148970 G C Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 3 126148979 C A N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 3 126149082 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 126149216 C T Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 126149293 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 126149331 C G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 126149332 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 126149382 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126149394 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 126149424 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 126149430 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 126149453 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 126149499 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 126149662 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 126149845 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 126149857 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 126149861 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 126149908 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 126149964 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 126149967 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 126149995 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 126150237 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126150441 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 126150494 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 126150498 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 126150549 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 126150790 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126150823 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 126151009 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 3 126151030 A C N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 3 126151043 T A N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.307692307692308 0.615384615384615 0.0769230769230769 16 10 4 8 1 3 126151350 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 126151486 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 126151511 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 126151566 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 126151594 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126151699 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 126151720 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 126151731 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 126151757 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 126151931 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126151986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126152034 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126152056 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 126152164 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 126152173 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 126152195 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 126152219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126152282 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126152306 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 126152630 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 126152840 C G Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 126153018 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126153057 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126153177 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 126153256 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 126153356 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 126153405 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 126153408 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 126153447 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 126153452 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126153495 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 126153513 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 126153595 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 126153707 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 126153734 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 126153774 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 126153880 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 126153923 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 126153984 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 126154073 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126154080 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 126154089 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 126154091 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 126154177 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 126154288 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 126154290 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 126154451 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 126154473 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 126154500 A C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 126154520 T A N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 126154535 C T N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 126154825 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 126154829 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 126154889 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 126154905 G T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 126154918 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 126154941 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 126154986 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 126155001 C A Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 126155104 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 126155184 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 126155199 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 126155273 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 126155390 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 126155408 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 126155429 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 126155569 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126155617 T A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 126155819 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 126155859 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 126155860 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 126155891 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 126155909 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 126156039 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 126156062 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 126156197 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 126156243 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 126156380 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 126156518 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 126156734 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 126156746 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 126156775 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 126156833 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 126156879 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 126157002 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 126157291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126157318 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 126157401 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 126157529 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 126157547 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 126157555 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 126157567 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 126157623 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 126157639 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126158518 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126159035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126159720 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126159741 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 126159861 G T N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 126159962 T G N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 126159975 G A N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 3 126160024 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 126160032 T C N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 3 126160135 A C N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 126160149 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 126160188 T A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 126160258 A T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 126160338 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 126160865 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 126160925 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 126160964 A C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 126161588 C T N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 126161750 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 126162049 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 126162142 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126162237 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 126163036 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 126163041 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126163059 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 126163117 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 126163207 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126163566 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 126163845 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 126164006 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 126164013 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 126164322 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126164790 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 126164846 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 126165021 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126165045 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126165050 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 126165072 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 126165103 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 126165171 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 126165775 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 126165876 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 126166085 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 126166178 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 126166181 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 126166312 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 126166342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126166464 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 126166513 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 126166534 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 126166547 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 126166566 G C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 126166568 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 126166607 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 126166635 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 126166640 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 126166710 T A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 126166736 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 126166748 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 126166858 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 126166970 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 126166991 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126167098 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 126167108 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 126167135 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 126167157 C T Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 126167291 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 126167292 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 126167520 A C Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 126167527 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 126167532 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 126167553 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 126167618 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 126167843 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 126167932 G A Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 126168120 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126168183 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 126168193 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 126168863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126168922 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 126169003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126169035 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 126169066 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 126169272 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126169281 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 126169732 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 126169737 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 126169919 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 126169968 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 126170021 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 126170177 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126170815 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126171311 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 126171356 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 126171643 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 126171995 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 126172144 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 126172392 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126172514 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 126172827 T C Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 126173226 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 126173690 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 126174313 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 126174686 A C N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 3 126174849 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 126175462 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 126175887 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 126176211 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 126176475 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 126176675 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 126176837 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 126176907 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126176916 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 126176954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126177076 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126177509 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126177689 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126178023 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 126178421 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 126178510 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 126178526 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 126179182 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 126179482 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 126179848 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126180103 G T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 126182214 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126182708 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126185362 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 126185613 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 126186203 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 126186648 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 126187789 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126187992 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 126188814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126190896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126191209 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126192640 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 126192992 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126192993 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126194436 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126194742 G C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 126196645 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 126196659 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 126196790 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 126196993 G A Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 3 126197004 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 3 126197643 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 126200350 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 126201948 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 126202832 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 126203328 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 126204350 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 126204517 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 126204688 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 126204735 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 126205328 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 126206035 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126206594 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126207888 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 126207901 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126207940 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 126208140 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 126208398 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 126209479 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 126210003 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 126210178 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 126210228 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 126210862 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 126213885 C T Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 126213972 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 126214055 T C Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 126215611 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 126215660 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 126215989 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 126216225 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 126216940 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 126217129 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126217679 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 126217707 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 126217759 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 126217833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126218077 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 126218131 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 126218300 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 126218390 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 126218430 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 126218459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126218531 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 126218535 C G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 126218696 G C N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 126218709 C G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 126218718 T G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 126218771 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 126218804 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 126219004 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 126219038 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 126219184 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 126219575 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 126219647 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 126219836 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 126219919 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 126219965 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 126220010 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 126220018 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 126220054 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 126220065 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 126220237 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 126220369 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 126220397 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 126220539 G T Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 126220676 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 126220816 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 126221644 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 126222243 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 126222615 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126223307 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 126224226 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 126224899 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 126224923 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 126224955 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 126224957 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 126225045 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 126225097 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126225255 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 126225270 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 126225308 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 126225338 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 126226235 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 126226658 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 126226884 A C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 126227947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126227972 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 126228230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126229444 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 126229978 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 126230105 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 126230106 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 126230190 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 126230323 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 126230482 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 126230590 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 126230877 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 126230980 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 126231126 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 126231360 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 126231501 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 126231717 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 126231803 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 126231815 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 126231865 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 126231935 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 126231944 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 126231973 A T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 126232101 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 126232158 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 126232458 A C N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 126232645 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 126233334 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 126233355 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 126233410 G C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 126233442 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 126233570 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 126233609 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 126233716 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 126233753 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 126234204 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 126234234 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 126234307 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 126234339 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 126234345 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 126234393 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 126234636 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 126234889 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 126234953 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 126235101 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 126235112 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 126235325 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 126235391 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 126235486 G A N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 3 126235523 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 126235739 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 126235897 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 126235914 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 126235924 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 126235998 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 126236028 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 126236060 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 126236073 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 126236076 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 126236099 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 126236100 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 126236262 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 126236297 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 126236709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126236715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126236852 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 126236899 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 126237198 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 126237357 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 126237619 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 126237754 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 126238191 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126238433 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 126239029 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 126239201 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 126239244 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 126239259 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126239307 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 126239313 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 126239332 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 126239335 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 126239441 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 126239699 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126239846 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 126240031 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 126240036 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 126240071 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 126240239 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 126240635 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 126240730 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126240749 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 126240837 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 126240866 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 126240916 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 126241376 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 126241507 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 126241510 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 126241533 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 126241754 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 126241764 C G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 126242156 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 126242157 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 126242410 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 126242514 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 126242653 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 126242660 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 126243182 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 126243266 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 126243301 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 126243367 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 126243383 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 126243389 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 126243608 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 126243828 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 126244247 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 126244259 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 126244320 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 126244331 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 126244415 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 126244501 C A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.352941176470588 0.117647058823529 0.529411764705882 14 20 6 2 9 3 126244539 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 126244798 T G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 126244801 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 126244828 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 126244918 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 126245066 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 126245071 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 126245189 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126245250 T A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126245252 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126245267 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 126245275 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 126245286 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126245319 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 126245555 T C Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 126246239 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 126246240 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 126246308 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 126246393 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 126246421 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 126246569 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 126246577 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 126246617 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 126246622 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126246653 G A Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 126246722 G C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 126246733 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 126246839 T C Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 3 126246871 T C Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 126246908 A C Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 3 126247072 G A Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 126247163 A C Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 126247177 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 126247197 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 126247201 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126247388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126247619 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 126247858 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126248014 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 126248578 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 126248684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126248935 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 126248939 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 126248946 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 126249010 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 126249092 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126249103 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 126249154 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 126249177 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 126249313 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126249543 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 126249554 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 126249596 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126249610 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 126249638 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 126249708 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126249911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126250326 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 126250406 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126250496 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126250553 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126250583 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 126250597 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126250637 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 126250689 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 126250737 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 126250758 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 126250811 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126250924 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 126250996 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 126251196 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126251342 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 126251436 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126251518 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 126251544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126251550 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 126251597 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 126251677 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 126251692 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 126251703 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 126251714 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 126251730 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126251745 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 126251807 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 126251826 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126251837 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 126251904 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126251907 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126251924 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126251958 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126252073 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126252105 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126252174 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 126252427 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 126252614 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 126252696 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 126252732 T A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 126253171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126253326 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 126254137 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126254376 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 126254534 T A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 126254873 C G Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 126254894 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126254905 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 126254908 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 126255054 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 126255210 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 126255273 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 126255307 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 126255392 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 126255393 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 126255409 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 126255462 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 126255681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126255726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126255861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126255975 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126256367 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126256469 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 126256520 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 126256537 C T Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 126256729 G T N N 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 6 10 2 2 4 3 126257143 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126257388 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126257438 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 126257482 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 126257691 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 126257804 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 126258170 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 126258200 A T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 126258272 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 126258330 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 126258375 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 126258561 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 126258687 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 126258709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126258979 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126259078 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 126259318 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126259692 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 126259897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126260177 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 126260289 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126260348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126260440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126260477 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126260510 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 126260561 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126260597 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 126260637 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 126260679 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 126260780 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 126260953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126261115 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126261154 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126261158 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126261231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126261273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126261359 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126261461 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126261489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126261493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126261553 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 126261737 T G N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 126262285 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 126262389 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 126262555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126262783 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126263124 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 126263192 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 126263224 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 126263394 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 126263956 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 126264130 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 126264388 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 126265085 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 126265364 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 126265504 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 126265586 A T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 126265609 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126266026 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 126266035 T A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 126266264 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 126266284 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 126266287 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 126266332 A G Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 126266721 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126266735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126266999 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 126267019 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 126267204 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 126267214 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 126267260 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126267711 T A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126267740 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 126267741 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126267918 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126268529 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 126268641 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126268836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126269127 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126269233 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 126269291 C G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126269325 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126269404 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126269503 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 126270143 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 126270274 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 126270653 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 126271572 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 126272242 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 126272569 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126273376 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 126273390 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 126273420 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 126273503 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 126273748 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 126273755 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 126274003 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 126274188 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126274334 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 126274412 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 126274493 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126274868 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126274936 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 126275131 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 126275166 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 126275169 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 126275208 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 126275286 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 126275455 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126275547 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126275617 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126275779 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 126275851 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126275908 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 126275943 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126275949 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126275961 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 126276101 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 126276237 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126276326 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 126276800 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 126276870 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 126276923 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 126276980 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126277025 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 126277125 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 126277133 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 126277208 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 126277456 G A N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.538461538461538 0.153846153846154 0.307692307692308 16 10 7 2 4 3 126277525 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 126277526 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 126277593 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 126277688 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126277821 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 126277876 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 126277893 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 126277894 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 126277945 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 126277988 A G N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 126278070 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 126278111 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 126278238 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 126278256 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 126278281 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 126278490 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 126278544 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 126278565 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 126278585 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 126278587 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 126278603 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 126278757 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 126278798 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 126278899 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 126278960 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 126278999 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 126279160 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 126279372 C A N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.375 0.1875 0.4375 15 17 6 3 7 3 126279881 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 126279907 A C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 126280087 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126280184 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126280275 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 126280369 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 126280382 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126280468 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 126280523 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 3 126280651 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 126280672 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 126280718 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 126280748 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 126280752 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 126280807 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 126280863 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 126280976 A T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 126281079 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 126281088 C A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 3 126281224 A C N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.666666666666667 0.133333333333333 0.2 22 8 10 2 3 3 126281226 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 3 126281289 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 126281290 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 126281409 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126281468 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 126281524 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 126281644 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126281676 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126281718 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 14 26 6 2 12 3 126281756 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126281802 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 126281978 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 126282026 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126282068 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 126282218 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 126282231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126282324 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 126282399 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 126282471 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 126282572 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 3 126282623 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 126282902 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 126282993 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 126283013 T G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 126283015 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 126283029 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 126283092 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 126283113 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 126283145 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 126283213 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 126283264 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 126283298 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 126283394 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 126283492 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 126283551 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 126283771 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126283873 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 126283916 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 126283941 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 126283993 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 126284014 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 126284028 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 126284238 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 126284239 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 126284275 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 126284386 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.333333333333333 0.0555555555555556 0.611111111111111 13 23 6 1 11 3 126284423 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 126284427 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126284517 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 126284537 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 126284748 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126284929 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 126284962 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 126285066 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 126285527 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.578947368421053 0.105263157894737 0.315789473684211 24 14 11 2 6 3 126285583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126285652 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126285660 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126285675 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126285739 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 126285851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126286209 G C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 126286313 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 126286381 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 126286510 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126286832 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 126286964 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 126287057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126287147 A C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126287156 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 126287395 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126287421 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126288076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126288174 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126288295 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 126288431 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 26 14 12 2 6 3 126288473 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 126288524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126288527 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126288640 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126288650 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 126288681 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 126288718 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 126288738 T G N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 3 126288754 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 126288789 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 126289068 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.611111111111111 0.111111111111111 0.277777777777778 24 12 11 2 5 3 126289118 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.578947368421053 0.105263157894737 0.315789473684211 24 14 11 2 6 3 126289153 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126289689 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.333333333333333 23 13 11 1 6 3 126289930 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126289942 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 26 14 12 2 6 3 126289948 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126289974 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 26 14 12 2 6 3 126290005 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 126290287 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 26 14 12 2 6 3 126290350 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126290545 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126290689 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 126290730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126290831 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 126291022 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126291063 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 126291136 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 126291144 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126291192 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 126291217 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126291244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126291273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126291396 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126291494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126291510 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 126291606 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 126291717 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 126291758 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126291869 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 126291896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126291907 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126291926 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 126291939 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126291972 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126291975 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 126292001 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 126292015 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126292037 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126292454 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 126292580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126292796 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 126292802 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 126292810 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 126293085 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 126293238 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 126293248 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 126293259 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 126293352 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 126293720 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 126293835 G T Y N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 3 126293981 A C N N 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 10 6 4 2 2 3 126294093 T C N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 12 8 5 2 3 3 126294249 A T N N 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 3 126294257 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 126294301 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 126294323 G A Y Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 6 8 2 2 3 3 126294478 A T N N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 3 126294691 T G N N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 3 126294858 G A Y Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 3 126294924 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 6 12 2 2 5 3 126295040 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 126295125 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 126295266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126295326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126295438 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 126295462 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 126295913 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 126296334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126296393 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126296400 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126296578 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126296931 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126297779 C T Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 126298711 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 126298979 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126299591 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 126299610 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 126299650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126299756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126299778 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 126301095 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 126301186 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 126301448 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 126301554 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 126301596 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 126301753 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 126302185 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 126302238 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126302240 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 126302316 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 126302379 A T Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 126302388 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126302593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126302596 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 126302621 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 126302772 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 126302843 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 126302895 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 126302927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126302935 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 126303177 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 126303341 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 126303344 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 126303354 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 126303972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126303975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126304012 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126304100 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126304182 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126304190 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126304239 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 126304388 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126304403 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 126304503 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126304703 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 126304838 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126304880 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 126305199 T C N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 126305247 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 126305696 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 126306122 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 3 126306187 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 126306264 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 126306464 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 126306515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126306554 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 126306640 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 126306785 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 126306788 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 126307053 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 126307282 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 126307300 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 126307325 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126307384 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 126307557 A C Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 126307635 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 126307749 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126308005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126308155 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126308208 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 126308253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126308325 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126308589 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 126309168 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 126309312 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 126309730 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 126310032 T C N Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.6 0 0.4 6 4 3 0 2 3 126310152 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 126310164 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 126310658 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 126311214 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 126311231 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 126311576 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 126311634 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 126311656 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 126311715 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 126311904 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 126311981 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 126312119 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 126312216 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 126312491 G T Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 3 126312495 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 3 126312505 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 126312898 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 126313024 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 126313233 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 126313248 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 126313251 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 126313287 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126313857 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 126313895 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 126313931 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126314202 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 126314364 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 126314611 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 126314639 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 126314647 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 126314655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126314765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126314797 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 126314816 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 126314830 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 126314885 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126315228 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 126315862 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 126315949 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126316386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126317270 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 126317760 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 126317841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126318048 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126320306 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 126320480 T A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 126320972 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126321277 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126321534 G T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 126321700 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126322457 T A N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 126322618 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 126322794 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 126322843 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 126322872 G T N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 3 126322985 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 126323012 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 126323053 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.25 0.333333333333333 0.416666666666667 10 14 3 4 5 3 126323184 G T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 126323204 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 126323387 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 126323398 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 126323490 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 126323593 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 126323603 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 126323668 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 126323954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126323997 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 126324197 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 126324246 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 126324287 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 126324510 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 126324586 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126324864 T A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 126324946 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 126325403 T G Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 126325416 G T Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 126325428 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 126325447 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 126325582 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 126325613 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 126325701 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 126325719 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 126325752 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 126325779 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 126326064 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.15 0.85 0 23 17 3 17 0 3 126326140 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 126326177 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 126326194 C G Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 126326298 G T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 126326347 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 126326356 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 126326394 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 126326416 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 126326434 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 126326440 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 126326470 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 126326608 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126326643 C A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 126326674 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 126326687 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126326752 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126326842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126327034 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 126327113 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 126327182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126327220 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 126327224 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 126327262 G C Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 126327285 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 126327501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126327580 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 126327795 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126327859 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 126327898 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 126328000 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 126328048 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 126328187 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 126328678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126328927 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 126329153 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 126329440 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 126329443 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 126329546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126329663 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 126329700 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 126329797 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 126329893 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 126329898 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 126330020 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 126330033 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 126330053 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 126330063 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 126330117 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 126330161 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 126330205 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126330230 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 126330267 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 126330429 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 126330430 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 126330442 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 126330484 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 126330710 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 126330759 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 126330913 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 126331065 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 126331087 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 126331153 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 126331183 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 126331265 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 126331285 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 126331286 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 126331379 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 126331413 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 126331444 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 126331611 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 126332002 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 126332072 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 126332096 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 126332099 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 126332116 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 126332151 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 126332304 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 126332589 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 126332643 C A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 126332649 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 126332675 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126332837 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 126332859 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 126332869 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 126332913 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 126332926 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 126332961 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 126333025 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 126333156 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 126333182 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 126333224 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 126333232 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 126333287 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 126333295 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 126333361 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 126333389 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 126333618 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 126333750 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 126333838 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 126333909 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 126333923 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 126334026 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 126334265 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 126334412 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 126334504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126334526 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 126334905 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 126336463 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126336480 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 126337062 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 126337206 A T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 126337562 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 126337718 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 126337878 A C N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 126337893 G T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 126337975 G A Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 126338019 A G N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 126338228 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 126338243 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 126338297 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 126338332 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 126338465 A C N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 126338608 T G N N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 3 126338717 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126338749 C A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 126338750 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.333333333333333 0.2 0.466666666666667 13 17 5 3 7 3 126338926 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 126339073 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 126339162 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126339211 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126339421 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126339493 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126339623 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 126339654 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126339769 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126339805 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 126340428 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 126340429 A G Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 126340607 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 126340677 A G Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.333333333333333 0.6 0.0666666666666667 19 11 5 9 1 3 126340801 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 126340912 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 126340960 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 126340963 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126341041 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 126341571 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 126341581 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 126341797 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 126342946 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126343520 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 126344350 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 126344351 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 126344374 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 126344833 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126345202 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 126345888 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 126345912 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 126346000 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 126346106 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 126346110 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 126346722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126347935 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 126347978 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 126348318 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 126348558 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126348621 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 126350604 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 126351180 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126351369 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 126351954 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 126354605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126355833 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126358213 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 126359506 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 126359538 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 126359599 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 126359692 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 126363775 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 126363962 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 126364119 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 126364170 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 126364240 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 126364378 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 126364452 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 126364516 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 126364604 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 126364617 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 126364739 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 126364809 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 126364930 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 126365006 C G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 126365052 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 126365074 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 126365137 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 126365143 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 126365198 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 126365201 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 126365301 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 126365578 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 126365579 T G Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 126365609 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 126365696 T A Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 126365715 G T Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 126365726 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 126365815 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 126365819 T C Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 126365862 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 126365884 A C Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 3 126366107 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 126366145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126366236 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126366243 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 126366259 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 126366293 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 126366419 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 126366429 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 126366490 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 126366648 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 126366649 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 3 126366708 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 126366763 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 126366764 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126366774 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 126366897 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 126366957 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 126367026 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 126367054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126367256 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126367330 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 126367401 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 126367444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126367499 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 126367572 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 126367732 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 126367864 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 126367928 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 126368255 C A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 126368935 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 126368964 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 126369033 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 126369051 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 126369067 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 126369146 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 126369218 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 126369462 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 126369532 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 126369791 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 126369806 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 126369825 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 126369907 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 126369914 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 126370616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126370634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126370654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126370655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126370873 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 126370965 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 126371212 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126371401 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 126371466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126371504 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 126371533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126371606 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 126371628 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 126371971 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 126371973 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 126372016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126372042 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 126372046 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 126372220 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 126372445 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 126372589 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126372647 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126372953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126372966 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126374005 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 126374049 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 126374192 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126374229 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126374452 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 126374623 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126375207 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 126375333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126375755 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126376051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126376052 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 126376140 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 126376251 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126376275 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 126376292 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 126376325 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 126376838 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 126376981 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 126377028 A G N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 3 126377123 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 126377246 C T N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.384615384615385 0.230769230769231 0.384615384615385 13 13 5 3 5 3 126377253 G A N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.333333333333333 0.25 0.416666666666667 11 13 4 3 5 3 126377265 A G N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 3 126377301 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 126377537 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 126377550 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 126378305 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 126378363 T C Y Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 3 126378808 T G Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 126378962 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126379012 A G Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 126379198 A G N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 6 10 1 4 3 3 126379516 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 126379772 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 126380073 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 126380339 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 126380450 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126380507 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 126380612 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 126380963 A C Y N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.0666666666666667 0.666666666666667 0.266666666666667 12 18 1 10 4 3 126381071 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 126381233 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 126381570 A G Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 126381897 G A Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 126382009 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 126382110 C G N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 126382183 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 126382230 C A N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 3 126382722 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 126382723 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 126382770 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 126382802 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 126383070 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 126383183 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 126383821 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 126383901 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 126383902 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 126384232 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 126384643 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 126384746 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 126384917 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 126384990 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 126385052 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 126386300 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 126386351 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 126387449 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 126388910 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 126389764 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 126390302 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 126390350 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126390360 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 126390489 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 126390509 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 126390830 T A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 126391231 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 126391326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126391787 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 126392056 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 126392427 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.2 0.133333333333333 0.666666666666667 8 22 3 2 10 3 126393340 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 126393509 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 126393651 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 126393683 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 126393942 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126394022 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 126394109 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 126394152 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 126394226 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 126394409 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126394620 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 126394691 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 126394735 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 126395233 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 126395581 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 126395858 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 126395859 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 126395884 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 126395908 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 126396025 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 126396054 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 126396253 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 126396753 A T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 126397243 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 126397352 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 126399521 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 126399680 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 126400466 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 126401821 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126401878 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 126402149 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 126402161 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 126402940 A T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 126403016 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 126404066 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 126404247 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 126405043 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 126405120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126405503 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 126405567 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 126406161 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 126406483 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 3 126406727 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126406745 A C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 126406746 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 126407248 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126407269 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126407334 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 126407732 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 14 26 6 2 12 3 126408220 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 126408254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126408559 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 126408733 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 126408925 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 126409939 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 126409984 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 126410074 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 126410206 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 126410235 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 126410238 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 126410799 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 126412298 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 126412336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126412439 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 126412835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126412839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126412868 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126413004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126413111 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 126413213 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126413242 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126413378 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 126413387 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126413432 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 126413574 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126413597 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126413615 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126413627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126413640 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126413665 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126413686 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126413721 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126413833 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126413927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126413980 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126414023 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126414043 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126414132 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126414146 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126414339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126414361 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126414433 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126414475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126414534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126414606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126414939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126415039 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 126415130 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 126415459 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 126416658 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 126417249 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 126417792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126418610 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 126418615 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 126418762 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 126418767 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 126419203 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 126419220 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 126419228 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 126419251 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 126419407 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 126419414 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 126419500 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126419621 A T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 126419649 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 126420735 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 126421932 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 126422452 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 126422705 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126423522 G A N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.307692307692308 0.615384615384615 0.0769230769230769 16 10 4 8 1 3 126424476 T G N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.230769230769231 0.538461538461538 0.230769230769231 13 13 3 7 3 3 126424639 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 126425123 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126425137 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 126425290 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 126426588 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 126426881 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 126427328 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 126427894 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 126428198 G A N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 126428666 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 126429293 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 126429548 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 126429621 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 126429704 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 126430054 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126431646 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 126432815 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126434823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126435208 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 126435254 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 126436517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126436798 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 126437727 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 126437933 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 126438066 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126438109 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 126438403 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 126438407 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 126438429 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 126438493 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 126439614 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 126439655 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 126439804 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 126439883 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 126439936 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 126440038 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 126440653 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 126441532 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 126441539 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 126441560 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 126442354 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 126442611 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 126442633 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 126442864 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 126443039 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 126443268 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 126443435 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 126443637 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 126443779 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 126443847 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 126443973 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 126444545 T A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 126444777 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 126444917 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 126444951 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 126449207 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126449607 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 126450278 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 126450956 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 126452050 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 126453683 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 126454477 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126454479 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 126457747 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 3 126457978 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126458118 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126459683 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 3 126460102 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 126460115 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126460133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126460208 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 126460320 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 126460383 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 126460417 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 126460596 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 126460603 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 126460611 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 126460664 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 126460734 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 126460832 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 126460873 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 126460903 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 126460923 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 126460955 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 126461067 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 126461100 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 126461107 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 126462097 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 126462125 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 126462169 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126462322 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 126462966 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 126463246 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 126463281 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 126463806 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 126463822 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 126463880 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 126463900 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 126463918 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 126463919 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 126464134 T G Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 126464298 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126464467 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 126464520 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 126464989 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 126465235 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 126465324 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126465406 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 126465650 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 126465784 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 126465852 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 126466362 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126467397 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 126467482 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126467568 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 126467656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126467674 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126467902 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126468458 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 126471802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126471916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126471950 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 126472275 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 126472299 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 126473111 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126473388 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126473389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126473518 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126473571 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126473589 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126473861 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126473918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126474538 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126474914 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 126475064 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126475516 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126475551 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 126475897 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126476000 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 126476137 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126476148 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126476176 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126476259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126476323 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126476452 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126476543 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 126476593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126476691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126476721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126476731 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126476780 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 126477064 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 126477394 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 126477465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126477604 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 126477741 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 126478016 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126478234 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 126478271 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 126478344 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 126478349 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126478652 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 126478689 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 126478800 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 126478806 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 126479081 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 126479164 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 126479344 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 126479358 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126479363 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126479510 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126479667 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126479802 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 126480552 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126480894 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 126480903 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 126480936 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 126481397 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 126481437 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 126481447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126481533 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 126484794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126484807 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126485044 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 126485407 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 126487210 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 126487947 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126488461 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 126489367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126490058 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126490412 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 126491515 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126492442 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126492920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126493226 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 126493577 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126493600 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126494723 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 126494913 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126495633 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 126496063 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126496588 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 126497621 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 126498373 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126498953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126499972 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 126502375 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126503063 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 126503069 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 126503786 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 126504263 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 126506549 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 126507153 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126510357 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126513656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126517266 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126517755 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 126522163 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 126523043 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 126524304 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 126525058 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 126525832 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126527036 A G N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 3 126531502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126532339 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 126533362 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 126533723 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 126536169 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 126536450 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126536485 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126539002 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 126540926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126542516 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 126543321 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 126543804 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126544145 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126545012 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 126545182 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 126545626 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126545659 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126547021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126548196 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 126548521 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 126548813 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 126549635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126549726 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 126550024 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 126550120 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 126550768 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126551917 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 126552989 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126553124 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 126553806 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126554524 G A Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 126554698 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 126555309 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126555691 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 126555702 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 126555884 C A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 126556176 C A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.05 0.75 0.2 17 23 1 15 4 3 126556285 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 126556291 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 126556546 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126557180 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126557946 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 126559440 T G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 126559838 A C N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 126560192 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 126560211 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 126560725 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126560949 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 126561163 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 126562473 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 126563143 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126563144 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126563303 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126566972 A C Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 126567664 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 126567733 C T Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 126568360 A G Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 126569406 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126569952 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 126569953 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 126570029 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 126570270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126570467 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126573868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126574027 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 126574907 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 126574962 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 126575753 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 126577416 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126578865 A C Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 126579364 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 126580498 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 126580749 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 126581846 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 126581962 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126583054 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 126583403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126585457 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126586001 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126586005 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126586832 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126586893 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 126587027 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 126587882 A T Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 126588927 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 126589061 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 126592073 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 126592382 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126593042 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126593617 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126599509 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126599615 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126599666 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 126600213 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126601222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126601530 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126602060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126602609 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126603396 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126604099 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 126606542 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126607501 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126614122 G T Y N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.5 0 0.5 4 4 2 0 2 3 126614135 G A Y Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.5 0 0.5 4 4 2 0 2 3 126614879 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126615561 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126616247 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 126616337 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 126616513 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 126616568 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126616600 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126616997 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126617054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126617113 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 126617161 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 126617326 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 126617337 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 126617373 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 126617383 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 126617514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126617710 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 126617919 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 126618088 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 126618102 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 126618164 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 126618288 T C Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 126618404 G C N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 126618493 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 126618539 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 126618651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126618840 T C Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 126618962 G C N N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 3 126619439 C G N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 126619451 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 126619742 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126619801 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 126619910 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 126619915 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 126620066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126620119 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126620202 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 126620285 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 126620318 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 126620482 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 126621289 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 126621526 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 126621936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126622031 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 126622544 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 126622565 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 126622677 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 126622681 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 126622743 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126622765 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126622842 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 3 126622867 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 126622868 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 126623174 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126623191 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 126623313 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 126623442 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126623515 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126624227 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126624344 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 3 126624377 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 126624463 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126624858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126624882 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 126625445 A T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 126625454 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126625554 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 126625565 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 126625870 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 126626198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126626373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126626469 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126627531 C A Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 3 126629923 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126629964 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126630032 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126630164 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126630418 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 126630902 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126630927 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 126631128 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 126631272 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126631423 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126631661 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 126632038 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 126632147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126632194 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 126632215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126632233 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 126632263 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126632270 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 126632460 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 126633452 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126633709 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 126633773 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 126634010 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 126634199 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 126634631 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 126635649 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 126635794 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 126635967 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 126636862 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126637446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126638050 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126639677 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 126639733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126639864 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 126639928 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 126639957 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 126639985 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 126640023 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 126640046 T G N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 126640174 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 126640221 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 126640346 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126640372 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126640421 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126640449 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126640463 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126640466 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126640512 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126640539 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 126640702 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126640932 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126640959 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126640970 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126640976 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126640987 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126641007 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 126641046 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126641142 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 126641148 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 126641351 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 126641458 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 126641528 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 126641585 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 126641590 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 126641632 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 126641705 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126641714 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 126641735 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 126641856 A T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 126642025 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 126642071 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 126642131 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 126642200 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 126642214 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126642484 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 126642505 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 126642511 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126642587 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 126642594 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 126642635 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 126642740 T G N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 126642779 G C N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 126642835 T A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 126642846 T G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 126643375 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126643425 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126645403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126646593 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 126647221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126647302 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 126648027 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 126648166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126648232 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126648513 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 126648533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126649173 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126649366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126651054 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126651288 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126653735 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 126653849 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126656562 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 126657067 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 126658180 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 126658182 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 126658685 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 126658775 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 126659047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126659321 C G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 126659434 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 126659460 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 126659474 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 126659513 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 126659600 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 126659643 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 126659849 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 126659936 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 126659957 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 126659970 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 126660139 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126660849 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 126661154 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 126661167 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126661216 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 126661321 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 126661326 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 126661338 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 126661351 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 126661357 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126661391 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 126661392 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 126661422 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 126661466 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 126661479 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 126661541 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126661641 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 126661695 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 126661699 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 126661731 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 126661750 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 126661901 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 126661979 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 126661985 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 126662031 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 126662060 T C N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 3 126662076 A G N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 3 126662088 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 3 126662337 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 126662393 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 126662453 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 126662494 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 126663014 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 126663021 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 126663290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126663351 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 126663494 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 126663509 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 126663523 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 126663528 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 126663535 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 126663540 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 126663562 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 126663576 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 126663615 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 126663641 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 126663647 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 126663721 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 126663731 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 126663781 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 126663884 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 126663903 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 126663951 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126664312 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 126664313 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126664337 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 126664365 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 126664444 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 126664468 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 126664505 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 126664547 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 126664548 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 126664645 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 126664723 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 126664881 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126664923 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 126664942 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 126664973 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 126665000 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 126665005 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 126665052 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 126666873 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126667204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126667389 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126667779 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126668186 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 3 126668209 G C N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 3 126668217 G C N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 3 126668247 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 126668284 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126668405 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126668433 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 126668551 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 126668565 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 126668663 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 126668732 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 126668797 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 126668879 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 126669017 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 126669522 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126669561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126669619 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 126669768 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126669943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126670196 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 126670326 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126670372 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126670427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126670545 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 126670551 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 126670893 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126671568 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126674224 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126674493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126675128 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126676668 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 126677906 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 126682160 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 126683227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126683236 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 126683451 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 126686066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126686182 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 126686290 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 126686313 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 126686395 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 126686498 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 126686601 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 126687307 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126687425 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 126687521 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.0625 0.8125 0.125 15 17 1 13 2 3 126688086 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126688114 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 126688131 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 126688239 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 126688323 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 126688339 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 126688347 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 126688357 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 126688463 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 126688467 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 126688528 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 126689515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126689730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126690221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126691159 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126692515 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 126693069 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 126693280 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126693745 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 126694374 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 126694724 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 126694820 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126694840 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 126696723 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126698225 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 126698719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126699684 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 126702071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126703008 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 126703383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126703678 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 126703903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126703970 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 126704119 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 126704155 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 126704568 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 126704816 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126705191 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 126705463 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 126705798 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 126705819 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 126705840 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 126705887 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 126705981 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 126706071 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 126706265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126706345 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 126706571 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 126706603 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126706775 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 126706787 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 126706920 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126706984 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 126707093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126707160 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126707308 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126707383 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 126707500 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126707507 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126707517 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 126707607 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 126707666 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 126707890 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 126707894 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 126708013 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 126708455 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 126709420 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126709566 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 126709823 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 126709833 A T Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 126709967 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126710167 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126710383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126710548 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126710599 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126711807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126711850 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126711954 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 126712053 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126712157 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126712335 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126712406 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126712481 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126712506 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 126712617 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126712662 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126712712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126712787 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 126712860 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126712862 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126713217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126713372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126713583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126713761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126714152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126714297 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126714315 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126714323 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126714352 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 126714360 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 126714557 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 126714578 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126714603 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 126714786 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 126715228 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126715827 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 126715910 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 126716057 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126716092 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126716169 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 126716314 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126716386 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 126716585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126716639 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126716641 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 126716669 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 126716679 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126716708 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126716717 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126716776 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126716881 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 126716911 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 126716931 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126716999 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 126717167 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126717174 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126717266 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 126717309 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 126717312 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 126717396 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 126717609 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 126717710 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 126717779 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126718041 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 126718267 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126718309 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126718323 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 126718391 A T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126718574 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 126718653 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126718888 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126718942 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 126718960 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 126719164 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 126719182 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126719199 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 126719394 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 126719581 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 126719588 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 126719663 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 126719671 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 126719677 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 126719707 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126720077 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 126720217 G C N N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 15 9 6 3 3 3 126720249 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 3 126720362 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 126720434 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126720616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126720694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126721070 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 126721252 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126721336 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 126721351 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126721436 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126721539 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126721554 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 126721631 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 126721779 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 126721790 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 126721820 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 126722018 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 126722306 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126722392 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 126722434 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126722611 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126722863 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 126722872 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 126723005 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 126723245 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 126723555 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 126723789 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 126723843 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 126723871 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126723950 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 126724032 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 126724250 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126724397 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 126724567 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126724575 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126724694 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 126724819 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 126725008 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 126725330 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 126725489 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 126725942 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 126726025 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 126726033 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126726054 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126726079 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 126726126 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 126726429 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 126726437 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126726524 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126726925 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126727069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126727082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126727336 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126727677 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126727912 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 126728142 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 126728257 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 126728373 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 126728395 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 126728799 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 126729181 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 126729298 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 126729328 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 126729521 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 126729733 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126730519 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 126730565 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126730663 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 126730743 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 126730772 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 126730873 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 126730895 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126730938 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126730957 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126731036 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126731154 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126731166 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126731212 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126731241 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126731583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126731657 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126731909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126732509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126732650 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126732736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126732744 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126732763 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126733339 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126734713 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126734813 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126735606 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126736103 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126737055 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126737700 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126738639 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 126740883 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 126743127 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 126743462 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126744023 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126745177 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 126745574 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126745633 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126745704 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126745774 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126746136 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 126746165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126746245 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 126746263 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 126746275 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126746289 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 126746368 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126746542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126746582 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 126746634 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126746656 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 126746666 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 126747027 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 126747104 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126747189 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126747369 A C N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 126747457 T G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 126747654 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126747707 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 126747840 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126747923 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126747963 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126747986 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126747997 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126748016 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126748178 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126748240 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126748262 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126748292 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126748758 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126748853 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126748863 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126748919 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 126748920 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 126748950 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126749039 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126749114 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126749160 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 126749192 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126749261 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 126749368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126749810 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 126749814 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 126749825 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126749839 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 126749901 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 126749918 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126749985 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126750071 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126750464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126750480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126750562 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 126750663 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 126750689 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 126750776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126750790 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 126750911 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 126750972 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 126750982 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126751036 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 126751329 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 126751439 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126751567 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 126751587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126751624 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126751645 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 126751679 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126751698 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126751702 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 126751827 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126751865 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 126752192 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 126752205 A C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 126752286 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 126752727 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126752846 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 126753976 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126754052 T G N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 126754078 A C N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 126754113 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 126754176 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 126754243 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 126754339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126754466 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126754596 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126754612 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126754754 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 126754983 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 126754991 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126755253 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126755264 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126755284 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 126755343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126755624 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 126756014 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 126756035 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 126756134 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 126756281 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 126756326 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 126756483 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126756509 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 126756587 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126756687 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126757308 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 126757530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126757833 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 126757842 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 126757871 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 126757901 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 126758004 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 126758110 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 126758777 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126758804 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 126758818 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 126758868 G C Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 126758896 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126758903 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 126758932 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 126758935 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 126758962 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 126759096 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 126759229 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 126759262 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 126759321 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 126759391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126759434 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 126759595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126759645 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 126759693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126759780 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 126760036 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 126760060 G C N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 3 126760107 C A N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 126760113 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 3 126760134 A T N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 126760172 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 126760324 G A Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 126760542 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 126760864 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 126760943 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 126760983 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 126761010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126761044 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 126761113 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 126761142 C A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 126761174 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 126761325 A T Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 126761332 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 126761338 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 126761542 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126761545 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 126762550 A T Y N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 18 14 4 10 2 3 126762726 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126762777 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 126762954 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 126762961 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126763040 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 126763064 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 126763394 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 126763423 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 126763471 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 126763529 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126763536 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 126763804 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 126763812 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 126765497 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126765592 G C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 126766230 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 126770570 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 126770582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126770595 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 126770603 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 126770736 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126770799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126771526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126773831 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 126778117 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126778822 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126778977 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 126779045 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 126779161 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126779522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126779622 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126779699 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126779759 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 126779853 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126780534 C A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 126780642 C T N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 3 126780789 T C N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.230769230769231 0.615384615384615 0.153846153846154 14 12 3 8 2 3 126780807 A C N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 3 126780828 C A N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 3 126780914 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 126781139 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 126781198 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126781459 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126782107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126782290 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 126782395 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126782625 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126782864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126783235 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126783460 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126786057 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126786674 T G N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0 0.8125 0.1875 13 19 0 13 3 3 126787764 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126788007 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 126788794 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 126790294 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126792080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126792859 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126794973 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 126795903 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126796895 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 126797962 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 126798211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126800312 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126802143 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126803182 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 126806500 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 126808019 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126808137 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 126808143 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 126808629 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 126809246 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 12 6 3 6 0 3 126810134 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126810436 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126810452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126812769 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126812772 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 126812802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126813579 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.125 0.6875 0.1875 15 17 2 11 3 3 126813750 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 126813815 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126813835 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126813844 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 126813962 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 126815217 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126816179 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 126817035 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 3 126817758 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 126817773 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 126817778 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 126817851 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 126817875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126818388 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 126818529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126818531 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126818566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126818703 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 126818730 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 126818787 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 126818926 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 126819158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126819165 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126819258 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 126819294 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 126819411 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 126819606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126819623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126820026 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126820315 T C N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 3 126820376 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 126820705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126820767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126821071 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 126821935 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 126822204 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126822342 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126822351 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126822356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126822554 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126822649 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 126822728 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126822729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126823140 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126823212 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126823228 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126823231 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 126823269 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126823282 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 126823384 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126823635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126823734 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126823790 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126824108 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 126824126 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126824329 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126824444 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126824565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126824656 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126825040 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 126825101 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126825141 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 126825240 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126825267 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 126825291 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 126825339 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126825390 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126825521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126825534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126825553 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126826278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126826325 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 126826455 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126826804 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126826830 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 126827008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126827132 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 126828097 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 126828197 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 126828520 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126828785 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126828858 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 126829362 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 126829481 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126829491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126829516 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126829576 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126829626 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126829636 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126829720 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126829808 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126829842 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126829926 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126829928 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126830052 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 126830066 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126830068 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126830084 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126830120 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126830220 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126830259 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 126830391 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126830444 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126830774 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126830845 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126831043 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126831071 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126831453 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126831475 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 126831521 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 126831528 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 126831550 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 126831576 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126831605 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126831770 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126831843 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126831853 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126831856 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126832147 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 126832169 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126832182 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126832504 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126832509 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126832557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126832608 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 126832711 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 126832836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126832883 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 126832928 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 126833064 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126833086 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126833268 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126833418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126833440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126833623 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 126833773 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126833864 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 126833879 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 126834201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126834271 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126834538 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 126834961 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 126834994 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 126835017 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 126835018 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 126835059 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 126835092 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 126835216 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 126835531 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 126835537 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126835625 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 126835708 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 126835711 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 126835719 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 126835818 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126835841 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 126835945 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 126836087 C G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 126836139 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 126836374 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126836686 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126836977 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126836997 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 126837558 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 126837578 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126837610 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 126838908 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126841518 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 126841577 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 126841715 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 126842923 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126843231 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126851377 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126852202 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126852941 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126852985 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126853021 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126853221 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126853246 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 126853291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126853329 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 126853335 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126853416 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 126853430 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 126853760 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 126853770 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 126854091 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 126854108 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126854114 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 126854121 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 126854142 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 126854317 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126854356 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126854409 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126854450 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126854470 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126854563 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 126854630 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 126854647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126854660 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126854673 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 126854710 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 126854779 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 126855143 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126855155 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 126855371 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 126855415 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 126855529 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 126855543 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 126855559 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 126855584 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 126855591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126855888 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 126856239 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126856566 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126856687 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126856763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126856855 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126856866 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 126857360 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126857470 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126857774 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 126857881 T A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 126857892 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 126857899 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 126857949 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126858329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126859825 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126860364 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 126860650 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126861077 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 126861152 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126861495 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 126861646 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 126861952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126862095 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 126862148 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126862445 G C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 126862469 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 126862608 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126862721 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 126862892 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 126863031 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 126863153 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 126863495 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126863783 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 126863852 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 126865104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126865393 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 126865758 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126865822 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126865943 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126865945 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 126865987 G T Y N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 3 126866062 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126866092 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 126866261 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 126866304 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126866528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126866693 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126866854 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126866880 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126866949 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126867230 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126867246 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126867252 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126867284 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 126867737 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 126867828 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 126867833 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 126867918 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 126867983 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 126869065 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 126869188 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 126869302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126869348 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126869395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126869879 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 126870200 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126870338 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 126870368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126870398 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126870911 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126871304 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 126871363 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126871462 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126871534 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 126872114 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126872117 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126872141 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126872160 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126873040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126873324 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126873364 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 126873366 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 126873430 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126873582 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126873632 A G Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 126873861 T C Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 126873934 C T Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 126874100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126874133 C A Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 126874387 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126876502 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126877539 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126877571 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 126880088 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 126880273 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126883429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126883542 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 126883651 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 126884940 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126885168 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126887529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126888589 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126889555 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126889579 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126889741 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126890747 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 126892312 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126894160 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126894371 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126894396 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126894665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126894786 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126894793 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126894799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126894844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126894851 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126894866 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126894914 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126894917 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 126895015 T A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 126895065 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 126895103 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126895111 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 126895148 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126895188 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 126895197 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 126895202 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 126895238 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 126895257 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 126895325 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126895495 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126895535 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126895645 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126895845 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126895904 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126895968 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126895972 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126896025 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126896125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126896221 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126896527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126896771 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126896979 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126897319 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126897686 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126897693 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126898253 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126898360 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126898400 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 126898683 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 126898687 C A Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 126898746 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126898771 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126898802 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126898803 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126898831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126898841 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126898902 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126898916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126899011 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126899142 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126899162 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126899164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126899726 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126900136 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 126900259 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126900367 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126900438 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126900462 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 126900610 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126900892 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126900924 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126901031 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 126901050 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 126901200 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 126901335 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 126901381 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 126901479 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126901581 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126901702 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126901730 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126902017 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126902037 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126902101 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126902107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126902128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126902188 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126902305 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126902442 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126902563 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 126902655 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 126902796 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126902815 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126902824 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126902841 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126902889 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126902936 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126902949 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 126902993 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 126903021 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 126903041 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 126903085 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 126903098 T A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 126903210 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 126903332 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126903340 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 126903358 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 126903439 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 126903459 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126903481 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126903523 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 126903569 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126903633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126903667 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 126903678 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126903722 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126903806 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 126903889 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126903987 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126903999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126904218 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126904234 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126904602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126904641 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126904826 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 126904850 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 126904852 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 126904877 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 126904902 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126904925 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126904929 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 126905013 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126905052 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 126905117 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126905133 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126905147 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126905274 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 126905344 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 126905346 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 126905355 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 126905545 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126905971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126906048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126906572 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 126906778 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126907308 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126907439 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126907441 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126907526 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 126907896 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126907903 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126907923 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 126908103 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126908216 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126908271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126908305 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126908417 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126908464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126908470 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126908724 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126908940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126909186 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126909280 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 126909552 G C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 126909718 A G N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 126909722 C T N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 126909923 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 126909925 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 126909970 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 126910017 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 126910084 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126910239 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126910338 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 126910390 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126911960 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 126911990 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126912597 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 126912691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126912808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126912923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126912941 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 126913663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126914834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126914905 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 126915050 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126915242 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126915400 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 126915419 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 126915472 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 126915487 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 126915535 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 126915570 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 126915635 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126915880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126915987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126916135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126916175 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 126916203 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 126916328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126916435 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 126916454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126916755 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 126916778 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 126916799 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126916810 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 126917033 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126917067 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 126917070 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 126917150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126917920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126918331 C A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 126918483 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 126918579 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 3 126919042 G T N N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0 0.727272727272727 0.272727272727273 8 14 0 8 3 3 126919401 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 126919583 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 126919728 T G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 126919752 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 126919952 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 126919994 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 126920222 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 126920278 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 126920318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126920475 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126920532 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126921368 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126921529 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 126922010 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 126922448 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 126922581 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126922763 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126922830 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 126923154 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 126923169 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 126923192 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126923351 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 126923375 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 126923594 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 126923641 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126924129 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 126924236 C T N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 3 126926345 C G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 126926803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126927298 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126927325 A C Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 126927661 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 126929417 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126929527 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126929762 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 126929930 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 126930091 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126930095 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126930345 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 126930500 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126930526 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 126930544 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 126930800 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126930875 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126930911 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 126931562 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126933370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126935359 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126935637 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126936764 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126938448 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126938604 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126938687 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126938965 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 126939047 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126939861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126941132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126941589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126942051 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126944195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126944315 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126944343 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126944389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126944427 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 126944476 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 126944510 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 126944533 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 126944544 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 126944568 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 126944628 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 126944666 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 126944830 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 126944838 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 126944866 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126944955 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 126944964 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126945017 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126945019 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 126947245 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 126947414 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 126947463 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 126947718 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 126947899 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126948075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126948292 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 126948423 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126948550 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 126948701 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 126948721 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126948769 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 126948957 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 126948961 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 126949576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126949942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126949984 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126950081 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 126950122 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126950201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126950263 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126950700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126951318 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 126951917 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 126952226 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 126952236 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 126952247 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 126952550 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 126952730 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 126952880 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 126952955 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 126953007 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 126953057 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 126953059 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126953092 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 126953131 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 126953147 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 126953198 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 126953214 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 126953218 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 126953269 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 126953338 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 126953443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126953455 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 126953461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126953518 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126953640 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 126953703 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126953739 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126953873 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126953979 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 126954029 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126954227 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 126954268 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 126954382 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 126954454 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 126954486 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 126954499 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 126954525 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 126954704 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 126954734 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 126954785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126954855 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126954970 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126954985 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 126955091 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126955405 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 126955703 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 126955710 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 126955733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126956112 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 126956189 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126956214 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126956259 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 126956309 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 126956354 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126956390 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 126956466 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 126956568 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126956678 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126956693 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 126956711 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 126956760 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 126956761 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 126956925 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 126956979 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 126956996 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 126957052 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126958273 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 126958323 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 126958445 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 126958551 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 126958648 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 126958677 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 126958690 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 126958746 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 126958884 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 126958914 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 126959033 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 126959253 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126959681 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 126959737 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 126959831 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126959836 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 126960090 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 126960246 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 3 126960376 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 126960981 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 126961604 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 126961655 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 126961697 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 126962027 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126962059 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126962925 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126963140 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 126963264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126963462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126963898 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126963902 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 126964737 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126965247 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 126965326 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 126965441 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 126965443 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 126965696 A T Y N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 126965789 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 126965821 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 126966112 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 126966247 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 126966308 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 126966390 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 126966727 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126966882 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 126966893 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 126966946 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 126967452 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 126967759 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126967834 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 126967934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126967965 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 126968185 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126968318 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 126968319 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 126968346 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 126968388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126968614 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 126968652 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126968978 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126968979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126969271 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 126969819 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 126969892 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126969964 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126969976 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 126970133 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 126970194 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 126970237 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 126970296 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 126970603 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 126970661 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 126970992 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126971080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126971190 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126971307 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 126971409 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126971796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126972385 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126973144 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 126973316 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 126973407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126973435 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 126973446 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126973475 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 126973545 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 126973619 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 126973651 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 126973724 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126973825 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 126973828 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 126973977 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 126974079 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 126974102 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 126974128 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 126974429 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 126974477 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 126974804 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 126974826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126975618 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 126976593 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126976779 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 126977262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126978642 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126978647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126978659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126978672 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126979154 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126980956 G C Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 126981901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126983401 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 126983780 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126985098 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126985282 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126985445 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126985541 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 126986037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126987318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126987637 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 126990967 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 126991070 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 126991359 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 126992256 C A Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 126992358 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 126992370 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 126992381 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 126992393 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 126993042 A G Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 126993145 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 126993236 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 126993266 T C Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 126993272 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 126993282 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 126993361 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 126993602 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 126993610 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 126993621 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 126993639 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 126993698 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 126993845 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126994271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126994402 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 126994407 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 126994557 A G Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 126994785 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 126994824 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 126994843 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 126994857 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 126994943 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 126994947 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 126995009 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 126995010 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 126995106 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 126995157 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 126995245 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 126995270 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 126995289 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 126995481 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 126995801 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 126995826 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 126995839 G T Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 126995850 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 126995911 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126995929 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 126995943 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 126996163 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 126996195 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 126996203 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 126996224 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 126996524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126996775 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 126996796 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 126996804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126996854 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 126996917 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 126996992 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 126997544 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 126997775 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126998027 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 126998037 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 126998158 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 126998266 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 126998403 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 126998496 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 126998709 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 126998715 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 126998733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127000124 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127000343 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127002061 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127002422 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 127003931 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 127003942 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127004211 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 127006258 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 127006293 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 127006335 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 127006411 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 127006539 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 127006843 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 127006982 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 127007337 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 127007448 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 127007502 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 127007506 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 127007811 T C Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 3 127007814 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 127007841 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 127007899 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127007951 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 127008035 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127008049 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 127008071 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 127008074 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 127008174 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 127008306 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 127008332 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 127008365 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 127008425 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 127008438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127008462 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 127008640 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 127008643 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 127008759 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 127009135 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 127009147 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 127009165 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127009203 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 127009702 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 127009743 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 127009948 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127010855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127012272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127012541 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127013265 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127013314 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127013628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127013636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127014475 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127014521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127016148 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127017032 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127017064 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 127017173 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 127017414 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127017610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127017643 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127017696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127017798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127017881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127018282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127018443 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127018459 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127018488 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127018554 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 127018615 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 127018885 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127018912 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 127019085 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 127019096 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 127019169 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 127019399 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 127019421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127019438 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 127019630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127019703 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 127019738 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 127019788 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 127019812 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 127019883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127019955 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127020051 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127020060 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 127020153 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127020700 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127021313 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 127022407 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 127022478 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 127022685 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 127022738 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127022823 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 127022843 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 127022847 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 127023161 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 127023289 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127023465 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 127023593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127023736 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 127023827 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 127023838 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 127023886 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 127024042 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 127024238 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 127024297 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 127024320 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 127024327 G C Y N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 12 16 0 12 2 3 127024758 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127024916 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 127025419 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 127025843 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127028426 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 127029552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127029592 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 127029643 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 127029673 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 127029937 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 127030162 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127030196 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127030211 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 127030279 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 127030554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127030626 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127030713 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127030729 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127030734 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127030749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127030768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127030821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127030829 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127030857 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127030891 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 127030925 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 127030949 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127030958 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127030967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127030985 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 127031118 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 127031460 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127031487 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 127031509 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127031628 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127031689 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127031736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127031765 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 127031825 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 127031889 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 127031895 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 127032073 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127032078 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127032127 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127032155 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127032386 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 127032416 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127032443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127032723 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 127032843 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 127032879 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127032979 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 127033050 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127033130 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127033240 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 127033286 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 127033374 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 127033652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127033928 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127033951 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127034116 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127034191 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127034193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127034204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127034292 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127034435 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 127035192 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 127035881 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127035906 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127035931 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 127036000 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127036054 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127036064 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127036228 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 127036494 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127036582 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 127036587 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 127036614 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 127036625 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 127036653 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127036755 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 127036781 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 127036931 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 127036941 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 127036951 T G N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 127037001 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 127037035 G A N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 127037128 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 127037286 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127037289 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 127037328 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127037373 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127037379 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127037460 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127037490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127039481 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127039589 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 127040548 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127041060 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127041121 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127041198 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127041235 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127041245 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127041269 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127041279 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127041295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127041320 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127041360 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127041438 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 127041455 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127041472 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127041497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127041557 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127041564 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127041630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127041718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127041722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127041734 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127041831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127041858 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127041872 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 127042400 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127042485 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127042565 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127043482 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127043568 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127044867 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127045140 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 127045212 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 127045263 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127045288 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 127045601 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127046539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127046909 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127046984 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 127047534 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 127047644 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127047767 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127047812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127048025 T G N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 3 127048164 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 127048212 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 127048289 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 127048354 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 127048410 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 127048634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127048699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127048835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127048945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127049061 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127049154 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127049477 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 127049732 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127049782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127050292 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 127050901 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127051042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127051110 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 127051201 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127051223 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127051323 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 127051388 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127051666 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127051786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127051946 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127052291 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 127053289 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127053401 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127053931 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 127053994 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127053999 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127054081 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 127054148 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127054172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127054197 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127054217 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127054305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127054367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127054426 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127054438 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127054645 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127054743 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127054914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127055297 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127055393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127055417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127055477 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127055546 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127055587 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127055668 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127055826 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127055828 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127056101 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127056162 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127056235 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127056272 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127056301 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127056376 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127056528 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127056558 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127056614 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127056636 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127056674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127056885 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 127056901 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 127056910 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 127056928 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127056963 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127057014 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127057033 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127057114 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127057116 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127057137 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127057139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127057163 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127057176 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127057263 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127057324 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 127057861 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127057883 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127057958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127058046 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127058510 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 127058999 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.105263157894737 0.894736842105263 0 21 17 2 17 0 3 127059580 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127064104 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127065039 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 127066550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127067905 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127068539 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127069331 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127069570 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127069854 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 127070136 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127070424 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 127070862 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127071825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127076148 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 127077439 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127079294 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 127079368 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 127079565 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 127081094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127081327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127081582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127081881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127083314 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127083689 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127083940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127084907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127084993 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 127088778 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 127089338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127089441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127091101 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127091102 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127091808 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127091926 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 127092001 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 127092082 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 127092101 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 127092115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127092731 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127093219 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127093239 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127093483 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127093700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127093916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127093953 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127093962 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127093981 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127093990 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127093996 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127094070 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127094206 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127094727 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127095147 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127095194 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127095770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127095877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127095900 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127097213 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127100455 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127102539 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127103025 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 127103939 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127106229 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127108314 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127111045 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127111105 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 127111148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127111422 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127113747 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127114388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127114769 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127115144 A T Y N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 127118110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127118219 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127118282 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127118697 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127119234 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127119387 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127120001 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127120251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127123014 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127123854 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 127123855 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 127123934 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127123949 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127124165 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127124231 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 127124692 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 127124836 G C N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 3 127124891 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 127124904 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 127124913 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 3 127124919 T G N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 3 127124955 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 3 127124991 A G N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 3 127125100 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 127125303 G C N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 3 127125512 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 127125894 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 3 127125928 A C N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 3 127126397 G A Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 3 127126414 C G N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 3 127126755 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 127126807 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 127126912 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 127127016 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 127127069 A C N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 127127072 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 127127157 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127127178 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 127127185 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 127127289 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 127127292 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 127127321 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 127127391 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 127127543 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127127767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127127865 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127127922 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 127128492 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 127128520 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 127128543 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 127128689 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127129285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127130060 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127130721 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 127130843 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 127131032 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127131059 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 127131091 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 127131115 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 127131132 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127131292 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 127131823 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127131980 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127132515 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127133073 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 127134216 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127134420 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 127135071 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 127135787 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127136302 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 127137569 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 127137668 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127137727 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 127137796 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 127137954 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 127138435 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 127138763 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 127138777 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 127138785 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 127140116 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 127140542 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127141057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127141191 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 127141370 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127141389 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127141393 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127141414 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127141619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127141831 C T N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0 0.9 0.1 9 11 0 9 1 3 127141936 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 127142263 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 127143627 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 127144615 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127145920 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127146078 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127146123 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127146885 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 127147215 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 127148417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127148510 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 127148787 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 127148946 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127148972 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127149066 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127149172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127149220 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 127149240 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127149289 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127149395 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 127149471 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 127149542 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 127150467 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 127150469 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127150492 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127150545 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 127150577 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 127150580 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 127150615 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 127150930 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 127151045 A C N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 127151095 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 127151396 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 127151430 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127151442 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127151495 T G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 127151514 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 127151522 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127151554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127151738 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 127151754 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127151837 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127151859 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127152078 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 127152310 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127152378 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127152379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127152409 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127152478 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127152497 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127152772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127152832 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127153145 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127153236 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 127153712 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 127153786 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 127153900 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127153924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127153966 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 127154600 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127154747 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 127155348 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 127155726 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 127155749 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 127155812 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 3 127155814 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0 0.733333333333333 0.266666666666667 11 19 0 11 4 3 127155893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127156089 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 127156181 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 127156285 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 127156608 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 127156622 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 127156634 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 127156635 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 127156736 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 127156847 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 127156878 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 127156982 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 127157221 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 127157253 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 127157744 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 127157821 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127158143 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 127158482 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 127158498 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 127158668 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 127158831 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 127158903 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 127158907 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 127159016 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 127159062 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 127159067 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 127159245 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127159427 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 127159443 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127159689 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 127159961 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 127159978 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 127159989 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127160120 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127160297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127160447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127160719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127161093 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127161203 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127161277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127161730 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127162020 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 127162232 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127162240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127162406 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127162459 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127162674 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127162727 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127163129 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127163178 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 127163206 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 127163534 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 127163734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127163758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127163760 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127163816 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127164009 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127164504 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127164528 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127164564 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127164968 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127165031 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 127165388 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127165450 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 127165638 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 127166887 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 127167395 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 127168902 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 127170639 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 127175460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127176262 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 127176676 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 127176723 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127176758 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 127177562 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 127177824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127178514 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127178872 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127179822 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 127180102 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 127180142 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127180180 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127180181 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 127180207 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 127180257 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 127180281 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127180662 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 127180784 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127180804 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 127180861 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127180972 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127181138 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 127181141 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 127181181 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 127181197 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127181383 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127181511 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 127181666 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 127181774 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 127181781 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 127181790 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 127181967 T C Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 127182462 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127182550 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 127183035 G C N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 127183044 A G N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.153846153846154 21 5 10 1 2 3 127183168 C G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 127183294 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 127183443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127183702 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127184372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127185727 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127186509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127186568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127186916 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127187112 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127189949 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 127190086 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 127190550 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 127190656 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 127191050 T A N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 127191360 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 127193059 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 127193068 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 127199614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127200112 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127201549 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127201753 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 127201900 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127204383 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 127205026 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 127206154 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 127206246 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 127206472 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127206685 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 127206690 A G Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 127206894 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 127206905 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127206936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127207029 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127207032 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127208615 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 127209442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127211322 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127211840 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 127211884 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127212018 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 127212039 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 127212181 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127212416 T A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 127212441 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 127212597 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 127212943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127213010 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 127213204 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 127213221 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 127213251 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 127214005 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127214098 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127214839 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127216045 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127216108 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127217387 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 127218104 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 127219641 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127220027 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 127220185 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 127220901 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 127221905 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 127222205 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127223268 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 127224076 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 127224122 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127224769 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 127225069 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127225083 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127225090 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 127226983 C T N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 127227191 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 127227197 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 127227288 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 127227619 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127228213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127228376 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127228602 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 127229129 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127229441 A G N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 127229729 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 127229907 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 127229914 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127230065 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 127230213 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 127230544 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127230783 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 127231131 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 127231163 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127231169 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 127231193 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 127231434 C T Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 127231442 T C Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 127231525 A G Y Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 127231579 T C Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 127231600 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 127231645 C T Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 127231708 A G Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 127231840 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 127231858 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 127231880 A G Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 127231949 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 127231973 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127232074 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 127232963 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127233010 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 127233204 A T Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 127233210 G C Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 127233219 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 127233284 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127233349 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 127233362 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 127233528 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 127233544 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 127233596 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 127233646 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 127233675 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 127233699 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 127233701 T G Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 127233893 A G N Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 3 127233948 T A N N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 3 127234045 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 127234143 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127234482 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 127234642 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 127234646 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 127234815 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127234840 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 127235154 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 127235169 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 127236133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127237111 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 127237289 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 127237599 C T Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 127237625 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 127238296 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 127238388 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 127238648 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 127238749 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 127238953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127239373 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 127239478 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 127240679 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 127240707 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 127240837 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127240846 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 127241393 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 127241635 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127242301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127242315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127242437 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127242531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127242699 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127243049 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127243067 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127243371 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127245189 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 127245552 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127246256 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127246286 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127246522 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 127246940 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 127247040 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 127247233 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127247276 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127247383 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127247424 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127248101 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127248187 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127248262 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 127248417 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127249099 T G Y N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 3 127249110 G C Y N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 3 127249119 C G Y N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 3 127249134 C T Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 3 127249213 G A Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 3 127249216 G A Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 3 127251124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127253434 A G N Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 6 6 1 4 1 3 127254706 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 127254746 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127255905 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 127257520 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127257686 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127257724 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127257897 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127258404 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 127258507 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127258530 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127258619 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 127258992 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 127259575 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 127260004 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127261711 T A N N 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 3 127262323 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127262791 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127262817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127264570 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 127264913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127265011 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 127265054 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127265082 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 127265466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127265894 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 127266756 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127266807 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127267016 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127267171 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127267192 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127267258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127267580 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 127268082 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 127268098 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 127268991 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 127269047 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 127269064 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 127269262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127269287 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127270061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127270167 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127270574 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 127270596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127270647 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127270677 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127271369 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 127271778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127271833 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 127271874 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 127272265 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 127272699 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 127272772 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 127272814 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 127272821 A C Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 127272847 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 127272858 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127272947 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 127273018 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127273109 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 127273215 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 127273280 A C Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 127273462 G A Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 127273571 T A Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 127273654 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 127273762 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 127273825 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 127273844 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 127274282 A G Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 127274361 T C Y Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 3 127274394 G T Y N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 127274713 G T Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 127274731 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127274754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127274766 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127274783 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127274819 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 127274848 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 127274866 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 127274902 A T Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 127275097 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 127275138 G T Y N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0 1 0 16 16 0 16 0 3 127275452 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 127275919 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 127276433 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 127276617 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 127276872 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 127277003 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 127277127 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 127277262 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 127277291 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127277387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127277528 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 127277807 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127277878 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127277901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127278058 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 127278114 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127280997 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127281414 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127284672 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127286100 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127286808 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 127288522 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127293793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127293863 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127294149 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 127294194 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 127294297 A G Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 127294322 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127294687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127297339 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 127297540 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127297644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127297793 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127298239 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127298309 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 127298508 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 127299083 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 127299119 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 127299298 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 127299452 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 127299486 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127299617 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127299633 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127299655 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 127299717 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0 0.9375 0.0625 15 17 0 15 1 3 127300086 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 127300134 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127300139 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127300152 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127300303 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 127300649 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 127300772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127300877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127300967 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 127301108 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 127301453 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 127301991 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 127302010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127302105 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 127302144 C A Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 127302453 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127302669 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 127303032 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127303291 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 127304191 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127305183 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127305238 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 127306295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127307599 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127307994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127309536 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 127310688 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 127311359 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127316481 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127316653 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 127317229 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 127317253 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 127318832 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127319098 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127319861 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127322316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127323687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127324417 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127327519 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 127327557 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 127327796 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 127328338 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127329171 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127329851 G A Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 127330722 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 127332954 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127333625 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 127334031 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 127334075 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 127337499 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127338064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127338243 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 127339018 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127339496 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 127339516 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 127339911 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 127340136 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 127340158 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127340647 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 127340756 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127340810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127341236 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 127342828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127343070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127344447 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 127344509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127344984 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127345235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127345246 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127346056 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127346591 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127350339 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 127350963 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127351008 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 127351188 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 127351707 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127351709 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127352750 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 127352767 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 127352773 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 127352789 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 3 127352792 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 127352864 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 127352918 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 127353241 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 127353450 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 127353496 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 127353662 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127353748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127353966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127353981 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 127354008 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127354155 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127354719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127355476 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127356331 T A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 127356715 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 127356827 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127356880 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127357875 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127357897 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127357901 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 127357948 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127360162 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 127364324 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127364993 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 127365016 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 127366726 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 127366801 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 127366829 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 127366851 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 127366877 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127366961 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127366976 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 127367011 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127367012 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 127367043 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127367066 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127367075 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127367092 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 127367148 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127367158 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127367160 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127367432 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127368244 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 127368436 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 127368502 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127368638 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127368875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127369383 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127369688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127371221 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 127371333 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 127371431 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 127371486 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 127371557 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 127371565 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 127371571 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127372766 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 127372774 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127372787 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127372841 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 127373094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127373114 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 127373185 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 127373234 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127373841 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 127374206 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127374246 A C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 127374490 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127374545 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127374600 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127374608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127374759 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 127374874 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 127374924 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 127374971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127375478 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 127375758 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127375912 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 127375914 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 127375981 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 127375982 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 127377287 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 127379835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127380889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127381077 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127381168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127381230 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127381875 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127382164 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 127382999 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127383355 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 127383801 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 127383813 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 127383836 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127384986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127385005 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 127385049 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 127385069 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 127385150 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 127385153 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 127385285 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 127385328 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 127385565 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 127385933 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 127385941 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 127386090 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 127386134 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 127386203 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 127386225 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 127386285 T A Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 127386384 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 127386397 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 127386491 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127386602 G C Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 127386838 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 127386940 C T Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 127386948 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 127386984 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 127387008 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 127387078 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 127387079 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 127387189 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 127387452 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 127387537 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 127387647 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 127387683 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 127387857 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 127387882 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 127387887 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 127388008 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 127388062 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 127388195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127388332 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127388766 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 127388810 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 127388811 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 127388880 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 127388906 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127389075 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 127389087 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 127389218 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 127389260 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 127389433 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 127389575 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 127389640 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 127389657 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 127389728 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 127389771 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 127390028 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127390349 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 127390435 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 127390605 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 127390621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127391342 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 127391526 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127391647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127392230 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127392402 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127393373 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 127393533 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 127394488 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 127395015 A G N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 3 127395454 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 127395718 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 127395897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127396240 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 127396241 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 127396835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127397268 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 127399091 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127400084 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127401792 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127401843 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 3 127401864 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 3 127401989 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 127402063 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 127402319 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127402372 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127402596 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 127402606 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127402916 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 127402923 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 127402940 A T Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 127403358 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 127406370 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127407285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127407477 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127407573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127407582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127407666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127407727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127407743 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127407801 C A Y N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 127407810 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 127407827 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 127407828 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127409176 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127410214 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127410238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127410960 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 127412771 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127413971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127414399 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127418436 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127418995 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 127419064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127419068 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127419479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127420215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127421182 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127421410 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 127421467 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 127423404 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127423901 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 127424527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127425132 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 127425788 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127428688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127429029 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127429449 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127429480 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127430286 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127430424 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127431365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127432562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127432564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127432912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127433201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127433600 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 127434943 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 127435044 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 127435070 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 127435223 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 127435280 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127435325 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 127436879 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 3 127436887 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 127436981 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 127437077 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127437394 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127440846 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 127441597 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 127441905 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 127442278 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 127442491 C T N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 127442496 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 127442777 G A N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.181818181818182 0.454545454545455 0.363636363636364 9 13 2 5 4 3 127442781 G A N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.181818181818182 0.454545454545455 0.363636363636364 9 13 2 5 4 3 127442834 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 127442841 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 3 127443240 G A N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 3 127443343 T G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 127443396 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 127443397 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 127443453 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 127443493 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 127443517 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 127443592 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 127443625 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 127443776 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 127444305 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 127444425 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 127444426 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 127444472 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 127444560 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 127444615 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 127444631 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 127444666 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 127444682 G T N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 127444919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127444990 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 127445010 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 127445192 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127445336 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 127445445 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 127445448 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 127445492 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 127446182 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127447087 A C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 127447129 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 127447157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127447216 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 127447424 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127448038 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 127448211 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127449847 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127455984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127456654 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127456677 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 127456689 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127456748 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 127456792 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127456834 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 127456893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127456957 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 127457098 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 127457149 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 127457161 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 127457188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127457198 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127457286 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127457349 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127457364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127457706 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127457717 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127457776 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127457861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127457884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127457888 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 127457978 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127458048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127458074 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127458210 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127458266 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127458426 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127458500 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 127458507 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 127459894 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 127459985 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 127460010 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127460192 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 127460226 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 127460233 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 127460386 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127460713 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 127460748 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 127460755 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 127460774 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 127460878 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 127460894 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 127460903 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 127460938 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 127460939 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 127460985 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 127461832 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127462077 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 127462106 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 127462621 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127462965 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127465346 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127465872 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 127466761 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 127466790 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127466858 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 127467285 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 127467621 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 127467689 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127467709 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 127468230 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 127468241 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 127468339 A G Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 3 127468344 A G Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 3 127468462 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 127468544 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 127468567 G A N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 127468570 C T Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 127468944 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 127469051 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 127469350 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 127470375 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 127470387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127470388 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 127470509 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 127470612 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 127470649 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 127470653 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 127470672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127470709 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 127470717 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 127470927 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 127470941 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 127470972 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 127470986 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 127471046 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 127471200 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 127471201 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127471214 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127471234 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 127471310 T A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 127471423 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127471507 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 127471527 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 127471537 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 127471573 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 127471849 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 127473476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127481899 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127482235 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127483356 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127483463 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 127483482 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 127484050 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127484141 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127484818 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 3 127486022 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127486196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127486787 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 127486798 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 127486818 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 127486853 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 127486871 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127486893 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 127486967 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 127487125 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 127487230 G T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 127487285 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 127487414 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 127487451 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 127487498 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 127487802 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 127487855 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 127488001 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 127488012 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127488131 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 127488934 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127489283 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127490484 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127490623 G A Y Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 3 127491273 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127491332 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127492187 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 127492785 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127492935 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 127492982 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127493239 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127493398 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127494208 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 127494283 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 127494883 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 127495028 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 127495232 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127495424 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 127495598 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127495694 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 127496012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127496055 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 127496283 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 127496489 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127496913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127497653 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 127497813 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 127499206 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 127499574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127501702 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127501884 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 127502551 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 127502777 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 127503665 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127503832 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127504950 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 127505039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127505626 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 127505861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127505945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127506577 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 127507129 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127507243 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 127507445 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 127507576 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127507652 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 127507710 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 127507915 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 127507938 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 127507977 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 127508129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127508151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127508216 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 127508266 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 127508330 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127508338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127508464 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127508598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127508608 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127508731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127508789 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127508801 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127509322 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127509369 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 127512504 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127512505 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127512591 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 127512786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127513059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127513407 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127514151 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 127514365 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 127514683 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127515003 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 127515285 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 127515398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127515498 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 127515513 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 127515665 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 127516593 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 127517287 A G Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 127517921 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 127518389 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 127518895 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 127519740 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 127519887 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 127520205 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 127520367 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 127520419 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 127520456 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 127520457 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 127520489 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 127520542 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 127520548 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 127520562 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127520569 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 127521186 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127521274 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 127521670 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 127521818 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 127521855 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 127521878 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 127521951 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 127522249 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 127522256 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 127522400 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 127522408 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127522436 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 127522458 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 127522662 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 127522882 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 127523010 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 127523227 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 127523434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127523457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127523550 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127524224 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 127524457 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 127524550 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127524724 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 127524909 T G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 127525017 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 127525327 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 127525341 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 127525353 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 127525402 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 127525440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127525471 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 127525659 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 127526115 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 127526149 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 127526427 C A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 127526451 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 127526837 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 127527117 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 127527207 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 127527298 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 127527363 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 127527413 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 127527659 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 127527973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127528004 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 127528103 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 127528116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127528381 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 127528447 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 127528463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127528565 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 127528658 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 3 127528808 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 127528932 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 127529010 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 127529632 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 127529642 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 127529645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127529713 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 127529789 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 127529806 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 127529817 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 127529833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127530016 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127530113 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 127531391 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 127531395 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 127531576 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127531636 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127531801 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 127531847 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127531879 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127531906 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 127531940 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 127531947 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 127532002 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 127532025 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 127532173 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 127532412 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 127532430 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 127532470 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 127532496 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 127532705 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 127532716 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 127532789 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127532822 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 127532853 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 127533057 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 127533276 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 127533831 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 127533861 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 127533903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127534102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127534401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127534709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127534811 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 127534889 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 127535034 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 127535078 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 127535117 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 127535175 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 127535182 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 127535475 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 127535505 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 127535547 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 127535552 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 127535638 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 127535871 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 127535872 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 127535990 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 127536112 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 127536141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127536283 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 127536465 T A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 127536668 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127537088 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 127537448 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 127537484 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 127537516 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 127537562 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127537595 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 127537608 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 127537626 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 127537762 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 127537781 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 127537812 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 127537884 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 127538004 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 127538125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127538136 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 127538244 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 127538258 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 3 127538388 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 127538430 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 127538480 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 127538484 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 127538583 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 127538626 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 127538662 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 127538689 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 127538785 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 127538794 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 127538876 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 127538879 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 127539054 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 127539055 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 127539299 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 127539314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127539573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127539773 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 127541027 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 3 127541109 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0 0.894736842105263 0.105263157894737 17 21 0 17 2 3 127541141 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 127541193 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 127542176 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 127542349 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 127542384 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 127542464 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 127542487 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 127542495 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 127542531 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 127542547 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 127542678 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 127542743 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 127542839 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 127542941 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 127543264 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 127543294 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 127543376 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 127543403 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127543672 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 127544169 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 127544187 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 127544188 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 127544248 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 127544260 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 127544343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127544380 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 127544772 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 127544890 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 127544902 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 127544913 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 127545107 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 127545142 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 127545186 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 127545550 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 127545747 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 127545967 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 127546178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127546279 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 127546421 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 127546498 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 127546625 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 127546784 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 127546993 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 127547378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127547394 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 127547448 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 127547481 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 127547551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127547732 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 127547741 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 127547769 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127547920 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 127547931 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 127548010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127548369 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 127548414 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 127548688 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 127548760 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 127548850 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127549164 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 127549331 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 127549918 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 127549975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127549999 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127550164 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 127550437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127550491 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127550582 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 127550593 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 127550600 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 127550731 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 127550838 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 127550864 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127551010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127551056 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127551115 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 127551158 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127551198 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 127551199 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 127551323 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 127551324 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 127551374 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127551389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127551397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127551427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127551560 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127551687 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 127551700 T G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 127551741 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 127551757 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 127551777 G T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 127551795 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 127551845 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 127551937 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 127551987 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 127552043 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 127552099 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127552151 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 127552158 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 127552240 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 127552266 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 127552267 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 127552309 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 127552518 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 127552596 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 127552618 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127552645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127552803 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 127552819 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 127552879 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 127553072 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 127553640 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 127553846 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 127553943 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 127553947 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 127553989 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127554135 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 127554273 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 127554330 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127554492 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 127554845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127554991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127555743 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 127556243 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 127556415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127556759 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 127557449 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 127557648 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127557679 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 127557792 T A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 127558127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127559149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127559814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127560038 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127560069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127560862 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 127561040 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 127561140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127561150 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 127561370 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127561529 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127561679 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 127561857 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127561939 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 127561943 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 127562013 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127562028 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127562029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127562105 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 127562243 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127562345 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 127562382 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 127562384 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 127562437 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.588235294117647 0.117647058823529 0.294117647058824 22 12 10 2 5 3 127562454 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 127562482 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 127562495 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 127562527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127563035 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 127563139 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 127563235 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 127563236 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 127563344 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 3 127563348 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 127563365 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 127563513 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127563757 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 127563974 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127564305 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127564369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127564426 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 127564530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127564698 C G Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 127564727 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 127564859 G C Y N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 127564874 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 127564908 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127564975 T C Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 127565085 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 127565216 A G Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 127565219 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 127565578 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 127565617 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127565975 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 127566347 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 3 127567008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127567127 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127567404 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127567405 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127567479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127567745 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127567877 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 127568506 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 127568684 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127568921 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127568948 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127568987 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127569007 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127569343 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 127569518 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 127569527 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 127572681 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 127573405 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127573666 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127574071 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127574580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127577209 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127577220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127577247 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127578116 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127578314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127578664 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127578815 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 127578822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127578827 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127578897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127579001 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 127579516 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 127579694 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127579715 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 127579786 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127579863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127579894 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 127580133 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 127580224 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 127580255 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 127580309 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127580383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127580400 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 127580425 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127580465 G T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 127580664 C A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 127580712 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127581135 G T Y N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 3 127581153 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 127581170 G A N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 127581213 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 127581305 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 127581725 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 3 127582361 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127582484 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 127582530 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127582769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127582791 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127582815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127582966 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 127583453 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 127583592 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 127583760 G C N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 127583786 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 127583915 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 127584187 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 127584242 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 127584284 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127584632 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127585690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127585863 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 127586476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127586484 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127586520 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127597896 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 127598130 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 127601041 T A N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.133333333333333 0.6 0.266666666666667 13 17 2 9 4 3 127602214 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 127603253 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 127604012 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127604111 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 127604438 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127604439 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127604475 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 127604535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127604679 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127604721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127604730 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127604919 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 127604995 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127605060 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 127605313 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127605332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127605348 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127605780 G T Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 127605965 C A Y N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 127605969 A C Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 127605996 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 127606185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127606535 T G Y N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 3 127607051 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127607206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127607981 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 127608067 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 127608071 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 127608373 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 127608701 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 127608748 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 127609196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127610516 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127610660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127611583 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 127611586 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 127611613 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 127611640 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127612547 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127612548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127612844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127612875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127613175 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127613176 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127613197 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 127613303 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127613443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127613997 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127613998 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127614051 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127614772 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127614827 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127614834 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127615258 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 127616837 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 127617064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127617079 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 127617087 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 127617106 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 127617110 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 127618216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127618432 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 127618445 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 127620800 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 127620835 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 127620848 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127620917 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 127620950 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127620991 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 127621013 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 127622521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127624682 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127625853 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127626059 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 127626079 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127626953 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 127628353 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 127629833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127630022 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127630250 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 127631380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127632234 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127633829 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 127633878 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 127633890 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 127633892 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 127633966 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 127634202 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127634339 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 127634347 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 127634722 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 127634918 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 127634941 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 127634965 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127635041 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 127635046 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 127635070 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 127635089 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127635204 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127635251 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 127635283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127635296 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 127635301 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 127635805 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127635949 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 127636099 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127636119 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 127636593 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 127636698 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 127636738 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127636778 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127636810 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127636827 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127636834 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127636865 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127636909 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127636920 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127637024 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127637028 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127637040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127637145 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127637228 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 127637237 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127637257 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 127637407 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127637951 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 127638361 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127638537 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 127639155 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127639164 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127639296 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127639336 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127639720 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127639751 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 127639964 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127639974 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127640240 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 127640243 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 127640281 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127640580 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 127641162 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127641328 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 127641664 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127641742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127641775 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127641787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127641846 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127643014 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127643023 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127643102 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127643694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127643892 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127643899 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127644082 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127644117 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127644132 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127644201 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127644202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127644241 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127644327 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127644369 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127644734 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127644737 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127644972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127645516 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 127645601 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127645802 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127645894 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127645903 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127646013 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127646388 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127646397 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127646418 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127646454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127646492 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127646498 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127646514 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127646960 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 127647016 C A N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 3 127647080 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127647103 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127647109 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127647196 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127647306 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 127647415 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127647540 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127648105 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 127648118 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 127648156 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 127648195 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 127648416 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127648567 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 127648981 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127649022 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 127649219 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127649572 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127649611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127649643 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127649840 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127650080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127650105 G C N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 3 127650119 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127650499 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0 0.7 0.3 14 26 0 14 6 3 127650752 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127651283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127651620 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 127651884 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127651948 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 127652176 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 127652257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127652602 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 127652686 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 127652698 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 127652706 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 127652749 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 127652964 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127653139 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 127653402 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127653932 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 127654179 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 127654279 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 127654291 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127654399 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 127654420 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 127654430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127654442 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 127654523 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 127654625 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127654931 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 127655030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127655311 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 127655378 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 127655391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127655419 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 127655458 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 127655459 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 127655525 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127655532 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 127655554 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127655558 C A Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 127655566 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127655617 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 127655652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127655667 T A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 127655671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127655689 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 127655774 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 127655806 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127655877 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 127655893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127655926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127655977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127656010 T G Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 127656020 T C Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 127656035 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127656059 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127656154 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 127656235 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 127656303 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127656372 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 127656391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127656396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127656458 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127656685 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 127656697 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127656793 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 127656839 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127657082 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 127657084 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127657104 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127657121 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127657147 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127657159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127657397 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 127657519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127657729 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127657745 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 127657753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127657854 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 127658040 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 127658071 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127658107 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127658108 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127658281 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 127658423 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127658460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127658551 T G Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 127658566 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 127658853 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127658894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127658911 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 127658958 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127658962 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127658994 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 127659004 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 127659013 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127659060 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 127659089 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 127659169 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 127659180 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 127659245 T A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 127659284 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 127659498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127659513 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127659536 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 127659544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127659560 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127659674 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 127659731 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127659761 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 127659764 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127659773 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127659828 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127659845 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 127659870 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 127659897 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 127659912 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 127660091 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127660125 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127660143 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 127660164 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127660244 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 127660245 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127660308 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 127660620 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 127660780 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 127660894 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127660960 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127661123 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 127661125 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 127661251 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 127661336 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 127661339 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 127661379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127661383 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 127661472 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 127661475 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 127661563 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 127661708 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 127661743 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127661996 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127662068 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127662130 G T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 127663523 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 127663562 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 127663661 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 127663789 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 127663819 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 127663858 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 127663908 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 127663941 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 127663958 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 127664083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127664215 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127664247 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 127664276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127664283 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 127664408 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 127664443 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 127664546 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 127664574 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127664590 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 127664684 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 127664709 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 127664715 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 127664723 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 127664754 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 127664758 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 127664778 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 127664793 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 127664957 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 127665360 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 127665456 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 127665462 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 127665494 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127665535 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 127665541 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127665552 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127665599 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 127665614 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 127665627 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 127665759 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 127665867 T A Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 127666013 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 127666032 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 127666044 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 127666108 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127666364 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 127666384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127666418 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 127666552 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 127666605 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 127666614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127666628 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127667064 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 127667091 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 127667140 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 127667151 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 127667157 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 127667344 G A N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 3 127667381 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127667507 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 127667547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127667835 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 127668092 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 127668102 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 127668180 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 127668351 C T N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 0.153846153846154 0.153846153846154 20 6 9 2 2 3 127668471 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 127668518 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 127668538 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 127668550 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 127668604 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 127668699 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 127668707 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 127668714 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 127668723 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 127668969 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 127669090 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 127669142 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127669239 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 127669519 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 127669632 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 127669694 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 127669858 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 127669922 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 127669977 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 127670010 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 127670058 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 127670126 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127670183 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 127670673 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 127670773 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 127670802 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 127671077 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 127671121 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 127671130 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 127671539 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 127671862 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 127671893 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127672009 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 127672091 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 127672096 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 127672114 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 127672147 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 127672165 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127672234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127672237 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127672393 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 127672402 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 127672415 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 127672489 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 127672795 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127672855 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 127672870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127672910 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127672917 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127672976 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 127673055 T A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.1875 0 0.8125 6 26 3 0 13 3 127673071 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 3 127673075 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 127673202 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.1875 0 0.8125 6 26 3 0 13 3 127673209 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 127673221 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 127673256 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 127673924 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 127673935 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 127674135 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 127674229 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 6 30 3 0 15 3 127674330 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.157894736842105 0 0.842105263157895 6 32 3 0 16 3 127674383 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.176470588235294 0 0.823529411764706 6 28 3 0 14 3 127674467 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127674580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127674595 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 127674737 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127674738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127674966 T G N N 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 6 8 2 2 3 3 127674976 C G N N 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 7 5 3 1 2 3 127675230 G C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.176470588235294 28 6 14 0 3 3 127675310 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 127675364 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 127675421 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 127675687 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 127675776 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 127675998 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127676006 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 127676026 G A Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 127676053 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127676259 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 127676406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127676638 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 127676708 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 127676993 T C N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 127677327 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127677579 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 127677837 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 127677935 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127677951 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 127677964 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 127677980 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127677990 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 127678145 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 127678174 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 127678198 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 127678250 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 127678285 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 127678299 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 127678410 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127678618 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 127678637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127678696 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 127678727 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 127678807 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127678856 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127678891 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127678953 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 127679005 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 127679060 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 127679154 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 127679199 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.157894736842105 32 6 16 0 3 3 127679200 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.157894736842105 32 6 16 0 3 3 127679217 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 127679227 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 127679467 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 127679543 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 127679556 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 127679581 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 127679663 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 127679679 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 127679762 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 127679782 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 127679787 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 127679830 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 127679865 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 127679922 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 127679993 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 127680306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127680515 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 127680629 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 127680743 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 127680842 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 127680858 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.133333333333333 26 4 13 0 2 3 127681017 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.157894736842105 0 0.842105263157895 6 32 3 0 16 3 127681018 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 127681112 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127681135 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 127681200 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127681221 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127681273 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 127681307 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 127681390 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 127681443 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 127681964 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 127682083 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 127682376 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127682422 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127682487 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 127682507 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 127682636 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 127682706 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 127683079 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127683098 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 127683524 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127683553 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127683560 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 127683565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127683740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127683846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127684141 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 127684220 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 127684236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127684239 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 127684417 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 127684461 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 127684527 G C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 127684689 G A N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 3 127684953 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 127684965 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 127685088 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 127685209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127685295 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127685401 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127685409 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127685420 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127685534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127685629 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 127685694 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127685697 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127685732 G A Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 3 127685747 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 127685866 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 127686028 C T Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 127686061 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 127686098 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127686769 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127686877 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 127686982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127686995 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 127687108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127687233 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127687502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127687535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127687842 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127687857 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 127687879 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 127687985 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127688036 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127688037 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127688082 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 127688321 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 127688350 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127688364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127688389 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 127688595 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 127688709 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 127688721 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 127688784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127688884 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 127689065 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127689079 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127689138 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 127689178 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 127689237 C A N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 127689525 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 127689590 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 127689597 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127689646 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 127689792 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 127690049 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 127690182 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 127690235 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 127690274 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 127690410 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 127690472 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127690525 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 127691365 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127691531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127691874 C G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 127691985 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 127691988 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 127692247 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 127692292 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 127692430 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127692447 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127692470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127692560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127692596 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 127692637 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 127692675 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127692681 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127692967 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 127693012 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 127693488 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 127693499 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 127693545 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 127693584 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 127694254 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 127694447 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 127694520 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 127694523 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 127695001 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127695011 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 127695039 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127695273 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 127696649 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 127698604 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 127698618 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 127698778 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 127699179 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127699441 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 127700083 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 127700166 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 127700424 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 127701450 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 127701575 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127701701 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 127701998 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 127702139 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127702368 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 127704228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127706103 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127706114 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127706199 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 127706467 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 127706751 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127707334 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 127707488 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 127707620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127709612 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 127709771 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 127710289 A C N N 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 3 127710635 T G Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 127710842 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 127712504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127716096 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 127716289 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 127716465 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 127716647 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127716712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127717194 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127717793 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127717856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127718172 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127718388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127718491 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 127718501 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127718518 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 127718552 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 127718733 C A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 127719038 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 127719206 C T Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 127719208 T G Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 127719264 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127719309 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127719490 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 127719514 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 127719515 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 127719525 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 127719675 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 127719812 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127719880 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127719938 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127719940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127720014 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127720052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127720207 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127720459 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127720563 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127720564 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127720641 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 127720689 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 127720729 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 127720802 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127720875 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 127720884 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127720907 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127720915 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127720944 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127721044 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127721114 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127721155 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127721359 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 127721390 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 127722101 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127722168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127722201 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127722216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127722363 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127723557 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.3 0.7 0 26 14 6 14 0 3 127724866 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 127725608 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 127725742 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127726105 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 127726112 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127727121 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127727302 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 127728027 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 127728072 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 127728073 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 127728098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127728246 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 127728271 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127728305 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 127728310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127728342 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 127728366 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 127728395 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127728457 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 127728463 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127728468 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127728836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127728963 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 127728990 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127729081 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127729265 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 127729343 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 127729389 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127729441 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 127729512 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127729691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127729990 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127730111 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127730308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127731854 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 127732557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127732701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127733064 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 127733330 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127733690 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127733723 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 127733727 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 127733792 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 127733797 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 127733899 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127734002 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127734135 T A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 127734172 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 127734236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127734245 C G Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 3 127734284 C G Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 3 127734315 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 127734385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127734493 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 127734542 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 127734634 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 127734651 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127734676 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 127734694 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 127734699 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 127734708 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 127734763 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 127734797 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 127734812 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 127734819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127734825 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 127735055 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 3 127735130 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 127735181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127735291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127735876 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 127735905 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 127735966 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 127735991 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 127736081 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 127736167 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 127736185 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 127736362 T G Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 127736682 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127736735 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 127736909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127737167 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127737168 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127737281 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 127737393 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 127737424 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 127737591 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 127737711 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 127737799 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 127737807 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 127738221 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 127738249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127738277 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 127738352 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127738429 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127738451 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 127738495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127738598 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127738616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127738865 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 127738887 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127738923 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 127739246 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127739317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127739346 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127739519 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127739751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127739818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127740035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127740186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127740216 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 127740336 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 30 6 15 0 3 3 127740417 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 127740443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127740555 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127740608 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 127740759 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 127740845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127740869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127741034 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 3 127741151 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 127741170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127741215 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127741260 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 127741372 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 127741606 A C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 127741633 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127742188 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127742516 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 127742710 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 127742829 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 127742838 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 127742962 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127743128 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 127743199 T G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 3 127743218 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127743222 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127743335 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127743783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127743875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127743911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127744026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127744170 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 127744217 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127744221 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 127744280 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127744359 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 127744384 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127744407 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 127744450 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127744495 A C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 3 127744802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127744962 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127745045 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127745077 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127745078 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127745204 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127745223 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127745248 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 127745329 G T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 127745393 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 127745496 A G N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 0.142857142857143 0.214285714285714 20 8 9 2 3 3 127745733 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 3 127745751 C T N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 3 127745946 A C N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.571428571428571 0.214285714285714 0.214285714285714 19 9 8 3 3 3 127746168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127746530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127748346 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127748740 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127748815 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 127750612 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 127750625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127750713 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 127750995 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127751332 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127751337 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127753875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127753961 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127754487 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127756429 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.266666666666667 21 9 10 1 4 3 127757149 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 127757464 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 127757634 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 127758397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127758441 T A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 127758470 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 127758499 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 127758513 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 127758812 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127759061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127759105 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 127759164 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127759167 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127759181 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127759951 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 127759964 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 127760096 T C Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 127760393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127761331 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127761738 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127761942 G C Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 127762121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127762431 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 127763349 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 127763364 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 127763924 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 127764290 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127764711 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127764733 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 127764775 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 3 127764807 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 3 127765020 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 127765082 G T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 127765101 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127765184 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 127765272 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127765370 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127765477 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 127765704 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127765761 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127765786 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127765905 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127765971 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 127766051 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 127766076 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 127766096 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 127766100 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 127766178 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 127766318 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127766676 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127766696 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 127766894 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 127766994 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 127767110 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 127767242 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 127767639 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 3 127767889 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127768151 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 3 127768172 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 127768451 C T N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.333333333333333 0.0833333333333333 0.583333333333333 9 15 4 1 7 3 127768528 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 3 127768887 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.222222222222222 0.0555555555555556 0.722222222222222 9 27 4 1 13 3 127769257 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 127769558 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 3 127769570 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 127770603 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 127770684 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 127770689 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127770821 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127770904 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 127771018 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 127771364 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 127771384 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127771436 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.210526315789474 0.0526315789473684 0.736842105263158 9 29 4 1 14 3 127771801 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 127771990 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 127772064 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 127772301 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127772623 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127773445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127773871 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 127774361 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 127774513 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 127775777 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 127775833 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 127776033 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 127776036 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 127776142 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 3 127776176 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 3 127776830 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.235294117647059 0.117647058823529 0.647058823529412 10 24 4 2 11 3 127776952 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 127777980 A C N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 127779635 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 127780800 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127780872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127780919 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127781159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127781396 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127781414 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127781467 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127781498 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127781521 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127781550 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127781572 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127781681 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 127781843 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 127781861 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 127781948 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127781962 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127781975 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127781983 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127782051 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127782478 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 127782498 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 127782606 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 127782674 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 127782706 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127783109 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 127783467 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127783721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127784169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127788900 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 127790210 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127792796 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127793361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127794217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127796971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127797059 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127797736 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127797772 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127797965 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127798185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127799640 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 3 127799860 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127802252 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127802486 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 127802680 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 127804149 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127806056 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127806136 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127806170 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127806197 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127806418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127806667 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 3 127807048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127807381 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 127807761 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127808012 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127809720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127810661 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 127811845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127813883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127814477 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127814882 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127819402 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 127821486 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127824054 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127825230 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127825652 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 127826296 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 127826517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127826601 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 127826619 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 127827067 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 127827072 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 127827844 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 127827917 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127828158 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.7 0.05 0.25 29 11 14 1 5 3 127828464 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127828524 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127829907 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127830163 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127830235 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 127830840 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127831563 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127831859 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127835157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127836266 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 127837056 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 127838198 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 127839327 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 127839901 G A Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.533333333333333 0.2 0.266666666666667 19 11 8 3 4 3 127848573 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127848593 A G Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 127848787 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.555555555555556 0.111111111111111 0.333333333333333 22 14 10 2 6 3 127849963 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.263157894736842 0 0.736842105263158 10 28 5 0 14 3 127849968 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127849983 T A Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.263157894736842 0 0.736842105263158 10 28 5 0 14 3 127850065 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 127850086 T C Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 127850105 G A Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 127850145 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 127850159 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 127850217 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.25 0.05 0.7 11 29 5 1 14 3 127850237 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.25 0.05 0.7 11 29 5 1 14 3 127850266 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 127850388 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.263157894736842 0.0526315789473684 0.684210526315789 11 27 5 1 13 3 127850531 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 127850897 T C N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.416666666666667 0.0833333333333333 0.5 11 13 5 1 6 3 127851400 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 127851454 G T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 3 127851996 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127853638 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 127856326 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 127856387 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 127856389 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 127857658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127857821 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 127858348 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 127858370 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 127858510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127858530 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127858770 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127859024 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127859146 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127859714 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127860106 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 127861222 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127861242 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127861309 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 127861364 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 127861978 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 127862583 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127862961 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127863525 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127864967 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 127865208 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 127865279 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 127865433 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 127865442 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 127865445 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 127865519 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127867096 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127867955 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.333333333333333 0.2 0.466666666666667 13 17 5 3 7 3 127868027 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127868974 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 127869141 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127869153 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 127869440 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 127869849 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 127869944 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127870107 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127871897 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127872190 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 127872475 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127872510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127872514 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127872537 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.55 0.1 0.35 24 16 11 2 7 3 127872764 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 127872790 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 127872891 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127872966 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127873132 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 127873161 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 127873645 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 127874056 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127874264 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127874870 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127874871 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 127874928 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 127875172 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.7 0.05 0.25 29 11 14 1 5 3 127875490 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 127875905 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.7 0.05 0.25 29 11 14 1 5 3 127876423 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127876495 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 127877024 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127877509 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 127877658 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.263157894736842 0.0526315789473684 0.684210526315789 11 27 5 1 13 3 127878080 C G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 3 127878256 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 127878280 C T N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.5 0.142857142857143 0.357142857142857 16 12 7 2 5 3 127878732 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 127879031 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 127879084 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 127879224 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 127879293 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 127880201 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127880365 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 127880704 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127880776 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 127880777 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 127881066 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 127881250 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 127881398 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 127881703 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127881833 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 127882338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127882352 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 127882368 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 127882446 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 127882876 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 127882981 C A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 127883091 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 127883098 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127883138 C A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 127883153 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 127883311 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 127883446 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 127883574 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 127884075 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 127884408 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 127884446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127884615 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 127884667 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 127884678 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 127884938 C A Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 127884950 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 127885059 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 127885221 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127885276 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 127885281 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 127885345 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 127885368 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 127885645 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 127885716 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 127885937 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127885956 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 127886000 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 127886300 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 127886317 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 127886569 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 127886794 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 127886877 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 127886888 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 127887061 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 127887081 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 127887109 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 3 127887186 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 127887525 G A N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.5 0.142857142857143 0.357142857142857 16 12 7 2 5 3 127887658 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 127887744 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127888026 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.4375 0.125 0.4375 16 16 7 2 7 3 127888491 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 127888651 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 127888794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127888811 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 127888901 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 3 127888971 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 3 127889304 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127889370 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 3 127889383 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 127889443 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 127889451 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 127889492 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 3 127889528 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 127889637 T A N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 3 127889718 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 127889728 A G N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 3 127889729 G T N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.153846153846154 22 4 11 0 2 3 127889864 G C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 127889914 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 127891399 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 127891402 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 127891747 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 127891829 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 127891921 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 127892032 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127892102 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 127892362 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127892938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127893962 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 127894383 T A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 127894811 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127894924 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 127895037 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 127895292 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 127895310 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 127895493 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127895507 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127896227 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127896338 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.411764705882353 0.117647058823529 0.470588235294118 16 18 7 2 8 3 127896359 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127896381 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 127896403 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 127896406 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 127896468 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 127896857 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 127896965 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 3 127897032 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127897113 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 127897427 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 127897474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127897570 G T Y N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 4 24 2 0 12 3 127897575 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 127897624 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 127897783 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127897855 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 127898092 A C Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 127898480 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 127898664 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127899309 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127899459 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 127899533 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 127899591 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 127899607 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 127899666 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 127899707 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 127899794 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 127899999 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 127900402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127900506 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 127901401 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.263157894736842 0.0526315789473684 0.684210526315789 11 27 5 1 13 3 127903277 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127904004 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 127904149 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 127904154 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 127904183 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 127904467 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127904598 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127904840 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127904972 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127905122 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 127905142 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 127905368 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127905889 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127905918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127906248 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127906263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127906303 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 127906329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127906331 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 3 127906344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127908054 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127909109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127909335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127909408 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 127909476 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 127911479 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127911522 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127911986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127915015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127917316 G C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 127917483 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 127918224 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 127920738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127922926 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127924319 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127924577 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127925569 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 127926897 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127930207 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127930266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127930518 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127931026 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 127931243 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 127931402 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127931493 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 127931522 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 127931862 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 127931997 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 3 127932078 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 127932101 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 127932242 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 127932561 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 127932806 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.5 0.142857142857143 0.357142857142857 16 12 7 2 5 3 127933045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127933706 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127934068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127934461 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127934772 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 127935712 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 127937486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127937522 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 127939330 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127940847 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127941112 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127941381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127942813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127942869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127943225 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 127943326 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 127943952 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 3 127943956 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.176470588235294 28 6 14 0 3 3 127944450 G C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.176470588235294 27 7 13 1 3 3 127944974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127946642 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127948134 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 127949489 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127949547 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127949804 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 127949903 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 127950003 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 127950007 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 127950105 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 127950213 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127950779 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 127951196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127951615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127951640 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 127951653 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127951803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127951957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127951978 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127952017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127952400 G A N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 3 127952456 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 127952489 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 127952771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127952840 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 127953049 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 127953067 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 127953136 G A N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 3 127953178 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 127953205 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 127953562 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127953955 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127954023 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127954101 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127954923 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127955007 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 127955253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127955452 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 127955463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127955844 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127956921 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 127957022 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 127957177 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 127957253 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 127961530 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127963292 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 127963532 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 127963578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127963976 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127964143 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 127964671 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127965255 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 127968789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127970900 A T Y N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.0666666666666667 0.733333333333333 0.2 13 17 1 11 3 3 127975013 T A N N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 127976927 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 127977516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127980571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127980785 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127980958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127983072 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127987131 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 127989390 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127989403 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127989437 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 127990138 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 127990784 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127992904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127993680 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127993759 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 127994817 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 127995052 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 127995899 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 127997547 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 127997966 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128000968 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128001163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128001581 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 128002071 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128002362 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128002469 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128002683 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128002976 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128003068 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128003118 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128003330 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128003661 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 128003975 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128004757 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 128004793 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 128005216 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128005381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128005546 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 128005598 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 128005655 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128005964 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 128005978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128006421 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128006441 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 128006471 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 128006505 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 128006573 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 128006574 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 128006622 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 128006625 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 128006664 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 128006718 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 128006767 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 128006779 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 128006796 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 128006925 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 128007057 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 128007226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128007925 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128008017 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 128008060 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 128008133 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 128008156 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 128008397 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128008412 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128008451 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 128008572 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 128008903 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128008979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128009040 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 128009223 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 128009242 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 128009272 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 128009297 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 128009920 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 128009929 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128010055 T G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 128010107 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 128010290 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 128010315 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 128010320 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 128010455 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 128010678 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 128011001 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128015559 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128015984 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 128015985 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 128016365 C T N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 3 128016475 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128016479 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 128016486 T G N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 3 128016575 G C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 128016576 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 128016611 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 128016853 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 128017007 G A N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.307692307692308 0.153846153846154 0.538461538461538 10 16 4 2 7 3 128017014 T C N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 3 128017398 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 128017596 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128017778 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 128017801 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 128017830 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 128017881 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 128017986 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 128018065 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 128018098 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 128018103 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 128018186 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 128018569 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 128018782 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 128019826 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128021075 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128022284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128024592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128025071 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128026193 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 128026960 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128028075 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128028341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128028362 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 128028942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128029005 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 128029526 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 128029899 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 128030155 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128030260 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 128031812 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128032268 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128032661 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128032956 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128034434 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128034826 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128035461 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 128038455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128039200 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128039531 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128041025 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128041560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128042704 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128043699 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128044102 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128044512 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 128044765 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128045785 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128045899 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 128046714 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 128046880 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 128047043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128048066 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 128048110 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 128048739 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128048837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128048852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128048877 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128048964 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128049061 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 128049302 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 128049339 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128049344 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128049428 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 128049471 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.157894736842105 0 0.842105263157895 6 32 3 0 16 3 128049517 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128049585 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 128049849 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 128049961 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128049993 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 128050079 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128050147 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128050414 A C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 128050629 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128050704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128050731 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128050765 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128051717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128051916 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 128051935 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 128052067 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128052088 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 128052241 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128052348 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 128052515 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 128053065 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 128053332 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 3 128053355 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 128053647 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 128054114 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128054125 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128054237 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128054330 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128054505 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128054614 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128054730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128054810 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128054849 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128054906 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 128054939 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128054959 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128054971 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 128055075 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 128055087 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128055136 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128055233 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128055357 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128055389 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128055398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128055414 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128055496 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128055510 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128055514 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128055616 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128055734 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 128055758 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 3 128055802 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 128056058 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128056081 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 128056153 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128056209 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128056258 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 128056342 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 128056542 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 128056785 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 128057024 A C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 128057026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128057076 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 128057221 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128057244 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 128057388 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 128057711 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 128058019 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 128058736 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128058752 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128058815 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128059345 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 128059361 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 128059363 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128059400 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 128059517 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 128059530 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 128059546 T A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 128059632 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 128059642 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 128059643 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128059680 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 128059710 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 128059763 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 128059780 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 128059802 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 128059859 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 128060159 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 128060568 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 128061058 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 128061159 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128061310 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 128061342 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 128061447 C A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 128064480 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128065661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128066999 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128067296 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 128067504 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128068304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128068335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128069993 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128070048 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128070101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128071358 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 128071791 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128073434 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128073707 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128074667 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128075458 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 128075792 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128076027 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128077772 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 128079798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128085268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128088179 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128089332 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128089415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128090771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128090896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128091993 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 128092854 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128093161 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128093688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128094296 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128097033 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 128097772 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128100670 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 128100836 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 128100842 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 128100995 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 128101222 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128102546 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128102756 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128102923 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 128103588 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128104829 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 128105345 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128105351 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 128105411 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 128105536 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128105549 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128105655 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 128105688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128105893 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 128105927 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128106048 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128106139 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128106226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128106267 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128106354 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 128106511 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128107737 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128107774 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128107852 C G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 128108102 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 128108290 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128108296 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128108389 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128108401 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128108772 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128108782 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128108794 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128108856 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128108891 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128108927 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128109033 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128109061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128109187 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128109271 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128109375 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128109437 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128109456 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128109470 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128109494 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128109510 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 128109514 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128109627 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128109688 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128109692 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128109816 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128109914 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128110407 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128110408 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128110770 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128110772 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 128110858 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 128110875 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 128110962 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 3 128111008 G T N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 128111062 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 128111093 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 128111235 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128111260 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 128111741 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128112507 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 128113279 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128113782 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128113795 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 128113903 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 128114140 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128114190 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 128114238 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 128114243 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 128114578 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 128114823 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128115186 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128115233 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128115279 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128116126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128116476 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128116499 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128116812 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 128116899 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 128117038 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128117225 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128117244 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128117362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128117375 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128117406 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128117765 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128117823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128118384 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 128119401 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128119797 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128120138 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128121366 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 128121794 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 128122153 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128122242 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 128122617 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128123005 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 128123573 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 128124036 A C Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 128124233 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 128124503 A C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 128124544 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 128124566 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 128124675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128124800 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 128124839 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128124881 G C Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 128124916 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 128125080 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 128125107 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 128125160 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 128125162 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 128125251 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 128125697 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 128127365 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 128127475 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 128127598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128127739 T A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 128127844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128128632 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 128128824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128129565 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 128129813 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128130008 T A Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 128130128 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 128130131 C A Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 128130655 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 128130776 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 128130916 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 128131096 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 128132043 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 128132704 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128133263 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 128133822 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 128134696 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 128134703 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 128134902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128135353 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 128135375 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 3 128135632 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 128135950 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 128136041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128136386 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 128136422 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 128136738 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 128136768 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 128136789 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 128137028 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 128137084 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 128137139 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 128137152 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 128137198 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 128137298 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 128137390 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 128137558 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 128137669 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 128137719 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 128137746 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 128137748 C G N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 3 128138086 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 128138093 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 128138121 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 128138194 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 128138213 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128138227 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 128138327 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128138461 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128138522 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 128138615 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 128138706 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 128139060 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 128139153 C T Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 128139222 C T Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 128139256 G A Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 128139331 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 128139869 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128139952 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128140026 C G Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 128140252 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128140346 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 128140628 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 128140651 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 128140952 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 128141215 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 128141670 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 128141701 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 128141708 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 128141717 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 128141721 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 128141733 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 128141735 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 128141838 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 128141869 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 128141891 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 128141911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128142039 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 128142050 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 128142060 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128142103 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 128142215 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128142307 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 128142480 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 128142558 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 128142628 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128142674 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128142675 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 128142779 C T Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 128142840 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128142880 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 128149729 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128149970 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 128150123 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128150347 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 128150491 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128153048 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128153294 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128154826 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 128156796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128157063 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128159732 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128160657 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128161148 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128161885 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 128162940 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128164027 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 128164467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128164612 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128165488 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 128166095 C T N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 3 128166183 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128166403 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 128167171 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128168611 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128171049 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128173287 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128174413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128176170 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128176261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128177891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128179161 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128179286 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128179477 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128179490 G T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 128180983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128182981 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 128183166 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128184763 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 128185088 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128185780 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128187645 C A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 128189517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128191003 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 128191167 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 128192742 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128192894 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 128195844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128195954 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 128196787 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 128198406 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128201608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128204404 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 128205182 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128205342 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 128205453 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 128205751 C G N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 128205787 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 3 128205984 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128206104 T G Y N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 128206400 A G Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 128206490 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 128206659 G C N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 3 128206696 T A N N 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.363636363636364 0.454545454545455 0.181818181818182 13 9 4 5 2 3 128206866 T C Y Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 3 128206867 G T N N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 3 128206939 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 128207064 A T N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 3 128207158 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 128207198 C T N Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 9 5 4 1 2 3 128207363 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 13 5 6 1 2 3 128207394 G A N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 5 15 2 1 7 3 128207470 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 128207491 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 128207550 G A N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.181818181818182 17 5 8 1 2 3 128207587 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 128207617 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 128207869 C A N N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.625 0.125 0.25 11 5 5 1 2 3 128207972 T A Y N 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 5 13 2 1 6 3 128208347 T C Y Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 5 13 2 1 6 3 128208510 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 128208593 G T N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 128208665 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 128210533 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128211415 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 128212863 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128213228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128213416 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128214775 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128215505 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128215524 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128215835 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128216044 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 128217501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128217742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128218443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128218936 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128223025 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128223879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128224059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128224149 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 128224221 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128227289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128228084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128228851 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128229889 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 128230787 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128231007 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128231671 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128231902 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 128231904 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128231948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128232242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128232456 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128232893 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128233019 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128233036 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128233553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128233570 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 128233708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128234001 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128234207 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128234689 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128235280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128236178 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128236845 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 128237167 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128237178 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128237386 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128237506 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128237566 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128237631 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128237928 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128238484 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.210526315789474 0 0.789473684210526 8 30 4 0 15 3 128238509 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 3 128238550 C A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.235294117647059 0 0.764705882352941 8 26 4 0 13 3 128238687 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128238826 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128239993 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 128240110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128240475 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128240591 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128241299 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 128241530 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 128241702 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 128241789 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 128241791 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 128241802 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128242290 C T Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 128242455 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 128242581 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 128242704 T A Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 128243020 A G Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 128243074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128243369 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128243408 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 128243426 T C Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 128243523 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 128244313 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 128244339 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 128244588 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128244736 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 128244800 G C Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 128245001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128245103 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 128245402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128245649 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 128245659 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128245857 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128245961 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 128246007 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 128246953 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 128247042 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 128247063 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 128247494 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 128247823 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 128247854 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 128248029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128248140 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128248690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128248710 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128248723 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128248790 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128248883 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128249490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128249922 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 128250222 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128250278 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128250377 G T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.235294117647059 25 9 12 1 4 3 128250452 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128250552 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 128250767 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.210526315789474 29 9 14 1 4 3 128250816 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128251422 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128252013 C G N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 128252073 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128252477 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128253123 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 128253373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128253456 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128255110 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128255260 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128255261 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128255580 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 128255718 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 128255994 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 128256044 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128256236 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128256392 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128256574 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128256587 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 128256602 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 128256627 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 128256642 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128256682 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128256759 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 128256773 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128256859 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 128256883 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 128257029 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 128257043 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 128257054 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 128257075 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 128257234 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 128257253 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128257310 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128257410 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128257511 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128257655 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128257696 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128257723 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128257761 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128257821 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128257840 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128257938 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128257941 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128258021 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128258077 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128258160 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128258331 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 128258374 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128258408 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128258558 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128258642 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128258683 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128258982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128259235 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 128260419 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 128260437 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 128260609 A C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 128260849 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128261484 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128262973 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 128263391 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 128263460 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 128263527 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128263595 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 128263641 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 128263650 C G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 128263754 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 128263820 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128263846 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 128264038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128264548 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128264782 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 128264853 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128265038 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128265061 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 128267577 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128267736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128268568 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 128268575 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128268813 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 128269625 C T Y Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0 1 0 11 11 0 11 0 3 128270938 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 128271014 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 3 128272811 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128274484 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 128275299 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 128276459 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128278130 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 128278880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128280808 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128280918 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128281572 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128282028 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128282144 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 128282209 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 128282280 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 128282335 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128282378 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 128282661 C T Y Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 3 128282819 A C Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 128282938 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 128283049 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128283253 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128284696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128284729 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 128284835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128284846 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128284857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128285107 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 128285151 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128285200 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 128285230 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 128285291 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128285292 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 128285412 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 128285464 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 128285543 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 128285582 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 128285965 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128286981 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 128290537 C G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 128292309 G T N N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 15 9 6 3 3 3 128293751 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128296019 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128299080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128299465 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 128301563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128301687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128302190 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128303154 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128305122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128305594 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128305964 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128306425 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128306639 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128307014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128311188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128313253 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 128313328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128313982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128315072 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 128317788 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128318289 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128321294 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 128321381 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 128321423 T C Y Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 128321458 G A Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 128321629 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 128321665 A G Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 3 128321806 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 128321818 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 128321849 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 128322006 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 128322056 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128322116 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 128322588 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 128322646 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 128322650 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 128322686 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 128322927 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 128322947 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 128323045 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 128323064 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 128323073 C A Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 128323230 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 128323245 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 128323254 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 128323337 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 128323550 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 128323707 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 128323708 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 128323800 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 128323981 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 128323989 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 128324018 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 128324142 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 128324330 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 128324367 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 128324494 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 128324641 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 128324766 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 128324842 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128329438 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 128329447 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 128329475 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 128329749 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 128329763 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 128331001 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 128331225 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128331701 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 128331741 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 128331931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128332020 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 128332053 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128332729 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 128332797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128332991 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 128333049 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 128333064 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 128333160 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 128333313 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 128333323 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128333360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128333375 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128333445 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 128333543 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 128333565 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 128333632 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 14 10 6 2 4 3 128333663 G C N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.384615384615385 0.230769230769231 0.384615384615385 13 13 5 3 5 3 128334732 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 128335157 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 128335232 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 128335279 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 128335414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128335429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128335456 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128335502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128336447 T A N N 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 11 9 4 3 3 3 128337040 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128338423 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128338469 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128338714 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 128340896 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 128341081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128343815 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128345376 G T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 128345531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128346289 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128346583 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128346872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128348850 A C Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 128352855 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128354553 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 128354579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128354847 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 128355352 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 128355380 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 128355471 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128355485 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 128355509 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 128355517 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 128356395 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128356745 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 128356894 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 128357986 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 128361775 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128361873 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128363965 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128365401 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128365487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128365586 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128367471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128367535 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 128367593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128369743 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 128369940 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128369999 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128371917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128372785 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128373744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128373904 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 128373915 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128373962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128374005 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128374043 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 128374131 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128374313 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 128375178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128375267 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 128375407 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 128375467 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128375530 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 128375760 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128375950 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128376183 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 128376858 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 128376921 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128376933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128377302 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128377398 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128378126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128381018 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128382724 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128382978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128383188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128384215 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128384472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128385716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128385976 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128386649 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128389949 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 128390627 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 128391838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128392352 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128393377 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128393664 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128393674 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 128400910 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 128402544 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128402662 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 128402879 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 128402964 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 128403034 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 128403623 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 128404349 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 3 128404818 C T N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 3 128405038 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 128405253 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 128405263 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 128405395 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128405463 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128405522 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 128405541 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128405550 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 128405567 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 128405586 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 128405748 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128405913 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 128405980 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 128406060 A G Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 128406075 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 128406187 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128406254 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 128406333 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 128406353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128406385 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 128406459 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 128406479 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 128406513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128406526 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 128406603 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 128406621 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 128406676 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 128406767 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128406812 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 128406849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128406874 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 128406877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128406955 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 128406962 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128406995 C G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 128407246 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128407281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128407457 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128407494 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 128407625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128407647 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 128407715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128407752 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128407768 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 128407782 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 128407987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128408081 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128408210 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128408217 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128408324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128408401 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 128408445 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 128408469 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 128408488 A C N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 128408495 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 128408508 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128408527 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128408548 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128408693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128408703 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128408876 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 128409466 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128409496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128409511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128409643 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128409654 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128409791 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128409858 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128409885 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128410184 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 128410232 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 128412175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128412454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128412855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128413168 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 128413560 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 128413628 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128413734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128413755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128413803 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128413869 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128414031 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 128414156 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 128414166 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128414362 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 128414432 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 128414436 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128414459 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 128414482 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 128414519 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 128414581 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128414708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128415663 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128415676 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128415719 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128415960 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128416032 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128416153 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128416344 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128416402 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128416434 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 128416709 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 128416892 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 128416908 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 128416925 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 128416995 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 128417016 T G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 128417143 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 128417206 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 128417305 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 128417464 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 128417583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128417663 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 128417723 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128418066 C A Y N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 3 128418281 T C Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 128418304 C G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 128418330 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 128418376 A T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 128418379 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 128418517 G T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 128418591 T G Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 128418710 G A Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 128418781 C T Y Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 0.0909090909090909 13 9 3 7 1 3 128418916 T G Y N 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 3 128419008 A G N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 6 10 2 2 4 3 128419024 C T Y Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 6 6 2 2 2 3 128419110 A G Y Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 5 11 0 5 3 3 128419120 C A Y N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 3 128419201 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 128419246 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 128419263 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 128419369 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 128419383 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 128419386 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 128419399 T G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 128419421 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 128419597 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 128419600 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128419666 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 128419682 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 128419710 C A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 128419730 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 128419746 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 128419789 A T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 128419840 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 128419957 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 128419979 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 128420054 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128420115 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 128420130 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 128420266 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128420401 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128420412 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 128420738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128420937 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 128421458 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 128421475 C T Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 128421477 A T Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 128421674 G A N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 3 128422159 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128422988 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128423809 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128423841 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128423843 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 128425612 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128425631 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128426696 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128427227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128429892 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128430205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128430862 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128431451 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128434349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128434754 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128435588 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128435683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128436119 G C N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 128439522 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128439587 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128439613 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128439645 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128439657 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128440106 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128440770 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128443767 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 128445011 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128445181 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128445533 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128446550 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 128446749 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 128447187 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128448897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128449496 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128449888 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128450385 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128451054 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128451156 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 128452096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128452821 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128453805 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128455450 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128455451 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128455734 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128455792 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 128456541 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 128456604 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 128456682 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128456707 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128456767 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128457033 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 128457276 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 128458025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128458516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128458636 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 128459569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128459617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128459687 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128459754 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 128460008 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128460444 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128460569 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 128460683 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 128460834 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128461245 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 128461251 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 128463958 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 128464326 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 128464406 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 128465590 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 128465636 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128466326 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128466669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128466792 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128466970 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128467080 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128467557 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128468160 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128468240 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128468394 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128469127 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128470718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128471334 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128472274 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128472481 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128472756 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128473146 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128473218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128474145 A G Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 128474842 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128474849 A T Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 128475382 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128475514 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128476384 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128476417 C A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 128476581 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 128477364 T G Y N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 128478802 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128478864 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128478946 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 128488572 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128488793 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 128489418 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 128489552 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 128489593 G T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 128489802 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 128489937 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128490108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128490394 C T N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 3 128490495 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 128490910 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128492397 T C Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 128492783 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128492816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128493331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128493352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128494118 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 128494412 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 128494465 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 128497719 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 128500230 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 128500435 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128501331 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128502042 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 128502611 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128504567 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128504807 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128504894 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128511383 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128511812 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128511932 C G Y N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.1875 0.75 0.0625 18 14 3 12 1 3 128512961 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 128513204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128513749 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 128515234 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 128516090 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128516419 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128516572 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128517329 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128517377 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128518123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128518124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128520533 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128522213 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 128522230 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 128523682 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128527610 T C N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 128527851 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 128529031 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 128530079 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128530665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128531618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128534414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128534956 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128535468 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128540814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128541684 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128542174 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128542386 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128542710 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128543528 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128544952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128546353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128549257 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128549438 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128550179 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128551294 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 128551449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128551450 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128551660 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 128552369 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 128552659 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 128552671 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 128554127 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 128554153 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 128554163 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 128555840 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128556380 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128556482 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 128557143 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128558142 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128558192 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128558249 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128559683 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128560324 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128562492 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128562493 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128562506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128562675 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128562771 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128563405 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 128563735 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128563842 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 128563885 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 128563922 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 128563964 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 128563968 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 128563994 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128564114 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 128564745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128565327 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128565891 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128566653 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128566847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128566903 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 128568428 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128569475 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 128570367 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128572070 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128573300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128573558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128574155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128574388 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128574857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128574901 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128575607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128576138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128576757 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128576805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128578417 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128578580 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128579143 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 128579518 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 128579859 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 128581714 A C Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 128581936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128582375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128582489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128584322 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128584435 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128585005 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128587330 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 128587524 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128588173 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128588722 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 128589227 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 128589645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128590738 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 128590828 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 128591046 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 128591323 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128591482 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128591507 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 128592230 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128592287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128592311 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 128592488 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128592599 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128592684 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128592685 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128592782 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128593439 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 128594240 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 128594501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128595799 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 128596133 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 128596142 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 128596237 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 128596280 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128596504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128597156 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128597226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128597247 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128597258 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128597408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128597488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128597494 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128597527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128597742 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128597776 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128597850 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128597870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128597926 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128598101 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128598161 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 128598404 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 128598470 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 128598509 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 128598565 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128598660 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 128598681 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 128598820 G T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 128598876 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 128599055 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 128599115 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128599417 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128599424 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128599434 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 128599457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128599515 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 128599529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128599575 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 128599876 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128599901 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 128599942 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 128601094 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128602602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128604002 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 128604035 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128604161 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 128605605 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128605721 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128606745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128607596 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128607935 G C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 128609197 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 128610480 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128610573 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128611676 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128611854 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 128613335 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128613927 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 128614070 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128616104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128616791 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128617070 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128620213 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128621734 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128624140 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 128624610 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128625710 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128625804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128627154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128630329 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128631900 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128632364 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128634485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128635495 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128635652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128636566 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128636767 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128638243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128638649 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128638660 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128639213 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128640668 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 128641113 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 128641812 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128643725 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128644261 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128645058 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128645467 T C Y Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.2 0.8 0 6 4 1 4 0 3 128645870 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128650281 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128650586 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 128650851 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128652197 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128652737 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128654138 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128654912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128655566 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128656700 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128657495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128657558 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128658047 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128658062 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128658165 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 128658401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128659358 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128660668 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128669806 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128670083 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128671459 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128672238 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128672448 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128672585 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 128676201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128676208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128677138 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128677241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128677392 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128678087 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128678541 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128678787 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128678845 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128678875 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 128678918 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128679089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128679156 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 128679180 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128679183 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128679223 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 128679341 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128679358 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128679401 G C Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 128679421 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 128679530 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128679558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128679660 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 128680111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128680191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128680196 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128680509 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128680817 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 128681039 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 128681092 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128681108 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 128681119 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128681275 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 128681708 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 128681745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128682294 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128684242 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 128684253 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 128684254 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 128684372 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 128684616 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 128684714 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 128685132 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128687910 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128688899 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 128689154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128689876 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 128689939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128691382 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128691433 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 128694616 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128695822 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128698328 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 128701779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128702004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128702570 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 128703296 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 128703793 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128704507 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128704613 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 128704949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128706113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128706186 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128706274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128706355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128706581 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128707134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128707635 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128707667 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128708227 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 128708448 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128709418 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128709924 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128710641 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 128710995 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128710996 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128712253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128713278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128713542 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128713958 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128713972 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128714000 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128719643 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 128722932 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 128723210 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 128723902 A G Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 128724904 G C Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 128725155 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 128736258 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128737615 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128738638 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 128740197 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 128740482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128741834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128742355 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128742948 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128744803 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 128747746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128747752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128747759 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128748838 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128749180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128749369 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 128750321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128750917 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128751012 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 128753077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128753416 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128753834 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 128754050 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 128756431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128759373 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128759448 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128764193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128765338 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 128765729 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128765886 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128765905 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128766251 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 128766316 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 128766367 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 128766787 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 128767004 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 128767066 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128767565 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 128767636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128767653 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128769880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128771428 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128772214 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128772284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128772355 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128772651 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 128773112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128773429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128777298 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 128778173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128782590 C A Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 128782906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128786303 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128786729 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 128789291 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128789531 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128790573 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128791879 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128794830 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128795023 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 128795039 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 128795592 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128795865 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128795881 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128795996 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 128796166 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128796173 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 128796304 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 128796347 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 128796395 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 128796432 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128796537 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 128796585 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128796722 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 128797070 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 128797185 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 128797191 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128797383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128797399 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 128797403 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 128797669 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 128797817 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 128797925 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 128798141 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 128798304 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 128798367 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 128798387 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 128798392 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 128798401 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 128798446 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 128798464 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 128798560 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 128798607 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 128798656 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 128798849 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 128798872 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 128798899 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128798941 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 128799040 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 128799048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128799764 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 128799880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128799937 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128800163 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128800202 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 128800224 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128800283 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 128800354 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 128800525 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 128800554 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128800583 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128800595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128800601 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 128800765 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 128800848 A G N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 3 128800905 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 128800981 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 128801036 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128801061 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 128801493 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 128801550 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 128801603 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 128801627 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 128801831 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 128801926 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128802226 A C Y N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 128802411 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128802479 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 128802698 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 128803088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128803128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128803135 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 128803631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128803642 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 128803719 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 128804596 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 128804625 T A N N 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 128804744 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 128804772 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128806347 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 128810933 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128811661 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 128812027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128812077 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128812571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128812609 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 128812969 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 128813774 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128814615 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 128815644 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128815645 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128816795 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128816923 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128817012 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128817232 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 128817511 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 128817531 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128817699 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128817726 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128817731 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128817763 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 128818423 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 128818686 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128818932 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 128819209 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 128819502 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128819607 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128820147 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128820184 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 128820420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128821418 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 128821740 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 128824036 A G Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 128827357 A G Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 128828102 G A Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 128828283 A T Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 128830215 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 128830770 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128831137 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 128831600 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128832479 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128835611 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128836830 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128837939 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 128838083 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 128838185 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128838189 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128838410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128838507 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 128838648 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128838799 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 128838889 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128839307 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128839340 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128839459 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128839654 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 128839705 C G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 128839709 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 128839755 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 128839820 T A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 128839844 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 128839915 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 128839957 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 128839972 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 128840060 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 128840088 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 128840100 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 128840118 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 128841331 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128841348 C G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 128841396 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 128842439 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 128843400 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 128843702 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 128844735 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128844809 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 128844989 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 128845102 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 128845182 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 128845298 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 128845702 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 128845860 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 128846217 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 128846297 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 128846574 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 128846712 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128846734 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 128846739 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 128846799 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 128846842 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128846856 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 128847002 G A N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 3 128847005 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 128847017 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 128847081 A T N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 3 128847136 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 128847202 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 128847287 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128847431 A G N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 3 128848108 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 128848314 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 128848961 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 128849277 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128849444 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 128849828 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128850121 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 128850144 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128850704 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128851157 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128851371 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 128851459 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 128851647 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 128851690 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 128851747 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 128851749 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 128851806 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 128851868 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128851980 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 128852099 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128852551 T A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 128852699 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 128852700 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 128852783 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128852826 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 128852941 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 128852983 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 128858304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128858309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128858839 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 128858990 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 128859013 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128859020 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 128859037 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128859063 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128859076 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 128859097 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 128859119 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128859208 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128859298 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 128859389 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128859418 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128859539 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 128859591 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 128859734 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 128860136 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 128860265 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 128860287 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 128860293 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 128860317 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128860368 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128860536 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 128860564 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128860634 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 128860709 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128860850 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 128860999 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 128861285 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 128861311 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 128861389 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 128861438 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128861441 C T Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 128861576 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128861886 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 128862020 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 128862031 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 128862162 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 128862250 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 128862361 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128862372 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128862389 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128862396 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128862465 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128862508 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128862659 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 128862684 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 128862775 G C Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 128862780 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 128862893 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 128862903 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 128862921 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128862954 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128863038 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 128863079 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 128863128 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128863176 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128863744 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128863859 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 128863868 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 128864019 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128864258 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128865097 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128865334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128867187 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128867910 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 128869440 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128870214 G C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 128870316 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 128871775 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 128872465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128872563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128873010 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 128873278 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128873557 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128875313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128875490 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128876494 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128876648 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128876753 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 128876847 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128876998 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128877565 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 128877677 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 128878803 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 128880618 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 128882270 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128882502 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128882567 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 128882643 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128883190 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 128883205 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 128883551 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 128883674 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128883682 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 128883690 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 128883703 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 128883716 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128883807 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128883822 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128883913 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128883982 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128883983 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128884145 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 128884858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128884915 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 128886123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128887261 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0 0.789473684210526 0.210526315789474 15 23 0 15 4 3 128889257 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128891445 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128892261 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128892327 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128892365 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128896232 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 128896628 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 128897220 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128897693 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128898807 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 128898925 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 128900530 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128901335 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128902581 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128904065 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 3 128906677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128906737 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128907253 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128907435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128908509 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 128908969 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 128909590 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 128909998 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 128910835 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128911278 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 128911568 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128912846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128913667 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128913708 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 128914262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128914430 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128914765 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 128915004 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128915570 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128916119 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128917828 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128918026 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 128918440 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128922686 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128922692 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128924252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128924367 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128926320 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128926986 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128927043 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128927227 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128927743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128928082 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128928264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128928435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128928474 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 128928656 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 128928804 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128929290 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128929320 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128929483 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128929860 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128929954 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128930800 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 128930801 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128930929 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128931197 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128931284 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128931866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128933879 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128934003 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 128934086 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 128934948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128936436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128937170 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128937376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128938565 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128938775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128941838 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128942352 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 128944743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128944783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128945556 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 128947343 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128947479 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128947834 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128947943 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128948120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128948215 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128948441 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128950173 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 128950236 C G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 128950992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128951632 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128954548 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 128954557 A G N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 128955108 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 128955751 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128956022 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 128956773 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128957195 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 128958555 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 128959204 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128959218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128960003 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 128960054 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128960114 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 128960249 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 128960528 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128960728 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 128960747 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128960757 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 128960791 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128960796 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 128960809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128960994 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 128961023 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 128961061 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 128961093 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 128961111 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128961165 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 128961197 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 128961212 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 128961217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128961300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128961365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128961397 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 128961436 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128961456 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128961473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128961474 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 128961487 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 128961803 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 128961829 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 128961839 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 128961866 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 128962000 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 128962035 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 128962362 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128962559 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 128962577 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 128962602 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 128962603 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 128962641 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 128962671 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 128962841 A C Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 128964727 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128964773 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128964893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128964923 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 128965212 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128965706 A C N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 128966233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128966267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128966438 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 128966453 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 128966778 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 128966802 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 128966833 A T Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 128966857 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 128966924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128967103 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 128967228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128967434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128967898 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 128968339 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128968586 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128968653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128968679 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128970120 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 128970213 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 128971131 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 128971170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128971177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128971213 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 128971253 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128971316 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 128971347 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128971360 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 128971521 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 128971653 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 128971657 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 128971669 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 128973047 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128973087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128973144 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 128973161 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 128973305 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128973467 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128973475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128973504 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 128973514 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 128973592 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 128973615 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128973830 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 128973887 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128974278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128974906 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 128974925 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 128975014 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 128975294 G A Y Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.363636363636364 0.454545454545455 0.181818181818182 13 9 4 5 2 3 128975302 G A Y Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.363636363636364 0.363636363636364 0.272727272727273 12 10 4 4 3 3 128975558 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 128975691 A G Y Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 8 10 0 8 1 3 128975700 A G Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 3 128975865 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128975888 C A Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 128975924 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128976097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128976154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128976706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128976795 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 128977025 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 128977141 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128977369 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 128977696 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128977752 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 128978217 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128978483 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 128978546 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 128978675 C A Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 128979036 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128979233 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128979269 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128979276 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128979398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128979429 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 128979504 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 128979619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128979779 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 128979786 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 128979873 T A Y N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 128979884 T A Y N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 128980150 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 128980178 T C Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 128980213 T G N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 128980259 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 128980298 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 128980329 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 128980427 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 128980428 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 128980475 C A Y N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 128980489 C G Y N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 128980555 A G N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 128980558 G A N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 128980590 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 128980641 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 128980695 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 128980712 C T Y Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 128980734 G T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 128980887 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 128980922 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 128980927 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128981180 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 128981184 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128981194 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 128981347 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 128981630 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 128981664 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 128981742 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128981807 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 128981975 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128982132 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 128982176 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 128982179 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 128982298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128982332 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 128983505 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 128983553 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128983644 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 128984457 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 128985468 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128986222 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128987470 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 128992488 G C N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 128992507 A C N N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 3 128992607 T A N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 128992870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128992927 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128993350 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128993353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128993455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128993498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128993605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128993789 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 128993882 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 128994006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128994186 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 128994264 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 128994266 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 128994300 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128994518 C T N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 3 128994648 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128994893 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128994971 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128995084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128995131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128995150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128995705 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 128995777 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 128995983 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128996146 C G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 128996383 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 128996395 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 128996569 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128996584 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 128996622 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128996626 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 128997092 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128997147 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128997300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128997378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 128997490 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129000696 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 129000698 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 129001333 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 129001371 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 129001411 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 129001982 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129002776 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 129003157 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 129005447 G A Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 129005492 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 129005506 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 129005509 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 129006101 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 129007804 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129007977 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 129008650 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 129008686 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 129008781 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 129008798 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 129008885 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 129009059 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 129009350 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 129009452 A T Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 129009629 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 3 129009673 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 129009720 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 129009722 A G Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 129009837 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 129009882 C T Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 129009884 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 129009910 G A Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 3 129009933 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 129010023 T C Y Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 129010027 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 129010394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129010483 A T N N 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 129010746 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129010881 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 129010937 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 129011056 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 129011254 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 129011278 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129011387 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129011423 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129011436 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129011593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129011697 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129011713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129011885 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 129012070 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 129012221 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129012295 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129012414 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 129012444 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 129012750 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129012975 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129013329 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129013588 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 129013614 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 129013638 A G N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.75 0 0.25 12 4 6 0 2 3 129014065 A C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.235294117647059 0.117647058823529 0.647058823529412 10 24 4 2 11 3 129014069 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 129014088 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 129014139 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 129014357 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 129014383 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 129014402 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 129014682 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129014686 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 129014693 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 129014703 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 3 129014753 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 129014787 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129014966 A T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 129015070 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 129015164 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 129015196 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129015301 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129015359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129015786 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 129015839 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 129016017 A C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 129016693 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 129016788 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 129016800 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129016848 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 129016906 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 129016909 G T Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 129016938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129016982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129017051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129017057 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129017112 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 129017117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129017145 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129017268 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 129017299 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 129017321 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 129017403 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 129017496 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 129017585 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 129017593 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 129017641 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 129017717 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 129017945 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 129018020 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 129018021 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129018118 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 129018167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129018413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129018482 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129018589 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 129018602 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 129018627 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 129018719 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129018877 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 129018959 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 129019000 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 129019216 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 129019265 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 129019281 T A N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0 0.8125 0.1875 13 19 0 13 3 3 129019324 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 129019420 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 129019449 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129019562 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129019575 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129019609 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129019721 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129019816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129020170 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 129020227 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 129020238 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 129020257 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 129020351 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 129020371 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 129020419 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 129020463 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 129020516 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 129020528 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 129020631 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 129020752 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 129020914 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 129020925 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 129020959 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 129021282 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 129021291 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 129021300 G C N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 129021333 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 129021334 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129021478 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 129021600 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 129021785 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 129022091 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 129022104 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129022105 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129022472 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 129022562 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 129022820 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 129022829 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 129023060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129023084 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129023158 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129023491 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129023501 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 129023771 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 129024003 A G N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 3 129024060 T C Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 129024225 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 129024478 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 129024493 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129024915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129025655 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 129025677 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 129026150 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 129026246 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 129026331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129026611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129026876 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 129026991 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 129027070 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 129027128 T C N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 8 12 2 4 4 3 129027222 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 129027370 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 129027593 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 129027612 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129027636 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 129027677 T A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 129027695 G C N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 129027766 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129028806 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 129028817 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 129028839 C A Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 129028923 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129029102 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 129029162 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 129029195 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 129029292 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 129029318 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 129029328 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 129029472 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 129029475 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 129029514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129029572 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 129029620 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 129029671 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 129030638 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 129032170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129033367 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 129033417 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129033456 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 129033606 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 129033607 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 129033787 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 129033834 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129035845 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129035877 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129036860 A C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 129037316 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 129037828 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 129037861 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 129038110 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 129038881 C A N N 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 129039541 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 129039703 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129039866 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 129040173 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129040189 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 129040284 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 129040309 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 129040824 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 129040876 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 129040934 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129041078 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 129041194 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 129041219 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129041398 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129041526 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129041558 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 129041740 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 129041749 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129041798 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129041862 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 129042192 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 129042224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129042316 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129042330 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129042339 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 129042462 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 129042560 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129042866 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 129042969 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 129043086 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129043253 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 129043338 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 129043473 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 129043528 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 129043702 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 129043737 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129043752 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 129043754 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 129043775 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 129043789 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129043951 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 129044790 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 129044880 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 129044952 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 129044964 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 129045527 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 129045660 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 129045734 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 129045985 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 129046175 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 129046182 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 129046205 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 129046501 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 129046575 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129046620 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 129046633 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129046664 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 129046733 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 129046780 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129046819 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 129046850 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 129047065 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129047200 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 129047219 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 129047277 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 129047410 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 129047476 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 129047918 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 129047929 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129048074 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 129048076 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129048117 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 129048159 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 129048312 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 129048525 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 129048586 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 129048724 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 129048726 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 129048744 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 129048753 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129048801 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 129048804 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 129048960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129049187 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129049191 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 129049639 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 129049650 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129049691 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 129049773 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 129050020 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 129050183 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 129050247 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 129050370 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 129050420 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 129050629 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 6 12 2 2 5 3 129050655 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 12 6 5 2 2 3 129051073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129051514 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129051868 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 129051925 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 129052018 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 129052366 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 129052390 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129052403 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129052534 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 129052579 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 129052664 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129052975 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129053321 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129053354 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129053398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129053456 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 129053958 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 129054081 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 129054213 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129054764 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129054793 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 129054832 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 129055069 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 129055543 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129055584 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 129055588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129055618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129055661 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129055770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129055851 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129056821 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129057599 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129059393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129060133 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 129065718 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 129065735 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 129065864 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129065865 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129066276 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129066669 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129066876 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129067452 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129067557 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129070008 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 129070044 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 129070085 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129071033 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 129071479 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129071554 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129072868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129074773 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129075401 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129076014 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129076296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129077645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129078676 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129079216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129080117 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 129080471 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129080473 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129080569 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 129080598 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 129080870 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129081099 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 129081295 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129081641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129082246 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 129082486 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 129082500 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 129082626 G A N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 3 129082951 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129082963 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129083154 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 129083177 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 129083217 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 129083241 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 129083386 A G N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 3 129083771 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 129083902 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 129083924 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 129083951 G A N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 3 129083964 C G N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.538461538461538 0.230769230769231 0.230769230769231 17 9 7 3 3 3 129084121 A G N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.461538461538462 0.230769230769231 0.307692307692308 15 11 6 3 4 3 129084140 T G N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 129084180 G A N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 129084193 A G Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 129084302 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 3 129084671 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 129084991 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 129085232 C T Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.375 0.125 0.5 14 18 6 2 8 3 129086944 G A N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 3 129087415 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 129087885 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 129087958 G A Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 3 129087960 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 129088010 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 129088051 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129088104 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 129088139 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 129088364 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 129089073 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 129089225 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 129089561 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129089594 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 129089662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129090159 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 129090293 A C Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 129090851 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 129091027 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 129091399 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 129091406 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 129091424 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 129091425 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 129091622 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 129091723 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 129092084 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 129092085 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 129092187 T A N N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.272727272727273 0.545454545454545 0.181818181818182 12 10 3 6 2 3 129092346 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 129093622 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129094941 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129095793 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 129095901 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129099168 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 129102844 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 129103187 C A Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 129103716 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129106375 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 129106502 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 129106568 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 129106834 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 129106860 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 129106919 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129106991 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 129107090 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 129107179 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129107212 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129108034 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129108108 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 129108145 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 129108355 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129108437 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 129108946 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 129109030 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 129109054 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 129109174 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129109260 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 129109283 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129109298 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 129109320 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129109324 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129109394 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129109448 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129109774 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129109891 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129110070 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 129110212 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 129110294 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 129110353 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129110408 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129110563 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129110643 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129110715 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129110751 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 129110939 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 129110954 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 129111042 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 129111061 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 129111073 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129111406 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 129111568 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 129111585 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 129111592 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 129111688 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 129111722 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 129111818 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 129111822 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 129111898 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 129111926 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 129111985 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129112230 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 129112234 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 129112246 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 129112250 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 129112285 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 129112453 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129112497 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 129112617 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129112666 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 129112846 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 129112862 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 129112872 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 129112910 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 129112954 C A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 129113246 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 129113247 T G Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 129113382 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 129113486 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 129113489 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 129113542 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129113558 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 129113560 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 129113617 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 129113900 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129114108 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 129114294 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129114766 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129115097 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 129115142 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 129115205 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 129115669 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 129115772 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 129115790 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 129115870 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 129116466 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 129117241 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129117753 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 129117934 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129119046 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 129119303 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129119480 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 129120881 T C Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 129121630 A G Y Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 129122548 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 129124866 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129124879 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129125926 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 129125991 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129126188 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129126285 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129126944 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129126945 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 129127567 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 129127583 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 129127624 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 129127985 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129128710 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129128982 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 129129028 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 129129190 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129129260 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129129445 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129130612 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 129130626 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 129130673 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129130826 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129131879 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129132149 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129132809 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129133249 G C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 129135537 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 129136738 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129136901 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129136902 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 129137862 G C Y N 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 3 129137880 A G N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 129139497 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 129140748 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 129140889 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129141106 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 129141157 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 129141256 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129141593 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 129142495 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129144699 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 129149382 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 129154783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129158080 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129163091 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 129163208 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129164566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129166499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129166514 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 129167406 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 129167433 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 129167436 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 129167486 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 129167488 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 129167534 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 129167588 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129167875 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.45 0.15 0.4 21 19 9 3 8 3 129168246 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129168303 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 129169043 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129169769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129172331 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 3 129174346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129175815 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129176089 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129176264 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129176399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129177187 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 129177261 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 129177270 A T Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 129177504 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 129177822 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129177866 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 129179544 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 129179868 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129179915 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129180228 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129180368 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 129181620 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129182524 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129182602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129183252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129183298 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 129184476 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 129184971 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129185107 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 129185181 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 129185189 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129185304 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129185873 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 129185943 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 129186008 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 129186683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129187040 T A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 129187082 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129187099 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 129187324 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 129187363 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129187364 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 129187513 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 129187514 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 129187585 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 129187780 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 129187800 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 129187809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129187864 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 129189863 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129191029 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129192457 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 129192670 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 129194096 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129194293 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 129194314 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129195055 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129195118 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 129195209 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129196266 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129196347 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129197230 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 129197335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129201286 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129201740 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129205262 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129205357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129205683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129206740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129208156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129208367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129209787 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 129211769 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 129212687 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129212705 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129213187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129215005 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129215351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129217563 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129222825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129223433 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 129223921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129224003 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 129225042 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129226266 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129226319 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129226984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129227156 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129227163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129227188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129227212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129227236 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129228742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129228788 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 129228808 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 129229159 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 129231073 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 129231496 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 129231924 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 129232058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129233079 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 129233246 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129233623 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 129233989 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 129234014 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 129234015 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 129234028 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 129235835 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 129235962 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 129237240 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129237457 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129238633 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129238777 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129239787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129240617 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 129240728 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 129240734 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129241003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129241499 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 129242041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129242189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129242885 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 129242986 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 129243108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129244412 A T Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 15 21 0 15 3 3 129244822 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.1 0.75 0.15 19 21 2 15 3 3 129245419 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129246915 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129247487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129247642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129249334 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129249797 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 129250772 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129251020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129252229 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129253568 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129253726 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 129254359 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129254935 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129256050 T G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 129257175 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 129258149 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 129258153 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 129258598 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129259239 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129259263 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 129259294 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129260759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129260928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129261881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129261887 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129262030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129262366 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 129263006 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 129263015 G T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 129263677 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 129263708 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 129263725 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 129263858 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 129263913 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 129263996 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 129264000 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 129264110 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 129264284 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 129264553 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 129265325 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129265524 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 129265865 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 129265910 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 129266221 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 129266593 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 129267125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129267150 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 129267419 C T Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 129267895 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 129268016 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129268302 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129268403 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 129268568 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129268606 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129268742 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129268754 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129268773 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129268775 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129268822 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129268842 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129268843 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129268853 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129268931 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129269084 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129269087 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129269169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129269275 A G Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 129269425 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129269435 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129269459 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 129269630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129269631 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129269656 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129269682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129270279 G A Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 129270405 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 129270926 C A N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 129273675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129275675 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129275725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129275733 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 129275789 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129277141 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129277497 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129277573 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129277624 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129277693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129277838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129278381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129278416 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129278521 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 129278674 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129278764 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 129278766 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 129278863 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129278870 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 129278919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129278967 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 129279094 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129279135 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129279237 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129279253 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129279598 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129279658 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129279811 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129280235 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129280237 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129280255 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129280586 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129280672 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129281056 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 129281346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129281389 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 129281846 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129282743 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129283519 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129283989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129284156 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129284261 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 129284473 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129284509 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129284620 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129284624 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 129284658 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 129284751 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129284817 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129284841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129284874 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129285019 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129285049 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129286097 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129286240 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129286321 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129286533 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129286679 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129287900 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129288691 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129288995 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129289094 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 129289098 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 129289134 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 129289267 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 129289341 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 129289430 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129289455 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 129289464 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129289466 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129289476 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 129289479 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 129289518 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 129289577 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 129289669 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 129289784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129289807 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 129289819 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 129289838 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 129289843 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 129290170 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 129290187 C G Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 129290341 C G Y N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 129290375 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129291197 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129291621 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 129291651 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 129292639 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 129292797 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129293878 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 129294384 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 129294561 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129295518 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 129295874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129296423 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 129296480 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 129296859 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 129297034 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 129297451 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129298913 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129298934 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129299072 G T Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 129299421 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129300287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129301380 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129301547 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129301593 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129301633 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129301761 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 129301886 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129302037 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 129302202 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129302206 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129302230 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 129302307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129302451 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 129302970 C G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 129303212 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 129303243 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 129303327 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 129303379 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129303438 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129303530 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 129303729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129303852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129303868 A C Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 129303943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129304103 C A Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 129304107 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 129304321 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129304481 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129304542 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129304792 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 129304805 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 129304821 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 129304888 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129304893 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 129309502 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129310273 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129310289 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129311412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129311929 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129313613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129319964 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129320250 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129320427 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129320777 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 129321019 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129321498 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129322801 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129324124 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 129324170 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 129324236 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 129324260 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129324382 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129324481 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129325520 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 129325928 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129326534 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 129328531 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 129329350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129329674 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129329750 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 129329793 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129331055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129331546 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 129331961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129334875 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129335395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129338189 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 129338386 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 129339378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129340342 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129340948 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129341052 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129342549 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129343939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129344471 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129345431 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129345445 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129345569 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129345717 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129345924 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 129347347 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129347545 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129349917 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 129351182 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129352100 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 129352327 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129352467 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129352589 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129352603 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129352693 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129352807 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129352833 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129352844 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129352953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129352980 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129353186 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129353290 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129353456 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 129353511 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 129353776 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129354108 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 129354162 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129354394 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129354464 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 129354507 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 129354560 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 129354592 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 129354638 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129354747 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 129354852 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129354866 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129355030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129355062 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129355135 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 129355391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129355853 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129355881 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129356433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129357288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129357409 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 129357762 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 129357834 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 129358123 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129358339 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 129358489 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 129358580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129358957 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 129358973 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129359109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129359110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129359848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129360281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129360373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129360693 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129360786 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129360807 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129360848 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129361293 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129361358 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129361627 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129361683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129361730 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129361731 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129362289 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 129364129 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129364494 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129364683 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129364695 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 129364874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129365036 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129365178 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 129365192 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 129365217 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129366836 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129366955 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129367279 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129367309 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129367775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129367791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129367811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129367815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129367855 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129368576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129368676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129368957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129369026 A G Y Y 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 3 129371731 C T Y Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0 0.8 0.2 8 12 0 8 2 3 129371758 T C Y Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0 0.727272727272727 0.272727272727273 8 14 0 8 3 3 129376861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129376893 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 129377121 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129377815 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129377849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129377927 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129377943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129378029 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129378064 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129378908 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 129379244 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129379265 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129379330 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129379663 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129379709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129380060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129380158 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129380358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129380447 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129380608 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 129380775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129380777 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129380827 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129380854 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129380865 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129380876 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129380927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129381037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129381346 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129381604 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129382115 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129382186 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129382278 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129382281 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129382338 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129382514 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129382531 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129382573 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129382643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129382814 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129382828 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129382832 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129382948 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 129382949 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 129382978 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 129383019 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129383056 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129383486 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129383503 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129384151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129384688 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129385020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129385274 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129385538 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129385875 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129386009 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129386060 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129386153 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129386157 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129387320 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129387845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129387890 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129387982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129388215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129389728 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129389781 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129389833 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129390404 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129391144 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129391235 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129391351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129391524 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129391595 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 129392303 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129392304 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129392509 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129392619 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129392687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129392695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129392733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129392756 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129392882 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129393147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129393303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129393448 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129393595 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129393696 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129393721 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129393775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129393850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129394083 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129394107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129394926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129395408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129395565 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129395599 A T Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 129395691 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129395696 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129395702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129395765 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129396019 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129396037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129396229 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129396238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129396301 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129397184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129397229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129397235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129397902 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129398177 G A N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 129398659 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129398923 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129398952 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129399193 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129399196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129399231 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129399243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129399322 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129399980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129400142 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129400146 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129400253 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 129400347 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 129400445 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129400464 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129400598 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129400721 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129401059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129401073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129401139 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129401225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129401235 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129401365 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129401648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129402033 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129402297 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 129402420 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129402941 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129403119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129403448 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129403484 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129403653 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129403731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129403746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129404060 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129404425 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129404460 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 129404537 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129405642 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129405726 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129406150 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129406195 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129406361 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129406484 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129409468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129410946 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129411284 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129411469 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129412864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129414040 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129416541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129416817 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129417451 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 129417503 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129417564 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129418399 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 129418428 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 129418699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129418815 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129418864 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 129419358 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129419372 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129419509 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129419530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129419859 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129419904 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 129419933 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129419934 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129419977 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129420009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129420107 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 129420231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129420246 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129420436 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129420815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129420926 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129420991 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129421004 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129421147 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129421162 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 129421348 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129421373 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129421492 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 129421603 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 129421610 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 129421619 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 129421659 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 129422678 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 129423032 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129423094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129424064 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 129424258 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129424274 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129424381 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 129424401 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 129424524 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129424614 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129424782 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129424799 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 129424828 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 129424930 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 129424955 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129424970 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 129424987 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 129424989 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129425094 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 129425099 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 129425286 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 129425430 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 129425434 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 129425446 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 129425601 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 129425832 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 129426393 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129426499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129426678 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129426770 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129426840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129426857 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129426996 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129427071 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 129427708 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 129427929 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129428114 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129428591 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 129428647 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129429668 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 129430472 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 129430905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129430934 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 129430960 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 129430983 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 129431007 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 129431293 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 129431577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129431717 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 129431741 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 129431998 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 129432772 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129432774 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 129433887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129434165 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129434627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129434693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129434938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129435179 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 129435181 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 129435191 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 129435234 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 129435262 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 129435264 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 129435396 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 129435542 G C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 129435547 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 129435608 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 129435616 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 129435628 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 129435727 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 129435822 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 129436332 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 129436836 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129436950 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 129437416 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129437518 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 129437797 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 129438301 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 129438459 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 129438471 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 129438667 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129439205 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129439325 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 129439483 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 129439839 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129440075 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 129440152 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129440226 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 129440553 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129440612 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129440637 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 129440829 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129440873 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129440946 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129441124 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 129441316 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129441317 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129441431 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129441586 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 129441649 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 129441679 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129441696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129441789 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129441894 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 129441975 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129442003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129442162 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 129442180 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 129442254 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 129442535 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129442611 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129442646 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 129442673 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 129442677 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 129442696 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 129442712 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 129442798 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 129443134 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 129443225 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 129443352 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 129443355 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 129443394 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 129443525 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129443555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129443670 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129443711 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 129443879 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 129443902 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129443918 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 129443926 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 129444072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129444143 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 129444225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129444385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129444396 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 129444778 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 129444899 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 129444940 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 129444987 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 129445236 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129445444 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 129445503 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 129445524 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 129445645 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 129445649 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 129445736 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 129445870 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129445978 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 129445997 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 129446069 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129446285 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 129446530 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 129446610 A C N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.3125 0.625 0.0625 20 12 5 10 1 3 129446632 G A N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 3 129446641 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 129446669 G A N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.333333333333333 0.6 0.0666666666666667 19 11 5 9 1 3 129446703 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 3 129446704 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 129446841 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 129447014 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 129447019 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 129447153 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 129447155 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129447179 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129447281 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 129447284 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 129447292 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 129447439 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129447609 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129447647 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129447716 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129447761 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 129447791 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 129447804 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 129448005 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129448029 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 129448310 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 129448365 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 129448433 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 129448502 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129448538 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 129448540 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 129448583 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 129448616 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 129448631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129448681 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 129448689 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 129448709 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 129448734 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 129448738 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 129448748 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 129448783 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 129448801 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129448812 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129448859 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 129449004 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 129449078 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 129449085 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129449199 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129449393 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 129449424 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 129449427 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129449474 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 129449530 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 129449562 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 129449598 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 129449610 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 129449636 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 129449639 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 129449653 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 129449660 A C N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 129449912 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 20 4 10 0 2 3 129449936 T C N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.181818181818182 18 4 9 0 2 3 129450005 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 129450006 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 129450030 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 129450059 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129450072 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129450149 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129450221 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 129450235 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129450254 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 129450312 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129450317 G T Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 129450344 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 129450587 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 129450615 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129450670 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 129450700 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129450780 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 129451257 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 129451281 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129451434 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129451436 A T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 129451452 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129451506 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 129451576 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 129451709 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 129452133 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 129452143 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 129452721 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129452727 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129452996 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129453107 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 129453341 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 129453356 G A N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.230769230769231 0.538461538461538 0.230769230769231 13 13 3 7 3 3 129453430 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 129453563 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 129453573 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 129453622 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 129453657 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 129453725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129453792 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 129453840 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 129453878 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 129454378 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129454969 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129454971 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129455005 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129455012 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 129455031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129455195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129455822 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129455826 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129456759 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129457394 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129457982 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129458425 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 129458538 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129458564 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 129458628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129458671 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129458867 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129459031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129459072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129459105 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 129459205 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129459218 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129459248 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129459403 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129459407 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129459828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129459912 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129459932 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129460089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129460107 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129460151 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129460241 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129460303 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129460357 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129460378 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129460435 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 129460551 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 129460629 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 129460757 G T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129460763 A C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129461105 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 129461134 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129461144 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 129461193 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 129461283 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 129461320 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129461358 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 129461369 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129461528 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 129461612 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129461644 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129461677 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 129461679 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 129461770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129461830 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129461832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129461872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129462098 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 129462122 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 129462183 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129462214 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 129462286 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129462337 T G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 129462377 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 129462537 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 129462552 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129462628 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 129462650 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 129462736 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 129462746 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 129462861 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 129463008 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129463016 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129463046 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 129463079 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 129463186 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129463187 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129463221 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 129463306 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129463330 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129463340 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129463377 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 129463380 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 129463490 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129463533 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129463598 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129463621 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129463632 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129463695 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 129463727 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129463736 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129463738 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129463810 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 129463879 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129464162 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 129464283 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 129464348 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 129464457 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 129464690 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129464807 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129465078 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 129465098 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129465183 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 129465301 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 129465302 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 129465409 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 129465512 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 129465523 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 129465541 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 129465620 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129465824 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 129466076 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129466341 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129466718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129466752 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129466849 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 129466870 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129467236 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 129467326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129467529 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129467562 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129467574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129467781 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129467811 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129467856 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 129468063 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 129468151 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 129468156 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 129468278 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 129468316 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129468343 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129468644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129469406 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 129469832 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129470910 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129471009 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129471085 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129471125 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129471368 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129471444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129471572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129471877 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 129472069 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 129472302 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129472324 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129472358 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129472649 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129472888 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129472898 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129472952 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129473036 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129473233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129473697 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129473855 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129473994 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129474323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129474348 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129474358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129475384 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129475658 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129475713 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129475783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129476451 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129476519 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 129477642 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 129479982 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129480266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129481726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129481781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129481812 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129481844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129482011 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129482064 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129482122 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129482165 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129482181 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129482183 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129482330 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129482361 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129482397 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129482598 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 129482710 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129482832 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 129482948 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 129483038 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129483052 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129483073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129483238 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129483262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129483426 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129483477 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129483638 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129484270 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 129484314 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129484327 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129484368 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129484476 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129484851 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129484861 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129484880 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129485128 A C Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 129485188 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129485250 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 129485314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129485332 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129485416 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129485481 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 129485500 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 129485755 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129485774 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 129485777 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 129486074 A T Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 129486141 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 129486180 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 129486203 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 129486630 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 129486658 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129486749 A T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 129486752 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 129486828 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129487106 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 129487598 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 129487704 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129487829 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 3 129487897 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129488041 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129488214 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 129488359 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 129488582 A G Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 3 129488604 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 129488607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129488651 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 129488670 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 129488681 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 129488692 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 129488718 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129488765 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 129488788 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129488795 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 129489157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129489207 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129489235 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129489301 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129489447 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 129489558 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 129489564 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 129489651 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 129489698 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129489700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129489851 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129489880 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 129490840 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129490881 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 129490924 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 129490943 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 129490978 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 129491031 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 129491057 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 129491424 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 129491744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129491949 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 129491965 G T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 129492035 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 129492172 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 129492247 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129492306 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 129492333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129492461 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 129492472 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 129492551 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 129492562 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 129492578 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 129492830 T C N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 3 129492871 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 129493033 G A N Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 5 9 2 1 4 3 129493054 T C N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 3 129493142 C T N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.0909090909090909 11 11 1 9 1 3 129493306 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 129493393 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 3 129493453 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 129493454 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 129493506 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 129493513 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 129493647 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 3 129494261 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 129494497 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 129494608 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 129494623 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 129494629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129494647 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 129494699 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129494763 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 129494856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129494896 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 129494963 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 129495021 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 129495039 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 129495256 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129495283 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129495349 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129495363 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 129495423 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129495492 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 129496020 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 129496483 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 129496495 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 129496506 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 129496571 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 129496683 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 129496785 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 129496881 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 129497324 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 129497416 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 129497418 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 129497464 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 129497524 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 129497535 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 129497633 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129497636 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 129497724 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129497737 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129497862 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129497880 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 129497916 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 129498073 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129498090 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 129498240 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129498243 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 129498268 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 129498288 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129498321 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 129498328 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 129498351 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129498536 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129498553 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129498568 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129499089 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 129499285 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 129499295 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 129499333 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 129499352 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 129499389 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 129499821 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 129499914 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 129500067 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 129500153 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 129500318 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 129500401 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129500533 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129500602 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 129500682 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129500703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129500833 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129500881 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129501058 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 129501116 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 129501171 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 129501379 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 129501889 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 129501900 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 129501933 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129502020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129502054 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 129502172 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 129502381 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129502413 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 129502518 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 129502537 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129502539 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 129502597 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 129502859 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129502873 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 129502993 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 129503004 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 129503088 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 129503124 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 129503344 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 129503355 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 129503546 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 129503578 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129503774 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129504016 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 129504032 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 129504047 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 129504150 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 129504177 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 129504205 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 129504356 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 129504390 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 129504400 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 129504527 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 129504536 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 129504582 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 129504698 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129504813 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129505057 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 129505235 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 129505661 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129505825 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129505872 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129505914 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.0625 0.9375 0 17 15 1 15 0 3 129505961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129505990 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129506040 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129506082 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 129506103 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 129506231 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 129506244 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 129506307 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 129506501 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 129506523 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 129506617 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129506747 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129506824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129506986 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 129506995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129507020 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 129507141 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 129507157 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 129507268 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 129507361 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 129507665 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 129507734 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129508987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129509316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129510055 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129510066 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 129510071 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129510080 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129510087 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129510119 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129510179 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129510192 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129510232 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129510306 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 129510337 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 129510363 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 129510371 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129510449 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129510587 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129510610 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 129510727 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 129510769 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129510784 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129510880 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129511072 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 129511168 G T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 129511365 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129511474 T A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 129511552 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 129511686 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 129511752 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129511763 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129512145 G T Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 129512157 C T Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 129512316 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 129512392 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129512654 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129512741 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 129513112 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 129513128 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 129513156 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 129513187 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 129513451 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129513538 T G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 129514812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129515093 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129515136 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129515873 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129515878 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129515945 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 129516024 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 129516050 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 129516476 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 129516517 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129516518 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 129516538 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 129516556 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129516575 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129516586 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129516593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129516666 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129516671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129516678 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129517025 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 129517077 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 129517099 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 129517130 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 129517132 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 129517147 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 129517148 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 129517164 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 129517218 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 129517384 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 129517402 C A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 129517487 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 129517610 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129517654 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 129517665 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 129517673 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 129517823 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 129517868 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 129517910 G T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 129517958 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 129518129 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 129518160 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129518176 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129518184 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129518242 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129518427 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 129518473 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 129518565 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 129518591 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 129518694 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 129518767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129518797 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129519239 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 129519420 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 129519443 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 129519766 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 129519868 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 129519905 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 129519953 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129520006 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129520054 A G N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 129520463 A C Y N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 129521016 A G Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 129521287 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129521509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129521641 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 129521866 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 129522025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129522218 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129522259 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 129522289 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 129522306 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 129522536 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 129522572 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129522616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129522617 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129523331 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 129523654 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 129523662 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 129523879 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129523933 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 129523985 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 129524252 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129524488 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129524493 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129524617 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 129524656 A T N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 129524870 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 129525145 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129525692 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 129525805 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129526031 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129526115 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129526137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129527185 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129527208 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129527322 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129527397 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 129527597 C T Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0 1 0 17 17 0 17 0 3 129527824 T C Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 3 129527828 C G Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 3 129527882 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 3 129527883 A T Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 3 129527935 G A N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 16 14 1 14 0 3 129528057 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 129528059 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 129528212 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 129528298 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 129528353 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 129528368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129528517 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 129528742 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129528825 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129528898 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 129529000 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 129529139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129529203 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129529235 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129529566 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 129529589 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 129529919 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 129529940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129530027 T G N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 129530272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129530442 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129530517 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 129530626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129530676 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 129530677 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 129531002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129531067 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129531148 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129531177 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129531184 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129531279 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129531406 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 129531814 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129532435 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 129533070 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129533411 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129533430 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129533431 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129533812 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129533847 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129534186 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129534726 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 129534786 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129534832 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129534870 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129534881 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129534883 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129534957 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 129534985 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 129534991 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 129535004 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 129535005 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 129535108 C T N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 129535228 T C Y Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 3 129535255 T C Y Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 14 6 6 2 2 3 129535259 A T Y N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 14 6 6 2 2 3 129535388 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129535402 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129535569 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129535621 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129535679 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129535804 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129535838 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129535914 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129535978 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 129536047 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129536063 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129536320 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 129536341 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 129536366 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129536459 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 129536475 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 129536510 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129536528 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 129536545 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129536578 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 129536601 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 129536837 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 129536924 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129537182 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129537355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129537493 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 129537601 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 129537638 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 129537652 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129537695 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 129537761 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129537771 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 129537928 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129537944 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129538189 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129538214 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 129538781 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 129538841 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 129538926 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129538980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129539049 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 129539174 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 129539178 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129539188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129539211 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 129539226 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 129539229 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129539278 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129539406 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 129539450 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 129539665 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 129539795 A C N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 129539817 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 129540188 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 129540529 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129540620 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 129540810 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 129540827 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129541274 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 129541301 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 129541451 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129541489 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129541506 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129541512 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 129541658 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129541692 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129541748 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129541896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129542022 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129542027 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129542144 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129542149 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129542183 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129542195 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129542246 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129542255 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129542308 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129542314 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129542412 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129542473 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129542605 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129542612 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129542730 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129543698 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 129543828 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129544218 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 129544386 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129544422 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 129544560 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 129544810 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 129544872 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 129544896 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 129544986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129545368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129545385 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129545393 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129545499 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 129545545 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 129545554 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129545559 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129545601 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 129545688 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 129545708 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 129545796 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.117647058823529 0.764705882352941 0.117647058823529 17 17 2 13 2 3 129545884 T C N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 129545893 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 129545899 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 129545910 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 129545912 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 129545960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129545986 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 129546086 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129546133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129546149 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129546285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129546318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129546454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129546515 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129546529 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129546547 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129546561 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129546781 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129546791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129546826 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129546828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129546863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129546937 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129546976 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129547035 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129547156 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129547167 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129547213 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129547307 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129547314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129547368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129547423 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 129547439 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 129547531 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129547588 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129548653 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 129548772 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129548849 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129549002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129549057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129549080 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129549100 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 129549108 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129549903 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129550332 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 129550403 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 129550410 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129550432 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129551061 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129551650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129552084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129552297 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 129552582 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 129552634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129552758 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 129552803 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 129553432 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129553971 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129554135 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 129555026 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 129555027 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 129555394 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 129555467 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 129555505 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129555712 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 129555716 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 129555724 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 129555831 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 129555858 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 129555904 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129556296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129556302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129556703 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 129556834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129557134 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129557147 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129557196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129557245 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129557355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129557397 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 129557439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129557444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129557470 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 129557577 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 129557636 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129557637 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 129557657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129557663 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129557806 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129557914 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 129557932 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129558003 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129558195 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 129558291 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 129558320 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129558457 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 129558458 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129558482 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 129558534 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129558536 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129558606 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 129558661 T G N N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0 0.636363636363636 0.363636363636364 7 15 0 7 4 3 129558955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129559016 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 129559035 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 129559040 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 129559224 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 129559578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129560152 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 129560165 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 129560190 T A Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 129560194 A C Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 129560507 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 129560564 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 129560617 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 129560770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129560948 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129561000 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129561215 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 129561968 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129561997 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129562005 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129562017 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129562118 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129562233 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129562318 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129562499 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129562506 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129562534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129562561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129562568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129562741 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129563335 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 129563385 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 129563485 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129563524 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129563607 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 129563826 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129563884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129563906 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129563949 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 129563998 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 129564539 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129564551 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 129564575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129564747 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129564857 G T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 129564991 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 129565010 T G N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 3 129565063 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 14 10 4 6 2 3 129565105 A G N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 9 11 2 5 3 3 129565136 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 129565215 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129565278 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 129565290 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 129565320 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 129565330 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 129565379 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 129565409 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 129565560 G T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 129565635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129565707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129565765 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 129565872 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 129566129 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 129566490 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 129566785 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 129566953 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129567156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129567343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129567695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129567766 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129567799 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 129567832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129567834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129567895 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129568050 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 129568073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129568098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129568148 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 129568155 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 129568293 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129568313 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129568405 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129568583 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 129568584 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 129568870 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 129568874 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 129568884 C A N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 129568953 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 129568965 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 129568981 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 129569051 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 129569329 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129569423 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129569609 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 129569680 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 129569733 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 129569746 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 129569806 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 129569818 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 129569946 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 129569952 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 129569989 T A Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 129570131 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129570134 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129570320 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 129570330 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129570399 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 129570493 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129570580 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129570596 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 129570640 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129570658 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129570669 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129570718 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129570809 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 129570862 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 129571234 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129571246 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129571294 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129571318 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129571570 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129571723 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129571880 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 129571932 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129571971 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129571978 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129572034 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129572071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129572080 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 129572098 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 129572173 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129572210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129572531 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129572673 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 129572701 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 129572706 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129572717 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 129572750 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 129572832 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129572836 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129572881 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129572994 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129573001 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129573132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129573268 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129573502 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 129573550 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129573571 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129573750 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 129573924 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129574441 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129574467 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129574533 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129574696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129574771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129575408 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129575467 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 129575473 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 129575615 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 129575633 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129575690 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 129575713 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129575843 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129575873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129575891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129575954 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129575966 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129575992 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129576008 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129576157 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129576267 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 129576285 G A N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 3 129576420 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129576728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129576864 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129576939 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129577068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129577368 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129577689 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129577767 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 129577879 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 129577897 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 129578023 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 129578081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129578160 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129578295 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 129578306 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129578307 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 129578682 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 129578889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129579128 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129579280 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 129579370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129579407 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 129579598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129579666 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129579676 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 129579700 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 129579870 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 129579960 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 129579963 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 129580209 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 129580216 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 129580435 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 129580496 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 129580805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129580923 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129580967 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129581130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129581197 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129581246 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 129581267 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 129582579 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 129582622 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 129582640 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 129582694 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 129582723 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 129582727 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 129582832 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 129582857 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 129583194 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 129583219 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 129584010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129584044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129584391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129584464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129584474 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129584476 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129584591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129584708 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 129584778 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 129584811 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 129584821 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 129584942 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 129585028 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 129585321 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 129585468 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 129585502 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 129585504 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 129585607 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 129585634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129585643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129585705 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129585745 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129585791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129585824 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129585932 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 129586190 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129586204 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 129586273 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129586380 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 129586651 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 129586792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129586898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129587337 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 129587521 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 129587647 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129587684 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 129587755 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 129587772 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129587912 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 129587978 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 129588210 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129588498 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 129588572 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 129588608 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 129588787 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 129589056 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 129589059 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 129589083 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129589470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129589570 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 129589627 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 129589733 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 129589954 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129590325 G C N N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 3 129590481 C G N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 129590497 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 129590708 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 129590755 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 129590854 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129591525 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129591684 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 129591709 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129591999 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129592008 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129592049 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129592135 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129592172 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129592219 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 129592367 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129592426 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 129592653 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 129593124 G T Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 129593138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129593157 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 129593169 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129593458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129593474 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129593483 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 129593515 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 129593833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129593856 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129594092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129594646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129594707 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 129594779 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 129594948 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 129595276 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 129595527 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 129596828 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 129596845 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 129596954 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 129597448 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 129597968 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 129598117 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129598452 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129598610 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 129598720 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129598735 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129598881 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 129599767 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129599931 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129599939 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129599956 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 129600340 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 129600406 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 129600424 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 129600506 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 129600683 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 129600897 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 129600927 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 129600956 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 129601085 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 129601111 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 129601156 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 129601157 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 129601447 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129601642 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129601711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129601868 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 129602180 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 129602641 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 129603181 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 129603188 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 129603576 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129603603 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 129604467 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 129604536 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 129604583 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 129604587 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 129604721 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 129604727 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 129604746 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 129604794 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129605126 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 129605475 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 129605697 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129607459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129607799 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129607937 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 129607944 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 129608018 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129608090 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129608113 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 129608273 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 129608316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129608352 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129608434 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129608484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129608492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129608607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129608814 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 129608839 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 129609011 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 129609057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129609140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129609495 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129609505 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129609689 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 129609739 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 129609762 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129609772 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 129609805 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129609845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129609946 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129610057 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 129610128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129610245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129610278 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 129610332 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129610771 C A Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 129610903 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129610920 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129610963 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129611028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129611044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129611072 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129611110 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129611251 A G N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 129611325 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129611380 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129611443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129611519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129611544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129611660 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 129611672 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 129611722 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129611767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129611784 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129611804 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129611926 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129611933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129611970 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129611985 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129611988 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129611997 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129612099 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129612118 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129612140 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129612174 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 129612482 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 129612553 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 129612555 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 129612728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129612764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129612813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129612979 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 129613045 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 129613102 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 129613133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129613231 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129613288 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 129613296 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 129613335 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 129613346 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 129613379 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129613496 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129613692 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 129613739 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 129613795 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 129613823 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 129613904 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129613918 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 129614065 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129614098 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129614112 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 129614425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129614477 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129614518 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 129614702 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 129614728 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 129614744 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 129614756 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 129615328 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 129615345 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129615362 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 129615364 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 129615444 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129615489 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129616071 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 129616101 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129616144 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129616152 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129616158 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129616179 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129616228 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 129616278 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 129616386 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 129616485 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 129616650 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 129617010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129617161 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 129617167 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 129617553 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 129617748 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129617881 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129617971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129618024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129618180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129618234 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129618468 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129618565 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129618597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129618827 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 129618968 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 129619052 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129619086 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129619437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129619494 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 129619689 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 129619757 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129619821 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 129620217 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129620302 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 129620441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129620464 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129620494 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129620495 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129621265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129621288 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 129621312 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129621405 A C Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 129621969 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 129621983 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 129622157 C T N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 3 129622221 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 129622224 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 129623129 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129623263 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129623587 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 129623594 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 129623665 T A N N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.166666666666667 0.583333333333333 0.25 11 13 2 7 3 3 129623676 T C N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 3 129624041 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 129624095 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 129624232 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129624382 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 129624455 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 129624783 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129624974 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 129625298 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129625752 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129629302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129629325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129629362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129629377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129629934 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 129630405 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129630543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129630562 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 129630683 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 129630717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129630725 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 129630756 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129630855 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129630894 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 129631311 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 129631360 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 129631619 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 129631637 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 129631664 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 129631852 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129631937 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 129632169 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 129632190 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 129632213 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 129632253 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 129632268 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 129632338 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 129632458 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 129634069 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 129634145 A C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 129634503 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 129634537 T C Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 129634583 T C N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.636363636363636 0.0909090909090909 0.272727272727273 15 7 7 1 3 3 129634795 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 16 8 4 8 0 3 129634868 T C N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 15 9 6 3 3 3 129635256 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129635793 T A N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 3 129635956 G A Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 129636137 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 129636158 T G Y N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 129636164 C T Y Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 129636184 C G N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 3 129636244 T C N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 129636273 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 129636493 A G N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 129636776 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 129636847 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 129636897 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 129636929 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 129636992 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 129637171 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 129637226 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 129637251 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 129637421 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 129637637 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 129637661 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 129638076 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 129638164 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 129638519 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 129638583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129638676 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 129639071 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 129639098 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 129639103 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 129639225 T C Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 129639232 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 129639392 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 129639739 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 129639790 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 129640277 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 129640653 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 129640658 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 129640683 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 129640730 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 129640828 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 129640839 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 129640849 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 129640889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129640976 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 129641256 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 129641282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129641384 A T N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 129641411 A T N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.142857142857143 0.714285714285714 0.142857142857143 14 14 2 10 2 3 129641510 A G N Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 5 5 1 3 1 3 129641521 T C N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 129641665 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 3 129641701 T G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 129641796 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 129641814 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129642996 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129644108 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 129644368 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129644391 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129644568 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129644632 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 129644708 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 129644825 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 129644828 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 129644918 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 129644991 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 129645015 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 129645492 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 129645781 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 129645862 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129645945 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 129645957 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 129645959 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 129646007 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 129646068 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129646086 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 129646195 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 129646206 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 129646225 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129646239 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129646483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129646516 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 129646659 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 129646693 T C Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 129646907 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 129646989 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 129647049 T G Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 129647117 G A Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 129647145 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 129647292 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129647355 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 129647418 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 129647614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129647726 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 129647872 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129647967 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 129648018 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 129648071 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129648100 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129648160 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 129648163 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 129648195 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 3 129648197 G T N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 3 129648222 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129648246 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129648268 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 129648327 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 129648444 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129648964 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 129648970 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 129649176 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 129649942 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 129649983 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129649984 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129650016 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 129650022 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 129650070 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 129650082 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 129650118 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 129650133 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 129650154 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129650178 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 129650927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129651319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129652134 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 129652461 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 129652800 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 129653537 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129654091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129654099 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 129654120 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 129654300 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129654398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129654521 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 129654875 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129654905 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129655160 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 129655787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129656175 T G N N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 5 11 2 1 5 3 129656391 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 129656556 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129656762 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 129657089 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 129657105 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129658093 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 129658316 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 129658973 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 129659653 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129659679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129659920 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129661278 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 129662232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129662483 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129663727 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 129663883 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 129664049 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 129664634 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129664845 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129665110 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 129666400 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129666738 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 129668850 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 129668857 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 129668989 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 129669317 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129669358 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 129669383 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 129669388 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 129669479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129669538 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 129669547 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 129669593 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129669648 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129669719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129669720 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 129670357 C A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 129670374 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 129670529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129671728 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 129671765 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 129671856 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 129672041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129672045 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 129672195 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 129672637 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 129672640 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 129672892 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129672896 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129672932 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129672951 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 129672980 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 129673056 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 129673248 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 129673275 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 129673581 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129673659 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 129673691 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 129673707 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 129673941 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 129674025 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 129674060 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 129674127 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129674590 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 129674594 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 129674864 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 129674882 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 129674912 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 129674948 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 129675086 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129675121 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129675199 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 129675497 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 129675507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129675524 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 129675535 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 129675603 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 129675613 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 129675620 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 129675669 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 129675677 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 129675691 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 129675705 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 129675722 G C Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 129675731 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 129675766 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129675879 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 129675972 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 129676107 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 129676201 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 129676235 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 129676509 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 129676624 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 129676627 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 129676654 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 129676852 T C Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 129676937 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 129676956 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 129676975 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 129676977 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 129677283 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 129677983 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 129678115 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 129678229 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129678477 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 129678562 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129678966 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129679291 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 129679870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129679984 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 129680498 T C Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 129680900 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 129681782 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129681840 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 129681926 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129682013 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 129682588 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 129683403 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 129683478 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 3 129683493 C T Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 3 129683681 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 129683721 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 129683727 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 129683733 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 129683836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129683940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129683986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129684307 T G N N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 3 129684404 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 129684592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129684692 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 129684746 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 129684772 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 129684946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129684982 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 129685080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129685775 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 129686000 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 129686768 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 129687235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129687331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129687499 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 129687528 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 129688046 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129689000 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129689221 G A Y Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0 1 0 8 8 0 8 0 3 129689682 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 129690086 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 129690780 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129692928 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 129694088 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 129694217 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 129694274 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 129695429 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 129695491 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129695698 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 129695900 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129696426 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 129696736 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 129696824 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 129696843 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 129696983 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 129697661 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129697812 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 129697935 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129697945 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129698001 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129698594 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129699733 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 129700208 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129701393 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 129703329 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 129704113 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129704375 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129704873 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 129705021 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 129705055 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129705072 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 129705212 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 129705358 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 129706574 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 129706749 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129707316 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129707777 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 129707778 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 129708145 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 129708534 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 129708982 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 129710287 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 129710679 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 129710830 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 129710852 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 129710991 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 129711060 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 129711085 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 129711288 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 129711976 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 129712269 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129712992 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129713791 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129713846 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129715043 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129716092 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129716186 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 129717103 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129718134 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129718211 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 129718401 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 129718452 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 129718726 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 129718731 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 129718905 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 129719976 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129720080 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 129720325 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 129720342 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 129720488 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129720688 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129721055 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129721752 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 129721876 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129722259 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 129722365 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129722999 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 129723913 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 129725219 G A Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 3 129725459 G T N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 3 129725479 C G N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 3 129725586 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129726283 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 129726352 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 129726462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129726479 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129726657 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 129726716 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 129726974 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129727142 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129727586 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129728255 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 129730400 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 129731364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129731737 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129732175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129732605 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129732704 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129732840 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 129733103 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129733776 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129734307 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129734673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129734817 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129734847 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129734867 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129735707 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129736626 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129736710 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129739148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129741212 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129744110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129747223 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 129751254 A C Y N 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.181818181818182 0.818181818181818 0 13 9 2 9 0 3 129754456 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129755384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129755529 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129757867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129757975 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129758992 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129759015 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129759617 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129759685 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129760309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129760496 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129761178 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 129761231 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129762138 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 129762889 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 129763808 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 129763922 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129763958 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 129764107 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129764164 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 129764171 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 129764256 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129764371 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 129764417 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129764839 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 129765027 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129765032 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129765363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129765422 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129765477 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 129765503 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 129765505 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 129765517 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 129765572 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 129765726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129765742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129765791 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129766036 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129767259 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 129767263 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129767291 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129767396 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 129767398 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 129767417 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129767536 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 129767574 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 129767582 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129767687 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129768039 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129768077 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129768110 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129768393 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 129768453 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129768676 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 129768981 A G N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 3 129769023 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 3 129769100 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 129769385 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 129769409 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 129769612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129769793 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129769838 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129769922 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129770049 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 129770086 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 129770213 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129770223 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129770278 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 129770884 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129770935 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129771069 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 129772202 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129772928 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129773566 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129773710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129773874 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129774633 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129774790 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129775229 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 129775676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129776213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129777196 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129777988 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129779102 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129779416 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129780005 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129780855 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 129781393 C A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 129781437 C A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 129781723 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129782235 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129782300 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129782324 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129784580 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129785046 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129786822 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129787704 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 129787757 C T Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 129787988 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129788703 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129789316 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129789333 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129790706 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129790792 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 129790835 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129790922 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 129791177 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129791524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129794274 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129794405 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129795201 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129795808 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129796072 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 129796861 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 129797227 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 129797257 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129797480 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 129797574 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 129797614 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 129797672 A T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 129797746 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 129797777 G C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 129797938 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 129797971 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 129798195 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.1 0.75 0.15 19 21 2 15 3 3 129798230 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129798233 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129798248 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 129798284 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129798430 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 129798455 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 129798548 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129798600 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129798825 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129798848 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129798862 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129798882 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129799147 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129799163 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129799307 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 129799406 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 129800172 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 129800341 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 129800359 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 129800705 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 129800726 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129800930 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129801117 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129801314 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129801491 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129801904 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 129801917 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129802134 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129802197 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 129802209 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 129802249 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 129802356 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129802382 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 129802395 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 129805108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129805158 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 129805755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129806001 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129806080 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 129806125 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 129806292 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129806318 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129806319 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 129806370 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 129806388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129806693 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129806735 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129806785 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 129806924 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 129807058 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 129807094 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129807185 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 129807213 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129807266 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 129807282 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 129807899 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129808045 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 129809580 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 129809851 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129810232 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 129810598 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129810599 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129810894 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 129810979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129810997 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 129811171 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 129811256 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 129811268 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129811335 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129811357 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129812664 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129812954 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129813466 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 129813617 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129813690 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129813815 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129813906 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 129813925 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129814163 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 129814164 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129814201 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 129814328 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129814378 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 129814411 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 129814472 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129814491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129814554 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 129814946 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 129814951 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129815082 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129815129 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129815137 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 129815242 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 129815255 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 129815266 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 129815304 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129815389 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 129815508 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129815890 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129815903 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 129816163 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 129816197 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 129816258 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 129816378 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129816408 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129816448 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129816513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129819394 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129819561 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 129819610 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 129819614 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 129819720 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 129819796 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 129819927 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 129820289 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129820309 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 129820326 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 129820470 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129820501 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 129820509 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 129820596 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 129820612 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129820635 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 129820844 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 129820869 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 129821105 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129821288 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129821797 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 129821851 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 129822016 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 129822110 G T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 129822181 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 129822199 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 129822203 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 129822277 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 129822413 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 129822510 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 129822516 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 129822557 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 129822563 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129822847 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129823373 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 129824483 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 129826426 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129828045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129828063 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 129828065 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129828528 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 129828825 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129828863 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 129829085 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129829349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129829470 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129830196 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 129830208 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129830406 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129830694 G C N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 129830718 G A N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 12 10 1 10 0 3 129830765 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 129830827 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129830888 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129831033 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129831445 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129831523 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 129831786 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129832116 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129832296 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129833250 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129834019 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 129834453 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129834683 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129834738 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 129834997 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129835287 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129835583 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129835882 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129836251 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129836253 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129836558 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 129836564 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 129836612 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 129836641 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 129836868 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129837025 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 129837071 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 129837290 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 129837301 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 129837358 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 129837381 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 129837393 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 129837397 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 129837534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129837545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129837584 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 129837650 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 129837713 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129837917 T A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129837969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129838067 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129838100 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129838179 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 129838227 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129838433 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 129838435 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 129838510 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 129838522 A T N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 129838604 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 129838817 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129838918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129839107 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129839174 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129839211 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129839273 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 129839397 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129839553 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 129839669 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 129839717 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129840202 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 129840423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129840461 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129840715 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129840736 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129840744 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129840847 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129840854 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 129840869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129840893 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 129840908 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129841032 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 129841076 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 129841118 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 129841184 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 129841194 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 129841240 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 129841341 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 129841416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129841480 T G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 129841552 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 129841572 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 129841656 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 129841703 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 129841712 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 129841723 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 129841726 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129841762 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129841788 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129841870 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 129841876 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129841886 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 129841991 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129842059 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129842128 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 129842175 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 129842442 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 129842659 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129842762 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129842822 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129842876 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129843320 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129843467 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129843520 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129844842 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 129844934 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129844942 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129844987 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 129845025 T A Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 129845093 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 129845148 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 129845172 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129845462 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129845795 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 129845962 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 129846279 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 129846300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129846309 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129846337 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129846349 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129846426 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129846439 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 129846488 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129846524 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129846608 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 129846766 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 129846814 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 129847164 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 129847229 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129847265 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 129847289 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 129847330 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 129847394 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129847552 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129847669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129847971 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129848231 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129848924 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129849135 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 129849431 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 129849803 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129849830 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129850022 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 129850792 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 129850812 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 129851644 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 129851912 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129852033 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129853104 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 129853763 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 129854086 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129854243 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 129854388 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 129854626 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.25 0.166666666666667 0.583333333333333 8 16 3 2 7 3 129854638 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 129854749 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 7 5 3 1 2 3 129854750 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 7 5 3 1 2 3 129854760 G A N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.181818181818182 17 5 8 1 2 3 129854783 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 3 129854877 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 129854915 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 129854921 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 129854944 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 129854965 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 129855067 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 129855076 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 129855136 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 129855146 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129855229 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 129855324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129855354 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129855363 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129855489 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 129855492 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 129855834 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 129855856 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 129855887 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 129856218 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 129856357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129856370 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 129856421 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 129856723 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129856760 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 129856775 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129856804 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129856805 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129856859 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129856944 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129856946 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129856956 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129856963 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129857022 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 129857038 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129857045 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 129857056 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129857069 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129857150 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129857204 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129857224 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129857329 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129857332 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129857372 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129857388 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 129857406 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129857448 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129857564 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129857573 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129857606 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129857786 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129857863 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 129858074 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 129858077 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 129858100 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 129858129 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 129858757 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 129858911 A G N Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 3 129858996 A T N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 129859059 C A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 129859158 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129859292 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129859318 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129859320 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 129859344 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129860539 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129860778 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 129860780 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 129860926 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 129861043 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 129861410 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 129861411 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 129861447 T G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 129861460 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 129861741 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 129861758 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 129861765 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 129861792 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 129861884 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 129861928 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 129861951 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 129862449 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 129862467 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129862482 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 129862642 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129862718 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 129862812 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129862817 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129862900 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129863592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129863896 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129864430 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129864678 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 129864738 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129864905 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 129864999 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 129865064 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 129865125 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 129865225 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 129865286 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 129865366 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 129865561 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 129865668 T A N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 129865775 G A N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.384615384615385 0.307692307692308 0.307692307692308 14 12 5 4 4 3 129866012 G A N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.571428571428571 0.214285714285714 0.214285714285714 19 9 8 3 3 3 129866014 A C N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.571428571428571 0.214285714285714 0.214285714285714 19 9 8 3 3 3 129866028 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 129866035 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 129866057 T A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 129866122 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 129866273 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 129866316 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 129866658 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129866662 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129866688 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129866866 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129866957 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129867266 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 129867667 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 129867697 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 129867755 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129867984 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 129868033 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 129868201 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 129868202 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 129868212 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 129868258 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 129868458 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129868582 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129868649 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 129868843 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 129868944 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 129869098 T A N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.5 0.214285714285714 0.285714285714286 17 11 7 3 4 3 129869144 T C N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 18 10 8 2 4 3 129869326 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 129869336 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5625 0.125 0.3125 20 12 9 2 5 3 129869359 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 129869375 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 129869383 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 129869393 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129869418 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129869478 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129869490 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 129869493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129869519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129869595 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129869879 G T N N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 3 129870276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129870302 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129870479 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129870534 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129870586 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 129870587 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 129870599 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129870620 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 129870667 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129870756 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129870794 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129870824 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129870914 G C Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 129870941 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129871001 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129871024 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129871096 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129871148 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129871270 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129871432 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 129871662 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 129872239 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 129872280 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 129872581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129873006 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 129873423 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 129873505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129873930 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129874150 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129874151 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129874174 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129874179 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129874190 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129874275 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 129874281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129874377 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 129874386 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 129874598 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 129874691 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 129874698 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 129874711 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 129874721 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 129874747 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 129874801 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129874911 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129874991 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 129875154 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 129875239 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 129875465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129875519 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 129875595 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 129876022 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 129876167 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129876269 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 129876283 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129876304 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129876350 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 129876378 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 129876581 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 129876852 A C N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 3 129876862 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 129876884 T G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 129876892 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 129876909 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 129876933 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 129876958 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 129877007 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 129877020 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 129877088 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129877252 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 129877294 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129877895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129880572 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129880749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129882214 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129882284 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129882340 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 129882536 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129882604 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129882661 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129882959 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 129883316 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 129883354 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 129883382 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129883619 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 129884099 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 129884797 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129884852 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129885211 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 129885727 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129885732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129886148 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 129886163 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 129886187 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129886209 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129886234 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129886257 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129886270 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129886281 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 129886294 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129886325 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129886933 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 129887014 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 129887077 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 129887100 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 129887159 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129887173 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 129887264 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 129887300 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 129887329 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 129887335 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 129887410 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 129887444 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 129887472 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129887528 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 129887626 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 129887643 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 129888066 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 129888925 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129890380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129892193 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129893433 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129894922 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129894981 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 129895326 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 129897064 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 129897965 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 129898037 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129898756 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129898757 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129899664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129900404 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 129900468 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 129900753 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129900794 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129900812 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 129900862 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129900964 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 129901369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129901385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129901514 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 129901601 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129901623 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129902038 A G Y Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 129902316 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129902447 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129902862 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 129902928 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 129903107 C T Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 129903218 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129903285 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 129903301 A C Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 129903308 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 129904106 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129904309 G A N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 129904415 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 129904426 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 129904513 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 129904529 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 129904546 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 129904619 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 129904629 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 129904813 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 129904866 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 129904899 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 129904954 T C Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 129904957 A G Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 129904966 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 129904972 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 129905190 G T Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 129905299 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 129905300 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 129905326 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 129905368 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129905403 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129905404 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129905492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129905644 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129905818 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129905857 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129905959 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129906054 A T N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 129906350 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129906367 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 129906663 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 129906673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129906760 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129906762 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129907171 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 129907585 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129907836 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 129907893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129908010 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 129908225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129908306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129908308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129913019 G T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 129913037 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 129913038 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 129913561 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 129913632 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 129913665 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 129913667 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 129914226 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129914254 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 129914264 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 129914412 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 129914433 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129914453 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 129914458 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 129914830 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129918479 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 129919267 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 129919533 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129919767 G A Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 129921186 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 129921953 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129922017 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 129923141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129924160 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129926908 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129927124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129928449 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 129929046 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129929463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129932223 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 129932384 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 129935495 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 129935970 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 129936157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129936887 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 129937717 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 129938330 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129938440 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129938818 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 129938923 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129939139 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 129939312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129939349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129940327 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 129940979 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 129942863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129943466 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 129945276 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129945828 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129946839 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 129946862 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 129946879 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 129946903 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 129946940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129947096 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129947142 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 129947187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129947314 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 129947317 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 129947478 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 129947655 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 129947811 T C N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 3 129947819 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 129947920 T G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 129947965 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129947969 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 129947996 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 129948183 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 129948260 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 129948266 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 129948486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129950309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129950449 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 129950487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129952480 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 129952606 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 129953400 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129953431 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 129953455 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 129953805 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129954123 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 129956145 A G Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 129956682 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129957583 C A Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 129957595 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 129958932 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 129960776 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129961347 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 129961485 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 129961669 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 129963210 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129963706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129963799 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 129963809 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 129963828 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 129963916 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 129964005 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 129964192 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 129965566 A T Y N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 129966998 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129968226 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 129968231 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 129968286 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 129968287 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 129968490 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 129968593 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129968616 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 129969960 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129970648 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129971056 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129972022 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 129972999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129973052 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 129973053 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 129973492 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 129973516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129973526 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 129973533 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 129974059 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 129974140 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129974211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129974306 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 129974529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129975030 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 129975031 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 129975080 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129975128 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 129975167 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129975217 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129975231 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 129975264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129975444 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 129976198 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129976322 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129976346 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 129976462 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 129976809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129977362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129978365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129978543 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 129978636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129978747 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129978988 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 129979074 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 129979082 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 129979128 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 129979264 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129979284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129980441 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 129980455 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 129980697 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129980716 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 129980741 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 129981418 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129982877 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129983710 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129984400 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129986279 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 129986294 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 129987239 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 129987308 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129987432 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 129988830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129989129 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129989139 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 129989204 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 129989230 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 129989324 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 129989361 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 129989504 T G N N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 129989512 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 129989696 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 129989761 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129989852 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129989877 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129990104 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129991309 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 129991558 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 129991676 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 129991795 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 129991814 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 129991815 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129991833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129991849 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129991929 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 129992081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129992485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129993875 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 129994016 A C Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 129997074 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 129999209 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129999264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 129999944 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130000965 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130000969 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 130001272 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 130001356 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 130001418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130001481 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130001543 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130001547 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130002212 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 130002234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130002251 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 130002400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130002954 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 130003420 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130003828 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130003871 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 130003913 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130003980 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130003993 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 130004142 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130004250 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 130004341 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 130004447 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130004499 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130004530 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 130004819 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 130004855 A G N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 3 130004862 A G N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 13 7 4 5 1 3 130005012 C T Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 130005032 C A Y N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 3 130005051 A G Y Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.545454545454545 0.272727272727273 0.181818181818182 15 7 6 3 2 3 130005057 T C Y Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 3 130005108 G A Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 130005109 C T Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 130005143 T C Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 130005183 T G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 130005233 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130005282 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 130005338 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130005389 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130005471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130005536 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130005594 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130005619 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130005648 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 130005690 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 130005806 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 130005920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130006052 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130006787 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 130006822 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 130006828 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130006924 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 130006941 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 130007468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130007566 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 130007846 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 130007859 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 130008114 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130008434 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 130008471 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 130008511 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 130008531 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 130008572 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 130008805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130008984 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 130009057 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 130009116 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130009425 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 130009432 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130009446 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 130009461 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 130009496 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130009516 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 130009532 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 130010093 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 130010099 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 130010149 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 130010158 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 130010363 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 130010390 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 130010477 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 130010486 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 130010731 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130010778 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 130010856 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 130010867 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 130010904 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 130010928 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 130011089 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 130011171 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 130011296 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 130011523 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 130011619 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 130011635 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 130011637 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 130011670 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 130011850 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 130011945 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 130011988 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 130012502 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 130012716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130012839 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 130012988 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130013207 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 130013251 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130013471 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 130014136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130014651 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 130014737 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 130014917 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130014931 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 3 130014973 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 130015267 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 130015304 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 130015450 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130016057 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 130016230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130016382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130016445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130016620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130016702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130016762 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 130016785 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 130016849 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 130016862 C G Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 130016884 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 130016901 A T Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 130017136 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 130017572 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 130017581 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 130017614 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 130017658 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 130017693 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 130017711 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 130017741 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130017760 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 130017778 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130017847 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 130018031 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130018112 A C Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 130018138 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130018262 T A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 130018445 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 130018611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130018794 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 130019210 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 130019480 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 130019590 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 130019602 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130019632 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 130019700 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 130019715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130019746 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 130019774 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 130019795 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 130019869 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 130019889 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 130020226 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 130020229 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 130022403 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130023158 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130023648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130023748 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 130024772 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130025273 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 130025539 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 130025585 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130025675 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 130025747 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 130025847 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 130026196 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 130027193 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 130027321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130027757 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130027823 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 130027896 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130028051 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130028062 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130028092 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 130028202 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130028203 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 130028275 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 130028496 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130028509 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130028679 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 130028695 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 130028747 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130028800 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 130029046 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 130029170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130029314 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 130029351 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 130030120 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 130030522 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 130030811 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130030915 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 130031239 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130032584 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 130032594 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130033133 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 130033136 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 130033149 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 130033171 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 130033220 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 130033233 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 130033872 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130034329 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130036589 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 130036606 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 130036640 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130036705 A T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 130036919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130037573 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 130037628 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130038170 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 130038230 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 130038256 A C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 130038265 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 130038329 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 130038334 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 130038762 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 130038891 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 130038893 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 130038928 A T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 130039035 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 130039156 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 130039186 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 130039655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130039702 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 130039762 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 130039782 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130039826 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130040036 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 130040095 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130040270 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130040375 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130040521 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 130040842 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 130040849 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 130040984 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130041002 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130041102 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130041246 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130041255 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 130041391 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 130041437 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130041535 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130041556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130041689 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 130041828 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 130041995 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130042008 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0 0.789473684210526 0.210526315789474 15 23 0 15 4 3 130042088 C G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 130042109 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130042149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130042150 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130042251 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 130042328 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130042374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130042415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130042463 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130042489 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130042490 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130042631 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 130042706 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130042761 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 130042794 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 130042811 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 130042823 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130042925 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 130042961 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130042976 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 130043041 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 130043089 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130043150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130043323 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130043426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130043435 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130043729 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130043747 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130043816 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 130043821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130043873 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130043900 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 130043996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130044079 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130044255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130044306 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130044423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130044560 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130044821 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 130044908 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 130045109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130045418 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 130045740 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 130045866 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 130046011 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 130046297 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 130046838 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 130046931 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 130047032 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 3 130047204 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130047652 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 130047763 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130047771 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 130047955 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130047965 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 130048002 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130048208 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130048233 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130048258 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 130048392 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130048452 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 130048469 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130048492 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 130048576 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 130048610 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 130048621 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 130048632 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 130048687 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130048711 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130048827 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130048909 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130048929 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130048944 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130049120 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130049136 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130049156 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130049192 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130049269 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 130049456 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 130049478 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130049606 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 130049620 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130049936 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 130050001 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 130050055 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130051150 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130052794 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130053430 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130053575 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130053798 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130053813 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 130054362 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 130054966 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130055108 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130055380 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 130055407 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 130056276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130056334 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 130056916 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 130056958 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 130057079 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 130057135 A G N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.384615384615385 0.230769230769231 0.384615384615385 13 13 5 3 5 3 130057261 A T N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.4 0.133333333333333 0.466666666666667 14 16 6 2 7 3 130057275 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.375 0.1875 0.4375 15 17 6 3 7 3 130058080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130058287 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130058725 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 130058755 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 130058812 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 130058881 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 130059128 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 130060048 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130060464 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130061107 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130061133 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 130061134 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 130061154 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 130061201 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130061355 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 130061742 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 130061908 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130061931 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130062001 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 130062052 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 130062063 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 130062073 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 130062231 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 130062260 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 130062272 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 130062366 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130062993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130063014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130063320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130063444 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130063520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130066019 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130066994 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130067944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130068098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130068189 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130068212 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130068710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130069672 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130072915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130073627 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130073966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130074036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130074214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130075911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130077495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130077705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130077836 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130078278 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130078368 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130078515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130078573 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130078625 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 130078645 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 130078724 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130079211 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130079219 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130079391 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 130080058 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130080703 T A Y N 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.333333333333333 0.111111111111111 0.555555555555556 7 11 3 1 5 3 130080707 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 130080879 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 3 130081513 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130081563 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130082504 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130082531 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130082734 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 130083102 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130083490 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 130083995 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 130083996 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 130084207 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130084544 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130085114 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130085177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130085484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130085490 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130085505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130085661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130086357 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 130086389 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130086438 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130086523 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 130086589 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 3 130086954 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 130086960 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 130087018 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130087053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130087106 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 130087118 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 130087154 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130087211 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 130087252 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 130087291 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130087336 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 14 18 0 14 2 3 130087348 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 130087642 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 130087820 G T Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 130087880 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130087884 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130088118 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 130088416 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 130088420 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 130088490 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 130088494 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 130088727 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130088740 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130088774 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130088791 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130088795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130088806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130088847 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 130088974 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 130089142 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 130089151 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 130089529 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 130090015 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130090114 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 130090151 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 130090171 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130090280 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130090327 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130090345 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130090382 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130090385 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 130090562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130090615 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130090625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130090679 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 130090726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130090939 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130091085 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 130091194 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130091222 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130091346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130091367 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130091390 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130091457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130091556 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130091667 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 130091683 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 130091684 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 130091767 G T N N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 8 12 3 2 5 3 130091867 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130091908 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 130091960 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130092055 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 130092429 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130092443 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130092561 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130092758 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130092848 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130092859 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130092892 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 130092913 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130092969 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130092983 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130092992 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130093014 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130093034 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130093059 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130093095 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130093113 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130093212 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130093327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130093416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130093666 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 130093714 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 130093844 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130093974 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130094031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130094097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130094128 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 130094189 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130094190 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 130094208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130094230 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130094236 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130094245 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130094294 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130094391 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 130094399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130094434 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130094440 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130094473 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130094504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130094507 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130094661 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130094801 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130094824 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130094992 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 3 130095073 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130095152 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130095217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130095338 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 130095471 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 130095518 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 130095543 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 130095557 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 130095724 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 130095811 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130096085 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 130096128 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130096251 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 130096315 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 130096523 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 130096524 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 130096673 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 130097248 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130097290 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130097328 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130097339 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 130097484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130097589 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130097660 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 3 130097661 G T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5625 0.125 0.3125 20 12 9 2 5 3 130097735 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 130097846 T G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 130097867 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 130097970 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 130097997 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 130098009 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 130098012 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 130098032 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 130098083 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 130098284 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 3 130098301 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 3 130098311 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 130098361 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 3 130098399 G A N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 3 130098646 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 130098760 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 130098821 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 130099014 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130099026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130099074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130099091 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130099150 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130099165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130099213 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130099461 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 130099493 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130099505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130099544 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 130099545 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130099560 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 130099580 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130099724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130100037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130100074 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 130100224 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 130100252 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 130100318 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130100322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130100348 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 130100513 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 130100517 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 130100525 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 130100529 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 130100587 C A Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 130100604 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130100640 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 130100649 G C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 130100666 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 130100686 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 130100796 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 130100818 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 130100837 G T Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 130101183 G A Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 130101200 C T Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 130101592 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 130101742 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 130101776 G A N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 3 130101789 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 130101911 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 130101927 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 3 130101937 G C N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 3 130102011 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 130102161 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130102311 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130102408 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 130102440 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 130102458 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130102464 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 130102584 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130102657 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 130102695 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 130102712 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 130102815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130102863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130102986 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 130103024 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 130103071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130103161 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130103266 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 130103268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130103384 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 130103752 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130103768 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 130103798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130104339 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130104547 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130104570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130104788 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 130105243 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 130105283 C A N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.375 0.1875 0.4375 15 17 6 3 7 3 130105502 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130105722 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130105836 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130106050 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130106205 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130106283 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130106351 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 130106391 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 130106585 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 130106610 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130106856 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 130107007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130107047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130107062 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 130107169 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 130107284 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130107316 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130108076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130108112 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130108194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130108254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130108676 C A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 3 130108729 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 130108810 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 130108854 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 130108876 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 130108980 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 130109091 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 130109144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130109398 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 130109450 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 130109559 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 130109716 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.375 0.1875 0.4375 15 17 6 3 7 3 130109795 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130109882 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 130110521 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130110779 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 130111101 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 130111852 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 130112480 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 130112763 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 130112812 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 130113298 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 130113395 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130113776 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130113833 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 130114087 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 130114209 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 130114245 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 130114257 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 3 130114439 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 130114527 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130114731 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 130114896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130116527 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 130116858 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 130116862 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 130116907 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 130116919 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 130117270 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 130117301 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 130117391 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 130117466 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130117473 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 130117508 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 130117585 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 3 130117857 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130118216 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130118280 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130118412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130118536 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 130118569 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130118651 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 130118695 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 130118766 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130118882 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 130119123 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 130119126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130119383 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130119472 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 130119507 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 130119534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130119706 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 130119730 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 130119758 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 130119901 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130119902 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 3 130119962 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 130120139 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130120435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130120501 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130120653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130120669 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 130120777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130120812 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130120817 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130120853 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130120868 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130120875 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130120903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130120948 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130121042 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130121107 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 130121217 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 130121262 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130121295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130121325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130121416 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130121421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130121524 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130121625 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130122315 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 130122330 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 130122347 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 130122386 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130122402 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 130122497 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130122672 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130123161 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 3 130123221 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 130123639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130123740 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 130123931 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130124099 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 130124235 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 130125508 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130126248 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130126865 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 130127703 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130127959 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130128096 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130128211 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130128444 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130128565 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130129841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130130304 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130130976 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 130131406 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130133459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130133475 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 130133587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130133668 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130134490 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 130136511 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130138209 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 130138308 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130138351 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130138372 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 130138500 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 130138960 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 130139059 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130139082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130139314 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130139475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130140923 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130140940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130140998 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130141747 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130142831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130145595 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 130146749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130147279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130148922 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 130151092 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 130152225 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130152985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130153766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130154512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130154994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130155873 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130155939 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130157878 C G Y N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 130159517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130160495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130161873 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130162659 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 130163134 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130164368 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 130164648 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130165400 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130165838 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130166695 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130167141 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130167589 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130168997 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 130169448 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130169609 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130170681 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 130170841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130171633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130172560 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130172793 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130172825 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 130173111 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130173343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130173468 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 130174991 A C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 130176940 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130177436 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130178726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130178884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130179686 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130179842 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130180882 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 130181663 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 130182714 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130182775 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130182874 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130183424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130183530 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130184086 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 130184274 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130184302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130185220 G T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 3 130185356 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130185372 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 130185992 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 130186003 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 130186245 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130186246 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130187693 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130187827 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130188006 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 130188124 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130188182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130188212 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130188213 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130188313 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130188326 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 130188702 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130188812 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 130188937 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 130190098 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130190110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130190193 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130190428 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130190748 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 130190880 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130191143 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130191364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130191379 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130191591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130191647 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 130191856 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130192112 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130192233 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130192402 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130192891 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130192927 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130193377 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130193387 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130193534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130193777 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130194505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130194585 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 130195093 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 130195184 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 130195919 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130196323 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130196355 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130196580 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130196722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130198104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130198353 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130198670 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130198677 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130198685 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 130198699 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130199441 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130199512 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 130200387 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130200487 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130201071 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130204843 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130206316 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130206511 C A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 130206512 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 130206544 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 130206716 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 3 130207052 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130207367 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130207720 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130209333 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130209449 A C N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 130209551 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 130209633 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130209686 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130209783 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130209969 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 130210272 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130210447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130210875 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 130210897 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130210979 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 130211063 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130211205 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 130211250 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 130211263 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 130211287 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 130211357 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130211480 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 130211521 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 130211654 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130218159 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130218227 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 130218237 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 130218349 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130218374 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 130218432 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 130218605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130218953 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 130219479 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130219483 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130219639 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130219756 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130219827 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130219870 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 130219944 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 130219992 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130220032 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 130220117 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 3 130220485 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130220585 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130220673 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130220691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130220972 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130220980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130220985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130221017 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130221625 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 130221631 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 130221699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130221902 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 130221906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130222015 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130222041 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130222206 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 130222357 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 130222427 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130222554 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 130222735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130222815 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130222905 G T Y N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.0625 0.6875 0.25 13 19 1 11 4 3 130222909 G T N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 3 130223045 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130223065 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130223092 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130223104 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130223191 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130223269 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130223308 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130223393 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130223432 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130223450 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130223644 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130223820 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130224020 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130224079 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130224092 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130224239 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130224346 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130224359 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130224396 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130224900 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130225431 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130225536 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130225686 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130226052 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 130226394 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130227416 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130227917 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130228403 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 130228451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130228467 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130228471 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130229193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130229203 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130229332 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130229837 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130230342 G C N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 130230505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130230890 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130230939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130231079 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 130231110 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130231152 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 130231200 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130231221 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 130231291 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 130231313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130231325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130231360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130231492 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 130231531 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 130231564 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 130231586 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 130231597 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 130231613 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 130231657 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 130231742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130231883 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 130232066 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 130232090 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 130232507 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 130232573 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 130232654 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 130232713 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 130232873 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130232927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130233203 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 130233348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130233435 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 130233487 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130233560 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130233620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130233630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130233635 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 130233687 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130233749 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 130233753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130233769 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 130233832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130233967 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 130234114 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 130234186 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 130234195 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 130234203 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130234265 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 130234314 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 130234355 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 130234402 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130234697 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 130235017 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130235061 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 130235302 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130235494 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130235550 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130235618 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130235642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130235756 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 10 22 0 10 6 3 130235796 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 130236232 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130236587 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 130236932 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 130237587 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130237854 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130238054 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130238085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130238164 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 130238177 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130238266 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 130238433 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 130238442 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 130238467 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 130238535 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130238599 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 130238749 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 130238760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130238989 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 130239012 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 130239059 C T Y Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.230769230769231 0.769230769230769 0 16 10 3 10 0 3 130239090 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 130239946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130240053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130240280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130240470 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130240532 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 130242569 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 130243847 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 130243904 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130244532 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130244629 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 130244740 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130245649 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 130247327 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130249000 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 130249998 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130250572 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 130250666 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130250719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130250881 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130250969 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 130251040 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130251163 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130251216 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 130251481 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130251549 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130251619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130252252 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130252358 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 130252364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130252485 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 130252502 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 130252520 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130252589 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 130252801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130252909 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130253307 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 130253313 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130253408 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 130253427 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 130253697 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130253767 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 130253788 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 130253799 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 130253824 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 130253890 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 130253902 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 130254001 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130254010 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 130254021 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 130254079 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 130254153 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130254191 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 130254334 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 130254335 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 130254394 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 130254522 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 130254529 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 130254762 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130254829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130254855 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 130254908 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 130254963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130255063 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 130255076 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 130255150 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 130255205 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 130255211 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 130255900 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 130255969 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 130256012 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 130256051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130256377 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 130256536 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 130256601 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 130256626 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130256633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130256657 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 130256694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130256710 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130256773 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130256810 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 130256844 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130256878 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 130256890 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 130256897 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 130256957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130257312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130257701 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 130257778 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 130257787 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 130257828 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 130257986 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 130258052 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 130258062 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 130258190 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 130258217 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130258293 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 130258299 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 130258308 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 130258366 T G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 130258430 G A N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 130258485 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 130258490 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 130258543 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 130258606 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 130258613 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130258664 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 130258733 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 130258748 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 130258768 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130258779 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 130258795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130258804 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 130258816 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 130258888 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 130258932 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 130259074 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 130259093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130259267 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 130259723 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 130259749 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 130259757 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 130259799 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 130259920 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 130259934 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130259949 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130260045 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 130260151 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130260205 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 130260719 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 130260735 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 130260924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130260929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130261041 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 130261232 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 130261268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130261359 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130261430 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 130261556 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 130261560 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 130261674 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130261696 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 130261911 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 130261927 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 130261960 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 130262148 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 130262164 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 130262193 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 130262221 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130262243 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130262264 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 130262394 A G N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 130262410 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 130262431 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 130262462 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 130262549 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 130262635 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 130262673 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 130262710 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 130262767 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 130262782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130262864 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 130262870 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 130262887 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 130263049 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 130263155 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 130263387 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 130263391 G A N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 130263536 A T N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 130263559 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 130263623 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 130263742 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 130263834 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 130263874 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 130263916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130263993 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130264038 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130264055 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 130264072 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130264108 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 130264245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130264360 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130264665 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 130264734 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130264849 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130264851 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130264961 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130265124 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130265491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130265817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130266164 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130266226 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130266334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130266359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130266614 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 130266725 G C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 130267475 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 130267548 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 130267963 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 130268088 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130268231 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 130268358 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130268738 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130268834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130269085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130269196 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 130269266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130269364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130269563 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130269661 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 130270119 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 130270448 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 130270845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130270888 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 130270973 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 130271035 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130271241 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 130271245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130271321 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 130271336 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 130271350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130271543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130271612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130272198 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 130272209 A T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 130272210 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 130272628 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 130273432 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130273438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130273443 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130273653 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130273667 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130273725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130273823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130274050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130274084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130274120 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 130274193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130274227 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130274352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130274382 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 130274598 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130274683 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130274698 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130274881 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130274931 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130274935 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130274970 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130275106 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130275265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130275452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130275525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130275554 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130275565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130275579 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 130275581 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 130275652 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130276065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130276327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130276385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130276447 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 130276452 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130276564 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 130276593 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130276784 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130276791 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 130276868 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130276920 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 130276931 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 130276993 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130277004 A C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 130277203 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 130277209 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 130277386 G C N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 130277425 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 130277449 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 130277484 G A N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 130277528 G A N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 130277830 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130278209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130279368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130279422 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130279866 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130281090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130281353 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 130281439 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 130281536 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 130281638 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130281675 G T Y N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.153846153846154 0.846153846153846 0 15 11 2 11 0 3 130281835 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 130282033 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 130282566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130282814 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 130283306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130283409 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 130283466 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130283473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130283567 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 130284295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130284371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130284426 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 130284750 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130284791 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 130284910 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 130285036 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130285120 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 130285250 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130285339 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 130285549 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 130285700 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 130285916 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130285930 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 130285980 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130286056 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130286203 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130286273 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 130286431 G C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 130286441 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 130286569 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 130286696 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 130286845 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130287961 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 130287967 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 130288029 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 130288099 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 130288110 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 130288776 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130288793 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130288810 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130288818 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 130288985 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 130289254 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130289259 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130289314 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 130289385 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130289668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130289757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130289832 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 130289956 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130290042 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130290134 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130290197 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130290484 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130290648 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130290820 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130291909 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130293186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130295212 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130296390 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130296775 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130297323 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130297683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130298215 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130298283 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130298767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130300522 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 130301059 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130301254 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130302022 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130302548 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130302581 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130302920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130303125 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130303267 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 130304595 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130305028 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130305666 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130305768 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 130306389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130307250 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 130307278 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130309585 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130310827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130311664 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 130313585 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 130313591 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130313780 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 130313798 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 130313808 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 130313809 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 130314339 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 130314417 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 130314550 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 130314605 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 130314703 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130314789 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 130314829 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 130314836 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 130315266 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 130315398 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 130315609 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130315652 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 130315688 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 130315750 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 130315810 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 130315878 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 130316303 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130316362 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 130316816 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 130316880 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 130316958 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 130317033 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 130317650 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130317717 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 130317762 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 130317790 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 130318049 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 130318107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130318129 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 130318228 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 130318233 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 130318249 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 130318261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130318435 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 130318523 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 130318580 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 130318621 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130318726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130319067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130319126 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 130319782 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 130320773 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 130321155 T G N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 3 130321371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130321430 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 130321446 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130321714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130322449 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 130322600 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130322734 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 130323012 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 130323428 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130324181 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 130324447 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 130324598 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 130324671 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 130324686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130324727 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130324741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130324810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130324818 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 130324920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130324979 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 130325124 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 130325145 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 130325325 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130325423 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 130325538 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 130325563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130325778 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 130325826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130325855 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130326193 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 130326359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130326388 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 130326400 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 130326708 A G Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 130326709 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 130326740 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 130326766 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 130326782 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 130326801 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 130326988 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 130327047 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 130327128 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 130327165 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 130327179 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 130327206 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 130327570 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130327818 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130328465 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130328654 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130328727 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130329099 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130329207 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130329385 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 130329584 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 130329782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130329859 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 130330180 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 130330205 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130330242 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130330375 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 130330577 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130330599 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 130330718 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130330734 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130330758 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 130330772 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130330801 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130330856 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 130330890 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 130331277 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 130331288 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130331400 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130331951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130332055 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 130332071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130332075 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130332155 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 130332157 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 130332174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130332200 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130332562 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130332593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130332614 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130332942 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130333044 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130333611 C G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 130333612 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 130333684 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 130333744 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130333889 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130333913 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130333961 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 130333972 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130333989 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 130334061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130334108 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 130334756 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 130334774 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130334908 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130334935 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 130334964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130335178 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130335179 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130335500 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 130336761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130337001 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130338336 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 130338702 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130338729 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130338776 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130338903 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 130339116 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 130339233 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 130339242 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 130339258 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 130339295 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 130339298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130339307 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 130339412 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 130339735 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 130339792 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 130339816 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130339821 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130340170 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 130340198 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130340209 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 130340210 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 130340229 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 130340502 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 130340520 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130340525 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130340549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130340575 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 130340600 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130340667 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 130340725 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130340794 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 130340900 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 130341016 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 130341213 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130341225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130341261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130341312 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130341314 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130341520 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130341547 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130341576 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 130341637 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 130341646 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 130341670 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 130341771 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 130341777 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 130341840 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 130342002 C T N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 130343916 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 130343932 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130343979 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 130343987 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130344147 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 130344173 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 130344193 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130344218 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.0555555555555556 0.777777777777778 0.166666666666667 16 20 1 14 3 3 130344220 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.111111111111111 0.833333333333333 0.0555555555555556 19 17 2 15 1 3 130344531 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 130344573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130344576 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 130344733 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 130344771 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130344787 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 130344816 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 130344897 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 130344925 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 130344926 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 130344944 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130344952 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 130344978 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 130344989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130345001 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 130345067 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 130345087 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 130345135 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130345166 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130345318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130345331 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130345364 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130345446 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130345450 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130345481 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130346001 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 130346033 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 130346801 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 130348138 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130349795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130349995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130351288 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 130352344 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 130352425 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130353481 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 130353493 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 130353841 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 130353843 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 130354099 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 130354280 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 130354288 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 130355017 G A N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0 0.6 0.4 6 14 0 6 4 3 130355074 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 130355195 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 130355197 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130355296 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 130355479 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 130355516 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 130355648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130355699 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 130355700 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 130355716 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 130355882 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130355976 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 130356053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130356217 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130356539 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130356616 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130356638 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130356831 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 130356888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130356893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130357053 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 130357131 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130357328 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130357509 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 130357533 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 130357548 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 130357669 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 130357744 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 130357772 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 130357844 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 130357886 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 130357891 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 130357976 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 130357978 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 130357994 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 130358014 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 130358024 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 130358107 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 130358116 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 130358150 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 130358214 C A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 130358274 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 130358363 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 130358505 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 130358521 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 130358632 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130358705 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 130358718 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 130358806 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 130358818 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 130358828 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 130359107 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 130359126 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 130359143 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 130359198 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 130359229 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 130359284 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 130359300 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 130359589 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 130359627 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130359691 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 130359738 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 130359825 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 130360080 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 130360124 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 130360271 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 130360371 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 3 130361054 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130361160 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 130361486 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130361668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130362041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130362486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130363312 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130363417 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130363442 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130363727 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130363810 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130363854 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 130364062 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130364506 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130364780 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 130364979 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130364984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130365760 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130365955 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 130366102 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130366352 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130366433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130366435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130367321 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130367435 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130367866 T A Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 130367927 T C Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 130371740 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130371829 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130372535 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130374253 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 130374380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130374599 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 130374607 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130374996 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 130375008 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130375009 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130375050 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 130376821 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 130377172 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 130380153 A C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 130381026 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130381029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130381901 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 130382390 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130385409 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 130385511 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 130385954 A C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 130385982 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 130386017 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 130386067 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 130386093 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130386147 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 130386266 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 130386331 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 130386343 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130386513 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 130386532 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 130386594 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130386718 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 130386984 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130387030 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 130387063 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 130387091 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130387188 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 130387290 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 130387530 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 130387570 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 130387643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130388147 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 130388223 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 130388265 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130388334 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130388384 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 130388470 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130388613 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130388796 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130388875 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130389046 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130389080 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 130389438 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130389826 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 130389850 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 130389880 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 130389881 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 130389947 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 130390101 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130390107 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 130390153 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130390157 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130390690 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 130390723 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 130391910 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130391958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130391965 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130391998 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130392514 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 130393066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130393794 G A Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 130393812 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 130393843 A T N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 130393850 C A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 130394090 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 130394164 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 130394233 C G Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 130394269 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 130394305 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 130394332 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 130394431 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130394478 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 130394602 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130394631 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 130394859 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 130394943 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130395197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130395291 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130396129 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130396139 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130396250 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130396324 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130396449 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130396856 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 130396900 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 130397105 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 130397353 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 130398363 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130398935 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 130398967 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130399483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130399549 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130399563 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 130399637 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 130399670 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130399834 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 130399843 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 130399850 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 130400048 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 130400278 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130400402 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 130400576 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 130400599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130400753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130400931 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130400932 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130401255 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130401276 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130401332 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 130401352 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 130401472 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 130401482 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130401484 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 130401646 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130401698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130401785 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130401864 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 130401912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130402058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130402109 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 130402321 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 130402365 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130402515 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 130402554 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130402592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130402645 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130402667 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 130402868 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130402962 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 130403213 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130403217 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130403295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130403301 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130403678 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 130403704 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 130403744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130403813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130403835 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 130403999 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130404192 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 130404807 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 130405011 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 130405043 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 130405081 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130405111 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130405120 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 130405130 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130405134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130405216 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 130405218 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 130405275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130405374 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 130405639 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 130405656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130405749 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130405911 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 130405947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130405957 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 130406490 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 130406529 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 130406555 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 130406579 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 130406758 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130406843 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 130406965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130407027 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 130407101 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 130407142 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 130407350 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 130407463 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 130407717 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 130407756 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 130407886 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 130407997 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130408009 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 130408056 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130408064 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130408078 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130408142 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130408276 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130408280 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130408298 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130408450 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 130408489 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 130408512 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130408567 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130408591 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130408657 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130408662 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130408700 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130408822 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130408855 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 130408857 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130408978 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 130409171 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 130409210 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 130409219 T A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 130409225 T G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 130409505 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 130409803 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130409837 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130409852 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130409867 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130409879 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130409931 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130409967 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130410120 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130410359 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 130410392 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130410958 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130410959 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130411029 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130411032 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 130411136 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 130411245 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 130411301 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 130411316 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 130411484 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 130411502 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130411525 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130411557 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130411630 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 130411841 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 130412027 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130412183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130412375 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130412489 T G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 130413138 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130415156 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 130415841 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 130415844 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 130415913 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 130416269 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 130416571 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 130417090 A T Y N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 130417124 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 130417328 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130417652 A C Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 130417861 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130418339 G T Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 130418370 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 130418770 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 130419718 A T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 130419719 C G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 130419772 A C Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 130419830 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130419889 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130419896 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 130419963 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130420061 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 130420073 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 130420243 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 130420327 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 130420658 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130420912 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 130420928 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 130421027 A G N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 3 130421283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130421421 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130421430 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 130421663 T G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130421813 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 130421855 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 130421957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130422328 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130422659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130422704 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 130422830 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130422920 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130422932 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 130422966 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130423494 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 130423540 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 130423547 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130423599 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130423608 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130423825 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130423920 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130423988 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130424041 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130424066 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130424074 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 130424203 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 130424225 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 130424238 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 130424441 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130424468 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 130424491 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130424558 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 130424632 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 130424677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130424686 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 130424757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130424774 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 130425022 T A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 130425034 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 130425120 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 130425329 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 130425444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130425517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130425975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130426002 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130426163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130426474 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130426492 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 130426534 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130426590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130426648 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130426654 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130426842 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 130426906 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 130426915 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 130427084 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 130427085 C G N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 130427251 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130427827 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130427915 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 130427926 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130427955 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 130428090 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 130428104 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 130428302 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 130428431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130428469 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 130428656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130428700 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 130428855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130429348 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130429632 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 130429695 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 130430656 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 130430793 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 130430817 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130431299 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 130431333 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 130431578 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 130432002 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130432102 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 130432373 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130432631 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130433520 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130433568 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 130433592 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130433959 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 130434655 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130434711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130434731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130434826 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130434893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130435335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130436154 G A N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 3 130436399 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 130437171 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 130437297 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 130437608 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130438904 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130440241 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130440284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130440942 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 130440960 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 130441291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130441329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130441411 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 130441463 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 130441516 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130441593 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 130441636 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 130441716 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 130441781 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 130441834 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 130441903 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 130441913 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 130441927 T A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 130442035 T C Y Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 3 130442353 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 130442432 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 130442472 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 130442554 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 130442568 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 130442720 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 130442856 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 130442965 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0 0.6875 0.3125 11 21 0 11 5 3 130443355 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 130444596 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 130444626 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 130444793 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 130444802 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 130444831 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 130444879 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 130444886 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130444892 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 130444921 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 130445047 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 130445322 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 130445360 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 130445488 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130445650 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 130447214 A G Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 130447309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130447443 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 130447611 C G N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 3 130447686 T G Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 130448215 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130448224 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 130448247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130448372 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 130448442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130448495 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 130448523 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 130448551 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130449522 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130450778 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 130450864 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 130450871 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 130450896 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130451220 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 130451246 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 130451352 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130451400 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 130451640 T G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 130452132 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 130452206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130452344 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130452631 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 130452693 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130452939 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 130453270 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 130453411 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 130453412 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 130453457 G T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 130453504 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 130453598 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 130453698 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130453729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130453846 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 130453881 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130453896 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130454091 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 130454218 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 130454276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130454360 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 130454385 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130454468 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 130454497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130454557 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 130454585 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 130454880 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 130454985 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 130455110 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 130455193 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 130455310 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130455333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130455345 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130455383 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 130455405 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 130455425 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 130455516 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 130455540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130455676 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 130455699 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 130455781 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 130455794 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 130455832 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 130455899 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 130456093 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130456275 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130456390 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 130456566 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 130456861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130457312 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 130457451 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 130457875 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130458242 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130459812 A T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 130459856 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 130459862 A G Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 130459906 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 130460091 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130460128 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 130460138 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130460386 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 130460389 C G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 130460425 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 130460467 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 130460513 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 130460527 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 130460556 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130460589 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130460633 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130460651 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130460688 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130460778 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 130460832 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 130460856 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 130461414 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 130461687 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 130462147 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 130462172 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 130462218 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 130462241 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130462253 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130462353 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 130462387 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130462419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130462442 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130462447 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 130463472 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 130463474 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 130463594 T A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 130463651 A T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 130463656 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 130463673 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 130463759 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 130464070 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 130464093 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130464726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130465987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130466435 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130466928 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 130467481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130467521 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130467674 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130469821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130470914 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 130471144 A G Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 130471169 T C Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 130471175 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 130471325 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130471339 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 130471598 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130472080 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130472395 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130474885 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130474979 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130475552 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130475633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130475735 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130475877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130475889 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 130475895 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130475959 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 130476195 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130476291 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 130476927 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130483701 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 130483921 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130484149 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130484208 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 130484354 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130484421 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 130484501 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130484515 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130484581 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130484831 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 130484832 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 130484978 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 130485004 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 130485031 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 130485036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130485250 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 130485251 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 130485505 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 130485560 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 130485598 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 130485654 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 130485676 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 130485683 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 130485764 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 130485786 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 130486143 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 130486182 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 130486540 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 130486608 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 130486639 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 130486653 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 130487070 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 130487093 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 130487121 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 130487657 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 130487786 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 130487801 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 130488148 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 130488368 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 130488385 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 130488521 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 130488536 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 130488540 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 130488609 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 130488677 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 130488695 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130488696 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130488725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130488747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130488790 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 130488799 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130488815 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 130488831 T G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 130488946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130488991 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 130489262 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 130489277 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 130489327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130489408 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130489804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130489809 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130489826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130489828 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130489916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130489985 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130490258 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130490341 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 130490381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130490579 C A Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 130490603 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 130490660 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.166666666666667 0.777777777777778 0.0555555555555556 20 16 3 14 1 3 130490661 G A Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.117647058823529 0.823529411764706 0.0588235294117647 18 16 2 14 1 3 130490681 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 130490725 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 130490823 T G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 130490841 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130490872 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 130490913 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130490917 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 130490975 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130491152 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130491230 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 130491287 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 130491365 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 130491417 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130491615 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 130491629 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 130491633 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 130491720 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130491772 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 130491796 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 130492118 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 130492122 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 130492211 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130492328 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 3 130492338 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130492350 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 130492361 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 130492553 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130492763 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130492825 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 130492883 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130493005 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 130493014 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 130493020 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 130493089 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 130493104 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 130493327 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 130493397 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 130493409 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 130493519 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130493547 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 130493559 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 130493591 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 130493628 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 130493654 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 130493750 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 130493821 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130493858 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 130493918 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 130493921 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 130493959 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130493993 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 130493994 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 130494183 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130494247 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 130494325 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 130494378 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 130494383 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 130494789 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 130494819 A T N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 130494869 A G N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 3 130494912 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 130495071 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 130495121 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 130495411 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 130495646 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 130496034 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 130496058 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 130496076 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 130496093 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 130496102 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 130496105 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 130496158 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 130496206 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 130496229 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 130496239 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 130496252 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 130496315 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 130496338 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 130496382 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 130496587 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130496615 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 130496627 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 130496631 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 130496872 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 130496953 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 130497051 C T N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 130497169 G A N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 3 130497205 T C N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.363636363636364 0.363636363636364 0.272727272727273 12 10 4 4 3 3 130497282 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 3 130497311 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 130497319 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 130497326 T A N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 130497339 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 130497361 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 130497438 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 130497622 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 130497641 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 130497689 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 130497795 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 130497866 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 130497872 T A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 130497988 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 130498198 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 130498402 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130498419 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 130498478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130498636 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130498757 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 130498902 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 130498945 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 130499009 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 130499157 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 130499253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130499507 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130499661 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 130499849 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 130499942 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130500049 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 130500700 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130501387 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130501434 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 130501718 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 130501733 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 130501745 G C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 130501818 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 130502253 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 130502301 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130502341 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 130502342 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 130502413 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 130502417 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130502456 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 130502461 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 130502704 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 130502872 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130502893 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 130503059 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 130504339 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130504458 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 130504579 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130504591 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 130504604 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 130504686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130504716 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 130504728 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 130504881 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 130504902 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 130504947 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 130505011 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 130505017 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 130505169 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130505207 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 130505416 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130505623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130505661 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 130505681 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 130505714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130505729 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 130505770 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 130505809 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 130505885 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 130506417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130506599 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 130506622 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 130507000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130507111 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 130507178 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 130507287 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 130507338 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130507422 T C N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 15 15 6 3 6 3 130507431 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 130507464 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 130507496 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 130507515 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 130507788 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 130507843 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 130508279 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130508838 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 130509985 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 130510371 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 130510495 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 130510527 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 130510541 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 130510569 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 130510749 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 130510798 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 130510818 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 130510828 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 130510899 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 130510918 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 130511089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130511138 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 130511175 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 130511229 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 130511268 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 130511281 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 130511305 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130511314 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 130511318 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 130511345 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 130511417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130511463 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 130511500 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 130511552 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 130511585 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 130511605 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 130511688 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 130511971 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 130511978 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 130512073 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130512539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130512558 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130512726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130512740 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 130512791 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 130512819 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130512976 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 130513045 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 130513061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130513069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130513222 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130513243 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 130513638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130513652 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130513681 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 130513874 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 130513907 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130514071 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130514094 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130514106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130514128 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 130514189 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130514204 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 130514323 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 130514335 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 130514377 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 130514513 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 130514607 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 130514800 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 130514958 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 130515059 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 130515062 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 130515115 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 130515431 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 130515546 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 130515591 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 130515662 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 130515663 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 130515696 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 130515751 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.235294117647059 0.705882352941177 0.0588235294117647 20 14 4 12 1 3 130515835 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130515914 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 130515960 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130515964 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130516071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130516084 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 130516200 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 130516255 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 130516261 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 130516267 G T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 130516342 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 130516493 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 130516647 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 130516704 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130516800 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130516889 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130517004 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 130517088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130517132 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 130518023 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 130518042 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 130518044 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130518085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130518109 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 130518153 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 130518288 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 130518301 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 130518371 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 130518394 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 130518401 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 130518465 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 130518636 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 130518651 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 130518676 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 130518751 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 130518782 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 130518834 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130518836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130519338 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130519448 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130519844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130519926 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130520067 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 130521010 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 130521052 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 130521259 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 130522231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130522313 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 130522860 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 130522924 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 130523009 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 130523109 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 130523410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130523436 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 130523610 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 130524100 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 130524135 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 130524326 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 130524434 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130525094 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130525095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130525316 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130525405 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130525460 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130526108 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130526129 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130526267 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 130526343 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130527029 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 130527410 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 130527679 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 130527684 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130527740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130528259 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130528429 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 130528565 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130528578 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 130528731 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 130528753 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 130528921 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130528976 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 130528995 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 130529016 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 3 130529106 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 130529115 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 130529346 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130529817 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130529872 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130529893 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 130529904 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 130529927 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 130530064 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 130530077 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 130530165 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 130530779 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130530957 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 130531709 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 130532064 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 130532723 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 130532773 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 130532917 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 130532941 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 130533078 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 130533098 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 130533468 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130533512 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130533589 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 130533663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130533761 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 130533963 A T N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.266666666666667 0.666666666666667 0.0666666666666667 18 12 4 10 1 3 130534286 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 130534346 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130534443 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130534826 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 130535067 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 130535358 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130535770 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 130536549 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 130536695 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 130536720 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 130536755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130536871 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 130537009 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 130537209 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 130537612 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 130537634 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 130537673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130537732 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130537752 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 130537763 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 130537798 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 130537909 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 130537959 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 130538005 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 130538006 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 130538081 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 130538225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130538419 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 130538509 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 130538533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130538630 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130538674 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 130538708 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 130538739 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 130539070 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 130539167 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 130539199 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 130539352 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 130539545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130539549 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130539711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130539895 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130539928 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 130539958 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 130540005 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130540028 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 130540029 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 130540055 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 130540354 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 130540366 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130540819 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 130540931 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130541055 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 130541348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130542097 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130542682 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130543179 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 130543207 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 130543386 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130543698 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130543714 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130543718 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 130543873 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130544640 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 130544740 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 130544829 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 130544832 A G Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 130545458 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 130545601 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130545835 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130546002 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 130547072 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130547092 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130547265 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130547393 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130547575 C T N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 3 130547608 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 130547892 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 130548167 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 130548217 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 130548243 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 130548283 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 130548321 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 130548410 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 130548448 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 130548887 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 130549441 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 130549442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130549551 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 130549607 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 130549620 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 130550268 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130550347 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130550575 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130550688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130550865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130550931 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 130551117 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 130551721 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130551759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130552125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130553062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130553724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130553783 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130554252 C T Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 130554439 G C Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 130554453 C G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 130554665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130554958 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130555028 T A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 130555452 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130555475 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 130555923 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 130556296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130556479 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130556488 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 130557713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130558048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130558184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130558450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130558491 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130560276 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 130560284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130560338 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 130561352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130563381 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 130563382 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 130563397 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130564098 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130565460 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130565694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130566251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130566481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130567066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130567404 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 130567514 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 130568240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130568290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130569137 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130569315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130569356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130569921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130570024 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130570697 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 130571003 A G N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 130571300 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 130571365 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 130571444 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 130571464 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 130571567 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 130571607 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 130571694 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 130571727 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 130571731 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 130571793 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 130571879 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 130572072 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 130572122 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 130572145 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 130572219 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 130572256 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130572288 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 130572311 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 130572343 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 130572386 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 130572477 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 130572509 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 130572534 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 130572551 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 130572556 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 130572582 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 130572658 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 130572670 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 130572765 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 130573283 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 130573419 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 130573528 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130573643 A C Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 130573927 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 130573933 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 130574284 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130574407 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130574546 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130574742 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130574920 G A N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 3 130574944 C T N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 3 130575046 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130575053 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 130575120 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 130575201 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 130575351 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 130575424 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130575512 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 130575561 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130575616 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130575685 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130575739 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 130575744 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130575798 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130575839 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 130575854 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130576148 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 130576166 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 130576250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130576944 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 130576991 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130577153 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130577691 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130578262 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130578459 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130578705 A T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 130578725 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130578726 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130578813 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 130578832 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130578839 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130578941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130579041 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130579067 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130579143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130579262 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130579351 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130579416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130579448 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130579500 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130579717 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130579726 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130579869 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130579914 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130579961 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130580256 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130580438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130580557 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 130580687 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 130580710 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 130580737 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130580820 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130580959 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130580966 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130581262 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130581480 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130581585 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 130581630 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 130581660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130581674 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 130581685 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 130581745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130581756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130581894 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130582148 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130582213 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 130582274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130582319 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130582459 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 130582462 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 130582644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130582957 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 130582984 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 130583192 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130583389 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130583543 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130583560 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 3 130583796 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 130583970 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 130584024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130584038 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 130584100 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 130584594 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 130584729 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130584794 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130585515 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 130585986 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130586698 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 130587460 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 130587928 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 130587929 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 130588649 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 130588751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130588933 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 130589196 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130589275 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130589598 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 130589719 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 130589805 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 130589997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130590201 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130590512 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130590515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130590804 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 130593750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130594403 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 130594414 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 130594465 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 130594665 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 130595034 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 130595065 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130595124 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 130595153 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 130596078 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 130596167 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 130596240 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 130596525 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 130596573 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 130596855 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 130597050 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 130597078 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130597083 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 130597115 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 130597176 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 130597192 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 130597205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130597216 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 130597248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130597249 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 130597261 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 130597278 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 130597519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130599239 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 130599358 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130599379 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130599409 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130599684 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 130599735 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130599821 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 130599839 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 130599866 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130599891 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 130600030 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 130600170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130600363 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 130600376 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 130600419 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 130600473 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 130600546 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130601270 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 130601482 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 130601646 C A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 130601647 A G Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 3 130601767 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 130601797 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 130601986 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 12 16 2 8 4 3 130602027 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 130602095 A G N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 130602188 C T N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 130602427 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 130602703 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 130602731 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 130602848 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 130602859 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130602914 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130603055 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 130603079 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 130603093 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 130604028 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130604045 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 130604537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130606306 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 130606328 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 130606367 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 130606381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130606399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130606406 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 130606494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130606635 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 130606724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130606744 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 130606858 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130607278 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130607483 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 130607493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130607498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130607516 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130607576 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 130607623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130607688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130607702 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 130608237 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 130608273 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 130608393 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 130608410 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 130608506 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 130608577 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 130608736 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130609109 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130609431 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 130609538 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 130609566 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 130609842 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 130610142 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 130610163 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 130610223 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 130610270 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130610358 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130610364 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130610441 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130610487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130610492 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130610501 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 130611185 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130611207 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 130611370 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130611570 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130611615 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 130611786 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130612108 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130612148 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 130612160 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 130612198 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130612263 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 130612337 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 130612413 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 130612418 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130612450 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 130612489 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 130612943 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 130612998 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 130613086 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 130613212 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130613215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130613232 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130613287 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 130613466 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 130613479 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 130613819 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 130614117 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 130614132 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 130614174 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 130614253 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130614644 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 130614900 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 130615015 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 130615039 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 130615051 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 130615185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130615226 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 130615246 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 130615786 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 130615816 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 130615834 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 130615882 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 130615892 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 130615895 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 130615912 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 130615917 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 130615963 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 130615992 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 130616119 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 130616663 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130616692 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 130616742 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 130616756 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 130616790 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 130616794 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 130616831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130616888 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 130616915 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 130616984 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 130617040 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 130617060 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 130617078 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 130617099 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130617158 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 130617190 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 130617207 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 130617214 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 130617298 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 130617322 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 130617323 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 130617508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130617575 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 130617637 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 130617695 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 130617884 T C N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 3 130617889 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 130617921 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 130618161 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 130618237 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 130618311 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130618322 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 130618356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130618387 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 130618596 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130619102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130619843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130619925 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 130620632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130620688 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130620700 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130624429 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 130625022 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 130625191 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 130625308 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 130625362 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 130625448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130625599 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 130625647 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 130625810 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130625851 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 130626221 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 130626224 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 130626827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130627359 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 130627396 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 130627417 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130627545 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 130627602 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130627624 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 130627635 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 130627637 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 130627706 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 130627751 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 130627837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130627909 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130628670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130628811 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 3 130628894 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 130628906 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 3 130629154 G A Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 130629225 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130629305 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 130629349 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 130629354 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 130629364 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 130629391 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 130629500 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 130629882 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 130629893 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 130629967 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 130630778 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130630781 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 130630836 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 130631742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130631938 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 130632583 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130632743 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 130632824 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 130633007 A G Y Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0 0.545454545454545 0.454545454545455 6 16 0 6 5 3 130633041 T C Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 130633086 A G Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 130633399 A G Y Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.0909090909090909 0.636363636363636 0.272727272727273 9 13 1 7 3 3 130633499 G A Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 3 130633510 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 130634297 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 130634386 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 130634521 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 130634667 A C N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 3 130635008 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 130635022 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 130635271 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130635510 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 130635676 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 130635682 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 130635692 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 130636564 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 130636768 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 130637078 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130637383 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130637572 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130637611 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130637844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130638485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130638923 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 130639254 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130640026 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130640311 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130640347 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130640771 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130640939 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 130641316 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 130641439 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 130641443 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 130641802 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130641830 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130641869 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130641915 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 130641990 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130642031 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130642037 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130642576 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130642669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130642723 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130642750 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130642928 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130642982 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130643000 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130643108 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 130643889 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 130644010 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 130644029 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 130644159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130644475 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130644567 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 130644579 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130645344 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 130645556 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 130645748 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 130645829 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 130649526 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130650611 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130650625 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 130650726 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 130650730 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 130650738 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 130650974 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130651318 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 130651340 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 130651540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130651548 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130651551 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130651660 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 130651724 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130652395 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 130652414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130652431 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 130652587 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 130652768 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130652796 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 130653019 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130653416 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 130654079 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130654183 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130654252 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 130654396 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130655296 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 130655496 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 130655671 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 130655735 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 130655792 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130656256 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 130656859 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130656903 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130657358 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 130657397 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 130657416 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 130657461 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 130657463 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 130657652 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 130658030 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130658376 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130658460 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 130658519 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130658672 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130658727 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 130658728 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130658894 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 130659601 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130659636 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130660571 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130663154 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 130663588 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130663709 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 130664206 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 130665179 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130667860 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130668177 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130668576 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 130669206 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 130670628 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130671008 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 130672059 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130672291 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130672431 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 130672659 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 130672783 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130672796 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130672848 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 130673223 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130673475 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130673476 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 130673564 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130673657 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 130673685 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 130673895 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 130674646 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 130674662 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 130675315 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 130675329 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 130675340 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130675641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130675783 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130676753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130677686 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 130678207 T C Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 130678897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130678898 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 130678923 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 130678934 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130679009 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130679180 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130679217 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130679264 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130679521 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130679538 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130679635 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 130679815 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130680107 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 130680109 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 130680185 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 130680695 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 130680796 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130681214 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130681310 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 130681682 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 130682055 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130682120 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130682493 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130682656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130682750 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 130682980 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130683263 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130683463 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 130684241 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130684281 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 130684368 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130685399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130687905 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130688376 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130688797 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 130688803 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 130689047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130689284 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 130689897 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130690700 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130692702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130692717 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 130697851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130698553 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130698833 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130699134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130699230 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130699711 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130700584 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130700749 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130700773 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130700776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130700864 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 130700998 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 130701193 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130701312 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 130701403 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130701492 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130701625 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 130701651 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 130702168 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130703758 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 130704121 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130705144 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130705145 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 130705238 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 130705274 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 130705330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130705337 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 130705361 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 130707253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130708571 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 130721315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130721791 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 130722680 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130723296 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 130724952 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 130725268 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130725474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130727383 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 130727595 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130727846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130729756 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 130730139 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 130730537 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130731438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130732824 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 130733264 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 130733604 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130734288 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130734780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130735314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130736100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130737379 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130737499 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130737825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130739205 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130739765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130739880 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130741378 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 130741397 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130741800 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130741804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130742407 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130742758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130742828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130743201 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130743276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130743277 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130743413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130743432 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130743557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130744221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130744261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130744401 G T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 130744984 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 130745004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130745096 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130745525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130745658 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 130745680 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 130745753 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 130745759 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130746039 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130746150 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 130746151 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130746258 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 130746724 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 130746733 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 130746791 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 130746828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130746900 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 130746995 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130747092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130747770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130747908 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130749467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130752760 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130753149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130753244 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130753448 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 130753514 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 130753540 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 130753660 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130753738 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130754001 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 130754433 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 130754563 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130754733 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130754858 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 130754988 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 130755011 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130755115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130755218 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 130755247 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130755792 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130755824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130755870 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130755921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130756023 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130756024 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 130756086 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130756137 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 130756226 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 130756285 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 130756373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130756378 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 130756412 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 130756479 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 130756573 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 130756611 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 130756660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130756667 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130756747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130756778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130756861 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 130757874 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 130757883 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 130758020 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 130758132 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 130758500 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130758547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130758679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130758681 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130758692 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130758762 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130758777 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130758808 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130758811 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130758845 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 130759064 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 130759099 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130759134 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130759397 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 130759401 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 130759635 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130759685 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130759719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130759874 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 130760150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130760503 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 130760635 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 130761537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130761906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130762342 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130766823 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130767105 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 130767152 C T Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.25 0.6875 0.0625 19 13 4 11 1 3 130770261 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 130770779 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130772593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130773816 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130775323 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130776694 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 130777879 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130778232 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130778265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130778877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130778903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130778907 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130778940 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130779025 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130779096 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130779336 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130779386 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 130779459 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 130779648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130779698 A G Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 130781125 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130781141 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130781898 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 130782259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130783637 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 130783649 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 130783661 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130783724 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130783923 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130784881 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130788679 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130789115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130789132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130789173 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130789187 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130789202 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130789336 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 130789382 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 130789571 C G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 130789731 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 130789809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130790187 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 130790469 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130790548 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 130790752 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130792410 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 130794382 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130794670 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 130795509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130795719 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130796333 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130799882 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130799966 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130800024 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130800203 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 130800581 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 130801558 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130802763 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130802791 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130805325 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130806620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130806655 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130806674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130806779 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130806826 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130807383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130807744 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130807787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130807814 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130807854 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130807904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130808083 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 130808200 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 130809983 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130811489 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 130811591 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 130811656 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 130811791 C T N Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 10 6 4 2 2 3 130813646 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130813922 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 130815352 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 130815427 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 130815485 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 130815526 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 130815621 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130816384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130816617 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 130817206 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130817214 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130817506 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130819869 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130819882 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 130820185 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 130820218 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130820274 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 130820279 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 130820343 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 130820589 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 130821005 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 130821006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130821048 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 130821346 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 130821362 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 130821364 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 130821379 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 130821451 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130821463 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130821536 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130821566 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130821891 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 130821932 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 130821965 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 130821983 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 130822275 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 130822287 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 130822496 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130822679 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130822747 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130822805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130822947 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130823019 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130823162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130823407 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130823619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130823781 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130823988 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130824094 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130824467 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130824684 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 130825072 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 130825271 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130825830 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130825847 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 130825882 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130825888 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130825977 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 130826123 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 130826786 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 130827085 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 130827555 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130827639 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 130827768 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 130827780 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 130828308 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 130828547 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 130828720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130828912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130829380 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130829735 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 130829737 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 130830066 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 130830331 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130830432 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 130830992 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130831523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130831761 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130831840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130832079 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 130832088 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 130832123 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 130832275 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 130832337 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130832633 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 130832795 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130832891 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 130832986 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 130832988 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 130833002 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130833049 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 130833064 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130833114 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130834051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130834073 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130834146 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130834293 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 130834335 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130834374 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130834397 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130834768 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 130834769 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 130834841 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 130834968 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 130835098 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 130835146 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130835438 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 130835473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130835567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130835603 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130835699 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130835709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130835909 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 130835919 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 130835921 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 130836131 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 130836132 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 130836163 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130836289 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130836308 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 130836452 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 130836752 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130837242 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 130837282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130837385 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 130837398 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 130837591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130837797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130837888 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130838106 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130838589 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 130838650 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130838673 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 130838693 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130839153 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130839172 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 130839308 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 130840828 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130840895 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130841060 G T Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 130841588 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130841654 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 130843265 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 130843460 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 130844545 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 130844610 A G Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 130845007 G T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 130845877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130846579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130849199 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130849670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130850025 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 130850028 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 130850436 T A N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 130850608 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 130850630 C T N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 130850686 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 130850828 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130850841 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130850929 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130851108 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130851148 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 130851776 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130852053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130852509 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130852619 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 130852666 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 130852913 T G Y N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 5 5 2 1 2 3 130853191 G A N Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.428571428571429 0.142857142857143 0.428571428571429 7 7 3 1 3 3 130853201 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 7 5 3 1 2 3 130853404 T G N N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.5 0.125 0.375 9 7 4 1 3 3 130853902 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 130853997 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 130854017 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 130854095 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 130854434 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130854592 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130854615 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130854665 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130854688 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130854707 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130854761 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130855008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130855025 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130855057 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130855091 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130855183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130855228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130855242 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130855264 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130855381 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 130855459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130855552 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130855657 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130855670 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130855723 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 130855783 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130855853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130855859 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130855897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130855913 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130855930 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130855961 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130856020 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130856090 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130856128 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130856370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130856376 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130856391 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130856406 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130856430 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130856533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130856690 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 130856884 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130857161 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 130857189 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130857333 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 130857768 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130857799 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 130857831 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 130858030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130858196 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130858314 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 130858443 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130858468 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130858505 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 130858593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130858624 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 130858990 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130859030 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130859374 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130859405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130859491 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130859585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130859593 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130860237 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130862232 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 130863815 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 130863878 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130864316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130864683 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 130864696 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 130865095 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 130865534 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 130865607 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 130865609 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 130865663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130865676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130865768 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 130865788 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 130865839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130865858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130865899 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130865971 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 130866137 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 130866151 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 130866196 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130866208 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 130866262 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130866274 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130866334 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130866336 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 130866348 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130866389 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130866454 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130866486 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130867043 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 130867181 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 130867188 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 130867241 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130867268 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 130867452 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130867462 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130867478 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130867647 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130867701 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130867905 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 130868234 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 130868405 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 130868413 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 130868458 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 130868466 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 130868693 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 130868983 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130869177 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130869261 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 130869291 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 130869479 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 130869502 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 130869602 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 130869610 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 130870235 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 130870411 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 130870574 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 130870589 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 130870664 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130870745 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130870871 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130871730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130872385 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130873007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130873010 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 130873832 C G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 130874114 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 130874145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130874155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130875264 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130875697 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130875771 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130875907 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130875914 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130876130 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 130877253 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 130877448 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130877508 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 130877542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130879010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130879233 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130880046 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 130880182 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130880201 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130880413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130880460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130881375 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130881377 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130881582 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 130882600 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 130882671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130882700 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130882719 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130883788 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130884475 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 130884577 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130884601 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 130885346 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130885876 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130886094 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 130887958 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130888192 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 130888315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130888362 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130888369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130890481 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130890588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130892311 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 130893592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130894168 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 130894323 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130895126 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130895186 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130895304 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130895321 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130895328 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130895347 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130895481 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130895537 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 130895570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130895635 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 130895959 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 130895980 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 130896017 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 130896274 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 130896667 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130896917 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 130896932 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130897527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130897763 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130898154 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 130898196 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 130898399 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 130898482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130898571 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 130898625 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 130898641 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130898669 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130898670 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130898694 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130898759 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130899326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130899974 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 130900309 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 130900426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130901304 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 130901519 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130901869 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 130902003 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130902741 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130902782 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130902881 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130902918 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130903013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130903568 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 130903720 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 130903750 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 130903774 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 130903958 A G N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 3 130903967 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130903997 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130904019 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130904028 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130904117 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130904128 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130904146 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 130904204 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130904250 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130904345 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 130904366 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130904409 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130904609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130904762 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130904768 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130904778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130904835 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130904838 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 130904866 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130904888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130904904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130904927 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130904944 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130905084 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130905100 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130905165 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130905312 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130905427 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130905580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130905601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130905650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130905658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130905661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130905744 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130905764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130906036 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130906058 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130906082 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130906185 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130906341 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 130906731 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130906746 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 130907679 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130908415 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130908545 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 130909605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130910940 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130912060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130914319 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 130914558 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130915682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130915880 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130915922 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130916133 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130916144 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130916181 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 130916377 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130916992 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 130917511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130918085 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130918486 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130918537 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130919924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130921808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130923697 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130923711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130934474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130936007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130939300 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 130939914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130942174 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 130942329 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 130942376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130942416 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 130942582 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130942722 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130943382 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130943516 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130943587 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130943592 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130943632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130943713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130944733 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 130945101 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130945134 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 130945159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130945186 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 130945222 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130945292 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130945378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130945558 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 130945701 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130945704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130945717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130946714 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130946887 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130947082 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 130947098 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130947212 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 130947262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130947288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130947866 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 130947878 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 130948870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130949129 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130949536 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 130949537 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130949892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130950239 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 130950253 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 3 130950382 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 130950443 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 130950520 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 130950679 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130950737 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 130950811 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 130950911 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130950967 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 130950982 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130951043 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130951050 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130951175 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 130951342 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 130951744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130952930 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 130954265 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130955078 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130955155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130955198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130955242 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130955701 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130955744 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130956202 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130956327 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130956592 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130956715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130956780 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130956789 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130957004 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130957362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130957741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130958099 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130958241 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 130958339 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 130958451 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 130958463 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 130958472 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 130958750 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130958874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130958889 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130959124 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130959214 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 130959969 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130960441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130960457 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 130960940 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 130960953 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 130960987 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 130960995 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 130961013 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 130961027 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 130961040 A C N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 3 130961041 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 130961094 C A N N 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.428571428571429 0 0.571428571428571 6 8 3 0 4 3 130961111 G A N Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.5 0 0.5 6 6 3 0 3 3 130961121 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 5 13 2 1 6 3 130961134 A G N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 3 130961141 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 130961213 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 130961260 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 130961292 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 130961299 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 130961304 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130961317 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 130961368 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 130961374 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 130961380 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 130961416 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 130961425 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 130961462 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 130961471 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 130961494 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 130961497 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 130961505 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 130961596 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 130961618 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 130961645 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 130961736 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 130961783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130961805 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 130961839 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 130961887 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130961915 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 130961985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130962055 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130962070 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 130962099 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 130962260 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130962268 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130962313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130962359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130962360 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 130962421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130962439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130962574 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130962610 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130963212 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130963217 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130963465 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130963533 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 130963777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130963914 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 130964081 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 130964239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130964514 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 130964691 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 130964847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130964859 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130964910 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130965038 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 130965426 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130966424 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 130966922 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 130967701 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130968076 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130971101 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 130971160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130972649 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130972846 A T Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 130973697 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130974465 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 130974519 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130975043 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 130975127 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 3 130976145 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 130976539 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130976622 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130976660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130976672 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 130976688 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 130976830 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 130976924 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 130977005 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 130979650 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130979972 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130980945 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 130981155 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 130982847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130984541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130984665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130984718 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130984819 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 130984825 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 130984864 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130984903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130984912 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 130984932 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 130984933 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130985001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130985113 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130986073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130987463 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130988813 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130988984 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 130989306 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 130990055 G A Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 130990065 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 130990149 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 130990308 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130990373 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130990555 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 130990560 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 130990583 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130990616 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130990727 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 130990756 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130990796 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 130990850 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 130990981 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130991073 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130991137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130991146 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130991166 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130991212 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130991223 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130991443 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130991477 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130991482 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130991585 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130991616 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130991640 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130991675 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130991676 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 130991716 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130991728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130991756 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130991778 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130991793 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 130991802 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 130991816 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130991833 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130991852 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130992269 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 130992275 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 130992334 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130992368 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130992421 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 130992654 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130992718 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130992945 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130993028 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 130993036 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130993120 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130993150 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 130993792 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 130993961 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 130994006 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130994011 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 130994056 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 130994278 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 130994612 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 130994926 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 130996137 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 130996358 T C Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 3 130998717 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 130999515 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131000151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131001152 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 131003003 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 131006678 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131007017 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 131007249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131007737 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 131007751 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131007994 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131007999 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131008630 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 131008763 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 131009136 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131009900 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131010498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131010624 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 131012236 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 131012466 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131012583 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131013346 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 131013664 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 131020115 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131021571 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131021996 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131023431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131024039 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 131026668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131026940 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 3 131027343 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 131027644 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 131029640 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131029722 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131029860 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 131029969 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131031157 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 131032577 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131033628 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 131033777 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 131033782 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 131033858 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 131034146 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 131037390 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 131037448 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131037450 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131037713 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131039866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131041650 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 131041907 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131043673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131043819 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131045075 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 131045449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131045972 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 131045973 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 131046018 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 131046068 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 131046169 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131046171 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131046188 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 131046465 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 131046554 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131046666 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 131046895 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131046923 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 131046937 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 131046950 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 131047207 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 131047252 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 131047430 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 131047489 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 131047567 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131047570 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 131047583 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 131047898 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131048020 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 131048031 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131048116 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131048350 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 131048360 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 131048404 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 131048445 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 131048667 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 131048797 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 131048953 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131049095 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131049105 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131049120 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 131049220 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 131049774 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131050636 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 131050768 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131052026 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131052676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131053573 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131053675 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 131053757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131054038 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 131054083 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131054191 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131054200 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 131054281 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131054317 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131054538 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131054639 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131054649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131054660 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131054667 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131054676 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131054720 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131055475 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131055536 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131055609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131055726 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131055769 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131055785 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131055809 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 131055827 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131055846 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 131055870 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131055876 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131055910 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131055925 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131055939 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 131056097 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 131056106 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 131056137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131056230 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131056260 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131056344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131056540 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131056546 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131056563 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131056629 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131056636 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 131056724 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131057266 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131057578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131057696 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 131057767 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131057818 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131057949 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131058270 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131058308 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 131058430 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131058549 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131058559 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 131058734 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131058744 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131058790 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131058842 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 131058918 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 131059064 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 131059171 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 131059187 A G N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 131059297 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 131059314 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131059334 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131059361 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131059374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131059413 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131059419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131059438 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131059441 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131059482 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131059597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131059787 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131059900 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131059953 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 131060031 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 131060370 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 131060420 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 131060491 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 131060528 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131060588 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131060618 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131060643 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131060654 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 131060838 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131060987 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 131061071 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 131061147 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 131061453 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 131061540 G C N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 131061823 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 131061838 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 131061844 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 131061963 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131062205 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 131062277 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131062422 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131062433 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 131062453 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131062705 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131062752 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131062754 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131062935 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 131063164 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131063456 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131063834 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 131063835 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 131063911 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131063977 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 131064020 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131065046 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 131065246 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 131065300 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131065422 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131065431 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131065455 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131065620 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 131065683 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131065881 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 131065882 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 131066006 G C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 131066078 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 131066199 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 131066211 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131066281 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131067001 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 131067025 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 131067030 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 131067316 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 131067971 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131067989 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 131068074 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 131068138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131068190 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131068197 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 131068494 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 131068496 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 131068575 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 131068576 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 131068605 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 131068668 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 3 131069005 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 131069019 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 131069478 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 131069569 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131069640 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 131069811 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131070133 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 131070245 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 131070270 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 131070392 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131070400 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131070571 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 131070747 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 131070879 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 131070886 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131070906 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 131071011 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 131071017 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 131071071 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 131071215 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 131071828 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131071885 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 131071989 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131072020 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 131072173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131072208 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 131072209 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 131072359 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 131072508 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131072510 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131072521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131072550 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131072551 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131072646 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 131072660 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131072701 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131072711 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131072750 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131072885 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 131072910 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131072936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131072954 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131072968 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131072982 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131073017 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 131073026 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131073042 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131073067 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 131073087 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131073093 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131073115 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131073149 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131073255 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131073390 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 131073433 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131073445 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131073704 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 131073772 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 131073886 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131073887 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 131074028 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 131074078 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 131074153 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131074326 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 131074501 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131074640 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 131074667 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131074668 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 131074702 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131074748 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131074828 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 131074834 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 131074913 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 131074914 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 131074968 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 131074975 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 131074997 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131075012 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 131075040 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 131075391 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131075393 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131075437 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131075448 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 131075464 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 131075481 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 131075522 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 131075597 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 131075610 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131075717 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131075825 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131076081 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 131076303 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 131076307 C T N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.615384615384615 0.153846153846154 0.230769230769231 18 8 8 2 3 3 131076356 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 131127268 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 131127280 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 131127296 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131127714 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131127715 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 131127759 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131127795 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131127807 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131127822 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131128029 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 131128380 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 3 131128643 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 131129237 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131129268 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 131129280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131130265 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131130450 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131132789 C A Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 131133597 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131133661 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 131133690 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131135461 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131135494 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 131135795 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 131136419 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 131136939 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 131139639 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 131139663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131139944 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131139966 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 131140066 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 131140923 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131140971 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 131140998 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 131141091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131141333 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131141638 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131141761 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 131141834 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 131141973 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131142009 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131142131 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 131142280 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131142369 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131142408 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 131142536 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 131142647 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131142956 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 131143062 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 131143120 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131143236 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 131143351 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131143391 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 131143476 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 131143488 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 131143540 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 131143722 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 131143862 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131144036 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131144058 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 131144178 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131145487 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 131145549 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 131145929 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 131146050 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 131146340 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 131146360 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 131146632 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 131146917 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131146962 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131147027 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131147262 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 131147379 T A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 131147458 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 131147497 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 131147710 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 131147713 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 131148002 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 131148202 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 131148204 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 131148232 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 131148276 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131148320 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 131148330 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 131148378 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131148391 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131148442 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131148475 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131148646 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131148673 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 131149146 A T N N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 3 131149661 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 131149777 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 3 131149972 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 131150330 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131150380 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131150431 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 131150446 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131150476 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131151152 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 131151274 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 131151316 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 131151342 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 131151362 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 131151389 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 131151477 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 131151733 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 131151737 A T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 131151758 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 131151980 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 131152018 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 131152020 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 131152309 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131152544 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 131152824 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131152826 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 131152836 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 131152980 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131154551 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 131155035 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131162653 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 131164272 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 131164665 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131164705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131164829 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131164893 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 131164915 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 131165177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131165441 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131165532 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 131165733 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 131165734 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 131165752 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 131165786 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131166498 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 131166529 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 131166563 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 131166566 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 131166594 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 131166666 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 131166766 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 131166769 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 131166786 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 131166848 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131166888 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131166922 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 131167239 G C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 131167472 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 131167521 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 131167577 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 131168127 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131168180 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131168587 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 131173565 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131173757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131173873 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131174996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131175234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131175258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131175261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131175502 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 131175543 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 131175599 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 131175892 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 131176116 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 131176425 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 131176746 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 131181693 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131184250 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 131185211 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131185477 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 131191404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131191475 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 131193347 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131193867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131194256 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 131194451 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 131194537 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 131196800 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131196999 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131197557 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 26 14 12 2 6 3 131197903 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 131198411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131198557 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 131199191 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 131199257 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 131199668 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 131199703 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131199745 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131199841 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131199893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131200410 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 131200479 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 131200487 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131200495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131200528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131200551 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131200588 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 131200611 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 131200625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131200630 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 131200801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131200958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131201043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131201064 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131201314 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131201805 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131201964 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131201974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131202180 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131202365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131202410 G C Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 131202576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131202632 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131202702 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131202816 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 131203011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131203551 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 131203747 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131203756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131203815 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 131203825 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131203893 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 131203902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131204027 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 131204040 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 131204220 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 3 131204317 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 131204760 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 131204786 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 131204816 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 131205389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131206148 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131211021 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 131211252 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 131211697 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131212193 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131212324 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131212818 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131213298 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 131213462 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131213640 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 131213661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131213771 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131213832 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131213835 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131213968 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 131214830 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131216210 G T Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 131216292 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131216549 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 131216580 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131216992 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 131218874 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131219251 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131219288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131219707 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131219876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131219903 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 131220182 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 131220202 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 131220249 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 131221946 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131222637 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 131223061 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131223062 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131223089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131224254 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131224340 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131225680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131226463 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131227719 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131229186 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 131229269 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 131230195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131231798 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 131231941 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131231976 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131232174 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 131232214 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131232219 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 131232246 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 131232260 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131232365 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131232570 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 131232633 G T Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 131232709 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 131232792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131232813 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131232875 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 131232998 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131233149 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 131233272 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131233639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131233705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131233711 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131233755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131233813 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 131233828 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131233917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131233919 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 131233988 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131234018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131234041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131234076 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131234103 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131234154 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131234290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131234310 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131234419 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131234886 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131234937 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131234954 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131235029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131235520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131235579 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131235746 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 131236403 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131237476 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131238131 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131238321 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131238333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131240725 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131241096 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 131241507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131244397 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 131244398 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 131244896 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 131244911 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 131245164 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 131245612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131246880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131249152 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131253879 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 131254240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131254663 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 131254871 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 131254896 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 131254909 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 131255578 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 131255980 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131256043 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131256339 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131258079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131260257 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131263874 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131264654 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131265571 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 131265671 C T N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 8 12 2 4 4 3 131265679 G A N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 3 131265773 C G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 131265821 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131266428 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 131267154 C G Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 131267155 A G Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 131267165 A C Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 131267180 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131267263 C T Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 131267611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131267703 T C Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 131267756 A C Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 131267768 A G Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 131267769 G A Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 131267780 G A Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 131267894 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 131267899 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 131267916 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 131267949 T A Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 131267965 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 131267983 A G Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 131268103 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 131268118 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 131268213 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 131268329 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 131268380 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 131268434 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 131268467 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 131268546 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 131268722 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 131268754 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 131269213 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 131269228 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 131269269 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 131269447 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 131269547 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 131270063 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 131270077 T G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 131270260 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 131270287 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 131270529 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 131270537 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 131270596 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 131270695 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 131270804 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 131271297 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 131271303 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 131271347 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 131271349 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 131272196 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131272296 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131272408 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131272611 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 131277255 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131277398 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131278030 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 131278035 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 131278153 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 131278178 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 131278675 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 131278828 C G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 3 131278908 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 131278996 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 131279220 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 131279249 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 131279366 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131279373 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131279390 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 131279409 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 131279511 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 131279529 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 131279540 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 131279541 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 131279825 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 131279852 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 131280072 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 131280509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131280957 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 131281026 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131285499 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 131285834 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131285862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131286088 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 131286224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131286396 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131286657 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131287167 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131287197 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131287214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131287536 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131287791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131287926 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131288011 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131288024 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131288377 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131288407 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131288422 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 131290959 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131291159 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 131291903 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131291908 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 131292104 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 131292819 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 131292836 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 131293218 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131293322 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131294144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131294375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131294693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131295658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131296543 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131297141 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 131298913 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131299097 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131299505 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131299768 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131300111 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131300690 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131300937 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131301831 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131301886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131302028 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 131302041 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 131302298 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 131302393 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131302770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131303155 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131303339 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 131303408 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 131303487 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 131306800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131306991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131307000 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131307312 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 131307597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131307906 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131308298 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131308475 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131308582 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131308887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131308915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131309338 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 131309474 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 131309531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131309691 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131309783 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 131309819 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131309821 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 131310216 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131310362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131310820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131311056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131313484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131314133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131314275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131315243 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 131315308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131315316 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131315336 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131315355 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 131315392 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131315419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131315812 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 131315941 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 131316127 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 131316167 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131316429 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 131317006 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131317511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131317600 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 131317910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131318115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131318251 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 131318290 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131318465 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 131318589 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131318764 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131318854 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131319507 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 131320470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131322073 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131322185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131322407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131322467 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 131322640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131322645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131322723 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 131323361 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 131323414 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 131324008 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 131324022 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131324204 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131324490 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 131324652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131324996 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131325038 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131325069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131325196 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 131325280 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131325360 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 131325361 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 131325628 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131326505 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131327615 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 131327794 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 131327901 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 131328561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131330209 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131331094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131331827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131332127 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131332311 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131334755 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131335266 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 131337761 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 131337903 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131338938 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131340452 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131340907 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 131341112 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 131341607 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131341718 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131341781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131342101 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131342576 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 131348236 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 131348699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131349425 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131350080 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131352297 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131353804 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131354150 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131355089 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 131355209 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 131355602 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 131357335 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131358807 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131359495 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131361355 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131361384 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 131362929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131363179 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131376024 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131376142 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131376644 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131376752 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131377228 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131378015 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 131378050 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131378078 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 131378370 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131381818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131383605 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 131384328 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 131385361 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131385666 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131388059 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 3 131388079 A G N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 3 131388624 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131389037 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131389607 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 131390268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131390865 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131392365 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131393273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131393759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131394404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131394599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131394851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131396042 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 131396161 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131397353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131397524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131398320 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131398436 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131398927 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131399463 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131400058 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131400328 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131403509 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131404468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131405656 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131406074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131407672 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 131408731 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131408768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131408977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131409187 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 131409832 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131410524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131410622 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 131410833 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131411733 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131412425 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131413673 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 131415078 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131415991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131417213 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 131417653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131417970 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131418281 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131418847 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131419216 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 131420771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131421040 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 131421056 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 131421064 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 131424005 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131425255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131426662 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 131426952 T A Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 131426971 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131427070 A G Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 131427338 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131427864 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131428145 T C Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 131429424 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 131430133 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131430229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131432551 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131432623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131432828 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131433601 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131434425 C T N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 15 9 6 3 3 3 131436977 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 131437625 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131437974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131438585 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 131441903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131443217 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 131443631 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131444101 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131444264 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 131453120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131454161 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131454183 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131455458 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 131455699 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 131456335 T G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 131457015 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 131457042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131459866 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131461279 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 131461676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131462287 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131462288 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131463436 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 131465421 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 131467443 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131467744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131468167 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131468223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131469149 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131469404 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131470337 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131471425 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131471468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131471691 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131473083 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131473296 C T Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 3 131473500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131473571 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 131476162 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131478211 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 131478315 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131478785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131479676 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131480029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131480743 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131481210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131481637 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131481644 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131481818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131482001 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131487042 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 131487114 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 3 131487195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131487299 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 131487384 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 131487494 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 131487818 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131487899 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 131487984 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 131490103 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 131490165 T C N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 3 131490278 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 131490530 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 131490544 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 131491159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131491167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131491217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131491318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131491826 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 131491887 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 131492298 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 131492329 A G N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 3 131492376 A C N N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 3 131492491 G T Y N 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0 1 0 11 11 0 11 0 3 131492513 T C N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 131492537 T C Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 131492553 G A Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 131492605 C T Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 131492765 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 131492773 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 131492928 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 131493024 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131493075 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 131493086 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 131493089 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 131493142 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 131493286 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 131493305 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 131493340 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 131493495 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 131493502 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 131493590 G C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 131493609 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 131493619 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 131493723 T G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 131493808 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 131493825 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 131493862 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 3 131493921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131493962 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 131494065 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 131494109 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 131494430 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131494437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131494480 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131494737 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 131494754 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 131494789 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 131494840 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 131495079 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 131495261 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 131495386 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131495499 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 131495593 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131495619 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 131495628 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131496034 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131496039 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131496149 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131496320 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131496800 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 131496965 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 131497026 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131497116 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131498616 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131498839 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131498866 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 131498891 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 131499037 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131499079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131499483 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 131499484 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 131499781 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131500084 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 131500591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131500669 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 131500712 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 131502638 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 131503071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131503485 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131505018 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131505253 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 131505885 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131506464 C A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 131507035 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 131511608 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 131514991 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131516403 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 131516548 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 131517309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131519119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131519354 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131519813 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 131520100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131520264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131520407 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 131520410 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 131520487 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 131520505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131520849 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131520917 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 131520918 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 131520945 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 131521040 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 131521164 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 131521184 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 131521268 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 131521312 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 131521331 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 131521350 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 131521503 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 131521802 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 131522550 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 131522948 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 131523079 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 131523086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131523098 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 131523328 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 131523376 T A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 3 131523427 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 131523461 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 131523761 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 131523868 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 3 131523884 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131523906 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 131523917 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 131524034 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 131524261 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 131524276 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 131524348 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 131524358 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 131524407 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 131524418 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 131524422 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 131524527 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 131524564 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 131524567 G T Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 131524660 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 131524837 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 131524848 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131524879 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 131524892 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 131525213 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131525527 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 131525553 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131525641 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 131525772 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131525816 A T N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 3 131525932 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 131526076 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131528259 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 131528279 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131528392 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 131528750 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131528756 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 131528783 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 131528981 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131529157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131529222 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 131529385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131530118 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 131531770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131533158 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131533735 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 3 131534358 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131534439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131535847 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 131537354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131541288 T C Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 131545705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131546269 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131546294 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 131546455 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131547782 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 131547846 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 131547880 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 131547895 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 131548091 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 131548114 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 131548715 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 131548782 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 131548919 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 131548974 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 131549117 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 131549165 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 131549184 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 131549190 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 131549221 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 131549340 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 3 131549489 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 131549563 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 131549720 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 131550107 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 131550675 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 131550768 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 131550996 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131551038 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131551099 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 131551231 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 131551390 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 131551444 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 131551999 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 131552040 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 131552542 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 131552664 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 131552762 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 131552791 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 131552899 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 131552920 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 131553063 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 3 131553105 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 131553151 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131553259 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 131553592 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 131553749 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 131553818 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 131553832 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 3 131553881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131553941 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 131554021 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 131554064 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 131554077 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 131554199 A C N N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.363636363636364 0.636363636363636 0 15 7 4 7 0 3 131554445 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131554474 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 131554586 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 131554615 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 131554688 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 131554751 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131554980 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 131555018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131555086 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 131555107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131555179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131555219 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 131555230 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 131555294 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 131555441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131555570 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131555779 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131556321 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 131556791 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131557452 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 131558100 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 131558262 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 131558554 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131558805 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131558889 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131559089 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 131559900 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 131560134 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131560413 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131560436 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131560446 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131560488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131561803 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131561855 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 131562912 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 131563139 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131563198 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 131563276 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 131563372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131563884 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131563910 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131564491 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 131564530 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 131564608 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131564697 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131565046 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 131565157 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 131565358 G A N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 3 131565720 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131566168 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 131566274 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 131567083 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 131567512 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131567552 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 131567847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131567892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131569126 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131570111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131570304 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 131570633 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 131570646 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 131570668 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 131570699 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 131571056 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 131571099 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131571246 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 131571454 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131571586 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131571651 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131571765 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131571933 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131571953 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 131572098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131572497 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 131572752 C T N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 3 131573313 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 131573717 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131573744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131573827 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131574047 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 131574268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131574333 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 131574336 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131574522 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 131574547 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 131574569 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 131574715 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 131574832 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131574871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131574941 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131575393 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131575760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131576484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131577935 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 131577988 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 131578004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131578012 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131578359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131578374 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 131578379 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131578484 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 131578500 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 131578626 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 131578718 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131578735 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131578802 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 131578918 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 131578973 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131579008 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 131579278 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131579419 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131579447 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131579453 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131579466 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 131579543 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 131579555 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 131579613 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 131579671 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131579733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131580223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131580603 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131580707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131581112 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131581486 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 131581972 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131582270 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 131582302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131582349 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131582371 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131582479 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131583171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131584896 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 131589170 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131591258 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131591457 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 131602490 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131602539 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131602986 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131604023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131604159 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131604296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131604757 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 131605082 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131605821 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131606323 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131606352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131606483 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 131616723 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 131617589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131617838 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131619838 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 131620258 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 131620402 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131620475 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 131621522 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131621613 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 131621837 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 131622485 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 131622487 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 3 131622557 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 131622601 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 131622619 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 131622628 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 131622685 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 131623164 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131624148 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131624513 C A N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 3 131624567 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 131625180 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 3 131625284 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 131625838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131626010 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131626226 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 131626873 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 131626921 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 131627118 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 131628397 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 131629430 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131629547 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 131630380 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 131630420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131630951 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131631202 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131631236 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131631373 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 131631582 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 131632339 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131635370 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 131635537 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 131636673 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 131637260 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 131637322 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 131637337 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 131637420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131637609 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 131639726 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 131639799 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131639826 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 131640175 C A N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 131640222 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 131640241 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 131640302 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 131640323 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 131640400 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 131640553 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 131640585 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 131640701 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 131640716 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 131640818 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 131640877 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 131640926 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 131641000 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 131641079 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 131641081 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 131641181 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 131641269 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 131641274 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 131641355 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 131641400 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131641441 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131641464 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 131641465 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 131641514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131641520 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 131641525 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 131641634 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 131641665 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 131641807 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 131641857 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 131641859 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 131641882 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131641986 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 131642316 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 131642322 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 131642340 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 131642779 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131642836 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 131642849 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 131642941 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 131642967 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 131643064 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 131643065 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131643094 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131643737 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131644839 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131646026 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 131646115 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131646459 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 131647987 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131648306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131649314 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 131649973 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131651819 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 131651820 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 131651974 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 131651992 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 131651997 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 131652055 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 131652124 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 131652154 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 131652258 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 131652437 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131652455 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 131652648 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131652701 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 131652798 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 131652884 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 131653304 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131653417 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 131653758 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131653920 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 131653985 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 131653997 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131654029 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131654054 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131654109 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131654168 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131654213 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 131654220 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 131654282 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 131654303 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131654399 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 131654404 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 131654425 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 131654761 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 131654807 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 131655119 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 131655660 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 131656190 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 131656805 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 131658408 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131658444 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131658915 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 131659119 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 131660183 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 131661048 G C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 131662140 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131663080 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 131663274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131663398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131663622 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131664589 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131664764 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 131665781 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131665852 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131666175 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 131666394 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131666826 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131667833 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 3 131668303 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131668563 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 131670013 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131670174 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131670593 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131670971 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131672634 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131672790 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 131672802 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 131673440 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131673647 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131673705 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131673949 T G N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 131674147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131674197 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131674466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131674951 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131675910 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 131675988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131676139 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 131676475 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 131679957 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 131680459 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131681703 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 131681955 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 131682130 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131682489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131682597 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 131682770 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 131682773 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 131682880 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 131683124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131683230 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 131683362 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 131683464 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 131683613 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 131683617 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 131683749 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 131683939 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 131684392 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 131684800 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 131685112 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131685166 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131685318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131685717 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131685789 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 131686067 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 131686444 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 131687092 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 131687193 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131687324 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131687331 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 131687342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131687737 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131687789 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131687813 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131688556 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 131688690 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 131688932 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131689027 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 131689098 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 131689209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131689213 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 131689221 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131689237 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 131689280 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131689333 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 131689383 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 131689617 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 131689633 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 131689732 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 131689733 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 131689796 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 131689942 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 131689989 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 131690000 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 131690255 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 131690418 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 131690471 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 131690526 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 131690583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131690620 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131690860 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 131690966 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 131691052 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131691083 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 131691370 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 131691463 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 131691520 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 131691578 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 131691598 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 131691708 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131691746 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 131691859 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 131692388 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 131692750 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 131692770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131693230 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 131693512 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 131693564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131693595 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 131693643 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 131693667 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131693742 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 131693756 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 131693803 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 131693865 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 131693980 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 131694041 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 131694098 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 131694562 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 131694597 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 131694610 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 131694835 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 131694922 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 131694936 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 131694951 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 131694958 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 131694974 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131695005 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 131695057 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 131695081 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 131695167 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 131695202 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 131695497 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 131695532 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 131695579 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 131695581 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 131695690 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 131696035 G A N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 131696228 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131696229 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 131696282 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 131696377 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131696621 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131696922 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 131697008 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 131697134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131697161 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 131697461 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131697863 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131697905 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 131698004 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 131698132 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 131698379 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131698510 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 131698511 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 131698554 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 131698690 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 131698781 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 131698880 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131699117 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 131699134 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 131699279 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 131699653 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 131699857 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 131700339 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131700340 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 131700517 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 131700581 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 131701020 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 131701101 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 131701187 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 131701225 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131701426 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 131701479 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 131701623 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 131701642 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 131701736 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 131702069 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 131702534 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131702540 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131702927 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131703302 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 131703450 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 131704067 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 131704094 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 131704294 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 131704362 A C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 131704460 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 131704724 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 131704749 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 131704751 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 131704861 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 131704965 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 131704970 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 131705039 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 131705116 A T N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 131705163 T A N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 131705547 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131705658 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 131705727 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 131705732 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 131706094 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 131706173 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131706207 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 131706214 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 131706331 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131706443 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131706446 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 131706487 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131706540 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131706541 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 131706633 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 131706969 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 131707065 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131707119 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 131707187 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 131707267 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 131707545 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 131707601 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 131707677 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 131707691 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 131707813 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131707876 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 131707933 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 131708046 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 131708076 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 131708091 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 131709040 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 131709061 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 131709089 G T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 131709317 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 131709335 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 131709361 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 131709456 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 131709468 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131709479 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 131709550 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 131709617 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 131709642 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 131709652 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131709679 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131709789 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 131710455 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 131710709 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 3 131710804 C T N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 131711110 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 131711332 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 131711488 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 131711579 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 131711644 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131711687 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131711746 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131712465 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 131712931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131713139 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 131713141 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 131713178 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 131713201 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 131713244 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 131713421 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 131713477 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 131713597 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 131713654 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 131713773 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 131714249 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131714375 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 131714518 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 131714648 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 131714756 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 131714879 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131714982 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131714996 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 131715033 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131715633 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131715734 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 131715908 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 131716224 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 131716681 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 131716998 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131717016 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131717082 A C Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 131717339 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 131717811 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131717897 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131719744 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 131719824 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131720482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131722252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131722314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131723047 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131725459 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 131725913 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131726139 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131726336 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131726585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131726922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131727301 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131727458 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131728782 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131729079 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 3 131729878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131731242 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 131731263 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131731295 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131731360 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 131731461 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 131732350 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 131732388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131732416 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 131732522 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 131732566 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 131732689 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 131732751 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 131732766 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131732772 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 131732800 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 131732836 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 131733072 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 131733141 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 131733160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131733234 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 131733480 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131733508 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 131733656 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 131733867 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 131733885 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 131733900 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 131734145 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 131734147 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131734213 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 131734249 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131734566 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131734668 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 131734771 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131734772 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 131734902 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 131735099 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 131735118 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 131735124 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 131735145 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 131735197 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 131735229 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 131735432 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 131735492 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 3 131735582 T C N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 3 131735679 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 131735922 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 131735924 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 131735957 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131736032 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 131737235 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 131737550 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 131737613 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 131737770 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 131737843 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 131737863 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 131737885 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 131737922 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 131738051 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 131738270 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 131738306 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 131738809 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 131739306 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131740247 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131740360 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131740507 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131740609 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131740651 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 131740744 A T Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 131740773 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 131740796 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 131740859 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 131741386 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131741389 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131741642 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131741655 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 131741775 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131741779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131741979 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131742094 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131742160 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131742370 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 131742405 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 131742505 C A Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 131742533 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 131742915 A T Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 131742933 C T Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 131742955 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 131743000 A T Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 131743151 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 131743220 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 131743260 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131743272 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131743362 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131743723 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131743724 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131743813 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 131743954 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 131743955 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 131744007 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 131744032 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 131744124 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 131744158 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 131744181 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 131744330 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 131744966 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 131745961 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 131745978 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 131746261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131746298 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 131746340 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 131746431 T C N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 3 131746536 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 131746565 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 131746674 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 131746796 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 131746811 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 131746848 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 131746918 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 131747560 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 131747570 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131747621 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 131747759 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 131747996 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 131750584 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131750949 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 131751037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131751831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131755610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131755832 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131757516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131757628 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131758043 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 131758134 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 131758849 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 131758961 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 131758999 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 131759202 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 131759570 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 131759688 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131759727 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 131759748 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 131759764 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 131759846 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 131759857 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 131760024 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 131760046 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 131760206 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 131760686 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 131760806 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 131761119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131761809 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131762696 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131764165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131764340 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 131764437 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 131764616 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 131764657 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 131765408 G T Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 131765805 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 131765834 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131766566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131766991 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 131767023 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 131767350 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131767707 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131767722 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131767823 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131768002 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131768513 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 131768534 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 131768606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131768622 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 131768679 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 131768738 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131768792 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 131768851 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 131769238 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 131769253 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 131769293 G C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 131769302 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 131769333 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131769412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131769440 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 131769446 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 131769635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131769656 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 131770073 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 131770228 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131770694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131770748 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 131770773 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 131770775 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 131770785 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 131770787 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 131770924 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 131770933 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 131770937 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 131770956 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 131770965 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 131770983 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 131771114 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131771190 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 131771364 A T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 3 131772861 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 131772983 A T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 131773492 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131773580 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131773611 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 131774537 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131775343 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 131783039 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 131783539 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 131783716 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 131783724 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 131783768 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 131783769 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 131783946 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 131784149 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 131784187 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 131784193 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 131784423 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 131784434 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 3 131784816 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131784872 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 131784912 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 131785035 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 131785063 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 131785118 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 131785287 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131785341 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 131785705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131785722 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131786002 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 131787036 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 131787294 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131787944 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131788292 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131789377 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131789484 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131790416 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131792551 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 131793541 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131795026 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131795698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131795789 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 131796925 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 3 131801118 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131802066 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131803420 C G Y N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 3 131803432 C G Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 131805170 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131805645 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131805685 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131805696 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 131805766 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 131811094 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131811682 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 131813230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131815893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131815927 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 131818496 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 131818550 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 131818577 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 131818699 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 6 12 2 2 5 3 131818730 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 3 131818834 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 131819156 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 131819226 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 131819230 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 131819359 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 131819404 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131820991 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131821163 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 131821821 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 131822074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131822350 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131823605 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 131824814 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131825256 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131825505 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 131826387 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131826804 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131827363 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131827396 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131827675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131827986 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131828013 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131828070 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131828236 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 131828252 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 131828274 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 131828477 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 131828775 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 131828894 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 131829064 A C N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 131829070 T A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 131829188 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 131829215 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 131829216 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 131829291 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131829592 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 131829627 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 131829648 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 131829659 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 131829668 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 131829803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131829914 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 131829920 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 131830189 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 131830216 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 131830224 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 131830560 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 131830627 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131830633 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 131830664 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 131830693 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 131830813 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 131831088 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131831268 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 131831319 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131831334 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131831335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131831532 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131831573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131831591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131831801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131832065 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 131832430 T C Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 131832518 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 131832848 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 131833103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131833172 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 131833261 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 131833309 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 131833342 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 131833444 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 131833487 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 131833488 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 131833540 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 131833557 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 131833589 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 131833641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131833673 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 131833693 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 131833704 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131833807 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131833913 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 131834100 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 3 131834131 C A N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.142857142857143 0.642857142857143 0.214285714285714 13 15 2 9 3 3 131834141 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 131834181 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 131834187 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 131834225 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 131834262 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 131834774 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131834989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131835127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131835468 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131835518 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131836356 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131836479 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131836489 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 131836905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131837088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131837431 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 131837492 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 131838449 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 131840674 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 131841496 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 131842376 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 131842445 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 131842587 A G Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 131842723 A G Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 131842783 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131843390 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 131843493 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131843531 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 131843534 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131843565 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 131843641 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 131843654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131843710 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131843809 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 131845074 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 131845509 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 131845821 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131847909 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 131848668 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131849477 A G N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 3 131849914 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 131853447 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131854963 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131855485 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 131855574 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 131855600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131855830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131855851 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131855926 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 131856165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131856675 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 131857107 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 131857261 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131857638 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 131857639 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 131858148 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 131858391 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131858781 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 131858880 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131859040 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 131859052 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 131859163 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 131859378 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 131859528 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131859610 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 131860313 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 131860555 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 131860612 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131862194 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131863307 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131864018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131864789 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131865541 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 131866669 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131867354 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131867510 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131867686 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131867718 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131868641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131868722 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131868945 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 131869039 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131869733 C T N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 131869840 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 131870597 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 131871100 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131871725 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 131871759 T A N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 3 131871803 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 131872774 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131874785 C A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 131875540 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131876015 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131878264 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131878841 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131879883 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 131880097 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 131880149 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131880159 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 131880214 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 131880236 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 131880257 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 131880291 A T N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 131880318 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 131880741 C T N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 3 131880793 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 131880821 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 131880831 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 131880886 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131880887 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 131880899 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 131880930 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 131880931 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 131880944 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 131880945 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 131881113 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 131881124 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 131881145 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 131881211 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 131881265 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 131881373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131881491 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 131881588 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 3 131881682 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 131881706 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 131881839 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 131881887 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 3 131881933 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131881984 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 131882022 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 131882068 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 131882109 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 131882126 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 131882273 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 131882381 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 131882427 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 131882488 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 131882613 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 131882617 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 131882626 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 131882661 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 131882689 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 131882790 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 131882986 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 131882990 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 131883045 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 131884096 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131887607 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 131888409 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 131888427 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131888471 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 131888570 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131892122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131893271 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 131894024 C A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 131894446 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131894582 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131894635 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 131895125 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 131895428 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 131895448 C T N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 131896012 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131896608 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 131896733 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 131896842 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131897320 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 131897661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131897861 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 131897934 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 131898227 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 131898461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131899321 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131899400 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 131899658 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 131899670 G C N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 131899720 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 131899821 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 131899872 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 131899903 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 131899909 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 131899966 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 131899981 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 131899997 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 131900022 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0 0.842105263157895 0.157894736842105 16 22 0 16 3 3 131900087 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 131900202 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 131900560 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131900910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131901033 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 131901103 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131901273 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 131901291 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131901325 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131901493 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 131901608 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 131901645 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 131901855 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 131902465 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 131902473 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 131902710 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 131903108 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 131903361 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 131903998 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 131904188 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131904214 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 131904334 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 131904392 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 131904457 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 131904473 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 131904504 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 131904555 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 131904583 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131904635 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 131905040 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 131905170 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 131905175 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 131905198 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 131905295 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 131905311 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 131905317 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 131905332 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131905492 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 131905711 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 131906100 G A N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 131906255 G T Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 3 131906269 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 131906276 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 18 14 4 10 2 3 131906413 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 18 14 4 10 2 3 131906470 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 3 131906655 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 131906670 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 131906707 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 131906771 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 131906873 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 131906889 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 131907267 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 131907440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131907497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131907537 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 131907773 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 131907804 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 131907917 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131907965 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131908065 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131908207 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131908213 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131908265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131908350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131908570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131908699 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131908714 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 131908897 T A N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 131908912 A G N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 3 131908953 G T N N 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 12 8 4 4 2 3 131908980 G C N N 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 3 131909023 T A N N 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0833333333333333 0.666666666666667 0.25 10 14 1 8 3 3 131909033 G C N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 3 131909105 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 131909166 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 131909236 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 131909255 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131909362 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 131909376 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 131909511 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 131909567 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 131909575 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 131909581 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 131909588 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 131909687 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 131909762 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131909810 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 131909990 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131910094 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 131910153 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 131910221 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 131910245 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 131910401 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 131910571 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 3 131910741 G A N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 131910830 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 131910859 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 131910992 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131911121 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 131911123 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 131911257 A C N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.153846153846154 0.615384615384615 0.230769230769231 12 14 2 8 3 3 131911635 T G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 131911638 C A N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 131911741 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 131911756 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 131911913 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 131911922 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 131911966 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 131912200 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131912782 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131913011 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 131914106 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 131914137 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 131914267 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 131914470 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131914555 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 131914570 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 131914590 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 131914597 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 131914913 T C N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 3 131914941 A T N N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.363636363636364 0.363636363636364 0.272727272727273 12 10 4 4 3 3 131915146 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 131915255 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 131915484 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131915812 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 131915818 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 131916116 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131916196 T A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 131916299 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131916418 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 131916458 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131916569 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131916658 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 131916683 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 131916703 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 131916715 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131916778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131916785 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131916807 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131916884 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 131916910 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131917331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131917494 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131917648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131918153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131918258 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131918370 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 131918371 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131918437 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 131918493 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131918549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131918874 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 131918981 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 131919104 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 131919233 C T N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 131919519 C T N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 3 131919524 T G N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 3 131919532 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 131919552 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 131919742 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 131919865 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 131919882 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 131919931 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 131920411 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 131920901 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131921897 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 131922431 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 131922961 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 131923167 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 131923261 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 131923771 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131925067 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 131925109 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 131925151 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 131925211 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 131925485 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131925509 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 131925650 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 131925685 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 131925699 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 131925997 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 131926033 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 131926210 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131926362 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 131926519 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 131926929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131927052 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 131927147 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 131927306 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 131927340 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 131927410 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 131927476 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 131927604 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 131927610 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 131927683 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 131927707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131927776 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 131927791 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131927835 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 131927842 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 131927870 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 131927901 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 131928040 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 131928203 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 131929112 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 3 131929157 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 131929226 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 131929323 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 131929352 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 131929406 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 131929646 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 131929747 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 131929753 C G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 131929846 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 131930091 T C Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 131930202 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 131930354 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 131930404 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 131930639 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131930766 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 131930852 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 131930938 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 131931039 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 131931101 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 131931107 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 131931195 G T N N 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 3 131931231 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 131931317 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 131931458 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131931534 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131931681 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 131931708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131931780 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 131931848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131931869 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131932185 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 131932218 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131932243 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 131932244 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 131932283 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 131932328 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 131932468 G A N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 131932490 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 131932539 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 131932619 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 131932672 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 131932768 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 131932784 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 131933132 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 131933187 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 131933208 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 131933281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131933322 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 131933423 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 131933425 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 131933454 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 131933471 A G Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 3 131933509 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 131933510 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 131933585 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 131933613 G A N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 3 131933648 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 131933761 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 131933773 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 131933780 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 131933791 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 131933944 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131934012 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 131934020 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 131934144 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131934219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131934337 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131934463 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 131934498 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 131934718 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 131934730 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 131934736 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 131934818 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 131934825 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 131935018 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 131935025 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 131935087 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 131935174 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 131935445 T A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 131935492 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 131935494 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 131935551 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 131935623 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 3 131935692 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 131935733 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 131935740 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 131935780 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 131935790 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131935845 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 131935896 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 131936191 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 131936250 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 131936261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131936662 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 131936706 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 131936773 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 131936909 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 131937052 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 131937130 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 131937151 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 131937171 G T N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 3 131937173 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 131937183 G T N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 3 131937227 T G N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 3 131937280 G T N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 3 131937316 A G N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 3 131937391 A T N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.230769230769231 0.692307692307692 0.0769230769230769 15 11 3 9 1 3 131937473 A C N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.333333333333333 0.6 0.0666666666666667 19 11 5 9 1 3 131937665 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 131937670 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 131937728 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 131937746 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 131937750 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 131937763 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 131938215 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 131938799 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131939221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131939374 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131939410 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131939920 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 131939946 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131940110 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 131940202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131940264 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 131940280 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131940464 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 131940506 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131940601 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131940913 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 131941131 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 131941158 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 131941189 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 131941245 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 131941338 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 131941346 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131941363 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 131941431 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 131941437 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 131941497 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 131941591 C T N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 3 131941621 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 3 131941673 G C N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 3 131941716 G T N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 131941725 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 131941739 C G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 131941768 T A N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 3 131941772 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 131941790 A G N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 3 131941860 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 3 131941886 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 131942032 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 131942043 C G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 131942048 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 131942103 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 131942124 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 131942169 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 131942188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131942230 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 131942473 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 131942779 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 131942872 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 131942892 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 131942925 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 131942953 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 131942962 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 131942972 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 131943069 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 131943134 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 131943169 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 131943240 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 131943268 G T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 131943399 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131943524 T C N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 3 131943624 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 131943691 A C N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 131943720 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 131943845 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 131943856 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 131943919 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 131943952 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 131944554 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 131944601 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 131944627 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 131944939 G C N N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.181818181818182 0.545454545454545 0.272727272727273 10 12 2 6 3 3 131944986 T C N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.214285714285714 0.642857142857143 0.142857142857143 15 13 3 9 2 3 131945016 A T N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 3 131945616 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 131945846 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 3 131945922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131946060 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 131946233 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131946576 C A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 3 131947229 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 131947526 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 131947640 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 131947899 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 131948001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131948272 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 131948286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131948321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131948394 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 131949127 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 131949200 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 131950672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131952673 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131952896 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 131952962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131953750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131953757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131953950 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131955135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131955155 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 131955163 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131955301 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 131955464 T G N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 131955807 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 131955842 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 131955847 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 131955883 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 131955999 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131956144 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 131956260 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131956462 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 131956545 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 131956597 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 131956618 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 131956652 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 131956729 T G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 131957226 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 131958041 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 131958215 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 131958824 G T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 131958828 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 131958867 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 131959718 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 131961148 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 131961946 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 131962907 G C Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 131969106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131969468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131969540 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 131970261 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 131970475 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 131970616 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 131971303 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131971912 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 131972115 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 131972341 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 131972445 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 131973502 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131974787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131974884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131975450 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 131976040 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131976278 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 131976312 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 131976413 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 131976664 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 131977538 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 131977552 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131977714 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 131977726 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 131978433 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 131979390 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131979735 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 131979772 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131979853 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 131980312 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131980313 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131980620 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 131980882 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131981528 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131981635 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131982747 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 131982865 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 131982928 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131982946 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.611111111111111 0.111111111111111 0.277777777777778 24 12 11 2 5 3 131983151 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 131983465 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 131983522 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 131983574 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 131983613 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 131983725 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 131983939 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 131984089 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 131984109 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 131984115 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 131984485 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 131984585 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 131984829 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 131984846 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131985063 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 131985078 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 131985158 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 131985392 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 131985395 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131986257 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 131986641 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 131986904 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 131987189 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 131987233 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 131987389 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 131987521 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 131987717 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 131987903 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 131988183 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 131988263 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 131988296 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 131988490 T G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 131989292 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 131989501 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 131989518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131989583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131989644 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131989671 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131989870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131989903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131989935 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 131989961 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131989997 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 131990018 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131990384 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131990537 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131990663 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 131990705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131990817 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 131990818 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 131990863 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 131990996 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131991045 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 131991123 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 131991356 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 131991382 A T N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 3 131991467 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 131991555 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131991571 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 131991607 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 131991782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131992012 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 131992027 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131992033 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 131992111 G A N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 3 131992509 C A N N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 8 12 1 6 3 3 131992723 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 131992742 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 131992792 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 131992861 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 131992907 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 131992925 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 131992971 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 131992995 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 131993196 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131993213 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131993283 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 131993319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131993460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131994029 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131994053 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131994066 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131994534 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131994573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131994588 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131995465 T A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 131995643 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 131995644 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 131995743 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 131996218 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 131996439 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131996520 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 131996573 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 131996611 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 131996928 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131996931 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131997009 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 131997238 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 131997479 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 131997540 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 131997987 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 131998051 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 131998209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131998263 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 131998347 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 131998416 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 131998421 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 131998447 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 131998448 G C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 131998555 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 131998586 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 131998655 T G N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 131998664 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 3 131998704 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 131998753 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 131998791 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 131998804 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 131998829 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 131998838 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 131999435 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 131999447 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 131999462 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 131999469 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 131999680 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 131999818 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 131999865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 131999948 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 132000000 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 132000150 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 132000566 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132000630 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 132000665 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 132000680 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 132000742 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 132000785 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 132000918 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 132000954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132000965 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 132000990 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132001071 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 132001105 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 132001216 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 132001257 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 132001268 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 132001269 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132001286 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 132001292 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 132001329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132001410 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 132001502 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 132001517 G T Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 132001584 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 3 132001614 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 132001667 A T Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 132001681 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 132001708 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 132001715 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132001795 A C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 3 132001860 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 132001876 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 132001909 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 132001923 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 132001952 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 132001994 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 132002086 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132002170 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132002173 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 132002196 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 132002198 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 132002405 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 132002437 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 132002475 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132002597 G A Y Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.125 0.75 0.125 8 8 1 6 1 3 132002817 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132002818 C G N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 3 132002836 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132002870 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 132002873 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 132002968 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 132003031 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 132003143 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132003160 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 132003173 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 132003206 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 132003308 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 132003389 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 132003422 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132003434 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 132003451 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 132003460 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132003610 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 132003674 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 132003685 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 132003698 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 132003710 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 132003745 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 132003758 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 132003781 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 132003813 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 132003832 A G N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 3 132003960 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 132003985 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 132004012 T C N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 3 132004128 C T N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 3 132004271 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132004537 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 132004599 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 132004657 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 132004746 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 132004757 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 132005003 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 132005016 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 132005073 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 132005173 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 132005225 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132005460 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132005517 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 3 132005712 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 132005732 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 132005879 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 132006401 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 132006677 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 132006758 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 132008332 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132008453 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132008544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132008572 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132008899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132009184 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132009370 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 132009419 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 132009461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132009518 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 132010335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132010604 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 132010880 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132011057 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 132011093 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 132011118 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 132011324 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 132011466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132011584 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132011637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132011663 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132011708 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 132011839 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 132011893 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 132011995 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132012060 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132012114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132012191 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 132012252 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 132012276 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 132012377 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 132012397 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132012403 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 132012737 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 132012916 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 132012988 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132013325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132013478 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 132013509 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132013596 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132013614 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 132013627 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132013853 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 132013854 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 132014013 T A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 132014106 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132014112 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132014143 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 132014247 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 132014282 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 132014301 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 132014325 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 132014342 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132014348 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 132014363 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 132014431 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 132014497 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 132014511 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 132014543 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 132014544 C G N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 132014566 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 132014579 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 132014588 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 132014638 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 132014693 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 132014920 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 132014934 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 132014935 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 132015017 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132015133 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 132015140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132015165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132015189 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 132015215 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 132015307 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 132015320 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 132015558 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 132015685 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 132015774 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 132015978 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 132016161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132016318 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 132016566 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 132016635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132016734 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 132016752 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 132016758 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132016823 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 132016927 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 3 132017132 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 132017241 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 132017449 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 132017564 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 132017714 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 132017826 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 132017888 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 132017957 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 132017969 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 132017971 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 132018024 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 132018191 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 132018211 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 132018311 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 132018313 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 132018323 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 132018343 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 132018402 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 132018609 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 132018623 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 132018724 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 132018816 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 132018828 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 132018840 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 132018891 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 132018912 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 132018914 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 132018944 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 132018990 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 132019013 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 132019049 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 132019175 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 132019193 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 132019202 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 132019221 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 132019242 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132019298 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132019378 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132019539 G A Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 132019587 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132019764 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 132019772 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132019817 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 132021092 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 132021313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132021378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132021957 C A N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 132022169 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132022739 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 132022763 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 132022786 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 132022789 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 132022827 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 132022903 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 132022982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132023059 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 132023180 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 132023181 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 132023227 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 132023255 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 132023430 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132023972 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132024149 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 132024173 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 132024301 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 132024664 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 132024699 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132024713 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 132024945 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 132024975 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0 0.736842105263158 0.263157894736842 14 24 0 14 5 3 132025140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132025376 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 132025529 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 132025885 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132026166 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132026251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132026311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132026360 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132026395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132026434 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132026478 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132026514 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132026645 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132026667 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 132026714 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132026728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132026782 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132027104 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132027337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132027609 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 132027886 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 132027912 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132028130 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132028200 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 132028586 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132028709 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 132029893 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132030539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132030613 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 132031105 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 132031313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132031641 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132032298 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 132032368 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132032379 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132032585 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 132032596 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 132032632 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132032808 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132032978 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 132033040 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132033094 C G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 132033165 C G N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 132033208 G A N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 3 132033225 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 132033231 A T N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 3 132033271 A C N N 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 7 11 1 5 3 3 132033319 A G N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 7 13 1 5 4 3 132033324 C A Y N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 7 13 1 5 4 3 132033337 A C Y N 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 7 11 1 5 3 3 132034285 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132034360 A T N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 3 132034389 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 132035236 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132035484 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 132035709 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 132035759 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132035781 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 132035827 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132036106 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 132036577 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 132036763 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 132037056 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 132037473 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132037603 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 132037655 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132037716 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 132037747 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132037815 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132037912 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 132037939 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 132037963 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 132037991 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132038021 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132038059 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 132038233 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 132038239 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132038255 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 132038453 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 132038464 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 132038616 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132038822 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132038923 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132039204 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 132039473 G C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 132039656 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 132039786 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132039795 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132039897 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 132039913 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132040070 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132040076 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 132040098 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 132040245 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 132040260 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 132040291 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 132040381 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 132040387 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 132040428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132040583 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 132040607 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 132040666 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132040830 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132040835 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132040851 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 132040924 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132041029 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132041045 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 132041192 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 132041313 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132041337 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 132041347 C A Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 132041361 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 132041589 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132041920 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 132042009 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132042166 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 132042219 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 132042220 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 132042325 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132042410 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132042911 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 132042958 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 132042977 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 132043381 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 3 132043399 G T Y N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 132043950 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 132043971 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132044002 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 132044013 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132044021 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 132044080 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 132044094 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 132044143 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132044188 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 132044224 A T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.176470588235294 0.764705882352941 0.0588235294117647 19 15 3 13 1 3 132044293 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0 0.722222222222222 0.277777777777778 13 23 0 13 5 3 132044460 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 132044475 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 132044598 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 132044615 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 132044630 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 132044632 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 132044707 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 132044713 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 132044729 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 132044824 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 132044859 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 132044900 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 132044903 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 132044953 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 132044998 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 132045045 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 132045051 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 132045084 T A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 132045252 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 132045372 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132045373 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132045787 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 132045846 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 132046198 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 132046328 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132046371 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 132046443 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 132046763 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 132046764 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132046781 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 132046917 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 132046974 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 132046983 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 132047031 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132047042 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 132047153 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 3 132047639 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 132047768 G A Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 132047865 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 132047920 A C Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132047956 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 132047971 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 132048142 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132048223 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 132048303 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132048378 C G Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 132048448 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 132048453 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 132048482 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 132048550 T C Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 132048988 T C Y Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0 0.6 0.4 6 14 0 6 4 3 132049069 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 132049081 T C N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 5 11 0 5 3 3 132049230 C T Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 132049470 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132049592 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 132049610 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 132049656 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132049925 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132050595 A G N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 132050688 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 132050730 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 132050802 T G N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 132050870 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 132051095 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132052230 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 132052454 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 132052513 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 132052524 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 132052715 T G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 132052917 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 132052953 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 132053048 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132053098 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 132053185 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132053195 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 132053309 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 132053603 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 132053743 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 132053839 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 132054646 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 132054943 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 132055334 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 132055547 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 132055642 A C N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 3 132055703 A C N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.333333333333333 0.6 0.0666666666666667 19 11 5 9 1 3 132056102 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132056103 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 132056144 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 132056165 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 132056207 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 132056241 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 132056267 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 132056485 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 3 132056589 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 3 132056740 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 132056812 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 132056919 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 132057247 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132057269 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132057451 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132057453 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 132057486 T C Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 132057514 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 132057550 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 132057552 C T Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 132057564 A G N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 132057583 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 132057611 A T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 132057632 A C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 132057648 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 132057705 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 132057719 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 132057724 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 132057756 A C N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 3 132057775 C A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 132057802 T A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 132057828 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 132057892 T G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 132057961 A T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 132058014 A C Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 132058059 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 132058062 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 132058100 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 132058106 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 132058121 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 132058146 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 132058227 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 132058290 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 132058302 T A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 132058323 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132058330 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 132058423 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 132058651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132058831 T G Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 132058844 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132058856 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132058924 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.5 0.416666666666667 8 16 1 6 5 3 132058957 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 132058992 G A Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 132059005 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 132059013 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 12 16 2 8 4 3 132059050 G A Y Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 132059098 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 132059251 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 132059261 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 132059400 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132059402 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 132059411 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 132059545 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 132059593 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 132059664 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 132059745 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 132059771 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132059816 T C Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 132059873 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 132059890 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 132059892 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 132059909 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132060255 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 132060303 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 132060304 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132060676 G C N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 3 132060724 A G N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 132060885 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 132060920 T C Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 132060971 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132061007 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132061180 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 132061257 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132061436 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132061456 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 132061807 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 132061811 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 132061834 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 132062029 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 132062070 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 132062071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132062662 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 132062682 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 132062702 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 132062735 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132062780 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132062833 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 132062837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132062846 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132062906 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132063092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132063120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132063284 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 132063387 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 132063422 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 132063433 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132063458 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 132063584 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 132063669 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132063676 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132063696 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132063710 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132063712 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 132063726 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 132063774 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 132063912 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132064155 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 132064208 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132064242 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132064249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132064266 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132064341 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132064346 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132064387 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132064576 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132064582 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132064785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132064827 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132064868 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132065036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132065054 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132065065 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132065086 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 132065119 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 132065162 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132065186 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 132065190 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132065203 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132065233 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132065237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132065265 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132065280 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132065341 T C Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 132065418 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 132065425 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132065434 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 132065830 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 132066264 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132067008 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132067021 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132067320 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132067537 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 132067730 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 132068022 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 132068435 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 132068839 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 132076978 C T N Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.428571428571429 0.142857142857143 0.428571428571429 7 7 3 1 3 3 132078565 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 132078860 T A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 132078972 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 132078974 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 132079726 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132079955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132080392 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132080605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132081033 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132082739 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 132082931 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 132083080 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 132084107 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 132084140 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132084760 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132084823 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 132085861 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 132087147 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132087982 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 132088681 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132089746 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132089760 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 132090266 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 132091968 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 132092157 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132096582 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 132097445 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 132101873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132102217 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 132102452 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 132102538 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132102932 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132102933 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 132102948 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 132103069 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 132103207 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 132103227 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 132103360 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 132103361 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 132103618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132103736 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 132103762 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132103763 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132104178 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 132104654 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132105030 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 132105162 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132105209 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132105447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132105525 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 132105527 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 132105537 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132105680 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132105879 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132105920 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 132106161 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 132106236 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 132106404 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 132106577 A G N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.545454545454545 0.272727272727273 0.181818181818182 15 7 6 3 2 3 132106824 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 132107000 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 132107432 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 132107495 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 132108039 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 132108127 T G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 132108155 T C N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 3 132108516 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132108646 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132109131 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 132109184 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 132109315 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 132109317 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 132109659 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 132109698 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 132109711 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 132109778 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 132109910 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 132110141 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132110187 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 132110263 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 132110337 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 132110443 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 132110507 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132110610 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 132110653 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 132110712 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 132110713 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 132110724 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 132110792 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 132110809 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 132110834 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 132110881 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 132110886 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 132110912 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 132110966 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 132111049 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 132111119 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 132111154 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 132111270 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 132111403 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 132111456 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132111482 C T N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 3 132111524 G A N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 3 132111577 G T N N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 6 12 2 2 5 3 132111794 G T Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 132112510 T A Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 132113033 A G N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 3 132113064 G C N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 12 16 2 8 4 3 132113094 G C N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 12 16 2 8 4 3 132113096 A G N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.153846153846154 0.615384615384615 0.230769230769231 12 14 2 8 3 3 132113151 C G Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 15 5 7 1 2 3 132113398 G A Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 132114096 A G Y Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 11 9 3 5 2 3 132114101 G A N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.363636363636364 0.363636363636364 0.272727272727273 12 10 4 4 3 3 132114297 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 132114299 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 132114462 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 132114485 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 132114514 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 132114671 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 132114756 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 132114786 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132114812 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 132115046 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132115145 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132115171 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132115352 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132115377 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 132115618 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132115675 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132115967 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 132116117 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132116282 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132116309 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 132116445 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132116659 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132116754 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 132116824 A C N N 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 9 11 2 5 3 3 132116905 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132116961 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132116981 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132117030 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132117099 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 132117265 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 132117267 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 132117433 G A N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 3 132117619 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 132117644 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 132117848 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 132118065 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 132118085 G T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 132118461 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132118724 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 132118786 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132118796 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132118986 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132119034 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 132119245 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132119342 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132119467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132119515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132120253 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132120358 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132120623 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 132120640 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 132120734 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 132120973 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 132121026 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 132121107 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 132121133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132121138 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 132121508 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132121581 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 132121588 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 132121608 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132121617 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 132121784 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 132121899 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 132121968 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 132122006 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132122303 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132122401 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 132122649 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 132122650 A G N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 132123003 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 132123052 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 132123503 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 132123546 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 132123664 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 132123721 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132123722 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132124222 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 132124417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132124657 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132124689 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 132124752 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 132124848 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 132124945 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 132125062 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132125130 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 132125141 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 132125221 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 132125320 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 132125324 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 132125388 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 132125439 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 132125526 T A Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 132125548 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132125555 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132125612 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132125632 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132125688 T A Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 132125821 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132125944 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 132125995 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 132126036 A T Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 3 132126187 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 132126271 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 132126284 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 132126314 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 132126329 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132126370 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132126392 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 132126459 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 132126528 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 132126605 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 132126679 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 132126700 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 132126709 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 132126718 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 132126770 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 132126810 G T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 132126872 C G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 132126914 C T Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 3 132126953 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 132126994 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 132127039 C A Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 132127044 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132127218 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 3 132127279 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 132127332 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 132127443 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132127622 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 132127665 T G N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 132127718 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 132128036 A C N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 15 15 6 3 6 3 132128079 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 132128105 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 132128189 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 132128216 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 132128222 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 132128247 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 132128248 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 132128338 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 132128395 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 132128398 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 132128411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132128497 C G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 132128587 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 132128694 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 132128713 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 132128739 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132128930 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 132129244 G T Y N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 3 132129274 C G Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 3 132129649 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132129679 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 132130029 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 132130032 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 132130238 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 132130646 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132130860 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132130977 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 132131016 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 132131079 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132131087 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132131133 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 132131134 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 132131162 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 132131395 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132131749 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 132131965 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132131974 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 132132003 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132132035 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 132132204 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 132132205 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 132132297 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 132132657 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 132132703 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 132132728 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 132132815 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 132132845 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 132132932 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 132132934 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 132133003 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132133034 C G N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 3 132133218 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132133367 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 132133381 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 132133403 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132133452 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132133497 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 132133498 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 132133514 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132133552 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 132133599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132133644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132133719 G C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 132133836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132134168 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132134176 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132134189 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132134239 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 132134341 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 132134507 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 132134625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132134627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132134641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132134960 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132135107 A C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 132135135 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132135165 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132135286 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132135441 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132135481 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132135564 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132135623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132135636 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 132135649 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132135664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132135673 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 132135689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132135769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132135780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132136176 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 132136195 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 132136217 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 132136229 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132136236 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 132136319 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 132136327 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 132136372 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 132136383 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 132136402 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132136423 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132136481 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 132136484 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 132136604 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132136649 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 132136667 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 132136716 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 132136769 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 132136797 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132136810 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 132136821 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132136823 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132136918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132137150 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132137299 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 132137516 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 132137585 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 132137628 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132137682 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 132138049 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 132138405 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132138425 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132138442 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132138455 A T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 132138616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132138628 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132138655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132138660 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 132138696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132138730 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132138783 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132138866 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132138878 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132138882 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132138895 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132138981 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 132139002 C T Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 132139011 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 3 132139164 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 132139212 G T N N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0 0.636363636363636 0.363636363636364 7 15 0 7 4 3 132139238 C G N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0 0.583333333333333 0.416666666666667 7 17 0 7 5 3 132139243 G A N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 3 132139268 C T N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 3 132139401 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 132139506 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 132139552 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132139568 G A Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 132139570 C T Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 132139649 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 132139657 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 132139698 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132139735 C A N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 3 132139755 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 132140065 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 132140165 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 132140279 A T N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 132140289 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 3 132140298 A C N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 3 132140325 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 3 132140405 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 132140596 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 132140603 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 3 132140611 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 3 132140625 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 3 132140630 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 3 132140667 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 3 132140722 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132140744 A T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 3 132140877 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 132140899 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 3 132140983 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 3 132141062 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 132141096 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 132141195 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 132141230 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132141318 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 132141341 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 132141382 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 132141479 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 132141496 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 132141506 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 132141626 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 132141655 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 132142123 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132142126 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 132142264 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 132142374 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132142824 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132142852 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 132142963 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132143006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132143027 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 132143078 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 132143213 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132143290 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 132143926 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 132144257 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 132144398 G T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 132144852 T C N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 132144856 T A N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.333333333333333 0.6 0.0666666666666667 19 11 5 9 1 3 132144915 A G Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 3 132144929 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 132145397 G A Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 132145428 T A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 132145565 A G Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 132145626 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 132145645 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 132145733 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 132145838 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 132145903 T A Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 132145934 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 132146008 A T Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 132146027 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132146085 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 132146287 T G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 132146377 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 132146412 A T Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 132146528 A G Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 3 132146603 A G Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 132146755 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 3 132146793 C T Y Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 3 132146857 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 11 7 4 3 2 3 132146860 A G Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 132147064 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132147119 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 132147181 C A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 132147321 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 132147420 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.210526315789474 29 9 14 1 4 3 132147439 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 3 132147689 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132147938 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132147953 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 132148331 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 132148470 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132149079 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132149314 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 132150944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132151185 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132151485 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 132151551 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132151772 G A N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 132152037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132152324 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 132152348 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132152982 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 132153449 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132153522 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.611111111111111 0.111111111111111 0.277777777777778 24 12 11 2 5 3 132153694 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 132153779 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 132154197 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132154302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132154307 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 132154577 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 132154606 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132154717 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132154893 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 132154971 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 132154990 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 132155109 T G N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.333333333333333 0.6 0.0666666666666667 19 11 5 9 1 3 132155281 A T N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 3 132155394 C T N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 3 132155675 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 132155935 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 132156040 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132156062 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 132156115 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 132156131 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 132156499 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132156649 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 132156660 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 132156799 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 132156832 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 132156911 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 132157222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132157455 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 132157765 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 132157848 T A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 132158027 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132158482 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132158770 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132159419 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 132159893 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 132160574 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 132160756 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 132160853 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 132161118 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 132161147 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 132161169 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 132161327 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 132161403 T C N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 3 132161448 C T N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 3 132161500 G T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 132161533 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 132161640 A G N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 132161682 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132161712 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 132161718 C A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 3 132161812 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 132162035 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 132162039 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 132162132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132162233 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 132162313 A G N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 3 132162346 A G Y Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 8 6 1 6 0 3 132162474 A G N Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 3 132162515 G T N N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.363636363636364 0.181818181818182 0.454545454545455 10 12 4 2 5 3 132162546 A C N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 3 132162560 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 132162594 A C N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 132162621 G T N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 132162638 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132162662 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 132162690 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 132162713 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 132162844 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132162875 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 132162894 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 132162919 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 132162983 C G Y N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 132163080 A G Y Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 3 132163107 A C Y N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.454545454545455 0.363636363636364 0.181818181818182 14 8 5 4 2 3 132163112 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 3 132163227 T G Y N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 132163269 A G Y Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 3 132163270 A G Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 3 132163352 A G Y Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 12 8 4 4 2 3 132163392 G A Y Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.454545454545455 0.272727272727273 0.272727272727273 13 9 5 3 3 3 132163442 A G Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 13 5 6 1 2 3 132163454 A G Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 13 5 6 1 2 3 132163600 T G Y N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 132163611 T G Y N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 132164001 T A Y N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 3 132164193 A G Y Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.454545454545455 0.272727272727273 0.272727272727273 13 9 5 3 3 3 132164241 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 132164259 C G Y N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 3 132164267 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 3 132164285 T C Y Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 3 132164486 A T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 132164591 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 132164636 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 132164648 C T N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 132164658 G C N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 3 132164719 A T N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 3 132164808 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132164844 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 132164892 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 132164898 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 132165369 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 132165384 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 132165415 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 132165487 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 132165650 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 132165697 C A Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 132165915 A G Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 132166346 C G N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.538461538461538 0.0769230769230769 0.384615384615385 15 11 7 1 5 3 132166422 C A N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.5 0.0714285714285714 0.428571428571429 15 13 7 1 6 3 132166509 C T N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.4 0.0666666666666667 0.533333333333333 13 17 6 1 8 3 132166765 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 132167037 C G N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 132167189 C T N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 3 132167317 A T N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 3 132167454 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 132167660 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 132167760 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132167767 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 132167954 A C N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 3 132168539 A G N Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 10 6 3 4 1 3 132169183 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132169389 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 132169555 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132169902 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 132169909 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 132170052 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 132170194 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 132170566 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 132170602 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 132170720 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132171414 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132171772 T A Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 3 132173142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132174016 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132174027 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132174084 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 132174109 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 132174304 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132174585 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 132174973 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132175017 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132175224 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132175248 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132176052 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132176179 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 132176371 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132176603 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132176730 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132177122 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 132178153 A G N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.285714285714286 19 9 9 1 4 3 132178798 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132179813 C A N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 132186709 C A N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.357142857142857 0.142857142857143 0.5 12 16 5 2 7 3 132186898 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 132187271 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 132189066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132189484 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132190018 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132190891 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132192119 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132192244 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132193168 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132194836 A G N Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 6 6 1 4 1 3 132195263 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132195405 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 132195776 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 132195919 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 132195933 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 132196502 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132196718 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132196780 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 132196953 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 132198863 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 132198948 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 132199352 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 132199604 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 132200510 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 132201605 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132201638 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132201738 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 132201884 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 132202127 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132202453 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132202462 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132202485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132202512 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132202527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132202539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132202833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132203405 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132203505 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132203533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132203754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132203763 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132203795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132203868 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132203875 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132203926 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132203952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132203971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132203978 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132204003 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132204031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132204035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132204081 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132204105 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132204119 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132204134 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132204156 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132204265 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132204393 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132204439 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132204516 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132204623 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132204635 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132204644 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132204746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132204838 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132204869 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132204899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132204922 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132205024 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132205093 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132205133 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132205172 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132205197 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132205330 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132205331 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132205354 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132205533 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132205547 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132205587 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132205640 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132205651 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132205678 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132206140 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 132206304 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 132206353 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132206399 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 132207090 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132207275 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132207383 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132207405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132207447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132207482 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132207521 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132207617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132207685 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132207748 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132207783 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132207965 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132208108 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132208110 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132208143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132208209 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132208276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132208342 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132208419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132208430 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132208488 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132208519 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132208533 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132208542 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132208619 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132208649 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132208799 T A Y N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 3 132208921 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132208929 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132208942 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132208957 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132208987 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132208988 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132209034 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132209079 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132209117 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132209118 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132209252 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132209329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132209345 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132209356 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132209394 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132209421 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132209432 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132209476 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132209547 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132209572 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132209610 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132209762 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132209765 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 132209914 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 132209922 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132210022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132210027 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132210045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132210101 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132210141 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132210191 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 132210328 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132210338 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132210424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132210660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132210729 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132210760 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132210913 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132210982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132211021 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132211058 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132211107 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132211131 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132211155 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132211166 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132211218 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 132211241 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132211307 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132211412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132211460 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132211470 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132211942 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 132211972 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 132212201 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132212225 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132212262 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 132212523 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 132212557 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 132212686 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 132212704 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 132212734 C A Y N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.333333333333333 0.6 0.0666666666666667 19 11 5 9 1 3 132212776 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 132212829 T A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 132212846 A G Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 3 132212848 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 3 132212880 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 132212907 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132212909 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 132212922 G C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 132212993 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 132213071 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 132213199 C T N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 3 132213207 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 132213707 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 132213728 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 132213797 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132213837 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 132213891 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132213893 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132214055 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132214198 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 132214226 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 132214476 C G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 132214527 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 132214601 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 132214622 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 132214762 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 132214860 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 132214865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132215026 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 132215081 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 132215484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132215500 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 132215576 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 3 132215652 C A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 132216654 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132217372 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 132217455 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 132217766 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 132217779 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 132217795 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 132217844 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 132217912 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 132217992 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 132218093 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.3 0.7 0 26 14 6 14 0 3 132218095 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.1 0.8 0.1 20 20 2 16 2 3 132218273 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132218289 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132218369 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 132218402 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 132218449 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 132218491 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 132218696 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132218797 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 132218808 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132218859 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132218864 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132219020 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 132219043 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 132219044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132219144 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132219178 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 132219215 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 132219366 T G Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 132219397 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 132219851 G A Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 132219914 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 132219961 A G Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 132220036 T A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 132220042 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 132220059 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 132220065 G C Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 132220071 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 132220079 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 132220394 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132220431 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 132220485 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 132220546 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 132220634 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 132220780 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 132220987 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 132221131 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 132221319 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 132221335 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 132221344 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 132221368 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132221409 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 132221536 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 132221551 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 132221625 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 132221655 C G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 132221663 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 132221670 C G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 132221750 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 132221812 A G Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 132221938 T C Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 132221983 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 132222026 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 132222049 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 132222054 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 132222083 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 132222099 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 132222101 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 132222137 C T Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 132222256 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 3 132222349 G A Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 132222353 G A Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 132222369 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 132222401 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 132222459 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 132222510 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 132222530 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 132222582 G A Y Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 12 12 3 6 3 3 132222624 C G Y N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.166666666666667 0.583333333333333 0.25 11 13 2 7 3 3 132222645 T C Y Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 9 9 2 5 2 3 132222646 G A Y Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.181818181818182 0.636363636363636 0.181818181818182 11 11 2 7 2 3 132222894 A C N N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 3 132222938 A T N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.384615384615385 0.538461538461538 0.0769230769230769 17 9 5 7 1 3 132222995 A C N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.384615384615385 0.538461538461538 0.0769230769230769 17 9 5 7 1 3 132223185 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 132223265 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 132223271 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 132223289 T A Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 132223347 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 132223489 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 132223525 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 132223549 G C Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 132223704 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 132223714 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 132223779 C A Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 132223834 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 132223867 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 132223868 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 132223904 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132223910 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132223916 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132223970 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132224001 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 132224053 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132224073 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 132224108 A G Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 132224128 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 132224258 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 132224333 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 132224489 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132224594 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 132224920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132225222 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 132226125 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132228855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132229330 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132229573 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132229888 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132229967 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132230055 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 132230786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132230903 C G Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 132231009 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132231027 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 132231073 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132231085 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.2 0.75 0.05 23 17 4 15 1 3 132231594 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 3 132231642 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.111111111111111 0.722222222222222 0.166666666666667 17 19 2 13 3 3 132231645 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.111111111111111 0.722222222222222 0.166666666666667 17 19 2 13 3 3 132233459 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 132233741 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132234610 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132234897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132234977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132235044 A G Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 132235134 A G Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 132235164 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132235411 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132235609 A G Y Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 3 132235656 G A Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 3 132236494 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132236619 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.15 0.75 0.1 21 19 3 15 2 3 132237336 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132237447 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.210526315789474 0.736842105263158 0.0526315789473684 22 16 4 14 1 3 132237529 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132238146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132238243 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 3 132238327 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 132238478 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 132238545 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 132238546 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 132238558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132238906 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 132240270 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 132240302 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 132240320 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132240702 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 132240759 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 3 132240798 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132240799 T G Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 132240883 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 132241018 T G Y N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.307692307692308 0.615384615384615 0.0769230769230769 16 10 4 8 1 3 132241042 T C Y Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 12 8 3 6 1 3 132241086 C T Y Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 12 12 3 6 3 3 132241096 C T Y Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.272727272727273 0.545454545454545 0.181818181818182 12 10 3 6 2 3 132241120 G T Y N 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.142857142857143 0.714285714285714 0.142857142857143 7 7 1 5 1 3 132241122 G T Y N 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.142857142857143 0.714285714285714 0.142857142857143 7 7 1 5 1 3 132241134 C G Y N 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.142857142857143 0.714285714285714 0.142857142857143 7 7 1 5 1 3 132241331 T C N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 7 9 1 5 2 3 132241697 T A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 132241814 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132241921 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 132241929 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 132241974 C G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 132242016 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 132242066 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 132242114 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 132242159 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 132242174 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 132242187 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 132242204 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 132242221 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 132242235 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 132242288 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 132242321 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 132242361 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 132242398 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 132242419 T A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 132242428 C A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 132242515 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 132242565 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 132242614 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 132242638 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 132242742 A T N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 3 132244262 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 132244274 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 132244319 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 132244366 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 3 132244371 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 132244408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132244450 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 132244456 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 132244490 A T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 132244554 A G Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 132244715 A T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 132244720 T A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 132245227 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 132245240 G T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 132245366 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 132245547 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 132245639 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132245853 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132245958 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 132246017 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 132246121 C T Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 132246313 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.2 0.733333333333333 0.0666666666666667 17 13 3 11 1 3 132246407 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.214285714285714 0.714285714285714 0.0714285714285714 16 12 3 10 1 3 132246857 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132246859 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 132246915 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132247032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132247121 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132247152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132247689 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 132248720 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.210526315789474 0.736842105263158 0.0526315789473684 22 16 4 14 1 3 132249037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132249163 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.2 0.75 0.05 23 17 4 15 1 3 132249173 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.2 0.75 0.05 23 17 4 15 1 3 132249358 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.2 0.75 0.05 23 17 4 15 1 3 132249425 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132249467 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.210526315789474 0.736842105263158 0.0526315789473684 22 16 4 14 1 3 132249936 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.2 0.75 0.05 23 17 4 15 1 3 132250001 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 132250195 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.2 0.75 0.05 23 17 4 15 1 3 132250293 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.2 0.75 0.05 23 17 4 15 1 3 132250306 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.2 0.75 0.05 23 17 4 15 1 3 132250348 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.2 0.75 0.05 23 17 4 15 1 3 132250380 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.157894736842105 0.789473684210526 0.0526315789473684 21 17 3 15 1 3 132250543 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132250562 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.2 0.75 0.05 23 17 4 15 1 3 132250818 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.157894736842105 0.789473684210526 0.0526315789473684 21 17 3 15 1 3 132250834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132250911 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132251019 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 3 132251081 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 132251246 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.210526315789474 0.736842105263158 0.0526315789473684 22 16 4 14 1 3 132251277 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 132251280 A T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 132251490 A G N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.214285714285714 0.714285714285714 0.0714285714285714 16 12 3 10 1 3 132251516 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.416666666666667 0.5 0.0833333333333333 16 8 5 6 1 3 132251791 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.2 0.75 0.05 23 17 4 15 1 3 132252169 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 132252679 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 132252685 C A Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 132252795 C T Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 132252859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132252969 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 132253070 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 132253248 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 132253317 A C Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 132253547 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 132253683 G A Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.0625 0.75 0.1875 14 18 1 12 3 3 132254112 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132254211 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132254369 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 132254396 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 132254456 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.1 0.7 0.2 18 22 2 14 4 3 132254547 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132254610 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 132254819 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 132254830 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 132254919 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 132254970 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132254982 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 132255041 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 132255081 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132255136 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132255189 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 132255456 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.1 0.7 0.2 18 22 2 14 4 3 132255614 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 132255632 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 132255713 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 132255985 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 132256015 G A Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 132256220 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 132256594 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132256677 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132256730 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132256759 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132256775 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132256887 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132256920 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132256929 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 132257037 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132257070 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 132257113 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 132257195 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132257210 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132257414 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132257606 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132258354 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 132258661 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132258793 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 132259363 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132259766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132259774 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132259984 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 132260332 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 132260414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132260708 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132261226 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132261257 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132261269 C A Y N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 132261284 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 132261504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132261617 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132261649 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132261829 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 132262424 G A Y Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 132262432 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 132262772 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 132263024 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 132263273 G A Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.117647058823529 0.705882352941177 0.176470588235294 16 18 2 12 3 3 132263286 T A Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 132263598 G T Y N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 132263926 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132264076 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 132264863 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132265952 A G Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 132265973 A G Y Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 132266931 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132267782 C G Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 132267822 T G Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 132267937 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 132268579 A T Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 132268949 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132269002 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132269012 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 132269065 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132269455 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132269984 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132270171 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132270609 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 132270754 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132270882 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132271028 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132271083 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132271551 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132271873 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132271998 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132272032 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132272063 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132272077 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132272168 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 132272486 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132272809 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 132272858 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132273034 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.05 0.7 0.25 16 24 1 14 5 3 132273139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132273164 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 132273167 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132273485 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 8 16 0 8 4 3 132273530 C T Y Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.0714285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 11 17 1 9 4 3 132274090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132274256 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 132274670 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132274836 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132274867 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132274939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132274990 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 132274991 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 132275029 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132275153 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132275401 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 132275412 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 132275442 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132275495 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132275855 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132276074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132276235 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 132276572 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132276581 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132276963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132277079 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132277187 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 132277416 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132280795 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132280858 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132280896 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132281510 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132281923 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 132281926 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132282082 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132282162 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132282252 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132282370 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 3 132282758 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 132283392 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132284486 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 132284513 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132285409 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132285767 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132286516 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 132290956 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 132290959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132290991 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 3 132291264 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132291320 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 132291395 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 132291615 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132291915 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 132291958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132291999 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132292045 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 132292068 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 132292175 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 132292311 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 132293879 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 132293918 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 132293992 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132294071 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132294238 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132294321 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132294478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132295561 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 132295659 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 132296149 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 132296571 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 132296808 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 132296965 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 132297024 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 132297074 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 132297317 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.2 0.75 0.05 23 17 4 15 1 3 132297445 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132297572 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 132298118 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 132298266 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 132298354 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132298357 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 132298422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132298452 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132298482 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132298494 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.05 0.75 0.2 17 23 1 15 4 3 132298528 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132298611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132298645 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 132298774 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132298796 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132299177 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 132299448 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132299514 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 132299607 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132299659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132299729 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 132299761 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 132299927 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 132300021 T A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0 0.647058823529412 0.352941176470588 11 23 0 11 6 3 132300195 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132300399 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132300473 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 132300477 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 132300560 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0 0.65 0.35 13 27 0 13 7 3 132300591 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132300893 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 132301013 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 132301080 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 132301082 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132301124 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132301133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132301142 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 132301329 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132301398 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 132301417 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132301493 T G Y N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 3 132301678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132301706 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 132301937 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132301967 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132302469 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132302486 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 132302561 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 132302728 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132302814 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132302999 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132303095 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 132303096 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 132303288 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132303332 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132303417 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132303498 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132303528 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 132303573 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132303583 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132303607 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132303611 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132303898 A C Y N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 132304079 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 132304181 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.05 0.85 0.1 19 21 1 17 2 3 132304406 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 132304487 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 132304519 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 132304589 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132304590 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 132304669 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 132304814 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 132304960 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132305014 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 132305052 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 3 132305123 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.0526315789473684 0.736842105263158 0.210526315789474 16 22 1 14 4 3 132305376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132305409 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 132305489 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 132305536 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 132305642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132305651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132305694 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 3 132305990 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132305992 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132306219 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132306235 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.05 0.75 0.2 17 23 1 15 4 3 132306259 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132306302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132306320 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.05 0.75 0.2 17 23 1 15 4 3 132306369 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132306386 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.05 0.75 0.2 17 23 1 15 4 3 132306464 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132306498 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132306504 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.05 0.75 0.2 17 23 1 15 4 3 132306767 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.0526315789473684 0.736842105263158 0.210526315789474 16 22 1 14 4 3 132306839 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132306886 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132307001 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 132307223 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 132307872 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132307972 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 132308101 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 132308326 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 132308340 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 132308368 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 132308577 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 132308923 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 132309029 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 132309041 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 132309094 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 132309301 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 132309360 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 132309466 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132309965 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 132310099 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0 0.789473684210526 0.210526315789474 15 23 0 15 4 3 132310125 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.05 0.75 0.2 17 23 1 15 4 3 132310291 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132310521 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 132310708 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.05 0.75 0.2 17 23 1 15 4 3 132310765 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.0526315789473684 0.736842105263158 0.210526315789474 16 22 1 14 4 3 132310844 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132311021 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.0588235294117647 0.705882352941177 0.235294117647059 14 20 1 12 4 3 132311094 A C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 132311141 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132311453 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132311854 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132313428 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 132313508 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132314588 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 132315153 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132319230 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 3 132321117 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 132322501 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 132323317 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132323508 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 132323698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132323721 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132324362 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132324505 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132325358 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 132325743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132326748 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132327374 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132329600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132329650 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.05 0.75 0.2 17 23 1 15 4 3 132329671 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132330024 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 132330155 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 132330802 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 132331079 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 132331193 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 132331280 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 132332602 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132333305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132333315 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132333645 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 132334220 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132336257 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132337372 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 132337405 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 132338402 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132340285 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 132340286 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 132340341 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 132341029 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132341493 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132341663 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 132341824 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 132344551 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 132344704 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132344926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132344953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132345756 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132347284 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 132347345 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 132347391 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132347465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132347473 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132347929 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 132347940 G C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 132348125 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132348147 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 3 132348831 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132349677 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132349727 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132350218 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 132350352 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 132350384 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 132350392 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 132350418 G C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 132350440 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 132350450 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 132350451 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 132350463 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 132350521 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132350525 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132350621 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132350644 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132350691 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132350695 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132350765 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 132350804 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132350843 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132350846 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132350858 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132350866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132350905 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 132350907 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132350921 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 132350933 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132350963 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132350973 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 132351008 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132351057 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132351138 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132351200 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132351272 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132351360 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132351391 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 132351397 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132351475 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 132351629 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132351652 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 132351668 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132351688 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132351699 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132351715 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132351727 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132351740 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132351745 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132351802 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 132351833 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 132351838 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 132351996 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132352080 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132352093 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 132352103 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132352201 A G Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 132352259 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 132352388 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 132352473 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132352479 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132352485 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132352668 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 3 132352690 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.0526315789473684 0.736842105263158 0.210526315789474 16 22 1 14 4 3 132352718 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132352726 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.0526315789473684 0.736842105263158 0.210526315789474 16 22 1 14 4 3 132352915 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132352925 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132352995 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 132352996 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 132353043 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132353269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132353278 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 132353579 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132353591 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132353630 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132354074 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 132354248 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132354483 T A Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 132354507 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132354584 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 132355479 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 132355765 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132355769 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132355776 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132355932 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 132356101 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132356463 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 132356679 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132356842 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132356884 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132356902 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132357157 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 132358106 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132358317 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132358486 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132358858 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132359440 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132359986 G A Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 3 132360003 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 132360270 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132360894 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132361349 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132361435 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.0526315789473684 0.736842105263158 0.210526315789474 16 22 1 14 4 3 132361436 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 132361517 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 132361635 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 132361719 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 132361814 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132361873 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132361911 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 132362235 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132362695 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 132362755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132362788 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 132362858 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132362952 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 132363011 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132363206 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132363473 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 132363503 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 132363528 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 132363571 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 132363630 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 132363796 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132364029 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 132364041 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 132364157 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 132364233 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 132364426 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132364427 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132364481 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 132365258 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 132366098 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 132366610 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132367413 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 132368525 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 132368612 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 132368643 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 3 132368675 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 132369278 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 132370473 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 132371810 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132371847 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 132373166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132373634 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132374747 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.210526315789474 0.736842105263158 0.0526315789473684 22 16 4 14 1 3 132375203 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132376431 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 132376577 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132378193 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132379047 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132379545 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 132381110 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 132381787 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132382845 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132383630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132384400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132385072 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132385389 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 132385496 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 132385704 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 132385848 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132386395 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 132386783 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132387328 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 132387573 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 132387955 T G Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 132387963 A C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 132388197 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.0526315789473684 0.789473684210526 0.157894736842105 17 21 1 15 3 3 132388474 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0 0.65 0.35 13 27 0 13 7 3 132388516 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 132388700 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.0526315789473684 0.736842105263158 0.210526315789474 16 22 1 14 4 3 132388811 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 132389155 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 10 22 0 10 6 3 132389166 T A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 132389199 C A N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 132389288 T A N N 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 3 132389313 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 132389496 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 132391034 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 132391072 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 132391232 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 132391265 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.05 0.75 0.2 17 23 1 15 4 3 132391365 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 132391430 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132391431 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132391544 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132391557 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132391598 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 132391675 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 132391676 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 3 132391776 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132391867 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132391905 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132391933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132392018 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132392073 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132392129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132392241 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132392470 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132392545 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132392580 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132392585 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132392665 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 132392765 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132392795 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 132392804 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132392813 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132392966 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 132393035 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132393057 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 132393233 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132393424 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 132393443 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 132393486 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132393490 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132393513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132393742 C T Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 132393764 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132393794 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132393815 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 132393962 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 132394072 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132394206 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 132394253 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 132394256 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 132394269 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 132394282 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 132394379 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 132394473 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132394529 T A Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 3 132394574 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132394641 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 132394665 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 132394685 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132394736 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132394792 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132394808 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132395177 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132395180 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 132395285 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 3 132395306 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 132395314 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 132395340 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 3 132395432 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 132395448 A T N N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 5 5 1 3 1 3 132395856 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132395869 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132395917 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.05 0.75 0.2 17 23 1 15 4 3 132396006 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 132396010 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 132396090 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 132396175 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 3 132396248 G T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 132396438 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 132396552 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132396583 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.0526315789473684 0.736842105263158 0.210526315789474 16 22 1 14 4 3 132396590 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132396672 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 3 132396771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132396825 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132396874 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.0526315789473684 0.736842105263158 0.210526315789474 16 22 1 14 4 3 132396912 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.05 0.75 0.2 17 23 1 15 4 3 132396916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132396938 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132396950 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.05 0.75 0.2 17 23 1 15 4 3 132397002 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.0555555555555556 0.777777777777778 0.166666666666667 16 20 1 14 3 3 132397187 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0833333333333333 0.666666666666667 0.25 10 14 1 8 3 3 132397256 T A N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.0625 0.8125 0.125 15 17 1 13 2 3 132397261 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.0555555555555556 0.833333333333333 0.111111111111111 17 19 1 15 2 3 132397421 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 132397427 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.0526315789473684 0.736842105263158 0.210526315789474 16 22 1 14 4 3 132397602 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132397619 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 132397690 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0 0.65 0.35 13 27 0 13 7 3 132397741 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.05 0.75 0.2 17 23 1 15 4 3 132397858 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.05 0.75 0.2 17 23 1 15 4 3 132398365 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 132398498 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132399141 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132399210 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132399674 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132399875 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 132400045 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 132400239 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 132401579 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 132401639 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 132402099 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132402347 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 132402407 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132402419 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132402448 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 132402647 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132402861 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 132402892 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132402939 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 132402953 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132402956 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 132402972 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 132403082 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132403181 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132403221 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132403906 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 132403918 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132403983 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132404023 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132404064 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132404117 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132404131 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132404329 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132404418 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132404428 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132404453 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132404487 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132404558 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132404580 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132404649 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132404738 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 132404799 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 132404894 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132405013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132405073 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132405074 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132405245 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132405254 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132405290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132405293 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 3 132405472 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 132405605 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132405664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132405810 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132406152 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132406236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132406259 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132406339 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 132406351 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 132406404 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132406447 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132406509 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132406672 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132406706 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 132406967 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132407046 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132407124 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 132407131 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132407226 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132407238 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132407253 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132407265 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 132407272 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132407389 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132407631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132408037 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 132408098 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 132408114 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 132408199 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 132408343 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.0526315789473684 0.736842105263158 0.210526315789474 16 22 1 14 4 3 132408406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132408464 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132408528 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132408588 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.0526315789473684 0.736842105263158 0.210526315789474 16 22 1 14 4 3 132408604 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.05 0.75 0.2 17 23 1 15 4 3 132408640 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132408780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132409150 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132409156 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132409369 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 132409410 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 3 132409509 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 132409611 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132409685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132409804 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.05 0.75 0.2 17 23 1 15 4 3 132409816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132409987 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132410091 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.05 0.75 0.2 17 23 1 15 4 3 132410099 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132410164 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 132410274 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132410399 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.0588235294117647 0.705882352941177 0.235294117647059 14 20 1 12 4 3 132410655 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132410686 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 132411169 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132411346 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 132411444 C T N Y 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 12 8 3 6 1 3 132411563 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 3 132411564 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 3 132411626 T G N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 3 132411678 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132411713 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 132411764 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132411777 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 132412055 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132412072 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132412117 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132412187 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132412306 C T N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.1 0.8 0.1 10 10 1 8 1 3 132412503 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132412596 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 132412645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132412665 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 132412881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132412997 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132413099 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132413178 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.0555555555555556 0.777777777777778 0.166666666666667 16 20 1 14 3 3 132413271 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132413294 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132413398 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132413450 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132413509 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.0526315789473684 0.736842105263158 0.210526315789474 16 22 1 14 4 3 132413581 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 132413743 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.0526315789473684 0.736842105263158 0.210526315789474 16 22 1 14 4 3 132413774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132413780 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 132413822 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132413843 T G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 132413913 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132413924 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.0526315789473684 0.736842105263158 0.210526315789474 16 22 1 14 4 3 132414071 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132414083 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132414153 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132414300 A C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 132414307 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 132414400 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 132414440 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 132414567 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 132414709 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132414733 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132414817 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132414838 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 132414843 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132414907 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132414932 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132415087 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 3 132415098 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132415199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132415233 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 132415307 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.105263157894737 0.736842105263158 0.157894736842105 18 20 2 14 3 3 132415314 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 132415341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132415372 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 132415383 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132415476 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 3 132415689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132415717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132415769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132416045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132416054 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132416059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132416228 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132416249 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132416315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132416338 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132416346 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132416357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132416433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132416471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132416480 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.05 0.75 0.2 17 23 1 15 4 3 132416500 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132416568 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132416629 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132416720 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132416765 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132416776 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.05 0.75 0.2 17 23 1 15 4 3 132416808 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132416869 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132416880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132416979 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132417027 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132417174 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 132417291 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 132417419 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 132417426 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 132417480 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 132417499 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132417577 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132417642 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132417656 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132417664 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132417737 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132417754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132417755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132417770 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132417774 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132417914 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0 0.789473684210526 0.210526315789474 15 23 0 15 4 3 132417917 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132418125 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132418160 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 132418171 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 132418180 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0 0.8125 0.1875 13 19 0 13 3 3 132418183 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.176470588235294 0.705882352941177 0.117647058823529 18 16 3 12 2 3 132418202 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 132418217 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 132418356 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 132418520 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 132418605 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 132418664 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 132418703 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 132418723 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 132418787 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132418824 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 132418841 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132419037 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132419103 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 132419123 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 132419399 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132419457 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 132419495 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 132419503 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132419596 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 132419665 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132420040 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.05 0.75 0.2 17 23 1 15 4 3 132420177 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132420400 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132420428 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132420525 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132420602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132420649 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 132420774 A G Y Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 9 7 1 7 0 3 132420775 T G Y N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 9 7 1 7 0 3 132420899 T C N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 132420900 C T N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 132420935 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 132420941 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 132421052 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 132421059 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 132421191 T A Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 132421316 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132421355 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 132421389 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 132421396 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132421429 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132421483 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 132421529 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132421602 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 132421875 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132422028 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.0526315789473684 0.736842105263158 0.210526315789474 16 22 1 14 4 3 132422037 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.05 0.75 0.2 17 23 1 15 4 3 132422086 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132422287 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 15 21 0 15 3 3 132422330 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 3 132422352 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132422451 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132422576 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132422681 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.05 0.75 0.2 17 23 1 15 4 3 132422779 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 132422790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132424178 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 3 132424263 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 3 132424270 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132424400 G T N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.0625 0.625 0.3125 12 20 1 10 5 3 132424465 G A N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.0769230769230769 0.692307692307692 0.230769230769231 11 15 1 9 3 3 132424473 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132424490 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 132424572 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 132424661 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 132424833 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 132424861 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132424962 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.0526315789473684 0.736842105263158 0.210526315789474 16 22 1 14 4 3 132425015 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 132425066 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 132425089 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132425097 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132425105 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132425139 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 132425375 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132425590 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 132425824 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132426029 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132426042 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 132426045 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 132426059 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 132426279 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 132426361 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132426369 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132426409 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132426433 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132426443 T G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 132426701 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 132426735 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132426764 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.0555555555555556 0.777777777777778 0.166666666666667 16 20 1 14 3 3 132426793 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132426814 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 132426828 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132426846 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 132426861 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132426966 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132427009 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 132427079 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 132427885 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 132428008 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 132428155 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132428417 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 132428956 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 132429193 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 132429487 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.05 0.75 0.2 17 23 1 15 4 3 132430108 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132430144 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 132430300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132430518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132430554 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 132430567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132430604 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 132430619 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 132430625 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 132431019 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 132431024 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 132431077 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 132431436 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 132431496 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 132431624 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132431670 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 132431743 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 132431818 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 132431859 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 132431897 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 132432041 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 132432051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132432262 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 132432286 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 132432311 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132432449 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.05 0.75 0.2 17 23 1 15 4 3 132432457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132432497 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 3 132432530 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132432587 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 132432807 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 132432877 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 132433165 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 132433333 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 132433342 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 132433431 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 132433449 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 132433618 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 132433669 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 132433670 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 132433702 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132433831 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 132433952 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132433984 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 132434293 C T N Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.2 0.8 0 6 4 1 4 0 3 132434428 A G N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 3 132434476 T G N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 3 132434492 A G Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 132434546 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 132434563 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 132434738 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132435091 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 132435397 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 3 132435514 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 132435603 T A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 132435816 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 132435860 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 132435912 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 132435968 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132435979 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 132436008 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 132436132 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 132436210 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 132436234 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 132436240 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 132436263 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 132436730 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132436742 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 132436764 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132436826 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 132437004 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132437025 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 132437058 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 132437124 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132437224 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132437369 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 132437467 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132437482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132437499 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 132438022 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 132438255 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 132438299 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 132438411 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132438504 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132439005 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132439044 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 132439129 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 132439270 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 132439378 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132439387 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 132439635 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 132439685 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132440817 T G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 132441293 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 132441432 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 132441499 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 132441659 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 132441850 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 132442675 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 3 132443093 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 3 132444151 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132444630 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132444693 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132444715 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.157894736842105 0.736842105263158 0.105263157894737 20 18 3 14 2 3 132445211 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 132445461 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132445770 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132446438 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132446467 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132446769 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 3 132446990 A C N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 3 132447080 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 3 132447118 A G N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 10 10 2 6 2 3 132447537 T G N N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0.2 0 0.8 2 8 1 0 4 3 132447567 T C N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 3 132447677 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 132447821 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 132448015 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 132448123 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 132448238 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 132448257 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 3 132448356 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 132448398 T C N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 3 132448407 T C N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 3 132448449 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 132448506 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 132448839 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 132448855 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 132448864 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 132448967 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 3 132449391 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132449955 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 132450059 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132450067 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132450140 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 3 132450176 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132450278 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.0588235294117647 0.705882352941177 0.235294117647059 14 20 1 12 4 3 132450356 A T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 132450721 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 132450777 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 132450800 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132450885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132450930 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 3 132450948 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 3 132451246 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 132451292 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 132451300 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 132451322 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 132451351 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 132451360 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 132451434 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132451452 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132451554 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 132451875 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 132452122 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 3 132452138 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 132452154 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 3 132452174 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 132452292 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 3 132452378 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 132452395 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 132452482 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 3 132452620 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132452643 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132452781 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 132452853 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 132452971 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 132452986 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 132453112 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 132453338 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 132453373 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 132453404 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 132453547 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 132453828 T G N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 132453850 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 132453871 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 132454078 C G N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 3 132454165 C G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 132454246 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132454247 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 132454263 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 132454335 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 132454469 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 132454474 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 132454573 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132454738 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 132454755 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 132454785 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 132454789 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 132454835 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132454862 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 132455072 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 132455229 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 132455337 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 132455542 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 132455803 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132455823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132455831 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 132455854 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132455883 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 132456009 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132456045 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 132456059 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 132456124 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132456261 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132456569 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 132456751 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 132456999 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.25 0.7 0.05 24 16 5 14 1 3 132457051 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 132458420 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 132458549 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132458895 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 132459032 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132459197 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132459366 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132459606 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132460296 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132460432 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132460548 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 3 132460647 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 132461834 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 3 132461933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132461970 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 132462964 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 3 132462982 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 132463036 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 132463086 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132463185 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 3 132463218 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 132463315 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 132463350 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 3 132464689 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.05 0.7 0.25 16 24 1 14 5 3 132464847 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.05 0.7 0.25 16 24 1 14 5 3 132464859 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132465092 A C N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.0625 0.625 0.3125 12 20 1 10 5 3 132465119 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 132465588 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.166666666666667 0.722222222222222 0.111111111111111 19 17 3 13 2 3 132465590 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.166666666666667 0.722222222222222 0.111111111111111 19 17 3 13 2 3 132465627 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 3 132465825 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 132465860 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 132465908 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 3 132466045 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 132466202 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 3 132466225 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.111111111111111 0.722222222222222 0.166666666666667 17 19 2 13 3 3 132466377 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 3 132466483 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 3 132466492 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 3 132466520 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 132466601 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 132466891 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.176470588235294 0.705882352941177 0.117647058823529 18 16 3 12 2 3 132466900 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.166666666666667 0.722222222222222 0.111111111111111 19 17 3 13 2 3 132466903 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.166666666666667 0.722222222222222 0.111111111111111 19 17 3 13 2 3 132466952 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 3 132467017 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 3 132467022 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 3 132467097 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 3 132467423 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 132467492 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 132467619 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132467642 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 3 132467974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132468155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132468372 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.15 0.75 0.1 21 19 3 15 2 3 132468707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132469138 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132469676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132469828 G C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 132469906 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 132470048 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 132470061 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.105263157894737 0.736842105263158 0.157894736842105 18 20 2 14 3 3 132470074 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132470115 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 3 132470266 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.1 0.75 0.15 19 21 2 15 3 3 132470292 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.1 0.75 0.15 19 21 2 15 3 3 132470383 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 132470438 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 132470545 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 132470577 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 132470675 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 132470693 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132470742 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 132470768 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 132471309 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 132471554 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.0625 0.9375 0 17 15 1 15 0 3 132471633 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 3 132471645 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 3 132471679 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 3 132471694 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 3 132471716 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 3 132471723 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 3 132471765 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 3 132471800 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132471817 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132471852 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132471872 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 3 132471933 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 132471943 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 3 132472064 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 3 132472097 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132472740 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 3 132472943 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132473349 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 132473378 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 3 132473460 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 132473535 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132473620 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132473653 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132473745 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 132473779 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 132473956 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 3 132474094 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 132474232 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 132474253 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 132474352 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 132474400 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 132474403 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 132474495 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132474528 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 132474735 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 132474811 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 132474872 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 132475038 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 132475051 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 132475194 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 132475365 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132475608 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132476354 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 132476379 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 132476399 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 132476413 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132476515 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 132476691 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 132476907 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132477264 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 132477471 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 132477964 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132478220 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132478286 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132478518 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 3 132478543 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 132478545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132478634 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132478867 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 3 132478990 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132479158 C T N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 3 132479410 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 132479816 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 132481079 C T N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 132481087 C T N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 132481512 A G N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.181818181818182 0.636363636363636 0.181818181818182 11 11 2 7 2 3 132481608 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 3 132481821 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.117647058823529 0.764705882352941 0.117647058823529 17 17 2 13 2 3 132482753 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.111111111111111 0.722222222222222 0.166666666666667 17 19 2 13 3 3 132482773 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0 0.705882352941177 0.294117647058824 12 22 0 12 5 3 132482791 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132483380 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.1 0.75 0.15 19 21 2 15 3 3 132483631 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132483787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132483930 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 132493587 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132493723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132494262 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.15 0.7 0.15 20 20 3 14 3 3 132494448 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.157894736842105 0.684210526315789 0.157894736842105 19 19 3 13 3 3 132494693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132494999 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132495023 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 132495118 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.235294117647059 0.705882352941177 0.0588235294117647 20 14 4 12 1 3 132495145 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 132495152 A G Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 132495361 A G Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 3 132495390 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.25 0.7 0.05 24 16 5 14 1 3 132495818 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 132495852 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 132495917 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 132496133 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 132496323 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132496442 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132496457 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 132496519 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 132496554 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132496567 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 132496592 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 3 132496677 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 132496690 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132496714 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 3 132496813 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 132497038 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 132497170 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 132498240 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132498391 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 132498617 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 132499098 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132499265 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.05 0.7 0.25 16 24 1 14 5 3 132499566 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 132500335 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132500614 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132501285 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 132501310 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 132501346 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 132501925 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 132501998 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 132502083 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 132502134 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 132502149 T A N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 132502166 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 132502276 G A Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 132502291 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 132502311 C A N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 132502318 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 132502328 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 132502369 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 3 132502423 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 3 132502439 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 132502440 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 132502500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132502504 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 132502534 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 132502567 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 132502579 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 132502590 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 132502617 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 132502686 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 132502708 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 132502709 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 132502768 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 132503051 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132503262 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 132503289 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 132503307 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 132503346 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 132503370 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 132503474 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 132503599 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 132503653 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 3 132503691 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 132503839 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 132503888 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 132503892 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 132503933 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 132503948 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 132503980 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 132504028 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 132504063 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 132504227 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 132504263 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132504288 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 132504825 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132504957 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 132505190 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 132505197 T A N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 3 132505540 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 132505811 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 132505978 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132506078 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 3 132506250 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132506600 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132506738 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 3 132507247 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 132507350 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 132507501 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 132507507 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 132507518 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 132507569 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132508057 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 132508058 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 132508374 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 132508410 C A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132509073 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 132509243 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 132509822 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 132509894 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 132510275 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 132510332 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132510577 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 132510628 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 132511051 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132511068 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132511156 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 132511344 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132511526 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 132511548 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 132511769 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 132511804 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 14 18 0 14 2 3 132511845 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 132511851 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132511897 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132511937 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 132511980 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132511991 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 132511995 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132512038 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 132512075 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 132512290 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.05 0.7 0.25 16 24 1 14 5 3 132512744 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 132512779 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 132512814 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132512942 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132512975 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 132513018 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 132513053 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 132513081 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 3 132513100 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 132513143 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132513238 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132513400 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 132513882 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 132513922 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132514031 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 132514117 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 132514261 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 132514891 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132515263 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 132516553 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132516597 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 132516617 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132516902 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 132516998 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 132517014 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 132517015 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 132517029 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 132517116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132518004 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.1 0.8 0.1 20 20 2 16 2 3 132518045 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 132518090 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 132518091 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 132518335 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 132518367 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 3 132518716 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 132518720 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 132518988 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 3 132519007 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 132519169 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0833333333333333 0.666666666666667 0.25 10 14 1 8 3 3 132519263 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.1 0.75 0.15 19 21 2 15 3 3 132519285 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.1 0.75 0.15 19 21 2 15 3 3 132519455 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 3 132519518 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 3 132519659 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 132519931 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 132519946 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 132519949 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 132520033 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 132520118 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 132520213 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 132520622 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 132520662 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 132520746 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132520809 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 132520981 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 132521063 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 132521073 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 132521257 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 132521316 A G Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 132521532 C T N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 3 132521544 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 132521587 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132522335 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 132522381 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 132522769 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 132522784 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 132522871 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 132522904 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 132523152 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 132523316 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 3 132523709 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132523864 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 132523867 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132523931 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 132523987 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 132524182 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 132524342 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 132524343 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 132524626 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132524880 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 132525049 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.15 0.75 0.1 21 19 3 15 2 3 132525066 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 132525357 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.15 0.75 0.1 21 19 3 15 2 3 132525398 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 132525411 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 132525433 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.1 0.75 0.15 19 21 2 15 3 3 132525520 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 132525522 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 132525534 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 132525560 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 132525567 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 132525654 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 132525704 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 132525833 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 132525852 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.157894736842105 0.736842105263158 0.105263157894737 20 18 3 14 2 3 132525873 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 132525921 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 132525968 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132525987 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 132526102 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 132526546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132526574 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132526693 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 132526701 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 132527473 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132528031 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132528105 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132528461 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132528610 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132528678 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132528694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132528726 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 132529930 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132530707 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 132530999 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132531263 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 132531446 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132531629 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132531659 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132531729 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 132531741 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 132531873 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132531899 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132531964 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 132532021 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 132532397 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 132532589 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 132532629 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132532736 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.2 0.75 0.05 23 17 4 15 1 3 132532905 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132533460 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 132533512 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 132533513 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 132533624 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 132533696 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 132533700 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132533731 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132533744 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132533845 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132533891 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132534347 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132534365 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 132534455 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 132534743 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.05 0.7 0.25 16 24 1 14 5 3 132534762 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132534832 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132534985 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132535059 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132535209 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 132535618 C G N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 3 132535624 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 3 132535646 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 3 132535650 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.133333333333333 0.666666666666667 0.2 14 16 2 10 3 3 132535803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132535957 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.05 0.75 0.2 17 23 1 15 4 3 132535977 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.05 0.75 0.2 17 23 1 15 4 3 132536081 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.05 0.7 0.25 16 24 1 14 5 3 132536135 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 132536136 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 132537412 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132537544 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132537680 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132537697 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132537709 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132538198 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132538691 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132538715 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132538716 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132539156 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.2 0.75 0.05 23 17 4 15 1 3 132539249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132539368 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.15 0.8 0.05 22 18 3 16 1 3 132539564 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132540736 G A N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 132540953 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 132541044 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 132541069 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 132541335 T A N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 132541438 A T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 132541466 G A Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 132541478 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 132541597 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 132541706 C G N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.428571428571429 0.142857142857143 0.428571428571429 14 14 6 2 6 3 132541722 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 132541777 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 132541789 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 132541820 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 132541993 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 132542198 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 132542230 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 132542383 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132542643 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132542669 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 132542791 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132542844 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132543134 C A Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 132543210 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 132543219 T A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 132543589 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 132543638 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132543775 C G Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 132543821 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132543900 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 132544022 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132544497 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 132544582 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 132544710 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 132544864 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 132545019 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 132545162 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 3 132545458 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.0526315789473684 0.736842105263158 0.210526315789474 16 22 1 14 4 3 132545947 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 132546153 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 132546198 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132546401 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132547156 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132548367 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132548910 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132549130 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132549642 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132549807 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132549974 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 132550038 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 132550129 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 132550281 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132550282 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 132550397 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 132550909 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 132550986 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132551127 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 132551178 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132551412 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 132553628 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 132554585 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132555015 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.05 0.75 0.2 17 23 1 15 4 3 132555024 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 132555067 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 132555228 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 132555240 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 132555330 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 132555446 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 132555596 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 132555622 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 132555696 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 132555733 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 132555748 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 132555844 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132555898 T A Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 132556168 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132556231 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132556385 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 3 132556546 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132556581 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.210526315789474 0.736842105263158 0.0526315789473684 22 16 4 14 1 3 132556585 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 132556592 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 132556775 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.2 0.75 0.05 23 17 4 15 1 3 132556955 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 132556957 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 132557028 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.05 0.75 0.2 17 23 1 15 4 3 132557092 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.15 0.8 0.05 22 18 3 16 1 3 132557263 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132557264 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132557486 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132557531 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.05 0.75 0.2 17 23 1 15 4 3 132557776 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0 0.764705882352941 0.235294117647059 13 21 0 13 4 3 132557788 T A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.0588235294117647 0.705882352941177 0.235294117647059 14 20 1 12 4 3 132558437 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 132558726 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 132558740 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 132558857 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132558915 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132559014 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.25 0.7 0.05 24 16 5 14 1 3 132559201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132559318 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132559332 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132559424 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 132559496 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132559811 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132560067 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132560629 A T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 132560812 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132561107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132561390 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 132561460 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.05 0.8 0.15 18 22 1 16 3 3 132561516 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132561541 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132561560 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.0526315789473684 0.789473684210526 0.157894736842105 17 21 1 15 3 3 132561794 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132561881 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132562098 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.1875 0.6875 0.125 17 15 3 11 2 3 132562267 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 18 14 4 10 2 3 132562271 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132562280 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132562414 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.333333333333333 0.6 0.0666666666666667 19 11 5 9 1 3 132562512 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 132562575 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132562585 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.2 0.75 0.05 23 17 4 15 1 3 132562774 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132562790 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 132562895 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132562896 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132562983 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 132563068 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.0526315789473684 0.789473684210526 0.157894736842105 17 21 1 15 3 3 132563132 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132563180 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132563211 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 132563229 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 132563234 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 3 132563264 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 132563397 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.2 0.75 0.05 23 17 4 15 1 3 132563476 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132563557 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132563576 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132563637 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 132563867 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 132563868 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 132563900 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132563901 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132563973 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132563984 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.05 0.7 0.25 16 24 1 14 5 3 132563989 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 132564011 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132564017 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 132564036 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132564058 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132564488 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.25 0.7 0.05 24 16 5 14 1 3 132564516 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132564553 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 132564895 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 3 132564945 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132565104 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132565365 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 132565382 G C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 132565457 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 3 132565522 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 132565938 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132565964 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132566070 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 3 132566083 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132566107 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132566204 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 132566295 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 132566677 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 132566924 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132566944 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132567217 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132567249 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132567251 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 3 132567292 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 132567304 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.05 0.7 0.25 16 24 1 14 5 3 132567352 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 132567385 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 132567432 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132567463 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132567590 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132567598 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132567614 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132567752 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 132568224 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 132569249 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 132569962 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 132570021 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 132570059 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 132570077 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132570234 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 3 132570523 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132570719 C A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 132571828 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132571850 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 132572058 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.125 0.8125 0.0625 17 15 2 13 1 3 132572086 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 132572676 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132572730 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132573020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132573021 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132573147 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132574172 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 132574433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132574803 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 132575615 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132575616 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 3 132576074 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 132576726 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 132577036 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132577043 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132577327 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132577674 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 132577707 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 132577728 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132577731 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132578448 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 132578513 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 132578538 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 132578693 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 3 132578706 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.263157894736842 0.684210526315789 0.0526315789473684 23 15 5 13 1 3 132578797 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132578906 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132578959 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 132579078 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 132579292 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 132579312 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 132579334 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 132579408 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 132579417 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132579707 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132579810 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132580722 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 132580772 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132581691 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 132581748 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 132582054 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 132582171 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132582527 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 3 132582584 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.0526315789473684 0.789473684210526 0.157894736842105 17 21 1 15 3 3 132582832 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.05 0.85 0.1 19 21 1 17 2 3 132582970 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 132583103 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 132583108 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 22 18 4 14 2 3 132583208 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 132583280 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132583350 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132583501 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 132583677 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 132583798 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132583824 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 132583842 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 3 132583951 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132583958 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 132584428 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132584656 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 132585087 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132585135 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 132585292 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132585652 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 132585721 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 132585891 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 132586207 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132587046 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132587092 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132587122 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132587131 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132587143 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132587327 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 132587472 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132587692 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132589106 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 132590784 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 132591185 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 132591233 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132591310 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 132591647 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132591799 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 132591877 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 132591887 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 132591919 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 132591976 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 132592597 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 132592663 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 132592751 T A Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.1 0.7 0.2 18 22 2 14 4 3 132592791 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 132592829 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132592878 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 132592960 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 132592988 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 132593337 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132593353 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 132593387 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 132593489 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 132593529 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132593588 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 132593628 G C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 3 132593629 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 3 132593825 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.235294117647059 0.705882352941177 0.0588235294117647 20 14 4 12 1 3 132593894 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 132593932 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132593947 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 132594040 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 132594148 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.235294117647059 0.705882352941177 0.0588235294117647 20 14 4 12 1 3 132594247 A T Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.105263157894737 0.736842105263158 0.157894736842105 18 20 2 14 3 3 132594932 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132594937 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132595031 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132595190 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 132595225 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 132595346 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 132595380 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132595412 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132595690 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 132595885 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 132595955 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 132595979 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.3 0.65 0.05 25 15 6 13 1 3 132596014 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 132596340 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 132596389 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132596416 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132596880 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 132596883 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 132597004 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 132597063 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 132597593 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 132597932 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 132598090 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132598093 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 132598239 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 132598375 T C Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 3 132598474 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 132598593 G C Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 132598659 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 132599032 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 132599320 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 132599600 C T Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.1875 0.6875 0.125 17 15 3 11 2 3 132599653 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 132599660 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 132599733 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 132599967 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 132600086 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 132600096 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 132600183 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 132600207 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 132600832 T A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 132600982 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.117647058823529 0.705882352941177 0.176470588235294 16 18 2 12 3 3 132601017 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132601514 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 132601533 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 132601668 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 132601849 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 132601915 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 132602743 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.266666666666667 0.2 0.533333333333333 11 19 4 3 8 3 132602824 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 132602888 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 132602979 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 132603248 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 132603313 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 132603395 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.266666666666667 0.133333333333333 0.6 10 20 4 2 9 3 132603863 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 132604096 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132604097 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132604198 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132604260 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 132604313 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132604369 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132604379 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132605625 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 132605799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132605988 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 132606126 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 132606518 A C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 132606686 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 132606698 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132607241 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 132607242 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 132607278 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 132607666 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 132607967 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132608602 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 132608866 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 132608949 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132608963 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132608987 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132609554 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132609640 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132609697 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 132609707 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132609755 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132609815 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132609825 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132609865 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132609877 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132609895 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 132609936 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132609955 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 132610064 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132610631 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 132610728 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132610785 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132610929 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 132610987 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132612227 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132612601 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 132612730 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132613553 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132613918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132614685 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132614688 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132614952 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 132615969 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 132617608 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.133333333333333 0 0.866666666666667 4 26 2 0 13 3 132618876 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 132619213 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132620716 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132620982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132621499 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 132621545 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 132621832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132621958 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 132621990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132622172 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132622585 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132622734 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132622748 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132622890 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 132623012 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 132623077 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132623148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132623303 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132623595 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 132623799 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 132623808 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 132623927 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 132624386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132624473 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132625032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132625316 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 132626478 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132626915 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132627183 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132627418 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132628166 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 132628238 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132628240 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132628252 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132628614 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 132628651 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132628661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132628674 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132628680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132629076 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132629395 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132629411 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 132629547 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132629602 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 132629704 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132630124 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 132630152 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132630179 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 132630332 T G Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 132630336 C T Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 132630467 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 132630489 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132630552 C A Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 132630581 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 132630583 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132630609 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 132630642 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 132630676 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 132630694 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 132630742 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 132630791 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 132630799 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132630805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132631046 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132631182 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132631204 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132631251 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132631254 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 132631339 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132631501 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132631591 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132631682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132631792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132631822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132631823 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 132632133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132632179 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 132632200 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 132632328 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132632373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132632410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132632412 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132632435 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 132632486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132632553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132632555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132632586 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132632597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132632629 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 132632673 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132632686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132632722 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 132632806 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 132632812 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132632863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132632905 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132632927 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132633013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132633063 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132633187 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 132633227 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 132633247 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132633519 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 132633682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132633982 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 132634114 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 132634186 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132634207 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132634208 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132636489 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132637085 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 132637224 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132638846 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 132638859 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 132639075 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 132639216 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 132640466 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 132640494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132640513 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132640586 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 132640909 A T N N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 3 132641128 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 132641283 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132641297 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 132641576 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 132641589 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 132641595 A G N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.307692307692308 0.615384615384615 0.0769230769230769 16 10 4 8 1 3 132641612 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.416666666666667 0.5 0.0833333333333333 16 8 5 6 1 3 132641627 A G N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.307692307692308 0.615384615384615 0.0769230769230769 16 10 4 8 1 3 132641698 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 132641705 G C N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 3 132641718 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 132641741 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 132641759 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 132641816 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 132641817 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 132642024 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 132642030 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 132642086 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 132642133 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 132642170 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 132642171 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 132642182 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 132642189 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 132642218 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 132642253 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 132642254 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 132642626 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 132642790 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 132642900 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 132642921 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 132643174 G T Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 132644069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132644627 A C N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 132644698 C T N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 3 132645605 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132645670 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132645750 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 132645810 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132645979 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 132645980 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 132646550 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132647241 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 132648059 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 132648197 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 132648322 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 132648961 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 132648966 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 132649154 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 132649316 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 132649318 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 132649355 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 132649521 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 132649617 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 132649794 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 132650061 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 132650080 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 132650328 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 132650329 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 132650360 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 132650426 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132650480 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 132650563 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 132650572 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 132650825 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 3 132650859 C A N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 12 16 2 8 4 3 132650939 A T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 132650945 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 132650999 G A N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 3 132651224 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132651240 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 132651259 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 132651309 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 132651335 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 132651477 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 132651528 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 132651535 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 132651540 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 132651642 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 132651803 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 132652302 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132652371 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 132652420 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 132657464 G A Y Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 3 132657553 C A Y N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 3 132658085 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 132658277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132658519 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 132659349 G C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 132659690 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 132659752 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 132659768 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 132659777 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 132659927 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 132659944 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 132659985 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 132660085 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 132660119 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 132660204 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 132660236 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 132660283 A T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 132660374 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 132660525 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132660602 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 3 132660702 G C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 132660731 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 132660916 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 132661619 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 132661621 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 132661674 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 132661745 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 132661977 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 132662753 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 132662792 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 132663252 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 132663341 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 132663361 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 132663613 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 132663618 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 132663783 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 132663923 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 132664365 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 132664481 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 132664778 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 132664899 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 132665042 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 132665403 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 132665631 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 132665745 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 132665924 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 132666169 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 132666832 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132666926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132667017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132667446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132667450 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 132667577 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 132668197 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132668718 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132668765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132668800 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132668912 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 132669002 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132669092 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132669140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132669267 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132669303 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132669354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132669392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132669414 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132669468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132669481 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132669482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132669500 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132669568 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132669586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132669600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132669639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132669649 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132669750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132669764 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132669842 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132669855 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 132670022 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132670149 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132670187 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132670191 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 132670285 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132670309 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132670339 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132670348 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132670400 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 132670486 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 132670583 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132670611 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132670618 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132670697 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132671097 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 132671115 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132671165 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132671186 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132671198 G C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 132671277 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132671318 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132671323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132671535 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 132671628 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132671718 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132671727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132671905 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 132671918 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 132672021 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132672052 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132672167 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132672279 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132672322 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 132672519 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132672601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132672741 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132672893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132672914 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 132673240 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 132673302 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 132673350 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 132673413 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132673433 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132673469 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 132673878 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 132673882 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 132674086 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132674318 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132674653 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132675185 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132675717 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132676488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132678076 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132678103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132678633 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 132680102 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132680782 A C Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 132681009 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 3 132682851 T G Y N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 3 132684691 T C Y Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 3 132685016 G T Y N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 132685030 T C Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 132686499 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132687321 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 132687437 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 132689711 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 132691075 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132693096 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 132694266 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132695787 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132696339 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 132696965 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132697483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132699827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132700899 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 132701285 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 132702532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132702607 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 132705820 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 132707860 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132708939 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132708940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132709275 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132710048 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132710864 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 132710865 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132711010 G C Y N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 132711276 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132712669 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132712895 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132713103 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 132713710 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 132713825 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132713888 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 132713907 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 132714097 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132714576 A T N N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 2 10 1 0 5 3 132715807 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 132715939 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132716132 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 132716353 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 132717640 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 132717642 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132717898 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 132718494 T C Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 132718560 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 132718593 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 132719007 A G N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 3 132720067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132720170 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 132720202 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 132721654 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 132721910 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 132722077 C G N N 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 3 132723067 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 132723647 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 132724097 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 132724548 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 132724733 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 132726026 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132726177 T A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 132726237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132734348 A C Y N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 132734832 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 132735268 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132736135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132737882 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132738166 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 132738566 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 132740931 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132741717 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 132741735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132743295 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 132748462 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132748698 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132748753 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 132749620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132750858 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 132751011 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132753562 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 132753869 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 132753956 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132754141 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132754321 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 132755002 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 132756085 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132756100 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132758328 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132759102 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132759234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132759305 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132759632 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132760297 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132763992 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132765588 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132766714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132770285 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132770340 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132770733 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132771083 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132771095 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132772937 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132773127 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132773176 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132773215 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132774347 C T N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 3 132774789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132774812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132774850 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132777785 C A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 132778241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132780112 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 132782362 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132782454 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132782564 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132783797 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 132784007 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132784538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132784597 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132784649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132784790 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132784918 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132794886 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132795596 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132795640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132795646 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132795894 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132796451 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 132796989 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 132798209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132799101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132800170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132800231 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132800858 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132802750 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 132802763 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 132802771 G C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 132802775 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 132802889 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132803283 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132804606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132804784 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132804888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132804934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132805106 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 132805289 C G Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 132805839 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132805913 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132806078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132806261 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 132806306 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132806868 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 132808473 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132808510 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 132808561 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 132808645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132808666 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132808793 A T N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 132808815 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132808933 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132808945 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132809079 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132809086 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132809093 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132809191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132809208 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 132809658 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132809668 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132809678 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132809679 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132809692 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132809733 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132809774 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 132810050 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 132810729 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 132810752 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 132810774 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 132810850 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132810911 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 132811013 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 132811066 A G Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 132811429 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132811469 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 132811969 T C Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 132812013 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 132812299 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 132812315 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 132812334 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 132812401 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 132812472 C T N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 8 12 3 2 5 3 132813077 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 132813078 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132813235 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 3 132813484 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 132813515 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 3 132813650 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 132814065 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 132814283 C A N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 3 132814356 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 132815319 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 132815604 A T N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 3 132815839 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132815844 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132815857 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 132815904 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132815926 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 132815927 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 132816006 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 132816044 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132816148 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 132816173 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 132816237 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132816390 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 132816494 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 132816581 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132816615 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132816632 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132817429 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132818159 G C Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 132818274 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132818546 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132819230 T A N N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 3 132819350 T C N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 3 132819441 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 3 132819998 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132820038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132820373 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 132823002 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 132823982 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 132823983 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 132824004 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 132824027 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 132824058 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 132824501 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 132824609 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132824870 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 132824962 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 132825523 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 132825933 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 132826067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132826601 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132826669 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 132826689 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132826731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132827468 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 132827510 C A Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 132829308 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132830360 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132831436 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132832693 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132832874 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132833053 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132833237 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132833241 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 132833458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132835114 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132836319 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132839528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132839619 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132839634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132840727 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132840748 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132843150 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132843614 A T N N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.384615384615385 0.307692307692308 0.307692307692308 14 12 5 4 4 3 132844043 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 132844103 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132844226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132844257 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132844362 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132844450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132844973 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132845507 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 132846580 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132847082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132848827 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132849071 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 132851059 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132851114 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132851881 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 132852226 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 132852234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132853019 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132853392 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 132853932 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132854054 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132856203 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132856901 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 132858785 G T Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 132858893 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132867938 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132869003 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132869146 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132870282 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132871849 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 132873130 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 132873392 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 132874576 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 132876758 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132877639 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132878146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132878554 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132879774 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132879933 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132880266 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 132880819 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 132881786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132884295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132884992 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132885611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132885982 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 132886024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132886060 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 132886090 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132886143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132886366 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 132886550 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132886623 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132886691 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 132886702 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 132886733 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 132887032 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 132887058 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 132887062 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 132887274 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132887417 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132887505 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 132887603 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 132887702 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 132888402 G C N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.538461538461538 0.153846153846154 0.307692307692308 16 10 7 2 4 3 132888435 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 132889031 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 132889124 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132889584 G A N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.428571428571429 0.214285714285714 0.357142857142857 15 13 6 3 5 3 132890361 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 132890759 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132891279 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132891544 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132892116 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 132893287 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 132893455 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 132893737 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132893854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132893890 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132893902 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132894403 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132894441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132894525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132894575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132895571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132895845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132898243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132899191 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 132899408 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 132899441 A C N N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 3 132899951 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132900709 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132901660 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132902955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132903407 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 132904695 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 132904712 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132904735 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 132904741 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 132905487 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 132905791 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132905872 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 132907024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132907061 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 132907108 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 132907118 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132907520 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 132907818 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132908119 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132908829 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132909289 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 132909312 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 132909409 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 132909481 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 132909497 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 132909701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132909713 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132909936 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132909976 T A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 132910116 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132910120 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132910590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132910656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132910658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132910851 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 132911419 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132911440 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132911805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132915958 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132915972 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132916033 T C Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 132916115 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132916130 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132916157 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132916653 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 132916675 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132916928 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132916937 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132916960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132917247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132917477 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132917663 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132917684 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132917709 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132917711 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132917724 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132917732 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132917807 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132918138 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 132918335 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132918786 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132918852 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132919572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132919692 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132919830 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132920238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132920422 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132920641 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132920777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132920884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132921349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132922300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132922750 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132922792 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 132923169 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 132923323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132923328 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132923440 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132923609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132924123 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132926174 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132926647 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132926816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132927321 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132927493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132932760 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 132933032 A G Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 132933410 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 132933921 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132934481 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132934522 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 132935820 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 132937924 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132938204 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132938561 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 132938613 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132938698 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 132938803 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 132938875 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 132938913 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132938924 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132939113 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 132939166 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 132939178 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 132939207 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 132939245 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132939422 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132939689 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 132940068 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 132940152 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132940225 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132940375 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 132940471 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 132940516 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 132940542 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132940941 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 132941040 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132941087 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132941238 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132941297 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132941348 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132941356 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132941531 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132941547 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 132941549 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132941578 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 132941633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132941670 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132941691 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132942050 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132942103 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132942260 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 132942261 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132942481 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 132942539 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 132942746 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132942768 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132942786 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132943071 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132943925 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132945241 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 132945332 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 132945859 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 132945878 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 132946140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132946157 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 132946321 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132946494 A G N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.384615384615385 0.230769230769231 0.384615384615385 13 13 5 3 5 3 132946805 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 3 132946829 T C N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 7 9 2 3 3 3 132947126 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 132947220 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132947454 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 132947517 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132947630 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 132947717 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 132947758 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132947792 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 132948057 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132948193 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132948214 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 132948222 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132948336 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132948347 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 132948382 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 132948385 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 132948474 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 132948638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132948906 C A Y N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 3 132948942 C A Y N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 3 132949072 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 132949151 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132949219 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 132949428 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 132949442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132949626 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132949689 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132950065 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 132950095 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 132950108 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132950125 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 132950141 A T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 3 132950410 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 132950815 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 132951540 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132951579 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132951608 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132951778 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 132951811 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132951946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132951961 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 132952019 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132952043 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132952048 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 132952157 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 132952263 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 132952449 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132952470 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 132952568 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 132952596 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132952655 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 132952675 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 132952698 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132952780 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 132952789 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 132952829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132952857 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 132952973 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 132952979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132953086 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 132953225 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 132953258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132953277 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 132953294 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 132953383 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132953478 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132953533 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 132953546 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132953592 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 132953612 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132953648 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132953653 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132953706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132953835 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132953852 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 132953873 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 132953874 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 132954018 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 132954047 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 132954076 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 132954087 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 132954088 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 132954117 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 132954190 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 132954202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132954294 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 132954330 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 132954354 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 132954395 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132954406 G T N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 132954407 G T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 132954453 C T N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 3 132954647 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 132954993 T C N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 3 132955001 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 132955244 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 132955245 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 132955353 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 132955632 G A N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 3 132956216 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 132957398 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.375 0.1875 0.4375 15 17 6 3 7 3 132957457 G A N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 132957511 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132957635 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132957834 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 132958116 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132958518 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132959071 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 132959485 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132959619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132959727 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 132959811 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 132960113 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 132960160 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132960167 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132960218 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132965365 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132967393 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132967699 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 132969426 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132971257 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132972969 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132974267 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 132975806 C A N N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 132975862 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 132975901 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 132978142 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132978229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132980122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132982614 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132983301 A G Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 132983691 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132985447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132985729 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132985936 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132986160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132986834 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 132988236 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 132989714 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 132989759 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 132989807 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 132990039 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 132990050 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132990123 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 132990176 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 132990380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132990454 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 132990486 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 132990500 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 132990510 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 132990521 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 132990633 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 132990680 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 132990725 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 132990794 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 132990800 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132990916 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 132990982 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 132991002 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 132991098 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 132991152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132991221 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 132991280 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 132991333 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 132991416 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 132991621 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 132991667 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132991734 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 132992194 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132992267 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132992436 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132992895 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132993498 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132993996 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132994016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132994494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132995062 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 132995080 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 132995137 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 132995231 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 132995248 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 132995260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132995326 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132995384 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 132995499 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 132995550 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 132995680 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 132995913 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 132995983 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 132996155 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 132996549 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 132996550 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 132996622 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132996624 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 132996890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132997317 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 132997318 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 132997399 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 132997406 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 132997524 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132997724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132998070 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 132998111 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 132998378 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 132998457 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 132998771 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132999353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 132999532 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132999749 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 132999952 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 133000001 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133000312 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133000340 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 133001508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133002459 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133002634 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 133002640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133002738 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 133002746 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133002785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133002835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133004751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133004880 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 133004914 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 133005242 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 133005256 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 133005260 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 133005881 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 133006178 A T Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 133006239 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 133006240 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 133006361 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 133006464 C T Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 133006468 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 133006799 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 133006812 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 133006934 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 133006999 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 133007151 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 133007349 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 133007426 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 133007440 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 133007445 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133007899 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 133008069 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 133008604 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 133008619 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 133008761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133008809 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 133009051 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133009528 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133009617 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133009639 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133009668 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133010086 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 133010464 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133010830 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 133011260 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 133011358 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133011382 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 133011484 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 133011515 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133011726 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133011751 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 133011795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133011952 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 133011969 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 133012017 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 133012234 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 133012369 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 133012395 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 133012787 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 133012899 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 133013272 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 133013352 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 133013985 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 133014004 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 133014019 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 133014075 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133014080 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 133014089 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 133014106 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 133014132 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 133014156 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 133014204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133014219 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 133016788 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 133016864 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133016873 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133016889 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 133016892 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133017197 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 133017243 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 133017738 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 133017747 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133017915 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 133017929 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 133017945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133018081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133018131 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 133018171 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 133018550 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 133018700 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133019320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133021480 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133021534 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133022140 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133022360 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133023720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133024520 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133025864 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133027387 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133029269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133029806 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 133030592 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 133030955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133030958 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133031327 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133031803 A T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 133033795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133034858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133036065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133036220 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 133036743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133037053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133037088 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133038244 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133038602 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133038662 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 133038771 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133039505 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133040061 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133040218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133040317 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133040366 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133040393 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 133040783 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133040785 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133040903 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133041718 G C Y N 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0 1 0 7 7 0 7 0 3 133042071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133044851 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133044904 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133047832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133048415 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133050316 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133050379 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 133050927 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133051850 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 133051937 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133052309 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133052628 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 133052732 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133052943 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133054718 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133054786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133056642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133058185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133061009 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 133061167 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133061396 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133062497 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133063775 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133066725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133068215 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133068644 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 133068653 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133068828 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133069119 T G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 133070117 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 133070167 T C N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 133070274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133070362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133070397 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 133070436 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 133070450 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133070517 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133070518 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133070535 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133070614 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133070715 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 133070716 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133071574 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133071629 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133071846 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 133072076 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133072099 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133074699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133075229 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133075366 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133076662 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133077472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133077876 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133079491 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133084094 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 133086907 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133088342 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133090278 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133090921 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133091290 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133092740 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 133092933 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133093706 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133093796 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 133093871 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133094220 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 133094294 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 133094338 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 133094366 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133094452 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 133095139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133095220 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133095370 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 133095520 G T Y N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 133096174 C G Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 133096838 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 133097020 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 133097374 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133097754 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133098084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133098431 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133099643 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133100133 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133100332 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 133100757 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133100991 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133101143 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133101769 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 133101868 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 133102008 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 133102284 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 133102337 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 133103306 A T N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 133104462 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133104573 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 133104756 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133104932 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 133105367 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 133105895 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133105939 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133106371 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133106522 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133106538 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133106664 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 133106872 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 133107138 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 133107208 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 133107655 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 133107779 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133107922 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 133108058 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 133108071 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 133108081 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 133108237 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 133108393 T G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 133108605 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 133108654 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 133108708 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 133108735 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 133108820 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 133108848 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 133108861 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 133109634 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133110407 C T Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 133111472 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 133112431 G C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 133113430 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133114873 T C Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 133114923 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 133114938 G T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 133115031 A G Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 133115084 A T N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 133115095 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 133115241 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 133115254 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 133115338 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 133115393 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 133115449 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 133115492 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 133115668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133115692 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 133115848 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 133115905 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 133116287 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 133116346 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133116606 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 133116626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133116653 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 133117055 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 133117090 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133117267 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 133117403 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 133117519 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 133117537 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 133117575 T G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 133117886 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 133117916 T G Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 133117926 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 133117946 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 133117993 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 133118035 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 133118129 A C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 133118473 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 133118695 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133118797 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 133118893 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133119359 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133119643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133119659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133120073 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 133120719 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 133121099 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 133123395 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 133123474 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 133124914 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133125350 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133125398 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 133125601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133125610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133126279 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133126339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133126455 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 133128466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133130685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133133639 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133134097 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 133137896 A G N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 133138586 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133139828 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 133142126 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 133142141 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133144735 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133144914 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133145056 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 133145592 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133145851 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133146933 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133148329 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133149114 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 133149751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133151721 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133152254 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 133152270 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 133152376 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133152423 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133152428 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133152603 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133152903 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133152924 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 133153029 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 133153256 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133153383 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133153401 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 133153674 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 133153740 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 133153930 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 133153954 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 133153962 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 133154165 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 133154324 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133154478 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133154523 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133154550 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 133154574 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133154646 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 133154655 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 133154659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133154676 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 133154702 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 133154722 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 133154789 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 133154868 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 133154872 A C N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 133156294 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 133156335 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 133157570 T C N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 133157635 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 133157642 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 133157766 C T N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 133157826 A C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 133157830 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 133157858 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133157918 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 133157986 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 133158068 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 133158072 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 133158090 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 133158128 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 133158280 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 133158308 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 133158350 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 133158474 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133158517 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 133158522 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133158549 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133158561 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 133158743 G C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 133158764 T C Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 133158766 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 133158778 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 133158780 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133158798 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 133158816 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133158820 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 133158864 G A Y Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 133159046 G T N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 133159179 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 133159497 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 133159545 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 133159651 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 133159712 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 133159960 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 133160945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133161086 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 133162279 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133162802 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133162857 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133162936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133162981 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133163045 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 133163073 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133163318 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 133163654 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 133164168 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133164172 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133164269 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133164544 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133167650 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 133168860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133169605 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133169656 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133169999 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133170287 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133170763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133170787 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133171969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133172921 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133173340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133173566 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 133174028 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 133176689 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 133176902 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133176971 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133177476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133177599 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133177711 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133179210 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133180021 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 133180389 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133180413 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 133180476 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133181048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133181284 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133181377 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133181395 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133181399 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 133181445 T A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 133181468 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133181490 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133181574 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133181725 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133181872 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133181911 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 133182980 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133184947 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 133185015 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 133185280 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133186440 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 133186448 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133186674 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133186869 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133186988 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133187692 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133187991 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133188002 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133188052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133188217 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 133188305 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 133189062 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133189887 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133189970 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 133190026 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 133190098 C G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 133190365 G T N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 133191024 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133191072 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 133192849 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 133192896 A G N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.0909090909090909 0.545454545454545 0.363636363636364 8 14 1 6 4 3 133193731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133193763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133194222 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 133194577 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 133194679 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133194711 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133194733 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133194749 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133194957 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 133195139 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 133195208 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 133195222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133195544 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133195723 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 133196093 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 133196402 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 133196772 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 133196834 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 133196853 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 133196860 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 133197024 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 133197210 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133197337 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 133197481 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 133197626 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133199614 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133200222 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 133201347 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133201431 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133201486 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133201500 G A Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 133201760 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133201802 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 133201931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133202036 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133202081 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133202287 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 133202616 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 133203148 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133203394 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133205948 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133205967 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133206484 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133209398 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 133210910 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133213074 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 133214423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133215431 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133215567 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133215715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133215775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133215781 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133215853 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133215919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133216332 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133216862 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133217680 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133218405 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 133221018 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133223434 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133224284 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 133226477 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133226981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133228043 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133233481 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 133235129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133235264 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 133235486 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133235709 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 133235792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133235930 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 133235954 T G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 133236200 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133236285 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133236318 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133236392 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 133236713 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 133236818 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133236900 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133237355 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133237960 G A Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 133238362 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 133238487 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 133238548 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 133238556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133238629 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 133238703 G T N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 133238904 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 133239031 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 3 133239242 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 133239261 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 133239803 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 133239929 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 133240247 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133240303 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133240387 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133240417 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133240840 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 133241125 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 133241221 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133241300 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133241327 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133241358 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133241615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133241723 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133242051 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 133242218 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133242249 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133242994 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133243543 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133244178 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133244636 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133247393 G A Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 133247454 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 133247945 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 133248466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133249446 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 133254158 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133254180 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133254758 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133255814 G T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 133256716 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 133256717 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 133256748 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 133256926 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 133256945 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133257056 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133257057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133257166 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133257316 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133258011 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133258214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133258340 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 133258566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133258599 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133258614 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133259333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133259335 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133259508 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133259513 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133259686 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133259935 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133259984 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133260636 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133260714 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 133260767 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133260786 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133260788 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 133260809 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133260943 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133261011 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133261012 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133261103 C A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 133261110 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133261197 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 133261206 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133261356 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133261526 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133261813 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 133262150 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 133262173 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 133262353 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 133262562 A G Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 3 133262602 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 133262616 A G Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 133262677 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 133262678 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 133262718 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133262721 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 133262807 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 133263094 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 133263596 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133264698 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 133264871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133265041 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133265056 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133265838 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 133266437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133266716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133266985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133267012 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133267395 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 133267638 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133268147 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133269748 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133270072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133270687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133270808 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133271700 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 133271707 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133271770 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133272285 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133273692 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133274769 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 133274884 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 133274889 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 133274977 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 133274988 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 133275125 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 133275132 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 133275191 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 133275325 A C N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 133275440 G T N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 133275517 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 133275573 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 133275618 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 133275664 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 133275672 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 133275700 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 133275772 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 133275815 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 133275825 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 133275828 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 133275847 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133275966 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 133275997 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 133275999 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 133276231 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 133276275 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 133276345 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 133276422 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 133276440 C A N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 3 133276475 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 133276579 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.2 0.75 0.05 23 17 4 15 1 3 133276588 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 133276648 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 133276715 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 133276755 T G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 133276804 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 133276827 T G N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 133276831 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 133276847 A T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 133276923 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 133276944 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 133277023 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 133277384 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133277558 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133277592 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133277622 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133277742 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133277939 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 133278288 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133278486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133278510 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133278706 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133279221 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 133279293 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133279446 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 133279484 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133279574 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133280098 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133280215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133280788 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133281204 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133281971 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133282458 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133282501 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133282618 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 133282656 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 133282772 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 133282925 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133282942 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133282949 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133283089 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 133283160 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133283239 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 133283336 G C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133283540 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133283588 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133283705 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133283792 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 133283941 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133283951 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 133283985 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 133284056 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 133284175 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 133284212 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133284219 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 133284239 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 133284253 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 133284307 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 133284318 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 133284416 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 133284429 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 133284566 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 133284573 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 133284616 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 133284675 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133284687 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 133284692 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 133284706 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 133284740 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133284757 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 133284758 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 133284790 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 133284791 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133285017 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 133285317 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133285328 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133285608 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133285635 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133285685 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 133285802 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133285814 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133286104 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133286200 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133286406 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 133286722 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133286796 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133286846 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133286901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133287057 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 133287296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133287886 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 133287922 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133287930 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133287946 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 133287964 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 133287981 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 133288465 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133288732 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133288757 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133289030 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 133289162 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133289836 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133290230 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133290481 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133290692 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 133290706 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133290756 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 133290932 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 133290949 A T N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 133291643 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 133293388 T A N N 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.75 0 0.25 6 2 3 0 1 3 133293918 T C Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 133293972 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 133294003 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 133294049 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 133294252 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 133294263 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 133294279 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 133295087 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 133295533 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 133295975 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 133295995 A G Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 133296195 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 133296236 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133296480 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 133296639 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 133296675 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 133297001 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 133297014 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 133297133 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 133297237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133297301 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133297340 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 133297344 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 133297626 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133297714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133297843 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 133297902 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 133298086 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133298191 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133305877 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133306031 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 133306048 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133306104 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 133306460 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 133306852 T A N N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 3 133306979 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133307035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133307117 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133307191 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133307302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133307320 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133307329 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133307599 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 133307637 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 133307658 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 133307751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133307985 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133308451 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 133308608 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133308647 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 133308779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133308783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133308884 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 133308969 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 133308978 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 133309059 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 133309169 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 133309253 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 133309295 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133309607 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 133309724 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 133309903 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133310788 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 133311149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133311356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133311565 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 133311770 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 133311797 G C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 133312002 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133312210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133312638 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 133312674 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 133312865 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 133313140 A T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 133313321 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 133313442 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 133313553 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 133313714 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 133313792 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 133314779 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133314877 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 133315117 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 133315237 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 133315258 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 133315780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133315897 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133316006 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133316023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133316104 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133317243 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 133317540 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133318050 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 133318072 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133318202 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133318472 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 133318547 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 133318648 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 133319176 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 133319754 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133319777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133319804 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133319882 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 133319884 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 133320226 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133320237 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133320240 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 133320415 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 133320468 G A Y Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 133320639 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 133320648 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 133320707 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 133320756 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 7 5 1 5 0 3 133321056 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 133321503 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133321829 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133321949 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133322010 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133322043 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133322275 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 133322340 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133322433 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133322438 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133322455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133322567 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 133322594 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 133322659 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133322671 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133322726 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133322846 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 133322913 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133323000 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133323070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133323196 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133323215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133323316 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133323347 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133323360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133323457 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133323479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133323522 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133323573 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133323655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133323814 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133323845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133324010 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133324024 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133324070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133324230 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133324429 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133324499 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133324593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133324760 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 133324834 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133324939 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 133324971 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 133325072 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 133325144 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133325208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133325244 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 133325343 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133325461 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 133325495 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 133325511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133325539 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 133325545 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 133325619 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133325698 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 133325700 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 133325968 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 3 133326042 C A N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 133326221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133326227 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133326425 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 133326435 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 133326445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133326453 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133326477 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 133326494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133326495 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133326517 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 133326655 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133326739 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133326822 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 133326876 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133326883 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 133326927 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 133326947 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133327153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133327187 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 133327324 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 133327341 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133328192 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 133328205 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 133328426 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133328916 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 133329206 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 133329400 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133329442 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 133329471 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133329571 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133329584 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 133330065 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133330096 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 133330185 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133330186 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133330287 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133330318 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133330684 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133330713 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 133330793 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133330837 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133331175 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 133331208 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 133331344 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 133331362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133331417 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133331468 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 133331790 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 133331916 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 133331928 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 133332134 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133332187 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133332260 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 133332318 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 133332515 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133332581 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 133332614 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133332667 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 133332676 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 133332685 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 133332823 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 133332843 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 133332940 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 133332981 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 133332986 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 133332998 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 133333034 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 133333100 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 133333507 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133333553 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 133333707 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133333901 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 133334123 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 133334194 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 133334207 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 133334221 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 133334226 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 133334324 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 133334565 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 133334598 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 133334615 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 133334727 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133335026 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 133335182 A T Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 133335378 C G N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 133335408 C T Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 133335449 A T N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 133335544 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 133335552 G T N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 133335560 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 133335571 A T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 133335572 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 133335665 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 133335670 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 133335754 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133335801 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 133335821 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133335832 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 133335840 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 133335953 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133336015 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133336097 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133336144 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 133336157 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 133336207 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133336308 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133336339 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133336510 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 133336555 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 133336755 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 133336826 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 133336845 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 133337825 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133338000 C T Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 133338038 A G Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 133338533 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 133338557 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 133339082 C T Y Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 3 133339294 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 133339645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133339676 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133339930 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 133339954 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 133340020 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 133340271 A G Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 133340461 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133340535 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133340769 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 133341031 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 133341157 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 133341520 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 133341604 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 133342004 A G Y Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 133342012 T C Y Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 133342517 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 133342646 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133342737 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 133343341 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 133343612 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 133343666 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133343755 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133343818 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 133344064 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 133344274 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 133344316 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133344368 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 133344739 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 133345092 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133345102 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 133345422 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 133345595 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133345818 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 133345835 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 133345910 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133346024 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 133346181 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133346214 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133346455 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 133346553 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133346857 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 133346989 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 133347049 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 133347145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133347193 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 133347269 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 133347310 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 133347425 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 133347585 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 133347771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133348454 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 133348614 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 133348725 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 133348846 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 133349030 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 133349063 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 133349091 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133349137 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133349178 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 133349180 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 133349219 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133349345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133349416 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133349510 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133349645 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133349704 A G N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 3 133349739 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 133349903 G A Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 133350178 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133350910 T G N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.0666666666666667 0.8 0.133333333333333 14 16 1 12 2 3 133350955 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 133351164 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 133351360 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 133353188 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 133353897 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 133354538 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 133354569 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 133354723 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 133354966 A T Y N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 3 133355446 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 133356091 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133356328 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 133356507 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133356780 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 133357692 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133357723 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133358343 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 133358691 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 133358845 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133359181 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 133359218 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 133359820 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133359848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133359931 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133360415 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 133360464 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133360633 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133360858 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133360960 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133361107 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133361467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133361469 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133361632 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133361827 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133361905 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133362025 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133362197 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133362650 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133362811 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133363048 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133363131 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133363184 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133363469 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133363556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133363702 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133363762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133363878 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 133364010 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133364023 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133364221 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133364343 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133364508 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 133364545 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133364616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133364638 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 133364670 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133364836 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133365005 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133365244 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133365497 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133365510 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133365558 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 133365688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133365801 C T Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 133365851 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 133365886 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133365929 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 133365972 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 133365996 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 133366021 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133366076 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133366284 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133366407 A C Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 133366512 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133366577 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133366612 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133366675 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133366854 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133366892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133367075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133367079 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133367207 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133367377 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 133367640 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133367818 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133368155 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133368301 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133368450 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 133368900 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 133368945 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133369087 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 133369347 A C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 133369485 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133369581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133369705 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133369806 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133369951 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133370033 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 133370534 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 133371389 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 133372064 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133372191 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133372404 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133372564 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133372618 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133372716 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133372747 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 133373748 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 133373754 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133375438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133375873 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133376092 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133376122 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133376143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133376194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133376423 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133376481 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133376744 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133376963 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133377501 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 133378027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133378028 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133378286 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 133378299 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133378537 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 133378549 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133378912 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133378940 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133379011 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133379024 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133379044 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133379080 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133379087 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 133379168 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133379208 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133379236 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 133379256 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 133379329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133379377 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133379615 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 133379944 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133380070 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133380127 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133380128 G T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 133380186 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133380349 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 133380422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133380541 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133380726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133380777 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133380834 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133381008 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133381080 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133381084 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133381293 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 133381420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133381465 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 133381728 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133381734 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133381781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133381840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133381878 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133382013 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133382035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133382136 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 133382169 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 133382224 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133382396 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 133382537 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133382758 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133382906 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133383022 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133383108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133383113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133383304 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133383415 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 133383758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133383896 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133383907 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 133383945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133384137 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 133384242 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133384281 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133384330 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133384336 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 133384440 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133384461 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133384617 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133384656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133384803 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 133384944 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133384957 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 133384976 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133385028 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133385111 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133385161 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133385174 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133385258 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 133385286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133385394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133385475 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133385558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133385565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133385609 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133385618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133385650 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133385658 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133385703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133385725 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133385760 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133386004 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 133386122 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 133386381 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 133386574 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 133386587 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 133386670 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 133386705 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 133386739 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133386812 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 133386834 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 133386875 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133386935 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 133386974 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 133386994 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 133387096 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 133387143 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 133387161 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 133387183 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 133387220 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 133387389 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 133387429 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133387443 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133387463 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 133387465 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 133387512 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133387571 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 133387586 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 133387806 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 133387844 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133387932 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 133388188 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 133388197 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 133388244 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 133388250 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133388322 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 133389136 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 133389556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133389711 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 133389727 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 133389762 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 133389817 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 133389918 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133390080 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 133390085 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 133390094 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 133390238 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133390266 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133390288 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133390380 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133390408 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133390782 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133390998 C A Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 133391429 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 133392692 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 133392923 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 133393061 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 133393436 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133394391 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 133394826 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133394995 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 133395061 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133395437 T A N N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 133395624 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133395785 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133395851 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133395985 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133396015 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133396346 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133396610 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133396642 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133396779 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133397024 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133397212 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 133397226 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133397430 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133397481 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 133397530 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 133397757 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133398265 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133398426 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 133398829 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133398838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133398862 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133398896 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 133399033 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133399581 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 133399598 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 133399658 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133399748 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 133399914 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 133399946 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 133400052 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 133400366 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 133400448 G A N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 133400494 A T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 133400500 A T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 133400570 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133400624 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133400699 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133400700 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133400716 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 133400790 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133400814 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133401119 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 133401488 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 133401699 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 133401910 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133401924 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 133402438 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 133402467 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 133402619 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133402707 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133402956 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133403017 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133403082 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133403345 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133403371 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133403469 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 133404253 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133404387 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133404485 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133404534 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133404854 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133404902 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133404969 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 133405010 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 133405023 C G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133405048 G T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 133405059 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 133405419 A G N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 3 133405954 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133405995 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133406012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133406210 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133406267 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 133406405 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 133406477 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133406753 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133406864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133406923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133407007 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133407323 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133407439 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133407662 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 133407772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133408100 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133408281 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133408558 G T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 10 22 0 10 6 3 133408991 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133409017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133409262 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133409314 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133409545 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133409587 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133409641 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133409898 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133410103 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133410166 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133410615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133411389 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 133411897 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133411971 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 133412028 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133412130 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 133412346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133412517 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133412670 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133413137 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133413158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133413613 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133414109 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133414286 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133414613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133414664 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133414926 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133415002 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133415193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133415319 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133415448 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 133415504 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 133415524 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 133415641 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133415663 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133415710 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133415783 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133417557 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133418050 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133418090 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 133418186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133418209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133418221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133418251 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133418775 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133418807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133418845 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133419347 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 133419406 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 133419432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133419450 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133419498 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 133419571 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 133419710 A C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 133419739 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133419781 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133419829 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133419860 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133419966 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133420039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133420352 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 133420494 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 133420773 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133420918 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133421066 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 133421438 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133421700 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133422299 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133424297 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133424583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133426782 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133427389 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 133429015 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133429995 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133430964 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 133431046 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133432288 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133432800 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 133432821 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 133434561 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133434753 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133435463 T G Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 133435857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133436040 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133436906 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133437139 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133437726 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 133437964 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 133438576 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 133438682 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 133438815 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 133439048 A G Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 133439309 A C Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 133439818 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 133439914 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133440128 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133440163 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133440293 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133440318 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 133441059 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133441102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133441164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133441166 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133441210 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133441361 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133441536 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 133441566 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133441662 A G N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 133441674 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 133441689 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 133441690 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 133441720 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 133441891 A T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 133442388 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 133442901 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133454786 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 133456380 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133456978 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133457013 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133457287 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133457856 C T N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 133457929 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 133470168 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 133471931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133473230 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133474188 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133474928 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133474993 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133475222 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133475377 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 133475949 C T Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 133476011 A T Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 133476714 C A Y N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 133476759 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 133477425 G C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 133479560 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133494789 G T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 133496505 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 133496650 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 133496729 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 133499346 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 133499368 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 133499842 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133502594 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 133503068 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 133503118 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133503556 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133503795 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133503906 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133504277 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133505468 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 133506873 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133507877 C T Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 133508305 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133509247 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133513935 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133515066 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 133524198 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133524533 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 133525929 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133526389 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133527132 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133527309 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 133527597 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133527937 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133529010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133529183 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133529792 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133532265 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133532510 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133532531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133533558 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133534527 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 133535174 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133535175 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133535965 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 133536408 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133536503 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133538242 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133538323 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133538832 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133540484 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133541084 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133541354 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 133541694 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133541718 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133541931 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133542133 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133543734 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 133545788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133545900 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133545979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133546119 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133547042 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 133548003 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133548077 C T Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 133548094 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 133548142 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 133548554 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133549031 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133549103 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133549792 A G Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 133550152 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 133550502 A C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 133550854 G A Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 133551609 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133552157 A G Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 133552300 G T Y N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 133552699 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133552997 T C Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 133553530 A G Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 133553612 G T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 133553684 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133554108 C A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 133554128 G T Y N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 133554269 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133554322 T G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 133555149 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 133555703 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133555945 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133555946 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133556064 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133556259 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133556428 C T Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 3 133556612 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 133559046 A G Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 133559137 C T Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 133559234 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 133559670 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 133560320 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133560558 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133561133 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133561776 T C Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 133562130 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133562483 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133563446 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133563562 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133564146 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133564576 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133567712 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133568399 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133569279 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133569432 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133570088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133570133 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133570396 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133570495 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133570861 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133571475 A T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133572351 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133572638 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133574677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133574928 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133574943 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133575026 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 133575469 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133575885 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 133575922 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 133578444 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133578577 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133578670 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133579529 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133579747 T A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 133580116 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 133580918 C G Y N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 133581517 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133582384 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133582411 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133582576 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133583831 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133584712 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133584849 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133584890 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 133584904 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 133584971 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133585039 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 133585042 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 133585060 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133585261 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133585281 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133585331 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 133585422 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133585571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133585582 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133585662 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133585676 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133585681 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133585691 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133585692 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133585799 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133585909 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 133585914 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133585923 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133585940 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133585941 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 133586068 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133586136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133586192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133586225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133586376 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 133586385 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133586488 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133586675 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 133586758 T C N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 3 133586762 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 133586837 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 133586859 A C N N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.384615384615385 0.307692307692308 0.307692307692308 14 12 5 4 4 3 133586922 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 133586959 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 133586960 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 133586982 C A N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 133587062 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 133587098 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133587103 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133587118 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133587140 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133587141 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 133587239 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 133587271 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133587310 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133587324 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133587425 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133587505 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 133587526 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133587726 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 133587732 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 133587782 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133587813 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 133587820 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 133587897 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133587898 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 133587914 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 133588008 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133588134 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 133588331 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 133588336 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 133588373 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 133588416 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 133588444 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 133588453 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133588468 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133588513 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133588563 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133588592 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133588604 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133588611 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133588629 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 133588635 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 133588670 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 133588673 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133588757 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133588864 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133588886 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133588931 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133588938 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133588979 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 133589004 C G Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 133589006 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 133589041 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133589062 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 133589112 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133589268 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 133589286 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 133589293 A T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 133589363 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133589489 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133589511 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 133589572 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133589581 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133589611 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133589645 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133589738 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 133589745 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133589757 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133589758 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133589814 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133589849 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133589850 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133589881 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133589886 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133589893 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133590013 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133590015 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 133590027 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133590047 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133590105 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133590140 C T Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 133590145 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133590151 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 133590399 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 133590965 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133590999 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133591051 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133591063 G T Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 133591108 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 133591143 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133591206 C T Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 133591231 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133591269 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133591291 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133591317 G T Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 133591345 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133591425 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133591456 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133591633 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 133591642 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133591659 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 133591712 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 133591788 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133591801 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 133591841 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 133591892 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133591905 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133591999 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133592009 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133592010 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133592137 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133592157 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133592171 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 133592242 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133592267 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133592310 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 133592317 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133592339 A T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 133592345 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133592405 A G Y Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.307692307692308 0.230769230769231 0.461538461538462 11 15 4 3 6 3 133592461 A T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 133592552 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 133592760 T C Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 133592924 T A Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 133593023 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133593026 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 133593065 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133593106 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133593112 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133593151 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 133593195 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133593206 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133593217 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 133593294 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133593348 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133593356 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133593385 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133593420 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133593485 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133593563 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133593582 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133593620 T A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 133593657 A T N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 3 133593676 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 133593770 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 133593823 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 133593848 C A Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 133594317 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 133594381 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 133594401 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 3 133594403 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 3 133594468 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 133594470 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 133594503 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 133594549 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133594599 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 133594629 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 133594639 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 133594653 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133594691 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 133594866 G T Y N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 133594971 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 133594985 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133595040 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 133595058 T G N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 133595072 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 133595089 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 133595115 T A N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 133595140 G A N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 3 133595149 A C N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 3 133595175 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133595215 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 133595225 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 133595226 A G Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 133595304 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 133595325 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 133595393 A G Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 133595466 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 133595500 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 133595655 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133595726 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133595751 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 133595835 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133595868 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 133595935 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133595950 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 133595972 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133596011 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133596014 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133596116 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 133596140 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 133596167 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133596215 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133596235 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 133596304 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133596505 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133596605 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133596655 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133597875 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 133598127 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133598161 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 133598202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133598236 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 133598435 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133598943 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 133599564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133599645 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133599667 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133599703 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133599785 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 133599844 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133599981 C A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 133600074 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 133600170 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 133600180 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 133600181 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 133600274 T A N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 133600297 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 133600298 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 133600429 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133600442 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133600548 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133600581 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133601373 T C N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 3 133601435 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 133601799 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 133601814 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 133601866 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 133601899 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133601900 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 133602218 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133602233 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133602235 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 133602518 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 133602626 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 133602908 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 133603481 A G N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 3 133603509 T C N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 133603611 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 133604408 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133604416 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133604529 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 133604888 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133604961 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133605038 C A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133605066 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133605122 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133605291 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133605374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133605626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133605821 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133606135 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133606165 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133606407 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133606500 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133606887 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 133606976 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133607363 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133608099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133608142 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133608331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133608512 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 133608653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133608695 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 133608707 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133608881 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 133608904 A T Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 133608975 A C N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 133608980 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 133609084 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 133609128 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 133609843 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 3 133611349 A G Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 133617571 T G Y N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 3 133617583 G A Y Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.363636363636364 0.454545454545455 0.181818181818182 13 9 4 5 2 3 133617654 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 133617824 A C Y N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 133617881 T C Y Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 12 12 3 6 3 3 133617961 A G Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 133618107 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133618332 A G N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 133618459 A T Y N 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 8 10 3 2 4 3 133618461 C A N N 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 8 10 3 2 4 3 133618591 T A N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 10 18 4 2 8 3 133619036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133619218 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 133619329 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 133619399 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 133619539 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 133619540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133619574 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 133619607 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 133620069 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 133620551 C G Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 133620559 A T N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 133620883 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 133620899 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 133620912 A G Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 133621072 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133621303 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133621533 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 133621713 T A Y N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 3 133621782 A G N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.181818181818182 0.454545454545455 0.363636363636364 9 13 2 5 4 3 133622010 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133622147 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 133622261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133622344 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 133622551 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133622675 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133622787 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 133622843 T G N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 133623314 C A Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 133623316 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 133623575 C T Y Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 133623616 C T Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 133623626 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 133623935 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133624015 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133624052 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133624087 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133624309 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133624358 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133624405 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133624491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133624563 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133624688 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133624789 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133624927 T G Y N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 3 133625003 G A Y Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 3 133625025 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 133625106 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 133625156 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133625310 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133625388 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133625401 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 133625443 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133625666 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133625807 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133625817 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 133625835 G A Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 133625841 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 133626038 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 133626100 C T Y Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 133626118 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 133626127 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133626137 A T Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133626210 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133626215 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133626266 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133626299 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133626482 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 133626582 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 133626598 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 133626602 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 133626654 A C Y N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 133626717 C A Y N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 3 133626718 C G Y N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 5 11 0 5 3 3 133626753 G C Y N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 3 133626942 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 133627015 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133627048 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 133627074 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 133627142 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 133627161 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 133627177 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 133627239 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133627250 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 133627287 C T N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 3 133627324 A G Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 133627333 A T Y N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 133627425 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 133627458 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133627459 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 3 133627560 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 133627588 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133627689 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133627732 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133627778 C A Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 133627968 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133628064 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 133628073 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133628119 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133628209 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133628359 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133628428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133629096 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 133629223 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133629260 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133629392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133629536 A C Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 133629631 C T Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 3 133629714 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 133629745 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133629870 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 133630063 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133630200 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133630207 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 133630231 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133630301 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133631812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133632924 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133634344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133634864 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133637126 T C Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 133637239 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133637734 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133638136 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133638278 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133638336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133638495 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133640492 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133641944 C T Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 133642667 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133643682 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133644321 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133644599 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133644679 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133645351 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133646361 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133647045 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133647187 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133647315 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133647381 A G Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 3 133647459 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 133648063 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133648154 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133648177 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133648866 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133650002 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133650601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133650623 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133651086 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133651139 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133651918 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133653109 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133655563 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133655635 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133656094 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133656163 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133656954 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 133657139 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133657143 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133657317 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133659950 A G Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 133660195 G A Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 133660276 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 133660368 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133660637 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133660699 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133660892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133660897 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133661094 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133661356 G A Y Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 133661622 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 133661732 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 133661745 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 133661828 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 133661987 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133661988 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133662091 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 133662177 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 133662205 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 133662426 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133662575 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 133662590 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 133662771 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 133662904 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 133663068 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133663196 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 133663367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133664182 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133664262 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 133664375 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 133664605 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133664631 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133664709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133664772 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133664801 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 133665020 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 133665425 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133665896 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133667057 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133667079 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133667218 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133667693 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133667885 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133667966 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 133667990 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 133668171 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133669169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133669330 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133669678 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133677041 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133677319 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 133677469 G T Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 133677513 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 133677525 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 133677881 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 3 133678207 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 133678245 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 133678277 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 133678932 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133678970 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133679063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133679074 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133679149 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133679154 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133679266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133679519 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133679944 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133680002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133680456 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133680662 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133680785 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133680878 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133681064 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133681332 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 133681873 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133681966 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133682046 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133682084 A T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 133682827 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133682844 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133682980 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133683014 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 133683015 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133683044 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133683177 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133683183 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133683321 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 133683581 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133683622 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133683677 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133683746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133683842 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133684045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133684157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133684195 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133684199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133684453 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133684591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133684974 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133684993 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133685018 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 133685186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133685239 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 133686050 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133686233 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133686324 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133686579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133686722 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133686958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133686980 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 133687012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133687133 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133687167 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 133687197 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133687251 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 3 133687701 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 133688034 C A Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 133688066 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133688278 G T Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 133688537 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133688732 C T Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 133688972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133689960 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 133690588 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133691964 G T Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 133691965 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 133691983 T G Y N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 133692168 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 133692522 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133692571 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133692702 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133692762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133692833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133692862 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133692965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133693068 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133693228 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133693493 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133693666 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133693753 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133693838 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 133693885 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133694187 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133694196 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133694215 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133694257 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133694341 A T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 133694540 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133694687 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133694716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133694798 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133694882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133695309 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 133695520 A G Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 133695658 G A Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 133695696 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133695877 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133695887 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133696141 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133696224 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133696459 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133696480 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133696560 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133696659 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133696852 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133696894 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133696959 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133697045 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133697131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133697330 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133697422 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133697624 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133697682 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133697776 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133697913 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133697937 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 133698026 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133698057 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133698194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133698451 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133698750 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 133698792 C G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 133698802 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133698866 T A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 133699089 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133699245 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133699268 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133699464 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133699708 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133699901 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133699923 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133700001 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133700180 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133700191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133700229 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133700234 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133700249 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133700251 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133700307 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133700316 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133700366 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133700671 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133700736 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 133700770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133700861 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133700936 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 133701001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133701039 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133701067 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 133701252 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 133701298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133701353 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 133701363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133701630 G T Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 133701733 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 133701760 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 133701781 C G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 133701843 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 133701882 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 133701943 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 133701987 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 133701999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133702147 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133702160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133702191 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 133702192 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133702203 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133702216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133702293 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133702429 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133702496 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 133702827 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 133702903 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 133703279 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 133703485 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133703496 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133703622 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 133703727 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 133703739 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 133703806 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 133703936 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133704089 A T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 133704216 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 133704300 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 133704304 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 133704501 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 133704564 A C N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 133704727 C A N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 133704820 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 133704837 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 133704847 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 133704894 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 133704903 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 133705013 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133705160 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133705214 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 133705437 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 133705449 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 133705497 A C N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 133705555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133705560 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 133705575 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 133705648 G T Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 133705870 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133705922 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 133705952 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 133706144 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 133706499 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133706663 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 133706678 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 133707040 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133707098 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133707111 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133707337 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133707946 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133708354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133709482 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 133709535 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133710535 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 133710702 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133710902 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133711068 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 133711211 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 133711419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133712294 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 133712339 G T Y N 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 12 4 5 2 1 3 133712340 G T N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 133712605 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133713317 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133713391 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 133713563 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133714061 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 133714119 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 133714120 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 133714172 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 133714296 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133714341 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 133714368 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 133714373 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133714414 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133714432 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133714511 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133714524 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133714599 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133714873 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133715175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133715241 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133715243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133715370 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133715431 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133715478 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 133715679 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133715724 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133715868 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133715938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133716053 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133716139 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133716281 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133716336 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133716503 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133716504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133716531 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133716562 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133716582 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133716614 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133716618 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133716712 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133716720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133716762 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133716842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133716924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133716958 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133716991 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133717017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133717123 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133717210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133717290 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133717325 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133717375 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133717402 C A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 133717411 G A Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 133717606 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 133717627 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 133717851 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133717900 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133717901 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 133717999 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133718036 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 133718055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133718198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133718436 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133718745 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133718826 C A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 133718842 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 133718858 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 133718940 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 133719005 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 133719024 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 133719037 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 133719071 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133719153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133719200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133719201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133719246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133719328 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 133719539 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133719596 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 133719600 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 133719758 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133719761 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133719842 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133719855 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133719864 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133719945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133720138 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 133720189 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133720218 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133720380 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133720396 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133720555 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 3 133720983 C G N N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.454545454545455 0.454545454545455 0.0909090909090909 15 7 5 5 1 3 133720987 C T N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.454545454545455 0.454545454545455 0.0909090909090909 15 7 5 5 1 3 133721022 T C Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 133721103 C T Y Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 133721135 C A N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 133721152 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 133721208 C T Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 133721337 A G Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 133721377 G T Y N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 133721427 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 133721455 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 133721578 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 133721599 A G Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 133721687 T G Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 133721807 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 133721833 A G Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 133721844 T G Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 133721891 T C Y Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 3 133721896 C G Y N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 3 133721974 A G Y Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 3 133721999 T C Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 133722036 C G Y N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 3 133722107 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.416666666666667 0.5 0.0833333333333333 16 8 5 6 1 3 133722174 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 133722312 T G Y N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 3 133722389 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 133722773 A C Y N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 133722950 G C Y N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 133723247 T A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 133723787 G T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 133723940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133723953 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133723970 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133724022 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133724038 A C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 133724083 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 133724103 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 133724125 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 133724164 C T Y Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 133724167 G A Y Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 133724236 A G Y Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 3 133724238 C T Y Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 3 133724250 G A Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 3 133724330 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 133724347 G T Y N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 3 133724547 G A Y Y 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 3 133725553 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 133725577 C T Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 3 133725617 G T N N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.454545454545455 0.363636363636364 0.181818181818182 14 8 5 4 2 3 133725622 C T Y Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 3 133725634 G A Y Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 133725695 G A Y Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 3 133725704 C T Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 3 133725729 T G Y N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 3 133725745 G C Y N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 3 133725829 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 3 133725831 G A Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 133725879 A C Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 133725893 G T Y N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 3 133725895 C T Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 3 133725978 G A Y Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 3 133726034 G T Y N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 133726057 T A Y N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 3 133726090 G T Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133726099 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133726141 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133726221 A T Y N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.636363636363636 0.181818181818182 0.181818181818182 16 6 7 2 2 3 133726222 T G Y N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 14 6 6 2 2 3 133726390 A T Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 3 133726433 G A N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 3 133726464 G A Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 133726523 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 133726526 T C Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 133726539 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133726542 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133726702 G A Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 133726742 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133726913 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 133726946 C A Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 133726951 G T Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 133727022 G C Y N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 133727061 C A Y N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.571428571428571 0.214285714285714 0.214285714285714 19 9 8 3 3 3 133727105 T G Y N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 133727131 A G Y Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 3 133727173 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 3 133727251 T G Y N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 3 133727258 T G Y N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 3 133727264 A G Y Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 3 133727306 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 133727325 A G Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 133727446 T C Y Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.545454545454545 0.272727272727273 0.181818181818182 15 7 6 3 2 3 133727461 G T Y N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 3 133727509 T C Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 133727604 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 133727612 T A Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 133727688 T C Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 133727724 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133727779 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133727794 A C Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133727797 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 133727822 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133727880 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133727883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133727898 G T Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133727918 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133727983 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133728098 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133728151 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 133728206 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133728281 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 133728300 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 133728341 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133728358 A T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 133728444 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133728458 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 133728475 A T N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 133728479 A C N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 133728579 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 133728693 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 133728979 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133729100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133729195 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 133729258 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 133729316 C G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 133729344 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 133729473 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133729850 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133729904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133730127 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133730146 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133730226 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 133730304 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 133730427 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 133730566 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 133730622 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133730635 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133730714 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133730832 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 133730982 G T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 133730983 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 133731119 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 133731140 A T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 133731236 C T N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 133731258 T G N N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 3 133731266 G A N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 3 133731333 C T N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 133731363 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133731407 T A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 133731647 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133731648 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133731867 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 133731893 A T N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.153846153846154 0.615384615384615 0.230769230769231 12 14 2 8 3 3 133731894 G A N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 3 133732071 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133732162 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133732350 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133732387 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133732390 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133732487 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133732496 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133732578 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133732742 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133732768 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133732805 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 133732820 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133732833 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133733103 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 133733557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133733600 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133733695 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 133733757 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 133733793 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 133733810 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 133733817 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 133733843 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 133733875 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 133733896 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133733912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133733949 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 133734012 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133734029 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 133734142 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 133734205 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 133734447 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 133734510 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 133734563 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 133734576 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 133734587 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 133735043 T C Y Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 3 133735080 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 133735087 C A Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 133735456 G T Y N 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 3 133735467 G T Y N 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 3 133735512 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 133735827 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 133735840 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 133735952 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 133736026 G A Y Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 133736055 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133736091 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133736101 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 133736106 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 133736202 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 133736286 G C Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 133736457 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133736942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133737086 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 133737245 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 133737508 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 133737564 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 133737580 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 133737591 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 133737639 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 133737654 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 133737700 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 133737761 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 133737783 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 133737795 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 133738197 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133738498 T C N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 3 133738533 A C N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 133738597 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 133738613 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 133738779 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 133738961 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 133738966 G T Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 133739743 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133740205 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 133740688 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133740773 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 133740793 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 133741126 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133741282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133743443 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133743513 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133743798 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133743800 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133743910 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133743928 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133743965 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133744518 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.4 0.1 0.5 18 22 8 2 10 3 133744626 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 133744997 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133745060 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 133745412 C A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 133745529 G T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 133745825 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 133746176 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 133746818 A G Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 133746943 T G Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 133747270 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 133747674 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133747718 A C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 133748279 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 133749335 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 133750262 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 133750791 A C Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 133751503 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 133751906 T A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 133752200 C A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 133752225 C G Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 133752392 T C Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 133752607 G C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 133752704 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 133753005 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 133753153 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 133753433 A G Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 133753590 G A Y Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 3 133753636 T C Y Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 133754106 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133754114 C A Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 133754156 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133754853 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133755059 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133755341 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133755517 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133755732 A C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 133755784 A G N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 133755803 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 133756249 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133756509 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 133756776 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133756966 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 133756977 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 133757442 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 133757507 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133757661 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 133758092 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 133758165 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 133758504 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 133758506 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 133758812 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 133759191 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133759538 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133759642 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 133759766 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 133759815 T A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 133759867 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 133760250 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133760446 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.421052631578947 0.0526315789473684 0.526315789473684 17 21 8 1 10 3 133760448 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133760491 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.388888888888889 0.111111111111111 0.5 16 20 7 2 9 3 133761241 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 133762495 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 133762930 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133763276 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 133764082 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133764207 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133764527 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 133764629 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133765909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133767097 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133768509 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133769028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133769722 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133770421 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133770627 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133770974 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133771703 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133771743 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 133772572 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133772695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133774381 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 133774418 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 133774617 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 133774802 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.368421052631579 0.105263157894737 0.526315789473684 16 22 7 2 10 3 133774820 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 133775043 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 3 133775044 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 3 133775227 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.368421052631579 0.105263157894737 0.526315789473684 16 22 7 2 10 3 133775647 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133775767 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133775953 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 133776018 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 133776032 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 133776061 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 3 133776139 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 133776283 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 133776308 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 133776648 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 133777956 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 133778002 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133778161 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133778281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133778818 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133779174 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 133779254 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 133779278 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133779801 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 133779853 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133780494 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 133780614 C A Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 133781132 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 133782035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133783358 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 133783736 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 133783828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133783844 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 133783972 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133784173 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 133784367 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 133784378 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133784417 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133784433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133784444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133784445 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133784611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133784660 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 133784914 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 133785161 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133785243 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133785327 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 133785443 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 133785500 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133785502 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133785550 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 133785724 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 133785999 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 133786046 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 133786152 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133786172 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133786207 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133786898 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 133787277 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133787328 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133787467 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133787485 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133787499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133788280 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 133788426 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133788588 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133788854 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133788939 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 133789110 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133789183 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 133789782 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133789878 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133790231 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133790548 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 133790727 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 133790888 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133791927 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133792656 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 133792670 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 133792673 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 133792844 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 133792860 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 133792899 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 133792954 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 133793190 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 133793253 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 133793296 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 133793378 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133793387 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133793423 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133793455 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133793510 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133793512 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133793541 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133793583 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133793715 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133793736 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 133793803 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133793885 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 133793886 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 133793949 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 133793975 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 133794104 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133794170 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 133794183 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133794203 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133794223 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133794366 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 133794401 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133794430 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133794435 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133794819 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133794866 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133794882 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133794898 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133794942 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133794949 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133795081 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133795105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133795138 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133795148 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133795163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133795243 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133795413 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133795414 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133795948 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133796134 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 133796230 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133796246 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 133796358 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 133796490 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 133796567 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 133796573 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 133797411 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133798531 G A Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 3 133799871 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133800250 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133801037 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133801112 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133801214 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 133801664 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 133802318 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 133803566 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 133803658 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 133803974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133804002 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 133804297 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133806172 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 133806565 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133806697 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 133809824 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133810341 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133810414 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133810719 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133811216 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 133811218 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133811444 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133811721 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 133811974 C A Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 133811991 C T N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 3 133812348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133812961 G T Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 133813484 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133813545 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 133813565 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133813655 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133813665 C T Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 133813673 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 133813802 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133813817 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133813886 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133814095 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 133814117 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133814128 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133814275 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133814286 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 133814640 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133814868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133816653 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133816738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133816995 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133818043 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 133818202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133819797 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133821669 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133822053 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 133822066 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133822223 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133822231 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 133822505 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 133823959 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133824619 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133826456 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 133826498 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133826621 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133826956 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133826997 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133827516 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133827829 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133829095 A C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 133829157 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133830256 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133830409 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133830971 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133831064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133831143 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133831148 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133831169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133831930 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 133832088 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 133832420 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133832459 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 133832480 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 133832850 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133834522 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133838140 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133839386 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 133841087 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133841592 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 133842032 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133842701 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 133843409 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133845043 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 133845362 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133845454 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133845721 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 133846762 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133846969 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133848111 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 133848293 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133848844 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 133849738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133850514 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133851104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133851251 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 133851309 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133852379 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 133852984 G T Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 133853098 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133853254 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133854415 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 133854551 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 133854630 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 133854632 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133854855 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 133855102 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133855201 C G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 133855212 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 133855737 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 133856991 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 133857191 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 133857485 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133857501 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 133857743 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 133857750 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 133857839 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 133858136 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 133858459 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 133858485 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133858798 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 133858834 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133858849 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 133858955 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133859235 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 133859445 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 133859552 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 133859609 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 133859673 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 133859699 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133859745 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 133859810 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133859825 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 133860164 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 133860244 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133860332 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133860433 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133860445 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133860478 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133860755 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 133860907 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 133860930 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 133860943 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 133860995 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 133861297 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 133861547 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 133861751 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 133862038 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 133863552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133863623 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133864066 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 133864086 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 133864839 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133865518 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 133865795 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133866533 T A Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 133867491 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 133867493 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 133867543 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133867718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133868100 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 133868101 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133868119 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 133868197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133868593 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133869085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133869097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133869113 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133869222 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133869293 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133869329 T G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133869382 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133869438 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133869547 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133869996 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133870080 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 133870389 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133870410 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 133870968 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133871174 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133871225 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133872436 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 133872620 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 133872647 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 133872681 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133872698 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 133872720 T C Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 133872731 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 133872734 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133872745 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133873231 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133873237 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133873423 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133873594 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 133873602 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133873609 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133873628 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133873675 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 133873925 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133874201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133874514 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 133874738 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 133874801 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133876398 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133876417 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133877103 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133877675 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133877731 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133877834 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133878055 T A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 133878066 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 133878153 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133878410 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 133879254 T C Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 3 133879548 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133880102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133880914 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133880915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133881419 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133882176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133882906 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133883408 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133883854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133883960 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133884873 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133885791 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133886478 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 133886640 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 133888181 A C Y N 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 3 133888489 T A Y N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 133889163 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133889209 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133889672 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133889815 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133890092 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 133890110 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 133890164 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133890857 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 133891345 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133891816 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133895859 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 133898598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133905167 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133906880 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 133907508 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 133908015 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133908185 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 133908893 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 133911619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133915620 C A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 133915981 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133916613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133917487 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 133919746 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 133920629 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 133924816 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 133927708 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133928372 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133928936 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 133929176 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 133929245 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133929275 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 133929328 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 133929555 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133929603 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133929629 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 133930279 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 133930508 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 133930558 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 133930644 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133930675 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133931394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133932154 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 133932273 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 133932400 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 133932569 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133932626 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 133932750 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 133934759 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 133934870 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133934878 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133935130 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133935529 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133941536 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 133942703 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 133944002 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133945425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133946929 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133947547 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133947840 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133949748 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 133949802 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133951556 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 133951673 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 133951731 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 133953561 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133954784 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 133955084 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 133955954 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 133956099 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 133956391 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 133956949 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133957154 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 133957420 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 133957489 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 133957534 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 133957570 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 133957587 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 133957600 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 133957693 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 133957804 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 133958104 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133958334 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133958609 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 133958690 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 133958905 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133959591 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133959644 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133959839 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 133959971 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133959991 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133960113 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 133960157 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133960168 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133960204 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133960212 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133960222 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133960238 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133960260 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 133960278 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133960284 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 133960303 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133960314 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133960330 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133960341 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133960353 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133960417 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133960737 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 133960740 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 133964765 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133966503 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133966980 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133968297 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133968459 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 133968815 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 133969108 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 133970225 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 133970383 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133970920 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133971438 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 133971636 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 133974345 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133974485 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133974650 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133975166 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133977102 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133977228 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133977682 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 133979112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133979159 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133979298 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133979878 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133980698 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133981072 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 133982810 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133983332 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133983420 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133983421 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133983608 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 133983669 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133983758 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 133983789 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 133984004 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 133984091 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 133984103 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 133984105 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 133984123 G T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 133984188 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 133984206 C A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 133984215 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 133984228 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 133984334 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 133984335 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 133984349 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 133984350 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 133984460 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 133984488 T G N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 133984581 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 133984639 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 133984798 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 133984912 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 133987631 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 133989694 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 133992384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 133993404 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133995688 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133995731 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 133997942 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 133997970 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 133998655 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 133998934 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 133999338 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134000171 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134000402 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134000442 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134001221 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 134001292 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 134001358 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 134001713 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134002408 C T N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 134002627 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134003058 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 134003400 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134003546 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 134003653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134003682 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134003938 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134004088 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134004117 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134004152 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134004181 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134004210 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134004260 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134004274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134004289 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134004310 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134004314 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134004388 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134004410 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134004421 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134004433 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134004525 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 134004531 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 134004685 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 7 5 1 5 0 3 134004700 A C N N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0 1 0 8 8 0 8 0 3 134004729 A C N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 134004822 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 134004831 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 134004844 A C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 134004859 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 134004869 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 134004984 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134005003 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134005146 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134005183 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134005303 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134005310 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134005331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134005344 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134005403 C A Y N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 134005480 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134005556 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134005785 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134005800 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 134005805 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 134005976 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 134005992 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 134006007 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 134006127 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 134006195 A C Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 134006216 C A N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 134006237 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 134006267 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 134006289 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 134006383 T A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 134006394 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 134006401 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 134006472 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 134006829 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134006947 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134006987 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134007023 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134007086 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134007121 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134007195 A T N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 134007203 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 134007231 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 134007293 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134007302 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134007421 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134007679 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 134007761 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134007768 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134007886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134007970 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134008210 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 134008228 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134008267 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134008370 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134008381 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134008416 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134008422 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134008441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134008444 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134008477 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134008484 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134008793 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134008920 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134008976 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134009035 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134009135 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134009165 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134009176 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134009255 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134009259 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134009336 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134009343 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134009358 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134009372 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134009427 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134009493 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134009494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134009662 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134009687 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134009690 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 134009757 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134010010 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134010011 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134010034 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134010068 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134010085 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 134010124 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134010134 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134010240 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134010256 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134010294 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134010301 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134010332 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134010419 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 134010421 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134010469 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134010503 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 134010546 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134010845 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134010902 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134010964 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134011007 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134011429 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134011715 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134011750 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134011867 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134011935 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134012069 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134012393 T A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 134012457 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 134012907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134012927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134012967 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134013046 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134013199 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134013435 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 134013484 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134013651 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134013664 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134013672 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134013711 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134013741 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134013774 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134013826 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134014081 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134014143 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134014326 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 134014551 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 134014934 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134014937 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 134015027 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134015036 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134015068 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 134015668 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 134016329 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134016336 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134016506 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134017346 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 134017429 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134017606 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134017714 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 134017846 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 134018059 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 134018288 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134018326 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134018669 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 134018728 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134019150 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 134019426 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 134019747 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 134019758 T G N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 134019761 A T N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 134020660 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134020701 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134021028 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134021250 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134021472 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 134021680 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134021990 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134022245 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134022311 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134022376 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134022496 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134022576 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134022657 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134022677 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134022756 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134023517 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 134023564 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134023835 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134024196 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 134024305 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134024406 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134024415 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134024670 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 134024890 A T N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 134025021 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 134025367 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134025492 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134025753 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134025826 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134025934 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134026375 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134026396 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134027503 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134027564 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134027595 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134027747 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 134027805 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 134027945 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 134027992 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 134028336 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 134028423 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 134028586 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134028593 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134028792 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 134029001 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134029014 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134029067 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 134029207 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 134029726 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 134029748 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 134029891 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134030075 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 134030217 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 134030293 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134030403 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134030461 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 134030638 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134030799 T G Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 134031057 T C N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 134032127 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134032940 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134033105 T G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 134033310 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134033493 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 134033512 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 134033636 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134033654 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134033685 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 134033715 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 134033718 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 134033727 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134033775 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134033802 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 134033858 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134034143 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134034278 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134034346 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 134034415 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134034416 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134034519 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134034540 G T Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 134034552 G A Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 134034732 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 134034764 C A Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 134034911 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134034949 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134034987 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134035037 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134035107 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134035235 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 134035477 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134035502 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134035516 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134035528 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134035716 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134035834 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 134035908 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134035916 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134035950 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134035978 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134036034 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 134036115 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 134036174 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134036220 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134036230 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134036643 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134036677 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134036816 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134036820 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134036838 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134036901 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 134036959 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 134037274 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134037386 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134037397 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134038155 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 134038253 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 134038283 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 134038331 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 134038381 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 134038443 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 134038550 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 134038646 G A Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 134039182 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134039411 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 134039412 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134039752 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 134039794 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 134039933 T A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 134040110 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 134040136 T A N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 3 134040258 C G Y N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 134040643 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 134040749 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 134040888 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134040958 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 134040983 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 134041068 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 134041079 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 134041083 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 134041124 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 134041234 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 134041251 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 134041260 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 134041490 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 134041551 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134041634 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 134041775 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134041846 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134042456 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 134042726 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134042743 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 134042849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134042886 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 134042896 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 134042906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134042907 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134042986 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 134042994 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 134043124 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 134043165 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 134043237 T G N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 134043308 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 134043475 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 134043574 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 134043634 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 134043680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134043861 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 134043877 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 134043920 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 134043960 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 134044288 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134044302 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134044316 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 134044358 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 134044415 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 134044484 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134044511 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 134044522 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 134044553 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 134044566 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 134044585 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 134044615 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 134044620 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134044685 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134044702 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 134044742 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134044770 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134044798 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134044874 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134044881 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 134044953 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 134045213 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 134045214 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 134045262 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134045340 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134045523 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 134045542 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134045555 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134045640 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134045655 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 134045680 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 134045765 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 134045768 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 134045933 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134045990 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134046006 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134046095 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134046116 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134046197 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134046210 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134046273 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134046364 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 134046612 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 134046689 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 134047047 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134047050 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134047078 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 134047243 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 134047265 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 134047316 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 134047459 A T N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 134047620 C T Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 134047634 C G Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 134047677 G C Y N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 134048745 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 134048921 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134049148 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 134049162 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 134049245 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 134049442 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 134049600 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 134049650 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 134049744 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 134049852 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 134050195 T C N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 134050375 G A Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 134050477 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 134050536 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 134050764 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 134050812 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 134050814 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 134050982 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134051202 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 134051226 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 134051393 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 134051484 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 134051498 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 134051500 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 134051521 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 134051572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134051578 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 134051623 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 134051633 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 134051636 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 134052875 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 134052885 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 134052954 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 134053059 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 134053060 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 134053101 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 134053106 A C N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 134053114 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 134053124 G T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 134053330 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 134053596 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 134053638 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 134053701 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 134053704 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 134053741 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 134053895 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 134054465 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 134055102 T G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 134055553 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134055714 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 134055799 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134056269 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134056911 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 134057044 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134057184 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134057278 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 134057365 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134057497 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 134057520 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 134057639 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 134057794 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 134058054 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134058289 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 134058329 A G Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 134058422 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 134058456 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 134058460 G T N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 134058476 T A N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 134058479 A G N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 134058535 T C N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 134058695 C A Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 134058846 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 134058851 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 134059072 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 134059234 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134059313 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134059391 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134059401 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134059424 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 134059502 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 134059508 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 134059529 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 134059728 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 134059745 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 134059751 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134059767 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134059825 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134059876 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134060984 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134061118 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 134062596 A G Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 134063033 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 134063850 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134064000 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134064172 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134064328 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134064697 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134064763 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 134065427 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 134065960 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 134065971 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 134066006 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 134066098 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 134066374 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 134066545 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 134066769 A G Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 134066770 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 134067217 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134067365 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 134067442 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 134067491 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 134067516 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 134067720 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 134067911 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134068102 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 134068132 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 134068832 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134069032 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134069140 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134069190 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 134069251 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 134069273 A G N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 134069378 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 134069383 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 134069397 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 134069459 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 134069616 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 134069631 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 134069658 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134069695 C A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 134069747 C A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 134069748 A T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 134069760 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 134069854 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 134069939 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134069975 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134070020 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134070049 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134070148 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 134070158 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134070208 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 134070302 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 134070410 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 134070423 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 134070504 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134070572 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134070608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134070781 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 134071320 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134071362 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134071397 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134071444 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134071805 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134071808 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134071864 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134071889 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134072462 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 134072614 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 134072663 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 134072994 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 134073014 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 134073063 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 134073172 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134073262 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 134073315 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134073357 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134073399 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134073599 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 134073679 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 134073830 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 134073937 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134073993 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 134074028 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134074039 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134074092 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 134074097 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 134074104 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 134074183 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134074310 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 134074383 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134074394 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134074408 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 134074538 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134074539 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134074595 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 134074662 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134074722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134074723 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134074737 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134074770 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134074798 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 134074838 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134074947 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 134074995 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 134075268 T G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 134075576 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 134075766 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 134075858 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 134076146 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134076346 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134077185 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 134077605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134078313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134080460 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134081089 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134081097 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134082182 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134082371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134082831 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134083435 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134083499 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134084047 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 134086806 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134089640 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 134089972 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 134090389 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 134090408 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 134092398 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134092774 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134093828 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 134094536 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 134094563 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 134094613 G C N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 134097779 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134098846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134098890 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134099596 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 134101421 G C Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 134102648 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 134104508 T G Y N 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 3 134104518 A G Y Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 3 134104818 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 134105550 T C Y Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.25 0.0833333333333333 0.666666666666667 7 17 3 1 8 3 134106120 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134106288 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134107699 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134108499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134110090 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134110886 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 134111965 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 134111966 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 134112265 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 134119620 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 134119636 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134120077 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 134120901 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134121082 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134121114 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134121131 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134121175 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134121437 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134121558 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 134121786 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 134121819 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 134121857 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 134121945 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134121998 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134122059 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134122081 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 134122154 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134122201 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 134122342 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134122443 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 134122505 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134122507 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134122728 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 134122735 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134122866 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 134122885 T C Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 134122899 T A Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 134122924 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134122980 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134123087 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 134123846 G A Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 134123868 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134123895 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134123984 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 134124069 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 134124152 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134124171 A T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 134124316 T A Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 134124373 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134124390 A C Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134124440 C T Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 134124450 T A Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 134124466 G C Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 134124467 G T Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 134124882 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134124976 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134125223 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 134125517 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134125536 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 134125731 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134126160 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 134126171 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 134126199 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 134126220 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 134126248 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134126297 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134126357 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134126591 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134126644 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134126754 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 134127013 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134127062 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 134127247 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 134127499 A G N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 134127565 G T N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 134127653 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 134127668 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 134127715 T G Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 134127753 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 134127770 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 134128215 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134128237 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134128810 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 134128919 A C N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 134128927 G T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 134128967 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 134129127 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134129304 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 134129436 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134129464 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134129623 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134129671 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 134129690 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134129702 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134129730 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134129762 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134129809 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134129813 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134129844 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134129865 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134129873 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134130096 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 134130131 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 134130140 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 134130167 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 134130185 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 134130268 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 134130533 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 134130612 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134130647 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 134130660 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 134130699 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134130736 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134130865 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134130918 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134131044 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134131075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134131313 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 134132525 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134132702 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134133266 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134133417 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134134636 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134135489 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 134135623 T C Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 134137026 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134138153 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 134138193 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134138300 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134139326 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134139409 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 134140777 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134141022 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134141368 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134142013 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134143424 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 134144153 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 134144469 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 134144474 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 134144820 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134145920 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134146411 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 134146746 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134146790 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 134148879 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134149089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134149130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134149150 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 134150176 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134150309 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134150343 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134150416 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134150497 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 134150702 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134150729 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134150789 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134150795 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134150810 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134150889 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134150934 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134151057 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134151169 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 134151214 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134151349 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134151446 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 134151495 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 134151882 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 134151962 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 134156684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134156724 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134158518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134159772 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134161432 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134162001 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 134163441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134164766 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134168167 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134170663 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134170974 A G Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 134171182 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 134174609 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 134178530 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134179046 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134179126 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134179182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134179923 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134180245 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134180634 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134181448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134182741 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134183640 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 134184768 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134185159 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 134187301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134188599 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134189987 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 134191376 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134191914 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 134192835 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 3 134192864 C A Y N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 134194243 C T Y Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 3 134201049 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 134202913 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 134203103 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 134203550 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 134205950 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 134206496 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134207525 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 134208444 A C N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 134216149 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134217266 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 134217599 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134217610 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134218336 C T N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 134218452 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 134218456 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 134219139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134219295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134219623 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 134222323 C G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 134222448 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 134223888 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 134223910 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134224928 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134225507 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 134225791 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134227426 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134228549 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 134229381 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134230164 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 134230694 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134231283 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134231709 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 134232545 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134235737 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134236038 C A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 134236039 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 134236721 G A Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 134236846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134236944 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134237987 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 134238655 G T Y N 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 134240281 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134240541 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134240610 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134242064 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134242162 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 134243678 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134244382 G A Y Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 134245161 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134245472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134245790 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 134246012 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134246117 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 134246132 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 134246143 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 134246153 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 134247057 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 134247078 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 134247673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134247968 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 134248510 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134248664 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134248774 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134249003 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134249044 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134249303 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 134249557 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134249798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134249865 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134249899 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134250046 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 134250824 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134250975 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 134251269 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134251333 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134251352 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134251354 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134251760 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134252178 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134252233 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134252369 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 134252500 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 134252620 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134252647 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 134252677 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134252781 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134252792 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134252971 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 134253089 C G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 134253431 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134253796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134253896 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134254560 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 134254669 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 134254690 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 134254699 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 134254720 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 134254726 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 134254753 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 134254772 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 134254782 A T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 134254804 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 134254896 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 134254961 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134254963 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134255079 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 134255084 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 134255134 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134255271 G C Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 134255299 A G Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 134255423 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 134255719 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134255741 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134255744 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134255995 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134256077 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134256125 C A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 134256134 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 134256281 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 134256282 A G Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 134256365 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134256392 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 134256494 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134256508 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 134256522 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 134256570 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134256728 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134256866 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134256977 G A Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 134257016 C A Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 134257118 A C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134257288 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134257382 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 134257476 A T Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 134257568 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 134257570 G T Y N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 3 134257651 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 3 134257691 C T Y Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 3 134257705 G T Y N 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 3 134257715 C T Y Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 3 134257820 C T Y Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 3 134257823 A G Y Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 3 134257871 G A N Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 3 134257884 A G N Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 3 134258463 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 134258482 C T Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 134258492 G A Y Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 3 134258493 C G Y N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0 1 0 4 4 0 4 0 3 134258625 C T Y Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 3 134259059 A G Y Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 134259138 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 134259162 T A Y N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 134259169 G A Y Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 3 134259207 G C Y N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 134259242 G A Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 134259284 G T Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134259351 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 134259409 T G Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 134259430 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 134259478 G T Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134259545 T C Y Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 3 134259643 A G Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 134259667 G A Y Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 134260975 A G Y Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 3 134260980 A T Y N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 134260987 T A Y N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 134261031 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134261105 T G Y N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 134261158 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 134261261 C A Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 134261306 A G Y Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 3 134261543 T C Y Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 3 134261558 C T Y Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 3 134261594 T C Y Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 134262265 G A Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 134262310 C T Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 134262323 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 134262433 T C Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 134262450 C G Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134262468 C T Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 134262470 T A Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 134262597 A G Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 134262635 C G Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134262668 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 134262710 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134262743 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134262749 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134262756 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134262786 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134262795 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134262814 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134262872 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 134262924 C T N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 134262927 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 134262978 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 14 10 2 10 0 3 134263008 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 134263133 A T Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 134263192 C T Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 134263255 A T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 134263314 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134263370 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134263450 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134263472 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134263505 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 134263525 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134263530 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134263582 G T Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 134263621 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 134263679 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134263684 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134263732 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134263789 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134263900 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134263977 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134264077 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134264162 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134264172 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134264261 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134264298 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 134264333 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134264410 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134264428 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 134264449 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134264497 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134264603 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134264622 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134264629 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134264741 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134264890 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134264922 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134265098 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134265283 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134265564 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 134265717 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 134265873 C A Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 134266242 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 134266294 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 134266318 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134266407 T A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 134266430 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 134266434 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 134266446 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 134266464 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 134266685 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 134266749 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 134266767 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 134267003 C G Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 134267045 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134267388 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 134267399 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134267419 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 134267484 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 134267791 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134267977 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134268089 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 134268173 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 134268424 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134268459 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134268848 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 134268958 A G N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 134269000 A G N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 3 134269026 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 134269085 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 134269239 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134269371 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134269620 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 134269674 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 134269691 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 134269767 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134269783 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 134269825 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 134269978 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134269985 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134269998 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 134270190 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 134270191 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134270233 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 134270315 A C N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 3 134271250 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134271251 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 134271351 A C Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 134271376 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 134271399 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134271458 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 134271851 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 134272059 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134272093 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134272156 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 134272524 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 134272790 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 134272984 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134273077 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134273203 A G Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 134273260 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 134273635 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134273683 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 134273962 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134274384 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134274418 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134274435 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134274443 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134274537 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 134274569 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134274897 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134274958 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134275401 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134275506 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134277695 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 134278547 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134278940 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134279326 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134281019 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 134281554 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134281629 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134283216 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134283254 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134283581 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 134284040 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134284252 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134284264 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 134284434 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 134284584 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 134284623 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 134284650 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 134284659 G C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 134284677 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 134284697 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 134284929 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 134284971 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 134284981 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 134285007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134285008 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 134285057 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134285128 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134285294 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134285345 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134285490 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 134286406 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134287237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134287246 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134287264 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134287366 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 134287654 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134289304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134289608 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134290104 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134290118 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 134290266 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 134291648 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 134292897 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134293594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134293665 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 134293690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134295156 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 134295331 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 3 134295504 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134296185 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 134296776 T G Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 134297614 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 134297641 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134297732 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134297870 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 134298331 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134300152 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 134301776 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 134303526 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134303536 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134303561 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134303937 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134304958 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134305054 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134306031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134306143 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134306278 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 134307335 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 134307784 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134308232 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 134308511 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134309743 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 134309928 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134310007 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134310577 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134310663 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134310795 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134310834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134310944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134311026 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 134311174 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 134311256 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 134311478 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134311512 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 134311641 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134311728 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134311890 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134312035 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 134312253 A G Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 134312270 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 134312307 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134312368 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134312384 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134312390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134312660 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134312968 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134313478 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 134313565 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134314508 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134314522 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 134314587 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 134314863 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 134314929 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134314960 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 134314984 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 134315009 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 134315055 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 134315093 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 134315109 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 134315117 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 134315132 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 134315156 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134315164 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 134315191 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 134315268 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 134315283 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134315286 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 134315296 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 134315315 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 134315336 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 134315355 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 134315372 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 134315412 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 134315551 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 134315583 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 134315602 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 134315651 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 134315876 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134315907 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 134316029 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 134316049 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 134316216 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134316400 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 134316413 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134316414 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134316438 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 134316482 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134316528 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134316559 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 134316578 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 134316633 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134316889 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 134316891 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 134316920 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134317230 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134317246 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 134317253 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 134317643 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 134317776 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134318119 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134318296 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134318316 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134318437 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 134318579 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134318616 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134319326 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 134319331 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 134319474 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134320303 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 134320880 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 134320882 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134321300 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 134321363 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 134321444 A T N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 134321663 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134322565 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134322762 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 134323032 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134323159 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134323383 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134323513 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134323515 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134323612 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134324591 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134324653 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134324738 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134324832 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134324927 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134325110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134325448 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134325596 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134326664 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 134326712 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 134326738 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 134326804 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 134327543 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 134327667 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134328223 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 134328327 T G Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 134328455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134328488 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 134329131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134329518 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134329695 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134330272 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 134330370 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 134330585 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134330617 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 134330625 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 134331440 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134331442 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 134331554 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134331596 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134331619 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134331628 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134331750 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 134331838 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134331903 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134332288 A T N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 134332433 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 134332496 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134332886 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134333148 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134333177 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134333271 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134333309 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 134333392 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134333453 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134333462 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134333529 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 134333574 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134333619 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134333741 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 134333912 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134333913 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134333934 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134333999 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134334050 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134334207 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134334322 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134334334 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 134334344 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 134334390 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 134334403 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 134334488 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134334516 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134334549 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134334589 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134334615 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134334622 A G Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 134334711 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 134334737 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 134334775 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 134334789 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 134334967 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 134335020 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134336309 C A Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 134336331 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 134337492 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134337509 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134337621 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134337845 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134338645 A C Y N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 134338733 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 134339410 G A Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 134339426 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134339865 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134340125 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134340378 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134340605 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 134343012 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134343212 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 134343261 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 134343266 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 134343562 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134344419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134344664 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134344773 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134345755 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134346252 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134347022 A T Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 134354372 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134355811 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134356341 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 134356663 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134357910 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134358264 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134358876 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134361198 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134364553 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134365419 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 134366479 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134366673 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134366787 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134366801 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134366998 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134367852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134368256 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134369246 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134369958 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134370458 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134371149 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134371254 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134372173 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 134372477 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134372494 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 134372636 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134373722 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134374215 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134374264 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134379127 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134381225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134381476 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134381577 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 134383332 G A Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 134385261 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 134385482 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 134385782 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134386579 A G Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 134389565 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 134390538 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134390560 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 134390621 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134391493 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134391567 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 134392333 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 134392395 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 134392424 G A Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 134392566 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 134392929 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134393002 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 134393473 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 134393558 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134393560 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134393889 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134393905 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134393926 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134394005 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134394264 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 134394362 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134394682 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134394705 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134394710 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134394726 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134395510 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134396075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134396571 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 134396753 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 134397099 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134397163 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134397186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134397335 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 134398158 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 134398286 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 134398307 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134398345 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134398356 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134398359 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134398787 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 134398830 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134398875 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 134399738 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 134400438 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134401010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134402912 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134403925 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134404758 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134405995 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 134411515 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134412491 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134412816 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134413094 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134413515 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134416469 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134416928 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134418357 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134418644 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 134419525 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 134419887 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134420355 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 134420422 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134420824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134423395 G T Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 134425772 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134425989 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134426233 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134429007 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134429753 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 134429756 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 134429996 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134431521 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134434603 C G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 134436563 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134436670 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 134437155 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 134437433 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 134437493 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134437676 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 134437689 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 134439533 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134441060 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134441281 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 134441343 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 134441732 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134442254 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 134443030 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 134443116 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 134443596 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134443616 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 134443626 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134443720 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 134443898 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134444293 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 134445271 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134447789 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 134448159 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134448513 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134449134 A C Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 134449186 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 134449739 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 134450191 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 134450270 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 134450542 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 134450746 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 134453182 A C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 134454193 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134454821 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 134454902 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 134455465 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134455617 G A Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 134455631 A T Y N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 134457696 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134457715 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134458276 G T Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 134458405 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134459261 G A Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 134459296 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 134459312 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 134459319 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 134459832 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134460229 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 134460512 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134461408 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134461665 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134462492 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134464640 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134465002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134465305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134467226 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134467361 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 134467532 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 134467995 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 134468359 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134469210 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 134469211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134469285 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134471314 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 134471698 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134471704 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 134471747 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134471963 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134472802 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 134472845 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 134473983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134474623 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 134474721 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 134475655 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134475783 G C Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 134476790 G T Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 134476883 A C Y N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 134477696 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 134485160 C A Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 134485886 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 134485921 T C Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 134486273 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 134487093 A T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 134487148 C G N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 134488247 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134490637 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134490727 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134493045 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 134493214 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134493278 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 134494495 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134494687 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134495684 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 134495996 A C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 134497221 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134497773 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134497928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134498026 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 134498156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134499228 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134499830 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134500164 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134501063 C G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 134501113 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134501571 T A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 134501723 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 134501750 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 134501783 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 134501921 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134502017 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134502020 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134502056 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134502345 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134504403 G A Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 3 134505541 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 134505655 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 134505756 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 134505832 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134506527 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134508099 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134508235 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 134509373 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 134511974 A T Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 134512164 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134512191 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134512605 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134512699 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 134513190 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 134513579 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134513976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134514058 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134514261 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134514273 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 134514381 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134514573 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134514589 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 134514590 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 134514605 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 134514716 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134514992 A T N N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 3 134514998 T A N N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 3 134515054 T A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 134515210 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134515239 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134516633 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134517375 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 134517388 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 134517463 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 134517582 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134518606 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 134519032 T C Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 134520539 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134521305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134523460 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134524437 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134524440 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134525071 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134532854 T G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 134533206 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 134538519 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 134539212 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 134539674 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 134540754 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 134540842 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134541863 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134542705 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134552365 A C N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 134552551 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 134553137 A G N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 134553412 G A N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 134555249 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 134556391 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 134557227 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 134562003 A C Y N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 134562951 G A Y Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 3 134564134 T A Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 134566152 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134566729 T G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 134570334 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 134572815 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 134572845 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 134572903 C T Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 3 134572927 C T Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 3 134572953 C T Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 3 134573004 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 134573078 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134573178 T A Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 134573181 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 134573237 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 134574999 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134575271 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 134576654 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134577729 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 134579536 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 134580701 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134581050 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 134582261 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134585570 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 134586046 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134587488 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134587675 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134588397 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134588817 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 134588905 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134589357 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134589878 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 134590148 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 134590427 G C N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 134590595 G T N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 3 134591427 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134592143 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 134592463 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 134592588 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 134595339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134596331 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134597407 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 134598076 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134599489 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134599637 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134600536 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134600566 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134600589 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134600606 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134600632 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134600668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134600699 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 134600741 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134600878 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134601291 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134601362 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 134601481 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 134601608 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134601936 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 134602213 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 134602467 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 3 134602518 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 134602693 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 134602976 G T Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 3 134603670 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134603790 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134603922 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 134604016 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 134604118 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134604245 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134604294 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134604372 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134604419 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 134604434 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 134604529 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134604537 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134604586 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134604603 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 134604639 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 134604647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134604858 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 134604864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134604909 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 134605154 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134605339 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 134605452 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134605565 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 134605626 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134605676 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 134605754 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 134605787 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134605986 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 134606006 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 134606098 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 134606147 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 134606186 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134606366 G C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 134606477 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 134606492 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 134606510 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 134606516 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134606572 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134606625 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134606635 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 134606767 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 134607070 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134607096 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134607117 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 134607242 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 134607306 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134607531 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134607615 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 134608020 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 134608120 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 134608157 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134608447 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 134608842 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 134609112 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134609113 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134609204 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134609337 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134609359 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134609392 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134609499 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134609503 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134609619 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 134610120 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134610239 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 134610241 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134610337 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134610357 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134610719 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134610842 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134610934 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134610996 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134611003 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 134611043 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134611065 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 134611264 A T N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 134611310 C T N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 134611408 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134611518 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134611568 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134611611 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134611753 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134611920 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 134612118 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134612256 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134612302 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 134612373 A C Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 134612468 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 134612508 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 134612549 T C Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 134612573 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 134612684 T G Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134612781 A C Y N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 134613008 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134613207 G A Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 134613250 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 134613289 A T Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 134613351 C G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 134613382 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 134613508 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 134613614 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 134613647 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 134613934 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 134613957 G A Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 134614362 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 134614423 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 134614433 A G N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.363636363636364 0.545454545454545 0.0909090909090909 14 8 4 6 1 3 134614534 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 134614665 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134614675 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 134614687 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 134614810 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 134614814 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134614825 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 134614830 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 134614926 A G Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 134614991 A C Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 134615004 G A Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 134615045 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134615072 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 134615144 T C Y Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 134615179 C A Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 134615183 T A Y N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 3 134615213 A G Y Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 3 134615318 A G Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 134615343 G A Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 134615358 G A Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 134615377 G T Y N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 3 134615642 A T Y N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 134615748 C G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 134615810 A T Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 134615855 C T Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 134615882 T C Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 134615909 A G Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 134615916 C A Y N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 134615930 T C Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 134616045 C T Y Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 134616065 C A Y N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 134616073 C T Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 134616081 G A Y Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 134616100 C T Y Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 134616153 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 134616198 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 134616257 G A Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 134616268 A T Y N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 3 134616363 A C Y N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 134616465 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 134616697 A T Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 134616879 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134616958 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 134617030 A C Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134617116 A C Y N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 134617149 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134617162 C G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 134617231 G C N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 3 134617246 A C N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 3 134617261 A T Y N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 3 134618036 G A Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 134618103 C G Y N 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 134618181 A G Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 134618334 A G Y Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 3 134618335 A G Y Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 8 6 1 6 0 3 134618347 A G Y Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 6 10 2 2 4 3 134618394 A G Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 134618443 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 134618471 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 134618480 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134618542 A G Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.0588235294117647 0.823529411764706 0.117647058823529 16 18 1 14 2 3 134618624 C A Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.0526315789473684 0.736842105263158 0.210526315789474 16 22 1 14 4 3 134618967 G A Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 134619064 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 134619120 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 134619161 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134619239 A C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 134619297 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 134619426 A G Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 134619484 A G Y Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 134619542 C A Y N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 134619556 G A Y Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 134619600 G T Y N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 134619604 A G Y Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 3 134619841 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 134619912 C A Y N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 134620009 C A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 134620011 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 134620037 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 3 134620069 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 134620140 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 134620205 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 134620245 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134620260 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 134620290 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 134620444 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134620466 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 134620765 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134620777 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 134620903 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 134621029 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 134621056 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 134621072 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 134621104 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 134621114 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 134621137 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 134621193 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 134621252 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 134621306 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134621430 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 134621483 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 134621600 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 134621723 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 134621767 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 134621806 A T Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 134621989 A C Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 134622109 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 134622180 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 134622208 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 134622221 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 134622256 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 134622551 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 134622597 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 134622678 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 134622790 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134622826 A C Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 134622995 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134623034 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 134623089 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 134623131 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 134623290 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 134623302 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 134623333 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 134623440 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 134623506 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 134623575 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 134623619 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 134623696 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 134623761 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 134623827 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 134623829 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 134623845 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 134623875 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134623884 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 134623938 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 134623998 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134624160 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 134624229 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 134624441 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 134624691 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 134624744 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 134624919 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 134624992 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 134625003 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 134625053 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 134625089 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 134625138 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 134625172 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 134625204 T C N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 3 134625207 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 134625230 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 134625415 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134625433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134625440 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 134625495 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 134625509 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 134625517 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 134625520 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134625534 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 134625573 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 134625608 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134625665 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134626120 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 134626135 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 134626215 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 134626446 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134626484 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134626523 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 134626567 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 134626577 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 134626586 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 134626591 C G N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 134626620 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 134626695 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 134626716 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 134626803 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 134626958 T A N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 134627057 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 134627088 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 134627126 C G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 134627177 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 134627253 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134627324 G A N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 134627383 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 134627415 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 134627445 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 134627633 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 134627791 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 134627804 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134627825 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134627988 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 134628014 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 134628083 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 134628167 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 134628213 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 134628223 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 134628361 A G N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 134628442 T G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 134628565 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 134628570 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 134628618 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 134628680 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134628690 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 134628751 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134628848 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134628940 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134629004 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 134629223 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 134629255 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134629271 A C Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 134629436 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 134629548 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 134629677 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134629712 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134629764 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134629876 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134629972 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 134630015 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 134630042 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134630081 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134630114 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134630115 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134630213 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 134630263 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134630413 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 134630472 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 134630610 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134630688 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134630774 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134630840 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134630917 A T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 134630945 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 134630972 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 134631112 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 134631185 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134631215 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 134631236 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 134631380 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134631444 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 134631448 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 134631492 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134631542 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 134631938 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134632275 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 134632338 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134632451 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134632587 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134632611 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134632634 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134632795 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134632899 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 134632944 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134633072 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134633093 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134633159 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134633236 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 134633258 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134633288 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 134633437 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 134633635 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134633667 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134633742 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134633832 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 134633930 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 134634085 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134634379 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134634836 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 134634851 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 134634858 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134634969 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134634979 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134635063 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 134635112 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 134635565 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 134636733 G A N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 3 134636751 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 134636753 A T N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 134636835 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 134636851 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 134636853 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 134636903 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 3 134636922 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 134636930 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 134636948 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 134637125 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 134637149 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 134637176 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 134637218 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134637265 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 134637267 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 134637364 C G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 134638263 T G N N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 3 134638294 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 134638333 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 134638375 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 134638397 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 134638451 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 134638471 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 134638683 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 134638684 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 134638700 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 134638708 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 134638895 T G N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 134638902 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 134638921 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 134639017 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 134639134 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 134639200 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134639230 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 134639299 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 134639416 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 134639425 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134639683 T A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 134639696 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 134639730 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 134639733 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 134639817 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 134639874 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 134639949 C A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 134640005 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 134640015 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 134640020 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 134640075 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 134640471 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134640512 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134640546 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 134640666 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 134640698 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 134640970 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134640999 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134641066 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134641377 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 134641452 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134642057 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 134642234 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134642451 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134642508 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 134642585 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 134642668 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 134642752 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134642763 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134642816 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134643000 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134643158 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 134643159 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 134643404 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 134643484 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 134643776 G A N Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 8 6 2 4 1 3 134643789 G A N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 3 134643880 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 134643896 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 134644053 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 134644182 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134644239 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134644256 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 134644264 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134644305 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134644379 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134644411 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134644608 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 134644728 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 134644847 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 134644852 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 134645024 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 134645143 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 134645324 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134645357 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134645374 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 134645670 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 134645683 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 134646046 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134646089 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 134646120 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134646161 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 134646181 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134646196 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 134646226 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 134646335 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134646359 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 134646551 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134646745 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134646885 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134646916 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134647116 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 134647161 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 134647291 G C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 134647320 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 134647340 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 134647387 A C N N 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 6 6 1 4 1 3 134647642 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 134647669 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 134647685 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 134647806 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134647818 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 134647843 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 134647893 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 134648122 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134648159 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134648263 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134648321 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 134648411 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134649047 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 134649061 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134649157 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134649162 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 134649229 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134649260 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134649316 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134649518 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134649572 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134650002 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 134650274 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 134650299 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 134650393 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134650428 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 134650538 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134650660 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134650716 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134650776 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134650817 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134650854 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134650959 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 134651070 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134651091 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 134651128 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 134651182 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134651235 G C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 134651249 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134651253 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 134651262 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 134651271 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 134651842 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 134651866 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 134651870 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 134651924 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 134651979 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 134652030 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 134652045 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 134652094 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134652156 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 134652246 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 134652310 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 134652420 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 134652449 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134652473 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 134652521 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134652606 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 134652633 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 134652692 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134652845 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 134652941 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134653054 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134653075 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134653308 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 134653320 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 134653338 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 134653435 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 134653591 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134653592 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134653619 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134653686 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 134653767 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 134653799 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 134653822 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 134653852 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 134653868 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 134653983 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134654061 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 134654113 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 134654263 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134654348 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 134654574 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 134654687 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 134654701 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134654805 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134654922 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 134654974 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134655083 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134655131 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 134655151 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 134655448 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134655489 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 134655490 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 134655659 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 134655696 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134655761 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134655765 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 134655779 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 134655801 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 134655874 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134655914 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134656069 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 134656123 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134656197 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134656204 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 134656227 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 134656251 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134656257 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 134656267 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134656290 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 134656443 C A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 134656452 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 134656455 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134656551 A T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 134656569 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 134656587 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134656630 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 134656649 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 134656801 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134656849 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134656884 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 134656924 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 134657317 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 134657380 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134657416 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134657447 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 134657486 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 134657996 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134658622 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134658769 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134658805 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 134659625 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 134659627 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 134659646 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 134659726 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 134659855 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134659899 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 134659941 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 134660175 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 134660639 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134660838 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 134661043 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134661581 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134662029 C G Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 134662030 T A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 134662121 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134662289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134662355 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 134662447 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134662522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134662605 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134662861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134662936 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134663439 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134663595 A C Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 134663726 A G Y Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 5 5 1 3 1 3 134663745 A G Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 134663748 T C Y Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 3 134663932 A G Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 134663951 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 134664039 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 134664099 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 134664233 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 134664584 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 134665126 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134665372 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134667026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134667207 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134667599 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 134667776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134668080 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134668084 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134668238 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 134668360 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134668380 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134668412 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134669010 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134669237 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 134669608 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 134669908 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134669998 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134670151 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 134670315 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134670596 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134670792 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134670933 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 134670971 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134671080 G T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 134671113 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 134671696 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134671742 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134671979 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134672020 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 134672059 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 134672273 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 134672399 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134672821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134672827 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134673886 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134673898 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134673932 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134674017 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 134674055 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134674091 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 134674439 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134674461 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 134674507 T A N N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 3 134674539 A C N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 134674928 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134676849 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134678213 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134678834 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134678887 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134678969 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134679836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134680073 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134680227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134680870 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134681524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134681678 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134681856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134682393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134682397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134684910 T A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 134685539 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 134685544 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134685562 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134685817 C T Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 134686284 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134687103 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134687515 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134688059 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 134688160 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 134688411 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134688786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134691508 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134691672 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 134692121 A T N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 134692634 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134693323 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134693759 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134695318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134695765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134696309 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134696525 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134696562 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134696901 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 134696921 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 134697077 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 134697122 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 134697140 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 134697353 C A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 134697354 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 134697624 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134697800 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134698032 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134698240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134698273 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 134698376 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134698726 G A Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 134699454 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134699594 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 134699599 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134699801 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 134700731 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 134701007 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 134701466 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 134701595 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 134701753 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134701813 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134701838 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134701921 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134701994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134702128 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134702188 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134702298 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134703196 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134703796 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 134703921 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 134704178 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134704198 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 134704203 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 134704360 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134704390 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 134704508 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 134704613 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134706055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134706336 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134706346 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 134706366 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134706498 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134706702 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134710103 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134710319 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134711252 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134711461 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134711683 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134712910 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 134714427 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134714484 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134716621 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134717174 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134717205 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134717723 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 134718067 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 134718325 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134719532 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134719724 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134719827 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134721950 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134722367 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134723112 G C Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 134723170 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134726575 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134726846 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 134728176 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 134728238 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134728340 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134729332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134729891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134730860 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 134731241 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134731500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134732266 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134732274 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134732387 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 134733361 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134733506 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134733993 C A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 134734573 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134735383 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 134735527 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134735972 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134736361 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134736456 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 134736981 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134737126 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 134737146 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134737327 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134737478 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 134737693 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134737781 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134737919 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134738100 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134738197 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134738198 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134738462 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 134738469 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 134738555 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134738587 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 134738673 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 134738705 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 134738825 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134738857 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 134738927 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 134738933 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 134739209 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134739337 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 134739407 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134739571 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 134740419 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 134740800 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 134741002 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134741047 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134741080 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 134741099 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 134741301 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134741527 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 134741565 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 134741609 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134741659 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 134741741 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 134741952 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134742000 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134742058 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134742150 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134742198 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 134742319 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134742570 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134742598 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134742616 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134742670 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 134742720 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134742736 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134742960 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134742968 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134743015 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134743032 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134743146 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134743156 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134743309 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134743400 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134743699 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 134744285 G C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 134744338 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 134744363 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 134744373 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 134744397 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134744516 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134744531 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134744646 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 134744731 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134744757 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 134744899 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 134745036 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134745117 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134745235 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134745276 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134745341 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134745374 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134745449 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134745523 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134745560 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134745591 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 134745600 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134745652 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 134745667 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134745668 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134745726 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134745733 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 134745788 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134745852 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 134745901 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 134745950 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134746140 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134746216 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 134746253 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 134746259 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 134746292 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 134746346 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 134746449 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 134746477 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 134746528 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 134746590 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 134746610 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 134746672 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 134746798 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 134746864 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134746903 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 134747012 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 134747195 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134747412 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 134747418 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 134747480 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 134747595 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 134747686 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 134748245 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 134748323 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134748345 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 134748392 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134748397 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 134748405 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134748453 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134748682 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134748689 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134748766 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134748832 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 134749215 A T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 134749281 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134749310 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 134749435 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134749452 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 134749497 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 134749516 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 134749525 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 134749623 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134749689 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 134749737 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134749819 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134749853 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134749910 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 134749942 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134749965 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134750017 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134750076 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134750096 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 134750130 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134750150 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134750167 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 134750366 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134750404 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 134750427 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 134750493 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 134750516 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 134750530 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 134750608 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 134750630 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 134750634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134750641 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 134750671 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134750718 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134750765 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 134750852 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 134750862 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134752831 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134752866 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134753048 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134753124 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 134753134 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 134753190 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 134753268 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 134753909 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.133333333333333 0.6 0.266666666666667 13 17 2 9 4 3 134753933 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 134754171 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 134754192 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134754353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134754772 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134755069 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134755871 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 134756118 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 134756153 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 134756172 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 134756208 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 134756339 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 134756427 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 134756678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134756695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134756802 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 134756856 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 134757182 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 134757397 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 134757462 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134757710 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134757936 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 134758020 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 134758071 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 134758089 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 134758233 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 134758497 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134758572 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134758577 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134758589 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134758601 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134758606 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134758626 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134758631 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134758644 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134758658 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134758668 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134758693 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 134758699 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134758746 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134758787 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134758841 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 134759044 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 134759061 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 134759122 A C N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 134759141 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 134759191 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 134759221 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 134759250 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 134759257 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 134762876 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134762995 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134763062 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 134763201 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134763209 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134763250 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134763568 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 134763616 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134763850 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134764029 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 134764030 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 134764152 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 134764171 T C N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.181818181818182 0.545454545454545 0.272727272727273 10 12 2 6 3 3 134764209 A G N Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 3 134764235 A G N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 10 10 3 4 3 3 134764251 T C N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 3 134764289 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134764299 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 134764392 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 134764481 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 134764513 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134764984 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134765032 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134765136 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 134765353 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134765377 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 134765388 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 134765473 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 134765990 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 134766271 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134766511 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 134766526 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134766650 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134766660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134766726 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134766807 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134767329 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 134767330 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 134767578 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 134767582 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 134767601 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134768111 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134768266 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134768335 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 134768369 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134768375 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134768430 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 134768472 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134768484 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 134768854 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134768990 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 134768999 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 134769084 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134769113 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134769377 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134769438 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134769449 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134769473 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134769667 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134769965 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134770031 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 134770206 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 134770501 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 134770557 G T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 134770611 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 134770624 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 134770724 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 134770781 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 134770870 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 134770875 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 134770972 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 134771022 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 134771076 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 134771223 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134771310 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 134771418 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 134771422 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 134771429 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 134771470 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 134771483 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 134771816 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 134771907 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 134771911 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 134771921 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 134772143 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134772170 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 134772184 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 134772265 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 134772435 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 134772473 G A Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 134772485 T A N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 134772813 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 134773000 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 134773700 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134773734 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 134773948 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 134774033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134774338 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 134774863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134775366 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134775412 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134775683 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 134775990 G A Y Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 134776262 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134776491 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 134776513 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 134776722 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 134776881 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134777750 A G N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.454545454545455 0.454545454545455 0.0909090909090909 15 7 5 5 1 3 134778206 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 134778234 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 134778320 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 134778783 T A N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 134779230 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134779308 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134779310 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134779708 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 134779756 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 134779848 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134779935 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 134780366 C A Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 134780371 G A Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 134780882 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 134781023 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 134781119 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134781127 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134781398 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 134781714 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 134781755 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 134781919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134782059 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 134782165 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 134782187 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 134782305 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 134782338 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 134782342 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 134782368 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 134782396 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 134782586 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 134782703 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134782833 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 134782891 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134782956 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134783095 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 134783101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134783146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134783310 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 134783322 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134783371 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 134783379 A T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 134783892 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 134784107 T C Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 134784123 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 134784130 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 134784134 A T N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 134784165 A G Y Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.230769230769231 0.769230769230769 0 16 10 3 10 0 3 134784274 C A Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 134784276 T C Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 134784296 G A Y Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.416666666666667 0.583333333333333 0 17 7 5 7 0 3 134784412 T A Y N 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.25 0.75 0 10 6 2 6 0 3 134784418 T A N N 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0 0.777777777777778 0.222222222222222 7 11 0 7 2 3 134784428 A C Y N 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.3 0.7 0 13 7 3 7 0 3 134784444 C T N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.384615384615385 0.538461538461538 0.0769230769230769 17 9 5 7 1 3 134784450 T A Y N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.384615384615385 0.538461538461538 0.0769230769230769 17 9 5 7 1 3 134784455 C T Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.384615384615385 0.538461538461538 0.0769230769230769 17 9 5 7 1 3 134784706 T A Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 134784742 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 134784744 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 134784926 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134785059 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134785299 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134785312 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134785362 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134785399 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134785670 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134785893 G T Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 134785900 T C N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 134785956 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 134785964 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 134786141 G T Y N 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 3 134786159 G A Y Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 134786454 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134786478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134786536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134786548 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134786700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134786725 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134786925 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 134786942 T A Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 134787501 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 134787660 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 134787852 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134788159 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134788166 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134788184 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134788279 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 134788500 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 134788581 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134788583 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 134788596 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134788984 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134789015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134789055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134789162 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 134789176 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134789193 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134789216 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134789217 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 134789249 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 134789250 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 134789350 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134789363 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134789366 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134789381 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134789400 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134789997 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 134790033 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 10 20 0 10 5 3 134790133 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 134790367 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 134790434 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 134790459 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 134790474 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 134790509 A T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 134790752 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 134790781 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 134790784 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 134790818 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 134790948 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 134790967 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 134791126 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 134791159 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134791162 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134791178 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 134791192 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 134791195 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 134791234 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 134791243 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134791296 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 134791405 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 134791505 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134791522 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 134791584 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134792699 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134792705 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 134792785 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 134792902 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 134792911 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134793010 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134793414 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 134793921 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134793926 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134794012 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 134794056 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134794172 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134794199 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134794215 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134794302 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 134794371 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 134794610 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134794619 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 134794640 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134794724 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134794756 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 134794763 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 134794854 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134794873 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 134794902 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134794934 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134794951 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134795021 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 134795040 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 134795314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134795316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134795847 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134795905 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134796574 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 134796635 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 134796778 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 134797075 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 134797081 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134797624 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 134797797 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134798145 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 134798469 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 134798471 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 134798504 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 134798687 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 134798747 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 134799157 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134799200 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 134799367 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134799635 T G Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 134799647 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134799761 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 134799814 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134799860 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 134800005 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 134800060 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 134800132 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 134800185 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134800323 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 134800328 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 134800380 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 134800513 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134800622 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 134800669 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 134800677 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134800874 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 134800885 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 134800957 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 134801035 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 134801424 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134801501 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 134801537 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134801547 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134801594 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134802034 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134802077 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134802105 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134802223 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134802226 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134802563 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134802778 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134802907 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 134802957 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 134802985 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 134803094 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 134803388 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 134803435 C A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 134803488 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 134803608 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 134803804 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 134803933 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134803976 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 134804010 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 134804027 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134804039 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134804072 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 134804087 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 134804111 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 134804448 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134804608 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134804677 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 134804687 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 134804801 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134804807 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 134804832 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 134805290 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134806544 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 134808364 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 134808389 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 134808504 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 134808816 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 134808934 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 134809048 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 134809320 T G Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 134809417 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134809426 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 134809543 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 134809720 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 134809740 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134809786 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 134809793 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 134809956 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 134809976 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 134810016 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 134810140 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134810172 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 134810190 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 134810212 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134810221 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 134810401 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 134810403 A G Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 134810536 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 134810567 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 134810616 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 134810640 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 134810682 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 134810692 T A Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 134810743 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 134810785 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 134810837 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 134810841 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 134810882 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 134811004 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 134811093 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 134812508 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 134812551 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134812610 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134812674 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134813119 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 134813222 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134814606 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 134814655 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134815389 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134815411 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134815616 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134815769 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134815926 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134817057 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134817180 C G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 134817371 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 134817641 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134817773 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134818057 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 134818172 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 134818430 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 134818482 T A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 134818490 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 134818633 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134818683 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 134818819 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 134819145 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 134819661 A G N Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 9 9 3 3 3 3 134826354 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134826911 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 134826959 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134827514 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 134827816 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 134827927 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 134828018 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134828021 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134828111 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 134828156 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 134828172 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 134828184 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 134828338 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 134828365 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 134828380 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134828475 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134828501 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 134828505 A C Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134828519 T A Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 134829321 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 134829385 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 134829410 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 134829596 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 134829598 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 134829665 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 134829681 C T N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 134829726 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 134829801 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 134829874 G C N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 134830000 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134830047 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 134830079 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 134830180 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134830210 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 134830468 T A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 134830479 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 134830515 C G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 134830523 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 134830529 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 134830539 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 134830547 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 134830592 C A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.4375 0.1875 0.375 17 15 7 3 6 3 134830628 C A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 134830828 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 134830913 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 134830946 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 134830994 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 134831087 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 134831192 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 134831196 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 134831237 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 134831256 A C N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 134831378 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 134831404 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 134831471 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 134831495 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 134831519 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134831546 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 134831661 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 134831692 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 134831729 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 134831755 A T N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 134831758 G C N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 134831769 T G N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 3 134831921 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134831947 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 134832002 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134832014 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134832064 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 134832087 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 134832189 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134832227 C G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 134832326 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 134832345 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 134832346 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 134832378 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 134832537 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 134832732 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 134833772 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 134834051 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134834079 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 134834323 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134834340 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 134834357 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134834791 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 134835041 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134835597 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 134836672 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134837140 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 134838088 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134839108 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 134839188 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134840363 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134840911 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134842106 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 134842703 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 134843854 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134844196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134844428 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134844486 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 134844497 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134845025 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 134845185 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 134845217 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134845279 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134845854 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134845891 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134846155 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 134846500 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 134847136 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 134847146 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 134847222 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 134847266 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 134847352 C T N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 3 134847829 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 134848157 T A N N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 3 134849900 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134850131 T G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 134850256 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 134850422 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 134850538 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134850584 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134850620 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134850699 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134850789 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 134851012 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134851026 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134851068 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 134851072 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 134851184 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134851540 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134851620 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134851680 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134852251 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134852433 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134852463 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134852482 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 134852670 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 134852676 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134852708 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 134852785 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134853034 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 134853287 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 134853879 G A Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 134855067 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 134855141 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 134855366 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134857088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134863581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134863635 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 134863645 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 134863650 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 134863786 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 134863794 G T N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 134863820 A T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 134863825 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 134863863 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 134863877 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 134864081 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 134864194 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134864310 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 134864444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134864512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134864534 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 134864614 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 134864657 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 134864677 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 134864776 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134864796 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134864830 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 134864876 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 134864878 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 134864940 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 134865073 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134865171 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134865241 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134865402 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 134865535 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 134865613 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134865674 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134865688 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134865690 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134865733 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134865813 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134865844 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134866000 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 134866017 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 134866046 T A N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 3 134866056 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 134866192 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 134866366 G C Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 134867027 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 134867028 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 134867077 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134867190 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134867755 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 134867768 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 134868489 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134868539 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 134868542 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 134868656 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134868744 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 134868751 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134868899 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134868960 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134869015 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 134869256 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134869268 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134869314 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 134869353 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 134869384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134869451 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 134869466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134869543 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 134869664 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134869709 A T N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 134869802 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 134870036 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 134870129 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 134870270 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 134870271 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 134870358 C G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 134870391 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 134870417 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 134870957 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 134871559 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.105263157894737 0.789473684210526 0.105263157894737 19 19 2 15 2 3 134871687 T C Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 134871975 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 134871995 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 134872009 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 134872679 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 134872734 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 134872828 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 134873234 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 134873235 C G Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 134873367 T A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 134873441 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 134873744 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 134873747 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 134873769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134873770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134873818 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 134873884 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 134874276 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 134874327 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134874347 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 134874899 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 134875565 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134875573 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134875727 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 134876004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134876072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134876648 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134877395 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134878686 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134879859 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134880399 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 134880408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134880682 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134881576 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134881775 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134882484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134884417 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134884492 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134884797 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 134884807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134884922 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 134885955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134886024 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 134886751 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 134886787 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 134887196 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 134887214 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 134887367 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134887605 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134887635 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134888129 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 134888366 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 134889574 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134889715 C G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134889954 T A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 134891898 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134892167 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134892621 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134894241 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 134894287 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134894307 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134894440 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134894466 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134894645 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134894654 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134894904 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134895200 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 134895262 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134895335 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134895479 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134895596 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 134895612 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134895726 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134895932 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 134896468 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 134896469 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 134896490 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 134896582 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134896621 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134897284 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 134897307 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134897328 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 134897522 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134897534 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134897608 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 134897624 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 134897718 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 134897898 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134897933 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134897936 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134897947 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134898211 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134898222 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 134898340 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 134898440 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 134898530 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 134898582 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 134898881 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134899007 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134899158 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 134899189 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134899193 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134899236 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 134899361 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 134899397 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 134899426 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 134899562 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 134899636 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 134899834 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 134899852 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 134900039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134900083 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134900239 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134900280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134900297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134900470 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 134900485 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 134900514 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 134900647 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134900652 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134900721 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134900851 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 134900855 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 134901022 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134901053 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134901086 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134901135 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 134901391 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134901400 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 134901485 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 134901486 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 134901681 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 134901692 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 134901831 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134901838 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 134901855 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134901933 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 134901953 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 134902373 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134902430 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 134903179 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134903270 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134903272 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134903301 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134903772 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134904093 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 134904252 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 134904316 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 134904348 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 134904370 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134904387 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134904416 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 134904446 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134904461 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134904825 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134905082 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 134905150 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134905172 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 3 134905316 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134905372 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 134905421 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 134905450 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 134905640 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 134905684 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 134905689 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 134905785 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 134905796 T G N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 134905899 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134906075 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 134906279 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134906319 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 134906323 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 134906381 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 134906468 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134907180 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 134907198 T G N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 3 134907406 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 134907531 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 134907611 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 134907624 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134907700 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 134907727 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134907731 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134907746 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 134907869 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134907901 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134908021 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 134908111 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 134908189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134908190 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134908256 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 134908451 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134908569 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134908597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134908628 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 134908695 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134908871 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 134908897 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 134908924 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 134908970 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 134909012 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134909051 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 134909095 C G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 134909243 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 134909588 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 134909666 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 134909738 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 134909774 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 134910065 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 134910190 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 134910580 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134910790 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134910795 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 134910956 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 134910987 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 134911667 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134912077 G T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 134912506 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 134912525 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 134913306 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 134913869 G A Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.285714285714286 0.642857142857143 0.0714285714285714 17 11 4 9 1 3 134914222 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 134914244 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 134915176 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 134916409 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 134917201 A T Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 134917328 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.133333333333333 0 0.866666666666667 4 26 2 0 13 3 134917412 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 134917501 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 134918126 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 134918367 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134920067 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134920689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134921953 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 134922789 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 134923368 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 134923714 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134924196 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134924403 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134925810 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 134926206 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 134926315 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 134926436 G C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 134926962 G C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 134927195 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 134927428 C A N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 134927574 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134928166 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134929349 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 134929623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134929702 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134930144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134930274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134930275 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134930819 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134931102 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134931357 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134931531 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134931822 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 134931825 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134931907 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134932719 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134932751 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134932920 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134934426 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134934958 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134935265 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134935325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134936664 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 134937730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134938070 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134938404 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 134938405 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 134938416 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134938660 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134938878 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 134939032 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134939146 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134939489 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 134939596 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134939627 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134939787 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134939837 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134939873 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 134939880 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134940004 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134940008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134940292 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134940459 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 134940496 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 134940505 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134940619 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134940980 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 134941126 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 134941453 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134941684 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134941810 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 134941838 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 134941959 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 134941962 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 134942042 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 134942106 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134943983 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134944145 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134944192 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134944294 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134944418 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 134944914 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 134945045 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134945051 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 134945083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134945092 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134945122 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 134946006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134946129 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134946668 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134946680 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 134946791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134946874 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 134946889 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 134946897 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134946973 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 134947002 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 134947007 T G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 134947443 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134949056 G C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 134949665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134949827 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134949866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134949951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134950348 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 134951029 C T Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 3 134951064 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 134951399 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134951409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134951441 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 134951663 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 134951698 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 134951757 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 3 134952294 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 134952319 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134952369 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 134952471 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 134952571 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 134952622 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 134952658 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134952790 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 134952810 A C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 134953169 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134953174 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134953314 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 134953326 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 134953400 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134953458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134953462 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134953561 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134954038 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134954185 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 134954188 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 134954199 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 134954244 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 134954348 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 134954435 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 134954505 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 134954584 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 3 134954611 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 134954664 A C N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 134954841 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 134954959 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134955375 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134955419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134955464 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 134955533 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 134955548 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 134955609 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134955715 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 134955757 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 134955847 A C Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 134955880 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134955963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134955989 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 134956086 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134956177 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134956205 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 134956244 C G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 134956252 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 134956333 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 134956347 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 134956349 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 134956365 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 134956572 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 134956588 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 134956676 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 134956715 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 134956749 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 134956808 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 134956815 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 134956836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134957151 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 134957209 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 134957240 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 134957293 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 134959443 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 134959637 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 134959750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134959943 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 134960058 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 134960097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134960114 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 134960164 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 134960179 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134960244 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 134960251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134960256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134960303 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 134960314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134960318 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134960435 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 134960481 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 134960486 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134960556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134960573 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 134960710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134960737 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 134960748 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 134960836 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 134960983 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 134960984 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 134961234 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 134961248 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 134961293 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 134961319 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 134961326 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 134961488 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 134961618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134961630 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 134962589 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 134963783 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134963829 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 134963840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134963886 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134963994 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 134964304 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134964433 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 134964585 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 134964844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134964873 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 134964936 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 134965021 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 134965297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134965452 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 134965466 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134965490 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134965653 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 134965685 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134965733 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134965739 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134965818 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134965957 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134965970 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134966173 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134966232 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134966488 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134966553 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134966668 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134966683 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134967152 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 134967188 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 134967228 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 134967779 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134967857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134968359 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134968384 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134968391 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134968454 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 134968572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134968594 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 134968698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134968805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134968810 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 134968850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134968876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134969020 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134969220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134969270 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 134969478 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 134969540 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 134969582 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 134969717 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134969805 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 134970067 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 134970075 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134970238 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 134970309 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 134970339 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 134970515 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 134970630 T C N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 134970640 C G N N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 3 134970695 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 134970954 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 134971743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134971929 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 134972443 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134972570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134972648 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134972976 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 134972989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134973016 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134973097 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 134973105 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134973127 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134973129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134973170 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 134973243 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 134973255 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134973284 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134973347 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 134973385 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134973453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134973455 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134973549 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134973566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134973829 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 134973846 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 134973880 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 134973922 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 134974099 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 134974100 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 134974220 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134974250 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 134974610 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 134974881 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 134974903 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 134974919 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134975085 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 134975120 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 134975156 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 134975260 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 134975288 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 134975299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134975300 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 134975402 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 134975426 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134975531 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134975532 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 134975658 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 134975695 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 134975789 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 134975837 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134975935 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 134976153 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134976374 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 134976440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134976554 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 134976574 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134976610 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 134976929 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 134977225 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 134977243 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134977337 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 134977344 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 134977352 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 134977365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134977689 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 134977690 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 134977839 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 134978245 A C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 134978311 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 134978397 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134978578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134978582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134978636 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 134978666 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 134978718 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 134978775 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 134978787 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 134978896 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 134978924 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 134978969 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 134978983 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 134979032 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 134979087 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 134979797 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 134979859 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 134979901 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 134980580 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 134980594 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 134980606 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 134980982 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 134981034 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 134981039 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 134981081 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 134981129 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 134981131 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 134981202 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 134981246 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 134981420 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 134981481 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 134981549 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134981577 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134981585 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134981623 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 134981773 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 134981779 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 134981896 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 134981903 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 134982105 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 134982388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134982815 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134983634 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 134983692 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 134983886 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 134984022 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134984290 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 134984323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134984337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134984545 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 134984663 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 134984733 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134984798 T G N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 134985041 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134985375 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 134985464 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 134986032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134986042 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 134986127 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 134986550 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 134986552 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 134986582 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134986630 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 134987629 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 134987633 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134987658 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134987756 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 134987828 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134987866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134987907 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134987910 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 134987924 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 134987999 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 134988070 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134988134 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134988159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134988221 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134988350 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 134988352 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134988368 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 134988428 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 134988456 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 134988573 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 134988805 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 134988992 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134989390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134989780 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134989911 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134990736 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134991430 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 134991437 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134991562 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 134991957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134992151 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 134992490 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134994174 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 134994192 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 134994250 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 134994473 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134994490 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 134995020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134995186 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 134995305 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 134995344 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 134995400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134995414 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 134995616 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 134995815 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 134996754 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 134996849 C G N N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 9 9 2 5 2 3 134996946 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 134997007 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 134997472 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 134997602 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 134997776 T C N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 3 134997819 C T N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 3 134998025 C T N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 3 134998064 A G N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 3 134998191 G A N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.181818181818182 0.454545454545455 0.363636363636364 9 13 2 5 4 3 134998234 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 134998318 A T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 134998398 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 134998437 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 134998662 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 134998800 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 134999089 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 134999198 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 134999205 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 134999218 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 134999251 G C Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 134999271 A T Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 134999314 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 134999404 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 134999492 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 134999531 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 134999562 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 134999638 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 135000012 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 135000023 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135000029 C G Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 135000075 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 135000112 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 135000148 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 135000209 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135000223 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 135000281 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 135000367 C G Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 135001070 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135001244 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135001311 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 135001419 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 135001430 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 135001632 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 135002028 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 135002099 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 135002334 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135002345 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 135002662 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135002757 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 135002766 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 135002794 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 135002818 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 135002985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135002991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135003013 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 135003016 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 135003063 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 135003110 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 135003164 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 135003185 T G Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 135003285 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135003336 C A Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 135003338 T G Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 135003354 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135003370 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135003442 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 135003498 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 135003583 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135003631 C T Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 135003730 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 135003912 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 135003932 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 135004029 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 135004030 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135004069 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 135004090 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 135004096 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 135004179 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 135004189 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 135004240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135004250 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 135004281 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 135004286 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 135004304 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 135004410 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 135004778 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 135004883 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135004895 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135004947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135005063 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 135005146 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135005281 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 135005514 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 135005537 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 135005629 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 135005636 A G Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 135005698 C T N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 3 135005765 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 135006273 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 135006329 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 135006345 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 135006385 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135006485 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135006544 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135006552 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 135006555 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 135006567 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 135006609 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 135006610 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 135006744 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 135006761 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 135007030 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 135007166 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 135007295 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135007340 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 135007389 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 135007392 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 135007448 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 135007450 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 135007679 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 135008181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135008529 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 135008565 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 135008612 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 135008655 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135008731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135009139 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 135009411 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 135009537 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 135009559 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135009583 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 135009599 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 135009790 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 135009914 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 135010028 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135010288 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 135010446 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135010600 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135010813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135010892 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135011025 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135012214 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135014866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135015088 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135015194 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135015547 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 135016056 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135016498 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 135017348 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135017643 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135018584 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 135018763 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135019008 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135019209 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135019504 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 135019601 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 135019845 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135019890 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 135020048 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 135020088 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 135020102 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 135020217 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 135020313 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 135020329 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 135021621 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135021919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135021941 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 135022489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135022819 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135023248 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 135023418 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 135024010 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 135024079 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 135024121 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 135024334 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 135024485 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 135024567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135024699 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135024723 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 135024761 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 135025067 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 135025139 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 135025371 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135025512 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 135025853 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 135026095 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 135026314 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 135026315 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 135026350 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 135026364 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 135026594 G T N N 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 8 6 1 6 0 3 135026633 C T N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 3 135026806 A G Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 3 135027346 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 135027649 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135027655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135027728 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135028849 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135029559 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 135029854 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135029861 T G Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 135031039 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135032292 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 135032696 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 135032738 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 135032747 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 135032764 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 135033557 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135033983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135034737 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 135035335 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 135035369 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 135035406 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 135035572 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 135035589 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 135035592 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 135035624 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 135035644 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 135035728 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 135035780 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 135036339 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 135036348 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 135036388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135036391 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 135036435 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 135036473 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 135036528 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 135036892 A G N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 3 135036954 T A N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 135036988 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 135037006 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 135037047 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 135037082 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 135037158 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 135037159 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 135037240 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 135037246 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 135037441 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 135037462 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 135037509 A T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 135037577 A G N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 135037594 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 135037610 A T N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 135037796 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 135037823 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 135037892 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 135037926 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 135037979 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 135038071 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 135038083 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 135038179 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 135038266 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 135038288 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 135038589 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 135038981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135039012 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 135039016 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 135039589 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 135039715 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 135039822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135039917 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135039950 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135039977 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135040087 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135040089 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135040125 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135041336 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135041393 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135041809 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135041844 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135041851 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 135041935 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135041962 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 135042102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135042105 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135042129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135042136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135042509 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 135042743 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135042930 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135043133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135043523 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135043548 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135043590 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135043726 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 135043787 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135043925 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 135043953 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 135043961 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 135044075 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135044173 A G N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 135044186 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 135044235 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 135044785 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 135045234 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 135045240 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 135045488 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 135045996 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135046321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135046782 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 135046852 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135047197 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 135047239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135047704 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135047974 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135048028 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135048350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135048478 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135048701 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 135048734 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135049331 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135050856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135052480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135053223 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135053866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135054384 T A Y N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 6 12 0 6 3 3 135054446 T C Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.133333333333333 0.8 0.0666666666666667 16 14 2 12 1 3 135054834 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135056763 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 135056842 A T N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 135057232 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135057410 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 135057468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135057560 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135057706 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 135057710 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 135057956 A T N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 135057992 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 135058019 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 135058081 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 135058101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135058625 T A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 135058882 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 135059006 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135059080 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 135059424 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 135059626 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 135059681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135060880 G A N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 3 135060964 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 135061093 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135061453 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 135061465 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135061927 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 135062033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135062092 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 135062136 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 135062165 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 135062192 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 135062216 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 135062311 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 135062348 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 135062643 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 135062658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135062765 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135062944 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 135062999 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 135063159 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 135063301 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 135063306 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135063354 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135063516 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 135063525 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 135063604 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 135063641 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 135063764 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 135063953 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 135064503 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 135064562 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 135064623 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 135064801 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 135064828 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 135065065 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135065481 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135066221 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 135066284 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 135066336 A T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 3 135066509 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 135066577 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 135066718 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 135066723 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 135066737 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 135066907 C G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 135066919 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 135066999 C T Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 3 135067200 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 135067219 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 135067249 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135067318 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135067387 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135067458 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135067536 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135067874 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135068170 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 135068465 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135068512 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 135068622 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135068721 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135069619 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 135069743 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 135069804 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 135069833 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135070701 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 135071874 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 135071914 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 135071967 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 135072160 G A N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 3 135072213 C A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 135072336 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 135072481 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 135073014 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 135073212 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135073487 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 135073489 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 135073699 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 135073710 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135073735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135074443 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 135074450 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 135074624 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 135074674 A T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 135074835 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 135074840 T A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 135074874 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 135076250 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 135076291 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 135078187 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135079783 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 135079804 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 135080074 A T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 135080113 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 135080928 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135080955 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135081693 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 135081933 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 135083050 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 135083403 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 135083703 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 135083792 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 135083903 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 135083963 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 135083986 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 135084104 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 135084170 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 135084777 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135084897 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 135084999 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 135085018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135085910 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135086056 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135086936 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135087223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135087590 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 135087785 G T N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 135088464 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 135088740 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 135089966 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 135090059 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135090412 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 135091769 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135091805 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135091893 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135092361 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135092884 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135093523 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135093583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135094612 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135094641 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0 0.777777777777778 0.222222222222222 14 22 0 14 4 3 135094759 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135095188 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135095557 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135095869 A C Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 135097436 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135097451 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 135097619 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135097794 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 135099227 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135099392 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135102519 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135102677 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135103409 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 135105131 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 135106933 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135108199 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135108687 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135109594 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135109879 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 135110021 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135112530 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135113496 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 135114148 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135114979 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 135116479 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135116859 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135122362 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 135122588 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135122687 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135129567 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 135131035 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135133105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135134378 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135134565 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135134707 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 135134871 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135136247 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 135137186 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 135137383 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135137394 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 135137589 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135137697 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 135137738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135138314 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135138344 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 135138681 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135138713 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 135138735 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 135138864 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135138865 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 135138964 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 135139461 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135139480 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 135139636 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 135139738 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 135139745 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 135140068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135140855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135141045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135141146 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135141165 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135141197 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135141331 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135141384 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 135141505 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 135141580 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 135141722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135141817 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 135141920 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 135142073 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 135142156 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135142235 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 3 135142347 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 135142348 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 135142367 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 135142562 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 135142563 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 10 14 2 6 4 3 135142719 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 135142728 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 135142759 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135142846 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 135142968 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135142980 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135142982 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135143757 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 135143807 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135144012 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 135144047 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 135145262 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 135145805 G C Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 135146493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135148406 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135148565 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135149136 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135149139 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135149171 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135149172 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135149193 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135149521 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135149784 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 135149792 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 135150261 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 135150286 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 135150371 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 135150685 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135150888 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 135150928 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135150995 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135151107 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 135151488 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135151570 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 135151945 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135152380 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 135152636 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 135152900 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135153059 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 135153818 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 135153868 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 135153887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135154323 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 135154342 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 135154519 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 135154557 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135154607 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135154911 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 135154949 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 135155159 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 135155215 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135155286 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 135155408 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 135155438 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135155470 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 135156062 A G Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 135156911 C T Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 135157044 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 135157212 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 135157347 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135157492 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135157700 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135157876 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135158416 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 135158463 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135158566 T C Y Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 135158852 G A Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 135159152 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135159448 A T Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 135159525 A G Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 135159613 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 135159944 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 3 135160258 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 135160478 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 135160493 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135160982 C T Y Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 3 135161030 C T Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 135161757 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135162242 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135162412 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135162638 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 3 135163058 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135163964 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135163986 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 135163997 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135164452 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 135164564 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135164730 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135164750 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 135165161 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135165170 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135165177 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135165922 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135166107 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 135166121 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 135166412 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 135166426 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 135166435 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 135166553 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 135166678 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 135166805 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135166849 T G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 135166868 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 135166882 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135166896 T C Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 135166914 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 135166915 A G Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 135166984 A C Y N 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 3 135167331 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135167757 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 135167791 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 135167808 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 135167861 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 135167872 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135167891 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 135167896 C A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 135167938 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 135167951 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 135168051 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 135168545 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135168597 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 135168695 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 135168738 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135169619 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 135171480 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135171525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135171720 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135177203 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135177613 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135177898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135178276 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 135178443 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 135178484 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 135180687 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 135181883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135182829 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 135183093 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135183336 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135183480 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 135183566 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135184081 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135185737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135186024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135186465 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135187791 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 135189956 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 135190282 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135192068 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135192132 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 135192931 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 135193281 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135193778 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135194344 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135194499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135194973 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135195500 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135196968 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 135197003 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 135197017 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135197031 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135197050 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135197071 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135197073 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 135197086 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135199457 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135200167 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 135200359 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135200430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135201265 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135202038 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135203809 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135203873 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135204354 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135206427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135206484 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 135206522 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 135206729 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 135207074 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 135207286 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135208326 A T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 135208894 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135211822 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135211940 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135212473 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 135212550 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 135212764 G C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 135212797 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 135212809 T G N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 135212857 A G N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 3 135213004 G T Y N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 3 135213087 A G N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 3 135213242 G C Y N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 3 135213453 C T Y Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 135213455 C T Y Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 135213483 A G Y Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 3 135213548 C T Y Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 3 135213688 T A Y N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 3 135213716 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 135214015 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 135214068 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 135214074 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135214331 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 135214351 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 135214515 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 135214534 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 3 135214563 C T N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 135214602 G A N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 3 135214616 C T N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 3 135214705 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 135214769 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 135215049 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 135215116 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 135215216 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 135215411 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 135215467 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 135215783 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135215810 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 135216158 T A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 135216159 T A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 135216183 T A N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 135216208 T C Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 135216247 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 135216325 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 135216337 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 135216350 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 135216602 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135216613 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135216675 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135216683 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135216727 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 135216742 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 135216835 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 135216844 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135216889 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 135216893 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 135216902 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 135216986 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 135217170 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 3 135217210 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 10 8 2 6 1 3 135217235 C T Y Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 10 6 3 4 1 3 135217504 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135217551 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 135217596 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 135218145 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 135218376 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 135218997 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 135219050 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 135219174 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 135219197 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 135219543 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135221058 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135221850 G T Y N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 3 135223909 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 135225053 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135225361 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 135225369 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 135225417 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135225506 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135226140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135226982 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 135228546 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135229095 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135229713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135229836 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 135229931 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135229971 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 135229988 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 135229997 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 135230003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135230957 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 135231015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135231253 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135232874 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 135233080 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 135233708 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135233709 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135233980 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135233981 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 135234039 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135234235 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 135234344 T A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 135234360 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 135234694 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 135235535 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 135235991 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 135236126 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 135236165 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135236518 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135236590 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135236625 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135236675 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 135236912 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135237107 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135237141 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 135237199 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135237331 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 135237343 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 135237588 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 135238121 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 135238127 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 135238225 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 135238318 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 135238348 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135238390 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135238506 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 135238576 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 135238586 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 135238588 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 135238660 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 135238704 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 135238768 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 135239114 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 135239428 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 135239437 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 135239536 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135239560 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135239754 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135239769 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 135239793 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 135239823 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 135239939 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135241598 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 135241969 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 135241971 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 135242310 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135242514 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 135243036 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 135243041 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135243676 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 135244691 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 135245124 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135245157 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135245161 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135245210 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135245214 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135245223 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135245330 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135245355 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135245659 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 135247087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135247954 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135248669 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 135248678 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 135248686 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135248700 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135248738 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135248741 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 3 135248852 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135248922 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135249057 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135249116 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135249402 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 135249907 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135250370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135250865 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 135253339 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135254310 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135256321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135256568 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 135256595 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135257696 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135257755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135258175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135258892 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135259239 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135260347 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 135260568 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135261033 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135261736 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135261747 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135262039 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 135262673 G C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 135263058 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135263241 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 135263288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135263653 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135264118 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135265700 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 135267982 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135269394 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 135269396 A C Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 135269503 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135271198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135274284 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135274890 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135276630 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135277041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135278017 A T Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 135279014 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135279848 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135281220 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 3 135281243 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 135281300 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135281522 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135284515 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135284708 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 135284813 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 135284855 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 135284964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135285260 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135286172 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135287165 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135287582 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 135288315 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135289453 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135289485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135289731 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 135289757 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 135290200 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 135290254 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 135290297 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 135290323 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 135290387 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 135290475 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135290495 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 135290553 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 135290576 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 135290731 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 135290849 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135291234 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135291476 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135291628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135292127 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135292466 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135292520 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135292788 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135292931 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 135293092 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135293341 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135293530 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135293615 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135294354 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135294984 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 135297480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135298042 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 135298661 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135298758 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135298914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135299057 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 135299269 T G Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 135299385 C T Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 135299388 A T Y N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 135299401 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135299404 T C Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 135299729 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 135299758 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135299811 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 135300224 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135300264 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 135300356 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 135300381 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135301788 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 135302002 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135302022 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135302098 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135302947 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 135303127 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135303152 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 135303234 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135303485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135303514 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 135303615 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135303710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135303856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135304392 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135306603 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 135306794 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135306810 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 135306893 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135307106 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 135307239 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 135307460 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 135308076 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 135308183 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135308402 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 135308582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135308597 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 135308672 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 135308747 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 135308788 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135308878 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 135308987 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 135309077 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135309084 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 135309189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135309208 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 135309219 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 135309256 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 135309264 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 135309376 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 135309451 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 135309452 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135309484 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 135309517 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 135309581 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 135309582 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135309627 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 135309628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135310273 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 135310329 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 135310743 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135310757 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 135310901 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135310915 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135310986 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135311031 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135311049 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135311067 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 135311088 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 135311292 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135311293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135311420 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135312025 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135312221 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 135312223 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135312241 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 135312242 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 135312303 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 135312335 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 135312554 G T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 135312594 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 135312621 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135312692 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 135312720 A T Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 135312721 A T Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 135312776 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 135313239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135313806 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135313946 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135313965 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135314061 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 135315492 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 135316421 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 135316436 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135316941 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135316958 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135317362 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135317736 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 135317935 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 135318024 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135318110 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 135318603 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135318610 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 135319306 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 135319388 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135319485 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135319486 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135319938 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135320139 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135320245 A C N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 3 135320528 A C N N 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.272727272727273 0.272727272727273 0.454545454545455 9 13 3 3 5 3 135321321 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135321323 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135321361 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 135321447 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 135321551 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 135321781 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 135321899 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 135321959 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 135321960 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 135322116 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 135322198 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 135322211 A G N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 135322397 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 135322567 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 135322674 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 135322819 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 135322857 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 135322903 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 135323078 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 135323161 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 135323240 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 135323391 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 135323424 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 135323726 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 135323735 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 135323766 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 135323795 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 135323975 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 135323984 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 135324027 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135324083 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 135324088 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 135324098 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 135324202 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 135324240 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 135324248 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 135324322 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 135324517 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135324540 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 135324556 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 135324813 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135324821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135324831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135325293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135325357 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 135325422 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135325445 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 135325459 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 135325496 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135325761 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135326117 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135326268 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135326438 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135326619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135326647 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135326748 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135327032 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135327098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135327244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135327512 A T Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 135328446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135328491 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135328515 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135328535 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135328673 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135329195 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135329199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135329383 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135329491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135329503 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135329507 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135329943 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135330379 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135330659 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 135331176 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135331331 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135331430 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135331538 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 135331925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135333306 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 135333437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135333788 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 135333925 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 135334232 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 135334332 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135334407 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 135334904 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 135334938 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135334972 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 135335179 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135335213 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135335305 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135336141 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 135336144 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135336153 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135336165 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135336371 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135336395 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 135336415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135336491 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135336563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135336708 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135336728 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135336822 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135337027 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 135337042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135337043 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135337174 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 135337196 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 135338119 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135338196 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135338249 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135338372 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135338404 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135338550 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 135338612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135339382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135339894 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135340098 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135340220 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135340318 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135340547 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135340673 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135340691 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135340804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135341159 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135341304 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 135341376 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135341436 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 135341448 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 135341497 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 135341677 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135342069 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135342436 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135342557 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135342696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135342791 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135342856 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135342956 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 135343033 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135343042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135343247 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135343371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135344054 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135344171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135344290 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135344306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135344345 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135344372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135344458 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135344483 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135344569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135344581 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 135344683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135344692 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135344715 T C Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 135344720 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 135344745 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135344770 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135344952 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135345166 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 135345225 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135345321 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135345616 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135345836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135345878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135345944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135345992 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135346088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135346181 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 135346386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135346393 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 135346610 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135346621 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 135346671 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135346701 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135347161 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135347329 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135347456 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135347890 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 135348241 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 135348266 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 135348549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135348635 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 135348965 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 135349060 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135349180 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 135349631 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 135349638 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135349969 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 135350027 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 135350117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135350665 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135351809 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135351922 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 135352203 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135353050 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 135353082 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 135353204 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135353607 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135356477 C G Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 135356804 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 135357044 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135357403 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135357666 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 135357708 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135357843 T A N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 3 135357982 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135358102 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 135358447 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 135358457 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 135358607 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135358629 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 135358641 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135358669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135358976 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 135359149 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 135359208 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 135359518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135359585 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 135359595 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135359596 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 135359942 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 135360028 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 135360816 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 135361057 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135361063 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 135362374 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 135362393 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135364219 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 135364399 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 135365805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135366583 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135366648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135367238 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 135367252 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135367477 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135367658 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 135367755 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 135368342 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 135368682 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 135369276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135369529 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135369879 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 135370027 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 135370305 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 135370519 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 135370654 A T Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 135370756 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 135373225 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135373236 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 135373438 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135373545 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 135373861 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 135374088 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 135374303 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 135374318 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 135374445 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 135374488 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 135374563 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 135374584 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 135374607 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 135374732 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 135374988 C T N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 10 18 4 2 8 3 135375026 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 135375083 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 135375750 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 135375751 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 135375901 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 135375967 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 135375968 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135376083 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 135376686 C G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 135377173 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 135377182 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 135377223 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 135377732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135377751 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135378452 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135378711 A G Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 135379134 C T N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 3 135380720 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 135380820 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 135380910 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135381061 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135381709 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 135381771 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 135382037 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 135382073 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 135382125 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 135382169 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 135382173 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135382204 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 135382207 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 135382319 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135383110 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135383451 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 135383473 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 135383859 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135383988 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 135384156 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 135384235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135384655 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 135384699 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135385193 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 135385207 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 135385362 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 135385942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135386741 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 135386808 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135388141 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 135388161 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 135389614 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 135389908 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 135390348 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 135390422 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135390592 A G Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 135390613 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 135390666 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135390687 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135390824 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135390887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135390947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135391005 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135391065 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135391262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135391354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135391406 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135391486 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 135391490 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 135391534 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 135391652 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135391909 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 135391957 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135392017 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 135392024 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135392080 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 135392193 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135392214 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135392218 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135392318 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 3 135392329 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 135392357 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135392362 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135392374 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 135392409 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 3 135392486 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 135392526 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 135392588 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 135392662 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 135392887 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 135393059 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135393065 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 135393258 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 135393332 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 135393342 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 135393410 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 135393433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135393839 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 135393956 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135394125 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 135394297 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 14 10 6 2 4 3 135394307 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.583333333333333 0.166666666666667 0.25 16 8 7 2 3 3 135394934 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135394957 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 135395057 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135395076 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135395427 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 135395496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135395894 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135395934 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135396906 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 135397028 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 135397329 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135397337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135397347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135397816 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 135398031 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135400872 C T Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 135402678 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 135403347 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 135403670 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135404621 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 135408511 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135408771 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 135408891 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135409889 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 135409947 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135410539 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135410725 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135410926 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135410941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135412318 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 135417829 A G Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 135418341 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 135418854 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135419102 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 135419422 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 135419780 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135419876 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 135420292 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135420651 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135421278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135421689 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135422111 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 135422703 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135424854 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 135425144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135425208 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135425212 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135426876 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 135428229 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135428721 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135429655 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135430223 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135430543 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135430730 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135431839 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135438255 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135439037 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135439797 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 135440191 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135440222 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135442046 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 135442490 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135442638 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135442697 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 135443238 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135443423 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135443804 T A N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 135444878 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 135444920 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 135446591 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 135446658 A T N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 135446846 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135447037 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135447871 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135449005 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135449122 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 135449508 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135450003 G T Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 135451217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135451495 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 135451603 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135451812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135452522 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135453051 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135453334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135453343 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135453386 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135455215 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135455667 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 135457535 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135458033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135461709 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 135466428 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 135467236 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135467922 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135468967 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135469481 C G Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 135469638 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 135471131 C A Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 135471174 A G Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 135471458 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 135472747 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135473567 C G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135473605 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135474154 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135474915 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135475997 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135476274 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135476503 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 135476504 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135476877 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 135477083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135478198 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135478978 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 135479125 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 135479500 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 135479675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135479973 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135479974 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135480776 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135480807 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135481005 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135481342 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135481471 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135481499 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135481559 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135481901 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 135481982 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 135482160 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135482249 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 135482261 A T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 135482377 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 135482409 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 135482418 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 135482425 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 135482434 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 135482651 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 135482691 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 135482759 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 135482870 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 135482927 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135483034 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 135483045 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 135483122 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 135483124 T G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 135483137 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 135483241 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135483250 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135483283 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135483337 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 135483367 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 135483377 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135483428 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 135483432 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 135483557 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 135483576 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 135483591 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 135483606 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 135483642 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 135483735 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 135483776 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135483820 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135483977 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 135484142 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135484213 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 135484516 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135484595 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135484612 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135484647 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 135484649 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135484660 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135484671 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135484804 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 135484949 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135485632 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 135486075 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 135486398 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135488063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135490586 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135490845 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135491723 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135491872 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135493464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135493725 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135495799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135495806 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135495975 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 135496330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135496991 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135497269 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135497439 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135498260 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135498631 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135498923 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135499033 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 135500245 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135500266 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135500276 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135500385 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135500424 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135500506 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135500514 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135500623 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135501447 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 135501585 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135501595 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135501597 C T Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135501742 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135501743 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135501776 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 135501778 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135501862 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135501865 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135502117 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135502123 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135502233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135502655 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135502857 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135503206 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135503225 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135505353 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135505970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135506597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135506704 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135506859 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135506893 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135506948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135507856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135508239 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135508920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135509166 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135509281 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135509290 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135509341 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135509347 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135509369 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135509585 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135509695 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135509724 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135509740 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135509756 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135509808 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135509816 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135509951 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135510112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135510149 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135512302 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135512353 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135513074 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135513398 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135513586 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135515334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135515542 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 135519053 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135520761 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135520812 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135520873 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 135520900 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 135521396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135521877 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.0526315789473684 0.736842105263158 0.210526315789474 16 22 1 14 4 3 135522079 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 135522243 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 135523141 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 135523573 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 135523791 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 135524098 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135524103 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135524126 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135524138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135524344 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 135524365 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 135524476 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 135524809 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135524821 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135524972 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 135525951 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135526195 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135526206 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135526209 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135526269 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135526305 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135526360 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135526413 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135526472 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 135526643 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135527212 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 135527336 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135527346 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135527540 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135527989 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135528220 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135528338 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135528456 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135529120 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135529121 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135529215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135529451 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135530202 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135530458 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135530475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135530640 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135530664 T C Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 135530806 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135531238 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 135531242 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135531284 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135531374 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135531406 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135531468 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 135531728 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135531769 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135531890 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 135532411 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135532499 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 135532758 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 135532785 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135533487 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135533522 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 135533564 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135533687 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 135534139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135534253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135534368 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135534421 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135534841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135535018 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 135535087 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135535162 A T Y N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 3 135535408 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135535504 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 135536264 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135536375 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135536464 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135536481 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 135536574 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135536665 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135537289 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135537812 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135537825 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135538092 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 135538107 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135538251 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 135539094 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135539483 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 135540019 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135540891 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 135540954 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 135541356 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 135541558 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135541569 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135541581 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135541593 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 135541607 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 135541608 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 135541686 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 135542041 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135542058 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.0588235294117647 0.588235294117647 0.352941176470588 12 22 1 10 6 3 135542066 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 135542100 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 135542114 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 135542247 A C Y N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 135542303 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 135542337 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 135542350 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135542351 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 135542517 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135542530 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 135542560 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 135542571 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 135542689 C T Y Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 5 9 1 3 3 3 135542724 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 3 135542729 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 3 135543040 C A Y N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 3 135543048 C A Y N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 3 135543071 G A Y Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 3 135543319 A T Y N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 8 12 2 4 4 3 135543366 A G Y Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.25 0.333333333333333 0.416666666666667 10 14 3 4 5 3 135543425 G C Y N 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 9 11 3 3 4 3 135543483 G A Y Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 135543489 C T Y Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 135543497 C T Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 135543512 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135543530 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 135543560 C T Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 135543710 A G Y Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 135543774 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 135543783 T A Y N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 135543794 T A Y N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 135543825 T C Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 135543846 C G Y N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 135543848 A C Y N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 135543879 G A Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 135543918 C G Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 135543927 C T Y Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 135543983 T G Y N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.153846153846154 0.769230769230769 0.0769230769230769 14 12 2 10 1 3 135544083 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 135544084 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135544107 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 135544133 T C Y Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 3 135544212 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 135544223 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 135544230 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 135544252 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 135544302 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 135544328 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 135544334 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 135544357 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 135544361 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 135544372 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 135544380 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 135544421 T C Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 135544459 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 135544483 T G Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 135544534 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 135544614 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 135544622 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 135544632 A G Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 135544638 A G Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 135544658 T C Y Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 135544706 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 135544730 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 135544753 C G Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 135544767 G A Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 135544817 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 135544832 C A Y N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 135544833 A G Y Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 3 135544925 C T Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 135545010 G A Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 135545023 G T Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 135545255 G A Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 135545364 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 135545429 T G Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 135545441 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 135545454 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 135545533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135545557 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 135545560 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 135545616 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 135545622 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 135545651 C G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 135545722 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135545804 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135545856 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135545895 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135545919 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135546020 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 135546090 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 135546129 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 135546187 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 135547247 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135547802 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 135547881 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135548024 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 135548742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135548983 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 135550756 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135551072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135551414 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 135551481 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135551794 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135551862 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135551868 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 135551883 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 135551954 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 135551977 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 135552001 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 135552021 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 135552042 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 135552083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135552097 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135552141 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135552169 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135552261 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135552339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135552642 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135552662 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135552801 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135553047 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135553050 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135553198 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 135553208 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 135553250 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135553483 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135553487 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 135553737 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135554056 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 135554081 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135554086 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135554130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135554170 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 135554216 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 135554224 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 135554369 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 135554376 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 135554698 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135554709 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135554768 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135555562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135555774 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135555781 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135555875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135556228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135556249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135557069 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 135557127 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 135557349 A T Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 135557543 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 135557551 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135557558 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135557622 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 135557794 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135558097 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 135558098 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135558236 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135558249 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 135558264 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 135558304 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135558374 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 135558511 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135558537 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 135558685 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135558704 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135558815 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135558832 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135558834 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135558854 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135559165 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 135559298 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 135559374 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 135559581 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 135559726 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 135559755 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 135559823 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 135560011 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 135560098 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 135560109 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 135560415 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135560847 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135561707 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135561795 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135561856 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135562240 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135562659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135562695 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135562701 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135562710 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135563166 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135563490 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135563659 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135564215 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135564320 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135564412 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135564660 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135564735 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 135565067 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 135565078 A T N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 135565330 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 135565378 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 135565384 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 135565409 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135565817 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135565850 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135565928 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 135565963 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135566012 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135566059 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 135566077 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 135566090 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 135566949 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 135566982 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 3 135567262 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 135567299 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 135567321 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 135567590 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 135567669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135567919 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0 0.8125 0.1875 13 19 0 13 3 3 135567920 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0 0.6875 0.3125 11 21 0 11 5 3 135568052 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135568209 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 135568258 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 135568442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135568634 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 135568680 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135568699 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135568771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135568933 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135568997 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 135569157 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135569186 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135569447 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135569797 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135570387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135571677 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135571837 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135572123 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 135572699 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135572786 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135573093 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 135573149 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135573171 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135573236 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 135573240 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 135573275 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135573402 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135573463 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135573528 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 135573693 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135573820 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 135573830 C G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 135573847 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 135574322 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135574325 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135574436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135574557 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 135574654 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 135575044 T G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 135575317 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 135575391 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 135575428 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 135575483 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 135575517 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135575571 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135575814 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 135576097 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 135576102 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135576450 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 135576874 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 135576989 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135577059 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 135577073 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 135577169 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 135577607 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 135577628 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 135577652 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 135578141 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 135578312 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 135578377 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 135578405 G C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 135578479 T C N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.384615384615385 0.538461538461538 0.0769230769230769 17 9 5 7 1 3 135578499 T C N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 13 7 4 5 1 3 135578527 C T N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 135578583 A C N N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 9 5 3 3 1 3 135578676 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 135578735 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 135578821 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 135579216 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 135580235 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135580369 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135580406 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135580441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135580985 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135581147 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 135581204 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135581212 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 135581229 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135581250 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 135582052 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135582357 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135582427 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 135582555 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 135583057 A G Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 135583197 T C Y Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 3 135583202 G A Y Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 3 135583233 T A Y N 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0 0.777777777777778 0.222222222222222 7 11 0 7 2 3 135583637 G A Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 135583644 G A Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 135583681 A C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 135583839 G C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 135583944 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135583948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135583957 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135584031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135584032 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135584042 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135584090 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135584131 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135584206 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135584216 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135584314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135584486 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135584618 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135584641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135584653 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135584735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135584747 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135584900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135584911 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135584922 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135584923 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135585003 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135585154 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135585337 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135585339 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135585588 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 135585685 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135585921 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135585941 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135585953 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135586013 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135586046 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135586136 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 135586375 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 135586445 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135586723 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 135586828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135587275 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135587478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135587498 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 135587592 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135587757 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135587766 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135587786 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 135588103 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135588202 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 135588281 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 135588414 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 135589829 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135590079 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 135590236 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 135590279 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135590304 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135590337 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135590360 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 135590399 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135590499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135590509 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 135590542 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135590729 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 135590848 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135590888 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 135590893 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135590955 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135591166 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135591198 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135591332 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135591726 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135591854 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 135591937 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135592005 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135592017 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135592047 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135592090 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 135592308 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 135592332 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135592338 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 135592645 T A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 3 135592654 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 135593018 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 135593440 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 135593574 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135593597 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135593688 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135593820 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 135593968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135594140 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 135594603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135594606 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 135594666 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135595012 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135595339 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135595528 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135595556 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135595787 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 135595899 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135595993 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 135596042 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135596078 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135596175 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135596286 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135596333 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 135596374 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 135596471 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 135596632 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 3 135596725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135596890 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135596931 A C N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 135597097 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 135597364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135598197 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135598861 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 135599362 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 135599526 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 135599766 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 135599837 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 135599853 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 135599930 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135599933 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 135600025 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135600437 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135600517 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 135600603 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 135600651 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 135600754 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 135600865 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 135600967 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135601018 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 135601116 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135601120 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135601249 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135601362 C T Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 135601432 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 135601540 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135601602 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135601784 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 135601851 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135602021 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 135602222 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 135602283 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135602396 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135602583 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135602733 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135603470 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135608084 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135608644 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135612437 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135614458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135615623 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 3 135616807 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 135617530 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135618284 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135621927 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135622281 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 135625802 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 135625836 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 135625977 C A N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 135626549 G T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 135626591 A C N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 135626903 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135626966 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135628495 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135629078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135629968 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 135630156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135630526 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135630550 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 135630568 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135630746 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 135630837 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135631206 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135631830 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 135631980 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135632171 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135632174 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135632887 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 135633410 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135633611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135633697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135634911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135635203 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 135635273 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 135635526 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135636438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135637596 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135637715 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 135637880 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 135638078 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135638141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135638420 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 135638938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135639972 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135644730 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 135644898 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135645006 T C Y Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 3 135645501 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 135645959 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 135648490 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135648701 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135648896 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135649282 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135651363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135651802 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135652809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135652852 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 135653843 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135654033 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 135654069 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135654189 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 135654464 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 135654476 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135654863 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 135654894 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 135654986 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 135655042 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135655309 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 135655610 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135655947 A G Y Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 7 9 1 5 2 3 135656545 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 135657070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135657216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135659520 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135659823 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135660269 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135660679 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135661256 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 135661314 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135661371 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 135661431 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 135661453 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 135661506 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 135661513 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 135661549 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 135661800 T G N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 3 135661824 A T N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 135661843 C G N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 135661844 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 135661956 A C N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 135661957 C T N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 3 135661993 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 135662123 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 135662151 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 135662176 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 135662208 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 135662358 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 135662363 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 135662469 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 135662639 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 135662656 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 135662676 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135662691 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135662732 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135662782 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135662790 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 135662959 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135662975 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135663135 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135663221 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135663267 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135663308 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135663423 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135663494 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 135663508 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 135664005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135664329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135666009 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 135667305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135667980 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 135668955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135669352 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135669721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135669831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135669909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135670677 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135670696 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135670723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135670806 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 135671331 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135671516 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135671526 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 135671564 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135671598 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 135671612 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 135671644 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 135671662 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135671926 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135672000 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 135672001 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 135672027 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135672030 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135673777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135675149 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 135675966 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 135677053 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135677287 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135677823 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 135678234 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135679450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135679473 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135680160 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135680768 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135684571 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135684615 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135684637 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135685040 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 135685282 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 135685443 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 135685702 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135685973 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135686361 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 135686552 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 135687183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135687392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135687760 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135688075 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135688370 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 135688750 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 135688831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135688839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135689096 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135689136 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 135689439 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 135689590 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135689734 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135690098 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 135690101 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 135690300 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135690709 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 135690717 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135690732 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135690962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135691059 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 135691160 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 135691164 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 135691178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135691291 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 135691370 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 135691752 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135691829 A T N N 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 3 135691971 G T N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 135692074 C T N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 3 135692240 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 135692664 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 135692722 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 135692744 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 135693122 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 135693262 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135693364 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135693422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135693578 T C N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 3 135693638 A C N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 135693999 C T Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 135694022 A C N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 3 135694029 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 135694047 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135694168 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135694199 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135694250 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 135694277 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135694453 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135694503 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 135694533 C G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 135694668 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 135694833 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 3 135694917 G A Y Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.307692307692308 0.615384615384615 0.0769230769230769 16 10 4 8 1 3 135695125 G A N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.333333333333333 0.583333333333333 0.0833333333333333 15 9 4 7 1 3 135695656 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 135695845 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135695915 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135695919 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 135695955 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135695969 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135696047 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135696232 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135696584 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135696623 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 135696656 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135696661 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135696670 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135696906 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135697371 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 135698135 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 135698476 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135698577 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135698735 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135698768 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135698775 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135699246 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135699519 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 135699554 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135699632 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135699784 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135699870 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135699884 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135699926 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 135700077 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 135700102 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135700291 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135700431 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 135700534 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135700637 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 135700713 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135700739 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 135700740 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135700769 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 135700803 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 135700804 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 135700907 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 135701062 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 135701310 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135701340 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 135701429 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135701501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135701592 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135701593 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 135701702 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135701746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135701747 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 135701764 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 135701777 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135701953 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135702100 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135702566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135702579 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135702756 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135702945 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135703298 C G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 3 135703489 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135703635 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135703719 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 135703797 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135703852 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 135703887 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135703969 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 135704068 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 135704093 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 135704422 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135704517 C G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 135704542 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135704605 A C Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 135704660 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135704991 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 135705017 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 135705038 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 135705182 A G Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 3 135705214 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 135705260 T G Y N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 3 135705355 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135705563 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135705592 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135705653 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135705697 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135705753 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 135706192 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135706359 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135706898 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135707037 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135707198 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135707338 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135707411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135707614 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135707732 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135707825 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135707908 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 135708061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135708125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135708169 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135708242 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135708945 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135708950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135709412 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135709462 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135709576 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135709658 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 135710206 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135710207 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135710246 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135710389 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 135710642 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135710752 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 135710774 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135710790 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135710832 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 135711063 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135711290 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135711324 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135711566 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135711572 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 135711686 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135711756 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135712004 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 135712054 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135712132 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135712462 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135712488 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135712538 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135712542 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135713238 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135713483 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135713498 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135713517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135713552 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135713648 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135713740 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135713758 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135713942 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135713973 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135713995 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 135713997 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135714011 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 135714038 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135714057 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 135714285 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135714334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135714398 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135714497 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135714501 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135714583 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135714615 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135714651 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135714680 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135714690 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135714692 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135714735 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135714737 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135714898 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135714916 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135714936 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135715131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135715200 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135715244 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135715262 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135715296 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135715337 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135715349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135715430 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135715443 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135715454 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135715999 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 135716007 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135716221 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 135716225 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 135716371 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135716396 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135716539 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 135716687 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135716787 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 135716791 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135716855 T C Y Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 3 135716862 C T Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 3 135717082 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 135717245 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 3 135717271 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 135717488 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 135717580 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 135717582 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135718041 T C Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 135718112 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 135718238 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 135718277 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 135718328 T C Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 135718372 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135718439 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 135718454 G C N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 3 135718474 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 135718484 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 135718489 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 135718512 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 135718581 G A N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.142857142857143 0.642857142857143 0.214285714285714 13 15 2 9 3 3 135718784 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 135718833 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135718939 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135719491 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135719718 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 135719723 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135719768 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 135719822 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 135719826 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 135719848 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135719897 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 135719903 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 135720138 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135720161 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 135720277 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135720322 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 135720364 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 135720680 T A Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 135720719 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135720808 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 3 135720968 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 135723227 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135723271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135724369 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 135724470 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135726599 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 135727189 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 135728319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135729848 T G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 135730210 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135731340 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 135733856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135734559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135735422 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135736666 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135736853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135742012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135742722 C G Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 135742796 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 135747080 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135748277 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135751083 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135751334 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135751341 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135751914 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135752689 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 135752952 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135752953 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135753764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135756076 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 135756185 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 135758883 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135759449 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 135759528 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 135759681 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135760631 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 135760907 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 135760975 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 135760980 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 135761145 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135761253 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 135762450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135762523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135762992 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135763160 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135763414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135764047 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 135764053 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135767860 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135768676 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 135769426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135769634 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 135770222 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 135770343 C G N N 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 135770490 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 135771121 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135771569 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135771867 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 135772028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135772125 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 135772155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135773273 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135774035 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 135774430 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135775297 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135775376 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 135778590 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 135780470 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135785846 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135786252 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 135786683 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 135787097 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135787176 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135787216 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135788119 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135788163 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135788824 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135789659 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135790813 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 135790831 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 135791975 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135792221 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135792392 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135792404 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135792438 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 3 135793754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135793977 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 135794670 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135795082 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135795223 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135796932 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 135796973 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135797358 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135798449 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 135798551 G C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 135799883 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135800365 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 135800662 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135801649 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 135802046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135802209 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135802334 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135802368 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 135802389 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 135802735 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135802819 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135802901 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 135803087 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135803245 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 135803435 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135803460 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135803554 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135803702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135803816 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 135803817 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 135803922 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 135803998 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 135804075 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 135804089 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 135804107 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135804239 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 135804362 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135804397 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 135804571 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135804861 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 135805316 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 135805461 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 135805536 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 135805669 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 135805706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135805903 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 135805926 A C N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.2 0.133333333333333 0.666666666666667 8 22 3 2 10 3 135806214 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 135806232 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 135806283 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 135806369 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 135806629 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 135807028 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 135807406 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 135807433 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 135807456 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 135807955 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 135808003 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135808144 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 135808254 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 135808256 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 135808383 C G N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.642857142857143 0.0714285714285714 0.285714285714286 19 9 9 1 4 3 135808432 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 135808601 A C N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 135809013 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 135809102 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 135809227 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 135809240 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 135809243 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 135809270 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 135809274 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 135809281 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 135809322 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135809323 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135809498 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135809499 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 135809550 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135809668 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 135809672 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 135809809 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 135809839 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 135809843 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 135809888 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135809908 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 135810051 T G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 135810169 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 135810212 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 135810344 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 135810484 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 135810649 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 135810762 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 135810917 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 3 135811021 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 135811054 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 135811127 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 135811230 G A N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.333333333333333 0.583333333333333 0.0833333333333333 15 9 4 7 1 3 135811271 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 135811523 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 135811628 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 135811808 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 135811809 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 135811966 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 135811985 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135812046 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135812182 T G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 135812188 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 135812240 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 135812261 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 135812287 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 135812374 T C N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 135812404 G T N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 135812436 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 135812495 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 135812572 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 135812723 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 135812738 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 135812848 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 135812982 T A N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 0.142857142857143 0.214285714285714 20 8 9 2 3 3 135813118 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 135813164 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 135813174 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 3 135813227 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.666666666666667 0.133333333333333 0.2 22 8 10 2 3 3 135813296 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 135813775 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135813785 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 135813831 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 135813946 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 135814003 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 135814215 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135814399 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 135815176 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 135815387 G T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 135815437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135815627 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 135815653 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 135815703 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135816003 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 135816062 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 135816139 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 135816204 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 135816302 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 135816510 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 135816531 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 135816540 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 135816685 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 135816702 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 135816886 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 135817178 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 135817801 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 135818461 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 135818578 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135819238 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 135819315 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 135819550 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135824019 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 135826221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135828685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135830506 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 135830855 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135831274 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135831565 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 135831594 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135831655 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135832633 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135832809 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 135832925 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 135833013 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135833027 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135833068 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 135833170 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 135833265 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135833342 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135834521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135834777 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 135835352 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 135835475 G A N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 135835722 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 135835826 C T N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 135835855 T A N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 135836119 A G N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 135836162 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 135836232 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135836361 G C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 135836396 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135843934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135844000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135844053 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135844173 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 135844180 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 135844275 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135844493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135844682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135848519 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135849491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135850270 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135852787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135854276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135855043 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 135855754 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 135856037 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 135856618 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135857300 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 135857396 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 135858256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135858375 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 135858462 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 135859248 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135859269 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 135859294 G T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 135859425 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 135859524 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 135859636 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 135859674 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 135859742 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 135859785 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 135859786 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135859809 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 135859883 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 135860078 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135860411 C A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 135860439 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 135860507 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 135860524 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 135860799 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135860937 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 135860958 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 135860982 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 135861080 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 135861178 A G N Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 10 10 2 6 2 3 135861606 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 135861740 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 135861869 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 135862021 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 135862114 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135862140 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135862188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135862386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135862870 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 135862872 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 135862881 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 135862887 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 135862925 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 135863156 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135863201 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135863420 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 135863490 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 135863534 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 135863720 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 135863791 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135863944 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 135864029 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 135864164 C A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 135864183 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135864270 T C Y Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 3 135864281 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 135864301 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 135864308 A T Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 135864321 G A N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 135864475 G A Y Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.181818181818182 0.545454545454545 0.272727272727273 10 12 2 6 3 3 135864546 C T Y Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 3 135864660 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 135868198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135868254 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 135868319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135868354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135868358 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 135868469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135868500 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135868615 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 135868779 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 135868874 C T Y Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 135868976 G A Y Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 3 135868990 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 135869468 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 135869481 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 135869638 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135869668 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 135870057 T G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 135870296 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 135870429 A G Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 135870528 T C Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 135870542 G C Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 135870586 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 135870665 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 135870712 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 135870983 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 135871005 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135871184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135871252 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135871334 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 135872406 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135872511 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 135872572 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135872725 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 135872762 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135872798 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 135872843 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135872909 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 135873024 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 135873071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135873082 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 135873266 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 135873311 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 135873334 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 135873476 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135873490 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 135873522 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 135873566 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 135873569 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 135873618 T C N Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 9 5 3 3 1 3 135873854 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 135873886 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 135874306 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135874333 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 135874383 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 135874560 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135874640 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 135874716 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 135875236 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135875270 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135875415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135875434 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 135875440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135875661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135876084 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 135876132 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 135876152 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 135876197 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 135876285 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 135876303 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 135876335 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 135876384 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 135876688 C T Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 135876873 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 135876874 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 135877049 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135877062 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 135877201 T C Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 135877207 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 135877264 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 135877286 A C Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 135877310 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 135877322 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 135877403 C T Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 135877483 C A Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 135877489 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135877504 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 135877528 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 135877819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135878125 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 135878293 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 135878319 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135878382 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 135878394 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 135878421 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 135878463 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 135878556 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135878631 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 135878651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135878672 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 135878907 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 135878952 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135879020 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 135879207 G A Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 135879220 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135879236 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 135879275 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 135879308 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 135879382 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 135879451 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135879496 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135879521 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 135879589 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 135879637 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 135879683 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 135879703 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 135879812 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 135879828 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 135879850 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 135880103 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 135880120 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135880540 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 135880574 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135880715 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 135880776 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135880984 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 135881195 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 135881484 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135881549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135881719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135882058 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.3 0.7 0 26 14 6 14 0 3 135882256 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 135882257 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135882541 T C N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 135882710 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 135882862 C G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 135883461 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 3 135883508 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 135883632 G T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 135883637 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 135883654 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 135883686 C T N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 135883706 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 135883789 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135883917 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 135883976 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 135884026 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 135884109 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 135884113 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 135884200 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 135884244 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 135884297 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 135884363 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135884422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135884509 T G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 135884969 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 135885104 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 135885257 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135885968 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135887301 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 135887983 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 135888034 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 135889353 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 135890110 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135890199 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 135890719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135891008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135891017 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135891024 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135891060 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 135892103 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135895473 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 135896197 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135896916 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135898501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135898716 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 135899530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135900975 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135901432 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 135901517 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135901920 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 135901972 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 135902055 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135902548 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 135902579 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135903356 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135903971 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 135904227 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135904530 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135904839 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135905140 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 135905530 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 135905605 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 135906400 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 135906615 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135907132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135907142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135907635 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135907760 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135907874 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135908024 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 135908403 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 135908697 A G N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.363636363636364 0.363636363636364 0.272727272727273 12 10 4 4 3 3 135908810 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 135909517 G C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 135909576 G A N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 135909611 G A N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 135909717 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 135909748 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 135909770 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135909902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135910003 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 135910175 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 135910218 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 135910339 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 135910740 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135910893 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 135911116 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 135911227 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 135911241 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135911481 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135911574 T A N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.666666666666667 0.133333333333333 0.2 22 8 10 2 3 3 135912355 C A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 135912388 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 135912520 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 135912608 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 135912616 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 135912625 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135912740 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 135912911 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 135912965 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 135913182 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 135913515 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 135913673 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 135913688 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 135913870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135913871 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135914099 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 135914103 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 135914332 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 135915077 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135916054 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 135916972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135917784 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135918144 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135918411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135918870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135919645 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135920118 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 135920797 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135921447 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 135921464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135921661 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135921822 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135922518 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 135922750 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135923997 A C N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 135924159 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135924899 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135924960 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 135926242 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135927704 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 135927795 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135927875 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135928244 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 135928322 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 135928331 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 135928405 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 135928523 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 135928546 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135928575 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 135928589 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 135928591 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 135928661 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 135928672 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 135928674 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 135928684 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 135928710 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 135928748 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 135928806 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 135929059 C T N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 135929074 C A N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 135929196 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 135929239 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 135929267 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 135929501 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135929628 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 135929756 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 135929836 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 135929851 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135929866 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 135929956 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 135930005 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 135930039 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 135930045 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 135930142 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 135930170 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 135930210 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 135930387 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 135930544 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 135930565 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 135930584 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 135930625 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 135930627 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 135930723 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 135930777 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 135931071 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 135931372 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 135931391 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135931465 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 135931478 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 135931572 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135931714 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135931762 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 135931766 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135931827 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 135931921 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135932070 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135932278 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 3 135932900 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135933000 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135933002 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135933525 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 135933531 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 135933615 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 135933710 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 135934069 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135934126 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 135934142 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 135934219 C T N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 135934229 T A N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 3 135934230 T G N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 3 135934256 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 3 135934315 C A N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 3 135934340 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 135934355 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 135934383 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 135934399 T C N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.0769230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 9 17 1 7 5 3 135934400 T C N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.0769230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 9 17 1 7 5 3 135934410 A C N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0 0.583333333333333 0.416666666666667 7 17 0 7 5 3 135934489 A G Y Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 7 13 1 5 4 3 135934543 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.25 0.333333333333333 0.416666666666667 10 14 3 4 5 3 135934645 T A N N 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 3 135934802 T A N N 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 6 8 2 2 3 3 135934916 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 135934981 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 135935072 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135935232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135935290 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 135935328 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 135935340 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 135935357 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 135935396 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 135935553 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 135935671 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 135935683 C G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 3 135935732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135936070 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 135936151 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 3 135937133 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135937382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135938256 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135939273 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 135939579 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135940058 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 135940096 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 135940552 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135941465 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 135941699 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135942869 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 135943225 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 135944210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135944408 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135944741 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135944785 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135945605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135945841 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135946236 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 135946808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135946863 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135947067 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135947195 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 135947364 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 135947378 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 135947408 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 135947420 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 135947438 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 135947513 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 135947720 G A Y Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.454545454545455 0.363636363636364 0.181818181818182 14 8 5 4 2 3 135947861 A G N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 3 135947900 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 135947906 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 135948403 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 135948411 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135949894 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 135949920 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 135950537 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 135950708 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 135950734 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 135950771 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 135950952 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 135951000 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 135951082 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135951129 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 135951339 G T N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 0.153846153846154 0.153846153846154 20 6 9 2 2 3 135951718 T C N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 135951762 A T N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 3 135951838 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135952031 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 135952177 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135952244 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 135952263 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 135952279 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 135952304 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 135952353 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 135953384 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 135953450 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 135953543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135953861 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135954210 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 135954372 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 135954479 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135954684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135955464 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135955577 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135955749 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135955862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135956430 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135957839 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 135958213 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 135958390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135958520 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135958837 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135958905 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 135959185 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 135959520 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 135959612 C T Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 135959822 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135959923 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135960288 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135960353 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 135960556 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 135960704 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135961273 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 135962299 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 135962359 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 135962519 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 135962934 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 135963227 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 135963284 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 135963285 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 135963296 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 135963322 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 135963389 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 135963422 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135963440 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 135963557 G C N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 3 135963572 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 135963638 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 135963661 G C N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 135963834 G A Y Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 135963866 T C Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 135963874 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 135963921 T A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 135964106 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 135964288 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 135964343 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 135964433 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 135964526 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135964552 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135964634 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 135964798 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 135964808 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 135964835 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 135964846 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 135964926 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 135964942 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 135965034 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 135965332 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 135965356 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 135965460 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 135965518 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 135965605 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 6 30 3 0 15 3 135965650 T C Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 135965700 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 3 135965726 T G N N 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 3 135965865 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 135965889 G C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 3 135965916 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135965918 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 135965932 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135965940 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 135966203 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 135966356 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 135966372 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 135966486 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 135966524 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 135966553 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 135966577 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 135966609 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 135966649 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 135966661 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 135966671 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 135966812 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 135966860 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 135966917 C G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 135967014 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 135967120 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 135967140 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 135967192 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 135967226 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 135967267 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 135967441 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 135967475 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 135967548 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 135967551 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 135967592 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 135967650 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 135967713 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 135967773 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 135967777 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 135967845 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 135967880 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 135967895 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 135967954 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 135968080 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 135968106 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 135968185 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 135968303 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 135968387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135968852 T C Y Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 3 135968879 G A N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.166666666666667 0.0833333333333333 0.75 5 19 2 1 9 3 135968999 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 135969078 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 135969275 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 135970858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135970908 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135971298 C T N Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 6 6 2 2 2 3 135971917 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135972773 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 135972826 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135973077 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135973133 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135973260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135973357 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 135973372 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135973489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135973827 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 135973950 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 135974177 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135974221 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 135974521 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 135974535 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 135974581 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 135974600 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 135974753 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 135974779 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 135974856 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 135974928 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 135975030 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 135975081 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 135975217 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 135975232 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135975347 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135975365 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135975366 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135975385 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135975483 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 135975653 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135975810 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135977519 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135977877 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 135977929 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 135978206 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 135978328 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 135978945 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 135979231 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 135979306 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 135979392 C A Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 135979612 A T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 135979643 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 135979992 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135980168 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135980841 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135981048 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 135981115 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 135981834 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 135981860 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135982039 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 135982311 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 135982362 T G Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 135982618 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135983200 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 135983255 A G Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 135983297 A T Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 135983443 G T Y N 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 3 135984528 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 135984579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135984786 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135984857 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 135984992 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 135985330 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 135985631 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 135985640 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 135985685 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 135985823 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 135985840 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 135985887 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 135986359 T G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.470588235294118 0.117647058823529 0.411764705882353 18 16 8 2 7 3 135986501 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 135986573 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 135986609 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 135986780 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135987053 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 135987103 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 135987107 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 135987175 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 135987189 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 135987223 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 135987227 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 135987274 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 135987325 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 135988730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135991664 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135994401 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 135995483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135995589 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135996366 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 135996515 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 135997992 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 135998362 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 135998405 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 135998473 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135998625 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135998923 G C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.157894736842105 32 6 16 0 3 3 135998985 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 135999024 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 135999254 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 135999686 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 135999726 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 135999820 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136000290 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 136000414 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 136000583 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 136001065 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136001518 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136001569 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 136002758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136002846 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136003112 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136003184 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136003198 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 136004993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136005679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136005697 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 136006084 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136006432 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136007344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136008507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136009497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136012022 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136012290 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 136012962 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136013292 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136013392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136014184 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136014426 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 136014620 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 3 136014766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136014856 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136014939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136014954 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136014977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136014989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136015027 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 136015034 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136015040 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136015242 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 136015257 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 136015308 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 136015421 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 136015454 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 136015466 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 136015499 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 136015656 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 136015703 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 136015741 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 136015749 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136015768 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136015872 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136015877 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136015933 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 136015960 T A N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.133333333333333 0.733333333333333 0.133333333333333 15 15 2 11 2 3 136015975 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 136015986 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 136016140 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 136016189 T C N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 8 12 2 4 4 3 136016193 C A N N 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 7 11 2 3 4 3 136016387 T C N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.230769230769231 0.153846153846154 0.615384615384615 8 18 3 2 8 3 136016433 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 136016720 C T N Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 5 15 2 1 7 3 136016803 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 136017137 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 136017152 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136017834 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 136018299 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 136018327 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 136018371 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136018374 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 136018389 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136018529 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 136018540 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 136018593 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136018715 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 136018884 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 136018894 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 136018899 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 136018926 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 136019070 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 136019671 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136019849 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136019979 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136020831 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136021042 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 136021153 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 136023964 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136024410 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 136025094 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 136027736 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136028083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136029100 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136029476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136029618 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 136030105 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 136031263 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 136031848 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.157894736842105 32 6 16 0 3 3 136032069 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 136032076 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 136032171 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 136032481 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 136032536 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 136032605 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 136032707 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 136033053 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136033231 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136033730 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 136033813 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.153846153846154 0 0.846153846153846 4 22 2 0 11 3 136033817 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 3 136033954 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 136033998 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 136034161 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 136034193 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 136034194 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 136034222 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136034249 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136034445 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136035007 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 136035028 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136035115 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136035270 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 136035657 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136035680 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136036054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136036117 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136036180 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136036398 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136036500 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 136036508 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 136036704 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136037052 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136037868 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 136038193 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 136038299 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136038506 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136038543 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136038628 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 136038708 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136038787 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136038854 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 136038898 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136038922 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136039220 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136039237 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136039513 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136039519 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136039539 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136039700 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136039718 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136039753 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136039785 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136039787 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 136040125 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 136040326 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136040370 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 136040472 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 136040530 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 136040559 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 136040615 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 136040616 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 136040707 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 136040741 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 136040770 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 136040845 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 136040878 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136040917 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 136041031 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136041188 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 136041249 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 136041292 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 136041337 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 136041387 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 3 136041489 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 136041498 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 136041578 G C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 136041610 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 136041725 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 136041737 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 136041972 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 136041999 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 136042037 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136042038 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136042084 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 136042088 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 136042163 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 136042253 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 136042268 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 136042313 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 136042319 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 136042324 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 136042431 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 136042450 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 136042479 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 136042538 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 136042564 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136042609 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 136042621 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136042661 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 136042700 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 136042712 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 136042955 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 136043005 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 136043025 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 136043045 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 136043123 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 136043134 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 136043186 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 136043294 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136043371 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 136043680 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 136043717 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136043730 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 136043816 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136044193 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 136044248 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 136044354 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136044360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136044786 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136044790 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 136044820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136045026 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 136045092 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 136045139 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 136045159 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136045160 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136045201 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136045220 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 136045295 A G Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 136045376 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 136045707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136045714 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 136045815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136045827 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136045835 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136045871 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136045883 A G Y Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 136045902 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 136045930 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 136045945 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136045996 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 136046093 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136046202 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 136046254 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 136046316 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136046333 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136046382 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136046407 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136046452 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 136046478 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136046594 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136046793 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136046806 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136046851 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136046894 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136046921 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 136047009 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 136047060 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136047321 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 136047470 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 136047490 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 136047568 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136047576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136047589 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136047706 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 136047711 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 136048537 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136049097 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136049527 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 136049545 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 136049589 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 136049592 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 136049664 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136049684 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136049801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136049880 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136050301 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 136050429 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136050464 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136050482 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136050865 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136050896 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136050901 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136050994 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 136051028 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136051107 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136051650 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 136051702 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136051867 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136051876 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136052028 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136052031 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136052083 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136052112 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136052186 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136052204 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136052233 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136052256 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136052707 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136052753 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136052889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136053410 A G Y Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 3 136054087 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 136054089 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 136054145 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136054188 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 136054376 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 136054537 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 136054773 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 136054894 A G N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0.125 0 0.875 2 14 1 0 7 3 136055096 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136055153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136055169 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 136055489 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 136055634 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 136056022 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 136056114 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 136056287 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 136056454 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 136056557 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 136057006 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136057011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136057032 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 136058991 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 136059250 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 136059351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136059399 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136059493 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136059511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136059569 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136059590 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136059613 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 136059635 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136059686 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136059942 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136060027 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136060144 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 136060469 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 136060548 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 136060566 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 136060588 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 136060605 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136060657 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 136060841 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136060931 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 136060989 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136061003 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136061021 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136061106 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 136061111 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 136061269 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 136061276 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 136061310 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 136061322 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 136061387 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 136061504 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 136061539 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 136061596 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 136061600 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 136061818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136061889 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136062087 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 136062128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136062224 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136062240 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 136062525 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 136062542 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 136062553 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 136062684 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 136062710 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 136062950 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 136062981 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 136063038 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 136063082 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136063211 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 136063338 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 136063374 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 136063409 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136063473 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 136063653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136063721 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 136063782 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 136063788 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 136063873 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 136063896 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 136063982 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 136064022 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 136064094 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 136064098 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 136064240 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 136064298 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 136064356 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 136064384 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136064389 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 136064727 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136064859 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 136064936 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 136065043 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 136065147 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 136065323 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 136065324 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.875 0 0.125 28 4 14 0 2 3 136065366 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 24 4 12 0 2 3 136065454 T C N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 136065553 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 136065670 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 136065713 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 136065739 G A N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 136066003 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 136066082 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 136066085 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 136066162 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 136066320 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 136066346 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 136066488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136066499 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136066559 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 136066605 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 136066626 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136066645 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136066657 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136066731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136066781 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136066903 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136066956 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 136066965 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 136067037 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 136067160 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 136067225 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136067235 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136067475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136067559 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136067860 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 136068085 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 136068247 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 136068357 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 136068386 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136068988 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 136069031 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 136069151 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 136069192 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136069239 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 136069777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136070070 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 136070071 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 136070101 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 136070149 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136070445 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 136070477 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 136070823 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136071050 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136071095 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136071122 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136071276 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 136071382 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 136071445 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136071503 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 136071568 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 136071750 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 136071797 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 136071799 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 136071808 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 136071819 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 136071843 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 136071852 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 136072073 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 136072158 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 136072487 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 136072494 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 136072681 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 136072745 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136074262 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136074841 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136074898 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136075251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136075264 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136075269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136075316 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136075369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136075407 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136075515 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136075533 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136075570 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136075573 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136075612 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136075641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136075645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136075666 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 136075667 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 136075724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136075787 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 136076098 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136076114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136076245 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 136076475 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136076609 G T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 136077410 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136077563 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136078174 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136078178 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136078434 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 136078503 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 136078741 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136079128 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136079174 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136079507 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136079544 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136079858 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 136079951 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 136080038 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 136080320 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136080344 G T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 136080556 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136080718 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 136080923 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136080991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136081062 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136081249 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 136081375 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 136081430 A G Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 136082109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136082297 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136082452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136082518 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 136082651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136082684 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 136082780 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 136083066 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136083121 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136083167 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136083252 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 136083299 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 136083466 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136083480 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 136083493 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 136083615 G A N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 3 136083979 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136084078 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136084154 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136084224 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 136084225 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 136084251 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 136084457 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 136084469 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 136084476 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 136084502 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 136084510 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136084543 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136085068 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136085113 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136085298 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136085326 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136085642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136085655 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136085672 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136085684 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136085699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136085746 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 136085796 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136085922 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 136086013 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 136086105 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 136086111 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 136086379 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 136086622 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136086681 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136086870 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 136086890 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 136086946 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136087065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136087082 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136087180 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 136087294 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136088198 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136088320 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136088322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136088507 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136088788 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136088950 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 136088958 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 136089001 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 136089063 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 136089195 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 136089333 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136089453 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 136089463 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 136089471 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 136089502 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 136089531 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 136089580 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136089586 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 136089611 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 136089913 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136090616 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136090618 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 136090700 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 136090961 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 136091550 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136092279 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 136093220 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136093223 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136093941 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 136094306 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 136094442 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 136094744 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136095538 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136095838 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136095844 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136096114 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136096170 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136096189 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136096555 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136096587 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 136096657 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 136096819 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 136096930 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 136096942 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 136096979 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 136097133 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 136097310 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136097493 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 136097707 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136097719 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 136097768 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136097955 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 136098325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136098371 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 136098379 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 136098420 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136099122 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 136099180 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136099233 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136099324 C T N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 136099337 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 136099470 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 136099738 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 136099739 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 136100093 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 136100215 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 136100239 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 136100300 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 136100368 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 136100463 C A N N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 3 136100547 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 136100557 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136100653 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136100746 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136100901 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 136101018 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 136101048 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 136101090 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136101114 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 136101257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136101461 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136101508 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 136101620 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 136101633 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 136101634 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 136102366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136102397 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 136102477 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136102603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136102657 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136103010 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136103152 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 136103245 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136103247 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136103413 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 136103414 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 136103531 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 136103633 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 136103781 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 136103812 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136103930 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 136103943 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136103944 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 136103994 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 136104011 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136104021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136104510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136104584 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 136104600 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136104635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136104667 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136106312 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 136106352 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 136106830 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 136107373 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136107569 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136107735 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 136109018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136109056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136109352 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136110965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136110981 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136112980 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 136113333 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 136113460 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 136113732 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136114421 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136114645 G C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 136114745 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136115337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136115660 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136115667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136116207 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136116656 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 136117032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136117371 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136117790 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 136117839 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136118905 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136119520 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136119546 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 136119576 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136120656 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 136120804 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136121111 T A Y N 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 3 136121297 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136121301 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136121415 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 136121546 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136121552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136121635 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 136121706 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 136122716 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 136122784 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136122855 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136122913 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136123085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136123131 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 136123132 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136123189 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136123313 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136123583 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136123722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136123733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136123770 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136124033 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 136124071 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 136124256 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136124273 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136124304 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136124679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136124922 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136124981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136125093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136125102 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136125128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136125150 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136125157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136125175 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136125277 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136125440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136125441 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136125614 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 136126091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136126097 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 136126656 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136127327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136127617 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136127728 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136128285 G T Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 136129381 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136129460 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 136129915 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 136130027 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136130143 C G Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 136130333 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 136130410 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136130565 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 136130632 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136131638 T G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 136131904 C A Y N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 136132068 C A Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 136133779 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136134045 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 136134081 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 136134232 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 136134453 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 136134496 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 136134664 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 136134799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136134823 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 136134878 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 136135039 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136135063 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136135091 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136135601 T C N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.454545454545455 0.363636363636364 0.181818181818182 14 8 5 4 2 3 136136153 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136136233 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 136136295 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 136136667 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136136748 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136136761 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136136769 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136138106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136138723 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136138786 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 136138841 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 136139038 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136140145 T G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 136140364 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136140429 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136140449 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136140545 T C Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 136140683 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136141079 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136141175 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136141384 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136141761 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 136141793 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136141799 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 136142251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136142566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136142637 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136142797 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 136142815 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 136143892 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 136144178 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 136144919 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 136146638 T C Y Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 3 136146712 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 136146781 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136146967 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136147066 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 136147077 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136147080 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136147326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136147429 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136148012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136148169 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136148308 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 136148328 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.176470588235294 27 7 13 1 3 3 136148365 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 136148572 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136148622 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136148633 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136148761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136148911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136149100 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 136149113 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136149328 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 136149700 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136149725 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136149805 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 136149823 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136149839 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136149888 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136150057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136150181 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136150210 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 136150374 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 136150698 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 136150856 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136150933 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136151124 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 136151135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136151279 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 136151393 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136152010 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136152024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136152205 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 136152256 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 136152468 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136152501 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136152933 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136152940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136153025 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136153172 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136153296 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136153416 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 136153543 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 136153685 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 136153918 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136154131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136154208 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 136154385 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 136154538 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 136158885 A C Y N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 136163994 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136165125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136165278 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 136165842 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136169315 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 136171283 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 136172145 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136173597 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136180140 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 136180489 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136182093 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136187621 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 136187725 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136187795 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136188406 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 136189465 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136192794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136192998 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136192999 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136193188 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136193204 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136193259 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136193549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136193550 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 136195231 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136195621 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136196227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136197757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136198102 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 136198560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136198580 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136199621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136200000 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136200021 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136200065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136200190 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 136200301 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136200442 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136200615 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 136200791 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 136201060 C T N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 136201114 A G N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 3 136201264 C G N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 3 136201349 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 136201364 C T N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.214285714285714 21 7 10 1 3 3 136201379 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 136201396 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136201804 G C Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 136202100 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 136202168 T A Y N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 136202895 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 136203315 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 136203343 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 136203874 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 136204125 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 136204233 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 136204315 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 136204671 C A N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 136204808 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 136204843 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 3 136205578 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 136205696 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 136206280 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136206444 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 3 136208209 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136208230 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 30 6 15 0 3 3 136208345 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136208459 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 136208495 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136210482 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136212254 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 136212381 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136212417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136212610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136212620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136212673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136212680 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136212692 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136212712 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136212726 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136213361 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136215672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136216595 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136218150 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136218548 C A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 136218621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136219027 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136219280 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 136219396 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136219447 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136219661 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 136219718 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136219768 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136219806 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136219840 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136219852 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136220005 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136220013 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136220020 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136220482 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 136220487 A G Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 136220497 A C Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 136220515 G T Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 136220702 G A Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 136220761 G C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 136220947 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136221043 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136221060 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136221163 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136221180 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136221207 G T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 136221889 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 136221965 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136222007 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136222061 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 136222405 T G N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 136222439 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 136222661 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 136222699 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 136222756 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 136222973 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 136222993 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 136223082 G A N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 136223149 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 136223158 A T N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 136223194 G C N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 136223696 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136224459 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136224826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136224921 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136225236 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 136225259 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 136225260 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 136225490 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 136225503 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 136225538 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 136225859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136225947 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 136226108 G T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 136226491 A G N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.181818181818182 17 5 8 1 2 3 136226682 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 3 136226738 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 136226817 T G N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 136227041 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 136227058 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 136227096 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136227148 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 136227163 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136227312 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 136227479 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 136227595 C T N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 136227848 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 136227883 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 136228221 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 136228257 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136228285 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 136228305 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 136228369 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 136228393 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 3 136228425 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136228434 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 136228438 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 136228469 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 136228491 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 136228530 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136228682 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136228706 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136228708 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 136228718 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136228731 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136228877 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 136229018 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 136229048 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136229235 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 136229368 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136229813 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 136229955 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136230500 C T N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.357142857142857 0.214285714285714 0.428571428571429 13 15 5 3 6 3 136230805 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136233610 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136234744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136234781 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136234843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136234985 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136235082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136235722 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136236176 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136236198 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136236637 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136237642 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136238147 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 136238274 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 136238856 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136239396 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136239481 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136240042 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136240068 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136240205 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136240712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136240867 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 136240954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136241836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136241995 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136243267 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136243599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136244069 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136244267 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 3 136244284 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 136244680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136244817 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136244878 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136244971 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 136245229 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 136245231 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136245289 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 136245611 A T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 136245715 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 136245828 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 136245844 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 136245845 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 136245868 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136246420 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 136246514 T C Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 136246544 G A Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 136246700 A C N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 3 136246929 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 136247137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136247275 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 136247510 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 136247557 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 136247592 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 136247666 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 136247732 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 136247967 A C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 136248299 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 136248309 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 136248562 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 136248564 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 136248709 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 136248761 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 136248918 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 136249158 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 136249180 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 136249241 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 136249252 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136249254 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136249320 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 136249400 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136249496 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 136249682 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 136249975 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 136250295 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 3 136251342 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 136251575 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136251708 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 136251829 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 136252103 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136252297 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 136252338 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136252412 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 136253163 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136253180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136253361 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136253579 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 136253641 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 136253646 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 136253882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136254080 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136256002 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 136257199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136258527 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136258971 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 136258989 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136260271 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 136260832 G A N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 0.153846153846154 0.153846153846154 20 6 9 2 2 3 136260970 C A N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 136261577 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 136262032 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136262046 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136262064 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136262293 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 3 136262452 T G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 136262712 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 136263282 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136263952 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136264057 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 136264099 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 136264146 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136264194 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 136264403 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136264583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136264636 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136268429 A G N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.714285714285714 0.285714285714286 10 18 0 10 4 3 136274745 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 136274884 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136275106 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 136276953 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136277043 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136277143 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136283943 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136283985 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136284047 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 136285239 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136285289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136285395 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136286149 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 136288727 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136289234 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136289465 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 136291108 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136291174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136291861 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 136293146 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 136293603 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136293963 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136295510 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136295575 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 136298253 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136306515 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136306522 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136306550 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 136306743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136307565 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 136308036 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136308683 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136309151 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 136309346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136309359 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 136309528 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 136309725 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 136309866 C G N N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 3 136309888 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 136310112 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 136310148 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 136310312 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 136310452 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 136310497 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136310992 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 136310998 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136311768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136312348 C T Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 136312815 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136312925 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136314074 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 136314454 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 136314707 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136314865 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 136315327 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 136315382 C T N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.533333333333333 0.133333333333333 0.333333333333333 18 12 8 2 5 3 136315764 T C N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.357142857142857 0.214285714285714 0.428571428571429 13 15 5 3 6 3 136316975 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 136317757 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136318121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136318187 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 136318188 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136319057 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136320222 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136320950 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136321310 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 136321935 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 136321952 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 136321955 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 136322060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136322186 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136322223 G T N N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 3 136322235 T C N Y 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 3 136322289 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 136322331 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 136322872 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 136322904 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 136322909 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 136322963 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136322987 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 136323190 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 136323280 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 136323294 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 136323438 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136323561 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136323694 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 136323713 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136323733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136323754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136323773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136323782 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136324088 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136324709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136326542 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 136326795 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136326807 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136326881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136327629 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136328057 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136328310 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136329171 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 136329258 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136329277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136329823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136329948 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 136330129 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136330171 T A Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 136330269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136330945 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136331159 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136335558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136337677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136338283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136339048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136339133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136341030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136341276 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 136341720 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136343020 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136343860 C T N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 3 136344586 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 136344767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136344768 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136345106 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 136345109 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 136345226 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 136345317 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 136345616 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 136345654 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 136347229 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 136347465 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136347512 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 136347515 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 136348373 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 136348459 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 136348630 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136348655 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 136348672 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 136349152 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 136349154 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 136349256 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 136349409 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 136349423 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 136349496 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 136349612 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 136349645 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 136350769 T A N N 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 3 136350974 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136351017 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 136351612 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 136352639 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 136352657 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 136352990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136353019 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136353073 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136353124 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 136353135 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 136353317 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 136353335 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 136353362 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136353392 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136353406 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 136353441 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 136353474 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 136353570 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136353596 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136353620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136353870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136353871 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 136353909 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 136353954 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136354117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136354265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136354267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136354310 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136354581 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136354596 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136354703 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136354706 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136355396 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 136355616 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 136355808 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 136356064 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 136356357 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136356592 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 136357171 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136357461 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136358200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136358934 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 136359129 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136360240 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136360694 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 136361128 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 136361147 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 136361262 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136361289 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 136361551 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 136361760 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136361872 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 136362021 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 136362154 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136363075 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136363082 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136363230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136364006 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136364477 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136364796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136364906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136364989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136367145 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136367778 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136368411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136368537 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136368886 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136370596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136371670 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 136371677 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136371932 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136372635 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136372754 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 136372778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136374971 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136375180 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136375366 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136375740 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136375907 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136377707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136378609 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136378718 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 136379661 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136380071 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136380190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136380259 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 136380465 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136380529 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136380790 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136381504 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136381508 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 136381949 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 136381966 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136382019 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 136382059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136382077 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136382107 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 136382121 T A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 136382167 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 136382179 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 136382863 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 136382883 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 136382903 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136382972 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 136383054 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 136383629 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 136383978 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136384245 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 136384264 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 136384301 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136384723 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 136384845 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 136387336 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136388199 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136388422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136388537 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136389506 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136389821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136389824 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136390096 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 136390644 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136391988 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 136392039 C A Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 136392144 T G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 136392687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136392708 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 136392799 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136392894 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 136393297 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136393327 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136393683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136393766 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 136394120 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 136394402 C T Y Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 3 136394462 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 136395267 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136395355 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 136396480 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136396843 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136397046 C A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 136397049 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 136397120 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136397146 A C N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.5 0.1875 0.3125 19 13 8 3 5 3 136397295 C A Y N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 136397401 G C N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 136398298 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136398694 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136399482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136402350 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136403535 G T Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 136403598 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136404666 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 136404683 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 136404699 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 136404706 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 136404711 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 136404762 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 136404831 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136405510 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 136405685 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136405701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136406105 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136406610 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 136407048 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136407106 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136407404 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136410051 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136410697 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136412046 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 136415509 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136416101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136417147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136417159 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 136417292 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 136423980 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136424298 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136424462 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 136424922 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136425508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136425690 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136427421 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136427722 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 136430003 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136431089 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 136432148 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136432854 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136433408 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136433432 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 136433774 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136433827 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 136434139 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 136434276 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 136434552 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136434562 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 136434772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136434776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136434837 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 136434851 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136434895 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 136434995 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 136435015 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136435086 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 136435138 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136435177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136435187 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 136435492 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136435536 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 136435541 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136435595 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 136435658 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136435659 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136435686 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136435703 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136435710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136435733 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136436006 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 136436072 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136436090 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136438407 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136438798 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 136438874 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136439953 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136440676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136440990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136441020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136441094 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 136441109 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136441112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136441135 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136441203 G T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 136441441 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136441444 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 136441465 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136441580 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136441713 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136441756 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136441884 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 136441888 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 136441934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136441993 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136442632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136442742 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136442811 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 136442934 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136443567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136444018 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136444289 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136444641 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136445833 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136448124 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136449379 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136449817 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 136450191 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136451844 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136453847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136459026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136459474 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136459544 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 136459584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136463390 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136463545 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136464453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136464712 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136464713 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136465025 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136465086 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136465153 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136465340 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136465361 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136465470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136466987 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136467008 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136467221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136467885 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136468205 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136468283 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136468707 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136468856 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 136470320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136471667 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136474511 A C Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 3 136475170 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136476381 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136478134 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136479613 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136481093 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 136482236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136486369 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136487952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136488225 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136488296 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136488639 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136489113 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136489243 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136489878 C T Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 136490014 A C Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 136490292 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136492618 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136493985 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136494193 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136494790 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 136494791 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 136495017 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136495254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136495926 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136495990 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136496619 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136497551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136499220 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 136499518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136500798 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136501056 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 136501089 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 136501373 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136501911 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136505001 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 136505997 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 136506633 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136506634 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136507300 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 136507336 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 136507409 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 136507510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136507888 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 136509684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136509978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136510479 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136511196 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136512520 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136513471 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136514041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136514217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136514823 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136515668 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 136516180 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 136516223 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 136516258 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 136516439 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136517026 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 136517086 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 136517344 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 136517372 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136517382 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 136517653 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 136517864 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 136517980 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136518111 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 136518321 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 136518803 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 136518845 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 136518915 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 136519056 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136519078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136519267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136519346 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 136520363 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136520366 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136521375 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 136521494 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136521593 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 136522174 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 136522383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136522927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136523038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136525312 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 136527230 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136531830 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136533239 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136535291 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136535612 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136536352 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 136537894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136538575 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136539371 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136539582 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136539606 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136540318 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 136541782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136541905 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136543381 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136543630 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136544022 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 136544040 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 136544312 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136544597 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 136544611 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136544677 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 136544906 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 136544950 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 136544953 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 136545000 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 136545136 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 136545162 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 136545197 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136545207 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 136545366 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136545509 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 136545939 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 136546246 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 136546412 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 136546508 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 136546708 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 136546729 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 136546881 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 3 136546923 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.176470588235294 27 7 13 1 3 3 136546979 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 136546982 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 3 136547233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136547559 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 136547584 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 136548130 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 136548234 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 136548248 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 136548327 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 136548400 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 136548403 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 136548552 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 136548602 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136548619 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 136548645 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136548698 T G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 136548811 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 136548918 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 136549064 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136549090 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136549134 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 136549160 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 136549199 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 136549311 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136549589 A T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 136549610 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136549644 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 136549794 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136549830 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136549910 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136549911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136549966 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136550162 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136550173 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136550210 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136550263 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136550268 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136550457 T C Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 136550506 T G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 136550535 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 136550568 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 136550588 G T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 136550614 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136550717 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136550720 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136550803 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 136550851 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 136550869 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 136550900 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136551234 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136551241 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136551269 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136552211 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 136552309 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 136552372 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136553078 A T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 136553136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136553540 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 136553577 T A Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.133333333333333 26 4 13 0 2 3 136553977 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 30 6 15 0 3 3 136554149 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 136554413 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136554496 C A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 136554554 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136554836 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136554990 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136556117 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136556766 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 136556995 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136557548 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 136557619 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136557735 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136557783 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136557835 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 136557867 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136560909 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 136561070 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 136561098 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 136561135 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 136561150 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 136561170 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136561989 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 136562093 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 136562161 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 3 136562360 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136562435 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 136562468 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136562508 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 136562606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136562689 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136563543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136566674 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 136566689 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136566746 T C Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 136566774 T G Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 136566806 C G Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 136566963 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 136567041 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 136567045 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 136567132 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 136567177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136567631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136567742 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 136567791 A G Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 136568926 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136569038 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136569235 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 136570022 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136570114 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136573215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136573247 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136573633 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136573646 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136573693 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136573737 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136573762 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136573786 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136574025 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136574613 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136574916 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136575613 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 136575825 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 136575849 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 136576074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136576265 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136576718 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 136577237 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 136580641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136580656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136580733 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136581671 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136581922 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136583024 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136584235 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136584539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136588136 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 136588410 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 136588672 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 136588682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136588717 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 136588737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136588850 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 136589827 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136590798 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136591199 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136592816 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136593063 G C Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 136593643 C G N N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 5 11 2 1 5 3 136594931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136597676 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136597958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136599228 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 136600884 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136601121 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136601260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136602669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136603205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136603229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136604906 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136606366 G T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 136608503 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 136608871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136610243 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136610310 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136611182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136611735 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 136611831 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136612247 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136616031 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 136616637 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 136620115 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136625648 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 136626359 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136629923 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136631741 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136632126 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136632384 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 136632720 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 136633526 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136635156 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 136635202 A C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 136635207 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 136635216 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 136635296 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 136635432 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 136635442 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 136635444 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 136635455 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 136635472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136635643 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 136635651 G C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 136635822 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 136635830 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 136635936 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 136635941 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 136635957 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 136636128 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 136636142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136636199 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 136636234 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 136636373 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 136636393 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 136636416 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 136636465 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 136636677 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 136636959 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 136637038 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 136637080 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 136637208 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 136637307 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 136637386 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 136637626 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 136637740 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 136637862 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 136637929 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136637932 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 136637944 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 136637985 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 136638148 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 136638262 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 136638271 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 136638282 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 136638490 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 136638605 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 136638783 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 136638795 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136638831 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 136638866 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136638869 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136638879 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136638904 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136639053 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 136639092 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136639104 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136639156 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136639343 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 136639359 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136639360 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136639380 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 136639417 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136639585 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136639641 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 136639667 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136639765 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 136639929 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 136640046 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 136640061 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 136640087 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 136640129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136640137 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 136640166 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136640422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136640559 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136640572 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136640600 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136640796 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136642321 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 136644042 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136647302 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136648340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136649231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136649431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136651175 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 136652250 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 136652283 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136654436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136655138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136657453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136658334 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136658678 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 136658920 A C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 136659118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136659385 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136659660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136660173 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136660421 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136660551 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 136660627 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 136660642 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 136660661 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 136660821 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 136660996 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136661137 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 136661170 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136661244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136661255 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 136661422 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 136661558 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 136662569 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 136662640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136662673 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136663116 T A Y N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 136665052 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 136665107 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136665218 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136665394 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136665447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136665454 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136665503 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 136665520 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136665605 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 136665652 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136665675 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136665956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136666223 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 136666404 G A Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 136666421 G T Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 136666423 A T Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 136666549 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 136666559 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 136666622 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136666859 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 136666890 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 136667204 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 136667793 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136668283 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136668284 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136668371 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136668872 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136669148 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136669252 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 136669253 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 136669296 A G Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 136669302 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 136669395 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136669455 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 136669480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136669522 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136669867 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136669882 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 136669918 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 136670181 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 136670205 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 136670206 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 136670255 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 136670380 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136670438 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136670460 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136670670 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136670929 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 136670931 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 136671668 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136672043 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 136672560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136672888 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136674050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136674886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136675188 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136675652 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 136676359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136678830 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136679258 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136680512 G C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 136680564 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136680925 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 136681057 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 136681165 C T Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 136681221 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 136682510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136682762 C T Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 136682860 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 136683846 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 136684031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136684219 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 136684257 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136684514 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136684961 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136686171 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136686246 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136686891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136687841 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 136688625 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 136690050 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136690127 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136690407 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136690582 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 136690611 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136690635 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 136690717 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 136690809 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 136692071 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136692326 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136693028 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136694344 T C Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 136694498 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136694533 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136694576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136694609 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 136694706 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 136694770 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136694773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136694885 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136695149 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136695785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136695852 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136695877 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 136695945 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 136695986 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136696002 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 136696098 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136696175 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 136696495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136696721 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 136696822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136697295 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 136697332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136697467 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 136697496 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136697910 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136698033 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136698096 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136698466 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 136699922 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136700090 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136700374 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136700463 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 136700794 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136700825 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136700834 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136700872 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136700874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136701025 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 136701452 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136701529 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 136701667 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136702122 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 136702155 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 136702227 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 136702239 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 136702473 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 136702565 T G Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 136702776 G T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 136703053 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 136703284 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136703421 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136703579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136703624 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136703632 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136703815 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136703847 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136703885 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136704221 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 136704233 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 136704452 T C Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 136704609 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 136704612 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 136704659 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 136705004 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 136705055 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 136705386 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 136705389 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 136705493 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 136706131 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 136706657 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 136706674 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 136707125 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 136707208 G A N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 136707264 G A N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.571428571428571 0.214285714285714 0.214285714285714 19 9 8 3 3 3 136707558 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 136707645 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 136707909 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 136707977 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 136707983 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136708034 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 136708275 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136708580 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 136708642 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136708884 T G N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 136709009 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 136709861 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 136710335 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 136710629 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 136710690 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 136710736 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 136710808 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136713751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136713789 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 136713794 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136713899 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 136714029 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136714763 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136714803 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136715398 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 136715623 G A Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.0555555555555556 0.833333333333333 0.111111111111111 17 19 1 15 2 3 136715795 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 136716217 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 136716598 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136716645 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136716745 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136716783 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136716919 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136716994 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136717032 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 136717704 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 136717852 C A Y N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 136717903 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 136718126 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 136718159 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 136718190 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 136718227 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 136718375 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 136718461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136718471 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 136718487 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136718670 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 136718671 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 136718825 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136718849 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 136718859 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 136718879 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136719758 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 136719789 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136722231 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 136723073 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136723778 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 136725710 A C Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 136726806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136729494 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136729549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136729902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136730138 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 136731197 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 136733107 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 136733943 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136734201 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 136734413 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 136734442 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 136734567 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 136734895 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 136735056 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 136735060 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 136735344 A C Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 136735361 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 136735730 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 136736273 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136736707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136737788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136737946 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 136738074 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 136738209 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 136738315 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 136738545 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 136738570 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 136738604 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 136738695 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 136738783 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 136738793 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 136738817 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 136738831 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 136738842 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 136738926 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 136739011 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 136739083 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 136739091 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 136739376 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 136739827 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 136739878 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 136739953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136740016 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136740042 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 136740350 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 136740357 G C Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 136740476 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136741672 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136742268 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 136742570 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136743065 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 136745788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136748254 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136748813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136748955 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136749041 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 136749441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136749450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136749545 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136749760 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136750474 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136750766 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 136751626 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136751813 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 136751953 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 136752044 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 136752427 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 136752437 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 136752544 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 136752563 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 136752689 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 136752786 C T N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 136753344 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 136753920 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 136756026 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 136767070 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136774981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136787949 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 136796739 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 136801940 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136806158 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136814216 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 136815864 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 136816146 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 136818222 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136819786 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136820083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136821439 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136822204 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136822531 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136823636 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 136824385 A T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 136828849 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136832091 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136832092 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136834689 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 136836400 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136837338 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136840977 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136844848 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136844874 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136844964 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136844980 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136844993 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136845061 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 136845219 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 136845431 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 136845443 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 136845458 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 136845481 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 136845524 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 136845563 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 136845656 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 136845835 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136845948 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 136845996 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136846025 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 136846043 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 136846071 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 136846079 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 136846200 G T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 136846249 A C N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 3 136846315 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 136846570 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 136846733 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 136846758 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 136846806 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 136846847 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 136846926 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136846932 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 136846981 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 136847039 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 136847325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136847326 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136847486 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 136847707 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136847761 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 136847791 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 136847864 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 136848444 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 136848458 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 136848599 A G N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 3 136849067 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136849476 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 136849578 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 136850178 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 136850269 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136850401 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 136850996 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 136851057 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 136851542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136851797 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136852998 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136853552 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 136853846 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 136853971 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 136854071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136854552 T G Y N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 136854863 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136854995 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 136855002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136855390 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 136855469 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 136855581 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 136855622 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 136855623 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 136855637 C A Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 136855788 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136856720 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 136856761 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 136856773 C A Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 136856908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136857184 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 136857313 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 136857376 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 136857450 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 136857501 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 136857526 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 136857527 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 136857705 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136857802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136857984 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 136858268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136858282 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 136858323 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136858359 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 136858374 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 136858390 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 136858427 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 136858455 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 136858471 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 136858869 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 136858881 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 136858962 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 136858982 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136859171 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 136859355 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 136859428 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 136859663 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 136859695 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136859836 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 136860148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136860323 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 136860494 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 136860712 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136860888 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136861100 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136861300 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136861344 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 136861413 G C Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 136861635 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.25 0.333333333333333 0.416666666666667 10 14 3 4 5 3 136861686 G T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 136862051 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 136862393 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 136862575 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 136862738 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136862816 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 136863176 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136863384 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 136863413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136863576 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 136863593 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136863634 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136864119 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136864300 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136864467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136865049 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 136865842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136866056 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136866805 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 136867052 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136867157 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 136867613 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136871768 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136872473 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136872900 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136873465 G A Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 136874092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136874278 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136874984 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136876135 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136876731 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 136877193 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136878229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136878716 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 136879237 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136879779 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136881017 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 136881673 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136881914 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136882970 G T Y N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 136883063 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136883350 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 136883555 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 136883701 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 136883916 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 136883986 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 136884068 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136884493 T C N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 136884920 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 136884965 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 136885253 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 136885294 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 136885388 G C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 136885625 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 136886014 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 136886034 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 136886190 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 136886296 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 136886523 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 136886725 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 136887925 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 136889180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136891190 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136891229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136891381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136895783 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136898567 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136898981 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 136898988 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 136899059 T C Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 136899220 G T Y N 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 3 136899487 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 136899626 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 136899666 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 136899678 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 136899871 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 136899884 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 136899927 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136900023 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 136900033 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136900059 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136900060 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136900090 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 136900107 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 136900117 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 136900329 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136900438 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 136900580 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 136900801 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136901530 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 136901571 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136901596 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 136901667 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136901689 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 136901803 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136901929 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136902149 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 136902164 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 136902175 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 136902180 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 136902194 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136902232 A C Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 136902358 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 136902647 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 136902955 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 136902969 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 136902973 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136902983 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 136903077 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 136903159 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136903271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136903313 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 136903548 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136903597 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136903667 G T N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 136903800 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 136903950 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 136904110 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 136904150 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136904184 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 136904295 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 136904330 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 136904354 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 136904501 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 136904511 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 136904755 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 136904759 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 136904802 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 136904807 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 136904928 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 136904948 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 136904950 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 136905083 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136905131 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136905241 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 136905288 G A N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 136905337 G T N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 136905381 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136905442 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 136905549 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136906169 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 136906289 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 136907001 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 136907089 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 136907111 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136908049 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 136908285 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136908675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136908935 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 136909391 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 136909753 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136909828 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 136909882 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136910004 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136910176 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 136910204 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 136910310 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 136910561 A C Y N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0 0.642857142857143 0.357142857142857 9 19 0 9 5 3 136910960 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136913195 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 136913447 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136914774 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 136914784 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 136915668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136915754 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136915947 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136916995 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136917261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136918175 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 136918329 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 136918372 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 136918587 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 136918798 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 136918914 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 136919317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136919467 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 136920219 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136920333 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136920578 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 136920715 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 136921029 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 136921174 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 136921395 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136921777 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 136922163 A G Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 136922323 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136922879 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136922933 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 136923009 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 136923134 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 136923189 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 136923242 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136923269 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136923272 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136923620 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 136923710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136923784 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 136924236 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 136924660 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 136924877 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 136924889 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 136924932 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 136925865 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 136925944 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136925968 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136926207 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136926231 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 136926403 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 136926629 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 136926661 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 136926689 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 136926815 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136926845 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 136927252 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 136927330 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 136927449 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136927630 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 136927785 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136928749 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 136928930 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136929001 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 136929194 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136929417 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 136930167 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136930409 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136930611 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136931035 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136931040 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136931173 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 136931203 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 136931287 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 136931538 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136931676 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136931753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136931757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136931997 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 136932002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136932018 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 136932200 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 136932252 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 136932390 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136932407 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136932487 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 136932523 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 136932533 T C Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 136932646 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136932685 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 136932726 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136932803 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136932858 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 136932959 T A Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 136932960 T A Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 136932975 G A Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 136932998 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 136933020 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 136933030 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136933186 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 136933253 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136933293 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 136933304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136933329 G T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 136933474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136933671 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 136933720 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 136933727 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 136933791 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136933837 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 136934329 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 136934368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136934402 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 136934428 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 136934450 A T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 136934481 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 136934635 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 136934732 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 136934751 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 136934752 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 136934762 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 136934873 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 136934978 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 136935055 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136935115 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 136935329 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136935648 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 136935708 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 136935732 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136935749 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136935836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136935882 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 136935885 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 136935934 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 136936073 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136936239 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136936494 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 136936495 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 136936526 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 136936677 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 136936708 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 136936751 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136936772 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136936818 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136936931 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136936993 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136937172 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 136937266 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136937319 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 136937334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136937348 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136937370 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136937384 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136937408 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136937418 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136937650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136937818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136937839 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136937904 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 136937934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136937948 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 136937981 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136938071 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136938112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136938209 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 136938242 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 136938251 A C Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 136938365 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 136938398 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136938430 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 136938788 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 136938827 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 136938933 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 136938942 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 136938965 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 136939171 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 136939189 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 136939253 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 136939898 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 136939973 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 136939987 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 136940044 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 136940245 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 136940300 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 136940320 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 136940347 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.8125 0 0.1875 26 6 13 0 3 3 136940593 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 136940775 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 136940855 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136940934 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136941286 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136941449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136941593 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 136941981 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136942230 C G Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 136942711 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136943221 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136943277 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 136943330 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 136943490 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 136943508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136943641 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 136943954 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 136943972 A G Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 136944110 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 136944261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136944356 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 136944478 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136949055 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136949164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136949218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136949274 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136949288 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 136949405 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 136949471 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 136949472 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 136949576 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 136949589 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 136949593 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 136949778 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 136950142 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136951287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136951383 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 136952258 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 136952523 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136952990 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 136953137 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136954251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136954524 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136954525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136954959 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136955172 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136955224 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 136955328 T C Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 136955337 T C Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 3 136955552 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136955778 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136956360 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136956661 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136956811 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136957110 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136957306 G A Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 136958560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136958745 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136958828 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136958925 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136959429 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 136959574 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136959604 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136959687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136959799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136959811 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136959818 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136959836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136959842 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136959884 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 136959939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136959948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136959999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136960192 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136960451 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 136960826 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 136961073 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 136961122 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 136961315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136961382 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136961392 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 3 136961398 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136961454 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136961486 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 136961542 A C N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 136961756 T A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 136961878 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 136961910 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 136962109 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136962321 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136962457 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136962732 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136962832 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136962909 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136963229 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 136963301 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 136963333 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 136963353 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 136963481 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 136963521 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 136963545 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 136963617 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 136963619 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 136963768 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 136964047 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136964134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136964182 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136964276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136965424 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136967045 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136969590 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136971303 C G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 136972946 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136973190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136974585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136975831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136976541 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136976629 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136977812 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 136979322 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136979774 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136979906 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 136980393 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136980711 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 136980806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136981673 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 136981947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136981997 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 136982445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136982925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136982936 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 136983064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136983115 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 136983399 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 136983552 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 136983569 C G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 136983701 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 136984383 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 136984497 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 136984512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136984715 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 136985013 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136985288 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 136985479 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136985481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136985622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136985804 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 136985905 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136986055 T G Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 136986062 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 136986185 A G Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 3 136986202 T G Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 3 136986232 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 136986237 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136986304 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 136986305 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 136986384 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136986403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136986533 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136986534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136986646 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 136986669 T C Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 136987207 T G N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.333333333333333 0.2 0.466666666666667 13 17 5 3 7 3 136987509 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 136987528 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 136987586 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 136987588 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 136987620 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 136987725 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 136988003 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 136988248 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 136988328 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 136988889 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 136988925 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 136988973 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136989064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136989085 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 136989103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136989363 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136989571 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 136989572 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136989812 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 136989822 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 136989897 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 136989925 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 136989968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136990064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136990104 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 136990175 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 136990289 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 136990377 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136990414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136990768 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 136990842 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 136990889 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 136990891 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 136990913 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 136990943 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 136991002 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 136991044 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 136991049 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 136991064 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 136991112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136991213 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136991514 G T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 136991563 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136991620 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136991728 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 136991955 T C N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.181818181818182 0.0909090909090909 0.727272727272727 5 17 2 1 8 3 136992230 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 136992322 T C N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 136992416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136992467 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 136992544 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 136992584 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136992595 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 136992793 T C Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.214285714285714 21 7 10 1 3 3 136992858 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136992973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136993081 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 136993112 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 136993159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136993263 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136993406 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 136993524 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136993759 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136993811 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136994229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136994455 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136994470 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136994614 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136994639 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136994706 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136994839 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136994862 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136994920 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 136995235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136995450 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 136995595 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136995602 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136995641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136995675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136995881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136996070 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 136996083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136996160 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 136996251 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 136996328 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 136997665 C T Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 3 136997831 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 136997940 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136998531 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 136999034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136999362 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 136999402 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 136999547 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136999580 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136999642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136999847 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 136999901 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 136999922 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 136999949 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 137000032 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137000194 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 137000232 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137000259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137000365 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 137000408 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 137000414 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137000495 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137000635 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 137000763 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 3 137000912 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137000919 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 137000968 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137001059 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 137001100 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 137001180 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137001706 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 137002192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137002231 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 137002237 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137002242 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 137003070 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 137003101 A G Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 137003368 T C Y Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 3 137003623 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 137003624 C A N N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 15 9 6 3 3 3 137003773 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 3 137004032 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 137004172 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 137004194 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 137004197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137004440 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137004592 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 137004607 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 137004931 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 137005130 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137005230 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 137005297 A G N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.25 0 0.75 4 12 2 0 6 3 137005329 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 137005353 A C N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 137005391 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 137005503 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 137005526 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 137005586 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 137005629 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 137005675 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 3 137005804 C T N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.5 0.0714285714285714 0.428571428571429 15 13 7 1 6 3 137005977 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 3 137005987 C T Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.153846153846154 21 5 10 1 2 3 137005998 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 3 137006180 T A N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 137006578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137006702 T G Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 137006720 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 137006723 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 137006784 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 137006846 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 137007024 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 137007095 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 137007433 T G Y N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 3 137007454 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 137007491 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 137007522 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 137007624 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 137007637 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 137007680 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 137007708 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 137007724 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 137007736 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 137007765 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 137007810 G T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 137007980 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 137007982 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 137008103 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 137008141 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 137008156 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137008167 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 137008211 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 137008245 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 137008460 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 137008495 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 137008548 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 3 137008604 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 137008615 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 137008720 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 3 137008816 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.588235294117647 0.0588235294117647 0.352941176470588 21 13 10 1 6 3 137008821 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 137008886 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 3 137008990 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 137009014 A G Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 137009188 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 137009545 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 137009824 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 137010259 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 137010261 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 137010291 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 137010426 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 137011034 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 137011043 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 137011090 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 137011205 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 137011244 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 137011253 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 137011268 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137011296 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 137012548 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137012873 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137013432 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 137013468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137013531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137013538 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 137013557 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 137013658 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 137013904 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 137014222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137014686 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 137015063 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 137015257 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 137015274 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 137015519 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 137015527 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137015696 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 137016106 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137016203 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137016299 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137016350 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 137016363 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137016431 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137016499 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137016665 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 137016993 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 137017011 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 137017013 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 137017282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137018010 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 137018416 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 137018431 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 137018707 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 137018818 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137018958 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137019192 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137019633 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 137019663 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137020106 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137020168 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137020429 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 137020547 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137020841 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 137021150 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 137023869 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 137023976 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 137024132 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 137024169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137024316 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 137024334 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 137024342 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137024415 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 137024496 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 137024778 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 137024780 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 137025023 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 137025041 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 137025134 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 137025147 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 137025378 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 137025396 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 137025496 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 137025689 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 137025707 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 137025727 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 137026142 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 137026521 G C N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 137026571 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 137026640 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137026697 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 137026769 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 137026912 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 137027085 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 137027157 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 137027158 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 137027225 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 137027770 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 137028152 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 137028191 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 137028224 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 137029057 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 137029313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137029487 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137029825 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137029946 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 137030010 A G Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 137030065 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 137030130 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137030196 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 137030219 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 137030366 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 137030746 G C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 15 21 6 3 9 3 137030784 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 137030896 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 137030996 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 137031668 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137031738 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 137031743 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 137031804 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137031997 G A Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 137032083 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 137032225 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 137032308 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137032588 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 137032768 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 137032869 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 137032917 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 137033115 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 137033239 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 137033600 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 137034225 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 137034462 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 137036005 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137037561 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137039298 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137039368 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 137039403 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137039967 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 137040350 C G Y N 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 3 137040393 G A Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 137040446 T A Y N 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 3 137041172 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 137041941 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137042027 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137042447 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 137042506 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 137042697 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137043231 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137043343 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 137043540 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137043660 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137043963 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137044703 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 137045609 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137046008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137046677 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 137046749 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137046851 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 137046931 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 137047539 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137047559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137048011 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 137048269 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 137048864 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 137049896 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137049954 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 137050709 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 137050721 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 137051063 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137051119 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 137051345 T G N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 137051518 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137051702 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 137051736 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 137051752 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 137051812 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 137051828 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 137051861 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 137051906 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 137051945 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 137052008 T A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 137052024 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 137052096 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 137052457 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 137052519 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 137052539 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 137052585 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 137052628 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 137052634 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 137052669 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 137053281 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 137053308 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 137053436 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137053671 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 137053780 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 137053841 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.294117647058824 0.117647058823529 0.588235294117647 12 22 5 2 10 3 137054038 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 137054097 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 137054288 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 137054360 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137054386 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 137054397 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 137054495 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 137054608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137054743 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 137054808 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137054861 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 137055459 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 137055736 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 137055831 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 137056146 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137056276 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137056561 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 137056589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137056645 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137056922 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 137057226 G T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 137057409 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137057481 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 137057541 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137057604 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 137058057 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 137058375 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137058718 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 137058719 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 137059077 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 137059777 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.55 0.1 0.35 24 16 11 2 7 3 137059894 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 137059905 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 137060037 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137060719 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 3 137061906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137064068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137064992 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 137066157 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137068106 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137076889 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137077976 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137078898 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137079729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137081451 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137081607 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 137083540 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 137083986 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137084062 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 137084177 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 137086971 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137087549 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137089411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137090369 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137091058 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137092954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137093309 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 137096356 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137096364 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137118442 G C Y N 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 3 137121229 A C N N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0 0.6 0.4 6 14 0 6 4 3 137122030 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 137123483 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 137123828 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 137127235 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137128625 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137129364 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137129479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137129774 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137129929 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 137130127 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 137130129 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 137130340 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137130550 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 137130619 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 137130816 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 137130820 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 137130861 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 137130948 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137131028 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 137131346 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.25 0.0625 0.6875 9 23 4 1 11 3 137131388 C T N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.285714285714286 0.0714285714285714 0.642857142857143 9 19 4 1 9 3 137131447 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 3 137131474 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 3 137131478 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 137131488 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 137131516 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137131705 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137131758 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137131902 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 137132055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137132264 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 137133821 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137133984 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137134381 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 137134485 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 3 137134512 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 137134537 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 137134816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137135064 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 137135120 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137135570 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137135666 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137135694 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137135695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137136370 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137136525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137136568 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137136670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137136752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137136758 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137136786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137136916 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137136983 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137137007 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137137100 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137137159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137137261 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137137315 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 137137334 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 137137399 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137137482 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137137651 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 137137652 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 137137731 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 137137742 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 137137871 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137137881 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137138236 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137138250 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137138287 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137138332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137138404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137138525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137138536 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137138569 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137138581 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137138838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137139012 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137139075 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137139092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137139120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137139272 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137139480 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137139502 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 137139799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137139824 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137139972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137140034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137140238 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137140331 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137140581 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137140637 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137140714 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 137140730 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137140805 C A Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 137140820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137140839 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137141139 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137141147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137141189 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137141514 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 137141653 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 137141732 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137141979 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 137142774 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137142936 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137143468 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 137143765 G T Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 137143883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137144669 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137144872 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137145571 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 137147389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137147531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137148283 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 137148331 T A Y N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 137148440 C A Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 137149044 A G Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 137149206 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 137149871 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137150411 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137150529 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 137150574 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137150736 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137151672 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137151796 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 137151808 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137152059 C T Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 137152832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137152911 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137153100 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 137153174 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 137153218 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 137153301 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 137153316 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 137153348 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 137153399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137154033 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137154056 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 137154062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137154705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137154970 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137155270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137158801 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137158868 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137160796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137161620 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137161850 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137162459 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137163995 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137164538 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137165131 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137165424 C T Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 137166816 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137167767 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137170045 T G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 137170315 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 137170582 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137171031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137171816 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 137172010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137172136 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 137173293 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 137173483 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 137173992 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 137174044 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 137174045 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 137174239 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 137174565 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 137174679 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 137177061 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137177093 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 137177512 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 137177912 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 137178882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137180155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137181131 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 137181142 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 137182313 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137182702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137183157 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137183508 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 137184030 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137184436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137184689 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137184989 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137184994 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137185196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137185452 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 137185886 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137186269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137186470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137186502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137186751 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 137186951 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137186954 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137187460 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 137187658 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 137187670 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 137187703 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 137187739 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137187748 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 137187915 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 137188142 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 137188147 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 137188155 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 137188170 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 137188234 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 137188246 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 137188346 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 137188725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137188759 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137188987 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 137189106 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137189785 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 137190088 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 137190456 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 137191839 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 137191897 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 137192082 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 137192292 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 137192410 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 137192605 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 137193449 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 137193569 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 137193571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137193767 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 137193986 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137194538 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 137195508 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 137195709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137196277 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137196289 A C Y N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 3 137196342 A G Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 3 137196372 T A Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 3 137196525 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137197161 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 137199026 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137199883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137200382 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137200499 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137201408 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137201711 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137201871 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 137202493 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 137202510 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137202523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137202557 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137202853 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 137203654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137204205 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137204283 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 137204489 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 137204682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137204774 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137204923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137205129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137205350 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.235294117647059 0.117647058823529 0.647058823529412 10 24 4 2 11 3 137205981 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137206447 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 137206559 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137206560 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 137206694 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137206713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137206860 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137207131 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 137207209 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 137207288 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137207490 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137207550 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 137207828 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137208254 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 137208535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137208629 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137208749 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137208805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137208837 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 137209089 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137209099 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137209365 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137209399 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 137209506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137209545 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137209775 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 137210062 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 137210100 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 137210200 T G N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 3 137210217 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 137210223 G T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 137210259 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 137210313 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137210319 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 3 137210327 C A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 137210446 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137210633 C G Y N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 137212302 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137213098 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 137213462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137214650 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137217130 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137217387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137220959 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137223274 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137224364 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137224483 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137225096 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 137225192 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 137225197 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 137225205 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 137225648 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137226025 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 137226122 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 137226168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137226206 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 137226238 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137226670 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137227142 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137227778 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137228718 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 137228938 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137228983 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 137229066 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 137229067 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 137229208 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137229223 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 137229239 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137229277 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 137229288 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 137229544 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 137229568 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 137229574 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 137229604 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 137229641 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 137229681 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137229853 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 137230019 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137230140 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137230161 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 137230319 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 137230437 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 137230526 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 137230527 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 137230551 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 137230582 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 137230667 A T Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 137230754 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 137230806 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 137230940 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 137230941 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 137231020 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 137231053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137231100 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 137231149 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 137231253 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 137231558 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137232237 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 137233674 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 137233930 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137234352 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 137234699 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 137235112 T C Y Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.714285714285714 0.285714285714286 5 9 0 5 2 3 137235627 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137235660 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 137235749 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137235783 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137235852 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137236018 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137236027 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137236189 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137236244 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137236287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137236307 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137236398 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137236447 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137236466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137236469 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137236500 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137236522 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137236546 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137236583 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137236630 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137236656 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 137236945 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137237251 A G Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 137237500 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137237520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137237821 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137237854 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137237913 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137238008 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 137238010 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 137238054 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137238467 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 137238587 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 137238716 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 137238755 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 137238794 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 137239021 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 137239154 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 137239350 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 137239382 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 137239470 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 137239474 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137239565 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 137239620 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 137239687 A C Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 137241225 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 137242170 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137242215 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 137242800 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137243352 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137243607 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 137243633 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 137245355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137245627 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137246851 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 137247341 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 137247361 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 137248333 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 137248407 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137248426 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137248990 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 137249317 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137249339 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137249492 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 137250115 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137251677 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 137251961 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137252019 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 137252123 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 137252179 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 137252232 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 137252241 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 137252412 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 137252496 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137252596 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137252642 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 137252672 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137252758 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 137252768 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137252792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137252799 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137252956 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 137253089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137253134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137253228 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137253308 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137253344 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137253400 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 137253631 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 137253659 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137254017 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 137254032 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 137254049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137254217 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137254294 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 137254297 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 137254671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137254711 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137254720 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 137254785 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 137254835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137254839 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 137254973 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137255018 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 137255213 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 137255257 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 3 137255305 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137255325 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 137255349 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 137255359 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137255363 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 137255902 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 137256084 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137256170 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 137256269 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 137256377 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 137256384 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137256487 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 137256727 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 3 137257144 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 137257242 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 137257264 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 137257265 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 137257312 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 137257357 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137257377 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137257455 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 137258106 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137258428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137258498 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137258560 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 0.105263157894737 0.421052631578947 20 18 9 2 8 3 137259648 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 3 137259663 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 137259693 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137259756 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 137259765 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 137259968 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137260358 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 0.105263157894737 0.421052631578947 20 18 9 2 8 3 137260628 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 137260680 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137261033 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 137261036 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 137261063 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137261149 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137261387 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 137261585 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 137261748 A G Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 137261813 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 137262587 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137263221 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 137271283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137271740 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137272071 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 137272085 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 137272828 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137275121 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 137275273 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 137275304 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137275464 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 137275477 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 137275587 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137275600 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137275859 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137275897 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137275940 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137275947 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 137276281 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 137276308 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 137276321 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137276480 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137276492 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 137276520 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 137276540 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 137276667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137276685 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 137276715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137277276 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137278577 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137279090 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137280479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137280508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137280667 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 137280742 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 137280872 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 137281670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137281913 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137282131 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 137282369 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 137282991 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 137283208 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 137284117 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137284118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137284644 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 137285748 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137285927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137286246 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 137286624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137287544 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137288634 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137288816 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137290953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137290990 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 137291052 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137291124 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137291128 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137291212 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137291449 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 137291701 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 137291726 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 137291766 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 137291767 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 137291780 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137291839 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 137291974 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137291984 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 137292017 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 137292061 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 137292071 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 137292222 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 137293819 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137295038 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137297902 A G Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 137298268 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 137298423 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137300216 G T N N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.6 0 0.4 6 4 3 0 2 3 137300227 G C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 137300441 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 137300581 A G N Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.428571428571429 0 0.571428571428571 6 8 3 0 4 3 137300733 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 137301834 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 137302065 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137302415 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 137303470 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137303656 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 137303976 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137304622 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 137305310 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 137305917 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 137305941 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 137305954 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137306060 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137306085 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 137307288 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 137307296 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 137307653 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137308412 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137310583 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 137310859 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 137311756 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137313692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137314788 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137314814 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 137315242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137315781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137315999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137316791 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137317282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137317428 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137318292 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 137318573 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137318587 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 137319642 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 137319921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137320279 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137320337 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137320863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137320991 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137328035 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 137328517 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137328840 C G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137328904 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137328990 G A Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 137329313 G T Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 137329336 C A Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 137329513 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 137329971 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 137338751 G A Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 137338973 G A Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 137339101 G C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 137339194 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 137340292 A G Y Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 8 10 0 8 1 3 137341528 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137341557 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137341773 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137344308 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137344329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137344569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137346687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137346794 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137347551 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137347862 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137350180 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 137350634 C T Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 137352405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137352527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137352756 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 137354339 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 137356542 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137357527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137359945 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137360137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137360791 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 137361098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137361728 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 137362513 G A N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 6 10 2 2 4 3 137364296 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137365865 T G Y N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 137365883 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 137366603 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 137366604 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137366660 G A Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 137367975 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137368478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137368679 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137369120 C G Y N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 3 137369874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137370836 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137371913 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 137372207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137372626 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 137373062 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137373460 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137373487 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 137373512 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137373584 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 137373638 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 137373653 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 137373738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137373805 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 137374559 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137374834 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 137375347 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 137375442 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 137376116 C T N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 0.153846153846154 0.153846153846154 20 6 9 2 2 3 137376790 A T N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 3 137377078 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137377298 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 137377532 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 137377746 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 137377757 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 137377997 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 137378340 A G N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0 0.916666666666667 0.0833333333333333 11 13 0 11 1 3 137378545 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 137378547 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 137378995 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 137379052 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 137379175 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 137379180 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 137380075 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137380094 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.176470588235294 27 7 13 1 3 3 137380236 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 137380275 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 3 137380343 A G N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 3 137380378 C A N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 137380380 T C N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 137381036 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 137381204 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 137381267 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 137381294 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 137381295 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 137381310 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 137381325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137381339 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137381342 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137381409 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 137381446 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 137381553 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 137381595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137381884 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 137381927 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137382029 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137382054 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 137382145 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 137385503 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 137385547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137385745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137386649 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 137386703 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137386713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137386720 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 137387006 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 137387045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137387112 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 137387210 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137387266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137387573 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 137387598 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137387675 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137387715 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 137387781 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137387788 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 137387833 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137387876 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 137387903 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137387915 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 137388000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137388007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137388185 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 137388204 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 137388218 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 137388236 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 137388238 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 137388426 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137388439 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 137388463 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 137388481 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 137388484 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 137388565 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 137388808 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 137388829 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 137388833 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 137388844 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 137388930 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 137389181 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 137389232 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 137389263 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 137389363 A T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 137389426 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 137389448 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 137390113 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137390184 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 137392262 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137392570 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 137392586 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 137392653 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 137392804 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 137392918 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 137392955 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 137393540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137394007 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137394357 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137394932 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 137394943 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 137395001 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 137395112 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137395118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137395158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137395215 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137395416 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137395501 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137395664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137396267 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 137396285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137396718 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 137397312 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 137397404 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 137398579 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 137400368 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137400640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137400917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137401673 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 137402445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137404582 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137404682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137405011 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137405028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137406833 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137406935 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 137407717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137407927 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 137408909 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 137409479 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 137409533 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 137410647 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 137411496 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 137411553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137411626 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 137411633 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 137414464 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 137414695 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137415598 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 137416036 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137417690 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137417718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137418590 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 137420059 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 137420332 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137420509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137420670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137421681 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137422373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137425245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137426613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137426817 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 137427404 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137428303 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 137428596 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 137429458 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 137429477 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 137429519 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 137430173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137430312 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 137430313 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 137430344 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 137431031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137431057 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137431093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137431193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137431309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137431543 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 137431591 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 137431672 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 137431683 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 137431727 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 137431799 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 137431881 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 137432319 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137432351 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 137432387 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 137432619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137432667 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 137432865 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 137433130 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 137433441 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 137433522 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 137433618 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 137433668 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 137433768 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137434306 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 137434425 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 137434990 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137435683 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137435959 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137436370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137436414 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137438975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137440091 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137440140 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137440563 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137440903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137441419 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137441526 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 137441588 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 137441783 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 137441910 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137441980 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 137442918 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 137443133 G C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 137443279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137444070 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 137444139 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 137444190 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 137444319 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 137444408 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137444416 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137445041 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137445282 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137447954 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 137447958 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 137448000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137448285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137450414 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 137450702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137451577 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137452005 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137452118 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 137453360 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 137453753 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 137453761 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 137454106 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 137454277 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137454296 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 137454347 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 137454489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137454579 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 137454745 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137454951 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 137454960 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 137455399 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 137455445 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137455509 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 137455575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137455584 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 137455601 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137456278 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137456464 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 137457600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137457783 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 137457840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137458179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137458729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137459139 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137459177 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137459972 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137460028 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137460042 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137460646 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 137460927 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 3 137461834 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137461989 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137462022 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137462106 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.222222222222222 27 9 13 1 4 3 137462168 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 137462480 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 137462914 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 137463075 C T N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 137463431 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137463563 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137464295 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137465636 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 137465755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137466490 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 137467365 C G Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 137468751 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 137468774 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 137468849 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137469453 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137469766 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 137469969 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 137470010 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137470373 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137470432 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137470822 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 137470840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137470854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137471294 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 137473245 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137473251 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 137474487 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137475134 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 137475605 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 137475683 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137476436 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 137477046 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 137477234 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137477577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137477609 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137477658 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 137477678 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 137477908 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 137478207 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137478491 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 137479041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137479199 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137479781 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 137480647 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137480727 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 137480825 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 137480839 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 137480958 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 137481231 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 137481413 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 137481587 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 137481616 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 137481967 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 137482281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137482617 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 137482671 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 137482722 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 137482856 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 137482886 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 137483477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137483737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137483822 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 137483996 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 137484046 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 137484142 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137484307 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137484504 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137484751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137484789 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137484859 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137485129 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137485147 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137485169 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137485328 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137485337 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137485353 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137485359 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137486201 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 137486234 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 137486275 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 137486580 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137487060 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 137487312 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137487330 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137487894 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137488185 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 137488659 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137488768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137488804 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137488934 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137489105 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 137491754 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 137491906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137492059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137492420 T A Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 137492562 G T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 137492702 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137492780 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 137492919 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 137492963 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137493038 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 137493108 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137493111 T G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 137493163 A T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 137493336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137493393 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 137493509 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 137493923 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137494321 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137495215 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 137496205 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137496219 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137496237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137496294 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 137496854 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 137497024 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137497198 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 137498923 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137499481 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137499524 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137499559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137500716 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137503589 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137503636 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 137505013 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 137505253 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137507054 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137508213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137509279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137509913 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 137510139 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137510361 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137510402 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 137510403 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137510422 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137510474 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137510512 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 137510534 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137510617 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137510624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137510664 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137511232 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137511738 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137512730 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 137512941 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 137512956 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137513405 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137513550 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 137513660 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137513822 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 137514183 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 137514227 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137514682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137514750 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137514982 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 137515129 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137515132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137515144 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137515394 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137515502 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137516411 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137516523 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137516626 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 137516977 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 137517001 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137517490 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 137517715 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137517747 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137518020 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137519178 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 137520352 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137520462 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137521937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137522246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137522957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137522973 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137524354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137524867 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137525120 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137525667 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137525813 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137531491 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137532065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137532424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137533543 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 137533634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137535027 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 137535097 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 137535417 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 137535422 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 137535536 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 137535558 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 137535579 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 137535655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137535786 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 137535906 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 137536249 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137536379 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137536656 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 137536724 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 137536977 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137537059 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137537202 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137537252 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 137537456 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137537682 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 137538070 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137538542 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 137538839 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 137539181 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 137539229 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 137539275 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 137539384 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 137539491 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 137539584 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 137539588 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 137539792 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 137539820 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137539846 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 137539913 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137539943 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 137539953 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 137540008 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 137540009 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 137540027 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 137540049 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 137540273 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 137540415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137540450 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 137540466 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137540505 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137540631 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137540748 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 137540770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137540798 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137540897 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137540930 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137540989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137541022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137541051 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137541056 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137541172 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137541576 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137541579 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137541731 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137541841 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137541897 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137542196 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137542643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137543399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137544048 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 137544175 T A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 137544393 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 137544885 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 137545005 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137545008 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 137545047 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 137545048 A T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 137545106 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 137545275 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137546075 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 137546202 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 137546290 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 137546509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137547283 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137547754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137548040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137548367 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137548456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137549258 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137549381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137549391 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137549417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137549574 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137550040 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 137550707 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137551195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137552485 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 137552907 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 137552986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137553160 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137553260 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 137553463 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 137553479 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 137553487 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137554264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137554414 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 137554434 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 137554458 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 137554527 C T N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 137554668 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 137554707 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 137554708 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 137554775 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 137554798 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 137554828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137555039 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137555046 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 137555187 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137555205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137555218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137555307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137555587 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 137555588 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 137555622 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 3 137555630 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 3 137555829 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137555935 A C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 137555964 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 137556018 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137556058 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 137556076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137556154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137556172 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137556203 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137556291 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137556301 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137556309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137556327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137556364 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137556391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137556581 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137556602 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137556605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137556676 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137556786 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137556801 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137556919 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137557083 G T N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 137557274 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 137557386 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 137557561 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 137557720 T A N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 137557921 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137558133 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 137558145 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 137558205 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137558212 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 137558268 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 137558331 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 137558336 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 137558367 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 137558438 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 3 137558490 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137558505 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 137558514 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 137558528 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 137558537 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 137558562 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 137558600 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 137558676 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 137558681 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 137558806 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 137559128 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 137559166 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 137559205 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 137559397 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 137559398 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 137559456 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 137559462 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137559473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137559480 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 137559532 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 137559619 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 137559878 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 137560059 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137560112 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137560403 C T N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 137561179 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 137561198 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 137561362 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 137561363 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 137561762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137561989 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 137562044 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 137562115 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 137562191 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137562316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137562356 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137562693 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 137562765 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 137563253 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 137563309 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137563436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137563491 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 137563566 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 137563765 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 137563779 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 137563810 C A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 137563844 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 137563849 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 137563934 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 137564354 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 137564590 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 137564613 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 137564707 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 137564745 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 137564962 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137565128 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 137565696 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 137566185 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 137566418 A T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 137566419 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 137567163 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137567264 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137568027 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137568090 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137568138 C G Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 137568367 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137568667 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137569175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137569213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137569354 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 137569963 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 137570004 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 137570030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137570087 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 137570430 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 137570708 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 137570834 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137570940 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 137570953 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137571013 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 137571166 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 3 137571282 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 137571295 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 137575633 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137576747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137576871 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137577862 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 137577995 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 137580239 C G Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 137581132 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137581340 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 137581441 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137581512 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 137581812 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 137582208 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 137582213 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 137582269 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 137582453 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 137582599 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 137582811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137582829 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 137583185 T A Y N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 137583350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137583631 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 137583657 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 137584062 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 137584436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137584874 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 137584912 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 137584933 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 137585178 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 137585343 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 137585409 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 137585600 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 137585606 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 137585623 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 137585651 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 137585904 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137585921 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 137586079 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 137586086 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 137586357 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137586374 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 137586435 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 137586641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137586658 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137586677 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137586858 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137588973 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 137589938 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137590059 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137590166 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 137590412 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 137590420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137590428 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137590434 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 137590642 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 137590694 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 137590704 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 137590809 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137590853 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 137590945 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 137591011 G T N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 137591037 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 137591052 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 137591117 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 137591123 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137591290 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 137591298 T G Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 137591312 C G Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.15 0.85 0 23 17 3 17 0 3 137591417 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137591565 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137591931 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137593096 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137593176 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 137593460 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137593489 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 137593557 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137593787 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137594010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137594233 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 137594319 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 137594332 C G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 137594468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137594847 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137594892 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137595283 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 137595284 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137595538 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137595868 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 137596272 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137596661 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 137596985 C T N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 137597250 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137597323 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 137597534 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137597619 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 137597773 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 137597780 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 137597821 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 137597846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137597876 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137597895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137597927 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 137597973 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 137598198 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 137598381 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 137598397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137598498 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 137598650 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 137598862 G A Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 137598874 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137598941 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137598957 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137598997 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137599531 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137599533 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137600032 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137600071 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 137600168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137600246 A T N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 137600281 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137600327 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137600342 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 137600428 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0 0.933333333333333 0.0666666666666667 14 16 0 14 1 3 137600480 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 137600529 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137600538 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137600676 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 137600825 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137600846 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 137600952 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137601094 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 137601110 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137601466 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 137601549 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 137601557 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 137601587 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 137601605 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 137601658 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 137601679 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137602063 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 137602166 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 137602364 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 137602713 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 137602841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137603313 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 137603340 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 137603346 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 137603888 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137604331 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 137604396 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 137604419 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 137604650 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137604658 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 137604790 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 137604862 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 137604874 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 137604947 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 137604966 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 137605062 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 137605322 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 137605328 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 137605338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137605588 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 137605651 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 137605709 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 137605961 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 137606038 T C Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 137606079 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 137606097 T C Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 137606150 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 137606178 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 137606195 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 137606533 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 137606553 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137606640 C T N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 3 137606894 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 137606929 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137607013 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 137607150 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 137607251 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137607495 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 137607734 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137608878 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137609218 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137610420 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 137610752 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 137611180 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 137611730 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 137611779 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137611930 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 137612311 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 137612326 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 137612464 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 137614093 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 137614251 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137615390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137615956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137616110 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137616479 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 137616586 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137616848 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 137617242 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 137617335 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137617474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137617837 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 137618344 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137618390 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 137618483 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 137618497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137618711 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137619250 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 137619540 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 137619580 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 137619709 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137619768 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137620048 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 137620061 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 137620062 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 137620102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137620233 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137620254 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 137620268 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137620505 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 137620652 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 137620654 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 137620684 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 137620755 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 137621335 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 137621358 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 137621541 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 137621565 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 137621738 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 137622012 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 137622080 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 137622313 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 137622370 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137622420 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 137622466 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 137622662 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 137622764 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137622830 A T N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.0769230769230769 0.769230769230769 0.153846153846154 12 14 1 10 2 3 137623282 G T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 137623641 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 137623644 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 137624144 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137624162 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137624320 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 137624503 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 137624750 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 137624925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137624947 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 137625075 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137625553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137625581 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 137625804 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137626039 A G Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 137626275 T G Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 137626775 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 137626866 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 137626903 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 137627233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137627419 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 8 4 4 0 2 3 137627461 C T N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.75 0 0.25 12 4 6 0 2 3 137627462 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 137627568 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 137627598 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137627658 A G Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 137627665 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 137627784 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 137627968 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 137627969 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 137628052 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137628168 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 137628488 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137628712 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 137628850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137629117 A T Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 137629248 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 137629270 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 137629298 A C Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 137629324 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 137629329 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 137629409 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 137629446 A C Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 137629493 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 137629553 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 137629599 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 137629612 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 137629629 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 137629799 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 137630032 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 137630413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137630443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137630528 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 137630649 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 137630766 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 137631032 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 137631071 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 137631269 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 137631323 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 137631371 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 137631425 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 137631560 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 137631661 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 137631782 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 137632024 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 137632040 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 137632183 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 137634889 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 137634950 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 137635911 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 137636637 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 137637201 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 137637305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137637364 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 137637688 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 137638645 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137639799 C T N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 137639931 A G N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0.2 0 0.8 2 8 1 0 4 3 137639933 G A N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0.2 0 0.8 2 8 1 0 4 3 137639958 T G N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 3 137640388 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 137640636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137640721 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 137640846 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 137641577 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 137641677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137643086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137643310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137643465 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137643491 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 137644144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137644461 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137645483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137645488 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 137645505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137645566 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 137645618 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137645670 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 137645724 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 137645781 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 137645807 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 137645841 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137645889 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 137645899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137645914 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137645923 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 137646571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137646608 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 137646642 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137646646 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137646665 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137646709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137646713 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 137646753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137647067 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 137647070 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137647081 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 137647124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137647327 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 137647344 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 137647779 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 137647909 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 137648021 C T N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 3 137648028 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 137648064 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 137648073 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 137648109 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 137648132 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 137648164 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 137648370 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 137648479 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 137648730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137648748 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 137648782 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 137648784 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 137648794 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 137648819 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137648827 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137648836 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 137648876 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 137648918 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 137648939 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137648996 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 137649003 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 137649016 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 137649085 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137649176 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 137649180 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 137649207 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 137649357 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 137649374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137649389 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 137649453 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 137649591 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137649611 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 137649637 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 137649640 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137649897 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137650431 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 137650443 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 137650497 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 137650503 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 137650990 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 137651383 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137651414 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 137651659 C T Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 3 137651669 C T N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 3 137651701 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 137651702 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 137651715 C T Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 137651768 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 137651833 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 137651864 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 137652025 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137652075 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137652246 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 137652353 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 137652774 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 137652842 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 137652930 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 137653757 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 137653795 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 137653839 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 137653932 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 137654252 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 137654400 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 137654432 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 137654444 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 137654962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137655044 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 137655529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137655546 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137655669 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137655742 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 137655743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137656342 C G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 137656359 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137657215 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 137657432 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 137657439 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 137657450 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 137657462 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 137657468 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 137657475 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 137657502 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 137657615 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 137657659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137657700 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137657759 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137658543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137658689 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 137658806 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 137658926 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 137659028 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 137659110 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 137659160 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 137659182 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 137659193 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 137659234 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 137659257 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 137659311 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 137659363 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 137659412 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 137659491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137659531 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 137659533 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 137659562 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 137659566 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 137659582 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 137660169 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 137660346 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 137660447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137660953 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 137661111 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 137661222 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 137661288 T G N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 137661416 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 137661489 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 137661622 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137661711 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137661740 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 137661859 C G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 137662296 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 137663181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137665144 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137665597 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137665661 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 137665788 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 137665972 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 137666123 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 137666986 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 137666997 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 137667772 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137668493 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137669306 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137669331 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137669548 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 137669778 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137669833 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137669847 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137669877 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 137670169 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137670369 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 137670416 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 137670478 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 137670493 C T N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 137670604 C A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 3 137670930 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 137670981 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 137670988 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 137671109 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 137671613 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137671618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137672140 C A N N 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 12 4 5 2 1 3 137672183 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 137672289 C A N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 137672310 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 137672340 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 137672395 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 137672425 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 137672428 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 137672457 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 137672497 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 137672543 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 137672604 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 137672677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137672683 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 137672777 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 137672789 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 137672822 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 137673066 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 137673081 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 137673109 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 137673198 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 137673331 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 137673379 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 137673385 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 137673434 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 137673509 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 137673619 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 137673624 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 137673649 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 137673681 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 137673767 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137673933 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 137674089 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 137674541 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 137674567 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 137675056 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 137675500 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 137675603 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 137675631 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137675669 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 137675746 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 137675855 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137676117 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137676783 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 137676921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137677486 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 137677653 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 137677915 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 137678279 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137678612 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 137678727 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137678840 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 137678846 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 137678914 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 137679168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137679358 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 137679367 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 137679390 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 137679414 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 137679619 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137679644 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 137679728 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137680003 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 137680004 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 137680429 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 137680652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137680691 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137680713 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137680718 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 137681229 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137681312 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137681374 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 137681754 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137681971 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 137682004 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 137682005 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 137682039 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 137682107 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 137682113 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 137682122 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 137682138 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 137682160 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 137682163 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 137682174 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 137682232 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 137682282 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 137682375 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 137682438 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 137682580 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 137682638 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 137682650 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 137682687 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 137682849 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 137682861 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 137683086 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137683248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137683295 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137683307 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 137683312 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 137683319 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137683396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137683423 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 137683432 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 137683443 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137683489 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137683494 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137683580 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137683708 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 137683807 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137683884 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137683930 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 137683932 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137683945 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 137684025 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 137684066 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137684107 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137684111 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137684163 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 137684181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137684294 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137684331 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137684516 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 137684519 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 137684527 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137684567 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137684659 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137684679 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137684887 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 137684890 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 137684936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137685048 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137685224 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137685367 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137685405 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 137685576 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137685966 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 137685976 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137685985 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137686032 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137686103 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 137686154 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 137686318 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 137686505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137686527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137686528 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137686581 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 137686661 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137686683 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137686761 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 137686836 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137686891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137686972 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 137687024 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 137687029 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 137687072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137687143 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 137687505 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137687631 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 137687648 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 137687713 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 137687835 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 137687936 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 137687983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137688050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137688063 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 137688086 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137688156 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137688296 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 137688587 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 137688772 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 137688922 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 137689547 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 137689548 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 137689585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137689607 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 137689743 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 137689767 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137689882 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 137690110 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 137690116 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 137690126 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 137690140 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 137690364 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137690378 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137690479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137690618 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137690655 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137690884 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 137690900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137690909 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 137691126 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 137691127 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 137691167 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137691465 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 137691499 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 137691526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137691681 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137691881 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 137691903 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137692135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137692225 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 137692360 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137692727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137692773 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 137693006 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 137693073 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 137693088 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 137693092 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 137693104 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 137693171 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 137693216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137693249 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 137693259 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 137693318 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137693319 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 137693578 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 137693598 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137693872 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 137694029 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137694401 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137695015 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137695197 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 137695356 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 137695382 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 137695399 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 137695467 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 137695525 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 137695583 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 137695687 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 137695816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137695855 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 137696270 T A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 137696282 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 137696295 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 137696296 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 137696320 T G N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 137696508 A T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 137696589 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 137696635 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137696702 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 137698216 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 137698735 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 137698780 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 137699836 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 137700389 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137701801 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137702301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137702549 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137704057 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 3 137704533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137705166 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137705296 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137705848 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137711218 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137711447 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137713871 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137714616 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 137715325 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137715847 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137715922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137716133 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137717151 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137718810 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 137720353 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 137720358 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 137720469 G A N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 137720470 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 137720617 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 137720966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137721001 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137721277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137721491 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 137721638 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137721806 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 137721938 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 137721961 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 137722049 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 137722090 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137722122 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 137722285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137722340 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 137722522 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 137722683 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 137722757 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 137723143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137723164 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 137723190 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 137723563 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137723872 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 137724031 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 137724313 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137724358 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 137725621 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 137725653 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 137726326 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 137726546 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137726592 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 137726649 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137726876 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 137726892 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 137726899 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137726984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137726994 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 137727217 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 137727247 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 137727548 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 137727684 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137727704 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137730208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137730775 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 137731669 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137734422 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 137737874 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137737902 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137737921 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137738086 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 137738245 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 137738514 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 137739304 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137739380 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137741004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137741243 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137741660 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137741714 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 137741849 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 137741859 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 137742458 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 137742462 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 137743580 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137743591 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137743654 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137743694 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137743770 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 137743850 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 137744034 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137744397 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 137744500 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137744596 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137744728 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137745209 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137745231 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 137745293 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137745312 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 137745372 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 137745465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137745516 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 137745652 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 137745944 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137746120 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 137746188 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137746517 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137746639 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 137746729 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 137747276 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137747533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137747744 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 137747919 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137749564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137749933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137750471 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 137750495 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 137750524 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137750547 G C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 137750551 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 137750742 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137750755 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137751069 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137751383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137752232 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137752253 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 137752321 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 137752322 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 137752344 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 137752370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137752389 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 137752611 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 137752688 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 137752732 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137752786 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 137752934 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 3 137753268 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 137753278 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 137753312 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 137753593 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 137753598 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 137753609 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 137753616 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 137753640 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 137753642 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 137753835 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 137753983 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137754205 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 137754295 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 137754472 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 137754623 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 137754768 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 137754809 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 137754817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137754890 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137755130 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 137755256 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 137755406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137755476 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 137755500 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 137755527 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 137755831 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137755896 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 137755899 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137755907 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 137755929 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 137756094 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 137756243 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 137756265 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 137756289 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 137756490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137756704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137756767 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 137757905 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137757949 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137758246 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 137758399 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 137758400 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 137758743 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 137758980 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 137759045 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 137759090 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 137759205 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 137759223 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137759243 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 137759284 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 137759308 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 3 137759319 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 137759352 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 137759380 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 137759381 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 137759480 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 137759520 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 137759549 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 137759627 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 137759663 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 137760364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137760428 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 137760454 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 137760706 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 137760708 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 137760849 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 137760917 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 137761062 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 137761161 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 137761232 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 137761452 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 137761576 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 137761683 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 137761713 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 137761840 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137761892 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 137762064 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 137765114 T C N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.416666666666667 0.583333333333333 0 17 7 5 7 0 3 137765345 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 137765501 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 137765507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137765592 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 137766436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137766474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137766481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137766646 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 137767023 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 137768038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137768343 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137768344 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137768391 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137768439 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137768846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137769155 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137769541 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 137770561 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 137770572 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 137770594 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137770926 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 137771106 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137771560 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137771777 G T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 137772366 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 137772383 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137772390 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137772408 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137772429 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 137772467 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137772646 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137772734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137772843 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 137772854 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 137772888 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 137772893 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 137772906 T G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 3 137772912 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 3 137772921 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137772970 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 137773392 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137773857 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137775320 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137775602 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137776514 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 137777088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137777566 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 137778334 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 137778370 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 137778409 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 137778413 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 137778462 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 137778479 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 137778503 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 137778668 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 137778685 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 137779046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137779097 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 137779178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137779224 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 137779231 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 137779240 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 137779256 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 137779294 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 137779353 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 137779722 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 137779844 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137779973 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 137780060 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137780239 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 137780395 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 137780515 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 137780590 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 137780617 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 137780770 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 137780811 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137780819 T C N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 3 137780870 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 137780883 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 137780885 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 3 137780936 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 137781419 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137781572 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 137781876 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 137781900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137781914 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 137781981 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 137782012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137782032 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137782387 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 137782672 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137783628 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137783843 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 137784023 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 137784046 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 137784928 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 137785080 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 137785715 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137787601 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137787691 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137791680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137792881 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 137795485 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 137797420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137797776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137798710 C T N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 137799384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137801762 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137801833 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137807196 G A Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.625 0.125 0.25 22 10 10 2 4 3 137808819 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 137808883 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 137809190 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137810216 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137810386 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137811230 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137811285 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137811484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137811747 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137811929 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137814807 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 137816811 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 137819412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137819855 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137820001 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137820162 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137820220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137822468 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137823403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137824858 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137825952 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137826857 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137826997 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 137827489 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137828410 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137828431 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137828483 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137828946 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137829044 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137829173 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137829429 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137829457 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 137829551 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 137835904 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137835906 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137835953 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 137836112 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137836130 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137836144 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 137836154 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 137836304 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 137836331 C G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 137836397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137836856 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 137836858 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 137836978 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 3 137837233 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 137837784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137837799 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137837895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137837907 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 137838434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137838875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137838903 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 137839804 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137840216 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137840217 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137840514 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 137840851 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 137841673 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 137841676 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 137842131 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137842876 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137842918 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 137842990 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 137843499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137843993 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137847193 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137847334 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 137847388 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 137847493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137847544 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 137847661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137848076 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 137848876 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 137849526 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137849654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137849703 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 137849819 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 137849842 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137849879 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 137849931 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 137849952 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 137849968 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 137850019 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 137850233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137850400 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 137850520 T C N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 3 137850649 G A Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 137850705 C T N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 3 137850793 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 137850929 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 137850944 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 137850962 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 137851103 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 137851107 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 137851226 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 137851231 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 137851708 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 137851728 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 137852007 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 137852058 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 137852302 A C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 137852313 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137852535 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.368421052631579 0.105263157894737 0.526315789473684 16 22 7 2 10 3 137852776 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 137852932 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137853112 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.6 0.1 0.3 26 14 12 2 6 3 137853325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137853406 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 137853462 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137853933 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 137853972 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137854026 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 137854158 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 137854281 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 137854328 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137854507 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 137854541 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137854567 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 137854709 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 137854755 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 137854781 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 137854794 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 137854995 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 137855005 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 137855342 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 137855347 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137855475 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 137855496 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.7 0.05 0.25 29 11 14 1 5 3 137855530 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 137855592 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.368421052631579 0.157894736842105 0.473684210526316 17 21 7 3 9 3 137855916 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.263157894736842 0 0.736842105263158 10 28 5 0 14 3 137856166 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 3 137856270 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 137856307 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 137856318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137856371 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 137856378 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 137856410 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 137856468 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137856585 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137856597 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 137856732 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 137856739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137856891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137856906 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137856916 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137857174 C G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 137857207 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 137857316 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137857344 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 137857350 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 137857421 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 137857443 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 137857461 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 137857495 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 137857500 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 137857806 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 137857810 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 137857828 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 137857983 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 137858104 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 137858105 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 137858251 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 137858327 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 137858343 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 137858389 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 137858420 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 137858708 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 137858784 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137858880 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 137858922 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 137858934 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 137858947 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 137858963 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 137859056 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 137859184 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 137859365 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 137859423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137859894 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 137860937 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137861215 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 137861373 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 137861648 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 137861814 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137862027 A G N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.5 0.214285714285714 0.285714285714286 17 11 7 3 4 3 137862200 G T N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 137862232 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 137862536 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 137862750 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 137862763 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 137862764 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 137862874 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137865580 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137865613 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 137865648 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137865683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137865684 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137865741 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 137865792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137865869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137865933 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 137866024 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137866087 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 137866123 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 137866229 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137866232 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137866273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137866296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137866324 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 137866419 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137866450 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 137866545 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 137866582 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 137866633 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 137866638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137866702 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 137866707 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137866716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137866812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137866852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137866939 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137866953 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137867025 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 137867365 T A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 137867448 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 137867608 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 137867729 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 137867735 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 137867891 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 137868121 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 137868148 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137868219 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137868292 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137868596 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137868674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137871396 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 137871441 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 137871627 C G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 137871664 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 137871797 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 137872009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137872092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137872162 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137872170 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 137872452 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137872474 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 137873041 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137873530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137873626 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137874996 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 137875242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137875971 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 137877191 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 137877205 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 137877240 C G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 137877330 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 137877339 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 137877530 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 137877543 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137877670 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 137877972 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 137878204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137879295 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137879500 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137879505 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 137879573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137879711 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137880322 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137880768 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137880970 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 137881811 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137882717 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137882820 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 137882848 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 137882964 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137885151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137885273 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 137886476 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137887001 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 137887542 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137889374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137889541 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137891381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137891467 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137892501 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137893033 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137893212 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137893705 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 137893881 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137893942 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 137894071 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 16 20 0 16 2 3 137894191 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 137894194 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 137894265 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 137894374 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 137894391 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 137894398 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137894424 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137894434 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137894450 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137894501 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137894634 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 137894828 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137894899 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137894902 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 137895095 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137895181 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137895184 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 137895507 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 137895540 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 137895624 G T N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 137895711 G A N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 3 137895718 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 137895793 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137895890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137896106 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 137896253 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137896352 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137896844 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137896857 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137896956 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137897515 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 137897523 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137897566 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137897897 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 137897914 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 137898016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137898025 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 137899017 T G N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 137899409 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137900637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137901908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137902464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137903286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137903345 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137906863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137908161 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137909351 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 137909837 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137909946 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 137910645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137913100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137913159 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137913390 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 137915577 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137915601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137915823 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137917764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137917799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137918975 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137919091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137920055 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137921363 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137921611 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 137924084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137924341 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137924604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137926671 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 137927925 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 137927942 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 137927999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137928039 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 137928055 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 137928175 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 137928209 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 137928788 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137928846 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137928923 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137928974 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137929035 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137929057 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137929131 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137929135 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137929408 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137929426 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137929430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137929476 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137929503 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137929566 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137929583 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137929660 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137929691 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137929709 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137932368 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 137932470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137932789 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137932822 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137932949 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137932975 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137933082 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137933155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137933184 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137933225 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137933248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137933566 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137933819 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137933938 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137933983 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137934261 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 137934858 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 137935003 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 137935104 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 137935266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137935505 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137935682 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 137935704 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 137935747 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 137935782 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 137935887 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 137935969 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137936006 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137936021 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137936042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137936142 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 137936213 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 137936321 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 137936665 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137936684 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 137936779 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 137936946 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137937047 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 137937352 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 137937490 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137937999 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137938013 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 137938059 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137939266 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137940880 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137940977 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137941127 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 137941352 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 137941414 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 137942118 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 137942873 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 137948590 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137948622 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137948631 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137949147 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137949222 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137949309 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137952029 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137952927 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137956769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137957234 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137957764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137958724 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 137958974 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137959100 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137961319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137961347 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137961494 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137961675 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137961684 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137961757 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 137961759 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 137961989 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 137962010 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137962196 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137962235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137962237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137962384 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 137962464 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 137962538 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 137962594 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 137962772 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137963038 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137963050 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137963176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137963201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137963241 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137963265 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137963282 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137963450 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137963483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137963553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137963596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137963658 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137963710 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137963813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137964070 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 137964127 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137964177 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137964180 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137964204 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137964269 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137964343 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137964370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137964471 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137964494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137964503 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137964529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137964570 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137964605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137964623 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137964764 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137964882 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137964891 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137965013 G A Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 3 137965255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137965276 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137965294 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 137966097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137966359 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137966362 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137966375 T G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 137966533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137966558 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137967628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137967712 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137967797 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137967885 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137968030 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137968091 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137968167 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 137969034 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 137969541 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 137969763 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137969997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137970000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137970038 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137970070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137970073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137970270 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137970284 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137970434 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137970444 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137970514 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137970558 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137970578 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137970708 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137970717 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137970731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137970786 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137970797 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137970875 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 137970879 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137970900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137970902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137970923 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137971030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137971286 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137971466 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137971650 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 137971662 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137971902 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 137971978 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 137972008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137972641 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 137972794 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 137972795 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 137973030 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137973173 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137973263 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137973337 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137973669 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137973716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137973749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137973939 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137973969 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137974073 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137974090 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137974138 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137974361 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 137974366 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 137974555 A T Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 137974920 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137975002 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137975063 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 137975106 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137975224 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 137975412 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137975437 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137975657 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137975701 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137975747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137975814 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 137975878 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137975927 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137976080 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137976122 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137976171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137976191 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137976229 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 137976253 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137976329 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137976347 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137979072 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137979074 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137979156 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 137979424 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 137979460 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137979472 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137979519 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137979589 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137979592 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137979766 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137980086 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137980088 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137980177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137980190 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 137980406 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137980774 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 137980846 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 137980941 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 137981033 A G N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.454545454545455 0.363636363636364 0.181818181818182 14 8 5 4 2 3 137981074 A G N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 3 137981177 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 137981214 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137981465 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137981469 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137981578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137981672 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 137982099 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137982134 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 137982283 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 137982458 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 137982488 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137982507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137982538 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 137982709 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 137982742 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 137983186 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 137983305 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 137983391 A T N N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 3 137983554 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 137983589 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137983955 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 137983956 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 137984062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137984610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137984718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137984766 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137984784 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137984832 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 137984854 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137985404 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 137985413 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 137985576 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 137985813 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 137985999 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 137986032 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 137986673 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 137987181 C G N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.5 0.214285714285714 0.285714285714286 17 11 7 3 4 3 137988138 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 137991228 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137991476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137992755 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 137993112 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 137993128 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 137993207 C T Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 137993356 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 137993363 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 137993414 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 137993555 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 137993648 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 137993676 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 137993680 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 137993704 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 137993712 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 137993745 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 137993746 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 137993855 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 137993920 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 137994394 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 137994577 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 137994627 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 137994667 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 137994678 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 137994689 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 137994699 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 137994704 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 137994711 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 137994732 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 137994738 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 137994759 T A N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 137994776 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 137994792 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 137994830 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 137995013 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 137995059 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 137995068 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 137995072 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 137995107 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 137995884 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 137995897 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 137996066 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 137996283 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 137996727 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137996843 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 137996889 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 137996901 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 137996924 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 137996942 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 137997029 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 137997046 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 137997052 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 137997097 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 137997277 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 137997364 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 137997419 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 137997422 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 137998127 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 137998165 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 137998449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137998644 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 137998706 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 137998767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 137999011 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 137999249 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 137999266 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 137999933 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 138000218 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 138000544 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 138000776 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 138000810 T G Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 138000811 G C Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 138000844 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 138000853 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 138000861 T A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 138000943 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 138000974 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 138001054 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 138001111 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 138001261 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138002020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138002124 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138002647 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 138002659 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 138002674 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 138002755 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 138002801 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 138004017 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 138004168 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138004217 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138004320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138004942 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138005330 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138005716 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 138005904 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138005995 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 138006147 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138006428 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138006468 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138006483 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 138006523 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138006534 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138006702 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 138006706 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 138006743 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 138006786 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 138006815 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 138006861 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138006883 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138006923 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138006928 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138007141 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138007179 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138007363 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 138007389 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 138007396 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 138007440 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138007512 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 138007516 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 138007974 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138008116 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 138008308 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138008449 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138008487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138008522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138008889 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138008957 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 138009334 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138009411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138010067 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 138010120 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 138010779 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138010820 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138010879 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138010921 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 138010937 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 138010987 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138010992 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138011000 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 138012704 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138013707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138015864 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138016230 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 138017110 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138018688 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138019119 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138019264 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138019271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138019288 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 138019291 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138019377 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 138019413 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 138019783 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 138019829 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 138019830 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 138019929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138020070 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138020657 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 138020669 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 138020672 T C Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 138020737 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138020870 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138021061 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138021758 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 138021783 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 138022290 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 138022305 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 138022459 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 138022461 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 138022473 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 138022479 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138023505 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 138023561 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 138023683 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138023797 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 138023827 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 138023902 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138024307 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138024700 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138025201 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138025292 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138025314 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 138025346 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138025365 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 138025416 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 138025443 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 138025472 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 138025482 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 138025885 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 138025904 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 138026630 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138027452 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 138028648 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138028706 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138029338 G T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 138030717 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138032846 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138033574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138034444 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138034528 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138034679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138035738 T A Y N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 12 16 0 12 2 3 138035849 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 138038139 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138038576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138038610 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 138038657 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 138039392 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138039444 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 138039823 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138040173 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 138040780 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 138041085 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 138041626 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138042710 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138042858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138042977 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138043511 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138043520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138043551 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138043729 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138043872 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 138043932 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 138043934 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 138043953 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138044224 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138044246 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138044369 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138044371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138044400 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138044424 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138044512 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138044517 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138044580 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138044581 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 138044599 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 138044669 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138044948 C T N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 138045043 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138045097 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138045260 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 138045276 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 138045349 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 138045353 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 138045361 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 138045406 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 138045429 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 138045449 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 138045469 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 3 138045493 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 138045547 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 138045584 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 138045702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138045705 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138045867 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138046299 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 138046797 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 138046985 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 138047165 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 138047414 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 138047485 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 3 138047664 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 138047668 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 138047690 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 138047698 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 138047724 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 138047745 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 138047811 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138047816 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138047891 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 138048172 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 138048282 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138048285 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 138048371 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 138048377 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 138048447 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 138048489 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 138048490 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 138048505 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 138048593 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.05 0.85 0.1 19 21 1 17 2 3 138048662 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138048710 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 138048716 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 138048721 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 138048745 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 138050080 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 138050102 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 138050131 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 138050166 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138050630 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 138050805 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138050817 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138050824 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 138050859 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 138050865 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 138050979 T G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 138051064 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 138051082 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 138051107 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 138051272 A T N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 138051328 G A N Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.6 0 0.4 6 4 3 0 2 3 138051777 G C Y N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 138051792 C T Y Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 138051967 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 3 138052108 C T Y Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 3 138052477 G A Y Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 3 138055057 C A Y N 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 3 138055134 T A Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 138055186 G T Y N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 138055189 G A Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 138055362 T A Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 138055413 A G Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 138055886 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 3 138056090 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 138056127 G A Y Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 3 138056277 C T Y Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 3 138056415 A G Y Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 3 138056618 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 138056851 G T Y N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 138057168 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 138057178 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 138057193 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 138057233 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 138057285 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 138057292 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 138057392 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 138057490 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138057584 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 138057585 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 138057601 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 138057666 A G N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 138057736 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 138057789 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 138057816 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 138057859 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 138057866 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 138057912 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 138057926 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138058009 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138058049 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138058059 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 138058061 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138058075 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138058175 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138058335 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 138058410 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 138058418 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 138058439 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138058510 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 138058562 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 138058802 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138062283 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 138062652 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 138062703 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 138063129 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 138063600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138063823 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138063869 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138063921 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138064149 A C N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 3 138064166 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138064289 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 138064311 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 138064312 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138064338 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 138064351 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 138064357 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138064366 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 138064511 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 138064514 A T Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 138064552 C T Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 3 138064610 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 138064611 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 138064622 A G Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 138064633 T A Y N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 138064675 G C Y N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.133333333333333 0 0.866666666666667 4 26 2 0 13 3 138064727 T G Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 138064980 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 138066130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138070910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138073577 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138075146 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138075675 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138076298 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 138078008 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138079262 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 3 138079641 T C Y Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 138080719 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138080740 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138081400 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 138081534 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 138081545 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 138081961 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 138082093 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 138082160 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138082222 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 138082638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138082651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138082700 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138083037 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138083185 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138084546 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 138085476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138085603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138086967 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138088781 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138089213 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138089281 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 138089428 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138089461 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138090507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138091001 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138093715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138093964 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 138094360 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138094722 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 138099765 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138101617 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 138101630 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138101927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138102435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138103669 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 138103682 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 138104264 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138104567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138104661 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138105024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138105835 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 138106085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138106211 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 138106469 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 138106498 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138106663 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138106697 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138107349 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 138107564 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138107576 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138107593 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138107755 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138107833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138107959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138108136 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138108198 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138108216 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138108349 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 3 138108799 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 3 138109345 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138110243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138110615 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 138110729 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 138110745 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 138111131 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 138111143 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 138111179 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 138111327 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 138111438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138111492 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 138111538 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 138111549 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 138111683 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 138112053 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138112324 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 138113133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138113153 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138113443 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 138113629 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138113788 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138113825 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 138114716 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138115667 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 138119703 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 138119745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138119765 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 138119802 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 138119980 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138120201 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 138120338 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 138120363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138120712 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138120747 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138120780 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 138120825 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138120877 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 138120964 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 138120966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138120995 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 138121001 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 138121037 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 138121146 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 138121149 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 138121367 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138121853 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138121911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138123582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138123686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138123700 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 138123747 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 138124060 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138124159 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138125764 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138127661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138127693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138127800 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 138128047 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 138128440 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138128466 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138128509 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138130518 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138130713 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138131569 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138131715 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 138132403 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138132559 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 138133353 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138133355 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 138133396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138133818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138133916 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138134101 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 138134158 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138134284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138134327 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138134432 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138134552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138134679 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138134683 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138134713 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138134793 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 138134848 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 138135745 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138135784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138135853 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 138135968 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138135971 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138136648 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138136705 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138136733 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138136751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138137074 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 138137271 A C N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 138137530 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138137640 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 138137676 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138138327 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138138347 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138138402 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138138514 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 138138534 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138138816 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138139050 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 138139059 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 138139080 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 138139238 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 138139290 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138139326 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 138139783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138140624 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138140826 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138142432 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 138143190 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 138143224 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 138143320 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 138143953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138143978 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 138144477 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138144790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138145050 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138145320 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 138146389 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 138146396 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 138146461 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 138146725 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 138146846 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138146850 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 138147248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138147305 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 138148492 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 138151352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138151614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138154502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138154894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138155393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138156518 C T Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 138156787 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138161971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138162447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138164966 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138166866 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138167141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138167157 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138167246 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138167283 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 138167434 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 138167641 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 138167785 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138167992 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138168364 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138168373 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138168583 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138168769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138168780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138168803 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138168821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138168823 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138169310 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 138169529 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138171556 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138177468 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138179630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138182156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138186444 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138186630 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138188877 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 138189681 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138192919 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138194484 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138195019 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138195281 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 138195282 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 138195847 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138195985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138197238 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138199420 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138204986 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138205223 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138207667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138208478 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 138209922 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138214475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138216740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138218080 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138220634 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 138221824 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138226124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138226474 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 138226561 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138226672 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138226680 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138226714 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138226743 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 138226774 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138226791 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138226895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138226898 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138226979 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138226991 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138227002 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138227017 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138227444 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138227448 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138227586 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138227756 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138227760 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138227810 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138227851 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138227862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138228075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138228089 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138228091 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138228111 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138228332 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 138228512 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 138228802 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 138228944 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 138229154 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 138229260 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138229269 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 138229573 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 138229832 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138230168 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 138230187 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 138230291 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138230299 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 138230363 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 138230454 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 138230460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138230513 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 138230605 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 138230641 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 138230642 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 138230684 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 138230707 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138230856 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 138230938 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 138230939 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138231412 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 138231416 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 138231431 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 138231625 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 138231653 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 138231718 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 138232021 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 138232023 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 138232069 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 138232318 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 138232359 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 138232385 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 138232389 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 138232442 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 138232578 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138232608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138232694 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 138232760 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 138232941 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 138233253 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 138233322 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 138233395 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 138233754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138234634 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 138235008 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 138235064 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 138235484 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 138235604 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 138235680 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 138235791 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 138235822 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 138235833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138236031 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138236076 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138236203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138236215 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138236593 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 138236621 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 138236632 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 138236642 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 138236686 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138236855 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138236957 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138237030 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138237082 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 138237152 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138237171 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 138237251 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138237278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138237335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138237369 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 138237371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138237399 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138237437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138237474 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 138237523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138237943 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 138238211 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 138238241 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 138239592 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 138239918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138240815 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 138241677 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138241978 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 138241982 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 138242047 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 138242106 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138242109 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138242134 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138242186 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138242225 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 138242440 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 138242454 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 138242475 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 138242518 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 138242582 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 138242618 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 138242625 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 138242764 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 138242778 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 138242855 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138243287 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 138243313 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138243326 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 138243336 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 138243350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138243363 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 138243375 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 138243417 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 138243534 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 138243638 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 138243668 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 138243808 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138243882 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138243888 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 138243928 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 138244220 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138244420 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 138244575 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 138244684 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 138244697 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 138244986 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138245018 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 138245036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138245351 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138245654 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 138245663 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 138245706 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138245714 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138245831 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138245908 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 138245909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138245970 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 138246222 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138246401 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 138246720 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 138246916 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 138247053 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 138247091 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 138247434 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138247501 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138247618 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 138247833 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 138247850 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138247851 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138247930 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 138247954 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 138248082 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138248126 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138248302 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138248324 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138248367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138248672 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138249361 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138249362 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 138249668 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 138249781 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 138249808 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138249813 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138250016 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 138250103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138250177 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138250542 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138250553 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138250688 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138250706 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138250831 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138251054 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 138251122 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 138251227 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138251232 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138251353 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138251382 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138251541 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 138252515 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 138252558 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 138252754 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 138252935 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 138252961 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 138253002 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 138253030 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 138253044 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 138253088 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 138253098 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 138253129 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 138253145 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 138253229 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 138253243 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 138253250 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 138253299 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138253397 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138253399 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138253824 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 138253848 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 138253888 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 138254062 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 138254153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138255012 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 138255876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138256901 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 138257043 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 138257072 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138257104 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 138257109 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 138257243 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 138257259 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 138257415 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 138257463 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138257566 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 138257721 G C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 138257870 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 138257902 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138258376 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138258701 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138258962 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 138259030 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 138259179 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 138259457 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138259501 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 138259622 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 138259646 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 138259828 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 138259965 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 138259971 A T N N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 3 138259978 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 138260884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138261127 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138261686 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138261914 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 138261977 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 138262222 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 138262286 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 138262344 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 138262356 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 138262768 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 138262839 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138263010 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138263029 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 138263269 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 138263282 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138263451 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138263482 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138263555 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138263636 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 138263712 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 138263941 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138264647 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138264706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138264843 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138264928 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 138265377 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 138265553 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138265666 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 138265874 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 138266049 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 138266135 T G N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 138266288 T G N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 138266289 T G N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0 0.8 0.2 12 18 0 12 3 3 138266306 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 138266526 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 138266670 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 138266704 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 138266785 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 138266862 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138266950 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 138266975 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 138267012 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138267139 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 138267746 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 138268005 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 138268690 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138269470 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 138269830 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138269849 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 138269871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138269913 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 138270369 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138270430 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 138270509 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138270562 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138271654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138271701 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138271860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138272330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138272545 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138272546 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138272948 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138272990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138273033 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 138274143 C A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 138274991 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 138275047 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 138275150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138275171 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 138275276 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 138275303 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138275434 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138275482 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138275548 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138275889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138275923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138276504 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138276542 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 138276998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138277170 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138277204 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 138277259 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 138277368 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 138277446 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138277636 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 138277784 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 138277818 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 138277842 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 138277847 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 138278047 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 138278050 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 138278171 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 138278189 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 138278330 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 138278343 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 138278372 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 138278490 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 138278555 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138278708 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 138278792 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 138278812 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138278813 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 138278834 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 138278980 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 138279042 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 138279055 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 138279085 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138279248 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 138279315 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 138279320 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 138279365 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 138279385 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 138279423 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 138279495 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 138279496 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 138279640 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138279720 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 138279789 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 138279862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138279922 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 138280011 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 138280133 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138280145 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 138280212 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 138280629 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 138281031 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 138281233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138282147 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 138282187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138282396 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138282551 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 138283102 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 138283217 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.0625 0.9375 0 17 15 1 15 0 3 138283393 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 138283573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138283629 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 138283844 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 138283845 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 138284102 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 138284120 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138284860 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 138284939 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 138284971 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138285192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138285373 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 138285855 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 138285877 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 138285894 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 138286160 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 138286219 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 138286286 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 138286309 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 138286328 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 138286340 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 138286544 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138286575 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0 0.722222222222222 0.277777777777778 13 23 0 13 5 3 138287123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138287143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138289045 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138289446 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138289573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138290882 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138291335 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138291416 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138291822 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138291896 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138291965 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 138291994 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 138292302 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138292630 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 138292682 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 138292691 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 138292727 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 138292750 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 138292791 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138293042 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 138293150 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 138293250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138293279 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138293305 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 138293578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138293717 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138293928 C T N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 138294765 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138294901 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 138297683 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 138302302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138303194 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138303246 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138303351 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138303781 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138304690 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 138304705 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 138304889 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 138306813 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138307438 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138309921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138311528 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138312746 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138314347 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 138316713 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138317272 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138318942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138322273 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138322320 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 138322463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138323168 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138323624 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138323627 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138324332 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138324380 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138324510 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138325406 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 138330941 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 138330973 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138333097 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 138337262 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 138337370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138337625 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138338051 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 138338473 G C Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 138338663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138339322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138339587 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138340023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138342533 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138344460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138346024 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138351880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138351912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138356549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138358741 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138359616 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 138360704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138361739 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138362026 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 138364164 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 138364571 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 138364645 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138364659 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138364708 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138364762 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138364773 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138364900 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138364932 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138365068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138365308 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138365521 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 138365940 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 138366059 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138366217 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138366909 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138366916 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 138366972 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138368534 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138370107 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138370617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138370991 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 138372895 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 138373535 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138373649 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 138373670 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 138373928 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 3 138374079 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 138374083 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 138374109 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 138374168 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138374183 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 138374200 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138374217 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 138374437 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 138374477 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 138374492 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 138374493 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 138374544 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 138374575 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 138374632 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138374639 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 138374657 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 138374790 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 138374802 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 138374951 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 138375059 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 138375092 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138375138 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 138375152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138375195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138375216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138375229 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 138375280 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 138375347 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 138375479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138375552 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138375583 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138375892 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 138375916 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 138375934 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138375946 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 138376078 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 138376122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138376141 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138376170 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 138376195 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 138376239 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138376251 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138376264 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138376334 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 138376439 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 138376447 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 138376921 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138377016 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 138377136 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 138377212 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 138377268 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 138377423 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 138377592 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 138377753 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138378016 A G N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 138378349 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 138378485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138378841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138379080 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 138379105 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138379222 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138379254 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138379277 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 138379324 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138379346 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138379398 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138379407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138379457 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 138379467 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 138379473 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 138379551 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138379553 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138379590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138379642 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 138379643 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138379711 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138379719 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138379823 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138379830 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138379891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138379893 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138379918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138379985 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138379991 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138380015 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 138380113 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138380156 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 138380187 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138380354 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138380769 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138381334 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 138381392 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138381405 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 138381740 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 138381792 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 138381829 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 138382124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138382316 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 138382530 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 138382657 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138382938 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138383497 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 138383566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138383670 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138384160 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138384698 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 138384775 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 138384788 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 138384911 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 138385647 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 138386084 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138386156 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138386309 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 138387676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138389471 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 138389497 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 138390160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138390199 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 138390223 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 138390272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138390955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138391266 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138391429 T C N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.363636363636364 0.363636363636364 0.272727272727273 12 10 4 4 3 3 138391610 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 138391741 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 138391799 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 138391870 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 138391924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138391935 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 138392086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138392217 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 138392403 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 138392505 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138395836 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138395910 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138395966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138396532 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 138396672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138396860 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138396865 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138396941 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 138397706 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138399182 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138399298 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138399788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138399853 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138400733 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138401167 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138401200 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138401206 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138401243 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138401944 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 138404244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138404313 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138405930 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138406896 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138407367 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138407686 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138408297 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138409289 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138411808 C T Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 3 138411882 C A Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 3 138411887 A G Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 138411900 G A Y Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 3 138412400 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 138412621 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138412636 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138412698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138412710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138412718 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138413040 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138413124 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 138413189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138413255 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138413285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138413430 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138413515 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138413517 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138413541 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138413544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138414076 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 138414264 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 138414315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138414464 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 138414641 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138414744 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 138414781 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 138415107 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 138415163 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 138415187 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138415287 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138415321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138415333 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 138415346 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138415373 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 138415448 G A Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 3 138415794 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138415810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138415863 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 138415891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138415922 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 138415957 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 138416104 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 138416198 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.0555555555555556 18 18 1 16 1 3 138416263 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 138416498 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 138417235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138417392 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138417396 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 138417447 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 138417619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138418453 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138419684 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138420641 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138420745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138422753 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138425547 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138426643 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 138427552 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138429420 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 138429540 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 138429567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138429890 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 138429955 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 138429958 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 138430086 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 138430199 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138430254 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138430326 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 138430712 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138430977 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138431549 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 138431698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138436708 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138437131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138440120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138440284 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138440570 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138441355 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138441580 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 138442097 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 138442566 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138442634 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138442758 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138443029 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 138443085 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138443285 G C N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 138443313 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 138443346 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 138443604 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 138443844 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138443853 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138444207 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138444273 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138444296 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138444992 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 138445031 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 138445244 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138445289 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138445291 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138445325 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138445342 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138445374 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 138445382 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 138445772 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 138445849 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138446611 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 138448710 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138448809 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138449170 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 138450089 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138450181 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 138450195 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138450502 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 138450746 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138451212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138451371 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 8 10 2 4 3 3 138451583 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138452085 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138452179 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 138452302 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 138452554 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 138452610 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138452763 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 138452776 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138452787 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 138452807 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 138452836 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 138452939 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 138452971 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 138453163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138453444 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138453963 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 138454026 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 138454138 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 138454312 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 138454420 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 138454640 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 138454644 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 138454881 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138454894 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138455024 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138455046 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138455104 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138455435 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 138455541 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138455588 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 138455679 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 138455852 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138455892 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138455910 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138455931 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 138456025 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 138456038 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 138456068 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 138456072 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 138456103 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 138456125 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 138456196 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 138456224 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 138456270 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 138456314 G T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 138456318 T A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 138456421 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 138456444 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 138456496 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 138456524 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 138456686 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 138456695 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 138456830 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138456831 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138456996 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 138457028 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 138457148 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138457180 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138457269 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 138457300 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138457875 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 138457885 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 138457948 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138458182 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 138459605 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 138459618 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 138460155 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 138460241 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 138460258 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138460274 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 138460424 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138460555 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 138460570 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138460694 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 138460751 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 138461068 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 138461071 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 138461108 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138461656 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 138461669 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138461781 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 138462066 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 138462982 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 138465583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138466592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138467883 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 138469428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138470420 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 138471087 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 138471362 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.214285714285714 22 6 11 0 3 3 138471462 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 138471521 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 3 138471558 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 138471716 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 3 138471844 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.214285714285714 22 6 11 0 3 3 138472305 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138472979 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138473041 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 138473439 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 138473631 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138473962 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 138474473 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138474489 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 138474505 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 138474507 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138474547 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138474622 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138474913 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 138475089 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 138475140 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138475186 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138475216 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 138475257 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 138475298 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138475371 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 138475755 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 138475948 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 138476357 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138476583 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 138476589 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 138477446 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 138478828 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138479657 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 138479922 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 138481410 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138482495 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 138483348 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 138484118 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138487158 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138487205 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 138487687 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 138487699 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 138487730 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138488099 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138488408 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 138488409 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 138488426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138488804 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 138489501 G C Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 138489632 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138489808 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138489853 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138490080 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 138490222 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138491410 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138491908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138493261 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 138495342 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138495344 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138495616 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 138495638 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 138495879 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 138496150 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138496703 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 138496868 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138497051 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 138498265 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138498272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138498325 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 138498407 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138498410 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 138498423 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 138499976 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 16 8 4 8 0 3 138500128 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138500191 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138500365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138501128 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 138501246 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 138502314 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138502612 G A Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 138502956 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138503530 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138503628 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138503678 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138503714 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 138503889 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 138505770 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138505977 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138506030 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 138506193 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 138506238 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 138506447 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138506496 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138507051 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 138507179 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138507193 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 138507867 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138508023 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138508411 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138508472 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138508704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138508945 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138508957 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138509054 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138509202 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 138509203 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 138509298 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 138509540 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138509918 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138509958 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138509961 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138510008 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138510009 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 138510049 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 138510704 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 138511115 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 138511137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138511191 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 138511204 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 138511224 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 138511241 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 138511247 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138511303 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 138511386 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138511477 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138511604 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 138511634 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 138511667 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 138511762 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 138511897 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 138512009 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 138512033 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 138512277 T A N N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 8 12 1 6 3 3 138512296 A G N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 3 138512342 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 138512603 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138512626 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138512639 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138512650 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138513021 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138513024 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138513150 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138513312 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138513984 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 138514437 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138514568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138514745 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138515228 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 138515246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138515313 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138515444 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138515778 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 138515910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138515973 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138516417 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138517000 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138518716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138519299 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138520453 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138520921 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 138521026 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138523211 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138525147 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138525621 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138525671 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138525865 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 138525870 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 138525884 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 138525892 G C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 138526364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138526972 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 138527280 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138527756 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 138527931 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 138528044 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 138528550 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 138528663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138528700 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 138528701 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 138528739 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 138529244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138529273 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138530083 C G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 138530193 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138530512 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138530703 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 138530781 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 138530793 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138530802 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138530808 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138531006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138531081 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 138531251 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 138531519 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138531724 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138531859 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 138531869 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 138531871 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 138531887 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 138531990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138532050 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138532192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138532461 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 138532625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138532686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138532941 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 138533275 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 138533276 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 138533332 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 138533333 A T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 138533363 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 138533407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138533529 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138533778 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 138533944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138534108 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 138534119 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 138534279 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 138534403 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 138534539 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 138534869 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 138534883 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 138534888 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 138534943 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138535053 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 138535111 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 138535293 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.578947368421053 0.105263157894737 0.315789473684211 24 14 11 2 6 3 138535306 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 138535331 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 138535363 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 138535399 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 138535402 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 138535570 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138535792 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138536120 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138536654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138536783 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 138537066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138537493 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 138537534 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138537677 G C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 138538013 C A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 138539719 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 138540559 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138541965 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138542152 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 138542676 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 138542811 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 138542912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138543026 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 138543027 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 138543192 G T N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 138545377 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138546494 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138546591 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138546863 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138547613 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138547837 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 138547842 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138547900 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 138548075 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 138548259 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 138548484 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 138550068 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 138552908 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138553606 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138554162 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 138554350 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 3 138554492 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 138554667 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 138554729 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138554730 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 138554759 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 138554782 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 138554810 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138554816 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 138554876 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 138554892 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138554932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138555087 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 138555175 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 138555184 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138555279 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138555317 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138555324 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138555367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138555417 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138555626 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 138555727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138555778 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 138555826 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 138555830 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 138555857 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 138555918 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 138555930 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 138556009 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 138556029 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 138556250 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 138556287 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 138556336 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 138556567 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 138556652 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138557682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138557822 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138558946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138558947 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138559047 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138559190 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138559218 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138559220 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 138559236 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138559238 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138559890 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138559904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138560375 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 138560389 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 138560831 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138560929 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138561974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138562279 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138563375 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138563471 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138564377 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138564627 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138564850 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138565235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138568596 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 138568598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138568635 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138568996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138569633 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 138569853 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138569926 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138570068 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 138570096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138570229 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138570567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138570615 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138570693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138570719 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138570733 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138570756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138571228 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138571264 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 138571269 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 138571284 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138571438 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 138571544 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138571545 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138571555 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138571594 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138571633 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138571733 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138571760 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138571827 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138571969 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138571997 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138572007 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138572021 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138572112 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138572211 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138572234 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138572251 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138572262 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138572266 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138572286 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138572296 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138572775 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138572783 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138572933 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138572941 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138572995 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138573142 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138573365 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138573444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138573519 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138573621 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138573628 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138573657 A C Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 138573695 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 138573758 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 138573818 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 138573971 C G Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 138575415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138575512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138575520 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138576022 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138576117 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 138576179 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138576235 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138576262 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138576301 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 138576316 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138576377 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138576508 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138576529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138576659 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138576663 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138576686 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138576881 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138576893 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138577007 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138577033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138577225 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138577344 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 138577450 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138577589 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138577814 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138578233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138578659 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 138578735 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138578754 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138578932 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 138579327 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138579434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138579677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138579689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138579792 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138579813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138579858 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138580049 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 138580456 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138580460 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138580490 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138580501 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138583703 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138584741 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 138585521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138586800 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138586810 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138586890 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138586990 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138587081 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 138588486 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138589248 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138589855 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138593507 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138594265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138595171 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 138596033 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138596495 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138596647 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138597111 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138597681 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138599075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138599196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138599809 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138599933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138600344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138602009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138602031 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138602121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138602244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138602459 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 138603583 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 138604181 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 138604534 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138604538 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138604675 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138604936 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 138605158 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138605166 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138608601 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138610740 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138610893 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 138610912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138611136 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138611695 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138612573 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138616337 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138619489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138620247 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138621582 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138621841 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138623613 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138625849 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138629840 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138632039 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 138632098 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 138632108 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138632434 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138632674 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138633023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138633147 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138633162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138633631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138633654 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138634076 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138634153 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138634193 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138634219 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138634579 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138634623 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138634716 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138634751 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138634760 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138635049 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138635245 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 138635347 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 138635625 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138635736 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138636229 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138636478 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 138636510 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 138636705 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138637071 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138637462 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138638581 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138639069 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138639684 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138640125 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138640680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138640771 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138641309 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138641769 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138641973 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138642417 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138642522 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138642555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138642607 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138642708 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138643020 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138643202 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138643247 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 138643347 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138643353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138643494 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138643861 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 138643922 A T N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 138644058 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 138644210 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138644271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138644291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138644429 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138644853 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138644892 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138645239 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138645249 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138645261 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138645966 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 138646365 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138646472 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138646579 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138647147 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 138647245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138647443 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138647464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138647617 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138648007 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138648343 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138649342 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138649704 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138649720 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138651974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138652528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138653494 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 138655264 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138655633 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 138655951 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 138656981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138657359 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138657419 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 138657895 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 138658090 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138658127 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138658173 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138658176 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138658831 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138658884 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138658966 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138659241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138659350 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138659351 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138659379 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138659399 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138659414 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138659549 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138659621 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138659623 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138659638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138659648 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138659670 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138659743 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138659802 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138659896 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138660094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138660272 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138660278 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138660452 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138660598 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138660629 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138660665 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138661060 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 138661087 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 138661096 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 138661211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138661241 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138661252 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138661277 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138661301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138661341 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 138661344 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138661366 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138661468 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138661471 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138661640 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138661683 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 138661827 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138661992 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138662006 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138662113 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138662733 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138662793 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138665533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138666047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138667671 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 138668992 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 138669470 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138671261 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138672450 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138672866 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138673186 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138673803 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 138674155 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138674904 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138675342 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138675566 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138675664 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138675665 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138675711 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138675901 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 138675908 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 138676037 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138676203 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 138676238 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138676253 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138676327 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 138676336 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 138676571 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138676716 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138676860 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138676903 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138677431 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138677608 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 138677663 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138677676 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138678683 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138678686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138678862 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138679112 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138679173 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 138679281 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138679381 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 138679475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138679667 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138679673 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138679711 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138679761 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 138679857 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138680244 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 138680252 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 138680398 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 138680445 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138680682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138680793 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 138680826 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 138680903 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 138680915 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138680978 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 138681025 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 138681095 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138681272 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 138681388 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 138681437 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138681460 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138681479 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138681578 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138681586 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138681609 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 138681843 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 138681993 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 138682028 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138682166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138682189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138682199 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 138682257 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138682280 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138682322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138682360 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 138682423 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138682432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138682808 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138682839 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138682840 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 138683155 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 138683490 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 138683612 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 138683815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138684040 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138684468 C A N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 138684571 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 138684580 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 138684660 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 138685127 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138685223 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 138685236 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 138685733 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138685851 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138685913 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 138685915 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 138686075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138686086 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 138686294 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 138686397 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138686443 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 138687011 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138687201 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 138687204 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 138687278 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 138687436 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138687466 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 138687532 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138687709 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 138687809 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138687848 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138688341 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138688359 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138688430 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138688448 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138688865 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138688870 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 138688961 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138689194 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138689205 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 138689273 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 138689279 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 138689297 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 138689341 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 138689471 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 138689547 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 138689561 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 138690049 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138690086 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 138690135 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138690228 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138690289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138690391 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 138690394 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138691137 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 138691335 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138691660 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 138691754 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138691823 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 138691929 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138692023 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 138692039 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 138692075 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 138692076 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138692088 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138692344 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138692415 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 138692429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138692498 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 138692692 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138692735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138692791 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138692885 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138693090 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 138693560 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 138693601 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138693603 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 138694183 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138694805 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138695090 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 138695092 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 138695227 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 138695234 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 138696121 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138696126 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138696155 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138696213 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138696637 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 138696846 G A N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 3 138697082 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 138697087 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 138697441 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 138697534 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138697586 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138697707 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138697780 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138697995 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138698126 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138698775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138699084 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138699100 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138699386 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138699615 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 138699634 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138699756 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 138700163 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138700282 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138700435 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138700486 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138700555 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138700588 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138700692 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138700956 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138701385 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 138701552 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 138701888 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 138702324 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138702560 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138702568 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138702703 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 138702704 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138702717 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138702730 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 138702772 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 138702780 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138703285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138704099 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138704941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138705607 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138708668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138709227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138709699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138711014 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138711464 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 138711773 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138711929 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138712964 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138712971 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138713038 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 138713097 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138713145 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138713174 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138713214 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138713266 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 138713282 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138713289 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138713435 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138713660 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138713764 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138713777 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138713820 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138713919 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138714002 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 138714318 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 138714319 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138714409 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 138715273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138716093 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138716222 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138716386 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138716406 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138719073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138719798 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138720359 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 138720372 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 138720637 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 138720795 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138721186 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138721224 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138721228 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138721290 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138721364 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138721423 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138721550 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 138721590 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 138721705 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138721713 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138721803 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 138721833 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138721979 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138722167 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 138722650 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138723187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138723659 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138724326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138724334 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138724352 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138724447 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138724676 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138724758 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138724979 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138725357 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138725371 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138725422 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138725565 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138726075 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138726178 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 138726308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138726336 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138726543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138726641 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138726828 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138727083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138727256 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138727545 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138728184 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138728507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138728537 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138728754 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138728793 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138728822 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138728905 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138728990 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138729396 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 138729672 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138729778 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138729794 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 138729874 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138729901 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138730193 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138730791 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138731049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138731577 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138731877 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138732181 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 138732241 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138732272 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138732372 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138732398 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138732813 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138732995 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138733013 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138733081 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138734490 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138735078 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138735949 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138736414 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 138736580 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 138736645 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 138736784 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 138738475 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138739834 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138739906 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138740104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138740213 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 138740380 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 138740394 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 138740536 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 138740610 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 138740692 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 138740873 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138740884 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138740922 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138741168 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138741170 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138741191 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138741226 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 138741261 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138741307 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 138741356 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 138741530 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 138741615 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 138741770 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138741841 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 138742112 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 138742170 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 138742191 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 138742209 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 138742247 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138742333 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 138743123 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 138743286 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138743419 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138743447 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138743907 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138743943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138746046 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 138746323 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 138746572 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138746610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138746626 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138747032 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 138747648 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138747651 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138747664 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138747757 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138747917 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 138747946 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138747955 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138748039 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 138748436 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138748443 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 138748483 G C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 138749363 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138749474 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138749503 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138749527 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138749576 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138749593 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138749602 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138749778 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138749879 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 138749893 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138750031 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138750117 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 138750149 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138750395 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138750517 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138750563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138750806 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138750813 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138750882 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138750943 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138750978 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138751038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138751168 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138751248 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138751255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138751275 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 138751323 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138751741 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138751799 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138752067 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138752421 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 138752450 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138752462 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138752500 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 138752571 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138752608 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138752634 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138752646 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138752654 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138752665 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138752683 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138752723 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 138752742 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 138752788 G T Y N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 3 138752811 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 3 138752826 G C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 138752839 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 138752848 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 138752850 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 138752884 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 138752896 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 138752908 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 138752962 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 138753116 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138753124 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138753154 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138753213 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138753277 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138753284 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138753333 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138753720 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138753779 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138753806 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 138753883 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138753964 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 138754034 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 138754451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138754582 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138754817 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138754970 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138754985 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 138755177 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138755203 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138755233 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138755317 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 138755336 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 138755440 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 138755510 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 138755636 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138755652 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138756032 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 138756142 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138756200 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138756303 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138756352 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138756799 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 138756910 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 138756941 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 138757019 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138757257 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 138757580 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138757643 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138757670 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138757673 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138757893 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138758118 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138758249 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 138758261 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 138758265 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 138759063 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138759092 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138759310 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138761568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138761643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138761663 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 138762245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138762583 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 138762820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138762965 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 138763198 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138763221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138763524 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138763562 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 138764010 T A N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 3 138764015 A T N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 3 138764587 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 138764686 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 138764750 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 138764759 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 138764888 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 138765179 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 138765205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138765250 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 138765272 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 138765409 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 138765536 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 138765562 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 138765609 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 138765622 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 138765818 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 138765819 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138766015 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 138766229 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138766317 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 138766454 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138767118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138767146 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 138767316 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 138767356 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 138767369 A T N N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 13 11 1 11 0 3 138767472 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 138767739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138767750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138767933 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138768138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138768499 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 138768848 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 138768938 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138769215 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 138769228 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 138769244 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 138769417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138769445 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 138769543 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138769728 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138769734 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138769789 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138769933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138770170 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 138770216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138770228 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138770272 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 138770380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138770434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138770497 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138770498 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138770522 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138770583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138770657 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138770700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138770706 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138770789 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138770837 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138771203 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138771204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138771229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138771264 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138771388 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138771403 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138771458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138771514 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 138771642 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138771661 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138771776 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138771800 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138771898 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138771980 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138772085 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138772143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138772166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138772326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138772368 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138772409 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138772432 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138772458 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138772537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138772610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138772620 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138772628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138772954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138773000 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138773004 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 138773215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138773222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138773241 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138773463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138773735 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138773744 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138773862 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138774274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138774277 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138774609 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138774619 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138774658 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138774719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138774833 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138774854 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138775269 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138775569 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138775657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138775909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138776410 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 138776553 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138776645 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138776772 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138776996 G A Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 138777687 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138777831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138778066 C G Y N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 138778072 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 138778227 G C Y N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 138778370 T C Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 138778458 A G Y Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 3 138778625 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138778841 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138779018 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138779073 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138779328 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138779366 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138779398 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138779501 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138779558 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138779655 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138780915 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138781327 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 138781510 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138781537 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138781645 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138781799 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 138782658 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 138782765 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 138782830 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138782973 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138783454 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138783542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138783761 C G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 138784205 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 138784310 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 138784900 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 138785040 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138785528 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138785677 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 138785724 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138786011 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 138786280 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138786375 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138786398 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138786427 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138786429 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138786449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138786535 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 138786805 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 138786810 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 138786847 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 138786900 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 138787564 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138788088 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 138788503 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138788842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138789059 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138789278 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 138789387 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138789669 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 138790159 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138790389 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 138790416 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138790436 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138790449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138790482 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138790493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138790525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138790533 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 138790558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138790570 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138790745 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 138790759 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138790806 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 138790868 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 138790885 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138790904 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138790912 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138791014 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138791053 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 138791054 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 138791084 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 138791196 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 138791321 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138791346 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 138791348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138791444 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 138791465 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 138791545 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 138791629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138791656 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 138791697 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138791716 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 138791811 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 138791825 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 138791860 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 138791861 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 138791988 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 138792039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138792054 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138792062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138792288 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 138793031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138793498 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 138795295 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138796731 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 138798193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138798721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138799940 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138800746 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138801085 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 138801680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138802529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138803011 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 138803107 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 138803142 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 138803148 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 138803242 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 138803338 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 138803405 T G N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 138803476 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 138803517 G C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 138804638 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138807228 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138810244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138810347 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 138810349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138811117 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 138811248 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 138811353 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138811435 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138812226 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138812734 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 138813603 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 138813701 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138813991 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 138814049 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138814107 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 138814144 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 138814276 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 138814302 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 138814562 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 138814699 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138815812 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 138815966 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138816127 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 138816735 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138816837 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 138817246 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138818105 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138818136 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138818163 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 138818322 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 138818439 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 138819055 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 138819072 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 138819111 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 138819430 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 138819505 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 138819904 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 138820012 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 138820038 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138820208 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 138820395 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 138820646 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 138820714 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 138820731 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 138820912 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 138821376 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138821553 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138821679 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138821780 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138821934 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 138822042 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 138822043 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138822064 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 138822165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138822227 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138822285 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138822581 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138822647 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138823085 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138823684 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138823738 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 138823874 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138823888 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138824146 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138824372 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 138824549 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 138824725 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 138825443 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 138825596 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138825731 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138825771 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138829552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138829588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138829619 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138830494 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138831057 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 138832092 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138833584 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138833819 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138835478 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 138835479 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138835677 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138837248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138837470 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138837626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138837810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138838922 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138840246 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138840383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138841562 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 138841572 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 138841575 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 138841760 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 138841807 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 138841813 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138841915 A T Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 138841919 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 138842030 G A Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 138842052 G A Y Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 3 138842071 A G Y Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 3 138842249 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 138842290 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 138842304 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 138842314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138842475 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 138842654 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 138842783 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138849331 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 138849339 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 138849361 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 138850094 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138850096 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 138850115 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 138850137 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 138850147 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 138850202 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 138850211 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138850269 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 138850271 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 138850287 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 138850317 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 138850333 T C N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 138850338 T A N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 138850345 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 138850399 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 138851846 T G Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 138851897 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 138851943 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138852013 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138852027 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 138852078 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138852164 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138852264 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 138852273 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 138852308 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 138852335 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 138852340 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 138852355 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 138852363 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 138852378 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138852423 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138852482 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138852504 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138852507 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138852689 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 138852730 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138852776 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138852787 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138853019 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138853109 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138853147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138853161 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138853189 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138853297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138853307 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 138853343 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138853385 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138853449 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138853471 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138853488 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138853533 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138853537 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138853643 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138853733 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138853815 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138854074 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138854195 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138854219 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138854280 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138854403 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 138854529 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138854657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138854672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138854943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138855292 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138856921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138860741 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 138862821 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 138863394 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138863419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138864477 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138864867 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138867527 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138869383 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 138869643 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138870239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138870521 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 138870654 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138870706 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 138870931 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 138871054 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 138871451 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 138871528 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 138871780 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 138872036 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 138872137 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 138872555 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 138872607 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 138872954 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 138872979 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 138873145 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 138873195 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 138873211 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 138873229 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 138873479 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 138873618 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138873654 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 138873702 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138873753 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 138873928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138874089 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 138874662 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 138874698 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 3 138874967 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 138875104 T C N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 3 138875188 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 138875433 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138876514 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 138876962 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138878242 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138878844 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138879029 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 138879067 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 138879144 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 138879161 T A N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 138880098 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 138880210 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 138880279 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138880356 T G N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 138880410 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 138880627 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 138880686 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 138880915 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 138881402 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 138881414 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138881433 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138881448 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 138881463 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 138881522 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 138881543 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 138881554 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 138881555 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 138881573 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138881646 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138881684 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 138881886 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 138881887 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 138882076 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 138882560 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 138882648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138882906 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 138883297 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 138883804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138883989 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 138884420 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 138884903 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 138885376 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138885600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138886030 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 138887127 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138887990 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 138889581 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 138889628 A T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 138889694 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 138890038 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138890127 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 138890204 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 138890214 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138890237 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138890314 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138890316 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138890328 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138890864 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 138890982 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 138891077 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 138891192 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 138891303 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 138891407 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 138891761 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138891872 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 138891951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138892149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138893060 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138894816 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138894994 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138895692 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 138896059 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138896263 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 138896691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138896748 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138897135 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138897348 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138897538 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 138897768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138897809 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 138898005 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 138898987 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 138900598 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138903205 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138903722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138904428 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138905210 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138906592 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138908459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138909880 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138910141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138910701 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138911263 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 138911706 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138912117 A C Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 138912130 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 138912375 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138912655 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138912887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138914842 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 138915786 T C Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 138915787 A T Y N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 138916491 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138916815 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 138917032 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138917033 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138917532 G A Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 138917745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138918002 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138918115 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138918704 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138919296 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 138919542 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 138921716 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138921995 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138922215 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138925861 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138926167 C T Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 138926261 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138927402 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 138930068 G A Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 138930715 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 138930742 T A Y N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 138930954 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138931474 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138931906 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 138931992 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 138932102 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138932754 A G Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 138932930 T A Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 138936017 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138936186 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138937416 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 138938201 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138938219 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 138938735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138939289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138940463 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138940912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138940967 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 138945433 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138945761 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138946651 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138947415 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138948307 T C Y Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.0833333333333333 12 12 1 10 1 3 138948891 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138949599 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138951731 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138951858 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 138953216 A G Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 138953527 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138953693 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138954687 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138954743 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138955374 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 138955518 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138955680 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138955757 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 138955870 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138955956 T G Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 138955957 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 138956837 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138958163 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 138958563 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138958651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138958690 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 138959278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138960354 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138960612 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 138962280 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 138962370 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 138964622 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138965632 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138965674 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 138965838 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 138966000 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 138966236 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 138967183 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138967910 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 138969507 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 138969763 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 138970621 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138971852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138972008 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 138972539 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 138973883 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 138975910 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138976328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138977042 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 138977075 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 138978239 G A Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 138978652 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 138978835 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 138978957 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138979067 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 138979587 C A N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 3 138979802 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138980022 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 138980056 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138981079 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138981165 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138981253 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138981382 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 138981405 A T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 138981592 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138981864 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 138981884 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 138981926 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 138983545 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 138983663 C A N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 3 138984204 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 138984476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138984547 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 138984734 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138985221 A C N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 138985419 C A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 138985461 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 138985666 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 138985848 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 138985918 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 138986062 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 138986172 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 138986306 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 138986396 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 138986725 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 138986845 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 138986869 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 138987122 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 138987250 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138987573 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138988138 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138988357 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 138988766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138989464 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138989646 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 138989681 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138989813 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138990298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138990935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138991573 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138992997 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 138994278 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 138995254 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138995258 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138997960 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138998982 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 138999669 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 138999925 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139000304 G T N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 139000473 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 139000497 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 139000551 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 139000557 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 139000570 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 139000664 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 139001052 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 139001087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139001124 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 139001125 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 139001198 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 139001377 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 139001457 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 139001502 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 139001538 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 139001551 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 139001563 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 139001568 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 139001684 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 3 139001786 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 139001940 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 139001968 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 139002033 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 139002297 G A N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 139002373 A G N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 139002395 G A N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 3 139002468 G T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 139002599 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 139002628 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 139002648 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 139002706 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 139002891 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 139003015 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 139003110 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 139003116 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 139003121 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 139003177 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 139003178 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 139003191 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 139003203 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 139003220 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 139003251 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 139003295 C A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 139003318 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 139003416 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 139003735 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 139003749 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 139003767 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 139004103 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139004221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139004346 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 139004387 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 139004426 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 139004448 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 139004490 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 139005085 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 139005147 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 139005149 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 139005348 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139005472 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 139005637 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139005773 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139005809 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 139005849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139005861 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 139006091 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139006234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139006380 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 139006409 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 139006424 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 139006517 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139006537 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139006724 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139006864 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139007058 G A N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 3 139007147 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 139007533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139008168 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139008226 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139008346 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 139008437 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 139008470 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 139008494 A T N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 3 139008614 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139008637 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 139008675 T G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 139008742 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 139009227 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 139009248 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139009259 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 139009283 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 139009357 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 139009369 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 3 139009443 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 139009531 G C N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 139009569 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139009598 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 139009601 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 139009622 T A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 139009666 T A N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 139009691 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 3 139009762 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139009794 A C N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 139009799 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 139009839 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 139009843 C T N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 139009896 C T N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 7 9 2 3 3 3 139009948 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 3 139009957 A C N N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 3 139009971 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 3 139010011 T G N N 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 8 8 3 2 3 3 139010025 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 139010043 G A N Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 3 139010049 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 3 139010082 T C Y Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.428571428571429 0 0.571428571428571 6 8 3 0 4 3 139010118 C T N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 5 11 2 1 5 3 139010151 T G N N 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 139010156 T C N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 3 139010163 C T N Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 139010312 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 139010315 A C N N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 7 13 2 3 5 3 139010400 C G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 139010432 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 3 139010746 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 139010837 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 3 139011086 G A N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 139011099 C T N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 3 139011152 T A N N 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.5 0 0.5 6 6 3 0 3 3 139011203 C G N N 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 139011228 A C N N 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.428571428571429 0 0.571428571428571 6 8 3 0 4 3 139011256 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 7 5 3 1 2 3 139011261 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 7 5 3 1 2 3 139011286 T C N Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.428571428571429 0.142857142857143 0.428571428571429 7 7 3 1 3 3 139011311 C T N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.625 0.125 0.25 11 5 5 1 2 3 139011325 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.285714285714286 10 4 5 0 2 3 139011336 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.166666666666667 10 2 5 0 1 3 139011352 C T N Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 3 139011530 A C N N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 3 139011550 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 3 139011551 A G N Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.375 0.125 0.5 7 9 3 1 4 3 139011978 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 10 8 4 2 3 3 139012056 C T N Y 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 7 13 3 1 6 3 139012215 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 139012347 A G N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.230769230769231 0.153846153846154 0.615384615384615 8 18 3 2 8 3 139012352 T C N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.230769230769231 0.153846153846154 0.615384615384615 8 18 3 2 8 3 139012360 C A N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 3 139012391 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 16 8 4 8 0 3 139012392 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 16 8 4 8 0 3 139012410 T C N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 9 15 3 3 6 3 139012415 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 10 14 4 2 6 3 139012495 C A N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 3 139012499 T G N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.25 0.166666666666667 0.583333333333333 8 16 3 2 7 3 139012565 A C N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.25 0.166666666666667 0.583333333333333 8 16 3 2 7 3 139012601 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.25 0.166666666666667 0.583333333333333 8 16 3 2 7 3 139012658 T A N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.25 0.166666666666667 0.583333333333333 8 16 3 2 7 3 139012670 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.25 0.166666666666667 0.583333333333333 8 16 3 2 7 3 139012702 G T N N 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 8 10 3 2 4 3 139012782 C G N N 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 139012958 C T Y Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 9 5 4 1 2 3 139013014 G A Y Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.428571428571429 0.142857142857143 0.428571428571429 7 7 3 1 3 3 139013089 G A N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.333333333333333 0.0833333333333333 0.583333333333333 9 15 4 1 7 3 139013251 G T Y N 0.35 REF 0.5 0.5 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 7 13 3 1 6 3 139013252 T G Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 139013336 G C Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 139013338 C T Y Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 3 139013360 C T Y Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 3 139013432 T C N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.272727272727273 0.181818181818182 0.545454545454545 8 14 3 2 6 3 139013595 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 139013645 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 3 139013651 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 3 139013692 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 3 139013774 G A Y Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 3 139013827 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 139013848 C G Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 139013865 C T Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 139013866 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 139013941 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 139013943 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 139013999 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 3 139014009 G T N N 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 3 139014026 G C N N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.5 0 0.5 4 4 2 0 2 3 139014072 T G N N 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.428571428571429 0.142857142857143 0.428571428571429 7 7 3 1 3 3 139014284 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 139014293 A C N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 3 139014328 A G N Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.214285714285714 0.214285714285714 0.571428571428571 9 19 3 3 8 3 139014375 C T Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 16 12 6 4 4 3 139014485 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 139014497 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 139014575 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 139014594 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 139014609 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 139014630 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 139014686 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 139014695 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 139014703 G C Y N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 139014749 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 139014756 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 139014762 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 139014796 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 139014801 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139014811 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139014871 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 139014882 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 139014913 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139014914 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 139014928 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 139015012 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 139015024 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139015057 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139015151 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 139015287 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 139015313 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139015336 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 139015382 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 139015387 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 139015395 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 139015410 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139015462 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 139015518 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 139015598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139015649 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 139015741 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 139015770 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139015839 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 139015847 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 139015877 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 139015902 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 139015912 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 139015936 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 139016066 A C Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 139016130 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 139016151 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 139016223 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139016228 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139016282 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139016417 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 139016454 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139016620 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139016703 C G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 139016713 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139016728 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 139016850 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139016864 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 139016947 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.2 0.133333333333333 0.666666666666667 8 22 3 2 10 3 139016948 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 3 139016969 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139017156 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 139017188 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 139017201 C A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 139017202 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 139017230 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 139017254 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 139017304 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139017328 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 139017380 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 139017409 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 139017434 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 139017501 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139017699 G T N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 139017745 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 3 139017752 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 139017768 G A N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 139017811 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 139017919 T G N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 3 139018005 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 139018201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139018221 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 139018301 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139018518 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139018533 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 139018602 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 139018603 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 139018948 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139019001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139019083 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139019204 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139019240 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 139019320 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 139019363 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 139019462 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139019550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139019637 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139019832 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 139020293 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 139020429 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139020523 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139020535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139020582 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139020687 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 139020994 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 139021079 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139021202 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 139021469 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 139021560 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 139021592 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139021641 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 139021948 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 139021960 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 139021961 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 139021973 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 139022007 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139022029 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 139022045 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 139022047 T C N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.333333333333333 0.2 0.466666666666667 13 17 5 3 7 3 139022057 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 139022132 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139022238 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 3 139022271 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 139022479 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 139022480 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 139022525 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 139022534 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 139022569 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 139022575 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 139022590 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 139022911 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 139022966 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139022996 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 139023023 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 139023063 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 139023152 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 139023166 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 139023233 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 139023316 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 139023339 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 139023480 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 139023501 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 139023503 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 139023525 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 139023539 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 139023639 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 139023667 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 139024068 G T N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 139024109 C G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 139024149 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 139024449 A T N N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 3 139024597 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 139024622 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 139024799 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 139024908 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 139024983 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 139025056 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 139025092 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 139025203 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 139025257 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 139025288 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 139025357 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 139025504 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 139025517 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 139025711 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 139025807 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139026029 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 139026084 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 139026197 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139026349 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 139026480 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 139026642 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 139026859 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139026883 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 139026885 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139027221 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 139027435 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139027496 T G Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 139027529 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 139027545 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 139027637 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139027708 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 139027773 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 139027779 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 139027996 T C Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 139028027 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139028063 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 139028161 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139028315 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 139028341 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 139028368 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 139028369 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 139028399 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 139037996 A C N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 139038030 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 139038093 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 139038111 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 139038193 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 139038257 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 139038279 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 139038454 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 139038502 C G Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 139038553 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 139038619 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 139038735 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 139038842 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 139038898 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 139038957 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 139039126 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 139039213 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 139039389 A T Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 139039402 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 139039426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139039452 T C Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 139039472 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139039545 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 139039570 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 139039578 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 139039597 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 139039620 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 139039775 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 139039923 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 139040054 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 139040095 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 139040282 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 139040368 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139040395 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 139040474 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 139040490 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 139040579 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 139040675 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 139040689 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 139040826 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 139040829 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 139040860 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 139040870 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 139040917 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 139040961 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 139040974 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 139040987 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 139041102 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 139041240 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 139041263 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 139041321 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 139041435 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 139041436 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 139041454 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 139041612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139041728 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139041731 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139041748 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139041791 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 139041852 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139041935 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 139042013 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 139042078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139042147 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139042453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139042585 T C N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.153846153846154 0.692307692307692 0.153846153846154 13 13 2 9 2 3 139042690 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139042886 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 139042989 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139043069 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139043237 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 139043475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139043642 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139043857 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139043935 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139044552 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 139044640 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 139044738 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 139044946 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 139045639 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 139045802 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139045956 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139046152 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139046380 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139047010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139047247 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 139047322 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 139048138 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 139048503 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 139048601 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 139048797 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 139049107 G A N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 9 11 2 5 3 3 139049120 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 139049150 G A N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 3 139049218 A G N Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 8 8 2 4 2 3 139049683 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139049691 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 139049970 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 139050127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139050261 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 139050327 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 139050334 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139050595 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139050719 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139050867 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 139050868 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 139057416 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139057426 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139057834 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139058385 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139058560 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 139059280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139060759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139061575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139062066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139062141 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 139062231 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 139063072 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 139063090 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 139063271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139063373 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139063860 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139063952 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139064918 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139065016 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139065881 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139065887 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139066062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139066360 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 139066719 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139066800 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139067008 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139067723 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139069013 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 139069019 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 139069027 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139069121 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139069131 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139069187 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139069243 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139069253 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 139069379 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 139069428 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 139070006 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139070163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139070348 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139070484 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139070497 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 139070547 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139070918 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 139070945 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139071055 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 139071167 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139071278 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139071346 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139071359 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 139071413 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139071494 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 139071498 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139071627 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139071654 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 139071684 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139071700 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 139071720 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 139071770 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 139071773 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 139071831 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139071902 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139071938 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 139071973 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 139071984 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 139072006 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 139072089 A C Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 139072124 C T Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 139072269 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 139072275 G T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 139072390 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 139072399 C A N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 139072404 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 139072483 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139072497 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 139072542 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139072577 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139072933 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139072957 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139073299 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 139073508 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139073509 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139073522 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139073531 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 139073553 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 139073597 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139073606 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139073642 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139073643 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 139073741 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139074122 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 139074149 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139074240 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 139074310 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139074318 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139074687 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 139074688 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 139074719 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 139074767 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 139074788 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 139074955 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 139074971 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 139075193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139075218 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 139075367 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139075495 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 139075496 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 139075759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139075811 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 139076027 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 139076033 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 139082821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139085570 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 139087025 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139087055 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139090732 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139091203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139091477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139091584 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139091585 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139093080 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 139093230 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 139093515 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 139094031 G C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 139094204 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139094523 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139094531 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 139094607 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 139095034 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 139095048 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 139095063 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 139095071 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 139095785 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139095812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139095846 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139095986 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 139096047 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 139096112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139096281 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 139096462 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 139097442 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139098891 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 139098916 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 139100117 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 139101236 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139102878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139103551 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139105072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139105138 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139109101 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139112333 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 139114661 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 139115053 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 3 139115629 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 139116415 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139116679 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139117193 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 139117709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139117768 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139118560 G T Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 139118770 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 139119099 C T Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 139119168 A C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 139119195 C G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 139119312 C G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139121015 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139121729 C G Y N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 139122010 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139122758 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139122772 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139123108 G C N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 139123597 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 139123677 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.15 0.8 0.05 22 18 3 16 1 3 139123692 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.277777777777778 0.111111111111111 0.611111111111111 12 24 5 2 11 3 139123760 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 139123831 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 139123940 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 139124064 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 139124097 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139124195 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 139124263 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139124340 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139124909 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 139125430 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 139125942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139125974 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139125998 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 139126117 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 139126407 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 139126598 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139126600 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 139127025 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 139127076 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139127094 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 139127192 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139127290 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 139127302 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 139127366 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139127782 A G N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.230769230769231 0.230769230769231 0.538461538461538 9 17 3 3 7 3 139128035 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 139128191 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139128213 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 139128238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139128375 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 139128553 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139128565 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139128569 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139128583 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 139128708 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139128743 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139128892 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 139129033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139129066 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139129127 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139129364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139129809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139130033 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 139130459 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139130488 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 139131144 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 139131637 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139131885 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139131896 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139132077 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 139132230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139132277 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 139132657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139132663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139132736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139133137 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 139133199 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 139133237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139133439 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139134068 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139134207 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139134465 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 139134481 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139134692 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 139134836 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 139135215 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 139135278 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 139135362 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 139135376 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 139135445 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 139135510 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139135572 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139135989 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139136231 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139136358 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 139136415 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 139136472 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 139136672 T A N N 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 7 9 1 5 2 3 139137136 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 139137290 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 139137539 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 139137554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139137590 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 139137700 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 139137726 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 139137845 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 139138327 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139138878 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 139140579 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 139140583 A G N Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.444444444444444 0.111111111111111 0.444444444444444 9 9 4 1 4 3 139140590 T C Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.625 0.125 0.25 11 5 5 1 2 3 139140654 G T Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 139140843 C T Y Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 139141059 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 139141081 G C N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 139141199 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139141261 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139141302 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 139141769 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 139141884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139141887 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 139141904 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 139141976 C A Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 139142220 C T Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 3 139142597 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 139142599 C T Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.5 0.214285714285714 0.285714285714286 17 11 7 3 4 3 139142710 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 139142756 T C Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 139142987 C A N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 3 139143037 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 139143091 C G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.176470588235294 27 7 13 1 3 3 139143195 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 139143748 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139144067 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139144117 G T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 139144340 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139144389 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 139144406 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139144409 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139144552 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139144688 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.166666666666667 0.111111111111111 0.722222222222222 8 28 3 2 13 3 139144779 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 139144834 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139144862 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 139145204 C T Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.666666666666667 0.133333333333333 0.2 22 8 10 2 3 3 139145235 G A Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 3 139145241 C A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139145553 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 139145706 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 139145739 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139146112 G A Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 139147276 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 139147335 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 139147347 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 139147350 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 139147359 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139147363 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 139147443 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139147456 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 139147549 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139147600 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139147741 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139147863 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139147935 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 139148195 C G N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 3 139148205 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 139148350 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 139148406 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 139148569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139148597 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 139148688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139148772 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 139148773 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 139148869 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 139148881 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 139148890 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139148892 A G Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 139149001 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139149045 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 139149176 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 139149212 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 139149220 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139149280 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139149395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139149419 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139149440 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 139149446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139149564 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139149585 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139149600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139149616 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139149628 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 139149644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139149655 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139149710 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139149716 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139149916 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 139149926 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 139149936 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 139150171 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 139150239 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 139150242 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 139150368 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 139150377 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 139150485 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 139150510 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 139150577 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 139150755 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 139150816 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139150821 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 3 139150880 C G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 139150928 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139150982 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 139151008 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 139151065 T G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 139151160 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139151286 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 139151299 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139151301 A T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 139151326 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 139151508 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 139151538 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139151607 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 139151634 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 139151663 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 139151858 T C N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 139151937 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 139152167 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 139152465 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 139152492 A T Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 139152505 T G Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 139152836 T C Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 139152863 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 139153017 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 139153208 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 139153504 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 139153623 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139153760 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 139153779 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139153848 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 139154000 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 139154421 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139154423 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 139154432 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 139154498 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 139154560 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 139154584 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 139154800 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 139154810 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 139154861 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 139154884 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139154921 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139155235 T A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 139155747 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 139155755 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 139155759 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 139155868 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 139155880 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 139155950 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 139155975 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 139156182 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139156195 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 139156302 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139156342 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 139156355 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 139156376 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 139156524 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139156787 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 139157130 A G N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 139157184 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 139157238 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 139157384 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139157535 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 139157592 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139157638 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 139157740 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 139157741 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139157800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139157921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139157943 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 139157968 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 139158082 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 139158204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139158459 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139158895 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 139159166 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 139159391 A G N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 139159640 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 139159660 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 139160079 C G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 139161039 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139161254 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 139161412 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 139161474 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 139162022 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 139162242 A C Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 139162248 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 139162383 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 139162459 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 139162502 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 139162524 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 139163045 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 139163119 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139163287 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 139164663 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 139164863 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 139165194 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 139165200 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 139165239 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 139165306 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 139165525 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 139165645 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139165664 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139165726 A T N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 139165747 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 139166016 A T N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 139166078 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 139166244 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 139166248 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 139166461 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 139166489 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 139166651 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 139166664 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 139166691 C G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 139166707 C T N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 139166886 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 139167197 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 139167318 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 139168206 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139168289 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 139168300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139168302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139168598 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139169076 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139169101 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 139169234 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139169272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139169472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139169576 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 139169621 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 139169630 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 139169655 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139169798 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139169918 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 139170116 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139170118 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 139170206 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 139170258 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139170320 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 139170331 C G N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 139170334 T A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 139170347 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 139170348 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 139170373 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 139170397 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 139170409 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 139170419 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139170457 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 139170493 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 139170635 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 139170648 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139170709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139170711 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139170764 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139170765 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139170782 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 139170833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139170853 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139170881 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139171573 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139171880 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 139172188 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 139172657 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 139172673 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 139172677 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139172745 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 139172750 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 139172801 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 139172816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139173093 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139173109 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139173230 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 139173366 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139173414 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 139173511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139173639 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 139173728 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 139173752 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 139173901 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 139174226 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139174431 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139174577 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139174678 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139174749 T G N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 139174760 T C N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 3 139174830 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 139174841 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 139175326 T C N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.416666666666667 0.166666666666667 0.416666666666667 12 12 5 2 5 3 139175714 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 139176001 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139176055 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 139176073 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 139176084 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139176100 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 139176123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139176137 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139176195 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 139176870 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 139177062 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139177170 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 139177183 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139177389 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139177735 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 139177736 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139177771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139177779 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 139177920 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 139177936 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139177966 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139177967 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 139178020 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139178677 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 139178809 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139179565 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139179609 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139179685 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139179709 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139179718 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139180023 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 139180076 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139180133 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139180154 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 139180250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139180339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139180352 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139180486 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 139180519 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139180711 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139180728 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 139180756 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139180773 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 139180837 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 139180839 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 139180864 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 139180983 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 139181032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139181160 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 139181670 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 139181820 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139181877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139181927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139182004 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139182139 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139182278 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139182308 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 139182397 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139182530 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 139182541 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139182971 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139183007 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 139183077 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 139183253 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 139183313 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 139183333 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 139183510 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139183557 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 139183581 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139183670 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139183788 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139184048 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139184054 G T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 139184232 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139184265 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139184277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139184293 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139184326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139184407 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139184542 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 139184563 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 139184576 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 139184589 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 139184686 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139184914 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139185187 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139185228 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139185448 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 139185931 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 139186095 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139186138 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 139186368 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 139186569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139186661 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139186730 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 139186731 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 139186765 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139186943 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139187074 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139187689 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 139187705 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 139187742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139187968 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 139187998 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 139188007 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139188267 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139188583 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139189870 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 139189882 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 139190801 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 139190918 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139191812 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139191986 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 139192218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139192265 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 139193011 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 139193063 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 139193345 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 139200523 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 139200583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139200863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139200864 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139201131 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 139201453 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139201455 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 139201690 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139201843 C G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 139201888 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 139201970 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139201995 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 139202194 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 139202253 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 139202536 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139202557 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139202811 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139202832 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139202837 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139202944 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139202989 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139203038 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139203266 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 139203300 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 139203311 A T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 139203341 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 139203342 G T N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 139203419 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 139203798 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139204035 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139204285 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139204511 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139204518 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139204888 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 139205115 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139205842 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139205985 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139206326 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139206765 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139206825 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 139206844 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139206848 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139206877 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 139206953 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139207153 G C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 139207235 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 139207247 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 139207255 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 139207262 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 139207622 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139207822 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139207922 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 139208038 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 139208042 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 139208298 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 139208518 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139208643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139209050 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139209116 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 139209166 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139209479 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 139209659 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 139210380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139210942 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139211570 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139211691 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139211918 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139212038 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 139212064 C T N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 3 139212150 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 139212610 G A N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 6 10 2 2 4 3 139213073 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 139214496 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 139214797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139215360 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 139215712 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 139216222 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 139216260 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139216701 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 139217033 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 139217850 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 139218584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139219052 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139219748 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139219785 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 139219933 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 139220269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139220942 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 139221946 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 139222658 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 139227244 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 139234923 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139234926 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 139234996 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 139235341 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139235501 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 139235502 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 139235636 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139235849 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 139235867 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 139236067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139236442 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139236471 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 139236495 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 139236548 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 139236865 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 139236915 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139237307 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 139237519 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139238123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139238233 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139238352 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139238632 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139238685 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 139239017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139239056 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139239249 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 139239291 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 139239292 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 139239474 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 139239680 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 139239681 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 139240032 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 139240323 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 139241156 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139241418 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 139241712 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 139242394 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 139242397 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 139242464 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139242484 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 139242543 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 139242982 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139242992 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139243008 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139243014 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139243226 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139243420 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139243670 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139243816 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 139243887 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 139244062 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 139244694 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 139244793 T C N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 139245066 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 139245371 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 139246173 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 139246279 T G N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 139246517 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139246536 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139246545 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139246663 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139246712 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139246727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139246734 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139247593 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139248036 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 139248329 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 139248860 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 139249261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139249361 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139249450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139249530 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139249567 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139249608 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139249731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139250073 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139250439 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 139250579 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 139251688 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139252026 A G Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 3 139252041 G A Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 139252048 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 3 139252070 C T Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 139253050 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139254367 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139255152 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139255651 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139256059 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139256767 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 139257748 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139257749 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139257780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139258119 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139258597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139258987 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 139259314 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139259471 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139264165 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139264857 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139266817 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139266938 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139268139 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139269715 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139269773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139270936 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 139271112 A G Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 139271144 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 139271272 C T Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 139271288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139271310 C T Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 3 139271319 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 3 139271476 A T Y N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 3 139273406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139274227 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139274597 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 139275100 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139275209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139275268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139275661 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 139276937 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 139277798 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 139278033 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139278559 C A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 139278658 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 139278716 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 139279082 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 139279180 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 139279508 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 139279756 A C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 139279798 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 139280297 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 139280332 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 139280745 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 139280811 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 139280929 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 139281334 G A N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 139281379 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 139281447 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 139281561 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 139281946 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139282053 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 139282083 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139282108 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139282377 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 139282685 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 139282705 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 139282947 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 139282964 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 139283167 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 139283170 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 139283317 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 139283450 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 139283451 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139283577 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 139283804 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 139283939 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 139284539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139284610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139284697 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 139284703 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 139284711 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 139284762 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139284773 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139284790 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 139284878 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 139284964 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 139285142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139285353 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139285400 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139285449 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139285463 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139285471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139285552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139285650 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 139285927 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139286104 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 139286211 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139286297 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139286303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139286406 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 139286423 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139287138 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139290744 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139291642 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139291867 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 139291995 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 139292722 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139292818 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139292946 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139293385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139293935 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139294421 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139294913 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139295616 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139297635 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139298639 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139299104 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139299135 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139299839 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 139299940 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139299964 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139300111 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 139300233 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139301157 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139303743 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 139303813 G A Y Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 139305074 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 139306911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139307490 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 139309908 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139311531 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139311597 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139314357 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139314766 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139314900 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 139315291 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139315567 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139316017 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139316683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139317261 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 139317399 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139317439 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139317446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139317491 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139317520 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139317558 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139317567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139317662 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139317762 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139317784 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139317787 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139317876 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 139317949 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 139318046 C T N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 3 139318517 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139319194 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139319433 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139319548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139319625 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139320147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139320191 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139320295 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139320296 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139320513 A T N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 3 139320737 A C N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 139321081 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139321441 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 139321553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139321721 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 139321771 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 139322093 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139323154 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 139323250 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139323336 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 139324272 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 139325467 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139325719 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 139325899 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 139326026 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 139326124 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 139326136 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 139326252 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139326431 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 139326529 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 139326715 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139326789 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 139327270 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139327615 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 139327741 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 139327787 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 139327853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139328066 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139328189 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 139328347 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139328369 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 139328396 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139328432 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139328478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139328625 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 139328820 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 139328898 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 139328918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139329248 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139329313 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 139329421 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139329454 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 139329552 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139330163 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 139330256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139330578 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 139330610 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 139330615 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 139330642 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 139330676 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 139330771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139331493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139331926 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139332023 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139332179 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139333629 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139334047 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139334537 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 139335632 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139337740 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139339723 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 139340680 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139342266 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139343692 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139344010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139344067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139344753 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 139344757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139345055 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 139345113 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139345175 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139345195 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139345291 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139345305 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139345329 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139345718 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 139348409 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139349076 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139349210 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 139349366 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 139349653 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 139349666 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 139349782 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 139349863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139349910 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 139349911 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 139350288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139350519 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 139350578 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139350677 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 139350687 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139352013 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 139352124 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139352455 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 139352662 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 139352825 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 139353200 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 139353439 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 139353493 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 139353495 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 139353545 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 139353612 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 139353624 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 139353816 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 139353820 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 139353912 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 139354031 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 139354060 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139354258 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 139354385 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 139354802 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 139355125 G T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 139355139 T G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 139355624 G T N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 3 139355726 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 139355763 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 139355789 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 139355958 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 139357190 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139357206 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139357279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139357441 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 139357480 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 139357734 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139357773 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 139357787 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139357864 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139358005 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.111111111111111 0.833333333333333 0.0555555555555556 19 17 2 15 1 3 139358487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139358559 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 139358671 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 139358710 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 139358857 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 139359445 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 139359581 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 139359586 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 139359670 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 139359755 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 139359939 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 139360137 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 139360330 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 139360458 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 139360461 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 139360471 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 139360501 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 139360516 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 139360535 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 139360568 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 139360574 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 139360645 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 139360720 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 139361061 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139361239 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 139361325 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 139361334 T A N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 139361376 T C N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 3 139361393 C T N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 139361471 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 139361816 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139361836 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 139363552 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139365276 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 139365297 G A N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 139366234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139366749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139367167 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 139367278 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 139370536 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 139370762 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 139371321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139372312 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 139372377 C A N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 139372774 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 139372962 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 139373105 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 139373152 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 139373257 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 139376035 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 139376440 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139376621 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 139378142 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 139378496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139378792 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139379348 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 139380738 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139381093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139381120 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139381122 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139381159 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139381177 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 139381181 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 139381618 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139382189 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139382476 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 139383245 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139383681 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139383843 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139383851 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139384201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139384321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139385065 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 139385151 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 139385320 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139385338 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139385585 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 139386034 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 139386084 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 139386129 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 139386815 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 139387120 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139387322 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139387540 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 139388513 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 139388551 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 139390582 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 139390681 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139390755 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 139390882 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 139391041 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 139391588 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 139391601 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 139392015 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 139392137 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 139392198 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139392477 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 139392635 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139392738 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 139393442 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 139393502 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 139393542 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 139393708 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 139393709 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 139393725 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 139393727 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 139393803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139393811 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 139394607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139394775 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 139394802 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 139394825 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 139394826 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 139394859 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 139394895 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 139394914 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 139394927 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139395001 T G N N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 3 139395299 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 139395412 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 139395582 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 139395714 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139395738 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 139395743 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 139395766 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139395804 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139395820 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139395839 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 139395993 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 139396070 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139396102 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 139396135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139396185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139397019 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139397260 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 139397276 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 139397296 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 139397436 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 139397464 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 139397534 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139397542 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139397684 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 139397723 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139398177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139398338 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 139398369 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139398498 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139398884 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139398896 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139398951 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139398958 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139399174 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139399386 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 139399446 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 139399464 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139400152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139400189 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 139400282 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 139401034 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 139401118 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139401426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139401740 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 139401759 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 139401780 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139401810 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139401826 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139401888 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 139401915 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 139401983 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139402549 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 139402774 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 139402846 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 139402861 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 139402902 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 139403047 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139403105 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 139403159 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 139403187 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 139403194 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 139403577 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 139403631 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139403637 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139403741 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 139403915 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 139403933 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 139404005 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 139404053 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 139404085 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 139404109 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139404187 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 139404211 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139404360 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 139404361 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 139404392 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 139404402 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 139404426 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 139404561 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 139404576 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 139404588 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139404683 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 139404772 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 139404786 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 139404845 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139404973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139405050 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 139405088 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 139405271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139405327 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139405411 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139405463 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139405485 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139405529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139405561 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139405648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139405663 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139405814 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139406002 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139406077 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 139406337 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 139406570 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139407068 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139407113 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 139407188 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 139407199 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 139407289 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 139407474 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139407885 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 139407893 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 139408047 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 139408229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139408327 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 139409125 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139409249 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 139409264 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 139409419 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139409444 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 139409461 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 139409587 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 139409866 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 139410069 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139410256 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 139410292 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 139410437 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139410473 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 139410483 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 139411118 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 139411136 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139411177 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 139411236 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 139411292 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139411294 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139411691 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139411721 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 139411965 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139412109 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139412232 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 139412293 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 139412370 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 139412911 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 139413124 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139413604 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139414838 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 139415042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139419129 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139421336 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 139421456 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139421526 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 139422123 C T Y Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0 1 0 6 6 0 6 0 3 139422290 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139422677 C T Y Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 3 139422765 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 139425577 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139429281 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139429732 G A Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 3 139430352 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139430398 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139430403 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139430791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139430868 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139431159 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139431261 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139431658 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139431680 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139432222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139432795 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139432815 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139432838 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139433946 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 139434015 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139434692 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 139434864 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 139434989 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 139435012 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 139435023 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 139435033 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 139435480 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139435492 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139435558 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139435630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139435883 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 139436179 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 139436180 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 139436229 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139436325 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139436384 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139436440 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139436483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139437108 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139437272 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139437399 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139437417 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139437453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139437494 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 139437535 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 139437581 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 139437596 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139437668 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 139437684 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 139437706 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 139437712 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 139437756 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139438354 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139438362 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139438384 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139438416 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139438423 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 139438686 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139438687 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 139438807 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139438912 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 139438919 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 139438938 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 139439039 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139439109 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 139439123 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 139439231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139439840 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139439987 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 139440388 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139440439 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139440641 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139440656 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139440835 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139440877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139440984 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139441432 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139441789 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139441916 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139442061 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139442502 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139442638 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139442740 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139442790 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 139442866 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139442912 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139442967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139443050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139443108 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139443141 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139443161 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 139443183 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 139443234 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 139443347 G C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 139443397 A T N N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 3 139443570 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 139443571 G A N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 3 139443603 T C N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 139443641 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 139443735 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 139443786 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139443793 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139443974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139444256 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139444799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139445223 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0 0.6875 0.3125 11 21 0 11 5 3 139446573 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 139446708 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 139447155 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 139447210 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139447264 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139448051 A G N Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 3 139448379 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 139448672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139448961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139449527 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 139449659 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139450478 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139451534 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139451770 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 139451938 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 139451990 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 139452111 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 139452124 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139452196 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 139452202 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 139452267 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 139452392 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 139452432 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139453196 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 139453205 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 139453218 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 139453337 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 139453425 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139453496 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 139453832 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 139453953 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 139453991 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 139454153 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 139454256 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 139454267 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139454607 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 139454797 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139454886 C G Y N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 139455129 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139455253 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 139455641 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139455937 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 139456103 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 139456106 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 139456231 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139456638 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139456750 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139456908 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139457010 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139457206 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139457210 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139457229 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 139457258 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 139457356 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 139457561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139457615 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139459197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139459478 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139459521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139460214 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 139460520 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139460936 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139461119 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139461327 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139461556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139461647 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 139462001 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139462008 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139462054 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139462075 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139462271 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139462312 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 139462410 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 139462672 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 139462690 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 139462713 C A Y N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 139462716 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 139462957 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 139463053 G A Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 139463912 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 139463995 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 139464126 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139464243 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139464272 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139464478 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 139464487 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139464546 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 139464565 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139464876 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 139465026 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139465119 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 139465450 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139465532 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139465662 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 139465798 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 139465813 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139465815 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139465933 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139465975 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139465993 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139466019 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139466037 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139466205 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139466224 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139466251 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139466374 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139466402 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 139466412 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 139466608 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139466643 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139466649 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139466815 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139466930 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139466993 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 139467733 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 139467999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139468029 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139468051 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 139468557 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139468612 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139468660 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139468825 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139468835 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139468859 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139468865 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139469070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139469142 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139469307 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 139469428 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139469743 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139469818 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139470030 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 139470031 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 139470306 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139470496 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 139470551 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139470895 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 139470973 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 139471097 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139471110 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 139471118 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 139471622 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139471800 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139472079 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 139472102 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 139472422 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139472556 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139472569 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 139472852 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 139472888 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139473175 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 139473227 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 139473509 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139474272 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 139474550 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 139474551 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 139474649 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 139474714 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139475300 T G N N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 3 139476395 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 139476683 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139476713 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139476811 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139477587 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139478006 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139478253 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 139478391 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139478399 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 139478473 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139478544 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139478689 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139485000 C T Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 139486113 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139486184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139486494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139487390 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139487957 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 139487972 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 139488187 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 139488189 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139488219 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 139488231 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 139488510 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139488755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139489224 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139489303 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 139489513 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139489620 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139489630 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139489647 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139489676 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139489683 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139489709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139489716 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139489727 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139489785 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139489819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139489852 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139489890 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139489969 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139490021 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139490060 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139490131 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139490184 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139490220 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139490242 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 139490252 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 8 16 0 8 4 3 139490348 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 139490595 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139490685 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139490769 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139491047 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 139491072 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139491108 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139491141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139491184 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 139491194 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139491202 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139491228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139491259 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139491318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139491319 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139491372 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139491433 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139491550 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139491593 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139491606 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139491619 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139491753 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139491869 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139492041 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139492144 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 139492163 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139492173 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139492237 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139492270 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139492276 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139492376 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139492394 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139492399 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139492445 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 139492453 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 139492642 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139492737 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139492909 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 139492929 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 139492945 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 139493016 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 139493089 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 139493139 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139493147 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139493209 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139493286 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 139493309 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139493332 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 139493382 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 139493442 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139493464 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139493549 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139493623 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139493656 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 139493814 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139494132 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 139494221 C G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 139494231 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 139494392 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 139494504 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139494536 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139494558 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139494562 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139494784 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 139495003 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139495067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139495149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139495161 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139495172 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139495193 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139495198 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139495349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139495403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139495461 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139495486 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139495565 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139495579 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139495589 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139495731 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139495862 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139495941 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139496148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139496230 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 139496233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139496409 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139496444 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139496473 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139496513 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 139496714 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139496801 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139496816 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139496948 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139496965 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139497078 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139497093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139497107 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139497138 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139497200 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139497215 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139497298 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139497304 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139497329 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139497362 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139497401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139497426 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139497453 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139497481 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139497543 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139497555 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139497588 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139497597 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139498049 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139498056 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139498090 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139498091 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139498102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139498114 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139498186 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139498188 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139498215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139498285 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139498433 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139498452 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139498456 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139498638 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139498735 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139498770 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139498771 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139498901 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139498921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139498924 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139499014 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 139499040 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139499063 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139499106 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139499131 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139499134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139499237 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139499243 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139499717 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139499765 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139500157 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 139500169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139500180 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139500371 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139500452 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139500522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139500536 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139500549 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139500551 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139500576 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139500594 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 139500622 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139500751 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139500803 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139500827 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139500899 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 139500911 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 139501109 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 139501247 A C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 139501262 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 139501263 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 139501462 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139501902 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139502059 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139502094 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139502140 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139502159 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139502346 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139502433 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 139502478 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 139502693 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 139502785 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 139502835 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139502878 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139503019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139503098 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 139503112 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139503168 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139503197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139503237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139503274 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 139503291 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139503509 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139503510 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139503816 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 139503868 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 139504217 A G N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 139504520 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 139504602 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139504699 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 139504720 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 139504866 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139505785 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139505866 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 139506008 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139506098 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 139506143 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 139506146 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139506167 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 139506271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139506333 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139506374 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139506464 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 139506619 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 139506810 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139506869 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139507029 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139507046 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139507146 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139507285 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139507404 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139507584 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139507625 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 139507767 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139507813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139507814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139507890 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139508076 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139508275 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139508449 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 139508643 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 139508690 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 139509392 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139509416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139509450 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139509469 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139509524 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139509562 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139509687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139509894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139510126 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139510130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139510522 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 139510526 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 139510543 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 139510700 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139510728 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139510749 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139510763 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 139510774 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 139510808 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139510822 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139510940 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139511022 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 139511109 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 139511138 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 139511301 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139511325 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 139511366 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139511374 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139511457 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139511544 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139512461 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 139512552 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139512569 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 139512919 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 139513041 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 139513176 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 139513222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139513394 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 139513490 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 139513698 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 139513705 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 139513907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139514010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139514164 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 139514548 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139514609 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139514695 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139514859 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139515190 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 139515406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139515457 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 139515563 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 139515725 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139515750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139515751 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139515820 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139515937 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 139515952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139516446 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139516450 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 139516505 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139517067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139517091 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 139517178 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 139517185 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 139517210 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 139517257 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 139517381 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139517495 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139517540 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139517650 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 139517798 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139517997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139517998 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 139518106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139518201 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139518250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139518350 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139518391 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139518444 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139518589 T G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 139518639 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139518640 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139518846 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139519012 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139519055 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 139519126 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 3 139519207 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 139519230 C A N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 139519258 T G Y N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 139519366 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 139519411 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139519469 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139519473 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139519512 A T N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 139519617 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139519650 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139519671 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139519673 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139519685 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139519954 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139519998 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139520181 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139520193 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139520273 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139520308 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139520309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139520507 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139520525 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139520545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139520911 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139521193 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139521324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139521437 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 139521573 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139521758 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 139522070 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 139522346 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139522579 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 139522593 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 139522606 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 139522654 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139522931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139523141 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 139523239 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139523454 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 139523682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139523692 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139524040 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139524422 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139524610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139524781 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139525186 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139525579 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139525587 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139526026 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139526622 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139526720 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139526746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139526970 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 139527227 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 139527413 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 139527416 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 139527482 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 139527765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139527854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139527859 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139528047 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139528218 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139528263 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139528386 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 139528442 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 139528485 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 139528494 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139528501 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 139528528 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 139528574 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139528820 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139529563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139530035 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 139530045 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 139530097 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139530153 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139530284 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139530507 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139530612 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139530711 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139530712 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139530796 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139530825 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139531310 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 139531332 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139531406 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139531439 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 139531457 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139531467 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139531484 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139531529 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 139531636 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139531725 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 139531889 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 139531943 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 139531950 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 139532209 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 139532216 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139532258 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139532265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139532271 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139532302 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139532319 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139532320 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139532383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139532415 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139532501 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139532575 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 139532654 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139532670 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139532753 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 139532819 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139532846 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139532854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139532886 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 139532938 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139532993 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 139533153 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 139533242 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 6 12 0 6 3 3 139533327 T A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 139533420 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 139533456 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139533465 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139533499 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 139533606 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139533635 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139533649 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 139533782 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 139533810 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139533960 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139533972 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139533979 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139534098 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139534142 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 139534166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139534179 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139534305 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 139534797 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139534883 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 139534915 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 139534945 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139534990 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139535068 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139535100 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139535125 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139535143 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139535226 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 139535299 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 139535362 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 139535403 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 139535468 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 139535511 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 139535570 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139535581 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139535616 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139535649 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139535671 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139535697 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139535725 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139535737 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139535833 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139535857 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139535893 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139535985 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139536091 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 139536118 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139536122 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 139536275 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139536290 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139536304 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139536381 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139536384 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139536409 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139536522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139536548 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139536740 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139536767 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139536891 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139536905 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139536984 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139537051 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139537077 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139537133 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139537245 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139537249 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139537284 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139537340 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139537363 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139537364 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 139537378 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 139537426 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 139537537 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139537566 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 139537824 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139537929 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139537931 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139537965 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139537989 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139537995 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139538018 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139538181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139538184 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139538222 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139538354 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139538470 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139538499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139538638 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139538744 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139538765 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139538973 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139539029 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139539030 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139539091 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139539137 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139539175 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139539247 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139539339 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139539357 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139539374 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139539456 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139539527 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 139539540 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 139539614 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139539698 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139539703 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139539730 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139539773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139539903 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 139540124 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139540173 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139540192 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139540237 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139540259 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139540338 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139540371 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139540399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139540406 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139540452 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139540459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139540463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139540484 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139540517 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139540559 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139540597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139540692 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 139540747 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139540800 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139540821 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139540903 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139540914 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139540923 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139540985 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139541004 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139541225 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139541337 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 139541388 C A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 139541401 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 139541405 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 139541482 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139541522 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139541588 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139541688 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139541728 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139541811 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139541823 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139541929 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139541967 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139541977 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139541997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139542078 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139542088 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139542122 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139542139 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 139542235 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 139542727 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 139542752 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139542834 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139542862 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139542932 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139543043 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 139543070 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139543239 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 139543501 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139543521 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139543558 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 139543564 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 139543578 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139543792 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 139543824 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139544090 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 139544176 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139544182 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139544286 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 139544646 T A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 139544666 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139544764 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 139544820 A G Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 139544835 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 139544849 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 139544894 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 139544912 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 139544968 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 139545038 A C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 139545141 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 139545283 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 139545382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139545441 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139545478 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139545537 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139545678 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 139545745 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139545914 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139545991 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139546003 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139546041 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139546357 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139546404 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139546406 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139546528 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139546791 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 139546896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139547044 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139547095 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139547122 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 139547229 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 139547238 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139547246 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139547280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139547361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139547394 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 139547420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139547607 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139548070 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 139548124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139549096 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 139549382 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139549914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139550121 T A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 139550132 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 139550149 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 139550165 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 139550299 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139550621 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139550626 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139550651 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139550678 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139550693 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139550731 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139551237 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 139551315 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139551852 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 139552066 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 139552107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139554325 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139555310 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 139555345 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139555391 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139555656 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 139556905 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139557040 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 139557056 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139558463 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 139558539 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139558854 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 139559371 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139560446 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139560562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139560808 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139562321 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 139562946 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 139563204 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 139563802 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 139564077 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 139564234 A G N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 139565057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139565062 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139565267 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 139565308 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139565547 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139566015 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 139567497 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139567797 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 139568892 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 139569465 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 139569548 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139569947 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 139570536 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139570713 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 139570741 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139570983 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 3 139571029 C T N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 139571038 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 139571092 C A N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 139571150 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 139571353 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 139571381 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139571407 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139571451 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 139571556 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139571572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139571588 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139571692 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139571742 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139571820 C A N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 139572166 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 139572192 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 139572292 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 139572355 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139572381 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 139572417 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 139572452 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139572461 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139572736 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139572740 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139572984 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139572986 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139573091 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139573329 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 139573460 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 139573953 T A N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 139573964 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 139573970 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 139574088 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 139574092 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 139574130 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 139574194 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139574257 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 139574278 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139574329 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139574330 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 139574646 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139574820 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139575059 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139575152 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139575381 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139575491 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 139575601 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139575701 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139575838 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139576109 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 139576273 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 139576469 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 139576518 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139576581 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139576711 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 139576872 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139576946 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 139576987 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139577121 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139577251 C G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 139577305 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.117647058823529 30 4 15 0 2 3 139577352 T A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 139577365 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 139577483 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 139577597 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 139577639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139577935 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139577960 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 139578099 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 139578138 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 139578228 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139578319 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 139578395 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 139578438 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 139579175 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139580056 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139580494 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139580956 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139581484 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139581590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139581810 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 139581816 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 139581842 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 139581861 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 139581888 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 139581898 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 139581908 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 139581987 C G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 139582072 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 139582101 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 139582165 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 139582265 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 139582294 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 139582345 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 139582386 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 139582418 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 139582433 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 139582446 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 139582496 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 139582497 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 139582513 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 139582527 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 139582543 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 139582575 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 139582657 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 139582664 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 139582675 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 139582774 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 139582877 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 139582886 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 139582943 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 139582966 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 139583001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139583011 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139583072 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 139583098 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 139583328 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 139583356 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 139583507 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 139583698 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 139584780 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 139585130 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139585850 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139585946 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 139587667 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 139587695 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 139588072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139588897 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139588947 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 139589358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139589689 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139589704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139589870 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 139590049 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139591334 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139591874 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139592017 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139592116 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 139592583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139592636 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139593060 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139593107 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 139593394 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139594040 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139594725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139595414 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 139595738 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139595745 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139595832 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 139596087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139596149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139597280 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139599375 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139599785 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139600692 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 139601174 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139601180 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 139601877 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 139602640 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 139602641 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139602683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139602787 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139602859 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 139602977 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 139603013 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 139603015 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 139603244 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139603776 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 139603777 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 139605397 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139605511 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139607268 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139607467 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139607653 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139609867 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 139610033 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139613540 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139613848 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139613882 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139613964 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 139614451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139615338 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139615583 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139616470 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139617101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139617464 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139617663 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139618376 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139619341 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 139620367 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139623535 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139623892 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139625737 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139627897 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139632821 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 139633761 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139633869 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 139634428 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139635080 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139635987 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 139642375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139642536 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139643455 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139644949 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139646103 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139646675 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 139648272 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 139649405 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139649543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139652181 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139652344 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139652736 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139653359 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139655022 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139655029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139655056 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139655065 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139655117 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139656254 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139656511 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139656537 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 139656736 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 139657070 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139657928 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139658303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139658405 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139658971 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 139659147 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 139659302 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 139659358 G C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 139659491 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 139660150 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139660393 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 139660475 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139660561 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139660606 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139660650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139660716 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 139660878 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 139660919 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139660931 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 139661072 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 139661075 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 139661147 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139661280 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139661315 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139661409 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 139661596 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 139661651 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139662045 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 139662115 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 139662201 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139662236 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139662260 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139662314 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139662475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139662872 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 139663045 T A N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 139663207 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139663607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139663670 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139663837 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139663964 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139664034 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139664041 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 139664184 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 139664251 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139664460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139664510 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139664637 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139664643 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139664680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139664980 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139664991 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139665127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139665129 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139665281 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139665339 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 139665529 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 139665557 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139665781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139666243 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139666406 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139666471 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 139666534 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 139666552 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 139666812 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 139666875 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 139666976 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139667020 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139667080 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139667151 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139667154 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139667165 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139667210 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139667375 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139667494 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 139667530 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 139667552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139668454 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 139668577 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 139669066 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 139669347 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139669740 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 139669756 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 139669972 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139670666 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 139671000 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 139672188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139672521 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 139672704 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139672936 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 139673054 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 139673245 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 139674225 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139674453 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 139674563 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 139674697 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139674960 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 139675096 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 139675164 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 139675183 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 139675312 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 139675325 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 139675353 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139675415 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 139675527 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139675857 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 139676303 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139676405 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139676603 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139677319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139677685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139677763 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139677895 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 139678244 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 139678357 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139678392 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 139678464 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 139678578 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 139678609 T A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 139678611 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 139678623 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 139678626 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 139678784 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 139679160 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139679176 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139679340 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139679371 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139679611 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 139679645 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139679701 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 139679865 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 139680246 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139680287 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 139681316 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 139681613 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 139681700 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 139682181 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139682260 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 139682433 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139682559 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 139690423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139690618 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139690650 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139690780 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139690895 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 139691389 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 139691547 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 139692204 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 139692245 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139692964 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 139693147 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139693209 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139693251 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139693319 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139693414 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139693587 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139693696 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139693749 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 139693799 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139693994 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 139694000 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 139694056 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139694226 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 139694252 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 139694402 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 139694617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139694633 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 139694784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139694838 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139694874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139695702 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139696117 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139696338 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 139696633 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139696888 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139697078 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139697146 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 139697328 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139697946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139699046 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139699048 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139699446 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 139699617 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139699751 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 139701429 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139702348 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139703391 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139703430 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139703853 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139704018 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139706230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139706359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139706867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139707044 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139707314 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139708038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139708581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139709509 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139709624 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 139710983 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 139711722 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139712224 A T N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 3 139712290 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139712449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139713412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139713668 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 139714253 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 139715454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139716465 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139716728 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139717131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139717727 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139719358 A G N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 3 139719454 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139720493 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 139720916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139720939 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 139721585 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139721833 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139722465 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 139722638 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 139722770 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 139722977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139723201 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139724281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139724680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139724693 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 139724765 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 139725123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139725850 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 139725952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139726214 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139726430 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139726512 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139726819 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 139727239 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139727327 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 139727463 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 139727609 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 139727659 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 139727699 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 139727746 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 139727752 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 139727927 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 139728219 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 139728253 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 139728311 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 139728393 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 139728451 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 139728748 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 139728795 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 139729428 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 139729455 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 139729465 G T N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 139729559 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139729633 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139729778 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 139729806 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 139729822 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 139729842 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 139729915 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 139730128 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 139730159 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 139730193 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 139730225 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 139730312 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 139730341 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 139730361 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139730396 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 139730402 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139730426 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 139730491 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 139730509 C T N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.333333333333333 0.6 0.0666666666666667 19 11 5 9 1 3 139730535 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 139731802 T G N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 139731930 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139731999 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139732015 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139732052 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139732156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139732294 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 139732331 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139732354 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139732356 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139732419 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139732491 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139732696 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 139732715 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139732803 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139733437 C A N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 3 139733551 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139734182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139734560 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139735331 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139735368 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139735685 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 139735811 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139736234 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 139736358 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 139736868 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 139736945 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139736971 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139736981 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139737077 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139737167 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139737203 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139737255 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139737642 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 139737675 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139737723 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139737983 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 139738103 T A Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 139738178 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139738195 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 139738632 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 139739555 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139740030 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139740210 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 139740280 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 139740827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139741391 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139741824 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139742211 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139742753 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139743671 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 139743876 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139744076 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 139744117 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 139744234 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139744484 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 139744649 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 139744921 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139744942 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139745511 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 139746196 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139746380 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 139746445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139746772 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 139746983 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 139747286 T A N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 139747641 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 139747689 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 139748018 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 139748303 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 139748702 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139748847 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139749157 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139749281 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139749472 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 139749489 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139749730 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139749746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139750857 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139752565 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139753003 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 139753739 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139753934 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139754464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139754864 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139755334 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139755448 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139756052 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139756384 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139756761 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 139757008 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139757242 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 139757259 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 139757660 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139757703 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139758188 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 139758316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139758485 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 139759430 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139759452 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 139759985 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 3 139760381 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 139760405 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139760748 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139760899 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139761044 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139761605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139762243 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 139762941 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139763137 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 139763360 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139763760 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139764068 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139764142 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 139764467 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139765067 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139765237 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 139765319 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139765459 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 139765504 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 139765717 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 139765747 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 139765992 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 139766054 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 139766146 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 139766152 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 139766367 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139766672 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139766707 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 139766807 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 139766882 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 139767005 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 139767134 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 139767195 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139767234 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 139767248 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 139767290 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 139767342 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 139767507 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 139767579 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 139767654 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 139767911 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 139767984 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139768038 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139768217 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 139768230 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 139768270 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 139768289 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 139768787 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 139768865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139768869 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139768952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139769006 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 139769156 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 139769268 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 139769305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139769354 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 139769494 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139769606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139769635 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139769650 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 139769655 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 139770031 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139770253 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 139770521 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 139770616 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139770631 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 139770660 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139770677 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 139770771 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 139770891 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 139770893 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 139770954 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139771873 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 139771880 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 139771959 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 139771974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139772270 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139772451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139772487 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 139772521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139772766 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139772949 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 139773218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139773299 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 139773523 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 139773587 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139773630 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 139773695 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 139773859 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 139773865 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139773881 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139773935 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139773941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139773960 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139774021 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 139774032 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 139774139 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 139774158 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139774191 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139774242 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139774281 C T N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 3 139774321 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139774403 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139774468 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 139774500 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139774535 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139774540 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 139774611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139774617 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 139774641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139774723 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139774754 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139774803 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139774812 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139774847 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139774928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139775045 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139775171 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139775354 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 3 139775429 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 139775431 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 139775451 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139775567 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 139775635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139775640 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 139775651 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 139775830 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 139775842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139775853 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 139775914 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139775929 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 139775976 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 139775982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139776021 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 139776073 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 139776095 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 139776379 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139776400 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139776452 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 139776485 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139776519 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 139776571 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139776602 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139776625 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139776630 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 139776701 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 139776717 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 139776736 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 139776777 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 139776897 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 139777159 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 139777371 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139777414 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139777532 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 139777669 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 139778133 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139778218 A G Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.125 0.75 0.125 16 16 2 12 2 3 139778229 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139778283 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139778314 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 139778346 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 139778353 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139778365 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139778393 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139778404 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139778422 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139778604 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139778752 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 139778851 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139778978 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139779114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139779264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139779791 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139780415 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139780416 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 139781207 A C Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 139781935 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 139781944 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 139782330 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 139782481 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 139782555 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 139782610 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 139782761 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 139782793 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139782822 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 139782899 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 139788649 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 139788851 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 139788892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139788946 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 139789240 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 139789356 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 139789457 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 139789763 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 139789921 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 139790533 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139790686 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 139790699 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 139790763 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 139791530 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 139791562 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 139791590 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 139791595 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 139791703 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 139791717 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 139791756 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 139791771 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 139791964 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 139792064 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139792229 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 139792300 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 139792640 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 139792662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139792756 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 139792869 A T N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 3 139792909 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139792959 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 139792978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139792997 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 139793081 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 139793246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139793318 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 139793324 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 139793391 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 139793421 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 139793432 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 139793464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139793567 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 139793580 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 139793688 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 139793752 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 139793798 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 139793877 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 139793931 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 139794329 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 139794405 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 139794551 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 139794683 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 139794795 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 139794816 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 139794937 T A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 139795196 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 139795244 T G N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 139795697 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139795702 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 139795871 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 139795986 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 139796026 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 139796174 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 139796367 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 139796377 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 139796618 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 139796847 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 139797006 G C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 139797130 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 139797290 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139797354 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 139797406 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 139797871 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139797905 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139798020 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139798033 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139798055 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 139798102 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 139798151 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 139798317 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 139798353 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139798383 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 139798730 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 139798781 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 139798806 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 139798841 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 139798855 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 139798966 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 139799024 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 139799050 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 139799333 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139799546 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139799722 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139799738 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139799855 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139799884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139799956 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139800363 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139800549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139800720 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139800821 T G N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 139800836 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 139800979 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 139801295 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139801373 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139801385 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 139801462 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 139801648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139801657 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 139801678 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 139801768 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139801785 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 139801807 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139801942 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139802063 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139802380 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 139802393 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 139802626 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139802821 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139802832 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139803027 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 139803288 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 139803321 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 139803362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139803376 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139803395 G C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 139803398 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 139803413 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 139803431 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 139803456 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 139804636 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139804689 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 139804761 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 139804800 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139804816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139804840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139804885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139804993 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139805079 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 139805133 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139805166 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139805393 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139805485 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 139805564 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 139805691 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 139805757 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 139805763 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 139805849 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 139805890 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 139805912 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 139805942 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 139806122 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139806134 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 139806138 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 139806167 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 139806191 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 139806424 G T N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 139806548 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 139806727 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 139806731 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 139806762 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 139806803 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 139806834 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 139806836 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 139806930 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 139807004 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 139807379 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139807426 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 139807553 C A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 139807601 T A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 139807608 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 139807685 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 139807770 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 139807771 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 139807923 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 139808085 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 22 6 10 2 2 3 139808348 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 139808737 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 139809466 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 139809536 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139809592 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 139809731 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 139809734 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 139809752 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 139809864 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 139809900 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 139809955 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 139810215 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139810402 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139810426 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 139810534 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139810535 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 139810546 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139810624 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 139810635 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 139810636 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 139810984 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 139811294 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 139811602 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 139811630 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 139811668 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 139811796 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 139812417 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 139812443 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 139812488 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 139812593 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 139812739 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 139812744 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139812930 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 139812996 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 139813128 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139813148 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 139813305 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 139813402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139813765 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 139813782 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 139813841 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 139813988 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 139814013 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 139814026 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139814027 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 139814042 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 139814136 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 139814161 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 139814186 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 139814295 A G Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 139814407 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 139814410 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 139814464 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 139814521 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 139814567 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 139814576 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 139814598 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 139814631 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 139814649 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 139814659 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 139814691 C T Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 139814717 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 139814780 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 139814790 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 139814806 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 139814830 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 139814854 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 139814942 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 139815044 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 139815053 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 139815067 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 139815095 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 139815241 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 139815244 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 139815395 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 139815412 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 139815425 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 139815675 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 139815713 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139815759 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139815787 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 139815810 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 139815830 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 139815856 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 139815863 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 139815966 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 139816250 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 139816338 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 139816353 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 139816771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139816797 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139817932 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139818932 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139819015 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 139819027 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 139819037 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139819073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139826556 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139826571 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139826737 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139828631 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139828936 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139829344 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 139829458 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 139829468 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139829637 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139829656 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139829673 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139829686 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 139829751 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139829758 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 139829904 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139830111 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 139830113 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139830181 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139830326 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 139830518 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139830529 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139830703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139830766 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 139830770 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 139830780 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 139830787 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 139830809 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 139831005 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 139831360 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 139831378 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139831434 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 139831448 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 139831475 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 139831623 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139831695 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 139831955 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 139832078 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 139832213 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 139832242 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 139832294 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 139832398 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 139832469 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 139832472 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 139832492 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 139832545 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 139832666 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 139832766 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 139832835 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 139832867 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 139832942 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 139832957 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 139832993 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 139833052 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 139833063 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 139833105 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 139833240 G A N Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 5 9 2 1 4 3 139833255 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 139833294 A C N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 139833390 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 139833471 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 139833481 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 139833496 A C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 139833498 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 139833517 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 139833531 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 139833563 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 139833572 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 139833651 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 139834069 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 139834208 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 139834285 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 139834327 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 139834379 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 139834395 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 139834416 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139834680 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 139835356 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 139835800 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 139835937 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 139836025 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 139836044 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 139836079 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 139836238 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 139836253 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139836308 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139836330 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 139836516 A T N N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 6 12 2 2 5 3 139836527 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 139836725 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 139836769 A C N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 139836852 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 139837102 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 139837134 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 139837171 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 139837191 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 139837206 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 139837332 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 139838106 G T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 139838118 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 139838302 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 139838338 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 139838446 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 139838448 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 139838460 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 139838544 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 139838611 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 139838670 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 139838671 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 139838836 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 139838956 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 139838979 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 139839085 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139839163 C T N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 139839514 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 139839557 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 139839757 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 139839815 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 139840043 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139840128 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139840756 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 139840761 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 139840809 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 139840946 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 139841591 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139841602 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 139842231 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 139843053 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 139843235 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 139843665 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 139843792 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139844156 C T N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.153846153846154 0.0769230769230769 0.769230769230769 5 21 2 1 10 3 139844374 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 139844562 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 139845119 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139845188 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 139845263 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 139845430 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139845568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139846150 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 139846237 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 139846371 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 139846730 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 139846731 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 139847238 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 139847456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139847478 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 139847572 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139847692 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 139847846 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 139847918 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 139848002 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 139848056 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139848203 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139848595 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 139848667 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139849173 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139849659 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 139849887 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 139849895 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139850441 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 139850459 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139850729 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139850783 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 139850902 T C N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 139851546 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 139851926 T G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 139852095 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 3 139852154 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 139852446 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 139852531 T G N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 139852581 A C N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 139852886 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 139853039 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139853183 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139853233 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 139853262 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 139853289 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 139853584 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 139853740 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 139853906 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 139854242 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 139854257 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 139854293 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 139854586 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139854731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139855090 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 139855493 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 139856071 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 139856210 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139856301 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139856313 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 139857142 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 139857391 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139857438 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139857591 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 139857666 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139857815 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 139858128 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 139858376 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139858590 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 139858699 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 139859021 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139861405 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 139861459 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 139862358 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 139862394 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 139862613 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 139863062 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 139863770 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139864111 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139864492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139864617 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 139864724 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 139864824 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 139864973 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 139865275 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 139865868 G C N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 139866131 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139866140 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 139866220 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 139866256 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139866363 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 139866417 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139866644 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 139866921 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 139866952 G C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 139866979 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 139867062 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139867121 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 139867137 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 139867396 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 139867522 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 139867988 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139868635 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 139869083 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 139869086 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139869199 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 139869318 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 139869502 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139870007 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 139870244 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 139870619 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 139870656 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 139870871 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 139870940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139871310 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 139871711 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 139871768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139872038 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 139872684 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 139873094 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 139873182 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 139873238 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 139873243 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 139873778 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 139873816 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 139875012 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 139875599 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 139875621 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 139876184 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139876319 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 139876459 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 139876641 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 139877578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139877915 G C N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 139878525 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 139878865 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139878971 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 139880586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139880861 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 139881203 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 139881958 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139882585 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139883883 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 139885615 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139886692 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 139886838 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139887152 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 139888506 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139889190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139889340 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139889851 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 139889893 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 139889997 T A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 139890173 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139890339 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 139890558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139890935 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 139890981 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 139891134 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 139891170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139891267 G C Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 139891936 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 139892392 C G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 139892409 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 139892522 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 139892611 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139892849 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 139893140 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139893537 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 139893777 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 139894013 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139894111 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 139894553 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 139894559 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 139894568 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 139894578 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 139894654 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 139894660 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 139894809 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 139894832 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 139894948 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 139895017 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139895076 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 139895147 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 139895155 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 139895253 T A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 139895309 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 139895339 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 139895345 G C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 139895395 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 139895432 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 139895515 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 139895530 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 139895644 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 139895652 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 139895682 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 139895689 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 139896382 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139896510 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139896828 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 139897554 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139897574 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 139897623 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139898073 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 139898630 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139899006 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139899101 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 139899156 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139899315 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139900219 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139900242 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139900337 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 139900445 C T N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 139900711 A T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 139900822 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 139901357 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139901429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139901711 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 139902594 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139902607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139902915 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139903287 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 139903594 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139903713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139903739 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 139903834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139904038 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 139904270 T A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 139905941 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139907403 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139909482 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 139909591 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 139911051 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 139911375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139912269 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139914492 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 139917933 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139918659 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139920620 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 139921782 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139922394 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139923548 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139923753 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139924190 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 139925424 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139927102 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139930866 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139931257 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 139932115 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 139932332 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139932599 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139933525 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139934005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139934011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139934092 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139934157 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139934175 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 139934246 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 139934263 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139934319 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139934395 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 139934437 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 139934920 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139936335 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139936958 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139937529 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139937642 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 139937645 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139938037 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139938309 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139939352 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139939379 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139939730 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139939851 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139940180 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 139940720 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 139942302 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139942351 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139943089 G C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 139944640 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139945559 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139945798 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139946060 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139946269 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139946454 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139946599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139946729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139947892 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139948289 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 139948628 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 139948708 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139948828 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 139949325 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 139949327 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 139949337 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 139949396 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 139949469 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 139949553 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 139949683 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 139949871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139949948 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 139950117 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 139950685 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139951204 G A Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 139951558 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139951568 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 139951614 A G Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 139951626 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139951674 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139951702 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139951857 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139951866 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 139952568 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139953051 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 139953228 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139953554 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 139953610 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139953702 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 139953766 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 139953817 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 139953823 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 139953988 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 139954062 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 139954199 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 139954488 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 139954501 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139954535 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 139954623 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 139954692 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 139954914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139955551 T G N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 139955706 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 139955719 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 139955912 G T N N 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 5 9 2 1 4 3 139955932 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 6 8 2 2 3 3 139956037 A G N Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.428571428571429 0 0.571428571428571 6 8 3 0 4 3 139956083 A T N N 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.428571428571429 0 0.571428571428571 6 8 3 0 4 3 139956130 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.333333333333333 0.111111111111111 0.555555555555556 7 11 3 1 5 3 139959552 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139959748 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 139961099 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139961163 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 139961464 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 3 139961478 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 139961486 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139962030 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139962147 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139964282 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 139965673 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139966103 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 139966224 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139968364 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139970381 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139970755 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 139970871 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 139971257 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139971806 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139971967 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139972410 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 139973146 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 139974824 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 139975102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139975134 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 139975239 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 139975876 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139975939 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139976166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139976169 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139976218 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139976232 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139976428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139976433 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139976458 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139976467 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139976474 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139976478 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139976635 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 139976692 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 139977181 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 139977271 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139977330 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 139977392 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139977698 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 139977910 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139977984 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 139978037 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139978114 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139978326 C A Y N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 139978444 T A N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 3 139978470 G C N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 139978876 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 139979105 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139979467 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139979764 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 139980407 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139980633 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139981022 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139981287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139981666 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 139981916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139983129 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 139983285 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 139983841 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 139984308 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139985401 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139985640 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139985886 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 139986353 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139986385 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 139987402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139988354 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139988806 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 139989021 C T N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 139989474 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139989614 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139989789 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 139991082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139991302 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 139991893 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139992229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 139993464 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 139994915 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 139995030 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 139995505 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 139996906 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 139998751 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140000304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140000604 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140000661 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140001523 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 140001650 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140001789 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140001965 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140002106 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 140002134 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 140002207 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 140002318 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 140002818 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140002931 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 140003391 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140004879 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140005277 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140005868 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140006221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140007707 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140007964 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140008092 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140010668 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140010927 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 140012670 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140012705 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140012822 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140012837 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140012959 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140013056 C A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 140013087 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 140013107 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 140013216 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140013242 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140013487 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140013489 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140013558 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140013600 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140013633 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140013650 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140013752 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140013810 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140013812 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 140013901 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 140014084 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 140014096 C G N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 140014119 T A N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 140014691 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 140014904 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 140014933 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140015066 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140015107 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140015250 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140015314 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140015556 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140015594 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140015708 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140015753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140015799 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140015803 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140015818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140015874 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140015889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140016031 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140016074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140016125 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140016135 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140016140 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140016211 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140016259 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140016269 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140016388 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140016523 A G N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 140016685 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 140016774 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 140016808 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140016885 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140016993 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140017135 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 140017173 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140017532 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140017547 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140017613 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 140017643 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 140017830 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 140017877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140017887 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 140017893 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 140017923 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 140018058 C T N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 140018130 T G N N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 3 140018145 C A N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 3 140018432 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140018466 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140018486 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 140018631 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 140018652 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 140018678 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 140018696 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 140018749 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 140018797 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 140018892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140018917 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 140018918 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 140018933 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 140018934 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 140019013 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 140019057 T A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 140019133 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 140019143 T A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 140019162 C A Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 140019201 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 140019221 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 140019247 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 140019282 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 140019293 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140019396 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 140019475 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140019639 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 140019722 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 140019818 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 140019837 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 140019922 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 140020009 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140020192 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140020334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140020420 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140020433 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 140020481 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 140020753 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140020831 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 140021380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140021519 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140021697 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 140021782 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 140021890 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 140022139 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140022338 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 140022422 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 140022502 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 140022613 C G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 140022684 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 140022818 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 140022820 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 140022900 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140022915 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140022937 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140023012 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 140023081 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 140023144 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 140023616 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140023880 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 140024067 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 3 140024086 C G N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 3 140024092 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 3 140024605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140024622 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140024778 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140024828 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140024888 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140025071 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 140025087 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 140025216 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 140025510 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 140025609 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 140025682 T G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 140025755 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 140025913 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 140026069 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 140026198 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140026239 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140026244 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140026381 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 140026501 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 140026898 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 140026913 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140026929 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 140026936 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 140026980 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 140027001 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 140027025 C A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 140027090 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 140027163 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 3 140027197 A G N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.363636363636364 0.0909090909090909 0.545454545454545 9 13 4 1 6 3 140027252 A C N N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 3 140027322 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 140027484 T C N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 3 140027538 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140027542 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 140027554 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 140027612 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140027664 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 140027676 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140027750 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 140027874 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 140027919 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 140027929 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 140027939 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 140027972 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140027992 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 140028081 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 140028120 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 140028223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140028289 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 140028326 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 140028399 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 140028511 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140028547 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140028662 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140028799 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 140028993 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140029017 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 140029099 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 140029282 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 140029337 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140029386 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 140029392 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140029415 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 140029463 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 140029517 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140029520 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 140029544 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140029549 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140029573 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 140029605 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 140029688 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 140029706 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 140029759 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 140029848 T G N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 140030056 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 140030260 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 140030371 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 140030521 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 140030537 G T N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 140030747 T C N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.363636363636364 0.272727272727273 0.363636363636364 11 11 4 3 4 3 140031137 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 140031184 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 140031309 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140031316 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140031379 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140031474 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140031544 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 140031596 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 140031612 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 140031703 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140031743 A T N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 3 140031758 C T N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 3 140031892 C A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 140032006 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 140032143 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 140032572 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140032606 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140032639 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 140032673 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140032676 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140032738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140032758 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 140032791 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 140032887 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 140032902 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 140032927 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 140032999 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 140033029 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140033051 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140033548 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 140033576 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 140034162 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 3 140034242 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 140034326 C T N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 3 140034511 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 140034607 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 140034621 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 140034631 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140034643 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 140034669 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 140034681 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 140034701 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 140034717 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 140034743 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 140034841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140034999 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 140035143 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 140035541 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140035746 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 140035790 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 140035915 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 140036685 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140036906 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140036960 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140037042 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 140037115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140037132 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 140037214 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140037385 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 140037484 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 140037783 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 140038151 T G N N 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 3 140038433 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140038675 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 140038793 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140039240 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 140039262 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 140039295 A C N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 3 140039302 G T N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 3 140039639 G C N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 140039760 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 140039908 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 140047176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140047300 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 140047414 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140047565 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 140047633 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 140047716 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140047802 T G Y N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 140047825 T G Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 140048489 C T N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 140048644 C G N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 3 140048994 A G N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 3 140049448 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140049926 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 140050126 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 140050339 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140050436 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140050474 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140050729 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140050802 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140050850 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140050912 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140050946 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140050966 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140051028 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140051042 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140051169 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 140051206 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 140051210 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 140051221 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 140051317 T A N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 140051431 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 140051560 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 140051690 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140051858 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140051921 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 140051922 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140052714 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140052967 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140052979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140053025 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140053074 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140053124 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140053380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140053392 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 140053525 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140054098 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140054123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140054315 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140054366 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140054400 A T Y N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 140054592 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140054782 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140055341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140055391 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140055625 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140055732 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140055742 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140055755 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140055881 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140055885 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140055975 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 140056644 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140057094 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 140057693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140057746 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140057782 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140057792 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140057825 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140057859 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140057886 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140057928 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 140057987 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140058070 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 140058077 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140058173 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 140058238 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140058417 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140058572 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140058895 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140058929 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140058965 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140059302 C A N N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 140059317 T C N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 140059737 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140059739 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140059918 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140060005 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140060359 A C N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 140060856 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140060937 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140061033 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140061118 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140061396 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 140061550 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 140061934 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140062450 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140062580 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140062727 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140062774 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140063158 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140063226 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140063268 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 140063306 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 140063540 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140063587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140063765 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140063940 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140064373 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140064513 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140064557 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140064574 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140064585 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140064694 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140064757 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140064855 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 140064893 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140064942 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140065179 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140065237 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140065243 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140065267 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140065269 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 140065400 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140065545 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140065597 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140065630 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140065633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140065965 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140066034 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 140066221 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140066226 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140066234 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140066252 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140066257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140066266 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 140066287 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140066294 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140066343 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140066375 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 140066581 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140066587 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140066656 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 140066856 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 140067109 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140067119 T G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 140067146 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140067212 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140067285 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 140067311 C A N N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 3 140067569 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 140067714 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 140067727 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 140067825 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 140067972 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 140068026 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140068089 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 140068252 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 140068271 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 140068337 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140068382 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140068497 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 140068525 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140068980 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 140069072 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140069086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140069273 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140069288 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140069807 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140070453 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140070454 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140070955 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140070975 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140072888 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 140072969 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140073811 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 140075164 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 140075238 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140075328 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140075378 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140075570 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140075662 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140075913 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140076703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140077157 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 140077201 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 140077612 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140077682 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140077778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140078107 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140078140 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140079615 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 140079867 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140081391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140081962 G C Y N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 140082052 G A Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 3 140082733 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 140082746 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 140082757 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 140086492 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140088093 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140088105 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140088106 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140088214 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140088609 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 140089279 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140089531 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 140090178 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 140092050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140092488 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 140092549 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140092577 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140092800 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 140092965 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140096220 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 140096340 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 140097274 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 140097626 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 140098686 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140099470 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140099975 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140100648 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 140100672 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140100892 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140101067 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 140101154 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 140101347 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140101605 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140101615 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140101645 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 140101738 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 140101914 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 140102304 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 140102871 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 140103022 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 140103057 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 140103410 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 140103413 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 140103599 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 140103738 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 140103775 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 140103997 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140104018 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 140104069 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140104772 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.25 0.166666666666667 0.583333333333333 8 16 3 2 7 3 140104861 A G N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 3 140105014 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 140105032 A C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 140105123 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 140105273 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 140105292 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 140105294 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 140105320 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 140105776 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140106380 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140106441 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 140107179 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140107909 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140108874 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140108923 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140109106 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 140109158 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140109451 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140109492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140109563 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140109653 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 140109654 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140109675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140109819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140109900 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140109993 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 140110048 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 140110100 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140110205 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 140110246 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 140110527 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140110600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140110607 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140110695 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140110697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140110730 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140110768 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140110777 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140110914 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140111062 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140111364 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140111410 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140111531 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140111962 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 140114668 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 140114729 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140115750 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140116280 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140116554 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140116613 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140116893 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140116945 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140117023 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140117301 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140117465 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140117518 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140117592 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 140117832 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 140118195 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140118395 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140118415 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140118563 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140118630 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140118717 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140118887 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140118901 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140118976 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140118986 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140119045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140119140 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140119192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140119541 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140119641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140119671 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140119706 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140119822 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 140119831 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 140119843 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140119857 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140120084 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140120119 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140120199 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140120265 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140120378 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 140120613 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 140120892 G A N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 140121013 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 140121450 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 140121581 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 140121658 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 140121786 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 140121787 T A N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 140121868 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140121891 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140121950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140122084 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140122501 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140122516 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140122520 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140122660 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140122699 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 140122800 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140123087 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 140123158 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140123270 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140123430 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140123737 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 140123874 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140124118 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140124157 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140124215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140124223 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140124253 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140124285 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140124471 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140124579 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140124855 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140124896 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140124906 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140124933 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140125075 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 3 140125348 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140125554 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140125601 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140125666 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 140125837 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140126035 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140126407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140126488 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140126614 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140126706 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140126805 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140126995 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140127065 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140127077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140127150 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140127177 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140127258 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140127673 A C N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 140127679 A T N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 140127857 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140128000 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140128070 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 140128198 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140128230 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140128902 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140129022 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140129200 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140129219 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140129648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140130196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140130419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140130738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140130960 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 140130974 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140131050 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140131262 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140131610 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140132461 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140133268 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140134107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140134186 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140135792 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 140136318 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 140136671 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140136859 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 140137062 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140137510 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 140137785 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140138103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140138569 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140138620 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140139534 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140139537 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140140053 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140140451 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140140489 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140140543 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140140650 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140141275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140141845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140141914 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140142934 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 140143425 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 140143493 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140143507 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 140143694 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 140143776 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140143881 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140143885 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140143924 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140144034 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140144278 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140144466 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 140144544 T C Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 3 140144710 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 140144728 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 140144813 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 140144892 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140144919 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 140145286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140145688 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140145968 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 140145999 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 140146959 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140147198 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140147288 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140148269 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140148776 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140149073 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 140149211 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140150081 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 140150116 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140151294 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140151650 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140154037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140154290 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140155571 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 140155739 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 140156084 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 140156901 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140157076 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140157519 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140157570 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 140157595 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140157717 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140157896 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 140158214 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140158427 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 140158480 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 140158542 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 140158639 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 140158803 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 140159062 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 140159306 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140159481 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140159791 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140159820 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140159880 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140159957 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140160217 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140160252 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140160272 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140160284 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140160313 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140160379 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140160434 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 140160435 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 140160489 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 140160493 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 140160559 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 140160643 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140160759 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140160837 G T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 140160854 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 140160902 G A N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 3 140160904 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 3 140160923 A C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 140161075 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 140161109 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140161114 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140161146 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140161167 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140161260 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140161272 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140161309 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140161318 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140161468 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140161771 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140161835 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 140161970 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140161981 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140162123 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 140162361 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 140162453 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140162599 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 140162689 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 140162708 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 140162733 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140162869 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 140163470 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140163794 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 140163948 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140163991 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140164099 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140164436 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 140164495 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 140164500 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 140164655 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 140164863 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 140164895 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 140164916 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 140164971 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140165005 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140165016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140165059 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140165076 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140165112 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140165188 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 140165251 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 140165561 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140165699 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140165746 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140165819 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140166127 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140168099 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140168328 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140168392 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140168586 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140168667 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140168848 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 140169019 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 140169281 G T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 140169516 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140169650 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140169938 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140170132 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140170242 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 140170705 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 140170923 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 140171643 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140171817 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140172304 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140173107 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140173526 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140173569 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140173723 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140173815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140174213 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140174706 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140174794 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140175072 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140175091 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140175352 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140182013 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140182096 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140182201 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 140182394 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140182650 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140182872 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140183136 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 140183554 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140183783 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140184253 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140184491 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140185083 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140185406 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140186086 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140186294 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140188371 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 140188968 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140189012 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 140189231 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 140189611 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 140190318 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140191125 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140191193 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140191596 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140191995 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140195097 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140195246 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140196412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140196693 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140197864 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140198333 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140198938 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140199188 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140199435 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 140199485 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 140199573 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140200213 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 140200355 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140201001 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140201002 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140201895 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140202320 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 140202323 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 140202569 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140202630 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140203087 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 140203537 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140203704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140204377 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 140204670 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140204690 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140204721 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140204941 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140205836 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140206345 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140206420 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140207097 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140207621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140207999 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140209230 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140209546 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140209583 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140209639 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140209778 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140209796 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140210029 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140210254 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140210262 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140210265 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140210343 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140210374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140210431 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140210445 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140210465 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140210538 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140210947 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 140211435 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140211771 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140211831 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140211893 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140212006 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140212245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140212299 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140212474 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140212570 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140212600 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140212636 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 140212702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140212860 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140212874 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140213583 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140213726 G T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 140213767 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140214587 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140214594 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140215298 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140215307 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140215419 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140215619 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140215710 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140216179 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140216210 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140216551 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 140216571 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140216573 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140217178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140218406 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140218481 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140218809 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 140218869 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140219097 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140219159 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 140220001 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 140220031 A C N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 140220413 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140220810 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140221356 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140221357 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140221530 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140221534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140221542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140221561 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140221610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140221672 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140221751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140221770 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140221833 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140221860 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140221883 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140221956 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 140221965 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140222047 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140222061 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140222141 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140222153 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140222158 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140222261 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140222314 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140222423 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 140222453 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140222470 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140222476 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140222521 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140222534 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140222609 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 140222638 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140222669 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140222702 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140222725 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 140222763 G T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 140222889 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 140223008 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140223026 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140223038 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140223052 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140223100 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140223140 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140223157 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140223166 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140223251 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140223354 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140223373 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140223374 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140223482 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140223568 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140223608 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140223609 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140223647 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140223746 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 140223776 T G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 140223799 G T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 140223823 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 140223871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140223921 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140223954 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140223969 C A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 140225590 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 140225618 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 140225642 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140225706 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140225717 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140225731 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140225747 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140225787 C A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 140225789 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 140225812 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 140225858 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140225877 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140225897 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140225924 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140226034 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140226209 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 140226215 A G N Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 3 140226293 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 140226374 A T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 140226471 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140226527 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140226569 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140226590 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140226639 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140226692 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140226701 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140226822 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140226832 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140226850 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140226859 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140226871 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140226883 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140226902 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140226936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140226948 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140226995 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140227014 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140227919 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140228481 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 140228630 A T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 140228631 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 140228727 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 140228731 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 140228918 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 140228953 T G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 140229087 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140229149 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140229368 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140229415 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140229562 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140229579 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140229613 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 140229658 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140229782 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 140229813 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140230209 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140230827 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140231590 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 140231591 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 140231677 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 140231792 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140231871 T G Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 140232230 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140232870 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 140232883 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140232924 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140232996 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140233020 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140233025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140233051 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140233056 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140233119 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140233125 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140233170 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140233174 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140233183 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140233216 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140233233 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140233234 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140233479 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140233490 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140233493 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140233600 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140233614 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140233704 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140233725 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140233737 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140233752 G C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 140233767 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140234131 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140234212 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140234246 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140234249 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 140234293 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140234320 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140234406 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140234514 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140234595 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140234667 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140234681 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140234682 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140234695 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140234711 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140234854 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 140234862 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140234925 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140234954 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140234957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140234984 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140235002 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140235289 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140235372 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140235379 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140235420 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140235474 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 140235486 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140235546 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140235724 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140235761 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140235864 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140236008 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140236070 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 140236281 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140236294 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140236325 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140236332 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140236498 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140236547 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 140236627 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 140236643 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 140236711 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140236741 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140236751 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140236764 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140236860 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140237022 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140237748 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140237879 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140237880 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140237904 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140237980 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140238006 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140238084 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140238111 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140238113 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140238135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140238157 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140238166 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140238194 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140238210 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140238261 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140238279 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140238435 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140238448 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140238525 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 140238554 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 140238605 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140238655 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 140238688 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 140238756 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 140238852 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 140239490 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 140239521 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 140239614 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 140240307 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140240331 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 140240981 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140241776 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140242937 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140243182 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 140243582 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 140244646 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140244726 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140245401 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 140245519 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140245626 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140245765 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140245793 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140245850 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140245977 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140246168 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140246268 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140246481 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140247221 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 140248252 G C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 140248334 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 140248430 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 140248516 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140249192 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140249354 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140249458 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140249853 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 140250881 A C Y N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 140251673 G A N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 3 140251779 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140251824 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140252053 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140252077 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140255404 T C Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 140255768 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140255786 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140255872 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140255879 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 140255999 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140256183 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140256767 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 140256919 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140257583 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 140257623 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 140257638 T A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 140257760 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140257869 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140258189 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140258781 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140259191 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140259264 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140259445 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140259488 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140259897 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140260021 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140260045 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140260057 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140260429 G C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 140260500 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140260619 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 140260742 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140260848 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140260879 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140260977 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 140261567 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 140261599 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140261650 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 140262000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140262005 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140262227 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 140262332 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 140262379 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 140262396 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 140262444 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 140262541 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140262574 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140262619 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140262753 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140262764 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140262828 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140262948 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140263018 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140263075 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 140263134 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140263202 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140263253 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140263380 C G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 140263837 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140263841 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140263857 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140263867 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140264085 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140264240 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140264324 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140264375 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140264411 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140264764 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140264791 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 140264820 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140264893 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140264956 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140264986 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 140265014 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 140265123 T C N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 140265127 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 140265151 G A N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 140265346 G A N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 140265672 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140266635 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140266645 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 140266922 C G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 140268717 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140268807 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 140268832 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 140268878 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 140268943 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140268962 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140268989 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140269128 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140269139 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140269140 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140269218 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140269226 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140269484 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140269495 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140269496 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140269528 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140269581 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140269752 T C N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 140269838 C T N Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 3 140269844 A G N Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 3 140269865 G A N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 140269871 T A N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 3 140269928 T G N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 140269993 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 140270010 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140270056 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 140270065 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140270204 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140270316 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140270322 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140270355 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 140270396 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140270499 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 140270555 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 140270699 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 140270843 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 140270881 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 140270905 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140270974 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 140271073 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 140271077 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140271400 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140271525 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 140271535 C G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 140271642 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140271661 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140271716 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140271891 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 140271910 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 140271930 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 140272229 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140272482 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140272621 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140272713 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140272769 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140272799 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140272800 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140272856 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 140272857 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140273044 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140273062 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140273072 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140273092 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 140273121 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140273205 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 140273239 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 140273243 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 140273256 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 140273268 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 140273285 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 140273297 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140273379 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 140273418 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 140273435 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140273544 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 140273547 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 140273799 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 140273843 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 140274170 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140274195 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 140274210 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 140274276 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 140274311 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140274353 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140274414 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140274458 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140274491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140274504 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140274576 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140274589 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140275314 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140275715 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140275858 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140276567 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 140277637 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140278655 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 140278700 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 140278960 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140279054 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140279119 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 140279160 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140279285 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140279357 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140279367 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140279371 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140279409 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140279434 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140279499 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140279569 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 140279704 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 140279790 G C N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 140279796 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 140279854 T A N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 140279870 A C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 140279935 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 140280018 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 140280084 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140280095 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140280151 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140280184 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140280207 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140280214 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140280295 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140280483 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140280519 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140280533 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140281071 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 140281201 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140281442 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140281612 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140281814 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140281847 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140282117 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140282400 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140283911 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140283929 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140284606 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140285156 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140285190 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140285222 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140285279 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140285342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140285470 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140285545 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140285582 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140285700 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140285703 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140285717 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140285788 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140285802 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140285819 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140285900 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140285948 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 140286004 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140286082 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 140286300 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140286314 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140286347 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140286449 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140286473 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140286492 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140286528 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140286551 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140286571 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140286624 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140286629 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140286647 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140286710 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140286774 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140286776 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140286798 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140286812 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140286827 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140286881 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140286892 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140286908 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140286951 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 140286952 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140287044 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 140287684 G A N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 140287690 C T N Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 140287909 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 140287970 T G N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 140288073 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140288096 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 140288101 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140288183 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 140288221 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140288349 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 140288383 C A N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 140288392 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 140288422 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 140288440 A G N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 140288447 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 140288530 C A N N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 3 140288604 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 140288673 C T N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 140288742 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140288811 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140288831 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140288945 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140288946 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140288975 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140289026 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140289174 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140289371 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140289496 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 140289602 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140289613 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 140289711 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 140289735 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140289818 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140289834 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 140289890 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 140289906 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140290016 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 140290071 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 140290578 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140290633 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 140290697 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 140290788 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 140290957 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140290977 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 140290990 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 140291028 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 140291151 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 140291157 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 140291260 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 3 140291262 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 19 17 1 17 0 3 140291365 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 140291397 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 140291401 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 140291417 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140291646 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140291753 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140291767 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140291781 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140291856 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140291866 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 140291878 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140291934 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 140291956 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 140291999 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140292038 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 140292068 G C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 140292096 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 140292133 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 140292147 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 140292330 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140292361 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140292462 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 140292467 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 140292939 C A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 140292951 G C Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 140292999 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140293007 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140293096 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140293109 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140293173 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140293335 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140293436 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 140293448 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 140293485 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 140293659 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 140293728 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 140293811 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140293859 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140294000 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140294001 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140294070 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140294098 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 140294150 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 140294191 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140294192 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140294213 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140294229 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 140294271 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140294373 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140294450 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140294464 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140294491 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140294538 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140294540 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140294597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140294615 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140294661 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140294715 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140295047 T C N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 140295221 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 140295435 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140295468 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140295479 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140295555 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140295648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140295708 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140295715 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140295808 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140295926 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140295959 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140296474 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140296630 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140296760 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 140297308 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140297340 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140298053 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140298235 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 140298718 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140299219 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140299294 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140299407 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140299479 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140299585 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140299760 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140299839 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140300857 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 140301068 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140301210 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 140301836 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140302396 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140303172 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140303626 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140304234 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140304282 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140304314 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140304320 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140304341 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140304402 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140304669 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140304703 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140304712 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140304724 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140304872 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 140305009 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 140305010 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 140305225 T A Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 140305247 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140305275 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 140305282 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140305329 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140305465 A T Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 140305481 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 140305545 T C Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 140305546 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 140305582 T C Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 140305611 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 140305632 T A Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 140305633 C A Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 140305686 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140305699 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140305712 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140305872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140305981 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140305988 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140306165 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140306261 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 140306293 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140306300 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140306326 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140306393 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140306841 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140306875 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140306954 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140306998 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140307009 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140307023 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140307040 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140307150 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140307524 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140307544 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 140307593 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 140307729 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140307730 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140307796 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140307923 G T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 140308111 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140308158 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 3 140308177 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140308199 G A Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 140308376 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 140308401 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140308486 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 140308583 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140308637 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 140308676 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 140308723 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140308750 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 140308865 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 140309232 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140309818 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140309911 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140310065 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140310106 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140310562 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 140310722 G A Y Y 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 3 140311016 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140311329 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140311696 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140311725 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140311773 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140311817 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140311856 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140312016 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140312030 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 140312087 T C Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 140312093 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 140312167 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140312273 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140312575 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 140312851 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140312852 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140312926 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 140312961 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 140312962 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140313044 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140313141 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140313461 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140313736 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140314051 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140314117 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 140314155 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140314178 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140314240 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140314253 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140314287 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140314321 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140314436 T G Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140314465 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140314586 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140314597 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140314620 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140314637 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140314789 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140314816 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140314863 T G Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 140314938 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140314939 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140315046 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 140315125 A T Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 140315183 G A Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 140315287 T A Y N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 140315321 T A Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 140315352 C A Y N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 140315654 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 3 140315667 C G Y N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 140316341 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140316381 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 140316526 A G Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 140316570 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 3 140316641 T C Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 140316642 G A Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 140316668 G A Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 140316669 G A Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 140316791 G A Y Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 3 140316815 C T Y Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 3 140316844 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 12 6 3 6 0 3 140316980 C T Y Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 3 140316986 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 140317103 A T Y N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 140317429 A G Y Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.75 0 0.25 6 2 3 0 1 3 140317696 G A Y Y 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 3 140317786 C T Y Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 3 140317811 T C Y Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 3 140317830 T C Y Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 140318056 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140318263 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140318282 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140318308 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140318372 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140318508 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140318833 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 140318898 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140318914 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140319012 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140319025 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140319475 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140319606 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140319693 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 140319752 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140319753 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140319816 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140319932 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 140320006 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140320071 T G Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 140320074 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 140320086 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140320211 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140320215 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140320234 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140320239 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140320264 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140320379 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 140320425 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140320483 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140320484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140320511 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140320526 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140320533 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140320571 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140320583 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140320602 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140320668 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140320716 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140320735 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140320800 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140320843 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140320993 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 140321007 C A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 140321013 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 140321069 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140321076 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140321084 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140321133 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140321173 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140321342 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140321377 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140321440 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140321478 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140321720 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140321724 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140321857 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 140321946 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140322017 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 140322043 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 140322422 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140322493 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140322556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140322746 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140322753 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140322828 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140322830 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140322948 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140322988 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140323020 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140323107 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140323108 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140323136 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140323267 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140323270 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140323367 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 140323414 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 140323423 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 140323565 A T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 140323577 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 140323639 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 140323824 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 140323899 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 140323902 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 140323962 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 140324121 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 140324220 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140324265 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 140324299 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 140324367 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 140324534 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140324573 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 140324751 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140324753 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 140324890 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140324915 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140324965 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140324968 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140324996 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140325014 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140325067 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140325081 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140325101 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140325173 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140325177 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140325269 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140325289 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140325329 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140325413 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140325460 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140325626 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 140325738 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140325843 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 140325896 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140325939 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140325958 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140325997 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 140326312 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 140326714 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 140327025 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140327269 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140327455 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140327463 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140327739 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 140327778 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140327811 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 140327838 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140327839 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140327918 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140328019 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140328333 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140328464 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140328563 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140328805 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140329683 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140330009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140330064 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140330378 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 140331127 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140331812 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140332096 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140332168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140332520 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140332589 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140333267 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140333514 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140333516 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140333643 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140334215 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140334366 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140334417 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140334422 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 140334643 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140335424 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140335426 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140335606 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140335652 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140335657 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 140335828 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140335836 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140335862 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140335927 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140335943 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140336166 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140336393 T C Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 140336552 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140336807 T C N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 140336981 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 140337183 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140337362 T G Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 140337794 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140337853 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140337925 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140338031 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140338059 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140338069 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140338210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140339127 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140339442 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140339521 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140340012 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140340478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140340501 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 140340760 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140340937 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140340968 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140341385 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140341456 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140341530 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140341606 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 140341720 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140341838 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140342086 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140342356 T G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 140342672 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140343047 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140343343 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140343413 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140343728 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140343744 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140343802 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140343803 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140343813 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140343821 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140343871 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140343961 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140344098 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140344175 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140344260 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140344277 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140344292 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140344301 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140344305 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 140344467 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140344544 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140344685 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140344761 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140344769 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140344939 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140344998 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140345077 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140345083 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140345127 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 140345194 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 140345356 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 140345696 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140345719 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 140345773 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140346054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140346071 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140346093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140346114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140346133 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140346213 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140346307 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140346317 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140346388 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140346429 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140346616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140346624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140346633 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140346660 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140346690 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 140346691 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 140346780 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 140347344 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140347476 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 140349847 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 140349969 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 140350019 C T N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 3 140350023 G T Y N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 140350240 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 140350327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140350688 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140350716 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 140350906 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140350946 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 140351150 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140351725 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140351732 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140351835 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 140351984 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140352549 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 140352799 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 140352814 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 140353017 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140353060 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140353173 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140353260 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140353274 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140353372 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140353404 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 140353454 A C N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 140353579 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 140353714 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140353754 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140353871 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140353974 A G N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.0714285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 13 15 1 11 2 3 140354022 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140354485 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140354501 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140354607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140354684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140354728 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 140354743 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 140354807 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 140354820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140354833 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140354851 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 140354868 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140355240 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140355803 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140355900 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 140356040 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140356188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140356291 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140356329 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 140356538 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140356562 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140356809 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140356911 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 140357000 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140357149 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140357271 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140357318 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 140357336 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140357353 C G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 140357375 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140357400 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140357467 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140357475 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140357594 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 140357601 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140357627 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140357659 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 140357729 A G Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 140357763 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140357873 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 140357879 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140357946 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140358028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140358104 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140358117 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140358256 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 140358277 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140358283 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 140358292 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140358347 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 140358371 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 140358421 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140358522 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140358709 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 140358765 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 140358769 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140359026 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 140359027 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 140359047 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140359053 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140359408 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140359476 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140359494 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140359598 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 140359666 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140359740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140359762 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140360905 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140361894 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140362193 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140362344 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 140362386 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140362455 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140362466 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 140362866 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140363102 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 140363115 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 140363185 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140363288 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 140363477 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140363520 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140363778 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 140363785 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 140363795 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140363899 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 140363974 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 140364002 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140364029 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140364120 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 140364354 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140364369 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 140364428 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140364443 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 140364466 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140364467 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140364512 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 140365046 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 140365051 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140365270 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140365353 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 140365376 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140365395 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140365412 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140365565 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140365600 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140365665 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140365778 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 140365902 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140365978 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 140365983 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140366017 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 140366094 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140366096 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140366155 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140366164 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140366300 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140366312 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140366342 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140366523 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140366760 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 140366813 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 140367198 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140367372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140367388 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140367488 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140367552 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 140367707 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 140368174 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 140368205 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 140368322 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 140369959 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140370054 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140370171 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140370280 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 140370286 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140370370 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 140370373 C A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 140370464 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140370691 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 140370747 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 140370986 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 140371026 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140371110 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 140371153 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140371204 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140371254 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140371333 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 140371394 A C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 140371406 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 140371473 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 140371596 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140371634 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140371650 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140371675 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140371837 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140371877 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140371943 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140371966 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140372018 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 140372088 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 140372110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140372211 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140372392 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140372485 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140372528 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140372606 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140372918 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140373016 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140373049 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140373087 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140373157 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140373186 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140373225 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 140373392 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140373434 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140373475 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140373590 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 140373594 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140373650 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 140373712 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140374247 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 140374321 T A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 140374779 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140374894 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140374943 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140374957 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140375030 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140375197 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 140375483 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 140375511 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140375564 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140375605 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140375616 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140375706 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140375716 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140375755 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140375817 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140375822 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140375845 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140375879 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140375994 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140376099 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140376100 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140376153 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140376154 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140376164 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140376249 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 140376392 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 140376662 G T N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 140376947 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 140377041 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 140377078 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 140377111 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140377154 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 140377224 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140377332 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140377649 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 140377889 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 140378074 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140378364 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140378611 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 140378874 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 140378883 A G N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 140379364 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140379579 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140379632 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140379779 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140379814 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140380086 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140380232 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140380284 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140380328 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140380355 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140380811 A T N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 140381010 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 140381044 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 140381088 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 140381141 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 140381256 G T N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 140381407 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 140381465 G C N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 140381609 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140381673 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 140382576 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140382581 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140383189 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140383259 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140383291 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140383344 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140383751 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140383777 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140383812 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 140384069 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 140384390 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 140384465 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140384502 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 140384725 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140384969 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140385385 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140385757 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140386002 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140386088 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140386845 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140387559 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140387563 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140388285 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140388468 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140388500 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140388523 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140388589 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140388980 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140389214 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140389282 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 140390299 T C Y Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 3 140394805 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140396149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140396279 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 140396876 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140396983 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 140397860 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 140399586 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140399800 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140402602 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 140402705 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140402838 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140403042 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140403291 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140403527 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140403750 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140403909 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140403970 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140403989 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140404046 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140404170 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140404172 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140404249 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140404468 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140404490 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 140404509 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140404547 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140404582 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 140404760 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 140404809 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140404812 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140404828 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 140404881 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 140405007 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140405109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140405138 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 140405209 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 140405373 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140405643 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140405728 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140405842 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140405916 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140406315 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140406336 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 140406371 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140406832 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140406924 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140407097 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140407398 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140407517 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140407562 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140407806 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140407818 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140407846 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140407948 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140408252 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 140408750 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140409135 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 140409175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140409265 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140409330 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140410303 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140410340 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140411105 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 140411372 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140411444 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140411854 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140412167 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140412379 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140412508 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140412530 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140412550 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140413350 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 140413943 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140413955 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140414151 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140414268 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140415198 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140415312 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140416478 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140417135 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140417180 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140417766 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140417863 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140417943 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140418118 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140418899 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140418949 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140419021 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140419363 T G Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 140419835 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140421144 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140421337 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140421841 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140436982 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140437024 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140437046 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 140437100 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140437146 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140437277 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 140437286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140437688 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140437898 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140438070 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 140438098 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 140438371 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140438409 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140438427 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140438686 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140438709 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140438739 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140439310 C T N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 140439355 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 140439361 C T Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 140439468 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140439619 A C N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 140440000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140440171 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140440466 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140441230 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140441318 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140441723 G C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 140442158 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 140442287 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140442428 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140442806 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140442887 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140442910 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140443397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140443461 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140443776 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140443805 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 140444007 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 140444067 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 140444115 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140444369 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140444442 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140444876 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 140444907 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 140444921 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140445122 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140445484 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 140445517 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 140445595 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 140445663 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 140446981 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 140447140 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140447179 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140447427 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 3 140447714 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 140448296 A T N N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 140448335 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 140448715 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 140449235 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140449437 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140449512 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 140449782 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 140449817 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 140449946 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 140450071 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 140450079 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140450089 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 140450143 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140450582 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 140450597 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140450639 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 140450760 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140450983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140451100 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 140451319 T G N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 140451446 C A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 140451468 C A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 140451965 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140452053 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 140452131 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140452216 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140452298 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140452480 G C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 140452599 A C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 140452622 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 140452689 C T N Y 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 3 140452700 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 140453394 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 140453468 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 140453490 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 140453530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140453536 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 140453676 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 140453920 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 140453989 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140454017 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140454228 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 3 140454645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140454658 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 140454943 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140455248 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 140455485 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140455550 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 140455622 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 140455685 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140455750 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 140455862 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 140455930 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 140456030 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 140456053 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 140456120 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140456169 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 140456301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140456359 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 140456364 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 140456388 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 140456621 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140456633 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 140456793 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 140456806 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 140456922 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140456939 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 140457001 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140457046 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140457090 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140457130 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 140457255 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140457273 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140457324 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140457436 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140457684 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 140457739 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140457801 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140457806 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140457901 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140457912 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140457941 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 140458269 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140458308 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140458411 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140458474 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140458548 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140458579 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140458601 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140458665 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140458746 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140458750 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140458826 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 140458831 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140458943 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 140458955 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140458998 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 140459037 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 140459044 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 140459092 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 140459188 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140459261 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140459276 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 140459331 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140459390 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140459391 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140459513 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 140459526 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 140459637 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140459721 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 140459796 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 140459834 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 140459842 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 140459849 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140460006 A T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 3 140460031 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 140460055 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140460166 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140460299 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140460323 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140460491 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140460525 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 140460527 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 140460600 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140460665 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140460725 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140460739 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140460926 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140460956 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140461013 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140461227 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140461258 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 140461405 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140461411 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140461778 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140462429 C A N N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 15 9 6 3 3 3 140462507 C T N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 15 9 6 3 3 3 140462518 G A N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 140462904 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140462963 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 140462966 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 140463001 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140463511 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 140463609 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 140463611 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140463632 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 140463856 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 140463859 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140463933 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140463937 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140464023 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140464172 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140464228 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140464286 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140464306 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140464402 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 140464472 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140464604 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 140464671 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 140464709 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 140464742 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 140464789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140464857 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140464885 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 140465035 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 140465076 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 140465094 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 140465179 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 140465205 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 140465407 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 140465431 G T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 140465456 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 140465465 T G N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 140465477 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 140465505 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 140465597 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 140465643 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 140466059 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 140466102 C A N N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 3 140466201 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 140466209 A T N N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 3 140466230 C T N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 3 140466256 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 140466501 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 3 140466514 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 140466523 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140466645 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 140466650 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140466731 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140467234 C G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 140467242 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 140467253 G C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 140467389 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 140467610 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 140467651 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 140467666 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 140467814 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 140467871 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140467968 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 140468126 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140468132 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140468251 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140468361 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140468425 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140468435 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140468448 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140468531 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140468840 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140468878 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140468939 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140468984 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140468992 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140469012 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140469223 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 140469343 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140469475 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140469529 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140469604 A C Y N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 140469935 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 140469948 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140469988 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140470115 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140470147 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140470240 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140470295 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140470351 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140470405 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140470410 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 140470436 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140470450 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 140470496 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140470585 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 140470598 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 140470650 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 140470658 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 140470785 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140470794 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140470813 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140470932 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 140471030 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140471114 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140471178 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 140471298 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140471714 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140471970 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140471977 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140472008 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140472031 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140472088 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 140472173 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 140472287 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 140472351 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 140472362 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 140472378 T C N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 140473754 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140474245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140474399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140474575 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 140475129 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 140475144 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140475198 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 140475814 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 140476041 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 140476185 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 140476478 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 140476824 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 140477408 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140477880 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 140478285 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140478401 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140479367 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 140479368 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 140479440 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140479883 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140480370 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 140480424 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140480585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140480586 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140481010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140481011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140482665 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140483757 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140484048 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 3 140484986 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140485079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140487274 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140487286 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140488004 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140488033 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140489715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140490259 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140493621 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140493899 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140495790 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 140495946 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140497419 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 140498805 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 3 140500967 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140501839 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140503688 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140505407 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140506216 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 140506511 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140506747 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140506898 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 140506936 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 140507286 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140507578 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140508484 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140510314 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140510718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140511026 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140511876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140513826 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140514418 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140514862 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 140518128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140518777 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140519297 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140519900 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140520967 T C Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 140522509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140525534 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140526654 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 140527744 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140534676 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 3 140535727 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140538615 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140539014 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140539051 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140539721 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 140542027 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 140542497 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140543426 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140543447 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140543974 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 140544084 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 140544089 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140544484 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140544497 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 140544597 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 140544690 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 140544705 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 140544718 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 140544986 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 140545103 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140545303 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140545477 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140545639 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140545878 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140545898 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140546011 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140546050 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140546138 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140546223 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 140546294 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 140546545 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 140546585 T A N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 140546629 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 140546652 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 140546653 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 140546732 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 140546824 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 140546920 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 140546962 T A N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 140546978 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 140546986 C A N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 140547069 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 140547256 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 140547307 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140547481 T G N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 140547745 C T N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 140547914 T C N Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 6 8 1 4 2 3 140547944 A G N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 140548047 C A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 140548271 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 140548345 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 140548346 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140548552 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140548710 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 140549879 T G Y N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 3 140549895 G A Y Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 3 140549970 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 140550035 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 140550065 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 140550091 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 140550157 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140550450 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140550562 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140551013 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 140551123 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 140551153 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 140551156 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140551244 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140551459 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140551556 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 140552514 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 140552547 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140552584 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140552985 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 140553006 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 140553060 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140553299 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 140553346 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 140553450 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 140553526 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 140553870 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 140553947 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 140554018 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 140554105 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 140554156 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 140554208 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 140554237 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 140554248 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 140554449 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 140554625 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 140554695 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 140554699 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 140554839 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 140555012 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 140556170 G T N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 140556495 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 140556642 T A N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 140556878 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 140557030 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 140557694 T C N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 3 140557902 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 140558059 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 140558102 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 140558864 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 140558944 A C Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 140559159 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 140559195 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140559198 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140559262 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140559354 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140559430 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140559432 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140559471 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140559574 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 140559606 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 140559608 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 140559730 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140559887 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 140560017 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 140560072 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 140560119 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 140560613 T C Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 140560631 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 140560658 T A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 140560726 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 140560884 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 140560913 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 140560915 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 140560958 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 140561143 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 140561207 G A Y Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.454545454545455 0.454545454545455 0.0909090909090909 15 7 5 5 1 3 140562533 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 140562615 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140562635 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 140562671 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 140562805 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 140562806 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140562923 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 140562935 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 140562979 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 140563018 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 140563056 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 140563095 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 140563109 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 140563112 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 140563449 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 140563547 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 140563561 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140563616 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 140563683 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 140563997 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 140564101 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 140564142 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 140564160 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140564172 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 140564341 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140564390 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140564547 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140564739 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140564950 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 140564992 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 140565308 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 140565457 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 140565746 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140566208 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140566263 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140566490 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 140566517 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140567949 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140568016 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140568265 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140568339 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140568397 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140568581 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140568598 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140568607 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140568714 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140568785 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140568903 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140569006 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140569030 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140569078 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 140569200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140569285 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140569343 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140569356 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 140569375 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 140569396 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140569406 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140569458 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 140569476 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 140569506 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140569558 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 140569581 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 140569589 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 140569653 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140569700 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140569729 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 140569849 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 140570161 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 140570192 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 140570196 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 140570303 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 140570319 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 140570378 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140570457 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 140570504 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140570585 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140570693 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 140570724 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 140570742 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140571057 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 140571114 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 140571252 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140571422 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140571471 A G Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 140571489 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 3 140571685 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140571694 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140571720 A G N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 140571741 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 140571777 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140571875 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140571961 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140571987 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140572019 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140572040 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140572081 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140572149 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140572309 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140572396 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 140572414 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 140572424 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140572488 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140572518 A C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 140572589 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 140572644 A T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 140572682 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 140572759 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140572765 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140572771 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140572786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140572796 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140573028 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140573077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140573150 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 140573186 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140573211 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 140573281 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140573361 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140573441 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140573523 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 140573571 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140573806 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140573831 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140573963 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 140574097 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 140574434 G A N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 140574528 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140574584 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140574643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140574795 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 140574806 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140574868 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140574875 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140574952 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140575012 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140575019 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140575072 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140575150 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140575182 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140575189 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140575220 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140575223 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140575237 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140575248 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140575326 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140575356 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140575391 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140575409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140575477 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140575481 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140575494 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140575514 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140575577 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140575618 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140575699 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140575718 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140575727 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140575766 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140575836 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140575837 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140575896 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140575932 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140575977 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 140575982 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 140576024 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140576077 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140576092 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140576114 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140576115 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140576152 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140576155 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140576196 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140576200 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140576219 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140576267 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 140576662 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140576708 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140576739 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140576836 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140576891 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140576957 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140576977 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140577006 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140577022 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140577090 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140577098 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140577117 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140577151 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140577177 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140577400 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140577471 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140577642 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140577643 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140577690 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140577922 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140578004 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140578081 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 140578129 T G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 140578259 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 140578307 T C N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 140578736 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140578964 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140579110 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 140579465 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 140579527 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 140579605 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140579768 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140579769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140579873 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140580244 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140580285 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 140580323 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140580395 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140580522 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140580565 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140580586 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140580829 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140580916 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 140581019 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140581133 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 140581190 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140581479 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 140581515 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 140581864 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140582065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140582114 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 140582252 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140582305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140582663 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140583006 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140583033 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140583510 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140583569 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140583625 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140583660 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140583667 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140583672 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140583692 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140583719 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140583779 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140583829 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140583831 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140583943 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140583949 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140583984 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 140583986 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140584093 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140584124 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140584135 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140584175 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140584176 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140584192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140584219 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140584313 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140584348 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140584368 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140584425 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 140584446 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 140584459 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140584495 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140584579 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140584602 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140584617 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140584652 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140584676 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140584692 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140584706 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140584721 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140584722 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 140584823 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140584835 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 140584880 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140584886 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140584892 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 140585060 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 140585093 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 140585116 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 140585195 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 140585239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140585278 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 140585299 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140585499 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 140585569 A T N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 3 140585787 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 140585814 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 140585940 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 140585960 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 140585961 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 140585987 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140586175 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140586297 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 140586329 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140586384 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 140586473 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140586571 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140586614 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140586624 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 140586628 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140586699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140586739 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140586745 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140586811 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140586869 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140587071 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140587218 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 140587219 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 140587272 G C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 140587348 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 140587356 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140587398 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 140587433 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 140587467 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 140587589 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 140587623 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 140587644 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 140587724 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 140587869 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 140588137 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 140588233 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 140588478 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140588491 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 140588495 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140588591 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 140588601 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 140588607 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 140588627 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 140588689 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 140588754 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 140588797 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140588812 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 140588818 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 140588993 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 140589072 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 140589309 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 140589384 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140589404 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 140589430 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 140589507 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 140589590 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 140589612 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 140590051 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 140590564 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 140590632 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 140590771 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 140590807 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 140590865 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 140590866 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 140590900 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 140590964 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 140591096 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 140591261 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 140591284 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 140591340 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 3 140591361 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 140591487 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 140591493 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 140591511 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 140591590 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140591818 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 140592385 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 140592404 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140592441 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 140592562 G T N N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 140593413 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 140593819 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 140594057 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 140594236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140594244 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 140594799 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 140594816 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 140594826 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 140595264 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 140595333 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140595368 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 140595373 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140595391 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 140595595 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140595662 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 140595692 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 140595777 T A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 140595841 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 140596070 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 140596092 G T N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 140596136 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 140596172 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 140596222 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140596284 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 140596306 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 140596423 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 140596564 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 140596587 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140596610 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 140596802 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 140596827 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 140596900 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 140596912 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 140596928 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 140596976 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 140597003 A C N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 140597031 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 140597151 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 140597184 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 140597453 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 140597472 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 140597520 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 140598086 A G N Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 6 8 1 4 2 3 140598154 C T N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.25 0.0833333333333333 0.666666666666667 7 17 3 1 8 3 140598285 C A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 140598348 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 140598352 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140598389 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 140598428 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 140598448 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 140598467 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 140598496 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 140598538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140598678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140598784 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140598809 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140598818 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140598852 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 140599037 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 140599097 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 140599141 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 140599287 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 140599301 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 140599333 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 140599352 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 140599358 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 140599466 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 140599490 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 140599541 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140599700 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140599747 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 140599759 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140599771 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 140599912 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140600028 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 140600059 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140600317 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140600452 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140600663 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140600883 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 140601000 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 140601102 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 140601199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140601309 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140601376 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140601495 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 140601679 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140601759 T C Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 140601994 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 140602083 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 140602210 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140602315 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140602782 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140602793 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140602853 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 140603586 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140603900 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 140604181 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140604760 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 140605134 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140605152 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 140605519 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140605754 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 140606096 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 140606199 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140606273 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140606330 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140606357 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 140606460 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140606491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140606534 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140606632 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140606745 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140606799 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140606888 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 140606899 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140606911 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140607099 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140607128 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140607144 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140607233 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140607240 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140607662 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140607942 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 140608310 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 140608439 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140608479 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140608858 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140608922 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 140609024 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 140609032 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 140609070 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 140609197 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 140609200 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 140609280 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 140609330 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140610038 T A N N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 140610462 G A N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 140610619 A C N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 140610739 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 140610780 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 140610819 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 140611041 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 140611581 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 140611608 C T Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 140611656 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 140611687 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 140611735 T G N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 140611786 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 140611832 A T N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 140611838 T C Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 140611861 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 140611899 G A Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 140611911 C T Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 140611934 T G Y N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 140611938 G C Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 140612014 G C Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 140612064 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 140612165 C G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 140612205 G C Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 140612259 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140612316 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 140612334 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 140612363 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 140612497 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 140613742 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140613804 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 140614208 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 140614486 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 140614538 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140614558 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 140614620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140614836 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140614959 A T N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 140614977 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 140615122 A G Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 140615178 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 140615330 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140615391 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 140615410 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140615453 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140615608 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140615655 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 140615704 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140615847 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 140616193 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140616242 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140616666 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 140616681 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140616880 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140617031 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 140617338 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 140619825 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 140620181 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140620190 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 140620959 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 140620968 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 140621314 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140621365 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140621838 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140621847 C A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 140621932 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140622057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140622168 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 140622355 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140622413 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140622696 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 140622784 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140622906 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140623047 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 140623150 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 140623181 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140623189 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140623244 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 140623310 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140623448 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140623673 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140623986 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140624033 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 140624227 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140624375 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 140624403 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140624530 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 140624996 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140626221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140626431 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140626500 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140626687 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140626953 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140628445 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140628550 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140629334 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140629501 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140630741 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 140630984 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140631578 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140631654 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140632605 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140633634 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140635942 G A Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 140636321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140636805 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140637027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140637683 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 140638718 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140639527 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 140640169 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140640905 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 140642593 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 140644010 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140644116 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140644511 C A N N 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 140644918 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 140646142 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140646187 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 140647489 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140648624 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 140648729 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140649347 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140651021 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 140651526 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140651643 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140651747 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140651756 G C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 140651763 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 140651778 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 140651833 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 140652116 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140652137 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140652167 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140652453 G C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 140652469 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 140652682 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 140652728 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140653068 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 140653646 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 140653746 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140653920 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140653961 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 140654206 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140654227 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 140654311 G T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 140654376 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 140654415 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 140654437 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 140654463 G T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 140654501 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 140654513 T A N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 140654559 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 140654683 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140654696 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140654703 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140654755 A T Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 140654768 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140654774 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140654855 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140654878 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140654935 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140654945 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140654969 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140654987 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140654991 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140655089 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 140655113 G T N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 3 140655432 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140655578 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140655663 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 140655664 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140655690 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 140655881 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140655919 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140656064 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 140656142 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140656319 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140656335 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140656787 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140656896 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140657302 A T Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 140657467 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140657543 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140657569 T G Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 140657689 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140657690 A C Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 140657957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140658004 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 140658054 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 140658088 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140658122 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 3 140658124 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 140658161 A T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 140658250 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 140658358 C A Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 140658367 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 140658688 G A Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 140658776 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 140658858 T C Y Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 3 140658908 C A Y N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 3 140659182 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 140659202 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 140659447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140659503 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 140660263 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 140660358 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 140660453 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140660458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140660755 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 140660829 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 140660868 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 140660898 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140661031 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 140661087 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140661402 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 140662035 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 140662142 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 140662617 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140662900 C A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 140662971 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 140663176 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140663234 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 140663273 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140663309 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 140663313 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 140663489 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 140663515 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140663867 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140663952 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 140663956 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140664026 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 140664108 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 140664233 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 140664296 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 140664301 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140664334 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 140664406 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140664429 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140664783 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140664788 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140664815 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140664866 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140664904 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140665187 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140665215 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140665284 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 140665447 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 140665562 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 140665685 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140665857 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140665956 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140666320 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140666529 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140666554 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140666601 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140666618 C G Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 140666637 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140666641 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140666654 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140666678 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140666735 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140666774 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140666775 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140666841 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140666886 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140666946 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140666981 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140667143 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140667145 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140667169 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140667288 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140667303 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140667339 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140667422 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140667442 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140667534 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140667619 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140667651 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140667688 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140667694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140667739 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140668029 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 140668077 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140668575 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 140668624 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140668706 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 140668720 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 140668925 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140670520 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140670707 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140671327 C A Y N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 3 140672592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140673035 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 140673897 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 140674717 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140674917 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140676767 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140677230 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 140677358 G T Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 140678127 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140678228 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 140678479 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 140678508 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 140678572 T G Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 140678658 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140678794 T A Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 140679009 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 140679153 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 140679404 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 140679733 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140679813 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 140679980 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140679998 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 140680389 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 140680785 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 140681342 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 140682165 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140682413 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 140682431 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140682470 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140682505 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140682659 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140683279 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140683345 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140683830 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140684752 A G Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 140685841 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 140685913 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 140685981 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 140686185 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 140686208 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 140686227 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 140686461 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 140686464 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140686482 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 140686599 C A N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 3 140686642 G A N Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 3 140686981 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 140686992 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140687019 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 140688233 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 140688421 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140688551 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 140688800 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140689031 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 140689036 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 140689060 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140689537 T G Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 140690004 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 140690087 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 140690363 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140690804 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 140690965 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 140691285 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140691468 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140691633 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140691890 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140691997 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140692023 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 140692050 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140692498 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140693011 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140693170 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 140693210 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 140693980 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 140694034 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 140694161 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 140694225 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 140694435 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140694484 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140694485 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 140694767 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140694778 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140694797 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 140695013 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 140695091 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 140695555 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140695891 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140696318 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 140696329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140696821 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 140696845 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 140697059 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140697172 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 140697214 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 140697420 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 140697446 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140697472 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140697483 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140697670 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140698627 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140698725 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 140698758 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 140701902 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140702614 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140702964 G A Y Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 7 11 2 3 4 3 140703267 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140703271 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 140703352 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 140703399 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 140703856 C G N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 3 140704357 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 140704378 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 140704423 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 140704459 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 140704691 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140704818 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 140704936 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 140705528 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 140705657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140706103 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 140706174 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 140706493 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 140706638 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140706809 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140706818 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140706999 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140707260 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 140707351 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 140707925 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 140708268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140708388 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140708432 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 140708449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140708463 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140708598 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 140708636 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140708674 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 140708699 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 140708709 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 140708818 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 140708822 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 140708950 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 140708982 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 140709099 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 140709322 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140709392 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140709783 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140710051 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140710058 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140710062 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140710149 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140710188 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140710189 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140710285 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140710299 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140710338 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140710506 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140710540 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 140710550 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140710622 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 140711266 T A N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 3 140711402 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140711465 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 140711540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140711806 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 140711863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140711873 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 140711898 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 140712106 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140712110 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140712235 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140712353 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140712372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140712425 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140712459 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140712495 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140712526 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140712594 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140712834 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140712889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140712935 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 140713035 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140713081 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140713133 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140713194 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140713287 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140713296 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140713339 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140713364 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140713398 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 140713493 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140713515 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140713653 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140714139 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 140714141 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140714240 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140714424 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140714632 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140714688 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140714724 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140714769 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140714788 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140714919 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 140715185 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140715236 A C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 140715288 A G N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 140715618 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140715635 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140715759 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140715803 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140722079 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 140722182 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 140722205 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 140722223 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 140722270 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 140722637 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 140722700 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140722773 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140722855 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 140722901 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140723098 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 140723142 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140723145 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140723335 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140723350 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140723376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140723380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140723444 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140723531 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0 0.647058823529412 0.352941176470588 11 23 0 11 6 3 140723560 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140723574 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 140723599 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140723655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140723659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140723699 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140723730 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140723870 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 140724009 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 140724020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140724225 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140724291 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140724418 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140724521 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140724552 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 140724581 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 140724659 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140724685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140724716 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140724777 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140724804 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140724968 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 140724996 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 140725048 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 140725073 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 140725192 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 140725267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140725318 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 140725324 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 140725367 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 140725411 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140725459 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 140725656 C A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 140726068 T G Y N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 140726377 T C Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 140726482 G T Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 140726563 G A Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 140727421 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140727474 C T Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 140727496 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 140727568 C A N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 140727660 T C Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 140727716 A T Y N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 140727732 T A Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 140729044 A G Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 140729158 G T Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 140729176 G T Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 140729194 C A Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 140729851 A T Y N 0.25 ALT 0.9 0.9 0.75 0.25 0.5 0.5 0 3 1 1 1 0 3 140730200 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 140730287 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 140730304 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 140730416 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 140730537 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 140730612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140730658 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 140730672 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140730740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140730817 A T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 140731075 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 140731240 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 140731276 A T Y N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 140731352 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 140731916 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140731949 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140732083 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 140732127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140732150 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140732164 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140732324 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140732327 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140732336 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 140732338 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140732503 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140732940 C A N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.153846153846154 22 4 11 0 2 3 140733387 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 140733499 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 140733728 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 3 140733855 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 140734005 G A N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 3 140734036 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 140734061 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 140734105 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 140734484 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 3 140734847 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 140734956 A G N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 3 140734983 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 140735018 C G N N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 8 12 2 4 4 3 140735225 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140735549 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 140735855 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 140736081 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140736096 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 140736206 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140736235 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 140736527 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 140737807 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 140738419 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 140738469 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 140738600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140739438 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140739506 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 140739549 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 140739693 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 140740020 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 140740055 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 140740083 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 140740244 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 140740423 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 140740478 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 140740526 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 140740541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140740614 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 140740653 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 140740698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140740758 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 140740760 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140740875 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140741192 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 140741275 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 140741301 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 140741370 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 140741382 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 140741389 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 140741541 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140741674 C A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 140741690 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 140741822 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 140741960 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 140742052 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 140742178 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 140742263 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140742272 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 140742546 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 140742609 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 140743526 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 140743638 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 140743827 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 140743901 A T N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 140744159 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 140744347 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140744415 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 140744438 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 140744654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140744693 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140744731 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140745066 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140745095 T A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 140745149 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 140745181 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140745354 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140745577 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140745879 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 140746113 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 140746445 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140746506 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 140747061 C A Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 140747066 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 140747331 C T Y Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 3 140747380 T C Y Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.5 0 0.5 4 4 2 0 2 3 140747606 A T Y N 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.8 0 0.2 8 2 4 0 1 3 140747683 T G N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 3 140747703 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140747797 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 140747911 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140748042 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 140748366 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 140748437 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 140748702 C A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 140749147 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140749222 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140749621 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140750234 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 140750297 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 140750529 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 140751125 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140751287 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 140751833 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 140752504 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 140752563 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140753167 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140753186 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140753220 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 140753284 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 140753309 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 140753394 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 140753415 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140753422 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 140753490 A T N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 140753514 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140753948 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140754843 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140755150 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140755489 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140755560 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 140755605 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140755991 C A Y N 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 140756607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140756655 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140756687 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140756688 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140757123 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 140757151 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 140757217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140757299 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140757418 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 140757450 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140757483 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140757493 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140757494 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140757586 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 140757717 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140757793 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140757831 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140757906 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140757930 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 140758414 A T N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 140758659 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 140759584 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140759752 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140759871 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 140759892 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140760017 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140760023 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 140760032 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 140760200 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140760235 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 140760302 A C N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 3 140760336 C T N Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 8 6 2 4 1 3 140760660 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 140760683 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 140760691 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 140760733 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 140760909 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 140761017 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 140761062 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 140761120 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140761151 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 140761207 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 140761260 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 140761401 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 140761517 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 140761633 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 140761687 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 140761697 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 140761846 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 140761860 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.0625 0.5625 0.375 11 21 1 9 6 3 140761895 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 140761908 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 140761959 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 140761998 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 140761999 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 140762221 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 140762279 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 140762445 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 140762474 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 3 140762484 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 140762530 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 140762635 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 140762765 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140762790 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 140762830 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140762856 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140762869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140762942 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140762973 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140763290 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140763362 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140763378 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140763494 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 140763559 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 140764261 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 140764489 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 140764520 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140764544 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 140764586 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 140764687 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 140764809 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140765030 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140765095 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140765135 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140765345 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 140765638 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 140765661 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 140765710 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 140765894 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140765945 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 140766479 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140766593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140766662 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140766702 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140766769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140766803 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140767011 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 140767122 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 12 6 3 6 0 3 140767150 A G N Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 3 140767579 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 140767638 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 140767716 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 140767948 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 140768083 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 140768278 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140768291 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 140768337 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 140768510 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 140768523 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140768556 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 140768621 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140768922 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 140769245 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140769343 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 140769806 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 140769808 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140769962 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 140770345 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 140770775 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 140770935 T G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 140771105 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 140771106 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 140771689 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 140771837 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 140772047 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 140772177 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 140772178 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 140772298 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 140772426 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140772428 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 140772510 A C Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 140772710 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 140772740 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 140772746 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 140773025 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 140773191 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140773228 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 140773266 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 140773299 A C N N 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 7 9 0 7 1 3 140773342 A G Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 140773419 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140773420 C G Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 140773442 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140773673 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140774011 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140774278 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 140774881 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 140775477 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140775991 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 140776408 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 140776646 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 140776867 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140777153 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 140777369 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 140777457 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 140777517 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140777518 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140777828 G C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 140777907 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 140778228 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140778403 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 140778438 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 140778708 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140778789 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 140778842 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140778973 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140779166 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140779407 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 140779556 C T N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.25 17 7 8 1 3 3 140779753 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 15 21 0 15 3 3 140780233 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140780344 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140780876 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 140781368 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 140781737 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 140781790 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 140781954 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 140781994 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 140782052 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 140782065 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 140782113 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 140782334 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 140782410 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140782444 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140782632 C T N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 140782645 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 140782737 A G N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 140782817 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 140782979 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 140783194 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 140783396 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 140783467 G C N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 140783486 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 140783544 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 140783646 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 140783662 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 140783669 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 140783699 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 140783714 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 140783728 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 140783792 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 140783903 G A N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.363636363636364 0.181818181818182 0.454545454545455 10 12 4 2 5 3 140784000 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 140784276 A T N N 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 3 140784389 T G N N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 3 140784426 T A N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 140784491 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140784568 G T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 140784644 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 140784675 G T Y N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 140784680 G A Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 140784695 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 140784706 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 140784826 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 140784872 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 140784873 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 140784895 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 12 6 3 6 0 3 140784937 A T N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 3 140785000 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 140785064 C T N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 140785065 A G N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 140785155 T A N N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.363636363636364 0.545454545454545 0.0909090909090909 14 8 4 6 1 3 140785261 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 140785289 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 140785324 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140785346 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 140785366 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 140785409 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 140785532 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 140785680 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140785704 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140785749 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 140785838 A T N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 140785878 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140786175 A T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 140786202 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 140786346 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 140786553 T A Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 140786644 T A N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 3 140786679 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140787200 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140787370 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 140787386 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140787434 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140787571 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140787670 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 140788040 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 140788814 T G N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 3 140789933 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 140790196 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 140790267 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140790362 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140790399 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140790433 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 140790450 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 140790570 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140790585 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 140790663 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 140790786 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 140790800 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 140790837 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 140790842 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 140790915 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 140791399 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 140792092 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 140792163 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 140792164 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 140792185 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 140792198 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 140792321 G C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 140792411 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 140792575 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 140792637 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 140792745 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 140792810 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 140792950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140792970 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140793004 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140793048 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 140793156 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 140793261 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 140793266 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 140793356 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 140793400 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140793460 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 140793494 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 140793563 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 140793583 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140793691 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 140793926 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 140793951 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 140794009 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140794341 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 140794382 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 140794428 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 140794469 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 140794952 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 140794969 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 140795036 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 140795115 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 140795190 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140795405 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 140795509 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 140795557 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 140795644 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140795856 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 140795933 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 140796134 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140797588 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140797935 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 140798067 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140798089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140798116 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 140798129 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 140798140 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 140798339 G A Y Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 140798617 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 140798655 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140798770 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 140798932 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 140799004 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 140799089 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 140799182 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 140799212 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 140799304 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140799561 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 140799611 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140799646 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140800510 C A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 140800535 A G N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 140800573 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 140801233 G A Y Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 3 140801353 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 140801506 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140802067 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140802162 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140802360 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 140802401 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140802571 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140802767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140802846 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140803186 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 140803247 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140803331 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 140803339 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140803509 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140804081 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140804096 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140804179 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140804488 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 140804771 A T Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 140804851 C T Y Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 3 140805065 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 140805272 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 140805719 A C Y N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 3 140805720 A C Y N 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 3 140805832 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 140805871 C G Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 140805877 T A Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 140805914 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140805932 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 140806040 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140806120 C A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 140806227 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 140806443 A C Y N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 3 140806608 A G Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 140806816 A C Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140806951 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 140806976 A T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140807092 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140807261 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140807436 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 140807483 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140807769 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140807817 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140807842 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140808122 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 140808251 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 140808482 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140808630 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140808656 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140808773 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140808775 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140808949 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140809246 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140809407 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 140809856 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 140810134 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140810229 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 140810247 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140810283 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 140810338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140810486 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140810544 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140810554 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 140810609 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 140810650 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 140810672 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 140810700 C A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 140810702 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 140817990 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 140817992 A T N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 3 140818008 A C N N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 3 140818179 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140818345 G C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 140818365 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140818416 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 140818426 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 140818438 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 140818459 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 140818673 C A N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 140818698 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 140818802 C T N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 140819085 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 140819141 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 140819374 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140819658 T A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 140819709 C G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 140819775 G A N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 140819812 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 140819980 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 140820044 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 140820093 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 140820688 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140820778 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 140820795 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 140820809 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140820865 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 140820877 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 140820954 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 140820965 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 140821028 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 140821125 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140821156 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 140821219 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 140821245 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 140821291 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140821581 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 140821623 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 140821718 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 140821758 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 140821789 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140821805 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 140821988 T A N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 3 140822118 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 140822130 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140822142 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 140822159 A C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 140822397 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 140822430 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 140822607 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 140822664 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 140822755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140822797 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140822840 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 140822904 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 140822948 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 140822987 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 140823079 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 140823145 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140823198 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 140823258 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 140823316 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 140823644 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 140823691 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140823759 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 140823949 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 140824092 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140824156 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140824212 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140824238 A C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 140824346 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 140824471 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140824566 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140824633 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140824813 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140824964 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 140825408 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140825657 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 140825900 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140826092 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140826128 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140826146 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 140826494 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140826495 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140826560 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 140826641 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 140826642 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 140826796 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140826805 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140826875 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140826890 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140827038 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140827169 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 140827352 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140827680 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140827877 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 140827939 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140827950 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140828236 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140828263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140828321 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140828539 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140828692 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 140828714 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 140828744 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 140828813 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 140828848 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 140829345 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 140829388 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 140829530 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 140829911 A G Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 140830284 C A Y N 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 3 140830837 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 140830894 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 140831039 A T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 140831367 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 140831474 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 140831517 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 140831665 T A N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 3 140831888 G C Y N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 3 140831962 C T Y Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.363636363636364 0.545454545454545 0.0909090909090909 14 8 4 6 1 3 140831980 C T Y Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.363636363636364 0.545454545454545 0.0909090909090909 14 8 4 6 1 3 140832029 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 140832087 G T N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 140832189 G A Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 140832210 G C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 140832270 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 140832273 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 140832302 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 140832416 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 140832547 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 140832605 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 140832651 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 140832819 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 140832909 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 140832914 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 140833068 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 140833069 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 140833199 C A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 140833237 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 140834245 A T N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 140834651 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140834720 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 140834759 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 140834846 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 140835134 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 140835278 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 140835609 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 140835777 A T Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 140835813 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140835872 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140836020 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 140836190 A C Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 140836778 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 140836799 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140836850 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140836925 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140837529 T C N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 140837567 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 140838001 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140838092 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 140838323 T C Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 3 140838647 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 140838717 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 140839310 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 140839408 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140839756 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 140839879 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 140839929 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 140840449 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140840462 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140840635 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140841028 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140841044 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140841136 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 140841273 C T N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 140841318 G T N N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 3 140841401 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 140841660 G T N N 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 140841703 A G N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 17 3 8 1 1 3 140841779 T G N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 140841907 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140841995 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 140842011 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140842143 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140842158 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140842160 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140842185 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140842244 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140842528 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 140842544 A T N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 140842551 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 140842676 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 140842745 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 140843015 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 140843032 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 140843284 C T N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 3 140843485 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 140844360 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 140844457 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 140844520 G T N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 140844524 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 140844635 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 140844664 G A N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.181818181818182 0 0.818181818181818 4 18 2 0 9 3 140844761 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140844779 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 140844854 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 140844880 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 140845084 C A N N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 3 140845244 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 140845270 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 140845322 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 140845339 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 140845472 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 140845581 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140845691 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 140845746 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140845850 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140845869 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140845874 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140845907 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140845933 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140846131 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140846245 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 140846272 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 140846313 G C N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 140846386 T C N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 3 140846776 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140846777 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140846794 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140846843 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140846962 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140847083 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 140847122 C A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 140847162 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 140847446 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140847470 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 140847558 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140847572 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140847605 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140847800 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 140847870 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 140847871 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 140848161 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 140848191 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140848214 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140848672 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 140848732 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140848770 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 140848810 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140848921 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140848962 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140848976 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 140849058 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140849071 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140849107 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140849204 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140849255 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 140849387 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140849423 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140849428 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140849437 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140849458 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140849526 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140849534 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 140849561 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 140849669 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 140849715 T G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 140849853 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 140849866 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140849940 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140849984 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140850127 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140850199 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 140850210 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 140850424 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140850449 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140850486 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140850500 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140850690 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140850698 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 140850789 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140850828 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140850887 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140851063 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140851146 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 140851313 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 140851337 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140851403 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 140851911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140851997 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140852077 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140852093 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140852124 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140852199 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140852250 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 140852305 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 140852333 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 140852380 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140852390 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140852405 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140852454 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140852455 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140852724 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140852828 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140852829 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140852908 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 140853120 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 140853142 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140853376 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140853399 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 140853638 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140853679 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140853698 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140853731 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 140853864 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140853878 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140854068 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140854121 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140854331 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 140854461 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140854466 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140854513 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140854671 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140854706 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140855238 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 140855443 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 140855452 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 140855465 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 140855489 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 140855550 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 140855555 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140855564 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140855697 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140855735 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140855901 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140855928 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140855985 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 140856078 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 140856144 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140856192 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 140856622 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 140856895 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 140856949 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140857076 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 140857077 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 140857123 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 140857134 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 140857904 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 140857908 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140857982 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140858029 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140858261 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140858526 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 140859160 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140859631 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 140859960 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 140861427 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140861679 A C Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 140862603 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 140862762 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 140862819 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 140864144 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140864166 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 140864182 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140864495 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140864592 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 140864839 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 140865163 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140865282 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140865383 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140865421 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140865525 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 140865692 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140865743 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 140865757 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140865775 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 140865822 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 140865932 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140865983 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140866092 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 140866295 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 140866364 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 140866435 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 140866528 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 140866710 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140866769 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 140866816 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 140866903 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 140866909 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 140867068 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 140867139 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 140867146 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 140867195 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 140867202 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 140867425 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 140867491 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 140867589 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 140867682 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 140867818 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 140868491 A T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 140868509 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 140868594 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 140868633 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 140868839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140868870 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 140869057 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 140869065 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 140869207 A T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 140869549 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140869669 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 140870050 T C N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 140870301 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 3 140870450 G A N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 3 140870515 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 140870769 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 140871505 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 140871704 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140872650 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 11 7 3 5 1 3 140874008 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140875045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140875189 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140875259 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140875491 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 140875668 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140875691 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140875702 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 140875742 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140875803 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140875886 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140875940 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140875947 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140875985 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 140876097 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140876105 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140876108 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140876286 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140876324 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 140876407 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 140877136 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 140877654 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140880106 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 140881188 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140882422 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 140883380 T C N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 140883387 T C N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 140883797 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 140883798 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140883976 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140884174 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140884254 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140884652 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 140885247 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140885303 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140885707 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 140885766 A T N N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 3 140885801 T G N N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 3 140885857 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 6 8 2 2 3 3 140885870 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 6 8 2 2 3 3 140885927 G T N N 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 5 5 1 3 1 3 140886093 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 140886372 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140886410 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 140886429 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 140886545 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 140886552 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140886919 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 140887101 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 140887128 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140887234 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 140887300 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 140887559 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 140887629 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 140887665 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 140887677 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 140887759 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 140887769 G T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 140887773 T G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 140887936 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 140888089 G C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 140888143 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 140888208 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 140888359 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 140888469 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 140888574 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 140888674 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 140888901 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 140888904 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140889005 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140889039 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140889123 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 140889215 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140889564 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 140890478 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 140890487 C A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 140890679 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140890705 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140890721 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 140890722 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 140890770 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 140890782 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 140890785 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140891069 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 140891080 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 140891107 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140891208 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140891651 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 140891775 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140891846 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 140891941 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 140891990 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 140892118 A T N N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 8 12 3 2 5 3 140892453 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 140892496 C A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 140892773 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 140892788 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 140892866 G C N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 140893129 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 140893147 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 140893164 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 140893174 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 140893268 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140893273 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 140893303 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 140893307 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 140893337 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 140893385 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140893402 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140893440 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 140893537 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140893665 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 140893666 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 140893836 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140894212 A T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 140894619 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 140894701 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 3 140894891 C T Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 140894908 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 140894916 A G N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 8 12 3 2 5 3 140894983 C T Y Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.181818181818182 17 5 8 1 2 3 140897169 T A Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 140898674 G A Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 140898700 A C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 140898753 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 140899177 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 140899202 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 140899226 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 140899408 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 140899501 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140899609 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 140899640 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140899687 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140899756 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 140899847 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 140899899 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 140900012 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 140900178 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 140900186 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 140900633 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 140900943 G T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 140901150 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 140901304 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 140901316 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 140901432 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 140902159 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 140902205 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 140902690 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140902893 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 140902907 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 140902992 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140903013 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 140903019 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 140903056 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 140903114 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 140903174 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 140903175 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 140903217 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 140903489 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 140903647 T G N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 140903709 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 140903710 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 140903732 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 140903762 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 140903765 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 140903808 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 140903898 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 140903941 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 140904196 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 140904533 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140904563 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 140904650 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 140904712 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 140904725 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 140905071 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140905182 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 140905217 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 140905273 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 140905309 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140905480 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 140905574 A C Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 140905831 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 140905999 G C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 140906135 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 140906221 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 140906347 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 140906428 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 140906691 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 140906748 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 140906837 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 140906982 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 140907052 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 140907064 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 140907377 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 140907557 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140907849 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140907878 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 140908053 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140908249 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 140908250 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140908456 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140908945 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 140908993 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 140909027 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140909121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140909183 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 140909219 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 140909321 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 140909390 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 140909711 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 140909841 T C Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 140909870 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 140909944 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 140910074 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 140910192 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 140910231 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 140910307 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140910328 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 140910362 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 140910397 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 140910409 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 140910438 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140910510 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140910560 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 140910574 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 140910645 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140910663 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 140910671 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 140910761 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140910776 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 140910797 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140910831 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 140910855 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 140910883 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 140910900 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 140910908 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 140910918 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 140910940 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140910980 A G Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 140911018 C A Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 140911031 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 140911049 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140911166 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 140911179 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140911195 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140911245 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140911248 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140911304 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 140911393 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 140911412 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140911436 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140911460 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 140911499 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 140911528 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 140911637 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 140911640 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 140911994 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 140912060 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140912195 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 140912244 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 140912245 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 140912291 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140912469 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140912538 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140912675 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 140912791 G T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 140913114 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 140913156 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140913194 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 140913225 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140913256 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 140913279 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140913335 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140913454 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 140913524 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140913702 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 140913767 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 140913896 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 140913932 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 140914002 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 140914096 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 140914233 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 140914767 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 140914963 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 140914980 C A Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 140915007 G T Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 140915047 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 140915062 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 140915264 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140915278 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 140915281 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 140915306 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140915443 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 140915484 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140915510 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 140915567 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 140915649 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140915740 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140916244 T C N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 3 140916301 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 140916499 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 140916574 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 140916617 T A Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 140916681 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140916698 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 140916838 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 140916905 A C Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 140917174 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 140917303 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 3 140919463 A T N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 140919470 G T N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 140919477 T A N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.142857142857143 0.357142857142857 0.5 9 19 2 5 7 3 140919675 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 140919845 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 140919906 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 140920072 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 140920099 T A N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 140920114 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 140920121 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 140920132 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 140920151 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 140920174 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 140920199 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 140920208 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 140920212 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 140920241 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 140920394 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140920483 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 140920536 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 140920628 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 140920710 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 140920754 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 140921003 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 140921993 A T N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 140922341 T C N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 3 140922410 G A N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 140922446 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 140922548 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 140922568 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 140922578 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 140922629 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 140922739 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140922790 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 140922806 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 140922897 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 140922928 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 140923197 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 140923391 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 140923624 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 140923751 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 140923910 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140923964 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 140923978 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 140924110 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 140924300 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 140924303 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 140924403 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 140924462 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 140924499 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 140924552 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 140924858 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140924898 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140924907 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 140924982 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 140925004 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 140925035 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 140925152 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 140925159 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 140925171 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 140925202 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 140925440 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 140925599 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 140925719 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 140926032 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 140926033 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 140926102 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 140926108 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 140926126 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 140926136 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 140926162 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 140926180 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140926256 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 140926268 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 140926337 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 140926402 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 140926428 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 140926439 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 140926676 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 140926702 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 140926810 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 140927105 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140927110 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 140927154 C A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 140927206 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 140927279 C T N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 3 140927286 T A N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 3 140927551 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 140927633 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 140927684 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 140927812 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 140927825 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 140927851 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 140927878 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 140927909 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 140928026 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 140928383 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140928441 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140928471 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 140928482 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 140928538 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140928602 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 140928665 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 140928685 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 140928710 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 140928732 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 140928738 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 140928747 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 140928756 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 140928758 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 140928890 C T N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 140929060 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 140929084 T G N N 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.545454545454545 0.272727272727273 0.181818181818182 15 7 6 3 2 3 140929155 A G Y Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 3 140929160 T G N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 140929238 C A N N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 3 140929261 G T N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 3 140929419 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 140929433 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 140929435 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 140929496 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 140929537 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 140929544 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 140930108 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 140930402 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 140930408 C A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 140930433 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 140930451 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 140930638 T G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 140930724 G C N N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 140931045 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 140931060 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 140931196 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 140931969 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140932012 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 140932211 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 140932291 T A N N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.625 0.125 0.25 11 5 5 1 2 3 140932680 C A Y N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 3 140932833 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 140932879 G A Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 140932890 A G Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 140933028 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.4375 0.1875 0.375 17 15 7 3 6 3 140933033 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140933368 T C Y Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 3 140936364 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 140936483 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 140936488 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 140936827 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 140936832 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 140936846 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 140936876 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 140936878 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 140936943 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 140936998 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 140937018 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140937054 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 140937123 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 140937240 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 140937323 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140937416 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 140937473 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 140937480 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 140937543 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 140938078 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 140938169 A T N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 140938183 T C N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 0.153846153846154 0.153846153846154 20 6 9 2 2 3 140938203 T G N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 0.153846153846154 0.153846153846154 20 6 9 2 2 3 140938217 G T N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 0.153846153846154 0.153846153846154 20 6 9 2 2 3 140938231 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 140938300 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 140938301 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 140938320 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 140938437 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 140938443 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 140938490 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 140938498 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 140938516 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 140938555 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 140938573 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 140938629 A G Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 140938652 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 140938705 T C Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 140938741 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 140938758 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 140938771 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 140938783 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 140938785 C G N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 140938810 C A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 140938822 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 140938835 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 140938868 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 140938904 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 140938943 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 140938990 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 140939030 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 140939037 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 140939086 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 140939095 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 140939099 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140939115 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 140939133 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 140939134 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 140939145 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 140939224 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 140939463 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 140939464 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 140939501 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 140939535 T G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 140939602 G T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 140939647 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 140939662 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 140939708 G A N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 140939820 C G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 140939857 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 140939875 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 140939887 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 140939902 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140939964 G C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 140939973 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 140939982 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140939987 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 140939998 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 140940027 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 140940029 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 140940114 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 140940146 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 140940166 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 140940194 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 140940237 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 140940242 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 140940262 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 140940369 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 140940384 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 140940428 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140940444 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140940582 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 140940679 C G N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 140940745 T A N N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 6 12 2 2 5 3 140940765 T A N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 140940927 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 140941045 C G N N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.333333333333333 0.416666666666667 0.25 13 11 4 5 3 3 140941123 A T N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 8 16 2 4 6 3 140941166 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 140941178 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 140941193 C T Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 140941272 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 140941304 A G Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 140941317 A T Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 140941484 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 140941501 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 140941526 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 140941657 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 140941804 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 140942121 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140942178 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 140942410 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 140942514 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140942613 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 140943499 T G Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 140943513 A T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 140943894 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 140943990 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 140944035 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 140944067 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 140944168 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 140944247 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 140944312 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140944356 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 140944416 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 140944543 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 140944604 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 140944611 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 140944712 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 140945041 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140945134 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 140945256 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 140945259 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 140945386 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 140945453 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 140945463 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 140945518 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 140945541 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140945589 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 140945629 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 140946010 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 140946060 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 140946180 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 140946284 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140946362 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 140946479 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 140946582 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140946832 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140947126 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 140947273 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140947673 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140947804 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 140948393 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140948987 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140949392 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 140949670 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 140949685 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140949743 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 140949791 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 140950327 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 140950511 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 140950536 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140951079 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 140951130 C G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 140951417 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140954146 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140954468 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 140956126 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 140956479 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 140959143 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 140959819 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 140959994 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140960917 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 140960983 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140961145 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140961388 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140961472 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140961520 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 140961522 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140964068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140967133 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140967486 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 140967507 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 140967703 A C N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 140967776 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 140969021 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140969912 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140969928 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140969995 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 140970016 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 140970098 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 140970189 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 140970362 C A Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 140971099 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140972408 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 140972612 T C Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 140973172 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140973211 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140973434 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140974060 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140974510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140974636 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140975292 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140976228 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 140976267 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 140976355 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 140976764 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 140976901 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 140976933 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 140976959 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140977388 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 140977553 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 140977606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140978574 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 140979008 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140979748 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140981685 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 140982221 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 140984561 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140984578 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 140985131 G A N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 3 140985477 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 140986113 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 140986328 T A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 140987139 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 140987927 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 140988103 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 140988111 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 140988282 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 140988311 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 140988600 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 140988631 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 140988780 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 140988842 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140988886 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140989075 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 140989223 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 140989308 G A N Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 8 6 2 4 1 3 140989402 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 3 140989657 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 140990477 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 140990622 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 140990779 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 140991268 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 140991654 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 140991696 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 140991769 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 140991783 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 140992233 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 140992321 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 140992532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140992786 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 140992879 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 140993791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140994887 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140995177 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 140995373 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 140995508 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 140995655 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140995697 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140995698 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140995732 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140996014 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 140996199 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 140996473 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 140996531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140996600 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140996703 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140996746 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140996962 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140996977 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140997225 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 140997252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140997432 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 140997491 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 140997589 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 140997709 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 140997996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140998005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140998291 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 140998499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140998697 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 140998727 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 140998728 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 140998891 T G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 140998904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140998932 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 140999118 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 140999131 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 140999144 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 140999343 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 140999482 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 140999771 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 140999809 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 141000016 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 141000069 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141000374 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141001261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141002655 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141003385 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141004009 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141004702 C G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 141004714 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 141004726 C G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 141005044 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 141005083 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 141005201 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 141005234 T A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 141005942 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 141005997 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141006017 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141006030 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 141006322 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 141006375 T A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 141006532 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 141006615 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141006855 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 141007268 G T Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 141007509 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 141007519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141007624 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 141007629 C G Y N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 3 141007722 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 141007766 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 141007883 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 141008078 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 141008103 A G Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 141008156 C A Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 141008279 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 141008331 C T Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 141008338 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 141008375 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 141008393 T C Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 141008640 G A Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 3 141008885 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 141009009 G A Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.5 0.1875 0.3125 19 13 8 3 5 3 141009014 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 141009161 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 141009169 A G N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 3 141009206 G A Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 3 141009222 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 141009418 A G Y Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 11 7 4 3 2 3 141009777 G A Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.533333333333333 0.2 0.266666666666667 19 11 8 3 4 3 141009854 G A Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.533333333333333 0.2 0.266666666666667 19 11 8 3 4 3 141010006 C G Y N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 3 141010018 C T Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 141010043 T G Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 141011067 A C Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 141011180 A G Y Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 3 141011193 A G Y Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 3 141011314 C A Y N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 3 141011476 G A Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 3 141011480 T A Y N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 3 141011493 A G Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 3 141011673 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 141011751 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 141011893 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 141011906 C A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 141012067 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141012068 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141012202 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141012257 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 141012295 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141012591 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 141012660 T C Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 141012687 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 141012706 G T N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 141012917 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 141012928 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 141013087 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 141013146 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141013277 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 141013321 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 141013613 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141013625 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 141013686 T G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 141013700 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141013729 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 141013803 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 141013848 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 141013880 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 141013923 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 141013956 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 141014130 A C N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 141014141 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 141014287 T C Y Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 141014526 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 141016559 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 141016650 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141017043 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141017806 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 141020280 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 141020685 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141021298 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141021520 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141021595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141022408 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 141022439 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141022465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141023645 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 141025343 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141026027 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141026739 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 141027330 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141027727 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 141028396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141028774 G T N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 141028876 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 141028940 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141030036 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 141031150 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141031650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141032763 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141032804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141033199 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 141033601 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 141033905 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141034557 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 141034623 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 141034655 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 141034659 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 141034683 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 141035269 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 141035865 T A Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 141036103 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 141036574 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 141036862 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141036892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141039296 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141040969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141048147 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 141048305 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141048603 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 141049217 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 141049275 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141049420 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 141050243 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141051779 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141051987 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 141052726 A C N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 3 141052853 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 141052883 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141052924 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 141052962 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141053011 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 141053200 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 141053202 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 141053221 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 141053629 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141053733 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 141053972 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 141054257 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 141054572 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 141054766 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141055475 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 141055486 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 141055512 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141055752 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141055828 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141055994 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 141056323 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 141056420 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 141056490 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141056608 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141056660 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 141056811 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141057534 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 141057597 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 141057924 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 141057960 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 141058104 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141058191 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 141058854 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141059051 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 141059163 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141059195 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 141059221 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 141059601 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 141059690 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 141060294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141060313 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141060369 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 141060463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141060466 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141060476 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141060905 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141060930 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141061075 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141061231 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141061304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141061468 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 141061540 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141061937 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141061981 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 141062093 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 141062111 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 141062217 A T N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 3 141062236 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 141062291 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 141062300 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141062342 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 141062641 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 141062644 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 141062676 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 141062714 T C Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 141062779 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 141062841 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 141063035 A T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 141063073 C G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 141063130 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 141063154 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141063171 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 141063287 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 141063312 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 141063485 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 141063533 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 141063658 A T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 141063671 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 141063768 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 141063938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141064012 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 141064405 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 141064479 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 141064536 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 141064893 T A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 141064998 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 141065003 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 141065077 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 141065102 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 141065320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141065348 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 141065353 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 141065407 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 141065420 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 141065619 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 141065776 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 141065788 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 141065790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141065810 A T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 141065866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141065946 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 141065956 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 141066073 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 141066670 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141066699 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 141066751 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 141066755 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 141067177 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 141067234 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 141067465 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 141067793 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 141067868 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 141067869 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 141067918 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 141068032 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 141068213 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 3 141068246 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 141068295 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 141068331 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 141068506 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 141068589 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 141068643 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 141068703 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141068830 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 141068928 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141068932 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141069156 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141069399 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 141069406 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141069528 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141069573 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141069676 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 141069707 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141069708 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141069726 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141069834 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 141069909 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 141069975 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 141070205 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 141070252 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 141070351 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 141070927 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 141071326 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 141071726 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 141071734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141072855 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141073072 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 141074220 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 141076252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141076253 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 141076394 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141076484 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 141076512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141078327 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 141078942 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141079326 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 141079516 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141079974 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141081013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141081140 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 141081281 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141082968 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 141083687 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141083727 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141084116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141084405 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141084675 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 141084896 G T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 141084951 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141085669 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 141085983 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 141086135 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141087895 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141088038 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141088204 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141089126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141090200 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141090512 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 141090915 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141091398 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 141092178 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 141093776 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141094202 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 141094355 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 141096734 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 141099229 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141099240 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141099329 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 141099357 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141099433 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141099595 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141099656 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141099729 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141099874 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141100453 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 141100472 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 141100960 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141101105 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141101126 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 141101443 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141101471 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 141101553 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141101708 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 141101961 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 141102092 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141102094 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 141104124 T G N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 141105094 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 141105107 C A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 141105149 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 141106156 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141106597 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141106927 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 141107268 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141107367 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 141107884 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 141108705 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141109752 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141109925 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141110091 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141110711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141110888 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141111006 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 141111013 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 141112180 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 141112381 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 141113366 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 141116759 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 141117088 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 141117524 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141118765 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 141119443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141119455 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141119497 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141120299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141121239 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 141121693 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141122569 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141122667 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141122765 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 141122836 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 141124320 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141124739 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 141125154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141128983 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141129609 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 141131120 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 141131462 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141132825 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141133091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141133305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141133370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141133795 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141135002 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141135961 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 141136181 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141136266 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141136359 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141136508 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141136555 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141136611 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 141136631 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 141136632 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141137368 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 141137639 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 141137788 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 141137856 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141137983 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141138000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141138025 C A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 141138073 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141138110 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141138162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141138242 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 141138256 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 141138584 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 141138598 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 141138698 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 141139156 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 141139511 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 141139618 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 141139798 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 141139874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141139890 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 141139901 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 141139993 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141140014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141140048 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 141140067 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 141140263 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 141140379 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 141140552 C G Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 141140809 G T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 141140828 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141140885 T G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 141140887 T C Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 141141081 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 141141227 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 141141253 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 141141361 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 141141555 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 141141664 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 141141684 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 141141750 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141141817 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 141141915 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 141142114 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 141142170 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141142269 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 141142413 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 141142428 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 141142480 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 141142529 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 141142546 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 141142625 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 141142687 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141142781 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 141142884 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 141142897 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141142956 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141143082 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 141143086 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 141143206 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141143213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141143256 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 141143271 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141143413 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 141143485 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141143498 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 141143664 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141143875 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141144133 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141144807 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 141144828 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 141145061 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 141145067 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 141145157 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 141145288 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 141145425 C A Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 141145811 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141145930 A T Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 141147291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141147974 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141148606 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141148637 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 141148651 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 141148783 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141148821 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 141148847 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 141148879 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 141148903 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 141149065 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 141149088 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 141149114 T G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 141149185 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 141149256 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 141149377 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 141149385 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 141149397 T G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 141149426 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 141149429 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141149502 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141149564 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 141149671 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 141149685 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 141149910 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 141150031 C A Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 141150808 A C Y N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 141150830 T G Y N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 141151187 T A Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 141151726 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141151739 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 141151774 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141151792 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141151923 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 141152053 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 141152136 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 141152391 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 141152655 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141152704 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 141152755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141152779 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141152815 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141152918 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141152935 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141153603 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 141153683 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 141153708 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 141153828 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141153889 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 141153893 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 141153917 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 141153921 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 141153955 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 141153970 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 0.916666666666667 2 22 1 0 11 3 141154093 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 141154317 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 141154407 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 141154409 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141154569 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141154725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141154994 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 141155146 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141155371 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 141155884 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 141156573 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 141156592 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141156593 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141157399 C G N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 141157436 T C N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 3 141157440 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 141157494 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 3 141158018 G A N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.25 0.583333333333333 0.166666666666667 13 11 3 7 2 3 141158428 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141158489 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141158519 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 141158549 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 141158882 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 141159022 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 141159069 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141159229 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 141159261 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 141159413 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 141159472 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 141159484 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 141159626 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141160006 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141160158 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141160468 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 141160557 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 141160630 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 141160729 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 141160764 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 141161164 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 141161175 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141161297 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141161478 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141161795 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 141162020 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 141162444 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 141162624 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141162705 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 141162877 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 141163212 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141163398 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 141163453 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 141163599 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 141163628 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 3 141163659 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 141163687 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 141163715 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 141163725 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 141163747 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 141163783 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 141163856 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 141163874 G T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 141163891 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 141163952 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 141164114 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 141164295 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 141164768 A G Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 141164929 G T Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 141165079 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 141165438 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 141165508 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 141165520 A T N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 3 141165531 A G N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 3 141165572 A C Y N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 3 141165581 C T N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 3 141165595 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 141165606 A G N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 3 141165705 T C N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 3 141165772 A T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 141165796 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 141165814 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 141165881 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 141165894 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 141165964 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 141165975 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 141166004 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 141166217 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 141166257 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 141166272 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 141166293 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 141166305 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 141166392 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 141166470 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141166544 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141166575 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 141166627 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 141166636 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 141166730 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 141166750 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 141166809 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 141166830 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 141166851 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 141167076 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141167109 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 141167190 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141167291 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 141167516 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 141167527 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 141167542 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 141167576 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 141167596 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141167692 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 141167695 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 141167764 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 141167773 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141167830 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141168130 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 141168164 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 141168178 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 141168233 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 141168239 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 141168279 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 141168359 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 141168396 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 141168537 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 141168550 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 141168622 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 141168792 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 141169103 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141169149 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141169157 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 141171216 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 141171300 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141172232 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141172383 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 141177046 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 141177477 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 141179393 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141180127 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 141180818 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141180831 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141181186 A T Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 141181216 A C N N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 8 12 2 4 4 3 141181301 T C N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 141181604 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141181812 A G Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 141181995 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 141182321 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141182911 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 141183135 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 141183181 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141183955 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141184176 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 141184632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141184819 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 141184958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141185048 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 141185147 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 141185162 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 141185602 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 141186235 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141186676 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 141186741 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 141187001 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 141187103 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 141187222 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 141187252 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 141187271 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 141187315 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 141187376 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 141187491 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141187859 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 141187862 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 141188227 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 141188275 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 141188381 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 141189416 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 141189542 C A N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 141189912 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 141189925 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 141190021 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 141190284 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 141193144 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 141193338 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 141193419 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 141194866 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141195062 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 141195111 C G N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 141195511 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 141195734 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 141196269 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 141196834 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 141197308 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 141197572 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 141197914 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141198409 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 141198621 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141198877 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 141199735 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 141199757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141200047 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 141200064 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141200400 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141201145 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141202095 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 141202853 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 141204624 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 141204691 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 141205204 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 141205314 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 141205392 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141206544 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 141206627 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 141206632 G A N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 141206892 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 141207853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141208247 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141210214 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141210747 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 141210856 C A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 141211065 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141211157 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 141211217 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 141211270 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 141211298 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 141211304 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 141211877 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141212136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141212267 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141212417 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 141212421 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 141213757 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 141214115 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 141214127 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 141214130 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 141216466 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141218131 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 141218191 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141218595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141218721 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141219143 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141220004 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141221223 C A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 141221373 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 141221401 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 141221881 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141222750 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141222948 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141223054 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141223925 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141224006 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 141224012 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 141224072 T G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 141224256 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 141224340 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141224535 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 141224708 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141224928 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141225066 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141225092 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141225329 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141225426 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141225536 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141225560 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141225588 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141225592 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141225606 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141225654 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141225672 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141225729 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141225777 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141225885 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 141225914 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 141226056 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141226111 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141226217 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 141226218 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 141226229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141226257 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141226280 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141226784 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 141226937 T A N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.538461538461538 0.230769230769231 0.230769230769231 17 9 7 3 3 3 141226939 A T N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 3 141227935 G T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 141228285 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141228348 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 141228360 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141228472 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141228528 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141228732 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141228947 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141229045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141229421 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 141229585 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 141229741 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 141229884 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141230087 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 141230256 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 141230260 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 141230583 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 141230659 C T Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 141231033 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141231251 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 141231308 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141231400 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141231457 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 141231530 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 141231785 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 141232273 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 141232369 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141232925 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 141233019 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 141233247 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141233347 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 141234168 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 141234210 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141234336 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141234349 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 141234588 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 141234728 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141234732 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141234807 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 141235629 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141235696 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 141235788 A T N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 141236731 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141236822 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 141237346 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 141237422 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 141237630 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141237675 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141238746 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141238896 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141239978 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 141240020 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 141240204 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 141240266 C A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 141240267 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 141240538 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141240755 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 141240868 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141240912 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141240927 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141241012 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 141241055 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 141241348 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141241595 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141241724 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 141241754 A C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 141241840 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 141241924 C T N Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 3 141242616 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141243792 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141244220 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141244972 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 141245796 A T N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 141246237 C G N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 141248358 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 141248377 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 141248549 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141248656 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141248758 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141249144 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141249237 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141249351 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141249802 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141249843 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141249938 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141250446 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 141250632 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 141250749 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141250870 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 141250978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141251094 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 141251198 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141252291 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 141253267 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141256960 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 141257857 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 141257891 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141258109 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 141258281 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 141258350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141258440 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141258475 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 141258704 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 141258784 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 141258851 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 141258992 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141259101 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 141259124 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 141259306 C G N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 141259349 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 141259356 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 141259444 A G Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 141259446 C G Y N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 141259809 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141259908 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 141260016 G C Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 141260355 C T Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 141260841 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 141260893 C G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 141260955 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 141261011 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 141261102 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 141261115 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141261116 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141261179 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 141261308 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 141261440 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 141261480 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 141261621 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 141261647 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 141261718 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141261763 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 141261783 T G N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 141261836 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 141261881 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 141262237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141262270 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141262668 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141262891 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 141263063 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 141263135 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141263653 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141263842 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141264318 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 141264637 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141264935 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 141265648 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141273739 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 141273896 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141274422 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 141274427 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 141275083 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141275118 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141275147 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141275196 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 141275272 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 141275343 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 141275407 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141275487 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141275557 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141275613 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 141275709 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141275816 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141275988 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141276195 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141276342 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 141276454 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 141276506 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 141276578 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141276592 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 141276699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141277041 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141277147 A G Y Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.384615384615385 0.538461538461538 0.0769230769230769 17 9 5 7 1 3 141277179 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 141277303 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141277688 C A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 141277745 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141277893 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 141278014 C G Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 141278105 C G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 141278249 T G Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 141278307 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141278521 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 141278947 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 141278954 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 141278977 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 141279144 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 141279182 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 141279228 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141279254 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 141279256 A G Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 141279365 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 141279498 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 141279576 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 141279631 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 141279672 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 141279673 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 141279906 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141279926 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141279999 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141280028 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 141280051 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141280057 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 141280063 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 141280083 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 141280403 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141280497 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141280569 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 141280573 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141280811 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141281109 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141281923 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141282128 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141282852 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141284024 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 141284620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141284747 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141285799 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141286068 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 141286271 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 141286761 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 141287083 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 141287522 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141287581 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 141287783 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 141287934 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 141288162 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 141289029 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141293217 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 141293253 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141294213 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141295050 T C N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 141296121 C T N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 141298918 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 141299168 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141300069 A C N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 141301003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141301255 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141301446 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141301454 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141301457 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 141301483 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141301505 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 141302635 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141302662 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 141302939 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 141303201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141303824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141303987 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 141304201 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 141304939 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 141305382 A G N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 3 141305413 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 141305573 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141305727 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141305884 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 141305984 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141306216 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141306276 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 141306785 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 141306818 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 141306861 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141306871 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141306991 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 141307047 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141307289 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 141307483 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 141307658 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141307680 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 141307764 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 141308275 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 141308288 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 141309175 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 141309190 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 141309264 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141309275 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141309725 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141309813 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 141309830 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 141309871 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 141310044 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 141310222 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 141310335 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 141310533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141310654 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 141310658 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141311732 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 141311804 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 141311811 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 141311842 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 141311863 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 141312043 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 141312075 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141312135 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141312179 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141312191 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141312219 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141312272 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 141312358 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 141312402 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141312598 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 141312633 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141312644 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141312683 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 141312899 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 141312934 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141312945 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141313010 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141313060 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141313067 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141313162 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141313338 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141313478 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141313694 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141313731 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141314023 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141314071 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141314134 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141314402 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141314480 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141314591 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141314725 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141314730 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141314768 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 141314772 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141314815 A G N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 141315495 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 141315552 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 141315588 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 141315660 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 141315683 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 141315710 T A N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 141315805 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 141315844 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 141316191 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141316300 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141316510 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 141316600 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 141316710 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 141316814 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 141316832 C A N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 141316849 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141316928 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 141316931 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 141317026 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141317040 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141317188 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141317287 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141317407 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141317408 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141317689 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141317772 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141317812 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 141317896 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 141318019 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 141318073 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141318162 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 141318462 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 141318527 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 141318563 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 141318586 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 141318789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141318826 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141318860 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141318871 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 141318891 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141318915 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141318949 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141319198 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 141319253 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 141319504 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141319520 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141320073 A G N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 141320151 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141320152 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141320164 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141320184 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141320222 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 141320223 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141320257 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141320298 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141320313 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141320331 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141320337 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141320342 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141320390 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141320416 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 141320418 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141320453 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141320502 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 141320524 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141320536 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141320568 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 141320599 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 141320682 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141320756 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141320766 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141320978 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141321001 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141321138 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 141321201 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 141321391 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141321577 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141321581 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141321597 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141321599 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141321613 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141321698 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141321699 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141321822 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141321836 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141321931 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141322103 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 141322166 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141322202 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 141322223 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141322360 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 141322396 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141322551 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 141322559 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141322575 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 141322672 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141322689 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141322707 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 141323191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141323238 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141323553 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141324534 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 141325207 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 141327116 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 141327992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141330039 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 141330248 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 141331050 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 141332796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141333201 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141333652 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141334733 C T Y Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 141334952 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 141335071 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 141336553 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141336716 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141337611 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 141337694 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 141338113 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 141338115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141338177 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 141338302 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 141338336 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 141338400 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 141338429 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 141338437 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 141339359 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 141339414 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141339598 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141339860 T C N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 141339926 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 141339984 C A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 141340011 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 141340053 A T N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 141340093 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 141340113 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 141340127 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141340159 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 141340221 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 141340252 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 141340283 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 141340307 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141340357 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 141340366 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141340369 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141340454 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141340467 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141340483 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141340487 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141340597 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141340614 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141340636 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141340689 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 141340846 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 141341184 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141341198 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141341200 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 141341231 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 141341264 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141341275 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141341283 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 141341332 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141341574 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 141341594 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 141341716 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 141341764 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 141341824 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 141341943 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 141341965 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 141342274 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 141342433 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 141342636 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 141342665 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 141342759 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 141342760 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 141342927 G C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 141342965 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 141342967 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141343021 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 141343064 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 141343098 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 141343189 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 141343243 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 141343245 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 141343516 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141343589 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141343612 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141343696 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 141343714 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 141343723 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 141343872 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 141343891 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141343964 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 141344054 T A Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 141344055 T A N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 141344343 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141344584 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 141344593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141344642 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 141344705 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 141344717 C G N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 3 141345069 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 141345122 G C N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 141345147 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 141345149 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141345518 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141345528 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141345542 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141345799 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 141346102 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141346239 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 141346311 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 141346780 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 3 141346818 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 141346845 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141346850 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141346954 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 141347490 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141347542 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141347549 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141347621 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141347698 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 141347732 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141347754 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141347769 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 141347810 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141347884 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 141347990 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141348028 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141348050 G T N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 141348057 C A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 141348142 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 141348242 A G N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 141348293 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 141348449 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 141348481 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141348648 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141348726 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141348870 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 141349056 G A N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 141349075 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 141349109 A G N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 3 141349135 A T N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 141349156 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 141349507 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141349606 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 141349675 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 141349700 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 141349965 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141350079 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 141350084 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 141350191 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 141350263 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 3 141350334 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 141350347 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 141350400 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 141350475 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 141350627 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141350706 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 141350776 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141350889 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141351038 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 141351044 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 141351101 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 141351293 G C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 141351299 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 141351325 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141351531 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 141351636 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 141351657 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 141351727 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 141351841 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141351933 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 141351942 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 141351969 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 141352044 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 141352072 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 141352702 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 141352776 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 141352781 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 141352794 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 141352849 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 141353150 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 141353172 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 141353271 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141353452 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141353456 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141353617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141353623 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141353911 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 141354245 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141354401 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141356256 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141356859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141357151 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 141357264 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 141357388 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141357445 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141358298 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 141358420 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 141358509 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 141358664 T A N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 3 141358779 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 141358860 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141358997 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 141359113 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 141359159 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141359238 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 141359317 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141359734 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141359827 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 141359906 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141360107 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141360232 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 141360325 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 141360417 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 141360446 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 141360607 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 141360717 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141360916 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 141360961 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 141361286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141361514 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141364280 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141364448 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141365531 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 141365901 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141366684 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 141367770 G A Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 141367913 C T Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 141368392 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141370129 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 141372238 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141372712 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141372826 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 141373375 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 141373441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141374372 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 141374747 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 141374947 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 141375443 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 141375745 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 141375761 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 141375796 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 141375858 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 141375863 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141375959 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 141375972 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 141376033 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 141376182 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 141376285 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 141376456 C A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 141376479 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 141376486 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 141376514 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 141376584 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 141377300 G T Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 141377345 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 141377984 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 141378208 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141378326 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141378665 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141378675 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 141378691 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 141378711 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141378887 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 141379129 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 141379445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141379555 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 141379727 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141379935 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 141380053 T A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 141380123 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 141380144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141380185 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141380301 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141380406 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141380486 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 141380505 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 141380546 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141380733 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141380739 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141380770 G C Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 141380843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141380983 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141381091 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 141381217 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 141381288 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141381507 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141381508 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141381550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141381771 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141381955 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 141381979 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 141382006 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141382075 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 141382078 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 141382087 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141382223 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 141382267 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 141382273 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 141382285 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 141382295 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 141382412 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 141382657 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 141382658 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 141382694 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 141382702 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 141382711 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 141382801 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 141382820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141382822 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 141382875 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 141382958 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 141383026 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 141383189 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 141383402 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 141383456 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141383488 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 141383604 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 141383641 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 141383739 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 141383787 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 141383833 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 141383864 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 141383986 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 141384356 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141384646 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 141385060 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 141385228 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 141385761 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141385917 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141386020 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141387354 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141388094 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141388111 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141388320 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 141388503 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 141388506 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 141388627 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 141388648 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141388689 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 141388899 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141388950 A C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 141388951 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 141389061 G T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 141389086 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 141389132 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 141389174 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 141389198 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 141389332 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 141389353 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141389358 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141389377 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 141389889 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141389936 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 141390126 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 141390213 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141390308 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 141390366 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 141390375 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 141390430 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 141390479 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 141390487 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 141390519 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141390535 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 141390698 T G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 141390735 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 141390991 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 141391014 C G Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 141391026 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 141391027 T A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 141391093 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 141391278 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 141391395 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 141391512 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 141391635 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 141391687 T A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 141391738 T G N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 141391904 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 141391958 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 141392050 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 141392114 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 141392405 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141392517 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 141392619 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 141392960 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141393055 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141393359 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 141393411 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 141393483 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141393484 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 141393528 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 141393531 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 141393547 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 141393593 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141393635 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141393721 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141393795 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 141394044 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141394065 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141394220 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 141394349 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141394828 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 141395470 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141395624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141396308 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 141396738 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 141397140 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 141397277 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141397428 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 141397445 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 141398141 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 141398205 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 141398206 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141398788 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 141398836 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 141399475 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 141399907 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141400145 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 141400157 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 141400158 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 141400179 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 141400365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141400523 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141400640 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141400800 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141401659 A T Y N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 3 141401837 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 141401841 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 141401966 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141401968 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141402001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141402014 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141402115 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141402323 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141402505 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141402730 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 141402811 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141402850 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141403059 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141403233 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141403321 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 141403373 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 141403455 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141403536 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 141403560 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 141403597 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 141403872 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141404393 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 141404454 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141404575 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141404610 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141404702 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 141404730 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141405575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141405679 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141406253 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141406616 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141407013 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141407156 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141407869 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 141409114 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 141409118 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 141409149 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 141409153 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 141409161 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 141410252 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141410341 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141410861 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141411498 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141411685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141412188 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 141413170 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 141413277 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 141413334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141413861 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141415659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141415682 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141416173 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 141416559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141418135 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141418839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141418860 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 141419080 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141419189 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 141419192 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 141419547 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141419570 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141419850 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141419898 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141420680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141422290 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 141429622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141431043 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141431540 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 141433634 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141434436 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 141434656 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141437344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141437615 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 141439155 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 141439899 A G Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 141440194 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141440524 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 141440876 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 141441192 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141442535 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 141442980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141443017 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 141443629 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141443987 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 141444095 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 141444101 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141444846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141444969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141445265 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 141445403 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 141445459 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141445650 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141445807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141445852 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141446208 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 141446238 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 141446248 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 141446470 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141446484 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141446809 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141446844 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141446858 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141446880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141447138 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141447191 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141447282 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141447348 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141447452 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141448058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141448158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141449447 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141450107 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141450825 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 3 141450835 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 141450850 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 141450869 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 141452874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141453262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141454144 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141454474 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141455086 A C N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 141455356 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 141457986 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 141458037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141458080 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 141458160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141459869 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141462605 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141463845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141464031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141467767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141467952 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141469028 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141469092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141469781 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141469893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141470461 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141471049 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141473522 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 141474346 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141478978 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 141479002 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 141479019 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141479062 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 141479100 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141479128 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 141479259 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 141479287 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141479294 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 141479563 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141479638 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141481256 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141481986 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141483250 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 141483931 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.166666666666667 0.777777777777778 0.0555555555555556 20 16 3 14 1 3 141483964 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 141483968 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 141484200 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 141484633 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141484812 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 141484893 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 141485179 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 141485347 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141485681 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 141486218 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 141486234 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 141486358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141486540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141486822 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 141487651 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 141488299 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 141489028 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 141489064 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 141489096 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 141489169 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 141489395 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 141489773 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 141489892 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 141489917 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141490163 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 141490192 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 141490524 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 141490705 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141490998 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 141491000 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 141491082 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 141491221 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141491259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141491537 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 141492574 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 141492740 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 141492840 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141492868 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 141493330 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141493354 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 141493633 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 141493696 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 141493760 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141493966 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 141494228 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 141494691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141495184 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141495292 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141496187 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 141497003 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 141497064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141498678 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 141498767 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141499135 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141499357 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 141499501 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 141499810 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 141500294 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 141500296 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 141501447 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 141501943 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 141501968 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 141502212 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141503297 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 141503805 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 141504574 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 141505144 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141505246 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 141505353 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 141505366 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 141506397 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 141506845 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141509304 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141509312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141509642 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 141510303 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 141511056 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 141511931 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 141511932 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 141512830 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141513056 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 141514036 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141514111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141514430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141514675 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 141514801 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 141515622 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 141515922 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 141516615 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 141517350 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 141517666 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 141518022 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 141518146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141518325 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 141518634 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141518974 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 141519015 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141519044 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 141519101 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 141519240 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 141519435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141519453 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141519617 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 141519740 C A N N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 141519895 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 141519936 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 141520104 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 141520111 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 141520230 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141520351 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 141520495 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 141521026 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 141521258 C A N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 141521342 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 141521348 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 141521359 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 141521364 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 141521493 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141521722 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 141522127 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 141522136 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 141522749 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 141522793 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 141523036 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 141523046 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 141523576 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 141523740 C G N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 141523787 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 141523894 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 141523951 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 141525019 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 141525068 T C Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 141525267 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 141525295 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 141525300 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141525309 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 141525378 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141525387 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 141525564 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 141525635 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141525723 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141525781 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141525860 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 141525884 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141525918 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141525924 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 141526028 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 141526109 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 141526117 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 141526131 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 141526169 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 141526305 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 141526335 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 141526428 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 141526672 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 141527026 A G Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 141527054 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 141527077 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 141527246 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 141527359 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 141527366 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 141527429 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 141527430 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 141527644 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 141527648 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 141527666 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 141527731 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 141527745 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 141527821 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 141527885 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141527925 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 141527979 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 141528046 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 141528051 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 141528058 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 141528123 T A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 141528233 C G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 141528312 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 141528372 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 141528408 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 141528424 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 141528470 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 141528656 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 141528679 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 141528700 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 141528703 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 141528718 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 141528744 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 141528803 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 141529087 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 141529141 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 141529146 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 141529184 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 141529265 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 141529303 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 141529327 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141529368 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 141529381 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141529410 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141529466 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 141529605 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141529709 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 141529804 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 141529867 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141529892 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141529953 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 141530014 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 141530087 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 141530220 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 141530277 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 141530376 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 141530404 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 141530471 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141530549 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 141530960 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 141531128 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 141531151 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 141531214 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 141531224 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141531295 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141531352 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 141531404 C A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 141531406 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 141531455 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 141531980 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 141532085 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 141533185 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141534860 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 141535697 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141536479 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.25 0.7 0.05 24 16 5 14 1 3 141536532 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141536651 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141536820 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141536903 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141537345 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 141537478 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 141537483 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 141538181 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 141538434 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141538453 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141539158 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 141539439 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 141539976 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141540447 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 141540590 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 141540649 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 141540662 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 141540683 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 141540701 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141540781 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 141540916 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 141540929 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 141541000 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 141541200 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 141541248 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 141541249 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 141541409 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141541483 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141541537 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 141541661 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141541685 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141541854 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 141541878 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 141542028 A C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 141542248 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 141542429 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 141542474 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 141542508 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 141542519 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 141542529 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141542545 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141542667 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141542863 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 141542943 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 141543131 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 141543163 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 141543181 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 141543266 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 141543273 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 141543501 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 141543550 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 141543610 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 141543619 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 141543900 C G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 141543908 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 141544612 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 141544747 T G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 141544792 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 141544799 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 141544908 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 141545149 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 141545785 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141545897 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 141546063 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 141546137 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 141546149 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 141546322 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141546376 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141546417 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 141546456 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 141546507 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 141546720 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 3 141546733 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 141546852 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 141546911 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 141547045 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 141547304 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141547306 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 141547331 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 141547333 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 141547356 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141547525 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141547529 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 141547632 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 141547745 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 141547840 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 141547842 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 141547877 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 141547904 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 141547906 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141547923 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 141548050 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 141548205 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 141548293 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 141548456 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 141548468 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 141548532 T A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 141548609 T G N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 3 141549243 C T Y Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 3 141549356 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 141549574 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 141549652 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 141549744 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 141549828 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 141549960 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 141550030 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 141550056 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 141550127 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 141550197 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 141550249 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 141550411 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 3 141550560 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 141550563 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 141550599 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 141550712 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 141550793 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 141550897 C G N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 141551116 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 141551129 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 141551437 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 141551535 C G Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 141551536 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 141551573 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 141551574 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 141551652 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141551683 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 141551824 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141551847 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141552310 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141552355 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 141552363 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 141552472 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 141552543 A C N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 141552841 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 141552849 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 141553081 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 141553668 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141553743 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 141553760 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 141553972 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 141554330 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 141554628 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 141554938 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 3 141555265 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 141555382 C A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 141555419 A G N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 141555437 G A N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 3 141555843 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141556438 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 141556881 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 141556938 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 141556961 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 141556964 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 141556975 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 141557010 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 141557050 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 141557052 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 141557082 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 141557102 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 141557130 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 141557134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141557289 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 141557752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141557792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141557840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141557877 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 141558113 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 141558270 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 141558544 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141560249 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141562391 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141563176 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 141563177 A C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 141563581 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 141564538 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141568712 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 141568713 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 141568958 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 141569777 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 141569891 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141570091 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141570104 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 141570314 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 141570529 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141571033 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 141571239 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 141571283 G T N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 141571312 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 141571730 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0 0.684210526315789 0.315789473684211 13 25 0 13 6 3 141571855 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 141571860 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 141571966 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 141572299 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141572481 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141572611 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 141572632 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 141573118 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 141573452 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141573488 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141573489 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 141573842 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 141573924 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 141573940 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 141573943 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 141573996 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 141574080 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 141574089 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 141574469 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 141574483 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141574502 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 141574507 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 141574528 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 141574556 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 141574750 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 141574856 A T Y N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 141575293 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 141575350 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141575395 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141576989 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141577455 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141577858 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 141578033 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 141579211 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141580666 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 141582440 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141585064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141590834 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141591983 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 141592112 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 141592158 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141592658 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141594719 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141594733 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 141594757 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 141594919 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 141594943 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.176470588235294 0.0588235294117647 0.764705882352941 7 27 3 1 13 3 141595189 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 141595593 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141595639 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 141595732 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 141595764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141595968 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 141596107 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 141596567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141596876 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141596963 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 141597323 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 141597438 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 141597467 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 141597564 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141597770 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141597797 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 141597805 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141597810 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 141597833 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 141597907 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 141597919 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 141597932 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 141598066 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 141598147 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 141598250 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 141598255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141598283 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 141598400 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141598422 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 141598970 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141598978 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141598992 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141599012 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141599055 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141599140 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141599305 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 141599359 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 141599898 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141600361 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 141600376 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 141600757 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 141601373 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141601407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141601521 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 141601607 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 141601611 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 141601665 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 141602037 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 141602394 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141604938 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 141605327 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 141605384 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 141605489 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 141605775 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 141605838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141605851 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141605854 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 141605876 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 141605935 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 141606194 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 141606669 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 141606707 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 141606749 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 141606910 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 141607226 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 141607255 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141607297 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 141607327 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 141607408 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 141607457 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 141607577 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141607793 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141608144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141608259 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 141608854 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 141608997 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 141609094 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 141609422 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 141609636 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 141611262 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 141612396 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 141612759 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141612874 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 141613196 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 141613226 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141618006 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141619537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141619671 G C Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 141620332 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 141620374 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 141620408 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 141620850 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 141620900 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141621063 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 141621206 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141621256 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141624055 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141624248 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141624634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141624884 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 141624921 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 141624947 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 141625024 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141625103 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 141625219 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 141625222 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 141625270 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 141625916 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 141626299 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 141626963 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 141627963 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 141628339 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 141628534 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 141628693 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 141628730 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 141628896 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141629135 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 141629230 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141630470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141631086 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141632349 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 141632934 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 141632948 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 141633079 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 141633130 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 141633180 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 141633304 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 141633390 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 141633407 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 141633629 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141633671 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 141634011 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 141634139 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 141634223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141634864 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 141635050 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141635067 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 141635071 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141635433 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141635721 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 141635966 T A Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 141636073 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141636250 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 141636306 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 141636446 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 141636486 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 141636501 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 141636583 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 141636587 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 141636600 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 141636634 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 141636648 A C Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 141636675 T G N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 3 141636784 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 141636939 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141636946 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 141637040 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141637254 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 141637277 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 141637294 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 141637367 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 141637808 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141637824 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 141637878 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 141637896 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 141637963 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 141637998 T A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 141638016 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 141638097 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 141638126 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 141638165 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 141638180 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 141638184 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 141638479 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 141638552 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 141638614 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 141638689 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 141639158 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 141639979 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 141640129 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 141640364 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 141640400 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141640431 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141640453 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 141640612 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 141640734 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 141640903 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141641011 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141641022 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 141641164 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 141641166 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 141641213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141641245 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141641249 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141641274 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 141641345 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 141641357 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 141641450 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 141641471 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 141641496 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141641548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141641561 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 141641685 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141641713 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141641721 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 141641770 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 141641805 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 141642211 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 141642220 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 141642298 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 141642360 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 141642389 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 141642525 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141642565 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 141642571 A T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 141642626 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 141642875 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 141642979 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141642994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141642996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141643092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141643108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141643142 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141643211 C A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 141643226 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 141643391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141643394 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 141643464 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 141643539 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141643557 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 141643675 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 141643694 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 141643751 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141643825 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 141643893 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141643967 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 141643989 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 141644076 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 141644338 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 141644475 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141644522 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 141644990 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 141645011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141645185 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 141645459 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141645541 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 141645724 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 141645919 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 3 141645954 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 141645988 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 141646229 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 141646245 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 141646903 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 141646920 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 141646976 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 141647133 C A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 141647251 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 141647373 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141647374 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 141647602 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141647664 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 141647679 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 141648308 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 141648380 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141648467 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 141648503 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 141648655 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141648664 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 141648827 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141648959 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141649007 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 141649237 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141649241 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141649253 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141649943 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 141650047 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 141650057 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 141650082 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 141650150 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 141650425 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 141650630 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141651215 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 141651290 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 141651464 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 141651483 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 141651636 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 141652447 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 141652719 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 141652788 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 141652813 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 141652820 T A N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 141652909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141652988 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 3 141653041 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 141653077 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 141653174 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141653258 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 141653275 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 141653349 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 141653360 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 141653452 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 141653501 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141653534 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 141653637 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 141653671 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141653708 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141654013 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 141654031 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 141654419 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 141654997 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 141655362 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 141655603 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141655633 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141655716 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141655718 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141655775 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141655788 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141655818 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 141655832 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 141655834 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 141655851 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 141656050 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141656917 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 141657051 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 141657178 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 141657183 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 141657311 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 141657369 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 141657496 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 141657506 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 141657559 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 141657591 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 141657728 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 141657963 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141658170 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141658207 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141658223 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141658328 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141658395 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 141658403 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 141658735 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 141658738 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 141659243 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 141659391 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 141659914 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141659954 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 141659993 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141660239 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 141660283 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 141660342 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 141660431 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 141660596 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 141660806 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141660990 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 141661050 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 141661549 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141662013 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 141662577 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 141663075 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 141663509 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 141663533 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141663534 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141663581 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 141663619 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 141663625 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 141663666 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 141663667 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141663853 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141663966 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 141663974 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141664002 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141664059 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141664082 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141664084 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141664124 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141664377 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 141664793 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 141664849 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 141665165 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 3 141665332 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 141665375 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141665396 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 141665596 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141665620 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141665627 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 141665688 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141665689 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141665715 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141665734 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141665781 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 141673641 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 141673703 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141673872 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141674003 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 141674290 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 3 141674336 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.411764705882353 0.176470588235294 0.411764705882353 17 17 7 3 7 3 141674363 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 141674464 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 141674648 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141674939 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141675905 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141676196 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 141676203 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141676377 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141676593 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 141676629 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141676687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141676729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141676874 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141676911 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141676928 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141676934 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 141676942 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141677202 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 141677921 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 141677997 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 141678112 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141678497 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 141678519 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 141678715 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141679210 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141679552 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141679645 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 141680299 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141680410 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141680484 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141681854 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141683978 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 141684746 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141685229 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 141685800 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141686841 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141690826 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141691186 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141691829 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 141692029 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141692300 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141692302 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141692322 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141692870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141693041 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141693516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141696073 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141696316 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141696948 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 141697321 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141697406 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 141697722 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141697755 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 141697823 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 141698042 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 141698504 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141698890 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141698934 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141699252 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141699274 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 141699339 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 141699492 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 141699521 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 141699526 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141699906 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 141699932 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 141700043 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 141700087 C G Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 141700088 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 141700108 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141700159 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141700266 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141700669 A T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 141701177 A G Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 141701409 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141701410 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 141701487 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 141701529 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 141701666 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 141701675 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 141701721 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 141701807 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141701825 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141701827 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141701891 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 141701957 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 141702065 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 141702137 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141702151 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141702161 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141702224 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 141703013 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141703043 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141703050 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141703182 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 141703193 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 141703411 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141703535 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141703583 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 141703601 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 141703656 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 141703778 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141704040 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 141704085 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141704226 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 141704614 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 141704637 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141704815 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141704828 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141704844 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 141704928 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 141704955 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 141704960 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 141705108 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 141705112 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 141705131 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 141705166 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 141705485 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141705701 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 141705826 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 141706271 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 141706866 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141706961 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141707438 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 141707493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141707638 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141707683 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141707685 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141707712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141707778 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 141707800 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141707818 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 141708025 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141708082 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141708143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141708299 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 141708432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141708542 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 141708547 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141708558 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 141708588 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 141708657 A G N Y 0.428571428571429 ALT 0.65 0.65 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 8 6 2 4 1 3 141708926 G A Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 141709004 G T N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 141709178 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 141709313 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141709329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141709378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141709560 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 141709731 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141709982 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141710371 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 141710405 C A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 141710479 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 141710495 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141710830 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141711156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141711192 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 141711207 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 141711984 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141712230 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141712475 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141715270 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 141715282 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 141715390 G C N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 3 141715437 C G Y N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.153846153846154 21 5 10 1 2 3 141715723 G T N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.333333333333333 0.133333333333333 0.533333333333333 12 18 5 2 8 3 141716469 T C Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 24 4 12 0 2 3 141716478 T C N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.142857142857143 23 5 11 1 2 3 141716528 A G Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 3 141716569 G A N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 6 22 2 2 10 3 141716931 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 141717133 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 141717198 G T Y N 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 141717633 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 3 141717760 G A Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 3 141718128 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 5 13 2 1 6 3 141718196 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 141719983 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 141720274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141720286 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141720385 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 141720689 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141722636 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141722713 A C Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 141722859 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 141722945 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 141723071 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 141723226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141723589 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141723808 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141723947 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141725578 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141726620 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141727073 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141727299 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141728272 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 141728279 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 141728304 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141728309 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 141728359 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 141729450 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141730327 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141730987 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 141731039 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 141731328 A G N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 141731430 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 141731574 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 141731625 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141731702 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 141731759 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141732010 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141732324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141732388 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141732425 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141732583 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141733139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141733141 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141733215 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141733994 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141734279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141734838 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141735006 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 141735514 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141735763 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141735805 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141735907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141735931 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141735935 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141736101 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141736115 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 141736142 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141736323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141736364 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 141736435 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141736462 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 141736539 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 141736559 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 141736592 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 141736750 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 141736756 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 141736809 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141736875 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141736918 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141737012 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 141737234 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141737246 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 141737250 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141737375 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 141737815 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141737832 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141738003 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141738035 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141738053 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141738085 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141738099 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 141738279 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 141738615 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 141738852 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 141740570 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141740578 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141740618 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141740634 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 141742888 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141744932 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 141747411 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 141747723 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141748492 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 141748745 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141750548 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141751282 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 141751389 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141752613 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 141753903 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141754697 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141755272 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 141759163 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141761888 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 141763702 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141764247 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141765595 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141766057 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141768183 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141768720 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 141770711 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 141770748 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 141770754 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 141770759 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 141770946 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 141770986 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 141771059 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 141771416 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141771479 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141771513 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141771617 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 141771787 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 141771933 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 141771987 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 141772479 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141772597 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141772918 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 141773191 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141773221 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141773228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141773262 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141773346 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141774071 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 141774368 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141774669 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141774670 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 141775041 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141775094 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141775136 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 141775141 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 141775151 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141775294 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141775394 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141775670 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 141775682 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 141775766 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141776079 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141776165 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141776267 G A N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 3 141776493 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 141776512 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 141776625 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 141776715 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 141776761 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 141776773 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141776804 A T Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 141776876 T C N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 3 141777264 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141777624 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 3 141777749 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141777838 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 141778745 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 141779008 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 141779085 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 141779124 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 141779133 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141779473 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 141779541 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 141779557 A T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 141779607 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 141779663 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 141779824 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 141779879 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 141780078 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 141780094 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 141780107 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 141780289 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 141780382 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141780643 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141780731 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141780873 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 141780888 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141780933 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 141781043 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 141781137 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 141781228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141781399 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 141781412 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141781534 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 141781596 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 141781601 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141781740 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 141781835 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 141781872 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 141781955 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 141782008 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 141782029 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 141782123 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141782185 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141782258 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 141782374 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 141782648 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 141782922 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 141782925 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 141783005 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141783293 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141783456 A T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 141783503 A C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 141783550 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 141783619 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141783649 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 141783671 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141783702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141783848 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141783875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141783910 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 141784075 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141784221 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141784239 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 141784245 T G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 141784291 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 141784296 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 141784432 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 141784501 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141784667 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 141784810 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141784811 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141785035 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 141785181 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141785190 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 141785322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141785340 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141785355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141785415 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141786062 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141786126 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141786205 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141786262 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141786470 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 141786495 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141786691 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 141786819 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141786929 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141786997 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 141787002 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 141787180 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141787368 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 141787444 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141787513 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 141787866 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 141787930 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 141788019 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 3 141788045 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 141788049 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 141788096 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 141788100 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 141788119 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 141788187 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 141788998 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141789177 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 141789182 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 141789464 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 141789640 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141790104 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141790277 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 141790652 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141790687 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141791065 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 141791131 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 141791222 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141791276 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141791289 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141791333 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 141791402 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141791412 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141791417 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141791423 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141791582 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 141791666 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141791721 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141791813 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141791985 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141792072 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141792369 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 141792548 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 141792787 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 141793114 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141793283 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141793374 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141793527 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 141793682 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 141793729 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 141793987 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141794519 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 141794533 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 141794549 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141794607 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141794920 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141794921 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 141794983 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141795016 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141795662 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141796115 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141796766 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 141797939 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141798223 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141798293 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 141798482 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141798660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141799680 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141799872 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141799984 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 141800843 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 141801203 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 141801574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141801670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141801690 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141801870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141801976 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141802378 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141802599 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141802767 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 141802835 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 141802922 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141803103 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 141803127 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 141803322 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141803353 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 141803744 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 141803825 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 141803929 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 141804081 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141804083 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141804150 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141804182 A C Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 141804197 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141804214 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141804291 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 141804341 T C Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 141804420 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 141804465 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141804774 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141805019 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 141805067 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 141805103 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141805268 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 141805511 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 141805672 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 141805711 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 141805956 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 141806370 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141806435 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141806531 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 141806548 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141806641 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141806682 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141806877 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 141807040 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141807050 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141807141 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 141807263 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141807668 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141807676 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141807812 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141807844 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 141807855 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141807951 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141807972 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141808085 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141808272 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141808280 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 141808455 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 141808512 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141808617 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 141808660 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141808835 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 141808912 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141809020 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141809039 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 141809065 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 141809118 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 141809542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141809990 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 141810032 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 141810181 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 141810529 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 141810565 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 141810569 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141810585 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 141810618 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 141810627 G T N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 141810639 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 141810697 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 141810752 C A N N 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0 0.75 0.25 3 5 0 3 1 3 141810907 G A N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.272727272727273 0.545454545454545 0.181818181818182 12 10 3 6 2 3 141810973 T G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 141811173 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 141811187 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 141811209 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 141811246 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 141811356 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141811370 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 141811415 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141811426 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141811452 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141811456 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141811464 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 141811489 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 141811716 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141811729 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 141811789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141812319 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 141812367 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 141812420 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 141812459 T C N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 3 141812537 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 141812564 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 141812565 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 141812608 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 141812705 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 141812866 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 141812875 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 141812957 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 141813037 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 141813249 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 141813328 A T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 141813441 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141813519 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141813537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141813595 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141813646 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141813697 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 141813698 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141813763 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 141814313 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 141814871 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141815845 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141816759 A T Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 141816849 G T N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0 0.583333333333333 0.416666666666667 7 17 0 7 5 3 141816851 C A Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 141817232 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141817502 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 141817746 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 141819080 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141819266 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 141819545 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 141819592 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141819674 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 141819753 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 141820068 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 141820105 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 141820164 C T Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 141820168 A C N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 141820522 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141820647 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141820885 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141820977 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 141821137 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141821149 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 141821305 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141822439 T A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 141822476 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 141822504 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 141822519 C A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 141822578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141822798 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 141822884 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 141822894 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 141823014 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 141823043 A C Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 141823054 A C Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 141823075 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 141823620 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 141823721 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 141823758 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141823995 G A Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 141824465 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 141824473 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 141824914 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 141825680 A T Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 141825968 G T Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 141826022 A C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 141826055 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 141826259 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 141826395 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 141826431 A T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 141826556 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 141826627 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 141826656 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 141826721 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 141826766 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 141826838 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 141826852 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 141826916 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 141826927 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 141826942 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141827302 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141827357 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 141827377 T C Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 141827441 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 141827457 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 141827643 A C Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 141827964 C A Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 141828502 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 141828627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141829007 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 141829020 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 141829219 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 141829286 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 141829386 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 141829467 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 141829523 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 141829634 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 141829727 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 141829844 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 141829922 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 141830045 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 141830052 A T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 141830236 C G N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 141830242 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 141830265 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 141830332 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 141830521 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 141830554 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 141830747 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 141830908 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.117647058823529 0 0.882352941176471 4 30 2 0 15 3 141831125 G C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 141831377 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 141831775 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 141831799 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 141831860 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 141832012 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 141833159 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 141833170 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 141833216 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 141833280 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 141833587 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 141833615 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141833628 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 141833699 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 141833744 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 141833769 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 141834021 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141834111 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141834762 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 141835098 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 141835222 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 141835260 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 141835281 G A Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 141835327 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 141835352 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 141835371 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 3 141835372 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 141835508 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 141835901 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 141836161 C G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 141836167 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 141836279 T C Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 141836409 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141836440 A G N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 3 141836798 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141839392 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 141840818 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141841440 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141841695 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 141841702 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141841806 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 141842477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141842486 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 141842751 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141842810 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141842856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141843264 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 141843848 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 141844404 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 141850971 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141851231 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141851548 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 141851679 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 141851731 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141851876 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141852505 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141852600 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141853269 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141853455 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 141853653 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141854081 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 141854083 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 141854315 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 141855317 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 141855423 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 141855430 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141855561 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 141857208 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 141857247 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 141857288 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 141857315 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141857316 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 141857330 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 141857363 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 141857377 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 141857813 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141859233 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141859539 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 141859721 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141859760 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 141859883 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 141859967 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141860013 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141860043 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 141860081 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 141860310 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141860666 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141860862 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141860863 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 141860892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141860925 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141860962 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141860975 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 141860999 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 141861034 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 141861040 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 141861111 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141861197 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141861245 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141861266 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 141861268 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 141861455 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.166666666666667 0.722222222222222 0.111111111111111 19 17 3 13 2 3 141861686 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141861712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141861853 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141861904 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 141861970 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141862105 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 141862303 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141862430 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 141862707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141862728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141863375 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 141863460 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 141863493 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 141863543 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 141863581 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 141863636 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 141863658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141863668 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 141863800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141863814 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 141864016 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 141864120 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 141864376 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 141864460 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 141864628 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141864788 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 141864931 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 141865763 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 141867061 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141867564 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 141867696 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 141867760 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 141867825 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 141868075 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 141868162 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141868183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141868213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141868260 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 141868624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141869530 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 141870235 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141873406 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141873508 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141873578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141873768 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 141873832 G A Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 141874992 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141875031 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 141875195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141875758 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141875785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141876988 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141877037 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141877161 A C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 141877175 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141877258 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 141877260 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141877328 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 141877346 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 141877427 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 141877461 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 141877474 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 141877643 C G N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.357142857142857 0.142857142857143 0.5 12 16 5 2 7 3 141878218 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 141878229 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 141878260 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 141878489 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141878547 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 141878657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141878707 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141878779 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141878796 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141878971 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 141879143 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141879185 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 141879339 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 141879364 C A N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 141879948 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141880082 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141880247 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 141880760 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 141880856 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141880869 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 141880962 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141881162 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141881307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141881445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141881720 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141881787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141881853 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 141881871 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 141881884 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 141882008 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 141882216 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 141882238 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 141882241 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 141882270 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 141882294 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 141882362 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 141882405 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 141882417 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 141882474 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 141882527 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 141882560 A T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 141882569 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 141882591 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 141882654 A G Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 3 141882680 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 141882738 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141882763 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141882895 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 141882931 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 141882991 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 141883397 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141883534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141883706 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 141885116 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141885311 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141885386 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141885449 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 141885644 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 141885683 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141885847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141886986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141887040 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 141887157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141888419 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 141888554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141888860 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141889052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141889096 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 141889225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141889385 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141889392 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141889939 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 141890014 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 141890101 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 141890612 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141890613 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141890642 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 141890949 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 141891193 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 141891270 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141891409 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141891416 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 141891563 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 141891811 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141891812 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141891930 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141891945 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 141892152 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 141892445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141892550 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141892631 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141892682 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141892804 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 141893035 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 141893137 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141893172 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141893319 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141893341 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141893459 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 141893700 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 141893724 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 141893746 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 141893749 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141893759 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141894055 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 141894143 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 141894167 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 141894469 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 141894782 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141894841 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 141894986 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 141895018 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 141895429 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 141895459 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 141896174 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 141896476 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141898687 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141899122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141899857 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141900978 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141901082 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 141901163 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 141901226 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 141902497 G C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 141902751 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 141902932 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 141902998 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 141903293 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141903298 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 141903624 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 141903703 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 141904114 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 141904430 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 141906502 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 141906933 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141907572 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 141907968 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141908010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141908195 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141912696 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141913055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141914456 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141914715 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 141914827 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 141915248 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 141915257 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141917148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141920567 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141921543 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141924149 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 141926169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141934705 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 141936408 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 141936423 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 141937125 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141937185 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141937220 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141937349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141937638 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141937712 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141937800 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141939365 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141939447 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 141939475 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141939991 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141940206 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141940222 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141940304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141940361 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 141940380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141940458 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141940497 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 141940567 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 141940739 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 141940871 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141941074 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 141941259 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141941262 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141941291 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 141941417 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 141941494 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141941503 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141941699 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 141941731 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 141941969 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 141942061 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 141942083 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 141942164 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141942461 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 141942552 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141942727 T C N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 3 141942738 T C N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 141943056 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141943066 T C Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 141943079 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 141943095 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141943269 T G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 141943355 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141943380 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141943491 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 141943501 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 141943560 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 141943572 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 141943670 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 141943713 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141943768 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 141943779 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 141943901 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 141943940 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 141944039 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 141944088 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 141944109 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 141944119 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 141944311 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 141944492 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 141944979 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141945009 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 141945067 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141945080 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141945112 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 141945117 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 141945560 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 141945568 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 141945586 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 141945594 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 141945717 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 141945807 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 141946067 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141946161 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 141946381 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 141946409 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 141946480 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 141946485 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 141946612 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 141946652 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 141946996 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141947030 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141947086 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 141947229 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141947400 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 141947857 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141948112 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 141948252 G A Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 141948286 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0 0.75 0.25 12 20 0 12 4 3 141948570 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141948838 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141950286 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141951048 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141952168 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141952809 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 141953335 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 141953473 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141953485 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 141953698 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 141953717 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 141953763 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141953979 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 141953991 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 141954171 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141954502 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141954604 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 141954737 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141954842 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141955242 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 141955270 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 141955571 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141955628 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 141955685 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141955806 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141956297 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 141956337 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 141956675 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141956750 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 141956863 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 141956970 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 141956987 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141957051 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 141957078 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 141957127 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 141957176 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 141957646 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 141957691 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 141957701 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 141957993 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 141958100 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141958139 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141958166 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 141958168 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141958234 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141958247 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 141958540 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141958565 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141958586 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 141958662 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 141958760 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 141958776 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 141958889 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 141958941 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 141958977 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 141958991 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 141959555 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 141959629 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 141959664 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 141959748 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 141959814 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 141960120 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 141960460 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 141961226 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 141961298 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 141961447 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 141961508 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 141961530 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 141961935 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 141962213 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 141962276 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141962571 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 141963070 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 141963083 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 141963178 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 141963899 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 141966680 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 141966735 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 141966856 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 141967023 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141967454 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 141968072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141968095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141968354 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 141969833 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 141970407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141972626 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141972750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141973538 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 141975814 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141976460 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141976777 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 141977982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141980483 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 141982884 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141983012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141983427 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 141983988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141985987 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141986396 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 141987381 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 141987775 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141987888 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141988008 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 141988065 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 141988099 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 141988137 C T N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 3 141988142 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 141988423 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 141988624 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141988942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141989171 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 141989240 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 141989465 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 141989495 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 141989618 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 141989703 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 141989755 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141989763 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141989811 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 141990600 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 141990605 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 141990730 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 141990932 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 141990994 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141991007 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141991043 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141991124 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141991224 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141991332 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141991341 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141991425 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141991479 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 141991986 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141992021 T G N N 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 141992921 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 141993805 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 141993857 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 141993939 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 141994046 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141994047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141994186 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141994453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 141994501 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 141994730 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 141994756 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 141994767 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 141994784 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 141995392 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 141995478 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141996299 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 141996699 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141996725 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141996872 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 141996963 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 141997040 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 141997228 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 141998244 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141999660 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 141999858 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142000376 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142000378 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 142000654 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142001240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142001669 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 142001773 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 142001933 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 142002414 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142002731 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 142002742 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 142002904 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 142003022 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 142003339 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 142003577 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 3 142003615 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 142003667 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142003679 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142003862 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 142004000 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 142004957 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 142006256 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142007055 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142007257 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142007271 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142007394 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142009494 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142009872 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142010517 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 142011128 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142011620 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 142012362 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 142012837 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142012959 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 142012975 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 142014067 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 142014095 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 142014107 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 142014345 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 142014897 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142014978 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 142014992 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 142015027 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142015093 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 142015120 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 3 142015296 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 142015297 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 142015321 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 142015483 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 142015562 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 142015805 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142015962 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142016059 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 142016223 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142016541 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142016634 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 142016848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142017016 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 142017040 C A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 142017084 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 142017112 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 142017262 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142017380 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142017511 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142017654 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142017950 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142018181 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142018224 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142018259 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142018836 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142020726 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 142021360 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 142022724 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 142023427 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 142024310 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 142024637 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 142024836 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 142025068 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142025097 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 142025107 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 142025243 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 142025319 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142025399 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142028234 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142028972 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142029455 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 142030373 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 142030535 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 142030571 A C N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 142030578 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 142030584 G T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 142032309 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 142032618 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 142032766 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142032821 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142033379 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142033396 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 142033925 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 142034041 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 142034134 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 142034388 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142034474 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 142034490 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 142035288 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 142038417 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142038754 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 142039051 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142039082 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 142039344 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 142040414 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142040728 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142040789 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142040835 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142040989 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142042105 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 142042255 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 142042364 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142042603 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 142042774 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142042789 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142042888 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142042918 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142042944 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142043174 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 142043204 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 142043430 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 142043492 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142043524 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142044100 G A Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 3 142045739 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142045782 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 142045813 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 142045841 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 142045955 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 142046029 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 142046377 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 142046410 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142046555 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142046757 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 142047105 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142047139 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 142047313 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142047324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142047371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142047387 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142047471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142047574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142047792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142047903 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142047990 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 142048020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142048679 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 142048737 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142048878 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142048908 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 142049100 G T N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 3 142049125 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 142049135 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 142049191 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 142049698 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 142049796 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 142049873 C G Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 142049897 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 142050027 G A N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 142050677 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142050750 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142050800 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142050857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142051309 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142051420 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142051457 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142051501 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142052556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142052574 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142052699 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 142052704 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 142052853 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 142053235 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142053711 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142053725 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142053757 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142053783 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142054219 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142054317 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142054331 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142054952 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142056576 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 142056717 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 142056746 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 142056756 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 142056900 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142057537 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 142057566 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142057621 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142058503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142059299 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 142059512 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 142059588 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 142059842 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 142059847 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 142059930 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 142060230 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142060360 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142060363 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142060517 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142060555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142060556 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 142060640 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142060651 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142060692 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 142060853 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142060957 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142061109 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142061133 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142061627 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142061718 C A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 142061797 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 142061871 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 142061923 G T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 142061954 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 142062082 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 142062131 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 142062142 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 142062166 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 142062300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142062307 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 142062484 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142062667 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142062708 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142063454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142064001 T C N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 142064789 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142064856 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142065826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142066086 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142067770 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 142067903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142068304 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142068370 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142068453 G T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142068514 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142068658 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142068822 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142069057 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142069150 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 142069176 T G Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 142069354 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142069365 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142069633 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 142069782 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 142069833 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142069839 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142069851 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142069861 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142069867 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142069879 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142069906 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 142069916 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 142069931 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 142070014 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142070026 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142070043 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 142070419 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142070577 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142070596 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142070913 G A N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 142070984 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 142071037 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 142071041 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 142071177 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 142071201 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 142071284 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 142071490 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 142071564 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 142071655 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142071707 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142071742 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142071759 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142071768 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142071973 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142072184 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 142072251 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 142072392 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 142072469 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142072864 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 142072941 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 142072994 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142073012 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142073086 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 142073210 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142073216 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 142073446 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142073725 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142073766 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 142073872 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 142073928 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142073980 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142073991 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142074000 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142074014 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142074043 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142074103 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142074206 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142074303 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 142074307 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 142074399 A T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 142074505 A G N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 3 142074551 T C N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 142074552 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 142074640 A G N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 142074712 A C N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 142074751 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142074758 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 142074850 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142075056 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142075132 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142075146 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142075778 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 142075803 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142075842 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 142075871 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 142075893 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 142075938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142075952 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142076009 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 142076091 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142076104 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 142076263 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142076297 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142076311 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142076370 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 142076421 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142076443 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142076613 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142076627 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142076730 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142076753 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142076769 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 142076789 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142076803 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142076837 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142076875 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 142077019 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142077072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142077080 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 142077126 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 142077154 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142077206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142077338 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142077406 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 142077411 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 142077470 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142077476 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142077619 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142077673 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142077732 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142077741 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142077874 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142077875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142077978 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 142078128 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 142078159 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142078180 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142078225 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142078289 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142078531 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142078544 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 142078840 G T N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 142079087 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 142080409 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142080423 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142080529 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142080901 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 142081106 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142081229 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142081275 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142081318 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142081353 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142081754 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142081758 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142081765 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 142081933 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142081942 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142081977 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142082196 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 142082488 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142082513 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142082606 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 142082647 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 142082909 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 142083189 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142083216 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 142083282 C T Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 142083638 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142083656 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142083860 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 142084189 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142084308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142084585 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142084730 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 142084773 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 142084807 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 142084882 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 142085197 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142085332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142085498 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142085680 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 142085974 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142086150 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 142086610 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 142086880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142086972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142087239 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142087701 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142088235 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142090968 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142091701 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142092134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142092168 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142092205 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142092322 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 142092334 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 142092730 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 142093160 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142093310 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142093319 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142093357 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142093372 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142093422 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142093518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142093737 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142093956 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142093965 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142093989 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142094242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142094255 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142094281 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142094297 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142094382 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 142094383 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 142094452 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 142094454 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142094478 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142094597 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142094707 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142094712 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142094741 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142095158 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 142095982 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142096007 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142096115 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142096162 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 142096289 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 142096310 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 142096586 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 142096600 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142096651 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142096729 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 142096771 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142096841 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142096890 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142096913 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142096948 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 142097125 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 142097467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142097983 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142098045 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 142098059 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 142098326 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 142098393 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 142098405 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 142098409 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 142098418 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 142098470 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 142098484 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142098754 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 142098817 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 142098916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142099042 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142099151 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142099869 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142100056 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 142100157 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 142100181 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 142100251 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142100387 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142100916 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142100929 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142101416 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142101426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142101645 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 142101665 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 142101710 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142101763 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 142101766 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142102128 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 142102135 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 142102234 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 142102344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142102374 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 142102636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142102753 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142102819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142103263 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142103500 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142103520 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142103559 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 142103647 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 142103827 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142103906 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142103918 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142103957 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 142103974 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142103977 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142104006 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142104045 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 142104097 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142104159 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142104177 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 142104189 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 142104245 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 142104282 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 142104496 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 142104529 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142104789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142104829 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142104847 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 142104877 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 142104919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142104944 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 142104986 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 142105033 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142105181 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142105730 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142106099 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142106143 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142106197 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142106378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142106495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142106508 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 142106536 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142107200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142107876 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142107929 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142107957 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 142108399 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142110279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142110962 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142111461 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142111605 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142111685 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142111696 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 142111700 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 142111710 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 142111798 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142111828 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142111853 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 142112503 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142112643 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142113246 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142113813 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 142113903 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 142114038 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 142114039 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142114060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142114270 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 142114516 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 142114545 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 142116805 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 142116985 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142117022 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142117126 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 142117129 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 142117151 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 142117250 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142117748 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142118117 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142118194 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142118202 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142118284 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 142118316 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142118497 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142118846 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142119195 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 142119199 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 142119270 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142119436 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 142119471 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 142119547 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 142119607 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 142119715 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142119716 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142119787 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142119847 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142119996 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 142120339 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 142120552 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 142120595 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 142120601 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 142120698 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 142120712 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 142120733 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 142121161 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 142121314 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142121466 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142121477 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142121488 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142121500 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 142121610 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 142121671 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142121725 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 142121757 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 142122169 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 142122301 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 142122330 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 142122377 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 142122403 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 142122453 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 142122513 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 142122713 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142122965 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142122977 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 142123098 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 142123112 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142123139 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142123789 A T N N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 142123895 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 142123983 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 142124014 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 142124206 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142124351 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 142124363 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142124557 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142124688 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142124772 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142124808 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142125604 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 142125621 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142126022 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 142126065 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142126083 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142126173 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142126260 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 142126292 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142126531 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142126878 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 142127263 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 142127286 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142127582 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142127668 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142127810 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 142128125 C G Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 3 142128722 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142128862 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 142129027 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 142129064 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 142129118 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 142129308 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 142129364 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 142129375 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 142129602 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142129604 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 142129754 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 142129950 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142130141 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 142130156 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 142130185 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 142130218 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 142130751 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 142130904 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 142130923 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142131011 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 142131806 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142132066 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142132067 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142132427 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 142132932 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 142133002 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 142133025 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 142133163 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 142133245 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 142133334 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 142133425 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142133673 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142133755 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 142133761 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 142133881 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142133948 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142133955 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142133992 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142134239 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 142134695 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 142134706 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 142134710 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 142134750 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 142134849 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 142135068 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142135585 C G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 142135824 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 142135907 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 142135932 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 142135937 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 142136111 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 142136711 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 142136824 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142136918 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142136988 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142137304 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 142137368 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 142137516 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 142137631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142138307 A G Y Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.181818181818182 0.818181818181818 0 13 9 2 9 0 3 142138597 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 142138793 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142138832 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 142139251 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 142139351 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 142139380 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 142139678 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 142139834 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142139986 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142141068 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142141126 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 142141215 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142141977 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142141992 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 142142014 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 142142067 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 142142073 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 142142101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142142530 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142142534 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 142142550 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 142142567 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142142606 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 142142683 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142142827 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142143072 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 142143127 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 142143373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142143379 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 142143453 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142143563 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 142143569 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142143596 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 142143599 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 142143610 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 142143682 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 142143724 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 142143752 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 142143883 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 142143925 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 142144067 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 142144107 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 142144223 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142144302 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 142144322 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 142144349 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 142144554 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142144590 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142144850 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 142144875 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 142144909 A G N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 3 142145171 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142145175 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 142145300 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142145360 G T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 142145450 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 142145503 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142145556 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142145654 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142145808 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 142145855 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 142145882 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142145963 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 142145975 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142146056 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142146089 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142146098 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142146281 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142146305 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 142146384 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 142146483 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 142146509 T G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 142146525 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 142146539 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 142146557 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 142146741 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 3 142146855 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 142146948 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 142146952 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 142147043 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 142147068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142147131 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 142147142 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142147159 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 142147300 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 142147343 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 142147466 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142147474 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 142148855 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 142148958 A G N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 142149011 A C N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 142149547 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142149672 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142149685 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 142149775 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142149909 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 142149913 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 142149972 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 142149988 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 142150010 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 142150117 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142150225 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 142150375 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 142150388 T A N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 142150390 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 142150525 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 142150561 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 142150711 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 142150779 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 142150990 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142151030 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142151056 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 142151132 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 142151297 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142151315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142151324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142151569 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 142151641 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142151647 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142151668 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142151676 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142151680 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 142151730 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142151825 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 142151855 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 142151938 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142151966 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142151973 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142152071 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 142152083 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142152192 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142152198 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142152216 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142152218 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142152293 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142152380 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142152484 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142152510 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 142152558 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142152585 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142152608 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 142152665 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142152692 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 142152846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142153173 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 142153320 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 142153356 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142153462 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142153543 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 142153574 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 142153611 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142153651 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142154985 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 142156114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142157385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142161070 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 142161148 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 142162138 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142162293 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 142162642 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142167310 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 142167702 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 142168324 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 142168325 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 142168455 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 142169469 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 142170488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142171867 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 142172028 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 142172345 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 142181756 T C Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 142182026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142182306 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142188103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142188303 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 142189434 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142189730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142190516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142193252 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142194200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142195056 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142195560 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 142196868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142196987 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 142197035 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 142198213 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 142198287 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 142199209 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 142199813 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 142199878 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 142200092 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 142201318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142201597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142204791 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142206134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142206365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142207846 T A N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 142208997 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142209085 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 142209145 A C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 142210070 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 142211621 C G Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 142211709 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142212494 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142212767 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 142212972 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142213316 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 142213365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142213553 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 142214127 A G N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 3 142215319 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142216436 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142218624 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142219548 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 142219783 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142219842 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142219890 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 142219924 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142219983 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142220063 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 142220093 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142220127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142220181 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 142220393 T A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 142220396 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142220414 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142220949 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142221600 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142221768 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142222347 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 142222437 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142223397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142223554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142224489 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142224628 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142225264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142225280 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142226044 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142226049 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142226118 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142226177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142226807 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142226845 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142226934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142227089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142227609 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142227903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142228453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142228491 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142228647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142228691 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142228846 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142228907 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142228917 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142229070 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142229099 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142229157 G C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 142229174 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 142229199 C G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 142229319 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142229590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142229634 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142230082 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142230251 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 142230264 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142230341 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 142230663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142231188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142231656 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142231954 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 142232208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142232693 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142232932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142232997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142233030 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142233121 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142233138 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142233458 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 142233591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142233740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142234081 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 142234342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142234438 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 142234633 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142234647 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142234730 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142234793 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142234982 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 142234989 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142235085 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0 0.75 0.25 12 20 0 12 4 3 142236894 C T Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 142236899 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 142239110 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 16 8 4 8 0 3 142239111 G T Y N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.307692307692308 0.692307692307692 0 17 9 4 9 0 3 142240119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142240405 C T Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 142240979 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142241339 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142241632 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142241753 G T Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 3 142241947 T C Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 142241952 T A Y N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 142242379 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 142242575 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 142245760 A C Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 142245767 T G Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 142245989 T G N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 142246059 G A Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 142246099 T A Y N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 142246100 A G Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 142246161 G T Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 3 142246420 C A Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 142246709 A T Y N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 142246716 C T Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 142246970 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 142247027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142247229 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 142247258 A G Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 3 142247337 C G Y N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 3 142247343 C G Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 142247472 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 142247517 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142247708 C A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 142248149 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142248535 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 142248620 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 142248621 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142248957 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142249207 C T N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 3 142249256 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 142249550 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 142249552 C G Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 142249613 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 142249700 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 142249892 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 142249893 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 142249922 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142249960 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142255717 A G Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 142255762 A G N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 16 12 2 12 0 3 142257263 A G N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.153846153846154 0.846153846153846 0 15 11 2 11 0 3 142258173 C A Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 19 17 1 17 0 3 142258637 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 142258644 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 142258655 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142258662 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 142258691 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 142258701 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 142258727 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 142258742 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 142258791 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 142258803 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 142259010 T G N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 142259104 A G N Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 5 5 1 3 1 3 142259177 A G N Y 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 3 142259192 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 3 142259196 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 142259208 C G N N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 3 142259413 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 142259515 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 142259568 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 142259702 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 142260416 A T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 142260439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142260510 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 142260541 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 142260557 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 142260790 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 142268728 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 142272205 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 142272342 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142272378 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142277745 G A Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.142857142857143 0.857142857142857 0 16 12 2 12 0 3 142277755 C T Y Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.181818181818182 0.818181818181818 0 13 9 2 9 0 3 142277952 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 142278064 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 142278260 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 142285090 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 142285102 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 142285190 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 142285332 T C N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.363636363636364 0.363636363636364 0.272727272727273 12 10 4 4 3 3 142285385 G T N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.333333333333333 0.6 0.0666666666666667 19 11 5 9 1 3 142285510 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 142285536 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 142285645 A T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 142285647 A G Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 142285688 T A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 142285716 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142285908 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 142286956 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 142286959 T G Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 142286974 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 142287096 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 142287200 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 142287494 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 142287535 T G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 142287543 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 142288845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142288884 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 142288970 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 142289168 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 142289218 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 142289278 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 142289566 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 142290966 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142291193 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 142291374 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 142292722 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 142292823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142292910 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 142292942 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142292981 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142292991 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 142293113 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142293306 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 142294913 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142295045 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 142295049 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 142295082 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 142295111 T C N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 3 142295861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142295876 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 142295911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142296127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142296841 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 142297106 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 142297497 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 142297855 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 142298347 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 142298581 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142299667 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142299714 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 142299757 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 142299859 A T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 3 142301132 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142301283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142301429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142301741 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 142301784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142301994 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 142302222 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 142302279 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 142302330 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 142302333 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 142302694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142302821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142303310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142303321 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142303369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142303380 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142303427 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142303527 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 142303588 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 142303640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142303715 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 142303726 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 142303990 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 142304009 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142304027 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142304051 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 142304055 C A N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 142304162 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 142304250 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 142304480 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 142305039 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 142305353 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142305823 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142306844 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142308697 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142308960 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142309400 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 142309446 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142309835 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 142309878 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142311067 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 142311080 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 142311882 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 142313021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142313423 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142319751 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 142320511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142321020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142321147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142321276 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142321570 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142321602 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142321774 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142322281 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142322875 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142323449 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142323549 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142323556 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142323649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142323799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142323888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142323969 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142324081 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142324091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142324198 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142324245 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142324398 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142324463 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 142324588 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 142324680 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142324973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142324988 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 142325078 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 142325112 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142325280 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 142325390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142326070 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 142326088 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142326438 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142326506 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 142327451 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142327584 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142327602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142328279 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142328635 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142328807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142329235 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142329309 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 3 142329349 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 3 142329350 G C Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 142329538 C T Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 3 142329555 T C Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.0625 0.9375 0 17 15 1 15 0 3 142329596 T C Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 16 14 1 14 0 3 142329631 C T Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 3 142329644 G T Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 142329661 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 142329695 T A Y N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 142330430 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142330743 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142330904 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 142332684 A T Y N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 142333205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142333400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142333701 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142333749 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 142334064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142334410 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 142334414 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 142334423 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 142334665 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 142334714 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 142334928 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 142335095 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 142335632 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 142335642 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142335755 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142335788 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 142335817 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 142335951 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 142336226 A G Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 142336254 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 142336270 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142336745 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 142337452 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 142337610 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 142337651 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 142337705 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 142337754 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 142338294 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142338309 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 142338318 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142338593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142338767 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142339390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142339462 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142339926 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 142340003 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142340152 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142340708 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 142340719 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142341979 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142342635 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142342637 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142343049 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142343551 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 142343692 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 142345219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142345330 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 142345378 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0 0.705882352941177 0.294117647058824 12 22 0 12 5 3 142345383 G A Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 3 142345918 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 142346256 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 142346796 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142347310 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142347832 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 142347964 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 142347984 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 142349024 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 142349484 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142349563 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 142350406 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142350431 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142350607 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142352154 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142352242 G A Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 142353729 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142354102 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 142354823 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 142355167 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142355235 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142356227 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 142356411 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142357739 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 142357877 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 142358439 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 142358657 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 142358876 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 142359094 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 142359593 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142359891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142359913 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142360545 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142360606 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142361171 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142362375 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 142362405 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 142364591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142364816 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142366631 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142366635 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142366704 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142366706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142368593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142369370 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142369401 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142369475 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 142369493 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 142369513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142371383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142371961 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 142373324 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 142374484 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142374896 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142376229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142376326 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 142376515 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 142377022 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142378115 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 142378566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142378968 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142380071 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142380099 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142380592 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 142383406 C T N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 142383463 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 142384236 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142384320 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142384786 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 142384788 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 142385208 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 142385307 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 142385460 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 142385477 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 142385552 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 142385592 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 142385604 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 142385609 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 142385806 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 142385815 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 142385831 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 142385848 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142385897 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 142386542 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 142386579 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142386582 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142386671 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142386684 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142386712 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142386743 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 142386989 G C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 142387236 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 142387370 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 142387903 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 142388816 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 142389325 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142389349 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142389511 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142389833 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 3 142390264 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142390549 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142390945 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142391113 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142391214 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 142391347 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 142391382 A T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 142391393 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 142391546 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 142391593 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 142391699 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 142391753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142391781 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 142391821 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 142392472 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 142393006 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142393096 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 142393351 T G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 142393389 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 142393523 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 142393525 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 142393689 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 142394907 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 142394934 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142395036 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142395052 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142395452 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142395553 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 142395815 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142396025 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142396701 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142397145 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142397237 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 142397323 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142397342 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 142397993 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 142398007 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 142398021 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 142398047 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 142398192 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 142398290 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142398351 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 142398842 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142398923 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142398956 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142399127 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142399132 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142399151 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 142399406 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 142399455 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142399566 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142399568 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 142399633 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 3 142399713 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142399715 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142399727 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142399728 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142399895 T A N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 142399913 A C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 142400204 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142400667 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142400761 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 142400994 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 142401022 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 142401055 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 142401252 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 142401286 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 142401333 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142401408 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 142401513 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 142401799 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142402501 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142402775 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142403853 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142403940 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142404062 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 142404076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142404129 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 142405159 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142405211 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142405414 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 142405836 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 142405852 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 142406042 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142406411 C T N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.0909090909090909 11 11 1 9 1 3 142406654 T C N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 142406676 T C N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.636363636363636 0.181818181818182 0.181818181818182 16 6 7 2 2 3 142407378 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142407616 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142407712 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 142407963 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 142408132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142408158 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 142408192 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 142408422 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 142408534 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142408745 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 142408797 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 142408848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142408882 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 142409489 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142410494 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142410589 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142410991 G C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 142411005 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 142411564 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142412793 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142413214 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 142413333 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142413641 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142413681 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 142413770 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 142414486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142414556 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142414615 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 142414694 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142414723 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 142414770 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 142414800 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 142414803 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 142414819 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 142415070 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 142415108 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 142415150 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142415173 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 142415189 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 142415210 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 142415372 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 142415391 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 142415392 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 142415427 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 142415430 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 142415473 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 142415715 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142416925 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142416989 A T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 3 142417517 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 142418184 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 142418504 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 142418703 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 142418868 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 142418882 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142418905 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 142419046 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142419326 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142419578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142419617 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 142419628 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 142419851 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 142419939 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 142419959 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 142420280 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 142421030 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142421042 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142421045 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142421761 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142421939 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142421996 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142422254 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 142422283 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 142422433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142422472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142422748 G T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 142422773 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 142423031 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 142423198 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142423600 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 142423673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142424394 A T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 142424880 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142425350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142425542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142425746 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142426156 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142426298 A C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 142426723 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142426889 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142426978 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142427126 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142427147 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 142427202 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142427584 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142428499 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142428646 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142428834 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142429002 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142429592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142429730 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142429955 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142430838 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 142431388 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142431474 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142431775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142431799 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142431890 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 142432174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142433096 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142433209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142433349 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142433397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142433419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142433637 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142434701 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 142434773 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 142435036 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 142436534 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0 0.777777777777778 0.222222222222222 7 11 0 7 2 3 142436543 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 142436552 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 142436555 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 142436630 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142436672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142437368 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142437941 T G Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 142437987 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142438012 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142438051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142438101 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142438115 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142438124 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 142438429 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142438608 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142438642 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142438654 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142438703 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 142438759 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 142439114 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 142439236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142439412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142439590 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142439727 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 142440112 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 142440221 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142440378 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 142440699 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142441030 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142441039 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142441070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142441462 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 142441943 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 142442042 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142442364 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142443107 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142443372 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142443385 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 142443481 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142443504 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142443526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142443678 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142444623 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142444849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142445164 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142445417 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142445798 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142445830 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142446075 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142446112 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142447091 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142447353 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142447648 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 142447696 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 142447716 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142448378 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142448440 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142448546 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 142448885 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142449055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142449152 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142449172 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142449735 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142449824 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142449952 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142450130 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142450339 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142450465 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142450468 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142450726 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142451030 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 142451039 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142451326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142451476 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 142451588 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142451655 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142452118 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 142452391 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 142452397 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 142452425 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142452493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142452496 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 142452507 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142452846 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 142452895 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142453344 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142453386 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142453546 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 142453710 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142453782 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142453821 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142454168 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142454172 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142454264 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142454392 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 142455192 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142455417 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142456493 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142457064 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142457173 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142457500 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142457547 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142457784 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142457844 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142458097 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142458106 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142458121 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142458125 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142458147 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142458167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142458193 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142458292 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142459203 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142459355 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142459490 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142459968 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142460099 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142460235 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142460255 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142460293 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142460310 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142460332 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 142460340 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142460457 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 142460534 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142460564 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142460791 T C N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 142460901 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142460927 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 142460955 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 142460991 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142461038 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 142461516 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 142461578 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142461683 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142461891 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142462063 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142462312 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142462459 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142462489 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142462502 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142462527 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142462605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142463184 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 142463421 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142463490 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142463502 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142463733 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142463764 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142464227 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 142464397 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142464444 A C Y N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 142464466 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142464729 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 142464758 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 142464934 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 142464988 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142465042 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 142465342 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 142465581 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142465853 A C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 142465888 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 142465890 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 142466198 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 142466304 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142466500 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142466604 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142466888 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 142466992 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 142467178 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 142467514 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 142467625 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 142467789 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142467928 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 142468094 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142468162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142468517 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 142468567 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 142468596 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142468894 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 142468982 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 142469208 A G N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.5 0.0714285714285714 0.428571428571429 15 13 7 1 6 3 142469250 A G N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 3 142469566 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142469593 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142469673 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142469695 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142469873 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 142470052 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142470142 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142470394 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142470935 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142471140 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142471363 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142471566 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142473044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142473606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142474051 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142474151 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142474377 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142475027 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142475321 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142475723 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 142475831 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142475916 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142476046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142476298 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142476639 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142476683 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142476724 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142476930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142476946 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 142478154 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142478803 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142479020 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142480546 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142481070 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 142483198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142485322 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142485465 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142485620 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142485783 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 142486169 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 142486371 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142486861 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142491583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142491754 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 142492664 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 142493943 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142494830 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142496097 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142497755 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142499488 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142499631 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142499867 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142500137 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142501445 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142501485 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142501991 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 142503120 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142504386 C A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 142505514 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142505539 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 142505657 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142505705 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142511918 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142512097 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 142512639 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142514008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142514381 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142522796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142525698 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 142528446 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142529247 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142530754 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 142532938 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 142533104 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142533985 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142534451 G T Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 142536201 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142539854 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142540744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142541786 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142545459 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142545693 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142546304 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 142546395 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142546452 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 142546569 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 142547355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142547378 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142548817 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142549954 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 142550010 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 142550040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142550097 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 142550991 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142551464 T A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 142551901 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142552792 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 142554543 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142557257 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142557765 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142558994 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 142559180 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 142559670 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 142560005 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 142560211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142560771 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142560776 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142560825 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142560988 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 142561255 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 142561382 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142561986 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 142562075 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 142562110 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142562267 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 142562926 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 142562927 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 142563004 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 142563067 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 142563089 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 142563161 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 142563172 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142563218 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 142563265 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142563417 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 3 142563433 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 142563615 G A N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.533333333333333 0.2 0.266666666666667 19 11 8 3 4 3 142563738 C T N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 142564030 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 142564161 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 142564275 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 142564279 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 142564433 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 142564602 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142564716 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 142564915 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 3 142564951 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 142565046 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 142565056 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 142565104 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 142565115 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 142565196 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 142565257 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 142565566 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142565811 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 142565972 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142566030 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 142566048 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 142566061 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 142566063 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142566088 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.529411764705882 0.176470588235294 0.294117647058824 21 13 9 3 5 3 142566105 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 142566144 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142566285 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 142566591 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142566688 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 142566689 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 142566751 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 142566926 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 142567090 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 142567100 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 142567187 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 142567197 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 142567202 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 142567286 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 142567323 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 142567374 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 142567501 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 142567538 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 142567581 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 142567672 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 142567728 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 142567777 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 142567783 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 142567799 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 142567987 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 142568001 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 142568088 G A Y Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 3 142568128 T C N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 3 142568305 A C Y N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 142568390 C A Y N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 142568523 T C Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 142568612 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 142568720 C A Y N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 142568862 G C Y N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 142568878 C A Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 142568985 G T Y N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 142568989 A G Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 142569061 A C Y N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 142569109 T A Y N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 3 142569179 G A Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 3 142569229 T C Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.571428571428571 0.214285714285714 0.214285714285714 19 9 8 3 3 3 142569255 A G Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.666666666666667 0.133333333333333 0.2 22 8 10 2 3 3 142569383 A C Y N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 3 142569540 T G Y N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 142569579 T C Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 142569647 G C Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 142569812 G A Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 142569890 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 3 142569921 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 142570009 G C Y N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 15 9 6 3 3 3 142570068 A G Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 142570114 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.416666666666667 0.5 0.0833333333333333 16 8 5 6 1 3 142570164 C G Y N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 142570210 A G Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 142570745 G C Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 3 142570836 T C N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 142570905 C A Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 142571535 T C Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 142571638 A T Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.2 23 7 11 1 3 3 142571672 A G Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 142571714 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 142571829 T C N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 142571832 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 142571841 A G N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 3 142571853 G A N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 3 142571877 A T N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 18 10 8 2 4 3 142571928 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.444444444444444 0.166666666666667 0.388888888888889 19 17 8 3 7 3 142571974 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 142572002 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 142572124 A C N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 142573923 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 142574115 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142574860 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 142574912 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142574935 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 142574942 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 142575351 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 142575555 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142575808 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 142576067 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 142576068 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 142576114 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 142576176 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 142576207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142576244 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 142576316 C A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 142576318 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 142576334 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 142576345 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 142576406 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 142576457 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 142576509 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 142577340 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 142577473 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142578087 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142578348 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 142578510 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142578618 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 142578637 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 142578724 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 142578753 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142578766 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 142578805 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 142578911 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142578946 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 142579008 C G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 142579257 C T N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 142579397 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 142579522 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 142579600 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 142579627 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 142579628 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 142579717 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 142579734 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 142579897 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 142580211 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142580346 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142582375 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142582446 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 142582622 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 142582650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142584598 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 142584704 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 142584737 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 142584768 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 142584794 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 142584847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142585108 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 142585201 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142585234 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142585246 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142585308 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 142585492 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 142585583 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142585995 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 142586169 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 142586190 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 142586204 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 142586575 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 142586600 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142586645 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142586793 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142586870 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 142586946 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 142586989 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 142587001 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 142587010 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142587139 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 142587142 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 142587259 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142587318 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 142587377 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 142587660 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142587694 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142587805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142587986 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 142588681 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142588806 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142588808 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142589020 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142589043 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142589080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142589106 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142589127 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142589166 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142589190 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142589362 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142589382 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 142589466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142589544 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142591438 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142591835 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142591880 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 142592018 A G N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 142592032 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 142592153 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142592193 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 142592243 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142592263 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 142592389 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142592466 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142592598 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 142592744 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 142592764 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 142592776 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 142592963 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142592994 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 142593379 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 142593585 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142594106 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 142594107 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 142594191 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 142594652 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 142594794 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 142594836 C T N Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.6 0 0.4 6 4 3 0 2 3 142594870 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 142594915 G A N Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 142594940 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 142595064 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 142595118 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 142595131 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 142595272 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142597364 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 142597962 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 142598026 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 142598357 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 142598425 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 142598690 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142598866 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 142598959 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142599011 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 142599300 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142599317 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142600390 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 142600403 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 142602118 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142602136 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142602584 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142602712 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 142602720 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142602937 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142603081 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 142603100 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142603568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142603662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142603803 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142603945 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142605039 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142605132 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142605235 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 142605599 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142605905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142605921 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 142605923 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 142606025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142606302 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 142606380 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142606909 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 142607033 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 142607223 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142607297 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 142607960 A G N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 142608132 A G N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 142608212 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142608257 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 142608488 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 142608573 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 142608987 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142609025 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142609059 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 142609108 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142609242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142609320 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 142609492 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142610935 C G N N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.625 0.125 0.25 11 5 5 1 2 3 142610939 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 12 6 5 2 2 3 142610957 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 3 142610989 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 142611053 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 142611417 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 142611444 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 142611477 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 142611480 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 142612223 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142612917 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142613280 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142613650 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 142613654 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 142613692 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 142613986 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 142614444 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 142614628 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 142614686 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 142614797 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 142615125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142615202 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 142615300 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 142615352 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 142615377 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 142615415 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 142615459 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 142615705 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 142615876 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 142616005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142616061 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142616468 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142616635 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 142616737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142616740 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142616858 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 142616919 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 142617011 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142617090 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 142617207 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 142617217 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 142617521 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 142618116 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 142618481 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142618551 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 142618612 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 142618632 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 142618895 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 142619280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142619590 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142619628 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142619638 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 142619718 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142619795 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 142619800 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 142620421 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 142620456 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 142620468 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 142620505 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 142620590 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 142620612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142620696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142620701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142620945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142621175 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142621908 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142621987 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142622525 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 142622842 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 142622887 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 142622904 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 142622959 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 142623636 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142623680 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142623837 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142624291 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142624488 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142626846 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142627665 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 142627693 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 142627904 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142628115 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 142629250 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142629277 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142629436 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 142629547 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142629649 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142629870 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142629966 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142630019 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142630042 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142630152 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142630283 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142630617 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142631606 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142634213 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142634607 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142635592 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142635617 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142635831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142639770 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142640769 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142640810 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142642264 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142642390 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142644624 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142645253 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142645827 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 142645869 C G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 142646575 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142646632 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 142646971 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 142647114 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 142647199 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 142647510 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 142647591 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142647920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142648222 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142648418 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 142648613 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142648618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142649335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142649665 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142649957 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142650415 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142650475 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142650542 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 142652658 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142652811 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 142653026 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 142653603 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 142653634 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 142654178 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 142654214 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142655553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142656024 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142656358 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142656391 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142656505 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142656553 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142656555 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142656565 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142656592 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142656611 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142656687 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142656723 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142656745 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142656877 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142656883 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142656890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142657050 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142657060 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142657362 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142657527 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142657560 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142657574 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142657768 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142658008 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142658048 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142658287 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142658591 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 142658619 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142658666 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 142658706 T A N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 142658813 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 142658946 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142658975 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142659264 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 142659475 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142659611 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142659708 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142659779 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142659889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142660001 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142660763 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 142661265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142662456 T G N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 142664140 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 142664182 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142664590 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 142664691 T C N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.272727272727273 0.727272727272727 0 14 8 3 8 0 3 142664960 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 142665094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142665365 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 142665498 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 142665777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142665889 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 142666001 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 142666122 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 142666256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142666316 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 142666449 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142666476 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142666499 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142666520 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 142666553 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 142666601 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 142666692 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142666789 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 142667084 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 142667183 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 142667255 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 142667325 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 142667338 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 142668070 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 142668087 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 142668106 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 142668330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142668353 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 142668378 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 142668397 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 142668403 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 142668544 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142668591 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 142668678 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 142668802 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142668916 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 142669013 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 142669067 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 142669074 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 142669112 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 142669124 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 142669227 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 142669241 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 142669283 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 142669423 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 142669452 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 142669744 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 142669809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142669819 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 142669864 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 142669899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142669954 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 142669995 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 142670037 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 142670079 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 142670290 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 142670491 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142670916 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 142671838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142672018 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142672547 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142673127 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142673823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142674366 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142675641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142678695 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142678967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142679571 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 142679831 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142680401 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 142680458 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 142680479 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 142681953 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142682807 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142683432 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142684608 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142685181 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142686431 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142696193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142701202 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 142701363 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142702896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142703098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142704588 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 142704633 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 142705764 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142705822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142706808 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 142706903 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 142707157 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 142707167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142707224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142707232 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 142707252 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 142707683 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 142707747 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 142707899 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142708292 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142708351 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 142708405 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142708938 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 142709135 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142710127 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 142710209 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142710690 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 142710881 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 142710961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142711050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142711064 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 142711077 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 142711347 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142711348 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142711500 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 142711616 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142711909 G A N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 3 142711925 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 142711937 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142712283 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142712312 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142712437 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 142712627 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142712637 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 142712915 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 142713150 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142713155 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142713186 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 142713302 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142713309 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142713316 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 142713342 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 142713366 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 142713497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142713556 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142713568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142713607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142713728 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142713854 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142714042 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142714206 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142714226 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 142714873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142714884 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142715035 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142715171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142716694 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 142717842 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 142718115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142718559 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 142719359 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 142720405 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 142720586 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142720592 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142720760 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142720770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142720991 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 142721802 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 142722313 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 142722447 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 142722458 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 142722583 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 142722864 A T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 142722906 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 142723103 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 142723252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142723340 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 142723405 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142723573 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 142723874 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 142724288 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 142724440 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 142724858 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 142725030 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142725407 T G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 142725453 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 142725485 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142725602 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142725648 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 142725949 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 142726320 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 142726321 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 142726449 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142726543 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 142726665 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 142726751 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 142726927 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 142726942 A C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 142726967 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 142726970 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 142727150 A T N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 142727191 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142727214 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142727243 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142727253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142727268 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142727291 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142727335 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 142727832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142727972 A G N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 142728279 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 142728344 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142730995 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142731126 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142731382 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142731700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142731822 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142733640 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 142733956 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142734137 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142734657 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142735075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142735145 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142736452 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142736636 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142738475 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142739577 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142739725 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142739726 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142739967 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142740279 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142740579 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142740726 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 142740755 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 142741099 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142741540 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 142741792 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142742781 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 142743384 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142743614 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 142744244 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 142744635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142744926 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142745169 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142745174 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142745198 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142745294 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142745417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142745686 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142746099 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 142746403 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 142746467 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 142746769 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142746893 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142747024 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 142747037 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142747454 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 142748866 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 142748924 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 142749159 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142749513 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 142749772 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 142749880 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 142750421 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 142750495 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 142750802 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142750995 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142751236 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142751304 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 142751319 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 142751360 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142751390 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 142751427 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 142751502 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142751536 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142751584 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 142751854 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 142751968 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 142751990 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142752272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142752301 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 142752534 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142752545 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142752709 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 142752804 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 142752993 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142753004 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 142753091 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 142753252 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 142753511 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 142753922 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 142755307 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 142755560 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 142755673 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142755710 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142755803 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142755828 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 142755960 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142756407 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142756410 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 142756434 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142756550 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142756789 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142756909 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142757221 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142757512 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142757519 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142757656 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142757739 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142757820 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142757879 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142758879 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142759101 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142759124 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 142759179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142759186 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142759234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142759241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142759450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142759569 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142759655 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142759742 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 142759791 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142759835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142759977 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142759995 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 142760012 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 142760208 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 142760218 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 142760220 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 142760277 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 142760316 T C Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 142760369 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 142760632 T C N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 142760633 G C N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 142760647 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 142760648 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 142760664 C G N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 142760672 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 3 142760753 A T Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 142760790 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 142760919 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 142760924 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142760938 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 142760996 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 142761126 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 142761411 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142761473 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142761730 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 142762645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142762714 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142762851 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142763113 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142763371 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142764987 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 142765139 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 142766761 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142768449 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142770036 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142770795 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142771690 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142772474 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142772594 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142773217 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142773303 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 142774794 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142774981 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 142775042 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142775230 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142775392 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142775741 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142776545 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142776940 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 142776981 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 142777107 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142777206 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142777217 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142777222 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142777389 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142777418 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142777573 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 142777694 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 142777810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142777954 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 142778297 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142778330 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142778577 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142778650 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142778738 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142778745 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 142778788 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142778881 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142778967 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 142779306 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142779632 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 142779934 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142780949 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142781080 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 142781189 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142781221 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 142781229 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142781233 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 142781398 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 142781399 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142781425 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142781487 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 142781820 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 142781950 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 142782116 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142782199 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142782357 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 142782638 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 142782715 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142782840 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142782936 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 142783006 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 142783136 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 142783208 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 142783313 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142783458 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 142783587 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 142783617 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 142783650 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 142783700 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142783773 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 142783796 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 142784032 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 142784171 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142784290 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 142784415 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 142784419 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142784495 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142784508 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142784731 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142785150 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142785155 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 142785188 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 142785278 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 142785307 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 142785331 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 142785494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142785566 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 142785569 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142785600 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142785619 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 142785794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142785809 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142785820 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142785823 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 142785970 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 142785985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142785988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142786001 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142786072 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142786221 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 12 6 5 2 2 3 142786374 T C N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 3 142786437 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142786440 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 142786558 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 142786635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142786912 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142787119 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 142787182 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142787199 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142787233 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142787278 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142787480 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142787658 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142787845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142788118 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142788182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142788203 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142788225 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142788489 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142788518 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142788564 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142788692 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 142788853 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142789188 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142789265 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142789277 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 142789496 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 142789552 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142789662 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142789793 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 142789814 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 142789976 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142790340 T A N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 142790665 T C N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 142791125 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 142791655 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 142792625 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142792742 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142793029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142796218 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142796306 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142796669 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142796894 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 142796924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142796969 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 142797076 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 142797160 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 142797312 T C N Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 3 142798559 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 142798639 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 142798719 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 142798728 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 142798761 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 142799074 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142799158 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 142799259 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142799371 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142800161 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 142800427 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 142800543 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 142800565 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 142800622 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142801576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142801653 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142801725 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142802112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142802190 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142802321 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142802447 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142802633 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 142803021 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142804847 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142805879 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 142806447 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142806810 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142806915 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142807333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142807489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142807594 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142807656 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142807753 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142807894 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142808175 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142808652 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 142808739 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 142808840 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 142808902 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 142809045 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142809330 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142809950 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 142810168 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142810225 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 142810343 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 142810515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142810997 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 142811186 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 142811207 T G N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 3 142811857 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142811895 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142812340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142812570 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142812783 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142812922 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142813093 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 142813234 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 142813344 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 142813723 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142813735 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 142813753 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 142813880 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 142813893 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142813943 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142814158 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 142814413 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 142814586 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142814891 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 142815113 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 142815249 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 142815250 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 142815269 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 142815366 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 142815422 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142815508 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 142815664 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 142815732 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 142816500 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142816511 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 142816549 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142816729 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 142816922 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142818072 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142818100 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 142818208 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 142818432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142818446 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 142818593 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142818813 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142818845 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 142818885 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142819029 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 142819109 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 142819123 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142819336 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 142819730 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 142819772 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 142819976 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142820108 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142820192 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142820218 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 142820231 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 142820327 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 142820332 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 142820908 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142820962 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 142821385 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142821399 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142821444 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 142821992 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142822438 C A Y N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 142822561 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142823203 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 142823274 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 142823419 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 142823490 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 142823588 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 142823699 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142823715 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 142823942 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 142823953 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142824155 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142824279 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 142824314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142825195 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142825251 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142825277 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142825399 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142825483 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142825528 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142825778 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142825910 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142826512 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142826573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142826716 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142827176 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 142827534 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142828168 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 142828195 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 142829280 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142829646 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 142830116 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 142830879 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 142830914 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 142831298 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 142831378 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 142831761 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 142831777 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 142831946 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 142832188 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 142832223 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142832456 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 142833053 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 142833656 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142833734 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142833783 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142833828 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142833886 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142834020 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142834136 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142834236 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142834278 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142834396 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142834513 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142834525 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 142834664 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 142834737 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142834741 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142834793 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 142834822 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142835019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142835021 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142835083 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 142835233 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 142835273 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 142835556 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 142835607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142835636 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142835986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142836884 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 142836888 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 142837557 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 142837615 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142837839 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 142837880 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142837998 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142838011 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 142838029 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 142838120 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142838409 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142838465 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142838472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142838476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142838489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142838499 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142838688 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142838699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142838794 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142838942 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 142839033 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 142839051 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 142839064 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142839076 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142839168 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142839342 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 142839354 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 142841108 C G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 142841210 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142841276 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142841306 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142841324 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142841429 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142841457 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 142841476 C T Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 142841590 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142841639 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 142841908 G T Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 142841926 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142842013 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142842080 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142842199 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142842307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142842341 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 142842356 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142842361 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 142842512 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142842569 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142842677 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142842692 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142842694 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142842738 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142842764 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 142842793 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 142842998 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142843225 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142843228 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142843300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142843368 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142843400 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142843425 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142843453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142843457 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142843469 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142843479 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142843521 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142843537 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142843562 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142843594 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142843814 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142843960 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142843984 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142844100 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142844153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142844208 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142844216 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142844592 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142844707 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142844721 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142844772 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142844785 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142844795 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142844846 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142845153 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 142845282 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142845384 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142845417 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142845567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142845673 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142845857 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142845957 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142845976 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142846115 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 142846309 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142846654 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142846788 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 142846808 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 142846963 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 142847028 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 142847079 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 142847096 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 142847108 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 142847123 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 142847305 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 142847322 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 142847431 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 142847624 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 142847629 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 142847889 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 142847901 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 142847906 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142847927 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 142847956 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142848003 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 142848034 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 142848082 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 142848154 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142848185 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142848289 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142848317 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142848439 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142848448 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 142848618 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142848732 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142849027 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142849045 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142849064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142849135 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142849281 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142849581 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142849995 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 142850110 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142850122 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142850230 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142850479 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142850666 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142850774 C A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 3 142850788 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142850805 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142851152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142851170 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142852043 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142852525 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 142852913 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142853623 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142853670 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142854062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142854547 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142854868 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142854934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142855102 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 142855119 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142855153 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 142855295 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142855396 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 142856021 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142856084 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142856226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142857029 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142859058 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142859166 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142859371 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142859568 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 142859582 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 142860410 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142860617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142860683 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142860739 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 142860869 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142861774 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142861952 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 142862169 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 142862189 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 142862200 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 142862201 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142862235 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142862259 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142862440 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 142862618 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 142862887 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 142864296 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 142864492 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 142864918 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142865871 T A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 142865914 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 142866092 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142866828 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142867393 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 142868089 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142869529 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142870642 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 142871733 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 142872157 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 142872354 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142872878 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142872901 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 142873195 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142875840 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142876065 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 142877320 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142878444 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142882567 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142883342 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142886073 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142890400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142892692 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 142893669 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 142893968 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142896601 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 142897381 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142902466 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 142903461 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142905653 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 142906053 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142906181 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142906581 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142908026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142908144 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142908210 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142908340 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 142908787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142908805 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142910029 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142911357 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142913091 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142913536 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142916004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142918560 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 142920607 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142920702 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142920764 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142921096 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142921826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142921961 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142922003 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142922325 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142923112 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142925256 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142926738 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 142931294 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 142931356 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 142932514 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 142935669 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142936211 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 142936322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142936704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142936764 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142937010 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142937541 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142939378 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 142940724 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142940726 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 142940747 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 142940959 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 142940990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142941000 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 142941011 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142941036 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 142941093 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 142941130 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 142941148 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 142941306 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 142941340 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 142941358 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 142941380 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142941485 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 142941517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142941568 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 142941580 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 142941593 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142941760 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 142941807 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142941815 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142941893 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 142941958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142942107 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 142942148 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142942192 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 142942224 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142942520 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 142943382 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 142943386 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142943740 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 142943918 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 142944011 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142944161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142944197 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 142944350 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142944408 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 142944411 T A N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 142944449 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 142944475 A C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 142945329 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 142945710 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 142945746 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142945970 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142946065 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 142946182 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142946183 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142946346 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 142946988 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142947471 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142947770 A T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 142948018 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142948154 C T N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 3 142948602 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 142949037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142949997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142951961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142952653 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142952765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142952791 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 142954025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142954326 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 142956149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142956987 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142956994 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 142958312 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142960375 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142960851 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142960934 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 142962551 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 142964126 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142964609 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 142964774 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 142965315 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 142965573 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142966584 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 142966631 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 142966712 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 142966770 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 142966836 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 142967206 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 142967697 T C N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.3 0 0.7 6 14 3 0 7 3 142968113 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 142968410 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 142968615 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 142969143 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 142970177 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 142970839 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142971143 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142972196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142972388 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142973682 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 142974812 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 142975033 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 142975395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142975603 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 142977350 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142978123 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142978579 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142979968 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 142980904 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142981043 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142981114 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 142982532 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142982726 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142982952 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 142986633 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142987302 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 142988285 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142989396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142993683 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142993807 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142993867 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 142993920 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142994041 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142994116 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142996031 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142996112 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 142996797 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142996817 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142997028 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 142997058 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 142997080 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 142997098 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 142997230 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 142997257 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 142997274 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 142997406 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 142997433 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 142997519 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142997719 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 142997757 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142997972 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142998036 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142998171 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142998187 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142998228 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 142998304 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 142998467 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 142998521 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 142998610 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142998767 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 142998809 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142998840 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 142998851 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142998884 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 142998904 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142999092 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 142999093 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142999205 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 142999268 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 142999283 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 142999317 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 142999358 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 142999593 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 142999876 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 142999933 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 143000098 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143000120 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143000584 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143000643 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143000683 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 143000718 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143000829 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 143000832 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 143000843 C T Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 143001221 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143001236 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143002380 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 143002381 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 143002493 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143002606 A G N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 143002617 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 143002629 T C N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 143002735 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 143002784 C T Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 143003071 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 143004340 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143005710 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143006674 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143007073 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143008097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143008108 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143008119 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143008325 T A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 143008357 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143008362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143008499 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 143008643 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 143008728 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 143008903 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 143008988 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 143009008 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 143009104 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 143009139 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 143009154 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 143009306 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 143009579 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 143010119 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 143011637 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143011879 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143012115 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 143012697 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143014198 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 143014294 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 143014656 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 143014668 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143015147 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143015362 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 143015676 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143015736 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 143015748 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 143015755 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 143015805 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 143015870 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143015871 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 143015980 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143016092 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143016217 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 143016220 C G N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 143016323 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 143016476 C A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 143016531 T C N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 143016559 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 143016672 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 143016710 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143016739 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143016757 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 143017061 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143017213 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 143017384 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143017468 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143017830 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 143017928 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 143017969 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143018045 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143018095 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 143018347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143018433 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143018587 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143018953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143019228 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 143019255 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 143019259 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 143024677 A T N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 143024693 C T N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 3 17 1 1 8 3 143024697 G C N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 143024713 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 143024721 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 143024800 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 143024806 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 143024856 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 143024892 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 143025012 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 143025020 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 143025054 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 143025075 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 143025241 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 143025247 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 143025302 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143025552 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143025567 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143025594 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143025599 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143025620 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 143025730 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 143025880 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143025899 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143025900 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143025970 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 143025998 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 143026020 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 143026066 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 143026076 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143026091 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 143026178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143026208 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 143026223 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 143026251 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 143026608 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 143026780 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 143027309 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143027354 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143027409 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143027425 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 143027524 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 143027907 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143028708 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 143029684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143030307 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 143031151 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143031364 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 143032032 G C Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 143032034 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 143032345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143032886 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 143032947 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 143032988 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 143033401 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 3 143034621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143034641 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 143035807 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 143036931 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143037031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143037087 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143037552 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 143039042 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143042264 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 143042381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143042483 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 143042484 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143042520 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143044041 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 143044333 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 143044367 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 143044384 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 143045962 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 143046409 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 143046890 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 143046902 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 143047268 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 143047270 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 143047712 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 143047876 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 143047883 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 143047890 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 143048016 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 143048019 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143048256 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143048331 A G Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 143048434 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 143048542 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143048575 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143048620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143048649 A G Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 143048715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143048730 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143048741 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143048900 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143049041 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 143049205 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 143049291 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 143049292 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 143049344 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143049465 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143049476 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143049501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143049561 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 143049581 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 143049716 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 143049786 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 143049804 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 143049922 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 143050141 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 143050285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143050365 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 143050554 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 143050650 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143050697 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 143050743 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 143050767 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 3 143050786 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 143050844 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 143051115 G A N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.153846153846154 0.0769230769230769 0.769230769230769 5 21 2 1 10 3 143051131 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 143051238 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 143051417 G T Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 143051668 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 143051692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143051941 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 143052022 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 143052033 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 143052206 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 143052256 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 143052324 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 143052739 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 143053011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143053187 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 143053420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143053471 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 143053540 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 143053554 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 143053631 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 143053641 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 143053711 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 143053714 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 143053747 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 143053866 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 143053902 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 143053912 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 143054029 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 143054264 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 143054306 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 143054353 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 143054453 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 143054861 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 143054874 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 143054896 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 143055014 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 143055015 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 143055075 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 143055093 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 143055099 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 143055105 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 143055111 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 143055427 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 143055523 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 143055629 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 143055789 G A N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 143055823 C T N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 143055869 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 143055896 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 143055951 G A N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 143055962 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 143056018 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 143056071 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 143056083 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 143056115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143056223 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 143056238 A C Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 143056517 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 143056913 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 143056973 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 143057002 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 143057134 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143057143 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 143057837 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 143058041 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 143058331 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 143058625 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 143058663 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 143058668 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 143058727 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 143058795 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 143058890 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 143058999 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 143059059 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 143059139 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 143059147 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 143059181 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 143059209 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 143059280 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 143059345 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143059368 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 143059430 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 143059458 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 143059908 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 143060066 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143060101 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 143060151 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 143060193 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 143060300 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 143060590 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 143060683 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 143061397 G A N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0.363636363636364 0.0909090909090909 0.545454545454545 9 13 4 1 6 3 143061563 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 143061669 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143061754 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 143061826 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 143061837 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 143061966 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 143061998 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 143061999 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 143062099 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143062156 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 143062244 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 143062327 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 143062416 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143062489 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 143062499 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 143062576 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143062770 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143063001 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 143063008 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143063167 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 143063314 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 143063425 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 143064488 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 143064579 A G Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 143064876 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 143064967 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 143064968 C A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 143065811 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143065916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143065963 G T Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 143066152 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143066577 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 143066645 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 143067049 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 143067100 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143067121 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 143067320 A T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 143067380 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 143067404 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 143067489 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 143067506 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143067625 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143067709 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 143068016 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 143068059 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 143070141 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143070745 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143071200 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 143071230 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143072519 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143072892 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143073087 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143073840 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143075048 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 143076036 C A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 143076186 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143076621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143077140 C T Y Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 3 143080203 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 143080309 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 143080514 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 143081113 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 143081380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143081527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143081741 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143081743 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 143082005 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143082126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143082416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143082619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143082625 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 143082656 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143082713 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143082790 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143083011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143083192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143083207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143083237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143083292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143083512 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 143083648 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 143083995 T C Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 143084136 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 143084211 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 143084271 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143084523 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 143084534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143084733 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 143084952 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 143084955 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 143084965 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 143084999 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 143085001 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 143085410 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 143085567 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 143085722 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 143085812 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 143086006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143086032 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143086038 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 143086049 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143086188 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 143086189 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 143086585 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 143087109 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 143087115 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143087481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143087650 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 143087742 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 143087820 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 143087862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143088280 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 143088367 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 143088425 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 143088782 G A N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 3 143088785 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 143088973 A G Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 143088990 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 143089010 T C Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 143089087 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 143089100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143089127 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 143089249 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 143089271 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 143089317 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 143089327 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 143089349 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 143089541 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 143089661 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 143089732 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 143089745 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 143089746 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 143089756 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 143089832 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 143089834 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 143089916 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 143089966 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 143090077 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143090118 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143090154 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143090274 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 143090423 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 143090427 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 143090856 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 143091673 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 143091766 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 143091821 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 143091838 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 143091940 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 143091970 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 143092110 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 143092113 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 143092200 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 143092371 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 143092469 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 143092522 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 143092676 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 143092776 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 143092789 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 143092812 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 143092996 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 143095205 C T N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 3 143096022 A C Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 143096063 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 143098123 A C Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 143098867 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 143099435 A G Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 143099738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143102157 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143102974 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143103023 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 143103117 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 143103238 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 143103641 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 143103760 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 143103778 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 143105223 G T N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 143105403 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 143105966 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 143106059 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 143108090 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 143108710 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143108827 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143109075 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143109577 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143109595 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143110048 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143111773 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 143112865 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 143112887 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 143112910 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 143113095 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143113097 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143113491 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 143113597 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143113649 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143113717 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 143114365 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 143114417 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 143117361 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 143118629 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 143121028 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143122489 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143127689 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 143128183 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 143128219 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 143130686 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 143130767 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143130910 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 143130956 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143132822 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 143133358 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 143135840 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 143138606 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 143139346 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143139433 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 143139548 A C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 143139707 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 143139853 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 143139861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143140184 T A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 143140216 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 143140469 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 143140958 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143141361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143141614 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143142896 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143143459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143143660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143143950 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143145629 C G N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 3 143145694 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143146585 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 143146897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143146936 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143147068 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143147977 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143148279 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 143148878 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143149451 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143149725 A C Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 143150081 T C Y Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 143150417 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143150733 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 143150870 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143151365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143152515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143152536 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 143153038 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 143153359 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143154373 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 143155341 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 143155505 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143156102 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143156460 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143156662 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143157090 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 143158513 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143158751 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143158897 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 143159371 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 143159784 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143160357 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143161126 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 143162149 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 143162326 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143162530 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 143162659 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 143162712 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 143162803 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 143162845 T A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 143162958 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 143163209 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 143163239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143163581 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 143163634 T A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 143164732 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143164783 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 143165079 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 143165589 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143166221 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 143166276 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 143166608 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 143166656 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 143166694 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 143166707 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 143166709 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 143166720 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 143166980 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 143167059 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 143167457 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 143167473 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 143167535 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 143167541 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 143167555 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143167559 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 143167653 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 143167761 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 143168468 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 143168525 C A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 143170109 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143170186 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 143170403 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 143170612 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 143171190 C G Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 143171202 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 143171273 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 143171476 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143171839 A C N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 143172174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143172232 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 143173118 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 143173232 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 143173274 T A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 143173305 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143173485 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 143173731 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 143173821 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 143174082 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 143174149 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 143174159 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 143174166 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 143174270 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 143174323 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 143174488 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 143174499 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 143174645 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 143174813 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 143175162 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143175456 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 143176247 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143176284 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 143176299 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 143176729 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 143178082 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 143178140 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 143178577 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 143178630 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143179611 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 143180784 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 143180912 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143182853 C T N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 3 143182881 A G N Y 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 3 143182975 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 143183703 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 143183720 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 143184535 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 143184810 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 143185019 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 143185758 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 143186639 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 143187226 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 143187258 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 143187999 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143188170 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143189077 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 143189499 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 143189973 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 143190066 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143190128 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 143190303 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143190451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143190519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143190937 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 143191105 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 143191319 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 143191581 C G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 143191777 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 143192176 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 143192741 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 143192786 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 143192788 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 143192963 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 143193065 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143193461 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 143193499 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 143193639 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143193873 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 143193990 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 143194092 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 143194212 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 143194370 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 143194552 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 143194565 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 143194701 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 143194723 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 143194769 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 143194810 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 143194891 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 143194907 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 143195159 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143195206 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 143195309 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 143195355 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 143195705 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 143195713 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 143195720 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 143195943 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 143195974 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 143196097 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 143196283 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 143196397 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 143196445 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 143196451 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 143196499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143196583 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 143196596 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 143196710 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 143197574 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 143197595 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 143197707 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 143197740 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 143198137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143198807 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 143199032 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 143199349 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143199674 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 143200462 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 143201084 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 143201415 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 143201559 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143201571 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 143201631 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 143201895 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 143201957 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 143201989 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 143202010 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 143202024 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 143202032 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 143202045 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 143202191 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 143202228 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 143202462 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 143202483 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 143202667 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 143202851 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 143202862 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 143203030 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 143203036 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 143203542 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 143203612 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 143203648 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 143203770 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 143203892 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 143203896 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 143203926 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 143204008 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 143204145 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 143204545 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 143204591 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 143204615 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 143204688 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 143204790 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 143205136 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 143205155 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 143205843 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 143206045 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 143206275 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 143206420 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 143207272 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 143207522 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143208056 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 143208081 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 143208547 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 143209623 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 143209873 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 143209911 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 143210235 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143210780 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 143211210 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 143211401 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 143211764 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143211865 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 143211870 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 143212059 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 143212578 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 143212762 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 143212773 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 143212826 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 143212857 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 143212869 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 143212895 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 143213025 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 143213125 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 143213154 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 143213270 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 143213303 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 143213357 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143213462 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 143213567 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 143213586 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 143213607 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 143213841 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 143214070 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 143214088 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 143214126 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 143214252 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 143214311 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 143214489 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 143214643 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 143214755 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143215125 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 3 143215310 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 143215437 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 143215451 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 143215458 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 143215476 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 143215495 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 143215953 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 143217729 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143218921 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143219549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143219783 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143222294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143222734 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 143223481 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 143223538 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 143224107 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 143224258 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 143224500 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 143226035 G A Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 143227641 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143227910 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143227958 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143228190 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 143228592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143228621 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 143229114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143229329 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143230029 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143232983 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143234864 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 143235138 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 143236048 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 143236137 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143236174 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 143236497 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 143237025 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 143237874 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143238032 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143238033 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 143238046 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 143238092 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 143238168 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 143238231 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 143238589 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 143238913 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143239189 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 143239443 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143239948 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 143240022 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 143240044 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143240104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143240187 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 143240188 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 143240418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143240460 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143241876 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143243171 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 143243213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143243279 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143243511 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 143243713 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 143244994 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 143245898 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 143246357 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 143246994 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143247819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143248059 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143248237 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143248363 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 143248416 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143248769 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 143249484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143250386 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 143252609 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143253107 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143253993 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 143254115 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 143256205 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143256228 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143256859 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 143257238 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 143257522 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143258156 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 3 143258216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143260679 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 143261111 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143261466 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 143261634 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 143262216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143263048 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143263118 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143264458 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 143265149 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 143265201 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 143266099 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143266598 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 143268132 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 143268237 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 143268281 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 143268358 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 143268472 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 143269320 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 143269512 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 143270032 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 143270162 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 143270239 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 143270254 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 143270432 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 143270796 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 143270865 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 143270877 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 143270931 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 143270939 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 143271244 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 143271353 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 143271505 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 143271578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143272216 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 143272676 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 143272812 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 143272886 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143273059 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 143273369 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 143273467 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 143273469 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 143273487 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 143273488 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 143273528 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 143273594 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 143273620 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 143273694 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 143273711 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 143273794 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 143273808 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 143273810 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 143273820 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 143273832 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 143273837 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 143273977 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 143273994 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 143274044 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 143274089 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 143274098 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 143274118 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 143274160 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 143274194 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 143274214 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 143274240 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 143274259 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 143274273 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 143274292 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 143274331 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 143274335 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 143274394 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 143274417 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 143274446 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 143274479 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 143274524 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 143274541 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 143274557 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 143274663 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 143275703 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 143275708 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 143275732 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 143275749 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 143275867 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 143275965 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143276003 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 143276074 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 143276236 A G Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 143276244 T G Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 143276279 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 143276310 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 143276370 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 143276585 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 143276964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143278428 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 143278826 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 143278830 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143278906 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 143279008 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 143279153 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 143279213 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 143279279 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 143279331 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 143279358 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 143279370 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 143279434 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 143279500 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 143279586 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 143279621 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 143279645 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 143279663 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 143280046 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 143280275 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143280397 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143280447 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 143280448 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 143280812 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143281218 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143281277 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 143281436 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 143281567 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143281620 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143281844 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 143282640 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 143282824 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143283028 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143283032 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 143283271 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143283434 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 143283588 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 143283617 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143284078 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 143284130 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 143284133 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 143284310 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143284417 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 143284425 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143284527 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 143284819 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 143284848 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143284915 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 143284946 A C N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 143285504 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 143285562 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 143285698 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 143285711 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 143286399 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 143286945 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 143286954 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143287479 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143287501 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 143287599 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143287625 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 143287690 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143287858 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 143287864 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143287964 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 143288083 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143288199 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 143288254 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 143288316 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 143288394 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 143288476 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 143288568 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 143288783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143288931 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 143289039 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143289049 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143289141 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143289338 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 143289385 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 143289511 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 143290030 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 143290079 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143290191 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 143291112 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 143292838 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 143294215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143295641 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 143295642 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 143295979 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143296945 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 143297157 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 143297275 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 143297463 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 143297478 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 143297486 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143297657 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 143297741 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 143297798 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143298027 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143298070 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 143298219 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 143298241 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 143298305 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 143298472 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 143298628 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 143298646 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 143298668 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 143298803 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143299090 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143299332 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143299345 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 143299372 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 143299409 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 143299804 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 143299808 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 143300354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143300689 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143301525 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 143301870 T G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 143302121 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 143302130 A C Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 143302259 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 143302319 T A Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 143302325 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 143302368 T C Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 143302369 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 143302395 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 143302536 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 143302841 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 143302934 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 143303226 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143303320 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143303446 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 143303618 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 143304324 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143304951 T G N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 143305038 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 143305133 T A N N 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 0.0909090909090909 13 9 3 7 1 3 143305286 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 143305310 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 143305345 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 143305453 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 143305547 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 143305758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143305784 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 143305861 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 143305866 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 143305958 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 143306140 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143306864 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143307664 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 143307708 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 143308093 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 143308425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143308874 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 143309104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143309149 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143309182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143309265 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 143309415 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143309429 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 143309435 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 143309503 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 143309505 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 143309516 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 143309563 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 143309747 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 143309756 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143309889 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143309942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143310615 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143310659 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 143310686 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 143310710 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143311079 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 143311142 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 143311262 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 143311282 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 143311544 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143311871 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 143312736 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143313362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143313687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143314111 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143315341 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143315624 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 143315871 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143315882 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 143315915 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 143316297 T C Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 143316319 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 143316347 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143316357 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 143316430 C G N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 143316531 C A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 143316888 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 143316923 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 143316971 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 143316999 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 143317008 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 143317034 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 143317054 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 143317124 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 143317125 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 143317143 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 143317153 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 143317176 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 143317283 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 143317307 A C N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 143317311 T A N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 143317543 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143317594 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 143317626 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 143317642 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143317684 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143317704 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143317707 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 143317814 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 143317875 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 3 143317927 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 143318486 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143318652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143318731 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143319000 C A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 143319119 C A N N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 143319316 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 143319511 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 143319751 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 143319775 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 143320143 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143320834 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143321464 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143323226 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 143323637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143324405 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143327733 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143330374 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143330931 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143331082 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143336065 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 143337898 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143338103 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143338344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143339715 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143340305 T A Y N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 143344072 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143344832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143344996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143345424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143346420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143347091 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143347460 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 143347701 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 143347766 C G Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 143347961 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 143348008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143348240 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 143348450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143348666 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 143348713 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143349081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143349195 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143349631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143349727 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 143350399 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143351352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143351457 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 143352207 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143352391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143353176 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143353242 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143353316 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143353713 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 143356693 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143356863 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143357202 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143359863 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143360925 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143361102 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 143362825 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143363312 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 143364038 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143366980 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143367387 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143368755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143371318 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 143371320 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143371347 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 143371396 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 143371450 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 143372493 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143372645 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 143372833 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 143373083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143373478 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143373509 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143373546 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143373755 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143373848 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143374310 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 143374620 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 143375156 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 143376857 A C N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 143377530 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143377871 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 143378662 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143378754 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143378854 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143379275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143379568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143380451 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143380891 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 143383523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143389583 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143390189 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143390659 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143394589 A C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 143397465 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143399123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143400900 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 143401837 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143402064 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143407997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143408271 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143409241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143409467 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143409482 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143409648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143409652 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143409724 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143410118 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143410337 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 143410380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143410459 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143410538 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143411985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143413380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143414007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143414498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143416415 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143416731 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143416764 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 143416781 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143416889 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143416890 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143416924 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143417105 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143417106 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143417209 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143417319 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 143417442 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 143417577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143417905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143417914 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143417926 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 143417941 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 143417975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143418141 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143418173 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143418362 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143418372 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143418378 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 143418411 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143418451 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143418509 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143418556 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 143418652 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 143418787 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143419082 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143419375 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 143419469 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 143419567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143419620 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 143419698 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 143419740 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143419747 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143419804 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143419864 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143420204 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 143421097 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 143421170 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 143424143 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 143424404 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 143424465 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 143425281 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143425755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143425984 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143426381 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143426618 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 143426629 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143426630 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 143427384 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143427565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143428062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143428770 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143428826 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143429253 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 143429254 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 143429595 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143430325 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 143430459 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 143430482 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 143431332 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143431570 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143432050 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143432334 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 143432814 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143433366 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143433448 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143433960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143434754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143435128 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143435444 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 143435651 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 143436320 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143436747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143436749 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 143436921 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143437518 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 143437667 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 143437787 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 143437938 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 143439539 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 143439752 C T N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.538461538461538 0.230769230769231 0.230769230769231 17 9 7 3 3 3 143440706 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143441351 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 143441474 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143441538 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143441759 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 143441762 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143442249 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 143442264 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 143442275 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 143442396 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 143442407 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 143442499 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143442557 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 143442628 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 143442676 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143442706 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 143442739 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 143442799 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 143442914 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 143442929 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 143442995 C G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 143443044 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 143443319 T A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 143443365 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 143443564 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 143443590 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 143443660 T G N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 143443764 G T Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 143443879 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 143443977 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 143444135 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143444541 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143444663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143444867 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143444977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143444983 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143445162 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 143445193 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143446010 T C Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 143446106 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143446346 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143446387 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 143446470 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143446601 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 143446621 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143446713 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 143446880 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 143447064 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 143447273 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143447700 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 143447851 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143448446 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143448527 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 143448646 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 143449149 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 143449650 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 143449716 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 143449758 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 143450017 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 143450022 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 143450077 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 143450110 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 143450620 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143450807 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 143450841 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143451518 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 143451547 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 143451633 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 143451798 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 143452008 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 143452134 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 143452313 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 143452369 G A Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 143452409 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 143452440 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 143452496 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 143452539 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 143452577 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 143452600 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 143452655 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143452704 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 143452710 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 143453589 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143454904 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 143454932 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 143455052 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 143455331 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 143455481 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143455615 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143455655 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143455673 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143455854 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143456304 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143456807 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143457344 C T Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 143457522 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143457655 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 143458717 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143461369 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143461429 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 143461905 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143462936 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143463032 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143463385 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143463406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143464079 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 143464095 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143465106 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143465118 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143465183 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143465270 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143465300 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143465338 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143465403 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143465475 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143465735 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143465766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143465803 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 143465874 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143466079 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143466089 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143466376 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 143466387 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143466458 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143466569 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143467007 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143467012 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143467055 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143467135 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143467144 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143467206 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143467213 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143467241 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 143467430 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 143467452 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143467467 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143467483 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 143467485 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 143467510 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143467524 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143467533 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143467554 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143467595 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143467797 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143467798 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143467809 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143467841 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143467850 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143467859 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143467961 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143468051 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143468204 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143468218 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143468243 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143468259 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143468333 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143468388 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143468831 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 143469352 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 143469564 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 143469631 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143469790 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 143469821 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 143469964 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143470055 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143470217 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143470388 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143471413 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 143471431 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143471470 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143471561 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143471741 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143471755 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143471831 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143472090 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 143472123 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 143472145 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 143472199 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143472377 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143472480 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143472576 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143472667 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143472807 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 143472820 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143472866 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143472940 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143472992 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143473054 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143473057 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143473096 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 143473219 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143473261 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143473560 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143473609 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143473738 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143474797 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143474918 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 143474952 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 143474960 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 143474983 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 143475290 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 143475474 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143475772 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 143475950 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143476620 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 143477084 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 143477096 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143477210 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143477943 C G Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.166666666666667 0.777777777777778 0.0555555555555556 20 16 3 14 1 3 143477989 C G Y N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 143478198 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143478962 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 143479082 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143479250 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143479332 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 143479461 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 143479664 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143479731 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 143479803 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 143479837 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143479946 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143480279 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143481310 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 143482726 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 143484998 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143485159 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 143485411 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143487187 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143487711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143487753 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143488260 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143488373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143489975 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143490220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143490635 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143490690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143490748 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143490998 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 143491063 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 143491290 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143491322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143491331 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143492349 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143492361 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143492376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143492511 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143493869 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143493917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143494048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143494052 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143494142 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143494484 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143494618 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143494630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143494634 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143494642 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143494668 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143494692 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143494829 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143494879 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143494915 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143494925 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143495138 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143495188 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 143495470 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143495572 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143495744 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143495954 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 143496122 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 143496147 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 143496263 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 143496698 T G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 143496931 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143497366 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 143498885 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143500967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143501979 T C Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 143502110 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 143503489 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 143503559 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143503582 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143503725 T A N N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 5 7 0 5 1 3 143510107 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143510120 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143511160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143511326 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143512078 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143512179 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143512309 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143512327 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143512790 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143513151 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143513374 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 143513411 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 143513828 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143513960 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143513968 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143514069 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143514117 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143514164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143514187 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143514198 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143514213 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143514237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143514246 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143514286 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143514296 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143514327 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143515559 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 143515613 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 143515623 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 143515800 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 3 143515952 A G Y Y 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 143516014 G A Y Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 143516096 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 143516117 C T Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 143516118 A G Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 143516181 C A Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 143516361 A G Y Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 143516562 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 143517143 A C Y N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0 0.727272727272727 0.272727272727273 8 14 0 8 3 3 143517211 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 143517226 T G Y N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 143517268 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 143517405 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 143517448 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 143517544 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 143517602 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143517724 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 143517750 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143517752 C A Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 143517809 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143517843 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143517894 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143517926 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143518292 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 143518324 A C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 143518464 G A Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 143518638 C A Y N 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 143518643 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 143518705 G A Y Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 143518706 T G Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 143519341 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 143519406 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 143519417 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143519477 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143519517 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 143519815 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143519835 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143519979 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143520020 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143520075 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143520121 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143520158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143520466 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 143520476 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 143520551 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143520710 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143520752 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 15 21 0 15 3 3 143520754 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 3 143521124 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143521223 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143521279 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143521291 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143521306 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143521422 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143521440 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143521449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143521481 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143521486 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143521513 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143521876 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143521939 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 143521950 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 143522220 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143522566 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143522607 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143522802 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 143522958 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143523130 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143523370 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 143523603 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143530946 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143531377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143531794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143532215 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 143534449 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143534932 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143535192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143536019 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143537138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143537511 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 143539497 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 143539558 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143539575 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 143539809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143539890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143539892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143539918 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143539989 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143540066 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143540085 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143540108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143540181 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143540219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143540274 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 143540319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143540354 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143540600 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143541634 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143541903 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 143542949 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 143543171 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 143543599 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143543871 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143544421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143544576 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143545485 A C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 143546115 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143548519 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 143551685 A G N Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 3 143551761 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 143552617 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 143552620 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 143553412 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143553882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143555622 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 143555674 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 143555678 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 143555739 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 143555861 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 143555862 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 143555897 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 143556053 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 143556083 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 143556158 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143556161 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143556204 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 143556477 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143556537 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 143556587 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143556649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143556712 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 143556880 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 143556952 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 143556953 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 143557002 G A Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 143557172 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 143557635 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 143557750 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 143557755 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 143558357 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143558399 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143558669 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143559654 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143560317 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143560794 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 143560853 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143560898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143560965 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 143561431 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143561945 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 143562356 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143562460 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143562504 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143562600 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143562815 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143563140 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 143563690 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143563701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143563775 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 143564067 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 143564636 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 143565247 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143565701 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143565766 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143565955 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 143566224 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143566973 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 143568087 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143568363 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 143568409 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143568423 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 143569090 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143569182 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 143570788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143571090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143571942 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143572302 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143572355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143572785 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143573085 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 143573844 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143573857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143573861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143574365 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143575998 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143576157 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 143576532 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143576807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143577149 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143577197 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 143578162 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143578294 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143579384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143580485 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 143580923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143580990 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 143581096 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143581126 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143581209 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 143581216 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 143581232 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 143581891 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143582299 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143584913 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143584962 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 143584995 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 143585207 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143585275 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 143585421 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143585588 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 143585935 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143585949 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 143586473 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143587984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143587991 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143588817 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143589470 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143589843 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143589974 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143590117 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143590180 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143590494 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143590548 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 143590561 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 143590732 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143590800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143591356 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 143592387 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143592402 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143592415 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143592438 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143592441 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143592480 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143592502 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143592620 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 3 143592632 T C N Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 3 143592744 T C N Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 5 5 2 1 2 3 143592762 T G N N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 3 143592782 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 6 8 2 2 3 3 143592803 T C Y Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 6 8 1 4 2 3 143592834 T C Y Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 3 143592843 C G Y N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 3 143592868 C A Y N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 3 143592872 A G Y Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 143592938 C T Y Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 3 143592953 T A Y N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 3 143593030 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 143593050 T A Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 143593112 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 143593283 T A N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 143593302 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 143593353 T A N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 143593401 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 3 143593418 A G N Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 3 143593428 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 5 7 1 3 2 3 143593553 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 143593560 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 143593607 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143593609 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 143593634 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 143593854 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 143593904 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 143594008 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 143594030 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 143594090 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143594158 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143594272 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 143594468 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 143594473 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 143594686 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 143594723 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 143594741 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 143594907 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 143595225 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 143595250 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 143595344 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 143595358 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 143595449 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143595579 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 143595775 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143595860 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 143595890 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 143596231 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143596286 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143596300 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 143596328 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 143596359 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 143596415 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143596432 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143597290 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 143597411 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143597445 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143599095 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 143599416 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 143600270 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143600375 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 143600685 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 143600977 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 143601024 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 143601080 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 143601186 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 143601301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143601407 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 143601689 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 143601771 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 143602002 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 143602033 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 143602034 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 143602067 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 143602083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143602092 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143602252 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 143602379 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 143602814 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 143602843 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 143602911 G C N N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.142857142857143 12 2 6 0 1 3 143602987 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 3 143603019 T C N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 143603104 T G Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 143603126 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 143603130 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 143603322 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143603408 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 143603512 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 143603521 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 143603536 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 143603554 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 143603627 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 143603762 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 143603797 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143603884 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 143603912 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 143603919 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 143603958 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 143603970 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 143604063 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143604126 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 143604146 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 143604165 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 143604201 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143604202 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 143604296 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 143604337 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 143604462 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 143604465 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 143604530 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143604563 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 143604575 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 143604873 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 143604912 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 143604916 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 143605027 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 143605042 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 143605057 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143605093 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143605968 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143606274 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143606653 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143606967 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 143607360 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143607435 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143607458 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143607461 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 143607514 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 143607812 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 143607814 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 143607937 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 143608258 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 143608272 C T N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 143608375 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 143608429 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 143608437 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143608493 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143608515 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143608547 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 143608549 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 143608589 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 143608735 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143608749 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 143608917 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 143609053 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143609145 A T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 143609342 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 143609343 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 143609353 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 143609355 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 143609364 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 143609705 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143611420 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143612276 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 143612286 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 143612390 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143613054 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 143613292 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 143613327 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 143613486 G T N N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.461538461538462 0.153846153846154 0.384615384615385 14 12 6 2 5 3 143613594 C A N N 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 3 143613854 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 143614136 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143614399 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 143614552 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143614921 T A Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 143615005 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143615028 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143615574 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143615764 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143616072 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143616333 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 143616427 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143616492 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 143616520 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 143616553 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 143616562 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 143616605 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143616722 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 143616769 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 143616888 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 143617123 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 143617178 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 143617202 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143617217 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 143617289 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143617330 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143617391 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143617404 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143617439 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143618591 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143618920 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143619055 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 143619139 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143619681 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143619819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143619835 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 143620041 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143620047 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143620494 C T N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 3 143620573 G T N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 143620853 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143622030 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143622111 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 143622452 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 143622601 C A N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 143622650 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143622724 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143622762 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 143622774 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143622776 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143622794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143622859 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143622875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143623145 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143623301 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143623355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143623572 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143624877 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143624943 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 143625252 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143625325 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143625406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143625535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143625967 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143626391 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 143627324 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 143627366 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143627547 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 143627671 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 143627703 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 143627731 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143627832 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 143627846 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 143627847 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 143627986 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 143628088 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 143628192 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 143628222 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143628229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143628252 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 143628262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143628298 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143628299 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143628423 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 143628754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143628795 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 143628987 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143629338 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 143629381 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 143629410 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 143629592 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143629810 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143629868 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143629936 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 143630010 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143630057 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143630257 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 143630263 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 143630312 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 143630342 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143630388 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 143630392 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 143630534 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143630557 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143630574 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143630824 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 143630836 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 143630857 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 143630889 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 143630896 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 143630974 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 143630990 T A N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 143631004 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 143631044 A C N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 143631049 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 143631181 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143631736 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 143631764 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143631810 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 143631813 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143631843 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 143631863 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 143632206 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 143632322 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 143633231 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 143633955 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143636013 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143636167 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143637514 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143638758 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 143639841 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143639857 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143640300 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143640595 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143642352 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 143642446 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 143642502 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143642503 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 143642694 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 143643279 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143643319 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143643345 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143643361 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143643367 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143643374 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143644801 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143645550 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 143645631 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 143646095 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143647279 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143647361 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143647467 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143647853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143648255 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143648294 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143648333 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 143649488 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 143649489 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 143650195 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143651222 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143651633 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143651731 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143651795 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143652180 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143652225 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143652916 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143652917 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143652969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143653221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143653623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143653673 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143654018 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143654191 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 143654208 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 143654236 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143654304 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143654308 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143654322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143654328 A T Y N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0 0.75 0.25 12 20 0 12 4 3 143654343 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143654734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143654758 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143655533 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143655677 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143655785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143655957 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143657599 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143657661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143658794 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143659476 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143659662 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143660133 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143660321 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143660602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143660606 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 143660731 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143660768 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143660830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143661651 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143662281 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 143662499 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143662516 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 143662540 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143663253 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 143663356 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143663434 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143663871 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 143664051 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143664924 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143664941 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143664948 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143665245 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 143665410 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 143665767 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143665808 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143667710 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143667936 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143668126 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143668178 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 143668385 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143668387 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143668398 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 143668477 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143668492 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143668554 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143668578 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143668635 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143668637 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143668751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143668953 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143668977 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143669023 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143669027 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143669183 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143669264 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143669807 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143669821 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143670057 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143670510 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 143670559 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 143670784 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143671096 T G N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 143671327 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143671424 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 143671427 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 143671638 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143671652 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143671742 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143671930 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143672027 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143672043 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143672151 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143672738 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143672793 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 143672823 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 143672930 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 143674497 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 143675720 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 143677356 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143678028 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 143678157 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143678221 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143678238 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143678250 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143678695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143680378 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143680585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143680941 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 143681745 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143683681 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143684513 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143687605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143689283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143689427 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143689641 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143690531 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143692429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143692889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143700055 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143700145 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143700346 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143700365 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143701848 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143703759 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 143706783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143707188 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143707997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143710196 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143711499 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143712252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143713434 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143713818 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143713843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143715714 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 143717311 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143719041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143720418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143721358 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143721644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143723023 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143723071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143723119 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 143723154 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143723171 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143723180 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143723414 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143723417 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143723427 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143723547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143723584 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143723688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143723726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143723776 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143723954 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 143724228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143724651 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143724791 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143724865 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143725042 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143725082 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143725158 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 143725287 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 143725787 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143725788 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143725921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143725931 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143725991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143726043 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143726105 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143726165 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143726194 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143726323 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 143726452 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 143726578 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 143726765 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143726839 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143727000 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143727009 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143727054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143727113 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143727181 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143727229 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143727360 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143727378 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143727420 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143727482 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 143727534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143727535 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143727579 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143727673 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 143727686 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143727942 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 143727968 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 143728134 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143728141 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143728286 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 143728389 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143728421 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143728515 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143728524 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143728528 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143728540 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143729006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143729151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143729310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143729328 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143730207 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 143731090 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 143732110 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143732154 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 143732490 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143732980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143733418 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143733837 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 143734261 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 143734341 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 143734524 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143734686 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143734995 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143735048 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 143735231 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143735321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143735586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143735668 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143735670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143735961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143736012 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143736062 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143736718 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143737378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143737782 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 143737823 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 143737887 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143737977 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143738062 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143738189 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143738652 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 143739372 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143739698 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143739704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143739710 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143739865 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143739970 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143740159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143741194 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143741498 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143742534 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143742567 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143742771 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143743065 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 143743675 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143747060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143747675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143748626 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143748886 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143749570 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143749932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143752822 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143753274 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143759620 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 143759718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143760957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143761328 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143761487 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 143761996 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143764323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143765367 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143765835 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143765849 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 143766223 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143766249 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143766302 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143766323 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143766633 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143766845 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 143766846 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 143766903 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143767073 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143767141 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143767223 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 143767283 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143767301 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 143767316 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143767329 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 143767357 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143767393 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 143767407 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 143767599 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143767705 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 143767921 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 143768080 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 143768898 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143769401 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143769520 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 143769721 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 143769737 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 143769795 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143769822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143769929 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 143770039 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143770115 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143770135 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143770358 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 143770462 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 143770529 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 143770753 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143772429 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143772915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143772973 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143773703 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 143773783 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143773862 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143773941 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 143774731 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143774988 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143775033 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143775084 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143775316 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143775355 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 143775728 T C Y Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 143776684 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 143776940 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 143777096 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 143777934 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143778595 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 143778871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143781212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143781772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143781776 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143782639 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143783454 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 143783587 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 143783621 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 143783706 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 143783831 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143784079 A T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 143784114 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 143784214 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143784370 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143784375 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143784664 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143784751 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143784764 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143784842 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143785028 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143785043 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143785122 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143785266 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143785268 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 143785436 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 143785515 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143785521 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143785531 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 143785590 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 143786208 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 143786431 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 143786439 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 143786501 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 143786513 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 143786589 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143786687 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143786735 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143786764 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 143786819 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 143786881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143786946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143787320 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143787990 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143788105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143788920 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143791678 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143791813 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143791843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143791974 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143791998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143792009 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143792084 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143792187 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143792263 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143792398 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 143792454 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 143792706 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 143792707 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143792829 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143792833 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143792841 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143792851 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143792853 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143792970 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143792989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143792992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143793021 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143793083 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143793127 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143793174 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143793175 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143793268 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143793322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143793323 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 143793341 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143793498 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143793551 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143793577 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143793594 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 143793608 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 143793778 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143793826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143793870 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143793888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143793890 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143793933 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143794061 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 143794199 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143794365 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143794416 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 143794474 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143794520 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143794542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143794595 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143794629 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143794707 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143794817 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143794838 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143795107 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 143795115 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 143795149 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143795168 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143795180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143795256 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143795298 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143795379 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143795417 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143796000 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143796066 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 143796136 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143796160 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143796313 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143797013 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 143797035 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 143797069 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143797193 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 143797283 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 143797314 G A N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 143797433 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 143797505 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 143797542 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 143797559 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 143797566 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 143797600 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143797601 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143797763 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143798189 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143798205 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143798473 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 143798615 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143798717 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143798783 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 143798803 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 143798916 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 143798978 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 143799019 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 143799047 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 143799062 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 143799492 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 143799704 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 143799868 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 143799911 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 143799923 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 143799988 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 143800178 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 143800279 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143800309 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 143800576 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143800595 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143800617 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143800693 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143800936 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 143801784 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 143801881 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143802077 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143802176 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 143802455 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 143802546 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143802581 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 143802845 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 143803000 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143803024 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143803121 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 143803365 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 143803464 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 143803479 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 143803594 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143804013 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143805226 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143805595 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143805689 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143807356 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 143807377 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143810349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143810960 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143810966 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 143811208 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143811429 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143811758 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143813182 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 143813341 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143813667 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143813941 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143813946 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 143813997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143814026 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 143814066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143814173 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143814198 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143814311 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 143814533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143814652 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143814655 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143814679 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143814689 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143814729 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143814753 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143814754 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143814888 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143815146 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143815286 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143815306 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143815309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143815325 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143815410 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143815431 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143815536 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143815605 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143815633 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 143815697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143815736 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143815834 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 143815874 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143815878 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 143815896 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 143815898 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143815916 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143816207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143816516 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143816680 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143816842 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143818000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143818272 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143819100 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143821008 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143822797 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 143823032 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143826492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143826786 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 143827532 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143828589 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 143829545 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143830385 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 143830404 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 143830507 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143830842 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143830879 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143831552 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143832182 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143832837 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143835345 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143837713 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143839234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143839960 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143840632 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143841672 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143842086 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143842372 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 143843830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143845105 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143845630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143846900 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 143848743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143849698 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143850403 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 143850801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143851040 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143851150 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143851224 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143851326 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143851388 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 143852319 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143852579 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 143853820 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143855138 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143856547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143856692 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143861579 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143863663 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143864449 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143866187 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 143866438 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143867617 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 143870465 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143870617 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 143871154 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143871426 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143871514 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 143872409 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143873437 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143877372 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 143878136 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143878336 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 143878453 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 143878512 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 143878533 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 143878540 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143878550 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 143878562 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 143878618 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 143878700 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 143878765 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143878776 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 143878778 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 143878810 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 143878837 T A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143878866 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 143878887 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 143878947 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 143878963 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 143878977 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 143879027 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143879104 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 143879346 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 143879430 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 143879555 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 143879576 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 143879619 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 143879628 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 143879977 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143880031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143880233 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143880586 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 143880597 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 143880928 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 143881491 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143881579 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 143881652 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 143882095 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143883544 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143883849 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 143886228 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 143889360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143890027 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 143890089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143890184 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 143890325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143891519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143892533 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 143892746 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 143893426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143894596 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 143895407 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143895560 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143895683 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143896095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143896554 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 143896597 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 143896755 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 143897053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143897317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143899339 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143899440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143900009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143900060 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143900200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143900354 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 143900789 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 143900875 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 143900969 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 143901264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143901952 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 143902188 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 143902271 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 143902295 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143902331 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 143902371 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 143902393 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 143902517 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 143902562 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 143902645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143902832 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 143902926 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 143903061 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 3 143903146 G T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 143903157 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143903367 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 143903432 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143903469 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 143903510 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 143903545 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143903555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143903558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143903668 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 143904108 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 143904292 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143905141 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143905318 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 143905603 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143905782 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 143906087 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 143906127 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 143906129 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 143906138 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 143906211 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 143906339 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143906522 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143906527 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 143906559 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143906789 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143906842 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143906862 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143906948 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 143907017 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143907212 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 143907260 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 143907298 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 143907539 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143907550 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143907972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143908296 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143909222 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 143914072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143914488 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 143916068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143917690 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 143919614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143920040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143923009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143923449 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143923674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143923848 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 143924317 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 143924318 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143924380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143924728 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 143924928 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143925680 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 143925891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143925912 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 143926035 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 143926097 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 143926170 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 143926268 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 143926353 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 143926361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143926403 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 143926444 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 143926533 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 143926615 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 143926640 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 143926650 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 143926661 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 143926664 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 143926683 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 143926815 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143927064 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 143927076 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 143927180 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 143927367 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 143927412 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 143928075 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 143928330 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 143928354 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 143928395 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 143928403 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 143928684 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 143928858 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143928929 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 143928999 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 143929018 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 143929036 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 143929500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143935024 A C N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 3 143935063 T C N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 143935434 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 143935625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143935825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143936117 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 143936871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143936991 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 143937101 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 143937566 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 143937630 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 143937903 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 143938090 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 143938262 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 143938599 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 143938604 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 143938698 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 143938748 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 143938788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143938901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143939116 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 143939862 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 143940341 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143940359 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143940360 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143940607 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 143941234 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143941339 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 143941457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143941510 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 3 143941550 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 143941554 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 143941813 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 143942904 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 143947676 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 143948096 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 143948132 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 143948332 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 143948455 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 143948575 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 143949312 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143949648 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 143949653 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 143949843 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 143950001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143951859 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 143952087 C G N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 143952677 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 143952788 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143952809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143952824 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 143952829 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 143952853 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143952910 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143952925 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 143953028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143953052 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 143953219 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 143953265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143953455 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 143953461 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 143953542 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 143953693 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 143953781 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 143953851 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143953870 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 143954399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143954599 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 143955785 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 143956516 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143957433 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 143957554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143957569 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 143957672 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 143957892 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143957977 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 143958012 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 143958073 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 143958111 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 143958328 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 143958367 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 143958505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143959030 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 143959050 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 143959392 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 143959490 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143959557 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 143959720 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 143959736 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143959940 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 143959953 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 143960036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143960154 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143960169 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 143960203 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 143960758 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143960760 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 143960819 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 143960850 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 143961112 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 143961245 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 143961328 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143962821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143963060 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 143963198 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143966614 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143968507 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143969407 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143969759 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 143969899 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 143970453 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 143970754 A T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 143972932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143972970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143973696 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143974583 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 143974724 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 143974739 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 143974804 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 143974984 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 143974992 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 143975003 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 143975023 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 143975850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143976328 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 143976355 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 143976404 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143976459 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 143976680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143978770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143979208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143979527 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 143979667 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 143979690 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143979742 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 143979744 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 143979756 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 143979799 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 143979840 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 143979843 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 143980170 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143980183 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143980196 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143980224 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 143980228 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 143980310 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 143980450 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 143980467 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 143980603 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 143980706 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143980770 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 143980774 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 143983204 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 143983577 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143984500 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143984694 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 143986103 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143986296 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 143986305 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143986582 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 143986629 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 143986653 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 143986697 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 143986757 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 143986788 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 143986911 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 143987007 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 143987085 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 143987097 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 143987121 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 143987326 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 143987366 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143987651 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 143987686 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 143987693 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 143987702 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 143988163 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 143988527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143988575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143988641 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 143988648 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143988712 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 143988771 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 143988837 A G Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 143988858 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143988863 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 143989104 T G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 143989147 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 143989189 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 143989275 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 143989317 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 143989353 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 143989365 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 143989468 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 143989660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143989719 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 143989763 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 143989930 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143990188 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143991629 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143991668 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 143991691 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 143991826 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 143992411 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 143992772 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143994098 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 3 143996645 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143997708 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 143998140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 143998722 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 143999799 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144000412 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 144000716 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144000836 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144001045 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144001378 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144001405 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144001661 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144002058 C G N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 3 144002265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144002481 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 144002512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144002536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144002544 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144003270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144003934 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144004129 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144004915 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144007813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144008342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144008430 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 144008716 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 144008770 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144008783 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 144010753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144011326 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 144011353 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 144011540 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144011565 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144012004 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144012006 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144012113 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144012121 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144012296 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144012366 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144012396 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144012407 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144012457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144012477 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144012478 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144012649 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144012767 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144012777 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144012779 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144012940 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 144013379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144013942 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144014537 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144014718 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144014719 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144014784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144014893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144015209 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144015480 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144015505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144015524 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144015551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144015719 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144015746 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144015969 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 144016109 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144016143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144016258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144016269 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144016317 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144016512 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144017779 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144017847 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144017936 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144017966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144018301 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 144019506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144019703 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 144019722 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 144020267 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144021230 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144022355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144022367 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144023361 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144024069 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144026854 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144027134 C A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 144027834 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144027847 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144028164 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144028302 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 144028607 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144028809 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 144029840 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 144029870 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 144030362 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144030406 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 144030464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144030517 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144030549 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 144031078 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 144031300 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 144031503 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144031509 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 144031538 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 144031616 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 144031618 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 144031648 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 144031713 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 144031775 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 144031817 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144032128 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 144033302 T C N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 144033370 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 144034026 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144034545 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 144034592 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144034898 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 144035117 C A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 144035198 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 144035254 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144035330 G T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 144035355 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 144035399 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 144035424 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144035438 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 144035460 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 144035819 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 144035948 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144035959 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 144036040 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 144036068 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 144036563 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 144036566 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144036644 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 144036694 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 144037100 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 144037546 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144037609 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144037620 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 144037629 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 144037715 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 144037903 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 144037904 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 144037988 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 144038009 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 144038020 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 144038115 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144038348 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144038976 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144038978 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144039032 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144039232 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 144039291 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144039632 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 144039920 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144040057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144040611 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144041122 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 144042328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144042792 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 144042989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144043669 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 144048983 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144050307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144050957 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144051014 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 144051314 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144051709 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144051868 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144052028 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 144052030 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144052243 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144052453 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 144052504 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144052682 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 144052737 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 144052800 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 144052831 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 144052903 G T Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 144052931 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 144052988 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 144053074 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 144053363 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 144053414 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144053488 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 144053527 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 144053627 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144053682 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144053739 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144053958 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 144054001 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 144054012 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 144054063 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144054126 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 144054655 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144054864 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144054933 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144054949 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 144054988 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 144055165 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 144055195 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 144055321 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144055435 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144055799 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144055833 A C Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 144055961 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 144055988 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 144056093 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 144056239 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 144056330 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 144056331 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 144056393 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 144056422 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144056459 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144056523 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144056543 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144056606 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144056658 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144057120 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144057752 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 144057795 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144057893 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 144058938 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 18 14 4 10 2 3 144059005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144059011 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144059167 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 144059187 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144059200 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 144059300 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 144059316 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144059488 C A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 144059500 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 144059633 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144059873 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 144059951 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 144060272 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 144060302 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 144060806 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 144060813 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 144060915 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144060969 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 144061246 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 144061249 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144061299 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144061337 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144061752 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 144061836 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 144062140 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144062767 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144062820 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144062957 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144063538 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 144063903 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 144064263 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144064586 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 144064628 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144064758 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 144065120 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144065215 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144065811 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144065856 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 144066616 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144067215 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144067440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144068093 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144068123 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 144068290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144068342 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 144068716 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 144068980 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 144069010 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144069014 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144069199 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144069209 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 144069280 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 144069349 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144069407 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144069514 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144069550 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144069598 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 144070072 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 144070194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144070201 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144070227 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144070335 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 144070366 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144070609 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144070642 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 144070789 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 144070822 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144070866 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144071251 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 144071412 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144071456 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 144071469 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 144071573 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144071623 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 144071624 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 144071673 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 144071793 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 144071812 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 144071875 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 144071944 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 144072073 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 144072150 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 144072437 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 144072498 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144072526 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 144072567 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 144072578 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 144072581 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 144072614 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 144072631 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144072712 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 144072832 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144073238 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 144076356 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144076648 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144076912 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144076957 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 144077129 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144077356 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144077431 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 144077459 G C Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 144077469 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144077479 C A Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 144077608 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 144077732 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144077802 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 144077842 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144077843 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144077880 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144078081 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 144078359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144078369 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0 0.85 0.15 17 23 0 17 3 3 144078452 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 144078459 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 144078496 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 144078653 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 144078752 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 144078761 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 144078776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144078820 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 144078837 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 144079385 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 144079510 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144080597 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144080843 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144081059 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144081112 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144081113 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144081203 A C Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 144081239 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 144081283 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144081356 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144081473 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144081627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144081746 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 144081791 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 144081870 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144081903 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144082454 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144082795 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144083024 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 144083125 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 144083149 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144083210 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144083273 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 144083738 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144083904 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144084072 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 144084164 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 144084166 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 144084214 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.133333333333333 0.666666666666667 0.2 14 16 2 10 3 3 144084269 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144084333 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 144084410 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 144084533 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 144084583 C G N N 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 144085058 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 144086353 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144087975 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 144088011 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 144088071 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144088380 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144088643 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144088717 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144088931 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 144088958 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144088975 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144088986 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 144088991 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 144089030 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144089066 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144089067 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144089080 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144089145 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144089175 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 144089202 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144090141 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 144090274 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144090668 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144090994 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 144091025 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144091727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144092203 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144093591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144094451 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 144094487 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144094502 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 144094591 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 144094607 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 144095237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144095297 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 144095441 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 144095684 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144096643 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144097091 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144097388 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144097572 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144097581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144097861 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144098153 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144098260 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144098604 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 144098617 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144098630 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144098677 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 144098847 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 144099335 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144099508 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144099757 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144099811 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 144099858 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 144099990 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 144102104 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144102105 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 144102142 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144102554 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 144102712 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 144102744 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 144102903 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 144103067 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 144103909 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144104983 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 144105348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144105379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144105514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144105739 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 144105855 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 144105963 G A Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 144106062 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 144106502 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144106538 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144106598 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 144107422 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144107527 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 144108396 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144108889 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144109329 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144109992 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144111113 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144111172 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144111266 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144111957 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144112795 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144113165 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144113411 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144113432 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144113609 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144114285 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 144114582 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144114700 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144114982 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144115084 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 144115292 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 144115451 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 144115506 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144115521 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144115621 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 144115778 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 144115988 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 144116204 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144117518 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144117578 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144117587 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144117846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144117938 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 144118182 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144118188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144118536 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144118926 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144119154 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 144119341 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144119385 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144119619 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 144119869 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 144119886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144120191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144120301 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144120395 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144120465 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144120797 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144121033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144121248 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 144121801 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144122010 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144122923 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 144122941 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 144123152 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144123722 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144125697 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144126464 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144126475 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 144126730 A C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 144127144 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144127232 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 144127511 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144127934 A C N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 144128647 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144128803 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 144129049 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 144129323 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 144129459 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 144129484 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144129905 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 144129934 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 144130538 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144130597 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144131132 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 144131305 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144132039 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 144132339 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144133028 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144133964 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 144133974 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144133982 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 144134314 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 144134347 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 144134398 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144134505 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144134523 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144134582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144135205 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144135693 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144135869 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144137785 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 144138142 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144138654 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 144138837 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144139988 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144140829 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 144140855 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 144141134 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 144141418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144142174 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144142294 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 144142633 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144142872 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 144142876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144142964 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 144143020 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144143035 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144143048 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144143062 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144143244 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 144143322 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144143329 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144143333 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 144143537 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 144143702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144143748 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 144143781 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 144143789 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 144143858 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 144143868 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 144143889 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144145099 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144145223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144145225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144145238 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 144145299 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 144145329 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 144145346 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144146140 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 144146511 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144146647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144147060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144147989 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144149160 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144149289 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144150635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144151039 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144151247 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144151691 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144154687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144155001 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 144155051 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 144155150 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144155356 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 144155450 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 144155508 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 144155671 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 144155679 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144155831 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 144155885 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144156081 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 144156114 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144156352 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 144156470 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 144156666 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 144156679 T A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 144157101 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144157160 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 144157213 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144157319 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144157596 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144157697 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144159650 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144159998 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144161253 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 3 144161276 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 144161277 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 144161547 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144162304 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144162432 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144162627 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144162653 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 144163769 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 144165112 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144165302 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144165771 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 144166593 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144167288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144168570 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144168714 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144168782 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144168789 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144168953 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144169312 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144170244 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144170397 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144170578 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144170650 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144170816 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 144171365 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 144171419 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144171428 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 144171552 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 144171584 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144172062 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 144172367 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 144172422 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144173097 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 144173122 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144173751 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144173817 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144174501 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 144174519 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 144174565 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144174851 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 144174930 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 144174941 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144175018 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 144175029 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144175041 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 144175072 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144175128 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 144175165 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 144175186 T C Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 144175191 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 144175862 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 144175929 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 144176160 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 144176472 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 144176548 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 144176625 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144176670 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144176795 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 144177052 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144177866 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 144177903 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144178106 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 144178145 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 144178316 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 144178551 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144178835 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 144179033 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 144179041 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 144179079 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 144179196 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 144179200 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 144179224 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 144179364 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 144179393 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 144179606 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 144179641 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144179654 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 144179891 T G Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 144179925 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 144179992 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 144180175 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144180232 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 144180306 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 144180307 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 144180344 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 144180512 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 144180558 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144180972 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 144181179 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144181231 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144181516 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144181547 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144181615 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144181640 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144181730 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144181796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144182039 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 144182923 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144183104 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144183685 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 144184416 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 144184443 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144184496 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144184639 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 144184679 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 144185094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144185157 C T Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 144185432 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 144185642 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 144185649 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 144185694 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144185710 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144185728 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144185860 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144185934 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144185998 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 144186000 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 144186200 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 144186217 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 144186244 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 144186246 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 144186482 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144186541 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 144186592 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144186715 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 144186724 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144186765 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144186989 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144186991 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144187295 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 144187309 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 144187391 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144187399 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 144187594 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 144187673 A T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 144187698 A T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 144188197 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144188203 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144188300 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144188370 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 144188397 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144188621 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 144188860 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 144189101 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144189126 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 144189649 G A N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 144189828 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 144190299 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144190413 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144190457 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 144190694 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 144190816 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 144191188 A T Y N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 3 144191487 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 144191498 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 144191731 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 144191746 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 144191892 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 144192098 G C Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 144192429 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 144192532 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 144192544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144192633 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 144192795 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 144192924 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 144193647 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 144193991 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 144194001 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 144194027 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 3 144194402 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144194821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144194931 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 144195003 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144195092 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144195132 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144195137 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144195767 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 144196537 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144196636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144196805 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 144197196 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 144197276 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 144197294 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144197351 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 144197742 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144198249 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144198453 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144199159 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 144199262 A G Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 144199335 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144200032 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 144200197 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144200237 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 144200948 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144201040 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144202661 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144202868 C G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 144202880 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 144203166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144203180 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144203260 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144203507 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144204000 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 144204016 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144204188 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144204209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144204223 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 144204381 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144204461 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 144204756 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 144204857 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 144205235 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144205462 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144205596 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 144206270 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 144206448 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144206535 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144206668 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144206846 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144207043 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144207348 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 144207404 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144207448 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 144207907 T A Y N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 144207980 C A Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 144208559 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 144208578 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 144208644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144208665 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144209130 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144212089 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144212847 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144212912 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144213070 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144213429 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144213619 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 144213655 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 144213665 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 144213690 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144214145 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144214317 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 144214372 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144214521 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 144214851 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 144214987 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144215323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144215391 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 144215573 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144216053 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 144216100 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 144216344 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 144216408 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 144216521 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 144216591 G T Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 144216618 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 144216676 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 144216754 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 144216818 C T N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 9 11 3 3 4 3 144216898 G A N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 144217236 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 144217462 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 144217921 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 144217955 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 144218072 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 144218096 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 144218111 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144218156 G C Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 144218581 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 144218822 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 144219403 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144219516 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144219582 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144219837 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 144220004 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 144220038 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144220103 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 144220156 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 144220287 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 144220290 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 144220349 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 144220611 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144220820 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 144220893 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 144220996 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 144221012 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 144221068 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144221129 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144221132 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144221298 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 144221356 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 144221417 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 144221589 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 144221668 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 144221755 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144221888 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 144222295 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 144222325 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 144222493 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 144222632 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144222857 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144222869 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 144223569 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144223983 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144224067 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144224189 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 144224365 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144224426 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144224455 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 144224504 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144224655 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 144225302 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 144225387 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144225409 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144225440 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144225671 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144225755 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 144225843 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 144225871 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 144225895 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144226060 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144226068 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 144226484 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 144226536 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 144226538 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 144226549 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 144227133 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144227265 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144227336 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144227615 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144227625 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144227662 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144228044 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 144228973 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 144229426 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 144229557 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144230494 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 144230979 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 144231773 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144231774 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144232144 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 144232444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144233275 T A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 144233316 C G Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 144233368 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 144233435 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144233643 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 144233799 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144233831 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 144234114 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144234248 A C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 144234258 A C Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 144234315 T G Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 144234591 T A Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 144234760 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 144235037 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144235627 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144237318 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144237389 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144238624 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 144243176 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 144243399 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144243768 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 144244033 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144245416 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 144245605 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144245738 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144245789 T A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 144245799 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144246382 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144246986 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 144247251 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144247679 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 144248642 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144249784 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144250398 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144251970 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144252174 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 144252787 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144255780 A G N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 144255917 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144256039 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144256630 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 144257454 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144259225 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144259340 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144259553 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 144259932 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 144259992 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 144260108 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 144260113 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 144260236 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 144260339 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 144260349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144260458 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 144260535 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 144260814 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 144260917 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 144261402 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144261410 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 144261472 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144261479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144261493 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 144262093 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 144262528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144263229 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 144263236 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144263655 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144263681 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144263880 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 144263937 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 144263973 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 144264088 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 144264232 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 144264328 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144264347 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144264392 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144264480 C G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 144264484 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 144264514 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 144264549 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144264566 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 144264671 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144264697 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144264702 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144264727 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144264804 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 144264852 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144264886 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144264910 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144264952 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144264968 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144265017 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144265131 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144265135 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144265170 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 144265345 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144265519 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144265745 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144265828 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 144265955 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144265962 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 144266038 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 144266054 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144266200 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 144266239 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 144266276 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 144266296 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 144266298 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 144266310 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 144266446 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 144266552 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144266576 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144266802 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144266819 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 144266836 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 144266858 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 144266891 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 144266944 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144266984 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144267010 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 144267665 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 144267926 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 144268005 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 144268083 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144268100 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144268112 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144268155 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 144268178 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144268193 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 144268307 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144268315 T G Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 144268359 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 144268402 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 144268430 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 144268451 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 144268495 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 144268561 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144268673 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144268856 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144268991 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 144269215 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 144269385 A C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 144269408 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 144269479 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 144269706 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 144269790 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 144270091 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 144270117 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 144270131 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 144270250 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144270379 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144270450 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 144270720 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 144271231 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144271289 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 144271301 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144271400 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144271437 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 144271455 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144271513 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144271518 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 144271575 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 144271589 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 144271800 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 144271813 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144271898 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 144271940 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 144272177 C G N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 144272415 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 144272597 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144272650 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 144272666 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144272740 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 144272758 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 144272825 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 144272845 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 144272980 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144273104 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 144273110 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 144273192 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 144273275 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 144273513 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 144273737 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 144273741 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 144273804 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 144273858 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144273899 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144273938 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 144273943 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 144274183 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 144274230 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 144274252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144274321 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 144274485 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 144274534 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144274542 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144274681 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144274821 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 144274857 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 144275063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144275188 G C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 144275190 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 144275279 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144275317 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144275482 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 144275903 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 144275940 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 144275966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144276000 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 144276056 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 144276393 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 144276432 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 144276548 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144276627 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 144276669 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144276727 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144277364 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 144277418 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144277588 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144278094 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144278247 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144278766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144279222 T C Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 144279227 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 144279296 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144279371 C T Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 144279391 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144279421 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144279454 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144279511 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144279622 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 144279626 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144279634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144279825 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 144280405 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144280504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144280716 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144281374 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144281543 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 144285565 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 144285606 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 144286721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144286786 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 144286971 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 144287019 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 144287412 A T N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 144289712 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 144290160 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144290433 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144290759 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144291110 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144294310 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144294983 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144295288 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144295354 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144296462 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 144297047 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 144297082 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 144298507 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144298561 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144299088 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144299101 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 144299478 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 144299706 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144300586 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 144301626 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144301966 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 144302017 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 144302044 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 144302075 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 144302098 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 144302149 C A Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 144302239 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 144302603 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144302894 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 144303111 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144303328 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144303347 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144305115 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144305656 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144305693 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 144305924 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144305928 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144306287 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144306471 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144306819 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 144307521 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 144307555 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 144308624 A T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 144308878 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 144308943 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144308980 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144309007 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144309105 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 144309843 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144310441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144312405 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144313047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144314244 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144315799 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144316391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144316493 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144316494 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144316583 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 144316627 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 144316628 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 144316792 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144316825 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144316984 C A Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 144317037 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 144324014 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 144324032 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 144324087 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 144324197 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144324226 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 144324314 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 144324360 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144324373 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144324467 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144324498 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144324623 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144324644 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144324671 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144324708 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 144324720 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 144324733 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144324785 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144324804 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144324812 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144324937 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144324942 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 144324965 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144324982 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144325017 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144325032 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144325037 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144325830 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 144325866 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 144325874 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144325972 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 144326086 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 144326118 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144326198 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144326224 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 144326275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144326445 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144326462 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 144326560 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 144326625 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144326774 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144326864 G C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 144326883 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 144326959 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144327152 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 144327168 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 144327169 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 144327263 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144327328 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144327341 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 144327438 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 144327823 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 144328135 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 144328208 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 144328255 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 144328293 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 144328404 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 144328419 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 144328438 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 144328499 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144328925 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 144328930 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 144328979 A T Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 144329126 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 144329127 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 144329175 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144329186 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 144329230 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144329262 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 144329349 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144329361 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 144329594 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 144329763 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 144329783 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 144329790 C A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 144329856 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 144329865 A C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 144329875 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 144329880 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 144329902 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 144329921 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 144329924 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 144330128 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 144330304 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144330433 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 144330455 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 144330523 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144330530 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144330628 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 144330733 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 144330783 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 144330805 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 144330849 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 144330864 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 144330872 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 144330899 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 144330913 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 144331149 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 144331195 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 144331235 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 144331244 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 144331301 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 144331367 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 144331445 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 144331466 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 144331540 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 144331573 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 144331695 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 144331769 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 144331797 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 144331884 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 144331885 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 144331964 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 144331965 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 144332036 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 144332083 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144332122 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 144332280 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 144332410 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144332768 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144332885 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 144333149 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 144333282 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144333449 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144333692 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 144335044 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 144335111 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144336021 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 144336041 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 144336379 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 144336615 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 144336688 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144337121 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 144337349 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144337458 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 144337467 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 144337622 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144337841 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144337920 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144337949 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144337965 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 144338105 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 144338220 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 144338311 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 144338375 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144338380 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144338411 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144338521 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144338535 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144338554 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144338583 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144338624 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 144338660 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 144338732 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 144338785 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 144338857 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 144338887 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144338939 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 144339035 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144339073 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 144339334 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144339359 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 144339401 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 144339413 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 144339442 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 144339487 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 144339508 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144339560 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 144339561 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144339651 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144339683 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 144339755 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 144339771 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 144339925 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144340013 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 144340133 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 144340246 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144340294 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 144340319 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144340335 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 144340338 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 144340395 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144340516 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 144340537 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 144340590 C G Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 144341345 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144341520 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 144341869 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 144341882 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144342110 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144342460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144342505 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144342571 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 144342703 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 144343066 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144343148 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144343163 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 144343227 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144343431 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 144343446 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 144344114 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 144344147 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 144344268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144344480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144344508 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 144344986 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144345176 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 144345366 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144345572 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 144345705 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 144345735 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 144345988 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 144346005 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 144346047 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 144346330 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 144346376 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 144346475 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 144346617 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 144346723 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144346818 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144346824 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144346896 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 144346982 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 144347332 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144347403 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 144347423 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 144347465 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144347466 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 144347480 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 144347590 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 144347655 T A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 144347656 T A Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 144347787 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 144347942 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 144347953 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 144348155 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144348537 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 144348713 A G N Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 7 7 2 3 2 3 144348924 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144349064 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144349351 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 144350833 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144350921 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 144351934 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 144352031 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 144353554 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144353789 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 144353924 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 144355702 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 144355977 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144356530 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144356592 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144357178 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144357198 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144357349 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144357856 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144358130 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 144358535 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 144358768 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 144359516 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144360113 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 144360252 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 144361115 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144361302 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144361396 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144361894 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144362071 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144362140 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144362454 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 144362668 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144363141 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144364035 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144364424 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 144364540 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144365266 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144365350 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 144365383 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 144365437 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 144365829 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 144366096 C A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 144366138 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 144366183 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 144366237 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 144366377 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144366842 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144367824 T A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 144367834 A T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 144367849 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 144367871 T C Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 144367880 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 144368132 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 144368228 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144369246 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144370507 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 144370537 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 144371146 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144372012 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 144372258 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144372352 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144372392 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 144372489 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 144373649 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 144373653 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 144374336 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144374421 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 144375406 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144375742 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144375858 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 144375985 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144375998 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144376150 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 144376308 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 144376339 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 144377185 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 144377246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144378528 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 144379210 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144379916 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 144380246 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 144380539 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 144380555 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144380771 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 144381004 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 144381034 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 144381378 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 144381602 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 144381617 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144381735 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 144381994 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 144382077 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 144382186 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144383865 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 144383952 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 144383993 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144384028 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 144384089 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 144384112 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 144384117 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 144384124 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 144384155 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 144384273 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144384405 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144384439 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144384478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144384565 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144384677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144384748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144384770 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144384799 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144384819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144384827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144384831 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144384913 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144384941 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144384968 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144385191 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 144385244 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 144385285 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 144385596 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 144385906 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.166666666666667 0.777777777777778 0.0555555555555556 20 16 3 14 1 3 144385930 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 144385935 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 144386050 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 144386097 C T Y Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.1 0.9 0 11 9 1 9 0 3 144386106 C T Y Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 144386121 G T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 144386279 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 144386305 T G N N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 9 9 2 5 2 3 144386530 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 144386538 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 144386568 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144386762 G A N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 144387091 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144387097 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 144387488 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144387494 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 144387649 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 144387693 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144387882 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144388040 G A Y Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 3 144388046 G A Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 144388131 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 144388202 C A Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 144388207 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144388259 G A Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 144388297 C A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 144388392 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 144388395 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 144388421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144388495 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144388537 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144388833 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144388903 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 144388915 T G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 144388925 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144389164 A T N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 144389218 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144389380 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144389448 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144389449 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144389534 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 144389576 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144389703 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 144389722 G T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 144389732 C T Y Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0 0.615384615384615 0.384615384615385 8 18 0 8 5 3 144389770 C T N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 144389796 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 144389821 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144389929 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144389931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144389953 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144389990 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144390045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144390097 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144390109 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144390145 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144390206 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144390208 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144390264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144390279 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144390377 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144390402 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144390452 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 144390501 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144390773 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144390813 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144390820 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144390839 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144390995 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144391052 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 144391335 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144391432 G C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 144391509 G C Y N 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.363636363636364 0.272727272727273 0.363636363636364 11 11 4 3 4 3 144391523 A T Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 144391539 G A Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 144391602 C G Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 144391985 A T Y N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 144392174 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144392186 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 144392219 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 144392252 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 144392253 G A Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 144392384 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144392412 C A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 144392739 A T N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 144393196 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 144393422 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144393481 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144393492 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 144393643 T G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 144393680 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144393734 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 144393745 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 144393956 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144394028 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 144394086 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 144394097 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144394132 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144394174 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144394178 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144394278 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 144394288 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144394342 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144394903 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 144394911 A T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 144397062 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 144397235 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144397838 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144397839 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 144397909 A G Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 144397946 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 144398023 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 144398070 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 144398095 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144398125 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144398338 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 144398365 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 144398374 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 144398610 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 144398646 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 144398666 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144398682 G C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 144398749 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 144399123 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 144399427 A T Y N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 144399674 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 144399779 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 144399932 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 144400244 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 144400272 G A Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 144400518 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144400552 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144400608 A G N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 3 144400638 A C N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 144400749 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144401190 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144401407 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144406613 A T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 144407247 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 144407820 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144408016 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 144408021 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 144408055 C T N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 144409696 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144409888 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 144410061 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144410360 T G Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 144410381 T C Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 144410540 C T Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 144410823 A C Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 144410834 T C Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 144410911 T C Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 144410985 T C Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 144410991 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 144411018 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 144411228 G A Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 144411340 T C N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 3 144411473 G A Y Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 144411624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144411671 A C Y N 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 144411675 C T Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 144411873 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144412666 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 144413108 T A Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 3 144413315 G C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 144413536 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 144413593 T A N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 3 144413611 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144413621 C T Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 144413694 G T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 144413741 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 3 144413755 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 3 144413792 T C Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 144415001 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144415173 G C Y N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.0625 0.9375 0 17 15 1 15 0 3 144415174 G A Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 18 16 1 16 0 3 144415192 G A Y Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0 1 0 14 14 0 14 0 3 144415250 A C Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 144415263 A G Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 3 144415266 T A Y N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 144415377 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144415400 A G Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 144415417 C T Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 144415596 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 144415607 T G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 144415649 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 144415885 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 144415921 G A Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 144415990 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 144416237 A G N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 144416250 G C Y N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 144416341 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 144416352 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144416586 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 144416848 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 144416953 G T Y N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 144417125 G A Y Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.153846153846154 0.846153846153846 0 15 11 2 11 0 3 144417149 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 144417159 T C Y Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0 1 0 13 13 0 13 0 3 144417267 G A Y Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.133333333333333 0.6 0.266666666666667 13 17 2 9 4 3 144417286 C T Y Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0 0.928571428571429 0.0714285714285714 13 15 0 13 1 3 144417287 T A Y N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0 0.928571428571429 0.0714285714285714 13 15 0 13 1 3 144417335 T G Y N 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0 0.9 0.1 9 11 0 9 1 3 144417408 T C Y Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.181818181818182 0.818181818181818 0 13 9 2 9 0 3 144417474 A T N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 144417482 T C Y Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 10 8 1 8 0 3 144417487 T A Y N 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 10 8 1 8 0 3 144417588 A G Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0 0.941176470588235 0.0588235294117647 16 18 0 16 1 3 144417755 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.05 0.7 0.25 16 24 1 14 5 3 144417824 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144417936 A G Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0 0.941176470588235 0.0588235294117647 16 18 0 16 1 3 144418041 C G Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 3 144418050 T G Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144418105 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 144418235 G C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 144418256 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144418326 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 144418363 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 144418391 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 144418399 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 144418415 C A Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 144418430 T C Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 144418448 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 144418451 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 144419601 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 144419626 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 144419787 A G Y Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 13 11 1 11 0 3 144419850 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 144419851 G A N Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.25 0.75 0 10 6 2 6 0 3 144420071 C G Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.0526315789473684 0.842105263157895 0.105263157894737 18 20 1 16 2 3 144420172 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144420415 A T N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 3 144420632 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144420964 T C Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 144421125 C A N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 3 144421129 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 14 10 2 10 0 3 144421296 T C Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 3 144422672 C T N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 15 13 1 13 0 3 144422694 A G N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 3 144423022 T C N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 144423031 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 144423217 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 144424226 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 144424282 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144424422 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 144424698 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 144425087 G T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 144425183 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144425211 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144425497 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144425647 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 144425686 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 144425780 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 144425903 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 144425975 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 144426015 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 144426019 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 144426310 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144426612 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144426743 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 144426863 T C N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 144427293 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 144427420 T C Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 144427773 T G Y N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 144428144 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 144428496 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 144428687 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 144429132 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 144429347 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144429695 T C Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 144430030 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 144430037 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 144430042 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 144430222 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 144430499 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 144430956 T G N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 144431418 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 144431532 C A N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 3 144431584 C A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 144431797 A T N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 144431915 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 144431924 T G N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 144431982 C G N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 144432464 A G N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.230769230769231 0.384615384615385 0.384615384615385 11 15 3 5 5 3 144432612 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 144432934 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 144433196 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144433407 G A N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 3 144433778 A G Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 144440024 C G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 144440141 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 144440461 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144440595 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144440824 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144440887 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144441257 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 144441287 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144441609 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 144441613 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 144441788 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 144441935 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144441962 C A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 144442050 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 144442344 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144442407 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 144442424 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 144442468 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144442486 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144442644 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144443012 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144443020 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144443045 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144443138 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 144443254 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144443256 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144443282 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144443299 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144443302 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 144443385 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144443622 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 144443639 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 144443766 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144443933 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144443987 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 144444042 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144444066 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 144444327 A G N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 3 144444463 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144444806 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 144444820 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144444840 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144444855 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 144444964 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 144445058 A G Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 144445191 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 144445480 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 144445664 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144445679 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144445735 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144445831 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 144445832 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144445885 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144445913 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 144446022 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144446106 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 144446158 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144446292 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144446345 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144446369 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144446410 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 144446509 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144446519 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144447141 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144447165 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144447329 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144447377 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 144447381 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 144447497 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144447498 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 144447708 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144447846 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144447878 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144447885 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144447954 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144448161 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144448279 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144448458 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144448487 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144448518 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144448615 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 144448681 G A Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 144448692 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144448704 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144448745 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144448791 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 144448949 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 144449033 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.0625 0.9375 0 17 15 1 15 0 3 144449077 T C N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 3 144449087 T C N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.181818181818182 0.818181818181818 0 13 9 2 9 0 3 144449100 G T N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 144449103 A G N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 144449832 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.05 0.85 0.1 19 21 1 17 2 3 144450702 A G Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 3 144450728 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144450793 A G Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 3 144450892 T A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144451468 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144451477 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 144451809 G C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 144451944 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144452243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144452309 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144452757 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 144452768 C T Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 144452889 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144453221 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144453230 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144453285 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 144453360 C A N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 144453445 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 144453651 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 144453943 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144454062 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 144454184 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 144454645 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144454677 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 144454767 C T Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 144454990 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 144454997 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 144455312 A T N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 144455459 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 144455554 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 144455620 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144455691 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144456003 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 144456014 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144456151 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 144456154 A C Y N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 3 144456485 C G Y N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 3 144457569 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 144457584 T G Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 144457630 G A Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 144457645 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 144457658 A G Y Y 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 5 15 1 3 6 3 144457861 A C Y N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 144458064 A G Y Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 3 144458179 G A Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 144458199 G T Y N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 144458417 G T Y N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 144458448 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144458583 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 144458776 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144458991 C T Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 144459023 A C Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 144459119 T C Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 144459173 A T Y N 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 3 144459462 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 144459488 T G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 144459545 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144459595 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144459720 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144459785 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 144459816 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 144459885 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144459889 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144460042 C A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 144460145 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144460199 C G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 144460248 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144460347 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 144460417 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144460472 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144460923 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144460961 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144461042 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144461069 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144461081 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144461206 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144461230 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144461281 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 144461384 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 144461416 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 144461590 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144461613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144461666 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144461718 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144461839 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144461994 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144462121 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144462149 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 144462180 A C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 144462224 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 144462230 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144462239 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 144462531 C G Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0 0.882352941176471 0.117647058823529 15 19 0 15 2 3 144462570 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144462588 T C Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 144462624 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144462626 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 144462734 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 144462736 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144462793 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144463014 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144463159 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144463198 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 144463273 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144463293 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 144463298 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144463309 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144463655 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 144463779 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144463791 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144463822 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144463954 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 144464043 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144464099 T A Y N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 3 144464336 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 144464370 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144464424 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144464447 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144464538 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144464547 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144464606 G T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 144464613 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144464655 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144464663 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144464682 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 144464738 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 144464836 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 144464896 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144464950 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 144465184 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144465339 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144465426 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144465499 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 144465582 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144465665 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 144465760 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144465858 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 144465887 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 144465893 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144465912 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 144466166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144466273 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144466299 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144466387 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144466396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144466436 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 144466475 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144466488 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144466575 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144466640 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144467943 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 144468051 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 144468355 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144468621 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144468665 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144468697 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144468800 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 144468981 G C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 144469316 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144469393 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144469489 A G Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 144469584 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 144469624 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144469628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144469655 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144469746 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144469750 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144469897 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 144469903 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144469926 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144469930 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144470128 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144470186 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 144470218 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144470391 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144470453 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 144470466 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144470478 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144470567 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 144470585 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 144470589 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 144470605 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 144470695 C A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 144470715 A G Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 144470788 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144470816 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144470849 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144470962 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144471334 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 144471490 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 144471553 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 144471580 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 144471749 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144471781 A C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144471836 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144472482 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144472543 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144472582 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144472619 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144472655 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144472742 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 144472840 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144473886 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 144473904 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 144473952 T G Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 144473975 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144473978 T A Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144474046 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 144474051 G C N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 144474059 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 144474090 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 144474120 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 144474187 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144474215 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144474282 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144474336 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144474397 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144474424 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 144474587 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144474627 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144474665 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144474675 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144474676 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 144474701 C G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 144474783 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 144474786 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 144474889 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144474903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144474932 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 144474979 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 144475025 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 144475106 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144475113 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 144475147 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144475207 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 144475240 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144475245 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 144475269 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 144475285 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 144475306 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 144475371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144475402 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144475435 C T Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 144475507 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144475548 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 144475572 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 144475601 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 144475607 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 144475630 A G N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 144475920 T C N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 144475935 T G N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 144476658 A G Y Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 3 144476764 C G Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 3 144476773 T G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 144476815 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 144476847 G A N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 144476880 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144477087 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144477088 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144477100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144477136 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 144477154 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 144477157 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 144477198 C A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 144477405 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 144477413 A T N N 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 3 144477426 C G N N 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 3 144477649 G C Y N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 144477712 A G Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 144478860 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 3 144478871 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 144478957 T A N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 144478977 G A N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 144478983 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 144479023 A C N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 144479036 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 144479270 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144479293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144479335 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144479372 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144479479 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144479536 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144479564 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144479579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144479652 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144479690 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144479842 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 144479847 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 144479909 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 144480006 G A N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 144480103 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 144480411 G T Y N 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 3 144480476 A T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 144480592 A T Y N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 144480726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144480762 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144480818 T G Y N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 144480834 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 3 144480875 C A N N 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0 0.818181818181818 0.181818181818182 9 13 0 9 2 3 144481010 A G Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 144481368 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 144481490 T G N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 144481583 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 144481587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144481717 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 144481864 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144481866 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144481891 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 144482051 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 144482052 G C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 144482090 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 144482108 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 144482128 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 144482418 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144482435 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144482468 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 144482488 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144482490 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144482615 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144482630 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 144482654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144482662 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144482690 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144482782 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144482812 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144482850 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144482878 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144483220 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144483430 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144483441 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144483522 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 144483747 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 144483815 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144483948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144484045 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144484128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144484141 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144484243 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 144484277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144484300 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144484340 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144484381 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 144484417 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144484442 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 144484450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144484499 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 144484521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144484595 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 144484653 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 144484704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144484717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144484880 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144484935 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144485076 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 144485157 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144485217 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144485232 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144485437 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 144485498 G A N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 144485539 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144486184 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 3 144486275 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144486415 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144486540 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144486705 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 144486719 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144486737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144486811 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 144486869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144486941 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144486945 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 144486973 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144487138 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144487256 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144487757 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144488016 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144488290 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144488323 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 144488787 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144489643 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144489656 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 144489779 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 144490019 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144490845 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144490879 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144491169 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144491187 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 144491272 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 144491310 T G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 144499031 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144499189 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144499518 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144499543 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144499606 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144499618 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144499722 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144499750 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144499763 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144499957 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144500026 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144500069 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144500101 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 144500104 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144500153 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144500159 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144500265 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144500365 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144500515 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144500753 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144500861 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144500976 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144501030 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144501256 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144501430 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144501486 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144501577 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144501620 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144501686 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144501695 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144501791 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144501832 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144501941 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144501968 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144502036 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144502455 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 144502503 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 144502545 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144502549 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144502599 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 144502606 T G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 144502670 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 144502912 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 144503081 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144503228 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 144503251 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 144503283 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 144503314 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 144503340 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 144503401 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 144504021 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144504213 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 144504246 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 144504342 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 144504356 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 144504381 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 144504412 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 144504438 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.25 0.166666666666667 0.583333333333333 8 16 3 2 7 3 144504473 G C N N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 3 144504483 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 144504533 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 144504598 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144504699 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144504805 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144504913 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144504943 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144505042 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144505089 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144505247 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 144505258 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 144505379 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 144505406 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 144505411 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 144505441 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 144505465 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 144505499 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 144505564 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144505609 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144505634 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144505694 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144505717 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144505760 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144505782 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 144505786 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144506007 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144506331 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144506515 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144506548 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 144506770 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144506831 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 144506887 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144507037 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144507112 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144507125 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144507345 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144507796 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144507864 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144507924 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144507934 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144508075 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 144508163 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 144508190 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 144508276 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 144508434 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 144508468 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 144508545 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 144508554 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 144508646 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 144508723 G A N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 3 144508743 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 144508823 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144509039 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144509048 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144509168 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144509172 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144509337 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144509452 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 144509571 G A N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 144509666 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 144509676 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144509747 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144509929 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144510107 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144510110 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144510205 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144510250 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144510277 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144510279 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144510326 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144510431 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144510446 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144511267 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144511268 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144511421 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 144511508 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144511811 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144512157 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 144512251 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144512284 A G Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 144512818 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144513063 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 144513260 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 144513419 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 144513759 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 144513993 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144514321 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 144514563 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144514788 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 144514984 C T Y Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 144515020 T C Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 144515098 T C Y Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 3 144516133 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 144516239 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144516242 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144516277 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144516358 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144516847 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144516900 A T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 144516972 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 144517016 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 144517351 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 144517447 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144518160 C T Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 144518396 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 144518604 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 144518845 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144518872 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 144518991 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 144519108 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144519226 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144519493 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 144519636 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144520150 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144520282 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144520364 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144520500 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 144520530 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 144520662 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144520945 C T Y Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 5 9 1 3 3 3 144521426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144521499 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 144521706 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 144521717 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 144521786 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 144521835 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 144521879 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144522241 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144522489 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144522701 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144523365 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 144523421 A C N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 144523611 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 144523705 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 144523909 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144524355 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 144524687 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 144524696 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 144524848 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144524870 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144525501 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144525510 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 144526030 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 144526130 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 144526158 G T Y N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 144527903 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 144528050 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 144528254 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144528583 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144528711 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144530554 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 144530828 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 144530833 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144530863 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 144530872 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 144531016 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 144531086 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 144531212 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144531253 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 144531266 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 144531316 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144531336 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144531338 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144531369 A T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 144531425 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 144531450 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 144531452 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 144531485 T A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 144531511 A T Y N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 144531517 G T Y N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 3 144535161 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 144535170 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144535239 G T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 144535245 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 144535309 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 144535324 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 144535332 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 144535343 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 144535360 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 144535363 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 144535377 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 144535442 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 144535489 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 144535528 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 144535549 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 144535570 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 144535577 A C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 144535645 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 144535657 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 144535664 T G Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 144535674 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144535677 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144535685 A T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 144535692 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 144535747 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 144535752 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 144535759 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 144535812 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 144535916 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 144535957 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 144536002 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144536232 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144536273 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144536480 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 144536685 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 144536716 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 144536725 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 144536739 A C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 144537366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144537632 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144537886 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144538354 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144539274 C T Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 144540115 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144540298 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144541548 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144541561 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144541590 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144542477 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 144542524 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 144542942 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144543379 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144544865 T G Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144545844 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 144546760 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 144547102 A C Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 144547670 G A Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 144548722 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144548902 T G Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 144549264 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144549362 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144549623 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144549816 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144550007 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 144551101 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144551326 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 144554203 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144554466 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 144554631 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 144554730 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 144554749 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 144555206 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 144555811 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 144555925 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 144556346 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144556365 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 144556933 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144556972 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 144557029 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 144557258 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 144557282 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 144557283 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 144557722 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 144558372 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 144558540 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 144559262 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144560044 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144560569 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 144560604 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 144560653 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 144560767 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144560801 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144560969 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144562500 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144563812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144564869 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 144565952 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 144566271 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144566334 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 144567261 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 144567565 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144567604 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144568879 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144569451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144571075 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144571576 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 144571761 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144572003 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144572009 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144572183 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 144572228 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144573027 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144573052 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144573073 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144573082 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144573152 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144573192 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144573232 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 144573245 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144573315 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144573346 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144573354 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144573471 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144573531 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144573605 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144573709 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144573724 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 144573837 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144573870 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144574210 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144574291 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144574294 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144574346 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 144574520 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144574566 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144574703 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144574712 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144574718 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144574753 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144574756 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144574778 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144574781 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 144574845 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144574855 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144574931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144574974 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144575004 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144575044 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144575143 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144575233 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144575238 T A Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 144575287 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144575309 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144575346 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144575347 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144575364 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144575385 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 144575407 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144575431 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144575434 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144575467 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 144575534 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 144575586 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 144575651 G C Y N 0.333333333333333 ALT 0.55 0.55 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 12 6 4 4 1 3 144575697 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 3 144575735 T A N N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 3 144575738 G T Y N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 3 144575998 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 144575999 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 4 8 1 2 3 3 144576050 G C Y N 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 144576099 G A Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 144576436 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 144576483 T G N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 144576491 T C Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 144576526 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 144576914 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144576934 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 144576935 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144576966 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 10 8 1 8 0 3 144577049 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144577058 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 144577081 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 144577195 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144577335 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144577370 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144577386 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144577388 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144577484 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 144577517 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 144577536 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144577538 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144577660 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144577679 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144577724 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144577753 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144577768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144577784 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144577954 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144577965 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 144578051 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144578138 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144578159 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144578171 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144578177 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144578185 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144578206 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144578233 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144578251 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 144578375 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 144578386 T A Y N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 144578401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144578425 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144578465 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 144578487 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 144578563 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 144578607 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144578612 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144578812 C T Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 144578864 A C Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 144578969 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 144579271 C G Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 144579413 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 144579486 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 144579512 A G Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 144579523 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 144579532 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 144579535 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 144579560 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 144579561 G C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 144579689 G A Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 144579717 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 144579725 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 144579767 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144579799 G T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 144580159 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144580464 T G Y N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 3 144580653 C A Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 144580705 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 144580807 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 144580855 G C Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 144580975 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144580976 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 144581132 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 144581704 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144581707 G A Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 144581864 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 144581917 T C Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 144582139 T C Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.0625 0.875 0.0625 16 16 1 14 1 3 144582569 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 144582573 T A Y N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 144582932 C A Y N 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 4 8 2 0 4 3 144584044 C T Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 144584183 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 144584541 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 144584615 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 144584641 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 144584662 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 144584664 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144584876 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 144584984 C A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 144585164 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 144585362 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 144585511 C G N N 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 144585687 T A Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 144586049 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 144586219 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 144586244 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144586329 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144586339 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 144586361 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 144586488 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144586495 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144586541 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144586543 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144586624 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144586637 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144586682 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144586688 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144586753 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144586802 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144586813 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144587089 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144587182 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144587193 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144587213 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144587381 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144587424 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 144587430 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 144587563 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144587583 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144587742 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144587747 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144588081 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144588103 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 144588114 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 144588137 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144588252 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144588364 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 144588365 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 144588429 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 144588511 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144588674 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144588713 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 144588714 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 144588906 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144588956 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 144589029 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144589160 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144589225 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 144589227 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 144589578 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 144589587 G A Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0 0.8125 0.1875 13 19 0 13 3 3 144589647 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.157894736842105 0.736842105263158 0.105263157894737 20 18 3 14 2 3 144589766 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144589915 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 144589924 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 144589941 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144589953 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 144590037 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144590118 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 144590139 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144590322 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144590399 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 144590405 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 144590591 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 144590595 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144590757 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 144590765 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 144590822 A T Y N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 144590831 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 144590894 G T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 144590895 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 144591149 G A Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 144591218 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 144591417 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 144591628 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 3 144591745 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 144591781 C A Y N 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 3 144591820 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 144591837 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144591872 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 144591936 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 144591938 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144591949 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 144591990 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 144592011 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144592091 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 144592104 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144592140 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144592260 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144592274 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 144592382 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144592426 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 144592486 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144592615 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144592644 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 144592680 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144592685 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144592700 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 144592712 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144592731 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 144592742 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 144592805 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144592820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144593064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144593105 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 144593148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144593206 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144593309 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 144593446 G A Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 144593459 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144593636 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144593657 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 144593683 C G Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 144593721 A G Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 144593751 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 144593766 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 144593774 G T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 144593784 A C Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 144593815 T G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 144593878 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144593922 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144594111 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144594117 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144594429 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.0526315789473684 19 19 1 17 1 3 144594456 G A Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.111111111111111 0.833333333333333 0.0555555555555556 19 17 2 15 1 3 144594459 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144595142 T C Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 144595145 C G Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 144595216 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 144595375 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 144595488 C T Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 144595507 G T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 144595593 T A Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 144595634 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 144595674 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 144595925 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 144595930 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144596061 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 144596068 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 144596097 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 144596112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144596124 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144596174 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 144596290 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 144596378 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144596404 G C Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 144596416 T C Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 144596459 T A Y N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.461538461538462 0.384615384615385 0.153846153846154 17 9 6 5 2 3 144596492 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144596554 T C Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 144596561 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 144596606 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 144596657 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 144596691 A T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 144596695 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 144596748 A C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 144596809 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 144596837 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 144596944 T G Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 144597150 A C Y N 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 144597176 C T Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 144597483 T A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 144597519 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144597581 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144597629 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 144597812 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 144597933 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144597936 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 144597947 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 144597948 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144597959 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 144598074 C T Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 144598200 C G N N 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.545454545454545 0.0909090909090909 0.363636363636364 13 9 6 1 4 3 144598277 A G Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 144598328 G A Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 144598390 G C Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 3 144598405 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 144598452 G T Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 144598552 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 144598605 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 144598740 T A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 144602234 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 144602235 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 144602392 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 144602399 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144602421 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144602520 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144602720 G T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 144602918 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144602930 T A Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 144602981 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 144603147 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 144603192 G C Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 144603428 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144603542 A T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 144603642 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144603706 A C Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 144603717 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144603747 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144603756 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144603824 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 144603847 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 144603941 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 144604219 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 144604276 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 144604298 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144604308 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144604330 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 144604432 C G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 144604517 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 144604581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144604651 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144604895 A G Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 144605474 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144605691 C T Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 144605706 C T Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 144605831 C T Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 144605953 A T Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 144605963 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 144606045 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144606101 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144606344 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 144606457 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144606541 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.583333333333333 0.166666666666667 0.25 16 8 7 2 3 3 144606552 A C Y N 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.555555555555556 0.111111111111111 0.333333333333333 11 7 5 1 3 3 144606581 A T Y N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 9 7 3 3 2 3 144606640 C T Y Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 3 144606902 C T Y Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 10 10 4 2 4 3 144607077 T A Y N 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.454545454545455 0.272727272727273 0.272727272727273 13 9 5 3 3 3 144607093 T C Y Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 144607387 A G Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 144607471 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 144607496 A G Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 3 144607599 C G Y N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 144607681 A C Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 144607927 T A Y N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 144607963 C T Y Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 3 144608088 C T Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 3 144608123 G T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144608143 G C Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 144608145 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 144608287 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 144608352 A T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 144608382 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.588235294117647 0.176470588235294 0.235294117647059 23 11 10 3 4 3 144608417 T C Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 144608455 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144608492 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144608665 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 144608688 T C Y Y 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 10 10 4 2 4 3 144608767 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 3 144609009 G C N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 3 144609262 T G Y N 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 10 8 3 4 2 3 144609293 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 144609311 C T Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 144609323 A C Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 144609411 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 144609441 T G Y N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.636363636363636 0.181818181818182 0.181818181818182 16 6 7 2 2 3 144609449 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 144609657 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 144609753 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144609789 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144609837 C T Y Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 3 144610176 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144610343 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 144610460 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144610466 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144610519 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144610522 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 144610616 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144610987 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 144611060 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144611084 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144611134 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144611301 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144611364 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144611411 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 144611443 T A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 144611604 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144611681 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 144611684 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 144611779 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144611790 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144611862 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144611868 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 144611921 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 144611928 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 144612005 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 144612083 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 144612170 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144612185 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144612234 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 144612237 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 144612290 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 144612465 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 144612487 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 144612491 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 144612586 T G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 144612742 A G Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 144612755 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144612780 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144612856 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144612863 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144612947 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144612985 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144613020 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144613032 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144613091 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144613187 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 144613196 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 144613210 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 144613326 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144613358 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 144613505 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 144613644 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 144613723 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 144613829 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 144613855 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144613929 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144613931 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 144614118 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144614143 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 144614201 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144614235 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 144614241 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 144614336 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 144614353 A T N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 144614371 C T Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 144614468 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144614512 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 144614524 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 144614704 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144614711 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144614735 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144614834 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144615302 T A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 144615614 A G Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 144615772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144616059 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144616144 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 144616148 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 144616197 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 144616213 T A Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 144616632 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144616639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144616653 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144616871 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144616873 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144616949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144616964 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144617027 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144617114 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144617168 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 144617485 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.105263157894737 0.894736842105263 0 21 17 2 17 0 3 144617579 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.1 0.8 0.1 20 20 2 16 2 3 144617891 A C Y N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.5 0 0.5 4 4 2 0 2 3 144617902 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 7 5 1 5 0 3 144618031 C T Y Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.363636363636364 0.545454545454545 0.0909090909090909 14 8 4 6 1 3 144618166 G C Y N 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 144618260 G A Y Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 3 144618277 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 144618313 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144618400 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144618448 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 144618456 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144618493 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 144618555 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 144618590 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144618624 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144618673 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 144618813 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144618838 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144618845 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144618876 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144618877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144618965 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 144618998 A T Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 144619343 C G Y N 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.5 0 0.5 6 6 3 0 3 3 144619377 T C N Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.5 0 0.5 6 6 3 0 3 3 144619439 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 144619546 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 4 2 2 0 1 3 144619669 A G Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 144619675 A G Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 144619732 C G Y N 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 3 144620110 A C Y N 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 3 144620200 A T Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 144620338 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 144620355 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 144620356 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 144620525 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 144620537 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 144620710 A G Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 144620733 A C Y N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 144621177 T G Y N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 144621332 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 144621333 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144621348 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 144621370 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 144621415 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 144621538 G C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 144621539 G A Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 144621964 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 144622104 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 144622108 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 144622273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144622308 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 144622380 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 144622569 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 144622574 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 144622665 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144622676 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144622701 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 144622768 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.1 0.75 0.15 19 21 2 15 3 3 144623075 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 144623166 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 144623268 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144623510 T A Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 144623601 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 144623858 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 144623864 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 144624300 G C Y N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 144624317 T G Y N 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 144624373 A G Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 144624428 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 144624503 T C Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 144624516 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 144624637 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144624774 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 144624799 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 144624833 G T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 144624848 G T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 144624905 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 144625107 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 144625522 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 144625541 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144625627 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 144625655 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 144625701 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 144625763 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144626007 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 144626047 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144626068 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 144626143 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144626228 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 144626408 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 144626871 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 144627252 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 144627255 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144627308 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 144627423 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144627507 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 144627521 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 144627702 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144627714 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144627787 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 144627942 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144628005 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 144628278 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144628341 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 144628454 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 144628941 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144629011 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144629167 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144629305 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144629331 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 144629345 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 144629665 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 144629746 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144629756 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144629769 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144629908 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 144630009 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144630316 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 144630459 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144630516 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144630568 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144630763 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144630769 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 144630820 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 144630989 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144631047 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144631071 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 144631608 A G N Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.75 0 0.25 6 2 3 0 1 3 144631631 A G N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 144631635 G A N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 144631753 A G Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.0555555555555556 0.833333333333333 0.111111111111111 17 19 1 15 2 3 144631924 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144632819 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 144632881 C A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 144634186 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 144634201 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 144634594 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 144634855 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144634975 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144635008 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144635083 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 144635127 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144635169 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144635182 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 144635265 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 144635380 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 144635493 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 144635808 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 144635891 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 144636639 A T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 144636730 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144636873 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 144636875 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 144637030 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 3 144637052 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 144637657 T C Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 144637738 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 144637899 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 144637913 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 144637942 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 144638005 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144638022 G T Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 144638437 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 144638515 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144638843 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 144639379 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144639601 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144640028 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 144640184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144640192 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144640464 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 144640475 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 144640660 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 144640810 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 144640885 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144640935 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144640988 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144641002 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144641053 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144641081 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 144641162 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144641429 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 144641454 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144641468 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144641481 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144641499 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144641559 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144641757 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144641762 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144641783 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144641792 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144641816 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144641817 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144641864 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 144641896 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 144641897 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 144642071 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144642109 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144642188 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144642208 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144642229 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144642232 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144642545 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144643543 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144643607 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144643867 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 144643971 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 144644159 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 3 144644743 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144644821 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144644996 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144645133 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144645153 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144645220 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 144645237 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 144645243 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144645249 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 144645319 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 144645331 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 144645348 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144645584 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 144645607 C A N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 144645982 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144646079 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 144646127 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 144646186 A C N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 3 144646597 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 144647114 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 144647224 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 144647246 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 144647402 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 144647945 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 144648091 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 144648148 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 144648245 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144648344 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144648914 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144648972 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 144649007 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144649048 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144649127 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144649385 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144649431 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144649599 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 144649798 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144649896 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144649906 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144650039 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144650262 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144650411 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144651047 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144651163 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 144651224 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 144651238 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144651427 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 144651793 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 144651815 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 144652624 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 144652658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144653170 T G N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 144653325 A C N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 144653474 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144653928 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144653983 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 144654009 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 144654018 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 144654031 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 144654286 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144654294 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144654308 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144654710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144654868 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144655067 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 144655074 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144655116 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144655257 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144655736 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144655839 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144655967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144656076 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144656088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144656211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144656248 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144656419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144656611 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144656834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144656908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144657123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144657177 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 144657269 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144657310 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144657840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144657939 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 144658634 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 144659269 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144659737 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144659746 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144660083 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 144660229 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144660360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144660463 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144660563 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144660614 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 144660651 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144660717 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144660778 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144660958 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 144661059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144661407 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144661568 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144661661 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144661699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144661940 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144662023 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144662322 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144662357 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 144662528 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 144662736 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 144662973 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 144663008 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 144663295 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144663606 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144663662 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144663738 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 144663972 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 144664260 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 144664265 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144664308 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144664420 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 144664718 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144664730 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144664778 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144664903 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 144664964 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144665098 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 144665399 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 144665430 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 144665463 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 144665593 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 144666041 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144666106 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 144666133 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 144666158 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 144666174 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 144666194 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 144666268 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 144666304 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 144666307 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 144666354 T C N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 3 144666422 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144666816 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144666834 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144666920 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 144666963 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 144666998 G T N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 144667016 C G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 144667032 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144667057 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 144667074 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 144667146 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144667244 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144667251 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144667518 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144667566 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144667582 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144667621 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144667720 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144667804 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144668023 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144668168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144668603 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144668727 C T N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 144668814 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 144668857 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 144668956 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 144669112 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144669156 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144669167 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144669228 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 144669244 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144669488 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144669744 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 144669855 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144669975 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144670026 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144670158 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144670233 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 144670473 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144670528 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 144670690 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144670787 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 144670901 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144670907 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144670964 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 144670965 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144670979 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 144671012 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 144671077 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144671139 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144671218 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144671287 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144671320 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 144671564 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144671604 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144671616 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144671832 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 144671999 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144672481 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144672530 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144672755 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144673077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144673084 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144673148 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144673215 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144673234 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144673268 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144673309 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 144673444 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 144673578 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144673602 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144673617 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144673621 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144673650 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 144673746 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 144673884 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144673933 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144674049 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144674127 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144674291 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 144674307 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 144674308 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 144674456 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144674548 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 144674709 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144675620 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144676045 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144676103 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144676108 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144676138 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144676163 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144676406 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144676590 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144676634 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144676673 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144676726 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144676756 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 144677226 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144677277 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144677669 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144677909 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144678338 G T N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 144678606 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144679025 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144679027 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144679058 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144679575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144679809 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 144679833 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 144679880 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144679918 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144679954 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144679995 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144680274 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144680470 A C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 144680558 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144680626 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144680799 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144680842 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144680844 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144680872 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144680950 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144680954 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144680961 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144681357 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144681464 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144681471 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144682547 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 144682679 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 144682871 C T N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 144682908 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144682937 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 144683125 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 144683224 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144683319 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144683396 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144683663 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144683673 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144684150 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144684217 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144684334 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144684381 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 144684531 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144684728 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144684743 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144684761 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144684840 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144684864 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144684976 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 144684979 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144685012 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 144685038 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 144685238 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144685352 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144685662 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 144685932 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144686193 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 144686266 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 144686391 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 144686419 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144686431 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144686479 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144686486 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144686548 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144686598 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144686622 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144686655 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144686656 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144686666 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144686799 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144686874 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144687026 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144687047 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144687093 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144687108 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144687266 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144687310 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144687391 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144687452 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144687501 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144687531 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144687948 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144688297 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144688797 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144688817 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144688854 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144688861 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144688875 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144688889 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144689782 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144689855 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144689899 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144689930 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144690070 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144690100 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144690114 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144690180 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144690196 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144690236 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 144690427 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144690510 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144690806 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144690835 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144690892 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144690979 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144691055 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 144691063 C A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 144691088 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 144691229 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144691259 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144691260 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144691307 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144691519 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144691607 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144691617 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144691863 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 144691918 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 144692092 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144692166 T A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 144692172 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 144692246 C A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 144692314 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 144692472 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144692533 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144692714 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144692730 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144693153 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144693398 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144693410 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144693456 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144693750 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144693869 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144693989 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 144694009 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 144694014 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 144694149 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144694158 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 144694186 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144694206 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144694314 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144694451 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 144694519 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 144694532 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 144694553 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144694681 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 144694736 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 144694802 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144694852 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 144694895 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 144695090 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144695705 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144695721 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144696124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144696721 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144696884 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144696918 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 144697083 A C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 144697090 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144697180 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144697551 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144697662 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144697978 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 144698185 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144698308 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144698310 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144698545 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144698564 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144698901 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 144698994 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 144699077 A C N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 144699099 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 144699183 G T N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 0.153846153846154 0.153846153846154 20 6 9 2 2 3 144699397 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144699489 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144699490 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144699916 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144699933 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144699957 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144700072 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144700103 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144700121 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144700236 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144700251 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144700325 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144700330 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144700420 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 144700484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144700876 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 144701026 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 144701066 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 144701128 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 144701631 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144701709 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144701954 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 144702094 A T Y N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 3 144702399 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 144702595 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 144702659 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144709622 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 144709786 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 144709920 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 144709988 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 144710087 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144710216 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 144710434 T C Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 144710560 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 144710561 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 144711079 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144711109 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 144711806 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144711939 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144712057 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144712081 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144712111 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144712167 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144712206 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144712260 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144712285 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 144712962 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 144713163 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144713252 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 144713371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144713473 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144713492 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144713572 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144713780 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144713876 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 144713979 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 144714038 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 144714084 C G Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 144714133 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144714434 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144714461 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144714479 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144714499 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144714545 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 144714548 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144714598 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144714622 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 144715119 C T Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 144715157 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 144715341 A C Y N 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 144715363 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 15 3 7 1 1 3 144715459 T C Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 144715577 A G Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 144715990 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144716115 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 144716186 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 144716211 A G Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 144716258 G T Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 144716266 T A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.176470588235294 0.705882352941177 0.117647058823529 18 16 3 12 2 3 144716338 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 144716371 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144716487 A C Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144716515 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144717199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144717978 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144724924 G C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 144725004 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 144725130 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 144725649 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 144725755 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144725821 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 144725988 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144726036 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 144726051 A C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 144726114 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 144726275 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 144726304 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 144726342 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 144726462 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144726989 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144727323 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144727474 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144727915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144728092 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144728841 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 144728898 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 144728982 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 144729267 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144729611 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144729738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144729939 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144729960 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144730078 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144730143 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144730154 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144730189 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144730412 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 144731190 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 144731237 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 144731502 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144731572 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144731584 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144731781 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144731808 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144731932 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 144732523 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144732591 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 144732794 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144732903 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 144732961 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 144732962 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 144732986 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 144733218 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 144733429 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 144733493 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144733591 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144733705 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144733778 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 144733898 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144734520 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144734625 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144734823 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144735449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144735621 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 144735711 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144735712 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144735815 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144735964 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144737094 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144737143 T G Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 144737201 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 144737592 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 144737714 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 144737958 T C N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 144738247 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 144738939 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 144738953 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 144739026 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 144739055 C A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 144739177 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144739242 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144739438 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 144739546 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 144739691 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 144739692 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 144739738 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 144739755 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 144739774 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 144739850 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144739867 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144739914 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144739949 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144739950 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144739988 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144740043 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144740104 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144740129 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144740168 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144740217 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144740399 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 144740440 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 144740591 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 144740779 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 144740998 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144741013 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144741206 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 144741225 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 144741266 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144741272 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144741342 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144741452 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144742485 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144742793 A G Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 144742895 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144742919 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144743016 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144743018 T G Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144743053 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144743141 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144743195 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144743262 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144743275 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144743569 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 144743668 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144743674 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144744166 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144744271 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144744340 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144744384 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144744453 A T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 144744724 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144744789 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144744854 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 144745594 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144745657 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144745690 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144745720 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144745747 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144745769 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144745837 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144745847 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144745895 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 144745975 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144745990 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144746002 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144746108 G T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 144746702 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144747278 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 144747335 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144747394 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 144747472 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 144747601 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144747699 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 144747925 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144748303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144748333 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144748485 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 144748845 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 144748859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144748894 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 144748914 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 144749140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144749254 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144749361 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144749416 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144749683 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144749706 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144749750 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144749755 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144749765 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144749808 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144749968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144750090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144750178 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144750352 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144750594 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144750767 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 144750789 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 144750888 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144751032 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144751052 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 144751136 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144751149 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 144751154 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144751188 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 144751246 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 144751252 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144751570 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144751612 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 144751633 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144751654 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 144751673 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144751681 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 144751693 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144751820 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 144751863 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144751930 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144751937 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 144752040 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144752101 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 144752143 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 144752157 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 144752174 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 144752203 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144752351 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144752696 A G Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 144752735 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 144752809 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144752939 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 144752945 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 144752986 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144753013 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144753027 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144753062 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 144753118 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144753393 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 144753455 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144753493 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144753505 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144753509 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144753551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144753587 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144753809 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144754202 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144754240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144754256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144754280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144754596 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144754628 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 144754712 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144754797 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 144754844 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 144754911 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 144754955 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144755016 A T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 144755039 C A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 144755042 T C Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 144755104 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 144755145 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144755181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144755304 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 144755547 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 144755678 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 144755727 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 144755757 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 144755759 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 144755784 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 144756025 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 144756048 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 144756155 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 144756179 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 144756187 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 144756246 T C N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 3 144756307 G T N N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.714285714285714 0.142857142857143 0.142857142857143 11 3 5 1 1 3 144756317 A T N N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 3 144756649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144756735 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 144756833 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 144757054 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144757197 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144757249 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 144757278 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 144757302 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 144757437 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 144757604 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 144758317 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 144758463 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 144758526 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 144758541 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144758576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144758946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144759282 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 144759828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144760045 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144760459 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144760976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144762433 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 144762708 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 144763000 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144763310 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144763334 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 144763417 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 144763515 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 144763516 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 144763621 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144763641 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144763686 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 144763694 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144763853 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144763883 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144763901 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 144764215 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144764259 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 144764531 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 144764653 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 144764969 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 144765192 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144765197 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144765204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144765468 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144765628 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 144765670 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 144765710 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 144769669 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144769988 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144777486 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144777833 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144778770 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144781795 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 144782080 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144783140 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 144783146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144783368 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 144784246 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 144787307 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144788537 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 144789292 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144789592 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144791756 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144792127 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144794487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144798041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144798765 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144798853 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 144799559 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 144799946 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 144800595 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144800945 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 144805189 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144808617 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 144808881 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 144810342 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144812351 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 144813869 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 144814066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144819943 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144820120 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 144820218 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144820261 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 144820453 G A N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 144820539 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 144820677 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 144820704 C G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 144820905 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 144820923 G A Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 3 144821129 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144821207 G C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 3 144821546 C G N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 3 144821571 C G N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 144821690 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.3125 0.1875 0.5 13 19 5 3 8 3 144821915 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144821996 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144822566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144822873 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 144822874 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 144823162 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 144823677 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 144823707 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.176470588235294 0.117647058823529 0.705882352941177 8 26 3 2 12 3 144823724 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 144823759 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 144823854 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 144823978 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 3 144824763 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 144827212 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 144827726 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 144828074 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 144828103 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 144828141 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 144828456 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 144828843 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 144828847 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 144831389 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 144832457 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144832467 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 144832501 C A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 144832542 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 144833254 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144834923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144838026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144838619 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144839248 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144839764 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144839815 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 144840825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144840956 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144841023 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144841378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144841568 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 144841591 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 144841719 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 144841726 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144841779 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 144841782 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 144841829 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144841859 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144841889 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 144841917 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 144842032 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144842334 T A Y N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 3 144842427 C T Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 144842699 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 144843040 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 144843043 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 144843774 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 144844252 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 144844262 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 144844341 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 144844368 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 144844417 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 144844691 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144844849 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144845045 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 144845111 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 144845202 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 144845463 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 144845582 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 144845895 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144846006 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 144846367 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144846596 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144846835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144846960 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 144847074 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 144847107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144847238 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144847271 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 144847276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144847306 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 144847713 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144847886 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144848025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144848444 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144848982 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 144849062 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 144849197 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144849698 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 144849752 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144850003 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144850050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144850523 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 144855495 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144855971 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144856168 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144856315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144857312 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144857335 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144857346 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144857357 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 144857411 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144857412 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144857483 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144857600 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 144857823 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 144858778 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 144858900 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144859036 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 144859066 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 144859127 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144859184 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144859223 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 144859232 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144859308 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144859641 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 144859761 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 144859794 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 144859805 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 144859816 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 144859881 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 144860019 G C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 144860021 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144860213 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144860301 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144860318 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144860365 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 144860385 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 144860488 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 144860528 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 144860565 G C N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 9 15 3 3 6 3 144860575 T A N N 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 10 14 4 2 6 3 144860614 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 144861072 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 144861130 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 144861310 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 144861316 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 144861404 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 144861451 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 144861491 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 144861508 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 144861636 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 144861691 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 144861732 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 144861771 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 144861776 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 144861789 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144861900 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 144861901 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 144862013 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 144862034 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 144862218 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 144862308 A T N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 144862423 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 144862441 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 144862496 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 144862536 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 144862833 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144862837 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 144862939 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144863078 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144863079 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144863097 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144863320 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144863394 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144863397 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144863504 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144863558 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144863574 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144863589 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144863596 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144864070 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144864665 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144864723 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 144864835 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 144864964 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 144864975 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 144865055 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 144865108 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 144865219 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144865998 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144866544 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144866871 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144866917 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144867174 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 144867404 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144867568 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 144867613 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 144867644 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 144867645 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 144867713 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144867724 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 144868056 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 144868060 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 144868213 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 144868217 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144868244 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144868351 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144868469 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144868475 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144868661 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144868684 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144868958 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 144869654 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144869731 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144870278 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144870340 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 144870376 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 144870394 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 144870428 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 144870460 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144870464 C A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 144870496 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 144870501 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 144870523 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 144870570 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 144870601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144870696 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144870894 G A Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 144870908 C T N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.583333333333333 0.0833333333333333 0.333333333333333 15 9 7 1 4 3 144871155 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144871182 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144871222 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144871287 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144871499 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144871507 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144871533 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 144871613 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 144871668 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 144871699 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 144871753 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 144871803 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 144872062 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144872101 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 144872156 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144872158 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144872187 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144872376 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144872924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144874120 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 144874767 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 144874805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144874939 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144874944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144875280 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 144875694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144875811 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 144875875 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 144875958 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 144876223 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 144876313 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144876604 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144876718 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144876814 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 144877178 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144878892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144881137 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144881204 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144881229 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 144885909 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144886021 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144886358 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144887788 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144888796 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 144890398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144890553 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 144890606 G C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 144896685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144896733 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144896758 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 144898192 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144899759 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144901295 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144901637 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144904372 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144904765 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144906626 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144907539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144909606 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144911271 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144912594 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144913484 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 144913536 T G Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 144913555 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 144914505 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 144915505 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 144915507 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 144918989 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144919459 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144919545 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144919599 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144920999 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144921258 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144921284 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144921391 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144921667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144922735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144922833 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144922993 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144923008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144923946 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144924254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144924780 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 144924893 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144924948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144925058 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 144925144 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144925211 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 144925467 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 144925485 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 144925486 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 144925510 T C N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 144925586 C G N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 144925599 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 144925600 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 144925617 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 144925638 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 144925718 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 144925784 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 144925817 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 144925941 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144925954 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144926411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144926575 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144926595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144926600 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144927706 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 144927926 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144928044 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 144928050 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144928206 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 144928659 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 144928686 G T N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 3 144928697 A C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 144928896 T G N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 3 144928992 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144929001 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144929698 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 144929784 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 144929805 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 144929913 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144929998 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 144930006 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 144930100 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 144930177 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 144930372 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 144930412 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 144930432 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 144930440 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 144930449 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 144930538 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 144930660 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144930696 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 144930729 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 144930793 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 144930810 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 144930885 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 144931198 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144931724 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144931780 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144931791 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 144931897 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 144931926 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144931934 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 144932007 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144932024 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 144932092 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 144932116 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 144932151 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 144932233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144932271 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 144932292 T G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 144932552 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 144932578 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 144932620 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144932664 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 144932698 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 144932744 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 144932884 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 144932904 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 144932927 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 144933003 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144933024 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 144933170 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144933349 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144933552 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144933565 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144933742 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144933748 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144933784 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144933816 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144933844 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144933857 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144933892 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144933952 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 144933961 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144933965 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144934072 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 144934113 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144934135 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 144934306 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 144934332 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 144934376 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 144934482 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144934549 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 144935100 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144935121 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144935137 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144935175 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144935199 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144935248 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144935287 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144935288 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144935426 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144935430 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 144935530 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 144935532 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 144935565 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144935605 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144935741 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144935748 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144935843 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144935950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144936032 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144936052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144936235 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 144936237 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144936246 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 144936267 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144936427 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 144936433 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 144936444 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 144936465 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 144936613 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144936648 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 144936710 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144936715 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 144936775 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 144936988 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 144937030 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 144937122 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 144937161 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 144937260 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 144937618 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144941542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144941638 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 144943049 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 144943102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144943304 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144944402 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144945305 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144945932 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144946082 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144946277 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 144946698 G T Y N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 3 144948395 A G N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 144948770 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144949574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144949603 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 144949757 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 144949876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144951126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144952487 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 144953029 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144953190 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144953266 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144953341 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144953382 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144953581 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144953615 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144953630 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144953640 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 144953748 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144953888 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 144954046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144954219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144954258 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144954404 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144954478 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 144954500 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 144954595 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 144954608 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 144954689 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 144954751 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144954792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144954795 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 144954915 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144955005 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144955112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144955174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144955231 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144955303 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144955377 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144955770 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 144955790 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144955844 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144955855 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 144956149 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144957245 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144957566 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144957872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144957887 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144957919 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144957955 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144957966 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144957993 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144958000 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144958055 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144958076 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144958084 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144958271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144958351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144958406 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 144958496 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 144958568 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 144958641 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 144958667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144958700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144958783 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144959011 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144959151 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144959193 T A N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 3 144959462 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 3 144959562 C T N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 3 144959680 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 144959756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144959763 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144959823 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144959914 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 144960294 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144960522 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144961635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144961737 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144962220 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144962276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144962416 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144962645 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144964202 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 144964250 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 144964357 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144964468 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144966385 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144966458 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144966650 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144967445 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 144967546 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144968764 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144970534 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144970766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144973067 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144973196 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144973425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144973926 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 144974845 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144975254 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 144975266 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 144975429 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 144975441 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 144975442 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 144975502 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 144975517 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 144975598 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 144975806 T A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 144975855 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 144975863 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 144975880 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 144975882 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 144975967 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 144975972 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 144976038 G A N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 144976217 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144976457 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 144977742 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144977964 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144978195 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144978199 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144978922 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144979939 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 144980086 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 144980198 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 144980600 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 144980828 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 144980871 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144980897 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 144980900 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 144980963 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144980991 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144981000 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144981006 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144981145 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144981148 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 144981435 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 144981450 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144981460 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144981504 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144981532 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 144982038 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 144982149 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144982150 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144982193 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144982382 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 144982557 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 144982589 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 144982626 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 144982656 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 144982811 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 144983020 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 144983222 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 144983233 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 144983466 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 144983734 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 144983805 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 144983837 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144983845 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 144983867 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 144984005 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144984027 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 144984147 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 144984218 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 144984333 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 144984427 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 144984776 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 144985066 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 144985208 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 144985263 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 144985281 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 144985329 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 144985338 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 144985365 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 144985393 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 144985443 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 144985481 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 144985500 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 144985630 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 144985636 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 144985867 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 144986079 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144986327 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 144986395 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144988568 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144988793 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144988849 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 144989030 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144989429 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 144990230 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144990830 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 144991284 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144991316 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144991433 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144992054 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 144992202 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144992355 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144992642 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144993821 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 144994869 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144994929 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 144995003 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144995142 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144995568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144997040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144997100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144997710 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 144997816 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 144997831 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 144997955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144998581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 144998695 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145001084 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145002512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145002839 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145003098 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145003325 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 145003326 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 145003347 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 145003440 T G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 145003503 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 145003530 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 145003533 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 145003552 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 145003589 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 145003590 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 145003824 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 145003855 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 145003931 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 145003940 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145004059 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145004091 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145004463 T G Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 145004506 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145004674 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145004757 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 145004823 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145004876 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145005232 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 145005379 T G N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 3 145005431 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 145005730 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 145005836 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 145007184 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145007244 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 145007253 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 145008347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145009264 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 145010170 G A Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 145010304 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 145010365 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 145010527 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 145010637 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 145010719 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 145010732 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 145010964 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 145011014 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145011240 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 145011450 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 145011504 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145011625 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 145011822 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 145011950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145012318 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 145012323 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 145013309 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145013313 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145013391 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145013428 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 145013496 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145013616 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145013629 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 145013751 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145013791 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 145014067 T G N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 145014100 G T N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 3 145014164 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 145014261 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 145014332 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 145014551 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 145014562 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 145014637 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145014697 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145016254 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 145016310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145016768 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 145016898 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145016967 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 145017212 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 145017222 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 145017376 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 145017380 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 145018221 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 145018501 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 145018504 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 145018649 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 145018651 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 145018687 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 145018797 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145018854 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 145018870 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 145018930 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 145018936 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 145019073 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 145019081 C G Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 3 145019116 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 145020002 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 145020174 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 145021781 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 145022260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145024077 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145024208 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 145024290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145024460 A T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 145024470 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 145024493 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 145025306 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 145025327 G C Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 145025396 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 145025682 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 145026059 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 145026109 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 145026444 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 145026837 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 145027566 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 145027598 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 145027686 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 145027922 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 145027998 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 145028108 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145028768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145028813 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 145028818 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 145028983 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 145029019 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 145029036 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145029158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145029399 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 145029417 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 145029422 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 145029587 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 145029627 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 145029871 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 145030016 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 145030038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145030150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145030174 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 145030417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145030523 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145030766 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 145030844 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 145033272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145034571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145035620 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 145039600 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 145044158 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 145044380 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145044657 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 145044670 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 145044687 C T Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 145044902 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 145045026 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 145045115 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 145045162 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 145045165 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 145045211 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 145045288 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 145045308 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145045324 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 145045336 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 145045362 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 145045376 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 145045458 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 145045469 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 145045483 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 145045484 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 145045611 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145045659 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 145045664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145045706 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 145045735 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 145045819 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145046066 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 145046087 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 145046088 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145046219 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145046388 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 145046396 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145046401 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 145046410 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 145046464 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145046469 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 145046496 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 145046520 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145046561 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145046714 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 145047567 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 145047652 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145047707 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 145047810 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 145048105 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 145048254 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 145048371 T A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 145048512 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 145048519 A T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 145048748 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 145048847 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 145049120 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 145049775 C T N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 145049899 T C N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 3 145050141 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 145050287 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 145050408 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 145050450 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 145050577 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145050599 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 145050635 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 145050813 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 145050833 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 145050965 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145051048 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145051085 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 145051100 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145051811 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145051864 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 145051997 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 145052069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145052098 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145052148 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145052173 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 145052308 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145052677 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 145052831 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 145052974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145053647 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145053714 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145053761 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145053873 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 145054503 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 145054949 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 145055725 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145056285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145056389 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145056636 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145056986 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 145057008 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 145057112 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 145057201 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145057232 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145057304 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 145057322 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 145057327 T G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 145057349 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 145057369 A C N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 145057378 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 145057430 A T Y N 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 3 145057499 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 3 145057752 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 145057798 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 145058193 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 145058227 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 145058252 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 145058274 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 145058322 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145058427 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 145058469 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 145058472 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 145058660 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145059071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145059073 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 145059128 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145059228 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 145059504 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 145059562 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 145059563 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 145059609 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 145059692 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 145059756 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 145059813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145060200 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 145060325 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 145060494 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 145060708 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 145060806 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145060832 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145061030 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145061244 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145063063 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 145063100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145063558 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 145063579 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145063671 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145064402 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 145064613 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 145064698 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 145064857 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 145065176 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 145065245 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 145065249 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145065328 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 145065418 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 145065756 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145065822 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 145065870 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145065925 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 145066031 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 145066203 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 145066345 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 145066424 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 145066510 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 145066546 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145066726 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 145066742 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 145066799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145066818 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145066846 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 145066952 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145067090 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145067239 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 145067273 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 145067356 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 145067783 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 145067810 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 145067820 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 145067860 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 145067920 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 145067966 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 145068022 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 145068101 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 145068132 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 145068245 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145068283 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 145068333 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145068357 T C Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 145068358 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 145068370 T G Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 145068489 T C Y Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 145068492 C T Y Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 145068628 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 145068630 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 145068788 T C Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 145068826 A T Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 145068866 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 145068900 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 145068901 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 145068920 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 145068942 A G N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 3 145068978 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 11 7 3 5 1 3 145069046 G A N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 145069065 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 145069149 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 145069157 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 145069166 C A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 145069252 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 145069298 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 145069335 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145069396 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 145069457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145069689 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145069697 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145069791 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 145069928 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145070190 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 145070194 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145070319 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 145070540 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145070779 T A N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 145070859 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145070860 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 145070878 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 145070986 G T Y N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 145071070 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145071099 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 145071158 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 145071161 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 145071199 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 145071330 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145071342 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 145071376 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 145071847 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 145072152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145072186 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145072594 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 145072701 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 145072731 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 145073618 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145073731 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 145073765 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145073920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145073987 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 145074257 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145074290 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 145074979 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145074992 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145075003 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145075026 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145075072 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 145075193 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 145075213 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 145075260 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 145075400 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 145075510 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 145075692 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145075823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145076051 A G N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 145076164 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 145076284 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 145076321 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 145076645 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145076742 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145076830 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 145076914 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 145076957 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 145076958 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145076980 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 145076995 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 145077027 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 145077102 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 145077108 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 145077142 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 145077207 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 145077307 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 145077329 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 145077385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145077411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145077423 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145077505 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 145077516 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145077909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145077927 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145078044 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 145078088 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 145078116 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145078221 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 145078248 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145078282 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 145078353 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145078378 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145078397 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 145078411 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145078463 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 145078464 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 145078504 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145078580 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 145078625 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145078668 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 145078769 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145078829 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145078888 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145079216 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 145079386 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 145079396 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 145079723 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 145079796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145079994 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 145080112 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 145080448 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 145080830 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145080926 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145081100 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145081137 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145081463 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145081478 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145081530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145081549 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145081566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145081830 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145081856 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 145081857 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 145081871 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 145082099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145082199 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145082426 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 145082495 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 145082607 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145082715 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 145082978 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145083052 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 145083111 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 145083149 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 145083194 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 145083243 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 145083413 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 145083414 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145083495 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145083727 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 145083732 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 145083749 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145083939 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145083977 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145084820 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 145085620 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145085930 G C N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 145086267 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 145086525 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 145086674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145086900 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 145086914 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 145087038 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 145087258 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 145087512 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 145087673 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 145088109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145088937 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 145089348 G T Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 145089349 A T Y N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 145089371 G A Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 145089939 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145089955 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 145090469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145092251 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145092321 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145092633 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 145092747 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 145092939 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 145093056 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 145093287 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145093307 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145093327 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145093336 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145093521 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145093542 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 145093622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145093649 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145094165 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 145094170 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 145094189 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 145094213 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145094435 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145094443 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145094462 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145094540 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 145094553 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 145094589 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145094654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145094718 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145094756 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 145094895 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 145094939 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 145094942 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 145095085 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 145095086 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 145095133 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 145095134 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 145095349 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 145095360 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 145095425 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 145095517 T G N N 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 3 145095938 A C N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 3 145095963 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 145096048 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145096070 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145096163 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 145096219 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 145096374 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 145096375 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 3 145096408 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 145096421 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 145096424 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 145096440 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 145096478 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 145096507 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 145096525 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 145096577 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 145096618 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 145096984 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145097012 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145097168 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145097244 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145097437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145097974 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145098643 A C N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 3 145098987 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 145099689 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 145100036 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 145100150 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 145100299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145100769 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145100805 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145100823 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 145100824 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 145100951 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145101010 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 145101018 C A Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 145101070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145101071 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145101212 G C Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 145101260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145101266 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145101346 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145101383 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 145101393 T C Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 145101399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145101498 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 145101510 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145102118 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 145102805 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145103648 A G N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 145104685 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 145104864 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145104886 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 145104941 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 145104944 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 145105748 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145105787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145106033 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145106521 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145106677 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 145106836 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 145106952 T A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 145107200 G A Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 145107281 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145107307 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145107495 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 145107496 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 145107516 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 145107679 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 145107742 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 145107810 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0 0.733333333333333 0.266666666666667 11 19 0 11 4 3 145108057 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 145108118 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145108153 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 145108156 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 145108164 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 145108168 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 145108185 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 145108221 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 145108247 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 145108364 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 145108436 C A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 145108481 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 145108492 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 145108514 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 145108534 G T N N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 3 145108679 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 3 145108681 G A N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 3 145108737 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 145108959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145109110 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 145109415 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 145109551 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145109822 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 145109953 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 145110117 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 145110127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145112344 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145113924 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145115081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145116051 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 145116267 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 145116372 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 3 145116399 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 145116432 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 145116809 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 145117677 T C Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0 0.588235294117647 0.411764705882353 10 24 0 10 7 3 145117848 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 145118951 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 145119566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145121769 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145122407 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145123011 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 145123576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145127749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145127777 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145128089 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 145128228 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145128946 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145129542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145131283 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 145131830 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 145131923 G T Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 145132033 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 145132273 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 145132357 T G Y N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 3 145132362 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 3 145132911 A C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 145132935 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 3 145133273 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145133965 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 145133969 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145133984 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 145134032 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 145134121 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 145134275 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 145134552 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145134617 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145135313 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 145136452 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 145136500 T C Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 3 145136548 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145136633 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 145136698 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 145136734 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145136779 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 145137004 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145137077 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 145137155 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145137530 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 145137554 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 145137690 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 145137745 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 145137756 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 145137777 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 145137796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145137817 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 145137858 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 145137916 C A Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 145137922 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 145137934 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 145137973 C A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 145137985 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.166666666666667 0 0.833333333333333 4 20 2 0 10 3 145137995 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 145138195 C T Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 145138305 T C Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 145138391 G T Y N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 16 2 8 0 1 3 145138531 C T N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.25 0.75 0 15 9 3 9 0 3 145138679 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 145138733 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 145138842 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 145138888 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 145138920 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 145138990 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 145139096 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 145139121 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 145139305 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145139336 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 145139339 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 145139352 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 145139355 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 145139435 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 145139471 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145139580 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145139612 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145139629 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 145139646 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 145139744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145140030 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145140049 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 145140059 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145140070 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 145140086 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 145140203 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145140372 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145140449 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 145140494 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 145140577 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 145140682 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145140732 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 145140882 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 145141140 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145141195 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 145141276 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 145141316 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 145141543 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 145141568 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 145141835 T G N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 145141875 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 145141916 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 145141981 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 145142008 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 145142009 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 145142136 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 145142162 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 145142177 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 145142199 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 145142304 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 145142355 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 145142435 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 145142440 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 145142475 G C N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 145142491 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 145142499 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 145142587 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 145142591 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 145142626 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 145142884 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 145142890 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 145142943 G T N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 145143162 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 145143206 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 145143241 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 145143246 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145143807 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 145143817 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 145143858 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 145144030 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 145144170 G T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 145144204 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 145144563 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 145144989 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 145145209 T A Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 145145587 T G Y N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 145145920 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 145146146 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 145146605 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145147525 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 145147843 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 145147875 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 145148214 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 145148289 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 145148887 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 145149681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145152272 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145152273 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145152312 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145152742 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 145153562 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 145153949 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145155398 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 145155968 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145156053 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145156426 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 145156928 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 145157907 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145158058 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145158720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145159387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145159879 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145160433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145161012 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145163971 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145164400 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145164615 A T N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 145164779 T C N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 15 9 6 3 3 3 145164798 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.5 0.1875 0.3125 19 13 8 3 5 3 145165180 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.235294117647059 25 9 12 1 4 3 145165597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145166159 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145167369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145167583 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145168541 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 145169140 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145169176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145169178 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 145169811 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145170644 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 145170938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145171104 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145171136 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 145171147 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 145171186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145171288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145171303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145171330 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 145171346 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145171364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145171370 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145171434 T C N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.307692307692308 0.615384615384615 0.0769230769230769 16 10 4 8 1 3 145171537 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 145171541 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 145171665 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 145171814 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145171885 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145171897 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 145173046 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145173159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145173191 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145173777 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145174186 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 145175178 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145178409 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 145181852 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 145181853 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 145184979 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145185744 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145186940 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145187148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145187906 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 145189118 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145189345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145189679 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145190471 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 145192022 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145192667 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145194675 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145194904 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 145194991 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 145195230 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 145195291 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 145195579 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 145195886 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 145196102 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145196200 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145196400 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 145196472 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 145196541 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 145196727 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145196955 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 145197039 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 145197278 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 145197365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145197375 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 145197481 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 145197540 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 145197684 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 145197856 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145198087 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 145198198 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 145198249 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 145198269 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 145198270 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 145198483 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 145198514 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145198540 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 145198566 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 145198913 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145198951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145199103 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 145199339 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145201962 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 145201983 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 145201987 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 145202043 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 145202059 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 145202159 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 145202174 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 145202212 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 145203449 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 145204326 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 145204488 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145204750 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145204772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145204810 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145205069 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145205125 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 145205167 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 145205180 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145205195 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145205255 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145205406 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145205509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145205667 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 145205743 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145205938 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 145206024 T C N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 3 145206026 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 3 145206107 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 3 145206566 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 145206682 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145207545 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145207616 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145207653 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 145207802 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145208066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145208162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145208273 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145208589 C T N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 145208620 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 3 145208641 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.705882352941177 0.117647058823529 0.176470588235294 26 8 12 2 3 3 145208667 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 145208778 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145208779 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145208793 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 145209082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145209236 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 145209590 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 145209688 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 145209704 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 145209771 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 145209822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145209823 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 145210012 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145210074 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 145210110 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145210280 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 145210585 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 145211002 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145211143 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 145211182 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145211207 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 145212002 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145212024 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 145212357 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145212376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145212395 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 145212434 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 145212660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145212675 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 145212684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145212997 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 145213016 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 145213048 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 145213113 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 145213147 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 145213255 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 145213415 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145213619 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 145214028 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 145214079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145214573 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 145215089 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 145215151 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 145215231 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 145215356 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 145215518 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 145217376 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145217536 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 145217549 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 145218236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145218377 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145218500 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 145218588 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145220215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145220235 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 3 145220262 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 3 145220313 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.222222222222222 0.0555555555555556 0.722222222222222 9 27 4 1 13 3 145220486 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 145220643 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 3 145220656 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 145220905 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 145220918 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.263157894736842 0.105263157894737 0.631578947368421 12 26 5 2 12 3 145221064 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 145221129 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145221452 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 10 26 4 2 12 3 145221472 C T N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.384615384615385 0.0769230769230769 0.538461538461538 11 15 5 1 7 3 145221640 A G N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.307692307692308 0.0769230769230769 0.615384615384615 9 17 4 1 8 3 145221657 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 145221811 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 145222270 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 3 145223239 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145223599 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145224615 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145224683 C A Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 3 145224778 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 145224795 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145225492 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145225585 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145225743 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 145227225 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145227404 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145227426 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145227451 T A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 145228637 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145228874 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145230293 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 145231547 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145231690 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145231772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145232394 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145232433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145232664 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 145232992 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145233031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145233124 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145233965 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 145233971 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145233987 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 145234023 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145234066 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 145234090 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 145234498 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 145234512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145234794 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 145234888 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 145234904 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 145234940 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 145235075 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 145235122 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 3 145235161 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 145235209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145235283 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 145235366 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 145235495 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 145235549 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 3 145235734 A G N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5625 0.125 0.3125 20 12 9 2 5 3 145235815 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145235861 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 145235946 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145235993 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.210526315789474 29 9 14 1 4 3 145236131 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 145236132 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 145236145 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 145236149 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 145236181 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 145236194 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 145236244 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145236449 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 145236475 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 145236614 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 3 145236647 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 3 145236653 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 3 145236776 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 145236792 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 145237015 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 3 145237072 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 3 145237104 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145237217 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.176470588235294 0.0588235294117647 0.764705882352941 7 27 3 1 13 3 145237294 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 145237435 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145237515 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145237597 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145237764 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145237790 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 145238682 C T N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.266666666666667 0.0666666666666667 0.666666666666667 9 21 4 1 10 3 145238868 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 145238927 T G Y N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 10 22 4 2 10 3 145238992 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 145240804 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 145242106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145242780 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145243219 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145244384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145244411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145244479 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 3 145246011 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145246096 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145246273 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145247616 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145247651 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145248148 G C Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 145248167 C T Y Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 5 9 1 3 3 3 145249902 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145250217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145250348 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 145250484 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145250736 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145250830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145251174 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 145252032 G A Y Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 145252985 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145254151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145259025 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145261617 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 145262252 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145264063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145264084 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 145265004 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145265039 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145265506 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145265763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145265913 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145266794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145267026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145267842 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145269064 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145270146 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145270869 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145271293 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 145271336 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 3 145271348 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145272753 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145272851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145272853 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145272996 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145273250 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 3 145274244 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145275486 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145275566 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145276824 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 145277080 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145278182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145278309 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145278487 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145280356 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145280545 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145281084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145283036 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 145285302 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 26 10 12 2 4 3 145285579 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145287354 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 145289522 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 145289542 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 145290044 G C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 145290893 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145292537 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 145293462 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145294396 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 145295033 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145295805 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 145295914 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 145296188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145296302 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 145296328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145296377 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145296495 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 145297923 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145297963 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 145298284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145298359 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145298452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145298479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145298491 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145298908 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 145299113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145301079 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 145301081 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 145301127 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 145301193 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145301245 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 145301755 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145304260 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145306724 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145307430 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145310359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145311406 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145316442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145318345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145318925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145319060 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 145319379 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 145319534 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 145319553 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145320404 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 145320459 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 145320548 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145321363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145321404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145321534 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 145321759 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145321760 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145322185 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145322314 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 145322670 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 145322881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145322981 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 145325675 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145326774 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 145326775 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 145329187 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 145329894 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 145329955 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 145329956 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 145330238 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 145330771 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 145331006 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 145331113 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 145332377 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 145332649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145333396 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145333863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145333935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145334035 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145334275 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 145334330 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 145336212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145336749 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145336783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145336812 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145336835 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 145336907 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 145336921 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 145336948 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145336965 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145337035 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 145337036 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 145337113 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 145337215 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145337577 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145338048 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145339538 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145339568 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145339821 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 145340147 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145340162 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 145340192 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 145340227 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 145341206 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145341375 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 145341529 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 145342714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145343195 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145343880 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145344916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145345404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145345421 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 145346093 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145346476 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145346477 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145346792 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 145348158 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 145348418 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 145348549 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 145348950 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 145349897 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 145349920 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145350044 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 145350115 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 145350181 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 145350332 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 145350394 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 145350671 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145350755 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 145350756 A C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 145350911 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 145350988 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 145351125 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 145351350 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 145351373 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 145351390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145351412 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 145351597 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 145351639 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 145352309 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 145352333 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 145352689 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 145353084 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 145353117 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 145353195 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 145353405 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 145354428 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 145354442 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 145354589 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145354927 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145355582 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145356558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145357494 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145357623 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 145358527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145358923 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 3 145359312 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145359329 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 145359353 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.210526315789474 29 9 14 1 4 3 145359479 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 145359800 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.210526315789474 0.0526315789473684 0.736842105263158 9 29 4 1 14 3 145359880 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 3 145360539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145360804 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 145360949 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.5 0.111111111111111 0.388888888888889 20 16 9 2 7 3 145361139 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 145361150 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 145361165 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 145361185 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 145361190 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 145361377 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145361419 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 145361494 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 145361504 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145361700 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 145361770 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 145361840 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 145362031 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 145362035 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 145362805 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 145363109 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145363171 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 145363174 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 145364663 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145365370 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.210526315789474 29 9 14 1 4 3 145366194 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 145367527 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 145368097 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145369547 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145369601 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 145369765 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145369977 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 145370139 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 3 145370241 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 145370584 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 145372362 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 145372522 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 145373160 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 145373213 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 145373220 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 145373234 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 145373247 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 145373325 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 145373341 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 145373389 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 145373445 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 145373472 G A N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 145373480 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 145373630 G A N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 3 145373935 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 145373958 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 145373975 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 145373976 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 145375218 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 145375469 T C Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 3 145375470 T G Y N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 145375595 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 145375600 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 145375654 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 145375673 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 145375743 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 145375753 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 145375765 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 145375788 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 145376280 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 145376298 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 145376341 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 145376518 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 145376616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145376624 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 145376699 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 145376878 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 145377068 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 145377150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145377156 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145377172 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 145377234 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145377311 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 145377312 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 145377532 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 145377608 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 145377609 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 145377849 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 145377870 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145378291 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 145378428 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 145378452 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 145378456 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145378481 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 145378637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145378649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145379043 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 145379062 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 145379546 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 145379578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145379611 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 145379630 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 145380393 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 145380805 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 145381013 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 145381014 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 145381231 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 145381491 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 145381617 A T N N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.363636363636364 0.545454545454545 0.0909090909090909 14 8 4 6 1 3 145381804 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 145381821 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 145381836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145381985 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 145382134 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 145382135 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 145382155 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 145382156 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 145382184 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 145382369 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 145382407 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 145382460 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 145382477 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 145382538 T G N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 145382757 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 145383750 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145384540 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 145384631 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 145384655 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 145385526 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 145388155 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 145388196 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 145388291 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 145388834 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 145389427 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 145389670 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 145389892 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145389908 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145389998 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 145390079 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145390103 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 145390366 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 145390507 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 145390544 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 145390651 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 145390678 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 145390716 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 145390788 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 145390861 T C Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 145390953 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 145390970 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 145390987 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 145391616 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 145391655 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 145391811 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145392123 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 145392297 A C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 145392301 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 145393715 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 145394029 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145394579 G A N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 145395569 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145395581 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145395637 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 145395769 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 145395792 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 145395794 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 145395834 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 145395949 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 145396104 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145396116 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 145396139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145396328 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 145396329 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 145396393 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 145396460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145396777 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 145396901 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 145396954 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 145397588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145398715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145398991 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145400063 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 145401559 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 145405071 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 145405373 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145406357 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145408973 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 145411136 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 145411355 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 145411532 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 145411649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145411684 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 145412290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145412462 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 145412659 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 145412701 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145412764 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 145412783 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145412883 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145412891 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145412958 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 145413246 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 145413491 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 145413612 G T Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 145413639 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145413669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145413670 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 145413704 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 145413715 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 145413779 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 145414122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145414137 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 145414138 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145414192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145414384 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 145414394 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 145414420 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145414530 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 145414734 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 145414738 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 145414760 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 145414882 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 145414979 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 145415161 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 145415269 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 145415531 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 145415536 C A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 145415666 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 145415878 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145415883 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145415905 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145415973 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145416044 C A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 145416335 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 145416406 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145416946 A G N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.571428571428571 0.214285714285714 0.214285714285714 19 9 8 3 3 3 145417089 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 145417138 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 145417633 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 145417717 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 145418596 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 145418714 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 145418770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145420253 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145421165 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145422255 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 145422312 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 145422584 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 145422683 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 145422940 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 145423014 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 145423173 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 145423234 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 145423534 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 145426096 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 145426123 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145426290 C A Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 145426510 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145426548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145426695 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145426696 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145426867 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145427057 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145427778 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145428284 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 145428825 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 145428882 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 145428935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145429008 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 145429142 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 145429186 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 145429230 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 145429263 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 145429310 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 145429327 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 145429985 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 145430126 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 145430298 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 145430442 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 145430472 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 3 145430508 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 145430681 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 145430699 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 145430711 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 145430800 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 145431029 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145431105 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145431214 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 145431555 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 145431576 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 145431618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145432195 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 145432506 A G Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 145432521 C G Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 145432524 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 145432607 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145432683 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 145433170 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145433179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145433419 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 145433470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145433515 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 145433537 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 145433542 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 145433555 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 145434128 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 145434197 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145434269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145434312 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145434342 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145434357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145434443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145434475 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145434483 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145434513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145434670 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 145434718 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 145434795 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145434835 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 145434869 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 145434874 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 145434943 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145434959 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 145434975 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 145435009 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 145435014 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 145435025 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 145435171 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 145435243 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 145435262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145435318 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 145435337 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 145435340 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 145435354 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 145435388 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 145435910 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 145435987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145436083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145436089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145436101 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 145436131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145436193 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145436270 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 145436281 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145436315 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 145436405 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 145436551 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145436579 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145436591 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 145436767 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 145436806 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 145436836 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 145437035 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145437206 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 145437286 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 145437300 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 145437370 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145437632 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145437902 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 145438018 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 145438041 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145438244 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145438301 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145438452 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145438492 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145438511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145438945 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 145439018 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 145439120 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 145439351 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145439458 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 145439653 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145439664 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 145439684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145439722 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145441712 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 145442059 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 145442207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145442226 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 145442746 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 145442757 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 145442968 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 145443381 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 3 145443477 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 145443492 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 145443545 G C N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 145443763 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 145443764 G A N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 3 145443880 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 145443939 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 145443960 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 145444070 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145444130 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 145444397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145444485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145444503 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 145444616 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 145444683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145444692 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 145444701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145444775 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 145444802 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145444816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145444963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145444972 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145445116 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 145446194 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 145446245 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 145446367 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 145446449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145447024 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145447048 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145447082 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145447176 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145447265 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 145447301 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 145448183 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 145448401 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 145448541 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 145448571 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 145448896 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145448902 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 145449718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145450816 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 145450840 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 145451050 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 145451123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145451230 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 145451266 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 145451353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145451420 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 145451799 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145451833 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 145452201 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 145452361 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 145452389 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145452476 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 145452532 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145452568 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 145452594 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 145452635 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 145452734 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 145452773 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 145452791 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145452834 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 145452973 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 145453125 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 145454020 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 145454265 C G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 145454379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145454501 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 145454770 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.4 0.15 0.45 19 21 8 3 9 3 145454830 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 145454856 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 145454865 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 145454941 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 145455323 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 145455358 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 145455401 T A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 145455566 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 145455688 T A Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 145455722 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 145455738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145455765 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 145455872 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 145455948 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 145456077 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 145456275 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 145456496 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 145456583 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145456599 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 145456668 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145456842 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 145457100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145457287 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 145457489 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 145457901 C T N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 145457981 A G N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 10 18 4 2 8 3 145458068 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 145458100 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 145458265 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 145458267 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 145458422 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 145458551 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145458576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145458676 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145458755 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 145458897 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 145458992 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145459645 T A N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 145459661 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 145459789 A T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 145459794 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 145459977 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 145460156 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 145460380 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 145460454 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 145460490 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 145460533 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145460648 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 145460711 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 145460807 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145460888 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 145460898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145461244 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145461346 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145461812 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145461861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145461909 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145462089 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.5 0.111111111111111 0.388888888888889 20 16 9 2 7 3 145462213 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 145462224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145462371 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 145462435 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145462448 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 145462757 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145462865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145462875 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145462919 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145463051 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 145463059 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145463123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145463348 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 145463363 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 145463389 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145463401 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145463416 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 145463434 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145463453 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145463479 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145463481 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 145463547 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145463567 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145463613 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145463622 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 145463839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145463884 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145463889 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 145464136 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145464245 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145464255 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145464307 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 145464340 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145464442 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145464463 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 145464506 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 145464509 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 145464517 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.6 0.15 0.25 27 13 12 3 5 3 145464552 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 145464596 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 145464948 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145464968 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 145465006 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 145465196 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 145465380 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 145465435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145465627 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 145465629 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 145465655 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145465667 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 145465673 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 145465737 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 145465954 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 145467015 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 145467271 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 145467415 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 145467500 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 145468214 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 145468371 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145468430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145468460 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145468467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145468535 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 145468639 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 145468645 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 145468702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145468842 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 145468922 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145468943 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145468962 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 145468968 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 145468995 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145469003 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 145469043 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 145469062 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145469119 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 145469134 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145469182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145469259 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145469310 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145469337 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 145469549 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 145469553 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 145469774 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 145469783 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 145469919 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 145470061 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 145470154 C G N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 145470165 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 145470175 C T N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.384615384615385 0.230769230769231 0.384615384615385 13 13 5 3 5 3 145470185 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 145470188 C T N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 145470295 G A Y Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 145471000 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145471692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145471977 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 145474545 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145475136 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145475223 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145475288 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145475544 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 145475768 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145476036 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 145476742 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 145476990 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 145477026 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 145477079 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 145477220 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 145477223 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 145477306 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 145477316 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 145477474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145477571 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 145477586 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 145477623 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 145477816 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 145477823 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 145478211 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 145478217 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.470588235294118 0.117647058823529 0.411764705882353 18 16 8 2 7 3 145478316 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 145478678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145479537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145479575 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 145479716 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 145479762 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 145479941 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 145480055 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 145480233 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 145480297 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145480386 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 145480473 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 145480569 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 145480683 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 145480782 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 145480873 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 145481000 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 145481544 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 145481968 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145482613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145482731 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 145482825 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 145483129 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 145483372 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 145484012 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 145484182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145484391 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 145484654 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 145484755 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 145484955 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 145484967 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 145485038 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 145485147 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 145485152 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 145485169 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 145485171 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 145485523 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 145485549 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 145485931 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 145485981 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 145486012 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 145486016 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 145486055 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 145486192 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145486234 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 145486367 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 145486621 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 145486800 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145486898 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145486914 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 145486964 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 145487076 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 145487142 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 145487447 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 145487497 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 145488018 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145488054 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145488100 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 145490566 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 145490683 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 145491124 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 145491166 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145491348 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 145493114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145493433 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 145493702 A T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 145493823 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145493832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145494111 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 145494125 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 145494251 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 145495071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145495113 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145495463 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145495808 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145495902 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 145496104 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 145496778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145497316 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 145498248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145499344 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 145500471 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145501164 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 145501275 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 145505811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145507194 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145508311 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 145508634 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145508752 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 145509099 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 145509126 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145509203 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 145509380 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 145509988 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 145510277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145512498 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145512499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145513381 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 145513503 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 145514126 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145514327 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 145514332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145514345 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 145514403 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 145514404 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145514618 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145514620 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145514648 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 145514651 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145514905 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145514952 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145514957 G C Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 145515013 C G Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 145515038 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145515054 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145515096 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145515166 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 145515167 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 145515246 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145515312 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 145516535 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145518653 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145519246 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 145519342 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 145520028 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145520124 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145520137 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145520175 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 145520216 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145520265 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145520269 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 145520757 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145520901 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 145521136 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 145521200 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145521253 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145521267 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 145521343 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145521392 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 145521396 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 145521593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145521603 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 145521605 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 145521764 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 145521858 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 145521938 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 145522509 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 145522560 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145522735 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 145522967 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145523245 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 145523306 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 145523336 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145523348 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 145523449 T A Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 145523494 C G Y N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 145523497 T C Y Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 145523517 G A Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 145523595 G A Y Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 3 145523611 C G Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 145523722 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 145523942 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145524064 C A Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 145524071 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 145524142 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145524896 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 145524997 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 145525095 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 145525097 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 145525392 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 145525420 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 145525486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145525653 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 145525752 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 145526003 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 145526192 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145526270 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 145526344 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145527128 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 145527252 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 145527299 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 145527416 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145527466 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145527644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145527793 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 145527795 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 145527938 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 145534947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145535106 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 145535557 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 145535624 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 145535638 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 145535668 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 145536097 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 145536118 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145536262 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145536967 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 145537018 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 145537058 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145537269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145538136 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145538245 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 145538463 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 145538540 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145538720 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145538760 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 145538947 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 145539010 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 3 145539078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145539195 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145539236 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 145539289 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 145539328 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 145539379 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 145539407 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145539876 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 145540066 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 145540430 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 145540664 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 145540681 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145540862 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 145541214 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 145541827 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 145542409 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145542470 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145542610 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 145542699 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 145542716 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 145542736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145543108 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 145543116 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 145543163 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 145543165 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 145543320 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 145543560 G T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 145543584 C A N N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 145543606 A T N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 145544433 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 145544491 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145544514 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 145544909 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145544958 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 145544999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145545105 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145545121 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 145545206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145545253 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145545270 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 145545273 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 145545294 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 145545335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145545336 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145545545 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 145545925 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 145546102 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 145546181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145546602 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 145546635 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 145547131 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 145547256 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 145547279 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 145547308 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 145547733 G C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 145547839 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 145547907 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 145547931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145548041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145548439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145548551 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 145548593 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 145548657 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145549003 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145549138 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145549899 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 145550063 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 145550164 G T Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 145550172 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 145550223 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 145550376 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145550598 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145550903 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 145550973 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145551414 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 145551769 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145552475 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145553034 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145553200 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 145553222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145553383 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 145553528 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 145553573 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 145553602 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 145553755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145554267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145554340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145554679 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 145554926 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 145555024 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 145555196 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 145555275 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145555344 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145555656 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 145555676 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145555755 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145555782 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 145555820 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 145555999 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 145556193 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 145556405 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 145556563 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 145557684 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145557750 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 145557768 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 145557979 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 145558059 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 145558121 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145558190 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145558233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145558239 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145558266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145558365 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145558379 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145558693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145558828 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 145558834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145558850 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 145558896 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 145559004 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 145559129 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 145559164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145559170 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 145559184 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 145559201 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 145559216 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145559285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145559290 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 145559368 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145559438 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 145560275 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 145560423 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 145560600 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 145560737 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 145560740 T G Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 145560774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145560865 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 145560922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145561028 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 145561031 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 145561180 T G N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 3 145561260 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 145561315 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 145561353 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 145561359 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 145561793 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145561945 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 145562119 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145562216 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 145562334 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145562513 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145562626 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145562669 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 145562680 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 145562721 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145562869 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 145562887 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 145562917 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 145563032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145563280 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 145563291 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 145564052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145564185 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 145564349 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 145564401 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 145564454 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 145564672 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 145566331 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145566420 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 145567053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145567602 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 145567727 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 145567762 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 145567824 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145568058 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 145568104 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145568305 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 145568361 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 145568493 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145568666 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145568707 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145568729 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 145568732 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 145568926 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 145568954 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 145568965 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 145569025 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145569141 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145569370 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 145569423 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 145569450 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 145569478 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 145569507 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145569669 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 145569989 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145570031 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145570040 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145570147 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 145570160 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 145570172 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145570228 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145570372 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145570444 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 145570491 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 145570538 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 145570575 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 145570599 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 145570614 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 145570714 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 145570730 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 145570745 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 145571054 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145571294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145571300 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 145571442 C G Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 145571456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145571515 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 145571550 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 145572000 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 145572389 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 145572870 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 145572942 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 145573063 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145573150 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145573159 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145573168 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 145573182 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145573183 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 145573198 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 145573781 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 145573830 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 145573912 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 145574001 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 145574006 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 145574070 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 145574087 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 145574209 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 145574228 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 145574238 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 145574459 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 145574476 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 145574555 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 145574596 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 145574764 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 145574780 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145574833 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 145574882 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 145574980 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 145574992 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 145575132 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145575264 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 145575289 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 145575297 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 145575316 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 145575382 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 145575401 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 145575443 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 145575495 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145575513 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 145575573 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145575610 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 145575706 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145575712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145575735 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 145575961 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145575975 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 145576021 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 145576034 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 145576191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145576212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145576237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145576247 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145576506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145576771 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 145576782 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145576885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145576915 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145577034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145577106 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 145577137 A G Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 145577157 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145577168 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145577289 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 145577383 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145577555 G A Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 145578172 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145578276 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 145578295 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 145578416 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145578758 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 145578759 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 145578796 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 145578921 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 145578937 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 145579055 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 145579107 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 145579119 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 145579131 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 145579331 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 145579502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145579531 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145579578 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145579593 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145579682 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 145579712 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145579735 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 145579737 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145579755 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145579770 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145579845 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 145579944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145580097 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 145580352 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 145580488 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 145580581 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 145580627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145580982 C G Y N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.333333333333333 0.25 0.416666666666667 11 13 4 3 5 3 145581057 C G N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 145581178 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 145581629 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 145581679 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 145581694 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145581772 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 145581780 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145581799 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145581868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145581936 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145585333 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145585530 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 145585630 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145585687 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145586381 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145586382 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145587773 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 145589941 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 145590655 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 145591579 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 145591780 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 145592017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145592278 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 145592330 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145592399 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145592511 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145592714 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 145592777 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 145592883 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 145593268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145593715 T G N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 145594293 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 145594299 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 145594576 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145594592 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 145594883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145594896 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 145595035 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 145595679 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145596377 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 145596712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145596980 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145599059 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145600282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145600399 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 145600528 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145600710 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 145600821 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 145600831 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 145600915 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 145601746 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 145602166 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145602544 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 145602877 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 145603516 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145604253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145605054 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 145606838 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 145608016 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 145608018 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 145608185 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 145608373 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 145608784 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 145609009 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 145609501 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 145609555 G C Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 145609578 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 145609612 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145609659 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 145609721 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 145609898 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 145609906 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 145609943 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 145610590 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 145610647 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 145610735 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 145611327 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145611336 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 145611361 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 145611455 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 145611585 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 145611592 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 145611764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145611921 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 145611968 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 145612055 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 145612223 A G Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 145613110 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 145613150 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 145613216 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145613351 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 145615605 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 145615656 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 145615836 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 145615874 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 145616401 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 145618398 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 145618412 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 145618415 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 145618459 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 145618489 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 145618529 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 145618545 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 145618587 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 145618615 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 145618760 G A N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.153846153846154 21 5 10 1 2 3 145618846 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 145618851 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 145618859 T G Y N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 3 145618875 C T Y Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 3 145618970 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 3 145618992 A G N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 3 145618994 C T N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 3 145619009 C T N Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.727272727272727 0.181818181818182 0.0909090909090909 18 4 8 2 1 3 145619023 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 145619046 A G N Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 145619081 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 145619096 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 145619099 C T Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 145619224 C T Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 145619228 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 145619237 T A Y N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 145619243 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 145619409 G A Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 3 145619421 A C Y N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 0.142857142857143 0.214285714285714 20 8 9 2 3 3 145619519 G A Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 3 145619540 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 3 145619678 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 145619681 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 145619691 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145619703 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 145619737 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 145619835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145619892 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 145619907 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 145620064 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 145620094 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145620208 A T Y N 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 8 10 1 6 2 3 145620244 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 145620245 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 145620393 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 145620447 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 145620769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145620992 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 145621162 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 145621653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145621862 G T N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 145622420 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 145622577 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145622706 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145622892 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 145623351 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145623525 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 145623925 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 145624020 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 3 145624255 A G N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 145624278 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 145624339 G A N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 145624481 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 145624771 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145624802 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 145624911 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 145624976 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 145624986 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 145625190 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 145625242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145625779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145625844 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145625866 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145629850 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145629990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145630000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145630073 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145630116 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 145630615 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 145630633 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145631685 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 145631781 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145631866 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 145632202 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 145632385 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145632613 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145632710 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 145632771 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 145633054 T C N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 8 12 2 4 4 3 145633670 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 145633781 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 145633907 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 145633941 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 145634196 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 145634825 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145634841 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 145634924 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 145634938 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 145634945 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 145634976 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 145635344 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 145635735 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 145635866 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 145635876 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 145636114 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 145636365 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 145636539 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 145636710 C T N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 145636983 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 145637050 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145637141 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 145637245 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145637259 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145637402 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145637411 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145637435 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 145637458 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145637474 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 145637497 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 145637499 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 145637509 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145637510 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 145637526 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145637588 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 145637711 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 145637741 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145637827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145637985 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 145638177 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 145638301 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 145638340 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145638662 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 145638849 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145638862 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 145638910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145638982 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145638984 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 145639048 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 145639155 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 145639204 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 145639244 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 145639325 A T N N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 3 145641040 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 145641072 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 145641100 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 145641249 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 145641434 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 145641493 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 145641683 G T Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 145641686 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 145641711 A T Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 3 145643028 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 145644305 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 145644410 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 145645049 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 145645105 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 145645141 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145645217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145645227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145645327 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145645390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145645947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145645992 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 145646019 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 145646168 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 145646173 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 145646184 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 145646939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145647435 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 145647449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145647627 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145648023 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145648191 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 145648204 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 145650448 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 145650463 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145652419 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145653468 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145653647 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 145654663 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 145655158 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145655200 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 145655226 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 145655298 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 145655397 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 145655416 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 145655476 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 145655477 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145655507 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 145655573 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 145655724 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 145656387 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 145656479 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 145656498 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 145656507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145656592 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145656887 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145657162 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 145657201 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 145657290 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 6 12 2 2 5 3 145657313 T C N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 3 145657721 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145658030 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 145658042 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 145658059 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 145658123 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145658146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145658628 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145658651 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 145658731 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145659827 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 145660145 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 145660516 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 145660536 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145660548 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145660575 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 145660587 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0 0.842105263157895 0.157894736842105 16 22 0 16 3 3 145660691 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 145660704 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145660715 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145660729 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 145660750 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145660821 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 145660978 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 145661110 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 145661418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145662027 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 145662046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145662118 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145662122 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145662260 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145662461 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 145662490 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145662507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145662528 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 145662530 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145662566 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 145662871 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 145663198 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 145663292 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 145663333 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 145663338 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 145663411 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 145663468 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 145663485 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 0.933333333333333 2 28 1 0 14 3 145663504 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 145663514 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 145663569 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 145663658 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 145663872 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 145663990 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 145664222 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 145664984 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 145665047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145665260 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 145665347 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 145665371 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 145665401 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 145665485 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 145665501 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 145665641 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 145665874 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 145665915 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 145666150 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 145666166 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 145666242 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 145666255 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 145666367 C G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 145666382 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 145666494 G C N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 145666529 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 145666628 C A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 145666660 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 145666872 G A Y Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 145666877 T C Y Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 145667239 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 145667550 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145667675 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 145667711 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 145667790 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 3 145667923 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 145667930 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 145668026 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 145668165 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 145668193 T C Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 145668211 A G Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 145668226 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 145668238 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 145668248 G C N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 3 145668335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145668442 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 145668446 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 145668706 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 145668898 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 145668930 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 145668962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145668984 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 145669021 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 145669244 G A N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.416666666666667 0.25 0.333333333333333 13 11 5 3 4 3 145669478 C T N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 3 145669645 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 145669730 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 145669806 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145669838 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145669998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145670136 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 145670349 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 145671114 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145671225 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145672441 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145674620 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 145675392 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 145675427 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145675771 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 145675870 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 145675874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145675929 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 145675942 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 145676008 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145676017 T G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 145676023 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.466666666666667 0.2 0.333333333333333 17 13 7 3 5 3 145676174 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 145676364 C T Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 145676401 A G Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.428571428571429 0.5 0.0714285714285714 19 9 6 7 1 3 145676466 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.0833333333333333 22 2 11 0 1 3 145677088 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 145677105 A C Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 145677168 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 145677825 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 145677831 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 145678683 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 145678822 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 145679363 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 145679409 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 145680395 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 145681162 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145681179 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145681186 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145681199 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145681246 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145682438 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 145683006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145683840 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 145685033 T C Y Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 3 145685162 T A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 145685320 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145685492 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 145686538 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145686827 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145686928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145687242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145688632 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 145689157 A G Y Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 145689768 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 145689873 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 145689877 T A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 145689890 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 145689895 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 145689949 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 145689983 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 145689987 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145690064 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 145690192 C G N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 145690815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145693017 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145694525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145694566 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145695058 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 145698485 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 145698507 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 145698638 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 145698641 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 145699076 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145699118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145699282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145699583 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145700944 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 145701073 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 145701571 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 145701617 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 145702002 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 145702046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145702403 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 145702449 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 145702992 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 145703018 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 145703022 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 145703090 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 145703255 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 145703782 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 145703853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145703999 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145704021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145704276 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 145704407 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 145704415 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145704432 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145704559 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145704587 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145704740 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 145704815 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 145705067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145705470 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 145705479 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145705952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145707127 G A Y Y 0.1 ALT 0.75 0.75 0.9 0.1 0.8 0.2 0 9 1 4 1 0 3 145707906 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 145708668 G A Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 145712742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145715368 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145715879 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145716023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145717056 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145718856 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145719821 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 145720605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145720617 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 145720631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145720653 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 145720784 T C Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 145720827 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 145720906 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 145720968 G A Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 145720978 G T Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 145721052 T A Y N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 145721727 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 145722363 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 145725048 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 145725728 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145726347 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145727323 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 145728173 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145729752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145729793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145730365 G T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 145730410 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 145730500 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 145730524 T G Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 145730557 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 145730561 G C Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 145730974 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145731248 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 145731252 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 145731339 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 145731448 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145731462 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145731486 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 145731526 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 145731552 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 145731666 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145731864 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145731894 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145731988 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145732614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145732662 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145732720 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145732811 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145732851 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145733002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145733032 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145733063 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145733363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145733378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145733400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145733532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145733632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145733717 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145733863 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145733877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145734119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145734170 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 145734579 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145734678 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145735110 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145735975 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145736095 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 145739072 T G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 145739479 T G Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 145742464 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145742579 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145742764 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145743282 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145743374 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 145743814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145743925 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145744070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145744080 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145744410 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 145745449 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145745621 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 145745758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145745935 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 145746067 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 145746383 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 145746451 C A N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 145753410 C T Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.0909090909090909 19 3 9 1 1 3 145753462 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145754501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145754511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145754627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145754763 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 145754907 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 145755188 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 145755741 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145756440 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 145756984 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145757289 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145757455 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 145757733 T C Y Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 145758255 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145758707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145759499 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 145759592 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 145759881 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145759901 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 145760186 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145760536 A C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 145760659 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145760757 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 145761479 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145762496 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145763177 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145763258 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 145766368 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 145766988 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 145767590 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145767770 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 145767801 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145767962 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 145768047 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145768123 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 145768265 A C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 145768530 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 145768616 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 145768756 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 145768801 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 145768844 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145768848 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 145768902 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 145768970 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 145769074 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 145769094 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 145769120 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 145769308 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 145769323 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 145769390 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 145769415 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 145769423 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 145769428 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 145769649 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 145769706 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 145769763 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145769804 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145769834 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 145769914 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145769928 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 145770024 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 145770167 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 145770418 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 145770477 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 145770479 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 145770513 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 145770520 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 145770526 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 145770539 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 145770690 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 145770780 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 145770794 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 145770810 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 145770906 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 145770989 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145771010 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145771013 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145771167 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145771294 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145771319 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145771331 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 145771343 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145771572 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145771647 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145771686 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145771705 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 145771754 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 145771794 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 145771806 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 145771853 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 145772164 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 145772175 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 145772407 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145772534 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145772611 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 145772621 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145773034 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145773038 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145773091 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145773237 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145773264 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 145773304 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 145773533 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 145773652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145773673 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145773898 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 145773968 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145774037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145774053 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145774123 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145774185 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145774478 C T Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 145774721 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 145774813 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 145774916 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 145774942 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 145774986 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145774992 A C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 145775045 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145775074 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145775449 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 145775461 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 145775476 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 145775488 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145775501 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145775510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145775513 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 145775579 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 145775631 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 145775658 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145775672 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145775676 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 145775683 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 145775844 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 145775873 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 145775938 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145776001 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145776110 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145776145 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 145776650 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145776725 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 145776950 C A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 145777064 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 145777188 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 145777249 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 145777257 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 145777260 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 145777298 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 145777367 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 145777394 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 145777428 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145777452 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 145777503 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 145777559 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 145778136 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 145778247 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 145778316 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 145778396 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145778397 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 145778487 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 145778588 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 145778594 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145779028 T G N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 145779085 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 145779268 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 145779309 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 145779823 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145779880 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 145780582 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145780595 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145780662 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145780665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145780930 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145780952 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.0588235294117647 0.705882352941177 0.235294117647059 14 20 1 12 4 3 145780963 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145780988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145781012 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 145781079 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 145781098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145781101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145781163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145781215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145781221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145781236 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 145781242 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 145781396 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 145781473 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 145781501 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 145781533 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 145781534 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145781648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145781915 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 145781968 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 145781972 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145782354 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 145782466 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145782508 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145782573 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 145782576 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 145782714 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 145782724 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 145782745 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 145782785 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 145782836 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 145782954 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 145783115 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 145783221 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145783236 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 145783238 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 145783247 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145783886 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145784106 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 145784792 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 145784810 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 145785175 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 145785314 A G N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 145786380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145786500 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 145786529 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 145787089 C T N Y 0.5 ALT 0.75 0.75 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 5 5 1 3 1 3 145787095 T C Y Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 3 145787123 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 5 7 0 5 1 3 145787137 C T Y Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0 1 0 3 3 0 3 0 3 145787351 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 145787571 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 145787665 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 145787690 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 145787867 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 145787990 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 145788134 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 145788241 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 145788274 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 145788414 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 145788437 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 145788448 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 145788651 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 145788669 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 145788818 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 145788975 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 145789183 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 145789487 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 145789518 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 145789873 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 145789902 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 145789903 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 145789954 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 145790058 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 145790082 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 145790314 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145790556 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 145790574 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 145790644 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145790666 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 145791259 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 145791260 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145791307 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145791309 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145791397 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145791411 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145791429 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145791453 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 145791540 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 145791879 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145792261 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145792262 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145792491 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 145792520 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145792624 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145792908 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 145793076 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145793080 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145793484 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 145793497 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145793524 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145793549 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145793557 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 145793570 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145793695 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145794004 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145794055 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145794103 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145794164 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145794579 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145794766 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145794778 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145794811 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145794878 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 145794908 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145794943 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 145794948 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 145795019 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 145795045 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145795137 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145795394 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 145795413 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 145795418 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 145795554 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145795589 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 145795668 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145796092 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 145796109 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 145796355 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 145796366 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 145796386 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 145796396 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 145796415 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 145796745 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 145796801 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 145796935 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 145796986 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 145797053 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145797087 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 145797261 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 145797330 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 145797331 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145797381 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 145797391 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 145797394 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 145797539 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 145797635 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145797755 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 145797880 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 145797894 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 145798188 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 145798204 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 145798372 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 145798563 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 145798733 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 145798734 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 145798755 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 145798972 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 145799140 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145799218 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 145799261 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 145799525 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 145799635 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 145801370 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 145801390 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 145803238 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 145803743 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 145803778 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 145803781 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 145803824 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 145803868 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 145803888 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 145803901 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 145803974 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 145804011 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 145804089 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 145804102 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 145804182 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 145804276 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 145804374 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 145804404 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 145804465 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 145804473 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 145804494 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 145804611 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 145804645 T G N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 145804900 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 145805079 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 145805162 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 145805193 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 145805514 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 145805698 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145805994 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 145805999 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 145806019 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 145806279 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 145806351 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 145806359 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 145806489 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 145806512 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 145806517 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 145806547 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 145806553 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 145806576 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 145806594 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145806640 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145806678 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 145806729 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 145806735 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 145806797 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.0526315789473684 0.684210526315789 0.263157894736842 15 23 1 13 5 3 145806915 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 145806918 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 145806963 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 145806966 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 145806993 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 145807023 T A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 145807026 T A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 145807039 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 145807374 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145807383 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145807391 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145807395 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145807415 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 145807428 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 145807450 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 145807460 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 145807813 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 145808027 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145808053 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145808077 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145808232 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145808287 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145808415 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 145808760 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 145808780 G C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 145808841 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 145808962 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145808989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145809076 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145809182 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 145809250 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145809253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145809305 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145809381 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 145809439 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145809463 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145809480 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 145809585 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 145809635 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 145809637 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 145809677 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145809708 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 145809719 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 145809785 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145810023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145810030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145810065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145810562 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145811074 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 145811087 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 145811269 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145811275 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 145811386 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145811394 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 145811420 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145811743 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 145811832 C A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 145811882 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 145811902 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 145812014 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 145812152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145812318 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145812346 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145812490 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 145812892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145813060 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145814062 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145814176 C G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 145814238 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145814938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145815653 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 145815987 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 145816120 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 145817309 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 145818056 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 145818840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145818869 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 145820968 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 145821001 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 145821194 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 145821196 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 145822026 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 145822240 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145822695 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 145823318 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 145823450 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145823485 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 145823779 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 145824970 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145825086 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145825737 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 145826095 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 145826098 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145826258 A G Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 145826335 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 145826390 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145826517 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 145826664 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 145826674 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 145826687 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 145826706 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 145826775 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 145826858 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 145826968 C T Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 145827125 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 145827126 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 145827136 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 145827143 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 145827273 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 145827283 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 145827444 A C Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 145827481 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 145827608 T C Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 145827671 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145827836 G A N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 145827846 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 145827873 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 145827888 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 145827897 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 145827959 G T Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 145827973 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 145828150 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 145828198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145829288 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145829424 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145829716 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 145830100 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 145830178 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145830195 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 145830203 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 145830246 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 145830288 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 145830306 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 145830406 G T Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 145830573 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 145830595 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 145830762 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145830791 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 145830798 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 145830845 A G Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 145830850 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 145831012 C T Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 145831020 G T Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 145831216 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 145831423 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 145831670 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145832342 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 145832504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145832550 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145833437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145833542 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145833561 G C Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 145834327 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145834728 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145834772 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145834878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145835118 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145835202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145835289 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 145835599 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 145835666 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 145835845 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 145835869 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 145835953 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145836140 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 145837220 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145837250 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145840236 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 145840487 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 145840644 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 145840653 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145840766 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145840914 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 145841003 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 145841018 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 145841083 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 145841186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145841230 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 145841267 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145841326 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 145841953 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 145841962 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 145842235 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 145842344 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145842392 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 145842509 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 145842534 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 145842624 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 145842650 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 145842699 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 145842703 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 145842718 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 145842848 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 145842849 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145842889 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145842898 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145844622 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 145844645 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 145844657 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 145844687 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 145844833 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 145844837 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 145844844 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 145845210 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 145845708 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 145845903 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145846262 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 145846472 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 145846991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145847036 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145847539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145847932 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145849087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145849616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145849813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145850056 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145850689 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 145854629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145854844 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 145858782 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145859340 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145865175 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145865773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145865815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145865857 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 145865898 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 145865941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145866339 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 145866387 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 145866539 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 145866548 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 145866551 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 145866607 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 145866657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145867003 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 145867089 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145867129 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145867156 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 145867477 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145867505 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 145867525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145867526 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 145867786 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145867858 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145867961 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 145868288 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145868289 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145868439 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 145868616 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145868732 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145869097 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 145869191 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 145869577 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145870464 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 145870655 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 145870703 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145872119 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145873715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145875585 A C Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 145875793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145875985 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145876030 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145876073 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145876098 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145876121 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145876143 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 145876432 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145876834 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145876867 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145876901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145876923 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145876939 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145877210 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 145877224 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 145877411 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145877454 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145877467 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145877480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145877510 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 145877680 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145877802 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 145877824 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 145877887 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 145877929 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 145877991 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 145878004 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145878007 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 145878030 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 145878227 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145879466 G A Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 145879826 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 145881519 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145881589 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 145881613 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145881619 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145881767 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 145881949 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145882013 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 145882607 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145882945 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 145882946 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145883069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145883378 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145883864 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 145883980 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 145884185 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 145884370 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145884727 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 145884896 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145885002 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 145885072 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 145885153 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 145885202 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145885251 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 145885315 C A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 145885379 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 145885607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145885625 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 145885937 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 145885987 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 145886301 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145886677 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145886714 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 145886726 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 145886868 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 145886949 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 145887121 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 145887134 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145887164 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 145887494 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 145887709 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145887996 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 145888330 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145888345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145888381 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 145888447 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145888450 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 145889083 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 145889106 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 145889639 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 145889668 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 145889867 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 145889966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145890292 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145890402 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 145890789 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 145891269 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 145891272 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 145891389 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145891491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145891801 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 145892160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145892291 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 145892406 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 145892527 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 145892649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145892708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145892883 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 145892908 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 145892911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145893175 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145893756 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145894552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145894829 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 145894964 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145895296 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145895743 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145895991 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145896003 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145896071 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 145896207 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145896757 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 145896837 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145896895 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145897798 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145897825 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 145897826 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 145897842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145897927 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145897972 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 145898045 T G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 145898703 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 145900665 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145901487 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145903014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145903221 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 145903350 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 145903361 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 145903362 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 145907210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145908608 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145908934 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145909314 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 145910006 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145911174 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 145911349 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145911912 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145912016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145912035 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 145912077 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145912095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145912113 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 145912196 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145912198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145912253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145913328 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 145913368 G T Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 145913556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145913952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145914007 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 145914163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145914265 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145914346 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 145914542 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145914555 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 145914584 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 145914803 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145914843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145915580 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 145915590 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 145915677 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 145916840 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145917816 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145919257 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 145919319 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 145920757 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145920809 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 145920899 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 145920902 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 145920952 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145921056 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 145921167 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145921224 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145921227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145921300 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 145921343 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145921996 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145922022 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145922049 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145922135 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145922149 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145922192 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 145922208 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145922354 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 145922403 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 145922405 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 145922419 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 145922455 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145922698 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 145922703 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 145922750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145922775 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 145922878 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145922945 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145923083 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145923170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145923181 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145923182 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145923194 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145923239 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 145924648 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145924897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145925173 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 145925180 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 145926127 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145926172 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145926781 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 145926825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145926871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145928181 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145928606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145928835 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 145929411 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145932199 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 145932289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145932351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145932464 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145932772 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145933480 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145933560 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145934897 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 145934955 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 145935741 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 145935748 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145936319 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145936582 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 145936870 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 145938292 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 145938385 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145938551 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145938706 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 145939006 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 145939056 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 145939104 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 145939272 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 145939301 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 145939482 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 145939529 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145939614 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 145939942 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145940017 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145940119 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 145940311 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 145940480 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145940492 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145940923 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 145941028 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145941196 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145941753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145941815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145942126 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145942542 G C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 145942597 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145943255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145944072 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145945934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145946121 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145946456 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 145948096 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145948265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145948520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145949418 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145952038 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 145952591 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 145952733 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 145952757 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 145952802 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 145952817 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 145952868 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 145952869 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 145952886 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145953001 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 145953011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145953570 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 145953712 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 145953771 T A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 145953876 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 145954019 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 145954127 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 145954280 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 145954308 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145954319 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 145954331 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 145954333 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 145954518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145954800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145954976 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 145954982 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 145954994 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 145955040 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 145955043 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 145955064 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 145955318 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 145955326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145955359 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145955915 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 145955959 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 145956086 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 145956342 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145956427 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 145956477 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 145956559 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 3 145956583 G A N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 12 4 5 2 1 3 145962893 A C N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 145963197 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 145963207 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 145963284 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145963313 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 145963345 G C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 145963437 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 145963592 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 145963687 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 145963896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145964439 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 145964475 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 145964661 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 145965130 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145965232 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 145967979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145968206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145972643 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 145972654 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 145972656 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 145972743 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 145972993 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 145973296 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145973344 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145973387 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 145973472 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 145973473 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 145973577 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 145973656 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 145973850 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 145973991 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145974120 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145974222 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145974446 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145974459 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145974470 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145974618 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 145975193 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145976179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145977103 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145977159 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 145977857 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 145978036 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145978112 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145978116 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145978133 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145978308 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 145978328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145978468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145978537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145978571 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145978619 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145978810 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 145978887 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 145978971 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 145979088 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 145979226 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145979537 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145979583 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 145979673 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 145979685 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 145979803 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 145979825 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 145979835 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 145979875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145979895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145979961 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 145979964 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 145979979 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 145979987 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 145979993 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 145980005 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 145980110 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 145980358 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 145980419 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 145980619 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 145985982 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 145986181 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145986606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145987074 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145987860 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 145987862 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 145987905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145988246 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145988471 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 145988627 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145990897 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145990899 A T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 145991086 G T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 145991100 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145991261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145991268 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 145991558 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145992201 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 145993018 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 145993063 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 145993689 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 145993733 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145993774 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 145993780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145993834 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 145993878 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 145993959 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145993967 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145994171 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 145994980 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 145994988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145995029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145995057 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145995166 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145995191 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145995206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145995258 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145995621 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 145995643 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 145995700 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145995755 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 145995949 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 145996185 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 145996360 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145997208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145997336 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 145997456 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 145997871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145998238 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145998257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 145999381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146001224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146002511 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 146002744 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146003237 C A N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 146003241 T G N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 146003282 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 146003354 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146003376 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 146003450 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 146003595 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 146003675 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 146003772 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 146003799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146004016 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 146004230 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146005426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146005732 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146006283 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 146006297 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 146006642 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146006718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146007881 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146007950 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146007989 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 146008348 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146008442 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 146008654 A T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 146009191 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 146010853 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146012064 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 146012237 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 146012251 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 146012526 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 146012789 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 146012998 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 146013013 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 146013995 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 146014056 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 146014080 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146014229 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 146014387 G C N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 146014615 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 146014651 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 146014811 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146015133 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 146015230 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146015243 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146015448 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 146015487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146015546 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 146016182 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146016194 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146017167 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 146017762 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146018099 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146018156 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146018184 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 146018212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146018248 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 146018323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146018352 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 146018369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146018489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146026047 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146026399 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146026420 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146026491 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146026508 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146026515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146026591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146026837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146026846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146026966 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146027038 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146027212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146027227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146027618 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146027694 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146027991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146028199 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146028221 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146028230 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146028318 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146028332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146028397 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146028437 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 146028464 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146028471 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146028613 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146028708 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146028774 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146029092 T G Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 146029141 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 146029282 A G Y Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 146030236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146030485 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146030528 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 146030669 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146030744 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146030768 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146030886 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146031027 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 146031220 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 146031224 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 146031361 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 146031363 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 146031401 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 146031508 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 146032097 G A Y Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 146032116 T C Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 146032125 T C Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.0625 0.9375 0 17 15 1 15 0 3 146032140 T G Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 146032364 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146032883 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 146032914 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146032953 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146032963 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146033147 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146033201 G T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 146033269 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 146033270 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 146033309 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146033331 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146033364 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146033569 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 146033631 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146033635 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146033691 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146033899 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146033901 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146034224 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146034459 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146036106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146036198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146036617 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146036633 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146036673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146036835 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146036998 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146037097 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146037149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146037150 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146037164 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146037200 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146037210 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146037263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146037276 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146038137 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146038557 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146039007 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146040080 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146040415 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146040561 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146040670 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146041039 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 146041281 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146041358 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146041607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146041756 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 146042619 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 146042735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146042784 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146042798 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146043109 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146043726 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146044290 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146044461 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146044546 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146044602 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146044704 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146044783 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146044797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146044984 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146044992 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146045813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146045905 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146046011 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146046425 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146046470 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 146048406 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146048617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146048640 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146048652 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146048715 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146048758 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146048788 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146049849 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146049895 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 146049978 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146050222 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 146050983 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146051023 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146051110 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146051235 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146051279 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146051356 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146051403 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 146051428 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 146051734 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146051812 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146051820 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146051874 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146051902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146052102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146052132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146052207 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146052292 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146052309 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146052389 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146052407 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146052530 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146052611 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146052614 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146052636 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146052742 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146053175 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146053227 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146053262 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146053438 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146053486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146053580 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146053589 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 146053599 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 146053933 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146054319 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146054414 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 146054432 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146054524 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146054584 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 146054618 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 146054704 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 146055678 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146055785 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146056079 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146056120 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146056306 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146056310 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146056449 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146056716 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 146056738 C G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 146056739 C G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 146056808 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146057298 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146057461 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146058015 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 146058713 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146058737 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146058939 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146058944 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 146059014 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146059582 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 146059622 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146060110 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146061171 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146061215 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 146061482 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 146061712 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146061720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146061730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146061744 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146061770 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146061865 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146061983 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 146062033 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 146062394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146062397 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146062967 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 146063541 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146063547 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146063578 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146063853 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146063856 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146063878 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146064064 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146064228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146064301 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146064391 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146064518 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146064519 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146064533 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146064537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146064627 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146064670 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146064680 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146064715 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146065652 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146066168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146066294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146066335 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146066748 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146066923 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146067115 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146068132 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146068746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146068920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146068926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146068980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146068985 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146069062 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146069146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146069460 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 146069493 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146069671 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146070014 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146070117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146070404 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146070408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146070466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146070643 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146071382 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146071426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146071428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146071854 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146071917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146072199 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146072344 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146072353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146072367 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146072413 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146072836 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 146072999 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146073566 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146073596 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146073872 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146073898 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146073935 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146073962 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146073994 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146074038 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146074086 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 146074100 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146074287 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146074295 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146074466 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146074541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146074567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146074578 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146074601 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146074760 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 146074949 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146074999 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146075008 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146075060 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146075187 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146075247 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146075605 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146075693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146075741 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146075824 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146075842 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146075931 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146076015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146076556 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146076604 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146076689 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146076708 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 146076715 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146076915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146077272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146077305 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146077311 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146077417 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146077441 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146077650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146077894 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146078294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146078295 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 146079034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146079193 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146079202 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146079213 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146079226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146079249 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146079382 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146079480 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146079654 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146079686 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146079914 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146080762 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146080832 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146080912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146081050 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146081335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146081339 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146081485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146081524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146081611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146081693 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146081773 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146081856 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146081911 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146082054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146082405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146082522 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146082787 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146082803 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146082816 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 146083714 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146083895 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146084301 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 146084958 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146085187 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146085702 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146085793 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146086437 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146086501 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146086586 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146086646 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 146086764 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 146086888 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 146086894 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 146086979 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 146087001 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 146087009 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 146087083 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 146087286 G A N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 15 13 1 13 0 3 146087304 T G N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 146087336 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 146087729 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146088776 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 146088825 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146089210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146089358 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146089513 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146089532 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146090008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146090361 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 146091804 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 146091810 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 146091874 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146091886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146092052 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146092262 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146092315 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146092580 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146092725 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146093043 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146093402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146093467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146093880 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146095031 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146095049 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 146096622 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146097407 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146097415 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146097574 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146097840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146097988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146098411 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146098480 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146098706 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146098802 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 146099023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146099291 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146099402 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146100618 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146100662 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146101244 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 146102922 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 146103452 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146103598 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146103816 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 146104274 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146106231 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146106280 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146106284 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146106432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146106438 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146106531 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146106701 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146106710 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146106733 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146106736 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146106756 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146106791 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146106800 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146106843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146106905 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146107424 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146107428 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146107481 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 146107733 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146108275 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146108336 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146108521 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146109780 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146109828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146109973 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146109983 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 146110003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146110052 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146110155 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146110634 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146110650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146110691 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146110846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146110941 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146111021 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146111170 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146111213 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146112019 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146112092 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146112130 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146112154 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146112223 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146112322 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 146112814 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 146112913 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 146112993 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146113121 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 146113281 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146113284 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146114434 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146114573 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146114814 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146114966 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146115074 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146115105 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146115190 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146115199 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146115408 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146115690 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146116105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146116584 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146116592 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146116739 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146116797 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146116804 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146116819 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146117050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146117196 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146117478 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146117649 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146117650 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146117709 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146117730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146117917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146118039 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146118099 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146118162 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 146118182 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146118447 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146118512 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146118522 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146118523 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146121693 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146122154 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 146124769 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 146124834 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146125429 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146125454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146125458 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 146125564 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146126455 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 146127963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146129032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146129256 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146131817 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 146133522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146134268 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146135387 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146138651 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 146141462 T G Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 146142971 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146143421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146143957 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 146145472 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 146145507 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 146149436 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146155166 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 146158156 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 146158191 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 146158213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146159906 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146160090 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146161203 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146162025 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 146162465 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 146163177 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146163494 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 146163588 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146163617 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 146163628 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 146163744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146163827 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146163910 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 146163974 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146163977 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146164045 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146164066 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146164107 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 146164255 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146164262 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146164321 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146164324 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146164350 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146164361 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146164483 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146164603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146164782 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146164917 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146164942 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146165051 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146165078 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146165081 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146165147 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146165154 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146165248 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146165330 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146165347 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146165407 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146165703 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146165831 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146165877 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146166097 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146166125 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146166211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146166310 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146166353 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 146166466 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 146166606 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146166874 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146166897 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146166951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146167055 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146167145 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146167203 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146167244 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 146167251 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 146167383 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146167525 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 146167688 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 146167836 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 146167994 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146168016 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146168088 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 146168157 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146168188 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146168538 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146168545 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146168651 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 146168662 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 146168829 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 146168901 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146168972 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 146168997 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 146169433 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 146169463 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146169513 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146169730 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 146169819 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 146169834 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 146169890 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146170123 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146170296 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 146170297 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 146170472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146170741 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 146170797 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146171528 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146171562 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146171911 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146172352 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146173043 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 146173169 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 146175004 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 146175010 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 146175394 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146177368 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 146177378 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 146177380 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 146178252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146178418 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0 0.5625 0.4375 9 23 0 9 7 3 146178899 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146178929 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146178933 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146180030 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 146180065 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 146180098 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 146180421 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 146180471 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146180483 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146180887 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 146181629 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146182138 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146182443 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146183832 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 146184495 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 146184631 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 146184765 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 146184813 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 146184828 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 146184832 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 146184839 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 146184996 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146185030 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 146185198 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 146185397 A G N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 146185463 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 146185956 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 146185971 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 146186009 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 146186129 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 146186450 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 146186899 G T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 146187214 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 146187430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146187506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146187523 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 146187847 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 146188615 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 146188702 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 146189454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146190269 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146190278 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146190667 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146191497 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 146191587 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146192905 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 146194028 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 146194029 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 146195208 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146195898 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146197345 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146197757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146197841 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146197890 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146197896 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146197902 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146197925 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146197972 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 146198109 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 146198143 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 146198576 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 146198853 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146198947 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 146199081 T C Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 146199154 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146199395 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 146199472 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 146199546 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146199562 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 146199570 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 146199584 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 146199680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146199693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146199790 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 146199796 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 146199875 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146200007 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 146200078 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146200315 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 146200672 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 146201523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146201539 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 146201618 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 146201710 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 146201742 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 146201860 G C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 146201889 T G Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 146202702 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 146202743 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 146202934 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 146203167 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 146203186 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 146203735 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146203737 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146203772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146203870 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146204104 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 146204305 T A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 146204515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146204592 G T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 146204742 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 146205092 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 146205130 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 146205168 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 146205182 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 146206159 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 146206374 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 146206619 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146206685 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146206761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146206913 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 146206964 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 146207014 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146207164 T G N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 3 146207675 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 146207933 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 146209971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146210704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146210722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146210975 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146211570 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146211707 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146212529 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 146213651 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146214110 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146214365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146214995 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146215094 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 146215125 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 146215278 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 146215292 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146215364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146215430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146215451 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146215527 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 146215572 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146215678 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146215722 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146215791 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146216281 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 146216514 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 146216521 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 146216565 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 146217016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146217261 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146217473 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 146217779 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 146217918 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146218003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146218075 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146218271 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146218292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146219321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146220537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146220553 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 146220869 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 146220874 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 146221385 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146221877 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146223880 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 146223908 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 146224143 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 146224154 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 146224447 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146225591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146225685 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 146228692 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146233721 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146234428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146235220 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 146237564 C A Y N 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 3 146238861 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146241705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146242050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146242355 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146242621 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146242652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146242869 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 146242960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146244588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146245338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146246536 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 146246637 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 146246742 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 146246928 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146247312 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 146247723 C T N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.272727272727273 0.454545454545455 0.272727272727273 11 11 3 5 3 3 146248010 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 146248067 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 146248399 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146248607 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 146248652 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146251951 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146252180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146253365 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146254855 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 15 21 0 15 3 3 146255522 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 146256384 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146256622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146257082 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146257282 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146257291 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 146257328 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 146257341 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 146257369 G C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 146257383 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 146257388 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 146257497 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 146257813 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146257967 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 146258051 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 146258230 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 146258237 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 146258539 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 146258846 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 146258882 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.105263157894737 0.842105263157895 0.0526315789473684 20 18 2 16 1 3 146258883 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.1 0.85 0.05 21 19 2 17 1 3 146258895 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 146258939 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 146258940 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 146259066 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146259675 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 146259709 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146260003 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 146260325 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 146260345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146260440 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146260450 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 146260470 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146260757 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 146260786 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 146260787 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 146260850 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 146260949 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146261029 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 146261051 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 146261078 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 146261084 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146261370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146261492 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 146261814 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146261846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146262690 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146262857 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 146263076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146263808 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146264808 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146264817 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 146264836 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 146264886 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146264981 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 146265047 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 146265303 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146265323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146265354 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 146265431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146266016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146266157 G C N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 146266159 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 146266204 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146266290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146266511 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 146266564 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 146266590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146266599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146266634 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146266704 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146266764 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146266929 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146266973 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146267021 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146267097 T G Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 146267165 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146267217 T G Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 146267241 G C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 146267301 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 146267302 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 146267490 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 146267540 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 146267597 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 146267680 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 146267856 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 146267895 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 146267952 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 146268120 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 146268408 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 146268472 C T Y Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 3 146268724 A G N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 146268790 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146268866 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 146269382 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146269385 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146269395 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 146269444 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146269447 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146269905 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146269923 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146269964 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146270001 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146270160 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146270201 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 146270573 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 146270769 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 146271126 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 146271147 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146271239 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146271256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146272732 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146273152 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 146273602 T A Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 146273630 C T Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 146273697 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146273706 A G Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 146273728 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 146273795 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 146273928 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 146273992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146274036 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146274075 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 146274184 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 146274395 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 146274412 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146274466 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 146274586 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 146274599 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146274601 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146274792 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 146274843 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146274849 A C Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 146275007 C A Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 146275074 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 146275114 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146275270 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146275276 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 146275351 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146275558 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146275628 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 146275716 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 146275785 T C Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 146275788 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 146276189 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 146276234 A C N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 146276552 C T Y Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 3 146276612 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 146276613 C T N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 146276762 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 146276897 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.111111111111111 0.888888888888889 0 20 16 2 16 0 3 146276977 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146277001 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 146277014 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146277031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146277204 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 146277408 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 146278278 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146278307 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146278320 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 146278349 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 146278386 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 146278579 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 146278860 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 146279025 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 146279625 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 146279740 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146279758 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146279782 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 146279929 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 146279958 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 146280093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146280374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146280508 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146285527 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 146289460 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146289533 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 146290261 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 146293473 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 146300003 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 146300979 T G Y N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 3 146301000 C A Y N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 3 146301293 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146302933 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 146302963 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 146302972 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 146303197 C G Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 146303265 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146303405 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 146303522 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 146303580 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 146303644 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 146303655 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 146303757 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 146303789 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 146304438 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 146304447 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146304520 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146304534 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146304861 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 146304962 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 146305207 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 146305518 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 146305955 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 146306392 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 146306540 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146306782 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146306845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146308485 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 146308790 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 146309751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146309899 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 146310091 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146310158 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 146310381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146310401 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146310570 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 146310602 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 146310960 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 146311340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146311562 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 146311583 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 146311584 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 146311601 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146312067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146312268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146312304 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146312422 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 146313100 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 146313114 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 146313593 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146313769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146314790 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 146315307 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 146316278 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146316781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146317748 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146319020 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146321187 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146321499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146321659 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146321693 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 146321759 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 146322289 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 146322359 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 146322516 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 146322580 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 146323241 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146323289 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146323904 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 146324057 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 146324330 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146324454 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146324633 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 146326560 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 146327209 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146327217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146330470 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 146330496 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 146330952 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 146330986 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146331121 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146331434 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 146332384 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146333647 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146333826 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146334045 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146334096 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146334470 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146335655 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 146335946 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 146336342 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 146336461 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 146336489 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 146336644 C A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 146336661 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146336668 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 146336735 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 146336841 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 146336976 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 146336984 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 146337004 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 146337594 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146339091 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 146341094 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 146341900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146341949 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 146342147 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 146342166 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 146342307 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 146342355 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 146342370 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 146342393 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 146342398 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 146342411 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 146342470 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 146342659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146342746 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 146342763 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 146342922 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146343007 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 146343041 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 146343078 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146343221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146345530 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 146346805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146347108 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146347743 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146348572 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 146351678 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146354306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146354594 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 146354604 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 146357137 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 146357308 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 146357312 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 146357608 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146362540 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 146363476 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146363565 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146363589 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 146363592 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 146363600 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146363628 C G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 146363650 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146363891 G A Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 146363953 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 146364053 A T Y N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 3 146364081 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 146364160 T C Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 146364871 A G Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 146364888 G C Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 146365057 T C Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 146365124 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 146365127 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 146365232 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 146365253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146365414 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146365473 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146365645 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 146365667 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 146365706 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 146365710 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 146365867 C G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 146365948 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 146365993 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 146366003 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 146366181 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 146366346 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 146366582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146366653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146366659 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 146366757 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 146366782 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146366801 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146366881 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 146366891 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 146367016 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 146367047 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 146367275 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146367381 T G Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 146367448 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146367491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146367551 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 146367705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146368022 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146368358 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 146368711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146368734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146368784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146369846 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 146370114 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 146370211 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146370714 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 146370769 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 146370816 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 146370845 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 146370938 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 146370953 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 146371085 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 146371267 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 146371270 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 146371682 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146372097 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146372978 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 146373208 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146373242 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146373383 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146373397 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146373566 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146373568 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 146373859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146373895 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146374114 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 146375395 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 146375583 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 146375597 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 146375656 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 146376775 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146377460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146377598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146377971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146378968 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146379246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146380567 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146380573 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 146382547 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146383339 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146383814 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146384030 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 146388484 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146395301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146395710 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146397679 C T Y Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 146404596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146406749 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 146407061 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 146408006 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 3 146408050 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 146408420 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146408438 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 146408660 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 146408662 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 146409554 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 146409618 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 146409971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146410454 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146410680 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 146410683 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 146410693 A T Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 146412350 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146413263 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146413312 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 146413396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146414759 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146417294 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146417450 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 146418931 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 146419687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146421168 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 146421603 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 146421735 A T Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 146422272 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 146423093 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 146423110 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 146423544 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146423576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146423628 G T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 146424248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146428765 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146429014 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146430641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146430810 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146434871 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146436455 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 146436542 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146437135 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 146437375 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146438362 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146438530 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146438855 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146438881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146440046 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146440289 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146440510 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146441324 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 146442545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146443752 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 146444545 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146444865 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146445944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146446060 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146447058 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146447076 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146447101 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146447111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146448000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146448001 T A Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 146448267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146448303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146449165 A G Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 146449640 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146449676 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146450183 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146450375 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 146450900 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146451484 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146451711 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 146452028 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 146452302 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146452432 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 146453075 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146453155 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146453977 A G N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.461538461538462 0.461538461538462 8 18 1 6 6 3 146454406 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146454935 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 146455118 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 146455910 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146456001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146456113 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146456256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146456541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146456613 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146456646 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146456648 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146457014 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 146457318 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 146457809 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146458217 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 146458353 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 146458543 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 146458784 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146459149 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146459575 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146459654 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 146459777 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146460309 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146464520 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146464859 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 146466107 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 146466300 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 146466462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146466638 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 146470884 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146472115 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146474158 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146476553 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 146479081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146479189 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146479831 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146479989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146480220 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146480791 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146482737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146483713 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146484826 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146485454 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146485767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146485970 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146486693 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 146486771 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 146486818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146486935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146487094 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 146487135 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 146487197 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 146487314 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 146487560 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 146487940 G C Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 146487965 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 146489163 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146491259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146493101 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 146493684 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 146494870 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 146495931 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 146495932 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 146495972 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 146495982 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 146495983 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 146496010 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 146496100 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 146496250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146496398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146496473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146496883 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 146497221 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 146497510 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146497711 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 146497716 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 146497739 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 146497793 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 146497812 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 146497933 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 146498180 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 146498256 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146498857 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 146499504 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 146500923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146500973 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 146500975 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 146501052 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 146503546 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146503972 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 146503973 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 146503983 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146508403 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146508830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146511164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146511602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146513276 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 146513280 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 146513334 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146513386 C A Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 146513443 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 146513489 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 146513613 A C Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 146513644 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 146513653 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 146513672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146513698 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 146513715 G C Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 146513733 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 146514099 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 146514310 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 146514408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146514527 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 146514995 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 146515456 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146516332 T C Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 146516493 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146518933 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146519676 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 146519882 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146519974 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 146520274 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 146520276 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 146520724 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146520803 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 146521007 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 146521019 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146521042 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146521046 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146521103 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146521329 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146522192 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 146522579 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 146522585 C G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 146523719 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 146523838 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 146524163 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 146524247 C T N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 146525827 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 146526401 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 146526414 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 146526529 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 146526544 G A Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 146526556 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 146526593 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 146526689 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 146526796 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 146526826 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 146526846 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 146526934 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 146527204 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 146527272 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146527383 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 146527443 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 146527576 A T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 146528195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146528286 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 146528304 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 146528329 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 146528479 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 146528480 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 146528552 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 146528553 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146528570 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 146528591 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 146528603 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146528655 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146528796 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146529383 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146529528 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146529537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146529709 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146529971 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 146530280 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146530343 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146530383 T C Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0.0666666666666667 0.0666666666666667 0.866666666666667 3 27 1 1 13 3 146530550 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 146530743 G T Y N 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 146530801 C T N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.181818181818182 0.181818181818182 0.636363636363636 6 16 2 2 7 3 146530824 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 146530935 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146531470 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146531643 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 146531963 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146532095 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146532212 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146532288 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 146532316 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 146532507 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146532550 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 146532700 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146532709 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 146532791 G A Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 146532831 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 146532835 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146532947 A G Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 146532967 T A Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 146533046 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 146533051 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 146533098 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 146533684 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 146534156 C A Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 146534177 A T Y N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 146534331 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 146534700 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 146534744 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146534830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146534837 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146534868 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146534892 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 146534931 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 146535019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146535282 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146535309 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146535656 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146535666 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146535667 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146535739 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146535832 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 146535853 T A Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 146536266 C T Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 146536426 C A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 146536510 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 146536735 T C Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 146536744 A G Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 146537007 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 146537081 T G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 146537169 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 146537186 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 3 146537207 C T N Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 9 3 4 1 1 3 146537285 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 146537392 C T Y Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 146537479 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 146537571 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146537640 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 146537817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146537959 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146538081 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146538138 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146538161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146538743 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146538857 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146538898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146538920 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146538951 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 146538972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146539294 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146539378 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 146539400 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 146540150 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 146540532 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 146540895 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146540969 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146541028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146541146 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 146541335 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 146542126 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 146542164 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 146542180 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 146542183 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 146542205 C A Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 146542317 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 146542382 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 146542399 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 146542403 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 146543115 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 146543117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146543210 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 146543237 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 146543288 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 146543361 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 146543395 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 146543474 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 146543489 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 146543520 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 146543560 G A Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 146543729 G A Y Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 146543783 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 146543833 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 146543849 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 146543915 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146543958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146544007 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 146544077 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 146544540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146544703 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 146544711 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 146544728 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 146544742 T C Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 146544860 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 146544871 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 146545098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146545488 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 146545490 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 146545502 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 146545519 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 146545682 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 146545713 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 146545809 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 146545867 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 146545908 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 146545913 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 146546051 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 146546141 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 146546199 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 146546252 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146546308 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 146546318 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 146546471 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 146546603 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146547020 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 146547028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146547040 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 146547185 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 146547270 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146547359 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 146547427 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 146547438 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 3 146547453 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 146547492 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 146547511 T A N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 146547537 A G N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 146547594 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 146547595 C A N N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 3 146547650 G A N Y 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 3 146547967 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146548123 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 146548173 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 146548439 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 146548547 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 146548596 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 146548664 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 146548687 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146548764 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146548799 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146548805 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146548884 C G Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 146549115 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 146549286 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146549304 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146549427 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 146549453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146549521 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146549575 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 146549712 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146549764 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146549846 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 146549886 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146549927 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146549943 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 146550107 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146550125 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146550129 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146550193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146550232 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146551626 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146551684 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 146551768 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 146551850 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 146551973 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146552012 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146552180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146552192 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 146552240 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146552243 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 146552278 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 146552322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146552341 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146552429 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146552433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146552693 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146552758 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146552931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146553189 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146553222 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146553323 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 146553395 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146553418 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146553520 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146553796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146553807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146553839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146553896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146554002 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146554031 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 146554090 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146554348 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146556362 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 146556423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146556887 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 146558209 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 146558394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146558863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146559029 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 146559563 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146560578 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 146561069 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 146563430 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 146563556 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146563685 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146563889 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146564004 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 146564152 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146564153 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146564195 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146565034 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 146565077 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 146565722 T C Y Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 3 146566522 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 146566535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146566595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146567333 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146567443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146567594 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 146567608 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146567734 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146567775 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146567806 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146567919 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146568143 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146568169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146568649 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146568679 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146568725 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146568755 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146568757 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146568878 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146568894 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 146569008 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146569022 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 146569028 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146569267 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146569287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146569349 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 146569364 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 146569401 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146569679 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146569717 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146569781 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146569804 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 146569847 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 146569867 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 146569883 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 146569921 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 146569956 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 146569969 T C N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 3 146569980 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 146570132 G C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 146570133 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 146570197 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 146570213 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 146570251 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 146570262 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 146570289 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146570455 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146570836 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 146570858 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 146570927 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 146571023 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146571246 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146571255 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 146571257 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 146571550 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146571591 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146571667 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 146571691 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 146571754 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 146571836 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 146571854 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 146572342 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146572430 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 146572448 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 146573064 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146573100 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 146573110 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 146573311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146573386 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 146573419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146573462 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146573530 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146573892 C T Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 146574139 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 146575516 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146575535 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 146575840 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146575881 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146576020 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 146576073 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146576149 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146576150 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146576168 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146576286 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146576325 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 146576359 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146576419 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146576421 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 146576494 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146576542 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146576555 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146576584 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146576610 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146576652 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146576677 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146576700 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146576735 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146576791 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146576817 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146576868 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146576884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146576994 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146577000 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146577012 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146577145 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146577398 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146577416 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146577417 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146577459 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 146577523 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146577559 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146577581 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146577738 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 146577757 G T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 146577820 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 146577932 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146578104 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 146578137 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146578169 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 146578267 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146578336 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 146578408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146578425 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 146578435 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 146578833 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 146578911 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 146579004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146579101 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 146579172 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146579175 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 146579259 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 146579340 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 146579349 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 146579355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146579441 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 146579480 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146579511 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 146579530 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146579534 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 146579559 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146579646 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 146579736 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146579746 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146579883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146579902 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146579910 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146579944 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 146579963 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 146580167 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146580556 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146580594 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 146580828 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 146580937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146581716 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 146587866 A G Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 146587911 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 146589989 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146590269 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146590393 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 146591036 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146591302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146591675 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146591681 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 146591700 C T Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 146591878 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146592009 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 146592410 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146592411 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146592476 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146592557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146592569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146592786 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146592840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146592845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146593049 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146593250 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146593297 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146593624 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146593763 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 146594411 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146594667 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146595387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146595517 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 146595527 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 146595831 T G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 146595967 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146596118 G T Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 146596160 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146596169 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 146596225 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 146596272 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 146596311 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146596339 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 146596430 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 146596508 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 146596532 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 146596577 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 146596752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146596950 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 146597043 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 146597151 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146597189 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 146597206 G C N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 146597313 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146597407 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146597861 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146599825 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 146600387 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146601175 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 146601745 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146602906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146602934 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 146602966 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 146603691 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146603871 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146603924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146603951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146604115 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 146604186 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 146604213 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 146604610 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 146605188 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 146605307 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 146605340 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 146605404 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 146605973 C T N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 146606018 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 146606211 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146606225 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 146606227 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146606414 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146606437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146606490 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146606510 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 146606711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146606865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146607364 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146607743 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146607879 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146607892 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146607921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146607966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146608289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146608299 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 146608301 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 146608408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146608955 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 146609095 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146609551 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146609765 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 146610264 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146610283 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146610851 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 146611028 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 146611217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146611380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146611424 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146611440 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146611469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146611657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146611703 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 146611728 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146611747 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146611754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146611793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146611923 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146613342 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146613510 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146613762 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 146614177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146614437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146614645 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 146614799 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146614849 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146614870 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146616125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146616237 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146617911 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146617923 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 146618545 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146619427 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 146619433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146619523 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 146619563 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 146619779 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 146619816 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 146620249 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 146620449 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146620483 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 146620610 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 146620875 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 146620926 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146621101 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146621119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146621279 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146621555 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146621659 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 146621924 C T Y Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 146622268 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 146622272 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 146622279 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 146622452 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 146622481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146622482 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 146622658 G A Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 146622737 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 146622745 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 146622748 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 146622761 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 146622808 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 146622810 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 146622838 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 146623010 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 146623136 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 146623190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146623216 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 146623249 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 146623422 G A Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 146623466 A T Y N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 146623494 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 146623680 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146623705 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146623848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146623893 C G Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 146623900 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 146623975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146623988 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 146624037 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 146624181 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146624225 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146624241 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 146624285 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146624317 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 146624576 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 146625536 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 146625657 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146625668 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 146626700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146626710 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146626803 G A Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 146626821 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 146627164 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 146627385 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 146627391 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146627502 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146627533 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 146627592 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 146627596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146627642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146627646 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 146627670 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146627702 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 146627897 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 146628047 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146628064 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 146628224 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 146628271 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 146628314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146628615 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146628897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146629645 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146629857 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 146630213 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 146630274 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146630704 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 146630722 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146630862 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 146631457 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 146631493 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146631549 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 146631648 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 146631658 T A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 146631810 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 146632271 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 146633311 G T Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 146633870 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146633889 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146634071 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146634470 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146634547 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146634735 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146634818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146635230 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146635335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146636030 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 146637089 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146637205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146637362 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146637695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146637790 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146638288 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 146638397 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 146638798 G T N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 3 146638853 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146638943 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146639213 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146639242 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 146639538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146639600 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146639906 C G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 146639938 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 146640002 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 146640018 C G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 146640268 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 146640272 G C Y N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 146640615 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146640752 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 146641484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146641485 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 146641501 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 146641523 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146641999 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146642018 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146643199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146643310 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146643603 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 146643635 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146643724 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 146643748 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 146643927 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146644170 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 146644551 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146645143 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146646223 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146646253 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146646405 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 146647062 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 146648755 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 146650273 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 146650734 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146652053 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 146652245 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146652369 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 146652566 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 146652593 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146652662 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146652861 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146652895 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146654484 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146655692 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 146655980 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146656132 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 146656779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146658722 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 146658773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146658951 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146659721 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146660287 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 146660686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146660740 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 146660908 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146661045 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146661080 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 146661157 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 146661193 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 146661229 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 146661232 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146661253 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 146661332 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 146661381 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 146661454 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 146661465 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 146661509 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 146661816 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146661902 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146662042 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 146662051 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 146662393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146662425 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 146662464 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 146665206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146667610 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146667734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146667755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146668064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146668167 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 146668244 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146668303 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146668412 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 146668422 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 146668501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146668546 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 146668721 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 146668812 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146668824 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146668997 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146669194 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 146669286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146669726 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146670100 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 146670315 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 3 146670451 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 146670584 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 146670646 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146671451 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146671490 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146671622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146672018 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146672241 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 146672342 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 146672368 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 146672479 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146672740 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146672952 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 146673053 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 146673504 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146673589 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 146674359 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146675343 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146675534 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146676040 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 146676359 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 146677195 T A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 146677213 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146677497 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146678100 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146678686 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146678821 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 146678912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146679141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146680096 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146680209 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146680250 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146680282 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146680721 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146680818 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 146681095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146681541 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146681613 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 146681617 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 146681671 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 146681851 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146682789 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 146683234 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146683298 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 146684133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146684394 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 146686121 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146687134 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146687292 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 146687531 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 3 146687730 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 146687742 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 146687796 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146688295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146688826 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 146689385 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146689535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146689626 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146689821 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 146690009 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146690153 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146690266 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 146690399 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146690531 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146690659 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146690821 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146690904 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 146691889 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146692986 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146693741 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 146693763 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 146695086 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146695227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146695404 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146695460 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146695494 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 146696424 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146697041 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 146697255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146697359 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 146699814 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 146699816 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146700017 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146700110 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146702985 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146703137 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146705452 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146707430 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146712756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146713049 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146714026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146714804 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146715270 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146717089 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146717383 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146717628 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146717699 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146717901 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 146717950 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 146720267 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146720592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146720731 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 146721033 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146721276 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 146721738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146721772 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 146721779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146721839 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146721988 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 146722019 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 146722029 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 146722099 G C Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 3 146722125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146722147 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 146724402 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146724731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146725268 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 146725611 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.222222222222222 27 9 13 1 4 3 146725928 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146726130 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.210526315789474 29 9 14 1 4 3 146726156 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.210526315789474 29 9 14 1 4 3 146727463 G A Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 146727619 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 146727785 G C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 3 146727800 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.75 0.05 0.2 31 9 15 1 4 3 146727850 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146729064 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 146729752 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146729793 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 146730112 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 146730253 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 146730872 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146731053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146731433 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 146731861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146732434 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 146732541 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146732795 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 146732820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146732996 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 146733056 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146733298 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146733344 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 146733785 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 146733789 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 146734460 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146734668 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 146734725 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 146734999 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146735018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146735092 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146735307 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 146735594 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146735883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146735939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146736142 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 146736151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146736598 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146736619 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146736660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146737231 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 146737492 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146737665 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 146737826 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 146738842 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146739126 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146739678 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 146740202 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146740394 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146740906 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 146741268 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146741324 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146741428 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146741827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146742222 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146742412 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 146742502 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 146742503 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 146742575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146742880 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 146743064 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 146743102 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 146743162 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146743967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146744106 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146744195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146744480 A T N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 146744534 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 146745084 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 146746739 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 146746800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146747280 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146747538 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146748279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146748589 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 146749265 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146749431 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 146749449 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 146749658 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 146749673 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 146749806 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 146749908 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 146750064 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 146750124 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146750274 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146750285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146750340 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146750606 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 146750633 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 146750717 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 146750997 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 146751111 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146751144 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146751217 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 146751243 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 146751331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146751518 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 146751607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146752136 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146752743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146753006 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146753012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146753144 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146753935 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146754095 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 146756155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146756411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146756898 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146757432 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 146759011 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 146760231 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146760341 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146760370 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146760408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146760423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146760507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146761194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146761955 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 146762391 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146763840 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 146763969 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 146765215 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146765472 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146765632 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146765688 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146765728 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146766318 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146766835 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146766894 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146766899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146767208 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146767532 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146767688 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146767766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146767821 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146767826 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146767842 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146767916 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146767947 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146767963 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146767993 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146768087 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146768335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146768557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146768783 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146768785 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146769241 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 146778921 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146779277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146779541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146780459 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146781134 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 146781426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146781634 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146781641 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146781909 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 146781939 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 146783913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146784852 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146785112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146785308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146785388 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146785740 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 146786041 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146786182 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 146786610 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146786694 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 146788524 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 146789310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146789730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146790442 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 146791960 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 146792100 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 146792643 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146792829 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146793186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146793198 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146793493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146794229 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 146794477 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 146795498 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 146795639 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 146796417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146796707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146796738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146796854 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146798026 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146798040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146798605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146799023 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146800040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146800705 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146801791 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146802938 A G N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 3 146802975 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 146803232 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146803522 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146803957 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146804589 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146804988 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146805244 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146805411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146805753 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 146806625 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 146807537 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 146807918 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 146807954 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 3 146808618 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146808956 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 146808982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146809074 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 146809289 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 146809509 A C N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 146809606 C T Y Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 3 146809652 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146809748 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 146809781 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146809934 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 146810023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146810044 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 146810220 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 146810383 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146810399 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146810615 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 146810660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146810675 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 146811236 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 146811295 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 146811308 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 146811442 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146811770 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 146811889 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 146812020 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 146812113 G T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 146812947 G T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 146814024 G A Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 3 146814061 G A Y Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.230769230769231 0.692307692307692 0.0769230769230769 15 11 3 9 1 3 146814257 C T N Y 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 10 6 4 2 2 3 146814345 T A N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.384615384615385 0.538461538461538 0.0769230769230769 17 9 5 7 1 3 146814371 A T Y N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 3 146814409 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 146814424 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 146814499 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 146814750 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 146814870 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 146815639 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 146815643 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 146815654 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 146815684 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 146815686 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 146815822 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 146816390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146816518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146816638 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146816663 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146816768 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 146816770 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 146816871 A G N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.875 0 0.125 14 2 7 0 1 3 146816917 T G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 3 146817283 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 146817287 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 146817315 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 146817364 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146817373 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146817391 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146817408 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146817450 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 146817569 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 146817625 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 146817732 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146817896 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 146817958 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 146818472 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146818531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146818982 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 146819274 G C N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 146819450 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146819489 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146819623 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146819644 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 146819709 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146819824 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146820038 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146820111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146820178 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 146820242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146820652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146820685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146820969 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146821063 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 146821094 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146821234 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 146821253 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 146821399 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 146821417 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 146821540 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 146821657 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 146821714 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 146821972 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146822458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146822882 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 146823123 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146823374 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146823404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146823525 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 146823602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146824008 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 146824325 A G N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 146824353 C G N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.538461538461538 0.461538461538462 0 20 6 7 6 0 3 146824354 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 146824366 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 146824382 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 146824425 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 146824443 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 146824551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146824602 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146825113 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 146825117 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 146825463 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146825908 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146825983 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146826057 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146826211 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146826490 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 146826583 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146826653 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 146827110 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146827122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146827342 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 146828207 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146830332 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146830681 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 146833121 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146833172 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146833302 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146833425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146833601 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146833609 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146834885 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146835463 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146837342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146839239 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146840096 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146840777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146840895 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146840906 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 146842376 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146842890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146842943 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146843929 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 146843996 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146844292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146844951 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 146845031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146845073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146845107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146846001 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146846027 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146846304 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146846679 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 146847266 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146847606 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146847870 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 146848483 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146848825 T C Y Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 3 146849017 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146851571 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146851584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146852649 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146853111 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 146853404 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 146853770 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 146853971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146853979 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 146854087 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 146854163 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 146854294 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 146854299 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 146854305 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 146854325 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 146854406 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 146854431 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 146854471 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 146854545 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 146854625 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 146854641 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 146854683 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 146854836 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146854956 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146855272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146855297 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 146855372 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 146855420 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 146855573 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 146855682 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 146855838 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146855865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146855906 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 146855980 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146856045 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 146856084 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146856207 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146856521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146858628 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146859263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146859278 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146859421 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 146859457 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 146859516 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 146859921 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 146860669 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146860698 T G Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 146861095 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 146862605 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146864098 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 146864523 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146864944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146865636 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146866284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146866433 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 146866692 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 146866955 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 146866970 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 146866992 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 146867900 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 146868438 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 146868639 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 146868682 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146868724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146868811 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 146868891 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146868965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146868968 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146869018 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 146869166 C G Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 146869587 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 146869618 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146869693 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146869787 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 146869927 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146869936 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 146869964 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146870152 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146870247 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146870273 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146870326 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146870395 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146871130 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146874208 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 146874287 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 146874443 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146874669 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 146874671 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 146874877 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146874987 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 146875020 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 146875125 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146875311 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 146875323 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 146875341 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 146875369 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 146875385 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146875743 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 146875788 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146875806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146875979 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 146876012 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146876151 A G N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0 0.5 0.5 7 21 0 7 7 3 146876673 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 146876826 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 146877096 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 3 146877670 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 146878034 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146878043 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146878055 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146879289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146879327 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 146879344 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146879357 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 146879523 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 146880064 G A Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 146880306 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 146880595 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146880627 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146880639 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146880662 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 146880712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146881101 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 146881104 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 146881534 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 146881612 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146881645 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146889274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146889425 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146889542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146889547 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146889581 T G Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 146889620 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 146889667 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 146889671 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 146890162 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146890438 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 146890511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146890843 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 146890920 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146891060 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146891273 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146891339 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 146891625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146892158 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146892181 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 146892224 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 146892454 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 146893380 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 146893448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146893477 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146894176 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146894248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146895055 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146895241 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146895547 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146895793 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 146895803 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 146895867 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 146896030 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 146896063 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146896082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146896091 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 146896121 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 146896192 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 146896247 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 146896251 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 146896920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146897163 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146899450 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146900609 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146900655 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146900993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146901256 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146901437 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146901449 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146902561 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 146902598 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 3 146903074 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 146903194 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146903276 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146903294 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146903366 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 146903439 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146903483 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146903537 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146903662 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146903935 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 146904160 C T Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 146904161 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146904230 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 146904443 G T Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 146905471 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146905496 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 146905640 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 146905773 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 146906473 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 146906619 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 146906753 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 146906918 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146906922 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 146907263 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 146907712 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146908327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146908363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146910488 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146910727 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146911150 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146911350 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 146911657 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 146911835 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146911903 A C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 146912095 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 146913172 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 146913178 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 146913268 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 146913924 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146914569 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 146915084 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 146915938 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 146916028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146916356 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146916361 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146916527 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146917206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146917283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146917286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146917598 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146917642 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146917696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146918616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146918652 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 146918826 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146918969 G T Y N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 146919082 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146919779 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 146919787 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146920107 A G Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 146920118 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 146920271 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146920307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146920390 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 146920531 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146920856 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 146920936 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 146920991 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146921021 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 146921395 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 146921863 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146922223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146922638 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146922749 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146923139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146923381 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 146923547 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146923623 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 146924915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146925036 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 146925321 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 146926024 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 146926301 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146926567 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 146926864 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146927125 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146927612 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 146928001 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146928010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146928024 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146928928 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146929659 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 146929879 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146930080 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146930125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146930354 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 146930509 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 146930650 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 146930805 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146931149 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146931437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146931621 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 146931852 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 146931894 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146931950 T G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 146932086 T A Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 146932327 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 146932682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146932804 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146932957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146933581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146934282 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 146934317 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146934692 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 146934759 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146934834 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 146934839 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 146934999 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146935290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146935340 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146935358 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 146935453 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 146935746 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 146935757 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 146935790 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146935804 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146935971 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146936346 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 146936463 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 146936722 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146936774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146936890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146936917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146937115 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 146937143 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 146937198 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146937315 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 146937330 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 146937353 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 146937364 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 146937367 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 146937385 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 146937386 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 146937400 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 146937555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146937976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146938154 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146938192 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146938830 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146939018 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146939384 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146939627 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146940061 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146940736 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 146940873 A C Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 146940983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146941491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146941552 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 146941701 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 146941732 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 146942056 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 146942154 T G N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 146942177 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 146942310 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 146942413 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 146942424 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 146942429 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 146942436 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 146942505 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146942532 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 146942544 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 146942638 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 146942830 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 146942971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146943015 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 146943053 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 146943165 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146943240 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 146943256 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 146943432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146943565 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 146943641 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 146943874 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146944254 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146944515 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 146944565 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 146944580 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 146944591 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 146944655 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 146945014 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 146945092 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146945232 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146945567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146945722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146946231 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 146946623 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 146947575 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 146948004 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146948827 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 146948979 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146949024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146949030 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146949062 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 146949145 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 146949178 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146949266 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 146949267 T A Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 146949318 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146949673 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146949747 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 146949774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146949792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146949947 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 146950154 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 146950157 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146950178 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 146950281 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 146950900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146951226 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146951334 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146951375 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146951479 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 146951481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146951693 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 146951826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146951847 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146952141 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146952159 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146952535 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146952566 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146952657 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146952713 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146952827 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146953125 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146953262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146953488 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 146953494 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 146953601 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 146953782 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146954002 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146954030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146954038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146954082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146954166 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146954172 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146954182 T A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 146954291 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 146954467 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 146954511 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 146954529 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 146954550 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 146954586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146955676 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146956064 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 146956653 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146956658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146956670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146956800 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146957152 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146958375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146958810 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 146959222 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146962979 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146969354 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146970085 T A Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 146971692 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146971904 G A Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 146973727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146974899 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 146974901 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 146974934 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 146974968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146975643 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146978381 A C Y N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 146978401 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 146978758 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146978835 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 146978953 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146978998 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 146979125 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 146981249 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146981253 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146981877 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146981959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146982277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146983273 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 146984413 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146987378 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 146990795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146991184 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146992207 G C Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 146992401 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146992769 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 146993523 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 146994095 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 146996386 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 146997072 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146997831 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 146998531 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146998539 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 146999357 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147000301 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147000975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147002871 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 147004709 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147004877 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 147005246 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147005651 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147006127 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147007004 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147007734 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147008150 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147008268 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147008832 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147008957 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147011952 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147012537 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147013739 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147013742 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147013762 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 147013840 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 147013845 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147014127 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147014363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147014669 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 147014738 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 147014775 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147015075 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147015165 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 147015535 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 147015695 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 147016004 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147016547 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147016686 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147017679 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147017839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147018859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147019069 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147025573 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 147025656 C A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 147025772 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 147025788 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 147025870 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 147026101 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 147026114 T C N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 6 14 2 2 6 3 147027044 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 147027075 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 147027123 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 147027460 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 147027569 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 147028262 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147028266 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 147028316 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 147028500 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 147028648 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 147029137 A T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 147030340 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147030994 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147031203 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147031688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147034034 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147037313 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147037730 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 147038863 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147038963 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147040133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147042022 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147042549 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 147042687 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 147043010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147043161 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147044326 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147044818 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147044850 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147044922 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147045343 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147045410 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147045474 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147045565 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147045673 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147045725 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147045805 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147045812 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147045922 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147045961 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147046087 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147046183 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 147046526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147046542 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 147046837 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147046913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147047040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147047104 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147047388 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147047499 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147048251 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 147048274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147048283 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 147048367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147049083 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147049160 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 147049204 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147049507 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147050178 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147050297 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147050312 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 147050511 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 147050665 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 147051020 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147051101 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147051130 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147051423 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147052038 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 147052335 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 147052601 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 147052616 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 147052689 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147053059 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 147053073 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 147053091 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 147053118 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 147053273 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147053416 A C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 147053481 G T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 147053547 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 147053609 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 147053619 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 147053778 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 147053969 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 147054034 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 147054285 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147054334 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 147054376 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 147054491 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 147054499 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 147055186 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147055357 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147055598 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 147057735 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147058695 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147058844 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147059053 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147059720 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 147060505 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147060817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147060902 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 147061134 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 147061147 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147061148 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 147061194 A C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 147061202 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 147061243 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147061302 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 147061411 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 147062174 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147062254 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147062408 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 147063848 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 147063960 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 147064094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147064323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147064815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147065254 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 147065322 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 147065464 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 147065626 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147065788 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147065921 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 147066682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147067551 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147067878 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147067916 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 147068342 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147069335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147069536 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 147069639 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147069869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147069984 A T Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 147070304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147070475 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 147070711 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 147070955 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147071083 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 147071392 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 147071409 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 147071500 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 147071530 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 147071534 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 147071636 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 147072544 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 147072551 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147072903 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147073047 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147073190 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147073506 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147073782 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 147074000 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 147074469 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 147074643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147074951 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 147075176 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 147075663 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 147075742 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147075849 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 147076041 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 147076183 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 147076197 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 147076205 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 147076234 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 147076364 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 147076595 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147076646 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147076763 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147076909 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 147077130 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147077311 G T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 147077391 A C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 147077866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147077904 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147078146 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147078321 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 147078427 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147078556 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 147078642 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 147079537 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147082199 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 147082934 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147083082 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 147083363 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147083920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147084170 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 147084338 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147084976 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147084997 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 147085083 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147085367 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 147086142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147087353 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147088877 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147088881 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147089025 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147089737 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147089761 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 147089923 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147090137 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 147090251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147090419 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147090573 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 147092123 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147092136 A G N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 147092386 A C Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 147092410 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 147092457 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 147092513 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 147092575 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 147092591 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 147092617 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 147092659 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 147092809 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 147092934 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 147092936 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 147093046 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 147093206 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 147093368 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 147093372 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 147093420 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 147093429 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 147093458 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 147093461 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 147093475 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 147093537 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 147093631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147093663 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 147093686 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 147093929 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 147094044 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 147094068 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 147094096 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 147094100 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 147094141 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 147094331 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 147094565 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 147094979 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147095429 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 147095432 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147095578 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 147095854 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147096721 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147096877 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 147098388 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147098556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147098613 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147098659 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 147098996 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 147098998 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147099390 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147100020 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147100045 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 147100309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147100512 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 147100539 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147100542 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147100640 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 147100798 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147100806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147100814 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147100839 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147100901 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147100951 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147100969 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 147101079 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147101092 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 147101109 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 147101141 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147101170 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 147101214 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147101323 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 147101340 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 147101425 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 147101773 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 147101792 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147101817 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147101884 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 147101917 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147102330 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 147102331 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 147102369 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147102373 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147102436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147102446 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147102492 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 147102559 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 147102583 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147102621 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147102622 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147102656 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 147102720 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 147102772 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147103009 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 147103534 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 147103780 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147104737 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 147105312 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 147105791 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 147105910 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 147106356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147106371 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147106410 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147106458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147107505 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 147107583 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 147107746 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147107845 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 147107902 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147108200 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147108294 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 147108519 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147108637 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147109116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147109297 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147109298 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147109456 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 147109463 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147109520 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 147109547 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 3 147109613 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147109756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147110190 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147110398 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 147110481 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 147110750 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 147110759 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 147111219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147111338 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 147111734 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147111901 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 147112038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147112091 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147112678 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147113719 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 147113800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147113986 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147114117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147114161 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147114619 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147115008 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147116091 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147116545 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147116619 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147117052 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147117077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147117205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147117374 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147117528 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147117562 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147117589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147119303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147119963 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147120846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147120893 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147120904 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147120915 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147120947 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147120949 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147121002 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147121892 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147123672 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 147124854 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 147126073 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 147126107 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147128132 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147129322 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147130825 T A N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 147130925 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 147131338 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147131426 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147132217 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 147132545 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147132628 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147132854 G A N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 147132879 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 147133173 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147133498 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 147133556 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 147133672 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 147133880 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 147134244 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147134751 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147134803 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147134971 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 147135117 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 147136428 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147136724 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147138648 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147138988 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147139095 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147139350 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 147140056 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 147140176 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147140217 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 147140238 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 147140646 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147140662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147141108 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147141233 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147141268 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147141346 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147141455 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147141505 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147141699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147142627 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 147142766 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147143156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147143327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147143545 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147143683 G T N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 147144206 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 147144299 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 147144840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147144883 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147145463 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 147146732 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147146897 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147148027 G A Y Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 147148078 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 147148183 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 147148226 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 147148227 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 147148294 C A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 147148325 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 147148775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147152849 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 147153596 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 147153713 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 147153795 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 147153888 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 147153927 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 147154181 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 147154304 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 147154352 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 147154465 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 147154912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147154943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147155054 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147155427 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147155434 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147155517 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147155679 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147155766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147155782 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147155909 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147156052 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147156053 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147156269 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147156350 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147156388 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147156504 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 147156751 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 147156962 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 147157088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147157968 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147158606 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 147159302 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147159832 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147159928 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147160699 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147160709 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147160789 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147161097 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147161098 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147161801 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 147162108 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147162239 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147162824 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147162857 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147163859 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147164386 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147164727 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147165696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147165985 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147166249 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 147167035 C T N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.25 0.75 0 15 9 3 9 0 3 147169397 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147171140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147173844 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147174016 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 147174069 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 147174141 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147174173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147174214 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147174321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147174363 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147175501 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147175793 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147176252 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147176253 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147176761 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147176815 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147176922 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 147176944 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 147177271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147177613 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 147177676 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 147177742 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 147177939 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 147177941 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 147178166 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 147178533 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 147178559 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 147178611 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 147178726 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 147178779 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 147178857 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 147178872 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 147178939 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 147178984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147179012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147179037 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 147179064 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 147179110 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 147179194 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 147179247 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 147179407 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 147179867 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 147179927 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 147179995 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 147180002 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 147180065 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147180085 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 147180101 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 147180106 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 147180166 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 147180292 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 147180326 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 147180355 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 147180393 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 147180520 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 147180561 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 147180584 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147180627 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147180696 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 147180708 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147180754 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147180864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147180906 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147180931 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147180981 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 147181226 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147181228 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147181258 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147181453 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147181533 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147181560 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147181621 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 147181639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147181682 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147181712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147181762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147181770 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147181777 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147181786 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147183129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147183143 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147183189 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147183262 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147183275 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 147183276 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147183366 G C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 147183506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147183532 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147183591 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 147183616 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147183658 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147183703 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147183725 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147183747 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147183769 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147183775 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147183813 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 147183871 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147183898 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147183930 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147184000 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147184008 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147184013 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147184038 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147184058 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147184220 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147184348 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147184411 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147184424 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147184481 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147184566 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147184753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147184770 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147184781 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147184843 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147184870 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 147184900 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 147185017 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147185263 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 147185274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147185315 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 147185334 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 147185361 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 147185362 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 147185425 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147185490 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147185491 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147185502 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147185572 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147185573 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147185644 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147185692 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147185699 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147185726 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147185789 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147185802 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147185815 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147185946 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147186018 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147186094 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147186159 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147186174 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147186180 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147186222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147186284 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147186331 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147186454 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 147186476 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 147186518 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 147186599 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147186624 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147186715 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147186773 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147186782 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147186794 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 147186804 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 147186805 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 147186826 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147186933 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147186973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147187055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147187105 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147187811 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147188177 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147188452 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147188458 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 147188493 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147188525 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 147188541 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 147188828 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 147189068 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147189122 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 147189529 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147189545 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147189609 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 147190092 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147191387 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147195241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147195542 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 147196126 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147196173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147196243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147196843 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147197061 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 147197338 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 147197348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147198620 T A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 147198704 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 147199645 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147200431 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147200881 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147201643 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147201695 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147203558 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147204145 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.166666666666667 0.777777777777778 0.0555555555555556 20 16 3 14 1 3 147207237 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147207630 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147209089 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 147209690 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147210191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147210392 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147210636 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 147211850 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 147211864 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147214160 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 147215518 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 147217128 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147225545 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 147228374 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147228939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147230699 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147231112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147233506 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147233562 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 147233732 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147233807 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 147233833 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147233861 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 147234122 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 147234484 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147234833 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147235684 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 147239110 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147239766 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 147240218 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 147240504 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147240796 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147241117 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147241301 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 147242801 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147243247 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147243972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147245138 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147246246 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147246813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147247324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147247673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147247837 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 147249248 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147250656 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147250818 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147251467 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147251478 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147251850 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147251857 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147253122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147253173 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147254132 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147254520 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147254633 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147254643 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147254649 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147254657 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147255018 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147255350 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147255491 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147255569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147255651 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147255665 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147256014 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147256582 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147256849 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147256961 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147256988 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147257018 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147257073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147257079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147257695 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147258091 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147258160 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147259147 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147259467 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 147259582 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 147259608 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 147259889 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147261467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147261498 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147261525 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147261639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147261669 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147261771 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147261792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147261815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147261838 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147261892 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147261995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147262139 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147262155 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147262480 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147262678 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147262803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147263291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147263346 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147263458 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147263553 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147263563 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147263909 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147264027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147264118 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147264338 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147264461 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147264495 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147264510 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147264526 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147264639 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147264708 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147264856 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147264862 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147265001 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147265145 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 147265374 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147265581 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147266105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147266130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147266965 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147267333 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 147267381 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 147269068 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147269251 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147270130 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147270415 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147270755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147271285 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 147272741 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147273811 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147273945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147274299 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147274306 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147274839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147274916 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147275016 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147275105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147275183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147275400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147276060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147276133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147276241 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147276262 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147276432 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147276581 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147278771 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147278800 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147278910 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147279205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147279642 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 147280102 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147280344 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 147281266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147281311 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147281736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147281807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147281920 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147281995 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147282091 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147282098 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147282107 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147282110 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147282513 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147282522 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147282611 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147282651 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147282693 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147282757 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147282764 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147282996 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147283084 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 147283160 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 147283166 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 147283304 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 147283307 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 147283435 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147283449 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147283505 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147283532 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147283540 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147283548 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147283551 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147283567 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 147283580 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147283863 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147283866 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147284006 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147284049 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147284097 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147284466 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147284469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147284732 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147284772 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147284941 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 147285062 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147285154 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147285227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147285499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147285650 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147285879 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 147286031 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 147286061 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147286237 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147286266 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 147286397 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147286411 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147286441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147286487 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147286532 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147286574 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147286723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147286754 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147286824 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147286828 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147287058 A G Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 147287137 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147287209 T C Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 147287244 T C Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 147287255 G A Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 147287264 G C Y N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 147287266 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147287349 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147287373 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147287400 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 147287439 G T Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 147287448 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147287476 A G Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 147287616 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 147287711 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147287725 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147288072 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 147288120 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 147288279 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147288355 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147288469 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147288540 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 147289877 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147290131 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147290266 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147290423 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147290598 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 147290601 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 147290630 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 147290892 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147290906 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147290984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147291160 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147291161 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147291224 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147292023 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147293022 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147293028 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147293141 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147293304 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147293621 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147293641 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147293954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147294332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147294939 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147296129 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147297664 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 147298266 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147300045 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 147300345 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 147300550 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147300926 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147301698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147302906 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147303017 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147303129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147303583 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147303758 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 147304133 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 147305162 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147305310 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147306659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147307621 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147308105 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147308680 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147308784 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147310441 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147310643 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147312282 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147312885 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147313246 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147315496 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147316383 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147316384 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147316397 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 147317524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147317588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147317793 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147317804 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147317830 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147317866 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147317889 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147317934 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147317972 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147317973 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147318184 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147318335 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147318761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147318843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147319163 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147320711 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147320917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147320926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147320944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147321049 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147321430 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147321749 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147322973 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147323140 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147323762 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147324077 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147324878 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147325132 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147325346 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147325456 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147325739 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147325947 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147326127 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147326157 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147326801 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 147326856 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 147327287 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147328034 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147331303 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 147331418 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147331671 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147331951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147332451 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147332613 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147332706 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147332935 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147332953 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 147332964 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 147332972 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 147333135 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 147333564 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 147333576 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 147333743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147333819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147333842 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 147333886 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147334018 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 147334241 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147334247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147334349 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147334512 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 147334608 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 147334685 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147334718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147334810 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 147335354 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147335473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147335899 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147336175 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147337006 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147339154 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 147339685 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 147341008 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147341534 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147342136 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147342273 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147342288 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147342335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147342476 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147343478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147343577 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 147343881 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147343960 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147344326 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147344552 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 147344569 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147344573 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 147344639 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 147344661 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 147344736 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 147344905 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147344937 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 147344965 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 147344988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147345107 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147345132 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147345179 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147345189 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147345193 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147345200 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147345401 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147345498 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147345913 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147345956 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 147345975 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 147346047 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147346138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147346141 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147346454 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147346459 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147346562 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147346577 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147346734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147346882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147346957 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147347141 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147347191 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 147347307 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147347445 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147347476 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147347622 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 147347699 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 147347779 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147347960 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 147348241 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 147348291 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 147348357 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147348444 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 147348555 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147348562 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147348701 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147348889 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 147349005 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 147349664 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147350029 T C N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 3 147350227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147350442 G C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 147350454 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 147350459 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147350497 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 147350525 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 147350541 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 147350665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147350959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147351112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147351189 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147351349 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147351350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147351363 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 147351467 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 147351517 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 147351586 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 147351605 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 147351630 A G Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 147351631 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 147351668 A T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 147351677 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147351686 C G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 147351797 T A Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 147351825 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 147351853 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 147352012 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 147352034 A T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 147352037 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 147352133 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147352343 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147352484 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147352949 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 147353261 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147353418 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147353442 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147353485 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147353579 C A Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 147354104 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 147354127 C A Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 147354152 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147354372 G A N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 147354611 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147355575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147355724 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147356135 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 147356517 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 147356689 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 147360024 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147360078 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147360324 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147361595 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147362094 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 147362527 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 147362737 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147363077 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147363337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147363616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147364071 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147364260 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 147364347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147364453 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147364697 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147364806 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 147364807 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 147364899 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147364965 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147365116 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 147365151 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 147366165 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 147366171 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 147366178 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 147366332 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147366472 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147367645 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147370282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147370637 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147371037 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 147371084 C T Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 147371085 A T N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.0714285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 11 17 1 9 4 3 147371169 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 147371235 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 147371253 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 147371306 T G N N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 147372474 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 147372476 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 147372485 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147372678 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 147372689 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 147372727 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 147373016 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147373051 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 147373058 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 147373088 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 147373118 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147373412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147373453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147373559 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 147373577 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 147373582 T A Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 147373589 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 147373737 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147373785 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 147373793 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 147373818 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 147373870 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147374159 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147374684 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 147375186 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147376093 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 147377930 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147378491 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 147378895 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147379019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147379032 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147379162 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147379562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147379920 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147380112 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0 0.684210526315789 0.315789473684211 13 25 0 13 6 3 147380619 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147381562 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147381691 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147382893 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147382952 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 147383294 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147384291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147384467 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147384736 A T Y N 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.25 0.583333333333333 0.166666666666667 13 11 3 7 2 3 147385703 G A N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 3 147386189 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147386431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147386473 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147386599 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147388094 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147390819 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 147393398 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147394352 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147394360 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 147394517 A C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 147394825 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 147394888 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 147394952 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 147395206 C T N Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.111111111111111 0.777777777777778 0.111111111111111 9 9 1 7 1 3 147395341 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 3 147395491 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 147395634 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 147395743 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 147395770 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 147395787 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 147395869 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 147395959 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 147396014 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 3 147396095 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.25 0.625 0.125 18 14 4 10 2 3 147396096 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.266666666666667 0.666666666666667 0.0666666666666667 18 12 4 10 1 3 147396115 A T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 3 147396185 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 147396284 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 147396376 G A N Y 0.45 REF 0.5 0.5 0.45 0.55 0.1 0.7 0.2 9 11 1 7 2 3 147396472 C G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 147396564 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147397083 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147397499 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 147397824 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147398027 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147398052 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 147398301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147398321 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 147398333 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 147398377 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 147398384 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 147398405 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 147398521 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147398614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147398639 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147398755 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 147398910 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147399084 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 147399339 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147399453 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147399819 T G Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 147400438 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147400567 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147401997 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147402088 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147402457 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 147404325 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 147404412 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 147404755 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 147405631 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147405846 A G N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 3 147405879 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147406590 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 147406692 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 147406864 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 147406915 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 147407056 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147407176 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147407370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147407738 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 147407917 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 147407982 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 147408055 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 147408259 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 3 147408371 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 147408377 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 147408732 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 147409058 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 147409864 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 147411377 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 147411468 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 147411655 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 147411662 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 147411706 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 147411707 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 147411802 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 147411961 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 147411971 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 147411992 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147412013 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 147412019 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147412160 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 147412267 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 147412520 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147412531 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 147412693 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147413230 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 147413378 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 147413385 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 147413422 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 147413485 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 147413552 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 147413833 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 147413842 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 147413925 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 147414017 A C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 147414043 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 147415255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147415272 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147415615 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 147415685 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147416050 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147416516 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 147416566 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147416767 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 147416965 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147417053 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147417093 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 147421348 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147421383 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 147421453 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 147421487 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 147421659 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147421977 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147422960 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147423530 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147423793 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147423955 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147424324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147426032 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147427436 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147427792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147427981 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147428630 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147430316 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147431899 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 147431900 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147431960 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147435714 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147436284 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 147436300 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 147436341 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 147436346 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 147436457 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 147436585 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147436796 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 147437168 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147437690 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147437729 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 147437880 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147437966 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147438136 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147438612 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 147438801 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 147438973 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 147439139 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 147439222 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 147439242 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 147439259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147439467 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 147439957 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147440014 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147440284 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147440289 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147440615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147440619 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147440642 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147441177 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147441197 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147441317 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147441345 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147441365 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 147441371 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 147441381 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147441455 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 147441589 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147441595 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147441831 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 147441855 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 147441906 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 147441976 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 147442775 T A Y N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 147444669 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147444962 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147445137 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147445352 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 147445427 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 147446044 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147446059 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 147446134 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147446366 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147447008 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147447576 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147447600 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147447657 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147447752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147447954 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147447986 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147448009 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147448019 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147448105 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 147448331 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 147448394 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 7 5 2 3 1 3 147448576 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 147448640 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 147448949 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147449005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147449011 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 147449026 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 147449054 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 147449589 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 147449929 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147450080 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147450216 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147450764 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 147451006 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147451144 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 147451432 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 147451561 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147451857 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 147452335 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147452889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147453038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147453247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147453466 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147453479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147453613 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147453617 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147454284 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147454575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147456831 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 147457731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147458182 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147459383 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147459829 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147460195 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 147460456 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147461698 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147462042 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147462197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147462997 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147463147 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 147463355 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147463379 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147463544 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147463703 T C Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 147463738 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 147463774 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147464035 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147464099 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147464122 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 147464150 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147464239 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147464455 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147464590 T A Y N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 147464834 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147464915 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 147464974 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147465045 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147465463 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 147465766 T C Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 147465780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147466320 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147466653 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147466812 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 147467291 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147467957 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147468211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147468415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147468740 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147468844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147468932 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 147468951 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 147469168 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 147469410 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 147469524 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 147469571 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 147469699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147469738 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147471138 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147471207 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 147471312 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147471512 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147471518 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 147471591 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147471655 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 147471753 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147471799 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 147474106 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147474115 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147474244 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147474560 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 147474838 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147475718 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 147475892 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 147475893 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 147475921 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147475935 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147476044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147476045 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 147476113 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 147476404 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147476467 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 147476773 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147477557 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147478689 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147479029 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147480582 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 147480639 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 147480728 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147481064 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 147481137 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147481388 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 147481475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147481500 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 147481588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147481958 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 147481974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147482048 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147482724 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 147482780 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147482781 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 147482861 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 147482870 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147482910 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 147483098 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 147483713 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147483717 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147484405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147484426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147485288 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147486071 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147488037 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147489525 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 147490080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147491478 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147493275 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147493458 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147494124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147494148 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147494742 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147494786 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147494879 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147494959 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147494967 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147495263 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 147495728 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147496003 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147496132 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147496149 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147496304 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147496377 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 147497012 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147497284 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147497299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147497340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147497353 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147497422 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147497461 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147497500 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147497535 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147497622 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147497670 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147498210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147498264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147498277 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147498311 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147498678 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147501851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147502391 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147505361 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147505506 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147508246 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147508367 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147510338 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147510459 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147513092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147514729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147515637 A G Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 147517962 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147519315 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147519456 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147519539 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 147519581 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 147519848 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 147519945 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 147519973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147519991 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 147520091 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147520246 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 147520336 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147520444 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 147520457 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147520528 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147520594 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 147520603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147520610 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 147520680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147520695 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147520808 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147520874 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147521392 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147522281 T C N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.0714285714285714 0.714285714285714 0.214285714285714 12 16 1 10 3 3 147523088 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 147523095 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147523309 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 147523320 A C Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 147523357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147523371 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 147523528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147523529 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147523931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147523952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147524048 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147524064 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147524111 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147524150 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147524165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147524184 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147524519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147524529 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 147524684 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 147524904 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147525340 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 147525996 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147526060 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147526130 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147526224 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147526462 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147527388 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147527389 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147527928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147529535 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147529591 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147529871 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147530001 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 147530037 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147530194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147530223 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 147530331 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 147530375 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 147530397 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 147530413 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 147530516 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 147530641 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147530661 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147530668 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147530684 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147530690 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 147530707 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147530719 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 147530755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147531091 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147532026 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147532151 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147532207 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147532217 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 147532593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147532849 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147533550 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147541069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147542464 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147542465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147543840 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 147543952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147544014 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 147544020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147544294 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 147545749 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147546782 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147546856 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147547292 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147547489 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147547789 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147549098 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 147549135 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147549974 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 147550070 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 147550622 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 147551164 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 147551212 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 147551324 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147552264 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 147553286 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147553992 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147554469 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 147555069 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147555540 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147555875 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147558294 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147558601 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147559186 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147559311 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147560319 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147561931 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147562658 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147562798 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147563308 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147563905 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 147564022 C G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 147564458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147565161 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147565171 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147565692 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147566019 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147566458 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 147566483 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 147567761 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147568044 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 147568348 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 147568683 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147568960 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147569052 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 147570644 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147571237 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147572492 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 147572621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147573201 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147573425 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147573755 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147577560 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147578655 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 147580231 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 147580311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147580322 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 147582355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147582537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147585196 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147586146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147586394 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147586642 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 147586693 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 147586750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147586807 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147586838 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147587147 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147587270 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 147587552 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147587561 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 147587958 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147588309 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147588389 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 147588405 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 147588512 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 147588564 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 3 147588927 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 147588933 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147589012 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 147589228 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 147589520 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 147589593 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 147589602 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147589680 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147589693 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 147589753 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147590013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147590232 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 147590273 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147590469 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147590481 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 147590522 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 147590547 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147590591 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 147590737 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 147590774 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147591311 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 147591807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147591963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147594148 A G Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 147594170 T C Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 147594176 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 147594237 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 147594239 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 147594285 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 147594334 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147594600 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 147595277 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147595360 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147597582 T A N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 147598334 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 147598664 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 147600700 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 147601028 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 147601708 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 147602831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147604736 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 147604979 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 147605857 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147606672 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147607175 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 147607881 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 147608753 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 147609482 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147611131 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 147611635 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 147611806 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 147611809 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 147611829 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 147612109 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 147612182 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 147612827 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147612953 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 147615804 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147619037 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147619828 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 147620001 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 147620242 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 147620672 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 147621123 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 147621146 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 147621218 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 147621468 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 147621469 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 147621484 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 147621603 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 147621682 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 147621868 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 147622402 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147623017 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 147623018 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 147623424 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 147623640 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147623912 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147624213 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147624541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147625460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147626171 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147626654 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 147626985 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 147627097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147628563 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147628774 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 147629017 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147630204 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147630209 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147630223 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147630425 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 147630648 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 147630850 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147632169 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 147632354 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 147632457 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 147632590 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 147632910 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 147633169 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147633292 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 147633345 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147633451 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 147633486 C T N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 147633916 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 147633932 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 147633933 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 147634608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147635758 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147636170 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147636750 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 147636858 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 147638381 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147640144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147640157 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147640290 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147641228 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 147641259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147641718 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147641748 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147642161 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 147642239 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 147642270 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 147642318 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 147642430 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 147642691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147642714 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147642747 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147642760 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 147642806 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 147642831 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147642868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147643081 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147643138 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147643139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147643209 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147643285 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147643304 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147643339 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147643357 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147643634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147644333 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147644510 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147644591 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 147644617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147645121 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 147645497 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147645537 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 147645578 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147645695 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 147646509 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147648104 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 147648202 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147648249 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147648285 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 147648370 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 147648433 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 147648596 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147649505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147650186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147650528 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147650658 T G Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 147650733 A T Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 147650761 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 147650812 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 147650852 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 147650915 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 147651113 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 147651159 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 147651244 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 147651257 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 147651393 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 147651456 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147651516 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 147652181 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 147652537 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 147652553 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147652831 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147652909 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 147653022 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147653072 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147653165 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147654896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147656048 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147656089 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147656272 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147656336 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 147657450 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 147657531 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147658572 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 147658743 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147659397 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147659443 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 147661582 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 147665378 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 147665432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147665436 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147665505 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147665669 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147665785 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 147665804 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 147665832 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 147665915 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 147666008 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 147666010 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 147666569 A T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 147666733 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 147666854 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 147666940 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 147667324 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 147667339 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 147667340 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 147667395 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 147667405 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 147667502 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 147667602 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 147667615 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 147667635 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 147667685 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147667886 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 147667988 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 147668008 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 147668024 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 147668038 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 147668303 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147668332 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147668348 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147668444 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147668580 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 147668903 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 147671236 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 147671308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147671491 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 147671587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147671688 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 147671715 G C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 147672722 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 147673584 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147675419 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147675916 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 147675927 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 147676133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147677402 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 147677456 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 147678398 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 147678402 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 147678418 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 147678470 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 147678475 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 147678591 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147678673 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147678712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147678980 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 147681068 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 147681628 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147686258 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 147686297 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147686298 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147686393 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 147686422 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 147686852 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 147686861 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 147686925 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 147687348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147687613 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 147687861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147687904 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 147688311 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147688367 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 147688375 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 147688398 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147688448 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 147688472 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 147688614 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147688705 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147688724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147688754 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 147688927 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147689085 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 147689097 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 147689153 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 147689220 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 147689463 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 147689608 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147689793 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 147689879 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 147689956 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147690160 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147690161 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147690261 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 147690303 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147691350 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147691365 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 147691552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147691706 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147691714 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147691776 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147691777 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147691804 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147691819 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147691859 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147692513 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147692678 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147693037 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 147693207 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147693561 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147693642 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147693673 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147693933 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147693990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147694578 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147694626 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 147694679 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 147695055 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 147695302 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 147696023 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 147696083 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 147696696 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 147697054 C A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 147697227 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147697288 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 147697528 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 147697621 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 147697880 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 147697893 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 147698203 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147698790 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 3 147701019 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 147701033 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147701247 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 3 147703341 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147703599 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 147703759 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147704103 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147704272 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147704370 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 147704407 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 147704545 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147704645 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 147704646 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147704673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147704881 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 147705713 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147707453 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 147707742 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147708006 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147708010 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147708023 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 147708175 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147708340 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 147708350 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147708421 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147708447 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147708525 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147708709 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147708800 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147708824 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147708881 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147708911 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147708952 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147708980 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147708991 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147709124 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147709162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147709174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147709180 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147709240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147709258 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147709290 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 147709312 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 147709314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147709369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147709386 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147709430 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147709431 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147709477 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147709541 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147709710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147709871 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 147710016 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 147710299 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 147710321 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 147710503 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 147710504 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 147710589 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 147710651 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 147710729 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 147710965 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 147711014 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 147711086 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147711136 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 147711272 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147711357 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 147711360 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 147711409 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147711465 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 3 147711577 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 147711592 T G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 147711613 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 147711725 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 147711742 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 147711752 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 147711769 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147711791 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 147711815 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 147711816 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 147711981 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 147712008 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 147712028 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 147712045 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 147712159 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 147712246 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 147712306 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 147712325 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 147712355 C A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 147712945 C G Y N 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0 0.615384615384615 0.384615384615385 8 18 0 8 5 3 147713036 T G Y N 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 3 13 1 1 6 3 147713057 T C Y Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 3 147713118 G T Y N 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 3 147713154 T C Y Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 3 147713159 T C Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 147713171 G T Y N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 147713235 T C Y Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 3 147713255 T G Y N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 3 147713258 G A Y Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 3 147713321 C T Y Y 0.25 REF 0.9 0.9 0.25 0.75 0 0.5 0.5 1 3 0 1 1 3 147713322 A G Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 147713332 G A Y Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 147713372 C T Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 147713473 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 147713504 C T Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 147713531 A G Y Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0666666666666667 0.533333333333333 0.4 10 20 1 8 6 3 147713552 T A Y N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 3 147713606 G C Y N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 147713652 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 147713705 A G Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 147713761 C G Y N 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 4 10 1 2 4 3 147713780 A T Y N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 3 147714074 C T Y Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 147714124 G T Y N 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 4 14 0 4 5 3 147714170 C T Y Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0 0.857142857142857 0.142857142857143 6 8 0 6 1 3 147714190 G A Y Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 3 147714220 G A N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 147714348 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 147714465 T G N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 3 147714702 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 147714722 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 147714751 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 147714790 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 147714855 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 147714868 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 147715282 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147715386 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 147715630 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147715860 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 147715889 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 147715900 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 147716247 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 147716693 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 147716795 C T N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.153846153846154 0.384615384615385 0.461538461538462 9 17 2 5 6 3 147716994 T G Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 147718050 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 147718497 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147718528 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147718710 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 147718754 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147718954 T G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 147719023 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 147719376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147719389 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147719710 A G N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 3 147719799 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 147719947 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 147720023 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 147720152 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 147720256 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 147720270 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 147720340 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147720412 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 147720434 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 147720451 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 147720462 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 147720464 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147720513 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 147720538 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147720582 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147720682 G C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 147720691 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 147720704 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 147720740 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 147720772 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 147720817 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 147720829 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 147720850 G T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 147720924 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 147720960 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 147721206 C T N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 147721250 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147721343 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147721572 C T N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 3 147721774 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147721869 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147721903 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 147721908 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147721929 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 147721936 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 147722049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147722066 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 147722126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147722211 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147722291 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147722403 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 147722415 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147722724 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 147722769 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 147722946 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 147723065 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 147723353 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147724147 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 147724202 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 147724221 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 147724263 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 147724433 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 147724453 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 147724825 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 147724913 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147724975 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 147724977 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 147725005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147725037 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 147725047 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 147725055 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 147725158 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 147725392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147725650 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147726009 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 147726646 T A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 147727381 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 147727418 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147727716 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147727998 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 147728198 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 147729137 G C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 147729562 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147730483 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147730819 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147731412 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 147731430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147731687 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 147731708 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 147731854 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147731982 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 147732188 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 147732836 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 147732837 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 147732944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147732999 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 147733091 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 147733131 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147733268 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 147733567 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 147733944 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 147734866 A T Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 147734890 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 147734932 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 147734995 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 147735052 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 147735465 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 147735473 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 147735482 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 147735506 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 147735529 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 147735756 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 147735831 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 147735881 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 147735901 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147735907 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 147736044 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 147736168 A C Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 147736312 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 147736415 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 147736436 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 147736456 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 147736482 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 147736570 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 147736641 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 147736652 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 147736743 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 147736749 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 147736795 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 147736925 A C N N 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 3 147737026 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 147737109 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 147737146 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 147737396 T G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 147737479 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 147737489 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 147738356 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147738501 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 147738507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147739195 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 147739565 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147739793 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 147739921 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 147740290 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 147740391 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 147740454 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147740821 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 147741307 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147741597 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147741941 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 147741959 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 147742130 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 147742369 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 147742526 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 147742574 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 147742583 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 147743637 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 147743645 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 147743752 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 147743841 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147743957 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147744392 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147744523 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 147744711 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147744759 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 147744795 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 147744978 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 147745080 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147745321 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 147745344 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 147745355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147745443 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 147745540 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147745615 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 147745726 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 147745733 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 147745749 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 147745861 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 147745923 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147745980 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 147745999 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 147746015 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 147746073 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 147746181 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 147746252 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 147746381 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 147746391 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147746398 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 147746563 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 147746587 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 147746688 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 147746982 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 147747069 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147747101 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147747130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147747147 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147747149 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147747350 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 147747398 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147747402 C G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 147747446 G A N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 3 147747545 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 147747573 A G N Y 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.363636363636364 0.363636363636364 0.272727272727273 12 10 4 4 3 3 147747591 C T N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.384615384615385 0.307692307692308 0.307692307692308 14 12 5 4 4 3 147747611 A T N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 3 147747679 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 147747738 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 147747747 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 147747909 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 147747924 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 147747928 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 147747960 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 147748092 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 147748125 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 147748150 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 147748276 G T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 147748298 T C Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 147748381 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 147748394 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 147748416 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 147748429 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 147748449 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 147748478 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 147748514 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 147748550 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 147748573 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 147748670 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 147748733 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 147748917 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 147749036 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 147749233 C A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 147749699 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 147749761 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147749822 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 147749935 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 147750006 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 147750041 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 147750341 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 147750583 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 147750961 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 147751558 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 147751801 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147752732 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147754327 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 147754980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147755227 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147755318 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147755466 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 147755718 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147756180 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147759528 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147761129 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 147761611 T G N N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 147762057 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147762201 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 147762455 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147762547 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147762575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147763564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147764023 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147764170 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 147764173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147764327 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 147764364 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 147764442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147764451 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 147765265 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 147765405 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 147765511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147765928 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 147766230 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 147766241 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 147766284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147766767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147766785 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147766908 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 147767077 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147767173 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 147767217 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 147767270 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 147767427 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 147767673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147767690 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 147767751 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 147767916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147768234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147768267 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147768374 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 147768644 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147769277 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147769799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147769901 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 147770094 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147770308 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147771638 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147773007 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147774805 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 147775758 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 147776753 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 147777066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147778078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147778538 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147778625 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147780414 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 147780677 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147780690 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147781612 A G Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 147781827 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147781918 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 147783705 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147784467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147784784 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 147785939 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147786338 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147786755 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 147787190 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147788404 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147789165 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147789425 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 147789674 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147789763 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 147789930 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147792276 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 147793096 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147794196 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147795396 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147795593 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147800570 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147800685 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 147803366 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147804478 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147806981 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147807228 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147807623 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147815740 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 147816735 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 147816736 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 147817407 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147818409 G A Y Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 147819602 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147827969 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 147829373 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 147829509 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147830138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147832444 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147833192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147834688 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147836606 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147837436 C A Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 147840083 G T Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 147841146 T C Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 147846165 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 147846614 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147846733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147847504 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147849710 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147850482 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147850568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147850808 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 147851800 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 147852601 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 147852693 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 147852842 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 147852994 C T Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 147853020 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 147853866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147854548 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 147854641 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 147854762 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147856578 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147857062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147857784 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 147858710 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 147860439 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147861186 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 147862106 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147863120 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147863129 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147863226 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147865230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147865564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147865777 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147867645 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 147868174 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 147870818 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 147870851 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 147871204 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 147871815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147871949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147872123 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 147872138 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 147872154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147872225 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 147872427 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 147872464 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147872468 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147872527 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 147872559 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 147872562 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 147872576 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 147872718 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 147872854 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147872955 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147872967 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147872990 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147873008 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147873051 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147873071 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147873395 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 147873533 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 147873717 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147873721 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147873795 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 147873923 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 147873925 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 147873999 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 147874103 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 147874451 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147874960 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147875000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147875092 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 147875682 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 147875706 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147875995 C A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 147876159 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 147876590 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 147876843 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147876878 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 147876968 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 147877249 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 147877460 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 147877581 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147877620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147877644 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 147877655 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 147877684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147877852 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147878206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147878531 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 147878561 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 147878677 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 147878703 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 147878776 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147878780 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147878863 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147878947 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 147879084 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 147879147 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 147879163 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 147879374 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147879399 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 147879486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147880557 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147880565 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 147880572 C T N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 147880612 T C Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 147880617 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147880793 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 147880891 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147881259 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147881401 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 147881598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147881786 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147881807 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147881859 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 147881903 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147881932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147881935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147881946 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 147881973 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147883343 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 147883474 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 147883641 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 147883711 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147884024 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 147884080 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 147884342 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 147884350 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 147884414 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 147884490 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 147884577 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 147884592 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 147884645 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 147884697 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 147884779 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 147885000 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 147885124 G C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 147885151 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.3 0.7 0 26 14 6 14 0 3 147885534 A C Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 147885552 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 147885655 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 147885674 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 147885754 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 147885817 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 147885887 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 147886802 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 147886973 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 147886994 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 147887004 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 147887227 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 147887493 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 147887651 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 147887663 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 147887880 A T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 147887882 A T N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 147887896 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147887968 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 147888016 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 147888057 A T N N 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 147888066 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 147888081 G T N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 147888086 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 147888138 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 147888145 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 147888212 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 147888229 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 147888269 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 147888354 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 147888617 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 147888704 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 147888750 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 147888768 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147888786 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 147888798 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 147888815 A G Y Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 147888959 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 147889100 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 147889112 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 147889417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147889481 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 147889516 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 147889529 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 147889575 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147889666 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 147890076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147890772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147891119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147892436 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147894000 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147898308 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147898983 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147900160 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147900699 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 147901113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147901349 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147901574 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147901582 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147901596 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147902223 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147902890 G T Y N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 147904276 C A Y N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 3 147905500 C A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 147905937 G A Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 147906174 T A Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 147906488 A G Y Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 147906575 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 147906602 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 10 8 4 2 3 3 147909449 C G Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 147911468 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 147911579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147912052 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147912807 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 147912967 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147913522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147913762 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147914029 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147915273 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 147916507 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 147916530 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 147916744 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147917014 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 147917375 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147917562 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147918013 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147920519 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 147921528 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 147921582 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 147921805 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 147921871 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 147922048 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 147922098 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 147922112 C G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 147922237 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 147922480 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 147922577 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147922679 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 147923377 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147923388 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147924339 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 147924384 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 147924496 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 147924511 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 147924565 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 147924588 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 147925089 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 147925122 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 147925224 C G N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 147925244 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 147925266 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 147925319 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147925367 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 147925424 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 147925850 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 147925871 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 147925874 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 147926063 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 147926101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147926120 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 147926231 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 147926320 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 147926327 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 147926796 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 147926803 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 147928145 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147928531 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 147928563 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147928649 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147928653 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 147928786 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 147928955 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 147929124 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 147929355 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147929363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147929412 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147929414 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 147929626 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147929894 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 147930025 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147930126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147930160 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147930969 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 147931149 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 147931162 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 147931365 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 147931372 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 147931459 T C N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 147931481 A G N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 147931513 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 147931515 T C N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 147931679 C A N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 147931751 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 147931921 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147932509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147933428 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 147933586 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 147933677 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 147933833 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147933834 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147934354 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 147934481 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 147934523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147934651 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 147934667 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 147934990 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147935085 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147935144 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 147935486 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 147935761 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 147936099 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147936186 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147936232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147936341 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 147936347 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 147936514 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 147936996 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147937063 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147937221 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 147937288 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 147937321 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147937415 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 147937990 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 147938059 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 147938112 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 147938132 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 147938142 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147938175 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 147938206 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 147938257 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 147938275 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 147938319 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 147938431 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 147938549 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147938600 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 147938675 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 147938676 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 147938686 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 147938701 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 147938717 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 147938817 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 147938861 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 147938932 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147939160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147939583 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 147940102 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 147940332 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 147940420 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147940993 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 147941282 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147942058 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147942696 T C N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 3 147942745 G A N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 3 147942960 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147942968 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 147943033 C G Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 147943286 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147943325 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 147943673 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 147947009 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147947307 T C N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 147947491 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 147947492 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 147947519 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 147947526 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147947543 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 147947564 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 147947575 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 147947585 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 147947616 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 147947625 C G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 147947636 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 147947812 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 147947990 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 147948029 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 147948084 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147948222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147948244 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147948383 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147948545 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 147948556 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 147949106 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147949317 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 147949381 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 147949516 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 147949534 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147949598 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 147949607 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147949642 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 147950085 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 147951437 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147952480 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147953181 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 147953208 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147953413 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 147953474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147953987 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 147954139 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 147954140 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 147954223 C T N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 147954227 C T Y Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 3 147954252 C A N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 3 147954330 A T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 147954331 T C N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 3 147954356 G T N N 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 12 8 4 4 2 3 147954622 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 147954710 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 147954742 A C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 147954775 G A Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 147954859 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 147954883 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 147954995 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 147954998 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 147955023 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 147955074 T C Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 147955111 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 147955192 G C Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 147955241 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 147955264 A T Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 147955277 T A Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 147955309 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 147955328 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 147955371 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 147955643 C A Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 147955686 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 147955798 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147955863 G C Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 147955923 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147955964 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147955966 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 147956042 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 147956046 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147956389 A G Y Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 3 147956416 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147956500 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 147956506 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147956982 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147957321 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 147957422 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147957425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147957441 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 147957486 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 147957497 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 147958067 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 147958448 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 147958472 T G Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 147958565 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 147958584 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147958752 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147959030 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 147960692 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147964042 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147972764 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147973368 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147973929 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147974545 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147974672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147975856 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147976606 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 147977075 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 147977124 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147977145 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147977149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147977284 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147977341 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147977354 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 147978714 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147978737 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147978943 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 147979148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147979372 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 147979588 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 147979676 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 147979714 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 147979769 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 147979773 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 147979818 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 147979889 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 147979896 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 147980188 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 147980224 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 147980252 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 147980275 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 147980290 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147980342 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 147980457 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 147980661 G A N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.454545454545455 0.363636363636364 0.181818181818182 14 8 5 4 2 3 147980797 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 147980869 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 147984949 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 147985219 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 147988733 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 147989014 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 147989110 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147989114 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147989344 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147989366 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 147989943 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 147990146 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 147990566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147990781 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 147990799 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 147990816 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 147992750 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 147993357 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147993974 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147994048 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 147994662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147994991 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 147996835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147997511 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147997606 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147997623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147998381 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 147999202 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 147999650 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 147999660 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 148000461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148000464 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148000572 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 148001260 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148001539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148001602 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148001770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148002941 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148003064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148003075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148003109 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148003148 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 148003280 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 148003484 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148004211 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148004742 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 148004813 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148004996 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 148005065 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 148005135 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148005143 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148005173 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 148005249 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 148005250 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 148005874 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 148005985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148006755 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 148007007 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148007103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148007350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148007684 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 148007826 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 148008000 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148008160 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 148008820 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148008979 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 148009231 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 148009298 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 148009314 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 148009327 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 148009336 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 148009415 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 148009460 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 148009591 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 148009641 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 148009669 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 148009751 A C N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 148009795 A T N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 148009950 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 148009962 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 148010090 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 148010505 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 148010519 A G N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 148010572 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 148010703 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 148010718 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 148010732 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148010739 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 148010902 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 148010981 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 148011049 C A N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 148011060 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 148011072 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 148011396 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 148011541 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 148011619 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 148011640 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 148011705 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148011787 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148011881 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 148011974 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 148011987 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 148012217 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 148012528 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 148012711 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 148012800 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 148012914 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 148012995 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148013009 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 148013398 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 148014177 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 148014224 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 148014306 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 148014358 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148014401 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 148014426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148014762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148015102 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148015138 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 148015827 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 148015894 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 148015938 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 148016091 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148016122 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 148016209 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 148017160 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148017305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148018274 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 148018326 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 148019155 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148019434 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 148019444 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148019498 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148019593 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 148019866 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148019879 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148019972 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148020222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148020439 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 148020452 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 148020470 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 148020484 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 148020705 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148020861 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 148020896 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 148020921 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 148020988 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148021160 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 148021181 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 148021217 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 148021243 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 148021281 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 148021288 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 148021765 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 148021899 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 148022073 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 148022273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148022390 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148022397 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148022621 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 148022804 T G N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 3 148024533 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 148024659 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 148024882 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148024907 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 148025367 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148026854 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148026878 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148027378 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148028504 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148028869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148029572 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 148035442 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148036045 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148037484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148037553 T A N N 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 6 22 0 6 8 3 148038222 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148043517 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148043847 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148043885 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 148044214 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 148044422 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 10 18 4 2 8 3 148044469 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 148044473 A C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 148044508 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 148044668 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 148044691 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 148044726 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 148045258 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148045287 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 148045297 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 148045376 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 148045386 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148045437 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 148045450 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 148045892 A G N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 148045963 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 148046078 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 148046208 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 148046351 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148046446 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 148046448 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 148046511 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 148046519 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148046668 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 148046793 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148046808 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 148046824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148046848 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 148046865 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 148046894 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 148047041 C A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 148047070 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148047167 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 148047262 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 148047276 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 148047559 T A N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.714285714285714 0.285714285714286 10 18 0 10 4 3 148047776 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148047934 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148047956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148048443 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148048458 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 148048725 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148048778 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148048841 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 148048979 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 148049012 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 148049018 A C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 148049201 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 148049232 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148049310 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 148049407 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 148049507 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 148049823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148049883 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 148050048 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148050588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148050683 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 148050720 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148051072 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148051360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148051552 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148052101 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 148052481 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 148053075 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 148053701 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148053846 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 148053864 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 148054053 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148054121 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 148055077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148055369 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 148055440 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148055672 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148055683 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148055747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148055871 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148056733 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148057118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148057381 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148057511 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 148058407 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148059202 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 148062069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148066554 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148067551 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148067817 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148068552 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148068930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148069160 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148069723 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 148070809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148072212 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148072547 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148073309 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148073553 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148073941 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 148074365 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148074819 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148074943 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148075586 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148076069 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148076247 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 148077033 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148077100 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148078537 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 148078760 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 148079123 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148079977 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 148080085 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148080267 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 148081876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148082394 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148082438 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148083230 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148084223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148084247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148084288 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 148084366 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 148084382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148084396 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 148084782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148085011 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148085157 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148085202 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148085426 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148085458 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148085477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148085847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148086327 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148086356 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 148086424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148086560 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148086580 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148086940 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148087498 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148087545 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148087854 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 148088270 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148088357 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148088474 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148088493 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 148088828 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148088907 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 148088961 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148089591 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148089613 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148089826 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 148089868 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148089942 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 148089984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148089993 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148090011 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 148090018 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148090180 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 148090445 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 148090527 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148090539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148091211 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148091511 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 148093354 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148095738 T G Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 148096257 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 148097202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148100023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148100130 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 148100179 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 148102244 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 148102278 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 148102289 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148102330 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 148102333 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 148102352 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 148103284 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 148104110 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148104268 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148104292 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148104700 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148105602 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 148106417 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148106773 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148108124 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148108905 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148110454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148114121 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148115819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148116767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148118998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148119132 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 148119435 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 148119899 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 148121752 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148122629 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148122651 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148123266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148124275 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148124812 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148126318 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148127372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148128717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148129361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148129519 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 148129681 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148130298 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148130867 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148132852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148133094 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148134196 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148134786 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148135396 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148135596 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148136930 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148138898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148139781 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 148139906 T A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 148139939 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 148140001 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 148140008 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 148140017 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 148140424 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 148140442 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 148140470 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148143570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148145428 A T N N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.363636363636364 0.363636363636364 0.272727272727273 12 10 4 4 3 3 148145461 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 148147930 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 148148794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148150824 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148151456 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 148151810 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 148152218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148153209 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 10 22 0 10 6 3 148153691 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 148153792 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148153804 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 148154022 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 148154122 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148154126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148154301 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148154415 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 148155339 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148157626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148157717 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148158956 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 148159002 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148159152 C G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 148159333 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 148160075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148160772 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 148161270 A C Y N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 148161581 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148161621 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148161687 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148162147 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148162159 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 148162786 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148162796 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 148162930 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148162942 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 148163344 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 148163452 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148163469 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 148163473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148164129 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148164383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148165090 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148165411 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 148165573 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 148165680 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148165737 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 148165982 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 148165999 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148166158 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 148166192 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 148166331 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 148166367 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 148166415 G T Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 148166477 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 148166516 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 148166664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148166778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148166829 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 148166862 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 148166869 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148167381 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 148167541 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 148167549 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 148167652 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148168124 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148168139 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148168400 A T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 148168413 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 148168483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148168524 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 148168624 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 148169138 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 148169266 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148169450 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 148169535 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 148169546 A T N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.307692307692308 0.538461538461538 0.153846153846154 15 11 4 7 2 3 148169573 T A N N 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 3 148169584 T C N Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 11 9 3 5 2 3 148169777 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 8 4 3 2 1 3 148169809 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 148169907 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 148170163 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 148170209 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 148170229 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 148170230 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 148170345 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 148170449 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148170488 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 148170586 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 148170653 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 148170678 T A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 148170800 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 148170995 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 148171006 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 148171021 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 148171097 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 148171143 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 148171147 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 148171303 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 148171367 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 148171433 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 148171489 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148171496 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 148171597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148171984 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148172141 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 148172213 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 148172225 T G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 148172370 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 148172375 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 148172579 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148172848 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148172856 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 148172979 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 148172981 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 148173360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148173768 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 148173816 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 148173818 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 148173896 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 148173989 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148174076 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 148174110 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 148174209 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148174251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148174268 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148174493 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 148174618 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 148174716 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148174879 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 148174905 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 148175099 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148175227 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 148175731 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148176279 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148176299 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 148176504 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 148176515 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 148176535 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 148176606 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148176932 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148176958 C A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 148177604 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148177782 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 148177846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148178128 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 148178315 A C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 148178316 G C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 148178452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148178702 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148178759 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148178789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148179473 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 148179644 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 148179704 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 148179742 G T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 148179808 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 148179884 A T Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 148179900 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 148179986 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 148180007 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 148180172 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 148180202 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 148180203 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 148180269 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 148180312 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 148180431 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 148180443 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 148180543 G C Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 148180889 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 148181039 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 148181189 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148181433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148181539 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 148181596 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 148182070 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 148182367 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148182449 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148182664 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148182713 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 148182720 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148182751 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 148182799 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 148183352 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148184218 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148184517 C T N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 148184562 C A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 148184567 C G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 148184579 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 148184652 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 148184666 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 148184767 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 148184768 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148184782 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 148184810 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 148184965 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148185013 A C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 148185491 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148185543 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 148185608 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 148185804 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 148185833 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 148185862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148185877 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 148185966 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 148186004 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 148186022 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 148186028 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 148186035 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 148186084 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148186097 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148186145 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148186201 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 148186220 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 148186303 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148187320 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148187392 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148187674 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 148187946 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 148188170 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148188655 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148188665 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148188721 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148188832 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148188899 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148188995 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 148189258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148189748 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 148189861 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 148189888 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148189916 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 148189948 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 148189991 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 148190084 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 148190095 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 148190163 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 148190195 G T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 148190730 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 148190823 A G Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 148190853 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 148190864 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 148190922 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 148191280 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 148191524 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 148191705 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 148191734 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148191759 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 148191771 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 148191774 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 148191899 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 148192013 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 148192615 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 148192647 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 148192728 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 148192790 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 148192841 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148193310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148194642 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148194666 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 148194788 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 148194873 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148194956 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148195979 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 148197436 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148197587 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 148197868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148198197 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 148198403 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148198759 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148199872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148200329 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148200705 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148202086 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 148202516 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148202702 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148202741 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148202816 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148202845 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 148203132 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 148203468 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 148203727 A C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 3 148205619 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148205883 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148207376 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148209161 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 148209165 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 148210678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148211275 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 148211373 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 148211391 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 148211396 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 148211402 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 148211496 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 148211502 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 148211510 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 148211519 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 148211597 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 148211643 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 148211653 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 148211725 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 148211756 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 148211757 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 148211801 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 148212290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148214232 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148214303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148214664 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 148214714 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148215517 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148215537 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148216716 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 148216958 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148217440 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 148217458 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 148217478 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 148217522 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 148217570 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 148217627 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 148217642 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 148217697 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 148217703 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 148217809 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 148218214 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148218852 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 148219123 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 148219359 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 148219631 T C N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 8 12 3 2 5 3 148219661 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.222222222222222 0.111111111111111 0.666666666666667 5 13 2 1 6 3 148219683 A G N Y 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0.142857142857143 0 0.857142857142857 2 12 1 0 6 3 148220287 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 148220342 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 148220402 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148220407 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 148220466 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 148220688 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 148221377 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 148221413 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 148222109 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 148222299 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 148222803 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 148223039 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 148223617 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 148223619 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 148223807 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 148224007 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 148224044 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148224458 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148224466 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 148225306 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148225872 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148226015 G A Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 148226018 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 148226049 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 148226083 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148226128 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148226139 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 148226272 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148226315 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148226524 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 148226771 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 148226784 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 148226926 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 148226981 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 148227351 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148227398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148227531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148227571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148228330 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148232054 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148232312 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148232797 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148235307 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148236716 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148240537 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148240741 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 148242105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148242132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148242141 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148242153 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 148243429 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148243468 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148247368 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148249068 A T N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 148249084 G T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 148249784 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 11 7 3 5 1 3 148249844 C A Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 148250497 G C Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 148252981 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 148253785 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148256331 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 148256886 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 148257256 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148257489 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148258143 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148258260 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148258261 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148258933 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 148260012 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 148260014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148260034 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 148260061 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 148260124 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 148260143 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148260431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148260746 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148260832 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 148262160 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 148263767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148263801 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148263810 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148263902 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 148263992 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148264119 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148264182 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 148264210 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148264225 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 148264256 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148264262 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148264359 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148264872 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 148264947 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 148264948 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 148265164 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148265165 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148265258 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 148265284 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 148265361 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 148266422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148267534 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 148267691 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 148268033 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 148268087 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 148268473 A C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 148268502 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 148268702 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 148268778 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 148269283 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148269422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148269806 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 148270460 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148271085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148271436 C T Y Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0 1 0 7 7 0 7 0 3 148271574 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148271829 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148272200 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 148272306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148272663 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 148273675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148273941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148274053 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148274316 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 148274518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148274761 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 148275614 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148275631 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148275709 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 148276319 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 148276594 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 148276651 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 148276714 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 148276744 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 148276917 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 148277523 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 148277722 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 148277896 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148277954 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 148278106 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 148278757 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 148278768 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 148278810 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 148278895 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 148279076 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148279122 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 148279447 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 148279646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148279665 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148279668 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 148279679 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 148279971 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 148280385 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 148280418 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 148280442 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 148280640 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 148280647 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 148280702 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 148280876 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 148280909 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 148281018 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 148281031 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 148281046 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 148281541 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 148281587 C T N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 148281610 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 148282126 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148282261 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148282279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148282352 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148282551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148282552 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148282690 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148282741 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 148282833 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 148283165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148283169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148283176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148283262 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148283432 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 148283741 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148284176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148284640 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 148284697 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 148285237 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148285338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148285391 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 148285405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148285600 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148286312 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148286885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148286927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148287911 T G N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 14 18 0 14 2 3 148288240 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148289506 T G N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 3 148289546 A T N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.307692307692308 0.230769230769231 0.461538461538462 11 15 4 3 6 3 148291242 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 148291382 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 148291402 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148291504 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 148291806 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 148291995 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148292352 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148293955 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148294061 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148294740 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148295531 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148295902 T C N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.363636363636364 0.272727272727273 0.363636363636364 11 11 4 3 4 3 148296107 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 148296405 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 148297855 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148298586 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 148299183 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 148299594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148300032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148300670 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 148301221 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 148301224 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 148301447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148301520 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 148301616 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 148301658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148302197 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148302610 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148302689 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 148303114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148303553 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 148303927 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 148303957 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 148303968 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 148304048 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 148304078 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 148304082 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 148304366 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 148304775 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148304809 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 148305191 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 148305322 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148305374 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 148305472 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148305897 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148305978 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148306198 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 148306241 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 148306463 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 148306464 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 148306495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148306779 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148306981 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 148307105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148307155 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 148307568 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 148307987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148308029 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148308061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148308208 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 148308222 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148308345 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 148308408 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148308536 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 148308544 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148308993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148309777 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148309894 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148310030 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148310413 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148310440 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148310670 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148310719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148310853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148311001 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 148311649 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 148311748 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 148311853 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 148312838 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 148313013 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 148313372 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 148313454 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148313470 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 148313509 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 148313581 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148313651 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148313710 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 148313825 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148313828 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 148313874 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148313898 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 148313960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148314027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148314166 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 148314219 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148314310 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 148314335 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 148314360 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 148314656 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 148314703 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 148314705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148314750 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148314871 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 148314911 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 148314985 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148314991 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 148315014 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 148315099 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148315251 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 148315453 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 148315473 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 148315581 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 148315964 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 148316103 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 148316167 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 148316185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148316284 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 148316339 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 148316450 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 148316492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148316503 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 148316515 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 148316833 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148317306 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 148317323 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 148317559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148317829 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148318096 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148318443 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 148319096 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 148319614 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 148319777 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 148320030 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 148321212 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148321514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148321671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148321699 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 148321752 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148321869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148321871 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 148322089 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 148322243 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 148322593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148322672 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148322980 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 148323142 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 148323159 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148323218 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148323529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148325196 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 148325236 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 148325630 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 148325639 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148325787 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 148325800 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 148326323 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148326784 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148326960 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 148327088 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148327208 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 148327209 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 148327382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148327781 G A N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 148327785 G C N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 148327897 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 148327982 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 148328019 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 148328047 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 148328092 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 148328102 C A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 148328316 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 148328386 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 148328951 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 3 148329028 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 148329049 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 148329191 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148329245 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 148329373 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148329418 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148329568 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 148329621 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148329753 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 148329778 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 148329850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148329937 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 148331162 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 148333589 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148333646 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148333764 T A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 148333804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148333864 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 148333894 A T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 148333963 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 148334028 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 148334061 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 148334145 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148334170 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148334193 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 148334330 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 148334542 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 148334648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148334661 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 148334722 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 148334902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148335265 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 148335380 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 148335797 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 148335802 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 148335918 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 148336060 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 148336108 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 148336310 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148336599 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148336643 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148336839 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 148336865 T C Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 148336987 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148337014 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 148337084 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148337263 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 148338019 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 148338176 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 148338236 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 148338331 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 148338364 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148338480 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148338859 A C Y N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 3 148339029 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 148339249 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 148339375 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 148339700 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148339729 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148339989 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148340352 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 148340400 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148340417 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 148340428 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 148340448 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 148340496 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148340554 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 148340596 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148340617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148341405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148341488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148341533 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 148341732 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 148341733 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 148341841 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148342390 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 148344526 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 148344997 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148345035 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148345074 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 148345075 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 148345670 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148347029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148347250 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148347265 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148349467 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 148349508 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 148350464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148350774 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 148350837 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 148350887 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 148351264 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148351366 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148351384 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 148351412 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 148351632 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 148351660 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 148351664 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 148352026 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 148352221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148352442 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148352734 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148353153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148353219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148353288 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 148353788 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 148353910 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148353957 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 148354685 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 148356577 C T Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 148358813 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 148361547 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148364272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148366249 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148366528 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148373485 A C N N 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0 0.8 0.2 4 6 0 4 1 3 148379914 T A Y N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 3 148380094 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148380646 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 148380773 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148380901 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148381510 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 148381512 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148382050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148382969 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148383484 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148383637 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148383672 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148383729 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 148383971 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 148384120 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 148384545 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 148384693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148384998 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148385064 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 148385508 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 148385524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148386866 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 148387249 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 148387513 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 148387523 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 148387996 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 148388077 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148388078 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148388219 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 148388297 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148388563 A T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 148388652 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 148388667 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 148388769 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 148388774 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 148388792 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 148388812 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 148388844 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 148388849 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 148388875 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 148388881 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 148388893 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 148389094 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148389119 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148389157 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 148389184 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 148389243 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 148389256 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 148389272 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 148389767 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148390172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148390273 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 148390454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148390486 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148390517 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148390654 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 148390909 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 148390951 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 148391408 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 148393248 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 148393353 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148393397 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 148393618 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 148393809 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148394100 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148394279 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148394434 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148394610 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 148394665 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 148394988 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148395063 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 148395081 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148395128 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 148395142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148395237 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148395283 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148395301 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 148395329 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 148395357 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 148395359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148395377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148395602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148395669 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 148395769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148395830 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 148395959 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 148396135 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 148396547 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148396878 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148400183 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 148401637 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148404044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148404265 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 148404485 A G N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 3 148404909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148405035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148405050 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 148405139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148405224 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 148405273 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 148405460 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 148405647 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 148405666 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 148405689 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 148405699 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 148405724 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 148405738 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 148405813 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 148405931 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 148405958 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 148406218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148406377 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 148406652 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148406668 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148406723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148406754 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148406788 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 148406951 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 148407014 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 148407348 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 148407510 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 148408462 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 148408475 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 148408483 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 148408503 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 148408504 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 148408561 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 148408771 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148408798 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 148408927 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 148408964 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148409003 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 148409098 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 148409127 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 148409180 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 148409208 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 148409292 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 148409525 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 148410069 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148410218 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148410593 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148421873 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 148422427 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 148422705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148423126 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148423273 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 148423839 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 148424099 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 148425252 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148426130 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 148426267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148426412 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148426441 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148426565 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148426633 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148428109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148433401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148435812 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148437171 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148437172 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148438310 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148438861 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148439602 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148439928 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 148440212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148440364 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148440692 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148440835 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148441483 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148441532 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148442659 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148444148 T A Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 148444387 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148444501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148445352 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148445465 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 148445586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148446298 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 148446396 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148446693 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 148446764 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148446930 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 148447032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148447044 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 148447151 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 148447186 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148447456 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 148447571 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 148447837 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148448086 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148448458 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 148448958 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 148448968 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148449024 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 148449382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148449504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148449580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148449624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148449755 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148449838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148450610 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 148450782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148450826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148450839 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 148450895 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 148450915 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148450933 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148451133 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148451489 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148451543 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 148451626 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 148451661 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148451701 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 148452415 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 148452462 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148452620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148452662 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148452685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148452701 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148452763 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148452814 A C Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 148452875 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148452955 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 148452998 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148453020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148453174 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 148453213 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 148453372 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 148453471 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 148453556 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 148453842 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148454646 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148455892 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 148455922 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 148457170 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 148457630 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 148458507 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148458879 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148459050 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148459077 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148459085 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148459092 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148459161 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148459542 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148459823 A T N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 148459854 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 148459856 C A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 148459915 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 148459923 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 148459960 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 148460069 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 148460103 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 148460108 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 148460167 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 148460985 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 148462364 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148462478 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 148462773 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 148463031 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 148463693 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 148463865 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 148464488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148464623 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148465568 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148465876 C G Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 148465906 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148467226 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 148467332 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 148467389 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 148467483 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 148467687 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 148467955 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 148467956 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 148467991 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 148468092 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 148468097 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 148468198 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 148468212 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 148468355 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148468528 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 148468606 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 148468614 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 148468674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148468830 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148468847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148469355 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 148469396 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148469414 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148469541 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148469641 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148469932 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 148470027 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148470164 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 148470165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148470683 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148470702 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148470736 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 148471150 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 148471647 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148471665 A G Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 148471723 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 148471808 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148471923 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 148471951 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 148472147 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148472201 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 148472223 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 148472235 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 148472258 G C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 148472353 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148472364 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 148473038 A G Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 148473127 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 148473164 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148473268 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 148474419 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 148474586 G C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 148474956 G C Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 148475736 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148475927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148478007 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148478914 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 148479526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148480076 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148481470 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148482612 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148483633 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148483668 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148485734 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148488298 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148488489 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 148488634 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148488735 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148490415 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148490967 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148492538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148493336 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148494192 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148494220 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148494250 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 148494633 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148494723 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148494861 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148495714 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148495775 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 148496234 C G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 148496526 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148496667 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148496672 C A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 148496715 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 148496764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148497106 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148497784 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148497873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148497899 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148498708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148499084 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148499165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148499572 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 148499696 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148499713 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 148499908 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 148499972 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 148500005 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 148500020 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 148500052 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 148500269 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148502416 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 148502768 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 148502811 G T Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 148502820 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 148503008 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 148503226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148503478 T G Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 148503523 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 148503524 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 148503642 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 148503827 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 148504081 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 148504160 C T N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 3 148504198 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 148504212 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 148504412 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 148504506 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0 0.933333333333333 0.0666666666666667 14 16 0 14 1 3 148504561 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 148504634 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 148504782 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 148504987 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148505049 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148505078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148505122 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148505377 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 148505458 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148505550 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 148505757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148505766 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 148505847 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 148506228 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 148506328 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 148506337 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 148506700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148507020 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148507128 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 148508632 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 148510315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148510514 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148511099 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148513159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148516182 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148516598 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148517517 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148518362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148520678 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148523315 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148525441 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148529163 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 148529197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148529367 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148529561 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148529643 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 148529890 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 148530287 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 148530347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148534096 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148534522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148535240 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148537894 T C N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 148537913 C A N N 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 3 148540105 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 148540382 G T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 148540937 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 148541032 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 148541044 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 148541050 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 148541267 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 148541281 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148541285 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 148541782 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 148541888 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 148542387 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 148542530 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148542545 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 148542707 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148542731 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148542821 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148542870 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 148542943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148543035 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 148543045 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148543060 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 148543152 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148543172 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148543186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148543396 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 148543504 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148543536 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 148543573 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148543707 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 148543780 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148543782 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148544330 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 148544488 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 148544500 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 148544788 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148544863 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 148546054 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148546768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148547074 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148547303 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 148547523 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148547547 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 148548022 T G Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 148548772 C A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 148548826 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148549498 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148549531 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148549709 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148550959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148551201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148551250 T A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 148551581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148551582 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148551776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148551884 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 148551895 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148551944 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148552618 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148552619 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148552864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148553241 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 148553367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148553612 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 148553685 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148553742 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148553765 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 148553928 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 148553961 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 148554018 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148554471 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 148554485 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 148554794 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 148555212 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 148555281 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 148555337 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 148555350 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148555352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148555479 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 148555840 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148555859 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148555892 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 148556007 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 148556008 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 148556073 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 148556329 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148556813 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 148557039 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148557337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148559062 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 148559154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148559243 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148559294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148559583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148559649 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 148559773 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148559992 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 148563417 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148564184 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148567754 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148567991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148568093 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148568549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148571265 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 148571984 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 148572201 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148572978 C A N N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 148573006 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 148573143 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 14 4 6 2 1 3 148573153 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 148573175 C A N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 3 148573382 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 148573392 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 148573400 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 148573479 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 148573514 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 148573518 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 148573550 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 148573608 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 148573689 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 148573690 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 148573869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148573932 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148574413 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 148574439 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 148574440 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 148574803 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148574899 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148575395 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 148575630 G A Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 148576357 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 148576569 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 148577275 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148578358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148578375 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148579900 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 148580035 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148580057 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148580977 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148581184 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148581390 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 148581399 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 148581403 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 148582240 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148582242 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148582365 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 148582494 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148582534 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148582539 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148582563 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 148582738 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 148582817 T G N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 148582912 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 148583021 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 148583270 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 148583275 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 148583389 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 148584027 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 148584187 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 148584333 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148584380 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 148584382 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 148584739 T A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 148584771 G T Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 148584783 G A Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 148584813 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148584892 A G Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 148585195 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148585226 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148585641 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 148586073 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 148586076 C T N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 148586147 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 148586265 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148586368 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 148586395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148586514 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 148586524 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148586874 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148587119 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 148587324 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 148587430 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 148587547 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 148587743 A C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 148588760 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 148588780 C A N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 148589106 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148589304 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148589533 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148589916 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 148589953 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 148589971 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148590447 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 148590991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148592728 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148593009 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148593022 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148594749 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148595086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148595471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148595489 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 148596689 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148596963 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 148597322 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 148597624 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 148598083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148598942 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148600138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148600193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148601738 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 148602288 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148605104 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 148605152 G T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 148605176 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 148605198 C T Y Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 148605394 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 148605407 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 148605709 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148605952 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148606020 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148606572 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148606784 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148607688 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 148609095 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 148609787 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 148611404 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148614184 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148614568 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 148614741 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148615676 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148617037 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148617411 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148618248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148618424 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148620922 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148621156 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148621474 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148621484 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 148621590 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148621940 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148622279 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148622429 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148624030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148624679 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148625367 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148625438 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148625489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148625540 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148625564 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 148625685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148625759 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 148625862 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148625920 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148625933 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148625942 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148625968 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148626054 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148626109 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 148626112 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 148626231 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148626313 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148626371 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148626390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148626534 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148627049 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148627317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148628110 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 148628421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148628536 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148629846 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148631005 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 148631065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148631176 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148631177 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148631286 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148631377 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148632231 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148632557 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148632766 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148633017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148633547 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 148633695 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 148633866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148634408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148634482 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 148635338 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148635785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148635835 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 148636302 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 148637276 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148638900 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 148639257 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148639350 A T N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 3 148640034 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148640073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148640273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148640896 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148641063 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 148641384 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 148641394 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 148641444 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 148641912 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 148642056 C A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 148642077 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 148642107 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 148642171 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 148642184 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 148642417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148642477 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 148642508 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 148642555 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 148642560 A C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 148642569 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 148642845 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 148642922 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 148642957 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 148642962 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 148643002 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 148643294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148644347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148645235 A T Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 148646559 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148646674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148647467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148648378 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148648532 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 148649077 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148649819 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148650977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148651218 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148651273 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148653279 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 148656120 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148656139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148657440 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 148657529 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 148657544 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 148657763 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 148657920 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148658019 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 148658220 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 148658222 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148658321 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 148658486 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148658594 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148658747 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 148659095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148659416 T A N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 148659456 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 148659705 G A N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 148659870 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 148659908 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 148659929 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 148660022 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 148660611 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148660617 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148660748 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148661402 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148661449 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148661688 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 148661719 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 148661908 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 148662029 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148662055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148662154 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148662305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148663841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148665137 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 148665379 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148666221 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 148666234 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148666749 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148667259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148667331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148667630 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148667857 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 148667882 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 148668157 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148668894 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 148668948 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148668973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148669967 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148670316 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148670798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148671822 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148671824 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148671890 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148672200 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 148672523 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148672611 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148672829 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 148673092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148673152 G A N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 148673199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148673242 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148673272 G A N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 148673276 C A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 148673915 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148674049 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148674156 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 148674436 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 148674980 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148674982 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 148675110 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148675271 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 148675335 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 148675365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148675460 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 148675654 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 148675713 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148675893 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 148675931 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 148676457 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 148676671 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 148676677 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 148676829 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 148677020 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 148677038 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148677602 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148677608 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148678046 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 148678226 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 148678358 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 148679415 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 148679483 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 148679619 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148681115 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148681203 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 148681255 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148682723 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148683372 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 148683405 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 148683569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148683589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148683668 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 148683761 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 148683763 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148683792 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 148683864 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 148683870 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 148683942 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148683959 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 148684035 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148684062 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 148684367 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148684397 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 148685236 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148685261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148686099 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 148686641 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 148686980 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 148688460 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148689318 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 148689597 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 148690707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148690790 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148691085 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148691403 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148695985 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 148696442 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 148696717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148696883 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148697081 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148697112 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148697602 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148697668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148697785 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 148697853 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 148698145 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148698179 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 148698280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148698291 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148698330 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148698911 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 148699349 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148699382 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148699475 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148699563 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 148699565 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 148700536 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 148700689 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148701020 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 148701615 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148701856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148702256 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 148702269 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148702465 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 148702615 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 148702771 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 148702789 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 148702850 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 148702921 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 148703008 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148703309 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 148703647 C T N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 148703687 T G N N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 148703696 C T N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 148703804 T A N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 148703809 T C N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 148703838 C G N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 148703864 A G N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 148703873 G T N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 148703889 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 148703902 A C N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 148704674 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148704786 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148705736 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148706030 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 148707206 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 148707226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148707657 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 148707710 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 148708163 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148709093 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148709107 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148709625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148710348 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 148711080 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148711684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148712011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148712072 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 148712123 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 148712171 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 148712260 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148712704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148712709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148712733 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 148713364 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 148714149 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 148714286 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 148714310 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 148714336 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 148714497 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 148714577 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148714676 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148714791 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 148714952 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 148715055 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 148715067 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148715089 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 148715111 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 148715946 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148716003 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148716143 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148716215 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148716303 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148716312 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148716400 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148716402 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148716610 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 148716644 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148716700 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148717266 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148717493 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148717541 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148717603 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148717608 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148718040 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148719060 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148719116 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148719343 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148719474 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 148719546 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148719826 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148721329 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 148723161 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 148723592 C G Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 148723784 T C Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 148725701 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148726749 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 148728719 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 148728762 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148729988 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148730085 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 148730097 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 148730126 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148731349 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 148731469 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 148731634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148731761 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 148731777 C A Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 148731789 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 148731984 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 148732009 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 148732169 C A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 148732794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148732821 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 148733009 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148733286 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148733518 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148733535 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148733640 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148733765 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 148733811 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 148734112 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 148737586 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 148737661 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 148738032 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148738799 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148739497 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 148739890 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148739905 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148739973 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148740072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148740686 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 148741001 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 148741011 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148741325 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 148741564 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148742231 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148742799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148742823 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148743187 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148743222 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148743243 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148743246 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 148743406 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 148743413 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148743422 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148743464 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148743586 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 148743728 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148744008 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 148744018 C A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 148744024 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 148744062 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 148744186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148744201 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 148744386 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148744388 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148744452 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148744471 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 148744627 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148744717 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 148744741 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148744762 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 148744834 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 148744959 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 148745288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148745381 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148745394 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148745593 G A N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 3 148745623 G A N Y 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.142857142857143 0.214285714285714 0.642857142857143 7 21 2 3 9 3 148745660 A G N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 3 148746308 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148746309 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 148747396 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 148747487 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 148747655 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148747787 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 148748024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148748250 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 148748281 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 148748528 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148748574 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 148748620 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 148748713 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 148749273 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 148749647 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 148749858 C G Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 148750097 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 148750383 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 148750386 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148750429 T A Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 148750447 A G Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 148750449 G T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 148750657 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 148750726 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 148750767 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 148750781 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 148750892 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 148751135 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148751437 A T N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 3 148752991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148753040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148754066 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 148754095 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 148755090 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148755200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148755289 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148756231 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148756299 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148756667 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148758827 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 148759151 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148761788 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 148761982 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 148761990 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 148762046 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 148762240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148762389 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 148762466 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148762497 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 148762552 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 148762562 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148762643 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 148763203 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148763259 G A Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 148763536 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 148763698 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148763710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148763786 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148763805 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 148764089 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 148764196 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 148764446 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 148764621 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 148764743 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 148765459 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 148765671 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 148766160 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 148766254 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148766261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148766356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148766897 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148766959 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148767003 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 148767020 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 148767040 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148767154 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148767427 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148767605 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 148767616 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 148767644 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148767656 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148767671 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148767698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148767710 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 148767755 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148767771 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148767904 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 148767925 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 148767936 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 148767953 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 148768133 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 148768212 A G Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 148768313 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 148768589 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 148768611 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 148768646 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 148768728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148768792 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 148768872 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 148768878 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 148768949 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 148768982 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 148769076 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 148769096 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 148769691 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148769766 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 148769821 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 148769919 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148769921 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148769961 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148770016 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 148770046 A C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 148770077 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148770092 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 148770098 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 148770125 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 148770246 C G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 148770291 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148770314 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 148770413 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 148770632 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 148770635 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 148770702 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 148770774 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 148770849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148771535 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 148771594 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 148771615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148771873 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 148772304 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 148772558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148772908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148773105 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148773330 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148773659 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148773984 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 148774005 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 148774130 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148774150 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148774303 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148775632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148775750 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 148775787 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148775789 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148775956 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148776017 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 148776026 T C Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 148776338 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 148776491 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148777094 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148777118 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148777124 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148777532 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148777564 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148778035 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148778050 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148778088 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148778349 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148778376 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148778527 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148778659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148778696 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 148779145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148779528 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 148779727 G C Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 148779962 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 148780163 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 148780433 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 148780544 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 148780738 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148780745 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148780809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148780924 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148781035 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 148781117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148781255 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148781306 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148781465 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148781512 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148781533 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148781623 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148781656 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148781661 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 148782362 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148782507 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 148782604 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 148783207 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 148783250 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148783347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148783365 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148783386 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148783596 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148783674 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148783693 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148783850 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 148783965 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 148784017 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 148784142 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 148784156 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148784310 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 148784505 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 148784520 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148784545 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 148784614 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 148784743 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 148784768 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 148784780 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 148784793 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148784796 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 148784827 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 148785026 T C Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 148785100 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 148785256 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 148785516 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 148785680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148786096 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 148786117 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148786751 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 148788760 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148788913 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 148788977 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 148789339 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 148789402 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148789418 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 148789493 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 148789599 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 148789651 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 148789705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148789770 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 148789786 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 148789791 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 148789891 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 148790092 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148790110 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148790114 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 148790174 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148790181 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148790358 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148790405 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 148790519 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 148790638 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 148791221 T G N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 148793156 A G N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 148793588 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148793785 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148795062 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 148800794 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148801467 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 148803111 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148803272 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 148804114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148804135 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 148804273 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148804293 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148804311 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148804352 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148804499 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 148804541 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148804750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148805175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148805206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148805236 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148805239 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148805256 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148805478 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148805482 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148805946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148805963 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 148806176 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 148806372 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 148806876 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148806999 G T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 148807601 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148807874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148808054 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 148808606 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 148809151 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 148809196 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 148809200 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 148809703 G T N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 148810039 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 148810076 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148810182 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148810413 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 3 148810447 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 148811386 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 148811549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148811721 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148811722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148812182 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148812199 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 148812296 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148812297 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148812339 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148812373 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148812625 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148812692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148812815 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148812837 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148813161 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 148813257 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148813317 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148813357 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148813571 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148813574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148813974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148814138 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148814151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148814225 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148814265 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 148814297 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148814506 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148814513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148814531 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148814537 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 148815177 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 148815791 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 148816140 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148816169 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 148816438 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148816454 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148816473 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148816477 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 148816500 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 148816691 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 148816745 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148816766 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 148817050 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 148817128 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 148817169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148817214 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 148817269 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 148817273 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148817328 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148817368 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148817409 T A Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 148817481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148817551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148817693 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 148817820 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 148817997 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 148817998 G A Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 148818076 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 148818083 A G N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 148818279 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 148818445 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 148818489 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148818504 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 148818541 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148818568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148818734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148818757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148818774 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148818834 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148818904 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 148818938 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 148819008 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 148819054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148819118 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148819260 G C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 148819380 G C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 148819400 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 148819456 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 148819469 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 148819574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148819609 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 148819660 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148819707 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 148819750 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148819804 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 148819811 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 148819964 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 148820051 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148820053 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148820063 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148820073 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148820083 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148820470 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148820517 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 148820711 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 148820755 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 148820834 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 148821336 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 148821337 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 148821404 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 148821495 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148821580 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148821812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148821873 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 148821906 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148822485 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148822577 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 148822729 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148823191 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 148823373 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 148823374 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 148823393 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 148823494 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148823522 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 148823648 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 148824032 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148824048 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 148824090 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 148824132 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 148824203 A T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 148824278 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 148824279 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 148824620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148824705 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148824749 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 148824936 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 148825119 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 148825149 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 148825173 T A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 148825179 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 148825271 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 148825578 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 148825607 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 148826027 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 148826324 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 148826346 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 148826465 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 148826519 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 148826526 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 148826591 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 148826620 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148826632 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 148827026 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148827243 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 148827342 A G N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 148827393 C T N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 3 148827499 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 148827583 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 148827687 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 148828404 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148828664 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 148828685 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148828693 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148828739 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 148828852 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 148828866 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 148829273 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 148829545 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 148829663 T G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 148829713 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 148829729 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 148829742 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 148829787 A C Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 148829804 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148829828 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 148829937 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 148829998 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 148830022 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148830644 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148830819 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 148830995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148831057 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148831136 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148831155 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148831178 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 148831366 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148831856 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 148831912 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 148831999 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148832023 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 148832024 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 148832056 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148832078 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148832098 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 148832105 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148832162 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 148832209 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 148832222 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 148832491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148832539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148832694 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148832800 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 148832937 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 148833039 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 148833605 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 148833823 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148833896 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 148833977 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 148833984 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 148834327 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 148834337 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 148834355 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 148834396 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148834424 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 148834440 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 148834458 A C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 148834475 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 148834624 G T Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 148834736 T C Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 3 148834857 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 148834928 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148836469 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148836542 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148836659 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 148837283 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148837284 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 148837352 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 148837523 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 148837697 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 148837867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148837935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148838010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148838585 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 148838587 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148838630 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 148838667 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 148838729 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 148838750 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 148839361 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148839367 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148839659 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148839709 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148839803 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148840152 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148840440 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148840502 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148840561 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148840687 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148840958 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 148841275 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 148841406 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 148841418 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 148841425 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 148841515 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 148841777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148841789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148841796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148841998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148842113 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 148842218 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 148842262 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 148843617 T A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 148843698 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 148845308 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 148846097 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148846707 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 148847279 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148847557 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148847988 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 148848031 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148848182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148848278 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148848606 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 148849212 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148849458 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148851354 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148851416 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148852676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148852997 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 148853035 G C Y N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 3 148853044 G A Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 3 148853218 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148853430 G A Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 148853917 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 148854979 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 148855955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148856828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148857782 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148857794 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148858923 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 148859126 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148859442 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 148859592 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 148860071 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 148860135 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 148860144 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 148860244 G A N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 3 148860250 G A N Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 3 148860310 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 148860391 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 148861675 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148861848 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 148862692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148863609 G A N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.416666666666667 0.166666666666667 0.416666666666667 12 12 5 2 5 3 148864255 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148864261 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148864653 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148864656 G T Y N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 3 148864983 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148865016 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148865029 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148865038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148865414 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148865504 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148865536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148865578 G C Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 148866878 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148867725 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148867809 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148867839 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148868112 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148868942 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 148868971 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148870750 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148870780 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148871704 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148872207 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148872825 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148872949 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148875806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148875884 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148876494 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148876775 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148876961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148877367 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148877878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148877965 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148879664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148879963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148880062 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 148881552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148882478 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148884346 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 148884356 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 148884455 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 148884486 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 148884632 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 148884750 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 148884766 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 148884815 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 148884816 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 148884995 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148885022 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148885068 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 148885169 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 148885178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148885738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148885902 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 148886190 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148886324 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148886359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148886493 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 148886504 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148886661 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148887179 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148887327 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148887544 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148887599 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148888002 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 148888124 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 148888358 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 148888395 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148888453 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 148888604 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 148888614 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148888636 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 148888646 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148888647 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148888663 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 148888989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148889239 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 148889255 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 148889278 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148889717 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 148889796 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 148890243 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148890428 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 148890511 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148890636 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148890794 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 148891015 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148891116 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148891215 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148891216 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148891336 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 148891375 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 148891422 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 148891995 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148892104 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148892270 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 148892388 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 148892452 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148892458 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148892640 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148892658 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148892702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148892839 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148892955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148893868 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148894841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148895545 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148895670 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 148897267 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148897367 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148900731 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 148900791 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148900865 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148900874 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 148901466 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148901592 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148901818 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148902595 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148902689 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148904113 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148904295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148904625 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 148904677 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 148904692 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 148904975 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 148905451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148905744 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 148907909 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148907996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148908523 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148908687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148908967 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148909363 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 148911142 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148911467 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148911831 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148912036 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 148912039 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148912052 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148912233 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 148912442 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 148912527 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 148912663 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 148912669 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 148912703 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 148912720 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 148912835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148912864 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 148912943 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 148912988 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 148913112 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 148913119 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 148913148 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 148913168 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 148914978 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 148915071 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148915321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148915941 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148916124 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 148916344 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 148917604 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148917677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148917881 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148917972 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 148918360 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 148918386 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 148918441 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148918581 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148918983 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 148919278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148921411 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 148921607 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 148922641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148922950 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148923051 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148923352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148925066 C G Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 148925073 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148925501 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 148925974 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148926194 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 148926197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148926315 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 148926322 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 148926351 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 148926365 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 148926510 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 148926588 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 148926633 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 148926663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148926704 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 148926865 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 148926940 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 148926999 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 148927024 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 148927028 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 148927307 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 148927814 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 148928177 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 148928217 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 148928237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148928578 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148928603 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 148928700 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 148929106 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148929274 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148929360 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148929853 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148930034 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 148931759 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148932478 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 148932490 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 148932538 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 148932571 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 148932593 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 148932858 C A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 148933259 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 148933376 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148933554 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148933627 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 148933761 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 148933776 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 148933803 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 148933810 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 148933999 T C Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 148934011 G A Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 148934015 G A Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 148934113 A C Y N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 148934213 A C Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 148934287 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 148934348 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148934875 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 148935080 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 148935132 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 148935133 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 148935145 C A Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 148935340 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148935725 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 148935774 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 148936045 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 148936188 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 148936253 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 148936292 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 148936293 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 148936333 T A N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 16 12 6 4 4 3 148936489 G A N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 3 148936727 T C N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 3 148936815 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 148936848 A C N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 148938445 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 148938593 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 148938599 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 148940969 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148940976 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 148940999 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 148941004 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 148941021 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 148941681 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148941721 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 148941741 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 148941876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148941928 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 148941951 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 148941995 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 148942007 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 148942079 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 148942146 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148942169 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 148942825 G T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 148942889 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 148943061 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 148943337 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148943388 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 148943485 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 148943499 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 148943749 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 148943904 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148943932 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 148943942 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 148944164 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 148944457 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 148944644 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 148944702 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 148945261 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 148945340 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 148945370 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 148945371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148945619 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 148945849 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148945890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148945943 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 148946050 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 148946124 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 148946127 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 148946388 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 148946395 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 148946625 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 148947003 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148947097 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 148947333 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 148947525 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 148948362 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 148948387 A C Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 148948507 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 148948837 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 148949528 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 148949710 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 3 148949776 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 148950092 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 148950104 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 148950175 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 148950194 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 148950563 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 148950625 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 148950723 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 148950735 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 148950971 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 148950972 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 148951034 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 148951050 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.375 0.1875 0.4375 15 17 6 3 7 3 148951090 T C N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.4 0.133333333333333 0.466666666666667 14 16 6 2 7 3 148951091 G A Y Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.4 0.133333333333333 0.466666666666667 14 16 6 2 7 3 148951127 A G N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 3 148951182 C T Y Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.375 0.1875 0.4375 15 17 6 3 7 3 148951212 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 148951213 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 3 148951331 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 148951462 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 148951474 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 148951493 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148951554 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 148951598 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 148951636 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 148951809 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 148951812 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 148951910 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 148952396 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148952398 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 148952440 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148952455 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 148952637 A T Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 148952654 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 148952856 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 148952974 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 148953120 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 148953398 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 148953970 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148954091 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 148955061 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 148955338 T C N Y 0.318181818181818 ALT 0.45 0.45 0.681818181818182 0.318181818181818 0.636363636363636 0.0909090909090909 0.272727272727273 15 7 7 1 3 3 148955494 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 148955526 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 148955528 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 148955720 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 148956048 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148956172 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 148956200 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 148956349 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 148956631 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 148957453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148957487 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 148957488 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 148959288 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 148959559 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148959681 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 148959737 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 148960201 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 148960311 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 148960858 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 148960860 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 148960944 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 148960962 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 148961067 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 148961151 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 148961404 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 148961572 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 148961591 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 148961601 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 148961616 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 148961688 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148961714 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 148961754 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 148961775 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 148961810 G T N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 148961870 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 148961892 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 148961898 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 148961909 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 148961995 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 148962021 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 148962426 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 148963236 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 148963320 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 148963565 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 148964469 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 148964517 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 148964588 T C Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 148965358 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 148965479 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 148965593 G T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 148965623 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 148965741 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 148965888 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 148965898 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 148965990 C T Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 148966068 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 148966104 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 148966207 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 148966320 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 148966377 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 148966518 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 148966526 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 148966594 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 148966696 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 148966777 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 148966798 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 148966806 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 148966812 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 148967257 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 148967507 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 148967593 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 148967777 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 148967829 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 148967900 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 148968001 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 148968099 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 148968152 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 148968302 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 148968399 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 148968909 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 148969104 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 148969239 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 148969344 C T Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 148969522 T C N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 148969632 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 148969642 A T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 148969945 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 148969987 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 148970075 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 148970671 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 148970851 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 148970940 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 148970977 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 148970981 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 148971319 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 148971402 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 148971533 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148971788 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 148971864 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 148971900 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 148971955 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 148972014 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148972365 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 148972424 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 148972491 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 148972853 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 148972967 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 148973243 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 148973597 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148973632 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 148973648 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 148973699 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 148973728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148973742 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 148973787 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 148973829 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 148974478 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 148974526 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148974550 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 148974634 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 148974798 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 148974968 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148976205 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148976685 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 148976877 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 148977576 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 148978234 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 148978428 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 148979554 G A Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 148979661 A T Y N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 148979697 T C Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 148979720 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148979744 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148979749 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 148979843 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 148980037 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 148980082 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 148980120 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 148980256 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 148980308 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 148980392 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 148980606 C G N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 148980672 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148980758 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148980873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148980923 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148981215 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 148981281 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 148981361 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148981398 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 148981458 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 148981465 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 148981492 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 148981519 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 148981562 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 148981650 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148981775 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148982128 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 148982174 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.35 0.15 0.5 17 23 7 3 10 3 148982330 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148982422 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 148982487 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148982593 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148982943 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 148983242 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 148983499 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 148983683 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 148983727 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 148983760 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 148983762 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148983805 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 148983808 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 148983837 A T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 148983889 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.5 0.15 0.35 23 17 10 3 7 3 148984007 T A N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 148984294 C A N N 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.363636363636364 0.272727272727273 0.363636363636364 11 11 4 3 4 3 148984324 A T N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 148984476 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 148984766 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 148984838 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 148985235 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 148985771 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 148985780 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 148985855 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 148985927 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 148986776 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148989224 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 148989608 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 148989833 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 148990329 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.7 0.7 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 7 5 1 5 0 3 148991049 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 148991120 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 148991311 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 148991411 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 148991533 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 148991593 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 148991601 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 148991651 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148991889 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 148991991 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148992025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148992074 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 148992159 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 148993653 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 148993690 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 148993724 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 148993910 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 148993951 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 148994038 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 148994271 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 148994330 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 148994888 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 148995046 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 148995253 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148995283 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148995865 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148996039 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 148996074 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 148996194 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 148996311 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148996672 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 148996788 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 148996799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148996852 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 148997357 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 148997368 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 148997394 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 148997395 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 148997471 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 148997480 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 148997621 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 148997632 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 148998806 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 148999151 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 148999258 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 148999268 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 148999346 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 148999351 A C Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 148999368 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148999654 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 148999725 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 148999786 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 148999862 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 148999887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 148999999 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 149001799 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 149001938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149002665 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149003065 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 149003592 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149003836 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 149004216 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 149005139 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 149005156 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149005271 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149005299 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 149005536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149005595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149005924 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 149006277 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149006539 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 149006712 G A N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 149006915 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 149007039 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 149007267 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149007336 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149007420 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 149007554 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 149007561 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 149007632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149007836 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 149007952 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 149008315 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149008338 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149009895 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 149010034 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 149010089 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149010097 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149010216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149010590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149010624 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149011030 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 149011103 T C Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 149011388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149012124 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149013350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149013833 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149015711 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149016073 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149016107 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 149016151 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149016312 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 149016390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149016573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149016788 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149016793 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149016812 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 149016823 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149016937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149016954 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 149017129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149017258 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149017296 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 149017301 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 149017513 A G N Y 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.5 0.125 0.375 9 7 4 1 3 3 149017652 A C N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 149017841 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 149018165 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 149018736 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149019248 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 149019676 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 149019871 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149020198 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149021960 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 149022199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149022520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149023262 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 149024162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149024329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149024617 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 149025083 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 149025387 G C Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 149025947 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 149026026 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 3 149026337 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 149026405 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 149026438 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 149026455 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 149026544 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149026657 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149026803 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149026953 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149026986 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 149027060 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149027305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149027525 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149027633 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 149027898 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 149028490 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 149029217 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 149029347 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 149029350 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 149029657 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 149029674 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 149029700 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 149029710 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 149029747 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 149029763 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 149030118 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149030278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149030487 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149030705 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149031409 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149031726 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.235294117647059 0.588235294117647 0.176470588235294 18 16 4 10 3 3 149032246 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 149032257 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 149032338 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 149032658 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 149032758 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 149032779 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 149032780 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 149032801 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 149033172 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 149033219 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149033236 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 149033370 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 149033378 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 149033454 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149033552 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 149033728 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149033964 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 149034023 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 149034776 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 149034945 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149035055 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 149035091 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 149035153 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 149035269 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 149035425 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 149035531 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 149035574 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 149035764 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 149035820 A T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 149035906 A C Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 149035987 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 149036028 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 149036286 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149036703 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 149037223 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 149037267 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 149037529 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 149037594 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 149038247 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 149038360 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 149038474 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 149038608 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149043047 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 149043066 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 149043228 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 149044230 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149044935 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 149046303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149048289 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149048663 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149048715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149048724 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149048733 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149048930 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149048975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149050051 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149050826 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149051273 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149051343 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149051821 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 149052853 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149053843 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149054327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149054640 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 149054652 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 149055184 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149055338 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149055385 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 149055536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149055892 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149055909 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149055996 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149056052 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149056103 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149056105 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 149056127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149056314 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149056366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149056420 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149056590 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 149056614 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 149056957 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 149057490 C T N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 149058023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149058142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149058286 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 149058491 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 149058543 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 149058603 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 149058646 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 149058653 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 149058663 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 149058684 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149058777 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 149058800 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 149058810 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 149058853 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 149058868 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 149058933 C G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 149059002 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149059224 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 149059244 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 149059277 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 149059598 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 149059666 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 149059712 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 149060024 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 149060031 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 149060091 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 149060165 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 149060189 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 149060256 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149060302 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149060303 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 149060324 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 149060428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149060438 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 149060485 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 149060562 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 149060604 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 149060626 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 149060798 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149061771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149061982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149062050 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149062665 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 149063109 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149063422 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 149063549 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149063630 T A Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 149063810 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 149063911 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 149064319 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 149064350 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 149064383 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 149064848 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 149064993 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 149064997 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 149065163 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149065727 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149065794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149066935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149067320 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149067548 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 149067720 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 149068009 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 149068030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149068261 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149068688 G T N N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 149068856 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149068878 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 149069114 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 149069118 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 149069139 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149069159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149069185 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149069510 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 149069511 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 149069549 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149069759 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 149069983 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 149070025 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 149070165 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 149070175 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 149070210 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 149070349 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 149070505 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149070583 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 149071298 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 149071394 T C Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 149071395 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 149071436 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 149071503 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 149071583 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149071590 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149071815 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149071983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149072051 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149072129 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149072337 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 149072690 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 149072747 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 149072808 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 149072863 T G Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 149073012 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 149073105 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 149073109 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 149073138 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 149073154 A C N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 3 149073167 C A Y N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 149073192 A T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 149073238 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 149073350 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149073413 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 149073525 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 149073614 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 149073715 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 149073777 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 149074046 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 149074140 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 149074142 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 149074203 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149074239 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 149074313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149076312 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 149076625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149076692 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 149076952 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149077124 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 149077153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149077208 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 149077892 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 149077893 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149078058 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 149078326 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 149078580 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 149078612 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 149078631 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 149078725 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 149078756 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 149078843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149079125 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149079180 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 149079422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149079467 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149079517 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149079568 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 149079570 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 149079665 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149079715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149079774 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149079910 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 149080016 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 149080017 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 149080041 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 149080142 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149080179 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149080204 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149080305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149080527 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 149080528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149080652 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149080664 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149080685 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 149080692 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149080760 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149081112 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149081144 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 149081178 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149081212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149081498 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 149081528 C G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 149081659 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 149081773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149084192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149085223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149086668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149087938 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149089197 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149091524 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 149091539 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 149092060 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 149092061 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 149092085 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 149092379 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149093327 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149093362 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149093874 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149094598 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149094838 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149095115 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149095555 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149095597 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149095869 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149096677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149096864 T A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 149096895 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 149097004 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149097063 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149097127 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 149097150 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149097228 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 149097348 A G Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 149097382 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149097653 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149098159 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149098342 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 149098500 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 149098697 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149098944 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 149099496 C A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 149099641 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 149099643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149099835 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 149099916 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 149100012 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 149100017 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 149100441 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 149100765 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 20 10 5 10 0 3 149101563 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149102213 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 149102273 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 149102284 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 149102287 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 149102388 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 149102465 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149102530 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149102540 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 149102557 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 149102778 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 149102929 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 149103073 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149103174 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 149103245 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 149103426 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 149103437 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 149104179 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 149104443 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149104459 C A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 149104627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149104646 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 149104848 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149104907 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 149104947 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149105119 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149105235 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 149105302 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 149105508 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149105913 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149106519 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 149106734 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149106819 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149107208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149107267 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149107308 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 149107430 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149107524 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 149108329 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149108400 A G Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 149108402 C G Y N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 149108695 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149109073 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149109140 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 149109761 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 149109922 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149109984 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 149110025 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 149110118 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149110284 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 149110645 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149110709 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 149111283 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149111471 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 149111689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149111948 T A N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 3 149112461 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149112484 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 149112523 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 149112528 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 149112576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149112727 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 149112737 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149112890 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 149112921 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 149113166 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 149113733 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 149113967 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 149114032 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149114138 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 149114382 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 149114443 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 149114485 G C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 149114533 A C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 149114561 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149114576 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149114642 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 149114679 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149114686 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 149114714 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 149114905 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 149115295 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 149115359 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 149115566 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 149115597 C A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 149115680 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 149115812 C G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 149115818 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 149117131 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149117366 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 149117472 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 149118041 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 149118065 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 149118272 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 149118903 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 149119088 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 149119109 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 149120077 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 149120208 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 149121498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149121826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149123072 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 149123469 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149125617 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149125710 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 149125986 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 149127062 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 149127398 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 149128543 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149129037 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 149129394 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149130000 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149132028 G C Y N 0.4375 ALT 0.6 0.6 0.5625 0.4375 0.5 0.125 0.375 9 7 4 1 3 3 149132105 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 149132174 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 149133772 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149134181 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149134331 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149135750 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149135831 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149136524 G T Y N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.615384615384615 0.384615384615385 0 21 5 8 5 0 3 149137172 G A N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.785714285714286 0.142857142857143 0.0714285714285714 24 4 11 2 1 3 149137999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149140045 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149142453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149143491 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 149143696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149143850 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 149144162 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 149145277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149145988 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 149146015 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 149146028 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 149146039 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 149146056 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.0555555555555556 0.833333333333333 0.111111111111111 17 19 1 15 2 3 149146067 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 149146149 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 149146224 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 149146284 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 149146569 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 149146735 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 149146899 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 149146913 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 149147025 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 149147036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149147083 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 149147095 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 149147130 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 149147330 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 149147402 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 149147406 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 149147578 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 149147590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149147766 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 149147955 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 149148000 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 149148090 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149148403 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 149148506 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 149148519 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 149148525 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 149148546 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149148560 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 149148640 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 149148701 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 149148806 G T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 149148858 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 149149019 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 149149074 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 149149135 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 149149202 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 149149682 T C N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 3 149149939 C G Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 149150197 T G Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 149150372 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 149150671 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 149150672 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 149150830 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 149150839 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 149151157 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 149151778 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149152685 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149153261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149153263 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 149153302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149153372 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 149153395 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 149153406 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 149153468 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 149153561 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149153637 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 149153644 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 149153658 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 149153674 G C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 149153732 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149153758 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 149153867 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149153875 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149154019 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 149154303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149154647 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149155114 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149155185 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0 0.85 0.15 17 23 0 17 3 3 149155798 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149155819 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149155949 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149155971 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149156026 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149156060 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149156277 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149156431 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 149156752 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 149156782 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 149156833 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 149156848 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 149156897 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 149157233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149157318 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149157542 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.15 0.8 0.05 22 18 3 16 1 3 149157543 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.263157894736842 0.736842105263158 0 24 14 5 14 0 3 149157792 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 149157813 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 149157976 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 149157991 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 149158007 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 149158088 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 149158492 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 149159146 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 149159584 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149159720 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149159745 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149160295 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149160297 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 149160340 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149160636 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 149160691 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 149160803 G A Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.8125 0.0625 0.125 27 5 13 1 2 3 149160948 G T N N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.181818181818182 0.272727272727273 0.545454545454545 7 15 2 3 6 3 149160958 G C N N 0.318181818181818 REF 0.45 0.45 0.318181818181818 0.681818181818182 0.0909090909090909 0.454545454545455 0.454545454545455 7 15 1 5 5 3 149161566 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 149161594 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 149161603 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 149162243 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.25 0.166666666666667 0.583333333333333 8 16 3 2 7 3 149162555 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 149162733 G C Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 149163243 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 149163282 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 149163343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149163469 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 149163537 A T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 149163645 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149164346 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149164706 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149164897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149165078 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 149165613 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 149165648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149165718 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 149165786 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 149165801 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 149165845 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 149165854 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 149165888 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149165902 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 149165956 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 149166078 A C Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 149166098 A C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 149166105 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 149166418 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 149166439 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 149166526 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 149166679 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 149167073 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149167336 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 149167364 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 149167388 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149167460 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 149167463 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 149167498 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 149167549 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 149167555 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 149167571 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 149167574 C G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 149169602 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149172414 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149172629 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149172860 T C N Y 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.25 0.416666666666667 0.333333333333333 11 13 3 5 4 3 149173061 C A Y N 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 11 9 4 3 3 3 149173433 C T Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 149173622 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 149173940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149173948 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149174066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149174186 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 149174375 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149174403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149174440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149175449 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 149176033 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 149176350 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 149177245 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149177958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149178318 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149178830 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149179224 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 149179737 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149180426 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 149180427 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 149180444 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149180449 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 149180457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149181549 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149181570 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149181609 A T N N 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.307692307692308 0.538461538461538 0.153846153846154 15 11 4 7 2 3 149181786 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 149182115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149182624 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 149182816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149183019 G C Y N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 3 149183101 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149183657 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149183879 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 149184243 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149184292 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 149184494 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149184520 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 149184567 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149184886 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149185027 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149185056 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 149185137 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 149185354 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149185403 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149185409 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 149185446 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 149185537 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149185646 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 149185773 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 149185838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149185946 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 149186199 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 149186224 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 149186242 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149186613 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149186830 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149187006 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 149187022 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 149187205 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 149188129 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149188164 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 149188349 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 149188750 G A N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.384615384615385 0.307692307692308 0.307692307692308 14 12 5 4 4 3 149188855 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 149188891 G T Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 149188902 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 149188931 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 149189161 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 3 149189246 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149189290 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 149189380 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 149189428 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 149189451 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 149189490 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 149190023 G T N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 149190069 G A N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 3 149190103 T G Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 149190114 T C Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 149190115 A T Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 149190128 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 149190926 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149191016 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 149191085 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 149191105 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 149191111 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 149191425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149191498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149193170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149193921 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149195227 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149195426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149195894 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 149196362 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149196566 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149196903 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 149197066 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149197381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149197893 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149198443 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149199200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149199243 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 149199893 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149199995 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149200605 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149200800 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149201167 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149202005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149202042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149204577 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149205056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149205062 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 149205611 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 149205628 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 149205634 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 149206070 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149206113 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149206138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149206202 C A N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 149206281 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149206518 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 149206520 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 149206621 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 149206766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149206811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149206832 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 149206842 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149206920 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 149206921 G C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 149206975 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 149207132 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 149207330 T G Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 149207398 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 149207402 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149207635 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 149207732 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149207771 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149208163 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149208567 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 149208850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149209157 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149209674 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 149209683 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 149209686 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 149209736 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 149209749 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149209808 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 3 149209895 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 149210149 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 149210232 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 149210266 G C Y N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 149210369 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 149210386 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 149210398 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 149210430 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 149210873 G C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 149210912 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 149210914 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 149211032 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149211062 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 149211078 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 149211088 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 149211200 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149211341 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 149211386 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 149211454 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 149211516 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 149211637 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149211656 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 149211852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149211890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149211894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149212029 T G Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 149212188 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149212228 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 149212245 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149212305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149212330 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 149212387 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149212388 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149212781 C G Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 149213196 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 149213617 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 149213932 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149214079 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 149214384 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 149214454 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 149214652 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 149214663 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149214752 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149214863 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 149215113 A T Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 149215133 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 149215147 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 149215185 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 149215207 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 149215227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149215282 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 149215283 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149215583 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 149215701 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149215738 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 149216058 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149216204 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149216522 T A Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 149217911 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 149218023 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149218540 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149218628 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 149219142 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 149219380 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 149219399 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149219472 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149219711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149219911 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149220069 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149220133 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149220167 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 149220210 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 149220264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149220411 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 149220496 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 149220541 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149220573 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 149221153 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149221172 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149221287 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 149221722 C G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 149222443 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149222849 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149223241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149223599 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149223804 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149224579 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 149224602 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149224915 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149224991 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 149225324 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149226013 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149226376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149226417 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 149226488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149226875 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149227170 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 149227354 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 149227759 C G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 149228055 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 149228328 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 149228809 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 149229147 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149229214 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 149229321 A C Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 149229639 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 149229654 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149229661 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 149229666 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 149229675 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 149229799 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 149229862 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 149229863 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 149229880 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 149230114 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 149230264 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 149230325 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 149230744 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 149231151 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 149231214 C A Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 149231394 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 149232159 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149232524 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149233252 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149233695 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149233747 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149233758 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 149233762 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 149234192 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 149234920 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 149234973 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 149234998 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 3 149235592 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 3 149235649 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.157894736842105 0.105263157894737 0.736842105263158 8 30 3 2 14 3 149235661 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 149235789 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 149236169 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 149237102 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 149237160 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 149237174 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 149237292 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 149237375 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 149237436 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 149237466 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 149237529 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 149237541 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 149237555 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 149237578 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149237676 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 149237745 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 149238458 G T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 149238530 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149239131 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149239242 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149239252 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149239292 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 149239425 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 149239605 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149239979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149240698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149242408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149243869 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 149246098 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 149246897 A T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 149249102 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149249636 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149250087 C A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 149251435 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149252262 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 149252949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149253927 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149254516 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149254625 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149257358 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 149257409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149257565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149258141 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149260744 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149263154 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 149265344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149266606 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 149268182 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 149268335 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 149268703 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 149268763 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 149269198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149269261 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149269449 T G Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 149269944 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149270494 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149270647 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149270945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149270971 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 149271342 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149271376 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149271377 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 149271394 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149271574 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 149271722 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 149271887 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 149272079 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 149272207 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149272470 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 149273134 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 149273316 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 149273391 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 149273458 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 149274002 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 149274102 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 149274230 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149274380 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 149274446 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 149274576 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149274578 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 149274641 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 149274683 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 149274777 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 149274863 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 149274963 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149275144 A T N N 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.230769230769231 0.538461538461538 0.230769230769231 13 13 3 7 3 3 149275161 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149275253 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 149275288 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 149275346 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 149275587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149275873 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149276663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149276949 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149277226 A T Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 149277266 G T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 149277897 G C Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 149277905 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149277918 T C Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 149277929 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 149277939 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 149277965 T C Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 149277986 G T Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 149278040 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 149278052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149278151 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 149278215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149278258 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 149278400 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 149278474 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 149278523 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 149278646 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 149278683 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 149278747 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 149278757 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 149278771 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 149278779 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149278784 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 149278803 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149278842 G T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 149278917 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 149278973 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 149278991 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 149279141 A C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 149279274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149279512 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 149279556 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149279623 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 149279672 C T Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 149279710 A C N N 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.181818181818182 0.636363636363636 0.181818181818182 11 11 2 7 2 3 149279726 C T N Y 0.458333333333333 ALT 0.4 0.4 0.541666666666667 0.458333333333333 0.25 0.583333333333333 0.166666666666667 13 11 3 7 2 3 149279754 T A Y N 0.388888888888889 ALT 0.55 0.55 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 11 7 2 7 0 3 149280192 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 149280241 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 149280308 T C Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 149280353 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 149280354 G C Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 149280380 A C Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 149280415 A T Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 149280428 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 149280478 G T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 149280485 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 149280498 A C Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 149280523 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 149280587 C T Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 149280630 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 149280670 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 149280684 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 149280787 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 149280789 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 149280898 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 149280904 T A Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 149281078 C T N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 3 149281199 A G Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 149281234 C T Y Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 149281272 A G Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 3 149281286 C A Y N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.266666666666667 0.666666666666667 0.0666666666666667 18 12 4 10 1 3 149281367 G T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 149281412 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 149281449 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 149281461 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 149281491 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 149281539 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 149281546 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 149281579 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 149281608 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 149281703 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 149281704 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 149281771 A T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 3 149281804 G A N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 149281956 A C Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 149281985 A G Y Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 149282240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149282310 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 149282417 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 149282518 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 149282944 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 149283134 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 149283201 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 149283218 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 149283271 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 149283395 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 149283398 T A Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 149283435 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149283806 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149283836 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149283944 T C Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 149283950 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 149284038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149284751 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 149284913 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 149285016 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 149285033 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 149285129 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149285171 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 149285291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149285455 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 149285480 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149285549 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149285619 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 149285946 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 149286021 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 149286063 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 149286094 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 149286135 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 149286239 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 149286329 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149286460 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 149286481 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 149286486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149286811 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 149286955 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 149287078 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 149287225 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149287334 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 149287477 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 149287605 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 149288076 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 149288309 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149288492 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 149288623 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 149288695 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 149288749 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 149288750 C A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 149288848 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 149288876 T G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 149289068 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 149289091 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 149289092 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 149289193 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 149289258 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 149289314 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149289439 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 149289562 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 149289616 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 149289698 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149289777 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 149289803 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149289819 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 149289933 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149290335 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 149292835 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 149292864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149293074 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149294404 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149294460 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149294559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149295511 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 149296212 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 149296707 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149297933 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 149298269 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 149298365 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149299266 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149302060 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149302067 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149302708 A T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 149303060 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 149303246 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149304120 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 149305467 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 149305727 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149308883 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149309643 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149309886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149310369 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149310832 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 149311198 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 149311416 C T N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.0909090909090909 0.727272727272727 0.181818181818182 10 12 1 8 2 3 149311661 T C Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 149311674 A G Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 149311749 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149311874 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149311996 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 149311999 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 149312040 T G Y N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 149312124 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.125 0.6875 0.1875 15 17 2 11 3 3 149312191 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 149312478 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149312497 T G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 149313130 C T Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 149313283 T C Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 149313285 C A Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 149313412 G A N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 3 149313434 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.25 0.5625 0.1875 17 15 4 9 3 3 149313455 A G Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 149313472 T C Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 149313484 G A Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 149313573 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 149314090 T C Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 149314118 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 149314204 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 149314246 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149314293 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 149314467 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 149314711 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149315195 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 149315221 T A Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 149315804 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149315828 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 149315961 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149315962 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 149316018 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 149316031 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149316068 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149316228 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 3 149316545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149316572 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 149316707 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 149317108 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 149317109 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149317176 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 149317375 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 149317595 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149317758 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 149317854 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149318015 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 149318191 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 149318371 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 149318667 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149319199 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 149319204 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 149319310 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149319338 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 149319398 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 149319784 A G N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.142857142857143 0.642857142857143 0.214285714285714 13 15 2 9 3 3 149319844 T G N N 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.0769230769230769 0.615384615384615 0.307692307692308 10 16 1 8 4 3 149319918 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 6 12 0 6 3 3 149319940 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 3 149319965 T C N Y 0.5 ALT 0.8 0.8 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 4 4 1 2 1 3 149320170 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 149320346 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 149320352 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 149320507 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 149320573 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 149320676 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 149320745 A G N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 3 149320839 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 149320981 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 149321072 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 149321346 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149322101 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 149322584 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149322627 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149322972 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 149323197 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149325134 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149325714 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 149326805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149327617 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 149328496 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149329996 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149333851 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149334130 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 149334365 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149334981 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149335968 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 149336572 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149336633 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149337159 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149337355 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 149337358 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 149337388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149337398 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149337411 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149337424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149337959 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149338538 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149339160 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 149339562 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149340161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149341015 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149342020 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149342533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149344214 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149345862 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149347874 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149348499 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 149349938 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 149349977 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 149350389 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149350481 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149351495 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 149352112 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149352845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149353240 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 149353267 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 149353275 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 149353304 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 149353324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149353377 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 149353392 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 149353425 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 149353436 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 149354551 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149354820 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149358267 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149358425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149360390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149361242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149362115 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 149362165 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149362552 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 149362920 T C N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 149364617 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149367065 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149369462 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 149369604 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149369760 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 149370171 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 149374214 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149374375 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149375283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149375610 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149376192 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149377075 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 149378921 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149379485 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149379641 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149380832 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149382739 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149382836 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149382885 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 149383002 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 149383348 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149384028 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 149384114 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 149384798 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 149385115 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149385204 T C Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 149385793 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149386755 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 149387077 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 149387338 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149387411 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 149387546 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 149387917 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 149388020 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 149388135 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149388233 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 149388325 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 149388708 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149389135 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 149389136 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 149389211 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 149389232 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 149389297 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 149389326 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149389337 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 149389378 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 149389922 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149390143 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 149390875 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 149392736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149393708 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 149395090 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 149395735 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 149396524 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 149400986 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149401793 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149401862 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 149402228 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 149403107 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 149403792 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149403885 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149404201 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149405613 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149406452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149406685 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149406860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149407569 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 149407624 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 149409581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149409676 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 149412117 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149414605 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 149415692 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 149415714 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 149415720 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 149415798 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149415824 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149415825 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 149415838 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149415891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149415907 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149415915 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149415985 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149416040 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149416071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149416095 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149416299 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149416351 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149416358 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 149416378 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149416831 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 149416852 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 149416958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149417030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149417060 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149417116 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149417159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149417408 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149417741 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149417861 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 149417929 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 149418067 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149418158 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 149418175 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 149418193 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 149418202 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 149418218 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 149418287 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 149418291 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 149418373 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 149418454 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 149418476 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 149418479 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 149418665 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 149418761 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149418800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149418854 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149418902 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149419190 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 149419212 A C N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 149419266 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 149419296 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 149420053 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149420310 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 149420537 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149420920 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149421318 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149421382 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 149421620 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149421739 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149421824 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149421841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149421977 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 149422003 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 149422004 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 149422018 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 149422026 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 149422072 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149422232 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 149422270 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149422271 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149422489 A C N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 149422550 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 149422555 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149422583 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 149422672 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 149422722 G T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 149422827 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 149422945 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149423040 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149423235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149423258 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149423354 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149423361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149423368 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149423413 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 149424057 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149424155 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149424257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149425000 A C Y N 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 149425034 A G N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 149425080 G C Y N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 149425128 A C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 149425512 A C Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 149426040 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 149426507 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149426809 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 149427271 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 149427692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149427818 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149428021 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 149428050 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 149428161 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149428606 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149430678 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149432136 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149432153 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149432208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149432235 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149432808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149432864 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 149433046 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149433135 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149433139 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149433212 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149433302 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149433769 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149434025 T A N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 149434037 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149434110 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149434141 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149434257 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149434593 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149434614 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 149434733 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149435534 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 149435544 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 149435653 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 149435898 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149436739 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 149436746 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149436888 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 149436993 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 149436997 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 149437020 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 149437361 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149437783 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149438038 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149438178 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149438193 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149438203 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149439495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149439737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149440313 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149440746 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149441112 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149441447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149441953 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149442005 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149442029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149442452 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149443550 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149443825 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149444843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149448625 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149448729 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149449825 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149449966 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149450222 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149450345 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149450437 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149450852 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 149453224 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149453226 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149454195 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149454578 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149454681 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149454696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149455096 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149455310 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149455318 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149455344 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149455361 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149455967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149456135 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149456310 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149457329 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149458162 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149458250 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 149458473 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 149458479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149458642 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 149458644 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 149458697 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 149458928 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149458988 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149459064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149459206 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149459240 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149459353 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 149459963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149460673 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 149461756 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149461928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149462715 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149462735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149462802 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 149462996 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 149463095 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 149463186 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 149463395 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 149463495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149464577 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 149464582 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 149464733 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149464937 G T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 149464987 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149465109 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149465125 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 149465561 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 149465646 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 149465656 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 149465790 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 149465862 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 149465893 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 149466288 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 149466305 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 149466348 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 149466412 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 149466417 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 149466442 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 149466661 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149466662 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 149466693 T C N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 149466844 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 149466897 G A N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 149467047 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 149467156 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 149467171 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 149467175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149467190 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149467248 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149467366 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149467574 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149467647 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 149467916 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 149467920 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 149468038 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 149468052 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 149468105 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 149468709 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149468740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149468746 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149468761 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 149468807 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 149468878 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149469360 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 149469475 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149469523 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 149469867 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149470178 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 149470302 G A Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 149470401 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 149470702 G C Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 149471092 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149471201 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 149471616 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 149472047 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 149472230 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 149472231 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 149472446 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 149472545 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 149472622 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 149472881 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 149472906 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 149473235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149473261 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149473568 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149473665 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149473717 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 149473763 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 149473780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149473820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149473979 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149474414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149474419 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149474427 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 149474529 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 149474673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149475533 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 149475636 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 149475843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149476537 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 149476617 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149479657 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 149480304 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149480325 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149481046 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 149481372 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 149482385 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149482681 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149483670 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149483815 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 149483937 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 149484071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149484075 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149484247 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 149484662 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149485292 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 149485345 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 149485449 C A N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 149486154 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149486158 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 149486999 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149488027 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 149488282 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 149490184 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149490324 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 149490341 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149491223 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 149491253 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 149491539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149492194 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149492763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149493347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149493435 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 149493817 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 149496332 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 149496600 G A Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 149497852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149498516 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 149498674 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 149498860 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 149499225 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149499598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149501178 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149502044 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 149502208 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 149502291 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 149502366 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 149502384 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149502418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149503075 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149503431 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149504792 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 149505217 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 149507302 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 149507933 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 149507992 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 149508207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149508381 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149508955 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 149509024 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 149509211 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 149509328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149509491 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 149509502 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 149509634 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 149509869 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 149509999 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 149510009 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149510107 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 149510141 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 149510181 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 149510206 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 149510251 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 149510287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149510324 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 149510331 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 149510421 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 149510493 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 149510591 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 149511003 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 149511012 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 149511887 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149512592 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149512675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149512804 A T Y N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 149512816 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 149512944 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149512970 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 149513604 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149513864 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 149513950 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 149515422 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149515568 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 149515604 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.4 0.1 0.5 18 22 8 2 10 3 149515606 G T Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.4 0.1 0.5 18 22 8 2 10 3 149516033 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 149516152 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 149516223 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 149516291 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 149516292 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 149516738 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 149516933 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149517056 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 149517259 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 149517323 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 149517335 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 149517381 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 149517423 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 149517435 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 149517492 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 149517493 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 149517616 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 149517949 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149517965 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149518062 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.294117647058824 0.176470588235294 0.529411764705882 13 21 5 3 9 3 149518074 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 149518081 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 149518121 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149518169 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 149518218 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 3 149518346 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 149518377 A C Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 149518423 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 149518548 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 149518577 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 149518581 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 149518701 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 149518738 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 149519144 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 149519152 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149519182 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149519263 T C Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 149519312 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 149519560 C A N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 3 149519573 A T Y N 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.363636363636364 0.181818181818182 0.454545454545455 10 12 4 2 5 3 149519861 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149520899 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149521081 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 149521149 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 149521632 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 149521723 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 149521743 A G Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 149522114 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149522293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149522466 C G Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.3 0.15 0.55 15 25 6 3 11 3 149522521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149522598 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149522619 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149522714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149522754 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149523047 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 149523113 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 149523165 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 149523167 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 149523180 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 149523192 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 149523243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149523248 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 149523258 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149523346 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 149523363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149523502 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149523615 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149523633 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149523737 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 149523769 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 149523772 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149523827 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149523911 C A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 3 149523972 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 149524070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149524168 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 149524191 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149524424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149524431 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 149524482 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 149524494 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 149524517 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 149524558 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.555555555555556 0.111111111111111 0.333333333333333 22 14 10 2 6 3 149524594 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 149525036 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 149525085 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 149525109 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 149525178 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 149525198 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 149525208 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.588235294117647 0.117647058823529 0.294117647058824 22 12 10 2 5 3 149525214 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.631578947368421 0.105263157894737 0.263157894736842 26 12 12 2 5 3 149525248 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.611111111111111 0.111111111111111 0.277777777777778 24 12 11 2 5 3 149525264 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 149525269 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149525408 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 149525542 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 149525682 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 149525968 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 149525993 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 149526184 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 3 149526186 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 3 149526198 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149526200 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149526269 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 149526339 G C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.315789473684211 0.105263157894737 0.578947368421053 14 24 6 2 11 3 149526628 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 149526632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149526702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149526808 C T Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 149528034 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 149528226 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149528800 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.578947368421053 0.105263157894737 0.315789473684211 24 14 11 2 6 3 149529038 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149529050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149529188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149529192 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149529260 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 149529262 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149529576 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.315789473684211 0.105263157894737 0.578947368421053 14 24 6 2 11 3 149529933 A T Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.352941176470588 0.176470588235294 0.470588235294118 15 19 6 3 8 3 149530360 A G Y Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 10 18 4 2 8 3 149530537 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.666666666666667 0.133333333333333 0.2 22 8 10 2 3 3 149530645 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149530731 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149530807 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 149531052 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 149531153 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149531167 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.588235294117647 0.117647058823529 0.294117647058824 22 12 10 2 5 3 149531203 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 149531210 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149531282 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149531401 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149532388 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 149532440 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149532648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149532813 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 149532828 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 149533252 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149533308 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149533413 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149533600 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 149533610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149533773 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149534303 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149534450 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 149534500 G T N N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 14 6 6 2 2 3 149535353 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149536048 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149536862 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 149536873 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149536893 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149536926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149536998 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 149537020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149537029 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 149537071 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 149537090 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 149537162 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 149537178 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 149537212 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 149537317 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 149537343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149537370 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149537463 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149537512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149537590 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 149537616 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 149537668 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149537689 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 149537712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149538022 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149538035 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 149538608 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 0.117647058823529 0.352941176470588 20 14 9 2 6 3 149538982 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149539262 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149539405 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149539614 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 149539737 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149540083 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 149540266 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 149540331 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149540450 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 149540538 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 149540569 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 149540611 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149540669 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149540866 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149541467 G C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 149541735 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 149541781 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149541998 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149542758 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.235294117647059 25 9 12 1 4 3 149542939 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 149543009 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149543891 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 149545417 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149545755 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149546613 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 149546921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149546922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149547355 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 149547984 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 149551521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149552540 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149553230 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149554031 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149554305 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 149554601 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.263157894736842 0.157894736842105 0.578947368421053 13 25 5 3 11 3 149554754 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 149554824 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149554899 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 149554915 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.55 0.15 0.3 25 15 11 3 6 3 149555047 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149555053 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149555077 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149555187 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149555599 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149555627 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 149555643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149555685 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 149555718 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149556246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149556316 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 149556546 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149556699 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149557965 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 149558609 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149559609 G T Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 149559907 A G Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 149559930 A G Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 149560022 A C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 149560528 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 149561445 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149561696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149562412 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 149563214 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149564241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149564457 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149565861 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149567030 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149567668 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149567938 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 149568082 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149568143 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149568162 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149568305 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149568561 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 149569502 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149571000 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149571274 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149572031 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149572244 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149573403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149573810 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149573900 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149573908 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 149573916 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149574486 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 149574512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149574614 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 149575050 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 149575220 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149575375 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 149575753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149575824 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 149575840 C T N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 149575841 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 149576064 C A N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.0833333333333333 0.333333333333333 0.583333333333333 6 18 1 4 7 3 149576631 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 149576823 T C Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 149577105 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149577245 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149577392 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 149577822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149578742 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 149579332 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 149579537 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 149580205 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149580954 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 149581173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149581244 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149581289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149581327 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149581335 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 149581382 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149581656 A C N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.466666666666667 0.466666666666667 0.0666666666666667 21 9 7 7 1 3 149582649 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149584030 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 149584418 A T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 149584656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149584757 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 149585057 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149585083 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149585096 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149585119 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149585299 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 149585626 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 149585662 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149585738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149585807 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 149586337 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149586563 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149587881 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 149588146 G T N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 149588161 T A N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 149588162 C A N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 149588210 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 149588256 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 149588431 A T Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 3 149588570 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 149588581 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 149588725 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149589733 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 149589783 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149589889 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 149591168 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149591292 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149596402 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149596475 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149600438 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149600881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149601303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149601890 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149602570 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 149602593 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 149602604 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149603490 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 149603491 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149603522 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 149603531 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 149603644 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 149603962 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149604157 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 149604192 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 149604203 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 149604455 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 149604517 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 149604782 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149605124 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 149605154 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 149605216 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 149605294 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 149605364 G C N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 149605768 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 149606027 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 149606095 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 149606107 A C Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.1 0.85 0.05 21 19 2 17 1 3 149606108 G C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 3 149606208 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 149606236 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 149606399 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 149606452 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 149606567 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 149606598 A C Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 3 149606599 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 3 149606638 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 149606755 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 149606804 G T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 149606834 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 149606842 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 149606918 C G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 149606944 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 149606967 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 149606977 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 149606999 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 149607024 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 149607031 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 149607107 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 149607136 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 149607326 T A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 149607444 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 149607488 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 149607992 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149608164 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 149608345 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 149608381 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 149608401 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 149608490 C A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 149608491 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 149608510 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 149608663 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 149608777 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 149609144 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149609222 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 149609321 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 149609382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149609413 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 149609452 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 149610083 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149610089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149610169 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 149610179 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149610254 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149610266 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 149610388 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 149610553 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 149610601 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149610669 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 149610740 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 149611219 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149611455 C G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 149611476 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149611859 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149612738 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 149613312 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 149613469 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 149613502 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 149613995 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149615264 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149615338 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149615390 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149615533 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 149615538 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149615810 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149616352 T C N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 3 149616428 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149617723 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 149617837 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149618045 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 149618912 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 149619500 T G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 149619840 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149619937 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149620411 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149622106 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149624583 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149626160 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149626626 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149626807 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149627228 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149627308 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 149627392 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149627643 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 149627775 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 149627803 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.466666666666667 0.4 0.133333333333333 20 10 7 6 2 3 149628300 C T N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 3 149628404 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149628565 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 149628720 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 149628736 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149628878 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149629344 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 149629559 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149629580 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 149629666 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149630003 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 149630024 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 149630108 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 149630125 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149630420 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 149630595 T A N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 149630615 C A N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 149630628 G T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 149630661 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149630720 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149630800 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 149630979 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 149631059 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 149631077 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 149631161 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149631631 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149631729 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 149632101 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 149632536 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 149632645 A C N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 149632727 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 149633165 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149633826 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149640439 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 149640746 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 149640919 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149641010 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.210526315789474 0.684210526315789 0.105263157894737 21 17 4 13 2 3 149641107 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 149641147 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 149641244 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149641255 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 149641476 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 149641478 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149641507 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149641620 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149641719 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 149641978 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149641984 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149642083 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 149642176 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149642600 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 149642642 C A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 149642924 A C Y N 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 149643009 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 0.909090909090909 2 20 1 0 10 3 149643092 A T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 149643140 A G N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 3 149643186 A G Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 149643208 T C N Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 3 149643226 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 149643233 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 149643277 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149643485 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149643532 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149643612 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 149643628 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 149643767 G T Y N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 16 8 4 8 0 3 149643892 G T Y N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 13 5 4 5 0 3 149644033 T C Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.285714285714286 0.571428571428571 0.142857142857143 16 12 4 8 2 3 149644135 G A Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.285714285714286 0.642857142857143 0.0714285714285714 17 11 4 9 1 3 149644214 T C Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 149644270 T C N Y 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.214285714285714 0.642857142857143 0.142857142857143 15 13 3 9 2 3 149644277 A C N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.214285714285714 0.714285714285714 0.0714285714285714 16 12 3 10 1 3 149644364 G T Y N 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 3 149644461 C A N N 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 3 149644497 A G N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.272727272727273 0.727272727272727 0 14 8 3 8 0 3 149644515 A C N N 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.4 0.6 0 14 6 4 6 0 3 149644702 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 149644797 C G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.117647058823529 0.588235294117647 0.294117647058824 14 20 2 10 5 3 149644884 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 149644966 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 149645063 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 3 149645069 G C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 149645296 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 149645409 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 149645756 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149645837 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 149646008 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 149646122 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 149646966 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149647103 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149647676 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149647725 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149648229 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 149649984 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 149650206 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149650454 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 149650515 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 149650710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149651276 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149651842 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 149651883 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 149652031 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 149652119 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 149652153 C A N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 149652490 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149653352 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 149653427 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149654014 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 149654089 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 149654376 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 149654472 C T N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 149654748 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 149654960 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 149654985 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 149655573 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 149655662 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149655714 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 149655807 G C Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 149655929 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149655991 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149656273 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149656315 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149656317 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149656453 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149656473 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 149656552 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 149656562 A G Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 149657364 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149657939 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 149658061 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149658078 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 149658091 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 149658273 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 149658318 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149658408 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149658563 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 149659098 A C N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 149659241 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 149659300 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 149659345 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 149659407 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149659431 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 149659563 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 149659626 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149659637 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149659650 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149659680 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 149659765 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149659816 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149659876 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 149659883 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149659964 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 149660069 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 149660088 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 149660094 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149660269 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149660608 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 149660665 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 149660777 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149661028 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 149661186 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 149661191 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 149661220 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 149661299 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 149661305 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 149661315 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 149661322 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 149661555 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 149661574 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 149661646 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 149661658 A G N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.384615384615385 0.307692307692308 0.307692307692308 14 12 5 4 4 3 149661685 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 149661717 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 149661777 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 149661921 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 149661979 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 149662011 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 149662086 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 149662105 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 149662122 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 149662177 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 149662186 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 149662219 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149662220 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 149662277 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 149662358 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 149662375 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 149662377 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149662397 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149662491 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 149662498 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 149662534 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 149662588 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149662608 T A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 149662707 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 149662723 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 149662783 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 149662850 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 149662962 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149662973 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 149662979 A C N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 149663030 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 149663199 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 149663244 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149663257 C A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 149663407 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 149663411 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 149663494 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 149663617 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 3 149663651 A G N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 3 149663814 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 149663864 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 149663921 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149663960 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 149663983 G T N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 149664198 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 149664232 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149664244 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149664273 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 149664298 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149664340 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 149664370 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149664403 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 149664413 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149664437 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 149664462 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149664494 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 149664527 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149664568 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 149664582 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149664602 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 149664713 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 149664715 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 149664745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149664844 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149664920 C A Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 149665050 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 149665072 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 149665107 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 149665121 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149665135 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 149665188 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149665199 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149665311 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 149665545 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149665602 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 149665640 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 149665646 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 149665651 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149665795 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 149665804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149665950 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 149666045 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149666096 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 149666221 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 149666273 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 149666422 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149666488 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 149666496 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 149666572 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 149666580 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 149666598 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 149666633 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 149666670 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 149666693 A C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 149666747 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 149666768 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149666786 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 149666803 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 149666921 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 149667487 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 149667584 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149667634 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149667643 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 149667664 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 149667686 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 149667763 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 149667771 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 149667781 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 149667814 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 149667860 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 149668092 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 149668160 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 149668209 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 149668332 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 149668337 T G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 149668441 C T N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 3 149668481 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 149668603 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 149668621 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 149668630 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 149668663 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 149668796 T A N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 149668983 G A N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 3 149669065 A T N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 3 149669616 A G N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.0666666666666667 0.6 0.333333333333333 11 19 1 9 5 3 149669674 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 149669871 A C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 149669900 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149670274 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149670293 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149670337 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 149670403 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 149670468 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 149670745 C A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 149670888 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149671033 T C N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 3 149671505 A T N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 149671519 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149671552 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 149671677 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 149671799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149671811 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 149671828 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149671851 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149671906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149672008 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149672021 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149672037 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149672081 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149672228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149672275 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149672326 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149672355 A G Y Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 3 149672361 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 149672368 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 149672392 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 149672431 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149672434 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149672483 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149672527 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149672539 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149672638 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149672653 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149672674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149672758 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149672764 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149672787 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149672835 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 149672852 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 149672918 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 149672968 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149673037 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 149673059 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 149673071 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 149673092 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 149673133 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 149673162 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 149673200 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 149673328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149673342 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149673402 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 149673405 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149673470 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 149673477 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 149673495 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 149673523 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 149673557 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 149673569 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149673575 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 149673625 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 149673779 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149673855 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 149673900 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 149673934 G C N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 149673994 T G N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 149674059 T C N Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0 0.615384615384615 0.384615384615385 8 18 0 8 5 3 149674409 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149674860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149674878 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149675303 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149675337 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 149675735 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149675738 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149675915 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149676002 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 149676076 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149676563 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 149676643 C T N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.0909090909090909 0.545454545454545 0.363636363636364 8 14 1 6 4 3 149676675 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 149676864 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 149676865 T G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 149676883 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 149676964 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 149676990 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 149677161 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 149677193 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 149677199 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149677242 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149677279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149677289 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 149677294 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 149677333 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 149677677 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 149677890 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 149677923 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 149677933 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 149678036 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 149678081 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149678097 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 149678141 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 149678148 T A N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 149678293 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 149678425 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 149678447 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149678478 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 149678550 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 149678701 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 149678716 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 149678767 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149678901 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 149678944 A G N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 149678961 G T N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 149678974 T A N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 149679011 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 149679097 C A N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 149679099 A G N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 10 18 2 6 6 3 149679114 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 149679165 C A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 149679220 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 149679222 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 149679254 A T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 149679321 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 149679568 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 149679602 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 149679801 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149679850 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 149679865 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 149679948 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 149679978 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 149679994 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 149680022 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149680320 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 149680464 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149680605 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 149680700 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 149680737 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 149680807 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 149681162 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 149681441 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149681454 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 149681630 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149681663 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 149681764 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 149681807 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 149681812 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 149681842 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 149681852 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149682032 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 3 149682951 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149683278 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149683321 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 149684346 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149684456 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 149684499 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 149684528 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 149684535 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 149684544 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 149684827 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 149684884 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 149684908 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149685143 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 149685288 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 149685330 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149685337 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 149685348 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149685394 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149685426 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 149685486 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 149685630 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149685787 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149685906 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 149686118 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 149686136 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 149686263 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 149686424 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 149686719 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 149686758 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 149686779 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149686855 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 149686936 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 149687059 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 149687125 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 149687130 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 149687305 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 149687321 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 149687470 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 149687542 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 149687687 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 149687751 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 149687770 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 149687853 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 149687862 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 149687973 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 149688018 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.65 0.65 0.285714285714286 0.714285714285714 0 0.571428571428571 0.428571428571429 4 10 0 4 3 3 149688078 T C N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 3 149688095 T A N N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 149688186 C T Y Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.714285714285714 0.285714285714286 5 9 0 5 2 3 149688244 T C Y Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 149688409 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 149688511 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 149688632 T C Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 149688723 C A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 149688732 C G Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 149689175 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149689318 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 149689333 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 149689423 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 149689533 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 149689771 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149689849 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149690021 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149690267 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 149690332 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 149690367 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149690497 A T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 149690711 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149690782 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149690821 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149691028 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 149691538 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 149692079 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149692249 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149692483 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149692671 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149693013 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 149693043 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149693167 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 149693319 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149693370 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 149693476 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149693628 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 149693754 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149693757 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 149693771 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 149693773 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149694337 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 149694423 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 149695911 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149695959 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 149695991 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149696620 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 149696812 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 149697225 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149698245 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149698288 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149698697 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 149698771 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 149699016 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 149699620 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 149699932 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 149699996 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 149700240 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149700480 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149701694 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 149702999 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 149703325 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149704048 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 149704130 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 149704216 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 149704247 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 149704290 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 149704330 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149704743 A C Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 149704764 G A Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 149705061 T C Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 3 149705146 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 149705280 G C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 149705433 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 149705465 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 149705740 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 149705911 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 149705960 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149706321 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 149706463 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 149706505 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149706649 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 149706720 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 149707156 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149707346 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 149707896 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 149708061 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 149708232 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149708353 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 149708855 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 149708879 A T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0555555555555556 0.555555555555556 0.388888888888889 12 24 1 10 7 3 149709171 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149709223 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 149709260 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 149709261 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 149709291 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149709416 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 149709500 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149709563 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 149709602 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 149709669 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 149709754 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149709797 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149710003 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 149710073 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149710090 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149710103 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149710205 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 149710218 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 149710238 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149710274 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 149710293 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 149710310 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149710342 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 149710350 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 149710368 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149710376 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 149710505 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149710595 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149710633 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149710892 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 149710950 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149711052 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 149711099 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149711475 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149711500 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149711572 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149711632 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149711861 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149711937 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149712058 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149712065 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 149712163 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 149712714 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149713120 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149713173 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149714352 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149714400 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149714414 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149714583 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149714819 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 149714876 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149714904 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149714954 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149715034 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149715176 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 149715232 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149715257 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 149715267 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 149715286 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 149715335 G T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 149715446 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 149715507 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149715512 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149715587 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149715849 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 149715879 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 149716169 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 149716360 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149716584 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149716736 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 149716919 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149716954 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149717073 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 149717314 T A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 149717377 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 149717386 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 149717394 C A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 149717407 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 149717446 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 149717456 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 149717507 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 149717780 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149718001 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 149718101 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 149718307 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 3 149718357 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149718370 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 149718381 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 149718383 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 149718455 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 149718458 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 149718541 G C N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 149718884 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 149719994 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149720611 A G Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 149720639 T G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 149721529 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 149721566 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149722296 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149723480 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 149723514 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149723531 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 149723652 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149723796 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 149724099 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 149724235 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 149724387 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 149724473 G C N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 149724490 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 149724492 A G N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 149724528 C G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 149724540 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149724588 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149724644 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 149724649 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 149724672 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 149724754 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149724833 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 149724843 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 149724862 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 149724909 G C N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 149725064 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 149725294 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149725492 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149725593 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149725650 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149725973 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 149725981 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 149726011 T G N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 149726047 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 149726069 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 149726319 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 149726320 G T N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 3 149726737 T A N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 149726751 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 149726831 T A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 149727073 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 149727102 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 149727110 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 149727131 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149727211 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 149727368 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149727495 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149727778 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 149728205 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 149728286 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 149728694 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 149728720 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149728766 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149728780 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149729053 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 149729154 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149729176 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 149729395 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149729653 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 149730574 T A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 149730640 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 149730826 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 149730989 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149731089 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 149732698 G A N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 149732737 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 149732953 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149732981 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 149733011 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149733083 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149733084 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 149733126 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 149733206 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 149733224 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 149733479 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149733487 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149733496 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 149733512 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 149733593 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149733615 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 149733620 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149733681 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149733694 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149733820 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 149733890 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 149733908 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 149733980 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 149734000 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149734014 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 149734023 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 149734027 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 149734058 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149734074 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149734767 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 149734780 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 149734909 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 149734974 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149735004 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149735197 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149735202 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149735212 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 149735346 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 149735389 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 149736800 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 149736920 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 149737149 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 149737172 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 149737280 C G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 149737289 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 149737429 T G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 149737432 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 149737445 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 149737559 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 149737701 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149737702 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 149737719 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 149737720 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 149737889 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149737902 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149737959 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149737979 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149738135 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149738150 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 149738228 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 149738297 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 149738394 G A N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 149738560 T C N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 149738601 A T Y N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 149738643 C T Y Y 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 5 7 0 5 1 3 149738669 G T Y N 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 149738887 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.0714285714285714 26 2 13 0 1 3 149739290 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149739461 G T Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 149739627 T C Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 149739796 C A N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.9375 0 0.0625 30 2 15 0 1 3 149739896 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149749449 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149749581 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149749582 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149749704 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 149750063 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 149750315 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 149750389 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149750509 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149750552 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 149750555 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 149751108 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149751133 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 149751202 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149751204 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 149751260 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 149751674 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149753142 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 149753236 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149753237 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 149753250 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 149753690 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149753691 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149754055 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 149754331 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149754339 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 149754454 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149754649 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 149754689 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149754692 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149754907 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 149755035 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 149755198 T G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 149755218 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 149755412 T G N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 149755940 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0.0714285714285714 0.0714285714285714 0.857142857142857 3 25 1 1 12 3 149756122 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 149756646 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149757410 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149757752 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 149758020 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149758564 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 149758709 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149759480 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149760066 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149760219 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149760572 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 149762208 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 149762275 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149762638 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149763044 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 149763220 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 149763715 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149764022 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 149765322 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149766172 A C Y N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 149766767 A G Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 149771529 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 149772050 A G Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 149775138 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 149775630 G A N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 149776233 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 149776274 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 149777423 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149777992 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 149778163 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149778380 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 149778626 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 149778907 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 149779848 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149779925 G T N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 149780220 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149780239 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 149780266 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 149780299 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 149780514 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149781016 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 149781319 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149781886 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149782733 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149783202 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149786927 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149786967 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149787176 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149787340 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149788036 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 149788049 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 149788119 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 149788134 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 149788389 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149788753 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 149788836 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 149789441 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149789442 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149789501 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149789897 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149790131 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149790596 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149790702 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149791032 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 149791299 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149791470 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 149791658 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 149791780 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149791782 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149791844 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 149791930 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 149791960 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 149791988 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 149792002 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 149792024 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 149792063 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 149792152 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 149792277 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 149792493 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149793018 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 149794078 T G N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 149794169 T C N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 149794450 G T N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0 0.545454545454545 0.454545454545455 6 16 0 6 5 3 149794479 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 149795355 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149795360 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149795390 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149795891 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 149795942 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149796025 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 149796263 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 149796556 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 149796755 G A Y Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 149796857 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 149797023 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 149798390 A C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 149798499 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 149798642 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 149798855 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 149798860 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 149798875 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 149798966 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 149799351 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 149799366 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149799716 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 149799891 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 149799991 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 149800537 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 149801353 A G N Y 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.0769230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 9 17 1 7 5 3 149801359 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 149801618 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 149802641 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 149803015 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 149803087 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149803424 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149803479 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149803530 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149803799 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 149804802 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149804919 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 149805191 C A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 149805487 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 149805514 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 149806156 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149806517 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 149806518 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 149807231 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 149807439 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149807504 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149807997 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149809355 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 149811979 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149812497 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 149813633 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149814409 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149814750 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 149815458 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149815899 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149817444 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149817511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149819344 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149819552 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149819936 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149819937 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149820008 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149820300 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149828603 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 149829269 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149830432 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149831684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149831961 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 149832014 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 149832517 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 149832706 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149833711 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149833720 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149834415 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 149835678 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149839035 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149839252 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 3 149841300 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149841826 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149841985 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149843258 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 149844982 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 149845946 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149846604 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149846826 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 149847348 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 149847592 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 149848266 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 149848712 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 149848836 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149849439 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149849997 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 149850151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149850912 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149851995 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149853410 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149854285 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 149854456 G T N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 149855523 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149856980 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149857036 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 149857040 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 149857054 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 149857082 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149857101 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149857374 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149857409 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149857770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149859023 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 149859056 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149859709 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 149860650 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149862136 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 149862853 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 149863043 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149863751 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 149863881 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 149864081 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 149864503 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 149864867 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 149865294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149865516 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149866659 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149867061 C A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 149867062 T A N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 149868312 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149868433 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149868470 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 149869158 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 149869461 T C N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 149869532 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 149869581 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 149869584 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 149869723 G A Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 149870608 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 149870800 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 149872845 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149873040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149875921 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149876912 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 149877295 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149878523 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 149878819 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 149879558 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149879810 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149880536 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149882934 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149884236 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 149886045 A C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 149886709 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149886977 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 149892862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149894425 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149899570 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149903138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149904313 A T N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 149905304 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149906754 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 149909045 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149910133 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149910273 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149910978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149912031 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149912844 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 149914309 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 149914403 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 149914896 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149915091 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 149915515 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 149916231 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 149916286 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149916523 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 149918044 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149918049 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149918478 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149918936 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149920892 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 149921994 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149922103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149923986 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149924603 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 149925553 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149925868 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149926121 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149926550 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 149927836 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 149928157 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 149928252 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149931053 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149931076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149931097 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149931212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149931279 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 149931300 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 149931306 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 149931392 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149931612 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 149931750 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 149931860 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 149931882 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149931956 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149931983 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149932063 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149932080 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149932084 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149932116 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149932121 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149932163 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149932169 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149932193 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149932198 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149932219 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149932249 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 149932302 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149932306 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149932316 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149932405 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149932419 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149932481 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149932484 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149932508 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149932513 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149932528 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149932562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149932564 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149932578 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149932607 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149932876 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149932900 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 149932933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149933094 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149933159 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149933335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149933418 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149933484 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 149933515 A G Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 149933619 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 149933641 G C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 149933644 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 149933684 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 149933701 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149933973 C T Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 149934057 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149934417 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 149934548 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 149934555 C T N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 149934614 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 149934788 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149934790 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 149934838 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149934843 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 149934852 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149934962 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 149935070 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 149935152 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149935184 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149935191 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 149935267 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 149935367 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149935456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149935607 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 149936767 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 149936806 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149937521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149937770 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149937935 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149938088 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149938107 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149938829 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149938993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149939534 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149940167 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149940400 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 149940571 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 149940681 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 149941299 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 149941717 C G N N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 149941858 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 149942559 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149942664 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149942829 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149942939 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149943071 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 149943103 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 149943229 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149943364 A C N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 149943696 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 149943748 C A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 149943815 C T N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 149943830 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 149943904 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 149943927 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149944070 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 149944208 G C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 149944541 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149944588 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149944784 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 149944828 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149944913 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149945151 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 149945293 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 149945437 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 149945470 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 149945553 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 149945567 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149945568 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149945581 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149945665 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 149945746 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149945786 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 149945809 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 149945827 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 149945882 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 149945982 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 149946007 T C N Y 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 18 6 8 2 2 3 149946047 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 149946119 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149946123 C T N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 149946197 G T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 149946204 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 149946210 T G N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 149946274 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149946426 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 149946455 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 149946639 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149946665 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149947537 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149947848 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149948228 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 149948379 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149948528 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149948587 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149948936 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 149949004 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 149949346 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149950371 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149951218 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 149951474 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149952057 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149952377 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 149953430 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 149953935 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149953936 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 149954374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149954907 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149954911 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149955027 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 149955064 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149955089 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149955464 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 149956691 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149956696 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149956708 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149956837 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149956838 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149956990 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149957150 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 149957651 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149957972 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149957983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149958104 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149961802 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 149962102 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 149962557 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149963225 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 149963976 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 149964429 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 3 149965300 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149965527 T A Y N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.272727272727273 0.727272727272727 0 14 8 3 8 0 3 149965969 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149966730 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149967429 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 149967956 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 149968062 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 149968102 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 149968106 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 149968139 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149968651 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149968767 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149968908 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149968946 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 149969136 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149969347 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 149969683 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149969793 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149969838 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149970001 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 149970325 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 149970678 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 149970688 A G Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 149971148 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149971278 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149971463 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149971595 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 149971612 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 149971723 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 149971730 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149971754 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149971823 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 149971864 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149972025 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 149972573 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 149972790 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 149972856 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 149972921 A T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 149973189 C T N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 149973240 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 149973322 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 149973567 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 149973628 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 149973645 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149974048 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 149974097 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 149974136 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 149974840 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149975197 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 149975326 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 149975379 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 149975555 C G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 149975719 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 149976276 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 149976485 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149976562 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149976564 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149976629 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149976877 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149976917 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149977117 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 149977162 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149977206 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149977233 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 149977803 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 149979582 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149980000 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149980943 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149981890 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149983122 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 149983329 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149984538 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149984614 A C N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 149984709 T A N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 149984993 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149988096 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 149988156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149988799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149988812 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 149989024 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149989279 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149989843 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149990245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149992089 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149992922 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 149993262 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149993539 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 149994086 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149994269 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149994803 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 149994983 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 149996181 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 149996881 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149996920 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 149997824 C T N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 3 149999380 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 149999601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150005133 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150006569 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 150006733 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150007743 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150007948 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 150007967 G T Y N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 150008214 G T N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 150008246 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 150008249 C T N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 150008313 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150008515 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150008622 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150009373 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150009429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150009549 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150009583 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 150009980 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150010369 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150010678 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150010684 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150010771 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150010855 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150011020 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 150011484 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 150011745 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150011773 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150011779 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 150012173 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150012480 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 150012662 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150012690 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 150012713 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 150012736 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 150012790 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 150013111 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150013226 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 150013983 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 150014014 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 150014043 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 150014074 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 150014135 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 150014163 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 150014265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150014543 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150014592 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150015061 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 150015276 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 150015903 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 150015944 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 150016470 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150016484 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 150016500 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150016627 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 150016813 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 150016833 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 150016920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150017177 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 150017220 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 150017286 T G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 150017299 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 150017496 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 150017560 A C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 150017846 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 150017978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150017996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150017999 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 150018101 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 150018177 T A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 150018490 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 150018705 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 150018844 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150018915 A C N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 150019013 A G Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 150019967 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 150021290 A T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 150021355 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 150021440 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 150021484 G T N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 150021599 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 150022944 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0 0.823529411764706 0.176470588235294 14 20 0 14 3 3 150024098 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150024185 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 150024217 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 150024922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150024970 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150025897 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150026618 C T N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.5 0.5 0 21 7 7 7 0 3 150027725 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 150028556 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 150029797 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150032131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150033222 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150033451 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150033648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150033670 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150034261 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150034593 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150034641 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150035034 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150035231 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150035478 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 150035506 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 150035521 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 150035623 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150035694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150035816 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150035830 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150035996 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150036155 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150036366 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150036424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150036517 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150036523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150036711 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150036765 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150036862 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150037002 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150037041 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150037051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150037073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150037088 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150037159 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150037203 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150037466 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 150037503 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150037585 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150037592 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 150037860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150037948 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150038391 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 150038864 G T N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 150038889 A G N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 150038924 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 150038932 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 150038937 A C N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 150038952 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 150038968 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 150038986 C A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 150038998 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 150039012 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 150039022 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 150039029 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 150039548 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150040026 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150040322 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 150040614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150041303 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 150042068 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 150042332 T G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 150042363 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 150042588 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150042908 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 150042948 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 150043074 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 3 150043375 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 150043577 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150044330 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150044365 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 150044369 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 150044417 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 150044418 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 150045262 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 150045346 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 150045396 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 150045399 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 150045521 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150045535 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 150045541 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 150045612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150045783 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 150045852 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150045964 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 150045977 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 150046022 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 150046375 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 150046425 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150046517 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 150046627 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 150046960 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 150046963 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 150047022 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 150047345 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150047429 G C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 150047470 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 150047774 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150048205 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 150048310 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150048914 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150049066 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 150049171 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 150049650 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 150049724 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 150049750 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 150050000 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150050002 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150050172 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150050257 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150050370 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150050681 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150050682 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150051102 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 150051134 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150051264 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150051276 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150051361 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150051484 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 150051847 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 150051918 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 150052370 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150052630 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150052769 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 150052792 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 150052831 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 150053102 G T N N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 3 150053164 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 150053532 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150053587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150053725 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150053912 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150054480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150057555 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150057774 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 150058961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150059014 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 150060767 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150060894 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 150060933 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 150061101 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 150061106 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 150061421 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150061577 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 150061741 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150061771 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150061942 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 150062450 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 150062956 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 150063088 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150063128 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150063159 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 150063192 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 150063330 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150063479 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 150063549 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 150063647 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 150063737 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150064116 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150064117 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 150064273 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150064478 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150064482 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150064888 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 150064923 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150064930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150064946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150065029 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150065090 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 150065161 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150065230 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 150065257 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150066908 A T N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 3 150067104 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 150067530 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 150067863 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150068073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150068510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150068704 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 150068796 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150069199 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 150069616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150069987 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150070086 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150070911 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150070923 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150071272 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150071897 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 150072008 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 150072147 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 150072205 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 150072225 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 150072233 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 150072347 G T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 150072402 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 150072630 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 150072635 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150072643 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 150072743 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150072807 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 150072817 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150072941 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150073153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150073173 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150073434 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150073774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150073970 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150073992 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 150074139 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150074186 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150074192 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 150074272 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 150074349 T A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 150074437 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 150074594 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150074727 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 150074768 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 150074803 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 150074828 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 150074888 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 150075589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150075746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150075768 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150075774 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150075779 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150075790 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150075808 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 150075867 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 150075905 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150075951 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150075988 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150076092 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150076164 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150076310 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150076558 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 150076911 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 150076931 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 150077054 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150077090 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 150077288 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 150077375 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 150077491 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150077504 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150077646 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 150077760 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 150077771 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 150077854 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 150077971 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 150078055 A C Y N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0 0.833333333333333 0.166666666666667 5 7 0 5 1 3 150078346 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 150078368 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150078641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150078843 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150078910 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150079132 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150079338 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 150079369 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150079402 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150079755 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150079902 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 150079919 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 150079952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150079958 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 150079992 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 150080066 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150080179 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150080208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150080596 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150080717 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150081307 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 150081368 G T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 150081432 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 150081560 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 150081832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150082092 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 150082281 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 150082584 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 150082607 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 150082659 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 150083025 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150083233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150083270 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 150083301 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 150084149 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 150084176 C A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 150085025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150085391 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150085507 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150086090 T C Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 150086168 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 150086302 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150086739 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150087323 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150088745 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150089096 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150089267 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150089522 G T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 150089820 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150089944 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 150090713 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 150091667 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 150091724 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 150091741 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 150091787 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 150091790 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 150091955 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 150092222 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 150092408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150092707 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 150093370 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150093377 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 150093557 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 150093589 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 150093695 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150093706 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 150093710 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 150093761 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150093768 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150093797 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150093821 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 150093825 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150093841 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150093893 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150094586 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 150094641 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150095083 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150095729 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150096100 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 150096281 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 150096452 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150096569 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 150096582 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 150096642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150096684 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150096726 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150096791 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 150096804 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 150096831 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150096901 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150096965 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 150097074 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 150097106 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150097285 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 150097292 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 150097300 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 150097361 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 150097670 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 150097717 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 150097822 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 150098311 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150098564 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150098808 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150099168 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150099240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150099945 C G Y N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 150100117 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 150100157 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 150100467 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 150100469 G A N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 3 150100749 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 150100800 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 150100871 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 150101087 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 150102440 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150103113 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150103223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150103313 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 150105343 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 150105440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150105902 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 150105984 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150106397 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150106595 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150106810 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 150107020 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150107022 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 150107098 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150107245 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150109927 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150110839 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 150115653 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150115756 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150115957 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150117195 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150118145 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150118971 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150123057 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150128723 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 150128753 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150129701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150130133 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 150130681 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150130808 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150130839 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 150130887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150131973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150132031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150132780 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150134039 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150134756 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 150134787 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150136878 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 150137578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150139562 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150139691 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150139804 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150139811 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150139926 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150140041 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150140366 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150140391 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 150140392 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150140560 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 150140669 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150140732 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 150140908 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150140968 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 150140984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150141020 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150141088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150141201 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150141510 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 150141759 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150141923 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150142168 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150142306 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 150142365 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 150142400 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 150142626 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150142949 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 150143152 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150143625 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150143832 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150144724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150148851 G T Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 150148916 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150149303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150149678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150150044 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150150593 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150153940 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 150154867 A C N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 150154979 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 150155066 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 150155865 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150156764 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150156930 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 150157794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150158980 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150159537 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 150159608 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 150160138 T C N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 150160140 T G Y N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 3 150161508 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 150162867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150163081 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150163559 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 150164715 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150164838 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150164865 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150164899 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 150165046 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 150166786 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150166951 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 150167376 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 150168928 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 150169120 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 150169450 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150169465 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150169691 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 150169864 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150170155 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 150170169 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 150170223 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 150170868 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 150170946 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 150171140 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 150171147 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 150171175 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 150171301 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 150171456 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 150171614 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150171737 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150171760 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 150172209 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150172453 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 150172586 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150172603 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150172743 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 150172769 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150173182 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150173265 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150173275 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150173350 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 150173434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150173480 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150173521 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150173598 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150173720 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150173746 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150173953 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 150174204 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 150174643 T G N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 150174820 A T N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 150174839 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 150174921 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 150174996 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 150175155 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150175240 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 150175256 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 150175261 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 150175407 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 150175425 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 150175451 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 150175500 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 150175516 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 150175541 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 150175544 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 150175679 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 150175788 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 150175922 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150176259 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 150176389 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150176515 A G N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 150176516 G A N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 150176724 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150176782 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 150176783 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150176799 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 150176831 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 150176869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150176934 A G N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 150176983 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 150177017 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 150177160 T A N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 150177219 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 150177403 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 150177416 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 150177441 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 150177686 T G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 150177696 A T N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 150177992 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150178030 C T Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 150178315 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 10 22 0 10 6 3 150178328 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 150178686 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150178732 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 150178738 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 150178990 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 150179002 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 150179190 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150179214 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0 0.75 0.25 15 25 0 15 5 3 150179234 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150179441 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 150179442 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 150179507 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 150179533 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 150179667 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 150179902 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 150179927 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150179993 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 150180030 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 150180113 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 150180117 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150180265 T G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 150180619 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 150180678 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150180836 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150180997 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150181018 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 150181038 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 150181280 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 150181471 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 150181482 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150181623 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 150181699 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 150181938 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 150182025 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 150182029 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 150182445 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150184048 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 150185111 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150185952 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150186120 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150187662 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150188001 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150188253 C A N N 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 3 150189271 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150189284 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 150189828 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 150190681 A C Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 150190738 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150191415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150191590 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150193018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150195530 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150195543 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150195595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150196450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150197268 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150198664 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150198797 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150199151 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150199777 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150201261 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150201905 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 150202755 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 150204574 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150205990 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150206844 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150208784 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150208959 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150209587 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150209662 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150210191 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 150210207 C T N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 150210234 C T N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 3 150210399 A T N N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 3 150211104 T G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 150212737 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150213003 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 150213082 C T N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 150213223 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 150213662 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150213810 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 150213811 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 150213837 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 150214353 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150214435 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 150214507 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 150214774 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 150215339 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 150215745 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 150215762 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 150215795 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 150215813 A C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 150215814 C G N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 150215836 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 150215850 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 150216190 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150216861 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 150218902 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 150219008 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 150219156 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 150219549 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150219684 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 150220409 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 150220946 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 150220955 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 150221194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150221829 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 150221846 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 150222029 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 150222169 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 150222384 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 150222478 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 150222487 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150222587 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 150222671 A G N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 3 150222924 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 150223072 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 150223116 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 150223240 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 150223362 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 150223379 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 150223392 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 150223491 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 150224473 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 150224579 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 150224609 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 150224726 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 150225655 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150225701 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150225891 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 150226247 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 150226855 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 150227694 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150227907 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150227926 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 150228504 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 150228598 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 150229174 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150229622 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 150230377 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 150230527 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 150230783 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150231659 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 150236290 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 150236355 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 150236637 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150237598 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150238685 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150239275 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150239818 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 150240123 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150240140 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 150240203 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 150240327 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 150240378 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 150241196 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 150241562 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 150241599 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 150241690 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150241716 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150241935 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 150241953 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 150241974 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 150242061 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 150242093 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 150242204 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 3 150242353 G T N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 150242404 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150242618 T C N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.1875 0.625 0.1875 16 16 3 10 3 3 150242637 A T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 150242828 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 150242959 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 150243099 C T Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 150243105 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 150243131 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 150243192 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 150243253 G C Y N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 150243278 A G N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.230769230769231 0.615384615384615 0.153846153846154 14 12 3 8 2 3 150243324 G A N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 150243386 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 150243530 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 150243629 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 150243717 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150243721 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150243758 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150243789 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150243916 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150243996 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 150244060 T G Y N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.416666666666667 0.583333333333333 0 17 7 5 7 0 3 150244247 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 150244284 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 150244484 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150244521 C G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 150245424 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 150245436 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150245437 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150245491 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150245576 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150245647 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 150245724 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150245754 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 150245813 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 150245814 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 150245879 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 150245907 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 150245925 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 150246023 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 150246035 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 150246118 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150246148 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 150246560 G A N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 3 150246603 G A N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 150246677 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 150246691 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 150246730 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 150248852 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150249123 A G N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.230769230769231 0.538461538461538 0.230769230769231 13 13 3 7 3 3 150250557 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150251806 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150252277 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150252884 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150252941 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 150253077 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150253485 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 150254054 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 150254283 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 150254351 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 150254467 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 150254554 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150254564 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150254587 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150254603 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150254620 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150254747 G A N Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 150254830 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 150254869 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 150254874 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 150254930 T A Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 150254939 G T Y N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 150255035 A C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 150255056 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150255181 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150255297 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 150255348 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150255378 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150255503 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150255575 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 150255699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150255767 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150255777 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150255809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150257067 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 150257134 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150257876 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150258054 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150259042 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150260301 G A Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 150260611 A C Y N 0 REF 0.95 0.95 0 1 0 0 1 0 2 0 0 1 3 150260799 A G Y Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 13 7 4 5 1 3 150260842 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 150261251 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 150262272 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 150262412 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 150263808 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 150264112 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 150264396 T A N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 3 150264534 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 150264696 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 150264716 T C N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 3 150265117 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 150265149 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 150265271 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150265775 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150266052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150266355 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 150266431 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150267580 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 150267754 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150267793 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 150269960 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150270018 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150271049 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 150271051 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 150271296 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 150271325 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 150271377 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 150271378 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 150271866 A T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 150271918 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 150271992 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 3 150272017 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150272031 G T Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 150272055 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150272145 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 150272748 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 150272809 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 150272872 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 150272921 T A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 150273063 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 150273079 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 150273183 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 150273228 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150273292 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 150273402 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 150273467 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 150274309 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150274313 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 150274603 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150274668 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150275132 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150275262 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150275292 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150275356 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 150275376 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150275710 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 150275873 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150275875 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150275933 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 150276232 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150276348 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 150276354 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 150276844 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150277819 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 150278198 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 150278368 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 150278390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150278547 G T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 150278566 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 150278604 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 150278635 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 150278741 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150278757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150278867 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 150278904 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 150279229 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 150279251 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 150279274 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 150279298 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 150279315 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 150279321 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 150279582 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 150279797 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 150279816 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 150279842 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 150279859 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 150279874 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 150279974 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 150280018 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150280037 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 150280083 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 150280090 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 150280155 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 150280234 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 150280333 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 150280334 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 150280383 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 150280415 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 150280546 T A N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 150280678 A C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 150280726 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 150280749 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 150280753 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 150280774 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 150280838 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 150281087 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 150281106 G C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 150281116 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150281138 A T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 150281155 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 150281159 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 150281170 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 150281183 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 150281207 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 150281231 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 150281307 C G N N 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.538461538461538 0.230769230769231 0.230769230769231 17 9 7 3 3 3 150281357 A G N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 3 150281361 A G N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 3 150281386 T A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 150281392 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 150281397 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 150281448 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 150281524 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 150281525 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 150281581 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 150281665 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 150281713 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 150281717 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 150281794 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150281797 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150281875 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 150281913 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 150282168 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150282221 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 150282324 A C N N 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 150282351 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 3 150282407 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 150282600 T G N N 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 150282828 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 150283598 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150283625 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150283706 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 150283736 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 150284170 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150285680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150285733 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150285811 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150285927 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150286014 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150286022 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150286261 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150286292 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150286304 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150286340 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150286399 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 150286440 C G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 150286526 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 150286544 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 150286695 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150286745 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150286843 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150286918 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 150287699 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150288069 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150288118 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 150288595 G T N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 150288608 T G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 150288611 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 150288640 A T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 150288679 T A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 150288765 A G N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 3 150288929 A C N N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 150289043 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 150289505 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 150289748 T G N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.4375 0.1875 0.375 17 15 7 3 6 3 150289890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150289935 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 150291466 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150291518 C G Y N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 3 150292751 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 150293126 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150293563 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 150293941 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150294375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150294562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150295706 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 150295935 G C N N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0 0.5 0.5 2 6 0 2 2 3 150296467 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 150297139 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150299900 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 150300562 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 150300694 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150301034 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 150301209 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 150301456 T G Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 150301550 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150301628 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 150301693 A G Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 150302241 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150302389 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150303183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150303628 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150303640 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 150303822 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 150304472 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 150304679 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 150304775 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 150304886 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 150304889 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 150304996 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150305366 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 150305433 G T N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.1875 0.5625 0.25 15 17 3 9 4 3 150305457 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 150305477 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 150305621 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 150305770 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150305785 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150305810 A C N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 150305969 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 150305975 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 150306101 C G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 150306185 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 150306196 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 150306327 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 150306432 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150306450 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 150306723 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 150306853 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 150307006 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 150307062 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 150307081 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 150307138 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 150307337 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 150307414 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150307589 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 150307600 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 150307701 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150307755 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150307955 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 150308004 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 150308092 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 150308291 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 150308504 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 150308898 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 150308922 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150309084 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150309133 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 150309500 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150310315 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 150311985 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150314035 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150314783 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 150315468 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 150315538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150315694 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150316590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150316713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150316778 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 150316791 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 150316821 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150316921 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 150316994 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 150317027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150317123 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150317536 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150318178 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150318236 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150318247 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150318487 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150321346 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 150321361 C G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 150321401 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 150321424 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150321838 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.15 0.8 0.05 22 18 3 16 1 3 150321907 T A N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 150322041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150322087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150322106 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150323455 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 150323500 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 150323562 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 150323682 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150323702 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 150323827 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 150323935 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150324135 C A N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 150324195 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 150324339 A G Y Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 150324454 C A N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 150324603 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 150324625 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 150324681 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150324834 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150325163 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 150325515 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150326011 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 150326049 A C N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 150326277 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150326702 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150326761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150326820 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 150326842 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 150326909 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150327106 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150327177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150327968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150328005 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150328080 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 150328258 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150328390 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150328471 G T Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 150328572 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150328588 A T Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 150328757 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150328947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150328985 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 150329288 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 150329400 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 150331378 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150331981 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150332050 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150332451 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150333627 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 150333895 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150335200 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150335333 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150335604 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150335621 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150336095 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 150336138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150336690 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 150338595 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150339051 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 150339545 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 150340248 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150340390 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 150340593 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 150340725 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 150341024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150341379 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 150341436 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150341822 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 150342958 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150344546 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 150344636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150344779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150344920 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 150345166 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 150345167 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 150345178 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 150345270 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 150345619 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 150345649 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150345843 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 150345873 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 150346092 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 150346172 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 150346239 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 150346783 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 150346840 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150347190 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150347694 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 150348089 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 150348099 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 150348161 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 150348264 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 150348373 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 150348711 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150348870 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 150348949 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 150348977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150349043 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 150349100 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 150349178 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 150349206 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 150349228 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 150349369 C G N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.5 0.214285714285714 0.285714285714286 17 11 7 3 4 3 150349849 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 150349867 A T N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 150349892 T C N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 3 150349986 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 150350123 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 150350267 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 150350398 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 150350542 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 150350587 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 150350603 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 150350967 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150351278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150351705 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 150351708 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 150351869 T C N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 150352054 T C N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 3 150352305 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 150352324 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 150352336 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 150352423 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 150352468 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 150352476 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 150352567 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 150352656 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 150352814 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 150352851 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 150352865 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 150353049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150353066 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150353086 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 150353102 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 150353117 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 150353120 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 150353387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150353671 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150353757 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 150353939 G C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 150355079 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150355152 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150356075 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150356934 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150357096 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 150357520 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 150357862 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150357991 T A N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 150358335 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150358743 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150358932 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 150359794 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 150360519 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150360690 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 150360723 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150360823 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150360872 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150360977 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 150360996 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150361031 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 150361276 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150362126 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 150362312 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150362332 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 150362641 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 150363753 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150365623 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 150365725 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 150365902 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 150366252 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 150366911 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150366980 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 150367063 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 150367139 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 150367546 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150367689 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 150367706 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 150367730 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 150367875 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 150367876 C G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 150367889 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 150367928 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150367931 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 150368002 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 150368069 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 150368226 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 150368243 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 150368297 C A N N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 3 150368346 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 150368427 C A Y N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 3 150369052 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 150369257 T G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 150369703 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150369728 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150369871 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 150370347 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 150371004 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 150371084 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 150371085 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 150371565 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 150371857 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150371878 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 150371918 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 150372083 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 150372183 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 150372296 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 150372384 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 150372392 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150372748 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150372996 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 150373078 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 150373359 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 150373459 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 150374002 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150374198 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150374233 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 150374851 T G Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 150374892 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 150375098 G T N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 3 150375120 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 150375136 G T N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 150375165 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 150375180 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 150375185 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 150375196 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 150375285 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.315789473684211 0.684210526315789 0 25 13 6 13 0 3 150375298 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 150375423 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 150375433 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 150375436 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 150375466 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 150375596 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 150375616 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 150375625 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150375707 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 150375716 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 150375794 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 150375811 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 150375947 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 150376091 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 150376212 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150376316 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150376327 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 150376604 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 150377004 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150377087 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 150377394 G T Y N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 150377449 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 150377485 A G Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 150377542 A C Y N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 150377699 T G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 150378148 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 150378318 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150378499 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 150378797 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150379416 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 150379830 A C Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 150379943 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 150380412 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150380538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150380648 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 150380661 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150380686 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 150380782 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 150380820 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 150381020 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 150381190 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150381243 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 150381307 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 150381391 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 150381406 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150381422 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150381425 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150381653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150381656 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 150381727 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150381770 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150381799 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150382117 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150382179 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150382187 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150382200 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150382312 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 150382334 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150382341 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150382348 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 150382430 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150382487 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150382506 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150382569 T C Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 150382637 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150382669 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 150382860 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150382906 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 150383030 C G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 150383331 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150383628 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 150383650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150383691 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 150383692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150384016 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 150384077 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 150384086 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150390158 T C N Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 6 8 1 4 2 3 150390257 C T Y Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 150391202 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 150391217 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 150391600 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 150391610 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 150391616 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 150391734 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 150391741 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 150392067 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 150392371 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 150392403 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 150392412 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 150392432 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 150392593 A G N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 150392610 T G N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 150392642 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 150392717 A G N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 3 150392860 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 150392948 A G Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 150393121 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 150393192 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 150393346 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 150393375 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 150393386 C T N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.117647058823529 0.529411764705882 0.352941176470588 13 21 2 9 6 3 150393410 G T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 150393431 T G N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 150393641 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 150393696 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 150394131 A C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 150394209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150394221 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 150394249 T G Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 150394287 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150394378 G C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 150394388 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 150394629 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 150394646 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 150394647 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 150394673 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 150394835 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150394858 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 150394925 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 150394937 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150395006 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150395090 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150395156 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 150395323 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 150395347 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150395414 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 150395472 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 150395497 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 150395508 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 150395878 T C N Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 150395897 A G N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 3 150395919 A T Y N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 150395941 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 150396029 G T Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 150396059 T G Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 150396274 G C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 150396678 A C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 150396953 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 150397897 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 150398568 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150400300 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150400356 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150400370 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150401291 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150403025 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 150403029 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 150403760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150410823 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 150412056 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150412195 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150413265 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150414671 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150414674 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150414686 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150414692 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 150414770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150415131 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150415154 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150415187 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150415512 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 150417553 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150418013 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150418577 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150418587 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 150418647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150419183 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150420000 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150420153 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150420554 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150420613 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150420984 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150422061 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 150425272 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 150425998 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 150426222 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 150426334 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 150426375 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 150426603 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150427596 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150427609 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 150428388 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 150428607 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 150429252 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 150429318 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 150429364 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 150429374 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 150429523 G A N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 3 150429907 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 150430125 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 150431905 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150432691 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150432906 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150433043 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 150433147 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 150433880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150434434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150435228 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 150436949 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150439584 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150441341 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150441395 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150441771 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 150441803 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 150441833 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150441921 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 150441937 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 150441946 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 150441956 G T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 150442058 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150442063 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 150442081 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 150442094 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150442131 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150442152 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150442155 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150442202 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150442261 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150442294 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 150442452 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150442455 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 150442475 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150442506 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150442512 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150442525 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150442598 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 150442632 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150442639 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150442809 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150442811 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150442824 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150442854 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150442946 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150442983 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150443113 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150443134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150443194 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150443210 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150443230 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150443291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150443520 G T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 150443656 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 150443711 G T N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 150443863 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150443953 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 150443960 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150444005 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150444078 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150444144 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 150444314 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 150444320 A T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 150444555 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 150444558 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 150444785 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.3125 0.625 0.0625 20 12 5 10 1 3 150444852 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 150445149 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 150445300 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 150445318 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 150445459 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150445847 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150445888 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150446174 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150446199 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 150446202 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 150446220 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 150446411 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150446470 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 3 150446485 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150446491 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150446993 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 150447463 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150447569 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 150447863 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150447999 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150448146 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 150448370 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 150448569 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 150448875 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150449005 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150449319 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150449573 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150449620 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150449684 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150449883 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150449987 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 150450168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150450292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150450603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150451309 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150452341 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 150452453 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150452765 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150453004 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150460266 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150460297 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150460586 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 150461266 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150461319 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 150461339 C A N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 150462152 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150463183 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150463591 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 150464562 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150464799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150465835 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150466352 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150466364 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150467537 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150468901 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150471284 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 150472635 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150478358 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150478752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150480028 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150481463 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150481592 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150481898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150482514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150482797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150483484 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150484106 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150484802 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150486766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150486774 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150487092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150487200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150489637 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150489696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150491230 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150491769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150492290 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150492321 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 150492500 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 150492535 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 150492653 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 150492791 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 150493007 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150493032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150493181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150493465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150494052 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150494125 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150494164 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150494314 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150495263 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150496423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150497267 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150498937 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150499157 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150500097 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150500768 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 150500798 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 3 150501555 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150502083 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 150502910 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150503936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150506071 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150506111 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150506490 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 150507136 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150507168 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 150507798 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150507820 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 150507821 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 150507994 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 150508143 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150508193 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 150508195 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 150508401 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 150508456 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150508513 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.0555555555555556 0.666666666666667 0.277777777777778 14 22 1 12 5 3 150508753 A G N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0 0.785714285714286 0.214285714285714 11 17 0 11 3 3 150508770 C T N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.133333333333333 0.6 0.266666666666667 13 17 2 9 4 3 150508812 G A N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.714285714285714 0.285714285714286 10 18 0 10 4 3 150508813 G A N Y 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0 0.714285714285714 0.285714285714286 10 18 0 10 4 3 150508858 C A N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0 0.692307692307692 0.307692307692308 9 17 0 9 4 3 150508895 G A N Y 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.0769230769230769 0.692307692307692 0.230769230769231 11 15 1 9 3 3 150508963 A C N N 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 7 9 0 7 1 3 150509130 G A N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0 0.545454545454545 0.454545454545455 6 16 0 6 5 3 150509232 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 150509283 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 150509319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150509331 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 150509379 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 150509426 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 3 150509486 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 150509949 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150509990 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 150510067 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150510160 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 150510640 T A N N 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 6 8 1 4 2 3 150511870 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 150511921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150512368 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150512441 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150513800 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150515665 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150515715 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150516173 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150516713 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150516752 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 150517098 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 150517400 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 150517652 T A Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 150517728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150517963 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 150518858 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 150518946 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150519306 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 150519367 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 150519636 A T N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 150519642 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 150519844 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 150519894 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 150520207 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150520754 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 150521190 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 150521210 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 150521429 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150521461 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 150521623 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 150521636 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 150521697 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 150522584 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150522707 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 150522872 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 150523126 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150523597 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 150523762 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 150524231 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150525331 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150526801 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150528330 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150529400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150529591 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150529615 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 150530649 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150530943 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150531338 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 150531884 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150532420 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150532589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150532824 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150533982 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150534280 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 150534620 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 150534915 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150536094 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150539109 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150540235 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150541200 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150541327 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150541505 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150541521 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150541564 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 150541581 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150541643 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 150541720 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 150541794 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 150541900 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 150541912 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 150541941 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 150541998 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150542007 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150542117 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 150542121 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 150542194 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150542208 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150542237 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150542250 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150542272 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150542317 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150542501 T G N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 150542542 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 150542748 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150542868 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 150542900 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150543063 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150543113 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150543224 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 150543232 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 150543401 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 150543557 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 150543667 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 150543744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150543787 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150543898 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 150543918 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 150543962 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 150543994 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150544207 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150544229 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150544455 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150544458 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150544653 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 150544790 C T Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 150544933 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 150545760 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150545845 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150545887 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 150545962 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 150546005 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 150547166 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 150547263 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150547488 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 150547943 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150548040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150548067 A T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 150548138 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 150548227 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150548274 A T N N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 150548330 C G N N 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 10 14 2 6 4 3 150548542 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 150548935 G C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 150548971 G C N N 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.214285714285714 0.5 0.285714285714286 13 15 3 7 4 3 150549164 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 150549334 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 150549443 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150550036 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 150550109 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150550114 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150550565 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 150550591 A G N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 150550883 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150551225 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 14 18 0 14 2 3 150552018 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150552096 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 150553085 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 150553098 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150553330 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150553355 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 150553543 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 150553650 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 150553666 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 150553748 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150553858 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150554014 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150554292 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150554356 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150554477 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 150554478 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 150554499 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150554616 A T N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 150554643 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 150554686 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150554741 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 150554813 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 150554857 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150554917 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150555116 G C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 150555127 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 150555242 G A N Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.153846153846154 0.615384615384615 0.230769230769231 12 14 2 8 3 3 150555339 G T N N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.153846153846154 0.538461538461538 0.307692307692308 11 15 2 7 4 3 150555402 G T N N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 8 12 1 6 3 3 150555404 A C N N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 8 12 1 6 3 3 150555481 C A N N 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 8 10 1 6 2 3 150555502 T G N N 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 6 14 1 4 5 3 150555633 A T N N 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 6 8 1 4 2 3 150555639 T C N Y 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 6 8 1 4 2 3 150555789 T C N Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 3 150555858 T C N Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.357142857142857 0.5 0.142857142857143 17 11 5 7 2 3 150555860 T C N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.384615384615385 0.461538461538462 0.153846153846154 16 10 5 6 2 3 150556041 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150556089 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 150556290 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 150556347 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 150556392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150556404 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150556561 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150556620 C A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 150556632 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150556676 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150556765 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150556859 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 150556873 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150557081 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 150557131 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 150557181 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 150557271 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 150557272 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 150557307 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 150557442 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 150557453 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 150557473 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 150557526 T A N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 150557590 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 150557653 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 150557711 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 150557712 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 150557745 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150557763 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150557824 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150557859 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 150557923 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150558161 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150558189 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 150558212 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150558215 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150558231 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150558300 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 150558352 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150558498 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150558561 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 150558704 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150558768 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150558803 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 150558812 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150558886 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 150558887 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 150558930 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150559064 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150559108 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150559128 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150559153 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 150559239 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 150559268 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150559390 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 150559392 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150559437 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150559519 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150559591 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150559635 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 150559636 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 150559721 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 150559813 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 150559936 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 150560001 C T N Y 0.454545454545455 REF 0.45 0.45 0.454545454545455 0.545454545454545 0.272727272727273 0.363636363636364 0.363636363636364 10 12 3 4 4 3 150560065 A G N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 3 150560071 A G N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 3 150560100 T A N N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0.0909090909090909 0.363636363636364 0.545454545454545 6 16 1 4 6 3 150560119 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 150560165 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 150560193 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 150560281 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 150560414 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 150560448 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150560509 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150560560 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150560746 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 150560781 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150560885 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150561063 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150561284 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150561444 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150561570 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150561636 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150561659 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 150561788 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 150562006 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150562127 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 150562406 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150562744 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150562912 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150563567 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150563809 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150563869 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 150564055 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 150564597 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150564793 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150564812 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150564859 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 150564896 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 150565580 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 150566487 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 150567486 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 150567854 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150567926 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150568814 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 150568844 A G Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 150568987 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150569169 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 150569743 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 150569789 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 150569972 T A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 150570105 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 150570186 G T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 150570492 T A N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 150570753 A C Y N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 150572125 T C Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 150572735 A C Y N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.333333333333333 0.166666666666667 0.5 5 7 2 1 3 3 150572756 C G N N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 3 150572808 C G Y N 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.2 0.7 0.1 11 9 2 7 1 3 150573456 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 150573489 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 150573896 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 150573924 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 150574001 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 150574152 G A Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 150574193 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 150574579 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 150574598 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 150574753 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 150575068 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 150575090 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150575391 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 150576573 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150576728 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150576746 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 150577217 A C N N 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0.0833333333333333 0.5 0.416666666666667 8 16 1 6 5 3 150577270 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 150577380 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150577955 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150578060 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 150578120 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150578200 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 150578422 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150578763 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150578797 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150578810 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 150578926 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150579061 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 150579062 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 150579171 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150579208 T G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 150579533 C A N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 150579586 C T N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 150579622 A G N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 3 150579671 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 150579759 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 150579773 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150579901 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 150580059 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150580081 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 150580149 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150580194 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 150580199 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150580214 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 150580244 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150580252 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150580286 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150580335 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 150580338 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 150580348 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 150580349 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 150580373 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150580418 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150580460 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150580473 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150580891 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150580969 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 150581159 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 150581167 T C Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 150581241 A C Y N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 3 150581242 A C N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0 0.5 0.5 6 18 0 6 6 3 150581647 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150581697 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150581787 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150581791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150581872 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150582167 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150582785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150585691 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 150585697 T A Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 150585916 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 150586475 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 150587229 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 150587409 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 150588585 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150588983 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150589924 T C Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 150590723 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 150590868 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150591523 G C Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 150591847 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 150591852 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150592596 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150592857 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150594116 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 150594212 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 150595032 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 150596195 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 150596790 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150598554 G T Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 150599533 T C Y Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 3 150599652 G A N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 3 150600100 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150601047 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150603443 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150604400 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 150604914 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 150605101 C T N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 150605456 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 150605757 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150606500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150606946 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150607328 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150607724 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150612759 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150613302 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 150614487 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 150614634 G C Y N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 150614686 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150614712 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150614771 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150615175 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150615209 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 150615776 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 150615801 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150615936 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 150615967 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 150616120 T G Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 150616495 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150617124 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 150617253 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 150617844 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150619179 C A N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 150619301 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 150619441 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 150619510 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150619612 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 150619666 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150619677 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 150619724 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150619806 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 150620098 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 150620113 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 150620168 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 150620201 A G Y Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 150620222 T A Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 150620252 A T Y N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 150620285 G A Y Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 150620411 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 150620431 T C Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 150620465 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150620486 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 150620529 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 150620559 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 150620684 T A Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 150620757 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 150620800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150620853 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 150620898 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 150620911 T G Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 150621075 A G Y Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 150621153 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 150621307 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150621338 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 150621406 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 150621442 C A Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 150621484 G A Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 150621489 C T Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 150621516 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 150621854 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 150621869 A C N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 150621921 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 150621949 G A N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 3 150621950 T C N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 3 150622033 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 150622053 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 150622123 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 150622143 T C Y Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 3 150622161 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 150622171 T A Y N 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0 0.545454545454545 0.454545454545455 6 16 0 6 5 3 150624007 A G N Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 8 8 2 4 2 3 150624124 G A Y Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 150624147 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 150624177 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150624183 C A Y N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 150624296 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 150624309 T C Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 150624362 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150624384 C A Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 150624441 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 150624566 T C Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 150624621 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 150624790 G A Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 150625023 T A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 150625153 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 150625300 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 150625468 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150625582 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150625640 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150625762 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150626137 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150626150 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150626447 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150626834 C A Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 150627118 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150627447 T C Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 150628434 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150629742 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150631512 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150631691 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150631848 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150633801 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150634317 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150634791 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 150634895 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 150638357 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150638979 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150639222 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 150639606 A C N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 150640026 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150640406 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150640759 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150642433 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150642827 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150642954 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150643058 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 150643062 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 150643075 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150643264 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 150643285 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150643366 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150643391 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150643666 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 150643687 G C N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 150643699 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 150643829 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150644298 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150644326 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150644365 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150644421 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150644991 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150645011 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150645035 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 150645875 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 150646421 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150646457 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150646509 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150646527 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 150646626 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150647084 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150647110 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150647184 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150647328 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150647367 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150647505 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150647520 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150647532 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150647585 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150647592 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150647620 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150647792 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150647832 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150647853 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150647887 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 150647888 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150647901 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150647922 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150647945 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150648008 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150648041 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150648079 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150648088 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 150648104 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150648126 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150648148 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 150648289 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150648376 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150648394 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 150648435 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150648475 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150648478 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 150648487 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 150648535 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150648558 A C Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 150648684 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 150648692 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 150648724 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150648861 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150648981 T A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 150649075 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150649215 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150649240 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150649310 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150649316 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150649337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150649369 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150649377 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150649385 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150649409 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150649492 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150649510 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150649511 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150649606 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150649622 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150649753 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 150649768 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150649782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150650109 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150650185 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150650280 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150650340 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 150650370 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 150650374 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 150650488 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150650929 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 150650968 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150652679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150652793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150652851 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150653638 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150654675 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150655081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150655514 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150656548 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150658167 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150659007 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150659127 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150659189 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 150659204 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 150659798 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150659890 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150659980 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150659991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150660081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150660244 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150660320 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 150660436 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150660710 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150661292 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 150661347 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 150662324 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150662490 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150662663 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150663450 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150665220 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150665291 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150665979 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150666408 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150666713 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150666981 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150667294 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 150667622 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 150667661 A G Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 150668095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150668679 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 150668919 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 150668962 A C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 150669063 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 150669220 A G N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.4375 0.25 0.3125 18 14 7 4 5 3 150669244 G A N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 3 150669401 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 150669415 G C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 150669576 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 150669616 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150669628 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150669651 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150669682 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 150669713 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 150669753 A T Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 150669757 A T Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 150669966 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150670205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150670352 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150671120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150671663 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150673308 T A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 150673402 A G N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 150673710 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 150673929 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150673987 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150674129 A G Y Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 150674617 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 150674700 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 150674889 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 150675002 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 150675488 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 150675543 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 150675553 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150675557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150675564 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150675609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150675672 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150675801 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150675876 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 150675928 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150676236 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150676538 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150676658 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 150676854 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 150677224 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150677269 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 150677332 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150678262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150678274 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150678611 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 150678775 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 150679727 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 150680414 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 150681025 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150681438 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 3 150681821 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 150682142 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 150682532 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 150682544 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 150683052 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 150683538 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 150683569 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 150684014 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 150684144 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 150684527 A G N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 150684561 G A N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 150685064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150685587 T G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 150685674 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0666666666666667 0.2 0.733333333333333 5 25 1 3 11 3 150685679 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 150685843 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150685990 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150686307 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 150686529 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150686700 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150686712 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150686738 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150686914 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150686958 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150686966 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150686979 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150687005 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150687067 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 150687124 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150687243 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150687289 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150687301 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 150687345 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 150687367 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 150687373 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 150687402 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 150687539 G A N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 150687750 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 150687824 C T N Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 150687830 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 150687925 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 3 150688122 C A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 150688123 A G N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 150688136 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 150688184 T G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 150688207 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 150688210 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 150688299 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 150688536 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150688589 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 150688597 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 150688609 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 150688805 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 150688833 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 150688846 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 150688988 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 150689017 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150689054 A G N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 3 150689142 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 150689206 T C N Y 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.142857142857143 0.428571428571429 0.428571428571429 5 9 1 3 3 3 150689469 G A N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0 0.5 0.5 3 9 0 3 3 3 150689502 C T N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 150689527 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 150689849 T C Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 150690002 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150690260 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 150690391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150690489 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150690617 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150690669 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 150690992 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150691094 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150691254 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150691291 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150691494 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 150691577 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150691726 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150691771 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 150694861 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150695075 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 150695086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150695399 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150695429 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150695601 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150695642 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150695720 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150695778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150695814 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150695859 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 150696301 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150696446 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150696693 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150696769 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150697053 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150697143 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150697278 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150697752 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150697944 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150698023 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150698083 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150698145 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150698169 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150698179 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 150698220 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 150698325 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 150698776 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150698928 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 150698989 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150699048 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150699053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150699456 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150699673 A G Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 150699860 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150700049 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150700354 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 150700397 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 150700462 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 150700494 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 150700514 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 150700676 C A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 150700718 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 150700737 C A N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 150700803 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 150700823 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 150700824 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 150700847 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 150700924 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 150700965 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 150700973 G T Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 150700977 T C Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 150701153 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 150701312 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 150701356 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150701406 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 150701426 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 150701555 G C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 150701556 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 150701627 A C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 150701671 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 150701672 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 150701684 C A N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 150701787 C A N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 150701807 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 150701896 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 150701904 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 150701908 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 150701919 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 150702011 A C Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 150702199 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150702651 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150702740 C A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 150702845 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 150702898 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 150703006 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 150703138 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 150703458 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 150703459 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 150703471 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150703495 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150703529 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150703715 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 150703853 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 150703861 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 150704015 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 150704081 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 150704108 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 150704162 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150704364 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 150704620 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 150704694 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150704709 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 150704722 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 150704799 T G N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 150704801 G T N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 3 150704816 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 150704842 A G N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 150704881 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 150705058 T A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 150705175 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 150705215 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 150705234 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 150705258 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150705396 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150707986 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150709214 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 150709643 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150709737 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150709989 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150710381 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 150710439 G A Y Y 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 150710643 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 150711354 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 150711791 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150711835 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150711887 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150711947 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150711961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150711979 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150712247 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150712268 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 150712280 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 150712344 A T Y N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 150712405 A G Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.75 0.0833333333333333 0.166666666666667 19 5 9 1 2 3 150712499 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 150712545 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 150712567 A T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 150712624 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 150712638 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 150712660 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 150712870 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150712938 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150712951 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150713077 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 150713095 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 150713098 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 150713121 G T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 150713408 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 150713430 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 150713442 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 150713463 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150713530 T G N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 150713560 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 150713830 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 150713976 T A Y N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 9 9 2 5 2 3 150714027 C T N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 150714042 C T N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 150714083 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 150714087 G C N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 150714112 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 150714134 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 150714146 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 150714160 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150714161 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 150714252 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 150714276 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 150714311 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 150714488 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150714557 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150714667 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150714683 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 150714872 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150715817 T G Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 150715939 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150716514 T A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 150716792 T C Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 150716900 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 150716953 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 150717958 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150717984 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 150718008 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 150718078 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150718081 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150718089 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150718104 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150718195 T C N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.384615384615385 0.230769230769231 0.384615384615385 13 13 5 3 5 3 150718240 G A N Y 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 150718269 C A N N 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.428571428571429 0.142857142857143 0.428571428571429 7 7 3 1 3 3 150718282 G T N N 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 150718411 C G N N 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 3 150718431 C A N N 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 6 10 1 4 3 3 150718753 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 150719740 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150719864 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150719989 G T Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 150720047 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 150720056 T A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 150720484 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 150720568 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 150720573 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 150720660 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150720707 G A N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.666666666666667 0.133333333333333 0.2 22 8 10 2 3 3 150721112 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 150721192 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150721744 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150721761 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150722334 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150722753 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150722926 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150723086 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150723140 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150723168 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150723177 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150723245 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 150723303 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 150723353 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150723360 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150723484 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150723491 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150723596 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150723624 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 150723812 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 150723853 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 150723885 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 150723949 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 150724097 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 150724358 A T Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 150724521 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 150724539 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150724776 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 150725145 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 150726127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150726378 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150727023 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 150728414 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 150728512 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 150728711 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150728721 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150730086 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150730309 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150730808 G C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 150731328 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150732956 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150733085 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 150734504 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150735105 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 150735434 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 150736521 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150736561 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150736922 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150737180 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 150737390 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150737502 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150737555 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150737858 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150739282 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 150739321 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 150739338 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150739708 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150739821 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150748016 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150748123 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150749091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150749335 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 150749450 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150749564 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150749755 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 150750064 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150750088 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150750089 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150750145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150750195 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150750258 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150750262 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150750329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150750365 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150750376 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150750442 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150750452 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150750458 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 150750469 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150750533 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150750597 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150750657 G T N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 150750686 T A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150750715 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150750722 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150750739 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150750741 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150750785 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 150750818 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150750890 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150750910 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150750920 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150750947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150750954 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150750964 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 150750980 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150750987 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150751192 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150751241 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150751335 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150751343 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150751387 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150751477 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150751520 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 150751541 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 150751562 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150751564 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150751600 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150751674 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 150751720 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 150751735 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 150751838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150751873 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150751880 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150751937 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 150752120 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150752219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150752258 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150752313 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150752335 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150752403 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150752430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150752474 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150753185 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150753215 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 150753263 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 150753264 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 150753291 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150753414 C T N Y 0.45 ALT 0.5 0.5 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 11 9 4 3 3 3 150753452 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 150753596 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150753670 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 150753698 C A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 150753769 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 150753794 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 150753881 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 150753954 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 150754045 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 150754114 T C N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 150754139 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 150754177 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150754312 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 150754387 A T N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 150754480 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 150754498 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 150754523 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 150754537 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 150754602 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 150754615 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 150754662 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 150754669 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 150754774 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 150754788 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150755005 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150755250 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 150755277 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150757120 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150760099 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 150760632 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150761277 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150761326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150761354 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150761639 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150761862 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 150762324 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150763329 T A N N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 150764405 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 150764419 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150764681 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150764800 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150765298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150765822 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 150766169 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150766605 C A N N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 150766671 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150766713 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150767150 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 4 8 0 4 2 3 150767608 T G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150768146 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 150768184 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 150768706 A T Y N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 150769517 T A Y N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 3 150769609 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 150770325 A G Y Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.266666666666667 0.266666666666667 0.466666666666667 12 18 4 4 7 3 150770923 A G Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 150772017 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 150772785 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150772934 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150773133 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150777423 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150778153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150778191 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150780146 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150780400 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150781323 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150782928 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150783844 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150784310 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 150784433 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150784867 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150785141 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 150785318 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150785400 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 150785447 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150785583 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 150786302 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 150787180 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150787521 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 150787887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150789007 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 150789323 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150790584 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 150790588 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 150790609 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 150790647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150791271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150792280 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150792471 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150794112 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 150794354 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150794407 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150795062 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 150795359 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150795364 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 150795483 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 150795546 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 150796267 T G N N 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 6 10 1 4 3 3 150796433 C T N Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 3 150796874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150797992 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150798189 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150798484 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150798958 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150799312 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150799663 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150799671 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150799773 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150800226 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150801022 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 150801678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150802697 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 150803672 T G Y N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 150803825 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 150804646 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 150804770 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 150808572 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 150808667 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 150809786 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150810014 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150810054 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 150810295 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 150810373 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 150810403 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150810543 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 150810716 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 150810826 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 150811283 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 150811885 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150812242 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150812246 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 150812368 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 150812503 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150814242 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 150815144 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150815583 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150815589 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150816126 A T Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 150817188 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150817232 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150817277 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150817283 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 150817483 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150817929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150818129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150818133 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150818814 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150819768 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150821107 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150822055 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150822284 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150823445 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150823453 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150824383 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150825089 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 150827169 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 150827216 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150827371 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150827553 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 150828330 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 150828566 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150828652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150829290 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150830088 G C Y N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 150830605 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150830893 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150831230 C G Y N 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 150831490 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150831592 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150831658 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150832027 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 150832055 A T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 150832103 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150833379 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150833504 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150833921 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150834433 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150835224 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150835586 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150835661 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150835706 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 150836294 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150837232 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150837358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150837911 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150839417 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150839758 G T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150839821 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150839845 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 150842028 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 150842088 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 150842303 A G Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 150843643 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150844083 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150844130 A T Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 150844371 G A N Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 150844470 T C N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 150844805 T A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 150847439 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150847784 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 150848591 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150848982 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 150848994 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 150849147 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 150849617 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 150849638 T G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 150849883 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 150849940 T C Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 150849967 T G N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 150849979 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 150850093 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150850219 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150850335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150850382 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 150850575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150851167 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150851928 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150852051 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 150852057 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 150852439 G A Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 150852493 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150852503 C G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 150852512 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 150852519 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 150852536 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150852564 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 150852638 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150852701 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150852738 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150852794 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150852815 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 150852829 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150852848 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150852881 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150852910 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150853292 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150853377 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150853397 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150853440 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150853600 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150853672 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150853722 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150853749 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150853801 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150853896 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150853921 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150853955 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150854104 T C N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 150854439 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 150854824 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150855274 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150855343 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 150855403 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150855447 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150855509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150855602 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 150855684 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150855760 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 150855795 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150855883 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150855905 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150856011 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150856104 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 150856138 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150856147 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150856170 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150856227 G T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 150856428 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150856538 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150856546 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 150856630 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 150856683 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 150856687 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 150856857 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 150856861 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150856945 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150856956 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 150857086 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 150857133 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 150857185 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150857409 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 150857491 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150857532 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 150857582 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150857652 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 150857672 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 150857694 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 150857700 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150857790 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150857839 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150858011 A T N N 0.428571428571429 REF 0.65 0.65 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 6 8 2 2 3 3 150858041 T A N N 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 6 10 2 2 4 3 150858255 G A Y Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.625 0.125 0.25 11 5 5 1 2 3 150858306 T A N N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 5 11 2 1 5 3 150858443 A G N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 6 10 2 2 4 3 150858535 A G N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 5 11 2 1 5 3 150858570 C T N Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 6 10 2 2 4 3 150858651 A G N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 5 11 2 1 5 3 150858652 A G N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.25 0.125 0.625 5 11 2 1 5 3 150858735 T C Y Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 6 10 2 2 4 3 150858784 T A N N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 3 150858817 T A N N 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 3 150858909 T C N Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 3 7 1 1 3 3 150860139 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 150860528 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150861008 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 150861220 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150861231 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150861244 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 150861367 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 150861388 C T N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 150861802 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 150861961 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150861972 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 150862154 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150862308 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150862339 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 150862988 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 150863188 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 150863468 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 150863742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150863840 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 150863874 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 150863904 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 150863925 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 150864040 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150864138 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150864153 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150864232 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150864259 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 150864315 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150864472 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150864487 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150864583 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150864714 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150864735 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150864828 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150864831 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150865112 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150865117 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150865191 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150865216 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150865238 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150865316 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150865384 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 150865837 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 150866214 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 150866304 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 150866343 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150866380 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 150866542 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 150866547 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 150866609 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 150866750 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150866757 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150866764 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 150866847 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150866889 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150866908 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150866923 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 150866951 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 150867269 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 150867519 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 150867558 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150867610 C G N N 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 150867658 C A N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 150867691 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 150867725 T A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 150867823 A G Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 150867883 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 150867899 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150867920 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 150867925 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 150867942 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 150868095 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 150868230 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150868248 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 150868450 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 150868457 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 150868620 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 150869005 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 150869006 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150869156 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 150869361 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 150869369 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 150869413 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 150869426 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 150869977 C T Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 150869995 A G Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 150870021 G T Y N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 150870062 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 150870323 T G Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150870455 G C Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150870493 A T Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150870696 G A Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 150870963 T C Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150871023 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150871039 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150871296 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150871565 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 150871642 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 150871744 G A N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.181818181818182 0.0909090909090909 0.727272727272727 5 17 2 1 8 3 150871851 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150872098 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 150872171 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 150872253 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150872294 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 150872354 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 150872392 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150872510 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150872531 C T N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 150872859 C A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 150872936 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150873190 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 150873289 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150873385 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150873741 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150873849 C G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 150874205 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 150874464 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150874532 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150874543 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150874591 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150874733 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150874890 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150874898 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150874980 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150875060 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150875067 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150875073 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150875107 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150875193 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 150875250 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 150875279 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 150875291 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 150875361 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 150875378 C G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 150875395 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 150875399 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 150875429 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 150875455 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 150875466 C A N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 150875481 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 150875661 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150875752 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150875878 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150875901 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150875982 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150875998 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150876184 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150876762 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150876916 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150877111 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150877192 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150877266 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150877329 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 150877340 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150877585 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150877609 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 150878640 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 150878655 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150878662 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 150879152 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 150879210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150880324 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150880498 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150880582 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150882269 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150882488 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 150882514 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 150882521 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 150882582 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150883502 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150883509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150886047 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 150887761 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150887762 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150888246 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150888275 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 150888288 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150890087 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150890264 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150890274 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 150890282 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 150890754 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 150891010 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 150891096 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 150891562 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 150891565 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 150891613 A T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 150891812 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 150891848 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 150891908 A G N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 150892198 A G N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 150892378 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 150893028 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 150893967 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150896025 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150900761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150902722 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 150906072 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150907777 A C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 150907803 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150908207 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150909786 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 150909899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150909909 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 150910316 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150911881 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150912515 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150912943 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 150913932 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150914300 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 150914421 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150914628 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150915323 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150915778 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150916749 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 150917000 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 150918056 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150918558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150919662 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 150919758 C A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 150919809 G T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 150920004 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 150920005 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 150920043 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 150920781 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 150921468 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 150921485 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150922479 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 150922896 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150923121 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 150923614 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.210526315789474 0.631578947368421 0.157894736842105 20 18 4 12 3 3 150924258 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 150924277 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 150924451 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 3 150924484 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150924499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150924505 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150924559 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 150924565 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 150924590 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 150924642 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150924897 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 150924912 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 150924934 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 150925000 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 150925243 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 150925246 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 150925344 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 150925619 G T Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 150925631 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 150925648 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150925862 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 150925877 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 150925913 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 150925949 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 150925997 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 150926033 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150926048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150926054 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 150926256 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150926623 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150926736 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 150926751 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 150926984 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 150927087 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 150927134 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 150927167 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 150927293 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 150927430 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 150927568 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 150927594 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 150927629 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150928048 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.25 0.65 0.1 23 17 5 13 2 3 150928197 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 150928246 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 150928392 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 150928406 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150928412 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150928428 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 150928490 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 150928515 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 150928691 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 150928752 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 150928781 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 150928830 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 150928833 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 150928977 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 150928986 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150929048 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 150929049 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 150929065 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 150929067 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 150929222 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 150929256 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 150929281 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150929300 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150929323 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 150929332 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150929347 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150929361 T C N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 150929393 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150929412 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 150929418 A C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 150929436 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 150929528 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150929552 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 150929703 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 150929781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150929847 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150930430 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150930462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150930627 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 150930745 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 150930763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150931188 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 150931192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150931207 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 150931277 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 150931299 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 150931374 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 150931381 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 150931418 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 150931450 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 150931485 C T N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.3125 0.5625 0.125 19 13 5 9 2 3 150931501 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 150931502 T C N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 150931560 T C N Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 3 150931674 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 150931727 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 150931775 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 150932033 T C N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0.4 0.6 4 16 0 4 6 3 150932468 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 150932506 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 150932594 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 150932680 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 150932682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150932694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150932695 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 150932747 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 150932758 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 150932817 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 150932913 G A N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 3 150933323 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 150933453 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 150933535 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 150933571 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 150933594 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 150933665 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 150933831 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 150933850 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 150934254 T A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 150934269 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 150934455 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 150934700 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 150934703 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150935160 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 150935220 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 150935228 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 150935310 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150935330 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150935349 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 150935393 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 150935493 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 150935566 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 150935582 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 150935599 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 150935626 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 150935958 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150936057 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 150936140 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 150936853 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 150937058 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 150937406 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 150938096 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 150938259 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 150938441 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 150938454 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150938969 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 150939147 A C N N 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 150939261 C G N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 150939464 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 150939530 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 150939603 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150939608 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 150939638 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 150939655 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150939688 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 150939731 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 150939836 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 150939921 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 150940227 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 150940378 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 150940525 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 150940533 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 150940628 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 150940789 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 150941042 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 150941137 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 150941175 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150941201 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 150941231 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 150941428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150941585 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 150941961 G T Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 150942709 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 150942722 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 150942747 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 150942840 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150942875 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150942958 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 150943314 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 150943722 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 150943842 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150943882 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150944002 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 150944053 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 150944387 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 150944393 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 150944521 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 150944582 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150944718 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150944758 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150944872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150945151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150945308 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150945403 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 150945546 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 150945555 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 150945579 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 150945665 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 150945681 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 150945694 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 150945725 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150945774 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 150945906 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 150945922 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 150946925 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150946959 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 150947408 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150947430 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 150947623 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 150947761 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 150947762 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150947786 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 150947820 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 150948052 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150948065 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150948446 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150948727 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150952063 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150952586 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150954630 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 150954736 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 150955527 T G Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 150956415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150956498 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 150956636 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 150957105 T C Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 150957198 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 150957222 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150957344 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 150957475 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 150957761 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 150958880 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 150958957 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 150959993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150960016 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 150960951 T A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 150961907 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 150963326 A T Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 150963394 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 150963744 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 150964042 T C N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 15 15 3 9 3 3 150964393 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150965433 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 150965764 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 150965815 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 150965910 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 150968537 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 150968674 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 150968695 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 150968738 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 150968793 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 150968900 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 150969580 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 150970091 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 150970098 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150970114 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 150970118 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 150970164 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150970474 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150970715 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150971404 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 150973805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150979350 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 150979642 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 150979869 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150979906 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 150980098 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150980114 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 150980354 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 150980484 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 150980732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150981132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150981177 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150981439 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 150981464 A G Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 150981609 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150981617 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150981822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150982064 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 150982680 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 150982890 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150982902 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 150983008 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 150983036 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150983124 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150983266 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 150983480 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 150984218 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150984253 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 150984333 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 150984354 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 150984560 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 150985042 C T N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 3 150985167 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.411764705882353 0.235294117647059 0.352941176470588 18 16 7 4 6 3 150985644 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 150985912 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 150986128 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 150986249 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150986537 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150987198 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150987303 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 150987599 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 150987683 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150987706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150987729 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 150987810 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 150987936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150987990 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 150988023 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 150988066 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 150988091 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150988100 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 150988950 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150989206 G A N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 150989408 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 150989416 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 150989476 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 150989875 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 150989885 G T N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 150989889 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 150989905 C T N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 150989939 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 150989957 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 150989978 G T N N 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 8 12 2 4 4 3 150990004 G A N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 150990006 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 7 11 2 3 4 3 150990542 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150990556 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 150990607 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 150990630 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 150990656 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 150990681 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 150990701 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 150991005 T G Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 150991526 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150991849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150992715 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 150993178 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 150993405 G A N Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 150993568 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150993629 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 150993795 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150993817 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 150994164 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 150994196 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 150994201 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 150994302 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 150994340 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 150994413 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 150994437 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 150994689 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 150994696 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 150994706 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 150994874 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 150995320 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150996219 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150996355 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150996398 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 150996554 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 150996666 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 150996685 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 150996804 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150996825 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 150997506 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 150997548 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150997567 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 150997731 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150998006 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 150998332 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 150998346 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150998391 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 150998488 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150998770 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150998786 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 150998827 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150998840 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 150998936 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 150999055 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 150999153 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 150999273 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 150999359 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 150999871 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151000182 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 151000419 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151000585 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 151001469 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 151002740 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151002772 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 151002789 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151003150 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 151003228 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151003252 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151003256 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151003281 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151003488 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151003604 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 151003972 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 151004119 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 151004120 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 151004221 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 151004489 G C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 151004555 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 151004882 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 151004891 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 151004900 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 151004906 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 151004969 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 151005022 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 151005076 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151005081 C A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 151005096 G A N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 151005182 T G Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 151005205 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 151005457 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 151005484 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 151005631 T A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 151006017 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 151006156 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 151006231 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 151006254 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 151006380 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 151006477 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 151006511 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 151006774 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 151006837 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151007155 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151007382 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151007568 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151007609 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151008131 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151008159 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151008256 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151008436 C A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 151008437 A G N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 151008461 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151008469 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 151008622 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151008656 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151008673 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 151008917 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 151008929 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 151008941 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151008987 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 151009120 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 151009134 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 151009140 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 151009181 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 151009238 C A Y N 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 5 3 2 1 1 3 151009696 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 3 151009734 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 151009739 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 151009778 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 151009859 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 151009886 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 151009950 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 151009981 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 151010042 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 151010051 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 151010100 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151010137 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 151010159 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151010196 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151010222 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151010233 A T N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 151010290 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 151010356 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151010363 G T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 151010372 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 151010390 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151010480 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 151010561 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 151010575 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151010620 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 151011044 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151011397 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 151011483 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151011520 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 151011575 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151011613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151011635 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151011683 C T Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 151011686 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 151011716 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 151011740 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 151011741 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 151011867 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 151011944 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151011987 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 151012143 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151012200 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 151012227 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 151012231 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 151012246 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 151012292 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 151012303 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 151012333 G T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 151012343 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 151012398 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 151012535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151012559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151013304 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151013906 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151014323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151014461 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 151014476 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 151014548 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 151014709 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151014966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151015012 A T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 151015135 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 151015148 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 151015242 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 151015330 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151015355 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151015388 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151015400 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151015435 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 151015472 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 151015586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151015671 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 151015749 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 151015829 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151015889 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151015954 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151016004 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151016181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151016450 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151016839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151016889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151017086 A G N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 3 151017391 C G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 151018346 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151018637 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151019133 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151019206 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151019887 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151020088 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151020268 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151021199 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151021217 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151021257 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151021368 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151021526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151021542 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151021557 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151021593 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151021754 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151022154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151022162 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151022322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151022476 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151022495 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151022793 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151022848 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151022924 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 151022981 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 151024874 C A N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 151025821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151025917 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151030556 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 151031639 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151032242 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151032656 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151032902 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151035646 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151037822 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151038026 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151040961 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 151041608 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151041626 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151042548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151045762 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151047160 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151048214 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151048251 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 151049724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151049814 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151050276 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151050441 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151051273 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151053528 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151053741 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151054195 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 151054502 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 151054649 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 151054670 G T N N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 151054945 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 151054949 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 151056138 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 151056328 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 151056367 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 151056406 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 151056632 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151056988 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151057246 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151057708 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 151057721 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 151057752 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 151057898 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 151057914 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 151058076 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 151058163 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 151058189 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 151058235 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 151058504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151058562 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151058665 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151059604 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151059725 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151060819 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151061389 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 151061606 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151061949 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 151061968 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151062600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151062774 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151062783 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151062806 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151064144 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151067072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151068544 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151071109 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151071376 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151075757 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 151076429 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151076961 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151077568 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151077637 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 151078034 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151078037 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151078494 G T N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 151079086 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151079700 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 151079912 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 151079919 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151080048 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151080061 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151081343 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151081634 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 151081656 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 151081716 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 151081814 A T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 151081816 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151081890 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151082245 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151082317 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151082520 A T Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 3 151082550 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151082762 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 151082766 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151082785 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 151082943 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151082971 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151083024 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151083151 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151083222 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151083406 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151083429 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 151083457 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151083600 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151083604 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151083618 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151083655 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151083662 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151083898 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 151084003 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151084147 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 151084268 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 151084350 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151084370 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151084595 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 151084724 C A Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 151084820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151084915 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 151084946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151085040 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151085055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151085131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151085149 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 151085154 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 151085182 A C Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 151085342 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 151085402 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151085494 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151085540 G T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 151085550 A G Y Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 151085658 G C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 151085692 G A Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 151085704 G T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 151085706 T G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 151085751 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 151085808 A G Y Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 151085836 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 151085968 G C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 151086179 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 151086493 A C Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 151086507 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151088368 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151088954 A C Y N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 151090340 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151090410 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151090411 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 151090459 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 151090622 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151090716 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151090874 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151090936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151091174 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151091236 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151091380 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151091505 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151091576 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 151091593 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 151091599 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151091712 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 151091746 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 151091838 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 151091923 A T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 151091935 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151091936 G C Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 151091970 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 151092043 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151092455 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 151092461 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151092496 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 151092613 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 151092643 A T Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 151092680 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 151092811 T A N N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 10 10 3 4 3 3 151092886 T C N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 3 151092917 G T N N 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 3 151092947 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 151093261 T G N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 151093293 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 151093504 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 151093648 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 151093826 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151094000 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151094010 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151094017 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151094046 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 151094110 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151094347 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 151094348 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 151094489 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 151094496 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 151094514 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 151094567 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151094711 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151094758 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 151094878 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151095002 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151095118 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 151095226 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151095354 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 151095356 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 151095568 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 151095678 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 151095710 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 151095858 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151095928 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 151095946 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 151095973 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 151095977 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 151095988 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 151096046 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 151096082 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 151096590 T C Y Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 3 151096682 G A Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 151096708 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 151096743 G T Y N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.0769230769230769 0.384615384615385 0.538461538461538 7 19 1 5 7 3 151096747 C T N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 151096855 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 151096891 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151096913 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 151096939 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 151097080 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 151097380 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151097703 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 151097792 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151097992 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151098017 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151098101 A T Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 151098104 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151098536 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 151098719 G C N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 151098822 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 151098982 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 151099084 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 151099105 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 151099717 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 151099776 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 151099848 T C Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 151099940 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 151100170 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151100196 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151100233 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 151100445 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 151100505 G T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 151100533 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 151100665 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 151100885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151100938 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151101258 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151101277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151101806 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151101836 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 151101860 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 151101875 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 151101895 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 151101911 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 151102422 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151102605 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151102785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151103017 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151103764 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151105419 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151105579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151107011 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 151107580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151107650 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 151107802 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 151107962 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 151108011 A T N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 151108044 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 151108079 A C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 151108794 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151108928 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151109098 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151109103 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151109112 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151109191 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151109215 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151109237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151109354 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 151109381 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 151109472 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151109500 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 151109579 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 151109902 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 151110182 A T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 151110208 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151110828 C G N N 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 4 6 1 2 2 3 151111019 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 151111125 T A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 151111313 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151111334 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 151111354 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 151111356 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 151111446 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 151111569 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 151111591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151111650 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151111673 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151111814 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 151111826 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 151111891 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 151111918 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 151111937 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151111976 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151112029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151112096 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151112131 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 151112406 T C N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 3 151112469 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 151112506 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 14 10 4 6 2 3 151112612 C A N N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 151112834 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 151113010 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 151113100 A G N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 151113144 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 151113184 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 151113649 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 151113666 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 151113682 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 151113934 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 151114190 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.333333333333333 0.555555555555556 0.111111111111111 22 14 6 10 2 3 151114435 T C N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 151115002 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 151115004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151115112 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 151115406 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 151115427 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 151115844 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 151116766 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151116875 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 151116933 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 151116942 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 151117032 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 151117064 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 151117283 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151117602 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 151117718 C A N N 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.615384615384615 0.307692307692308 0.0769230769230769 20 6 8 4 1 3 151117780 A G N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 3 151117897 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 151118130 A G N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.538461538461538 0.307692307692308 0.153846153846154 18 8 7 4 2 3 151118264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151118295 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 151118372 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 151118531 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 151118542 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151118563 T A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 151118565 C A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 151118580 C A N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 151118634 C T N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.416666666666667 0.583333333333333 0 17 7 5 7 0 3 151118695 G A N Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 3 151118894 C A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 151118917 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 151119020 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 151119030 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 151119031 G T N N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 151119170 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 151119228 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 151119248 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 151119281 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 151119282 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 151119317 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 151119358 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 151119384 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 151119419 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 151119566 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 151119602 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 151119606 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 151119632 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151119647 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 151119696 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 151119713 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 151119745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151119789 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 151119835 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151119852 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 151119889 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 151119958 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 151120092 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 151120339 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 151120771 A T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 151121446 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 151121836 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 151121953 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 151122290 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 151122311 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 151122315 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 151122406 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 151122499 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 151122781 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151123318 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151123516 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 151123759 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151123850 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 151124386 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 151127795 G T N N 0.142857142857143 REF 0.65 0.65 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 2 12 0 2 5 3 151127936 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 151128185 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 151128365 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151128433 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151128444 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151128911 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 151129548 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 151130720 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 151130845 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 151130916 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 151130990 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151131138 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151131391 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 151132256 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151132485 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 151132518 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151132747 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 151132826 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 151132853 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 151133001 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 151133178 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 151133276 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151133496 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151133814 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 151133898 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151133936 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 151134006 A C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 151134017 A C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 151134067 A G N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5 0.4375 0.0625 23 9 8 7 1 3 151134092 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151134140 A C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 151134170 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 151134271 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151134460 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 151134467 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 151134475 T C N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 151134502 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 151134565 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 151134754 T A N N 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0.0714285714285714 0.5 0.428571428571429 9 19 1 7 6 3 151134792 A G N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 151135209 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 151135229 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 151135271 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 151135343 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151135658 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 151135812 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 151136817 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 151136911 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 151136940 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151137727 C A N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 3 151137970 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 151138010 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 151138198 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 151138773 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 151138805 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 151139026 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.176470588235294 0.588235294117647 0.235294117647059 16 18 3 10 4 3 151139042 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151139051 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 151139070 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 151139082 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 151139333 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 151139591 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151139606 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151139635 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 151139736 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 151139768 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 151139810 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 151140028 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151140059 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 151140074 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 151140089 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 151140118 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 151140163 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 151140295 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 151141007 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151141263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151141781 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151141984 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 151142198 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 151142380 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 151142414 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 151142491 G T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 151142854 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151143145 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151143293 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151143313 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151143998 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 151144738 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 151144755 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 151144893 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 151145505 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 151145730 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 151146342 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151147180 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 151147564 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 151147735 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 151147813 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151147927 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 151147939 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 151147967 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 151148349 G C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 151148493 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 151148568 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 151149400 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151149599 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 151149717 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 151149881 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 151149936 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 151150475 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 151150626 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 151150636 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151150696 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 151150740 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 151150786 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 151151004 C T Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 151151155 G C Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 151151168 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 3 151151189 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 151151313 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 3 151151330 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 151151338 A T Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 151151385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151151399 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 151151405 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 151151453 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 151151467 C T Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 151151468 C G Y N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 151151511 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 151151628 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 151151877 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 151151986 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151152067 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 151152170 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 151152192 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 151152491 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 151152953 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 151153203 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 151153625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151153668 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151153963 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151154154 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 151154284 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 151154561 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 151155275 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 151155344 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 151155414 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 151155497 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151155883 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 151155982 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 151156086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151156130 C A N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.2 0.533333333333333 0.266666666666667 14 16 3 8 4 3 151157963 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 151157997 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.65 0.65 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 11 3 4 3 0 3 151158127 A G Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 151158167 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 151158274 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151158315 C T Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 151158318 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151158371 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151158381 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151158397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151158469 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151158576 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151158717 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 151158818 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 151158929 C T N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 151159210 A T N N 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 2 4 1 0 2 3 151159370 C T N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 151159546 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 151159622 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151159636 C T Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 151159994 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 151160006 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 151160167 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151160825 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 151161157 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 151161253 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 151161797 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151161801 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 151161828 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 151161896 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 151162171 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151162266 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 151162312 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 151162343 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 151162362 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 151162387 T C N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.0666666666666667 0.466666666666667 0.466666666666667 9 21 1 7 7 3 151162417 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 151162481 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 151162518 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 151162556 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.0588235294117647 17 17 1 15 1 3 151162595 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 151162752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151162824 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151162982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151163253 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 151163406 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 151163435 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151163676 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 151164012 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 151164133 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 151164199 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 151164307 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 151164439 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 151164503 T C Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 151164506 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 151164556 A T Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.294117647058824 0.705882352941177 0 22 12 5 12 0 3 151164618 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 151164623 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151164854 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 151164879 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 151164912 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 151164972 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 151165004 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 151165018 A C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 151165039 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 151165076 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151165274 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 151165275 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 151165459 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 151165470 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151165922 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 151166009 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 151166271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151167338 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 151167449 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 151167512 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 151167596 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 151167705 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 151168304 T C Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 151168464 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 151168465 C A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 151168486 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151168597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151168641 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 151168643 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 151168685 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 151168801 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 151168804 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 151170041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151170765 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 151170824 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 151170853 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151170962 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151171843 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 151172022 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151172039 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151172402 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 151172552 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151174191 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151174209 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 151174734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151174902 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151175078 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151175707 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151175951 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 151178123 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151178900 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 151178933 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 151179022 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 151179527 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 3 151179755 C T Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 151181941 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151182099 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151182637 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 151186818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151188649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151189341 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151189641 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 151189720 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151189734 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151190149 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151190423 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 151190517 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151190569 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151190572 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151190608 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 151190672 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151190720 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 151190758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151191201 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 151191817 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151191895 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151192110 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151192188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151192422 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151192910 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 151193385 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151194021 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 151194129 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151194861 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 151195692 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151195903 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151196703 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 151198161 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151198187 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151199112 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151200923 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151200933 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 151201592 A C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 151201739 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 151201750 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 151202256 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 151202421 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151202542 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 151202545 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 151202555 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 151203042 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 151203220 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151205235 T G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 151205262 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151205371 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151205397 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151205403 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151205482 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151205595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151205610 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 151205612 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151205660 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151205666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151205714 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 151205729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151205964 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 151205965 G A N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 151206120 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 151206137 G T Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 151206171 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 151206352 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151206451 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151207582 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151207662 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151207720 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151207838 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 151207998 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 151208078 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151208500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151208527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151208560 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151209020 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151209228 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151209296 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151209300 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151209310 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 151209350 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 151209700 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151209773 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 151209812 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 151209868 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151209936 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151209960 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151209971 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 151210449 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 151210551 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151210643 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 151210771 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151210963 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151210973 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151211012 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151211114 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151211261 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 151211289 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151211303 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 151211371 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 151211388 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 151211433 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151211500 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 151211508 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 151211604 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 151211721 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 151212219 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151212388 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151212493 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151213378 C T N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 3 151213539 T A N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 151213555 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 151213635 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 151213796 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 151213881 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151214065 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151214344 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 151214521 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151214845 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151214888 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151215847 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 151216018 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151216035 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151216406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151216410 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 151216886 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151216943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151216988 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151217635 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151217736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151217744 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151217889 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151218094 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151218147 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151218416 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151218522 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 151218531 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 151218600 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 151218710 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151218800 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151218808 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151218910 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151219294 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151219449 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151219516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151220146 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151220580 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 151220615 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151220677 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151221098 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151221323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151221349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151222081 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151222115 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151222745 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151222799 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151222816 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151222907 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151222925 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151222984 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 151223191 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151223257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151223298 A C Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 151223554 T A Y N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 151223572 T A Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 151223649 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 151223770 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 151223781 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151223791 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151223838 T A Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 151223843 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151223901 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151223950 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151223965 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151224011 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151225180 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151225246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151225470 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 151225473 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151225537 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151225579 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151226252 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151226286 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151226540 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151226563 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151226669 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151227550 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 151227770 T G Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 3 151227895 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 151228735 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151228922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151228965 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151228976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151229103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151229170 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151229217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151230334 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 151230951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151232335 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151232344 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151232457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151232505 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151232577 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151232580 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151232880 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151233045 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151233066 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151233122 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151233128 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151233167 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151233289 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151233491 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151233524 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 151233540 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 151233728 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151233747 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151234071 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 151234142 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151234336 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151235219 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151235358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151236651 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151237183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151237226 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 151237512 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151237782 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151237898 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 151238213 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 151238240 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151238352 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151238356 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151238410 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151238507 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151238696 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151238729 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 151238822 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151239018 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151239141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151239282 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151239884 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 151240159 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151240160 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151241665 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151241732 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151245817 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151246655 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151246941 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151246973 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 151246986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151247529 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151247567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151247810 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151248047 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151248108 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151248258 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151248280 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 151248316 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151248321 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151248340 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151248364 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151248385 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151248400 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151248405 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151248419 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151248484 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151248502 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151248789 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151248810 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151249012 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151249021 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151249247 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151249343 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151249377 G C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 151249380 C G Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 151249392 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 151249405 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 151249432 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 151249436 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 151249453 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 151249465 G A Y Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 151249467 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 151249840 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151250112 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151250221 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151250294 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151250308 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151250665 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151251140 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151251991 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151253092 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151253390 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151253692 T C Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 151253908 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 151254015 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151254126 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151254128 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151254240 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151254834 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151255157 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151255222 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151255242 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151255283 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 151255742 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151255776 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151256039 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151256091 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151256145 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151256199 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151256206 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151256546 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151256953 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151257123 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151258225 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 151258692 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151258745 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151259028 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151259471 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151259562 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151259581 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 151259689 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 151259906 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151260388 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151260403 G A Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 151260775 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151261161 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151261210 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151261442 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 151262018 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151262090 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151263270 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151264473 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151264639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151265575 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 151265713 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151266694 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151267598 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 151267735 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 151269446 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151270055 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151270147 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 151270770 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151270936 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151271035 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151271875 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 151272025 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 151272128 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 151272509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151272513 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 151272521 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151272683 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 151272790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151272869 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 151272883 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 151272921 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 151272985 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151273071 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 151273106 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151273157 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 151273216 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151273270 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 151273374 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151273482 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151273726 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151273880 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 151274226 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 151274251 G A Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 151274253 C A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 151274377 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151274476 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151274581 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151275598 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151275649 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151275750 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151275878 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 151275983 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151276145 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151276172 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 151276193 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151276235 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151276247 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151276572 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151276686 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 151276934 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151277220 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151277301 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 151277333 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151277338 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 151277348 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151277354 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 151277749 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 151277828 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151277988 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151278042 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151278070 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 151278103 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 151278127 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 151278490 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 151278603 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 151278962 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 151278967 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 151279191 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151279200 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 151279251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151279293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151279411 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 151279437 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 151279877 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151279894 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 151279908 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 151280537 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151280658 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151280670 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151280699 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151280706 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151280765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151280796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151280803 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151280874 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151281378 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151281812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151281995 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151282278 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151282293 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151282640 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151282867 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151282999 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 151283395 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151283406 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151283454 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151284345 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151284374 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151284524 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 151284601 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151284908 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151285122 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151285158 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151285610 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151285630 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151285730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151286280 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151294160 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151295156 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151295562 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151295675 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151295804 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151295890 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151295964 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151296141 C A Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151296143 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151296159 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151296164 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151296307 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 151296368 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151296917 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151296993 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151297344 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151297373 G C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151297378 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151297400 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151297402 G T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 151297573 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 151297749 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151297906 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151298212 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151298457 A C N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 151298837 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 151299051 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151299222 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151299388 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 151299429 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 151299433 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 151299478 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 151299762 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151299765 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151300063 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151300725 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 151301022 A G N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 151301733 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151301892 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151302239 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151302471 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151302638 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 151302762 A G N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 151302846 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 151303071 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 151303191 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 151303380 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151303446 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151303512 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151303573 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 151303739 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 151303785 G T N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 151303946 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 151304094 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151304248 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151304548 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151304955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151305121 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151305379 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 151305667 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151305680 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 151305712 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 151306162 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151306169 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151306291 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 151306338 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151306834 C T Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 151307828 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151308408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151309253 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151309254 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151309369 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151311091 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 151313303 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151314961 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151318096 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151318821 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151325211 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 151327913 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151330067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151330216 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151331301 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151332178 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 151333160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151334023 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151334055 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151334375 C A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 151334526 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 151334650 A G N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 151335508 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 151345484 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151345764 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151346613 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 151346662 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151347044 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151347687 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151350537 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 151351058 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151351311 C A Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151351470 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 151351977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151353667 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151354098 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151354174 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151354191 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151354219 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151354314 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151354339 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151354393 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151354551 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 151354647 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 151354729 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 151354794 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151354836 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 151354977 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 151355069 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 151355195 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151355453 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151355565 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151355829 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 151356634 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 151356643 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151356661 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 151357163 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151357182 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151357279 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151357330 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151357659 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151358008 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151358028 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151358220 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 151358406 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151358479 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 151358573 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151358623 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151358633 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151358635 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 151358789 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 151358812 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 151358910 C T N Y 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 3 151359608 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 151359676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151359883 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151359981 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151360359 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151360393 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151360567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151361074 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151361108 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151361299 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 151361328 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 151361346 T A N N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 151361502 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 151361521 A G N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 151361523 T G N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 151361622 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 151361721 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151361744 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 151361827 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151362110 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151362805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151362982 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151363263 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151364236 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 151364321 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 28 8 10 8 0 3 151364372 T C Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 151364472 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 151364609 T C Y Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0 1 0 9 9 0 9 0 3 151364679 T A Y N 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0 1 0 7 7 0 7 0 3 151364724 T G Y N 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0 0.777777777777778 0.222222222222222 7 11 0 7 2 3 151364753 T C Y Y 0.321428571428571 REF 0.3 0.3 0.321428571428571 0.678571428571429 0 0.642857142857143 0.357142857142857 9 19 0 9 5 3 151364756 T C Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.461538461538462 0.538461538461538 6 20 0 6 7 3 151364775 C T Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 151364799 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151364843 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151365079 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151365415 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 151365416 C A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 3 151365812 T G N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 151365932 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151365981 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151366147 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151366473 A C N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0 0.8 0.2 12 18 0 12 3 3 151366563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151366655 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 151367170 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 151367225 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 151367601 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151367805 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151368396 G A Y Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 3 151368882 G T N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 151368989 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151369043 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151369488 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151369546 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151369653 T G N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 151370029 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151370049 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151370117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151370230 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151370231 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151370337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151370690 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151370967 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151371024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151371084 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151371834 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151371910 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151371998 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151372284 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151372316 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151372423 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 151372519 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151372694 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151372708 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151372782 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151372832 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151372966 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 151373274 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151373285 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 151373547 C A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 151373682 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151373693 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151373749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151373835 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151373868 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151373896 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151374015 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151374032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151374066 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151374100 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151374269 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151374288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151374289 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151374364 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151374562 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151374885 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 151375100 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 151375156 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 151375406 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151375770 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151375807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151375837 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151375906 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151375908 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151375930 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151375959 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151376106 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151376260 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151376329 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151376399 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151376586 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 151376817 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151377565 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151377649 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151377900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151377937 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151378625 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151378859 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 151378860 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 151378945 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 151379101 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 151379310 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 151379367 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 151379472 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151379695 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 151379937 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151379970 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151380007 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 151380540 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151380786 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151380822 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 151380967 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151381057 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 151381064 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 151381102 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 151381265 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151381275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151381336 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151381433 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151381435 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151381573 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 151381740 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 151382058 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151382163 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 151382246 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 151382269 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151382289 C A Y N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 151382436 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151382726 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 151383027 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151383153 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 151383219 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 151383230 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151383353 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151383369 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151383378 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 151383537 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151383606 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151383706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151383738 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 151383799 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 151383816 C T Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 151384212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151384224 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 151384282 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151384306 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151384310 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151384352 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151384481 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151384588 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151384687 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 151384868 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151384999 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 151385047 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 151385522 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 151385537 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151385730 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 151385750 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151385979 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151386136 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151386191 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 151386210 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151386221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151386276 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 151386429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151386646 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151386679 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151386703 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 151386835 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 151387039 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 151387149 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 151387441 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151387495 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151387550 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151387597 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151387644 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 151387678 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151387737 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151387884 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151387885 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151387908 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151387936 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151388085 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151388132 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 151388196 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151388261 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 151388291 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 151388314 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151388347 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 151388556 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151388884 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 151389120 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 151389433 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151389450 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151389505 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151389583 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151389617 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151389674 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151389790 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151389856 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 151389871 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151389985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151390372 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151391006 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151391189 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151391280 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 151391763 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151391808 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 151391856 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 151391861 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 151391957 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151391958 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151392073 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151392200 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 151392338 C T Y Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 10 4 3 4 0 3 151392446 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 151392930 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151393086 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151393153 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 151393399 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 151393408 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 151393475 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 151393529 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151393642 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 151393645 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151393681 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151393698 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151393764 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 151393771 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 151393860 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 151393963 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151394084 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151394096 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151394127 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151394184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151394232 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151394271 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 151394394 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151394426 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151394470 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151394495 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151394509 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 151394598 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 151394709 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 151394779 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151394803 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 151394835 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 151394954 G A N Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 151394958 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 151394998 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151395030 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151395111 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 151395115 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 151395162 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 151395252 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151395338 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151395555 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 151395637 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151395670 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 151395676 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 151395929 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151395989 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 151395994 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 151396007 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 151396074 G C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 151396160 A T N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 151396292 T G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 151396352 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 151396381 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 151396433 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 151396498 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151396568 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 151396652 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 151396657 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 6 12 1 4 4 3 151396666 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 8 10 1 6 2 3 151396722 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 151396787 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 151397011 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 151397182 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 151397296 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 151397297 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 151397309 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 151397380 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 151397398 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 151397432 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151397551 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 151397559 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151397602 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151397603 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151397626 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151397642 G C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 151397823 A G N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 151397824 G A N Y 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 151397839 A G N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0 0.230769230769231 0.769230769230769 3 23 0 3 10 3 151397886 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151398110 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151398230 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 151398232 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151398245 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 151398453 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 151398972 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 151399002 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 151399182 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151399251 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151399260 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151399282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151399802 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151399980 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151400016 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 151400156 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151400176 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151400183 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151400310 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151400311 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151400350 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 151400351 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151400367 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 151400607 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151400637 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151400960 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151401331 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151401421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151401549 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151401572 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151401594 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 151401595 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 3 151401623 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 151401654 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151401657 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151401665 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151401683 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151401691 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 151401732 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 151401756 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 151401772 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 151401790 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 151401830 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 151402004 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 151402025 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 151402420 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 151402478 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 151402541 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 151402570 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151402730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151402762 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 151402860 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151402872 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151402900 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151402926 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151402939 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151402975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151403015 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151403050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151403085 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151403099 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151403142 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151403380 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 151403436 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 151403528 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 151403592 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 151404150 A G Y Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 151404208 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 151404287 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151404321 G T N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 151404331 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 151404378 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 151404384 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 151404480 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151404511 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151404527 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151404544 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151404570 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151404616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151404914 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151404932 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 151405025 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 151405031 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 151405041 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151405238 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151405289 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 151405290 A G N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 151405409 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151405417 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151405460 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151405616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151405637 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151405667 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151405726 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151405745 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151405768 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151405805 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151405821 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151405883 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 151405986 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 151406002 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 151406016 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151406058 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 151406179 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 151406225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151406250 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151406253 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151406414 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 151406679 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 151406761 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 151406785 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 151406819 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151406848 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151406923 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 151407807 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151407808 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 151407896 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 151408034 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151408680 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 151408910 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151409178 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151409519 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 151409638 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 151410205 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151410285 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151410292 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151410372 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151410533 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151410623 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151410742 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151410848 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151411114 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 151411493 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151411527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151411607 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151411892 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 151411923 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 151411942 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 151412643 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 151412659 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 151412703 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 151412789 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 151413010 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 151413522 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 151413858 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 151414029 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 151414243 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 151414311 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 151414489 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 151414569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151414594 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151414608 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151414676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151414699 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151414748 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151414761 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151414773 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151414791 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151414805 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151414828 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151414882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151414930 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151414946 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151414957 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151414967 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151415213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151415222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151415245 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151415359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151415465 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151415481 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151415490 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151415513 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 151415621 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151415679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151416006 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 151416207 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151416209 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151416226 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151416390 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151416438 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151416442 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151416477 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151416496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151416563 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151416630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151416632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151416695 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151416867 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151416911 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151416925 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151416970 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151417005 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151417016 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151417046 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151417433 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151417491 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 151417494 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151417505 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151417651 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151417787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151418469 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151418685 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 151419296 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 151419389 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151419460 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151419575 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151419750 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151419758 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151419788 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 151419798 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151419824 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151419891 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151420099 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151420103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151420214 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 151420226 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 151420320 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151420381 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 151420604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151421535 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151422002 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151422103 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151422438 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151422723 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 151423330 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151423462 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 151424041 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 151424420 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 151424580 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 151424623 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 151424748 C G N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 151424761 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151424772 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151424808 C T N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 151424824 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 151424848 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 151424853 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 151425036 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 151425627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151425753 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 151425796 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151425901 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151426044 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151427108 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151427142 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151427182 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151427199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151427243 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 151427479 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151427817 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151428100 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151428101 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151428126 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151428133 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151428222 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151428382 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151428978 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151429398 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 151429799 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 151430144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151431904 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151432037 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151432408 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151432656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151433511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151434079 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151434644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151435431 A T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 151435446 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 151435456 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 151435464 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 151435472 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 151435485 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 151435497 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151435534 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 151435623 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 151435705 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151435804 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 151436444 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151436587 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151436879 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151436999 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151437050 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151437113 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151437170 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151437178 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151437222 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151437234 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151437261 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151437477 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151437488 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151437529 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151437530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151437594 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151437615 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151437618 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 151437660 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151437687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151437713 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151437718 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151437740 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151437758 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151437794 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151437801 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151437875 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151437891 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151438221 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151438229 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 151438460 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151438479 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151438508 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 151438510 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151438630 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 151438708 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 151438760 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151438851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151438957 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151438980 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 151438981 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 151439059 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 151439115 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 151439252 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 151439266 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151439274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151439279 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151439331 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151439370 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 151439420 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151439437 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151439466 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 151439499 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151439502 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 151439631 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 151439638 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 151439669 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 151439683 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 151439713 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 151439744 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 151439823 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 151439881 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 151439882 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151439961 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151439974 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 151440013 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 151440062 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151440097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151440192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151440247 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151440314 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 151440361 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151440368 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151440373 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151440494 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151440633 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 151440659 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151440819 T A Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 151440862 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151440972 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 151441157 C G N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 151441190 A G Y Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 151441244 G A N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 151441280 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 151441523 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151441590 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151441675 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 151441676 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 151441833 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 151441962 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151442033 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 151442160 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 151442238 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 151442331 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 151442414 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 151442416 G A N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 151442465 C G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 151442478 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 151444177 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 151444260 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151444375 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 151444563 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151444786 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151444936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151445150 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151445233 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 151445281 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 151445309 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 151445340 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151445355 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 151445358 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 151445390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151445505 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151445519 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151445590 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 151445865 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 151446206 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 151446238 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 151446293 C T Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 151446308 C A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 151446317 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 151446437 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 151446495 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151446561 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 151446716 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151446758 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151446759 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151447037 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151447053 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 151447076 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 151447320 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151447365 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 151447480 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151447539 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151447543 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151447550 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 151447795 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 151448238 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151448341 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151448765 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151450016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151450570 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151450612 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151451157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151451464 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151451480 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151451612 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151451773 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151451889 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 151451930 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151451996 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151452226 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 151452231 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 151452325 T A Y N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 3 151452486 G A Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 151452646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151453332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151453369 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 151453530 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151453775 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151453894 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151454013 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151454046 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 151454094 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 151454235 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 151454253 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 151454262 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151454422 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 151454472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151454483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151454695 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 151454704 G C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 151454749 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 151454750 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 151454926 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 151454986 T C N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.615384615384615 0.230769230769231 0.153846153846154 19 7 8 3 2 3 151455038 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 151455260 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151455382 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151455426 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151455545 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 151455579 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151455645 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 151455694 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 151455717 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 151455746 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151456053 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151456100 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 151456113 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 151456148 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 151456180 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151456192 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151456215 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 151456220 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 151456556 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151456813 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151456925 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151457303 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 151457436 C A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 151457714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151459120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151459592 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151459599 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151461875 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151463089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151464972 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151465795 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151468969 C G Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 151469379 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151469801 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151469914 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151471421 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151472121 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151472661 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151472690 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151472700 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151472712 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151472719 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151472726 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151472817 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151472870 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151472891 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151472967 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151472977 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151472979 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151473485 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151473981 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151474264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151474413 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151474595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151475494 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 151475545 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 151475562 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 151475571 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 151475644 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 151475704 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 151475952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151476033 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151476058 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151476064 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151476256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151476285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151476305 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151476437 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151476456 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151476759 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151477060 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151477125 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 151477324 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 151478108 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151478185 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151478426 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151478429 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151478464 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 151478504 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 151478515 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 151478532 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151478555 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151478603 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 151478663 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151478880 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 151479026 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151479497 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151479956 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151479991 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 151480058 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151480093 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 151480245 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 151480632 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151480644 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 151480693 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 151480698 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 151480733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151480749 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151480831 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 151481424 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151481430 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151481902 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151481954 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151482023 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151482044 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 151482193 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 151482195 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 151482241 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 151482249 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 151482304 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 151482452 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151482455 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151482497 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 151482507 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 151482530 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151482551 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151482637 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151482676 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151483305 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 151483354 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 151483438 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151483626 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 151484197 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151484393 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151484881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151485765 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151485775 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 151485829 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151485858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151485877 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151486616 C T N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 9 21 3 3 9 3 151486902 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151487456 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151487500 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151488342 G T N N 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 5 11 0 5 3 3 151488519 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151488571 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151488926 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151488991 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 151489089 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151489137 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151489164 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151489470 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151489522 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 151489670 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 151489858 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 151489986 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 151490109 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151490413 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 151490416 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 151490472 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 151490539 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151490865 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151490926 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151491021 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151491186 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151491266 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151491303 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151491397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151491551 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151491582 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151491663 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 151491785 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151491823 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151491939 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 151492010 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 151492327 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 151492401 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151492405 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151492517 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151492661 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151493138 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151493377 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151493421 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151493479 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151493937 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 151494027 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 151494036 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 151494155 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 151494512 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 151494524 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 151494562 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 151494627 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 151494677 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151494776 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 151494778 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 151494904 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151495037 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151495070 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 151495280 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 151495304 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 151495326 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151495433 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151495436 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 151495560 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151495619 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 151495858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151496171 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 151496176 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 151496275 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 151496293 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 151496331 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 151496350 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151496423 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151496588 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151496829 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151497250 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151497325 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 151497348 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 151497562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151497655 G T Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 151497771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151497785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151497820 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151497869 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 151497979 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 151497980 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151498001 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151498408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151498522 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 151499172 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 151499588 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151499751 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 151499816 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151500038 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151500255 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151500581 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 151500947 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151502234 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151502297 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151502404 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151502570 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151502875 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151502966 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151503113 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151503381 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151503526 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151503606 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151503607 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151503989 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151504004 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151504015 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151504076 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151504112 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151504176 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151504183 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151504221 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151504426 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151505926 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151505929 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151507542 G A Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 151508149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151508327 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151508334 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151508417 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151508514 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151508545 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151508963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151509084 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151509190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151510119 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151510269 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151510321 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151510344 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151510362 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151510392 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151510843 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151510860 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151510870 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151511087 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151511196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151511219 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151511264 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151511534 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151511578 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151511580 T G Y N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 151511822 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 151511863 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 151512037 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 151512049 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151512533 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151512740 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151512887 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151512969 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151513095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151513133 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151513293 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151513307 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151513343 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151513375 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151514124 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151514262 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151514279 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151514822 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151514963 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151515089 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151515656 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 151515942 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151516157 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151516331 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151516524 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151516531 G C Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151516655 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151516714 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151516721 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151516784 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151516811 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 151516821 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151516827 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151517019 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151517100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151517210 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151517553 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151517663 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151517723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151517764 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151517948 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151518103 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151518198 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151518268 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151518282 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151518288 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151518313 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151518588 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151518828 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151519028 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151519085 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151519140 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151519142 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151519168 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151519187 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151519240 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151519262 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151519277 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151519340 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151519397 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151519562 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151519648 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151520037 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151520070 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151520152 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151520165 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151520166 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151520908 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 151521197 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151521258 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151521683 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151521735 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151521793 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151521845 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151522088 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 151522127 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151522225 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151522393 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151522474 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151522481 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151522488 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151522719 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151522942 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151522950 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151523126 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 151523184 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151523350 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 151523580 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 151523734 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151523835 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151524007 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151524035 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151524163 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151524303 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151524397 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151524413 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151524585 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151524600 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151524625 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151524648 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151524777 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151524897 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151525028 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151525111 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151525125 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151525273 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151525297 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151525303 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151525321 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151525377 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151525396 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151525399 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151525423 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151525424 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151525439 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151525497 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151525515 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151525553 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151525576 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151525601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151525675 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151525700 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151525762 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151525781 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151525786 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151526012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151526035 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151526057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151526084 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151526109 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151526148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151526200 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151526927 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 151527009 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151527034 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151527047 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151527058 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151527072 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151527076 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151527089 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151527401 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151527423 G A N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 151527464 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151527532 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151527571 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151527603 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151527611 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151527615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151527637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151527970 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 151527973 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151528074 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151528094 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151528149 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151528202 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151528665 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151528713 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151528738 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151528778 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151528824 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151528851 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151528861 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151528887 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151528905 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151528997 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151529016 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151529296 G C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 151529393 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151529492 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 151529561 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 151529866 G A N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 151530018 T C N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 151530127 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151530185 G C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 151530215 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151530569 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 151530668 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151530727 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151530792 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 151530847 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151531001 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151531186 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151531411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151531486 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151531541 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151531746 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151531890 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151531926 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151531931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151532004 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151532017 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151532045 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151532123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151532175 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151532551 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151532848 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151532863 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151533041 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151533148 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151533300 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151533330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151533331 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151533484 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 151533583 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151534538 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151535900 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151536522 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151536733 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151536785 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151536847 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 151537314 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151537327 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151537348 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151537354 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151537377 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151537593 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151537693 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151537777 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151537863 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151537897 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151537925 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151538158 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151538543 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151538548 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151538656 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151538814 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151538969 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151539017 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151539357 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151539401 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151539415 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151539422 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151539463 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151539584 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151539591 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151539600 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151539618 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 151539705 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151539776 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151539780 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151540341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151540343 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151540530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151540581 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151540622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151540705 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151540732 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151540961 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151540974 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151540981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151541004 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151541030 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 151541054 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 151541139 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151541217 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151541311 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151541335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151541354 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151541373 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151541405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151541469 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151541539 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151541621 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151541647 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151541701 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151541729 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151541740 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151541812 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151541849 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151541877 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151542000 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151542029 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151542034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151542144 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151542181 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151542182 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151542245 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151542368 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 151542423 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151542494 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151542529 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151542690 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151542704 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151543420 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151543630 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151543728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151543876 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151544009 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151544290 G T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151544657 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151545503 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151546103 T A Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 151546621 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151546659 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151546927 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151546965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151547078 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151547097 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151547397 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151547673 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151547999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151548089 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151548396 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151548474 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151548520 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151548585 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151548663 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151548794 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151548807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151548837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151548949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151548959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151549018 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151549052 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151549129 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151549213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151549230 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151549237 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151549302 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151549354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151549471 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151549488 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151549498 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151549833 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 151549835 G A Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 151550404 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 151550440 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151550560 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 151550821 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151550834 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151550968 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151550993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151551016 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151551026 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151551352 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151551358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151551500 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151551592 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151551602 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151551624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151551630 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151551745 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151551830 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151551905 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151552082 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151552660 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151553092 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151553650 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151554380 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 151554538 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 151554679 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151554741 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151554761 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 151555279 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 151555333 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151555355 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151555368 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151555426 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151555584 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151555682 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151555767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151555872 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151555881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151556075 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151556216 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151556255 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151556587 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151556823 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151556917 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151556963 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151557082 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151557125 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151557547 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151557574 A T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 151557916 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151558184 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151558250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151558457 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151558985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151558986 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151559076 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151559248 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151559606 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151559634 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151559693 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 151559847 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151559870 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151560104 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151560299 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151560425 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151560473 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151560530 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151560864 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151560870 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151560885 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151560916 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151561079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151561099 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151561951 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151563730 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151563922 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 151564110 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151564387 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151565056 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151565275 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151565295 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151565550 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151565623 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151565808 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151565827 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151565856 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151566450 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151566451 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151567096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151567243 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151567670 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151567859 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151568015 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151568027 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151568071 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151568524 A T Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 151568545 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 151568767 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151568871 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151569083 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151569199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151569586 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151569621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151569698 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151569826 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151569876 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151570054 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151570216 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151570251 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151572145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151573081 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151573588 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151573926 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151574102 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151574191 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151574284 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151574451 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151574503 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151574777 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 151574820 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151574976 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151574997 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151575041 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151575051 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151575080 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151575094 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151575208 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151575249 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151575345 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151575542 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151576034 C A N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 151576123 A C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 151576274 A G N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 151576361 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 151576401 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 151576439 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151576948 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151576952 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151577422 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151577721 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151577820 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151577906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151577954 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151577956 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151577987 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151578096 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151578124 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151578170 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151578411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151578460 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151578512 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151578579 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151578616 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151578623 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151578659 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151578664 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151578722 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151578798 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151578957 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151578969 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151578996 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151579023 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151579189 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151579205 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 151579250 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151579506 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 151579718 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 151579878 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151580112 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151580120 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151580271 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 151580365 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151580587 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151580948 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 151580971 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151580994 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 151581245 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151581815 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151582004 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151582410 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 151582581 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151582804 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 151582852 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 151583655 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151583847 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151583860 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151584498 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151584501 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151586144 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151586552 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151587509 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151587672 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151588062 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 151588139 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151588140 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151588796 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151588816 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151589165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151589486 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151589654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151589727 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151589822 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151589904 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151590610 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151590758 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151590973 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151591079 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151591293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151592078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151592112 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151593273 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151593505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151593724 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151593904 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151594013 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151594678 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151594991 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151595899 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 151596138 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 151596292 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151596347 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151596514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151596533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151596736 T A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151597519 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151597940 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151598153 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 151598171 T A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151598196 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 151598350 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151598390 G A Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 151598391 T A Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 151598907 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151599610 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151599916 T G Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151599954 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151599973 T A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151600009 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151600108 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151600229 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151600902 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151601523 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151601974 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151603385 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151603998 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151605556 T C Y Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0 0.823529411764706 0.176470588235294 14 20 0 14 3 3 151606326 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151606500 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151607479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151608546 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151609431 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151609481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151609500 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151609521 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151609609 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151609744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151609869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151609921 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151610675 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151610704 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151610736 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151610752 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151610797 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151610856 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151610953 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151610992 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151610993 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151611034 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151611037 C A Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151611157 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151612461 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151612588 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151612609 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151613101 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151613787 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151613842 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151621447 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151621871 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151622430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151622444 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151622552 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151622599 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151622756 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151622922 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 151630376 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 151630425 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151631046 C T Y Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 151631052 A G Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.133333333333333 0.866666666666667 0 17 13 2 13 0 3 151632309 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151632331 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151632410 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151632609 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151632668 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151632875 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151633070 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151633906 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151634274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151635037 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151635535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151635672 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 151635985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151637355 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151638172 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151640948 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151641803 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151641812 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151644708 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151645466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151645706 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151648074 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 151648453 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151648520 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151648785 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151648797 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151649547 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151650228 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151650646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151650707 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151651234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151651607 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151652267 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151652989 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151654487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151655770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151656275 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 151656332 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 151656383 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151657373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151657806 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151659992 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151660012 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151660244 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151660999 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151661061 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151661125 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151661254 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151661301 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151661318 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151661445 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151661505 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151661643 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151662245 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151662321 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151662338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151662426 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 151662427 G A N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 151662480 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 151662616 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 151662617 T C N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 151662789 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151662984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151663082 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151663132 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151663150 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151663440 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151663484 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151663574 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151663788 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151664171 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151664504 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151664730 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151664759 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151665271 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151665977 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151665994 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151666160 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151666182 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151666257 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151666315 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151666356 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151666402 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151666419 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151666533 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151666574 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151666952 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151667613 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151667648 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151667682 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151667717 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151667724 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151667749 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151667872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151668001 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151668109 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151668125 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151668176 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151668281 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151668351 A T Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151668370 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151668437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151668493 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151668507 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151668629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151668657 T A N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 151668704 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151668833 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151668901 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151668933 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151668948 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151668962 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151669077 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151669131 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 151669151 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151669167 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151669256 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151669269 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151669307 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151669388 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151669389 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151669654 A G N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 151669894 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 151669903 C A N N 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 151669950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151670112 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 151670158 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151670182 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151670403 G T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151670434 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151670476 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151670649 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151670790 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151670829 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151670830 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151670853 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151671268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151671296 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151671516 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151671658 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 151671697 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 151672179 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151672184 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 151672303 A C Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 151672360 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151672371 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151672456 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151672508 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151672691 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151672729 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151672798 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151672890 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 151672921 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151672929 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151672969 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151672981 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151673422 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151673488 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151674073 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151674161 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151674238 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 151674722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151675320 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151675518 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 151675759 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151675766 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151675773 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151675790 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151675841 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151675850 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 151675896 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151675941 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151676048 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151676062 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151676082 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151676092 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151676242 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151676261 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151676274 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151676295 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151676329 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151676349 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151676358 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151676423 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 151676483 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151676523 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151676547 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151676632 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151676725 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 151676739 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151676817 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151677084 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151677138 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151677141 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151677150 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 151677220 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151680241 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151680256 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151680420 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 151680451 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151680581 T A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 151680625 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151680639 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 151680670 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 151680763 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151680780 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 151681261 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151681299 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151681332 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 151681586 C A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 151681595 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151681612 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 151681754 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151681835 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151681836 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151681857 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151681885 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151681965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151682005 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151682043 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151682062 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151682117 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151682198 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151682215 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151682219 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151682320 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151682566 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151682570 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151682653 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 151682664 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 151682873 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151683023 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151683132 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151683641 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151683697 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151683893 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151684001 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151684070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151684146 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151684165 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151686427 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151687953 G T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151687986 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151688250 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151688298 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151688344 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151688815 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151689104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151689764 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151690125 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151690189 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151690571 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151690871 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151691170 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151692837 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151692939 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151692979 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151693042 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151693171 C G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 151693616 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151693617 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151694519 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151695215 C T Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 151695221 T C Y Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.583333333333333 0.416666666666667 0 19 5 7 5 0 3 151695309 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 151695479 C G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151695513 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151695660 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151695921 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151696179 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 151696251 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 151696534 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 151696591 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151696614 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151696820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151696928 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151696971 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151696989 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151697007 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151697049 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151697092 A G Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 151697138 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151697552 C A Y N 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0 0.454545454545455 0.545454545454545 5 17 0 5 6 3 151697619 A G Y Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 151697855 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151697857 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151697905 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151698308 G A N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 151698383 G C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 151698393 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 151698408 T C Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 151698567 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151698696 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151699213 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151699280 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151700680 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151700731 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151700921 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151701523 A G Y Y 0.0714285714285714 REF 0.65 0.65 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 1 13 0 1 6 3 151703035 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151703072 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151703089 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151703403 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151703510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151703753 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151703775 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151703876 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151704175 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151704336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151704967 A C Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 151704993 C T Y Y 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 151705468 A G Y Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 3 151705689 T G N N 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 151705833 C T N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 151705936 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151707970 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151708218 C T Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 151709265 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151709862 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151709986 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 151710557 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151710623 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151710676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151710882 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151711384 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151711387 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151711447 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 151713321 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151714056 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151714089 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151714207 T A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 151714335 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 151714369 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151714420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151714421 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151714450 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151714762 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151715092 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 151715232 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 151715263 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 151715356 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 151715396 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151715437 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 151715500 T C Y Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 151715550 A G Y Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 5 13 1 3 5 3 151715698 T C Y Y 0.333333333333333 REF 0.7 0.7 0.333333333333333 0.666666666666667 0.333333333333333 0 0.666666666666667 4 8 2 0 4 3 151715746 G A Y Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 7 9 1 5 2 3 151715767 A G Y Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.2 0.8 0 6 4 1 4 0 3 151715825 A G Y Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 3 151716478 A G Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 151716833 C A Y N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 151716839 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151716967 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 151717291 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151717388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151717438 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 151717443 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 151717514 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151717550 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 151717551 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151717590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151717595 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 151717625 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151717706 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 151717823 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 151717944 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 151718151 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 151718242 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 151718354 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 151718372 G A Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 151718383 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 151718500 G A N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 151718504 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 151718572 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 151718637 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 151718854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151718906 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 151719056 A C N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 151719057 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 151719091 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151719118 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 151719153 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 151719193 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151719206 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 151719211 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 151719598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151719823 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151719824 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151719854 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151720158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151720186 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 151720303 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 151720558 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151720569 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151720573 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151720594 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151720634 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151720711 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 151720905 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151720918 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151721195 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 151721390 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151722045 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 151722060 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151722548 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 151722566 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 151722974 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151722992 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151723022 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151723031 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151723067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151723208 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151723227 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151723270 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 151723271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151723305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151723308 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151723352 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151723423 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151723431 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151723457 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151723541 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151723605 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151723696 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 151724256 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151724294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151724491 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 151724497 T G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 151724531 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 151724653 C A N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 151724810 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 151724927 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 151725284 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151725329 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151725897 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 151725967 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151726421 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151727026 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151727733 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151728207 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 151728694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151728936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151729103 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151729182 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151729908 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151729958 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151730214 T C Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 151730228 T G Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 151730279 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 151730404 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 151730627 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151730647 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151730718 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 151730777 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151730997 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 151731007 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 151731318 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 151731556 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 151731590 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 151731712 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 3 151731729 C T Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 151731825 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 151731888 A T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 151731930 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 151731975 G T N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 151732233 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151732687 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151732700 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 151732703 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 151732798 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 151733005 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 151733029 T A Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 151733055 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 151733075 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 151733092 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 151733156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151733208 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151733239 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 151733316 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 151733324 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151733368 C A Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 151733433 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 151734618 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 151734703 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 151734706 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 151735127 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151735960 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 151736705 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 151738193 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151738296 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 151740367 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151742384 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151742738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151744042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151745532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151746763 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 151747193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151747289 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 151747629 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151747843 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151747964 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151747995 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151748006 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 151748034 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151748036 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151748298 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 151748686 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 151748781 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 151748934 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 151748967 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151749365 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 151749425 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 151749428 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 151749468 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 151749574 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 151749827 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151749920 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151749923 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151750254 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 151750259 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 151750309 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151750361 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 151750401 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 151750555 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151750620 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151750714 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151750736 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151750748 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151750762 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 151750847 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 151751099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151751302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151751489 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151751658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151751743 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 151751754 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151751869 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 151752174 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151752606 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151752613 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151753126 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151754884 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151754956 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 151755305 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 151755489 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151755605 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 151755648 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 151755666 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 151755705 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151755732 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151755834 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151755841 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151755993 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151756046 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151756268 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 151756780 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 151757550 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 151757557 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 151757600 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151757705 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 151757757 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 151758063 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151758143 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 151758164 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 151758242 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 151758361 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 151758559 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 151758793 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 151758831 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151759408 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 151759689 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 151760213 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 151760253 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 151760268 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 151760274 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 151760368 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 151760512 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 151760532 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 151761105 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151761216 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 151761503 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151761562 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 151761574 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 151761583 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 151761708 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 151761936 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 151761952 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 151762031 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 151762033 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 151762065 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 151762103 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 151762115 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 151762144 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 151762449 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151762460 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 151762499 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 151762552 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 151762605 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 151762963 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151763175 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 151763188 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 151763201 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 151763280 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151763335 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 151763512 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 151763516 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 151763616 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 151763805 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151764037 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 151764592 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151764653 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151764700 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 151764936 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 151765106 A G Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 151765315 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 151765350 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151765390 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151765432 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151765451 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151765466 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 151765501 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 151765760 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151765808 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 151765830 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 151765902 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151765913 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 151767861 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151768041 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 151768727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151769774 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 151770013 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151770084 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 151770157 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 151770778 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151771241 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151771507 G A N Y 0.375 REF 0.8 0.8 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 3 5 1 1 2 3 151772844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151773275 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151773396 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 151773475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151773590 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151773641 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 151774535 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 151774690 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151774919 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 151775020 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 151775047 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 151775188 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 151777148 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151777188 G T N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 151777207 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 151777211 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 151777263 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151777336 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151777345 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 151777359 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 151777462 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151777535 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151777675 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 151777805 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 151778334 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151778507 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 151778531 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 151778631 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 151778690 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151778700 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151778868 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151778924 A C N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 151778975 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 151778991 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151779034 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 151779071 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 151779094 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 151779125 G T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 151779168 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151779324 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 151779402 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 151779406 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 151779570 G T N N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.545454545454545 0.363636363636364 0.0909090909090909 16 6 6 4 1 3 151779776 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 151779806 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151779824 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151779888 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 151779910 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 151779913 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 151780153 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 151780165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151780332 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151780475 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 151780495 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151780514 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 151780525 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 151780552 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 151780566 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151780575 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 151780593 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151780634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151780652 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151781057 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151781110 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151781151 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 151781152 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151781276 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 151781477 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 151781727 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 151781837 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151781841 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151781906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151782020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151782045 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151782064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151782249 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151782323 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 151782364 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 151782443 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 151782449 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 151782457 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 151782520 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 151782530 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 151782540 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 151782615 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151783046 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151783056 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 151783291 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151783342 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151783512 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151783892 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151783914 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 151784079 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151784101 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151784156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151784270 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 151784274 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 151784286 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151784334 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151784374 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151784491 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 151784676 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 151784781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151784831 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 151784906 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151784940 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151784944 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 151784990 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151785036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151785345 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 151785389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151785421 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151785461 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 151785533 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 151785686 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151785716 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 151785732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151785818 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 151785941 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 151786073 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151786078 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151786133 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 151786198 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151786336 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 151786699 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151786724 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151786772 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 151787041 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151787111 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151787210 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151787311 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151787346 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151787419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151787456 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151787492 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 151787589 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 151787640 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151787688 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 151787700 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 151787733 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 151787855 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151787918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151788812 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151788850 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151788996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151789283 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151789324 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 151789330 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 151789342 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151789415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151789696 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151789711 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 151790698 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151790713 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151790768 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151791311 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 151791313 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 151791548 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 151792939 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 151793105 G C N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 151793155 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 151793295 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 151793389 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 151793529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151793544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151793699 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151794199 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 151794720 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151794779 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 151794888 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151794890 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151794902 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 151794990 G T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.125 0.125 0.75 6 26 2 2 12 3 151795069 A C N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 151795080 C T N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 151795140 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 151795235 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 151795244 C G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 151795304 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151795349 C T N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 151795436 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.166666666666667 0.75 4 20 1 2 9 3 151795461 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.0714285714285714 0.214285714285714 0.714285714285714 5 23 1 3 10 3 151795524 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151795667 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151796042 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 151796076 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 151796079 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 151796101 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 151796132 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 151796185 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 151796213 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 151796222 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 151796229 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 151796275 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 151796283 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 151796291 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 151796523 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 151796560 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151796580 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 151796877 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 151797165 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151797179 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151797284 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151797316 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 151797350 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 151797579 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 151797614 G T Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 151797843 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 151798425 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151798610 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151798625 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151798780 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151800398 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 151800892 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 151801395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151801527 G C Y N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 151801868 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151802252 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151802957 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151804601 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 3 151804961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151804974 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151805230 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 151805513 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 151805557 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151805704 A T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 151805705 A C N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 151805892 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 151805903 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151805905 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151806374 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151806621 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151806761 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151806888 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151806906 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 151806936 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151807613 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151807857 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 151808995 G C N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 3 151809398 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151809413 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 151809555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151809556 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151810720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151811478 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151811769 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151812700 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 151812817 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151812907 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151813090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151813339 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151813362 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151813373 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 151813523 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151813541 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151813545 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151813641 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 151813795 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151814013 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 151814510 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 151814516 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 151814730 A G N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 3 151814910 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151815287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151815462 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151815546 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151815903 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151815947 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151815951 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151815960 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151816099 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151816104 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 151816115 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 151816172 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 151816263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151817016 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 151817066 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 151817114 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 151817198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151817238 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151817413 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 151817695 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 151818228 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 151818415 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 151818493 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 151818522 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 151818682 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 151819271 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151819325 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151819380 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 151819434 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151819580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151819654 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151819678 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151819801 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 151819812 T A Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 151819836 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 151819873 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151819923 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 151819939 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 151819982 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151820096 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 151820116 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 151820140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151820411 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151820416 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151820514 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151820614 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151820693 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 151821074 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151821343 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 151823168 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 151823222 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151823271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151823292 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151823390 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 151823698 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151823767 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 151823934 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151823960 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151824067 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 151824091 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 151824397 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151824422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151824448 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151824491 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151824602 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151824651 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151824682 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151824686 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151824810 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151824835 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151824980 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151825151 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151825389 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 151826554 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151826691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151826766 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 151826929 G T N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 151826933 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 151827480 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 151827559 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151827962 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151828042 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151828117 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 151828179 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151828318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151828336 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151828383 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151828415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151831024 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151832305 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 151833631 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151835310 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151835482 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151835574 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151835658 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151836213 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151836269 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151836270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151836336 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 151836380 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151836423 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151836424 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151836465 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151836684 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151836696 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151836783 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151836941 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151837136 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151837616 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151837978 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151838029 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151838036 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151838072 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151838119 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151838128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151838140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151838197 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151838266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151838315 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151838328 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151838509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151838548 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151839242 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151839344 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151839346 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151839481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151839516 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151839564 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151839580 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151839600 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151839624 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151839703 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151839710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151839866 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 151839900 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 151839901 A T N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 151839942 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 151840199 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 151840404 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 151840672 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 151840831 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 151840832 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 151840922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151841860 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 151842212 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151842298 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151842513 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 151842594 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151842662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151843664 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151844373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151845323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151845359 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151849151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151850582 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 151852949 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 151857707 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 151858644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151858813 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151859098 A G Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 151862460 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151863608 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 151863668 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 151865300 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151865580 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151868221 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151868678 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 151871448 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151872943 A T N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 151873117 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151873172 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 151873758 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151874772 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151875044 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 151875971 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151876565 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151877215 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 151878821 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151879239 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 0.928571428571429 2 26 1 0 13 3 151879630 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151879716 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 151879718 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151880313 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151880660 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151880702 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151880730 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 151880745 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151880746 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151880826 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 151880835 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151880841 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151880856 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 151880865 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 151880870 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 151881644 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151882540 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151883981 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151885241 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151886518 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151891031 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151893323 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151893837 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 151901647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151901677 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151901678 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151901793 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151902188 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151902961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151903353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151904212 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151904673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151906035 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151906450 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151907691 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 151907696 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 151907799 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151907837 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 151909015 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151909468 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 151909469 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151913111 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 151913643 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151913653 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151916228 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 151917242 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151917619 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151919515 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151920373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151921257 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151921499 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151921544 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151921780 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151921875 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 151921877 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 151922038 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151922136 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151922538 G T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 151922565 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151922673 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151922691 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151922722 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151922873 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151923007 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151923546 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151923684 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151923700 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151923893 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151923956 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151923957 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151924234 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151924717 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151925069 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 151925072 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 151925166 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151925522 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151925529 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151926021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151926382 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151926799 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151927734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151929084 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151929145 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151929500 G A N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 3 151930304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151930427 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151931825 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151933027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151934509 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151934566 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151934891 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151937150 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151939123 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151939131 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151939192 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151939330 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151939838 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151939927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151940315 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151941659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151942195 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151943400 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151943414 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151943751 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151945434 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151945820 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151945849 C T N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.153846153846154 0.769230769230769 4 22 1 2 10 3 151946122 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151946172 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151946279 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151946477 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151946613 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151947406 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151947651 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151947691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151949214 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151949856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151950003 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151950075 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151950356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151950421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151950434 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151950993 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151951119 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151951340 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151951369 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151951515 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151951732 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151951848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151951953 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151952441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151953028 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151953034 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151953616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151953931 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151954155 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151954233 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151954358 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151954422 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151954513 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151954539 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151954612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151954646 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151955091 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151955097 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151955132 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 151955720 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 151955795 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151956007 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 151956129 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151956202 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151956270 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151956308 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151956353 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151956591 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151956594 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151956740 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151956889 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 151956941 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 151957416 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151957426 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151957430 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151957439 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151957460 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151957531 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 151957536 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151957777 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151958169 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 151958305 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151958477 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151958591 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151958621 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151958645 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151958741 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0 0.529411764705882 0.470588235294118 9 25 0 9 8 3 151959130 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151959205 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151959399 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151959463 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151959610 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151959653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151959696 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151959750 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151960199 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151960793 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151960848 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151961045 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 151961201 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151961203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151961212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151961260 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151961267 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151961312 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151961433 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151961500 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151961587 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151961997 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151962011 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151962103 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151962192 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 151962238 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 151962293 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 151962472 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151962494 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151962517 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151962528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151962598 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151963075 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151963174 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151963235 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151963238 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151963284 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151963297 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151963315 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 151963392 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151963426 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151963622 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 151963749 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 151964020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151964038 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151964206 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 151964233 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 151964389 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151964455 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151964648 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151964789 A C N N 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 151965192 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151967216 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151968149 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151969546 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151970989 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 151971296 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 151971536 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 151971617 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151971707 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151971822 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 151971968 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151971991 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151972078 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151972094 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 151972185 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151972195 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151972819 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151973142 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151973176 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151973333 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151973350 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151973452 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151973463 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151973623 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151974375 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151974519 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151974544 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151974560 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 151974571 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151974579 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151974696 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151974707 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151974765 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151975100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151975106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151975127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151975164 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151978514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151978598 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151978696 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151980412 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151981135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151981449 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151982612 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151982616 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151984358 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151985324 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151985811 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 151995301 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 151995547 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151996880 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 151997008 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 151997068 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151997756 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151998226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151998590 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 151999355 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151999361 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 151999644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 151999886 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 151999887 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 151999986 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152000177 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 152000259 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152000265 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152000448 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152000469 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 152001247 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152001906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152003231 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 152003569 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152003639 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 152003712 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152004361 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152004389 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152004414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152004493 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152004863 T C N Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 7 7 2 3 2 3 152004956 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152005199 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152005605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152005910 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152006207 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152006222 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152006248 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152006322 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152006565 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 152006722 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152006723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152006740 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 152006949 C T Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 152006961 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 152007154 T C N Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 6 6 2 2 2 3 152007309 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 152007369 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 152007846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152007849 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152008520 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152008657 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152008863 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152008920 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152009149 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 152009202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152009977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152010011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152011228 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152012144 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152012170 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152012240 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152012440 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152012470 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152012475 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152012751 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152013088 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152013103 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152013134 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 152013209 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 152014102 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 152014292 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152016396 T G Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 152016535 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 152016707 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 152017001 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 152017018 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 152017134 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 152017812 G T Y N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 3 152019648 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152020133 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152020679 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152021014 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 152021028 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152021031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152022572 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152022821 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152025977 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152027983 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152029552 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152031132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152031841 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 152032544 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152033142 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152033340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152033733 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152034410 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152037067 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152037590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152037694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152039159 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152039247 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152042492 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152042685 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152042924 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 152044546 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152045705 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152046878 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152047378 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 152048258 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 152051261 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152051340 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 152051595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152052027 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 152052380 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 152052694 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152052937 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152053262 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152054346 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152055514 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152056688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152057541 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152060768 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 152060960 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 152061365 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152061414 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152065961 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 152067149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152069817 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 152070660 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 152072846 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152073241 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 152073245 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152074716 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152074942 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 152074961 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152077347 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152077429 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 152078178 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152079080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152080673 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 152081182 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 152081226 G A Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.0588235294117647 0.823529411764706 0.117647058823529 16 18 1 14 2 3 152081230 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.0555555555555556 18 18 1 16 1 3 152081252 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152081276 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152081289 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 152081329 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 152081342 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 152081433 G T N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 3 152083222 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152084706 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152085493 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152088220 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 152088812 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152093605 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152093881 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152094503 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152095882 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 152097983 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 152099155 T G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 152099222 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 152099252 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 152099450 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 152101222 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152101312 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152101465 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152102205 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152104622 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152105076 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152105551 T A N N 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 3 152107891 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 152108123 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152108877 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152108878 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152109537 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152110665 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152110804 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152110838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152110848 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152110850 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152111900 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 152112048 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152112083 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 152112829 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152113147 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152114290 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152114446 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 152114450 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 152114579 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 152115035 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152115151 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152115152 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152115167 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 152115300 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 152115357 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 152115753 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152117127 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152118226 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 152119570 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 152119941 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 152120053 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152120694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152120733 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 152120952 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152123243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152124194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152124214 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152124425 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 152124701 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 152124996 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152125667 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 152125718 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152126623 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152126869 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 152127136 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152127278 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152127608 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152127897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152128089 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152128156 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 152128290 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 152128526 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 152128903 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152129258 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152129407 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152129412 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152129462 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152129471 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152129492 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152129680 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152130944 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 152131305 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 152131769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152131804 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 152131892 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 152131989 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 152131990 G C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 152132086 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 152132146 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 152132427 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 152132580 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152132594 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 152132653 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 152132660 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 152132726 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 152132911 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152132918 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152132958 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152132973 T C Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 152133189 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 152133348 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152133439 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 152133481 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152133506 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152133844 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 152133887 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 152133935 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 152134277 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 152134280 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 152134335 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152134638 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 152135034 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 152135139 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152135230 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 152135235 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152135308 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152135516 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152135556 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 152135940 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 152135951 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 152135953 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152136731 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 152136795 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 152136826 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 152136836 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152136889 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 152136973 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152136988 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 152136993 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 152137028 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 152137137 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 152137201 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 152137263 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152137271 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 152137282 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 152137291 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 152137348 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152137384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152137443 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 152137576 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 152137980 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152138079 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 152138234 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152138243 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152138465 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 152138503 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 152138505 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 152138613 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 152139210 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 152139405 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 152139576 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 152139758 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 152140495 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 152141614 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 152141633 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 152141787 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 152142677 C A Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 152144262 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152144313 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 152144385 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 152144478 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 152144871 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152145325 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 152145538 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152146699 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 152146808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152146827 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 152146861 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 152147070 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 152147516 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 152147652 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152147867 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152147977 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152148013 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152148627 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 152148646 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152148669 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 152148681 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 152149898 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 152150044 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152150204 T G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 152151058 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 152151078 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 152151351 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 152151383 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152151492 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 152151495 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152151760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152151881 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 152152165 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 152152224 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 152152233 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 152152252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152152302 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 152152337 A G N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 152152355 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 152152396 A T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 152152411 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 152152832 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 152152842 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 152152879 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 152152931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152153066 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 152153077 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 152153275 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152153322 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152153461 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 152153492 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152153573 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152153861 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152153875 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152153942 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152155447 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152155586 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 152155839 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152156204 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152156234 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 152156270 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152156615 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 152156695 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 152156765 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 152156775 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 152156788 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 152156793 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 152156856 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152157010 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 152157063 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 152157065 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 152157074 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 152157142 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152157146 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 152157268 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152157319 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152157377 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 152157390 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152157394 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152158286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152159514 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152159524 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152159588 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 152159597 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152159934 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152160718 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 152160931 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152161006 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 152161262 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 152161575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152161604 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 152162868 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152162924 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152162949 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152164051 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152164056 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152164076 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152164288 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152164388 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152164923 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 152164974 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152164983 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 152165144 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 152165479 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152166244 A C Y N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.166666666666667 0.25 0.583333333333333 7 17 2 3 7 3 152166519 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152166685 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152166731 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 152167010 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152167146 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152167176 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152167205 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 152167236 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152167282 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152167480 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 152167482 G T N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 152167554 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152167603 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152167650 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152167674 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152167854 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 152168025 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 152168144 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 152168197 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152168672 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152168722 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152168783 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152168882 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152168890 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152168901 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152168902 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152168924 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152168982 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152169003 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152169005 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152169020 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 152169083 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 152169189 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 152169251 A C Y N 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.0714285714285714 0.714285714285714 0.214285714285714 12 16 1 10 3 3 152169383 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 152169451 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 152169820 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152172649 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 152173411 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152173427 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152174685 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152174698 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 152175347 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152175366 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152175369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152175447 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 152175495 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 152175524 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 152175710 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152175751 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 152175884 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152176092 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152176126 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 152176213 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152176432 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 152176531 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 152177499 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 152177926 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152178055 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152178095 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152178197 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152178339 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 152178433 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 152178679 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152178723 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 152178850 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152178868 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 152178934 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152178952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152179250 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152179281 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152179299 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 152179314 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152179366 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 152179448 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 152179594 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 152179637 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 152180344 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152180380 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 152180625 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 152180659 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152180841 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152180846 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152180852 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152180862 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152180879 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 152180979 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152181164 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 152181338 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 152181355 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152181708 G C N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 152181784 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 152181865 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 152182261 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 152182351 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152182413 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152182566 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152182626 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152182628 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152182647 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152182697 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152182770 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152182817 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152182867 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152182921 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 152182928 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 152182932 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 152183046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152183157 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152183725 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152183809 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 152183814 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 152183857 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152183869 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 152184056 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152184791 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152184936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152184979 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 152185033 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 152185079 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152185087 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152185115 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 152185384 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 152185500 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152185543 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 152185631 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 152185683 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 152185747 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 152185783 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 152185934 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 152185945 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152186014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152186087 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 152186159 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152186495 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152186582 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 152186678 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152186735 A G N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 152186741 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 152186803 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152186921 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 152186989 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152187195 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152187210 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 152187326 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 152187409 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 152187616 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152187668 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 152187810 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152187886 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152188626 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 152188650 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 152188662 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 152188922 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 152189036 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 152189192 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 152189194 T A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 152189209 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152189249 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 152189412 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152189465 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 152189467 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 152189476 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 152189506 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 152189646 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 152189914 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152189946 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152190038 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 152190966 C T Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 152191150 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 152191157 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152191262 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152191300 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152191337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152191542 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152191702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152191774 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 152191792 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152191818 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 152191859 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152192045 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 152192123 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 152193189 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152193208 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152193508 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152193580 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152193832 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 152193887 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 152193995 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152195864 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 152196140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152196276 T G Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 152196277 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152196611 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 152197567 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 152197710 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152197949 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152198051 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152198283 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 152198513 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 152198586 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 152198644 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 152205232 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 152205237 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 152205246 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152205533 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 152205655 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152205837 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 152206059 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152206072 T G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 152206207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152206356 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 152206842 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 152207055 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152207120 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 152207123 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 152207139 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 152207297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152207315 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152207320 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 152207425 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 152207851 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 152208150 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 152208179 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 152208228 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 152208242 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152208243 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152208257 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 152208313 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152208520 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 152209161 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 152209204 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 152209217 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 152209233 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 152209273 G T Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 152209307 T C Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 152209649 A G Y Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.222222222222222 0 0.777777777777778 4 14 2 0 7 3 152209760 T G N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 152209791 T A Y N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 152209871 A G Y Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.571428571428571 0.428571428571429 0 22 6 8 6 0 3 152209877 A G Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.1875 0.8125 0 19 13 3 13 0 3 152209947 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 152210201 G T Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 152210210 A C Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 152210216 G A N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 3 152210301 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 152210316 G C N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 26 6 12 2 2 3 152210365 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 152210379 A T N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.733333333333333 0.133333333333333 0.133333333333333 24 6 11 2 2 3 152210826 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 152211355 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152212061 T C N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0 0.928571428571429 0.0714285714285714 13 15 0 13 1 3 152212706 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152212761 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152212804 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152213338 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 152213368 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 152213444 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 152213482 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152213555 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152213569 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152213731 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152213797 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152214046 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 152214212 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 152214454 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 152214459 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 152214653 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 152214840 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 152214851 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 152214909 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 152215012 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 152215292 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 152215295 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 152215322 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152215323 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 152215992 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 152216042 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152216102 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 152216223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152216405 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152216525 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 152216714 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152216731 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152217439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152217511 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152217646 C A N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 152217810 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 152217850 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152217858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152217942 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 152217970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152218038 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152219732 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 152219829 G A Y Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 152220587 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 152220694 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 152220839 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 152221587 T G N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 3 152221625 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 152221724 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 152221796 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152221824 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 152222101 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 152222125 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 152222372 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 152222400 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 152222401 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 152222420 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 3 152222439 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152222487 G A N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 152222685 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 152222707 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 152222733 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 152222746 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 152222761 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 152222993 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152223024 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 152223079 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 152223082 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 152223100 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 152223521 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152223859 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 152224257 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 152224394 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 152224400 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 152224455 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 152224507 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 152224537 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 152224648 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 152224649 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 152224683 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 152225168 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 152225644 C T N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.214285714285714 0.428571428571429 0.357142857142857 12 16 3 6 5 3 152225754 T C Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 152225815 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 152225832 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 152225879 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 152225952 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 152226076 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 152226258 G A Y Y 0.375 ALT 0.8 0.8 0.625 0.375 0.25 0.75 0 5 3 1 3 0 3 152226490 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 152227644 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 152227779 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 152227799 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 152227844 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 152227903 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152227948 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152227994 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 152228129 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152228180 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152228446 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 152229955 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 152230197 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152230217 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152230748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152231163 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152231287 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 152231952 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152231988 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152232005 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 152232038 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152232086 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152232529 C G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 152232628 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 152232899 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 152239709 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152239736 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 152239737 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 152239985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152240032 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 152240109 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152241465 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 152242428 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152242639 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152242672 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152242754 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152242911 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 152243105 C T Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 152243133 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152243152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152243178 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 152243231 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 152243242 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 152243661 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152243833 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152243834 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152243914 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152243952 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152244415 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152244508 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 152244592 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152244759 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152244975 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 152244990 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152245091 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152245108 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 3 152245348 A G Y Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0 0.647058823529412 0.352941176470588 11 23 0 11 6 3 152245517 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 152245562 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152245567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152245599 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152245621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152245846 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152245916 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152245982 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152246157 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152246326 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 152246463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152246765 A G N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 3 152247111 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 152247227 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 152247260 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 152247316 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 152247348 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 152247349 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152247379 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152247560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152247629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152247820 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 152247821 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152248955 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 152249009 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152249035 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 152249050 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 152249398 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 152249481 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152249523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152249582 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 152249586 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 152253019 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152255384 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152258284 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152259559 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152264322 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152264511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152265595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152267666 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152268282 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152269468 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 152270276 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 152271258 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 152271407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152271737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152273724 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152273993 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152275390 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152276737 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152277960 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152278572 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 152278623 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 152278749 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 152278843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152279763 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152280544 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152280676 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152280716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152280884 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152281241 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152281654 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152281765 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152281900 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152282046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152282105 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152282133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152282310 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 152282480 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 152282603 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152283105 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152283141 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 152283184 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152283286 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152283389 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 152283505 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 152283629 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 152283636 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 152283746 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 152284015 A T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 152284712 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 152284821 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 152284832 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 152284845 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 152284889 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 152284972 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 152284999 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 152285007 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 152285144 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 152285152 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 152285157 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 152285217 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 152285253 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 152285328 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 152285340 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 152285856 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152285941 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152286699 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 152286703 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 152286770 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152286823 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152286919 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 152287117 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 152287140 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152287165 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152287167 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152287246 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 152287593 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 152287820 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 152287932 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 152287955 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 152287978 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152288006 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152288093 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 152288356 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152289411 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 152289549 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 152290142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152290179 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 152290192 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 152290257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152290295 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152291039 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 152291157 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 152291193 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 152291216 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152291217 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152291231 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152291311 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 152291607 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 152291610 C T Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 152291637 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 152291663 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 152291720 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 152291755 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 152291811 T C Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 152291887 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 152291916 A T N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 152292129 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 152292613 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 152292637 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 152292663 C T Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 152292680 T C Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 152292699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152292763 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 152292884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152292895 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152292951 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152293458 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 152293656 G C Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 152293693 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.0526315789473684 0.736842105263158 0.210526315789474 16 22 1 14 4 3 152293731 A T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 152293777 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 152293831 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 152294252 G T Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 152294297 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152294325 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 152294484 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 152294590 A T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 152294731 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 152294891 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 152294893 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 152294914 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 152294994 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 152295236 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 152295248 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 152295282 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 152295355 G A N Y 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.0666666666666667 0.4 0.533333333333333 8 22 1 6 8 3 152295412 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 152295458 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 152295710 T G N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 152295842 C A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 152296235 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 24 12 6 12 0 3 152296313 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 152296317 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 152296361 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152296393 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 152296470 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152296479 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152296517 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 152296536 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 152296543 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152296568 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 152296615 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 152296628 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 152296650 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152296679 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 152296682 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 152296807 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 152296827 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 152296831 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 152296842 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 152296992 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152297130 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152297172 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152297182 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 152297229 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152297285 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152297294 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152297433 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 152297473 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 152297485 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 152297523 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152297539 T G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 152297676 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152297818 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 152297951 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 152297952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152297976 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 152298012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152298151 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152298526 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 152298532 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 152298578 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 152298600 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 152298673 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 152299005 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152299015 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152299192 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152299247 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152299263 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152299269 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152299333 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152299371 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152299375 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 152299395 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 152299396 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152299445 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152299480 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152299701 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 152299974 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152299990 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 152300107 A C Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 152300177 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152300320 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152300349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152300491 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152300693 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152300828 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152301624 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 152301626 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 152301920 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152302761 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 152302853 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152302892 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152302950 T C Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 152302978 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 152303098 C T Y Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.307692307692308 0.615384615384615 6 20 1 4 8 3 152303174 C T Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 152304209 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152304340 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 152304390 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152304514 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 152304786 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 152304875 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152304921 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 152305136 C T N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 3 152305918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152306374 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 152307336 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 152307505 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152307549 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 152307928 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 152308963 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 152309786 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 152310714 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152310814 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152311138 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152311140 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152311418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152311550 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 152311659 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152311735 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 152311739 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 152311791 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152311823 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 152311942 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152312041 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 152312100 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152312321 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 3 152312358 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 152312372 T C Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 152312414 G A Y Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 152312421 T C Y Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.333333333333333 0.583333333333333 0.0833333333333333 15 9 4 7 1 3 152312432 G A Y Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.0833333333333333 12 12 1 10 1 3 152313203 T C Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.0666666666666667 27 3 13 1 1 3 152313219 A C Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 152313540 A T Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 152313571 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 152313610 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 152313679 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152313683 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152313691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152313928 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152313956 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152314101 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 152314188 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 152314192 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152314292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152314435 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152314544 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 152315013 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152315062 A T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 152315137 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152315240 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 152315251 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 152315710 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152315744 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152315943 T G N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 152316384 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 152316467 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 152316529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152316557 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152316620 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152316626 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152317536 A T N N 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0 1 0 9 9 0 9 0 3 152318322 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 152318358 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152318445 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152318454 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152318548 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 152318579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152318602 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 152318626 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152318639 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152318641 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152318709 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152318825 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152318829 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152318885 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152319084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152319142 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152319232 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152319257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152319361 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 152319392 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152319416 G T Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 152319425 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 152319497 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152319513 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152319689 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 152319864 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152319922 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 152320039 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 152320333 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152320359 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 152320546 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 152320689 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 152320695 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 152321197 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 152321408 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 152322054 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152322082 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152322094 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152322164 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152322189 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152322668 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152322837 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 152323881 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 152324064 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 152324106 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152324118 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152324125 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152324168 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152324213 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 152324275 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152324376 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 152324428 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 152324510 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 152324513 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 152324528 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 152324647 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 152324761 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 152324824 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 152324840 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 152324869 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 152325119 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 152325134 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 152325143 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 152325156 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 152325174 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 152325182 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 152325206 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 152325261 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 152325362 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 152325366 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.421052631578947 0.157894736842105 0.421052631578947 19 19 8 3 8 3 152325570 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 152325816 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 152325818 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 152326001 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152326008 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152326098 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 152326151 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 152326158 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 20 20 8 4 8 3 152326368 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152326450 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152326632 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 152327472 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 152327600 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 152327923 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152328139 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152329349 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152329475 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152329747 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 152330456 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152330542 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 152332247 T A N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 152333225 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152333325 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 152333494 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152333588 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152333600 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152334006 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152334054 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152334164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152334344 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152334537 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152335703 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152336569 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 152337661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152337754 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 152337873 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 152337884 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152338198 T A N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 152338206 T G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 152338215 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 152338232 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 152338329 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 152338391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152338449 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 152338478 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152338757 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152339552 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 152339569 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152340186 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 152340222 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 152340815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152342039 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152342060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152342308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152342486 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 152342584 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 152342687 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 152342753 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 152342774 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 152342821 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 152342863 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152342921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152343068 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 152343377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152343560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152343593 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152343633 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 152343777 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 152343792 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 152343898 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 152343957 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152344094 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152344149 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 152344227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152344321 G A N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 152344365 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 152344386 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 152344522 C A N N 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 3 152344596 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 152344605 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 152344629 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152344658 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152344817 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 152344848 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 152344864 A G N Y 0.461538461538462 ALT 0.35 0.35 0.538461538461538 0.461538461538462 0.307692307692308 0.461538461538462 0.230769230769231 14 12 4 6 3 3 152344909 T A Y N 0.333333333333333 REF 0.85 0.85 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 2 4 0 2 1 3 152345295 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152345411 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 152345500 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 152345538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152345545 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152345684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152345704 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152345705 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152345727 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152347299 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 152347321 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 152347356 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 152347363 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152347407 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 152347477 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152347548 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 152347550 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152347608 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152347794 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 152347850 C A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 152347920 G A N Y 0.208333333333333 ALT 0.4 0.4 0.791666666666667 0.208333333333333 0.666666666666667 0.25 0.0833333333333333 19 5 8 3 1 3 152348154 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 152348170 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 152348209 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 152348252 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 152348360 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 152348365 G C N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 152348459 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152348535 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152348548 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152348587 C G Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 152348670 G A Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 152348906 T G Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 152348995 A G Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 152348996 T A Y N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 152349023 C A Y N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 152349074 A G Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 6 26 0 6 10 3 152349086 A T Y N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 152349101 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 152349148 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 152349221 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 152349294 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 152349383 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152349421 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 152349616 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 152349655 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 152349817 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152349858 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152349952 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152350045 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152350061 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152350085 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152350087 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152350141 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152350181 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152350197 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152350268 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 152350347 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 152350365 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152350466 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 152350474 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 152350478 T G Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 152350504 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 152350589 T C Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 152350601 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 152350605 G T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 152350616 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 152350810 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 152350818 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 152350958 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 152351042 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152351089 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152351134 C G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 152351248 A T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 152351258 T G N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.352941176470588 0.529411764705882 0.117647058823529 21 13 6 9 2 3 152351272 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 152351323 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 152351332 T G N N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.266666666666667 0.533333333333333 0.2 16 14 4 8 3 3 152351537 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 152351561 A T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 152351573 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 152351593 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 152351670 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152351693 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 152351704 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 152351826 T A Y N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 152351842 G T N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 3 152351909 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 152352092 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 152353235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152354037 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152354374 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 152354484 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 152354607 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 152354619 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 152354706 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 152354830 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 152354856 G A Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 152355001 T A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.0588235294117647 0.647058823529412 0.294117647058824 13 21 1 11 5 3 152355658 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152355677 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152355680 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 152355713 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152356047 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152356216 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152356279 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152356379 T C Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 152356395 G A Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 152356441 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152356569 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152356704 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 152356722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152356796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152357538 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152357740 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152361484 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152361634 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152363844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152364270 C A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 152364471 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152364482 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152364854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152364984 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 152365036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152365062 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152365075 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152365621 G A Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 152365809 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 152366037 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 152366134 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 152366149 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 152366180 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 152366245 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 152367259 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 152367328 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 152367398 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 152367792 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152367921 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 152367978 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 152367987 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152368039 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 152368421 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 152368526 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 152368553 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152368697 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 152368939 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152369218 A C Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.210526315789474 0.789473684210526 0 23 15 4 15 0 3 152369280 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 152369329 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 152369341 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 152369543 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152369640 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 152369755 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152370342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152370582 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152370635 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 152370719 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 152370721 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152370784 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152370874 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152370887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152370921 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152370945 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152371047 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152371120 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 152371168 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152371246 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 152371357 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 152371570 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 152371650 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152371833 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152371863 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152372016 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152372027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152372224 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152372244 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152372249 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152372277 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152372315 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152372459 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152372522 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152372532 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152372578 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152372818 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152372864 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152373104 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152373151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152373189 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152373237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152373284 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152374583 T G Y N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 152374588 C G Y N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 152374724 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152374786 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152374841 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152374842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152374948 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152374955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152375027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152375111 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 152375258 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 152375284 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 152375293 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 152375307 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 152375382 T C N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 152375492 A G Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 152375609 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152375628 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152375700 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 152375746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152375758 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 152375770 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 152375771 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 152376026 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 152376044 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 152376096 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 152376131 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 152376278 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 152376281 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 152376366 A C Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 152376448 C T N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.357142857142857 0.571428571428571 0.0714285714285714 18 10 5 8 1 3 152376567 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152376615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152376723 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152376726 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152376778 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 152376856 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152376889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152377622 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152377749 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 152377756 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 152377939 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152377941 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 152378028 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 152378322 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 152378337 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152378345 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 152378432 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152378546 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 152378597 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 152378605 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 152378656 G A N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 3 152378819 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152378825 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 152379179 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 152379406 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 152379424 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 152379482 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 152379734 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 152380478 C T N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 152380493 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.7 0.7 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 1 11 0 1 5 3 152380563 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 152380565 C G N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 152380685 T A N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 152380748 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 152380797 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 152380825 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 152380979 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 152381417 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152381454 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152381564 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 152381585 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 152381591 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 152381599 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 152381784 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 152381852 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152381952 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152381964 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152381993 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152382048 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152383107 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 152383125 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 152383136 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 152383351 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152383457 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152383519 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 152383598 C T Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 152383711 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 152383729 T G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 152383741 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 152383780 A T N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 152383838 G T N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 3 152383918 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 152383942 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 152383963 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 152383974 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 152384104 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 152384106 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 152384204 A T N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 152384254 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 152384284 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 152384400 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 152384607 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 152384664 T C N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 152384879 A G Y Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 152384955 A G N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 152385018 G T N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.125 0.5625 0.3125 13 19 2 9 5 3 152385098 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 152385342 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 152385592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152385819 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152386865 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 152386986 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152387086 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 152387878 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152388063 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 152388476 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 152388482 T G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 152389313 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152389316 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 152389673 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 152389853 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 152390158 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152390380 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152390598 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 152390660 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 152390783 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 152390923 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 152391036 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152391711 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152391721 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 152391981 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 152392204 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152392427 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 152392599 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 152392794 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.0555555555555556 0.611111111111111 0.333333333333333 13 23 1 11 6 3 152392814 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152392902 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 152392919 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152393218 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 152393375 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 152393545 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152393588 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152393616 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 152393661 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 152393692 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152393719 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 152393887 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 152393986 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152394364 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 152395134 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 152395138 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 152395155 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 152395343 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 152395361 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152395740 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 152396039 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 152396142 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152396173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152396711 T C Y Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 3 152397060 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 152397751 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152398212 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 152398226 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 152398256 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 152398288 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 152399086 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 152399091 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152399141 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152399200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152399203 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152399262 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 152399295 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 152399637 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 152399809 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 152399887 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 152399892 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 152400119 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 152400343 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 152400458 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152400460 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152400499 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152400518 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152400580 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 152400654 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 152400710 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 152400724 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 152400901 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152401585 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152401880 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152403602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152403768 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152404033 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 152404183 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 152405611 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152408338 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 152409048 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152409225 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152409988 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 152411030 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 152411241 T A N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 152411283 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 152411750 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 152411804 T G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 152413065 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152413968 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152413971 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152414274 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152414318 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152414653 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 152414691 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152414882 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152416091 A G N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 152416810 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 152416945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152417225 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152417296 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152417573 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 152417632 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152417733 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152418878 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152418894 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 152419523 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152420130 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152420157 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 152420162 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 152420228 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152423047 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 152423611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152423728 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 152423745 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 152423783 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 152424123 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152425056 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 152425226 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 152425286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152425412 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152426018 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 152426275 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152426300 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 152426413 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 152426421 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 152426589 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152426767 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152426920 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 152427141 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152427185 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 152428045 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152428789 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 152428793 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 152429083 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152430246 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 152432620 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152433133 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152433254 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 152433339 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 152433756 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 152433776 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 152433836 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 152433865 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152434000 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152434115 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 152434167 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 152434556 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 152436453 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152436473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152436496 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152437356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152438013 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152438358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152438434 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152439691 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 152439759 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152440288 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152440379 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 152442380 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152442433 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 152444583 T C Y Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 152444824 C T Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 152445407 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152445421 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152445479 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 152445784 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152448044 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152448188 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152448365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152448520 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 152449922 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 152449924 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152449940 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 152449997 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152450044 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152450176 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152450184 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152450234 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 152450365 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152450506 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152451473 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 152451500 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152451575 G C N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 152451920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152452018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152452182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152452265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152452439 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 152452719 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152452862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152453052 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 152453079 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 152453198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152453211 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152453525 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152453670 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152453713 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152453771 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152453785 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152454184 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 152454536 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152454603 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152454622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152454845 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 152455422 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 152455433 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 152455448 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 152455730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152455740 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152455876 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 152455881 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 152456080 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 152456108 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 152456389 G T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 152456441 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 152456504 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152456547 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 152456646 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 152456675 C A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 152456905 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 152457225 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 152457555 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 152457903 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 152457918 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 152458110 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 152458140 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 152458271 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 152458280 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 152458322 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 152458716 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 152458748 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 152458762 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 152458835 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152458841 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 152458870 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152458919 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 152459296 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152459304 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 152460094 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 152460095 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152460107 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 152460121 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 152460165 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152460241 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0 0.55 0.45 11 29 0 11 9 3 152460242 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 152460305 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 152460456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152460477 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152460524 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 152460622 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 152460750 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152460927 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152461015 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 152461047 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 152461082 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 152461089 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 152461114 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 152461341 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 152461351 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 152461405 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 152461422 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 152461436 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 152461441 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 152461604 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152461626 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152461644 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152461678 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152461706 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 152461707 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152461818 A T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 152461866 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152461876 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152461898 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 152463180 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 152463185 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152463206 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152463270 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152463281 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152463366 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 152463618 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 152463727 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 152463915 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 152463975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152463998 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 152464028 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 152464033 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 152464285 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 152471925 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152471989 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152472005 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152472215 G A Y Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 3 152472539 A G N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 3 152472801 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 152472931 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 152472961 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152472981 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152473427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152474008 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 152474757 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 152474798 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152474884 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 152475048 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152475101 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152475213 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 152475323 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 152475525 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 152475547 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 152475555 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 152475562 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 152475618 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152475662 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152475842 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 152476035 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 152476463 A C Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 152476648 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152476671 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152477071 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152477173 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152477228 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 152477338 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152477348 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152477469 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 152477499 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 152477573 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152477646 G A Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 152477869 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152477948 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.7 0.1 0.2 30 10 14 2 4 3 152478012 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152478215 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152478347 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152478425 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152478433 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 152478646 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152478682 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152478701 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152478812 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 152478847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152478874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152478968 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152478996 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 152479004 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152479046 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 152479485 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152479724 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152480130 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 152480514 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 152480564 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152480605 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 152480789 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152480993 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152481001 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152481110 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152481148 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 152481264 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 152481760 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152482089 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 152482466 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152482490 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 152482600 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152482849 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 152482881 T C Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 3 152482936 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152483058 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152483465 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152483802 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152484319 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152484724 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152484735 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152484788 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152484855 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 152484984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152485874 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152485887 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152485915 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 152485949 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152485963 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 152486033 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152486042 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152486096 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 152486139 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 152486582 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152486583 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152486597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152486617 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 152486752 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152486984 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 152486995 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 152487147 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152487343 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152487378 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 152487788 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152487842 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152487910 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152487984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152488115 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152488177 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 152488396 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152488468 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 152488492 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152488497 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152488718 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152488789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152489311 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152489441 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 152489492 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 152489493 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 152489666 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.736842105263158 0.105263157894737 0.157894736842105 30 8 14 2 3 3 152489773 A G N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.722222222222222 0.111111111111111 0.166666666666667 28 8 13 2 3 3 152490110 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 152490186 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 152490269 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 152490319 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 152490370 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152490380 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 152490385 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152490538 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152490575 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152490619 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152491551 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152491682 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152491717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152492419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152492801 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152493926 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 152494457 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152494486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152494677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152495482 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152495945 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152496095 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 152496098 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 152496319 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152496643 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152496706 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152496849 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152496877 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 152497208 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152497661 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152497668 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152497812 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152497839 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152498027 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152498078 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152498112 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152498246 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152498271 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152498377 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 152498479 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152498637 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152499228 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152499365 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152499583 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152499723 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152500228 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152500578 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 152500597 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152500659 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152501087 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 152501094 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 152501163 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 152501473 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152502213 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 152502290 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 152502914 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152504682 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 152504763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152504772 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152504790 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 152504890 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 152504985 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 152505032 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 152505039 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 152505044 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152505150 T C Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 152505407 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 152506470 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152506543 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152507053 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152507183 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152507461 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152507536 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 152508675 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152508735 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152508828 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152509030 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152509056 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152509872 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 152510346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152510365 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152511723 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152511802 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152511823 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152511892 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152511893 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152511934 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152512560 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152513236 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152514329 C T Y Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 3 152514640 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152515396 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152515447 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152515465 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152515941 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152515988 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 152516004 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 152516063 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152516152 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152516290 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152516300 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152517479 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152517583 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152518149 C A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152518622 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152518629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152519593 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152519678 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 152519776 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152520575 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152520614 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152520622 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152521204 G T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 152521232 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152521292 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152521293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152521516 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152521547 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 152521682 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152521828 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152521989 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152522060 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 152522061 T A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 152522474 G T Y N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 152522516 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152522550 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152522565 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152522610 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152522626 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152522679 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152523230 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 152523368 C G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 152523433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152523460 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152523686 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152523693 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152523737 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152524704 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152524824 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152525591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152525622 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152525643 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152525644 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152525697 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152525699 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 152525995 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152526104 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152526149 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152526183 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152526675 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152526812 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152526902 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152526970 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152526991 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152527010 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152527016 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152527023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152527053 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 152527106 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152527123 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152527179 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152527185 T G Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152527204 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152527220 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 152527240 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152527258 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152527279 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 152527414 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 152527583 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152527599 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152527756 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 152528954 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152529180 G T Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 152529506 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152529853 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152529883 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152529919 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152529988 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152530168 T A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 152530275 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 152530395 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152530743 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152530943 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152531717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152533117 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152533928 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152534898 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152535193 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 152535237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152535507 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152535840 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152536263 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152536316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152536924 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152537342 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152539399 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152539751 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152539780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152540070 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152540253 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 152540596 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152540865 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152540999 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152541012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152541547 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152541590 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152541646 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152542537 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 152543188 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152543267 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152543501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152543835 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152545313 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 152545369 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152545371 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152546298 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152548168 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152548369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152548690 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152548835 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152549138 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 152549264 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152549326 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152549949 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 152550179 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 152550758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152550776 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152550924 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152551033 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152551050 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 152551052 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152551163 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 152551277 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 152551283 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152551339 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152551574 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152551576 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152551665 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 152551768 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152551799 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152552048 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152552111 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152552824 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 152552877 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 152552929 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 152552940 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152553030 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152553153 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152553217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152553660 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 152553794 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 152553823 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 152554738 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152554811 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 152554993 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152555064 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152555207 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152555228 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152555247 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152555412 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 152555445 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 152555458 A C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 152555661 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152555663 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152556165 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 152556423 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 152556437 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 152556567 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152556704 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 152556715 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 152556844 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 152556860 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 152556891 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 152556944 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152557121 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 152557245 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 152557336 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 152557467 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 152557592 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 152560757 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152560991 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 152561010 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152561104 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152561109 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152561872 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 152562400 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152562443 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 152562488 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152562554 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 152562605 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 152562611 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 152562631 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 152562632 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 152562696 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 152562712 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 152562734 A C N N 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 3 152562769 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 152562887 A G N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 152562895 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 152562952 A G N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 3 152562954 G A N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.583333333333333 0.25 0.166666666666667 17 7 7 3 2 3 152562968 G A N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 0.153846153846154 0.153846153846154 20 6 9 2 2 3 152562998 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 152563018 A G Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 152563107 A G Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 0.142857142857143 0.214285714285714 20 8 9 2 3 3 152563124 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 152563151 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152563157 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152563179 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152563353 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 152563380 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152563388 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 152563421 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 152563531 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 152563744 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152563798 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152563870 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152564175 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 152564293 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152564299 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152564661 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 152565072 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 152565075 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 152565103 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 152565767 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152565999 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152566066 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 152566067 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 152566385 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152566412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152566877 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 152567603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152567626 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152567702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152568758 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152569329 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 152569371 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152569492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152569505 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152569561 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 152569631 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 152569746 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 152569755 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 152569767 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 152569837 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 152570140 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 152570378 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152570609 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152570625 T A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 152570684 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 152570854 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152570871 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 152571119 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152571933 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 152571957 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 152572072 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 152572803 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 152572924 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152573024 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152574022 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152574907 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152575000 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152575314 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 152575322 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152575476 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 152575515 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 152575528 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.294117647058824 0.0588235294117647 0.647058823529412 11 23 5 1 11 3 152575552 T G N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 152576108 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152576247 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152576334 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 152576369 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152576395 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152576561 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152576756 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152576904 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 152577789 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152577812 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 152578419 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152579216 A G Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 152579439 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152579518 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152579536 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152579584 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152579799 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152579800 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152580094 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152580113 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152580305 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152580512 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 152580984 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 152582320 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 152582378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152587703 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152587943 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152587951 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152588038 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152588041 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152588090 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 152588200 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152588349 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152588481 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 152588528 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 152588631 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152589135 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 152589206 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152589221 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 152589302 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 152589492 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152589588 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152589601 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152589774 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152589880 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 152589924 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 152589953 G T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 152589995 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 152590101 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 152590230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152590239 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152590419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152590465 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152591180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152591660 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 152591784 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152591936 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 152592104 C G N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 152592105 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 152592233 C G Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 152592529 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152592554 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152592629 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 152592651 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 152592660 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 152592662 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 152592850 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152592881 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 152592981 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152592991 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152593027 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 152593651 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 152594044 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 152594057 A G N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 152594129 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 152594164 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 152594205 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 152594586 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 152594788 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152595176 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152595182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152595212 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152595237 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152595315 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152595486 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152595819 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 152595830 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 152595882 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 152595890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152595941 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 152596398 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152596446 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152596544 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152596667 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 152597227 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152597339 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152598320 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152598388 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152598599 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 152598634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152598849 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 152598879 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 152599004 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 152599089 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152599298 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152599307 A T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 152599379 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152599613 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 152599629 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 152599674 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152599746 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 152599796 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 152599863 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 152599869 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152599878 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152599915 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152600465 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 152600755 T G N N 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.363636363636364 0.545454545454545 0.0909090909090909 14 8 4 6 1 3 152600787 T A N N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 152600882 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 152600895 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 152600952 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 152601010 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 152601065 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152601087 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152601158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152601178 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 152601183 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 152601267 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 152601332 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 152601334 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 152601694 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152602636 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 152602836 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152602863 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152603284 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152603347 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152603591 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 152603998 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 152604377 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152604730 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 152604767 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152605527 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 152605889 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152605968 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152606165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152606252 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 152607874 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152607940 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 152608104 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 152608115 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152608130 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152608164 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 152608219 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152608224 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152608252 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152608270 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152608284 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152608391 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 152608776 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152608777 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152608825 T C Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152608864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152609064 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 152609096 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152609200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152609207 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 152609243 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152609256 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152609354 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152609401 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 152609510 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152609563 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152609642 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 152609768 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152609917 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 152610895 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152611898 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152613064 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152613066 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 152613250 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 152613436 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 152613538 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152613552 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 152613562 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152613634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152613687 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152614269 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152614327 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152614352 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 152614384 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152614406 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152614541 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152614552 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 152614662 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152614663 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 152615005 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 152615200 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152615540 T G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 152615595 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 152615600 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 152615637 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 152615714 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152615729 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152615747 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152615789 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152615800 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152615805 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152615829 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152615896 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 152615948 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 152616003 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 152616013 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 152616351 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152616384 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0 0.705882352941177 0.294117647058824 12 22 0 12 5 3 152616441 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 152616516 T G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 152616900 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152617465 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152617676 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 152617767 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152618179 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 152618232 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152618272 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 152618277 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 152618303 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 152618311 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 152618315 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 152618905 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152619884 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152619935 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 152619972 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 152619981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152620439 A T N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 152620612 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 152620669 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 152620766 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 152621568 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152623481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152623625 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152623690 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152623975 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152625261 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152625397 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152625678 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152625868 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152626080 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152626822 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152627993 G A Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 152628060 G A N Y 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.416666666666667 0.583333333333333 0 17 7 5 7 0 3 152628088 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 152628116 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 152628120 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 152628133 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152628381 T A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.0588235294117647 0.823529411764706 0.117647058823529 16 18 1 14 2 3 152629375 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152630328 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152630442 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152630735 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152631744 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152632025 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152634063 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152635134 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152635295 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 152638542 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152638883 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 152638920 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 152640291 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152640512 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152640945 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152641941 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152642275 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152642416 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152644600 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152645284 T G N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 152645316 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152645354 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 152645364 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 152645489 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 152646005 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152646128 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152646130 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152646148 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152646302 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152647049 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152647399 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152647645 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152647693 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 152647831 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 152647871 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152648013 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 152648029 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 152648033 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152648765 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 152648859 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 152648917 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 152648918 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 152648983 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 152650006 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152650713 T G N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 152650876 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 152650911 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 152652423 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152652466 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152652957 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152652978 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 152653533 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152653537 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152653910 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152654008 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152654172 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152655089 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152655134 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152655202 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152655327 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152655454 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 152655793 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 152655852 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152655884 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 152655942 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152657390 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152657561 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152657612 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152657777 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152657817 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 152657870 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 152657927 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 152658046 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 152658054 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152658134 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 152658188 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 152658287 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 152658366 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 152658853 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 152658877 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152659141 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 152659221 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152659950 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152661646 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152662430 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152662463 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152662561 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152662576 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 152662577 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 152663325 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152663351 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 152663507 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152663508 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152663522 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152663679 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152663730 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152663859 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 152663868 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152663896 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152664506 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 152664515 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 152664720 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152664849 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152664975 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152665012 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152665014 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 152665030 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152665060 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 152665064 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 152665074 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 152665140 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152665156 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 152665162 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 152665224 T G N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 152665232 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 152665544 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152665557 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152666208 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152666213 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152666311 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152666346 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152666372 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152666432 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152667034 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 152667036 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 152667058 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 152667582 C G N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 152667655 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 152667727 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152667836 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 152667999 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 152668038 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152668472 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152668478 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152668538 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152668540 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 152668990 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152669009 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 152669032 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 152669051 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152669200 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152669212 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152669232 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152670018 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152670416 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152670689 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152670806 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152671018 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152672324 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152672444 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152672575 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152673039 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 152673192 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 152673261 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152673826 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 152673991 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152674267 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152674747 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 152674750 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 152674772 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 152674816 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152674888 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 152675002 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 3 152675015 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 152675089 G A N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 6 14 2 2 6 3 152675105 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 152675195 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 152675318 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152676973 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 152677518 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152677858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152677887 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 152677999 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 152678000 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 152678025 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152678038 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 152678067 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 152678460 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 152678499 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 152678512 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152678579 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152678704 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 152678780 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 152678791 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152678801 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152678820 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152678826 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 152679019 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.117647058823529 0.705882352941177 0.176470588235294 16 18 2 12 3 3 152679020 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.125 0.8125 0.0625 17 15 2 13 1 3 152679124 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 152679375 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152679465 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152679546 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 152679575 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 152679590 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152679662 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 152679691 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152679759 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152679799 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152679841 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 152679860 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 152680298 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 152680419 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 152680644 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152680852 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152680853 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152680887 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152680888 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152680921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152681539 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152681555 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 152681650 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 152681680 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 152681684 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 152681711 T A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 152681807 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 152681848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152681873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152681917 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152682066 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152682372 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152682422 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 152682675 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 152682790 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 152682935 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 152684007 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 152684040 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 152684043 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 152684092 C G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 152684128 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 152684705 C T N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 152686374 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 152686405 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152687108 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 152687412 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152689441 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 152689504 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152689544 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152689627 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 152689647 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152690046 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 152690069 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152690222 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152690254 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 152690592 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152690652 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152690754 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152690949 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 152690976 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152691130 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 152691874 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 152692537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152692729 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 152692853 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 152692965 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152693198 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 152693601 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 152693813 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 152696037 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 152696075 T A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 152696473 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 152696739 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 152697810 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152699265 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152699440 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 152699451 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 152699951 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 3 152699962 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 152701149 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152701686 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 152702023 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 152702182 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 152702304 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152702520 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152702531 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 152702602 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 152703854 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152704236 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 152704338 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 152704602 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 152704667 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 152705021 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152705098 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 152705974 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 152706227 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152706282 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152706458 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 152706501 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 152706544 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 152706548 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 152706715 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 152706762 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 152706860 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 152706969 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 152709826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152712486 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152712517 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152712615 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152713366 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152713447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152713654 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152713657 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152714127 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152714144 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 152715995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152716494 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 152716700 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152717384 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 152717816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152718330 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152719017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152719488 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152719709 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 152720067 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 152720168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152721403 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 152721540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152722349 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152722689 T C Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 152722896 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 152723354 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152723504 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152723637 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152724347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152724406 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152725066 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152725090 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152725509 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 152725510 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152725536 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152725625 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152725760 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 152726133 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 152726429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152726598 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152726600 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152726902 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 152727731 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152729012 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152729340 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 152729504 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152730172 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 152730230 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152730396 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152730658 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152730663 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 152731540 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152731542 T A N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 152731580 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 152731586 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 152732225 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 152732300 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152732631 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 152732788 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152732880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152732957 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152733066 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 152733139 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152733272 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 152733318 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 152733529 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152733565 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 152734538 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 152734548 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 152734687 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 152734860 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 152735443 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152735936 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152736319 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 152736361 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 152736400 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 152736518 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152736746 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152736793 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152736801 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152736812 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 152736846 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 152736859 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152737022 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152737049 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 152737156 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152737365 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152737431 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152737436 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152737443 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152737448 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152737457 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152737499 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152737541 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152737558 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152737564 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152737721 C G N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 152737736 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152737929 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 152737936 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 152738117 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 152738178 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 152738213 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 152738242 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152738726 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152739566 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152739803 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 152740020 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 152740138 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152740173 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 152740208 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152740223 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152740261 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152740290 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152740302 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 152740381 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 152740883 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 152741061 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 152741145 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 152741177 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152741222 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 152741232 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152741264 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 152741274 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 152741497 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152741522 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152741679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152741954 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152742172 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152742187 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 152742428 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 152743011 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152743042 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152743044 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152743099 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152743537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152743891 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152744096 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152744345 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152744347 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152744385 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152744771 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152744865 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 152744885 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 152744886 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 152744904 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 152744928 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152744950 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 152744953 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 152745094 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152745739 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 152745838 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152745906 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 152745952 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 152745955 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 152746158 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152747057 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152747197 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152747419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152747645 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152748091 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152748282 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152748438 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152748453 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152748598 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152748835 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152748884 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152749245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152749357 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 152749611 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152750904 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 152750967 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152750968 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152751059 G C Y N 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 152751202 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 152751304 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 152751420 A G Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 152751479 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152752301 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 152752370 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152752436 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152752587 G A Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 152752663 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152752696 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152752708 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152752845 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152753315 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152753399 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152756720 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 152756725 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 152756757 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152757082 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152757102 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152757122 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152757142 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 152757909 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 152758096 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152758205 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152758392 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152758458 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152758472 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152758502 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152758508 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152758563 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152758593 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152758762 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152758819 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 152758836 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152758878 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 152759018 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 152759101 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 152759195 C G Y N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 152759209 G C Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 152760049 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 152760502 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 152760765 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 152760772 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 152760896 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152761306 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 152761443 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152761477 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 152761493 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 152761497 C G N N 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 152761695 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 152761789 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 152762180 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 152762212 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 152762308 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152762361 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152762459 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152762479 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152762525 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152762560 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152762595 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152762615 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 152763115 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152763256 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152763537 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152763558 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152763797 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 152763878 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152764010 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152764041 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 152764067 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 152764181 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152764183 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152764195 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152764216 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152764221 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152764290 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152764323 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152764590 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 152764796 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 152764802 G T N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 152764857 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 152765184 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 152765257 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 152765269 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 152765325 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 152765333 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 152765344 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 152765371 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152765389 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 152765397 T G N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 152765435 G A Y Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.117647058823529 0.235294117647059 0.647058823529412 8 26 2 4 11 3 152765709 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152765736 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152765756 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152765816 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152765827 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152765858 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152765937 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152766456 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 152766586 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152766816 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152767098 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 152767113 A C N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 152767268 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 152767782 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152767862 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152767925 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.65 0.1 0.25 28 12 13 2 5 3 152767994 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 152768014 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 152768070 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 152768288 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152768493 T A Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152768811 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152768893 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152768911 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 152768997 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 152770710 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152773102 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 152773212 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 152773292 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 152773652 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 152773736 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152773740 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 152773957 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 152773996 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152774105 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152774116 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152774122 C G Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 152774770 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152774923 G C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 152775075 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152775081 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152775105 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 152775212 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 152775268 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152775508 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152776012 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152776040 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152776145 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152776348 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 152776617 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152776822 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152777594 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152777626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152777641 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152778163 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152778205 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152778284 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 152778834 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152778840 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152778850 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 152779320 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152779451 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152779453 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152779470 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152779487 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152779519 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152779548 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152779668 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 152779763 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152779896 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152779955 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152779967 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152780086 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152780087 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152780287 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152780305 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152780510 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152780631 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152780765 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152780804 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152781133 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152781262 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152781271 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 152781428 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 152781446 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152781617 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152781792 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 152781977 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152782244 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152782295 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 152782474 A G N Y 0.3125 REF 0.6 0.6 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 5 11 1 3 4 3 152782630 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 152782720 A T N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 152782745 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152782792 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 152782797 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 152782837 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152783047 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 152783059 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152783075 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152783208 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152783449 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 152783466 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152783997 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 152784056 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 152784083 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152784114 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152784124 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152784325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152785103 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 152785170 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152785658 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152785692 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 152785705 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 152785778 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152785847 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152785849 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152785859 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 152785861 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152785878 T G Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 152786209 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 152786338 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 152786568 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152786680 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 152787663 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 152787704 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 152787707 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152787822 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 152787913 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 152787963 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 152787985 A T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 152788078 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 152788156 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 152788427 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 152788722 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 152788783 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 152789217 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 152789248 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152789264 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152789408 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 152789414 G A N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 152789513 A C N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 152789806 G C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 152789840 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152789841 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152790035 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152790104 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 152790125 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 152790132 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152790250 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152790286 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 152790794 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 152790833 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152790838 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152790847 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152790938 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 152791057 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 152791154 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 152791166 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152791276 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 152791291 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 152791313 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 152791355 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 152791356 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152791405 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 152791831 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152791891 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152791903 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152791927 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152792023 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152792048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152792221 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152792243 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152792879 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 152793049 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152793102 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 152793216 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152793248 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 152793268 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152793325 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152793334 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 152793368 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152793526 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152793601 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 152793604 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 152793668 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 152793933 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 152793968 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 152794040 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 152794056 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152794071 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0 0.65 0.35 13 27 0 13 7 3 152794082 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152794093 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152794188 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 152794190 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 152794314 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152794323 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152794396 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 152794605 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 152794630 G A N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 3 152794756 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 152795183 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152795382 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 152795407 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152795423 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 152795475 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152795783 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152795793 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152796170 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 152796298 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 152796334 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 152796664 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152796859 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152796875 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 152796911 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 152797184 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 152797190 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 152797198 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 152797209 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152797630 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 152798622 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152798700 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152798712 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152798980 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152799021 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 152799095 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152799204 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152799293 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 152799310 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152799341 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152799345 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 152799362 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 152799419 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152799427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152800763 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 152801304 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152801343 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152801613 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152802028 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152802088 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152802935 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152802965 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152803107 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152803645 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152803810 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152803885 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152803909 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152804029 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152804033 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152804588 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 152804591 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152805055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152806390 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152806548 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152806763 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 152806866 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 152806984 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152806998 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152807000 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 152807218 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 152807220 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 152807237 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 152807805 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 152807822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152808021 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 152808071 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 152808314 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152808376 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 152808399 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 152808400 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152808414 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 152808432 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152808496 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 152808651 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152808816 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152809443 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152809455 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152809734 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152809934 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152809982 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 152810289 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152810395 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152810434 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152810537 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 152810564 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 152810619 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152810838 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152811240 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152811267 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152811272 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152811341 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152811381 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 152811383 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 152811482 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152811483 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152812615 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152812630 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 152812793 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152812927 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152812957 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152812970 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152813028 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152813043 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152813148 A T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 152813241 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 152813302 C T N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 152813571 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 152813615 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 152814059 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 152814483 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 152814791 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152814956 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152814967 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152814975 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152815296 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152815754 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152815762 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152815824 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152815825 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152815892 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152815927 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 152816021 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152816053 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152816105 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152817122 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 152817169 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 152817272 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 152817321 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 152817384 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 152817493 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 152817524 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 152817548 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 152817691 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152817808 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152817840 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 152818187 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 152818226 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 152818362 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152818512 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152818549 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 152818712 C A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 152819031 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 152819114 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 152819128 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 152819131 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 152819151 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 152819166 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152819167 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152819191 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152819222 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152819407 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152819453 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152820196 C A N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.4375 0.5 0.0625 22 10 7 8 1 3 152820461 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 152820467 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152820614 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 152820687 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152820985 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152820998 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 152821039 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 152821218 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152821257 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152821381 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152821437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152822034 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152822408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152822603 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 152822953 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 152824389 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152824496 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 152824992 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152825400 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152825427 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152825452 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152825457 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152825679 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 152826325 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 152826527 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 152826577 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 152826743 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 152826927 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 152827062 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 152827745 C G Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 152827824 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 152827873 T A N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 152828179 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 152828180 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 152828278 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152828569 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152828580 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152828677 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 152828747 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152828771 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152828795 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152828885 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 152829215 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 152829312 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 152829401 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 152829592 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152829773 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152830488 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 152830569 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152830617 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 152830632 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 152830706 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152831681 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152831966 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152831974 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152832025 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152832046 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 152832088 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 152834638 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152835340 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 152835574 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152835591 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152835733 A C N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 152835998 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 152836307 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152836361 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152836491 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152836536 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152836631 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 3 152836946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152837091 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 152837320 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 152837433 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152837452 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 152837491 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 152837539 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 152837894 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152837906 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 152837937 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152837944 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152838112 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 152838343 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 152838441 T G Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 152838602 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 152838833 A C N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 152838843 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152838972 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152839004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152839149 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 152839197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152839228 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 152839234 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 152839240 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 152839325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152839449 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 152839702 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 152839713 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 152839902 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152839967 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152839969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152840258 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152840515 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 152840542 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152840993 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 152841006 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 152841015 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 152841064 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152841321 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152841343 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 152841410 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152845619 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152845937 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 152846246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152847950 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152850074 G T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 152850479 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152850541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152850542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152850616 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152850626 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152850635 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 152850637 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152850706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152850750 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152850776 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152850799 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152850825 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152850856 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152850905 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152850956 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152850957 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152851054 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152851105 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152851135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152851182 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152851257 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152851491 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152851500 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152851659 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152851931 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152851960 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 152852212 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 152853111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152853118 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152853990 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152854630 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152854935 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152855368 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152855627 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 152855714 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 152855749 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 152856202 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 152857484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152859970 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 3 152860427 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152860445 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152860457 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152860477 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 152860962 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 152861402 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152861561 G C N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 152861946 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152862019 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 152862248 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 3 152862273 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152862295 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 3 152862851 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152862951 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 152866884 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152867171 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 152867302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152867329 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152867387 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 152867396 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 152867674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152868032 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152868033 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152868995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152869776 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 152870026 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 152870676 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152870865 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152870915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152871976 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 152872086 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152872166 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 152873554 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 152873621 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152873703 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152873741 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152873749 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152874682 C A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 152874870 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 152874893 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 152875015 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 152875073 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 152875212 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 152875241 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 152875452 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 152875579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152875917 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152875928 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 152876157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152877037 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 152877286 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 152877829 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 152877968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152877978 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152878010 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152878034 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152878035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152878124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152878353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152878409 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 152878502 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 152878643 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 152878880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152878960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152878972 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 152879449 G T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 152879455 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152880264 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 152880378 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 152880488 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 152880759 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 152880792 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 152880837 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 152881020 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 152881160 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 152881970 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152882210 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 152882510 C G N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 3 152882769 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 152883561 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152883722 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152885218 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152885219 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152885626 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152885756 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 152886142 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152886214 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 152886280 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 152886288 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 152886392 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 152886499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152886532 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 152886987 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 152887009 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 152887138 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 152887482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152887485 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152887495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152887592 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 152887594 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 152887848 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 152887903 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 152887952 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 152887978 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 152887982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152887992 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 152888755 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152888930 G C Y N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 152888944 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 152889063 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 152889223 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 152889232 G T Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 152889241 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 152889610 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 152890509 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 152890617 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 152890626 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 152890733 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 152890916 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152892171 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 152892549 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 152892630 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152892774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152893085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152893890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152894162 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 152894204 A C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 152894462 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 152894464 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 152894490 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 152894506 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 152894512 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 152894778 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 152894840 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 152895422 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152896113 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 152896153 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 152896181 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.222222222222222 0.666666666666667 0.111111111111111 20 16 4 12 2 3 152896464 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 152896965 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 152896972 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 152896986 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 152897200 G A N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 152897240 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 152897271 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 152897274 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 152897511 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152897580 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152897618 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152897804 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 152898204 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 152898243 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 152898323 A G N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.142857142857143 0.642857142857143 0.214285714285714 13 15 2 9 3 3 152898429 A C N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.117647058823529 0.647058823529412 0.235294117647059 15 19 2 11 4 3 152898443 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 152898580 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152899021 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 152899125 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152899160 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 152899173 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152899188 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 152899256 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152899429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152899559 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152899636 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152899919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152900020 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152902241 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152902540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152903290 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 152903514 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152903619 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152904026 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152904050 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152904117 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 152904420 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152904492 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 152904542 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 152904734 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 152904767 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 152904893 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152904941 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152905171 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152905228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152905461 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152905502 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152905760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152905766 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 152905936 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152905950 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152906081 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152906490 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152906681 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 152906682 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 152906711 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 152906712 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 152906797 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152906825 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 152906846 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152906976 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152907057 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152907296 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 152907428 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152908357 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 152908365 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 152908373 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 3 152908429 G C Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 152908539 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152908661 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 152909149 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152909172 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 152909180 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152909494 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 152909806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152910140 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152910370 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 152910415 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 152910462 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152910495 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152910689 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152910841 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152910965 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152911308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152911547 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152911624 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 152912010 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 152912596 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152912628 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 152912680 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 152912729 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 152912992 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.263157894736842 0.631578947368421 0.105263157894737 22 16 5 12 2 3 152913048 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152913578 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 152913906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152914165 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 152915332 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 152915632 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152915685 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152916229 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 152917270 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 152917566 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152917620 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152917732 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152917791 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 152918349 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152919565 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 152919709 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 152920180 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152920950 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152921005 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152921064 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 152921720 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 152921724 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 152921743 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152921798 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 152921820 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152921992 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 152922001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152922039 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 152922407 T G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 152922515 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152922671 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 152922719 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152922770 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152922798 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152922956 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152922990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152923007 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 152923012 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152923019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152923376 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 152924005 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152924161 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152924359 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.105263157894737 0.631578947368421 0.263157894736842 16 22 2 12 5 3 152924871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152925292 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 152925341 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.25 0.6 0.15 22 18 5 12 3 3 152926870 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 152927403 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152927704 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 152928865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152929624 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152930689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152931236 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152933060 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 152933618 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152933823 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 152933885 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 152934080 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 152934231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152934250 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152934292 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 152934303 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 152934398 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 152934480 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 152934751 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 152934759 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 152935153 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 152935256 C G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 152935284 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 152935379 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 152935406 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 152935419 G C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 152935432 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152935598 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 152935603 T C N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 152935692 G A N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 152935783 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 152935841 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 152935969 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 152935998 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 152936044 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 152936055 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 152936145 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 152936167 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152936216 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152936354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152936355 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 152936373 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 152936379 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 152936418 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 152936427 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 152936485 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 152936523 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 152936529 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 152936553 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 152936656 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152936763 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 152936823 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152936967 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 152937420 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 152937432 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 152937479 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 152938001 G C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 152938083 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 152938144 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 152938207 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 152938220 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152938256 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152938267 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 152938298 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 152938318 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 152938331 A C Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.35 0.65 0 27 13 7 13 0 3 152938412 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152938441 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 152938455 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 152938462 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 152938470 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 152938499 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152938516 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 152938603 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 152938615 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 152938676 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 152938842 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152938870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152938919 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 152939153 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 152939159 C G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 152939173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152939369 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 152939469 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 152939507 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 152939519 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 152939550 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 152939558 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 152939853 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152940059 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 152940570 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 152940807 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 152940833 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152940856 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 152940877 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 152940911 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 152941103 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 152941128 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 152941178 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 152941179 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152941215 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 152941312 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 152941491 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 152941562 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 152941567 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152942318 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 152942545 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 152942648 C G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 152942739 C T N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 152942742 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 152942831 C T N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.235294117647059 0.235294117647059 0.529411764705882 12 22 4 4 9 3 152942956 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 152942991 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 152943024 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152943349 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 152943418 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 152943442 C T N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 3 152943686 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 152943695 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 152943728 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 152943748 A T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 152943776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152943884 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 152943910 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152944174 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 152944423 T A N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 152944489 G A N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 3 152944711 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 152944762 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 152944812 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 152944861 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 152944905 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 152944951 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.111111111111111 0.611111111111111 0.277777777777778 15 21 2 11 5 3 152944976 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 152945059 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 152945095 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 152945280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152945470 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152945472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152945661 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 152945926 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 152946430 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 152946529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152946574 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 152946856 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152946952 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 152946998 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 152947010 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 152947027 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 152947047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152947050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152947182 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152947253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152948004 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 152948141 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152948161 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 152948326 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152948618 A T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 152948623 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 152948744 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 152948781 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 152948827 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152948838 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 152948843 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152948877 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 152948898 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152949047 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 152949202 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 152949261 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 152949288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152949359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152949400 T A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 152949489 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152949605 A T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 152949624 C G N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 3 152949728 C A N N 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 152949907 A C N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 152949926 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 152949942 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 152949944 T C N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 152949956 G C N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 152949959 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 152950094 G T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 152950170 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 152950237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152950304 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 152950630 C G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 152950708 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152950730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152950838 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 152950894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152951271 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 152951300 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 152951318 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 152951755 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 152951763 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 152952131 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 152953745 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 152954020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152954333 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152954937 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152955450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152955607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152955990 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152956137 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152956282 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152956458 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152956553 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152958032 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 152958891 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152959547 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152961415 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 152961424 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152961427 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 152961966 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152962144 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 152962236 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152962251 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 152962345 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152962399 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 152962663 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152962694 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 152962724 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 152962742 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 152962746 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 152962762 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 152962810 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 152962852 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 152963150 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 152963171 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152963257 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.421052631578947 0.210526315789474 0.368421052631579 20 18 8 4 7 3 152963382 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 152963464 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.473684210526316 0.157894736842105 0.368421052631579 21 17 9 3 7 3 152963617 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152963728 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 152963735 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 152963780 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152964001 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.45 0.2 0.35 22 18 9 4 7 3 152964630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152964848 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152964878 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 152964958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152965039 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152965077 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152965228 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152965308 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152965318 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 152965684 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152965721 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152965743 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152965753 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152965769 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152965782 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152965813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152965834 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152965978 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152966037 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152966171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152966209 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152966212 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152966245 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152966248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152966263 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152966325 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152966599 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 152966610 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 152966666 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 152966779 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 152966877 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 152966916 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 152966924 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 152966971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152967105 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152967133 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152967237 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152967244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152967257 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152967272 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152967346 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 152967360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152967407 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152967421 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 152967449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152967465 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152967606 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152967766 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 152967769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152967917 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 152968011 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 152968086 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152968278 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 152968299 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 152968656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152968682 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152968753 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 152969077 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152969166 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152969167 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152969216 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 152969263 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 152969307 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152969317 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 152969362 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 152969432 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152969504 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152969560 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 152969579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152970328 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.3 0.1 0.6 14 26 6 2 12 3 152970341 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.210526315789474 29 9 14 1 4 3 152970705 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 152971294 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152971611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152971905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152971911 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152971988 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152972198 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 152972301 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152972571 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152972631 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 152973899 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 152973900 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 152973948 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 152973961 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152974369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152974379 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 152974402 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152974516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152974588 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 152974717 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152974734 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 152974794 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 152974816 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 152974985 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 152975058 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 152975351 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 152975367 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 152975435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152975587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152975638 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152975875 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152976212 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 152976369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152976833 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152977173 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152977248 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152977711 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 152977752 T C N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 152977769 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 152977946 G T Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 152977963 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 152977970 T C N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 152977976 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 152977989 T A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 152978231 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 152978355 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152978381 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 152979179 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 152979416 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 152979543 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 152979570 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 152979685 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152980069 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 152980093 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 152980322 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 152980341 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 152980467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152980501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152980595 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 152980610 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 152980716 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 152981012 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 152981073 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 152981087 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 152981322 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 152981453 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152981468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152981554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152981606 A C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 152981684 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 152981749 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152981917 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 152981959 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 152982050 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152982505 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 152982579 A T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 152982759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152983049 A T Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 152983125 C A N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 152983211 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 152983945 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 152984019 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 152984097 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 152984139 G C Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 152984144 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152984479 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152984536 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 152984576 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 152984594 C G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.555555555555556 0.166666666666667 0.277777777777778 23 13 10 3 5 3 152984649 G T N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 152984789 C A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 152984817 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 152984827 G T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 152986226 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 152986389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152986413 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 152986473 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 152986477 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152986523 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152986620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152986714 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 152986858 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152986871 C A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 152986872 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 152986898 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 152986920 T G Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 152986925 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 152987117 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 152987127 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152987595 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152987834 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152987930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152988140 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 152988173 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 152988194 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152988198 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152988260 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 152988335 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 152988350 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152988385 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152988772 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 152988804 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 152989133 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152989555 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 152989769 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 152989815 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 152989981 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 152989983 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 152990044 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 152990242 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 152990295 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 152990486 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 152990662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152990678 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152990866 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152991211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152991213 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152991377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152991524 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 152992010 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152992096 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 152992316 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 152992355 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 152992390 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 152992953 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.526315789473684 0.157894736842105 0.315789473684211 23 15 10 3 6 3 152993044 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152993121 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 152993263 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 152993788 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 152993789 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152993842 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 152993843 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152993883 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 152994044 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 152994982 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 152994991 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 152995196 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 152995262 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.5 0.166666666666667 0.333333333333333 21 15 9 3 6 3 152995402 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152995416 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 152995507 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 152995693 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 152995741 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 152995800 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 152996091 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152997154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152997156 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152997608 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152997638 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152997849 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 7 11 2 3 4 3 152997861 G T N N 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 6 6 2 2 2 3 152997894 C A Y N 0.25 REF 0.8 0.8 0.25 0.75 0.25 0 0.75 2 6 1 0 3 3 152998023 G A N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.285714285714286 0.285714285714286 0.428571428571429 12 16 4 4 6 3 152998109 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 152998213 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 152998248 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152998270 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 152999159 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 152999379 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 152999446 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153000003 A G Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 153000151 G C N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 153000155 A G N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.2 0.466666666666667 0.333333333333333 13 17 3 7 5 3 153000251 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 153000301 T A N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 153000375 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 153000535 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 153000568 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153000597 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 153000668 T A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 153000703 C A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.555555555555556 0.111111111111111 0.333333333333333 22 14 10 2 6 3 153000738 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 153000810 A G N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 153000822 G T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 153000838 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 153000918 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153001676 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 153002218 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153002359 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 153002451 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 153002455 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153002490 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153002744 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 153002796 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153002814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153002898 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 153002958 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153003041 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 153003044 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 153003243 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153003551 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 153003791 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153004026 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 153004067 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153004147 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153004198 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153004253 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153004481 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153004533 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153004551 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153004805 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153004864 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153004920 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153004922 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153005026 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153005136 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153005217 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153005300 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153005311 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153005330 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153005362 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153005573 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153005615 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153005616 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 153006147 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 153006418 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153006469 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 153006533 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153006702 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153006905 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 153006934 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153006947 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 153007139 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153007349 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 153007688 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 153007866 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 153008509 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 153008556 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 153008583 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153008823 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 153008957 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 153009540 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153009638 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 153009697 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153009863 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 153009889 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 153009998 A C N N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 153010012 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 153010032 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 153010045 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 153010055 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 153010084 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 153010168 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 153010235 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 153010361 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153010444 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153010800 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 153010813 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153010909 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153011142 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 153011249 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153011346 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153011362 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153011719 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 153011754 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 153012155 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153012480 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153012641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153012817 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 153013004 A T Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 153013009 G A Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 153013059 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153013076 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 153013153 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 153013220 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153013235 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 153013294 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153013321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153013324 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 153013411 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 153014545 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153014573 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153015013 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153015616 A T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 153015657 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 153015742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153015784 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153016704 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153016706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153016939 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 153018139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153018275 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 153018329 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 153018483 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153018514 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153018584 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 153018626 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 153018653 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153018671 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 153018776 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153018811 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153019069 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153019170 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153019188 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 153019274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153019280 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153019341 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153019648 G A Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 153019787 A T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 153020073 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 153020189 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 153020223 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 153020346 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 153020392 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 153020393 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153020444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153020738 C A N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 153020816 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 153020924 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 153020932 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 153020979 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 153021099 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 153021122 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 153021145 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 153021301 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 153021381 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 153021761 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153021974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153022138 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153022473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153022838 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153023145 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153023184 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153023196 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 153023306 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 153023349 T G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 12 24 4 4 10 3 153023502 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153023534 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 153023590 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 153023598 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.25 0.2 0.55 14 26 5 4 11 3 153023647 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 153023732 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 153023793 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 153023794 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153023809 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 153023854 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153023865 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153023897 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 153023922 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 153023996 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153024088 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153024822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153025408 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 153025780 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 153028528 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 153028582 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153030742 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153031344 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 153031532 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 153031599 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153031853 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.368421052631579 0.210526315789474 0.421052631578947 18 20 7 4 8 3 153031889 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 153032570 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 153033783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153034382 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 153034417 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 153034583 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 153034664 T A Y N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 153038407 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 153038408 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 153038511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153038560 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 153038611 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153038656 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 153038657 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 153038695 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 153038724 T A N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 153038789 T A N N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 153038820 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 153039132 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 153039220 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153040609 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153040897 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153041538 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153043238 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153043484 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 153043575 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 153045239 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153046557 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 153047041 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153047046 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153047105 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153047271 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153047293 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153047338 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153047436 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153047446 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 153047529 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153047613 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 153047773 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153047824 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153048009 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153048060 C T N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 153048208 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 153048356 G T N N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 153048627 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153048727 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153048950 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153049002 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153050041 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153051067 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 153051569 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 153051601 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 153051671 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 153052388 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 153052399 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 153052409 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 153052415 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 153052465 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 153052808 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153053039 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153053329 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 153053444 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 153053447 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 153053664 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153053733 A G Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 153053788 T A N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 153053820 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 153053916 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 153053922 T A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 153054064 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 153054102 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 153054377 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 153054701 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 153054900 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 153055152 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153055214 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 153055495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153055975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153057380 A C N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 153057506 G T Y N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.833333333333333 0.0833333333333333 0.0833333333333333 21 3 10 1 1 3 153057827 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 153057836 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 153057876 T C N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 153057920 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 153058353 G A N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 3 153058738 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 153058832 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153058846 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153059113 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153059134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153059770 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153059952 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 153060615 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 153061827 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 153061889 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 153062051 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 153062231 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 153062387 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 153062495 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 153062605 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 153062631 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 153063843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153063878 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153063892 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153063906 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153063924 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153064216 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153064285 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153064309 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 153064458 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153064473 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153064589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153064843 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 153064883 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 153065008 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 153065509 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 153065647 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153067073 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 153068645 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153068724 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153069194 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153069334 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153069470 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 153069647 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153070300 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153071035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153071059 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153071130 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 153071480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153071553 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 153071562 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153071573 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153071685 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153072875 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153072963 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153073202 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 153073208 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153073335 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153073425 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 153073781 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153073805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153073848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153073905 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153074339 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153074879 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 153075173 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 153075432 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 153075553 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153075560 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 153075629 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 153075706 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 153075971 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 153076019 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 153076047 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 153076199 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153076327 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 153076661 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 153076769 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 153077728 C G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 153077789 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153077813 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153077904 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153077925 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153078066 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 153078095 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 153078282 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 153078400 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153078531 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 153078954 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153079115 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 153079355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153080299 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153080458 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 153080793 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 153080940 A T N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 153080956 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 153080999 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153081147 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153081189 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153081217 A T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 153081500 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 153081540 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 153081805 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 153081827 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 153082166 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 153082780 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 153082785 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 153082845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153082867 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 153082925 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153082939 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 153082942 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 153083049 G T Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 153083679 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 153083732 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153084138 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 153085362 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 153085364 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 153085513 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153086055 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153086251 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 153087310 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153088190 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153091144 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153091210 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153091515 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 153091520 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 153091527 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 153092318 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 153094111 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153094158 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153094431 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 153094949 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 153095119 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 153095469 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153095501 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 153096359 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 153097465 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 153097493 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 153097544 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 153097850 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 153097853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153097895 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 153098231 C T Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 153098271 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 153098338 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 153098462 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 153098983 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 153099194 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153099457 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153099794 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 153099988 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 153100151 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153100172 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 153100786 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153101328 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 153101352 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 153101493 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153103724 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153103807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153103809 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153104074 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 153104754 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 153104913 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 153105036 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 153105043 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 153105076 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 153105239 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153105273 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 153105299 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 153105379 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 153105449 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 153106395 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153106509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153106519 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 153106656 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 153106730 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 153106822 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 153106851 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 153106886 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153107010 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 153107110 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 153107136 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 153107365 A C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 153107404 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153107479 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153107509 A G Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 153107630 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153107868 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 153107912 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 153107944 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153108013 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 153108057 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 153108101 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 153108139 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 153108179 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 153108208 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 153108231 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 153108294 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 153108298 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 153108334 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 153108410 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153108432 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 153108491 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 153108525 T A N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 153108575 G C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 153108697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153108722 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 153108824 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 153109240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153109327 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 153109378 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153109438 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153110116 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 153110155 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 153110231 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 153110341 T G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 153110414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153110444 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 153110560 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 153110612 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 153110752 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153110833 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153110860 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 153110878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153111320 C G Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 153111763 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153111781 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153111875 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 153112116 C G Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 153112149 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 153112156 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153112160 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 153112169 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 153112271 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 153112307 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 153112387 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 153112412 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 153112805 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153112813 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 153112842 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 153112942 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 153113180 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153113191 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153113203 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 153113295 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153113506 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153113553 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 153113557 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153113580 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153113595 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153113662 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153113681 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 153113720 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153113831 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153113955 G A Y Y 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 153114009 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 153114097 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153114194 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 153114386 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153114491 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 153114535 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153114768 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153114792 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153114808 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 153114876 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 153114911 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 153114927 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153115427 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 153115533 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 153115557 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 153115631 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 153115787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153115887 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 153115895 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 153115941 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 153116004 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 153117193 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153117204 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153117308 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153117608 A T Y N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 153117634 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 153117720 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 153117740 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 153117784 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153117829 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 153117847 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153117923 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 153117964 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 153118035 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153118148 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 153118305 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.05 0.65 0.3 15 25 1 13 6 3 153118312 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 153118547 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153118614 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 153119337 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 153120021 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 153120083 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 153120093 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 153120375 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 153120420 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 153120497 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153120727 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 153120757 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 153120782 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 153120843 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 153120900 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153120982 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 153121054 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 153121707 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153122145 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153122600 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153123331 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153123401 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153124025 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 153124179 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 153124299 C T Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 153124397 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153125089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153125095 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 153125232 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153125825 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 153126023 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 153126131 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 153126160 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 3 153126253 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153126264 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 153126323 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 153126346 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 153126375 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153126453 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153126589 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153126607 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153126650 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153126809 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153127840 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 153127953 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153128431 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153128491 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153128604 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153128621 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 153128681 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153128711 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153128734 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153129257 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153129362 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153129585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153129621 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153130189 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 153130212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153130387 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 153130449 C T N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 153130493 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 153130599 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153130763 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153130793 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 153130834 T G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 153130855 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153130986 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153131016 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 153131027 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 153131079 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153131246 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153131301 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 153131303 A C Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 153131349 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 153131358 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 153131415 T C Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.0526315789473684 0.631578947368421 0.315789473684211 14 24 1 12 6 3 153131717 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153131729 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 153131775 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153131824 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 153135292 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 153136002 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153136057 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 153136058 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 153136664 G T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 153136732 C G N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 153136780 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 153136846 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 153137707 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 153138148 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 153139352 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 153139403 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 153139781 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153140064 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 153140174 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 153140303 A C Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 153140318 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 153140360 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 153140401 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153140505 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 153140531 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 153141008 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 153141275 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 153141285 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 153141315 A G Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 153141380 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 153141381 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 153141394 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 153141396 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 153141414 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 153141523 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 153141556 A G Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 153141687 G A N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 3 153142229 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 153142439 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 3 153142508 A G N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 153142545 G A N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 21 9 9 3 3 3 153142891 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 153142921 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 153142943 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 153143064 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 153143070 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 153143160 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 153143399 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 153144217 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153144368 A C Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 153144464 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 153144590 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 153144832 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 153145788 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 153145804 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153146055 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153146099 A C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 153146429 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 153147554 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 153147601 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 153147730 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 153147809 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 153148151 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 153148273 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 153148290 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 153148385 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0.0625 0 0.9375 2 30 1 0 15 3 153148423 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 153148426 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 153148438 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 153148548 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 153148574 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 153149041 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 153149057 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 153149065 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 153149078 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 153149182 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 153149220 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 153149308 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153149415 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 153149429 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153149505 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 153149517 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 153149588 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 153149602 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 153149631 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153149687 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 153149723 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153149889 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 153149918 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 153149921 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 153149937 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 153149955 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153149963 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153150106 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 153150252 T G N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 153150910 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 153151203 C G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 153151466 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153151681 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 153151830 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 153151930 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 153151972 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153151981 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 153152049 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 153152350 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 153152356 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 153152382 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 153152426 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 153152506 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 153152514 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 153152539 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 153152652 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 153152660 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153152780 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 153152967 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153153215 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 153153380 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 153154337 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153155430 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153155949 A C Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 153155985 T A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 153156065 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.166666666666667 0.611111111111111 0.222222222222222 17 19 3 11 4 3 153156168 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153156320 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 153156419 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 153156546 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 153157109 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153157117 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 153157188 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 153157317 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153157335 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153157401 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 153157448 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 153157468 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 153157592 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 153157670 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153157680 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 153157697 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 153157864 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 153158114 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 153158170 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 153158322 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.166666666666667 0.666666666666667 0.166666666666667 18 18 3 12 3 3 153158346 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 153158455 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153158534 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.117647058823529 0.705882352941177 0.176470588235294 16 18 2 12 3 3 153158604 C T N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 16 16 6 4 6 3 153158739 A C N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 153158877 A C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 153159013 T G N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 153159030 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 153159071 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 153159184 G T N N 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 153159361 T C N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0 0.5 0.5 4 12 0 4 4 3 153159413 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 153159500 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 153159557 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 153159650 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 153159663 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 153159712 T G N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 153159810 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 153159963 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 153159977 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153160010 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 153160024 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 153160233 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 153160358 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 153160407 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 153160493 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153160738 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 153160772 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 153160885 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 153160902 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 153160948 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 153160999 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 153161021 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 3 153161047 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 153161071 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 153161088 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153161176 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 153161360 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153161570 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 153161662 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 153161715 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 153161962 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153162221 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153162390 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 153163786 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153163901 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153163942 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 153164099 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153164882 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153164971 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153165473 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153165804 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153166688 A C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 153166723 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153166730 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153166984 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 153167121 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153167217 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153167295 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 153167578 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 153167664 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 153167801 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153168085 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 153168101 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153168522 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153168618 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 153168678 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153168699 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 153168758 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 153168759 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 153168796 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 153168914 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 153169066 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 153169125 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153169659 A G Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 153169666 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153169680 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 153169726 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 153169785 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 153169800 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153170296 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 153170593 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153170599 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153171069 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 153171172 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 153171272 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 153172196 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153172513 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 153172568 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 153172589 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 153172702 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 153173915 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153176893 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153177396 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153179452 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153179973 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 153180052 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153180178 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 153180222 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 153180226 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 153180274 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 153180529 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 153180591 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 153181215 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153181244 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 153181295 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153181333 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153181357 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153181435 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153181517 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 153181553 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 153181674 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153181741 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 153181939 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153182710 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 153182729 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153182777 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 153182889 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.1 0.65 0.25 17 23 2 13 5 3 153183062 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 153183153 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 153183224 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153183334 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 153183351 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153183496 C A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 153183735 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153183965 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153184013 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153184499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153184738 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153185049 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 153188422 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153188551 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153188715 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153188993 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153189374 C G N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 153189717 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153189939 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 153189982 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153190193 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 153190389 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 153190562 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 153190714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153191112 T C Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 153191734 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153191975 C G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 153192042 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 153194293 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153195808 T C Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 153196890 A G Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 153197421 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153198008 T C Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 153198559 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153199233 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153199379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153199738 G T Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 153199833 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153199947 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 153200025 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153200032 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 153200045 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153200054 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 153200548 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153200552 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153200612 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 153200762 A T N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 153200991 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 153201416 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153201443 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153201528 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153201536 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153201714 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 153201730 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 153201816 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 153202002 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 153202007 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153202170 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153202548 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 153202677 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153202682 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153202800 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153202837 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 153202869 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153203344 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 153203374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153203388 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153203415 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153203429 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 153203430 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153203448 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153203479 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153203568 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153203614 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153203651 T C N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 153204004 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 153204175 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 153204242 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 153204252 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 153204258 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 153204328 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153204395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153204437 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153204438 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 153205095 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 153205105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153205125 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153205149 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 153207096 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 153207098 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 153207178 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 153207201 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 153207418 A C Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 153207535 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 153207546 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 153207701 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153207925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153207983 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153208059 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153208142 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153208184 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153208215 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 153208256 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153208305 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153208363 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153208410 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 153208450 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 153208523 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153208578 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153208640 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153208674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153208748 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153208765 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153208779 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153208925 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153208981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153209525 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153210269 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153211185 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153212662 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 153212746 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153212771 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 153212827 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 153213026 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153213112 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 153213131 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153213150 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 153213159 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 153213233 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 153213238 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 153213756 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153213889 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153213946 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153213974 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153214085 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153214290 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 153214343 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153215106 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153217156 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 153217158 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 153218080 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153218712 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153220004 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153220751 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153220886 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153221023 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153225717 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 153225935 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 153226972 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 153227080 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153227694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153227924 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 153228097 A T N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 3 153228331 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153228347 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153228442 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153228478 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 153228505 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 153228538 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153228586 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 153228682 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153228757 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 153228845 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 153229065 C G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 153229101 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 153229374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153229398 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153229413 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153229523 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153229529 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 153229899 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 153229920 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153229999 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153230277 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153230331 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153230355 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153230359 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153230367 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153230374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153230385 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153230393 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153231038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153231072 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153231154 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153231178 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 153231212 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153231236 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153231241 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153231271 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153231495 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153231501 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153231506 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153231984 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153232236 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153232401 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153232513 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153232554 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153232599 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 153233682 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153233699 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153233782 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153233872 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 153233999 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 153234200 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 153234285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153234490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153234686 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153234739 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153234956 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 153235001 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153235018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153235126 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153235156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153235317 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 153235445 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153235521 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153235522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153235883 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 153236026 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 153236043 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153236055 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 153236169 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153236345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153236354 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153236408 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153236470 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153236505 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153236603 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153236612 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153236851 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.263157894736842 0.210526315789474 0.526315789473684 14 24 5 4 10 3 153237079 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153237093 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153237151 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153237291 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153237624 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153237752 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153238019 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153238032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153238036 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153238072 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 153238204 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153238433 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153239865 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153242928 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153244210 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153244439 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153244453 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153244653 G C N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 14 18 0 14 2 3 153244666 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.166666666666667 0.833333333333333 0 21 15 3 15 0 3 153244761 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153244875 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153245021 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 153245117 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153245267 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153245312 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 153245351 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 153246419 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153247269 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153247329 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153247676 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 153247694 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 153247857 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 153247865 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153248184 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153248272 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153248348 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153248452 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 153248728 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153249280 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153249709 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153249905 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153250074 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153250454 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 153250708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153253047 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153253265 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153253298 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153253299 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153253358 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 153253440 C G N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 153253452 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 153253551 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 153253569 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153253639 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153253700 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153253751 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153253945 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153253965 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153254108 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153254160 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153254191 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153254201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153254331 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153254363 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153254411 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153254428 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153254486 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153254529 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 153254749 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 153254860 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153255843 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153255845 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153255886 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153255901 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 153255949 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 153255973 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 153256005 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 153256142 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153256197 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 153256293 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153256355 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153256386 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 153256553 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 153256716 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 153256800 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 153256968 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 153257029 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153257072 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 153257307 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153257310 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153257426 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153258054 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153258164 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153258318 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153258342 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153258404 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 153258447 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 153258631 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 153258674 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153258702 G T Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 153258725 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 153258845 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153258846 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153258937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153258956 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153260569 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153260629 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153260678 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 153260684 T G Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153261050 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 153261058 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153261131 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153261282 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 153261404 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153261471 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 153261560 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153261709 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153262291 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153262315 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 153262403 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 153262429 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153262634 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153262676 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153262728 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153262777 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153263143 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153263160 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153263285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153263562 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 153263587 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153263621 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153263628 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153263662 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 153263704 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153263716 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153263804 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153264104 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153264191 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 153264366 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153264367 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153265507 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153265762 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153266058 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153266078 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 153266094 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153266472 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153266702 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153267906 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 153267931 C T N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 153268253 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153268308 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 153268652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153268719 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153268933 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153270236 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 153271295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153271802 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153272795 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 153272867 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 153272900 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153272934 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153273587 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 153273656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153273697 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 153273884 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 153273963 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153274025 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153274256 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153274404 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153274533 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 153275400 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 153275429 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153275574 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153275626 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 153275851 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153276040 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153276062 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153276081 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153276093 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153276107 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153276209 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 153276720 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153276771 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153276809 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153277033 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 153277157 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153277574 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153278239 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153278345 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153278450 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153278497 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 153278862 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153279620 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 153279676 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153279784 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153279849 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153279864 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153279890 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153280238 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 153280350 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153280359 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153280683 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153280834 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153280880 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153280883 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 153280967 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153280996 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 153281016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153281077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153281086 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153281358 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153281454 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153281509 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153281604 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153281812 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153281846 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153282106 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153282680 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153282735 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153282776 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153282936 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153283364 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153283594 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153284831 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153284838 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 153284996 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153285154 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153285318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153285341 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153285379 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153285605 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153285713 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153286040 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153286090 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153286096 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153286106 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153286289 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 153286315 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 153286397 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 153286430 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153286431 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 153286539 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 153286594 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153286598 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153286767 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 153286789 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153287074 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153287532 G A Y Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 9 5 2 5 0 3 153287540 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 153287754 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 153287797 T G Y N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 153288358 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153288396 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153288406 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153288650 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153288831 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153288880 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153288969 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153288992 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 153289126 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153289195 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 153289246 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 153289297 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 153289313 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153289364 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153289481 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153289535 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153289538 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 153289550 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 153289551 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 153289681 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 153290178 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 153290221 G C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 153290231 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 153290237 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 153290271 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153290296 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 153290402 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153290420 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 153290673 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153290775 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153290897 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153290996 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153291090 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153291146 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153291333 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153291365 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153291504 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 153291508 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153291570 C T Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 3 153291716 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153291798 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153291822 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 153291906 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153292137 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153292172 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153292180 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153292223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153292283 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153292354 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153292439 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153292734 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153292852 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153293667 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153294269 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153294329 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153294896 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153294931 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 153294947 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153295423 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153296279 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 153296429 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153296472 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153296558 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153296876 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 153296955 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153297096 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153297177 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153297179 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153297219 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153297238 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153297383 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153297386 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153297419 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153297440 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153297599 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153297624 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 153297625 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 153297643 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153297677 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153297726 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153297850 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153297890 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153298034 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153298196 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153298263 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153298292 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153298296 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153298464 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153298536 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153298703 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153299537 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153299560 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153299602 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153299709 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153299870 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153299942 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153299945 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153300063 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153300069 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153300228 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153300238 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 153300286 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153300462 T A N N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 153300548 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 153300695 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153300826 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 153300868 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 153300880 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153301117 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 153301119 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 153301143 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153301185 A G N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 153301195 T G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 153301311 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 153301466 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153301699 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 153301732 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153302012 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153302308 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153302316 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 153302691 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153303215 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153303270 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153303979 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 153304203 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 153304208 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153304321 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 153304397 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153304472 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 153304548 A C Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 153304569 A C Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 3 153304657 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153304661 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153305326 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153305370 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 153305424 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153305444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153305884 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153305904 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153306002 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 153306039 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153306329 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 153306605 G C N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 153306631 C A N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 153307318 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 153307467 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153308216 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153308238 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153308659 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153308723 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 153309210 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153309321 G A N Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.692307692307692 0.0769230769230769 0.230769230769231 19 7 9 1 3 3 153309553 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.4 0.4 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 2 22 0 2 10 3 153309597 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 153309612 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 153309618 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 153309712 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 153309724 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 153310032 A G Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 153310086 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153310135 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 153310261 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 153310274 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 153310385 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153310469 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153310592 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153310918 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 153310957 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153310993 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153311002 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153311022 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153311062 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153311140 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153311422 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153311516 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 153311558 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 153311862 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 153312045 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 153312066 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153312183 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 153312196 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153312223 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153312252 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 153312265 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 153312283 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 153312337 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.3 0.2 0.5 16 24 6 4 10 3 153312392 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 153313663 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153313890 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153314304 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153314444 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 153314511 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153314600 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153315132 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153315155 G T Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 153315156 G A Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 153315168 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153315197 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153315230 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153315301 G T Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 153315318 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153315352 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153315403 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153315448 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 153315512 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 153316086 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153317000 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 153317029 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153317879 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 153318096 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 153318702 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153319128 A T Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 153319675 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 153319686 C A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 153319768 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.5 0.2 0.3 24 16 10 4 6 3 153319922 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.315789473684211 0.157894736842105 0.526315789473684 15 23 6 3 10 3 153320032 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 153320293 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153320311 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153320449 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153320769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153320860 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153321353 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 153321887 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153322058 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 153322557 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153322696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153322710 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153322748 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153323206 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 153323210 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153323224 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153323378 T A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 153323389 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 153323779 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153323890 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153324445 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153324503 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 153324664 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 153324687 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 153324839 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 153324882 C A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 153324892 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 153324905 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 153324970 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 153324995 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 153325160 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 153325293 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 153325313 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 153325419 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 153325457 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 153325521 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 153325599 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 153325615 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 153325694 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153325894 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153326125 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153326311 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153326330 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 153326375 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153326979 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 3 153327064 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 153327150 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153327163 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 153327190 G C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 153327235 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153327570 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 153328270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153328765 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 153329674 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 153329717 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 153329732 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 153329794 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153329928 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 153330035 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153330212 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153330217 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153330323 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153331000 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 153331162 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153331224 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153331250 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 153331266 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153331286 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153331477 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 153332580 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153332923 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153333390 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 153333471 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153333506 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 153333624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153334777 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 153335110 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153335122 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153335199 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 153335361 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153335379 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153335408 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 153335600 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 153335644 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153335723 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153336013 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153336043 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 153336050 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153336148 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153336260 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 153336346 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153336828 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153337173 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 153337443 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 153337807 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 153337906 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 153338488 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 153338565 G T N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 153338612 G A N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 153338694 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 153338763 A G N Y 0.230769230769231 REF 0.35 0.35 0.230769230769231 0.769230769230769 0.153846153846154 0.153846153846154 0.692307692307692 6 20 2 2 9 3 153341644 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153341687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153342186 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 153342204 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153342215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153342274 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153342535 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 153342568 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 153342713 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153343349 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153343434 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153343504 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153343579 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 153343618 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153344022 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 153344068 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153344113 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 153344416 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 153344470 G A Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 153344558 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 153344563 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 153345126 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 153345186 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153345725 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153345802 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 153345948 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 153346002 C T N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 3 153346253 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 153346254 A T Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 153346685 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 153346700 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153346763 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153351677 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153351752 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 153351779 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 153351829 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153351899 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 153352040 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153352362 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 153352602 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 153352614 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 153352628 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153352846 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153352856 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153352919 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153353417 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 153353464 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 153353480 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 153353683 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153353762 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 153353815 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153354555 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153354804 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 153354887 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153355063 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 153355064 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 153355226 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 153355513 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153355688 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153355810 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153355887 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153355917 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 153355933 G T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 153355965 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 153356079 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153356082 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153356091 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153356123 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 153356248 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 153356562 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153356732 G A N Y 0.5 ALT 0.95 0.95 0.5 0.5 0 1 0 1 1 0 1 0 3 153356814 T G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 153356828 C G Y N 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 153357029 T C N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 3 153357043 A T N N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 2 16 1 0 8 3 153357105 G C N N 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.166666666666667 0.416666666666667 0.416666666666667 9 15 2 5 5 3 153357131 T G N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 153357195 T C Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 153358288 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 153358318 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153358333 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 153358357 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153358418 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153358444 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153358477 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 153358493 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 153358522 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153358547 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153358569 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153358933 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153359232 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 153359295 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153359308 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153359479 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153359747 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153359789 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 153359792 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 153359801 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 153359841 C A Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 153360279 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153361273 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 153361349 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 153361369 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 153361664 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 153361899 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153361927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153362084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153362445 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153362686 C G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 153362934 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153362961 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153362970 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153362999 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153363056 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153363102 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153363155 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153363222 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 153363261 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153363281 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153363493 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 153363901 G T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 153364262 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153364304 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153364497 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 153364674 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153364738 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153364918 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 153364938 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153364992 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153365011 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 153365084 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153365237 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153366993 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153367072 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153367276 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153367342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153368600 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153368611 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 153368650 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 153368864 A G N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.1875 0.1875 0.625 9 23 3 3 10 3 153368887 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 153368913 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 153368934 C G N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 153369049 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153369073 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153369115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153369284 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 153369291 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 153369556 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 153369565 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 153369647 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 153369677 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 153369731 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 153369775 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153369778 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 153369805 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 153369818 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153369838 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 153369896 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153370001 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153370007 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153370269 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153370381 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153370430 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153370525 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153370570 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153370574 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153370760 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153370815 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153370927 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 153370930 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 153371053 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153371065 A C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 153371100 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 153371394 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153371557 G A Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 153371570 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153371583 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 153371619 C T Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 153371674 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153371722 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 153371960 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 153372175 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153372910 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153372962 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153373140 A G N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 153373531 A T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 153373798 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153373865 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153374444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153374660 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153374693 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 153374701 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 153374861 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153375101 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153375171 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 153375743 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153375753 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153376909 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 153378196 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 153380095 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153380410 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153380627 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 153381212 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 153381301 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153381456 G C N N 0.25 REF 0.5 0.5 0.25 0.75 0 0.5 0.5 5 15 0 5 5 3 153381867 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 153383583 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153383934 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153384257 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 153384345 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153384366 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 153384369 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153384398 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 153384431 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 153384463 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 153384491 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153384501 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153384590 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153385251 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153385330 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153385335 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 153385457 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 153385524 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 153385531 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 153385606 A G Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 153385734 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 153385970 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153386021 G T N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 153386023 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 153386053 T A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 153386267 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153386376 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 153386529 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153386545 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153386704 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153386774 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 153387995 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 153388439 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153388537 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153388621 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 153388980 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153389119 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 153389142 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153389429 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 153389510 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153389548 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153389579 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153389659 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 153389816 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 153389905 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153389915 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153390092 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 153390136 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153390183 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 153390860 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153390862 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153390887 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153391075 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153391080 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153391096 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 153391161 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153391162 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153391225 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153391431 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153391815 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 153392272 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 153392306 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 153392320 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153394427 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 153394459 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153394613 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 153394614 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 153394770 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 153394884 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153395477 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153395570 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 153395809 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 153398123 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153398636 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153398763 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153399210 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153399463 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 153399498 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153399854 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153399914 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153399928 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153400187 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 153400274 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 153400359 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153400488 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 153400855 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153400871 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 153400916 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 153400942 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 153400950 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 153401178 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153401461 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153401527 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153401537 C A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 153401554 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 153401708 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153401718 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 153402793 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 153403200 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 153403238 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 153403239 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 153403279 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153403292 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153403310 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153403320 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153403349 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153403379 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 153404491 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153404519 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 153404665 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153404721 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 153404810 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153405579 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153405662 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153405698 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 153405718 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 153406148 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 153406189 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 153406196 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 153406244 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 153406245 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 153406336 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153406491 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153406656 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153406771 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 153407143 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153407870 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153408560 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153408836 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153409248 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153409249 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153409290 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153409556 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 153409830 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153409919 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 153410123 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153410126 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153410143 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153410151 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153410224 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153410372 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 153410374 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 153410405 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153411442 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 153411574 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153411585 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153411589 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 153411664 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153411705 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153412201 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153412438 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153412446 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153412449 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153412469 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 153412566 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153412573 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 153412646 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153413017 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 153413021 C A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 153413147 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 153413454 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153413629 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 153413648 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 153413973 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 153414460 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153414610 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153414652 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153414925 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 153415097 C T Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 153415394 A G N Y 0.272727272727273 REF 0.45 0.45 0.272727272727273 0.727272727272727 0 0.545454545454545 0.454545454545455 6 16 0 6 5 3 153416040 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153416092 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 153416104 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 153416268 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153416467 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153416505 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 153416597 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 153416686 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153416717 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153416832 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153416886 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 153416906 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153416926 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153417003 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153417006 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153417017 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153417018 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153417054 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153418129 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153418137 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153418202 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153418464 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153418598 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153418692 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 153418741 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153418747 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153418784 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 153418808 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 10 22 0 10 6 3 153418813 T C N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 3 153418831 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153419256 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153419269 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153419286 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153419747 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153419790 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153419967 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153420198 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153420255 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153420382 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153421272 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153421454 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 153421457 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153421466 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 153421613 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153421790 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 153422145 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153422206 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153422402 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153422434 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 153422538 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153422604 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153422754 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153423325 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153423437 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153423472 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153423659 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153423683 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153423695 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153423748 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153423938 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153423973 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153424027 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153424131 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153424387 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153424402 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153424443 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153424591 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153425059 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153425096 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 153425119 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153425126 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153425204 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153425287 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153425325 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153425349 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 153426425 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153427481 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 153427578 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153428012 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 153428409 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153428623 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153428911 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153429766 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153429771 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153430000 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153430064 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153430162 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153431042 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153431171 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153431190 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153431552 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153431676 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153431707 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153432812 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 153433433 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 153433610 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 153433943 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 153434027 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153434173 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 153434182 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 153434192 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 153434210 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153434475 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153435290 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 153438088 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153438278 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153439316 T C N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 153439320 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 153440495 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153440509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153440613 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153440628 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 153440695 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153440744 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 153440903 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 153440986 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153441011 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153441065 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153441422 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153441428 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153441437 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153441729 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153441975 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153442005 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153442414 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153442438 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153442482 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153442627 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153442636 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153442639 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153442673 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153442692 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0 0.894736842105263 0.105263157894737 17 21 0 17 2 3 153442693 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0 0.888888888888889 0.111111111111111 16 20 0 16 2 3 153442759 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153442798 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153443539 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153443574 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153443581 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153443613 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153443651 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153443676 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153443695 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153443892 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153443996 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 153444212 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153444325 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153444486 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153444621 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153444725 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153444912 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153446475 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153446510 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153446635 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153447003 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153447019 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153447100 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 153447106 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153447151 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153447161 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153447212 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153447236 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153447247 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153447317 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153447323 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 153447337 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 153447347 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 153447374 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153447433 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153447482 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153447578 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153447627 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153447702 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 153447764 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 153447776 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153448071 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 153448074 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 153448345 C G Y N 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 153448357 C G Y N 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 3 153448369 C G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 153448408 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 153448421 A C Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 153448456 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 153448583 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 153448586 G A N Y 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 153448624 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 3 153448719 A C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 153448729 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 153449003 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153449042 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 153449116 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153449125 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153449127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153449149 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153449257 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153449336 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153449361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153449627 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153450312 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153450430 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153450778 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153451773 A T Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 153452231 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 153452273 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153452310 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153452312 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153452325 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153452444 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153452572 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153452601 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 153452697 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153452701 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 153452835 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153452872 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 153452931 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153452936 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 153452947 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 153453040 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 153453154 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153453742 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153453766 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153453963 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153454143 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 153454741 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 153454781 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 153454931 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153455040 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153455310 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153455348 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153455514 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153455521 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153455792 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153456490 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153456709 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 153456713 G A N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 153456905 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153456982 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153456983 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153457022 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153457034 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153457047 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153457057 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153457064 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153458188 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153458250 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153458363 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153458457 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153458540 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153458621 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153458702 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153458709 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153458793 T A N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 153458802 C A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 153458849 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 153458896 G A N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 153459005 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 153459062 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 153459176 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153459199 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153459283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153459305 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 153459314 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153459317 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153459388 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153459399 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153459753 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153459803 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153459980 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153460605 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153460649 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153460710 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 153460737 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153460770 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153460803 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153460970 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 153460974 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 153461117 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153461187 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153461893 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153462019 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153462056 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 153462071 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 153462115 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153463435 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153463709 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153463731 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 153463784 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 153463844 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153464151 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153464381 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153464398 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153464406 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 153464509 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153469399 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153469461 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153470702 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153470771 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153471438 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153472400 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 153472438 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 153472735 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 153472884 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 153473051 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 153474157 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153474388 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 153474864 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 153475089 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153475119 A T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 153475231 A T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 153475239 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 153475374 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 153475401 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 153475697 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153475812 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 153475819 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 153476073 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 153476116 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153476214 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153476312 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153476544 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153476584 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153476598 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153476632 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 153476972 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 153476988 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153477169 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.55 0.2 0.25 26 14 11 4 5 3 153477332 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153477343 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 153477354 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 153477415 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 153477418 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 153477448 A T N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 153477501 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 153477558 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 153477591 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 153477611 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 153477641 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 153477658 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153477748 A G Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 153477842 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153477946 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153477968 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 153478031 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153478365 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 153478419 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153478424 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153478436 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153478484 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 153478505 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 153478577 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153478682 A C N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 153478693 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 153478813 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153478846 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153478850 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153478922 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 153478968 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 153479065 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 153479162 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153479343 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 153479419 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 153479497 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153479521 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 153479541 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 153479558 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 153479587 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 153479690 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 153479724 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 153479801 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153479901 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 153479909 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 153479929 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 153479946 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 153479976 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153480130 A G Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 153480138 G C Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 153480198 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 153480209 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153480231 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153480358 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153480392 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 153480414 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153480686 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153480838 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153480942 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153481191 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153481210 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 153481855 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153482163 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153482164 A C Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 153482292 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153483111 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153483123 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153483294 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153483353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153483610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153483638 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153483659 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 153483955 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 153484037 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 153484047 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153484205 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 153484563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153484909 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153484997 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 153485176 G A N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 3 153485364 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 153485469 A T N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 153485475 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153485499 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 153485523 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 153485536 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 153485540 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 153485592 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 153485632 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153485695 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 153486110 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153486138 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 153486150 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 153486278 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153486325 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 153486479 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 153487013 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 153487169 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153487194 T A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 153487413 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153487482 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 153488035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153488089 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 153488176 G C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 153488221 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 153488782 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 153488872 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 153488889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153488933 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 153488994 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 153489223 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 153489252 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 153489253 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 153489304 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 153489370 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 153489487 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153489734 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 153489753 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 153490066 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 153490130 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 153490941 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 153490963 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 153490995 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 153490999 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 153491043 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 153491060 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.3 0.7 0 26 14 6 14 0 3 153491161 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 153491306 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 153491337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153491589 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 153491651 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 153491756 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 153491771 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 153491860 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 153491927 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 153491943 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 153492349 G T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 153492471 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 153492484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153492498 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 153492587 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 153492599 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 153492680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153492734 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 153492942 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 153492982 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 153493051 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 153493090 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.315789473684211 0.578947368421053 0.105263157894737 23 15 6 11 2 3 153493182 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 153493193 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 153493252 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 153493290 G C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 153493333 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 153493363 A T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 153493370 T A N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 153493397 T C N Y 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 7 3 3 1 1 3 153493417 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 8 4 2 4 0 3 153493427 T C N Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 7 7 2 3 2 3 153493449 C A N N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.214285714285714 21 7 10 1 3 3 153493470 T C N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 153493539 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 153493560 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 153494037 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153494045 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 153494048 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 153494085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153494118 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 153494225 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 153494245 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 153495857 A C Y N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 153495921 A G Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 153496084 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153496102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153496138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153496217 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153496281 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 153496459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153496588 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153497085 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 153498077 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 153498491 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 153498871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153500577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153502756 C A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 153502789 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 153503116 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 153503230 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 153503321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153503850 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153503851 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153504348 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153504441 G A Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 153504448 G T Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 153504644 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153504769 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 153504970 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 153505097 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 153505104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153505145 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153505279 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153505333 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 153505559 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 153505630 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153505677 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 153506424 G T N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 153506859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153507189 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 153507407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153508145 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 153508806 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 153508870 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153509172 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153510251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153510546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153510684 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153510781 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153511141 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 153511218 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 153511303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153511363 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 153511605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153512508 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 153513590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153514650 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153515443 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153516141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153516519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153517332 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153519930 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 153520461 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153520819 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153521355 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153521422 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153521443 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 153521444 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153522090 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 153522157 G A Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 153522549 A G Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 153522684 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 153522845 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 153522991 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 153523677 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153524010 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 153524041 C A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 153524869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153525017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153525885 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 153529228 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153529281 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153530221 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153531537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153531735 A G Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 153532324 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153532741 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 153532851 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153533004 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 153533046 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153533140 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 153533170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153533440 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 153533548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153533738 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 153533869 A G N Y 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0 1 0 11 11 0 11 0 3 153534169 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.157894736842105 0.631578947368421 0.210526315789474 18 20 3 12 4 3 153534196 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 153534559 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 153534725 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 16 20 2 12 4 3 153534736 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 153534745 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.15 0.6 0.25 18 22 3 12 5 3 153534936 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 153535064 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.166666666666667 0.722222222222222 0.111111111111111 19 17 3 13 2 3 153535101 A T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.176470588235294 0.705882352941177 0.117647058823529 18 16 3 12 2 3 153535342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153535408 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 153535627 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 153535644 A T N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 153535796 G A N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 153536166 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153536338 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153536376 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153536413 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 153536726 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 153536892 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153536975 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153537114 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 153537143 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 153537604 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 153537717 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153537905 T C N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 153537924 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 153537937 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 153538494 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.3 0.55 0.15 23 17 6 11 3 3 153538617 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.15 0.65 0.2 19 21 3 13 4 3 153538762 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 153538773 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 153538980 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153539430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153539587 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 153539889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153540161 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153541063 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153541318 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153541364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153541784 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 153542270 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 153542392 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 153542431 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 153543110 T C N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 0.153846153846154 0.153846153846154 20 6 9 2 2 3 153543133 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 153543191 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153543378 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153543848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153544798 T G N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0 0.533333333333333 0.466666666666667 8 22 0 8 7 3 153545772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153548102 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153548621 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 153549011 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153549101 C G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.235294117647059 0.647058823529412 0.117647058823529 19 15 4 11 2 3 153552289 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153552795 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 153553380 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153553780 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 153554249 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 153554262 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 153554454 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153554477 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0 0.684210526315789 0.315789473684211 13 25 0 13 6 3 153555163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153555262 A G Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 153555351 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 153555897 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153556801 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153557882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153558168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153558513 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 153558616 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 153558811 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 153559347 A T N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 153559519 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 153559959 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 153559964 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 153560140 A C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 153560163 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 153560375 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 153560393 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 153560504 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153560595 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153560853 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153561480 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153561750 C T N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.5625 0.4375 0 25 7 9 7 0 3 153563198 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 153563747 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 153565369 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.388888888888889 0.222222222222222 0.388888888888889 18 18 7 4 7 3 153566183 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153566300 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 153566356 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 153566376 G T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 153566761 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 153566791 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 153566794 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 153566816 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 153566971 G A N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 153567439 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 153567496 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153567521 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153567767 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 153567781 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 153569793 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 153570148 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153571298 T A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 153572643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153572793 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153574117 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153575656 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153576918 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153577080 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 153578723 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153578922 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 153579070 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 153579076 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153579093 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153579563 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 153580449 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153584464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153585766 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 153585789 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153586100 A G N Y 0.2 ALT 0.75 0.75 0.8 0.2 0.6 0.4 0 8 2 3 2 0 3 153587549 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153587836 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153589571 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 153590303 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153590952 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 153590961 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 153591210 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.55 0.55 0.333333333333333 0.666666666666667 0.222222222222222 0.222222222222222 0.555555555555556 6 12 2 2 5 3 153591290 C T N Y 0.227272727272727 REF 0.45 0.45 0.227272727272727 0.772727272727273 0.0909090909090909 0.272727272727273 0.636363636363636 5 17 1 3 7 3 153592917 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 153593385 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153593397 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153593419 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153593455 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 153594791 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153594943 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 153595035 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 153595126 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153595133 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153595137 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 153595833 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153595893 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153595969 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153596084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153596332 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153596742 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153596758 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153597145 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153597262 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153597279 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153597301 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153597360 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153597433 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153597453 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153597552 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153597561 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153597842 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153598061 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153598410 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153598435 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153599065 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 153599330 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153600062 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153600097 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153600168 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153600426 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153600530 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153600611 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153601443 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153601464 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153602599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153604292 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 153604399 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 153604414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153604740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153605031 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153605182 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 153605368 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 153605389 T G N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 153605477 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 153605516 T C N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 153605583 G C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 153605616 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153605760 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 153605774 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 153605790 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153605924 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153605938 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153606174 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153606257 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153606460 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 153606501 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 153606668 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 153606719 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 153606722 T G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 153606804 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 153606852 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 153607483 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153607757 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153609140 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153610039 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153610045 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 153610442 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153610929 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 153611324 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153611338 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153611665 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153612253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153612984 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153613131 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153614823 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153615543 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153615988 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153617275 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 153617333 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153617335 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153619649 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153619656 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153619727 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153620384 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153620535 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 153620637 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 153620649 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 153620680 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 153620737 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153621168 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153621236 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153621807 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153622816 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 153622991 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153623014 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 153623871 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153623921 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153624056 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 153624213 A T Y N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 153624375 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 153624684 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153624848 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 153624853 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 153624866 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153624958 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153625169 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 153625183 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153625262 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153625375 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 153625402 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 153625450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153625528 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153625551 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 153625574 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 153625767 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153625773 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153625782 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153625789 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153625806 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 153625817 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153625855 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 153625918 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153625993 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 153626126 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153626209 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 153626267 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153626376 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 153626564 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153626654 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 153626913 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153627117 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153627135 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153627218 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153627230 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 153627235 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 153627299 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153627306 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 153627327 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 153627348 C G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153627381 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 153627475 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 153627540 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 153627552 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 153627662 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153627753 T C Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 153627960 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 153628109 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153628158 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153628629 A G Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 153628735 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153628763 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153628923 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 153629073 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 153629105 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 153629339 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 153629348 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 153629376 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153629491 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 153629501 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 153629502 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 153629515 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 153630599 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153631188 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 153632251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153632570 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153632779 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153632858 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153633406 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 153633569 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153633783 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 153634745 G C N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 153635187 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153635197 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 153635328 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153635819 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153636002 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153636037 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153636038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153636064 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 153636100 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 153636125 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153636914 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153637145 A C N N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 153637510 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153637659 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 153637722 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153637987 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153640107 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153641069 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153642598 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5 0.5 0 24 8 8 8 0 3 153645730 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153645778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153646069 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153646635 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153647005 A T N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 153647834 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153648017 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153648119 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153648474 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 153648884 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153650354 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 153650661 C G Y N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 153651445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153651478 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153651873 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 153651906 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153651936 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 153651943 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153651948 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 153652100 A C Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.157894736842105 0.842105263157895 0 22 16 3 16 0 3 153652959 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153652992 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153654306 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 153654744 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153655317 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 153655534 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153655557 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153656023 A T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 153656309 A G Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 153656561 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153656742 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 153656818 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 153656939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153657110 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 153657131 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153657328 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153657386 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 153658008 A T Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 153658428 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153658440 C G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 153658917 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153658959 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 153659012 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 153659255 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 153659517 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153659523 C G N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 153659845 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153659879 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 153659890 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153659919 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153659946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153659954 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153660081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153660135 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153660866 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153661168 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153661463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153661575 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153661578 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153661940 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153661966 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153661976 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153662008 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153662015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153662024 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153662048 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153662161 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 153662371 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 153662455 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 153663210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153664438 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153664454 G T Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 153664532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153664549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153664741 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153665184 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 153665190 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153665196 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 153665288 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 153665316 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 153665536 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 153665620 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 153667849 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 153668094 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153668120 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153668167 T G N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 153668238 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 153668512 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153668566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153668599 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153668719 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153669558 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153669573 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153669708 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153669861 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153670054 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153670150 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153670173 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153670203 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153670250 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153670261 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153670411 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153670498 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153670620 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153671443 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 153671597 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153671892 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153672150 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 153672283 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 153672413 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 153672518 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 153672526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153672661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153672736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153672922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153672966 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 153673009 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 153673088 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 153673126 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153673144 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153673182 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 153673189 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153673211 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 153673255 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153673813 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153673820 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 153673931 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 153674222 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153674296 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 153674392 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153675093 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153675094 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153675304 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 153675634 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153675990 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 153676038 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 153676399 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153676473 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 153676687 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153676728 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153676899 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153676919 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 153677063 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153677096 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153677117 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153677165 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153677214 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153677227 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153677841 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153677869 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153677882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153677916 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 153677924 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 153677929 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153678022 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153678120 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 153678352 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 153679392 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 153679398 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 153679488 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 153679498 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 153679521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153679565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153679583 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153679617 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153679900 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 153680008 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 153680061 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153680163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153680205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153680269 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153680328 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153680389 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153680479 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153680780 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 153681001 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153681043 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 153681118 C T N Y 0.3 ALT 0.5 0.5 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 14 6 5 4 1 3 153681411 C T Y Y 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 0.0769230769230769 19 7 7 5 1 3 153681499 C T Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 3 153682182 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153682238 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153682251 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153682344 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153682443 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153682550 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 153682572 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 153682817 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 153682865 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153682889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153682900 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 153682929 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 153682969 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 153683173 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 153683400 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153683407 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 153683525 G A N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 153683564 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153683768 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153683845 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153684005 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153684066 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153684075 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153684077 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 153684294 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153684357 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 153684364 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153684382 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 153684448 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 153684700 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 153684701 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 153684758 C G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 153684850 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153685049 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 153685228 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 153685244 A C N N 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 153685288 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 153685312 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 153685332 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 153685399 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153685441 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153685522 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153685562 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153685574 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 153685679 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 153685811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153685832 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 153685837 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153685864 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153685873 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 153686088 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 153686156 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 153686192 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153686268 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 153686296 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153686333 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153693220 C T Y Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 3 153693469 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 153693676 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 153693677 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 153693727 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 153693756 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 153693759 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 153693772 C A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 153694108 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153694268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153694446 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 153694699 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153695329 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153696017 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153696602 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153698270 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153702633 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153704095 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153705037 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153705195 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153705869 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 153706248 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153706887 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153707550 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153707565 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 153707869 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153708178 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 153708192 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 153708244 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 153708257 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153708297 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 153708329 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 153708347 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 153708538 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 153708544 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 153708662 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153708723 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153708745 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153708896 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 153708897 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 153709170 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 153709256 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 153709755 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 153709851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153709868 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153709994 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153710017 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 153710070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153710133 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153710208 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153710646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153710791 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 153710854 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153710870 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 153710905 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 153710917 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 153712357 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153712771 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153715279 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153715640 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153715716 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 153715723 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 153716661 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 153716824 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 153716846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153717025 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 153717198 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 153717243 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153717534 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153717581 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153717778 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 153717885 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 153717907 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153717945 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153718002 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153718117 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153718170 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153718276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153718378 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153718418 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153718447 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 153718538 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 153718585 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153718717 C T N Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 153718718 A T N N 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.714285714285714 0.214285714285714 0.0714285714285714 23 5 10 3 1 3 153718818 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 153718865 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153718883 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 153718896 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 153718948 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 153718961 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 153718968 G A N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 153718975 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 153719009 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153719042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153719093 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153719129 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153719196 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 153719208 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 153719251 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 153719404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153719449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153719643 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 153719657 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 153719825 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 153719833 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153719929 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 153719940 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 153719945 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 153719998 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153720245 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153720259 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153720650 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153721920 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153721978 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 153722005 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 153722029 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153722041 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153722106 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153722204 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153722476 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153722518 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 153722552 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 153722560 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 153722572 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 153722608 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 153722645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153722646 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153723064 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 153723082 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 153723103 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 153723222 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153723278 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 153723385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153723395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153723459 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153723479 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 153723625 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153723626 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153723776 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153723782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153723790 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153723826 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153723864 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153723870 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153723881 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153723893 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 153723946 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 153724004 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153724020 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153724090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153724122 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153724137 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153724206 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 153724247 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 153724313 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 153724433 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 153724436 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153724563 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153725136 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 153725151 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153725200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153725346 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153725403 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153725432 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153725485 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153725500 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 153725511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153725526 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153725540 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153725563 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153725578 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153725595 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153725635 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153725661 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153725690 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153725703 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153725704 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153725717 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153725805 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153725820 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 153726000 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153726069 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153726880 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153726887 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 153726998 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 153727198 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153727202 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 153727311 T C N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 153727323 G A N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 153727631 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 153727827 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153728171 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153728454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153728658 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153728923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153730682 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153731675 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153732311 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153734076 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 153734482 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153735370 C T Y Y 0.375 REF 0.6 0.6 0.375 0.625 0 0.75 0.25 6 10 0 6 2 3 153735446 G C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 153736045 C A Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 153736074 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 153736122 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 153736257 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 153736343 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153736569 C T N Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 153737973 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 153738120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153738589 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153739805 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153739835 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153740449 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153740786 G A N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 153741359 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 153742700 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153742934 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153742980 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 153742981 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 153743002 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 153743066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153743249 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 153743320 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153743594 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153743635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153743647 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153743673 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 153743702 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153743978 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 153744115 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153744155 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 153744216 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 153744318 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153744600 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153744700 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153744943 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 153745067 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 153745300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153745390 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153745502 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 153745817 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153745836 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153745985 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153745997 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 153746173 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153746192 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 153746194 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153746289 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153746321 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153746330 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153746651 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153746663 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153746695 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 153746711 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 153746761 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 153746855 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153746875 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153746969 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 153747100 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153747124 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153747146 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153747515 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 153747538 G C N N 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 153747576 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 153747660 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 153747662 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153747689 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153747724 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 153748127 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 153748199 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 153748393 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 153748450 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153748462 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153748706 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153748727 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 153748816 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153749333 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153749587 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153749668 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153749686 T A N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 153749895 G T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 153749992 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153750080 G T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 153750266 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153750326 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153750350 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 153750533 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153750718 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 153750737 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153750859 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153750936 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153751665 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 153751986 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 153751999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153752135 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 153753150 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153753211 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153754029 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153754042 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153755072 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153755178 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 153755410 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153755738 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 153755877 C G N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 153756525 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153756551 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153756785 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153756889 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 153757011 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153757432 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 153757552 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153758403 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153758610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153759171 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153759306 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153759592 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153761028 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 153761056 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153761144 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153761175 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153761192 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153761796 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153761830 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 153761853 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153761854 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153761930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153761963 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153762168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153762547 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 153762854 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153762940 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153762980 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153762991 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153763032 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153763054 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 153763644 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153763655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153763656 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153763666 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153763715 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153763759 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153763801 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153763904 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153764012 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153764027 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153764295 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153764424 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 153764426 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 153764487 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153765160 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153765587 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153765651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153765663 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 153765800 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153765823 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153765831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153765929 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153766097 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153766204 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153766281 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153766605 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 153766620 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 153766832 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153766885 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153766957 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 153766958 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 153767048 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 153767165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153767201 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153767777 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 153767894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153768112 A T Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 153768699 T G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.125 0 0.875 4 28 2 0 14 3 153768966 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 153769518 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153770227 T A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 153770358 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153770372 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153770664 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153770839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153770878 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153770892 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153770944 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153771050 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 153771063 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153771097 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153771895 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153772029 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 153772109 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 153772307 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 153772335 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153772380 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 153772397 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153772566 G C Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153772947 T C N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 153773129 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 153773577 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153773599 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153773605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153773759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153774306 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153774636 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153774685 G T Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153774984 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153774989 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153775086 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153775258 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153775276 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 153775399 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153775407 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153775422 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153775432 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153775437 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153775489 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153775514 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153775544 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153775605 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153775746 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153775767 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153775814 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153775973 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153776038 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153776045 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153776363 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153776440 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153776659 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 153776827 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153776881 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153776901 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153777081 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153777182 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153777204 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153777371 C A N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 153777382 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 153777416 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153777432 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153777766 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153777768 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153777891 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153777905 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153777986 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153778271 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153778391 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153778405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153778502 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153778521 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 153778618 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153778868 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 153779091 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 153779443 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153779797 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153779807 A G Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153779830 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153779853 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 153779947 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153779976 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153780016 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153780067 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153780115 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153780129 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153780149 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153780322 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 153780577 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 153780845 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153781031 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153781074 T C Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 153781141 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 153781148 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 153781406 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 153781710 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153782010 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 153783066 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153783475 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.85 0.85 0.666666666666667 0.333333333333333 0.333333333333333 0.666666666666667 0 4 2 1 2 0 3 153785561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153786735 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153787485 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153788028 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153788701 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153788702 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153789287 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153789631 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153789761 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153789770 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153789814 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153789835 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153789861 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153789923 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153790005 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153790090 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 153790117 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 153790178 G C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153790207 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153790246 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 153790248 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 153790281 G T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153790783 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153791112 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153791372 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153792149 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153792273 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153792508 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153792678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153792976 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153793689 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153794873 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153795372 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0 0.882352941176471 0.117647058823529 15 19 0 15 2 3 153795390 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0 0.705882352941177 0.294117647058824 12 22 0 12 5 3 153795537 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 153795541 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153795785 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153795811 G A Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 153796618 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 153796679 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153796691 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 153797030 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153797047 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153797127 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153797131 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153797482 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 153797546 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153797555 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153797569 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153797584 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153797779 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 153797784 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153797960 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153797996 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153798144 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 153798258 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153798380 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153798429 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153798570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153798645 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153798653 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153798720 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 153798850 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 153798877 A T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 153798994 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153798998 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153799075 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 153799204 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 153799430 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153799563 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153799585 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153800049 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153800121 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153800613 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153800651 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153801171 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153801242 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153801328 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 153801358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153801386 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153801625 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 153801662 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 153801696 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 153801911 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 153801951 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153802133 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153802242 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153802524 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153804159 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 153804188 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 153804335 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153804625 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153804877 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153804962 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153805012 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153805031 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 153805167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153805269 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153805338 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153805341 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153805353 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153805569 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153805586 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153805880 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153806003 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153806039 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153806040 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153806503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153806688 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153807033 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153807041 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153807076 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153807141 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153807262 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153807281 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 153807352 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153808074 A C N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153808151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153808253 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153808320 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153808387 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153808437 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153808446 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153808469 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153808487 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153808555 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153809221 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 153809339 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 153809378 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 153809660 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 153810812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153811368 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153811866 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153812051 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 153812748 T G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 153812773 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 153812968 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153812980 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153813091 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153814202 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153814424 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153814443 A G Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 3 153814465 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153815244 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153815363 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153815430 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153815908 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153816043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153816091 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 153816117 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 153817383 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153818485 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153819630 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153819966 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153821685 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153821839 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153822426 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153822566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153823394 T C Y Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 153823959 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 153824251 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153824265 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153824494 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153824644 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153824746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153824995 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153825360 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153825435 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153825502 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153825527 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153825666 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153825840 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 153826058 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153826569 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153826705 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153827734 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153827920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153828179 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153828353 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153828646 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153828967 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153830090 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153830116 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 153830711 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153830863 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153830866 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 153830892 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153832082 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153832850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153833208 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153833717 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 153833951 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 153833965 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153834025 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153834212 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153834424 G T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 153834509 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 153834552 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 153834650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153834943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153836707 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153836711 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153837159 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153837511 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153837633 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153837942 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 153838005 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153838085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153838146 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153838320 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 153838353 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 153838531 G T Y N 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 3 153838880 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 153839439 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 153839452 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153839734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153840191 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153840271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153840273 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 153840296 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153840325 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153840502 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153840538 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153840564 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153840624 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153840894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153840895 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153840912 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153841260 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153841308 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153841702 T C Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153841733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153841818 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153841844 A C Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 153842692 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153842756 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153842797 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153842864 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153842889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153842913 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153842964 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153842980 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153843093 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 153843136 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153843461 A G Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 153843489 C T Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 153843491 C T Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 153843583 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 153843672 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153843758 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153843771 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153843780 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153843807 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153843814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153843865 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153844140 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153844174 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153844742 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153844821 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153844843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153844844 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153845057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153845192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153845795 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153845996 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153847053 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153847077 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153847370 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153847448 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153847520 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153847820 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153848026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153848192 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153848300 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153848321 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153848349 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153848502 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153849280 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153849461 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153849496 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153849638 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 153849760 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 153849804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153850070 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 153850150 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 153850385 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153850416 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153850506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153850582 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153850647 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153850648 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153850687 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 153850706 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153850778 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153850793 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153850902 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153850910 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153851157 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153851236 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153851245 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153851496 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 153851498 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 153851618 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 153851757 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153851769 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 153851932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153852193 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153852426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153852595 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153852644 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153852682 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153852759 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153852796 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153852797 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153852893 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 153852939 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153852941 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153852985 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153853038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153853304 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153853457 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153853486 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153853709 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153853714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153854000 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153854508 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153854518 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153854617 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153854701 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153855360 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153855436 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153855472 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153855503 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153855605 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153855664 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153855688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153856157 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153856247 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153856254 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153856569 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153856591 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153856620 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153856637 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153857121 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153857179 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153857185 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153857194 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153857200 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153857281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153857348 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153857351 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153857422 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 153857431 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153857443 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 153857514 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 153857900 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153859913 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153861575 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153862581 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153862677 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153863759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153864019 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153864037 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153864195 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153864207 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153864266 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153864339 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153864428 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153864435 C T Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 153864442 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 153864467 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 153864477 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 153864538 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 153864589 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153864614 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153864623 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153864765 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 153865361 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153865389 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153865518 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153865555 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153865658 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 153865700 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153865725 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153865743 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153865858 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 153865935 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 153866696 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153866697 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153866917 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 153866979 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153867138 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153867196 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153867448 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153867715 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153867722 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 153867776 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153867794 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 153868220 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 153868251 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 153868256 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 153868573 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153868928 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153869152 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153869173 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 153869866 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153869947 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153870659 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 153870737 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 153872019 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153872775 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153873416 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153873880 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153874337 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153874351 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153874504 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 153874553 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153875947 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 153875954 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 153875991 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 153875994 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 153876007 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153876099 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 153876108 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 153876178 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 153876193 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 153876205 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 153876334 G C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 153876375 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 153876503 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 153876726 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 153876794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153876799 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153876852 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 153876933 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 153876937 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 153876969 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153876983 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 153877170 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153877272 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 153877352 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153877421 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 153877602 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153877664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153878192 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 153878237 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 153878346 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 153878509 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153878581 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153878603 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153878630 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 153878788 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 153878798 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153878807 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 3 153880697 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0 0.631578947368421 0.368421052631579 12 26 0 12 7 3 153881689 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 153881807 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153884029 G C Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.45 0.55 0 29 11 9 11 0 3 153884683 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 153884924 A C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 153884940 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0 0.578947368421053 0.421052631578947 11 27 0 11 8 3 153884988 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153885200 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 153885213 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 3 153885653 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153885674 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153885946 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153886026 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 3 153886066 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153886072 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153886093 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 153886247 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153886304 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153886310 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153886465 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 3 153886798 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 3 153886804 T A Y N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.285714285714286 0.714285714285714 0 18 10 4 10 0 3 153886879 T G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 3 153886883 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 3 153886960 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0 0.6 0.4 12 28 0 12 8 3 153887034 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 3 153887079 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.4375 0.5625 0 23 9 7 9 0 3 153887140 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 3 153887174 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153887189 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153887221 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 153887256 A C N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.375 0.5625 0.0625 21 11 6 9 1 3 153887328 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 3 153887337 T G N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 3 153887353 T A N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.266666666666667 0.733333333333333 0 19 11 4 11 0 3 153887384 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 153887418 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 153887525 T C Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 153887695 G A Y Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 153887727 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 153887869 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0 0.411764705882353 0.588235294117647 7 27 0 7 10 3 153887880 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 153887928 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153888004 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 3 153888012 T A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 153888278 A G Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 153888337 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153888429 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 153888546 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153888734 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153888738 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153888749 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153888753 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153888878 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153888934 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 153889018 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153889188 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153889371 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153889402 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 153889403 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 153889439 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153889634 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 153889644 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 153889677 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 153889698 C T Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 153889707 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 153889771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153889805 T A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 153889933 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153889960 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153889977 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153889978 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153890215 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153890272 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 153890286 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153890289 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 153890343 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 153890364 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153890451 C A Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 153890489 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153890501 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153890978 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 153890983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153891063 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153891129 G T Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 153891173 A G Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 153892012 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153892068 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153892850 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153892956 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153893159 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153893171 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 153893412 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153893447 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 153893518 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 153893538 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 153893583 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153893863 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 153894246 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 153894622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153894629 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 153894673 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153894722 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153894734 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153894754 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 153894777 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153894872 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153894901 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153895083 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 153895137 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153895149 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 153895241 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 153895285 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153895334 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153895356 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 153895362 T C N Y 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0 0.285714285714286 0.714285714285714 4 24 0 4 10 3 153895398 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153895409 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153895425 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153895434 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153895440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153895491 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153895673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153895675 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153895787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153896045 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153896114 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 153896118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153896454 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153896641 G T N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 153896652 C T N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.8125 0.125 0.0625 28 4 13 2 1 3 153897068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153897289 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153897356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153897439 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 153897633 A T Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 153897767 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153897771 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153897878 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153898243 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 153898244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153898303 G C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153898377 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153898429 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153898549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153898572 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153899098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153899232 C T Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 153899233 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 153899328 C A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 153899468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153899595 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153899655 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 153899770 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153900046 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153900072 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 153900101 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 153900350 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.578947368421053 0.157894736842105 0.263157894736842 25 13 11 3 5 3 153900419 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153900528 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153900622 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 153900636 A T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 153900663 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153900785 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153900787 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 153900801 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153900937 A G N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 153900981 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 153900998 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153901011 T G N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 153901035 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 153901042 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153901058 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 153901109 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 153901305 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153901374 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 153901411 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153901488 C T Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 3 153901738 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153901752 C T Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 153901973 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153902000 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153902134 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153902217 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153902220 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153902238 C G Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 153902385 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153902511 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153902641 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153902874 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 153902928 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 153903062 G A Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.470588235294118 0.176470588235294 0.352941176470588 19 15 8 3 6 3 153903233 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153903392 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 153903410 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153903457 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153903537 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 153903635 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 153903658 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 153903660 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 153903741 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 153904000 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 153904499 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 153904520 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 153904531 A T N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 153904569 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 153904574 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 153904626 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 153904638 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 153904659 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 153904675 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 153904705 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 153904743 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 153904781 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 153904877 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153904985 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 153905077 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 153905085 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.5 0.222222222222222 0.277777777777778 22 14 9 4 5 3 153905119 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 153905122 T C N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 153905160 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 153905293 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153905322 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 153905343 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 153905362 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 153905434 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153905450 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 153905451 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 153905525 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 153905614 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153905619 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 153905679 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 153905725 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153905737 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153905856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153906700 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 153907220 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153908769 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153909168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153909314 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153910225 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 153910732 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153911452 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153911514 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153911757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153912235 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153912786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153913065 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 153913071 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 153913210 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 153913219 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 153913462 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 153913559 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153913656 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 153913658 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 153913783 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 153913796 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 153913825 G T N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 153913841 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 153914100 G T Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 153914134 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153914135 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153914158 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153914242 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153914325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153914359 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 153914505 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153914764 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153914771 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153915035 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153915112 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153915451 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153915518 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153915531 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 153915648 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153915683 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153915706 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153915741 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 153915795 G C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 153915819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153916144 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153916254 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 153916408 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153916465 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153917615 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153917735 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153918023 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153918492 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 153918860 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153919926 A C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 153920084 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153920095 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 153920370 T C N Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.0769230769230769 24 2 12 0 1 3 153920417 A G N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 3 153920577 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153920886 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 153921689 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 153921912 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153922055 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 153922450 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153922585 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153922647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153922751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153922978 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153923076 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 153923331 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153923356 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153923387 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153923394 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 153923405 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153923427 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153923431 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 153923500 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 153923510 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 153923585 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 153923689 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153923954 G T Y N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 153924524 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153924915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153924949 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153925306 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 153925331 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 153925462 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153925477 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 153925656 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 153925676 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 153925743 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 153925833 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 153926200 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 153926565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153927327 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153927539 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153927857 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 153928034 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153928776 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153929132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153930293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153930410 T G N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 153930861 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153931135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153931265 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 153931292 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153931538 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 153931718 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153931865 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 153931884 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 153932061 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 153932086 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 153932170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153932187 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153932205 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153932614 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153933149 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 153933817 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153934049 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 153934074 G A N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 153934075 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 153934144 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 153934275 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153934574 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 153935206 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 153935212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153935272 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 153935304 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153935311 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153935381 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153935475 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153935510 C G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 153935736 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153935955 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153935961 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153935991 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153936225 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153936283 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 153936342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153936368 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 153936468 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153936494 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153936674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153936899 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153936925 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153936981 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153937054 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 153937164 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153937883 G C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 153939623 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153939624 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153940252 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 153940312 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 153940355 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 153940518 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 153940531 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153940675 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 153940817 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 153941023 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153941242 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153941609 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 153941728 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153941767 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153944041 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 153944102 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 153944202 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 153944345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153945159 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153946103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153946152 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153946207 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 153946280 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 153946310 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 153946437 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153946810 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 153947034 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 153947095 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153947371 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 153947457 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 153948072 A C Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 153948469 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 153948984 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153949039 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153949063 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153949078 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153949238 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 153949373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153950008 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153950023 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153950292 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153950342 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153950531 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 153950725 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153951024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153951032 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153951103 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153951107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153952140 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 153952215 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 153952306 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 153952338 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153952472 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 153952475 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 153952509 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 153952643 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 153952673 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 153952726 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153952741 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153952806 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153952900 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153952910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153953010 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153953059 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153953095 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 153953131 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153953180 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153953264 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153953548 A G Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 153953996 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 153954111 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153954185 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 153954203 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153954282 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153954291 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 153954294 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 153954448 C T N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 153954501 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 153954518 G C Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 153954539 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 153954598 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 153954602 G A Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 153954652 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 153954674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153955036 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 153955060 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 153955126 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153955249 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153955369 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153955524 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153955525 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153955963 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153956058 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153956178 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 153956244 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153956323 G C N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 153956350 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153956352 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153956372 T A Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 153956456 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 153956596 G T Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 153956624 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153956774 A T Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 153956776 T G Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 153956869 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153957793 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153957851 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 153957908 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 153958139 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 153958335 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 153958349 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153958403 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153958416 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153958605 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153958813 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153958855 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153958969 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153959070 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153960534 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153960731 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153961049 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153961199 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153961209 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153961232 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153961262 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 153961327 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 153961966 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153962032 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153962066 G A Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 153962363 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153962369 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 153962839 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 153962915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153963046 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153963361 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 153963629 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153963769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153963792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153964021 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153964069 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153964926 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 153965040 C G Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 153966758 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153966847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153967135 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153967582 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153967923 A T Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 153967948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153967994 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153967999 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153968066 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153968135 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153968765 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153968885 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 153968914 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 153968924 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 153969865 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153970353 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 153970422 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 153970510 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153970638 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 153970653 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 153970705 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153970771 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 153970846 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 153971146 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153971205 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 153971233 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 153971255 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153971300 G A Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 153971330 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 153971566 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153971622 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153971733 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 153971789 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 153971833 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 153972009 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153972216 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 153972238 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 153972474 C T Y Y 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.461538461538462 0.307692307692308 0.230769230769231 16 10 6 4 3 3 153972694 C T N Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 153972750 C T Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 153972767 A C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 153972785 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153972882 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 153973036 G T Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 153973069 G T Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 153973279 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153973388 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153973472 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 153973484 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 153973556 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153973653 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 153973732 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153973854 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153974019 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 153974038 T C Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 153974145 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 153974191 G A N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 153974193 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 153975775 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 153976316 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153976542 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 153976673 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153976698 T A Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 153976843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153977349 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153977581 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153978252 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153978418 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 153978710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153979118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153979126 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153979332 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153980011 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153980296 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153980307 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 153980451 G T Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 153980465 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 153980486 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 153980490 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 153980685 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 153980714 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 153980727 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153980757 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 153981022 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153981168 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 153981564 C T N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 153982166 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153982177 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153982356 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153982484 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 153982532 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 153982713 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153982724 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153982735 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153982827 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 153982945 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153983011 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153983332 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 153983756 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 153986011 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 153986052 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 153986131 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 153986265 A C Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 153986287 G A Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 153986321 T A N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 3 153986357 A T N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 153986504 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 153986521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153986724 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 153986782 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 153987015 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153987674 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 153987676 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153987729 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153987890 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 153987906 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 153987946 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 153988002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153988032 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 153988103 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153988125 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153988289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153988306 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 153988837 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153989351 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 153989782 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 153992737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153992752 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 153992768 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153992791 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153993426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153994226 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.277777777777778 0.5 0.222222222222222 19 17 5 9 4 3 153994820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153996018 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153996150 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 153996172 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153996192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153996511 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 153996929 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 153997119 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 153999679 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 154000710 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154001385 T C N Y 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.2 0.8 0 6 4 1 4 0 3 154002412 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154006518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154007705 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154011050 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154011182 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 154011315 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154011658 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154012602 C A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 154012618 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 154012818 A G N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 154012828 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 154012921 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 154012932 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154012941 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 154013033 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 154013057 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 154013126 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154013258 C T Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 154013320 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 154013340 T C Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 154013462 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154013503 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154013631 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154013636 G T Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 154013728 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 154013742 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 3 154013828 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154014025 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154014054 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154014112 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 154014151 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154014229 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154014329 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154014429 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 154014447 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 154014629 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 154014714 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154014843 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 154015241 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154015445 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154016007 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154016984 A G Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 154017967 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154017999 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154018032 C T Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 154018658 A C Y N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 11 5 3 5 0 3 154018662 C T Y Y 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 3 154019518 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 154021026 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154021359 T G Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154021729 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154022274 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154022510 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154022655 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154022739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154023749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154026170 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154026375 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 154026784 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154027388 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154027592 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154027766 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154027775 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154027777 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154027845 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 154028185 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154028257 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154028841 A T Y N 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 154029427 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 154029496 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154029516 C T Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 154029571 T A Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 154029662 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154029679 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154029810 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154032497 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154033286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154033399 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154034248 T C Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154034258 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154034533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154034622 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154034686 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154034705 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154034744 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154035337 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154035378 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154035398 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154035484 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154035502 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154035575 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154035649 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154035983 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154036372 C T Y Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 154036473 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154036513 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 154036526 G T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 154036553 C A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 154036597 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 154036651 G T Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 154036658 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154036797 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154037080 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154037194 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154037306 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 154037450 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 154037586 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154037602 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154037759 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154037806 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154037874 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154037987 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154038343 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154040450 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 154040665 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 154040915 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154041166 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154041182 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154041416 G C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 154041421 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 154041660 T C Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 3 154041664 G A Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 3 154043879 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 154046192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154049589 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 154049673 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 154049683 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 154050017 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154050373 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 154050515 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 154050566 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 154050694 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 154050763 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 154051065 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154051106 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 154051671 G C Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 154052073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154052101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154052784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154052819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154052883 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154052904 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154052950 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 154052964 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 154052987 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154053032 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 154053169 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 154053186 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154053429 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 154053435 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 154053705 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 154053710 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154053741 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 154053790 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154054028 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154054082 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154054103 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 154054151 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 154054158 C A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 154054851 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154054967 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 154055009 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 154055078 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 154055134 C G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 154055193 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 154055260 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 154055276 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 154055441 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 154055442 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 154055529 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 154055815 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 154055827 A T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 154056117 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 154056124 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 154056171 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 154056176 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154056219 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154056527 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 154056531 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 154056580 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 154056620 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 154056644 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154056943 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 154057400 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 154057475 G C N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 3 154057498 C G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 154057515 T G Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 154057530 G A N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.214285714285714 0.357142857142857 0.428571428571429 11 17 3 5 6 3 154057570 C G Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 154057571 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 154057739 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 154057929 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154058216 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 154058255 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154058286 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154058344 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 154058377 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 154058495 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 154058598 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 154058608 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154058808 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154058817 A T Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 154058905 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154059124 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154059128 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 154059177 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154059433 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154059488 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 154059526 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154059596 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154059608 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 154059722 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154059801 A G Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 154059832 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154059892 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 154059954 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 154060019 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154060057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154060155 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 154060226 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 154060308 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 154060352 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 154060366 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154060409 T A N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 154060646 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154060765 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154060771 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154060793 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 154061500 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154061511 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 154061522 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 154061608 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154061662 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154061712 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 154061728 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154061760 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154061819 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154061849 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154061869 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154061901 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 154061995 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154062042 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154062102 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 154062106 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 154062299 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154062523 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 154062595 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 154062614 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 154062656 G C N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 154062748 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154062931 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154062958 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154062997 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154063032 T G Y N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 154063060 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154063158 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154063184 C T N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 154063486 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 154063509 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154063573 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154063597 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154063598 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154063618 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154063643 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154063649 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154063749 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154063916 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 154064129 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154064318 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154064323 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154064342 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154064388 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 154064407 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154064427 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154064534 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 154064546 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154064580 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 154064605 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 154065150 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154065446 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154065458 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154065500 C G Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 154065604 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154065622 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 154065659 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154065783 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154065826 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154065845 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154065982 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154065991 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154066009 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154066015 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154066108 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154066200 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 154066263 T C N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 16 4 7 2 1 3 154066460 G A Y Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 154066517 C A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 154066539 C T N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 154066554 T A Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 154066651 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154066761 A T Y N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 154066847 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154066876 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 154066961 T G Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154066977 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154066978 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154067000 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154067043 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154067044 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154067162 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154067188 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154067203 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154067316 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154067358 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154067363 G T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154067601 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154067616 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154067649 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154067734 G A Y Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 154067864 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154068009 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154068072 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 154068138 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 154068139 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154068230 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154068420 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154068563 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154068756 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154068811 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154068871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154068886 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154068908 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154068946 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154068965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154069012 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154069014 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 154069034 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154069044 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154069055 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154069066 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154069109 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 154069283 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 154069311 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 154069332 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154069433 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154069463 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154069684 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154069685 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154069700 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154069772 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154069804 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154069917 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154069938 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154070033 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 154070166 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154070388 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154070417 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154070638 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154070658 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154070667 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154070691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154070758 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 154070792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154070862 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 154070951 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154071029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154071049 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154071356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154071377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154071778 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 154071866 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 154071888 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 154071894 T C N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 154072120 C T N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 154072180 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 154072490 A T Y N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 154072552 C A Y N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 154072556 C A Y N 0.25 REF 0.3 0.3 0.25 0.75 0.0714285714285714 0.357142857142857 0.571428571428571 7 21 1 5 8 3 154072590 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 154072798 A G Y Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 154072970 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154073178 T C Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 154073198 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154073596 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154073705 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 154073858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154073874 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154073947 G T Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 154074291 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154074356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154074394 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154074465 A G Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 154074625 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 154074641 A T N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 154075028 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154075438 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 154075445 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 154075471 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154075638 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154075689 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 154075711 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 154075715 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 154075946 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 154076163 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 154076377 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154076553 G A Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 154076672 C G N N 0.15 REF 0.5 0.5 0.15 0.85 0 0.3 0.7 3 17 0 3 7 3 154076685 C G N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 154076717 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 154076726 G A N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 154076835 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 154076847 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 154076950 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 154077022 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 154077040 A G N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 154077069 T G Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 154077164 A G N Y 0.1875 REF 0.6 0.6 0.1875 0.8125 0 0.375 0.625 3 13 0 3 5 3 154077220 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.55 0.55 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 4 14 1 2 6 3 154077297 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 154077345 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 154077355 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 154077375 T G N N 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 3 154079699 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0 0.8 0.2 16 24 0 16 4 3 154079751 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 154079815 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 154079838 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 154079853 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 154080062 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154080309 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 154080448 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154080461 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154080492 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 154080493 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154080508 G T Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 154080531 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154080578 G T N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 154080674 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.3 0.3 0.214285714285714 0.785714285714286 0.0714285714285714 0.285714285714286 0.642857142857143 6 22 1 4 9 3 154080702 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 154080775 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 154080822 T G Y N 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0833333333333333 0.666666666666667 0.25 10 14 1 8 3 3 154081024 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154081040 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 154081092 C T Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 154081369 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 154081390 G A Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 154081423 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154081496 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 154081526 C A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 154081704 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 154081905 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 154082147 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154082162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154082201 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154082205 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154082214 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 154082232 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154082769 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154082789 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 154082808 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154082810 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 154082883 G C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 154082919 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154082929 C A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 154082958 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 154082959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154082976 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 154083020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154083158 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 154083269 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154083293 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154083366 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 154083721 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154083741 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154083770 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154083788 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154083839 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154083987 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154083999 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154084004 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154084139 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154084243 G C N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 154084353 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154084380 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154084397 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154084413 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154084420 T G Y N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 154084431 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154084496 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154084553 G T N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 154084657 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154084759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154084836 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154084921 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 154085122 C T Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 154085126 G T N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 154085188 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 154085195 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154085199 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154085239 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 154085240 C A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 154085360 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 154085410 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154085422 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154086843 C T Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0 0.5 0.5 9 27 0 9 9 3 154086892 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154086906 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154087014 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154087019 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154087077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154087113 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154087261 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154087274 A G Y Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 154087322 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 154087359 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154087370 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154087425 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 154087443 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 154087462 G A Y Y 0.464285714285714 REF 0.3 0.3 0.464285714285714 0.535714285714286 0.285714285714286 0.357142857142857 0.357142857142857 13 15 4 5 5 3 154087531 A C N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.3125 0.25 0.4375 14 18 5 4 7 3 154087757 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 154087761 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 154087782 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154087841 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154087941 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154087993 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 154088138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154088368 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 154088514 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 154088703 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 154088709 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154088714 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 154088768 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 154088825 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 154088856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154088861 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154089243 C A N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.166666666666667 0.555555555555556 0.277777777777778 16 20 3 10 5 3 154089296 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 154089367 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 154089397 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 154089403 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 154089427 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 154089521 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 154089726 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 154089740 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 154089857 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 154089992 G C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 154090016 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 154090084 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 154090480 G T Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 154090583 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 154090760 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 154091026 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 154091199 C A Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 154091213 T A Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 154091231 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154091292 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 154091371 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 154091388 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 154091600 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154091611 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 154091651 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 154091769 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 154091772 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154091793 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 154091807 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 154092066 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154092130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154092178 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 154092226 C T N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.214285714285714 0.571428571428571 0.214285714285714 14 14 3 8 3 3 154092275 C T Y Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.3 0.7 0 13 7 3 7 0 3 154092468 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 154092505 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 154092546 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154092609 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 154092699 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 154092775 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154092856 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 154092864 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154093111 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154093303 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154093358 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 154093974 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154094229 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154094321 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154094495 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154094704 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154095154 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 154095452 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154095536 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154095556 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154095621 T A Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154095691 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154095938 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154095952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154095964 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154095982 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154096020 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 154096046 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154096169 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 154096214 A T Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154096316 T A Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 154096330 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154096372 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154096564 A T Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 154096625 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154096667 C T Y Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 154096770 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 154096806 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154096826 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 154096979 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154096980 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154096998 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154097276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154097345 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154098444 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154098710 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 154098839 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 154099122 C T Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 154099199 T A Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154099261 A T Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154099345 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154099713 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 154100002 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154100104 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154100271 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154100278 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154100348 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154100377 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154100489 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154100531 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154100544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154100714 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 154100732 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 154100854 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154100960 C A Y N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 154100995 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 154101112 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154101148 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 154101150 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154101202 C G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154101208 T G Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154101305 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154101517 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154101738 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 154101774 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154101792 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154101819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154101852 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 154101977 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154102211 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154102681 A G Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154102864 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 154104223 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154104277 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154105122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154106501 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154107602 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154107643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154108124 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154108480 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 154108582 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 154108776 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 154109066 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 154109382 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 154109540 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 154109550 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 154109585 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 154109697 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.1 0.85 0.05 21 19 2 17 1 3 154109702 T C Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.105263157894737 0.842105263157895 0.0526315789473684 20 18 2 16 1 3 154109749 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 154109775 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 154109900 T C Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 154109932 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 154110088 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 154110217 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 154110377 G A Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 154110414 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 154110437 T C Y Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 154110797 G A N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 3 154111093 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154111228 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154111321 G A Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 154111719 T C Y Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 154111740 C T Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 3 154111780 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.105263157894737 0.894736842105263 0 21 17 2 17 0 3 154111815 A G Y Y 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.214285714285714 0.785714285714286 0 17 11 3 11 0 3 154111974 T C Y Y 0.178571428571429 ALT 0.3 0.3 0.821428571428571 0.178571428571429 0.642857142857143 0.357142857142857 0 23 5 9 5 0 3 154111989 A G Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.6 0.4 0 24 6 9 6 0 3 154111999 A G Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 154115284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154115334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154117003 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154117005 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 154117014 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154117026 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0 0.526315789473684 0.473684210526316 10 28 0 10 9 3 154117132 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 154117173 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 154117264 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154117278 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 10 26 0 10 8 3 154117316 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 154117366 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 154117368 A T N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 154117393 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 154117475 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 154117623 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 154117640 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 154117720 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154117732 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154117883 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 154117933 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 154118073 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 154118235 G T Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 154118323 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 154118364 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154118380 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 154118390 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 154118393 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 154118460 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 154118611 C T N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 154118812 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 154118839 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 154118999 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154119070 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154119073 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 154119082 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 154119121 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 154119176 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 154119210 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 154119228 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154119246 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 154119265 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154119269 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154119286 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154119419 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 154119457 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 154119556 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 154119607 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154119613 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 154119643 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 154119650 G A Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 154119671 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 154119828 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154119901 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154119909 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 154119997 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 154120288 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 154120292 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 154120362 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 154120372 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 154120397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154120476 G T N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 154120504 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 154120600 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 154120611 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 154120619 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154120680 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154120684 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 154120694 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 154120739 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154120745 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154120765 A T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154120928 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 154120947 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 154121005 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 154121096 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 154121637 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154121954 G A N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 154122039 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.7 0.7 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 10 2 4 2 0 3 154122044 G A N Y 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 3 154122133 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 154122157 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154122357 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 154122458 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 154122661 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154122713 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154122714 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154122795 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 154122796 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154122873 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 154122902 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 154122970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154123100 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154123285 G C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 154123388 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 154123590 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 154123668 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154123696 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154123781 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 154123843 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 154123897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154124208 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 154124253 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154124310 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 154124395 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 154124508 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154124885 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154124928 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154125148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154125547 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154125638 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154125666 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154125688 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154125931 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154126079 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154126083 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 154126128 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 154126732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154127150 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 154127834 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154127839 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 154127980 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 154128018 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 154128097 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154128162 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 154128204 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 154128275 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 154128317 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 154128320 A T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 154128405 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 154128491 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154128535 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 154128570 T G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 154128614 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 154128615 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 154128646 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 154128664 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 154128818 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154129223 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 154129230 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 154129245 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 154129278 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 154129469 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 154129568 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154129795 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 154129854 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 154130495 G A Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 154130703 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154130773 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154130783 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 154131533 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 154131641 C T Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 154132867 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154132972 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 154133063 G A N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 154133176 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 154133218 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 154133256 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154133363 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 154133400 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154133532 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 154133703 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 154133834 T G N N 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.3 0.7 0 13 7 3 7 0 3 154134397 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 154134541 A G N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0 0.75 0.25 9 15 0 9 3 3 154134620 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 154134873 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154135368 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154135434 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154137033 A C Y N 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 3 15 1 1 7 3 154137038 C A Y N 0.423076923076923 REF 0.35 0.35 0.423076923076923 0.576923076923077 0.0769230769230769 0.692307692307692 0.230769230769231 11 15 1 9 3 3 154137445 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 154137450 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 154137527 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 154137667 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 154138494 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154138852 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 154138940 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154138951 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154139044 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 154139055 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 154139163 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 154139204 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 154139316 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154140093 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 154140244 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 154140546 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 154140647 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154140659 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154140668 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 154140675 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154141095 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154141204 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154141322 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154141478 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154141709 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 154141749 A C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 154141812 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154141873 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 154141879 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154141926 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 154141927 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154141939 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154142235 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0 0.473684210526316 0.526315789473684 9 29 0 9 10 3 154142343 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154142369 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154142435 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154142438 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154142451 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154142487 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 154142488 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154142507 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154142508 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154142558 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 154142696 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154142790 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154143514 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154144354 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154144487 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154144589 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 154144596 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 154144640 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 154144942 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 154145001 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 154145002 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 154145038 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 154145325 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154145379 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154145560 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 154145641 T G N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 154145644 C T N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 154145742 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 154145841 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 154145918 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 154146197 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 154146300 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154146312 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 154146313 T A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 154146409 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 154146461 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 154146487 C A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 154146558 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 154146735 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154146774 A C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 154146791 C A N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 154146792 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 154146976 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 154147083 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 154147216 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 154147264 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 154147411 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 154147880 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154147893 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 154148261 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 154148342 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 154148471 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154149067 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 154149082 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 154149165 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 154149290 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154149318 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 154149329 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 154149386 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154149390 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154149567 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154150289 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 154150330 G C Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 154150509 G A Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 154150787 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 154151154 C A Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 154151391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154153114 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154153230 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154154443 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154155099 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 154157217 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154158243 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 154159367 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154166066 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154166650 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 154166704 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154166750 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154166834 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 154166893 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154166927 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 154167006 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 154167026 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 154167189 A G Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 154167360 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 154168783 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154168894 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 154169389 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154169468 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154169798 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 154169823 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 154169933 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 154169967 A G Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 154170221 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 154170278 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154170299 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154170371 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154170426 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154170449 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154171066 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 154171359 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154171383 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154171993 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154172108 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154172332 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 154172363 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154172658 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154172680 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154172694 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154172711 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 154172778 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 154172874 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 154173232 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154173797 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 154174361 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154175084 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 154176201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154176228 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154176542 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154176543 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 154176650 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154176811 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154176846 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 154177149 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 154177177 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154177200 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154177230 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154177252 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 154177402 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154177575 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154178234 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154178841 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154179195 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154179788 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 154180158 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 154180567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154180954 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154180975 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154181067 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154181177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154181543 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154181629 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 154181745 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154181873 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154182293 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154183730 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154183839 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154183877 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 154184020 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154184988 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154185138 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154185320 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 154186036 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154186177 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154186226 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154186238 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154186245 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154186273 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154186388 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154186401 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 154186408 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154186425 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154186451 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154186695 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154186792 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154187378 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154187565 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154187567 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154187642 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154187670 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154188203 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 154188207 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 154188217 T A N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 154188269 A G N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 154188397 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 154188398 A G N Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 154188517 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 154188538 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 154188569 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154188609 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 154188674 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 154188675 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 154188775 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 154188781 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154188816 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154188834 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154188849 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154189249 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 154189296 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154189342 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154189539 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 154189620 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154189621 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154189649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154189731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154189818 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154189926 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154190006 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 154190019 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 154190020 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 154190078 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 154190208 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 154190212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154190237 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 154190247 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 154190348 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154190431 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154190446 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154190454 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154190500 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154190538 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154190580 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154190734 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 154190751 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 154190757 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 154190771 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154190828 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154190842 G A Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154190975 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154191128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154191208 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154191269 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 154191324 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154191387 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 154191417 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154191622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154192362 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 154193074 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154193662 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 154193863 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154193942 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154194025 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 154194150 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154194513 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154194603 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 154194768 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 154194872 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 154194898 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 154194940 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 154194946 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154195026 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 154195063 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 154195078 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 154195182 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 154195254 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 154195311 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 154195382 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 154195417 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154195439 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 154195442 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 154195753 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 154195761 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 154195802 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154195857 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 154195967 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 154196225 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 154196818 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 154197195 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 154197235 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154197396 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154197444 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 154197511 C T Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 154197514 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154197564 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154197579 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 154197667 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 154197849 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 154198726 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154199330 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154202169 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 154202205 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 154202870 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154203310 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154203913 T G N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 154203939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154203976 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154204035 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 154204576 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 154204673 A G Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 154204696 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 154204813 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 154204909 T A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 154204947 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 154205474 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 154205557 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154205739 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 154205762 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 154205782 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154205807 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 154205863 G T N N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 154205864 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 154205948 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 154206024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154206063 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 154206129 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154206202 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 154206363 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154206376 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 154206437 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 154206525 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154206581 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154206587 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154206609 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 154206647 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154206665 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 154206765 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154206783 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154206809 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 154206822 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154206842 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154207609 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 154207860 T C N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 154207873 C A N N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 154208051 A T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 154208062 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 154208121 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 154208122 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154208156 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 154208201 A C N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 154208212 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 154208221 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 154208463 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154208559 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 154208637 G C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 154208675 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154208709 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 154208823 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154208865 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 154208894 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154208915 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154209389 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154209784 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154209813 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154209828 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 154210058 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154210253 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154210339 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 154210359 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 154210753 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 154210807 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 154211317 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154211409 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154213806 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154214049 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 154214331 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 154214538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154215738 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154215775 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154215873 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154216059 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154216483 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 154216658 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154217706 T G N N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 154217723 A C N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 154217725 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 154218013 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154218057 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 154218824 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 154218840 G A Y Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 154218872 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154219075 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 154219424 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 154219700 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 154219716 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 154219849 A G Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 154219853 A G Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 154220083 G T Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 154220126 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 154220133 A T Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 154220224 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 154220226 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 154220352 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 154220396 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 154220845 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154221150 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 154221183 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 154221387 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154221576 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 154221597 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 154221682 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154221739 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 154221747 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 154221769 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 154222163 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 154222960 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154223135 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 154224095 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 154224137 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154224175 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154224180 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 154224501 G A N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 154224530 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 154224617 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 154224625 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 154224642 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 154224749 G T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 154224887 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 154224902 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 154225026 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 154225027 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 154225050 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 154225419 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 154225464 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154225478 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.263157894736842 0.526315789473684 0.210526315789474 20 18 5 10 4 3 154225492 G C N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 154225493 T G N N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 154225711 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154225751 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154225869 T G Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 154225887 C A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 154226089 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 154226091 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154226699 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 154226797 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 154227731 T C Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 154227764 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 154227839 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 154227947 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154228058 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 154228341 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 154229256 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154229321 T G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 154229345 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 154229591 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 154229635 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 154229726 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 154229809 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 154229813 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 154229838 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 154229960 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 154231660 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 154231800 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 154232004 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 154232093 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154232094 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 154232952 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 154233476 C A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 154233592 A G Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 154234360 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154234661 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154234730 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154235534 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 154235577 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 154235578 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154235637 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 154235738 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 154235883 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 154236010 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 154236044 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 154236144 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154236156 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154236172 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154236198 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154236308 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154236347 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 154236600 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 154237057 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 154237085 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154237126 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 154237175 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 154237197 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154237476 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 154237505 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154237532 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154237544 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 154238140 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154238426 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 154238441 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154238484 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154238521 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154238532 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 154238627 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154238866 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 154238981 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154239189 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154239331 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 154239358 G C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 154239401 T G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.647058823529412 0.117647058823529 0.235294117647059 24 10 11 2 4 3 154239502 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154239840 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154240534 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154241816 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.2 0.05 0.75 9 31 4 1 15 3 154242442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154242636 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154242646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154243292 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154247364 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154248165 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154248188 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154248475 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154248581 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154250398 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154250410 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154250565 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154250598 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 154250691 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154250835 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 154250927 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 154250930 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154250939 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 154251154 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154251177 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 154251184 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154251286 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 154251330 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154251446 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154251453 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154251489 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154251640 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154251684 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154251716 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 154252031 A C Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 154252124 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 154252286 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154252941 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 154253053 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154253063 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154253161 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154253434 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154253677 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154253781 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154253795 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 154254808 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 154257234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154258282 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154259012 T G N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 154259748 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154260148 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154260437 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154262670 G A N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 154262715 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 154262720 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 154262738 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154262800 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 154262902 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154263124 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 154264162 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.3125 0.625 0.0625 20 12 5 10 1 3 154264237 C T N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 154264273 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 154264449 G A N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 154264632 A C N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 154264633 G C N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 154264672 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 154264733 C A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 154264917 T C N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 3 154264934 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 154264950 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 154265123 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 154265219 G T N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 154265288 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 154265383 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 154265389 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 154265461 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 154265678 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 154265813 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 154265849 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 154267997 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 154268884 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154269953 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154270964 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154273744 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154275049 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154275693 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 154277571 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154278208 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154278606 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154280419 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154280630 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 154280715 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 154280824 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154281100 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154282421 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 154282570 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 154286303 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154288153 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154288539 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154289041 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 154289226 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154289255 C A Y N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 154289351 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154289425 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 154289464 T C Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 154289591 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154289636 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154291234 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 154291799 A C Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 154292521 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154292600 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154292631 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154294450 T A Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 154295826 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 154296870 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 154297106 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 154297564 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 154299744 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154299971 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154310438 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 154310618 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 154310742 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 154310795 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 154312068 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154313118 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154313181 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154313679 A G Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 154314366 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0 0.944444444444444 0.0555555555555556 17 19 0 17 1 3 154314747 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 154315209 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 154316891 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154320303 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 154320954 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154320959 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154321751 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154321818 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 154321821 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154322046 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154322839 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154323059 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 154323131 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 154323348 G C Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 154323776 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 154323966 C G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 154324284 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 154324308 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 154324314 A C Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 154324347 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 154324353 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 154324721 C A Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 154324724 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 154325451 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154326096 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 154326120 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 154326169 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 154326236 G C Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 154326367 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154326417 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154326440 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 154326489 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 154326505 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154326653 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154326745 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154326906 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 154326993 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 154327019 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 154327206 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154327272 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154327341 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154327358 G A Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 154327467 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 154327538 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154327861 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154327915 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 154327963 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154328070 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154328450 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154328494 G C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154328641 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154328665 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154328678 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154328875 C A Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154328935 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154328991 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154329112 A G Y Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 154329114 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 154329147 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 154329316 C T Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 154329492 C G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 154329951 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 154330104 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 154330123 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 154330213 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154330286 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154330346 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154330454 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154330456 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154330745 T A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 154330811 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154330884 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 154330895 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 154330918 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 154331107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154331140 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 154331220 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 154331358 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 154331391 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 154331420 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 154331501 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 154331949 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154331961 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154332057 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 154332197 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 154332290 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154332610 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154332715 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154332728 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154332786 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154332812 C A Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 154334083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154334444 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154335625 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154336495 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154336714 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154336831 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154337821 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 154339441 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 154339951 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154340260 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154340517 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154340661 C T Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 154340957 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154340966 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 154341524 C A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 154341535 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 154341567 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154341699 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154341820 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154341919 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154342105 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154342610 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154342667 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154342735 C G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 154343262 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154343393 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154343592 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154343722 A C N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 154344287 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 154344316 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154344990 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154345087 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154345132 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154345142 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154345177 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154345202 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154345209 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154345264 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154345289 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154345327 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154345402 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154345457 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154345662 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154346411 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154346524 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154346543 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154346807 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 154346820 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154346903 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154347087 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 154347098 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154347179 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154347237 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154347384 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154347580 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154347619 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154347753 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 154347948 G C N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 154347950 C A N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.0769230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 9 17 1 7 5 3 154347972 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 154348021 C T N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.0909090909090909 0.545454545454545 0.363636363636364 8 14 1 6 4 3 154348534 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154348879 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154348920 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154349064 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154349366 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 154349546 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 154349601 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 154349623 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154349754 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 154349787 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 154349887 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 154350167 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 154350185 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 154350198 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154350246 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154350380 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154350381 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154350499 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 154350508 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 154350573 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 154350912 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 154351063 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 154351415 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 154351570 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 154351910 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154352326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154352821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154352863 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 154353241 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154353479 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 154353540 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154354201 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154354318 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 154354341 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 154354447 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154354459 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 154354559 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154354564 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154354587 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 154354673 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 154354686 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 154354773 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 154354801 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154354854 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 154354892 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 154355689 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154355764 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 154355877 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154356007 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154356042 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 154356734 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154356793 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154357014 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154359045 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 154359163 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 154359255 C T Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154360144 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154360183 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154360581 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 154360889 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 154361398 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 154361473 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154361486 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 154361494 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 154361594 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154361717 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154361718 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154361816 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 154362161 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154362441 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 154362453 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 154362554 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 154362699 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 154362720 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 154362732 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 154362974 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154363321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154364278 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154364419 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154365586 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154365989 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 154366216 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154366392 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 154366974 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154367580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154367592 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154368585 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154369400 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154369526 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154369652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154370325 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154370487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154370490 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154370960 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 154371062 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154371285 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154371486 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 154371545 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 154371801 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154371829 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 154371998 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 154372015 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154372069 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154372218 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 154372380 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 154372401 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 154372445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154372510 G T N N 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 154372736 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154372743 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154372969 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154373224 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 154373275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154373332 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 154373375 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154373385 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 154373520 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 154373525 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 154373606 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 154373703 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 154373720 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154373812 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 154374001 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154374146 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154374157 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154374203 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154374212 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154374238 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154374429 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154374488 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154374526 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 154374611 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154374623 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154374710 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 154374747 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154374820 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154374870 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 154374874 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154375139 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 154375143 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 154375290 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 154375313 A T Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.222222222222222 0.722222222222222 0.0555555555555556 21 15 4 13 1 3 154375440 T C N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 154375491 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 154375605 G A Y Y 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 7 9 1 5 2 3 154375626 C T N Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.142857142857143 0.714285714285714 0.142857142857143 7 7 1 5 1 3 154375674 A C N N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 154376320 G T Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 154376464 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154377075 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154377138 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 154377209 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 154377489 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154377676 C A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 154378190 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 154378204 T A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 154378422 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154378468 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 154378536 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154378616 G C Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 154378739 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154378797 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154378842 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154378921 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154379049 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 154379451 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154379529 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154379543 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 154379928 C T N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 154379956 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154381241 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 154381511 A C N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.533333333333333 0.4 0.0666666666666667 22 8 8 6 1 3 154381524 A G N Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.571428571428571 0.357142857142857 0.0714285714285714 21 7 8 5 1 3 154381885 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 154382132 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 154382998 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154383281 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 154383636 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154383832 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 154383865 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 154384102 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154384290 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 154384313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154384459 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154384848 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154384918 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 154384932 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 154385070 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 154385097 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 154385279 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 154385456 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 154385463 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 154385669 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 154385758 A T Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 154385950 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 154386034 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 154386200 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154386287 A C Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 154386332 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154386440 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154386560 C G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 154386576 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 154386627 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 154386650 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 154386670 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 154386686 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154386813 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 154387289 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154387789 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 154387810 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 154387848 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 154387944 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154387959 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154388024 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 154388049 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 154388330 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154388402 G A Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 154388473 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 154388504 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 154388516 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154388548 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 154388585 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 154388610 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 154388657 G T N N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 18 12 6 6 3 3 154388910 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154389051 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154389057 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 154389092 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154389095 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154389164 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154389176 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154389182 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154389274 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 154389339 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 154389396 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 154389469 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 154389736 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 154389753 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 154389908 C A N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 154389931 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 154389945 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 154389968 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 154389993 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 154390141 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154390145 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 154390197 C T N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 154390282 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 154390304 C G Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 154390315 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 154390558 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 154390577 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154390585 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154390618 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 154390691 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154390758 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154391139 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154391157 G C Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 154391694 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 154391843 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154391928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154391999 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154392015 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154392059 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154392138 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154392890 C A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 154392962 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154393238 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 154393286 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 154393306 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154393310 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154393338 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154393353 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 154393365 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154393450 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154393460 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154393533 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154394065 A C N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 154394117 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154394142 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 154394170 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154394203 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154394283 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154394427 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154394927 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154394949 G A Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154394971 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154395265 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154395334 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 154395340 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154395458 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154395501 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154395522 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 154395674 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154395933 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 154396826 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154397804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154398254 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154398256 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154398276 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154398432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154398459 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154398803 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154398886 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154399345 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154400473 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154400799 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 154400820 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154400863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154400968 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 154400996 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154401027 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154401086 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 154401714 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154401888 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154401967 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154402029 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154402038 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 154402338 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154404652 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154404783 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 154405072 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 154405381 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154405701 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154406076 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154406132 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154406197 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154406288 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 154406513 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154406547 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154406637 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154406678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154406697 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154406722 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154406724 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154407633 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 154407639 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154407665 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 154407735 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 154407886 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 154407957 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 154408187 T C Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 154408211 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 154408307 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154408461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154408516 C G Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 154408549 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 154408624 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154408664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154408702 G C N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 154408703 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 154408873 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 154408996 A G Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 154409117 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 154409155 A T Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 154409159 C T Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 154409255 A C Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 154409282 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154409297 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 154409306 G A Y Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 154409383 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 154409404 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 154409608 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 154409612 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 154409680 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 154409796 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154409808 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 154409841 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 154410052 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 154410205 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154410703 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 154410704 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 154410733 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154410769 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154410808 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 154410920 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 154411054 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 154411177 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 154411199 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 154411325 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 154411344 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154411420 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 154411609 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154412225 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154412259 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154412375 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154412835 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154413457 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 154413765 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154416163 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154416250 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154416603 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154416965 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154417380 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154417405 A T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154417468 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154418550 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154418618 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 154418624 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154418662 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 154418807 G T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 154418814 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 154418931 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154419197 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154419338 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 154419769 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154420159 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 154420200 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 154420213 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 154420215 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 154420278 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154420286 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 154420296 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 154420354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154420427 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154420514 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154420535 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154420543 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154420787 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154420807 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154421036 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154421662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154421722 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154421904 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 154422624 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154422645 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154423010 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154423035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154423061 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154423249 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154423268 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154423989 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154424009 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154424036 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154424155 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154424235 A T Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 154426158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154426788 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154427216 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154427323 C A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 154427345 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 154427352 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154428231 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154428809 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154428831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154428989 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 154430432 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154430898 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154430992 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 154431011 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154431184 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154431321 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154432034 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154432273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154432424 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154432919 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 154433046 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154433116 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154433252 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154433480 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 154433483 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 154433883 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154434270 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 154434297 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154434845 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154435226 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154437180 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 154439929 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154440247 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 154440269 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 154440481 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154440496 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154440529 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154440556 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154440603 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 154440780 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 154440908 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154441035 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154441045 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154441115 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154441432 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154441678 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154442113 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154442809 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154443111 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 154443112 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 154444570 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154444983 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154445883 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 154446238 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154446242 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154448920 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 154449080 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154449249 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154449257 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154449287 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154449337 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 154449338 T A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 154449380 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 154449385 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154449558 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 154449579 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 154450431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154451802 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154452024 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154453442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154453553 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 154453659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154453874 C A Y N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 154453947 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 154453975 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 154453991 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 154454255 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 154454444 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 154454467 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154454535 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154454565 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154454616 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154454627 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154454628 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 154454674 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 154454768 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154454864 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 154455215 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 154455216 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154455241 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 154455273 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154455920 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154455922 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154455939 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 154455941 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 154455972 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154456039 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154456050 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154456089 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154456236 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 154456244 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 154456327 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154456338 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154456339 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 154456565 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154456835 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154456840 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154457069 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154457087 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154457207 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154457218 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 154457245 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154457408 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154457449 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154457601 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154457801 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154457805 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154457936 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154458082 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 154458203 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 154458422 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 154458539 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 154458701 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 154458720 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 154458728 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154458843 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 154458856 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154458875 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154459039 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 154459233 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154459545 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154459808 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154460334 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 154460497 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154460527 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154460540 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 154460617 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154460845 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 154460874 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 154460887 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 154461614 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 154461869 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154462309 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154462612 T A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 154462627 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 154462656 A T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 154462658 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 154462670 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 154462809 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 154463004 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 154463135 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154463388 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154463400 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 154463442 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 154463447 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 154464002 G A N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 154464033 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 154464193 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154464207 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 154464252 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 154464307 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 154464336 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 154464439 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 154464453 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 154464487 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154464536 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 154464725 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154466470 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154468614 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154468694 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154468746 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154468928 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154469477 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154469560 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154470642 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154470933 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 154471358 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 154471457 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 154471541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154471561 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 154471643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154471791 G T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 154471817 G A Y Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 154471818 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154471910 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154471994 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 154472017 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 154472018 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 154472141 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 154472145 A G Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 154472154 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 154472163 C G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 154472189 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 154472256 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154472467 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154472682 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 154474043 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154474078 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 154474114 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154474443 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154475963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154476001 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154476045 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154476151 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154476220 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 154476360 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154476486 C T N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 154476489 A G N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 154476701 T A Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 154476778 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154477468 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154477497 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154477569 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154477603 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154477604 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154477679 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154477755 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 154478142 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 154478169 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 154478456 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154479516 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 154481417 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 154481426 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 154481444 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 154481455 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 154481812 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 154481972 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 154481998 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 154482036 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 154482108 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 154482176 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 154482449 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154482667 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 154483028 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154483077 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154483316 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154483392 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 154483415 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 154483423 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 154483430 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 154483449 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 154483468 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 154483498 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 154483651 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154483686 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 154483717 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 154483821 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 154483974 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 154483975 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 154484093 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 154484374 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 154484435 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 154484446 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154484503 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 154484685 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154484690 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154485215 G A N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.266666666666667 0.6 0.133333333333333 17 13 4 9 2 3 154485253 G T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 154485293 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 154485302 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 154485376 G T N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.4 0.466666666666667 0.133333333333333 19 11 6 7 2 3 154485563 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 154485566 C A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 154485616 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 154485888 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 154485928 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 154485936 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 154485952 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 154485979 T A Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 154485981 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 154486376 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 154487861 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154488182 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 154488325 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 154488673 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 154489045 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 154489202 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 154489529 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 154489567 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 154489730 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 154492092 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154492160 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 154492282 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 154492287 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 154492652 C A Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 154492758 C T Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 154492769 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 154493258 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 154493703 T G Y N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 154493749 C T Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 154494017 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 154494197 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 154494728 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 154494740 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 154494891 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 154494894 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 154495009 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 154495109 G T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 154495306 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154495392 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154495592 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 154495829 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154496424 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 154496575 T G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 154496582 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 154497085 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154497153 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154497184 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 154497201 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 154497319 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154497325 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 154497762 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 154497922 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 154497937 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 154498297 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.15 0.55 0.3 17 23 3 11 6 3 154498515 G C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 154498546 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 154498657 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 154498876 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154498984 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 154499034 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 154499090 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 154499107 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 154499258 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 154499265 A G Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 154499336 A T Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 154499390 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154499493 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154499573 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.157894736842105 0.526315789473684 0.315789473684211 16 22 3 10 6 3 154499617 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154499638 T C Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 154499667 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 154499712 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 154499716 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 154499857 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 154499923 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 154500048 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 154500166 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 154500432 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 154500597 G A Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.45 0.45 0.1 27 13 9 9 2 3 154500627 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 154501715 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 154501730 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 154501968 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 154502016 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 154502098 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 154502119 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 154502164 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154502257 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 154502385 T G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 154502409 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 154502429 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 154502484 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 154502523 A C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 154502620 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154502653 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 154502655 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 154502733 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 154502778 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 154503015 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154503153 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 154503310 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154503325 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154503399 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 154503429 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 154503471 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 154503520 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 154503698 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154503947 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 154504328 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 154504643 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 154504714 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154504772 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 154504811 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 154504814 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 154504828 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 154504841 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 154504863 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 154504877 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 154504995 A T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 154505068 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 154505215 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 154505422 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 154505632 G A Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 154505782 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 154505955 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 154506394 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 154506424 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 154506442 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 154506447 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 154506469 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 154506583 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 154506597 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 154506667 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 154506722 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 154506795 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154506807 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 154507216 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154508007 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154510580 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154511416 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154511720 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154511742 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154512667 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 154513001 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154513036 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 154513059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154513077 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 154513160 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154513181 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.2 0.65 0.15 21 19 4 13 3 3 154513269 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 154513508 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 154513514 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 154513647 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 154513651 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 154514313 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154514344 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 154514480 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 154514809 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154516026 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154516634 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 154516670 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 154516830 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 154517014 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154517126 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154517130 T G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 154517141 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154517199 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 154517221 C G N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 154517460 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 154517486 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 154517517 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 154517650 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 154517720 G C N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 3 154517763 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 154517804 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 154518253 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154518315 G C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 154518349 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154518428 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 154518528 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 154518545 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 154518563 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154518583 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 154518665 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 154519285 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154519733 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 154520039 A C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 154520047 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154520132 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 154520307 C G N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 154520314 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 154520355 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0 0.357142857142857 0.642857142857143 5 23 0 5 9 3 154520654 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 154520750 C T N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 154520771 G A N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 154520793 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 154520851 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 154521185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154521199 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154521260 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154521304 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 154521377 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 154521459 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154521655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154521673 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154521698 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154521706 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154521714 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154521767 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154521800 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154521815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154521826 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154521871 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154521908 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154521918 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154522035 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 154522099 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154522175 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154522419 C A N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 154522596 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 154522601 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 154522643 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154522687 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154522737 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154522891 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154522918 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154523502 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 154523534 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 154524147 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154524241 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154524489 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154525845 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154526425 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154526473 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154526677 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154526708 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154527586 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 154527668 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154527715 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154528086 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154528437 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154528439 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154530362 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154530592 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154531446 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154531450 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154532167 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 154532240 G C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154532324 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 154532659 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 154532855 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 154533154 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154534406 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154534449 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154534759 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 154534808 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154534943 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 154535006 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154535089 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154535148 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154535522 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154535712 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154535731 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154535995 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154536026 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154536042 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 154536085 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154536086 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154536096 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154536107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154536115 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 154536157 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154536262 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154536569 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154537134 G C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 154537183 A C N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 154537196 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 154537202 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 154537225 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 154537249 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 154537313 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 154537359 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 154537387 C A Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.5 0.444444444444444 0.0555555555555556 26 10 9 8 1 3 154537391 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154537446 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 154537463 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 154537480 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154537539 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 154537547 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 154537560 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 154537600 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 154537768 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 154537769 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 154537786 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 154537851 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 154537857 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 154538002 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 154538155 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154538377 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 154538382 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 154538394 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 154538402 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 154538439 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 154538480 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154538483 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154538599 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154538802 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 154538964 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 154538979 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 154539053 T A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 154539060 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 154539077 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 154539131 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 154539135 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 154539147 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 154539157 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 154539216 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154539236 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 154539265 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 154539325 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154539358 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 154539453 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 154539513 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 154539578 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 154539579 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 154539633 C A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 154539886 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 154539897 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 154539918 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 154540238 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 154540620 T A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 154540701 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 154540989 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 154541055 G T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 154541151 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154541515 A C Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 154541684 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 154541689 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 154541716 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154541743 T G Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 154541746 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 154541765 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 154541780 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 154541878 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 154541884 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 154541902 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 154541908 G T N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 154541973 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 154542013 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 154542031 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 154542073 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154542448 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 154542536 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 154542537 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154542571 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 154542573 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 154542644 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 154542772 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 154542785 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154542855 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.210526315789474 0.578947368421053 0.210526315789474 19 19 4 11 4 3 154543057 A G Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 154543219 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 154543226 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 154543302 C T Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.529411764705882 0.294117647058824 0.176470588235294 23 11 9 5 3 3 154543336 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 154543337 A T N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 154543359 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154543401 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 154543740 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154543773 C G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 154543863 A G Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 154543895 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 154543915 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 154543926 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 154543941 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154544005 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154544429 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 154544660 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154544686 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154544727 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 154544773 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 154544982 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 154545021 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154545129 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154545163 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 154545237 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154545271 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 154545369 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 154545425 A C N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 154545569 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154545621 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 154545771 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 154545878 A C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154545926 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 154546052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154546185 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154546442 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154546444 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154546896 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 154546948 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154546992 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 154547011 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 154547085 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154547201 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154547246 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 154547340 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154547360 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154547467 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 154547484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154547693 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 154547953 C T Y Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.75 0.125 0.125 13 3 6 1 1 3 154548029 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 154548094 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 154548191 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154548354 G A Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 154548382 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 154548604 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154548618 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 154548629 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154548662 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 154548735 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154548739 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 154548932 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 154549058 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 154549107 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 154549183 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 154549281 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 154549368 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 154549590 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154549607 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154549754 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 154549757 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154549817 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154549900 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154549927 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154549966 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154550028 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 154550032 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154550127 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154550206 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154550223 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 154550241 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154550455 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 154550478 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154550483 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154550519 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154550525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154550536 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154550582 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154550653 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154550809 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 154550855 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154550975 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 154550981 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 154551045 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154551128 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 154551136 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154551201 A C Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 154551227 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 154551246 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154551264 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 154551473 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154551758 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 154551801 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154551833 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 154551868 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 154551940 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 154551945 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 154551998 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 154552024 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 154552135 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154552168 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 154552239 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154552250 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154552271 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154552326 C T N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 154552586 A T N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 154552738 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 154552909 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 154552935 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154553033 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154553125 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154553163 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 154553466 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 154553506 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154553516 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 154553556 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 154553681 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 154553709 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 154553747 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 154553799 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 154553807 T A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 154553819 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 154553891 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 154553949 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 154553951 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154553999 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 154554258 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154554320 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 154554392 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 154554471 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 154554508 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 154554596 C G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 154554639 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154554740 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 154554763 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 154554928 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 154555009 C T N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 154555119 A G N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 154555312 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154555315 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154555685 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 154555897 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 154557231 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154559087 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 154559378 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 154559398 A T N N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 154559586 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 154559595 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154559619 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 154559856 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154559874 T A Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 154559883 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 154559891 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 154560103 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 154560330 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 154560445 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 154560498 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 154560589 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 154560621 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 154560625 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 154560666 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 154560671 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 154560709 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 154560720 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 154560756 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154560777 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 154560787 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 154560861 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 154560873 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154560962 T A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 154561026 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 154561058 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 154561108 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 154561147 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 154561282 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 154561321 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 154561324 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 154561342 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 154561547 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 154561611 C A N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 154561624 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 154561639 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 154561688 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 154561737 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154561745 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 154561804 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 154561825 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 154561869 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 154561947 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 154562214 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 154562229 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 154562230 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 154562249 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 154562318 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 154562345 G C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 154563317 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154563977 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 154564004 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 154564064 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 154564074 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 154564075 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 154564308 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 154564937 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154565549 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154565551 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 154565712 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 154565823 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 154566168 C G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 154566559 A T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 154567055 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 154567241 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154567316 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154567365 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154567467 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154567502 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154567519 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 154567564 C T N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 154567575 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 154567889 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154567926 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154567956 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 154568041 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154568044 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154568251 C G N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 154568333 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.55 0.55 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 15 3 6 3 0 3 154568355 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 13 5 5 3 1 3 154568481 T C N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 154568518 G A N Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 154568717 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 154568993 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154569367 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 154569818 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 154569854 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154569864 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 154569941 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154569979 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154570067 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154570172 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154570395 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154570450 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154570547 C A Y N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 154570740 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154570920 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154571293 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154571581 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154572188 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154572418 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154573409 C A N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 154573515 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 154573673 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 154574630 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154574671 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154575568 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 154575905 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154576138 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154576636 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 154577040 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 154577180 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 154577266 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154577324 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 154577526 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154577557 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 154577572 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 154577649 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 154577697 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154577848 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154578182 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 154578234 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154578235 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 154578291 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 154578349 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 154578424 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154578501 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 154578530 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 154580641 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154580684 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 154580693 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154580962 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 154581011 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 154581127 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 154581141 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 154581240 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 154581271 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 154581280 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 154581304 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 154581350 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 154581424 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 154581539 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 154581560 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 154581587 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 154582177 A G Y Y 0.5 ALT 0.85 0.85 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 3 3 1 1 1 3 154583118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154583303 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 154583404 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154584344 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154584481 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154585345 T A N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 16 16 4 8 4 3 154586474 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154586803 A C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 154587485 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154587563 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154588730 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 154588812 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 154588815 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 154589089 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 154589123 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 154589347 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154589490 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 154590014 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154590029 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 154590037 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154590329 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 154590353 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154590504 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 154590974 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154591014 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 154591039 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154591313 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 154591416 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154591554 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 154591621 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154591705 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 154591771 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 154592468 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154592476 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154593334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154593365 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154594028 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 154596026 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 154596873 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 154597106 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154597128 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 154597130 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 154597283 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 154597363 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 154597574 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 154597627 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154597668 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154597669 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154597725 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154597774 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154597822 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154597914 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 154597974 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 154598015 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154598116 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154598160 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154598183 G C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 154598360 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 154598444 A C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 154598462 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154598493 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 154598539 T A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 154598587 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 154598588 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 154598610 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154598611 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 154598670 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 154598722 G C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 154598803 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 154598837 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154598861 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154598862 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154598876 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 154598999 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154599190 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 154599229 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 154599245 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 154599277 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 154599318 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154599631 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 154599772 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 154599783 C T N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 154599790 A G N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 154599920 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154599987 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 154600033 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154600048 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 154600205 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154600251 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154600417 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154600736 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 154600778 A C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 154600787 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 154601354 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154601674 A G Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 154602523 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154602819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154603441 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154603488 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154603786 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154603823 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154603914 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154604817 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 154604967 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154608045 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.444444444444444 0.222222222222222 0.333333333333333 20 16 8 4 6 3 154608198 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 154608529 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 154608700 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 154609099 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 154609393 T A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 154609469 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 154609491 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154610138 C G Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 154610139 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 154610247 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 154610250 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 154610285 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 154610900 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154610911 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154610993 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154611061 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154611069 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154611077 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154611118 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154611155 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154611174 C G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154611175 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154611229 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154611238 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154611246 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154611270 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154611313 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 154611322 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 154611420 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154611433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154611530 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154611538 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154611660 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154611674 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154611709 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 154611721 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 154611735 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 154611879 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154611949 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154612080 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154612095 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154612130 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154612380 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154612431 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154612558 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154612661 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 154612770 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 154612856 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 154612863 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154612928 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154612944 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 154613029 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 154613184 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 154613509 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 154613892 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 154613959 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154614056 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 154614207 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 154614359 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 154614387 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 154614444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154615136 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154615198 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154615206 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154615320 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.210526315789474 0.526315789473684 0.263157894736842 18 20 4 10 5 3 154615335 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 154615399 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 154615451 C A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 154616591 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 154616763 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154617435 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 154617848 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154619827 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154619887 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154621426 T G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 154621547 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 154621674 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154621788 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 154621937 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 154621943 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 154621985 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154622095 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154622106 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 154622245 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 154623349 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 154623423 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 154623476 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154623526 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 25 15 10 5 5 3 154623709 C G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 154623963 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 154623993 A T Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 154624136 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 154624669 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154625128 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154625159 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 154625241 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154625277 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154625278 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154625472 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154626387 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 154626691 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154626778 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154627325 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 154627572 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154627775 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154627822 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154628256 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154629381 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154630361 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 154630388 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154630468 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 154630497 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 154631155 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 154631215 T A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 154631732 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154632471 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154633609 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 154633680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154633793 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 154634308 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154636770 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154637634 T A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 154637648 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 154638181 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 154638273 C A Y N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 154639303 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154643175 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154646940 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 154649219 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154651182 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154651736 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154652370 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154652405 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154652445 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154652630 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154653251 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154653280 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 154653303 G T Y N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 154653353 A T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 154653426 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 154653468 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154653573 T C Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 154653829 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 154653934 A G Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 154653964 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154653994 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 154654029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154654071 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154654211 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 154654242 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 154654305 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 154654420 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 154654521 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154654544 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154654727 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154654964 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154655046 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154655056 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 154655125 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 154655141 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 154655327 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154655396 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 154655453 T C Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 154655475 A T Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 154655479 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154655498 G A Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 154655512 C A Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 154655590 C T Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.352941176470588 0.235294117647059 0.411764705882353 16 18 6 4 7 3 154655599 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 154655700 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 154655739 T C Y Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 154656184 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 154656201 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 154656711 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154656893 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154657193 G C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 154657275 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 154657488 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 154657489 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 154657503 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 154657510 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 154657571 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 154657750 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 154657768 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 154657778 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 154658024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154658059 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 154658257 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 154658487 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 154658511 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0 0.4 0.6 6 24 0 6 9 3 154659021 C T N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 154659585 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 154660352 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 154660490 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154660509 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 154660837 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 154660879 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154661044 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 154661140 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 154661176 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 154661441 G C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 154661465 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 154661510 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 154661527 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 154661540 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154661546 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 154661599 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 154661801 C A Y N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 154661815 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 154661844 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 154662111 C T Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 154662719 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 154663576 A C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 154664446 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 154664534 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154665746 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154666578 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154668877 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 154669688 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154670065 T G Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 154670553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154670608 C G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 154670773 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 154670997 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 154671058 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 154671158 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 154671268 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 154671309 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 154671497 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 154671504 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 154671589 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 154671652 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 154671720 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 154671824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154671911 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 154672000 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154672084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154672167 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 154672717 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 154672722 T A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 154672842 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 154672891 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 154673028 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 154673199 A G N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 154673515 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 154673640 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 154674113 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 154674265 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154674317 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 154674391 G A Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 154674508 C G Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 154674532 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154674714 A G Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 154674917 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 154674971 A C Y N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 154675014 C T N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 154675044 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.235294117647059 0.529411764705882 0.235294117647059 17 17 4 9 4 3 154675221 A C N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.357142857142857 0.357142857142857 0.285714285714286 15 13 5 5 4 3 154675524 A T Y N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 154675610 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.222222222222222 0.555555555555556 0.222222222222222 18 18 4 10 4 3 154675622 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 154675796 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 154675944 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 154676083 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.222222222222222 0.5 0.277777777777778 17 19 4 9 5 3 154676322 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154676656 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154676908 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154676921 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154676956 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154677786 A G Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 154678277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154678566 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 154678689 T A N N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 154678693 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 154678826 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 154678870 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 154678931 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 154679163 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 154679175 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 154679292 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 154679379 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 154679489 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154679501 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 154679503 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154679526 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154679541 C G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 154679633 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 154679760 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 154679780 T A N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 154679898 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 154680299 A G N Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 3 154680303 T C N Y 0.5 ALT 0.7 0.7 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 6 6 2 2 2 3 154680320 A G N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0.142857142857143 0.142857142857143 0.714285714285714 3 11 1 1 5 3 154680384 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 3 154680572 A T N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 154680712 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 154680731 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154680981 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154681106 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 154681107 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 154681684 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154681889 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154681916 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 154682121 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154682799 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154682898 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154683864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154685868 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154686165 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154686169 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154686301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154686535 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 154686617 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 154686641 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154686690 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154686743 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154687182 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154687293 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 154687316 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 154687364 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 154688302 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 154688428 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 154688459 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 154688555 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 154688595 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 154688635 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 154688756 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 154688770 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 154688783 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 154688792 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154688890 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 154688901 C T N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 154688919 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 154688944 A G N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 154688960 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 154689000 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 154689292 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 154689322 G A N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.333333333333333 0.266666666666667 0.4 14 16 5 4 6 3 154689370 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 154689453 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 154689471 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 154689555 T G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 154689615 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 154689695 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 154689875 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 154690760 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154690779 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154690782 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154690996 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 154691106 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 154691391 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 154691414 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 154691634 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 154691716 C G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 154691723 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 154691727 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 154692192 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154692268 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 154692277 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 154692284 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 154692306 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 154692412 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 154692445 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.1 0.85 0.05 21 19 2 17 1 3 154692487 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0 0.842105263157895 0.157894736842105 16 22 0 16 3 3 154692617 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154692738 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154694766 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154695134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154695154 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154695185 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154695455 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 154695479 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 154695729 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154696283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154697147 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154697221 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154697274 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154697419 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154697448 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154697855 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154697861 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 154698045 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154698282 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 154698293 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 154698384 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154698405 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154698486 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 154698543 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 154698680 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154699264 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154699339 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 154699444 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 154699474 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 154699495 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 154699512 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 154699761 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 154700027 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 154700077 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 154700099 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 154700483 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 154700541 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 154700547 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 154700596 C G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 154700614 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154700619 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 154700688 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 154701003 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 154701369 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 154701436 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 154701447 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 154701468 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 154701632 G A N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 154701711 G T N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 154701786 T G N N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 154702006 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 154702585 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 154702867 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154703002 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154703802 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 154703892 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 154704154 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 154704155 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 154704237 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.277777777777778 0.166666666666667 0.555555555555556 13 23 5 3 10 3 154704317 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 154704349 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 154704611 C G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 154704615 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 154704763 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 154704890 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 154704909 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 154705361 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154705787 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 154705876 A C Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 154706018 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 154706075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154706299 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 154706307 C G Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 154706531 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154706735 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 154707062 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 154707793 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154707997 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 154708032 C T Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 154708455 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 154708570 C A Y N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 154708667 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 154708895 G A Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 154709259 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 154710088 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154710139 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 154711849 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 154711963 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 154711990 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 154712019 A G N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 3 154712031 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 154712038 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.416666666666667 0.333333333333333 0.25 14 10 5 4 3 3 154712278 T G Y N 0.4 ALT 0.75 0.75 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 6 4 2 2 1 3 154712423 C T Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 3 154712647 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 154712764 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 154713035 T C Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 154714188 G A Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 154714260 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 154714286 C G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 154714325 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154714341 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 154714470 G C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 154714505 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154714771 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 154714936 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 154715160 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154715162 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154715217 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154715318 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154715360 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154715661 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154715710 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 154715841 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154715843 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 154716293 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 154716500 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154716501 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154716627 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 154716897 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 154716910 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 154716933 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 154717040 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 154717152 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 154717188 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154717191 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 154717337 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154717400 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 154717918 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 154718163 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 154718169 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154718289 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 154718658 T C Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 154718677 G T Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 154718688 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 154718723 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 154718741 C A Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 154719117 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154719294 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 154719325 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 154719326 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 154719341 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 154719417 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 154719609 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 154719830 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 154720316 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 154720328 G C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 154720331 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154721037 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 154721048 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 154721107 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 154721221 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154721235 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 154721543 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 154721575 G T Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 154721632 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154721788 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154722303 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154722430 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 154722431 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 154722507 A C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 154723411 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 154723436 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 154723704 T G N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 154723850 T C N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 154723853 G C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 154723914 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 154723973 G A N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 154724293 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 154724460 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 154724525 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 154724622 G C N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0.153846153846154 0.230769230769231 0.615384615384615 7 19 2 3 8 3 154724747 C G N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 154724920 A G N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 3 154725156 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 154725249 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 154725291 C A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 154725294 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 154725367 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154725419 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 154725500 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 154725577 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 154725615 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 154725718 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 154725778 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 154725888 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 154725938 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 154725998 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154726081 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 154726083 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154726140 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 154726556 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 154726574 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 154726984 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 154727447 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154727585 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154728075 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154729202 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154729328 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 154730173 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154730505 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 154730607 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 154731048 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154731277 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 154731392 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 154731899 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154731948 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 154732048 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 154732138 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 154732268 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 154732832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154732992 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 154734320 C G Y N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 154734525 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 154734575 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154734630 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 154734941 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 154735026 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154735051 C T N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 154735125 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 154735181 C T N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 154735426 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 154735732 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154736057 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154736074 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 154736089 A C N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 154736129 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 154736180 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 154736184 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 154736219 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154736274 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 154736291 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 154736302 A G N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 154736348 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 154736423 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 154736629 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 154736636 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 154736696 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 154736714 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 154736743 T G Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 154737004 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 154737035 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 154737102 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 154737169 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 154737236 A T N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 154737299 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 154737404 T G N N 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 7 9 2 3 3 3 154737864 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 154737880 T G Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154737938 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154737988 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 154738255 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 154738538 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 154738736 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 154738741 C G Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 154738749 G A Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 154738777 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 154738900 C A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 154738966 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 154738972 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 154739272 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 154739383 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 154739390 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 154739433 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 154739508 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 154739698 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154739862 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 154740010 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154740043 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 154740065 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 154740099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154740251 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 154740285 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 154740425 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 154740435 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 154740535 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 154740795 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 154740981 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 154740991 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154740994 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154741057 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154741060 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154741088 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 154741189 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 154741225 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154741267 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154741347 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154741419 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154741538 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 154741543 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 154741558 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 154741675 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154741679 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154741760 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 154741768 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.470588235294118 0.235294117647059 0.294117647058824 20 14 8 4 5 3 154741819 T A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 154741886 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154741912 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 154741937 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154742038 A C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.85 0 0.15 34 6 17 0 3 3 154742046 A T Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 154742137 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154742139 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154742236 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 154742269 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154742282 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154742337 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.368421052631579 0.263157894736842 0.368421052631579 19 19 7 5 7 3 154742446 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 154742504 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154742519 T C N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 154742548 T G N N 0.458333333333333 REF 0.4 0.4 0.458333333333333 0.541666666666667 0.333333333333333 0.25 0.416666666666667 11 13 4 3 5 3 154742955 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154743225 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154743244 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.111111111111111 0 0.888888888888889 4 32 2 0 16 3 154743334 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154743340 T G N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 154743352 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 154743442 T C N Y 0.5 ALT 0.35 0.35 0.5 0.5 0.307692307692308 0.384615384615385 0.307692307692308 13 13 4 5 4 3 154743457 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 154743694 G T N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 154743832 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 154743977 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 154744161 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 154744191 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 154744208 C T N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 154744216 C T N Y 0.230769230769231 ALT 0.35 0.35 0.769230769230769 0.230769230769231 0.769230769230769 0 0.230769230769231 20 6 10 0 3 3 154744231 G C N N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 3 154744670 G C N N 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 9 5 4 1 2 3 154745918 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 154745971 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154746159 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 154746219 T C N Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 154746452 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 154746592 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 154746604 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 154746609 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 154746684 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154746698 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 154746969 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 154747267 T G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 154747312 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 154747448 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 154747603 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 154747737 G C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.15 0 0.85 6 34 3 0 17 3 154747802 G A N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 154747951 T C N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 154748078 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 154748096 A C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 154748154 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 154748277 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 154748353 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 154748379 G T N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 154748491 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 154748741 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154749000 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 154749026 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 154749037 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 154749040 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 154749087 A C Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 154749208 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 154749222 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 154749266 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 154749394 C T N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 154749419 G A N Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 20 12 6 8 2 3 154749564 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 154749569 C G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 154749742 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 154749784 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 154749804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154750048 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 154750090 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 154750248 T A N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 154751005 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154751180 C T N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 154751326 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 154751332 A C N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 154751386 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 154751521 T A N N 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0.133333333333333 0.0666666666666667 0.8 5 25 2 1 12 3 154751658 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 154751686 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 154751789 T G N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 154751817 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 154751879 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 154751924 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 154751994 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 154752071 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 154752463 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 154752526 C T N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 154752637 T C N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.5 0.428571428571429 0.0714285714285714 20 8 7 6 1 3 154752723 C A N N 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 154752767 A G N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 3 154752942 C A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 154753048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154753139 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 154754065 A G N Y 0.178571428571429 REF 0.3 0.3 0.178571428571429 0.821428571428571 0.142857142857143 0.0714285714285714 0.785714285714286 5 23 2 1 11 3 154755113 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 154756184 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 154757029 A T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 154757290 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 154757430 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 154757478 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154757496 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 154757802 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 154758066 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154758399 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154758406 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154758575 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 154758764 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154758993 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154759024 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154759039 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154759122 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 154759139 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154759274 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 154759336 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 154759510 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 154759686 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 154759727 T C N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154759750 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154759763 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154759892 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154759976 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154760006 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154760072 G T N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154760097 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154760134 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 154760169 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154760193 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154760281 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154760300 C G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 154760375 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154760459 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 154760488 G C Y N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 154760497 G T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 154760678 T C Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 154760913 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154760964 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 154760975 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 154761069 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 154761070 G T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 154761138 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154761164 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 154761177 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 154761318 T C Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 154761457 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 154761559 C G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 154761604 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 154761935 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154762039 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 154762410 A T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 154762450 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 154762460 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 154762737 C A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 154762777 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 154762870 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 154763079 G T Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 154763196 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154763422 G T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 154763672 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154763758 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.7 0.15 0.15 31 9 14 3 3 3 154764757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154765910 T C Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 154766810 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154767170 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154767782 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 154768100 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154768238 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154769258 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154769377 A G Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 154769421 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154769618 A T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 154769825 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 154770774 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 154771733 G A N Y 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.142857142857143 0.285714285714286 0.571428571428571 8 20 2 4 8 3 154772554 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 154772781 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 154774549 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 154774674 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 154775745 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154775983 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 154776148 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 154776345 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 154776611 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154776653 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 154776654 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 154777557 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 154779144 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154779255 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154779472 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 154779610 T G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 154779868 G C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 154780078 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154780234 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154780678 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 154781139 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 154781248 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.15 0.15 0.7 9 31 3 3 14 3 154782567 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 154782729 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154782970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154783469 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 154783754 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154783772 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 154783778 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154783825 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154784550 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154784567 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 154784595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154784945 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154784952 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 154785397 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 154786530 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154786540 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154786658 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154787384 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154787822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154788453 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154788467 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154788687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154789374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154789969 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 154789970 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 154790241 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154790383 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154790875 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154791041 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 154792843 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 154792915 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 154794059 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154795925 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154799647 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 154799840 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 154799873 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154799915 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 154801813 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 154801841 C G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 154801965 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154802335 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154802501 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154803278 C G N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 154803848 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154804169 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154804970 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154805511 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154805782 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154806158 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 154806780 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154806801 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 154806842 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 154806856 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154806913 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154807023 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154807110 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154807238 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154807256 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154807322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154807475 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 154807702 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154807920 A G Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 154807983 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 154808073 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 154808082 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 154808101 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 154808381 G C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 154808416 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154808662 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 154808728 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 154808758 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 154808761 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 154808785 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 154808883 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 154808893 G A Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 154808905 G T Y N 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.4 0.266666666666667 0.333333333333333 16 14 6 4 5 3 154815346 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 154815762 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 154816764 G A Y Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 154816952 A T Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 154818020 A G Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 154818769 G T Y N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 154818794 G A Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 3 154818907 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 154819393 A G Y Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 154819438 G A Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 154819709 T G Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 154819729 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 154819779 G A Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 154819797 T G Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 154819852 A G Y Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.533333333333333 0.2 0.266666666666667 19 11 8 3 4 3 154819859 G T Y N 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.533333333333333 0.2 0.266666666666667 19 11 8 3 4 3 154819865 A C Y N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.5 0.1875 0.3125 19 13 8 3 5 3 154819889 C G Y N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.5 0.1875 0.3125 19 13 8 3 5 3 154819920 G A Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 154819950 G A Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 154820963 T C Y Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 154821249 G C Y N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 3 154821330 T G Y N 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 154821339 G T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 154821432 A G Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 154821471 C T Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 154821481 G T Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 154821488 T G Y N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 154821498 G T Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 154821537 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 154821577 A G Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 154821666 C T Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5 0.3125 0.1875 21 11 8 5 3 3 154821770 A T Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 154821854 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 154822012 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 154822036 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 154822047 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 154822080 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 154822133 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 154822137 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 154822200 T G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 154822322 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 154822323 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 154822420 C A Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 154822454 G T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 154822529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154822652 T C Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 154822653 G T Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 154822780 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 154822802 C A Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 154822912 G T Y N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 154822951 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 154822959 A G N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 154823011 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 154823045 C A Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 154823151 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 154823176 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154823331 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154823356 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 154823435 A T N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 154823636 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154823786 G T Y N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 154823842 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154823870 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154823925 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154824130 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 154824264 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154824302 A C Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 154824454 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 154824598 G A Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 154824682 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154824736 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154824975 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154825167 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 154825251 C T Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 154827485 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 154827510 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154828137 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154828578 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154831596 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154831847 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154832031 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154832258 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 154832873 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 154834274 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154834694 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 154837197 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154838638 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 154839424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154839744 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 154839772 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 154839847 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 154840786 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154841679 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154842910 C T Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 154845509 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154846367 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154847303 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154848380 T A N N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 154849448 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154851684 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154852004 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154853183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154857055 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 154862579 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154863480 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154863552 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154863918 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 154863989 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154865472 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154865475 G C Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 154865567 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154865721 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154865778 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 154866012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154866081 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154867905 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 154868063 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 154868206 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154868418 C G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 154868461 G T N N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 154868645 G A N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 154868842 A C N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 154868936 A G Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 154869027 T A N N 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 154869037 C T N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.647058823529412 0.294117647058824 0.0588235294117647 27 7 11 5 1 3 154869051 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 154869121 C T N Y 0.2 ALT 0.5 0.5 0.8 0.2 0.6 0.4 0 16 4 6 4 0 3 154869303 A C N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 154869410 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 154869461 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 154869482 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 154869655 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 154869830 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 154870196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154870849 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154870859 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 154870943 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154871064 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 154871067 T A N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 154871102 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 154871330 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 154871359 A C Y N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 154871417 T C N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 154871628 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 154871742 T A Y N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 154872119 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154872436 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154872759 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154872909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154873146 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154873550 A G Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 154873624 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154873644 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154873749 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154873755 T A Y N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 154873775 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154873809 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154874283 C A Y N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 154874467 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 154874472 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 154874510 C A Y N 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 154875876 T G Y N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.0625 0.875 0.0625 16 16 1 14 1 3 154875962 C A Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 3 154880227 T G Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 154880892 C T Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 154880992 C A N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 154881006 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 154881333 T C Y Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 154881367 C G N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 154881420 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 154881498 T C N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 3 154881645 A G N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 154881836 C T Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 154882140 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 154884071 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154884095 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 154884298 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154884358 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 154884458 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154884872 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 154884920 G A Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 154884952 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 154884960 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 154885028 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154885119 C T Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 154885136 A G Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 154885208 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154885266 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 154885281 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154885546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154886127 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154886435 G A Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 154886983 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154887315 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154887377 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154887896 C A N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 154887928 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 154888142 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154888221 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154888254 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154888283 A T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 154888346 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154888476 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 154888574 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 154888657 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154888693 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 154888786 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154888849 G A Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 154888971 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 154889003 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154889394 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154889611 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154889619 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 154889628 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 154889692 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154889811 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154889869 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 154889899 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154889974 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154890010 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154890275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154890345 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 154890346 C A Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 154890374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154890404 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154890505 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154890558 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 154890855 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 154890965 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 154891021 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 154891112 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154891136 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 154891294 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 154891363 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 154891399 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 154891553 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 154892016 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154892062 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154892482 T C Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 154892783 G T Y N 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 154893084 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154893161 A G Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 154893190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154893274 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154893326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154893393 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154893449 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154893453 G C Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 154893673 G A Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 154893923 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 154893940 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 154893943 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154894238 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 154894269 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154894308 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154894937 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 154894941 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 154894951 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 154895236 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 154895306 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 154895462 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 154895563 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 154895637 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 154895728 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154895730 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154895788 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154895799 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 154895829 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 154896085 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154896256 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 154896822 T G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 154897274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154898323 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 154898513 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154899020 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154899272 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 154899301 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154899603 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154899873 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 154900065 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154900805 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154901669 C A N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.4375 0.375 0.1875 20 12 7 6 3 3 154901777 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154902575 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154902824 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154903365 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154903415 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154903538 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154903562 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 154903657 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154904124 G A Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 154904161 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 154904255 T A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 154904303 G C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 154904951 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 154905226 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154905272 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154905336 G T Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 154905397 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154905536 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154905561 C T Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 154905726 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 154906031 A C Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 154906084 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 154906137 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154906160 C T Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 154906430 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154906521 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154906736 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.55 0.55 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 10 8 3 4 2 3 154906934 T G Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 154906971 C A Y N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 3 154907012 A C Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 154907013 T A Y N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 154907055 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154907064 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 154907122 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154907134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154907152 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154907182 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 154907241 C T Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 154907370 G C Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 154907497 G T Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 154907579 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154907610 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154907778 T C Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 154907782 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 154907837 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154907929 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154908000 A T Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 154908074 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 154908195 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154908405 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154908419 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154908434 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154908512 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154908536 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154908969 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 154908974 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154908988 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154909006 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154909041 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154909042 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154909068 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154909135 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154909233 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154909311 T C Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 154909315 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154909437 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154909438 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154909449 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154909485 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154909602 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154909611 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154909757 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154909968 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154910395 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 154910796 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154910943 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 154910961 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 154910994 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 154911937 T G N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 154912008 G T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 154912828 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154912920 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154913220 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154913382 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154913413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154913846 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154914033 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154914104 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154914150 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154914349 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154914798 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154914883 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154915125 G A Y Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 0.923076923076923 2 24 1 0 12 3 154915212 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 154915326 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154915398 C A Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 154916347 C A Y N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.294117647058824 0.235294117647059 0.470588235294118 14 20 5 4 8 3 154917799 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 154918042 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154918922 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154918936 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154919460 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154919502 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154922314 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154924969 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154925062 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 154925954 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 154929236 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154930922 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154931990 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154932361 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 154932552 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154934123 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154934295 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 154937774 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 154937778 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.25 0.5 0.25 20 20 5 10 5 3 154937790 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154937814 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 154937931 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 154937943 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 154938012 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 154938907 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154940433 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154941739 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154941782 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154943032 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154943353 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154945387 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154945473 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154946623 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 154947048 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154949157 A C N N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 12 10 1 10 0 3 154949159 C A N N 0.454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.545454545454545 0.454545454545455 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 12 10 1 10 0 3 154949584 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154952275 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154952416 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154952489 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 154952850 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154953319 G A Y Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 154956988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154957115 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154958615 C T N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 154960288 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 154961375 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 154962666 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 154964430 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154964503 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 154966104 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154973584 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154973787 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154974621 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154974721 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154974731 C G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 154974819 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 154977914 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154978434 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154979857 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154980320 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154983770 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154984250 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154987582 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 154989272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154990399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154991326 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 154992794 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154992970 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154993403 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154993517 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 154994771 A T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 154998858 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 154999158 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155003794 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155004336 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155007161 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155007746 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155009527 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155010176 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155010857 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155012487 G A N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 155012965 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155013333 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155013352 T C N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.6875 0.1875 0.125 25 7 11 3 2 3 155013747 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 155013748 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 155014823 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 155016628 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155019654 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155020399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155021898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155023080 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155023237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155026370 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 155026784 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155026787 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155027221 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155027629 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155028083 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155028331 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155028335 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 155028360 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 155028381 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 155028417 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 155028582 T A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 155028585 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 155028595 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 155028621 A G Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 155028717 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 155029297 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155029327 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155029551 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155029710 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155029994 T C N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 3 155030033 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155030068 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 155030163 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 155030269 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155030380 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 155030454 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155030472 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 155030932 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155031242 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155031245 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 155031284 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155031600 T C Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 155031613 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 155031677 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155031787 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155031874 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 155031883 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155032156 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155032176 A C N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 155032636 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 155032656 T A Y N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 155032778 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 155032794 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 155032907 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 155033041 C A Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 155033169 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 155033301 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 155033691 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 155033807 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155034403 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 155034508 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155034666 A C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 155034945 T C Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 155034977 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 155035142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155035171 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 155035278 A G N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 155035541 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155035776 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155036038 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155036690 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155037524 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155037529 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155037757 T A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 155037983 T C Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 155037994 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 155038012 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 155038027 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 155038028 T A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 155038101 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 155038186 A T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155038426 T G Y N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 155038714 T C Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 155038754 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 155039007 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 155039095 A G Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 155039141 G A Y Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 155039925 A G Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 155040159 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 155040261 T G Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 155040525 T A Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 155040568 C G Y N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 155042201 A G Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 155042366 A C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 155042367 A T Y N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 155042463 A G Y Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 3 155042477 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 155042503 T A Y N 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0 0.363636363636364 0.636363636363636 4 18 0 4 7 3 155042560 T G Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 155042879 G A Y Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 155042990 T C Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 155043067 A C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 155043659 T A Y N 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 155043664 C T Y Y 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 155044078 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155044232 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155044594 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 155044647 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155045500 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155048240 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155048574 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155048642 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155048738 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 155048750 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.2 0.6 0.2 20 20 4 12 4 3 155048898 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155049048 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 155049068 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 155049304 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 155049332 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 155049345 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 155049536 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 155049545 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 155049562 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 155049653 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 155049844 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 155050865 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155050919 A T Y N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 155051545 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 155052199 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.157894736842105 0.578947368421053 0.263157894736842 17 21 3 11 5 3 155052249 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 155052288 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.222222222222222 0.611111111111111 0.166666666666667 19 17 4 11 3 3 155052395 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155052730 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 155052821 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 155052935 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155053095 G T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 155053508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155053698 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.263157894736842 0.578947368421053 0.157894736842105 21 17 5 11 3 3 155053731 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 155055404 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155055550 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155056457 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155056640 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155058629 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155059808 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155061310 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.277777777777778 0.555555555555556 0.166666666666667 20 16 5 10 3 3 155061519 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 155062362 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155062812 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155062872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155062894 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.2 0.55 0.25 19 21 4 11 5 3 155062945 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 155063079 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 155063240 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155063527 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 155063577 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155063646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155063672 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155063708 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155063831 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 155063833 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 155063960 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 155064196 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155064262 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155064614 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155064688 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 155064795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155065315 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155065333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155065412 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155065534 A C Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 155065828 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 155067383 A C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 155067435 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155067919 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155068435 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155068576 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 155069375 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155070145 T C Y Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 155070395 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 155070795 C T N Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 155071154 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 155071236 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155071240 G A Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 155071347 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155071655 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 155071658 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 155071685 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 155071723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155071746 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155071806 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155071820 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 155072100 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155072126 A C Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 155072127 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 155072248 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 155072281 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155072569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155072710 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155072741 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 155072748 C T Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 155073481 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 155073758 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 155074233 G T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 155074305 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155074499 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155074649 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155074849 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155075053 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155075281 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 155075706 G A Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 155075925 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155075973 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155076000 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155076439 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155076604 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 155076605 A T Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 155076657 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155076702 C T Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 155076859 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 155076961 G A Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155077025 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155077253 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 155077451 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155077636 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155077748 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155078073 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155078078 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 155078178 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 155078230 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155078279 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 155078320 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155078342 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155078439 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155078544 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155078549 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155078579 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155078592 A C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 155078646 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 155078669 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155078670 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 155078825 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 155078896 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 155078963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155078981 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155079052 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 155079080 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155079362 C G Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 155079616 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 155079685 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 155079742 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155079817 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155079987 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155080009 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155080735 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155080771 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 155080954 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155081183 A C Y N 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 155081305 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 155081380 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 155081415 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155081582 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 155081970 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155082070 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 155082101 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 155082574 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155082640 A C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155082927 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155082960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155083286 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155083314 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155083797 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155083845 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155083894 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155084458 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155084586 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155085152 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155085153 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155085246 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155085252 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155085276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155085395 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155085447 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155085603 C A Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 155085625 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 155085856 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 155085943 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 155085975 A G N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.0588235294117647 31 3 15 1 1 3 155086093 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 155086389 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155086447 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155086520 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155086643 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155086721 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155086777 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155086842 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155086950 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155087371 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155088173 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155088474 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155088650 C T Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 155088653 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155088861 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155088895 A C Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 155089179 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155090010 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155090762 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155091008 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 155091354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155091668 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155091671 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 155092414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155092776 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 155092929 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155093120 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155093897 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 155095034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155095462 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155095885 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155096316 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 155096451 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.55 0.55 0.722222222222222 0.277777777777778 0.666666666666667 0.111111111111111 0.222222222222222 13 5 6 1 2 3 155096739 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 155097091 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 155097384 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 155097830 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155097859 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 155097934 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155098170 C G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 155098361 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 155098504 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 155098537 A C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 155098727 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 155098917 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155098965 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 155099048 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 155099766 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 155099837 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 155099885 A T Y N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 155099902 A G Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 155099914 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 155099982 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 155100059 T G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 155100080 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 155100502 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155100534 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155100541 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 155100574 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 155100657 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 155100853 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 155100872 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 155100949 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 155101112 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 155101173 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 155101313 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 155101360 G A Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 155101764 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 155101845 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 155101857 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 155101878 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155102169 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 155102176 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 155102392 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 155102393 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 155102655 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 155103086 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 155103171 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 155103185 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 155103247 G C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 155103987 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155104024 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155104029 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155104039 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 155104150 C A Y N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 155104277 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155104332 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 155104359 T G Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 155104390 A G Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 155104412 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 155104632 T G N N 0.4 ALT 0.5 0.5 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 12 8 3 6 1 3 155104773 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155104881 T G N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.1875 0.25 0.5625 10 22 3 4 9 3 155105196 T A Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 155105474 T A N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 155105513 G A Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 155105540 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 155105554 C T Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 155105674 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 155105678 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155105742 T C Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 155105754 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 155105769 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 155105898 T G N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.153846153846154 0.0769230769230769 0.769230769230769 5 21 2 1 10 3 155105912 C A N N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0.0833333333333333 0.0833333333333333 0.833333333333333 3 21 1 1 10 3 155105921 A G Y Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.230769230769231 0.307692307692308 0.461538461538462 10 16 3 4 6 3 155106097 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 155106118 T C Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.117647058823529 29 5 14 1 2 3 155106124 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 155106206 C T Y Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 155106232 C A Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 155106240 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 155106341 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 155106726 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 155106811 C T Y Y 0.307692307692308 REF 0.35 0.35 0.307692307692308 0.692307692307692 0.153846153846154 0.307692307692308 0.538461538461538 8 18 2 4 7 3 155106823 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 155107153 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 155107357 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 155107486 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 155107579 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 155107614 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 155107804 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155107911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155110241 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 155110592 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 155110885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155111018 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155111098 T C Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 155111125 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155111199 A G Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 155111488 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155111594 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155111674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155111718 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155111782 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 155111826 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155111836 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 155111956 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155111988 T G N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 155111992 T A N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 155112017 C G Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 155112063 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 155112155 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155112280 G T Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 155112344 T C N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 155112358 C T Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.666666666666667 0.2 0.133333333333333 23 7 10 3 2 3 155112462 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155112492 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 155112541 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 155112638 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 155112728 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 155112987 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 155113070 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 155113089 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 155113228 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155113337 G A Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 155113343 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 155113433 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 155114183 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155116021 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 155116109 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 155116443 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 155117216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155117423 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155117543 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155117661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155118672 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155118680 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 155118800 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 155118987 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155119134 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155119232 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 155119416 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 155119441 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 155119506 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 155119514 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 155119585 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 155119591 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155119599 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155119672 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 155119685 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 155119700 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 155120331 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155120380 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 155120390 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 155120428 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 155120454 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 155120492 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 155120532 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 155120764 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 155121166 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 155121181 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 155121435 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155121668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155123571 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155124645 C A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 155126207 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155126610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155127083 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155128134 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155128320 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155128631 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155128661 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 155131044 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155131174 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155132151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155132233 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155132366 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155132499 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155134662 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155136248 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155136342 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155137275 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155137446 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155137649 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155138678 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 155139403 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 155142240 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155142775 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155142840 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155142970 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155143145 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155143605 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155144144 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155145229 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155145840 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155146907 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 155147454 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 155147489 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 155147688 A T Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 155148539 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155148727 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155149185 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155149800 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 155150704 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155151211 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 155151220 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155152027 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155154451 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155154843 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155155731 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155155880 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 155158040 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155158142 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155158358 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155158475 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 155158512 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155158538 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155158583 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 155158588 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 155158682 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155158722 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 155158853 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155158862 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155159073 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 155159246 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155159268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155159272 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155159691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155159779 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 155159880 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155159893 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 155159946 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 155160038 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155160086 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155160087 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 155160163 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155160219 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 155160336 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 155160337 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 155160348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155160428 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 155160443 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 155160629 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 155160674 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 155160695 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 155160747 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 155160814 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 155160832 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 155161010 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155161611 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 155161644 T C N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 155161712 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155161906 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 155161936 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 155161982 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 155161996 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 155162309 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 155162323 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 155162393 T A N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 155162465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155162484 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 155162590 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 155162643 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155162940 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 155163210 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155163224 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 155163289 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 155163550 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155163625 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155163800 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155164155 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155164915 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 155167901 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155167919 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 155168425 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 155168659 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155168718 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 155169578 A C N N 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 155170113 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155170767 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155171650 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155171878 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155173285 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155173737 G T Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 155173743 G A Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 155173751 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.4 0.6 0 28 12 8 12 0 3 155174048 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155174811 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155175537 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155178366 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155178584 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155181347 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 155181456 G C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 155181463 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 155181601 C T N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 155181610 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 155181619 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 155182060 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155182402 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155182799 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 155182820 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 155182846 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 155182876 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 155182883 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155182977 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 155183072 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 155183117 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 155183127 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155183138 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 155183360 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 155183422 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 155183596 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 155183743 G A N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 155183996 C T N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 155184764 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 155184780 C G N N 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.0588235294117647 0.235294117647059 0.705882352941177 6 28 1 4 12 3 155184876 C T N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 155184888 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 155184932 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 155184976 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 155184997 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 155184999 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 155185024 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 155185126 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 155185203 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 155185253 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 155185406 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 155185465 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 155185487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155185500 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 155185633 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 155185746 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 155185997 C T N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 155186357 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 155186506 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 155186540 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 155186570 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 155186582 C A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 155186638 T G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 155186660 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 155186677 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155186696 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155186849 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 155186946 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 155187040 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 155187123 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 155187189 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 155187284 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 155187325 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 155187499 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 155187678 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 155187878 T C Y Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 155187879 G C Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 155188504 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155188526 G C Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 155188718 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 155188763 A C Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 155188779 A T Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 155188862 C G Y N 0.416666666666667 REF 0.7 0.7 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 5 7 1 3 2 3 155188872 G T Y N 0.285714285714286 ALT 0.65 0.65 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 10 4 4 2 1 3 155188934 T C N Y 0.125 ALT 0.6 0.6 0.875 0.125 0.75 0.25 0 14 2 6 2 0 3 155188998 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 155189271 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 155189335 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 155189497 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 155189734 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 155189784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155189968 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.0588235294117647 32 2 16 0 1 3 155190145 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 155190270 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 155190384 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 155190550 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 155190578 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 155190583 A T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 155190607 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155190759 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 155190879 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155191051 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155191202 G A Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 155191386 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155191448 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 155191516 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 155191623 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155191788 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155191812 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 155191947 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155192613 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155192829 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155193223 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155194698 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155195121 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155195563 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155195720 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 155195789 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155196193 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155196336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155196425 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155196879 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155197001 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155197045 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155197046 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155197149 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155197248 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155197466 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155197496 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155197772 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155197865 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155198027 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155198046 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155198084 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155198722 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155198909 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155199548 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155200426 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 155200436 T A N N 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 155200455 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 155200720 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 155200800 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155200915 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155201876 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155205032 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155206699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155209977 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155210951 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155210957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155210971 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155210997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155211520 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155211949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155212184 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 155212406 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155212412 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155212577 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155212668 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155212928 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155212960 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155213157 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155213184 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155213299 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155213621 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155213672 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155213691 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155214073 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155214501 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155214661 A G Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 155215280 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155215566 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155215678 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155215848 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 155215858 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155215877 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155215916 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155216327 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155216446 T C Y Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 155216541 C A Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 155216548 G T Y N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 155217233 A C Y N 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 155217454 A G Y Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 155217606 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155217845 T A Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155217869 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155218867 C T Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 155219157 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155219313 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155219343 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155219414 A G Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 155220192 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155220459 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155220841 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155220972 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155221015 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155221048 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155221175 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155221234 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155221288 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155221423 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155221668 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155221866 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155222123 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155222173 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155222235 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155222322 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155222561 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155222717 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155222782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155222897 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155222912 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155222947 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155222978 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155222998 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155223179 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155223228 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155223308 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155223350 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155223399 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155223419 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155223584 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 155224014 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155224179 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155224186 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155224325 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155224383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155224417 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155224634 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155224688 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155224704 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155224909 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155224920 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155224980 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155224984 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155224996 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155225024 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155225267 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 155225285 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155225676 T C N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 155226229 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 155226539 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155226620 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155226640 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155226699 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155226756 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155226775 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155226823 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155226829 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 155226849 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155227337 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 155227349 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 155227526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155227540 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 155227561 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 155227649 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155227695 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155227927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155228359 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155228432 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155228669 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155230313 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155230879 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155231099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155231938 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155232839 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155233821 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155235374 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155235846 C G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155236479 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 155236871 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155237105 C A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 155237710 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155239761 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 155240616 G A Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 155240834 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 155240852 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 155241018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155241103 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155241374 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155241442 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155242022 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155242145 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155242593 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155242777 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155242790 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155242959 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155243283 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155243436 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155243449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155244608 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 155244782 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155244793 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155244872 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155244892 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155244900 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155245050 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155245850 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155247018 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155247256 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155247401 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 155247413 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155247432 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 155247475 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155247521 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155247555 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155249182 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 155249216 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 155249226 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 155249235 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 155249405 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 155249409 T G N N 0.125 REF 0.6 0.6 0.125 0.875 0 0.25 0.75 2 14 0 2 6 3 155249421 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 155249451 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 155249467 C T N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 155249697 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155249761 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155249882 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155250047 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155250192 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 155250533 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155251209 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 155252012 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155252668 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155253444 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155255201 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 155256334 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155256920 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155257814 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155258954 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155259630 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155259654 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155259708 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155259712 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155259818 T C Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 155260051 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 155260054 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155260068 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155260099 T G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 155260244 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155260565 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 155260575 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155260743 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155260751 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155260812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155260848 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 155261027 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155261322 G C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 155262981 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 155263192 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 155263314 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155263446 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 155263480 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155263614 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155264701 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155264852 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155265362 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155266043 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155266440 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155266501 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155267369 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155267384 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155267711 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155268947 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155270665 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 155270746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155270756 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155270897 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155270919 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 155270996 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155271840 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155271841 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155271871 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155271906 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155272285 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155273034 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 155273085 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155273132 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 155273215 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 155273357 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 155273484 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 155273536 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 155273552 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 155273760 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 155274075 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155274612 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155274786 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 155275348 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 155275959 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 155276150 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 155276468 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155277230 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155277433 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155277445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155277464 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 155277486 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155278005 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155278541 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155278874 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155278954 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155279243 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155279351 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155279430 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 155280036 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 155280182 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155280251 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155280338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155280448 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155280520 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 155280556 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155281298 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155281392 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155281726 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155282219 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155282664 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155282676 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155282917 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155283112 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155283134 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155283153 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155283356 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155283551 T A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 155283602 T C N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 155284244 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155284309 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 155284340 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155284617 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155284809 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 155285338 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155285380 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 155285415 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155285435 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155286292 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155286348 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 155286378 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 155286580 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 155286739 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 155286749 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 155286804 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155286841 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155286863 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 155286964 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 155287010 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155287474 A T N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 155288088 C T Y Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 155288121 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 155288206 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 155288268 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 155288350 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 155288382 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155288392 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155288626 T C N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 155288670 G A N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 155288685 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 155288810 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 155288815 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 155288959 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155288978 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 155289192 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155289334 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 155289373 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155289382 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155289525 C T N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 155289552 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 155289632 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 155289668 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 155289673 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155289715 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 155289813 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 155290001 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 155290069 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155290126 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 155290266 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155290424 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 155290444 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 155290488 A C N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 155290490 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 155290502 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 155290534 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 155290543 C A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 155291176 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155291267 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 155291320 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155291362 T G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 155291606 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 155291629 A T N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 155292154 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155292308 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155292333 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155292360 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155292378 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155292512 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155292693 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155293243 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 155293708 T A N N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 155294523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155295052 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155295212 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 155295668 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 155297919 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155301415 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155302545 C T N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 155302839 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155302912 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155303134 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155303430 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155304652 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155304769 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155305613 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155312738 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155313619 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155313801 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 155314383 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155316023 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155317320 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155317767 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155317908 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155318114 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155319317 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155321624 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155322611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155323603 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155323900 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155324132 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155324439 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155325641 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155326265 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155329953 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155330037 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155330253 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155330572 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155330644 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155330921 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155331205 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155331307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155331361 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155331541 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155331635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155331657 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155331738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155331761 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155331807 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155331908 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155332066 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155332240 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155332243 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155332608 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 155332921 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 155332929 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 155333271 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155333438 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 155333610 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155334526 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 155335892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155336383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155336613 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155336668 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155337065 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155337396 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155337448 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155337528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155337750 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155337755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155337960 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155338985 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 155340636 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155340671 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155340690 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155341130 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155341363 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155342117 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155342938 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155342975 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155344236 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155345674 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155348202 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155351693 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155352099 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155352271 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155352728 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155354446 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155354699 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155355406 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155358347 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155359586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155359841 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155360692 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155361544 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155362438 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155363691 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155363963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155364541 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 155365077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155366167 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155368101 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155368673 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155369333 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155369389 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155373379 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155373758 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155377792 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 155377942 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155378286 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155378716 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155380010 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155380502 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155380797 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155382600 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155383297 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155383337 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155383369 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.05 0.75 0.2 17 23 1 15 4 3 155384223 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155384586 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155385067 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155385327 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155385558 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155386295 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155386881 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155387362 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 155387749 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155387760 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155388691 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155390064 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155390092 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155390161 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155391219 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155392905 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155393525 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 155394621 A T N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 155395248 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155396318 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155398662 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155398964 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155399553 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 155399917 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 155400031 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 155400059 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 155400184 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155400291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155400751 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155401240 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155401330 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 155401545 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155402049 C G N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 155402108 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155402267 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155402995 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155403196 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155403552 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155404007 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155405055 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 155406087 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 155406717 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 155406754 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 155406912 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 155406992 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 155406995 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 155407046 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 155407226 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 155407384 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 155407385 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 155407479 G C Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 155407528 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 155407782 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155407857 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 155407980 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 155408003 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 155408073 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 155408210 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155408326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155408348 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155408371 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 155408447 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155408526 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155409728 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 155409952 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 155410074 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 155410086 C A N N 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 155410095 A G N Y 0.107142857142857 REF 0.3 0.3 0.107142857142857 0.892857142857143 0 0.214285714285714 0.785714285714286 3 25 0 3 11 3 155410101 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 155410124 C T N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 155410208 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155410261 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155410275 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 155410299 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 155410300 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 155410317 A G N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 155410387 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 155410536 A C Y N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 155410537 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155410593 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 155410635 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 155410660 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155410717 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155411001 A G N Y 0.25 REF 0.6 0.6 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 4 12 1 2 5 3 155411061 C T N Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 155411082 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 155411138 C T N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 155411198 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155411200 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 155411235 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155411242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155411469 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 155411754 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155411995 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155412093 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 155413044 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155413071 G T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 155413111 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 155413233 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 155413292 G T N N 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 155413343 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 155413354 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 155413492 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 155413791 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 155414108 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 155414217 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 155415230 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 155415251 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 155415329 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155415589 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155415658 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 155415932 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155416252 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 155416637 A G Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 155416713 T C Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 155417190 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 155418202 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155418213 T A N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 155418290 T C Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 155418340 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 155418395 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 155418438 A C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 155418473 T G N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 155418562 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 155418640 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 155418665 T G Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 155418730 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 155418788 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 155418945 T C Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155419040 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 155419372 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155419444 T C Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 155419668 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155419753 A C N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 155419785 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 155421185 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 155421493 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155421854 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 155421984 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155422833 G A N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 155423110 A C N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 155423268 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155424423 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155424589 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 155424741 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 155424875 G A N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.125 0.625 0.25 14 18 2 10 4 3 155424993 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 155425130 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155425183 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 155425259 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 155425319 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 155425657 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155425714 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155425753 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155425876 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 155425881 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155426037 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 155426655 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155427159 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155427304 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155427402 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155427418 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155427553 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 155427651 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 155427727 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155428658 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155435651 A T N N 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 155435751 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 155436016 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155436532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155438551 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155439938 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155440347 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155440357 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155441373 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155441649 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155441876 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155442197 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155442477 C A N N 0.4375 REF 0.6 0.6 0.4375 0.5625 0 0.875 0.125 7 9 0 7 1 3 155442493 T C N Y 0.4 REF 0.5 0.5 0.4 0.6 0 0.8 0.2 8 12 0 8 2 3 155443346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155445673 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155446930 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155447978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155450736 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155450965 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155451208 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155452037 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 155452204 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 155452207 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155452233 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 155452520 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 155453320 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155453570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155453797 A G N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 155455020 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155455382 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 155455589 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155455817 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 155455824 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 155455852 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 155455927 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 155456018 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155456718 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.105263157894737 0.578947368421053 0.315789473684211 15 23 2 11 6 3 155457096 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155457294 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 155457430 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155457791 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155457959 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155457969 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155458165 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155458181 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 155458400 G A Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.176470588235294 0.647058823529412 0.176470588235294 17 17 3 11 3 3 155459184 T G N N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 155459288 T G N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 155459484 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 155459499 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155459726 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.1 0.6 0.3 16 24 2 12 6 3 155459968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155460215 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155460472 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155460906 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155461219 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155461448 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155461542 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155461579 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155461696 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155461942 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155461958 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 155462044 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 155462052 T C Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 155462109 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155462260 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155462519 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155462674 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155462687 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155463044 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155463096 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155463356 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155463663 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155463811 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155464024 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155464085 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155464263 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155464363 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155465702 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155465711 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155465764 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155465823 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155466014 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155466690 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 155467103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155467271 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155467555 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155468077 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155468165 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 155468521 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 155469107 T C Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 155469465 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 155469522 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155469571 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155469753 T A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.3 0.6 0.1 24 16 6 12 2 3 155469772 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155469881 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155470030 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155471779 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 155471816 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 155471861 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 155471916 C T Y Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 3 155471938 A G N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 155471980 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 155472102 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 155472122 C A Y N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 155472300 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155472360 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0 0.5 0.5 10 30 0 10 10 3 155472406 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155472472 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.526315789473684 0.473684210526316 0 29 9 10 9 0 3 155472579 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155472750 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 155472884 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155472917 T C Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 155473032 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 155473124 T G Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 155473135 A G Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 155473152 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 155473168 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155473218 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 155473245 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 155473283 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 155473348 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 155473384 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 155473392 A G Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 155473458 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 155473465 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 155473595 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 155473672 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 155473685 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 155473698 A T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 155473722 A G Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 155473814 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 155473851 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 155474010 A C N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 155474022 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 155474032 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.473684210526316 0.526315789473684 0 28 10 9 10 0 3 155474079 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 155474096 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 155474107 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155474236 G T Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 3 155474290 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155474294 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155474413 T C N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.444444444444444 0.555555555555556 0 26 10 8 10 0 3 155474603 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155474988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155475169 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155475369 T A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 155475545 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 155475629 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155475763 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 155475956 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155475972 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 155475988 T A N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.5 0.5 0 30 10 10 10 0 3 155475997 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155476183 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 155476393 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 155476463 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 155476563 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 155476587 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155476841 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155476868 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155476932 C A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.0526315789473684 0.578947368421053 0.368421052631579 13 25 1 11 7 3 155477126 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 155477156 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 155477218 C A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 155477364 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 155477797 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 155477890 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155477959 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155478406 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155478557 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.25 0.25 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 5 25 0 5 10 3 155478692 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.294117647058824 0.588235294117647 0.117647058823529 20 14 5 10 2 3 155483580 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155483834 G C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 155483946 G C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.352941176470588 0.647058823529412 0 23 11 6 11 0 3 155484124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155484234 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155484717 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 155485031 T C N Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0.1 0 0.9 2 18 1 0 9 3 155485520 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 155485657 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155485695 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155485766 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155485892 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 155486477 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155486700 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155486753 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155486798 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155486854 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155486938 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155486946 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155486957 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155487025 C T Y Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 155487035 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155487042 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155487298 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155487438 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 155487657 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155488723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155489381 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155489553 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155489718 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155489744 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155490124 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155490129 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155490285 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155490451 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 155491104 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155491240 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155491312 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155491379 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155491445 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155491529 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155491532 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155491785 T A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 155491947 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155492037 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155492039 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155492159 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155492319 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155492423 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155492531 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155492567 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155492667 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155493118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155494906 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155495207 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155495340 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 155495623 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155496035 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155499663 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 155502651 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155503599 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155503614 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155509908 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155513184 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155513299 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155516143 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155518553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155518564 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155519072 T C Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155519344 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155519743 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155519759 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155519818 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155519995 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 155520165 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155520186 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155520892 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 155521072 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 155521306 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 155521408 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155521936 G T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 155521953 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 155521956 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 155521981 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155522328 T C N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.117647058823529 0.882352941176471 0 19 15 2 15 0 3 155522483 A T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 155522502 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 155522533 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 155522544 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155522651 A T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155522746 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155522787 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155522807 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155522810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155522838 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155522872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155522889 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155523153 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155523409 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 155524997 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155525309 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155525464 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155525614 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155525627 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155526140 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155527192 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155527200 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155527530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155527556 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155527629 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155530042 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155530140 C G N N 0.269230769230769 ALT 0.35 0.35 0.730769230769231 0.269230769230769 0.461538461538462 0.538461538461538 0 19 7 6 7 0 3 155530400 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155530468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155531931 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155533481 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155534170 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155534838 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155534842 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155535971 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 155536849 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155536881 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155536899 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155537014 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155537271 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155537595 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155538697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155539070 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155539264 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155539811 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155540244 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155540360 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155540479 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155540647 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155542212 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155542236 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155542337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155542642 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155542734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155542813 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155542814 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155543003 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155543034 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155543157 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155543254 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155543297 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155543312 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155543359 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155543485 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 155543585 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155543702 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155544117 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155544372 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155544863 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155544925 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155545949 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155546003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155546481 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155546562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155547068 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 155547105 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155547121 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155547217 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155547285 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155547411 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155547460 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155548089 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155548664 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155549433 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155549958 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155550045 G A N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 155551851 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155553215 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 155553652 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155554130 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155554292 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155554732 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155555648 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155555662 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155555694 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155556059 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155557092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155557629 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 155558659 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155558839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155558973 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155559064 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155559457 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155560911 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 155560924 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 155562552 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155563090 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155563414 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155563517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155563855 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155563874 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155564389 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155564468 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155565671 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155565943 T C Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155572379 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155572703 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155573319 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155574034 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155574073 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155576682 A G Y Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.2 0.8 0 18 12 3 12 0 3 155577869 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155578032 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155578350 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155578362 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155578367 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155578601 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155580164 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155582249 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155582478 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155582845 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155582886 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155583116 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155583159 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155583176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155583186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155583409 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155583452 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155583671 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155584028 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155584182 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155584583 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155584798 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155584846 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155584864 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155584993 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155585128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155585204 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155585235 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155585247 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155585304 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155585445 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155585532 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155585678 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155585785 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155586421 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155587406 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 155587844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155588061 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155588357 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155588840 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155588929 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155589134 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155589166 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155589460 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 155589700 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155590053 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155590843 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155591304 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155591353 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155591529 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155591848 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155591967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155592063 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155592259 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155592276 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155592400 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155592504 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155592522 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155592546 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155592573 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155592640 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155592656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155592665 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155592667 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155592692 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155592704 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155592802 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155592806 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155592824 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155592859 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155592900 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 155592901 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 155592949 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155592954 C A Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155592979 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155592994 G T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155593070 G A Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 155593155 A C Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 155593160 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 155593207 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 155593218 A G Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 155593246 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 155593260 C T Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155593278 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155593306 A T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155593344 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155593374 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155593384 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155593408 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155593438 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155593440 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 155593465 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155593480 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155593589 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155593657 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155593700 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155593736 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155593761 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155593762 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155593804 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155593933 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155594003 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155594248 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155594389 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155594752 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155594924 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 155595091 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155595297 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155595381 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155595427 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155595711 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155596348 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155596858 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155597105 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155598714 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 155598749 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155598814 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155599990 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155600336 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155601012 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155601305 A T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 155601318 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 155601329 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 155601646 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155602387 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155603379 C G Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155604389 T A N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 155605237 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 155606033 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155607118 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155607265 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155608216 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155608292 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155608488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155609012 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155609188 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155609233 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155609266 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155609452 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155609477 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155609522 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155609589 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155609673 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155609781 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 155609945 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 155610037 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 155610057 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 155610379 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155610448 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155610678 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155610729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155610762 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155611005 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155611010 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155611131 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155611211 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155611283 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 155611418 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155611656 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155611670 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155611696 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155611738 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155611750 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 155612224 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155612378 G T N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 155612645 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 155612716 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155616153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155616711 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155617748 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155619468 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155619542 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155619975 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155620908 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155620912 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155621273 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155621735 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155623674 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155623837 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155624040 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155624537 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155625108 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155625434 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155626972 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155627246 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155627623 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 155627644 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 155627665 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 155628005 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155629277 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155630914 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155631138 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155631599 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155632338 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155632767 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155632901 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155633314 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155633919 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155635591 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155635745 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 155635977 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 155636042 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 155636280 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 155636339 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155636364 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155636740 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155636776 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 155636810 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 155636894 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 155636899 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 155636953 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 155636967 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155636998 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155637037 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 155637066 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155637126 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 155637152 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155637301 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 155637353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155637595 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155637607 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 155637711 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155637794 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155637811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155637826 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155637846 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155637869 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155638000 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155638010 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 155638014 G T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 155638080 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 155638081 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 155638092 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 155638116 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 155638148 C G Y N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.533333333333333 0.466666666666667 0 23 7 8 7 0 3 155638190 A G N Y 0.3 REF 0.75 0.75 0.3 0.7 0 0.6 0.4 3 7 0 3 2 3 155638317 A T N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 155638333 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155638405 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 155639001 G A N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 155640493 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155641131 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155641991 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155645584 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155645599 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155645836 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155645993 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 155646985 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155647563 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 155648053 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155648056 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155648105 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155648156 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155648166 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155648224 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155648272 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155648287 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155648376 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155648401 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155648460 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155648482 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155648503 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155648526 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155648702 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155648747 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155648760 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155648810 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155648829 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155648835 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155648863 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155648875 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155648908 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155648932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155649115 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155649140 C A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 155649347 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 155649348 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155649451 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155649615 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155649677 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155649707 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155649761 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155649807 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155649818 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155649888 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155650034 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 155650322 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155650408 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155650580 G C N N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 155650720 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 155650724 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 155650731 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155650757 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155650784 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155650817 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155650860 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155650868 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 155650895 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155651589 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155651931 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155652103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155652893 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155653547 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155653848 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155653855 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155653883 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 155653929 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155654067 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155654128 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155654143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155654162 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155654269 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155654526 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155654806 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 155654868 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155654962 T C N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 155655002 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 155655075 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 155655095 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 155655119 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 155655245 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 155655257 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 155655286 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155655341 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155655471 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155655543 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155655555 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155655728 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155655769 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155656012 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155656073 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155656378 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155656419 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155656466 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155656510 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155656585 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155656589 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155656650 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155656730 G T Y N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.5 0.5 0 18 6 6 6 0 3 155656816 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155657218 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155658113 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155658223 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155658594 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 155658884 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 155658909 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 155658957 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155658988 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155659064 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155659580 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155659824 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 155660243 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155660844 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155661491 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 155661859 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155665465 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155665531 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155665584 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155666883 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155667386 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155671721 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155672791 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155672915 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155673153 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155673215 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155673427 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155675224 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155675449 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155675910 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155676003 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 155676060 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155676459 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155676700 A G N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 155677132 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155677245 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155677275 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155677324 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155677426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155677459 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155677469 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 155677559 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155677601 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155677938 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155680355 A C N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 155680923 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155680943 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155681009 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 155681055 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155681145 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 155681409 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 155681421 A C N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 155682170 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155682443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155682691 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155682756 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155682841 G T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155682844 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155682912 A C N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 155683148 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 155683354 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 155683389 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 155683462 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 155683506 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155683631 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155683654 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 155683661 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 155683694 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155683702 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 155683817 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 155683825 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 155683834 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 155683841 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155683914 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155684040 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155684155 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155684237 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155684281 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155684679 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 155685074 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155685101 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155685137 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155685538 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 155686099 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 155686141 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 155686155 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 155686498 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 155686624 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155686847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155687189 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155687280 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 155687680 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155688112 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155688115 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 155688330 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 155688468 G T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 155688534 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155688962 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 155689126 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155689213 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 155689236 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 155689251 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155689291 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155689491 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 155689608 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 155689630 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155689723 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 155689871 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 155689964 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155690225 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155690256 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 155690381 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155690442 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155690729 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155690789 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155690851 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 155690917 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 155690962 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155691151 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155691157 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 155691166 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 155691262 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 155691413 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 155691454 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 155691553 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155691622 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155691754 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 155692243 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155692326 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 155692434 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155692665 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 155692733 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 155692774 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155692794 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155692806 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155692815 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155692923 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 155693114 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155693124 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 155693301 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 155693807 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 155694077 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 155694405 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 155694680 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155695193 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155695315 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155695331 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 155695332 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 155695351 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 155695572 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 155695697 C A N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 155696023 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155696259 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 155696590 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155697228 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155697486 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 155697673 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 155697783 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 155697961 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 155699833 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155700323 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 155700324 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 155700474 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155701852 A T N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 155702172 G A N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 155705535 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155705595 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155706348 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155707336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155707840 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155707899 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155708189 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155708420 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 155709611 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155709877 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155710133 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155710258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155710620 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155714840 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155714870 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155715422 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 155716150 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155716227 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155716856 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 155717087 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 155718270 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155719910 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155720791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155720902 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155721196 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155721272 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155721510 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155721670 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155721684 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155722157 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155722530 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155723288 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155723705 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155724022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155725905 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155726706 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155727738 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155728032 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155728141 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155728159 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155728278 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155728298 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155728906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155729002 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155729040 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155729041 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155729124 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155729163 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155729199 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 155729859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155729872 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155729956 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155730231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155730248 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155730268 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155730326 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155730387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155730400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155730484 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155730584 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155730748 G A N Y 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 3 155730750 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 3 155731215 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155731791 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155731795 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155731854 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155731916 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155731995 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155732025 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155732031 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155732098 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155732107 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155732139 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155732223 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155732258 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155732278 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155732306 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155732517 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155732522 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155732530 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155732535 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155732580 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155732775 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155732922 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155733004 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155733007 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155733067 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155733244 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155733371 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155733561 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155733707 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155733717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155733724 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155734142 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155734972 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155735093 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155735126 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155735477 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155735501 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155735646 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155736133 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155736302 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155736546 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155736833 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155736857 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155736873 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155737616 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 155737646 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 155737760 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155737761 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155737822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155737843 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155737921 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155737922 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155738042 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155738057 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155738187 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155738304 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155738512 G A N Y 0.409090909090909 REF 0.45 0.45 0.409090909090909 0.590909090909091 0 0.818181818181818 0.181818181818182 9 13 0 9 2 3 155738576 A G N Y 0.5 ALT 0.9 0.9 0.5 0.5 0 1 0 2 2 0 2 0 3 155738638 C T N Y 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 155738642 A T N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 155738843 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155738876 A G N Y 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 155739023 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155739026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155739042 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155739353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155740451 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155741312 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155741891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155743216 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155743908 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155744994 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155745747 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155746379 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155746500 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155746587 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155747164 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155751220 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155752136 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155752243 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 155752246 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 155752332 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155752361 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155752847 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155752911 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155753296 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 155753368 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 155753628 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155753691 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155754392 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 155755383 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155755406 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155755419 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155755448 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155756117 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155756490 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155756584 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155756609 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155757313 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155758157 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155758178 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155758387 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155759635 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155759656 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155759738 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155759751 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155760026 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155760249 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 155760253 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155760408 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155761168 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155762247 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155762938 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155765413 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155768524 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155768822 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155770258 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155770395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155770779 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155770976 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155771055 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155771356 G A N Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.357142857142857 0.642857142857143 0 19 9 5 9 0 3 155771456 T G N N 0.166666666666667 REF 0.7 0.7 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 2 10 0 2 4 3 155771543 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 155771646 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155771728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155772106 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155772558 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155773321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155773467 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155773522 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155773848 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155774088 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155774909 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155774924 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155776684 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155776874 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155777018 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155777206 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155778107 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155778561 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155778647 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155778859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155779005 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155780002 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155780405 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155781944 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 155781974 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 155782157 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155783739 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155787611 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155789719 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155790207 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155790461 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155792317 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155792526 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155793067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155793076 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155794390 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155796430 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155796492 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 155797209 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155797460 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155797481 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155798000 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155799006 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155799131 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155800104 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155800190 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155800415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155800818 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155801031 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155801052 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155801081 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155801095 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155801308 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155801584 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155801726 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155801744 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155801994 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155802407 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155802425 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155802750 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155802877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155803117 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155803165 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155806252 A G Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 155807346 C G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 155807621 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155807804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155808580 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155808927 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155809306 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155809558 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155810291 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155810746 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155812276 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155812784 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155813123 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155813157 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155813171 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155814507 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155814562 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155814852 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155814984 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155815025 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155815026 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155815302 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155815576 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155815596 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155816062 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155816543 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155817226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155817698 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155817702 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155817807 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155817850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155817973 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155817985 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155818006 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155818086 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155818108 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155818109 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155818197 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155818210 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155818260 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155818283 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155818374 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155818494 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155818552 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155818711 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155818766 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155818799 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155818808 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155818824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155819109 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155820885 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155821756 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155824395 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155824723 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155824981 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155825373 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155828586 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155828611 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155828634 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155828646 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155828657 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155828670 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155828711 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155828783 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155828815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155828829 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155828923 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155828952 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155828953 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155829613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155829712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155830105 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155830251 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155831024 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155831394 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155831895 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 155832446 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155832589 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155832590 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155832883 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155832971 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155832983 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155833170 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155833268 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155833292 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155833313 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155833548 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155833730 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155833825 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155833872 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155833917 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155833986 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155834016 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155834029 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155834230 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155834308 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155834360 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155834565 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155834679 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155834714 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155834966 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155835011 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155835017 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155835065 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155835127 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155835138 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155835184 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155835248 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155835419 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155835427 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155835443 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155835583 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155835830 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155835845 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155835863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155836063 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 155836408 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155836431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155836537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155836640 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155836641 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155836737 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155836741 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155836794 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 155836854 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155836880 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 155836918 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155836937 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155836950 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155836988 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155837052 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155837127 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155837173 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155837366 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155837467 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155837507 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155837733 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155838087 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155838417 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155838447 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155838561 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155838597 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155838678 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155838697 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155838884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155838938 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155839015 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155839039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155839047 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155839068 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155839088 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155839107 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155839146 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155839153 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155839164 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155839211 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155839231 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155839274 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155839333 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155839532 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155839548 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155839840 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155839894 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155839902 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 155839905 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 155840046 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155840143 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155840204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155840241 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155840245 C A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 155840291 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155840405 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155840533 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155840597 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155840608 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155840672 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155840699 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155840743 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155845717 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155845757 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155845769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155845792 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155845964 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155845966 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155846027 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155846030 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155846049 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155846468 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155846510 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155846556 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155846574 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155847109 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155847154 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 155847260 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155847514 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155847750 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155847938 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 155848222 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155848264 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155848385 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155848540 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155848647 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155848686 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 155849036 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155849072 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155849160 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155849179 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155849180 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155849292 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155849317 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155849368 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155849392 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155849397 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155849901 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155849903 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155849930 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155849971 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155849990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155850045 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155850126 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155850814 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155850984 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155850991 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155851162 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155851207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155851210 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155851302 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 155851311 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155851348 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155851433 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155851570 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155851825 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155851838 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155851912 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155852122 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155852333 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155853012 T G Y N 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 155854613 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155854709 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155854847 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155855296 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155855860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155855924 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155855933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155856073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155856120 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155856491 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155856526 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155857005 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155857327 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155857452 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155858081 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155858418 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155858772 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155858774 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155858964 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 155859211 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155859571 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155859581 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155860847 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155860975 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155861157 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155861477 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155861935 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155861959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155862720 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 155862811 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155862908 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155865009 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155865071 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155865147 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155865819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155868125 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155868212 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155868901 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155870787 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155870957 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155871310 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155871618 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155871874 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155872020 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155875251 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.55 0.55 0.277777777777778 0.722222222222222 0 0.555555555555556 0.444444444444444 5 13 0 5 4 3 155881743 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155885796 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155885817 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155886220 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155886700 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155887370 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155887513 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155887514 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155887774 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155887965 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155888515 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155888963 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 155889206 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 155889288 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155889375 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 155889646 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 155890278 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 155890421 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 155890832 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 155890847 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 155890860 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 155891151 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155891158 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155891368 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155892404 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 155892792 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 155893220 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 155893543 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 155893921 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 155895445 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 155895761 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 155901670 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155902415 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155903388 G T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 155903517 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155904260 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155906820 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155907079 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155907106 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155907941 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155908119 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155909269 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155911178 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155911258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155911738 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155912916 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155913791 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155913991 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155916217 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155918451 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155918575 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155918576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155919125 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155919136 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155919237 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155926465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155927178 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155928524 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155928539 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155930621 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155930923 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155930996 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155931286 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155931532 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155933948 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155934277 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155934346 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155934362 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155934434 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155934446 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155934475 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155934529 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155935087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155937360 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155937463 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155937904 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155938043 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155938093 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155938606 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155938664 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155938954 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155939582 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155940388 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155941810 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155942963 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155943064 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155943131 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155944700 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155945092 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155947670 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155954931 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155955385 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155957189 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 155957797 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155957858 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155961103 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155963676 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155965565 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155966090 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155966892 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155967128 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155967185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155967627 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155967650 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155967789 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155967799 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 155968061 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155968074 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155968263 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155968355 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155971542 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155971554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155971877 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155972055 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155975939 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155976057 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155976929 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 155977156 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155978762 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155978859 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155978889 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155979058 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155985996 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155988464 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155990902 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155992176 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155992284 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155992508 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155993378 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 155993659 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155994624 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155994920 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 155995017 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 155997865 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 155999681 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156001861 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156001867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156002195 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156002408 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156002675 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 156002676 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 156003469 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156004648 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156004713 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156004820 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156004831 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156005049 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156005059 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156005089 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156005165 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156005342 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156005408 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156005627 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156006371 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156006500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156006554 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156006752 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156006774 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156006937 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156007038 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156007173 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156007565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156007749 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156008030 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156008149 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156008301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156008455 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156008522 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156008557 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156008900 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156008979 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 156008996 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156009538 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156009663 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156009678 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156010059 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 156010570 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156010826 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156010845 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156012025 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156012177 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156012190 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156012422 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 156012449 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156012623 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156012988 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156013442 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 156013809 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156015128 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156015400 G A Y Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 3 156015747 T A N N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0 0.384615384615385 0.615384615384615 5 21 0 5 8 3 156016440 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156016530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156016565 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156017859 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156019964 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156020497 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156021292 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156022239 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156022646 G T Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 156022801 T C Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 156023256 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156023757 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156023972 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156024104 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156024716 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156025175 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156026105 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156026123 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156027955 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156028044 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156028118 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156028374 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156028473 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156028577 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156028932 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156030872 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 156030878 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156031226 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156031710 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156031979 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156034498 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 156034516 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 156034919 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156035153 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156035731 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156036430 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156037078 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156037449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156037466 A T N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 156037496 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156037511 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156037634 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156037704 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 156037745 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156037776 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156037833 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156037956 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 156037994 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 156037997 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 156038008 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156038067 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156038335 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 156038464 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 156038508 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 156038609 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156039004 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 156039120 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156039217 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156039280 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156039373 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156039517 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 156039696 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 156039796 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156039814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156039865 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156040037 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 156040117 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156040515 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 156040550 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 156040616 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 156040621 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156040732 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156040783 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156040882 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156041091 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156041271 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156041504 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156041523 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156041541 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156041619 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 156041638 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 156042212 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156042407 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156042442 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156042461 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156042545 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156042627 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156042638 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156042656 C G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 156042671 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156042710 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 156042798 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 156042838 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156042859 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156042958 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156043261 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156043544 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 156043551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156043630 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156043652 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156043733 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156043848 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156043885 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156043911 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156044107 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156044114 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 156044249 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 156045549 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156045553 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 156045634 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156045806 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156045945 C T N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 156046814 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 156048181 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 156049616 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156050789 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 156054334 T G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 156054490 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 156054609 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156055107 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 156055126 G C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 156055136 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156055169 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156055188 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 156055368 G A Y Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0 0.6875 0.3125 11 21 0 11 5 3 156055379 A G Y Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 156055430 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156055524 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156055561 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156055597 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156055626 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156055764 G T N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 156055867 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156055872 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156055958 C A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156056079 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156056128 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156056139 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156056144 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156056246 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 156056637 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 156056713 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 156056763 C G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 156056782 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 156057012 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156057034 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156057598 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156058870 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 156059001 T C N Y 0.115384615384615 REF 0.35 0.35 0.115384615384615 0.884615384615385 0.0769230769230769 0.0769230769230769 0.846153846153846 3 23 1 1 11 3 156059413 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 156059659 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 156060115 C T N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 156060145 T C N Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 156060146 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 156060371 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156060379 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 156060487 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156060625 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156061079 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156061199 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 156061239 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156061285 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156061362 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156061617 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156061646 T C Y Y 0.1875 ALT 0.6 0.6 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 13 3 5 3 0 3 156061648 T C Y Y 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 3 156062080 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156062108 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156062580 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156062704 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156062895 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156063372 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156063637 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156063862 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156064487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156064885 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156066504 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 156066874 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156067342 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156067603 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156067821 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156067906 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156068527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156068619 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156069344 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156069710 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156069917 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156070034 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156070256 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156070270 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156070330 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156070357 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156072305 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156072351 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156072749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156072821 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156073239 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156073492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156074249 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156074259 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156074882 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156075476 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 156076613 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156076701 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156076867 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156077073 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156078923 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156079274 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156080937 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 156081032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156081371 A C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 156081567 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 156082197 C T N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 156082517 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156084668 C A Y N 0.384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.615384615384615 0.384615384615385 0.230769230769231 0.769230769230769 0 16 10 3 10 0 3 156085025 A G N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 156085595 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156086560 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156086844 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156086946 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156087510 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156087776 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156088240 C A Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156088345 C T N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 156088413 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156088427 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156089057 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 156089178 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 156090180 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156090687 G C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 156090745 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156090781 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156090787 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156090971 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156091020 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156091121 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156091322 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156091337 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156091539 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156091719 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 156091722 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 156091772 A C N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 156091936 G C N N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.357142857142857 0.428571428571429 0.214285714285714 16 12 5 6 3 3 156093208 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156093286 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156093367 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156093380 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156093490 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156093714 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156093817 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156094091 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156094448 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156094486 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156094501 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 156094558 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156094987 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156095509 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156095756 A G Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 19 17 1 17 0 3 156097935 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156098094 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156098229 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156098582 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156098685 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156099065 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156099248 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156107632 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156109555 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156110094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156110349 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156110739 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156111151 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156111208 A C N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 156111377 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156111401 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156111697 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156111753 T A Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156111754 A T Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156111782 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156111847 G C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156111964 T G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 156112294 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156112451 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156112811 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156113043 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156113284 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156113364 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156113438 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156113629 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156114167 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156114222 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156114238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156115495 A C N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 156115518 A T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 156115604 T A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156115658 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156115795 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156115874 T G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156115924 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 156116155 C G Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156116694 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 156117275 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156117797 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156118118 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156118669 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156118765 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156118846 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156118953 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 156118995 A C N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156119003 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156119049 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156119229 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156119405 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156119455 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156119528 T C N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 156119568 G T N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 156119585 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 156119661 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156119766 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156119868 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156120077 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156120084 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156120133 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156121119 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 156121229 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156121330 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156121522 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156121580 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156121637 G C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 156121643 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156121788 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 156122457 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156122499 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156122504 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156122678 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156122821 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156122884 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156123056 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156123277 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 156123551 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 156123778 G T Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 156124026 G A Y Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.235294117647059 0.470588235294118 0.294117647058824 16 18 4 8 5 3 156124047 A G N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 156124229 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156124524 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156124671 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156125001 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156125554 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156126112 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.4 0.4 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 4 20 0 4 8 3 156126337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156126399 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156126419 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156126509 G A Y Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 156126631 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156126660 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156126667 G A Y Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 156126771 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156127119 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156127128 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156127136 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156127149 C T Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 156127456 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156127687 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156127694 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156127830 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156128013 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156128893 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156129183 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 156130076 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156130077 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156131846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156133029 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.294117647058824 0.470588235294118 0.235294117647059 18 16 5 8 4 3 156133223 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 156133733 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156134099 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156134350 T G Y N 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 156134781 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156134826 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156134859 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156134891 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156135806 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156136135 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156136173 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156136536 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156137078 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156137230 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156137261 A T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156137268 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156137283 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156137345 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156138491 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 156138890 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 156138966 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156138994 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 156139070 A T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 156139549 G T N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 156141697 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156141706 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 156141763 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 156142647 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156142933 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156143895 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156144331 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156144348 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156144440 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 156144567 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156144599 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156145050 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 156145063 A C N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 156145896 C A Y N 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 156145931 C T Y Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 156145959 C A Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 156145971 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156146293 C T Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 156148950 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 156149092 C A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 156149604 G A Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 156149734 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156150682 C A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 156150695 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156150906 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156151174 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156151358 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 156151906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156152040 C A Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 156152239 A G Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.8 0.2 0 18 2 8 2 0 3 156152342 C T Y Y 0.166666666666667 REF 0.85 0.85 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 1 5 0 1 2 3 156152895 G C Y N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 156152909 A C Y N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 156153122 A C N N 0.5 ALT 0.5 0.5 0.5 0.5 0.4 0.2 0.4 10 10 4 2 4 3 156153516 C T Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 156153557 C A Y N 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 156153663 A C Y N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 3 156154037 C A Y N 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 3 156154344 T C Y Y 0.0625 REF 0.6 0.6 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 1 15 0 1 7 3 156155321 A G Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 156155471 G C Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 156155731 G T Y N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 156156209 T C Y Y 0.321428571428571 ALT 0.3 0.3 0.678571428571429 0.321428571428571 0.5 0.357142857142857 0.142857142857143 19 9 7 5 2 3 156156499 G A N Y 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 156156516 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 156157177 T C Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 156157484 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 156157546 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 156157821 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 156158249 T G N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 156158696 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 156158913 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 156159029 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156159213 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 156159472 C T N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 156159544 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 156160100 T C N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 156160139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156160371 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 156160501 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156160525 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156161283 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156161754 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156161927 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 156162030 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 156163212 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156163279 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156163911 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 156163912 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 156163958 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 156164030 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.294117647058824 0.294117647058824 0.411764705882353 15 19 5 5 7 3 156164173 A G N Y 0.363636363636364 REF 0.45 0.45 0.363636363636364 0.636363636363636 0.181818181818182 0.363636363636364 0.454545454545455 8 14 2 4 5 3 156164723 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156164728 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 156164775 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 156165149 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156166032 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156166064 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156166175 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156166243 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156166436 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156168077 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156169116 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 156169903 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156170521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156172084 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156172200 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 156172796 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156173641 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156174249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156175107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156176274 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156178880 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156178959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156179149 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156180234 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156183060 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156183202 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156185167 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156187276 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 156187964 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156188198 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156188204 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156188522 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156188537 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156188554 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156188569 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156188817 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156188957 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156195099 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156195658 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156198334 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156198402 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156200391 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156200687 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 156203113 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156205163 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156205663 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156205684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156205945 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 156206219 C T N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.266666666666667 0.666666666666667 0.0666666666666667 18 12 4 10 1 3 156206938 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 156208313 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156209907 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 156209927 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 156209951 C A N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 156210228 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 156210258 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156210446 T A N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 156210538 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 156210855 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156210933 C T N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 156211292 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 156211380 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 156211935 T A N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 156212042 G T N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 156212210 A T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 156212226 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 156212246 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 156212509 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 156212560 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 156212629 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 156212720 C A N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 156212851 G A N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 156212978 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 156212986 G C N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 156212999 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 156213016 T A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 156213025 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 156213064 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 156213131 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 156213162 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 156213173 C T N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 156213193 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 156213194 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 156213272 T G N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 156213906 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 156214015 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 156214099 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 156214238 G T N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 156214279 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 156214297 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 156214673 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 156215085 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 156215279 T A N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 156215306 A C N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 156215446 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 156215541 A G N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 156215801 A C N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 156215999 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 156216132 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 156216915 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156217023 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 156217321 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 156217360 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 3 156217373 A G N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.375 0.3125 0.3125 17 15 6 5 5 3 156218182 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156218347 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156218377 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156218499 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156219086 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156219176 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 156219332 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 156220107 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156220585 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 156220598 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 156220605 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 156221176 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156221300 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156221317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156221464 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156222031 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156223851 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156224710 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 156225541 C G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 156225854 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 156226337 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156226544 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156226664 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156227020 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156227102 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156229224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156229274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156230730 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156230825 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156230964 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 156231019 C T N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 3 156231100 G A N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 156231152 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 156231186 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 156231224 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 156231364 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 156231572 T A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 156231585 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 156231609 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 156231618 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 156231688 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 156231754 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 156231952 A G N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 156231959 C G N N 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.294117647058824 0.529411764705882 0.176470588235294 19 15 5 9 3 3 156232053 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 156232211 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 156232212 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 156232225 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 156232250 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 156232374 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156232654 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 156232785 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156232856 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156232939 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 156233039 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 156233068 A C N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 156233108 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156234096 C G N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 156234375 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 156234397 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 156234400 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 156234634 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156234848 C A N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 156234884 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156234989 G T N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 156235038 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156235137 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156235221 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 156235678 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 156236042 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.25 0.75 0 25 15 5 15 0 3 156236360 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156236566 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 156236898 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156237562 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156238279 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 156238974 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 156239546 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156239738 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156240105 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 156240130 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 156240384 G A Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 156240661 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 156240789 G C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 156241302 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156242402 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 156242468 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 156242648 G A Y Y 0.125 REF 0.8 0.8 0.125 0.875 0 0.25 0.75 1 7 0 1 3 3 156243206 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156243245 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156243272 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 156243300 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156243305 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156243471 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156243625 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156243641 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156243870 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 156244174 T A N N 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 156244828 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 156245089 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 156245197 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156245242 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156245628 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156245780 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 156245923 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 156246002 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 156246014 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 156246168 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 156247291 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 156247504 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 156247730 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156247906 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 156247931 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 156248158 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156250047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156250360 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 156250804 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156252057 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156252155 C T Y Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 156252240 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156252876 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156253656 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 156253784 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156254051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156254453 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156254800 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156256026 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156257008 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 156259644 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156261167 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 156262062 C T Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 156262403 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 156263824 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156265551 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156267812 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156268434 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156268621 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 156268915 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156269076 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156269130 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 156269250 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156269486 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.277777777777778 0.222222222222222 0.5 14 22 5 4 9 3 156269661 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 156269991 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 156270296 C G N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 156270334 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.315789473684211 0.210526315789474 0.473684210526316 16 22 6 4 9 3 156270410 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 156270446 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 156270536 C G Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 156270552 A G Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 156270911 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 156271358 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 156271737 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 156271980 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 156272084 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 156272363 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 156272386 G A Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 156272464 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 156272839 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 156272910 G T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 156272919 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 156273113 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156276136 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156276721 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156278238 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156278822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156279839 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156279871 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156280873 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156281221 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 156282121 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 156282842 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156283278 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156283643 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156285321 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156285507 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156285836 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156286443 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156287059 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 156287465 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156288006 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 156289072 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156290446 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156290528 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 156292282 G A N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 156292423 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156292715 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 156293489 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 156294272 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156294751 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156294754 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 156294768 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156294781 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156294903 A C N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 156294904 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156294966 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 156294975 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 156295118 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156295297 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156295702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156296091 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156296102 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156296307 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156296308 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156296956 A G N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 156297679 A C N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 156297835 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 156298036 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156298252 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156298961 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 156299065 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156299279 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 156299722 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 156299936 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156301325 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 156302763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156305128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156305627 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156305704 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156306074 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156306979 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156308892 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 156309203 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156310703 A C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 156310991 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 156311281 T G N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 156311308 C G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 156311586 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156311704 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156312079 T C N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 156312100 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 156312230 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 156312428 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156313424 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156313433 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156313529 T G N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 156313799 A C N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 156313846 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 156313855 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 156313925 G T N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 156313962 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 156314013 T A N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 156314037 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 156314338 G T N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 156314366 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 156314399 C G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 156314470 A T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 156314521 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 156314698 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 156314891 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156314903 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 156314970 T C N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 156315095 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 156315170 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 156315256 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 156315367 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156315394 A G N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.3125 0.3125 0.375 15 17 5 5 6 3 156315414 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156315439 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156315809 C A N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 156315888 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156315990 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 156316006 G A N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 156316086 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 156316151 G T N N 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.277777777777778 0.388888888888889 0.333333333333333 17 19 5 7 6 3 156316296 T G N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 156316328 G C N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 156316396 A T N N 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.352941176470588 0.294117647058824 0.352941176470588 17 17 6 5 6 3 156316418 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 156316439 G A N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 156316690 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 156316762 T G N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 156316834 T C N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 156317113 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 156317252 G T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 156317309 T G N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 156317389 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 156317424 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 156317705 A T N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 156317911 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156318051 T C N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 156318124 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 156318164 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 156318439 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 156318453 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 156318522 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156318830 G C N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 156318956 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156319135 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 156319138 A T N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 156319403 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 156319479 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 156319669 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 156319862 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156320350 A G Y Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 156320374 A G Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 156320716 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156320784 C T N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 156320835 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 156320839 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 156320882 T C N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.315789473684211 0.263157894736842 0.421052631578947 17 21 6 5 8 3 156322177 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156322756 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156324642 G T N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 156324973 T G N N 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.277777777777778 0.277777777777778 0.444444444444444 15 21 5 5 8 3 156325261 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 156327865 G C N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 156328067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156328373 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156328675 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156329521 A T Y N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 156330392 G A Y Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.533333333333333 0.0666666666666667 0.4 17 13 8 1 6 3 156330670 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156331233 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156331250 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156331428 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156331475 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 156332163 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156333330 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 156333647 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 156333666 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156333686 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156333716 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156334137 A G N Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.333333333333333 0.277777777777778 0.388888888888889 17 19 6 5 7 3 156334176 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156334184 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156334263 C A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 156334334 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 156334344 T G N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 156334354 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 156334478 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156334501 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156334624 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 156334736 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 156334872 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156335170 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156335209 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156335824 T A N N 0.346153846153846 REF 0.35 0.35 0.346153846153846 0.653846153846154 0.0769230769230769 0.538461538461538 0.384615384615385 9 17 1 7 5 3 156336090 A G Y Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 156336440 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156336551 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156336575 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156336670 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156337251 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156337505 T G Y N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 156337692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156338202 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156338298 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 156338554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156338769 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156339073 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156339626 T A N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 156340006 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156342812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156343036 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156343121 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156343238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156343383 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156344032 T A N N 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 156344116 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156344303 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156344483 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 156344689 G A N Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 156344889 C T Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 156345146 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156345571 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156345713 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156345863 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156345886 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156345921 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156346043 T G Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 156346245 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156346256 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156346663 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156346778 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156346963 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156347004 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156347018 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156347209 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 156347248 G C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 156347321 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156347542 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156347965 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156348280 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 156348937 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 156349185 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156349203 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156349640 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156349718 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156349760 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156349832 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156350673 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156350707 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156350921 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 156351045 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 156351570 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156351601 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.157894736842105 0.473684210526316 0.368421052631579 15 23 3 9 7 3 156351846 T G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 156351889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156352131 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156352141 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156352215 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 156352248 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156352276 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 156353033 T G Y N 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.111111111111111 0.666666666666667 0.222222222222222 8 10 1 6 2 3 156353188 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156353534 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156353612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156353667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156353757 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156354363 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 156354419 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 156355188 A G N Y 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.357142857142857 0.285714285714286 0.357142857142857 14 14 5 4 5 3 156355475 C A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.2 0.5 0.3 18 22 4 10 6 3 156355908 T C Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 156356009 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156356863 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156357703 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156357968 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156358663 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156358740 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156358761 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156358778 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 156358876 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 156358898 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156358911 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156360020 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 156360578 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156360604 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156360608 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156360723 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156361030 C T N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 156361069 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156361112 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156361248 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 156361321 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156361536 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156362348 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 156362897 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 156363184 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156363401 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156363438 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156363484 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 156363986 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 156364053 A T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 156364073 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 156364158 A G N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 156364317 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156364424 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156365401 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 156366132 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 156366191 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156366326 C A N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 156366364 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156367042 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156367046 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 156367177 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156367331 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156367528 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156367716 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156368073 A T N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 156368353 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156368444 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156368685 G A N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 156368771 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 156369923 G T N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 156370236 C T N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 156370257 T C N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 156370558 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156370581 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 156370682 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156370909 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156370936 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 156370953 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 156371277 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 156371326 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 156371348 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156371392 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156371498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156371635 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156371921 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156371937 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 156371951 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156372002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156372011 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156372034 A C N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 156372047 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 156372359 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156372380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156372459 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 156372474 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 156372475 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 156372496 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 156372507 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 156372557 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156372573 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 156372584 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 156372615 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 156372840 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 156372908 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.235294117647059 0.352941176470588 0.411764705882353 14 20 4 6 7 3 156372932 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 156373045 C A N N 0.3 ALT 0.75 0.75 0.7 0.3 0.4 0.6 0 7 3 2 3 0 3 156373140 A G N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.625 0.125 0.25 11 5 5 1 2 3 156373169 A G N Y 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 3 156373261 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 156373309 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 156373416 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156373495 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 156373580 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 156373597 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 156373718 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 156373955 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 156373984 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 156374051 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 156374200 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 156374307 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 156375151 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156375195 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 156375291 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 156375311 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156375576 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 156375578 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 156375723 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156375961 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 156375972 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156376137 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 156376291 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156376362 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 156376533 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 156376923 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 156377038 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156377077 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 156377189 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 156377623 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 156377653 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 156377693 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156377707 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156377758 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 156378172 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156378301 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156378314 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156378333 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156378927 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156379012 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 156379445 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156379590 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156379650 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156379696 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156379981 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156381671 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 156381776 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 156381953 T G N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 156381980 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156382229 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 156382234 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 156382272 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 156382398 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156382422 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156382423 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156384031 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156384500 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.133333333333333 0.466666666666667 0.4 11 19 2 7 6 3 156384592 T G N N 0.269230769230769 REF 0.35 0.35 0.269230769230769 0.730769230769231 0 0.538461538461538 0.461538461538462 7 19 0 7 6 3 156384617 C T N Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 156384650 C A N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 156384658 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 156384787 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 156384924 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 156384930 C A N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 156384941 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 156384957 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 156385026 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156385158 C G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 156385493 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 156385563 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156385566 G T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 156385815 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156385872 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156385900 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156386520 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156386545 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 156386646 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 156386806 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 156386874 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156386888 A T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 156386905 A G N Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.4375 0.4375 0.125 21 11 7 7 2 3 156386990 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 156387000 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 156387053 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 156387110 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 156387182 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 156387191 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 156387841 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156387843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156394839 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156395038 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 156395108 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156395143 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156395318 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 156395332 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 156395552 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 156395598 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 156395650 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 156395663 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 156395740 A T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 156395927 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 156396237 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 156396266 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 156396282 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156396536 T G N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 156396628 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156396997 T C N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 156397060 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156397082 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 156397133 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 156397331 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156397353 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 156397424 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 156398046 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 156398520 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 156398579 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 156398620 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 156398646 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156398698 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 156398823 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 156398988 T C N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 156399718 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 156399766 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 156399920 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 156400234 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 156400287 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 156400403 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 156401028 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 156401231 C T N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 156401249 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 156401367 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156401474 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 156401593 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 156401710 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156401744 C A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 156401825 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 156401859 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156401863 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156401872 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156402214 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156402774 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156402896 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156402897 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156403130 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 156403148 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156403201 G A N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 156403219 T C N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 156403358 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 156403445 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 156403469 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 156403566 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 156403768 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 156403799 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156403839 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 156404017 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 156404156 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156404173 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 156404363 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 156404530 C A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 156404817 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156404845 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 156404880 A T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 156405249 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156405257 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 156405397 C T N Y 0.2 REF 0.5 0.5 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 4 16 1 2 7 3 156405423 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 156405461 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156405685 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156405901 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 156405925 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 156405937 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156405990 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156405995 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156406012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156406028 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156406122 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156406133 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156406225 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156406288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156406703 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156406751 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156407300 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 156407304 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 156407442 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156407895 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156407992 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 156408057 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 156408062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156408202 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 156408428 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156408469 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156408504 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156408775 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 156408843 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156408879 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 156408902 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156409031 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 156409042 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 156409203 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 156409275 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 156409418 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156409584 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 156409586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156409595 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156409604 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156409609 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156409656 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 156410045 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 156410079 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156410558 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156410579 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156410593 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156410661 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156411012 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156411017 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156411061 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.526315789473684 0.263157894736842 0.210526315789474 25 13 10 5 4 3 156411206 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156411237 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156411253 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156411331 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156411482 G A N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 156411490 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 156411912 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156412032 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156412039 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156412083 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156412382 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156412687 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156412706 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156413019 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 156413127 G C N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 156413196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156413320 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 15 25 5 5 10 3 156413427 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156413491 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156413563 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156413709 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 156413979 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156414133 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156414599 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 156414715 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156414717 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156414775 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156414827 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156414882 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 156414963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156415265 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156415335 C T Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 156415409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156416184 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156416232 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156416316 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156416394 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 156416700 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156416786 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 156417110 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156417259 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156417505 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156418641 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156418785 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156419106 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 156419115 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 156419198 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156419403 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156419623 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 156419854 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 156420128 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156420212 T C N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 156420231 A T N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 156420232 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 156420244 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 156420245 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 156420256 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 156420318 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 156420350 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 156420393 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 156420541 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 156420924 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 156420948 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 156421013 A G N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 156421024 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 156421098 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156421272 T G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156421273 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156421394 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156421480 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156421567 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156421657 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 156421946 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156421979 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156422040 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156422055 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156422060 T G N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.25 0.25 0.5 12 20 4 4 8 3 156422089 G T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.1875 0.3125 0.5 11 21 3 5 8 3 156422158 G A N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 156422187 A C N N 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 156422219 A G N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.285714285714286 0.214285714285714 0.5 11 17 4 3 7 3 156422234 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 156422241 T C N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 156422277 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 156422310 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156422447 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156422452 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156422489 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156422504 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 156422521 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156422598 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156422615 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156422627 T G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 156422651 C A N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 156422696 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156422761 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 156422961 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156423598 A T Y N 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 156423739 G T N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 156423898 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 156424001 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156424174 G A Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 156424302 T A Y N 0.333333333333333 ALT 0.7 0.7 0.666666666666667 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.333333333333333 8 4 4 0 2 3 156424303 T C N Y 0.357142857142857 ALT 0.65 0.65 0.642857142857143 0.357142857142857 0.571428571428571 0.142857142857143 0.285714285714286 9 5 4 1 2 3 156424326 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 156424379 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 156424421 A C Y N 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 156424461 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 156424500 C T Y Y 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 3 156424569 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 156424625 A G Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 156424626 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 156424714 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 156424836 C A Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.666666666666667 0.133333333333333 0.2 22 8 10 2 3 3 156424908 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 156424910 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156424933 G A Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 156425013 A C N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 156425028 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 156425152 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 156425180 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156425234 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156425343 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156425393 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156425436 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 156425437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156425450 T C Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 156425649 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156425688 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156425725 G A Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 156425753 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 156426336 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156426465 C A Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 156426692 C A Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 156426766 C T Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 156426770 A T Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 156426783 A C Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 156427031 G C Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 156427037 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 156427063 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 156427077 A G Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 156427495 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156427661 C A Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 156427781 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156427849 A G Y Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 156427980 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 156428019 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156428032 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 156428352 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 156428408 A C N N 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 156428413 A T N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.5625 0.1875 0.25 21 11 9 3 4 3 156428657 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 156428707 G C N N 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 156428777 C G Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 156428785 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 156429014 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 156429054 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 156429075 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156429084 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156429168 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156429187 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156429252 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 156429273 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156429372 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 156429394 A G Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 156429396 T G N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 156429420 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 156429468 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156429509 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156429604 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156429858 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156430013 C T N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 156430051 A G Y Y 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.214285714285714 0.714285714285714 0.0714285714285714 16 12 3 10 1 3 156430303 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 156430321 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 156430348 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 156430784 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 156431770 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156431941 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 156432005 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 156432142 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156432337 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156432379 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156432395 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156432527 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156432550 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156432678 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156432856 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 156432876 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 156433000 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156433197 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156433247 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 156433386 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156433429 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156433439 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156433461 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156433792 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 156433859 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156434064 G C N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 156434070 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 156434117 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 156434212 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156434242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156434299 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156434307 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156434365 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156434465 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156434627 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156434800 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 156434835 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156435019 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156435049 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156435191 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156435250 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 156435308 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 156435320 T A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 156435407 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156435487 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156435540 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 156435588 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 156435981 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 156436002 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 156436009 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 156436053 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 156436085 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 156436422 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156436696 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156437940 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156437973 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156438111 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156438321 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 156438533 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156438566 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156438713 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156438726 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156438852 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156438988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156438989 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156439067 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156439100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156439117 A T Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 156439129 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156439475 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 156439605 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 156439686 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 156439708 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156439755 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156439783 G A Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 156439816 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156439833 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156439911 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156440151 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156440266 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156440377 G T Y N 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 156440378 T C Y Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 156440652 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156441046 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 156441076 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 156441939 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156441962 T G Y N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 156441993 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156442008 T A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 156442025 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156442099 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156442153 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156442203 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156442329 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156442337 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156442370 T G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 156442466 G A Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 156442534 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156442573 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156442579 A C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 156442706 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 156442723 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 156442753 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156442796 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156442802 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156442861 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156443115 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156443258 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156443551 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 156443799 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 156443883 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156443985 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156444684 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 156444717 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156445238 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156445600 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 156445651 T G N N 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 15 9 6 3 3 3 156445667 T C N Y 0.0416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.958333333333333 0.0416666666666667 0.916666666666667 0.0833333333333333 0 23 1 11 1 0 3 156445886 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 156445887 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 156445940 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 156445973 T C N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 156446157 T C N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 156446158 G A N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.176470588235294 0.294117647058824 0.529411764705882 11 23 3 5 9 3 156446464 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156446467 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156446515 T A Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 156446601 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156446604 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156446829 T C N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 156446854 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156446888 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156446898 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 156446901 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156446958 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 156447009 A T N N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 156447042 T C Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 156447043 A G Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 156447148 T C Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.222222222222222 0.777777777777778 0 22 14 4 14 0 3 156447149 C G N N 0.34375 ALT 0.2 0.2 0.65625 0.34375 0.3125 0.6875 0 21 11 5 11 0 3 156447285 G C Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 156447290 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 156447335 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156447563 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156447822 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 156448015 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156448366 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 156448495 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 156448506 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156448655 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156448807 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156448883 A G N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 156448954 T C N Y 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 156448955 G C N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 156449243 T A Y N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 156449340 C A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 156449473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156449871 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156450314 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 156451561 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156451804 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156452155 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 156452223 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156452440 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156453586 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156454101 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156454102 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156454395 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156454542 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156454945 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 156455404 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156455533 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 156455620 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156457286 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 156457414 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156457787 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156458085 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 156458186 T A N N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 156458198 G A N Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 156458603 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 156458776 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156458814 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156458847 T C N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 156458974 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156459030 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156459049 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156459184 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156459322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156459349 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156459365 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156459407 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156459422 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156459724 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156459758 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156459775 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 156460180 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156460224 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156461208 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 156462103 G T Y N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.470588235294118 0.529411764705882 0 25 9 8 9 0 3 156468038 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156468091 T A N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 156468142 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 156468164 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156468178 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156468214 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156468363 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 156468369 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 156469020 G T N N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 156469814 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 156469857 A G N Y 0.0384615384615385 ALT 0.35 0.35 0.961538461538462 0.0384615384615385 0.923076923076923 0.0769230769230769 0 25 1 12 1 0 3 156469894 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156470668 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156472717 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156472845 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 156473046 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156474151 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 156474610 T C Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 156474651 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156474686 G A Y Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.111111111111111 0.444444444444444 0.444444444444444 12 24 2 8 8 3 156475684 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 156475979 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 156476043 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156476050 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 156476190 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 156476276 G A N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 156477226 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 156477261 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 156477417 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 156477845 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156477861 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 156477978 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156477984 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 156478407 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156478703 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 156478881 C G N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 156479030 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156479175 G T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 156479213 C G Y N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156479467 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156479479 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156479482 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156479619 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156479743 A C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 156480529 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156480602 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156480941 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156482105 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156482115 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 156482116 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156482254 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156482538 A C N N 0.416666666666667 REF 0.4 0.4 0.416666666666667 0.583333333333333 0.0833333333333333 0.666666666666667 0.25 10 14 1 8 3 3 156482871 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156482880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156482929 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156483027 C A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.105263157894737 0 0.894736842105263 4 34 2 0 17 3 156483220 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156483238 A C Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 156483462 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 156483867 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 156484035 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156484099 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 156485843 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156485867 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 156486078 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156486246 C T Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156486446 T A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 156487103 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156487227 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156487772 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156488268 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156488383 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156488454 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 156488692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156488906 C A Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156488953 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156489183 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 156489244 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156489553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156489717 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156490002 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.1 0 0.9 4 36 2 0 18 3 156490012 C A Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 156490127 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 156490381 T C Y Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 156490707 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 156490879 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156490884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156490958 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156491054 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156491121 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 156491125 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 156491341 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156492055 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 156492622 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156492959 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156492964 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156493028 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156493140 C G Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 156493248 T A Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 156493303 T C Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 156494326 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 156494493 A C N N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 156494873 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156496305 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156497197 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156498421 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156498863 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156499816 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156502359 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156503714 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156504393 C T Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.0666666666666667 28 2 14 0 1 3 156504969 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156505119 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156505149 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156505830 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156505847 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156506122 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156506285 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156506372 G C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 156506379 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156506398 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156506418 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156506662 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156506665 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156506844 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156506913 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156506966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156506971 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156507072 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156507159 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 156507160 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 156507184 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156507205 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156507211 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156507237 T A N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 156508292 C A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 156508757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156508845 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 156508854 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156508865 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156508918 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156508967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156509522 A T N N 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.307692307692308 0.307692307692308 0.384615384615385 12 14 4 4 5 3 156509651 C T N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 156509690 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156509918 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 156509961 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156509972 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156510019 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 156510359 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156510403 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156510545 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 156510766 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156510833 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156511065 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156511130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156511165 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156511240 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 156511253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156511411 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156511453 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156511476 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156511503 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156511711 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 156511814 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156511870 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156512025 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156512026 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156512081 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156512136 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156512357 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 156512412 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156512532 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156512576 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156512586 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156512659 A C N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 156512660 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 156512740 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156512747 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 156512803 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156512825 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156512879 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156513056 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156513062 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156513072 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156513121 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156513175 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156513240 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156513577 A C N N 0.5 ALT 0.45 0.45 0.5 0.5 0.363636363636364 0.272727272727273 0.363636363636364 11 11 4 3 4 3 156513617 A C N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 156513687 C A N N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 156513800 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 156513835 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 156513916 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 156514027 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156514037 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156514124 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 156514125 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 156514186 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156514208 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156514228 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156514288 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156514304 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 156514368 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156514449 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156514461 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156514586 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156514684 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156514687 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156514707 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156514732 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 156514780 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156514784 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156514804 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156514852 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156514947 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156515022 T G N N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 156515047 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156515116 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156515569 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156515632 G T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 156515863 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156515939 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156516236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156517111 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 156519809 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156520087 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156520747 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156520921 C T N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 156520982 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156521100 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 156521296 C A N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.157894736842105 32 6 16 0 3 3 156521374 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 156522170 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156523320 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156527963 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156528444 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156532408 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 156536341 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156536414 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156536427 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156536496 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156536573 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156537354 T C Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 156537556 G A Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 156537682 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156538480 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156538854 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 156538928 A G N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156538992 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 156538999 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 156539299 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 156539338 T G N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 156539371 T G N N 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.266666666666667 0.333333333333333 0.4 13 17 4 5 6 3 156539437 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 156539492 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 156539894 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156540106 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156540387 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 156540411 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156540498 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156540580 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156540617 C A N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156540926 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156541166 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156541196 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156541312 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156541323 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 156541324 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 156541390 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 156541416 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 156541581 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156541585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156542003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156542254 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156542465 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156542485 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156542518 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156542700 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156542870 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156542976 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156543226 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156543227 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156543241 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156543283 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156543321 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156543408 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156543440 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156543914 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156544251 C T Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156544679 A G Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 156545280 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156545324 A G Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 156545340 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 156547424 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156547850 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156547882 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156547980 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 156548092 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156548157 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 156548188 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156548208 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156548221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156548224 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156548258 T C N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 156548329 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 156548370 G A Y Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 156548422 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 156548998 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156551022 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 156551227 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 156552436 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156553184 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 156554389 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 156559816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156560572 T G N N 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 156562419 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156565027 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 156566023 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156566522 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156567212 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 156568082 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156570422 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 156570577 C T N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156571322 A C N N 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 156571420 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156571553 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0.117647058823529 0.117647058823529 0.764705882352941 6 28 2 2 13 3 156571841 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 156572064 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 156572114 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156572408 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 156572417 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 156572434 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 156572505 C T N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 156572516 G C N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 156572531 A T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 156572713 G A N Y 0.375 REF 0.4 0.4 0.375 0.625 0.0833333333333333 0.583333333333333 0.333333333333333 9 15 1 7 4 3 156572889 T A N N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.125 0.5 0.375 12 20 2 8 6 3 156572894 T C N Y 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.133333333333333 0.533333333333333 0.333333333333333 12 18 2 8 5 3 156572986 G C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 156572987 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 156573002 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156573044 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 156573121 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156573178 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156573343 A C N N 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 156573354 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156573590 T A N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 156573694 C G N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 156573935 A T N N 0.464285714285714 ALT 0.3 0.3 0.535714285714286 0.464285714285714 0.285714285714286 0.5 0.214285714285714 15 13 4 7 3 3 156574073 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156574107 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 156574123 T A N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 156574164 A T N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.111111111111111 32 4 16 0 2 3 156574256 T C N Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.153846153846154 22 4 11 0 2 3 156574513 C T N Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.142857142857143 0.571428571428571 0.285714285714286 12 16 2 8 4 3 156574519 C T N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 156574663 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 156574684 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156574767 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156575285 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 156575287 G T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 156575421 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156575524 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 156575661 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 156575766 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156575997 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156576021 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156576177 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156576329 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156576346 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156576558 A G Y Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.4 0.6 0 21 9 6 9 0 3 156576696 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 156576715 C A N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 156576741 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156576832 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156576870 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 156576886 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156576981 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156577046 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156577106 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156577173 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156577174 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156577306 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156577313 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156577317 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156577357 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156577420 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156577430 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156577468 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156577496 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156577715 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156578490 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 156578658 A G N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 156578860 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 156578889 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156579243 T C Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 156579258 G C Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 156579264 T C Y Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 156579342 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 156579612 T A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 156579766 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 156579983 A T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 156580085 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 156580107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156580261 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 156580389 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.0555555555555556 0.444444444444444 0.5 10 26 1 8 9 3 156580415 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 156580543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156580564 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156580575 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156580751 T A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 156580773 C A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 156580820 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 156580863 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 156581062 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156581495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156581510 C T Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 156581524 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 156582410 A G N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 156582441 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156582554 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 156582584 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156582611 C T N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 156582685 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 156582951 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 156583011 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 156583068 T C N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 156583071 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156583113 A T Y N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 156583261 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156583357 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156583530 T A Y N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0.1 36 4 18 0 2 3 156583735 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156583782 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 156584211 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156584695 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 156584860 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156585330 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156585425 C T N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.111111111111111 0.0555555555555556 0.833333333333333 5 31 2 1 15 3 156585515 C G N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 156585721 G A Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.1 0.05 0.85 5 35 2 1 17 3 156586230 T G Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 156586231 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 156586345 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 156586435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156586471 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 156586514 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 156586591 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 156586606 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 156586654 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 156586684 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 156586840 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 156586888 C G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 156586977 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 156587011 G A Y Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 156587097 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 156587173 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 156587340 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156587341 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 156587562 T C N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 156587751 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.105263157894737 33 5 16 1 2 3 156588174 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156588410 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156588444 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156588549 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156588758 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 156589036 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156589580 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156590097 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156590696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156590796 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 156591084 T C N Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 156591105 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 156591120 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 156591180 T C N Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.428571428571429 0.428571428571429 0.142857142857143 18 10 6 6 2 3 156591250 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 156591417 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 156591424 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 156591513 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156591719 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 156591738 C A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.157894736842105 0.0526315789473684 0.789473684210526 7 31 3 1 15 3 156591748 T G N N 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 156591769 A C N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.210526315789474 0.473684210526316 0.315789473684211 17 21 4 9 6 3 156591784 A T N N 0.4 REF 0.25 0.25 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 12 18 3 6 6 3 156591791 T A N N 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.1875 0.5 0.3125 14 18 3 8 5 3 156591827 T C N Y 0.411764705882353 REF 0.15 0.15 0.411764705882353 0.588235294117647 0.176470588235294 0.470588235294118 0.352941176470588 14 20 3 8 6 3 156591851 T A Y N 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 156591903 T C N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 156592823 G T Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.8 0.05 0.15 33 7 16 1 3 3 156592939 G A N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 156593105 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.166666666666667 29 7 14 1 3 3 156593256 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.15 0.05 0.8 7 33 3 1 16 3 156593476 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156593580 G A Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 156593838 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 156593941 A G N Y 0.0714285714285714 ALT 0.65 0.65 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 13 1 6 1 0 3 156593944 C T Y Y 0.0625 ALT 0.6 0.6 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 15 1 7 1 0 3 156594027 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156594086 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.133333333333333 0 0.866666666666667 4 26 2 0 13 3 156594105 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.176470588235294 27 7 13 1 3 3 156594147 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156594202 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.105263157894737 34 4 17 0 2 3 156594372 C G Y N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.111111111111111 31 5 15 1 2 3 156594862 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156594928 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 156595083 G A N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 156595385 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 156595510 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156595549 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156595653 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156595772 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156595938 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.157894736842105 31 7 15 1 3 3 156596521 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 156596585 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156596656 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156596659 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156596673 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156596787 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.166666666666667 0.0555555555555556 0.777777777777778 7 29 3 1 14 3 156596862 A C N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 156597239 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156597402 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156597409 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156597626 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156597786 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156597822 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 156597861 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156597889 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156598714 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156599715 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156599868 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156600322 T G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 156600644 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 156600831 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156601972 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 156602344 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156602974 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156603073 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156603688 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156604135 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156604877 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156606926 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 156606991 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156607674 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156608311 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156610299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156610527 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156611057 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 156613861 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156614716 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156615124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156615386 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156616258 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156617648 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156618286 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156618300 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156618343 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156618360 G T N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 156618551 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 156618576 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156619182 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156620431 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156621150 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156622386 C T Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 156623297 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156623480 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156630396 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156631666 T A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 156631741 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 156631777 T G N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 156631946 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156632155 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 156632760 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 156632910 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156633169 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156633339 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156633685 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 156633732 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 156633734 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 156633822 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.210526315789474 0.105263157894737 0.684210526315789 10 28 4 2 13 3 156633829 C G Y N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 156634074 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 156634204 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 156634226 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156634249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156634253 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 156634272 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 156634278 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 156634358 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 156634543 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 156634588 C T Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 156634747 T C N Y 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.117647058823529 0.176470588235294 0.705882352941177 7 27 2 3 12 3 156635407 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 156635661 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156636096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156636153 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 156636291 T A Y N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 156636345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156636593 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156636704 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156636712 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156636751 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 156636846 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156636902 G A N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 156637154 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 156637200 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 156637206 C T N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 156637259 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 156637264 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.105263157894737 0.0526315789473684 0.842105263157895 5 33 2 1 16 3 156637318 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 156637404 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156637423 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156637456 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.222222222222222 0.166666666666667 0.611111111111111 11 25 4 3 11 3 156637472 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 156637647 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 156637656 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 156637736 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156637754 A C Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 156637856 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 156637897 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 156637991 C G N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 156638012 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 156638013 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 156638030 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 156638165 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 156638197 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 156638209 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 156638367 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 156638416 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 156638445 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 156638648 T A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 156638782 G T N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 156638853 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 156638866 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 156638917 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 156638932 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 156639020 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156639069 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 156639473 G C N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 156639661 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156639684 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 156639752 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 156640070 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 156640115 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156640118 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 156640241 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 156640539 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156640570 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 156640581 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 156640583 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 156640626 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 156640668 C G N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 156640689 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 156640741 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156641021 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 156641151 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 156641213 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 156641255 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 156641258 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 156641672 A T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 156641897 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 156642121 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 156642405 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 156643618 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 156643872 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 156643937 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156644076 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156644803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156645913 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156645959 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 156646414 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 156646429 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 156646491 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156646498 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156646505 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 156647087 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156647256 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156647896 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156649216 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156650922 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156652361 T C Y Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 156652470 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156653903 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 156655080 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156655229 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156655910 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156658286 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 156659033 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156659289 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156659872 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156661307 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156661439 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 156663709 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156663714 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 156663734 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 156664805 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 156664965 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156665231 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156665274 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156665476 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156665550 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 156665644 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 156665654 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156665666 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156665922 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 156665930 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156666005 C A Y N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 156666051 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156666116 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 156666144 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 156666145 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 156666200 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 156666221 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 156666326 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156666392 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156666407 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156666433 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156666574 A T Y N 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.692307692307692 0.230769230769231 0.0769230769230769 21 5 9 3 1 3 156666723 C T Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 156666745 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.6875 0.125 0.1875 24 8 11 2 3 3 156666873 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156666884 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156667150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156667701 C G Y N 0.0555555555555556 REF 0.55 0.55 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 1 17 0 1 8 3 156667885 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156668284 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 156668400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156668508 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.1 0.1 0.8 6 34 2 2 16 3 156668757 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156669034 G A N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 156669414 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156669439 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 156669455 A G N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 156669511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156669534 T A N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.105263157894737 0.684210526315789 0.210526315789474 17 21 2 13 4 3 156676121 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156676271 A T N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 156676311 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 156676336 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 156676550 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 156676606 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 156676674 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156676974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156677039 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 156677067 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 156677127 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 156677148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156677534 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 156677590 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156678359 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 156678652 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 156678812 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 156679242 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156679387 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 156679393 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 156679682 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 156679683 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 156679724 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 156680258 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156680388 G T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 156680390 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156680761 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 156680865 A G N Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 156681722 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 156682542 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 156682625 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 156682833 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156683019 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 156683065 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 156683802 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 156683813 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156683843 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 156683918 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 156684228 T C N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 156684669 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 156684696 C A N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.235294117647059 25 9 12 1 4 3 156684806 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 156685008 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 156685206 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 156685269 T A Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 156685352 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 156685366 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 156685378 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 156685408 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 156685415 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 156685433 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156685521 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 156685525 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 156685721 T A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 156685794 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 156685812 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.85 0.05 0.1 35 5 17 1 2 3 156685844 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 156685874 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 156685991 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156685995 C A N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.684210526315789 0.105263157894737 0.210526315789474 28 10 13 2 4 3 156686211 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156686279 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 156686284 C G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.277777777777778 0.0555555555555556 0.666666666666667 11 25 5 1 12 3 156686535 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 156686582 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 156686692 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 156686733 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156686835 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 156686980 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 156687017 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 156687113 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 156687169 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 156687182 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156687215 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156687414 C G N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 156687462 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 156687561 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156687616 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156687631 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156687657 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156688283 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156688503 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 156688603 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 156689593 T A N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0 0.611111111111111 0.388888888888889 11 25 0 11 7 3 156689623 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 156690250 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.2 0.1 0.7 10 30 4 2 14 3 156690628 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.4 0.333333333333333 0.266666666666667 17 13 6 5 4 3 156690650 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 156690704 A G N Y 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 156690744 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156690987 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.25 0.1 0.65 12 28 5 2 13 3 156690990 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156691326 A C N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 156691333 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 156691540 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 156691829 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156691849 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156691886 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 156692366 A T N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 156692410 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156692526 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156692611 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 156692732 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 156692743 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 156693101 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156693318 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 156693423 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 156693652 T G N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 156693785 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156693956 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 156693991 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156694026 C A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 156694051 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 156694213 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 156694359 G T N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 156694375 G A N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 156694409 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 156694416 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 156695023 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156695129 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156695258 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156695266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156695420 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 156695565 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156695740 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156695754 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156695755 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156695787 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156696021 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156696788 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156698393 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156699259 A C N N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 156699458 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 156699483 A G N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 156699652 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156699798 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156699947 A T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 156699959 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 156700005 T C N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.133333333333333 0.133333333333333 0.733333333333333 6 24 2 2 11 3 156700093 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 156700169 A G N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.153846153846154 21 5 10 1 2 3 156700426 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156700493 T C Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 156700508 C T N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 156700525 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156700540 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 156700802 A T N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 156701216 C T Y Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 156701358 C T N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0.0625 0.125 0.8125 4 28 1 2 13 3 156701560 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156701681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156701852 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156701908 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 156702450 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156702611 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156702782 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 156702982 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156703000 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156703216 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 156703217 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 156703228 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156703245 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 156703507 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 156703706 G A Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 156703736 T G Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 156703763 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 156703859 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 156704031 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156704161 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 156704458 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156704473 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 156704484 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 156704492 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156704496 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0.0588235294117647 0.0588235294117647 0.882352941176471 3 31 1 1 15 3 156704505 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 156704937 G A N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 156704959 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 156704983 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 156704996 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 156705072 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156705351 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156705463 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156706259 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156706330 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156706637 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156706736 A G Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 156706906 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156707106 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.117647058823529 0.0588235294117647 0.823529411764706 5 29 2 1 14 3 156707843 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156707866 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 156708075 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156708190 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156708430 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156710786 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156711005 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 156711318 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156712571 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156712615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156712691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156712740 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156712966 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156713169 T A Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 156713256 A G Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 156713421 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 156713455 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156713939 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156714543 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 156714772 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156715174 A T Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 156715221 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 156715514 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156715599 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 156715716 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156715892 T C Y Y 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.466666666666667 0.533333333333333 0 22 8 7 8 0 3 156716543 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156716721 A T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 156716836 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 156716940 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156717440 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 156717984 A C Y N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 156718040 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156718144 C T N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 156718191 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 156718213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156718256 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156718592 G C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 156718823 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156718836 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156719204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156719689 T A N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 156719912 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 156719942 T A N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 3 156720002 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156720222 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 156720318 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156720381 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 156720536 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156720792 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156720807 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.125 0.0625 0.8125 5 27 2 1 13 3 156720923 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 156721035 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 156721855 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156721856 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156721908 A G N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 156722100 A T Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 156722110 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 156722186 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156722376 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 156722443 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 156722488 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156722646 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 156722670 G T N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 156722848 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156722866 C G N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 156722896 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156723181 G C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 156723188 C A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 156723248 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 156723341 A G N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 156723369 T C N Y 0.1 REF 0.25 0.25 0.1 0.9 0 0.2 0.8 3 27 0 3 12 3 156723463 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 156723632 C T N Y 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 15 15 5 5 5 3 156723647 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 156723656 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 156723698 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156723761 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 156724067 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156724133 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156724324 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156724504 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 156724529 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.2 0.15 0.65 11 29 4 3 13 3 156724544 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 156724660 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 156724864 T C Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 156724884 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156725016 A G Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 156725149 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156725205 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.631578947368421 0.157894736842105 0.210526315789474 27 11 12 3 4 3 156725208 G A N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 156725263 T G N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 156725410 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 156725421 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 156725588 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156725691 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156725774 C T Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 156725852 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156726045 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156726120 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.8 0.1 0.1 34 6 16 2 2 3 156727272 G A Y Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 156729134 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156729516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156730753 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156733421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156733811 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156734687 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156735312 G T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 156735595 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156735615 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156737760 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156740565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156740786 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 156741031 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156741061 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156741111 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 156741116 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156741255 G A N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 156741322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156741345 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156741386 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156741496 G A N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 156741549 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156741573 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 156741665 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156741681 T C N Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 156741807 T C Y Y 0.1 REF 0.5 0.5 0.1 0.9 0 0.2 0.8 2 18 0 2 8 3 156741832 T C N Y 0.5 ALT 0.4 0.4 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 12 12 4 4 4 3 156741940 T A N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 156742027 G A N Y 0.5 ALT 0.55 0.55 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 9 9 3 3 3 3 156742126 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 156742424 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 156742448 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156742548 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156742589 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156742660 G A N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156742713 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156742733 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156743007 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156743272 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156743338 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156743369 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156743373 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156743387 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156743443 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156743512 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156743827 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 156743849 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156743938 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156744009 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156744052 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156744096 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156744127 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156744138 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156744153 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156744455 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156744463 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 156744518 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 156744963 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 156745101 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 156745695 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156745781 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 156746904 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156746905 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156746927 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156748119 T C Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 156748884 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156749487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156749835 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156750736 C A N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 156751183 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 156751458 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 156751466 G A N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 156751610 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 156751675 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156751759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156751972 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156752027 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156752065 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.352941176470588 0.411764705882353 0.235294117647059 19 15 6 7 4 3 156752220 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156752556 T C N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 156752566 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 156752875 G T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 156753025 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 156753201 G T N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 156753332 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156753391 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 156753478 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156753531 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 156753712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156753770 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156754546 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 156754654 C T N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 156755048 T A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 156755104 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156755213 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 156755265 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156755838 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156756122 A G Y Y 0.428571428571429 REF 0.3 0.3 0.428571428571429 0.571428571428571 0.0714285714285714 0.714285714285714 0.214285714285714 12 16 1 10 3 3 156756297 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156756327 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 156756377 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156756409 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 156756614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156756885 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156757014 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156757266 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 156757275 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 156757918 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 156757955 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156758199 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 156759585 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156762047 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156762766 G A Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 156763246 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156763473 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156763483 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 156763547 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 156765252 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156765308 C G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 156765420 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156765427 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156765433 T A N N 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 156765467 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 156765959 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156766279 C T Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 156766925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156767756 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 156767982 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 156767997 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156768757 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156768861 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156768866 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156769292 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 156769349 T C N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 156769392 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 156769661 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 156769848 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156769873 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156769905 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156769908 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156769932 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156770119 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156770122 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156770209 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156770285 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156770500 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156770863 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 156770949 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 156771021 A G N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 156771088 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 156771198 G T N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 156771259 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156772859 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 156772867 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 156774073 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156774217 A G N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.470588235294118 0.470588235294118 0.0588235294117647 24 10 8 8 1 3 156774836 A C Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 156774895 G T Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156774965 G A Y Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.5625 0.375 0.0625 24 8 9 6 1 3 156775771 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156775772 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156775838 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156776218 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 156776972 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 156776978 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 156777038 T G N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 156777096 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 156777106 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 156777114 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 156777293 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156777299 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 156777352 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 156777488 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156777495 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156777716 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156777865 A G N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 156777951 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156778069 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 156778073 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 156778485 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156778652 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156779624 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156779799 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156779982 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156780095 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156780141 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156780165 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 156782002 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156782022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156782080 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156782376 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156782377 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156782421 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156782433 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156782962 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 156783122 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156783162 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156783185 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 156783549 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 156783714 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156783858 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 156783889 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156784229 C T Y Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0 0.923076923076923 0.0769230769230769 12 14 0 12 1 3 156784393 T C N Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.0625 0.75 0.1875 14 18 1 12 3 3 156784468 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 156784768 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 156784775 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 156784784 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 156784803 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 156784823 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 156784858 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156784883 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156785002 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 156785026 C G N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 156785028 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 156785043 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 156785100 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156785193 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 156785305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156785378 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156785453 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 156785454 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 156785540 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 156785548 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 156785557 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 156785587 A T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 156785650 A C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 156785704 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 156785845 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 156785919 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 156785954 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 156785981 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 156786015 T A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 156786166 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 156786190 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 156786220 G A N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 156786266 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156786282 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 156786351 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 156786355 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 156786532 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156786540 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156786562 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156786603 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 156786618 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 156786952 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156786966 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 156787145 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 156787149 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 156787234 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 156787285 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 156787299 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156787487 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156787557 C T N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 156787677 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156787706 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 156787733 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 156787793 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 156787929 C G N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 156788000 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 156788019 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.411764705882353 0.470588235294118 0.117647058823529 22 12 7 8 2 3 156788468 C G N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 156788698 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 156788769 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 156789119 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 156789495 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156791318 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156792159 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156793064 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156793356 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156794353 G T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 156797461 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 156797574 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156798587 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156800609 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156800681 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156800766 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156805041 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156805315 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 156805324 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 156805394 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.368421052631579 0.473684210526316 0.157894736842105 23 15 7 9 3 3 156805429 G A N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.333333333333333 0.533333333333333 0.133333333333333 18 12 5 8 2 3 156805448 T C N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.411764705882353 0.411764705882353 0.176470588235294 21 13 7 7 3 3 156805463 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.388888888888889 0.444444444444444 0.166666666666667 22 14 7 8 3 3 156805530 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156805749 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 156805904 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156805941 C A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 156806000 A C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 156806006 T A N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 156806073 T G N N 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 156806198 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 156806219 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156806270 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 156807990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156807991 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156808593 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156808888 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156808943 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 156809682 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156809733 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156810138 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156810590 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156810727 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 156810861 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 156811119 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156811262 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156811265 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156811333 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156811597 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156811654 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156812299 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 156812317 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 156812323 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 156812369 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156813587 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156814259 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 156814415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156814428 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156814436 A G Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 156814480 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156814805 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 156815514 C G N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156816857 G A N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 156816910 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.4 0.4 0.333333333333333 0.666666666666667 0 0.666666666666667 0.333333333333333 8 16 0 8 4 3 156816999 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156817667 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 156817796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156818408 G A N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 156818634 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 156818662 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 156818669 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 156818776 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156818882 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 156819074 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 156819102 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 156819413 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 156819476 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 156819484 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 156819534 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 156819541 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 156819926 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 156819927 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 156820008 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 156820045 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 156820057 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 156820126 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 156820202 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 156820290 C T N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 156820407 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 156820421 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 156820439 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 156820470 G T N N 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.166666666666667 0.444444444444444 0.388888888888889 14 22 3 8 7 3 156820553 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 156820558 A G N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 156820694 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 156820895 T C N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.125 0.375 0.5 10 22 2 6 8 3 156820963 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 156821050 C A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 156821150 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 156821468 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156821653 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156821945 G A Y Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 156822143 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156822408 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156822440 A G Y Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 156822457 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156822824 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156822890 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156822904 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156822907 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156823018 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156823038 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156823131 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156823181 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156823449 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156823460 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 156823472 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156823518 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 156823744 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156824006 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156824014 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156824087 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156824101 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156824133 G A Y Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 156824323 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 156824547 G C N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 156824640 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 156824765 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156824799 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 156824904 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 156824943 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 156824981 G A N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 156825137 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156825170 G A Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 156825207 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156825320 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 156825362 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 156825494 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 156825553 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 156825565 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156825904 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 156826085 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 156826093 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156826268 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 156826777 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156826801 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156826861 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 156827301 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156827445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156827475 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156827545 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156827566 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156827597 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 156827647 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 156827657 T A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 156827675 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156827738 A G N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 156827757 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 156827762 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 156827778 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 156827920 G C N N 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 156828133 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156828179 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156828183 T C Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 156828202 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156828214 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156828215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156828233 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156828347 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156828625 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156828629 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156828694 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156828708 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156828870 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156828886 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156828932 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156828965 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156829027 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156829124 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156829239 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156829244 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156829302 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156829406 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156829518 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156829598 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156829688 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156829969 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156830075 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 156830088 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 156830206 G C N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 156830622 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 156830636 C G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 156830666 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 156831138 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156831542 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156831569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156831904 A T N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 156832241 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 156832408 C T Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 156832881 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156833793 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 156833945 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156835616 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156835619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156835639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156835662 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156835813 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 156836353 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156837220 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156837468 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156837670 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156837683 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 156838116 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156838217 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156839312 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156841252 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156843267 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 156843363 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156843907 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156844372 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.15 0.45 0.4 15 25 3 9 8 3 156844478 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156844732 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156845601 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156845876 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156846344 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156846728 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 156847901 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156848711 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156849485 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156849632 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 156850278 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156852825 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156853513 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156857530 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 156857583 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 156857637 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 156857851 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156858135 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 156858771 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 156858778 A G Y Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 156859415 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156859666 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156859972 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 156862622 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156863639 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156864156 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156864354 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156865677 G C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 156867249 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156868025 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 156868702 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 156868763 C A Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 156868801 A C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 156868944 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 156869176 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 156869280 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156869761 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 156870006 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156870490 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 156870534 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 156870592 A G N Y 0.433333333333333 ALT 0.25 0.25 0.566666666666667 0.433333333333333 0.333333333333333 0.466666666666667 0.2 17 13 5 7 3 3 156870757 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 156870790 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156871144 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156871186 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156871193 T C Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.111111111111111 0.5 0.388888888888889 13 23 2 9 7 3 156871225 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156871231 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 156871341 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 156871388 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156871480 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156871672 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 156871747 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 156871873 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 156872369 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 156872558 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156872691 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 156872793 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 156872934 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156873221 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156873512 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156873520 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 156873910 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156874035 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156874251 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156874301 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 156875230 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 156875246 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 156875364 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 156875658 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156875743 C T Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 156875847 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156875922 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156876060 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156877081 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 156877184 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 156877266 A C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 156877270 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156877353 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156877500 C G N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 156877644 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 156877762 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 156877768 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156877839 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 156878347 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 156878783 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 156878937 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156879212 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 156879820 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156880464 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 156880574 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 156880704 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 156880961 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 156882149 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156882260 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 156882345 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 156882971 T C Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 156883001 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156884768 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156884885 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 156885081 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156885085 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156885223 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156885233 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156885682 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 156885834 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 156886696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156886702 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 156888421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156890670 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 156890775 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 156890825 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156891498 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 156891507 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 156891548 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156892076 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 156892134 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156892306 C A Y N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 156893461 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156893571 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156893678 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156893702 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156893820 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156893832 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156894401 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156894846 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156896775 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156897044 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156899496 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156899743 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156899852 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 156899962 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156900042 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 156900483 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156900501 A T N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 156900621 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 156901309 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156901598 G T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 156901967 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156902174 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156902283 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156905764 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156905910 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156906503 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156907417 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156907880 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156909201 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156909466 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 156910070 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 156910837 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 156911441 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156911971 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156912236 T C Y Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.1 0.5 0.4 14 26 2 10 8 3 156916021 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156916819 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156916820 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156916985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156917585 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156917626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156921717 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 156921790 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156921810 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 156922093 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 156923312 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156924223 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156925127 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156925256 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156925459 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156925653 G T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 156926322 A C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156927066 T C Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 156927290 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156927463 A G N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 156927473 T A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156927510 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 156927676 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156927777 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156928275 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156931415 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156931958 G C N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.0588235294117647 0.470588235294118 0.470588235294118 10 24 1 8 8 3 156933066 C G Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 156933437 G A N Y 0.392857142857143 REF 0.3 0.3 0.392857142857143 0.607142857142857 0.142857142857143 0.5 0.357142857142857 11 17 2 7 5 3 156934891 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156935317 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156935342 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156936164 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 156936614 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156936948 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156937488 C A Y N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 156938645 A G Y Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 156939207 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156939620 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 156939688 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156940820 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 156940847 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 156941998 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156942033 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156942266 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156942457 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156943021 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156943639 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156943673 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156943957 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156944540 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156944594 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156945449 T A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156945567 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156945728 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156945745 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156945965 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 156946327 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156946623 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156946654 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156946746 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156946761 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 156947138 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 156947216 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156947227 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156947244 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156947255 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 156947601 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 156947631 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156947632 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 156947694 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 156947775 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156948058 A C N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 156948420 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 156948669 G C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 156948731 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156948841 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 156948950 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 156949039 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 156949193 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 156949382 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 156949487 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 156949666 C G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156949905 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156949945 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 156950045 A T Y N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 156950120 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 156950459 T C N Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 156950472 T G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 156950982 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 156951095 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 156951251 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 156951356 T G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 156951365 G T Y N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 156951584 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156951585 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156951872 T C Y Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 156952046 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 156952243 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 156952285 T G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 156952560 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156952649 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 156952802 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 156952886 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 156952911 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 156953004 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 156953015 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156953092 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 156953134 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156953266 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 156953285 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 156953347 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156953472 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 156953774 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156954487 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156954603 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 156954825 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156954934 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156955612 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 156955887 A G Y Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 156955914 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156955960 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156956122 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156956256 T C N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 156956683 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156956744 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156956931 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156957050 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156957184 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156957264 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156958447 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 156958561 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156958988 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156959990 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156960200 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156960228 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156960423 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156960731 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156960837 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156961099 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156961450 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156961779 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 156962205 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156962453 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156962816 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156962827 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 156962854 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156962946 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 156963181 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156963353 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 156963576 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156964061 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 156964149 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156964879 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156965172 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156965329 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156965611 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156965744 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156966071 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156966209 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 156966285 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 156967185 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 156967199 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 156967215 A T Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 156967244 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156967357 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156967586 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 156968034 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156968227 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 156968272 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156968487 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 156969535 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156969696 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156969710 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156969741 A C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156969974 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 156970081 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 156970845 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 156975232 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 156975365 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 156975385 T C Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 156975590 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156975627 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156975784 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156976239 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156976983 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156980620 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 156980734 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156980762 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156980844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156981150 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156981815 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156982047 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156982362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156984026 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156984982 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156987151 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156987842 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156987869 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156987897 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156987915 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156988071 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156988594 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156990219 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156990421 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 156993806 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156993925 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156994104 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156994162 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156994381 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 156994529 A G N Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 156994966 C T N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 156995196 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 156995400 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156995423 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 156995742 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 156995847 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 156995955 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 156996792 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156999233 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156999246 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 156999339 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157000231 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157000392 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157001948 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 157007806 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157007922 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157008296 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 157008347 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157008449 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157008495 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157008570 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157009141 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157009379 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157009812 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157018730 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 157018757 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157019490 T G N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 157019944 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157020251 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157020507 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157021176 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157021891 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157021907 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157022032 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157022565 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 157022776 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 157022929 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157023060 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157023103 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157023442 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157023613 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157023679 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157023797 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157023843 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157024300 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157024309 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157024333 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157024412 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 157024434 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157024441 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157024555 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157024660 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157024696 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 157024700 G T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 157024726 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 157024818 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157024831 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157024838 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 157024969 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157024972 A G Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 157025163 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157025295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157025309 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157025433 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157025472 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157025504 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157025674 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157025692 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157025759 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157025825 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 157025842 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 157025962 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157026085 G A Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 157026106 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 157026229 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 157026279 G C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 157026319 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157026369 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157026636 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 157026789 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 157026900 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 157027073 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 157027161 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 157027394 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157027813 G C N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 157027865 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 157028410 G T N N 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 157028494 G A Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 157028495 T C Y Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 157029237 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 157029360 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 157029398 T C N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 157029610 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157029675 C A N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 157029830 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157029924 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157029932 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157029955 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 157030097 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157030454 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 157030631 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157030699 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 157030715 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 157030781 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 157031242 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157031386 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 157031465 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 157031498 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157031566 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 157031571 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 157032126 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157032387 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157032824 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157032874 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157033295 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157033399 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157033526 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157033551 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157034211 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157034255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157034565 A T N N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 157035028 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157035075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157035953 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157036948 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157038006 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157038921 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157039224 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157039472 T A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 157040530 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157040578 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157040660 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157041002 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157042986 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157043802 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157043916 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157043951 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157043962 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157043991 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157044244 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157044320 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 157044381 A G N Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 157044855 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157044932 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157045260 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157045306 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157045326 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157045334 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157046030 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 157046058 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157046331 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 157046664 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157046673 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157046839 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157046964 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157047033 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157047264 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157047482 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157047583 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157047630 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157047669 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157047699 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157048064 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157048271 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157048320 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157048380 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157048676 C T Y Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 157048994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157049173 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157050371 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157053278 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 157053371 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 157054132 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157054175 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157054214 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157054322 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157055406 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157055605 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157055735 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157055774 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157055778 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157056112 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157056259 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 157056597 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157056668 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157056700 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157056779 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157057103 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157057275 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157057415 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157057422 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157057430 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157057595 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157057598 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157057796 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 157057915 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157058000 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157058020 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157058032 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157058222 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157058293 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157058368 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157058878 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157059102 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157059679 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 157060540 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157061233 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157061242 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157061296 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157061934 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157062007 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157062547 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157063029 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157063142 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157063671 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157063738 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157063925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157064018 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157064030 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157064071 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157064150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157066421 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157067421 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157067767 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157067815 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157067903 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157068272 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 157068398 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157068499 T A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 157068522 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157068530 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157068552 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157068563 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 157068784 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157068812 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 157068868 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157069094 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157069260 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157069263 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157069415 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157069499 C G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157069574 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157069597 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157069763 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157070340 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157070384 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157070443 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157072025 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157072400 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157072402 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157072512 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157072583 G C Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.263157894736842 27 11 13 1 5 3 157072699 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157073146 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157073148 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157073225 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157073384 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157073456 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157086468 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157086510 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157087141 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157087558 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157087734 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157088061 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157088383 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157088466 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157088521 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157088604 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157089013 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157089049 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157089943 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157090872 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157090963 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157091751 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157091786 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157091921 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157092063 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157092486 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157092900 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157093170 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157093321 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157093501 G A Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 157093616 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 157093666 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157093739 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157093915 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157093934 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157094135 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157094459 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157094470 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157094543 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157094676 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157094769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157094804 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157094880 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157094996 A G Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 157095472 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157095720 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157095739 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157095803 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157095839 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157095920 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157095993 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157096126 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157096265 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157096388 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157096559 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157096650 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157096676 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157096709 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157096710 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157096818 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157096922 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157097031 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157098225 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157098284 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157098529 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157098977 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157099098 A C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 157099192 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157099655 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157099707 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157099725 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157099768 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157099902 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157099996 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157100381 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 157100489 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157100515 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157100520 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157100912 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157101240 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 157101807 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157102492 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157102560 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157103857 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157103901 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 157105726 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 157105734 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 157106028 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 157106029 T G N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 157106669 A C N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 157106670 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 157106896 T G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157106938 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157107106 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157107335 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157107373 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 157107691 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157108011 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157108250 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 157109198 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 157109313 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157109356 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 157109940 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157110007 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 157110114 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157110141 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157110655 A T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 157111477 G T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157112426 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157112983 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 157113216 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157113305 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157113919 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157114301 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157114464 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 157114762 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 157114868 G A Y Y 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 3 157114942 G A Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 157115208 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157115216 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157115442 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 157115573 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157115944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157116112 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157116463 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157117955 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157118463 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 157119422 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 157120289 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 157120299 G T Y N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 157120552 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157120620 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157120802 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157121093 C T Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 157121275 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 157121321 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157121405 C G Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 157121533 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157121631 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157121681 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157121692 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157122681 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157123914 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157124419 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157124744 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157125408 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 157125694 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157126155 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157127613 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157127983 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 157128707 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157128740 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157129131 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157129737 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157129898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157129922 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 157130152 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157130884 A C N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 157131922 A C N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 157132077 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 157132221 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157132436 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 157132492 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 157132642 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157132837 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157132846 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 157132928 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157132970 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157132971 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157134967 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157136255 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157139135 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157139342 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157141917 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 157142076 G A Y Y 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.1875 0.4375 0.375 13 19 3 7 6 3 157142079 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 157142355 T A Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 157143523 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157145424 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 157145473 G T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 157145859 A G Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 157146021 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157146049 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 157146462 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 157147663 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 157149158 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157149618 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 157149729 C G Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 157149843 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 157149870 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157149994 C A Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 157150014 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157150094 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157150139 A G Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 157150172 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157150225 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157150304 G C N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 157150338 G C Y N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 157150465 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157150794 G C Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 157150795 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 157152290 G C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 157152412 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 157152452 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157152499 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 157152546 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157152622 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 157152776 T C Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 157152825 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 157152862 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 157153069 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 157153371 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157153399 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 157153413 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157153434 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157153505 A C Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 157153530 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157153541 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157153546 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157153740 C G Y N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 157153824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157153848 A T Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 157153958 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 157153964 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157153994 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157154048 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 157154061 A G N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 157154140 C T Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 157154175 A T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 157154176 G C Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 157154209 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157154405 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 157154432 G T N N 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 157154479 C T Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 157154861 G A N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 157154893 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157154970 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 157155624 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157156124 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157156214 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157156225 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157156252 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 157156305 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 157156416 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157156617 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157156643 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 157156687 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 157156709 T C Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 157156729 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157156791 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 157156862 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157156914 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 157156977 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 157157522 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 157158264 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 157158321 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 157158382 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 157158396 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 157158484 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 157158562 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 157159022 G A N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 157159222 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 157159321 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 157159546 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 157159630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157159823 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.111111111111111 0.222222222222222 0.666666666666667 8 28 2 4 12 3 157160137 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.55 0.55 0.777777777777778 0.222222222222222 0.555555555555556 0.444444444444444 0 14 4 5 4 0 3 157160183 A G Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 157160371 A G Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 157160742 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157160987 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 157161964 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157162146 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 157162258 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 157162891 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157163559 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157163677 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157163987 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 157164488 T A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 157164643 G A Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 157164701 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157164751 T G Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 157164769 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157165073 C A N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 157165076 A C N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 157165089 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 157165246 T C N Y 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 157166035 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 157166082 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157166588 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157166623 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157168142 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157168283 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157168340 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.105263157894737 0.210526315789474 0.684210526315789 8 30 2 4 13 3 157169283 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 157170533 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157171562 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157172113 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157172293 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157172443 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157173075 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 157173193 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157173566 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157179595 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157181451 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 157182753 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157183671 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157185679 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157187793 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157189091 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 157189230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157189558 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157190757 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157191951 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157192174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157193357 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157193409 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 157193483 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 157194059 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157194197 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 157194223 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 157194241 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157194377 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157194543 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157194596 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157194989 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 157195863 G T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157196002 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 0.944444444444444 2 34 1 0 17 3 157196074 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157196661 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157197218 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157197538 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 157197758 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157197979 A G N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 157198243 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157198963 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 157200428 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 157203989 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157204232 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157207486 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157207777 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157208278 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 157214678 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157219786 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157219975 T A N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 157219977 G T N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 157220677 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157220680 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157221029 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157221791 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157222393 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157222460 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 157222560 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 157222619 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157224363 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157224961 C T N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 157225204 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157225599 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157225786 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157226817 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157227287 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157227440 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 157227588 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157227702 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157227710 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157228253 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0.133333333333333 0.333333333333333 0.533333333333333 9 21 2 5 8 3 157228313 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 157228534 A G N Y 0.3 REF 0.5 0.5 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 6 14 2 2 6 3 157228567 G A Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 157229663 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157231612 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 157231857 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 157231887 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 157231891 C A N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 157231934 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0.05 0.15 0.8 5 35 1 3 16 3 157231973 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 157232000 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157232213 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157232371 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157232506 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157232581 A C Y N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157232713 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157233144 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157233179 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157233215 G A Y Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 157233304 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157233634 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 157233676 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157233832 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157234289 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 157235560 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157235804 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 157236047 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157236344 G A Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 157237007 G A Y Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 157237191 A T Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 157237245 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157238184 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 157238291 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 157239372 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157239585 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157239756 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157239785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157239804 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157239916 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 157241196 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157241446 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157241824 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157243154 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157244238 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 157244503 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 157246750 T C Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 157247277 T A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157247756 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157248253 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 157248692 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 157248824 G A Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 157253704 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157258445 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157259864 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 157262092 A G Y Y 0.1 ALT 0.5 0.5 0.9 0.1 0.9 0 0.1 18 2 9 0 1 3 157263770 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157264644 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 157266008 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157266019 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 157269519 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157269728 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157273022 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157273175 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157273480 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157274179 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157274443 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157275638 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157276204 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157276689 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157277677 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157277866 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 157278943 A G N Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 157279817 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157280787 A C N N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 157281989 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 157281996 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 157282345 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157285716 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157286218 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 157286545 C T Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.846153846153846 0.0769230769230769 0.0769230769230769 23 3 11 1 1 3 157288351 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157288476 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157290183 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157290652 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157292391 G T Y N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.0909090909090909 20 2 10 0 1 3 157292676 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157293029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157293227 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157294489 G C N N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 157295113 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 157297038 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157297580 G T N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 157297782 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 157298078 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 157298461 A T N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 157298595 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 157298598 G T N N 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 157298675 A C N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 157298692 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.0555555555555556 34 2 17 0 1 3 157298774 G A N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 157299075 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157299264 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 157299558 G T N N 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 157299723 G C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 157299794 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 157299915 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 157299917 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157300167 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 157300860 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157300988 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 157301353 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157301368 C T Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 157301506 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157301522 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157301560 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 157301585 G A Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 26 14 10 6 4 3 157301820 A C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 157301922 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 157301957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157302074 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 157302327 C A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 157302376 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 157302811 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 157302922 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157302957 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 157303375 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 157303589 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 157303597 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 157303999 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157304034 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 157304186 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 157304243 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157304423 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 157304508 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 157304510 T C N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 157304653 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157304690 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157304910 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157304986 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 157305005 T A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 157305015 G A N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 157305059 C A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 157305212 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157305632 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157305745 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 157305837 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 157305842 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 157305900 G T Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 157305994 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 157306124 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157306125 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157306166 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 157306287 G C Y N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 157306420 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157306540 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157306829 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157307114 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 157307154 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 157307170 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 157307217 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 157307503 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.0526315789473684 36 2 18 0 1 3 157307858 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 157307905 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157307938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157308021 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157308204 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 157308253 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157308255 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 157308409 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157308486 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 157308488 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 157308647 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157308818 T A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 157308855 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157308911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157308945 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 157308967 G A N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 157309108 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157309205 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 157309363 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 157309548 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 157309569 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157309697 C T N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 157315997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157316261 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 157316311 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 157316326 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157316460 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 157316471 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 157316520 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 157316623 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 157316879 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157317982 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 157318481 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157320489 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 157321140 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 157321195 G T Y N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 157321426 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 157321751 T C Y Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 157321852 T A Y N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 157322253 A G Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 157322904 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157323024 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 157323185 G C Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 157323723 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 157323841 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157324303 A T Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 157324506 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 157324578 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 157324595 C T Y Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 157324610 T G Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 157324622 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157324811 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157324867 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 157325313 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 157325761 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157326018 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 157326185 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.105263157894737 0.842105263157895 4 34 1 2 16 3 157326341 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 157326353 T A N N 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 157326379 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 157326488 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 157326533 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157326652 A G N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 157326896 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 157326955 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0.0588235294117647 0.117647058823529 0.823529411764706 4 30 1 2 14 3 157327002 C A Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 157327057 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 157327079 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 157327146 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157327200 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157327296 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 157327387 C A Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 157327567 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 157327581 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 157327638 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 157327707 T C Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 157328155 T G N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 157328388 C A N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 157328458 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 157328631 C A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 157328876 T C Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 157329027 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157329068 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 157329100 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 157329101 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 157329251 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157329866 A G N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 157329942 G T N N 0.142857142857143 REF 0.3 0.3 0.142857142857143 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.142857142857143 0.785714285714286 4 24 1 2 11 3 157330628 T G Y N 0.192307692307692 REF 0.35 0.35 0.192307692307692 0.807692307692308 0.0769230769230769 0.230769230769231 0.692307692307692 5 21 1 3 9 3 157330658 C G Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 157338675 G A Y Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 157339217 C T Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 157339280 T C Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 157339453 G T Y N 0.291666666666667 ALT 0.4 0.4 0.708333333333333 0.291666666666667 0.5 0.416666666666667 0.0833333333333333 17 7 6 5 1 3 157339484 C G Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 157341157 A T Y N 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 157341287 C A Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 157341344 T C Y Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 157341431 A G Y Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 157341578 A G Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 157341992 T C N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.352941176470588 0.470588235294118 0.176470588235294 20 14 6 8 3 3 157342031 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 157342101 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 157342128 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 157342554 A G N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.722222222222222 0.166666666666667 0.111111111111111 29 7 13 3 2 3 157342901 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 157342973 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.444444444444444 0.444444444444444 0.111111111111111 24 12 8 8 2 3 157343092 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 157343340 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 157343552 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 157343845 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157344202 T A N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 157344313 A T N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 157344841 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157344862 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157345719 C T Y Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 157346705 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 157346856 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 157346889 A C N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 157347110 T G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 157347362 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 157347708 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 157348358 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 157348576 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 157348928 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.4 0.45 0.15 25 15 8 9 3 3 157350248 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 157350312 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 157352294 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157352871 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157354705 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 157355395 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157355599 G A N Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 157355806 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 157355820 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157355858 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157355872 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157355927 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157355959 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 157355975 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157356094 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157356096 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157356109 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157356122 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157356203 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157356227 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157356540 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157356550 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157356574 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157356686 C T N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 157356799 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157356948 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157357003 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157357018 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157357054 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157357075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157357144 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157357145 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157357244 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157358243 T G N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 157358337 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 157360711 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 157360714 A T N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 157361029 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157361136 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157363426 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 157364422 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157364496 T G N N 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 157364629 T C N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 157364651 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 157364791 C T N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.277777777777778 0.333333333333333 0.388888888888889 16 20 5 6 7 3 157364829 A G N Y 0.470588235294118 REF 0.15 0.15 0.470588235294118 0.529411764705882 0.294117647058824 0.352941176470588 0.352941176470588 16 18 5 6 6 3 157364858 G T N N 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 157364946 C T N Y 0.5 ALT 0.65 0.65 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 7 7 2 3 2 3 157364964 G A N Y 0.05 ALT 0.5 0.5 0.95 0.05 0.9 0.1 0 19 1 9 1 0 3 157365089 T C N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 157365114 A G Y Y 0.4375 REF 0.2 0.2 0.4375 0.5625 0.25 0.375 0.375 14 18 4 6 6 3 157365295 G A Y Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0 0.272727272727273 0.727272727272727 3 19 0 3 8 3 157367420 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 157367646 C A N N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 157367797 C T Y Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 157367813 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 157367845 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 157367959 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157367966 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 157368022 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 157368101 C T N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.25 0.45 0.3 19 21 5 9 6 3 157368111 T A N N 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.25 0.4 0.35 18 22 5 8 7 3 157368130 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157368207 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 157368474 C T N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.263157894736842 0.263157894736842 0.473684210526316 15 23 5 5 9 3 157368551 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.5 0.388888888888889 0.111111111111111 25 11 9 7 2 3 157368611 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 157368680 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 157368713 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 157368737 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 157368817 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157368892 A G Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 157368964 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 157368979 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 157369033 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 157369138 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 157369237 G A N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.0555555555555556 33 3 16 1 1 3 157369313 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 157369318 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 157369328 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 157369367 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 157369497 T G N N 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0.0625 0.0625 0.875 3 29 1 1 14 3 157369577 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 157369605 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 0.941176470588235 2 32 1 0 16 3 157369883 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 157369889 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 157369927 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157370025 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 0.947368421052632 2 36 1 0 18 3 157370497 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157370617 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157370670 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 157370822 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 157371060 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 157371244 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157372515 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157372579 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157372630 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157373027 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157373414 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157373547 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157374690 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157376492 G A Y Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.733333333333333 0.2 0.0666666666666667 25 5 11 3 1 3 157376551 G T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 157376818 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157377054 T C Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.210526315789474 0.263157894736842 0.526315789473684 13 25 4 5 10 3 157377136 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 157377935 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157379326 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157380284 G A Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 157380322 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 157380333 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157380340 G T Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 157380395 G C Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 157380478 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157380572 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 157380651 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 157380986 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157381200 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.2 0.45 0.35 17 23 4 9 7 3 157381251 G A N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 157381277 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 157381298 G C Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 157381443 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.105263157894737 0.473684210526316 0.421052631578947 13 25 2 9 8 3 157381576 G C N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 157381627 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 157381779 C A N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 157381803 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 157381882 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 157381915 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 157381938 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 157382148 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0.05 0.1 0.85 4 36 1 2 17 3 157382149 G A N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 157382702 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 157382762 G A N Y 0.433333333333333 REF 0.25 0.25 0.433333333333333 0.566666666666667 0.0666666666666667 0.733333333333333 0.2 13 17 1 11 3 3 157382797 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 157382812 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0.05 0 0.95 2 38 1 0 19 3 157382826 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157383384 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157383516 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 157383526 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 157384332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157384372 C T N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 157384389 A C N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 157384480 A G N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 157384556 G A N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 157384585 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 157384633 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 157384687 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 157384744 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 157384768 C T N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 157384936 G A N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.3125 0.5 0.1875 18 14 5 8 3 3 157384952 A G N Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 157385077 C A N N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 3 157385079 G T N N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 3 157385143 C G N N 0.392857142857143 ALT 0.3 0.3 0.607142857142857 0.392857142857143 0.428571428571429 0.357142857142857 0.214285714285714 17 11 6 5 3 3 157385385 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 157385539 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 157385580 T C N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 157385623 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 157385779 T C N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.0588235294117647 0.529411764705882 0.411764705882353 11 23 1 9 7 3 157385887 G A N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 157385954 T A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 157386017 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 157386072 G T N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 157386252 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 157386272 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 157386427 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157386457 A G N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 157386558 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 157386809 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 157386989 C A N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.15 0.3 0.55 12 28 3 6 11 3 157387207 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 157387214 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 157387488 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 157387609 C G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 157387665 C T N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 157387779 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 157387802 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 157387820 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 157387894 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 157388303 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157388413 A C N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 157388597 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157388633 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 157388647 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157388777 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 157388823 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157389017 A T N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 157389708 A G N Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 157389823 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157389849 A C N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 157389889 T C N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 157390004 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 157390118 A G N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 157390199 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 157390250 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 157390307 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 157390648 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 157390715 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157390789 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 157390799 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 157390918 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.842105263157895 0.105263157894737 0.0526315789473684 34 4 16 2 1 3 157390953 T C N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 157391051 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 157391065 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 157391157 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 157391488 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 157391498 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 157391809 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 157391990 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 157392076 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 157392392 T A N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 157392498 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 157392510 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 157392556 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157392608 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 157392757 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.95 0 0.05 38 2 19 0 1 3 157392770 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 157393022 A G N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 157393926 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 157394020 T C N Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 157394196 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 157394368 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 157394718 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 157395061 T G N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 157395082 C A N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 157395093 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157395100 G A Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 157395277 G C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 157395320 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 157395429 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157395583 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 157395631 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157395655 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157395896 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 157395992 T G N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 157396093 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 157396101 A T N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 157396121 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 157396423 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157396487 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 157396497 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 157396549 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 157396556 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 157396696 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 157396729 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 157396801 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 157396816 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 157396830 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 157396867 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 157396876 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 157397088 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 157397122 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 157397216 T G N N 0.25 ALT 0.7 0.7 0.75 0.25 0.5 0.5 0 9 3 3 3 0 3 157397290 C G N N 0.142857142857143 ALT 0.65 0.65 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 12 2 5 2 0 3 157397740 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157397843 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157397960 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 157398049 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 157398054 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 157398065 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157398070 G T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 157398094 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157398154 G A N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 157398212 T C N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 157398458 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157398726 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 157398834 A T N N 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 157398926 A C N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 157399016 A T N N 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 157399026 T G N N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 157399317 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157399388 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 157399492 T A N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 157399753 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 157399754 G A N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 157399767 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 157399781 C G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 157399864 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 157399922 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 157399972 A T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 157399975 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 157400135 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157400173 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157400200 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157400203 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157400240 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157400290 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157400302 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157400331 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157400375 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 157400451 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157400535 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157400570 C T N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 157400684 G T N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 157400697 C T N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 157400708 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 157400812 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 157401261 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 157401270 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.2 0.25 0.55 13 27 4 5 11 3 157401371 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157401672 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157401795 A G N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 157401852 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157401936 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 157401942 T G N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 157402210 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 157402256 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157402300 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 157402412 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157402435 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 157402436 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 157402477 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 157402557 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 157403095 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157403251 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 157403263 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157403621 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157403687 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157403892 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157403957 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157404442 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157405169 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157405201 G A Y Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 157406109 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157406188 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157408088 G A Y Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157408089 G C Y N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157408123 A C Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157408392 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157408406 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 157408452 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157408570 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 157408637 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 157408790 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 157409092 A C N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 157409443 T C Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 157409480 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157409604 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 157409677 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 157409920 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157409951 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 157409967 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 157409998 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 157410735 G T N N 0.25 ALT 0.4 0.4 0.75 0.25 0.583333333333333 0.333333333333333 0.0833333333333333 18 6 7 4 1 3 157410739 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 157410832 G C N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 157411005 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 157411050 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 157411057 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 157411346 C G N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.35 0.3 0.35 20 20 7 6 7 3 157411358 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157411432 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 157411717 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157411820 A G N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.3 0.25 0.45 17 23 6 5 9 3 157411992 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 157412216 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 157412230 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157412263 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157412977 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157412996 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 157413336 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 157413457 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157413508 A G Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 157413543 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157413743 T A Y N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 157413929 C A N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 157414068 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157414102 A C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 157414139 A G Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 157414184 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 157414186 A G Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 157414236 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 157414397 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 157414429 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 157414523 G C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 157414655 G C N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 157414884 G A Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.473684210526316 0.421052631578947 0.105263157894737 26 12 9 8 2 3 157414946 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157415072 G A N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 157415153 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 157415192 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 157415210 G A Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 157415572 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 157415749 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 157415819 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 157416123 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 157416134 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157416204 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 157416417 T C N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 157416883 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 157416897 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 157417106 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 157417115 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 157417299 G T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 157417417 C A N N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.35 0.35 0.3 21 19 7 7 6 3 157417659 G C N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 157417710 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157417953 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157418235 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157419959 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157420289 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157420477 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 157420630 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.421052631578947 0.263157894736842 0.315789473684211 21 17 8 5 6 3 157420772 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 157420857 T A Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 157420874 G A Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 157420894 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157420928 C T Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 157420958 T C N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.388888888888889 0.277777777777778 0.333333333333333 19 17 7 5 6 3 157421027 A C N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.526315789473684 0.210526315789474 0.263157894736842 24 14 10 4 5 3 157421046 T G N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 157422079 G C N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 157423481 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157423890 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157424511 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 157424966 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 157425034 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157425105 A T N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 157425392 G C Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 157425435 A C Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 157425485 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 157425581 T A Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 157425589 C T Y Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.3 0.35 0.35 19 21 6 7 7 3 157425738 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157425837 G A Y Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157425951 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157425991 G T Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 157426021 A G Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 157426036 T C Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 157426120 A C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157426124 A T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 157426155 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.315789473684211 0.315789473684211 0.368421052631579 18 20 6 6 7 3 157426271 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157426422 T C Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 157426442 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157426445 G A Y Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.25 0.3 0.45 16 24 5 6 9 3 157426836 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157426966 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157427050 G A N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 157427085 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 157427101 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.45 0.25 0.3 23 17 9 5 6 3 157427171 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 157427305 T A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 157427418 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 157427440 G A N Y 0.441176470588235 ALT 0.15 0.15 0.558823529411765 0.441176470588235 0.411764705882353 0.294117647058824 0.294117647058824 19 15 7 5 5 3 157427539 A T Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 157427540 A C Y N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 157427641 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157427706 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 157427790 A C Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 157427949 A G Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 157427959 C T Y Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.529411764705882 0.411764705882353 0.0588235294117647 25 9 9 7 1 3 157427992 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 157428068 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 157428088 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157428158 T G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 157428184 C T Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 157428425 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 157428562 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 157428599 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 157428654 A G Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 157428795 C A Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157428995 A G N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 157429002 C A N N 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 157429130 G C Y N 0.0769230769230769 ALT 0.35 0.35 0.923076923076923 0.0769230769230769 0.846153846153846 0.153846153846154 0 24 2 11 2 0 3 157429145 G A Y Y 0.0714285714285714 ALT 0.3 0.3 0.928571428571429 0.0714285714285714 0.857142857142857 0.142857142857143 0 26 2 12 2 0 3 157429182 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 157429413 C G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 157429900 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 157429961 C A Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 157429980 C T N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 157429984 A T N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 157430012 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 157430037 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 157430040 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 157430077 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157430145 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157430322 T C Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 157430345 A C Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 157430359 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157430372 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157430394 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157431028 C T Y Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 157431042 G A N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 157431119 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.588235294117647 0.352941176470588 0.0588235294117647 26 8 10 6 1 3 157431303 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157431399 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 157431529 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157431542 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 157431735 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157431748 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157431841 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 157431851 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157431880 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 157431926 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 157431931 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 157431986 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157432029 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 157432139 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 157432161 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 157432169 C T Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 157432179 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 157432180 T G N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 157432285 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 157432303 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 157432484 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 157432487 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157432644 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157432762 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 157432768 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157432845 T C Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 157432937 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157432944 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157432957 T A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 157433167 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 157433249 T G N N 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.368421052631579 0.315789473684211 0.315789473684211 20 18 7 6 6 3 157433265 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 157433266 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157433306 G T N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 157433312 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157433368 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157434948 G A Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.7 0.7 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 11 1 5 1 0 3 157435164 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 157435178 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 157435200 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 157435259 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 157435290 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 157435302 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157435305 T A Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 157435453 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157435500 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157435554 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157435674 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 157435703 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 157435724 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157435767 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 157435816 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 157435952 G T Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 157436308 T C N Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 157436523 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157436549 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 157436589 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157436722 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 157436977 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157436989 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 157437025 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157437086 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157437119 G T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 157437130 T G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 157437212 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 157437356 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157437830 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157437860 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157437940 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157438134 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157438785 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157439316 A T Y N 0.357142857142857 REF 0.65 0.65 0.357142857142857 0.642857142857143 0.285714285714286 0.142857142857143 0.571428571428571 5 9 2 1 4 3 157439442 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 157439657 C A Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 157439699 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157440022 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157440478 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 157441001 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157441253 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157441447 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 157441539 A T Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 157441574 C A Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 157441605 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 157441615 C G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 157441868 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157442121 G T N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 157442216 G A N Y 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 157442262 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 157442289 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 157442318 T C Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 157442386 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 157442820 G T Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 157443053 A G Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 157443594 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 157443615 A G Y Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 157443668 C A N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 157443674 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157443679 C G N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 157443886 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 157443900 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 157444131 G C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 157444171 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 157444187 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 157445187 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157445673 T G Y N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 157445675 A G Y Y 0.15 ALT 0.5 0.5 0.85 0.15 0.7 0.3 0 17 3 7 3 0 3 157446296 T A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 157446315 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 157446594 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157447187 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157447249 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 157447489 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157447558 G T N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.6 0.4 0 32 8 12 8 0 3 157447591 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157447623 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157447911 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157448166 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157448296 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157448650 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157448667 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157448760 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 157448809 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 157449066 A T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157449088 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157449200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157449977 G C N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 157450332 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157451306 C A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 157451386 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 157451412 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157451809 C G N N 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 157452554 A G Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 157452568 G A Y Y 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.733333333333333 0.266666666666667 0 26 4 11 4 0 3 157452724 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157453597 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157453630 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157453645 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157453696 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157453760 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 157453928 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157453959 C A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 157454071 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 157454081 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157454113 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157454131 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 157454174 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 157454265 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157454450 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.5 0.4 0.1 28 12 10 8 2 3 157454455 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157454530 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157454711 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 157455779 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 157455842 G T N N 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 157455930 C T N Y 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.117647058823529 0.411764705882353 0.470588235294118 11 23 2 7 8 3 157455931 A C N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 157455946 C T N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 157455995 T C N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 157455999 A T N N 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 157456088 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 157456090 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 157456171 A T N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 157456348 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 157456858 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157456920 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 157458211 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157458421 A C N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 157458782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157459114 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157459141 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 157460070 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157461657 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157462174 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157462234 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157462284 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157462519 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157462611 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157462651 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.0526315789473684 0.421052631578947 0.526315789473684 10 28 1 8 10 3 157463533 G C N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.1 0.45 0.45 13 27 2 9 9 3 157463782 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157463804 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 157463936 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.85 0.85 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 5 1 2 1 0 3 157463963 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 157464015 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157464259 A T Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 157464379 C A Y N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 157464447 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157464981 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157465043 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157465087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157465429 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157475095 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157477122 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157477225 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157477644 T C Y Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.0625 0.4375 0.5 9 23 1 7 8 3 157477658 A G N Y 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0.0625 0.5 0.4375 10 22 1 8 7 3 157477915 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157478067 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157478166 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 157478333 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157478406 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 157478472 A T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 157478478 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 157478496 C G N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 157478578 C G N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 157478612 T G N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 157478616 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0 0.4 0.6 8 32 0 8 12 3 157478837 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 157478869 G T N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 157478894 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 157478946 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 3 157478952 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0 0.5 0.5 8 24 0 8 8 3 157478971 C A N N 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0 0.444444444444444 0.555555555555556 8 28 0 8 10 3 157479016 T C N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 157479044 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 157479054 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 157479125 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 157479147 A G N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0 0.421052631578947 0.578947368421053 8 30 0 8 11 3 157479169 T A N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 157479551 A G N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 157479652 A C N N 0.4 REF 0.75 0.75 0.4 0.6 0.4 0 0.6 4 6 2 0 3 3 157479781 G A Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 157479848 A C Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 157480710 G A N Y 0.3 REF 0.25 0.25 0.3 0.7 0 0.6 0.4 9 21 0 9 6 3 157480741 G C N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 157480744 T C N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 157480839 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157480859 G C N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 157480881 A G N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.0526315789473684 0.526315789473684 0.421052631578947 12 26 1 10 8 3 157480887 G C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 157480917 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 157480933 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 157481030 C G N N 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0 0.470588235294118 0.529411764705882 8 26 0 8 9 3 157481044 T G N N 0.3125 REF 0.2 0.2 0.3125 0.6875 0 0.625 0.375 10 22 0 10 6 3 157481093 G A N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0 0.466666666666667 0.533333333333333 7 23 0 7 8 3 157481120 A C N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 157481309 C T N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 157481378 A G N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 157481483 A T N N 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 3 157481725 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 157481814 T G N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 157481875 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 157482036 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 157482052 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 157482060 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 157482290 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 157482313 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.0526315789473684 0.473684210526316 0.473684210526316 11 27 1 9 9 3 157482618 A C N N 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 157482637 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157483663 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157483689 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 157483743 G A N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 157483919 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157484903 A C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157484914 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 157485164 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 157485242 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157485258 T C N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 157485549 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157485592 G A N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 157485652 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 157485667 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 157485945 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 157486244 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.55 0.55 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 7 11 1 5 3 3 157486912 G C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157487160 G T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.4 0.4 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 22 2 10 2 0 3 157488207 A G Y Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0 0.4 0.6 2 8 0 2 3 3 157488300 T C Y Y 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 157489198 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157489447 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157489511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157489561 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 157489827 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 157489884 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157490080 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157490115 G C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.05 0.4 0.55 10 30 1 8 11 3 157490479 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 157490518 A G N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 157490604 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 157490630 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 157490642 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157491233 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157494759 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157498348 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157502454 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 157503883 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157506902 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 157509579 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 157510036 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 157510050 A G N Y 0.111111111111111 REF 0.55 0.55 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 2 16 0 2 7 3 157510333 A G N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 157510807 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157511049 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 157511683 C T Y Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 157514601 A G N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 157514645 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 157514715 T C N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 157514762 A C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.05 0.45 0.5 11 29 1 9 10 3 157514801 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 157515013 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 157515211 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 157515277 G C N N 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.777777777777778 0.166666666666667 0.0555555555555556 31 5 14 3 1 3 157515334 G A N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 157515343 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 157515427 G A N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.647058823529412 0.235294117647059 0.117647058823529 26 8 11 4 2 3 157515561 G C N N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 157515586 A G N Y 0.25 ALT 0.2 0.2 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 24 8 10 4 2 3 157515654 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 157515667 C A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 157516012 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157516373 T A N N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 157516526 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157516565 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157516643 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.55 0.25 0.2 27 13 11 5 4 3 157516739 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 157516895 A G N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 157516969 T G N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 157517167 C A N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 157517174 C T N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.473684210526316 0.315789473684211 0.210526315789474 24 14 9 6 4 3 157517278 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0 0.45 0.55 9 31 0 9 11 3 157517342 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157517410 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157517625 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157517755 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157517978 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157518079 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157518160 C T N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 157518839 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 157519143 C G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 157519431 C A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 157519736 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157520406 A G N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 157520519 T C N Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 157520600 T A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 157520990 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157521001 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157521108 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157521199 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157521230 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157521314 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157521498 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 157521540 C T N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 157521859 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 157521878 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 157522033 T C Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 157522384 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157522431 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157522498 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157522697 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 157522731 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 157523125 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157523481 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157523931 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157524000 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157524388 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157524545 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157524864 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157525051 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157525156 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157525821 G A N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 157526105 C A Y N 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 157526805 C T Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 157527484 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157527639 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 157528022 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157528036 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157528500 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 157528667 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157528975 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157529670 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 157529707 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157530138 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157530200 A C N N 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 157530588 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157530590 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157530889 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 157531122 C A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 157531377 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157531481 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 157531701 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157531983 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 157531998 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.166666666666667 0.277777777777778 0.555555555555556 11 25 3 5 10 3 157532234 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 157532334 T C N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 157532346 A G N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 157532376 G A N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 157532544 T C N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 157532560 A G N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 157532592 G A N Y 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.117647058823529 0.470588235294118 0.411764705882353 12 22 2 8 7 3 157532616 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0 0.388888888888889 0.611111111111111 7 29 0 7 11 3 157532676 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157532821 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 157533110 A G N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 157533136 T G N N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 157533141 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157533300 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157533329 A G N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 157534296 T A N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 157535000 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 157535013 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 157535279 T C Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 157535335 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157535428 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 157535452 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157535563 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157535579 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 157535580 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157536148 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157536368 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157536589 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157536676 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 157536716 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157536873 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157536936 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157538452 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 157538583 C G Y N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 157538587 T C N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 157538717 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157538771 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157539153 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157539512 A G N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 157539523 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 157539524 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 157539796 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 157540001 C A N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 157540119 T C N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.578947368421053 0.421052631578947 0 30 8 11 8 0 3 157540185 A G N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 157540281 C A N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 157540344 G A N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 157540384 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 157540495 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 157540672 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 157540700 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 157540891 G A N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 157540901 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 157540914 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 157541008 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157541018 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157541083 T G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157541121 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157541162 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157541205 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157541212 A G N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 157541220 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 157541245 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157541271 G C N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 157541298 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157541314 A G N Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.555555555555556 0.333333333333333 0.111111111111111 26 10 10 6 2 3 157541403 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157541413 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157541446 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157541455 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157541492 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157541741 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 157541875 G A N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.111111111111111 0.388888888888889 0.5 11 25 2 7 9 3 157541894 G A N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 157542200 C T N Y 0.222222222222222 REF 0.1 0.1 0.222222222222222 0.777777777777778 0.0555555555555556 0.333333333333333 0.611111111111111 8 28 1 6 11 3 157542314 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 157542379 A G N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 157542413 C T N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.526315789473684 0.368421052631579 0.105263157894737 27 11 10 7 2 3 157542566 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157542577 G T N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 157542639 A C N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 157542763 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 157542927 T G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 157543004 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 157543056 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157543063 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 157543199 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157543236 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157543327 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157543503 G A N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 157543764 A T N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 157543788 C T N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 157544457 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157544501 A G N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.764705882352941 0.117647058823529 0.117647058823529 28 6 13 2 2 3 157544553 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 157544578 A G N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0 0.277777777777778 0.722222222222222 5 31 0 5 13 3 157544623 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 157544642 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 157545581 G C N N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 157545681 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157545880 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 157545881 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 157546041 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157546278 C T N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 157546879 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157547023 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157547167 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157547910 G A Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 157548038 C G N N 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 157548140 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157548151 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157548196 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157548253 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157548316 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157548327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157548384 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157548392 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157548517 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157548563 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157548619 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157548698 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157548800 T C N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 157548802 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 157549578 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157549614 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157549737 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157549825 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157549826 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157549849 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157549863 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157550004 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157550209 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157550259 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157550277 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157550282 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157550288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157550331 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157550412 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157550464 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157550467 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157550671 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157550831 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157550847 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157550860 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157551020 G A N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 157551074 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157551093 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157551239 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157551248 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157551328 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157551342 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157551411 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157551425 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157551429 T C N Y 0.0882352941176471 ALT 0.15 0.15 0.911764705882353 0.0882352941176471 0.823529411764706 0.176470588235294 0 31 3 14 3 0 3 157551443 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 157551515 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 157551526 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157551769 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157551792 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157551867 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 157551944 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157551962 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157551996 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157552035 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157552100 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157552190 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157552405 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157552429 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157552663 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157552712 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157552719 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157552725 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157552925 T C N Y 0.125 ALT 0.8 0.8 0.875 0.125 0.75 0.25 0 7 1 3 1 0 3 157553214 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157553231 A G N Y 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 157553285 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 157553296 C T N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 157553345 C G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157553403 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157553462 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157553781 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157553978 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157554191 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157554273 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157554400 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157554424 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157554497 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157554514 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157554642 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 157554655 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157554720 A G N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 157554816 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 157555008 C A N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 157555019 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157555124 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157555142 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157555163 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 157555202 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 157555206 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157555286 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157555291 C T N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 157555304 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157555351 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 157555641 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 157555970 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157555989 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157556701 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157557685 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157557846 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157558111 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157558120 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157558255 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157558304 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157558319 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157558462 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.894736842105263 0.0526315789473684 0.0526315789473684 35 3 17 1 1 3 157558493 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157558553 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157558634 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157558656 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157558744 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157558749 T G N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 157558810 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157558887 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157558903 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157559435 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157559669 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157559858 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 157559907 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 157560012 G A N Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.416666666666667 0.416666666666667 0.166666666666667 15 9 5 5 2 3 157560238 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157560418 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157560480 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157560510 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157560528 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 157560573 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157560734 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157560843 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157560985 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157560990 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157561120 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157561210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157561335 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157561422 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157561506 G T Y N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 157561551 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157561633 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157561683 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157561688 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157561718 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157561721 C G N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 157561839 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157561843 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157561929 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157561935 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157562218 G C N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 157562288 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157562316 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157562431 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.1 0.35 0.55 11 29 2 7 11 3 157562479 C T N Y 0.235294117647059 REF 0.15 0.15 0.235294117647059 0.764705882352941 0.0588235294117647 0.352941176470588 0.588235294117647 8 26 1 6 10 3 157562488 A G N Y 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.0588235294117647 0.411764705882353 0.529411764705882 9 25 1 7 9 3 157562658 C G N N 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 3 157562894 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 157563226 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 157563258 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157563592 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157563675 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157563705 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157563726 A G N Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 157563847 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157564246 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157564331 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157564403 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157564412 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157564418 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157564477 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157564512 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157564530 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157564557 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157564592 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157564612 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157564702 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157565071 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 157565116 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157565375 C T N Y 0.2 REF 0.25 0.25 0.2 0.8 0.0666666666666667 0.266666666666667 0.666666666666667 6 24 1 4 10 3 157565485 G A Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 157566888 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157566893 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157566962 T C Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 157567011 T C N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 157567016 C T N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 157567034 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157567041 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 157567198 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 157567467 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157567992 C G Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 157569410 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157569561 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157570636 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157571045 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157571597 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157572231 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157573159 G C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157573529 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 157573544 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157573592 C G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157573635 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 157573785 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157573788 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157573919 C A Y N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 157573929 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157573967 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157574059 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157574234 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157574302 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157574511 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157575061 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157575526 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 157575538 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 157575598 G A N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.75 0.2 0.05 34 6 15 4 1 3 157575780 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 157575849 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157576089 C G N N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 157576127 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 157576251 T C N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 157576273 G A N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 157576296 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 157576413 G T N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 3 157576430 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 157576495 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 157576512 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 157576701 G A N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 157576765 A G N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 157576948 A G N Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 157578250 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 157578551 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 157578694 T A N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 157578699 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157578860 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157578946 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 157579106 G A Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 157579608 A C N N 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0 0.416666666666667 0.583333333333333 5 19 0 5 7 3 157579634 C G N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 157579657 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 25 5 10 5 0 3 157579799 C T N Y 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.0555555555555556 0.388888888888889 0.555555555555556 9 27 1 7 10 3 157580042 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 157580962 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 157581078 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157581093 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 157581146 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 157581153 C A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 157581159 C G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 157581184 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 157581568 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157581845 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 157584117 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 157585017 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 157585757 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157586154 G A Y Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 157586954 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 157586979 C G N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 157586999 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 157587021 G T Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 157587667 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 157587778 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 157588459 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 157588842 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 157588865 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157588897 C G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 157588919 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 157588979 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 157589088 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 157589136 A G N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.526315789473684 0.421052631578947 0.0526315789473684 28 10 10 8 1 3 157589250 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 157589341 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 157589768 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 157589933 C T N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 157589973 A T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 157589992 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157590087 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 157590158 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157590375 A T N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 157590449 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 157590461 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 157590539 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 157590642 G A N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 157590737 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.5 0.45 0.05 29 11 10 9 1 3 157590779 C T N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.1 0.4 0.5 12 28 2 8 10 3 157590820 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 157590834 C A N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 157590880 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 157590972 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 157591515 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157592249 G T N N 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 157594045 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157594155 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157594404 A C N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 157594487 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157594512 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 157594830 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157595106 C G Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157595307 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157595495 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157595504 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157595721 T A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157595818 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 157595851 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157596244 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157596540 G C Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 157596929 T C Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 157597048 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157597529 C T Y Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 157597759 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157598495 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157600764 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 157601516 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 157601608 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157601795 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157601798 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 157601810 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157601885 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 157601908 T A N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 157602086 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 157602274 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 157602315 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157602775 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 157602814 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 157602840 G C N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 157602865 A G N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 157603072 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 157604146 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 157605670 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 157605701 C T Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 157605956 G T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.45 0.4 0.15 26 14 9 8 3 3 157605968 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157606031 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 157606155 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157606547 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157606574 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157606598 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157606732 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157606772 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157606908 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157607722 G A Y Y 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 157607979 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157607995 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 157608121 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157609596 A C N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 157610116 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157613189 G T Y N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 157614336 A T N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 157614337 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 157615102 C G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157615524 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157615822 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157615970 C T N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 157616225 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157616267 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157616532 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157616900 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157617652 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157618637 A G N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 157619367 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157619868 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 157620115 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157621485 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157621804 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157621812 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157622613 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 157622996 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 157623072 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157623140 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157623429 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 157623770 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157624593 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157624715 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 157625079 G C N N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 157626226 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157626787 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 157626891 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157627184 C G N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 157627577 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157628204 G C Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 157629928 C A Y N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 157632308 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157634169 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157634454 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 157635686 C T N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.166666666666667 0.5 0.333333333333333 15 21 3 9 6 3 157636025 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 157636758 T C N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 157637733 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157637991 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 157639220 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157640346 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157640559 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157642689 T C N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 157644454 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157645577 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157645755 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157646338 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157647713 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157648127 T G Y N 0.352941176470588 REF 0.15 0.15 0.352941176470588 0.647058823529412 0.176470588235294 0.352941176470588 0.470588235294118 12 22 3 6 8 3 157648941 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157649493 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157650023 A G Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 157651449 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 157655845 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157656983 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157657317 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157657469 C A Y N 0.0277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.972222222222222 0.0277777777777778 0.944444444444444 0.0555555555555556 0 35 1 17 1 0 3 157658606 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157661347 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 157662500 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157663111 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157663155 G C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157663580 C T Y Y 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 157664607 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157664633 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157666032 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157668103 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157668485 A T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157668521 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157669728 T C N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 157669916 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 157670097 G A Y Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 157670210 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.125 0.875 0 18 14 2 14 0 3 157670300 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 157670431 C T Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.25 0.75 0 20 12 4 12 0 3 157670860 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.2 0.8 0 24 16 4 16 0 3 157671592 G T N N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 157671990 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157672329 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157673607 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157675223 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157677238 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157677306 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 157677314 T C Y Y 0.0333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.966666666666667 0.0333333333333333 0.933333333333333 0.0666666666666667 0 29 1 14 1 0 3 157677910 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157678029 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157685632 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157690023 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157690288 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157690663 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157691567 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157691769 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157692249 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157695825 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157697222 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157697985 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157700078 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157700758 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157700956 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157701151 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157701489 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157701743 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157702118 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157702267 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157702752 C T N Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 157703244 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157703305 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157705361 T C N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.133333333333333 0.4 0.466666666666667 10 20 2 6 7 3 157705727 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157705762 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157705843 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157706615 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157707304 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157707471 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157707498 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157707697 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157707963 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157708891 T G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 157709075 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157709245 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 157709716 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 157709789 C T N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 157709932 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 157710217 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 157710869 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 157711572 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157711642 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157711926 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 157712111 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 157712477 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157712531 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157712590 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157712824 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157713072 A T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157713397 C T N Y 0.117647058823529 REF 0.15 0.15 0.117647058823529 0.882352941176471 0 0.235294117647059 0.764705882352941 4 30 0 4 13 3 157713567 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 157713815 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157714277 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157714389 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157714434 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 157714909 T A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 157715000 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 157715015 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157715046 A G N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 157715160 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157715185 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 157715276 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157715488 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.277777777777778 0.611111111111111 0.111111111111111 21 15 5 11 2 3 157716150 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157716371 A T Y N 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.5 0.5 0 12 4 4 4 0 3 157716372 A G Y Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.545454545454545 0.454545454545455 0 17 5 6 5 0 3 157716949 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157717039 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157717184 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157717245 C A N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157717251 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157717278 T G N N 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.85 0.1 0.05 36 4 17 2 1 3 157717488 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157717896 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157718368 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 157718434 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 157718850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157718948 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157719313 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157719371 T A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157719432 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157719446 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157720333 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157720549 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157720697 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157720717 A T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157720771 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 157720938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157720957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157721276 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157721692 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157721727 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157721872 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157722019 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157722095 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157722118 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157722578 G A N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 157722630 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157722744 T G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 157723173 A C N N 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 157723363 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157723464 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 157723488 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157723512 G C N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157723542 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157723707 C T N Y 0.0294117647058824 REF 0.15 0.15 0.0294117647058824 0.970588235294118 0 0.0588235294117647 0.941176470588235 1 33 0 1 16 3 157723739 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157723754 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157724013 A T N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157724388 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 157724458 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 157724496 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157724581 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157724640 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157724682 T C N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 157724875 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157724922 G T N N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 157725568 A G N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 3 157725847 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157725908 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157725937 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 157726242 G A N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 3 157726255 G T Y N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.368421052631579 0.631578947368421 0 26 12 7 12 0 3 157726264 T A Y N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.388888888888889 0.611111111111111 0 25 11 7 11 0 3 157726287 G A N Y 0.346153846153846 ALT 0.35 0.35 0.653846153846154 0.346153846153846 0.384615384615385 0.538461538461538 0.0769230769230769 17 9 5 7 1 3 157726348 T C N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.266666666666667 0.666666666666667 0.0666666666666667 18 12 4 10 1 3 157726361 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 157726642 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 157726845 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157726915 T G N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 3 157726917 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 3 157727189 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157727385 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 157727517 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157727767 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 157727825 T C N Y 0.363636363636364 ALT 0.45 0.45 0.636363636363636 0.363636363636364 0.272727272727273 0.727272727272727 0 14 8 3 8 0 3 157727849 C T N Y 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.384615384615385 0.615384615384615 0 18 8 5 8 0 3 157728009 C A N N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.5 0.5 0 15 5 5 5 0 3 157728045 T C N Y 0.272727272727273 ALT 0.45 0.45 0.727272727272727 0.272727272727273 0.454545454545455 0.545454545454545 0 16 6 5 6 0 3 157728078 A T N N 0.307692307692308 ALT 0.35 0.35 0.692307692307692 0.307692307692308 0.461538461538462 0.461538461538462 0.0769230769230769 18 8 6 6 1 3 157728208 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 157728284 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 157728316 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157728373 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157728440 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 157728562 A G N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.352941176470588 0.588235294117647 0.0588235294117647 22 12 6 10 1 3 157728633 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157728851 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 157729185 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157729678 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157729864 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 157729914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157730361 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 157730891 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157731242 C T N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 157731277 C T N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.05 0.6 0.35 14 26 1 12 7 3 157731281 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 157731693 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 157731790 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157732471 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157732626 C G Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157732751 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157732820 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 157733212 G A N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 157733234 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157733813 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157733814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157733851 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157733979 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157734124 C T N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 157734461 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157735005 G A N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 157735238 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157735277 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157735351 T G Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157735458 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157735654 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157735689 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157735709 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 157735774 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 157735907 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157736066 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157736119 T C N Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 3 157736380 A C N N 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.294117647058824 0.647058823529412 0.0588235294117647 21 13 5 11 1 3 157736603 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 157736686 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157736801 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 157736812 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.315789473684211 0.631578947368421 0.0526315789473684 24 14 6 12 1 3 157737046 A T N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 157737148 C G N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.333333333333333 0.611111111111111 0.0555555555555556 23 13 6 11 1 3 157737318 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157737485 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 157737602 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 157737714 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157737743 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157738005 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157738042 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157738178 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.1 0.55 0.35 15 25 2 11 7 3 157738314 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157738515 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157738580 G T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 157738860 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157739039 T A N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 157739109 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 157739513 G C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.55 0.4 0.05 30 10 11 8 1 3 157739630 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 157739712 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.631578947368421 0.315789473684211 0.0526315789473684 30 8 12 6 1 3 157739796 A T N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 157739808 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157739959 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157739964 C T Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 157740037 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157740195 G A Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 157740295 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157740328 G A Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 157740407 A G Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 157740442 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157740524 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157740525 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157740565 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157740635 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157740779 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157740796 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157740973 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 157741412 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157741591 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157742029 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157742911 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 157745033 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157745795 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157746631 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 157747041 T A N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 157748024 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157751035 C A N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 157751938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157752699 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157753057 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157757626 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157758160 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157772309 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.45 0.5 0.05 28 12 9 10 1 3 157772629 T G N N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 157774266 T A N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157774582 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157775395 G A Y Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 157782225 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 157782834 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157784064 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157784316 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157784693 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157784974 A G N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 157786725 G A N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 157787361 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157787647 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157789174 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157789542 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157791837 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157792211 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157792246 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157793084 G C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157794720 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157795314 T C N Y 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 157795377 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157795414 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157795446 A C N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 157795494 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157796727 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157797723 G C N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 157797948 G A N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157799410 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157800341 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157801151 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157801282 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157801390 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157802171 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157803250 A C N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 157805882 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157806852 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157806869 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 157808057 A G N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 157808070 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 157808169 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157808253 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 157808280 C T N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 157808315 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157808414 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 157808879 A T N N 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 157808979 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157809097 C T N Y 0.0333333333333333 REF 0.25 0.25 0.0333333333333333 0.966666666666667 0 0.0666666666666667 0.933333333333333 1 29 0 1 14 3 157809248 T A N N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 157809290 C A N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 157809302 T G N N 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 157809548 G T Y N 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 157809613 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157809620 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157809718 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 157809854 C T N Y 0.181818181818182 REF 0.45 0.45 0.181818181818182 0.818181818181818 0.0909090909090909 0.181818181818182 0.727272727272727 4 18 1 2 8 3 157809884 A G Y Y 0.25 REF 0.7 0.7 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 3 9 1 1 4 3 157811131 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157814256 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157814991 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157815706 C G N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 157815946 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157817412 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157820443 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157820674 G A N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 30 6 12 6 0 3 157821720 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157821975 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157822037 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157822439 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157825543 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 157825635 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157825742 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157826371 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 157827838 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157827858 G C Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157827892 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157827913 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157827963 T G N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157827966 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157828550 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157828608 C T Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 157829072 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157829486 A G Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 157829543 T C Y Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.05 0.55 0.4 13 27 1 11 8 3 157829546 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157829901 C A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157830404 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157833264 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157834134 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 157834343 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 157834904 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157835114 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 157835248 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157835326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157838574 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157838665 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157838895 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157839130 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157839137 A G N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157839356 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157839418 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157839432 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157840109 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157840402 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 157840418 T G Y N 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 157840549 A G Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 157840551 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157840939 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157841442 A T Y N 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 157841507 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 157841972 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 157842167 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157842238 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157842769 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157842836 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 157842935 G A N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 157843178 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157843188 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.05 0.5 0.45 12 28 1 10 9 3 157843459 A C N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157843604 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157844441 G A N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 157844615 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157844677 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157844722 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157844730 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 157844903 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 157845385 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157845421 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157845458 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157845491 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157845529 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157845548 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157845683 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 157845701 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157845711 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 157845859 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 157845873 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157845879 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.555555555555556 0.388888888888889 0.0555555555555556 27 9 10 7 1 3 157845884 T G N N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 157845956 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 157846149 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 157846357 A C N N 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 157846721 A G N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 157846965 C T N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 157847087 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 157847224 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0.0555555555555556 0.0555555555555556 0.888888888888889 3 33 1 1 16 3 157847272 G A N Y 0.214285714285714 ALT 0.3 0.3 0.785714285714286 0.214285714285714 0.642857142857143 0.285714285714286 0.0714285714285714 22 6 9 4 1 3 157847331 G A N Y 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 157847341 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 157847585 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 157847649 A T N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 157847709 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 157847766 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157847790 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157847924 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157847982 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157848002 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157848089 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157848244 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157848259 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157848471 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157848495 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157848924 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157848945 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157848954 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157848994 G A N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 157849022 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.176470588235294 0.823529411764706 0 20 14 3 14 0 3 157849037 T C N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 157849065 G A Y Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 157849117 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157849261 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157849274 T A N N 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.0555555555555556 0.222222222222222 0.722222222222222 6 30 1 4 13 3 157849423 T A N N 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 157849555 C G N N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 157849561 A G N Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.6875 0.25 0.0625 26 6 11 4 1 3 157849579 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 157849673 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157849698 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157849864 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157849970 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157850140 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157850335 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157850356 C T N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 157850473 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157850520 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 157850791 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 157851070 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157851083 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157851192 T C N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 157851430 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.0526315789473684 0.263157894736842 0.684210526315789 7 31 1 5 13 3 157851518 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 157851541 A G N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 157851827 G C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157851829 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157852019 C T N Y 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0 0.222222222222222 0.777777777777778 4 32 0 4 14 3 157852022 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157852215 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157852262 C T N Y 0.15 ALT 0 0 0.85 0.15 0.7 0.3 0 34 6 14 6 0 3 157852345 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157852788 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157852893 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157853024 A C N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 157853082 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 157853093 T A N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 157853128 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157853139 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157853141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157853322 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157853344 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 157853510 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 157853539 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157853558 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157853574 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157853673 C A N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157853683 C G N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157853837 G A N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 157853960 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 157854195 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157854250 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157854273 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157854336 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157854337 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 157854405 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 157854429 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157854460 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157854723 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 157855290 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 157855757 T G N N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 157855997 G A N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 157856199 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 157856333 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157857253 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 157857510 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 157857584 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 157857652 C A N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 157857721 T G N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 157857770 G A N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 157857998 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 157858021 G C N N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 157858033 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 157858149 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 157858212 A C N N 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 157858417 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 157858440 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157858810 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0 0.35 0.65 7 33 0 7 13 3 157858905 C G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157859076 A T N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 157859121 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157859473 C G N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 157859505 G A N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.05 0.3 0.65 8 32 1 6 13 3 157859524 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157859578 A T N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157859609 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157859624 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157859740 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157859741 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157859772 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 157859816 T C N Y 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 157859912 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157859962 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 157859988 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157860018 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 157860047 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 157860087 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 157860101 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 157860239 C A N N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 32 4 14 4 0 3 157860288 A G N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 157860495 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 157860508 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0 0.294117647058824 0.705882352941177 5 29 0 5 12 3 157860552 G C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.0625 0.3125 0.625 7 25 1 5 10 3 157860606 T C N Y 0.153846153846154 REF 0.35 0.35 0.153846153846154 0.846153846153846 0 0.307692307692308 0.692307692307692 4 22 0 4 9 3 157860754 A C N N 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 157860856 G A N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.4 0.533333333333333 0.0666666666666667 20 10 6 8 1 3 157860905 C T N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 157860972 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 157861041 T C N Y 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.35 0.6 0.05 26 14 7 12 1 3 157861262 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157861324 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157861471 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0.0526315789473684 0.0526315789473684 0.894736842105263 3 35 1 1 17 3 157861620 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 157861751 C T N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 157861831 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157862364 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 157862500 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157862536 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157862564 A T Y N 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 157862653 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157862660 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157862752 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157863117 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157863133 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157863179 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157863640 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157863706 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157863793 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157863849 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157863976 T A N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.277777777777778 0.666666666666667 0.0555555555555556 22 14 5 12 1 3 157864033 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 157864285 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157864330 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0.05 0.05 0.9 3 37 1 1 18 3 157864333 C A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 157864399 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157864668 G A Y Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 157864741 C T N Y 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 157864920 G A N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157864921 C T Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 157865393 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157865693 G A N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157866081 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 157866740 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 157866756 G T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 157866805 T A N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 157866806 T A N N 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 157867085 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.444444444444444 0.5 0.0555555555555556 25 11 8 9 1 3 157867226 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 157867291 T G N N 0.35 ALT 0 0 0.65 0.35 0.4 0.5 0.1 26 14 8 10 2 3 157867373 G A Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 157867406 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 157867413 A G N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 157867823 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 157867909 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 157867954 A G Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 157869029 G T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157869052 G A N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.368421052631579 0.578947368421053 0.0526315789473684 25 13 7 11 1 3 157869178 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157869181 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 157869332 C T N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.5 0.5 0 27 9 9 9 0 3 157869345 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 157869370 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 157869482 A T N N 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 157869526 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 157869622 A C N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 157869623 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 157869651 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 157869715 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 157869740 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 157869873 A C N N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 157869874 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.388888888888889 0.555555555555556 0.0555555555555556 24 12 7 10 1 3 157869886 G T N N 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.368421052631579 0.526315789473684 0.105263157894737 24 14 7 10 2 3 157869912 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157869989 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157870067 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 157870116 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 157870190 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 157870256 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 157870279 A G N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 157870329 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 157870339 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 157870341 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 157870369 G T N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.35 0.55 0.1 25 15 7 11 2 3 157870429 C T N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 157870541 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 157870587 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.4 0.55 0.05 27 13 8 11 1 3 157870639 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157870652 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157871073 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157871100 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157871168 G T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157871260 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157871321 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 157871327 C T N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.421052631578947 0.526315789473684 0.0526315789473684 26 12 8 10 1 3 157871669 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 157872434 A C N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157872760 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157874053 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157874246 G T Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157874346 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157875057 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157876201 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157879801 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157880508 C A Y N 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.875 0.0625 0.0625 29 3 14 1 1 3 157881368 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 157882137 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157882788 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157882966 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157882990 C T N Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 157883796 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157884357 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157884433 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157885102 C G Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 157886518 G A Y Y 0.0666666666666667 ALT 0.25 0.25 0.933333333333333 0.0666666666666667 0.866666666666667 0.133333333333333 0 28 2 13 2 0 3 157888079 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157889568 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 157889834 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 157890065 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 157890166 T C Y Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 157890312 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 157890539 T C N Y 0.5 ALT 0.6 0.6 0.5 0.5 0.375 0.25 0.375 8 8 3 2 3 3 157890811 A G Y Y 0.46875 ALT 0.2 0.2 0.53125 0.46875 0.3125 0.4375 0.25 17 15 5 7 4 3 157890878 G T N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 157891010 T C N Y 0.136363636363636 ALT 0.45 0.45 0.863636363636364 0.136363636363636 0.727272727272727 0.272727272727273 0 19 3 8 3 0 3 157891049 C A N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 157891056 T C N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 157891076 T G Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 157891138 A C N N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 22 10 8 6 2 3 157891247 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 157891256 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 157891263 G A Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 157891294 C A Y N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.444444444444444 0.388888888888889 0.166666666666667 23 13 8 7 3 3 157891384 T C N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 157891428 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 157891462 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 157891467 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 157891595 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 157891688 T C Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 157891700 A G Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 157891727 T C Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 157891761 T C Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 157891790 C T Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 157891798 A T Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 157891848 C T Y Y 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 157891946 G A Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 157891990 A G Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 157891996 G T Y N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 157892009 G A Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 157892011 T C Y Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.421052631578947 0.473684210526316 0.105263157894737 25 13 8 9 2 3 157892131 C T N Y 0.411764705882353 ALT 0.15 0.15 0.588235294117647 0.411764705882353 0.411764705882353 0.352941176470588 0.235294117647059 20 14 7 6 4 3 157892157 A C Y N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 157892173 A G Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 157892231 C T N Y 0.333333333333333 ALT 0.25 0.25 0.666666666666667 0.333333333333333 0.533333333333333 0.266666666666667 0.2 20 10 8 4 3 3 157892411 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 157892432 G A Y Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 157892525 G T Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.705882352941177 0.235294117647059 0.0588235294117647 28 6 12 4 1 3 157892576 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 157892598 C G Y N 0.357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.642857142857143 0.357142857142857 0.5 0.285714285714286 0.214285714285714 18 10 7 4 3 3 157892651 T C N Y 0.366666666666667 ALT 0.25 0.25 0.633333333333333 0.366666666666667 0.466666666666667 0.333333333333333 0.2 19 11 7 5 3 3 157892781 T G N N 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 157892861 G A Y Y 0.138888888888889 ALT 0.1 0.1 0.861111111111111 0.138888888888889 0.722222222222222 0.277777777777778 0 31 5 13 5 0 3 157892911 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 157892973 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157893048 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.444444444444444 0.277777777777778 0.277777777777778 21 15 8 5 5 3 157893068 A C N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 157893129 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 157893158 G A Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 157893168 A G Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.4 0.4 0.2 24 16 8 8 4 3 157893194 A C Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 157893219 T C Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 157893275 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 157893334 A G N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 157893380 G T N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157893414 T C N Y 0.470588235294118 ALT 0.15 0.15 0.529411764705882 0.470588235294118 0.352941176470588 0.352941176470588 0.294117647058824 18 16 6 6 5 3 157893472 C G Y N 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 157893578 A T Y N 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.375 0.4375 0.1875 19 13 6 7 3 3 157893625 C A N N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 157893893 T C Y Y 0.375 ALT 0.2 0.2 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 20 12 8 4 4 3 157893927 C T Y Y 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.555555555555556 0.222222222222222 0.222222222222222 24 12 10 4 4 3 157894031 G A Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 3 157894077 T C Y Y 0.181818181818182 ALT 0.45 0.45 0.818181818181818 0.181818181818182 0.636363636363636 0.363636363636364 0 18 4 7 4 0 3 157894135 T C N Y 0.409090909090909 ALT 0.45 0.45 0.590909090909091 0.409090909090909 0.454545454545455 0.272727272727273 0.272727272727273 13 9 5 3 3 3 157894144 C T N Y 0.35 ALT 0.5 0.5 0.65 0.35 0.5 0.3 0.2 13 7 5 3 2 3 157894187 T C Y Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.5 0.25 0.25 15 9 6 3 3 3 157897614 T C Y Y 0.40625 ALT 0.2 0.2 0.59375 0.40625 0.4375 0.3125 0.25 19 13 7 5 4 3 157897753 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 157897764 A C N N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.411764705882353 0.529411764705882 0.0588235294117647 23 11 7 9 1 3 157897801 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 157897808 A C N N 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 157897837 G A N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 157897866 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 157898004 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 157898037 T A N N 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 157898051 A G N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.4 0.3 0.3 22 18 8 6 6 3 157898055 A C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 157898100 T C N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 157898197 G T N N 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 157898362 G A N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 157898367 T G N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 157898487 A G N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 157898498 C T N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 157898502 C T Y Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 157898982 T A N N 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.388888888888889 0.388888888888889 0.222222222222222 21 15 7 7 4 3 157899070 C T N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 157899204 G T N N 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 157899316 T C N Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.388888888888889 0.333333333333333 0.277777777777778 20 16 7 6 5 3 157899336 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 157899349 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157899369 C T N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 157899614 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 157899899 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 157899924 C T N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 157899989 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157900037 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 157900057 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 157900234 C T N Y 0.388888888888889 ALT 0.1 0.1 0.611111111111111 0.388888888888889 0.444444444444444 0.333333333333333 0.222222222222222 22 14 8 6 4 3 157900313 A G N Y 0.472222222222222 ALT 0.1 0.1 0.527777777777778 0.472222222222222 0.333333333333333 0.388888888888889 0.277777777777778 19 17 6 7 5 3 157900796 A G N Y 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 157900868 A C N N 0.5 ALT 0.2 0.2 0.5 0.5 0.3125 0.375 0.3125 16 16 5 6 5 3 157900889 C T N Y 0.466666666666667 ALT 0.25 0.25 0.533333333333333 0.466666666666667 0.333333333333333 0.4 0.266666666666667 16 14 5 6 4 3 157901028 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 157901060 C T N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.55 0.45 0 31 9 11 9 0 3 157901150 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 157901221 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 157901597 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 157901814 G C N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 157901829 T C N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 157901850 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 157901952 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 157902168 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157902240 T C N Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 157902401 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 157902564 A C N N 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 157902576 T A N N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 157904080 C T N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 157905148 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157905149 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157905211 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157905748 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157906588 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157906726 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157907785 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157910984 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157911180 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157913655 A T N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 157913672 G T N N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 157913729 C T Y Y 0.0357142857142857 ALT 0.3 0.3 0.964285714285714 0.0357142857142857 0.928571428571429 0.0714285714285714 0 27 1 13 1 0 3 157914293 A T N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 157914359 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 157914760 A C N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157914969 G A N Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 157915427 A T N N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 157915486 A G N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 157915824 G A Y Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 157915947 T C Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 157916185 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157916281 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 157916306 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157916391 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157916400 T G N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157916446 T C N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157916470 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157916482 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157916499 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157916533 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.631578947368421 0.368421052631579 0 31 7 12 7 0 3 157916540 T A N N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.611111111111111 0.388888888888889 0 29 7 11 7 0 3 157916655 A C N N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 157916660 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.65 0.35 0 33 7 13 7 0 3 157916914 G A Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 157917076 A T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 157917167 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157917527 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 157917676 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 157917783 T A Y N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.75 0.166666666666667 0.0833333333333333 20 4 9 2 1 3 157917979 T C Y Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 157918200 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 157918244 T G Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 157918382 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157918727 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 157919037 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157919108 A G Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157919353 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157919360 G C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157919385 A G Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 157919450 C G Y N 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.15 0.35 0.5 13 27 3 7 10 3 157919613 C T Y Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 157919738 G A N Y 0.025 ALT 0 0 0.975 0.025 0.95 0.05 0 39 1 19 1 0 3 157919760 T C Y Y 0.125 REF 0 0 0.125 0.875 0 0.25 0.75 5 35 0 5 15 3 157919803 C A Y N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 157920016 C A N N 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 157920067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157920173 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 157920243 T A N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 157920260 T C Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157920370 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 157920472 A C Y N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 157920757 C T N Y 0.176470588235294 REF 0.15 0.15 0.176470588235294 0.823529411764706 0 0.352941176470588 0.647058823529412 6 28 0 6 11 3 157920792 G A Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 157921097 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157921227 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 157921565 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157921738 T C N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 157921866 C G N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 157921964 C T Y Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 157922012 A C N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 157922052 C T N Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 157922086 C T N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 157922104 G T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 157922140 C T Y Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 157922284 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157922372 C A Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 157922373 A G Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 157922401 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 157922423 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 157922553 C T N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 157922610 A C Y N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 157922668 C T Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 157922705 A G Y Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 157922865 G T Y N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 157923015 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0 0.368421052631579 0.631578947368421 7 31 0 7 12 3 157923095 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 157923182 G A N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 157923365 G C Y N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 157923643 A T Y N 0.375 REF 0.2 0.2 0.375 0.625 0.1875 0.375 0.4375 12 20 3 6 7 3 157923742 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.105263157894737 0.421052631578947 0.473684210526316 12 26 2 8 9 3 157923822 A G N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 157923988 A T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 157924304 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 157924600 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 157924691 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157924795 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.210526315789474 0.421052631578947 0.368421052631579 16 22 4 8 7 3 157924800 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157925727 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157925734 T G N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157925948 G A N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157926032 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157926127 A T N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 157926432 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157927827 C T Y Y 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.692307692307692 0.307692307692308 0 22 4 9 4 0 3 157928418 T A N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 157928817 T C N Y 0.125 ALT 0.2 0.2 0.875 0.125 0.75 0.25 0 28 4 12 4 0 3 157928862 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 157928985 T G N N 0.166666666666667 ALT 0.4 0.4 0.833333333333333 0.166666666666667 0.666666666666667 0.333333333333333 0 20 4 8 4 0 3 157929044 C T N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 157929371 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157929439 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157929473 A G N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 157929709 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157929939 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 157930294 T C N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157930355 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.75 0.25 0 35 5 15 5 0 3 157930518 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157930543 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157930819 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157930846 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157931127 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157931561 C T Y Y 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 157931648 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157931701 T A Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157932340 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157932520 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157932550 C T Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157932748 C T N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 157933155 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157933739 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157934484 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157934558 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157934801 G A Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 157935693 T C Y Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 30 10 12 6 2 3 157935926 C T Y Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.9 0.05 0.05 37 3 18 1 1 3 157936048 G A N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.684210526315789 0.315789473684211 0 32 6 13 6 0 3 157936147 T C N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 157936335 C T Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157936507 A G N Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 157936696 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 157936750 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157936939 T C N Y 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 157937068 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157937078 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157937173 T C N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.35 0.4 0.25 22 18 7 8 5 3 157937395 C T N Y 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 157937541 G A N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 157937642 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0 0.263157894736842 0.736842105263158 5 33 0 5 14 3 157937684 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 157938136 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 157938302 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157938329 A T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 157938677 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 157938730 T G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 157938752 T A N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.105263157894737 0.368421052631579 0.526315789473684 11 27 2 7 10 3 157938768 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 157938811 A T N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.117647058823529 0.294117647058824 0.588235294117647 9 25 2 5 10 3 157938947 C A N N 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.117647058823529 0.352941176470588 0.529411764705882 10 24 2 6 9 3 157939076 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 157939134 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 157939973 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 157940517 C A Y N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.473684210526316 0.473684210526316 0.0526315789473684 27 11 9 9 1 3 157940649 C T Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 157940981 T C N Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 16 20 4 8 6 3 157941027 A T N N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.15 0.5 0.35 16 24 3 10 7 3 157941199 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157941354 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157941442 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 157941443 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157941464 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157941482 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157942122 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 157942355 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 157942604 A G N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 157942842 A T N N 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.105263157894737 0.526315789473684 0.368421052631579 14 24 2 10 7 3 157943244 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 157943345 A G N Y 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.0666666666666667 0.333333333333333 0.6 7 23 1 5 9 3 157943389 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 157943495 A G N Y 0.1875 REF 0.2 0.2 0.1875 0.8125 0.0625 0.25 0.6875 6 26 1 4 11 3 157943575 G A N Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.294117647058824 0.411764705882353 0.294117647058824 17 17 5 7 5 3 157943579 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 157943611 G A N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.0555555555555556 0.277777777777778 0.666666666666667 7 29 1 5 12 3 157943725 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 157943765 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.05 0.25 0.7 7 33 1 5 14 3 157943780 A G N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.277777777777778 0.444444444444444 0.277777777777778 18 18 5 8 5 3 157943835 C G Y N 0.205882352941176 REF 0.15 0.15 0.205882352941176 0.794117647058823 0.0588235294117647 0.294117647058824 0.647058823529412 7 27 1 5 11 3 157943990 C T Y Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.25 0.55 0.2 21 19 5 11 4 3 157944003 T C Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.0526315789473684 0.368421052631579 0.578947368421053 9 29 1 7 11 3 157944240 G A N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 157944332 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157944344 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157944409 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157944470 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157944597 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157944619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157944673 G A N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 157944730 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157945359 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 157945369 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157945526 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157945620 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 157945864 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157945887 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157946441 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157946484 G C N N 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.65 0.3 0.05 32 8 13 6 1 3 157946489 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157947664 T C N Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.611111111111111 0.333333333333333 0.0555555555555556 28 8 11 6 1 3 157948116 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157948401 C G N N 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.35 0.5 0.15 24 16 7 10 3 3 157948806 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157949019 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157949197 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 157950832 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157950962 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157950971 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157951081 T C N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 157951167 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157951207 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157951276 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 157951279 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 157951290 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 157951324 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157951365 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157951377 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157951412 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 157951465 T A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 157951555 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 157951557 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 157951746 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157951752 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157951819 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157951878 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157951917 G C N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 157952145 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157952335 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 157952356 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157952436 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157952528 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 157952647 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157952932 C A N N 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 157952974 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157953252 A G N Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 157953305 G A N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 157953407 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 157953426 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 157953518 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 157953609 T C N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 157953653 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 157953708 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 157953723 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 157953762 C A N N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 157953770 C T N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 157953790 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 157953808 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 157953885 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 157953886 A G N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 157953910 C A N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 157953911 T G N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 157954014 C T N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 157954231 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157954441 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 157954458 C T N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 157954653 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 157954706 C T N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 157954880 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 157954993 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 157955065 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157955298 G A N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 157955393 T C N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 157955559 A T Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157955578 G T N N 0.111111111111111 REF 0.1 0.1 0.111111111111111 0.888888888888889 0.0555555555555556 0.111111111111111 0.833333333333333 4 32 1 2 15 3 157955583 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157955639 T C Y Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 157955651 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157955698 C T Y Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 157955883 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157956013 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157956017 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157956118 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157956179 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157956200 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157956387 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157956479 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 157956504 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 157956924 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157957018 G T Y N 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 157957167 G T Y N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 157957389 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157957494 T G Y N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 157957868 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157958091 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157958301 A C Y N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 157958788 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157959030 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157959648 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157959733 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157960057 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157960982 T C Y Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 157961259 C T Y Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.705882352941177 0.176470588235294 0.117647058823529 27 7 12 3 2 3 157961295 C T Y Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 157961504 T A Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 157961545 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157961568 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 157961585 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 157961683 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157961703 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157961744 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157961754 A G N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.555555555555556 0.277777777777778 0.166666666666667 25 11 10 5 3 3 157961757 A C N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.588235294117647 0.294117647058824 0.117647058823529 25 9 10 5 2 3 157961890 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157961990 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157962069 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 157962118 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157962146 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157962968 C T Y Y 0.21875 ALT 0.2 0.2 0.78125 0.21875 0.625 0.3125 0.0625 25 7 10 5 1 3 157963480 A G Y Y 0.277777777777778 ALT 0.1 0.1 0.722222222222222 0.277777777777778 0.611111111111111 0.222222222222222 0.166666666666667 26 10 11 4 3 3 157963570 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157963700 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157963728 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 157964140 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157964430 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157964479 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 157964563 G A Y Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.55 0.3 0.15 28 12 11 6 3 3 157964638 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 157964678 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 157964696 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157964705 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 157964788 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157964861 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157965199 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 157965427 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157965483 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157965517 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157965528 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157965539 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 157965560 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157965643 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 157965727 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 157965788 T G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 157966001 A G Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 157966068 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157966207 C G N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 157966260 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157966404 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 157966414 C T Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.684210526315789 0.157894736842105 0.157894736842105 29 9 13 3 3 3 157966500 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 157966574 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157966575 T C N Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 157966779 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 157966887 G T Y N 0.266666666666667 ALT 0.25 0.25 0.733333333333333 0.266666666666667 0.6 0.266666666666667 0.133333333333333 22 8 9 4 2 3 157967102 A G N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 157967187 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 157967259 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157967391 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 157967410 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 157967542 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 157967613 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157967658 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 157967730 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157967969 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157967992 T C Y Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 157968143 T C Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 157968148 T C Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 157968164 C G Y N 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 157968303 G A N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 157968415 T C N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 157968421 G A Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 157968441 G C Y N 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.5625 0.25 0.1875 22 10 9 4 3 3 157968503 G A Y Y 0.115384615384615 ALT 0.35 0.35 0.884615384615385 0.115384615384615 0.769230769230769 0.230769230769231 0 23 3 10 3 0 3 157968604 A G N Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.571428571428571 0.285714285714286 0.142857142857143 20 8 8 4 2 3 157968959 A C N N 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 157969031 T G Y N 0.142857142857143 ALT 0.3 0.3 0.857142857142857 0.142857142857143 0.714285714285714 0.285714285714286 0 24 4 10 4 0 3 157969036 T C N Y 0.3 ALT 0.25 0.25 0.7 0.3 0.533333333333333 0.333333333333333 0.133333333333333 21 9 8 5 2 3 157969056 C T N Y 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.5625 0.3125 0.125 23 9 9 5 2 3 157969090 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157969193 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 157969272 T A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 157969386 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 157969503 G A Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 157969583 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 157969654 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 157969657 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 157969701 A T N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 157969912 C T Y Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 157969942 C T Y Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.421052631578947 0.315789473684211 0.263157894736842 22 16 8 6 5 3 157969960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157969981 T G N N 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 157970103 C T N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 157970133 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157970146 A G Y Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 157970231 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 157970435 G A Y Y 0.1 ALT 0 0 0.9 0.1 0.8 0.2 0 36 4 16 4 0 3 157970444 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157970455 C T Y Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 157970602 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157970617 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157970967 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157971771 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 157972211 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 157973026 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 157973678 G A N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 157974801 T C N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.125 0.25 0.625 8 24 2 4 10 3 157974921 T C N Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.157894736842105 0.263157894736842 0.578947368421053 11 27 3 5 11 3 157975672 T G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 157976204 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157977302 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157977468 A G N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 157977485 A G N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 157977504 A T N N 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 157977928 T C N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 157977973 C T N Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 157978019 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 157978357 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157978657 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157979376 T G N N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.75 0.1875 0.0625 27 5 12 3 1 3 157979798 T C N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 157980060 C T N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 157980399 C G N N 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 157980566 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 157981088 C T N Y 0.425 REF 0 0 0.425 0.575 0.25 0.35 0.4 17 23 5 7 8 3 157981206 G A N Y 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 157981900 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157982051 C A Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157982810 A G N Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 157983756 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157984198 T C N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 157984934 C T Y Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 157985043 C T N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157985616 G A N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 157985910 A G N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157985998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157986135 A C Y N 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157986425 T C N Y 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 157986447 G T N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.684210526315789 0.263157894736842 0.0526315789473684 31 7 13 5 1 3 157987638 T C N Y 0.325 ALT 0 0 0.675 0.325 0.5 0.35 0.15 27 13 10 7 3 3 157987694 A G N Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.736842105263158 0.210526315789474 0.0526315789473684 32 6 14 4 1 3 157987893 A G N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 157988543 T C N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.7 0.25 0.05 33 7 14 5 1 3 157988548 G A N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 157989475 T A N N 0.1 REF 0 0 0.1 0.9 0 0.2 0.8 4 36 0 4 16 3 157989988 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.3 0.3 0.4 18 22 6 6 8 3 157990088 C A N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 157990301 G T N N 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.722222222222222 0.222222222222222 0.0555555555555556 30 6 13 4 1 3 157992457 T C N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 157995100 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 157995876 G T Y N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 157996323 A G Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 157996623 T C Y Y 0.208333333333333 REF 0.4 0.4 0.208333333333333 0.791666666666667 0.0833333333333333 0.25 0.666666666666667 5 19 1 3 8 3 157996656 C A Y N 0.0909090909090909 REF 0.45 0.45 0.0909090909090909 0.909090909090909 0 0.181818181818182 0.818181818181818 2 20 0 2 9 3 157996658 C A Y N 0.125 REF 0.4 0.4 0.125 0.875 0 0.25 0.75 3 21 0 3 9 3 157997785 A T Y N 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 157998929 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 157999109 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 157999170 A C Y N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0 0.3125 0.6875 5 27 0 5 11 3 157999212 A C Y N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 158000038 G A Y Y 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 158000682 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158002246 T G N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.157894736842105 0.315789473684211 0.526315789473684 12 26 3 6 10 3 158002275 C T N Y 0.333333333333333 REF 0.1 0.1 0.333333333333333 0.666666666666667 0.166666666666667 0.333333333333333 0.5 12 24 3 6 9 3 158002686 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158004801 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158005957 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158007404 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158010602 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158011281 G T Y N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 158012395 A C Y N 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 158013667 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 158013728 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158013984 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158015115 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158015310 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158019766 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158021793 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158023038 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158023232 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158023803 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158024046 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158024056 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158024361 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158024370 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158024871 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158024872 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158025445 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158026081 C T Y Y 0.444444444444444 REF 0.55 0.55 0.444444444444444 0.555555555555556 0.222222222222222 0.444444444444444 0.333333333333333 8 10 2 4 3 3 158028858 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158029640 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158034450 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158035702 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158037706 C A N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 158037905 T G Y N 0.323529411764706 ALT 0.15 0.15 0.676470588235294 0.323529411764706 0.470588235294118 0.411764705882353 0.117647058823529 23 11 8 7 2 3 158038111 C A N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 158038124 T C N Y 0.294117647058824 REF 0.15 0.15 0.294117647058824 0.705882352941177 0.176470588235294 0.235294117647059 0.588235294117647 10 24 3 4 10 3 158038158 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 158038566 C T N Y 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 158038680 C A Y N 0.153846153846154 ALT 0.35 0.35 0.846153846153846 0.153846153846154 0.769230769230769 0.153846153846154 0.0769230769230769 22 4 10 2 1 3 158038752 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 158038837 A G N Y 0.136363636363636 REF 0.45 0.45 0.136363636363636 0.863636363636364 0.0909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 3 19 1 1 9 3 158039085 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 158039111 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 158039134 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 158039143 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 158039163 C A Y N 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 158039203 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 158039211 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158039277 C A Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 158040215 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158041088 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 158041226 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 158041406 T A Y N 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 158041468 A C Y N 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.666666666666667 0.166666666666667 0.166666666666667 27 9 12 3 3 3 158041615 C T Y Y 0.222222222222222 ALT 0.1 0.1 0.777777777777778 0.222222222222222 0.666666666666667 0.222222222222222 0.111111111111111 28 8 12 4 2 3 158041623 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158041755 C G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158042067 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158042282 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158042315 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158042357 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158042554 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158042571 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158042653 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158042913 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158043503 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158043535 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 158043603 A C Y N 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 158043652 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158043759 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158043772 T C N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 158043784 C T Y Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.631578947368421 0.210526315789474 0.157894736842105 28 10 12 4 3 3 158043821 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158043826 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158043897 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158043981 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158044213 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158044249 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158044623 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158044782 A G Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 158044853 A T N N 0.264705882352941 ALT 0.15 0.15 0.735294117647059 0.264705882352941 0.647058823529412 0.176470588235294 0.176470588235294 25 9 11 3 3 3 158044901 T C Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 158044984 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 158045947 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158046038 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158046199 A G N Y 0.09375 REF 0.2 0.2 0.09375 0.90625 0 0.1875 0.8125 3 29 0 3 13 3 158046205 T C N Y 0.0769230769230769 REF 0.35 0.35 0.0769230769230769 0.923076923076923 0 0.153846153846154 0.846153846153846 2 24 0 2 11 3 158046352 C G N N 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 158046642 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158046713 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158046731 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 158046886 C T N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 158047199 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 158047364 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158047394 T C N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 158047487 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158047618 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158047851 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 158048213 A T N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 158048743 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158048816 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 158049216 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158050009 G C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 158050156 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158050234 A T N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 158050282 A G Y Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.375 0.625 0 22 10 6 10 0 3 158050318 G A Y Y 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 158050332 T A Y N 0.285714285714286 ALT 0.3 0.3 0.714285714285714 0.285714285714286 0.428571428571429 0.571428571428571 0 20 8 6 8 0 3 158050438 G A Y Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 158051187 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 158051296 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 158051334 C T N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 158051341 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.6 0.25 0.15 29 11 12 5 3 3 158051377 A G N Y 0.075 ALT 0 0 0.925 0.075 0.85 0.15 0 37 3 17 3 0 3 158051417 T G N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 158051454 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 158051476 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 158051503 T C N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.35 0.45 0.2 23 17 7 9 4 3 158051736 T G N N 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.157894736842105 0.157894736842105 0.684210526315789 9 29 3 3 13 3 158051893 G A N Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.470588235294118 0.294117647058824 0.235294117647059 21 13 8 5 4 3 158051927 G A N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 158052137 T C N Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 158052179 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 158052405 G T N N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 158052407 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 158052503 T C N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 158052790 G A N Y 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 158053035 A C N N 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.166666666666667 0.222222222222222 0.611111111111111 10 26 3 4 11 3 158053070 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.15 0.2 0.65 10 30 3 4 13 3 158053711 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158053789 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158053862 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158053937 G T N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 158054020 A G N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 158054033 T C N Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 158054193 T C N Y 0.03125 ALT 0.2 0.2 0.96875 0.03125 0.9375 0.0625 0 31 1 15 1 0 3 158054253 T C N Y 0.1 ALT 0.25 0.25 0.9 0.1 0.8 0.2 0 27 3 12 3 0 3 158054297 G T N N 0.125 ALT 0.4 0.4 0.875 0.125 0.75 0.25 0 21 3 9 3 0 3 158054509 C G Y N 0.28125 ALT 0.2 0.2 0.71875 0.28125 0.625 0.1875 0.1875 23 9 10 3 3 3 158054791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158055327 G A Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 158056619 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158056677 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158058667 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 158059358 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158059556 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158059558 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158059781 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158060055 A G N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 158060560 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158061020 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158061293 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158061559 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158061783 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158064939 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158065179 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158065277 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158065355 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158065748 A G N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 158066290 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158066782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158067008 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158067420 C T Y Y 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 158067488 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158067565 G A N Y 0.0789473684210526 REF 0.05 0.05 0.0789473684210526 0.921052631578947 0 0.157894736842105 0.842105263157895 3 35 0 3 16 3 158067585 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158067839 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158067894 G A N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 158067988 G A Y Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 158068150 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158068269 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158068483 T G N N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 158070098 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158072223 C A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158072684 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158073940 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.222222222222222 0.277777777777778 0.5 13 23 4 5 9 3 158075187 G T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 158077709 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158078789 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158079212 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158080428 T A N N 0.2 ALT 0.25 0.25 0.8 0.2 0.666666666666667 0.266666666666667 0.0666666666666667 24 6 10 4 1 3 158080944 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158080979 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158081850 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158082738 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 158083101 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158087400 A G N Y 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.421052631578947 0.578947368421053 0 27 11 8 11 0 3 158087590 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158087591 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158087966 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158088258 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158089176 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158089487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158090876 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158090987 C T N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.1 0.2 0.7 8 32 2 4 14 3 158091361 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.7 0.2 0.1 32 8 14 4 2 3 158091776 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 158092894 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158094185 T C N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 158094875 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158095040 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158097307 G A Y Y 0.2 REF 0.75 0.75 0.2 0.8 0.2 0 0.8 2 8 1 0 4 3 158098824 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158099194 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158099738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158100300 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158100305 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158101076 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158101494 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158102537 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158102816 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158103053 T C N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 158103068 G A N Y 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 158103279 A T Y N 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 158103583 G T Y N 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 158103730 T C N Y 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 158104100 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 158104488 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158111436 T G N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 158111560 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158111925 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158113822 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158113952 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158114311 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158115194 T G N N 0.0294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.970588235294118 0.0294117647058824 0.941176470588235 0.0588235294117647 0 33 1 16 1 0 3 158115349 T C N Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 158115800 A G N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 158115835 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158116017 C T N Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 158116021 G T N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 158116076 C A N N 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 158116143 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 158116151 C A N N 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 158116424 A G N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 158116623 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158117011 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 158117359 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158120401 C G N N 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 158121553 A G N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 158121826 G A N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0 0.266666666666667 0.733333333333333 4 26 0 4 11 3 158121912 C T N Y 0.214285714285714 REF 0.65 0.65 0.214285714285714 0.785714285714286 0 0.428571428571429 0.571428571428571 3 11 0 3 4 3 158121917 C T N Y 0 REF 0.75 0.75 0 1 0 0 1 0 10 0 0 5 3 158121931 C T N Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 158122383 A C N N 0.0555555555555556 REF 0.1 0.1 0.0555555555555556 0.944444444444444 0 0.111111111111111 0.888888888888889 2 34 0 2 16 3 158122760 C G N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 158122961 G A N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 158123016 C A N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 158123235 A C N N 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 158123331 C T N Y 0.05 REF 0 0 0.05 0.95 0 0.1 0.9 2 38 0 2 18 3 158123546 A T N N 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.5 0.277777777777778 0.222222222222222 23 13 9 5 4 3 158123802 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158123827 G A N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 158123887 T C N Y 0.0833333333333333 REF 0.1 0.1 0.0833333333333333 0.916666666666667 0 0.166666666666667 0.833333333333333 3 33 0 3 15 3 158124191 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158124412 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158124445 T A Y N 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 158126119 C T N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 158126182 A G N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 158126468 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158127554 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158127816 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158128166 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 158128390 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 158128777 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158128967 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158130129 A G N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 158130380 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158130546 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158131710 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158133833 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 158134188 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158135208 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158135840 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158136150 T C N Y 0.105263157894737 REF 0.05 0.05 0.105263157894737 0.894736842105263 0 0.210526315789474 0.789473684210526 4 34 0 4 15 3 158136681 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158137175 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 158137808 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158138768 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158139184 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158140097 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158140888 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158141823 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158143321 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158143644 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158144127 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158146788 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 158149093 C T Y Y 0.2 ALT 0 0 0.8 0.2 0.75 0.1 0.15 32 8 15 2 3 3 158150063 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158150099 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 158150281 T C N Y 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 158151228 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158151250 A G N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 158152683 G A N Y 0.425 ALT 0 0 0.575 0.425 0.4 0.35 0.25 23 17 8 7 5 3 158153662 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158154027 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158154929 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158155503 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158156594 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158157083 A G Y Y 0.1875 ALT 0.2 0.2 0.8125 0.1875 0.625 0.375 0 26 6 10 6 0 3 158157484 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158160462 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158161521 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158162466 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158163990 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158166434 C T N Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.368421052631579 0.368421052631579 0.263157894736842 21 17 7 7 5 3 158167255 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 158167662 G A N Y 0.5 ALT 0.1 0.1 0.5 0.5 0.333333333333333 0.333333333333333 0.333333333333333 18 18 6 6 6 3 158169605 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158170000 G A Y Y 0.05 ALT 0 0 0.95 0.05 0.9 0.1 0 38 2 18 2 0 3 158171064 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158171437 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158175791 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158176655 A T Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 158177016 T C Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158177425 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158177712 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158178189 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 158178982 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158179400 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158179481 G A Y Y 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 158179703 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158179844 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158180327 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158183400 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 158185328 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158186782 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158187067 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158188053 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158188103 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158189667 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158189842 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158190198 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 158194236 T C N Y 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 158194437 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158195636 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158195805 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 158196143 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158196424 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158198593 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158199158 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 158200285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158201837 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158201997 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158204487 A G N Y 0.075 REF 0 0 0.075 0.925 0 0.15 0.85 3 37 0 3 17 3 158205724 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158206005 A G N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 158208291 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 158209723 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158210294 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158211413 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158211739 C T N Y 0.466666666666667 REF 0.25 0.25 0.466666666666667 0.533333333333333 0.266666666666667 0.4 0.333333333333333 14 16 4 6 5 3 158212961 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158213262 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158216537 G A N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 158218937 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158219329 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158219952 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158221528 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158222183 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158222286 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158222710 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158222927 G A Y Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 158224672 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 158225278 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158227603 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158230286 T C N Y 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 158236319 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158239019 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158239960 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158240516 A G N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 158241438 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158242365 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158242859 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158244720 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158245026 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158245526 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 158245934 T C N Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 158246055 T G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 158247625 A C N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 158247817 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158248114 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158249532 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158249905 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158250090 C T Y Y 0.25 ALT 0.1 0.1 0.75 0.25 0.611111111111111 0.277777777777778 0.111111111111111 27 9 11 5 2 3 158250137 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158250294 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158251279 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158254575 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158255118 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158255211 G A N Y 0.3125 ALT 0.2 0.2 0.6875 0.3125 0.625 0.125 0.25 22 10 10 2 4 3 158256641 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158256852 C T N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 158257381 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158259439 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158260011 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158261064 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158261429 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158262720 A G N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 158263036 G T Y N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 158263292 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158263593 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158265694 C G N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 158265812 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158265813 G T N N 0.5 ALT 0 0 0.5 0.5 0.3 0.4 0.3 20 20 6 8 6 3 158267810 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158268623 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158269433 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158269639 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158269810 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158269888 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158270322 C G N N 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 158271452 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158273814 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158274018 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158274751 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158274813 C T Y Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.470588235294118 0.352941176470588 0.176470588235294 22 12 8 6 3 3 158275666 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158276408 C T N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 158276629 G C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158276671 G A N Y 0.45 ALT 0 0 0.55 0.45 0.3 0.5 0.2 22 18 6 10 4 3 158278580 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158279035 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158279312 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158281214 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158281321 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158281850 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158281851 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158282918 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158283511 T C Y Y 0.0454545454545455 REF 0.45 0.45 0.0454545454545455 0.954545454545455 0 0.0909090909090909 0.909090909090909 1 21 0 1 10 3 158285623 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 158285650 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 158285766 C A N N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 158285830 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158286251 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158288133 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 158288920 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158289585 A C Y N 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 158298243 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158298849 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158299660 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158300473 C T Y Y 0.472222222222222 REF 0.1 0.1 0.472222222222222 0.527777777777778 0.388888888888889 0.166666666666667 0.444444444444444 17 19 7 3 8 3 158300676 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158301644 C G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158301645 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158301771 A C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158302080 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158302530 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158302587 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158302617 A G N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 158302952 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158303341 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158303736 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158305083 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 158306278 T C N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 158306491 T A Y N 0.25 ALT 0.5 0.5 0.75 0.25 0.6 0.3 0.1 15 5 6 3 1 3 158309306 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158311453 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158314746 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158315762 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158316123 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158318012 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158318061 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158318262 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158318527 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158318605 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158318836 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158318974 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158319351 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158319672 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158321155 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158322271 G C N N 0.166666666666667 ALT 0.25 0.25 0.833333333333333 0.166666666666667 0.8 0.0666666666666667 0.133333333333333 25 5 12 1 2 3 158322286 T G N N 0.233333333333333 REF 0.25 0.25 0.233333333333333 0.766666666666667 0.133333333333333 0.2 0.666666666666667 7 23 2 3 10 3 158322838 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158322849 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158323298 T G N N 0.125 REF 0.2 0.2 0.125 0.875 0 0.25 0.75 4 28 0 4 12 3 158323982 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 158324541 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158324841 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158324865 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158325160 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.315789473684211 0.526315789473684 0.157894736842105 22 16 6 10 3 3 158326596 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158326975 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158327244 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158328537 A G N Y 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 158329619 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158329776 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158329819 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158334220 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158334351 A G Y Y 0.5 ALT 0.15 0.15 0.5 0.5 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.0588235294117647 17 17 1 15 1 3 158334771 G A N Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 158335443 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 158335582 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158336110 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158336169 G C Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158336724 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158336752 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158337012 G A Y Y 0.4375 ALT 0.2 0.2 0.5625 0.4375 0.375 0.375 0.25 18 14 6 6 4 3 158337968 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158340114 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158343879 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 158344207 A G Y Y 0.0714285714285714 REF 0.3 0.3 0.0714285714285714 0.928571428571429 0 0.142857142857143 0.857142857142857 2 26 0 2 12 3 158344533 A T Y N 0.0357142857142857 REF 0.3 0.3 0.0357142857142857 0.964285714285714 0 0.0714285714285714 0.928571428571429 1 27 0 1 13 3 158344604 A G Y Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 158344748 A C Y N 0.0666666666666667 REF 0.25 0.25 0.0666666666666667 0.933333333333333 0 0.133333333333333 0.866666666666667 2 28 0 2 13 3 158345462 G T Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158346145 C T Y Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 158346779 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158346848 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158348730 A G N Y 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.176470588235294 0.529411764705882 0.294117647058824 15 19 3 9 5 3 158350345 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158352477 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158352819 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158354451 G A Y Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 158355216 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158356986 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158357746 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158359183 T A Y N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 158360307 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 158360323 T C Y Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 158367262 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 158367281 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 158367401 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158367636 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158368547 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 158370749 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158371382 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158371474 G A Y Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 158371788 C G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 158374133 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158379541 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158380254 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158381055 C T N Y 0.0526315789473684 ALT 0.05 0.05 0.947368421052632 0.0526315789473684 0.894736842105263 0.105263157894737 0 36 2 17 2 0 3 158382611 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158382725 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158383117 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158385541 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158385586 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158385699 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158385802 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158385881 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158388395 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158388460 C A Y N 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 158389200 C A Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 158391937 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158392951 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158392959 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158392966 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158402881 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158404862 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 158406351 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 158407678 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158408103 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158408193 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158412235 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158412508 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158413119 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158413587 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158414179 A T Y N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 158420718 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158420981 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158421186 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158422281 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158423443 A C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 158425786 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158428173 G A N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 158428458 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 158429446 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158430635 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158431143 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158432002 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 158432879 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158433963 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158434263 G A N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0 0.3 0.7 6 34 0 6 14 3 158434445 T C N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 6 30 0 6 12 3 158434801 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158434958 C T Y Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0 0.315789473684211 0.684210526315789 6 32 0 6 13 3 158436998 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158441477 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158442665 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158446167 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158446247 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158446742 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158447068 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158447396 A G N Y 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.421052631578947 0.368421052631579 0.210526315789474 23 15 8 7 4 3 158448245 G A N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 158449472 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158452625 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158453296 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158454514 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158455480 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158456427 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158458341 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158458852 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158459383 C A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 158459533 A G N Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 158459654 A G N Y 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.4 0.25 0.35 21 19 8 5 7 3 158462499 T A Y N 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 158462620 T C N Y 0.227272727272727 ALT 0.45 0.45 0.772727272727273 0.227272727272727 0.636363636363636 0.272727272727273 0.0909090909090909 17 5 7 3 1 3 158462884 G C Y N 0.0555555555555556 ALT 0.55 0.55 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 17 1 8 1 0 3 158464069 A G Y Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 158465099 G A Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 158465183 T C Y Y 0.461538461538462 REF 0.35 0.35 0.461538461538462 0.538461538461538 0.230769230769231 0.461538461538462 0.307692307692308 12 14 3 6 4 3 158466617 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158468210 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158469163 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 158469220 C T N Y 0.166666666666667 REF 0.55 0.55 0.166666666666667 0.833333333333333 0 0.333333333333333 0.666666666666667 3 15 0 3 6 3 158470929 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158472747 C A N N 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 158472958 G A N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.368421052631579 0.421052631578947 0.210526315789474 22 16 7 8 4 3 158473051 C T N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 158473273 T C N Y 0.421052631578947 ALT 0.05 0.05 0.578947368421053 0.421052631578947 0.473684210526316 0.210526315789474 0.315789473684211 22 16 9 4 6 3 158473290 T C N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 158473520 T A N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 158473536 C A Y N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.214285714285714 0.714285714285714 0.0714285714285714 16 12 3 10 1 3 158473638 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 158473658 G T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 158473676 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 158473701 T C N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 158473711 A G N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.222222222222222 0.333333333333333 0.444444444444444 14 22 4 6 8 3 158473818 G A N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 158473849 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158473905 T C N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 158473974 G A N Y 0.361111111111111 REF 0.1 0.1 0.361111111111111 0.638888888888889 0.166666666666667 0.388888888888889 0.444444444444444 13 23 3 7 8 3 158474019 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 158474046 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 158474058 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 158474073 G A N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 158474082 T G N N 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.15 0.4 0.45 14 26 3 8 9 3 158474228 T C N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 158474374 G A N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 158474631 T C N Y 0.28125 REF 0.2 0.2 0.28125 0.71875 0.125 0.3125 0.5625 9 23 2 5 9 3 158475514 G A N Y 0.384615384615385 REF 0.35 0.35 0.384615384615385 0.615384615384615 0.153846153846154 0.461538461538462 0.384615384615385 10 16 2 6 5 3 158475622 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158475724 T G N N 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 158475775 G A N Y 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.235294117647059 0.294117647058824 0.470588235294118 13 21 4 5 8 3 158475891 A T N N 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 158476219 G C N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 158476326 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158476378 T G N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 158476629 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158476711 A G N Y 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 158476807 G A N Y 0.46875 REF 0.2 0.2 0.46875 0.53125 0.25 0.4375 0.3125 15 17 4 7 5 3 158476841 A T N N 0.382352941176471 REF 0.15 0.15 0.382352941176471 0.617647058823529 0.176470588235294 0.411764705882353 0.411764705882353 13 21 3 7 7 3 158477096 C T Y Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.333333333333333 0.583333333333333 0.0833333333333333 15 9 4 7 1 3 158477122 A G Y Y 0.416666666666667 ALT 0.4 0.4 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 14 10 4 6 2 3 158477137 T C Y Y 0.375 ALT 0.4 0.4 0.625 0.375 0.333333333333333 0.583333333333333 0.0833333333333333 15 9 4 7 1 3 158477395 G A Y Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 158477426 C A Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158477750 C G Y N 0.25 ALT 0.8 0.8 0.75 0.25 0.5 0.5 0 6 2 2 2 0 3 158477804 A T Y N 0.3125 ALT 0.6 0.6 0.6875 0.3125 0.5 0.375 0.125 11 5 4 3 1 3 158477826 A G Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 158477997 C T N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 158478049 A C N N 0.366666666666667 REF 0.25 0.25 0.366666666666667 0.633333333333333 0.2 0.333333333333333 0.466666666666667 11 19 3 5 7 3 158478072 C A Y N 0.357142857142857 REF 0.3 0.3 0.357142857142857 0.642857142857143 0.214285714285714 0.285714285714286 0.5 10 18 3 4 7 3 158478659 A G N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 158478673 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158478845 G A N Y 0.375 REF 0 0 0.375 0.625 0.2 0.35 0.45 15 25 4 7 9 3 158478871 A G N Y 0.342105263157895 REF 0.05 0.05 0.342105263157895 0.657894736842105 0.157894736842105 0.368421052631579 0.473684210526316 13 25 3 7 9 3 158478974 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158479184 A T N N 0.394736842105263 REF 0.05 0.05 0.394736842105263 0.605263157894737 0.210526315789474 0.368421052631579 0.421052631578947 15 23 4 7 8 3 158479360 C T N Y 0.45 REF 0 0 0.45 0.55 0.35 0.2 0.45 18 22 7 4 9 3 158479564 T C N Y 0.34375 REF 0.2 0.2 0.34375 0.65625 0.125 0.4375 0.4375 11 21 2 7 7 3 158479600 C T N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 158479668 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158479854 T C N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 158479857 A C N N 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 158480288 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158482265 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158482472 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158483411 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 158483577 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 158483753 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158485302 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158485552 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158487586 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158487996 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158488595 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158489440 C T N Y 0.25 ALT 0 0 0.75 0.25 0.65 0.2 0.15 30 10 13 4 3 3 158490039 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158490645 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158490661 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158491618 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158493985 T C N Y 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 158494508 T A N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 158495523 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 158496054 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 158499346 C T Y Y 0.157894736842105 ALT 0.05 0.05 0.842105263157895 0.157894736842105 0.789473684210526 0.105263157894737 0.105263157894737 32 6 15 2 2 3 158503587 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 158504511 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158505524 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 158506389 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158506423 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158507960 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158510362 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158513030 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158513536 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158514331 G A N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 158514937 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158515242 C T N Y 0.133333333333333 REF 0.25 0.25 0.133333333333333 0.866666666666667 0.0666666666666667 0.133333333333333 0.8 4 26 1 2 12 3 158515357 T G Y N 0.133333333333333 ALT 0.25 0.25 0.866666666666667 0.133333333333333 0.8 0.133333333333333 0.0666666666666667 26 4 12 2 1 3 158516565 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158517963 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 158518852 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158518902 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158525770 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158527248 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158529057 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 158529188 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158529229 G A N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 158529363 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158529703 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158530934 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158531348 A C N N 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 158531497 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158531897 G A Y Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 158532664 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158532710 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158533236 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158534209 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158547806 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158548943 A G N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 158550363 C A Y N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.823529411764706 0.117647058823529 0.0588235294117647 30 4 14 2 1 3 158550826 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 158551006 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158551225 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 158551644 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158551738 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158552042 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158552619 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158553645 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158553726 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158553914 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158554128 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158554217 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 158554267 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158554655 A T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 158555524 C G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 158555585 C A Y N 0.428571428571429 ALT 0.3 0.3 0.571428571428571 0.428571428571429 0.428571428571429 0.285714285714286 0.285714285714286 16 12 6 4 4 3 158555944 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158557414 C A Y N 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 158558356 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158558840 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158559234 C A N N 0.394736842105263 ALT 0.05 0.05 0.605263157894737 0.394736842105263 0.473684210526316 0.263157894736842 0.263157894736842 23 15 9 5 5 3 158559490 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158561191 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158561264 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158561321 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158561670 C T Y Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 158563007 G A N Y 0.4 ALT 0 0 0.6 0.4 0.45 0.3 0.25 24 16 9 6 5 3 158566563 T G N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 158566756 C A N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 158567279 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158567583 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158568375 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158568453 C T N Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 158568778 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158570867 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158571881 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158573535 C A Y N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 158574365 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158574649 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158575847 C T N Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.588235294117647 0.235294117647059 0.176470588235294 24 10 10 4 3 3 158576260 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158577718 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158578285 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158578538 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 158578638 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 158578812 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158579755 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158579798 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158580126 G A N Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 158580654 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158582523 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158585285 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158586766 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158587610 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158589158 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158598129 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158600087 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158600541 G A Y Y 0.444444444444444 REF 0.1 0.1 0.444444444444444 0.555555555555556 0.333333333333333 0.222222222222222 0.444444444444444 16 20 6 4 8 3 158600614 A C Y N 0.0526315789473684 REF 0.05 0.05 0.0526315789473684 0.947368421052632 0 0.105263157894737 0.894736842105263 2 36 0 2 17 3 158601284 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158601379 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158601423 C T Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158601467 C T Y Y 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 158603827 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158605167 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158605633 A G Y Y 0.025 REF 0 0 0.025 0.975 0 0.05 0.95 1 39 0 1 19 3 158606749 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158617288 C G N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 158617372 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 158618743 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158619254 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158620298 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158620299 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158625324 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158625342 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158627274 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158627316 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158627604 T C N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 158627930 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158628038 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158629436 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158629712 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158630268 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158630790 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158633108 G C N N 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 158633652 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158634233 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158635570 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158635600 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158636508 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158636864 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158638386 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158638461 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158638792 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158643056 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158643521 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158643862 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158645196 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158646074 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158646107 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158647705 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158648327 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158648940 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158649838 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158649937 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158650643 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158658110 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158658205 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158658976 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158659636 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158660010 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158660199 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158660898 G C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158661118 T C N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 158662302 G A N Y 0.416666666666667 ALT 0.1 0.1 0.583333333333333 0.416666666666667 0.333333333333333 0.5 0.166666666666667 21 15 6 9 3 3 158662465 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158664906 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158666738 A G N Y 0 REF 0.9 0.9 0 1 0 0 1 0 4 0 0 2 3 158667385 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158668416 A G N Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.388888888888889 0.5 0.111111111111111 23 13 7 9 2 3 158669411 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 158670024 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158670041 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158670858 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158672123 C T N Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 158672255 T C N Y 0.388888888888889 REF 0.1 0.1 0.388888888888889 0.611111111111111 0.111111111111111 0.555555555555556 0.333333333333333 14 22 2 10 6 3 158672321 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 158672464 C T N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.857142857142857 0.0714285714285714 0.0714285714285714 25 3 12 1 1 3 158672909 G A N Y 0.0625 ALT 0.2 0.2 0.9375 0.0625 0.875 0.125 0 30 2 14 2 0 3 158673188 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158673430 A T N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 158673479 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158673916 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 158674321 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 158674469 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 158675968 G C N N 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.1 0.25 0.65 9 31 2 5 13 3 158676416 A C N N 0.147058823529412 REF 0.15 0.15 0.147058823529412 0.852941176470588 0.0588235294117647 0.176470588235294 0.764705882352941 5 29 1 3 13 3 158676531 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158676549 A G N Y 0.225 REF 0 0 0.225 0.775 0.05 0.35 0.6 9 31 1 7 12 3 158676673 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158676794 C T N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 158676865 C T N Y 0.277777777777778 REF 0.1 0.1 0.277777777777778 0.722222222222222 0.111111111111111 0.333333333333333 0.555555555555556 10 26 2 6 10 3 158676868 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158677048 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158677365 C A N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 158677450 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 158677467 G T N N 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 158677653 C T N Y 0.210526315789474 REF 0.05 0.05 0.210526315789474 0.789473684210526 0.0526315789473684 0.315789473684211 0.631578947368421 8 30 1 6 12 3 158677663 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158677721 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158677988 A G N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 158678352 C T N Y 0.291666666666667 REF 0.4 0.4 0.291666666666667 0.708333333333333 0.0833333333333333 0.416666666666667 0.5 7 17 1 5 6 3 158678943 C T N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.105263157894737 0.315789473684211 0.578947368421053 10 28 2 6 11 3 158679092 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158680041 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158680620 T C N Y 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 158680667 C T N Y 0.275 REF 0 0 0.275 0.725 0.15 0.25 0.6 11 29 3 5 12 3 158680801 G T N N 0.25 REF 0 0 0.25 0.75 0.1 0.3 0.6 10 30 2 6 12 3 158680905 T G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.111111111111111 0.277777777777778 0.611111111111111 9 27 2 5 11 3 158681004 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158681491 T C N Y 0.15 REF 0 0 0.15 0.85 0.05 0.2 0.75 6 34 1 4 15 3 158683043 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158684195 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158684354 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158685264 A G N Y 0.2 REF 0 0 0.2 0.8 0.15 0.1 0.75 8 32 3 2 15 3 158685828 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158685854 T C N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 158686227 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 158687889 A T N N 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 158688629 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158688716 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158689315 T C N Y 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.0526315789473684 0.210526315789474 0.736842105263158 6 32 1 4 14 3 158689571 T C N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 158689692 A G N Y 0.166666666666667 REF 0.1 0.1 0.166666666666667 0.833333333333333 0.111111111111111 0.111111111111111 0.777777777777778 6 30 2 2 14 3 158689722 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 158689777 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158690128 C A N N 0.03125 REF 0.2 0.2 0.03125 0.96875 0 0.0625 0.9375 1 31 0 1 15 3 158690195 T G N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 158690221 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 158690400 C T N Y 0.194444444444444 REF 0.1 0.1 0.194444444444444 0.805555555555556 0.111111111111111 0.166666666666667 0.722222222222222 7 29 2 3 13 3 158691417 T C N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 158691475 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 158692752 C G N N 0.15625 REF 0.2 0.2 0.15625 0.84375 0.0625 0.1875 0.75 5 27 1 3 12 3 158692817 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 158693267 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158694595 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158694909 A C N N 0.157894736842105 REF 0.05 0.05 0.157894736842105 0.842105263157895 0.105263157894737 0.105263157894737 0.789473684210526 6 32 2 2 15 3 158695066 T G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 158695227 C G N N 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 158696639 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158698768 G A Y Y 0.447368421052632 ALT 0.05 0.05 0.552631578947368 0.447368421052632 0.315789473684211 0.473684210526316 0.210526315789474 21 17 6 9 4 3 158698783 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158698818 C A N N 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.55 0.35 0.1 29 11 11 7 2 3 158698826 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158699059 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158699104 G A Y Y 0.444444444444444 ALT 0.1 0.1 0.555555555555556 0.444444444444444 0.333333333333333 0.444444444444444 0.222222222222222 20 16 6 8 4 3 158699116 A T Y N 0.475 ALT 0 0 0.525 0.475 0.3 0.45 0.25 21 19 6 9 5 3 158699140 A G N Y 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 158699429 T C N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.65 0.25 0.1 31 9 13 5 2 3 158699479 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158699688 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158700160 A C N N 0 REF 0.7 0.7 0 1 0 0 1 0 12 0 0 6 3 158701225 G C Y N 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.263157894736842 0.473684210526316 0.263157894736842 19 19 5 9 5 3 158701227 C T N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 158701245 G A N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.157894736842105 0.421052631578947 0.421052631578947 14 24 3 8 8 3 158702038 C T N Y 0.175 REF 0 0 0.175 0.825 0.1 0.15 0.75 7 33 2 3 15 3 158702107 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158702791 T G N N 0.25 REF 0.4 0.4 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 6 18 2 2 8 3 158702971 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 158703168 T C N Y 0.131578947368421 REF 0.05 0.05 0.131578947368421 0.868421052631579 0.0526315789473684 0.157894736842105 0.789473684210526 5 33 1 3 15 3 158703578 G A Y Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.1875 0.125 0.6875 8 24 3 2 11 3 158703988 T C N Y 0.138888888888889 REF 0.1 0.1 0.138888888888889 0.861111111111111 0.0555555555555556 0.166666666666667 0.777777777777778 5 31 1 3 14 3 158704254 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 158704276 T A N N 0.266666666666667 REF 0.25 0.25 0.266666666666667 0.733333333333333 0.133333333333333 0.266666666666667 0.6 8 22 2 4 9 3 158704430 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158704628 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158704784 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 158704968 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158705233 A G N Y 0.184210526315789 REF 0.05 0.05 0.184210526315789 0.815789473684211 0.105263157894737 0.157894736842105 0.736842105263158 7 31 2 3 14 3 158705640 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158705780 G A Y Y 0.236842105263158 REF 0.05 0.05 0.236842105263158 0.763157894736842 0.105263157894737 0.263157894736842 0.631578947368421 9 29 2 5 12 3 158705786 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158706257 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158706313 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158706531 T A Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 158706603 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158706614 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158706616 A C N N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0.125 0.1875 0.6875 7 25 2 3 11 3 158706641 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158707124 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158707270 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 158707341 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158707661 A C Y N 0.323529411764706 REF 0.15 0.15 0.323529411764706 0.676470588235294 0.235294117647059 0.176470588235294 0.588235294117647 11 23 4 3 10 3 158708070 T A N N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 158708425 T C Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 158708444 G A Y Y 0.289473684210526 REF 0.05 0.05 0.289473684210526 0.710526315789474 0.210526315789474 0.157894736842105 0.631578947368421 11 27 4 3 12 3 158708456 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158709323 A T Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 158709416 G A N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 158709618 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158710358 A T Y N 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 158710463 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 158710690 C A Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 158710757 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 158711162 C T Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 158711510 A G Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 158711592 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 158711666 T C N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 158711785 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 158711910 T C N Y 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 158711954 T G Y N 0.315789473684211 REF 0.05 0.05 0.315789473684211 0.684210526315789 0.210526315789474 0.210526315789474 0.578947368421053 12 26 4 4 11 3 158712142 C A Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 158713125 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 158713630 G A Y Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 158713992 A T Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 158714246 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158714411 C G N N 0.25 REF 0.1 0.1 0.25 0.75 0.166666666666667 0.166666666666667 0.666666666666667 9 27 3 3 12 3 158714434 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158714894 A G Y Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 158715146 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158715319 C A N N 0.264705882352941 REF 0.15 0.15 0.264705882352941 0.735294117647059 0.176470588235294 0.176470588235294 0.647058823529412 9 25 3 3 11 3 158715397 A C Y N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 158715604 A C N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 158715760 A G N Y 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 158715962 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158716290 A G N Y 0.263157894736842 REF 0.05 0.05 0.263157894736842 0.736842105263158 0.157894736842105 0.210526315789474 0.631578947368421 10 28 3 4 12 3 158716473 T C N Y 0.325 REF 0 0 0.325 0.675 0.25 0.15 0.6 13 27 5 3 12 3 158717220 A G N Y 0.333333333333333 REF 0.25 0.25 0.333333333333333 0.666666666666667 0.2 0.266666666666667 0.533333333333333 10 20 3 4 8 3 158717358 C T Y Y 0.361111111111111 ALT 0.1 0.1 0.638888888888889 0.361111111111111 0.277777777777778 0.722222222222222 0 23 13 5 13 0 3 158717543 T C N Y 0.333333333333333 ALT 0.4 0.4 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 16 8 6 4 2 3 158717945 C T N Y 0.192307692307692 ALT 0.35 0.35 0.807692307692308 0.192307692307692 0.769230769230769 0.0769230769230769 0.153846153846154 21 5 10 1 2 3 158717988 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 158718184 C G N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 158718325 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158718327 T C N Y 0.275 ALT 0 0 0.725 0.275 0.65 0.15 0.2 29 11 13 3 4 3 158719057 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 158719209 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 158719251 G A N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 158719359 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 158719421 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158719464 T C N Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 158719602 T A N N 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.578947368421053 0.210526315789474 0.210526315789474 26 12 11 4 4 3 158719957 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158720651 G T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158721262 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158722630 G T N N 0.3 REF 0 0 0.3 0.7 0.2 0.2 0.6 12 28 4 4 12 3 158722746 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158723188 G A N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158725074 C G Y N 0 REF 0.8 0.8 0 1 0 0 1 0 8 0 0 4 3 158727986 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158728012 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158732006 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 158732153 G A Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 158732440 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158732685 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158733232 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158733661 C A Y N 0.111111111111111 ALT 0.1 0.1 0.888888888888889 0.111111111111111 0.833333333333333 0.111111111111111 0.0555555555555556 32 4 15 2 1 3 158733716 C A N N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.736842105263158 0.263157894736842 0 33 5 14 5 0 3 158733922 T A N N 0.184210526315789 ALT 0.05 0.05 0.815789473684211 0.184210526315789 0.736842105263158 0.157894736842105 0.105263157894737 31 7 14 3 2 3 158734004 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158734166 A G N Y 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 158734393 A G Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 158734394 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158734406 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 158734856 C T Y Y 0.175 ALT 0 0 0.825 0.175 0.75 0.15 0.1 33 7 15 3 2 3 158734912 A G N Y 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.764705882352941 0.176470588235294 0.0588235294117647 29 5 13 3 1 3 158734916 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 158735166 T C N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 158735374 G A N Y 0.4 ALT 0.25 0.25 0.6 0.4 0.466666666666667 0.266666666666667 0.266666666666667 18 12 7 4 4 3 158735395 C T N Y 0.233333333333333 ALT 0.25 0.25 0.766666666666667 0.233333333333333 0.6 0.333333333333333 0.0666666666666667 23 7 9 5 1 3 158735787 C T N Y 0.352941176470588 ALT 0.15 0.15 0.647058823529412 0.352941176470588 0.529411764705882 0.235294117647059 0.235294117647059 22 12 9 4 4 3 158735826 T A N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 158736078 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158736121 C T N Y 0.305555555555556 ALT 0.1 0.1 0.694444444444444 0.305555555555556 0.611111111111111 0.166666666666667 0.222222222222222 25 11 11 3 4 3 158736381 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158736388 T G N N 0.3 ALT 0 0 0.7 0.3 0.6 0.2 0.2 28 12 12 4 4 3 158736653 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 158736905 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158736949 T A N N 0.289473684210526 ALT 0.05 0.05 0.710526315789474 0.289473684210526 0.578947368421053 0.263157894736842 0.157894736842105 27 11 11 5 3 3 158737051 T A N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 158737067 A T Y N 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 3 158738821 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158742365 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158744358 G T Y N 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 158745808 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158745896 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158746073 G A N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.578947368421053 0.368421052631579 0.0526315789473684 29 9 11 7 1 3 158746137 T C N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158746349 C A N N 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.529411764705882 0.352941176470588 0.117647058823529 24 10 9 6 2 3 158746512 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158746564 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 158746572 G A N Y 0.263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.736842105263158 0.263157894736842 0.578947368421053 0.315789473684211 0.105263157894737 28 10 11 6 2 3 158746657 C T N Y 0.236842105263158 ALT 0.05 0.05 0.763157894736842 0.236842105263158 0.631578947368421 0.263157894736842 0.105263157894737 29 9 12 5 2 3 158747122 A G N Y 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 158747509 C G N N 0.225 ALT 0 0 0.775 0.225 0.6 0.35 0.05 31 9 12 7 1 3 158748005 C T N Y 0.176470588235294 ALT 0.15 0.15 0.823529411764706 0.176470588235294 0.647058823529412 0.352941176470588 0 28 6 11 6 0 3 158748215 G A N Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 158748216 T A N N 0.25 ALT 0.6 0.6 0.75 0.25 0.625 0.25 0.125 12 4 5 2 1 3 158748584 G A N Y 0.423076923076923 ALT 0.35 0.35 0.576923076923077 0.423076923076923 0.384615384615385 0.384615384615385 0.230769230769231 15 11 5 5 3 3 158748673 T G N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 158748714 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158748716 C A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158748760 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 158748966 G T N N 0.40625 REF 0.2 0.2 0.40625 0.59375 0.25 0.3125 0.4375 13 19 4 5 7 3 158749122 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158751823 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158752651 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158752723 G A N Y 0.475 REF 0 0 0.475 0.525 0.35 0.25 0.4 19 21 7 5 8 3 158754387 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158756356 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158759237 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158759669 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 158760875 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 158760984 G A N Y 0.416666666666667 REF 0.1 0.1 0.416666666666667 0.583333333333333 0.222222222222222 0.388888888888889 0.388888888888889 15 21 4 7 7 3 158761191 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158765211 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158768139 A G Y Y 0.166666666666667 ALT 0.1 0.1 0.833333333333333 0.166666666666667 0.777777777777778 0.111111111111111 0.111111111111111 30 6 14 2 2 3 158771653 T C Y Y 0.0625 REF 0.2 0.2 0.0625 0.9375 0 0.125 0.875 2 30 0 2 14 3 158771940 G A Y Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 158772331 G A Y Y 0.09375 ALT 0.2 0.2 0.90625 0.09375 0.8125 0.1875 0 29 3 13 3 0 3 158772588 C T Y Y 0 REF 0.65 0.65 0 1 0 0 1 0 14 0 0 7 3 158779176 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158779335 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158783898 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158784210 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158787345 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158787417 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158787487 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158788885 T C N Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 158789896 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158790048 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158791653 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158792409 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158794956 G A N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 158795096 C T N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 158795717 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158796175 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158797178 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 158798210 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158800176 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158801000 T C Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 158804382 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158805600 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158812140 G A N Y 0.25 REF 0.2 0.2 0.25 0.75 0.0625 0.375 0.5625 8 24 1 6 9 3 158812680 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158813765 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158814274 T C N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 158817301 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158819302 T C N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 158820052 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158823345 C A Y N 0.342105263157895 ALT 0.05 0.05 0.657894736842105 0.342105263157895 0.473684210526316 0.368421052631579 0.157894736842105 25 13 9 7 3 3 158824263 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158825530 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158827301 T C Y Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 158827837 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 158827968 A G N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 158828472 T A N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158836846 G A N Y 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 158838110 C A Y N 0.375 ALT 0.6 0.6 0.625 0.375 0.375 0.5 0.125 10 6 3 4 1 3 158844962 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158845244 T C N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 158845682 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158846139 G C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 158847249 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158847678 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158848196 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158849349 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158850430 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158851592 G A Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158852981 C T Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158858686 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158860514 T A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 158864224 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158864556 C A Y N 0.4 REF 0 0 0.4 0.6 0.2 0.4 0.4 16 24 4 8 8 3 158865252 C T Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158865447 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158865878 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158867228 T G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158867751 T G N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 158868681 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158869781 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 158870385 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158871569 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158872085 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158872219 G A N Y 0.0789473684210526 ALT 0.05 0.05 0.921052631578947 0.0789473684210526 0.842105263157895 0.157894736842105 0 35 3 16 3 0 3 158877272 A T N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158879124 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158882559 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158884533 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158884845 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158885002 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158885886 A T Y N 0.21875 REF 0.2 0.2 0.21875 0.78125 0 0.4375 0.5625 7 25 0 7 9 3 158888234 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158888684 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158903872 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158904288 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158904529 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158908793 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158908938 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158909971 A T Y N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 158909999 T G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158912841 T C N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 158913518 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158915283 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158916295 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158917453 G T Y N 0.0833333333333333 ALT 0.1 0.1 0.916666666666667 0.0833333333333333 0.833333333333333 0.166666666666667 0 33 3 15 3 0 3 158918028 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158920008 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158923084 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158923781 A G N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 158924367 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158925581 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158930126 C A N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 158932164 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158943931 T A N N 0 REF 0.4 0.4 0 1 0 0 1 0 24 0 0 12 3 158944934 G A N Y 0.5 ALT 0.05 0.05 0.5 0.5 0.315789473684211 0.368421052631579 0.315789473684211 19 19 6 7 6 3 158945956 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158947020 G A Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158947141 G T N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 158947172 T G N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 158947822 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158948234 G A Y Y 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 158949289 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158952185 A C Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158952362 T C Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158953421 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158953693 C T Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158955557 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 158961621 G A N Y 0.473684210526316 ALT 0.05 0.05 0.526315789473684 0.473684210526316 0.315789473684211 0.421052631578947 0.263157894736842 20 18 6 8 5 3 158964667 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158965588 C T N Y 0.105263157894737 ALT 0.05 0.05 0.894736842105263 0.105263157894737 0.789473684210526 0.210526315789474 0 34 4 15 4 0 3 158967830 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158967870 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 158967879 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 158967912 A G N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 158968041 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158973530 G T N N 0.5 ALT 0.3 0.3 0.5 0.5 0.285714285714286 0.428571428571429 0.285714285714286 14 14 4 6 4 3 158973947 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158974824 A G Y Y 0.294117647058824 ALT 0.15 0.15 0.705882352941177 0.294117647058824 0.411764705882353 0.588235294117647 0 24 10 7 10 0 3 158975190 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 158976862 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158981927 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 158984966 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158987819 C T N Y 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 158988585 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158988635 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158988876 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158991080 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 158992924 G T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 158992990 T C Y Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 158994067 T C Y Y 0.421052631578947 REF 0.05 0.05 0.421052631578947 0.578947368421053 0.263157894736842 0.315789473684211 0.421052631578947 16 22 5 6 8 3 158994220 T C Y Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 158995043 A C N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 158997180 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 159001610 G A Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159001923 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 159002477 A T Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159003488 T A Y N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 159004464 G C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 159006344 A G Y Y 0 REF 0.6 0.6 0 1 0 0 1 0 16 0 0 8 3 159006797 A G Y Y 0 REF 0.45 0.45 0 1 0 0 1 0 22 0 0 11 3 159006928 C T Y Y 0.111111111111111 ALT 0.55 0.55 0.888888888888889 0.111111111111111 0.777777777777778 0.222222222222222 0 16 2 7 2 0 3 159011308 T G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 159013160 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 159013395 T C Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 159014133 C G N N 0.473684210526316 REF 0.05 0.05 0.473684210526316 0.526315789473684 0.263157894736842 0.421052631578947 0.315789473684211 18 20 5 8 6 3 159014153 T C N Y 0.0882352941176471 REF 0.15 0.15 0.0882352941176471 0.911764705882353 0 0.176470588235294 0.823529411764706 3 31 0 3 14 3 159014561 A G Y Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 159017368 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159018446 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159024759 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159026124 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159029498 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159031269 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159031487 T C N Y 0.0588235294117647 REF 0.15 0.15 0.0588235294117647 0.941176470588235 0 0.117647058823529 0.882352941176471 2 32 0 2 15 3 159035232 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159036383 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159038112 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159038478 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159038519 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159038909 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159039482 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159040636 G A N Y 0.375 ALT 0 0 0.625 0.375 0.45 0.35 0.2 25 15 9 7 4 3 159040827 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159044876 C T Y Y 0.0263157894736842 ALT 0.05 0.05 0.973684210526316 0.0263157894736842 0.947368421052632 0.0526315789473684 0 37 1 18 1 0 3 159045700 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159045859 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159046468 A C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 159047341 G A Y Y 0.382352941176471 ALT 0.15 0.15 0.617647058823529 0.382352941176471 0.235294117647059 0.764705882352941 0 21 13 4 13 0 3 159047462 C T N Y 0.194444444444444 ALT 0.1 0.1 0.805555555555556 0.194444444444444 0.666666666666667 0.277777777777778 0.0555555555555556 29 7 12 5 1 3 159048277 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 159048293 G C N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 159054592 G T N N 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 159056658 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 159056886 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 159057154 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159057232 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159057971 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159058162 A G N Y 0.305555555555556 REF 0.1 0.1 0.305555555555556 0.694444444444444 0.0555555555555556 0.5 0.444444444444444 11 25 1 9 8 3 159059472 A G N Y 0.235294117647059 ALT 0.15 0.15 0.764705882352941 0.235294117647059 0.529411764705882 0.470588235294118 0 26 8 9 8 0 3 159059530 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 159059749 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159060389 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 159063516 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159064649 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 159065815 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 159066238 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159071736 C T N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 159072166 C G N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 159073342 T C N Y 0.0384615384615385 REF 0.35 0.35 0.0384615384615385 0.961538461538462 0 0.0769230769230769 0.923076923076923 1 25 0 1 12 3 159074152 G A Y Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 159076314 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159076526 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159076530 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159082242 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 159082421 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159083302 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 159088077 G A N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 159088245 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159088340 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 159090062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159094702 C T N Y 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 159096215 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159100222 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 159104010 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 159109041 A G Y Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159112154 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159113097 G C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159116504 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 159124224 A G N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 159128875 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 159132566 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159133652 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 159137031 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159138894 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159140684 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159146897 T G Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 159147147 A G Y Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 159147414 G C Y N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 159148138 A G N Y 0.368421052631579 REF 0.05 0.05 0.368421052631579 0.631578947368421 0.210526315789474 0.315789473684211 0.473684210526316 14 24 4 6 9 3 159151253 T C N Y 0.205882352941176 ALT 0.15 0.15 0.794117647058823 0.205882352941176 0.588235294117647 0.411764705882353 0 27 7 10 7 0 3 159152804 T A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159153275 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 159155603 G A Y Y 0.368421052631579 ALT 0.05 0.05 0.631578947368421 0.368421052631579 0.421052631578947 0.421052631578947 0.157894736842105 24 14 8 8 3 3 159157469 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 159158165 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159159949 G A Y Y 0.210526315789474 ALT 0.05 0.05 0.789473684210526 0.210526315789474 0.684210526315789 0.210526315789474 0.105263157894737 30 8 13 4 2 3 159160881 A T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 159165141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159167348 C T Y Y 0.315789473684211 ALT 0.05 0.05 0.684210526315789 0.315789473684211 0.526315789473684 0.315789473684211 0.157894736842105 26 12 10 6 3 3 159168420 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 159176080 G T N N 0.117647058823529 ALT 0.15 0.15 0.882352941176471 0.117647058823529 0.764705882352941 0.235294117647059 0 30 4 13 4 0 3 159176848 G C Y N 0.441176470588235 REF 0.15 0.15 0.441176470588235 0.558823529411765 0.235294117647059 0.411764705882353 0.352941176470588 15 19 4 7 6 3 159191928 T G N N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 159198270 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 159214153 C T N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 159214873 T C N Y 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 159214898 A C N N 0.05 REF 0.5 0.5 0.05 0.95 0 0.1 0.9 1 19 0 1 9 3 159220613 C T Y Y 0.25 ALT 0.3 0.3 0.75 0.25 0.642857142857143 0.214285714285714 0.142857142857143 21 7 9 3 2 3 159221120 C A N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159223141 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159224578 C A N N 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 159225121 G T Y N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 159225466 G T Y N 0.0909090909090909 ALT 0.45 0.45 0.909090909090909 0.0909090909090909 0.818181818181818 0.181818181818182 0 20 2 9 2 0 3 159226760 G A Y Y 0.0416666666666667 REF 0.4 0.4 0.0416666666666667 0.958333333333333 0 0.0833333333333333 0.916666666666667 1 23 0 1 11 3 159228524 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159233511 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159235832 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159239786 A C N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159239892 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 159252689 G T Y N 0.5 ALT 0.25 0.25 0.5 0.5 0.266666666666667 0.466666666666667 0.266666666666667 15 15 4 7 4 3 159253129 A T N N 0.125 ALT 0 0 0.875 0.125 0.8 0.15 0.05 35 5 16 3 1 3 159271938 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159271961 A T Y N 0.0555555555555556 ALT 0.1 0.1 0.944444444444444 0.0555555555555556 0.888888888888889 0.111111111111111 0 34 2 16 2 0 3 159272992 C G Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 159276589 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159279237 T A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 159279959 A C N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 159280090 C G Y N 0.131578947368421 ALT 0.05 0.05 0.868421052631579 0.131578947368421 0.789473684210526 0.157894736842105 0.0526315789473684 33 5 15 3 1 3 159282638 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 159285971 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 159286232 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 159291513 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159292319 C T N Y 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 159297608 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 159307991 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 159308025 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 159310091 T C N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 159317165 T C N Y 0 REF 0.5 0.5 0 1 0 0 1 0 20 0 0 10 3 159325753 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 159326048 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 159326097 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 159326281 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 159327361 G A Y Y 0.447368421052632 REF 0.05 0.05 0.447368421052632 0.552631578947368 0.263157894736842 0.368421052631579 0.368421052631579 17 21 5 7 7 3 159327642 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159330635 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159331519 A G N Y 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 159338336 T C Y Y 0 REF 0.85 0.85 0 1 0 0 1 0 6 0 0 3 3 159343598 A G N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 159343600 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 159347277 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159357753 G C N N 0 REF 0.55 0.55 0 1 0 0 1 0 18 0 0 9 3 159362039 A C Y N 0 REF 0.15 0.15 0 1 0 0 1 0 34 0 0 17 3 159369579 C T N Y 0.0263157894736842 REF 0.05 0.05 0.0263157894736842 0.973684210526316 0 0.0526315789473684 0.947368421052632 1 37 0 1 18 3 159370980 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 159371859 T A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 159374087 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159375880 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 159376059 C T N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159376255 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 159387230 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159395731 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 159398124 G C N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 159408221 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159411329 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 159423546 A T Y N 0.15625 ALT 0.2 0.2 0.84375 0.15625 0.6875 0.3125 0 27 5 11 5 0 3 159426634 T A Y N 0.0588235294117647 ALT 0.15 0.15 0.941176470588235 0.0588235294117647 0.882352941176471 0.117647058823529 0 32 2 15 2 0 3 159426679 T G Y N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 159427834 T G Y N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159428027 G A N Y 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 159428934 A T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159441238 C A N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 159447398 C T N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 159451122 T C N Y 0.35 REF 0 0 0.35 0.65 0.2 0.3 0.5 14 26 4 6 10 3 159464014 G C N N 0.285714285714286 REF 0.3 0.3 0.285714285714286 0.714285714285714 0.0714285714285714 0.428571428571429 0.5 8 20 1 6 7 3 159466213 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159466665 G T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 159467114 A C Y N 0.0454545454545455 ALT 0.45 0.45 0.954545454545455 0.0454545454545455 0.909090909090909 0.0909090909090909 0 21 1 10 1 0 3 159467165 C G Y N 0.147058823529412 ALT 0.15 0.15 0.852941176470588 0.147058823529412 0.705882352941177 0.294117647058824 0 29 5 12 5 0 3 159470259 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159474065 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 159483190 T C N Y 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 159485778 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159487090 G T N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 159491442 T C N Y 0.107142857142857 ALT 0.3 0.3 0.892857142857143 0.107142857142857 0.785714285714286 0.214285714285714 0 25 3 11 3 0 3 159494972 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 159495831 T G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159495935 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159496771 C G N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159504793 G A N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 159508357 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 159515533 G A N Y 0 REF 0.35 0.35 0 1 0 0 1 0 26 0 0 13 3 159519781 A C N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 159520573 A T N N 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 159520677 G T N N 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159521656 C A N N 0 REF 0.25 0.25 0 1 0 0 1 0 30 0 0 15 3 159523062 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159526894 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159537038 A C N N 0.1 REF 0.75 0.75 0.1 0.9 0 0.2 0.8 1 9 0 1 4 3 159539890 C G N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 159540051 A C N N 0 REF 0.3 0.3 0 1 0 0 1 0 28 0 0 14 3 159541356 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159544979 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159551813 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 159557791 A T N N 0.0277777777777778 REF 0.1 0.1 0.0277777777777778 0.972222222222222 0 0.0555555555555556 0.944444444444444 1 35 0 1 17 3 159559234 G T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 159559261 C A Y N 0.333333333333333 ALT 0.1 0.1 0.666666666666667 0.333333333333333 0.5 0.333333333333333 0.166666666666667 24 12 9 6 3 3 159561426 A G N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159565503 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159566958 A G N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 159582563 T A N N 0 REF 0.1 0.1 0 1 0 0 1 0 36 0 0 18 3 159588257 A T N N 0 REF 0.2 0.2 0 1 0 0 1 0 32 0 0 16 3 159588355 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 159591164 T C N Y 0 REF 0.05 0.05 0 1 0 0 1 0 38 0 0 19 3 159593340 T C N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20 3 159596390 G A N Y 0 REF 0 0 0 1 0 0 1 0 40 0 0 20